FR3020485A1 - Procede, systeme et produit-programme d'ordinateur pour afficher une image d'un objet - Google Patents

Abstract

Procédé d'affichage d'une image d'un objet (205) sur un écran d'affichage (304) d'une interface-utilisateur (302), ladite interface-utilisateur (302) comprenant un moyen d'activation (306), ledit procédé comprenant les étapes suivantes : - acquisition d'au moins deux images de l'objet (205), chaque image de l'objet (205) étant associée à une position différente de l'objet (205), chaque position étant repérée dans un référentiel d'acquisition par des premières coordonnées ; mise en mémoire de chaque image acquise de l'objet (205) et des valeurs des premières coordonnées correspondantes pour constituer une liste des premières coordonnées des images acquises ; - émission d'une requête d'affichage d'une image de l'objet (205) au moyen de l'actionnement du moyen d'activation (306) dans un référentiel de restitution ; restitution d'au moins une image de l'objet (205), ladite au moins une image de l'objet (205) étant associée à des premières coordonnées de la liste des premières coordonnées sur l'écran d'affichage (304).

Description

PROCEDE, SYSTEME ET PRODUIT-PROGRAMME D'ORDINATEUR POUR AFFICHER UNE IMAGE D'UN OBJET Domaine Technique La présente invention concerne le domaine de l'analyse biologique et, plus précisément, un procédé, un système, et un produit-programme d'ordinateur pour afficher une image d'un objet tel qu'une boîte de Petri et permettre, à partir de plusieurs images de la boîte de Petri, l'identification et le dénombrement de colonies de micro-organismes cultivés au sein de la boîte de Petri. Etat de la technique Dans l'art antérieur, il est connu d'identifier et de dénombrer automatiquement des colonies de micro-organismes en utilisant des systèmes d'acquisition d'images afin d'acquérir des images numériques d'une boîte de Petri contenant des colonies de micro-organismes. Les systèmes d'acquisition d'images comprennent généralement un moyen d'acquisition d'images telle qu'une caméra numérique, des sources lumineuses émettant des rayons lumineux de longueurs d'onde différentes et, de manière optionnelle, un dispositif de rotation associé à la boîte de Petri. Un exemple de système d'acquisition d'images est décrit dans la demande de brevet EP2161341. Le système d'acquisition d'images comprend un dispositif de rotation afin que la boîte de Petri soit mise en rotation, selon plusieurs angles de rotation autour d'un axe de rotation localisé au centre de la surface de ladite boîte de Petri.

Les images ainsi obtenues de la boîte de Petri correspondent donc à des images d'une même boîte de Petri observée selon différents angles de rotation de la boîte de Petri par rapport à l'axe central de la caméra numérique et aux axes centraux des sources lumineuses. Ensuite, les images ainsi acquises peuvent être traitées ensemble au moyen d'un système de traitement d'images afin d'identifier et de dénombrer automatiquement les colonies de micro-organismes présentes au sein de la boîte de Petri. Il existe également d'autres systèmes d'acquisition d'images comprenant un ou plusieurs fonds de couleur, par exemple, un fond noir ou un fond blanc. Ainsi, lors de l'acquisition d'images d'un échantillon biologique observé, les données spécifiques présentes sur les images acquises sont spécifiques à chaque fond de couleur. Cependant, les systèmes d'acquisition d'images connus dans l'art antérieur ne permettent pas d'obtenir une représentation fidèle d'une boîte de Petri telle qu'observée par un utilisateur lors d'une manipulation classique. En effet, ladite manipulation classique consiste à observer la boîte de Petri en imposant un pivotement selon un angle d'inclinaison de la boîte de Petri par rapport au plan horizontal de la boîte de Petri et une orientation angulaire spécifique du plan de la boîte de Petri par rapport au plan d'une source lumineuse. Une telle manipulation classique permet d'obtenir des caractéristiques tridimensionnelles relatives à l'état de la surface, à la texture, à la géométrie et à l'élévation des colonies observées. Les systèmes d'acquisition d'images de l'état de l'art permettent seulement d'observer des images bidimensionnelles de la boîte de Petri. Par conséquent, les caractéristiques tridimensionnelles nécessaires à l'utilisateur pour caractériser les colonies de micro-organismes ne sont pas visibles par l'utilisateur. Les conditions d'observation de la boîte de Petri imposées par les images acquises au moyen des systèmes d'acquisition d'images connus dans l'art antérieur ne sont donc pas optimales.

De plus, les images obtenues pour chaque différente position de la boîte de Petri, au moyen des systèmes d'acquisition de l'art antérieur, doivent être combinées et analysées au moyen d'un programme informatique afin d'obtenir, à partir de l'ensemble des images, des informations pertinentes concernant les colonies de micro-organismes observées. Ainsi, l'observation directe d'une image par un utilisateur, sans analyse informatique des images, ne permet pas de caractériser les colonies de micro-organismes. Les systèmes d'acquisition d'images selon l'art antérieur sont généralement volumineux et ne peuvent donc pas être aisément intégrés à un système global d'analyse automatisé comprenant, par exemple, un système d'approvisionnement de boîtes de Petri, un incubateur et un système de convoyage de boîtes de Petri. Certains systèmes d'acquisition d'images peuvent être relativement compacts sans toutefois permettre le pivotement des boîtes de Petri. Par conséquent, les conditions d'observation des boîtes de Petri sont extrêmement limitées.

