JP2002183467A - Consigment sale method of gene containing dna micro chip - Google Patents

Consigment sale method of gene containing dna micro chip

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JP2002183467A
JP2002183467A JP2000384794A JP2000384794A JP2002183467A JP 2002183467 A JP2002183467 A JP 2002183467A JP 2000384794 A JP2000384794 A JP 2000384794A JP 2000384794 A JP2000384794 A JP 2000384794A JP 2002183467 A JP2002183467 A JP 2002183467A
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customer
gene
dna
analysis
manufacturer
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JP2000384794A
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Japanese (ja)
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Hirokazu Yoshioka
弘料 吉岡
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KAKEN GENEQS KK
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KAKEN GENEQS KK
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To achieve a genetic research and a genetic diagnosis without an expensive device or equipment by designing a DNA micro chip that a customer requires through the Internet, and by selecting a partial charge of work through gene detection profiling analysis to order from a marker. SOLUTION: Using a genetic information database 13 wherein the genes are classified to plural items containing kinds, tissues, and functions to be searched, the customer 15 selects a desired gene and designs a DNA chip A from the database 13. Then, the partial charge of the work is designated with respect to the plural work containing the production of the DNA chip, hybridization, gene detection profiling analysis and physiological analysis gene order to be ordered. The marker 12 conducts the prescribed work in accordance with the ordered partial charge. The obtained information is encoded and transferred to the customer on the Web.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、科学研究者や医師
を含む広い範囲の顧客が必要とするDNAマイクロチッ
プを設計すると共に、DNAマイクロチップの設計から
遺伝子発現解析、更に生理解析用遺伝子の調製に至る作
業分担を指定してメーカーに発注することが出来、且つ
メーカーは受注したDNAマイクロチップ及び生理解析
用遺伝子を製造すると共に作業分担に従って作業を行な
って得たデータを顧客に対し合理的に伝達し、且つ安全
にストックして利用し得るように構成したDNAマイク
ロチップの受託販売方法に関するものである。
The present invention relates to designing a DNA microchip required by a wide range of customers, including scientific researchers and physicians, as well as designing a DNA microchip, analyzing gene expression, and analyzing genes for physiological analysis. It is possible to specify the work sharing leading to the preparation and place an order with the manufacturer, and the manufacturer manufactures the DNA microchip and the gene for physiological analysis and receives the data obtained by performing the work according to the work sharing to the customer. The present invention relates to a method for consigned sales of DNA microchips that are conveyed to a company and that can be safely stocked and used.

【0002】[0002]

【従来の技術】遺伝子に関わる研究や開発、或いは遺伝
子を利用した診断を含む医療の発展には目ざましいもの
がある。例えば、遺伝子の組み換えの技術によって、人
類に有益な食料の生産や医薬品の開発が実現している。
また遺伝子診断を行なうことによって、多くの遺伝子的
要因を含む疾患の発症を予測し得るようになり、またそ
の原因を特定することが可能となってきている。これに
伴って、これまで原因不明とされていた疾患の根治的な
治療法や、医薬品の開発、そして予防的な生活改善を実
行することによる発症の延期等が可能となっている。
2. Description of the Related Art There has been a remarkable progress in research and development relating to genes or in medical treatment including diagnosis using genes. For example, gene recombination technology has enabled the production of foods useful for humankind and the development of pharmaceuticals.
In addition, by performing genetic diagnosis, it becomes possible to predict the onset of a disease including many genetic factors, and it is possible to identify the cause. Along with this, it has become possible to radically cure diseases previously unknown, to develop drugs, and to postpone the onset by implementing preventive living improvements.

【0003】遺伝子研究や遺伝子診断を行なう場合、研
究目的や診断目的となる遺伝子の種類,組織,機能に対
応した複数の既知の遺伝子、及び未知の塩基配列を含む
遺伝子を利用することが行なわれる。この場合、利用さ
れる複数の既知の遺伝子、及び未知の遺伝子は、前記各
種類,組織,機能に応じて適当なものが複数選択され、
且つ選択された最適なものを配列させたDNAマイクロ
アレイとして取り扱われることが多い。
[0003] When conducting genetic research or genetic diagnosis, a plurality of known genes corresponding to the type, organization, and function of the gene to be studied or diagnosed, and a gene containing an unknown base sequence are used. . In this case, a plurality of appropriate known genes and unknown genes are selected according to the respective types, tissues, and functions.
In addition, it is often handled as a DNA microarray in which the selected optimal ones are arranged.

【0004】例えば遺伝子診断を行なう場合、配列され
た遺伝子に対してハイブリダイゼーションを行い、遺伝
子発現プロファイリング解析を行なう作業を経ることが
必要となる。また前記作業を行なう過程で、多数(数百
〜数万)のDNAマイクロアレイ作製用遺伝子の調製
や、これらの遺伝子を大量に増産する作業等の作業が付
加される。
[0004] For example, when performing a gene diagnosis, it is necessary to perform an operation of performing hybridization on a sequenced gene and performing gene expression profiling analysis. In addition, in the process of performing the above-mentioned operations, operations such as preparation of a large number (hundreds to tens of thousands) of genes for preparing a DNA microarray and operation of increasing the production of these genes in large quantities are added.

【0005】上記の如き作業を必要とする遺伝子研究や
遺伝子診断を行なう場合、高価な機械装置や設備が必要
であり、設備的な問題及び作業スペースの問題等から極
く限られた一部の機関で行なわれているのが実情であ
る。これらの機関では、夫々が前述した各作業を行なう
能力を有しているところが多く、遺伝子の取引は、所望
の遺伝子を単独で、或いは例えばガラス基盤上にDNA
マイクロアレイを形成したDNAマイクロチップとして
行なわれる。
[0005] When conducting genetic research or genetic diagnosis which requires the above-mentioned operations, expensive machinery and equipment are required, and some of the equipment is extremely limited due to problems in equipment and work space. It is the fact that it is being done at the institution. In many of these institutions, each has the ability to perform each of the above-mentioned operations, and gene trading involves transferring a desired gene alone or, for example, by placing DNA on a glass substrate.
It is performed as a DNA microchip on which a microarray is formed.

【0006】上記DNAマイクロチップは、目的の遺伝
子研究や遺伝子診断等に必要な遺伝子を選択すると共
に、選択された遺伝子をアレイヤーと呼ばれる機械装置
を利用して基盤上に転写することで、該基盤上にDNA
マイクロアレイを形成して構成されている。このDNA
マイクロチップでは、複数の既知の遺伝子及び未知の遺
伝子が予め設計された条件に従って配列,固定されてお
り、この状態で通常の流通手段によって流通することが
出来る。
[0006] The DNA microchip is used to select genes required for the purpose of gene research or genetic diagnosis, and to transfer the selected genes onto a substrate using a mechanical device called an arrayer. DNA on top
It is configured by forming a microarray. This DNA
In the microchip, a plurality of known genes and unknown genes are arranged and fixed in accordance with predesigned conditions, and can be distributed by ordinary distribution means in this state.

【0007】顧客が遺伝子研究や遺伝子診断を行なおう
とする場合の手順について説明する。顧客は目的の研究
に必要な遺伝子の情報を独自に保有する情報やメーカー
が公開するカタログや雑誌から取得し、取得した情報に
基づいて保有している遺伝子を確認し、保有していない
遺伝子をメーカーに発注し、保有している遺伝子を基板
に張り付けてDNAマイクロチップを製作する。また遺
伝子を受注したメーカーでは、受注した遺伝子を基板に
張り付けたDNAマイクロチップを製作し、このDNA
マイクロチップの状態で顧客に配送する。DNAマイク
ロチップを入手した顧客は、必要な検体を採取して該検
体によるハイブリダイゼーションを実施し、更に、スキ
ャナーによるスキャンニングデータを採取すると共に採
取したデータを解析し、得られたデータをデータバンク
化して生理用解析遺伝子を発注している。
[0007] A procedure when a customer intends to conduct genetic research or genetic diagnosis will be described. The customer obtains information on the genes necessary for the intended research from catalogs and magazines published by the manufacturer or from the catalogs and magazines published by the manufacturer, confirms the genes possessed based on the acquired information, and identifies the genes not possessed. An order is placed with a manufacturer, and a DNA microchip is manufactured by attaching the gene on the substrate. In addition, the manufacturer that received the order for the gene manufactures a DNA microchip in which the ordered gene is attached to a substrate.
Delivery to customers in microchip form. The customer who has obtained the DNA microchip collects the required sample, performs hybridization with the sample, collects scanning data with a scanner, analyzes the collected data, and stores the obtained data in a data bank. And ordering of genes for sanitary analysis.

