JP2001157588A - Gene trap using green fluorescent protein - Google Patents

Gene trap using green fluorescent protein

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JP2001157588A
JP2001157588A JP34322299A JP34322299A JP2001157588A JP 2001157588 A JP2001157588 A JP 2001157588A JP 34322299 A JP34322299 A JP 34322299A JP 34322299 A JP34322299 A JP 34322299A JP 2001157588 A JP2001157588 A JP 2001157588A
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protein
cell
gfp
cells
green fluorescent
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JP34322299A
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Japanese (ja)
Inventor
Atsushi Nishimune
敦史 西宗
Akira Kakitsuka
彰 垣塚
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Osaka Bioscience Institute
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Osaka Bioscience Institute
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for observing and determining the localization and dynamic behavior of a protein in an intact cell. SOLUTION: A linearized trap vector, which contains an intron and splice donor sequence, a DNA sequence encoding green fluorescent protein(GFP) from which N-terminal methionine and valine ware deleted, an inner ribosome-binding site, a DNA sequence encoding a selective marker, and a polyadenylated signal sequence, is transfected into a cell, and GFP is expressed as a fused protein with an intrinsic protein. Observation of the green fluorescence allows to observe and determine the localization and dynamic behavior of the intrinsic protein.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、緑色蛍光タンパク
質(GFP)をレポーターとして用いた新規な遺伝子ト
ラップ法に関する。詳しくは、細胞内に局在するタンパ
ク質を緑色蛍光タンパク質と融合して発現する動物細
胞、そのような細胞を製造する方法、及びそのような細
胞を製造するためのトラップベクターに関する。
[0001] The present invention relates to a novel gene trapping method using green fluorescent protein (GFP) as a reporter. More specifically, the present invention relates to an animal cell that expresses a protein localized in a cell by fusing it with a green fluorescent protein, a method for producing such a cell, and a trap vector for producing such a cell.

【0002】[0002]

【従来の技術】ヒトを含むいくつかのモデル生物を対象
としたゲノム解析計画の進展に伴って、莫大な数の未知
遺伝子の構造が明らかにされてきている。この計画では
21世紀初頭にはヒト染色体の全ての塩基配列が決定され
る予定となっている。従って、来世紀の医学生物学の研
究は、ヒトの体内に存在する全てのタンパク質の一次構
造を全ての科学者の共通の知識として進められていくで
あろうことは疑い得ない。しかしながら、全てのタンパ
ク質の担っている機能の解明は依然として終着点の見え
ない目標であり、ポストゲノム解析時代に突入してゆこ
うとする現在の医学生物学研究のなかで、タンパク質の
生体機能を系統的に明らかにしてゆく研究が、最もその
実現を要請されている課題であると言っても過言ではな
いであろう。
2. Description of the Related Art With the progress of a genome analysis plan for several model organisms including humans, the structure of an enormous number of unknown genes has been revealed. In this plan
At the beginning of the 21st century, the entire nucleotide sequence of the human chromosome will be determined. Therefore, there is no doubt that the research of medical biology in the next century will proceed with the primary structure of all proteins present in the human body as common knowledge of all scientists. However, elucidation of the functions of all proteins remains an endless goal, and in the current medical biology research that is about to enter the post-genome analysis era, the biological functions of proteins have been It is not an exaggeration to say that systematically elucidating research is the task most demanded for its realization.

【0003】それでは、具体的にタンパク質の生体機能
をどのようにして明らかにしてゆけばよいのであろうか
?一つの明らかに生産的な戦略は、得られた全タンパク
質の一次構造と、既知の機能タンパクとの徹底的な比較
によって相互の類縁関係を明らかにし、既知機能とのア
ナロジーで理解してゆこうとする方向である。しかし、
これでは機能が全く知られていない、或いは既知タンパ
ク質と全く相同性を持たないタンパク質については理解
できなくなってしまう。
[0003] Then, how do we specifically clarify the biological functions of proteins? One apparently productive strategy is to make a thorough comparison of the primary structure of the whole protein with known functional proteins to reveal their relatives and to gain an analogy with known functions Direction. But,
This makes it impossible to understand proteins whose functions are not known at all or have no homology at all with known proteins.

【0004】機能未知のタンパク質が得られた場合には
その機能を知る上で、そのタンパク質が生体内のどの器
官・組織に発現し、さらに細胞内(あるいは細胞外)の
どの領域に存在しているかを明らかにすることで、機能
について考察するための情報量が飛躍的に増大する。つ
まり、配列が明らかになった遺伝子産物について、まず
第一に行わなければならない実験が、そのタンパク質の
器官・組織特異性の検索であり、細胞内(外)局在の解
析なのである。
[0004] When a protein of unknown function is obtained, the protein is expressed in any organ or tissue in the living body, and is present in any region inside the cell (or outside the cell) in order to know its function. The amount of information required to consider the function is dramatically increased by clarifying whether or not the function is available. In other words, the first experiment to be performed on a gene product whose sequence has been identified is to search for the organ / tissue specificity of the protein, and to analyze the intracellular (external) localization.

【0005】ここで、前者の器官・組織特異性の検索は
ゲノム計画の生産物であるDNA塩基配列をもちいて、DNA
プローブを利用したハイブリダイゼーション技術によっ
て直接的に情報が得られる。これに対して、タンパク質
の細胞内局在については、DNAプローブを用いて解析す
ることはできず、また、一次構造情報から演繹的に解明
することは現在の知識ではほとんど不可能である。
[0005] Here, the former search for organ / tissue specificity uses a DNA base sequence which is a product of the genome project,
Information can be obtained directly by a hybridization technique using a probe. On the other hand, the intracellular localization of a protein cannot be analyzed using a DNA probe, and it is almost impossible with a current knowledge to clarify it a priori from primary structural information.

【0006】現在のところ最も信頼されている実験技術
は、遺伝子産物特異的な抗体を利用する間接免疫組織化
学法である。ただしこの方法には、二つの難点がある。
つまり、まず第一に、この応用に堪える高品質の特異抗
体をつくるために多大な労力と専門知識を要する点であ
る。第二に、仮に抗体が得られたとしても生細胞を観察
するのが(細胞表面抗原を標的にする場合以外は一般的
に)非常に困難な点があげられる。
At present, the most trusted experimental technique is an indirect immunohistochemical method using an antibody specific to a gene product. However, this method has two disadvantages.
That is, first of all, a great deal of effort and expertise is required to produce high quality specific antibodies that can withstand this application. Second, even if antibodies are obtained, it is very difficult to observe living cells (generally, except when targeting a cell surface antigen).

【0007】[0007]

【発明が解決しようとする課題】本発明は、タンパク質
の細胞内局在を、そのタンパク質に特異的なプローブを
用いることなく、しかも細胞を生きたまま観察する方法
を提供することを目的とする。
SUMMARY OF THE INVENTION An object of the present invention is to provide a method for observing the intracellular localization of a protein without using a probe specific to the protein, and while keeping the cell alive. .

【0008】[0008]

【課題を解決するための手段】先ず本発明は、5’末端
側から3’末端方向に順に、 (1)イントロン及びスプライスアクセプター配列; (2)N末端のメチオニン及びバリンを欠失させた緑色
蛍光タンパク質(GFP)をコードするDNA配列; (3)内部リボソーム結合部位(IRES); (4)選択マーカーをコードするDNA配列;及び (5)ポリアデニル化シグナル配列 を含有するトラップベクターを要旨とする。
First, in the present invention, (1) an intron and a splice acceptor sequence; and (2) a methionine and a valine at the N-terminus are sequentially deleted from the 5'-terminus toward the 3'-terminus. A trap vector containing a DNA sequence encoding a green fluorescent protein (GFP); (3) an internal ribosome binding site (IRES); (4) a DNA sequence encoding a selectable marker; and (5) a polyadenylation signal sequence. I do.

【0009】本発明はさらに、(1)上記トラップベク
ターを哺乳動物の細胞に導入して形質転換し、(2)該
細胞を固体培地で培養してコロニーを得、(3)各コロ
ニーより得られる細胞について、緑色蛍光タンパク質を
発現する細胞を選択し、(4)緑色蛍光タンパク質に融
合した細胞に内在するタンパク質を同定する、ことを含
む、緑色蛍光タンパク質に融合した細胞に内在するタン
パク質を発現する動物細胞の製造方法にも関する。
The present invention further provides (1) transformation by introducing the above trap vector into mammalian cells, (2) culturing the cells in a solid medium, and (3) obtaining colonies from each colony. Selecting a cell expressing the green fluorescent protein for the cell to be obtained, and (4) identifying a protein endogenous to the cell fused to the green fluorescent protein, including expressing the protein endogenous to the cell fused to the green fluorescent protein The present invention also relates to a method for producing animal cells.

【0010】本発明はまた、上記方法により製造するこ
とのできる、緑色蛍光タンパク質に融合した内在性タン
パク質を発現する動物細胞にも関する。該細胞を蛍光顕
微鏡で観察すれば、緑色蛍光タンパク質に融合したタン
パク質の細胞内局在性、動的挙動を容易に観察、決定で
きる。
[0010] The present invention also relates to an animal cell expressing an endogenous protein fused to a green fluorescent protein, which can be produced by the above method. If the cells are observed with a fluorescence microscope, the intracellular localization and dynamic behavior of the protein fused to the green fluorescent protein can be easily observed and determined.

【0011】従って本発明はさらに、上記細胞の緑色蛍
光タンパク質の発する蛍光を観察することにより、緑色
蛍光タンパク質に融合した内在性タンパク質の細胞内に
おける局在性、動的挙動を観察する方法にも関する。
Therefore, the present invention further provides a method for observing the localization and dynamic behavior of an endogenous protein fused to a green fluorescent protein in a cell by observing the fluorescence emitted by the green fluorescent protein of the cell. Related.

【0012】本発明の概略を図1によって説明する。イ
ントロンとスプライスアクセプター配列(SA);N末
端のメチオニン及びバリンを欠失させた緑色蛍光タンパ
ク質(GFP)をコードするDNA配列;内部リボソー
ム結合部位(IRES);選択マーカーをコードするD
NA配列(bsr);及びポリアデニル化シグナル配列
(pA)を有する上記の線状化トラップベクター(pG
FTV、図1のA)を細胞にトランスフェクションする
と、該トラップベクターは染色体にアトランダムに組込
まれ、融合遺伝子を形成する(図1のB。斜線をほどこ
した枠は染色体中のタンパク質をコードするエクソンを
示し、白枠は非翻訳エクソン領域を示す)。該融合遺伝
子は転写され(図1のC)、スプライシングを受け、翻
訳され、タンパク質と融合した緑色蛍光タンパク質及び
マーカータンパク質が発現する(図1のD)。緑色蛍光
によりGFP融合タンパク質を発現する細胞を容易に選
択でき、またその細胞内局在性も容易に決定できる(図
1のE)。
The outline of the present invention will be described with reference to FIG. Intron and splice acceptor sequence (SA); DNA sequence encoding green fluorescent protein (GFP) deleted of N-terminal methionine and valine; internal ribosome binding site (IRES); D encoding selectable marker
And a linear trap vector (pG) having an NA sequence (bsr); and a polyadenylation signal sequence (pA).
When the cells are transfected with FTV, FIG. 1A), the trap vector is integrated at random into the chromosome to form a fusion gene (FIG. 1B. The shaded frame encodes a protein in the chromosome). Exons, white boxes indicate untranslated exon regions). The fusion gene is transcribed (FIG. 1C), spliced and translated, and a green fluorescent protein and a marker protein fused to the protein are expressed (FIG. 1D). The cells expressing the GFP fusion protein can be easily selected by the green fluorescence, and their intracellular localization can be easily determined (E in FIG. 1).

【0013】本発明のトラップベクターは以下の3つの
特徴をもつ。 (1)ベクターの5'領域にイントロン及びスプライス・
アクセプター部位を有する。哺乳類ゲノム上の構造遺伝
子の多くはタンパク質をコードしている領域を含むエク
ソン部分を分断するイントロンを含んでおり、構造遺伝
子上にDNA断片が取り込まれた場合には、イントロン領
域に挿入される可能性が高いと考えられる。イントロン
に取り込まれた状態で融合タンパク質を発現できるよう
に、ベクターの5'側にイントロンとスプライス・アクセ
プター部位を持たせた。これによって、挿入部位の5'上
流側のエクソン部分とGFPが融合した転写産物が発現す
るようになる。なお、イントロンを含まない構造遺伝子
も知られているが、そのような遺伝子に挿入された場合
にも融合タンパクが正しく発現されるように、ベクター
上のイントロン配列にもGFPと同じ読み枠内には停止コ
ドンが含まれない構造に設計する。
The trap vector of the present invention has the following three features. (1) Introns and splices are added to the 5 '
It has an acceptor site. Many structural genes on the mammalian genome contain introns that divide the exons that contain the protein-encoding region, and when a DNA fragment is incorporated into the structural gene, it can be inserted into the intron region It is considered highly likely. The vector was provided with an intron and a splice acceptor site on the 5 'side so that the fusion protein could be expressed while incorporated into the intron. This results in the expression of a transcript in which the exon portion 5 ′ upstream of the insertion site and GFP are fused. Structural genes that do not contain introns are also known, but in order for the fusion protein to be correctly expressed when inserted into such a gene, the intron sequence on the vector is also placed in the same reading frame as GFP. Is designed to have a structure that does not include a stop codon.

