JP2000506380A - Human cancer antigens of tyrosinase-related proteins 1 and 2, and genes encoding the same - Google Patents

Human cancer antigens of tyrosinase-related proteins 1 and 2, and genes encoding the same

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、正常なメラノーマ形成性遺伝子であるgp75遺伝子が、Tリンパ球によって認識される抗原性癌ペプチドにプロセスされる、ORF3の24アミノ酸ペプチドである遺伝子産物をコードすることを開示する。ORF3から誘導される本発明の癌ペプチドは、腫瘍拒絶抗原として癌抗原特異的Tリンパ球によって認識される。本発明は、TIL586細胞株から由来するHLA−A31制限CTLクローンによって認識される第2の腫瘍抗原の同定に関する。TRP−2タンパク質腫瘍抗原から由来するこの抗原およびそのペプチドは、1nMのペプチド濃度でCTLクローンによる溶解のために標的細胞を感作することができる。修飾されたペプチドもCTLクローンによって認識された。これらの遺伝子の産物は、癌を有する患者の治療および診断のための免疫治療戦略の有望な候補である。   (57) [Summary] The present invention discloses that the gp75 gene, a normal melanoma forming gene, encodes a gene product that is a 24-amino acid peptide of ORF3 that is processed into an antigenic cancer peptide recognized by T lymphocytes. The cancer peptide of the present invention derived from ORF3 is recognized as a tumor rejection antigen by cancer antigen-specific T lymphocytes. The present invention relates to the identification of a second tumor antigen recognized by an HLA-A31 restricted CTL clone derived from the TIL586 cell line. This antigen and its peptides, derived from the TRP-2 protein tumor antigen, can sensitize target cells for lysis by the CTL clone at a peptide concentration of 1 nM. The modified peptide was also recognized by the CTL clone. The products of these genes are promising candidates for immunotherapy strategies for the treatment and diagnosis of patients with cancer.

Description

【発明の詳細な説明】 チロシナーゼ関連タンパク質1及び2のヒト癌抗原並びにこれをコードする遺伝 子発明の分野 本発明は、癌ワクチンを含む癌の診断薬および治療薬の領域に関する。より具 体的には、本発明は、新規な癌ペプチド並びにその癌ペプチドをコードする代替 (alternative)オープンリーディングフレームDNA配列の単離と精製に関す る。本発明はさらに、癌を治療および防止する際の道具として作用し得る新規な 腫瘍抗原並びにその癌抗原をコードするDNAの単離と精製に関する。本発明は さらに、チロシナーゼ関連タンパク質1(TRP1)遺伝子内に由来する代替オ ープンリーディングフレームDNA配列によってコードされる新規な癌ペプチド に関する。本発明はまた、TRP2遺伝子内に由来する新規な癌ペプチドに関す る。本発明はさらに、個人における癌と前癌を検出および診断および治療するた めの方法に関する。発明の背景 腫瘍浸透リンパ球(TIL)の養子免疫伝達は、転移性メラノーマを伴う患者 で腫瘍の退行を仲介することができ、T細胞によって認識される腫瘍拒絶抗原が これらの腫瘍細胞上に存在することが示唆される。そのようなT細胞が入手可能 なことにより、ヒトメラノーマ抗原をコードする遺伝子をクローン化し配列決定 することが可能になっている。ヒトメラノーマからこれまでに同定された抗原は 、その発現パターンに基づいて2つのクラスに分類することができる。第1のク ラスの抗原は、腫瘍および精巣でのみ発現し、他の正常ヒト組織で発現しない遺 伝子によってコードされる。MAGE1、MAGE3、GAGEおよびBAGE はこのクラスの例である。第2のクラスの抗原は、メラノサイト、メラノーマお よび正常網膜でのみ発現する遺伝子によってコードされる分化抗原を表す。MA RT−1/Melan−A、gp100およびチロシンはこのクラスの例である 。これらの抗原は全て未変異自己タンパク質である。しかしながら、CDK4、 B −カテニンおよびMum−1を含む幾つかの変異抗原もまた、T細胞によって認 識されることが同定された。対応する遺伝子産物に由来するT細胞によって認識 される抗原性エピトープの同定は、自己抗原に対する免疫応答の機構を理解する ためのみならず、癌を伴う患者の治療のためのこれらの抗原または合成ペプチド による新規で有効な免疫治療戦略を開発するためにも、重要である。 以前の研究により、メラノーマを伴う自己由来患者内にTIL586+IL− 2を注入すると転移の客観的な退行が生じることが示された。より最近に、HL A−A31と関連してTIL586によって認識される腫瘍抗原をコードする遺 伝子、チロシナーゼ関連タンパク質1(TRP−1またはgp75)がクローン 化された。興味深いことに、遺伝子産物gp75は、転移性メラノーマを伴う患 者からの血清中のIgG抗体によって認識される抗原として最初に同定された。 その遺伝子は、メラノーマ、正常メラノサイト細胞株および網膜でのみ発現し、 試験した他の正常組織では発現しないことが判明した。従って、この遺伝子は、 MART−1/Melan−A、gp100およびチロシナーゼを含む第2のク ラスの抗原の一員である。 本分野では、癌の発達から個人を保護するための免疫原またはワクチンとして 有用である癌細胞上のエピトープを同定することは困難であった。本発明は、T 細胞によって特異的に認識されるTRP−1遺伝子内の代替オープンリーディン グフレーム配列からコードされるペプチド内の癌ペプチドおよび抗原性癌エピト ープの同定である。本発明は、TRP−2遺伝子によってコードされる癌ペプチ ドを包含する。本発明の癌ペプチドは咄乳類で癌を阻害または防止するための免 疫原およびワクチンとして有用である。発明の要旨 本発明の一つの目的は、Tリンパ球によって癌抗原として認識される新規なペ プチドおよびその一部を提供することである。 本発明の癌ペプチドおよびその癌ペプチドの抗原性癌エピトープ部分は、同一 の遺伝子由来の正常のタンパク質またはペプチドをコードするために使用される オープンリーディングフレームDNA配列以外の遺伝子の代替オープンリーディ ングフレームDNA配列によってコードされる。この範囲内に入る遺伝子はTR P−1遺伝子である。 本発明の別の側面は、同一の遺伝子由来の正常のタンパク質またはペプチドを コードするオープンリーディングフレームDNA配列以外の遺伝子の代替オープ ンリーディングフレームDNA配列によってコードされる腫瘍抗原である。この 範囲内に入る遺伝子はTRP−1遺伝子である。 本発明の別の目的は、癌ペプチドとして作用する、TRP−1、TRP−2お よびその変異体のペプチドフラグメントである。 本発明の腫瘍抗原およびその腫瘍抗原の抗原性癌ペプチドは、TRP−2遺伝 子(配列番号46)の全部または一部によってコードされる。TRP−2は、チ ロシナーゼ関連遺伝子ファミリーの一員である。TRP−2はT細胞に免疫応答 を引き出させることができる新規で潜在的な腫瘍抗原として現在同定されている 。 本発明の一つの側面は、癌の発達から被験者を保護できる癌ワクチンとして有 用である、TRP−1遺伝子、TRP−2遺伝子またはその変異体によってコー ドされる癌ペプチドである。本発明はまた、癌を防止するのに有効な量の癌ワク チンを投与する方法に関する。 本発明の別の側面は、癌ペプチドまたはその抗原性癌エピトープを単独または 1以上の免疫刺激分子と組み合わせて含む医薬組成物である。本発明の別の側面 は、TRP−1癌抗原を単独、TRP−2腫瘍抗原を単独、または1以上の同時 免疫刺激分子と組み合わせて含む医薬組成物である。本発明の別の目的は、T細 胞を刺激して腫瘍および癌に対して免疫原性応答を引き出す、TRP−1、TR P−2ペプチドまたはその組み合わせを含む、医薬組成物である。癌ペプチドま たはその抗原性癌エピトープは、癌の防止または治療のための免疫原としてまた はワクチンとして提供することができる。医薬組成物は、哺乳類において癌を治 療または防止する方法で有用である。治療方法では、医薬組成物は、哺乳類にお ける癌を防止または阻害するのに有効な量で哺乳類に投与される。 本発明の別の目的は、同一の遺伝子由来の正常のタンパク質をコードするオー プンリーディングフレームDNA配列以外の遺伝子由来の代替オープンリーディ ングフレームDNA配列の翻訳によって癌ペプチドおよびそのペプチド内の抗原 性癌エピトープを生成する方法である。 本発明のさらに別の目的は、正常のタンパク質またはペプチドをコードするオ ープンリーディングフレームDNA配から翻訳される遺伝子産物以外の遺伝子由 来の代替オープンリーディングフレームDNA配列から翻訳される癌ペプチド遺 伝子産物またはその一部を検出および同定する方法である。 本発明のさらに別の側面は、癌ペプチドまたはその一部をコードする代替オー プンリーディングフレームDNAまたはRNA配列、並びに癌ペプチドまたはそ の一部を産生する方法におけるそのDNAまたはRNA配列の使用である。本発 明はさらに、プローブまたはプライマーとして使用するための代替オープンリー ディングフレームDNAまたはRNA配列のオリゴヌクレオチドを提供する。 本発明のさらに別の目的は、細胞で発現させた場合に腫瘍抗原を産生する、T RP−2またはそのフラグメントをコードする核酸配列である。 本発明はさらに、癌ペプチドまたはその一部をコードする代替オープンリーデ ィングフレームDNA配列を単独または少なくとも1つの免疫刺激分子をコード する第2のDNA配列と組み合わせて含むベクターを提供する。代替オープンリ ーディングフレームDNA配列は、TRP−1遺伝子またはその変異体からのも のでもよい。 本発明はまた、癌ペプチドまたはその一部をコードする代替オープンリーディ ングフレームDNA配列を単独または少なくとも1つの免疫刺激分子をコードす る第2のDNA配列と組み合わせて含むベクターでトランスフェクトまたは形質 導入した宿主細胞を提供する。 本発明はさらに、腫瘍抗原をコードするTRP−2遺伝子またはその一部を単 独または少なくとも1つの同時免疫刺激分子をコードする第2のDNA配列と組 み合わせて含むベクターを提供する。ベクターおよび宿主細胞はワクチンとして 作用することができ、腫瘍抗原または癌ペプチドの発現は、ワクチンで免疫化し た哺乳類における腫瘍抗原特異的Tリンパ球の刺激を生じさせる。 本発明はまた、TRP−2腫瘍抗原またはその変異体をコードするDNAを単 独または少なくとも1つの同時免疫刺激分子をコードする第2のDNA配列と組 み合わせて含むベクターでトランスフェクトまたは形質導入した宿主細胞を提供 する。 ベクターおよび宿主細胞はワクチンとして作用することができ、TRP−2腫 瘍抗原の発現は、ワクチンで免疫化した哺乳類における抗原特異的Tリンパ球の 刺激を生じさせる。 ベクターおよび宿主細胞はワクチンとして作用することができ、癌ペプチドま たはその一部の発現は、ワクチンで免疫化した哺乳類における癌ペプチド特異的 Tリンパ球の刺激を生じさせる。 本発明のさらに別の目的は、ヒトの前新生物性および新生物性の細胞および組 織を診断する方法を提供することである。 本発明は、同一の遺伝子由来の正常のタンパク質をコードするために使用され るオープンリーディングフレーム核酸配列以外の遺伝子の代替リーディングフレ ーム核酸配列によってコードされる癌ペプチドまたはその一部を検出することに よって哺乳類における癌または前癌を診断する方法であって、その癌ペプチドま たはその一部がTリンパ球によって認識される方法を提供する。代替リーディン グフレーム核酸配列は、TRP−1遺伝子またはその変異体からのものでもよい 。 本発明のさらに別の目的は、ヒトの前新生物性および新生物性の細胞および組 織を診断する方法を提供することである。本発明によれば、その方法は、ヒトか ら細胞、組織またはその抽出物を単離し、癌ペプチドをコードする代替オープン リーディングフレームDNA配列、RNA配列またはその一部を検出するか、代 替オープンリーディングフレームDNA配列またはRNA配列によって発現され る癌ペプチドまたはその一部を検出することを含み、代替オープンリーディング フレームDNA配列、RNA配列または発現産物の検出またはその増加は、前新 生物または新生物の指標である。 本発明は、TRP−2腫瘍抗原の検出による哺乳類の癌または前癌の診断方法 であって、腫瘍抗原、癌ペプチドまたはその変異体がTリンパ球によって認識さ れる方法を提供する。 本発明は、TRP−2遺伝子またはそのフラグメントによってコードされる腫 瘍抗原の検出による哺乳類の癌または前癌の診断方法であって、腫瘍抗原がTリ ンパ球によって認識される方法を提供する。 本発明のさらに別の目的は、癌ペプチドまたはその一部をコードする代替オー プンリーディングフレームDNA配列の1以上のコピーをそのゲノム中に取り込 んでいるトランスジェニック動物を提供することである。代替リーディングフレ ーム核酸配列はTRP−1遺伝子またはその変異体からのものでもよい。代替オ ープンリーディングフレームDNA配列の取り込みにより、多重型または変異型 の癌ペプチドの過剰発現または発現が生じる。そのようなトランスジェニック動 物は癌の治療に有用な治療剤のスクリーニングのために有用である。 本発明のさらに別の目的は、本発明の腫瘍抗原の1以上のコピーをそのゲノム 中に取り込んでいるトランスジェニック動物を提供することである。TRP−2 DNA配列またはそのフラグメントの取り込みにより腫瘍抗原の過剰発現または 発現が生じる。そのようなトランスジェニック動物は、癌の治療に有用な治療剤 のスクリーニングのために有用である。 本発明はまた、代替オープンリーディングフレーム核酸配列またはTRP−2 腫瘍抗原核酸配列に特異的にターゲッティングして結合し、同一の遺伝子に由来 する正常タンパク質の発現に悪影響を及ぼすことなく癌ペプチドまたは腫瘍抗原 の発現を阻害する、アンチセンスオリゴヌクレオチドを包含する。 本発明のさらに別の側面は、診断および検出アッセイで使用するためのTRP −1癌ペプチドおよびTRP−2脛瘍抗原を含む癌ペプチドおよびその抗原性癌 エピトープと反応性を有するモノクローナルおよびポリクローナル抗体である。 モノクローナルおよびポリクローナル抗体は、単独または診断および検出アッセ イで通常使用される他の試薬と一緒のキットの形態で提供することができる。図面の簡単な説明 本発明のこれら及び他の目的、特徴、および随伴する利点の多くは、添付する 図面を一緒に考慮して、以下の詳細な説明を読むことでより良く理解されるであ ろう。図面中、 図1Aおよび1Bは、TIL586によって認識される抗原性ペプチドをコー ドするgp75ヌクレオチド配列の位置を示す。 図1Aは、gp75の1584bpのオープンリーディングフレームを含む全 長cDNAを示す。ヌクレオチドは、リーダー配列と成熟gp75から成るタン パク質へと翻訳される開始コドンから番号付けされている。pcDNA776は 最初の246ヌクレオチドコード領域を欠くgp75の部分cDNAであり、H LA−A31遺伝子と一緒にCOS−7をコトランスフェクションした際に、T IL586によるGM−CSF分泌を刺激する能力に基づくアッセイを使用して cDNAライブラリーから単離された。一連の欠失構築物およびPCR DNA フラグメントを作製した。pD776AはApaI制限酵素での消化後のpcD NA776の誘導体である。 図1Bは、TIL586によるGM−CSFの放出を示す。TIL586によ るGM−CSF分泌は、図1Aに示すDNAフラグメントとHLA−A31遺伝 子でコトランスフェクションしたCOS−7で同時培養した後に測定した。対照 刺激物質細胞は、586mel、397mel/A31+ 、COS−7単独、 およびHLA−A31またはpcDNA776cDNAでトランスフェクトした COS−7を含む。 図2は、gp75遺伝子のヌクレオチド、アミノ酸配列およびオープンリーデ ィングフレームを示す。最初の157アミノ酸の部分ヌクレオチドおよびアミノ 酸配列を、ORF1(gp75)の翻訳の開始コドンから示した。TIL586 からのGM−CSF放出を刺激する能力を付与したDNAフラグメントを下線で 示す。2個の推定開始コドン、ATG(254−256)およびATG(294 −296)を太字で示し、各々ORF2およびORF3の翻訳を生じさせること ができる。ORF3からTIL586によって認識されるペプチド配列は太字と 下線で示す。 図3Aと3Bは、抗原性ペプチドと代替オープンリーディングフレームの翻訳 を示す。 図3Aは、PCRによって増幅されたPCRフラグメントの位置と長さを示す 。DNAフラグメントはPCR増幅によって得られ、pCR3発現ベクター中に クローン化された。位置294−296のATGのATCによる置換は、材料お よび方法に記載される通りに行った。 図3Bは、TIL586からのサイトカイン放出を刺激するDNAフラグメン トおよび変異構築物の試験を示す。GM−CSF放出アッセイは図1の場合と同 様に行った。 図4A−4Cは、TIL586によって認識される抗原性ペプチドの特徴を示 す。 図4Aは、種々の刺激物質とともに同時インキュベートした場合の、HLA− A31制限TIL586によるGM−CSFの放出を示す。トランスフェクショ ンおよびサイトカインアッセイは図1AおよびBと同様に行った。586mel および397melをTIL586の反応性に関して陽性および陰性対照として 含めた。ORF3Pペプチドを1μg/mlの濃度で90分間586EBV(A 31+)およびT2(非−A31)細胞とともにインキュベートした。TIL5 86によるGM−CSF分泌の剌激は、ペプチドORF3Pでパルスした自己由 来586EBVおよび異質遺伝子型の1510EBV(A31+)細胞で同時イ ンキュベートした場合は有意に増加したが、586EBV単独またはORF3P ペプチドで充填したT2(非−A31)細胞で同時インキュベートした場合は増 加しなかった。 図4Bは、TIL586による標的細胞の細胞毒性溶解を示す。586mel (−■−)および397mel(−□−)を各々陽性および陰性対照として使用 した。586EBV B細胞を、マークした通り、ORF3P(pep)と(− ▲−)、無関係なペプチドと(ipep)(−●−)、ペプチドなしに(−△− )インキュベートし、そしてT2細胞をORF3Pでパルスした(−○−)。イ ンキュベーション後、TIL586を添加し標的細胞と混合した。TIL586 の細胞溶解活性を4時間のクロム放出アッセイで測定した。 図4Cは、TIL586による溶解のために標的細胞を感作するためのペプチ ド濃度の滴定を示す。586EBV細胞を、ORF3P(pep)(−▲−)ま たは無関係なペプチド(ipep)(−●−)の連続希釈で、そしてT2細胞を ORF3Pペプチドで(−○−)90分間別々にインキュベートした。TIL5 86の細胞溶解活性は、エフェクター:標的(E:T)の比率40:1で4時間 の51Cr放出アッセイで評価した。 図5Aおよび図5Bは、ORF3Pペプチドでロードした未標識586EBV 細胞による51Cr標識した標的細胞の溶解の阻害を示す。 図5Aは、586mel細胞をクロムで90分間「ホット」標的として標識し たことを示す。ORF3P(−▲−)、無関係なペプチド(−△−)でパルスし た586EBV細胞並びにORF3PペプチドでロードしたT2細胞(−□−) を「コールド」標的細胞として使用した。洗浄後、「ホット」および「コールド 」標的細胞を再度計数し、1:1、5:1、10:1および20:1の「コール ド」/「ホット」比で混合した。TIL586をエフェクター:「ホット」標的 (E:T)比率20:1で添加した。クロムの放出を4時間のインキュベーショ ン後に測定した。 図5Bは、gp100を認識したTIL1200による51Cr標識した624 mel(「ホット」標識)の溶解が、無関係なペプチド(−△−)でパルスした 586EBV細胞と比較して、ORF3P(−▲−)でパルスした586EBV 細胞によって阻害されなかったことを示す。「コールド」および「ホット」標的 細胞を示した比率で混合した。TIL1200をエフェクター:ホット標的(E :T)比率30:1で添加した。TIL1200の細胞溶解活性を4時間の51C r放出活性で評価した。 図6A−6Dは、TIL586細胞株からの抗原性ペプチドT細胞クローンの 認識を示す。T細胞クローンをTIL586細胞株から生成した。586EBV B細胞をORF3Pペプチドまたは無関係なペプチドでパルスした。T細胞ク ローンまたはTIL586細胞を添加して同時インキュベートした。586me l、397mel/A31+ 腫瘍およびメラノサイトNHEM680細胞につ いて、1×105 細胞/ウエルを、各々T細胞クローン、TIL586−C1 (図6A)、TIL586−C4(図6B)およびTIL586−C6(図6C )またはTIL586(図6D)に18〜24時間1×105 細胞でインキュ ベートした。GM−CSFアッセイを図1Bに記載した通り行った。 図7.TIL586に由来するCTLクローンによる種々の標的細胞および抗 原性ペプチドの認識。T細胞クローンをTIL586細胞株由来の限界希釈(1 細胞/ウエル)によって生成し、6000IU/mlのIL−2を含むAIM− V培地中でさらに膨張させた。CTLクローン586TIL−C1およびクロー ン4によるGM−CSF分泌を、正常メラノサイト細胞株(HLA−A31+) 、ORF3Pペプチドまたは無関係なペプチドでパルスした586EBV B細 胞、397melまたは586mel細胞と同時培養した後に測定した。 図8.CTLクローン4により認識された新規な腫瘍抗原としてのTRP−2 の同定。CTLクローン4によるGM−CSF放出を、MART−1、gp75 /TRP−1、gp100、チロシナーゼ、p15およびTRP−2をコードす る遺伝子と一緒にHLA−A31cDNAでコトランスフェクションしたCOS −7と同時培養後に測定した。対照剌激物質細胞には、586mel、397m el、COS−7単独、およびHLA−A31cDNAでトランスフェクション したCOS−7が含まれた。 図9.TRP−2遺伝子の欠失およびサブクローンの構築およびT細胞認識。 1557bpオープンリーディングフレームを含むTRP−2の全長cDNAを 示す。ヌクレオチドをTRP−2cDNAの5’未翻訳領域からf〜rstヌク レオチドから番号を付けた。一連の欠失構築体およびDNAフラグメントのスブ クローニングを作製した。各構築物のT細胞認識を、上記したDNAフラグメン トおよびHLA−A31遺伝子でコトランスフェクションしたCOS−7でCT Lクローン4を同時培養した後に測定した。 図10.TRP−2の抗原性ペプチドおよび部分コード配列.TRP−2遺伝 子の部分ヌクレオチドおよびアミノ酸配列を示す。pTD4、pTA、pTD3 およびpTK中のDNAフラグメントの長さおよび3’末端を矢印で示し、Ap aI、PstIおよびKpnIの制限部位に印を付ける。CTLクローン4で認 識される抗原性ペプチド配列を太字および下線で示す。 図11Aから図11C. CTLクローン4で認識される抗原性ペプチドの特 徴。 図11(A).異なるペプチド濃度でのT細胞によるGM−CSF放出。586 EBV(A31+)を、TRP197-205ペプチド(−−▲−−)でパルスし、T 2(非−A31)細胞をTRP197-205ペプチド(−−●−−)で異なるペプチ ド濃度で90分間パルスした。対照ペプチドとしてのORF3Pを、586EB V B細胞(−−△−−)上にパルスした。CTLクローン4によるGM−CS F放出を、TRP197-205およびORF3Pでパルスした586EBV B細胞 、そしてTRP197-205でパルスしたT2細胞と同時インキュベートした後に測 定した。 図11(B).異なるペプチド濃度でのCTLクローン4による溶解のための標 的細胞の感作。586EBV B細胞を、TRP197-205(−−▲−−)、無関 係なペプチドORF3P(−−△−−)とインキュベートし、そしてT2細胞を 種々のペプチド濃度でTRP197-205でパルスした(−−●−−)。ペプチドイ ンキュベーション後に、標的細胞を30分間標識した。洗浄後、E:T比率40 :1でのCTLクローン4の細胞溶解活性をT細胞と標的細胞との4時間のイン キュベーション後に測定した。図11(C).異なるE:T比率でのCTLクロ ーン4による標的細胞の溶解。標的586EBV細胞を、TRP197-205(−− ▲−−)または無関係なペプチドORF3P(−−△−−)と別々にインキュベ ートし、標的T2細胞をTRP197-205ペプチド(−−●−−)と90分間イン キュベートした。586mel(−−□−−)および397mel(−−■−− )を各々陽性および陰性対照として使用した。発明の詳細な説明 本発明は、免疫系のTリンパ球によって免疫学的に認識される、癌ペプチド、 腫瘍抗原並びにそれらの一部、誘導体または変異体を包含する。本発明はさらに 、癌ペプチドまたは腫瘍抗原中に含まれる抗原性癌エピトープを包含する。抗原 性癌エピトープは免疫系のT細胞との相互作用により細胞仲介免疫応答を特異的 に生じさせる。抗原性癌エピトープとT細胞との相互作用により、T細胞はヒト を含む哺乳類中の癌に対して反応し、それを防止、排除または減少させる。 一つの態様において、本発明の癌ペプチドの中に含まれる癌ペプチドおよび抗 原性癌エピトープは、癌ペプチドが遺伝予内の正常のタンパク質またはペプチド をコードするオープンリーディングフレーム以外の遺伝子の代替オープンリーデ ィングフレームによってコードされるという点で、正常のタンパク質またはペプ チドと区別される。癌ペプチドおよびその一部は、特徴的なことに、正常な細胞 では不在であるか非常に低いレベルで存在し、前癌および癌細胞では高いレベル で存在する。高いレベルでの癌ペプチドの発現は、正常細胞から前癌または癌細 胞への形質転換と相関している。 本発明の癌ペプチドは、原発性または転移性のメラノーマ、胸腺腫、リンパ腫 、肉腫、肺癌、肝臓癌、非ホドキンの(non−Hodgkin' s)リンパ腫、ホドキン のリンパ腫、白血病、子宮癌、頸部癌、膀胱癌、腎臓癌、およびアデノカルチノ ーマ、例えば乳癌、前立腺癌、卵巣癌、膵臓癌等を含むがこれらに限定されない 癌の一部を形成するか、それらから誘導される。 メラノーマという用語には、メラノーマ類、転移性メラノーマ、メラノサイト またはメラノサイト関連母斑細胞の何れか由来のメラノーマ、黒色癌、黒色上皮 腫、黒色肉腫、in situメラノーマ、表在拡散性メラノーマ、結節性メラノーマ 、ほくろ悪性メラノーマ、末端性ほくろ性メラノーマ、侵食性メラノーマまたは 家族性非定型性母斑及びメラノーマ(FAM−M)症候群が含まれるが、これら に限定されない。 特に興味深いのは、癌、特にメラノーマを有する患者中の自己由来CTLによ って認識される癌ペプチド、そのフラグメントまたは誘導体である。さらに興味 深いのは、MHC制限CTL、特にMHCクラスI制限CTLによって認識され る癌ペプチド、そのフラグメントまたは誘導体である。 本発明の「腫瘍抗原」は、哺乳類での抗腫瘍応答を引き出すことができる癌ま たは腫瘍タンパク質およびその癌または腫瘍タンパク質の任意の部分を包含する 。一つの態様では、腫瘍抗原には、全長TRP−2タンパク質が含まれる。 「癌ペプチド」という用語は本明細書で使用する場合、腫瘍抗原として作用す る、癌または腫瘍タンパク質の任意のエピトープまたはフラグメントを包含する 。 「フラグメント」という用語は本明細書で使用する場合、タンパク質フラグメ ントの場合で少なくとも5または6アミノ酸そして遺伝子の場合で少なくとも1 5から18ヌクレオチドを有するタンパク質または遺伝子の任意のセグメントを 意味する。 一つの態様では、本発明の癌ペプチドは、正常遺伝子由来の代替オープンリー ディングフレームDNA配列の発現から生じる。正常の遺伝子産物が発現される よりむしろ、MHC制限様式でTリンパ球によって免疫学的に認識されることが できる癌ペプチドが発現する。MHC制限Tリンパ球は癌または前癌に関連する 代替オープンリーディングフレーム遺伝子産物を同定するのに有用である。 特に興味深いのは、TRP−1(gp75);マウス腫瘍サプレッサーINK 4a遺伝子の代替リーディングフレームから生じるタンパク質p19ARF(Quell e,D.E.他、Cell Vol.83,pp993-1000,1995);抗原性オクタペプチドSVVE FSSL、即ち、JAL8、bm1抗B6同種異系反応性bm1BZ19.4T 細胞によって認識される異質遺伝子型ペプチド(Malarkannan,S他、J.Exp.Med .Vol.182,pp.1739-1750,1995)など:に関連する癌ペプチドである。 一つの態様では、本発明の癌ペプチド、そのフラグメントまたは誘導体は、哺 乳類の癌腫瘍由来の腫瘍浸透性リンパ球(TIL)によって免疫学的に認識され る抗原性癌エピトープを含む。特に興味深いのは、癌抗原特異的細胞傷害性T細 胞によって認識される抗原性癌エピトープである(CD8+)。 本発明の一つの態様では、癌ペプチドは約24アミノ酸を含み、図2に記載し たチロシナーゼ関連タンパク質1をコードする同一の遺伝子由来またはそれらの ホモログまたは変異体由来の代替オープンリーディングフレーム3DNA配列に よって発現される。 一つの態様では、本発明の癌ペプチドはアミノ酸配列: MXaaLQRQFLRTQLWDVPSWLERSCL(配列番号7)および そのフラグメントまたは誘導体を含む(式中、XaaはSerまたはAlaであ る)。配列番号6と部分的配列相同性を共有する癌ペプチドまたはその一部も本 発明の範囲内に含まれる。部分的アミノ酸配列相同性とは、配列番号6と少なく とも85%の配列相同性、好ましくは少なくとも95%の配列相同性またはそれ 以上を有するペプチドを意味し、癌抗原特異的Tリンパ球を刺激する生物学的作 用を有する。 本発明の一つの態様では、癌ペプチドは式: MetXaaLeuGlnArgGlnPheLeuArg(配列番号8)およ びそのフラグメントおよび誘導体によって表すことができる(式Xaa=Ser またはAla)。 本発明の癌ペプチドの別の態様では、アミノ酸配列: MSLQRQFLR(配列番号9)およぴそのフラグメントおよび誘導体を含む 。 別の態様では、本発明の腫瘍抗原の中に含まれる癌ペプチドおよび抗原性癌エ ピトープは、メラノーマ、正常メラノサイト細胞株および網膜で主として発現す るTRP−2タンパク質に由来する。本発明の腫瘍抗原は、前癌および癌細胞で 見られる上昇したレベルよりも大部分の正常細胞では有意に低いレベルで存在す る。腫瘍抗原の上昇した発現は正常細胞の前癌または癌細胞への形質転換と相関 する。TRP−2はヒト染色体13に位置し、チロシナーゼ関連遺伝子ファミリ ーの一員であることが示され、チロシナーゼおよびgp75/TRP−1に対し て40−45%のアミノ酸配列同一性を共有する(Yokoyama他(1994); Bouchard 他(1994))。TRP−2は519アミノ酸を有するタンパク質をコードし、メラ ニン合成に関与するDOPAクロム互変異性化酵素(tautomerase)活性を有す ることが実証されている(Bouchard他(1994))。 特に興味深いのは、癌、特にメラノーマを有する患者における自己由来CTL によって認識されるTRP−2の癌ペプチドまたはその変異体である。さらに興 味深いのは、MHC制限CTL、特にMHCクラスI制限CTLによって認識さ れる癌ペプチド、そのフラグメントまたは誘導体である。癌ペプチドによって認 識される好ましいHLAサブタイプはHLA−A31サブタイプである。本発明 は、HLA−A31制限T細胞によって認識される潜在的な腫瘍抗原としての、 TRP−2、チロシナーゼタンパク質ファミリーのメラノーマ/メラノサイト分 化抗原の同定に関する。TRP−2遺伝子産物はTIL586から単離されたC TLクローンによって認識される第2の腫瘍抗原である。 本発明の別の態様では、腫瘍抗原は約9アミノ酸を含む癌ペプチドであり、チ ロシナーゼ関連タンパク質−2(配列番号46)をコードする遺伝子または図1 0に示すそのホモログまたは変異体から発現される。 さらに別の態様では、TRP−2タンパク質のフラグメントまたはその機能的 に均等な変異体は癌ペプチドとして使用される。好ましくは、本発明の腫瘍抗原 はアミノ酸197−205の少なくとも一部分を含むTRP−2タンパク質のフ ラグメントを含む。最も好ましくは、本発明の癌ペプチドはアミノ酸配列:LL GPGRPYRおよびそのフラグメントまたは誘導体を含む。アミノ酸197− 205を含むTRP−2の領域と部分的配列相同性を共有する癌ペプチドまたは その一部も本発明の範囲内に含まれる。部分的アミノ酸配列相同性とは、LLG PGRPYRと少なくとも85%の配列相同性、好ましくは少なくとも95%の 配列相同性またはそれ以上を有するペプチドを意味し、癌抗原特異的Tリンパ球 を刺激する生物学的作用を有する。 本発明の別の態様は、癌ペプチドとして有効に作用するのに十分な相同性をL LGPGRPYRに対して有する癌ペプチドを包含する。そのようなペプチドは 1以上の位置で保存的アミノ酸変化を有していてもよい。保存的アミノ酸変化と は、特定の位置での本来存在するのと同一の型のアミノ酸変化を意味し、即ち、 疎水性アミノ酸が疎水性アミノ酸に変化し、塩基性アミノ酸が塩基性アミノ酸に 変化すること等である。そのようなアミノ酸変化はペプチドの全体の荷電および 配置を有意には変更せず、従ってそのような変異体は癌ペプチドの抗癌活性を維 持する。そのような保存的変化の例は当業者に周知であり、本発明の範囲内であ る。 本発明のさらに別の態様は、LLGPGRPYRペプチドに由来するが、1以 上の位置で非保存的アミノ酸変化を含む数種の癌ペプチドに関する。そのような ペプチドが本発明で同定され、LSGPGRPYR、KLGPGRPYR、LL GPGFPYRおよびそのフラグメントおよび誘導体を含むが、これらに限定さ れない。 本発明はTRP−1またはTRP−2癌ペプチドの機能的に均等な変異体に関 する。「機能的に均等な変異体」には、部分的配列相同性を有するペプチド、1 以上の特定の保存的および/または非保存的アミノ酸変化を有するペプチド、ペ プチド結合体、キメラタンパク質、融合タンパク質およびペプチド核酸が含まれ る。 癌ペプチド、腫瘍抗原およびそれらの抗原性癌エピトープは、一次臨床単離物 、細胞株などからなどのように天然源から精製および単離することができる。癌 ペプチドおよびその一部は少なくとも90%の純度、好ましくは少なくとも95 %の純度、そして100%の純度である。癌ペプチドおよびそれらの抗原性エピ トープはまた、化学合成によってまたは当分野で公知の組み換えDNA技術によ っ て得ることもできる。化学合成の技術はJ.M.StewardおよびJ.D.Young,”Solid Phase Peptide Synthesis”,W.H.Freeman & Co.,San Francisco,1969; M. Bodansky他”Peptide Synthesis”,John Wiley & Sons,第2編、1976、お よびJ.Meienhofer,”Hormonal Proteins and Peptidea”,Vol.2,p.46,Acade mic Press,New York,1983およびE.SchroderおよびK.Kubke”The Peptides” Vol.1,Academic Press,New York,1965に記載されている。 癌ペプチドおよびそれらの抗原性癌エピトープは、当分野で公知の方法によっ て薬学的に許容可能な担体とともに医薬組成物に調剤化することができる。本組 成物は癌を防止または治療するためのワクチンとして有用である。本組成物はさ らに少なくとも1つの免疫刺激分子を含む。抗原特異的T細胞応答を刺激するた めに癌ペプチドまたはその一部分と組み合わせて使用するための免疫刺激分子に は、1以上の主要組織適合性複合体(MHC)分子、例えばクラスIおよびクラ スII分子、好ましくはクラスI分子が含まれるが、これらに限定されない。本 組成物はさらに、B7.1、B7.2、ICAM−1、ICAM−2、LFA− 1、LFA−3、CD72等を含む他の刺激剤分子、並びに、IL−1からIL −15、TNFα、IFNγ、RANTES、G−CSF、M−CSF、IFN α、CTAPIII、ENA−78、GRO、I−309、PF−4、IP−1 0、LD−78、MGSA、MIP−1α、MIP−1βを含むがこれらに限定 されないサイトカイン類、またはそれらの組み合わせ等を、免疫強化のために含 んでもよい。 刺激分子は物理的に別個の形態として提供してもよいし、B細胞、マクロファ ージまたは樹枝状細胞などの抗原提示細胞の膜中に、リポソームの膜中に提供し てもよいし、形質導入またはトランスフェクションした細胞の表面上に発現して もよい。MHC免疫刺激分子のDNA配列はGenBank等から入手可能であ る。 癌ペプチド、腫瘍抗原およびそれらの抗原性癌エピトープは、癌を防止または 治療するための方法で有用であり、ヒトを含む哺乳類中の癌または前癌を検出す るための診断アッセイで有用である。癌ペプチドまたはその一部は、放射標識、 ビオチン、フルオレセインなどの他の構成成分がそれに付着している、誘導体の 形態でもよい。特定の器官、腫瘍または細胞型への特異的ターゲッティングを可 能にするターゲッティング物質もまた腫瘍抗原、癌ペプチドまたはその一部に付 着させてもよい。そのようなターゲッティング物質は、ホルモン、サイトカイン 、細胞受容体などでもよい。癌ペプチド、腫瘍抗原およびそれらの一部は、単独 または他の試薬と組み合わせてキットの形態で用意することができる。 本発明の別の側面は、癌に対する腫瘍特異的細胞仲介免疫性を誘導するのに有 用なワクチンである。 癌の免疫療法に対するアプローチは能動または受動のカテゴリーに分類するこ とができる。能動免疫療法には、腫瘍に対する免疫応答を増進するための試みに おいて癌抗原を有する癌患者を直接免疫感作することが含まれる。受動免疫治療 は、抗腫瘍応答を直接的に仲介することを目標にして、抗腫瘍反応性を有する免 疫細胞または抗体などの免疫試薬を投与することを言う。 能動免疫療法の最初の試みは、無傷な癌細胞または癌細胞抽出物のいずれかを 、これらの物質が免疫応答を刺激できる量および形態で腫瘍抗原を含んでいると いう期待をもって、利用した。しかしながら、癌抗原の分子の同定により、ヒト 癌の治療のための免疫療法を開発する新たな可能性が開けた。これらの試みの幾 つかの要約を表1に示す。 表1 癌抗原の分子同定に基づく癌治療 1. 以下のものによる能動免疫治療: a.免疫優性ペプチド 1)単独 2)アジュバンドとの組み合わせ 3)ヘルパーペプチド、脂質またはリポソームに結合 4)抗原提示細胞上にパルス b.MHC分子への結合を増大させるアミノ酸置換による免疫優性ペプチド c.単独またはアジュバンドと組み合わせたタンパク質 d.癌抗原をコードする「裸の」DNA 1)皮膚内注入のための「遺伝子銃」 2)筋肉内注入 3)脂質に結合 e.次をコードするワクシニア、鶏痘又はアデノウイルス等の組み換えウイルス 1)癌抗原単独 2)癌抗原+サイトカインをコードする遺伝子、同時刺激分子、または免疫 疫応答を増強する他の遺伝子 f.単独または免疫刺激分子と組み合わせて癌抗原をコードするBCG、サルモ ネラまたはリステリア等の組み換え細菌 2. 免疫刺激サイトカインの投与を伴う(上記の)能動免疫治療 1. IL−2 2. IL−6 3. IL−10 4. IL−12 5. IL−15など 3.TIL又はPBLの次へのインビトロ感作で生じた抗腫瘍リンパ球による受動免疫治療 1.抗原提示細胞上にパルスした免疫優性ペプチド(CD8細胞を生じる) 2.抗原提示細胞と同時インキュベートした抗原性タンパク質(CD4細胞 を生じる外生抗原提示経路) E.coli、酵母またはバキュロウイルスなどの高効率発現系への癌抗原を コードする遺伝子の挿入は、免疫化で使用するための大量の精製された腫瘍抗原 を得る機会を提供する。あるいは、これらの腫瘍抗原からの免疫優性ペプチドは インビトロで容易に合成でき、単独にあるいはアジュバンド、脂質/リポソーム またはヘルパーペプチドへの結合との組み合わせなどのそれらの免疫原性を改善 することを意図した形態で免疫化のために大量に精製することができ、または抗 原提示細胞上へパルスすることができる。MHC抗原への結合効率を改善するた めの免疫優性ペプチドの個々のアミノ酸の修飾により、天然のペプチドと比較し て免疫原性を潜在的に増加させることができる。 筋肉中または皮膚中に直接注入した「裸の」DNAを使用する最近の技術は、 コードされた抗原に対する細胞性とホルモン性の両方の免疫応答を高めることを 示した(Cooney,E.L.,A.C.Collier,P.D.Greenberg,R.W.Coombs,J.Zarli ng,D.E.Arditti,M.C.Hoffman,S.L.HuおよびL.Correy,1991,Lancet337: 567;Wolff,J.A.,R.W.Malone,P.Williams,W.Chong,G.Acsadi,A.Jani, およびP.L.Felgner,1990,Science 247:1465;Davis,H.L.,R.G.Whalen,およ びB.A.Demeniex,1993,Hum.Gene Ther.4:151; Yang,N.S.,J.Burkholder,B .Roberts,B Martinelli,およびD.McCabe,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 8 7:9568;Williams,R.S.,S.A.Johnston,M.Riedy,M.J.Devlt,S.G.McElligo tt,およびJ.C.Sanford,1991,Proc.Natl.Acad.Sci.USA88:2726;Fynan,E.R. ,Webster,D.H.Fuller,J.R.Haynes,J.C.Santoro,およびH.L.Robinson,199 5,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:11478;Eisembraum,M.D.,D.H.Fuller,およびJ .R.Haynes,1993,DNA and CellBio.12:791; Fuller,D.H.およびJ.R.Haynes ,1994,AIDS Res.Hum.Retrovir.10(11):1433;Acsadi,G.,G.Dickson,D.R .Love,A.Jani,F.S.Walsh,A.Gurusinghe,J.A.Wolff,およびK.E.Davies ,1991,Nature 352:815)。生活力のないDNAベクターを使用する技術は準備 の容易性と投与の安全性の利点を有している。本発明の代替核酸配列は癌に対す る免疫原としてまたはDNAワクチンとして有用である。TRP−1の本発明の 代替オープンリーディングフレーム核酸配列あるいは本発明のTRP−2タンパ ク質またはペプチドをコードするDNA配列は、癌細胞に対する細胞応答を引き 出す量で遺伝子銃を 使用して投与することができる。ナノグラムの量がそのような目的にとって有用 である。 免疫化の有効な形態は、BCG、サルモネラまたはリステリア等の組み換え細 菌中にあるいはワクシニア、鶏痘またはアデノウイルス等の組み換えウイルス等 中に免疫原性分子をコードする遺伝子を取り込むことを含む。癌抗原をコードす る遺伝子は、単独で、あるいは免疫刺激分子をコードする遺伝子または感染後に 免疫応答を増大させることができる他の遺伝子と一緒に発現させることができる 。マウスモデル中のモデル腫瘍抗原による研究は、インターロイキン−2(IL −2)またはB7.1の遺伝子の取り込みによりモデル腫瘍抗原の免疫原性を増 大することができ、これらの抗原を有する確立した肺転移巣の減退を仲介さえで き、そしてこれらの抗原を有する確立した肺転移巣の減退を仲介さえできること を示した。IL−2、IL−6、IL−10、IL−12またはIL−15等の 免疫刺激サイトカインの外来投与を伴う能動免疫治療を使用して免疫応答を改善 することもできる。 ヒト腫瘍抗原を認識できる遺伝的に改変した免疫細胞(通常は養子免疫治療と 称される)による受動免疫は転移性メラノーマを有する選択患者における癌の退 行を仲介するのに有効である。ヒトリンパ球が抗原提示細胞上に提示された腫瘍 抗原免疫優性ペプチドにインビトロで感作されるインビトロ技術が開発されてい る。反復したインビトロ刺激によって、ヒト腫瘍抗原をコードする遺伝子をクロ ーン化するために使用したTILよりもはるかに大きなヒト腫瘍抗原を認識する 能力を有する細胞を誘導することができる。即ち、癌ペプチドによる反復したイ ンビトロ感作によって、TILの50〜100倍以上の効力を有するリンパ球を 誘導することができた。これらの細胞の養子移入は、通常通り生育したTILよ りもインビトロでの腫瘍退行を仲介するのにより有効であるかもしれない。 癌を防止または阻害する方法において、癌ペプチドまたはその一部を、静脈内 、筋肉内、皮下、皮膚内、腹腔内、くも膜内、胸膜内、子宮内、直腸、膣、局所 、腫瘍内などを含むがこれらに限定されない複数の経路の一つを通じて投与する ことができる。 投与は、粘膜通過または皮膚通過手段で行うことができる。粘膜通過または皮 膚通過投与のためには、透過すべき障壁に適した浸透剤を調剤中に使用する。そ のよ うな浸透剤は当分野で一般的に既知であり、例えば、粘膜通過投与のためには胆 汁塩およびフシジン酸(fusidic acid)誘導体が含まれる。さらに、洗浄剤を使 用して浸透を容易化することができる。粘膜通過投与は、例えば、鼻腔スプレー 、または座薬によるものでもよい。経口投与のためには、癌ペプチド、腫瘍抗原 、その一部または変異体は、カプセル剤、錠剤および毒物(toxics)などの通常 の経口投与形態に調剤化される。 一般に、被験者の体重1Kg当たり少なくとも約1pg、好ましくは体重1K g当たり少なくとも約1ng、より好ましくは体重1Kg当たり少なくとも約1 μg以上の投与量の癌ペプチドまたはその一部を被験者に供給することが望まし い。体重1Kg当たり約1ngから体重1Kg当たり約100mgの範囲が好ま しいが、より低い投与量またはより高い投与量を投与することもできる。投与に より、癌抗原特異的Tリンパ球、好ましくは細胞毒性Tリンパ球のクローン性膨 張を開始、刺激および/または生じさせるのに有効であり、これらは次いで被験 者中で癌を防止または阻害することができる。 投薬量は少なくとも1回投与され、巨丸薬(bolus)としてまたは連続投与と して供給してもよい。数週間から数カ月間にわたる投薬量の多数回投与が好まし いかもしれない。次の投与は指示された通りに投与することができる。 治療方法においては、癌ペプチドまたはその一部を含むワクチンを有効量で哺 乳類に投与し、哺乳類における癌を防止する。特に興味深いのは、メラノーマの 防止のためのTRP−1遺伝子のORF3によってコードされる癌ペプチドまた はその一部を含むワクチンである。また特に興味深いのはメラノーマの防止のた めのTRP−2遺伝子のフラグメントによってコードされる1以上のペプチドを 含むワクチンである。 腫瘍を有する動物における腫瘍の負荷を減少する方法においては、当該方法は 腫瘍の負荷の部位に有効量の抗原性癌エピトープを投与することを含み、その量 はその部位の腫瘍の大きさを減少するのに有効である。 治療の別の方法では、自己由来の細胞毒性リンパ球または腫瘍浸透リンパ球を 癌を有する患者から得ることができる。リンパ球を培養液中で生育させ、特異的 癌ペプチドまたは抗原性癌エピトープの単独での、またはサイトカインを有する 少なく とも1つの免疫剌激分子と一緒での存在下において培養することによって癌抗原 特異的リンパ球を膨張させる。抗原特異的リンパ球を次いで、患者の腫瘍を減少 または排除するのに有効な量で患者中に注入して戻す。 免疫化の後に、ワクチンの効率を、特異的溶解活性、特異的サイトカイン産生 、腫瘍退行またはこれらの組み合わせによって評価される通り、癌抗原を認識す る免疫細胞の産生によって評価することができる。免疫化すべき哺乳類が癌また は転移性癌に既に罹患している場合には、ワクチンを、免疫調節剤、例えば、I L−2、IL−6、IL−10、IL−12、IL−15、インターフェロン、 腫瘍壊死因子などの他の治療処置、シスプラチナムなどの化学治療剤、ガンシク ロビルなどの抗ウイルス剤、アムホテリシンB、抗生物質などと組み合わせて投 与することができる。 本発明の別の側面は、正常のタンパク質またはペプチドをコードするオープン リーディングフレームDNA配列以外の遺伝子の代替オープンリーディングフレ ームDNA配列であって、代替オープンリーディングフレームDNA配列が免疫 系のT細胞によって免疫学的に認識される癌ペプチドおよびその一部をコードす る、上記DNA配列である。 代替オープンリーディングフレームDNA配列は、TRP−1遺伝子、TRP −2遺伝予、INK4a遺伝子などからのDNA配列を含むが、これらに限定さ れない。 興味深いのは、メラノーマ形成遺伝子由来の代替オープンリーディングフレー ムDNA配列である。メラノーマ形成遺伝子は、MART−1/MelanA、 チロシナーゼ、gp100、gp75(TRP−1)、TRP−2(Helahan,R 他、1993 J.Invest.Dermatol.100(Suppl.): 176S-185S)などをコードする遺 伝子を含むが、これらに限定されない。 本発明の一つの態様は、チロシナーゼ関連タンパク質をコードする遺伝子配列 内からの癌ペプチドをコードする代替オープンリーディングフレームDNA配列 またはその一部である。TRP−1の遺伝子配列は、Vijayasaradhi,S.他(199 0,J.Exp.Med.171:1375-80)に記載されている通り、アクセッション番号X51 455により、そしてCohen,T.他1990 Nucleic Acids Research,VOL.18:2807 に記載 されている通り、EMBLアクセッション番号X51420により、EMBLデ ータバンクに開示されている。 一つの態様において、代替オープンリーディングフレームDNA配列は、腫瘍 浸透リンパ球を含む癌抗原特異的Tリンパ球によって認識される癌ペプチドまた はその一部をコードする、配列番号5を有する図2に記載のORF3、その一部 および機能的に均等なその配列変異体を含む。図2に記載したORF3に相補的 並びに抗相補的な核酸配列も本発明に含まれる。 別の態様において、代替オープンリーディングフレームDNA配列は、 ATGTCACTGCAACGGCAATTTCTCAGG(配列番号10)を 含む。 本発明の一つの態様は1以上の癌ペプチドをコードするTRP−2の一部であ る。TRP−2の遺伝子配列は、Yokoyama他(1994)に記載されている通りアク セッション番号D17547そしてBouchard他(1994)に記載されている通りジ ーンバンクアクッション番号S69231によりジーンバンクに開示されている 。 一つの態様において、TRP−2遺伝子フラグメントは、LLGPGRPYR および、腫瘍浸透リンパ球を含む癌抗原特異的Tリンパ球によって認識される癌 ペプチドについての機能的に均等なその配列変異体をコードする。LLGPGR PYRをコードする配列およびその均等な配列変異体に相補的並びに抗相補的な 核酸配列も本発明に含まれる。 別の態様において、TRP−2タンパク質をコードするDNA配列は全てまた はその一部以上を発現する。TRP−2遣伝子の好ましいフラグメントは、ヌク レオチド位置947のPstI部位とヌクレオチド位置1080のKpnI部位 の間の領域を含む。 TRP−2遺伝子の別の好ましいフラグメントは、 TTATTAGGACCAGGACGCCCCTACAGG を含む。 遺伝コードの縮重のため、DNA配列の変形が均等な癌ペプチドの翻訳を生じ るであろう。その結果、置換が癌抗原MHC制限T細胞によって認識される癌ペ プチドの発現を生じる限り、そのような置換も本発明の範囲内に含まれる。本発 明に包 含される一つの置換は、SerをコードするTCAのAlaをコードするGCT 、GCC、GCAまたはGCGの代わりの置換である。他の咄乳類種からのホモ ログが本発明の範囲内に含まれる。 TRP−1遺伝子などからのような代替オープンリーディングフレームDNA 配列の全部または一部をプローブとして使用して他の咄乳類種の癌ペプチドのホ モログを同定および単離することができる。同様に、TRP−2遺伝子の全部ま たは一部をプローブとして使用して他の哺乳類種の癌ペプチドのホモログを同定 および単離することができる。一つの態様においては、マウスcDNA配列を使 用してヒトホモログ核酸配列の哺乳類cDNAライブラリーをスクリーニングす る。陽性クローンを選択して配列決定する。cDNAライブラリーを合成できる 組織種類の例としては、真皮、表皮、固体腫瘍、メラノーマ、メラノサイトなど が含まれるがこれらに限定されない。当業者ならばホモログを検出するために使 用する好適なハイブリダイゼーション条件を理解するであろう。核酸ハイブリダ イゼーション、ライブラリーの構築およびクローニング技術の慣用的方法はSamb rook他(eds)(1989)「Molecular Cloning.A Laboratory Manual」 Cold Spr ing Harbor Press,Plainview,New YorkおよびAusubel他(eds)「Current Pro tocols in Molecular Biology」(1987)、John WileyおよびSons,New York,N ew Yorkに記載されている。 本発明の別の側面は、癌を有する哺乳類から単離された生物試料中のTRP− 1、TRP−2癌ペプチドなどのような癌ペプチドを転写するRNAの検出およ び定量のための核酸プローブである。対照RNA試料に対するRNAのレベルの 変化は哺乳類の疾患の診断および予後において有用である。 一つの態様において、mRNAを癌または前癌を有することが疑われる患者の 組織から誘導し、健常な対照被験者由来のmRNAと比較する。対照と比較して 、患者中の癌ペプチドをコードする代替オープンリーディングフレームmRNA の定量的および/または定性的増加は患者中の癌または前癌の指標である。mR NAはmRNAにハイブリダイズできるオリゴヌクレオチドプローブを使用して 検出できる。一つの態様において、プローブはTRP−1のORF3の転写産物 とハイブリダイズできる。 本発明の別の側面は、癌を有する哺乳類から単離された生物試料中のTRP− 2腫瘍抗原を転写するRNAの検出および定量のための核酸プローブである。対 照RNA試料に対するRNAのレベルの変化は咄乳類の疾患の診断および予後に おいて有用である。 一つの態様において、TRP−2mRNAを癌または前癌を有することが疑わ れる患者の組織から誘導し、健常な対照被験者由来のTRP−2mRNAと比較 する。対照と比較して、患者中のTRP−2mRNAの定量的および/または定 性的増加は患者中の癌または前癌の指標である。mRNAはオリゴヌクレオチド プローブを使用して検出できる。 癌ペプチドまたはその一部をコードする配列に基づくオリゴヌクレオチド対の 組み合わせをPCRプライマーとして使用して、選択されたRNA配列を増幅す るための逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)法を使用して生物試 料中のmRNAを検出することができる。本発明はまた癌ペプチドまたはその一 部をコードするDNAおよびRNAの検出のためのin situPCRおよび in situRT−PCRをも包含する。その技術は、標的核酸のコピー数が 非常に低い場合、または異なる型の核酸を区別しなければならない場合に好まし い。その方法は正常細胞由来の前癌および癌を検出および識別する際に特に有用 である。 本発明は、遺伝子由来の核酸欠失フラグメントの生成を含む抗原特異的T細胞 と反応性を有する抗原性癌エピトープを同定する方法を含む。欠失フラグメント を好適なベクター中に置き、これを次いで核酸産物の発現のために宿主細胞中に トランスフェクトまたは形質導入する。場合により、宿主細胞は免疫刺激分子を も発現する場合もある。癌抗原特異的T細胞応答は欠失産物を発現する宿主細胞 の存在下で測定される。 宿主細胞が欠失産物のみを発現する場合、免疫刺激分子を、B細胞、マクロフ ァージ、樹枝状細胞などの抗原提示細胞によってあるいは刺激分子でトランスフ ェクションした細胞によって供給することができる。一つの態様において、免疫 刺激分子はMHCクラスI分子である。 このアプローチを使用するマッピングによって、癌ペプチドまたは抗原性癌エ ピトープをコードする代替オープンリーディングフレームDNA配列を決定する 。 癌抗原および抗原性癌エピトープを同定する代替法は、合成ペプチドを作製し 、その合成ペプチドで抗原提示細胞をパルスし、そしてペプチドでパルスした抗 原提示細胞を抗原特異的T細胞と一緒に添加し、そしてペプチドでパルスした抗 原提示細胞の存在下でT細胞の抗原特異的応答を測定することによる。抗原特異 的T細胞応答を生じる合成ペプチドは本発明の抗原性癌エピトープを含む。 本発明はまた、癌ペプチドまたは抗原性癌エピトープをコードする代替オープ ンリーディングフレームDNA配列を含むベクターを包含する。場合により、ベ クターは少なくとも1つの免疫剌激分子をコードするDNA配列をも含むことが できる。一つの態様において、ベクターはTRP−1遺伝子のORF−3を含む 。 本発明はまた、本発明の腫瘍抗原をコードするTRP−2遺伝子およびそのフ ラグメントを含むベクターを包含する。場合により、ベクターは少なくとも1つ の同時免疫刺激分子をコードするDNA配列をも含むことができる。 真核発現ベクターには、レトロウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクタ ー、アデノウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、鶏痘ウイルスベクタ ー、バキュロウイルスベクター、ヒトパピローマウイルスベクター、馬脳炎ベク ター、インフルエンザウイルスベクターなどが含まれるがこれらに限定されない 。 本発明は、同一の遺伝子からの正常のタンパク質またはペプチドをコードする ために使用されるオープンリーディングフレーム核酸配列以外の遺伝子の代替オ ープンリーディングフレーム核酸配列によってコードされる癌ペプチドまたはそ の一部を発現する新規な組み換えウイルスを包含する。別の態様において、本発 明は、TRP−2遺伝子またはそのフラグメントまたは変異体の核酸配列によっ てコードされるTRP−2腫瘍抗原を発現する新規な組み換えウイルスを包含す る。組み換えウイルスは少なくとも1つの免疫刺激分子を発現してもよい。組み 換えウイルスは、哺乳類、特にヒトの癌を防止または治療する目的のために、哺 乳類において細胞仲介免疫応答を引き出すかアップ調節することができる。 