【0008】上記した一連の作業を実施する際に、DN
Aマイクロチップを製作する場合にはアレイヤーと呼ば
れる装置が必要であり、ハイブリダイゼーションを行な
う場合には該作業に特有なハイブリダイゼーション技術
が必要であり、スキャンニングを行なう場合にはスキャ
ナーが必要である。
[0008] When performing the above series of operations, DN
When manufacturing an A microchip, an apparatus called an arrayer is required. When performing hybridization, a hybridization technique specific to the work is required. When performing scanning, a scanner is required. .

【0009】[0009]

【発明が解決しようとする課題】上記の如く、遺伝子を
直接取り扱って科学研究や医学的診断を行なう場合、多
種類の高価な機械装置や設備を設置することが必要とな
る。このため、比較的小さい組織、例えば個人的な研究
者や開業医が、遺伝子研究や遺伝子診断を行なうことが
出来ないという問題がある。
As described above, in the case of conducting scientific research or medical diagnosis by directly handling genes, it is necessary to install various kinds of expensive machinery and equipment. Therefore, there is a problem that a relatively small tissue, for example, a personal researcher or medical practitioner cannot perform genetic research or genetic diagnosis.

【0010】また大きな機関に属する研究者や医師であ
っても、現在、国内で販売されているDNAマイクロチ
ップは僅かであり、且つDNAマイクロチップを受託作
成する業者の極めて少なく、目的に対し最適なDNAマ
イクロチップを入手することが困難であるという問題も
ある。この原因は、DNAマイクロチップを利用した高
度な機能解析は未だ緒に就いたばかりであることや、D
NAマイクロアレイを製作するアレイヤー等の装置が高
価であること、更に、DNAマイクロアレイシステムに
よる遺伝子発現プロファイリング解析技術も発展途上で
あり完成度も未熟な点等にある。
[0010] Even among researchers and physicians belonging to large institutions, only a few DNA microchips are currently sold in Japan, and there are very few outsourced DNA microchip manufacturers. There is also a problem that it is difficult to obtain a suitable DNA microchip. This is because advanced functional analysis using a DNA microchip has just begun,
Equipment such as an arrayer for producing an NA microarray is expensive, and furthermore, gene expression profiling analysis technology using a DNA microarray system is in the process of development and the degree of completion is immature.

【0011】また現在の研究の流れを見ると、個々の研
究者が遺伝子発現解析によって特定した遺伝子につい
て、この遺伝子を保持していないか入手が困難な場合
は、その遺伝子の発現しているであろう組織からmRN
Aを抽出してその抽出した遺伝子をクローニングし、更
に、サブクローニングして生理学的解析を行なっている
のが一般である。しかし、遺伝子のクローニング、及び
各種生理学的研究に利用するためのサブクローニング等
の作業は、PCR(Polymerase Chain Reactin)法によ
る遺伝子の大量増産の工程と、クローニングされた遺伝
子の塩基配列決定作業の工程が必然的に複数回含まれる
ため、多くの人手と時間がかかり、コストを押し上げる
要因となっている。
According to the current flow of research, regarding genes identified by individual researchers by gene expression analysis, if the genes are not retained or are difficult to obtain, the genes are expressed. MRN from a certain organization
Generally, A is extracted, the extracted gene is cloned, and further subcloned for physiological analysis. However, the work of gene cloning and subcloning for use in various physiological studies involves the process of mass production of genes by the PCR (Polymerase Chain Reactin) method and the process of determining the nucleotide sequence of cloned genes. Inevitably included multiple times, it takes a lot of manpower and time, and is a factor that raises costs.

【0012】更に、天文学的な情報量になることが予測
される遺伝子発現解析を低いコストで且つ迅速に進める
には、メーカー側の理論で研究者や医師等にDNAマイ
クロチップを押し付けるのではなく、研究者や医師とD
NAマイクロチップの技術を確立した専門家の間で、個
々の研究者や医師が必要とするDNAマイクロチップと
遺伝子に関する諸作業及び情報交換を、研究者や医師の
意図に従って速やかに且つ円滑に実現し得ることが望ま
れている。
[0012] Furthermore, in order to rapidly and at a low cost perform gene expression analysis that is expected to be an astronomical information amount, it is not necessary to impose a DNA microchip on a researcher or a doctor according to the manufacturer's theory. , With researchers and doctors
Experts who have established NA microchip technology can quickly and smoothly perform various tasks and information exchange on DNA microchips and genes required by individual researchers and doctors according to the intentions of the researchers and doctors. It is hoped that it can be done.

【0013】特に、ゲノムプロジェクトが終了すると、
全世界に膨大な量の遺伝子情報が公開される。この遺伝
子情報は、生物学や基礎医学の研究に限定されることな
く、臨床医学を含めた広い分野で多大な貢献をすること
が期待されている。このため、公開された遺伝子情報を
迅速に且つ安全迅速に通信し、且つストックする環境を
整備することが急務である。
In particular, when the genome project ends,
An enormous amount of genetic information is made available worldwide. This genetic information is not limited to research in biology and basic medicine, and is expected to make a great contribution in a wide range of fields including clinical medicine. Therefore, it is urgently necessary to quickly and safely communicate the released genetic information and to prepare an environment for stocking the information.

【0014】本発明の目的は、インターネットを介し
て、第1に顧客が必要とするDNAマイクロチップを設
計すると共に、遺伝子発現プロファイリング解析に至る
間で経る作業の分担を選択してメーカーに発注すること
で、高価な装置や設備がなくとも遺伝子研究や遺伝子診
断を実現出来るようにしたDNAマイクロチップを含む
遺伝子の受託販売方法を提供すること、第2にDNAマ
イクロアレイ用遺伝子と生理解析用遺伝子を両方取り揃
えて行くことで、遺伝子発現解析からその遺伝子産物の
生理学的機能解析に移行するまでの期間を大幅に短縮さ
せることにより、研究スピードの向上とコストの低減を
可能にすること、第3にデータベースを提供し或いはデ
ータベース化サービスを行なうことで、膨大な情報量と
なる遺伝子発現解析情報を、顧客が管理利用し易くする
こと、等を可能にするDNAマイクロチップを含む遺伝
子の受託販売方法を提供することにある。
An object of the present invention is to first design a DNA microchip required by a customer via the Internet, and to select an allotment of work to be performed up to gene expression profiling analysis and place an order with a manufacturer. Thus, it is possible to provide a consignment sale method of a gene including a DNA microchip, which enables the realization of genetic research and gene diagnosis without expensive equipment and facilities. Second, a gene for DNA microarray and a gene for physiological analysis are provided. By combining both, the time required to shift from gene expression analysis to physiological function analysis of the gene product can be significantly shortened, thereby improving research speed and reducing costs. Gene expression analysis that provides a huge amount of information by providing a database or providing a database creation service Distribution and customers to easily use management is to provide a consignment method of gene comprising a DNA microchip such permits.

【0015】[0015]

【課題を解決するための手段】上記課題を解決するため
に本発明に係るDNAマイクロチップを含む遺伝子の受
託販売方法は、遺伝子の種類,組織,機能を含む複数の
項目に分類して検索し得るようにした遺伝子情報を用
い、顧客は前記遺伝子情報から所望の遺伝子を選択して
独自のDNAマイクロチップを設計すると共に、基盤上
への遺伝子の転写,ハイブリダイゼーション,遺伝子発
現プロファイリング解析,生理解析用遺伝子の注文を含
む複数の作業に対して顧客側とメーカー側の作業分担を
指定して発注し、メーカーは顧客が選択した作業分担に
従って所定の作業を行い、且つ前記所定の作業を行なっ
て得た情報をウエブ上で顧客に伝達することを特徴とす
るものである。
According to the present invention, there is provided a method for consigning and selling a gene including a DNA microchip according to the present invention. Using the obtained gene information, the customer selects a desired gene from the gene information to design a unique DNA microchip, and also transcribes the gene onto a substrate, hybridizes, analyzes gene expression profiling, and analyzes the physiology. For a plurality of operations including an order for a gene, an order is assigned by designating the work sharing between the customer and the manufacturer, and the manufacturer performs predetermined work according to the work sharing selected by the customer, and performs the predetermined work. The obtained information is transmitted to a customer on a web.

