FR3067110A1 - DEVICE AND METHOD FOR DETECTION AND IMAGING BIOCONTAMINANT ELEMENTS - Google Patents

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FR3067110A1
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FR
France
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light
elements
support
biocontaminant
incident
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Withdrawn
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FR1770567A
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Ludovic Escoubas
Marcel Pasquinelli
Leon Espinosa
Isabelle Tovena-Pecault
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Aix Marseille Universite
Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
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Aix Marseille Universite
Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
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    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
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Abstract

L'invention concerne un dispositif et un procédé de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants (BC), comprenant une matrice (M) de pixels détecteurs ayant une face active (FA) sur laquelle une lumière (L) est incidente, un support (S) transparent à la lumière qui couvre la face active (FA) et des moyens d'éclairage (ME) qui produisent la lumière (L) incidente sur la face active (FA), des moyens de visualisation (MV). L'invention se caractérise en ce que la lumière incidente (L) est la lumière émise par les éléments biocontaminants (BC) et en ce que le dispositif comprend en outre en outre au moins un filtre (F), un polariseur (P) et un analyseur (A), ledit polariseur (P) et ledit analyseur (A) étant positionnés en configuration croisée pour s'affranchir des granularités laser dans les images.The invention relates to a device and a method for detecting and imaging biocontaminant elements (BC), comprising a matrix (M) of detector pixels having an active face (FA) on which a light (L) is incident, a light-transparent support (S) which covers the active face (FA) and illumination means (ME) which produce the light (L) incident on the active face (FA), visualization means (MV). The invention is characterized in that the incident light (L) is the light emitted by the biocontaminant elements (BC) and in that the device further comprises at least one filter (F), one polarizer (P) and an analyzer (A), said polarizer (P) and said analyzer (A) being positioned in a cross configuration to overcome the laser granularities in the images.

Description

® DISPOSITIF ET PROCEDE DE DETECTION ET D'IMAGERIE D'ELEMENTS BIOCONTAMINANTS.® DEVICE AND METHOD FOR DETECTION AND IMAGING OF BIOCONTAMINANT ELEMENTS.

FR 3 067 110 - A1 (57) L'invention concerne un dispositif et un procédé de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants (BC), comprenant une matrice (M) de pixels détecteurs ayant une face active (FA) sur laquelle une lumière (L) est incidente, un support (S) transparent à la lumière qui couvre la face active (FA) et des moyens d'éclairage (ME) qui produisent la lumière (L) incidente sur la face active (FA), des moyens de visualisation (MV). L'invention se caractérise en ce que la lumière incidente (L) est la lumière émise par les éléments biocontaminants (BC) et en ce que le dispositif comprend en outre en outre au moins un filtre (F), un polariseur (P) et un analyseur (A), ledit polariseur (P) et ledit analyseur (A) étant positionnés en configuration croisée pour s'affranchir des granularités laser dans les images.FR 3 067 110 - A1 (57) The invention relates to a device and a method for detecting and imaging biocontaminant elements (BC), comprising a matrix (M) of detector pixels having an active face (FA) on which a light (L) is incident, a support (S) transparent to the light which covers the active face (FA) and lighting means (ME) which produce the light (L) incident on the active face (FA), display means (MV). The invention is characterized in that the incident light (L) is the light emitted by the biocontaminant elements (BC) and in that the device also further comprises at least one filter (F), a polarizer (P) and an analyzer (A), said polarizer (P) and said analyzer (A) being positioned in a cross configuration to overcome laser granularities in the images.

DISPOSITIF ET PROCEDE DE DETECTION ET D'IMAGERIEDETECTION AND IMAGING DEVICE AND METHOD

D'ELEMENTS BIOCONTAMINANTSBIOCONTAMINANT ELEMENTS

DOMAINE DE L'INVENTIONFIELD OF THE INVENTION

La présente invention concerne un dispositif et un procédé de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants. Le dispositif selon la présente invention comprend plus particulièrement une matrice de pixels détecteurs ayant une face active sur laquelle une lumière est incidente, un support transparent à la lumière et qui recouvre la face active, sur lequel les éléments biocontaminants sont susceptibles de se déposer, des moyens d'éclairage, qui produisent un faisceau de lumière qui est incident sur la face active, et des moyens de visualisation aptes à visualiser, sous forme d'images fixes ou d'images vidéo, un signal numérique délivré par des moyens de traitement.The present invention relates to a device and a method for detecting and imaging biocontaminant elements. The device according to the present invention more particularly comprises a matrix of detector pixels having an active face on which light is incident, a support transparent to light and which covers the active face, on which the biocontaminant elements are capable of being deposited, lighting means, which produce a beam of light which is incident on the active face, and display means suitable for viewing, in the form of still images or video images, a digital signal delivered by processing means.

ART ANTERIEURPRIOR ART

La maîtrise de la biocontamination est un enjeu de santé publique, aussi bien au niveau de la sécurité alimentaire qu'au niveau des établissements de santé ou de la pharmacopée. De même, dans l'habitat, en particulier dans l'habitat collectif (établissements scolaires, restauration, crèche, école, garderie, maison médicalisée), le respect des règles d'hygiène doit être garanti. Il est donc nécessaire de disposer de moyens de suivi de la qualité de l'air et de la propreté des environnements et surfaces.Controlling biocontamination is a public health issue, both in terms of food safety and in health establishments or the pharmacopoeia. Similarly, in housing, in particular in collective housing (schools, catering, crèche, school, daycare, nursing home), compliance with hygiene rules must be guaranteed. It is therefore necessary to have means of monitoring air quality and the cleanliness of environments and surfaces.

Dans le domaine des salles propres et bio-propres, il existe des compteurs optiques pour le suivi particulaire (particule viable ou non) ainsi des échantillonneurs actifs de suivi des biocontaminants (par impaction, filtration ou barbotage) ou passifs par sédimentation (géloses) .In the field of clean and bio-clean rooms, there are optical counters for particulate monitoring (viable particle or not) as well as active samplers for monitoring biocontaminants (by impaction, filtration or bubbling) or passive by sedimentation (agars).

L'air est généralement contaminé par une flore microbienne diversifiée qui est souvent résistante et variable dans le temps et l'espace. Pour mettre en place une chaîne globale de la maîtrise de la propreté et de l'hygiène, il faut pouvoir mesurer de manière précise et réactive les biocontaminants. De plus, compte tenu de la cinétique de reproduction de ces biocontaminants (pour certaines bactéries, toutes les 20 à 40 minutes), il faut pouvoir disposer de moyens de contrôle in situ, fiables et rapides de suivi de la croissance de ces biocontaminants.The air is generally contaminated by a diverse microbial flora which is often resistant and variable in time and space. To set up a global chain of cleanliness and hygiene control, it is necessary to be able to measure biocontaminants precisely and reactively. In addition, taking into account the kinetics of reproduction of these biocontaminants (for certain bacteria, every 20 to 40 minutes), it is necessary to be able to have means of in situ, reliable and rapid control of monitoring the growth of these biocontaminants.

Pour les établissements de santé, les niveaux de propreté bactériologique sont définis dans la norme NF S 90 351. La norme NFFor health establishments, the levels of bacteriological cleanliness are defined in standard NF S 90 351. The standard NF

S 90 351 recommande des performances techniques en fonction des zones à risques.S 90 351 recommends technical performance according to the risk zones.

Dans le domaine pharmaceutique, le guide des Bonnes Pratiques deIn the pharmaceutical field, the Good Practice Guide for

Fabrication (BPF) propose quatre niveaux de françaises et européennes proposent aussi une surveillance et une classification microbiologique des zones de production en activité, dans le cas de la fabrication des médicaments stériles.Manufacturing (BPF) offers four levels of French and European also offer monitoring and microbiological classification of active production areas, in the case of the manufacture of sterile drugs.

La norme NF EN ISO 14698-1 décrit deux catégories de dispositifs de prélèvement d'air applicables aux environnements maîtrisés :The NF EN ISO 14698-1 standard describes two categories of air sampling devices applicable to controlled environments:

- les échantillonneurs passifs : plaques de sédimentation- passive samplers: sedimentation plates

- les échantillonneurs actifs : par impaction, filtration et barbotage.- active samplers: by impaction, filtration and sparging.

Toutes ces techniques de prélèvement reposent sur les méthodes conventionnelles de culture (ou culturales) à-dire l'aptitude des microorganismes, déposés sur un c ' estmilieu de culture gélosé approprié, à donner naissance des colonies visibles à nu, en fonction du milieu de culture utilisé et des conditions d' incubation etAll these sampling techniques are based on conventional methods of culture (or culture), i.e. the ability of microorganisms, deposited on a suitable agar culture medium, to give birth to visible colonies, depending on the environment. culture used and incubation conditions and

La durée d'incubation est habituellement de 2 à jours pour les bactéries et de à 7 jours pour les levures et moisissures.The incubation period is usually 2 to 7 days for bacteria and 7 to 7 days for yeasts and molds.

