FR2830534A1 - New polypeptide based on human immune deficiency virus gp41, useful in preventative or therapeutic vaccine, induces neutralizing antibodies against primary isolates - Google Patents

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Abstract

Polypeptides (I) containing fragments of the HIV gp41 protein and able to adopt a alpha -helical conformation are new. Polypeptides of formula (I) containing fragments of the HIV gp41 protein and able to adopt a alpha -helical conformation are new, where (N-S1)n-C-(S2-N)m (I) N = amino acids (aa) 30-77 of gp41; C = aa 117-154 of gp41; S1 and S2 = aa sequence such that (I) adopts an alpha -helical conformation, or may be absent; n and m = 0-1, but not both 0 The alpha -helical conformation is determined by the program SOPMA using the parameters: number of conformational states = 4; limit of similarity = 8 and width of window = 70. Independent claims are also included for the following: (1) Conjugate (II) of (I) with a carrier protein or peptide; (2) DNA sequence (III) that encodes (I) or (II); (3) Vector that contains (III); (4) Host cell containing the vector of (3); and (5) Preparation of polypeptides by expression from cells of (4).

Description

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La présente invention se rapporte à un antigène polypeptidique dérivant de la protéine gp41, ainsi qu'à son utilisation pour l'immunisation contre les infections liées au VIH., ces travaux ont été co-financés par l'ANRS.  The present invention relates to a polypeptide antigen derived from the gp41 protein, as well as its use for immunization against HIV-related infections., This work has been co-funded by the ANRS.

La mise au point d'une méthode d'immunisation contre le VIH est aujourd'hui l'une des priorités de la recherche scientifique.  The development of an immunization method against HIV is now one of the priorities of scientific research.

Les obstacles majeurs que sont la grande variabilité génétique du virus et la faible exposition au système immunitaire d'épitopes viraux neutralisants freinent considérablement l'élaboration d'une immunité neutralisante.  The major obstacles of the high genetic variability of the virus and the low immune system exposure of neutralizing viral epitopes significantly hamper the development of neutralizing immunity.

La glycoprotéine d'enveloppe du VIH qui est requise pour conférer au virus son caractère infectieux représente la cible d'anticorps neutralisants. Ces caractéristiques ont fait de cette dernière un sujet d'investigations intenses.  The HIV envelope glycoprotein that is required to confer the virus's infectivity represents the target of neutralizing antibodies. These characteristics have made the latter a subject of intense investigation.

L'enveloppe glycoprotéique (env) du virus d'immunodéficience humaine-l (VIH- 1) est synthétisée à partir du précurseur gpl60 qui donne sous l'action d'une protéase les sous-unités gpl20 et gp41.  The glycoprotein envelope (env) of the human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) is synthesized from the precursor gp160 which gives under the action of a protease the gp120 and gp41 subunits.

La fixation de gpl20/gp41 aux récepteurs cellulaires induit un changement de conformation de la gp41 d'un état latent (non-fusogène) à un état fusion-actif (fusogène).  The binding of gp120 / gp41 to cell receptors induces a conformational change in gp41 from a latent (non-fusogenic) state to a fusion-active (fusogenic) state.

Entre ces deux états, existe un état transitoire dit"intermédiaire"pendant lequel la gp41 se présente comme une protéine membranaire à la fois dans les membranes virale et cellulaire (Weissenhorn et al Nature (1997), 387 (6631), 426-30). Between these two states, there exists a so-called "intermediate" transient state during which gp41 is presented as a membrane protein in both the viral and cellular membranes (Weissenhorn et al Nature (1997), 387 (6631), 426-30). .

L'utilisation à des fins vaccinales de la gp41 dans sa conformation fusogénique est décrite dans WOOO/40616. Selon cette demande, les hélices N peuvent être utilisées seules ou en association avec les hélices C pour reproduire dans ce dernier cas la conformation fusogène de la gp41.  The vaccine use of gp41 in its fusogenic conformation is described in WO00 / 40616. According to this application, the N helices can be used alone or in combination with the C helices to reproduce in the latter case the fusogenic conformation of the gp41.

Des expériences de liaison ont permis d'établir d'autre part que l'état latent nonfusogène est caractérisé par l'inaccessibilité de larges portions de l'ectodomaine de la gp41. La gpl20 interagit en effet de sorte à masquer les épitopes. Il a par ailleurs été montré que l'inhibition du changement de structure de l'état intermédiaire vers l'état fusogène par des peptides utilisés en tant que compétiteurs pouvait affecter l'infection virale (Weissenhom W. et al, Molecular Membrane Biology, 1999,16, 3-9).  Liaison experiments have also established that the nonfusogenic latent state is characterized by the inaccessibility of large portions of the ectodomain of gp41. The gp120 interacts in effect so as to mask the epitopes. It has also been shown that the inhibition of the change of structure from the intermediate state to the fusogenic state by peptides used as competitors could affect the viral infection (Weissenhom W. et al, Molecular Membrane Biology, 1999 , 16, 3-9).

La demanderesse propose un nouvel antigène polypeptidique utilisable pour l'immunisation thérapeutique et prophylactique contre les infections liées au VIH. La demanderesse a en effet mis en évidence pour la première fois qu'un polypeptide mimant  The Applicant proposes a new polypeptide antigen that can be used for therapeutic and prophylactic immunization against HIV-related infections. The Applicant has indeed demonstrated for the first time that a polypeptide mimicking

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l'état intermédiaire de la gp41 est capable d'induire des anticorps neutralisant les isolats primaires du VIH
La présente invention concerne donc un polypeptide comprenant une séquence de formule 1 :

Figure img00020001

dans laquelle : N représente la séquence des acides aminés 30 à 77 de la gp41, C représente la séquence des acides aminés 117 à 154 de la gp41, SI et S2 sont indépendamment l'un de l'autre soit absents, soit représentent une séquence d'acides aminés telle que la séquence de formule 1 adopte une conformation en hélice
Figure img00020002

alpha telle que déterminée par le logiciel SOPMA dans les conditions suivantes : * nombre d'états conformationnels = 4 'Limite de similarité = 8 et, 'Largeur de la fenêtre = 70 n = 0 ou 1 ; m = 0 ou 1 et m + n = 1 ou 2. the intermediate state of gp41 is able to induce antibodies that neutralize primary HIV isolates
The present invention thus relates to a polypeptide comprising a sequence of formula 1:
Figure img00020001

in which: N represents the amino acid sequence 30 to 77 of gp41, C represents the amino acid sequence 117 to 154 of gp41, S1 and S2 are independently of each other either absent or represent a sequence of amino acids such that the sequence of formula 1 adopts a helical conformation
Figure img00020002

alpha as determined by the SOPMA software under the following conditions: * number of conformational states = 4 'Similarity limit = 8 and,' Width of the window = 70 n = 0 or 1; m = 0 or 1 and m + n = 1 or 2.

De préférence, le polypeptide tel que défini ci-dessus comprend une séquence de formule 1 dans laquelle m + n = 1.  Preferably, the polypeptide as defined above comprises a sequence of formula 1 in which m + n = 1.

De préférence SI est absent ou représente la séquence d'acides aminés D, DQ, DQQ, DQQL ou DNNMT et S2 est absent ou représente la séquence d'acides aminés W, WA, WAS, WASL ou WASLW.  Preferably, SI is absent or represents the amino acid sequence D, DQ, DQQ, DQQL or DNNMT and S2 is absent or represents the amino acid sequence W, WA, WAS, WASL or WASLW.

Les séquence d'acides aminés SI et S2 sont définies en utilisant le code à une lettre dans lequel D représente l'acide aspartique, Q représente la glutamine, etc...  The amino acid sequences S1 and S2 are defined using the one-letter code in which D is aspartic acid, Q is glutamine, etc.

Selon un mode de réalisation particulier le polypeptide comprend une séquence de formule 1 telle que définie ci-dessus dans laquelle N représente SEQ ID ? 26 et C représente SEQ ID Ni27.  According to a particular embodiment, the polypeptide comprises a sequence of formula 1 as defined above in which N represents SEQ ID. And C is SEQ ID Ni27.

Selon un autre mode de réalisation, le polypeptide selon l'invention comprend une séquence supplémentaire de formule (G) a-S- (H) b dans laquelle G représente un résidu glycine, H représente un résidu histidine, a est supérieur ou égal à 4 et b est supérieur ou égal à 6. Ladite séquence est liée par liaison amide à l'extrémité NH2-terminale ou COOH-terminale du polypeptide selon l'invention.  According to another embodiment, the polypeptide according to the invention comprises a further sequence of formula (G) aS- (H) b in which G represents a glycine residue, H represents a histidine residue, a is greater than or equal to 4 and b is greater than or equal to 6. Said sequence is linked by amide bond to the NH 2 -terminal or COOH-terminal end of the polypeptide according to the invention.

Selon un autre aspect la présente invention concerne un conjugué comprenant un polypeptide selon l'invention conjugué à une protéine ou un peptide porteur.  According to another aspect, the present invention relates to a conjugate comprising a polypeptide according to the invention conjugated to a protein or a carrier peptide.

Selon un autre aspect, la présente invention concerne une séquence d'ADN codant pour un polypeptide selon l'invention ou pour un conjugué selon l'invention.  According to another aspect, the present invention relates to a DNA sequence coding for a polypeptide according to the invention or for a conjugate according to the invention.

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La présente invention concerne également un vecteur d'expression comprenant ladite séquence d'ADN ainsi qu'une cellule hôte contenant ledit vecteur.  The present invention also relates to an expression vector comprising said DNA sequence as well as a host cell containing said vector.

La présente invention a également pour objet une composition pharmaceutique comprenant au moins un polypeptide tel que défini ci-dessus, ou au moins un conjugué tel que défini ci-dessus, ou au moins un vecteur d'expression tel que défini ci-dessus, un excipient pharmaceutiquement acceptable et éventuellement un adjuvant.  The present invention also relates to a pharmaceutical composition comprising at least one polypeptide as defined above, or at least one conjugate as defined above, or at least one expression vector as defined above, a pharmaceutically acceptable excipient and optionally an adjuvant.

