FR2846666A1 - New insect acetylcholine esterase, useful in screening for insecticides effective against strains resistant to organophosphates and carbamates - Google Patents
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Abstract
Description
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La présente invention est relative à un nouveau gène de l'acétyl- cholinestérase responsable de la résistance aux insecticides, notamment chez les moustiques, aux produits de ce gène (ADNc, protéine) et à leurs applications, notam- ment pour le criblage de nouveaux insecticides et la détection génétique de la résis- tance aux organophosphorés et/ou aux carbamates dans les populations de moustiques. The present invention relates to a new acetylcholinesterase gene responsible for insecticide resistance, particularly in mosquitoes, to the products of this gene (cDNA, protein) and their applications, particularly for the screening of new insecticides and genetic detection of organophosphorus and / or carbamate resistance in mosquito populations.
L'acétylcholinestérase (AChE, E.C. 3. 1.1.7) est une enzyme essen- tielle qui hydrolyse l'acétylcholine dans les synapses, mettant ainsi fin aux transmis- sions cholinergiques au niveau des jonctions neuronales ou neuromusculaires. L'inhi- bition de l'AChE empêche la désactivation du signal synaptique, conduisant ainsi à une perte de contrôle de la transmission cholinergique. La biologie de l'acétyl- cholinestérase a été très étudiée chez les invertébrés, et en particulier les insectes, car cette enzyme est la cible des principales classes de pesticides utilisés, les organo- phosphorés et les carbamates. Cependant, l'utilisation massive de pesticides au cours des dernières décennies a provoqué l'émergence d'espèces résistantes. Parmi les méca- nismes de résistance, la sélection de mutations rendant l'AChE insensible aux insecticides a été observée dans de nombreux cas (Pour une revue, voir Fournier et al.,
Comp. Biochem. Physiol., 1994,108, 19-31). Acetylcholinesterase (AChE, EC 3. 1.1.7) is an essential enzyme that hydrolyzes acetylcholine in synapses, thus ending cholinergic transmissions at neuronal or neuromuscular junctions. The inhibition of AChE prevents disabling of the synaptic signal, leading to a loss of control of cholinergic transmission. The biology of acetylcholinesterase has been extensively studied in invertebrates, especially insects, because this enzyme is the target of the main classes of pesticides used, organophosphorus and carbamate. However, the massive use of pesticides in recent decades has led to the emergence of resistant species. Among the resistance mechanisms, the selection of mutations making AChE insensitive to insecticides has been observed in many cases (For a review, see Fournier et al.
Comp. Biochem. Physiol., 1994, 108, 19-31).
Afin de déterminer avec précision, la nature de l'AChE cible des insecticides, ainsi que les mutations responsables de la résistance à ces derniers, les gènes codant pour des AChE (gènes ace) ont été isolés chez différentes espèces d'arthropodes (insectes et arachnides). In order to accurately determine the nature of the target AChE insecticides, as well as the mutations responsible for their resistance, the genes encoding AChE (ace genes) have been isolated from different arthropod species (insects and arachnids).
Le premier gène ace a été identifié chez la drosophile (Drosophila melanogaster), par génétique inverse (Hall et al., EMBO J., 1986,5, 2949-2954). La preuve que ce gène était impliqué dans la résistance aux insecticides a été fournie par la mise en évidence de substitutions d'acides aminés dans l'AChE de drosophiles résistantes, conférant l'insensibilité aux insecticides cholinergiques (Mutéro et al., P. N.A.S., 1994,91, 5922-5926). Les études chez D. melanogaster semblaient donc indiquer la présence d'un seul gène ace chez les insectes, codant pour l'AChE cible des insecticides cholinergiques. The first ace gene has been identified in Drosophila (Drosophila melanogaster), by reverse genetics (Hall et al., EMBO J., 1986, 5, 2949-2954). Evidence that this gene was involved in insecticide resistance was provided by the demonstration of amino acid substitutions in AChE of resistant drosophila, conferring insensitivity to cholinergic insecticides (Mutéro et al., PNAS, 1994). , 91, 5922-5926). Therefore, studies in D. melanogaster appeared to indicate the presence of a single ace gene in insects coding for the target AChE of cholinergic insecticides.
Toutefois, à l'exception du gène ace de deux autres insectes, Musca domestica (Williamson et al., 1992, In Multidisciplinary approaches to cholinesterase functions, Eds Schafferman A. & Velan B., Plenum Press, New-York, pp 83-86 ; However, with the exception of the ace gene of two other insects, Musca domestica (Williamson et al., 1992, In Multidisciplinary Approaches to Cholinesterase Functions, Eds Schafferman A. & Velan B., Plenum Press, New York, pp. 86;
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Walsh et al., Biochem. J., 2001,359, 175-181 ; Kozaki et al., Insect. Biochem. Mol.
Biol., 2001, 31,991-997) et Bactrocera oleae (Vontas et al., Insect Molecular
Biology, 2002, 11, 329-339), l'étude des gènes ace isolés chez d'autres insectes ou bien chez des arachnides, par homologie avec celui de la drosophile, indiquent qu'ils ne sont pas impliqués dans la résistance aux insecticides. Walsh et al., Biochem. J., 2001, 359, 175-181; Kozaki et al., Insect. Biochem. Mol.
Biol., 2001, 31, 991-997) and Bactrocera oleae (Vontas et al., Insect Molecular
Biology, 2002, 11, 329-339), the study of the ace genes isolated from other insects or from arachnids, by homology with that of Drosophila, indicate that they are not involved in insecticide resistance. .
En effet, aucune mutation dans la séquence en acides aminés de l'AChE codée par le gène ace d'Aphis gossypii, de Nephotettix cincticeps et de Boophilus microplus n'est observée entre les individus résistants et sensibles (Menozzi et al., Thèse de Doctorat de l'université Paul Sabatier, Toulouse, 2000 ; et al., Insect Biochem. Mol. Biol., 200,30, 325-333 ; Baxter et al., Insect Biochem. Mol. Indeed, no mutation in the amino acid sequence of AChE encoded by the ace gene of Aphis gossypii, Nephotettix cincticeps and Boophilus microplus is observed between resistant and susceptible individuals (Menozzi et al., Thesis of PhD from Paul Sabatier University, Toulouse, 2000, et al., Insect Biochem, Mol Biol., 200,30, 325-333, Baxter et al., Insect Biochem Mol.
Biol., 1998,28, 581-589 ; Hernandez et al., J. Med. Entomol., 1999,36, 764-770), et une ségrégation indépendante est observée entre le gène ace de Culex pipiens et C. tritaeniorynchus et la résistance aux insecticides (Malcolm et al., Insect. Mol. Biol.,
1998, 7, 107-120 ; Mori et al., Insect Mol. Biol., 2001, 10, 197-203). Biol., 1998, 28, 581-589; Hernandez et al., J. Med. Entomol., 1999, 36, 764-770), and independent segregation is observed between the ace gene of Culex pipiens and C. tritaeniorychus and insecticide resistance (Malcolm et al., Insect Mol., Biol.
1998, 7, 107-120; Mori et al., Insect Mol. Biol., 2001, 10, 197-203).
En ce qui concerne les autres gènes ace isolés chez d'autres insectes, leur rôle dans la résistance aux insecticides n'a pas été étudié (Lucilia cuprina : Chen et al., Insect. Biochem. Mol. Biol., 2001,31, 805-816 ; Schizaphis graminum : Gao et al., Insect. Biochem. Mol. Biol., 2001,31, 1095-1104) ou aucune forme d'AChE insensible aux insecticides n'a été décrite (Aedes aegypti, Anopheles gambiae et Anopheles stephensi : Anthony et al., FEBS letters, 1995,368, 461-465 ; Malcolm et al., In Molecular Insect Science, Eds Hageborn et al., Plenum Press, New-York, pp 57- 65). With respect to other ace genes isolated from other insects, their role in insecticide resistance has not been studied (Lucilia cuprina: Chen et al., Insect Biochem Mol Mol Biol., 2001,31, 805-816 Schizaphis graminum: Gao et al., Insect Biochem Mol Mol Biol., 2001, 31, 1095-1104) or any form of AChE insensitive to insecticides has been described (Aedes aegypti, Anopheles gambiae and Anopheles stephensi: Anthony et al., FEBS letters, 1995, 368, 461-465, Malcolm et al., In Molecular Insect Science, Eds Hageborn et al., Plenum Press, New York, pp. 57-65).
Deux hypothèses ont été émises pour expliquer la différence dans la résistance aux insecticides, observée entre Drosophila melanogaster ou Musca domestica et les autres insectes ou les arachnides qui ont été étudiés : la présence d'un "gène modificateur" responsable de modifications post-transcriptionnelles ou posttraductionnelles de l'AChE, conduisant à des formes d'AChE possédant des activités catalytiques différentes, et la présence d'un deuxième gène ace. Two hypotheses have been put forward to explain the difference in insecticide resistance observed between Drosophila melanogaster or Musca domestica and the other insects or arachnids that have been studied: the presence of a "modifying gene" responsible for post-transcriptional modifications or posttranslational AChE, leading to AChE forms with different catalytic activities, and the presence of a second ace gene.
Toutefois, aucune étude n'a permis de vérifier ces hypothèses et par conséquent de déterminer la nature du gène et celle de la cible (AChE) impliqués dans la résistance aux insecticides chez les insectes autres que Drosophila melanogaster et Musca domestica ou bien chez les arachnides : However, no study has verified these hypotheses and therefore the nature of the gene and that of the target (AChE) involved in insecticide resistance in insects other than Drosophila melanogaster and Musca domestica or in arachnids :
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- La mise en évidence, chez C. pipiens, de deux formes d'AChE possédant des activités catalytiques distinctes supporte les deux hypothèses et l'analyse biochimique de ces AChE n'a pas permis de déterminer la nature de l'AChE impliquée dans la résistance aux insecticides (Bourguet et al., J. Neurochemistry,
1996, 67, 2115-2123). - The discovery in C. pipiens of two forms of AChE with distinct catalytic activities supports both hypotheses and the biochemical analysis of these AChE did not make it possible to determine the nature of the AChE involved in the insecticide resistance (Bourguet et al., J. Neurochemistry,
1996, 67, 2115-2123).
- Un deuxième gène ace a été isolé chez les arachnides ; toutefois ce gène n'est pas impliqué dans la résistance aux insecticides (Hernandez et al., Baxter et al., précités). A second ace gene has been isolated from arachnids; however, this gene is not involved in insecticide resistance (Hernandez et al., Baxter et al., supra).
- Un deuxième gène ace n'a pu être isolé chez les insectes malgré de nombreuses tentatives dans différentes espèces (Menozzi et al., Tomita et al., Mori et al., précités ; Severson et al., J. Hered., 1997, 88, 520-524). A second ace gene could not be isolated from insects despite numerous attempts in different species (Menozzi et al., Tomita et al., Mori et al., Cited above, Severson et al., J. Hered., 1997). , 88, 520-524).
Il ressort de ce qui précède que la nature du gène et de la cible (AChE), impliqués dans la résistance aux organophosphorés et/ou aux carbamates, n'a pas été identifiée chez la plupart des insectes et chez les arachnides, notamment chez ceux où ils ont été recherchés ; on peut citer les plus importants dans les domaines de la santé humaine ou animale et de l'agriculture comme les vecteurs de pathogènes et les nuisibles, notamment de nombreux moustiques comme Culex pipiens, Aedes aegypti, Anopheles gambiae, Anopheles albimanus, Anopheles stephensi, et des ravageurs des cultures comme Aphis gossypii, Nephotettix cincticeps et Leptinotarsa decemlineata. It follows from the foregoing that the nature of the gene and target (AChE), involved in organophosphorus and / or carbamate resistance, has not been identified in most insects and in arachnids, particularly in where they were sought; the most important in the areas of human or animal health and agriculture as vectors of pathogens and pests, including many mosquitoes such as Culex pipiens, Aedes aegypti, Anopheles gambiae, Anopheles albimanus, Anopheles stephensi, and pests of crops such as Aphis gossypii, Nephotettix cincticeps and Leptinotarsa decemlineata.
Les Inventeurs ont identifié un nouveau locus du gène ace dans le génome d'Anopheles gambiae et de 15 espèces différentes de moustiques et ils ont montré que ce nouveau locus, non-homologue au locus précédemment décrit chez D. melanogaster, était impliqué dans la résistance aux insecticides chez les moustiques. The inventors have identified a new locus of the ace gene in the genome of Anopheles gambiae and 15 different species of mosquitoes and they have shown that this new locus, non-homologous to the locus previously described in D. melanogaster, was involved in resistance. insecticides in mosquitoes.
Les Inventeurs ont également montré que la résistance aux insecticides, au moins chez les moustiques des espèces Culex pipiens et Anopheles gambiae, était liée à une unique mutation dans la séquence de l'acétylcholinestérase codée par ce nouveau gène, située au voisinage du site catalytique de l'enzyme. The inventors have also shown that the resistance to insecticides, at least in the mosquitoes Culex pipiens species and Anopheles gambiae, was linked to a single mutation in the acetylcholinesterase sequence encoded by this new gene, located in the vicinity of the catalytic site of the enzyme.
Ce nouveau gène représente un outil de diagnostic pour la détection génétique de la résistance aux insecticides (organophosphorés, carbamates) dans les populations de moustiques. L'AChE codée par ce gène représente une cible pour le This new gene represents a diagnostic tool for the genetic detection of insecticide resistance (organophosphorus, carbamate) in mosquito populations. The AChE encoded by this gene represents a target for the
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criblage de nouvelles molécules actives sur les populations de moustiques résistants aux insecticides actuellement utilisés. screening of new active molecules on insecticide resistant mosquito populations currently in use.
La présente invention a, en conséquence, pour objet une protéine, caractérisée en ce qu'elle comprend une région catalytique centrale qui présente une séquence en acides aminés sélectionnée dans le groupe constitué par la séquence SEQ ID NO: 1 et les séquences présentant au moins 60 % d'identité ou 70 % de similarité avec la séquence SEQ ID NO: 1, à l'exclusion de la séquence NCBI AAK0973 correspondant à l'acétylcholinestérase de Schizaphis graminum. The subject of the present invention is therefore a protein, characterized in that it comprises a central catalytic region which has an amino acid sequence selected from the group consisting of the sequence SEQ ID NO: 1 and the sequences having at least 60% identity or 70% similarity with the sequence SEQ ID NO: 1, excluding the sequence NCBI AAK0973 corresponding to the acetylcholinesterase of Schizaphis graminum.
La protéine selon l'invention représente une nouvelle acétylcholinestérase d'insecte, dénommée ci-après AchEl, responsable de la résistance aux organophosphorés et/ou aux carbamates, au moins chez les moustiques, notamment chez C. pipiens ; le locus codant pour ladite AchEl est dénommée ci-après ace-1 ace-2 représente le second locus ace, qui n'est pas impliqué dans la résistance aux insecticides chez les moustiques. L'unique gène ace présent dans Drosophila melanogaster, qui est homologue à ace-2, est donc également dénommé ace-2. The protein according to the invention represents a new insect acetylcholinesterase, hereinafter referred to as AchEl, responsible for resistance to organophosphorus and / or carbamates, at least in mosquitoes, in particular in C. pipiens; the locus encoding said AchE1 is hereinafter referred to as ace-1 ace-2 represents the second ace locus, which is not involved in insecticide resistance in mosquitoes. The unique ace gene present in Drosophila melanogaster, which is homologous to ace-2, is therefore also called ace-2.
Conformément à l'invention, ladite région catalytique centrale contient le domaine catalytique de l'AChE et correspond à celle située entre les positions 70 et 593 de la séquence de l'AChEl 1 d'Anophèles gambiae (SEQ ID NO: 3, 643 acides aminés) ; correspond à celle située respectivement entre les positions 100 et 629 de la séquence d'AChElde Schizaphis graminum (NCBI AAK0973), 60 et 582 de la séquence de l'AChEl de Culex pipiens (SEQ ID NO : 34 et 593 de la séquence d'AChE2 d'Anopheles gambiae (figure 1, SEQ ID NO: 53), et 41 et 601 de la séquence d'AChE2 de Drosophila melanogaster (NCBI AAF54915). Cette région centrale qui contient le domaine catalytique est conservée chez les vertébrés et les invertébrés alors que les extrémités N- et C-terminales présentent une forte variabilité entre les différentes espèces. According to the invention, said central catalytic region contains the catalytic domain of AChE and corresponds to that situated between positions 70 and 593 of the AChE1 1 sequence of Anopheles gambiae (SEQ ID NO: 3, 643 acids). amines); corresponds to that located respectively between positions 100 and 629 of the Schizaphis graminum AChEl sequence (NCBI AAK0973), 60 and 582 of the AChE1 sequence of Culex pipiens (SEQ ID NO: 34 and 593 of the sequence of AChE2 of Anopheles gambiae (Figure 1, SEQ ID NO: 53), and 41 and 601 of the AChE2 sequence of Drosophila melanogaster (NCBI AAF54915) .This central region that contains the catalytic domain is conserved in vertebrates and invertebrates whereas the N- and C-terminal ends show a high variability between the different species.
Conformément à l'invention, l'identité d'une séquence par rapport à une séquence de référence (SEQ ID NO: 1) s'apprécie en fonction du pourcentage de résidus d'acides aminés qui sont identiques, lorsque les séquences correspondant à la région catalytique telle que définie ci-dessus sont alignées, de manière à obtenir le maximum de correspondance entre elles. According to the invention, the identity of a sequence with respect to a reference sequence (SEQ ID NO: 1) is assessed according to the percentage of amino acid residues which are identical, when the sequences corresponding to the catalytic region as defined above are aligned, so as to obtain the maximum of correspondence between them.
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Une protéine ayant une séquence en acides aminés ayant au moins X % d'identité avec la séquence de référence SEQ ID NO: 1 est définie, dans la présente invention comme une protéine dont la séquence correspondant à la région catalytique centrale telle que définie ci-dessus peut inclure jusqu'à 100-X altérations pour 100 acides aminés de la séquence SEQ ID NO: 1. Au sens de la présente invention, le terme altération inclut les délétions, les substitutions ou les insertions consécutives ou dispersées d'acides aminés dans la séquence de référence. Cette définition s'applique, par analogie, aux molécules d'acide nucléique. A protein having an amino acid sequence having at least X% identity with the reference sequence SEQ ID NO: 1 is defined in the present invention as a protein whose sequence corresponds to the central catalytic region as defined above. above may include up to 100-X alterations per 100 amino acids of the sequence SEQ ID NO: 1. For the purposes of the present invention, the term alteration includes consecutive or dispersed deletions, substitutions or insertions of amino acids in the reference sequence. This definition applies, by analogy, to nucleic acid molecules.
La similarité d'une séquence par rapport à la séquence de référence SEQ ID NO 1 s'apprécie en fonction du pourcentage de résidus d'acides aminés qui sont identiques ou qui différent par des substitutions conservatives, lorsque les séquences correspondant à la région catalytique centrale telle que définie ci-dessus sont alignées de manière à obtenir le maximum de correspondance entre elles. Au sens de la présente invention, on entend par substitution conservative, la substitution d'un acide aminé par un autre qui présente des propriétés chimiques similaires (taille, charge ou polarité), qui généralement ne modifie pas les propriétés fonctionnelles de la protéine. The similarity of a sequence with respect to the reference sequence SEQ ID NO 1 is judged according to the percentage of amino acid residues which are identical or different by conservative substitutions, when the sequences corresponding to the central catalytic region. as defined above are aligned so as to obtain the maximum of correspondence between them. For the purposes of the present invention, the term "conservative substitution" means the substitution of one amino acid by another which has similar chemical properties (size, charge or polarity), which generally does not modify the functional properties of the protein.
Une protéine ayant une séquence en acides aminés ayant au moins X % de similarité avec la séquence SEQ ID NO: 1 est définie, dans la présente invention comme une protéine dont la séquence correspondant à la région catalytique centrale telle que définie ci-dessus peut inclure jusqu'à 100-X altérations non-conservatives pour 100 acides aminés de la séquence de référence. Au sens de la présente invention, le terme altérations non-conservatives inclut les délétions, les substitutions non-conservatives ou les insertions consécutives ou dispersées d'acides aminés dans la séquence SEQ ID NO: 1. A protein having an amino acid sequence with at least X% similarity to the sequence SEQ ID NO: 1 is defined in the present invention as a protein whose sequence corresponding to the central catalytic region as defined above may include up to 100-X non-conservative alterations per 100 amino acids of the reference sequence. For the purposes of the present invention, the term non-conservative alterations includes deletions, non-conservative substitutions or consecutive or dispersed insertions of amino acids in the sequence SEQ ID NO: 1.
La comparaison de l'AChEl selon l'invention avec les AChE d'insecte disponibles sur les bases de données, par alignement des séquences correspondant à la région centrale telle que définie ci-dessus, à l'aide du logiciel BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/b12.html, paramètres par défaut, filtre inactivé) montre que : - les séquences d'AChEl et d'AChE2 d'insecte présentent 36-39% d'identité (53-57% similarité) entre elles. The comparison of the AChE1 according to the invention with the AChE of insect available on the databases, by alignment of the sequences corresponding to the central region as defined above, using the BLAST software (http: / /www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/b12.html, default settings, inactive filter) shows that: - AChEl and AChE2 insect sequences have 36-39% identity (53 -57% similarity) between them.
