IT201800020242A1 - Substrato tridimensionale per le colture microbiche - Google Patents
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Description
Descrizione
Forma oggetto della presente invenzione un substrato tridimensionale per le colture e co-colture microbiche e un metodo per la preparazione dello stesso dove detto substrato tridimensionale comprende:
-Un sistema di diffusione (1) che comprende un primo compartimento (2) e un secondo compartimento (3), dove detto primo compartimento, apicale (2) è posto al di sopra di detto secondo compartimento, basolaterale (3), detto primo e detto secondo compartimento (2, 3) essendo separati da una membrana semipermeabile (4);
-Una soluzione base che comprende polisaccaridi, proteine e sali; o in alternativa un idrogelo pre-formato che comprende polisaccaridi, proteine e sali;
-Un mezzo di reticolazione che comprende sali, terreni di coltura e acqua distillata.
Stato dell’arte
Le colture batteriche sono oggi tipicamente ottenute in agar, con i limiti che ne conseguono. Tra questi, è rilevante notare che i gel di agar morbido rendono possibile una certa mobilità batterica oltre che la diffusione di sostanze all'interno. Tuttavia, detti gel necessariamente sono posizionati su una base di agar dura (1,5 - 2,0% p / v) portando ad una migrazione tridimensionale che è solo parziale, poiché limitata da detta base.
Inoltre, la colata di gel di agar morbido in supporti ad alta resistenza quali le piastre per colture cellulari o piastre multipozzetto per high-throughput screening e l'interpretazione dei risultati richiede una certa manipolazione e strutture complesse, limitando la capacità di screening e aumentando il rischio di contaminazioni.
È fortemente avvertita l’esigenza di metodi alternativi per le colture e co-colture microbiche, in grado di mimare sia le condizioni che si trovano nel muco ma anche condizioni di coltura fisio-patologiche.
Descrizione dell’invenzione
Forma oggetto della presente invenzione un substrato tridimensionale adatto allo studio di colture co-colture batteriche e/o microbiche e un metodo per la sua produzione.
Descrizione delle figure
Figura 1: rappresentazione schematica del sistema di diffusione che contiene Bac3gel.
Figura 2: proprietà reologiche di Bac3gel con l’aggiunta di albumina di siero umano.
Figura 3: proprietà viscoelastiche di Mucin-Bac3Gel.
Figura 4: effetto barriera alla diffusione di attivi e nanoparticelle.
Figura 5: A) Bac3Gel colorato con rosso di alizarina per rappresentare il suo gradiente interno di reticolazione; B) proprietà viscoelastiche a diversi tempi di reticolazione.
Figura 6: Pseudomonas aeruginosa CFU/ml valutate su Bac3gel o su colture planctoniche
Figura 7: Escherichia coli CFU/ml valutate su Bac3gel o su colture planctoniche
Descrizione dettagliata dell’invenzione:
Il substrato tridimensionale secondo la presente invenzione, in seguito denominato Bac3gel, comprende una miscela di componenti in grado di formare gel utilizzando diversi agenti di reticolazione mediante un processo di diffusione. Gli autori della presente invenzione hanno sorprendentemente dimostrato che le proprietà reologiche di Bac3gel sono modificabili con precisione variando i parametri di reticolazione.
Bac3gel comprende un sistema di diffusione che è un sistema bicompartimentale che produce un gradiente di grado di reticolazione (distanza tra due punti di reticolazione) tale da modellare la tipica diffusione di nutrienti e molecole del microambiente microbiche.
Con riferimento alla figura 1, detto sistema di diffusione 1 comprende un primo compartimento 2 e un secondo compartimento 3. Detti primo e secondo compartimento sono separati da una membrana semipermeabile 4. In una forma preferita, detto primo compartimento 2 è posto sopra detto secondo compartimento 3. Detta membrana semipermeabile 4 è realizzata ad esempio in policarbonato, polistirolo, poli(diallildimetilammonio cloruro), polietilene tereftalato o poliammide (nylon). Detta membrana semipermeabile 4 è permeabile ai sali ma non alla soluzione di alginato e/o mucina.
In una forma preferita, detto sistema di diffusione 1 è progettato con software di progettazione e prodotto mediante stampa tridimensionale; alternativamente, è prodotto mediante prototipazione rapida, lavorazione con metodi additivi e sottrattivi, e stampaggio ad iniezione.