組み換えウイルスは、単独または免疫刺激分予をコードする1以上の遺伝子と 一緒に、癌ペプチド、その一部、または抗原性癌エピトープをコードする核酸配 列をそのゲノムまたはその一部中に取り込んでいる。一つの態様において、組み 換えウイルスは、TRP−1癌ペプチドまたはその一部をコードする核酸配列を そのゲノ ム中に取り込んでいる。別の態様において、組み換えウイルスは、単独または同 時免疫刺激分子をコードする1以上の遺伝子と一緒に、TRP−2腫瘍抗原また はその変異体をコードする核酸配列をそのゲノムまたはその一部中に取り込んで いる。組み換えウイルスで感染した宿主細胞は、癌ペプチド、その一部、または 抗原性癌エピトープを単独または少なくとも1つの免疫刺激分子と一緒に発現す る。 組み換えワクシニアウイルスベクターからの外来遺伝子産物を構築および発現 させる方法は、Perkus他Science 229:981-984,1985、Kaufman他Int.J.Cancer 4 8:900-907,1991、Moss Science 252:1662,1991、SmithおよびMoss BioTechniq ues Nov/Dec,p.306-312,1984、および米国特許4,738,846号に開示さ れている。SutterおよびMoss(Proc.Natl.Acad.Scl.U.S.A.89:10847-10851,1992 )およびSutter他(Virology 1994)は、本発明でウイルスベクターとして使用で きる非複製性組み換えアンカラウイルス(MVA、改変したワクシニアアンカラ )のベクターとしての構築および使用を開示している。BaxbyおよびPaoletti(V accine 10:8-9,1992)は、本発明でウイルスベクターとして使用するための、 カナリア痘ウイルス、鶏痘ウイルスおよび他の鳥類種を含む非複製性プロキシウ イルス(proxvirus)のベクターとしての構築および使用を開示する。 本発明のベクターは、癌ペプチドまたは抗原性癌エピトープの発現のために好 適な宿主細胞中に置くことができる。真核宿主細胞株には、COS細胞、CHO 細胞、HeLa細胞、NIH/3T3細胞、昆虫細胞、樹枝状細胞などの抗原提 示細胞などが含まれるがこれらに限定されない。場合により、宿主細胞は刺激分 子を発現することもできる。宿主細胞が癌ペプチドまたは抗原性癌エピトープを 少なくとも1つのMHC分子と一緒に両方発現する場合、真核発現系を使用して 適当なグリコシル化を行うことが好ましい。宿主細胞による癌抗原および免疫刺 激分子の両方の発現により、特異的T細胞に対して必要なMHC制限ペプチドと T細胞に対する好適なシグナルが供給され、抗原認識と増殖が助けられ、または 抗原特異的T細胞のクローン性膨張が助けられる。全体的な結果は免疫系のアッ プ調節である。免疫応答のアップ調節は、癌または前癌の増殖を殺傷または阻害 することができる癌抗原特異的細胞毒性リンパ球の増加によって明白である。 DNAは、当分野で既知の方法によってトランスフェクション、形質導入、リ ポ ソームなどによって宿主細胞中に挿入される(Sambrook他、1989、「Molecular Cloning A Laboratory Manual」、Cold Spring Harbor press,Plainview,New York)。リポソームのためには、例えば、ポリカチオン性脂質である、中性リン 脂質ジオレオイルホスファチジル−エタノールアミン(DOPE)と複合化した ジミリスチルオキシプロピル−3−ジメチル−ヒドロキシエチルアンモニウム( DMRIE)などのカチオン性脂質が好ましく、Nabel,E.G.他,1992,Hum.Gen e.Ther.3:367-275;Nabel,G.J.他,1992,Hum.Gene Ther.3:649-656;Stewart,M. J.他,1992 Hum.Gene Ther.3:399-410;Nabel,G.J.他1993 Proc.Natl.Acad.Sc i.USA 90:11307-11311;およびHarrison,G.S.他1995 BioTechniques 19:816-82 3に開示されている通りである。 宿主細胞によって発現された組み換え癌タンパク質、腫瘍抗原または抗原性癌 エピトープは、当分野で既知の標準的タンパク質精製法によって細胞ライセート または細胞上清から精製することができる。これらには、モレキュラーシーブク ロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、等電点フォーカシング、ゲ ル電気泳動、アフィニティ−クロマトグラフィー、HPLC、逆相HPLCなど が含まれるがこれらに限定されない(Ausubel他、1987,Current Protocols in Molecular Biology,John WileyおよびSons,New York,NY)。免疫アフィニテ ィ−クロマトグラフィーを、免疫アフィニティ−試薬として、本明細書に記載し た抗癌タンパク質抗体またはその抗原結合フラグメントを使用して精製のために 使用することもできる。 組み換えウイルスは治療剤またはワクチンとしても使用できる。そのような使 用では、被験者に約105から約1010プラーク形成単位/哺乳類mgの範囲内 の組み換えウイルスの投与量を供給することが望ましいが、より低いまたはより 高い投与量を投与することもできる。 組み換えウイルスベクターは、メラノーマなどの癌の証拠の前に、またはメラ ノーマなどの癌に罹患した哺乳類の疾患の退行を仲介するために、哺乳類に導入 することができる。ウイルスベクターを哺乳類に投与するための方法の例として は、ex vivoで組み換えウイルスに細胞を露出すること、あるいは罹患し た組織中の組み換えウイルスの注入または静脈内、皮下、皮膚内、筋肉内などの ウイルス投 与が挙げられるがこれらに限定されない。あるいは、組み換えウイルスベクター または組み換えウイルスベクターの組み合わせを好適な薬学的に許容可能な担体 中で癌性損傷への直接注入または局所投与によって局所的に投与することができ る。問題の核酸配列を有する組み換えウイルスベクターの量はウイルス粒子の力 価に基づく。免疫化の好ましい範囲は、哺乳類1頭、好ましくはヒト1人当たり 約105から1010ウイルス粒子である。 腫瘍拒絶に関与する本発明の癌抗原エピトープは本明細書に具体的に開示され たものに限定されない。本発明で開示した方法を使用して、代替オープンリーデ ィングフレーム産物に含まれる他の癌抗原エピトープを他の腫瘍関連抗原から同 定することができ(Van der Bruggen,P.他1991 Science 254:1643-47; Gaugle r,B他1994 J.Exp.Med.179:921-30;Boel,P.他19951 Immunity.2:167-75;Bri chard,V 他1993,J.Exp.Med.178:489-95; Robbins,P.F.他、1994、Cancer R esearch 54; 3124-26;Kawakami,Y.他1994,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.91:351 5-19;Coulie,P.G.他1994 J.Exp.Med.180:35-42;Bakker,A.他1994,J.Exp.Me d.179:1005-09)、例えばMART−1/MelanA(Kawakami,他J.Exp.Med .180:347-352,1994)、MAGE−3(Gaugler他、J.Exp.Med.179:921-930,1 994)、gp100(Kawakami,他Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.91:6458-6462, 1994)、チロシナーゼ(Brichard他J.Exp.Med.178:489,1993)、TRP−2、 CEA、CA−19−A、A−125、PSA、erb−2(Boon他、Ann.Rev. Immunol.12:337,1994)などから同定することができる。 腫瘍保有患者由来の腫瘍浸透リンパ球(TILs)は主要組織適合性複合体( MHC)クラスI分子によって提示される腫瘍関連抗原を認識する。インターロ イキン−2(IL−2)と一緒にTIL586を転移性メラノーマを有する自己 由来患者に注入すると、主要の客観的退行が生じた。TIL586によって認識 された腫瘍抗原をコードする遺伝子は最近単離され、gp75をコードすること が示された。本発明は、正常のgp75タンパク質に由来しない、TIL586 によって認識された、抗原ペプチド、MSLQRQFLR(配列番号9)の同定 と単離である。代わりに、この9量体ペプチドが同一遺伝子の代替オープンリー ディングフレームの翻訳から生じた。即ち、gp75遺伝子は2種の完全に異な るポリペプチド、即ち、 癌を有する患者からの血清中のIgG抗体によって認識される抗原としてのgp 75と、T細胞によって認識される腫瘍拒絶抗原としての24アミノ酸産物とを コードする。これは、ヒト腫瘍拒絶抗原が正常のタンパク質をコードするために 使用されるもの以外のオープンリーディングフレームを使用して正常の細胞遺伝 子から生成できることの最初の実証を意味する。これらの知見は、癌に対する腫 瘍特異的細胞仲介免疫を誘導するためのワクチンとして有用である、腫瘍抗原を 生成するための新規な機構を明らかにした。 ExoIII/S1欠失分析の方法は癌エピトープをgp75遺伝子の小さい DNAフラグメントに位置付けた。癌エピトープは正常のgp75タンパク質に 不在であった。TIL586によって認識された本発明の癌ペプチドは、正常の gp75タンパク質をコードする同一の遺伝子の代替オープンリーディングフレ ームから翻訳された遺伝子産物から誘導された。ヌクレオチド294−296の ATGをATCで置換するとTIL586からのサイトカイン放出を刺激する能 力の完全な損失が生じた。コールド標的阻害実験は、同定された癌エピトープが 腫瘍細胞上に存在する天然でプロセスされたペプチドによってT細胞認識を競合 できることを示した。TIL586細胞株から作製した6個のT細胞クローンは 、586mel腫瘍細胞、このペプチドでパルスした586EBV B細胞、お よび正常メラノサイトをHLA−A31制限様式で認識することができ、また代 替オープンリーディングフレームによってコードされた遺伝子産物が腫瘍細胞並 びに正常メラノサイト中に存在するかもしれないことも示唆される。 本発明はまた、TIL586によって認識される腫瘍抗原をコードしTRP− 2をコードすることを示した遺伝子に関する。本発明はまた、TRP−2に由来 し、癌ワクチンとして活性である抗原性ペプチドLLGPGRPYRの同定およ び単離に関する。 本発明は、癌ペプチドまたはその一部をコードする代替オープンリーディング フレームDNA配列の1以上のコピーをそのゲノム中に取り込んでいるトランス ジェニック動物を提供する。本発明はまた、TRP−2腫瘍抗原またはその一部 をコードするDNA配列の1以上のコピーをそのゲノム中に取り込んでいるトラ ンスジェニック動物を提供する。トランスジェニック動物の一般的な作製方法は 、Krimpenf ort他、米国特許5,175,384、Leder他、米国特許5,175,383、Wagner他、米国特許 5,175,385、Evans他、米国特許4,870,009およびBerns米国特許5,174,986に記載 されている。遺伝子の取り込みは、癌ペプチドの多重形態または変異体の過剰発 現、変化した発現または発現を生じる。得られたトランスジェニック動物は本発 明の癌または腫瘍抗原の発達の研究で有用である。動物モデルは癌治療のための ワクチンおよび化学療法剤のスクリーニングで有用である。トランスジェニック 動物はまた癌の発達の研究でも有用である。 本発明はさらに、本発明の癌ペプチドまたは抗原性癌エピトープの免疫化によ って引き出された抗体またはその抗原結合部分を含む。癌ペプチドまたは抗原性 癌工ピトープが数個のアミノ酸のみから成る場合、癌ペプチドまたは抗原性癌エ ピトープは、抗体反応を引き出すために担体タンパク質と結合させることができ る。KLHまたは破傷風毒素などの担体タンパク質および結合の方法は当分野で 公知である。抗体は本発明の癌ペプチドおよび抗原性癌エピトープに対する特異 性を有し、それと反応または結合する。 例示的な抗体分子は、完全な免疫グロブリン分子、実質的に完全な免疫グロブ リン分子または抗原結合部位を含む免疫グロブリン分子のこれらの一部分であり 、F(ab)、F(ab’)、F(ab’)2 、ヒト化キメラ抗体、およびF (v)として当分野で公知の免疫グロブリン分子の一部が含まれる。ポリクロー ナルまたはモノクローナル抗体は当分野で既知の方法によって作製できる(Kohl erおよびMilstein(1975)Nature 256,495-497; Campbell 「Monoclonal Anti body Technology,the Production and Characterization of Rodent and Human Hybridomas」 in Burdon他(eds.)(1985)、「Laboratory Techniques in Bioch emistry and Molecular Biology」第13巻、Elsevier Science Publishers,ア ムステルダム)。抗体または抗原結合フラグメントは遺伝子工学によって作製す ることもできる。重鎖および軽鎖の両方の発現のための技術はPCT特許出願、 公開番号WO901443、WO9014424、Huse他(1989)Science 246:12 75-1281、及び米国特許4,946,778の主題である。 一つの態様において、本発明の抗体を免疫分析で使用して、生物試料中のTR P−1ペプチドおよびTRP−2腫瘍抗原またはその一部を含む癌ペプチドを検 出 する。抗体またはその抗原結合フラグメントを使用して癌に罹患した哺乳類から の組織バイオプシー試料中の癌ペプチドを検出できる。疾患組織中の癌抗原の評 価を使用して哺乳類における疾患の進行を予測したり、治療の効果を診断できる 場合がある。免疫分析は放射免疫分析、ウエスタンブロット分析、免疫蛍光分析 、酵素免疫分析、ケミルミネッセント分析、免疫組織化学分析などが可能であり 、インビトロ、インビボまたはin situで行うことができる。ELISA に関する当分野で公知の標準技術は、「Methods in Immunodiagnosis」第2版、 RoseおよびBigazzi eds.John Wiley & Sons,1980;Campbell他「Methods and I mmunology」、W.A.Benjamin,社、1964;およびOellerich,M.1984,J.Clin.Chem .Clin.Biochem.22:895-904に記載されている。免疫組織化学のための慣用法はHa rlowおよびLane(eds)(1988)、 「Antibodies A Laboratory Manual」Cold Spri ng Harbor Press,Cold Spring Harbor,New York;Ausbel他(eds)1987「Curre nt Protocols in Molecular Biology」、John WileyおよびSons(New York,NY )に記載されている。そのような検出分析のために適当な生物試料は、細胞、組 織バイオプシー、全血、血漿、血清、たん、脳髄液、胸膜液、尿などが含まれる がこれらに限定されない。 本発明の抗体および抗原結合フラグメントは免疫治療でも使用できる。抗体ま たはその抗原結合フラグメントは、癌の症状の度合い、範囲または持続期間を防 止、減少または減衰させるのに十分な量で哺乳類に提供される。 引用された全ての文献および特許は引用により本明細書中に取り込まれる。 本発明を一定の特定の態様に関して上記で説明してきたが、多くの変形が可能 であること、並びに代替の物質および試薬を本発明から離れることなく使用でき ることが理解される。ある場合には、そのような変形および置き換えは若干の実 験を必要とするかもしれないが、通常の試験を含むだけである。 特定の態様の上記の記載は本発明の一般的性質を十分に明らかにし、他者は、 現在の知識を適用することによって、一般的概念から離れることなくそのような 特定の態様を各種の応用のために容易に改良および/または採択でき、従ってそ のような採択および改良は開示した態様の意味および均等の範囲の中に含まれる ことが意図される。実施例1 材料と方法 化学薬品と試薬 下記化学薬品と試薬は表示供給源から購入した:RPMI 1640,AIM −V培地,Lipofectamine,G418(GIBCO BRL,Ga ithersberg,MD);真核細胞発現ベクターpCR3(Invitr ogen,San Diego,CA);抗−HLA−A31モノクローナル抗 体(One lamda,Canoga Park,CA);フルオレセインイ ソチオシアネートとコンジュゲートした抗−免疫グロブリン M抗体(Vect or Laboratories,Inc.,Burlingame,CA)。 細胞傷害性Tリンパ球(CTL)と細胞系統 TIL586を、転移性メラノーマを有する患者の腫瘍標本から単離し、IL −2(600OIU/ml)(Chiron)を含有する培地中で32〜60日 間、既述されたように増殖させた(Topalian,S.,D.Solomo n,F.P.Avis,A.E.Chang,D.L.Freeksen,W. M.Linehan,M.T.lotze,C.N.Robertson,C. A.Seipp,P.Simon,C.G.Simpson及びS.A.Ros enberg,1988,J.Clin.Oncol.6:839〜53)。T IL586は主としてCD8+T細胞であった。TIL1200はTIL586 に関して述べた条件と同じ条件下で増殖させた。T細胞クローンはTIL586 細胞系統から限界希釈法によって得て、次に、6000IU/mlのIL−2を 含有するAIM−V培地中で膨張させた(expanded)。 メラノーマ細胞系統397mel,397mel/A31,586mel,6 24mel及びEBV形質転換B細胞系統586EBVと1510EBVをこの 実験室で確立して、10%ウシ胎児血清(FCS)を含有するRPMI 164 0培地中で培養した。幼児包皮(infant foreskin)に由来する正常培養メラノサ イト(Clonetics,CAから購入したNHEM680)はメラノサイト 増殖培地(MGM;Clonetics,CA)中で培養した。COS7細胞系 統はW.Leonard博士(NIH)から提供された。 GM−CSF分泌アッセイ DNAトランスフェクションとGM−CSF分析は既述されたようにおこなっ た(Wang,R.F.,P.F.Robbins,Y.Kawakami,X .Q.Kang及びS.A.Rosenberg,1995,J.Exp.Me .181:799〜804)。簡単には、異なるフラグメントを含有するDN A200μgとHLA−A31 DNA 50ngとを100μlのDMEM中 の200μlのリポフェクタミンと15〜45分間混合した。DNA/リポフェ クタミン混合物を次にCOS−7(5x104)細胞に加えて、一晩インキュベ ートした。翌日、細胞をDMEM培地によって2回洗浄した。TIL586を1 20 IU/mlのIL−2を含有するAIM−V培地中に1x105細胞/穴 の濃度で加えた。18〜24時間のインキュベーション後に、100μlの上澄 み液を回収し、GM−CSFを標準ELISAアッセイ(R+D System s,Minneapolis,MN)で測定した。ペプチドに関しては、586 EBV、1510EBV及びT2細胞を37℃においてペプチドと共に90分間 インキュベートしてから、120 IU/mlのIL−2を含有するAIM−V 培地によって3回洗浄した。TIL586を加え、さらに18〜24時間インキ ュベートし、100μlの上澄み液をGM−CSFアッセイのために回収した。 ExoIII/SI欠失構築とPCRフラグメント 一連の欠失を作製するために、poDNA776プラスミドDNAをXbaI によって消化させ、α−ホスホロチオエートデオキシリボヌクレオチド三リン酸 によって充填し、ExoIIIヌクレアーゼ消化をブロックした。pcDNA7 76プラスミドは2.4kb DNAフラグメントと、転写を導くためのCMV プロモーターとを含有するpcDNA3ベクターの誘導体である。直鎖状(linea rized)DNAを第2の制限酵素Xhol消化にさらして、ExoIIIに感受性 の1末端を形成した。ExoIIIヌクレアーゼ/Mung Beanヌクレア ーゼ欠失は製造者の指示(Stratagene,CA)に従っておこなった。 詳細なプロトコールは次の通りである: 1.10μgのDNAをXbaIによって消化させて、αホスホロチオエート デオキシリボヌクレオチドによって充填した。 2.DNAを第2酵素XhoIによって消化させた後に、フェノール抽出及び エタノール沈降をおこなった。 3.DNAペレットを乾燥させ、125μlの2X Exo緩衝剤、25μl の100mM β−メルカプトエタノール、100μlの水中に懸濁させ た。 4.全てのアリコートが取り出されて、ドライアイス上に置かれた時点で、 チューブを68℃で15分間加熱してから、氷上に置いた。 5.15UのMung Beanヌクレアーゼを各時点のチューブに(1X Mung Bean希釈緩衝剤によって予め希釈して)加えて、30℃に おいて30分間インキュベートした。 6.下記を加えた: 4μlの20%SDS 10μlの1M Tris−HCl,pH9.5 20μlの8M LiCl 250μlの緩衝剤平衡化フェノール:クロロホルム 7.サンプルをボルテックスし、マイクロフュージ中で1分間回転させ、 上部水層を取り出して、クロロホルムで抽出して、Mung Beanタ ンパク質をDNAから抽出した。 8.25μlの3M NaOAc(pH7.0)を水相に加えた。10ng/ μlの最終濃度までのtRNAを沈降のためのキャリヤーとして用いた。 9.650μlの冷エタノールを加えた。サンプルをドライアイス上で10分 間急冷して、マイクロフュージ中で20分間回転させた。 10.上澄み液を排出して、ペレットを80%エタノールによって洗浄した。 11.ペレットを乾燥させた。 12.DNAペレットを15μlの10mMTris−Cl(pH7.5)、 0.1mM EDTA中に再溶解した。 B.ライゲーション 13.DNA欠失を下記条件を用いてライゲートした。 1.0μlのExo/Mung処理DNA 2.0μlの10Xライゲーション緩衝剤 500mM Tris−Cl,pH7.5 70mM MgCl2 10mM DTT 2.0μlの5mM ATP,pH7.0〜7.5 2.0μlのT4 DNAリガーゼ(Cat#600011;キットと して提供) 13.0μlのH2O 20.0μlの総反応容量 室温においてインキュベート インサートをベクターにライゲートするためのDNAライゲーションキ ット(Cat#203003)をStratageneが提供。 14.残留する14.0μlのExo/Mung処理DNAのうちの7μlを ゲル電気泳動分析に用いた。 15.1μlのライゲーション反応を用いて、10μlのEpicuria n coli RecA−JM109又はXLI−Blue細胞を形質 転換させ、LB/AMPプレート上にプレートした。 C.低融点アガロース方法 欠失体のスクリーニングを最少にするために、欠失の一部を低融点アガロース 中で泳動し、問題のバンドを切り取り、ライゲーションを続けた。ライゲーショ ン反応において、アガロース濃度は0.5%未満に維持した。 PCR反応を94℃において2分間おこなった後に、94℃で1分間、55℃ で45秒間そして72℃で1分間の25サイクルを続けた。プライマーgpN( 5’AGAATGAGTGCTCCTAAACTCCTCTCTCTGGG)( 配列番号:42)とgp11B(5’CATGTGAGAAAAGCTGGTC CCTCA)(配列番号:43)とを用いて、DNAフラグメント(1〜667 )を生成し、次にpCR3発現ベクター中にクローン化して、pPCR110を 作製した。プラスミドpPCR210とpPCR220とは、それぞれ、プライ マーgp−1(5’TGGATATGGCAAAGCGC ACAACTC) (配列番号:44)とgp11B,gp−1及びgp22(5’TAAATGG AA ATGTTCTCAAATTGT GGCGTG)(配列番号:45)と を用いて増幅させたDNA挿入フラグメントを含有するpCR3ベクターであっ た。 細胞傷害性溶菌アッセイ 溶菌アッセイを既述されたようにおこなった(Kawakami,Y等,19 94,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:6458〜62 )。簡単には、ターゲット細胞をクロムによって90分間標識した。3回洗浄し た後に、細胞を1μg/mlの濃度のペプチドと共に90分間インキュベートし た。細胞を再び洗浄し、カウントし、次にTIL586とエフェクター:ターゲ ット(E:T)の指定比率で混合した。4時間のインキュベーション後に、クロ ム放出を測定した。ペプチドはペプチドシンセサイザー(Model AMS4 22,Gilson Co.社,Worthington,OH)を用いて固相 法によって合成した。一部のペプチドはHPLCによって精製され、98%を越 える純度を有した。TIL586によって認識されるORF3Pペプチドの滴定 のために、586EBV B細胞を種々な濃度の精製ORF3Pペプチドと共に インキュベートした。特異的溶菌(specific lysis)の%を式:(A−B)/(C −B)x100[式中、Aはペプチドの存在下でのTIL586による586E BV B細胞の溶菌であり、Bは同じペプチドの存在下、但し、エフェクター細 胞の不存在下での586EBV B細胞からの自然放出(spontaneous release) であり、Cは最大クロム放出である]から算出した。細胞溶解のコールドターゲ ット阻害は“ホット”ターゲットとして51Cr標識586mel又は624me lを、“コールド”ターゲットとして、ペプチドをパルスされた(pulsed)586 EBV B及びT2細胞を用いておこなった。 部位特異的突然変異誘発 部位特異的突然変異を構築するために、変異したプライマーGPMUTI、( 5’GCCATGGGCAGAGATGATCGGGAGGTCTGGCCCT TGCGCTTCTTCAATAGGACATTCACTGCAAC)(配列 番号:11)とGPA1とを用いて、ヌクレオチド296に変異(GからCへ) を含有するPCRフラグメントを生成した。野生型DNAフラグメントをプライ マーGPF1(5’GAAGATCTGCCATGGGCAGAGATGATC GGGAGG TCTG)(配列番号:12)、GPE1(5’GAATTCG TTG TGT CCTGAGAAATTGCCGTTG)(配列番号:13) 、GPE2(5’GA ATTCGACTATGAGAACCCTCTGGTC ACAGGC)(配列番号:14)及びGPA1(5’AAGATCTGGGC CCGGACAAAGTGGTTCTTTTC)(配列番号:15)を図3Aに おける矢印頭によって指示されるように用いることによって増幅させた。精製P CR生成物を次にpCR3発現ベクター中にクローン化した。PCRフラグメン トを含有する全てのプラスミドを配列決定して、方向とヌクレオチド配列とを確 認した。 実施例2 TIL586によって認識される抗原ペプチドの局在化 gp75から抗原性エピトープを同定するために、ExoIII/S1ヌクレ アーゼを用いて3’末端からgp75遺伝子の一連のネストされた欠失(nested deletions)を生成し、さらに、PCR増幅によってgp75から付加的なDNA フラグメントを生成した(図1A)。欠失研究のための出発物質としてpcDN A776を選択した理由は、このクローンが最初にライブラリースクリーニング によって同定され、TIL586からのサイトカイン放出を刺激する能力を与え たからである。プラスミドpcDNA776はAmerican Type C ulture Collection(12301 Parklawn Dri ve,Rockville,MD)にBudapest Treatyに従って 1996年1月19日に寄託され、受託番号ATCC97423を与えられた。 この研究の目的はTIL586によって認識されるエピトープを同定することで あるので、比較的小さいDNAフラグメント中のエピトープを迅速に局在化する ことができるように、できるかぎり短いフラグメント(全長cDNAの代わりの 、切頭型のgp75)が用いられた。次に、これらの欠失構築体をHLA−A3 1遺伝子を含有するpBK−CMVプラスミドと共にCOS−7細胞中にトラン スフェクトした(transfected)(Wang,R.F.等, J.Exp.Med . 1 81:799〜804)。24時間後に、トランスフェクトされたCOS−7細 胞を検査して、どの構築体がTIL586によるサイトカイン放出を刺激するこ とができるのかを判定した。正常gp75開始コドンを欠いた、ヌクレオチド2 47から771までの範囲の小さい切頭DNAフラグメントはTIL586によ るGM−CSF放出を刺激する能力を有し、このことはTIL586によって認 識されるエピトープが247から771までのヌクレオチドを含有するDNAフ ラグメント中に位置付けされることを示唆する。ヌクレオチド445〜447に 位置付けされたKozak配列(GATATGG)(配列番号:16)に比較的 良好に関係して、gp75オープンリーディングフレームと同じフレーム内にA TG開始コドンが存在するので、TIL586によって認識されるエピトープが ヌクレオチド445から771までの範囲内に位置付けされると推理された。そ れ故、pPCR210とpPCR220とを構築したが、これらはpCR3発現 ベクターの誘導体であり、切頭正常gp75タンパク質の翻訳のための開始コド ンとして445bpに位置付けされたgp75(GATATGG)(配列番号: 16)を有するフレーム中に内部ATGコドンを含有した。しかし、pPCR2 10又はpPCR220のいずれも、HLA−A31遺伝子とのCOS−7の同 時トランスフェクション後に(図1B)TIL586からのサイトカイン分泌を 刺激する能力を与えず、このことはこのエピトープがこれらのフラグメントの上 流に局在することを示唆した。それ故、さらに別のプラスミドpD776Aを構 築したが、これは247から442までのヌクレオチド配列を含有し、gp75 と同じフレーム中にATGコドンを有さなかったが、gp75とは異なるオープ ンリーディングフレーム中に2個のATGコドンを含有した。このプラスミドは 、A31cDNAと共にCOS−7細胞中に同時トランスフェクトしたときにT IL586からのサイトカイン放出を強度に刺激した。gp75の真正の開始コ ドンを含有するプラスミドpPCR110は、HLA−A31遺伝子と共に同時 トランスフェクトしたときに(図1B)、pDel5又はpD776Aよりも数 倍低いサイトカイン放出を刺激した。これらの結果は、TIL586によって認 識されるエピトープ(単数又は複数)がヌクレオチド247〜442の領域に位 置付けされることを示唆した。 この領域(ヌクレオチド247〜442)は正常gp75オープンリーディン グフレーム中にATG開始コドンを有さなかったが、例えばACG、CTG及び GTGのような非ATGコドンからの翻訳開始が幾つかの場合に報告されている (Hann,S.R.,1994,Biochimie 76:880〜86; Muralidhar,S.等,J.Virol.1994,68:170〜7 6)。この領域のエピトープを同定するために、HLA−A31のペプチド結合 モチーフ(binding motif)(位置2における疎水性残基とC末端における正に荷 電した残基)に基づいて合成ペプチドを作製した(図2)(Falk,K等,I mmunogenetics 1994,40:238〜41)。この研究のた めに選択されたペプチドの大部分はノナマー(nonamer)であったが、一部は10 マー及び11マーであった。これらのペプチドを586EBV B細胞上にパル スさせて、TIL586によるサイトカイン放出を刺激するこれらの細胞の能力 を調べた(表1)。1つのペプチド、AACDQRVLIVRR(配列番号:2 5)はTIL586からのGM−CSF放出を非常に弱く誘導した。しかし、こ のペプチドはTIL586による溶菌に関してペプチド負荷586EBV Bを 感作させることができなかった(表1)。表1 表1.TIL586に対する反応性による合成ペプチドのスクリーニング 586EBV細胞は1μg/mlの濃度の個々のペプチドと共に90分間イン キュベートした。GM−CSF放出はTIL586とのペプチド負荷586EB V細胞の同時インキュベーション後に測定した。剌激物質なしのTIL586の みによるGM−CSF分泌を控除した。586EBVはHLA−A−31を発現 するEBV形質転換済みB細胞系統であった。TIL586による、ペプチドパ ルスされた586EBVの細胞傷害性溶菌を4時間クロム放出アッセイにおいて おこなった。 このペプチドは、高濃度(>1μg/ml)で586EBV B細胞をインキ ュベートしたときにのみTIL586からのサイトカイン放出を弱く刺激し、1 0μg/mlのペプチド濃度においてもターゲット細胞をTIL586による溶 菌に関して感作しなかった(データ示さず)ので、このペプチドはTIL586 によって認識される主要なT細胞エピトープに相当する可能性はなかった。 この主要なT細胞エピトープを含有する領域をさらに定義するために、それぞ れ、プライマーGPF1と、GPE1及びGPE2とによって増幅されたPCR フラグメントを含有する、さらに2種類のプラスミドを構築した(図3A)。図 3Bに示すように、小さいPCRフラグメントの始点にATG開始コドンを含有 する両プラスミドは、HLA−A31に関連したTIL586によるサイトカイ ン放出を刺激する能力を与え、このことはT細胞によって認識されるエピトープ がgp75cDNAの塩基247から329までの82ヌクレオチド配列内でコ ードされることを示唆した。ORF1中の28のオーバーラップペプチド(overl apping peptides)(9マー又は10マー)をこの領域中のgp75のアミノ酸配 列に基づいて合成したが、いずれもGM−CSF放出を刺激しないか、又は58 6EBV B細胞をTIL586による溶菌に関して感作しないことが判明した (データ示さず)。 実施例3 gp75遺伝子の代替オープンリーディングフレームの翻訳から生じる 抗原性ペプチド この小領域においてTIL586によって認識されるエピトープを同定できな いことは、代替オープンリーディングフレームが翻訳されうることを示唆した。 比較的良好に関連した2種類のATGコドンが、gp75オープンリーディング フレーム(ORF1)とは異なるオープンリーディングフレーム中のこの領域( ヌクレオチド247〜442)に存在した(図2)。最初のATG(251GA GATGA257)(配列番号:29)からの翻訳は45アミノ酸をコードする オープンリーディングフレーム(ORF2)を生じたが、ヌクレオチド294〜 296間に位置付けられたATG(GACATGT)(配列番号:30)から出 発した翻訳は24アミノ酸遺伝子産物(ORF3)を生成した(図2)。OR F2に由来する3ペプチドとORF3に由来する2ペプチドを選択して、HLA −A31結合モチーフに基づいて合成した(表2と図2)。意外にも、ORF3 に由来する1つのペプチドMSLQRQFLR(配列番号:9)(ORF3Pと 表示)は、586EBV B細胞にパルスされたときに、TIL586によって 強度に認識された(表2)。TIL586によるORF3ペプチド(MSLQR QFLR)(配列番号:9)の認識は、このペプチドが自己由来586EBVB 細胞及び1510EBV B(A31+)細胞上にパルスされたときにのみ観察 されたが、ペプチドがT2(非HLA−A31)細胞上に負荷したときには観察 されず、このことはTIL586によるこのペプチドの認識がHLA−A31制 限されることを示唆した。ORF3Pのペプチド質量(peptide mass)は質量分光 測定分析によって確認された。図4Bに示すように、TIL586はORF3P ペプチドをパルスされた586EBV B細胞を溶菌したが、HLA−A31の ペプチド結合モチーフの基準を満たすがTIL586によって認識されない関連 のないペプチドをパルスされた586EBV B細胞、又はORF3Pペプチド をパルスされたT2細胞を溶菌することができなかった。ペプチドによる溶菌に 関する感作は100nMにおいて最大効果を示したが、1nMのペプチド濃度に おいても溶菌活性は検出された(図4C)。TIL586はペプチドMSLQR QFLR(配列番号:33)若しくはSLQRQFLRT(配列番号:34) のいずれも認識せず、MSLQRQFLR(配列番号:9)に由来する修飾ペプ チド(位置2、6及び9におけるアンカー残基の置換)MLQRQFLR(配 列番号:36)、MLQRQFLR(配列番号:37)、MSLQRFLR (配列番号:38)、MSLQRQFL(配列番号:39)、MSLQRQF L(配列番号:40)も認識しなかった(表2)。TIL586は、ペプチド MSLQRQFLR(配列番号:9)に比べて位置2におけるAlaによるSe r置換を有するペプチドMLQRQFLR(配列番号:35)のみを認識した (表2)。 表2.TIL586に対する反応性による抗原性ぺプチドの同定 586EBV B細胞によるペプチドインキュベーションとGM−CSF放出 アッセイとの条件は、表1に述べた条件と同じであった。刺激物質なしのTIL 586のみによるGM−CSF分泌を控除した。修飾ペプチドはMSLQRQF LR(配列番号:9)に対する位置2、6及び9におけるアミノ酸置換によって 作製した。TIL586による、ペプチドパルスされた586EBVの細胞傷害 性溶菌を4時間クロム放出アッセイにおいておこなった。 実施例3 自然プロセス抗原性ペプチド生成のために翻訳が必要である ORF3のATG開始コドン(294〜296)の上流の6ヌクレオチド中に 位置付けられた停止コドンTAG(288〜296)が存在した(図2)ので、 ORF3Pペプチドがフレームシフト(frameshift)から生じたとは思われなかっ た。DNA配列分析も、この上流領域に欠失又は挿入が存在しないことを確認し た。ヌクレオチド294〜296に位置付けられたATGが24アミノ酸産物の 翻訳に重要な役割りを果たすかどうかを調べるために、ATT(294〜29 7)からATTへ変異させて(294〜297)、ORF1(gp75)にお けるCys(UGU)からSer(UCU)への変化を生じると考えられる、O RF3の翻訳を排除した(図3A)。変異した遺伝子を含有するプラスミド(p GFMUT1)を、COS−7中にHLA−A31cDNAと共に同時トランス フェクトしたときにTIL586による認識を生じるその能力に関して試験した 。図3Bは、変異した遺伝子が、野生型遺伝子を含有する構築体に比べて、TI L586によるGM−CSF放出を刺激する能力を完全に失ったことを実証した 。この観察は、ヌクレオチド位置294〜296におけるORF3中のATGが 24アミノ酸産物の翻訳のために必要であるので、TIL586によって認識さ れるT細胞エピトープの生成のために重要であることを意味した。 Met(ATG)はぺプチドエピトープの位置1に存在し、ヌクレオチド29 4〜296におけるATGからATCへの変異はペプチドの位置1におけるMe tからIleへの変化を生じたので、TIL586が変異した遺伝子を認識しな いことは変異したぺプチドがMHCクラスI分子に結合する能力を失ったことに よると考えられる可能性を研究した。変異した遺伝子によってコードされる配列 と同じアミノ酸配列を有する合成ぺプチド(ISLQRQFLR)(配列番号: 41)を作製して、TIL586による認識に関して検査した。合成変異ぺプチ ドが野生型ぺプチドに匹敵する濃度においてTIL586によってまだ認識され ることが判明した。さらに、同じ変異を全長cDNA中に導入した場合には、T IL586に対する反応性が観察されなかったが、野生型cDNAはpPCR1 10と同様なレベルにおいてTIL586からのサイトカイン放出を刺激するこ とができた。このことは欠失データと一致し、TIL586が遺伝子の他の領域 におけるぺプチド(単数又は複数)を認識しなかったことを意味した。これらの 結果は、T細胞が変異遺伝子(ヌクレオチド294〜296におけるATGから ATCへ)を認識しないことはORF3の翻訳開始の不活化によるものであると 示唆した。 実施例4 腫瘍細胞並びにメラノサイト上の抗原性ぺプチドの認識 腫瘍細胞上のORF3Pぺプチドと同様な又は同じである自然プロセス(natur ally processed)ぺプチドをTIL586が認識するかどうかという問題に対処 するために、ORF3Pぺプチドをパルスされた586EBV B細胞がコール ドターゲット阻害アッセイにおいて51Cr標識586melの溶菌を阻害する能 力を検査した。51Cr標識586melの溶菌の顕著な阻害が、ORF3Pペプ チドをパルスされた586EBV B細胞によって観察されたが、関連のないペ プチドをパルスされた586EBV B細胞又はORF3Pペプチドをパルスさ れたT2細胞によっては観察されず(図5A)、このことは、このペプチドエピ トープがT細胞認識に関して腫瘍細胞上の自然プロセスペプチドと競合しうるこ とを意味した。予想されたように、ORF3P負荷586EBV B細胞はTI L1200によるターゲット624melの溶菌を阻害せず、TIL1200は 、586EBV B単独に比べて、HLA−A2に関連してgp100抗原を認 識する(図5B)。T細胞クローンがORF3Pペプチドをパルスされた586 EBV B細胞と腫瘍細胞系統の両方を認識することができるかどうかをさらに 試験するために、T細胞クローンを限界希釈(96穴丸底マイクロプレートにお いて1細胞/穴)によってTIL586細胞系統から生成し、培養においてさら に膨張させた。T細胞クローンは限界希釈(1細胞/穴)によってTIL586 細胞系統から生成した。T細胞クローンを6000IU/mlのIL−2を含有 す るAIM−V培地においてさらに膨張させた。培養においてさらに膨張させた。 586EBV B細胞をORF3Pペプチド又は関連のないペプチドによって3 7℃において90分間パルスした。3回洗浄した後に、T細胞クローン又はTI L586細胞を加えて、さらに18〜24時間同時インキュベートした。586 melと、397mel/A31+腫瘍と、メラノサイトNHEM680細胞と に関しては、1x105細胞/穴を、それぞれ、T細胞クローン、TIL586 −C1(図6A)、TIL586−C4(図6B)及びTIL586−C6(図 6C)又はTIL586(図6D)に対して1x105細胞で18〜24時間イ ンキュベートした。GM−CSFアッセイを図1Bに示すようにおこなった。6 種類のT細胞クローンは586mel腫瘍細胞と、ORF3Pペプチドをパルス された586EBV B細胞と、HLA−A31陽性(positive)メラノサイトと を認識することができたが、397mel/A31又は586EBV B細胞単 独を認識することができなかった。典型的なデータを図6A〜6Dに示す。これ らの結果は、T細胞クローンが恐らく腫瘍細胞及び正常メラノサイト上のORF 3Pペプチドと同様な又は同じの自然プロセスペプチドを認識することを示唆し た。 チロシナーゼ、gp100及びTRP−2に対するgp75の40〜45%ア ミノ酸配列同一性が存在するので、T細胞クローンによって認識されるペプチド がgp75に由来するのではなく、これらの他のタンパク質のいずれかに由来す る可能性を試験した。COS−7細胞をHLA−A31に加えたチロシナーゼ、 gp100又はTRP−2cDNAsによって、それぞれトランスフェクトして 、いずれも6種類のTクローンによって認識されることができないが、HLA− A31とgp75cDNAとによってトランスフェクトされたCOS−7は、こ れらのクローンからのGM−CSF放出を刺激することを発見した(データ示さ ず)。コンピューターのデータベースサーチも、データベース中のチロシナーゼ 、gp100及びTRP−2を含めた既知タンパク質がHLA−A31のペプチ ド結合モチーフを有するアミノ酸配列と、TIL586によって認識されるペプ チドエピトープとの顕著な類似性とを含有しないことを示した。実施例5 In vivo保護アッセイ in vivo保護試験のために、MHL−A31+トランスジェニックマウ スを、104Trp−1+B16マウスメラノーマ細胞による皮下チャレンジ又は 5x105Trp−2+B16マウスメラノーマ細胞による静脈内チャレンジの前 に、0日目と14日目に0、1Pg、1ng、1μg、1mg又は100mgの 癌ペプチド(配列番号:9)によって静脈内で免疫感作させる。腫瘍細胞を皮下 に受容したマウスを腫瘍発生に関して週2回観察して、サイズを測定する。腫瘍 細胞を静脈内に受容したマウスを12日目に安楽死させ、肺転移の数をHoug hton,A.N.1994,J.Exp.Med.180:1〜40によって 述べられているように測定する。 実施例6 In vivo処置アッセイ in vivo処置に関しては、肺転移を確立するために、MHL−A31+ トランスジェニックマウスを、1x105又は5x105Trp−1+B16マウ スメラノーマ細胞によって静脈内チャレンジする。続いて、マウスに105PF U/mg体重で癌ペプチド(配列番号:9)を発現する組換えウイルスを予防接 種する。マウスを12日目に安楽死させ、予防接種したマウス対非予防接種マウ スの肺転移の数を測定する。 実施例7 癌抗原特異的Tリンパ球 免疫療法 メラノーマ抗原に対して予感作されたTリンパ球は、メラノーマに罹患した哺 乳動物の治療処置に有効であると考えられる。Tリンパ球を末梢血又はメラノー マ懸濁液から単離して、in vitro培養した(Kawakami,Y.等 ,1988,J.Exp.Med.168:2183〜2191)。 Tリンパ球を癌ペプチド(配列番号:9)に1μg/mlの濃度において単独 で又はIL−2の存在下で暴露させ、再感作させ、培養で膨張させる。癌ペプチ ドに暴露させたTリンパ球を哺乳動物に約109〜1012リンパ球/動物で投与 する。これらのリンパ球は静脈内、腹腔内又は病巣内に投与する。この処置は例 えばサイトカイン、メラノーマの手術切除及び化学治療薬のような、他の治療処 置と同時に投与することができる。 実施例8 転移性メラノーマを有する患者の処置 このプロトコールでは、進行したメラノーマを有する患者を抗原性癌エピトー プによって免疫感作させる。 このトライアルに適した患者は、標準的な有効療法を失敗した、測定可能な又 は評価可能な転移性メラノーマの徴候を有さなければならない。患者は、腫瘍細 胞RNAのPCR又はノーザンブロット分析によって実証されるような、TPI −1抗原を発現する腫瘍を有さなければならない。 患者は1ng、1μg、1mg又は500mg/kg体重の癌ペプチド(配列 番号:6)を0日目、7日目及び14日目に単独で又はIL−2及び/又は免疫 刺激性分子と組合せて受容する。患者を毒性、免疫学的効果及び治療効力に関し て評価する。 処置した患者から採取したリンパ球をアミノ酸配列MSLQRQFLR(配列 番号:6)を含む癌抗原に対する特異的反応に関して検査する。 完全な反応は、少なくとも4週間持続する、疾患のあらゆる臨床徴候の完全な 消失として定義される。部分的反応(partial response)は、新たな病巣の出現が ないか又は病巣の増大のない、全ての測定可能な病巣の垂直直径の積(product) の全体として、少なくとも4週間にわたる50%以上の減少である。軽度反応は 、新たな病巣の出現がない又は病巣の増大のない、全ての測定可能な病巣の垂直 直径の積の全体として25〜49%の減少として定義される。部分的反応未満を 有する患者は不反応者と見なされる。部分的反応又は完全反応後の、新しい病巣 の出現又は先行病巣の垂直直径の積の25%を越える増加は再発と見なされる。 実施例9 TRP−2のための材料と方法 化学薬品と試薬 下記化学薬品と試薬は指定供給源から購入した:RPMI 1640,AIM −V培地,Lipofectamine,G418(GIBCO BRL,Ga ithersberg,MD);真核細胞発現ベクターpCR3(Invitr ogen,San Diego,CA);抗−HLA−A31モノクローナル抗 体(One lamda,Canoga Park,CA);フルオレセインイ ソチオシアネートとコンジュゲートした抗−免疫グロブリン M抗体(Vect or Laboratories, Inc.,Burlingame,CA) 。 T細胞クローンと系統 T細胞クローンは、TIL586細胞系統から限界希釈法(1細胞/穴)によ って、10%ヒトAB血清と500IU IL−2とを含有するRPMI 16 40中で支持細胞として同種PBL(1x103細胞/穴)を用いて生成させた 。12日間後に、T細胞クローンを6000IU/ml IL−2を含有するA IM−V培地中で膨張させた。最適な膨張(expansion)を得るために、S.Ri ddell(Walter等,1995,N.Engl.J.Med.333: 1038〜1044)が述べているOKT3膨張方法を用いた。簡単には、0日 目に5x104〜5x105T細胞をHLA−A31 PBL(500:1、PB L:T細胞比率)及び586EBV B細胞(100:1、EBV:T細胞比率 )と共に、11%ヒト血清と30ng/mlのOKT3抗体と抗生物質とを含有 するRPMI 1640(25ml)中で同時培養した。1日目に、IL−2を 180IU/mlの最終濃度で加えた。5日目に、この培地を、11%ヒト血清 と、IL−2 180IU/mlとを含有する新しい培地と交換した。次に、培 地を3日間毎に交換した。12〜14日目に、T細胞を回収して、計数し、冷凍 保存した。TIL586を転移性メラノーマを有する患者の標本から単離し、I L−2(6000IU/ml)(Chiron)を含有する培地中で既述された ように32〜60日間増殖させた(Topalian等,1988,J.Cli n.Oncol .6:839〜853)。TIL586は主としてCD8+T細 胞であった。 メラノーマ細胞系統397me1、397mel/A31、586mel、6 24mel、624mel/A31、及びEBV形質転換B細胞系統、586E BVと1510EBVを我々の実験室で確立して、10%ウシ胎児血清(FCS ) を含有するRPMI 1640培地中で培養した。幼児包皮に由来する正常培養 メラノサイト(NHEM680、Clonetics、CAから購入)をメラノ サイト増殖培地(MOM;Clonetics、CA)中で培養した。COS− 7細胞系統はDr.W.Leonard(NIH)によって提供された。 GM−CSF分泌アッセイ DNAトランスフェクションとGM−CSFアッセイとは既述されたようにお こなった(Wang等,1995,J.Exp.Med.181:799〜80 4)。簡単には、抗原をコードするDNA 200ngと、HLA−A31 D NA 50ngとを、100mlのDMEM中の2μlのリポフェクタミンと1 5〜45分間混合した。DNA/リポフェクタミン混合物を次にCOS−7(5 x104)細胞に加えて、一晩インキュベートした。翌日、細胞をDMEM培地 によって2回洗浄した。TIL586を120 IU/mlのIL−2を含有す るAIM−V培地中で1x105細胞/穴の濃度で加えた。T細胞クローンに関 しては、1〜2x104細胞/穴のみを加えた。18〜24時間インキュベート した後に、100μlの上澄み液を回収し、GM−CSFを標準ELISAアッ セイ(R+D Systems,Minneapolis,MN)で測定した。 ペプチド認識を試験するために、586EBV又はT2細胞を37℃においてペ プチドと共に90分間インキュベートしてから、120 IU/mlのIL−2 を含有するAIM−V培地によって3回洗浄した。T細胞を加え、さらに18〜 24時間インキュベートし、100μlの上澄み液をGM−CSFアッセイのた めに回収した。 ExoIII/SI欠失構築とサブクローニング TRP−2cDNAはDr.Shibaharaの贈り物(Yokoyama 等,1994,Biochim.Biophys.Acta,1217:317 〜321)であり、これを発現のためのCMVプロモーターと共にpCR3ベク ター中にサブクローニングした。一連の欠失を作製するために、TRP−2cD NAを含有するプラスミドpCR3をXbaIによって消化させ、α−ホスホロ チオエートデオキシリボヌクレオチド三リン酸によって充填し、ExoIIIヌ クレアーゼ消化をブロックした。直鎖状DNAを第2の制限酵素消化にさらして 、 ExoIIIに感受性の1端部を生成した。ExoIIIヌクレアーゼ/Mun g Beanヌクレアーゼ欠失は製造者の指示(Stratagene,CA) に従っておこなった。全ての欠失構築体を配列決定して、取り出されるDNA配 列の位置を決定した。pTAプラスミドは、TRP−2遺伝子の3’末端からA pa I DNAフラグメントが欠失した、pCR3−TRP−2の誘導体であ った。TRP−2遺伝子の3’末端からKpnI DNAフラグメントを除去し た後に、pTKが作製された。pTPは内部PstIフラグメントの欠失と再ラ イゲーションとによって生成された。 ノーザンブロット分析 グアニジンイソチオシアネート/塩化セシウム遠心分離法によって、総RNA を単離した。ヒト正常組織からの総RNAはClontech、CAから購入し た。20μgの総RNAに1.2%アガロースホルムアルデヒドゲル中での電気 泳動をおこなって、これをナイロン膜上に移した。TRP−2遺伝子の2.0k b DNAフラグメントをランダムプライミング法によって32P−α−CTPで 標識した。プレハイブリダイゼーションとハイブリダイゼーションとをQuic kHybプロトコール(Stratagene)に従っておこなった。膜を室温 での15分間の2XSSC/0.1%SDSによって2回、60℃での30分間 の0.1XSSC/0.1%SDSによって2回洗浄した。オートラジオグラフ ィーを−70℃においておこなった。 細胞傷害性アッセイ 溶菌をCalcein AM(Molecular Probes,Euge ne,OR)を用いておこなった。簡単には、T2細胞又は586EBV B細 胞をRPMI1640/5%FCS中でペプチドで90分間パルスした。腫瘍細 胞と、ペプチドパルスされたEBV B細胞とをCalcein AM(1x1 06細胞毎に15μlの1mg/ml Calcein AM)によって37℃ において30分間標識した。インキュベーション後に、細胞をAIM V/12 0IU IL−2によって3回洗浄した。1x103ターゲット細胞にT細胞を 種々なE:T比率で混合した。37℃における4時間のインキュベーション後に 、5μlの臭化エチジウム含有ウシヘモグロビンクエンチ溶液(bovine hemoglob in quench solution)を加えた。プレートをLambdaスキャンによって読み 取った。溶菌の%は下記式:[1−(A−B)/(C−B)]x100[式中、 AはT細胞の存在下での非溶菌細胞の読取り値であり、Bはバックグラウンドシ グナル値であり、Cはターゲット細胞からの最大シグナル値である]から算出し た。 ペプチドはペプチドシンセサイザー(Model AMS 422,Gils on Co.社,Worthington,OH)を用いて固相法によって合成 した。数種類のペプチドをHPLCによって精製し、これらは98%を越える純 度を有した。数種類のペプチドのペプチド質量を質量分光測定分析によって確認 した。 実施例10 CTLクローンによる腫瘍細胞上の新しい抗原の認識 以前の研究において、我々は限界希釈法によってTIL586細胞系統から多 くのT細胞クローンを単離している(Wang等,1996b,J.Exp.M ed.183:1131〜1140)。これらの中で、6種類のクローンが、T RP−1/gp75遺伝子の代替オープンリーディングから翻訳された遺伝子産 物に由来するORF3Pペプチドをパルスされた586EBV B細胞と、自己 由来586mel腫瘍細胞とを認識したが、関連のないペプチドをパルスされた 586EBV B細胞を認識しなかった。図7に示すような、これらのT細胞ク ローンの1つの代表としてTIL586−C1を選択した。しかし、同じTIL 586細胞系統から単離された幾つかのT細胞クローンは、TRP−1ペプチド ORF3Pをパルスされた586EBV B細胞も、TRP−1とHLA−A3 1cDNAとによってトランスフェクトされたCOS細胞も認識しなかったが、 586mel並びにHLA−A31+メラノサイトを認識することができた(図 7)。これらの結果は、これらのT細胞クローンが586mel腫瘍細胞上の付 加的な腫瘍抗原を認識することを示唆した。次に、これらのT細胞クローンを膨 張させて、材料と方法の項(実施例9)に述べた方法による認識に関して、cD NAライブラリーをスクリーニングするために又は他のcDNAを試験するため に充分な細胞を得た。1種類のクローン、CTLクローン4を以下に述べるよう な他の研究のために上首尾に膨張させて、用いた。 実施例11 T細胞クローンによって認識される腫瘍抗原をコードするcDNAの同定 CTLクローン4に抗原を提示する役割を担うHLA分子を決定するために、 例えば397mel及び624melのようなA31陰性腫瘍系統中にHLA− A31cDNAをトランスフェクトして、CTLクローンによる認識に関して試 験した。HLA−A31を発現する397mel及び624melのトランスフ ェクション体(transfectant)はCTLクローン4によって顕著に認識された(表 3)。さらに、これらのT細胞はHLA−A31陽性同種腫瘍系統1353me lをも認識することができ、このことは、CTLクローン4による腫瘍抗原の認 識がHLA−A31制限される(HLA-A31 restricted)ことを意味した。 表3.CTLクローン4によるGM−CSFの特異的分泌は HLA−A31制限される2x104CTLクローン4細胞をメラノーマ細胞系統又は、HLA−A31c DNAによってトランスフェクトされたCOS−7と共に24時間インキュベー ションした後に、上澄み液中のGM−CSFを測定した。 限られた数のT細胞のみが利用可能であったので、これらのT細胞が予め同定 された腫瘍抗原又はメラノサイト系統分化タンパク質(melanocyte-lineage diff erentiation protein)を認識するか否かを最初に試験した。HLA−A31cD NAと、MART−1(Kawakami等,1994a,Proc.Natl .Acad.Sci.USA ,91:3515〜3519)、gp75(Wan g等,1995,J.Exp.Med.181:799〜804)、gp100 (Kawakami等,1994b,Proc.Natl.Acad.Sci. USA ,91:6458〜6462)、チロシナーゼ(Brichard等,1 993,J.Exp.Med.178:489〜495)、p1S(Robbi ns等,1995,J.Immunol.154:5944〜5950)及びT RP−2(Yokoyama等,1994,Biochim.Biophys. Acta ,1217:317〜321;Bouchard等,1994,Eur .J.Biochem. 219:127〜134)を包含する、既知腫瘍抗原又 は推定される抗原をコードする遺伝子とによってトランスフェクトされたCOS −7細胞の、CTLクローン4による認識を試験した。HLA−A31のみ又は TRP−2のみによってトランスフェクトされたCOS細胞はT細胞クローンに よる認識を生じなかった。しかし、HLA−A31とTRP−2cDNAとによ ってトランスフェクトされたCOS細胞はT細胞からのGM−CSF放出を刺激 したが、HLA−A31と他の遺伝子とによってトランスフェクトされたCOS 細胞は刺激せず、このことは、T細胞クローン4がHLA−A31制限様式でT RP−2を腫瘍抗原として認識したことを示す。 