【0016】上記DNAマイクロチップを含む遺伝子の
受託販売方法(以下、単に「受託販売方法」という)で
は、遺伝子を種類,組織,機能を含む複数の項目に分類
して検索し得るようにした遺伝子情報データベースや遺
伝子の研究機関,大学等のホームページ(以下総称して
「遺伝子情報データベース」又は単に「データベース」
という)を用いることによって、遺伝子研究を行なう研
究者、遺伝子診断や遺伝子治療を行なう医師を含む顧客
は、前記遺伝子情報データベースに記録された遺伝子情
報から目的の研究或いは診断,治療(以下「研究等」と
いう)に沿って必要とされる所望の遺伝子を選択して独
自のDNAマイクロチップを設計することが出来る。
[0016] In the above-mentioned method of contract sale of a gene containing a DNA microchip (hereinafter, simply referred to as “consignment sale method”), the gene is classified into a plurality of items including types, tissues, and functions and can be searched. Information databases and websites of gene research institutions and universities (hereinafter collectively referred to as "gene information databases" or simply "databases"
By using this method, customers including researchers conducting genetic research and physicians performing genetic diagnosis and gene therapy can use the genetic information recorded in the genetic information database to conduct research, diagnosis and treatment (hereinafter referred to as “research etc.”). )) To design a unique DNA microchip.

【0017】また顧客は目的の研究等の内容や所有する
設備能力等の諸条件に従って、設計したDNAマイクロ
チップを製作するに当たって必要な基盤上への遺伝子の
転写作業や、目的の研究等に必要なデータを採取するの
に必要なハイブリダイゼーション作業,遺伝子発現プロ
ファイリング解析作業等の作業、更に、生理解析用遺伝
子の注文作業、を含む複数の作業に対し、夫々顧客が行
なうかメーカーが行なうかの作業分担を指定してメーカ
ーに発注することが出来る。
[0017] Further, the customer is required to carry out gene transfer work onto a substrate necessary for producing a designed DNA microchip and to conduct a target research in accordance with various conditions such as the contents of the target research or the like and the capacity of the equipment possessed. Whether the customer or the manufacturer performs multiple tasks, including the tasks of hybridization, gene expression profiling analysis, etc., required to collect vital data, and the task of ordering genes for physiological analysis. You can specify the work sharing and place an order with the manufacturer.

【0018】このため、メーカーでは受注した作業分担
に従って所定の作業を行い、この過程で発生したDNA
マイクロチップを含む製品を顧客に送付し、或いは取得
した情報をウエブ上で顧客に伝達することで、顧客は目
的の研究等の内容に沿った、且つ所有する設備能力に応
じた製品或いは情報を得ることが出来る。
For this reason, the manufacturer performs predetermined work in accordance with the work assignment received, and obtains the DNA generated in this process.
By sending products containing microchips to customers, or by transmitting the acquired information to customers on the web, customers can obtain products or information in line with the contents of the intended research, etc., and according to the equipment capabilities they possess. Can be obtained.

【0019】上記受託販売方法に於いて、メーカーがデ
ータバンクに保持している遺伝子は、DNAマイクロチ
ップ作成用遺伝子と完全長cDNAを含む生理解析用の
遺伝子の両方を保持し、DNAマイクロアレイによる大
量の遺伝子発現プロファイリング解析後は速やかに生理
学的解析用の遺伝子を供給することが好ましい。
In the above-mentioned consignment sales method, the genes held by the manufacturer in the data bank hold both genes for DNA microchip preparation and genes for physiological analysis including full-length cDNA, It is preferable to supply a gene for physiological analysis immediately after gene expression profiling analysis.

【0020】また顧客又はメーカーがDNAマイクロチ
ップのハイブリダイゼーションを行ない、且つDNAマ
イクロチップのデータの読み取りをメーカーが行なった
後、遺伝子発現プロファイリング解析を顧客が実施する
場合、メーカーは読み取ったDNAマイクロチップの読
取データをウエブ上で顧客に転送すると共に解析ソフト
を提供し、且つ顧客は提供された解析ソフトに基づいて
ウエブ上で転送されたDNAマイクロチップの読取デー
タを解析することが好ましい。
When the customer or the maker performs hybridization of the DNA microchip and the maker reads the data of the DNA microchip, and then performs the gene expression profiling analysis by the customer, the maker reads the DNA microchip. It is preferable to transfer the read data of the DNA microchip to the customer on the web and provide analysis software, and the customer analyzes the read data of the DNA microchip transferred on the web based on the provided analysis software.

【0021】特に、DNAマイクロアレイを含むDNA
マイクロチップのデータをウエブ上で転送するに際し、
前記データを暗号化することが好ましい。このようにデ
ータを暗号化することによって、秘密保持を行なうこと
が出来、遺伝子に関する情報の漏洩を防止することが出
来る。
In particular, DNA including DNA microarray
When transferring microchip data on the web,
Preferably, the data is encrypted. By encrypting data in this manner, confidentiality can be maintained, and leakage of information on genes can be prevented.

【0022】また、顧客が核酸を含む検体をメーカーに
提供して遺伝子発現プロファイリング解析を行なう場
合、メーカーは顧客から提供された検体を用いて遺伝子
発現プロファイリング解析を行い、その後、得られたデ
ータをウエブ上で顧客に転送することが好ましい。
Further, when a customer provides a sample containing a nucleic acid to a manufacturer and performs gene expression profiling analysis, the manufacturer performs gene expression profiling analysis using the sample provided by the customer, and then obtains the obtained data. Preferably, it is forwarded to the customer on the web.

【0023】また、顧客が核酸を含む検体をメーカーに
提供して遺伝子発現プロファイリング解析を行った場
合、メーカーは前記遺伝子発現プロファイリング解析結
果をデータベース化してウエブ上で顧客に提供し、又は
顧客自身が遺伝子発現プロファイリング解析を行なった
場合、メーカーは顧客に対し遺伝子発現プロファイリン
グ解析結果をデータベース化するためのソフト、或いは
データベース化し得るような環境をウエブ上で提供する
ことが好ましい。
When a customer provides a sample containing nucleic acid to a manufacturer and performs gene expression profiling analysis, the manufacturer prepares a database of the results of the gene expression profiling analysis and provides the result to the customer on the web, or the customer himself or herself. When the gene expression profiling analysis is performed, it is preferable that the maker provides the customer with software for creating a database of the gene expression profiling analysis results, or an environment on which the database can be created.

【0024】[0024]

【発明の実施の形態】以下、上記受託販売方法について
図を用いて説明する。図1は本発明に係る受託販売方法
を実施する際の関係を説明する図である。図2は受託販
売方法を実行する第1実施例を説明するフローチャート
である。図3は第2実施例を説明するフローチャートで
ある。図4は第3実施例を説明するフローチャートであ
る。図5は遺伝子を公開買い付けする際の手順を説明す
るフローチャートである。図6はDNAマイクロチップ
とDNAマイクロアレイを説明する図である。
DETAILED DESCRIPTION OF THE PREFERRED EMBODIMENTS The above-mentioned contract sales method will be described below with reference to the drawings. FIG. 1 is a diagram for explaining the relationship when the commissioned sales method according to the present invention is performed. FIG. 2 is a flowchart for explaining a first embodiment for executing the consignment sales method. FIG. 3 is a flowchart illustrating the second embodiment. FIG. 4 is a flowchart illustrating the third embodiment. FIG. 5 is a flowchart illustrating a procedure for tender purchase of a gene. FIG. 6 is a diagram illustrating a DNA microchip and a DNA microarray.

【0025】本発明に於いて、取引の対象となるのはD
NAマイクロチップを含む遺伝子であり、必ずしもDN
Aマイクロチップそのものを取引対象として限定するも
のではない。即ち、顧客が必要とする遺伝子を単独で或
いは複数の遺伝子を並列させたDNAマイクロアレイの
形式で取引することが可能である。しかし、説明が煩雑
になるため、以下複数の遺伝子を基盤上に並列させてD
NAマイクロアレイを形成したDNAマイクロチップを
取引する場合について説明する。
In the present invention, the object of the transaction is D
Gene containing NA microchip, not necessarily DN
The A microchip itself is not limited as a transaction target. That is, it is possible to trade the gene required by the customer alone or in the form of a DNA microarray in which a plurality of genes are arranged in parallel. However, since the description is complicated, a plurality of genes are arranged in parallel on
A case where a DNA microchip on which an NA microarray is formed is traded will be described.

【0026】本発明に係る受託販売方法の説明に先立っ
て、図6によりDNAマイクロチップAとDNAマイク
ロアレイBについて説明する。
Prior to the description of the consignment selling method according to the present invention, the DNA microchip A and the DNA microarray B will be described with reference to FIG.