Una soluzione, definita soluzione base, comprendente polisaccaridi, proteine e sali è depositata in detto primo compartimento apicale 2. Un mezzo di reticolazione che comprende sali, terreni di coltura e acqua distillata è depositato nel secondo compartimento basolaterale 3.
In una forma di realizzazione, detta soluzione base ha una viscosità compresa tra 0.05 e 100 Pa.s, preferibilmente tra 0.2 e 10 Pa.s.
In una forma di realizzazione alternativa, in detto primo compartimento apicale 2 è immesso un gel preformato che comprende polisaccaridi, proteine e sali. Il sistema di diffusione secondo una delle rivendicazioni 1, dove al posto di una soluzione si utilizza un gel preformato con i medesimi componenti della soluzione che viene introdotto nel primo compartimento apicale (2).
In una forma di realizzazione, detti polisaccaridi in detta soluzione base sono selezionati tra alginato di sodio a diversi pesi molecolari, pectina a diversi pesi molecolari diversi gradi di esterificazione e ammidazione, acido ialuronico a diversi pesi molecolari, gellano a diversi pesi molecolari, destrano a diversi pesi molecolari; dette proteine sono selezionate tra mucina, albumina sierica, fibrinogeno, fibronectina, collagene, elastina, insulina; detti sali sono selezionati tra cloruro di sodio, fosfato di ammonio, cloruro di potassio, fosfato di sodio bibasico, sodio bicarbonato, cloruro di potassio, fosfato di potassio dibasico triidrato, magnesio cloruro esaidrato, sodio solfato, tris (idrossimetil) amminometano, nitrato di sodio, nitrito di sodio, nitrato di potassio, nitrato di argento, nitrato di ammonio, nitrito di calcio, bisolfato di potassio, solfato di potassio, bisolfato di sodio, solfato di sodio e/o solfato di rame(I).
In una forma di realizzazione, detti sali compresi in detto mezzo di reticolazione sono selezionati tra calcio acetato, calcio citrato, calcio cloruro, calcio glubionato, calcio gluceptato, calcio gluconato, nitrato di calcio, fosfato di calcio, calcio idrogeno fosfato, idrossiapatite, carbonato-idrossiapatite, tricalcio fosfato, ottacalcio fosfato, nitrato di potassio, nitrato di zinco, nitrato di magnesio, nitrato di bario, nitrato di titanio, nitrato di ferro(III), nitrato di rame, nitrato di gallio, nitrito di calcio, solfato di alluminio, solfacetato di alluminio, solfato di zinco, solfato di tetraamino rame(II), rame solfato, ferro(III) solfato idrato, solfato di ferro, solfato di calcio e/o solfato di magnesio.
In una forma di realizzazione, i componenti di Bac3gel vengono sciolti in un terreno batterico adatto allo scopo o in soluzione acquosa.
In un’altra forma di realizzazione un idrogelo preformato contenente i medesimi componenti descritti per la soluzione viene introdotto in detto primo compartimento apicale (2).
Il processo di preparazione non espone Bac3gel ad alte temperature o a reagenti incompatibili con il caricamento di cellule eucariotiche o procariotiche, proteine o sostanze termolabili.
Gli autori della presente invenzione hanno sorprendentemente dimostrato che, con l'aggiunta di albumina di siero umano a Bac3gel, aumentano le proprietà viscoelastiche di Bac3gel. Questa osservazione è indicativa del fatto che non solo la proteina non è denaturata da Bac3gel, ma anche che Bac3gel consente di riprodurre le interazioni fisiologiche dell’albumina nel muco.
Questa osservazione rende particolarmente vantaggioso Bac3gel per modellare il muco. Infatti, le mucine oggi disponibili non possono essere reticolate poiché, durante il processo di estrazione e purificazione, perdono i siti di reticolazione. La gelificazione delle mucine è possibile solo in condizioni di forte acidità, non compatibili con le colture microbiche. Bac3Gel rende possibile produrre un idrogelo dalle mucine commerciali, definito Mucin-Bac3gel.
Mucin-Bac3gel così ottenuto è stato utilizzato per valutare la diffusione di attivi attraverso la barriera mucosa. Si è dimostrato che Bac3Gel agisce come una barriera verso la diffusione di attivi, sia in presenza che in assenza di mucina. Bac3Gel agisce anche da barriera verso la diffusione di nanoparticelle.
La tecnologia di produzione di Bac3gel permette l’applicazione del processo precedentemente descritto ad un idrogelo preformato, producendo gradienti che consentono di ottenere le proprietà viscoelastiche di interesse per la specifica applicazione.