HLA−A3、A11、A31、A33及びA68とそれらのペプチド結合モ チーフとにおける構造類似性の分析は、A3様スーパーモチーフ(A3-like super motif)の存在を示唆している(Sidney等,1996,Human Im munol .45:79〜93)。単一エピトープペプチドは、総集団(general population)の約40〜50%に累積的に発現されるHLA−A3、A11、A 31、A33及びA68分子と交差反応することができた。B型肝炎ウイルス ヌクレオキャプシドタンパク質に由来する同じペプチドエピトープがHLA−A 31と−A68分子によって提示され、対応するHLA−A31又は−A68制 限 CTRによって認識されることが報告されている(Missale等,1993 ,J.Exp.Med.177:751〜762)。HLA−A31制限T細胞 が、HLA−A3陽性EBV B細胞上にパルスされた場合のTRP−1及びT RP−2エピトープを認識するかどうかを試験した。興味深いことには、T細胞 からのGM−CSF放出に基づいて弱い認識が検出された。しかし、HLA−A 3陽性腫瘍細胞の認識は検出されなかった。 実施例12 TRP−2遺伝子の発現 種々な組織におけるTRP−2の発現パターンを評価するためのプローブとし てTRP−2cDNAを用いて、ノーザンブロット分析をおこなった。正常な網 膜組織は試験した正常なヒト組織のうちでTRP−2発現において唯一の陽性で あることが判明した。メラノーマ細胞系統と他の細胞系統とにおけるTRP−2 の発現パターンを以下の表4に列挙する。30のメラノーマ細胞系統のうちの2 5の細胞系統がTRP−2を発現することが判明した。BurkittのB細胞 系統 Daudiと胸部癌細胞系統MDA23 1とは、以前の結果と一致して 、陰性であった(Bouchard等,1994,Eur.J.Biochem .219:127〜134)。したがって、チロシナーゼ、TRP−1、gp1 00及びMART−1と同様に、この遺伝子の発現パターンはメラノーマ、正常 メラノサイト細胞系統及び網膜に限定されるように思われる。表4:種々な細胞系統と試験したヒト組織におけるTRP−2の発現 TRP−2の発現をノーザンブロット分析によって10−20〜gの総RNA を用いて試験して、TRP−2cDNAフラグメントによってプローブした。D audiはBerkittのB細胞系統であり、MDA231は乳癌細胞系統で ある。 実施例13 T細胞によって認識されるペプチドエピトープ TRP−2からの抗原性エピトープを判定するために、ExoIII/S1ヌ クレアーゼと、TRP−2の切頭形をコードするDNAフラグメントとを用いて 3’末端からTRP−2遺伝子の一連の組重ね欠失体を生成した。これらの欠失 体とサブクローン化構築体とを、HLA−A31cDNAを含有するpBK−C MVプラスミドと共に、COS−7細胞中にトランスフェクトした。トランスフ ェクトされたCOS細胞の認識をCTLクローンによって、CTLクローンから のGM−CSFサイトカイン放出を測定することによって試験した。図9は、p TD1、2及び3構築体がCTLクローン4からのサイトカイン放出を刺激する 能力を保有するが、pTD4とpTD5はCTLクローン4に対する刺激活性を 失ったことを示し、このことはCTLクローン4によって認識されるエピトープ (単数又は複数)がヌクレオチド836〜1045の領域に位置付けられたこと を意味した。このことはサブクローニング実験によって得られた結果と一致した 。pTAとpTPとはCTLクローン4からのサイトカイン放出を刺激する能力 を失ったが、pTKはサイトカイン放出アッセイにおいてまだ陽性のままである 。それ故、これらのエピトープは、図10に示すように、第1のPstIとKp nI部位によって隣接されたDNAフラグメント中に存在した。 この小さいDNAフラグメントのコーディング領域からエピトープを同定する ために、5種類の合成ペプチドはHLA−A31の合成ペプチド結合モチーフ( 位置2における疎水性残基と位置9における正に荷電した残基)に基づくもので あった(Rammensee等,1995,Immunogenetics,4 1:178〜228)。これらのペプチドを586EBV B細胞上にパルスし 、CTLクローン4によるサイトカイン放出を刺激するそれらの能力に関して試 験した。表5に示すように、ペプチドTRP197 〜205は、586EBV B細胞 上にパルスされたときに、CTLクローン4によって強度に認識された。CTL クローン4によるこのペプチドの認識は、このペプチドを、例えば586EBV と1510EBVのような、HLA−A31+EBV B細胞上にパルスしたと きにのみ観察され、HLA−A31陰性T2細胞上にパルスしたときには観察さ れなかった。CTLクローン4はTRP−1遺伝子の代替オープンリーディング フレームに由来するORF3Pペプチドを認識しなかった。これらの結果は、T IL586−ClがTRP−1由来ORF3Pペプチドを特異的に認識し、C TLクローン4がTRP2由来ペプチドを特異的に認識することを実証した。O RF3PとTRP2−p197の両方がHLA−A31分子によってT細胞に提 示されたときに、交差反応性は観察されなかった。 表5.T細胞クローンに対する反応性を有する合成ぺプチドの同定 586EBV細胞を1〜g/mlの濃度の個々のペプチドと共に90分間イン キュベートした。ペプチド負荷586EBV細胞を、TRP−1又はTRP−2 のいずれかを認識するT細胞クローンと共に同時インキュベーションした後にG M−CSF放出を測定した。刺激因子なしのT細胞のみによるGM−CSF分泌 を控除した。586EBVと1510EBVはHLA−A31を発現するEBV 形質転換B細胞系統であった。 実施例14 TRP197-205ペプチドの特徴付け 滴定実験は、1nMのペプチドがT細胞クローン4からのGM−CSF放出を 刺激するために充分であり、この刺激が500nMにおいてプラトーに達したこ とをことを実証した(図10A)。TRP197-205をパルスされた586EBV B細胞のCTLクローン4による溶菌も種々なペプチド濃度において測定し(図 10B)、サイトカイン放出アッセイと同様に、CTLクローン4によるターゲ ット細胞の溶菌は1nMペプチド濃度において検出された。最大溶菌は100n Mのペプチド濃度において見られた。CTLクローン4はTRP2−p197を パルスされた586EBVと586mel腫瘍細胞とを低いE:T比率において も溶菌することができたが、単独若しくは対照ペプチドORF3Pをパルスされ た586EBV B細胞も、HLA−A31陰性397mel系統も溶菌するこ とができなかった(図10)。 現在までに同定されたヒトメラノーマ抗原の大部分は非変異自己抗原であり、 対応するMHC分子に対するこれらの自己ペプチドのT細胞認識及び結合アフィ ニティは、幾つかの場合に、アンカー残基におけるアミノ酸の置換によって改良 されている。8マー又は10マーを包含する多くの合成ペプチドと、表6に表示 する修飾ペプチドとを作製し、586EBV B細胞にパルスされた場合のCT Lクローン4による認識に関して試験した。TRP197-205のN末端において1 アミノ酸が伸長された、10マーTLLGPGRPYRは、586EBV B細 胞にパルスされた場合に、CTLクローン4によってまだ認識されたが、反応性 は重複9マーLLGPGRPYRの約60%であった。HLA−A31の結合モ チーフに基づいて、アンカー残基位置2と9並びに他の位置におけるアミノ酸置 換によって若干の修飾ペプチドを生成した。C末端の位置9におけるArg残基 は、Lys残基によって置換されることができ、この修飾ペプチドは親ペプチド の活性の少なくとも60%を保有した。位置2におけるLeu残基の、Ser、 Ile又はVal残基による置換は、同じ活性を維持したか、又は親ペプチドの 60%に活性を低下させたが、この位置におけるAla又はPheによる置換は T細胞からのサイトカイン放出を刺激する能力を低下させた(表6)。他の修飾 はT細胞認識における可変な癌ペプチド活性を生じた。 表6.修飾ペプチドのT細胞反応性の比較 586EBV細胞を0.5〜g/mlの濃度の個々のペプチドと共に90分間 インキュベートした。ペプチド負荷586EBV細胞を、CTLクローン4細胞 と共に同時インキュベーションした後にGM−CSF放出を測定した。刺激因子 なしのT細胞のみによるGM−CSF分泌を控除した。586EBVはHLA− A31を発現するEBV形質転換B細胞系統であった。 TRP−2タンパク質は2つの推定の銅結合部位と、システイン富化領域と、 膜通過ドメインとを含有する。ヒトTRP−2は染色体13にマッピングされて おり、マウスの対応物は染色体14のコートカラー変異(coat color mutation) 、スレーティ(slaty)の領域にマッピングされている。TRP−2とチロシナー ゼ又はTRP−1/gp75との間には約40%のアミノ酸配列同一性が存在す るが、チロシナーゼタンパク質ファミリー間の共通ペプチドエピトープを認識す るCTL系統又はクローンは現在までに見つかっていない。 CTLクローン4によって認識された9マーTRP197-205ペプチドはTRP −2のコーディング領域における銅結合部位の1つに位置付けられる。このペプ チドは、この研究で試験した修飾ペプチドを含めた他のペプチドに比べて、T細 胞からのサイトカイン放出を最も効果的に刺激した。このことは、位置2におけ るLeuと位置9におけるArgとが好ましい残基であることを示す、予測され たHLA−A31結合モチーフと一致した。位置2におけるLeuと位置9にお けるArgとはそれぞれ位置2におけるIleとSer及び位置9におけるLy sと、T細胞認識に対する反応性の損失が殆ど無く若しくは微々たる損失で、置 換されることができるが、位置1、3又は6におけるアミノ酸置換は反応性の若 干の損失を生じた。 実施例15 In vivo処置アッセイ in vivo処置に関しては、肺転移を確立するために、MHL−A31+ トランスジェニックマウスを、1x105又は5x105Trp−1+B16マウ スメラノーマ細胞によって静脈内チャレンジする。続いて、マウスに105PF U/mg体重で癌ペプチド、LLGPGRPYRを発現する組換えウイルスを予 防接種する。マウスを12日目に安楽死させ、予防接種したマウス対非予防接種 マウスの肺転移の数を測定する。 実施例16 癌抗原特異的Tリンパ球 免疫療法 メラノーマ抗原に対して予感作されたTリンパ球は、メラノーマに罹患した哺 乳動物の治療処置に有効であると考えられる。Tリンパ球を末梢血又はメラノー マ懸濁液から単離して、in vitro培養する(Kawakami,等,1 988,J.Exp.Med.168:2183〜2191)。 Tリンパ球を癌ペプチド、LLGPGRPYRに1μg/mlの濃度において 単独で又はIL−2の存在下で暴露させ、再感作させ、培養で膨張させる。癌ペ プチドに暴露させたTリンパ球を哺乳動物に約109〜1012リンパ球/哺乳動 物で投与する。これらのリンパ球は静脈内、腹腔内又は病巣内に投与する。この 処置は例えばサイトカイン、メラノーマ損傷の手術切除及び化学治療薬のような 、他の治療処置と同時に投与することができる。 実施例17 転移性メラノーマを有する患者の処置 このプロトコールでは、進行したメラノーマを有する患者を抗原癌エピトープ によって免疫感作させる。 このトライアルに適した患者は、標準の有効療法に失敗した、測定可能な又は 評価可能な転移性黒色腫の徴候を有さなければならない。患者は、腫瘍細胞RN AのPCR又はノーザンブロット分析によって実証されるようなTPI−2抗原 を発現する腫瘍を有さなければならない。 患者は1ng、1μg、1mg又は500mg/kg体重の癌ペプチド、LL GPGRPYRを0日目、7日目及び14日目に単独で又はIL−2及び/又は 同時免疫刺激性分子(co-immunostimulatory molecule)と組合せて静脈内で受容 する。患者を毒性、免疫学的効果及び治療効力に関して評価する。 処置した患者から採取したリンパ球をアミノ酸配列、LLGPGRPYRを含 む癌抗原に対する特異的反応に関して検査する。 完全な反応は、少なくとも4週間持続する、疾患のあらゆる臨床徴候の消失と して定義される。部分的反応は、新たな病巣の出現がないか又は病巣の増大のな い、全ての測定可能な病巣の垂直直径の積の全体として、少なくとも4週間にわ たる50%以上の減少である。軽度反応は、新たな病巣の出現がないか又は病巣 の増大のない、全ての測定可能な病巣の垂直直径の積の全体として25〜49% の減少として定義される。部分的反応未満を有する患者は不反応者と見なされる 。部分的反応又は完全反応後の、新しい病巣の出現又は先行病巣の垂直直径の積 の25%を越える増加は再発と見なされる。 考察 例えばチロシナーゼ、MART−1/Melan−A及びgp100のような 対応する非変異性共有(non-mutated shared)メラノーマ抗原の正常オープンリー ディングフレームに由来する幾つかの抗原性T細胞エピトープが同定されている 。この研究では、TIL586によって認識される抗原性ペプチドがgp75遺 伝子の第2遺伝子産物に由来することを実証した。我々の知るかぎりでは、これ は、T細胞が同じ遺伝子の重複オープンリーディングフレームの翻訳から生じる 抗原性ペプチドを認識する最初の例であり、かつ2種類の完全に異なるタンパク 質及び/又はペプチドが単一細胞遺伝子の重複オープンリーディングフレームか ら翻訳されることができるという真核細胞における唯一つの例である。gp75 遺伝子のORF3は24アミノ酸の短いタンパク質をコードする。TIL586 によって認識される抗原性ペプチドは、代替オープンリーディングフレームのA TG(294〜296)開始コドンの直後に位置付けられた配列によってコード される。 gp75はチロシナーゼ、gp100及びTRP−2に対して40〜 45%の配列相同性を有するが、COS−7細胞中へのHLA−A31とチロシ ナーゼ、gp100又はTRP−2cDNA、それぞれとの同時トランスフェク ションはTIL586由来T細胞クローンからのGM−CSF放出を刺激するこ とができなかった。データベースサーチは、HLA−A31ペプチド結合モチー フと、TIL586とそれに由来するT細胞クローンによって認識されるペプチ ドエピトープに対して顕著な配列相同性とを有するタンパク質を明らかにしなか った。さらに、以前の研究は、メラノーマトランスフェクション体(gp75+ /A3 1+)がTIL586からのGM−CSF放出を刺激する能力を与えたが、gp 75メラノーマトランスフェクション体(gp75-/A31+)は与えなかった ことを示した(Wang,R.F.等,1995,J.Exp.Med.181 :799〜804)。他のメラノーマ細胞系統(gp75-/A31+)によって も同様な結果が得られた。ORF3Pペプチドはgp75遺伝子から同定された 唯一のエピトープであり、TIL586由来の6種類のT細胞クローンによって 認識されたので、このペプチドは腫瘍細胞又はメラノサイト上の自然プロセスペ プチドと同じ又は類似すると考えられる。このことは、このペプチドは腫瘍細胞 上の自然ペプチドとT細胞認識に関して競合することができたので、コールドタ ーゲット阻害実験によってさらに支持された。 結腸癌における変異した腺腫症結腸ポリポーシス(APC)遺伝子のフレーム シフトに由来するT細胞エピトープペプチドが予防接種したBALB/cマウス から得られたCTLによって認識されることが報告された(Townsend, A.等,1994,Nature,371:662)。図3の結果は、ヌクレオ チド294〜296におけるATGが24アミノ酸産物の翻訳のために必要であ り、24アミノ酸産物は次にTIL586によって認識される抗原性ペプチドに プロセシングされることを示した。TIL586は586EBV B細胞にパル スされた変異合成ペプチドをも認識したが、COS−7細胞中にHLA−A31 cDNAと共に同時トランスフェクトされた場合は、変異遺伝子を認識せず、こ のことは、TIL586による変異(ATGからATCへ)遺伝子の認識喪失が ORF3産物の翻訳の無いことに起因することを示した。DNA配列分析に加え てこれらの結果は、TIL586によって認識される抗原性ペプチドがgp75 のフレームシフト産物に由来するという可能性を除外した。それ故、多重のペプ チド又はタンパク質がしばしば単一真核遺伝子の重複オープンリーディングフレ ームから翻訳されるが、これらの代替産物を検出するための手段が利用可能でな かったことが考えられる。自然プロセスペプチドを検出するためのT細胞の鋭敏 な感受性は、この現象の多くの他の例を明らかにすることができる。 重複オープンリーディングフレーム3(ORF3)がin vivoで翻訳さ れる機構は、現在不明である。1つより多いAUGコドンにおいて開始し、幾つ かの稀な場合にはAUGコドンと、例えばCUGのような非AUGコドンの両方 において開始してN−末端伸長した同じ配列を形成する細胞mRNAの幾つかの 例が報告されているが、単一真核細胞mRNAからの重複オープンリーディング フレーム(即ち、2種類の全く異なるペプチドを翻訳する)の利用は、我々の知 る限りまだ述べられていない。単−mRNAからの重複リーディングフレームの 翻訳の幾つかの例は述べられているが、ウイルス遺伝子に排他的に限定されてい る。ウイルス遺伝子における重複オープンリーディングフレームの産物の検出は 、ウイルス感染宿主の血清中の反応性抗体の存在のために可能であった。本発明 では、T細胞アッセイを用いて、T細胞によって認識されるエピトープペプチド を同定した。このアプローチは慣用的なウェスタンブロット又は免疫沈降分析と は全く異なり、これらの分析よりも高感度である。真正開始コドンと、ORF3 の開始コドンとの間には5個のATGコドンが存在するが、ORF1(gp75 )のN末端部分と、完全なORF2及びORF3をカバーする構築体pPCR1 1O(ヌクレオチド1〜667)はTIL586からのサイトカイン放出を刺激 する能力をまだ保有する。しかし、刺激のレベルはgp75の5’切頭形(最初 の246ヌクレオチドが欠失)による刺激レベルよりも数倍低く(図1Aと1B )、このことは上流のATGコドンがORF3発現を部分的に阻害したと考えら れることを示唆した。幾つかのファクターがこの系におけるORF3産物の発現 を検出することを可能にしている。第一に、ORF3のATG開始コドンに先行 する上流のATGコドンは最適に関係しないように思われ、このことがリーキー スキャンニングモデル(leaky scanning model)による開始コドンとしての下流A TGの使用を可能にすると考えられる。第二に、COS−7細胞中のトランスフ ェクトされた遺伝子の比較的高い発現と、極度に敏感な手段としてのT細胞アッ セイの有効性とが非常に低レベルの翻訳産物の検出を可能にすると考えられる。 興味深いことには、ORF3産物は腫瘍細胞中並びに正常メラノサイト中でT 細胞によって検出され(図6A〜6D)、このことはORF3タンパク質が腫瘍 細胞における遺伝的変化(genetic alteration)に起因する遺伝子産物でないこと を強く示唆した。以前の研究では、TIL586が試験された多重の腫瘍細胞系 統(gp75+/A31+)を認識したことが示され、これは、TIL586が非 変異共有腫瘍抗原を認識することを示唆した(Wang R.F.等上記文献) 。gp75遺伝子はノーザンブロットとPCR分析とに基づくとメラノーマ中に 高度に発現され(Wang R.F.等上記文献)、その遺伝子産物gp75タ ンパク質はメラノーマ細胞とメラノサイトに発現された最も豊富な細胞内糖タン パク質であるので(Tai,T.,Eisinger,M.,Ogata,S. 及びLloyd,K.O.,1983,Cancer Res.43:2773 〜2779;Thomson,T.N.,Mattes,J.M.,Roux, L.,Old,L.J.及びLloyed,K.O.1985,J.Inves t.Dermat.85:169〜174;Thomson,T.N.,rea l,F.X.,Mutakami,S.,Cordon−cardo,C.,O ld,L.J.及びHoughton,A.N.1988,J.Invest. Dermat.90,459〜466),T細胞クローンが586EBV B細 胞(A31+),メラノーマ(gp75+/A31+)並びにA31+ラノサイト上 にパルスされた場合のORF3Pペプチドを認識したが、gp75+/A31+メ ラノーマ細胞上にパルスされた場合、又は非A31 T2細胞にパルスされたO RF3Pを認識しなかったことは意外ではない。腫瘍細胞とメラノサイトとにお けるペプチド発現を説明する他の可能性は、ORF3がgp75mRNA又は異 なるプロモーターの選択的スプライシング(alternative splicing)によって生成 された別のmRNA転写体(transcript)(単数又は複数)から翻訳されうること である。我々の知る限りでは、選択的スプライシングによって生成されたmRN A転写体は、同じオープンリーディングフレームを用いてアイソフォームタンパ ク質に翻訳される。しかし、本発明の場合には、別の転写体が生成されて、翻訳 の鋳型として用いられたとしても、gp75とは全く異なるオープンリーディン グフレームがORF3産物の翻訳に用いられた。in vivoでのORF3タ ンパク質の翻訳の機構を解明するには、さらなる実験が必要である。それにも拘 わらず、上述したこれらの可能性は相互に排他的ではない。 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION Human cancer antigens of tyrosinase-related proteins 1 and 2, and genes encoding the same ChildField of the invention   The present invention relates to the field of cancer diagnostics and therapeutics, including cancer vaccines. More In general, the present invention relates to novel cancer peptides and alternatives encoding the same. (Alternative) Regarding isolation and purification of open reading frame DNA sequences You. The present invention further provides novel novel compounds that can act as tools in treating and preventing cancer. The present invention relates to the isolation and purification of tumor antigens and DNA encoding the cancer antigens. The present invention In addition, alternative auxiliaries derived from within the tyrosinase-related protein 1 (TRP1) gene Novel cancer peptide encoded by open reading frame DNA sequence About. The present invention also relates to a novel cancer peptide derived from the TRP2 gene. You. The present invention is further directed to detecting and diagnosing and treating cancer and precancers in an individual. About the method.Background of the Invention   Adoptive transfer of tumor-infiltrating lymphocytes (TIL) in patients with metastatic melanoma Can mediate tumor regression, and tumor rejection antigens recognized by T cells Suggested to be present on these tumor cells. Such T cells are available In particular, the gene encoding human melanoma antigen was cloned and sequenced. It is possible to do. The antigens identified so far from human melanoma , Based on their expression patterns. The first qu Las antigen is expressed only in tumors and testes, but not in other normal human tissues. Coded by gene. MAGE1, MAGE3, GAGE and BAGE Is an example of this class. The second class of antigens is melanocytes, melanoma and And differentiation antigens encoded by genes expressed only in normal retina. MA RT-1 / Melan-A, gp100 and tyrosine are examples of this class . These antigens are all unmutated self proteins. However, CDK4, B -Several mutant antigens, including catenin and Mum-1, are also recognized by T cells. Was identified. Recognized by T cells derived from the corresponding gene product Of antigenic epitopes to be understood understands the mechanism of the immune response to self-antigens These antigens or synthetic peptides not only for the treatment of patients with cancer It is also important to develop new and effective immunotherapy strategies.   Previous studies have shown that TIL586 + IL- in autologous patients with melanoma It was shown that injection of 2 resulted in objective regression of metastases. More recently, HL Residue encoding a tumor antigen recognized by TIL586 in association with A-A31 Gene, tyrosinase-related protein 1 (TRP-1 or gp75) cloned Was Interestingly, the gene product gp75 is associated with metastatic melanoma. First identified as an antigen recognized by IgG antibodies in serum from humans. The gene is expressed only in melanoma, normal melanocyte cell lines and retina, It was found not to be expressed in other normal tissues tested. Therefore, this gene A second crop containing MART-1 / Melan-A, gp100 and tyrosinase He is a member of Russ's antigen.   In the field, as an immunogen or vaccine to protect individuals from cancer development It has been difficult to identify epitopes on cancer cells that are useful. The present invention uses T Alternative open readings in the TRP-1 gene specifically recognized by cells Cancer peptides and antigenic cancer epithelia within peptides encoded from gframe sequences Identification of the loop. The present invention relates to a cancer pepti encoded by the TRP-2 gene. Inclusive. The cancer peptide of the present invention is useful for inhibiting or preventing cancer in mammals. Useful as epidemiology and vaccine.Summary of the Invention   One object of the present invention is to provide a novel marker recognized by T lymphocytes as a cancer antigen. To provide peptides and parts thereof.   The cancer peptide of the present invention and the antigenic cancer epitope portion of the cancer peptide are the same. Used to encode a normal protein or peptide derived from the gene Alternative open reading of genes other than open reading frame DNA sequence Coding DNA sequence. Genes falling within this range are TR It is the P-1 gene.   Another aspect of the present invention relates to normal proteins or peptides from the same gene. Alternative open for genes other than the encoding open reading frame DNA sequence Tumor antigen encoded by the reading frame DNA sequence. this Genes falling within the range are TRP-1 genes.   Another object of the present invention is to provide TRP-1, TRP-2 and TRP-2 acting as cancer peptides. And its mutant peptide fragments.   The tumor antigen and the antigenic cancer peptide of the tumor antigen of the present invention are Encoded by all or part of the child (SEQ ID NO: 46). TRP-2 It is a member of the rosinase-related gene family. TRP-2 is an immune response to T cells Currently identified as a novel and potential tumor antigen that can elicit .   One aspect of the present invention is useful as a cancer vaccine that can protect a subject from developing cancer. The TRP-1 gene, the TRP-2 gene or a mutant thereof. Cancer peptide. The present invention also provides a cancer vaccine in an amount effective to prevent cancer. A method of administering tin.   Another aspect of the invention relates to the use of a cancer peptide or its antigenic cancer epitope alone or A pharmaceutical composition comprising a combination with one or more immunostimulatory molecules. Another aspect of the invention Means TRP-1 cancer antigen alone, TRP-2 tumor antigen alone, or one or more A pharmaceutical composition comprising a combination with an immunostimulatory molecule. Another object of the present invention is to provide a T-cell. TRP-1, TR stimulating vesicles to elicit an immunogenic response against tumors and cancer A pharmaceutical composition comprising a P-2 peptide or a combination thereof. Cancer peptide Or its antigenic cancer epitopes also serve as immunogens for the prevention or treatment of cancer. Can be provided as a vaccine. Pharmaceutical compositions cure cancer in mammals Useful in treating or preventing. In the method of treatment, the pharmaceutical composition is administered to a mammal. Administered to a mammal in an amount effective to prevent or inhibit cancer in a mammal.   Another object of the present invention is to provide an autologous gene encoding a normal protein from the same gene. Alternative open readies derived from genes other than punreading frame DNA sequences Peptide and antigens within the peptide by translation of the in-frame DNA sequence A method for generating a sex cancer epitope.   Still another object of the present invention is to provide a protein encoding a normal protein or peptide. Genes other than gene products translated from open reading frame DNA Cancer peptide residues translated from an alternative open reading frame DNA sequence A method for detecting and identifying a gene product or a part thereof.   Yet another aspect of the present invention is an alternative alternative encoding a cancer peptide or a portion thereof. Open reading frame DNA or RNA sequences, as well as cancer peptides or The use of that DNA or RNA sequence in a method of producing a portion of the DNA. Departure Ming also provides an alternative open source for use as a probe or primer. An oligonucleotide of the coding frame DNA or RNA sequence is provided.   Yet another object of the present invention is to provide a T cell that produces a tumor antigen when expressed in cells. Nucleic acid sequence encoding RP-2 or a fragment thereof.   The present invention further provides an alternative open readout encoding a cancer peptide or a portion thereof. Coding frame DNA sequence alone or encoding at least one immunostimulatory molecule Provided in combination with a second DNA sequence. Alternative open library The reading frame DNA sequence is derived from the TRP-1 gene or a variant thereof. It may be.   The present invention also provides an alternative open ready encoding a cancer peptide or a portion thereof. Coding frame DNA sequence alone or encoding at least one immunostimulatory molecule Transfected or characterized by a vector comprising in combination with a second DNA sequence An introduced host cell is provided.   The present invention further provides a TRP-2 gene encoding a tumor antigen or a portion thereof. Paired with a second DNA sequence encoding a German or at least one co-immunostimulatory molecule Provide a vector containing the combination. Vectors and host cells as vaccines Can act, the expression of tumor antigens or cancer peptides is immunized with the vaccine Causes stimulation of tumor antigen-specific T lymphocytes in mammals.   The present invention also relates to DNA encoding the TRP-2 tumor antigen or a variant thereof. Paired with a second DNA sequence encoding a German or at least one co-immunostimulatory molecule Provide host cells transfected or transduced with the vector I do.   Vectors and host cells can act as vaccines, Tumor antigen expression is determined by antigen-specific T lymphocyte expression in mammals immunized with the vaccine. Causes irritation.   Vectors and host cells can act as vaccines, including cancer peptides and Or some of its expression is specific for cancer peptide in vaccine-immunized mammals. Causes T lymphocyte stimulation.   Yet another object of the present invention is to provide human pre-neoplastic and neoplastic cells and compositions. It is to provide a method for diagnosing the weave.   The present invention is used to encode normal proteins from the same gene. Alternative reading frame for genes other than the open reading frame nucleic acid sequence Detecting a cancer peptide encoded by a nucleic acid sequence or a part thereof Therefore, it is a method for diagnosing cancer or precancerous cancer in a mammal, including the cancer peptide or Or a method wherein a part thereof is recognized by T lymphocytes. Alternative reading The gframe nucleic acid sequence may be from the TRP-1 gene or a variant thereof. .   Yet another object of the present invention is to provide human pre-neoplastic and neoplastic cells and compositions. It is to provide a method for diagnosing the weave. According to the present invention, the method comprises Cells, tissues or extracts thereof and an alternative open encoding cancer peptide Detect reading frame DNA sequences, RNA sequences or parts thereof, Expressed by an alternate open reading frame DNA or RNA sequence Alternative open reading, including detecting a cancer peptide or a portion thereof Detection or increase of the frame DNA sequence, RNA sequence or expression product is An indicator of an organism or neoplasm.   The present invention relates to a method for diagnosing mammalian cancer or precancerous cancer by detecting a TRP-2 tumor antigen. Wherein the tumor antigen, cancer peptide or variant thereof is recognized by T lymphocytes Provide a way to be.   The present invention relates to tumors encoded by the TRP-2 gene or a fragment thereof. A method for diagnosing cancer or precancerous cancer in a mammal by detecting a tumor antigen, wherein the tumor antigen is a T cell. Provide a method that is recognized by the sphere.   Yet another object of the present invention is to provide an alternative audio encoding a cancer peptide or part thereof. Incorporates one or more copies of the pruning reading frame DNA sequence into its genome To provide transgenic animals. Alternative reading free The nucleic acid sequence may be from the TRP-1 gene or a variant thereof. Alternative Multiplex or mutant, depending on the incorporation of open reading frame DNA sequences Overexpression or expression of the cancer peptide. Such transgenic movement The products are useful for screening for therapeutic agents useful for treating cancer.   It is a further object of the present invention to provide one or more copies of a tumor antigen of the present invention in its genome. The purpose is to provide the transgenic animals that have taken up. TRP-2 Overexpression of tumor antigens or incorporation of DNA sequences or fragments thereof Expression occurs. Such transgenic animals can be used as therapeutic agents useful for treating cancer. Useful for screening.   The present invention also provides an alternative open reading frame nucleic acid sequence or TRP-2. Specific targeting and binding to tumor antigen nucleic acid sequence, derived from the same gene Cancer peptides or tumor antigens without adversely affecting the expression of normal proteins Antisense oligonucleotides that inhibit the expression of   Yet another aspect of the invention is a TRP for use in diagnostic and detection assays. Peptide containing -1 cancer peptide and TRP-2 tibia antigen and antigenic cancer thereof Monoclonal and polyclonal antibodies reactive with the epitope. Monoclonal and polyclonal antibodies can be used alone or in diagnostic and detection assays. It can be provided in the form of a kit together with other reagents commonly used in (a).BRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES   Many of these and other objects, features, and attendant advantages of the present invention are set forth in the appended claims. BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS The drawings will be better understood from reading the following detailed description, taken together with the drawings. Would. In the drawing,   FIGS. 1A and 1B show the antigenic peptides recognized by TIL586. Gp75 nucleotide sequence.   FIG. 1A shows the entire gp75 containing the 1584 bp open reading frame. 1 shows a long cDNA. The nucleotide is a tandem consisting of the leader sequence and mature gp75. It is numbered from the start codon which is translated into protein. pcDNA776 is Gp75 partial cDNA lacking the first 246 nucleotide coding region; When COS-7 was co-transfected with the LA-A31 gene, T Using an assay based on the ability to stimulate GM-CSF secretion by IL586 Isolated from a cDNA library. A series of deletion constructs and PCR DNA Fragments were made. pD776A is pcD after digestion with ApaI restriction enzyme. It is a derivative of NA776.   FIG. 1B shows the release of GM-CSF by TIL586. According to TIL586 GM-CSF secretion was determined by the DNA fragment shown in FIG. 1A and the HLA-A31 gene. Measured after co-culture with COS-7 co-transfected with offspring. Contrast The stimulator cells were 586 mel, 397 mel / A31+  , COS-7 alone, And HLA-A31 or pcDNA776 cDNA Includes COS-7.   FIG. 2 shows the nucleotide, amino acid sequence and open reading of the gp75 gene. 3 shows a switching frame. Partial nucleotide and amino of the first 157 amino acids The acid sequence is shown from the translation start codon of ORF1 (gp75). TIL586 DNA fragments conferring the ability to stimulate GM-CSF release from Show. Two putative start codons, ATG (254-256) and ATG (294) -296) in bold, causing translation of ORF2 and ORF3, respectively Can be. The peptide sequence recognized by ORF3 by TIL586 is in bold Shown by underline.   Figures 3A and 3B show translation of antigenic peptides and alternative open reading frames. Is shown.   FIG. 3A shows the position and length of a PCR fragment amplified by PCR. . The DNA fragment was obtained by PCR amplification and contained in the pCR3 expression vector. Cloned. Replacement of the ATG at positions 294-296 with ATC can be accomplished by And as described in Methods.   FIG. 3B shows a DNA fragment that stimulates cytokine release from TIL586. 2 shows the testing of the mutant and mutant constructs. The GM-CSF release assay was the same as in FIG. I went.   4A-4C show the characteristics of the antigenic peptide recognized by TIL586. You.   FIG. 4A shows HLA- when co-incubated with various stimuli. Figure 4 shows the release of GM-CSF by A31 restricted TIL586. Transfection And cytokine assays were performed as in FIGS. 1A and B. 586 mel And 397mel as positive and negative controls for TIL586 reactivity included. The ORF3P peptide was 586 EBV (A 31+) and T2 (non-A31) cells. TIL5 Stimulation of GM-CSF secretion by 86 was self-pulsed with peptide ORF3P. 586 EBV and allogeneic 1510 EBV (A31 +) cells Incubation significantly increased, but 586 EBV alone or ORF3P Increased when co-incubated with peptide-loaded T2 (non-A31) cells Did not add.   FIG. 4B shows cytotoxic lysis of target cells by TIL586. 586 mel (-■-) and 397mel (-□-) used as positive and negative controls, respectively did. 586 EBV B cells were ORF3P (pep) and (−) as marked. ▲-), irrelevant peptide (ipep) (-●-), without peptide (-△- ) Incubate and T2 cells were pulsed with ORF3P (-O-). I After incubation, TIL586 was added and mixed with target cells. TIL586 Was measured in a 4 hour chromium release assay.   FIG. 4C shows a peptide for sensitizing target cells for lysis by TIL586. 4 shows the titration of the metal concentration. 