【0014】(2)GFP遺伝子からアミノ末端の2つの
アミノ酸を欠失させた変異体GFPをレポーター遺伝子に
利用している。本ベクターの開発過程で、野生型の全長
或いは開始コドンを欠失させたGFP(dM-GFP)を用いて行
った予備実験の結果から、これらの遺伝子トラップの効
率はきわめて低く、GFPのシグナルの見られる細胞の大
部分で非融合タンパク質が発現していることを明らかに
した。そこで、非融合タンパク質のバックグラウンドを
減らすことを目的として、欠失変異体dMV-GFP(N末端
のメチオニン及びバリンを欠失させた緑色蛍光タンパク
質)を用いた。その結果、効率よくGFP融合タンパク質
を発現する細胞株が得られるようになった。この欠失変
異体の使用が本法の実用化に必須であった。
(2) A mutant GFP obtained by deleting two amino-terminal amino acids from the GFP gene is used as a reporter gene. From the results of preliminary experiments performed using GFP (dM-GFP) in which the wild-type full-length or start codon had been deleted during the development of this vector, the efficiency of these gene traps was extremely low, and the signal of GFP was low. It revealed that the unfused protein was expressed in most of the cells seen. Therefore, for the purpose of reducing the background of the non-fusion protein, a deletion mutant dMV-GFP (green fluorescent protein from which N-terminal methionine and valine were deleted) was used. As a result, a cell line that efficiently expresses the GFP fusion protein can be obtained. The use of this deletion mutant was essential for practical use of this method.

【0015】(3)内部リボソーム結合部位の使用 一般に真核生物のmRNAの翻訳では、リボソームがmRNAの
5'末端から、開始コドンが見つかるまでスキャンするこ
とにより翻訳を開始する。これに対し、脳心筋炎ウイル
ス(ECMV)等のピコルナウイルスのmRNAでは、リボソーム
はIRESと呼ばれる内部部位に結合して翻訳を開始する。
このIRES配列は、無関係な遺伝子につなげることで、ポ
リシストロン性のmRNAを作ることができる。このバイシ
ストロン性(bicistronic)mRNAでは、5'末端からの目的
遺伝子とGFP との融合遺伝子の翻訳と、ECMV IRESから
のマーカー遺伝子の翻訳を、単一のmRNAにより行える。
目的遺伝子の転写単位に正方向に挿入されたベクターの
みからマーカー遺伝子(例えば抗生物質耐性マーカー遺
伝子)が翻訳されるので、抗生物質耐性の細胞株の中
で、遺伝子トラップされた株の割合を飛躍的に高めるこ
とが可能となる。
(3) Use of internal ribosome binding site Generally, in the translation of eukaryotic mRNA, the ribosome binds to the mRNA.
Begin translation by scanning from the 5 'end until the start codon is found. In contrast, in picornavirus mRNA such as encephalomyocarditis virus (ECMV), ribosomes bind to an internal site called IRES and initiate translation.
By connecting this IRES sequence to an unrelated gene, a polycistronic mRNA can be produced. In this bicistronic mRNA, translation of a fusion gene of the target gene and GFP from the 5 'end and translation of a marker gene from ECMV IRES can be performed by a single mRNA.
Marker genes (eg, antibiotic resistance marker genes) are translated only from vectors inserted in the forward direction into the transcription unit of the target gene, so that the percentage of gene-trapped strains among antibiotic-resistant cell lines is increased It becomes possible to raise it.

【0016】[0016]

【発明の実施の形態】トラップベクターの構築 本発明の遺伝子トラップベクターは以下のようにして構
築することができる。すなわち、該トラップベクターを
構成する各DNA断片を調製し、これらを適当なプラス
ミドに挿入、連結し、その後制限酵素を用いて連続した
DNA断片として切り出す。 (1)イントロン及びスプライスアクセプター部位 イントロンの一般的な構造として 5'-GU(A/G)AGU.....................(Py)6X(C/U)AG-3' が知られており、5'側のGU(A/G)AGU部分がスプライスド
ナー部位、3'側の(Py)6X(C/U)AG部分がスプライスアク
セプター部位として機能する。スプライスドナー部位を
除いたイントロンは、染色体上のイントロン領域に正し
い方向で組み込まれると機能を持つイントロンとして働
く。
DESCRIPTION OF THE PREFERRED EMBODIMENTS Construction of Trap Vector The gene trap vector of the present invention can be constructed as follows. That is, each DNA fragment constituting the trap vector is prepared, inserted into an appropriate plasmid, ligated, and then cut out as a continuous DNA fragment using a restriction enzyme. (1) Intron and splice acceptor site The general structure of the intron is 5'-GU (A / G) AGU ..... (Py) 6X (C / U) AG-3 'is known, the GU (A / G) AGU part on the 5' side is a splice donor site, and the (Py) 6X (C / U) AG part on the 3 'side is a splice Functions as an acceptor site. The intron excluding the splice donor site functions as a functional intron when integrated into the intron region on the chromosome in the correct orientation.

【0017】哺乳類間では一般に シグナルの細胞種特
異性、動物種特異性は報告されておらず、 スプライス
アクセプターとしての活性を持つ配列であればよい。た
だし、内部に別の遺伝子のコード領域または、スプライ
スドナー、3'端のスプライスアクセプター以外のスプラ
イスアクセプターの配列が含まれていないものを使用す
る必要がある。例えば、ウサギβ-グロビン遺伝子(Bru
ce Alberts, Dennis Bray, Julian Lewis, Martin Raf
f, Keith Roberts, and James D. Watsomn、 Molecular
Biology of the Cell (3rd ed.)、 Garland Publishin
g, Inc.、 New York & London (1994) p372 Figure 8-5
1)のintron IIを含むベクター(例えば、Stratagene社
製発現ベクターpSG5)からスプライスドナー部位を取り
除きスプライスアクセプター部位を含む配列をPCR法で
5'端にXhoI部位及び3'端にSalI部位を付加して利用す
る。
[0017] In general, the cell type specificity and the animal type specificity of the signal have not been reported between mammals, and any sequence having splicing acceptor activity may be used. However, it is necessary to use a gene that does not contain a coding region of another gene or a sequence of a splice acceptor other than a splice donor and a splice acceptor at the 3 ′ end. For example, the rabbit β-globin gene (Bru
ce Alberts, Dennis Bray, Julian Lewis, Martin Raf
f, Keith Roberts, and James D. Watsomn, Molecular
Biology of the Cell (3rd ed.), Garland Publishin
g, Inc., New York & London (1994) p372 Figure 8-5
1) Remove the splice donor site from the vector containing intron II (for example, Stratagene expression vector pSG5) and replace the sequence containing the splice acceptor site by PCR.
An XhoI site is added at the 5 ′ end and a SalI site is added at the 3 ′ end for use.

【0018】(2)GFP遺伝子 本発明のトラップベクターにおいては緑色蛍光タンパク
質(GFP)(オワンクラゲ(Aguoria victoria)のG
FPのcDNAを基に、哺乳動物細胞で使用頻度の高い
コドンを使用し、蛍光強度を高めるための変異を導入し
た人工配列)のアミノ末端のメチオニン及びバリンの2
つのアミノ酸を欠失させた変異体GFP(配列番号1)を
コードするDNA配列を用いる。例えば、GFPのcDNA
を、梅園らによって開発されたpCMX-SAH/Y145Fプラスミ
ド(Ogawa, H., Inouye, S., Tsuji, F. I., Yasuda,
K., and Umesono, K. (1995),"Localization, traffick
ing and temperature-dependence of the Aquorea gree
n fluorescent protein in cultured vertebrate cell
s", Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93: 4845-4850.)
より、アミノ末端のメチオニン及びバリンの2アミノ酸
を欠失させた変異体GFPをPCR法により作製する。5'端に
SalI部位及び3'端にEcoRI部位を付加して利用する。
(2) GFP gene In the trap vector of the present invention, green fluorescent protein (GFP) (G of Aguoria victoria)
Based on the cDNA of FP, an artificial sequence in which a codon frequently used in mammalian cells is used and a mutation for enhancing the fluorescence intensity is introduced (methionine and valine 2
A DNA sequence encoding a mutant GFP (SEQ ID NO: 1) with three amino acids deleted is used. For example, GFP cDNA
Was compared to the pCMX-SAH / Y145F plasmid (Ogawa, H., Inouye, S., Tsuji, FI, Yasuda,
K., and Umesono, K. (1995), "Localization, traffick
ing and temperature-dependence of the Aquorea gree
n fluorescent protein in cultured vertebrate cell
Natl. Acad. Sci. USA, 93: 4845-4850.)
Thus, a mutant GFP in which two amino acids of methionine and valine at the amino terminus are deleted is prepared by PCR. At the 5 'end
An EcoRI site is added to the SalI site and the 3 ′ end for use.

【0019】(3)内部リボソーム結合部位 本発明のトラップベクターにおいては内部リボソーム結
合部位(IRES)(Mountford, P.S., and Smith, A.
G.,"Internal ribosome entry sites and dicistronic
RNAs in mammalian transgenesis", Trends in Genetic
s 11: 179-184(1995);Ramage, A.D., Clark, A.J., Sm
ith, A.G., Mountford, P.S., and Burt, D.W.,"Improv
ed EBV-based shuttle vector system: dicistronic mR
NA couples the synthesis of the Epstein-Barr nucle
ar antigen-1 protein to neomycin resistance", Gene
197: 83-89 (1997))を用いる。
(3) Internal ribosome binding site In the trap vector of the present invention, an internal ribosome binding site (IRES) (Mountford, PS, and Smith, A .;
G., "Internal ribosome entry sites and dicistronic
RNAs in mammalian transgenesis ", Trends in Genetic
s 11: 179-184 (1995); Ramage, AD, Clark, AJ, Sm.
ith, AG, Mountford, PS, and Burt, DW, "Improv
ed EBV-based shuttle vector system: dicistronic mR
NA couples the synthesis of the Epstein-Barr nucle
ar antigen-1 protein to neomycin resistance ", Gene
197: 83-89 (1997)).

【0020】現在知られている動物ウイルス由来の内部
リボソーム結合部位は、様々な脊椎動物種に用いられて
おり、その生物活性が確かめられている。無脊椎動物に
ついても、少なくともショウジョウバエなどの昆虫で
は、活性が確認されている。そのほかの動物種について
は現在までのところ報告が乏しい。植物での作用は現在
までのところ報告されていない。酵母細胞では活性がな
いという結果が報告されている。従って本トラップベク
ターは酵母細胞へは適用できないことが明らかとなって
いる。現在、種々のIRESの配列が核酸データベース上で
入手可能であり、その配列を全合成して、調製すること
ができる。また報告者に連絡して入手することも可能で
ある。現在ではIRES配列を含む発現プラスミドはクロン
テック社などから市販されており、購入することも可能
である。例えば、脳心筋炎ウイルス由来の内部リボソー
ム結合部位をプラスミド6P-T3-Neolres LacZ-BS-MOより
EcoRI及びNcoI断片として得ることができる。
Currently known internal ribosome binding sites derived from animal viruses have been used in various vertebrate species, and their biological activities have been confirmed. The activity of invertebrates has been confirmed at least in insects such as Drosophila. Other animal species have been poorly reported to date. No effects on plants have been reported to date. It has been reported that there is no activity in yeast cells. Therefore, it is clear that this trap vector cannot be applied to yeast cells. Currently, various IRES sequences are available on nucleic acid databases, and the sequences can be fully synthesized and prepared. It can also be obtained by contacting the reporter. At present, an expression plasmid containing an IRES sequence is commercially available from Clontech or the like, and can be purchased. For example, an internal ribosome binding site derived from encephalomyocarditis virus was obtained from plasmid 6P-T3-Neolres LacZ-BS-MO.
It can be obtained as EcoRI and NcoI fragments.

【0021】(4)マーカー遺伝子 マーカーとしては、宿主細胞が感受性を示す抗生物質の
耐性遺伝子ならばどのようなものでも利用できる。ただ
し、本法では耐性遺伝子産物の発現量は、トラップした
遺伝子のプロモーター活性によって決まるトラップ遺伝
子の転写量に依存している。このため細胞内での発現量
が非常に微量であっても宿主細胞が耐性を獲得できるよ
うな耐性遺伝子を使用すれば、転写量の少ない遺伝子で
もトラップすることができるようになるものと考えられ
る。従ってこのような性質を有する耐性遺伝子の使用が
好ましい。例えば、ブラストサイジンS耐性遺伝子をIn
vitrogen社製のプラスミドpSVbsrよりPCR法で5'端にEco
RI部位及び3'端にXhoI部位を付加して利用できる。
(4) Marker gene Any marker can be used as long as it is a resistance gene of an antibiotic to which the host cell is sensitive. However, in this method, the expression level of the resistance gene product depends on the transcription level of the trapped gene determined by the promoter activity of the trapped gene. For this reason, it is considered that the use of a resistance gene that allows the host cell to acquire resistance even when the expression level in the cell is extremely small will enable trapping of even a gene with a small transcription amount. . Therefore, the use of a resistance gene having such properties is preferred. For example, blasticidin S resistance gene
From the plasmid pSVbsr manufactured by vitrogen, Eco was added to the 5 'end by PCR.
An XhoI site can be added to the RI site and 3 ′ end for use.