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- les séquences d'AChEl d'insecte présentent 65-97% d'identité (79-
98% similarité) entre elles, - les séquences d'AChE2 d'insecte présentent 58-99% d'identité (73-
99% similarité) entre elles,
En outre, l'analyse phylogénétique des AChE des différentes espèces animales montre que les séquences protéiques d'AChEl forment un groupe autonome significatif (bootstrap 795/1000), et que les AChEl d'insecte forment un sous-groupe distinct significatif (bootstrap 856/1000). - AChEl insect sequences have 65-97% identity (79-
98% similarity) between them, - the AChE2 insect sequences have 58-99% identity (73-
99% similarity) to each other,
In addition, phylogenetic analysis of AChE of different animal species shows that AChE1 protein sequences form a significant autonomous group (bootstrap 795/1000), and that insect AChE1 form a distinct distinct subgroup (bootstrap 856). / 1000).
L'AChEl selon l'invention comprend des motifs caractéristiques des AChE (figure 1) situés aux positions suivantes, respectivement dans la séquence SEQ ID NO: 3 et dans la séquence de référence de Torpédo californica (SWISSPROT P04058) : un motif canonique du type FGESAG autour de la sérine en position 266 (200), qui est caractéristique du site actif des AchE, un site de liaison à la choline (résidu Tryptophane en position 151 (84)), trois résidus de la triade catalytique (résidus sérine, acide glutamique et histidine, respectivement en positions 266 (200), 392 (327) et 506 (440 , six résidus cystéine potentiellement impliqués dans des ponts disulfures conservés (C134(67)-C161(94); C320(254)-C333(265), C468(402)-C589(521)), des résidus aromatiques bordant la gorge du site actif (10 résidus) et un résidu phénylalanine en position 355 (290) mais pas en position 353 (288), qui distingue les AChE d'invertébrés de celles de vertébrés. Elle possède également un peptide C-terminal hydrophobe correspondant à un signal d'addition d'un glycolipide, indiquant le clivage posttraductionnel d'un fragment C-terminal et l'addition d'une résidu d'ancrage glycolipidique comme chez Drosophila ; le résidu cystéine dans la séquence C-terminale précédant le site potentiel de clivage du peptide hydrophobe pourrait être impliqué dans une liaison disulfure intermoléculaire, liant les deux sous-unités catalytiques du dimère d'AChE. The AChE1 according to the invention comprises characteristic patterns of AChE (FIG. 1) located at the following positions, respectively in the sequence SEQ ID NO: 3 and in the Torpedo californica reference sequence (SWISSPROT P04058): a canonical pattern of the type FGESAG around the serine at position 266 (200), which is characteristic of the active site of AchE, a choline binding site (tryptophan residue at position 151 (84)), three residues of the catalytic triad (serine, acid residues glutamic and histidine at positions 266 (200), 392 (327) and 506 (440, respectively, six cysteine residues potentially involved in conserved disulfide bridges (C134 (67) -C161 (94); C320 (254) -C333 (265); ), C468 (402) -C589 (521)), aromatic residues bordering the throat of the active site (10 residues) and a phenylalanine residue at position 355 (290) but not at position 353 (288), which distinguishes AChE from invertebrates from those of vertebrates.It also has a pep hydrophobic C-terminal tide corresponding to a glycolipid addition signal, indicating the posttranslational cleavage of a C-terminal fragment and the addition of a glycolipidic anchoring residue as in Drosophila; the cysteine residue in the C-terminal sequence preceding the potential cleavage site of the hydrophobic peptide could be involved in an intermolecular disulfide bond, linking the two catalytic subunits of the AChE dimer.
L'AChEl selon l'invention se distingue de l'AChE de Drosophila (AChE2) par l'absence d'une insertion hydrophile de 31acides aminés entre les résidus situés aux positions 174 et 175 de la séquence SEQ ID NO: 3 (figure 1) ; cette insertion hydrophile pourrait être caractéristique de l'AChE2, au moins chez les diptères. The AChE1 according to the invention is distinguished from the AChE of Drosophila (AChE2) by the absence of a hydrophilic insertion of 31 amino acids between the residues located at positions 174 and 175 of the sequence SEQ ID NO: 3 (FIG. ); this hydrophilic insertion could be characteristic of AChE2, at least in Diptera.
L'invention englobe les AChEl d'insecte sensibles ou résistantes aux organophosphorés et/ou aux carbamates. The invention encompasses AChEl of insect susceptible or resistant to organophosphorus and / or carbamate.
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Au sens de la présente invention on entend par "AChE sensible", une AChE dont l'activité acétylcholinestérase est inhibée en présence d'organophosphorés ou de carbamates. For the purposes of the present invention, the term "sensitive AChE" means an AChE whose acetylcholinesterase activity is inhibited in the presence of organophosphorus compounds or carbamates.
Au sens de la présente invention on entend par "AChE résistante", une AChE dont l'activité n'est pas inhibée par des concentrations en organophosphorés ou en carbamates qui inhibent 100 % de l'activité de "l'AChE sensible" correspondante issue d'un individu de la même espèce ; cette "AChE résistante" diffère de la précédente par la présence d'une ou plusieurs mutations dans sa séquence en acides aminés (substitutions d'acides aminés) qui modifient sa sensibilité aux inhibiteurs de l'acétylcholinestérase ; parmi ces mutations on peut citer les suivantes F78S, I129V, G227A, F288Y, les acides aminés étant numérotés en référence à la séquence de l'AChE de Torpédo californica (SWISSPROT P04058). For the purposes of the present invention, the term "resistant AChE" is understood to mean an AChE whose activity is not inhibited by concentrations of organophosphorus compounds or carbamates which inhibit 100% of the corresponding "sensitive AChE" activity resulting from an individual of the same species; this "resistant AChE" differs from the previous one by the presence of one or more mutations in its amino acid sequence (amino acid substitutions) which modify its sensitivity to acetylcholinesterase inhibitors; among these mutations, the following may be mentioned: F78S, I129V, G227A, F288Y, the amino acids being numbered with reference to the AChE sequence of Torpedo californica (SWISSPROT P04058).
L'activité acétylcholinestérase et les paramètres catalytiques des AChE sont mesurés par les techniques enzymatique classiques telles que celles décrites dans Bourguet et al., précité. Acetylcholinesterase activity and catalytic parameters of AChE are measured by conventional enzymatic techniques such as those described in Bourguet et al., Supra.
Les protéines selon l'invention incluent toute protéine naturelle, synthétique, semi-synthétique ou recombinante de n'importe quel organisme procaryote ou eucaryote, comprenant ou consistant en une séquence d'acides aminés d'une protéine AChEl telle que définie ci-dessus. Elles incluent notamment les protéines naturelles isolées chez n'importe quelle espèce d'insecte, ainsi que les protéines recombinantes produites dans un système d'expression approprié. The proteins according to the invention include any natural, synthetic, semi-synthetic or recombinant protein of any prokaryotic or eukaryotic organism, comprising or consisting of an amino acid sequence of an AChE1 protein as defined above. These include natural proteins isolated from any insect species, as well as recombinant proteins produced in an appropriate expression system.
Selon un mode de réalisation avantageux de ladite AChEl, elle correspond à celle d'un insecte qui appartient à l'ordre des diptères (Diptera) ; de manière préférée, ledit insecte est choisi dans la famille des Culicidae, parmi les genres Culex, Aedes et Anopheles. According to an advantageous embodiment of said AChEl, it corresponds to that of an insect belonging to the order Diptera (Diptera); preferably, said insect is selected from the family Culicidae, from the genera Culex, Aedes and Anopheles.
Selon une disposition avantageuse de ce mode de réalisation, ladite AChEl est constituée par les séquences SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5 et SEQ ID NO: 126 d'Anopheles gambiae et la séquence SEQ ID NO : de Culex pipiens (souche S- LAB), sensibles aux organophosphorés et/ou aux carbamates. According to an advantageous arrangement of this embodiment, said AChE1 consists of the sequences SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 126 of Anopheles gambiae and the sequence SEQ ID NO: of Culex pipiens (strain S-LAB), sensitive to organophosphorus and / or carbamates.
Selon une autre disposition avantageuse de ce mode de réalisation, ladite région centrale catalytique de l'AChE comprend une séquence sélectionnée dans le groupe constitué par les séquences SEQ ID NO: 8 à 21 représentant un frag- According to another advantageous arrangement of this embodiment, said catalytic central region of the AChE comprises a sequence selected from the group consisting of the sequences SEQ ID NO: 8 to 21 representing a fragment
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ment d'environ 91 acides aminés (fragment K, figure 1), correspondant à celui situé entre les positions 445 et 535 de la séquence SEQ ID NO: 3. approximately 91 amino acids (K fragment, Figure 1), corresponding to that between positions 445 and 535 of the sequence SEQ ID NO: 3.
Selon un autre mode de réalisation avantageux de l'invention, ladite AChEl est une acétylcholinestérase résistante aux insecticides de la classe des organophosphorés et des carbamates incluant une mutation de la glycine située en position 119, en sérine (mutation Gl 19S) ; ladite position étant indiquée en référence à la séquence de l'AChE de Torpedo californica (SWISSPROT P04058). According to another advantageous embodiment of the invention, said AChE1 is an acetylcholinesterase resistant to insecticides of the class of organophosphorus and carbamates including a mutation of glycine located at position 119, in serine (mutation Gl19S); said position being indicated with reference to the AChE sequence of Torpedo californica (SWISSPROT P04058).
En effet, les Inventeurs ont montré que le résidu en position 119 est proche des résidus du site catalytique (sérine 200 et histidine 440) et que le remplacement de la glycine de l'AChEl des moustiques sensibles par une sérine, dans l'AChEI des moustiques résistants, réduit l'espace du site catalytique et empêche l'insecticide d'interagir avec la sérine catalytique (S200), du fait de l'encombrement stérique des liaisons de Van der Waals de la chaîne latérale de la sérine en position 119. Le rôle de la mutation G119S dans la résistance aux insecticides a été confirmé par l'analyse de l'activité acétylcholinestérase des protéines AChElrecombinantes produites à partir de l'ADNc de Culex pipiens sensibles (souche S-LAB possédant une AChEl incluant une glycine en position 119) ou résistants (souche SR dont l'AchEl diffère de la précédente uniquement par la présence d'une sérine en position 119) aux insecticides ; 90 % de l'activité de l'AChEl de la souche sensible est inhibée en présence de 10-3 M de propoxur alors que l'AChEl de la souche résistante conserve 75 % de son activité en présence de concentrations 100 fois plus élevées de cet insecticide (10-1 M de propoxur). In fact, the inventors have shown that the residue at position 119 is close to the residues of the catalytic site (serine 200 and histidine 440) and that the AChE1 glycine replacement of sensitive mosquitos by a serine, in the AChEI of the resistant mosquitoes, reduces the space of the catalytic site and prevents the insecticide from interacting with the catalytic serine (S200), because of the steric hindrance of Van der Waals bonds of the serine side chain at position 119. The role of the G119S mutation in insecticide resistance was confirmed by analysis of acetylcholinesterase activity of recombinant AChEl proteins produced from sensitive Culex pipiens cDNA (S-LAB strain possessing AChE1 including glycine in position 119) or resistant (strain SR whose AchE1 differs from the previous one only by the presence of a serine in position 119) to insecticides; 90% of the AChE1 activity of the susceptible strain is inhibited in the presence of 10-3 M propoxur whereas the AChE1 of the resistant strain retains 75% of its activity in the presence of 100 times higher concentrations of this protein. insecticide (10-1 M propoxur).
Selon une disposition avantageuse de ce mode de réalisation de ladite AChEl résistante, elle correspond à celle d'un insecte (résistant aux insecticides) qui appartient à l'ordre des diptères (Diptera) ; de manière préférée, ledit insecte est choisi dans la famille des Culicidae, parmi les genres Culex, Aedes et Anopheles. According to an advantageous arrangement of this embodiment of said AChEl resistant, it corresponds to that of an insect (insecticide resistant) which belongs to the order Diptera (Diptera); preferably, said insect is selected from the family Culicidae, from the genera Culex, Aedes and Anopheles.
De préférence, ladite AChEl résistante présente une séquence sélectionnée dans le groupe constitué par : - la séquence SEQ ID NO: 57, correspondant à la séquence complète de la souche SR de C. pipiens, résistante aux insecticides, Preferably, said resistant AChE1 has a sequence selected from the group consisting of: the sequence SEQ ID NO: 57, corresponding to the complete sequence of the C. pipiens strain SR, resistant to insecticides,
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- la séquence SEQ ID NO: 122, correspondant à la séquence complète de l'AChEl de la souche YAO d'An, gambiae (isolée en Côte d'ivoire), résistante aux insecticides, et - les séquences comprenant un fragment de séquence SEQ ID NO: 90,93, 94,95, 97 à 101,103 et 106 représentant un fragment peptidique d'environ 150 acides aminés codé par le troisième exon codant du gène ace-1 d'un insecte résistant tel que défini ci-dessus, contenant la mutation Gl 19S. the sequence SEQ ID NO: 122, corresponding to the complete AChE1 sequence of the YAO strain of An, gambiae (isolated in Ivory Coast), resistant to insecticides, and the sequences comprising a sequence fragment SEQ ID NO: 90.93, 94.95, 97-101,103 and 106 showing a peptide fragment of about 150 amino acids encoded by the third exon encoding the ace-1 gene of a resistant insect as defined above, containing the mutation Gl 19S.
Selon encore un autre mode de réalisation avantageux de l'invention, ladite AChEl est une acétylcholinestérase sensible aux insecticides de la classe des organophosphorés et des carbamates comprenant une séquence sélectionnée dans le groupe constitué par les SEQ ID NO: 91,92, 96,102 à 112,114, 115 et 117 à 119, représentant un fragment d'environ 150 acides aminés du troisième exon codant du gène ace-1 issu d'un insecte tel que défini ci-dessus, sensible aux insecticides, ledit fragment incluant une glycine en position 119 en référence à la séquence de l'AChE de Torpedo californica (SWISSPROT P04058). According to yet another advantageous embodiment of the invention, said AChE1 is an acetylcholinesterase sensitive to insecticides of the class of organophosphorus and carbamates comprising a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 91,92, 96,102 to 112,114 , 115 and 117 to 119, representing a fragment of about 150 amino acids of the third exon encoding the ace-1 gene from an insect as defined above, sensitive to insecticides, said fragment including a glycine at position 119 in reference to the AChE sequence of Torpedo californica (SWISSPROT P04058).
La présente invention a également pour objet un peptide, caractérisé en ce qu'il est constitué par un fragment d'au moins 7 acides aminés de la protéine AChEl, telle que définie ci-dessus ; ces fragments sont particulièrement utiles pour la production d'anticorps reconnaissant spécifiquement la protéine AChEl. The subject of the present invention is also a peptide, characterized in that it consists of a fragment of at least 7 amino acids of the AChE1 protein, as defined above; these fragments are particularly useful for the production of antibodies specifically recognizing the AChE1 protein.
La présente invention a également pour objet des anticorps, caractérisés en ce qu'ils sont dirigés contre la protéine AChEl ou un fragment de celle-ci, tels que définis ci-dessus. The present invention also relates to antibodies, characterized in that they are directed against the AChE1 protein or a fragment thereof, as defined above.
Conformément à l'invention, lesdits anticorps sont soit des anticorps monoclonaux, soit des anticorps polyclonaux. According to the invention, said antibodies are either monoclonal antibodies or polyclonal antibodies.
Ces anticorps peuvent être obtenus par les méthodes classiques, connues en elles-mêmes, comprenant notamment l'immunisation d'un animal avec une protéine ou un peptide conforme à l'invention, afin de lui faire produire des anticorps dirigés contre ladite protéine ou ledit peptide. These antibodies can be obtained by conventional methods, known per se, including in particular the immunization of an animal with a protein or a peptide according to the invention, in order to make it produce antibodies directed against said protein or said peptide.
La présente invention a également pour objet une molécule d'acide nucléique isolée, caractérisée en ce qu'elle présente une séquence sélectionnée dans le groupe constitué par : The subject of the present invention is also an isolated nucleic acid molecule, characterized in that it has a sequence selected from the group consisting of:
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- les séquences codant pour une protéine AChEl telle que définie cidessus (ADNc et fragment d'ADN génomique correspondants au gène ace-1), et - les séquences complémentaires des précédentes, sens ou anti-sens. the sequences coding for an AChE1 protein as defined above (cDNA and genomic DNA fragment corresponding to the ace-1 gene), and the complementary sequences of the previous ones, meaning or antisense.
- les fragments d'au moins 8 pb, de préférence de 15 pb à 500 pb des séquences précédentes. fragments at least 8 bp, preferably 15 bp to 500 bp from the preceding sequences.
L'invention englobe, les séquences des allèles du gène ace-1 issues de n'importe quel insecte, ainsi que les séquences des mutants naturels (allèles sensibles et résistants) ou artificiels du gène ace-1 codant pour une protéine AChEl sensible ou résistante, telle que définie ci-dessus. The invention encompasses the sequences of alleles of the ace-1 gene derived from any insect, as well as the sequences of the natural mutants (sensitive and resistant alleles) or artificial mutants of the ace-1 gene coding for a sensitive or resistant AChE1 protein. as defined above.
Selon un mode de réalisation avantageux de l'invention, ladite séquence codant pour une protéine AChEl est sélectionnée dans le groupe constitué par : a) les séquences SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO : 4, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 56 et SEQ ID NO: 121 qui correspondent à l'ADNc de la protéine AChEl de séquence en acides aminés, respectivement SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 57 et SEQ ID NO: 122, telles que définie ci-dessus, b) les séquences SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23 et SEQ ID NO: 127 qui correspondent au gène ace-1 d'Anopheles gambiae codant les AChEl telles que définies ci-dessus, lequel gène présente une organisation exon-intron comprenant au moins 9 exons (Tableau I), et c) les séquences comprenant la séquence SEQ ID NO: 120 qui correspond à la séquence quasi-complète du gène ace-1 d'Anophèles gambiae codant l'AChEl résistante de séquence SEQ ID NO: 122, telle que définie ci-dessus. According to an advantageous embodiment of the invention, said sequence coding for an AChE1 protein is selected from the group consisting of: a) the sequences SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 56 and SEQ ID NO: 121 which correspond to the cDNA of the AChE1 protein of sequence in amino acids, respectively SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 57 and SEQ ID NO: 122, as defined above, b) the sequences SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23 and SEQ ID NO: 127 which correspond to the gene Anopheles gambiae ace-1 encoding the AChE1 as defined above, which gene has an exon-intron organization comprising at least 9 exons (Table I), and c) the sequences comprising the sequence SEQ ID NO: 120 which corresponds to the almost complete sequence of the anopheles gambiae ace-1 gene coding for the resistant AChE1 of sequence SEQ ID NO: 122, as defined above.
Tableau 1 : Organisation Intron-Exon du gène ace-1
Table 1: Intron-Exon Organization of the ace-1 Gene
<tb>
<tb> Site <SEP> 5'~~~~~~~~~~~Site <SEP> 3'
<tb> Position <SEP> Séquence <SEP> Position <SEP> Séquence
<tb> Intron <SEP> 1 <SEP> 301 <SEP> AGCAA/gtaat <SEP> 1255 <SEP> cgcag/CCATT <SEP>
<tb> Intron2 <SEP> 1413 <SEP> CAATG/gtgag <SEP> 5338 <SEP> tgtag/CGCTC <SEP>
<tb> Intron3 <SEP> 5696 <SEP> CGCAG/gtcgg <SEP> 7634 <SEP> ttcag/ACGCA <SEP>
<tb> Intron4 <SEP> 7769 <SEP> CTCGG/gtaag <SEP> 7855 <SEP> ggcag/ACGCG <SEP>
<tb> Intron5 <SEP> 8393 <SEP> CTACG/gtagg <SEP> 8472 <SEP> gtcag/CTGGG <SEP>
<tb> Intron6 <SEP> 8670 <SEP> CTAAG/gtacg <SEP> 8756 <SEP> tccag/AGCAC <SEP>
<tb> Intron7 <SEP> 9464 <SEP> ACCGG/gtaag <SEP> 9530 <SEP> tacag/CAATC <SEP>
<tb> Intron8 <SEP> 9703 <SEP> TACCT/gtaag <SEP> 9810 <SEP> aacag/CGAAC
<tb> <Tb>
<tb> Site <SEP> 5 '~~~~~~~~~~~ Site <SEP>3'
<tb> Position <SEP> Sequence <SEP> Position <SEP> Sequence
<tb> Intron <SEP> 1 <SEP> 301 <SEP> AGCAA / gtaat <SEP> 1255 <SEP> cgcag / CCATT <SEP>
<tb> Intron2 <SEP> 1413 <SEP> CAATG / gtgag <SEP> 5338 <SEP> tgtag / CGCTC <SEP>
<tb> Intron3 <SEP> 5696 <SEP> CGCAG / gtcgg <SEP> 7634 <SEP> ttcag / ACGCA <SEP>
<tb> Intron4 <SEP> 7769 <SEP> CTCGG / gtaag <SEP> 7855 <SEP> ggcag / ACGCG <SEP>
<tb> Intron5 <SEP> 8393 <SEP> CTACG / gtagg <SEP> 8472 <SEP> gtcag / CTGGG <SEP>
<tb> Intron6 <SEP> 8670 <SEP> CTAAG / gtacg <SEP> 8756 <SEP> tccag / AGCAC <SEP>
<tb> Intron7 <SEP> 9464 <SEP> ACCGG / gtaag <SEP> 9530 <SEP> tacag / CAATC <SEP>
<tb> Intron8 <SEP> 9703 <SEP> TACCT / gtaag <SEP> 9810 <SEP> aacag / CGAAC
<Tb>
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Conformément à la présente invention, le troisième exon codant du gène ace-1 correspond à celui qui est situé entre l'intron 4 et l'intron 5 dans la séquence d'An. gambiae (Tableau I) , c'est à dire entre les positions 7854 et 8393 de la séquence SEQ ID NO: 127. In accordance with the present invention, the third exon coding of the ace-1 gene corresponds to that which is located between intron 4 and intron 5 in the sequence of An. gambiae (Table I), that is to say between positions 7854 and 8393 of the sequence SEQ ID NO: 127.
