JP2001508407A - Human protein having transmembrane domain and DNA encoding the same - Google Patents

Human protein having transmembrane domain and DNA encoding the same

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JP2001508407A JP52237498A JP52237498A JP2001508407A JP 2001508407 A JP2001508407 A JP 2001508407A JP 52237498 A JP52237498 A JP 52237498A JP 52237498 A JP52237498 A JP 52237498A JP 2001508407 A JP2001508407 A JP 2001508407A
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誠志 加藤
伸吾 関根
知子 木村
みどり 小林
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Abstract

(57)【要約】 配列番号1から配列番号2あるいは配列番号4から配列番号25で表されるアミノ酸配列のいずれかを含む蛋白質および該蛋白質をコードするDNA、例えば配列番号26から配列番号50で表される塩基配列を含むcDNA。膜貫通ドメインを有するヒト蛋白質をコードしているcDNA、およびこのヒトcDNAの組換え体を発現させることにより該蛋白質を提供することができる。   (57) [Summary] A protein comprising any of the amino acid sequences represented by SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4 to SEQ ID NO: 25, and a DNA encoding the protein, for example, a base sequence represented by SEQ ID NO: 26 to SEQ ID NO: 50 CDNA containing. By expressing a cDNA encoding a human protein having a transmembrane domain and a recombinant of this human cDNA, the protein can be provided.

Description

【発明の詳細な説明】 膜貫通ドメインを有するヒト蛋白質およびそれをコードするDNA 技術分野 本発明は、膜貫通ドメインを有するヒト蛋白質、およびそれをコードしている DNAに関する。本発明の蛋白質は、医薬品として、あるいは該蛋白質に対する 抗体を作製するための抗原として用いることができる。本発明のヒトcDNAは 、遺伝子診断用プローブや遺伝子治療用遺伝子源として用いることができる。ま た、該cDNAがコードしている蛋白質を大量生産するための遺伝子源として用 いることができる。 背景技術 膜蛋白質は、シグナルレセプター、イオンチャンネル、トランスポーターなど として、細胞膜を介する物質輸送や情報伝達において重要な役割を担っている。 例えば、各種サイトカインに対するレセプター、ナトリウムイオン・カリウムイ オン・塩素イオン等に対するイオンチャンネル、糖・アミノ酸等に対するトラン スポーターなどが知られており、その多くはすでに遺伝子もクローン化されてい る。 これらの膜蛋白質の異常は、これまで原因不明であつた多くの病気と関連して いることがわかってきた。例えば、嚢胞性線維症の原因遺伝子として12個の膜 貫通ドメインを有する膜蛋白質の遺伝子が同定された[Rommens,J.M.et al. ,Science 245:1059−1065(1989)]。また、いくつかの膜蛋白質は、ウイルス が細胞に感染する際のレセプターとして働いていることがわかってきた。、例え ば、HIV−1は、T細胞膜上の膜蛋白質、CD4抗原と7個の膜貫通ドメイン を有する膜蛋白質ヒュージンを介して細胞内に感染することが示された[Feng,Y .et al.,Science 272:872−877(1996)]。従って、新しい膜蛋白質が見い 出せれば、多くの病気の原因解明につながるものと期待され、膜蛋白質をコード する新たな遺伝子の単離が望まれている。 従来、膜蛋白質は、精製することが困難なので、遺伝子の方からのアプローチ によって単離されたものが多い。一般的な方法は、cDNAライブラリーを動物 細胞に導入して、cDNAを発現させたのち、目的とする膜蛋白質を膜上に発現 している細胞を、抗体を用いる免疫学的な手法や膜の透過性の変化を生理学的な 手法で検出する、いわゆる発現クローニングである。しかしこの方法では機能の わかった膜蛋白質の遺伝子しかクローン化できない。 一般に膜蛋白質は、蛋白質内部に疎水性の膜貫通ドメインを有しており、リボ ソームで合成された後、このドメインがリン脂質膜内に留まり膜にトラップされ る。従って、完全長cDNAの全塩基配列を決定してやり、そのcDNAがコー ドしている蛋白質のアミノ酸配列の中に疎水性の高い膜貫通ドメインが存在すれ ば、そのcDNAは膜蛋白質をコードしていると考えられる。 本発明の目的は、膜貫通ドメインを有する新規のヒト蛋白質、および該蛋白質 をコードするDNAを提供することである。 本発明者らは鋭意研究の結果、ヒト完全長cDNAバンクの中から膜貫通ドメ インを有するcDNAをクローン化し、本発明を完成した。すなわち、本発明は 膜貫通ドメインを有するヒト蛋白質である、配列番号1から配列番号2あるいは 配列番号4から配列番号25で表されるアミノ酸配列のいずれかを含む蛋白質を 提供する。また本発明は上記蛋白質をコードするDNA、例えば配列番号26か ら配列番号50で表される塩基配列のいずれかを含むcDNAを提供する。 本発明の蛋白質は、ヒトの臓器、細胞株などから単離する方法、本発明のアミ ノ酸配列に基づき化学合成によってペプチドを調製する方法、あるいは本発明の 膜貫通ドメインをコードするDNAを用いて組換えDNA技術で生産する方法な どにより取得することができるが、組換えDNA技術で取得する方法が好ましく 用いられる。例えば、本発明のcDNAを有するベクターからインビトロ転写に よってRNAを調製し、これを鋳型としてインビトロ翻訳を行なうことによりイ ンビトロで蛋白質を発現できる。また翻訳領域を公知の方法により適当な発現ベ クターに組換えてやれば、大腸菌、枯草菌、酵母、動物細胞等で、コードしてい る蛋白質を大量に生産することができる。 本発明の蛋白質を、大腸菌などの微生物で生産させる場合には、微生物中で複 製可能なオリジン、プロモーター、リボソーム結合部位、cDNAクローニング 部位、ターミネーター等を有する発現ベクターに、本発明のcDNAの翻訳領域 を組換えた発現ベクターを作成し、該発現ベクターで宿主細胞を形質転換したの ち、得られた形質転換体を培養してやれば、該cDNAがコードしている蛋白質 を微生物内で大量生産することができる。この際、任意の翻訳領域の前後に開始 コドンと停止コドンを付加して発現させてやれば、任意の領域を含む蛋白質断片 を得ることができる。あるいは、他の蛋白質との融合蛋白質として発現させるこ ともできる。該融合蛋白質を適当なプロテアーゼで切断することによって該cD NAがコードする蛋白質部分のみを取得することもできる。 本発明の蛋白質を、動物細胞で生産させる場合には、該cDNAの翻訳領域を 、プロモーター、スプライシング領域、ポリ(A)付加部位等を有する動物細胞 用発現ベクターに組換え、動物細胞内に導入してやれば、本発明の蛋白質を膜蛋 白質として細胞膜表面上で生産することができる。 本発明の蛋白質には、配列番号1から配列番号2あるいは配列番号4から配列 番号25で表されるアミノ酸配列のいかなる部分アミノ酸配列を含むペプチド断 片(5アミノ酸残基以上)も含まれる。これらのペプチド断片は抗体を作製する ための抗原として用いることができる。また、本発明の蛋白質の中でシグナル配 列を有するものは、シグナル配列が除去された後、成熟蛋白質の形で細胞表面に 出てくる。したがって、これらの成熟蛋白質は本発明の蛋白質の範疇にはいる。 成熟蛋白質のN末端アミノ酸配列は、シグナル配列切断部位決定法[特開平8− 187100]を用いて容易に求めることができる。また、いくつかの膜蛋白質 は、細胞表面でプロセシングを受けて分泌型となる。このような分泌型となった 蛋白質あるいはペプチドも本発明の蛋白質の範疇にはいる。アミノ酸配列の中に 糖鎖結合部位が存在すると、適当な動物細胞で発現させれば糖鎖が付加した蛋白 質が得られる。したがって、このような糖鎖が付加した蛋白質あるいはペプチド も本発明の蛋白質の範疇にはいる。 本発明のDNAには、上記蛋白質をコードするすべてのDNAが含まれる。該 DNAは、化学合成による方法、cDNAクローニングによる方法などを用いて 取得することができる。 本発明のcDNAは、例えばヒト細胞由来cDNAライブラリーからクローン 化することができる。cDNAはヒト細胞から抽出したポリ(A)+RNAを鋳 型として合成する。ヒト細胞としては、人体から手術などによって摘出されたも のでも培養細胞でも良い。cDNAは、岡山−Berg法[Okayama,H.and Be rg,P.,Mol.Cell.Biol.2:161−170(1982)]、Gubler−Hoffman法[Gubler,U.a nd Hoffman,J.,Gene 25:263−269(1983)]などいかなる方法を用いて合成し てもよいが、完全長クローンを効率的に得るためには、実施例にあげたようなキ ャッピング法[Kato,S.et al.,Gene 163:193−196(1995)]を用いることが 望ましい。 膜貫通ドメインを有するヒト蛋白質をコードするcDNAの第一次選別は、c DNAライブラリーから任意に選択したcDNAクローンの部分塩基配列決定、 塩基配列がコードするアミノ酸配列の決定、得られたN末端アミノ酸配列領域内 の疎水性部分の有無の確認によって行なう。次いでシーケンシングによる全塩基 配列の決定、インビトロ翻訳による蛋白質発現によって第二次選別行なう。本発 明のcDNAが、分泌シグナル配列を有する蛋白質をコードしていることの確認 は、シグナル配列検出法[Yokoyama−Kobayashi,M.et al.,Gene 163:193−1 96(1995)]を用いて行う。すなわち、ターゲット蛋白質のN末端をコードするc DNA断片を、ウロキナーゼのプロテアーゼドメインをコードするcDNAと融 合させたのち、COS細胞内で発現させ、ウロキナーゼ活性が細胞培養液中に検 出された場合には、挿入したcDNA断片がコードしている部分が、シグナル配 列として機能していることを意味する。一方、ウロキナーゼ活性が培地中に検出 できない場合には、N末端部は膜中に留まっていることを意味する。 本発明のcDNAは、配列番号26から配列番号50で表される塩基配列ある いは配列番号51から配列番号75で表される塩基配列のいずれかを含むことを 特徴とするものである。それぞれのクローン番号(HP番号)、cDNAクロー ンが得られた細胞、cDNAの全塩基数、コードしている蛋白質のアミノ酸残基 数をそれぞれ表1にまとめて示した。 なお、配列番号51から配列番号75のいずれかに記載のcDNAの塩基配列 に基づいて合成したオリゴヌクレオチドプローブを用いて、本発明で用いたヒト 細胞株やヒト組織から作製したcDNAライブラリーをスクリーニングすること により、本発明のcDNAと同一のクローンを容易に得ることができる。 一般にヒト遺伝子は個体差による多型が頻繁に認められる。従って配列番号5 1から配列番号75において、1又は複数個のヌクレオチドの付加、欠失および /又は他のヌクレオチドによる置換がなされているcDNAも本発明の範疇には いる。 同様に、これらの変更によって生じる、1又は複数個のアミノ酸の付加、欠失 および/又は他のアミノ酸による置換がなされている蛋白質も、配列番号1から 配列番号2あるいは配列番号4から配列番号25で表されるアミノ酸配列を有す るそれぞれの蛋白質の活性を有する限り、本発明の範疇に入る。 本発明のcDNAには、配列番号26から配列番号50で表される塩基配列あ るいは配列番号51から配列番号75で表される塩基配列のいかなる部分塩基配 列を含むcDNA断片(10bp以上)も含まれる。また、センス鎖およびアン チヤンス鎖からなるDNA断片もこの範疇にはいる。これらのDNA断片は遺伝 子診断用のプローブとして用いることができる。 図面の簡単な説明 図1:分泌シグナル配列検出ベクターpSSD3の構造を表す図である。 図2:クローンHP00442がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフィ ールを示す図である。 図3:クローンHP00804がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフィ ールを示す図である。 図4:クローンHP00804のノザンブロットハイブリダイゼーションの結 果を示す図である。 図5:クローンHP01098がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフィ ールを示す図である。 図6:クローンHP01148がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフィ ールを示す図である。 図7:クローンHP01148のノザンブロットハイブリダイゼーションの結 果を示す図である。 図8:クローンHP01293がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフィ ールを示す図である。 図9:クローンHP10013がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフィ ールを示す図である。 図10:クローンHP10034がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図11:クローンHP10050がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図12:クローンHP10071がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図13:クローンHP10076がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図14:クローンHP10085がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図15:クローンHP10122がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図16:クローンHP10136がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図17:クローンHP10175がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図18:クローンHP10179がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図19:クローンHP10196がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図20:クローンHP10235がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図21:クローンHP10297がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図22:クローンHP10299がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図23:クローンHP10301がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図24:クローンHP10302がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図25:クローンHP10304がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図26:クローンHP10305がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図27:クローンHP10306がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 図28:クローンHP10328がコードする蛋白質の疎水性/親水性プロフ ィールを示す図である。 発明を実行するための好ましい方法 実施例 次に実施例により発明を具体的に説明するが、本発明はこれらの例に限定され るものではない。DNAの組換えに関する基本的な操作および酵素反応は、文献 [“Molecular Cloning.A Laboratory Manual”,Cold Spring Harbor L aboratory,1989]に従った。制限酵素および各種修飾酵素は特に記載の無い場 合宝酒造社製のものを用いた。各酵素反応の緩衝液組成、並びに反応条件は付属 の説明書に従った。cDNA合成は文献[Kato,S.et al.,Gene 150:243−2 50(1994)]に従った。 (1)ポリ(A)+RNAの調製 mRNAを抽出するためのヒト細胞として、繊維肉腫細胞株HT−1080 (ATCC CCL 121)、類表皮癌細胞株KB(ATCC CRL 17 )、組織球リンホーマ細胞株U937(ATCC CRL 1593)、骨肉腫 細胞株U−2 OS(ATCC HTB 96)、末梢血から分離した白血球、 手術によって摘出された胃癌組織並びに肝臓を用いた。それぞれの細胞株の培養 は、常法に従って行った。 ヒト細胞約1gを5.5Mグアニジウムチオシアネート溶液20ml中でホモ ジナイズした後、文献[Okayama,H.et al.,“Methods in Enzymology”Vol .164、Academic Press,1987]に従い、総mRNAを調製した。これを20mM トリス塩酸緩衝液(pH7.6)、0.5M NaCl、1mM EDTAで洗浄した オリゴdTセルロースカラムにかけ、上掲文献に従いポリ(A)+RNAを得た 。 (2)cDNAライブラリーの作製 上記ポリ(A)+RNA10μgを100mMトリス塩酸緩衝液(pH8)に溶 解し、RNaseを含まないバクテリア由来アルカリホスファターゼ1単位を添 加し、37℃1時間反応させた。反応液をフェノール抽出後、エタノール沈殿を 行ない、ペレットを50mM酢酸ナトリウム(pH6)、1mM EDTA、0.1% 2−メルカプトエタノール、0.01%Triton X−100溶液に溶解し た。これに、タバコ由来酸ピロホスファターゼ(エピセンターテクノロジーズ社 製、1単位を添加して、総量100μlで37℃1時間反応させた。反応液をフ ェノール抽出後、エタノール沈殿を行ない、ペレットを水に溶解し、脱キャップ 処理したポリ(A)+RNA溶液を得た。 脱キャップ処理したポリ(A)+RNA、DNA−RNAキメラオリゴヌクレ オチド(5’−dG−dG−dG−dG−dA−dA−dT−dT−dC−dG −dA−G−G−A−3’)3nmolを50mMトリス塩酸緩衝液(pH7.5)、 0.5mM ATP、5mM MgCl2、10mM 2−メルカプトエタノール、25% ポリエチレングリコール水溶液に溶解し、T4RNAリガーゼ50単位を添加し 、総量30μlで20℃12時間反応させた。反応液をフェノール抽出後、エタ ノール沈殿を行ない、ペレットを水に溶解し、キメラオリゴキャップ付加ポリ( A)+RNAを得た。 本発明者らが開発したベクターpKA1(特開平4−117292号公報)を KpnIで消化後、末端転移酵素により約60個のdTテールを付加した。これ をEcoRV消化して片側のdTテールを除去したものをベクタープライマーと して用いた。 先に調製したキメラオリゴキャップ付加ポリ(A)+RNA6μgを、ベクタ ープライマー1.2μgとアニールさせた後、50mMトリス塩酸緩衝液(pH8. 3)、75mM KCl、3mM MgCl2、10mMジチオスレイトール、1.25mM dNTP(dATP+dCTP+dGTP+dTTP)溶液に溶解し、逆転写 酵素(GIBCO−BRL社製)200単位を添加し、総量20μlで42℃1 時間反応させた。反応液をフェノール抽出後、エタノール沈殿を行ない、ペレッ トを50mMトリス塩酸緩衝液(pH7.5)、100mM NaCl、10mM Mg Cl2、1mMジチオスレイトール溶液に溶解した。これにEcoRI100単位 を添加し、総量20μlで37℃1時間反応させた。反応液をフェノール抽出後、 エタノール沈殿を行ない、ペレットを20mMトリス塩酸緩衝液(pH7.5)、 100mM KCl、4mM MgCl2、10mM(NH42SO4、50μg/ml牛 血清アルブミン溶液に溶解した。これに大腸菌DNAリガーゼ60単位を添加し 、16℃16時間反応させた。反応液に2mM dNTP2μl、大腸菌DNAポ リメラーゼI4単位、大腸菌RNaseH0.1単位を添加し、12℃1時間つ いで22℃1時間反応させた。 次いでcDNA合成反応液を用いて大腸菌DH12S(GIBCO−BRL社 製)の形質転換を行なった。形質転換はエレクトロポレーション法によって行な った。形質転換体の一部を100μg/mlアンピシリン含有2xYT寒天培地 上に蒔いて37℃一晩培養した。寒天上に生じた任意のコロニーを拾い100μ g/mlアンピシリン含有2xYT培地2mlに接種して37℃で一晩培養した 。培養液を遠心して、菌体からアルカリリシス法によりプラスミドDNAを調製 した。プラスミドDNAはEcoRIとNotIで二重消化した後、0.8%ア ガロースゲル電気泳動を行ないcDNAインサートの大きさを求めた。また、得 られたプラスミドを鋳型にして、蛍光色素で標識したM13ユニバーサルプライ マーとTaqポリメラーゼ(アプライドバイオシステムズ社製キット)を用いて シ ーケンス反応を行なった後、蛍光DNAシーケンサー(アプライドバイオシステ ムズ社)にかけてcDNAの5’末端約400bpの塩基配列を決定した。配列 データはホモ・プロテインcDNAバンクデータベースとしてファイル化した。 (3)膜貫通ドメインを有する蛋白質をコードしているcDNAの選択 ホモ・プロテインcDNAバンクに登録された塩基配列を3フレームのアミノ 酸配列に変換し、開始コドンから始まるオープンリーディングフレーム(ORF )の有無を調べた。次いでORFがコードしている部分のN末端に分泌蛋白質に 特有なシグナル配列が認められるものを選択した。これらのクローンについては 、エキソヌクレアーセIIIによる欠失法を用いて、5’並びに3’両方向からシ ーケンシングを行い、全塩基配列の決定を行った。ORFがコードしている蛋白 質について、Kyte−Doolittleの方法[Kyte,J & Doolittle,R.F.,J.Mol.Biol .157:105−132(1982)]により、疎水性/親水性プロフィールを求め、疎水性 領域の有無を調べた。コードしている蛋白質のアミノ酸配列中に膜貫通ドメイン と思われる疎水的な領域がある場合には、この蛋白質は膜蛋白質であると見なし た。 (4)分泌シグナル検出ベクターpSSD3の構築 SV40プロモーターとウロキナーゼのプロテアーゼドメインcDNAを有す るpSSD1[Yokoyama−Kobayashi,M.et al.,Gene 163:193−196(1995)] 1μgを、BglII5単位とEcoRV5単位で消化した。ついでCIP処理 によって5’末端の脱リン酸化を行った後、アガロースゲル電気泳動によって約 4.2kbpのDNA断片をゲルから切り出し精製した。 2本のオリゴDNAリンカ−L1(5’−GATCCCGGGTCACGTG GGAT−3’)とL2(5’−ATCCCACGTGACCCGG−3’)を 合成し、T4ポリヌクレオチドキナーゼによりリン酸化した。両者をアニールし たのち、先に調製したpSSD1の切断片とT4DNAリガーゼにより連結し、 大腸菌JM109を形質転換した。形質転換体からプラスミドpSSD3を調製 し、リンカー挿入部分の塩基配列を決定することにより目的とする組換え体を確 認した。得られたプラスミドの構造を図1に示す。本プラスミドベクターは、ポ リクローニング部位に3種の平滑末端生成制限酵素部位、SmaI、PmaCI 、 EcoRVを有している。これらの切断部位は7bpの間隔で並んでいるので、 この中のいずれかを選べば、挿入するcDNA断片の3種のフレームと合わせて 融合蛋白質を発現するベクターを構築できる。 (5)分泌シグナル配列の機能確認 上記工程の結果得られた分泌蛋白質候補クローンについて、N末端の疎水性領 域が分泌シグナル配列として機能することを、文献記載の方法[Yokoyama−Koba yashi,M.et al.,Gene 163:193−196(1995)]によって確認した。まずターゲ ットcDNAを含んでいるプラスミドを、分泌シグナル配列をコードしていると 考えられる部分の下流に存在する適当な制限酵素部位で切断した。もしこの制限 酵素部位が突出末端である場合には、クレノウ処理やマングビーンヌクレアーゼ 処理によって平滑末端にした。さらにHindIIIによる消化を行い、SV40 プロモーターとその下流に分泌シグナル配列をコードしているcDNAを含むD NA断片をアガロースゲル電気泳動によって単離した。この断片を、pSSD3 のHindIIIと、ウロキナーゼのコーディングフレームと合うように選択した 制限酵素部位の間に挿入し、ターゲットcDNAの分泌シグナル配列部分とウロ キナーゼプロテアーゼドメインの融合蛋白質を発現するためのベクターを構築し た。 融合蛋白質発現ベクターを有する大腸菌(宿主:JM109)を100μg/ mlアンピシリン含有2xYT培地2ml中で37℃2時間培養した後、ヘルパ ーファージM13KO7(50μl)を添加し、37℃で一晩培養した。遠心に よって分離した上澄からポリエチレングリコール沈殿によって一本鎖ファージ粒 子を得た。これを100μlの1mMトリス−0.1mM EDTA、pH8(TE) に懸濁した。また対照として、pSSD3、並びにウロキナーゼの完全長cDN Aを含むベクターpKA1−UPA[Yokoyama−Kobayashi,M.et al.,Gene 1 63:193−196(1995)]から同様にして調製した一本鎖ファージ粒子懸濁液を用い た。 サル腎臓由来培養細胞COS7は、10%ウシ胎児血清を含むダルベッコ改変 イーグル(DMEM)培地中、5%CO2存在下、37℃で培養した。1×105 個のCOS7細胞を6穴プレート(ヌンク社、穴の直径3cm)に植え、5%C O2存在下、37℃で22時間培養した。培地除去後、リン酸緩衝液で細胞表 面を洗浄し、さらに50mMトリス塩酸(pH7.5)を含むDMEM(TDME M)で再度洗浄した。この細胞に一本鎖ファージ懸濁液1μl、DMEM培地0 .6ml、TRANSFECTAMTM(IBF社)3μlを懸濁したものを添 加し、5%CO2存在下、37℃で3時間培養した。サンプル液を除去後、TDME Mで細胞表面を洗浄し、10%ウシ胎児血清含有DMEMを1穴あたり2ml加 え、5%CO2存在下、37℃にて2日間培養した。 2%ウシフィブリノーゲン(マイルス社)、0.5%アガロース、1mM塩化カ ルシウムを含む50mMリン酸緩衝液(pH7.4)10mlに10単位のヒトト ロンビン(持田製薬)を加え、直径9cmのプレート中で固化させ、フィブリン プレートを調製した。トランスフェクションしたCOS7細胞の培養上清10μ lをフィブリンプレートに載せ、37℃15時間インキュベートした。得られた 溶解円の直径をウロキナーゼ活性の指標とした。もし、cDNA断片が分泌シグ ナル配列として機能するアミノ酸配列をコードしていること場合には、融合蛋白 質が分泌され、そのウロキナーゼ活性による溶解円を形成する。したがって、溶 解円を形成しない場合には、融合蛋白質が膜にトラップされたままになっており 、cDNA断片は膜貫通ドメインをコードしていると考えられる。 (6)インビトロ翻訳による蛋白質合成 本発明のcDNAを有するプラスミドベクターを用いて、TNTウサギ網状赤 血球溶解物キット(プロメガ社製)によるインビトロ転写/翻訳を行なった。こ の際[35S]メチオニンを添加し、発現産物をラジオアイソトープでラベルした 。いずれの反応もキットに付属のプロトコールに従って行なった。プラスミド2 μgを、TNTウサギ網状赤血球溶解物12.5μl、緩衝液(キットに付属)0 .5μl、アミノ酸混合液(メチオニンを含まない)2μl、[35S]メチオニ ン(アマーシャム社)2μl(0.37MBq/μl)、T7RNAポリメラー ゼ0.5μl、RNasin20Uを含む総量25μlの反応液中で30℃で9 0分間反応させた。反応液3μlにSDSサンプリングバッファー(125mMト リス塩酸緩衝液、pH6.8、120mM2−メルカプトエタノール、2%SDS 溶液、0.025%ブロモフェノールブルー、20%グリセロール)2μlを加 え、95℃3分問加熱処理した後、SDS−ポリアクリルアミドゲル 電気泳動にかけた。オートラジオグラフィーを行ない、翻訳産物の分子量を求め た。 (7)ノザンブロットハイブリダイゼーション ヒト組織における発現パターンを調べるため、ノザンブロットハイブリダイゼ ーションを行った。ヒトの各組織から単離したポリ(A)+RNAをブロットし た膜をクローンテック社から購入した。目的とするクローンからcDNA断片を 適当な制限酵素で切り出し、アガロースゲル電気泳動で単離したのち、ランダム プライマーラベリングキット(宝酒造社)により、[32P]dCTP(アマーシ ャム社)で標識した。ハイブリダイゼーションは、ブロット膜に付属の溶液を用 いプロトコールに従って行った。 (8)クローン例 <HP00442>(配列番号1、26、51) ヒト繊維肉腫細胞株HT−1080cDNAライブラリーから得られたクロー ンHP00442のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、81b pの5’非翻訳領域、618bpのORF、287bpの3’非翻訳領域からな る構造を有していた。ORFは205アミノ酸残基からなる蛋白質をコードして おり、5箇所の膜貫通ドメインが存在した。図2にKyte−Doolittleの方法で求 めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、翻 訳産物の明瞭なバンドは認められず、高分子量の位置にスメアなバンドが認めら れた。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 パン酵母プロトンATPaseのプロテオリピッドプロテインPPA1(SWI SS−PROTアクセション番号P23968)と類似性を有していた。表2に 、本発明のヒト蛋白質(HP)とパン酵母プロトンATPaseのプロテオリピ ッドプロテインPPA1(PL)のアミノ酸配列の比較を示す。−はギャップを 、*は本発明の蛋白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類似アミノ 酸残基をそれぞれ表す。両者は、N末端を除く全領域にわたって56.8%の相 同性を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有し、かつ開始コドンから含んでいるもの(例 えば、アクセション番号H87379)が存在したが、この配列から本蛋白質を 予想することはできない。 パン酵母プロトンATPaseのプロテオリピッドプロテインは、細胞の成育 に必須の膜蛋白質である[Apperson,M.et al.,Biochem.Biophys.Res.Commun.16 8:574−579(1990)]。したがって、そのホモログである本発明の蛋白質も、ヒ ト細胞の成育において必須であると考えられ、この蛋白質の異常に起因する病気 の診断や治療に用いることができる。 <HP00804>(配列番号2、27、52) ヒト白血球細胞cDNAライブラリーから得られたクローンHP00804の cDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、132bpの5’非翻訳領 域、1116bpのORF、576bpの3’非翻訳領域からなる構造を有して いた。ORFは371アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、7箇所の 膜貫通ドメインが存在した。図3にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の 疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、翻訳産物の明瞭な バンドは認められなかった。 本発明のcDNA断片を用いて、ノザンブロットハイブリダイゼーションによ り組織における発現パターンを検討したところ、図4に示すように、検討したす べての組織で発現していることが示された。したがって本発明の蛋白質はハウス キーピング蛋白質であると思われる。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 ラットNMDAレセプターグルタミン酸結合サブユニット(Genbankアク セション番号S61973)と類似性を有していた。表3に、本発明のヒト蛋白 質(HP)とラットNMDAレセプターグルタミン酸結合サブユニット(RN) のアミノ酸配列の比較を示す。−はギャップを、*は本発明の蛋白質と同一アミ ノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類似アミノ酸残基をそれぞれ表す。このサブ ユニットは516アミノ酸残基からなり、その68番目のグルタミンから342 番目のアルギニンまでの領域が、本発明の蛋白質のC末端270アミノ酸残基と 92.6%の相同性を有していた。しかし、N末端領域に相同性は認められなか った。なお、本発明の蛋白質のN末端には、プロリン、チロシン、グリシンに富 む特徴的な繰り返し配列が認められた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号W25 936)が存在したが、いずれも本cDNAより短く、開始コドンから含んでい るものは見いだせなかった。 ラットNMDAレセプターグルタミン酸結合サブユニットは、脳に特異的に存 在するNMDAレセプター複合体のサブユニットの一つとして見いだされた[Ku mar,K.N.et al.,Nature 354:70−73(1991)]。本発明の蛋白質との高い相同 性にも関わらず、N末端の配列や組織における発現パターンが異なることから、 両者は異なる機能を有しているものと思われる。本発明の蛋白質は、チャンネル やトランスポーターに特徴的な7個の膜貫通ドメインを有することから、チャン ネルやトランスポーターとしての役割を担っていると思われる。本発明の蛋白質 は、細胞にとって必須であるハウスキーピング蛋白質であるので、この蛋白質の 異常に起因する病気の診断や治療に用いることができる。 <HP01098>(配列番号3、28、53) ヒト胃癌cDNAライブラリーから得られたクローンHP01098のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、61bpの5’非翻訳領域、54 0bpのORF、475bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。OR Fは179アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、1箇所の膜貫通ドメ インが存在した。図5にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の疎水性/親 水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、ORFから予想される分子量 20,625にほぼ一致する20kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 イヌミクロソームシグナルペプチダーゼ18kDaサブユニット(SWISS− PROTアクセション番号P21378)と完全に一致していた。したがって、 本発明のcDNAは、ミクロソームシグナルペプチダーゼ18kDaサブユニッ トのヒトホモローグをコードしていることが示された。 本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ESTの中 に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号T60549 )が存在したが、不明瞭な配列が多く、本cDNAと同じORFは見いだせなか った。 イヌミクロソームシグナルペプチダーゼ18kDaサブユニットは、ミクロソ ームに存在するシグナルペプチダーゼ複合体のサブユニットの一つとして見いだ された[Shelness,G.S.& Blobel,G.,J.Biol.Chem.265:9512−9519(1990)] 。シグナルペプチダーゼは、分泌蛋白質が小胞体で分泌される際に、シグナル配 列を切断する酵素である。したがって、本発明のcDNAは、本蛋白質の生産や 、本蛋白質の異常に起因する病気の診断や治療に用いることができる。 <HP01148>(配列番号4、29、54) ヒト肝臓cDNAライブラリーから得られたクローンHP01148のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、101bpの5’非翻訳領域、1 044bpのORF、446bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。 ORFは347アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、N末端に1箇所 の膜貫通ドメインが存在した。図6にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質 の疎水性/親水性プロフィールを示す。本蛋白質のN末端178アミノ酸残基を コードしているcDNA部分を含むHindIII−PvuII断片をpSSD3 のHindIII−PmaCI部位に挿入した発現ベクターをCOS7細胞に導入 したが、ウロキナーゼの分泌は認められず、本蛋白質は膜に留まっていることが 示された。従って、本蛋白質はII型膜蛋白質であると思われる。インビトロ翻 訳の結果、ORFから予想される分子量38,101にほぼ一致する41kDa の翻訳産物が生成した。 本発明のcDNA断片を用いて、ノザンブロットハイブリダイゼーションによ り組織における発現パターンを検討したところ、図7に示すように、脾臓で強い 発現が認められた。また肝臓においてもわずかに発現していることが示された。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、ウ シWC1抗原(SWISS−PROTアクセション番号P30205)と類似性 を有していた。表4に、本発明のヒト蛋白質(HP)とウシWC1抗原(WC) のアミノ酸配列の比較を示す。−はギャップを、*は本発明の蛋白質と同一アミ ノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類似アミノ酸残基をそれぞれ表す。両者は3 8%の相同性を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号H91 200)が存在したが、部分配列なので本発明の蛋白質と同じ蛋白質をコードし ているかどうかは判定できない。 ウシWC1抗原は、γδT細胞に特異的に発現している膜抗原として見いださ れた[Wijngaard,P.L.J.et al.,J.Immunol.149:3273−3277(1992)]。類似性 を示している領域は、スカベンジャーレセプターシステインリッチ(SRCR) ドメインと呼ばれており、他にもマクロファージスカベンジャーレセプター[Ma tsumoto,A.et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:9133−9137(1990)]やT細 胞分化抗原CD6[Aruffo,A.et al.,J.Exp.Med.174:949−952(1991)]など に繰り返し配列として存在する。本蛋白質は、膵臓に特異的に発現していること から、膵臓の機能と深い関係があると思われ、他のSRCRファミリーと同様、 レセプターとして働いていると考えられる。 <HP01293>(配列番号5、30、55) ヒト肝臓cDNAライブラリーから得られたクローンHP01293のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、89bpの5’非翻訳領域、16 65bpのORF、134bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。O RFは554アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、12箇所の膜貫通 ドメインが存在した。図8にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の疎水性 /親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、明瞭なバンドは認められ ず、高分子量の位置にスメアなバンドが認められた。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 ラットカチオントランスポーター(Genbankアクセション番号X7885 5)と類似性を有していた。表5に、本発明のヒト蛋白質(HP)とラットカチ オントランスポーター(RN)のアミノ酸配列の比較を示す。−はギャップを、 *は本発明の蛋白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類似アミノ酸 残基をそれぞれ表す。両者は、全領域にわたって78.1%の相同性を有してい た。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したが、ヒト遺伝 子並びにヒトESTの中に90%以上の相同性を有するものは見いだせなかった 。 ラットカチオントランスポーターは、腎臓における薬物排出に関与する膜蛋白 質として見いだされた[Grundemann,D.et al.,Nature 372:549−552(1994) ]。したがって、そのホモローグである本発明の蛋白質も、同様の機能を有して いると考えられ、この蛋白質の異常に起因する病気の診断や治療に用いることが できる。また、薬物の排出に関与していると考えられることから、この蛋白質を 発現させた細胞はこれらの薬物をデザインするための道具として用いることがで きる。さらに、この蛋白質は肝臓や腎臓で主に発現していることから、この蛋白 質に対して親和性を有するものを作製すれば、これらの組織へのドラッグデリフ ァミリーシステムに応用できる。 <HP10013>(配列番号6、31、56) ヒト類表皮癌細胞株KBcDNAライブラリーから得られたクローンHP10 013のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、96bpの5’非 翻訳領域、1053bpのORF、884bpの3’非翻訳領域からなる構造を 有していた。ORFは350アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、N 末端にシグナル配列を、また内部に1箇所の膜貫通ドメインを有していた。図9 にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示 す。本蛋白質のN末端65アミノ酸残基をコードしているcDNA部分を含むH indIII−EcoO65I(マングビーンヌクレアーゼ処理)断片をpSSD 3のHindIII−EcoRV部位に挿入した発現ベクターをCOS7細胞に導 入したところ、培地中にウロキナーゼ活性が検出され、N末端がシグナル配列と して機能していることが示された。従って、本蛋白質はI型膜蛋白質であると思 われる。インビトロ翻訳の結果、ORFから予想される分子量39,008にほ ぼ一致する39kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号H07998)が存在したが、いずれも本cDNAよ り短く、開始コドンから含んでいるものは見いだせなかった。 <HP10034>(配列番号7、32、57) ヒト繊維肉腫細胞株HT−1080cDNAライブラリーから得られたクロー ンHP10034のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、175 bpの5’非翻訳領域、630bpのORF、106bpの3’非翻訳領域から なる構造を有していた。ORFは209アミノ酸残基からなる蛋白質をコードし ており、4箇所の膜貫通ドメインが存在した。図10にKyte−Doolittleの方法 で求めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果 、ORFから予想される分子量22,432にほぼ一致する21kDaの翻訳産 物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 ヒト腫瘍関連抗原L6(SWISS−PROTアクセション番号P30408) と類似性を有していた。表6に、本発明のヒト蛋白質(HP)とヒト腫瘍関連抗 原L6(L6)のアミノ酸配列の比較を示す。