L’utilizzo di Bac3gel, utilizzato per ottenere la MIC per un trattamento antibiotico, permette di ottenere risultati che più si avvicinano a quella che è la MIC richiesta per l’eradicazione di batteri nella matrice tridimensionale di diversi ecosistemi microbici. Bac3gel produce infatti un materiale in grado di fornire ai batteri un contesto adatto per consentire loro di produrre biofilm se sono batteri formanti biofilm oppure di mimare matrici tridimensionali quali il muco per ricreare fenomeni legati all'eterogeneità spaziale dei terreni. Questo è reso possibile dall’architettura tridimensionale di Bac3gel, oltre che dal gradiente di nutrienti, ossigeno e acqua, fattori che tipicamente non sono presi in considerazioni nelle colture planctoniche dello stato dell’arte.
In una forma di realizzazione, Bac3Gel è collocato all’interno di supporti, ad esempio supporti ad alta resistenza quali le piastre per colture cellulari o piastre multipozzetto per high-throughput screening consentendo di ottenere dati significativi in un'analisi a breve termine e una manipolazione minima, prevenendo così le contaminazioni incrociate.
In una forma di realizzazione, Bac3Gel può essere suddiviso in piastre multipozzetto della dimensione desiderata.
Gli esempi che seguono sono da considerarsi illustrativi dell’invenzione e non limitativi della stessa, la cui portata è definita dalle rivendicazioni che seguono.
Esempi:
Esempio 1: caricamento di Bac3gel con albumina di siero umano.
Albumina di siero umano (HSA) è stata aggiunto alla soluzione di alginato e alla soluzione di alginato di mucina prima della reticolazione, utilizzando il metodo della doppia siringa. In breve, 10 ȝl di soluzione di HSA 56,2 mg/ml sono stati miscelati con soluzioni di alginato o di mucina/alginato per ottenere una concentrazione finale di HSA pari a 1,182 mg/ml. Le proprietà viscoelastiche dell’idrogelo così ottenuto sono riportate in figura 2.
Esempio 2: ottenimento e caratterizzazione di Mucin-Bac3gel
A Bac3gel è stata aggiunta mucina nei quantitativi riportati in tabella 1, dove le concentrazioni di mucina sono indicate in riferimento al prodotto finito:
Tabella 1
Mucina gastrica porcina commerciale è stata sciolta in soluzione acquosa di NaCl (16,33 mg/ml) ad una concentrazione di 25 mg/ml. Dopo agitazione durante la notte a 4°C, la polvere di alginato è stata aggiunta fino a raggiungere la concentrazione desiderata indicata in tabella 1 e agitata fino a completa dissoluzione.
L’idrogelo è stato formato utilizzando il sistema di diffusione bicompartimentale. In breve, 200 ȝl di soluzione di mucina/alginato sono stati introdotti nella camera apicale del sistema di diffusione (diametro = 1.5 cm, spessore � 120 �m) e lasciati a 4°C per 20 ore per consentire la diffusione di ioni Ca<2+ >dalla soluzione di calcio gluconato caricata nella camera inferiore. L’esperto del settore sa come adattare lo spessore di Bac3Gel variando il volume di soluzione introdotto e il diametro di detto primo compartimento 2.
Si sono poi misurate le proprietà viscoelastiche e i dati ottenuti sono riportati in figura 3.
I dati ottenuti mostrano la possibilità offerta dal sistema secondo la presente invenzione di ottimizzare le proprietà viscoelastiche di idrogeli a base di mucina controllando il grado di reticolazione, come il tempo di reticolazione e la concentrazione del reticolante, e la concentrazione di polisaccaridico e il suo peso molecolare. Nella figura 3, è riportato un esempio di variazione delle proprietà al variare della concentrazione di alginato.
Esempio 3: Bac3gel e Mucin-Bac3gel (Mu<3>gel) come modello della barriera mucosa.
Bac3gel e Mu<3>gel con le caratteristiche di cui all’esempio 2 sono stati testati per la loro capacità di mimare la barriera mucosa.
Sono stati testati gli attivi Cefalexina e Epirubicina, oltre che nanoparticelle d’oro.
Le nanoparticelle d’oro hanno un ingombro sterico di circa 25 nm, la Cefalexina di circa 3 nm e l’Epirubicina di circa 4 nm.