Selon un autre mode de réalisation avantageux de l'invention, ledit fragment est sélectionné dans le groupe constitué par les amorces de séquence SEQ ID NO: 39 à 50,54, 55,58, 59,123, 124 et les fragments de séquences SEQ ID NO: 24 à 38 et 60 à 89. According to another advantageous embodiment of the invention, said fragment is selected from the group consisting of the primers of sequence SEQ ID NO: 39 to 50,54, 55,58, 59,123, 124 and the fragments of sequences SEQ ID NO : 24 to 38 and 60 to 89.
Les molécules d'acide nucléique selon l'invention sont obtenues par les méthodes classiques, connues en elles-mêmes, en suivant les protocoles standards tels que ceux décrits dans Current Protocols in Molecular Biology (Frederick M. The nucleic acid molecules according to the invention are obtained by conventional methods, known in themselves, following the standard protocols such as those described in Current Protocols in Molecular Biology (Frederick M.
AUSUBEL,2000, Wiley and son Inc, Library of Congress, USA). Par exemple, elles peuvent être obtenues par amplification d'une séquence nucléique par PCR ou RTPCR, par criblage de banques d'ADN génomique par hybridation avec une sonde homologue, ou bien par synthèse chimique totale ou partielle. AUSUBEL, 2000, Wiley and his Inc, Library of Congress, USA). For example, they can be obtained by amplification of a nucleic sequence by PCR or RTPCR, by screening of genomic DNA libraries by hybridization with a homologous probe, or by total or partial chemical synthesis.
Les molécules d'acides nucléiques telles que définies ci-dessus peuvent être utilisées comme sondes ou comme amorces pour isoler le gène ace-1 d'autres espèces ou des allèles de ce gène, notamment par criblage d'une banque d'ADN génomique ou d'ADNc, ainsi que pour détecter/amplifier des molécules d'acide nucléique (ARNm ou ADN génomique) codant une protéine AChEl telle que définie ci-dessus. The nucleic acid molecules as defined above can be used as probes or as primers to isolate the ace-1 gene from other species or alleles of this gene, in particular by screening a genomic DNA library or cDNA, as well as for detecting / amplifying nucleic acid molecules (mRNA or genomic DNA) encoding an AChE1 protein as defined above.
Ces différentes molécules d'acides nucléiques permettent de mettre en évidence le gène ace-l, des variants alléliques de ce gène, une altération fonctionnelle de ce gène ace-1 (changement substantiel de la sensibilité aux insecticides) résultant d'une mutation (insertion, délétion ou substitution) d'un ou plusieurs nucléotides au niveau dudit gène. These different nucleic acid molecules make it possible to highlight the ace-1 gene, allelic variants of this gene, a functional alteration of this ace-1 gene (substantial change in sensitivity to insecticides) resulting from a mutation (insertion deletion or substitution) of one or more nucleotides at said gene.
La présente invention a également pour objet une méthode de détection d'insectes porteurs d'une résistance aux insecticides de la classe des organophosphorés et des carbamates, caractérisée en ce qu'elle comprend : - la préparation d'un échantillon d'acides nucléiques à partir d'insectes à tester, et The subject of the present invention is also a method for detecting insects carrying resistance to insecticides of the class of organophosphorus compounds and carbamates, characterized in that it comprises: the preparation of a sample of nucleic acids to from insects to test, and
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- la détection par tout moyen approprié de la présence, dans ledit échantillon d'acides nucléiques, d'une mutation dans le gène ace-1 tel que défini cidessus. detection by any appropriate means of the presence, in said nucleic acid sample, of a mutation in the ace-1 gene as defined above.
Ladite détection est réalisée par les techniques classiques qui sont connues en elles mêmes, par exemple : (i) par amplification d'une région dudit gène ace-1 susceptible de contenir une mutation, puis détection de ladite mutation par séquençage ou par digestion par une enzyme de restriction appropriée, du produit de PCR obtenu, ou bien (ii) par hybridation avec une sonde marquée spécifique d'une région dudit gène ace-1 susceptible de contenir une mutation, puis détection directe des mésappariements et/ou digestion par une enzyme de restriction appropriée. Said detection is carried out by the conventional techniques which are known per se, for example: (i) by amplification of a region of said ace-1 gene capable of containing a mutation, then detection of said mutation by sequencing or by digestion with a appropriate restriction enzyme, the PCR product obtained, or (ii) by hybridization with a labeled probe specific for a region of said ace-1 gene likely to contain a mutation, then direct detection of mismatches and / or digestion with an enzyme appropriate restriction.
Selon un premier mode de mise en #uvre avantageux dudit procédé, un fragment d'environ 320 pb (fragment K) est amplifié à l'aide des amorces SEQ ID NO: 39 et SEQ ID NO: 40. Par exemple, chez les moustiques on obtient un fragment de séquence SEQ ID NO: 24 à 38 qui présente des mutations entre les moustiques sensibles et résistants aux insecticides. Par exemple, chez C. pipiens on observe 3 substitutions dans la séquence des individus résistants dont l'une introduit un site EcoRI. L'analyse du profil de restriction après amplification PCR du fragment K et digestion des produits obtenus par EcoRI (analyse RFLP), permet de détecter rapidement le génotype ace-1 dans une population de C. pipiens ; la présence d'un seul fragment correspond aux homozygotes résistants (RR), la présence de 2 fragments d'environ 106 pb et 214 pb correspond aux individus homozygotes sensibles (SS) et la présence de 3 fragments de 106 pb, 214 pb et 320 pb correspond aux individus hétérozygotes résistants (RS). According to a first advantageous embodiment of said method, a fragment of approximately 320 bp (fragment K) is amplified using the primers SEQ ID NO: 39 and SEQ ID NO: 40. For example, in mosquitoes a fragment of sequence SEQ ID NO: 24 to 38 is obtained which exhibits mutations between the mosquitos that are sensitive and resistant to insecticides. For example, in C. pipiens there are 3 substitutions in the sequence of resistant individuals, one of which introduces an EcoRI site. Analysis of the restriction profile after PCR amplification of the K fragment and digestion of the products obtained by EcoRI (RFLP analysis) makes it possible to rapidly detect the ace-1 genotype in a population of C. pipiens; the presence of a single fragment corresponds to resistant homozygotes (RR), the presence of 2 fragments of approximately 106 bp and 214 bp corresponds to susceptible homozygous individuals (SS) and the presence of 3 fragments of 106 bp, 214 bp and 320 pb corresponds to resistant heterozygous individuals (RS).
Selon un second mode de mise en oeuvre avantageux dudit procédé, la mutation Gl 19S dans le troisième exon codant du gène ace-1 qui est responsable de la résistance aux insecticides de la classe des organophosphorés et des carbamates chez les moustiques est détectée selon l'une des alternatives suivantes, respectivement chez les moustiques des espèces C. pipiens et An. gambiae : - chez les moustiques de l'espèce Culex pipiens, un fragment de 520 pb du troisième exon codant est amplifié à partir de l'ADN génomique, par PCR à l'aide du couple d'amorces Ex3dir et Ex3rev (SEQ ID NO: 58 et 59) ; fragment PCR est digéré par Alu I et le produit de digestion est séparé par électrophorèse en gel According to a second advantageous embodiment of said method, the Gl19S mutation in the third exon coding for the ace-1 gene which is responsible for resistance to insecticides of the class of organophosphorus compounds and carbamates in mosquitoes is detected according to the invention. one of the following alternatives, respectively in C. pipiens and An. gambiae mosquitoes: - in Culex pipiens mosquitoes, a 520 bp fragment of the third coding exon is amplified from the genomic DNA, by PCR using the pair of primers Ex3dir and Ex3rev (SEQ ID NO: 58 and 59); PCR fragment is digested with Alu I and the digestion product is separated by gel electrophoresis
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d'agarose, puis le profil de restriction ainsi obtenu est analysé : la présence d'un fragment de 520 pb correspond aux individus homozygotes sensibles SS, la présence de deux fragments (357 pb et 163 pb) correspond aux individus homozygotes résistants RR et la présence de 3 fragments (520 pb, 357 pb et 163 pb) correspond aux individus hétérozygotes résistants RS, - chez les moustiques de l'espèce Anopheles gambiae, un fragment de 541 pb du troisième exon codant est amplifié à partir de l'ADN génomique, par PCR à l'aide du couple d'amorces Ex3AGdir et Ex3AGrev (SEQ ID NO: 123 et 124) ; le fragment PCR est digéré par Alu I et le produit de digestion est séparé par électrophorèse en gel d'agarose, puis le profil de restriction ainsi obtenu est analysé : la présence de deux fragments (403 pb et 138 pb) correspond aux individus homozygotes sensibles SS, la présence de 3 fragments (253 pb, 150 pb et 138 pb) correspond aux individus homozygotes résistants RR et la présence de 4 fragments (403 pb, 253 pb, 150 pb et 138 pb) correspond aux individus hétérozygotes résistants RS ; étant donné que les fragments de 150 pb et 138 pb co-migrent, les individus homozygotes et hétérozygotes résistants sont détectés respectivement par la présence de 2 bandes (253 pb et environ 150 pb) et de 3 bandes (403 pb, 253 pb et environ 150 pb). agarose, then the restriction profile thus obtained is analyzed: the presence of a fragment of 520 bp corresponds to the SS sensitive homozygous individuals, the presence of two fragments (357 bp and 163 bp) corresponds to RR resistant homozygous individuals and the presence of 3 fragments (520 bp, 357 bp and 163 bp) corresponds to the RS-resistant heterozygous individuals, - in the mosquitoes of the Anopheles gambiae species, a 541 bp fragment of the third coding exon is amplified from the genomic DNA by PCR using the pair of primers Ex3AGdir and Ex3AGrev (SEQ ID NO: 123 and 124); the PCR fragment is digested with Alu I and the digestion product is separated by agarose gel electrophoresis, and the restriction profile thus obtained is analyzed: the presence of two fragments (403 bp and 138 bp) corresponds to the susceptible homozygous individuals SS, the presence of 3 fragments (253 bp, 150 bp and 138 bp) corresponds to RR resistant homozygous individuals and the presence of 4 fragments (403 bp, 253 bp, 150 bp and 138 bp) corresponds to RS resistant heterozygous individuals; Since the 150 bp and 138 bp fragments co-migrate, the homozygous and heterozygous resistant individuals are detected respectively by the presence of 2 bands (253 bp and about 150 bp) and 3 bands (403 bp, 253 bp and about 150 bp).
La présente invention a également pour objet un réactif de détection d'insectes porteurs d'une résistance aux organophosphorés et/ou aux carbamates, caractérisé en ce qu'il est sélectionné dans le groupe constitué par : les molécules d'acide nucléique et leurs fragments tels que définis ci-dessus (sondes , amorces) et les anticorps tels que définis ci-dessus. The present invention also relates to an insect detection reagent carrying organophosphorus and / or carbamate resistance, characterized in that it is selected from the group consisting of: nucleic acid molecules and their fragments as defined above (probes, primers) and the antibodies as defined above.
La présente invention a également pour objet un vecteur recombinant, caractérisé en ce qu'il comprend un insert sélectionné dans le groupe constitué par les molécules d'acides nucléiques codant une protéine AChEl et leurs fragments tels que définis ci-dessus. The present invention also relates to a recombinant vector, characterized in that it comprises an insert selected from the group consisting of nucleic acid molecules encoding an AChEl protein and their fragments as defined above.
De préférence, ledit vecteur recombinant est un vecteur d'expression dans lequel ladite molécule d'acide nucléique ou l'un de ses fragments sont placés sous le contrôle d'éléments régulateurs de la transcription et de la traduction appropriés. Preferably, said recombinant vector is an expression vector wherein said nucleic acid molecule or a fragment thereof is under the control of appropriate transcriptional and translational regulatory elements.
Ces vecteurs sont construits et introduits dans des cellules hôtes par les méthodes classiques d'ADN recombinant et de génie génétique, qui sont connues These vectors are constructed and introduced into host cells by conventional methods of recombinant DNA and genetic engineering, which are known
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en elles-mêmes. De nombreux vecteurs dans lesquels on peut insérer une molécule d'acide nucléique d'intérêt afin de l'introduire et de la maintenir dans une cellule hôte eucaryote ou procaryote, sont connus en eux-mêmes ; le choix d'un vecteur approprié dépend de l'utilisation envisagée pour ce vecteur (par exemple réplication de la séquence d'intérêt, expression de cette séquence, maintien de la séquence sous forme extrachromosomique ou bien intégration dans le matériel chromosomique de l'hôte), ainsi que de la nature de la cellule hôte. Par exemple, on peut utiliser des vecteurs viraux comme les baculovirus ou non-viraux comme des plasmides. Pour exprimer l'AChEl, l'ADNc d'ace-1 peut être placé sous le contrôle d'un promoteur constitutif comme le promoteur de l'actine 5C, dans un vecteur approprié et ledit vecteur recombinant est introduit dans des cellules d'insecte telles que des cellules de drosophile (cellules de Schneider S2). in themselves. Many vectors in which a nucleic acid molecule of interest can be inserted in order to introduce and maintain it in a eukaryotic or prokaryotic host cell are known per se; the choice of an appropriate vector depends on the use envisaged for this vector (for example replication of the sequence of interest, expression of this sequence, maintenance of the sequence in extrachromosomal form or integration into the chromosomal material of the host ), as well as the nature of the host cell. For example, viral vectors such as baculoviruses or non-virals can be used as plasmids. To express AChE1, the ace-1 cDNA can be placed under the control of a constitutive promoter such as the 5C actin promoter, in a suitable vector, and said recombinant vector is introduced into insect cells. such as Drosophila cells (Schneider S2 cells).
La présente invention a également pour objet des cellules procaryotes ou eucaryotes, modifiées par un vecteur recombinant tel que défini ci-dessus ; de préférence ces cellules sont des cellules d'insectes. The subject of the present invention is also prokaryotic or eukaryotic cells, modified by a recombinant vector as defined above; preferably these cells are insect cells.
Les vecteurs recombinants et les cellules modifiées telles que définies ci-dessus, sont utiles notamment pour la production des protéines et des peptides AChEl selon l'invention. The recombinant vectors and the modified cells as defined above are particularly useful for the production of AChEl proteins and peptides according to the invention.
La présente invention a également pour objet un animal invertébré transgénique, caractérisé en ce qu'il contient des cellules modifiées par au moins une molécule d'acide nucléique telle que définie ci-dessus ; de préférence ledit animal est un insecte. The present invention also relates to a transgenic invertebrate animal, characterized in that it contains cells modified by at least one nucleic acid molecule as defined above; preferably said animal is an insect.
Les animaux transgéniques et les cellules modifiées telles que définis ci-dessus, sont utiles notamment pour le criblage de substances insecticides et pour la lutte biologique contre les vecteurs de pathogènes et les insectes nuisibles. The transgenic animals and the modified cells as defined above, are useful in particular for the screening of insecticidal substances and for the biological control of vectors of pathogens and harmful insects.
La présente invention a également pour objet une méthode de criblage d'une substance insecticide, caractérisée en ce qu'elle comprend : a) la mise en contact de la substance à tester avec une protéine AChEl sélectionnée parmi : la protéine AChEl isolée selon l'invention, un extrait de cellules modifiées ou un échantillon biologique d'un animal transgénique contenant ladite protéine AChEl, tels que définis ci-dessus, en présence d'acétylcholine ou de l'un de ses dérivés, The subject of the present invention is also a method for screening an insecticidal substance, characterized in that it comprises: a) bringing the substance under test into contact with an AChE1 protein selected from: the AChEl protein isolated according to invention, a modified cell extract or a biological sample of a transgenic animal containing said AChE1 protein, as defined above, in the presence of acetylcholine or a derivative thereof,
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b) la mesure par tout moyen approprié, de l'activité acétyl- cholinestérase du mélange obtenu en a), et c) la sélection des substances capables d'inhiber ladite activité. b) the measurement by any appropriate means of the acetylcholinesterase activity of the mixture obtained in a), and c) the selection of substances capable of inhibiting said activity.
La présente invention a également pour objet une méthode de criblage d'une substance insecticide, caractérisée en ce qu'elle comprend : - la mise en contact d'un animal transgénique tel que défini ci-dessus, avec la substance à tester, et - la mesure de la survie de l'animal. The subject of the present invention is also a method for screening an insecticidal substance, characterized in that it comprises: contacting a transgenic animal as defined above with the substance to be tested, and measuring the survival of the animal.
Avantageusement, lesdites méthodes de criblages mettent en #uvre des AChEl résistantes aux organophosphorés ou aux carbamates ou bien des cellules ou des animaux transgéniques les contenant. Advantageously, said screening methods use AChEl resistant to organophosphorus or carbamates or transgenic cells or animals containing them.
La présente invention a également pour objet un réactif de criblage de substances insecticides, caractérisé en ce qu'il est sélectionné dans le groupe constitué par les protéines AChEl, les vecteurs recombinants, les cellules modifiées et les animaux transgéniques tels que définis ci-dessus. The present invention also relates to a reagent for screening insecticidal substances, characterized in that it is selected from the group consisting of AChEl proteins, recombinant vectors, modified cells and transgenic animals as defined above.
Des substances insecticides capables d'inhiber l'activité acétylcholinestérase des protéines AChEl résistantes aux insecticides de la classe des organophosphorés et des carbamates couramment utilisés ont des applications : en santé humaine et animale, pour lutter contre les vecteurs de pathogènes (par exemple Aedes aegypti, vecteur d'arboviroses comme la dengue et la fièvre jaune, Culexpipiens vecteur du virus WestNile, Anopheles gambiae vecteur africain de l'agent du paludisme, etc) et dans le domaine de l'agriculture, pour lutter contre les insectes nuisibles qui dévastent les récoltes (par exemple le doryphore (Leptinotarsa decemlineata) qui s'attaque aux pommes-de-terre, les pucerons ravageurs comme Aphis gossypii et Myzus persicae, etc. ). Insecticidal substances capable of inhibiting the acetylcholinesterase activity of AChEl proteins resistant to insecticides of the class of organophosphorus compounds and carbamates commonly used have applications in human and animal health, for the control of pathogen vectors (for example Aedes aegypti, vector of arboviruses such as dengue and yellow fever, Culexpipiens WestNile virus vector, Anopheles gambiae african vector of the malaria agent, etc.) and in the field of agriculture, to fight against pests that devastate crops (eg the Colorado potato beetle (Leptinotarsa decemlineata) which attacks potatoes, aphid pests such as Aphis gossypii and Myzus persicae, etc.).
L'invention a en outre pour objet une trousse de détection et/ou de criblage pour la mise en #uvre des méthodes telles que définies ci-dessus, caractérisée en ce qu'elle inclut au moins un réactif tel que défini ci-dessus. The invention further relates to a detection and / or screening kit for the implementation of the methods as defined above, characterized in that it includes at least one reagent as defined above.
Outre les dispositions qui précèdent, l'invention comprend encore d'autres dispositions qui ressortiront de la description qui va suivre, qui se réfère à des exemples de mise en #uvre du gène ace-1 et de ses produits (ADNc, protéine) selon la In addition to the foregoing, the invention also comprises other arrangements which will emerge from the description which follows, which refers to examples of implementation of the ace-1 gene and its products (cDNA, protein) according to the
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présente invention ainsi qu'au tableau résumant les séquences de la Demande et aux dessins annexés dans lesquels : - la figure 1 illustre l'alignement des séquences en acides aminés des protéines AChEl d'Anophèles gambiae, Schizaphis graminum, An. stephensi, Aedes aegypti, Drosophila melanogaster, Lucilia cuprina, Musca domestica et Culex pipiens. Par convention, les acides aminés sont numérotés en référence à la séquence de l'AChE du poisson torpille (Torpedo californica; SWISSPROT P04058). Les séquences N- et C- terminales ne sont pas représentées en raison de leur variabilité. the invention and the table summarizing the sequences of the application and the accompanying drawings in which: - Figure 1 illustrates the alignment of amino acid sequences AChEl proteins Anopheles gambiae, Schizaphis graminum, An. stephensi, Aedes aegypti , Drosophila melanogaster, Lucilia cuprina, Musca domestica and Culex pipiens. By convention, amino acids are numbered with reference to the AChE sequence of torpedo fish (Torpedo californica; SWISSPROT P04058). The N- and C-terminal sequences are not represented because of their variability.
Les acides aminés conservés entre AChEl et AChE2 sont indiqués en gris. Les acides aminés spécifiques dAChE2 sont indiqués en noir. Les 3 résidus représentant la triade catalytique (S200, E327 et H44o) sont encadrés. Le site de liaison à la choline (W84) est souligné. Les cercles représentent la position des 14 résidus aromatiques bordant la gorge du site actif dans l'AChE de Torpedo, dont 10 sont présents dans toutes les
AChEl et AChE2 (cercles pleins), les autres n'étant pas conservés (cercles vides). The amino acids conserved between AChE1 and AChE2 are indicated in gray. The specific amino acids of AChE2 are indicated in black. The 3 residues representing the catalytic triad (S200, E327 and H44o) are framed. The choline binding site (W84) is underlined. The circles represent the position of the 14 aromatic residues bordering the throat of the active site in AChE Torpedo, 10 of which are present in all
AChEl and AChE2 (solid circles), the others not being preserved (empty circles).