−はギャップを、*は本発明の蛋 白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類似アミノ酸残基をそれぞれ 表す。両者は、31.8%の相同性を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したが、ヒト遺伝 子並びにヒトESTの中に90%以上の相同性を有するものは見いだせなかった 。 ヒト腫瘍関連抗原L6は、ヒト腫瘍の細胞表面に大量に発現している膜抗原T M4スーパーファミリー蛋白質の一つである[Marken,J.S.et al.,Proc.Natl. Acad.Sci.USA 89:3503−3507(1992)]。これらの膜抗原は、ある特定の細胞や 癌細胞に特異的に発現しているので、これに対する抗体を作製すれば、各種診断 やドラッグデリバリー用キャリアーとして利用できる。また、これらの膜抗原遺 伝子を導入して膜抗原を発現させた細胞は、対応するリガンドの検出などに応用 できる。 <HP10050>(配列番号8、33、58) ヒト繊維肉腫細胞株HT−1080cDNAライブラリーから得られたクロー ンHP10050のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、9bp の5’非翻訳領域、492bpのORF、100bpの3’非翻訳領域からなる 構造を有していた。ORFは163アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしてお り、1箇所の膜貫通ドメインが存在した。図11にKyte−Doolittleの方法で求 めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、O RFから予想される分子量18,364にほぼ一致する23kDaの翻訳産物が 生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号H03117)が存在したが、不明瞭な配列が多く、 本cDNAと同じORFは見いだせなかった。 <HP10071>(配列番号9、34、59) ヒト胃癌cDNAライブラリーから得られたクローンHP10071のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、46bpの5’非翻訳領域、27 9bpのORF、69bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。ORF は92アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、2箇所の膜貫通ドメイン が存在した。図12にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の疎水性/親水 性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、ORFから予想される分子量1 0,094にほぼ一致する12kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号R97442)が存在したが、不明瞭な配列が多く、 本cDNAと同じORFは見いだせなかった。 <HP10076>(配列番号10、35、60) ヒトリンホーマ細胞株U937cDNAライブラリーから得られたクローンH P10076のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、81bpの 5’非翻訳領域、519bpのORF、132bpの3’非翻訳領域からなる構 造を有していた。ORFは172アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており 、2箇所の膜貫通ドメインが存在した。図13にKyte−Doolittleの方法で求め た本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。本蛋白質のN末端167アミ ノ 酸残基をコードしているcDNA部分を含むHindIII−EcoO65I(マ ングビーンヌクレアーゼ処理)断片をpSSD3のHindIII−EcoRV部 位に挿入した発現ベクターをCOS7細胞に導入したが、ウロキナーゼの分泌は 認められず、本蛋白質は膜に留まっていることが示された。インビトロ翻訳の結 果、ORFから予想される分子量18,450にほぼ一致する24kDaの翻訳 産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 パン酵母仮想蛋白質23.1kDa(SWISS−PROTアクセション番号P 34222)と類似性を有していた。表7に、本発明のヒト蛋白質(HP)と酵 母仮想蛋白質23.1kDa(SC)のアミノ酸配列の比較を示す。−はギャッ プを、*は本発明の蛋白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類似ア ミノ酸残基をそれぞれ表す。両者は、C末端139アミノ酸残基の領域で47. 5%の相同性を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号T74 847)が存在したが、不明瞭な配列が多く、本cDNAと同じORFは見いだ せなかった。 <HP10085>(配列番号11、36、61) ヒトリンホーマ細胞株U937cDNAライブラリーから得られたクローンH P10085のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、150bp の5’非翻訳領域、450bpのORF、97bpの3’非翻訳領域からなる構 造を有していた。ORFは149アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており 、N末端に1箇所の膜貫通ドメインが存在した。図14にKyte−Doolittleの方 法で求めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。本蛋白質のN末端5 7アミノ酸残基をコードしているcDNA部分を含むHindIII−EcoRI (クレノウ処理)断片をpSSD3のHindIII−EcoRV部位に挿入した 発現ベクターをCOS7細胞に導入したが、ウロキナーゼの分泌は認められず、 本蛋白質は膜に留まっていることが示された。従って、本蛋白質はII型膜蛋白 質であると思われる。インビトロ翻訳の結果、ORFから予想される分子量17 ,307にほぼ一致する20kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 ヒト初期活性化抗原CD69(SWISS−PROTアクセション番号Q071 08)と類似性を有していた。表8に、本発明のヒト蛋白質(HP)とヒト初期 活性化抗原CD69(CD)のアミノ酸配列の比較を示す。−はギャップを、* は本発明の蛋白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類似アミノ酸残 基をそれぞれ表す。両者は、C末端112アミノ酸残基の領域で36.6%の相 同性を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号H11 808)が存在したが、不明瞭な配列が多く、本cDNAと同じORFは見いだ せなかった。 ヒト初期活性化抗原CD69は、リンパ球を刺激した際に細胞表面に出現する 糖蛋白質であり、C型レクチンスーパーファミリー蛋白質の一つである[Hamann ,J.et al.,J.Immunol.150:4920−4927(1993)]。これらの膜抗原は、ある特 定の細胞に特異的に発現しているので、これに対する抗体を作製すれば、各種診 断やドラッグデリバリー用キャリアーとして利用できる。また、これらの膜抗原 遺伝子を導入して膜抗原を発現させた細胞は、対応するリガンドの検出などに応 用できる。 <HP10122>(配列番号12、37、62) ヒト胃癌cDNAライブラリーから得られたクローンHP10122のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、138bpの5’非翻訳領域、5 67bpのORF、481bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。O RFは188アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、2箇所の膜貫通ド メインが存在した。図15にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の疎水性 /親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、ORFから予想される分 子量21,175にほぼ一致する22kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号T80360)が存在したが、不明瞭な配列が多く、 本cDNAと同じORFは見いだせなかった。 <HP10136>(配列番号13、38、63) ヒトリンホーマ細胞株U937cDNAライブラリーから得られたクローンH P10136のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、81bpの 5’非翻訳領域、648bpのORF、680bpの3’非翻訳領域からなる構 造を有していた。ORFは215アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており 、C末端に1箇所の膜貫通ドメインが存在した。図16にKyte−Doolittleの方 法で求めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結 果、ORFから予想される分子量24,740にほぼ一致する28kDaの翻訳 産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 パン酵母蛋白質輸送蛋白質SLY2(SWISS−PROTアクセション番号P 22214)と類似性を有していた。表9に、本発明のヒト蛋白質(HP)とパ ン酵母蛋白質輸送蛋白質SLY2(SC)のアミノ酸配列の比較を示す。−はギ ャップを、*は本発明の蛋白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類 似アミノ酸残基をそれぞれ表す。両者は、全領域にわたって36.1%の相同性 を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号R80 136)が存在したが、いずれも本cDNAより短く、開始コドンから含んでい るものは見いだせなかった。 パン酵母蛋白質輸送蛋白質SLY2は、蛋白質を小胞体からゴルジ装置へ輸送 するために必須であり、細胞周期の制御にも関与していることが知られている[ Dascher,C.et al.,Mol.Cell.Biol.11:872−885(1991)]。したがって、本 発明のcDNAは、本蛋白質の生産や、本蛋白質の異常に起因する病気の診断や 治療に用いることができる。 <HP10175>(配列番号14、39、64) ヒト胃癌cDNAライブラリーから得られたクローンHP10175のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、173bpの5’非翻訳領域、3 39bpのORF、462bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。O RFは112アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、4箇所の膜貫通ド メインが存在した。図17にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の疎水性 /親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、ORFから予想される分 子量11,564にほぼ一致する13kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号W52852)が存在したが、不明瞭な配列が多く、 本cDNAと同じORFは見いだせなかった。 <HP10179>(配列番号15、40、65) ヒト類表皮癌細胞株KBcDNAライブラリーから得られたクローンHP10 179のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、121bpの5’ 非翻訳領域、345bpのORF、459bpの3’非翻訳領域からなる構造を 有していた。ORFは114アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、4 箇所の膜貫通ドメインが存在した。図18にKyte−Doolittleの方法で求めた本 蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、ORFか ら予想される分子量12,078にほぼ一致する14kDaの翻訳産物が生成し た。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。しかし、本発明のcDNAクローンHP10 175がコードする蛋白質と類似性を有していた。表10に、HP10179が コードしている蛋白質とHP10175がコードしている蛋白質のアミノ酸配列 の比較を示す。−はギャップを、*は本発明の蛋白質と同一アミノ酸残基を、. は本発明の蛋白質と類似アミノ酸残基をそれぞれ表す。両者は、全領域にわたっ て80.8%の相同性を有していた。また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、EST の中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号N559 91)が存在したが、不明瞭な配列が多く、本cDNAと同じORFは見いだせ なかった。 <HP10196>(配列番号16、41、66) ヒト繊維肉腫細胞株HT−1080cDNAライブラリーから得られたクロー ンHP10196のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、9bp の5’非翻訳領域、984bpのORF、122bpの3’非翻訳領域からなる 構造を有していた。ORFは327アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしてお り、N末端に1箇所の膜貫通ドメインが存在した。図19にKyte−Doolittleの 方法で求めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。本蛋白質のN末端 162アミノ酸残基をコードしているcDNA部分を含むHindIII−Bgl II(クレノウ処理)断片をpSSD3のHindIII−EcoRV部位に挿入 した発現ベクターをCOS7細胞に導入したが、ウロキナーゼの分泌は認められ ず、本蛋白質は膜に留まっていることが示された。従って、本蛋白質はII型膜 蛋白質であると思われる。インビトロ翻訳の結果、ORFから予想される分子量 36,163にほぼ一致する37kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、高い 類似性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてG enBankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するも の(例えば、アクセション番号T17026)が存在したが、いずれも本cDN Aより短く、開始コドンから含んでいるものは見いだせなかった。 <HP10235>(配列番号17、42、67) ヒト繊維肉腫細胞株HT−1080cDNAライブラリーから得られたクロー ンHP10235のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、5bp の5’非翻訳領域、1122bpのORF、594bpの3’非翻訳領域からな る構造を有していた。ORFは373アミノ酸残基からなる蛋白質をコードして おり、11箇所の膜貫通ドメインが存在した。図20にKyte−Doolittleの方法 で求めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果 、明瞭なバンドは認められず、高分子量の位置にスメアなバンドが認められた。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 ヒト核小体蛋白質HNP36(EMBLアクセション番号X86681)と類似 性を有していた。表11に、本発明のヒト蛋白質(HP)とヒト核小体蛋白質H NP36(NP)のアミノ酸配列の比較を示す。−はギャップを、*は本発明の 蛋白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と類似アミノ酸残基をそれぞ れ表す。両者は、全領域にわたって45.3%の相同性を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号R57 372)が存在したが、部分配列なので本発明の蛋白質と同じ蛋白質をコードし ているかどうかは判定できない。 ヒト核小体蛋白質HNP36は、細胞の成長や増殖に際して役割を担っている 遺伝子産物としてとして見いだされた[Williams,J.B.& Lanahan,A.A.,Bioch em.Biophys.Res.Commun.213:325−333(1995)]。したがって、その類縁体であ る本発明の蛋白質は、細胞の成長や増殖にとって必須であるハウスキーピング蛋 白質であると考えられ、この蛋白質の異常に起因する病気の診断や治療に用いる ことができる。 <HP10297>(配列番号18、43、68) ヒト胃癌cDNAライブラリーから得られたクローンHP10297のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、62bpの5’非翻訳領域、55 2bpのORF、890bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。OR Fは183アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、N末端にシグナル配 列を、また内部に1箇所の膜貫通ドメインを有していた。従って、本蛋白質はI 型膜蛋白質であると思われる。図21にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白 質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、ORFから予 想される分子量20,574にほぼ一致する24kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号R47823)が存在したが、不明瞭な配列が多く、 本cDNAと同じORFは見いだせなかった。 <HP10299>(配列番号19、44、69) ヒト胃癌cDNAライブラリーから得られたクローンHP10299のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、92bpの5’非翻訳領域、35 1bpのORF、89bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。ORF は116アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、N末端に1箇所の膜貫 通ドメインが存在した。図22にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の疎 水性/親水性プロフィールを示す。本蛋白質のN末端65アミノ酸残基をコード しているcDNA部分を含むHindIII−VspI(クレノウ処理)断片をp SSD3のHindIII−PmaCI部位に挿入した発現ベクターをCOS7細 胞に導入したが、ウロキナーゼの分泌は認められず、本蛋白質は膜に留まってい ることが示された。従って、本蛋白質はII型膜蛋白質であると思われる。イン ビトロ翻訳の結果、ORFから予想される分子量12,498にほぼ一致する1 3kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 パン酵母仮想蛋白質16.5kDa(SWISS−PROTアクセション番号P 42834)と類似性を有していた。表12に、本発明のヒト蛋白質(HP)と パン酵母仮想蛋白質16.5kDa(SC)のアミノ酸配列の比較を示す。−は ギャップを、*は本発明の蛋白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質と 類似アミノ酸残基をそれぞれ表す。両者は、C末端66アミノ酸残基の領域で5 3.0%の相同性を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号R27 748)が存在したが、不明瞭な配列が多く、本cDNAと同じORFは見いだ せなかった。 <HP10301>(配列番号20、45、70) ヒト類表皮癌細胞株KBcDNAライブラリーから得られたクローンHP10 301のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、91bpの5’非 翻訳領域、459bpのORF、112bpの3’非翻訳領域からなる構造を有 していた。ORFは152アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、4箇 所の膜貫通ドメインが存在した。図23にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋 白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、ORFから 予想される分子量16,516にほぼ一致する18kDaの翻訳産物が生成した 。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号N28828)が存在したが、不明瞭な配列が多く、 本cDNAと同じORFは見いだせなかった。 <HP10302>(配列番号21、46、71) ヒト肝臓cDNAライブラリーから得られたクローンHP10302のcDN Aインサートの全塩基配列を決定したところ、133bpの5’非翻訳領域、1 680bpのORF、560bpの3’非翻訳領域からなる構造を有していた。 ORFは559アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、12箇所の膜貫 通ドメインが存在した。図24にKyte−Doolittleの方法で求めた本蛋白質の疎 水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、明瞭なバンドは認め られず、高分子量の位置にスメアなバンドが認められた。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号N72434)が存在したが、いずれも本cDNAよ り短く、開始コドンから含んでいるものは見いだせなかった。 <HP10304>(配列番号22、47、72) ヒト骨肉腫細胞株U−2 OScDNAライブラリーから得られたクローンH P10304のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、10bpの 5’非翻訳領域、993bpのORF、313bpの3’非翻訳領域からなる構 造を有していた。ORFは330アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており 、N末端にシグナル配列を、また内部に1箇所の膜貫通ドメインを有していた。 従って、本蛋白質はI型膜蛋白質であると思われる。図25にKyte−Doolittle の方法で求めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳 の結果、ORFから予想される分子量36,840にほぼ一致する36kDaの 翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかつた。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号N26840)が存在したが、本cDNAと同じOR Fは見いだせなかった。 <HP10305>(配列番号23、48、73) ヒト骨肉腫細胞株U−2 OScDNAライブラリーから得られたクローンH P10305のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、109bp の5’非翻訳領域、327bpのORF、457bpの3’非翻訳領域からなる 構造を有していた。ORFは108アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしてお り、1箇所の膜貫通ドメインが存在した。図26にKyte−Doolittleの方法で求 めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。本蛋白質のN末端162ア ミノ酸残基をコードしているcDNA部分を含むHindIII−ApaI(マン グビーンヌクレアーゼ処理)断片をpSSD3のHindIII−PmaCI部位 に挿入した発現ベクターをCOS7細胞に導入したが、ウロキナーゼの分泌は認 められず、本蛋白質は膜に留まっていることが示された。従って、本蛋白質はI I型膜蛋白質であると思われる。インビトロ翻訳の結果、ORFから予想される 分子量12,199にほぼ一致する15kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの( 例えば、アクセション番号H02768)が存在したが、不明瞭な配列が多く、 本cDNAと同じORFは見いだせなかった。 <HP10306>(配列番号24、49、74) ヒト骨肉腫細胞株U−2 OScDNAライブラリーから得られたクローンH P10306のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、229bp の5’非翻訳領域、306bpのORF、155bpの3’非翻訳領域からなる 構造を有していた。ORFは101アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしてお り、2箇所の膜貫通ドメインが存在した。図27にKyte−Doolittleの方法で求 めた本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。インビトロ翻訳の結果、O RFから予想される分子量12,029にほぼ一致する14kDaの翻訳産物が 生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したが、類似 性を有する既知蛋白質はなかった。また、本cDNAの塩基配列を用いてGen Bankを検索したところ、ESTの中に、90%以上の相同性を有するもの (例えば、アクセション番号H44711)が存在したが、不明瞭な配列が多く 、本cDNAと同じORFは見いだせなかった。 <HP10328>(配列番号25、50、75) ヒト類表皮癌細胞株KBcDNAライブラリーから得られたクローンHP10 328のcDNAインサートの全塩基配列を決定したところ、117bpの5’ 非翻訳領域、1119bpのORF、950bpの3’非翻訳領域からなる構造 を有していた。ORFは372アミノ酸残基からなる蛋白質をコードしており、 1箇所の膜貫通ドメインが存在した。図28にKyte−Doolittleの方法で求めた 本蛋白質の疎水性/親水性プロフィールを示す。本蛋白質のN末端129アミノ 酸残基をコードしているcDNA部分を含むHindIII−PmaCI断片をp SSD3のHindIII−SmaI部位に挿入した発現ベクターをCOS7細胞 に導入したが、ウロキナーゼの分泌は認められず、本蛋白質は膜に留まっている ことが示された。従って、本蛋白質はII型膜蛋白質であると思われる。インビ トロ翻訳の結果、ORFから予想される分子量42,514にほぼ一致する41 kDaの翻訳産物が生成した。 本蛋白質のアミノ酸配列を用いてプロテインデータベースを検索したところ、 ショウジョウバエ神経性分泌信号蛋白質(GenBankアクセション番号U4 1449)と類似性を有していた。表13に、本発明のヒト蛋白質(HP)とシ ョウジョウバエ神経性分泌信号蛋白質(DM)のアミノ酸配列の比較を示す。− はギャップを、*は本発明の蛋白質と同一アミノ酸残基を、.は本発明の蛋白質 と類似アミノ酸残基をそれぞれ表す。両者は、中間領域202アミノ酸残基で3 8.6%の相同性を有していた。 また、本cDNAの塩基配列を用いてGenBankを検索したところ、ES Tの中に、90%以上の相同性を有するもの(例えば、アクセション番号R75 815)が存在したが、いずれも本cDNAより短く、開始コドンから含んでい るものは見いだせなかった。 本発明は膜貫通ドメインを有するヒト蛋白質、およびそれをコードしているc DNAを提供する。本発明の蛋白質は、いずれも細胞膜に存在するので、細胞の 増殖や分化を制御している蛋白質と考えられる。したがって、本発明の蛋白質は 、医薬品として、あるいは該蛋白質に対する抗体を作製するための抗原として用 いることができる。本発明のcDNAは、遺伝子診断用プローブや遺伝子治療用 遺伝子源として用いることができる。また、該DNAを用いることにより、該蛋 白質を大量に発現することができる。これら膜蛋白質遺伝子を導入して膜蛋白質 を大量発現させた細胞は、対応するリガンドの検出、新しい低分子医薬のスクリ ーニングなどに応用できる。 上記の活性および使用に加えて、本発明のポリヌクレオチドおよびタンパク質 は、以下に定義した使用または生物活性(本明細書に記載のアッセイに関するも のも含む)を1つ以上示し得る。本発明のタンパク質について記載した使用また は活性は、かかるタンパク質の投与または使用により、またはかかるタンパク質 をコードするポリヌクレオチドの投与または使用(例えば、遺伝子治療またはD NAの導入に適当なベクターにおいて)により得られ得る。 研究使用および有用性 本発明により提供されるポリヌクレオチドは、研究分野で種々の目的のために 使用することができる。このポリヌクレオチドは、解析、定性または治療使用の ための組換えタンパク質を発現させるために;対応するタンパク質が(構造的に 、または組織分化または発達の特定の段階において、または疾患の状態において )選択的に発現されている組織のマーカーとして;サザンゲル上の分子量マーカ ーとして;染色体の同定または関連遺伝子配座を位置付けるための染色体マーカ ーまたはタグ(標識されている場合)として;潜在的な遺伝子疾患を同定するた めに患者の内因性DNA配列と比較するために;ハイブリダイズさせて、新規な 、関連性のあるDNA配列を見つけるためのプローブとして;遺伝子フィンガー プリント法のためのPCRプライマーを誘導する情報源として;他の新規ポリヌ クレオチドを見つける過程において既知配列を「引く」ためのプローブとして; 「遺伝子チップ」または他の支持体に付着させるためのオリゴマーを選択および 製造するために(これは発現パターンを調査することも含む);DNA免疫技術 を用いて抗タンパク質抗体を産生させるために;および抗DNA抗体を産生させ るか、または他の免疫応答を引き起こすための抗原として、使用することができ る。ポリヌクレオチドが、他のタンパク質に結合、または結合し得るタンパク質 をコードしている場合(例えば、レセプター−リガンド相互作用において)、ポ リヌクレオチドを、相互作用トラップアッセイ(例えば、Gyuris et al.、Cell 75:791-803(1993)に記載)に使用すると、結合する別のタンパク質をコードする ポリヌクレオチドを同定、または結合相互作用の阻害剤を同定することができる 。 本発明により提供されるタンパク質は、同じようにアッセイにおいて、高スル ープット・スクリーニング用の多重タンパク質のパネルに含まれる生物活性を測 定するために;抗体を産生または他の免疫応答を引き起こすために;生物学的液 体中におけるタンパク質(またはそのレセプター)レベルを定量的に測定するた めに作成したアッセイにおける試薬(標識試薬を含む)として;対応するタンパ ク質が(構造的に、または組織分化または発達の特定の段階において、または疾 患の状態において)選択的に発現されている組織のマーカーとして;および、当 然、相関するレセプターまたはリガンドを単離するために使用することができる 。タンパク質が他のタンパク質に結合しているか、または結合し得る場合(例え ば、レセプター−リガンド相互作用において)、結合する他のタンパク質を同定 、または結合相互作用の阻害剤を同定することができる。また、これらの結合相 互作用に関与するタンパク質を用いると、ペプチドまたは結合相互作用の小分子 阻害剤またはアゴニストをスクリーニングすることができる。 これらの研究使用の一部または全ては、研究製品として市販できる試薬グレー ドまたはキット形態にすることができる。 上記にあげた用途の使用法は、当業者によりよく知られている。このような方 法を開示する参考文献は、「Molecular Cloning:A Laboratory Manual」、第2 版、Cold Spring Harbor Laboratory Press,Sambrook,J.、E.F.Fritsch and T. Maniatis編、1989、および「Methods in Enzymology:Guide to Molecular Cloni ng Techniques」、Academic Press、Berger,S.L.and A.R.Kimmel編、1987を制 限なく含む。 栄養剤としての使用 本発明のポリヌクレオチドおよびタンパク質はまた、栄養源または補足として 使用することができる。このような使用は、タンパク質またはアミノ酸補足とし ての使用、炭素源としての使用、窒素源としての使用、および炭水化物源として の使用を制限なく含む。このような場合、本発明のタンパク質またはポリヌクレ オチドは、特定の生物の食餌に添加できるか、または単離固体または液体製剤と して、例えば粉末、丸剤、溶液、懸濁液またはカプセル剤の形で投与することが できる。微生物の場合、本発明のタンパク質またはポリヌクレオチドは、微生物 を培養した培地中またはその上に加えることができる。 サイトカインおよび細胞増殖/分化活性 本発明のタンパク質は、サイトカイン、細胞増殖(誘導または阻害のいずれか )または細胞分化(誘導または阻害のいずれか)活性を示し得るか、または特定 の細胞群において他のサイトカインの産生を誘導し得る。全ての既知のサイトカ インを含む、現在までに発見されている多くのタンパク質因子が、1つ以上の因 子依存性細胞増殖アッセイにおいて活性を示し、従って、このアッセイはサイト カイン活性を確認するのに便利である。本発明のタンパク質の活性は、32D、 DA2、DA1G、T10、B9、B9/11、BaF3、MC9/G、M+( プレB M+)、2E8、RB5、DA1、123、T1165、HT2、CT LL2、TF−1、Mo7eおよびCMKを制限なく含む、数多くの細胞系のル ーチン因子依存性細胞増殖アッセイのいずれか1つにより確認される。 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法により測定し得る: T細胞または胸腺細胞増殖アッセイは、以下に記載されているものを制限なく 含む:Current Protocols in Immunology、J.E.Coligan、A.M.Kruisbeek、D.H.M argulies、E.M.Shevach、W Strober、Pub.Greene Publishing Associates and W iley-Interscience(第3章、In Vitro assays for Mouse Lymphocyte Function 3.1-3.19;第7章、Immunologic studies in Humans);Takai et al.、J.Immunol .137:3494-3500,1986;Bertagnolli et al.、J.Immunol.145:1706-1712,1990;Ber tagnolli et al.、Cellular Immunology 133:327-341,1991;Bertagnolli,et al. 、J.Immunol.149:3778-3783,1992;Bowman et al.、J.Immunol.152:1756-1761,1 994。 脾臓細胞、リンパ節細胞または胸腺細胞のサイトカイン産生および/または増 殖アッセイは、以下に記載されているものを制限なく含む:Polyclonal T cell stimulaion、Kruisbeek,A.M.およびShevach,E.M.、Current Protocols in Immun ology.J.E.e.a.Coligan編Vol 1 p.3.12.1-3.12.14、John Wiley and Sons、Tor onto.1994;およびMeasurement of mouse and human interleukinγ、Schreiber ,R.D.、Current Protocols in Immunology、J.E.e.a.Coligan編Vol 1 p.6.8.1-6 .8.8、John Wiley and Sons、Tronto.1994。 造血およびリンパ球生成細胞の増殖および分化アッセイは、以下に記載のもの を制限なく含む:Measurement of Human and Murine Interleukin 2 and Interl eukin 4、Bottomly,K.、Davis,L.S.and Lipsky,P.E.、Current Protocols in I mmunology、J.E.e.a.Coligan編Vol 1 p.6.3.1-6.3.12、John Wiley and Sons、T ronto.1991;deVries et al.、J.Exp.Med.173:1205-1211,1991;Moreau et al.、N ature 336:690-692,1988;Greenberger et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.80:2 931-2938,1983;Measurement of mouse and human interleukin 6-Nordan,R.、Cu rrent Protocols in Immunology、J.E.e.a.Coligan編Vol 1 p.6.6.1-6.6.5、Joh n Wiley and Sons、Tronto 1991;Smith et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.83: 1857-1861,1986;Measurement of human Interleukin 11-Bennett,F.、Giannotti ,J.、Clark,S.C.and Turner,K.J.、Current Protocols in Immunology、J.E.e.a .Coligan編、Vol 1 p.6.15.1 John Wiley and Sons、Tronto.1991;Measurement of mouse and human Interleukin 9-Ciarletta,A.、Giannotti,J.、Clark,S.C.a nd Turner,K.J.、Current Protocols in Immunology、J.E.e.a.Coligan編、Vol 1 p.6.13.1、John Wiley and Sons、Tronto.1991。 抗原に対するT細胞クローン応答アッセイ(これにより、とりわけ、APC− T細胞相互作用に影響を与え、並びに増殖およびサイトカイン産生を測定するこ とにより、T細胞効果を指示するタンパク質が同定される)は、以下に記載のも のを制限なく含む:Current Protocols in Immunology、J.E.Coligan、A.M.,Kru isbeek、D.H.,Margulies、E.M.,Shevach、W Strober、Pub.Greene Publishing A ssociates and Wiley-Interscience(第3章、In Vitro assays for Mouse Lymph ocyte Function;第6章、Cytokines and their cellular receptors;第7章、Im munologic studies in Humans);Weinberger et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:6091-6095,1980;Weinberger et al.、Eur.J.Immun.11:405-411,1981;Tak ai et al.、J.Immunol.137:3494-3500、1986;Takai et al.、J.Immunol.140:508 -512,1988。 免疫刺激または抑制活性 本発明のタンパク質はまた、本明細書に記載のアッセイの活性を制限なく含む 、免疫刺激または免疫抑制活性も示し得る。タンパク質は、種々の免疫不全およ び障害(重症複合免疫不全症(SCID)を含む)の処置、例えば、Tおよび/ま たはBリンパ球の成長および増殖の制御(上昇または下降)、並びにNK細胞お よび他の細胞群の細胞障害活性に影響を与えるのに有用であり得る。これらの免 疫不全は、遺伝的なものであるか、またはウイルス(例えば、HIV)並びに細 菌または真菌感染により引き起こされ得るか、または自己免疫疾患から生じ得る 。より具体的には、ウイルス、細菌、真菌または他の感染により引き起こされた 感染病(これは、HIV、肝炎ウイルス、ヘルペスウイルス、マイコバクテリア 、リーシュマニア種、マラリア種、およびカンジダ症などの種々の真菌感染を含 む)は、本発明のタンパク質を用いて、処理可能であり得る。当然、この観点か ら、本発明のタンパク質はまた、免疫系の亢進が一般的に望ましい場合、すなわ ち、癌の処置において有用であり得る。 本発明のタンパク質を用いて処置し得る自己免疫疾患は、例えば、結合組織病 、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、慢性関節リウマチ、自己免疫性肺炎 、ギラン・バレー症候群、自己免疫性甲状腺炎、インシュリン依存性糖尿病、重 症筋無力症、移植片対宿主疾患および自己免疫性眼疾患を含む。かかる本発明の タンパク質はまた、喘息(特にアレルギー性喘息)または他の呼吸障害などのア レルギー反応および症状の処置に有用であり得る。免疫抑制が望ましい他の症状 (例えば、臓器移植を含む)もまた、本発明のタンパク質を用いて処置可能であ り得る。 本発明のタンパク質を用いて、様々な方法で免疫応答を抑制することが可能で ある。ダウンレギュレーションは、すでに進行している免疫応答を阻害または遮 断する形態であり得るか、または免疫応答の誘導を妨げることに関与し得る。活 性化T細胞の機能は、T細胞応答を抑制することにより、またはT細胞に特異的 耐性を誘導することにより、またはその両方により阻害され得る。T細胞応答の 免疫抑制は、一般的に、活発で、非抗原特異的な過程であり、これには、T細胞 が抑制剤に連続的に接触することが必要である。T細胞における非応答またはア ネルギーの誘導に関与する耐性は、一般的に抗原特異的であり、抑制剤への接触 を停止した後にも持続する点から、免疫抑制とは相違する。手術時に、耐性剤の 非存在下において特異的抗原に再び接触させたときにT細胞応答が欠如している ことにより耐性を実証することができる。 1つ以上の抗原機能(Bリンパ球抗原機能(例えば、B7)を制限なく含む) のダウンレギュレーションまたは阻害、例えば、活性化T細胞による高レベルの リンホカイン合成阻害は、組織、皮膚および臓器移植の状況および移植片対宿主 疾患(GVHD)に有用である。例えば、T細胞機能の遮断により、組織移植に おける組織破壊が減少する。典型的には、組織移植において、移植片の拒絶は、 T細胞による異物の認識を介して始まり、ついで、移植片を破壊する免疫応答が 起こる。免疫細胞上でB7リンパ球抗原と天然リガンドとの相互作用を阻害また は遮断する分子を移植前に投与することにより(例えば、B7−2活性のみを有 するペプチドの可溶性モノマー形、または別のBリンパ球抗原(例えば、B7− 1、B7−3)または遮断抗体の活性を有するペプチドのモノマー形とのコンジ ュゲートで)、対応する共刺激シグナルを伝達することなく、分子は免疫細胞上 の天然リガンドに結合することができる。このように、Bリンパ球抗原機能を遮 断すると、T細胞などの免疫細胞によるサイトカイン合成が妨げられ、従って、 免疫抑制剤として作用する。さらに、共刺激の欠如はT細胞の免疫性を低下させ るに十分であり、これにより概体に耐性が生じる。Bリンパ球抗原遮断剤による 長期耐性の誘導により、これらの遮断剤を反復投与する必要性がなくなることが ある。概体が十分な免疫抑制または耐性を得るために、組合せBリンパ球抗原機 能の遮断が必要なこともある。 臓器移植拒絶またはGVHDを防ぐ特定の遮断剤の効力は、ヒトにおける効力 が予見される動物モデルを用いて測定できる。使用できる適当な系の例は、ラッ トにおける同種心臓移植片、およびマウスにおける異種膵臓島細胞移植片を含み 、その両方を用いて、Lenschow et al.、Science 257:789-792(1992)およびTurk a et al.、Proc.Natl.Acad.Sci USA、89:11102-11105(1992)に記載のようにイン ビ ボにおけるCTLA4Ig融合タンパク質の免疫抑制効果を調べる。