En pratique, une première lecture est faite en laboratoire après 48h pour les bactéries et à jours pour les levures et moisissures. La température d'incubation est habituellement de 30 à 35 °C pour les bactéries et 20 à 25°C pour les levures et moisissures. A noter le développement de méthodes alternatives (plus rapides que les méthodes conventionnelles) présentant un niveau de réponse plus court et un niveau de qualité des résultats au moins équivalent à celui des méthodes conventionnelles.In practice, a first reading is made in the laboratory after 48 hours for bacteria and up to date for yeasts and molds. The incubation temperature is usually 30 to 35 ° C for bacteria and 20 to 25 ° C for yeasts and molds. Note the development of alternative methods (faster than conventional methods) with a shorter response level and a level of quality of results at least equivalent to that of conventional methods.

Parmi ces méthodes alternatives, retenons la cytométrie de flux, la fluorescence des particules, intrinsèque ou après marquage par un fluorochrome.Among these alternative methods, let us retain flow cytometry, fluorescence of particles, intrinsic or after labeling with a fluorochrome.

Pour ce qui concerne le marquage reposant sur une réaction enzymatique avec le réactif fluorochrome, seuls les microorganismes viables sont rendus fluorescents. Cette technologie allie la filtration de l'échantillon, le marquage direct des micro-organismes viables et le dénombrement de cellules par cytométrie à balayage laser et visualisation au moyen d'un microscope à épi-fluorescence automatisé, en moins de 3 heures.With regard to labeling based on an enzymatic reaction with the fluorochrome reagent, only viable microorganisms are made fluorescent. This technology combines filtration of the sample, direct labeling of viable microorganisms and cell counting by laser scanning cytometry and visualization using an automated epi-fluorescence microscope, in less than 3 hours.

A ce jour, le suivi des processus de biocontamination s'effectue en utilisant des échantillonneurs passifs ou actifs .To date, the monitoring of biocontamination processes is carried out using passive or active samplers.

Les échantillonneurs actifs fonctionnent par sédimentation. La sédimentation est une méthode simple consistant à collecter les micro-organismes par gravité sur des boites de Pétri ouvertes contenant des milieux de culture gélosés. Les résultats sont exprimés par unité de surface pendant un temps donné. Cette méthode est requise par les Bonnes Pratiques de Fabrication de l'industrie pharmaceutique pour la fabrication des médicaments stériles. Cette méthode ne permet pas d'avoir un résultat quantitatif de l'aérobiocontamination mais sert plutôt à évaluer le risque de biocontamination d'une surface exposée dans cet environnement, à partir d'un nombre de particules viables sédimentées sur la boite en fonction de la surface et du temps d'exposition.Active samplers operate by sedimentation. Sedimentation is a simple method of collecting microorganisms by gravity on open Petri dishes containing agar culture media. The results are expressed per unit area for a given time. This method is required by Good Manufacturing Practices in the pharmaceutical industry for the manufacture of sterile medicines. This method does not allow a quantitative result of aerobiocontamination but rather serves to assess the risk of biocontamination of an exposed surface in this environment, from a number of viable particles sedimented on the box depending on the surface and exposure time.

Les échantillonneurs actifs proposent une collecte active des biocontaminants. Les différentes méthodes de collecte des biocontaminants recueillis dans un certain volume aspiré d'air pendant un certain temps (ou biocollecteurs) sont :Active samplers offer active collection of biocontaminants. The different methods of collecting biocontaminants collected in a certain volume drawn in air for a certain time (or biocollectors) are:

- la méthode par impaction sur le milieu de culture qui est la plus répandue et qui impose une brève durée d'échantillonnage suivie d'une longue durée de mise en culture et d'analyse microbiologique ;- the method by impaction on the culture medium which is the most widespread and which requires a short duration of sampling followed by a long duration of culture and microbiological analysis;

- la méthode par filtration qui permet des prélèvements plus longs (optimaux sur 8h) et le recours à différentes méthodes d'analyse microbiologique après récupération de la membrane filtrante en milieu liquide et dilutions successives de l'échantillon (il convient toutefois de s'assurer que les conditions de filtration n'affectent pas la viabilité des micro-organismes recueillis) ;- the filtration method which allows longer samples (optimal over 8 hours) and the use of different methods of microbiological analysis after recovery of the filter membrane in liquid medium and successive dilutions of the sample (it is however advisable to make sure that the filtration conditions do not affect the viability of the microorganisms collected);

- la méthode par barbotage en milieu liquide qui a pour intérêt majeur d'éviter le risque de dessiccation de l'échantillon, les microorganismes étant transférés directement en milieu liquide. Cette méthode de collecte est jugée moins stressante pour les biocontaminants et serait donc à privilégier.- the bubbling method in liquid medium which has the major advantage of avoiding the risk of drying of the sample, the microorganisms being transferred directly into liquid medium. This collection method is considered less stressful for biocontaminants and should therefore be preferred.

L'art antérieur présente les inconvénients suivants.The prior art has the following drawbacks.

Les échantillonneurs passifs sont des plaques témoins que l'on expose dans les mêmes conditions que celles dans lesquelles est exposé l'individu ou l'objet dont on cherche à surveiller la biocontamination.Passive samplers are control plates which are exposed under the same conditions as those in which the individual or object whose biocontamination is sought to be exposed is exposed.

Ces plaques témoin sont ensuite prélevées, conditionnées proprement et transportées jusqu'à une étuve pour une mise en incubation qui va favoriser la croissance des biocontaminants et permettre un dénombrement visible à l'œil mais après une durée non négligeable pouvant aller jusqu'à 72h-une semaine suivant les microorganismes et les milieux de culture. C'est un processus long et fastidieux qui, de plus, ne garantit pas la qualité du résultat, dans la mesure où certains des micro-organismes présents sur les plaques peuvent mourir avant d'arriver au laboratoire d'analyses biologiques, ou encore se mettre en état dit « adverse », c'est-à-dire un état quasi léthargique, sans reproduction et donc non détectable.These control plates are then removed, cleanly packaged and transported to an oven for incubation which will promote the growth of biocontaminants and allow a count visible to the eye but after a significant period of up to 72 hours. one week following the microorganisms and the culture media. It is a long and tedious process which, moreover, does not guarantee the quality of the result, insofar as some of the microorganisms present on the plates can die before arriving at the laboratory of biological analyzes, or even put in a state called "adverse", that is to say an almost lethargic state, without reproduction and therefore not detectable.

Les résultats obtenus avec ces échantillonneurs actifs sont des résultats de biocontamination sédimentée exprimés en UFC par unité de surface.The results obtained with these active samplers are results of sedimented biocontamination expressed in CFU per unit area.

Les échantillonneurs actifs, ou biocollecteurs, présentent les mêmes inconvénients que les échantillonneurs passifs quant à leur temps de réponse longs liés à la période d ' incubation.Active samplers, or biocollectors, have the same drawbacks as passive samplers with regard to their long response time linked to the incubation period.

noter toutefois qu ' il existe aujourd'hui des échantillonneurs actifs qui permettent de palier à cet inconvénient car ils sont couplés à des méthodes de microbiologie rapide (Rapidnote however that today there are active samplers which make it possible to overcome this drawback because they are coupled with rapid microbiology methods (Rapid

Microbiology Method ou RMM).Microbiology Method or RMM).

Citons parmi cesAmong these

RMM, les méthodes qui reposent sur ' autofluorescence détectée par un système d' imagerie CCD ouRMM, methods which rely on autofluorescence detected by a CCD imaging system or

CMOS. Une méthode encore plus efficace est la méthode de marquage fluorescent et excitation laser qui permet de détecter des microcolonnies en croissance. Les résultats de biocontamination obtenus avec ces préleveurs actifs sont des données de biocontamination aéroportée et s'expriment en UFC par unité de volume prélevé.CMOS. An even more efficient method is the fluorescent labeling and laser excitation method which makes it possible to detect growing microcolonies. The biocontamination results obtained with these active samplers are airborne biocontamination data and are expressed in CFU per unit of volume sampled.

Il existe en conséquence au moins deux sources d'erreur dans le dénombrement actuel des micro-organismes selon techniques de l'art antérieur :Consequently, there are at least two sources of error in the current count of microorganisms according to techniques of the prior art:

au niveau de la collecte dynamique des montré une efficacité physique qui varie entre et suivant les modèles de biocollecteurs, au niveau de la culture elle-même car la même étude montre que l'efficacité biologique de culture à partir d'un échantillon deat the level of dynamic collection of shown a physical efficiency which varies between and according to the models of biocollectors, at the level of the culture itself because the same study shows that the biological efficiency of culture from a sample of

L. Pneumophila par exemple en milieu liquide peut varier de à 5.L. Pneumophila for example in a liquid medium can vary from to 5.