Enfin, lorsqu'un premier utilisateur procède à l'observation de la boîte de Petri en manipulant ladite boîte de Petri, un deuxième utilisateur localisé à distance du lieu d'observation de la boîte de Petri n'a pas la possibilité de reproduire la manipulation de la boîte de Petri. Le deuxième utilisateur doit se contenter d'observer les images de la manipulation, sans interaction possible avec ces images. Objet de l'invention La présente invention vise à surmonter au moins partiellement les problèmes mentionnés ci-dessus. Résumé de l'invention Ainsi, un premier objectif de l'invention consiste à fournir un procédé d'affichage d'une image d'un objet sur un écran d'affichage d'une interface-utilisateur, ladite interface-utilisateur comprenant un moyen d'activation, ledit procédé comprenant les étapes suivantes : acquisition d'au moins deux images de l'objet, chaque image de l'objet étant associée à une position différente de l'objet, chaque position étant repérée dans un référentiel d'acquisition par des premières coordonnées ; mise en mémoire de chaque image acquise de l'objet et des valeurs des premières coordonnées correspondantes pour constituer une liste des premières coordonnées des images acquises ; émission d'une requête d'affichage d'une image de l'objet au moyen de l'actionnement du moyen d'activation dans un référentiel de restitution ; restitution d'au moins une image de l'objet, ladite au moins une image de l'objet étant associée à des premières coordonnées de la liste des premières coordonnées sur l'écran d'affichage.

De préférence, l'étape de restitution comprend les étapes suivantes : détection de la position du moyen d'activation dans le référentiel de restitution pour repérer le moyen d'activation par des deuxièmes coordonnées ; comparaison des deuxièmes coordonnées avec les premières coordonnées afin de retrouver les premières coordonnées correspondant aux deuxièmes coordonnées dans la liste des premières coordonnées ; en fonction du résultat de la comparaison, affichage sur l'écran d'affichage de l'image de l'objet pour laquelle les deuxièmes coordonnées correspondent aux premières coordonnées. De préférence, l'étape d'acquisition d'une image de l'objet comprenant une étape d'illumination de l'objet et une étape de déplacement de l'objet depuis une position de repos vers une première position.

De préférence, l'émission d'une requête d'affichage comprend l'actionnement d'un moyen d'activation externe tel qu'un dispositif de pointage ou l'actionnement d'un moyen d'activation interne tel qu'un capteur d'inclinaison.

De préférence, le procédé comprend une étape de transmission des deuxièmes coordonnées à un module de traitement de données. Un deuxième objectif de l'invention consiste à fournir un système d'affichage d'une image d'un objet comprenant : un système d'acquisition d'images comprenant un dispositif de mouvement, un moyen d'illumination et un dispositif de capture d'images ; un système de restitution d'images comprenant une interface-utilisateur comportant un écran d'affichage et un moyen d'activation pour activer l'affichage de l'image de l'objet sur l'écran d'affichage ; ledit système d'acquisition d'images permettant d'obtenir une image de l'objet dans une position correspondant à des premières coordonnées et ledit système de restitution d'images permettant d'obtenir l'affichage de l'image de l'objet dans ladite position lorsque ledit moyen d'activation est dans une deuxième position telle que les deuxièmes coordonnées correspondent aux premières coordonnées. De préférence, le système d'affichage comprend un micro-processeur pour détecter la position du moyen d'activation.

Un troisième objectif de la présente invention consiste à fournir un système d'analyse comprenant au moins un incubateur et un système d'affichage d'une image d'un objet tel que décrit ci-dessus selon la présente invention.

Un quatrième objectif de la présente invention consiste à fournir un produit- programme d'ordinateur comprenant des instructions logicielles pour la mise en oeuvre d'un procédé tel que décrit ci-dessus selon la présente invention lorsque ledit programme est exécuté par un processeur de données.

Brève description des dessins L'invention, sa fonctionnalité, ses applications ainsi que ses avantages seront mieux appréhendés à la lecture de la présente description, faite en référence aux figures, dans lesquelles : la figure 1 montre, de façon schématique, un système d'analyse biologique comprenant un système d'acquisition d'images d'un objet et un système de restitution d'images de l'objet, selon un premier mode de réalisation de l'invention ; la figure 2 montre, de façon schématique, les détails d'un dispositif de mouvement du système d'acquisition d'images selon la figure 1, selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 3 montre, de façon schématique, une vue de face du dispositif de mouvement du système d'acquisition d'images selon la figure 2, en présence d'un dispositif de capture d'images et de moyens d'illumination, selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 4 montre, de façon schématique, le repère orthonormé utilisé comme repère de référence pour définir l'inclinaison de l'objet en fonction des axes horizontaux (0X1), (0X2) et de l'axe vertical (OY), selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 5 montre, de façon schématique, l'angle d'inclinaison a entre l'objet et l'axe (0X1), selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 6 montre, de façon schématique, l'angle d'inclinaison a entre l'objet et l'axe (0X2), selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 7 montre, de façon schématique, 16 différentes positions que l'objet peut occuper en fonction de son inclinaison par rapport aux axes (0X1) et (0X2), selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 8 montre, de façon schématique, un système d'acquisition d'images automatisé comportant des dispositifs additionnels et le dispositif de mouvement selon la figure 2, selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 9 montre les différentes étapes du procédé d'acquisition d'images, selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 10 montre les 16 images acquises d'une boîte de Petri, selon les 16 positions de la figure 6, selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 11 montre les différentes étapes du procédé de restitution d'images, selon un mode de réalisation de l'invention ; la figure 12 montre l'image d'une boîte de Petri affichée sur un écran d'affichage d'un ordinateur personnel, selon un mode de réalisation de l'invention ; les figures 13, 14 et 15 montrent l'image d'une boîte de Petri affichée sur un écran d'affichage d'un dispositif électronique portable tactile, selon un mode de réalisation de l'invention.30 Description détaillée de l'invention La description détaillée ci-après a pour but d'exposer l'invention de manière suffisamment claire et complète, notamment à l'aide d'exemples, mais ne doit en aucun cas être regardée comme limitant l'étendue de la protection aux modes de réalisation particuliers et aux exemples présentés ci-après. La présente invention concerne l'analyse d'un échantillon. Selon la présente invention, l'échantillon peut être de diverses origines, par exemple d'origine alimentaire, environnementale, vétérinaire, clinique, pharmaceutique ou cosmétique. D'une manière générale, le terme « échantillon » se réfère à une partie ou à une quantité, plus particulièrement une petite partie ou une petite quantité, prélevée à partir d'une ou plusieurs entités aux fins d'analyse. Cet échantillon peut éventuellement avoir subi un traitement préalable, impliquant par exemple des étapes de mélange, de dilution ou encore de broyage, en particulier si l'entité de départ est à l'état solide.