I grafici di figura 4 mostrano la capacità di dette molecole di attraversare una barriera dove la barriera è costituita da un supporto permeabile, Bac3gel oppure Mu<3>gel.
I risultati mostrano che nel caso in cui il farmaco abbia una forte interazione con la mucina, come nel caso della Epirubicina (pKa = 8.01, logD7.4 = 0.03), il passaggio del farmaco è rallentato. Invece, nel caso di bassa interazione con la mucina, come nel caso della Cefalexina (pKa = 3.26 and 7.23, logD7.4 = -2.5) il passaggio è molto rapido. Questo dimostra la capacità di fungere come barriera interattiva, permettendo alla mucina nel Bac3Gel di conservare la sua capacità di interagire con le molecole.
A parità di interazione, è possibile evidenziare l’effetto di barriera sterica: dal confronto tra nanoparticelle d’oro (25 nm) e la Cefalexina (3 nm) si osserva che le nanoparticelle d’oro di maggiori dimensioni vengono rallentate dalla presenza de Bac3Gel.
Esempio 4: ottenimento di Bac3gel con proprietà viscoelastiche e gradienti differenziali.
Bac3gel prodotto da un idrogelo precedentemente reticolato viene indicato con double.
Bac3Gel sono stati prodotti all'interno del sistema di diffusione bicompartimentale con diversi tempi di reticolazione, per produrre una doppia struttura reticolante. In breve, l’alginato di sodio è stato sciolto al 2,8% (p / v) in soluzione di NaCl (16,33 mg / ml), sotto agitazione magnetica lenta per 12 ore. Le soluzioni di alginato e acqua distillata sono state miscelate in proporzione 1:4 usando il metodo a doppia siringa (fase 1). Una sospensione di carbonato di calcio (7 mg / ml) in soluzione di NaCl (16,33 mg / ml) è stata sottoposta a ultrasuoni (UP200S, processore ultrasonico, Hielscher, Ultrasound Technology) per 5 minuti, centrifugata (agitatore orbitale Vortex IKA MS3 100-240 V) a 3500 rpm per 1 min e ulteriormente miscelato con la soluzione preparata nel passaggio 1 in proporzione 1:5 (fase 2). Infine, una soluzione di GDL (10 mg / ml) è stata preparata in NaCl (16,33 mg / ml) e miscelata con la soluzione preparata al punto 2 in proporzione 1:6. Approssimativamente, 706 �l della miscela finale sono stati inseriti nel primo compartimento apicale e questa miscela è stata lasciata reagire per una notte (Bac3Gel - single). Dopo reticolazione durante la notte, 0,2% di calcio gluconato o calcio cloruro sono stati sciolti in 40 mM di rosso di alizarina e 6 ml di questa soluzione sono stati introdotti nel secondo compartimento basolaterale e lasciati reagire per diverso tempo, ad esempio per 5, 30 e 60 minuti, così come per 20 ore per consentire la produzione di un gradiente (Bac3Gel -doppio). Il rosso di alizarina è un colorante rosso organico utilizzato per identificare i depositi di calcio nella coltura cellulare con un protocollo di colorazione ben definito. Come osservato nella Figura 5A, la diffusione del gluconato di calcio porta alla formazione di un gradiente di calcio all'interno di Bac3Gel, con aree rosse intense o miste (rispettivamente nella parte inferiore e superiore dei campioni), mentre Bac3Gel - single era trasparente e Bac3Gel - double dopo 20 ore di seconda reticolazione ha mostrato un colore rosso omogeneo (nero nella figura).
Sono stati anche analizzati i cambiamenti viscoelastici indotti dalla seconda reticolazione di Bac3gel (Figura 5B). Entrambi i moduli conservativo e dissipativo sono aumentati con il tempo della seconda reticolazione, che era più visibile tra 60 minuti e 20 ore. Infatti, i valori massimi del modulo conservativo sono stati rilevati per il campione esposto a 20 ore di diffusione e non sono state riscontrate differenze significative tra 30 e 60 minuti di diffusione.
Esempio 5: Bac3gel simula un contesto fisiologico o patologico.
Una coltura batterica starter è stata inoculata nel terreno appropriato e coltivata durante la notte. Per inoculare la coltura starter, in questo caso Pseudomonas aeruginosa, una piccola quantità di materiale congelato batterico è stata rimossa meccanicamente dal crioflacone originale, conservato a -80°C, e sospesa in 10 ml di terreno di Mueller Hinton (MH), poi mantenuto a 37ºC sotto agitazione a 200 rpm durante la notte.