さらに、G VHDのネズミモデル(Paul編、Fundamental Immunology、Raven Press、New Y ork、1989、p.846-847参照)を用いて、その疾患の発症時にインビボにおけるB リンパ球抗原機能の遮断効果を決定することができる。 抗原機能遮断はまた、自己免疫疾患の処置に治療的に有用であり得る。数多く の自己免疫疾患は、自己組織に対して反応性のあるT細胞の不適当な不活性化の 結果であり、ここでは、疾患の病因に関与するサイトカインおよび自己抗体の産 生が促進されている。自己反応性T細胞の活性化を妨げると、疾患の徴候は減少 または消失し得る。Bリンパ球抗原のレセプター:リガンド相互作用を阻害する ことによりT細胞の共刺激を遮断する試薬を投与すると、T細胞活性化を阻害し 、疾患の経緯に関与し得る自己抗体またはT細胞由来サイトカインの産生を防ぐ ことができる。さらに、遮断剤により、自己反応性T細胞の抗原特異的耐性を誘 導し得、これにより、疾患を長期間軽減することができる。自己免疫疾患の予防 または軽減における遮断剤の効力は、数多くのヒト自己免疫疾患の十分に特徴付 けられた動物モデルを用いて決定することができる。例は、ネズミ実験的自己免 疫性脳炎、MRL/lpr/lprマウスまたはNZBハイブリッドマウスにお ける全身性エリテマトーデス、ネズミ自己免疫性コラーゲン関節炎、NODマウ スおよびBBラットにおける糖尿病、およびネズミ実験的重症筋無力症(Paul編 、Fundamental Immunology、Raven Press、New York、1989、p.840-856参照)を 含む。 免疫応答をアップレギュレーションする手段としての、抗原機能(好ましくは 、Bリンパ球抗原機能)のアップレギュレーションもまた、治療に有用であり得 る。免疫応答のアップレギュレーションは、現存する免疫応答を亢進、または最 初の免疫応答を発現する形態であり得る。例えば、Bリンパ球抗原機能を刺激す ることにより免疫応答を亢進することは、ウイルス感染の場合には有用であり得 る。さらに、インフルエンザ、風邪および脳炎などの全身性ウイルス疾患は、B リンパ球抗原を刺激形で全身投与することにより軽減し得る。 また、抗ウイルス免疫応答は、感染患者において、患者からT細胞を取り出し 、T細胞をインビトロで、本発明のペプチドを発現しているか、または本発明の 刺 激形の可溶性ペプチドと共に、ウイルス抗原パルスAPCを用いて共刺激し、イ ンビトロ活性化T細胞を患者に再び導入することにより亢進し得る。抗ウイルス 免疫応答を亢進する別の方法は、患者から感染細胞を単離し、細胞がその表面上 にタンパク質を全てまたは一部発現するように、本明細書に記載の本発明のタン パク質をコードする核酸を用いてトランスフェクションさせ、トランスフェクシ ョン細胞を患者に再び導入することである。ここで、感染細胞は、共刺激シグナ ルをT細胞に伝達することができるようになり、従って、インビボにおいてT細 胞を活性化することができる。 別の応用において、抗原機能(好ましくはBリンパ球抗原機能)のアップレギ ュレーションまたは亢進は、腫瘍免疫の誘導に有益であり得る。少なくとも1つ の本発明のペプチドをコードしている核酸でトランスフェクションさせた腫瘍細 胞(例えば、肉腫、黒色腫、リンパ腫、白血病、神経芽腫、癌)は、概体におけ る腫瘍特異的耐性を克服するために概体に投与することができる。所望であれば 、腫瘍細胞をトランスフェクションさせて、組合せペプチドを発現させることも できる。例えば、患者から得られた腫瘍細胞を、生体外でB7−2様活性のみを 有するペプチドの発現を指向した発現ベクターを用いて、またはB7−1様活性 および/またはB7−3様活性を有するペプチドと組み合わせてトランスフェク ションすることができる。トランスフェクションした腫瘍細胞を患者に戻すと、 トランスフェクション細胞の表面上にペプチドが発現される。また、遺伝子療法 技術を使用すると、インビボでトランスフェクションした腫瘍細胞を標的とする ことができる。 腫瘍細胞表面上にBリンパ球抗原活性を有する本発明のペプチドが存在するこ とにより、必要な共刺激シグナルがT細胞にもたらされ、トランスフェクション 腫瘍細胞に対してT細胞仲介免疫応答が誘導される。さらに、MHCクラスIま たはMHCクラスII分子を欠失する、または十分量のMHCクラスIまたはMH CクラスII分子を再発現できない腫瘍細胞は、MHCクラスIα鎖タンパク質お よびβ2ミクログロブリンタンパク質、またはMHCクラスIIα鎖タンパク質お よびMHCクラスIIβ鎖タンパク質の全てまたは一部をコードする核酸を用いて トランスフェクションさせ、よって、細胞表面上にMHCクラスIまたはMHC クラスIIタンパク質を発現させることができる。Bリンパ球抗原(例えば、B7 −1、B7−2、B7−3)活性を有するペプチドと組み合わせた適当なクラス IまたはクラスIIMHCの発現は、トランスフェクション腫瘍細胞に対してT細 胞仲介免疫応答を誘導する。所望により、不変鎖などのMHCクラスII関連タン パク質の発現を遮断するアンチセンス構築物をコードする遺伝子もまた、Bリン パ球抗原活性を有するペプチドをコードするDNAを用いて、共トランスフェク ションさせると、腫瘍関連抗原の提示を促進し、腫瘍特異的免疫を誘導すること ができる。従って、ヒト概体におけるT細胞仲介免疫応答の誘導は、概体におけ る腫瘍特異的耐性を克服するに十分であり得る。 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法により測定し得る: 胸腺細胞または脾臓細胞傷害性に関する適当なアッセイには、以下に記載のも のを制限なく含む:Current Protocols in Immunology、J.E.Coligan、A.M.,Kru isbeek、D.H.,Margulies、E.M.,Shevach、W Strober編、Pub.Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience(第3章、In Vitro assays for Mouse Lym phocyte Function 3.1-3.19;第7章、Immunologic studies in Humans);Herrma nn et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:2488-2492,1981;Herrmann et al.、J.I mmunol.128:1968-1974,1982;Handa et al.、J.Immunol.135:1564-1572,1985;Tak ai et al.、J.Immunol.137:3494-3500,1986;Takai et al.、J.Immunol.140:508- 512,1988;Herrmann et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:2488-2492,1981;Herrm ann et al.、J.Immunol.128:1968-1974,1982;Handa et al.、J.Immunol.135:156 4-1572,1985;Takai et al.、J.Immunol.137:3494-3500,1986;Bowmanet al.、J.V irology 61:1992-1998;Takai et al.、J.Immunol.140:508-512,1988;Bertagnoll i et al.、Cellular Immunology 133:327-341,1991;Brown et al.、J.Immunol.1 53:3079-3092,1994。 T細胞依存性イムノグロブリン応答およびアイソタイプスイッチ(これにより 、とりわけ、T細胞依存性抗体応答を調節し、Thl/Th2プロフィールに影 響を与えるタンパク質を同定する)のアッセイには、以下に記載のものを制限な く含む:Maliszewski、J.Immunol.144:3028-3033,1990;およびAssays for B cel l function:In vitro antibody production、Mond,J.J.and Brunswick,M、Curre nt Protocols in Imrnunology、J.E.e.a.Coligan編Vol 1 p.3.8.1-3.8.16、John Wiley and Sons、Toronto、1994。 混合リンパ球反応(MLR)アッセイ(これにより、とりわけ、優先的にTh 1およびCTL応答を引き起こすタンパク質が同定される)は、以下に記載のも のを制限なく含む:Current Protocols in Immunology、J.E.Coligan、A.M.Kru isbeek、D.H.Margulies、E.M.Shevach、W Strober、Pub.Greene Publishing Ass ociates and Wiley-Interscience(第3章、In Vitro assays for Mouse Lymphoc yte Function 3.1-3.19;第7章、Immunologic studies in Humans);Takai et a l.、J.Immunol.137:3494-3500,1986;Takai et al.、J.Immunol.140:508-512,198 8;Bertagnolli et al.、J.Immunol.149:3778-3783,1992。 樹状細胞依存性アッセイ(これにより、とりわけ、天然T細胞を活性化する樹 状細胞により発現されるタンパク質が同定される)は、以下に記載のものを制限 なく含む:Guery et al.、J.Immunol.134:536-544,1995;Inaba et al.、Journal of Experimental Medicine 173:549-559、1991;Macatonia et al.、Journal of Immunology 154:5071-5079,1995;Porgador et al.、Journal of Experimental Medicine 182:255-260、1995;Nair et al.、Journal of Virology 67:4062-4069 ,1993;Huang et al.、Science 264:961-965,1994;Macatonia et al.、Journal o f Experimental Medicinel 69:1255-1264,1989;Bhardwaj et al.、Journal of C linical Investigation 94:797-807,1994;およびInaba et al.、Journal of Exp erimental Medicine 172:631-640,1990。 リンパ球生存/アポトーシス(これにより、とりわけ、スーパー抗原導入後の アポトーシスを防ぐタンパク質およびリンパ球ホメオスタシスを調節するタンパ ク質が同定される)は、以下に記載のものを制限なく含む:Darzynkiewicz et a l.、Cytometry 13:795-808,1992;Gorczyca et al.、Leukemia 7:659-670,1993;G orczyca et al.、Cancer Research 53:1945-1951,1993;Itoh et al.、Cell 66:2 33-243,1991;Zacharchuk、Journal of Immunology 145:4037-4045,1990;Zamai e t al.、Cytometry 14:891-897,1993;Gorczyca et al.、International Journal of Oncology1:639-648,1992。 T細胞拘束および発達の初期段階に影響を及ぼすタンパク質のアッセイは、以 下に記載のものを制限なく含む:Antica et al.、Blood 84:111-117,1994;Fine et al.、Cellular Imminology 155:111-122,1994;Galy et al.、Blood 85:2770 -2778,1995;Toki et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:7548-7551,1991。 造血調節活性 本発明のタンパク質は、造血調節に、および結果として、骨髄またはリンパ系 細胞障害の処置に有用であり得る。コロニー形成細胞または因子依存性細胞系に 関与するほんのわずかな生物活性でも、例えば単独でまたは他のサイトカインと 組合せて赤芽球前駆細胞の成長および増殖を支持するといった造血調節に関与し ていることを示しており、それにより、例えば種々の貧血の処置に、または照射 /化学療法と組み合わせて赤芽球前駆体および/または赤芽球細胞の産生を刺激 するための使用に;例えば化学療法と組み合わせて結果として起こる骨髄抑制の 予防または処置に有用な顆粒球および単球/マクロファージ(すなわち、古典的 CSF活性)などの骨髄細胞の成長および増殖の支持に;巨核球および結果とし て血小板の成長および増殖を支持することにより血小板減少症などの種々の血小 板障害の予防または処置をなし、一般的に血小板輸血の代替または適当なものと して使用され;および/または、上記造血細胞のいずれかまたは全てに成熟でき 、従って、種々の幹細胞障害(再生不良性貧血および発作性夜間ヘモグロビン尿 症を制限なく含み、通常移植で処置されるもの)に治療有用性がある造血幹細胞 の成長および増殖の支持に、並びに、生体内または生体外(すなわち、骨髄移植 または末梢先祖細胞移植(同種または異種)と組合せて)で、正常細胞または遺 伝子療法で遺伝子操作した細胞として幹細胞コンパートメントを照射/化学療法 後に再集合させるのに有用性を示す。 本発明のタンパク質は、とりわけ、以下の方法により測定し得る: 種々の造血系の適当な増殖および分化アッセイは、上記に示す。 胚幹細胞分化アッセイ(これにより、とりわけ、胚分化造血に影響を及ぼすタ ンパク質が同定される)は、以下に記載のものを制限なく含む:Johansson et a l.Cellular Biology 15:141-151,1995;Keller et al.、Molecular and Cellular Biology 13:473-486、1993;McClanahan et al.、Blood 81:2903-2915,1993。 幹細胞生存および分化アッセイ(これにより、とりわけ、リンパー造血を調節 するタンパク質が同定される)は、制限なく、以下に記載のものを含む:Methyl cellulose colony forming assays、Freshney,M.G.、Culture of Hematopoieti c Cells、R.I.Freshney,et al.編Vol p.265-268、Wiley-Liss、Inc.、New York, NY.1994;Hirayama et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:5907-5911,1992;Primit ive hematopoietic colony forming cells with high proliferative potential 、McNiece,I.K.and Briddell,R.A.、Culture of Hematopoietic Cells、R.I.Fr eshney,et al.編Vol p.23-39、Wiley-Liss,Inc.、New York,NY.1994;Neben et a l.、Experimental Hematology 22:353-359,1994;Cobblestone area forming cel l assay、Ploemacher,R.E.、Culture of Hematopoietic Cells、R.I.Freshney,e t al.編Vol p.1-21、Wiley-Liss,Inc.、New York,NY.1994;Long term bone marr ow cultures in the presence of stromal cells、Spooncer,E.、Dexter,M.and Allen,T.、Culture of Hematopoietic Cells、R.I.Freshney,et al.編Vol p.163 -179、Wiley-Liss,Inc.、New York,NY.1994;Long term culture initiating cel l assay、Sutherland,H.J.、Culture of Hematopoietic Cells、R.I.Freshney, et al.編Vol p.139-162、Wiley-Liss,Inc.、New York,NY.1994。 組織成長活性 本発明のタンパク質はまた、骨、軟骨、腱、靭帯および/または神経組織成長 または再生、並びに創傷治癒および組織修復および置換に使用する組成物、およ び火傷、切開および潰瘍の処置において有用性を示し得る。 骨が通常形成されない環境下において軟骨および/または骨成長を誘導する本 発明のタンパク質は、ヒトおよび他の動物における、骨折および軟骨傷害または 不足の治癒に適用される。本発明のタンパク質を使用したかかる製剤は、皮下骨 折並びに開放骨折治癒に、および人工関節の固定化促進に予防的に使用し得る。 骨形成剤により誘導される新規骨形成は、先天性、外傷誘導、または腫瘍切除誘 導頭骸骨傷害治癒に寄与し、また、美容形成外科においても有用である。 本発明のタンパク質はまた、歯周病の処置、および他の歯治療過程にも使用し 得る。かかる薬剤は、骨形成細胞を引き付けるか、骨形成細胞を刺激するか、ま たは骨形成細胞の先祖の分化を誘導する環境を提供し得る。本発明のタンパク質 はまた、骨および/または軟骨修復を刺激することにより、または炎症過程が仲 介する炎症または組織破壊(コラゲナーゼ活性、破骨細胞活性等)過程を遮断す ることにより、骨粗鬆症または変形性関節症の処置に有用であり得る。 本発明のタンパク質に起因し得る組織再生活性の別のカテゴリーは、腱/靭帯 形成である。腱/靭帯様組織または他の組織形成を、通常かかる組織が形成され ない環境下で誘導する本発明のタンパク質は、ヒトおよび他の動物における、腱 または靭帯破壊、変形および他の腱または靭帯障害の治癒に適用される。腱/靭 帯様組織誘導タンパク質を使用したかかる製剤は、腱または靭帯組織の傷害から の保護、並びに腱または靭帯の骨または他の組織への固定化を亢進、並びに腱ま たは靭帯組織傷害を治癒するために予防的に使用し得る。本発明の組成物により 誘導される新規腱/靭帯様組織形成は、先天性、外傷誘導、または他の起源の他 の腱または靭帯障害の治癒に寄与し、また、腱または靭帯の接着または修復とい った美容形成外科においても有用である。本発明の組成物は、腱または靭帯形成 細胞を引き付けるか、腱または靭帯形成細胞の成長を刺激するか、腱または靭帯 形成細胞の先祖の分化を誘導するか、または、生体内に戻して組織を修復するた めに、腱/靭帯細胞または先祖の成長を生体外で誘導する環境を提供し得る。本 発明の組成物はまた、腱炎、毛根管症候群および他の腱または靭帯障害の処置に 有用であり得る。組成物はまた、当該分野でよく知られているように、適当なマ トリックス、および/または担体として金属イオン封印剤を含み得る。 本発明のタンパク質はまた、神経細胞増殖並びに神経および脳組織再生、すな わち、中枢および末梢神経系疾患並びにニューロパシー、並びに機械的および外 傷的疾患(これは、神経細胞または神経組織の変性、壊死または外傷を含む)の 処置に有用であり得る。より具体的には、タンパク質は、例えば末梢神経傷害、 末梢ニューロパシーおよび局所的ニューロパシーなどの末梢神経系疾患、および アルツハイマー、パーキンソン病、ハンティングトン舞踏病、筋萎縮性側索硬化 、およびシャイ・ドレーガー症候群などの中枢神経系疾患の処置に使用し得る。 本発明により処置し得る別の症状は、脊髄障害、頭部外傷、および卒中などの脳 血管障害といった機械的および外傷的障害を含む。化学療法または他の医学療法 が引き起こす末梢ニューロパシーもまた、本発明のタンパク質を用いて処置可能 である。 本発明のタンパク質はまた、圧迫潰瘍、血管障害に関連した潰瘍、手術的およ び外傷的創傷等を制限なく含む、治癒されていない創傷のより良く早い治癒を促 進するのに有用であり得る。 本発明のタンパク質は、臓器(例えば、膵臓、肝臓、腸、腎臓、皮膚、内皮を 含む)、筋肉(平滑筋、骨格筋または心筋)および血管(血管内皮を含む)組織 などの他の組織の生成または再生、またはかかる組織を含む細胞の成長を促進す る活性を示し得る。所望の効果の一部は、正常組織が再生するように線状の創傷 を阻害または調節することにより得られ得る。本発明のタンパク質はまた、血管 新生活性も示し得る。 本発明のタンパク質はまた、消化管保護または再生、および肺または肝繊維症 の処置、種々の組織における再還流障害、および全身性サイトカイン傷害から引 き起こされる症状に有用であり得る。 本発明のタンパク質はまた、前駆体組織または細胞から上記の組織の分化を促 進または阻害するのに、または上記の組織の成長を阻害するのに有用であり得る 。 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法により測定し得る: 組織生成活性のアッセイは、以下に記載のものを制限なく含む:国際特許公開 番号WO95/16035(骨、軟骨、腱);国際特許公開番号WO95/05846(神経、ニ ューロン);国際特許公開番号WO91/07491(皮膚、内皮)。 創傷治癒活性アッセイは、以下に記載のものを制限なく含む:Winter、Epider mal Wound Healing 、p.71-112(Maibach,HI and Rovee,DT編)、Year Book Medica l Publishers,Inc.、Chicago、これはEaglstein and Mertz,J.、Invest.Dermato l 71:382-84(1978)により修飾されている。 アクチビン/インヒビン活性 本発明のタンパク質はまた、アクチビンまたはインヒビン関連活性を示し得る 。インヒビンは、卵胞刺激ホルモン(FSH)放出阻害能により特徴付けられ、 一方、アクチビンは、卵胞刺激ホルモン(FSH)放出刺激能により特徴付けら れる。従って、本発明のタンパク質は、単独で、またはインヒビンαファミリー の1つとのヘテロダイマーの形で、雌哺乳動物における生殖能力を減少させ、雄 哺乳動物における精子形成を減少させるインヒビン効力に基いた避妊薬として有 用 であり得る。十分量の別のインヒビンを投与することで、これらの哺乳動物にお いて避妊を誘導することができる。また、ホモダイマーまたは他のインヒビン- β基のタンパク質サブユニットとのヘテロダイマーである、本発明のタンパク質 は、前下垂体細胞からFSH放出を刺激するアクチビン分子の能力に基づく、生 殖誘導治療薬として有用であり得る。例えば、米国特許4,798,885参照。本発明 のタンパク質はまた、ウシ、ヒツジおよびブタなどの家畜動物の生殖行動の期間 を延ばすために、性的に未熟な哺乳動物における生殖能力の開始を早めるのに有 用であり得る。 本発明のタンパク質はまた、とりわけ、以下の方法により測定し得る: アクチビン/インヒビン活性のアッセイは、以下に記載のものを制限なく含む :Vale et al.、Endocrinology 91:562-572,1972;Ling et al.、Nature 321:779 -782,1986;Vale et al.、Nature 321:776-779,1986;Mason et al.、Nature 318: 659-663,1985;Forage et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83:3091-3095,1986。 走化性/化学運動性 本発明のタンパク質は、例えば、単球、繊維芽細胞、好中球、T細胞、肥満細 胞、好酸球、上皮および/または内皮細胞を含む、哺乳動物細胞の走化性または 化学運動性(例えば、ケモカインとして働く)を有し得る。走化性および化学運 動性タンパク質は、所望の細胞群を所望の作用部位に移動または引き付けるため に使用することができる。走化性または化学運動性タンパク質は、組織の傷およ び他の外傷の処置、並びに局所的感染の処置に特に利点がある。例えば、リンパ 球、単球または好中球を腫瘍または感染部位に引き付けると、腫瘍または感染剤 に対する免疫応答が充進され得る。 タンパク質またはペプチドが、もし直接的または間接的に、特定の細胞群の指 示方向および運動を刺激することができるならば、それはこのような細胞群に対 して走化性を有する。好ましくは、タンパク質またはペプチドは直接的に細胞の 指示された運動を刺激することができる。特定のタンパク質が細胞群に対して走 化性を有するかどうかは、細胞走化性に関する任意の公知のアッセイにおいてか かるタンパク質またはペプチドを使用することにより容易に決定することができ る。 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法により測定し得る: 走化性のアッセイ(これにより、走化性を誘導または妨害するタンパク質が同 定される)は、膜を通して細胞の移動を誘導するタンパク質の能力、並びに1つ の細胞群から別の細胞群への癒着を誘導するタンパク質の能力について測定する アッセイから構成されている。移動および癒着に適当なアッセイは、以下に記載 のものを制限なく含む:Current Protocols in Immunology、J.E.Coligan、A.M. ,Kruisbeek、D.H.,Margulies、E.M.,Shevach、W.Strober編、Pub.Greene Publis hing Associates and Wiley-Interscience(第6.12章、Measurement of alpha an d beta Chemokines 6.12.1-6.12.28;Taub et al.J.Clin.Invest.95:1370-1376、 1995;Lind et al.APMIS 103:140-146,1995;Muller et al.Eur.J.Immunol.25:174 4-1748;Gruber et al.J.of Immunol.152:5860-5867,1994;Johnston et al.J.of Immunol.153:1762-1768,1994。 止血および血栓活性 本発明のタンパク質はまた、止血または血栓活性を示し得る。結果として、か かるタンパク質は、種々の凝固疾患(血友病などの遺伝性疾患を含む)の処置、 または外傷、手術または他の原因から生じた傷の処置における凝固および他の血 栓症状の亢進に有用であると期待される。本発明のタンパク質はまた、血栓形成 の溶解または阻害、およびそれから生じた症状(例えば、心筋梗塞および中枢神 経系血管閉塞(例えば、卒中))の処置および予防に有用であり得る。 本発明のタンパク質は、とりわけ、以下の方法により測定し得る: 止血および血栓活性のアッセイは、以下に記載のものを制限なく含む:Linet et al.、J.Clin.Pharmacol.26:131-140,1986;Burdick et al.、Thrombosis Res. 45:413-419,1987;Humphrey et al.、Fibrinolysis 5:71-79(1991);Schaub、Pros taglandins 35:467-474、1988。 レセプター/リガンド活性 本発明のタンパク質はまた、レセプター、レセプターリガンドまたはレセプタ ー/リガンド相互作用の阻害剤またはアゴニストとして活性を示し得る。かかる レセプターおよびリガンドの例は、サイトカインレセプターおよびそのリガンド 、 レセプターキナーゼおよびそのリガンド、レセプターホスファターゼおよびその リガンド、細胞−細胞相互作用に関与するレセプターおよびそのリガンドを制限 なく含む(制限なく、抗原提示、抗原認識および細胞性および体液性免疫応答に 関与する、細胞癒着分子(例えば、セレクチン、インテグリンおよびそのリガン ド)およびレセプター/リガンド対を含む)。レセプターおよびリガンドはまた 、可能性のあるペプチドまたは関連するレセプター/リガンド相互作用の小分子 阻害剤をスクリーニングするのに有用である。本発明のタンパク質(レセプター およびリガンドのフラグメントを制限なく含む)は、それ自体レセプター/リガ ンド相互作用の阻害剤として有用であり得る。 本発明のタンパク質は、とりわけ、以下の方法により測定し得る: レセプター−リガンド活性の適当なアッセイは、以下に記載のものを制限なく 含む:Current Protocols in Immunology、J.E.Coligan、A.M.,Kruisbeek、D.H. ,Margulies、E.M.,Shevach、W.Strober編、Pub.Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience(第7.28章、Measurement of Cellular Adhesion under static conditions 7.28.1-7.28.22)、Takai et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84:6864-6868,1987;Bierer et al.、J.Exp.Med.168:1145-1156,1988;Rosenstein et al.、J.Exp.Med.169:149-160,1989;Stoltenborg et al.、J.Immunol.Metho ds 175:59-68,1994;Stitt et al.、Cell 80:661-670,1995。 抗炎症活性 本発明のタンパク質はまた、抗炎症活性を示し得る。抗炎症活性は、炎症応答 に関与する細胞に刺激を与えるか、細胞−細胞相互作用(例えば、細胞癒着)を 阻害または促進するか、炎症過程に関与する細胞の走化性を阻害または促進する か、細胞遊出を阻害または促進し、炎症応答をより直接的に阻害または促進する 他の因子の産生を刺激または抑制することにより得られ得る。このような活性を 示すタンパク質を使用すると、感染(例えば、敗血症性ショック、敗血症または 全身性炎症応答症候群(SIRS))、虚血−再還流障害、エンドトキシン致死、 関節炎、補体仲介超急性拒絶、腎炎、サイトカインまたはケモカイン誘導肺障害 、炎症性腸疾患、クローン病またはTNFまたはIL−2などのサイトカインの 産生過剰から生じた疾患に関連する炎症を制限なく含む、慢性または急性状態を 含 む炎症症状を処置することができる。本発明のタンパク質はまた、抗原性基質ま たは物質に対するアナフィキラシーおよび過敏症の処置に有用であり得る。 腫瘍阻害活性 腫瘍の免疫学的処置または予防で上記した活性に加えて、本発明のタンパク質 は他の抗腫瘍活性を示し得る。タンパク質は、直接的または間接的に(例えば、 ADCCを介して)腫瘍成長を阻害し得る。タンパク質は、腫瘍組織または腫瘍 前駆体組織に作用するか、腫瘍成長に必要な組織形成を阻害するか(例えば、血 管形成を阻害することにより)、腫瘍成長を阻害する他の因子、薬剤または細胞 型を産生することにより、または腫瘍成長を促進する因子、薬剤または細胞型を 抑制、削除または阻害することにより、腫瘍阻害活性を示し得る。 他の活性 本発明のタンパク質はまた、以下の付加的な活性または効果を1つ以上示し得 る:細菌、ウイルス、真菌および他の寄生虫を制限なく含む、感染性病原体の成 長、感染または機能の阻害または殺滅;身長、体重、髪の色、目の色、皮膚、脂 肪対肉比または他の組織色素を制限なく含む体の特徴、または臓器または体部分 サイズまたは型(例えば、胸部増大または減少、骨の形または型の変化)に対す る影響(抑制または亢進);バイオリズムまたは心(caricadic)周期またはリ ズムに対する影響;雄または雌概体の生殖能力に対する影響;食用脂肪、脂質、 タンパク質、炭水化物、ビタミン、ミネラル、補因子または他の栄養因子または 成分の代謝、異化、同化、プロセシング、利用、貯蔵または削除に対する影響; 食欲、性欲、ストレス、認知(認知障害を含む)、抑鬱(鬱病を含む)および暴 力行動を制限なく含む、行動特性に対する影響;鎮痛効果または他の疼痛軽減効 果;造血系以外の系における胚幹細胞の分化および成長の促進;ホルモンまたは 内分泌活性;酵素の場合、酵素の欠乏の修正、および欠乏性関連疾患の処置;過 増殖疾患(例えば、乾癬)の処置;イムノグロブリン様活性(例えば、抗原また は補体と結合する能力);および、ワクチン組成物中で抗原として作用し、かか るタンパク質またはかかるタンパク質と交差反応する他の物質または実体に対し て免疫応答を引き起こす能力。 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION       Human protein having transmembrane domain and DNA encoding the same Technical field   The present invention provides a human protein having a transmembrane domain, and encodes the same. DNA. The protein of the present invention may be used as a pharmaceutical or for the protein. It can be used as an antigen for producing an antibody. The human cDNA of the present invention It can be used as a probe for gene diagnosis or a gene source for gene therapy. Ma In addition, it is used as a gene source for mass-producing the protein encoded by the cDNA. Can be. Background art   Membrane proteins include signal receptors, ion channels, transporters, etc. It plays an important role in transporting substances and transmitting information through cell membranes. For example, receptors for various cytokines such as sodium ion and potassium ion Ion channels for on / chlorine ions, etc. There are known sporters, many of which have already been cloned. You.   Abnormalities in these membrane proteins have been linked to a number of previously unknown diseases. I knew it was there. For example, twelve membranes are responsible for cystic fibrosis. A gene for a membrane protein with a transmembrane domain has been identified [Rommens, J.M. et al. , Science 245: 1059-1065 (1989)]. Also, some membrane proteins are viruses Has been found to act as a receptor in infecting cells. ,example For example, HIV-1 is a membrane protein on the T cell membrane, CD4 antigen and seven transmembrane domains. Has been shown to infect cells via the membrane protein Fugin, which has . et al., Science 272: 872-877 (1996)]. Therefore, new membrane proteins are found If it can be released, it is expected to lead to the elucidation of the causes of many diseases, and it encodes membrane proteins It is desired that a new gene be isolated.   Conventionally, membrane proteins have been difficult to purify. Many have been isolated by A common method is to use cDNA libraries in animals. After introducing cDNA into cells and expressing cDNA, express target membrane protein on membrane Cells are analyzed by immunological techniques using antibodies or changes in membrane permeability. This is so-called expression cloning, which is detected by a technique. But this way, Only genes with known membrane proteins can be cloned.   Generally, a membrane protein has a hydrophobic transmembrane domain inside the protein, After being synthesized by the some, this domain remains in the phospholipid membrane and is trapped in the membrane. You. Therefore, the entire base sequence of the full-length cDNA is determined and the cDNA is coded. The presence of a highly hydrophobic transmembrane domain in the amino acid sequence of the loaded protein If so, the cDNA is considered to encode a membrane protein.   An object of the present invention is to provide a novel human protein having a transmembrane domain, and the protein Is to provide a DNA encoding   The present inventors have conducted intensive studies and found that transmembrane domains were selected from human full-length cDNA banks. The present invention was completed by cloning a cDNA having an in. That is, the present invention SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2 which is a human protein having a transmembrane domain A protein comprising any of the amino acid sequences represented by SEQ ID NOs: 4 to 25; provide. The present invention also relates to a DNA encoding the above protein, for example, SEQ ID NO: 26 And a cDNA comprising any one of the nucleotide sequences represented by SEQ ID NO: 50.   The protein of the present invention can be isolated from human organs, cell lines, etc. A method for preparing a peptide by chemical synthesis based on the amino acid sequence, or the method of the present invention. A method for producing recombinant DNA technology using DNA encoding a transmembrane domain Although it can be obtained by any method, a method obtained by recombinant DNA technology is preferable. Used. For example, for in vitro transcription from a vector having the cDNA of the present invention. Therefore, RNA is prepared, and in vitro translation is performed using the RNA as a template. Protein can be expressed in vitro. Also, the translation region can be appropriately expressed by a known method. If it is recombined into a vector, it is encoded by Escherichia coli, Bacillus subtilis, yeast, animal cells, etc. In large quantities.   When the protein of the present invention is produced by a microorganism such as E. coli, Origin, promoter, ribosome binding site, cDNA cloning Translation region of the cDNA of the present invention in an expression vector having a site, a terminator, etc. A recombinant expression vector was prepared, and host cells were transformed with the expression vector. If the obtained transformant is cultured, the protein encoded by the cDNA Can be mass-produced in microorganisms. At this time, start before and after any translation area A protein fragment containing any region if expressed by adding codons and stop codons Can be obtained. Alternatively, it may be expressed as a fusion protein with another protein. Can also be. By cleaving the fusion protein with an appropriate protease, the cD Only the protein portion encoded by NA can be obtained.   When the protein of the present invention is produced in animal cells, the translation region of the cDNA is Animal cells having a promoter, a splicing region, a poly (A) addition site, etc. Once the protein of the present invention is recombined into an expression vector for It can be produced on the cell membrane surface as white matter.   