【0022】(5)ポリアデニル化シグナル ボリアデニル化シグナル配列としては哺乳類細胞のポリ
アデニル化シグナルを用いることができる。一般に シ
グナルの細胞種特異性、動物種特異性は報告されておら
ず、ポリアデニル化シグナルとしての活性を持つ配列で
あればよい。例えば、ポリアデニル化シグナルはK14ヒ
トI型ケラチン遺伝子由来のものをPCR法で5'端にEcoRI
とEcoT22I部位及び3'端にPstI部位を付加して利用でき
る。
(5) Polyadenylation signal A mammalian cell polyadenylation signal can be used as the boria adenylation signal sequence. In general, cell type specificity and animal type specificity of a signal have not been reported, and any sequence having a polyadenylation signal activity may be used. For example, the polyadenylation signal is derived from the K14 human type I keratin gene by EcoRI at the 5 'end by PCR.
And an EcoT22I site and a PstI site at the 3 ′ end.

【0023】(6)トラップベクターを保持するプラス
ミドの構築 次に 以上の様にして得られる(1)イントロン(スプライ
スアクセプター部位を含みスプライスドナー部位を含ま
ない)、(2)変異型GFPのcDNA断片、(3)IRES、(4)薬剤耐
性遺伝子、(5)ポリアデニル化シグナル配列のDNA断片
を、この順にプラスミドベクター上に挿入DNA断片とし
て連結して、トラップベクターを保持するプラスミドベ
クターを構築する。プラスミドベクターとしては、通常
の組換えDNA実験に用いられる汎用のベクターが使用
できるが、完成後大量のDNA断片を調製するために収
量の多いものが望ましい。つまり、大腸菌内で高コピー
数になるものの使用が望ましい。
(6) Construction of Plasmid Holding Trap Vector Next, (1) intron (including splice acceptor site but not splice donor site) and (2) cDNA of mutant GFP obtained as described above The DNA fragment of the fragment, (3) IRES, (4) drug resistance gene, and (5) polyadenylation signal sequence are ligated in this order as an inserted DNA fragment on a plasmid vector to construct a plasmid vector holding a trap vector. . As the plasmid vector, a general-purpose vector used in ordinary recombinant DNA experiments can be used, but a plasmid with a high yield is desirable in order to prepare a large amount of DNA fragments after completion. In other words, it is desirable to use one that has a high copy number in E. coli.

【0024】(7)トラップベクターの取得 次に該プラスミドベクターから、適切な制限酵素を使用
して、トラップベクターを連続したDNA断片として切り
出す。すなわち、完成した遺伝子トラップベクターを含
むプラスミドを、トラップベクターの内部を切断せず両
端(つまり(1)イントロンの5'側端、及び(5)ポリアデニ
ル化シグナルの3'側端)を切断する制限酵素によって消
化し、プラスミドの骨格からトラップベクターを遊離さ
せる。この際に、次に行うアガロースゲル電気泳動法に
よって分離可能であるようにトラップベクターとプラス
ミド骨格のDNAの分子量に差ができるようにする。消化
反応後のDNA混合液をアガロースゲル電気泳動によって
分離し、引き続いて精製することで、線状化トラップベ
クターを得る。例えば、完成した遺伝子トラップベクタ
ーを含むプラスミドをXhoI、PstI、AseIの3種の制限酵
素を用いて切断し、アガロースゲル電気泳動法によって
分離し、3kbのDNA断片を陰イオン交換膜への吸着法を
利用して精製することにより、線状化トラップベクター
を得る。
(7) Acquisition of trap vector Next, the trap vector is cut out from the plasmid vector as a continuous DNA fragment using an appropriate restriction enzyme. That is, the restriction | limiting which cut | disconnects both ends (that is, (1) the 5 'end of an intron, and (5) the 3' end of a polyadenylation signal) without cutting the inside of a trap vector with the plasmid containing a completed gene trap vector is carried out. The enzyme is digested to release the trap vector from the plasmid backbone. At this time, the molecular weights of the trap vector and the DNA of the plasmid backbone should be different so that they can be separated by the agarose gel electrophoresis to be performed next. The DNA mixture after the digestion reaction is separated by agarose gel electrophoresis and subsequently purified to obtain a linearized trap vector. For example, a plasmid containing the completed gene trap vector is cut with three kinds of restriction enzymes XhoI, PstI and AseI, separated by agarose gel electrophoresis, and a 3 kb DNA fragment is adsorbed on an anion exchange membrane. The linearized trap vector is obtained by purification using

【0025】細胞のトランスフェクション 次にこのようにして得たトラップベクターを動物細胞に
導入する。動物細胞としては、使用した IRESが活性を
持ち、用いる薬剤耐性マーカーで選択可能な細胞であれ
ば、どのような動物細胞も適用可能である。例えば、ラ
ット褐色細胞腫由来のPC12ASK1細胞を用いることができ
る。トラップベクターは、染色体上に一カ所だけ組み込
まれる条件で、トランスフェクションする必要がある。
効率よく一つの細胞あたりトランスフェクトされた染色
体上のランダムな一カ所に組み込まれるような導入方法
であれば、どのような方法で行ってもよい。電気穿孔法
は、このような目的に適した DNA導入の方法の一例であ
る。例えば、カルシウム及びマグネシウム不含リン酸緩
衝液(PBS(-))中に細胞を37℃,10分間保温した後、10ml
プラスティック注射器で21-ゲージの注射針に10回通す
ことで単細胞化する。細胞は5 x 106cells/mlの濃度に
なるようにPBS(-)に懸濁し、細胞懸濁液0.8mlと20μgの
線状化ベクターDNAを混合して電気穿孔法によるDNA導入
を行う。
Cell Transfection Next, the trap vector thus obtained is introduced into animal cells. As the animal cells, any animal cells can be used as long as the used IRES has activity and can be selected with the drug resistance marker to be used. For example, PC12ASK1 cells derived from rat pheochromocytoma can be used. It is necessary to transfect the trap vector under the condition that only one site is integrated on the chromosome.
Any method may be used as long as it is an introduction method that allows efficient integration into one random place on the transfected chromosome per cell. Electroporation is an example of a DNA introduction method suitable for such a purpose. For example, after incubating the cells in a phosphate buffer (PBS (-)) containing no calcium and magnesium at 37 ° C. for 10 minutes, 10 ml
Single cells are obtained by passing 10 times through a 21-gauge injection needle with a plastic syringe. The cells are suspended in PBS (-) at a concentration of 5 × 10 6 cells / ml, and 0.8 ml of the cell suspension and 20 μg of the linearized vector DNA are mixed, and DNA is introduced by electroporation.

【0026】細胞の選択 次にトランスフェクトされた細胞から所望の細胞を選択
する。細胞の選択は、使用した薬剤耐性遺伝子によって
使用する薬剤を決める。予備実験によって、トラップベ
クター未導入の宿主細胞が完全に死滅する薬剤濃度を求
めておく。それ以上の薬剤濃度でトラップベクター導入
細胞を培養し、コロニーを形成させる。次に、この耐性
コロニーを、蛍光顕微鏡を使用して生細胞のまま観察
し、GFPの蛍光シグナルを発している細胞を単離して以
下の解析に用いる。例えば、プラスミドサイジンSをマ
ーカーとして用いた場合、得られたブラストサイジンS
耐性コロニーを6穴の培養皿へ一個ずつ移して培養し、
水浸対物レンズを装着した蛍光顕微鏡で観察する。GFP
の緑色蛍光を示す細胞株を選択して培養を続け、以下の
解析に用いる。
Next, desired cells are selected from the transfected cells. The selection of cells determines the drug to be used according to the drug resistance gene used. Preliminary experiments determine the drug concentration at which the host cells without the introduction of the trap vector are completely killed. The trap vector-introduced cells are cultured at a higher drug concentration to form colonies. Next, the resistant colonies are observed as they are with viable cells using a fluorescence microscope, and cells emitting a GFP fluorescent signal are isolated and used for the following analysis. For example, when plasmid cidin S is used as a marker, the obtained blasticidin S
Transfer resistant colonies one by one to a 6-well culture dish and culture them.
Observe with a fluorescence microscope equipped with a water immersion objective. GFP
The cell line showing green fluorescence is selected and culture is continued, and used for the following analysis.

【0027】細胞株の解析 細胞株は10cm培養皿で増殖させ、凍結保存及びタンパク
質の抽出に供する。抗GFP抗体を用いたウエスタンブロ
ッティング解析により、未融合のGFP(約27kD)と比較
して分子量の大きくなった融合タンパク質を発現してい
る細胞を同定する)。それらの細胞からpoly(A)+ RNAを
精製し、5'RACE法によって、GFP融合遺伝子を同定す
る。以下に本発明を実施例によって説明するが、実施例
は説明のためのものであり、本発明が実施例によって限
定されるものではないことは勿論である。
Analysis of Cell Line The cell line is grown in a 10 cm culture dish and subjected to cryopreservation and protein extraction. Western blot analysis using an anti-GFP antibody identifies cells expressing a fusion protein with a higher molecular weight than unfused GFP (about 27 kD)). Poly (A) + RNA is purified from those cells, and the GFP fusion gene is identified by the 5'RACE method. Hereinafter, the present invention will be described with reference to examples. However, the examples are for explanation, and the present invention is not limited to the examples.

【0028】[0028]

【実施例】実施例1 トラップベクターの調製 トラップベクターの構成要素の各DNA断片に適当な制限
酵素認識部位を導入し、順番に連結してゆくことで、ト
ラップベクターを構築した。PCR法を用いて各DNA断片に
必要な制限酵素認識部位を導入した。すなわち、適切な
制限酵素認識部位を含むオリゴヌクレオチドプライマー
を合成し、このプライマーでPCRを行い、制限酵素消化
を行って、プラスミドベクターへ挿入する。PCR法の操
作は次のように行った。
Example 1 Preparation of Trap Vector A trap vector was constructed by introducing appropriate restriction enzyme recognition sites into each DNA fragment constituting the trap vector and ligating them sequentially. Restriction enzyme recognition sites required for each DNA fragment were introduced by PCR. That is, an oligonucleotide primer containing an appropriate restriction enzyme recognition site is synthesized, PCR is performed with the primer, restriction enzyme digestion is performed, and the resultant is inserted into a plasmid vector. The operation of the PCR method was performed as follows.

【0029】PCR法:用いたPCR反応混合液は以下の
ようである。 滅菌蒸留水 32 μl 10x KOD buffer 5 μl 2 mM dNTP mix 5 μl 25 mM MgCl2 2 μl 10μM 5'側プライマー 2 μl 10μM 3'側プライマー 2 μl 10 ng/μl 鋳型プラスミドDNA 1 μl KOD DNA ポリメラーゼ (2.5 U/μl ) 1 μl 合計 50 μl 注) 10xKOD bufferの組成 1.2M Tris-HCl (pH 8.
0);100mM KCl;60 mM (NH4)2SO4;1% Triton X-100;
0.1 mg /ml 牛血清アルブミン
PCR method: The PCR reaction mixture used was as follows. Sterile distilled water 32 μl 10x KOD buffer 5 μl 2 mM dNTP mix 5 μl 25 mM MgCl 2 2 μl 10 μM 5 ′ primer 2 μl 10 μM 3 ′ primer 2 μl 10 ng / μl Template plasmid DNA 1 μl KOD DNA polymerase (2.5 U / μl) 1 μl Total 50 μl Note) Composition of 10xKOD buffer 1.2M Tris-HCl (pH 8.
0); 100 mM KCl; 60 mM (NH 4 ) 2 SO 4 ; 1% Triton X-100;
0.1 mg / ml bovine serum albumin

【0030】PCR反応は以下のように行なった。予め反
応チューブおよび各成分を含むチューブを氷上で冷却し
ておく。混合液を上記の順番に加えて作成する。サーマ
ルサイクラーを98度に平衡化しておき、反応チューブを
サーマルサイクラーへ移した後、反応を開始する。サー
マルサイクラーはTaKaRa社のThermal Cycler MPを用い
て、以下のプログラムで行う。98℃、1 分間を1 サイク
ル;98℃、15 秒間、65℃で 2 秒間、そして74℃で30秒
間を25 サイクル;最後に74℃で4 分 30 秒次に 4℃で
一晩を1 サイクル。以下に作製する全てのプラスミド
は、候補を8種類用意し、まず初めに 4種類ずつ塩基配
列決定(シークエンシング)を行った。シークエンシング
は、ABI 310Prism Genetic Analyzerを使用したキャピ
ラリー電気泳動法によって行った。正しい構造を持つ候
補が最初の4種類の中に見つからない場合に、残りの4種
類のシークエンシングを行い正しい構造の候補を探し
た。
The PCR reaction was performed as follows. The reaction tube and the tube containing each component are previously cooled on ice. A mixed solution is prepared by adding the mixture in the above order. After equilibrating the thermal cycler to 98 degrees, transfer the reaction tube to the thermal cycler and start the reaction. The thermal cycler is performed with the following program using Thermal Cycler MP of TaKaRa. One cycle of 98 ° C for 1 minute; 25 cycles of 98 ° C for 15 seconds, 65 ° C for 2 seconds, and 74 ° C for 30 seconds; finally one cycle of 74 ° C for 4 minutes 30 seconds and then 4 ° C overnight. . Eight candidates were prepared for all plasmids to be prepared below, and first, four bases were sequenced (sequencing). Sequencing was performed by capillary electrophoresis using an ABI 310Prism Genetic Analyzer. If no candidate with the correct structure was found in the first four, the remaining four were sequenced to find a candidate for the correct structure.