Le dispositif selon l'invention ne présente pas ces inconvénients.The device according to the invention does not have these drawbacks.

Par ailleurs, on connaît, selon l'art antérieur, un dispositif de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants comprenant une matrice de pixels détecteurs ayant une face active sur laquelle une lumière est incidente, un support transparent à la lumière et qui recouvre la face active, support sur lequel les éléments biocontaminants sont susceptibles de se déposer, des moyens d'éclairage qui produisent la lumière qui est incidente sur la face active, des moyens de traitement aptes à transformer le signal délivré par la matrice de pixels détecteurs en signal numérique, et des moyens de visualisation aptes à visualiser sous forme d'images fixes ou d'images vidéo le signal numérique délivré par les moyens de traitement. Ce dispositifFurthermore, according to the prior art, a device for detecting and imaging biocontaminating elements is known, comprising a matrix of detector pixels having an active face on which light is incident, a support transparent to light and which covers the active face, support on which the biocontaminating elements are likely to be deposited, lighting means which produce the light which is incident on the active face, processing means capable of transforming the signal delivered by the matrix of detector pixels into digital signal, and display means able to display in the form of still images or video images the digital signal delivered by the processing means. These measures

est décrit 23/03/2010 . is described 03/23/2010. dans in le document brevet the patent document FR 2 FR 2 964 980 publié le 964 980 published on Toutefois, However, les the images fixes ou still images or vidéo video obtenues par ce obtained by this

dispositif comportent des granularités laser, des tavelures et/ou présentent un chatoiement, formant des petites taches. En langue anglaise, ces taches sont dénommées speckle.device have laser granularities, speckles and / or have a speckle, forming small spots. In the English language, these spots are called speckle.

RESUME DE L'INVENTIONSUMMARY OF THE INVENTION

L'invention propose un dispositif de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants qui ne présente pas les inconvénients précités des dispositifs de l'art antérieur et qui, notamment, présente des images de qualité améliorée en s'affranchissant du speckle.The invention provides a device for detecting and imaging biocontaminant elements which does not have the aforementioned drawbacks of the devices of the prior art and which, in particular, presents images of improved quality by eliminating the speckle.

A cet effet, l'invention a pour premier objet un dispositif de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants, comprenant :To this end, the first object of the invention is a device for detecting and imaging biocontaminant elements, comprising:

une matrice de pixels détecteurs ayant une face active sur laquelle une lumière est incidente, un support transparent à la lumière qui couvre la face active, sur lequel support, des éléments biocontaminants sont susceptibles de se déposer et de se multiplier, des moyens d'éclairage qui produisent la lumière incidente sur la face active, des moyens de visualisation aptes à visualiser, sous forme d'images fixes ou d'images vidéo, un signal numérique délivré par des moyens de traitement, caractérisé en ce que la lumière est la lumière réémise par les éléments biocontaminants et en ce que le dispositif comprend en outre au moins un filtre, un polariseur et un analyseur, ledit polariseur et ledit analyseur étant positionnés en configuration croisée pour s'affranchir des granularités laser dans lesdites images.a matrix of detector pixels having an active face on which a light is incident, a support transparent to light which covers the active face, on which support, biocontaminating elements are likely to be deposited and to multiply, means of lighting which produce the light incident on the active face, display means capable of displaying, in the form of still images or video images, a digital signal delivered by processing means, characterized in that the light is re-emitted light by the biocontaminating elements and in that the device further comprises at least one filter, a polarizer and an analyzer, said polarizer and said analyzer being positioned in a cross configuration to overcome laser granularities in said images.

Elle a pour second objet un procédé de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants comprenant les étapes de :The second object is a method of detecting and imaging biocontaminant elements comprising the steps of:

fourniture d'un dispositif comprenant une matrice (M) de pixels détecteurs ayant une face active sur laquelle une lumière est incidente, un support transparent à la lumière qui couvre la face active, sur lequel support les éléments biocontaminants sont susceptibles de se déposer et de se multiplier, des moyens d'éclairage qui produisent la lumière incidente sur la face active, des moyens de visualisation aptes à visualiser, sous forme d'images fixes ou d'images vidéo, un signal numérique délivré par des moyens de traitement, et au moins un filtre, un polariseur et un analyseur, ledit polariseur et ledit analyseur étant positionnés en configuration croisée ;supply of a device comprising a matrix (M) of detector pixels having an active face on which a light is incident, a transparent support to the light which covers the active face, on which support the biocontaminating elements are likely to deposit and multiply, lighting means which produce the light incident on the active face, display means capable of displaying, in the form of still images or video images, a digital signal delivered by processing means, and at less a filter, a polarizer and an analyzer, said polarizer and said analyzer being positioned in a cross configuration;

dépose et deposits and multiplication multiplication des éléments elements biocontaminants bio-contaminants sur le support on the support r r éclairage lighting du support support portant wearing les the éléments items biocontaminants bio-contaminants par les moyens by the means d'éclairage lighting r r

filtration de la lumière réémise par les éléments biocontaminants par le filtre, et polarisation et analyse de ladite lumière filtrée ;filtration of the light re-emitted by the biocontaminating elements by the filter, and polarization and analysis of said filtered light;

acquisition d'un signal d'image par la matrice de pixels détecteurs ;acquisition of an image signal by the matrix of detector pixels;

traitement de ce signal acquis par les moyens de traitement et communication du signal numérique aux moyens de visualisation en vue de la visualisation d'images fixes ou vidéo représentatives des éléments biocontaminants.processing of this signal acquired by the processing means and communication of the digital signal to the display means with a view to viewing fixed or video images representative of the biocontaminant elements.

De manière avantageuse, - le support comprend un ou plusieurs milieux de croissance des biocontaminants ; - le ou les milieux de croissance des biocontaminants sont des milieux nutritifs desdits biocontaminants ; - le ou les milieux de croissance des biocontaminants comprennent des marqueurs chimiques fluorescents ; - le support comprend une mosaïque de milieux de croissance des biocontaminants, les caractéristiques d'au moins deux de ces milieux de croissances étant différentes ; - le dispositif comprend un filtre de forte densité optique centré autour de la longueur d'onde d'émission du faisceau de lumière incident, avec une bande passante étroite, comprise entre plus et moins 20 nm ; le dispositif comprend un filtre passe haut filtrant le faisceau de lumière incident ; - le dispositif comprend un système de chauffage, et des moyens de contrôle de la température du ou des milieux nutritifs ; - le dispositif comporte en outre un couvercle opaque asservi ; - les moyens d'éclairage sont des moyens laser ; - la matrice et/ou le support sont mobiles ; - le support est divisé en une ίο mosaïque de milieux de croissance des biocontaminants, les caractéristiques d'au moins deux de ces milieux de croissances étant différentes ; - le dispositif comprend en outre un couvercle opaque (C) , et l'ouverture et la fermeture de ce couvercle sont synchronisées avec la phase de détection ; et - le dispositif comprend en outre une pompe couplée à un débitmètre, de manière à prélever activement l'air de la salle, qui est projeté à la surface du support et les Unités Formant Colonies par m3 d'air prélevé sont calculées, et l'aérobiocontamination mesurée.Advantageously, the support comprises one or more growth media for biocontaminants; - The growth medium or media of the biocontaminants are nutrient media of said biocontaminants; - the growth medium or media of the biocontaminants comprise fluorescent chemical markers; the support comprises a mosaic of biocontaminant growth media, the characteristics of at least two of these growth media being different; - The device comprises a high optical density filter centered around the emission wavelength of the incident light beam, with a narrow pass band, between plus and minus 20 nm; the device comprises a high pass filter filtering the incident light beam; - The device comprises a heating system, and means for controlling the temperature of the nutrient medium (s); - The device further comprises an opaque slave cover; the lighting means are laser means; - the matrix and / or the support are mobile; the support is divided into a ίο mosaic of biocontaminant growth media, the characteristics of at least two of these growth media being different; - The device further comprises an opaque cover (C), and the opening and closing of this cover are synchronized with the detection phase; and the device also comprises a pump coupled to a flow meter, so as to actively take the air from the room, which is projected onto the surface of the support and the Colony-forming Units per m 3 of air taken are calculated, and the aerobiocontamination measured.