L'échantillon prélevé est, en général, susceptible de - ou suspecté de - contenir au moins un micro-organisme externe cible tel qu'une bactérie, une levure, un champignon.

Selon la présente invention, l'analyse est réalisée à l'aide d'un objet tel qu'une boîte de Petri comprenant un fond et un couvercle. Le fond comprend un milieu de culture tel qu'un milieu de culture gélosé. Le but de l'analyse est de caractériser les colonies de micro-organismes présents au sein du fluide sur le milieu de culture gélosé, après incubation de la boîte de Petri.30 La figure 1 montre, de façon schématique, un système d'analyse biologique 100 comprenant un système d'acquisition d'images 200 et un système de restitution d'images 300.

Le système d'acquisition d'images 200 comprend un dispositif de mouvement 202 montré en détail sur la figure 2. Le dispositif de mouvement 202 comprend un support interne 204 de centre 0, destiné à recevoir un objet 205 à analyser tel qu'une boîte de Petri. Ainsi, tout changement de position du support interne 204 s'applique également à l'objet 205. De préférence, le support interne 204 a une forme circulaire adaptée pour recevoir une boîte de Petri. Le support interne 204 est maintenu par un premier axe de rotation 206, tel qu'une tige et par un deuxième axe de rotation 208, tel qu'une tige. Le premier axe de rotation 206 et le deuxième axe de rotation 208 sont disposés de manière perpendiculaire, l'un par rapport à l'autre. Le point d'intersection du premier axe de rotation 206 et du deuxième axe de rotation 208 correspond au centre 0 du support interne 204. Le support interne 204 est également repéré par un axe vertical (OY), non montré sur la figure 2, et perpendiculaire au plan horizontal du support interne 204 et passant par le centre 0. Ainsi, les premier et deuxième axes de rotation 206, 208 définissent un repère orthonormé (0, X1, X2, Y) ou référentiel d'acquisition montré sur la figure 4. L'axe (0X1), axe horizontal, représente le premier axe de rotation 206 comme montré sur la figure 4. L'axe (0X2), axe horizontal, représente le deuxième axe de rotation 208 comme montré sur la figure 4. Le premier axe de rotation 206 permet une inclinaison du support interne 204, selon un angle d'inclinaison a de valeur déterminée, par rapport au plan horizontal du support interne 204, selon l'axe (0X1), comme montré sur la figure S. Le deuxième axe de rotation 208 permet une inclinaison du support interne 204, selon le même angle d'inclinaison a de valeur déterminée, par rapport au plan horizontal du support interne 204, selon l'axe (0X2), comme montré sur la figure 6.

La valeur déterminée de l'angle d'inclinaison a varie selon l'environnement dans lequel le dispositif de mouvement 202 est utilisé. Ainsi, la valeur déterminée de l'angle d'inclinaison a peut être comprise entre 00 et 900 lorsque le dispositif de mouvement 202 est utilisé au sein d'un système global d'analyse automatisé décrit ci-après et comprenant des moyens adaptés tels qu'une pince capable de maintenir l'objet 205 et d'incliner ledit objet 205. De préférence, la valeur déterminée de l'angle d'inclinaison a est comprise entre 50 et 15°. De manière alternative, la valeur déterminée de l'angle d'inclinaison a est comprise entre 00 et 30° lorsque le dispositif de mouvement 202 est utilisé de manière autonome. De préférence, la valeur déterminée de l'angle est comprise entre 5° et 15°. Le dispositif de mouvement 202 comprend également un support externe 210 entourant le support interne 204 et destiné à maintenir les premier et deuxième axes de rotation 206, 208. Le support externe 210 et le support interne 204 sont séparés par une zone vide 207, de forme circulaire. La forme de la zone vide 207 peut varier afin d'être adaptée à la forme de l'objet 205.

Un premier dispositif de couplage 212 associé au premier axe de rotation 206 est localisé à l'extérieur du support externe 210. Un premier dispositif motorisé 214 tel qu'un servomoteur est connecté au premier dispositif de couplage 212 afin de contrôler la rotation du premier axe de rotation 206.

Un deuxième dispositif de couplage 216 associé au deuxième axe de rotation 208 est localisé à l'extérieur du support externe 210. Un deuxième dispositif motorisé 218 tel qu'un servomoteur est connecté au deuxième dispositif de couplage 216 afin de contrôler la rotation du deuxième axe de rotation 208.

Des supports de stabilisation 217, 219 permettent de maintenir les extrémités des axes 206, 208 en contact avec le support externe 210.

Un premier dispositif électronique de contrôle (non montré) est connecté aux premier et deuxième dispositifs motorisés 214, 218. Le premier dispositif électronique de contrôle permet de contrôler l'activation des premier et deuxième dispositifs motorisés 214, 218 afin de permettre l'inclinaison du support interne 204 seulement et donc l'inclinaison de l'objet 205 de manière solidaire au support interne 204. Comme décrit ci-dessous, un programme informatique d'acquisition permet d'activer soit le premier dispositif motorisé 214 seul, soit le deuxième dispositif motorisé 218 seul, soit le premier et le deuxième dispositif motorisés 214, 218 de manière simultanée afin d'obtenir différentes positions inclinées du support interne 204 sur toute la circonférence dudit support interne 204. Ainsi, le support interne 204 peut subir des inclinaisons de directions différentes pour un angle d'inclinaison a de même valeur. Le nombre d'inclinaisons est un paramètre d'acquisition P qui correspond au nombre d'images à acquérir lors du procédé d'acquisition d'images. De manière générale, le paramètre d'acquisition P peut être un multiple de 4 afin d'obtenir 4 images, 8 images ou 16 images par exemple. Le paramètre d'acquisition P peut être défini avant le déclenchement du procédé d'acquisition d'images ou, de manière manuelle, par l'utilisateur lors du déroulement du procédé d'acquisition d'images. La figure 7 montre une représentation des 16 différentes positions occupées par le support interne 204 dans le repère (0, X1, X2) lorsque le nombre d'images à acquérir est égal à 16 selon une vue du dessus du dispositif de mouvement 202. L'axe (0X1) représente le premier axe de rotation 206 et l'axe (0X2) représente le deuxième axe de rotation 208. Lorsque seul le premier dispositif motorisé 214 est activé, le support interne 204 peut s'incliner par rapport au premier axe de rotation 206 pour occuper une première position extrême A et une deuxième position extrême B.