Il giorno seguente la stima del numero di batteri è stata eseguita spettrofotometricamente a Ȝ = 600 nm (Optical Density600; OD600). Per preparare i campioni per il test di assorbanza, la sospensione è stata diluita in proporzione 1:10 con terreno MH fresco. Lo stesso terreno è stato usato come bianco. Una volta misurata l'assorbanza del campione diluito, il numero di batteri è stato stimato utilizzando una curva di calibrazione che riporta il numero di batteri con un valore di OD600. Questa concentrazione è stata poi corretta per il volume non diluito.
Per testare la vitalità batterica all'interno di Bac3Gel, ogni Bac3Gel è stato infettato da 500, 1000 e 5000 batteri per 24 e 48 ore di incubazione. Per fare ciò, 1 ml di sospensione è stato preso dalla coltura iniziale starter e diluito alle concentrazioni necessarie. Bac3Gel è stato quindi infettato introducendo 100 μl di sospensione di batteri e lasciato in incubazione in condizioni statiche a 37°C.
Conteggi di CFU sono stati usati per studiare la presenza di batteri all'interno di Bac3Gel, vale a dire i batteri che erano migrati e proliferati efficacemente all'interno di Bac3Gel come confronto con batteri coltivati in condizioni planctoniche. In questo caso, le colture axeniche sono state condotte sia in condizioni planctoniche che in Bac3Gel.
Per stimare il numero di batteri migrati e proliferati all'interno del Bac3Gel, i batteri residui presenti sulla parte superiore del Bac3Gel e sulle pareti del pozzetto sono stati rimossi grazie a due lavaggi con terreno MH fresco. Bac3gel è stato quindi sciolto utilizzando una soluzione di citrato di sodio 50 mM a pH 7,4. Dopo la dissoluzione, la sospensione è stata diluita e piastrata dopo il conteggio della CFU. In breve, il terreno è stato immesso in una provetta da centrifuga da 1,5 ml e quindi diluito a [10<-6>-10<-10>] volte in soluzione acquosa allo 0,9% di soluzione acquosa di cloruro di sodio, pH 7,4. Successivamente, 10 ȝl della sospensione diluita sono stati distribuiti uniformemente su piastre MH Agar.
Le piastre di MH agar sono state lasciate nell'incubatore per una notte. Le colonie effettive all'interno del Bac3Gel infetto sono state calcolate moltiplicando per il fattore di diluizione. Nel caso di Bac3Gel, sono stati considerati i 150 μl dell'agente di dissoluzione per calcolare CFU / ml. I risultati sono riportati in figura 6A.
In un ulteriore esperimento, Bac3gel è stato seminato con 10<4 >batteri/ml, necessari per raggiungere 10<8 >batteri dopo 24 ore. Dopo questo periodo, il supernatante su Bac3gel è stato rimosso e il Bac3gel è stato lavato due volte con terreno di coltura fresco. Successivamente, sono stati aggiunti 100 μl di antibiotico a tre diverse concentrazioni, ovvero 0,1 MIC, MIC e 10MIC. L'antibiotico è stato lasciato agire per 24 ore in incubazione statica a 37°C.
Dopo l'efficace tempo di azione antibiotica, è stato eseguito un conteggio CFU vitale. Sono stati eseguiti diversi controlli: (I) batteri planctonici a ciascuna concentrazione di antibiotici; (II) batteri planctonici senza alcun trattamento; (III) Bac3gel infetto non trattato; e (IV) soluzioni per la formazione di Bac3Gel. Per quanto riguarda il Bac3gel infetto e testato con antibiotici, anche in quest'ultimo caso, sono stati considerati solo i CFU di Bac3gel disciolto. I dati ottenuti sono riportati in figura 6B.
Esempio 6: A Bac3Gel preparato come descritto nell’Esempio 5 (Bac3Gel – single), si aggiunge Escherichia coli.
Una coltura batterica starter è stata precedentemente inoculata in Luria-Bertani (LB) broth e coltivata durante la notte. Per inoculare la coltura starter, in questo caso Escherichia coli, una piccola quantità di materiale congelato batterico è stata rimossa meccanicamente dal crio-flacone originale, conservato a -80°C, e sospesa in 10 ml di terreno di Luria-Bertani (LB) broth, poi mantenuto a 37ºC sotto agitazione a 200 rpm durante la notte.