BREVE DESCRIPTION DES FIGURESBRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES

L'invention sera mieux comprise à la lecture de la description non limitative qui suit, rédigée au regard des dessins annexés, dans lesquels :The invention will be better understood on reading the following nonlimiting description, drawn up with reference to the appended drawings, in which:

la figure 1 est une représentation schématique du dispositif selon l'invention ;Figure 1 is a schematic representation of the device according to the invention;

la figure 2 présente, de manière schématique, un mode de réalisation du dispositif selon l'invention, dans lequel le milieu de collecte forme une mosaïque de géloses spécifiques, et dans lequel le dispositif comprend un couvercle éventuellement chauffant visant à faciliter l'incubation, sur des courtes durées de l'ordre de l'heure, et à optimiser la détection et l'image des particules viables fluorescentes ; et les figures 3A et 3B sont des images réelle (Fig. 3A) et obtenues au moyen d'un dispositif selon l'invention (Fig. 3B) dans le cas d'un exemple dans lequel une solution très concentrée (10 heures de culture en milieu liquide « LB » avec agitation à 32°C) de Bacillus subtilis dont les membranes ont été marquées par le marqueur fluorescent référencé FM 1-43 spécifique de la membrane plasmique de tout être vivant.FIG. 2 schematically shows an embodiment of the device according to the invention, in which the collection medium forms a mosaic of specific agars, and in which the device comprises an optionally heating cover intended to facilitate incubation, over short periods of the order of an hour, and to optimize the detection and image of viable fluorescent particles; and FIGS. 3A and 3B are real images (FIG. 3A) and obtained by means of a device according to the invention (FIG. 3B) in the case of an example in which a very concentrated solution (10 hours of culture in liquid medium “LB” with stirring at 32 ° C.) of Bacillus subtilis whose membranes have been marked with the fluorescent marker referenced FM 1-43 specific for the plasma membrane of all living beings.

DESCRIPTION DETAILLEE DE L'INVENTIONDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

Des définitions sont données ci-dessous, de termes utilisés dans la présente description selon l'invention.Definitions are given below of terms used in the present description according to the invention.

Bio-contamination :Bio-contamination:

Contamination d'une matière, d'un appareil, d'un individu, d'une surface, d'un liquide, d'un gaz ou de l'air par des particules viables selon la normeContamination of a material, a device, an individual, a surface, a liquid, a gas or air by viable particles according to the standard

ISO 14698-1.ISO 14698-1.

Les biocontaminants présentent pour particularités supplémentaires par rapport à une contamination particulaire ou chimique :Biocontaminants have the following additional features compared to particulate or chemical contamination:

- leur capacité à se reproduire très rapidement,- their ability to reproduce very quickly,

- leur capacité à muter, s'adapter aux conditions même les plus sévères.- their ability to mutate, adapt to even the most severe conditions.

Les grandes familles de biocontaminants sont :The main families of biocontaminants are:

- les bactéries,- bacteria,

- les virus,- viruses,

- les levures, les moisissures et les champignons.- yeasts, molds and fungi.

Bactéries :Bacteria:

Les bactéries sont des êtres vivants unicellulaires microscopiques, se reproduisant par scissiparité et dont le noyau n'est pas délimité par une membrane. Les bactéries, comme toutes les autres cellules, ont besoin d'énergie. L ΆΤΡ est la source d'énergie biochimique universelle. LΆΤΡ est commune à toutes les formes de vie, mais les réactions d'oxydoréduction impliquées dans sa synthèse sont très variées selon les organismes et notamment chez les bactéries.Bacteria are microscopic single-celled living beings, reproducing by scissiparity and whose nucleus is not delimited by a membrane. Bacteria, like all other cells, need energy. L ΆΤΡ is the universal source of biochemical energy. LΆΤΡ is common to all forms of life, but the redox reactions involved in its synthesis are very varied depending on the organism and in particular in bacteria.

Elles peuvent ainsi utiliser une très large variété de source de carbone et/ou d'énergie.They can thus use a very wide variety of carbon and / or energy sources.

Bien que leur nom dérive du grec baktêria, « bâton », les bactéries ont des formes variables :Although their name derives from the Greek baktêria, "stick", bacteria have variable forms:

sphérique (cocci, du grec kôkkos, grain ou microcoques),spherical (cocci, from the Greek kôkkos, grain or micrococci),

- en bâtonnet (bacilles pl. baccili du Latin baculus, bâton),- stick (bacilli pl. baccili from Latin baculus, stick),

- ou spiralée (spirochètes).- or spiral (spirochetes).

La taille des bactéries varie deThe size of bacteria varies from

0,02 micromètre pour les nanobactéries à 0,75 millimètre pour Thiomargari ta namibiensis, visible à 1 'œil nu0.02 micrometer for nanobacteria to 0.75 millimeter for Thiomargari ta namibiensis, visible to the naked eye

La plupart mesure toutefois entre 0,5 et lOOpm.Most, however, are between 0.5 and 100pm.

Les bactéries se reproduisent de façon asexuée, par scissiparité (une simple division cellulaire) . Le matériel génétique est tout d'abord dupliqué, puis la bactérie s'allonge, se contracte en son milieu et se divise, formant deux cellules filles identiques à la cellule mère.The bacteria reproduce asexually, by scissiparity (a simple cell division). The genetic material is first duplicated, then the bacteria lengthens, contracts in its middle and divides, forming two daughter cells identical to the mother cell.

Ainsi, la descendance d'une cellule bactérienne est un clone de cellules génétiquement identiques, appelé colonie. On dénombre ensuite les bactéries en termes d'Unités Formant Colonies(UFC).Certaines bactéries se divisent toutes les 20 à 40 min. Dans des conditions favorables, à raison d'une division toutes les 30 min, une seule cellule aura produit, en quinze heures seulement, colonie visible à l'œil nu.Thus, the offspring of a bacterial cell is a clone of genetically identical cells, called a colony. The bacteria are then counted in terms of Colony-forming Units (CFU). Some bacteria divide every 20 to 40 min. Under favorable conditions, at the rate of a division every 30 min, a single cell will have produced, in just fifteen hours, a colony visible to the naked eye.

un milliard de cellules-fillesone billion daughter cells

En revanche, dans de mauvaises conditions, certaines espèces produisent des spores, formes dormantes de la cellule, capables de supporter des conditions extrêmes de température ou de sécheresse. Le taux de mutations spontanées des bactéries est très élevé, surtout lorsqu'elles sont placées dans un environnement défavorable.On the other hand, under poor conditions, certain species produce spores, dormant forms of the cell, capable of withstanding extreme conditions of temperature or drought. The rate of spontaneous bacteria mutations is very high, especially when placed in an unfavorable environment.

Levure :Yeast:

Une levure est un champignon unicellulaire (certaines levures sont cependant capables d'arborer un aspect pseudo pluricellulaire par la formation, par ex., de pseudomycélium) apte à provoquer la fermentation des matières organiques animales ou végétales. Les levures sont employées pour la fabrication du vin, de la bière, des spiritueux, des alcools industriels, du pain et d'antibiotiques.A yeast is a unicellular fungus (certain yeasts are however able to display a pseudo-pluricellular aspect by the formation, for example, of pseudomycelium) capable of causing fermentation of organic animal or vegetable matter. Yeasts are used to make wine, beer, spirits, industrial alcohols, bread and antibiotics.

Ces micro-organismes, de forme variable selon l'espèce (sphérique, ovoïde, en bouteille, triangulaire) mais généralement ovales, d'environ 6 à 10 microns et jusqu'à 50 micromètres, se multiplient par bourgeonnement ou par scissiparité. Ils sont souvent capables d'accomplir une sporulation soit dans un but de dormance en milieu défavorable, soit dans un but de dispersion.These microorganisms, of variable shape depending on the species (spherical, ovoid, bottled, triangular) but generally oval, around 6 to 10 microns and up to 50 micrometers, multiply by budding or by scissiparity. They are often able to perform sporulation either for the purpose of dormancy in an unfavorable environment, or for the purpose of dispersal.

Micro-organismes :Microorganisms:

Les micro-organismes sont des entités microbiologiques, cellulaires ou non, capables de se reproduire ou de transférer du matériel génétique.Microorganisms are microbiological entities, cellular or not, capable of reproducing or transferring genetic material.

Moisissures :Molds:

Les moisissures sont des organismes pluricellulaires. Ce sont des champignons microscopiques filamenteux du règne des mycètes. Il en existe des milliers de variétés différentes. Une espèce donnée de champignon microscopique peut générer plusieurs types de mycotoxines, et une même mycotoxine peut être produite par plusieurs espèces de moisissures. Ce sont des molécules de faible poids moléculaire (<1000 d), le plus souvent thermostables en milieu non aqueux. Difficilement dégradables, elles peuvent subsister dans les denrées même après l'élimination des moisissures.Molds are multicellular organisms. They are filamentous microscopic fungi from the kingdom of fungi. There are thousands of different varieties. A given species of microscopic fungus can generate several types of mycotoxins, and the same mycotoxin can be produced by several species of mold. These are molecules of low molecular weight (<1000 d), most often thermostable in non-aqueous medium. Hardly degradable, they can remain in foodstuffs even after the elimination of molds.