【0031】(1)GFP cDNAの断片の作製 5'側プライマー(145-5'H3Nco)として、 (配列番号2)を用い、3'側プライマー(145-3'Eco)と
して、 (配列番号3)用い、GFPを含むプラスミド (pCMX-SAH/
Y145F)を鋳型として、KOD DNAポリメラーゼを用いた PC
R法により約800bpのDNA断片を得た。この断片をEcoRI及
びHindIIIで消化後、pBluescriptII KS(+)ベクター (St
ratagene社)(以下 pBSIIと省略)の EcoRI, HindIII部位
へ挿入した。
(1) Preparation of GFP cDNA Fragment 5′-side primer (145-5′H3Nco) Using (SEQ ID NO: 2) as a 3′-side primer (145-3′Eco), (SEQ ID NO: 3) and a plasmid containing GFP (pCMX-SAH /
PC using KOD DNA polymerase with Y145F) as the template
A DNA fragment of about 800 bp was obtained by the R method. After digesting this fragment with EcoRI and HindIII, the pBluescriptII KS (+) vector (St
ratAgene) (hereinafter abbreviated as pBSII) into EcoRI and HindIII sites.

【0032】(2)マーカー(bsr)断片の作製 検出のためのマーカーとしてブラストサイジンS耐性遺
伝子を用いた。5'側プライマー(bsr5'EcoNco)として、 (配列番号4)を用い、3'側プライマー(bsr3'Pst)とし
て、 (配列番号5)を用い、bsrを含むプラスミドpSV2bsr
(科研製薬株式会社製)を鋳型として、KOD DNAポリメラ
ーゼを使用した PCR法によりDNA断片をえた。このDNA断
片を EcoRI及びPstIで消化後、pBSIIの同部位へ挿入し
た。
(2) Preparation of marker (bsr) fragment The blasticidin S resistance gene was used as a marker for detection. As 5 'primer (bsr5'EcoNco), Using (SEQ ID NO: 4) as a 3′-side primer (bsr3′Pst) Using (SEQ ID NO: 5), plasmid pSV2bsr containing bsr
(Kaken Pharmaceutical Co., Ltd.) was used as a template to obtain a DNA fragment by a PCR method using KOD DNA polymerase. This DNA fragment was digested with EcoRI and PstI, and inserted into the same site of pBSII.

【0033】(3)K14ポリアデニル化シグナル配列の断片
の作製 ポリアデニル化シグナルはK14ヒトI型ケラチン遺伝子
(Marchuk, D., McCrohon, S., and Fuchs, E., "Comp
lete sequence of a gene encoding a humantype I ker
atin: Sequences homologous to enhancer elements in
the regulatory region of the gene", Proc. Natl. A
cad. Sci. USA, 82: 1609-1613 (1985))由来のものを用
いた。5'側プライマー(5'K14 EcoR/T22I)として、 (配列番号6)を用い、3'側プライマー(3'K14Pst I)と
して (配列番号7)を用い、K14ポリアデニル化シグナルを
含むプラスミドpG3K14 Cassetteを鋳型とした。KODDNA
ポリメラーゼを使用したPCR法により得た増幅DNA断片を
EcoRI及び、PstIで消化後、pBSIIの同部位へ挿入した。
このプラスミドを pBS-K14pAEPと呼ぶ。
(3) Preparation of Fragment of K14 Polyadenylation Signal Sequence The polyadenylation signal was obtained from the K14 human type I keratin gene (Marchuk, D., McCrohon, S., and Fuchs, E., "Comp.
lete sequence of a gene encoding a humantype I ker
atin: Sequences homologous to enhancer elements in
the regulatory region of the gene ", Proc. Natl. A
cad. Sci. USA, 82: 1609-1613 (1985)). As 5 'primer (5'K14 EcoR / T22I) Using (SEQ ID NO: 6) as a 3′-side primer (3′K14Pst I) Using (SEQ ID NO: 7), a plasmid pG3K14 Cassette containing a K14 polyadenylation signal was used as a template. KODDNA
Amplified DNA fragment obtained by PCR using polymerase
After digestion with EcoRI and PstI, it was inserted into the same site of pBSII.
This plasmid is called pBS-K14pAEP.

【0034】(4)イントロン−スプライスアクセプター
の断片の調製イントロン−フプライスアクセプター配列
はウサギ−βブロビン遺伝子由来のものを用いた。5'側
プライマー(bg-int5'Xho Ver.2)として、 (配列番号8)を用い、3'側プライマー(3種) (bg-int
3'NcoEco A, B, C)として の3種を用いた。
(4) Preparation of Intron-Splice Acceptor Fragment The intron-splice acceptor sequence used was derived from the rabbit-β-brobin gene. 5 'primer (bg-int5'Xho Ver.2) (SEQ ID NO: 8), 3 ′ primer (3 types) (bg-int
3'NcoEco A, B, C) Were used.

【0035】3種のプライマーの組み合わせ (5' + 3'
A, 5' + 3'B, 5' + 3'C)を用い、intronを含むプラスミ
ドpSG5 (Stratagene社製)を鋳型として、KOD DNAポリメ
ラーゼによる PCR法で得た増幅DNA断片を XhoI及びEcoR
Iで消化後、pBSIIの同部位へサブクローニングした。
A combination of three primers (5 '+ 3'
A, 5 ′ + 3′B, 5 ′ + 3′C), and using the plasmid pSG5 containing intron (manufactured by Stratagene) as a template, the amplified DNA fragment obtained by the PCR method using KOD DNA polymerase was converted into XhoI and EcoR.
After digestion with I, it was subcloned into the same site of pBSII.

【0036】(5)内部リボソーム結合部位断片の作製 脳心筋炎ウイルス由来の内部リボソーム結合部位を、6P
-T3-Neolres LacZ-BS-MOプラスミドよりEcoRI及びNcoI
断片として得た。該プラスミドは Peter S. Mountford
博士より供与された。
(5) Preparation of Internal Ribosome Binding Site Fragment The internal ribosome binding site derived from encephalomyocarditis virus was
EcoRI and NcoI from -T3-Neolres LacZ-BS-MO plasmid
Obtained as fragments. The plasmid is Peter S. Mountford
Granted by Dr.

【0037】次にこのようにし得たDNA断片を以下の
ように順次接続した。 (1)イントロン部分と GFP部分の接続 イントロンを含む3種のプラスミド (pBS-bg int A, B,
C)を XhoI消化によって線状化した後、NcoI部分消化に
よって 610bpの断片をアガロースゲル電気泳動法により
精製した。この3種類のイントロン断片を、GFPを含む p
BS-GFP145プラスミドの XhoI, NcoI部位に挿入し、イン
トロン-GFPのカセットを持つ 3種のプラスミド pBS-in
t GFP A, B, Cを得た。
Next, the thus obtained DNA fragments were sequentially connected as follows. (1) Connection of intron and GFP three types of plasmids containing introns (pBS-bg int A, B,
After linearizing C) by XhoI digestion, a 610 bp fragment was purified by agarose gel electrophoresis by NcoI partial digestion. These three types of intron fragments were transformed with GFP-containing p
Three types of plasmids, pBS-in, which are inserted into the XhoI and NcoI sites of the BS-GFP145 plasmid and have an intron-GFP cassette
tGFP A, B, C were obtained.

【0038】(2)IRES部分とブラストサイジンS耐性遺伝
子の接続 6P-T3-NeolresLacZ-BS-MOプラスミドを 、EcoRI及びNco
Iで消化して得られる 600bpの IRES断片をアガロースゲ
ル電気泳動法で精製した。このDNA断片をブラストサイ
ジンS耐性遺伝子を持つプラスミド pBS-NcoBSRの EcoR
I, NcoI部位へ挿入し、IRES-bsrのカセットを持つプラ
スミド pBS-IRES bsrを得た。
(2) Connection between the IRES part and the blasticidin S resistance gene The 6P-T3-NeolresLacZ-BS-MO plasmid was ligated with EcoRI and Nco
A 600 bp IRES fragment obtained by digestion with I was purified by agarose gel electrophoresis. This DNA fragment was transformed into EcoR of plasmid pBS-NcoBSR with blasticidin S resistance gene.
A plasmid pBS-IRES bsr having an IRES-bsr cassette inserted into the I and NcoI sites was obtained.

【0039】(3)2つのカセットの接続 pBS-intGFP-A, B, Cから、3種のイントロン-GFPカセッ
トを、XhoI及び EcoRI消化によって得た。これらのカセ
ットは、 1.4Kbpの DNA断片としてアガロースゲル電気
泳動法により精製した。この断片を、 pBS-IRESbsrの E
coRI, XhoI部位へ挿入した。これによって、3種のプラ
スミド pBS-intGFP-IRES bsr A, B, Cを得た。
(3) Connection of two cassettes From pBS-intGFP-A, B and C, three intron-GFP cassettes were obtained by digestion with XhoI and EcoRI. These cassettes were purified as a 1.4 Kbp DNA fragment by agarose gel electrophoresis. This fragment was used as the pBS-IRESbsr E
It was inserted into the coRI and XhoI sites. As a result, three types of plasmids, pBS-intGFP-IRES bsr A, B, and C, were obtained.

【0040】(4)ポリアデニル化シグナルの挿入 ポリアデニル化シグナル配列を含むプラスミド pBS-K14
pAEPから挿入断片 (490bp)を EcoT22I及び PstIで消化
し、アガロースゲル電気泳動法によって精製した。EcoT
22Iは切断面の構造が PstIの切断面の構造と同じであ
る。従って PstI消化断片とEcoT22I消化断片とは結合で
きる。この DNA断片を、(3)の3つのプラスミド PstI部
位へ挿入した。得られたプラスミド EcoRIを PstIで消
化した。この操作で正しい構造を持つプラスミドは1.5k
bの断片 IRES-bsr-polyAを生じる。もし断片が PstI部
位に逆向きに挿入された場合は、IRES-bsrの 1.0kbの断
片を生じる。正しい方向にポリアデニル化シグナルの挿
入されたものを野生型 GFPを持つトラップベクターとし
た。
(4) Insertion of polyadenylation signal Plasmid pBS-K14 containing polyadenylation signal sequence
The insert (490 bp) from pAEP was digested with EcoT22I and PstI and purified by agarose gel electrophoresis. EcoT
22I has the same structure of the cut surface as the structure of the cut surface of PstI. Therefore, the PstI digested fragment and the EcoT22I digested fragment can be ligated. This DNA fragment was inserted into the three plasmid PstI sites of (3). The resulting plasmid EcoRI was digested with PstI. The plasmid with the correct structure is 1.5k
This generates fragment IRES-bsr-polyA of b. If the fragment is inserted in the PstI site in the opposite direction, a 1.0 kb fragment of IRES-bsr is generated. The one into which the polyadenylation signal was inserted in the correct direction was used as a trap vector having wild-type GFP.

【0041】(5)IRES-bsr-polyAカセットの作製 変異型GFPを持つトラップベクターの作製のために、IRE
S-bsr-polyAカセットを作製した。(4)と同様に、ポリア
デニル化シグナル断片を調製し、(2)のプラスミド pBS-
IRES bsrの PstI部位に挿入した。同様に EcoRI & PstI
消化で、正方向に挿入した構造の候補を同定した。完成
したプラスミドをpBS-IRESbsrpAと呼ぶ。
(5) Preparation of IRES-bsr-polyA cassette In order to prepare a trap vector having mutant GFP,
An S-bsr-polyA cassette was prepared. In the same manner as in (4), a polyadenylation signal fragment was prepared, and the plasmid pBS-
It was inserted into the PstI site of IRES bsr. Similarly EcoRI & PstI
Digestion identified candidates for the structure inserted in the forward direction. The completed plasmid is called pBS-IRESbsrpA.

【0042】(6)dMV-GFPの作製 5'プライマー(145-5'Xho)として、 (配列番号12)を用い、3'プライマー(145-3'Eco)と
して、 (配列番号13)を用い、GFPのN末端メチオニン及び、
非通常開始コドンの可能性のあるバリン(GTG)及び、ロ
イシン*(CTG)をロイシン(CTC)に変え、バリンをのぞく
ことで、回避することにした。KOD DNAポリメラーゼを
用いた PCR法により、GFPプラスミド(pCMX-SAH/Y145F)
を鋳型として得られた増幅断片を EcoRI及びXhoIで消化
した後、pBSIIの同じ部位に挿入した。
(6) Preparation of dMV-GFP As a 5 ′ primer (145-5′Xho), Using (SEQ ID NO: 12) as a 3 'primer (145-3' Eco) Using (SEQ ID NO: 13), the N-terminal methionine of GFP and
We decided to avoid valine (GTG) and leucine * (CTG), which may have unusual initiation codons, by changing them to leucine (CTC). GFP plasmid (pCMX-SAH / Y145F) by PCR using KOD DNA polymerase
Was digested with EcoRI and XhoI, and inserted into pBSII at the same site.