Il giorno seguente la stima del numero di batteri è stata eseguita spettrofotometricamente a λ = 600 nm (Optical Density600; OD600). Per preparare i campioni per il test di assorbanza, la sospensione è stata diluita in proporzione 1:10 con terreno fresco. Lo stesso terreno è stato usato come bianco. Una volta misurata l'assorbanza del campione diluito, il numero di batteri è stato stimato utilizzando una curva di calibrazione che riporta il numero di batteri con un valore di OD600. Questa concentrazione è stata poi corretta per il volume non diluito.
Per testare la vitalità batterica all'interno di Bac3gel, ogni Bac3gel è stato infettato da 500, 1000 e 5000 batteri per 24 ore di incubazione. Per fare ciò, 1 ml di sospensione è stato preso dalla coltura iniziale starter e diluito alle concentrazioni necessarie. Bac3Gel è stato quindi infettato introducendo 100 ȝl di sospensione di batteri e lasciato in incubazione in condizioni statiche a 37°C.
Conteggi di CFU sono stati usati per studiare la presenza di batteri all'interno di Bac3gel, vale a dire i batteri che erano migrati e proliferati efficacemente all'interno di Bac3gel come confronto con batteri coltivati in condizioni planctoniche. In questo caso, le colture axeniche sono state condotte sia in condizioni planctoniche che in Bac3gel.
Per stimare il numero di batteri migrati e proliferati all'interno del Bac3Gel, i batteri residui presenti sulla parte superiore del Bac3Gel e sulle pareti del pozzetto sono stati rimossi grazie a due lavaggi con terreno fresco. Bac3gel è stato quindi sciolto utilizzando una soluzione di citrato di sodio 50 mM a pH 7,4. Dopo la dissoluzione, la sospensione è stata diluita e piastrata dopo il conteggio della CFU. In breve, il terreno è stato immesso in una provetta da centrifuga da 1,5 ml e quindi diluito a [10<-6>-10<-10>] volte in soluzione acquosa allo 0,9% di soluzione acquosa di cloruro di sodio, pH 7,4. Successivamente, 10 ȝl della sospensione diluita sono stati distribuiti uniformemente su piastre LB Agar.
Le piastre di LB agar sono state lasciate nell'incubatore per una notte. Le colonie effettive all'interno del Bac3Gel infetto sono state calcolate moltiplicando per il fattore di diluizione. Nel caso di Bac3Gel, sono stati considerati i 150 ȝl dell'agente di dissoluzione per calcolare CFU / ml. I risultati sono riportati in figura 7.
Sono stati eseguiti diversi controlli: (I) batteri planctonici a ciascuna concentrazione di antibiotici; (II) Bac3gel senza infezione; e (III) soluzioni per la formazione di Bac3Gel.
Vantaggi: Il substrato tridimensionale secondo la presente invenzione presenta caratteristiche tali da renderlo vantaggioso in applicazioni nel settore alimentare, ambientale e della salute. Bac3gel trova anche impiego nel settore della produzione di prodotti correlati ai batteri, quali a titolo di esempio cellulosa, poliesteri, insulina, antibatterici, antimicotici, antivirali, antitrombotici, immunomodificanti, antitumorali, inibitori enzimatici, insetticidi, erbicidi, fungicidi (ad esempio alcaloidi e flavonoidi) e sostanze che promuovono la crescita per piante e animali. A titolo esemplificativo, il substrato tridimensionale trova vantaggiosamente impiego nelle analisi finalizzate al monitoraggio della crescita batterica, l'interazione tra comunità microbiche e/o il potenziale antimicrobico di farmaci e micro/nanoparticelle, inquinanti, probiotici, rilascio di probiotici. Detto substrato tridimensionale si presta inoltre a procedure di screening per la selezione di trattamenti antimicrobici efficaci, così come alle fasi iniziali di ricerca di nuovi farmaci oltre che alla ricerca aerospaziale per comprendere adattamenti microbici all'ambiente spaziale, come microgravità e alti livelli di radiazione. Ulteriori applicazioni sono nell’industria alimentare, ad esempio per capire in che modo determinati regimi dietetici e/o i probiotici influenzano il comportamento batterico e le comunità microbiche, così come agente di trasporto di probiotici come integratore alimentare e nelle scienze ambientali, ad esempio per valutare l'effetto di inquinanti o agenti biocidi in prodotti di pulizia rispetto alle comunità microbiche, come prodotto per migliorare la produzione agricola o per la bonifica della contaminazione ambientale. Altro esempio includono il settore cosmetico, come ad esempio prodotti cosmetici che rilasciano microrganismi con effetti dermatologici. Bac3Gel può anche essere sfruttato come un modo per riprodurre il microambiente di microrganismi all'interno di stuoie microbiche per il trattamento delle acque e la riduzione dell'inquinamento. La coltura simultanea di diversi microrganismi all'interno del substrato tridimensionale può essere sfruttata nella produzione di biocarburanti e conversione bioenergetica, poiché i microrganismi adottati per queste applicazioni richiedono un'organizzazione fisica e spaziale. Infine, il substrato tridimensionale può essere sfruttato come pila a combustibile microbiologica.