【0027】DNAマイクロチップAは、透明なプラス
チック板やガラス板からなる基盤1を有しており、この
基盤1に試薬の遺伝子を張り付けた点2を形成して構成
されている。基盤1に対して張り付けた点2の数は特に
限定するものではなく、1個或いは多数の点2を一定の
条件で張り付けて構成することが可能である。
The DNA microchip A has a substrate 1 made of a transparent plastic plate or a glass plate, and is formed by forming points 2 on which a gene for a reagent is attached. The number of points 2 attached to the base 1 is not particularly limited, and one or many points 2 can be attached under a certain condition.

【0028】DNAマイクロアレイBは、試薬の遺伝子
を並列させて張り付けた複数の点2によって構成されて
いる。この場合、点2を張り付けるベースの材料や形状
は特に限定するものではなく、上記基盤1或いは紙や不
織布等のシート状のもの、或いは金属等の無機質材料か
らなるシート状のもの等を利用することが可能である。
The DNA microarray B is composed of a plurality of points 2 where reagent genes are attached in parallel. In this case, the material or shape of the base to which the point 2 is attached is not particularly limited, and the base 1 or a sheet-like material such as paper or nonwoven fabric, or a sheet-like material made of an inorganic material such as metal is used. It is possible to

【0029】本実施例では、ガラス板からなる基盤1
に、10mm角の領域を設定して0.2 mmピッチで多数の点2
を張り付けることでDNAマイクロアレイ(以下「DN
Aアレイ」という)Bを形成し、且つDNAマイクロチ
ップ(以下「DNAチップ」という)Aを構成してい
る。
In this embodiment, the base 1 made of a glass plate is used.
Then, a 10 mm square area is set and a number of points 2 are set at 0.2 mm pitch.
A DNA microarray (hereinafter "DN
A array B) is formed, and a DNA microchip (hereinafter, “DNA chip”) A is formed.

【0030】次に、DNAチップAを含む遺伝子の受託
販売方法の幾つかの実施例について図1〜図5により説
明する。
Next, several embodiments of a method for consigned sale of a gene containing a DNA chip A will be described with reference to FIGS.

【0031】尚、図1に於いて、11はインターネットを
示し、12はメーカーを13はデータベースを示している。
また14a,14bは遺伝子に関する研究と保管を行なって
いる研究所や病院等の研究機関を示し、15a〜15cは遺
伝子そのもの或いは遺伝子情報を必要とする研究所や医
療機関等からなる顧客を示している。更に、実線はメー
カー12,研究機関14a,14b,顧客15a〜15cの間に形
成されるインターネット11を介在させた情報,データの
通信網(以下「通信網」という)を示し、一点鎖線はメ
ーカー12と研究機関14a,14bの間に形成される遺伝子
の物流網(以下「物流網」という)を示し、二点鎖線は
メーカー12と顧客15a〜15cの間に形成されるDNAチ
ップAを含む遺伝子の物流と決裁の流れを含む販売網
(以下「販売網」という)を示す。
In FIG. 1, 11 indicates the Internet, 12 indicates a maker, and 13 indicates a database.
Reference numerals 14a and 14b denote research institutions such as research laboratories and hospitals that conduct research and storage on genes, and reference numerals 15a to 15c denote customers comprising laboratories and medical institutions that require the gene itself or genetic information. I have. Further, a solid line indicates a communication network for information and data (hereinafter referred to as a “communication network”) via the Internet 11 formed between the maker 12, the research institutes 14a and 14b, and the customers 15a to 15c. 1 shows a gene distribution network (hereinafter, referred to as a “distribution network”) formed between the laboratory 12 and the research institutes 14a and 14b, and the two-dot chain line includes the DNA chip A formed between the manufacturer 12 and the customers 15a to 15c. This shows the sales network (hereinafter referred to as “sales network”) that includes the distribution of genes and the flow of decisions.

【0032】データベース13は遺伝子の種類,組織,機
能を含む複数の項目に分類して構成されており、関連す
る何れかの項目をキーワードとして所要のデータを収集
し得るように構成されている。このデータベース13をメ
ーカー12と研究機関14a,14bの何れが管理するかは限
定するものではないが、後述する各実施例では何れもメ
ーカー12が管理するものとしている。
The database 13 is composed of a plurality of items including gene types, tissues, and functions, and is configured so that required data can be collected using any of the related items as keywords. It is not limited which of the maker 12 and the research institutes 14a and 14b manages the database 13, but in each of the embodiments described later, the maker 12 manages the database 13.

【0033】次に、本発明の受託販売方法の具体的な実
施例を説明するに先立って、顧客がDNAチップを製作
する際の手順と、顧客及びメーカーの何れも必要な遺伝
子を保有せず、このため、必要な遺伝子を公開で買い付
けする場合の手順について図5により簡単に説明する。
Next, prior to describing a specific embodiment of the consignment sales method of the present invention, the procedure for producing a DNA chip by a customer and the fact that neither the customer nor the manufacturer possesses a necessary gene. For this reason, a procedure for purchasing a necessary gene in a public manner will be briefly described with reference to FIG.

【0034】遺伝子の種類は膨大なものであり、これら
の遺伝子の種類や組織,機能を含む情報がデータベース
13に公開されているとしても、実際の遺伝子を顧客15a
〜15c或いはメーカー12が全て保有しているという保証
はない。従って、顧客15a〜15cがDNAチップの設計
及び製作を行なう過程で顧客自身及びメーカー12が保有
していない遺伝子を公開で買い付ける必要が生じる。
The types of genes are enormous, and information including the types, tissues, and functions of these genes is stored in a database.
Even if it has been published on 13, the actual gene
There is no guarantee that 〜15c or maker 12 has it all. Therefore, it is necessary for the customers 15a to 15c to openly purchase genes not owned by the customer and the manufacturer 12 in the process of designing and manufacturing the DNA chip.

【0035】図5に於いて、顧客15(15a〜15cの何れ
か)としては比較的に充実した研究組織が想定されてお
り、DNAチップを製作する装置を保有することがあり
得る。このような顧客15では、該顧客15が研究目的に最
適な遺伝子を保有していないものの、遺伝子が入手し得
ればDNAチップAの製作は独自でなし得ることが想定
される。
In FIG. 5, a customer 15 (any of 15a to 15c) is assumed to have a relatively substantial research organization, and may have a device for manufacturing a DNA chip. It is assumed that the customer 15 does not have a gene that is optimal for the purpose of research, but the DNA chip A can be manufactured independently if the gene is available.

【0036】顧客15が生理学研究(ステップS11)を行
なうために遺伝子が必要となったとき、先ず、目的の生
理学研究に必要な遺伝子情報を収集する(ステップS1
2)。このとき、顧客15が保有していない遺伝子情報に
ついては通信網を利用してデータベース13にアクセスし
てデータを収集する。
When the customer 15 needs a gene for conducting a physiological study (step S11), first, gene information necessary for a target physiological study is collected (step S1).
2). At this time, for the genetic information not held by the customer 15, the data is collected by accessing the database 13 using the communication network.

【0037】目的の生理学研究に必要な全ての遺伝子情
報を収集した後、これらの遺伝子を如何なる配列にする
かを含めてDNAチップAを設計する(ステップS1
3)。DNAチップAの設計は、研究者が目的の研究を
進めるのに最適な遺伝子が最も合理的に配列されてい
る。
After collecting all the gene information necessary for the intended physiological study, the DNA chip A is designed including the sequence of these genes (step S1).
3). In the design of the DNA chip A, genes optimal for the researcher to proceed with the intended research are arranged most rationally.

【0038】設計されたDNAチップAを製作する場
合、該DNAチップAに張り付けるべき遺伝子を保有し
ていることが必要である。このため、ステップS14で保
有している遺伝子を調査し、保有している場合にはステ
ップS15に進行してDNAチップを製作する装置の有無
を確認し、保有していない場合には通信網を利用してメ
ーカー12に発注する。
When a designed DNA chip A is manufactured, it is necessary to have a gene to be attached to the DNA chip A. For this reason, the gene possessed is examined in step S14, and if possessed, the process proceeds to step S15 to confirm the presence or absence of a device for producing a DNA chip, and if not possessed, a communication network is established. Use and place an order with Maker 12.