【0043】(7)dMV-GFPと結合するためのイントロン断
片の再調製 β-グロビンのイントロンは、NcoI切断部位を内部にも
持っているため、(4)で調製したイントロン断片は、Nco
I部位で GFPの開始コドン部分と融合させるために、付
加した NcoIで切断された DNA断片を得るためには、Nco
Iで部分消化する必要があった。これは煩雑な精製操作
を必要とするので、操作を簡便化するために、dMV-GFP
版の作製用に新たにイントロンの部分もつくりなおし
た。5'側プライマー(bg-int5'Xho Ver.2)として、 (配列番号14)を用い、3'側プライマー(bg-int3'Eco
Sal A, B, C)として、 を用いた。3種のプライマーの組み合わせ (5' + 3'A,
5' + 3'B, 5' + 3'C)を用い、イントロンの含まれるプ
ラスミド(pSG5)を鋳型として、KOD DNAポリメラーゼに
よるPCR法で得た増幅 DNA断片を 、EcoRI及びXhoIで消
化後、pBSIIの同部位へ挿入した。完成したプラスミド
を pBS-X intSal-A, B, Cと呼ぶ。
(7) Re-preparation of intron fragment for binding to dMV-GFP Since the intron of β-globin also has an NcoI cleavage site inside, the intron fragment prepared in (4)
To obtain a DNA fragment cut with the added NcoI to fuse with the initiation codon portion of GFP at the I site, NcoI
Partial digestion with I was required. Since this requires a complicated purification operation, dMV-GFP was used to simplify the operation.
A new intron was also reworked for plate making. 5 'primer (bg-int5'Xho Ver.2) (SEQ ID NO: 14) using the 3′-side primer (bg-int3′Eco
Sal A, B, C) Was used. Combination of three primers (5 '+ 3'A,
Using 5 ′ + 3′B, 5 ′ + 3′C), the amplified DNA fragment obtained by the PCR method using KOD DNA polymerase with the intron-containing plasmid (pSG5) as a template, after digestion with EcoRI and XhoI, It was inserted into the same site of pBSII. The completed plasmid is called pBS-X intSal-A, B, C.

【0044】(8)イントロン-dMV-GFPカセットの作製 XhoI とSalI消化により、pBS-X intSal-A, B, Cからイ
ントロン断片を切り出し、アガロースゲル電気泳動法に
より精製した。この断片を、pBS-dMV-GFP plasmidの Xh
oI部位に挿入した。正しい構造のプラスミドは、XhoI,
EcoRI消化によって、1.4kbの断片を生じることで確認し
た。イントロン断片が逆向きに挿入されると、0.8kbの
断片を生じる。完成したプラスミドをpBS-intdMVGFP-
A, B, Cと呼ぶ。
(8) Preparation of Intron-dMV-GFP Cassette An intron fragment was cut out from pBS-X intSal-A, B and C by digestion with XhoI and SalI, and purified by agarose gel electrophoresis. This fragment was converted to Xh of pBS-dMV-GFP plasmid.
Inserted at the oI site. Correctly constructed plasmids are XhoI,
It was confirmed that a 1.4 kb fragment was generated by EcoRI digestion. Insertion of the intron fragment in the reverse direction results in a 0.8 kb fragment. The completed plasmid is called pBS-intdMVGFP-
Call them A, B, C.

【0045】(9)(5)の IRES-bsr-polyAカセット (1.6k
b)を、pBS-IRESbsrpAより EcoRI, PstIで消化すること
で得たのち、アガロースゲル電気泳動法により精製し
た。(8)の3つのプラスミドを EcoRI, PstIで消化したの
ち、IRES bsrpAカセットを挿入して、完成させた。完成
した遺伝子トラップベクターは、プラスミドより XhoI
及び、PstIで消化することによって、3kbの DNA断片と
して得られる。しかしながら、骨格となっている pBSII
も同じサイズであるため、このままではアガロースゲル
電気泳動法によってトラップベクター部分を精製できな
い。この問題を解決するため、骨格の pBSII部分のみを
切断し、トラップベクターの部分を切断しない制限酵素
として、AseIが適することを見出した。これに従って完
成した遺伝子トラップベクターを含む3種のプラスミド
はいずれもXhoI、PstI、AseIの3種の制限酵素を用いて
切断し、アガロースゲル電気泳動法によって分離し、3
kbのDNA断片を陰イオン交換膜への吸着法を利用して精
製した。該トラップベクターの全塩基配列を配列番号1
8に示す。
(9) The IRES-bsr-polyA cassette of (5) (1.6 k
b) was obtained by digesting pBS-IRESbsrpA with EcoRI and PstI, and then purified by agarose gel electrophoresis. After digesting the three plasmids (8) with EcoRI and PstI, the IRES bsrpA cassette was inserted to complete the plasmid. The completed gene trap vector is XhoI
And, it is obtained as a 3 kb DNA fragment by digestion with PstI. However, the skeleton pBSII
Since these are also the same size, the trap vector portion cannot be purified by agarose gel electrophoresis as it is. In order to solve this problem, they found that Asel was suitable as a restriction enzyme that cuts only the pBSII portion of the backbone and does not cut the trap vector portion. All three plasmids including the gene trap vector completed in this manner were cut with three restriction enzymes XhoI, PstI and Asel, separated by agarose gel electrophoresis, and
The DNA fragment of kb was purified using an adsorption method to an anion exchange membrane. SEQ ID NO: 1
FIG.

【0046】実施例2 トラップベクターの細胞への導入及び緑色蛍光タンパク
質を発現する細胞の選択 (細胞株の樹立)実施例1で得られたトラップベクター
を以下のようにしてラット細胞PC12ASK1へ導入
した。精製した線状化トラップベクターは、1mg/mlの濃
度になるように精製水に溶解しておく。トランスフェク
ションを行う 2日前に宿主細胞をPBS(-)ではがし、培地
中でピペッティングすることで細胞の大きなかたまりを
のぞいておく。さらに、21ゲージ針をつけた 10mlシリ
ンジの中を 10回往復させることで、ほぼ完全に単一細
胞の状態にしておく。これを 4 x 106cells/ 90 mm径デ
ィッシュの濃度でまき込んでおく。
Example 2 Introduction of Trap Vector into Cells and Selection of Cells Expressing Green Fluorescent Protein (Establishment of Cell Line) The trap vector obtained in Example 1 was introduced into rat cell PC12ASK1 as follows. . The purified linearized trap vector is dissolved in purified water to a concentration of 1 mg / ml. Two days before transfection, detach the host cells with PBS (-) and remove large clumps of cells by pipetting in the medium. Furthermore, the cells are reciprocated 10 times in a 10-ml syringe equipped with a 21-gauge needle to make the cells almost completely a single cell. Spread it at a concentration of 4 x 10 6 cells / 90 mm diameter dish.

【0047】トランスフェクション当日は以下のような
操作を行なう:メディウムを吸引して除く。10mlの PBS
(-)(室温)で洗浄する。10mlの PBS(-)(室温)を加えて、
CO2インキュベーターで 10分間保温する。ピペッティン
グにより、細胞をディッシュからはがす。50mlのコニカ
ルプラスチックチューブに移す。700rpm 2分間の遠心に
より、細胞を沈殿させる。上清を吸引によって除く。沈
殿にメディウムを 10ml加える。21ゲージ針をつけた 10
mlシリンジの中を5回通す。細胞数を計測する。この際
に、細胞が 95%以上、単細胞になっていることを確認
し、生細胞が 90%以上であることを確認する。700rpmで
再遠心し、上清を吸引して捨てる。細胞の密度が、5 x
106cells/mlとなるように PBS(-)に懸濁する。氷上で保
冷する。エッペンドルフチューブ (1.5ml, 全てオート
クレーブ滅菌)に 0.8mlの氷上で引き続き、10分間保冷
する。この間に、トランスフェクションの回数分 20ml
のメディウムを 50mlのコニカルプラスチックチューブ
に分注し、氷上で保冷しておく。同時に、エレクトロポ
レーション用のキュベットも包装紙につつまれた状態
で、氷にうめて保冷しておく。
On the day of transfection, the following operations are performed: the medium is removed by suction. 10 ml PBS
Wash with (-) (room temperature). Add 10 ml PBS (-) (room temperature)
Incubate for 10 minutes in a CO 2 incubator. Cells are removed from the dish by pipetting. Transfer to a 50 ml conical plastic tube. The cells are pelleted by centrifugation at 700 rpm for 2 minutes. The supernatant is removed by aspiration. Add 10 ml of medium to the precipitate. 10 with 21 gauge needle
Pass 5 times through the ml syringe. Count the number of cells. At this time, confirm that cells are 95% or more and single cells, and that live cells are 90% or more. Centrifuge again at 700 rpm, aspirate the supernatant and discard. 5 x cell density
Suspend the cells in PBS (-) to a concentration of 10 6 cells / ml. Keep on ice. Continue to cool in an Eppendorf tube (1.5 ml, all autoclaved) on 0.8 ml of ice for 10 minutes. During this time, 20 ml for the number of transfection
Dispense the medium into a 50 ml conical plastic tube and keep it on ice. At the same time, the cuvette for electroporation is wrapped in wrapping paper and kept in ice to keep it cool.

【0048】ジーンパルサーII(BIORAD社)の設定は以下
の条件で行った。0.4cm gap cuvetteを使用;Capacitan
ce extenderを使用;並列抵抗は接続せず;0.4cm gap c
uvetteを使用;印加電圧0.25kV;静電容量500μF。
The setting of Gene Pulser II (BIORAD) was performed under the following conditions. Use 0.4cm gap cuvette; Capacitan
Use ce extender; no parallel resistor connected; 0.4cm gap c
Use uvette; applied voltage 0.25 kV; capacitance 500 μF.

【0049】0.8mlの細胞とDNAとの混合液をキュベット
に加え、次に電気パルスを1回加える。氷上の 20mlメデ
ィウムの中へ、キュベット中の混合液をすばやく移しか
え、氷上で30分間保冷する。この間に(1回のトランスフ
ェクション当たり)5枚の150mm径ディッシュに 10mlずつ
メディウムを分注しておく。次に30mlのメディウムを加
え、10mlずつ 5枚のディッシュに分注する。CO2インキ
ュベーターに入れ、10% CO2, 37℃の状態で培養する。2
4時間後に、2.0μg/mlの終濃度になるようにブラストサ
イジン-Sを加える。実際には、メディウム中に 10μg/m
lのブラストサイジンSを含む5倍濃縮液をつくってお
き、この溶液をディッシュ一枚あたり5mlずつ加えるよ
うにする。CO2インキュベーター内に静置し、少なくと
も 14日間は動かさない。
0.8 ml of the mixture of cells and DNA is added to the cuvette, and then an electric pulse is applied once. Quickly transfer the mixture in the cuvette into a 20 ml medium on ice and keep on ice for 30 minutes. During this time, 10 ml of medium is dispensed into five 150 mm dishes (per transfection). Next, add 30 ml of medium and dispense 10 ml into 5 dishes. Place in a CO 2 incubator and culture at 10% CO 2 at 37 ° C. Two
After 4 hours, add blasticidin-S to a final concentration of 2.0 μg / ml. Actually, 10 μg / m in medium
Make a 5-fold concentrate containing 1 blasticidin S, and add 5 ml of this solution to each dish. Leave in the CO 2 incubator for at least 14 days.

【0050】得られたブラストサイジンS耐性コロニー
は6穴の培養皿へ一個ずつ移して培養し、水浸対物レン
ズを装着した蛍光顕微鏡で観察した。GFPの緑色蛍光を
示す細胞株を選択して培養を続け、以下の解析に用い
た。緑色蛍光を発する24の細胞株(以下dMV細胞と
呼ぶ)の中、緑色蛍光が、細胞全体で観察されるものが
8つ、細胞質で観察されるものが11、核で観察される
ものが2つ、ミトコンドリアで観察されるものが2つ、
核膜で観察されるものが1つであった。dMV-8 細胞は全
体が一様に蛍光を発している細胞株として同定したもの
である。ヒトレチクロンラットホモローグの一種のN末
端47アミノ酸と融合したGFPが発現している。dMV-7は
細胞核に蛍光が見られた細胞として同定したものであ
る。ラットZO-1のN-末端196アミノ酸と融合したGFP
が発現している。dMV-37は細胞質に蛍光が見られた細胞
として同定したものである。AnnexinIIのN-末端51ア
ミノ酸の領域と融合したGFPが発現している。dMV-38は
ミトコンドリアに蛍光が見られた細胞株として同定した
ものである。ribosomal protein L19のN-末端37アミ
ノ酸の領域と融合したGFPが発現している。222-17は核
内膜に蛍光が見られた細胞株として同定したものであ
る。Nucleoporin153のN-末端615アミノ酸の領域と融
合したGFPが発現している。
The obtained blasticidin S resistant colonies were transferred one by one to a 6-well culture dish, cultured, and observed with a fluorescence microscope equipped with a water immersion objective lens. A cell line showing green fluorescence of GFP was selected and cultured, and used for the following analysis. Of the 24 cell lines that emit green fluorescence (hereinafter referred to as dMV cells), 8 green fluorescence is observed in the whole cell, 11 is observed in the cytoplasm, and 2 is observed in the nucleus. Two things are observed in mitochondria,
One was observed in the nuclear envelope. dMV-8 cells were identified as a cell line that emits fluorescence uniformly throughout. GFP fused to the N-terminal 47 amino acids of a kind of human reticulon rat homolog is expressed. dMV-7 was identified as a cell with fluorescence in the cell nucleus. GFP fused to the N-terminal 196 amino acids of rat ZO-1
Is expressed. dMV-37 was identified as a cell whose fluorescence was observed in the cytoplasm. GFP fused to the N-terminal 51 amino acid region of AnnexinII is expressed. dMV-38 was identified as a cell line that showed fluorescence in mitochondria. GFP fused to the N-terminal 37 amino acid region of ribosomal protein L19 is expressed. 222-17 was identified as a cell line that showed fluorescence in the inner nuclear membrane. GFP fused to the N-terminal 615 amino acid region of Nucleoporin 153 is expressed.

