JP2000505418A - Oligonucleotide analogs - Google Patents

Oligonucleotide analogs

Info

Publication number
JP2000505418A
JP2000505418A JP9527063A JP52706397A JP2000505418A JP 2000505418 A JP2000505418 A JP 2000505418A JP 9527063 A JP9527063 A JP 9527063A JP 52706397 A JP52706397 A JP 52706397A JP 2000505418 A JP2000505418 A JP 2000505418A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
substituted
compound
independently
group
protecting group
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP9527063A
Other languages
Japanese (ja)
Inventor
コーリン,アレキサンダー・エイ
恭一 渡辺
Original Assignee
コドン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by コドン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド filed Critical コドン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド
Publication of JP2000505418A publication Critical patent/JP2000505418A/en
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04Antibacterial agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/10Antimycotics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents

Abstract

(57)【要約】 置換基が明細書中で定義される構造式(1)を含む巨大分子を開示するものでる。さらに、上記化合物の合成において有用な化合物並びに上記化合物を活性成分として含有する医薬組成物を開示する。 (57) Abstract This discloses a macromolecule wherein the substituent comprises structural formula (1) as defined in the specification. Further disclosed are compounds useful in the synthesis of the compounds and pharmaceutical compositions containing the compounds as active ingredients.