【0039】全ての遺伝子を保有しており、DNAチッ
プAの製作に移行する場合、ステップS15ではDNAチ
ップを製作する装置を保有しているか否かを検討し、保
有している場合にはステップS16に進行してDNAチッ
プAを製作し、保有していない場合にはメーカー12に依
頼する。
When all the genes are retained and the process proceeds to the production of the DNA chip A, it is determined in step S15 whether or not the apparatus for producing the DNA chip is possessed. Proceeding to S16, a DNA chip A is manufactured, and if it is not owned, the manufacturer 12 is requested.

【0040】顧客15から遺伝子の発注及びDNAチップ
Aの製作依頼を受けたメーカー12では、ステップS17に
進行して該メーカー12が保有している遺伝子を調査し、
受注した遺伝子を全て保有している場合にはステップS
18に進行してDNAチップAを製作する。
The maker 12 receiving the gene order and the production request of the DNA chip A from the customer 15 proceeds to step S17 to investigate the genes possessed by the maker 12,
If all the ordered genes are possessed, step S
Proceed to 18 to manufacture a DNA chip A.

【0041】また受注した遺伝子を保有していない場
合、メーカー12は通信網を利用して公開収集(ステップ
S19)する。このとき、収集対象となる遺伝子の情報
と、譲渡条件が公開される(ステップS20)。
If the gene does not have the ordered gene, the manufacturer 12 performs public collection using the communication network (step S19). At this time, information on the gene to be collected and the transfer conditions are disclosed (step S20).

【0042】ステップS19,20で公開された遺伝子の情
報及び譲渡条件を見た遺伝子の保有者(例えば研究機
関)は、メーカー12或いはメーカー12を仲介して顧客15
との間で、取引条件が無償であるか(ステップS21),
有償であるか(ステップS22)、有償である場合一括支
払か又は分割支払或いはローヤリティーか、或いは顧客
15と遺伝子の保有機関との共同研究(ステップS23)と
するか否か、等を含む譲渡条件について折衝し、互いに
折り合いがついたとき、目的の遺伝子のデータが通信網
を介して研究機関から顧客15に伝えられる。また遺伝子
は物流網を介して研究機関からメーカー12に配送され、
或いは顧客15がDNAチップの製作装置を保有している
場合には直接顧客に配送される。
The gene holder (for example, a research institution) who has seen the gene information and the transfer conditions disclosed in steps S19 and S20 is the manufacturer 12 or the customer 15 via the manufacturer 12
Whether the transaction conditions are free of charge (step S21),
If it is paid (step S22), if it is paid, it is one-time payment, installment payment or royalty, or customer
Negotiations on transfer conditions, including whether or not to conduct joint research with Step 15 and the gene holding organization (step S23), etc., and when mutual agreement is reached, data on the target gene is transmitted from the research institution via the communication network. Conveyed to customer 15. In addition, the gene is delivered from the research institution to the manufacturer 12 via a distribution network,
Alternatively, when the customer 15 has a DNA chip manufacturing device, the product is directly delivered to the customer.

【0043】ステップS19〜ステップS23を経てメーカ
ー12が入手した遺伝子は、例えばPCR法を適用するこ
とで大量に増産され、DNAチップAに張り付けた残り
がメーカー12に保存される。
Genes obtained by the maker 12 through steps S19 to S23 are increased in mass by applying, for example, the PCR method, and the rest attached to the DNA chip A is stored in the maker 12.

【0044】顧客15が入手した遺伝子に対する決裁は、
譲渡条件に従って通信網を介して或いは販売網を介して
行なわれる。
The decision on the gene obtained by the customer 15 is as follows:
It is performed via a communication network or a sales network according to transfer conditions.

【0045】上記一連の手順を経ることで、顧客15は目
的の遺伝子からなるDNAチップAを設計すると共に該
設計に基づいてDNAチップAを製作することが可能で
ある。
Through the above series of procedures, the customer 15 can design the DNA chip A including the target gene and manufacture the DNA chip A based on the design.

【0046】尚、通信網を構成するインターネットを介
してウエブ上でデータを転送する場合、データは全て暗
号化されている。特に、DNAアレイBを含むDNAチ
ップAのデータを転送する場合には、転送されるデータ
の秘守が必要な場合には暗号化される。DNAに関する
データの秘守が必要な場合に暗号化することは、本実施
例のみならず、以後説明する各実施例に於いても全く同
一に扱われる。
When data is transferred on the web via the Internet constituting a communication network, all data is encrypted. In particular, when data of the DNA chip A including the DNA array B is transferred, the transferred data is encrypted when confidentiality is required. Encrypting when the confidentiality of the data relating to DNA is required is handled in the same manner in each of the embodiments described below as well as this embodiment.

【0047】また図に於いて「web」と記載されてい
る部分は、インターネットを含む通信網を介して行なわ
れる作業或いは操作である。そして上記したように顧客
15,メーカー12の間で転送されるデータの秘守が必要な
場合は全てが暗号化される。
In the figure, the part described as "web" is a work or operation performed through a communication network including the Internet. And customer as mentioned above
15. If the confidentiality of data transferred between manufacturers 12 is required, everything is encrypted.

【0048】図2は第1実施例のフローチャートであ
り、本実施例に於ける顧客15としては、顧客15はDNA
チップの製作〜スキャンニング作業に至る全ての作業を
メーカー12に委託するものとしている。尚、図に於い
て、ステップS31の生理学研究からステップS33のDN
Aチップ設計までは前述した公開買い付けの例と同一で
あり、説明を省略する。
FIG. 2 is a flowchart of the first embodiment. In this embodiment, the customer 15 is a DNA customer.
All operations from chip production to scanning are outsourced to the manufacturer 12. In the figure, the physiology research at step S31 and the DN at step S33 are performed.
The process up to the A-chip design is the same as the above-described example of the tender offer, and the description is omitted.

【0049】ステップS34では、ステップS33までの工
程で生理学研究の目的に対応して設計されたDNAチッ
プAに対して必要な作業を検討し、顧客15が独自に行な
う作業とメーカー12に委託する作業を分類する。即ち、
設計されたDNAチップAを構成する遺伝子を収集する
作業やDNAチップAを製作する作業、及び目的の生理
学研究に必要な各種実験及び検体を採取する作業、更に
ハイブリダイゼーション,スキャンニング,データ解析
作業等を含む複数の作業の中から、顧客15が独自に行な
う作業とメーカー12に委託すべき作業を分類する。
In step S34, the work required for the DNA chip A designed for the purpose of physiological research in the steps up to step S33 is examined, and the work performed independently by the customer 15 and entrusted to the manufacturer 12 are performed. Classify work. That is,
The task of collecting the genes that make up the designed DNA chip A, the task of manufacturing the DNA chip A, the task of collecting various experiments and samples necessary for the intended physiological research, and the work of hybridization, scanning, and data analysis From among a plurality of works including the above, work classified by the customer 15 and work to be entrusted to the manufacturer 12 are classified.

【0050】その結果、スキャンニングまでの作業をメ
ーカー12に委託することが決定した場合(ステップS35
〜ステップS37)、ステップS41で検体のRNA(メッ
センジャーRNA,mRNA)を採取して販売網を介し
てメーカー12に配送する。
As a result, when it is determined that the operation up to the scanning is entrusted to the manufacturer 12 (step S35).
-Step S37), RNA (messenger RNA, mRNA) of the sample is collected in step S41, and delivered to the manufacturer 12 via the sales network.

【0051】メーカー12では、顧客15が設計したDNA
チップAの製作からスキャンニングまでの一連の作業を
受託し(ステップS38,ステップS40,ステップS4
3)、作業を進行する。このとき、受託したDNAチッ
プAを製作するのに必要な遺伝子をメーカー12が保有し
ていない場合、図5の例に於けるステップS19〜ステッ
プS23と同一の作業(公開買い付け)を行なって全ての
遺伝子を収集する。
In the maker 12, the DNA designed by the customer 15
A series of operations from chip A production to scanning are commissioned (Step S38, Step S40, Step S4)
3), work progress. At this time, if the maker 12 does not have the gene necessary for producing the received DNA chip A, the same operation (open offer) as in steps S19 to S23 in the example of FIG. Collect genes.

【0052】従って、メーカー12は前述した図5の例と
同一の手順に従って受託したDNAチップAを製作(ス
テップS39)する。その後、顧客15から配送された検体
のRNAを利用し、ステップS43でハイブリダイゼーシ
ョンを行ない、更に、ステップS44でスキャンニングを
行なう。そしてスキャンニングで得られたスキャンニン
グデータを顧客15に転送(ステップS46)することで、
メーカー12に於ける一連の受託作業が終了する。
Accordingly, the maker 12 manufactures the received DNA chip A according to the same procedure as in the example of FIG. 5 described above (step S39). Thereafter, hybridization is performed in step S43 using the RNA of the sample delivered from the customer 15, and scanning is performed in step S44. Then, by transferring the scanning data obtained by the scanning to the customer 15 (step S46),
A series of commissioned work by the manufacturer 12 is completed.