L’utilizzo del substrato tridimensionale qui descritto è di immediata comprensione, non richiede alcuna esperienza tecnica o attrezzatura specifica. Inoltre, il substrato tridimensionale secondo la presente invenzione è compatibile con le piattaforme comunemente utilizzate, quali le piastre multi-pozzetto convenzionali a 6, 12, 24, 48, 96 o 384 pozzetti, i sistemi Transwell® ed i dispositivi microfluidici. Detto substrato tridimensionale ha un costo assolutamente competitivo, e la sua produzione è scalabile e modulare, laddove le proprietà viscoelastiche e il rispettivo gradiente dello stesso sono facilmente modificabili in base allo scopo dello studio.
Esperimenti condotti avvalendosi del substrato tridimensionale secondo la presente invenzione hanno portato a risultati realistici e con un'elevata riproducibilità.
Bac3gel presenta ulteriori vantaggi rispetto ai materiali sintetici o a base di agar, vantaggi che si riepilogano nei paragrafi che seguono:
-I componenti possono essere fonti di carbonio per i batteri e, in alcuni casi, sono prodotti dagli stessi batteri, ad esempio Pseudomonas aeruginosa secernono alginato.
-Bac3Gel consente di coltivare i batteri in una struttura tridimensionale a gradiente, che i metodi attuali non mostrano.
-I microorganismi in coltura in Bac3Gel possono essere collocati in supporti ad alta resistenza (come piastre di high throughput screening), consentendo di ottenere dati significativi in un'analisi a breve termine e una manipolazione minima, prevenendo così le contaminazioni incrociate.
-Il processo di preparazione evita l'uso di alte temperature o reagenti incompatibili con l'incapsulamento di microorganismi (ad esempio cellule di batteri) o stratificati su un monostrato cellulare.
-Il processo di preparazione evita l'uso di alte temperature o reagenti incompatibili con il caricamento di cellule eucariotiche o procariotiche, proteine o sostanze termolabili.
-Il controllo della cinetica di reazione di Bac3Gel consente di suddividerlo efficacemente in piastre Multi-well di dimensioni diverse, da piastre da 6 a 96 o 384 piastre.
I gel di agar disponibili nell’arte nota, in particolare gel di agar 0,2 - 0,8% p / v, sono una possibilità per le colture microbiche in tridimensionale, ma presentano diverse limitazioni:
-non mostrano gradienti e sono posizionati su piastre 2D di agar dura;
-gel di agar morbido mostrano la possibile mobilità batterica e la diffusione della sostanza all'interno del gel. Tuttavia, sono posizionati su una base di agar dura (1,5 - 2,0% p / v). Ciò consente alle celle di migrare parzialmente in tridimensionale, poiché saranno bloccate dal livello alla base.
-la colata di gel di agar morbido in supporti ad alta resistenza (piastre di high throughput screening) e l'interpretazione dei risultati richiederebbe manipolazione e strutture complesse, pertanto aumenterebbe la possibilità di contaminazione e la capacità di screening unitamente all'efficacia dei costi sarebbe limitata rispetto a Bac3Gel.
-l'agar deve essere bollito per completa dissoluzione e mantenuto a 50-55°C per mantenerlo in forma liquida prima dell'inoculazione e della piastratura. Queste temperature sono ostili per molti microrganismi e influenzeranno i componenti termolabili che potrebbero essere necessari per arricchire la struttura della coltura (ad esempio proteine e vitamine). Bac3Gel è stato ideato per sintesi e polimerizzazione in condizioni che non influenzano componenti termolabili o incapsulamento di microorganismi (ad esempio cellule di batteri) o stratificati su un monostrato cellulare.