Selon un mode de réalisation particulier, la présente invention concerne une composition pharmaceutique telle que définie ci-dessus administrable par voie orale.  According to one particular embodiment, the present invention relates to a pharmaceutical composition as defined above that can be administered orally.

La présente invention a donc également pour objet le polypeptide tel que défini cidessus pour son utilisation à titre de médicament et en particulier pour son utilisation pour l'immunisation du corps humain contre les infections liées au VIH.  The present invention therefore also relates to the polypeptide as defined above for its use as a medicament and in particular for its use for the immunization of the human body against HIV-related infections.

Un autre objet de la présente invention a trait au procédé de préparation d'un polypeptide tel que défini ci-dessus comprenant l'expression dudit polypeptide à partir d'une cellule hôte telle que définie ci-dessus.  Another object of the present invention relates to the process for preparing a polypeptide as defined above comprising the expression of said polypeptide from a host cell as defined above.

L'invention est décrite plus en détails dans la description qui suit.  The invention is described in more detail in the description which follows.

Le phénomène de changement de conformation de la gp41 précédant la fusion des membranes cellulaires et virales est illustré à la figure 1. La fixation de la gpl20 sur le récepteur et le co-récepteur du virus provoque une première modification qui entraîne le dépliement du peptide de fusion et son ancrage dans la membrane cellulaire. A ce moment un état intermédiaire se forme dans lequel il n'y a pas d'interaction entre les hélices N et C. Le second événement illustré à la figure 1 est le repliement de la gp41 qui correspond à l'adoption d'une conformation thermodynamiquement plus stable de la molécule.  The phenomenon of conformational change of gp41 preceding the fusion of cellular and viral membranes is illustrated in FIG. 1. The binding of gp120 on the receptor and the co-receptor of the virus causes a first modification which causes the unfolding of the peptide of fusion and its anchoring in the cell membrane. At this moment an intermediate state is formed in which there is no interaction between the helices N and C. The second event illustrated in FIG. 1 is the folding of the gp41 which corresponds to the adoption of a conformation. thermodynamically more stable of the molecule.

L'énergie libérée au cours de ce repliement permet le rapprochement et la fusion des lipides des membranes cellulaire et virale. The energy released during this folding allows the approximation and fusion of the lipids of the cell and viral membranes.

La demanderesse a mis évidence de façon surprenante que le polypeptide selon l'invention qui mime l'état intermédiaire de la gp41 induisait des anticorps neutralisant les isolats primaires du VIH. L'induction d'anticorps neutralisant les isolats primaires peut être aisément déterminée par le test de neutralisation tel que décrit dans l'article de C. Moog et al (AIDS Research and human retroviruses, vol. 13 (1), 13-27,1997) auquel on pourra se référer pour un descriptif complet de ce dernier. On estime dans le cadre de la présente invention que des anticorps neutralisants ont été induits par l'antigène testé lorsque le sérum dilué au 1/5 entraîne une réduction d'un facteur 10 de la quantité de p24 présente dans le surnageant de culture.  The applicant has surprisingly demonstrated that the polypeptide according to the invention which mimics the intermediate state of gp41 induces antibodies which neutralize the primary isolates of HIV. Induction of antibodies neutralizing the primary isolates can be readily determined by the neutralization assay as described in the article by C. Moog et al (AIDS Research and Human Retroviruses, Vol 13 (1), 13-27, 1997) which can be referred to for a complete description of the latter. In the context of the present invention it is believed that neutralizing antibodies were induced by the tested antigen when the 1/5 diluted serum resulted in a 10-fold reduction in the amount of p24 present in the culture supernatant.

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Cette propriété fait du polypeptide selon l'invention un candidat vaccinal d'intérêt pour l'homme.  This property makes the polypeptide according to the invention a vaccine candidate of interest for humans.

Le polypeptide selon la présente invention à la particularité d'adopter, dans des conditions physiologiques, une conformation que l'on peut qualifier d'ouverte par opposition à la conformation fermée de la gp41 sous forme fusogène dans laquelle les domaines N et C sont appariés les uns aux autres selon une orientation anti-parallèle (Cf.  The polypeptide according to the present invention has the particularity of adopting, under physiological conditions, a conformation that may be described as open in opposition to the closed conformation of gp41 in fusogenic form in which the N and C domains are paired. to each other in an anti-parallel orientation (Cf.

Fig. 1). Fig. 1).

En effet, la conformation ouverte du polypeptide selon l'invention se caractérise par le fait que la séquence C n'est pas appariée à la séquence N selon l'orientation anti-parallèle telle que présente dans la forme fusogène. Le polypeptide selon la présente invention est de préférence sous une forme trimérique dans laquelle les séquences N et les séquences C sont respectivement appariées entre elles selon une orientation parallèle. Indeed, the open conformation of the polypeptide according to the invention is characterized in that the C sequence is not matched to the N sequence in the anti-parallel orientation as present in the fusogenic form. The polypeptide according to the present invention is preferably in a trimeric form in which the N sequences and the C sequences are respectively paired with each other in a parallel orientation.

La demanderesse a également mis en évidence de façon surprenante que le polypeptide selon l'invention conservait sa conformation ouverte en milieu fortement acide. Cette propriété fait du polypeptide selon l'invention un antigène vaccinal administrable par voie orale. La demanderesse a en effet montré que l'ectodomaine de la protéine gp41 est extrêmement thermostable à pH2,5. La mesure du Tm (température à laquelle 50% des protéines présentes sont dénaturées) de la gp41 dans 50mM de formate

Figure img00040001

de sodium par DSC (calorimétrie différentielle à balayage) donne une valeur de 110 C, le début du phénomène de dénaturation apparaissant à environ 100 C à pH=2, 5. La thermostabilité de la protéine gp41 à pH neutre a été évaluée par Weissenhorn et al (EMBO, 1996,7, 1507-1514). Le Tm mesuré à pH neutre par ces auteurs est de 78 C, ce qui signifie que de façon surprenante cette protéine est plus stable à pH acide qu'à pH neutre. Ces résultats ont été confirmé par une analyse par dichroïsme circulaire visant à calculer le pourcentage d'hélice alpha dans la protéine. The Applicant has also surprisingly demonstrated that the polypeptide according to the invention retains its open conformation in a strongly acidic medium. This property makes the polypeptide according to the invention an orally administrable vaccine antigen. The Applicant has indeed shown that the ectodomain of the gp41 protein is extremely heat stable at pH2.5. The measurement of Tm (temperature at which 50% of the proteins present are denatured) of gp41 in 50 mM of formate
Figure img00040001

of sodium by DSC (differential scanning calorimetry) gives a value of 110 C, the beginning of the denaturation phenomenon appearing at about 100 C at pH = 2, 5. The thermostability of the protein gp41 at neutral pH was evaluated by Weissenhorn and al (EMBO, 1996, 7, 1507-1514). The Tm measured at neutral pH by these authors is 78 ° C., which means that, surprisingly, this protein is more stable at acid pH than at neutral pH. These results were confirmed by circular dichroism analysis to calculate the percentage of alpha helix in the protein.

La demanderesse a également montré que le polypeptide selon l'invention présentait la même particularité. Cette propriété spécifique fait du polypeptide selon l'invention un antigène vaccinal de choix pour une administration par voie orale. The Applicant has also shown that the polypeptide according to the invention has the same peculiarity. This specific property makes the polypeptide according to the invention a vaccine antigen of choice for oral administration.

Cette conformation ouverte est obtenue par la liaison directe des séquences N et C telle que définies ci-dessus. Dans un tel cas, SI et S2 sont absents et le dernier acide aminé de la séquence N est directement lié par liaison amide au premier acide aminé de la séquence C ou inversement (ex : AA33-77-AA117-154). Cette conformation ouverte est également obtenue lorsque les séquences N et C telles que définies ci-dessus sont reliées entre elles via une séquence SI ou S2 telle que la séquence résultante de formule I adopte  This open conformation is obtained by the direct bonding of the N and C sequences as defined above. In such a case, SI and S2 are absent and the last amino acid of the N sequence is directly linked by amide bond to the first amino acid of the C sequence or vice versa (eg AA33-77-AA117-154). This open conformation is also obtained when the N and C sequences as defined above are connected to each other via a sequence S1 or S2 such that the resulting sequence of formula I adopts

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une conformation en hélice alpha telle que déterminée par le logiciel SOPMA dans les conditions suivantes : nombre d'états conformationnels = 4 ; limite de similarité = 8 et largeur de la fenêtre = 70.  an alpha helix conformation as determined by the SOPMA software under the following conditions: number of conformational states = 4; similarity limit = 8 and width of the window = 70.

La conformation ouverte selon l'invention se caractérise en effet par l'absence d'une région flexible entre les séquences N et C. Le logiciel SOPMA disponible sur le site : http : //npsa-pbil. ibcp. n-/cgi-bin/npsaautomat. pl ? page=/NPSA/npsasopma. html (GeourjonC et Deléage G. SOPMA, Casios (1995), 11,681-684) permet de déterminer aisément si la séquence SI ou S2 adopte dans le cadre du polypeptide de formule 1 une conformation en hélice alpha appropriée dans le cadre de la présente invention.  The open conformation according to the invention is characterized in fact by the absence of a flexible region between the sequences N and C. The SOPMA software available on the site: http: // npsa-pbil. IBCP. n / cgi-bin / npsaautomat. pl? page = / SNPA / npsasopma. html (GeourjonC and Deléage G. SOPMA, Casios (1995), 11, 681-684) makes it easy to determine whether the SI or S2 sequence adopts within the framework of the polypeptide of formula 1 an appropriate alpha-helix conformation in the context of the present invention. .

Selon un mode de réalisation préféré m + n = 1 et si SI est absent S2 représente W, WA, WAS, WASL ou WASLW et si S2 est absent SI représente D, DQ, DQQ, DQQL ou DNNMT.  According to a preferred embodiment m + n = 1 and if SI is absent S2 represents W, WA, WAS, WASL or WASLW and if S2 is absent SI represents D, DQ, DQQ, DQQL or DNNMT.