The protein of the present invention has a sequence from SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4 Peptide fragment containing any partial amino acid sequence of the amino acid sequence represented by No. 25 Fragments (5 amino acid residues or more) are also included. These peptide fragments create antibodies Can be used as an antigen. In addition, a signal distribution in the protein of the present invention. Those with rows have the cell surface in the form of the mature protein after the signal sequence has been removed. Come out. Therefore, these mature proteins fall within the scope of the proteins of the present invention. The N-terminal amino acid sequence of the mature protein can be determined by a signal sequence cleavage site determination method [Japanese Unexamined Patent Publication No. 187100]. Also some membrane proteins Is processed to be secreted at the cell surface. Became such a secretory type Proteins and peptides are also included in the category of the protein of the present invention. In the amino acid sequence If a sugar chain binding site is present, a protein with a sugar chain added when expressed in appropriate animal cells Quality is obtained. Therefore, proteins or peptides to which such sugar chains are added Also fall into the category of the proteins of the present invention.   The DNA of the present invention includes all DNAs encoding the above proteins. The DNA can be prepared by chemical synthesis or cDNA cloning. Can be obtained.   The cDNA of the present invention can be cloned, for example, from a human cell-derived cDNA library. Can be cDNA is poly (A) extracted from human cells+Cast RNA Synthesize as a type. Human cells that have been removed from the human body by surgery, etc. Or cultured cells. The cDNA was prepared by the Okayama-Berg method [Okayama, H .; and Be rg, P., Mol. Cell. Biol. 2: 161-170 (1982)], Gubler-Hoffman method [Gubler, U.S.A. a nd Hoffman, J., Gene 25: 263-269 (1983)]. However, in order to obtain a full-length clone efficiently, the key as described in the example is used. Capping method [Kato, S .; et al., Gene 163: 193-196 (1995)]. desirable.   The primary selection of a cDNA encoding a human protein having a transmembrane domain comprises c Partial base sequence determination of a cDNA clone arbitrarily selected from a DNA library, Determination of the amino acid sequence encoded by the nucleotide sequence, within the obtained N-terminal amino acid sequence region Is performed by confirming the presence or absence of a hydrophobic portion. Then all bases by sequencing A second selection is performed by determining the sequence and expressing the protein by in vitro translation. Departure Confirmation that light cDNA encodes a protein having a secretory signal sequence Is a signal sequence detection method [Yokoyama-Kobayashi, M .; et al., Gene 163: 193-1 96 (1995)]. That is, c encoding the N-terminus of the target protein The DNA fragment was fused with the cDNA encoding the urokinase protease domain. After cloning, it is expressed in COS cells, and urokinase activity is detected in the cell culture. If it is issued, the part encoded by the inserted cDNA fragment It means that it is functioning as a column. On the other hand, urokinase activity is detected in the medium If not, it means that the N-terminus remains in the membrane.   The cDNA of the present invention has a base sequence represented by SEQ ID NO: 26 to SEQ ID NO: 50. Or any of the nucleotide sequences represented by SEQ ID NO: 51 to SEQ ID NO: 75. It is a feature. Each clone number (HP number), cDNA clone Cell, total number of bases of cDNA, amino acid residue of encoded protein The numbers are summarized in Table 1.  In addition, the nucleotide sequence of any one of SEQ ID NO: 51 to SEQ ID NO: 75 Using the oligonucleotide probe synthesized based on the human Screen cDNA libraries from cell lines and human tissues As a result, the same clone as the cDNA of the present invention can be easily obtained.   Generally, polymorphism due to individual differences is frequently observed in human genes. Therefore, SEQ ID NO: 5 1 to SEQ ID NO: 75, addition or deletion of one or more nucleotides and CDNAs substituted with other nucleotides are also included in the scope of the present invention. I have.   Similarly, the addition or deletion of one or more amino acids caused by these changes And / or a protein in which substitution by another amino acid is also performed. Has the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4 to SEQ ID NO: 25 As long as it has the activity of each protein, it falls within the scope of the present invention.   The cDNA of the present invention has a base sequence represented by SEQ ID NO: 26 to SEQ ID NO: 50. Or any partial base sequence of the base sequence represented by SEQ ID NO: 51 to SEQ ID NO: 75 A cDNA fragment containing a sequence (10 bp or more) is also included. In addition, the sense strand and A DNA fragment consisting of a chain is also included in this category. These DNA fragments are It can be used as a probe for child diagnosis. BRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES   FIG. 1 is a diagram showing the structure of a secretory signal sequence detection vector pSSD3.   Figure 2: Hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP00442 FIG.   Figure 3: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP00804. FIG.   Figure 4: Northern blot hybridization results for clone HP00804. It is a figure showing a result.   Figure 5: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP01098 FIG.   Figure 6: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP01148 FIG.   Figure 7: Northern blot hybridization results for clone HP01148. It is a figure showing a result.   Figure 8: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP01293 FIG.   Figure 9: Hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10013 FIG.   Figure 10: Hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10034 FIG.   Figure 11: Hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10050 FIG.   Figure 12: Hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10071 FIG.   Figure 13: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10076 FIG.   Figure 14: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10085 FIG.   Figure 15: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10122 FIG.   Figure 16: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10136 FIG.   Figure 17: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10175 FIG.   Figure 18: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10179 FIG.   Figure 19: Hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10196 FIG.   Figure 20: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10235 FIG.   Figure 21: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10297 FIG.   Figure 22: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10299 FIG.   Figure 23: Hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10301 FIG.   Figure 24: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10302 FIG.   Figure 25: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10304 FIG.   Figure 26: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10305 FIG.   Figure 27: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10306 FIG.   Figure 28: The hydrophobic / hydrophilic profile of the protein encoded by clone HP10328 FIG. Preferred method for carrying out the invention Example   Next, the present invention will be specifically described by way of examples, but the present invention is not limited to these examples. Not something. The basic operations and enzyme reactions for DNA recombination are described in the literature. [“Molecular Cloning. A Laboratory Manual”, Cold Spring Harbor L aboratory, 1989]. Unless otherwise specified, restriction enzymes and various modifying enzymes The product made by Heho Shuzo was used. Includes buffer composition and reaction conditions for each enzyme reaction Followed the instructions. cDNA synthesis is described in the literature [Kato, S .; et al., Gene 150: 242-2 50 (1994)]. (1) Poly (A)+Preparation of RNA   As human cells for extracting mRNA, fibrosarcoma cell line HT-1080 (ATCC CCL 121), epidermoid carcinoma cell line KB (ATCC CRL 17) ), Histiocyte lymphoma cell line U937 (ATCC CRL 1593), osteosarcoma Cell line U-2 OS (ATCC HTB 96), leukocytes isolated from peripheral blood, Stomach cancer tissue and liver removed by surgery were used. Culture of each cell line Was performed according to a conventional method.   About 1 g of human cells was homogenized in 20 ml of a 5.5 M guanidium thiocyanate solution. After genizing, the literature [Okayama, H .; et al., “Methods in Enzymology” Vol .164, Academic Press, 1987]. This is 20mM Washed with Tris-HCl buffer (pH 7.6), 0.5 M NaCl, 1 mM EDTA Apply to an oligo dT cellulose column and apply poly (A) according to the above-mentioned literature.+RNA obtained . (2) Preparation of cDNA library   Poly (A) above+Dissolve 10 μg of RNA in 100 mM Tris-HCl buffer (pH 8) And add 1 unit of RNase-free bacterial alkaline phosphatase. And reacted at 37 ° C. for 1 hour. After extracting the reaction solution with phenol, ethanol precipitation was performed. Perform the pelleting and add 50 mM sodium acetate (pH 6), 1 mM EDTA, 0.1% Dissolve in 2-mercaptoethanol, 0.01% Triton X-100 solution Was. This includes tobacco acid pyrophosphatase (Epicenter Technologies, Inc.) And 1 unit was added, and reacted at 37 ° C. for 1 hour in a total volume of 100 μl. Reaction solution After ethanol extraction, ethanol precipitation is performed, and the pellet is dissolved in water and uncapped. Treated poly (A)+An RNA solution was obtained.   Decapped poly (A)+RNA, DNA-RNA chimeric oligonucleotide Otide (5'-dG-dG-dG-dG-dA-dA-dT-dT-dC-dG -DA-GG-A-3 ') 3 nmol in 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.5), 0.5 mM ATP, 5 mM MgClTwo, 10 mM 2-mercaptoethanol, 25% Dissolve in aqueous polyethylene glycol solution and add 50 units of T4 RNA ligase The reaction was carried out at 20 ° C. for 12 hours in a total volume of 30 μl. After extracting the reaction solution with phenol, The pellet was dissolved in water, and the chimeric oligo-capped poly ( A)+RNA was obtained.   The vector pKA1 (JP-A-4-117292) developed by the present inventors was used. After digestion with KpnI, about 60 dT tails were added by terminal transferase. this Was digested with EcoRV to remove one side of the dT tail, Used.   Chimera oligo-capped poly (A) prepared above+Transfer 6 μg of RNA to vector -After annealing with 1.2 µg of primer, 50 mM Tris-HCl buffer (pH 8. 3), 75 mM KCl, 3 mM MgClTwo, 10 mM dithiothreitol, 1.25 mM  Dissolve in dNTP (dATP + dCTP + dGTP + dTTP) solution and reverse transcription Add 200 units of enzyme (manufactured by GIBCO-BRL). Allowed to react for hours. After extracting the reaction solution with phenol, ethanol precipitation was performed. Was added to 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.5), 100 mM NaCl, 10 mM Mg. ClTwoAnd dissolved in 1 mM dithiothreitol solution. 100 units of EcoRI Was added and reacted at 37 ° C. for 1 hour in a total volume of 20 μl. After extracting the reaction solution with phenol, After ethanol precipitation, the pellet was washed with 20 mM Tris-HCl buffer (pH 7.5), 100 mM KCl, 4 mM MgClTwo, 10 mM (NHFour)TwoSOFour, 50μg / ml cow It was dissolved in a serum albumin solution. Add 60 units of E. coli DNA ligase to this At 16 ° C. for 16 hours. 2 μl of 2 mM dNTP and E. coli DNA Add 4 units of remerase I and 0.1 units of Escherichia coli RNase H, and add The reaction was carried out at 22 ° C. for 1 hour.   Next, Escherichia coli DH12S (GIBCO-BRL) was used using the cDNA synthesis reaction solution. Was carried out. Transformation is performed by electroporation. Was. A part of the transformant was used as a 2 × YT agar medium containing 100 μg / ml ampicillin. The cells were sown on the plate and cultured overnight at 37 ° C. Pick up any colonies that formed on the agar and 100μ 2 ml of 2 × YT medium containing g / ml ampicillin was inoculated and cultured at 37 ° C. overnight. . Centrifuge the culture and prepare plasmid DNA from the cells by alkaline lysis did. Plasmid DNA was double digested with EcoRI and NotI, followed by 0.8% Galose gel electrophoresis was performed to determine the size of the cDNA insert. Also, M13 universal ply labeled with a fluorescent dye using the resulting plasmid as a template And Taq polymerase (Applied Biosystems kit) Shi After performing a sequencing reaction, a fluorescent DNA sequencer (Applied Biosystem Muzu) to determine the nucleotide sequence of about 400 bp at the 5 'end of the cDNA. Array The data was filed as a homoprotein cDNA bank database. (3) Selection of cDNA encoding a protein having a transmembrane domain   The nucleotide sequence registered in the Homoprotein cDNA Bank can be converted to a three-frame amino acid sequence. Open reading frame (ORF) starting from the start codon after converting to an acid sequence ). Next, a secretory protein is added to the N-terminal of the portion encoded by the ORF. Those having a unique signal sequence were selected. For these clones Using the deletion method with Exonuclease III, from both 5 'and 3' directions. After sequencing, the entire nucleotide sequence was determined. The protein encoded by the ORF For quality, the method of Kyte-Doolittle [Kyte, J & Doolittle, R.F., J. Mol. Biol . 157: 105-132 (1982)] to determine the hydrophobic / hydrophilic profile, The presence or absence of the area was checked. Transmembrane domain in the amino acid sequence of the encoding protein If there is a hydrophobic region that seems to be Was. (4) Construction of secretion signal detection vector pSSD3   Has SV40 promoter and urokinase protease domain cDNA PSSD1 [Yokoyama-Kobayashi, M .; et al., Gene 163: 193-196 (1995)] 1 μg was digested with 5 units of BglII and 5 units of EcoRV. Then CIP processing After dephosphorylation of the 5 'end by agarose gel electrophoresis. A 4.2 kbp DNA fragment was cut out of the gel and purified.   Two oligo DNA linkers L1 (5'-GATCCCGGGTCACGTG GGAT-3 ') and L2 (5'-ATCCCACGTGACCCGG-3') Synthesized and phosphorylated by T4 polynucleotide kinase. Anneal both Thereafter, the cut piece of pSSD1 prepared above was ligated with T4 DNA ligase, E. coli JM109 was transformed. Preparation of plasmid pSSD3 from transformants Then, by determining the nucleotide sequence of the linker insertion part, the target recombinant is identified. I accepted. FIG. 1 shows the structure of the obtained plasmid. This plasmid vector is Three blunt-end generating restriction enzyme sites at the recloning site, SmaI, PmaCI , It has EcoRV. Since these cleavage sites are arranged at intervals of 7 bp, If you select one of these, you can combine it with the three frames of the cDNA fragment to be inserted. A vector expressing the fusion protein can be constructed. (5) Confirmation of function of secretory signal sequence   For the secretory protein candidate clone obtained as a result of the above step, the N-terminal hydrophobic region That the region functions as a secretory signal sequence, according to the method described in the literature [Yokoyama-Koba yashi, M. et al., Gene 163: 193-196 (1995)]. First target Plasmid containing a cDNA encoding a secretory signal sequence Cleavage was made at the appropriate restriction site downstream of the possible site. If this limit If the enzyme site has a protruding end, use Klenow treatment or mung bean nuclease. It was made blunt by treatment. Furthermore, digestion with HindIII was carried out to obtain SV40. D containing the promoter and cDNA encoding a secretory signal sequence downstream thereof NA fragments were isolated by agarose gel electrophoresis. This fragment was converted into pSSD3 Of HindIII and Urokinase coding frame Insert between the restriction enzyme site and the secretory signal sequence Construction of a Vector for Expressing a Kinase Protease Domain Fusion Protein Was.   E. coli having a fusion protein expression vector (host: JM109) was 100 μg / After culturing at 37 ° C. for 2 hours in 2 ml of 2 × YT medium containing 2 ml of ampicillin, -Phage M13KO7 (50 µl) was added, and the mixture was cultured at 37 ° C overnight. To centrifuge Therefore, single-stranded phage particles were separated from the separated supernatant by polyethylene glycol precipitation. Got a child. 100 μl of 1 mM Tris-0.1 mM EDTA, pH 8 (TE) Suspended in water. As controls, pSSD3 and urokinase full-length cDN were also used. A containing pKA1-UPA [Yokoyama-Kobayashi, M .; et al., Gene 1 63: 193-196 (1995)]. Was.   Monkey kidney-derived cultured cells COS7 were modified with Dulbecco's containing 10% fetal bovine serum. 5% CO in Eagle (DMEM) mediumTwoThe cells were cultured at 37 ° C in the presence. 1 × 10Five COS7 cells were plated in a 6-well plate (Nunc, 3 cm in diameter) and 5% C OTwoThe cells were cultured at 37 ° C. for 22 hours in the presence. After removing the medium, the cell surface is The surface was washed, and DMEM (TDME) containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.5) was further added. M) and washed again. 1 μl of a single-stranded phage suspension was added to the cells, and DMEM medium 0 .6 ml, 3 μl of TRANSFECTAM ™ (IBF) was added. 5% COTwoThe cells were cultured at 37 ° C. for 3 hours in the presence. After removing the sample solution, TDME Wash the cell surface with M and add 2 ml of DMEM containing 10% fetal bovine serum per well. Well, 5% COTwoThe cells were cultured at 37 ° C for 2 days in the presence.   2% bovine fibrinogen (Miles), 0.5% agarose, 1 mM potassium chloride 10 units of human per 10 ml of 50 mM phosphate buffer (pH 7.4) containing Lucium Add Rombin (Mochida Pharmaceutical), solidify in a 9 cm diameter plate, and add fibrin Plates were prepared. Culture supernatant of transfected COS7 cells 10μ 1 was placed on a fibrin plate and incubated at 37 ° C. for 15 hours. Got The diameter of the dissolved circle was used as an index of urokinase activity. If the cDNA fragment is If it encodes an amino acid sequence that functions as a null sequence, the fusion protein Quality is secreted and forms a lytic circle due to its urokinase activity. Therefore, If no rounding occurs, the fusion protein remains trapped in the membrane The cDNA fragment is considered to encode a transmembrane domain. (6) Protein synthesis by in vitro translation   Using a plasmid vector having the cDNA of the present invention, TNT rabbit reticulated red In vitro transcription / translation was performed with a blood cell lysate kit (Promega). This At the time of [35[S] methionine was added and the expression product was labeled with a radioisotope . All reactions were performed according to the protocol attached to the kit. Plasmid 2 μg to TN12.5 μl of T rabbit reticulocyte lysate, buffer (supplied with kit) 0 0.5 μl, 2 μl of amino acid mixture (without methionine), [35S] Methoni (Amersham) 2 μl (0.37 MBq / μl), T7 RNA polymerase In a total reaction volume of 25 μl containing 0.5 μl of RNasin The reaction was performed for 0 minutes. Add 3 μl of the reaction solution to SDS sampling buffer (125 mM Squirrel HCl buffer, pH 6.8, 120 mM 2-mercaptoethanol, 2% SDS Solution, 0.025% bromophenol blue, 20% glycerol). After heating at 95 ° C for 3 minutes, SDS-polyacrylamide gel It was subjected to electrophoresis. Perform autoradiography to determine the molecular weight of the translation product Was. (7) Northern blot hybridization   Northern blot hybridization to examine expression patterns in human tissues Session. Poly (A) isolated from human tissues+Blot the RNA Was purchased from Clonetech. CDNA fragment from target clone Cleavage with appropriate restriction enzymes, isolation by agarose gel electrophoresis, and random With the primer labeling kit (Takara Shuzo), [32P] dCTP (Amarshi JAM). For hybridization, use the solution provided with the blot membrane. Was performed according to the new protocol. (8) Clone example <HP00442> (SEQ ID NOs: 1, 26, 51)   Clos obtained from human fibrosarcoma cell line HT-1080 cDNA library The total nucleotide sequence of the cDNA insert of HP00442 was determined to be 81b. p, the 618 bp ORF and the 287 bp 3 'untranslated region. The structure had ORF encodes a protein consisting of 205 amino acid residues And there were five transmembrane domains. Figure 2 shows the results obtained using the Kyte-Doolittle method. 1 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein. In vitro translation results No clear band of the translation product was observed, and a smear band was observed at the high molecular weight position. Was.