Description

【発明の詳細な説明】 オリゴヌクレオチド類縁体 発明の背景 1.本発明の分野 本発明は一群のオリゴヌクレオチド、修飾されたオリゴヌクレオチド、または オリゴヌクレオシド(すなわち、ホスフェート不含オリゴヌクレオチド)に関す る。これらは要すれば末端が修飾されていてもよく、またその構造には、DNA 結合部位またはDNA相互作用基またはキャリアーまたは標的リガンドが結合す るためのアキラル性部位として(アザ)窒素を少なくとも1個含有する非ヌクレ オシド性の性質を持つリンカーを少なくとも1個有する。2.関連技術に関する記載 オリゴヌクレオチドには種々の疾患の処置に使用する治療剤として価値のある 可能性がある。一般に古典的な治療剤は蛋白質との相互作用に焦点を当てられて きたが、それは直接的に作用するか、またはその酵素作用を介して作用して動物 およびヒトにおける多数の病状に対して主に寄与するものである。古典的治療剤 と比較してオリゴヌクレオチドにはそのワトソン−クリックまたはフーグステー ンの様式で相補的核酸ストランドへの塩基対合をする性能によって効率の高度な 特異性が与えられる可能性がある。この意味でオリゴヌクレオチドは遺伝子治療 または翻訳または転写の制御について独特な機会を提供する。 遺伝子の機能は、その情報のメッセンジャーRNA(mRNA)への転写から 出発し、リボソーム複合体との相互作用によってその配列がコードする蛋白質の 合成に向かう。この合成過程は翻訳と呼ばれている。翻訳の過程には種々な補助 的因子およびビルディングブロック、アミノ酸およびそのトランスファーRNA (tRNA)の存在が必要であって、これらは正常な細胞には全て存在する。 転写の開始にはRNA合成酵素であるRNAポリメラーゼによるプロモーター DNA配列の特異的な認識が必要である。原核生物細胞では多くの場合に、真核 生物細胞では多分全ての場合に、この認識はプロモーターへの蛋白質転写因子の 配列特異的な結合に起因する。プロモーターに結合はするが、その結合がRNA ポリメラーゼの作用を阻止する別の蛋白質はリプレッサーと呼ばれる。 たとえばワトソン−クリック塩基対合相互作用のような配列特異的様式でトラ ンスセルラーRNAへの結合に関与する合成的オリゴヌクレオチドは「アンチセ ンス」プローブとして使用できるかもしれない。そこで、合成DNAは生体内で 翻訳を抑制する可能性もある。また、例えば、オリゴヌクレオチドまたはその他 のDNA認識試薬を使用する三重ヘリックス形成によってゲノムに影響を与える 可能性もある。 しかしながら、天然オリゴヌクレオチドは細胞内への浸透性が低いため、また 細胞内部にある酵素による急速な分解のために治療剤としては相対的に効果が乏 しい。従って天然オリゴヌクレオチドが治療的効果を発揮するには相対的に高い 濃度が必要である。 半減期ならびに膜浸透性を改善するためにポリヌクレオチド骨格における多数 の変化が行われたが、今までに期待された結果は得られていない。これらの変化 にはメチルホスホネート、モノチオホスフェート、ジチオホスフェート、ホスホ ルアミデート、ホスフェートエステル、架橋ホスホルアミデート、架橋ホスホロ チオエート、架橋メチレンホスホネート、シロキサン架橋、カーボネート架橋、 カルボキシメチルエステル架橋、アセトアミド架橋、カルバメート架橋、チオエ ーテル、スルホキシ、スルホノ架橋、種々の「プラスチック」DNA、アルファ ーアノマー性架橋、およびボラン誘導体を有するデホスホヌクレオチド間類縁体 の使用を含む。 例えば米国特許第5216141号はサブユニット間を結合する基として天然 オリゴヌクレオチドと結合を形成することのできるスルフィド、スルホキシドお よびスルホンを含むDNA類縁体に関する。 米国特許第5034506号はアキラル結合によって相互に結合するモルホリ ノサブユニットを含むポリマー性組成物に関する。各サブユニットはプリンまた はピリミジン塩基が対合する基を含むとしている。 米国特許第5405938号および米国特許第5166315号は非荷電性の 5−員環または6−員環の環状骨格を含み、その骨格には選択された塩基が結合 しているポリマーに関する。このポリマーは配列特異的様式で二本鎖ポリヌクレ オチドの標的配列に結合することができるとしている。 国際特許出願WO92/20702、WO92/20703およびWO94/ 25477はすべていわゆるペプチド核酸(PNA)に関するもので、これらは 相補性単一ストランドのDNAおよびRNAストランドに対応するDNAよりも 強く結合するとしている。このPNAはアザ窒素を介してペプチドの骨格または ポリアミドの骨格に結合するリガンドを含むとしている。 米国特許第5378825号はオリゴヌクレオチド類縁体であって、その正常 なホスホロジエステル糖間結合が4原子結合基で置換されたものに関する。 国際特許出願WO95/14706はPNA−DNA−PNAキメラ性マクロ 分子に関するものであって、そのPNAおよびDNA部分はアミド結合、アミン 結合またはエステル結合によって結合している。 今日ではヌクレアーゼ抵抗性、結合性能およびアンチセンスまたは抗原オリゴ ヌクレオチドの標的RNAストランドまたは二重ストランドDNAに対する結合 効率が重要であることが認識されている。同時に高度なヌクレアーゼ耐性および 膜浸透性を与え、ハイブリッド形成能を改善する方法および材料が必要なことは 以前から感じられてきた。本発明の化合物および組成物はこの必要性を充たすも のである。 発明の要約 本発明は態様の一つはマクロ分子であって、その少なくとも一部が次の構造: 式I [式中、 各Bは独立に水素、ヒドロキシ、天然起源ヌクレオベース、非天然起源ヌクレ オベース、DNAインターカレーター、共有結合性または非共有結合性のDNA 結合基、ヘテロ環基、または芳香族基である。 各B1は独立に水素、ヒドロキシ、アミノ、メルカプト、天然起源ヌクレオベ ース、非天然起源ヌクレオベース、DNAインターカレーター、共有結合性また は非共有結合性のDNA結合基、ヘテロ環基、芳香族基、標的基、キャリアー、 レポーター基、または溶解性または非溶解性のポリマーである。 nは1から50までの整数である。 各Xは独立に一重結合、メチレン、メチレンカルボニル、C7〜C12−アラル キレンまたは置換アラルキレン、C7〜C12−アラルキレンカルボニルまたは置 換アラルキレンカルボニル、または式: [式中、 各Zは独立に一重結合、O、S、NR6、C(=O)NR6、またはC(=O) NR6である。 各Z1は独立にO、S、NR5、メチレン、またはC(CH32である。 p、q、r、およびsは各々独立に0から20までの整数である。 R1、R2、R3およびR4は各々独立に水素;ヒドロキシ−またはアルコキシま たはアルキルチオ−で置換されていてもよいC1〜C8−アルキル;ヒドロキシ; アルコキシ;アルキルチオ;アミノ;またはハロゲンである。 R5およびR6は各々独立に水素;ヒドロキシ−またはアルコキシ−またはアル キルチオ−で置換されていてもよいC1〜C8−アルキル;ヒドロキシ;アルコキ シ;アルキルチオ;またはアミノである] で示される基である。 Q1またはQ2は各々独立に少なくとも3個の原子を含み、その中の少なくとも 1個は炭素である。 各Vは独立に酸素、硫黄、NR8、またはメチレンである。 各Jは独立に水素、アジド、ハロゲン、−OR7、−R7、または−NR78で あって、ここに各R7は独立に−NR89またはR8であり、ここにR8およびR9 は各々独立に水素、C3〜C10−分枝アルキルまたは置換アルキル、C1〜C10− 非分枝アルキルまたは置換アルキル、C1〜C10−非分枝オキサアルキルまたは 置換オキサアルキル、C6〜C10−アリールまたは置換アリール、C7〜C12−ア ラルキルまたは置換アラルキル、C1〜C10−非分枝アミノアルキルまたは置換 非分枝アミノアルキル、C1〜C10−非分枝アミノオキサアルキルまたは置換非 分枝アミノオキサアルキル、C3〜C10−およびN1〜N4−の分枝(ポリアミノ −またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ)アル キル、C1〜C10−およびN1〜N4−の非分枝(ポリアミノ−またはポリアザ− )アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキル、C1〜C10 −およびN1〜N4−の非分枝(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサアルキル または置換非分枝(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサアルキル、天然アミ ノ酸または非天然アミノ酸の側鎖基、または保護基である] を有するマクロ分子に関する。 別の態様では、本発明は前記化合物の有効量および医薬的に適する担体を含有 する医薬的組成物に関する。 他の態様では、本発明は病原性生物に起因する疾患の処置法に関し、処置を要 する宿主生物に前記化合物または医薬的組成物の有効量を投与することを包含す る。この宿主生物はこのような処置を必要とするいかなる生物であってもよく、 哺乳類およびヒトを含む。 さらに別の態様では、本発明は処置を要する生物に前記の化合物または医薬的 組成物の有効量を投与することを包含する腫瘍の処置法に関する。この生物はこ のような処置を必要とするいかなるものであってもよく、哺乳類およびヒトを含 む。 別の態様の一つでは、本発明は式: 式II [式中、 各Bは独立に天然起源ヌクレオベース、非天然起源ヌクレオベース、ヘテロ環 基、または芳香族基であって、いずれも要すれば保護基を有していてもよい。 各B1は独立に水素、ヒドロキシ、アミノ、メルカプト、天然起源ヌクレオベ ース、非天然起源ヌクレオベース、DNAインターカレーター、共有結合性また は非共有結合性のDNA結合基、ヘテロ環基、または芳香族基であって、いずれ も要すれば保護基を有していてもよい。 nは1から50までの整数である。 各Xは独立に要すれば保護されていてもよい基であって、一重結合、メチレン 基、メチレンカルボニル、C7〜C12−アラルキレンまたは置換アラルキレン、 C7〜C12−アラルキレンカルボニルまたは置換アラルキレンカルボニル、また は式: [式中、 各Zは独立に一重結合、O、S、NR6、C(=O)NR6、C(=S)NR6 、S(=O)NR6、またはS(=O)2NR6である。 各Z1は独立にO、S、Se、NR5、メチレン、またはC(CH32である。 p、q、r、およびsは各々独立に0から20までの整数である。 R1、R2、R3およびR4は各々独立に水素;ヒドロキシ−またはアルコキシ− またはアルキルチオ−基で置換されていてもよいC1〜C8−アルキル;ヒドロキ シ;アルコキシ;アルキルチオ;アミノ;またはハロゲンである。 R5およびR6は各々独立に水素;ヒドロキシ−またはアルコキシ−またはアル キルチオ−基で置換されていてもよいC1〜C8−アルキル;ヒドロキシ;アルコ キシ;アルキルチオ;またはアミノである] で示される基から選択された要すれば保護された基である。 Q1またはQ2は各々独立に少なくとも3個の原子を含み、その中の少なくとも 1個は炭素である。 各Vは独立に酸素、硫黄、NR8、またはメチレンである。ここにR8は独立に 水素、C3〜C10−分枝アルキルまたは置換アルキル、C1〜C10−非分枝アルキ ルまたは置換アルキル、C1〜C10−非分枝オキサアルキルまたは置換オキサア ルキル、C6〜C10−アリールまたは置換アリール、C7〜C12−アラルキルまた は置換アラルキル、C1〜C10−非分枝アミノアルキルまたは置換非分枝アミノ アルキル、C1〜C10−非分枝アミノオキサアルキルまたは置換非分枝アミノオ キサアルキル、C3〜C10−およびN1〜N4−の分枝(ポリアミノ−またはポリ アザ−)アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ)アルキル、C1〜 C10−およびN1〜N4−の非分枝(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキルま たは置換(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキル、C1〜C10−およびN1〜 N4−の非分枝(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサアルキルまたは置換非 分枝(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサアルキル、天然アミノ酸または非 天然アミノ酸の側鎖基、または保護基である。 各Jは独立に水素、−OR7、ハロゲン、アジドまたはR7であって、いずれも 要すれば置換されている。ここに各R7は独立に−NR89またはR8であって、 ここにR9は独立に水素、C3〜C10−分枝アルキルまたは置換アルキル、C1〜 C10−非分枝アルキルまたは置換アルキル、C1〜C10−非分枝オキサアルキル または置換オキサアルキル、C6〜C10−アリールまたは置換アリール、C7〜C12 −アラルキルまたは置換アラルキル、C1〜C10−非分枝アミノアルキルまた は置換非分枝アミノアルキル、C1〜C10−非分枝アミノオキサアルキルまたは 置換非分枝アミノオキサアルキル、C3〜C10−およびN1〜N4−の分枝(ポリ アミノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ )アルキル、C1〜C10−およびN1〜N4−の非分枝(ポリアミノ−またはポリ アザ−)アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキル、C1 〜C10−およびN1〜N4−の非分枝(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサア ルキルまたは置換非分枝(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサアルキル、天 然アミノ酸または非天然アミノ酸の側鎖基、または保護基である。 各Q3は独立に−OX−、−SX−、または−NR8X−であって、いずれも要 すれば保護されていてもよい。 各Q4は独立に酸素、硫黄、またはNR8であって、いずれも要すれば保護され ていてもよい。 Yは保護基である。 Y1は固体の支持体に結合しているスペーサー基である] を持つ化合物に関する。 さらに別の態様では、本発明は式: または[式中、 各Bは独立に天然起源ヌクレオベース、非天然起源ヌクレオベース、ヘテロ環 基、または芳香族基であって、いずれも要すれば保護基を有していてもよい。 各B1は独立に水素、ヒドロキシ、アミノ、メルカプト、天然起源ヌクレオベ ース、非天然起源ヌクレオベース、DNAインターカレーター、共有結合性また は非共有結合性のDNA結合基、ヘテロ環基、または芳香族基であって、いずれ も要すれば保護基を有していてもよい。 nは1から50までの整数である。 各Xは独立に要すれば保護されていてもよい次の基の中の1個である:一重結 合、メチレン、メチレンカルボニル、C7〜C12−アラルキレンまたは置換アラ ルキレン、C7〜C12−アラルキレンカルボニルまたは置換アラルキレンカルボ ニル、または式: [式中、 各Zは独立に一重結合、O、S、NR6、C(=O)NR6、C(=S)NR6 、S(=O)NR6、またはS(=O)2NR6である。 各Z1は独立にO、S、Se、NR5、メチレン、またはC(CH32である。 p、q、r、およびsは各々独立に0から20までの整数である。 R1、R2、R3およびR4は各々独立に水素;ヒドロキシ−またはアルコキシ− またはアルキルチオ−で置換されていてもよいC1〜C8−アルキル;ヒ ドロキ シ;アルコキシ;アルキルチオ;アミノ;またはハロゲンである。 R5およびR6は各々独立に水素;ヒドロキシ−またはアルコキシ−またはアル キルチオ−で置換されていてもよいC1〜C8−アルキル;ヒドロキシ;アルコキ シ;アルキルチオ;またはアミノである。 Q1またはQ2は各々少なくとも3個の原子を含み、その中の少なくとも1個は 炭素である。 各Vは独立に酸素、硫黄、NR8、またはメチレンである。 各Jは独立に、要すれば保護されていてもよい次の基:水素、OR7、ハロゲ ン、アジド、または−R7であって、ここに各R7は独立に−NR89またはR8 であり、ここにR8およびR9は各々独立に水素、C3〜C10−分枝アルキルまた は置換アルキル、C1〜C10−非分枝アルキルまたは置換アルキル、C1〜C10− 非分枝オキサアルキルまたは置換オキサアルキル、C6〜C10−アリールまたは 置換アリール、C7〜C12−アラルキルまたは置換アラルキル、C1〜C10−非分 枝アミノアルキルまたは置換非分枝アミノアルキル、C1〜C10−非分枝アミノ オキサアルキルまたは置換非分枝アミノオキサアルキル、C3〜C10−およびN1 〜N4−の分枝(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリア ミノ−またはポリアザ)アルキル、C1〜C10−およびN1〜N4−の非分枝(ポ リアミノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリア ザ−)アルキル、C1〜C10−およびN1〜N4−の非分枝(ポリアミノ−または ポリアザ−)オキサアルキルまたは置換非分枝(ポリアミノ−またはポリアザ− )オキサアルキル、天然アミノ酸または非天然アミノ酸の側鎖基、または保護基 、の中の1基である。 Q1 xおよびQ2 xは各々原子を少なくとも1個含み、Q1またはQ2で示される、 要すれば保護されていてもよいまたは活性化されていてもよい断片から独立に選 択される] で示される化合物に関する。 図面の簡単な説明 図1〜8は各々(B−1)から(B−24)および(C−1)から(C−6) の番号を付けた様々な本発明の化合物と先行技術化合物(各図で(A)と記載) との比較を図示する。 図9〜11は各々本発明の化合物を図示する。 図12〜14は各々(E−1)から(E−13)の番号を付けた様々な本発明 の化合物と先行技術化合物(各図で(A)と記載)との比較を図示する。 図15は本発明の化合物を図示する。 本発明の詳細な記載 本発明はオリゴヌクレオチドの様に機能することができ、またその他に有用な 性質を有するマクロ分子に関する。この明細書の実施例および反応式に例示する ように、このマクロ分子は塩基性のヌクレオシドユニットおよび特有なリンカー ユニットから構築され、ヌクレオベースまたはその他の核酸−結合性の要素を有 している。本発明のリンカー(すなわち、式IのQ1−N−Q2セグメント)を有 するヌクレオベースによって結合している本ヌクレオシドユニットはトリマー性 のユニットを形成する。このトリマーユニットはさらにヌクレオシドの追加によ ってペンタマー、ヘプタマー、その他の延長した高度なマクロ分子にまでさらに 伸長することができる。このトリマーユニット(および/またはさらに高級なユ ニッ ト)は、例えば正常なホスホジエステル結合、ホスホチオエート結合、ホスホジ チオエート結合、ホスホロアミデート結合、ホスホトリエステル結合、メチルそ の他のアルキルホスホネート結合またはその他の結合など、本発明の結合基以外 のもので結合されていてもよい。本発明の結合はアザ窒素原子を隔てて2個の部 分(またはサブ結合、すなわち式IにおけるQ1およびQ2)を含む。このアザー 窒素原子はヌクレオベースまたはその他の核酸結合基のいずれかのアキラル性の 結合部位である。ある種の態様では単一な型のサブ結合基を使用してヌクレオシ ドおよびアザー窒素原子を結合する。他の態様では異なるサブ結合基を2個使用 してトリマー性ユニットを形成するか、または異なるサブ結合基を2個またはそ れ以上使用してさらに高級なユニットを形成する。本発明の同じマクロ分子内に ある異なるユニット(トリマー性またはより大きいユニット)のサブ結合基は同 一なまたは相異なるこの明細書に記載する型のものであってもよい。以下に詳記 するように、トリマーユニット(および/またはさらに高級なユニット)のある ものはヌクレオシド間結合内のアキラル性アザ窒素原子に結合している天然起源 または非天然起源の核酸塩基を有し、他のユニットはヌクレオベース以外のヌク レオベース結合性リガンドを有する。 本明細書に示す天然起源のヌクレオベースには主たる天然起源ヌクレオベース 4種、すなわちチミン、シトシン、アデニンまたはグアニン、または、その他の 天然起源ヌクレオベース、たとえばヒポキサンチン、ウラシル、チオウラシル、 5−メチルシトシン、などを含む。 本明細書に示す非天然起源のヌクレオベースには、例えばフルオロウラシル、 ブロモビニルウラシル、トリアゾールカルボキサミド、ベンズイミダゾールなど を含む。 本明細書に示すヘテロ環基には、例えばニトロインドール誘導体、ニトロイミ ダゾール誘導体、ニトロトリアゾール誘導体などの少なくとも1個のヘテロ原子 を含む融合または非融合の環系のいずれのヘテロ環も包含する。 本明細書に示すDNA結合基には次のものを含む:すなわち1)化学的修飾に よってDNAと相互作用する共有結合性DNA結合基(例えば、マスタードガス 誘導体、ソラーレン(psoralen)およびその誘導体、マイトマイシンC 、など)、2)水素結合形成、インターカレーション、静電的な力、などによっ てDNAと相互作用する非共有結合性のDNA結合基。DNA(またはRNA) の官能基と核酸結合リガンドの官能基との間の水素結合形成は、抗生物質(たと えば、ジスタマイシン、ネトロプシン、エチノマイシンなど)または蛋白質(た とえば、レプレッサー、レストリクターゼなど)またはオリゴヌクレオチド(た とえば、DNA二重ストランド形成、またはDNA三重ストランド形成など)に よる核酸(特に二重鎖核酸)の特異的な認識に重要な役割を果たす。インターカ レーションは、インターカレーターと呼ばれている平面的な芳香族性(ヘテロ) 環性基の挿入を可能にするために隣接する塩基対2個を隔離することに関する、 核酸で観察される特別な種類のスタッキングである。本明細書に示す二重ストラ ンド核酸に結合することのできるインターカレーターには、例えばアクリジンま たはその誘導体、フェナントリジンまたはその誘導体などを包含する。本明細書 に示す核酸の三重ストランドクラスターに優先的に結合することのできる(二重 鎖と比較して)インターカレーターには、例えばコラリーン(プロトベルベリン 族アルカロイドcoralyne)、プロピジウムブロミドなどを含む。 本明細書に示すキャリアーには、例えばポリアミン基(たとえば、ポリエチレ ンイミン、スペルミン、スペルミジン、ポリ−L−リジン、スターバーストデン ドリマーなど)、または脂肪親和性基(たとえば、コレステロール、アルキル鎖 など)または可溶性ポリマー(たとえば、ポリエチレングリコール、ポリサッカ ライド、蛋白質など)または非溶解性ポリマー(たとえば、デキストラン、ポリ アクリルアミド誘導体、ポリビニル誘導体など)によるものまたは標的リガンド (たとえば、標的細胞、抗体、免疫グロブリンの表面で受容体に結合する部位と して作用する糖または糖ホスフェート残基、など)を含む。 本明細書で使用する「ヌクレオシド」はヘテロ環塩基および糖から構成される 単位を示し、たとえばKornbergとBaker著、「DNA・Repli cation(DNA複製)」、第2版、(Freeman社、サンフランシス コ、1992年)に記載されているような2’−デオキシおよび2’−ヒドロキ シ型を含む天然起源ヌクレオシドを含む。天然起源のヌクレオシドでは、ヘテロ 環塩基は典型的にはアデニン、シトジン、グアニン、チミン、またはウラシルで ある。その糖は正常にはデオキシリボース、すなわちエリスロ−ペントフラノシ ルであるか、またはリボース、すなわちリボーぺントフラノシルである。ヌレオ シドに関連する「類縁体」はたとえばScheit著、「Nucleotide .Analogues(ヌクレオチド類縁体)」、(John・Wiley社、 ニューヨーク、1980年)などのように、修飾された塩基部分(例えば、5( 6)ーニトロインドール、4−ニトロトリアゾール、3(4)−ニトロベンズイ ミダゾール、2−アミノプリン、ベンズイミダゾール、5−フルオロウラシル、 その他)および/または修飾された糖部分(例えば、アラビノ、キシロ、または リキソ−ペンタフラノシルの糖、または置換されたアラビノ、エリスロ、リボ、 キシロまたはリキソ−ペンタフラノシルの糖、または糖類似性非環状部分、また はヘキソース糖、その他)を有する合成ヌクレオシドを含む。このような類縁体 には合成のために適当な保護基を有しているかまたは有していない天然および合 成ヌクレオシドを含む。 本明細書で使用する「ヌクレオチド」は糖のヒドロキシル基の少なくとも1個 にエステル化されたホスフェート基を有するヌクレオシドを示す。 本明細書で使用する用語「オリゴヌクレオチド」にはデオキシリボヌクレオシ ド、リボヌクレオシド、そのアルファ−アノマー型、などを含む天然のまたは修 飾されたヌクレオシドの直線状オリゴマーであって、通常はホスホジエステル結 合またはその類縁体によって結合しており、たとえば2個〜3個と少数なモノマ ー単位から数百個におよぶモノマーユニットを有するサイズまでを包含する。オ リゴヌクレオチドに関する「類縁体」は、たとえば修飾された糖部分、修飾され た塩基部分または修飾された糖結合部分のように修飾された部分を含む構造を示 す。これらの中で例示的なものはホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、 ホスホロアミデート、ホスホロアニリデート、ホスホジエステル性のヌクレオシ ド間結合がホスホジエステル性ヌクレオシド間結合の代りに使用される、デアザ またはアザ体のプリンおよびピリミジンを天然のプリンまたはピリミジンの代わ りに用いてもよい。例えば4−、5−または6−位に置換基を有するピリミジン 塩基、例えば2−、6−または8−位に変化または置換基を有するプリン塩基、 または2’一位に置換基を有する糖、糖の水素原子1個またはそれ以上について の置換、または炭素環性の糖がある。好ましくは、本発明のオリゴヌクレオチド はモノマーユニット2個から50個までの範囲の長さを有する天然ヌクレオシド 、より好ましくはモノマーユニット2個から20個までの範囲の長さを有するオ リゴマーである。 前記の通り、本発明の化合物はオリゴヌクレオチドまたは修飾されたオリゴヌ クレオチドまたは要すれば末端が修飾されていてもよい所謂「オリゴヌクレオシ ド」(すなわち、ホスフェート不含オリゴヌクレオチド)によって表され、少な くともその一部が式Ia: 式Ia で示される構造を有するものである。 式Iaにおいて、置換基WおよびW1は本マクロ分子の残余の部分を示す。W およびW1は本化合物の有用性を損なうことのない置換基であってもよい。好ま しくはWおよびW1は各々が独立に−H;−OH;要すれば修飾されていてもよ いホスフェートまたはホスフェート類縁体;ヌクレオシドまたはその類縁体;ヌ クレオチドまたはその類縁体;オリゴヌクレオチドまたはその類縁体;アミノ; メルカプト;DNAインターカレーター;共有結合または非共有結合性のDNA 結合基;ヘテロ環基;または芳香族性基であっていずれも要すれば保護基を含ん でいてもよいもの;ペプチドまたはその類縁体;キレート形成基(たとえば、E DTA);ポリマー(たとえば、ポリアミド、ポリカチオン、ポリアニオンその 他);糖;配糖体;ポリサッカライド;または脂溶性基である。 好ましくは、各Bは独立に天然起源ヌクレオベース、非天然起源ヌクレオベー ス、ヘテロ環基、芳香族性基、DNAインターカレーター、共有結合性または非 共有結合性のDNA−結合基を含み、さらに好ましくは各Bは天然起源ヌクレオ ベースまたは非天然起源ヌクレオベースである。各Bについてのもっとも好適な 選択は天然起源ヌクレオベースである。 ある種の好適な態様では、B1の少なくとも1個が天然起源ヌクレオベースで ある。別の好適な態様では、B1の少なくとも1個が非天然起源ヌクレオベース である。他の好適な態様では、B1の少なくとも1個がDNAのインターカレー ター(たとえば、アクリジン誘導体、フェナジン誘導体などのようなもの)であ る。これとは別の好適な態様では、B1の少なくとも1個が共有結合性DNA結 合基(たとえば、マスタードガス誘導体、ソラーレン誘導体などのようなもの) である。その他の好適な態様では、B1の少なくとも1個がDNA結合性抗生物 質(たとえば、ダウノマイシン、アクチノマイシンDまたはアクチノマイシン族 のその他の代表例、ネトロプシンおよびその誘導体、ジスタマイシンおよびその 誘導体、その他のようなもの)である。その他の好適な態様では、B1の少なく とも1個がレポーター基(たとえば、螢光性または化学発光性標識、ビオチン、 その他のようなもの)である。その他の好適な態様では、B1の少なくとも1個 が特定の細胞を認識するための標的基(たとえば、抗体または配糖体のようなも の)である。その他の好適な態様では、B1の少なくとも1個が可溶性または非 可溶性のポリマーである。その他の好適な態様では、B1の少なくとも1個がオ リゴヌクレオチドの合成後修飾に適する反応性官能基(たとえば、アミノ、メル カプト、アルデヒド、カルボキシ、その他のようなもの)である。 好適な態様において、nは1から20までであり、最も好ましくは、n=1で ある。 ある種の好適な態様では、B1が天然起源ヌクレオベースまたは非天然起源ヌ クレオベースであり、Xが原子を1個から4個まで含む。他の好適な態様では、 B1をDNAインターカレーター、共有結合性または非共有結合性のDNA結合 基、またはDNA結合性抗生物質から選択する時には、X1は原子1個から12 個を含む。最も好適な態様では、B1がヌクレオベースであって、X1がメチレン カルボニルである。 好適な態様ではQ1およびQ2の各々は独立に少なくとも1個の以下の基を含有 する:すなわち、酸素、硫黄、置換炭素、カルボニル、チオカルボニル、スルホ ン、スルホキシド、C1〜C8−アルキレン、C2〜C8−アルケニレン、C2〜C8 −アルキニレン、C1〜C8−オキサアルキレンまたはチアアルキレンまたはアザ アルキレンであって、各々異なるヘテロ原子または同じ型のヘテロ原子を1個ま たは2個含むもの、またはいずれかの向きにあるNR7またはNR89またはN R7C(=O)−またはNR7C(=S)−または−NR7S(=O)−または− NR7S(=O)2−であって、ここにR7、R8およびR9は前記定義のもの、ま たはXであって、ここにXは前記定義のもの、または式: [式中、 Z4またはZ5は各々独立に一重結合、O、S、およびNR7から構成される群 から選択されるが、このR7は前記定義のものである。 各Z3は独立に水素、R8、OR7、SR7、およびNR78から構成される群か ら選択されるが、このR7およびR8は前記定義のものである。 各Z2は独立にO、S、およびNR7から構成される群から選択されるが、この R7は前記定義のものである] で示される基。 ある種の好適な態様ではQ1およびQ2の各々は独立に2個から8個までの原子 を含む。より好適な態様ではQ1およびQ2の各々は独立に3個から6個までの原 子、もっとも好適な態様では4個または6個の原子を含む。もっとも好適には、 各Q1は独立に次の基から選択される:いずれかの向きにおける−O−CH2−C H2−CH2−、−O−CH2−C(=O)−NH−、−NH−NH−C(=O) −CH2−、−NH−N=CH−CH2−、−NH−NH−CH2−CH2−、−O −NH−C(=O)−CH2−、−O−N=CH−CH2−、−O−NH−CH2 −CH2−、−CH2−NH−C(=O)−CH2−、−NH−NH−C(=O) −NH−、−O−C(=O)−NH−CH2−CH2−、−O−P(=Z2)Z3− NH−CH2−CH2−、または−CH2−NH−CH2−CH2−。および 各Q2は独立に次の基から選択される:すなわちQ1、−CH2−O−CH2−C H2−CH2−、−CH2−O−CH2−C(=O)−NH−、−CH2−NH−N H−C(=O)−CH2−、−CH2−NH−N=CH−CH2−、−CH2−NH −NH−CH2−CH2−、−CH2−O−NH−C(=O)−CH2−、−CH2 −O−N=CH−CH2−、−CH2−O−NH−CH2−CH2−、−CH2−N H−C(=O)−CH2−、−CH2−NH−NH−C(=O)−NH−、−O− C(=O)−NH−CH2−CH2−、−O−P(=Z2)Z3−NH−CH2−C H2−、または−CH2−CH2−NH−CH2−CH2−。 好ましくはVの少なくとも1個は酸素である。各Vについて最も好適な選択は 酸素である。 最も好適な態様では、Jの少なくとも1個は水素、フッ素、またはOCH3の 群から独立に選択される。Jについての最も好適な選択は水素である。 本発明の化合物は標準的なオリゴヌクレオチド合成操作法または標準的なペプ チド合成操作法を適用して、またはこれらの操作法を組合せて、液相または固相 で合成される。 標準的なオリゴヌクレオチド合成操作法を使用して、式II: 式II で示される伸長するオリゴヌクレオチドまたは修飾されたオリゴヌクレオチド鎖 の5’−末端に式Iで示される断片を導入することによって本発明の化合物を製 造することもある。 [式中、 B、B1、Q1、Q2、VおよびJは前記定義のものであっていずれも要すれば 適切な保護基(たとえば、アセチル、イソブチリル、フェノキシアセチル、ベン ゾイル、シアノエチル、4−ニトロフェニルエチルオキシカルボニル、4−ニト ロフェニルエチル、ベンジルオキシカルボニル、p−アニシルジフェニルメチル 、ジ−p−アニシルフェニルメチル、ピクシル、t−ブチルオキシカルボニル、 ジフェニルカルバモイル、ホルムアミジノ、アセトアミジノ、炭素原子3個から 14個を有するトリアルキルシリル、9−フルオレニルメチルカルバメート、そ の他;GreeneとWuts著、「Protective・Groups・i n・Organic・Synthesis(有機合成における保護基)」、第2 版(John・Wiley社、ニューヨーク、1991年)参照)で閉鎖してあ ってもよい。 各Q3は独立に一重結合、酸素、硫黄、−NR8−、−OX−、−SX−、−X −または−NR8Xを含み、ここにXおよびR8は式Iに関して前記定義のもので あり、好ましくは各Q3は独立に一重結合、−OCH2−、−SCH2−、−CH2 −、−NR8CH2−、−CH2CH2−、および−OCH2−CH2−を含む。Q3 についての最も好適な選択は−OCH2−である。 各Q4は独立に一重結合、酸素、硫黄およびNR8を含むが、ここにR8は式I に関して前記定義したものである。 Yは、たとえばトリフェニルメチル、p−アニシルジフェニルメチル、ジ−p −アニシルフェニルメチル、ピクシル、炭素原子3個から14個を有するトリア ルキルシリル、9−フルオレニルメチルカルバメート、トリフルオロアセチル、 その他のような保護基である。さらに好ましくは、Yはp−アニシルジフェニル メチル、ジ−p−アニシルフェニルメチル、またはピクシルである。 Y1は固体の支持体に結合するスペーサー基であって、このスペーサーはカル ボニル、エステル、カルバメート、ウレタン、ヒドラジド、C1〜C14−アルキ レンまたは修飾されたアルキレン、C6〜C14−アラルキレンまたは修飾された アラルキレン、C6〜C14−アルキルアリーレンまたは修飾されたアルキルアレ ーン、C1〜C100−オキサアルキレンまたはチアアルキレンまたはアザアルキレ ンであって各々1個から50個の異なるヘテロ原子または同じ型のヘテロ原子を 含むがこのアザ基は要すればアミノ保護基、C1〜C14−アルキレンカルボニル または修飾されたアルキレンカルボニルまたはアルキレンスルホンまたはアルキ レンスルホキシドで保護されていてもよく、C1〜C100−オキサアルキレンカル ボニルまたはチアアルキレンカルボニルまたはアザアルキレンカルボニル(また はそのチオカルボニルまたはスルホンまたはスルホキシド類縁体)であって、各 々1個から50個の異なるヘテロ原子または同じ型のヘテロ原子を含むがこのア ザ基は要すればアミノ保護基で保護されていてもよい、または式(III): 式III [式中、 各R10またはR11は独立にC3〜C10−分枝アルキル、C1〜C10−非分枝アル キルまたはオキサアルキル、C6〜C10−アリール、C7〜C12−アラルキルを含 む。R10またはR11の各々のより好適な選択はC3〜C10−分枝アルキルまたは C1〜C4−非分枝アルキルであり、R10またはR11の各々の最も好適な選択はイ ソプロピルである。 R12はC2〜C8−アルキレン、C2〜C8−アルケニレン、またはC2〜C8−オ キサアルキレンであって、ヘテロ原子1個または2個を含む。最も好適なR12は モルホリノ基である。 Z5はいずれかのホスフェート保護基であって、好ましくは4−Cl−C64 −O−、2−Cl−C64−O−、4−NO2−C64CH2CH2−O−、2, 4−NO2−C63CH2CH2−O−、2,4−Cl−C63−O−、2,3− Cl−C63−O−、NCCH2CH2−O−、NCCH2−C(CH32−O− 、CH3O−、(Z)3CCH2−O−、R10S−、R10S−CH2CH2−O−、 またはR10SO2−CH2CH2−O−であるが、このZはハロゲンであり、R10 は独立に前記の意味の中から選択される。 Z6は−F、−Cl、−Br、−I、イミダゾール−1−イル、テトラゾール− 1−イル、1,2,4−トリアゾール−1−イル、および1−ヒドロキシベンゾ トリアゾール−O−イルである。ある種の好適な態様では、Y1は本質がCPG またはポリスチレンである官能化固体支持体である。他の好適な態様ではY1は −HP(=O)OHまたはその塩である。別の好適な態様ではY1は−P−(O CH2CH2CN)(N(i−Pr)2)であるか、または−P(OCH3)−(N (i−Pr)2)である] で示される基、またはその塩である。 式(III)で示される化合物は通常(活性燐酸基Y1に関して)ホスホロア ミダイト(III−1およびIII−2)、燐酸(III−3)、H−ホスホネ ート(III−4)および活性ホスホジエステル(III−5)として知られて いる。構造(III−3)および(III−4)は中庸に強力な酸を代表し、こ れらの構造で表される試薬は一般にはその有機的に可溶性の塩として分離され、 使用される。 伸長する修飾されたオリゴヌクレオチド鎖の5’−末端に式Iで示される断片 を導入するための新規化合物は式IV: または 式IV [式中、 B、B1、Q1、Q2、V、XおよびJは前記定義のものであっていずれも要す れば適切な保護基で閉鎖してあってもよい。 Q1 xおよびQ2 xは各々Q1またはQ2の要すれば保護されたまたは活性化された 断片を含む。より好ましくはQ1 xおよびQ2 xは各々原子1個から3個を含み、い ずれも要すれば保護基を含む。最も好適な態様では各Q1 xは独立にY2−NH− CH2−、Y2−NH−O−、Y2−NH−NH−、Y2−NH−、Y2−NH−C H2−CH2−、Y2−NH−NH−CH2−、Y2−NH−C(=O)−CH2−、 Y2−NH−C(=O)−NH−、Y2−NH−NH−C(=O)−、を含み、こ のY2は保護基または水素である。より好ましくはY2はp−アニシルジフェニル メチル、ジ−p−アニシルフェニルメチル、ピクシル、9−フルオレニルメチル カルバメート、またはトリフルオロアセチルである。各Q2 xは独立にE−CH2 −CH2−、E−CH2−、E−NH−、E−O−を含むが、このEは独立にハロ ゲン、アルデヒド、アセタール、−S(=O)213、または−COR13であっ て、このR13はヒドロキシルまたは活性化基である。より好ましくはR13はハロ ゲン、ヒドロキシル、ペンタフルオロフェノキシ、テトラフルオロフェノキシ、 p−ニトロフェノキシ、またはN−サクシンイミドオキシから選択される] で表される。 本発明の化合物を5群に分類することもある。 (1)オリゴヌクレオチド類縁体であって、その非ヌクレオシド性結合が核酸 の塩基を有するもの。 (2)オリゴヌクレオチド類縁体であって、その非ヌクレオシド性結合が共有 結合性DNA結合基または非共有結合性DNA結合基またはDNAインターカレ ーターまたはDNA結合性抗生物質を有するもの。 (3)オリゴヌクレオチド類縁体であって、その非ヌクレオシド性の好適には 非ホフェート含有性の結合基がオリゴヌクレオチドまたは修飾オリゴヌクレオチ ドのクラスターを結合する新規な型のリンカーとして使用されるもの。 (4)オリゴヌクレオチド類縁体であって、その非ヌクレオシド性結合基がキ ャリアーまたはポリマーまたは標的リガンドまたは脂肪溶解性基を有するもの。 および (5)オリゴヌクレオチド類縁体であって、その非ヌクレオシド性結合が、た とえばビオチンのようなレポーター基を有するもの。 これらのオリゴヌクレオチド類縁体(1)〜(5)は一本鎖または二本鎖の核 酸の両方を認識することができる。式Iで示される断片を3’−および/または 5’−末端に、またはオリゴヌクレオチド鎖内に有するオリゴヌクレオチド類縁 体(1)はDNA断片に結合する性能を示すと同時に酵素安定性の増加を示す。 オリゴヌクレオチド鎖の特定の位置に式Iで示される断片を有するオリゴヌクレ オチド類縁体(2)は二重ストランドのDNAまたはRNAに効率的に結合し、 共有結合性DNA結合基または非共有結合性DNA結合基またはDNAインター カレーターまたはDNA結合性抗生物質の結合はトリプレックスを形成するオリ ゴヌクレオチド(TFO)によってポリピリミジントラクトを認識する問題を克 服する新しい機会を提供する。オリゴヌクレオチド類縁体(3)は新型のTFO として使用することができる。オリゴヌクレオチド類縁体(4)および(5)は オリゴヌクレオチド抱合体の合成に有用である。 本発明化合物の改良された酵素的安定性および結合性能および細胞膜透過性は アンチセンス(RNAへの結合)または抗原(DNAへの結合)試薬として効率 的にする。 また、本発明は特定の遺伝子の転写および/または複製を阻害するための試薬 および方法を提供する。また、前記定義の本発明化合物をある生物に投与するこ とによってその生物の細胞内における二本鎖DNAの特定領域を分解するための 薬剤および方法を提供する。 さらに本発明は細胞(たとえば腫瘍細胞のようなもの)または病原性生物(た とえば、ウイルス、細菌、真菌、その他)を殺すかまたは変異させる試薬および 方法を提供する。これはその細胞または生物をその細胞または生物に特異性を有 する本発明の化合物または組成物と接触させることによるものである。 この本発明の処置法に感受性のあるウイルスは通常の熟練者には容易に決定で きるものとなろう。これにはヘルペス・シンプレックスウイルス(HSV)、ヒ トパピローマウイルス(HPV)、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)などを含む であろう。 治療的または予防的処置のためには本発明の化合物は医薬的組成物として製剤 化してもよい。これには有効量の活性成分に加えて、医薬的に許容される担体、 増粘剤、希釈剤、緩衝液、保存剤、界面活性剤、その他を含有していてもよい。 医薬的組成物はまた、たとえば抗微生物剤、抗炎症剤、その他のような他の活性 成分を1種またはそれ以上含有していてもよい。 本発明の医薬的組成物は通常の熟練者に知られているような多数の方法で投与 してもよい。投与は、例えば局所的に、経口的に、吸入により、または非経口的 に行ってもよい。 局所的製剤には軟膏剤、ローション剤、クリーム剤、ゲル剤、ドロップ剤、坐 剤、スプレー剤、液剤、および粉剤を包含することもある。経口用製剤には例え ば粉末剤、顆粒剤、懸濁剤、または水溶液剤または非水性媒体剤、カプセル剤、 または錠剤を包含する。必要ならば、増粘剤、矯味剤、希釈剤、乳化剤、分散補 助剤、または結合剤も使用することがある。 非経口用製剤は緩衝液、希釈剤、およびその他の適当な添加剤を含有している こともある無菌水溶液を包含することもある。 用量計画は、たとえば処置すべき病状の重症度および応答性のような容易に決 定できる多数の因子に依存するものであるが、しかし正常には数日から数月にわ たる処置の過程で毎日1回またはそれ以上となるか、または治療が効果を現すま で、または病状の減退を見るまでとなる。通常の熟練者は至適な用量、投与方策 および反復のレートを容易に決定することができよう。一般的に、本発明の単位 用量剤型の組成物が約0.01mgから約100mgの活性成分、好ましくは約 0.1mgから約10mgの活性成分を含有するものである。局所用製剤(たと えばクリーム剤、ローション剤、液剤、その他のようなもの)は活性成分の濃度 として約0.01%から約50%まで、好ましくは約0.1%から約10%まで を有してもよい。 以下の図および反応式は限定的なものではなく、本発明の化合物および有用性 を例示するものである。図I〜IVは結合基Q1およびQ2の構造が異なる本発明 の三量体断片をいくつか示す(本明細書記載の式Iを参照)。B−1(図1)か らB−24(図6)までに記載した構造は全て結合基の異なる本発明のオリゴヌ クレオシドの三量体断片を代表するが、ここではBαは好ましくは核酸塩基であ る。構造C−1(図7)からC−9(図9)まではQ1−N−Q2にあるアザ窒素 原子がインターカレーター部分が結合する部位の役目をする例を代表する。式C −1(図7)はアクリジン残基がアシル型スペーサーを経て結合する場合を例示 する。式C−2でアクリジン残基はアルキル型スペーサーを経て結合している。 両構造において、インターカレーターはプロピルイミノプロピルであるヌクレオ シド間結合基にあるN−原子に結合している。C−3からC−6までの構造(図 8)は比較的長い(20から30原子)ホスフェート不含ヌクレオシド間結合基 にあるアザ原子へのインターカレーターの結合の例を示す。図9はコラリーン残 基が結合している本発明の構造を示す。報告されているように(J.S.Lee 、Biochemistry、1993年、32巻:5591〜5597頁)、 コラリーンは二本鎖との結合(結合定数は約103〜104-1である)と比較し てトリプレックス結合(結合定数は約106-1である)にはかなりの優先性を 示す。三重ヘリックスを形成するオリゴヌクレオチドに抱合しているコラリーン は形成されたトリプレックスの自己安定化に望ましいこともあろう。 図10および図11はDNA共有結合基(すなわちソラーレン)が本発明のヌ クレオシド間リンカーに抱合する場合を代表する。ソラーレンは二重ストランド DNA分子に優先的に結合し、オリゴヌクレオチドを形成するトリプレックス内 にある非塩基性部位へのソラーレンの結合はDNA2本鎖の部位修飾の正確さを かなり増加することになろう。 図12〜図14はアザ−窒素に結合する官能基を有する本発明トリマーユニッ トの例を示す。これら官能基はDNA活性物質(たとえばインターカレーター、 アルキレーター、DNA結合性抗生物質、またはその他の前記核酸結合基のいず れか)によるオリゴヌクレオチドの合成後修飾の部位として使用される。 本発明の化合物を合成するための様々な方法を以下の反応式に要約するが、こ れは以下に詳記する。 式I式II式III式IV式V式VI式VII式VIII 式IX 式X 式XI 式XII式XIII 式XIV式XV 式XVI 反応式Iは糖間結合基−OCH2CH2CH2N[X−B1]−CH2CH2CH2O CH2−(3’→4’)を有する式B−1(図1)で示される断片を含むトリヌ クレオシド単位の合成を例示する。保護された塩基および部分的に保護された糖 基を有するヌクレオシド(化合物I)の3’−位をシアノエチル化し(下記の実 施例2)、アミノプロピル誘導体にまで還元し(化合物5、実施例5)、次にト リフルオロアセチル化する(化合物6、実施例6)。この変換のもう一つの経路 はヌクレオシドの5’−位をアリル化し、続いて3−ブロモプロピル誘導体に変 換する(化合物9)。この反応は実施例7、8および9に例示する。化合物6を 化合物9でアルキル化して化合物10を得る。このオリゴヌクレオシド骨格の塩 基およびアザ−窒素を脱保護して化合物12を得る(実施例5)。化合物12は 本発明の種々の化合物を合成するための鍵となる物質である。例えば、化合物1 2を様々なヘテロ環塩基(たとえば、チミン、シトジン、アデニンおよびグアニ ン)のカルボキシメチル誘導体の活性化エステルでアシル化すると、各々トリヌ クレオシド14a、14b、14c、および14dが得られる(下記の実施例1 6〜18)。化合物12をN−保護−ω−アミノ酸誘導体(たとえば、N−Fm oc−4−アミノ酪酸)でアシル化して、このトリマー性のユニットをオリゴヌ クレオチド鎖に導入すると、脱保護した後に、その構造にアミノで修飾された( 非塩基性)部位(モチーフE−2、図12)を有するオリゴヌクレオチドが得ら れる。ここでは脂肪族性のアミノ基は種々のDNA−活性基の結合部位として役 立つ。化合物12をS−保護−ω−メルカプト酸誘導体(たとえば、3−Tr− 4−メルカプト酪酸)でアシル化してこのトリマー性ユニットをオリゴヌクレオ チド鎖に導入すると、脱保護の後に、その構造にメルカプトで修飾された(非塩 基性)部位(モチーフE−3、図12)を有するオリゴヌクレオチドが得られる 。ここでは脂肪族性のメルカプト基は種々のDNA−活性基の結合部位として役 立つ。化合物12を2,3−ジ−O−Fmoc−1−O−カルボキシメチルグリ セリンの活性化誘導体でアシル化してこのトリマー性ユニットをオリゴヌクレオ チド鎖に導入すると、脱保護の後に、その構造にシス−ジオールで修飾された( 非塩基性)部位(モチーフE−4、図12)を有するオリゴヌクレオチドが得 られる。このシス−ジオール基は過沃素酸酸化の後に種々のDNA−活性基の結 合部位として役立つアルデヒド基を与える。化合物12をジカルボン酸(たとえ ば、アジピン酸、ピメリン酸、スベリン酸、その他)のN−Fmoc−保護モノ ヒドラジド誘導体の活性化誘導体でアシル化してこのトリマー性ユニットをオリ ゴヌクレオチド鎖に導入すると、脱保護後に、その構造にヒドラジドで修飾され た(非塩基性)部位(モチーフE−5、図12)を有するオリゴヌクレオチドが 得られる。このヒドラジド基は脱保護の後に種々のDNA−活性基の結合部位と して役立つ。 反応式IIは糖間結合基−OCH2CH2CH2N[X−B1]−CH2−C(= O)NHQ3−CH2−(3’→4’)を有する断片を含むオリゴヌクレオシドを 製造するための中間体の合成を例示する。このオリゴヌクレオチド類縁体には式 B−2、B−3、またはB−4(図1)を有する化合物を包含する。化合物6( 反応式Iおよび実施例6を参照)はこの中間体を合成するための出発物質である 。化合物6をDMF中、水素化ナトリウムの存在下にブロモ酢酸のt−ブチルエ ステルでアルキル化して化合物19を得る(実施例23)。これは水素化すると 化合物20に変換される(実施例24)。トリフルオロアセチル保護基を化合物 20からアンモノリシスによって脱離させて化合物21が得られる(実施例25 )。化合物21を核酸塩基の活性化カルボキシメチル誘導体でアシル化して化合 物22を得(実施例26、27、28)、これを脱保護し、5’−O−保護基を テトラヒドロピラニルからモノメトキシトリチルに交換した後、カルボン酸誘導 体23に変換する(実施例29、30、31)。化合物23は直接的な縮合のた めに使用でき、また、例えば、活性化エステル24に変換できる(実施例32、 33、34)。 反応式IIIは糖間結合基−Q3NHC(=O)CH2N[X−B1]CH2−C H2CH2OCH2−(3’→4’)を有する断片を含むオリゴヌクレオシドの製 造用の中間体の合成を例示する。このオリゴヌクレオシドには式B−5、B−6 、またはB−7(図2)を有する化合物を包含する。化合物7(反応式I、実施 例7を参照)はこの中間体を合成するための出発物質である。化合物7をシアノ エ チル化して化合物25を得る(実施例35)。これは還元の後にトリフルオロア セチル化して化合物26を得る(実施例36)。化合物26をDMF中、水素化 ナトリウムの存在下にブロモ酢酸のt−ブチルエステルでアルキル化して化合物 27を得る(実施例37)。これは酸性で脱保護した後にカルボン酸誘導体28 に変換する(実施例38)。化合物28を飽和アンモニア性エタノール溶液で処 理し、核酸塩基の活性化カルボキシメチル誘導体でアシル化して化合物29を得 る(実施例39、40、および41)。化合物29をジメトキシトリチル化して 3’−ヒドロキシル基を保護して化合物30を得る(実施例42)。これは直接 的な縮合のために使用でき、また、例えば、活性化エステル31に変換できる( 実施例43)。 反応式IVは一般式24の化合物から出発して、式B−2、B−3、またはB −4(図1)のモチーフを含むトリヌクレオシド33の合成を例示する。また、 反応式IVは部分的に保護されたトリヌクレオシド32からホスホロアミダイト 34およびCPG誘導体35への変換経路を示す。 反応式Vは一般式31の化合物から出発して式B−5、B−6、またはB−7 (図2)のモチーフを含むトリヌクレオシド37を合成する実例を例示する。ま た、反応式Vは部分的に保護されたトリヌクレオシド36からホスホロアミダイ ト38およびCPG誘導体39への変換を示す。 反応式VIは糖間結合基−OCH2CH2CH2N[X−B1]CH2C(=O) NHCH2CH2−(3’→4’)を含むペプチド様オリゴヌクレオシド54の合 成を例示する。合成の方策は反応式Iに記載したものと同様である。保護された 塩基および部分的に保護された糖部分を有するホモヌクレオシド(化合物40、 実施例43)の3’−位をシアノエチル化すると化合物41が得られる(実施例 44)。これの5’−O−保護基をモノメトキシトリチルからテトラヒドロピラ ニルに交換した後に化合物42に変換する(実施例45)。化合物42を還元し てアミノプロピル誘導体とする(化合物43、実施例46)。アミノ基をトリフ ルオロアセチル保護基で閉鎖して化合物44を得る(実施例47)。化合物44 を水素化ナトリウムの存在下にブロモ酢酸のt−ブチルエステルでアルキル化す る(化合物45、実施例48)。6’−O−THP基をTHF中でCBr4/P( Ph)3で処理してブロモ誘導体に変換する(化合物46、実施例49)。化合 物46をDMF中でジ−t−ブチルイミノジカルボン酸のナトリウム塩で処理し て化合物47を得る(実施例50)。これは加水素分解およびアンモニア処理で 化合物48に変換される。化合物48を核酸塩基の活性化カルボキシメチル誘導 体でアシル化すると修飾されたジヌクレオシド49が得られる(実施例52およ び53)。酸活性保護基(Boc−およびtert−ブチル保護基)は50%T FA/DCMで除去され、6’−アミノ官能基をモノメトキシトリチル保護基で 閉鎖して化合物50を得る(実施例54および55)。化合物50は化合物54 の式の中の角括弧内に示す規則的な反復エレメントを有するオリゴヌクレオシド を固相ペプチド合成様に合成するためのビルディングブロックとして使用できる 。化合物50はまた反応式VIに示すように溶液中でのペプチド様オリゴヌクレ オシドの合成のためのビルディングブロックとして使用できる(化合物53およ び化合物54、実施例59〜実施例64)。 反応式VIIは糖間結合基−OCH2CH2CH2N[X−B1]CH2C(=O )NHN(CH3)CH2−(3’→4’)を含むペプチド様オリゴヌクレオシド 69の合成を例示する。合成の方策は反応式VIに記載したものと同様である。 反応式VIIIは一般式13で示される物質(反応式I参照)から出発して、 式B−1(図1)で示されるモチーフを含むトリヌクレオシドのホスホロアミダ イト18およびトリヌクレオシドのCPG誘導体17の合成を例示する。 反応式IXはアミノアルキルリンカーを含む非塩基性部位を有する5’−モノ メトキシトリチル保護トリヌクレオシド(化合物71)の合成およびこの化合物 のホスホロアミダイト72への変換を例示する。オリゴヌクレオチド鎖にホスホ ロアミダイト72を導入した後に脱保護すると、その構造にアミノ修飾(非塩基 性)部位(モチーフE−2、図12)を有するオリゴヌクレオチドを得る。その 脂肪族性アミノ基は種々のDNA活性基、たとえばアクリジン基(構造C−1、 図7)、コラリーン基(構造C−8、図9)またはソラーレン基(構造D−1、 図10)、などのための選択的結合部位として役立つ。 反応式Xは脂肪族性メルカプト基を含む非塩基性部位を有する5’−モノメト キシトリチル保護トリヌクレオシド(化合物74)の合成およびこの化合物のホ スホロアミダイト75への変換を例示する。オリゴヌクレオチド鎖へのホスホロ アミダイト75の導入は、脱保護の後、その構造にメルカプト修飾(非塩基性) 部位(モチーフE−3、図12)を有するオリゴヌクレオチドを得る。その脂肪 族性アミノ基は種々のDNA活性基、たとえばソラーレン基(構造D−2、図1 0)、などのための選択的結合部位として役立つ。 反応式XIはFmoc−保護ヒドラジド修飾非塩基性部位(モチーフE−5、 図13)を含むトリヌクレオシドのホスホロアミダイト75の合成を例示する。 反応式XIIは2,3−ジ−O−Ac−1−O−カルボキシメチルグリセリン 修飾非塩基性部位(モチーフE−4、図12)を有するトリヌクレオシドのホス ホロアミダイト81の合成を例示する。この三量体ユニットをオリゴヌクレオチ ド鎖に導入すると、脱保護した後に、その構造にシス−ジオール修飾非塩基性部 位(モチーフE−3、図12)を有するオリゴヌクレオチドを得る。このシス− ジオール基は、過ヨード酸酸化すると、様々なDNA活性基の結合部位としての アルデヒド基を与える。 反応式XIIIはトリヌクレオシド骨格にトリフルオロアセチル保護アザ−窒 素を含む非塩基性部位(モチーフE−1、図12)を有するホスホロアミダイト 83の合成を例示する。この三量体ユニットをオリゴヌクレオチド鎖に導入する と、脱保護した後に、その構造にトリヌクレオシド骨格中のアザ−窒素に置換基 を含まない非塩基性部位(モチーフE−1、図12)を有するオリゴヌクレオチ ドを得る。 反応式XIVはコラリーンのカルボキシル誘導体における活性化エステル88 の合成を例示する。化合物88はコラリーン部分を有するアミノアルキル型リン カーを含むオリゴヌクレオチドの合成後修飾に使用される。 反応式XVはソラーレンのカルボキシル誘導体における活性化エステル93の 合成を例示する。化合物93はソラーレン部分を有するアミノアルキル型リンカ ーを含むオリゴヌクレオチドの合成後修飾に使用される。 反応式XVIはオリゴヌクレオシド骨格にトリフルオロアセチルで保護された アザ−窒素を含む非塩基性部位(モチーフE−9、図14)を数個有するホスホ ロアミダイト101の合成を例示する。このユニットをオリゴヌクレオチド鎖に 導入すると、脱保護した後に、その構造にマイナス荷電燐酸基をその断片の骨格 に含まない非塩基性ポリオキサアザアルキレン断片で結合している規則的なホス ホジエステルオリゴヌクレオチドのクラスター(モチーフE−9、図14)を有 するオリゴヌクレオチドを得る。 以下の実施例は本発明の化合物および利用を例示するが、それを限定するもの ではない。 温度は全て摂氏で表す(25℃は常温または室温を示す)。別段の記載がなけ れば部は全て重量部であるが液体混合物については例外的に容積で表す。以下の 略号を使用した:AcOEtは酢酸エチル;DCEは1,2−ジクロロエタン; DCMはジクロロメタン;DIPFAはジイソプロピルエチルアミン;DMFは ジメチルホルムアミド;DMSOはジメチルスルホキシド;EtOHはエタノー ル;MeOHはメタノール;THFはテトラヒドロフラン;Pyはピリジン;P heはフェニル基;PPTSはp−トルエンスルホン酸ピリジン塩;TFAはト リフルオロ酢酸;Thyはチミン−1−基;Meはメチル基;Etはエチル基; Glyはアミノ酸であるグリシンの残基;dTはデオキシチミジン;DMTはジ メトキシトリチル保護基;MMTはモノメトキシトリチル(p−アニシルジフェ ニルメチル)保護基;BOMはベンジルホキシメチレン保護基;CEはシアノエ チル保護基;Bzlはベンジル保護基;Bocはtert−ブトキシカルボニル 保護基;t−Buはtert−ブチル保護基;THPはテトラヒドロピラニル保 護基;NMRは核磁気共鳴スペクトル;MSは質量スペクトル;TLCはシリカ ゲル上の薄層クロマトグラフィー;HPLCは高速液体クロマトグラフィー;m pは融点;mp dは分解を伴う融点;bpは沸点。NMRデータの記載には、 化学シフトをppmで、および結合定数(J)をヘルツ(Hz)で示す。融点は 全て未補正である。実施例1 3−N−ベンジルオキシメチル−5'−O−(p−アニシルジフェニルメチル)チミ ジン、1 5'−O−(p−アニシルジフェニルメチル)チミジン(25.75g、50ミリ モル)の無水DMF(350ml)溶液に攪拌下60%水素化ナトリウム(2.00 g、50ミリモル)の懸濁液を加える。混合物を室温で1時間攪拌し、BOM− Cl(7.67g、49ミリモル)を加える。混合物を室温で2時間攪拌し、DM Fを留去する。残渣を1リットルの酢酸エチル−水混合液に溶解する。有機層を 水(250ml)で2回および食塩水(250ml)で2回、順次洗浄し、硫酸マグ ネシウムで乾燥、真空乾固する。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー( 8x35cm)に供し、トルエン/酢酸エチルで溶出(酢酸エチルが10%から4 0%で勾配溶出)して、白色泡状の3−N−3'−O−(ジ−ベンジルオキシメチ ル)−5'−O−(p−アニシルジフェニルメチル)チミジン(4.15g、11%) 実施例2 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−(2−シアノエチル)−5'−O−(p− アニシルジフェニルメチル)チミジン、2 化合物1(12.70g、20ミリモル)の無水THF(150ml)溶液に攪拌 下60%水素化ナトリウム(60mg、50ミリモル)懸濁液を1度に加え、無水 アクリロニトリル(5ml)を5分間かけて滴下する。得られた混合物を周囲温度 でさらに1時間攪拌する。混合物を真空乾固する。残渣を酢酸エチル(500m l)に溶解する。有機層を食塩水(250ml)で2回洗浄し、硫酸マグネシウム で乾燥し、真空乾固する。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(4.5 x30cm)に供し、トルエン/酢酸エチルで溶出(酢酸エチルが10%から15 %で勾配溶出)して、無色油状の化合物2(12.66g、92%)を得る。 実施例3 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−(2−シアノエチル)チミジン、3化 合物2(12.04g、17.5ミリモル)の3%TFA/DCE溶液を15 分間周囲温度に保つ。反応混合物を5%炭酸水素ナトリウム(150ml)で3回 および水(150ml)で2回、順次洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥、真空乾固 する。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(4.5x20cm)に供し、 3%メタノール/クロロホルムで溶出して、無色油状の化合物3(6.90g、9 5%)を得る。 実施例4 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−(2−シアノエチル)−5'−O−(テ トラヒドロピラン−2−イル)チミジン、4 化合物3(6.90g、16.6ミリモル)の無水DCM(150ml)溶液に攪拌 下PPTS(100mg、0.4ミリモル)を加え、DHP(5ml)を15分間か けて滴下する。得られた混合物を周囲温度で更に3時間攪拌する。反応混合物を 真空乾固し、トルエン(100ml)で2回共沸し、酢酸エチル(250ml)に溶 解、ついで5%炭酸水素ナトリウム(100ml)で3回、および食塩水(100 ml)で2回、順次洗浄する。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(4. 5x30cm)に供し、トルエン/酢酸エチル(1:1)で溶出して、無色油状の 化合物4(7.62g、92%)を得る。 実施例5 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−(3−アミノプロピル)−5'−O−( テトラヒドロピラン−2−イル)チミジン、5 化合物4(7.0g、14ミリモル)と塩化コバルト6水和物(6.66g、28ミ リモル)のメタノール(150ml)溶液に攪拌下水素化ホウ素ナトリウム(4.4 8g、140ミリモル)を4回に分けて15分間かけて加える。得られた混合物 を周囲温度で更に1時間攪拌し、28%水酸化アンモニウム(70ml)を加え、周 囲温度で15分間攪拌する。混合物を遠心分離し、上清を集め、沈澱物をメタノ ールで2回洗浄する。集めた上清を留去し、残渣をクロロホルムに懸濁し、不溶 物を濾別し、濾液を真空乾固する。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (4.5x25cm)に供し、クロロホルム/メタノール/28%水酸化アンモニ ウム(100:3:0.25)で溶出して、黄色油状の化合物5(4.37g、62 %)を得る。 実施例6 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−(3−トリフルオロアセタミドプロピ ル)−5'−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)チミジン、6 化合物5(4.00g、8.0ミリモル)、DIPEA(0.5ml)およびトリフ ルオロ酢酸エチル(7ml)の無水エタノール溶液を周囲温度に一晩保つ。反応混 合物を真空乾固し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(4.5x25c m)に供し、トルエン/酢酸エチル(7:3)で溶出して、無色油状の化合物6(4 .46g、93%)を得る。 実施例7 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−(ベンジル)チミジン、7 化合物1(33.25g、50ミリモル)の無水DMF(150ml)溶液に攪拌 下60%水素化ナトリウム(2.4g、60ミリモル)の懸濁液を加え、1時間後 、さらに臭化ベンジル(12.0g、8.4ml、70ミリモル)を5分間かけて滴 下する。得られた混合物を周囲温度で一晩攪拌し、DMFを真空乾固して除く。 残渣を酢酸エチル(600ml)に溶解し、水(200ml)で1回、および食塩水 (200ml)で2回順次洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥、ついで真空乾固する 。残渣をトルエン(300ml)で2回共沸し、3%TFA/DCE(700ml) に溶解し、15分間周囲温度に保つ。反応混合物を5%炭酸水素ナトリウム(2 50ml)で3回、および水(250ml)で2回順次洗浄し、硫酸マグネシウム で乾燥し、真空乾固する。残渣をトルエン/ヘキサンで結晶化して白色結晶の化 合物7(17.42g、77%)を得る。母液をシリカゲルカラムクロマトグラフ ィー(2.5x25cm)に供し、トルエン/酢酸エチル(7:3)で溶出して、化 合物7のさらに2.15g(9.5%)が単離できる。 