Lorsque seul le deuxième dispositif motorisé 218 est activé, le support interne 204 peut s'incliner par rapport au deuxième axe de rotation 208 pour occuper une troisième position extrême C et une quatrième position extrême D.

Lorsque le premier et le deuxième dispositif motorisés 214, 218 sont activés simultanément, le support interne 204 peut s'incliner par rapport au premier et au deuxième axes de rotation 206, 208 pour occuper des positions intermédiaires entre les positions extrêmes A, B, C, D. Le nombre de ces positions correspond au nombre N d'images déterminé lors du paramétrage du système d'acquisition d'images 200. Comme montré sur la figure 7, le support interne 204 peut occuper les positions suivantes : positions extrêmes A, B, C, D, positions intermédiaires E, F, G localisées entre les positions extrêmes A et C, positions intermédiaires H, I, J localisées entre les positions extrêmes C et B, positions intermédiaires K, L, M localisées entre les positions extrêmes B et D, positions intermédiaires N, 0, P localisées entre les positions extrêmes D et A. Toutes ces positions peuvent être référencées avec les coordonnées ci-dessous en fonction des projections de chaque position sur les axes (0X1) et (0X2) : Positions extrêmes : A (0, X2max) ; B (0, X2 mm) ; C (X1max, 0) ; D (X1min, 0).

Positions intermédiaires : E (X1E, X2E) ; F (X1F, X2F) ; G (X1G, X2G) ; H (X1H, X2H) ; I (X1I, X2I) ; J (X1J, X2J) ; K (X1K, X2K) ; L (X1L, X2L) ; M (X1M, X2M) ; N (X1N, X2N) ; 0 (X10, X20) ; P (X1P, X2P). La figure 7 montre des exemples de projection des positions A, B, C, D, E, F et G permettant d'obtenir les coordonnées correspondantes mentionnées ci-dessus. Comme montré sur la figure 1, le système d'acquisition d'images 200 comprend également un moyen d'illumination 220 tel qu'une source lumineuse, capable d'émettre des rayons lumineux selon une ou plusieurs longueurs d'onde. Le moyen d'illumination 220 peut être positionné de manière fixe ou de manière mobile en rotation autour de son axe central. Le moyen d'illumination 220 peut comprendre au minimum une source lumineuse produisant un éclairage blanc telle qu'une diode électroluminescente blanche. De manière alternative, le moyen d'illumination 220 comprend une pluralité de sources lumineuses émettant différentes longueurs d'onde. Le moyen d'illumination 220 peut être localisé de manière spécifique, au- dessus ou au-dessous du dispositif de mouvement 202 et selon un angle d'inclinaison déterminé par rapport au dispositif de mouvement 202. Un deuxième dispositif électronique de contrôle (non montré) permet de contrôler le fonctionnement et le paramétrage du moyen d'illumination 220. Selon la figure 1, le système d'acquisition d'images 200 comprend également un dispositif de capture d'images 230 telle qu'une caméra numérique. Le dispositif de capture d'images 230 peut être localisé de manière spécifique, au-dessus du dispositif de mouvement 202 et selon un angle d'inclinaison déterminé par rapport au dispositif de mouvement 202. Le dispositif de capture d'images 230 peut être positionné de manière fixe ou de manière mobile en rotation autour de son axe central. Le dispositif de capture d'images 230 peut être programmé afin de capturer un nombre N d'images.

Un troisième dispositif électronique de contrôle (non montré) permet de contrôler le fonctionnement et le paramétrage du dispositif de capture d'images 230.

La figure 3 montre une vue de face du dispositif de mouvement 202 selon la figure 2 et selon le deuxième axe de rotation 208. Selon la figure 3, deux moyens d'illumination 220 et un dispositif de capture d'images 230, comprenant un objectif 231, sont disposés au-dessus de l'objet 205 à observer. Chaque moyen d'illumination 220 est orienté de manière déterminée par rapport au dispositif de capture d'images 230 et au support interne 204. L'objectif 231 du dispositif de capture d'images 230 est disposé au-dessus du centre 0 (non montré) du support interne 204.

Selon un mode de réalisation préféré, le support interne 204 subit seulement une inclinaison selon un angle d'inclinaison déterminé et associé à différentes orientations angulaires par rapport au moyen d'illumination 220 pour ledit même angle d'inclinaison. Le dispositif de capture d'images 230 ainsi que le moyen d'illumination 220 occupent une position fixe. Selon le mode de réalisation préféré, l'encombrement de l'ensemble formé par le dispositif de capture d'images 230, le moyen d'illumination 220 et le dispositif de mouvement 202 correspond donc à un volume minimal.

Le mode de réalisation préféré représente donc une solution aisée et peu coûteuse à implémenter, tout en améliorant la qualité de l'observation d'un objet 205 par un utilisateur. Selon un mode de réalisation alternatif, le support interne 204 peut subir une inclinaison et une rotation, le dispositif de capture d'images 230 et le moyen d'illumination 220 étant dans une position fixe. Selon un mode de réalisation alternatif, le support interne 204 peut subir une inclinaison, le dispositif de capture d'images 230 étant dans une position mobile en rotation et le moyen d'illumination 220 étant dans une position fixe.

Selon un mode de réalisation alternatif, le support interne 204 peut subir une inclinaison et une rotation, le dispositif de capture d'images 230 étant mobile en rotation et le moyen d'illumination 220 étant dans une position fixe.