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Proteolipid protein PPA1 of baker's yeast proton ATPase (SWI SS-PROT accession number P23968). Table 2 Proteolipi of human protein (HP) of the present invention and baker's yeast proton ATPase 1 shows a comparison of the amino acid sequences of human protein PPA1 (PL). − Indicates a gap , * Indicate the same amino acid residue as the protein of the present invention,. Is an amino acid similar to the protein of the present invention. Each represents an acid residue. Both have 56.8% phase over the entire region except for the N-terminus. Had the same sex.   When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having 90% or more homology and including from the start codon (eg, For example, accession number H87379) was present. I can't predict.   Proteolipid protein of baker's yeast proton ATPase is used for cell growth [Apperson, M. et al., Biochem. Biophys. Res. Commun. 16] 8: 574-579 (1990)]. Therefore, the homologue of the protein of the present invention is also Disease that is thought to be essential for the growth of It can be used for diagnosis and treatment. <HP00804> (SEQ ID NO: 2, 27, 52)   Of clone HP00804 obtained from human white blood cell cDNA library When the entire nucleotide sequence of the cDNA insert was determined, a 132 bp 5 'untranslated region was determined. With a structure consisting of an ORF of 1116 bp and a 3 'untranslated region of 576 bp Was. The ORF encodes a protein consisting of 371 amino acid residues, There was a transmembrane domain. FIG. 3 shows the protein of the present invention obtained by the method of Kyte-Doolittle. Shows a hydrophobic / hydrophilic profile. In vitro translation results in a clear translation product No band was observed.   Northern blot hybridization using the cDNA fragment of the present invention. When the expression pattern in the tissue was examined, as shown in FIG. It was shown to be expressed in all tissues. Therefore, the protein of the present invention It seems to be a keeping protein.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Rat NMDA receptor glutamate binding subunit (Genbank Accessory) (Session number S61973). Table 3 shows the human protein of the present invention. Quality (HP) and rat NMDA receptor glutamate binding subunit (RN) 1 shows a comparison of the amino acid sequences of -Indicates a gap, and * indicates the same amino acid as the protein of the present invention. Noic acid residues are represented by. Represents an amino acid residue similar to that of the protein of the present invention. This sub The unit consists of 516 amino acid residues, from the glutamine at position 68 to 342 The region up to the arginine corresponds to the C-terminal 270 amino acid residues of the protein of the present invention. It had 92.6% homology. However, no homology was found in the N-terminal region Was. The N-terminal of the protein of the present invention is rich in proline, tyrosine and glycine. Characteristic repetitive sequences were observed.   When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having a homology of 90% or more (for example, accession number W25) 936), which were shorter than the present cDNA and included from the start codon. Nothing could be found.   The rat NMDA receptor glutamate binding subunit is specifically located in the brain. One of the subunits of the existing NMDA receptor complex [Ku mar, K.N. et al., Nature 354: 70-73 (1991)]. High homology with the protein of the present invention Despite the sex, the N-terminal sequence and the expression pattern in the tissue are different, Both seem to have different functions. The protein of the present invention comprises a channel And seven transporter-specific transmembrane domains, It seems to play a role as a tunnel or transporter. The protein of the present invention Is a housekeeping protein that is essential for cells, It can be used for diagnosis and treatment of diseases caused by abnormalities. <HP01098> (SEQ ID NOs: 3, 28, 53)   CDN of clone HP01098 obtained from human gastric cancer cDNA library The total nucleotide sequence of the A insert was determined to be 61 bp of the 5 'untranslated region, 54 It had a structure consisting of a 0 bp ORF and a 475 bp 3 'untranslated region. OR F encodes a protein consisting of 179 amino acid residues and has a single transmembrane domain. Inn was present. FIG. 5 shows the hydrophobicity / parent of this protein determined by the Kyte-Doolittle method. 3 shows an aqueous profile. Molecular weight expected from ORF as a result of in vitro translation A 20 kDa translation product was generated, which approximately matched 20,625.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Canine microsomal signal peptidase 18 kDa subunit (SWISS- PROT accession number P21378). Therefore, The cDNA of the present invention comprises a microsomal signal peptidase 18 kDa subunit. It encodes a human homolog of the same.   When GenBank was searched using the nucleotide sequence of this cDNA, EST Those having 90% or more homology (for example, accession number T60549) ) Was present, but there were many unclear sequences, and the same ORF as this cDNA could not be found. Was.   The canine microsomal signal peptidase 18 kDa subunit is As one of the subunits of the signal peptidase complex [Shelness, G.S. & Blobel, G., J. Biol. Chem. 265: 9512-9519 (1990)] . Signal peptidases signal signals when secreted proteins are secreted in the endoplasmic reticulum. An enzyme that cuts a row. Therefore, the cDNA of the present invention can be used for production of the present protein, It can be used for diagnosis and treatment of diseases caused by abnormalities of the present protein. <HP01148> (SEQ ID NOs: 4, 29, 54)   CDN of clone HP01148 obtained from human liver cDNA library When the entire nucleotide sequence of the A insert was determined, a 101 bp 5 'untranslated region, 1 It had a structure consisting of a 044 bp ORF and a 446 bp 3 'untranslated region. ORF encodes a protein consisting of 347 amino acid residues and has Of the transmembrane domains. Fig. 6 shows the protein obtained by the Kyte-Doolittle method. 1 shows a hydrophobic / hydrophilic profile of N-terminal 178 amino acid residues of this protein The HindIII-PvuII fragment containing the encoding cDNA portion was cloned into pSSD3 Expression vector inserted into HindIII-PmaCI site of COS7 cells However, urokinase was not secreted, indicating that the protein remained in the membrane. Indicated. Therefore, this protein seems to be a type II membrane protein. In vitro translation As a result, 41 kDa almost coincides with the molecular weight of 38,101 predicted from the ORF. Translation product was produced.   Northern blot hybridization using the cDNA fragment of the present invention. When the expression pattern in the tissue was examined, as shown in FIG. Expression was observed. It was also shown that it was slightly expressed in the liver. When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Similarity to WC1 antigen (SWISS-PROT accession number P30205) Had. Table 4 shows the human protein (HP) and bovine WC1 antigen (WC) of the present invention. 1 shows a comparison of the amino acid sequences of -Indicates a gap, and * indicates the same amino acid as the protein of the present invention. Noic acid residues are represented by. Represents an amino acid residue similar to that of the protein of the present invention. Both are 3 It had 8% homology.   When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having a homology of 90% or more (for example, accession number H91) 200) was present, but since it is a partial sequence, it encodes the same protein as the protein of the present invention. Cannot be determined.   Bovine WC1 antigen has been found as a membrane antigen specifically expressed on γδ T cells. [Wijngaard, P.L.J. et al., J. Immunol. 149: 3273-3277 (1992)]. Similarity Indicates a scavenger receptor cysteine rich (SRCR) Domains, and other macrophage scavenger receptors [Ma tsumoto, A. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87: 9133-9137 (1990)] Vesicle differentiation antigen CD6 [Aruffo, A. et al., J. Exp. Med. 174: 949-952 (1991)] Exists as a repeating sequence. This protein must be specifically expressed in the pancreas Suggests a close relationship with pancreatic function, similar to other SRCR families, It is thought to work as a receptor. <HP01293> (SEQ ID NOs: 5, 30, 55)   CDN of clone HP01293 obtained from human liver cDNA library When the entire nucleotide sequence of the A insert was determined, 89 bp of the 5 'untranslated region, 16 It had a structure consisting of a 65 bp ORF and a 134 bp 3 'untranslated region. O RF encodes a protein consisting of 554 amino acid residues and has 12 transmembrane sites. There was a domain. Figure 8 shows the hydrophobicity of this protein determined by the Kyte-Doolittle method. / Hydrophilic profile. In vitro translation shows clear bands No smear band was observed at the high molecular weight position.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Rat cation transporter (Genbank Accession No. X7885) It had similarity with 5). Table 5 shows the human protein (HP) of the present invention and rat 2 shows a comparison of the amino acid sequences of on-transporters (RN). − Indicates a gap, * Indicates the same amino acid residue as the protein of the present invention; Is a protein of the present invention and similar amino acids Each represents a residue. Both have 78.1% homology over the entire region. Was.   GenBank was searched using the nucleotide sequence of this cDNA. None of the offspring and human ESTs with more than 90% homology were found .   Rat cation transporter is a membrane protein involved in drug excretion in the kidney [Grundemann, D. et al., Nature 372: 549-552 (1994)] ]. Therefore, the homologue of the protein of the present invention has a similar function. It can be used for diagnosis and treatment of diseases caused by this protein abnormality. it can. In addition, since this protein is thought to be involved in drug excretion, The expressed cells can be used as a tool to design these drugs. Wear. Furthermore, since this protein is mainly expressed in liver and kidney, If one has affinity for quality, drug delivery to these tissues Applicable to the family system. <HP10013> (SEQ ID NOs: 6, 31, 56)   Clone HP10 obtained from human epidermoid carcinoma cell line KB cDNA library When the entire base sequence of the cDNA insert of No. 013 was determined, a 96 bp 5 'non- A structure consisting of a translation region, an ORF of 1053 bp, and a 3 'untranslated region of 884 bp Had. ORF encodes a protein consisting of 350 amino acid residues, It had a signal sequence at the end and one transmembrane domain inside. FIG. Shows the hydrophobic / hydrophilic profile of this protein determined by the Kyte-Doolittle method. You. H containing the cDNA portion encoding the N-terminal 65 amino acid residues of the protein The indIII-EcoO65I (mung bean nuclease treated) fragment was converted to pSSD Expression vector inserted into the HindIII-EcoRV site of No. 3 was introduced into COS7 cells. As a result, urokinase activity was detected in the medium, and the N-terminus It was shown to be working. Therefore, this protein is considered to be a type I membrane protein. Will be As a result of the in vitro translation, the molecular weight estimated from the ORF was 39,008. A nearly identical translation product of 39 kDa was produced.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, the accession number H07998) was present, but none of these cDNAs Nothing was found from the start codon. <HP10034> (SEQ ID NO: 7, 32, 57)   Clos obtained from human fibrosarcoma cell line HT-1080 cDNA library The total nucleotide sequence of the cDNA insert of HP10034 was determined to be 175 bp 5 'untranslated region, 630 bp ORF, 106 bp 3' untranslated region Had the following structure. ORF encodes a protein consisting of 209 amino acid residues And there were four transmembrane domains. Figure 10 shows the Kyte-Doolittle method 2 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein determined in the above. In vitro translation results , 21 kDa translation product almost matching the predicted molecular weight of 22,432 from the ORF Things have formed.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Human tumor-associated antigen L6 (SWISS-PROT accession number P30408) And similarities. Table 6 shows that the human protein (HP) of the present invention and human tumor-associated 2 shows a comparison of the amino acid sequences of the original L6 (L6). -Indicates a gap and * indicates the protein of the present invention. Amino acid residues identical to white matter Represents a similar amino acid residue to the protein of the present invention, respectively. Represent. Both had 31.8% homology.  GenBank was searched using the nucleotide sequence of this cDNA. None of the offspring and human ESTs with more than 90% homology were found .   Human tumor-associated antigen L6 is a membrane antigen T expressed in large amounts on the cell surface of human tumors. One of the M4 superfamily proteins [Marken, J.S. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 3503-3507 (1992)]. These membrane antigens Since it is specifically expressed in cancer cells, if an antibody against it is prepared, And can be used as a carrier for drug delivery. In addition, these membrane antigens Transfected cells expressing a membrane antigen can be used for detection of the corresponding ligand it can. <HP10050> (SEQ ID NOs: 8, 33, 58)   Clos obtained from human fibrosarcoma cell line HT-1080 cDNA library The total nucleotide sequence of the cDNA insert of HP10050 was determined to be 9 bp. 5 'untranslated region, 492 bp ORF, 100 bp 3' untranslated region Had a structure. ORF encodes a protein consisting of 163 amino acid residues. And there was one transmembrane domain. Figure 11 shows the results obtained using the Kyte-Doolittle method. 1 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein. As a result of in vitro translation, O A 23 kDa translation product, which almost matches the molecular weight of 18,364 predicted from RF, Generated.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, accession number H03117) was present, but there were many unclear sequences, The same ORF as this cDNA could not be found. <HP10071> (SEQ ID NOs: 9, 34, 59)   CDN of clone HP10071 obtained from human gastric cancer cDNA library The total nucleotide sequence of the A insert was determined, and the 5 'untranslated region of 46 bp, 27 It had a structure consisting of a 9 bp ORF and a 69 bp 3 'untranslated region. ORF Encodes a protein consisting of 92 amino acid residues and has two transmembrane domains. There was. FIG. 12 shows the hydrophobicity / hydrophilicity of this protein determined by the Kyte-Doolittle method. 2 shows a gender profile. As a result of in vitro translation, the expected molecular weight 1 A 12 kDa translation product was generated, which almost matched 0.0094.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, accession number R97442) was present, but there were many unclear sequences, The same ORF as this cDNA could not be found. <HP10076> (SEQ ID NOs: 10, 35, 60)   Clone H obtained from human lymphoma cell line U937 cDNA library When the entire nucleotide sequence of the cDNA insert of P10076 was determined, it was 81 bp. It is composed of a 5 'untranslated region, a 519 bp ORF, and a 132 bp 3' untranslated region. Had a structure. ORF encodes a protein consisting of 172 amino acid residues. There were two transmembrane domains. Figure 13 shows the results obtained using the Kyte-Doolittle method. 1 shows the hydrophobic / hydrophilic profile of the present protein. N-terminal 167 amino acids of this protein No HindIII-EcoO65I (macro) containing the cDNA portion encoding the acid residue Ng bean nuclease treatment) The fragment was treated with HindIII-EcoRV part of pSSD3. Was inserted into COS7 cells, but secretion of urokinase was No protein was observed, indicating that the protein remained on the membrane. In vitro translation As a result, the translation of 24 kDa almost corresponds to the molecular weight of 18,450 predicted from the ORF. The product formed.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Baker's yeast virtual protein 23.1 kDa (SWISS-PROT accession number P 34222). Table 7 shows the human protein (HP) and the enzyme of the present invention. 2 shows a comparison of the amino acid sequence of the mother hypothetical protein 23.1 kDa (SC). − * Indicates the same amino acid residue as the protein of the present invention,. Is similar to the protein of the present invention. Each represents a amino acid residue. Both have 47.47 amino acid residues in the C-terminal region. It had 5% homology.   When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having a homology of 90% or more (for example, accession number T74). 847) was present, but there were many unclear sequences, and the same ORF as this cDNA was found. I didn't. <HP10085> (SEQ ID NOS: 11, 36, 61)   Clone H obtained from human lymphoma cell line U937 cDNA library The total nucleotide sequence of the cDNA insert of P10085 was determined to be 150 bp. A 5 'untranslated region, a 450 bp ORF, and a 97 bp 3' untranslated region. Had a structure. ORF encodes a protein consisting of 149 amino acid residues. , There was one transmembrane domain at the N-terminus. Figure 14 shows Kyte-Doolittle 1 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein determined by the method. N-terminal 5 of this protein HindIII-EcoRI containing cDNA portion encoding 7 amino acid residues (Klenow treatment) Fragment was inserted into HindIII-EcoRV site of pSSD3 The expression vector was introduced into COS7 cells, but no secretion of urokinase was observed. This protein was shown to remain on the membrane. Therefore, this protein is a type II membrane protein Seems to be quality. As a result of in vitro translation, a molecular weight of 17 307, a 20 kDa translation product was generated.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Human early activation antigen CD69 (SWISS-PROT accession number Q071) 08). Table 8 shows the human protein (HP) of the present invention and the early human phase. 3 shows a comparison of the amino acid sequences of the activation antigens CD69 (CD). − Indicates a gap, * Represents the same amino acid residue as the protein of the present invention; Is similar to the protein of the present invention Represents a group. Both have a 36.6% phase in the C-terminal 112 amino acid residue region. Had the same sex.  When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having a homology of 90% or more (for example, accession number H11) 808), but there were many unclear sequences, and the same ORF as this cDNA was found. I didn't.   Human early activation antigen CD69 appears on cell surface when stimulating lymphocytes It is a glycoprotein and one of the C-type lectin superfamily proteins [Hamann J. et al., J. Immunol. 150: 4920-4927 (1993)]. These membrane antigens have certain characteristics. Is specifically expressed in certain cells. It can be used as a carrier for drug delivery and drug delivery. Also, these membrane antigens Cells into which the gene has been expressed to express the membrane antigen can respond to detection of the corresponding ligand, etc. Can be used. <HP10122> (SEQ ID NOs: 12, 37, 62)   CDN of clone HP10122 obtained from human gastric cancer cDNA library The total nucleotide sequence of the A insert was determined, and the 138 bp 5 'untranslated region, 5 It had a structure consisting of a 67 bp ORF and a 481 bp 3 'untranslated region. O RF encodes a protein consisting of 188 amino acid residues and has two transmembrane domains. There was a main. Figure 15 shows the hydrophobicity of this protein determined by the Kyte-Doolittle method. / Hydrophilic profile. As expected from ORF as a result of in vitro translation, A translation product of 22 kDa was generated, which almost coincided with the amount of 21,175.