De plus, selon un mode de réalisation particulièrement préféré, dans le polypeptide

Figure img00050001

tel que défini ci-dessus les séquences AA30-AA77 et AA117-AA154 correspondent respectivement aux séquences SEQ ID N26 et SEQ ID Ni27. In addition, according to a particularly preferred embodiment, in the polypeptide
Figure img00050001

as defined above, the AA30-AA77 and AA117-AA154 sequences respectively correspond to the sequences SEQ ID N26 and SEQ ID Ni27.

Les séquences AA30-AA77 et AA117-AA154 issues de la gp41 sont numérotées en prenant pour référence la numérotation de la séquence de la protéine gp41 telle que donnée dans le listing de séquences sous l'intitulé SEQ ID ? 25. La séquence SEQ ID ? 25 correspond une protéine gp41 LAI tronquée dans laquelle le premier acide aminé A porte le numéro 1.  The AA30-AA77 and AA117-AA154 sequences resulting from gp41 are numbered, taking for reference the numbering of the sequence of the gp41 protein as given in the sequence listing under the heading SEQ ID? 25. The sequence SEQ ID? Corresponds to a truncated LAI gp41 protein in which the first amino acid A has the number 1.

Les séquences AA30-AA77 et AA117-AA154 selon la présente invention peuvent être issues de toute protéine gp 41 du VIH, incluant les souches VIH1 et VIH2, incluant les souches de laboratoire et les isolats primaires. De préférence les séquences N et C selon la présente invention sont issues d'une souche VIH1 et en particulier d'une souche VIH 1 LAI.  The AA30-AA77 and AA117-AA154 sequences of the present invention may be derived from any HIV 41 gp protein, including the HIV1 and HIV2 strains, including the laboratory strains and the primary isolates. Preferably, the sequences N and C according to the present invention are derived from an HIV1 strain and in particular from an HIV1 LAI strain.

Les séquences nucléotidiques et peptidiques d'un grand nombre de protéine gp41 sont connues et disponibles par exemple sur Internet sur le site http : //hiv-web. lanl. go ainsi que dans les compendium correspondant de Los Adamos. Il est clair que toute séquence dans laquelle une ou plusieurs mutations conservatives qui n'altèrent substantiellement ni l'immunogénicité ni la conformation ouverte ont été introduites est également incluse dans le cadre de la présente invention.  The nucleotide and peptide sequences of a large number of gp41 proteins are known and available, for example, on the Internet on the website http: // hiv-web. LANL. go as well as in the corresponding compendium of Los Adamos. It is clear that any sequence in which one or more conservative mutations that do not substantially alter either the immunogenicity or the open conformation has been introduced is also included within the scope of the present invention.

La conformation ouverte selon la présente invention se caractérise par un certain nombre de paramètres mesurables par la technique de DSC et la technique de dichroïsme circulaire. Ces techniques sont décrites en détails dans les articles suivants de A. Cooper et  The open conformation according to the present invention is characterized by a number of parameters measurable by the DSC technique and the circular dichroism technique. These techniques are described in detail in the following articles by A. Cooper and

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al, Phil Trans. R. Soc. Lon. A (1993). 345,23-25, et de V. V. Plotnikov et al Analytical Biochemistry 250,237-244, (1997) et S. M. Kelly et N. C. Price (1997) Biochim. Biophys.  al, Phil Trans. R. Soc. Lon. A (1993). 345,23-25, and V. V. Plotnikov et al. Analytical Biochemistry 250,237-244, (1997) and S. M. Kelly and N. C. Price (1997) Biochim. Biophys.

Acta. 1338,161-185. Acta. 1338.161 to 185.

La DSC mesure les paramètres thermodynamiques de la dénaturation des protéines. La dénaturation des protéines est un événement endothermique évaluable par la mesure de l'absorption de la chaleur par la protéine en fonction de la température. Les deux principaux paramètres obtenus sont : - le Tm ou point de demi-dénaturation (i. e. température à laquelle 50% de la protéine est présente sous forme native et 50% sous forme dénaturée) et - le AH ou variation d'enthalpie pendant la dénaturation (i. e. la chaleur nécessaire pour dénaturer la protéine). DSC measures the thermodynamic parameters of protein denaturation. Denaturation of proteins is an endothermic event that can be evaluated by measuring the heat absorption by the protein as a function of temperature. The two main parameters obtained are: - Tm or half-denaturation point (ie temperature at which 50% of the protein is present in native form and 50% in denatured form) and - AH or enthalpy variation during denaturation (ie the heat needed to denature the protein).

Ces deux paramètres sont des marqueurs précis de la conformation d'une protéine. These two parameters are precise markers of the conformation of a protein.

Une analyse par DSC est détaillée dans l'exemple 5 par référence à la figure 2. A DSC analysis is detailed in Example 5 with reference to Figure 2.

La technique de dichroïsme circulaire permet quant à elle d'évaluer la structure secondaire de la protéine. Le signal d'une hélice alpha est caractérisé par des minima à 208nm et 222nm. La valeur du signal à 222nm est utilisée pour déterminer le pourcentage d'hélice alpha dans une protéine. Le signal d'une boucle est caractérisé par un maximum à environ 205nm. Cette technique permet de mettre en évidence que le polypeptide selon l'invention ne contient pas la boucle normalement présente dans la forme fusogène et qu'il est constitué presque exclusivement, voire exclusivement, d'une hélice alpha.  The circular dichroism technique is used to evaluate the secondary structure of the protein. The signal of an alpha helix is characterized by minima at 208nm and 222nm. The signal value at 222nm is used to determine the percentage of alpha helix in a protein. The signal of a loop is characterized by a maximum at about 205 nm. This technique makes it possible to demonstrate that the polypeptide according to the invention does not contain the loop normally present in the fusogenic form and that it consists almost exclusively or exclusively of an alpha helix.

Une analyse par dichroïsme circulaire est détaillée dans l'exemple 6 par référence à la figure 3. Circular dichroism analysis is detailed in Example 6 with reference to FIG.

Bien que le polypeptide selon la présente invention présente une conformation ouverte qui soit stable, cette conformation peut être renforcée par addition de résidus cystéines aux extrémités du polypeptide. A cette fin, deux résidus cystéine supplémentaires peuvent être ajoutés en N-terminal ou en C-terminal, de préférence en Nterminal du polypeptide selon l'invention pour fixer par covalence le trimère dans une conformation ouverte.  Although the polypeptide according to the present invention has an open conformation that is stable, this conformation can be enhanced by adding cysteine residues to the ends of the polypeptide. For this purpose, two additional cysteine residues may be added at the N-terminus or at the C-terminus, preferably at the N-terminus of the polypeptide according to the invention for covalently fixing the trimer in an open conformation.

Le polypeptide selon l'invention peut être obtenu par toute technique classique de synthèse chimique ou de génie génétique.  The polypeptide according to the invention can be obtained by any conventional technique of chemical synthesis or genetic engineering.

Lorsque le polypeptide est produit par synthèse chimique, le polypeptide selon l'invention peut être synthétisé sous la forme d'une séquence unique, ou sous la forme de plusieurs séquences qui sont ensuite liées les unes aux autres. La synthèse chimique peut être réalisée en phase solide ou en solution, ces deux techniques de synthèse étant bien When the polypeptide is produced by chemical synthesis, the polypeptide according to the invention can be synthesized in the form of a single sequence, or in the form of several sequences which are then linked to each other. The chemical synthesis can be carried out in solid phase or in solution, these two synthesis techniques being well

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connues de l'homme de l'art. Ces techniques sont décrites notamment par Atherton et Shepard dans solid phase peptide synthesis (IRL press Oxford, 1989) et par Houbenweyl dans method der organischen chemie édité par E. Wunsch vol, 15-1 et II thieme, Stuttgart, 1974, ainsi que dans les articles suivants dont l'intégralité est incorporée ici à titre de référence : Dawson PE et al (Synthesis of proteins by native chemical ligation Science 1994 ; 266 (5186) : 776-9) ; Kochendoerfer GG et al (Chemical protein synthesis. Curr Opin Chem Biol 1999 ; 3 (6) : 665-71) ; et Dawson PE et al Synthesis of native proteins by chemical ligation, Annu Rev Biochem 2000 ; 69 : 923-60.  known to those skilled in the art. These techniques are described in particular by Atherton and Shepard in Solid Phase Peptide Synthesis (IRL Press Oxford, 1989) and by Houbenweyl in method der organischen chemie edited by E. Wunsch vol, 15-1 and II thieme, Stuttgart, 1974, as well as in the following articles, the entirety of which is incorporated herein by reference: Dawson PE et al (Synthesis of Proteins by Native Chemical Ligation Science 1994; 266 (5186): 776-9); Kochendoerfer GG et al (Chemical Protein Synthesis, Curr Opin Chem Biol 1999; 3 (6): 665-71); and Dawson PE et al Synthesis of Native Chemicals by Chemical Ligation, Annu Rev Biochem 2000; 69: 923-60.

Le polypeptide selon l'invention peut être également produit par les techniques de génie génétique bien connues de l'homme de l'art. Lorsque le polypeptide selon l'invention est produit par génie génétique il comprend à l'extrémité NH2-terminale de la séquence de formule I un résidu méthionine supplémentaire correspondant à la traduction du premier codon d'initiation. Ces techniques sont décrites en détails dans Molecular Cloning : a molecular manual de Maniatis et al, Cold Spring Harbor, 1989).  The polypeptide according to the invention can also be produced by genetic engineering techniques well known to those skilled in the art. When the polypeptide according to the invention is produced by genetic engineering, it comprises at the NH 2 -terminal end of the sequence of formula I an additional methionine residue corresponding to the translation of the first initiation codon. These techniques are described in detail in Molecular Cloning: a molecular manual by Maniatis et al, Cold Spring Harbor, 1989).