Selon des modes de réalisation alternatifs, le support interne 204 peut conserver une position immobile, le moyen d'illumination 220 et/ou le dispositif de capture d'images 230 étant dans une position fixe ou mobiles en rotation. Ainsi, ces modes de réalisation peuvent nécessiter, par exemple, une pluralité de moyens d'illumination 220 ainsi qu'une pluralité de dispositifs de capture d'images 230.

Le système d'acquisition d'images 200 peut opérer de manière autonome afin d'acquérir des images de l'objet 205 selon différentes positions d'inclinaison de l'objet 205 et stocker ces images au sein d'une base de données d'un dispositif électronique (non montré) pour une mise à disposition ultérieure pour un utilisateur. Dans le mode de réalisation où le système d'acquisition d'images 200 opère de manière autonome, l'approvisionnement de l'objet 205 à analyser peut être manuel ou automatisé.

Lorsque l'approvisionnement de l'objet 205 est manuel, l'utilisateur doit placer l'objet 205 sur le support interne 204. Lorsque l'approvisionnement est automatisé, des dispositifs additionnels, montrés sur la figure 8, peuvent être prévus. Ainsi, un premier dispositif additionnel 250 permet de stocker une pluralité d'objets 205 avant le système d'acquisition d'images 200. Un deuxième dispositif additionnel 251 permet de convoyer un objet 205 ainsi stocké jusqu'au système d'acquisition d'images 200 et plus spécifiquement jusque sur le support interne 204. Un troisième dispositif additionnel 252 permet de réceptionner l'objet 205 après le système d'acquisition d'images 200.

De manière alternative, le système d'acquisition d'images 200 peut opérer au sein d'un système global d'analyse automatisé (non montré) intégrant un incubateur, un moyen d'illumination et un dispositif de captures d'images tel que le système global d'analyse automatisé décrit dans la demande de brevet publiée sous le numéro EP2520923 et permettant de fournir des images d'échantillons biologiques. Le système global d'analyse automatisé comprend notamment un système d'approvisionnement de boîtes de Petri, un incubateur et un système de convoyage de boîtes de Petri. Ainsi, dans ce mode de réalisation, l'approvisionnement de l'objet 205 est automatisé et les dispositifs additionnels 250, 251, 252 décrits ci-dessus sont intégrés au système global d'analyse automatisé. Par conséquent, seul le dispositif de mouvement 202 du système d'acquisition d'images 200 est nécessaire au sein du système global d'analyse automatisé pour permettre l'acquisition d'images de l'objet 205.

Comme montré sur la figure 1, le système d'acquisition d'images 200 comprend également un dispositif électronique de contrôle global 240, tel qu'un ordinateur personnel, pour contrôler le fonctionnement du premier dispositif électronique de contrôle concernant l'activation des premier et deuxième dispositifs motorisés 214, 218 et également le fonctionnement du deuxième dispositif électronique de contrôle concernant le moyen d'illumination 220 et du troisième dispositif électronique de contrôle concernant le dispositif de capture d'images 230. Le dispositif électronique de contrôle global 240 comprend un micro-processeur 242 et un programme informatique d'acquisition 244 relatif à l'acquisition des images au moyen du système d'acquisition d'images 200. Ainsi, le micro-processeur 242 peut recevoir des instructions de lancement d'acquisition d'images et déclencher l'exécution du programme informatique d'acquisition 242. Le dispositif électronique de contrôle global 240 comprend également un composant de mémoire 246 qui peut être amovible afin de stocker, au sein d'une base de données 248, des données relatives aux images acquises lors du procédé d'acquisition d'images. La base de données 248 peut comprendre une liste d'un ou plusieurs objets 205 pour lesquels des images ont été acquises et une liste des images acquises pour lesdits objets 205. Chaque image est référencée par les coordonnées de la position correspondante de l'objet 205. La figure 9 présente les étapes d'un procédé d'acquisition de 16 images d'une boîte de Petri avec une inclinaison du support interne 204 selon un angle d'inclinaison a par rapport au plan (0X1 X2) et avec un approvisionnement de l'objet 205 effectué manuellement. Les 16 positions correspondantes de la boîte de Petri sont montrées sur la figure 7 Ainsi, dans une étape 270, l'objet 205 est disposé sur le support interne 204 par l'utilisateur. Dans une étape 272, une demande d'acquisition d'images est transmise au micro-processeur 242 afin d'exécuter le programme informatique d'acquisition 244. Dans une étape 274, le nombre d'images à acquérir est vérifié afin de fixer en conséquence le paramètre d'acquisition P, et donc le nombre d'inclinaisons du support interne 204 à réaliser. Si le nombre d'images à acquérir n'est pas indiqué, l'utilisateur doit le renseigner au moyen du dispositif électronique de contrôle global 240. Ainsi, l'utilisateur peut fixer par défaut la valeur du nombre d'images à acquérir comme étant égale à 16. Lorsque l'utilisateur souhaite augmenter la fluidité lors de l'affichage, c'est-à-dire lors de la restitution des images, la valeur par défaut peut être remplacée par une valeur spécifique supérieure à la valeur par défaut. Dans une étape 276, le dispositif électronique de contrôle global 240 règle les paramètres de fonctionnement des premier, deuxième et troisième dispositifs de contrôle afin que le dispositif d'acquisition 202, le moyen d'illumination 220 et le dispositif de capture d'images 230 soient correctement disposés les uns par rapport aux autres. Les paramètres de fonctionnement comprennent notamment l'angle d'inclinaison a du support interne 204, le type d'illumination souhaité par rapport aux sources lumineuses en présence. Dans le mode de réalisation préféré, le dispositif de capture d'images 230 et le moyen d'illumination 220 sont dans une position fixe déterminée par l'utilisateur. Pour tous les modes de réalisation, le dispositif électronique de contrôle global 240 permet d'obtenir un découpage en secteurs angulaires égaux de la circonférence de la boîte de Petri. Le nombre de secteurs angulaires correspond à la valeur du nombre d'images indiqué dans l'étape 274. Le dispositif électronique de contrôle global 240 détermine également les paramètres de fonctionnement des premier, deuxième et troisième dispositifs de contrôle afin que le nombre de positions, c'est-à-dire le nombre d'inclinaisons, du support interne 204, corresponde au nombre de positions imposé par la valeur du paramètre d'acquisition P.