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, accession number T80360) was present, but there were many unclear sequences, The same ORF as this cDNA could not be found. <HP10136> (SEQ ID NOs: 13, 38, 63)   Clone H obtained from human lymphoma cell line U937 cDNA library The total nucleotide sequence of the cDNA insert of P10136 was determined, It consists of a 5 'untranslated region, a 648 bp ORF, and a 680 bp 3' untranslated region. Had a structure. ORF encodes a protein consisting of 215 amino acid residues. , There was one transmembrane domain at the C-terminus. Figure 16 shows Kyte-Doolittle 1 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein determined by the method. In vitro translation As a result, a translation of 28 kDa almost coincides with the molecular weight of 24,740 predicted from the ORF. The product formed.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Baker's yeast protein transport protein SLY2 (SWISS-PROT accession number P 22214). Table 9 shows the human protein (HP) of the present invention and 2 shows a comparison of amino acid sequences of yeast protein transport protein SLY2 (SC). -Is gi * Indicates the same amino acid residue as the protein of the present invention,. Are the proteins and classes of the present invention. Each represents a similar amino acid residue. Both have 36.1% homology over the entire region Had.  When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having a homology of 90% or more (for example, accession number R80). 136) was present, but all were shorter than the present cDNA and included from the start codon. Nothing could be found.   Baker's yeast protein transport protein SLY2 transports proteins from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus And is known to be involved in cell cycle control [ Dascher, C.A. et al., Mol. Cell. Biol. 11: 872-885 (1991)]. Therefore, the book The cDNA of the present invention can be used for production of the present protein, diagnosis of diseases caused by abnormalities of the present protein, Can be used for treatment. <HP10175> (SEQ ID NOs: 14, 39, 64)   CDN of clone HP10175 obtained from human gastric cancer cDNA library When the entire base sequence of the A insert was determined, a 5 'untranslated region of 173 bp, 3 It had a structure consisting of a 39 bp ORF and a 462 bp 3 'untranslated region. O RF encodes a protein consisting of 112 amino acid residues and has four transmembrane domains. There was a main. Figure 17 shows the hydrophobicity of this protein determined by the Kyte-Doolittle method. / Hydrophilic profile. As expected from ORF as a result of in vitro translation, A 13 kDa translation product was generated, which almost coincided with the amount of 11,564.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, accession number W52852) was present, but there were many unclear sequences, The same ORF as this cDNA could not be found. <HP10179> (SEQ ID NOS: 15, 40, 65)   Clone HP10 obtained from human epidermoid carcinoma cell line KB cDNA library When the entire nucleotide sequence of the cDNA insert of 179 was determined, 121 bp of 5 ' A structure consisting of an untranslated region, a 345 bp ORF, and a 459 bp 3 'untranslated region Had. ORF encodes a protein consisting of 114 amino acid residues, There were several transmembrane domains. Figure 18 shows a book obtained by the Kyte-Doolittle method. 1 shows a hydrophobic / hydrophilic profile of a protein. ORF as a result of in vitro translation A 14 kDa translation product was generated, which almost matches the predicted molecular weight of 12,078. Was.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. However, the cDNA clone HP10 of the present invention 175 had similarity to the protein encoded by it. In Table 10, HP10179 Amino acid sequence of protein encoded by HP10175 and protein encoded by HP10175 The following shows a comparison. -Indicates a gap, * indicates the same amino acid residue as the protein of the present invention,. Represents an amino acid residue similar to that of the protein of the present invention. Both are spread across all areas Had a homology of 80.8%.When GenBank was searched using the nucleotide sequence of this cDNA, EST Among them, those having a homology of 90% or more (for example, accession number N559) 91) was present, but there were many unclear sequences, and the same ORF as this cDNA was found. Did not. <HP10196> (SEQ ID NOs: 16, 41, 66)   Clos obtained from human fibrosarcoma cell line HT-1080 cDNA library The total nucleotide sequence of the cDNA insert of HP10196 was determined to be 9 bp. 5 'untranslated region, 984 bp ORF, 122 bp 3' untranslated region Had a structure. ORF encodes a protein consisting of 327 amino acid residues. Thus, there was one transmembrane domain at the N-terminus. FIG. 19 shows Kyte-Doolittle 1 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the protein determined by the method. N-terminal of this protein HindIII-Bgl containing cDNA portion encoding 162 amino acid residues II (Klenow-treated) fragment inserted into HindIII-EcoRV site of pSSD3 The expressed expression vector was introduced into COS7 cells, but urokinase was secreted. In other words, it was shown that this protein remained on the membrane. Therefore, this protein is a type II membrane It seems to be a protein. Molecular weight expected from ORF as a result of in vitro translation A translation product of 37 kDa was generated which was almost identical to 36,163.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There were no known proteins with similarities. In addition, using the base sequence of this cDNA, When enBank was searched, ESTs with 90% or more homology (For example, accession number T17026), Nothing shorter than A and containing anything from the start codon was found. <HP10235> (SEQ ID NOs: 17, 42, 67)   Clos obtained from human fibrosarcoma cell line HT-1080 cDNA library The total nucleotide sequence of the cDNA insert of HP10235 was determined to be 5 bp. 5 'untranslated region, a 1122 bp ORF, and a 594 bp 3' untranslated region. The structure had ORF encodes a protein consisting of 373 amino acid residues And 11 transmembrane domains were present. Figure 20 shows the Kyte-Doolittle method 2 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein determined in the above. In vitro translation results No clear band was observed, and a smear band was observed at a high molecular weight position.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Similar to human nucleolar protein HNP36 (EMBL Accession No. X86681) Had the nature. Table 11 shows that the human protein (HP) of the present invention and the human nucleolar protein H 3 shows a comparison of the amino acid sequence of NP36 (NP). -Indicates a gap, and * indicates the present invention. Amino acid residues identical to the protein Represents the amino acid residues similar to those of the protein of the present invention. Represent. Both had 45.3% homology over the entire region.   When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having a homology of 90% or more (for example, accession number R57) 372) was present, but because it is a partial sequence, it codes for the same protein as the protein of the present invention. Cannot be determined.   Human nucleolar protein HNP36 plays a role in cell growth and proliferation As a gene product [Williams, J.B. & Lanahan, A.A., Bioch em.Biophys.Res.Commun. 213: 325-333 (1995)]. Therefore, its analogs The protein of the present invention is a housekeeping protein essential for cell growth and proliferation. It is thought to be white matter and is used to diagnose and treat diseases caused by abnormalities in this protein be able to. <HP10297> (SEQ ID NOs: 18, 43, 68)   CDN of clone HP10297 obtained from human gastric cancer cDNA library The total nucleotide sequence of the A insert was determined to be 62 bp of the 5 'untranslated region, 55 It had a structure consisting of a 2 bp ORF and an 890 bp 3 'untranslated region. OR F encodes a protein consisting of 183 amino acid residues and has a signal sequence at the N-terminus. The rows also had one transmembrane domain inside. Therefore, this protein is I It appears to be a type membrane protein. FIG. 21 shows the protein obtained by the Kyte-Doolittle method. 1 shows a quality hydrophobic / hydrophilic profile. As a result of in vitro translation, ORF A translation product of 24 kDa was generated, which almost matched the expected molecular weight of 20,574.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, accession number R47823) was present, but there were many unclear sequences, The same ORF as this cDNA could not be found. <HP10299> (SEQ ID NO: 19, 44, 69)   CDN of clone HP10299 obtained from human gastric cancer cDNA library The entire base sequence of the A insert was determined, and the 5 'untranslated region of 92 bp, 35 It had a structure consisting of a 1 bp ORF and an 89 bp 3 'untranslated region. ORF Encodes a protein consisting of 116 amino acid residues and has a single transmembrane Domain existed. FIG. 22 shows the sparseness of this protein determined by the Kyte-Doolittle method. 1 shows an aqueous / hydrophilic profile. Encodes the N-terminal 65 amino acid residues of this protein HindIII-VspI (Klenow-treated) fragment containing the cDNA portion The expression vector inserted into the HindIII-PmaCI site of SSD3 was Urokinase was not secreted, and the protein remained in the membrane. Rukoto has been shown. Therefore, this protein seems to be a type II membrane protein. Inn As a result of in vitro translation, the molecular weight, which is approximately equal to the predicted molecular weight of 12,498 from the ORF, is 1 A 3 kDa translation product was generated.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Baker's yeast virtual protein 16.5 kDa (SWISS-PROT accession number P 42834). Table 12 shows the human protein (HP) of the present invention and FIG. 4 shows a comparison of the amino acid sequences of the baker's yeast hypothetical protein 16.5 kDa (SC). − Is Gap, * indicates the same amino acid residue as the protein of the present invention,. Is the protein of the present invention. Each represents a similar amino acid residue. Both are 5 in the region of the C-terminal 66 amino acid residues. It had a homology of 3.0%.  When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having a homology of 90% or more (for example, accession number R27). 748) was present, but there were many unclear sequences, and the same ORF as this cDNA was found. I didn't. <HP10301> (SEQ ID NOs: 20, 45, 70)   Clone HP10 obtained from human epidermoid carcinoma cell line KB cDNA library When the entire nucleotide sequence of the cDNA insert 301 was determined, 91 bp of the 5 'non- It has a structure consisting of a translated region, a 459 bp ORF, and a 112 bp 3 'untranslated region. Was. ORF encodes a protein consisting of 152 amino acid residues, There were several transmembrane domains. FIG. 23 shows the present protein obtained by the Kyte-Doolittle method. 1 shows a hydrophobic / hydrophilic profile of white matter. In vitro translation results from ORF An 18 kDa translation product was generated, which approximately matched the expected molecular weight of 16,516. .   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, accession number N28828) was present, but there were many unclear sequences, The same ORF as this cDNA could not be found. <HP10302> (SEQ ID NOs: 21, 46, 71)   CDN of clone HP10302 obtained from human liver cDNA library The entire base sequence of the A insert was determined, and the 133 bp 5 'untranslated region, 1 It had a structure consisting of a 680 bp ORF and a 560 bp 3 'untranslated region. The ORF encodes a protein consisting of 559 amino acid residues and has 12 transmembrane sites. Domain existed. FIG. 24 shows the sparseness of this protein determined by the Kyte-Doolittle method. 1 shows an aqueous / hydrophilic profile. In vitro translation shows clear bands No smear band was observed at the high molecular weight position.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, accession number N72434) was present, Nothing was found from the start codon. <HP10304> (SEQ ID NOS: 22, 47, 72)   Clone H obtained from human osteosarcoma cell line U-2 OS cDNA library When the entire nucleotide sequence of the cDNA insert of P10304 was determined, A structure consisting of a 5 'untranslated region, a 993 bp ORF and a 313 bp 3' untranslated region Had a structure. ORF encodes a protein consisting of 330 amino acid residues , A signal sequence at the N-terminus and one transmembrane domain inside. Therefore, it is considered that the present protein is a type I membrane protein. FIG. 25 shows Kyte-Doolittle 2 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein determined by the method described above. In vitro translation As a result, a 36 kDa molecular weight almost matching the molecular weight of 36,840 predicted from the ORF A translation product was generated.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There is no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, the accession number N26840) was present, but the same OR F could not be found. <HP10305> (SEQ ID NOS: 23, 48, 73)   Clone H obtained from human osteosarcoma cell line U-2 OS cDNA library When the entire nucleotide sequence of the cDNA insert of P10305 was determined, it was 109 bp. 5 'untranslated region, a 327 bp ORF, and a 457 bp 3' untranslated region Had a structure. The ORF encodes a protein consisting of 108 amino acid residues. And there was one transmembrane domain. Figure 26 shows the results obtained using the Kyte-Doolittle method. 1 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein. N-terminal 162 a of the protein HindIII-ApaI (man) containing the cDNA portion encoding the amino acid residue The fragment was treated with HindIII-PmaCI site of pSSD3. Was introduced into COS7 cells, but secretion of urokinase was observed. It was shown that the protein remained on the membrane. Therefore, this protein is I It appears to be a type I membrane protein. In vitro translation results, expected from ORF A translation product of 15 kDa was generated, which almost coincided with the molecular weight of 12,199.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs having a homology of 90% or more ( For example, accession number H02768) was present, but there were many unclear sequences, The same ORF as this cDNA could not be found. <HP10306> (SEQ ID NOS: 24, 49, 74)   Clone H obtained from human osteosarcoma cell line U-2 OS cDNA library The total nucleotide sequence of the cDNA insert of P10306 was determined to be 229 bp. 5 'untranslated region, 306 bp ORF, 155 bp 3' untranslated region Had a structure. ORF encodes a protein consisting of 101 amino acid residues. And there were two transmembrane domains. Figure 27 shows the results obtained using the Kyte-Doolittle method. 1 shows the hydrophobicity / hydrophilicity profile of the present protein. As a result of in vitro translation, O A 14 kDa translation product which almost matches the molecular weight of 12,029 predicted from RF Generated.   A protein database was searched using the amino acid sequence of this protein. There was no known protein having any properties. In addition, using the base sequence of this cDNA, Gen When a bank was searched, ESTs with 90% or more homology (Eg, accession number H44711), but many unclear sequences The same ORF as this cDNA could not be found. <HP10328> (SEQ ID NOS: 25, 50, 75)   Clone HP10 obtained from human epidermoid carcinoma cell line KB cDNA library When the entire base sequence of the 328 cDNA insert was determined, 117 bp of 5 ' Structure comprising an untranslated region, an ORF of 1119 bp, and a 3 'untranslated region of 950 bp Had. ORF encodes a protein consisting of 372 amino acid residues, There was one transmembrane domain. Figure 28 shows the results obtained by the Kyte-Doolittle method. 1 shows the hydrophobic / hydrophilic profile of the protein. N-terminal 129 amino acids of this protein The HindIII-PmaCI fragment containing the cDNA portion encoding the acid residue was An expression vector inserted into the HindIII-SmaI site of SSD3 was transformed into COS7 cells. Urokinase is not secreted, and the protein remains on the membrane It was shown that. Therefore, this protein seems to be a type II membrane protein. Imbi As a result of the Toro translation, the molecular weight almost matches the predicted molecular weight of 42,514 41 A translation product of kDa was produced.   When a protein database was searched using the amino acid sequence of this protein, Drosophila neuronal secretory signal protein (GenBank accession number U4 1449). Table 13 shows the human protein (HP) of the present invention and 2 shows a comparison of the amino acid sequences of Drosophila neuronal secretory signal protein (DM). − Indicates a gap, * indicates the same amino acid residue as the protein of the present invention,. Is the protein of the present invention And similar amino acid residues, respectively. Both are 3 residues at 202 amino acid residues in the middle region. It had 8.6% homology.  When GenBank was searched using the base sequence of this cDNA, T having a homology of 90% or more (for example, accession number R75) 815) was present, but all were shorter than the present cDNA and included from the start codon. Nothing could be found.   The present invention relates to a human protein having a transmembrane domain, and a c protein encoding the same. DNA is provided. Since all of the proteins of the present invention exist in the cell membrane, It is considered a protein that controls proliferation and differentiation. Therefore, the protein of the present invention , As a pharmaceutical, or as an antigen for producing an antibody against the protein Can be. The cDNA of the present invention can be used as a probe for gene diagnosis or for gene therapy. It can be used as a gene source. In addition, by using the DNA, the protein White matter can be expressed in large quantities. By introducing these membrane protein genes, Cells expressing a large amount of are used to detect the corresponding ligand, It can be applied to training.   In addition to the activities and uses described above, polynucleotides and proteins of the invention Is defined as the use or biological activity defined below (for the assays described herein). One or more). The use described for the protein of the invention or Is determined by administration or use of such a protein, or Administration or use of a polynucleotide encoding (eg, gene therapy or D) (In a vector suitable for the introduction of NA).   Research use and usefulness   The polynucleotide provided by the present invention can be used for various purposes in the research field. Can be used. This polynucleotide can be used for analysis, qualitative or therapeutic use. The corresponding protein (structurally Or at a particular stage of tissue differentiation or development, or in a disease state ) As markers for selectively expressed tissues; molecular weight markers on Southern gels As chromosome markers to identify chromosomes or locate related gene loci Or as a tag (if labeled); to identify potential genetic disorders For comparison with the patient's endogenous DNA sequence; As a probe to find relevant DNA sequences; gene fingers As a source of information for deriving PCR primers for printing; other novel polynucleotides As a probe to "pull" known sequences in the process of finding nucleotides; Select and select oligomers for attachment to a "gene chip" or other support To manufacture (this also includes examining expression patterns); DNA immunization techniques To produce an anti-protein antibody using the method; and to produce an anti-DNA antibody Or can be used as an antigen to elicit other immune responses You. A protein to which a polynucleotide binds or can bind to another protein (Eg, in a receptor-ligand interaction) The oligonucleotides can be used in an interaction trap assay (eg, Gyuris et al., Cell 75: 791-803 (1993)) encodes another protein that binds Identify polynucleotides or identify inhibitors of binding interactions .   The protein provided by the present invention can also be used in assays to Determine biological activity in a panel of multiplex proteins for put screening To produce antibodies or elicit other immune responses; biological fluids For quantitatively measuring protein (or its receptor) levels in the body As reagents (including labeling reagents) in assays made for Quality (either structurally or at a particular stage of tissue differentiation or development, or disease As a marker for a tissue that is selectively expressed (in the disease state); and However, it can be used to isolate correlated receptors or ligands . When a protein is or can bind to another protein (eg, Identify other proteins that bind (eg, in receptor-ligand interactions) Alternatively, inhibitors of the binding interaction can be identified. In addition, these bonded phases With proteins involved in interactions, peptides or small molecules in binding interactions Inhibitors or agonists can be screened.   