【0053】ステップS43で行なわれるハイブリダイゼ
ーションは、DNAチップAを構成するDNAアレイB
に検体のRNAを作用させて補完的なDNAとの間でハ
イブリッド化させるものであり、検体のRNAを蛍光色
素等の蛍光材料によって蛍光標識してDNAアレイBに
対する結合処理を行なうものである。
The hybridization performed in step S43 is performed on the DNA array B constituting the DNA chip A.
In this method, RNA of a sample is caused to act on the DNA to hybridize it with complementary DNA, and the RNA of the sample is fluorescently labeled with a fluorescent material such as a fluorescent dye to perform a binding treatment to the DNA array B.

【0054】ステップS44で行なわれるスキャンニング
は、DNAチップAを構成するDNAアレイBに対し、
スキャナーから照射した励起光を走査してDNAアレイ
Bを構成する個々のDNAの蛍光量を測定し、各DNA
の位置情報と蛍光量のデータ(スキャンニングデータ)
を記憶装置に記憶する。そして全てのDNAの蛍光量を
測定した後、ステップS43に進行する。このとき、DN
AアレイBを構成するDNAに対する検体のRNAの結
合量が多い程、蛍光量も多くなる。
The scanning performed in step S44 is performed for the DNA array B constituting the DNA chip A.
The amount of fluorescence of each DNA constituting the DNA array B is measured by scanning the excitation light irradiated from the scanner, and each DNA
Position information and fluorescence amount data (scanning data)
Is stored in the storage device. After measuring the amounts of fluorescence of all the DNAs, the process proceeds to step S43. At this time, DN
The larger the amount of binding of the sample RNA to the DNA constituting the A array B, the greater the amount of fluorescence.

【0055】そしてステップS46では、記憶装置に記憶
した各DNAのデータを顧客15に転送する。
In step S46, the data of each DNA stored in the storage device is transferred to the customer 15.

【0056】スキャンニングデータが転送された顧客15
はステップS47でスキャンニングデータ解析ソフトの有
無を検討し、保有していない場合、メーカー12にスキャ
ンニングデータ解析ソフトの提供を依頼する。依頼を受
けたメーカー12は、必要なスキャンニングデータ解析ソ
フトを顧客15に転送(ステップS48)する。
The customer 15 to whom the scanning data has been transferred
Examines the presence or absence of the scanning data analysis software in step S47, and if not, requests the manufacturer 12 to provide the scanning data analysis software. The maker 12 receiving the request transfers necessary scanning data analysis software to the customer 15 (step S48).

【0057】その後、顧客15は提供されたスキャンニン
グデータ解析ソフトを利用してスキャンニングデータの
解析を行う(ステップS49,ステップS50)。この作業
は、記憶装置に記憶した各DNAのデータと蛍光量のデ
ータとを解析するものであり、DNAアレイBを構成す
るDNAとの結合量から、検体のRNAと補完関係にあ
るDNAを特定し、特定されたDNAのDNAアレイに
於ける配列位置から該DNAの性質を知ることで、検体
のRNAの性質或いは特徴を調査するものである。
After that, the customer 15 analyzes the scanning data using the provided scanning data analysis software (steps S49 and S50). This work analyzes the data of each DNA and the data of the amount of fluorescence stored in the storage device, and identifies the DNA complementary to the RNA of the sample from the amount of binding to the DNA constituting the DNA array B. Then, by knowing the properties of the specified DNA from the sequence position in the DNA array, the properties or characteristics of the RNA of the specimen are investigated.

【0058】スキャンニングデータ解析が終了した後、
ステップS51に進行し、スキャンニングデータはデータ
バンク化される。その後、ステップS52に進行して生理
用解析遺伝子を発注することで、顧客15に於ける独自の
一連の作業が終了する。
After the scanning data analysis is completed,
Proceeding to step S51, the scanning data is converted into a data bank. Thereafter, the process proceeds to step S52 to order the sanitary analysis gene, thereby completing a series of operations unique to the customer 15.

【0059】データバンクに保持される遺伝子は、DN
Aチップを製作するための遺伝子と、完全長cDNAを
含む生理解析用の遺伝子とからなり、必要に応じて速や
かに顧客に提供し得るように管理される。
The gene held in the data bank is DN
It is composed of a gene for producing an A chip and a gene for physiological analysis including full-length cDNA, and is managed so that it can be promptly provided to customers as needed.

【0060】次に、図3は第2実施例のフローチャート
であり、この実施例では、顧客15はハイブリダイゼーシ
ョン作業を顧客側で行い、DNAチップAの製作及びス
キャンニング作業をメーカー12に委託するものとしてい
る。尚、図に於いて、前述の第1実施例と同一の内容を
持つステップには同一の符号を付して説明を省略する。
Next, FIG. 3 is a flowchart of the second embodiment. In this embodiment, the customer 15 performs the hybridization work on the customer side, and entrusts the production and the scanning work of the DNA chip A to the manufacturer 12. It is assumed. In the figure, steps having the same contents as those in the above-described first embodiment are denoted by the same reference numerals, and description thereof is omitted.

【0061】図に示すように、ステップS31〜ステップ
S34の顧客がDNAチップAの設計を行なうと共に作業
検討を行なってDNAチップAの製作をメーカー12に依
頼するまでのステップと、ステップS38,39のメーカー
12が受託したDNAチップAを製作するステップは前述
の第1実施例と同一である。
As shown in the figure, the steps from step S31 to step S34 until the customer designs the DNA chip A, examines the work, and requests the maker 12 to manufacture the DNA chip A, and steps S38 and S39. Manufacturers
The steps for fabricating the DNA chip A accepted by 12 are the same as those in the first embodiment.

【0062】メーカー12は、DNAチップAを製作した
後、製作したDNAチップAを顧客15に物流網を介して
配送し、ステップS60でハイブリダイゼーションの依頼
のないことを確認してステップS65に進行して待機す
る。
After producing the DNA chip A, the manufacturer 12 delivers the produced DNA chip A to the customer 15 via the distribution network, confirms in step S60 that there is no request for hybridization, and proceeds to step S65. And wait.

【0063】DNAチップAを受け取った顧客15はステ
ップS61で検体のRNAを採取し、製作されたDNAチ
ップAのDNAアレイBに検体のRNAを作用させてハ
イブリッド化させるハイブリダイゼーション作業を行な
う(ステップS62,63)。その後、ステップS64に進行
してスキャナーの有無を確認し、スキャナーを保有しな
いことを確認して、ハイブリダイゼーション後のDNA
チップAをメーカー12に配送する。
The customer 15 having received the DNA chip A collects the RNA of the sample in step S61, and performs a hybridization operation in which the RNA of the sample is caused to act on the DNA array B of the manufactured DNA chip A and hybridized (step S61). S62, 63). Thereafter, the process proceeds to step S64 to check for the presence or absence of a scanner, to confirm that the scanner is not provided, and to determine the DNA after hybridization.
The chip A is delivered to the maker 12.

【0064】メーカー12では、ステップS65で顧客15か
らのスキャンニングの依頼を確認し、配送されたハイブ
リダイゼーション後のDNAチップAに対するスキャン
ニングを行なってスキャンニングデータを作成し(ステ
ップS66,67)、作成したスキャンニングデータをウエ
ブ上で顧客15に転送する。
The manufacturer 12 confirms the scanning request from the customer 15 in step S65, scans the delivered DNA chip A after hybridization, and creates scanning data (steps S66 and S67). Then, the created scanning data is transferred to the customer 15 on the web.

【0065】スキャンニングデータを受け取った顧客15
は、提供されたスキャンニングデータ解析ソフトを利用
してスキャンニングデータの解析を行って(ステップS
68)、検体のRNAの性質或いは特徴を調査する。
Customer 15 receiving scanning data
Analyzes the scanning data using the provided scanning data analysis software (step S
68) Investigate the properties or characteristics of the RNA of the sample.

【0066】スキャンニングデータ解析が終了した後、
ステップS51に進行し、スキャンニングデータはデータ
バンク化される。その後、ステップS52に進行して生理
用解析遺伝子を発注する。
After the scanning data analysis is completed,
Proceeding to step S51, the scanning data is converted into a data bank. Thereafter, the process proceeds to step S52 to order a physiological analysis gene.