Classiquement, la séquence d'ADN codant pour le polypeptide selon l'invention peut être produite par la technique de PCR dans laquelle les séquences N et C sont dans un premier temps amplifiées indépendamment l'une de l'autre puis sont dans un deuxième temps appariées et de nouveau amplifiées. La séquence d'ADN ainsi obtenue est ensuite insérée dans un vecteur d'expression. Le vecteur d'expression renfermant la séquence d'intérêt est alors utilisé pour transformer une cellule hôte permettant l'expression de la séquence d'intérêt. Le polypeptide produit est ensuite isolé du milieu de culture par des techniques classiques bien connues de l'homme de l'art, telles que précipitation à l'éthanol ou au sulfate d'ammonium, extraction par l'acide, chromatographie d'échange d'anion/cation, chromatographie sur phosphocellulose, chromatographie d'interaction hydrophobe, chromatographie d'affinité, chromatographie sur hydroxyapatite et chromatographie sur lectine. De préférence, la chromatographie liquide à haute performance (HPLC) est utilisée dans la purification. Conventionally, the DNA sequence coding for the polypeptide according to the invention can be produced by the PCR technique in which the N and C sequences are first amplified independently of one another and then are in a second step paired and amplified again. The DNA sequence thus obtained is then inserted into an expression vector. The expression vector containing the sequence of interest is then used to transform a host cell allowing expression of the sequence of interest. The polypeptide produced is then isolated from the culture medium by standard techniques well known to those skilled in the art, such as precipitation with ethanol or ammonium sulfate, extraction with acid, chromatography of exchange of anion / cation, phosphocellulose chromatography, hydrophobic interaction chromatography, affinity chromatography, hydroxyapatite chromatography and lectin chromatography. Preferably, high performance liquid chromatography (HPLC) is used in the purification.

Selon le système expression utilisé (protéine sécrétée ou non) et selon le procédé de purification, le polypeptide purifié peut se présenter sous différentes formes. Il peut être sous une forme dénaturée ou non dénaturée, monomérique ou multimérique. Lorsqu'il se trouve sous une forme dénaturée il est possible de lui rendre sa conformation ouverte selon l'invention en utilisant le procédé décrit dans les exemples donnés ci-après. Pour obtenir des formes multimériques et en particulier des trimères les molécules de polypeptide purifiées doivent être placées dans un milieu qui permet aux molécules d'être parfaitement Depending on the expression system used (protein secreted or not) and according to the purification method, the purified polypeptide can be in various forms. It may be in a denatured or undenatured, monomeric or multimeric form. When it is in a denatured form it is possible to return its conformation open according to the invention using the method described in the examples given below. To obtain multimeric forms and in particular trimers, the purified polypeptide molecules must be placed in a medium which allows the molecules to be perfectly

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solubles et essentiellement sans interaction entre elles et de préférence sans structure secondaire. Pour cela on peut utiliser des détergents tels que dodecyl sulfate de sodium, N lauryl sarcosine, Guanidinium chloride, Urée, Thiocyanate de sodium ou des agents chaotropiques. On pourra favoriser les conditions désirées par l'utilisation de solvants organiques ou l'utilisation d'acides. Cette première condition étant satisfaite, on place l'échantillon dans une cassette de dialyse pour éliminer une partie des détergents ou des agents chaotropiques utilisés, de façon à favoriser les interactions entre les monomères de polypeptide en conservant aux molécules suffisamment de solubilité. Dans une deuxième étape, la formation des trimères étant favorisée, on dialyse complètement l'échantillon dans un milieu physiologique qui maintient le polypeptide en solution ou en suspension.  soluble and essentially without interaction between them and preferably without secondary structure. For this purpose, it is possible to use detergents such as sodium dodecyl sulphate, lauryl sarcosine, guanidinium chloride, urea, sodium thiocyanate or chaotropic agents. The desired conditions can be promoted by the use of organic solvents or the use of acids. This first condition being satisfied, the sample is placed in a dialysis cassette to remove some of the detergents or chaotropic agents used, so as to promote interactions between the polypeptide monomers by keeping the molecules sufficiently solubility. In a second step, the formation of trimers being favored, the sample is completely dialyzed in a physiological medium which maintains the polypeptide in solution or suspension.

On obtient alors des trimères du polypeptide selon l'invention. Une telle technique est décrite en détail dans la demande WOOO/08167. Trimeres of the polypeptide according to the invention are then obtained. Such a technique is described in detail in application WO00 / 08167.

Pour mettre en oeuvre la synthèse du polypeptide, tout vecteur d'expression classiquement utilisé pour l'expression d'une protéine recombinante peut être utilisé dans le cadre de la présente invention. Ce terme englobe donc aussi bien les vecteurs d'expression dits vivants tels que les virus et les bactéries que les vecteurs d'expression de type plasmidiques.  To carry out the synthesis of the polypeptide, any expression vector conventionally used for the expression of a recombinant protein may be used in the context of the present invention. This term thus encompasses both so-called living expression vectors such as viruses and bacteria as plasmid expression vectors.

On utilise de préférence des vecteurs dans lesquels la séquence d'ADN du polypeptide selon l'invention est sous la dépendance d'un promoteur fort, inductible ou non inductible. On peut citer à titre d'exemple de promoteur utilisable, le promoteur de l'ARN polymérase T7.  Vectors in which the DNA sequence of the polypeptide according to the invention is under the dependence of a strong, inducible or non-inducible promoter are preferably used. As an example of a promoter that may be used, mention may be made of the promoter of the T7 RNA polymerase.

Les vecteurs d'expression incluent de préférence au moins un marqueur de sélection. De tels marqueurs incluent, par exemple, le gène de la dihydrofolate réductase ou le gène de résistance à la néomycine pour la culture des cellules d'eucaryote et les gènes de résistance à la kanamycine, tétracycline ou ampicilline pour la culture dans E. coli et des autres bactéries.  The expression vectors preferably include at least one selection marker. Such labels include, for example, the dihydrofolate reductase gene or the neomycin resistance gene for eukaryotic cell culture and the kanamycin, tetracycline or ampicillin resistance genes for culture in E. coli and other bacteria.

On peut citer à titre de vecteur d'expression utilisable dans le cadre de la présente invention les plasmides pET28 (Novagen) ou pBAD (Invitrogen) par exemple ; les vecteurs viraux tels que : baculovirus, poxvirus en particulier les poxvirus décrits dans les brevets US 5,942, 235, US 5,756, 103 et US 5,990, 091 dont l'intégralité est incorporée ici à titre de référence, les virus de la vaccine recombinants, en particulier les virus recombinants décrits dans les brevets EP 83286, US 5,494, 807 et US 5,762, 938 dans lesquels est cloné la séquence d'ADN codant pour un polypeptide selon l'invention.  Exemplary expression vectors which can be used in the context of the present invention are the plasmids pET28 (Novagen) or pBAD (Invitrogen) for example; viral vectors such as: baculovirus, poxvirus, in particular the poxviruses described in patents US 5,942, 235, US 5,756, 103 and US 5,990,091, the entirety of which is incorporated herein by reference, the recombinant vaccinia viruses, in particular the recombinant viruses described in patents EP 83286, US 5,494, 807 and US 5,762,938 in which the DNA sequence coding for a polypeptide according to the invention is cloned.

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Pour favoriser l'expression et la purification du polypeptide, ce dernier peut être exprimé dans une forme modifiée, telle qu'une protéine de fusion, et peut inclure non seulement des signaux de sécrétion, mais aussi des régions fonctionnelles hétérologues supplémentaires. Par exemple, une région d'acides aminés supplémentaires, particulièrement des acides aminés chargés, peut être ajoutée au N-terminal du polypeptide pour améliorer la stabilité et le maintien dans la cellule hôte.  To promote the expression and purification of the polypeptide, the latter may be expressed in a modified form, such as a fusion protein, and may include not only secretion signals, but also additional heterologous functional regions. For example, a region of additional amino acids, particularly charged amino acids, may be added to the N-terminus of the polypeptide to enhance stability and maintenance in the host cell.

Pour l'expression du polypeptide, toute cellule hôte classiquement utilisée en association avec les vecteurs d'expression décrits ci-dessus peut être utilisée.  For the expression of the polypeptide, any host cell conventionally used in combination with the expression vectors described above may be used.

On peut citer à titre d'exemple non limitatif les cellules de E. coli, BL21 (IDE3), HB101, Top 10, CAG 1139, Bacillus, les cellules eucaryotes telles que CHO ou Vero.  Mention may be made, by way of non-limiting example, of E. coli, BL21 (IDE3), HB101, Top10, CAG 1139, Bacillus cells, eukaryotic cells such as CHO or Vero.

De préférence on utilisera dans le cadre de la présente invention le système vecteur d'expression/cellule suivant : pET (Cer)/BL21LamdaDE3, ou BL21lamdaDE3 (RIL).  Preferably, in the context of the present invention, the following expression vector / cell system will be used: pET (Cer) / BL21LamdaDE3, or BL21lamdaDE3 (RIL).

En fonction de la cellule hôte utilisée pour l'expression du polypeptide, les polypeptides de la présente invention pourront être glycosylés ou non-glycosylés. De plus, les polypeptides selon l'invention pourront aussi inclure un résidu de méthionine supplémentaire en N-terminal.  Depending on the host cell used for expression of the polypeptide, the polypeptides of the present invention may be glycosylated or non-glycosylated. In addition, the polypeptides according to the invention may also include an additional N-terminal methionine residue.

Une fois purifié, le polypeptide selon l'invention peut avantageusement être mélangé avec du 2,2, 2-trifluoroéthanol (TFE). Pour ce faire, le polypeptide est de préférence mis dans un tampon acide tel que formate de sodium à un pH=2, 5. Le mélange ainsi formé contient de 10 à 50% en vol de TFE, de préférence de 15 à 30% en vol de TFE. Le TFE a pour effet d'augmenter le taux d'hélicité du polypeptide pour le porter à une valeur proche ou égale à 100%. Once purified, the polypeptide according to the invention may advantageously be mixed with 2,2,2-trifluoroethanol (TFE). To do this, the polypeptide is preferably placed in an acidic buffer such as sodium formate at a pH = 2.5. The mixture thus formed contains from 10 to 50% by vol of TFE, preferably from 15 to 30% by weight. TFE flight. The TFE has the effect of increasing the rate of helicity of the polypeptide to bring it to a value close to or equal to 100%.

Outre le TFE, d'autres solvants organiques ou détergents peuvent également être utilisés. In addition to TFE, other organic solvents or detergents can also be used.

On peut citer à titre d'exemple : l'isopropanol ou le lyso phospholipide. Les quantités appropriées de ces composés peuvent être aisément déterminées par l'homme de l'art. By way of example, mention may be made of: isopropanol or lyso phospholipid. Suitable amounts of these compounds can be readily determined by those skilled in the art.