Some or all of these research uses may be reagent gray products that are commercially available as research products. In kit or kit form.   Uses for the above-listed applications are well known by those skilled in the art. Such person References disclosing the method are "Molecular Cloning: A Laboratory Manual", Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Sambrook, J., E.F.Fritsch and T. Maniatis eds., 1989, and `` Methods in Enzymology: Guide to Molecular Cloni ng Techniques ", Academic Press, Berger, S.L. and A.R.Kimmel ed., 1987 Including without limit.   Use as a nutritional supplement   The polynucleotides and proteins of the present invention may also be used as a nutritional source or supplement. Can be used. Such use is intended as a protein or amino acid supplement. Use as a carbon source, use as a nitrogen source, and as a carbohydrate source Including without limitation the use of In such a case, the protein or polynucleotide of the present invention Otides can be added to the diet of a particular organism or can be added to isolated solid or liquid formulations. And can be administered, for example, in the form of powders, pills, solutions, suspensions, or capsules. it can. In the case of a microorganism, the protein or polynucleotide of the present invention is a microorganism or microorganism. Can be added in or on the cultured medium.   Cytokines and cell proliferation / differentiation activity   The proteins of the present invention may be cytokines, cell proliferation (either induced or inhibited). ) Or cell differentiation (either induction or inhibition) activity, or specific Can induce the production of other cytokines. All known sites Many protein factors that have been discovered to date, including Active in the cell-dependent cell proliferation assay, It is useful for confirming the activity of Caine. The activity of the protein of the present invention is 32D, DA2, DA1G, T10, B9, B9 / 11, BaF3, MC9 / G, M + ( Pre-B M +), 2E8, RB5, DA1, 123, T1165, HT2, CT A number of cell lines, including, without limitation, LL2, TF-1, Mo7e and CMK As determined by any one of the factor-dependent cell proliferation assays.   The activity of the protein of the invention can be measured, inter alia, by the following method:   T cell or thymocyte proliferation assays are not limited to those described below. Including: Current Protocols in Immunology, J.E.Coligan, A.M.Kruisbeek, D.H.M argulies, E.M.Shevach, W Strober, Pub.Greene Publishing Associates and W iley-Interscience (Chapter 3, In Vitro assays for Mouse Lymphocyte Function 3.1-3.19; Chapter 7, Immunologic studies in Humans); Takai et al., J. Immunol .137: 3494-3500,1986; Bertagnolli et al., J. Immunol. 145: 1706-1712,1990; Ber tagnolli et al., Cellular Immunology 133: 327-341,1991; Bertagnolli, et al. J. Immunol. 149: 3778-3783, 1992; Bowman et al. , J. Immunol. 152: 1756-1761,1 994.   Cytokine production and / or increase of spleen cells, lymph node cells or thymocytes Proliferation assays include, but are not limited to, those listed below: Polyclonal T cell stimulaion, Kruisbeek, A.M. and Shevac, E.M., Current Protocols in Immun ology.J.E.e.a. Edited by Coligan, Vol 1 p.3.12.1-3.12.14, John Wiley and Sons, Tor onto. 1994; and Measurement of mouse and human interleukinγ, Schreiber , R.D., Current Protocols in Immunology, edited by J.E.e.a.Coligan, Vol. 1 p.6.8.1-6 .8.8, John Wiley and Sons, Fronto. 1994.   Hematopoietic and lymphopoietic cell proliferation and differentiation assays are described below. Including without limitation: Measurement of Human and Murine Interleukin 2 and Interl eukin 4, Bottomly, K., Davis, L.S. and Lipsky, P.E., Current Protocols in I mmunology, edited by J.E.e.a.Coligan, Vol. 1 p.6.3.1-6.3.12, John Wiley and Sons, T. ronto. 1991; deVries et al., J. Exp. Med. 173: 1205-11211, 1991; Moreau et al., N. ature 336: 690-692, 1988; Greenberger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 2 931-2938,1983; Measurement of mouse and human interleukin 6-Nordan, R., Cu rrent Protocols in Immunology, edited by J.E.e.a.Coligan, Vol 1 p. 6.6.1-6.6.5, Joh n Wiley and Sons, Toronto 1991; Smith et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 1857-1861, 1986; Measurement of human Interleukin 11-Bennett, F., Giannotti , J., Clark, S.C. and Turner, K.J., Current Protocols in Immunology, J.E.e.a. Ed. Coligan, Vol. 1 p. 6.15.1 John Wiley and Sons, Fronto. 1991; Measurement of mouse and human Interleukin 9-Ciarletta, A., Giannotti, J., Clark, S.C.a nd Turner, K.J., Current Protocols in Immunology, J.E.e.a.Coligan, Vol. 1 p.6.13.1, John Wiley and Sons, Fronto. 1991.   T cell clonal response assay for antigens (this amongst others, APC- Affect T cell interactions and measure proliferation and cytokine production And thereby identify a protein that directs the T cell effect). Including, without limitation: Current Protocols in Immunology, J.E.Coligan, A.M., Kru isbeek, D.H., Margulies, E.M., Shevach, W Strober, Pub.Greene Publishing A ssociates and Wiley-Interscience (Chapter 3, In Vitro assays for Mouse Lymph Cellocyte Function; Chapter 6, Cytokines and their cellular receptors; Chapter 7, Im munologic studies in Humans); Weinberger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 6091-6095,1980; Weinberger et al., Eur.J.Immun. 11: 405-411,1981; Tak ai et al., J. Immunol. 137: 3494-3500, 1986; Takai et al., J. Immunol. 140: 508 -512,1988.   Immunostimulatory or suppressive activity   The proteins of the invention also include without limitation the activity of the assays described herein. , May also exhibit immunostimulatory or immunosuppressive activity. Proteins are involved in various immunodeficiencies and And disorders (including severe combined immunodeficiency (SCID)), such as T and / or Or control the growth and proliferation of B lymphocytes (up or down) and NK cells and And may affect the cytotoxic activity of other cell populations. These exemptions Plasmid deficiency can be genetic or caused by viruses (eg, HIV) and cells. Can be caused by a fungal or fungal infection or can result from an autoimmune disease . More specifically, caused by a virus, bacteria, fungus or other infection Infectious diseases (this includes HIV, hepatitis virus, herpes virus, mycobacteria And various fungal infections such as Leishmania, malaria, and candidiasis. May be treatable using the proteins of the present invention. Of course, from this perspective Furthermore, the proteins of the present invention may also be useful when enhancing the immune system is generally desired, i.e. That may be useful in the treatment of cancer.   Autoimmune diseases that can be treated using the proteins of the invention include, for example, connective tissue diseases. , Multiple sclerosis, systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis, autoimmune pneumonia , Guillain-Barre syndrome, autoimmune thyroiditis, insulin-dependent diabetes, severe Includes myasthenia gravis, graft-versus-host disease and autoimmune eye disease. Of the present invention Proteins can also be found in other sources such as asthma (particularly allergic asthma) or other respiratory disorders. It may be useful in treating allergic reactions and symptoms. Other symptoms for which immunosuppression is desired (Including, for example, organ transplants) can also be treated with the proteins of the invention. Can get.   Using the protein of the present invention, it is possible to suppress the immune response in various ways. is there. Downregulation inhibits or blocks the immune response already in progress. Or may be involved in preventing the induction of an immune response. Activity The function of sexualized T cells may be by suppressing T cell responses or by T cell specific It can be inhibited by inducing resistance, or both. T cell response Immunosuppression is generally an active, non-antigen-specific process that involves T cell Need to be in continuous contact with the inhibitor. Non-response or a Resistances involved in the induction of energy are generally antigen-specific, and exposure to inhibitors Is different from immunosuppression in that it persists after cessation. At the time of surgery, Lack of T cell response when re-contacted with specific antigen in the absence This can demonstrate resistance.   One or more antigen functions (including, without limitation, B lymphocyte antigen functions (eg, B7)) Down-regulation or inhibition of, eg, high levels of Inhibition of lymphokine synthesis depends on the status of tissue, skin and organ transplantation and graft versus host Useful for diseases (GVHD). For example, by blocking T cell function, tissue transplantation Tissue destruction is reduced. Typically, in tissue transplants, graft rejection is Beginning through the recognition of foreign bodies by T cells, then an immune response that destroys the graft Occur. Inhibits the interaction of B7 lymphocyte antigen with natural ligand on immune cells or Can be administered by administering a blocking molecule prior to transplantation (eg, having only B7-2 activity). A soluble monomeric form of the peptide, or another B lymphocyte antigen (eg, B7- 1, B7-3) or a monomeric form of a peptide having the activity of a blocking antibody Without transmitting the corresponding costimulatory signal) Of natural ligands. Thus, B lymphocyte antigen function is blocked. This would prevent cytokine synthesis by immune cells such as T cells, Acts as an immunosuppressant. Furthermore, the lack of costimulation reduces T cell immunity. Enough to make the general body resistant. By B lymphocyte antigen blocker Induction of long-term tolerance eliminates the need for repeated administration of these blockers is there. Combined B-lymphocyte antigen machinery for the general body to obtain sufficient immunosuppression or tolerance It may be necessary to interrupt the ability.   The efficacy of certain blocking agents to prevent organ transplant rejection or GVHD is Can be measured using animal models that are expected. Examples of suitable systems that can be used are Allogeneic heart grafts in mice and xenogeneic pancreatic islet cell grafts in mice Using both, Lenschow et al., Science 257: 789-792 (1992) and Turk a et al., Proc. Natl. Acad. Sci USA, 89: 11102-11105 (1992). Bi The immunosuppressive effect of the CTLA4Ig fusion protein in vivo is examined. Furthermore, G A rat model of VHD (Paul, Fundamental Immunology, Raven Press, New Y ork, 1989, pp. 846-847) using B in vivo at the onset of the disease. The blocking effect of lymphocyte antigen function can be determined.   Antigen function blockade may also be therapeutically useful for treating autoimmune diseases. Many Autoimmune diseases are caused by inappropriate inactivation of T cells that are reactive to self tissue. Here, the production of cytokines and autoantibodies involved in the pathogenesis of the disease Life is promoted. Preventing activation of self-reactive T cells reduces signs of disease Or may disappear. B lymphocyte antigen receptor: inhibits ligand interaction Thus, administration of a reagent that blocks costimulation of T cells inhibits T cell activation. Prevents the production of autoantibodies or T cell-derived cytokines that may be involved in the history of the disease be able to. In addition, blocking agents induce antigen-specific resistance of autoreactive T cells. Can lead to long term disease relief. Prevention of autoimmune diseases Or the efficacy of blockers in alleviation is well characterized for many human autoimmune diseases Can be determined using an animal model. An example is the rat experimental self-immunity Epidemic encephalitis, MRL / lpr / lpr mice or NZB hybrid mice Systemic lupus erythematosus, murine autoimmune collagen arthritis, NOD mau In diabetic and BB rats and experimental myasthenia gravis in rats (Paul , Fundamental Immunology, Raven Press, New York, 1989, pp. 840-856). Including.   Antigen function (preferably as a means of up-regulating the immune response) Up-regulation of B lymphocyte antigen function) can also be useful in therapy You. Up-regulation of the immune response enhances or maximizes the existing immune response. It may be a form that develops an initial immune response. For example, stimulate B lymphocyte antigen function Boosting the immune response can be useful in the case of a viral infection. You. In addition, systemic viral diseases such as influenza, colds and encephalitis are It can be reduced by systemic administration of the lymphocyte antigen in a stimulating form.   In addition, anti-viral immune response is based on removing T cells from patients in infected patients. , A T cell expressing the peptide of the invention in vitro, or the T cell of the invention. thorn Co-stimulation with viral antigen-pulsed APC with the intense form of soluble peptide It can be enhanced by reintroducing the in vitro activated T cells into the patient. Antivirus Another way to boost the immune response is to isolate infected cells from the patient and allow the cells to In order to express the protein in whole or in part, Transfected with nucleic acid encoding the protein, Is to reintroduce the cells into the patient. Here, the infected cells are Can be transmitted to T cells, and thus T cells can be transmitted in vivo. Vesicles can be activated.   In another application, upregulation of antigen function (preferably B lymphocyte antigen function) Modulation or enhancement may be beneficial in inducing tumor immunity. At least one Tumor cells transfected with a nucleic acid encoding a peptide of the invention Vesicles (eg, sarcomas, melanomas, lymphomas, leukemias, neuroblastomas, cancers) Can be generally administered to overcome tumor specific resistance. If desired Can also transfect tumor cells to express the combined peptide it can. For example, tumor cells obtained from a patient can be transformed in vitro with only B7-2-like activity. Using an expression vector directed to the expression of a peptide having B7-1 or B7-1-like activity And / or transfection in combination with a peptide having B7-3-like activity Can be When the transfected tumor cells are returned to the patient, The peptide is expressed on the surface of the transfected cells. Also gene therapy Using technology to target transfected tumor cells in vivo be able to.   The presence of the peptide of the present invention having B lymphocyte antigen activity on the surface of tumor cells Provides the necessary co-stimulatory signal to T cells, A T cell mediated immune response is induced against the tumor cells. In addition, MHC class I or Or MHC class II molecules are deleted or sufficient MHC class I or MH Tumor cells that are unable to reexpress C class II molecules are MHC class I α chain proteins and And βTwoMicroglobulin protein or MHC class II α chain protein or And nucleic acids encoding all or part of MHC class II β chain protein Transfected, and thus MHC class I or MHC on the cell surface Class II proteins can be expressed. B lymphocyte antigen (eg, B7 -1, B7-2, B7-3) Suitable classes in combination with peptides having activity Expression of I or class II MHC is expressed in T cells on transfected tumor cells. Induces a vesicle-mediated immune response. If desired, MHC class II related proteins such as invariant chains The gene encoding the antisense construct that blocks expression of the protein is also Cotransfection using DNA encoding a peptide having papocyte antigen activity Stimulates the presentation of tumor-associated antigens and induces tumor-specific immunity Can be. Thus, induction of a T cell-mediated immune response in the human body is not May be sufficient to overcome such tumor-specific resistance.   The activity of the protein of the invention can be measured, inter alia, by the following method:   Suitable assays for thymocyte or spleen cytotoxicity include those described below. Including, without limitation: Current Protocols in Immunology, J.E.Coligan, A.M., Kru Isbeek, D.H., Margulies, E.M., Shevach, W Strober, Pub. Greene Publishing  Associates and Wiley-Interscience (Chapter 3, In Vitro assays for Mouse Lym phocyte Function 3.1-3.19; Chapter 7, Immunologic studies in Humans); Herrma nn et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78: 2488-2492, 1981; Herrmann et al., J.I. mmunol. 128: 1968-1974, 1982; Handa et al., J. Immunol. 135: 1564-1572, 1985; Tak ai et al., J. Immunol. 137: 3494-3500, 1986; Takai et al., J. Immunol. 140: 508- 512, 1988; Herrmann et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78: 2488-2492, 1981; Herrm ann et al., J. Immunol. 128: 1968-1974, 1982; Handa et al., J. Immunol. 135: 156 4-1572, 1985; Takai et al., J. Immunol. 137: 3494-3500, 1986; Bowman et al., J. V. irology 61: 1992-1998; Takai et al., J. Immunol. 140: 508-512,1988; Bertagnoll i et al., Cellular Immunology 133: 327-341,1991; Brown et al., J. Immunol. 1 53: 3079-3092, 1994.   T cell dependent immunoglobulin response and isotype switching (this allows Modulates, inter alia, T cell-dependent antibody responses and affects Thl / Th2 profiles. Assays to identify proteins that affect Including: Maliszewski, J. Immunol. 144: 3028-3033, 1990; and Assays for Bcel l function: In vitro antibody production, Mond, J.J. and Brunswick, M, Curre nt Protocols in Imrnunology, edited by J.E.e.a.Coligan, Vol. 1 p.3.8.1-3.8.16, John  Wiley and Sons, Toronto, 1994.   Mixed lymphocyte reaction (MLR) assay (which, inter alia, preferentially 1 and proteins that cause a CTL response are identified) Including, without limitation: Current Protocols in Immunology, J.E. Coligan, A.M.Kru isbeek, D.H.Margulies, E.M.Shevach, W Strober, Pub.Greene Publishing Ass ociates and Wiley-Interscience (Chapter 3, In Vitro assays for Mouse Lymphoc yte Function 3.1-3.19; Chapter 7, Immunologic studies in Humans); Takai et a l., J. Immunol. 137: 3494-3500, 1986; Takai et al., J. Immunol. 140: 508-512, 198. 8; Bertagnolli et al., J. Immunol. 149: 3778-3783, 1992.   Dendritic cell-dependent assays, which include, inter alia, trees that activate native T cells Proteins identified by dendritic cells) are limited to those described below Including: Guery et al., J. Immunol. 134: 536-544, 1995; Inaba et al., Journal  of Experimental Medicine 173: 549-559, 1991; Macatonia et al., Journal of  Immunology 154: 5071-5079, 1995; Porgador et al., Journal of Experimental Medicine 182: 255-260, 1995; Nair et al., Journal of Virology 67: 4062-4069 , 1993; Huang et al., Science 264: 961-965, 1994; Macatonia et al., Journal o. f Experimental Medicinel 69: 1255-1264,1989; Bhardwaj et al., Journal of C linical Investigation 94: 797-807, 1994; and Inaba et al., Journal of Exp erimental Medicine 172: 631-640, 1990.   Lymphocyte survival / apoptosis (this is especially true after superantigen transfer) Proteins that prevent apoptosis and proteins that regulate lymphocyte homeostasis Are identified without limitation, including: Darzynkiewicz et a l., Cytometry 13: 795-808,1992; Gorczyca et al., Leukemia 7: 659-670,1993; G orczyca et al., Cancer Research 53: 1945-1951, 1993; Itoh et al., Cell 66: 2 33-243, 1991; Zacharchuk, Journal of Immunology 145: 4037-4045, 1990; Zamai t al., Cytometry 14: 891-897, 1993; Gorczyca et al., International Journal of Oncology1: 639-648,1992.   Assays for proteins that affect T cell commitment and early stages of development include: Including but not limited to: Antica et al., Blood 84: 111-117, 1994; Fine et al., Cellular Imminology 155: 111-122, 1994; Galy et al. , Blood 85: 2770 -2778, 1995; Toki et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 7548-7551, 1991.   