586 EBV cells were transformed into ORF3P (pep) (-▲-) Or serial dilutions of an irrelevant peptide (-ep-) and The ORF3P peptides were separately incubated for (-O-) for 90 minutes. TIL5 The cytolytic activity of 86 was obtained at an effector: target (E: T) ratio of 40: 1 for 4 hours. of51Evaluated in a Cr release assay.   FIGS. 5A and 5B show unlabeled 586 EBV loaded with ORF3P peptide. By cell514 shows inhibition of lysis of Cr-labeled target cells.   FIG. 5A labeled 586 mel cells with chromium as a “hot” target for 90 minutes. Indicates that ORF3P (-▲-), irrelevant peptide (-△-) 586 EBV cells and T2 cells loaded with ORF3P peptide (-□-) Was used as a "cold" target cell. After cleaning, "hot" and "cold" The target cells were counted again and the 1: 1, 5: 1, 10: 1 and 20: 1 “calls” C. "/" Hot "ratio. Effector TIL586: "Hot" Target (E: T) added at a ratio of 20: 1. 4 hours incubation of chromium release After the measurement.   FIG. 5B shows by TIL1200 that recognized gp100.51Cr labeled 624 Lysis of mel ("hot" label) was pulsed with an irrelevant peptide (-△-) 586 EBV pulsed with ORF3P (-▲-) compared to 586 EBV cells Indicates not inhibited by cells. "Cold" and "hot" targets Cells were mixed at the indicated ratios. Effector TIL1200: Hot Target (E : T) at a ratio of 30: 1. The cytolytic activity of TIL1200 was51C It was evaluated by the r-release activity.   Figures 6A-6D show antigenic peptide T cell clones from the TIL586 cell line. Indicates recognition. T cell clones were generated from the TIL586 cell line. 586 EBV   B cells were pulsed with ORF3P peptide or an irrelevant peptide. T cell cell Lawn or TIL586 cells were added and co-incubated. 586me 1, 397mel / A31+  Tumor and melanocyte NHEM680 cells And 1 × 10Five  Cells / wells were each cloned from a T cell clone, TIL586-C1. (FIG. 6A), TIL586-C4 (FIG. 6B) and TIL586-C6 (FIG. 6C). ) Or TIL586 (FIG. 6D) for 18-24 hours 1 × 10Five  Incubate with cells I was vate. The GM-CSF assay was performed as described in FIG. 1B.   FIG. Various target cells and anti-cells by CTL clones derived from TIL586 Recognition of native peptides. T cell clones were subjected to limiting dilution from TIL586 cell line (1 Cells / well) and containing 6000 IU / ml IL-2 The cells were further expanded in V medium. CTL clone 586TIL-C1 and Claw GM-CSF secretion by melamine 4 was performed in a normal melanocyte cell line (HLA-A31 +). , 586 EBV B cells pulsed with ORF3P peptide or an irrelevant peptide Vesicles were measured after co-culture with 397 mel or 586 mel cells.   FIG. TRP-2 as a novel tumor antigen recognized by CTL clone 4 Identification. GM-CSF release by CTL clone 4 was measured by MART-1, gp75. / Encodes TRP-1, gp100, tyrosinase, p15 and TRP-2 COS cotransfected with HLA-A31 cDNA together with the gene It was measured after co-culture with -7. Control stimulator cells included 586 mel and 397 m el, COS-7 alone and transfected with HLA-A31 cDNA COS-7 was included.   FIG. TRP-2 gene deletion and subclone construction and T cell recognition. A full-length TRP-2 cDNA containing a 1557 bp open reading frame Show. Nucleotides from the 5 'untranslated region of the TRP-2 cDNA Numbered from Leotide. Subsequent deletion constructs and DNA fragments Cloning was made. The T cell recognition of each construct was determined by DNA fragmentation as described above. CT and COS-7 cotransfected with HLA-A31 gene It was measured after co-culture of L clone 4.   FIG. TRP-2 antigenic peptides and partial coding sequences. TRP-2 inheritance The nucleotide and amino acid sequences of the offspring are shown. pTD4, pTA, pTD3 The length and 3 'end of the DNA fragment in pTK and pTK are indicated by arrows, and Ap Mark the restriction sites for aI, PstI and KpnI. Approved by CTL clone 4 The recognized antigenic peptide sequences are shown in bold and underlined.   11A to 11C. Characteristics of antigenic peptides recognized by CTL clone 4 Sign. FIG. GM-CSF release by T cells at different peptide concentrations. 586 EBV (A31 +)197-205Pulse with peptide (----) and T 2 (non-A31) cells were transferred to TRP197-205Peptides different for peptides (----) Pulse for 90 minutes. ORF3P as a control peptide was added to 586 EB Pulsed on VB cells (-△-). GM-CS by CTL clone 4 F release, TRP197-205EBV B cells pulsed with and ORF3P And TRP197-205After co-incubation with T2 cells pulsed at Specified. FIG. 11 (B). Markers for lysis by CTL clone 4 at different peptide concentrations Cell sensitization. 586 EBV B cells were transformed with TRP197-205(−− ▲ −−), unrelated Incubate with the relevant peptide ORF3P (-△-) and T2 cells TRP at various peptide concentrations197-205(−− ● −−). Pepti After incubation, target cells were labeled for 30 minutes. After washing, E: T ratio 40 : The cytolytic activity of CTL clone 4 at 1: 1 was determined for 4 hours between T cells and target cells. It was measured after the incubation. FIG. 11 (C). CTL black at different E: T ratios Lysis of target cells by Target 586 EBV cells are197-205(−− ▲ -−) or unrelated peptide ORF3P (−−−−−) The target T2 cells to TRP197-20590 minutes in with peptide (----) Cubbed. 586 mel (----) and 397 mel (-----) ) Were used as positive and negative controls, respectively.Detailed description of the invention   The present invention relates to a cancer peptide, which is immunologically recognized by T lymphocytes of the immune system, Includes tumor antigens and parts, derivatives or variants thereof. The invention further provides , Cancer peptides or antigenic cancer epitopes contained in tumor antigens. antigen Sexual Cancer Epitope Specificizes Cell-Mediated Immune Response by Interacting with Immune System T Cells Is caused. Due to the interaction between antigenic cancer epitopes and T cells, T cells Reacts with and prevents, eliminates or reduces cancer in mammals, including.   In one embodiment, a cancer peptide contained in a cancer peptide of the present invention and an anti-cancer peptide A primary cancer epitope is a normal protein or peptide whose cancer peptide is within Open reading of genes other than the open reading frame encoding Normal protein or peptide in that it is encoded by the It is distinguished from Pide. Cancer peptides and parts thereof are characteristically found in normal cells. Is absent or present at very low levels and high levels in precancerous and cancerous cells Exists in. High levels of expression of the cancer peptide are indicative of precancerous or cancerous cells from normal cells. Correlation with transformation into vesicles.   The cancer peptide of the present invention may be used for primary or metastatic melanoma, thymoma, lymphoma. , Sarcoma, lung cancer, liver cancer, non-Hodgkin's lymphoma, Hodkin Lymphoma, leukemia, uterine cancer, cervical cancer, bladder cancer, kidney cancer, and adenocarcinoma Including, but not limited to, breast cancer, prostate cancer, ovarian cancer, pancreatic cancer, etc. Form part of or are derived from cancer.   The term melanoma includes melanomas, metastatic melanoma, melanocytes Or melanoma, melanoma or melanoma derived from any of the melanocyte-related nevus cells Tumor, melanosarcoma, in situ melanoma, superficial diffuse melanoma, nodular melanoma , Mole malignant melanoma, terminal mole melanoma, erosive melanoma or These include familial atypical nevus and melanoma (FAM-M) syndrome It is not limited to.   Of particular interest are autologous CTLs in patients with cancer, especially melanoma. Or a fragment or derivative thereof. Further interest Deep is recognized by MHC restricted CTL, especially MHC class I restricted CTL Cancer peptide, a fragment or derivative thereof.   The "tumor antigen" of the present invention is a cancer or cancer capable of eliciting an antitumor response in mammals. Or an oncoprotein and any part of the cancer or oncoprotein . In one embodiment, the tumor antigen comprises the full length TRP-2 protein.   The term "cancer peptide", as used herein, acts as a tumor antigen. Encompass any epitope or fragment of a cancer or oncoprotein .   The term "fragment," as used herein, refers to a protein fragment. At least 5 or 6 amino acids for the gene and at least 1 amino acid for the gene Any segment of a protein or gene having from 5 to 18 nucleotides means.   In one embodiment, the cancer peptide of the present invention comprises an alternative open library derived from a normal gene. Arising from the expression of the coding frame DNA sequence. Normal gene product is expressed Rather, it is recognized immunologically by T lymphocytes in an MHC restricted manner. The resulting cancer peptide is expressed. MHC restricted T lymphocytes are associated with cancer or precancerous Useful for identifying alternative open reading frame gene products.   Of particular interest is TRP-1 (gp75); a mouse tumor suppressor INK. Protein p19 arising from the alternative reading frame of the 4a geneARF(Quell e, D.E. et al., Cell Vol. 83, pp993-1000, 1995); antigenic octapeptide SVVE FSSL, ie, JAL8, bm1 anti-B6 alloreactive bm1BZ19.4T Allogeneic peptides recognized by cells (Malarkannan, S et al., J. Exp. Med . Vol.182, pp.1739-1750, 1995) and the like.   In one embodiment, the cancer peptide of the present invention, a fragment or derivative thereof, comprises Immunologically recognized by tumor penetrating lymphocytes (TILs) from breast cancer tumors Antigenic cancer epitopes. Of particular interest are cancer antigen-specific cytotoxic T cells. Antigenic cancer epitope (CD8+).   In one embodiment of the invention, the cancer peptide comprises about 24 amino acids and is described in FIG. Derived from the same gene encoding tyrosinase-related protein 1 or Alternate open reading frame 3 DNA sequence from homologue or mutant Therefore, it is expressed.   In one embodiment, the cancer peptide of the invention has the amino acid sequence: MXaaLQRQFLRTQLWDVPSWLERSCL (SEQ ID NO: 7) and (Where Xaa is Ser or Ala) ). A cancer peptide or a part thereof sharing partial sequence homology with SEQ ID NO: 6 Included within the scope of the invention. The partial amino acid sequence homology is as few as SEQ ID NO: 6. At least 85% sequence homology, preferably at least 95% sequence homology or Biological peptide that stimulates cancer antigen-specific T lymphocytes Having   In one embodiment of the invention, the cancer peptide has the formula: MetXaaLeuGlnArgGlnPheLeuArg (SEQ ID NO: 8) and And its fragments and derivatives (Formula Xaa = Ser Or Ala).   In another embodiment of the cancer peptide of the invention, the amino acid sequence: Including MSLQRQFLR (SEQ ID NO: 9) and fragments and derivatives thereof .   In another aspect, the present invention relates to a cancer peptide contained in the tumor antigen of the present invention and an antigenic cancer antigen. Pitopes are mainly expressed in melanoma, normal melanocyte cell lines and retina Derived from the TRP-2 protein. The tumor antigens of the present invention are useful in pre-cancerous and cancer cells. Present at significantly lower levels in most normal cells than the elevated levels seen You. Elevated expression of tumor antigens correlates with transformation of normal cells into precancerous or cancerous cells I do. TRP-2 is located on human chromosome 13 and is a tyrosinase-related gene family. -Tyrosinase and gp75 / TRP-1 Share 40-45% amino acid sequence identity (Yokoyama et al. (1994); Bouchard Et al. (1994)). TRP-2 encodes a protein having 519 amino acids, Has DOPA chrome tautomerase activity involved in nin synthesis (Bouchard et al. (1994)).   Of particular interest is autologous CTL in patients with cancer, especially melanoma. Is a cancer peptide of TRP-2 or a variant thereof. Further interest Tasty is recognized by MHC restricted CTL, especially MHC class I restricted CTL. Cancer peptide, a fragment or derivative thereof. Recognized by cancer peptide The preferred HLA subtype recognized is the HLA-A31 subtype. The present invention Is a potential tumor antigen recognized by HLA-A31 restricted T cells. TRP-2, melanoma / melanocyte component of tyrosinase protein family The identification of antigens. The TRP-2 gene product was obtained from CIL isolated from TIL586. It is the second tumor antigen recognized by the TL clone.   In another aspect of the invention, the tumor antigen is a cancer peptide comprising about 9 amino acids, Gene encoding rosinase-related protein-2 (SEQ ID NO: 46) or FIG. 0 is expressed from its homologue or variant.   In yet another aspect, a fragment of the TRP-2 protein or a functional Equivalent variants are used as cancer peptides. Preferably, the tumor antigen of the present invention Is a fragment of a TRP-2 protein comprising at least a portion of amino acids 197-205. Including ragments. Most preferably, the cancer peptide of the invention has the amino acid sequence: LL GPGRPYR and fragments or derivatives thereof. Amino acid 197- A cancer peptide sharing partial sequence homology with the region of TRP-2 containing Some of them are also included in the scope of the present invention. Partial amino acid sequence homology refers to LLG At least 85% sequence homology with PGRPYR, preferably at least 95% A peptide having sequence homology or higher, which means a cancer antigen-specific T lymphocyte Has a biological effect that stimulates   Another aspect of the invention is that the homology of L is sufficient to effectively act as a cancer peptide. Includes cancer peptides having against LGPGRPYR. Such a peptide It may have conservative amino acid changes at one or more positions. Conservative amino acid changes Refers to the same type of amino acid change that exists naturally at a particular position, i.e., Hydrophobic amino acids change to hydrophobic amino acids, basic amino acids change to basic amino acids Change. Such amino acid changes can affect the overall charge of the peptide and It does not change the configuration significantly, and thus such variants maintain the anticancer activity of the cancer peptide. Carry. Examples of such conservative changes are well known to those skilled in the art and are within the scope of the present invention. You.   Yet another aspect of the invention is derived from the LLGPGRPYR peptide, wherein It relates to several cancer peptides containing non-conservative amino acid changes at the above positions. like that Peptides have been identified in the present invention, LSGPGRPYR, KLGPGRPYR, LL Including but not limited to GPGFPYR and fragments and derivatives thereof. Not.   The present invention relates to functionally equivalent variants of the TRP-1 or TRP-2 cancer peptide. I do. “Functionally equivalent variants” include peptides with partial sequence homology, 1 Peptides having specific conservative and / or non-conservative amino acid changes, Includes peptide conjugates, chimeric proteins, fusion proteins and peptide nucleic acids You.   Cancer peptides, tumor antigens and their antigenic cancer epitopes are Can be purified and isolated from natural sources, such as from cell lines and the like. cancer The peptide and its parts are at least 90% pure, preferably at least 95% % Purity, and 100% purity. Cancer peptides and their antigenic epi Topes can also be produced by chemical synthesis or by recombinant DNA technology known in the art. Tsu Can also be obtained. J. Chemical synthesis technology M. Steward and J. D. Young, “Solid  Phase Peptide Synthesis ”, W. H. Freeman & Co. , San Francisco, 1969; Bodansky et al., "Peptide Synthesis", John Wiley & Sons, 2nd ed., 1976. And J. Meienhofer, “Hormonal Proteins and Peptidea”, Vol. 2, p. 46, Acade mic Press, New York, 1983 and E. Schroder and K. Kubke “The Peptides” Vol. 1, Academic Press, New York, 1965.   Cancer peptides and their antigenic cancer epitopes can be obtained by methods known in the art. And a pharmaceutical composition together with a pharmaceutically acceptable carrier. Main group The composition is useful as a vaccine to prevent or treat cancer. The composition is And at least one immunostimulatory molecule. Stimulates antigen-specific T cell responses Immunostimulatory molecules for use in combination with cancer peptides or portions thereof Are one or more major histocompatibility complex (MHC) molecules, such as class I and Including, but not limited to, class II molecules, preferably class I molecules. Book The composition further comprises B7. 1, B7. 2, ICAM-1, ICAM-2, LFA- 1, other stimulant molecules including LFA-3, CD72, etc., and IL-1 to IL -15, TNFα, IFNγ, RANTES, G-CSF, M-CSF, IFN α, CTAPIII, ENA-78, GRO, I-309, PF-4, IP-1 0, LD-78, MGSA, MIP-1α, MIP-1β, but not limited to these Cytokines, or combinations thereof, are not included for immune enhancement. It may be.   The stimulatory molecules may be provided in physically separate forms, In the membrane of an antigen presenting cell, such as a page or dendritic cell, or in the membrane of a liposome. Or expressed on the surface of transduced or transfected cells. Is also good. DNA sequences of MHC immunostimulatory molecules are available from GenBank and others. You.   Cancer peptides, tumor antigens and their antigenic cancer epitopes prevent cancer or Useful in methods for treating and detecting cancer or pre-cancer in mammals, including humans Useful in diagnostic assays for The cancer peptide or a part thereof is radiolabeled, Derivatives with other components attached to it, such as biotin, fluorescein, etc. It may be in a form. Allows specific targeting to specific organs, tumors or cell types The targeting substance that activates also attaches to the tumor antigen, cancer peptide, or part thereof. May be worn. Such targeting substances include hormones, cytokines Or a cell receptor. Cancer peptides, tumor antigens and some of them alone Alternatively, it can be prepared in the form of a kit in combination with other reagents.   Another aspect of the invention is useful for inducing tumor-specific cell-mediated immunity to cancer. Vaccine.   Approaches to cancer immunotherapy can be categorized as active or passive. Can be. Active immunotherapy involves attempts to enhance the immune response to tumors Directly immunizing cancer patients with cancer antigens. Passive immunotherapy Have anti-tumor responsiveness with the goal of directly mediating the anti-tumor response. Administering an immunological reagent such as an epidemic cell or an antibody.   The first attempt at active immunotherapy involves either intact cancer cells or cancer cell extracts. That these substances contain tumor antigens in amounts and forms that can stimulate an immune response We used with expectation. However, the identification of cancer antigen molecules has New possibilities open up for developing immunotherapy for the treatment of cancer. The number of these attempts Some summaries are shown in Table 1. Table 1 Cancer treatment based on molecular identification of cancer antigens 1.   Active immunotherapy with: a. Immunodominant peptide     1) alone     2) Combination with adjuvant     3) Binding to helper peptides, lipids or liposomes     4) Pulse on antigen presenting cells b. Immunodominant peptides by amino acid substitutions that increase binding to MHC molecules c. Protein alone or in combination with adjuvant d. "Naked" DNA encoding a cancer antigen     1) "Gene gun" for intradermal injection     2) Intramuscular injection     3) Binding to lipid e. Recombinant virus such as vaccinia, fowlpox or adenovirus that encodes     1) Cancer antigen alone     2) Gene encoding cancer antigen + cytokine, costimulatory molecule, or immunity         Other genes that enhance the epidemiological response f. BCG, Salmo encoding cancer antigens alone or in combination with immunostimulatory molecules Recombinant bacteria such as Nera or Listeria 2.   Active immunotherapy (as described above) with administration of immunostimulatory cytokines   1.   IL-2   2.   IL-6   3.   IL-10   4.   IL-12   5.   IL-15, etc. 3. Passive immunotherapy with antitumor lymphocytes generated by in vitro sensitization following TIL or PBL     1. Immunodominant peptide pulsed on antigen presenting cells (producing CD8 cells)     2. Antigenic protein (CD4 cells co-incubated with antigen presenting cells)         Exogenous antigen presentation pathway that produces   E. FIG. E. coli, yeast, or baculovirus Insertion of the encoding gene translates into large amounts of purified tumor antigens for use in immunization Provide the opportunity to get Alternatively, immunodominant peptides from these tumor antigens Can be easily synthesized in vitro, alone or in adjuvant, lipid / liposome Or improve their immunogenicity, such as in combination with binding to helper peptides Can be purified in large quantities for immunization in a form intended to It can be pulsed onto the original presentation cells. To improve the binding efficiency to MHC antigens Modification of individual amino acids in immunodominant peptides for comparison with natural peptides Can potentially increase immunogenicity.   Recent techniques using "naked" DNA injected directly into muscle or skin are: Enhancing both cellular and hormonal immune responses to encoded antigens (Cooney, E. L. , A. C. Collier, P. D. Greenberg, R. W. Coombs, J. Zarli ng, D. E. Arditti, M. C. Hoffman, S. L. Hu and L. Correy, 1991, Lancet 337: 567; Wolff, J. A. , R. W. Malone, P. Williams, W.S. Chong, G. Acsadi, A .; Jani, And P. L. Felgner, 1990, Science 247: 1465; Davis, H. L. , R. G. Whalen, and B. A. Demeniex, 1993, Hum. Gene Ther. 4: 151; Yang, N. S. , J. Burkholder, B . Roberts, B Martinelli, and D.M. McCabe, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 8 7: 9568; Williams, R. S. , S. A. Johnston, M. Riedy, M. J. Devlt, S. G. McElligo tt, and J. C. Sanford, 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 2726; Fynan, E. R. , Webster, D. H. Fuller, J. R. Haynes, J. C. Santoro, and H. L. Robinson, 199 5, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 11478; Eisembraum, M. D. , D. H. Fuller, and J . R. Haynes, 1993, DNA and CellBio. 12: 791; Fuller, D. H. And J. R. Haynes , 1994, AIDS Res. Hum. Retrovir. 10 (11): 1433; Acsadi, G. , G. Dickson, D. R . Love, A. Jani, F. S. Walsh, A .; Gurusinghe, J. A. Wolff, and K. E. Davies 1991, Nature 352: 815). Ready to use non-viable DNA vectors It has the advantages of ease of administration and safety of administration. Alternative nucleic acid sequences of the invention are directed against cancer Useful as an immunogen or as a DNA vaccine. TRP-1 of the present invention Alternative open reading frame nucleic acid sequence or TRP-2 protein of the invention DNA sequences encoding proteins or peptides trigger cellular responses to cancer cells. The amount of gene gun Can be used for administration. Nanogram quantities are useful for such purposes It is.   Effective forms of immunization include recombinant cells such as BCG, Salmonella or Listeria. Recombinant virus such as vaccinia, fowlpox or adenovirus in bacteria And incorporating a gene encoding an immunogenic molecule therein. Encodes a cancer antigen Genes, either alone or after encoding an immunostimulatory molecule, or Can be co-expressed with other genes that can enhance the immune response . Studies with a model tumor antigen in a mouse model have been performed with interleukin-2 (IL -2) or B7. Increased immunogenicity of model tumor antigens by incorporation of one gene Can even mediate the decline of established pulmonary metastases with these antigens And can even mediate the decline of established pulmonary metastases with these antigens showed that. Such as IL-2, IL-6, IL-10, IL-12 or IL-15 Improving the immune response using active immunotherapy with outpatient administration of immunostimulatory cytokines You can also.   Genetically modified immune cells that can recognize human tumor antigens (usually Immunization with cancer regression in selected patients with metastatic melanoma Useful for mediating lines. Tumor with human lymphocytes presented on antigen presenting cells In vitro techniques have been developed to sensitize antigen immunodominant peptides in vitro. You. The gene encoding human tumor antigen is cloned by repeated in vitro stimulation. Recognizes human tumor antigens much larger than the TIL used to clone Capable cells can be induced. That is, repeated a In vitro sensitization, lymphocytes that are 50 to 100 times more potent than TIL Could be guided. Adoptive transfer of these cells is more likely than normal growth of TILs. May be more effective at mediating tumor regression in vitro.   In a method of preventing or inhibiting cancer, a cancer peptide or a portion thereof is administered intravenously. , Intramuscular, subcutaneous, intradermal, intraperitoneal, intrathecal, intrapleural, intrauterine, rectal, vaginal, topical Administered through one of a number of routes, including but not limited to intratumoral be able to.   Administration can be by transmucosal or transdermal means. Mucosal passage or skin For transdermal administration, penetrants appropriate to the barrier to be permeated are used in the formulation. So No Such penetrants are generally known in the art, and include, for example, biliary administration for transmucosal administration. Juice salts and fusidic acid derivatives are included. In addition, use cleaning agents. To facilitate penetration. For transmucosal administration, for example, nasal spray Or by suppository. For oral administration, cancer peptides, tumor antigens , Some or variants of which are usually found in capsules, tablets and toxics Is formulated into an oral dosage form.   Generally, at least about 1 pg per kg of body weight of the subject, preferably at least about 1 ng / g, more preferably at least about 1 / kg body weight It is desirable to supply a dose of at least μg of the cancer peptide or a part thereof to the subject. No. A range of about 1 ng / kg to about 100 mg / kg body weight is preferred. However, lower or higher doses can be administered. For administration More clonal expansion of cancer antigen-specific T lymphocytes, preferably cytotoxic T lymphocytes Effective in initiating, stimulating and / or causing tonicity, which are then Cancer can be prevented or inhibited in a subject.   The dosage may be administered at least once, as a bolus or as a continuous dose. May be supplied. Multiple doses over weeks to months are preferred Maybe. Subsequent administrations can be administered as indicated.   