Ces composés étant en général toxiques et par voie de conséquence non administrables chez l'homme, il est nécessaire de les éliminer avant administration. La demanderesse a mis en évidence que ces solvants ou détergents pouvaient être aisément éliminés par l'ajout d'un support adsorbant le polypeptide. Le support utilisé dans le cadre de la présente invention correspond à un support pharmaceutiquement acceptable pouvant être administré chez l'homme. On peut citer à titre d'exemple de support utilisable dans le cadre de la présente invention les gels d'hydroxyde, de phosphate, ou hydroxy-phosphate d'aluminium qui sont classiquement utilisés comme adjuvant dans les vaccins. Le support Since these compounds are generally toxic and consequently not manageable, it is necessary to eliminate them before administration. The Applicant has demonstrated that these solvents or detergents could be easily removed by adding a carrier adsorbing the polypeptide. The carrier used in the context of the present invention corresponds to a pharmaceutically acceptable carrier which can be administered in humans. Examples of carriers that may be used in the context of the present invention include aluminum hydroxide, phosphate, or hydroxy-phosphate gels which are conventionally used as adjuvants in vaccines. The support

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est utilisé en large excès par rapport au polypeptide pour obtenir une adsorption totale de ce dernier.  is used in large excess relative to the polypeptide to obtain a total adsorption of the latter.

Tout autre support pharmaceutiquement acceptable et susceptible d'adsorber le polypeptide selon l'invention pourrait être utilisé dans le cadre de la présente invention. Any other pharmaceutically acceptable carrier capable of adsorbing the polypeptide according to the invention could be used in the context of the present invention.

Classiquement la quantité requise de support pharmaceutiquement acceptable est ajouté au mélange polypeptide/TFE puis l'ensemble est incubé à température ambiante pendant la durée nécessaire pour permettre l'absorption totale du polypeptide sur le support. La durée d'incubation peut varier de 15 min. à 3H. le mélange est ensuite centrifugé 1 ou 2 fois à environ 10000g et le culot est repris dans une solution administrable chez l'homme telle que par exemple dans le cas d'une composition injectable du tampon PBS ou une solution saline physiologique.  Typically the required amount of pharmaceutically acceptable carrier is added to the polypeptide / TFE mixture and then the whole is incubated at room temperature for the time necessary to allow total absorption of the polypeptide on the support. The incubation time may vary from 15 minutes. at 3 o'clock. the mixture is then centrifuged 1 or 2 times at about 10000 g and the pellet is taken up in a solution that can be administered in humans, such as, for example, in the case of an injectable composition of PBS buffer or a physiological saline solution.

La présente invention a également pour objet les conjugués comprenant un polypeptide selon l'invention et une protéine porteur ou un peptide porteur.  The subject of the present invention is also the conjugates comprising a polypeptide according to the invention and a carrier protein or a carrier peptide.

La protéine (ou peptide) porteur renforce l'immunogénicité du polypeptide selon l'invention notamment en augmentant la production d'anticorps spécifiques. Ladite protéine (ou peptide) porteur comprend de préférence un ou plusieurs épitope (s) T helper.  The carrier protein (or peptide) enhances the immunogenicity of the polypeptide according to the invention, in particular by increasing the production of specific antibodies. Said carrier protein (or peptide) preferably comprises one or more helper epitope (s).

Par épitope T helper , on entend un enchaînement d'acides aminés qui, dans le contexte d'une ou de plusieurs molécules du MHC classe II, active les lymphocytes T helper. Selon un mode de réalisation avantageux, la protéine (ou peptide) porteur utilisée améliore la solubilité dans l'eau du polypeptide selon l'invention. By T helper epitope is meant a sequence of amino acids which, in the context of one or more molecules of the MHC class II, activates helper T cells. According to an advantageous embodiment, the carrier protein (or peptide) used improves the solubility in water of the polypeptide according to the invention.

Comme protéine porteur on peut utiliser par exemple les protéines de surface de phages comme la protéine pIII ou pVIII du phage M13, les protéines de surface bactériennes comme les protéines LamB, OmpC, ompA, ompF et PhoE d'E. coli, la protéine CotC ou CotD de B. Subtilis, les porines bactériennes comme la porine P 1 de Neisseria gonorrheae, la porine PI ou P2 d'H. influenzae B, la porine de classe 1 de N. meningitidis B, la porine P40 de K. pneumoniae, des lipoprotéines telles que OspA de B. bugdorfi, PspA de S. pneumoniae, TBP2 de N. meningitidis B, TraT d'E. coli ainsi que l'adhésine A de S. pneumoniae ; les heat shock protéines telles que Hsp65 ou Hsp71 de M. tuberculosis ou bovis ou Hin 47 d'H. infuenzae type B. Sont également particulièrement appropriées dans le cadre de la présente invention, les toxines bactériennes détoxifiées comme l'anatoxine tétanique ou diphtérique, la sous unité B de la toxine cholérique, la sous unité B de la toxine cholérique, la sous unité B de l'endotoxine A de P. aeruginosa ou l'exotoxine A de S. aureus.  As the carrier protein, for example, phage surface proteins such as phage M13 protein pIII or pVIII may be used, bacterial surface proteins such as LamB, OmpC, ompA, ompF and PhoE proteins of E. coli. coli, B. Subtilis CotC or CotD protein, bacterial porins such as Neisseria gonorrheae porant P 1, PI porin or P2 of H. influenzae B, N. meningitidis B class 1 porin, K. pneumoniae P. pneumonia, lipoproteins such as B. bugdorfi OspA, S. pneumoniae PspA, N. meningitidis B TBP2, E. coli as well as the adhesin A of S. pneumoniae; heat shock proteins such as Hsp65 or Hsp71 from M. tuberculosis or Bovis or Hin 47 from H. Infuenzae type B. Also particularly suitable in the context of the present invention are detoxified bacterial toxins such as tetanus toxoid or diphtheria, subunit B cholera toxin, subunit B cholera toxin, subunit B P. aeruginosa endotoxin A or S. aureus exotoxin A.

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Comme peptide porteur on peut utiliser par exemple dans le cadre de la présente invention les peptides p24E, p24N, p24H et p24M décrits dans W094/29339 ainsi que les peptides PADRE tels que décrits par Del guercio et al (Vaccine (1997) vo115/4, p441- 448).  As a carrier peptide, for example, the p24E, p24N, p24H and p24M peptides described in WO94 / 29339 and the PADRE peptides as described by Del guercio et al (Vaccine (1997) vo115 / 4 can be used for example in the context of the present invention. , p441-448).

La protéine (ou peptide) porteur est liée à l'extrémité N ou C terminale du polypeptide selon l'invention par tout procédé de conjugaison bien connu de l'homme de l'art. De plus, la séquence codant pour la protéine (ou peptide) porteur peut avantageusement être fusionnée à la séquence codant pour le polypeptide selon l'invention et la séquence résultante peut être exprimée sous la forme d'une protéine de fusion par tout procédé classique. Toutes les techniques de génie génétique utiles pour ce faire sont décrites dans le Maniatis et al. Lesdits conjugués peuvent être isolés par tout procédé classique de purification bien connus de l'homme de l'art.  The carrier protein (or peptide) is linked to the N or C terminus of the polypeptide according to the invention by any conjugation method well known to those skilled in the art. In addition, the sequence coding for the carrier protein (or peptide) may advantageously be fused to the coding sequence for the polypeptide according to the invention and the resulting sequence may be expressed in the form of a fusion protein by any conventional method. All the genetic engineering techniques useful for this purpose are described in Maniatis et al. Said conjugates can be isolated by any conventional purification method well known to those skilled in the art.

La présente invention a également pour objet les séquences d'ADN codant pour les polypeptides et les conjugués selon l'invention ainsi que les vecteurs d'expression comprenant lesdites séquences et les cellules hôtes transformées par lesdits vecteurs. Les séquences d'ADN codant pour les polypeptides selon l'invention peuvent être aisément produite par PCR en utilisant comme matrice la séquence nucléotidique d'une protéine gp41.  The subject of the present invention is also the DNA sequences coding for the polypeptides and the conjugates according to the invention as well as the expression vectors comprising said sequences and the host cells transformed by said vectors. The DNA sequences coding for the polypeptides according to the invention can be easily produced by PCR using as template the nucleotide sequence of a gp41 protein.

Plutôt que d'extraire et de purifier le polypeptide ou le conjugué exprimé par le vecteur d'expression il est souvent plus facile et parfois plus avantageux d'utiliser le vecteur d'expression lui-même dans le vaccin selon l'invention. La présente invention a donc également pour objet tout vecteur d'expression tel que défini ci-dessus. Dans un tel cas de figure, le vecteur d'expression est dépourvu de marqueur et correspond de préférence à un vecteur viral, en particulier un poxvirus tel que ALVAC ou NYVAC.  Rather than extracting and purifying the polypeptide or conjugate expressed by the expression vector, it is often easier and sometimes more advantageous to use the expression vector itself in the vaccine according to the invention. The present invention therefore also relates to any expression vector as defined above. In such a case, the expression vector is devoid of a marker and preferably corresponds to a viral vector, in particular a poxvirus such as ALVAC or NYVAC.

Toute cellule hôte telle que définie ci-dessus transformée par un tel vecteur d'expression est également incluse dans le cadre de la présente invention.  Any host cell as defined above transformed with such an expression vector is also included within the scope of the present invention.

La présente invention a également pour objet les anticorps dirigés contre les polypeptides et conjugués tels que décrits ci-dessus. La préparation de tels anticorps est mise en oeuvre par les techniques classiques d'obtention d'anticorps polyclonaux et monoclonaux bien connues de l'homme de l'art.  The subject of the present invention is also the antibodies directed against the polypeptides and conjugates as described above. The preparation of such antibodies is carried out by conventional techniques for obtaining polyclonal and monoclonal antibodies well known to those skilled in the art.

Ces anticorps sont particulièrement appropriés pour être utilisés dans un schéma d'immunisation passive.  These antibodies are particularly suitable for use in a passive immunization scheme.