Hematopoietic regulatory activity   The proteins of the present invention are useful for hematopoietic regulation and, consequently, in the bone marrow or lymphatic system. It may be useful for treating cell disorders. For colony forming cells or factor-dependent cell lines Even the slightest biological activity involved, for example alone or with other cytokines Involved in hematopoietic regulation, such as supporting the growth and proliferation of erythroid progenitor cells in combination And thus, for example, in the treatment of various anemias or in irradiation / Stimulates production of erythroid progenitors and / or erythroid cells in combination with chemotherapy For use in the treatment of bone marrow depression that results in combination with, for example, chemotherapy Granulocytes and monocytes / macrophages useful for prevention or treatment (ie, classical CSF activity) to support the growth and proliferation of bone marrow cells; megakaryocytes and consequently Supports platelet growth and proliferation by supporting various blood vessels such as thrombocytopenia Prevent or treat plate disorders and generally replace platelet transfusions or And / or mature to any or all of the above hematopoietic cells Therefore, various stem cell disorders (aplastic anemia and paroxysmal nocturnal hemoglobinuria) Hematopoietic stem cells that have therapeutic utility, including, without limitation, those normally treated by transplantation To support the growth and proliferation of, and in vivo or in vitro (ie, bone marrow transplantation) Or in combination with peripheral progenitor cell transplantation (allogeneic or xenogeneic) Irradiation of stem cell compartment as cells genetically engineered by gene therapy / chemotherapy Demonstrates usefulness for later reassembly.   The protein of the invention can be measured, inter alia, by the following method:   Suitable proliferation and differentiation assays for various hematopoietic systems are set forth above.   Embryonic stem cell differentiation assays, which include, inter alia, Proteins are identified) include, but are not limited to, those described below: Johansson et a l. Cellular Biology 15: 141-151, 1995; Keller et al., Molecular and Cellular  Biology 13: 473-486, 1993; McClanahan et al., Blood 81: 2903-2915,1993.   Stem cell survival and differentiation assays, which, among other things, regulate Are identified, without limitation, include: Methyl  cellulose colony forming assays, Freshney, M.G., Culture of Hematopoieti c Cells, R.I.Freshney, et al. eds.Vol. 265-268, Wiley-Liss, Inc., New York, NY.1994; Hirayama et al., Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89: 5907-5911,1992; Primit ive hematopoietic colony forming cells with high proliferative potential McNiece, I.K. and Briddell, R.A., Culture of Hematopoietic Cells, R.I.Fr eshney, et al., Vol. p. 23-39, Wiley-Liss, Inc., New York, NY. 1994; Neben et a. l., Experimental Hematology 22: 353-359, 1994; Cobblestone area forming cel l assay, Ploemacher, R.E., Culture of Hematopoietic Cells, R.I.Freshney, e t al. ed.Vol p.1-21, Wiley-Liss, Inc., New York, NY.1994; Long term bone marr ow cultures in the presence of stromal cells, Spooncer, E., Dexter, M. and Allen, T., Culture of Hematopoietic Cells, R.I.Freshney, et al., Vol. 163 -179, Wiley-Liss, Inc., New York, NY. 1994; Long term culture initiating cel l assay, Sutherland, H.J., Culture of Hematopoietic Cells, R.I.Freshney, et al. eds. Vol. pp. 139-162, Wiley-Liss, Inc., New York, NY. 1994.   Tissue growth activity   The protein of the present invention may also be used for bone, cartilage, tendon, ligament and / or neural tissue growth. Or compositions used for regeneration and wound healing and tissue repair and replacement, and It may show utility in treating burns, incisions and ulcers.   Books that induce cartilage and / or bone growth in an environment where bone is not normally formed The proteins of the invention are useful in humans and other animals for fracture and cartilage injury or Applied to deficiency healing. Such a formulation using the protein of the present invention can be used for subcutaneous bone It can be used prophylactically for healing of open and open fractures and for promoting fixation of artificial joints. Novel bone formation induced by osteogenic agents can be congenital, traumatic, or induce tumor resection It contributes to the healing of skeletal wounds and is also useful in cosmetic plastic surgery.   The proteins of the present invention may also be used in the treatment of periodontal disease, and in other dental treatment processes. obtain. Such agents may attract, stimulate, or otherwise induce osteogenic cells. Alternatively, it can provide an environment for inducing osteogenic ancestral cell differentiation. The protein of the present invention It may also stimulate bone and / or cartilage repair or mediate inflammatory processes. Block the process of inflammation or tissue destruction (collagenase activity, osteoclast activity, etc.) This may be useful for treating osteoporosis or osteoarthritis.   Another category of tissue regeneration activity that can be attributed to the proteins of the invention is tendon / ligament Is the formation. Tendon / ligament-like tissue or other tissue formation, usually such tissue is formed The protein of the present invention, which is induced in an environment free of Or applied to ligament destruction, deformation and healing of other tendon or ligament disorders. Tendon / tough Such preparations using zonal tissue-inducing proteins can protect against injury to tendon or ligament tissue. Protection of bones and the fixation of tendons or ligaments to bone or other tissues, Or it can be used prophylactically to heal ligament tissue injury. With the composition of the present invention Induced new tendon / ligament-like tissue formation may be congenital, traumatic, or of other origin. Contributes to the healing of tendon or ligament disorders, It is also useful in cosmetic plastic surgery. The composition of the present invention may be used for tendon or ligament formation. Attract cells, stimulate growth of tendon or ligament forming cells, tendon or ligament To induce the differentiation of the ancestors of the forming cells, or To provide an environment for inducing the growth of tendon / ligament cells or ancestors in vitro. Book The compositions of the invention are also useful in the treatment of tendinitis, root canal syndrome and other tendon or ligament disorders. Can be useful. The composition can also be made of a suitable matrix, as is well known in the art. The matrix may include a sequestering agent as a trick and / or carrier.   The proteins of the present invention may also be used for nerve cell proliferation and nerve and brain tissue regeneration, That is, central and peripheral nervous system diseases and neuropathy, and mechanical and Of traumatic disease (including degeneration, necrosis or trauma of nerve cells or nerve tissue) It may be useful for treatment. More specifically, the protein is, for example, peripheral nerve injury, Peripheral nervous system disorders such as peripheral and regional neuropathy, and Alzheimer's, Parkinson's disease, Huntington's chorea, amyotrophic lateral sclerosis And central nervous system diseases such as Shy-Drager syndrome. Another condition that can be treated according to the present invention is brain disorders such as spinal cord injury, head trauma, and stroke. Includes mechanical and traumatic disorders such as vascular disorders. Chemotherapy or other medical therapy -Induced peripheral neuropathy can also be treated with the protein of the invention It is.   The proteins of the present invention may also be used for pressure ulcers, ulcers associated with vascular disorders, Promotes faster healing of unhealed wounds, including without limitation, wounds and traumatic wounds It may be useful to proceed.   The protein of the present invention is used for organs (eg, pancreas, liver, intestine, kidney, skin, endothelium). Muscle) (including smooth, skeletal or cardiac muscle) and vascular (including vascular endothelium) tissue Promote the production or regeneration of other tissues, such as, or the growth of cells containing such tissues Activity. Some of the desired effects include linear wounds as normal tissue regenerates Can be obtained by inhibiting or regulating The proteins of the present invention also It may also exhibit neoplastic activity.   The proteins of the present invention may also be used to protect or regenerate gastrointestinal Treatment, reperfusion injury in various tissues, and systemic cytokine injury It may be useful for the symptoms that are caused.   The protein of the present invention also promotes the differentiation of the aforementioned tissue from precursor tissue or cells. May be useful to promote or inhibit or to inhibit the growth of the above tissues .   The activity of the protein of the invention can be measured, inter alia, by the following method:   Tissue generating activity assays include, without limitation, those described below: International Patent Publication No. WO95 / 16035 (bone, cartilage, tendon); International Patent Publication No. WO95 / 05846 (nerve, International Patent Publication No. WO 91/07491 (skin, endothelium).   Wound healing activity assays include, without limitation, those described below: Winter,Epider mal Wound Healing , P.71-112 (Maibach, HI and Rovee, DT), Year Book Medica l Publishers, Inc., Chicago, which is Eaglstein and Mertz, J., Invest. l 71: 382-84 (1978).   Activin / inhibin activity   The proteins of the invention may also exhibit activin or inhibin related activity . Inhibin is characterized by its ability to inhibit follicle stimulating hormone (FSH) release, Activin, on the other hand, is characterized by its ability to stimulate follicle stimulating hormone (FSH) release. It is. Therefore, the protein of the present invention may be used alone or in the inhibin α family. In the form of a heterodimer with one of the Useful as a contraceptive based on inhibin efficacy to reduce spermatogenesis in mammals for Can be Administering a sufficient amount of another inhibin to these mammals Can induce contraception. Also, homodimers or other inhibin- The protein of the present invention, which is a heterodimer with a β-subunit protein subunit Is based on the ability of activin molecules to stimulate FSH release from anterior pituitary cells, It may be useful as a reproduction-inducing therapeutic. See, for example, U.S. Patent 4,798,885. The present invention Proteins are also involved in the reproductive behavior of livestock animals such as cattle, sheep and pigs. To accelerate the onset of fertility in sexually immature mammals to prolong Can be for   The proteins of the invention can also be measured, inter alia, by the following methods:   Activin / inhibin activity assays include, without limitation, those described below : Vale et al., Endocrinology 91: 562-572,1972; Ling et al., Nature 321: 779. -782,1986; Vale et al., Nature 321: 776-779,1986; Mason et al., Nature 318: 659-663, 1985; Forage et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 3091-3095, 1986.   Chemotaxis / chemomotility   The proteins of the present invention include, for example, monocytes, fibroblasts, neutrophils, T cells, obese cells. Chemotaxis of mammalian cells, including vesicles, eosinophils, epithelial and / or endothelial cells It can have chemokinetic properties, such as acting as a chemokine. Chemotaxis and chemical luck Kinetic proteins are used to move or attract a desired group of cells to a desired site of action. Can be used for Chemotactic or chemokinetic proteins can damage tissues and And other traumas, as well as local infections. For example, lymph Attracting spheres, monocytes or neutrophils to a tumor or site of infection The immune response to the can be enhanced.   If the protein or peptide is directly or indirectly If it can stimulate the direction and movement, it will And has chemotaxis. Preferably, the protein or peptide is directly Instructed exercise can be stimulated. Specific proteins run against a group of cells Chemotaxis in any known assay for cell chemotaxis Can be easily determined by using such proteins or peptides You.   The activity of the protein of the invention can be measured, inter alia, by the following method:   Chemotaxis assay (where proteins that induce or interfere with chemotaxis are also identified) ) Is the ability of the protein to induce cell migration through the membrane, as well as one The ability of a protein to induce adhesion from one cell group to another It consists of an assay. Suitable assays for migration and adhesion are described below. Including, without limitation: Current Protocols in Immunology, J.E.Coligan, A.M. , Kruisbeek, D.H., Margulies, E.M., Shevach, W. Strober, Pub. Greene Publis hing Associates and Wiley-Interscience (Chapter 6.12, Measurement of alpha an d beta Chemokines 6.12.1-6.12.28; Taub et al. J. Clin. Invest. 95: 1370-1376, 1995; Lind et al. APMIS 103: 140-146, 1995; Muller et al. Eur. J. Immunol. 25: 174 4-1748; Gruber et al. J. of Immunol. 152: 5860-5867, 1994; Johnston et al. J. of Immunol. 153: 1762-1768, 1994.   Hemostasis and thrombotic activity   The proteins of the invention may also exhibit hemostatic or thrombotic activity. As a result, Such proteins are used in the treatment of various coagulation diseases (including genetic diseases such as hemophilia), Or coagulation and other blood in the treatment of wounds resulting from trauma, surgery or other causes It is expected to be useful for enhancing the thrombotic symptoms. The proteins of the present invention may also Dissolution or inhibition, and symptoms resulting therefrom (e.g., myocardial infarction and central It may be useful for treating and preventing transvascular occlusion (eg, stroke).   The protein of the invention can be measured, inter alia, by the following method:   Assays for haemostatic and thrombotic activity include, without limitation, the following: Linet et al., J. Clin. Pharmacol. 26: 131-140, 1986; Burdick et al., Thrombosis Res. 45: 413-419, 1987; Humphrey et al., Fibrinolysis 5: 71-79 (1991); Schaub, Pros. taglandins 35: 467-474, 1988.   Receptor / ligand activity   The protein of the present invention may also comprise a receptor, a receptor ligand or a receptor. It may exhibit activity as an inhibitor or agonist of a-/ ligand interaction. Take Examples of receptors and ligands are cytokine receptors and their ligands. , Receptor kinase and its ligand, receptor phosphatase and its Restricts ligands, receptors involved in cell-cell interactions and their ligands (Including, without limitation, antigen presentation, antigen recognition and cellular and humoral immune responses) Involved, cell adhesion molecules such as selectins, integrins and their ligands C) and receptor / ligand pairs). Receptors and ligands also , Potential peptides or small molecules of related receptor / ligand interactions Useful for screening inhibitors. The protein (receptor) of the present invention And without limitation fragments of the ligand) are themselves receptor / liga And may be useful as inhibitors of gland interactions.   The protein of the invention can be measured, inter alia, by the following method:   Suitable assays for receptor-ligand activity include, but are not limited to, those described below. Including: Current Protocols in Immunology, J.E.Coligan, A.M., Kruisbeek, D.H. , Margulies, E.M., Shevach, W. Strober, Pub. Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience (Chapter 7.28, Measurement of Cellular Adhesion under static conditions 7.28.1-7.28.22), Takai et al., Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84: 6864-6868,1987; Bierer et al., J. Exp.Med. 168: 1145-1156,1988; Rosenstein  et al., J. Exp. Med. 169: 149-160, 1989; Stoltenborg et al., J. Immunol. Metho. ds 175: 59-68, 1994; Stitt et al., Cell 80: 661-670,1995.   Anti-inflammatory activity   The proteins of the present invention may also exhibit anti-inflammatory activity. Anti-inflammatory activity, inflammatory response Stimulates cells involved in cell-mediated or cell-cell interactions (eg, cell adhesion) Inhibits or promotes or inhibits or promotes the chemotaxis of cells involved in the inflammatory process Inhibit or promote cell migration and more directly inhibit or promote the inflammatory response It can be obtained by stimulating or suppressing the production of other factors. Such activity The use of the indicated protein allows for infection (e.g., septic shock, sepsis or Systemic inflammatory response syndrome (SIRS)), ischemia-reperfusion injury, endotoxin lethality, Arthritis, complement-mediated hyperacute rejection, nephritis, cytokine or chemokine induced lung injury Inflammatory bowel disease, Crohn's disease or cytokines such as TNF or IL-2 Chronic or acute conditions, including without limitation inflammation associated with diseases resulting from overproduction Including Inflammatory conditions can be treated. The proteins of the present invention may also include antigenic substrates. Or anaphylaxis to substances and hypersensitivity.   Tumor inhibitory activity   In addition to the activities described above in the immunological treatment or prevention of tumors, the proteins of the present invention May exhibit other antitumor activities. Proteins can be directly or indirectly (eg, Tumor growth (via ADCC). The protein is Act on precursor tissue or inhibit tissue formation necessary for tumor growth (eg, blood Other factors, drugs or cells that inhibit tumor growth (by inhibiting tube formation) Factors, drugs or cell types that produce tumor types or promote tumor growth By suppressing, eliminating or inhibiting, it may exhibit tumor inhibitory activity.   Other activities   The proteins of the invention may also exhibit one or more of the following additional activities or effects: : The formation of infectious agents, including without limitation bacteria, viruses, fungi and other parasites Inhibition or killing of length, infection or function; height, weight, hair color, eye color, skin, oil Body features, or organs or body parts, including without limitation fat to meat ratio or other tissue pigments For size or type (eg, breast increase or decrease, change in bone shape or type) Effects (suppression or enhancement); biorhythm or caricadic cycle or Effects on male or female general fertility; edible fats, lipids, Proteins, carbohydrates, vitamins, minerals, cofactors or other nutritional factors or Effects on the metabolism, catabolism, assimilation, processing, utilization, storage or elimination of components; Appetite, libido, stress, cognition (including cognitive impairment), depression (including depression) and violence Influence on behavioral characteristics, including without limitation power behavior; analgesic or other pain relief Fruit; promoting differentiation and growth of embryonic stem cells in systems other than the hematopoietic system; Endocrine activity; in the case of enzymes, correction of enzyme deficiency and treatment of deficiency-related diseases; Treatment of a proliferative disease (eg, psoriasis); immunoglobulin-like activity (eg, antigen or Acts as an antigen in the vaccine composition; Proteins or other substances or entities that cross-react with such proteins Ability to elicit an immune response.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 小林 みどり 神奈川県大和市南林間3―2―3 ロイヤ ルコート306────────────────────────────────────────────────── ─── Continuation of front page    (72) Inventor Midori Kobayashi             3-2-3 Roiya, Minamirinkan, Yamato City, Kanagawa Prefecture             Le Cote 306

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1.配列番号1から配列番号2あるいは配列番号4から配列番号25で表され るアミノ酸配列のいずれかを含む蛋白質。 2.請求項1記載の蛋白質のいずれかをコードするDNA。 3.配列番号26から配列番号50で表される塩基配列のいずれかを含むcD NA。 4.配列番号51から配列番号75で表される塩基配列のいずれかからなる、 請求項3記載のcDNA。 5.請求項2から4のいずれかに記載のDNAを発現させて、請求項1記載の 蛋白質を産生することが出来る形質転換真核細胞。[Claims]   1. SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4 to SEQ ID NO: 25 A protein comprising any of the following amino acid sequences:   2. A DNA encoding any of the proteins of claim 1.   3. CD containing any of the nucleotide sequences represented by SEQ ID NO: 26 to SEQ ID NO: 50 NA.   4. Consisting of any of the base sequences represented by SEQ ID NO: 75 from SEQ ID NO: 51, The cDNA according to claim 3.   5. The DNA according to any one of claims 2 to 4 is expressed, and the DNA according to claim 1 is expressed. A transformed eukaryotic cell capable of producing a protein.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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WO2004078970A1 (en) * 2003-03-07 2004-09-16 Human Cell Systems Inc. Branched neutral amino acid transporters acting as single molecule
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