Trois liaisons disulfures intramoléculaires entre des résidus cystéines sont indiquées. La flèche horizontale indique la position du fragment K (amplifié à l'aide des amorces PdirAGSG et PrevAGSG). La région hypervariable d'AChE2 qui est absente dans AChEl est entourée. Three intramolecular disulfide bonds between cysteine residues are indicated. The horizontal arrow indicates the position of fragment K (amplified using primers PdirAGSG and PrevAGSG). The hypervariable region of AChE2 that is absent in AChEl is surrounded.
- la figure 2 illustre la détection génétique des moustiques résistants aux organophosphorés et/ou aux carbamates par PCR-RFLP : . la figure 2 A représente la comparaison de la séquence en acides aminés du fragment K de différentes espèces de moustiques : Pip (Culex pipiens), Ae alb (Aedes albopictus), Ae aeg (Aedes aegypti), An alb (Anopheles albimanus), An gamb (Anopheles gambiae), An fun (Anopheles funestus), An nil (Anopheles nili), An sac (Anopheles sacharovi), An pse (Anopheles pseudopunctipennis). Les acides aminés variants sont grisés. Les séquences suivantes sont identiques: An. darlingi et An. albimanus; An. sundaicus, An. gambiae et An. arbiensis ; An. moucheti, An. funestus et An. minimus; An. stephensi et An. saccharovi. FIG. 2 illustrates the genetic detection of organophosphorus and / or carbamate resistant mosquitoes by PCR-RFLP: FIG. 2A represents the comparison of the amino acid sequence of the K fragment of different mosquito species: Pip (Culex pipiens), Ae alb (Aedes albopictus), Ae aeg (Aedes aegypti), An alb (Anopheles albimanus), An gamb (Anopheles gambiae), An funeral (Anopheles funestus), An nil (Anopheles nili), An bag (Anopheles sacharovi), An pele (Anopheles pseudopunctipennis). The variant amino acids are grayed out. The following sequences are identical: An. Darlingi and An. Albimanus; An. Sundaicus, An. Gambiae and An. Arbiensis; An. Moucheti, An. Funestus and An. Minimus; An. Stephensi and An. Saccharovi.
. la figure 2B illustre la comparaison des séquences nucléotidiques correspondant au fragment K des souches sensibles (S-LAB) et résistantes (SR). Les nucléotides variants sont grisés (t # c en position 3 ; a # g en position 84 : lesite.EcoRI (gaattc) situé autour de cette position, utilisé pour l'analyse PCR-RFLP, est . FIG. 2B illustrates the comparison of the nucleotide sequences corresponding to the K fragment of the sensitive (S-LAB) and resistant (SR) strains. The variant nucleotides are greyed out (t # c at position 3; a # g at position 84: the EcoRel site (Gaattc) located around this position, used for PCR-RFLP analysis, is
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présent uniquement dans la souche S-LAB ; c# t en position 173). La figure 2C illustre les profils de restriction obtenus après électrophorèse en gel d'agarose des produits de digestion par EcoRI, du fragment K amplifié par PCR. La souche homozygote sensible S-LAB présente un profil caractérisé par 2 bandes (214 pb et
106 pb), la souche homozygote résistante présente un profil caractérisé par une seul bande de 320 pb et les moustiques résistants issus du croisement en retour présentent un profil hétérozygote caractérisé par 3 bandes (320 pb, 214 pb et 106 pb). present only in the S-LAB strain; c # t in position 173). Figure 2C illustrates the restriction profiles obtained after agarose gel electrophoresis of EcoRI digests, PCR amplified K fragment. The susceptible homozygous strain S-LAB has a profile characterized by 2 bands (214 bp and
106 bp), the resistant homozygous strain has a profile characterized by a single band of 320 bp and the resistant mosquitoes from the crossover have a heterozygous profile characterized by 3 bands (320 bp, 214 bp and 106 bp).
- la figure 3 illustre l'arbre phylogénétique des protéines AChE. - Figure 3 illustrates the phylogenetic tree of AChE proteins.
L'analyse phylogénétique a été réalisée à partir de 47 séquences de protéines AChE de 35 espèces différentes provenant de la base de données ESTHER (http://www.ensam.inra.fr/cgi-bin/ace/index). Les séquences ont été alignées et un arbre a été construit comme décrit à l'exemple 1. Seuls les n#uds correspondant à des valeurs de "bootstrap" > 50% (c'est à dire des scores supérieurs à 500) sont indiqués. Phylogenetic analysis was performed from 47 AChE protein sequences from 35 different species from the ESTHER database (http://www.ensam.inra.fr/cgi-bin/ace/index). The sequences were aligned and a tree was constructed as described in Example 1. Only nodes corresponding to bootstrap values> 50% (i.e., scores greater than 500) are indicated.
L'échelle représente une divergence de 10 %. Agam: An. gambiae ; Aeg : Aedes aegypti ; Aste : Anophèles stephensi; Cp : Culex pipiens; Dmel : Drosophila melanogaster: Lcup: Lucilia cuprina: Mdom : Musca domestica: Ldec : Leptinotarsa decemlineata; Amel: Apis mellifera: Ncin : Nephotettix cincticeps ; Sgra : Schizaphis graminum ; Rapp : Rhipicephalus appendiculatus ; Bmic : Boophilus microplus; Bdec : Boophilus decoloratus; Hsap: Homo sapiens ; Btau: Bos taurus ; Fcat : Felix catus ; Ocun : Oryctolagus cunhiculus ; Rnor : Rattus norvegicus ; Mmus : Mus musculus ; Ggal: Gallus gallus ; Drer : Danio reno ; Eele : Electrophorus electricus ; Tamr: Torpedo marmorata ; Tcal: Torpedo californica ; Bfas: Bungarus fasciatus ; Mglu : Myxine glutinosa ; Bflo: Branchiostoma floridae ; Blan : Branchiostoma lanceolatum ; Cint : Ciona intestinalis ; Csav : Ciona savignyi ; Celé: Caenorhabditis elegans ; Cbrig : Caenorhabditis briggsae ; Dviv: Dictyocaulus viviparus; Lopa : Loligo opalescens. The scale represents a divergence of 10%. Agam: An. Gambiae; Aeg: Aedes aegypti; Aste: Anopheles stephensi; Cp: Culex pipiens; Dmel: Drosophila melanogaster: Lupine: Lucilia cuprina: Mdom: Musca domestica: Ldec: Leptinotarsa decemlineata; Amel: Apis mellifera: Ncin: Nephotettix cincticeps; Sgra: Schizaphis graminum; Rapp: Rhipicephalus appendiculatus; Bmic: Boophilus microplus; Bdec: Boophilus decoloratus; Hsap: Homo sapiens; Btau: Bos taurus; Fcat: Felix catus; Ocun: Oryctolagus cunhiculus; Rnor: Rattus norvegicus; Mmus: Mus musculus; Ggal: Gallus gallus; Drer: Danio reno; Eele: Electrophorus electricus; Tamr: Torpedo marmorata; Tcal: Torpedo californica; Bfas: Bungarus fasciatus; Mglu: Myxine glutinosa; Bflo: Branchiostoma floridae; Blan: Branchiostoma lanceolatum; Cint: Ciona intestinalis; Csav: Ciona savignyi; Celé: Caenorhabditis elegans; Cbrig: Caenorhabditis briggsae; Dviv: Dictyocaulus viviparus; Lopa: Loligo opalescens.
- la figure 4 illustre le cladogramme des protéines AChEl et AChE2. FIG. 4 illustrates the cladogram of AChE1 and AChE2 proteins.
Les séquences des protéines AChEl et AChE2 ont été traitées comme à la figure 1. La séquence Bmic a été ajoutée comme séquence externe pour définir l'origine de l'arbre. The AChE1 and AChE2 protein sequences were processed as in Figure 1. The Bmic sequence was added as an external sequence to define the origin of the tree.
Les cadres marqués d'une astérisque représentent les protéines codées par un gène qui ségrège avec la résistance aux insecticides. Les cadres vides représentent les protéines codées par un gène qui ne ségrègue pas avec la résistance aux insecticides. L'échelle correspond à une divergence de 10 %. Frames marked with an asterisk represent the proteins encoded by a gene that segregates with insecticide resistance. Empty frames represent proteins encoded by a gene that does not segregate with insecticide resistance. The scale corresponds to a divergence of 10%.
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- la figure 5 illustre la comparaison des séquences en acides aminés de la protéine AChEl de C. pipiens, entre une souche sensible (S-LAB) et une souche résistante (SR) aux insecticides. L'unique mutation glycine 247(119) # sérine 247(119) (indiquée en grisée) est responsable de la résistance aux insecticides chez les moustiques de l'espèce C. pipiens ; elle correspond à la substitution de la glycine située en position 247 de la séquence de l'AChEl de C. pipiens (ou en position 119, en référence à la séquence de l'AChE du poisson torpille), par une sérine. FIG. 5 illustrates the comparison of the amino acid sequences of the AChE1 protein of C. pipiens, between a sensitive strain (S-LAB) and a resistant strain (SR) with insecticides. The unique glycine mutation 247 (119) # serine 247 (119) (indicated in gray) is responsible for insecticide resistance in C. pipiens mosquitoes; it corresponds to the substitution of the glycine located at position 247 of the AChE1 sequence of C. pipiens (or in position 119, with reference to the AChE sequence of the torpedo fish) by a serine.
- les figures 6A et 6B illustrent la comparaison des séquences nucléotidiques codant pour la protéine AChEl de C. pipiens, entre une souche sensible (S-LAB) et une souche résistante (SR) aux insecticides ; toutes les mutations sont silencieuses à l'exception de la mutation en position 739 (G # A) qui entraîne, d'une part la substitution du codon glycine (GGC) en position 247 de la séquence de la protéine AchEl de la souche sensible (S-LAB) par un codon sérine (AGC) responsable de la résistance aux insecticides dans la souche SR, et d'autre part, l'apparition d'un site Alu I (AGCT) dans la séquence de la souche résistante, utile pour la détection de la mutation. La mutation (G - A) en position 739 de la séquence nucléotidique et la mutation glycine # sérine en position 247 de la séquence en acides aminés sont indiquées en grisé. Les séquences des amorces utilisées pour détecter la mutation en position 739 (amorce Ex3dir et Ex3rev), ainsi que le site Alu I sont indiqués en gras et soulignés. FIGS. 6A and 6B illustrate the comparison of the nucleotide sequences coding for the AChE1 protein of C. pipiens, between a sensitive strain (S-LAB) and a resistant strain (SR) with insecticides; all mutations are silent with the exception of the mutation at position 739 (G # A), which leads, on the one hand, to the substitution of the glycine codon (GGC) at position 247 of the AchE1 protein sequence of the susceptible strain ( S-LAB) by a serine codon (AGC) responsible for insecticide resistance in the SR strain, and on the other hand, the appearance of an Alu I site (AGCT) in the sequence of the resistant strain, useful for the detection of the mutation. The mutation (G - A) at position 739 of the nucleotide sequence and the glycine # serine mutation at position 247 of the amino acid sequence are indicated in gray. The sequences of the primers used to detect the mutation at position 739 (primer Ex3dir and Ex3rev), as well as the site Alu I are indicated in bold and underlined.
- la figure 7 (A, B et C) illustre la structure tridimensionnelle de l'AchEl de C. pipiens, obtenue par modélisation moléculaire à partir de la structure de l'AchE du poisson torpille :
La figure 7A illustre (i) la structure globale des deux protéines et (ii) et l'encombrement stérique des liaisons de Van der Waals de la sérine 200 et de l'histidine 440 du site catalytique de l'enzyme, ainsi que celui de l'acide aminé en position 119 qui est muté dans les cas de résistance ; le résidu en position 119 est proche des résidu S200 et H440 du site catalytique. FIG. 7 (A, B and C) illustrates the three-dimensional structure of Achel of C. pipiens, obtained by molecular modeling from the structure of the AchE of the torpedo fish:
Figure 7A illustrates (i) the overall structure of the two proteins and (ii) and the steric hindrance of Van der Waals bonds of serine 200 and histidine 440 of the catalytic site of the enzyme, as well as that of the amino acid at position 119 which is mutated in the cases of resistance; the residue at position 119 is close to residues S200 and H440 of the catalytic site.
Les figures 7B et 7C illustrent la comparaison de l'encombrement stérique des liaisons de Van der Waals des acides aminés glycine (figure 7C) et sérine (figure 7B) en position 119, de respectivement la souche sensible et résistante. FIGS. 7B and 7C illustrate the comparison of the steric hindrance of Van der Waals bonds with amino acids glycine (FIG. 7C) and serine (FIG. 7B) at position 119, of the sensitive and resistant strain, respectively.
L'encombrement de la chaîne latérale de la Sérine en position 119 dans la souche The congestion of the serine side chain in position 119 in the strain
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résistante, réduit l'espace du site catalytique ce qui empêche vraisemblablement l'insecticide d'interagir avec la sérine catalytique (S200). resistant, reduces the space of the catalytic site which presumably prevents the insecticide from interacting with the catalytic serine (S200).
- la figure 8 illustre la détection par PCR-RFLP de la mutation glycine # sérine dans le troisième exon codant du gène ace-1, chez des moustiques de l'espèce C. pipiens : 1 bande (520 pb) est détectée chez les individus homozygotes sensibles SS, 2 bandes (357 pb et 163 pb) sont détectées chez les individus homozygotes résistants RR et 3 bandes (520 pb, 357 pb et 163 pb) sont détectées chez les individus hétérozygotes résistants RS. FIG. 8 illustrates the PCR-RFLP detection of the glycine # serine mutation in the third exon coding for the ace-1 gene, in C. pipiens mosquitoes: 1 band (520 bp) is detected in individuals SS-sensitive homozygotes, 2 bands (357 bp and 163 bp) are detected in RR-resistant homozygous individuals and 3 bands (520 bp, 357 bp and 163 bp) are detected in RS-resistant heterozygous individuals.
- les figures 9A et 9B illustrent la comparaison des séquences du gène ace-1 d'An. gambiae, entre une souche sensible (KISUMU) et une souche résistante (YAO) aux insecticides ; toutes les mutations sont silencieuses à l'exception de deux mutations : la première correspond au remplacement de la valine (CGT) en position 33 de la séquence de l'AChEl de la souche sensible (SEQ ID NO: 5) par une alanine (CGC) dans la souche résistante et la seconde est la même mutation glycine (GGC)- sérine (AGC) que celle trouvée chez Culex pipiens. La mutation glycine (GGC)-> sérine (AGC) entraîne l'apparition d'un second site Alu I (AGCT) dans la séquence du troisième exon codant de la souche résistante, utile pour la détection de la mutation. Les séquences codantes du gène ace-1 sont indiquées en gras et les mutations sont indiquées en grisé. Les séquences des amorces Ex3AGdir et Ex3Agrev utilisées pour détecter la mutation glycine (GGC)# sérine (AGC), ainsi que les sites Alu I du troisième exon codant sont indiqués en gras et soulignés. FIGS. 9A and 9B illustrate the comparison of the sequences of the ance-1 gene of An. gambiae, between a susceptible strain (KISUMU) and a resistant strain (YAO) to insecticides; all mutations are silent with the exception of two mutations: the first corresponds to the replacement of valine (CGT) at position 33 of the AChE1 sequence of the susceptible strain (SEQ ID NO: 5) by an alanine (CGC ) in the resistant strain and the second is the same glycine (GGC) - serine (AGC) mutation found in Culex pipiens. The glycine (GGC) -> serine (AGC) mutation causes the appearance of a second Alu I site (AGCT) in the sequence of the third exon coding for the resistant strain, useful for the detection of the mutation. The coding sequences of the ace-1 gene are indicated in bold and the mutations are indicated in gray. The sequences of the Ex3AGdir and Ex3Agrev primers used to detect the glycine mutation (GGC) # serine (AGC), as well as the Alu I sites of the third coding exon are indicated in bold and underlined.
- la figure 10 illustre la quantification de l'activité acétylcholinestérase des protéines recombinantes AChEl de Culex pipiens, sensibles (S-LAB, barres blanches) et résistantes (SR, barres grisées), produites en cellules d'insecte S2, par comparaison avec celle de broyats de C. pipiens de souche S-LAB (barres blanches hachurées) et de souche SR (barres grisées hachurées). L'activité acétylcholinestérase des extraits cellulaires et des broyats de moustiques a été mesurée en l'absence (C) et en présence de 10-4M et 10-2M de propoxur. L'unique mutation glycine247(119)->sérine247(119) rend l'acétylcholinestérase insensible à l'insecticide. FIG. 10 illustrates the quantification of the acetylcholinesterase activity of the recombinant AChE1 proteins of Culex pipiens, sensitive (S-LAB, white bars) and resistant (SR, gray bars), produced in S2 insect cells, in comparison with that crushed C. pipiens of S-LAB strain (hatched white bars) and SR strain (shaded gray bars). The acetylcholinesterase activity of the cell extracts and the crushed mosquitoes was measured in the absence (C) and in the presence of 10-4M and 10-2M propoxur. The single mutation glycine247 (119) -> serine247 (119) renders acetylcholinesterase insensitive to insecticide.