【0067】次に、図4は第3実施例のフローチャート
であり、本実施例に於ける顧客15としては、DNAチッ
プAの製作を含む全ての作業をメーカー12に依頼するも
のとしている。尚、図に於いて、前述の第1実施例と同
一の内容を持つステップには同一の符号を付して説明を
省略する。
FIG. 4 is a flowchart of the third embodiment, in which the customer 15 in this embodiment requests the maker 12 for all operations including the production of the DNA chip A. In the figure, steps having the same contents as those in the above-described first embodiment are denoted by the same reference numerals, and description thereof is omitted.

【0068】図に於いて、顧客15が行なうステップS31
の生理学研究からステップS34の設計されたDNAチッ
プに対する顧客15とメーカー12の作業分担を検討するス
テップの内容と、メーカー12が行なうステップS38のD
NAチップAの製作からステップS51のスキャンニング
データのデータバンク化までのステップの内容は前述し
た第1実施例と同一である。
In the figure, step S31 performed by the customer 15
Contents of the step of examining the division of work between the customer 15 and the maker 12 for the designed DNA chip in step S34 from the physiological study of step S34, and the step D
The contents of the steps from the production of the NA chip A to the conversion of the scanning data into a data bank in step S51 are the same as those in the first embodiment.

【0069】顧客15はステップS70でDNAチップAの
製作をメーカー12に委託し、且つハイブリダイゼーショ
ン作業(ステップS71),スキャンニング作業(ステッ
プS72)及びスキャンニングデータ解析作業の全ての作
業をメーカー12に委託する。この場合、顧客15はステッ
プS73で検体を採取し、採取した検体の血液,細胞,R
NAの何れかを物流網を介してメーカー12に配送する。
The customer 15 outsources the production of the DNA chip A to the maker 12 in step S70, and performs all the operations of the hybridization work (step S71), the scanning work (step S72) and the scanning data analysis work. Outsource to In this case, the customer 15 collects the sample in step S73, and obtains the blood, cells, and R of the collected sample.
One of the NAs is delivered to the maker 12 via the distribution network.

【0070】メーカー12では、受託したDNAチップA
の設計内容に従って保有していない遺伝子を収集した
後、DNAチップAを製作し、且つ顧客15から送られて
来た検体の種類(血液,細胞,RNA)に応じてRNA
を採取し、製作したDNAチップAに検体より採取され
たRNAを作用させてハイブリッド化させるハイブリダ
イゼーション作業を行い、ハイブリダイゼーションされ
たDNAチップAのDNAアレイBをスキャンニングし
た後、データ解析を行なう(ステップS38〜ステップS
50)。その後、ステップS51に進行し、解析データは、
直接臨床への利用或いは創薬への利用がなされ、データ
バンク化される。これらの一連の作業は前述した第1実
施例の作業と同一である。
In the manufacturer 12, the DNA chip A
After collecting the genes not possessed according to the design contents of the above, a DNA chip A is manufactured, and the RNA is determined according to the type of the sample (blood, cell, RNA) sent from the customer 15.
Is collected, a hybridization operation is performed in which the RNA collected from the sample is allowed to act on the produced DNA chip A to perform hybridization, and the DNA array B of the hybridized DNA chip A is scanned, followed by data analysis. (Step S38 to Step S
50). Thereafter, the process proceeds to step S51, where the analysis data is
It is directly used for clinical use or drug discovery, and is made into a data bank. These series of operations are the same as the operations of the first embodiment described above.

【0071】上記の如く、遺伝子を受託販売する場合、
顧客15の保有する技術や装置に応じて幾つかの段階が存
在するが、夫々の段階毎に如何様にも対応することが可
能である。
As described above, when a gene is contracted for sale,
There are several stages depending on the technology and equipment possessed by the customer 15, but it is possible to deal with each stage in any way.

【0072】[0072]

【発明の効果】以上詳細に説明したように本発明に係る
受託販売方法では、遺伝子を種類,組織,機能を含む複
数の項目に分類して検索し得るようにした遺伝子情報デ
ータベースを用いることによって、遺伝子研究を行なう
研究者、遺伝子診断や遺伝子治療を行なう医師を含む顧
客は、前記遺伝子情報データベースに記録された遺伝子
情報から目的の研究或いは診断,治療(以下「研究等」
という)に沿って必要とされる所望の遺伝子を選択して
独自のDNAマイクロチップを設計することが出来る。
As described in detail above, the consignment sales method according to the present invention uses a gene information database in which genes can be classified and searched for in a plurality of items including types, tissues, and functions. Customers, including researchers who conduct genetic research and physicians who perform genetic diagnosis and gene therapy, can conduct research, diagnosis, and treatment (hereinafter referred to as “research etc.”) based on the genetic information recorded in the genetic information database.
) To design a unique DNA microchip.

【0073】また顧客は目的の研究等の内容や所有する
設備能力等の諸条件に従って、設計したDNAマイクロ
チップを製作するに当たって必要な基盤上への遺伝子の
転写作業や、目的の研究等に必要なデータを採取するの
に必要なハイブリダイゼーション作業,遺伝子発現プロ
ファイリング解析作業等の作業、更に、生理解析用遺伝
子の注文作業、を含む複数の作業に対し、夫々顧客が行
なうかメーカーが行なうかの作業分担を指定してメーカ
ーに発注することが出来る。
Further, the customer is required to carry out gene transfer work onto a base necessary for producing a designed DNA microchip or to conduct a target research in accordance with various conditions such as the contents of the target research and the capacity of the equipment owned. Whether the customer or the manufacturer performs multiple tasks, including the tasks of hybridization, gene expression profiling analysis, etc., required to collect vital data, and the task of ordering genes for physiological analysis. You can specify the work sharing and place an order with the manufacturer.

【0074】このため、メーカーでは受注した作業分担
に従って所定の作業を行い、この過程で発生したDNA
マイクロチップを含む製品を顧客に送付し、或いは取得
した情報をウエブ上で顧客に伝達することで、顧客は目
的の研究等の内容に沿った、且つ所有する設備能力に応
じた製品或いは情報を短時間に得ることが出来る。
For this reason, the manufacturer performs predetermined work according to the work assignment received and receives DNA generated in this process.
By sending products containing microchips to customers, or by transmitting the acquired information to customers on the web, customers can obtain products or information in line with the contents of the intended research, etc., and according to the equipment capabilities they possess. Can be obtained in a short time.

【0075】また顧客又はメーカーがDNAマイクロチ
ップのハイブリダイゼーションを行ない、且つDNAマ
イクロチップのデータの読み取りをメーカーが行なった
後、遺伝子発現プロファイリング解析を顧客が実施する
場合、メーカーは読み取ったDNAマイクロチップの読
取データをウエブ上で顧客に転送すると共に解析ソフト
を提供し、且つ顧客は提供された解析ソフトに基づいて
ウエブ上で転送されたDNAマイクロチップの読取デー
タを解析することが出来る。
When the customer or the maker performs hybridization of the DNA microchip and the maker reads the data of the DNA microchip, and then performs the gene expression profiling analysis by the customer, the maker reads the DNA microchip. And the analysis data is provided to the customer on the web, and the customer can analyze the read data of the DNA microchip transferred on the web based on the provided analysis software.

【0076】特に、DNAマイクロアレイを含むDNA
マイクロチップのデータをウエブ上で転送するに際し、
前記データを暗号化することが好ましい。このようにデ
ータを暗号化することによって、秘密保持を行なうこと
が出来、遺伝子に関する情報の漏洩を防止することが出
来る。
In particular, DNA containing DNA microarray
When transferring microchip data on the web,
Preferably, the data is encrypted. By encrypting data in this manner, confidentiality can be maintained, and leakage of information on genes can be prevented.