実施例8 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−(ベンジル)−5'−O−(アリル)チミ ジン、8 化合物7(6.75g、15ミリモル)の無水DMF(75ml)溶液に攪拌下6 0%水素化ナトリウム(0.80g、20ミリモル)の懸濁液を加え、1時間後、 さらに臭化アリル(3.02g、2.16ml、25ミリモル)を5分間かけて滴 下 する。得られた混合物を周囲温度で2時間攪拌し、DMFを真空乾固して除く。 残渣を酢酸エチル(300ml)に溶解し、水(100ml)で1回および食塩水( 100ml)で2回順次洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥、ついで真空乾固する 。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(2.5x25cm)に供し、トル エン/酢酸エチル(9:1)で溶出して無色油状の化合物8(7.05g、95%) 実施例9 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−(ベンジル)−5'−O−(3−ブロモ プロピル)チミジン、9 隔壁口温度計口、および磁石攪拌機を備えた、乾燥した50ml容量のフラス コにアルゴンガスを浴びせ、アルゴン加圧下に保つ。フラスコに化合物8(4. 5g、9.1ミリモル)の無水THF(10ml)溶液を入れ、0℃まで冷却する。 水素化ホウ素の1M THF溶液(3.1ml、9.3ミリモル)を5分間かけて滴 下する。得られた混合物を0℃で30分間攪拌し、ついで周囲温度で30分間攪 拌する。さらにメタノール(60μl)を加えて過剰の水素化物を分解する。溶液 を−10℃に冷却し、食塩水(1.94g、0.62ml)12.1ミリモル)を10 分間かけて滴下する。さらに、ナトリウムメトキシドの4.34M溶液(3.5m l、15.2ミリモル)を0℃で45分間かけて滴下する。反応混合物を酢酸エチ ル(150ml)で希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム(50ml)で3回および食塩 水(50ml)で2回、順次洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥し、真空乾固する。 残渣をトルエン100mlで2回共沸する。残渣をシリカゲルカラムクロマトグ ラフィー(4.5x25cm)に供し、トルエン/酢酸エチルで溶出(酢酸エチルが 0%から10%の勾配溶出)して無色油状の化合物9(2.10g、40%)を得 実施例10 3−N−ベンジルオキシメチル−5'−O−(テトラヒドロピラン−2−イル) −3'−O−[(4−N−トリフルオロアセチル)−1,7−ヘプトアザ−4−ンジ イル]チミジリル−(3'→5’)−3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−( ベンジル)チミジン,10 無水DMF(10ml)中の化合物6(2.00g、3.3ミリモル)の撹拌溶液に、 60%NaH(140mg、3.5ミリモル)の懸濁液を加え、1時間後、無水D MF(5ml)中の化合物9(2.00g、3.5ミリモル)の溶液を加える。得られる 混合物を50℃で一夜撹拌し、周囲温度に冷却する。60%NaH(40mg、1 ミリモル)をさらに加え、1時間後無水DMF(2ml)中の化合物9(600mg、1 .0ミリモル)の溶液を加える。得られる混合物を50℃で一夜撹拌し、周囲温 度に冷却し、DMFを乾固するまで減圧蒸発する。残渣をEtOAc(100ml) に溶解し、水(1×30ml)および食塩水(2×30ml)で連続的に洗浄し、乾燥( MgSO4)し、乾固するまで減圧蒸発する。残渣を、溶離液としてトルエン/ EtOAc(10〜50%のEtOAc勾配)を用いるシリカゲルカラムクロマ トグラフィー(2.5×25cm)に付し、化合物10(2.99g、収率83%)を白 色泡 実施例11 5'−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)−3'−O−[(4−N−トリフルオ ロアセチル)−1,7−ヘプトアザ−4−ンジイル]チミジリル−(3'→5')−チ ミジン,11 EtOAc/MeOH(1/1)混合液中の化合物10(2.18g、2.0ミ リモル)の撹拌溶液に、10%Pd/C(Degussaタイプ、アルドリッチ)(1.1g) を加える。フラスコを脱気し、次いで水素で3回フラッシュし、最後に40〜5 0psiの水素を充填する。得られる懸濁液を23℃で14時間激しく撹拌する。 懸濁物質をブフナーロートに置いたセライトパッドで濾去し、次いでロートを少 量のEtOAcおよびMeOHで数回すすぐ。濾液と洗液を合わせ、乾固するま で減圧蒸発する。残渣を、溶離液としてMeOH/CHCl3を用いるシリカゲ ルカラムクロマトグラフィー(2.5×25cm)に付し、化合物11(1.32g、収率 87%)を白色泡状物で得る。 実施例12 5'−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)−3'−O−(1,7−ヘプトアザ− 4−ンジイル)チミジリルー(3'→5')−チミジン,12 12%NH3/EtOH−28%NH4OHの3:1混合液(20ml)中の化合物 11(1.14g、1.5ミリモル)の溶液を65℃にて一夜維持する。反応混合物 を冷却し、乾固するまで減圧蒸発し、残渣を、溶離液としてCHCl3/MeO H/28%NH4OH(95/5/0.5)を用いるシリカゲルカラムクロマトグ ラフィー(4.5×25cm)に付し、化合物12(0.96g、収率96%)を白色固 体で得る。 実施例13 5'−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)−3'−O−{4−N−[(チミジン −1−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ−4−ンジイル}チミジリル−(3'→ 5')−チミジン,13a 無水DMF(3.0ml)中の化合物12(333mg、0.50ミリモル)、チミジ ン−1−イル酢酸ペンタフルオロフェニルエステル(210mg、0.60ミリモ ル)およびDIPEA(0.6ミリモル)の溶液を周囲温度で2時間維持し、DMF を蒸発する。残渣を、溶離液としてCHCl3/MeOH/28%NH4OH(9 7/3/0.1)を用いるシリカゲルカラムクロマトグラフィー(2.5×25cm) に付し、化合物13a(407mg、収率98%)を白色固体で得る。 実施例14 5'−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)−3'−O−{4−N−[(4−N−( イソブチリル)シチジン−1−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ−4−ンジイ ル}チミジリル−(3'→5')−チミジン,13b 無水DMF(3.0ml)中の化合物12(333mg、0.50ミリモル)、[4−N −(イソブチリル)シチジン−1−イル]酢酸ペンタフルオロフェニルエステル(2 43mg、0.60ミリモル)およびDIPEA(0.6ミリモル)の溶液を周囲温度 で2時間維持し、DMFを蒸発する。残渣を、溶離液としてCHCl3/MeO H(0〜7%のメタノール勾配)を用いるシリカゲルカラムクロマトグラフィー (2.5×20cm)に付し、化合物13b(422mg、収率95%)を白色固体で得 る。1H−および13C−NMRにて構造を確認する。 実施例15 5'−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)−3'−O−{4−N−[(6−N−( フェノキシアセチル)アデニン−9−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ−4− ンジイル}チミジリル−(3'→5')−チミジン,13c 無水DMF(3.0ml)中の化合物12(333mg、0.50ミリモル)、[6−N −(フェノキシアセチル)アデニン−7−イル]酢酸ペンタフルオロフェニルエス テル(296mg、0.60ミリモル)およびDIPEA(0.6ミリモル)の溶液を周 囲温度で2時間維持し、DMFを蒸発する。残渣を、溶離液としてCHCl3/ MeOH(0〜7%のメタノール勾配)を用いるシリカゲルカラムクロマトグラ フィー(2.5×20cm)に付し、化合物13c(412mg、収率87%)を白色固体 で得る。1H−および13C−NMRにて構造を確認する。 実施例16 3'−O−{4−N−(チミジン−1−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ−4 −ンジイル}チミジリル−(3'→5')−チミジン,14a 無水EtOH(6ml)中の化合物13a(300mg、0.40ミリモル)およびP PTS(300mg、0.4ミリモル)の溶液を35℃で一夜維持する。反応混合物 を、溶離液としてMeOHを流速10ml/hにて用いるセファデックスLH−2 0カラムクロマトグラフィー(3.0×120cm)に付し、化合物14a(287mg 、収率96%)を白体固体で得る。 実施例17 3'−O−{[4−N−(シチジン−1−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ− 4−ンジイル}チミジリル−(3'→5')−チミジン,14b NH3で飽和したEtOH(5ml)中の化合物13b(355mg、0.40ミリモ ル)の溶液を周囲温度で一夜維持する。反応混合物を乾固するまで減圧蒸発する 。 無水EtOH(6ml)中の残渣およびPPTS(300mg、0.4ミリモル)を35 ℃にて一夜維持する。反応混合物を、溶離液としてMeOHを流速10ml/hに て用いるセファデックスLH−20カラム(3.0×120cm)クロマトグラフ ィーに付し、化合物14b(280mg、収率87%)を得る。 実施例18 3'−O−{4−N−[(アデニン−9−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ− 4−ンジイル}チミジリル−(3'→5')−チミジン,14c 化合物13c(380mg、0.40ミリモル)を実施例17と同様に処理して化 合物14c(240mg、収率82%)を得る。1H−NMRにて構造を確認する。 実施例19 5'−O−(p−アニシルジフェニルメチル)−3'−O−{[4−N−(チミジン −1−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ−4−ンジイル}チミジリル−(3'→ 5')−チミジン,15 無水EtOH(6ml)中の化合物13a(225mg、0.30ミリモル)およびP PTS(300mg、0.40ミリモル)の溶液を35同様で一夜維持する。無水P y(20ml)を反応混合物に加える。反応混合物を減圧蒸発し、次いで無水Py( 3×10ml)と共沸し、無水Py(5ml)に溶解し、MMT−Cl(110mg、0.3 6ミリモル)を加える。反応混合物を周囲温度で一夜維持し、次いでMeOH(1 00μl)を加え、30分後、反応混合物をCHCl3(50ml)に注ぎ入れる。有 機層をNaHCO3(3×15ml)、食塩水(2×15ml)で洗浄し、乾燥(MgSO4 )し、乾固するまで減圧蒸発し、残渣を、溶離液としてCHCl3/MeOH/ 28%NH4OH(97/2/0.1)を用いるシリカゲルカラムクロマトグラフ ィー(2.5×10cm)に付し、化合物5(279mg、収率91%)を白色泡状物で 得る。 実施例20 5'−O−(p−アニシルジフェニルメチル)−3'−O−{[4−N−(チミジン −1−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ−4−ンジイル}チミジリル−(3'→ 5')−3'−O−(スクシノイル)チミジン,16 化合物15(252mg、0.25ミリモル)を無水Py(3×5ml)と共沸し、P y(3ml)に溶解する。スクシン酸無水物(100mg、1ミリモル)およびDMAP (30mg、0.25)を加え、反応混合物を周囲温度で一夜維持する。水/Pyの 1:3混合物(4ml)を加え、周囲温度で一夜維持する。反応混合物を蒸発し、残 渣をCHCl3(25ml)に溶解し、0.5Mクエン酸(3×10ml)および食塩水( 2×10ml)で連続的に線上し、乾燥(MgSO4)し、乾固するまで減圧蒸発する 。残渣を、無水ジオキサン(2×5ml)と共沸し、無水ジオキサン(3ml)から凍結 乾燥して化合物16(270mg、収率97%)を得る。 実施例21 CPG結合トリヌクレオシド 16、17 トリヌクレオシド16をスクシンイミドエステルに変換し、長鎖アルキルアミ ンCPG(500オングストローム、シグマ)で処理する。15〜20μM/g のローディングをもつ、得られるCPG17を用いて、標準的プロトコルにした がって固相オリゴヌクレオチド合成を行う。 実施例22 5'−O−(p−アニシルジフェニルメチル)−3'−O−{[4−N−(チミジン −1−イル)アセチル]−1,7−ヘプトアザ−4−ンジイル}チミジリル−(3'→ 5')−3'−[(β-シアノエトキシ)−N−(ジイソプロピル)ホスフィリル]チミ ジン,18 化合物15(504mg、0.5ミリモル)をアルゴン雰囲気下、無水ジクロロメ タン(7ml)に溶解する。ジイソプロピルエチルアミン(0.22ml、1.23ミリモ ル)を加え、反応混合物を−30℃に冷却する。反応混合物にクロロ(ジイソプロ ピルアミノ)−β−シアノエトキシホスフィン(0.75ミリモル)を加え、反応混合 物を20℃まで暖め、4時間撹拌する。酢酸エチル(40ml)およびトリエチルア ミン(0.5ml)を加え、溶液を食塩水(3×20ml)で洗浄する。有機相を分離し 、乾燥(Na2SO4)する。固体を濾過後、溶媒を20℃にて減圧蒸発し、次いで 得られた油状物を、溶離液としてトルエン−酢酸エチル−トリエチルアミン(2 0:80:1)を用いるシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製する。次い で、画分を20℃で減圧蒸発(1トール)し、残渣を無水ピリジンで蒸発し、残 分をベンゼン−アセトニトリル(1:1)から凍結乾燥して標記化合物18を得 る。 実施例23 3−N−ベンジルオキシメチル−3'−O−[3−N−(トリフルオロアセチル) −3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル]−5'−O −(テトラヒドロピラン−2−イル)チミジン,19 無水DMF(10ml)中の化合物6(2.00g、3.3ミリモル)の撹拌溶液に、 60%NaH懸濁液(140mg、3.5ミリモル)を加え、1時間後、ブロモ酢酸 tert−ブチルエステル(FW195.06、d1.321)(0.68g、0.52ml 3.5ミリモル)を加える。得られる混合物を50℃で一夜撹拌し、周囲温度に冷 却する。さらに60%NaH(40mg、1ミリモル)を加え、1時間後ブロモ酢酸 tert−ブチルエステル(0.20mg、0.15ml、1ミリモル)を加える。得られる混 合物を50℃で一夜撹拌し、周囲温度に冷却し、DMFを乾固するまで減圧蒸発 する。残渣をEtOAc(100ml)に溶解し、水(1×30ml)および食塩水(2 ×30ml)で連続的に洗浄し、乾燥(MgSO4)し、乾固するまで減圧蒸発する。 残渣を、溶離液としてトルエン/EtOAc(10〜50%のEtOAc勾配) を用いるシリカゲルカラムクロマトグラフィー(2.5×25cm)に付して化合 物19(2.10g、収率89%)を白色泡状物で得る。 実施例24 3'−O−[3−N−(トリフルオロアセチル)−3−N−(tert−ブトキシカル ボニルメチル)−3−アミノプロピル]−5'−O−(テトラヒドロピラン−2−イ ル)チミジン,20 EtOAc(50ml)中の化合物19(2.14g、3.0ミリモル)の撹拌溶液に 、10%Pd/C(Degussaタイプ、アルドリッチ)(1.1g)を加える。フラスコ を脱気し、次いで水素で3回フラッシュし、最後に40〜50psiの水素を充填 する。得られる懸濁液を23℃で14時間激しく撹拌する。懸濁物質をブフナー ロートに置いたセライトパッドで濾去し、次いでロートを少量のEtOAcおよ びMeOHで数回すすぐ。濾液と洗液を合わせ、乾固するまで減圧蒸発する。残 渣を、溶離液としてトルエン/EtOAc(10〜70%のEtOAc勾配)を 用いるシリカゲルカラムクロマトグラフィー(2.5×25cm)に付し、化合物2 0(1.59g、収率87%)を白色泡状物で得る。 実施例25 3’−O−[3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプ ロピル]−5’−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)チミジン,21 化合物20(1.82g、3.0mmol)の12%NH3/エタノール−2 8%NH4OHの3:1混液中溶液を一晩65℃にて放置する。この反応混合物 を冷却し、減圧下に蒸発乾固し、得られた残留物に対しCHCl3/28%NH4 OH(99.5/0.5)(メタノール0から70%のグラジエント)を溶出液 として用いるシリカゲルカラム(4.5x25cm)のクロマトグラフィーにか け、化合物21(1.47g(96%))を油状物として得た。 実施例26 3’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(tert −ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル}−5’−O−(テトラヒ ドロピラン−2−イル)チミジン,22a 化合物21(1.02g、2.00mmol)、チミン−1−イル酢酸のペン タフルオロフェニルエステル(0.77g、2.10mmol)およびDIPE A(2.10mmol)の無水DMF(10.0ml)溶液を環境温度にて4時間 放置し、DMFを留去する。得られた残留物に対しCHCl3/メタノール/2 8%NH4OH(97/3/0.1)を溶出液として用いるシリカゲルカラム( 2.5x25cm)のクロマトグラフィーにかけ、化合物22(1.33g(9 8%))を白色固形物として得た。 実施例27 3’−O−{3−N−[((4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)ア セチル]−3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロ ピル}−5’−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)チミジン,22b 化合物21(1.02g、2.00mmol)、[4−N−(イソブチリル) シチジン−1−イル]酢酸のペンタフルオロフェニルエステル(0.85g、2 .10mmol)およびDIPEA(2.10mmol)の無水DMF(10. 0ml)溶液を環境温度にて4時間放置し、DMFを留去する。得られた残留物 に対しCHCl3/メタノール/(メタノール0から7%のグラジエント)を溶 出液として用いるシリカゲルカラム(2.5x25cm)のクロマトグラフィー にかけ、化合物22b(1.42g(97%))を白色固形物として得た。実施例28 3’−O−{3−N−[((6−N−(フェノキシアセチル)アデニン−9−イ ル)アセチル]−3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミ ノプロピル}−5’−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)チミジン,22c 化合物21(1.02g、2.00mmol)、[6−N−(フェノキシアセ チル)アデニン−9−イル]酢酸のペンタフルオロフェニルエステル(1.04 g、2.10mmol)およびDIPEA(2.10mmol)の無水DMF( 10.0ml)溶液を環境温度にて4時間放置し、DMFを留去する。得られた 残留物に対しCHCl3/メタノール/(メタノール0から7%のグラジエント )を溶出液として用いるシリカゲルカラム(2.5x25cm)のクロマトグ ラフィーにかけ、化合物22c(1.51g(92%))を白色固形物として得 た。 実施例29 3’−O−{3−N−[((チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(カルボ キシメチル)−3−アミノプロピル}−5’−O−(p−アニシルジフェニルメ チル)チミジン,23a 化合物22a(1.69g、2.5mmol)の50%TFA/DCM(50 ml)溶液を環境温度に30分放置した。この反応混合物を減圧下に留去し、得 られた残留物をトルエン(2x50ml)、Py(3x50ml)と共沸させ、 無水Py(25ml)に溶解し、MMT−Cl(0.93g、3.0mmol) を加える。この反応混合物を環境温度に一晩放置し、留去する。得られた残留物 をCHCl3(150ml)に懸濁し、水(2x50ml)、冷クエン酸(3x 30ml)および塩水(ブライン)(2x50ml)で連続して洗浄し、硫酸マ グネシウムで乾燥し、減圧下に留去する。得られた残留物をCHCl3/ヘキサ ンから再沈殿する。この沈殿物を捕集し、減圧下に乾燥し、化合物23a(1. 実施例30 3’−O−{3−N−[((4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)ア セチル]−3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル}−5’−O− (p−アニシルジフェニルメチル)チミジン,23b 化合物22b(1.46g、2.00mmol)を実施例29に記載のように して処理し、標題化合物23b(1.47g、85%)を得た。 実施例31 3’−O−{3−N−[(6−N−(フェノキシアセチル)アデニン−1−イル )アセチル]−3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル}−5’− O−(p−アニシルジフェニルメチル)チミジン,23c 化合物22c(1.64g、2.00mmol)を実施例29に記載のように して処理し、標題化合物23c(1.49g、78%)を得た。 実施例32 3’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(ペンタフ ルオロフェノキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル}−5’−O−(p −アニシルジフェニルメチル)チミジン,24a 化合物23a(1.00mmol)、ペンタフルオロフェノール(1.1mm ol)およびN,N'−ジシクロヘキシルカルボジイミド(1.1mmol)の DMF(7ml)中溶液を環境温度に1時間放置する。N,N'−ジシクロヘキ シル尿素を濾別し、得られた化合物24aの溶液を精製せずに使用する。 実施例33 3’−O−{3−N−[(4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)アセ チル]−3−N−(ペンタフルオロフェノキシカルボニルメチル)−3−アミノ プロピル}−5’−O−(p−アニシルジフェニルメチル)チミジン,24b 化合物23b(1.00mmol)を実施例32に記載のようにして処理し、 標題化合物24bの溶液を得た。 実施例34 3’−O−{3−N−[(6−N−(フェノキシアセチル)アデニン−1−イル )アセチル]−3−N−(ペンタフルオロフェノキシカルボニルメチル)−3− アミノプロピル}−5’−O−(p−アニシルジフェニルメチル)チミジン,2 4c 化合物23c(1.00mmol)を実施例32に記載のようにして処理し、 標題化合物24cの溶液を得た。 実施例35 3−N−ベンジルオキシメチル−5’−O−(2−シアノエチル)−3’−O− (ベンジル)チミジン,25 化合物7(2.0mmol)の無水THF(150ml)溶液に60%NaH (60mg、1.5mmol)の懸濁液を一度に加え、5分かけて正味のアクリ ロニトリル(5ml)を滴加する。得られた混合物を環境温度にてさらに1時間 攪拌する。この混合物を減圧下に蒸発乾固する。得られた残留物を酢酸エチル( 500ml)に溶解する。有機層を塩水(2x250ml)で洗浄し、硫酸マグ ネシウムで乾燥し、減圧下に蒸発乾固し、得られた残留物に対しトルエン/酢酸 エチル(酢酸エチル10から15%のグラジエント)を溶出液として用いるシリ カゲルカラム(4.5x30cm)のクロマトグラフィーにかけ、化合物25 実施例36 3−N−ベンジルオキシメチル−5’−O−(3−トリフルオロアセトアミドプ ロピル)−3’−O−(ベンジル)チミジン,26 化合物25を実施例5に記載のようにして処理し、3−N−ベンジルオキシメ チル−5’−O−(3−アミノプロピル)−3’−O−(ベンジル)チミジン 3−N−ベンジルオキシメチル−5’−O−(3−アミノプロピル)−3’− O−(ベンジル)チミジンを実施例6に記載のようして処理し、標題化合物26 実施例37 3−N−ベンジルオキシメチル−5’−O−[3−N−(トリフルオロアセチル )−3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル] −3’−O−(ベンジル)チミジン,27 化合物26(2.00mmol)を実施例23に記載のようにして処理し、標 題化合物27(85%)を得た。 実施例38 5’−O−[3−N−(トリフルオロアセチル)−3−N−(カルボキシメチル )−3−アミノプロピル]チミジン,28 化合物27(2.00mmol)を実施例24に記載のようにして処理し、5 ’−O−[3−N−(トリフルオロアセチル)−3−N−(tert−ブトキシ カルボニルメチル)−3−アミノプロピル]チミジン(82%)を得る。次いで 、5’−O−[3−N−(トリフルオロアセチル)−3−N−(tert−ブト キシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル]チミジンを実施例29に記載の ようにして処理することでそのカルボキシ部からtert−ブチル保護基を取り 除き、標題化合物28(95%)を得た。 実施例39 5’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(カルボキ シメチル)−3−アミノプロピル]チミジン,29a 化合物28を実施例25に記載のようにして処理し、5’−O−[3−N−( カルボキシメチル)−3−アミノプロピル]チミジン(97%)を得る。次いで 、5’−O−[3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル]チミジン を実施例26に記載のようにして処理し、標題化合物29aを白色固形物とし て得た(92%)。 実施例40 5’−O−{3−N−[(4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)アセ チル]−3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル]チミジン,29 b 5’−O−[3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル]チミジン を実施例27に記載のようにして処理し、標題化合物29bを白色固形物として 得た(91%)。 実施例41 5’−O−{3−N−[(6−N−(フェノキシアセチル)アデニン−1−イル )アセチル]−3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル]チミジン ,29c 5’−O−[3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル]チミジン を実施例28に記載のようにして処理し、標題化合物29cを白色固形物として 得た(93%)。 実施例42 5’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(カルボキ シメチル)−3−アミノプロピル}−3’−O−(ジ−p−アニシルジフェニル メチル)チミジン,30a; 5’−O−{3−N−[(4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)アセ チル]−3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル}−3’−O−( ジ−p−アニシルジフェニルメチル)チミジン,30b; 5’−O−{3−N−[(6−N−(フェノキシアセチル)アデニン−1−イル )アセチル]−3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル}−3’− O−(ジ−p−アニシルジフェニルメチル)チミジン,30c 化合物29を実施例29に記載の方法と同じくDMT−Clで処理し、標題化 合物30a−cを得た。 実施例43 5’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(スクシン イミドオキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル}−3’−O−(ジ−p −アニシルジフェニルメチル)チミジン,31a; 5’−O−{3−N−[(4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)アセ チル]−3−N−(スクシンイミドオキシカルボニルメチル)−3−アミノプロ ピル}−3’−O−(ジ−p−アニシルジフェニルメチル)チミジン,31b; 5’−O−{3−N−[(6−N−(フェノキシアセチル)アデニン−1−イル )アセチル]−3−N−(スクシンイミドオキシカルボニルメチル)−3−アミ ノプロピル}−3’−O−(ジ−p−アニシルジフェニルメチル)チミジン,3 1c 化合物30(1.00mmol)、N−ヒドロキシスクシンイミド(1.1m mol)およびN,N'−ジシクロヘキシルカルボジイミド(1.1mmol) のDMF(7ml)中溶液を環境温度に1時間放置する。N,N'−ジシクロヘ キシル尿素を濾別し、得られた化合物31の溶液を精製せずに使用する。 実施例43a 3−N−ベンジルオキシメチル−6’−O−(p−アニシルジフェニルメチル) −5’−ホモチミジン,40 5’−ホモチミジン(5.12g、20mmol)[Etzold,G.ら、 Chemical Communications,(1968),p.422]を実施例19の操作に従ってモノメ トキシトリチル化し、次いで実施例1の操作に従い、ベンジルオキシメチル化し 精製し、標題化合物40を得た(87%)。 実施例44 3−N−ベンジルオキシメチル−6−3’−O−(2−シアノエチル)’−O− (p−アニシルジフェニルメチル)−5’−ホモチミジン,41 実施例2の操作に従って、化合物40をシアノエチル化し、化合物41を得た 。 実施例45 3−N−ベンジルオキシメチル−3’−O−(2−シアノエチル)−6’−O− (テトラヒドロピラン−2−イル)−5’−ホモチミジン,42 実施例3の操作に従って、化合物41を脱保護し、次いで実施例4の操作に従 って処理し、化合物42を得た。実施例46 3−N−ベンジルオキシメチル−3’−O−(3−アミノプロピル)−6’−O −(テトラヒドロピラン−2−イル)−5’−ホモチミジン,43 実施例5の操作に従って、化合物42を還元して精製し、化合物43を得た。 実施例47 3−N−ベンジルオキシメチル−3’−O−(3−トリフルオロアセトアミドプ ロピル)−6’−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)−5’−ホモチミジン ,44 実施例6の操作に従って、化合物43をトリフルオロアセチル化して精製し、 化合物44を得た。 実施例48 3−N−ベンジルオキシメチル−3’−O−[3−N−(トリフルオロアセチル )−3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル) −6’−O−(テトラヒドロピラン−2−イル)−5’−ホモチミジン,45 実施例23の操作に従って、化合物44をブロモ酢酸のtert−ブチルエス テルでアルキル化して精製し、化合物45を得た。 実施例49 3−N−ベンジルオキシメチル−3’−O−[3−N−(トリフルオロアセチル )−3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル) −6’−ブロモ−5’−ホモチミジン,46 化合物45(5mmol)、CBr4(7mmol)およびP(Ph)3(14m mol)の無水THF(40ml)溶液を環境温度にて24時間攪拌する。この 反応混合物を減圧下に蒸発乾固し、得られた残留物をトルエン(2x100ml )とともに共沸させ、トルエン/酢酸エチル(7:3c1:1)を溶出液として 用いるシリカゲルカラム(4.5x25cm)のクロマトグラフィーにかけ、化 合物46(95%)を得た。 実施例50 3−N−ベンジルオキシメチル−3’−O−[3−N−(トリフルオロアセチ ル)−3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル ]−6’−N−(ジ−tert−ブチルオキシカルボニル)−6’−アミノ−5 ’−ホモチミジン,47 ジ−tert−ブチルイミノジカルボキシレート(1.09g、5.0mmo l)の無水DMF(20ml)溶液を攪拌し、それに60%NaH(200mg 、5.0mmol)の懸濁液を、次いで1時間後化合物46(4.0mmol) を加える。得られた混合物を50℃にて一晩攪拌し、環境温度に冷却し、DMF を減圧下に蒸発乾固する。得られた残留物を酢酸エチル(150ml)に溶解し 、水(1x30ml)および塩水(2x30ml)で連続して洗浄し、硫酸マグ ネシウムで乾燥し、減圧下に蒸発乾固する。得られた残留物に対しトルエン/酢 酸エチル(酢酸エチル10から15%のグラジエント)を溶出液として用いるシ リカゲルカラム(2.5x25cm)のクロマトグラフィーにかけ、化合物35 を得た。 実施例51 3’−O−[3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプ ロピル]−6’−N−(tert−ブチルオキシカルボニル)−6’−アミノ− 5’−ホモチミジン,48 実施例11の操作に従って、化合物47(2.0mmol)を水素添加反応に 付し、精製する。この反応の生成物を環境温度にて一晩、12%NH3/エタノ ール−28%NH4OHの3:1混液で処理する。この反応混合物を冷却し、蒸 発乾固し、得られた残留物に対しCHCl3/メタノール/28%NH4OH(9 5/1/0.5)を溶出液として用いるシリカゲルカラム(2.5x25cm) のクロマトグラフィーにかけ、化合物48を得た。 実施例52 3’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(tert −ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル}−6’−N−(tert −ブチルオキシカルボニル)−6’−アミノ−5’−ホモチミジン,49a 実施例26に記載しているようにして化合物48を処理し、標題化合物49a を白色固形物として得た(95%)。実施例53 3’−O−{3−N−[(4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)アセ チル]−3−N−(tert−ブトキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピ ル}−6’−N−(tert−ブチルオキシカルボニル)−6’−アミノ−5’ −ホモチミジン,49b 実施例27に記載しているようにして化合物48を処理し、標題化合物49b を白色固形物として得た(95%)。 実施例54 3’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(カルボキ シメチル)−3−アミノプロピル}−6’−N−(p−アニシルジフェニルメチ ル)−6’−アミノ−5’−ホモチミジン,50a 実施例29に記載しているようにして化合物49aを処理し、標題化合物50 aを白色固形物として得た(93%)。 実施例55 3’−O−{3−N−[(4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)アセ チル]−3−N−(カルボキシメチル)−3−アミノプロピル}−6’−N−( p−アニシルジフェニルメチル)−6’−アミノ−5’−ホモチミジン,50b 実施例30に記載しているようにして化合物49bを処理し、標題化合物50 bを白色固形物として得た(95%)。 実施例56 3’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(ペンタフ ルオロフェノキシカルボニルメチル)−3−アミノプロピル}−6’−N−(p −アニシルジフェニルメチル)−6’−アミノ−5’−ホモチミジン,51a 実施例32に記載しているようにして化合物50aを処理し、標題化合物51 aの溶液を得た(93%)。 実施例57 3’−O−{3−N−[(4−N−(イソブチリル)シチジン−1−イル)アセ チル]−3−N−(ペンタフルオロフェノキシカルボニルメチル)−3−アミノ プロピル}−6’−N−(p−アニシルジフェニルメチル)−6’−アミノ−5 ’−ホモチミジン,51b 実施例33に記載しているようにして化合物50bを処理し、標題化合物51 bの溶液を得た。 実施例58 3’−O−{3−N−[(チミン−1−イル)アセチル]−3−N−(N−(3 −N−(ジエチルアミノ)プロピル)カルボキシアミドメチル)−3−アミノプ ロピル}−6’−N−(p−アニシルジフェニルメチル)−6’−アミノ−5’ −ホモチミジン,52a 化合物51a(1mmol)のDMF(5ml)溶液を環境温度にて2時間、 3−N−(ジエチルアミノ)プロピルアミン(1.5mmol)で処理する。こ の反応混合物を減圧下に蒸発乾固し、得られた残留物に対しCHCl3/28% NH4OH(99.9/0.1)(メタノール0から9%のグラジエント)を溶 出液として用いるシリカゲルカラム(2.5x25cm)のクロマトグラフィー にかけ、化合物52a(85%)を油状物として得た。 実施例59 オリゴヌクレオシド53(n=1) 化合物52(1mmol)の80%AcOH(100ml)溶液を環境温度に 一晩放置する。その反応混合物を減圧下に蒸発乾固し、得られた残留物をPy( 3x50ml)および無水DMF(3x25ml)とともに共沸する。その残留 物を無水DMF(5ml)に溶解し、化合物51(1.2mmol)およびDI PEA(1.1っもl)の無水DMF(5ml)溶液を加える。その反応混合物 を環境温度に2時間放置する。得られた反応混合物を減圧下に蒸発乾固し、残留 物に対しCHCl3/28%NH4OH(99.9/0.1)(メタノール0から 10%のグラジエント)を溶出液として用いるシリカゲルカラム(2.5x25 cm)のクロマトグラフィーにかけ、化合物53(n=1)(89%)を得た。実施例60 オリゴヌクレオチド53(n=2) 実施例59に記載のようにして化合物53(n=1)を処理し、標題化合物5 3(n=2)を白色固形物として得た(95%)。 実施例61 オリゴヌクレオチド53(n=3) 実施例59に記載のようにして化合物53(n=2)を処理し、標題化合物5 3(n=3)を白色固形物として得た(94%)。 実施例62 オリゴヌクレオチド53(n=4) 実施例59に記載のようにして化合物53(n=3)を処理し、標題化合物5 3(n=4)を白色固形物として得た(90%)。 実施例63 オリゴヌクレオチド53(n=5) 実施例59に記載のようにして化合物53(n=4)を処理し、標題化合物5 3(n=5)を白色固形物として得た(91%)。 実施例64 オリゴヌクレオシド54 化合物53(1mmol)の80%AcOH(100ml)溶液を環境温度に 一晩放置する。その反応混合物を減圧下に蒸発乾固し、得られた残留物を水に溶 解し、エーテルで2回抽出する。水層を減圧下に蒸発乾固し、得られた残留物を 水から2回凍結乾燥する。 実施例65 修飾ヌクレオシドおよびオリゴヌクレオシド合成ブロックのホスホルアミダイ トを調製したなら、それらを、アプライド・バイオシステムズ,Inc.モデル 392などの自動核酸合成装置を使用して標準的な固相法で合成したオリゴヌク レオチド同族体に導入すればよい。これらの合成装置により標準的なホスホルア ミダイトカップリング化学(例えば、M.J.Gait,Oligonucleotide Synthesis.A practical approach.,pp35-81)を使用し、所望のオリゴヌクレオチドを得る。 テトラエチルチウラムジスルフィド(アプライド・バイオシステムズ,Inc. )の溶液を使用すれば、ホスホルチオエートオリゴヌクレオチドを得ること ができる。 実施例66 ハイブリダイゼーション分析 本発明の巨大分子が相補的核酸と結合する能力は、特定の二本鎖(ds)また は三本鎖(ts)複合体の融解温度を測定することによって比較することができ る。2つの一本鎖からdsDNAが形成される場合、塩基の積み重ねのために吸 光係数が減少する(吸光度低下(hypochromicity))。結局、DNAの変性は、吸 光度の変化を測定することによって、二重鎖の50%が消失して一本鎖となる温 度である融解温度(Tm)の関数として追跡できる。Tmが高くなれば、鎖の結 合強度も強くなる。 二重鎖は一本鎖オリゴデオキシリボヌクレオチドおよび本発明の巨大分子から 形成される。本発明の巨大分子は本明細書に示す説明または実施例に従って合成 される。オリゴデオキシリボヌクレオチドはアプライド・バイオシステムズ,I nc.モデル392DNA/RNA合成装置によって固相合成する。得られたオ リゴヌクレオチド種をジメトキシトリチル誘導体としてHPLCを用いる逆相ク ロマトグラフィー(Gilson)によって精製する。通常、0.3−0.50 D260オリゴヌクレオチド同族体を1当量の他の鎖とハイブリダイズさせ、ラン ダムコイル転移に対する二重鎖の吸光度(260nm)上昇をGilford応 答II分光器によってモニターする。使用する緩衝液はリン酸10mM、EDT A0.1mMおよびNaCl0.1Mまたは1Mのいずれかである。以下の吸光 係数を使用する;通常のオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド同族体と もに、dA:15.4ml/μmol・cm、dT8.8、dG:11.7およ びdC:7.3。融解曲線は0.5℃/分の工程で記録する。Tmは、温度に対 する第1誘導体のA260プロットの最大値から測定する。このデータは1/Tm 対ln[Coligo](ここに、Coligoはオリゴヌクレオチドの全濃度)のグラフ の値に基づいて分析できる。熱力学パラメーターはこの分析によって測定される 。ヌクレアーゼ耐性 A.血清および細胞質ヌクレアーゼに対する本発明巨大分子の耐性評価 本発明のオリゴヌクレオチド同族体について、種々の濃度のウシ胎児血清また は成人ヒト血清を含有する培地中におけるその安定性を評価した。オリゴヌクレ オチド同族体を種々の時間、インキュベートし、プロテアーゼKで処理し、次い で逆相もしくはイオン交換HPLCまたは20%ポリアクリルアミド−尿素で変 性させたゲルによるゲル電気泳動によって、次いでオートラジオグラフィーによ って分析する。修飾された連鎖の位置およびオリゴヌクレオチドの既知の長さに 基づき、ヌクレアーゼ分解に対する効果を連鎖の個々の修飾に応じて測定できる 。細胞質ヌクレアーゼでは、HL60細胞系を使用すればよい。 インキュベートの後、オリゴヌクレオチド同族体の分解を、血清ヌクレオチド 分解について先に記述したようにして評価する。オートラジオグラフィーの結果 は通常のオリゴヌクレオチドおよび本発明の巨大分子を比較して数量化する。 B.特異的エンド−およびエキソ−ヌクレーゼに対する本発明の巨大分子の耐 性評価 特異的ヌクレーゼ(即ち、エンドヌクレアーゼ、3’,5’−エキソ−および 5’,3’−エキソヌクレアーゼ)に対する本発明の巨大分子の耐性評価を行う ことで、分解条件下での安定性に対する特定の連鎖の効果が正確に評価できる。 オリゴヌクレオチド同族体を、種々の選択したヌクレアーゼに特異的な規定した 反応緩衝液中でインキュベートし、プロテイナーゼKで処理し、次いで逆相もし くはイオン交換HPLCまたは20%ポリアクリルアミド−尿素で変性させたゲ ルによるゲル電気泳動によって、次いでオートラジオグラフィーによって分析す る。DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION                          Oligonucleotide analogs                                 Background of the Invention 1. Field of the invention   The invention relates to a group of oligonucleotides, modified oligonucleotides, or Oligonucleosides (ie, phosphate-free oligonucleotides) You. These may be modified at the ends if necessary, and their structures may include DNA Binding site or DNA interacting group or carrier or target ligand binds Containing at least one (aza) nitrogen as an achiral moiety for It has at least one linker having osidic properties.2. Description of related technology   Oligonucleotides are valuable as therapeutic agents for the treatment of various diseases there is a possibility. Classical therapeutics are generally focused on interacting with proteins But it acts directly or through its enzymatic action And a major contributor to a number of medical conditions in humans. Classic treatment Oligonucleotides have their Watson-Crick or Hoogstay compared to The ability to base pair to complementary nucleic acid strands in a highly efficient manner Specificity may be given. Oligonucleotides in this sense are gene therapy Or it offers a unique opportunity for control of translation or transcription.   The function of a gene depends on the transcription of that information into messenger RNA (mRNA). Start and interact with the ribosome complex to determine the identity of the protein encoded by the sequence. Go to synthesis. This synthesis process is called translation. Various assistance in the translation process Factors and building blocks, amino acids and their transfer RNA The presence of (tRNA) is required and these are all present in normal cells.   To initiate transcription, a promoter by RNA polymerase, an RNA synthase Specific recognition of the DNA sequence is required. In prokaryotic cells, eukaryotes are often In living cells, probably in all cases, this recognition is Due to sequence specific binding. It binds to the promoter, but its binding is RNA Another protein that blocks the action of the polymerase is called a repressor.   Traffic in a sequence-specific manner such as, for example, Watson-Crick base pairing interaction. Synthetic oligonucleotides involved in binding to cellular RNA are Could be used as a "sense" probe. Therefore, synthetic DNA is It can also suppress translation. Also, for example, oligonucleotides or other Affects the genome by triple helix formation using DNA recognition reagents There is a possibility.   However, natural oligonucleotides have low permeability into cells, Relatively ineffective as a therapeutic agent due to rapid degradation by enzymes inside the cells New Therefore, natural oligonucleotides are relatively high for therapeutic effects Concentration is required.   Multiple in the polynucleotide backbone to improve half-life and membrane permeability Changes have been made, but the expected results have not been obtained. These changes Include methylphosphonate, monothiophosphate, dithiophosphate, phospho Luamidate, phosphate ester, cross-linked phosphoramidate, cross-linked phosphoro Thioate, cross-linked methylene phosphonate, siloxane cross-linked, carbonate cross-linked, Carboxymethyl ester cross-link, acetamide cross-link, carbamate cross-link, thioe -Tel, sulfoxy, sulfono crosslinked, various "plastic" DNA, alpha -Anomeric cross-links and dephosphonucleotide analogs with borane derivatives Including the use of   For example, U.S. Pat. No. 5,216,141 discloses a natural linking group between subunits. Sulfides, sulfoxides and the like that can form bonds with oligonucleotides And DNA analogs containing sulfones.   U.S. Pat. No. 5,034,506 discloses morpholy bonded to each other by achiral bonds. The present invention relates to a polymeric composition comprising a non-subunit. Each subunit is a pudding or Is said to contain a group to which the pyrimidine base pairs.   U.S. Pat. Nos. 5,405,938 and 5,166,315 are uncharged. Including a 5- or 6-membered ring skeleton, to which a selected base is bonded The polymer in question. This polymer is a double-stranded polynucleotide in a sequence-specific manner. It is said that it can bind to the target sequence of otide.   International Patent Applications WO92 / 20702, WO92 / 20703 and WO94 / 25477 all relate to so-called peptide nucleic acids (PNA), Complementary single strand DNA and RNA strands It is said to be strongly coupled. This PNA is linked to the peptide backbone or via the aza nitrogen. It is said to include a ligand that binds to the polyamide skeleton.   U.S. Pat. No. 5,378,825 is an oligonucleotide analog whose normal The present invention relates to a phosphorodiester having an intersugar bond substituted with a 4-atom bonding group.   International Patent Application WO 95/14706 describes a PNA-DNA-PNA chimeric macro Pertains to a molecule wherein the PNA and DNA portions are amide bonds, amines Linked by a bond or an ester bond.   Today, nuclease resistance, binding performance and antisense or antigen oligo Binding of nucleotides to target RNA or double-stranded DNA It has been recognized that efficiency is important. At the same time high nuclease resistance and The need for methods and materials that provide membrane permeability and improve hybridization It has been felt for a long time. The compounds and compositions of the present invention meet this need. It is.                                 Summary of the Invention   One aspect of the invention is a macromolecule, at least a portion of which has the following structure:                                    Formula I [Where,   Each B is independently hydrogen, hydroxy, naturally occurring nucleobase, non-naturally occurring nucleotide Obas, DNA intercalator, covalent or non-covalent DNA A bonding group, a heterocyclic group, or an aromatic group.   Each B1Are independently hydrogen, hydroxy, amino, mercapto, naturally occurring nucleobe Sources, non-naturally occurring nucleobases, DNA intercalators, covalent Is a non-covalent DNA binding group, a heterocyclic group, an aromatic group, a targeting group, a carrier, Reporter groups or soluble or insoluble polymers.   n is an integer from 1 to 50.   Each X is independently a single bond, methylene, methylenecarbonyl, C7~ C12-Aral Cylene or substituted aralkylene, C7~ C12-Aralkylenecarbonyl or A substituted aralkylene carbonyl, or a formula: [Where,   Each Z is independently a single bond, O, S, NR6, C (= O) NR6, Or C (= O) NR6It is.   Each Z1Are independently O, S, NRFive, Methylene, or C (CHThree)TwoIt is.   p, q, r, and s are each independently an integer from 0 to 20.   R1, RTwo, RThreeAnd RFourAre each independently hydrogen; hydroxy- or alkoxy Or an alkylthio-substituted C1~ C8-Alkyl; hydroxy; Alkoxy; alkylthio; amino; or halogen.   RFiveAnd R6Are each independently hydrogen; hydroxy- or alkoxy- or al- C which may be substituted with1~ C8-Alkyl; hydroxy; alkoxy Or alkylthio; or amino] Is a group represented by   Q1Or QTwoEach independently contain at least three atoms, at least One is carbon.   Each V is independently oxygen, sulfur, NR8Or methylene.   Each J is independently hydrogen, azide, halogen, -OR7, -R7Or -NR7R8so And here each R7Is independently -NR8R9Or R8Where R8And R9 Is independently hydrogen, CThree~ CTen-Branched or substituted alkyl, C1~ CTen− Unbranched or substituted alkyl, C1~ CTen-Unbranched oxaalkyl or Substituted oxaalkyl, C6~ CTen-Aryl or substituted aryl, C7~ C12-A Aralkyl or substituted aralkyl, C1~ CTen-Unbranched aminoalkyl or substituted Unbranched aminoalkyl, C1~ CTen-Unbranched aminooxaalkyl or unsubstituted Branched aminooxaalkyl, CThree~ CTen-And N1~ NFour-Branch (polyamino -Or polyaza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza) al Kill, C1~ CTen-And N1~ NFour-Unbranched (polyamino- or polyaza- ) Alkyl or substituted (polyamino- or polyaza-) alkyl, C1~ CTen -And N1~ NFour-Unbranched (polyamino- or polyaza-) oxaalkyl Or substituted unbranched (polyamino- or polyaza-) oxaalkyl, natural amino Is a side-chain or protecting group of the acid or unnatural amino acid] A macromolecule having   In another aspect, the invention comprises an effective amount of the compound and a pharmaceutically suitable carrier. Pharmaceutical compositions.   In another aspect, the present invention relates to a method of treating a disease caused by a pathogenic organism, the method requiring treatment. Administering an effective amount of said compound or pharmaceutical composition to a host organism. You. The host organism can be any organism in need of such a treatment, Including mammals and humans.   In yet another aspect, the present invention relates to a method of treating an organism in need of treatment with a compound as described above. A method of treating a tumor comprising administering an effective amount of a composition. This creature Such as mammals and humans. No.   In another embodiment, the present invention provides a compound of formula:                                    Formula II [Where,   Each B is independently a naturally occurring nucleobase, a non-naturally occurring nucleobase, a heterocycle Or an aromatic group, and any of them may have a protecting group if necessary.   Each B1Are independently hydrogen, hydroxy, amino, mercapto, naturally occurring nucleobe Sources, non-naturally occurring nucleobases, DNA intercalators, covalent Is a non-covalent DNA binding group, a heterocyclic group, or an aromatic group, May have a protecting group if necessary.   n is an integer from 1 to 50.   Each X is independently an optionally protected group, and includes a single bond, methylene Group, methylenecarbonyl, C7~ C12-Aralkylene or substituted aralkylene, C7~ C12-Aralkylenecarbonyl or substituted aralkylenecarbonyl, also Is the formula: [Where,   Each Z is independently a single bond, O, S, NR6, C (= O) NR6, C (= S) NR6 , S (= O) NR6, Or S (= O)TwoNR6It is.   