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Tableau II: Liste des séquences
Table II: List of sequences
<tb>
<tb> Numéro <SEP> Séquence
<tb> d'identification
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 1 <SEP> fragment <SEP> de <SEP> la <SEP> région <SEP> centrale <SEP> de <SEP> la <SEP> protéine <SEP> AChE1 <SEP> Anophèles
<tb> gambiae <SEP> (positions <SEP> 70 <SEP> à <SEP> 593 <SEP> de <SEP> la <SEP> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 3). <SEP>
<tb> <Tb>
<tb> Number <SEP> Sequence
<tb> identification
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 1 <SEP> fragment <SEP> of <SEP> the <SEP> region <SEP> Central <SEP> of <SEP> the <SEP> protein <SEP> AChE1 <SEP> Anopheles
<tb> gambiae <SEP> (positions <SEP> 70 <SEP> to <SEP> 593 <SEP> of <SEP> the <SEQ> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 3). <September>
<Tb>
SEQ <SEP> ID <SEP> NO:2 <SEP> ADNc <SEP> AChE1 <SEP> Anophèles <SEP> gambiae
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 3 <SEP> Protéine <SEP> AChE1 <SEP> Anophèles <SEP> gambiae
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 4 <SEP> ADNc <SEP> AChE1 <SEP> Anophèles <SEP> gambiae <SEP> (souche <SEP> KISUMU)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 5 <SEP> Protéine <SEP> AChE1 <SEP> Anopheles <SEP> gambiae <SEP> (souche <SEP> KISUMU)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 6 <SEP> ADNc <SEP> AChE1 <SEP> Culex <SEP> pipiens <SEP> souche <SEP> S-LAB <SEP> (séquence <SEP> complète)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 7 <SEP> Protéine <SEP> AChE1 <SEP> Culex <SEP> pipiens <SEP> souche <SEP> S-LAB <SEP> (séquence <SEP> complète)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 8 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Culex <SEP> pipiens
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 9 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Aedes <SEP> aegypti
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 10 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Aedes <SEP> albopictus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> N0:11 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> peptidique <SEP> AChE1 <SEP> Anophèles <SEP> darlingi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 12 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> sundaicus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 13 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> minimus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 14 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> moucheti
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 15 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> arabiensis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 16 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> funestus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 17 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> pseudopunctipennis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 18 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> sacharovi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 19 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> stephensi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 20 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An, <SEP> albimanus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 21 <SEP> fragment <SEP> peptidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> nili
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 22 <SEP> gène <SEP> ace-1 <SEP> An. <SEP> gambiae
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 23 <SEP> gène <SEP> ace-1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> KISUMU
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 24 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> C. <SEP> pipiens <SEP> (souche <SEP> S-LAB)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 25 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> C. <SEP> pipiens <SEP> (souche <SEP> SR)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 26 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Aedes <SEP> aegypti
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 27 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Aedes <SEP> albopictus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 28 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Anophèles <SEP> darlingi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 29 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> sundaicus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 30 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> minimus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 31 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> moucheti
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 32 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> arabiensis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 33 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> funestus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 34 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> pseudopunctipennis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 35 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> sacharovi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 36 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> stephensi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 37 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> albimanus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 38 <SEP> fragment <SEP> nucléotidique <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> nili
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 39 <SEP> amorce <SEP> PkdirAGSG
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 40 <SEP> amorce <SEP> PkrevAGSG
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 41 <SEP> amorce <SEP> PbdirAGSG
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 42 <SEP> amorce <SEP> PbrevAGSG
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 43 <SEP> amorce <SEP> culex-bdir1
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: 2 <SEP> cDNA <SEP> AChE1 <SEP> Anopheles <SEP> gambiae
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 3 <SEP> Protein <SEP> AChE1 <SEP> Anopheles <SEP> gambiae
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 4 <SEP> cDNA <SEP> AChE1 <SEP> Anopheles <SEP> gambiae <SEP> (strain <SEP> KISUMU)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 5 <SEP> Protein <SEP> AChE1 <SEP> Anopheles <SEP> gambiae <SEP> (strain <SEP> KISUMU)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 6 <SEP> cDNA <SEP> AChE1 <SEP> Culex <SEP> pipiens <SEP> strain <SEP> S-LAB <SEP> (Sequence <SEP > complete)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 7 <SEP> Protein <SEP> AChE1 <SEP> Culex <SEP> pipiens <SEP> strain <SEP> S-LAB <SEP> (Sequence <SEP > complete)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 8 <SEP> fragment <SEP> peptidic <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Culex <SEP> pipiens
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 9 <SEP> Peptide fragment <SEP>SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Aedes <SEP> aegypti
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 10 <SEP> fragment <SEP> peptidic <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Aedes <SEP> albopictus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> N0: 11 <SEP> peptide fragment <SEP> peptide <SEP> K <SEP> peptide <SEP> AChE1 <SEP> Anopheles <SEP> darlingi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 12 <SEP> Peptide fragment <SEP>SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> sundaicus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 13 <SEP> peptide <SEP> fragment <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> minimus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 14 <SEP> fragment <SEP> peptidic <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> moucheti
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 15 <SEP> peptide fragment <SEP><SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> arabiensis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 16 <SEP> Peptide fragment <SEP>SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> funestus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 17 <SEP> fragment <SEP> peptidic <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> pseudopunctipennis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 18 <SEP> fragment <SEP> peptidic <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> sacharovi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 19 <SEP> peptide <SEP> fragment <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> stephensi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 20 <SEP> peptide fragment <SEP>SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An, <SEP> albimanus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 21 <SEP> fragment <SEP> peptide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> nili
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 22 <SEP> gene <SEP> ace-1 <SEP> Yr. <SEP> gambiae
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 23 <SEP> gene <SEP> ace-1 <SEP> Yr. <SEP> gambiae <SEP> KISUMU
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 24 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> C. <SEP> pipiens <SEP> (strain <SEP> S-LAB)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 25 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> C. <SEP> pipiens <SEP> (strain <SEP> SR)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 26 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Aedes <SEP> aegypti
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 27 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Aedes <SEP> albopictus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 28 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Anopheles <SEP> darlingi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 29 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> sundaicus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 30 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> minimus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 31 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> moucheti
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 32 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> arabiensis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 33 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> funestus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 34 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> pseudopunctipennis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 35 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> sacharovi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 36 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> stephensi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 37 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> albimanus
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 38 <SEP> fragment <SEP> nucleotide <SEP> K <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> nili
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 39 <SEP> primer <SEP> PkdirAGSG
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 40 <SEP> primer <SEP> PkrevAGSG
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 41 <SEP> primer <SEP> PbdirAGSG
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 42 <SEP> primer <SEP> PbrevAGSG
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 43 <SEP> primer <SEP> culex-bdir1
<Tb>
<Desc/Clms Page number 21> <Desc / Clms Page number 21>
<tb>
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 44 <SEP> amorce <SEP> culex-krev1
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 45 <SEP> amorce <SEP> AG1-Adir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 46 <SEP> amorce <SEP> AG1-Arev
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 47 <SEP> amorce <SEP> AG1-Bdir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 48 <SEP> amorce <SEP> AG1-Brev <SEP>
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 49 <SEP> amorce <SEP> AG1-Cdir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 50 <SEP> amorce <SEP> AG1-Crev
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 51 <SEP> Protéine <SEP> AChE1 <SEP> Ciona <SEP> intestinalis
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 52 <SEP> Protéine <SEP> AChE1 <SEP> Ciona <SEP> savignyi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 53 <SEP> Protéine <SEP> AChE2 <SEP> Anopheles <SEP> gambiae
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 54 <SEP> Amorce <SEP> culex-5'dir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO <SEP> :55 <SEP> Amorce <SEP> culex-3'dir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 56 <SEP> ADNc <SEP> AChE1 <SEP> C. <SEP> pipiens <SEP> souche <SEP> SR <SEP> (séquence <SEP> complète)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 57 <SEP> Protéine <SEP> AChE1 <SEP> C. <SEP> pipiens <SEP> souche <SEP> SR <SEP> (séquence <SEP> complète)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 58 <SEP> Amorce <SEP> Ex3dir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 59 <SEP> Amorce <SEP> Ex3rev
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 60 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Espro <SEP> -P*-R****
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 61 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Pro-R-Q**-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 62 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> S-LAB-Q-S*****
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 63 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Padova-P-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 64 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Praias-P-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 65 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Supercar-Q-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 66 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> BrugesA-P-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 67 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> BQ-Q-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 68 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> DJI-Q-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 69 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Harare-Q-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 70 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Martinique-Q-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 71 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Barriol-P-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 72 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Bleuet-P-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 73 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> BrugesB-P-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 74 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Heteren-P-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 75 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Ling-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 76 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Mao-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 77 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> TemR-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 78 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Uppsala-T***-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 79 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Trans-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 80 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> BEQ-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 81 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> BSQ-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 82 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Brazza-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 83 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Bouaké-Q-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 84 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Thai-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 85 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Madurai-Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 86 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Recife-Q-R
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 87 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Brésil <SEP> Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 88 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Moorea <SEP> Q-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 89 <SEP> Fragment <SEP> nucléotidique <SEP> du <SEP> troisième <SEP> exon <SEP> codant <SEP> souche <SEP> Killcare <SEP> P-S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 90 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 91 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 92 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 93 <SEP> (1)
<tb> <Tb>
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 44 <SEP> primer <SEP> culex-krev1
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<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 46 <SEP> primer <SEP> AG1-Arev
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<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 48 <SEP> primer <SEP> AG1-Brev <SEP>
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 49 <SEP> primer <SEP> AG1-Cdir
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<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 52 <SEP> Protein <SEP> AChE1 <SEP> Ciona <SEP> savignyi
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEQ> 53 <SEP> Protein <SEP> AChE2 <SEP> Anopheles <SEP> gambiae
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 54 <SEP> Primer <SEP>culex-5'dir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO <SEP>: 55 <SEP> Primer <SEP>culex-3'dir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 56 <SEP> cDNA <SEP> AChE1 <SEP> C. <SEP> pipiens <SEP> strain <SEP> SR <SEP> (SEP sequence) complete)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 57 <SEP> Protein <SEP> AChE1 <SEP> C. <SEP> pipiens <SEP> strain <SEP> SR <SEP> (sequence <SEP> complete)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 58 <SEP> Primer <SEP> Ex3dir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 59 <SEP> Primer <SEP> Ex3rev
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 60 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Espro <SEP> -P * -R ****
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 61 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Pro- RQ ** - S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 62 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> S- LAB-QS *****
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 63 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Padova- PR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 64 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Praias- PR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 65 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Supercar- QR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 66 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> BrugesA- PS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 67 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> BQ- QR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 68 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> DJI- QR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 69 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Harare- QR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 70 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Martinique- QR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 71 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Barriol- PR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 72 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Blueberry- PS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 73 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> BrugesB- PS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 74 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Heteren PS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 75 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Ling QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 76 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Mao QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 77 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> TemR- QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEQ> 78 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Uppsala T *** - S
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 79 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Trans- QS
SEQ SEP ID SEP NO: SEP 80 SEP Fragment SEP nucleotide SEP third SEP exon SEP encoding SEP
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEQ> 81 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> BSQ-QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 82 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Brazza-QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 83 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Bouaké QR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 84 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Thai QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 85 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of the <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Madurai- QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 86 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Recife- QR
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 87 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Brazil <SEP> QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 88 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Moorea <SEP> QS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 89 <SEP> Fragment <SEP> nucleotide <SEP> of <SEP> third <SEP> exon <SEP> encoding <SEP> strain <SEP> Killcare <SEP> PS
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 90 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 91 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 92 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 93 <SEP> (1)
<Tb>
<Desc/Clms Page number 22> <Desc / Clms Page number 22>
<tb>
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 94 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 95 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 96 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 97 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 98 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 99 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 100 <SEP> (1)
<tb> SEO <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 101 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 102 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 103 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 104 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 105 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 106 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 107 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 108 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 109 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 110 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 111 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 112 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 113 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 114 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 115 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 116 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> N0:117 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> N0:118 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 119 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> N0:120 <SEP> gène <SEP> ace-1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> souche <SEP> YAO
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 121 <SEP> ADNc <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> souche <SEP> YAO <SEP> (séquence <SEP> complète)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 122 <SEP> protéine <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> souche <SEP> YAO <SEP> (séquence <SEP> complète)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 123 <SEP> amorce <SEP> Ex3 <SEP> AG <SEP> dir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 124 <SEP> amorce <SEP> Ex3 <SEP> AG <SEP> rev
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 125 <SEP> ADNc <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> souche <SEP> KISUMU <SEP> (séquence <SEP> complète)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 126 <SEP> protéine <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> souche <SEP> KISUMU <SEP> (séquence <SEP> complète)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 127 <SEP> gène <SEP> ace-1 <SEP> d'An. <SEP> gambiae <SEP> (incluant <SEP> 2 <SEP> exons <SEP> 5'non-codants)
<tb>
* P = Culexpipiens pipiens (sous-espèce pipiens) ** Q = Culex pipiens quinquefasciatus (sous espèce quinquefasciatus) *** T = Culex torrentium **** R = résistant ***** S = sensible (1) fragments peptidiques du troisième exon codant correspondants aux fragments nucléotidiques SEQ ID N0:60 à 89 EXEMPLE 1 : et méthodes a) Souches et croisements Cinq souches de C. pipiens ont été utilisées : une souche standard sensible aux insecticides (Georghiou et al., 1966, Bull. Wld. Hlth Org., 35, 691-708), SA1, SA4 et EDIT qui possèdent une seule AChE sensible aux insecticides, <Tb>
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 94 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 95 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 96 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 97 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 98 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 99 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 100 <SEP> (1)
<tb> SEO <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 101 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEQ> 102 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEQ> 103 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 104 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 105 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 106 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 107 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 108 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 109 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 110 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 111 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 112 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 113 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 114 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 115 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 116 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: 117 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: 118 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 119 <SEP> (1)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> N0: 120 <SEP> gene <SEP> ace-1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> strain <SEP> YAO
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 121 <SEP> cDNA <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> strain <SEP> YAO <SEP> (SEP sequence) complete)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 122 <SEP> protein <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> strain <SEP> YAO <SEP> (SEP sequence) complete)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 123 <SEP> primer <SEP> Ex3 <SEP> AG <SEP> dir
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 124 <SEP> primer <SEP> Ex3 <SEP> AG <SEP> rev
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 125 <SEP> cDNA <SEP> AChE1 <SEP> Yr. <SEP> gambiae <SEP> strain <SEP> KISUMU <SEP> (SEP sequence) complete)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 126 <SEP> protein <SEP> AChE1 <SEP> An. <SEP> gambiae <SEP> strain <SEP> KISUMU <SEP> (SEP sequence) complete)
<tb> SEQ <SEP> ID <SEP> NO: <SEP> 127 <SEP> gene <SEP> ace-1 <SEP> of An. <SEP> gambiae <SEP> (including <SEP> 2 <SEP> exons <SEP>5'non-coding)
<Tb>
* P = Culexpipiens pipiens (subspecies pipiens) ** Q = Culex pipiens quinquefasciatus (subspecies quinquefasciatus) *** T = Culex torrentium **** R = resistant ***** S = sensitive (1) peptide fragments The third coding exon corresponding to the nucleotide fragments SEQ ID NO: 60 to 89 EXAMPLE 1 and methods a) Strains and crosses Five strains of C. pipiens were used: a standard strain sensitive to insecticides (Georghiou et al., 1966, Bull Wld Hlth Org., 35, 691-708), SA1, SA4 and EDIT which have a single insecticide-sensitive AChE,
<Desc/Clms Page number 23><Desc / Clms Page number 23>
et SR qui est homozygote pour une AChE insensible aux insecticides (Berticat et al., Genet. Res., 2002,79, 41-47). Les souches possédant une AChE sensible et insensible sont dénommées respectivement S et R. b) Nomenclature des gènes ace et numérotation des séquencesd'acides aminés ace-1 représente le locus codant pour une AChE cholinergique responsable de la résistance aux organophosphorés et/ou aux carbamates chez C. pipiens (AChEl), précédemment dénommé Ace.l (Raymond et al., Genetica, 2001, 112/113, 287-296). ace-2 représente le second locus ace, qui n'est pas impliqué dans la résistance aux insecticides chez C. pipiens (précédemment dénommé Ace.2), dont la fonction est inconnue chez C. pipiens. L'unique gène ace présent dans Drosophila melanogaster, qui est homologue à ace-2, est donc dénommé de même. and SR which is homozygous for insect-insensitive AChE (Berticat et al., Genet Res., 2002, 79, 41-47). The strains possessing a sensitive and insensitive AChE are designated respectively S and R. b) Nomenclature of the ace genes and numbering of the amino acid sequences ace-1 represents the locus coding for a cholinergic AChE responsible for resistance to organophosphorus compounds and / or carbamates in C. pipiens (AChE1), previously named Ace.l (Raymond et al., Genetica, 2001, 112/113, 287-296). ace-2 represents the second ace locus, which is not involved in insecticide resistance in C. pipiens (previously named Ace.2), whose function is unknown in C. pipiens. The unique ace gene present in Drosophila melanogaster, which is homologous to ace-2, is therefore referred to as the same.
Dans les analyses qui suivent, les positions des résidus d'acides aminés sont indiquées en référence à la séquence de l'AChE du poisson torpille [Torpedo californica; GENBANK P04058], selon la nomenclature recommandée par Massoulié et al., 1992, In Multidisciplinary approaches to cholinesterase functions, eds, Schafferman, A. & Velan, B. (Plenum Press New York), p 285-288]. c) Analyse de la transmission du gène ace-1
Les femelles étant indiquées en premier, des croisements FI (S X R) et des croisements en retour (FIX S-LAB et S-LAB X FI) ont été obtenus par croisement en masse d'adultes. Quelques larves issues des croisements en retour ont été traitées avec une dose de carbamate (propoxur, 4mg/L) qui tue 100 % des larves sensibles. La liaison entre ace-1 et la résistance au propoxur a été étudiée par RFLP chez les larves survivantes, à partir d'un produit PCR de 320 pb permettant d'identifier les allèles S et R. Les expériences ont été réalisées de façon indépendante, avec S = SA1, S = SA4 et S = EDIT. d) Analyse des séquences et assemblage des gènes
Toutes les analyses de séquences ont été effectuées à partir des séquences brutes d'Anophèles gambiae disponibles sur le serveur INFOBIOGEN (http://www.infobiogen.fr) et des outils disponibles sur le site (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast). Les séquences génomiques codant une AChE ont été identifiées à l'aide des logiciels TBLASTN et BLAST (Altschul et al., J. In the following analyzes, the positions of the amino acid residues are indicated with reference to the AChE sequence of the torpedo fish [Torpedo californica; GENBANK P04058], according to the nomenclature recommended by Massoulié et al., 1992, In Multidisciplinary Approaches to Cholinesterase Functions, Eds, Schafferman, A. & Velan, B. (Plenum Press New York), p 285-288]. c) Analysis of the transmission of the ace-1 gene
Females being indicated first, FI (SXR) crosses and back crosses (FIX S-LAB and S-LAB X FI) were obtained by mass crossing of adults. Some larvae from backcrossing were treated with a dose of carbamate (propoxur, 4mg / L) that kills 100% of susceptible larvae. The binding between ace-1 and propoxur resistance was studied by RFLP in surviving larvae, from a 320 bp PCR product to identify the S and R alleles. The experiments were performed independently, with S = SA1, S = SA4 and S = EDIT. d) Sequence analysis and gene assembly
All the sequence analyzes were made from the raw Anopheles gambiae sequences available on the INFOBIOGEN server (http://www.infobiogen.fr) and the tools available on the site (http: //www.ncbi.nlm .nih.gov / blast / blast). The genomic sequences coding for AChE have been identified using the software programs TBLASTN and BLAST (Altschul et al., J.
Biol. Mol., 1990,215, 403-410). Les séquences génomiques identifiées ont été assem- Biol. Mol., 1990, 251, 403-410). The genomic sequences identified were assem-
<Desc/Clms Page number 24><Desc / Clms Page number 24>
blées à l'aide du logiciel ABI Prism Auto-Assembler (v2.1, PERKIN ELMER). Les séquences ont été vérifiées et corrigées à l'aide du logiciel Ensembl Trace Server (http: // trace.ensembl.org/). Deux concaténations de respectivement 5195 et 6975 paires de bases, codant respectivement pour AChEl et AChE2 ont été assemblées à partir de respectivement 64 et 74 séquences indépendantes (redondance moyenne de 10,5 et 6,5). Les exons et les séquences protéiques ont été identifiés à l'aide d'une combinaison entre les logiciels FGENESH (http://www.sanger.uk) et BLASTX (http://www.ncbi.nlm.nih.gov). Les séquences génomiques d'AChE d'ascidies ont été assemblées à partir de séquences brutes déposées dans les bases de données du NCBI (Ciona savignyi) et du Doe Joint Institute (Ciona intestinalis,
http ://www. j gi .doe. gov/prosrams/ciona/ciona mainae.html). Les recherches dans les bases de données de Drosophila ont été effectuées à l'aide de Flybase (http://www.fruitfly.org/). e) Comparaisons de séquences
Les séquences des protéines AChEl et AChE2 d'Anopheles gambiae déduites des séquences génomiques et les séquences peptidiques déduites de fragments PCR de C. pipiens et A. aegypti ont été alignées avec celles des AChE connues, à l'aide du logiciel ClustalW, en utilisant une matrice BLOSUM et des paramètres par défaut (Thompson et al., N. A.R., 1994,22, 4673-4680). using the ABI Prism Auto-Assembler software (v2.1, PERKIN ELMER). The sequences were verified and corrected using the Ensembl Trace Server software (http: // trace.ensembl.org/). Two concatenations of respectively 5195 and 6975 base pairs, coding respectively for AChE1 and AChE2 were assembled from respectively 64 and 74 independent sequences (average redundancy of 10.5 and 6.5). The exons and protein sequences were identified using a combination of FGENESH (http://www.sanger.uk) and BLASTX (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) software. The genome sequences of AChE ascidians were assembled from raw sequences deposited in the databases of NCBI (Ciona savignyi) and the Doe Joint Institute (Ciona intestinalis,
http: // www. j gi .doe. gov / prosrams / ciona / ciona mainae.html). Drosophila databases were searched using Flybase (http://www.fruitfly.org/). e) Sequence comparisons
The sequences of the AChE1 and AChE2 proteins of Anopheles gambiae deduced from the genomic sequences and the peptide sequences deduced from PCR fragments of C. pipiens and A. aegypti were aligned with those of the known AChE using the ClustalW software, using a BLOSUM matrix and default parameters (Thompson et al., NAR, 1994,22, 4673-4680).
Un arbre phylogénétique a été construit en utilisant l'algorithme du plus proche voisin (neighbour-joining algorithm) de la version DDBJ de Clustal W (http://hypernig.nig.ac.jp/homology/ex clustalw-e. shtml). L'analyse de type Bootstrap (1000 comptages et 111 valeurs d'entrée) a été utilisée pour évaluer les degrés de confiance pour la topologie de l'arbre. La construction des arbres a été réalisée à l'aide du logiciel Treeview (vl.6.6). f) Numéros d'accession
Les numéros des séquences (numéros d'accession dans les bases de données ou les numéros d'identification dans la liste de séquences) ayant servi à l'analyse génétique sont les suivants. A phylogenetic tree was constructed using the neighbor-joining algorithm of Clustal W's DDBJ (http://hypernig.nig.ac.jp/homology/ex clustalw-e.shtml) . Bootstrap analysis (1000 counts and 111 input values) was used to evaluate confidence levels for tree topology. Tree construction was performed using the Treeview software (v1.6.6). f) Accession numbers
Sequence numbers (accession numbers in the databases or identification numbers in the sequence listing) used in the genetic analysis are as follows.
- Craniata : Homo sapiens : NP~00046 ; Bos taurus : P23795 ; Felix catus: 06763 ; Oryctolagus cuniculus : Q29499 ; Rattus norvégiens : P36136 ; Mus musculus : P21836 ; Gallus gallus : CAC37792 ; Danio reno : Q9DDE3 ; Electropho- - Craniata: Homo sapiens: NP ~ 00046; Bos taurus: P23795; Felix catus: 06763; Oryctolagus cuniculus: Q29499; Norwegian rats: P36136; Mus musculus: P21836; Gallus gallus: CAC37792; Danio reno: Q9DDE3; electrophoresis
<Desc/Clms Page number 25><Desc / Clms Page number 25>
rus electricus : 6730113 ; Torpedo marmorata : P07692 ; Torpedo californica:
P04058 ; Bungarus fasciatus : Q92035 ; Myxine glutinosa : Q92081. rus electricus: 6730113; Torpedo marmorata: P07692; Torpedo californica:
P04058; Bungarus fasciatus: Q92035; Myxine glutinosa: Q92081.
- Cephalocordés : Branchiostoma floridae : 076998 et 076999 ; Branchiostoma lanceolatum : Q95000 et Q95001. - Cephalocordates: Branchiostoma floridae: 076998 and 076999; Branchiostoma lanceolatum: Q95000 and Q95001.
- Urocordés : Ciona intestinalis : SEQ ID NO : 51 ; Ciona savignyi :
SEQ ID NO : 52. - Urocordates: Ciona intestinalis: SEQ ID NO: 51; Ciona savignyi:
SEQ ID NO: 52.