Plaque de sédimentation :Sedimentation plate:

Une plaque de sédimentation est un réceptacle adapté, par exemple une boite de Pétri, de taille appropriée, renfermant un milieu de culture approprié, stérile, que l'on laisse ouvert pendant une durée définie afin de laisser se déposer des particules viables aéroportées (norme NF EN ISO 14698-A sedimentation plate is a suitable receptacle, for example a Petri dish, of appropriate size, containing an appropriate, sterile culture medium, which is left open for a defined period in order to allow the deposit of viable airborne particles (standard NF EN ISO 14698-

1) ·1) ·

Unité viable (UV) :Viable unit (UV):

Une unité viable est formée d'une ou plusieurs particules viables que l'on dénombre comme une seule unité. Lorsque l'on dénombre des unités viables sur un milieu gélosé, il est d'usage de les appeler « Unités Formant Colonies » (UFC). Une UFC peut se composer d'une ou de plusieurs UV (norme NF EN ISO 14698-1) .A viable unit is made up of one or more viable particles which are counted as a single unit. When there are viable units on an agar medium, it is customary to call them "Colony Forming Units" (UFC). A PDU can consist of one or more UV (standard NF EN ISO 14698-1).

Classification des micro-organismes :Classification of microorganisms:

Dans les normes actuellement accessibles de la série 14644 et 14698, il n'existe pas de classification de la biocontamination ni en volume, ni en surface. Toutefois, la norme ISO 14698-1 préconise des mesures visant à dénombrer des unités viables par dm2 et par heure pour évaluer des cinétiques de contamination.In the currently accessible standards of the 14644 and 14698 series, there is no classification of biocontamination, neither in volume nor in surface. However, the ISO 14698-1 standard recommends measures aimed at counting viable units per dm 2 and per hour to assess the kinetics of contamination.

L'invention concerne un dispositif de prélèvement, de détection précoce, et d'imagerie de microorganismes en croissance. Ce dispositif est montré à la figure 1. Ce dispositif constitue généralement un dispositif d'échantillonnage passif. Toutefois, dans certains modes de réalisation, ce dispositif est un dispositif d'échantillonnage actif.The invention relates to a device for sampling, early detection and imaging of growing microorganisms. This device is shown in Figure 1. This device generally constitutes a passive sampling device. However, in certain embodiments, this device is an active sampling device.

De manière générale, le dispositif selon l'invention comprend :In general, the device according to the invention comprises:

une matrice M de pixels détecteurs ayant une face active FA sur laquelle une lumière L est incidente, un support S transparent à la lumière qui couvre la face active FA, sur lequel support S, des éléments biocontaminants BC sont susceptibles de se déposer et de se multiplier, des moyens d'éclairage ME qui produisent la lumière L incidente sur la face active FA, des moyens de visualisation MV aptes à visualiser, sous forme d'images fixes ou d'images vidéo, un signal numérique SMT délivré par des moyens de traitement MT, caractérisé en ce que la lumière L est la lumière réémise par les éléments biocontaminants BC et en ce que le dispositif comprend en outre au moins un filtre F, un polariseur P et un analyseur A, ledit polariseur P et ledit analyseur A étant positionnés en configuration croisée pour s'affranchir des granularités laser dans lesdites images.a matrix M of detector pixels having an active face FA on which a light L is incident, a support S transparent to light which covers the active face FA, on which support S, biocontaminants BC are likely to be deposited and to be multiply, lighting means ME which produce the light L incident on the active face FA, display means MV able to display, in the form of still images or video images, a digital signal SMT delivered by means of MT treatment, characterized in that the light L is the light re-emitted by the biocontaminant elements BC and in that the device also comprises at least one filter F, a polarizer P and an analyzer A, said polarizer P and said analyzer A being positioned in cross configuration to overcome laser granularities in said images.

L'invention propose un nouveau concept de plaques de sédimentation et de croissance dites actives, car elles permettent à elles seules un suivi en quasi temps réel de la biocontamination aéroportée sédimentée ou de biocontamination surfacique. Le dispositif selon l'invention ne modifie généralement pas l'aéraulique de la salle pour prélever les particules viables. Ces particules se déposent naturellement sur le milieu nutritif de collecte. Toutefois, dans certains modes de réalisation, une pompe est ajoutée au dispositif selon l'invention, et couplée à un débitmètre, de manière à prélever activement l'air de la salle, qui est projeté ensuite à la surface du support, en permettant un calcul des Unités Formant Colonies par m3 d'air prélevé, pour la mesure de l'aérobiocontamination.The invention proposes a new concept of so-called active sedimentation and growth plates, because they alone allow almost real-time monitoring of sedimented airborne biocontamination or surface biocontamination. The device according to the invention generally does not modify the aeraulics of the room to collect viable particles. These particles are naturally deposited on the nutritive collection medium. However, in certain embodiments, a pump is added to the device according to the invention, and coupled to a flow meter, so as to actively take air from the room, which is then projected onto the surface of the support, allowing a calculation of the Colony-forming Units per m 3 of air taken, for the measurement of aerobiocontamination.

Le support S forme une surface de collecte par sédimentation des microorganismes, recouverte d'une gélose G à propriétés optiques optimisées et intégrant, préférentiellement, des marqueurs fluorescents. Ces marqueurs marquent les particules viables telles que les membranes plasmiques, les acides nucléiques ou les réactions enzymatiques spécifiques. Leur utilisation permet d'augmenter le contraste des biocontaminants en croissance sur le milieu nutritif. Le support S est transparent à la lumière. Il couvre la face active FA d'éclairage et de détection. Il est traité pour permettre le développement des particules viables susceptibles de s'y déposer. Par ailleurs, le dioptre hublotmilieu nutritif est traité de manière à diminuer les pertes de signal émis par les particules viables. Une originalité supplémentaire de l'invention est associée à la possibilité d'utiliser des lames amovibles jetables recouvertes d'un milieu de culture spécifique ou non, en lieu et place du hublot collecteur. Ces lames pourront être chauffées in situ pour optimiser les conditions de croissance et permettre la visualisation de la croissance des UFC, voire des biofilms en temps réel. Enfin, un système de chauffage contrôle la température du support transparent afin de favoriser la croissance optimisée des particules viables collectées, et un système de contrôle de l'hygrométrie du milieu nutritif qui détermine la durée de vie du milieu nutritif avant changement.The support S forms a collection surface by sedimentation of the microorganisms, covered with an agar G with optimized optical properties and preferably incorporating fluorescent markers. These markers mark viable particles such as plasma membranes, nucleic acids or specific enzyme reactions. Their use increases the contrast of growing biocontaminants on the nutrient medium. The support S is transparent to light. It covers the active face FA of lighting and detection. It is treated to allow the development of viable particles likely to deposit there. In addition, the nutritive window-medium diopter is treated so as to reduce the signal losses emitted by the viable particles. An additional originality of the invention is associated with the possibility of using disposable removable blades covered with a specific culture medium or not, in place of the collecting porthole. These slides can be heated in situ to optimize the growth conditions and allow visualization of the growth of CFUs, or even biofilms in real time. Finally, a heating system controls the temperature of the transparent support in order to promote the optimized growth of the viable particles collected, and a system for controlling the hygrometry of the nutritive medium which determines the lifetime of the nutritive medium before change.

Un dispositif de couverture C ou de cache opaque est disposé à la surface de collecte pour éviter, pendant la croissance, la dissémination des bactéries en développement dans l'environnement propre et optimisant les conditions de détection. Un asservissement synchrone permet la mise en place du cache opaque sur la surface de collecte avant le début de la détection automatique des particules viables déposées sur la surface de collecte.A cover device C or opaque cover is placed on the collection surface to prevent, during growth, the dissemination of the bacteria in development in the clean environment and optimizing the detection conditions. Synchronous servo-control allows the opaque cover to be placed on the collection surface before the automatic detection of viable particles deposited on the collection surface begins.