Infine, il substrato tridimensionale secondo la presente invenzione, composto da polimeri di origine naturale e idrosolubili e prodotto senza l'uso di solventi tossici, è un dispositivo eco-compatibile.
Claims (10)
- RIVENDICAZIONI 1. Un substrato tridimensionale per le colture microbiche che comprende: -Un sistema di diffusione (1) che comprende un primo compartimento apicale (2) e un secondo compartimento basolaterale (3), dove detto primo compartimento (2) è posto al di sopra di detto secondo compartimento (3), detto primo e detto secondo compartimento (2, 3) essendo separati da una membrana semipermeabile (4); -Una soluzione base che comprende polisaccaridi, proteine e Sali o un idrogelo pre-formato che comprende polisaccaridi, proteine e sali; -Un mezzo di reticolazione che comprende sali, terreni di coltura e acqua distillata.
- 2. Il substrato tridimensionale secondo la rivendicazione 1, dove detta membrana semipermeabile è realizzata in policarbonato, polistirolo, poli(diallildimetilammonio cloruro), polietilene tereftalato o poliammide (nylon).
- 3. Il substrato tridimensionale secondo la rivendicazione 1 o 2, dove detti polisaccaridi in detta soluzione base sono selezionati tra alginato di sodio a diversi pesi molecolari, pectina a diversi pesi molecolari diversi gradi di esterificazione e ammidazione, acido ialuronico a diversi pesi molecolari, gellano a diversi pesi molecolari, destrano a diversi pesi molecolari.
- 4. Il substrato tridimensionale secondo una delle rivendicazioni da 1 a 3, dove dette soluzioni hanno una viscosità compresa tra 0.05 e 100 Pa.s, o tra 0.2 e 10 Pa.s.
- 5. Il substrato tridimensionale secondo una delle rivendicazioni da 1 a 4, dove in detta soluzione base dette proteine sono selezionate tra mucina, albumina sierica, fibrinogeno, fibronectina, collagene, elastina, insulina.
- 6. Il substrato tridimensionale secondo una delle rivendicazioni da 1 a 5, dove in detta soluzione base detti sali sono selezionati tra cloruro di sodio, fosfato di ammonio, cloruro di potassio, fosfato di sodio bibasico, sodio bicarbonato, cloruro di potassio, fosfato di potassio dibasico triidrato, magnesio cloruro esaidrato, sodio solfato, tris (idrossimetil) amminometano, nitrato di sodio, nitrito di sodio, nitrato di potassio, nitrato di argento, nitrato di ammonio, nitrito di calcio, bisolfato di potassio, solfato di potassio, bisolfato di sodio, solfato di sodio e/o solfato di rame(I).
- 7. Il substrato tridimensionale secondo una delle rivendicazioni da 1 a 6, dove in detta soluzione di reticolazione detti sali sono selezionati tra calcio acetato, calcio citrato, calcio cloruro, calcio glubionato, calcio gluceptato, calcio gluconato, nitrato di calcio, fosfato di calcio, calcio idrogeno fosfato, idrossiapatite, carbonatoidrossiapatite, tricalcio fosfato, ottacalcio fosfato, nitrato di potassio, nitrato di zinco, nitrato di magnesio, nitrato di bario, nitrato di titanio, nitrato di ferro(III), nitrato di rame, nitrato di gallio, nitrito di calcio, solfato di alluminio, solfacetato di alluminio, solfato di zinco, solfato di tetraamino rame(II), rame solfato, ferro(III) solfato idrato, solfato di ferro, solfato di calcio e/o solfato di magnesio.
- 8. Un metodo per la preparazione di un substrato tridimensionale per le colture microbiche che comprende: -Mettere a disposizione un sistema di diffusione (1) che comprende un primo compartimento (2) e un secondo compartimento (3), dove detto primo compartimento (2) è posto al di sopra di detto secondo compartimento (3), detto primo e detto secondo compartimento (2, 3) essendo separati da una membrana semipermeabile (4); -Caricare in detto primo compartimento (2) una soluzione base o un idrogelo preformato che comprende polisaccaridi, proteine e sali; -Caricare in detto secondo compartimento (3) un mezzo di reticolazione che comprende sali, terreni di coltura e acqua distillata. -Incubare.
- 9. Un substrato tridimensionale per le colture microbiche ottenuto secondo il metodo di cui alla rivendicazione 8.
- 10. Il substrato per l’uso secondo la rivendicazione 9, dove dette colture microbiche sono colture batteriche.
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