- Nématodes : Caenorhabditis elegans (1 à 4) : P38433,061371, 061459 et 061372 ; Caenorhabditis briggsae (1 à 4) Q27459, 061378Q9NDG9 et Q9NDG8 ; Dictyocaulus viviparus : Q9GPLO. - Nematodes: Caenorhabditis elegans (1 to 4): P38433,061371, 061459 and 061372; Caenorhabditis briggsae (1-4) Q27459, 061378Q9NDG9 and Q9NDG8; Dictyocaulus viviparus: Q9GPLO.
- Insectes : Anopheles gambiae (1 et 2) : ID NO:3 et SEQ ID NO: 53 (BM 629847 et BM 627478); Aedes aegypti (1 et 2) : SEQ ID NO: 9 et AAB3500 ; An. stephensi :P56161 ; Culex pipiens : SEQ ID NO: 7 (ace-1) et Esther data base pour ace-2 ; Drosophila melanogaster :P07140 ; Lucilia cuprina : P91954 ; Musca domestica: AAK69132.1 ; Leptinotarsa decemlineata : Q27677 ; Apis mellifera : AAG43568 ; Nephotettix cincticeps : AF145235~1 ; Schizaphis graminum : Q9BMJ 1. - Insects: Anopheles gambiae (1 and 2): ID NO: 3 and SEQ ID NO: 53 (BM 629847 and BM 627478); Aedes aegypti (1 and 2): SEQ ID NO: 9 and AAB3500; An. Stephensi: P56161; Culex pipiens: SEQ ID NO: 7 (ace-1) and Esther data base for ace-2; Drosophila melanogaster: P07140; Lucilia cuprina: P91954; Musca domestica: AAK69132.1; Leptinotarsa decemlineata: Q27677; Apis mellifera: AAG43568; Nephotettix cincticeps: AF145235 ~ 1; Schizaphis graminum: Q9BMJ 1.
- Arachnides : Rhipicephalus appendiculatus : 062563 ; Boophilus microplus (1 et 2) : 045210 et 061864 ; Boophilus decoloratus : 061987 ; - Mollusques : Loligo opalescens : 097110. g) Clonage du fragment K et génotypage d'ace-1 chez Culex pipiens
L'ADN de moustique a été extrait comme décrit dans Rogers et al., [Plant Molecular Biology manual, 1988, eds. Gelvin, S.B.1Schilperoot, R. A. (Kluwer Academic Publishers, Boston), VoIA6, pl-10]. Les oligonucléotides PkdirAGSG ( 5'ATMGWGTTYGAGTACACSGAYTGG-3', SEQ ID NO: 39) et PkrevAGSG (5'GGCAAARTTKGWCCAGTATCKCAT-3', SEQ ID NO: 40) amplifient un fragment de 320 pb (fragment K) à partir de l'ADN génomique de plusieurs moustiques. 30 cycles d'amplification PCR ont été réalisés dans les conditions suivantes : 94 C pendant 30s, 50 C pendant 30s à et 72 C pendant 30s. Les séquences ont été déterminées directement sur les produits PCR sur un séquenceur ABI prism 310, à l'aide du kit Big Dye Terminator. - Arachnids: Rhipicephalus appendiculatus: 062563; Boophilus microplus (1 and 2): 045210 and 061864; Boophilus decoloratus: 061987; - Molluscs: Loligo opalescens: 097110. g) Cloning of fragment K and genotyping of ace-1 in Culex pipiens
Mosquito DNA was extracted as described in Rogers et al., [Plant Molecular Biology manual, 1988, eds. Gelvin, SB1Schilperoot, RA (Kluwer Academic Publishers, Boston), VoIA6, pl-10]. Oligonucleotides PkdirAGSG (5'ATMGWGTTYGAGTACACSGAYTGG-3 ', SEQ ID NO: 39) and PkrevAGSG (5'GGCAAARTTKGWCCAGTATCKCAT-3', SEQ ID NO: 40) amplify a 320 bp fragment (fragment K) from genomic DNA. several mosquitoes. 30 cycles of PCR amplification were performed under the following conditions: 94 C for 30s, 50 C for 30s at and 72 C for 30s. The sequences were determined directly on the PCR products on an ABI prism 310 sequencer, using the Big Dye Terminator kit.
Le génotypage d'ace-1 chez Culex est réalisé dans les conditions suivantes : Les fragments K obtenus comme décrit précédemment sont digérés par The genotyping of ace-1 in Culex is carried out under the following conditions: The K fragments obtained as described previously are digested by
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EcoRI et le produit de digestion est séparé par électrophorèse sur un gel d'agarose à 2%. Les profils de restriction montrent : 1 bande (320 pb) chez les moustiques homozygotes résistants RR, 2 bandes (106 pb et 214 pb) chez les moustiques homozygotes SS et 3 bandes (103 pb, 214 pb et 320 pb) chez les moustiques hétérozygotes RS. h) Clonage de l'ADNc d'ace-1 chez les individus sensibles et résistants
L'ADNc du gène ace-1 de Culex pipiens a été obtenu à partir de l'ARN extrait d'individus de la souche sensible de référence S-LAB et de la souche résistante SR, au tout premier stade de développement larvaire L1. La transcription inverse a été réalisée avec un oligonucléotide 18T et la SuperScriptIIRNaseH (IN VITROGEN), selon les conditions recommandées par le fabricant. EcoRI and the digest was separated by electrophoresis on a 2% agarose gel. Restriction patterns show: 1 band (320 bp) in RR resistant homozygous mosquitoes, 2 bands (106 bp and 214 bp) in homozygous SS mosquitoes and 3 bands (103 bp, 214 bp and 320 bp) in heterozygous mosquitoes RS. h) Cloning of ace-1 cDNA in susceptible and resistant individuals
The cDNA of the Culex pipiens ace-1 gene was obtained from the RNA extracted from individuals of the S-LAB reference strain and the SR resistant strain, at the very first stage of L1 larval development. Reverse transcription was performed with an 18T oligonucleotide and SuperScriptIIRNaseH (IN VITROGEN), according to the conditions recommended by the manufacturer.
- souche S-LAB
Deux fragments d'ADNc ont été amplifiés par PCR à l'aide d'oligonucléotides dégénérés obtenus à partir de l'alignement des séquences des gènes ace-1 d'Anopheles gambiae et de Schizaphis graminum : - un fragment b (193pb) a été amplifié à l'aide du couple d'amorces PbdirAGSG (5'GGYGCKACMATGTGGAAYCC3', SEQ ID NO: 41) et PbrevAGSG (5'ACCAMRATCACGTTYTCYTCCGAC3', SEQ ID NO: 42). - strain S-LAB
Two cDNA fragments were amplified by PCR using degenerate oligonucleotides obtained from the alignment of the sequences of the ance-1 genes of Anopheles gambiae and Schizaphis graminum: a fragment b (193 bp) was amplified using the pair of primers PbdirAGSG (5'GGYGCKACMATGTGGAAYCC3 ', SEQ ID NO: 41) and PbrevAGSG (5'ACCAMRATCACGTTYTCYTCCGAC3', SEQ ID NO: 42).
- un fragment k (320pb) a été amplifié à l'aide du couple d'amorces PkdirAGSG (5'ATMGWGTTYGAGTACACSGAYTGG3', SEQ ID NO: 39) et PkrevAGSG (5'GGCAAARTTKGWCCAGTATCKCAT3', SEQ ID NO: 40). a fragment k (320 bp) was amplified using the pair of primers PkdirAGSG (5'ATMGWGTTYGAGTACACSGAYTGG3 ', SEQ ID NO: 39) and PkrevAGSG (5'GGCAAARTTKGWCCAGTATCKCAT3', SEQ ID NO: 40).
Les fragments b et k ainsi obtenus ont ensuite été clonés et séquences, selon les techniques classiques connues en elles-mêmes de l'Homme du métier, telles que décrites dans Current Protocols in Molecular Biology (Frederick M. A USUBEL, 2000, Wiley and son Inc, Library of Congress, USA). The fragments b and k thus obtained were then cloned and sequenced, according to standard techniques known in themselves to those skilled in the art, as described in Current Protocols in Molecular Biology (Frederick M. A USUBEL, 2000, Wiley and his Inc, Library of Congress, USA).
Un fragment d'ADNc de plus grande taille a été amplifié par PCR, à l'aide d'amorces spécifiques de Culex pipiens déduites des séquences des fragments b et k précédemment obtenues. A savoir : - un fragment CulexA (1127 pb) a été amplifié par PCR à l'aide du couple d'amorces amorces : culex-bdirl (5'TACATCAACGTGGTCGTGCCACG3', SEQ ID NO: 43) et culex-krevl (5'GTCACGGTTGCTGTTCGGG3', SEQ ID NO: 44). Le fragment Culex A de 1127 pb ainsi obtenu a ensuite été cloné et séquence, comme ci-dessus. A larger size cDNA fragment was amplified by PCR, using Culex pipiens specific primers deduced from previously obtained b and k fragment sequences. Namely: a CulexA fragment (1127 bp) was amplified by PCR using the pair of primers: culex-bdirl (5'TACATCAACGTGGTCGTGCCACG3 ', SEQ ID NO: 43) and culex-krevl (5'GTCACGGTTGCTGTTCGGG3 ', SEQ ID NO: 44). The 1127 bp Culex A fragment thus obtained was then cloned and sequenced as above.
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Les extrémités des ADNc ont été amplifiées par la technique RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends), à l'aide d'un kit commercial (du kit Gene Racer (IN VITROGEN) selon les conditions indiquées dans le manuel d'utilisation. Ensuite elles ont été clonées puis séquencées, comme ci-dessus. The ends of the cDNAs were amplified by the Rapid Amplification of cDNA Ends (RACE) technique, using a commercial kit (from the Gene Racer kit (IN VITROGEN) according to the conditions indicated in the user manual. were cloned and sequenced, as above.
- souche SR
La séquence complète de l'ADNc du gène ace-1 de la souche résistante SR a été amplifiée par PCR à l'aide des amorces culex-5'dir (5'CCACACGCCAGAAGAAAAGA-3', SEQ ID NO: 54) et culex-3'dir (5'AAAAACGGGAACGGGAAAG-3, SEQ ID NO: 55) et le fragment de 2497 pb ainsi obtenu a été cloné et séquence, comme ci-dessus. i) Clonage dugène ace-1 chez les individus sensibles et résistants
L'ADN génomique de la souche KISUMU (souche sensible de référence de l'Afrique de l'Ouest) et de la souche YAO (souche résistante isolée en Côte d'ivoire) d'A.gambiae a été extrait à partir d'individus homozygotes comme décrit dans Rogers et al., [Plant Molecular Biology manual, 1988, eds. Gelvin, S.B. Schilperoot, R.A. (Kluwer Académie Publishers, Boston), VolA6, pl-10]. - strain SR
The complete sequence of the cDNA of the ace-1 gene of the SR resistant strain was amplified by PCR using the culex-5'dir primers (5'CCACACGCCAGAAGAAAAGA-3 ', SEQ ID NO: 54) and culex- 3'dir (5'AAAAACGGGAACGGGAAAG-3, SEQ ID NO: 55) and the 2497 bp fragment thus obtained was cloned and sequenced, as above. i) Cloning of ace-1 gene in susceptible and resistant individuals
The genomic DNA of the strain KISUMU (West African reference strain) and the YAO strain (isolated resistant strain in Côte d'Ivoire) of A. gambiae was extracted from individuals homozygotes as described in Rogers et al., [Plant Molecular Biology manual, 1988, eds. Gelvin, SB Schilperoot, RA (Kluwer Academy Publishers, Boston), VolA6, pl-10].
3 fragments chevauchants (A, B et C) ont été amplifiés dans les conditions suivantes : 94 C pendant 30s, 50 C pendant 30s à et 72 C pendant 30s (30 cycles), à l'aide d'amorces synthétisées à partir de la séquence du gène ace-1. A savoir : - le fragment A (1130pb) a été amplifié à l'aide du couple d'amorces AG1-Adir (5'CGACGCCACCTTCACA3', SEQ ID NO: 45) et AGI-Arev (5'GATGGCCCGCTGGAACAGAT3', SEQ ID NO: 46), - le fragment B (1167pb) a été amplifié à l'aide du couple d'amorces AGI-Bdir (5'GGGTGCGGGACAACATTCAC3', SEQ ID NO: 47) et AGI-Brev (5'CCCCGACCGACGAAGGA3', SEQ ID NO: 48), et - le fragment C (876pb) a été amplifié à l'aide du couple d'amorces AGl-Cdir (5'AGATGGTGGGCGACTATCAC3', SEQ ID NO: 49) et AGI-Crev (5'CTCGTCCGCCACCACTTGTT3', SEQ ID NO: 50). 3 overlapping fragments (A, B and C) were amplified under the following conditions: 94 C for 30s, 50 C for 30s at and 72 C for 30s (30 cycles), using primers synthesized from the sequence of the ace-1 gene. Namely: fragment A (1130bp) was amplified using the pair of primers AG1-Adir (5'CGACGCCACCTTCACA3 ', SEQ ID NO: 45) and AGI-Arev (5'GATGGCCCGCTGGAACAGAT3', SEQ ID NO 46), fragment B (1167bp) was amplified using the pair of AGI-Bdir primers (5'GGGTGCGGGACAACATTCAC3 ', SEQ ID NO: 47) and AGI-Brev (5'CCCCGACCGACGAAGGA3', SEQ ID NO: 48), and the fragment C (876bp) was amplified using the pair of primers AG1-Cdir (5'AGATGGTGGGCGACTATCAC3 ', SEQ ID NO: 49) and AGI-Crev (5'CTCGTCCGCCACCACTTGTT3', SEQ ID NO: 50).
Les séquences des fragments A, B et C ont été déterminées directement sur les produits PCR, à l'aide d'oligonucléotides internes, inclus dans ces fragments, en utilisant le kit Big Dye Terminator et un séquenceur ABI prism 310. The sequences of fragments A, B and C were determined directly on the PCR products, using internal oligonucleotides included in these fragments, using the Big Dye Terminator kit and an ABI prism 310 sequencer.
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j) détection de la mutation du troisième exon codant responsable de la résistance aux insecticides chez les moustiques des espèces C. pipiens et An. zambiae
L'ADN de moustique a été extrait comme décrit dans Rogers et al., précité, puis un fragment du troisième exon codant a été amplifié par PCR, séquence et la mutation dans la séquence codante du troisième exon codant a été détectée par PCR-RFLP, selon le principe tel que décrit ci-dessus pour le fragment K. j) detection of the mutation of the third coding exon responsible for insecticide resistance in C. pipiens and An. zambiae mosquitoes
The mosquito DNA was extracted as described in Rogers et al., Supra, then a fragment of the third coding exon was amplified by PCR, sequence and the mutation in the coding sequence of the third coding exon was detected by PCR-RFLP. , according to the principle as described above for the fragment K.
- C. pipens
Un fragment de 520 pb du troisième exon codant a été amplifié à partir de l'ADN génomique de plusieurs moustiques, par PCR à l'aide du couple d'amorces : - Ex3dir 5'-CGACTCGGACCCACTGGT-3' (SEQ ID NO: 58) et - Ex3rev 5'-GTTCTGATCAAACAGCCCCGC-3' (SEQ ID NO: 59). - C. pipens
A 520 bp fragment of the third coding exon was amplified from the genomic DNA of several mosquitoes, by PCR using the pair of primers: Ex3dir 5'-CGACTCGGACCCACTGGT-3 '(SEQ ID NO: 58 ) and - Ex3rev 5'-GTTCTGATCAAACAGCCCCGC-3 '(SEQ ID NO: 59).
Le fragment ainsi obtenu a été digéré par Alu I et le produit de digestion séparé par électrophorèse sur un gel d'agarose à 2%. Les profils de restriction attendus sont les suivants : 1 fragment (520 pb) chez les individus homozygotes sensibles SS, 2 fragments (357 pb et 163 pb) chez les individus homozygotes résistants RR et 3 fragments (520 pb, 357 pb et 163 pb) chez les individus hétérozygotes résistants RS. The fragment thus obtained was digested with Alu I and the digestion product separated by electrophoresis on a 2% agarose gel. The expected restriction profiles are: 1 fragment (520 bp) in SS susceptible homozygous individuals, 2 fragments (357 bp and 163 bp) in RR resistant homozygous individuals and 3 fragments (520 bp, 357 bp and 163 bp) in resistant heterozygous individuals RS.
- An. gambiae
Un fragment de 541 pb du troisième exon codant a été amplifié à partir de l'ADN génomique de plusieurs individus, par PCR à l'aide du couple d'amorces : - Ex3AGdir 5'- GATCGTGGACACCGTGTTCG -3' (SEQ ID NO: 123) et - Ex3AGrev 5'- AGGATGGCCCGCTGGAACAG -3' (SEQ ID NO: 124). - An. Gambiae
A 541 bp fragment of the third coding exon was amplified from the genomic DNA of several individuals, by PCR using the pair of primers: Ex3AGdir 5'-GATCGTGGACACCGTGTTCG -3 '(SEQ ID NO: 123 ) and - Ex3AGrev 5'-AGGATGGCCCGCTGGAACAG -3 '(SEQ ID NO: 124).
Le fragment ainsi obtenu a été digéré par Alu I et le produit de séparé par électrophorèse sur un gel d'agarose à 2%. Les profils de restriction attendus sont les suivants : 2 fragments (403 pb et 138 pb) chez les individus homozygotes sensibles SS, 3 fragments (253 pb, 150 pb et 138 pb) chez les individus homozygotes résistants RR et 4 fragments (403 pb, 253 pb, 150 pb et 138 pb) chez les individus hétérozygotes résistants RS ; donné que les fragments de 150 pb et 138 pb co- migrent, les individus homozygotes et hétérozygotes résistants sont détectés The fragment thus obtained was digested with Alu I and the product separated by electrophoresis on a 2% agarose gel. The expected restriction profiles are as follows: 2 fragments (403 bp and 138 bp) in SS-sensitive homozygous individuals, 3 fragments (253 bp, 150 bp and 138 bp) in RR resistant homozygous individuals and 4 fragments (403 bp, 253 bp, 150 bp and 138 bp) in RS resistant heterozygous individuals; As 150 bp and 138 bp fragments co-migrate, homozygous and heterozygous resistant individuals are detected.
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respectivement par la présence de 2 bandes (253 pb et environ 150 pb) et de 3 bandes (403 pb, 253 pb et environ 150 pb) en gel d'agarose. k) Mesure de l'activité acétylcholinestérase
Les ADNc codant les AchEl de respectivement la souche S-LAB et la souche SR ont été clonées dans le vecteur d'expression eucaryote pAc5.1/V5-His (INVITROGEN), selon les techniques classiques d'ADN recombinant en suivant les protocoles standards tels que ceux décrits dans Current Protocols in Molecular Biology, précité. Des cellules de drosophile (cellules de Schneider S2) ont été transfectées par les vecteurs recombinants ainsi obtenus, à l'aide du réactif Fugen (ROCHE), en suivant les instructions du fabricant. 24 heures après la transfection, les cellules ont été récoltées par centrifugation puis lysées dans du tampon phosphate 0. 25M contenant 1% Triton X-100. L'activité acétylcholinestérase des extraits cellulaires obtenus a été mesurée, en présence ou en l'absence d'insecticide (propoxur), par la méthode telle que décrite dans Bourguet et al. Biochemical Genetics, 1996,34, 351-362. respectively by the presence of 2 bands (253 bp and about 150 bp) and 3 bands (403 bp, 253 bp and about 150 bp) in agarose gel. k) Measurement of acetylcholinesterase activity
The cDNAs encoding the AchE1s of respectively the S-LAB strain and the SR strain were cloned in the eukaryotic expression vector pAc5.1 / V5-His (INVITROGEN), according to standard recombinant DNA techniques following standard protocols such as those described in Current Protocols in Molecular Biology, supra. Drosophila cells (Schneider S2 cells) were transfected with the recombinant vectors thus obtained, using the Fugen reagent (ROCHE), following the manufacturer's instructions. 24 hours after transfection, the cells were harvested by centrifugation and then lysed in 0.25M phosphate buffer containing 1% Triton X-100. The acetylcholinesterase activity of the cell extracts obtained was measured, in the presence or in the absence of insecticide (propoxur), by the method as described in Bourguet et al. Biochemical Genetics, 1996, 34, 351-362.
EXEMPLE 2 : en évidence de 2 gènes ace chez Anopheles gambiae
Des gènes homologues des gènes d'acétylcholinestérases humaines et de drosophiles ont été recherchés à partir de fragments de séquences déposées dans les bases de données, en utilisant le logiciel TBLASTN. Deux groupes de fragments distincts codant pour une AChE très similaire à celle de la drosophile ont été identifiés. Deux gènes de respectivement 6975 pb (ace-1) et 5195 pb (ace-2) ont été reconstruits à partir de fragments chevauchants de chaque groupe. L'analyse des gènes à l'aide des logiciels FGENESH et BLASTX montre que les gènes ace-1 et ace-2 sont constitués respectivement d'au moins 7 et 8 exons codant pour des protéines d'environ 534 et 569 acides aminés, dénommées respectivement AChEl et AChE2. Toutefois, cette analyse n'a pas permis de déterminer avec certitude la séquence des extrémités 5' et 3' de l'ADNc et les séquences NH2 et COOH des protéines correspondantes, qui ne sont pas conservées entre les différentes AChE. EXAMPLE 2: Evidence of 2 ace genes in Anopheles gambiae
Homologous genes from human acetylcholinesterase and Drosophila genes were searched for fragments of sequences deposited in the databases using TBLASTN software. Two groups of distinct fragments encoding AChE very similar to that of Drosophila have been identified. Two genes of 6975 bp (ace-1) and 5195 bp (ace-2) respectively were reconstructed from overlapping fragments of each group. Gene analysis using FGENESH and BLASTX software shows that the ace-1 and ace-2 genes consist of at least 7 and 8 exons coding for proteins of about 534 and 569 amino acids, respectively. respectively AChEl and AChE2. However, this analysis did not make it possible to determine with certainty the sequence of the 5 'and 3' ends of the cDNA and the NH 2 and COOH sequences of the corresponding proteins, which are not conserved between the different AChEs.