In the method of treatment, a vaccine containing a cancer peptide or a part thereof is administered in an effective amount. Administered to mammals to prevent cancer in mammals. Of particular interest is the melanoma Cancer peptide encoded by ORF3 of TRP-1 gene for prevention Is a vaccine containing a part of it. Of particular interest is the prevention of melanoma. One or more peptides encoded by fragments of the TRP-2 gene for Vaccine.   In a method of reducing tumor burden in an animal having a tumor, the method comprises: Administering an effective amount of an antigenic cancer epitope to the site of tumor burden, the amount of Is effective in reducing the size of the tumor at that site.   Another method of treatment involves autologous cytotoxic lymphocytes or tumor-penetrating lymphocytes. It can be obtained from a patient with cancer. Lymphocytes are grown in culture and specific Cancer peptide or antigenic cancer epitope alone or with cytokine Less Cancer antigen by culturing in the presence together with one immunostimulatory molecule Inflate specific lymphocytes. Antigen-specific lymphocytes then reduce the patient's tumor Or injected back into the patient in an amount effective to eliminate.   After immunization, the efficacy of the vaccine is determined by the specific lytic activity, specific cytokine production Recognizes cancer antigens as assessed by tumor regression or a combination of these Can be evaluated by the production of immune cells. If the mammal to be immunized has cancer or If already afflicted with metastatic cancer, the vaccine may be immunized with an immunomodulator such as I L-2, IL-6, IL-10, IL-12, IL-15, interferon, Other therapeutic treatments such as tumor necrosis factor, chemotherapeutic agents such as cisplatinum, cancer Rovir and other antivirals, amphotericin B, antibiotics, etc. Can be given.   Another aspect of the invention relates to an open protein encoding a normal protein or peptide. Alternative open reading frame for genes other than the reading frame DNA sequence Wherein the alternative open reading frame DNA sequence is Encoding a cancer peptide and a part thereof immunologically recognized by T cells of the system The above DNA sequence.   The alternative open reading frame DNA sequence is the TRP-1 gene, TRP -2, including, but not limited to, DNA sequences from the INK4a gene, etc. Not.   Interestingly, alternative open reading frames from melanoma forming genes The DNA sequence. The melanoma forming genes are MART-1 / MelanA, Tyrosinase, gp100, gp75 (TRP-1), TRP-2 (Helahan, R 1993 J. et al. Invest. Dermatol. 100 (Suppl. ): 176S-185S) etc. Including but not limited to genes.   One embodiment of the present invention provides a gene sequence encoding a tyrosinase-related protein. Alternative open reading frame DNA sequence encoding a cancer peptide from within Or part of it. The gene sequence of TRP-1 is described in Vijayasaradhi, S .; Other (199 0, J. Exp. Med. 171: 1375-80), accession number X51 455, and Cohen, T .; 1990 Nucleic Acids Research, VOL. 18: 2807 Described in EMBL accession number X51420, as Data banks.   In one embodiment, the alternative open reading frame DNA sequence is A cancer peptide recognized by a cancer antigen-specific T lymphocyte, including an infiltrating lymphocyte, or Is the ORF3 of FIG. 2 having SEQ ID NO: 5, encoding a portion thereof, a portion thereof And functionally equivalent sequence variants thereof. Complementary to ORF3 described in FIG. As well as anti-complementary nucleic acid sequences are included in the present invention.   In another embodiment, the alternative open reading frame DNA sequence is ATGTCACTGCAACGGCAATTTCTCAG (SEQ ID NO: 10) Including.   One aspect of the invention is a portion of TRP-2 encoding one or more cancer peptides. You. The gene sequence of TRP-2 was obtained as described in Yokoyama et al. (1994). Session number D17547 and as described in Bouchard et al. (1994). Disclosed to GeneBank under the umbrella cushion number S69231. .   In one embodiment, the TRP-2 gene fragment is LLGPGRPYR And cancer recognized by cancer antigen-specific T lymphocytes including tumor-infiltrating lymphocytes It encodes a functionally equivalent sequence variant for the peptide. LLGPGR Complementary and anti-complementary to the sequence encoding PYR and its equivalent sequence variants Nucleic acid sequences are also included in the present invention.   In another embodiment, the DNA sequences encoding the TRP-2 protein are all Expresses at least a part thereof. Preferred fragments of the TRP-2 gene are PstI site at leotide position 947 and KpnI site at nucleotide position 1080 Including the area between.   Another preferred fragment of the TRP-2 gene is TTATTAGGACCAGGACGCCCCTACCAGG including.   Due to the degeneracy of the genetic code, deformation of the DNA sequence results in equivalent translation of the cancer peptide Will be. As a result, cancer cells whose replacement is recognized by cancer antigen MHC restricted T cells Such substitutions are included within the scope of the invention, as long as they result in the expression of the peptide. Departure Wrapped in light One substitution involved was GCT encoding Ala of TCA encoding Ser. , GCC, GCA or GCG. Homo from other nursing species Logs are included within the scope of the present invention.   Alternative open reading frame DNA such as from TRP-1 gene etc. All or part of the sequence can be used as a probe to target cancer peptides of other mammalian species. Mologs can be identified and isolated. Similarly, the entire TRP-2 gene Or use as a probe to identify homologues of cancer peptides from other mammalian species And can be isolated. In one embodiment, a mouse cDNA sequence is used. To screen a mammalian cDNA library for human homologous nucleic acid sequences You. Positive clones are selected and sequenced. Can synthesize cDNA library Examples of tissue types include dermis, epidermis, solid tumor, melanoma, melanocytes, etc. But are not limited to these. One skilled in the art can use You will understand the suitable hybridization conditions to use. Nucleic acid hybridizer The conventional method of construction, library construction and cloning techniques is Samb rook et al. (eds) (1989) Molecular Cloning. A Laboratory Manual '' Cold Spr ing Harbor Press, Plainview, New York and Ausubel et al. (eds) "Current Pro tocols in Molecular Biology "(1987), John Wiley and Sons, New York, N ew York.   Another aspect of the present invention is directed to TRP- in a biological sample isolated from a mammal having cancer. 1. Detection and detection of RNA that transcribes cancer peptides such as TRP-2 cancer peptide And nucleic acid probes for quantification. RNA levels relative to control RNA samples The changes are useful in the diagnosis and prognosis of mammalian diseases.   In one embodiment, the mRNA is administered to a patient suspected of having cancer or precancerous. It is derived from tissue and compared to mRNA from healthy control subjects. Compared to the control , An alternative open reading frame mRNA encoding a cancer peptide in a patient A quantitative and / or qualitative increase in is an indicator of cancer or precancerous in the patient. mR NA is measured using an oligonucleotide probe that can hybridize to mRNA. Can be detected. In one embodiment, the probe is a transcript of ORF3 of TRP-1 And hybridize.   Another aspect of the present invention is directed to TRP- in a biological sample isolated from a mammal having cancer. 2 Nucleic acid probe for detection and quantification of RNA that transcribes tumor antigens. versus Changes in RNA Levels for Controlled RNA Samples Are Diagnosed and Prognosed for Neonatal Diseases It is useful in   In one embodiment, the TRP-2 mRNA is suspected of having cancer or precancerous. Compared to TRP-2 mRNA from healthy control subjects, derived from the patient's tissue I do. Quantitative and / or quantitative determination of TRP-2 mRNA in a patient as compared to a control Sexual gain is an indicator of cancer or precancerous in the patient. mRNA is an oligonucleotide It can be detected using a probe.   Oligonucleotide pairs based on the sequence encoding the cancer peptide or part thereof Use the combination as a PCR primer to amplify a selected RNA sequence Biological test using reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) MRNA in the sample can be detected. The present invention also relates to a cancer peptide or one thereof. Situ PCR for the detection of DNA and RNA encoding It also includes in situ RT-PCR. The technology uses a copy number of the target nucleic acid. Very low or preferred when different types of nucleic acids must be distinguished No. The method is particularly useful for detecting and distinguishing precancerous and cancerous cells from normal cells It is.   The present invention relates to an antigen-specific T cell comprising the generation of a nucleic acid-deleted fragment derived from a gene. And a method for identifying an antigenic cancer epitope reactive with the antigen. Deletion fragment In a suitable vector, which is then placed into a host cell for expression of the nucleic acid product. Transfect or transduce. In some cases, the host cell may supply an immunostimulatory molecule. May also be expressed. Cancer antigen-specific T cell responses are host cells expressing deletion products It is measured in the presence of   If the host cell expresses only the deletion product, the immunostimulatory molecule may be replaced with B cells, macrophages. Transfer by antigen-presenting cells such as phages, dendritic cells, or with stimulatory molecules Can be supplied by the injected cells. In one embodiment, the immune The stimulatory molecule is an MHC class I molecule.   Mapping using this approach allows for the identification of cancer peptides or antigenic cancer Determining an alternative open reading frame DNA sequence encoding a pitope .   An alternative method of identifying cancer antigens and antigenic cancer epitopes is to generate synthetic peptides. Pulsing antigen presenting cells with the synthetic peptide, and the peptide Protopresenter cells were added together with antigen-specific T cells and peptide-pulsed anti- By measuring the antigen-specific response of T cells in the presence of primitive presenting cells. Antigen specific Synthetic peptides that produce a specific T cell response include the antigenic cancer epitopes of the invention.   The present invention also provides an alternative open encoding a cancer peptide or antigenic cancer epitope. And vectors containing the reading frame DNA sequence. In some cases, The vector may also comprise a DNA sequence encoding at least one immune stimulating molecule. it can. In one embodiment, the vector comprises ORF-3 of the TRP-1 gene .   The present invention also relates to the TRP-2 gene encoding the tumor antigen of the present invention and its FRP gene. Vector containing the fragment. Optionally, at least one vector And DNA sequences encoding the co-immunostimulatory molecules.   Eukaryotic expression vectors include retrovirus vectors, vaccinia virus vectors -, Adenovirus vector, herpes virus vector, fowlpox virus vector -, Baculovirus vector, human papillomavirus vector, equine encephalitis vector Virus, influenza virus vectors, etc. .   The present invention encodes a normal protein or peptide from the same gene Alternatives to genes other than the open reading frame nucleic acid sequence used for Cancer peptide encoded by the open reading frame nucleic acid sequence or its And a novel recombinant virus that expresses a portion of E. coli. In another aspect, the invention This depends on the nucleic acid sequence of the TRP-2 gene or a fragment or variant thereof. Novel recombinant virus expressing TRP-2 tumor antigen encoded by You. The recombinant virus may express at least one immunostimulatory molecule. Braid Recombinant viruses are used to prevent or treat cancer in mammals, especially humans. A cell-mediated immune response can be elicited or up-regulated in mammals.   The recombinant virus may be alone or with one or more genes encoding immunostimulatory components. Together, nucleic acid sequences encoding a cancer peptide, a portion thereof, or an antigenic cancer epitope The sequence is incorporated into the genome or a part thereof. In one embodiment, the combination The recombinant virus has a nucleic acid sequence encoding a TRP-1 oncopeptide or a portion thereof. That geno In the system. In another embodiment, the recombinant virus is alone or in combination. Together with one or more genes encoding immunostimulatory molecules, a TRP-2 tumor antigen or Integrates the nucleic acid sequence encoding the variant into its genome or a portion thereof I have. A host cell infected with the recombinant virus may contain a cancer peptide, a portion thereof, or Expresses an antigenic cancer epitope alone or together with at least one immunostimulatory molecule You.   Construction and expression of foreign gene products from recombinant vaccinia virus vectors The method for this is described in Perkus et al., Science 229: 981-984, 1985, Kaufman et al., Int. J. Cancer 4 8: 900-907, 1991, Moss Science 252: 1662, 1991, Smith and Moss BioTechniq ues Nov / Dec, p. 306-312,1984, and U.S. Pat. No. 4,738,846. Have been. Sutter and Moss (Proc. Natl. Acad. Scl. U. S. A. 89: 10847-10851, 1992 ) And Sutter et al. (Virology 1994) find use in the present invention as viral vectors. Non-replicating recombinant ankara virus (MVA, modified vaccinia ankara) ) Are disclosed for construction and use as vectors. Baxby and Paoletti (V accine 10: 8-9, 1992) for use as a viral vector in the present invention. Non-replicating proxies including canary pox virus, fowlpox virus and other bird species Disclosed is the construction and use of proxvirus as a vector.   The vectors of the present invention are suitable for expressing cancer peptides or antigenic cancer epitopes. It can be placed in a suitable host cell. Eukaryotic host cell lines include COS cells, CHO Cells, HeLa cells, NIH / 3T3 cells, insect cells, dendritic cells, etc. Including, but not limited to, indicator cells. In some cases, the host cell Offspring can also be expressed. The host cell has a cancer peptide or antigenic cancer epitope When expressed together with at least one MHC molecule, a eukaryotic expression system may be used. Preferably, appropriate glycosylation is performed. Cancer antigens and immune stings by host cells The expression of both macromolecules allows the MHC restriction peptide required for specific T cells to A suitable signal to T cells is provided to aid antigen recognition and proliferation, or The clonal expansion of antigen-specific T cells is aided. The overall result is an improvement in the immune system. Adjustment. Up-regulation of the immune response kills or inhibits cancer or precancerous growth It is evident by the increase in cancer antigen-specific cytotoxic lymphocytes that can be performed.   DNA can be transfected, transduced, and resected by methods known in the art. Po (Sambrook et al., 1989, "Molecular Cloning A Laboratory Manual ", Cold Spring Harbor press, Plainview, New York). For liposomes, for example, neutral phosphorus, which is a polycationic lipid Complexed with lipid dioleoylphosphatidyl-ethanolamine (DOPE) Dimyristyloxypropyl-3-dimethyl-hydroxyethylammonium ( Cationic lipids such as DMRIE) are preferred; G. Et al., 1992, Hum. Gen e. Ther. 3: 367-275; Nabel, G. J. Et al., 1992, Hum. Gene Ther. 3: 649-656; Stewart, M. J. Et al., 1992 Hum. Gene Ther. 3: 399-410; Nabel, G. J. 1993 Proc. Natl. Acad. Sc i. USA 90: 11307-11311; and Harrison, G. S. 1995 BioTechniques 19: 816-82 3 as disclosed.   Recombinant oncoprotein, tumor antigen or antigenic cancer expressed by host cells Epitopes can be lysed by standard protein purification methods known in the art. Alternatively, it can be purified from the cell supernatant. These include molecular sieves Chromatography, ion exchange chromatography, isoelectric focusing, Electrophoresis, affinity chromatography, HPLC, reverse phase HPLC, etc. Including, but not limited to, Ausubel et al., 1987, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, New York, NY). Immune affinity Chromatography was described herein as an immunoaffinity reagent. For purification using anti-cancer protein antibodies or antigen-binding fragments thereof Can also be used.   Recombinant viruses can also be used as therapeutics or vaccines. Such use About 10 subjectsFiveFrom about 10TenPlaque-forming unit / mammalian mg It is desirable to supply a dose of recombinant virus, but lower or more Higher doses can be administered.   Recombinant viral vectors can be used either prior to evidence of cancer, such as melanoma, or Introduced into mammals to mediate regression of disease in mammals with cancer such as norma can do. As an example of a method for administering a viral vector to a mammal Are exposing cells to the recombinant virus ex vivo, or Injection of recombinant virus into a living tissue or intravenous, subcutaneous, intradermal, intramuscular, etc. Virus throw But not limited thereto. Alternatively, a recombinant viral vector Or a combination of recombinant virus vectors in a suitable pharmaceutically acceptable carrier Can be administered locally by direct injection or local administration to cancerous lesions in You. The amount of recombinant viral vector with the nucleic acid sequence in question depends on the power of the virion. Based on value. The preferred range of immunization is per mammal, preferably per human About 10FiveFrom 10TenVirus particles.   The cancer antigen epitopes of the present invention that are involved in tumor rejection are specifically disclosed herein. It is not limited to that. Using the method disclosed in the present invention, an alternative open read Other cancer antigen epitopes contained in the (Van der Bruggen, P. et al. 1991 Science 254: 1643-47; Gaugle r, B et al. 1994 J. Exp. Med. 179: 921-30; Boel, P.R. Et al. 19951 Immunity. 2: 167-75; Bri chard, V et al. 1993, J. Exp. Med. 178: 489-95; Robbins, P.F. Et al., 1994, Cancer R esearch 54; 3124-26; Kawakami, Y. et al. 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 351 5-19; Coulie, P.G. et al. 1994 J. Exp. Med. 180: 35-42; Bakker, A. et al. Exp.Me d.179: 1005-09), for example, MART-1 / MelanA (Kawakami, et al., J. Exp. Med. .180: 347-352, 1994), MAGE-3 (Gaugler et al., J. Exp. Med. 179: 921-930, 1). 994), gp100 (Kawakami, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6458-6462, 1994), tyrosinase (Brichard et al., J. Exp. Med. 178: 489, 1993), TRP-2, CEA, CA-19-A, A-125, PSA, erb-2 (Boon et al., Ann. Rev. Immunol. 12: 337, 1994).   Tumor penetrating lymphocytes (TILs) from tumor-bearing patients are MHC) recognizes tumor-associated antigens presented by class I molecules. Interlo TIL586 together with Ikin-2 (IL-2) self with metastatic melanoma When injected into the patient of origin, a major objective regression occurred. Recognized by TIL586 The gene encoding the isolated tumor antigen has recently been isolated and encodes gp75 It has been shown. The present invention relates to TIL586, which is not derived from the normal gp75 protein. Of an antigenic peptide, MSLQRQFLR (SEQ ID NO: 9), recognized by And isolation. Instead, this 9-mer peptide is an alternative open source of the same gene Ding frame translation. That is, the gp75 gene has two completely different Polypeptide, ie, Gp as antigen recognized by IgG antibodies in serum from patients with cancer 75 and the 24 amino acid product as a tumor rejection antigen recognized by T cells Code. This is because human tumor rejection antigen encodes a normal protein Normal cellular inheritance using open reading frames other than those used It represents the first demonstration of what can be generated from a child. These findings suggest that tumors Tumor antigens useful as vaccines to induce tumor-specific cell-mediated immunity A new mechanism for generation has been revealed.   The method of ExoIII / S1 deletion analysis shows that the cancer epitope is small in the gp75 gene. Localized to DNA fragment. Cancer epitope on normal gp75 protein I was absent. The cancer peptide of the present invention recognized by TIL586 has a normal Alternative open reading frame for the same gene encoding gp75 protein Derived from the gene product translated from the gene. For nucleotides 294-296 Ability to replace ATG with ATC to stimulate cytokine release from TIL586 A complete loss of force has occurred. Cold-target inhibition experiments show that identified cancer epitopes Compete for T cell recognition by naturally processed peptides present on tumor cells It shows that you can do it. Six T cell clones generated from the TIL586 cell line 586 mel tumor cells, 586 EBV B cells pulsed with this peptide, And normal melanocytes can be recognized in an HLA-A31 restricted manner, and Gene product encoded by the alternative open reading frame It is also suggested that they may be present in normal melanocytes.   The present invention also provides a TRP-encoding tumor antigen recognized by TIL586. 2 which has been shown to encode 2. The present invention also relates to TRP-2. And identification and identification of the antigenic peptide LLGPGRPYR that is active as a cancer vaccine. And isolation.   The present invention provides an alternative open reading encoding a cancer peptide or a portion thereof. A transgene that incorporates one or more copies of the frame DNA sequence into its genome. Provide genic animals. The present invention also provides a TRP-2 tumor antigen or a portion thereof. A chromosome that incorporates one or more copies of a DNA sequence encoding Provide transgenic animals. Common methods for producing transgenic animals , Krimpenf ort et al., U.S. Patent 5,175,384, Leder et al., U.S. Patent 5,175,383, Wagner et al., U.S. Patent 5,175,385; described in Evans et al., U.S. Patent 4,870,009 and Berns U.S. Patent 5,174,986 Have been. Gene incorporation can lead to overexpression of multiple forms or variants of the cancer peptide This results in altered expression or expression. The transgenic animal obtained Useful in studying the development of light cancer or tumor antigens. Animal models for cancer treatment Useful in screening vaccines and chemotherapeutics. Transgenic Animals are also useful in cancer development studies.   The present invention further provides for the immunization of a cancer peptide or antigenic cancer epitope of the present invention. Antibodies or antigen-binding portions thereof. Cancer peptide or antigenicity If the carcinoma pitope consists of only a few amino acids, the cancer peptide or antigenic cancer Pitopes can be conjugated to a carrier protein to elicit an antibody response You. Carrier proteins such as KLH or tetanus toxin and methods of conjugation are known in the art. It is known. Antibodies specific for the cancer peptides and antigenic cancer epitopes of the invention Reacts or binds with it.   Exemplary antibody molecules are intact immunoglobulin molecules, substantially intact immunoglobulins. A phosphorus molecule or a portion thereof of an immunoglobulin molecule containing an antigen binding site , F (ab), F (ab '), F (ab')Two  , A humanized chimeric antibody, and F (V) includes some of the immunoglobulin molecules known in the art. Polyclaw Null or monoclonal antibodies can be made by methods known in the art (Kohl er and Milstein (1975) Nature 256, 495-497; Campbell "Monoclonal Anti body Technology, the Production and Characterization of Rodent and Human  Hybridomas '' in Burdon et al. (Eds.) (1985), `` Laboratory Techniques in Bioch emistry and Molecular Biology, Vol. 13, Elsevier Science Publishers, Musterdam). Antibodies or antigen-binding fragments are produced by genetic engineering. You can also. Techniques for expression of both heavy and light chains are described in PCT Patent Application, Publication numbers WO901443, WO901444, Huse et al. (1989) Science 246: 12 75-1281, and U.S. Pat. No. 4,946,778.   In one embodiment, the antibodies of the invention are used in immunoassays to determine TR Detection of cancer peptide containing P-1 peptide and TRP-2 tumor antigen or a part thereof Out I do. From mammals with cancer using antibodies or antigen-binding fragments thereof Can be detected in a tissue biopsy sample. Evaluation of cancer antigens in diseased tissues Can be used to predict disease progression in mammals or to diagnose the effects of treatment There are cases. Immunoassays include radioimmunoassay, western blot analysis, and immunofluorescence analysis , Enzyme immunoassay, chemiluminescent analysis, immunohistochemical analysis, etc. In vitro, in vivo or in situ. ELISA Standard techniques known in the art for "Methods in Immunodiagnosis", 2nd edition, Rose and Bigazzi eds. John Wiley & Sons, 1980; Campbell et al. "Methods and I mmunology ", W.A. Benjamin, Inc., 1964; and Oellerich, M. 1984, J. Clin. Chem. Clin. Biochem. 22: 895-904. Ha is the conventional method for immunohistochemistry rlow and Lane (eds) (1988), Antibodies A Laboratory Manual, Cold Spri ng Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York; Ausbel et al. (eds) 1987 "Curre nt Protocols in Molecular Biology, ”John Wiley and Sons (New York, NY )It is described in. Biological samples suitable for such detection assays include cells, tissues and cells. Woven biopsy, including whole blood, plasma, serum, sputum, cerebrospinal fluid, pleural fluid, urine, etc. Are not limited to these.   The antibodies and antigen-binding fragments of the invention can also be used in immunotherapy. Antibody Or its antigen-binding fragment prevents the degree, extent or duration of cancer symptoms. Provided to the mammal in an amount sufficient to stop, reduce or attenuate.   All references and patents cited are incorporated herein by reference.   Although the invention has been described above with respect to certain specific embodiments, many variations are possible. And that alternative materials and reagents can be used without departing from the invention. It is understood that In some cases, such transformations and replacements may May require testing, but only includes regular testing.   