Each Z1Are independently O, S, Se, NRFive, Methylene, or C (CHThree)TwoIt is.   p, q, r, and s are each independently an integer from 0 to 20.   R1, RTwo, RThreeAnd RFourAre each independently hydrogen; hydroxy- or alkoxy- Or C which may be substituted with an alkylthio- group1~ C8-Alkyl; hydroxy C; alkoxy; alkylthio; amino; or halogen.   RFiveAnd R6Are each independently hydrogen; hydroxy- or alkoxy- or al- C optionally substituted with a quinthio group1~ C8-Alkyl; hydroxy; alco Xy; alkylthio; or amino] An optionally protected group selected from the groups represented by   Q1Or QTwoEach independently contain at least three atoms, at least One is carbon.   Each V is independently oxygen, sulfur, NR8Or methylene. Where R8Independently Hydrogen, CThree~ CTen-Branched or substituted alkyl, C1~ CTen-Unbranched alk Or substituted alkyl, C1~ CTen-Unbranched oxaalkyl or substituted oxaa Luquil, C6~ CTen-Aryl or substituted aryl, C7~ C12-Aralkyl or Is substituted aralkyl, C1~ CTen-Unbranched aminoalkyl or substituted unbranched amino Alkyl, C1~ CTenUnbranched aminooxaalkyl or substituted unbranched amino Oxaalkyl, CThree~ CTen-And N1~ NFour-Branches (polyamino- or polyamino- Aza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza) alkyl, C1~ CTen-And N1~ NFour-Unbranched (polyamino- or polyaza-) alkyl or Or substituted (polyamino- or polyaza-) alkyl, C1~ CTen-And N1~ NFour-Unbranched (polyamino- or polyaza-) oxaalkyl or substituted unsubstituted Branched (polyamino- or polyaza-) oxaalkyl, natural amino acids or non-amino acids It is a side chain group or a protecting group of a natural amino acid.   Each J is independently hydrogen, -OR7, Halogen, azide or R7And both Replaced if necessary. Where each R7Is independently -NR8R9Or R8And Where R9Is independently hydrogen, CThree~ CTen-Branched or substituted alkyl, C1~ CTenUnbranched or substituted alkyl, C1~ CTen-Unbranched oxaalkyl Or substituted oxaalkyl, C6~ CTen-Aryl or substituted aryl, C7~ C12 Aralkyl or substituted aralkyl, C1~ CTen-Unbranched aminoalkyl or Is a substituted unbranched aminoalkyl, C1~ CTen-Unbranched aminooxaalkyl or Substituted unbranched aminooxaalkyl, CThree~ CTen-And N1~ NFour-Branch (poly Amino- or polyaza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza) ) Alkyl, C1~ CTen-And N1~ NFour-Unbranched (polyamino- or polyamino- Aza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza-) alkyl, C1 ~ CTen-And N1~ NFour-Unbranched (polyamino- or polyaza-) oxaa Alkyl or substituted unbranched (polyamino- or polyaza-) oxaalkyl, Naturally, it is a side chain group of an amino acid or an unnatural amino acid, or a protecting group.   Each QThreeIs independently -OX-, -SX-, or -NR8X-, all of which are required If so, it may be protected.   Each QFourIs independently oxygen, sulfur, or NR8And protected if necessary. May be.   Y is a protecting group.   Y1Is a spacer group attached to the solid support] For compounds having the formula:   In yet another aspect, the invention provides a compound of the formula:                                   Or[Where,   Each B is independently a naturally occurring nucleobase, a non-naturally occurring nucleobase, a heterocycle Or an aromatic group, and any of them may have a protecting group if necessary.   Each B1Are independently hydrogen, hydroxy, amino, mercapto, naturally occurring nucleobe Sources, non-naturally occurring nucleobases, DNA intercalators, covalent Is a non-covalent DNA binding group, a heterocyclic group, or an aromatic group, May have a protecting group if necessary.   n is an integer from 1 to 50.   Each X is independently one of the following groups that may be protected if desired: single bond Methylene, methylenecarbonyl, C7~ C12Aralkylene or substituted ara Lucylene, C7~ C12-Aralkylenecarbonyl or substituted aralkylenecarbo Nil, or the formula: [Where,   Each Z is independently a single bond, O, S, NR6, C (= O) NR6, C (= S) NR6 , S (= O) NR6, Or S (= O)TwoNR6It is.   Each Z1Are independently O, S, Se, NRFive, Methylene, or C (CHThree)TwoIt is.   p, q, r, and s are each independently an integer from 0 to 20.   R1, RTwo, RThreeAnd RFourAre each independently hydrogen; hydroxy- or alkoxy- Or C which may be substituted with alkylthio-1~ C8-Alkyl; hydroxy C; alkoxy; alkylthio; amino; or halogen.   RFiveAnd R6Are each independently hydrogen; hydroxy- or alkoxy- or al- C which may be substituted with1~ C8-Alkyl; hydroxy; alkoxy C; alkylthio; or amino.   Q1Or QTwoContains at least three atoms each, at least one of which is Carbon.   Each V is independently oxygen, sulfur, NR8Or methylene.   Each J is independently optionally protected as follows: hydrogen, OR7, Haloge , Azide, or -R7Where each R7Is independently -NR8R9Or R8 Where R8And R9Is independently hydrogen, CThree~ CTen-Branched alkyl or Is a substituted alkyl, C1~ CTenUnbranched or substituted alkyl, C1~ CTen− Unbranched oxaalkyl or substituted oxaalkyl, C6~ CTen-Aryl or Substituted aryl, C7~ C12Aralkyl or substituted aralkyl, C1~ CTen-Undivided Branched aminoalkyl or substituted unbranched aminoalkyl, C1~ CTen-Unbranched amino Oxaalkyl or substituted unbranched aminooxaalkyl, CThree~ CTen-And N1 ~ NFour-Branched (polyamino- or polyaza-) alkyl or substituted (poly Mino- or polyaza) alkyl, C1~ CTen-And N1~ NFour-Unbranched (Po (Riamino- or polyaza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza) The-) alkyl, C1~ CTen-And N1~ NFour-Unbranched (polyamino- or Polyaza-) oxaalkyl or substituted unbranched (polyamino- or polyaza- ) Oxaalkyl, a side group or protecting group of a natural or unnatural amino acid , And one of them.   Q1 xAnd QTwo xContains at least one atom each,1Or QTwoIndicated by If necessary, independently select from protected or activated fragments. Selected] With respect to the compound represented by                              BRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES   1 to 8 show (B-1) to (B-24) and (C-1) to (C-6), respectively. Various compounds of the present invention and prior art compounds (numbered as (A) in each figure) FIG.   Figures 9-11 each illustrate a compound of the invention.   FIGS. 12-14 show various inventions numbered (E-1) through (E-13), respectively. 3 shows a comparison between the compound of the prior art and a compound of the prior art (described as (A) in each figure).   FIG. 15 illustrates the compounds of the present invention.                             Detailed description of the invention   The present invention can function like oligonucleotides, and can be useful It relates to a macromolecule having properties. Illustrated in the examples and reaction formulas of this specification As shown, this macromolecule consists of a basic nucleoside unit and a unique linker. Units, which contain nucleobase or other nucleic acid-binding elements. are doing. The linkers of the invention (ie, Q of formula I)1-N-QTwoSegment) This nucleoside unit linked by a nucleobase is trimeric To form a unit. This trimmer unit is further modified by the addition of nucleosides. To pentamers, heptamers and other extended macromolecules Can be extended. This trimmer unit (and / or more expensive Ni G) are, for example, normal phosphodiester bonds, phosphothioate bonds, Thioate linkage, phosphoramidate linkage, phosphotriester linkage, methyl Other than the bonding group of the present invention, such as other alkyl phosphonate bonds or other bonds May be combined. The bond of the present invention has two parts separated by an aza nitrogen atom. Minute (or sub-bond, ie Q in formula I)1And QTwo)including. This other The nitrogen atom is the achiral moiety of either the nucleobase or other nucleic acid binding groups. Binding site. In certain embodiments, a single type of sub-linking group is used to And the other nitrogen atom. In another embodiment, two different sub-linking groups are used To form a trimeric unit, or two or more different sub-linking groups Used to form more sophisticated units. Within the same macromolecule of the invention The sub-linking groups of certain different units (trimeric or larger units) It may be of one or a different type as described herein. Details below Some trimmer units (and / or more expensive units) Are of natural origin bound to achiral aza nitrogen atoms within internucleoside linkages Or has a non-naturally occurring nucleobase, and the other units are non-nucleobase Has a reo-based binding ligand.   The naturally-occurring nucleobases described herein include the major naturally-occurring nucleobases. Four, namely thymine, cytosine, adenine or guanine, or other Naturally occurring nucleobases such as hypoxanthine, uracil, thiouracil, 5-methylcytosine, and the like.   Non-naturally occurring nucleobases described herein include, for example, fluorouracil, Bromovinyluracil, triazolecarboxamide, benzimidazole, etc. including.   Heterocyclic groups described herein include, for example, nitroindole derivatives, nitroimid At least one heteroatom such as a dazole derivative or a nitrotriazole derivative Heterocycles of any of the fused or unfused ring systems comprising   The DNA binding groups shown herein include the following: 1) For chemical modification Thus, covalent DNA binding groups that interact with DNA (eg, mustard gas Derivative, psoralen and its derivatives, mitomycin C , Etc.) 2) Hydrogen bond formation, intercalation, electrostatic force, etc. Non-covalent DNA binding group that interacts with DNA. DNA (or RNA) Formation of hydrogen bonds between the functional group of the nucleic acid binding ligand and the functional group of the For example, distamycin, netropsin, etinomycin, etc.) For example, repressors, restrictases, etc.) or oligonucleotides (such as For example, DNA double strand formation or DNA triple strand formation) Plays an important role in the specific recognition of nucleic acids, especially double-stranded nucleic acids. Interca Is a planar aromaticity (hetero) called an intercalator Isolating two adjacent base pairs to allow insertion of a cyclic group, A special type of stacking observed with nucleic acids. The double strap shown in this specification Intercalators that can bind to nucleic acid nucleic acids include, for example, acridine or Or a derivative thereof, phenanthridine or a derivative thereof, and the like. This specification Can bind preferentially to the triple-stranded cluster of nucleic acids shown in Intercalators include, for example, colaline (protoberberine) Group alkaloids, propidium bromide and the like.   The carriers described herein include, for example, polyamine groups (eg, polyethylene Nimine, spermine, spermidine, poly-L-lysine, starburst den Lipophilic groups (eg cholesterol, alkyl chains) Or soluble polymers (eg, polyethylene glycol, polysaccharin) Or non-soluble polymers (eg, dextran, poly) Acrylamide derivatives, polyvinyl derivatives, etc.) or targeting ligands (For example, the sites that bind to receptors on the surface of target cells, antibodies, and immunoglobulins Sugars or sugar phosphate residues that act as a   As used herein, "nucleoside" is composed of a heterocyclic base and a sugar The unit is shown in, for example, "DNA Repli" by Kornberg and Baker. Cation (DNA replication) ", 2nd edition, (Freeman, San Frances 2'-deoxy and 2'-hydroxy as described in Includes naturally occurring nucleosides, including cis-forms. In naturally occurring nucleosides, The ring base is typically adenine, cytosine, guanine, thymine, or uracil is there. The sugar is normally deoxyribose, erythro-pentofuranos Or ribose, ie ribourantfuranosyl. Nureo “Analogs” related to Cid are described, for example, in Scheat, “Nucleotide . Analogues (nucleotide analogs) ", (John Wiley, Modified base moieties such as 5 (New York, 1980) 6) -Nitroindole, 4-nitrotriazole, 3 (4) -nitrobenzi Midazole, 2-aminopurine, benzimidazole, 5-fluorouracil, Other) and / or modified sugar moieties (eg, arabino, xylo, or Lyso-pentafuranosyl sugar or substituted arabino, erythro, ribo, A sugar of xylo or lyxo-pentafuranosyl, or a sugar-like acyclic moiety; Include synthetic nucleosides having hexose sugars, etc.). Such analogs Are natural and synthetic, with or without suitable protecting groups for synthesis. Contains adult nucleosides.   As used herein, "nucleotide" refers to at least one of the hydroxyl groups of a sugar. 1 shows a nucleoside having a phosphate group esterified as follows.   The term "oligonucleotide" as used herein includes deoxyribonucleotides. Or ribonucleosides, their alpha-anomeric forms, natural or modified A linear oligomer of a decorated nucleoside, usually a phosphodiester linkage A few monomers such as two or three -Units to sizes having hundreds of monomer units. Oh An "analog" for a oligonucleotide is, for example, a modified sugar moiety, a modified Structure containing a modified moiety, such as a modified base moiety or a modified sugar-binding moiety. You. Illustrative of these are phosphorothioates, phosphorodithioates, Phosphoramidate, phosphoranilide, phosphodiester nucleosi Deazas are used in place of phosphodiesteric internucleoside linkages. Or replace aza purines and pyrimidines with natural purines or pyrimidines. May be used. For example, a pyrimidine having a substituent at the 4-, 5- or 6-position Bases, for example purine bases having a change or substituent at the 2-, 6- or 8-position, Or a sugar having a substituent at the 2'-position, one or more hydrogen atoms of the sugar Or a carbocyclic sugar. Preferably, the oligonucleotide of the present invention Is a natural nucleoside having a length ranging from 2 to 50 monomer units Having a length in the range of from 2 to 20 monomer units, more preferably Rigomer.   As described above, the compounds of the present invention may be oligonucleotides or modified oligonucleotides. So-called "oligonucleotides" which may be modified at the end of the nucleotide or, if necessary, (Ie, a phosphate-free oligonucleotide) At least some of which are of formula Ia:                                 Formula Ia It has a structure shown by.   In formula Ia, the substituents W and W1Indicates the remainder of the macromolecule. W And W1May be a substituent which does not impair the usefulness of the present compound. Like Or W and W1Is each independently -H; -OH; may be modified if necessary Phosphates or phosphate analogs; nucleosides or analogs thereof; Oligonucleotide or an analog thereof; oligonucleotide or an analog thereof; amino; Mercapto; DNA intercalator; covalent or non-covalent DNA A bonding group; a heterocyclic group; or an aromatic group, each containing a protecting group if necessary. A peptide or an analog thereof; a chelating group (eg, E DTA); polymers (eg, polyamides, polycations, polyanions) Other); sugar; glycoside; polysaccharide; or fat-soluble group.   Preferably, each B is independently a naturally occurring nucleobase, a non-naturally occurring nucleobase. , Heterocyclic groups, aromatic groups, DNA intercalators, covalent or non- It contains a covalent DNA-binding group, and more preferably each B is a naturally occurring nucleoside. Base or non-naturally occurring nucleobase. Most suitable for each B The selection is a naturally occurring nucleobase.   In certain preferred embodiments, B1At least one of which is a naturally occurring nucleobase is there. In another preferred aspect, B1At least one of the non-naturally occurring nucleobases It is. In another preferred aspect, B1At least one of which is a DNA intercalation (Such as acridine derivatives, phenazine derivatives, etc.) You. In another preferred aspect, B1At least one has a covalent DNA bond. Combination groups (eg, mustard gas derivatives, psoralen derivatives, etc.) It is. In another preferred aspect, B1At least one is a DNA-binding antibiotic Quality (eg, daunomycin, actinomycin D or actinomycin family) Other representative examples of, netropsin and its derivatives, distamycin and its Derivatives, etc.). In another preferred aspect, B1Less of One is a reporter group (eg, a fluorescent or chemiluminescent label, biotin, Other things). In another preferred aspect, B1At least one of Are targeting groups (eg, such as antibodies or glycosides) ). In another preferred aspect, B1At least one is soluble or non-soluble It is a soluble polymer. In another preferred aspect, B1At least one of Reactive functional groups suitable for post-synthesis modification of oligonucleotides (eg, amino, mer Capto, aldehyde, carboxy, and others).   In a preferred embodiment, n is from 1 to 20, most preferably n = 1. is there.   In certain preferred embodiments, B1Is a naturally occurring nucleobase or non-naturally occurring nucleus Creobase, where X contains from 1 to 4 atoms. In another preferred aspect, B1DNA intercalator, covalent or non-covalent DNA binding Group, or a DNA-binding antibiotic, X1Is from one atom to 12 Including In the most preferred embodiment, B1Is a nucleobase and X1Is methylene Carbonyl.   In a preferred embodiment, Q1And QTwoEach independently contains at least one of the following groups To: oxygen, sulfur, substituted carbon, carbonyl, thiocarbonyl, sulfo , Sulfoxide, C1~ C8-Alkylene, CTwo~ C8-Alkenylene, CTwo~ C8 -Alkynylene, C1~ C8-Oxaalkylene or thiaalkylene or aza Alkylene, each containing one or more heteroatoms or heteroatoms of the same type; Or two or NR in either direction7Or NR8R9Or N R7C (= O)-or NR7C (= S)-or -NR7S (= O)-or- NR7S (= O)Two-Where R7, R8And R9Is as defined above, or Or X, wherein X is as defined above, or a formula: [Where,   ZFourOr ZFiveAre each independently a single bond, O, S, and NR7Group consisting of Selected from this R7Is as defined above.   Each ZThreeIs independently hydrogen, R8, OR7, SR7, And NR7R8Group consisting of Selected from the R7And R8Is as defined above.   Each ZTwoAre independently O, S, and NR7Selected from the group consisting of R7Is as defined above.] A group represented by   In certain preferred embodiments, Q1And QTwoIs independently 2 to 8 atoms including. In a more preferred embodiment, Q1And QTwoAre independently 3 to 6 elements And, in the most preferred embodiment, contain 4 or 6 atoms. Most preferably, Each Q1Is independently selected from the following groups: -O-CH in either orientationTwo-C HTwo-CHTwo-, -O-CHTwo-C (= O) -NH-, -NH-NH-C (= O) -CHTwo-, -NH-N = CH-CHTwo-, -NH-NH-CHTwo-CHTwo-, -O -NH-C (= O) -CHTwo-, -ON = CH-CHTwo-, -O-NH-CHTwo -CHTwo-, -CHTwo-NH-C (= O) -CHTwo-, -NH-NH-C (= O) -NH-, -OC (= O) -NH-CHTwo-CHTwo-, -OP (= ZTwo) ZThree− NH-CHTwo-CHTwo-Or -CHTwo-NH-CHTwo-CHTwo-. and   Each QTwoIs independently selected from the group: Q1, -CHTwo-O-CHTwo-C HTwo-CHTwo-, -CHTwo-O-CHTwo-C (= O) -NH-, -CHTwo-NH-N HC (= O) -CHTwo-, -CHTwo-NH-N = CH-CHTwo-, -CHTwo-NH -NH-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo—O—NH—C (= O) —CHTwo-, -CHTwo -ON = CH-CHTwo-, -CHTwo-O-NH-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo-N HC (= O) -CHTwo-, -CHTwo-NH-NH-C (= O) -NH-, -O- C (= O) -NH-CHTwo-CHTwo-, -OP (= ZTwo) ZThree-NH-CHTwo-C HTwo-Or -CHTwo-CHTwo-NH-CHTwo-CHTwo-.   Preferably, at least one of V is oxygen. The most preferred choice for each V is Oxygen.   In a most preferred embodiment, at least one of J is hydrogen, fluorine, or OCHThreeof Independently selected from group. The most preferred choice for J is hydrogen.   The compounds of the present invention can be prepared using standard oligonucleotide synthesis procedures or standard peptides. Apply the tide synthesis procedure or a combination of these procedures to the liquid or solid phase Synthesized by   Using standard oligonucleotide synthesis procedures, Formula II:                                    Formula II An extending oligonucleotide or modified oligonucleotide chain represented by The compounds of the present invention were prepared by introducing a fragment of formula I at the 5'-end of Sometimes it is made. [Where,   B, B1, Q1, QTwo, V and J are as defined above, and if all are required Suitable protecting groups (eg, acetyl, isobutyryl, phenoxyacetyl, Zoyl, cyanoethyl, 4-nitrophenylethyloxycarbonyl, 4-nitro Lophenylethyl, benzyloxycarbonyl, p-anisyldiphenylmethyl , Di-p-anisylphenylmethyl, pixyl, t-butyloxycarbonyl, Diphenylcarbamoyl, formamidino, acetamidino, from 3 carbon atoms 14-trialkylsilyl, 9-fluorenylmethyl carbamate, And Greene and Wuts, "Protective Groups i. n ・ Organic ・ Synthesis (protecting group in organic synthesis), 2nd. Edition (John Wiley, New York, 1991)). You may.   Each QThreeIs independently a single bond, oxygen, sulfur, -NR8-, -OX-, -SX-, -X -Or -NR8X, where X and R8Is as defined above for formula I Yes, preferably each QThreeIs independently a single bond, -OCHTwo-, -SCHTwo-, -CHTwo -, -NR8CHTwo-, -CHTwoCHTwo-, And -OCHTwo-CHTwo-Is included. QThree The most preferred choice for is -OCHTwo-.   Each QFourIs independently a single bond, oxygen, sulfur and NR8Where R8Is of the formula I Is defined above.   Y is, for example, triphenylmethyl, p-anisyldiphenylmethyl, di-p -Anisylphenylmethyl, pixyl, tria having 3 to 14 carbon atoms Rukysilyl, 9-fluorenylmethyl carbamate, trifluoroacetyl, Other protecting groups. More preferably, Y is p-anisyldiphenyl Methyl, di-p-anisylphenylmethyl, or pixyl.   Y1Is a spacer group that binds to the solid support, Bonyl, ester, carbamate, urethane, hydrazide, C1~ C14-Archi Len or modified alkylene, C6~ C14-Aralkylene or modified Aralkylene, C6~ C14Alkylarylene or modified alkylarenes , C1~ C100Oxaalkylene or thiaalkylene or azaalkylene Each containing from 1 to 50 different heteroatoms or heteroatoms of the same type. But this aza group may optionally be an amino protecting group, C1~ C14-Alkylenecarbonyl Or modified alkylenecarbonyl or alkylenesulfone or alkyl May be protected with lensulfoxide, C1~ C100-Oxaalkylenecar Bonyl or thiaalkylenecarbonyl or azaalkylenecarbonyl (also Is its thiocarbonyl or sulfone or sulfoxide analog), Each containing from 1 to 50 different heteroatoms or heteroatoms of the same type; The group may be optionally protected with an amino protecting group, or a compound of formula (III):                                Formula III [Where,   Each RTenOr R11Is independently CThree~ CTen-Branched alkyl, C1~ CTen-Unbranched al Kill or oxaalkyl, C6~ CTen-Aryl, C7~ C12-Including aralkyl No. RTenOr R11A more preferred choice for each ofThree~ CTen-Branched alkyl or C1~ CFour-Unbranched alkyl, RTenOr R11The most suitable choice for each of Sopropyl.   R12Is CTwo~ C8-Alkylene, CTwo~ C8-Alkenylene, or CTwo~ C8-E Xaalkylene containing one or two heteroatoms. Most preferred R12Is It is a morpholino group.   ZFiveIs any phosphate protecting group, preferably 4-Cl-C6HFour -O-, 2-Cl-C6HFour-O-, 4-NOTwo-C6HFourCHTwoCHTwo-O-, 2, 4-NOTwo-C6HThreeCHTwoCHTwo-O-, 2,4-Cl-C6HThree-O-, 2,3- Cl-C6HThree-O-, NCCHTwoCHTwo-O-, NCCHTwo-C (CHThree)Two-O- , CHThreeO-, (Z)ThreeCCHTwo-O-, RTenS-, RTenS-CHTwoCHTwo-O-, Or RTenSOTwo-CHTwoCHTwo—O—, wherein Z is halogen and RTen Is independently selected from the above meanings.   Z6Is -F, -Cl, -Br, -I, imidazol-1-yl, tetrazole- 1-yl, 1,2,4-triazol-1-yl, and 1-hydroxybenzo Triazol-O-yl. In certain preferred embodiments, Y1Is CPG in essence Or a functionalized solid support that is polystyrene. In another preferred embodiment, Y1Is —HP (= O) OH or a salt thereof. In another preferred embodiment, Y1Is -P- (O CHTwoCHTwoCN) (N (i-Pr)Two) Or -P (OCHThree)-(N (I-Pr)Two) Or a salt thereof.   The compound represented by the formula (III) is usually (active phosphate group Y1Regarding) phosphorophore Midite (III-1 and III-2), phosphoric acid (III-3), H-phosphone (III-4) and active phosphodiester (III-5) I have. Structures (III-3) and (III-4) represent moderately strong acids. The reagents represented by these structures are generally separated as their organically soluble salts, used.   A fragment of formula I at the 5'-end of the extended modified oligonucleotide chain A new compound for introducing is a compound of formula IV:                                   Or                                   Formula IV [Where,   B, B1, Q1, QTwo, V, X and J are as defined above and all are required If necessary, it may be closed with a suitable protecting group.   Q1 xAnd QTwo xIs Q1Or QTwoProtected or activated if required Including fragments. More preferably Q1 xAnd QTwo xContains from one to three atoms each, If necessary, a protecting group is included. In the most preferred embodiment each Q1 xIs independently YTwo-NH- CHTwo-, YTwo-NH-O-, YTwo-NH-NH-, YTwo-NH-, YTwo-NH-C HTwo-CHTwo-, YTwo-NH-NH-CHTwo-, YTwo-NH-C (= O) -CHTwo−, YTwo—NH—C (= O) —NH—, YTwo-NH-NH-C (= O)-, Of YTwoIs a protecting group or hydrogen. More preferably YTwoIs p-anisyldiphenyl Methyl, di-p-anisylphenylmethyl, pixyl, 9-fluorenylmethyl Carbamate or trifluoroacetyl. Each QTwo xIs independently E-CHTwo -CHTwo-, E-CHTwo-, E-NH-, EO-, where E is independently halo Gen, aldehyde, acetal, -S (= O)TwoR13Or -COR13So This R13Is a hydroxyl or activating group. More preferably R13Is halo Gen, hydroxyl, pentafluorophenoxy, tetrafluorophenoxy, selected from p-nitrophenoxy or N-succinimidooxy] It is represented by   The compounds of the present invention may be classified into five groups.   (1) Oligonucleotide analogs whose non-nucleosidic linkages are nucleic acids Having a base of   (2) oligonucleotide analogues whose non-nucleosidic bonds are shared DNA binding group or non-covalent DNA binding group or DNA intercalation With a DNA or DNA-binding antibiotic.   (3) an oligonucleotide analogue, preferably non-nucleoside, The non-phosphate containing linking group is an oligonucleotide or modified oligonucleotide Used as a new type of linker that joins clusters of clusters.   (4) an oligonucleotide analog, the non-nucleosidic binding group of which is Carriers or polymers or those having a targeting ligand or a lipophilic group. and   (5) an oligonucleotide analog, wherein the non-nucleosidic bond is Those having a reporter group such as biotin.   These oligonucleotide analogs (1) to (5) are single-stranded or double-stranded nuclei. Both acids can be recognized. Fragments of formula I are 3'- and / or Oligonucleotide analogs at the 5'-end or within the oligonucleotide chain Body (1) shows the ability to bind to DNA fragments and also shows an increase in enzyme stability. Oligonucleotides having a fragment of formula I at a specific position on the oligonucleotide chain Otide analog (2) binds efficiently to double-stranded DNA or RNA, Covalent or non-covalent DNA binding groups or DNA The binding of the calator or DNA binding antibiotics Overcoming the problem of recognizing polypyrimidine tracts by gonucleotides (TFO) Provide new opportunities to dress. Oligonucleotide analog (3) is a new type of TFO Can be used as Oligonucleotide analogs (4) and (5) Useful for the synthesis of oligonucleotide conjugates.   The improved enzymatic stability and binding performance and cell membrane permeability of the compounds of the present invention Efficient as an antisense (binding to RNA) or antigen (binding to DNA) reagent Make   The present invention also provides a reagent for inhibiting transcription and / or replication of a specific gene. And provide a method. In addition, the compound of the present invention as defined above may be administered to an organism. And to degrade a specific region of double-stranded DNA in the cells of the organism. Drugs and methods are provided.   In addition, the invention relates to cells (such as tumor cells) or pathogenic organisms (such as Reagents that kill or mutate viruses, bacteria, fungi, etc.) Provide a way. This makes the cell or organism specific to that cell or organism. By contact with the compound or composition of the present invention.   Viruses which are susceptible to this treatment method of the present invention can be readily determined by those of ordinary skill in the art. Will be able to This includes herpes simplex virus (HSV), Includes topapilloma virus (HPV), human immunodeficiency virus (HIV), etc. Will.   For therapeutic or prophylactic treatment, the compounds of the invention may be formulated as pharmaceutical compositions It may be. This includes, in addition to an effective amount of the active ingredient, a pharmaceutically acceptable carrier, It may contain a thickener, a diluent, a buffer, a preservative, a surfactant, and others. Pharmaceutical compositions may also have other activities such as, for example, antimicrobial agents, anti-inflammatory agents, and the like. One or more components may be contained.   The pharmaceutical compositions of the present invention can be administered in a number of ways as are known to the skilled artisan. May be. Administration can be, for example, topically, orally, by inhalation, or parenterally. You may go to.   Topical preparations include ointments, lotions, creams, gels, drops, suppositories It can also include agents, sprays, solutions, and powders. Oral formulation Powders, granules, suspensions, or aqueous or non-aqueous vehicles, capsules, Or tablets. If necessary, thickeners, flavoring agents, diluents, emulsifiers, dispersion aids Auxiliaries or binders may also be used.   Parenteral formulations contain buffers, diluents, and other suitable additives It may also include a sterile aqueous solution that may be present.   