La présente invention a également pour objet des compositions pharmaceutiques utiles à des fins d'immunisation thérapeutique et prophylactique des infections liées au  The present invention also relates to pharmaceutical compositions useful for the purpose of therapeutic and prophylactic immunization of infections related to

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VIH. Les compositions selon la présente invention comprennent au moins un polypeptide, au moins un conjugué ou au moins un vecteur d'expression tel que défini ci-dessus, un excipient ou diluant pharmaceutiquement acceptable et éventuellement un adjuvant.  HIV. The compositions according to the present invention comprise at least one polypeptide, at least one conjugate or at least one expression vector as defined above, a pharmaceutically acceptable excipient or diluent and optionally an adjuvant.

Selon un mode de réalisation préféré, la composition selon l'invention comprend en outre un support pharmaceutiquement acceptable. Tout support pharmaceutiquement acceptable susceptible d'adsorber le polypeptide selon l'invention peut être utilisé. Un descriptif de tels supports a été fourni ci-dessus. Dans le cas où le support pharmaceutiquement acceptable est un sel d'aluminium, ce dernier assure à la fois la fonction de support et celle d'adjuvant.  According to a preferred embodiment, the composition according to the invention further comprises a pharmaceutically acceptable carrier. Any pharmaceutically acceptable carrier capable of adsorbing the polypeptide according to the invention may be used. A description of such media has been provided above. In the case where the pharmaceutically acceptable carrier is an aluminum salt, the latter provides both the support function and the adjuvant function.

La quantité de polypeptide, de conjugué ou de vecteur dans la composition selon la présente invention dépend de nombreux paramètres comme le comprendra l'homme de l'art, tels que la nature de la protéine porteur, le vecteur utilisé ou, la voie d'administration. Une quantité appropriée est une quantité telle qu'une réponse immunitaire humorale capable de neutraliser des isolats primaires du VIH est induite après administration de cette dernière. La quantité de polypeptide à administrer est de l'ordre de lOug à 1 mg, la quantité sélectionnée variant en fonction de la voie d'administration. La quantité de conjugué à administrer sera déduite des quantités indiquées ci-dessus en tenant compte du PM de la protéine porteur. La quantité de vecteur d'expression à administrer est de l'ordre de 10 à 5000 micro grammes dans le cas d'un vecteur non viral et de l'ordre de 10E4 à 10Eg TCID50 dans le cas d'un vecteur viral.  The amount of polypeptide, conjugate or vector in the composition according to the present invention depends on many parameters as will be understood by those skilled in the art, such as the nature of the carrier protein, the vector used or the route of the invention. administration. An appropriate amount is an amount such that a humoral immune response capable of neutralizing primary isolates of HIV is induced after administration of the latter. The amount of polypeptide to be administered is of the order of 10 μg to 1 mg, the selected amount varying depending on the route of administration. The amount of conjugate to be administered will be deduced from the amounts indicated above taking into account the PM of the carrier protein. The amount of expression vector to be administered is of the order of 10 to 5000 micrograms in the case of a non-viral vector and of the order of 10E4 to 10Eg TCID50 in the case of a viral vector.

Les compositions pharmaceutiques selon la présente invention peuvent également contenir un adjuvant. Tout adjuvant ou mélange d'adjuvants pharmaceutiquement acceptable classiquement utilisé dans le domaine des vaccins peut être utilisé à cette fin.  The pharmaceutical compositions according to the present invention may also contain an adjuvant. Any adjuvant or mixture of pharmaceutically acceptable adjuvants conventionally used in the field of vaccines can be used for this purpose.

On peut citer à titre d'exemple les sels d'aluminium tels que l'hydroxyde d'aluminium ou le phosphate d'aluminium. Des agents auxiliaires classiques tels que agents mouillants, charges, émulsifiants, tampons etc.. peuvent également être additionnés à la composition selon l'invention. By way of example, mention may be made of aluminum salts such as aluminum hydroxide or aluminum phosphate. Conventional auxiliaries such as wetting agents, fillers, emulsifiers, buffers, etc. can also be added to the composition according to the invention.

Les compositions selon la présente invention peuvent être préparées par tout procédé classique connu de l'homme de d'art. Classiquement les antigènes selon l'invention sont mélangés avec un excipient ou diluant pharmaceutiquement acceptable, tel que eau ou solution saline tamponnée au phosphate. L'excipient ou diluant va être sélectionné en fonction de la forme galénique choisie, du mode et de la voie d'administration ainsi que de la pratique pharmaceutique. Les excipients ou diluants appropriés ainsi que les exigences en matière de formulation pharmaceutique sont décrits  The compositions according to the present invention may be prepared by any conventional method known to those skilled in the art. Conventionally, the antigens according to the invention are mixed with a pharmaceutically acceptable excipient or diluent, such as water or phosphate buffered saline. The excipient or diluent will be selected according to the chosen dosage form, mode and route of administration as well as pharmaceutical practice. Suitable excipients or diluents as well as pharmaceutical formulation requirements are described

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en détails dans Remington's Pharmaceutical Sciences, représentant un ouvrage de référence dans ce domaine.  in details in Remington's Pharmaceutical Sciences, representing a reference work in this field.

Les compositions mentionnées ci-dessus peuvent être administrées par toute voie classique, habituellement utilisée dans le domaine des vaccins, telle que la voie parentérale (intraveineuse, intramusculaire, sous-cutanée, etc..). On utilisera de préférence dans le cadre de la présente invention pour les compositions injectables une administration intramusculaire. Une telle administration peut être réalisée avantageusement au niveau des muscles de la cuisse ou du bras. Les compositions selon la présente invention peuvent également avantageusement être administrées par voie orale. Une administration via la muqueuse nasale, vaginale ou rectale peut être également recommandée dans le cadre de la présente invention. L'administration peut être réalisée par l'administration d'une dose unique ou de doses répétées, par exemple à JO, à 1 mois, à 3 mois, à 6 mois et à 12 mois.  The compositions mentioned above may be administered by any conventional route, usually used in the field of vaccines, such as parenteral (intravenous, intramuscular, subcutaneous, etc.). In the context of the present invention, preference will be given to injectable compositions for intramuscular administration. Such administration can be performed advantageously at the level of the muscles of the thigh or the arm. The compositions according to the present invention can also advantageously be administered orally. Administration via the nasal, vaginal or rectal mucosa may also be recommended in the context of the present invention. The administration can be carried out by the administration of a single dose or repeated doses, for example in OJ, at 1 month, 3 months, 6 months and 12 months.

On utilisera de préférence les injections à JO, à 1 mois et à 3 mois avec un rappel dont la périodicité pourra être aisément déterminée par le médecin traitant. OJ injections should preferably be used at 1 month and 3 months with a reminder whose periodicity can be easily determined by the attending physician.

La composition pharmaceutique selon la présente invention peut avantageusement être administrée selon un schéma posologique comprenant la co-administration d'un vecteur d'expression selon l'invention et d'un polypeptide selon l'invention ou selon un schéma de prime-boost dans lequel le vecteur selon l'invention est administré en premier et le polypeptide en tant qu'injection de rappel. Dans ces deux schémas posologiques, le vecteur d'expression selon l'invention peut être remplacé par tout vecteur d'expression exprimant un ou plusieurs antigènes ou épitopes du VIH différents du polypeptide selon l'invention, et en particulier par un poxvirus de préférence ALVAC ou NYVAC. On peut citer à titre d'exemple de vecteur ALVAC et NYVAC utilisables à cette fin les vecteurs décrits dans les brevets US 5,942, 235, US 5,756, 103 et US 5,990, 091 ; EP 83286, US 5,494, 807 et US 5,762, 938. On peut également avantageusement utiliser dans le cadre des compositions administrables par voie orale les vecteurs bactériens tels que lactobacillus ou salmonella. L'utilisation de ces vecteurs bactériens à des fins d'immunisation est décrite en détail dans International Journal of Food Microbiology 41 (1998) 155-167 de P. H. Pouwels et al et Cell vol 91,765-775, Dec, 1997 de A. Darji et al auxquels on pourra se référer pour plus de détails.  The pharmaceutical composition according to the present invention may advantageously be administered according to a dosage scheme comprising the co-administration of an expression vector according to the invention and a polypeptide according to the invention or according to a prime-boost scheme in which the vector according to the invention is administered first and the polypeptide as a booster injection. In these two regimens, the expression vector according to the invention may be replaced by any expression vector expressing one or more HIV antigens or epitopes different from the polypeptide according to the invention, and in particular by a poxvirus, preferably ALVAC. or NYVAC. Examples of ALVAC and NYVAC vectors that may be used for this purpose are the vectors described in US Pat. Nos. 5,942, 235, 5,756, 103 and 5,990,091; EP 83286, US 5,494, 807 and US 5,762,938. Bacterial vectors such as lactobacillus or salmonella can also be advantageously used in the context of compositions that can be administered orally. The use of these bacterial vectors for immunization purposes is described in detail in International Journal of Food Microbiology 41 (1998) 155-167 of PH Pouwels et al and Cell Vol 91,765-775, Dec, 1997 to A. Darji and al which we can refer for more details.

La présente invention entend également couvrir un polypeptide, un conjugué ou un vecteur tel que défini ci-dessus et la composition pharmaceutique contenant ces composés pour leur utilisation comme médicament, en particulier pour l'immunisation prophylactique et thérapeutique du corps humain contre les infections liées au VIH  The present invention also aims to cover a polypeptide, a conjugate or a vector as defined above and the pharmaceutical composition containing these compounds for their use as a medicament, in particular for the prophylactic and therapeutic immunization of the human body against infections related to HIV

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Selon un aspect préféré, la présente invention a pour objet l'utilisation d'un polypeptide selon l'invention pour l'immunisation du corps humain. La présente invention concerne donc de préférence une méthode d'administration dudit polypeptide pour induire une réponse humorale spécifique. According to a preferred aspect, the subject of the present invention is the use of a polypeptide according to the invention for the immunization of the human body. The present invention therefore preferably relates to a method of administering said polypeptide to induce a specific humoral response.