The above description of certain embodiments fully illuminates the general nature of the invention, and others disclose: By applying current knowledge, such departures can be made without departing from general concepts. Certain aspects can be easily modified and / or adopted for various applications, and Adoption and improvement such as are included within the meaning and equivalent scope of the disclosed embodiment. Is intended.Example 1 Materials and methods Chemicals and reagents   The following chemicals and reagents were purchased from the indicated sources: RPMI 1640, AIM -V medium, Lipofectamine, G418 (GIBCO BRL, Ga itersberg, MD); eukaryotic cell expression vector pCR3 (Invitr Ogen, San Diego, CA); anti-HLA-A31 monoclonal anti- Body (One lamda, Canada Park, CA); Anti-immunoglobulin M antibody conjugated with sothiocyanate (Vect or Laboratories, Inc. , Burlingame, CA). Cytotoxic T lymphocytes (CTL) and cell lineages   TIL586 was isolated from tumor specimens of patients with metastatic melanoma and IL 32-60 days in medium containing -2 (600 OIU / ml) (Chiron) While grown as previously described (Topalian, S., D. Solomo). n, F. P. Avis, A .; E. FIG. Chang, D.C. L. Freesen, W.C. M. Linehan, M .; T. lotze, C.I. N. Robertson, C.I. A. See Seipp, P .; Simon, C .; G. FIG. Simpson and S.M. A. Ros enberg, 1988,J. Clin. Oncol. 6: 839-53). T IL586 is mainly CD8+T cells. TIL1200 is TIL586 Were grown under the same conditions as described for T cell clone is TIL586 Obtained by limiting dilution from cell lines, then 6000 IU / ml IL-2 Expanded in the containing AIM-V medium.   Melanoma cell line 397mel, 397mel / A31,586mel, 6 The 24mel and EBV transformed B cell lines 586 EBV and 1510 EBV were Established in the laboratory, RPMI 164 containing 10% fetal calf serum (FCS) 0 medium. Normal cultured melanosa derived from infant foreskin (NHEM680 purchased from Clonetics, CA) is a melanocyte Cultured in growth medium (MGM; Clonetics, CA). COS7 cell line Toshi W. Courtesy of Dr. Leonard (NIH). GM-CSF secretion assay   DNA transfection and GM-CSF analysis were performed as described above. (Wang, RF, PF Robbins, Y. Kawakami, X . Q. Kang and S.M. A. Rosenberg, 1995,J. Exp. Me d . 181: 799-804). Briefly, DNs containing different fragments A200 μg and 50 ng of HLA-A31 DNA in 100 μl of DMEM Of lipofectamine for 15-45 minutes. DNA / Lipofe The ctamine mixture was then added to COS-7 (5 x 10Four) Incubate with cells overnight I did it. The next day, cells were washed twice with DMEM medium. TIL586 to 1 1x10 in AIM-V medium containing 20 IU / ml IL-2FiveCells / hole Was added. After 18-24 hours of incubation, 100 μl of supernatant The GM-CSF was collected in a standard ELISA assay (R + D System). s, Minneapolis, MN). For the peptide, 586 EBV, 1510 EBV and T2 cells at 37 ° C. with peptide for 90 minutes After incubation, AIM-V containing 120 IU / ml IL-2 Washed three times with medium. Add TIL586 and ink for another 18-24 hours And 100 μl of the supernatant was collected for the GM-CSF assay. ExoIII / SI deletion construction and PCR fragment   To make a series of deletions, the poDNA776 plasmid DNA was replaced with XbaI. Digested with α-phosphorothioate deoxyribonucleotide triphosphate And blocked ExoIII nuclease digestion. pcDNA7 76 plasmid contains a 2.4 kb DNA fragment and CMV to direct transcription. It is a derivative of pcDNA3 vector containing a promoter. Linear exposing the DNA to Xhol digestion with a second restriction enzyme, At one end. ExoIII nuclease / Mung Bean nuclease The deletion was performed according to the manufacturer's instructions (Stratagene, CA). The detailed protocol is as follows:   1. Digest 10 μg of DNA with XbaI and add α-phosphorothioate       Filled with deoxyribonucleotides.   2. After digesting the DNA with the second enzyme XhoI, phenol extraction and       Ethanol precipitation was performed.   3. The DNA pellet was dried and 125 μl of 2 × Exo buffer, 25 μl       Of 100 mM β-mercaptoethanol in 100 μl of water       Was.   4. Once all aliquots have been removed and placed on dry ice,       The tube was heated at 68 ° C. for 15 minutes and then placed on ice.   5. Add 15 U of Mung Bean nuclease to tubes at each time point (1 ×       Mung Bean dilution buffer) and add to 30 ° C.       And incubated for 30 minutes.   6. Added the following:       4 μl of 20% SDS       10 μl of 1 M Tris-HCl, pH 9.5       20 μl of 8M LiCl       250 μl buffer equilibrated phenol: chloroform   7. Vortex sample, spin in microfuge for 1 minute,       Remove the upper aqueous layer, extract with chloroform, and remove the Mung Bean       Protein was extracted from the DNA.   8.25 μl of 3M NaOAc (pH 7.0) was added to the aqueous phase. 10 ng /       tRNA to a final concentration of μl was used as carrier for precipitation.   9.650 μl of cold ethanol was added. Sample on dry ice for 10 minutes       Cooled quickly and spun in a microfuge for 20 minutes.   10. The supernatant was drained and the pellet was washed with 80% ethanol.   11. The pellet was dried.   12. 15 μl of 10 mM Tris-Cl (pH 7.5)         Redissolved in 0.1 mM EDTA. B. Ligation   13. The DNA deletion was ligated using the following conditions.         1.0 μl Exo / Mung treated DNA         2.0 μl of 10 × ligation buffer             500 mM Tris-Cl, pH 7.5             70 mM MgClTwo             10 mM DTT         2.0 μl of 5 mM ATP, pH 7.0-7.5         2.0 μl of T4 DNA ligase (Cat # 60011; kit and         And provided)         13.0 μl of HTwoO         20.0 μl total reaction volume         Incubate at room temperature         DNA ligation key to ligate insert to vector         (Cat # 203003) provided by Stratagene.   14. 7 μl of the remaining 14.0 μl Exo / Mung treated DNA         Used for gel electrophoresis analysis.   15. Using 1 μl of the ligation reaction, 10 μl of Epicuria         transforming E. coli RecA-JM109 or XLI-Blue cells         Converted and plated on LB / AMP plate. C. Low melting point agarose method   To minimize screening for deletions, select some of the deletions using low-melting-point agarose. And excised the band in question and continued ligation. Ligation In the reaction, the agarose concentration was kept below 0.5%.   After performing the PCR reaction at 94 ° C for 2 minutes, the reaction was performed at 94 ° C for 1 minute at 55 ° C. For 45 seconds and 1 minute at 72 ° C. Primer gpN ( 5'AGAATGAGTGCTCTCAAACTCCTCTCTCTGGG) ( SEQ ID NO: 42) and gp11B (5′CATGTGAGAAAAGCTGGTC) CCTCA) (SEQ ID NO: 43) and the DNA fragment (1-667). ) And then cloned into a pCR3 expression vector to create pPCR110 Produced. Plasmids pPCR210 and pPCR220 are Mar gp-1 (5'TGGATATGGCAAGCGC ACAACTC) (SEQ ID NO: 44) and gp11B, gp-1 and gp22 (5'TAAATGG AA ATGTTCTCAAATTGT GGCGTG) (SEQ ID NO: 45) PCR3 vector containing the DNA insert fragment amplified by Was. Cytotoxic lysis assay   Lysis assays were performed as previously described (Kawakami, Y et al., 19 94, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91: 6458-62. ). Briefly, target cells were labeled with chromium for 90 minutes. Wash three times After incubation, the cells were incubated with the peptide at a concentration of 1 μg / ml for 90 minutes. Was. The cells are washed again, counted, and then TIL586 and the effector: target (E: T) at the specified ratio. After 4 hours of incubation, System release was measured. The peptide was synthesized using a peptide synthesizer (Model AMS4). 22, Gilson Co. Solid phase using Worthington, OH) It was synthesized by the method. Some peptides were purified by HPLC and exceeded 98% It had a high purity. Titration of ORF3P peptide recognized by TIL586 For example, 586 EBV B cells were purified with various concentrations of purified ORF3P peptide. Incubated. The percentage of specific lysis is given by the formula: (AB) / (C -B) x100 where A is 586E by TIL586 in the presence of the peptide BV B cell lysis, B in the presence of the same peptide, but with the effector cells Spontaneous release from 586 EBV B cells in the absence of vesicles And C is the maximum chromium release]. Cold target for cell lysis Inhibition as a “hot” target51Cr label 586mel or 624me l as a "cold" target and 586 pulsed peptide This was performed using EBV B and T2 cells. Site-directed mutagenesis   To construct a site-specific mutation, the mutated primer GPMUTI, ( 5'GCCATGGGCAGATATGATCGGGAGGTCTGGCCCT TGCGCTTCTTCAATAGGACATCTCACTGCAAC) (sequence No. 11) and GPA1 were used to mutate to nucleotide 296 (from G to C) A PCR fragment containing was generated. Prime the wild-type DNA fragment Mer GPF1 (5'GAAGATCTGCCATGGGCAGAGATGATC GGGAGTCTCG) (SEQ ID NO: 12), GPE1 (5'GAATTCG) TTG TGT CCTGAGAAATTGCCGTTG) (SEQ ID NO: 13) , GPE2 (5 'GA ATTCGACTATGAGAACCCTCTGGTC ACAGGC) (SEQ ID NO: 14) and GPA1 (5 'AAGATCTGGGC CCGGACAAAGTGGTTCTTTTTC) (SEQ ID NO: 15) is shown in FIG. 3A. Amplified by using as indicated by the arrowhead in the arrow. Purified P The CR product was then cloned into the pCR3 expression vector. PCR fragment All plasmids containing plasmids are sequenced to confirm orientation and nucleotide sequence. I accepted.                                  Example 2             Localization of antigenic peptides recognized by TIL586   To identify an antigenic epitope from gp75, ExoIII / S1 A series of nested deletions of the gp75 gene from the 3 'end using deletions), and additional DNA from gp75 by PCR amplification. A fragment was generated (FIG. 1A). PcDN as starting material for deletion studies A776 was selected because this clone was first used for library screening. Conferred the ability to stimulate cytokine release from TIL586 This is because the. Plasmid pcDNA776 is from American Type C ultra Collection (12301 Parklawn Dri ve, Rockville, MD) according to Budapest Treaty Deposited January 19, 1996 and given accession number ATCC 97423. The purpose of this study was to identify epitopes recognized by TIL586 Rapid localization of epitopes in relatively small DNA fragments So that the shortest possible fragment (instead of the full-length cDNA) Truncated gp75) was used. Next, these deletion constructs were converted to HLA-A3 Transfected into COS-7 cells with the pBK-CMV plasmid containing Transfected (Wang, RF, et al., J. Exp. Med.) . 1 81: 799-804). After 24 hours, the transfected COS-7 cells The cells are examined to determine which constructs stimulate cytokine release by TIL586. It was determined whether it was possible. Nucleotide 2 lacking the normal gp75 start codon Small truncated DNA fragments ranging from 47 to 771 are due to TIL586. Have the ability to stimulate GM-CSF release, which is recognized by TIL586. DNA epitope containing 247 to 771 nucleotides Suggests that it is positioned in the fragment. At nucleotides 445-447 Relatively to the positioned Kozak sequence (GATATGG) (SEQ ID NO: 16) Well related, A was found in the same frame as the gp75 open reading frame. Due to the presence of the TG start codon, the epitope recognized by TIL586 It was deduced to be located in the range from nucleotides 445 to 771. So Therefore, pPCR210 and pPCR220 were constructed, but these were pCR3 expression Initiation code for translation of truncated normal gp75 protein, which is a derivative of the vector Gp75 (GATATGG) (SEQ ID NO: An internal ATG codon was contained in the frame with 16). However, pPCR2 10 or pPCR220, both of COS-7 and HLA-A31 gene When transfection (FIG. 1B), cytokine secretion from TIL586 Does not provide the ability to stimulate, which means that this epitope Suggested to be localized in the stream. Therefore, another plasmid pD776A was constructed. Which contains the nucleotide sequence from 247 to 442 and has a gp75 Did not have an ATG codon in the same frame as It contained two ATG codons in the reading frame. This plasmid is , When co-transfected into COS-7 cells with A31 cDNA, Cytokine release from IL586 was strongly stimulated. genuine starter of gp75 The plasmid pPCR110 containing the Hdon-don was co-simultaneously with the HLA-A31 gene. When transfected (FIG. 1B), the number was higher than pDel5 or pD776A. Stimulated a fold lower cytokine release. These results were confirmed by TIL586. Identified epitope (s) is located in the region of nucleotides 247-442 Suggested to be installed.   This region (nucleotides 247-442) is normal gp75 open reading Did not have an ATG start codon in the G frame, eg, ACG, CTG and Translation initiation from non-ATG codons such as GTG has been reported in some cases (Hann, SR, 1994, Biochimie 76: 880-86; Muralidhar, S.M. J. et al. Virol. 1994, 68: 170-7. 6). To identify epitopes in this region, peptide binding of HLA-A31 Binding motif (a hydrophobic residue at position 2 and a positive charge at the C-terminus) (FIG. 2) (Falk, K et al., I. Immunogenetics 1994, 40: 238-41). This research Most of the peptides selected for were nonamers, but some were 10 And 11-mers. These peptides were transferred to 586 EBV B cells Ability of these cells to stimulate cytokine release by TIL586 (Table 1). One peptide, AACDQRVLIVRR (SEQ ID NO: 2 5) induced GM-CSF release from TIL586 very weakly. But this Of the peptides have a peptide loading of 586 EBV B for lysis by TIL586. No sensitization was possible (Table 1).Table 1 Table 1. Screening of synthetic peptides by reactivity to TIL586   586 EBV cells were incubated with individual peptides at a concentration of 1 μg / ml for 90 minutes. Cubbed. GM-CSF release is peptide loaded 586EB with TIL586 Measured after co-incubation of V cells. TIL586 without stimulants GM-CSF secretion was subtracted. 586EBV expresses HLA-A-31 EBV transformed B cell line. Peptide protein by TIL586 Rused 586 EBV cytotoxic lysates in a 4 hour chromium release assay I did it.   This peptide inks 586 EBV B cells at high concentrations (> 1 μg / ml). Only weakly stimulate cytokine release from TIL586 The target cells were lysed with TIL586 even at a peptide concentration of 0 μg / ml. This peptide was not sensitized for fungi (data not shown), so this peptide was TIL586. Was not likely to correspond to the major T cell epitope recognized by.   To further define the region containing this major T cell epitope, PCR amplified by primer GPF1 and GPE1 and GPE2 Two more plasmids containing the fragment were constructed (FIG. 3A). Figure Contains the ATG start codon at the start of the small PCR fragment, as shown in 3B The two plasmids that carry HLA-A31-associated TIL586 The ability to stimulate the release of antigens, which is an epitope recognized by T cells. Is within the 82 nucleotide sequence from bases 247 to 329 of the gp75 cDNA. Suggested to be loaded. 28 overlapping peptides in ORF1 (overl apping peptides) (9-mer or 10-mer) is replaced with the amino acid sequence of gp75 in this region. Synthesized on a column basis, none of which stimulated GM-CSF release, or 58 6EBV B cells were found not to be sensitized for lysis by TIL586 (Data not shown).                                  Example 3       arising from translation of the alternative open reading frame of the gp75 gene                                Antigenic peptide   The epitope recognized by TIL586 in this small region could not be identified. This suggested that alternative open reading frames could be translated. Two ATG codons that are relatively well related are the gp75 open reading This region in an open reading frame different from the frame (ORF1) ( Nucleotides 247-442) (FIG. 2). First ATG (251GA GATGA257) (SEQ ID NO: 29) encodes 45 amino acids An open reading frame (ORF2) was generated, but with nucleotides 294- ATG (GAC located between 296ATGT) (SEQ ID NO: 30) The issued translation produced a 24 amino acid gene product (ORF3) (FIG. 2). OR HLA was selected by selecting 3 peptides derived from F2 and 2 peptides derived from ORF3. Synthesized based on -A31 binding motif (Table 2 and Figure 2). Surprisingly, ORF3 One peptide MSLQRQFLR (SEQ ID NO: 9) derived from ORF3P (Shown) by TIL586 when pulsed into 586 EBV B cells. Strongly recognized (Table 2). ORF3 peptide by TIL586 (MSLQR QFLR) (SEQ ID NO: 9) was confirmed by the fact that this peptide was autologous 586 EBVB Observed only when pulsed on cells and 1510EBV B (A31 +) cells But observed when the peptide was loaded on T2 (non-HLA-A31) cells However, this means that recognition of this peptide by TIL586 is HLA-A31 restricted. Suggested to be limited. ORF3P peptide mass is mass spectroscopy Confirmed by measurement analysis. As shown in FIG. 4B, TIL586 is ORF3P 586 EBV B cells pulsed with peptide were lysed, but HLA-A31 Associations that meet the criteria for peptide binding motifs but are not recognized by TIL586 EBV B cells pulsed with no peptide, or ORF3P peptide Failed to lyse T2 cells pulsed with. Peptide lysis Sensitization showed the greatest effect at 100 nM, but at 1 nM peptide concentration. In this case, lytic activity was detected (FIG. 4C). TIL586 is the peptide MSLQR QFLRT(SEQ ID NO: 33) or SLQRQFLRT (SEQ ID NO: 34) And a modified peptide derived from MSLQRQFLR (SEQ ID NO: 9) Tide (substitution of anchor residues at positions 2, 6 and 9) MLLQRQFLR (distribution (Column number: 36), MRLQRQFLR (SEQ ID NO: 37), MSLQRLFLR (SEQ ID NO: 38), MSLQRQFLE(SEQ ID NO: 39), MSLQRQF LK(SEQ ID NO: 40) was not recognized (Table 2). TIL586 is a peptide Se by Ala at position 2 compared to MSLQRQFLR (SEQ ID NO: 9) Peptide M with r-substitutionAOnly LQRQFLR (SEQ ID NO: 35) was recognized (Table 2). Table 2. Identification of antigenic peptides by reactivity to TIL586   Peptide incubation and GM-CSF release by 586 EBV B cells The conditions for the assay were the same as those described in Table 1. TIL without stimulants GM-CSF secretion by 586 alone was subtracted. The modified peptide is MSLQRQF By amino acid substitution at positions 2, 6 and 9 for LR (SEQ ID NO: 9) Produced. Cytotoxicity of peptide-pulsed 586 EBV by TIL586 Lytic lysis was performed in a 4 hour chromium release assay.                                  Example 3           Translation is required for production of natural process antigenic peptides   In the 6 nucleotides upstream of the ATG start codon of ORF3 (294-296) Since the located stop codon TAG (288-296) was present (FIG. 2), ORF3P peptide does not appear to have resulted from a frameshift Was. DNA sequence analysis also confirmed that there were no deletions or insertions in this upstream region. Was. The ATG located at nucleotides 294-296 is a 24 amino acid product To find out if it plays an important role in translation, ATGT (294-29 7) From ATCT (294-297) and ORF1 (gp75) Is considered to cause a change from Cys (UGU) to Ser (UCU) Translation of RF3 was eliminated (FIG. 3A). Plasmid containing the mutated gene (p GFMUT1) was cotransfected with HLA-A31 cDNA into COS-7. Tested for its ability to produce recognition by TIL586 when infected . FIG. 3B shows that the mutated gene has a TI as compared to the construct containing the wild-type gene. Demonstrated complete loss of ability to stimulate GM-CSF release by L586 . This observation indicates that the ATG in ORF3 at nucleotide positions 294-296 was Recognized by TIL586 as required for translation of the 24 amino acid product It is important for the generation of T cell epitopes.   Met (ATG) is located at position 1 of the peptide epitope and has nucleotide 29 The ATG to ATC mutation at 4-296 is due to the Me at position 1 of the peptide. TIL586 does not recognize the mutated gene since a change from t to Ile has occurred. The fact is that the mutated peptide has lost the ability to bind to MHC class I molecules. I studied the possibilities that could be considered. Sequence encoded by the mutated gene Synthetic peptide (ISLQRQFLR) having the same amino acid sequence as (SEQ ID NO: 41) was made and tested for recognition by TIL586. Synthetic Mutant Petit Is still recognized by TIL586 at concentrations comparable to wild-type peptide Turned out to be. Furthermore, when the same mutation was introduced into the full-length cDNA, T No reactivity to IL586 was observed, but wild-type cDNA was pPCR1 To stimulate cytokine release from TIL586 at levels similar to 10. I was able to. This is consistent with the deletion data, indicating that TIL586 is not Did not recognize the peptide (s). these The results indicate that the T cells were mutated (from ATG at nucleotides 294-296). Not recognizing ATC) is due to inactivation of ORF3 translation initiation. Suggested.                                  Example 4             Recognition of antigenic peptides on tumor cells and melanocytes   A natural process that is similar or identical to the ORF3P peptide on tumor cells ally processed) Dealing with the problem of whether or not the peptide is recognized by TIL586 586 EBV B cells pulsed with ORF3P peptide Target inhibition assays51Ability to inhibit lysis of Cr-labeled 586mel Inspect the force.51Significant inhibition of lysis of Cr-labeled 586 mel was due to ORF3P peptide. Unrelated markers observed with 586 EBV B cells pulsed with 586 EBV B cells or ORF3P peptide pulsed with peptide Was not observed by the isolated T2 cells (FIG. 5A), indicating that Can topps compete with natural process peptides on tumor cells for T cell recognition? And meant. As expected, ORF3P-loaded 586 EBV B cells had TI TIL1200 does not inhibit lysis of target 624mel by L1200. Gp100 antigen associated with HLA-A2 compared to 586 EBV B alone (Fig. 5B). 586 T cell clone pulsed with ORF3P peptide To determine whether it can recognize both EBV B cells and tumor cell lines To test, T cell clones were diluted by limiting dilution (in a 96-well round bottom microplate). (1 cell / well) from the TIL586 cell line and further in culture. Inflated. T cell clones were made to TIL586 by limiting dilution (1 cell / well). Produced from a cell line. T cell clone containing 6000 IU / ml IL-2 You Were further expanded in AIM-V medium. It was further expanded in culture. 586 EBV B cells were isolated by ORF3P peptide or an unrelated peptide. Pulsed at 7 ° C. for 90 minutes. After three washes, the T cell clone or TI L586 cells were added and co-incubated for an additional 18-24 hours. 586 mel and 397mel / A31+Tumor and melanocyte NHEM680 cells About 1x10FiveCells / wells are designated T cell clone, TIL586, respectively. -C1 (FIG. 6A), TIL586-C4 (FIG. 6B) and TIL586-C6 (FIG. 6C) or 1 × 10 for TIL586 (FIG. 6D)Five18-24 hours with cells Incubated. The GM-CSF assay was performed as shown in FIG. 1B. 6 T cell clones pulsed with 586 mel tumor cells and ORF3P peptide 586 EBV B cells and HLA-A31 positive melanocytes Could be recognized, but 397mel / A31 or 586EBV B cell single I could not recognize Germany. Typical data is shown in FIGS. this The results show that the T cell clones were probably ORFs on tumor cells and normal melanocytes. Suggests recognizing a natural process peptide similar or identical to the 3P peptide Was.   40-45% of gp75 against tyrosinase, gp100 and TRP-2 Peptides recognized by T cell clones due to the presence of amino acid sequence identity Is not derived from gp75 but from any of these other proteins Was tested. Tyrosinase obtained by adding COS-7 cells to HLA-A31; transfected with gp100 or TRP-2 cDNAs respectively Cannot be recognized by the six types of T clones, but HLA- COS-7 transfected with A31 and gp75 cDNA was Found to stimulate GM-CSF release from these clones (data shown). Zu). Computer database search, tyrosinase in the database Known proteins, including gp100 and TRP-2, are HLA-A31 peptides Amino acid sequence having a peptide binding motif and a peptide recognized by TIL586 And no significant similarity to the tide epitope.Example 5 In vivo protection assay   For in vivo protection studies, MHL-A31+Transgenic mau 10FourTrp-1+Subcutaneous challenge with B16 mouse melanoma cells or 5x10FiveTrp-2+Before intravenous challenge with B16 mouse melanoma cells On days 0 and 14, 0, 1 Pg, 1 ng, 1 μg, 1 mg or 100 mg It is immunized intravenously with a cancer peptide (SEQ ID NO: 9). Subcutaneous tumor cells The mice that have received the tumor are observed twice weekly for tumor development and their size is measured. tumor Mice receiving cells intravenously were euthanized on day 12 and the number of lung metastases was determined by Houg. hton, A .; N. 1994,J. Exp. Med. 180: 1 to 40 Measure as stated.                                  Example 6 In vivo treatment assays   For in vivo treatment, MHL-A31 was used to establish lung metastases.+ 1 x 10 transgenic miceFiveOr 5x10FiveTrp-1+B16 Mau Intravenous challenge with melanoma cells. Then, add 10FivePF U / mg body weight of recombinant virus expressing cancer peptide (SEQ ID NO: 9) To seed. Mice were euthanized on day 12 and vaccinated versus unvaccinated mice. The number of lung metastases is determined.                                  Example 7 Cancer antigen-specific T lymphocytes Immunotherapy   T lymphocytes pre-sensitized to melanoma antigens are It is believed to be effective in therapeutic treatment of dairy animals. T lymphocytes from peripheral blood or melanosis And isolated in vitro and cultured in vitro (Kawakami, Y. et al.). , 1988,J. Exp. Med. 168: 2183-2191).   T lymphocytes alone with cancer peptide (SEQ ID NO: 9) at a concentration of 1 μg / ml Or in the presence of IL-2, resensitized and expanded in culture. Cancer pepti T lymphocytes exposed to9-1012Lymphocyte / animal administration I do. These lymphocytes are administered intravenously, intraperitoneally or intralesionally. This action is an example Other treatments such as cytokines, surgical resection of melanoma and chemotherapeutics Can be administered at the same time.                                  Example 8 Treatment of patients with metastatic melanoma   In this protocol, patients with advanced melanoma are Immunize with   Patients who are eligible for this trial will have failed standard effective therapies, Must have evaluable signs of metastatic melanoma. Patient has tumor TPI, as demonstrated by PCR or Northern blot analysis of vesicle RNA Must have a tumor that expresses the -1 antigen.   Patients received 1 ng, 1 μg, 1 mg or 500 mg / kg body weight of the cancer peptide (sequence No .: 6) alone or IL-2 and / or immunization on days 0, 7 and 14 Accept in combination with stimulatory molecules. Patients with regard to toxicity, immunological effects and therapeutic efficacy To evaluate.   Lymphocytes collected from treated patients were analyzed for amino acid sequence MSLQRQFLR (sequence Test for specific response to cancer antigens, including No. 6).   A complete response is complete for all clinical signs of the disease, lasting at least 4 weeks. Defined as vanishing. Partial response is when new lesions appear The product of the vertical diameters of all measurable lesions without or with no lesion growth Overall is a 50% or greater reduction over at least 4 weeks. Mild reactions Vertical of all measurable lesions, with no new lesions appearing or no lesions growing Defined as a 25-49% reduction in overall diameter product. Less than partial response Patients who have are considered unresponsive. New lesions after partial or complete response An over 25% increase in the product of the vertical diameter of the preceding lesion or of the preceding lesion is considered a recurrence.                                  