【0051】図2は、細胞株dMV−8,dMV−7,
dMV−37、dMV−38、及び222−17の顕微
鏡写真である。図2において、左から順に各細胞の蛍光
像、DAP1染色した核の蛍光像、及び位相差像であ
る。細胞株dMV−8ではGFPが細胞全体に存在し、
dMV−7ではGFPが核に存在し、dMV−37では
GFPが細胞質に存在し、dMV−38ではGFPがミ
トコンドリアに存在し、222−17ではGFPが核膜
に存在することがわかる。細胞株dMV‐7、dMV‐8、dMV
‐37及びdMV‐38は、それぞれRat pheochromocytoma PC
12ASK1dMV-7、Ratpheochromocytoma PC12ASK1dMV-8、Ra
t pheochromocytoma PC12ASK1dMV-37及びRat pheochrom
ocytoma PC12ASK1dMV-38という名称で、それぞれ受託番
号 FERM P-17645, FERM P-17646, FERM P-17647 及び F
ERM P-17648 として工業技術院生命工学工業技術研究所
に寄託した。
FIG. 2 shows cell lines dMV-8, dMV-7,
It is a microscope photograph of dMV-37, dMV-38, and 222-17. In FIG. 2, a fluorescent image of each cell, a fluorescent image of a DAP1-stained nucleus, and a phase contrast image are shown in order from the left. In cell line dMV-8, GFP is present throughout the cell,
In the case of dMV-7, GFP is present in the nucleus, in the case of dMV-37, GFP is present in the cytoplasm, in the case of dMV-38, GFP is present in the mitochondria, and in the case of 222-17, GFP is present in the nuclear membrane. Cell lines dMV-7, dMV-8, dMV
-37 and dMV-38 are Rat pheochromocytoma PC
12ASK1dMV-7, Ratpheochromocytoma PC12ASK1dMV-8, Ra
t pheochromocytoma PC12ASK1dMV-37 and Rat pheochrom
ocytoma PC12ASK1dMV-38, accession numbers FERM P-17645, FERM P-17646, FERM P-17647 and F, respectively
Deposited as ERM P-17648 with the Research Institute of Biotechnology and Industrial Technology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology.

【0052】実施例3 細胞株の解析 実施例2で得られた、GFPの緑色蛍光を示す細胞株を
10cm培養皿で増殖させ、凍結保存し、タンパク質を抽出
した。抽出したタンパク質について、抗GFP抗体を用い
てウェスタンブロッティングで解析した。ウサギ抗GFP
抗体はClontech社又は MBL社より入手でき、1/200
0希釈の濃度で使用した。ウエスタンブロッティング解
析により、未融合のGFP(約27kD)と比較して分子量の
大きくなった融合タンパク質を発現している細胞を同定
した。図3はウエスタンブロッティング解析の結果を示
す。図中の数字は細胞株の整理番号を示し、右端は非融
合のGFPの場合を示す。
Example 3 Analysis of Cell Line The cell line showing GFP green fluorescence obtained in Example 2 was
Propagated in 10 cm culture dishes, cryopreserved and protein extracted. The extracted protein was analyzed by Western blotting using an anti-GFP antibody. Rabbit anti-GFP
Antibodies are available from Clontech or MBL;
Used at a concentration of 0 dilution. By western blotting analysis, cells expressing a fusion protein having a higher molecular weight than unfused GFP (about 27 kD) were identified. FIG. 3 shows the results of Western blot analysis. The numbers in the figure indicate the serial numbers of the cell lines, and the right end indicates the case of non-fused GFP.

【0053】以下に詳細に記載するように、それらの細
胞からpoly(A)+ RNAを精製し、5'RACE法によって、GFP
融合遺伝子を同定し、緑色蛍光タンパク質に融合したタ
ンパク質のcDNAの配列を決定し、同定した。GFPの
蛍光を示す細胞株を 10cmディッシュに培養し、Milteny
i Biotec社製のμMACS mRNA Isolation Kitを用いて、1
つの細胞株につき1 x 107cellsから直接Poly(A)+ RNAを
精製した。2〜10μgの Poly(A)+RNAが得られたが、この
うち 500ngの poly(A)+RNAを用いて、5'RACE法を行っ
た。5'RACE法は、LIFE TECHNOLOGIES社の 5'RACE Syste
m, version 2.0 kitを用いて行った。全ての操作は製造
者の使用説明書に従って行った。cDNAを合成し、増幅す
るのに用いた GFP特異的プライマーの配列は、以下のと
おりである。 OgGFP3:5'-GAA CTT CAG GGT CAG CTT GCC-3'(配列番号
19) OgGFP5:5'-TGA ACT TGT GGC CGT TCA CGT CGC CGT CCA
GCT C-3'(配列番号20) OgGFP7:5'-GAC CAG GAT GGG CAC CAC CCC GGT GAA CAG
CTC-3'(配列番号21)
As described in detail below, poly (A) + RNA was purified from those cells, and GFP was purified by the 5'RACE method.
The fusion gene was identified, and the sequence of the cDNA of the protein fused to the green fluorescent protein was determined and identified. Culture the cell line showing GFP fluorescence in a 10 cm dish,
i Using BioMAC μMACS mRNA Isolation Kit,
Poly (A) + RNA was directly purified from 1 × 10 7 cells per cell line. 2-10 μg of Poly (A) + RNA was obtained, and the 5′RACE method was performed using 500 ng of Poly (A) + RNA. The 5'RACE method is based on the 5'RACE System of LIFE TECHNOLOGIES.
m, using a version 2.0 kit. All operations were performed according to the manufacturer's instructions. The sequences of the GFP-specific primers used to synthesize and amplify the cDNA are as follows. OgGFP3: 5'-GAA CTT CAG GGT CAG CTT GCC-3 '(SEQ ID NO: 19) OgGFP5: 5'-TGA ACT TGT GGC CGT TCA CGT CGC CGT CCA
GCT C-3 '(SEQ ID NO: 20) OgGFP7: 5'-GAC CAG GAT GGG CAC CAC CCC GGT GAA CAG
CTC-3 '(SEQ ID NO: 21)

【0054】(1)まず、OgGFP3を用いて逆転写酵素によ
り、cDNAを合成する。 (2)次に、cDNAの 5'端にターミナルデオキシヌクレオチ
ジルトランスフェラーゼにより、ポリdCを合成する。 (3)この cDNAを精製したのち、OgGFP5及び、キットに付
属する5' RACE AbridgedAnchor Primer 5'-GGC CAC GCG TCG ACT AGT ACG GGI IGG GII GGG IIG
-3' (配列番号22)を用いてPCRを行った。 (4)この PCR産物を希釈して、OgGFP7プライマー及び、A
bridged Universal Amplification Primer (AUAP)
5'-GGC CAC GCG TCG ACT AGT AC-3' (配列番号23)を用いて nested -PCRを行い、目的の
産物を得た。 (5)この PCR産物は、アガロースゲル電気泳動法によっ
て精製を行い、T-vector(Novagen社製 pT7Blue-T vecto
r)に挿入後、大腸菌株 DH5aに導入し、プラスミド DNA
として回収して塩基配列決定を行った。表1は、以上の
ようにして同定したGFPに融合したタンパク質を、そ
れを発現する細胞及び該融合タンパク質の細胞内局在性
と共に示す。
(1) First, cDNA is synthesized by reverse transcriptase using OgGFP3. (2) Next, poly dC is synthesized at the 5 'end of the cDNA using terminal deoxynucleotidyl transferase. (3) After purifying this cDNA, OgGFP5 and 5 'RACE Abridged Anchor Primer 5'-GGC CAC GCG TCG ACT AGT ACG GGI IGG GII GGG IIG attached to the kit
PCR was performed using -3 ′ (SEQ ID NO: 22). (4) Dilute the PCR product and add OgGFP7 primer and A
bridged Universal Amplification Primer (AUAP)
Nested-PCR was performed using 5′-GGC CAC GCG TCG ACT AGT AC-3 ′ (SEQ ID NO: 23) to obtain the desired product. (5) This PCR product was purified by agarose gel electrophoresis, and the T-vector (pT7Blue-T vecto
r) and introduced into Escherichia coli strain DH5a.
And the nucleotide sequence was determined. Table 1 shows the proteins fused to GFP identified as described above, together with the cells expressing the proteins and the intracellular localization of the fusion proteins.

【0055】[0055]

【表1】 細胞株 融合タンパク質 GFPに融合したタンパク質 の細胞内局在性 dMV-8 細胞全体 ヒトレチクロンラットホモローグ dMV-7 核 ヒトZO-1 ラットホモローグ dMV-37 細胞質 アネキシン II dMV-38 ミトコンドリア リボソーマルプロテインL19222-17 核膜 ヌクレオポリン 153 [Table 1] Cell line Fusion protein Intracellular localization of protein fused to GFP dMV-8 Whole cell human reticulon rat homolog dMV-7 nucleus human ZO-1 rat homolog dMV-37 cytoplasm Annexin II dMV-38 mitochondrial ribosomal protein L19 222 -17 Nuclear membrane nucleoporin 153

【0056】実施例4 GFP発現プラスミドの調製と細胞局在性の確認 GFP融合タンパク質の発現プラスミドを、5'RACE法で解
析した塩基配列に基づき、融合タンパク質の開始コドン
部分を含むPCRセンスプライマーをつくり、GFPのカルボ
キシ末端に対応するアンチセンスプライマーとの間でRT
-PCRを行って得たPCR産物を発現ベクターpCIneo (Prome
ga社製)にサブクローニングすることにより調製した。
次にGFP融合タンパク質の発現プラスミドはリポフェク
トアミンプラス(ライフテックオリエンタル社)を用い
たリポフェクション法で親株のPC12ASK1細胞へ導入し
た。トランスフェクション後24時間〜48時間の間に
蛍光顕微鏡で観察し細胞局在性を確認した。
Example 4 Preparation of GFP Expression Plasmid and Confirmation of Cell Localization Based on the nucleotide sequence of the GFP fusion protein expression plasmid analyzed by the 5′RACE method, a PCR sense primer containing the initiation codon portion of the fusion protein was used. RT with the antisense primer corresponding to the carboxy terminus of GFP
-The PCR product obtained by performing PCR is transferred to the expression vector pCIneo (Prome
(manufactured by ga Co., Ltd.).
Next, the expression plasmid for the GFP fusion protein was introduced into parent PC12ASK1 cells by lipofection using Lipofectamine Plus (Lifetech Oriental). Between 24 hours and 48 hours after transfection, the cells were observed under a fluorescent microscope to confirm cell localization.

【0057】[0057]

【発明の効果】これまでGFPをレポーターとして用いた
実用的な遺伝子トラップ法の報告はなかったが、本法で
それが初めて実現した。本法の特徴はレポーター遺伝子
GFPを生きたままの細胞で観察できることで、これは従
来の他の遺伝子トラップ法では実現されていなかった点
である。トラップした遺伝子断片とGFPの融合タンパク
質を直接観察できるので、トラップ遺伝子産物の細胞内
局在を十分な精度で同定できる点が特徴である。これ
は、β-ガラクトシダーゼ遺伝子をレポーターとした従
来の方法では不可能であった。本発明の方法により、GF
P融合タンパク質の様々な細胞内局在をしめす細胞株が
得られる。実際にどの遺伝子と融合しているかを比較的
容易に解析できるので、様々な細胞機能の研究に応用可
能な細胞株を作り出せる。一方、本GFP遺伝子トラップ
法を用いれば、個々の遺伝子産物に特異的なプローブを
調製することなくその細胞内局在を明らかにでき、さら
に細胞を生きたまま観察しながら遺伝子産物の細胞内局
在を追跡することができるのである。つまり、間接免疫
組織化学法と相補的な実験技術を提供できるのである。
融合タンパク質を細胞内の様々な領域へと分配するシグ
ナルをもつcDNA断片および、そのGFP融合タンパク質を
発現する発現プラスミドを得ることができる。本法の適
用によって、特定の細胞小器官を生細胞で標識する技術
開発が行える。
Although no practical gene trap method using GFP as a reporter has been reported so far, this method has been realized for the first time by this method. The feature of this method is the reporter gene
The fact that GFP can be observed in living cells, which has not been realized by other conventional gene trapping methods. A characteristic feature is that the fusion protein of the trapped gene fragment and GFP can be directly observed, so that the intracellular localization of the trapped gene product can be identified with sufficient accuracy. This was not possible with the conventional method using the β-galactosidase gene as a reporter. According to the method of the present invention, GF
Cell lines exhibiting various subcellular localizations of the P fusion protein are obtained. Since it is relatively easy to analyze which gene is actually fused, a cell line that can be applied to various cell function studies can be created. On the other hand, by using the present GFP gene trap method, it is possible to clarify the intracellular localization of each gene product without preparing a probe specific to the gene product. You can track your location. That is, it can provide an experimental technique complementary to the indirect immunohistochemistry method.
A cDNA fragment having a signal for distributing the fusion protein to various regions in a cell, and an expression plasmid expressing the GFP fusion protein can be obtained. By applying this method, it is possible to develop a technique for labeling specific organelles with living cells.