【0077】また、顧客が核酸を含む検体をメーカーに
提供して遺伝子発現プロファイリング解析を行なう場
合、メーカーは顧客から提供された検体を用いて遺伝子
発現プロファイリング解析を行い、その後、得られたデ
ータをウエブ上で顧客に転送することが出来、且つ遺伝
子発現プロファイリング解析を行った場合、メーカーは
前記遺伝子発現プロファイリング解析結果をデータベー
ス化して顧客に提供し、或いは顧客自身が遺伝子発現プ
ロファイリング解析を行なった場合、メーカーは顧客に
対し遺伝子発現プロファイリング解析結果をデータベー
ス化するためのソフトを提供することで、顧客とメーカ
ーとの間に共通したデータベースを構築することが出
来、煩わしいデータの管理も簡単に行なうことが出来、
作業の効率化をはかることが出来る。またメーカーは多
くのデータを保有出来、顧客に対し質,量共に高いサー
ビスを行なうことが可能となる。
When a customer provides a sample containing a nucleic acid to a manufacturer and performs gene expression profiling analysis, the manufacturer performs gene expression profiling analysis using the sample provided by the customer, and then obtains the obtained data. In the case where the data can be transferred to the customer on the web and the gene expression profiling analysis is performed, the manufacturer makes the database of the result of the gene expression profiling analysis and provides the result to the customer, or the customer performs the gene expression profiling analysis. Manufacturers can provide their customers with software for creating database of gene expression profiling analysis results, enabling them to build a common database between customers and manufacturers, and easily manage cumbersome data. Is completed,
Work efficiency can be improved. In addition, manufacturers can hold a large amount of data, and provide high quality and quantity services to customers.

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】本発明に係る受託販売方法を実施する際の関係
を説明する図である。
FIG. 1 is a diagram for explaining the relationship when implementing a consignment sales method according to the present invention.

【図2】受託販売方法を実行する第1実施例を説明する
フローチャートである。
FIG. 2 is a flowchart illustrating a first embodiment for executing the consignment sales method.

【図3】第2実施例を説明するフローチャートである。FIG. 3 is a flowchart illustrating a second embodiment.

【図4】第3実施例を説明するフローチャートである。FIG. 4 is a flowchart illustrating a third embodiment.

【図5】遺伝子を公開買い付けする際の手順を説明する
フローチャートである。
FIG. 5 is a flowchart illustrating a procedure for tenderly purchasing a gene.

【図6】DNAマイクロチップとDNAマイクロアレイ
を説明する図である。
FIG. 6 is a diagram illustrating a DNA microchip and a DNA microarray.

【符号の説明】[Explanation of symbols]

A DNAチップ B DNAアレイ 1 基盤 2 点 11 インターネット 12 メーカー 13 データベース 14a,14b 研究機関 15,15a〜15c 顧客 A DNA chip B DNA array 1 Base 2 points 11 Internet 12 Manufacturer 13 Database 14a, 14b Research institution 15, 15a-15c Customer

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 15/09 C12Q 1/68 A C12Q 1/68 G01N 33/53 M G01N 33/53 33/566 33/566 37/00 102 37/00 102 G06F 17/30 170F // G06F 17/30 170 C12N 15/00 F Fターム(参考) 4B024 AA11 AA19 AA20 CA01 HA14 4B029 AA07 AA23 FA15 4B063 QA01 QA19 QA20 QQ42 QR08 QR33 QR56 QS34 QS39 QX02 5B075 KK07 KK13 KK22 KK33 KK37 ND03 ND20 ND22 ND34 NR02 NR12 PQ00 PR06 UU18 ──────────────────────────────────────────────────の Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) C12N 15/09 C12Q 1/68 A C12Q 1/68 G01N 33/53 M G01N 33/53 33/566 33 / 566 37/00 102 37/00 102 G06F 17/30 170F // G06F 17/30 170 C12N 15/00 FF term (reference) 4B024 AA11 AA19 AA20 CA01 HA14 4B029 AA07 AA23 FA15 4B063 QA01 QA19 QA20 QQ42 QR34 QR33 QR56 QS QS39 QX02 5B075 KK07 KK13 KK22 KK33 KK37 ND03 ND20 ND22 ND34 NR02 NR12 PQ00 PR06 UU18

Claims (6)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 遺伝子の種類,組織,機能を含む複数の
項目に分類して検索し得るようにした遺伝子情報を用
い、顧客は前記遺伝子情報から所望の遺伝子を選択して
独自のDNAマイクロチップを設計すると共に、基盤上
への遺伝子の転写,ハイブリダイゼーション,遺伝子発
現プロファイリング解析,生理解析用遺伝子の注文を含
む複数の作業に対して顧客側とメーカー側の作業分担を
指定して発注し、メーカーは顧客が選択した作業分担に
従って所定の作業を行い、且つ前記所定の作業を行なっ
て得た情報をウエブ上で顧客に伝達することを特徴とす
るDNAマイクロチップを含む遺伝子の受託販売方法。
1. Using a gene information which can be searched by classifying into a plurality of items including a kind, a tissue, and a function of a gene, a customer selects a desired gene from the gene information and selects a unique DNA microchip. Designing and ordering multiple tasks, including transcription of genes on the substrate, hybridization, gene expression profiling analysis, and ordering of genes for physiological analysis, by specifying the work sharing between the customer and manufacturer, A method for contract sale of a gene including a DNA microchip, wherein a manufacturer performs a predetermined operation in accordance with a task allocation selected by a customer, and transmits information obtained by performing the predetermined operation to the customer on a web.
【請求項2】 メーカーがデータバンクに保持している
遺伝子は、DNAマイクロチップ作成用遺伝子と完全長
cDNAを含む生理解析用の遺伝子の両方を保持し、マ
イクロアレイによる大量の遺伝子発現プロファイリング
解析後は速やかに生理学的解析用の遺伝子を供給するこ
とを特徴とする請求項1に記載したDNAマイクロチッ
プを含む遺伝子の受託販売方法。
2. Genes stored in a data bank by a manufacturer include both genes for preparing a DNA microchip and genes for physiological analysis including full-length cDNA, and after a large amount of gene expression profiling analysis using a microarray. The method of claim 1, wherein the gene for physiological analysis is promptly supplied.
【請求項3】 顧客又はメーカーがDNAマイクロチッ
プのハイブリダイゼーションを行ない、且つ前記DNA
マイクロチップのデータの読み取りをメーカーが行なっ
た後、遺伝子発現プロファイリング解析を顧客が実施す
る場合、メーカーは読み取ったDNAマイクロチップの
読取データをウエブ上で顧客に転送すると共に解析ソフ
トを提供し、且つ顧客は提供された解析ソフトに基づい
てウエブ上で転送されたDNAマイクロチップの読取デ
ータを解析することを特徴とする請求項1又は2に記載
したDNAマイクロチップを含む遺伝子の受託販売方
法。
3. The method according to claim 1, wherein a customer or a maker carries out hybridization of the DNA microchip, and
When the customer performs gene expression profiling analysis after the maker has read the data of the microchip, the maker transfers the read data of the read DNA microchip to the customer on the web and provides analysis software, and 3. The method of claim 1, wherein the customer analyzes the read data of the DNA microchip transferred on the web based on the provided analysis software.
【請求項4】 DNAマイクロアレイを含むDNAマイ
クロチップのデータをウエブ上で転送するに際し、前記
データを暗号化することを特徴とする請求項1〜3の何
れかに記載したDNAマイクロチップを含む遺伝子の受
託販売方法。
4. A gene comprising a DNA microchip according to claim 1, wherein the data is encrypted when transferring the data of the DNA microchip including the DNA microarray on the web. Contract sales method.
【請求項5】 顧客が核酸を含む検体をメーカーに提供
して遺伝子発現プロファイリング解析を行なう場合、メ
ーカーは顧客から提供された検体を用いて遺伝子発現プ
ロファイリング解析を行い、その後、得られたデータを
ウエブ上で顧客に転送することを特徴とする請求項1乃
至4の何れかに記載したDNAマイクロチップを含む遺
伝子の受託販売方法。
5. When a customer provides a sample containing a nucleic acid to a manufacturer and performs gene expression profiling analysis, the manufacturer performs gene expression profiling analysis using the sample provided by the customer, and then obtains the obtained data. 5. The method according to claim 1, wherein the gene is transferred to a customer on a web.
【請求項6】 顧客が核酸を含む検体をメーカーに提供
して遺伝子発現プロファイリング解析を行った場合、メ
ーカーは前記遺伝子発現プロファイリング解析結果をデ
ータベース化してウエブ上で顧客に提供し、又は顧客自
身が遺伝子発現プロファイリング解析を行なった場合、
メーカーは顧客に対し遺伝子発現プロファイリング解析
結果をデータベース化するためのソフトをウエブ上で提
供することを特徴とする請求項1乃至5の何れかに記載
したDNAマイクロチップを含む遺伝子の受託販売方
法。
6. When a customer provides a sample containing a nucleic acid to a manufacturer and performs gene expression profiling analysis, the manufacturer prepares a database of the gene expression profiling analysis results and provides the database to the customer, or the customer himself / herself. When performing gene expression profiling analysis,
The method according to any one of claims 1 to 5, wherein the maker provides a customer with software for creating a database of the results of gene expression profiling analysis on a web.
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