L'ouverture et la fermeture du couvercle sont donc synchronisées avec la phase de détection pour améliorer le rapport signal/bruit . Par ailleurs, le couvercle lui-même est éventuellement chauffant, en vue de faciliterThe opening and closing of the cover are therefore synchronized with the detection phase to improve the signal / noise ratio. Furthermore, the cover itself is optionally heated, in order to facilitate

1'incubation des biocontaminants sur une durée courte, et d'améliorer ainsi la détection. Le couvercle est éventuellement équipé moins une buse d'aspiration, ladite au moins une buse d'aspiration étant reliée à une pompe par exemple à débit variable et contrôlé par un débitmètre autorisant des aspirations d'air à des débits notamment inférieurs à 100Incubating the biocontaminants over a short period of time, thereby improving detection. The cover is optionally equipped with at least one suction nozzle, said at least one suction nozzle being connected to a pump, for example with variable flow rate and controlled by a flow meter allowing air aspirations at flow rates notably below 100

L/min. L'entrée de l'air aspiré au niveau de ladite au moins une buse est effectuée sur la partie extérieure du capot, et la sortie de l'air aspiré est située face à la gélose collectrice des éléments biocontaminants, à l'aplomb de la matrice CCD ou CMOS.L / min. The inlet of the sucked air at the level of said at least one nozzle is carried out on the external part of the cover, and the outlet of the sucked air is located opposite the agar collecting the biocontaminant elements, directly below the CCD or CMOS matrix.

Les moyens d'éclairage ME produisent la lumière monochromatique qui est incidente sur la face active. Ces moyens comprennent par exemple une diode électroluminescente, une diode laser ou un laser.The lighting means ME produce the monochromatic light which is incident on the active face. These means comprise for example a light-emitting diode, a laser diode or a laser.

La matrice M de pixels détecteurs est disposée directement au-dessous du support transparent. Elle a une face active sur laquelle une lumière est incidente. La matrice de pixels détecteurs est par exemple une matrice de capteurs CCD ou une matrice de capteurs CMOS. Les temps d'exposition du capteur sont avantageusement relativement importants, compris entre 10 et 100 ms.The matrix M of detector pixels is arranged directly below the transparent support. It has an active face on which a light is incident. The matrix of detector pixels is for example a matrix of CCD sensors or a matrix of CMOS sensors. The exposure times of the sensor are advantageously relatively long, between 10 and 100 ms.

Les moyens d'imagerie, comprenant le détecteur et la matrice M, et/ou le support S, sont déplaçables dans un plan, selon des axes XY, ou dans l'espace, selon des axes XYZ.The imaging means, comprising the detector and the matrix M, and / or the support S, can be moved in a plane, along XY axes, or in space, along XYZ axes.

Le filtre F comprend un filtre passe haut qui coupe le faisceau incident. Le dispositif comprend en outre un filtre supplémentaire, centré autour de la longueur d'onde d'émission, avec une bande passante fine, par exemple de l'ordre de +/-10 à 20 nm.Filter F includes a high pass filter which cuts the incident beam. The device also comprises an additional filter, centered around the emission wavelength, with a fine passband, for example of the order of +/- 10 to 20 nm.

Le polariseur P et l'analyseur A croisés permet de s'affranchir du « speckle » éventuel des moyens d'éclairage ME, notamment lorsqu'il s'agit d'une source de lumière laser.The crossed polarizer P and the analyzer A makes it possible to dispense with the possible “speckle” of the lighting means ME, in particular when it is a laser light source.

Les moyens de traitement MT sont aptes à transformer le signal délivré par la matrice M de pixels détecteurs en signal numérique SMT. Ils comprennent des moyens aptes à dénombrer les éléments biocontaminants par unité de surface et/ou par unité de temps, et des moyens permettant de visualiser la morphologie des éléments biocontaminants en croissance.The processing means MT are able to transform the signal delivered by the matrix M of detector pixels into a digital signal SMT. They include means capable of counting the biocontaminant elements per unit area and / or per time unit, and means making it possible to visualize the morphology of the growing biocontaminant elements.

Les moyens de visualisation MV sont aptes à visualiser sous forme d'images fixes ou d'images vidéo le signal numérique SMT délivré par les moyens de traitement afin de suivre la croissance des particules viables sur des longues périodes, notamment de l'ordre de la journée, à une semaine ou plus. Ces moyens permettent de suivre l'évolution de la taille d'une particule au cours du temps.The visualization means MV are able to visualize in the form of still images or video images the digital signal SMT delivered by the processing means in order to follow the growth of the viable particles over long periods, in particular of the order of day, a week or more. These means make it possible to follow the evolution of the size of a particle over time.

Le dispositif deThe device

1'invention peut permettre une classification de certains biocontaminants.The invention may allow classification of certain biocontaminants.

Ces biocontaminants sont les bactéries GRAM+ etThese biocontaminants are the GRAM + bacteria and

GRAM-. Un marqueur, qui pourrait être mis en œuvre pour cette classification, est un mélange d'hexidium iodide et de SYTO™ de ThermoFisher™. Toutefois, lesdites bactéries GRAM+ etGRAM. A marker, which could be used for this classification, is a mixture of iodide hexidium and SYTO ™ from ThermoFisher ™. However, said GRAM + bacteria and

GRAM- peuvent aussi faire l'objet d'une identification a posteriori. Une telle identification a posteriori peut en outre être utilisée pour une classification d'autres éléments biocontaminants, tels que les levures, moisissures ou champignons. Elle peut se faire, par exemple, par observation directe des éléments biocontaminants, après croissance suffisamment longue. Elle permettrait de donner également des informations morphologiques sur les éléments biocontaminants (ex. coques, bacilles, etc..).GRAM- can also be the subject of an a posteriori identification. Such a posteriori identification can also be used for a classification of other biocontaminant elements, such as yeasts, molds or fungi. It can be done, for example, by direct observation of the biocontaminant elements, after sufficiently long growth. It would also give morphological information on biocontaminant elements (eg hulls, bacilli, etc.).

A cet effet, et ainsi que cela est montré à la figure 2, le dispositif dispose avantageusement d'un milieu de culture G « mosaïque ». Il s'agit, dans l'exemple de la figure 2, d'une mosaïque de 4 géloses différentes spécifiques de différentes particules viables. Le milieu de culture peut être un milieu apte à favoriser la croissance d'un grand nombre d'éléments biocontaminants différents ou un milieu de culture spécifique qui favorise un type de biocontaminant particulier. Chaque partie du milieu de culture est alors spécifique des contaminants à détecter soit parce qu'elle intègre - ou non - des marqueurs fluorescents ou des inhibiteurs de croissance ou un milieu nutritif spécifique de tel ou tel contaminant.To this end, and as shown in FIG. 2, the device advantageously has a “mosaic” culture medium G. In the example in FIG. 2, this is a mosaic of 4 different agars specific for different viable particles. The culture medium can be a medium capable of promoting the growth of a large number of different biocontaminant elements or a specific culture medium which promotes a particular type of biocontaminant. Each part of the culture medium is then specific for the contaminants to be detected either because it incorporates - or not - fluorescent markers or growth inhibitors or a nutrient medium specific for such or such contaminant.

Selon encoreAccording to still

1'invention, une autre caractéristique supplémentaire de les moyens de traitement MT comprennent des moyens aptes à visualiser la morphologie des éléments biocontaminants.The invention, another additional characteristic of the MT treatment means comprises means capable of visualizing the morphology of the biocontaminant elements.

L'invention concerne également un système de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants, caractérisé en ce qu'il comprend un ensemble de dispositifs de détection et d'imagerie de microorganismes conformes à l'invention, les matrices de pixels détecteurs des dispositifs de détection et d'imagerie étant mises en réseau.The invention also relates to a system for detecting and imaging biocontaminant elements, characterized in that it comprises a set of devices for detecting and imaging microorganisms according to the invention, the pixel arrays of detector devices detection and imaging being networked.

Pour la mise en œuvre du procédé de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants selon l'invention, un dispositif tel que décrit ci-dessus est fourni. Le couvercle opaque est ouvert, et lesdits éléments se déposent naturellement sur la gélose portée par le support, par sédimentation, ou alors, activement, si ledit couvercle est muni de buses reliées à une pompe d'aspiration couplée à un débitmètre. Ces éléments biocontaminants se multiplient sur le support. Pour la visualisation de ces éléments, le couvercle est refermé et le support transparent portant lesdits éléments est éclairé, par le dessous, par les moyens d'éclairage. La lumière produite par ces moyens d'éclairage est réémise par les éléments biocontaminants. Elle est filtrée, puis traverse l'ensemble croisé formé du polariseur et de l'analyseur, avant traitement, ce qui supprime les chatoiements dans les images. Un signal d'image est acquis par la matrice de pixels détecteurs et ce signal acquis est traité par les moyens de traitement, puis envoyé aux moyens de visualisation en vue de la visualisation d'images fixes ou vidéo représentatives des éléments biocontaminants.For the implementation of the method of detection and imaging of biocontaminant elements according to the invention, a device as described above is provided. The opaque cover is open, and said elements are naturally deposited on the agar carried by the support, by sedimentation, or else, actively, if said cover is provided with nozzles connected to a suction pump coupled to a flow meter. These biocontaminants multiply on the support. For viewing these elements, the cover is closed and the transparent support carrying said elements is lit from below by the lighting means. The light produced by these lighting means is re-emitted by the biocontaminating elements. It is filtered, then crosses the crossed assembly formed by the polarizer and the analyzer, before processing, which eliminates the speckles in the images. An image signal is acquired by the matrix of detector pixels and this acquired signal is processed by the processing means, then sent to the display means for the display of still or video images representative of the biocontaminant elements.