Dosage regimens are easily determined, for example, the severity and responsiveness of the condition to be treated. It depends on a number of factors that can be determined, but normally over a period of days to months. Once or more daily during the course of the treatment, or until the treatment is effective. Or until you see a decline in your condition. Optimal dosage and administration strategy for ordinary skilled person And the rate of repetition could be easily determined. Generally, units of the present invention Dosage form compositions may contain from about 0.01 mg to about 100 mg of the active ingredient, preferably about Contains from 0.1 mg to about 10 mg of the active ingredient. Topical preparations Creams, lotions, liquids, etc.) are the active ingredient concentrations From about 0.01% to about 50%, preferably from about 0.1% to about 10% May be provided.   The following figures and reaction schemes are not limiting, and the compounds and utilities of the invention This is an example. Figures I-IV show the linking group Q1And QTwoThe present invention differs in the structure of Are shown (see Formula I herein). B-1 (Fig. 1) B-24 (FIG. 6) are all oligonucleotides of the present invention having different binding groups. Representative of a trimeric fragment of a nucleoside, where BαIs preferably a nucleobase You. Structures C-1 (FIG. 7) to C-9 (FIG. 9)1-N-QTwoAza nitrogen Representative examples of atoms acting as sites for attachment of intercalator moieties. Formula C -1 (FIG. 7) illustrates the case where an acridine residue is bonded via an acyl spacer. I do. In formula C-2, the acridine residue is linked via an alkyl-type spacer. In both structures, the intercalator is a nucleoside that is propyliminopropyl. It is bonded to the N-atom in the inter-side linking group. Structures from C-3 to C-6 (Fig. 8) is a relatively long (20 to 30 atoms) phosphate-free internucleoside linking group 2 shows an example of the binding of an intercalator to an aza atom in FIG. Figure 9 shows the remaining Coraleen 1 shows a structure of the invention in which a group is attached. As reported (JS Lee Biochemistry, 1993, 32: 5591-5597), Collaline binds to the double strand (binding constant is about 10Three-10FourM-1Is)) Triplex binding (binding constant is about 106M-1Has considerable priority Show. Collaline conjugated to triple helix-forming oligonucleotides May be desirable for self-stabilization of the formed triplex.   10 and 11 show that the DNA covalent linking group (ie, psoralen) is The case of conjugation to an internucleoside linker is represented. Psoralen double strand Within a triplex that binds preferentially to DNA molecules and forms oligonucleotides Binding of a psoralen to an abasic site in the DNA makes the accuracy of site modification of the DNA duplex It will increase significantly.   12 to 14 show a trimmer unit according to the present invention having a functional group binding to an aza-nitrogen. Here is an example. These functional groups can be used for DNA active substances (eg, intercalators, Any of an alkylator, a DNA-binding antibiotic, or any other of the above nucleic acid binding groups ) Is used as a site for post-synthesis modification of the oligonucleotide.   The various schemes for synthesizing the compounds of the present invention are summarized in the following schemes, This is described in detail below. Formula IFormula IIFormula IIIFormula IVEquation VFormula VIFormula VIIFormula VIII Formula IX  Formula X  Formula XI     Formula XIIFormula XIII Formula XIVFormula XV Formula XVI  Reaction formula I comprises an intersugar linking group -OCHTwoCHTwoCHTwoN [X-B1] -CHTwoCHTwoCHTwoO CHTwo-A bird comprising a fragment of formula B-1 (FIG. 1) having (3 '→ 4') The synthesis of a nucleoside unit is illustrated. Protected bases and partially protected sugars The 3'-position of the nucleoside having a group (compound I) is cyanoethylated (the following product). Example 2) Reduction to an aminopropyl derivative (Compound 5, Example 5) It is trifluoroacetylated (Compound 6, Example 6). Another path for this transformation Allylates the 5'-position of the nucleoside followed by conversion to the 3-bromopropyl derivative. (Compound 9). This reaction is illustrated in Examples 7, 8 and 9. Compound 6 Alkylation with compound 9 gives compound 10. The salt of this oligonucleoside skeleton Deprotection of the group and the aza-nitrogen gives compound 12 (Example 5). Compound 12 is It is a key substance for synthesizing various compounds of the present invention. For example, Compound 1 2 with various heterocyclic bases (eg, thymine, cytosine, adenine and guanine). Acylation with an activated ester of a carboxymethyl derivative of Creosides 14a, 14b, 14c and 14d are obtained (Example 1 below). 6-18). Compound 12 is an N-protected-ω-amino acid derivative (eg, N-Fm oct-4-aminobutyric acid) to convert this trimeric unit to an oligonucleotide. When introduced into the nucleotide chain, after deprotection, the structure was modified with amino ( An oligonucleotide having a (non-basic) site (motif E-2, FIG. 12) was obtained. It is. Here, the aliphatic amino groups serve as binding sites for various DNA-active groups. stand. Compound 12 is converted to an S-protected-ω-mercapto acid derivative (for example, 3-Tr- Acylation with 4-mercaptobutyric acid) to convert this trimeric unit to an oligonucleotide. When introduced into the chain, after deprotection, the structure was modified with mercapto (non-salt An oligonucleotide having a (base) site (motif E-3, FIG. 12) is obtained. . Here, the aliphatic mercapto groups serve as binding sites for various DNA-active groups. stand. Compound 12 was converted to 2,3-di-O-Fmoc-1-O-carboxymethylgly This trimeric unit is acylated with an activated derivative of serine to convert Upon introduction into the tide chain, after deprotection, the structure was modified with cis-diol ( An oligonucleotide having a (non-basic) site (motif E-4, FIG. 12) is obtained. Can be This cis-diol group is linked to various DNA-active groups after periodate oxidation. Provides an aldehyde group that serves as a bonding site. Compound 12 is a dicarboxylic acid (eg, Adipic acid, pimelic acid, suberic acid, etc.) This trimeric unit is acylated with an activated derivative of a hydrazide derivative to orient it. When introduced into a gonucleotide chain, after deprotection, the structure is modified with hydrazide. An oligonucleotide having a (non-basic) site (motif E-5, FIG. 12) can get. This hydrazide group, after deprotection, becomes the site of attachment of various DNA-active groups. To help.   Reaction formula II shows an intersugar linking group -OCHTwoCHTwoCHTwoN [X-B1] -CHTwo−C (= O) NHQThree-CHTwoOligonucleoside containing a fragment having-(3 '→ 4') 1 illustrates the synthesis of intermediates for preparation. This oligonucleotide analog has the formula Includes compounds having B-2, B-3, or B-4 (FIG. 1). Compound 6 ( (See Scheme I and Example 6) is the starting material for the synthesis of this intermediate. . Compound 6 was treated with t-butyl ether of bromoacetic acid in DMF in the presence of sodium hydride. Alkylation with stele gives compound 19 (Example 23). When this is hydrogenated Converted to compound 20 (Example 24). Compound with trifluoroacetyl protecting group Compound 21 is obtained by elimination from 20 by ammonolysis. ). Compound 21 is acylated with an activated carboxymethyl derivative of a nucleobase to form a compound. Compound 22 was obtained (Examples 26, 27 and 28), which was deprotected to give a 5'-O-protecting group. After the exchange from tetrahydropyranyl to monomethoxytrityl, carboxylic acid induction Converted to body 23 (Examples 29, 30, 31). Compound 23 was obtained by direct condensation. And can be converted to, for example, activated ester 24 (Example 32, 33, 34).   Reaction formula III shows an intersugar linking group -QThreeNHC (= O) CHTwoN [X-B1] CHTwo-C HTwoCHTwoOCHTwoPreparation of Oligonucleoside Containing Fragment Having-(3 '→ 4') The synthesis of the intermediate for production is illustrated. This oligonucleoside has the formula B-5, B-6 Or a compound having B-7 (FIG. 2). Compound 7 (Scheme I, performed (See Example 7) is the starting material for the synthesis of this intermediate. Compound 7 with cyano D Tylation gives compound 25 (Example 35). This is the trifluoroa Cetylation gives compound 26 (Example 36). Compound 26 is hydrogenated in DMF Alkylation with t-butyl ester of bromoacetic acid in the presence of sodium 27 is obtained (Example 37). This is a carboxylic acid derivative 28 after acid deprotection. (Example 38). Compound 28 was treated with a saturated ammoniacal ethanol solution. Compound 29 was obtained by acylation with an activated carboxymethyl derivative of a nucleobase. (Examples 39, 40, and 41). Dimethoxytritylation of compound 29 Protection of the 3'-hydroxyl group gives compound 30 (Example 42). This is directly For example, and can be converted to, for example, an activated ester 31 ( Example 43).   Scheme IV starts from a compound of general formula 24 and proceeds to a compound of formula B-2, B-3, or B 4 illustrates the synthesis of trinucleoside 33 containing the motif of FIG. Also, Scheme IV shows the conversion of a partially protected trinucleoside 32 to a phosphoramidite. 34 shows a pathway for conversion into CPG derivative 34 and CPG derivative 35.   Scheme V starts from a compound of general formula 31 and proceeds to a compound of formula B-5, B-6, or B-7 An example of synthesizing trinucleoside 37 containing the motif of FIG. 2 will be described. Ma Also, Scheme V shows the phosphoramidite conversion from partially protected trinucleoside 36. 19 shows the conversion to G38 and CPG derivative 39.   Reaction formula VI represents an intersugar linking group -OCHTwoCHTwoCHTwoN [X-B1] CHTwoC (= O) NHCHTwoCHTwo-The combination of peptide-like oligonucleosides 54 containing (3 '→ 4') An example is shown below. The synthetic strategy is similar to that described in Reaction Scheme I. protected Homonucleosides having a base and a partially protected sugar moiety (compound 40, Cyanoethylation of the 3'-position of Example 43) gives compound 41. 44). The 5'-O-protecting group is converted from monomethoxytrityl to tetrahydropyra. The compound is converted to compound 42 after exchanging for nil (Example 45). Reduce compound 42 To give an aminopropyl derivative (Compound 43, Example 46). Trif amino group Closure with a fluoroacetyl protecting group gives compound 44 (Example 47). Compound 44 With bromoacetic acid t-butyl ester in the presence of sodium hydride (Compound 45, Example 48). The 6'-O-THP group is converted to CBr in THF.Four/ P ( Ph)ThreeTo give the bromo derivative (Compound 46, Example 49). Compound Compound 46 was treated with di-tert-butyliminodicarboxylic acid sodium salt in DMF. To give compound 47 (Example 50). This is hydrogenolysis and ammonia treatment Converted to compound 48. Compound 48 is activated carboxymethyl derivative of nucleobase Acylation gives the modified dinucleoside 49 (Example 52 and Example 52). 53). Acid-active protecting groups (Boc- and tert-butyl protecting groups) have a 50% T FA / DCM to remove the 6'-amino function with a monomethoxytrityl protecting group Closure gives compound 50 (Examples 54 and 55). Compound 50 is Compound 54 Oligonucleosides having regular repeating elements shown in square brackets in the formula Can be used as a building block for solid phase peptide-like synthesis . Compound 50 is also a peptide-like oligonucleotide in solution as shown in Scheme VI. Can be used as a building block for the synthesis of osides (compounds 53 and And compound 54, Examples 59 to 64).   Reaction formula VII shows an intersugar linking group -OCHTwoCHTwoCHTwoN [X-B1] CHTwoC (= O ) NHN (CHThree) CHTwoPeptide-like oligonucleoside containing-(3 '→ 4') 69 illustrates the synthesis of 69. The synthetic strategy is similar to that described in Reaction Scheme VI.   Scheme VIII starts from the material of general formula 13 (see Scheme I), Phosphoramida of trinucleoside containing a motif represented by formula B-1 (FIG. 1) Illustrates the synthesis of site 18 and a CPG derivative 17 of a trinucleoside.   Scheme IX shows a 5'-mono with an abasic moiety containing an aminoalkyl linker. Synthesis of methoxytrityl protected trinucleoside (compound 71) and this compound To the phosphoramidite 72. Phospho on oligonucleotide chain Deprotection after the introduction of roamidite 72 results in amino modification (non-base An oligonucleotide having a (sex) site (motif E-2, FIG. 12) is obtained. That Aliphatic amino groups can be various DNA active groups, such as acridine groups (structure C-1, 7), a coraleen group (structure C-8, FIG. 9) or a psoralen group (structure D-1, (FIG. 10), etc.   Reaction formula X is a 5'-monomethod having an abasic site containing an aliphatic mercapto group. Synthesis of xitrityl protected trinucleoside (Compound 74) An example of the conversion to sholoramidite 75 is illustrated. Phosphoro to oligonucleotide chains The introduction of amidite 75, after deprotection, has its structure modified with mercapto (non-basic) An oligonucleotide having a site (motif E-3, FIG. 12) is obtained. That fat Aromatic amino groups can be selected from various DNA active groups such as psoralen groups (structure D-2, FIG. 0), and serve as a selective binding site for.   Scheme XI shows the Fmoc-protected hydrazide modified non-basic site (motif E-5, FIG. 13 illustrates the synthesis of the trinucleoside phosphoramidite 75 including FIG.   Reaction formula XII is 2,3-di-O-Ac-1-O-carboxymethylglycerin Trinucleoside phos with modified abasic site (motif E-4, FIG. 12) The synthesis of holoamidite 81 is illustrated. Oligonucleotide When introduced into the chain, after deprotection, the structure has a cis-diol-modified non-basic moiety. An oligonucleotide having a position (motif E-3, FIG. 12) is obtained. This system The diol group, upon periodate oxidation, becomes a binding site for various DNA active groups. Provides an aldehyde group.   Reaction formula XIII shows that the trinucleoside skeleton has a trifluoroacetyl protected aza-nitrogen. Phosphoramidite having an abasic non-basic site (motif E-1, FIG. 12) 83 illustrates the synthesis of 83. Introduce this trimer unit into the oligonucleotide chain After deprotection, the structure has a substituent on the aza-nitrogen in the trinucleoside skeleton. Having an abasic site (motif E-1, FIG. 12) not containing Get   Scheme XIV shows the activated ester 88 in the carboxyl derivative of colaline. Is exemplified. Compound 88 is an aminoalkyl-type phosphorus having a colaline moiety. Used for post-synthesis modification of oligonucleotides containing the car.   Reaction formula XV shows the activation of activated ester 93 in the carboxyl derivative of psoralen. Illustrate synthesis. Compound 93 is an aminoalkyl-type linker having a psoralen moiety Used for post-synthesis modification of oligonucleotides containing   Reaction formula XVI shows that the oligonucleoside skeleton is protected with trifluoroacetyl. Phospho with several non-basic sites containing aza-nitrogen (motif E-9, FIG. 14) The synthesis of roamidite 101 is exemplified. This unit into an oligonucleotide chain When introduced, after deprotection, a negatively charged phosphate group is added to the structure of the fragment. Phoss linked by non-basic polyoxaazaalkylene fragments not contained in Has clusters of homodiester oligonucleotides (motif E-9, FIG. 14) To obtain an oligonucleotide.   The following examples illustrate, but limit, the compounds and uses of the present invention. is not.   All temperatures are expressed in degrees Celsius (25 ° C. indicates room or room temperature). Unless otherwise stated All parts by weight are parts by weight, but liquid mixtures are exceptionally expressed by volume. below Abbreviations used: AcOEt ethyl acetate; DCE 1,2-dichloroethane; DCM is dichloromethane; DIPFA is diisopropylethylamine; DMF is Dimethylformamide; DMSO is dimethylsulfoxide; EtOH is ethanol MeOH is methanol; THF is tetrahydrofuran; Py is pyridine; he is a phenyl group; PPTS is p-toluenesulfonic acid pyridine salt; TFA is Trifluoroacetic acid; Thy is a thymine-1-group; Me is a methyl group; Et is an ethyl group; Gly is a residue of the amino acid glycine; dT is deoxythymidine; Methoxytrityl protecting group; MMT is monomethoxytrityl (p-anisyldife BOM is a benzyloxymethylene protecting group; CE is cyano Bzl is a benzyl protecting group; Boc is tert-butoxycarbonyl T-Bu is a tert-butyl protecting group; THP is a tetrahydropyranyl protecting group; Protecting group; NMR is nuclear magnetic resonance spectrum; MS is mass spectrum; TLC is silica Thin layer chromatography on gel; HPLC is high performance liquid chromatography; m p is the melting point; mp d is the melting point with decomposition; bp is the boiling point. In the description of the NMR data, Chemical shifts are given in ppm and coupling constants (J) are given in Hertz (Hz). Melting point All are uncorrected.Example 1 3-N-benzyloxymethyl-5'-O- (p-anisyldiphenylmethyl) thimi Gin, 1   5'-O- (p-anisyldiphenylmethyl) thymidine (25.75 g, 50 mm Mol) in anhydrous DMF (350 ml) under stirring with 60% sodium hydride (2.00 ml). g, 50 mmol). The mixture was stirred at room temperature for 1 hour and BOM- Cl (7.67 g, 49 mmol) is added. The mixture was stirred at room temperature for 2 hours, DM The F is distilled off. The residue is dissolved in 1 liter of an ethyl acetate-water mixture. Organic layer Wash twice with water (250 ml) and twice with brine (250 ml) in that order. Dry with nesium and dry under vacuum. The residue was purified by silica gel column chromatography ( 8 × 35 cm) and eluted with toluene / ethyl acetate (ethyl acetate from 10% to 4%). Gradient elution at 0%) to give 3-N-3′-O- (di-benzyloxymethyl) as a white foam. Ru) -5'-O- (p-anisyldiphenylmethyl) thymidine (4.15 g, 11%). Example 2 3-N-benzyloxymethyl-3'-O- (2-cyanoethyl) -5'-O- (p- Anisyldiphenylmethyl) thymidine, 2   Stir into a solution of compound 1 (12.70 g, 20 mmol) in anhydrous THF (150 ml) A 60% sodium hydride (60 mg, 50 mmol) suspension was added at once, and anhydrous Acrylonitrile (5 ml) is added dropwise over 5 minutes. Bring the resulting mixture to ambient temperature And stir for an additional hour. The mixture is evaporated to dryness in vacuo. The residue was treated with ethyl acetate (500 m Dissolve in 1). The organic layer was washed twice with a saline solution (250 ml), And dried under vacuum. The residue was purified by silica gel column chromatography (4.5). x 30 cm) and eluted with toluene / ethyl acetate (ethyl acetate from 10% to 15%). % Gradient elution) to give compound 2 (12.66 g, 92%) as a colorless oil. Example 3 3-N-benzyloxymethyl-3′-O- (2-cyanoethyl) thymidine Compound 2 (12.04 g, 17.5 mmol) in 3% TFA / DCE was added to 15 Keep at ambient temperature for minutes. The reaction mixture was washed three times with 5% sodium bicarbonate (150 ml) And twice with water (150 ml), dried over magnesium sulfate, and dried in vacuo I do. The residue was subjected to silica gel column chromatography (4.5 × 20 cm), Elution with 3% methanol / chloroform gave a colorless oily compound 3 (6.90 g, 9 5%). Example 4 3-N-benzyloxymethyl-3'-O- (2-cyanoethyl) -5'-O- ( Trahydropyran-2-yl) thymidine, 4   Stir into a solution of compound 3 (6.90 g, 16.6 mmol) in anhydrous DCM (150 ml) Lower PPTS (100 mg, 0.4 mmol) was added and DHP (5 ml) was added for 15 minutes. Drop. The resulting mixture is stirred at ambient temperature for a further 3 hours. The reaction mixture Vacuum to dryness, azeotrope twice with toluene (100 ml), and dissolve in ethyl acetate (250 ml). And then three times with 5% sodium bicarbonate (100 ml) and brine (100 ml). ml) twice. The residue was subjected to silica gel column chromatography (4. 5 × 30 cm) and eluted with toluene / ethyl acetate (1: 1) to give a colorless oil. Compound 4 (7.62 g, 92%) is obtained. Example 5 3-N-benzyloxymethyl-3′-O- (3-aminopropyl) -5′-O- ( Tetrahydropyran-2-yl) thymidine, 5   Compound 4 (7.0 g, 14 mmol) and cobalt chloride hexahydrate (6.66 g, 28 mg) Sodium borohydride (4.4 ml) in methanol (150 ml) under stirring. (8 g, 140 mmol) are added in four portions over 15 minutes. The resulting mixture Was stirred for another hour at ambient temperature, 28% ammonium hydroxide (70 ml) was added and Stir for 15 minutes at ambient temperature. The mixture is centrifuged, the supernatant is collected and the precipitate is methanol Wash twice with a tool. The collected supernatant is distilled off, and the residue is suspended in chloroform. The material is filtered off and the filtrate is dried in vacuo. Silica gel column chromatography of the residue (4.5x25cm), chloroform / methanol / 28% ammonium hydroxide Eluate (100: 3: 0.25) to give Compound 5 (4.37 g, 62) as a yellow oil. %). Example 6 3-N-benzyloxymethyl-3′-O- (3-trifluoroacetamide propyl Ru) -5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) thymidine, 6   Compound 5 (4.00 g, 8.0 mmol), DIPEA (0.5 ml) and Trif A solution of ethyl fluoroacetate (7 ml) in absolute ethanol is kept at ambient temperature overnight. Reaction mixture The compound was evaporated to dryness in vacuo, and the residue was subjected to silica gel column chromatography (4.5 × 25c). m) and eluted with toluene / ethyl acetate (7: 3) to give compound 6 (4) as a colorless oil. .46 g, 93%). Example 7 3-N-benzyloxymethyl-3′-O- (benzyl) thymidine, 7   Stir in a solution of Compound 1 (33.25 g, 50 mmol) in anhydrous DMF (150 ml) Add a suspension of lower 60% sodium hydride (2.4 g, 60 mmol) and after 1 hour Benzyl bromide (12.0 g, 8.4 ml, 70 mmol) was added dropwise over 5 minutes. Down. The resulting mixture is stirred overnight at ambient temperature and the DMF is removed by drying to dryness in vacuo. The residue was dissolved in ethyl acetate (600 ml), once with water (200 ml) and brine (200 ml) sequentially, dried over magnesium sulfate, and then dried in vacuo. . The residue was azeotroped twice with toluene (300 ml) and 3% TFA / DCE (700 ml) And maintain at ambient temperature for 15 minutes. The reaction mixture was treated with 5% sodium bicarbonate (2 (50 ml) three times and water (250 ml) twice. And dried under vacuum. The residue is crystallized from toluene / hexane to form white crystals Compound 7 (17.42 g, 77%) is obtained. Silica gel column chromatography of mother liquor (2.5 x 25 cm) and eluted with toluene / ethyl acetate (7: 3). An additional 2.15 g (9.5%) of compound 7 can be isolated. Example 8 3-N-benzyloxymethyl-3′-O- (benzyl) -5′-O- (allyl) thimi Gin, 8   Compound 7 (6.75 g, 15 mmol) was added to a solution of anhydrous DMF (75 ml) with stirring. A suspension of 0% sodium hydride (0.80 g, 20 mmol) was added and after 1 hour, Further, allyl bromide (3.02 g, 2.16 ml, 25 mmol) was added dropwise over 5 minutes. under I do. The resulting mixture is stirred at ambient temperature for 2 hours and the DMF is removed by vacuum drying. The residue was dissolved in ethyl acetate (300 ml), once with water (100 ml) and brine (100 ml). 100 ml), dried over magnesium sulfate, and then dried in vacuo. . The residue was subjected to silica gel column chromatography (2.5 x 25 cm), Compound 8 (7.05 g, 95%) as a colorless oil, eluting with ene / ethyl acetate (9: 1). Example 9 3-N-benzyloxymethyl-3′-O- (benzyl) -5′-O- (3-bromo Propyl) thymidine, 9   Dry 50 ml volumetric flask with septum port thermometer port and magnetic stirrer Bubble the gas with argon gas and keep under argon pressure. Compound 8 (4. (5 g, 9.1 mmol) in anhydrous THF (10 ml) and cool to 0 ° C. A 1M THF solution of borohydride (3.1 ml, 9.3 mmol) was added dropwise over 5 minutes Down. The resulting mixture was stirred at 0 ° C. for 30 minutes, then stirred at ambient temperature for 30 minutes. Mix. Excess hydride is decomposed by further adding methanol (60 μl). solution Was cooled to −10 ° C. and brine (1.94 g, 0.62 ml, 12.1 mmol) was added in 10 mL. Add dropwise over minutes. Further, a 4.34 M solution of sodium methoxide (3.5 m (15.2 mmol) at 0 ° C. over 45 minutes. The reaction mixture is (150 ml), 3 times with saturated sodium bicarbonate (50 ml) and Wash successively twice with water (50 ml), dry over magnesium sulfate and dry in vacuo. The residue is azeotroped twice with 100 ml of toluene. The residue is purified by silica gel column chromatography. Raph (4.5 x 25 cm) and elute with toluene / ethyl acetate (ethyl acetate (Gradient elution from 0% to 10%) gave compound 9 as a colorless oil (2.10 g, 40%). Example 10   3-N-benzyloxymethyl-5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) -3'-O-[(4-N-trifluoroacetyl) -1,7-heptaza-4-diene Yl] thymidylyl- (3 ′ → 5 ′)-3-N-benzyloxymethyl-3′-O- ( Benzyl) thymidine, 10   To a stirred solution of compound 6 (2.00 g, 3.3 mmol) in anhydrous DMF (10 ml), A suspension of 60% NaH (140 mg, 3.5 mmol) was added and after 1 hour, anhydrous D A solution of compound 9 (2.00 g, 3.5 mmol) in MF (5 ml) is added. can get The mixture is stirred at 50 ° C. overnight and cooled to ambient temperature. 60% NaH (40 mg, 1 Mmol) was added and after 1 hour compound 9 (600 mg, 1 mg) in anhydrous DMF (2 ml) was added. . (0 mmol). Stir the resulting mixture at 50 ° C. overnight, Cool and evaporate in vacuo until DMF is dry. The residue was taken up in EtOAc (100 ml) And washed successively with water (1 × 30 ml) and brine (2 × 30 ml) and dried ( MgSOFour) And evaporate under reduced pressure until dryness. The residue was treated with toluene / Silica gel column chromatography with EtOAc (10-50% EtOAc gradient) Compound 10 (2.99 g, 83% yield) was obtained by white chromatography (2.5 × 25 cm). Colored bubbles Example 11   5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) -3'-O-[(4-N-trifluoro [Roacetyl) -1,7-heptaza-4-enediyl] thymidylyl- (3 '→ 5')-thio Midin, 11   Compound 10 (2.18 g, 2.0 ml) in an EtOAc / MeOH (1/1) mixture 10% Pd / C (Degussa type, Aldrich) (1.1 g) Add. The flask was evacuated and then flushed with hydrogen three times and finally 40-40 Fill with 0 psi of hydrogen. The resulting suspension is stirred vigorously at 23 ° C. for 14 hours. The suspended material is filtered off with a celite pad placed on a Buchner funnel, and Rinse several times with the amount of EtOAc and MeOH. Combine the filtrate and washings and allow to dry. Evaporate under reduced pressure. The residue was eluted with MeOH / CHClThreeUsing silica gel Compound 11 (1.32 g, yield: 2.5 x 25 cm) was obtained. 87%) as a white foam. Example 12   5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) -3'-O- (1,7-heptaza- 4-ndiyl) thymidilulu (3 '→ 5')-thymidine, 12   12% NHThree/ EtOH-28% NHFourCompound in a 3: 1 mixture of OH (20 ml) A solution of 11 (1.14 g, 1.5 mmol) is maintained at 65 ° C. overnight. Reaction mixture Was cooled and evaporated to dryness under reduced pressure, and the residue was eluted with CHCl 3 as eluent.Three/ MeO H / 28% NHFourSilica gel column chromatography using OH (95/5 / 0.5) Compound 12 (0.96 g, 96% yield) was applied to a white solid (4.5 × 25 cm). Get in the body. Example 13   5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) -3'-O- {4-N-[(thymidine -1-yl) acetyl] -1,7-heptaza-4-enediyl} thymidylyl- (3 ′ → 5 ')-thymidine, 13a   Compound 12 (333 mg, 0.50 mmol) in anhydrous DMF (3.0 ml), thymidi 1-ylacetic acid pentafluorophenyl ester (210 mg, 0.60 mmol ) And DIPEA (0.6 mmol) at ambient temperature for 2 hours. Is evaporated. The residue was washed with CHCl as eluent.Three/ MeOH / 28% NHFourOH (9 7/3 / 0.1) column chromatography on silica gel (2.5 x 25 cm) To afford compound 13a (407 mg, 98% yield) as a white solid. Example 14   5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) -3'-O- {4-N-[(4-N- ( Isobutyryl) cytidin-1-yl) acetyl] -1,7-heptaza-4-enediii {Thymidylyl- (3 ′ → 5 ′)-thymidine, 13b   Compound 12 (333 mg, 0.50 mmol) in anhydrous DMF (3.0 ml), [4-N -(Isobutyryl) cytidin-1-yl] acetic acid pentafluorophenyl ester (2 43 mg, 0.60 mmol) and DIPEA (0.6 mmol) at ambient temperature For 2 hours and the DMF is evaporated. The residue was washed with CHCl as eluent.Three/ MeO Silica gel column chromatography using H (0-7% methanol gradient) (2.5 × 20 cm) to give compound 13b (422 mg, 95% yield) as a white solid. You.1H- and13The structure is confirmed by C-NMR.                                 Example 15   5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) -3'-O- {4-N-[(6-N- ( Phenoxyacetyl) adenin-9-yl) acetyl] -1,7-heptaza-4- Ndiyl} thymidyl- (3 ′ → 5 ′)-thymidine, 13c   Compound 12 (333 mg, 0.50 mmol) in anhydrous DMF (3.0 ml), [6-N -(Phenoxyacetyl) adenine-7-yl] acetic acid pentafluorophenyles Around a solution of ter (296 mg, 0.60 mmol) and DIPEA (0.6 mmol). Maintain at ambient temperature for 2 hours and evaporate DMF. The residue was washed with CHCl as eluent.Three/ Silica gel column chromatography using MeOH (0-7% methanol gradient) Feet (2.5 × 20cm), compound13c (412 mg, 87% yield) as a white solid Get in.1H- and13The structure is confirmed by C-NMR.                                 Example 16   3'-O- {4-N- (thymidin-1-yl) acetyl] -1,7-heptaza-4 -Ndiyl} thymidyl- (3 '→ 5')-thymidine, 14a   Compound 13a (300 mg, 0.40 mmol) and P in anhydrous EtOH (6 mL) A solution of PTS (300 mg, 0.4 mmol) is maintained at 35 ° C. overnight. Reaction mixture And Sephadex LH-2 using MeOH as an eluent at a flow rate of 10 ml / h. 0 column chromatography (3.0 × 120 cm) to give compound 14a (287 mg). , Yield 96%) as a white solid. Example 17   3′-O-{[4-N- (cytidin-1-yl) acetyl] -1,7-heptaza- 4-ndiyl} thymidyl- (3 ′ → 5 ′)-thymidine, 14b   NHThreeCompound 13b (355 mg, 0.40 mmol) in EtOH (5 ml) saturated with Solution) at ambient temperature overnight. Evaporate the reaction mixture under reduced pressure to dryness . Residue in anhydrous EtOH (6 ml) and PPTS (300 mg, 0.4 mmol) was added to 35 Maintain at ℃ overnight. The reaction mixture is brought up to a flow rate of 10 ml / h with MeOH as eluent. LH-20 column (3.0 × 120 cm) chromatograph Compound 14b (280 mg, 87% yield) was obtained.                                 