Dans une étape 278, le support interne 204 est déplacé par exemple depuis une position de repos vers une première position, par rapport aux 16 positions requises selon la valeur par défaut du nombre d'images à acquérir, par exemple la position A, selon une première inclinaison.

Dans une étape 280, le dispositif de capture d'images 230 acquiert la première image de l'objet 205 dans la position A et stocke la première image dans la base de données 248. La première image est référencée par les coordonnées de la position A (0, X2max).

Dans une étape 282, la valeur du nombre N d'images acquises est comparée à la valeur du paramètre d'acquisition P. Dans la situation où la valeur du nombre N d'images acquises est inférieure à la valeur du paramètre d'acquisition P, la valeur du nombre N d'images acquises est incrémentée d'un pas égal à 1 et le procédé d'acquisition d'images se poursuit. Dans le présent mode de réalisation, la comparaison indique à l'étape 282 : 1 (valeur du nombre N d'images acquises) < 16 (valeur du paramètre d'acquisition P).

Le procédé d'acquisition se poursuit en répétant les étapes 278, 280 et 282 pour chaque nouvelle position du support interne 204, jusqu'à ce que la valeur du nombre N d'images acquises soit égale à la valeur du paramètre d'acquisition P.

Lorsque la valeur du nombre N d'images acquises n'est plus inférieure à la valeur du paramètre d'acquisition P, c'est-à-dire lorsque le nombre N d'images acquises est atteint alors N = P dans l'étape 282. Ainsi, dans une étape suivante 284, l'objet 205 peut être retiré du support interne 204 par l'utilisateur. Le procédé d'acquisition peut ainsi être répété autant de fois que nécessaire selon le nombre d'objets 205 à analyser.

Dans la situation où le système d'acquisition d'images est inclus dans un système d'analyse global automatisé, des étapes préalables à l'étape 270 peuvent être ajoutées concernant notamment la mise en place des objets 205 dans le dispositif additionnel en amont du dispositif de mouvement 202, et la détection de la fin de la mise en place des objets 205, un déclenchement automatique du procédé d'acquisition d'images et un convoyage de chaque objet 205 jusqu'au dispositif de mouvement 202. Des étapes ultérieures à l'étape 284 peuvent également être ajoutées concernant le convoyage des objets 205 depuis le dispositif de mouvement 202 jusqu'au dispositif additionnel 252.

La figure 10 montre un exemple de 16 images acquises lorsque l'objet 205 est une boîte de Petri. Chaque image correspond à une position différente de la boîte de Petri avec des positions différentes de reflets lumineux au sein de la boîte de Petri. Ainsi, l'utilisateur peut analyser, de manière optimale, le contenu de la boîte de Petri.

A la fin du procédé d'acquisition d'images, la base de données 248 comprend une liste de données relatives à chaque image acquise, c'est-à-dire à chaque position de l'objet 205. Les données correspondent aux coordonnées de l'objet 205 dans chacune de ses positions, en fonction des axes de rotation (0X1) et (0X2) et par rapport à l'axe vertical (OY).

Comme montré sur la figure 1, le système d'analyse biologique 100 comprend également un système de restitution d'images 300. Comme montré sur la figure 1, le système de restitution d'images 300 comprend une interface-utilisateur 302 telle qu'un ordinateur personnel ou un dispositif électronique portable tactile tel qu'une tablette tactile. L'interface-utilisateur 302 comprend notamment un écran d'affichage 304 afin d'afficher les images acquises au moyen du système d'acquisition d'images 200. L'interface-utilisateur 302 comprend également un micro-processeur (non montré) et un composant de mémoire (non montré). L'interface-utilisateur 302 comprend également un moyen d'activation 306 pour activer l'affichage d'images sur l'écran d'affichage 304. Dans la situation où l'interface-utilisateur 302 est un ordinateur personnel, le moyen d'activation 306 est un moyen d'activation externe tel qu'un dispositif de pointage. Le moyen d'activation externe comprend par exemple une souris d'ordinateur. Ainsi, un changement de position du moyen d'activation externe correspond à un changement de position du dispositif de pointage sur l'écran d'affichage 304. Dans la situation où l'interface-utilisateur 302 est un dispositif électronique portable tactile, le moyen d'activation 306 est un moyen d'activation interne, intégré au dispositif électronique portable tactile, tel qu'un capteur d'inclinaison. Le moyen d'activation interne comprend par exemple un gyroscope et/ou un accéléromètre. Ainsi, un changement de position du moyen d'activation interne correspond à un changement de position du dispositif électronique portable tactile. L'utilisateur procède donc à un changement de position du moyen d'activation dans un référentiel de restitution (non montré). Le système de restitution d'images 300 comprend également un module informatique de restitution 308 capable d'interagir avec l'interface-utilisateur 302.