L'analyse des séquences en acides aminés confirme que les protéines AChEl et d'AChE2 sont très homologues à l'AChE de Drosophila (BLASTP : P < e- 180) et contiennent un motif canonique FGESAG autour de la sérine en position 200, en référence à la séquence de l'Ache de Torpedo (S200 figure 1), qui est caractéristique The analysis of amino acid sequences confirms that AChE1 and AChE2 proteins are highly homologous to Drosophila AChE (BLASTP: P <e-180) and contain a FGESAG canonical motif around serine at position 200, reference to the sequence of Torpedo's Ache (S200 figure 1), which is characteristic
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du site actif des AchE. En outre d'autres motifs caractéristiques des AChE ont également été retrouvés dans les deux séquences (AChEl et AChE2): le site de liaison à la choline (résidu Tryptophane en position 84, W84), les trois résidus de la triade catalytique (résidus sérine, acide glutamique et histidine, respectivement en positions 200, 327 et 440 : S200, E327 et H44o), les six résidus cystéine potentiellement impliqués dans des ponts disulfures conservés (C67-C94; C254-C265; C402-C521), et des résidus aromatiques bordant la gorge du site actif (10 et 11 résidus , respectivement pour AChElet AChE2). of the active site of AchE. In addition, other characteristic AChE motifs were also found in the two sequences (AChE1 and AChE2): the choline binding site (tryptophan residue at position 84, W84), the three residues of the catalytic triad (serine residues). , glutamic acid and histidine at positions 200, 327 and 440 respectively: S200, E327 and H44o), the six cysteine residues potentially involved in conserved disulfide bridges (C67-C94, C254-C265, C402-C521), and residues aromatics bordering the throat of the active site (10 and 11 residues, respectively for AChElet AChE2).
Dans les deux séquences, on observe la présence d'un résidu phénylalanine en position 290 (F290) mais pas en position 288 ; caractéristique commune aux AChE d'invertébrés est responsable d'une plus large spécificité de substrat des AChE d'invertébrés, par rapport à celles de vertébrés. In both sequences, the presence of a phenylalanine residue at position 290 (F290) but not at position 288 is observed; common feature of invertebrate AChE is responsible for a broader substrate specificity of invertebrate AChE compared to vertebrate.
L'analyse des séquences C-terminales des AChE de diptère montre la présence d'un peptide hydrophobe correspondant à un signal d'addition d'un glycolipide, indiquant le clivage post-traductionnel d'un fragment C-terminal et l'addition d'une résidu d'ancrage glycolipidique comme chez Drosophila et d'autres espèces de moustiques. Dans toutes les séquences on observe également la présence d'un résidu cystéine dans la séquence C-terminale précédant le site potentiel de clivage du peptide hydrophobe. Ce résidu cystéine pourrait être impliqué dans une liaison disulfure intermoléculaire, liant les deux sous-unités catalytiques du dimère d'AChE. The analysis of the C-terminal sequences of the dipteran AChE shows the presence of a hydrophobic peptide corresponding to a glycolipid addition signal, indicating the post-translational cleavage of a C-terminal fragment and the addition of a glycolipidic anchoring residue as in Drosophila and other mosquito species. In all the sequences, the presence of a cysteine residue in the C-terminal sequence preceding the potential cleavage site of the hydrophobic peptide is also observed. This cysteine residue could be involved in an intermolecular disulfide bond, linking the two catalytic subunits of the AChE dimer.
Les protéines AChEl et AChE2 d'An. gambiae présentent 53 % de similarité entre elles et montrent respectivement : 76 % et 55 % de similarité avec l'AChE de Schizaphis graminum (numéro d'accession NCBI AAK09373 ou GENBANK 12958609), 53 % et 98 % de similarité avec l'AChE d'An. stephensi (GENBANK 2494391), 54 % et 95 % de similarité avec l'AChE d'Aedes aegypti (GENBANK 2133626), 52 % et 83 % de similarité avec l'AChE de Drosophila (GENBANK 17136862). AChEl and AChE2 proteins of An. gambiae show 53% similarity to each other and show: 76% and 55% similarity with AChE of Schizaphis graminum (accession number NCBI AAK09373 or GENBANK 12958609), 53% and 98% similarity with AChE 'Year. stephensi (GENBANK 2494391), 54% and 95% similarity to Aedes aegypti AChE (GENBANK 2133626), 52% and 83% similarity to Drosophila AChE (GENBANK 17136862).
La différence majeure entre AChEl et AChE2 réside dans une insertion de 31 acides aminés dans la séquence d'AChE2 (figure 1). Cette séquence, dénommée "insertion hydrophilique" dans l'AChE de Drosophila, est absente dans les AChEs de vertébrés et de nématodes et pourrait être caractéristique de l'AChE2, au moins chez les diptères. The major difference between AChE1 and AChE2 is an insertion of 31 amino acids in the AChE2 sequence (Figure 1). This sequence, called "hydrophilic insertion" in Drosophila AChE, is absent in vertebrate and nematode AChEs and may be characteristic of AChE2, at least in Diptera.
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Ces résultats démontrent la présence de deux gènes ace dans le génome d'Anophèles gambiae, l'un codant pour AChElqui est apparentée à l'AChE de Schizaphis graminum, et l'autre pour AChE2 qui est apparentée à l'AChE de Drosophila et aux AChEs connues de moustiques. La présence d'autres gènes ace chez An. gambiae est très improbable dans la mesure où des recherches complémentaires dans les bases de données du génome d'An gambiae, en utilisant des paramètres moins stringents, ont détecté uniquement des séquences codant pour des alpha-estérases (EC 3.1.1) et des carboxylestérases (EC 3.1.1.1). These results demonstrate the presence of two ace genes in the Anopheles gambiae genome, one encoding AChE1 which is related to AChE of Schizaphis graminum, and the other for AChE2 which is related to AChE of Drosophila and AChEs known to mosquitoes. The presence of other ace genes in An. Gambiae is highly unlikely as further research in the An gambiae genome databases, using less stringent parameters, has detected only alpha-coding sequences. esterases (EC 3.1.1) and carboxylesterases (EC 3.1.1.1).
EXEMPLE 3 : Mise en évidence d'un unique gène ace chez Drosophila melanogaster
La présence d'un gène homologue du gène ace-1 a été recherchée dans le génome de Drosophila. Les recherches TBLASTN ont permis de détecter le gène ace précédemment identifié, homologue du gène ace-2 d'Anopheles gambiae mais n'ont pas permis de détecter d'autres séquences homologues du gène ace-1. Des recherches à l'aide de paramètres moins stringents ont permis de détecter uniquement des alpha et des carboxylestérases. Ces résultats démontrent que le génome de la drosophile contient un unique gène ace (ace-2). EXAMPLE 3 Demonstration of a unique ace gene in Drosophila melanogaster
The presence of a homologous gene of the ace-1 gene has been sought in the Drosophila genome. TBLASTN searches detected the previously identified ace gene homologous to the ance-2 gene of Anopheles gambiae but failed to detect other homologous sequences of the ace-1 gene. Searches using less stringent parameters have detected only alpha and carboxylesterases. These results demonstrate that the Drosophila genome contains a unique ace (ace-2) gene.
EXEMPLE 4 : en évidence d'au moins deux gènes ace chez les autres espè- ces de moustiques
La présence du gène ace-1 dans le génome d'autres espèces de moustiques a été analysée par PCR à l'aide d'oligonucléotides dégénérés (PdirAGSG et PrevAGSG, SEQ ID NO: 39 et 40) permettant d'amplifier un fragment exonique (fragment K, d'environ 320 pb figure 1), correspondant à des séquences conservées entre les séquences d'AChEl d'An. gambiae et Schizaphis graminum mais divergentes entre les séquences d'AChEl et AChE2 d'An. gambiae. EXAMPLE 4: Evidence of at least two ace genes in other species of mosquito
The presence of the ace-1 gene in the genome of other mosquito species was analyzed by PCR using degenerate oligonucleotides (PdirAGSG and PrevAGSG, SEQ ID NO: 39 and 40) to amplify an exon fragment ( fragment K, of approximately 320 bp FIG. 1), corresponding to sequences conserved between the AChE1 sequences of An. gambiae and Schizaphis graminum but divergent between AChEl and AChE2 sequences of An. gambiae.
La séquence des produits PCR obtenus à partir de l'ADN génomique de différentes espèces de moustiques, montre un pourcentage d'identité très élevé entre les séquences d'Anophèles, Culex et Aedes. En outre, la plupart des substitutions sont silencieuses puisque les séquences en acides aminés déduites de ces séquences nucléotidiques ne diffèrent entre elles que par 5 à 6 acides aminés (Figure 2A). Le fragment K a également été amplifié par RT-PCR à partir de l'ARNm de C. pipiens, indiquant que le gène ace-1 est exprimé sous forme d'ARNm ; ce résultat est en The sequence of PCR products obtained from the genomic DNA of different mosquito species shows a very high percentage identity between the Anopheles, Culex and Aedes sequences. In addition, most substitutions are silent since the amino acid sequences deduced from these nucleotide sequences differ from each other only by 5 to 6 amino acids (Figure 2A). The K fragment was also amplified by RT-PCR from C. pipiens mRNA, indicating that the ace-1 gene is expressed as mRNA; this result is in
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accord avec l'existence, chez C. pipiens, de deux AChEs possédant des propriétés catalytiques distinctes. agree with the existence, in C. pipiens, of two AChEs with distinct catalytic properties.
EXEMPLE 5: Analyse de la liaison entre le gène ace-1 et la résistance aux insecticides
Afin d'analyser la liaison entre le gène 6!ce-7 et la résistance aux insecticides, le fragment K amplifié à partir de l'ADN génomique de C. pipiens résistants (souche R), a été séquence. La comparaison des séquences du fragment K entre les souches S et R montre des différences au niveau de 3 nucléotides (substitutions silencieuses, Figure 2B). L'une de ces substitutions affecte un site EcoRI, ce qui permet de différencier facilement le locus ace-1 des souches S et R par PCR-RFLP : les profils de restriction montrent 1 bande (320 pb) chez les individus homozygotes résistants, 2 bandes (106 pb et 214 pb) chez les moustiques homozygotes SS et 3 bandes (103 pb, 214 pb et 320 pb) chez les moustiques hétérozygotes RS (figure 2C). EXAMPLE 5 Analysis of the Link Between the Ace-1 Gene and Insecticide Resistance
In order to analyze the binding between the 6! Ce-7 gene and the insecticide resistance, the amplified K fragment from the genomic DNA of resistant C. pipiens (strain R) was sequenced. The comparison of the K fragment sequences between the S and R strains shows differences at the level of 3 nucleotides (silent substitutions, Figure 2B). One of these substitutions affects an EcoRI site, which makes it easy to differentiate the ace-1 locus of the S and R strains by PCR-RFLP: the restriction profiles show 1 band (320 bp) in resistant homozygous individuals, 2 bands (106 bp and 214 bp) in homozygous SS and 3-band mosquitoes (103 bp, 214 bp and 320 bp) in heterozygous RS mosquitoes (Figure 2C).
La liaison entre le gène ace-1 et la résistance au propoxur a été étudiée, en triple, de la façon suivante : des larves de croisement en retour (S x R) x S ont été traitées par une dose létale pour les individus sensibles et le génotype d'ace-1 a été analysé chez les survivants, par PCR-RFLP. The binding between the ace-1 gene and the propoxur resistance was studied, in triplicate, as follows: cross-over (S x R) x S larvae were treated with a lethal dose for susceptible individuals and the genotype of ace-1 was analyzed in survivors by PCR-RFLP.
Les résultats montrent que l'exposition au propoxur tue 50 % des larves dans tous les croisements en retour, c'est à dire tous les individus sensibles. The results show that exposure to propoxur kills 50% of the larvae in all return crosses, ie all susceptible individuals.
Toutes les larves survivantes (100 pour chaque croisement en retour, 300 au total) montrent un profil hétérozygote en RFLP, indiquant qu'elles possèdent toutes une copie du gène ace-1 de la souche R. All surviving larvae (100 for each backcross, 300 in total) show a heterozygous RFLP profile, indicating that they all possess a copy of the ace-1 gene of strain R.
Ces résultats démontrent que le gène ace-1 est lié de façon très étroite avec la résistance aux insecticides (moins de 1 % de recombinaison avec un degré de confiance de 0,05). These results demonstrate that the ace-1 gene is very closely related to insecticide resistance (less than 1% recombination with a confidence level of 0.05).
EXEMPLE 6 : de la phylogénie des gènes ace-1 et ace-2. EXAMPLE 6 Phylogeny of the ace-1 and ace-2 genes
Des arbres phylogénénétiques ont été construits à partir des séquences des régions conservées des AChE d'An gambiae (SEQ ID NO: 1 et fragment 34- 393 de la séquence SEQ ID NO: 53, figure 1), des fragments K de C. pipiens et Aedes aegypti (SEQ ID NO: 8 et 9) et de 33 séquences d'AChE disponibles dans GENBANK, à l'aide de la méthode du plus proche voisin (neighbour-joining method), comme décrit dans le matériels et méthodes. Phylogenetic trees were constructed from the sequences of the conserved regions of AChE of An gambiae (SEQ ID NO: 1 and fragment 34-393 of the sequence SEQ ID NO: 53, FIG. 1), K fragments of C. pipiens and Aedes aegypti (SEQ ID NO: 8 and 9) and 33 AChE sequences available in GENBANK, using the neighbor-joining method as described in the materials and methods.
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La figure 3 illustre l'hétérogénéité du nombre de gènes ace au cours de l'évolution du règne animal. Chez les cordés, les céphalocordés possèdent au moins deux gènes ace alors que les urocordés n'en possèdent qu'un seul, comme déduit de l'analyse de leur génome. Chez les arthropodes, les diptères possèdent, soit un seul gène ace (Drosophila du sous-ordre des brachycères) ou deux gènes ace (moustiques du sous-ordre des nématocères). La topologie de l'arbre montre que ces deux gènes ace se sont dupliqués très précocement au cours de l'évolution, probablement avant la séparation entre les protostomes et les deutérostomes. Ces résultats sont supportés par le fait que les AChE de mollusques, de nématodes et d'arthropodes se ramifient à partir des séquences des cordés (craniatia, céphalocordés et urocordés). Les résultats montrent que les arthropodes et les nématodes possèdent une AChE apparentée. Figure 3 illustrates the heterogeneity of the number of ace genes during evolution of the animal kingdom. In strings, cephalocordates possess at least two ace genes whereas urocordates have only one, as deduced from the analysis of their genome. In arthropods, Diptera possess either a single ace gene (Drosophila suborder Brachycera) or two ace genes (mosquito suborder Nematocera). The topology of the tree shows that these two ace genes duplicated themselves very early in evolution, probably before the separation between protostomes and deuterostomes. These results are supported by the fact that AChEs of molluscs, nematodes and arthropods branch out from the sequences of chordates (craniatia, cephalocordate and urocorded). The results show that arthropods and nematodes have a related AChE.
Ces résultats indiquent que les gènes ace-1 et ace-2 identifiés chez les insectes proviennent d'un événement de duplication très ancien et que l'absence du gène ace-1, au moins chez certaines espèces du sous-ordre des brachycères (Drosophila ) résulte de la perte d'un gène ace plutôt que d'une duplication récente du gène ace chez les nématocères. Ces résultats suggèrent également que les extrapolations faites à partir d'études chez D. melanogaster sont à considérer avec réserve dans la mesure où la situation de Drosophila n'est ni représentative des diptères ni de l'ensemble de la classe des insectes. These results indicate that the ace-1 and ace-2 genes identified in insects come from a very old duplication event and the absence of the ace-1 gene, at least in some species of the suborder Brachycere (Drosophila ) results from the loss of an ace gene rather than recent duplication of the ace gene in nematocera. These results also suggest that extrapolations from D. melanogaster studies are to be considered with caution as the Drosophila situation is not representative of Diptera or the entire class of insects.
EXEMPLE 7 : Détermination de la séquence d'ADNc du gène ace-1
L'ADNc d'ace-1 a été cloné à partir de deux souches d'Anopheles gambiae (souche KISUMU sensible et souche YAO résistante) et de deux souches de Culex pipiens (souche S-LAB sensible et souche SR résistante), comme décrit dans le matériels et méthodes. EXAMPLE 7 Determination of the cDNA sequence of the ace-1 gene
The ace-1 cDNA was cloned from two strains of Anopheles gambiae (susceptible KISUMU strain and resistant YAO strain) and two strains of Culex pipiens (susceptible S-LAB strain and resistant SR strain) as described. in materials and methods.
La séquence complète de l'ADNc de la souche KISUMU correspond à la séquence SEQ ID NO: 125 qui code pour une protéine de 737 acides aminés (SEQ ID NO: 126). La séquence complète de l'ADNc et de la protéine AChEl de la souche YAO correspondent respectivement aux séquences SEQ ID NO: 121 et SEQ ID NO: 122. The complete sequence of the cDNA of strain KISUMU corresponds to the sequence SEQ ID NO: 125 which encodes a protein of 737 amino acids (SEQ ID NO: 126). The complete sequence of the cDNA and the AChE1 protein of the YAO strain correspond to the sequences SEQ ID NO: 121 and SEQ ID NO: 122, respectively.
Les séquences SEQ ID NO : 4 et SEQ ID NO : 5 correspondent à la séquence quasi-complète (à l'exception du premier exon codant du gène ace-1), respectivement de l'ADNc et de la protéine AChEl de la souche KISUMU. The sequences SEQ ID NO: 4 and SEQ ID NO: 5 correspond to the quasi-complete sequence (with the exception of the first exon coding for the ace-1 gene), respectively the cDNA and the AChEl protein of the KISUMU strain. .
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La séquence complète de l'ADNc des souches S-LAB et SR de C. pipiens correspond respectivement aux séquences SEQ ID NO: 6 et SEQ ID NO: 56 qui codent pour une protéine de 702 acides aminés (SEQ ID NO: 7 et SEQ ID NO: 57, respectivement pour la souche S-LAB et la souche SR). The complete sequence of the C. pipiens S-LAB and SR strains cDNA corresponds respectively to the sequences SEQ ID NO: 6 and SEQ ID NO: 56 which encode a protein of 702 amino acids (SEQ ID NO: 7 and SEQ ID NO: 57, respectively for strain S-LAB and strain SR).
EXEMPLE 8 : Détermination de la séquence du gène ace-1
La séquence du gène ace-1 a été déterminée à partir de l'ADN génomique de deux souches $ Anophèles gambiae, la souche sensible de référence de l'Afrique de l'Ouest (souche KISUMU) et une souche résistante de Côte d'ivoire (souche YAO), comme décrit dans le matériels et méthodes. EXAMPLE 8 Determination of the sequence of the ace-1 gene
The sequence of the ace-1 gene was determined from the genomic DNA of two strains $ Anopheles gambiae, the West African reference strain (strain KISUMU) and a resistant strain of Ivory Coast. (YAO strain), as described in the materials and methods.
La séquence complète d'An. gambiae correspond à la séquence SEQ ID NO: 127 qui présente une organisation intron-exon comprenant au moins 9 exons et incluant deux exons 5' non-codants (Tableau I)
La séquence quasi-complète (à l'exception des deux premiers exons 5' non-codants) du gène ace-1 de la souche KISUMU correspond à la séquence SEQ ID NO: 23. The complete sequence of An. gambiae corresponds to the sequence SEQ ID NO: 127 which has an intron-exon organization comprising at least 9 exons and including two 5 'non-coding exons (Table I)
The almost complete sequence (with the exception of the first two 5 'non-coding exons) of the ace-1 gene of the strain KISUMU corresponds to the sequence SEQ ID NO: 23.
La séquence quasi- complète (à l'exception des deux premiers exons 5' non-codants et du premier exon codant) du gène ace-1 de la souche YAO correspond à la séquence SEQ ID NO: 120. The almost complete sequence (with the exception of the first two non-coding exons and the first coding exon) of the ace-1 gene of the YAO strain corresponds to the sequence SEQ ID NO: 120.
EXEMPLE 9 : de mutation (s) dansla séquence en acides aminés de la protéine AchEl, responsable (s) de la résistance aux insecticides chez les moustiques des espèces Culex pipiens et Anopheles gambiae. EXAMPLE 9: mutation (s) in the amino acid sequence of the AchE1 protein, responsible (s) for insecticide resistance in mosquitoes Culex pipiens species and Anopheles gambiae.
La séquence nucléotidique codant la protéine AChEl (ADNc) a été déterminée à partir de deux souches d'Anophèles gambiae (souche KISUMU sensible et souche YAO résistante) et de deux souches de Culex pipiens (souche S-LAB sensible et souche SR résistante), comme décrit à l'exemple 7. The nucleotide sequence encoding the AChE1 protein (cDNA) was determined from two strains of Anopheles gambiae (strain KISUMU sensitive and strain YAO resistant) and two strains of Culex pipiens (strain S-LAB sensitive and strain SR resistant), as described in Example 7.