Example 18   3′-O- {4-N-[(adenine-9-yl) acetyl] -1,7-heptaza- 4-ndiyl} thymidylyl- (3 ′ → 5 ′)-thymidine, 14c   Compound 13c (380 mg, 0.40 mmol) was treated as in Example 17. Compound 14c (240 mg, 82% yield) is obtained.1The structure is confirmed by 1 H-NMR.                                 Example 19   5'-O- (p-anisyldiphenylmethyl) -3'-O-{[4-N- (thymidine -1-yl) acetyl] -1,7-heptaza-4-enediyl} thymidylyl- (3 ′ → 5 ')-thymidine, 15   Compound 13a (225 mg, 0.30 mmol) and P in anhydrous EtOH (6 mL) A solution of PTS (300 mg, 0.40 mmol) is maintained overnight at 35. Anhydrous P y (20 ml) is added to the reaction mixture. The reaction mixture was evaporated under reduced pressure and then anhydrous Py ( Azeotrope with 3 × 10 ml), dissolved in anhydrous Py (5 ml) and treated with MMT-Cl (110 mg, 0.3 mg). 6 mmol). The reaction mixture was maintained at ambient temperature overnight, then MeOH (1 00 μl) and after 30 minutes the reaction mixture was washed with CHClThree(50 ml). Yes NaHCOThree(3 × 15 ml), washed with brine (2 × 15 ml) and dried (MgSO 4)Four ) And evaporated under reduced pressure to dryness, and the residue is eluted with CHClThree/ MeOH / 28% NHFourSilica gel column chromatography using OH (97/2 / 0.1) (2.5 × 10 cm) to give compound 5 (279 mg, 91% yield) as a white foam. obtain. Example 20   5'-O- (p-anisyldiphenylmethyl) -3'-O-{[4-N- (thymidine -1-yl) acetyl] -1,7-heptaza-4-enediyl} thymidylyl- (3 ′ → 5 ')-3'-O- (succinoyl) thymidine, 16   Compound 15 (252 mg, 0.25 mmol) was azeotroped with anhydrous Py (3 x 5 ml) to give P Dissolve in y (3 ml). Succinic anhydride (100 mg, 1 mmol) and DMAP (30 mg, 0.25) is added and the reaction mixture is maintained at ambient temperature overnight. Water / Py A 1: 3 mixture (4 ml) is added and maintained at ambient temperature overnight. The reaction mixture is evaporated and the residue The residue is CHClThree(25 ml), 0.5 M citric acid (3 × 10 ml) and saline ( 2 × 10 ml) and dried (MgSO 4)Four) And evaporate under reduced pressure until dry . The residue is azeotroped with anhydrous dioxane (2 × 5 ml) and frozen from anhydrous dioxane (3 ml) Drying gives compound 16 (270 mg, 97% yield). Example 21   CPG-bound trinucleosides 16, 17   Trinucleoside 16 is converted to a succinimide ester, Process with CPG (500 Å, Sigma). 15-20 μM / g The resulting CPG17 was loaded into a standard protocol using Then, solid-phase oligonucleotide synthesis is performed.                                 Example 22   5'-O- (p-anisyldiphenylmethyl) -3'-O-{[4-N- (thymidine -1-yl) acetyl] -1,7-heptaza-4-enediyl} thymidylyl- (3 ′ → 5 ′)-3 ′-[(β-cyanoethoxy) -N- (diisopropyl) phosphyl] thimi Gin, 18   Compound 15 (504 mg, 0.5 mmol) was added to anhydrous dichloromethane under an argon atmosphere. Dissolve in tan (7 ml). Diisopropylethylamine (0.22 ml, 1.23 mmol ) And the reaction mixture is cooled to -30 ° C. Add chloro (diisopro (Pyramino) -β-cyanoethoxyphosphine (0.75 mmol), The thing is warmed to 20 ° C. and stirred for 4 hours. Ethyl acetate (40 ml) and triethyl alcohol Min (0.5 ml) is added and the solution is washed with brine (3 × 20 ml). Separate the organic phase , Dried (NaTwoSOFour). After filtration of the solid, the solvent was evaporated under reduced pressure at 20 ° C. and then The obtained oil was purified by using toluene-ethyl acetate-triethylamine (2. Purify by silica gel chromatography using 0: 80: 1). Next The fractions were evaporated at 20 ° C. under reduced pressure (1 Torr) and the residue was evaporated with anhydrous pyridine to give a residue. Lyophilized from benzene-acetonitrile (1: 1) to give the title compound 18. You.                                 Example 23   3-N-benzyloxymethyl-3′-O- [3-N- (trifluoroacetyl) -3-N- (tert-butoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl] -5'-O -(Tetrahydropyran-2-yl) thymidine, 19   To a stirred solution of compound 6 (2.00 g, 3.3 mmol) in anhydrous DMF (10 ml) A 60% NaH suspension (140 mg, 3.5 mmol) was added and after 1 hour, bromoacetic acid Tert-butyl ester (FW 195.06, d1.321) (0.68 g, 0.52 ml) (3.5 mmol). Stir the resulting mixture at 50 ° C. overnight and cool to ambient temperature Reject. Further 60% NaH (40 mg, 1 mmol) was added and after 1 hour bromoacetic acid Tert-butyl ester (0.20 mg, 0.15 ml, 1 mmol) is added. The resulting blend Stir the mixture at 50 ° C. overnight, cool to ambient temperature and evaporate under reduced pressure to dryness of DMF I do. The residue was dissolved in EtOAc (100 ml), water (1 × 30 ml) and brine (2 ×). × 30 ml) and dried (MgSO 4).Four) And evaporate under reduced pressure until dryness. Residue is eluted with toluene / EtOAc (10-50% EtOAc gradient) The compound was subjected to silica gel column chromatography (2.5 x 25 cm) using Compound 19 (2.10 g, 89% yield) was obtained as a white foam. Example 24   3′-O- [3-N- (trifluoroacetyl) -3-N- (tert-butoxycal Bonylmethyl) -3-aminopropyl] -5′-O- (tetrahydropyran-2-i Le) thymidine, 20   To a stirred solution of compound 19 (2.14 g, 3.0 mmol) in EtOAc (50 mL) Add 10% Pd / C (Degussa type, Aldrich) (1.1 g). flask Degassed, then flushed with hydrogen three times and finally filled with 40-50 psi hydrogen I do. The resulting suspension is stirred vigorously at 23 ° C. for 14 hours. Buchner suspension Filter off the celite pad on the funnel, then remove the funnel with a small amount of EtOAc and And rinse several times with MeOH. The filtrate and washings are combined and evaporated under reduced pressure until dryness. Remaining The residue was eluted with toluene / EtOAc (10-70% EtOAc gradient). The compound 2 was subjected to silica gel column chromatography (2.5 x 25 cm) to be used. 0 (1.59 g, 87% yield) as a white foam. Example 25 3'-O- [3-N- (tert-butoxycarbonylmethyl) -3-aminop Ropyl] -5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) thymidine, 21   12% NH in compound 20 (1.82 g, 3.0 mmol)Three/ Ethanol-2 8% NHFourThe solution in a 3: 1 mixture of OH is left at 65 ° C. overnight. This reaction mixture Was cooled and evaporated to dryness under reduced pressure.Three/ 28% NHFour OH (99.5 / 0.5) (methanol 0 to 70% gradient) as eluent For chromatography on a silica gel column (4.5 x 25 cm) This gave compound 21 (1.47 g (96%)) as an oil. Example 26 3'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (tert -Butoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl {-5'-O- (tetrahi Dropyran-2-yl) thymidine, 22a   Compound 21 (1.02 g, 2.00 mmol), pen of thymin-1-ylacetic acid Tafluorophenyl ester (0.77 g, 2.10 mmol) and DIPE A (2.10 mmol) in anhydrous DMF (10.0 ml) at ambient temperature for 4 hours Leave to evaporate DMF. CHCl was added to the obtained residue.Three/ Methanol / 2 8% NHFourSilica gel column using OH (97/3 / 0.1) as eluent ( Chromatography on 2.5 x 25 cm) gave compound 22 (1.33 g (9 8%)) as a white solid. Example 27 3'-O- {3-N-[((4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) a Cetyl] -3-N- (tert-butoxycarbonylmethyl) -3-aminopro Pill '-5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) thymidine, 22b   Compound 21 (1.02 g, 2.00 mmol), [4-N- (isobutyryl) Cytidin-1-yl] acetic acid pentafluorophenyl ester (0.85 g, 2 . 10 mmol) and DIPEA (2.10 mmol) in anhydrous DMF (10. 0 ml) The solution is left at ambient temperature for 4 hours and the DMF is distilled off. The residue obtained Against CHClThree/ Methanol / (methanol 0 to 7% gradient) Chromatography on silica gel column (2.5x25cm) used as eluent To give compound 22b (1.42 g (97%)) as a white solid.Example 28 3'-O- {3-N-[((6-N- (phenoxyacetyl) adenine-9-i Ru) acetyl] -3-N- (tert-butoxycarbonylmethyl) -3-amido Nopropyl {-5'-O- (tetrahydropyran-2-yl) thymidine, 22c   Compound 21 (1.02 g, 2.00 mmol), [6-N- (phenoxyacetate) Tyl) adenine-9-yl] acetic acid pentafluorophenyl ester (1.04 g, 2.10 mmol) and DIPEA (2.10 mmol) in anhydrous DMF ( 10.0 ml) The solution is left at ambient temperature for 4 hours and the DMF is distilled off. Got CHCl to the residueThree/ Methanol / (methanol 0 to 7% gradient Chromatography on silica gel column (2.5 x 25 cm) using eluate as eluent Roughing afforded compound 22c (1.51 g (92%)) as a white solid. Was.                                Example 29 3'-O- {3-N-[((thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (carbo Xymethyl) -3-aminopropyl {-5'-O- (p-anisyldiphenyl Chill) thymidine, 23a   Compound 22a (1.69 g, 2.5 mmol) in 50% TFA / DCM (50 ml) The solution was left at ambient temperature for 30 minutes. The reaction mixture was evaporated under reduced pressure to give The residue obtained is azeotroped with toluene (2 × 50 ml), Py (3 × 50 ml), Dissolve in anhydrous Py (25 ml) and add MMT-Cl (0.93 g, 3.0 mmol) Add. The reaction mixture is left overnight at ambient temperature and evaporated. The residue obtained To CHClThree(150ml), water (2x50ml), cold citric acid (3x 30 ml) and brine (2 × 50 ml). Dry over gnesium and evaporate under reduced pressure. The residue obtained is CHClThree/ Hex Reprecipitate from the solution. The precipitate was collected and dried under reduced pressure to give compound 23a (1. Example 30 3'-O- {3-N-[((4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) a Cetyl] -3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl {-5'-O- (P-anisyldiphenylmethyl) thymidine, 23b   Compound 22b (1.46 g, 2.00 mmol) was prepared as described in Example 29. To give the title compound 23b (1.47 g, 85%).                                Example 31 3'-O- {3-N-[(6-N- (phenoxyacetyl) adenin-1-yl ) Acetyl] -3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl {-5'- O- (p-anisyldiphenylmethyl) thymidine, 23c   Compound 22c (1.64 g, 2.00 mmol) was prepared as described in Example 29. To give the title compound 23c (1.49 g, 78%).                                Example 32 3'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (pentaf Fluorophenoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl {-5'-O- (p -Anisyldiphenylmethyl) thymidine, 24a   Compound 23a (1.00 mmol), pentafluorophenol (1.1 mm ol) and N, N'-dicyclohexylcarbodiimide (1.1 mmol) The solution in DMF (7 ml) is left at ambient temperature for 1 hour. N, N'-dicyclohexene Silurea is filtered off and the resulting solution of compound 24a is used without purification.                                Example 33 3'-O- {3-N-[(4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) acetate Tyl] -3-N- (pentafluorophenoxycarbonylmethyl) -3-amino Propyl-5-5-O- (p-anisyldiphenylmethyl) thymidine, 24b   Compound 23b (1.00 mmol) was treated as described in Example 32; A solution of the title compound 24b was obtained.                                Example 34 3'-O- {3-N-[(6-N- (phenoxyacetyl) adenin-1-yl ) Acetyl] -3-N- (pentafluorophenoxycarbonylmethyl) -3- Aminopropyl {-5'-O- (p-anisyldiphenylmethyl) thymidine, 2 4c   Compound 23c (1.00 mmol) was treated as described in Example 32; A solution of the title compound 24c was obtained.                                Example 35 3-N-benzyloxymethyl-5'-O- (2-cyanoethyl) -3'-O- (Benzyl) thymidine, 25   60% NaH was added to a solution of compound 7 (2.0 mmol) in anhydrous THF (150 ml). (60 mg, 1.5 mmol) suspension at once, and add Lonitrile (5 ml) is added dropwise. Allow the resulting mixture at ambient temperature for an additional hour Stir. The mixture is evaporated to dryness under reduced pressure. The obtained residue was treated with ethyl acetate ( (500 ml). The organic layer was washed with brine (2x250ml), After drying with cesium, evaporating to dryness under reduced pressure, toluene / acetic acid Silica using ethyl (ethyl acetate 10-15% gradient) as eluent Chromatography on a Kagel column (4.5 x 30 cm) gave compound 25. Example 36 3-N-benzyloxymethyl-5'-O- (3-trifluoroacetamido Ropyl) -3'-O- (benzyl) thymidine, 26   Compound 25 was treated as described in Example 5 to give 3-N-benzyloxyme Cyl-5'-O- (3-aminopropyl) -3'-O- (benzyl) thymidine  3-N-benzyloxymethyl-5'-O- (3-aminopropyl) -3'- O- (benzyl) thymidine was treated as described in Example 6 to give the title compound 26 Example 37 3-N-benzyloxymethyl-5'-O- [3-N- (trifluoroacetyl ) -3-N- (tert-Butoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl] -3'-O- (benzyl) thymidine, 27   Compound 26 (2.00 mmol) was treated as described in Example 23 and labeled. The title compound 27 (85%) was obtained.                                Example 38 5'-O- [3-N- (trifluoroacetyl) -3-N- (carboxymethyl ) -3-Aminopropyl] thymidine, 28   Compound 27 (2.00 mmol) was treated as described in Example 24 and treated with 5 '-O- [3-N- (trifluoroacetyl) -3-N- (tert-butoxy Carbonylmethyl) -3-aminopropyl] thymidine (82%). Then 5'-O- [3-N- (trifluoroacetyl) -3-N- (tert-but (Xycarbonylmethyl) -3-aminopropyl] thymidine as described in Example 29. In this manner, the tert-butyl protecting group is removed from the carboxy moiety. Removal gave the title compound 28 (95%).                                Example 39 5'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (carboxy Cimethyl) -3-aminopropyl] thymidine, 29a   Compound 28 was treated as described in Example 25 to give 5'-O- [3-N- ( Carboxymethyl) -3-aminopropyl] thymidine (97%). Then 5,5'-O- [3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl] thymidine Was treated as described in Example 26 to give the title compound 29a as a white solid. (92%).                                Example 40 5'-O- {3-N-[(4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) acet Tyl] -3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl] thymidine, 29 b   5'-O- [3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl] thymidine Was treated as described in Example 27 to give the title compound 29b as a white solid (91%).                                Example 41 5'-O- {3-N-[(6-N- (phenoxyacetyl) adenin-1-yl ) Acetyl] -3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl] thymidine , 29c   5'-O- [3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl] thymidine Was treated as described in Example 28 to give the title compound 29c as a white solid (93%).                                Example 42 5'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (carboxy Cimethyl) -3-aminopropyl {-3'-O- (di-p-anisyldiphenyl) Methyl) thymidine, 30a; 5'-O- {3-N-[(4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) acet Tyl] -3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl {-3'-O- ( Di-p-anisyldiphenylmethyl) thymidine, 30b; 5'-O- {3-N-[(6-N- (phenoxyacetyl) adenin-1-yl ) Acetyl] -3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl {-3'- O- (di-p-anisyldiphenylmethyl) thymidine, 30c   Compound 29 was treated with DMT-Cl as described in Example 29 to give the title. Compounds 30a-c were obtained.                                Example 43 5'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (succinyl Imidooxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl {-3'-O- (di-p -Anisyldiphenylmethyl) thymidine, 31a; 5'-O- {3-N-[(4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) acet Tyl] -3-N- (succinimidooxycarbonylmethyl) -3-aminopro Pill '-3'-O- (di-p-anisyldiphenylmethyl) thymidine, 31b; 5'-O- {3-N-[(6-N- (phenoxyacetyl) adenin-1-yl ) Acetyl] -3-N- (succinimidooxycarbonylmethyl) -3-ami Nopropyl {-3'-O- (di-p-anisyldiphenylmethyl) thymidine, 3 1c   Compound 30 (1.00 mmol), N-hydroxysuccinimide (1.1 m mol) and N, N'-dicyclohexylcarbodiimide (1.1 mmol) In DMF (7 ml) is left at ambient temperature for 1 hour. N, N'-dicyclohe The xylurea is filtered off and the resulting solution of compound 31 is used without purification.                               Example 43a 3-N-benzyloxymethyl-6'-O- (p-anisyldiphenylmethyl) -5'-homothymidine, 40   5'-homothymidine (5.12 g, 20 mmol) [Etzold, G .; Et al., Chemical Communications, (1968), p. 422] according to the procedure of Example 19. Toxitritylation followed by benzyloxymethylation according to the procedure of Example 1. Purification provided the title compound 40 (87%).                                Example 44 3-N-benzyloxymethyl-6-3'-O- (2-cyanoethyl) '-O- (P-anisyldiphenylmethyl) -5'-homothymidine, 41   According to the procedure of Example 2, compound 40 was cyanoethylated to give compound 41. .                                Example 45 3-N-benzyloxymethyl-3'-O- (2-cyanoethyl) -6'-O- (Tetrahydropyran-2-yl) -5'-homothymidine, 42   Deprotection of compound 41 was performed according to the procedure of Example 3 and then according to the procedure of Example 4. To give Compound 42.Example 46 3-N-benzyloxymethyl-3'-O- (3-aminopropyl) -6'-O -(Tetrahydropyran-2-yl) -5'-homothymidine, 43   According to the procedure of Example 5, compound 42 was reduced and purified to obtain compound 43.                                Example 47 3-N-benzyloxymethyl-3'-O- (3-trifluoroacetamido) Ropyl) -6'-O- (tetrahydropyran-2-yl) -5'-homothymidine , 44   Following the procedure of Example 6, compound 43 was trifluoroacetylated and purified. Compound 44 was obtained.                                Example 48 3-N-benzyloxymethyl-3'-O- [3-N- (trifluoroacetyl ) -3-N- (tert-Butoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl) -6'-O- (tetrahydropyran-2-yl) -5'-homothymidine, 45   Following the procedure of Example 23, compound 44 was converted to tert-butyl ester of bromoacetic acid. Purification by alkylation with ter gave compound 45.                                Example 49 3-N-benzyloxymethyl-3'-O- [3-N- (trifluoroacetyl ) -3-N- (tert-Butoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl) -6'-bromo-5'-homothymidine, 46   Compound 45 (5 mmol), CBrFour(7 mmol) and P (Ph)Three(14m mol) in anhydrous THF (40 ml) is stirred at ambient temperature for 24 hours. this The reaction mixture was evaporated to dryness under reduced pressure and the residue obtained was toluene (2 × 100 ml) ) And toluene / ethyl acetate (7: 3c1: 1) as eluent Chromatography on a silica gel column (4.5 x 25 cm) used Compound 46 (95%) was obtained.                                Example 50 3-N-benzyloxymethyl-3'-O- [3-N- (trifluoroacetyl ) -3-N- (tert-butoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl ] -6'-N- (di-tert-butyloxycarbonyl) -6'-amino-5 '-Homothymidine, 47   Di-tert-butyliminodicarboxylate (1.09 g, 5.0 mmol l) in anhydrous DMF (20 ml) was stirred and mixed with 60% NaH (200 mg). 5.0 mmol) and then 1 hour later compound 46 (4.0 mmol) Add. Stir the resulting mixture at 50 ° C. overnight, cool to ambient temperature, and add DMF Is evaporated to dryness under reduced pressure. The obtained residue was dissolved in ethyl acetate (150 ml). , Water (1 x 30 ml) and brine (2 x 30 ml) successively, Dry with nesium and evaporate to dryness under reduced pressure. Toluene / vinegar based on the residue obtained Ethyl acetate (10-15% gradient of ethyl acetate) as eluent Chromatography on a Ricagel column (2.5 x 25 cm) gave compound 35. I got                                Example 51 3'-O- [3-N- (tert-butoxycarbonylmethyl) -3-aminop Ropyl] -6'-N- (tert-butyloxycarbonyl) -6'-amino- 5'-homothymidine, 48   According to the procedure of Example 11, compound 47 (2.0 mmol) was subjected to a hydrogenation reaction. And refine. The product of this reaction is allowed to run overnight at ambient temperature with 12% NHThree/ Etano -28% NHFourTreat with a 3: 1 mixture of OH. The reaction mixture is cooled and steam After evaporating to dryness, CHCl was added to the obtained residue.Three/ Methanol / 28% NHFourOH (9 5/1 / 0.5) as eluent (2.5 x 25 cm) The compound 48 was obtained.                                Example 52 3'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (tert -Butoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl {-6'-N- (tert -Butyloxycarbonyl) -6'-amino-5'-homothymidine, 49a   Compound 48 was treated as described in Example 26 to give the title compound 49a. Was obtained as a white solid (95%).Example 53 3'-O- {3-N-[(4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) acetate Tyl] -3-N- (tert-butoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl Ru-6'-N- (tert-butyloxycarbonyl) -6'-amino-5 ' -Homothymidine, 49b   Compound 48 was treated as described in Example 27 to give the title compound 49b. Was obtained as a white solid (95%).                                Example 54 3'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (carboxy Cimethyl) -3-aminopropyl {-6'-N- (p-anisyldiphenylmethyl) ) -6'-amino-5'-homothymidine, 50a   Compound 49a was treated as described in Example 29 to give the title compound 50a. a was obtained as a white solid (93%).                                Example 55 3'-O- {3-N-[(4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) acetate Tyl] -3-N- (carboxymethyl) -3-aminopropyl {-6'-N- ( p-anisyldiphenylmethyl) -6'-amino-5'-homothymidine, 50b   Compound 49b was treated as described in Example 30 to give the title compound 50b. b was obtained as a white solid (95%).                                Example 56 3'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (pentaf Fluorophenoxycarbonylmethyl) -3-aminopropyl {-6'-N- (p -Anisyldiphenylmethyl) -6'-amino-5'-homothymidine, 51a   Compound 50a was treated as described in Example 32 to give the title compound 51a. A solution of a was obtained (93%).                                Example 57 3'-O- {3-N-[(4-N- (isobutyryl) cytidin-1-yl) acetate Tyl] -3-N- (pentafluorophenoxycarbonylmethyl) -3-amino Propyl {-6'-N- (p-anisyldiphenylmethyl) -6'-amino-5 '-Homothymidine, 51b   Compound 50b was treated as described in Example 33 to give the title compound 51 A solution of b was obtained.                                Example 58 3'-O- {3-N-[(thymin-1-yl) acetyl] -3-N- (N- (3 -N- (diethylamino) propyl) carboxamidomethyl) -3-aminop Ropyr'-6'-N- (p-anisyldiphenylmethyl) -6'-amino-5 ' -Homothymidine, 52a   A solution of compound 51a (1 mmol) in DMF (5 ml) was added at ambient temperature for 2 hours. Treat with 3-N- (diethylamino) propylamine (1.5 mmol). This The reaction mixture of was evaporated to dryness under reduced pressure and CHClThree/ 28% NHFourOH (99.9 / 0.1) (methanol 0 to 9% gradient) Chromatography on silica gel column (2.5x25cm) used as eluent To give compound 52a (85%) as an oil.                                Example 59 Oligonucleoside 53 (n = 1)   A solution of Compound 52 (1 mmol) in 80% AcOH (100 ml) was brought to ambient temperature. Leave overnight. The reaction mixture was evaporated to dryness under reduced pressure and the resulting residue was Py ( (3 x 50 ml) and azeotrope with anhydrous DMF (3 x 25 ml). Its residue Was dissolved in anhydrous DMF (5 ml) and compound 51 (1.2 mmol) and DI A solution of PEA (1.1 ml) in anhydrous DMF (5 ml) is added. The reaction mixture Is left at ambient temperature for 2 hours. The reaction mixture obtained was evaporated to dryness under reduced pressure and the residual CHClThree/ 28% NHFourOH (99.9 / 0.1) (from methanol 0) Silica gel column (2.5 × 25) using 10% gradient as eluent cm) chromatography to give compound 53 (n = 1) (89%).Example 60 Oligonucleotide 53 (n = 2)   Treatment of compound 53 (n = 1) as described in Example 59 gave the title compound 5 3 (n = 2) was obtained as a white solid (95%).                                Example 61 Oligonucleotide 53 (n = 3)   Treatment of compound 53 (n = 2) as described in Example 59 gave the title compound 5 3 (n = 3) was obtained as a white solid (94%).                                Example 62 Oligonucleotide 53 (n = 4)   Treatment of compound 53 (n = 3) as described in Example 59 gave the title compound 5 3 (n = 4) was obtained as a white solid (90%).                                Example 63 Oligonucleotide 53 (n = 5)   Treatment of compound 53 (n = 4) as described in Example 59 gave the title compound 5 3 (n = 5) was obtained as a white solid (91%).                                Example 64 Oligonucleoside 54   A solution of compound 53 (1 mmol) in 80% AcOH (100 ml) was brought to ambient temperature. Leave overnight. The reaction mixture was evaporated to dryness under reduced pressure, and the resulting residue was dissolved in water. Dissolve and extract twice with ether. The aqueous layer was evaporated to dryness under reduced pressure and the resulting residue Lyophilize twice from water.                                Example 65   Phosphoramidi of modified nucleoside and oligonucleoside building blocks Once the preparations have been made, they can be applied to Applied Biosystems, Inc. model Oligonucleotide synthesized by standard solid-phase method using an automated nucleic acid synthesizer such as 392 What is necessary is just to introduce into a leotide homolog. These synthesizers allow standard phosphorua Midite coupling chemistry (eg, M.J. Gait, Oligonucleotide Synthesis. A Use the practical approach., pp35-81) to obtain the desired oligonucleotide. Tetraethylthiuram disulfide (Applied Biosystems, Inc. )) To obtain phosphorthioate oligonucleotides Can be.                                Example 66 Hybridization analysis   The ability of the macromolecules of the present invention to bind to complementary nucleic acids is dependent upon the specific duplex (ds) or Can be compared by measuring the melting temperature of the triple-stranded (ts) complex You. If dsDNA is formed from two single strands, it will absorb due to the base stacking. The light coefficient decreases (hypochromicity). After all, denaturation of DNA By measuring the change in luminosity, the temperature at which 50% of the duplex is lost and becomes single-stranded. It can be tracked as a function of melting temperature (Tm), which is a degree. If Tm increases, chain binding The joint strength also increases.   Duplexes consist of single-stranded oligodeoxyribonucleotides and the macromolecules of the invention It is formed. The macromolecules of the invention can be synthesized according to the description or examples provided herein. Is done. Oligodeoxyribonucleotides are available from Applied Biosystems, I nc. Solid phase synthesis is performed using a model 392 DNA / RNA synthesizer. Obtained Oh Reversed phase chromatography using HPLC as the dimethoxytrityl derivative Purify by chromatography (Gilson). Usually 0.3-0.50 D260The oligonucleotide homolog is hybridized with one equivalent of the other strand and the run Gilford response to increase in absorbance (260nm) of duplex for dam coil transition Answer II Monitor by spectrometer. The buffer used is 10 mM phosphoric acid, EDT A 0.1 mM and either NaCl 0.1 M or 1 M. Less absorption Use coefficients; with ordinary oligonucleotides and oligonucleotide homologs In addition, dA: 15.4 ml / μmol · cm, dT 8.8, dG: 11.7 and And dC: 7.3. Melting curves are recorded at 0.5 ° C / min. Tm is a function of temperature A of the first derivative260Measure from the maximum value in the plot. This data is 1 / Tm Pair ln [Coligo] (Where ColigoIs the total concentration of the oligonucleotide) Can be analyzed based on the value of Thermodynamic parameters are measured by this analysis .Nuclease resistance   A. Evaluation of the resistance of the macromolecules of the invention to serum and cytoplasmic nucleases   For the oligonucleotide homologs of the present invention, various concentrations of fetal bovine serum or Evaluated its stability in a medium containing adult human serum. Oligonucleotide Otide homologs are incubated for various times, treated with protease K, then With reversed phase or ion exchange HPLC or 20% polyacrylamide-urea Gel electrophoresis on a denaturing gel followed by autoradiography To analyze. Modified linkage position and known length of oligonucleotide The effect on nuclease degradation can be measured according to individual modifications of the linkage . For cytoplasmic nucleases, the HL60 cell line may be used.   After the incubation, the degradation of the oligonucleotide homolog is determined by serum nucleotides. Decomposition is evaluated as described above. Autoradiography results Compares and quantifies conventional oligonucleotides and macromolecules of the invention.   B. Resistance of the macromolecules of the invention to specific endo- and exo-nucleases Sex evaluation   Specific nucleases (i.e., endonucleases, 3 ', 5'-exo- and 5 ', 3'-exonuclease) of the macromolecule of the present invention is evaluated. This allows one to accurately assess the effect of a particular chain on stability under degradation conditions. Oligonucleotide homologs were defined specific to various selected nucleases Incubate in reaction buffer, treat with proteinase K, then reverse phase Or a gel denatured with ion exchange HPLC or 20% polyacrylamide-urea. Analysis by gel electrophoresis followed by autoradiography. You.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 31/7088 A61K 31/70 623 48/00 48/00 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(KE,LS,MW,SD,S Z,UG),UA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD ,RU,TJ,TM),AL,AM,AU,BB,BG ,BR,CA,CN,CZ,EE,FI,GE,HU, IL,IS,JP,KG,KP,KR,LK,LR,L T,LV,MD,MG,MK,MN,MX,NO,NZ ,PL,RO,SG,SI,SK,TR,TT,UA, UZ,VN──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) A61K 31/7088 A61K 31/70 623 48/00 48/00 (81) Designated country EP (AT, BE, CH) , DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), OA (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, ML) , MR, NE, SN, TD, TG), AP (KE, LS, MW, SD, SZ, UG), UA (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM), AL , AM, AU, BB, BG, BR, CA, CN, CZ, EE, FI, GE, HU, IL, IS, JP, KG, KP, KR, LK, LR, LT, LV, MD , MG, MK, MN, MX, NO, NZ, PL, RO, SG, SI, SK, TR, TT, UA, UZ, VN