On entend par une réponse humorale spécifique une réponse comprenant la production d'anticorps dirigés spécifiquement contre le polypeptide selon l'invention. La production d'anticorps spécifiques peut être aisément déterminée par des techniques classiques bien connues de l'homme de l'art telles que ELISA, RIA, western blot.  By a specific humoral response is meant a response comprising the production of antibodies directed specifically against the polypeptide according to the invention. The production of specific antibodies can be easily determined by standard techniques well known to those skilled in the art such as ELISA, RIA, Western blot.

La demanderesse a mis en évidence de façon surprenante que le polypeptide selon l'invention était capable après administration d'induire des anticorps susceptibles de neutraliser des isolats primaires du VIH. Ces antigènes représentent donc des candidats de valeur pour l'élaboration d'un vaccin utilisable pour la protection et/ou le traitement d'un grand nombre, voire la totalité des sujets à risques ou infectés par le VIH
Sans vouloir être liée par aucune théorie, la demanderesse pense que la conformation ouverte du polypeptide selon l'invention rend accessible des domaines de la gp41 qui ne sont accessibles durant le phénomène de fusion des membranes virale et cellulaire que dans la conformation intermédiaire qui est adoptée de façon transitoire. Ces domaines rendus accessibles constitueraient la cible des anticorps induits par le polypeptide selon l'invention, ces derniers bloquant ainsi le phénomène de fusion membranaire à un stade pré-fusogénique. La conformation ouverte adoptée par le polypeptide selon l'invention mimerait donc la conformation adoptée par l'état intermédiaire.
The Applicant has surprisingly demonstrated that the polypeptide according to the invention is capable after administration of inducing antibodies capable of neutralizing primary isolates of HIV. These antigens are therefore valuable candidates for the development of a vaccine that can be used for the protection and / or treatment of many, if not all, HIV-infected or at-risk individuals.
Without wishing to be bound by any theory, the Applicant believes that the open conformation of the polypeptide according to the invention makes accessible domains of gp41 which are only accessible during the phenomenon of fusion of the viral and cellular membranes in the intermediate conformation which is adopted. transiently. These domains made accessible would be the target of the antibodies induced by the polypeptide according to the invention, the latter thus blocking the phenomenon of membrane fusion at a pre-fusogenic stage. The open conformation adopted by the polypeptide according to the invention thus mimics the conformation adopted by the intermediate state.

L'invention a également pour objet une méthode de diagnostic comprenant la mise en contact d'un polypeptide selon l'invention avec un échantillon biologique et la détection des complexes anticorps/polypeptide qui se sont formés. Les sujets VIH+ contiennent en effet des anticorps sériques anti-gp41. Un test immunologique (tel qu'un test ELISA dans lequel le polypeptide selon l'invention est fixé sur la plaque de test puis mis en contact avec le sérum à tester et les complexes anticorps/polypeptide sont ensuite détectés) permettrait donc de diagnostiquer les sujets infectés.  The invention also relates to a diagnostic method comprising contacting a polypeptide according to the invention with a biological sample and detecting the antibody / polypeptide complexes that have formed. HIV + subjects contain anti-gp41 serum antibodies. An immunological test (such as an ELISA test in which the polypeptide according to the invention is fixed on the test plate and then put in contact with the serum to be tested and the antibody / polypeptide complexes are then detected) would thus make it possible to diagnose the subjects infected.

La présente invention va être décrite de façon plus détaillée dans les exemples qui suivent par référence aux figures annexées dans lesquelles :
La figure 1 est une représentation schématique du phénomène de changement de conformation de la gp41 qui précède la fusion des membranes cellulaire et virale.
The present invention will be described in more detail in the examples which follow with reference to the appended figures in which:
Figure 1 is a schematic representation of the conformational change phenomenon of gp41 that precedes the fusion of cell and viral membranes.

La figure 2 représente un spectre obtenu par la technique de DSC.  Figure 2 shows a spectrum obtained by the DSC technique.

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La figure 3 représente un spectre obtenu par la technique de dichroïsme circulaire.  Figure 3 shows a spectrum obtained by the circular dichroism technique.

La figure 4 donne la carte plasmidique du pET-Cer (SEQ ID N 35).  Figure 4 gives the plasmid map of pET-Cer (SEQ ID N 35).

Les exemples décrits ci-dessous sont donnés à titre purement illustratif de l'invention et ne peuvent en aucun cas être considérés comme limitant la portée de cette dernière.  The examples described below are given purely by way of illustration of the invention and can in no way be considered as limiting the scope of the invention.

Exemple 1 : Construction des séquences d'ADN codant pour les polypeptides selon l'invention
Les séquences d'ADN codant pour les polypeptides correspondant aux séquences SEQ ID N'4, 5,6, 7,8 et 9 ont été obtenues par PCR selon le procédé suivant :
Les séquences N et C sont dans un premier temps amplifiées par PCR à partir

Figure img00150001

d'une matrice correspondant à un plasmide contenant la séquence d'ADN codant pour la région core de la gp41 (SEQ ID NO 34) en utilisant les paires d'amorces 5'N/3'N et 5'C/3'C telle que définies ci-dessous dans le tableau 1. Pour chacune des séquences, la réaction de PCR est mise en oeuvre dans les conditions suivantes : On mélange dans un premier temps les amorces, la matrice, le mélange de nucléotides et la Taq polymérase et on porte le mélange à 94 C pendant 2 minutes. Le mélange résultant est ensuite soumis à 25 cycles de PCR selon le schéma suivant : 94 30s, 55 30s, et 68 30s. Les produits ainsi amplifiés sont ensuite purifiés sur des colonnes QIAQUICK dans les conditions recommandées par le fabricant. Example 1 Construction of the DNA Sequences Coding for the Polypeptides According to the Invention
The DNA sequences coding for the polypeptides corresponding to the sequences SEQ ID N4, 5.6, 7.8 and 9 were obtained by PCR according to the following method:
The N and C sequences are first amplified by PCR from
Figure img00150001

of a template corresponding to a plasmid containing the DNA sequence coding for the core region of gp41 (SEQ ID NO 34) using primer pairs 5'N / 3'N and 5'C / 3'C As defined below in Table 1. For each of the sequences, the PCR reaction is carried out under the following conditions: The primers, the template, the nucleotide mixture and the Taq polymerase are first mixed together. the mixture is heated at 94 ° C. for 2 minutes. The resulting mixture is then subjected to 25 PCR cycles according to the following scheme: 94 30s, 55 30s, and 68 30s. The products thus amplified are then purified on QIAQUICK columns under the conditions recommended by the manufacturer.

Les deux produits ainsi purifiés qui comportent des séquences chevauchantes sont soumis mélangés et soumis à une réaction d'amplification par PCR utilisant les amorces 5'N et 3'C telles que définies ci-dessous dans le tableau 1. La réaction de PCR est mise en oeuvre selon le schéma suivant : les séquences N et C purifiées, la Taq polymérase et le mélange de nucléotides sont mélangés et soumis à 10 cycles : 94 30s, 55 30s, et 68 30s. On ajoute ensuite les amorces 5'N et 3'C et le mélange résultant est soumis à 20 cycles de PCR selon le schéma suivant : 94 30s, 55 30s, et 68 30s.  The two products thus purified which comprise overlapping sequences are subjected mixed and subjected to a PCR amplification reaction using the 5'N and 3'C primers as defined below in Table 1. The PCR reaction is set according to the following scheme: the purified N and C sequences, the Taq polymerase and the nucleotide mixture are mixed and subjected to 10 cycles: 94 30s, 55 30s, and 68 30s. The 5'N and 3'C primers are then added and the resulting mixture is subjected to 20 PCR cycles according to the following scheme: 94 30s, 55 30s, and 68 30s.

Les séquences d'ADN ainsi amplifiées sont ensuite purifiées sur colonnes QIAQUICK dans les conditions recommandées par le fabricant.  The DNA sequences thus amplified are then purified on QIAQUICK columns under the conditions recommended by the manufacturer.

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rableau 1 : Amorces utilisées dans les réaction d'amplification par PCR

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raster 1: Primers used in PCR amplification reaction
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<tb>. <SEP>3'CCCA<SEP> GAC <SEP> AAT <SEP> AAT <SEP> TGT <SEP> CTG <SEP> GCT <SEP> GCC <SEP> CAT <SEP> TTA <SEP> TCT <SEP> AAT <SEP> CBT
<tb> Construction <SEP> of <SEP> SEQ <SEP> ID <SEP> N033
<tb>. <SEP>5'N<SEP> GGG <SEP> CAA <SEP> GTT <SEP> TGT <SEP> GGA <SEP> ATT <SEP> GGG <SEP> CCA <SEP> GAC <SEP> AAT <SEP> TAT <SEP> TGT <SEP> GTG <SEP> GCCG <SEP> CTC <SEP> GAG
<tb>. <SEP>3'N<SEP> CTA <SEP> ATG <SEP> GTG <SEP> ATG <SEP> GTG <SEP> ATG <SEP> GTG <SEP> TGA <SEP> CCC <SEP> TBT <SEP> CCCTCC <SEP> CTT <SEP> TAG <SEP> GTA <SEP> TCT <SEP> TTC
<tb> CAC
<tb>. <SEP>5'C<SEP> CAT <SEP> GCC <SEP> ATG <SEP> GGA <SEP> TGG <SEP> ATG <SEP> GAG <SEP> TGG <SEP> GAC <SEP> AGA <SEP> GCCA <SEP> GAC <SEP> AAT <SEP> AAT <SEP> TGT <SEP> CTG
<tb>. <SEP>3'C<SEP> GCC <SEP> CAA <SEP> TTC <SEP> CAC <SEP> AAA <SEP> CTT <SEP> GCC <SEP> C
<Tb>

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Exemple 2 : Clonage des séquences d'ADN de l'exemple 1 dans un vecteur d'expression. Example 2 Cloning of the DNA Sequences of Example 1 into an Expression Vector

Les séquences d'ADN produites dans l'exemple 1 sont digérées par Ncol et Xhol dans des conditions standards en utilisant 10 unités de chacune des enzymes pour 1 g de

Figure img00180001

fragment PCR, puis clonées dans un vecteur pET-cer selon le mode opératoire suivant : le fragment PCR et le vecteur digéré par les enzymes Ncol et Xhol sont ligués entre eux puis utilisés pour transformer une souche bactérienne XLI par électroporation. L'obtention de la construction est vérifiée par minipréparation du plasmide et séquençage. The DNA sequences produced in Example 1 are digested with NcoI and XhoI under standard conditions using 10 units of each of the enzymes per 1 g of
Figure img00180001

PCR fragment, then cloned into a pET-cer vector according to the following procedure: the PCR fragment and the vector digested with the Ncol and XhoI enzymes are ligated together and then used to transform an XLI bacterial strain by electroporation. Obtaining the construct is verified by minipreparation of the plasmid and sequencing.