【0058】本ベクターは広汎な動物細胞に適用可能で
あると考えられ、ベクターDNAそのものが研究用のツ
ールとして用いることができ、商品化も可能であり、産
業上利用可能性を有する。つまり、実験手技的に特殊な
テクニックあるいは実験装置を必要とせず、比較的一般
的な動物細胞培養装置一式と電気穿孔装置及び蛍光顕微
鏡があれば行える実験方法であるため、一般的な実験手
技として利用される可能性を持つものである。本ベクタ
ーによる遺伝子トラップ実験は染色体改変技術でもあ
り、胚性幹細胞(ES細胞)に適用すれば、遺伝子破壊
動物を作製することが可能であると考えられる。遺伝子
破壊をアトランダムに行った後に破壊された遺伝子を同
定したES細胞のコレクションは遺伝子の機能を動物個
体レベルで解析するための、あるいは疾患モデル動物作
製のための貴重な研究資源であると考えられ、既に商品
化されている(米国Lexicon Genetics Incorporated Om
ni Bank Program)。
The present vector is considered to be applicable to a wide variety of animal cells, and the vector DNA itself can be used as a research tool, can be commercialized, and has industrial applicability. In other words, it is an experimental method that does not require special techniques or experimental equipment in the experimental technique and can be performed with a relatively general set of animal cell culture devices, an electroporation device, and a fluorescence microscope. It has the potential to be used. The gene trap experiment using this vector is also a chromosome modification technique, and if applied to embryonic stem cells (ES cells), gene-disrupted animals can be produced. A collection of ES cells that identified the disrupted gene after gene disruption at random was considered a valuable research resource for analyzing the function of the gene at the individual animal level or for producing disease model animals. Has already been commercialized (US Lexicon Genetics Incorporated Om
ni Bank Program).

【0059】本法によって作製された細胞は特定の細胞
小器官を生きたまま観察できるため、細胞小器官を標的
としてその形成を阻害したり促進したりする薬剤のスク
リーニングに貴重な実験系を提供することができる。従
って、本発明の細胞も産業上の利用可能性を有する。
Since cells produced by this method can observe specific organelles alive, they provide a valuable experimental system for screening drugs that target organelles and inhibit or promote their formation. can do. Therefore, the cells of the present invention also have industrial applicability.

【0060】[0060]

【配列表】 Sequence Listing <110> Osaka Bioscience Institute <120> Gene trap using green fluorescence protein <130> 167063 <160> 23[Sequence List] Sequence Listing <110> Osaka Bioscience Institute <120> Gene trap using green fluorescence protein <130> 167063 <160> 23

【0061】 <210> 1 <211> 260 <212> PRT <213> Aguorea victoria <400> Ser Lys Gly Glu Glu Leu Phe Thr Gly Val Val Pro Ile Leu Val Glu 5 10 15 Leu Asp Gly Asp Val Asn Gly His Lys Phe Ser Val Ser Gly Glu Gly 20 25 30 Glu Gly Asp Ala Thr Tyr Gly Lys Leu Thr Leu Lys Phe Ile Cys Thr 35 40 45 Thr Gly Lys Leu Pro Val Pro Trp Pro Thr Leu Val Thr Thr Phe Ala 50 55 60 Tyr Gly Val Gln Cys Phe Ser Arg Tyr Pro Asp His Met Lys Gln His 65 70 75 80 Asp Phe Phe Lys Ser Ala Met Pro Glu Gly Tyr Val Gln Glu Arg Thr 85 90 95 Ile Phe Phe Lys Asp Asp Gly Asn Tyr Lys Thr Arg Ala Glu Val Lys 100 105 110 Phe Glu Gly Asp Thr Leu Val Asn Arg Ile Glu Leu Lys Gly Ile Asp 115 120 125 Phe Lys Glu Asp Gly Asn Ile Leu Gly His Lys Leu Glu Tyr Asn Phe 130 135 140 Asn Ser His Asn Val Tyr Ile Met Ala Asp Lys Gln Lys Asn Gly Ile 145 150 160 165 Lys Val Asn Phe Lys Ile Arg His Asn Ile Glu Asp Gly Ser Val Gln 170 175 180 Leu Ala Asp His Tyr Gln Gln Asn Thr Pro Ile Gly Asp Gly Pro Val 185 190 200 Leu Leu Pro Asp Asn His Tyr Leu Ser Thr Gln Ser Ala Leu Ser Lys 205 210 215 Asp Pro Asn Glu Lys Arg Asp His Met Val Leu Leu Glu Phe Val Thr 220 225 230 Ala Ala Gly Ile Thr His Gly Met Asp Glu Leu Tyr Lys Ser Gly Gly 235 240 245 250 Ser Thr Ile Ser Gly Ser Trp Pro Ala Ser 255 260<210> 1 <211> 260 <212> PRT <213> Aguorea victoria <400> Ser Lys Gly Glu Glu Leu Phe Thr Gly Val Val Pro Ile Leu Val Glu 5 10 15 Leu Asp Gly Asp Val Asn Gly His Lys Phe Ser Val Ser Gly Glu Gly 20 25 30 Glu Gly Asp Ala Thr Tyr Gly Lys Leu Thr Leu Lys Phe Ile Cys Thr 35 40 45 Thr Gly Lys Leu Pro Val Pro Trp Pro Thr Leu Val Thr Thr Phe Ala 50 55 60 Tyr Gly Val Gln Cys Phe Ser Arg Tyr Pro Asp His Met Lys Gln His 65 70 75 80 Asp Phe Phe Lys Ser Ala Met Pro Glu Gly Tyr Val Gln Glu Arg Thr 85 90 95 Ile Phe Phe Lys Asp Asp Gly Asn Tyr Lys Thr Arg Ala Glu Val Lys 100 105 110 Phe Glu Gly Asp Thr Leu Val Asn Arg Ile Glu Leu Lys Gly Ile Asp 115 120 125 Phe Lys Glu Asp Gly Asn Ile Leu Gly His Lys Leu Glu Tyr Asn Phe 130 135 140 Asn Ser His Asn Val Tyr Ile Met Ala Asp Lys Gln Lys Asn Gly Ile 145 150 160 165 Lys Val Asn Phe Lys Ile Arg His Asn Ile Glu Asp Gly Ser Val Gln 170 175 180 Leu Ala Asp His Tyr Gln Gln Asn Thr Pro Ile Gly Asp Gly Pro Val 185 190 200 Leu Leu Pro Asp Asn His Tyr Leu Ser Thr Gln Ser Ala Leu Ser Lys 205 210 215 Asp Pro Asn Glu Lys Arg Asp His Met Val Leu Leu Glu Phe Val Thr 220 225 230 Ala Ala Ala Gly Ile Thr His Gly Met Asp Glu Leu Tyr Lys Ser Gly Gly 235 240 245 250 Ser Thr Ile Ser Gly Ser Trp Pro Ala Ser 255 260

【0062】 <210> 2 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> actttggcag ataagcttct aggtaac 27<210> 2 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> actttggcag ataagcttct aggtaac 27

【0063】 <210> 3 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttgaattcc tagctagctg gccagga 27<210> 3 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttgaattcc tagctagctg gccagga 27

【0064】 <210> 4 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttgaattcc ccatggtgaa aacatttaac atttct 36<210> 4 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttgaattcc ccatggtgaa aacatttaac atttct 36

【0065】 <210> 5 <211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttctgcagc atatggtaaa acttttaatt tcgggtata 39<210> 5 <211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttctgcagc atatggtaaa acttttaatt tcgggtata 39

【0066】 <210> 6 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttgaattca tgcatcctag gaggcccccc gtgtgg 36<210> 6 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttgaattca tgcatcctag gaggcccccc gtgtgg 36

【0067】 <210> 7 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttctgcaga ttctccaagg aatccctgat 30<210> 7 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttctgcaga ttctccaagg aatccctgat 30

【0068】 <210> 8 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttctcgagc tttctttttc gctattg 27<210> 8 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttctcgagc tttctttttc gctattg 27

【0069】 <210> 9 <211> 31 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gaattcccat ggaccaaaat gatgagacag c 31<210> 9 <211> 31 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gaattcccat ggaccaaaat gatgagacag c 31

【0070】 <210> 10 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattcc catggaacca aaatgatgag acagc 35<210> 10 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattcc catggaacca aaatgatgag acagc 35

【0071】 <210> 11 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattc ccatggaaacc aaaatgatga gacagc 36<210> 11 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattc ccatggaaacc aaaatgatga gacagc 36

【0072】 <210> 12 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> aagaagctcg agagcaaggg cgaggagctc ttcaccgggg tggtgccc 48<210> 12 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> aagaagctcg agagcaaggg cgaggagctc ttcaccgggg tggtgccc 48

【0073】 <210> 13 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttgaattcc tagctagctg gccagga 27<210> 13 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttgaattcc tagctagctg gccagga 27

【0074】 <210> 14 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttctcgagc tttcttittt ttcgctattg 30<210> 14 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tttctcgagc tttcttittt ttcgctattg 30

【0075】 <210> 15 <211> 34 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattcg tcgacaccaa aatgatgaga cagc 34<210> 15 <211> 34 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattcg tcgacaccaa aatgatgaga cagc 34

【0076】 <210> 16 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattcg tcgacaacca aaatgatgag acagc 35<210> 16 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattcg tcgacaacca aaatgatgag acagc 35

【0077】 <210> 17 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattcg tcgacaaacc aaaatgatga gacagc 36<210> 17 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gatgaattcg tcgacaaacc aaaatgatga gacagc 36