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1. 少なくとも一部分が以下の構造からなる巨大分子。 構造: [式中、各Bは独立して水素、ヒドロキシ、天然の核塩基(ヌクレオベース)、非 天然の核塩基、DNAインターカレーター(挿入物)、共有または非共有DNA結 合基、複素環部分、または芳香族部分であり、 各B1は独立して水素、ヒドロキシ、アミノ、メルカプト、天然の核塩基、非天 然の核塩基、DNAインターカレーター、共有または非共有DNA結合基、複素 環部分、芳香族部分、標的(ターゲッティング)基、キャリアー、レポーター基、 または可溶性もしくは不溶性ポリマーであり、 nは1から50までの整数であり、 各Xは独立して単結合、メチレン、メチレンカルボニル、C7−C12アラルキレ ンもしくは置換アラルキレン、C7−C12アラルキレンカルボニルもしくは置換 アラルキレンカルボニル、または式: [式中、各Zは独立して単結合、O、S、NR6、C(=O)NR6またはC(=O) NR6であり、各Z1は独立してO、S、NR5、メチレン、またはC(CH3)2で あり、 p、q、r、およびsは、それぞれ独立して0から20までの整数であり、 R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ独立して水素;ヒドロキシ、アルコキシ、もし くはアルキルチオで置換されていてもよいC1−C8アルキル;ヒドロキシ:アルコ シキ;アルキルチオ;アミノ;またはハロゲンであり、 R5およびR6は、それぞれ独立して水素;ヒドロキシ、アルコキシ、もしくはアル キルチオで置換されていてもよいC1−C8アルキル;ヒドロキシ;アルコシキ:ア ルキルチオ;またはアミノである]で示される基であり、 Q1およびQ2は、それぞれ独立して、少なくとも原子3個を含み(そのうちの少 なくとも1つは炭素である)、 各Vは独立して酸素、硫黄、NR8またはメチレンであり、 各Jは独立して、水素、アジド、ハロゲン、−OR7、−R7、または−NR78 である(ここで、各R7は独立して−NR89またはR9である(ここで、R8また はR9はそれぞれ独立して水素、C3−C10分枝状アルキルまたは置換アルキル、 C1−C10非分枝状アルキルまたは置換アルキル、C1−C10非分枝状オキサアル キルまたは置換オキサアルキル、C6−C10アリールまたは置換アリール、C7− C12アラルキルまたは置換アラルキル、C1−C10非分枝状アミノアルキルまた は置換非分枝状アミノアルキル、C1−C10非分枝状アミノオキサアルキルまた は置換非分枝状アミノオキサアルキル、C3−C10およびN1−N4分枝状(ポリア ミノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ−) アルキル、C1−C10およびN1−N4非分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ−) アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキル、C1−C10およ びN1−N4非分枝状(ポリアミノ−またはボリアザ−)オキサアルキルまたは置換 非分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサアルキル、天然または非天然の アミノ酸側鎖基、または保護基である)。] 2.Q1およびQ2がそれぞれ独立して少なくとも以下のひとつである請求項1に 記載の巨大分子。 酸素;硫黄;置換炭素;カルボニル;チオカルボニル;スルホン;スルホンオキ シド;C1−C8アルキレン;C2−C8アルケニレン;C2−C8アルキニレン;それぞ れ1または2個の異なる異種原子もしくは同じタイプの異種原子を含むC1−C8 オキサアルキレンもしくはチアアルキレンもしくはアザアルキレン;いずれかの 方向のNR7+NR89、NR7C(=O)−、−NR7C(=S)−、−NR7S(= O)−もしくは−NR7S(=O)2−(ここでR7、R8およびR9は前記と同意義で ある);X(ここで、Xは前記と同意義である);または [ここで、Z4またはZ5は、それぞれ独立して単結合、O、S、およびNR7に こで、R7は請求項1の記載と同意義である)であり、 各Z3は独立して水素、R8、OR7、SR7およびNR78(ここで、R7および R8は請求項1の記載と同意義である)であり、 各Z2は独立してO、SまたはNR7ここで、R7は請求項1の記載と同意義であ る)である]で示される基。 3.各Q1が独立していずれかの方向の−O−CH2−CH2−CH2−、−O−C H2−C(=O)−NH−、−NH−NH−C(=O)−CH2−、−NH−N=CH −CH2−、−NH−NH−CH2−CH2−、−O−NH−C(=O)−CH2−、 −O−N=CH−CH2−、−O−NH−CH2−CH2−、−CH2−NH−C( =O)−CH2−、−NH−NH−C(=O)NH−、−O−C(=O)−NH−CH2 −CH2−、−O−P(=Z2)Z3−NH−CH2−CH2−、または−CH2−N H−CH2−CH2−;および各Q2が独立していずれかの方向の−CH2−O−C H2−CH2−CH2−、−CH2−O−CH2−C(=O)−NH−、−CH2−NH −NH−C(=O)−CH2−、−CH2−NH−N=CH−CH2−、−CH2−N H−NH−CH2−CH2−、−CH2−O−NH−C(=O)−CH2−、−CH2 −O−N=CH−CH2−、−CH2−O−NH−CH2−CH2−、−CH2−N H−C(=O)−CH2−、−CH2−NH−NH−C(=O)−NH−、−O−C( =O)−NH−CH2−CH2−、 −O−P(=Z2)Z3−NH−CH2−CH2−、または、−CH2−CH2−NH− CH2−CH2−である請求項2に記載の巨大分子。 4.nが1である請求項3に記載の巨大分子。 5.少なくともVの1つが酸素である請求項2に記載の巨大分子。 6.少なくともVの1つが酸素である請求項3に記載の巨大分子。 7.少なくともVの1つが酸素である請求項4に記載の巨大分子。 8.少なくともJの1つがHである請求項2に記載の巨大分子。 9.少なくともJの1つがHである請求項3に記載の巨大分子。 10.少なくともJの1つがHである請求項6に記載の巨大分子。 11.少なくともJの1つがHである請求項7に記載の巨大分子。 12.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基である請求項2に記載の 巨大分子。 13.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基である請求項3に記載の 巨大分子。 14.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基である請求項10に記載の 巨大分子。 15.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基である請求項11に記載の 巨大分子。 16.少なくともB1の1つがDNAインターカレーター、共有DNA結合基、ま たは非共有DNA結合基を含む請求項12に記載の巨大分子。 17.少なくともB1の1つがDNAインターカレーター、共有DNA結合基、ま たは非共有DNA結合基を含む請求項13に記載の巨大分子。 18.少なくともB1の1つがDNAインターカレーター、共有DNA結合基、ま たは非共有DNA結合基を含む請求項14に記載の巨大分子。 19.少なくともB1の1つがDNAインターカレーター、共有DNA結合基、ま たは非共有DNA結合基を含む請求項15に記載の巨大分子。 20.少なくともB1の1つが天然または非天然の核塩基である請求項12に記載の 巨大分子。 21.少なくともB1の1つが天然または非天然の核塩基である請求項13に記載の 巨大分子。 22.少なくともB1の1つが天然または非天然の核塩基である請求項14に記載の 巨大分子。 23.少なくともB1の1つが天然または非天然の核塩基である請求項15に記載の 巨大分子。 24.少なくともXの1つが独立してC1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、ポリ アミド、C7−C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12ア ラルキレンカルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニルである請求項16に記 載の巨大分子。 25.少なくともXの1つが独立してC1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、ポリ アミド、またはC7−C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7− C12アラルキレンカルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニルを含む請求項 17に記載の巨大分子。 26.少なくともXの1つが独立してC1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、ポリ アミド、またはC7−C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7− C12アラルキレンカルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニルを含む請求項 18に記載の巨大分子。 27.少なくともXの1つが独立してC1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、ポリ アミド、またはC7−C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7− C12アラルキレンカルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニルを含む請求項 19に記載の巨大分子。 28.少なくともXの1つが独立してC1−C4アルキレンもしくは置換アルキレ ン、またはC1−C4アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニルを 含む請求項20に記載の巨大分子。 29.少なくともXの1つが独立してC1−C4アルキレンもしくは置換アルキレ ン、またはC1−C4アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニルを 含む請求項21に記載の巨大分子。 30.少なくともXの1つがメチレンカルボニルである請求項22に記載の巨大分 子。 31.少なくともXの1つがメチレンカルボニルである請求項23に記載の巨大分 子。 32.以下の式を有する化合物。 [式中、各Bは独立して天然の核塩基、非天然の核塩基、複素環部分、または芳 香族部分(これらはいずれも所望により保護基を含む)であり、 各B1は独立して水素、ヒドロキシ、アミノ、メルカプト、天然の核塩基、非天 然の核塩基、DNAインターカレーター、共有または非共有DNA結合基、複素 環部分、または芳香族部分(これらはいずれも所望により保護基を含む)であり、 nは1から50までの整数であり、 各Xは独立して、単結合、メチレン基、メチレンカルボニル、C7−C12アラル キレンもしくは置換アラルキレン、C7−C12アラルキレンカルボニルもしくは 置換アラルキレンカルボニル、または式:[式中、Zは独立して単結合、O、S、NR6、C(=O)NR6、C(=S)NR6、 S(=O)NR6 、またはS(=O)2NR6であり、 各Z1は独立してO、S、Se、NR5、メチレン、またはC(CH3)2であり、 p、q、r、およびsは、それぞれ独立して0から20までの整数であり、 R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ独立して水素;ヒドロキシ、アルコキシも しくはアルキルチオで置換されていてもよいC1−C8アルキル;ヒドロキシ;アル コシキ;アルキルチオ;アミノ;またはハロゲンであり、 R5およびR6は、それぞれ独立して水素;ヒドロキシ、アルコキシもしくはアル キルチオで置換されていてもよいC1−C8アルキル;ヒドロキシ;アルコシキ;ア ルキルチオ;またはアミノである]で示される基から選ばれる所望により保護され た基であり、 Q1およびQ2は、それぞれ独立して、少なくとも原子3個を含み(そのうちの少 なくとも1つは炭素である)、 各Vは独立して酸素、硫黄、NR8またはメチレンであり(ここでR8は独立して 水素、C3−C10分枝状アルキルまたは置換アルキル、C1−C10非分枝状アルキ ルまたは置換アルキル、C1−C10非分枝状オキサアルキルまたは置換オキサア ルキル、C6−C10アリールまたは置換アリール、C7−C12アラルキルまたは置 換アラルキル、C1−C10非分枝状アミノアルキルまたは置換非分枝状アミノア ルキル、C1−C10非分枝状アミノオキサアルキルまたは置換非分枝状アミノオ キサアルキル、C3−C10およびN1−N4分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ− )アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキル、C1−C10およ びN1−N4非分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリ アミノ−またはポリアザ−)アルキル、C1−C10およびN1−N4非分枝状(ポリ アミノ−またはポリアザ−)オキサアルキルまたは置換非分枝状(ポリアミノ−ま たはポリアザ−)オキサアルキル、天然または非天然のアミノ酸側鎖基、または 保護基である)、 各Jは独立して、水素、OR7、ハロゲン、アジド、−R7、またはR7であり(こ れらはいずれも所望により保護される)(ここで、各R7は独立して−NR89ま たはR8(ここで、R9は独立して水素、C3−C10分枝状アルキルまたは置換アル キル、C1−C10非分枝状アルキルまたは置換アルキル、C1−C10非分枝状オキ サアルキルまたは置換オキサアルキル、C6−C10アリールまたは置換アリール 、C7−C12アラルキルまたは置換アラルキル、C1−C10非分枝状アミノアルキ ルまたは置換非分枝状アミノアルキル、C1−C10非分枝状アミ ノオキサアルキルまたは置換非分枝状アミノオキサアルキル、C3−C10および N1−N4分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリアミ ノ−またはポリアザ−)アルキル、C1−C10およびN1−N4非分枝状(ポリアミ ノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ−)ア ルキル、C1−C10およびN1−N4非分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ−)オ キサアルキルまたは置換非分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサアルキ ル、天然または非天然のアミノ酸側鎖基、または保護基であり、 各Q3は独立して−OX−、−SX−、または−NR8X−(これらはいずれも所 望により保護される)であり、 各Q4は独立して酸素、硫黄またはNR8(これらはいずれも所望により保護され る)であり、 Yは保護基であり、 Y1は固体支持体と結合したスペーサー基である。] 33.Q1およびQ2がそれぞれ独立して、所望により保護されている以下の基の 少なくとも1つを含む請求項32に記載の化合物。 酸素;硫黄;置換炭素;カルボニル;チオカルボニル;スルホン;スルホキシド;C1 −C8アルキレン;C2−C8アルケニレン;C2−C8アルキニレン;それぞれが1ま たは2個の異なる異種原子もしくは同じタイプの異種原子を含むC1−C8オキサ アルキレンもしくはチアアルキレンもしくはアザアルキレン;いずれかの方向の NR7+NR89、NR7C(=O)−、−NR7C(=S)−、−NR7S(=O)− 、または−NR7S(=O)2−(ここで、R7、R8およびR9は前記と同意義である );またはX(ここで、Xは前記と同意義である);または [式中、Z1またはZ4は、それぞれ独立して単結合、O、SまたはNR7であり、 各Z3は独立して水素、R8、OR7、SR7またはNR78であり、 各Z2は独立して水素、O、S、またはNR7である]で示される基。 34.各Q1が、所望により保護基を含み、いずれかの方向の−O−CH2−CH2 −CH2−、−O−CH2−C(=O)−NH−、−NH−NH−C(=O)−CH2 −、−NH−N=CH−CH2−、−NH−NH−CH2−CH2−、−O−NH −C(=O)−CH2−、−O−N=CH−CH2−、−O−NH−CH2−CH2 −、−CH2−NH−C(=O)−CH2−、−NH−NH−C(=O)NH−、−O −C(=O)−NH−CH2−CH2−、−O−P(=Z2)Z3−NH−CH2−CH2 −、または−CH2−NH−CH2−CH2−の1つを含み、Q2が、所望により保 護基を含み、いずれかの方向の−CH2−O−CH2−CH2−CH2−、−CH2 −O−CH2−C(=O)−NH−、−CH2−NH−NH−C(=O)CH2−、− CH2−NH−N=CH−CH2−、−CH2−NH−NH−CH2−CH2−、− CH2−O−NH−C(=O)−CH2−、−CH2−O−N=CH−CH2−、−C H2−O−NH−CH2−CH2−、−CH2−NH−C(=O)−CH2−、−CH2 −NH−NH−C(=O)−NH−、または−CH2−CH2−NH−CH2−CH2 −を含む請求項33に記載の化合物。 35.Yがp−アニシルジフェニルメチル、ジ−p−アニシルフェニルメチル、 またはピキシルである請求項33に記載の化合物。 36.Yがp−アニシルジフェニルメチル、ジ−p−アニシルフェニルメチル、 またはピキシルである請求項34に記載の化合物。 37.スペーサー基が、カルボニル、エステル、カルバメート、ウレタン、ヒド ラジド、C1−C14アルキレンもしくは修飾アルキレン、C6−C14アラルキレン もしくは修飾アラルキレン、C6−C14アルキラレンもしくは修飾アルキラレン 、それぞれ1〜50個の異なる異種原子もしくは同じタイプの異種原子を含むC1− C100オキサアルキレンもしくはチアアルキレンもしくはアザアルキレン(ここで 、アザ基は所望によりアミノ保護基により保護される)、C1−C14アルキレンカ ルボニルもしくはアルキレンチオカルボニルもしくはアルキレンスルホンもしく はアルキレンスルホキシド、それぞれ1〜50個の異なる異種原子もしくは同じタ イプの異種原子を含むC1−C100オキサアルキレンカルボニルもしくはチアアル キレンカルボニルもしくはアザアルキレンカルボニル(またはそのチオカルボニ ルもしく はスルホンもしくはスルホキシド同族体)(ここで、アザ基は所望によりアミノ保 護基により保護される)、または式: で示される基およびその塩[式中、R10またはR11は、それぞれ独立して、C3− C10分枝状アルキル、C1−C10非分枝状アルキルもしくはオキサアルキル、C6 −C10アリール、C7−C12アラルキルからなる群から選ばれ、 R12は1または2個の異種原子を含むC2−C8アルキレン、C2−C8アルケニレ ンまたは−C2−C8オキサアルキレンであり、 Z5はホスフェート保護基であり、 Z6は水素、イミダゾール−1−イル、テトラゾール−1−イル、1,2,4−ト リアゾール−1−イル、および1−ヒドロキシ−ベンゾトリアゾール−O−イル である]を含む請求項35に記載の化合物。 38.Y1が−HP(=O)OHもしくはその塩、−P(OCH2CH2CN)(N(i− Pr)2)、または−P(PCH3)(N(i−Pr)2)である請求項35に記載の化合物 。 39.Y1が−HP(=O)OHもしくはその塩、−P(OCH2CH2CN)(N(i− Pr)2)、または−P(PCH3)(N(i−Pr)2)である請求項36に記載の化合物 。 40.nが1である請求項37に記載の化合物。 41.nが1である請求項38に記載の化合物。 42.nが1である請求項39に記載の化合物。 43.少なくともVの1つが酸素である請求項33に記載の化合物。 44.少なくともVの1つが酸素である請求項37に記載の化合物。 45.少なくともVの1つが酸素である請求項39に記載の化合物。 46.少なくともVの1つが酸素である請求項41に記載の化合物。 47.少なくともVの1つが酸素である請求項42に記載の化合物。 48.少なくともQ3またはQ4の1つが酸素である請求項33に記載の化合物。 49.少なくともQ3またはQ4の1つが酸素である請求項36に記載の化合物。 50.少なくともQ3またはQ4の1つが酸素である請求項44に記載の化合物。 51.少なくともQ3またはQ4の1つが酸素である請求項45に記載の化合物。 52.少なくともQ3またはQ4の1つが酸素である請求項46に記載の化合物。 53.各Jが独立して水素、OR7、またはフッ素である請求項33に記載の化合物 (ここで、いずれのOR7も所望により保護基を含む)。 54.少なくともJの1つが水素である請求項36に記載の化合物。 55.少なくともJの1つが水素である請求項37に記載の化合物。 56.少なくともJの1つが水素である請求項43に記載の化合物。 57.少なくともJの1つが水素である請求項45に記載の化合物。 58.少なくともJの1つが水素である請求項47に記載の化合物。 59.少なくともJの1つが水素である請求項51に記載の化合物。 60.少なくともJの1つが水素である請求項52に記載の化合物。 61.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基(これらはいずれも所望に より保護基を含む)である請求項33に記載の化合物。 62.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基(これらはいずれも所望に より保護基を含む)である請求項36に記載の化合物。 63.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基(これらはいずれも所望に より保護基を含む)である請求項44に記載の化合物。 64.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基(これらはいずれも所望に より保護基を含む)である請求項45に記載の化合物。 65.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基に(これらはいずれも所望 により保護基を含む)である請求項47に記載の化合物。 66.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基(これらはいずれも所望に より保護基を含む)である請求項59に記載の化合物。 67.少なくともBの1つが天然または非天然の核塩基(これらはいずれも所望に より保護基を含む)である請求項60に記載の化合物。 68.各B1が天然または非天然の核塩基(これらはいずれも所望により保護基を 含む)である請求項61に記載の化合物。 69.各B1が天然のまたは非天然の核塩基(これらはいずれも所望により保護基 を含む)である請求項62に記載の化合物。 70.各B1が天然のまたは非天然の核塩基(これらはいずれも所望により保護基 を含む)である請求項63に記載の化合物。 71.各B1が天然のまたは非天然の核塩基(これらはいずれも所望により保護基 を含む)である請求項64に記載の化合物。 72.各B1が天然のまたは非天然の核塩基(これらはいずれも所望により保護基 を含む)である請求項65に記載の化合物。 73.各B1が天然のまたは非天然の核塩基(これらはいずれも所望により保護基 を含む)である請求項66に記載の化合物。 74.各B1が天然のまたは非天然の核塩基(これらはいずれも所望により保護基 を含む)である請求項67に記載の化合物。 75.少なくともXの1つがC1−C4アルキレンもしくは置換アルキレン、また はC1−C4アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル(これらは いずれも所望により保護基を含む)である請求項68に記載の化合物。 76.少なくともXの1つがC1−C4アルキレンもしくは置換アルキレン、また はC1−C4アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル(これらは いずれも所望により保護基を含む)である請求項69に記載の化合物。 77.少なくともXの1つがC1−C4アルキレンもしくは置換アルキレン、また はC1−C4アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル(これらは いずれも所望により保護基を含む)である請求項70に記載の化合物。 78.少なくともXの1つがC1−C4アルキレンもしくは置換アルキレン、また はC1−C4アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル(これらは いずれも所望により保護基を含む)である請求項71に記載の化合物。 79.少なくともXの1つがメチレンカルボニルである請求項72に記載の化合物 。 80.少なくともXの1つがメチレンカルボニルである請求項73に記載の化合物 。 81.少なくともXの1つがメチレンカルボニルである請求項74に記載の化合物 。 82.B1がそれぞれ独立して水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレー ター、DNA結合基、ポリマー基または標的基(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項61に記載の化合物。 83.B1がそれぞれ独立して水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレー ター、DNA結合基、ポリマー基または標的基(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項62に記載の化合物。 84.B1がそれぞれ独立して水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレー ター、DNA結合基、ポリマー基または標的基(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項63に記載の化合物。 85.B1がそれぞれ独立して水素、アミオ、メルカプト、DNAインターカレー ター、DNA結合基、ポリマー基または標的基(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項64に記載の化合物。 86.B1がそれぞれ独立して水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレー ター、DNA結合基、ポリマー基または標的基(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項65に記載の化合物。 87.B1がそれぞれ独立して水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレー ター、DNA結合基、ポリマー基または標的基(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項66に記載の化合物。 88.B1がそれぞれ独立して水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレー ター、DNA結合基、ポリマー基または標的基(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項67に記載の化合物。 89.少なくともXの1つが単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、C1− C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサアルキ レンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7− C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレンカ ルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項82に記載の化合物。 90.少なくともXの1つが単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、C1− C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサアルキ レンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7− C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC2−C12アラルキレンカ ルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項83に記載の化合物。 91.少なくともXの1つが単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、C1− C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサアルキ レンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7− C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレンカ ルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項84に記載の化合物。 92.少なくともXの1つが単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、C1− C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサアルキ レンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7− C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレンカ ルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項85に記載の化合物。 93.少なくともXの1つが単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、C1− C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサアルキ レンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7− C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレンカ ルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項86に記載の化合物。 94.少なくともXの1つが単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、C1− C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサアルキ レンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7− C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、 またはC7−C12アラルキレンカルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル( これらはいずれも所望により保護基を含む)である請求項87に記載の化合物。 95.少なくともXの1つが単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アルキレ ン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、C1− C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサアルキ レンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7− C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレンカ ルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(これらはいずれも所望により保 護基を含む)である請求項88に記載の化合物。 96.下記式で表される化合物。 または [式中、各Bは独立して天然の核塩基、非天然の核塩基、複素環部分、または芳 香族部分(これらはいずれも所望により保護基を含む)であり、 各B1は独立して水素、ヒドロキシ、アミノ、メルカプト、天然の核塩基、非天 然の核塩基、DNAインターカレーター、共有または非共有DNA結合基、複素 環部分、または芳香族部分(これらはいずれも所望により保護基を含む)であり、 nは1から50までの整数であり、 各Xは独立して以下の所望により保護された基: 単結合、メチレン、メチレンカルボニル、C7−C12アラルキレンもしくは置換 アラルキレン、C7−C12アラルキレンカルボニルもしくは置換アラルキレンカ ルボニル、または式:[式中、Zは独立して単結合、O、S、NR6、C(=O)NR6、C(=S)NR6、 S(=O)NR6、またはS(=O)2NR6であり、 各Z1は独立してO、S、Se、NR5、メチレン、またはC(CH3)2であり、 p、q、r、およびsは、それぞれ独立して0から20までの整数であり、 R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ独立して水素;ヒドロキシ、アルコキシ、 もしくはアルキルチオで置換されていてもよいC1−C8アルキル;ヒドロキシ;ア ルコシキ;アルキルチオ;アミノ;またはハロゲンであり、 R5およびR6は、それぞれ独立して水素;ヒドロキシ、アルコキシ、もしくはア ルキルチオで置換されていてもよいC1−C8アルキル;ヒドロキシ;アルコシキ; アルキルチオ;またはアミノである]で示される基であり、 Q1およびQ2は、それぞれ少なくとも原子3個を含み(そのうちの少なくとも1 つは炭素である)、 各Vは独立して酸素、硫黄、NR8またはメチレンであり、 各Jは独立して以下の所望により保護された基: 水素、OR7、ハロゲン、アジド、、またはR7(ここで、R7は独立して−NR8 9またはR8にこで、R8またはR9は、それぞれ独立して水素、C3−C10分枝 状アルキルまたは置換アルキル、C1−C10非分枝状アルキルまたは置換アルキ ル、C1−C10非分枝状オキサアルキルまたは置換オキサアルキル、C6−C10ア リールまたは置換アリール、C7−C12アラルキルまたは置換アラルキル、C1− C10非分枝状アミノアルキルまたは置換非分枝状アミノアルキル、C1−C10非 分枝状アミノオキサアルキルまたは置換非分枝状アミノオキサアルキル、C3− C10およびN1−N4分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換 (ポリアミノ−またはポリアザ−)アルキル、C1−C10およびN1−N4分枝状(ポ リアミノ−またはポリアザ−)アルキルまたは置換(ポリアミノ−またはポリアザ −)アルキル、C1−C10およびN1−N4非分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ −)オキサアルキルまたは置換非分枝状(ポリアミノ−またはポリアザ−)オキサ アルキル、天然または非天然のアミノ酸側鎖基、または保護基である)であり、 少なくとも原子1個を含むQ1 xおよびQ2 x'は、それぞれ独立して所望により保 護されるかまたは活性化されたQ1またはQ2のフラグメントから選ばれる。] 97.Q1およびQ2がそれぞれ独立して、下記の、所望により保護された基の少 なくとも1つを含む請求項96に記載の化合物。 酸素;硫黄;置換炭素;カルボニル;チオカルボニル;スルホン;スルホキシド;ま たはC1−C8アルキレン;C2−C8アルケニレン;C2−C8アルキニレン;それぞ れ1または2個の異種原子もしくは同じタイプの異種原子を含むC1−C8オキサ アルキレンもしくはチオアルキレンもしくはアザアルキレン;いずれかの方向の NR7+NR89、NR7C(=O)−、−NR7C(=S)−、−NR7S(=O)− 、または−NR7S(=O)。−(ここで、R7、R8およびR9は前記と同意義);ま たはX(ここで、Xは前記と同意義);または [式中、Z4またはZ5は、それぞれ独立して単結合、O、S、またはNR7であり 、 Z3はそれぞれ独立して水素、R8、OR7、SR7、またはNR78であり、 各Z2は独立してO、S、またはNR7である] で示される基。 98.各Q1が独立して、所望により保護基を含み、いずれかの方向の−O−CH2 −CH2−CH2−、−O−CH2−C(=O)−NH−、−NH−NH−C(=O) −CH2−、−NH−N=CH−CH2−、−NH−NH−CH2−CH2−、−O −NH−C(=O)−CH2−、−O−N=CH−CH2−、−O−NH−CH2− CH2−、−CH2−NH−C(=O)−CH2−、−NH−NH−C(=O)NH− 、−O−C(=O)−NH−CH2−CH2−、−O−P(=Z2)Z3−NH−CH2 −CH2−、または−CH2−NH−CH2−CH2−を含み、Q2が独立して、所 望により保護基を含み、いずれかの方向のQ1、−CH2−O−CH2−CH2−C H2−、−CH2−O−CH2−C(=O)−NH−、−CH2−NH−NH−C(= O)−CH2−、−CH2−NH−N=CH−CH2−、−CH2−NH−NH−C H2−CH2−、−CH2−O−NH−C(=O)−CH2−、−CH2−O−N=C H−CH2−、−CH2−O−NH−CH2−CH2−、−CH2−NH−C(=O) −CH2−、−CH2−NH−NH−C(=O)−NH−、または−CH2−CH2− NH−CH2−CH2−を含む請求項97に記載の化合物。 99.nが1である請求項97に記載の化合物。 100.nが1である請求項98に記載の化合物。 101.Q1 xおよびQ2 xがそれぞれ原子1〜3個を含む(それらはいずれも所望によ り保護基を含む)請求項98に記載の化合物。 102.Q1 xおよびQ2 xがそれぞれ原子1〜3個を含む(それらはいずれも所望によ り保護基を含む)請求項100に記載の化合物。 103.Q1 xが独立してY2−NH−CH2−、Y2−NH−O−、Y2−NH−NH −、Y2−NH−、Y2−NH−CH2−CH2−、Y2−NH−NH−CH2−、Y2 −NH−C(=O)−CH2−、Y2−NH−C(=O)−NH−、またはY2−NH −NH−C(=O)−でありにこで、Y2は保護基または水素である)、 Q2 xが独立してE−CH2−CH2−、E−CH2−、E−NH−、E−O−(ここ で、Eは独立 してハロゲン、アルデヒド、アセタール、−S(=O)28である)、または−C OR13である(ここで、R13はヒドロキシルまたは活性化基である)請求項101に 記載の化合物。 104.Q1 xが独立してY2−NH−CH2−、Y2−NH−O−、Y2−NH−NH −、Y2−NH−、Y2−NH−CH2−CH2−、Y2−NH−NH−CH2−、Y2 −NH−C(=O)−CH2−、Y2−NH−C(=O)−NH−、またはY2−NH −NH−C(=O)−でありにこで、Y2は保護基または水素である)、 Q2 xが独立してE−CH2−CH2−、E−CH2−、E−NH−、E−O−にこ で、Eは独立してハロゲン、アルデヒド、アセタール、−S(=O)28である) 、または−COR13である(ここで、R13はヒドロキシルまたは活性化基である) 請求項102に記載の化合物。 105.Y2がp−アニシルジフェニルメチル、ジ−p−アニシルフェニルメチル 、ピキシル、フルオレニルメトキシカルボニル、またはトリフルオロアセチルで あり、 R13が水素、ペンタフルオロフェニル、テトラフルオロフェニル、p−ニトロフ ェニル、またはN−スクシニミジルである請求項103に記載の化合物。 106.Y2がp−アニシルジフェニルメチル、ジ−p−アニシルフェニルメチル 、ピキシル、フルオレニルメトキシカルボニル、またはトリフルオロアセチルで あり、 R13が水素、ペンタフルオロフェニル、テトラフルオロフェニル、p−ニトロフ ェニル、またはN−スクシニミジルである請求項104に記載の化合物。 107.少なくともVの1つが酸素である請求項99に記載の化合物。 108.少なくともVの1つが酸素である請求項101に記載の化合物。 109.少なくともVの1つが酸素である請求項104に記載の化合物。 110.少なくともVの1つが酸素である請求項106に記載の化合物。 111.少なくともJの1つが水素である請求項97に記載の化合物。 112.少なくともJの1つが水素である請求項101に記載の化合物。 113.少なくともJの1つが水素である請求項104に記載の化合物。 114.少なくともJの1つが水素である請求項110に記載の化合物。 115.少なくともBの1つが所望により保護基を含む天然または非天然の核塩基 である請求項97に記載の化合物。 116.少なくともBの1つが所望により保護基を含む天然または非天然の核塩基 であ る請求項101に記載の化合物。 117.少なくともBの1つが所望により保護基を含む天然または非天然の核塩基 である請求項113に記載の化合物。 118.少なくともBの1つが所望により保護基を含む天然または非天然の核塩基 である請求項114に記載の化合物。 119.各B1が所望により保護基を含む天然または非天然の核塩基である請求項1 15に記載の化合物。 120.各B1が所望により保護基を含む天然または非天然の核塩基である請求項1 16記載の化合物。 121.各B1が所望により保護基を含む天然または非天然の核塩基である請求項1 17に記載の化合物。 122.各B1が所望により保護基を含む天然または非天然の核塩基である請求項1 18に記載の化合物。 123.少なくともXの1つがC1−C4アルキレンもしくは置換アルキレン、また はC1−C4アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニルである(こ こで、これらはいずれも所望により保護基を含む)請求項119に記載の化合物。 124.少なくともXの1つがC1−C4アルキレンもしくは置換アルキレン、また はC1−C4アルキレンカルボニルまたは置換アルキレンカルボニルである(ここ で、これらはいずれも所望により保護基を含む)請求項120に記載の化合物。 125.少なくともXの1つがメチレンカルボニルである請求項121に記載の化合 物。 126.少なくともXの1つがメチレンカルボニルである請求項122に記載の化合 物。 127.各B1が独立して、水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレータ ー、DNA結合基、ポリマー基、または標的基(ここで、これらはいずれも所望 により保護基を含む)である請求項115に記載の化合物。 128.各B1が独立して、水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレータ ー、DNA結合基、ポリマー基、または標的基(ここで、これらはいずれも所望 により保護基を含む)である請求項116に記載の化合物。 129.各B1が独立して、水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレータ ー、DNA結 合基、ポリマー基、または標的基(ここで、これらはいずれも所望により保護基 を含む)である請求項117に記載の化合物。 130.各B1が独立して、水素、アミノ、メルカプト、DNAインターカレータ ー、DNA結合基、ポリマー基、または標的基(ここで、これらはいずれも所望 により保護基を含む)である請求項118に記載の化合物。 131.少なくともXの1つが、単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アル キレン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、 C1−C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサア ルキレンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7 −C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレン カルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(ここで、これらはいずれも所 望により保護基を含む)である請求項127に記載の化合物。 132.少なくともXの1つが、単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アル キレン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、 C1−C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサア ルキレンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7 −C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレン カルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(ここで、これらはいずれも所 望により保護基を含む)である請求項128に記載の化合物。 133.少なくともXの1つが、単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アル キレン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、 C1−C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサア ルキレンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7 −C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレン カルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(ここで、これらはいずれも所 望により保護基を含む)である請求項129に記載の化合物。 134.少なくともXの1つが、単結合、C1−C10アルキレンもしくは置換アル キレン、C1−C10アルキレンカルボニルもしくは置換アルキレンカルボニル、 C1−C10オキサアルキレンもしくは置換オキサアルキレン、C1−C10オキサア ルキレンカルボニルもしくは置換オキサアルキレンカルボニル、ポリアミド、C7 −C12アラルキレンもしくは置換アラルキレン、またはC7−C12アラルキレン カルボニルもしくは置換アラルキレンカルボニル(ここ で、これらはいずれも所望により保護基を含む)である請求項130に記載の化合物 。 135.有効量の請求項1に記載の巨大分子と医薬的に許容される担体を含む医薬 組成物。 136.有効量の請求項6に記載の巨大分子と医薬的に許容される担体を含む医薬 組成物。 137.有効量の請求項11に記載の巨大分子と医薬的に許容される担体を含む医薬 組成物。 138.有効量の請求項16に記載の巨大分子と医薬的に許容される担体を含む医薬 組成物。 139.有効量の請求項19に記載の巨大分子と医薬的に許容される担体を含む医薬 組成物。 140.有効量の請求項20に記載の巨大分子と医薬的に許容される担体を含む医薬 組成物。 141.有効量の請求項23に記載の巨大分子と医薬的に許容される担体を含む医薬 組成物。 142.病原性生物に起因する病気の処置を要する宿主生物に対して有効量の請求 項1に記載の化合物を投与することを含む該処置方法。 143.病原性生物に起因する病気の処置を要する宿主生物に対して有効量の請求 項6に記載の化合物を投与することを含む該処置方法。 144.病原性生物に起因する病気の処置を要する宿主生物に対して有効量の請求 項11に記載の化合物を投与することを含む該処置方法。 145.癌の処置を要する生物に対して有効量の請求項1に記載の化合物を投与す ることを含む該処置方法。 146.癌の処置を要する生物に対して有効量の請求項6に記載の化合物を投与す ることを含む該処置方法。 147.癌の処置を要する生物に対して有効量の請求項11に記載の化合物を投与す ることを含む該処置方法。 148.病原性生物に起因する病気の処置を要する宿主生物に対して有効量の請求 項135に記載の医薬組成物を投与することを含む該処置方法。 149.病原性生物に起因する病気の処置を要する宿主生物に対して有効量の請求 項136に記載の医薬組成物を投与することを含む該処置方法。 150.病原性生物に起因する病気の処置を要する宿主生物に対して有効量の請求 項137に記載の医薬組成物を投与することを含む該処置方法。 151.癌の処置を要する生物に対して有効量の請求項135に記載の医薬組成物を 投与することを含む該処置方法。 152.癌の処置を要する生物に対して有効量の請求項136に記載の医薬組成物を 投与することを含む該処置方法。 153.癌の処置を要する生物に対して有効量の請求項137に記載の医薬組成物を 投与することを含む該処置方法。[Claims]   1. A macromolecule at least partially composed of the following structure. Construction: Wherein each B is independently hydrogen, hydroxy, a natural nucleobase (nucleobase), Natural nucleobases, DNA intercalators (inserts), shared or non-covalent DNA A group, a heterocyclic moiety, or an aromatic moiety; Each B1Are independently hydrogen, hydroxy, amino, mercapto, natural nucleobases, Natural nucleobases, DNA intercalators, covalent or non-covalent DNA binding groups, Ring moiety, aromatic moiety, target (targeting) group, carrier, reporter group, Or a soluble or insoluble polymer, n is an integer from 1 to 50, Each X is independently a single bond, methylene, methylenecarbonyl, C7-C12Aralkyl Or substituted aralkylene, C7-C12Aralkylenecarbonyl or substituted Aralkylenecarbonyl, or a formula: Wherein each Z is independently a single bond, O, S, NR6, C (= O) NR6Or C (= O) NR6And each Z1Are independently O, S, NRFive, Methylene, or C (CHThree)Twoso Yes, p, q, r, and s are each independently an integer from 0 to 20, R1, RTwo, RThree, And RFourAre each independently hydrogen; hydroxy, alkoxy, if Or C which may be substituted with alkylthio1-C8Alkyl; hydroxy: alco Shiki; alkylthio; amino; or halogen; RFiveAnd R6Are each independently hydrogen; hydroxy, alkoxy, or al C optionally substituted with kirthio1-C8Alkyl; hydroxy; alcohol: a Alkylthio; or amino]. Q1And QTwoContain, independently of each other, at least three atoms (of which At least one is carbon), Each V is independently oxygen, sulfur, NR8Or methylene, Each J is independently hydrogen, azide, halogen, -OR7, -R7Or -NR7R8 (Where each R7Is independently -NR8R9Or R9(Where R8Also Is R9Is independently hydrogen, CThree-CTenBranched or substituted alkyl, C1-CTenUnbranched or substituted alkyl, C1-CTenUnbranched oxaal Killed or substituted oxaalkyl, C6-CTenAryl or substituted aryl, C7− C12Aralkyl or substituted aralkyl, C1-CTenUnbranched aminoalkyl or Is a substituted unbranched aminoalkyl, C1-CTenUnbranched aminooxaalkyl or Is a substituted unbranched aminooxaalkyl, CThree-CTenAnd N1-NFourBranched (Polya (Mino- or polyaza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza-) Alkyl, C1-CTenAnd N1-NFourUnbranched (polyamino- or polyaza-) Alkyl or substituted (polyamino- or polyaza-) alkyl, C1-CTenAnd And N1-NFourUnbranched (polyamino- or boraza-) oxaalkyl or substituted Unbranched (polyamino- or polyaza-) oxaalkyl, natural or unnatural An amino acid side chain group, or a protecting group). ]   2.Q1And QTwoWherein each is independently at least one of the following: The described macromolecule.   Oxygen; sulfur; substituted carbon; carbonyl; thiocarbonyl; sulfone; sulfoneoxy Cid; C1-C8Alkylene; CTwo-C8Alkenylene; CTwo-C8Alkynylene; each C containing one or two different hetero atoms or hetero atoms of the same type1-C8 Oxaalkylene or thiaalkylene or azaalkylene; any NR in direction7,+NR8R9, NR7C (= O)-, -NR7C (= S)-, -NR7S (= O)-or -NR7S (= O)Two− (Where R7, R8And R9Is as defined above X) (where X is as defined above); or [Where ZFourOr ZFiveAre each independently a single bond, O, S, and NR7To Where R7Is the same as described in claim 1), Each ZThreeIs independently hydrogen, R8, OR7, SR7And NR7R8(Where R7and R8Is the same as defined in claim 1), Each ZTwoIs independently O, S or NR7Where R7Has the same meaning as in claim 1. Is a group).   3. Each Q1Are independently -O-CH in either directionTwo-CHTwo-CHTwo-, -OC HTwo-C (= O) -NH-, -NH-NH-C (= O) -CHTwo-, -NH-N = CH -CHTwo-, -NH-NH-CHTwo-CHTwo-, -O-NH-C (= O) -CHTwo−, -ON = CH-CHTwo-, -O-NH-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo-NH-C ( = O) -CHTwo-, -NH-NH-C (= O) NH-, -OC (= O) -NH-CHTwo -CHTwo-, -OP (= ZTwo) ZThree-NH-CHTwo-CHTwo-Or -CHTwo-N H-CHTwo-CH2-; and each QTwoAre independently -CH in either directionTwo-OC HTwo-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo-O-CHTwo-C (= O) -NH-, -CHTwo-NH -NH-C (= O) -CH2-, -CHTwo-NH-N = CH-CHTwo-, -CHTwo-N H-NH-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo-O-NH-C (= O) -CHTwo-, -CHTwo -ON = CH-CHTwo-, -CHTwo-O-NH-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo-N HC (= O) -CHTwo-, -CHTwo-NH-NH-C (= O) -NH-, -OC ( = O) -NH-CHTwo-CHTwo−, -OP (= ZTwo) ZThree-NH-CHTwo-CHTwo-Or -CHTwo-CHTwo-NH- CHTwo-CHTwoThe macromolecule according to claim 2, which is-.   4. The macromolecule according to claim 3, wherein n is 1.   5. The macromolecule according to claim 2, wherein at least one of V is oxygen.   6. The macromolecule according to claim 3, wherein at least one of V is oxygen.   7. The macromolecule according to claim 4, wherein at least one of V is oxygen.   8. The macromolecule according to claim 2, wherein at least one of J is H.   9. The macromolecule according to claim 3, wherein at least one of J is H.   10. The macromolecule according to claim 6, wherein at least one of J is H.   11. The macromolecule according to claim 7, wherein at least one of J is H.   12. The method of claim 2, wherein at least one of B is a natural or unnatural nucleobase. Macromolecules.   13. The method of claim 3, wherein at least one of B is a natural or unnatural nucleobase. Macromolecules.   14. The method of claim 10, wherein at least one of B is a natural or unnatural nucleobase. Macromolecules.   15. The method of claim 11, wherein at least one of B is a natural or unnatural nucleobase. Macromolecules.   16. At least B1One is a DNA intercalator, a covalent DNA binding group, or 13. The macromolecule according to claim 12, comprising a non-covalent DNA binding group.   17. At least B1One is a DNA intercalator, a covalent DNA binding group, or 14. The macromolecule according to claim 13, comprising a non-covalent DNA binding group.   18. At least B1One is a DNA intercalator, a covalent DNA binding group, or 15. The macromolecule according to claim 14, comprising a non-covalent DNA binding group.   19. At least B1One is a DNA intercalator, a covalent DNA binding group, or 16. The macromolecule according to claim 15, comprising a non-covalent DNA binding group.   20. At least B113. The method of claim 12, wherein one of the is a natural or unnatural nucleobase. Macromolecules.   21. At least B114. The method of claim 13, wherein one of the is a natural or unnatural nucleobase. Macromolecules.   22. At least B115. The method of claim 14, wherein one of the is a natural or unnatural nucleobase. Macromolecules.   23. At least B116. The method according to claim 15, wherein one of the is a natural or unnatural nucleobase. Macromolecules.   24. At least one of X is independently C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, poly Amide, C7-C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12A The method according to claim 16, which is aralkylenecarbonyl or substituted aralkylenecarbonyl. The giant molecule on display.   25. At least one of X is independently C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, poly Amide or C7-C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7− C12Claims containing aralkylene carbonyl or substituted aralkylene carbonyl The macromolecule according to 17.   26. At least one of X is independently C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, poly Amide or C7-C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7− C12Claims containing aralkylene carbonyl or substituted aralkylene carbonyl The macromolecule according to 18.   27. At least one of X is independently C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, poly Amide or C7-C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7− C12Claims containing aralkylene carbonyl or substituted aralkylene carbonyl The macromolecule according to 19.   28. At least one of X is independently C1-CFourAlkylene or substituted alkylene Or C1-CFourAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl 21. The macromolecule according to claim 20, comprising the macromolecule.   29. At least one of X is independently C1-CFourAlkylene or substituted alkylene Or C1-CFourAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl 22. The macromolecule according to claim 21, comprising:   30. The macromolecule of claim 22, wherein at least one of X is methylenecarbonyl. Child.   31. The macromolecule of claim 23, wherein at least one of X is methylenecarbonyl. Child.   32. A compound having the formula: Wherein each B is independently a natural nucleobase, a non-natural nucleobase, a heterocyclic moiety, An aromatic moiety, each of which optionally includes a protecting group, Each B1Are independently hydrogen, hydroxy, amino, mercapto, natural nucleobases, Natural nucleobases, DNA intercalators, covalent or non-covalent DNA binding groups, A ring moiety, or an aromatic moiety (each of these optionally containing a protecting group); n is an integer from 1 to 50; Each X is independently a single bond, a methylene group, a methylene carbonyl,7-C12Aral Cylene or substituted aralkylene, C7-C12Aralkylene carbonyl or A substituted aralkylenecarbonyl, or a formula:[Wherein, Z is independently a single bond, O, S, NR6, C (= O) NR6, C (= S) NR6, S (= O) NR6 , Or S (= O)TwoNR6And Each Z1Are independently O, S, Se, NRFive, Methylene, or C (CHThree)TwoAnd p, q, r, and s are each independently an integer from 0 to 20, R1, RTwo, RThree, And RFourAre each independently hydrogen; hydroxy and alkoxy are also Or C which may be substituted with alkylthio1-C8Alkyl; hydroxy; al Koshiki; alkylthio; amino; or halogen; RFiveAnd R6Are each independently hydrogen; hydroxy, alkoxy or alk C optionally substituted with kirthio1-C8Alkyl; hydroxy; alcohol; a Alkylthio or amino). Group Q1And QTwoContain, independently of each other, at least three atoms (of which At least one is carbon), Each V is independently oxygen, sulfur, NR8Or methylene (where R8Independently Hydrogen, CThree-CTenBranched or substituted alkyl, C1-CTenUnbranched alk Or substituted alkyl, C1-CTenUnbranched oxaalkyl or substituted oxaa Luquil, C6-CTenAryl or substituted aryl, C7-C12Aralkyl or place Replacement aralkyl, C1-CTenUnbranched aminoalkyl or substituted unbranched amino acids Luquil, C1-CTenUnbranched aminooxaalkyl or substituted unbranched amino Oxaalkyl, CThree-CTenAnd N1-NFourBranched (polyamino- or polyaza- ) Alkyl or substituted (polyamino- or polyaza-) alkyl, C1-CTenAnd And N1-NFourUnbranched (polyamino- or polyaza-) alkyl or substituted (poly Amino- or polyaza-) alkyl, C1-CTenAnd N1-NFourUnbranched (poly (Amino- or polyaza-) oxaalkyl or substituted unbranched (polyamino- or Or polyaza-) oxaalkyl, natural or unnatural amino acid side groups, or A protecting group), Each J is independently hydrogen, OR7, Halogen, azide, -R7Or R7And this All of them are optionally protected) (where each R7Is independently -NR8R9Ma Or R8(Where R9Is independently hydrogen, CThree-CTenBranched alkyl or substituted alkyl Kill, C1-CTenUnbranched or substituted alkyl, C1-CTenUnbranched oki Saalkyl or substituted oxaalkyl, C6-CTenAryl or substituted aryl , C7-C12Aralkyl or substituted aralkyl, C1-CTenUnbranched aminoalkyl Or substituted unbranched aminoalkyl, C1-CTenUnbranched net Nooxaalkyl or substituted unbranched aminooxaalkyl, CThree-CTenand N1-NFourBranched (polyamino- or polyaza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza-) alkyl No- or polyaza-) alkyl, C1-CTenAnd N1-NFourUnbranched (polyamid (No- or polyaza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza-) a Luquil, C1-CTenAnd N1-NFourUnbranched (polyamino- or polyaza) Oxaalkyl or substituted unbranched (polyamino- or polyaza-) oxaalkyl A natural or unnatural amino acid side group, or a protecting group; Each QThreeIs independently -OX-, -SX-, or -NR8X- (all of these are Protected by hope) Each QFourIs independently oxygen, sulfur or NR8(All of these are protected if desired. ) Y is a protecting group, Y1Is a spacer group attached to a solid support. ]   33.Q1And QTwoAre each independently optionally protected of the following groups: 33. The compound of claim 32, comprising at least one.   Oxygen; sulfur; substituted carbon; carbonyl; thiocarbonyl; sulfone; sulfoxide; C1 -C8Alkylene; CTwo-C8Alkenylene; CTwo-C8Alkynylene; one for each Or C containing two different hetero atoms or hetero atoms of the same type1-C8Oxa Alkylene or thiaalkylene or azaalkylene; in either direction NR7,+NR8R9, NR7C (= O)-, -NR7C (= S)-, -NR7S (= O)- Or -NR7S (= O)Two− (Where R7, R8And R9Is as defined above Or X (where X is as defined above); or [Where Z1Or ZFourAre each independently a single bond, O, S or NR7And Each ZThreeIs independently hydrogen, R8, OR7, SR7Or NR7R8And Each ZTwoIs independently hydrogen, O, S, or NR7Is a group represented by   34. Each Q1Optionally contains a protecting group, and -O-CH in either directionTwo-CHTwo -CHTwo-, -O-CHTwo-C (= O) -NH-, -NH-NH-C (= O) -CHTwo -, -NH-N = CH-CHTwo-, -NH-NH-CHTwo-CHTwo-, -O-NH -C (= O) -CH2-, -ON = CH-CHTwo-, -O-NH-CHTwo-CHTwo -, -CHTwo-NH-C (= O) -CHTwo-, -NH-NH-C (= O) NH-, -O -C (= O) -NH-CHTwo-CHTwo-, -OP (= ZTwo) ZThree-NH-CHTwo-CHTwo -Or -CHTwo-NH-CHTwo-CHTwo-Including one ofTwoIs maintained if desired. -CH in any direction, including protecting groupsTwo-O-CHTwo-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo -O-CHTwo-C (= O) -NH-, -CHTwo-NH-NH-C (= O) CHTwo−, − CHTwo-NH-N = CH-CHTwo-, -CHTwo-NH-NH-CHTwo-CHTwo−, − CHTwo-O-NH-C (= O) -CHTwo-, -CHTwo-ON = CH-CHTwo-, -C HTwo-O-NH-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo-NH-C (= O) -CHTwo-, -CHTwo -NH-NH-C (= O) -NH-, or -CHTwo-CHTwo-NH-CHTwo-CHTwo 34. The compound of claim 33, which comprises-.   35. Y is p-anisyldiphenylmethyl, di-p-anisylphenylmethyl, 34. The compound according to claim 33, which is or pixil.   36. Y is p-anisyldiphenylmethyl, di-p-anisylphenylmethyl, Or the compound of claim 34, which is pixil.   37. When the spacer group is carbonyl, ester, carbamate, urethane, Rajid, C1-C14Alkylene or modified alkylene, C6-C14Aralkylene Or modified aralkylene, C6-C14Alkylarene or modified alkylalene , Each containing from 1 to 50 different heteroatoms or heteroatoms of the same type1− C100Oxaalkylene or thiaalkylene or azaalkylene (where The aza group is optionally protected by an amino protecting group), C1-C14Alkyleneca Rubonyl or alkylenethiocarbonyl or alkylene sulfone or Are alkylene sulfoxides, each of 1 to 50 different heteroatoms or the same C containing heteroatoms of ip1-C100Oxaalkylenecarbonyl or thiaal Cylenecarbonyl or azaalkylenecarbonyl (or its thiocarbony Le Is a sulfone or sulfoxide congener) (where the aza group is optionally amino-protected) Protected by a protecting group), or the formula: And a salt thereof, wherein RTenOr R11Is each independently CThree− CTenBranched alkyl, C1-CTenUnbranched alkyl or oxaalkyl, C6 -CTenAryl, C7-C12Selected from the group consisting of aralkyl, R12Is a C containing one or two heteroatomsTwo-C8Alkylene, CTwo-C8Alkenelle Or -CTwo-C8Oxaalkylene, ZFiveIs a phosphate protecting group, Z6Is hydrogen, imidazol-1-yl, tetrazol-1-yl, 1,2,4-to Riazol-1-yl, and 1-hydroxy-benzotriazol-O-yl 36. The compound of claim 35, wherein   38.Y1Is -HP (= O) OH or a salt thereof, -P (OCHTwoCHTwoCN) (N (i- Pr)Two) Or -P (PCHThree) (N (i-Pr)TwoThe compound according to claim 35, which is .   39.Y1Is -HP (= O) OH or a salt thereof, -P (OCHTwoCHTwoCN) (N (i- Pr)Two) Or -P (PCHThree) (N (i-Pr)TwoThe compound according to claim 36, which is .   40. The compound according to claim 37, wherein n is 1.   41. The compound according to claim 38, wherein n is 1.   42. The compound of claim 39, wherein n is 1.   43. The compound of claim 33, wherein at least one of V is oxygen.   44. The compound of claim 37, wherein at least one of V is oxygen.   45. The compound of claim 39, wherein at least one of V is oxygen.   46. The compound of claim 41, wherein at least one of V is oxygen.   47. The compound of claim 42, wherein at least one of V is oxygen.   48. At least QThreeOr QFour34. The compound according to claim 33, wherein one of is oxygen.   49. At least QThreeOr QFour37. The compound of claim 36, wherein one of is oxygen.   50. At least QThreeOr QFour45. The compound of claim 44, wherein one of is oxygen.   51. At least QThreeOr QFour46. The compound of claim 45, wherein one of is oxygen.   52. At least QThreeOr QFour47. The compound of claim 46, wherein one of is oxygen.   53. Each J is independently hydrogen, OR7Or the compound of claim 33, which is fluorine. (Where any OR7Also optionally includes a protecting group).   54. The compound of claim 36, wherein at least one of J is hydrogen.   55. The compound of claim 37, wherein at least one of J is hydrogen.   56. The compound of claim 43, wherein at least one of J is hydrogen.   57. The compound of claim 45, wherein at least one of J is hydrogen.   58. The compound of claim 47, wherein at least one of J is hydrogen.   59. The compound according to claim 51, wherein at least one of J is hydrogen.   60. The compound of claim 52, wherein at least one of J is hydrogen.   61. If at least one of B is a natural or unnatural nucleobase, 34. The compound according to claim 33, which comprises more protecting groups).   62. At least one of B is a natural or unnatural nucleobase (both of which may be 37. The compound according to claim 36, which comprises more protecting groups).   63. At least one of B is a natural or unnatural nucleobase (both of which may be 45. The compound according to claim 44, which further comprises a protecting group).   64. At least one of B is a natural or unnatural nucleobase (both of which may be 46. The compound according to claim 45, which comprises more protecting groups).   65. At least one of B is a natural or unnatural nucleobase (both of which are desired 48. The compound according to claim 47, which comprises a protecting group.   66. At least one of B is a natural or unnatural nucleobase (both of which may be 60. The compound according to claim 59, which further comprises a protecting group).   67. At least one of B is a natural or unnatural nucleobase (both of which may be 61. The compound according to claim 60, which further comprises a protecting group).   68. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase (both of which may optionally have a protecting group 63. The compound according to claim 61, wherein   69. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase (both of which are optionally protected groups) 63. The compound according to claim 62, wherein   70. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase (both of which are optionally protected groups) 64. The compound according to claim 63, wherein   71. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase (both of which are optionally protected groups) 65. The compound according to claim 64, wherein   72. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase (both of which are optionally protected groups) 66. The compound according to claim 65, wherein   73. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase (both of which are optionally protected groups) 67. The compound according to claim 66, wherein   74. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase (both of which are optionally protected groups) 68. The compound according to claim 67, wherein   75. At least one of X is C1-CFourAlkylene or substituted alkylene, or Is C1-CFourAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl (these are 70. The compound according to claim 68, wherein each of them optionally contains a protecting group).   76. At least one of X is C1-CFourAlkylene or substituted alkylene, or Is C1-CFourAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl (these are 70. The compound according to claim 69, wherein each of them optionally contains a protecting group).   77. At least one of X is C1-CFourAlkylene or substituted alkylene, or Is C1-CFourAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl (these are 71. The compound according to claim 70, wherein each of them optionally contains a protecting group.   78. At least one of X is C1-CFourAlkylene or substituted alkylene, or Is C1-CFourAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl (these are 73. The compound according to claim 71, wherein each of them comprises a protecting group if desired.   79. The compound of claim 72, wherein at least one of X is methylenecarbonyl .   80. The compound of claim 73, wherein at least one of X is methylenecarbonyl .   81. The compound of claim 74, wherein at least one of X is methylenecarbonyl .   82.B1Are independently hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalation , DNA binding groups, polymer groups or targeting groups (all of which may be 63. The compound according to claim 61, which comprises a protecting group).   83.B1Are independently hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalation , DNA binding groups, polymer groups or targeting groups (all of which may be 63. The compound according to claim 62, which comprises a protecting group).   84.B1Are independently hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalation , DNA binding groups, polymer groups or targeting groups (all of which may be 64. The compound according to claim 63, which comprises a protecting group).   85.B1Are independently hydrogen, amio, mercapto, DNA intercalation , DNA binding groups, polymer groups or targeting groups (all of which may be 65. The compound according to claim 64, which comprises a protecting group).   86.B1Are independently hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalation , DNA binding groups, polymer groups or targeting groups (all of which may be 66. The compound according to claim 65, which comprises a protecting group).   87.B1Are independently hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalation , DNA binding groups, polymer groups or targeting groups (all of which may be 67. The compound of claim 66, which comprises a protecting group).   88.B1Are independently hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalation , DNA binding groups, polymer groups or targeting groups (all of which may be 67. The compound of claim 67, which comprises a protecting group).   89. at least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1− CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaalki Lencarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7− C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Arakirenka Rubonyl or substituted aralkylenecarbonyl (both of which are optionally protected) 83. The compound of claim 82, which comprises a protecting group).   90. at least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1− CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaalki Lencarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7− C12Aralkylene or substituted aralkylene, or CTwo-C12Arakirenka Rubonyl or substituted aralkylenecarbonyl (both of which are optionally protected) 84. The compound of claim 83, wherein said compound comprises a protecting group.   91. at least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1− CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaalki Lencarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7− C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Arakirenka Rubonyl or substituted aralkylenecarbonyl (both of which are optionally protected) 85. The compound of claim 84, wherein said compound comprises a protecting group.   92. at least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1− CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaalki Lencarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7− C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Arakirenka Rubonyl or substituted aralkylenecarbonyl (both of which are optionally protected) 86. The compound according to claim 85, which comprises a protecting group).   93. at least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1− CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaalki Lencarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7− C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Arakirenka Rubonyl or substituted aralkylenecarbonyl (both of which are optionally protected) 89. The compound according to claim 86, which comprises a protecting group).   94. at least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1− CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaalki Lencarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7− C12Aralkylene or substituted aralkylene, Or C7-C12Aralkylenecarbonyl or substituted aralkylenecarbonyl ( 89. The compound according to claim 87, wherein each of these optionally includes a protecting group.   95. At least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkylene N, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1− CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaalki Lencarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7− C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Arakirenka Rubonyl or substituted aralkylenecarbonyl (both of which are optionally protected) 89. The compound of claim 88, which comprises a protecting group).   96. A compound represented by the following formula: Or Wherein each B is independently a natural nucleobase, a non-natural nucleobase, a heterocyclic moiety, An aromatic moiety, each of which optionally includes a protecting group, Each B1Are independently hydrogen, hydroxy, amino, mercapto, natural nucleobases, Natural nucleobases, DNA intercalators, covalent or non-covalent DNA binding groups, A ring moiety, or an aromatic moiety (each of these optionally containing a protecting group); n is an integer from 1 to 50; Each X is independently an optionally protected group: Single bond, methylene, methylenecarbonyl, C7-C12Aralkylene or substituted Aralkylene, C7-C12Aralkylene carbonyl or substituted aralkylene Rubonyl, or formula:[Wherein, Z is independently a single bond, O, S, NR6, C (= O) NR6, C (= S) NR6, S (= O) NR6, Or S (= O)TwoNR6And Each Z1Are independently O, S, Se, NRFive, Methylene, or C (CHThree)TwoAnd p, q, r, and s are each independently an integer from 0 to 20, R1, RTwo, RThree, And RFourAre each independently hydrogen; hydroxy, alkoxy, Or C which may be substituted by alkylthio1-C8Alkyl; hydroxy; a Rukoshiki; alkylthio; amino; or halogen; RFiveAnd R6Are each independently hydrogen; hydroxy, alkoxy, or a C which may be substituted with1-C8Alkyl; hydroxy; alcohol; Alkylthio; or amino]. Q1And QTwoContains at least three atoms each (at least one of which One is carbon), Each V is independently oxygen, sulfur, NR8Or methylene, Each J is independently an optionally protected group: Hydrogen, OR7, Halogen, azide, or R7(Where R7Is independently -NR8 R9Or R8Nico, R8Or R9Is independently hydrogen, CThree-CTenBranch Alkyl or substituted alkyl, C1-CTenUnbranched alkyl or substituted alkyl Le, C1-CTenUnbranched oxaalkyl or substituted oxaalkyl, C6-CTenA Reel or substituted aryl, C7-C12Aralkyl or substituted aralkyl, C1− CTenUnbranched aminoalkyl or substituted unbranched aminoalkyl, C1-CTenNon Branched aminooxaalkyl or substituted unbranched aminooxaalkyl, CThree− CTenAnd N1-NFourBranched (polyamino- or polyaza-) alkyl or substituted (Polyamino- or polyaza-) alkyl, C1-CTenAnd N1-NFourBranched (Po (Riamino- or polyaza-) alkyl or substituted (polyamino- or polyaza-) -) Alkyl, C1-CTenAnd N1-NFourUnbranched (polyamino- or polyaza -) Oxaalkyl or substituted unbranched (polyamino- or polyaza-) oxa Alkyl, a natural or unnatural amino acid side group, or a protecting group); Q containing at least one atom1 xAnd QTwo x 'Are independently protected if desired. Protected or activated Q1Or QTwoOf fragments. ]   97.Q1And QTwoAre each independently one of the following optionally protected groups: 97. The compound of claim 96 comprising at least one.   Oxygen; sulfur; substituted carbon; carbonyl; thiocarbonyl; sulfone; sulfoxide; Or C1-C8Alkylene; CTwo-C8Alkenylene; CTwo-C8Alkynylene; each C containing one or two hetero atoms or hetero atoms of the same type1-C8Oxa Alkylene or thioalkylene or azaalkylene; in either direction NR7,+NR8R9, NR7C (= O)-, -NR7C (= S)-, -NR7S (= O)- Or -NR7S (= O). − (Where R7, R8And R9Is as defined above); Or X (where X is as defined above); or [Where ZFourOr ZFiveAre each independently a single bond, O, S, or NR7Is , ZThreeIs independently hydrogen, R8, OR7, SR7, Or NR7R8And Each ZTwoIs independently O, S, or NR7Is] A group represented by   98. Each Q1Independently include an optional protecting group, and -O-CH in either directionTwo -CHTwo-CHTwo-, -O-CHTwo-C (= O) -NH-, -NH-NH-C (= O) -CHTwo-, -NH-N = CH-CHTwo-, -NH-NH-CHTwo-CHTwo-, -O -NH-C (= O) -CHTwo-, -ON = CH-CHTwo-, -O-NH-CHTwo− CHTwo-, -CHTwo-NH-C (= O) -CHTwo-, -NH-NH-C (= O) NH- , -OC (= O) -NH-CHTwo-CHTwo-, -OP (= ZTwo) ZThree-NH-CHTwo -CHTwo-Or -CHTwo-NH-CHTwo-CHTwo-Including QTwoBut independently Optionally containing protecting groups, Q in either direction1, -CHTwo-O-CHTwo-CHTwo-C HTwo-, -CHTwo-O-CHTwo-C (= O) -NH-, -CHTwo-NH-NH-C (= O) -CHTwo-, -CHTwo-NH-N = CH-CHTwo-, -CHTwo-NH-NH-C HTwo-CHTwo-, -CHTwo-O-NH-C (= O) -CHTwo-, -CHTwo-ON = C H-CHTwo-, -CHTwo-O-NH-CHTwo-CHTwo-, -CHTwo-NH-C (= O) -CHTwo-, -CHTwo-NH-NH-C (= O) -NH-, or -CHTwo-CHTwo− NH-CHTwo-CHTwo100. The compound of claim 97, which comprises-.   99. The compound of claim 97, wherein 99.n is 1.   100. The compound according to claim 98, wherein 100.n is 1.   101.Q1 xAnd QTwo xContains 1-3 atoms each (all of which are optional). 99. The compound according to claim 98, comprising a protecting group.   102.Q1 xAnd QTwo xContains 1-3 atoms each (all of which are optional). The compound of claim 100, wherein the compound comprises a protecting group.   103.Q1 xIndependently YTwo-NH-CHTwo-, YTwo-NH-O-, YTwo-NH-NH -, YTwo-NH-, YTwo-NH-CHTwo-CHTwo-, YTwo-NH-NH-CHTwo-, YTwo -NH-C (= O) -CHTwo-, YTwo—NH—C (= O) —NH—, or YTwo-NH -NH-C (= O)-, where YTwoIs a protecting group or hydrogen), QTwo xIs independently E-CHTwo-CHTwo-, E-CHTwo-, E-NH-, EO- (here And E is independent And halogen, aldehyde, acetal, -S (= O)TwoR8) Or -C OR13(Where R13Is hydroxyl or an activating group) A compound as described.   104.Q1 xIndependently YTwo-NH-CHTwo-, YTwo-NH-O-, YTwo-NH-NH -, YTwo-NH-, YTwo-NH-CHTwo-CHTwo-, YTwo-NH-NH-CHTwo-, YTwo -NH-C (= O) -CHTwo-, YTwo—NH—C (= O) —NH—, or YTwo-NH -NH-C (= O)-, where YTwoIs a protecting group or hydrogen), QTwo xIs independently E-CHTwo-CHTwo-, E-CHTwo-, E-NH-, EO- Wherein E is independently halogen, aldehyde, acetal, -S (= O)TwoR8Is) Or -COR13(Where R13Is a hydroxyl or an activating group) 103. The compound of claim 102.   105.YTwoIs p-anisyldiphenylmethyl, di-p-anisylphenylmethyl , Pixyl, fluorenylmethoxycarbonyl, or trifluoroacetyl Yes, R13Is hydrogen, pentafluorophenyl, tetrafluorophenyl, p-nitrophenyl 103. The compound according to claim 103, which is phenyl or N-succinimidyl.   106.YTwoIs p-anisyldiphenylmethyl, di-p-anisylphenylmethyl , Pixyl, fluorenylmethoxycarbonyl, or trifluoroacetyl Yes, R13Is hydrogen, pentafluorophenyl, tetrafluorophenyl, p-nitrophenyl 105. The compound according to claim 104, which is phenyl or N-succinimidyl.   107. The compound of claim 99, wherein at least one of V is oxygen.   108. The compound of claim 101, wherein at least one V is oxygen.   109. The compound of claim 104, wherein at least one of V is oxygen.   110. The compound of claim 106, wherein at least one V is oxygen.   111. The compound of claim 97, wherein at least one of J is hydrogen.   112. The compound of claim 101, wherein at least one of J is hydrogen.   113. The compound of claim 104, wherein at least one of J is hydrogen.   114. The compound of claim 110, wherein at least one of J is hydrogen.   115. A natural or unnatural nucleobase in which at least one of B optionally contains a protecting group 98. The compound of claim 97, which is   116. A natural or unnatural nucleobase in which at least one of B optionally contains a protecting group In 102. The compound of claim 101, wherein   117. Natural or unnatural nucleobases in which at least one of B optionally contains a protecting group 114. The compound of claim 113, which is   118. A natural or unnatural nucleobase in which at least one of B optionally contains a protecting group 115. The compound of claim 114, which is   119. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase optionally containing a protecting group. 15. The compound according to 15.   120. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase optionally containing a protecting group. 16. The compound according to 16.   121. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase optionally containing a protecting group. 17. The compound according to 17.   122. Each B1Is a natural or unnatural nucleobase optionally containing a protecting group. 19. The compound according to 18.   123. at least one of X is C1-CFourAlkylene or substituted alkylene, or Is C1-CFourAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl (this 119. The compound of claim 119, wherein each of these optionally includes a protecting group.   124. At least one of X is C1-CFourAlkylene or substituted alkylene, or Is C1-CFourAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl (here 121. The compounds according to claim 120, wherein each of them optionally contains a protecting group.   125. The compound of claim 121, wherein at least one of X is methylenecarbonyl. object.   126. The compound of claim 122, wherein at least one of X is methylenecarbonyl. object.   127. Each B1Independently of hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalator -, DNA binding group, polymer group, or targeting group (wherein 115. The compound according to claim 115, which comprises a protecting group.   128. Each B1Independently of hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalator -, DNA binding group, polymer group, or targeting group (wherein 117. The compound according to claim 116, wherein the compound comprises a protecting group.   129. Each B1Independently of hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalator ー, DNA binding A linking group, a polymer group, or a targeting group, wherein any of these 118. The compound according to claim 117, wherein   130. Each B1Independently of hydrogen, amino, mercapto, DNA intercalator -, DNA binding group, polymer group, or targeting group (wherein 118. The compound according to claim 118, which comprises a protecting group.   131. at least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkyl Kiren, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1-CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaa Alkylenecarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7 -C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Aralkylene Carbonyl or substituted aralkylene carbonyl (wherein 127. The compound of claim 127, which optionally includes a protecting group).   132. At least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkyl Kiren, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1-CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaa Alkylenecarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7 -C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Aralkylene Carbonyl or substituted aralkylene carbonyl (wherein 128. The compound of claim 128, which optionally comprises a protecting group).   133. At least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkyl Kiren, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1-CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaa Alkylenecarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7 -C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Aralkylene Carbonyl or substituted aralkylene carbonyl (wherein 129. The compound of claim 129, which optionally includes a protecting group).   134. At least one of X is a single bond, C1-CTenAlkylene or substituted alkyl Kiren, C1-CTenAlkylenecarbonyl or substituted alkylenecarbonyl, C1-CTenOxaalkylene or substituted oxaalkylene, C1-CTenOxaa Alkylenecarbonyl or substituted oxaalkylenecarbonyl, polyamide, C7 -C12Aralkylene or substituted aralkylene, or C7-C12Aralkylene Carbonyl or substituted aralkylenecarbonyl (here Wherein each of these optionally contains a protecting group). .   135. A medicament comprising an effective amount of the macromolecule of claim 1 and a pharmaceutically acceptable carrier. Composition.   136. A medicament comprising an effective amount of the macromolecule of claim 6 and a pharmaceutically acceptable carrier. Composition.   137. A medicament comprising an effective amount of the macromolecule of claim 11 and a pharmaceutically acceptable carrier. Composition.   138. A medicament comprising an effective amount of the macromolecule of claim 16 and a pharmaceutically acceptable carrier. Composition.   139. A medicament comprising an effective amount of the macromolecule of claim 19 and a pharmaceutically acceptable carrier. Composition.   140. A medicament comprising an effective amount of the macromolecule according to claim 20 and a pharmaceutically acceptable carrier. Composition.   141. A medicament comprising an effective amount of the macromolecule according to claim 23 and a pharmaceutically acceptable carrier. Composition.   142. Claim an effective amount for the host organism in need of treatment for the disease caused by the pathogenic organism Item 7. The method for treating, comprising administering the compound according to Item 1.   143. Claim an effective amount for the host organism in need of treatment for the disease caused by the pathogenic organism Item 7. The method for treating, comprising administering the compound according to Item 6.   144. Claiming an Effective Amount for a Host Organism Requiring Treatment of a Disease Caused by a Pathogenic Organism Item 12. The method for treatment, which comprises administering the compound according to Item 11.   145. Administering an effective amount of the compound of claim 1 to an organism in need of treatment for cancer. The treatment method comprising:   146. Administering an effective amount of the compound of claim 6 to an organism in need of treatment for cancer. The treatment method comprising:   147. Administering an effective amount of the compound of claim 11 to an organism in need of treatment for cancer. The treatment method comprising:   148. Claim an effective amount for the host organism in need of treatment for the disease caused by the pathogenic organism 140. A method of treating comprising administering the pharmaceutical composition of paragraph 135.   149. Claiming an Effective Amount for a Host Organism Requiring Treatment of a Disease Caused by a Pathogenic Organism 136. A method of treatment comprising administering the pharmaceutical composition of item 136.   150. Claiming an Effective Amount for a Host Organism Requiring Treatment of a Disease Caused by a Pathogenic Organism 137. A method of treatment comprising administering the pharmaceutical composition of item 137.   151.A pharmaceutical composition according to claim 135 which is effective against an organism in need of treatment for cancer. The method of treatment comprising administering.   152.A pharmaceutical composition according to claim 136, wherein the pharmaceutical composition is effective in an organism in need of treatment for cancer. The method of treatment comprising administering.   153.A pharmaceutical composition according to claim 137 which is effective against an organism in need of treatment for cancer. The method of treatment comprising administering.
JP9527063A 1996-01-26 1997-01-24 Oligonucleotide analogs Pending JP2000505418A (en)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US59225596A 1996-01-26 1996-01-26
US08/592,255 1996-01-26
PCT/US1997/001236 WO1997027206A1 (en) 1996-01-26 1997-01-24 Oligonucleotide analogs