Les séquences en acides aminés de la protéine AChEl des souches sensibles et résistantes, déduites des séquences précédentes, ont ensuite été alignées (figures 5,6 et 9). The amino acid sequences of the AChE1 protein of the sensitive and resistant strains, deduced from the preceding sequences, were then aligned (FIGS. 5, 6 and 9).
La comparaison des séquences en acides aminés de la protéine AChEl de C. pipiens (figure 5 et 6) montre qu'il existe une seule mutation non-silencieuse entre la souche sensible (S-LAB, SEQ ID NO: 7) et la souche résistante aux insecticides (souche SR, SEQ ID NO: 57), située dans la région codée par le troisième The comparison of the amino acid sequences of the C. pipiens AChE1 protein (FIGS. 5 and 6) shows that there is a single non-silent mutation between the sensitive strain (S-LAB, SEQ ID NO: 7) and the strain. insecticide resistant (strain SR, SEQ ID NO: 57), located in the region coded by the third
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exon codant du gène ace-1 : la glycine (GGC) en position 247 (ou en position 119, en référence à la séquence de l'AChE du poisson torpille) de la souche sensible est remplacée par une sérine (AGC) dans la souche résistante (G247 (119) # S247(119)). exon coding for the ace-1 gene: glycine (GGC) in position 247 (or in position 119, with reference to the AChE sequence of the torpedo fish) of the susceptible strain is replaced by a serine (AGC) in the strain resistant (G247 (119) # S247 (119)).
La localisation de l'acide aminé en position 247 dans la structure de l'acétylcholinestérase de C. pipiens et l'effet de la substitution glycine # sérine sur cette structure ont été analysées par modélisation moléculaire à partir de la structure de l'acétylcholinestérase du poisson torpille. Les résultats sont illustrés dans la figure 7 (A, B et C). La figure 7A montre que l'acide aminé en position 119 est proche des résidus du site catalytique (S200 et H44o). La figure 7C montre que, par comparaison avec la glycine de la souche sensible (figure 7B), l'encombrement de la chaîne latérale de la sérine de la souche résistante, réduit l'espace du site catalytique ce qui empêche vraisemblablement l'insecticide d'interagir avec la sérine catalytique (S200). The localization of the amino acid at position 247 in the structure of C. pipiens acetylcholinesterase and the effect of the glycine # serine substitution on this structure were analyzed by molecular modeling from the structure of the acetylcholinesterase of torpedo fish. The results are illustrated in Figure 7 (A, B and C). Figure 7A shows that the amino acid at position 119 is close to the residues of the catalytic site (S200 and H44o). FIG. 7C shows that, by comparison with the glycine of the susceptible strain (FIG. 7B), the congestion of the serine side chain of the resistant strain reduces the space of the catalytic site, which presumably prevents the insecticide from interact with the catalytic serine (S200).
La comparaison des séquences en acides aminés de la protéine AChEl d'An. gambiae montre qu'il existe deux mutations non-silencieuses entre la souche sensible (KISUMU, SEQ ID NO: 5) et la souche résistante aux insecticides (souche YAO, SEQ ID NO: 122) : la première correspond au remplacement de la valine (CGT) en position 33 de la séquence de la souche sensible (SEQ ID NO: 5) par une alanine (CGC) dans la souche résistante et la seconde est la même mutation glycine # sérine que celle trouvée chez Culex pipiens. The comparison of the amino acid sequences of the AChE1 protein of An. gambiae shows that there are two non-silent mutations between the susceptible strain (KISUMU, SEQ ID NO: 5) and the insecticide resistant strain (YAO strain, SEQ ID NO: 122): the first corresponds to the replacement of valine ( CGT) at position 33 of the sequence of the susceptible strain (SEQ ID NO: 5) by an alanine (CGC) in the resistant strain and the second is the same glycine # serine mutation as that found in Culex pipiens.
Etant donnée la position externe de la valine dans la structure de l'acétylcholinestérase, cette mutation n'est certainement pas impliquée dans la résistance chez Anopheles gambiae et seule la sérine doit être responsable de la résistance aux insecticides, à la fois chez Anopheles gambiae et Culex pipiens. Given the external position of valine in the structure of acetylcholinesterase, this mutation is certainly not involved in resistance in Anopheles gambiae and only serine should be responsible for insecticide resistance, both in Anopheles gambiae and Culex pipiens.
EXEMPLE 10 : de la mutation dans le troisième exon codant du gène ace-1 responsable de la résistance aux insecticides chez les moustiques des espèces Culex pipiens et Anopheles gambiae. EXAMPLE 10: mutation in the third exon coding of the ace-1 gene responsible for insecticide resistance in mosquitoes of the Culex pipiens and Anopheles gambiae species.
Le profil de restriction du troisième exon codant du gène ace-1 contenant la mutation glycine # sérine, a été vérifié dans de nombreuses populations et souches de moustiques des espèces C. pipiens et An. gambiae, sensibles et résistantes aux insecticides de la classe des organophosphorés et des carbamates, par PCR-RFLP selon le protocole tel que décrit à l'exemple 1. The restriction profile of the third exon coding for the ace-1 gene containing the glycine # serine mutation was verified in numerous populations and strains of C. pipiens and An. Gambiae mosquitoes, susceptible and resistant to insecticides of the class of organophosphorus and carbamates, by PCR-RFLP according to the protocol as described in Example 1.
De manière plus précise : More precisely:
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- chez C. pipiens, la mutation glycine (GGC) sérine (AGC) introduit un site Alu I (AGCT) unique dans la séquence de la souche résistante, qui est mis en évidence à partir d'un produit PCR de 520 pb, amplifié à l'aide des amorces Ex3dir et Ex3rev, comme illustré dans la figure 6. in C. pipiens, the glycine (GGC) serine mutation (AGC) introduces an Alu I site (AGCT) unique in the sequence of the resistant strain, which is evidenced from a PCR product of 520 bp, amplified using primers Ex3dir and Ex3rev, as shown in Figure 6.
- chez An. gambiae, la mutation glycine (GGC) # sérine (AGC) introduit un deuxième site Alu I (AGCT) dans la séquence de la souche résistante, qui est mis en évidence à partir d'un produit PCR de 541 pb, amplifié à l'aide des amorces Ex3AGdir et Ex3AGrev, comme illustré dans la figure 9. - in An. gambiae, the glycine mutation (GGC) # serine (AGC) introduces a second Alu I site (AGCT) in the sequence of the resistant strain, which is demonstrated from a PCR product of 541 bp, amplified using primers Ex3AGdir and Ex3AGrev, as shown in Figure 9.
Les résultats de PCR-RFLP ont ensuite été vérifiés par séquençage du fragment PCR de 520 pb ou 541 pb du troisième exon codant. The PCR-RFLP results were then verified by sequencing the 520 bp or 541 bp PCR fragment of the third coding exon.
- Espèce C. pipiens
Les populations et souches de Culex pipiens, résitants (R) ou sensibles (S) qui ont été analysées sont présentées dans le Tableau III ci-dessous : - Species C. pipiens
The populations and strains of Culex pipiens, resistant (R) or sensitive (S) that have been analyzed are presented in Table III below:
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Tableau III : et populations de l'espèce C. pipiens analysées
Table III: and populations of the species C. pipiens analyzed
<tb>
<tb> Classification <SEP> Nom <SEP> R/S* <SEP> Pays <SEP> Reference
<tb> C. <SEP> P' <SEP> BO <SEP> R <SEP> Burkina-Faso <SEP> Isolée <SEP> par <SEP> les <SEP> inventeurs
<tb> quinque <SEP> HARARE <SEP> R <SEP> Zimbabwe <SEP> Isolée <SEP> par <SEP> les <SEP> inventeurs
<tb> fasciatus <SEP> SUPERCAR <SEP> R <SEP> Côte <SEP> d'Ivoire <SEP> (F. <SEP> Chandre, <SEP> Thèse <SEP> de <SEP> Doctorat, <SEP> Université <SEP> Paris <SEP> XII, <SEP> 1998). <SEP>
<tb> <Tb>
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<tb> C. <SEP> P <SEP> BO <SEP> R <SEP> Burkina-Faso <SEP> Isolated <SEP> by <SEP> the <SEP> inventors
<tb> quinque <SEP> HARARE <SEP> R <SEP> Zimbabwe <SEP> Isolated <SEP> by <SEP> the <SEP> inventors
<tb> fasciatus <SEP> SUPERCAR <SEP> R <SEP> Cote <SEP> Ivory <SEP> (F. <SEP> Chandre, <SEP> Thesis <SEP> from <SEP> PhD, <SEP> University <SEP> Paris <SEP> XII, <SEP> 1998). <September>
<Tb>
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<tb> MARTINIQUE <SEP> R <SEP> Martinique <SEP> Bourguet <SEP> et <SEP> al., <SEP> Biochem. <SEP> Genet., <SEP> 1996, <SEP> 34, <SEP> 351-362 <SEP>
<tb> RECIFE <SEP> R <SEP> Brésil <SEP> Isolée <SEP> en <SEP> 1995 <SEP> parA.-B. <SEP> Failloux, <SEP> Institut <SEP> Pasteur, <SEP> Paris <SEP> (France)
<tb> PRO-R <SEP> S <SEP> Etats-Unis <SEP> Georghiou <SEP> et <SEP> al., <SEP> Bull. <SEP> Wld <SEP> Hlth <SEP> Org., <SEP> 1966, <SEP> 35, <SEP> 691-708. <SEP>
<tb> DJI <SEP> R <SEP> Mali <SEP> Isolated <SEP> by <SEP> the <SEP> inventors
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<tb> RECIFE <SEP> R <SEP> Brazil <SEP> Isolated <SEP> in <SEP> 1995 <SEP> byA.B. <SEP> Failloux, <SEP> Institut <SEP> Pasteur, <SEP> Paris <SEP> (France)
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<tb> MADURAI <SEP> S <SEP> India <SEP> Nielsen-Leroux, <SEP> and <SEP> al., <SEP> J. <SEP> Med. <SEP> Entomol., <SEP> 2002, <SEP> 39, <SEP> 729-735 <SEP>
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<tb> BRUGES-A <SEP> S <SEP> Belgium <SEP> Raymond <SEP> and <SEP> al., <SEP> Genet. <SEP> Res., <SEP> 1996, <SEP> 67, <SEP> 19 <SEP> -26. <September>
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BRUGES-B <SEP> S <SEP> Belgique <SEP> Raymond <SEP> et <SEP> al., <SEP> Genet. <SEP> Res., <SEP> 1996, <SEP> 67, <SEP> 19-26.
<tb> BRUGES-B <SEP> S <SEP> Belgium <SEP> Raymond <SEP> and <SEP> al., <SEP> Genet. <SEP> Res., <SEP> 1996, <SEP> 67, <SEP> 19-26.
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<tb> C. <SEP> torrentium <SEP> UPPSALA <SEP> , <SEP> S <SEP> Suède <SEP> M. <SEP> Raymond, <SEP> Ent. <SEP> Tidskr., <SEP> 1995, <SEP> 116, <SEP> 65-66.
<tb> KILLCARE <SEP> S <SEP> Autralie <SEP> Guillemaud <SEP> and <SEP> al., <SEP> Proc. <SEP> R. <SEP> Soc. <SEP> Lond. <SEP> B, <SEP> 1997, <SEP> 264, <SEP> 245-251, <SEP>
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<tb> HETEREN <SEP> S <SEP> Netherlands <SEP> Isolated <SEP> by <SEP> the <SEP> inventors
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<Tb>
* R/S résistant ou sensible aux insecticides de la classe des organophosphorés et des carbamates
L'analyse par PCR-RFLP de l'ensemble des moustiques du Tableau III montre qu'il existe une corrélation parfaite entre la résistance aux insecticides et le profil de restriction par PCR-RFLP, à savoir : 1 bande (520 pb) est détectée chez les individus homozygotes sensibles SS, 2 bandes (357 pb et 163 pb) sont détectées chez les individus homozygotes résistants RR et 3 bandes (520 pb, 357 pb et 163 pb) sont détectées chez les individus hétérozygotes résistants RS (figure 8). * R / S resistant or susceptible to insecticides of the organophosphorus and carbamate class
The PCR-RFLP analysis of all the mosquitos in Table III shows that there is a perfect correlation between insecticide resistance and the restriction profile by PCR-RFLP, namely: 1 band (520 bp) is detected in SS susceptible homozygous individuals, 2 bands (357 bp and 163 bp) were detected in RR resistant homozygous individuals and 3 bands (520 bp, 357 bp and 163 bp) were detected in RS resistant heterozygous individuals (Figure 8).
Ces résultats ont été confirmés par le séquençage du produit PCR de 520 pb pour l'ensemble des moustiques du Tableau III analysés par PCR-RFLP. These results were confirmed by the sequencing of the 520 bp PCR product for all Table III mosquitos analyzed by PCR-RFLP.
<Desc/Clms Page number 38><Desc / Clms Page number 38>
L'alignement des séquences obtenues (SEQ ID NO: 60 à 89), illustré dans le Tableau IV ci-dessous montre que chez les moustiques de l'espèce C. pipiens, la mutation glycine # sérine, située en position 739 en référence à la séquence de l'ADNc du gène ace-1 de la souche sensible de référence (souche S-LAB), qui est responsable de la résistance aux insecticides, provient de deux groupes de mutations indépendantes, respectivement chez C. pipiens pipiens et C. pipiens quiquefasciatus. The alignment of the sequences obtained (SEQ ID NO: 60 to 89), shown in Table IV below, shows that in C. pipiens mosquitoes, the glycine # serine mutation, located at position 739 with reference to the cDNA sequence of the ace-1 gene of the reference strain (strain S-LAB), which is responsible for insecticide resistance, comes from two groups of independent mutations, in C. pipiens pipiens and C. pipiens quiquefasciatus.
Tableau IV : de l'origine de la mutation glycine # sérine responsable de la résistance aux insecticides chez les moustiques de l'espèce C. pipiens
Table IV: the origin of the glycine # serine mutation responsible for insecticide resistance in C. pipiens mosquitoes
<tb>
<tb> Position <SEP> des <SEP> mutations <SEP> en <SEP> référence <SEP> à <SEP> la <SEP> séquence <SEP> d'ADNc <SEP> du
<tb> gène <SEP> ace-1 <SEP> de <SEP> la <SEP> souche <SEP> S-LAB <SEP> (SEQ <SEP> ID <SEP> N0:6)
<tb> 444455555666666677777777777788
<tb> 5 <SEP> 5 <SEP> 7 <SEP> 9 <SEP> 1 <SEP> 2 <SEP> 6 <SEP> 7 <SEP> 9 <SEP> 0 <SEP> 5 <SEP> 6 <SEP> 8 <SEP> 8 <SEP> 9 <SEP> 9 <SEP> 1 <SEP> 3 <SEP> 3 <SEP> 4 <SEP> 4 <SEP> 5 <SEP> 6 <SEP> 7 <SEP> 7 <SEP> 8 <SEP> 9 <SEP> 9 <SEP> 1 <SEP>
<tb> 031838437310141642917634700836
<tb> Souches <SEP> de <SEP> C. <SEP> pipiens
<tb> C. <SEP> pipiens <SEP> quiquefascia
<tb> BO <SEP> (R)* <SEP> T <SEP> C <SEP> A <SEP> T <SEP> C <SEP> G <SEP> G <SEP> G <SEP> G <SEP> C <SEP> G <SEP> G <SEP> G <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> A <SEP> C <SEP> C <SEP> T <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> G <SEP> G <SEP> A <SEP> T
<tb> Harare <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<tb> Supercar <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<tb> DJI <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<tb> Martinique <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<tb> Recife <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<tb> <Tb>
<tb> Position <SEP> of <SEP> mutations <SEP> in <SEP> reference <SEP> to <SEP><SEP> sequence <SEP> of cDNA <SEP> of
<tb> gene <SEP> ace-1 <SEP> of <SEP> the <SEP> strain <SEP> S-LAB <SEP> (SEQ <SEP> ID <SEP> N0: 6)
<tb> 444455555666666677777777777788
<tb> 5 <SEP> 5 <SEP> 7 <SEP> 9 <SEP> 1 <SEP> 2 <SEP> 6 <SEP> 7 <SEP> 9 <SEP> 0 <SEP> 5 <SEP> 6 <SEP > 8 <SEP> 8 <SEP> 9 <SEP> 9 <SEP> 1 <SEP> 3 <SEP> 3 <SEP> 4 <SEP> 4 <SEP> 5 <SEP> 6 <SEP> 7 <SEP> 7 <SEP> 8 <SEP> 9 <SEP> 9 <SEP> 1 <SEP>
<tb> 031838437310141642917634700836
<tb> Strains <SEP> of <SEP> C. <SEP> pipiens
<tb> C. <SEP> pipiens <SEP> quiquefascia
<tb> BO <SEP> (R) * <SEP> T <SEP> C <SEP> A <SEP> T <SEP> C <SEP> G <SEP> G <SEP> G <SEP> G <SEP> C <SEP> G <SEP> G <SEP> G <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> A <SEP> C <SEP> C <SEP> T <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> C <SEP> G <SEP> G <SEP> A <SEP> T
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<tb> Supercar <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP > - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<tb> DJI <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP > - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<tb> Martinique <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP > - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<tb> Recife <SEP> (R) <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP > - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP>
<Tb>
ProR(S)* - T ~ C ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ G ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ G
ProR (S) * - T ~ C ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ G ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ G
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<tb> S-Lab <SEP> (S) <SEP> - <SEP> T <SEP> - <SEP> C <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> G <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> G
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<Tb>
TemR (S) - T ~ ~ ~ ~ ~ A - - - - - - - - - - G - - - - - - - A - - -
TemR (S) - T ~ ~ ~ ~ ~ A - - - - - - - - - - G - - - - - - - A - - -
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Ling (S - T C C - - - - - - - - - - - - - - G - - - - T - - - - - Thai (S) - T C C - - - - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - G Mao (S) - T- C - - - - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - -
Ling (S - TCC - - - - - - - - - - - - - - G - - - - T - - - - - Thai (S) - TCC - - - - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - G Mao (S) - T- C - - - - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - -
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BSQ (S) - Tee - - - - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - G BE (S) - T ~ ~ ~ ~ ~ A - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - -
BSQ (S) - Tee - - - - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - G BE (S) - T ~ ~ ~ ~ ~ A - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - -
<tb>
<tb> Boualse <SEP> (S) <SEP> - <SEP> T <SEP> - <SEP> C <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> G <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> - <SEP> -
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- An. gambiae
Des souches sensibles KISUMU (souche sensible de référence de l'Afrique de l'est) et VK-PER (souche de référence KDR de l'Afrique de l'ouest) ainsi que des populations sensibles de la région de Yaoundé ont été testées par le test PCR-RFLP comme décrit ci-dessus. - An. Gambiae
Sensitive strains KISUMU (reference strain of East Africa) and VK-PER (reference strain KDR of West Africa) as well as susceptible populations of the Yaoundé region were tested by the PCR-RFLP test as described above.
Les résultats du test PCR-RFLP, montrent qu'il existe pour l'ensemble des moustiques An. gambiae analysés, une corrélation parfaite entre la résistance aux insecticides et le profil de restriction par PCR-RFLP, à savoir : 2 bandes (403 pb et 138 pb) sont détectées chez les individus homozygotes sensibles SS, 2 bandes (253 pb et environ 150 pb) ou 3 bandes (403 pb, 253 pb et environ 150 pb) sont détectées chez les individus résistants, respectivement chez les individus homozygotes (RR) et hétérozygotes (RS). The results of the PCR-RFLP test show that for all the An. Gambiae mosquitoes analyzed, there is a perfect correlation between the insecticide resistance and the restriction profile by PCR-RFLP, namely: 2 bands (403 bp) and 138 bp) are detected in susceptible SS homozygous individuals, 2 bands (253 bp and about 150 bp) or 3 bands (403 bp, 253 bp and about 150 bp) are detected in resistant individuals, respectively in homozygous individuals ( RR) and heterozygotes (RS).
EXEMPLE 11 : Analyse de l'activité acétylcholinestérase des protéines AChEl sensibles et résistantes aux insecticides. EXAMPLE 11 Analysis of the acetylcholinesterase activity of AChEl proteins that are sensitive and resistant to insecticides.
Les AchEl recombinantes de respectivement la souche S-LAB et la souche SR ont été exprimées dans des cellules d'insecte et l'activité acétylcholinestérase a été mesurée à partir des extraits cellulaires comme décrit à l'exemple 1. The recombinant AchE1 of the S-LAB strain and the SR strain respectively were expressed in insect cells and the acetylcholinesterase activity was measured from the cell extracts as described in Example 1.
Les résultats illustrés dans la figure 10 montrent que l'unique mutation glycine247(119)->sérine247(119) rend l'acétylcholinestérase insensible à l'insecticide. The results shown in Figure 10 show that the single mutation glycine247 (119) -> serine247 (119) renders acetylcholinesterase insensitive to insecticide.
Ainsi que cela ressort de ce qui précède, l'invention ne se limite nullement à ceux de ses modes de mise en #uvre, de réalisation et d'application qui viennent d'être décrits de façon plus explicite ; elle en embrasse au contraire toutes les variantes qui peuvent venir à l'esprit du technicien en la matière, sans s'écarter du cadre, ni de la portée, de la présente invention. As is apparent from the foregoing, the invention is not limited to those of its modes of implementation, implementation and application which have just been described more explicitly; it encompasses all the variants that may come to the mind of the technician in the field, without departing from the scope or scope of the present invention.
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