En définitive, le dispositif et le procédé selon l'invention constituent un moyen simple et facilement transportable qui permet de suivre, in situ et en continu, voire en réseau, les microorganismes susceptibles de se développer en biofilm sur les surfaces.Ultimately, the device and the method according to the invention constitute a simple and easily transportable means which makes it possible to monitor, in situ and continuously, or even in a network, the microorganisms liable to develop into biofilms on the surfaces.

Une liste d'avantages du dispositif et du procédé selon l'invention est mentionnée ci-après :A list of advantages of the device and of the method according to the invention is mentioned below:

- contrôler les particules viables sédimentées des environnements à risques biologiques,- control viable sedimented particles in environments with biological risks,

- permettre un suivi en continu et sur des longues périodes des particules viables en environnement contrôlé ou autre environnement même extérieur,- allow continuous monitoring over long periods of viable particles in a controlled environment or other environment, even outside,

- fournir en temps réel l'évolution des particules viables surfaciques déposées sur les surfaces d'une salle ou de plusieurs salles en même temps,- provide in real time the evolution of viable surface particles deposited on the surfaces of a room or several rooms at the same time,

- ne pas modifier 1' aéraulique de la salle par des prélèvements dynamiques,- do not modify the ventilation of the room by dynamic sampling,

- fournir des preuves objectives de la présence de ces particules viables avec prise de photos et suivi vidéo de leur évolution (traçabilité assurée),- provide objective evidence of the presence of these viable particles with photo taking and video monitoring of their evolution (traceability guaranteed),

- suivre la cinétique de croissance des unités formant colonies à partir d'une unité viable,- follow the growth kinetics of the colony forming units from a viable unit,

- alerter au plus tôt de la présence de ces particules viables par détection des premiers instants de croissance, dans des temps l'ordre de l'heure,- alert as soon as possible of the presence of these viable particles by detecting the first moments of growth, in times of the order of the hour,

- déduire une cinétique de biocontamination en fonction des conditions d'exploitation des salles, du nombre d'opérateurs, de visiteurs, de la température, du débit de filtration, etc. grâce au mode de prélèvement statique représentatif de la situation d'exposition des médicaments, patients ou aliments à protéger,- deduce a kinetics of biocontamination depending on the operating conditions of the rooms, the number of operators, visitors, temperature, filtration rate, etc. thanks to the static sampling method representative of the exposure situation of the drugs, patients or food to be protected,

- permettre d'optimiser la fréquence de nettoyage des surfaces par un suivi en temps réel de la biocontamination des surfaces,- allow the frequency of surface cleaning to be optimized by real-time monitoring of surface biocontamination,

- permettre un gain réel de temps par rapport aux plaques témoins passives de l'art antérieur,- allow a real saving of time compared to the passive witness plates of the prior art,

- améliorer la fiabilité des résultats en évitant tout transfert des plaques de collecte du point d'échantillonnage au point d'analyse,- improve the reliability of the results by avoiding any transfer of the collection plates from the sampling point to the analysis point,

- différencier les unités viables des unités mortes ou en état adverse par un suivi vidéo ou régulier de leur croissance,- differentiate viable units from dead units or units in an adverse state by video or regular monitoring of their growth,

- différencier les unités viables des unités mortes ou en état adverse par un éclairage laser UV et un milieu de culture intégrant des fluorochromes,- differentiate viable units from dead units or those in an adverse state by UV laser lighting and a culture medium incorporating fluorochromes,

- permettre le développement spécifique de tel ou tel micro-organisme en utilisant des milieux de culture sélectifs,- allow the specific development of a particular micro-organism using selective culture media,

- réaliser des procédés d'analyses de biocontaminants peu coûteux par rapport aux procédés d'analyse a posteriori en laboratoire de l'art antérieur.- Carry out inexpensive biocontaminant analysis methods compared to the prior art laboratory analysis methods.

L'invention trouve des applications dans toutes les industries (industrie pharmaceutique et agroalimentaire, mais aussi spatiale, micromécanique, optique, les nanotechnologies), et dans les établissements de santé et dans la lutte contre le bioterrorisme.The invention finds applications in all industries (pharmaceutical and agrifood industry, but also in space, micromechanics, optics, nanotechnologies), and in healthcare establishments and in the fight against bioterrorism.

A ce jour, la maîtrise de la biocontamination passe par des prélèvements de courtes durées, via des échantillonneurs passifs ou actifs. Ensuite, ces prélèvements doivent suivre un long processus de culture à une température et pendant des durées pouvant atteindre sept jours.To date, mastering biocontamination involves short-term samples, via passive or active samplers. Then, these samples must follow a long culture process at a temperature and for periods of up to seven days.

Le moyen de visualisation du dépôt de microorganismes en quasi temps réel proposé par l'invention est un substitut avantageux à ces échantillonneurs, d'autant qu'il est sur le concept très proche de la méthode de référence basée sur l'exposition passive de géloses aux points à risques de biocontamination de l'installation. Il permet de signaler instantanément que les niveaux d'alerte ou/et d'action sont atteints dans telle ou telle zone.The means of visualizing the deposit of microorganisms in near real time proposed by the invention is an advantageous substitute for these samplers, especially since it is very close in concept to the reference method based on passive exposure of agars at risk points for biocontamination of the installation. It makes it possible to instantly signal that alert or action levels have been reached in a particular area.

Exemple de mise en œuvreExample of implementation

Un dispositif selon l'invention a été réalisé en utilisant une boite de Pétri comprenant un milieu de culture TSA intégrant un marqueur fluorescent référencé FM 1-43 chez Thermofisher™. Une goutte de solution très concentrée (10 heures de culture en milieu liquide LB avec agitation à 32°C) de Bacillus subtilis a été déposée dans cette boite, l'objectif de l'expérience n'étant pas d'être représentatif du mode de dépôt mais bien de montrer le bon fonctionnement du dispositif opto-mécanique. Dans cet exemple, on a utilisé une source laser incidente monochromatique à 447 nm avec un polariseur et un analyseur croisés. Ces tests montrent que la configuration polariseur/analyseur croisés permet de s'affranchir du speckle de la source laser. Un filtre uniquement ne suffirait pas pour s'affranchir du speckle. Un filtre passe-haut coupant les signaux lumineux réémis et imagé à 500 nm (DO de 6) a été utilisé. Un filtre supplémentaire, centré autour de la longueur d'onde d'émission du marqueur FM 1-43, ici centré à 600nm, avec une bande passante de +/- 16 nm a été utilisé pour n'analyser que la lumière émise par les bacillus subtilis. Les temps d'exposition ont été compris entre 10 et 100 ms et 8 et 20 images ont été acquises. Dans la configuration de cet exemple, avec l'objectif mis en œuvre, un pixel de l'image correspond à 18 pm. Le capteur en lui-même présente des pixels de 6,45 pm de côtés, ce qui peut être optimisé, compte tenu de la qualité des caméras disponibles aujourd'hui. Le montage du dispositif optimisé avec couverture opaque de la boite de Pétri correspond à la configuration optimisée en termes de contrastes des bactéries sur la gélose. La photographie de la figure 3A correspond à l'image réelle. La photographie de la figure 3B est l'image de fluorescence obtenue au moyen d'un dispositif selon l'invention, dans les conditions spécifiques mises en œuvre dans cetA device according to the invention was produced using a Petri dish comprising a TSA culture medium incorporating a fluorescent marker referenced FM 1-43 from Thermofisher ™. A drop of very concentrated solution (10 hours of culture in an LB liquid medium with stirring at 32 ° C.) of Bacillus subtilis was placed in this box, the objective of the experiment not being to be representative of the mode of deposit but to show the proper functioning of the opto-mechanical device. In this example, a 447 nm monochromatic incident laser source was used with a crossed polarizer and analyzer. These tests show that the crossed polarizer / analyzer configuration eliminates the speckle of the laser source. A filter alone would not be enough to get rid of the speckle. A high-pass filter cutting the re-emitted and imaged light signals at 500 nm (OD 6) was used. An additional filter, centered around the emission wavelength of the FM marker 1-43, here centered at 600nm, with a passband of +/- 16 nm was used to analyze only the light emitted by the bacillus subtilis. The exposure times were between 10 and 100 ms and 8 and 20 images were acquired. In the configuration of this example, with the objective implemented, one pixel of the image corresponds to 18 pm. The sensor itself has pixels of 6.45 µm sides, which can be optimized, given the quality of the cameras available today. The mounting of the optimized device with opaque cover of the Petri dish corresponds to the optimized configuration in terms of contrast of the bacteria on the agar. The photograph in Figure 3A corresponds to the actual image. The photograph in FIG. 3B is the fluorescence image obtained by means of a device according to the invention, under the specific conditions implemented in this