Example 9                        Materials and methods for TRP-2 Chemicals and reagents   The following chemicals and reagents were purchased from designated sources: RPMI 1640, AIM -V medium, Lipofectamine, G418 (GIBCO BRL, Ga itersberg, MD); eukaryotic cell expression vector pCR3 (Invitr Ogen, San Diego, CA); anti-HLA-A31 monoclonal anti- Body (One lamda, Canada Park, CA); Anti-immunoglobulin M antibody conjugated with sothiocyanate (Vect or Laboratories, Inc. , Burlingame, CA) . T cell clones and lineages   T cell clones were obtained from the TIL586 cell line by limiting dilution (1 cell / well). Thus, RPMI 16 containing 10% human AB serum and 500 IU IL-2 Allogeneic PBL (1 x 10ThreeCells / well) . After 12 days, T cell clones were cloned into A containing 6000 IU / ml IL-2. Swelled in IM-V medium. To obtain optimal expansion, S.D. Ri ddell (Walter et al., 1995,N. Engl. J. Med. 333: 1038 to 1044) described above. Easy, 0 days 5x10 in the eyeFour~ 5x10FiveT cells were converted to HLA-A31 PBL (500: 1, PB L: T cell ratio) and 586 EBV B cells (100: 1, EBV: T cell ratio) ) Together with 11% human serum, 30 ng / ml OKT3 antibody and antibiotics Co-cultured in RPMI 1640 (25 ml). On the first day, IL-2 Added at a final concentration of 180 IU / ml. On day 5, the medium was replaced with 11% human serum. And a fresh medium containing 180 IU / ml of IL-2. Next, The land was changed every three days. On days 12-14, T cells are harvested, counted and frozen. saved. TIL586 was isolated from a sample of a patient with metastatic melanoma and As previously described in a medium containing L-2 (6000 IU / ml) (Chiron). Were grown for 32-60 days (Topalian et al., 1988,J. Cli n. Oncol . 6: 839-853). TIL586 is primarily CD8+T thin Vesicles.   Melanoma cell line 397me1, 397mel / A31, 586mel, 6 24mel, 624mel / A31, and EBV transformed B cell lines, 586E BV and 1510EBV have been established in our laboratory and 10% fetal calf serum (FCS ) And cultured in RPMI 1640 medium containing Normal culture derived from infant foreskin Melanosite (purchased from NHEM680, Clonetics, CA) Cultured in cyto growth medium (MOM; Clonetics, CA). COS- The 7 cell line is Dr. W. Provided by Leonard (NIH). GM-CSF secretion assay   DNA transfection and GM-CSF assay are as described above. (Wang et al., 1995,J. Exp. Med. 181: 799-80 4). Briefly, 200 ng of DNA encoding the antigen and HLA-A31D 50 ng of NA is combined with 2 μl of Lipofectamine in 100 ml of DMEM and 1 Mix for 5-45 minutes. The DNA / Lipofectamine mixture was then added to COS-7 (5 x10Four) Added to cells and incubated overnight. The next day, cells were transferred to DMEM medium Was washed twice. TIL586 contains 120 IU / ml IL-2 1x10 in AIM-V mediumFiveAdded at a cell / well concentration. T cell clone Then 1-2x10FourOnly cells / wells were added. Incubate for 18-24 hours After that, 100 μl of the supernatant was recovered, and GM-CSF was added to the standard ELISA. Measurements were made on R (D + D Systems, Minneapolis, MN). To test for peptide recognition, 586 EBV or T2 cells were incubated at 37 ° C. Incubate with peptide for 90 minutes, then 120 IU / ml IL-2 Was washed three times with AIM-V medium containing Add T cells and add 18- After incubating for 24 hours, 100 μl of the supernatant was subjected to GM-CSF assay. Collected for ExoIII / SI deletion construction and subcloning   TRP-2 cDNA is available from Dr. Shibahara's Gift (Yokoyama Et al., 1994,Biochim. Biophys. Acta, 1217: 317 321), which is pCR3 vector together with the CMV promoter for expression. Subcloned in the To create a series of deletions, TRP-2cD The plasmid pCR3 containing NA was digested with XbaI and α-phosphor Filled with thioate deoxyribonucleotide triphosphate, ExoIII Clease digestion was blocked. Subjecting the linear DNA to a second restriction digestion , One end sensitive to ExoIII was generated. ExoIII nuclease / Mun gBean nuclease deletion was performed according to the manufacturer's instructions (Stratagene, CA). It was performed according to. All deletion constructs were sequenced and the DNA sequence removed. Determined the position of the column. The pTA plasmid contains A from the 3 'end of the TRP-2 gene. A derivative of pCR3-TRP-2, wherein the paI DNA fragment has been deleted. Was. Remove the KpnI DNA fragment from the 3 'end of the TRP-2 gene After that, pTK was made. pTP was deleted and relaunched with the internal PstI fragment. Generated by irrigation. Northern blot analysis   Total RNA by guanidine isothiocyanate / cesium chloride centrifugation Was isolated. Total RNA from human normal tissues was purchased from Clontech, CA. Was. Electricity in 20% of total RNA in 1.2% agarose formaldehyde gel After electrophoresis, this was transferred onto a nylon membrane. 2.0k of TRP-2 gene b DNA fragments are prepared by random priming32With P-α-CTP Labeled. Pre-hybridization and hybridization Performed according to the kHyb protocol (Stratagene). At room temperature Twice with 2 × SSC / 0.1% SDS for 15 minutes at 60 ° C. for 30 minutes Was washed twice with 0.1X SSC / 0.1% SDS. Autoradiograph At -70 ° C. Cytotoxicity assay   Lysis was performed using Calcein AM (Molecular Probes, Euge). ne, OR). Briefly, T2 cells or 586 EBV B cells Cells were pulsed with the peptide in RPMI 1640/5% FCS for 90 minutes. Tumor Vesicles and peptide-pulsed EBV B cells were converted to Calcein AM (1 × 1 0637 ° C. with 15 μl of 1 mg / ml Calcein AM per cell) For 30 minutes. After the incubation, the cells were washed with AIM V / 12 Washed 3 times with 0IU IL-2. 1x10ThreeT cells as target cells Mixed in various E: T ratios. After 4 hours incubation at 37 ° C , Bovine hemoglobin quenching solution containing 5 μl ethidium bromide in quench solution). Read plate by Lambda scan I took it. The percentage of lysis is calculated by the following formula: [1- (AB) / (CB)] × 100 [where A is the reading of non-lysed cells in the presence of T cells and B is the background count. And C is the maximum signal value from the target cell]. Was.   The peptide was synthesized using a peptide synthesizer (Model AMS 422, Gils). on Co. on. By solid-phase method using Worthington, OH) did. Several peptides were purified by HPLC, which were more than 98% pure. Had a degree. Confirm peptide mass of several peptides by mass spectrometry analysis did.                                 Example 10             Recognition of new antigens on tumor cells by CTL clone   In a previous study, we determined from the TIL586 cell line by limiting dilution. Many T cell clones have been isolated (Wang et al., 1996b, J. Exp. M). ed. 183: 1131-1140). Among these, six types of clones Gene production translated from alternative open readings of the RP-1 / gp75 gene 586 EBV B cells pulsed with ORF3P peptide from Recognized 586 mel tumor cells of origin but pulsed with an unrelated peptide 586 EBV B cells were not recognized. As shown in FIG. TIL586-C1 was selected as one representative of the loan. But the same TIL Some T cell clones isolated from the 586 cell line have the TRP-1 peptide 586 EBV B cells pulsed with ORF3P also produced TRP-1 and HLA-A3 COS cells transfected with 1 cDNA also did not recognize, 586 mel and HLA-A31 + melanocytes could be recognized (Fig. 7). These results indicate that these T cell clones were not attached to 586 mel tumor cells. It suggested that it would recognize additional tumor antigens. Next, these T cell clones were expanded. With respect to recognition by the method described in the Materials and Methods section (Example 9), the cD To screen NA libraries or to test other cDNAs Enough cells were obtained. One type of clone, CTL clone 4, is described below. It was successfully inflated and used for other studies.                                 Example 11     Identification of cDNA encoding tumor antigen recognized by T cell clone   To determine the HLA molecule responsible for presenting the antigen to CTL clone 4, For example, HLA- in A31 negative tumor lines such as 397mel and 624mel. Transfect A31 cDNA and test for recognition by CTL clone Tested. Transfection of 397 mel and 624 mel expressing HLA-A31 The transfectant was significantly recognized by CTL clone 4. 3). Furthermore, these T cells are HLA-A31 positive allogeneic tumor line 1353me l can be recognized, indicating that tumor antigen is recognized by CTL clone 4. HLA-A31 restricted. Table 3. Specific secretion of GM-CSF by CTL clone 4       HLA-A31 restricted2x10FourCTL clone 4 cells were transformed into melanoma cell line or HLA-A31c 24 h incubation with COS-7 transfected with DNA After the GM-CSF, the GM-CSF in the supernatant was measured.   Since only a limited number of T cells were available, these T cells were identified in advance. Tumor antigen or melanocyte lineage differentiation protein (melanocyte-lineage diff erentiation protein). HLA-A31cD NA and MART-1 (Kawakami et al., 1994a,Proc. Natl . Acad. Sci. USA , 91: 3515-3519), gp75 (Wan g et al., 1995,J. Exp. Med. 181: 799-804), gp100 (Kawakami et al., 1994b,Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 91: 6458-6462), tyrosinase (Brichard et al., 1). 993J. Exp. Med. 178: 489-495), p1S (Robbi) ns et al., 1995,J. Immunol. 154: 5944-5950) and T RP-2 (Yokoyama et al., 1994,Biochim. Biophys. Acta , 1217: 317-321; Bouchard et al., 1994,Eur . J. Biochem. 219: 127-134), known tumor antigens or Is the COS transfected with the gene encoding the putative antigen -7 cells were tested for recognition by CTL clone 4. HLA-A31 only or COS cells transfected with TRP-2 alone become T cell clones Did not cause any recognition. However, both HLA-A31 and TRP-2 cDNA Transfected COS cells stimulate GM-CSF release from T cells However, COS transfected with HLA-A31 and other genes The cells did not stimulate, indicating that T cell clone 4 had T cells in an HLA-A31 restricted fashion. This shows that RP-2 was recognized as a tumor antigen.   HLA-A3, A11, A31, A33 and A68 and their peptide binding modules Analysis of the structural similarity with the chief revealed the A3-like supermotif (A3-like supermotif).  motif) (Sidney et al., 1996,Human Im munol . 45: 79-93). A single epitope peptide is available in the general population (general  HLA-A3, A11, A expressed cumulatively in about 40 to 50% of It could cross react with 31, A33 and A68 molecules. Hepatitis B virus The same peptide epitope derived from the nucleocapsid protein is HLA-A 31 and the corresponding HLA-A31 or -A68 Limit Has been reported to be recognized by CTR (Missal et al., 1993). ,J. Exp. Med. 177: 751-762). HLA-A31 restricted T cells Is TRP-1 and T when pulsed on HLA-A3 positive EBV B cells It was tested whether it recognizes the RP-2 epitope. Interestingly, T cells Weak recognition was detected based on GM-CSF release from. However, HLA-A No recognition of 3 positive tumor cells was detected.                                 Example 12 Expression of TRP-2 gene   A probe for evaluating the expression pattern of TRP-2 in various tissues Northern blot analysis was performed using TRP-2 cDNA. Normal net The membrane tissue was the only positive for TRP-2 expression among the normal human tissues tested. It turned out to be. TRP-2 in melanoma cell lines and other cell lines Are listed in Table 4 below. 2 of 30 melanoma cell lines Five cell lines were found to express TRP-2. Burkitt B cells The lineage Daudi and the breast cancer cell line MDA231 are consistent with previous results. Was negative (Bouchard et al., 1994,Eur. J. Biochem . 219: 127-134). Therefore, tyrosinase, TRP-1, gp1 00 and MART-1, the expression pattern of this gene was melanoma, normal It appears to be restricted to melanocyte cell lines and retina.Table 4: Expression of TRP-2 in various cell lines and human tissues tested   Expression of TRP-2 was determined by Northern blot analysis from 10-20 g total RNA. And probed with a TRP-2 cDNA fragment. D Audi is a Berkitt B cell line, and MDA231 is a breast cancer cell line. is there.                                 Example 13                 Peptide epitope recognized by T cells   To determine the antigenic epitope from TRP-2, ExoIII / S1 Using creatase and a DNA fragment encoding the truncated form of TRP-2 A series of stacked deletions of the TRP-2 gene was generated from the 3 'end. These deletions The body and the subcloned construct were constructed using pBK-C containing the HLA-A31 cDNA. It was transfected into COS-7 cells with the MV plasmid. Troff Of the detected COS cells by the CTL clone Was tested by measuring GM-CSF cytokine release. FIG. TD1, 2 and 3 constructs stimulate cytokine release from CTL clone 4 PTD4 and pTD5 have stimulatory activity against CTL clone 4 Lost, which is an epitope recognized by CTL clone 4. (S) located in the region of nucleotides 836 to 1045 Meant. This was consistent with the results obtained from subcloning experiments . pTA and pTP are capable of stimulating cytokine release from CTL clone 4 But pTK still positive in cytokine release assay . Therefore, these epitopes, as shown in FIG. Present in DNA fragments flanked by nI sites.   Identify the epitope from the coding region of this small DNA fragment Therefore, five types of synthetic peptides are synthesized peptide binding motifs of HLA-A31 ( (A hydrophobic residue at position 2 and a positively charged residue at position 9). (Rammensee et al., 1995,Immunogenetics, 4 1: 178-228). These peptides were pulsed onto 586 EBV B cells. Tested for their ability to stimulate cytokine release by CTL clone 4. Tested. As shown in Table 5, the peptide TRP197 ~ 205Is a 586 EBV B cell When pulsed up, it was strongly recognized by CTL clone 4. CTL Recognition of this peptide by clone 4 allows the peptide to be identified as, for example, 586 EBV. And pulsed on HLA-A31 + EBV B cells, such as 1510 EBV And only when pulsed on HLA-A31 negative T2 cells. Was not. CTL clone 4 is an alternative open reading of the TRP-1 gene The ORF3P peptide derived from the frame was not recognized. These results show that T IL586-Cl specifically recognizes the ORF3P peptide derived from TRP-1, It was demonstrated that TL clone 4 specifically recognizes a TRP2-derived peptide. O Both RF3P and TRP2-p197 are presented to T cells by the HLA-A31 molecule. When indicated, no cross-reactivity was observed. Table 5. Identification of synthetic peptides reactive to T cell clones   586 EBV cells were incubated with individual peptides at concentrations of 1-g / ml for 90 minutes. Cubbed. Peptide-loaded 586 EBV cells were isolated from TRP-1 or TRP-2. After co-incubation with a T cell clone that recognizes M-CSF release was measured. GM-CSF secretion by only T cells without stimulator Was deducted. 586 EBV and 1510 EBV are EBVs expressing HLA-A31 It was a transformed B cell line.                                 Example 14                      TRP197-205Peptide characterization   Titration experiments showed that 1 nM peptide released GM-CSF from T cell clone 4. Is sufficient to stimulate, and this stimulus has reached a plateau at 500 nM. (FIG. 10A). TRP197-205586 EBV pulsed Lysis of B cells by CTL clone 4 was also measured at various peptide concentrations (Fig. 10B) Targeted by CTL clone 4 as in cytokine release assay Lysis of cut cells was detected at 1 nM peptide concentration. Maximum lysis is 100n M was found at a peptide concentration of M. CTL clone 4 contains TRP2-p197 Pulsed 586 EBV and 586 mel tumor cells at low E: T ratio Also lysed, but were pulsed alone or with the control peptide ORF3P. 586 EBV B cells as well as HLA-A31 negative 397 mel line (Fig. 10).   Most of the human melanoma antigens identified to date are non-mutated autoantigens, T cell recognition and binding affinity of these self-peptides to the corresponding MHC molecules Nity is improved in some cases by substitution of amino acids at anchor residues Have been. Many synthetic peptides, including 8-mers or 10-mers, and are listed in Table 6 And CT when pulsed into 586 EBV B cells Tested for recognition by L clone 4. TRP197-2051 at the N-terminus of A 10-mer TLLGPGRPYR with extended amino acids is 586 EBV B When pulsed into cells, still recognized by CTL clone 4, but not reactive Was about 60% of the overlapping 9-mer LLGPGRPYR. HLA-A31 binding mode Based on the chief, amino acid positions at anchor residue positions 2 and 9 and other positions The exchange produced some modified peptides. Arg residue at position 9 at the C-terminus Can be replaced by a Lys residue, the modified peptide being the parent peptide Retained at least 60% of its activity. Ser of the Leu residue at position 2, Substitution by an Ile or Val residue maintained the same activity, or Although the activity was reduced to 60%, substitution at this position by Ala or Phe The ability to stimulate cytokine release from T cells was reduced (Table 6). Other qualifications Resulted in variable cancer peptide activity in T cell recognition. Table 6. Comparison of T cell reactivity of modified peptides  586 EBV cells for 90 minutes with individual peptides at concentrations of 0.5-g / ml Incubated. Peptide-loaded 586 EBV cells were converted to CTL clone 4 cells. GM-CSF release was measured after co-incubation with Stimulator GM-CSF secretion by T cells alone without was subtracted. 586 EBV is HLA- EBV-transformed B cell line expressing A31.   The TRP-2 protein has two putative copper binding sites, a cysteine-rich region, And a transmembrane domain. Human TRP-2 maps to chromosome 13 The mouse counterpart is the coat color mutation on chromosome 14. , Slaty area. TRP-2 and Tyrosiner There is about 40% amino acid sequence identity between the enzyme and TRP-1 / gp75. Recognizes common peptide epitopes between the tyrosinase protein families No CTL line or clone has been found to date.   9-mer TRP recognized by CTL clone 4197-205Peptide is TRP -2 is located at one of the copper binding sites in the coding region. This pep Tide was compared to other peptides, including the modified peptides tested in this study, by T-cells. Cytokine release from vesicles was most effectively stimulated. This means that in position 2 Predicted that Leu and Arg at position 9 are preferred residues. HLA-A31 binding motif. Leu at position 2 and position 9 Are the Ile and Ser at position 2 and the Ly at position 9, respectively. with little or no loss of reactivity to T cell recognition. The amino acid substitution at position 1, 3 or 6 can be Dried losses occurred.                                 Example 15 In vivo treatment assays   For in vivo treatment, MHL-A31 was used to establish lung metastases.+ 1 x 10 transgenic miceFiveOr 5x10FiveTrp-1+B16 Mau Intravenous challenge with melanoma cells. Then, add 10FivePF U / mg body weight of recombinant virus expressing oncopeptide LLPGGRPYR Immunize. Mice were euthanized on day 12 and vaccinated vs. non-vaccinated The number of lung metastases in the mice is determined.                                 Example 16 Cancer antigen-specific T lymphocytes Immunotherapy   T lymphocytes pre-sensitized to melanoma antigens are It is believed to be effective in therapeutic treatment of dairy animals. T lymphocytes from peripheral blood or melanosis Isolated from the suspension and cultured in vitro (Kawakami, et al., 1). 988,J. Exp. Med. 168: 2183-2191).   T lymphocytes were added to the cancer peptide, LLGPGRPYR, at a concentration of 1 μg / ml. Exposure alone or in the presence of IL-2, resensitize, and expand in culture. Cancer Approximately 10 T lymphocytes exposed to the peptide9-1012Lymphocytes / feeding Administration. These lymphocytes are administered intravenously, intraperitoneally or intralesionally. this Treatments include, for example, cytokines, surgical resection of melanoma injuries, and chemotherapeutic agents. Can be administered simultaneously with other therapeutic treatments.                                 Example 17 Treatment of patients with metastatic melanoma   In this protocol, patients with advanced melanoma are identified as antigenic cancer epitopes. For immunization.   Patients who are eligible for this trial will have failed standard effective therapy, be measurable or Must have evaluable signs of metastatic melanoma. The patient has tumor cells RN TPI-2 antigen as demonstrated by PCR or Northern blot analysis of A Must have a tumor that expresses   Patients received 1 ng, 1 μg, 1 mg or 500 mg / kg body weight of cancer peptide, LL GPGRPYR alone or on day 0, 7 and 14 or IL-2 and / or Intravenous reception in combination with co-immunostimulatory molecules I do. Patients are evaluated for toxicity, immunological effects and therapeutic efficacy.   Lymphocytes collected from treated patients were analyzed for amino acid sequence, LLGPGRPYR. Test for specific response to cancer antigens.   A complete response is associated with the disappearance of any clinical signs of the disease, lasting at least 4 weeks. Is defined as A partial response is the absence of new lesions or no increase in lesions. The total product of the vertical diameters of all measurable lesions over a period of at least 4 weeks. That is a reduction of more than 50%. Mild response indicates no new lesions or no lesions 25-49% of the total product of the vertical diameters of all measurable lesions without any increase Is defined as the decrease of Patients with less than a partial response are considered unresponsive . Appearance of a new lesion or product of the vertical diameter of the preceding lesion after a partial or complete response Over 25% is considered a relapse.                                   Consideration   Such as tyrosinase, MART-1 / Melan-A and gp100 Normal open reading of the corresponding non-mutated shared melanoma antigen Several Antigenic T Cell Epitopes Derived from the Reading Frame have been Identified . In this study, the antigenic peptide recognized by TIL586 was identified as gp75. It was demonstrated that it was derived from the second gene product of the gene. As far as we know, this Results from the translation of overlapping open reading frames of the same gene by T cells The first example of recognizing an antigenic peptide and two completely different proteins Whether the quality and / or peptide is an overlapping open reading frame of a single cell gene It is the only example in eukaryotic cells that can be translated from. gp75 ORF3 of the gene encodes a short protein of 24 amino acids. TIL586 The antigenic peptide recognized by the alternative open reading frame A Coded by a sequence positioned immediately after the TG (294-296) start codon Is done. gp75 is 40- to tyrosinase, gp100 and TRP-2. Although having 45% sequence homology, HLA-A31 and tyrosin in COS-7 cells Co-transfection with Nase, gp100 or TRP-2 cDNA, respectively Stimulates GM-CSF release from TIL586-derived T cell clones. And couldn't. Database search was performed for HLA-A31 peptide binding motivation. And a peptide recognized by TIL586 and a T cell clone derived therefrom. Identify proteins with significant sequence homology to epitopes Was. In addition, previous studies have shown that melanoma transfectants (gp75+ / A3 1+) Gave the ability to stimulate GM-CSF release from TIL586, but gp 75 melanoma transfectants (gp75-/ A31+Did not give (Wang, RF, et al., 1995,J. Exp. Med. 181 : 799-804). Other melanoma cell lines (gp75-/ A31+By) Also obtained similar results. ORF3P peptide was identified from the gp75 gene It is the only epitope and is identified by six T cell clones derived from TIL586. Recognized, this peptide can be used in natural processes on tumor cells or melanocytes. It is considered to be the same or similar to the peptide. This means that this peptide Since the natural peptide above could compete with T cell recognition, This was further supported by target inhibition experiments.   Mutated adenomatous polyposis coli (APC) gene frame in colon cancer BALB / c mice vaccinated with T cell epitope peptide derived from shift Is recognized by the CTL obtained from (Townsend, A. Et al., 1994, Nature, 371: 662). The results in FIG. ATG at Tides 294-296 Required for Translation of 24 Amino Acid Product The 24 amino acid product is then converted to an antigenic peptide recognized by TIL586. Processing. TIL586 pallets 586 EBV B cells HLA-A31 in COS-7 cells When co-transfected with cDNA, the mutant gene is not recognized This means that the loss of recognition of the mutated (ATG to ATC) gene by TIL586 This was due to lack of translation of the ORF3 product. In addition to DNA sequence analysis These results indicate that the antigenic peptide recognized by TIL586 is gp75 From the frameshift product. Therefore, multiple pep Tides or proteins are often duplicated open reading frames of a single eukaryotic gene. Translations, but no means are available to detect these alternative products. It is thought that it was difficult. Sensitivity of T cells to detect natural process peptides Sensitivity can reveal many other examples of this phenomenon.   Duplicate open reading frame 3 (ORF3) translated in vivo The mechanism involved is currently unknown. Starting at more than one AUG codon, In rare cases, both AUG codons and non-AUG codons such as CUG Some of the cellular mRNAs that form the same sequence N-terminally extended starting at Examples have been reported, overlapping open readings from single eukaryotic mRNA The use of frames (ie, translating two completely different peptides) has been As far as has not been said. Of overlapping reading frames from single-mRNA Some examples of translation are described, but are exclusively restricted to viral genes. You. Detection of products of overlapping open reading frames in viral genes This was possible due to the presence of reactive antibodies in the sera of virus-infected hosts. The present invention Now, an epitope peptide recognized by T cells using a T cell assay Was identified. This approach combines conventional Western blot or immunoprecipitation analysis. Are quite different and more sensitive than these analyses. Authentic start codon and ORF3 There are 5 ATG codons between the start codon and ORF1 (gp75 ) And the construct pPCR1 covering the complete ORF2 and ORF3 10 (nucleotides 1 to 667) stimulates cytokine release from TIL586 Still have the ability to However, the level of stimulus is 5 'truncated of gp75 (first Several times lower than the level of stimulation due to the deletion of 246 nucleotides (Figs. This suggests that the upstream ATG codon partially inhibited ORF3 expression. Suggested that Several factors affect the expression of the ORF3 product in this system It is possible to detect. First, preceding the ATG start codon of ORF3 Upstream ATG codons do not appear to be optimally related, Downstream A as start codon by a leaky scanning model It is believed that it allows the use of TGs. Second, transfection in COS-7 cells Relatively high expression of the targeted gene and T cell uptake as an extremely sensitive means. It is believed that the effectiveness of the sey permits the detection of very low levels of translation product.   