Le module informatique de restitution 308 comprend un micro-processeur 310, un programme informatique de restitution 312 et un module de traitement de données 314. Ainsi, le micro-processeur 310 peut détecter la position du moyen d'activation 306, recevoir des instructions de lancement d'affichage d'images acquises et déclencher l'exécution du programme informatique de restitution 312. Le module informatique de restitution 308 comprend également un composant de mémoire 316. Le composant de mémoire 316 comprend une base de données 318 afin de stocker les données relatives aux images à afficher sur l'écran d'affichage 304 et une base de données 320 afin de stocker les données relatives aux coordonnées des positions détectées de l'objet 205. Le module informatique de restitution 308 peut être intégré au sein de l'interface- utilisateur 302. Comme montré sur la figure 11, le procédé de restitution d'images acquises comprend plusieurs étapes. Dans une étape 400, l'utilisateur sélectionne, par exemple, dans la liste d'objets, l'objet 205 pour lequel il souhaite visualiser, au moyen du système de restitution d'images 300, les images acquises au moyen du système d'acquisition d'images 200. L'étape 400 est réalisée en utilisant les données stockées au sein de la base de données 318 du composant de mémoire 316 du système de restitution d'images 300. Lorsque le composant de mémoire 316 est amovible, les données utilisées peuvent être les images stockées au sein de la base de données 248 du composant de mémoire 246 du système d'acquisition d'images 200. Dans une étape 402, la liste des données relatives aux différentes images acquises pour l'objet 205 sélectionné est chargée c'est-à-dire stockée au sein du composant de mémoire 316. Dans une étape 404, à partir de la liste des données, la première image acquise de l'objet 205 sélectionné est affichée par défaut sur l'écran d'affichage 304. La première image acquise est référencée par les premières données de la liste de données, c'est-à-dire les coordonnées de la position correspondante de l'objet 205. Dans une étape 406, l'utilisateur déplace le moyen d'activation 306, soit en déplaçant le dispositif de pointage sur l'écran d'affichage, soit en modifiant l'angle d'inclinaison du dispositif électronique portable par rapport à un plan horizontal de référence associé à une position initiale de repos du dispositif électronique portable. Dans une étape 408, le micro-processeur 310 détecte la position du moyen d'activation 306, c'est-à-dire les coordonnées de la position du moyen d'activation 306.

Le micro-processeur 310 transmet les coordonnées de la position au composant de mémoire 316 au sein de la base de données 320 dans une étape 410. Le module de traitement de données 314 compare alors, dans une étape 412, les coordonnées de la position détectée avec la liste des données correspondantes dans la base de données 246 comprenant des coordonnées des images acquises pour le même objet 205 sélectionné. Lorsque le module de traitement de données 314 retrouve des coordonnées d'une image acquise qui correspondent aux coordonnées de la position détectée du moyen d'activation 306, alors le module de traitement de données 314 transmet les données de l'image acquise ainsi retrouvée pour affichage sur l'écran d'affichage 304 dans une étape 414. Lorsque l'interface-utilisateur 302 est un ordinateur personnel, l'affichage des images acquises de l'objet 205 sélectionné peut également être réalisé automatiquement. Ainsi, lorsque l'interface-utilisateur 302 est un ordinateur personnel, les paramètres d'affichage comprennent une temporisation T afin d'afficher de manière automatique toutes les images acquises présentes dans la liste de données concernant l'objet 205 sélectionné. Le nombre d'images visualisées peut ainsi varier selon la fluidité d'affichage souhaitée par l'utilisateur. Le délai d'acquisition des images diminue en fonction de l'augmentation du nombre d'images à afficher. Par exemple, la temporisation T peut être comprise entre 40 millisecondes (ms) et 1 seconde (s). Ainsi, l'utilisateur peut visualiser de manière correspondante de 25 images par seconde jusqu'à 1 image par seconde. A chaque affichage d'une image acquise, un indicateur d'affichage i est incrémenté afin de comparer l'indicateur d'affichage i avec le nombre N d'images acquises à afficher pour un objet 205 sélectionné. Ainsi, tant que l'indicateur d'affichage i reste inférieur à la valeur du nombre N d'images à afficher, l'affichage d'images acquises se poursuit. Un nombre N d'images égal à 16 permet d'obtenir un rendu visuel fluide lors de l'affichage. La comparaison des coordonnées associées à une position détectée du moyen d'activation avec les coordonnées associées aux différentes positions de l'objet sélectionné comprend la prise en compte d'une marge d'erreur. Ainsi, l'affichage d'une image acquise est possible même lorsque les coordonnées de la position détectée du moyen d'activation 306 ne correspond pas exactement aux coordonnées de la position de l'objet 205 lors de l'acquisition de l'image de l'objet 205. Cette marge d'erreur peut être paramétrée au sein du système d'acquisition d'images 200 afin de définir les différentes positions de chaque objet 205. Ainsi, chaque valeur d'une coordonnée peut être comprise dans un intervalle de valeur préalablement déterminé par l'utilisateur.

La figure 12 illustre l'affichage d'une image acquise d'une boîte de Petri, sur un écran d'affichage lorsque l'interface-utilisateur 302 est un ordinateur personnel. Sur la droite de la figure 12, trois boîtes de Petri sont présentées sous forme de vignettes. Chaque vignette représente une boîte de Petri que l'utilisateur peut sélectionner. Ainsi, l'utilisateur peut choisir la boîte de Petri qu'il souhaite observer en sélectionnant une des vignettes correspondantes. La boîte de Petri représentée au centre de la figure 12 correspond à la première vignette située dans le coin supérieur droit de la figure 12. Ainsi, l'image affichée sur la figure 12 correspond à une première position de la boîte de Petri. L'utilisateur peut alors utiliser le moyen d'activation externe (non montré) afin de déplacer ledit moyen d'activation externe sur l'image acquise, sur une zone spécifique de l'écran d'affichage, afin d'obtenir un affichage ultérieur d'une image acquise de la boîte de Petri selon la direction associée à la zone spécifique sélectionnée. Les figures 13, 14 et 15 illustrent l'affichage d'une boîte de Petri dans la situation où l'interface-utilisateur 302 est un dispositif électronique portable tactile. La figure 13 montre l'affichage d'une boîte de Petri dans laquelle des colonies de microorganismes sont visibles. Comme montré sur la figure 14, grâce aux propriétés tactiles de l'écran d'affichage, l'utilisateur peut obtenir un agrandissement d'une zone particulière en effectuant un mouvement des doigts sur l'écran d'affichage, ledit mouvement étant connu dans l'art antérieur dans le domaine des dispositifs électroniques portables tactiles.