Claims (15)

REVENDICATIONS 1. Dispositif de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants (BC), comprenant :1. Device for detecting and imaging biocontaminant elements (BC), comprising: une matrice (M) de pixels détecteurs ayant une face active (FA) sur laquelle une lumière (L) est incidente, un support (S) transparent à la lumière qui couvre la face active (FA), sur lequel support (S) les éléments biocontaminants (BC) sont susceptibles de se déposer et de se multiplier, des moyens d'éclairage (ME) qui produisent la lumière (L) incidente sur la face active (FA) , des moyens de visualisation (MV) aptes à visualiser, sous forme d'images fixes ou d'images vidéo, un signal numérique (SMT) délivré par des moyens de traitement (MT) caractérisé en ce que la lumière incidente (L) est la lumière émise par les éléments biocontaminants (BC) et en ce que le dispositif comprend en outre au moins un filtre (F) , et un analyseur (A), ledit et ledit analyseur (A) étant positionnés en configuration croisée pour s'affranchir des granularités laser dans lesdites images.a matrix (M) of detector pixels having an active face (FA) on which a light (L) is incident, a support (S) transparent to light which covers the active face (FA), on which support (S) biocontaminating elements (BC) are liable to deposit and multiply, lighting means (ME) which produce the light (L) incident on the active face (FA), display means (MV) capable of displaying, in the form of still images or video images, a digital signal (SMT) delivered by processing means (MT) characterized in that the incident light (L) is the light emitted by the biocontaminant elements (BC) and in that the device further comprises at least one filter (F), and one analyzer (A), said and said analyzer (A) being positioned in cross configuration to overcome laser granularities in said images. 2. Dispositif selon la revendication 1, caractérisé en ce que le support (S) comprend un ou plusieurs milieux de croissance des biocontaminants.2. Device according to claim 1, characterized in that the support (S) comprises one or more growth media for biocontaminants. 3. Dispositif selon la revendication 2, caractérisé en ce que le ou les milieux de croissance des biocontaminants sont des milieux nutritifs desdits biocontaminants.3. Device according to claim 2, characterized in that the growth medium or media of the biocontaminants are nutrient media of said biocontaminants. 4. Dispositif selon l'une des revendications 2 ou 3, caractérisé en ce que le ou les milieux de croissance des biocontaminants comprennent des marqueurs chimiques fluorescents.4. Device according to one of claims 2 or 3, characterized in that the growth medium or media of the biocontaminants comprise fluorescent chemical markers. 5. Dispositif selon l'une des revendications 2 à 4, caractérisé en ce que le support (S) comprend une mosaïque de milieux de croissance des biocontaminants, les caractéristique d'au moins deux de ces milieux de croissances étant différentes.5. Device according to one of claims 2 to 4, characterized in that the support (S) comprises a mosaic of biocontaminant growth media, the characteristics of at least two of these growth media being different. 6. Dispositif selon l'une des revendications précédentes, caractérisé en ce qu'il comprend un filtre de forte densité optique centré autour de la longueur d'onde d'émission du faisceau de lumière incident, avec une bande passante étroite, comprise entre plus et moins 20 nm.6. Device according to one of the preceding claims, characterized in that it comprises a high optical density filter centered around the emission wavelength of the incident light beam, with a narrow passband, between more and less 20 nm. 7. Dispositif selon l'une des revendications précédentes, caractérisé en ce qu'il comprend un filtre passe haut filtrant le faisceau de lumière incident.7. Device according to one of the preceding claims, characterized in that it comprises a high pass filter filtering the incident light beam. 8. Dispositif selon l'une des revendications précédentes, caractérisé en ce qu'il comprend un système de chauffage, et des moyens de contrôle de la température du ou des milieux nutritifs.8. Device according to one of the preceding claims, characterized in that it comprises a heating system, and means for controlling the temperature of the nutrient medium or media. 9. Dispositif selon l'une des revendications précédentes, caractérisé en ce qu'il comporte en outre un couvercle opaque asservi.9. Device according to one of the preceding claims, characterized in that it further comprises an opaque slave cover. 10. Dispositif selon l'une des revendications précédente, caractérisé en ce que les moyens d'éclairage sont des moyens laser.10. Device according to one of the preceding claims, characterized in that the lighting means are laser means. 11. Dispositif selon l'un des revendications précédentes, caractérisé en ce que la matrice (M) et/ou le support (S) sont mobiles.11. Device according to one of the preceding claims, characterized in that the matrix (M) and / or the support (S) are mobile. 12. Procédé de détection et d'imagerie d'éléments biocontaminants (BC) comprenant les étapes de :12. Method for detecting and imaging biocontaminant elements (BC) comprising the steps of: fourniture d'un dispositif comprenant une matrice (M) de pixels détecteurs ayant une face active (FA) sur laquelle une lumière (L) est incidente, un support (S) transparent à la lumière qui couvre la face active (FA), sur lequel support (S) les éléments biocontaminants (BC) sont susceptibles de se déposer et de se multiplier, des moyens d'éclairage (ME) qui produisent la lumière (L) incidente sur la face active (FA) , des moyens de visualisation (MV) aptes à visualiser, sous forme d'images fixes ou d'images vidéo, un signal numérique (SMT) délivré par des moyens de traitement (MT), et au moins un filtre, un polariseur et un analyseur, ledit polariseur et ledit analyseur étant positionnés en configuration croisée ;supply of a device comprising a matrix (M) of detector pixels having an active face (FA) on which a light (L) is incident, a support (S) transparent to light which covers the active face (FA), on which support (S) the biocontaminant elements (BC) are liable to be deposited and to multiply, lighting means (ME) which produce the light (L) incident on the active face (FA), display means ( MV) able to visualize, in the form of still images or video images, a digital signal (SMT) delivered by processing means (MT), and at least one filter, a polarizer and an analyzer, said polarizer and said analyzer being positioned in cross configuration; dépose et multiplication des éléments biocontaminants (BC) sur le supportremoval and multiplication of biocontaminants (BC) on the support éclairage lighting du of support (S) support (S) portant les éléments bearing the elements biocontaminants bio-contaminants (BC) (BC) par les moyens by the means d'éclairage (ME) ; lighting (ME); filtration filtration de of la lumière réémise par les éléments light re-emitted by the elements biocontaminants bio-contaminants (BC) (BC) par le filtre, et polarisation by the filter, and polarization et and analyse de ladite lumière filtrée ; analysis of said filtered light; acquisition acquisition d ' un of a signal d'image image signal par la matrice de pixels by the pixel matrix détecteurs ; detectors; traitement treatment de of ce signal acquis par les moyens this signal acquired by the means de of
traitement signal et communication du numérique (SMT) aux moyens de visualisation (MV) en vue de la visualisation d'images fixes ou vidéo représentatives des éléments biocontaminants (BC) .digital signal processing and communication (SMT) to the display means (MV) for the display of still or video images representative of the biocontaminant elements (BC).
13. Procédé selon la revendication 12, caractérisé en ce que support (S) est divisé en une mosaïque de milieux de croissance des biocontaminants, les caractéristique d'au moins deux de ces milieux de croissances étant différentes.13. Method according to claim 12, characterized in that support (S) is divided into a mosaic of biocontaminant growth media, the characteristics of at least two of these growth media being different. 14. Procédé selon l'une des revendications 12 ou 13, caractérisé en ce que le dispositif comprend en outre un couvercle opaque (C) , et en ce que l'ouverture et la fermeture de ce couvercle sont synchronisées avec la phase14. Method according to one of claims 12 or 13, characterized in that the device further comprises an opaque cover (C), and in that the opening and closing of this cover are synchronized with the phase 10 de détection.10 detection. 15. Procédé selon l'une des revendications précédentes, caractérisé en ce que le dispositif comprend en outre une pompe couplée à un débitmètre, de manière à prélever15. Method according to one of the preceding claims, characterized in that the device further comprises a pump coupled to a flow meter, so as to take 15 activement l'air de la salle, qui est projeté à la surface du support (S) et en ce que les Unités Formant Colonies par m3 d'air prélevé sont calculées, et l'aérobiocontamination mesurée.15 actively the air of the room, which is projected on the surface of the support (S) and in that the Colony-forming Units per m 3 of sampled air are calculated, and the aerobiocontamination measured.
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