Interestingly, the ORF3 product was expressed in tumor cells as well as in normal melanocytes. The cells were detected by the cells (FIGS. 6A-6D), indicating that ORF3 protein was Not a gene product due to genetic alteration in the cell Strongly suggested. In previous studies, TIL586 was tested on multiple tumor cell lines. To (gp75+/ A31+) Was recognized, indicating that TIL586 was non- Recognition of a mutation-sharing tumor antigen was suggested (Wang RF, et al., Supra). . The gp75 gene is found in melanoma based on Northern blot and PCR analysis. It is highly expressed (Wang RF et al., Supra) and its gene product gp75 Protein is the most abundant intracellular glycoprotein expressed on melanoma cells and melanocytes (Tai, T., Eisinger, M., Ogata, S. et al.) And Lloyd, K .; O. 1983, Cancer Res. 43: 2773 -2779; Thomson, T .; N. Mattes, J .; M. , Roux, L. , Old, L .; J. And Lloyed, K .; O. 1985, J. Am. Inves t. Dermat. 85: 169-174; Thomson, T .; N. , Rea 1, F. X. , Mutakami, S .; , Cordon-cardo, C .; , O ld, L .; J. And Houghton, A .; N. 1988, J.A. Invest. Dermat. 90, 459-466), and T cell clones were 586 EBV B cells. Vesicle (A31+), Melanoma (gp75+/ A31+) And A31+On Lanocite Recognized ORF3P peptide when pulsed to+/ A31+Me O when pulsed on ranoma cells or on non-A31 T2 cells It is not surprising that they did not recognize RF3P. Between tumor cells and melanocytes Another possibility to explain peptide expression in GFP75 is that Generated by alternative splicing of different promoters Can be translated from another mRNA transcript or transcripts It is. To our knowledge, the mRNs generated by alternative splicing The A transcript is an isoform protein using the same open reading frame. Translated into quality. However, in the case of the present invention, another transcript is generated and translated. Open readin completely different from gp75 even when used as a template for Frame was used for translation of the ORF3 product. ORF3 in vivo Further experiments are needed to elucidate the mechanism of protein translation. But also Nevertheless, the possibilities described above are not mutually exclusive.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 45/08 A61K 45/08 48/00 48/00 C07K 14/47 C07K 14/47 16/18 16/18 C12N 5/10 C12N 7/00 7/00 C12P 21/02 C C12P 21/02 C12Q 1/68 A C12Q 1/68 G01N 33/531 A G01N 33/531 C12N 5/00 B //(C12P 21/02 C12R 1:91) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(KE,LS,MW,SD,S Z,UG),UA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD ,RU,TJ,TM),AL,AM,AT,AU,AZ ,BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN, CU,CZ,DE,DK,EE,ES,FI,GB,G E,HU,IL,IS,JP,KE,KG,KP,KR ,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU,LV, MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ,P L,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI,SK ,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,UZ,VN, YU (72)発明者 ローゼンバーグ,スティーブン・エイ アメリカ合衆国メリーランド州20854,ポ トマック,アイロン・ゲイト・ロード 10104──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) A61K 45/08 A61K 45/08 48/00 48/00 C07K 14/47 C07K 14/47 16/18 16 / 18 C12N 5/10 C12N 7/00 7/00 C12P 21/02 C C12P 21/02 C12Q 1/68 A C12Q 1/68 G01N 33/531 A G01N 33/531 C12N 5/00 B // (C12P 21 / 02 C12R 1:91) (81) Designated countries EP (AT, BE, CH, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), OA (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, ML, MR, NE, SN, TD, TG), AP (KE, LS, MW, SD, SZ, UG), UA (AM, AZ, BY, G, KZ, MD, RU, TJ, TM), AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, CA, CH, CN, CU, CZ, DE, DK, EE, ES , FI, GB, GE, HU, IL, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, TJ, TM, TR, TT, UA, UG, UZ, VN, YU (72) Inventor Rosenberg, Stephen A. Iron Gate Road, Potomac, 20854, Maryland, USA 10104

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1. 同一の遺伝子からの正常のタンパク質またはペプチドをコードするオー プンリーディングフレーム配列以外の遺伝子からの代替オープンリーディングフ レーム核酸配列によってコードされる癌ペプチド、その一部または誘導体。 2. 癌ペプチドがMHC制限Tリンパ球によって免疫学的に認識される、請 求の範囲第1項に記載の癌ペプチド、その一部または誘導体。 3. Tリンパ球がMHCクラスI制限されている、請求の範囲第1項に記載 の癌ペプチド、その一部または誘導体。 4. 癌ペプチドが、非ホドキンのリンパ腫、白血病、ホドキンのリンパ腫、 肺癌、肝臓癌、転移癌、メラノーマ、アデノカルチノーマ、胸腺腫、結腸癌、子 宮癌、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、頸部癌、膀胱癌、腎臓癌、膵臓癌およびサルコ ーマから成る群から選択される癌から誘導される、請求の範囲第1項に記載の癌 ペプチド、その一部または誘導体。 5. 代替オープンリーディングフレーム核酸配列がTRP−1遺伝子からの ものである、請求の範囲第1項に記載の癌ペプチド、その一部または誘導体。 6. 癌ペプチドが腫瘍関連抗原から由来する、請求の範囲第1項に記載の癌 ペプチド、その一部または誘導体。 7. 腫瘍関連抗原が、胎児腫瘍性抗原、MART−1、Mage−1、Ma ge−3、gp100、チロシナーゼ、CEA、PSA、CA−171A、CA −19A、CA−125、erb−2、P−15およびβ−ガラクトシダーゼか ら成る群から選択される、請求の範囲第1項に記載の癌ペプチド、その一部また は誘導体。 8. 核酸配列が、配列番号5として図2に記載したORF3、その一部また は変異体を含む、請求の範囲第1項に記載の癌ペプチド、その一部または誘導体 。 9. 代替オープンリーディングフレーム核酸配列が、 ATGTCACTGCAACGGCAATTTCTCAGG(配列番号10)ま たはその一部または変異体を含む、請求の範囲第1項に記載の癌ペプチド、その 一部または誘導体。 10. 癌ペプチドが、アミノ酸配列: MXaaLQRQFLRTQLWDVPSWLERSCL(配列番号7)、およ びそのフラグメントまたは誘導体(式中、Xaa=SerまたはAla)を含む 、請求の範囲第1項に記載の癌ペプチド、その一部または誘導体。 11. 癌ペプチドが、アミノ酸配列: MSLQRQFLR(配列番号9)、そのフラグメントまたは誘導体を含む、請 求の範囲第1項に記載の癌ペプチド、その一部または誘導体。 12. 配列番号47を含むアミノ酸配列またはそのフラグメントまたは変異 体を有する単離された腫瘍抗原。 13. 少なくとも配列番号46のフラグメントを含む核酸配列またはその変 異体によってコードされる単離された腫瘍抗原。 14. 腫瘍抗原がMHC制限Tリンパ球によって免疫学的に認識される癌ペ プチドである、請求の範囲第12項に記載の腫瘍抗原。 15. Tリンパ球がHLA−A31制限されている、請求の範囲第14項に 記載の腫瘍抗原。 16. 腫瘍抗原が、非ホドキンのリンパ腫、白血病、ホドキンのリンパ腫、 肺癌、肝臓癌、転移癌、メラノーマ、アデノカルチノーマ、胸腺腫、結腸癌、子 宮癌、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、頸部癌、膀胱癌、腎臓癌、膵臓癌およびサルコ ーマから成る群から選択される癌から誘導される、請求の範囲第12項に記載の 腫瘍抗原。 17. 腫瘍抗原が配列番号49から配列番号59から成る群から選択される 癌ペプチドである、請求の範囲第12項に記載の腫瘍抗原。 18. 核酸配列:TTATTAGGACCAGGACGCCCCTACAG Gまたはその一部または変異体をさらに含む、請求の範囲第13項に記載の腫瘍 抗原。 19. 腫瘍抗原がアミノ酸配列: X1LLGPGRPYRX2およびその変異体(式中、X1およびX2は同一または 異なり各々1以上のアミノ酸である)を含む癌ペプチドである、請求の範囲第1 2項に記載の腫瘍抗原。 20. 腫瘍抗原がアミノ酸配列: LLGPGRPYRまたはその変異体を含む癌ペプチドである、請求の範囲第1 2項に記載の腫瘍抗原。 21. 請求の範囲第1項から第19項または第20項に記載の癌ペプチド、 腫瘍抗原、その一部または誘導体並びに薬学的に許容できる担体を含む医薬組成 物。 22. 請求の範囲第1項から第19項または第20項に記載の癌ペプチド、 腫瘍抗原、その一部または誘導体を単独または少なくとも1つの免疫刺激分子と 一緒に含む免疫原。 23. 免疫刺激分子がMHC分子である、請求の範囲第22項に記載の免疫 原。 24. 同一の遺伝子からの正常のタンパク質またはペプチドをコードするオ ープンリーディングフレーム配列以外の遺伝子からの癌ペプチド、その一部また は誘導体をコードする代替オープンリーディングフレーム核酸配列を含む、単離 された核酸配列。 25. 癌ペプチドが、非ホドキンのリンパ腫、白血病、ホドキンのリンパ腫 、肺癌、肝臓癌、転移癌、メラノーマ、アデノカルチノーマ、胸腺腫、結腸癌、 子宮癌、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、頸部癌、膀胱癌、腎臓癌、膵臓癌およびサル コーマから成る群から選択される癌から誘導される、請求の範囲第24項に記載 の単離された核酸配列。 26. 遺伝子がTRP−1遺伝子である、請求の範囲第24項に記載の単離 された核酸配列。 27. 核酸配列が、配列番号5として図2に記載したORF3、その一部ま たは変異体を含む、請求の範囲第24項に記載の単離された核酸配列。 28. 核酸配列が、 ATGTCACTGCAACGGCAATTTCTCAGG(配列番号10)ま たはその一部または変異体を含む、請求の範囲第27項に記載の単離された核酸 配列。 29. 配列が、アミノ酸配列: MXaaLQRQFLRTQLWDVPSWLERSCL(配列番号7)、およ びそのフラグメントまたは誘導体(式中、Xaa=SerまたはAla)をコー ドする請求の範囲第24項に記載の単離された核酸配列。 30. 配列が、アミノ酸配列: MSLQRQFLR(配列番号9)、そのフラグメントまたは誘導体をコードす る請求の範囲第29項に記載の単離された核酸配列。 31. 配列番号46または腫瘍抗原をコードするそのフラグメントを含む単 離された核酸配列。 32. 核酸配列が、非ホドキンのリンパ腫、白血病、ホドキンのリンパ腫、 肺癌、肝臓癌、転移癌、メラノーマ、アデノカルチノーマ、胸腺腫、結腸癌、子 宮癌、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、頸部癌、膀胱癌、腎臓癌、膵臓癌およびサルコ ーマから成る群から選択される癌から誘導される、請求の範囲第31項に記載の 単離された核酸配列。 33. 核酸配列が、TTATTAGGACCAGGACGCCCCTACA GGまたはその変異体を含む、請求の範囲第31項に記載の単離された核酸配列 。 34. 配列がアミノ酸配列:LLGPGRPYRまたはその変異体をコード する、請求の範囲第32項に記載の単離された核酸配列。 35. 請求の範囲第24項から第33項または第34項に記載の核酸配列を 含む組み換え発現ベクター。 36. 請求の範囲第35項に記載の組み換え発現ベクターで形質転換または トランスフェクションした宿主生物体。 37. 請求の範囲第24項から第33項または第34項に記載の核酸配列に 相補的な核酸配列を含むオリゴヌクレオチド。 38. 請求の範囲第24項から第33項または第34項に記載の核酸配列を ウイルスゲノムまたはその一部中に取り込んだ組み換えウイルスを含む組み換え ウイルス。 39. 免疫刺激分子をコードする少なくとも1つの遺伝子をさらに含む請求 の範囲第38項に記載の組み換えウイルス。 40. ウイルスがレトロウイルス、バキュロウイルス、アンカラウイルス、 鶏痘ウイルス、アデノウイルス、およびワクシニアウイルスから成る群から選択 される請求の範囲第38項に記載の組み換えウイルス。 41. 癌ペプチドがメラノサイトから由来する、請求の範囲第38項に記載 4の組み換えウイルス。 42. 免疫刺激分子がMHCクラスI分子である、請求の範囲第39項に記 載の組み換えウイルス。 43. 核酸配列が: ATGTCACTGCAACGGCAATTTCTCAGG(配列番号10)ま たはその変異体を含む、請求の範囲第38項に記載の組み換えウイルス。 44. 核酸配列が、アミノ酸配列: MXaaLQRQFLRTQLWDVPSWLERSCL(配列番号7)、およ びそのフラグメントまたは誘導体(式中、Xaa=SerまたはAla)を含む 癌ぺプチドをコードする請求の範囲第38項に記載の組み換えウイルス。 45. 核酸配列が、TTATTAGGACCAGGACGCCCCTACA GGを含む、請求の範囲第38項に記載の組み換えウイルス。 46. 核酸配列が、アミノ酸配列: X1LLGPGRPYRX2およびその変異体(式中、X1およびX2は同一または 異なり各々1以上のアミノ酸である)を含む腫瘍抗原をコードする、請求の範囲 第38項に記載の組み換えウイルス。 47. TRP−1遺伝子のORF3によってコードされる癌ペプチド、また はその一部に結合する単離された抗体。 48. 請求の範囲第1項から第19項または第20項に記載の癌ペプチド、 腫瘍抗原、またはその一部または変異体に結合する単離された抗体。 49. 配列番号46によってコードされる腫瘍抗原またはそのフラグメント に結合する単離された抗体。 50. 配列番号47を含む腫瘍抗原またはそのフラグメントに結合する単離 された抗体。 51. 請求の範囲第19項に記載の腫瘍抗原またはその変異体に結合する単 離された抗体。 52. 組み換え癌ペプチドまたはその一部の製造方法であって: a. 配列番号5として図2に記載したORF3のヌクレオチド配列またはそ の一部または変異体を発現ベクター中に挿入し; b. 発現ベクターを宿主細胞に導入し; c. 癌ペプチドまたはその一部の発現に適した条件下で宿主細胞を培養し; そして d. 組み換え癌ペプチドまたはその一部を回収する; ことを含む方法。 53. 工程(a)において、MHCクラスI分子をコードするヌクレオチド 配列またはその一部を発現ベクター中に挿入することをさらに含む、請求の範囲 第52項に記載の方法。 54. 組み換えTRP−2腫瘍抗原の製造方法であって: a. 少なくとも配列番号46の一部を含むヌクレオチド配列、またはその変 異体を発現ベクター中に挿入し; b. 発現ベクターを宿主細胞に導入し;腫瘍抗原の発現に適した条件下で宿 主細胞を培養し;そして c. 組み換え腫瘍抗原を回収する; ことを含む方法。 55. 工程(a)において、MHCクラスI分子をコードするヌクレオチド 配列またはその一部を発現ベクター中に挿入することをさらに含む、請求の範囲 第54項に記載の方法。 56. 哺乳類における癌または前癌の存在の検出方法であって: a. 配列番号5として図2に記載したORF3の核酸配列またはその一部ま たは変異体を、哺乳類から採取したmRNAの試験生物試料と、該配列と該mR NAとの間に複合体を形成させる条件下で接触させ; b. 複合体を検出し; c. 試験試料中のmRNAの量を、既知の正常の生物試料中からのmRNA の量と比較することを含み、試験試料からのmRNAの増加した量が癌または前 癌の指標である方法。 57. 癌または前癌がメラノーマである、請求の範囲第56項に記載の方法 。 58. 哺乳類における癌または前癌の存在の検出方法であって: 少なくとも配列番号46の一部を含む核酸配列またはその変異体を、哺乳類か ら採取したmRNAの試験生物試料と、該配列と該mRNAとの間に複合体を形 成させる条件下で接触させ;そして、複合体を検出することを含み、該複合体の 存在が癌または前癌の存在の指標である方法。 59. 癌または前癌がメラノーマである、請求の範囲第58項に記載の方法 。 60. 生物試料におけるORF3ゲノム核酸配列の検出方法であって: a. ゲノム核酸配列を、配列番号5として図2に記載したORF3またはそ の一部または変異体と、該ゲノム核酸配列とORF3との間に複合体を形成させ る条件下で接触させ;そして b. 複合体を検出する; ことを含む方法。 61. 生物試料における請求の範囲第1項から第19項または第20項に記 載の癌ペプチド、腫瘍または抗原またはその一部または変異体の検出方法であっ て; a. 試料を、上記癌ペプチドに特異的な抗体と、免疫複合体を形成させる条 件下で接触させ;そして b. 免疫複合体の存在を検出する; ことを含む方法。 62. 哺乳類における癌を防止または阻害する方法であって; 請求の範囲第1項から第19項または第20項に記載の癌ペプチド、腫瘍抗原 またはその一部の有効量を、単独またはMHC分子と一緒に哺乳類に投与するこ とを含み、上記量が哺乳類における癌を防止または阻害するのに有効である、方 法。 63. 哺乳類におけるメラノーマの阻害方法であって; a. Tリンパ球をインビトロで、請求の範囲第1項から第19項または第2 0項に記載の癌ペプチド、腫瘍抗原またはその一部に、単独またはMHC分子と 一緒に、癌ペプチド特異的Tリンパ球を引き出すのに十分な時間露出し; b. 癌ペプチド特異的Tリンパ球をメラノーマを阻害するのに十分な量で哺 乳類に投与する、 ことを含む方法。 64. 哺乳類における癌を防止または阻害する方法であって; 請求の範囲第1項から第19項または第20項に記載の癌ペプチドまたは腫瘍 抗原の有効量を、単独またはMHC分子と一緒に哺乳類に投与することを含み、 上記量が哺乳類における癌を防止または阻害するのに有効である、方法。 65. 哺乳類における癌を防止または阻害する方法であって; 請求の範囲第38項から第45項または第46項に記載の組み換えウイルスの 有効量を、単独または外因性免疫刺激分子と一緒に哺乳類に投与することを含み 、上記量が癌を防止または阻害するのに有効である、方法。 66. 請求の範囲第38項から第45項または第46項に記載の組み換えウ イルスを単独または外因性免疫刺激分子、化学治療剤、抗生物質、抗菌剤、抗ウ イルス剤またはそれらの組み合わせと一緒に含み、そして薬学的に許容できる担 体を含む医薬組成物。 67. 抗原特異的Tリンパ球と反応性を有する癌抗原の抗原性癌エピトープ の同定方法であって: a. 癌抗原をコードする遺伝子からの核酸欠失フラグメントを生成し; b. 欠失フラグメントを発現ベクター中に置き; c. 宿主細胞をベクターでトランスフェクションまたは形質導入し; d. 欠失生成物を発現する宿主の存在下で癌抗原特異的Tリンパ球応答を測 定する、 ことを含む方法。 68. 癌抗原をコードする遺伝子がTRP−1またはTRP−2である、請 求の範囲第67項に記載の方法。 69. 癌抗原の抗原性癌エピトープの同定方法であって: a. 多数の合成ペプチドを作製し; b. 癌抗原提示細胞を合成ペプチドでパルスし; c. ペプチドでパルスした細胞を癌抗原特異的Tリンパ球に添加し;そして d. 癌抗原特異的Tリンパ球応答を測定する、 ことを含む方法。 70. 癌抗原がメラノーマ抗原である、請求の範囲第69項に記載の方法。 71. 配列番号2または配列番号47のフラグメントを少なくとも含む腫瘍 抗原をコードする遺伝子を有するトランスジェニック動物。 72. 請求の範囲第71項に記載の腫瘍抗原を発現するトランスジェニック 動物。[Claims] 1. A cancer peptide, part or derivative thereof, encoded by an alternative open reading frame nucleic acid sequence from a gene other than the open reading frame sequence encoding a normal protein or peptide from the same gene. 2. The cancer peptide according to claim 1, wherein the cancer peptide is immunologically recognized by MHC-restricted T lymphocytes, a part or derivative thereof. 3. The cancer peptide according to claim 1, wherein the T lymphocyte is MHC class I restricted, a part or derivative thereof. 4. If the cancer peptide is non-Hodkin's lymphoma, leukemia, Hodkin's lymphoma, lung cancer, liver cancer, metastatic cancer, melanoma, adenocarcinoma, thymoma, colon cancer, uterine cancer, breast cancer, prostate cancer, ovarian cancer, cervical cancer, The cancer peptide according to claim 1, which is derived from a cancer selected from the group consisting of bladder cancer, kidney cancer, pancreatic cancer and sarcoma, a part or derivative thereof. 5. The cancer peptide, part or derivative thereof according to claim 1, wherein the alternative open reading frame nucleic acid sequence is from the TRP-1 gene. 6. The cancer peptide according to claim 1, wherein the cancer peptide is derived from a tumor-associated antigen, a part or derivative thereof. 7. The tumor-associated antigen is fetal neoplastic antigen, MART-1, Mage-1, Mag-3, gp100, tyrosinase, CEA, PSA, CA-171A, CA-19A, CA-125, erb-2, P-15 The cancer peptide according to claim 1, which is selected from the group consisting of and β-galactosidase, a part or derivative thereof. 8. The cancer peptide, part or derivative thereof according to claim 1, wherein the nucleic acid sequence comprises ORF3 described in FIG. 2 as SEQ ID NO: 5, a part or a variant thereof. 9. The cancer peptide, part or derivative thereof according to claim 1, wherein the alternative open reading frame nucleic acid sequence comprises ATGTCACTGCAACGGCAATTTCTCAG (SEQ ID NO: 10) or a part or variant thereof. 10. The cancer peptide according to claim 1, wherein the cancer peptide comprises the amino acid sequence: MXaaLQRQFLRTQLWDVPPSWLERSCL (SEQ ID NO: 7), and a fragment or derivative thereof (where Xaa = Ser or Ala). 11. The cancer peptide according to claim 1, wherein the cancer peptide comprises the amino acid sequence: MSLQRQFLR (SEQ ID NO: 9), a fragment or a derivative thereof, or a part or derivative thereof. 12. An isolated tumor antigen having an amino acid sequence comprising SEQ ID NO: 47, or a fragment or variant thereof. 13. An isolated tumor antigen encoded by a nucleic acid sequence comprising at least a fragment of SEQ ID NO: 46, or a variant thereof. 14. The tumor antigen according to claim 12, wherein the tumor antigen is a cancer peptide that is immunologically recognized by MHC-restricted T lymphocytes. 15. 15. The tumor antigen of claim 14, wherein the T lymphocytes are HLA-A31 restricted. 16. If the tumor antigen is non-Hodkin's lymphoma, leukemia, Hodkin's lymphoma, lung cancer, liver cancer, metastatic cancer, melanoma, adenocarcinoma, thymoma, colon cancer, uterine cancer, breast cancer, prostate cancer, ovarian cancer, cervical cancer, 13. The tumor antigen according to claim 12, which is derived from a cancer selected from the group consisting of bladder cancer, kidney cancer, pancreatic cancer and sarcoma. 17. 13. The tumor antigen according to claim 12, wherein the tumor antigen is a cancer peptide selected from the group consisting of SEQ ID NO: 49 to SEQ ID NO: 59. 18. 14. The tumor antigen of claim 13, further comprising a nucleic acid sequence: TTATTAGGACCAGGACGCCCCTACAG G or a part or variant thereof. 19. 13. The method according to claim 12, wherein the tumor antigen is a cancer peptide comprising the amino acid sequence: X 1 LLGPGRPYRX 2 and a variant thereof (wherein X 1 and X 2 are the same or different and each is one or more amino acids). The described tumor antigen. 20. The tumor antigen according to claim 12, wherein the tumor antigen is a cancer peptide comprising the amino acid sequence: LLGPGRPYR or a variant thereof. 21. A pharmaceutical composition comprising the cancer peptide according to any one of claims 1 to 19 or 20, a tumor antigen, a part or derivative thereof, and a pharmaceutically acceptable carrier. 22. An immunogen comprising the cancer peptide, tumor antigen, part or derivative thereof according to claims 1 to 19 or 20, alone or together with at least one immunostimulatory molecule. 23. 23. The immunogen according to claim 22, wherein the immunostimulatory molecule is an MHC molecule. 24. An isolated nucleic acid sequence comprising an alternative open reading frame nucleic acid sequence encoding a cancer peptide from a gene other than the open reading frame sequence encoding a normal protein or peptide from the same gene, part or derivative thereof. 25. If the cancer peptide is non-Hodkin's lymphoma, leukemia, Hodkin's lymphoma, lung cancer, liver cancer, metastatic cancer, melanoma, adenocarcinoma, thymoma, colon cancer, uterine cancer, breast cancer, prostate cancer, ovarian cancer, cervical cancer, 25. The isolated nucleic acid sequence of claim 24, wherein the nucleic acid sequence is derived from a cancer selected from the group consisting of bladder cancer, kidney cancer, pancreatic cancer and sarcoma. 26. 25. The isolated nucleic acid sequence according to claim 24, wherein the gene is a TRP-1 gene. 27. 25. The isolated nucleic acid sequence of claim 24, wherein the nucleic acid sequence comprises ORF3 set forth in FIG. 2 as SEQ ID NO: 5, a portion or a variant thereof. 28. 28. The isolated nucleic acid sequence of claim 27, wherein the nucleic acid sequence comprises ATGTCACTGCAACGGCAATTTCTCAG (SEQ ID NO: 10) or a portion or variant thereof. 29. 25. The isolated nucleic acid sequence of claim 24, wherein the sequence encodes the amino acid sequence: MXaaLQRQFLRTQLWDVPSWLERSCL (SEQ ID NO: 7), and a fragment or derivative thereof, wherein Xaa = Ser or Ala. 30. 30. The isolated nucleic acid sequence of claim 29, wherein the sequence encodes the amino acid sequence: MSLQRQFLR (SEQ ID NO: 9), a fragment or derivative thereof. 31. An isolated nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 46 or a fragment thereof encoding a tumor antigen. 32. The nucleic acid sequence is non-Hodkin's lymphoma, leukemia, Hodkin's lymphoma, lung cancer, liver cancer, metastatic cancer, melanoma, adenocarcinoma, thymoma, colon cancer, uterine cancer, breast cancer, prostate cancer, ovarian cancer, cervical cancer, 32. The isolated nucleic acid sequence of claim 31, wherein the nucleic acid sequence is derived from a cancer selected from the group consisting of bladder, kidney, pancreas and sarcoma. 33. 32. The isolated nucleic acid sequence of claim 31, wherein the nucleic acid sequence comprises TTATTAGGACCAGGACGCCCCTACA GG or a variant thereof. 34. 33. The isolated nucleic acid sequence of claim 32, wherein the sequence encodes the amino acid sequence: LLGPGRPYR or a variant thereof. 35. A recombinant expression vector comprising the nucleic acid sequence according to any one of claims 24 to 33 or 34. 36. A host organism transformed or transfected with the recombinant expression vector according to claim 35. 37. 35. An oligonucleotide comprising a nucleic acid sequence complementary to the nucleic acid sequence according to claims 24 to 33 or 34. 38. A recombinant virus comprising a recombinant virus having the nucleic acid sequence according to claims 24 to 33 or 34 incorporated into a viral genome or a part thereof. 39. 39. The recombinant virus according to claim 38, further comprising at least one gene encoding an immunostimulatory molecule. 40. 39. The recombinant virus of claim 38, wherein the virus is selected from the group consisting of retrovirus, baculovirus, ankara virus, fowlpox virus, adenovirus, and vaccinia virus. 41. 39. The recombinant virus according to claim 38, wherein the cancer peptide is derived from melanocytes. 42. 40. The recombinant virus according to claim 39, wherein the immunostimulatory molecule is an MHC class I molecule. 43. 39. The recombinant virus according to claim 38, wherein the nucleic acid sequence comprises: ATGTCACTGCAACGGCAATTTCTCAG (SEQ ID NO: 10) or a variant thereof. 44. 39. The recombinant virus of claim 38, wherein the nucleic acid sequence encodes a cancer peptide comprising the amino acid sequence: MXaaLQRQFLRTQLWDVPSWLERSCL (SEQ ID NO: 7), and a fragment or derivative thereof (where Xaa = Ser or Ala). 45. 39. The recombinant virus of claim 38, wherein the nucleic acid sequence comprises TTATTAGGACCAGGACGCCCCTACA GG. 46. 39. The method according to claim 38, wherein the nucleic acid sequence encodes a tumor antigen comprising the amino acid sequence: X 1 LLGPGRPYRX 2 and a variant thereof, wherein X 1 and X 2 are the same or different and each is one or more amino acids. 3. The recombinant virus according to item 1. 47. An isolated antibody that binds to a cancer peptide encoded by ORF3 of the TRP-1 gene, or a portion thereof. 48. 21. An isolated antibody that binds to the cancer peptide, tumor antigen, or part or variant thereof according to claims 1 to 19 or 20. 49. An isolated antibody that binds to a tumor antigen encoded by SEQ ID NO: 46 or a fragment thereof. 50. An isolated antibody that binds to a tumor antigen comprising SEQ ID NO: 47 or a fragment thereof. 51. 20. An isolated antibody that binds to the tumor antigen or a variant thereof according to claim 19. 52. A method for producing a recombinant cancer peptide or part thereof, comprising: a. Inserting the nucleotide sequence of ORF3 set forth in FIG. 2 as SEQ ID NO: 5, or a portion or variant thereof, into an expression vector; b. Introducing the expression vector into a host cell; c. Culturing the host cell under conditions suitable for expression of the cancer peptide or a portion thereof; and d. Recovering the recombinant cancer peptide or a part thereof. 53. 53. The method of claim 52, wherein step (a) further comprises inserting a nucleotide sequence encoding an MHC class I molecule or a portion thereof into an expression vector. 54. A method for producing a recombinant TRP-2 tumor antigen, comprising: a. Inserting a nucleotide sequence comprising at least a portion of SEQ ID NO: 46, or a variant thereof, into an expression vector; b. Introducing the expression vector into a host cell; culturing the host cell under conditions suitable for expressing the tumor antigen; and c. Recovering the recombinant tumor antigen. 55. 55. The method of claim 54, wherein in step (a), the method further comprises inserting a nucleotide sequence encoding an MHC class I molecule or a portion thereof into an expression vector. 56. A method for detecting the presence of a cancer or precancerous in a mammal, comprising: a. The nucleic acid sequence of ORF3 shown in FIG. 2 as SEQ ID NO: 5, or a part thereof or a variant thereof, is prepared by combining a mRNA test biological sample collected from a mammal with a complex between the sequence and the mRNA. B. Detecting the complex; c. A method comprising comparing the amount of mRNA in a test sample with the amount of mRNA in a known normal biological sample, wherein the increased amount of mRNA from the test sample is indicative of cancer or precancerous. 57. 57. The method according to claim 56, wherein the cancer or precancerous is melanoma. 58. A method for detecting the presence of a cancer or pre-cancer in a mammal, comprising: combining a nucleic acid sequence comprising at least a portion of SEQ ID NO: 46 or a variant thereof with a test biological sample of mRNA collected from the mammal; Contacting under conditions that allow for the formation of a complex therebetween; and detecting the complex, wherein the presence of the complex is indicative of the presence of a cancer or precancerous. 59. 59. The method according to claim 58, wherein the cancer or precancerous is melanoma. 60. A method for detecting an ORF3 genomic nucleic acid sequence in a biological sample, comprising: a. Contacting a genomic nucleic acid sequence with ORF3, or a portion or variant thereof, set forth in FIG. 2 as SEQ ID NO: 5, under conditions that cause a complex to form between said genomic nucleic acid sequence and ORF3; and b. Detecting the complex. 61. 21. A method for detecting a cancer peptide, a tumor or an antigen or a part or variant thereof according to claim 1 to claim 19 in a biological sample; Contacting a sample with an antibody specific for said cancer peptide under conditions that allow the formation of an immune complex; and b. Detecting the presence of the immune complex. 62. 21. A method for preventing or inhibiting cancer in a mammal, comprising administering an effective amount of a cancer peptide, tumor antigen or a part thereof according to claims 1 to 19 or 20 alone or together with an MHC molecule. Administering to a mammal, wherein the amount is effective to prevent or inhibit cancer in the mammal. 63. A method of inhibiting melanoma in a mammal, comprising: a. A T-lymphocyte can be used in vitro to bind to a cancer peptide, a tumor antigen or a part thereof according to claims 1 to 19 or 20 alone or together with an MHC molecule. Expose for a time sufficient to pull out the sphere; b. Administering a cancer peptide-specific T lymphocyte to the mammal in an amount sufficient to inhibit melanoma. 64. 21. A method for preventing or inhibiting cancer in a mammal, comprising administering to the mammal an effective amount of a cancer peptide or tumor antigen according to claims 1 to 19 or 20 alone or together with MHC molecules. Wherein the amount is effective to prevent or inhibit cancer in a mammal. 65. 47. A method of preventing or inhibiting cancer in a mammal, comprising administering to the mammal an effective amount of the recombinant virus of claims 38-45 or 46, alone or with an exogenous immunostimulatory molecule. And wherein the amount is effective to prevent or inhibit cancer. 66. Claims 38 to 45 or 46 comprising the recombinant virus alone or together with an exogenous immunostimulatory molecule, a chemotherapeutic agent, an antibiotic, an antibacterial agent, an antiviral agent or a combination thereof, And a pharmaceutical composition comprising a pharmaceutically acceptable carrier. 67. A method for identifying an antigenic cancer epitope of a cancer antigen reactive with antigen-specific T lymphocytes, comprising: a. Generating a nucleic acid deletion fragment from a gene encoding a cancer antigen; b. Placing the deleted fragment in an expression vector; c. Transfecting or transducing a host cell with the vector; d. Measuring a cancer antigen-specific T lymphocyte response in the presence of a host expressing the deletion product. 68. The method according to claim 67, wherein the gene encoding a cancer antigen is TRP-1 or TRP-2. 69. A method for identifying an antigenic cancer epitope on a cancer antigen, comprising: a. Making a number of synthetic peptides; b. Pulsing the cancer antigen presenting cells with the synthetic peptide; c. Adding the cells pulsed with the peptide to cancer antigen-specific T lymphocytes; and d. Measuring a cancer antigen-specific T lymphocyte response. 70. 70. The method according to claim 69, wherein the cancer antigen is a melanoma antigen. 71. A transgenic animal having a gene encoding a tumor antigen comprising at least the fragment of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 47. 72. A transgenic animal expressing the tumor antigen according to claim 71.
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