La figure 15 montre l'image d'une boîte de Petri sur l'écran d'affichage du dispositif électronique portable tactile. Sur la partie inférieure de l'image de la boîte de Petri, trois vignettes sont affichées. Chaque vignette correspond à une boîte de Petri différente à observer. L'utilisateur peut sélectionner l'une des vignettes correspondantes afin d'observer la boîte de Petri. Ainsi, il apparaît que la présente invention permet de fournir des informations tridimensionnelles équivalentes aux informations qu'un utilisateur, tel qu'un biologiste, observe directement lors de la manipulation d'un objet à observer tel qu'une boîte de Petri. La présente invention permet ainsi à chaque utilisateur, qu'il soit à distance du lieu de réalisation de la manipulation ou qu'il réalise directement la manipulation, de disposer des mêmes informations concernant un même objet à analyser. De plus, la présente invention permet d'obtenir des informations sur une colonie de micro- organismes sans nécessiter, au préalable, la combinaison informatique de plusieurs images. Contrairement aux méthodes d'analyse automatique selon l'état de l'art, la présente invention permet d'obtenir des compléments d'information concernant l'état de la surface, la texture, la géométrie, le relief et l'élévation d'une colonie de micro-organismes observée. De plus, la présente invention permet une reconstitution de l'observation de l'objet sous une forme d'animation tridimensionnelle des différentes images acquises et en conservant le référentiel visuel classique de l'utilisateur.

Par ailleurs, les images ainsi acquises peuvent être stockées et visualisées ultérieurement lors d'une étape de vérification ou de contrôle de boîtes de Petri ou encore lors de la présence de colonies de micro-organismes difficiles à identifier au cours d'une première observation d'une boîte de Petri. Enfin, les images peuvent également être acquises, visualisées et contrôlées en temps réel. La présente invention permet à un utilisateur distant, habitué à ce type d'analyse, de retrouver les sensations d'une observation manuelle sans nécessiter la manipulation manuelle effective de l'objet observé par l'utilisateur distant. Enfin, la présente invention permet une amélioration de la détection des colonies de micro-organismes localisées sur le bord d'une boîte de Petri. La présente invention permet également de faciliter l'observation des images concernant notamment le repérage de pathogènes dans des prélèvements polymicrobiens denses ou le repérage de micro-organismes sur les bords d'une boîte de Petri.

Claims (10)

1. REVENDICATIONS1. Procédé d'affichage d'une image d'un objet (205) sur un écran d'affichage (304) d'une interface-utilisateur (302), ladite interface-utilisateur (302) comprenant un moyen d'activation (306), ledit procédé comprenant les étapes suivantes : acquisition d'au moins deux images de l'objet (205), chaque image de l'objet (205) étant associée à une position différente de l'objet (205), chaque position étant repérée dans un référentiel d'acquisition par des premières coordonnées ; mise en mémoire de chaque image acquise de l'objet (205) et des valeurs des premières coordonnées correspondantes pour constituer une liste des premières coordonnées des images acquises ; émission d'une requête d'affichage d'une image de l'objet (205) au moyen de l'actionnement du moyen d'activation (306) dans un référentiel de restitution ; restitution d'au moins une image de l'objet (205), ladite au moins une image de l'objet (205) étant associée à des premières coordonnées de la liste des premières coordonnées sur l'écran d'affichage (304).
2. 2. Procédé selon la revendication 1, dans lequel l'étape de restitution comprend les étapes suivantes : détection de la position du moyen d'activation (306) dans le référentiel de restitution pour repérer le moyen d'activation (306) par des deuxièmes coordonnées ; comparaison des deuxièmes coordonnées avec les premières coordonnées afin de retrouver les premières coordonnéescorrespondant aux deuxièmes coordonnées dans la liste des premières coordonnées ; en fonction du résultat de la comparaison, affichage sur l'écran d'affichage (304) de l'image de l'objet (205) pour laquelle les deuxièmes coordonnées correspondent aux premières coordonnées.
3. 3. Procédé selon la revendication 1 ou 2, l'étape d'acquisition d'une image de l'objet (205) comprenant une étape d'illumination de l'objet (205) et une étape de déplacement de l'objet (205) depuis une position de repos vers une première position.
4. 4. Procédé d'affichage selon l'une des revendications précédentes, dans lequel l'émission d'une requête d'affichage comprend l'actionnement d'un moyen d'activation externe tel qu'un dispositif de pointage.
5. 5. Procédé d'affichage selon l'une des revendications 1 à 3, dans lequel l'émission d'une requête d'affichage comprend l'actionnement d'un moyen d'activation interne tel qu'un capteur d'inclinaison.
6. 6. Procédé d'affichage selon l'une des revendications 2 à 5 comprenant une étape de transmission des deuxièmes coordonnées à un module de traitement de données (314).
7. 7. Système d'affichage d'une image d'un objet (205), ledit système d'affichage comprenant : - un système d'acquisition d'images (200) comprenant un dispositif de mouvement (202), un moyen d'illumination (220) et un dispositif de capture d'images (230) ; - un système de restitution d'images (300) comprenant une interface- utilisateur (302) comportant un écran d'affichage (304) et un moyen d'activation (306) pour activer l'affichage de l'image de l'objet (205) sur l'écran d'affichage (304) ;ledit système d'acquisition d'images (200) permettant d'obtenir une image de l'objet (205) dans une position correspondant à des premières coordonnées et ledit système de restitution d'images (300) permettant d'obtenir l'affichage de l'image de l'objet (205) dans ladite position lorsque ledit moyen d'activation (306) est dans une deuxième position telle que les deuxièmes coordonnées correspondent aux premières coordonnées.
8. 8. Système d'affichage selon la revendication 7, comprenant un micro- processeur (310) pour détecter la position du moyen d'activation (306).
9. 9. Système d'analyse comprenant au moins un incubateur et un système d'affichage d'une image d'un objet (205) selon la revendication 7 ou 8.
10. 10. Produit-programme d'ordinateur comprenant des instructions logicielles pour la mise en oeuvre d'un procédé selon l'une des revendications 1 à 6 lorsque ledit programme est exécuté par un processeur de données.