【0078】 <210> 18 <211> 2917 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gtgagtttgg ggacccttga ttgttctttc tttttcgcta ttgtaaaatt catgttatat 60 ggagggggca aagttttcag ggtgttgttt agaatgggaa gatgtccctt gtatcaccat 120 ggaccctcat gataattttg tttctttcac tttctactct gttgacaacc attgtctcct 180 cttattttct tttcattttc tgtaactttt tcgttaaact ttagcttgca tttgtaacga 240 atttttaaat tcacttttgt ttatttgtca gattgtaagt actttctcta atcacttttt 300 tttcaaggca atcagggtat attatattgt acttcagcac agttttagag aacaattgtt 360 ataattaaat gataaggtag aatatttctg catataaatt ctggctggcg tggaaatatt 420 cttattggta gaaacaacta caccctggtc atcatcctgc ctttctcttt atggttacaa 480 tgatatacac tgtttgagat gaggataaaa tactctgagt ccaaaccggg cccctctgct 540 aaccatgttc atgccttctt ctctttccta cagctcctgg gcaacgtgct gcaacgtgct 600 ggttgttgtg ctgtctcatc attttccatg gtgagcaagg gcgaggagct gttcaccggg 660 gtggtgccca tcctggtcga gctggacggc gacgtgaacg gccacaagtt cagcgtgtcc 720 ggcgagggcg agggcgatgc cacctacggc aagctgaccc tgaagttcat ctgcaccacc 780 ggcaagctgc ccgtgccctg gcccacacta gtgaccacct tcgcttacgg cgtgcagtgc 840 ttcagccgct accccgacca catgaagcag cacgacttct tcaagtccgc catgcccgaa 900 ggctacgtcc aggagcgcac catcttcttc aaggacgacg gcaactacaa gacccgcgcc 960 gaggtgaagt tcgagggcga caccctggtg aaccgcatcg agctgaaggg catcgacttc 1020 aaggaggacg gcaacatcct ggggcacaag ctggagtaca acttcaacag ccacaacgta 1080 tacatcatgg ccgacaagca gaagaacggc atcaaggtga acttcaagat ccgccacaac 1140 atcgaggacg gcagcgtgca gctcgccgac cactaccagc agaacacccc catcggcgac 1200 ggccccgtgc tgctgcccga caaccactac ctgagcaccc agtccgccct gagcaaagac 1260 cccaacgaga agcgcgatca catggtcctg ctggagttcg tgaccgccgc cgggatcact 1320 cacggcatgg acgagctgta caagtcaggc gggtcgacga tatcaggatc ctggccagct 1380 agctaggaat tccgcccctc tccctccccc ccccctaacg ttactggccg aagccgcttg 1440 gaataaggcc ggtgtgcgtt tgtctatatg ttattttcca ccatattgcc gtcttttggc 1500 aatgtgaggg ggcccccccc ggaaacctgg ccctgtcttc ttgacgagca ttcctagggg 1560 tctttcccct ctcgccaaag gaatgcaagg tctgttgaat gtcgtgaagg aagcagttct 1620 ctggaagctt cttgaagaca aacaacgtct gtagcgaccc tttgcaggca gcgggaaccc 1680 cccacctggc gacaggggtt gccctctgcg gccaaaagcc acgtgtataa gatacacctg 1740 caaaggcggc acaaccccag tgccacgttg tgagttggat agttgtggaa agagtcaaat 1800 gggctctcct caagcgtatt caacaagggg ctgaaggatt ttgcccagaa agggtaaccc 1860 cattgtatgg gatctgatct ggggcctcgg tgcacatgct tttacatgtg tttagtcgag 1920 gttaaaaaac gtctaggccc cccccgaacc acggggacgt ggttttcctt tgaaaaacac 1980 gatgataagc ttRgccacaa ccatgaaaac atttaacatt tctcaacaag atctagaatt 2040 agtagaagta gcgacagaga agattacaat gctttatgag gataataaac atcatgtggg 2100 agcggcaatt cgtacgaaaa caggagaaat catttcggca gtacatattg aagcgtatat 2160 aggacgagta actgtttgtg cagaagccat tgcgattggt agtgcagttt cgaatggaca 2220 aaaggatttt gacacgattg tagctgttag acacccttat tctgacgaag tagatagaag 2280 tattcgagtg gtaagtcctt gtggtatgtg tagggagttg atttcagact atgcaccaga 2340 ttgttttgtg ttaatagaaa tgaatggcaa gttagtcaaa actacgattg aagaactcat 2400 tccactcaaa tatacccgaa attaacctag gaggcccccc gtgtggacac agatcccact 2460 ggaagatccc ctctcctgcc caagcacttc acagctggac cctgcttcac cctcaccccc 2520 tcctggcaat caatacagct tcattatctg agttgcataa ttctcgcctc tctctggtca 2580 ttgttaggag tgggggtggg gagaaagtgg gagagcatct ctttggagct tgtcatgcac 2640 ctggctatgg cccctgggac tgggagaaaa gtcctggggg tgggttgggc tcaggtccca 2700 ggatatcttt cgccatctca gaagacacag atagatgtgt gtaccaggtc atatgtggtg 2760 tctcctaggg tacggaggga tattcattca tttactcact cattttcatg tgtgtccatt 2820 cattcaccag atattgagtg cctctatgtc aggcactatg ttaggttaag gattcctgat 2880 gtttttgtgt atcagggatt ccttggagaa tctgcag 2917[0078] <210> 18 <211> 2917 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gtgagtttgg ggacccttga ttgttctttc tttttcgcta ttgtaaaatt catgttatat 60 ggagggggca aagttttcag ggtgttgttt agaatgggaa gatgtccctt gtatcaccat 120 ggaccctcat gataattttg tttctttcac tttctactct gttgacaacc attgtctcct 180 cttattttct tttcattttc tgtaactttt tcgttaaact ttagcttgca tttgtaacga 240 atttttaaat tcacttttgt ttatttgtca gattgtaagt actttctcta atcacttttt 300 tttcaaggca atcagggtat attatattgt acttcagcac agttttagag aacaattgtt 360 ataattaaat gataaggtag aatatttctg catataaatt ctggctggcg tggaaatatt 420 cttattggta gaaacaacta caccctggtc atcatcctgc ctttctcttt atggttacaa 480 tgatatacac tgtttgagat gaggataaaa tactctgagt ccaaaccggg cccctctgct 540 aaccatgttc atgccttctt ctctttccta cagctcctgg gcaacgtgct gcaacgtgct 600 ggttgttgtg ctgtctcatc attttccatg gtgagcaagg gcgaggagct gttcaccggg 660 gtggtgccca tcctggtcga gctggacggc gacgtgaacg gccacaagtt cagcgtgtcc 720 ggcgagggcg agggcgatgc cacctacggc aagctgaccc tgaagttcat ctgcaccacc 780 ggcaagctgc ccgtgccctg gcccacacta gtgaccacct tcgcttacgg cgtgcagtgc 840 ttcagccgct accccgacca catgaagcag cacgacttct tcaagtccgc catgcccgaa 900 ggctacgtcc aggagcgcac catcttcttc aaggacgacg gcaactacaa gacccgcgcc 960 gaggtgaagt tcgagggcga caccctggtg aaccgcatcg agctgaaggg catcgacttc 1020 aaggaggacg gcaacatcct ggggcacaag ctggagtaca acttcaacag ccacaacgta 1080 tacatcatgg ccgacaagca gaagaacggc atcaaggtga acttcaagat ccgccacaac 1140 atcgaggacg gcagcgtgca gctcgccgac cactaccagc agaacacccc catcggcgac 1200 ggccccgtgc tgctgcccga caaccactac ctgagcaccc agtccgccct gagcaaagac 1260 cccaacgaga agcgcgatca catggtcctg ctggagttcg tgaccgccgc cgggatcact 1320 cacggcatgg acgagctgta caagtcaggc gggtcgacga tatcaggatc ctggccagct 1380 agctaggaat tccgcccctc tccctccccc ccccctaacg ttactggccg aagccgcttg 1440 gaataaggcc ggtgtgcgtt tgtctatatg ttattttcca ccatattgcc gtcttttggc 1500 aatgtgaggg ggcccccccc ggaaacctgg ccctgtcttc ttgacgagca ttcctagggg 1560 tctttcccct ctcgccaaag gaatgcaagg tctgttgaat gtcgtgaagg aagcagttct 1620 ctggaagctt cttgaaga ca aacaacgtct gtagcgaccc tttgcaggca gcgggaaccc 1680 cccacctggc gacaggggtt gccctctgcg gccaaaagcc acgtgtataa gatacacctg 1740 caaaggcggc acaaccccag tgccacgttg tgagttggat agttgtggaa agagtcaaat 1800 gggctctcct caagcgtatt caacaagggg ctgaaggatt ttgcccagaa agggtaaccc 1860 cattgtatgg gatctgatct ggggcctcgg tgcacatgct tttacatgtg tttagtcgag 1920 gttaaaaaac gtctaggccc cccccgaacc acggggacgt ggttttcctt tgaaaaacac 1980 gatgataagc ttRgccacaa ccatgaaaac atttaacatt tctcaacaag atctagaatt 2040 agtagaagta gcgacagaga agattacaat gctttatgag gataataaac atcatgtggg 2100 agcggcaatt cgtacgaaaa caggagaaat catttcggca gtacatattg aagcgtatat 2160 aggacgagta actgtttgtg cagaagccat tgcgattggt agtgcagttt cgaatggaca 2220 aaaggatttt gacacgattg tagctgttag acacccttat tctgacgaag tagatagaag 2280 tattcgagtg gtaagtcctt gtggtatgtg tagggagttg atttcagact atgcaccaga 2340 ttgttttgtg ttaatagaaa tgaatggcaa gttagtcaaa actacgattg aagaactcat 2400 tccactcaaa tatacccgaa attaacctag gaggcccccc gtgtggacac agatcccact 2460 ggaagatccc ctctcctgcc caa gcacttc acagctggac cctgcttcac cctcaccccc 2520 tcctggcaat caatacagct tcattatctg agttgcataa ttctcgcctc tctctggtca 2580 ttgttaggag tgggggtggg gagaaagtgg gagagcatct ctttggagct tgtcatgcac 2640 ctggctatgg cccctgggac tgggagaaaa gtcctggggg tgggttgggc tcaggtccca 2700 ggatatcttt cgccatctca gaagacacag atagatgtgt gtaccaggtc atatgtggtg 2760 tctcctaggg tacggaggga tattcattca tttactcact cattttcatg tgtgtccatt 2820 cattcaccag atattgagtg cctctatgtc aggcactatg ttaggttaag gattcctgat 2880 gtttttgtgt atcagggatt ccttggagaa tctgcag 2917

【0079】 <210> 19 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gaacttcagg gtcagcttgc c 21<210> 19 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gaacttcagg gtcagcttgc c 21

【0080】 <210> 20 <211> 34 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tgaacttgtg gccgttcacg tcgccgtcca gctc 34<210> 20 <211> 34 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> tgaacttgtg gccgttcacg tcgccgtcca gctc 34

【0081】 <210> 21 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gaccaggatg ggcaccaccc cggtgaacag ctc 33<210> 21 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> gaccaggatg ggcaccaccc cggtgaacag ctc 33

【0082】 <210> 22 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> ggccacgcgt cgactagtac gggiigggii gggiig 36<210> 22 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> ggccacgcgt cgactagtac gggiigggii gggiig 36

【0083】 <210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> ggccacgcgt cgactagtac 20<210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> ggccacgcgt cgactagtac 20

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】 本発明の方法の概略を示す。FIG. 1 shows the outline of the method of the present invention.

【図2】 細胞内局在を示す細胞株の例を示す。左よ
り、GFP蛍光像、DAPI染色による核の蛍光像、位相差像
FIG. 2 shows an example of a cell line showing intracellular localization. From left: GFP fluorescence image, nucleus fluorescence image by DAPI staining, phase contrast image

【図3】 トラップ細胞株より抽出したタンパク質のウ
エスタンブロット解析の例を示す。
FIG. 3 shows an example of Western blot analysis of a protein extracted from a trap cell line.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C07K 19/00 C12N 5/00 B Fターム(参考) 2G045 AA35 BB20 CB01 CB17 DA12 DA13 DA14 FB07 FB12 GC15 4B024 AA11 BA80 CA07 DA02 EA04 GA11 HA20 4B063 QA01 QA08 QQ08 QQ42 QR60 QR80 QS38 QX02 4B065 AA90X AA90Y AB01 AC14 BA02 CA24 CA46 4H045 AA10 BA10 CA40 EA50 FA72 FA74 ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI theme coat ゛ (reference) C07K 19/00 C12N 5/00 BF term (reference) 2G045 AA35 BB20 CB01 CB17 DA12 DA13 DA14 FB07 FB12 GC15 4B024 AA11 BA80 CA07 DA02 EA04 GA11 HA20 4B063 QA01 QA08 QQ08 QQ42 QR60 QR80 QS38 QX02 4B065 AA90X AA90Y AB01 AC14 BA02 CA24 CA46 4H045 AA10 BA10 CA40 EA50 FA72 FA74

Claims (9)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 5’末端側から3’末端方向に順に、 (1)イントロン及びスプライスアクセプター配列; (2)N末端のメチオニン及びバリンを欠失させた緑色
蛍光タンパク質(GFP)をコードするDNA配列; (3)内部リボソーム結合部位(IRES); (4)選択マーカーをコードするDNA配列;及び (5)ポリアデニル化シグナル配列、を含有するトラッ
プベクター。
1. In order from the 5 ′ end to the 3 ′ end, (1) an intron and a splice acceptor sequence; (2) an N-terminal methionine and valine-deleted green fluorescent protein (GFP) A trap vector comprising: (3) an internal ribosome binding site (IRES); (4) a DNA sequence encoding a selectable marker; and (5) a polyadenylation signal sequence.
【請求項2】 (1)請求項1に記載のトラップベクタ
ーを哺乳動物の細胞に導入して形質転換し、(2)該細
胞を固体培地で培養してコロニーを得、(3)各コロニ
ーより得られる細胞について、緑色蛍光タンパク質を発
現する細胞を選択し、(4)緑色蛍光タンパク質に融合
した細胞に内在するタンパク質を同定する、ことを含
む、緑色蛍光タンパク質に融合した細胞に内在するタン
パク質を発現する動物細胞の製造方法。
2. Transformation by introducing (1) the trap vector of claim 1 into mammalian cells, (2) culturing the cells in a solid medium to obtain colonies, and (3) each colony. Selecting a cell expressing the green fluorescent protein from the obtained cells, and (4) identifying a protein endogenous to the cell fused to the green fluorescent protein, including: a protein endogenous to the cell fused to the green fluorescent protein A method for producing an animal cell expressing the same.
【請求項3】 緑色蛍光タンパク質に融合した細胞に内
在するタンパク質を含む動物細胞。
3. An animal cell containing a protein endogenous to a cell fused to a green fluorescent protein.
【請求項4】 該内在性タンパク質が細胞内で局在して
いる請求項3に記載の細胞。
4. The cell according to claim 3, wherein the endogenous protein is localized in the cell.
【請求項5】 該内在性タンパク質が細胞核に局在して
いる請求項3に記載の細胞。
5. The cell according to claim 3, wherein the endogenous protein is localized in a cell nucleus.
【請求項6】 該内在性タンパク質が細胞質に局在して
いる請求項3に記載の細胞。
6. The cell according to claim 3, wherein the endogenous protein is located in the cytoplasm.
【請求項7】 該内在性タンパク質がミトコンドリアに
局在している請求項3に記載の細胞。
7. The cell according to claim 3, wherein the endogenous protein is localized in mitochondria.
【請求項8】 該内在性タンパク質が核膜に局在してい
る請求項3に記載の細胞。
8. The cell according to claim 3, wherein the endogenous protein is localized in a nuclear membrane.
【請求項9】 緑色蛍光タンパク質の発する蛍光を観察
することにより、緑色蛍光タンパク質に融合した内在性
タンパク質の細胞内における動的な局在性をを観察する
方法。
9. A method for observing the dynamic localization of an endogenous protein fused to a green fluorescent protein in cells by observing the fluorescence emitted by the green fluorescent protein.
JP34322299A 1999-12-02 1999-12-02 Gene trap using green fluorescent protein Pending JP2001157588A (en)

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