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2000505418A true JP2000505418A (en) 2000-05-09

Family

ID=24369947

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP9527063A Pending JP2000505418A (en) 1996-01-26 1997-01-24 Oligonucleotide analogs

Country Status (4)

Country Link
EP (1) EP0885236A1 (en)
JP (1) JP2000505418A (en)
AU (1) AU1710997A (en)
WO (1) WO1997027206A1 (en)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6919441B2 (en) 1994-03-14 2005-07-19 Aventis Pharma Deutschland Gmbh Polyamide-oligonucleotide derivatives, their preparation and use
CA2491034A1 (en) 2002-06-26 2004-01-08 The Penn State Research Foundation Methods and materials for treating human papillomavirus infections

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5118605A (en) * 1984-10-16 1992-06-02 Chiron Corporation Polynucleotide determination with selectable cleavage sites
US5124246A (en) * 1987-10-15 1992-06-23 Chiron Corporation Nucleic acid multimers and amplified nucleic acid hybridization assays using same
US5386023A (en) * 1990-07-27 1995-01-31 Isis Pharmaceuticals Backbone modified oligonucleotide analogs and preparation thereof through reductive coupling
US5539082A (en) * 1993-04-26 1996-07-23 Nielsen; Peter E. Peptide nucleic acids
GB9207381D0 (en) * 1992-04-03 1992-05-13 Ici Plc Synthesis of oligonucleotides
US5403709A (en) * 1992-10-06 1995-04-04 Hybridon, Inc. Method for sequencing synthetic oligonucleotides containing non-phosphodiester internucleotide linkages
US5476925A (en) * 1993-02-01 1995-12-19 Northwestern University Oligodeoxyribonucleotides including 3'-aminonucleoside-phosphoramidate linkages and terminal 3'-amino groups

Also Published As

Publication number Publication date
WO1997027206A1 (en) 1997-07-31
AU1710997A (en) 1997-08-20
EP0885236A1 (en) 1998-12-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU763518B2 (en) Ligand-conjugated oligomeric compounds
US6191266B1 (en) Sugar modified nucleosides
JP3050595B2 (en) Oligonucleotide analogues
US6593466B1 (en) Guanidinium functionalized nucleotides and precursors thereof
EP0552766B1 (en) Oligonucleotide analogues, their preparation and use
US5789562A (en) Nucleotide monomers containing 8-azapurin bases or a derivative thereof, their preparation and their use in making modified olignonucleotides
CA2045891C (en) Oligonucleotide analogs with terminal 3'-3' or 5'-5' internucleotide linkages
WO2015125783A1 (en) Crosslinked nucleoside and nucleotide
JP2003520200A (en) 2'-O-acetamide modified monomers and oligomers
IL185569A (en) Cyclic nucleoside analogues
JP2002540118A (en) Xylo-LNA analog
JP4620810B2 (en) Polyamide-oligonucleotide derivatives, their production and use
JP2000512630A (en) 2'-substituted nucleoside and oligonucleotide derivatives
WO1994004550A1 (en) Cholesteryl-modified triple-helix forming oligonucleotides and uses thereof
US7002006B2 (en) Protection of nucleosides
JPH08208686A (en) Oligoribonucleotide with amide main chain
US6743902B1 (en) Sugar modified nucleosides
JP2000505418A (en) Oligonucleotide analogs
US6136965A (en) Deoxynucleic alkyl and alkoxy thiourea compounds
WO2023149038A1 (en) Phenoxazine derivative and drug delivery system formulation using same
WO2012149906A1 (en) Modified nucleic acid structure having anti-hiv-1 fusion activity
US7442788B2 (en) Antisense molecules and method of controlling expression of gene function by using the same
US6872809B2 (en) Nucleoside derivatives
CA2153057A1 (en) Novel oligonucleotides modified with non-nucleotide bridging groups
WO1995031572A1 (en) Aminohydrocarbon phosphonate oligonucleotides and uses therefor