Le vecteur pET-cer utilisé est construit à partir du vecteur pET28 de Novagen. Le vecteur commercial pET28c a été amplifié par PCR à l'aide de 2 amorces situées de part et d'autre de la région correspondant à l'origine fl, de sorte que le produit amplifié corresponde à la quasi totalité du vecteur d'origine moins la région comprenant l'origine fl. Les sites de restriction uniques AscI et PacI sont apportés respectivement par les 2 amorces ayant servi à l'amplification. Parallèlement le fragment cer est amplifié à l'aide de 2 amorces qui

Figure img00180002

permettent d'obtenir ce fragment encadré par les sites AscI et PacI. The pET-cer vector used is constructed from the Novagen pET28 vector. The pET28c commercial vector was amplified by PCR using 2 primers located on either side of the region corresponding to the origin f 1, so that the amplified product corresponds to almost all the original vector minus the region comprising the origin f1. The unique AscI and PacI restriction sites are provided respectively by the 2 primers used for the amplification. In parallel, the cer fragment is amplified using 2 primers which
Figure img00180002

allow to obtain this fragment framed by the sites AscI and PacI.

Vecteur et fragment cer sont digérés par les enzymes AscI et Pacl puis ligués entre eux Ce vecteur comprend en particulier une cassette d'expression sous le contrôle du promoteur T7, un polylinker en aval du promoteur T7 pour le clonage du gène d'intérêt, le fragment cer situé en aval du polylinker, permettant de diminuer la multimérisation des plasmides, un terminateur de transcription T7 term et le gène de résistance à la kanamycine. Vector and fragment cer are digested by the enzymes AscI and PacI then ligated together. This vector comprises in particular an expression cassette under the control of the T7 promoter, a polylinker downstream of the T7 promoter for cloning the gene of interest, the fragment cer located downstream of the polylinker, to reduce the multimerization of the plasmids, a term T7 transcription terminator and kanamycin resistance gene.

La régulation positive du promoteur est obtenue en présence de la T7 RNA polymérase. Positive upregulation of the promoter is achieved in the presence of T7 RNA polymerase.

La carte plasmidique du plasmide pET-cer est donnée à la figure 4 (SEQ ID NO 35). The plasmid map of the plasmid pET-cer is given in FIG. 4 (SEQ ID NO. 35).

Exemple 3 : Préparation du polypeptide SEO ID ? 7 selon l'invention
1-Expression L'expression du plasmide issu de l'exemple 2 renfermant la séquence codant pour le polypeptide SEQ ID ? 7 est réalisée chez une souche modifiée d'E. coli i. e. : BL21 RILXDE3.
Example 3: Preparation of the SEO ID polypeptide 7 according to the invention
EXPRESSION Expression of the Plasmid Derived from Example 2 Containing the Sequence Encoding the Polypeptide SEQ ID? 7 is carried out in a modified strain of E. coli ie: BL21 RILXDE3.

Cette souche est enrichie en tRNA rares (ARG, ILE, LEU), elle contient le gène codant pour la T7 RNA polymérase lequel est sous le contrôle du promoteur lac UV5 inductible par addition d'IPTG à une concentration de ImM Dans un premier temps la souche est transformée par le plasmide selon le protocole comprenant les étapes suivantes : repiquage de 3 colonies dans 10 ml de LB additionné de This strain is enriched in rare tRNAs (ARG, ILE, LEU), it contains the gene encoding the T7 RNA polymerase which is under the control of the inducible lac UV5 promoter by addition of IPTG at a concentration of 1 mM. strain is transformed by the plasmid according to the protocol comprising the following steps: transplanting 3 colonies into 10 ml of LB supplemented with

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Figure img00190001

kanamycine àune concentration de 25g/JlI ; Incubation une nuit à 37 C ; réensemencer la préculture au 1 : 100 dans 15ml de LB additionné de kanamycine à une concentration de 2511gel ; laisser pousser jusqu'à D0600 de 0,5 ; Prélever 1 ml pour vérifier la D0600 ; prélever 7 ml pour l'échantillon non induit ; induire les 7 autres ml avec 1 mM d'IPTG et induction 3H à 37 C.
Figure img00190001

kanamycin at a concentration of 25 g / ml; Incubation overnight at 37 C; reseed the preculture to 1: 100 in 15ml of LB supplemented with kanamycin at a concentration of 2511gel; allow to grow to D0600 of 0.5; Take 1 ml to check the OD600; take 7 ml for the uninduced sample; induce the other 7 ml with 1 mM IPTG and induction 3H at 37 ° C.

Le même protocole a été mis en oeuvre sur plusieurs litres de culture pour produire une grande quantité de bactéries pour purifier le polypeptide selon l'invention. The same protocol was implemented on several liters of culture to produce a large quantity of bacteria for purifying the polypeptide according to the invention.

2-Purification le culot cellulaire, formé des bactéries récoltées dans 500ml de milieu de culture, est décongelé et repris dans 100ml de tampon Tris-HCI 50mM à pH8,0 en présence d'un inhibiteur de protéase (Péfabloc, Interchim) à la concentration de lOOuM. Du lysozyme est ajouté à la concentration de 100ug/ml et le mélange est incubé 30 minutes à température ambiante avec agitation. Les cellules sont ensuite cassées par sonication (4 cycles de deux minutes) avec une puissance approximative de 150 Watts. On ajoute ensuite de la benzonase (DNase, Merck) avec du MgC12 1 mM et on incube le mélange 20 min à température ambiante avec agitation. Après centrifugation (20 min à 10000g), le polypeptide selon l'invention se trouve dans la fraction insoluble sous forme de corps d'inclusion. Ceux-ci sont lavés avec du tampon Tris-HCI 50mM à pH8,0 et centrifugés pendant 15min à 10000g.  2-Purification the cell pellet, formed of the bacteria harvested in 500 ml of culture medium, is thawed and taken up in 100 ml of 50 mM Tris-HCl buffer at pH 8.0 in the presence of a protease inhibitor (Péfabloc, Interchim) at the concentration 100uM. Lysozyme is added at a concentration of 100 μg / ml and the mixture is incubated for 30 minutes at room temperature with stirring. The cells are then broken by sonication (4 cycles of two minutes) with an approximate power of 150 Watts. Benzonase (DNase, Merck) is then added with 1 mM MgCl2 and the mixture is incubated for 20 minutes at room temperature with stirring. After centrifugation (20 min at 10,000 g), the polypeptide according to the invention is in the insoluble fraction in the form of inclusion bodies. These are washed with 50mM Tris-HCl buffer at pH 8.0 and centrifuged for 15min at 10000g.

Le polypeptide selon l'invention peut ensuite être purifié par l'un des deux procédés suivant : Procédé 1 : Après élimination du surnageant, la solubilisation du culot de centrifugation composé essentiellement des corps d'inclusion est effectuée en une heure à température ambiante par agitation douce en présence de 50ml de tampon CAPS à pH 11,0 contenant 1% de N-lauryl sarcosine. The polypeptide according to the invention can then be purified by one of the following two methods: Method 1: After removal of the supernatant, the solubilization of the centrifugation pellet consisting essentially of the inclusion bodies is carried out in one hour at room temperature by stirring soft in the presence of 50ml of CAPS buffer at pH 11.0 containing 1% N-lauryl sarcosine.

La fraction solubilisée est ensuite dialysée à 4 C contre du tampon Tris-HCI 50mM à pH 8,0 contenant des concentrations décroissantes de détergent (0.2% final) et filtrée sur un

Figure img00190002

filtre de porosité 0, 45um puis chargée sur une colonne Hi-Trap Iml (Pharmacia). Ces supports de chromatographie d'affinité chélatent des atomes de Nickel sur lesquels se fixent les résidus histidine de l'extrémité C-terminal du polypeptide. Après lavage, l'élution du polypeptide est obtenue avec du tampon acide formique 50mM à pH 2,5. The solubilized fraction is then dialyzed at 4 ° C. against 50 mM Tris-HCl buffer at pH 8.0 containing decreasing concentrations of detergent (0.2% final) and filtered through a filter.
Figure img00190002

filter of porosity 0, 45um then loaded on a Hi-Trap Iml column (Pharmacia). These affinity chromatography supports chelate nickel atoms on which the histidine residues of the C-terminus of the polypeptide are fixed. After washing, the elution of the polypeptide is obtained with 50 mM formic acid buffer at pH 2.5.

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Procédé2 : Après élimination du surnageant, la solubilisation du culot de centrifugation composé essentiellement des corps d'inclusion est effectuée en une heure à température ambiante par agitation douce en présence de 30ml de tampon Tris-HCI 50mM pH8,0, urée 8M. Après filtration sur un filtre de porosité 0, 45um, la fraction est chargée sur une colonne Hi-Trap 1ml (Pharmacia). Après lavage, l'élution est réalisée avec du tampon Tris-HCI 50mM pH8, 0 + Urée 8M + imidazole 500mM. La fraction éluée est ensuite dialysée contre du tampon acide formique 50mM à pH 2,5. Process2: After removal of the supernatant, the solubilization of the centrifugation pellet consisting essentially of the inclusion bodies is carried out for one hour at room temperature by gentle stirring in the presence of 30 ml of 50 mM Tris-HCl buffer pH 8.0, 8M urea. After filtration on a 0.45 μm porosity filter, the fraction is loaded onto a 1ml Hi-Trap column (Pharmacia). After washing, the elution is carried out with Tris-HCl buffer 50mM pH8, 0 + Urea 8M + imidazole 500mM. The eluted fraction is then dialyzed against 50 mM formic acid buffer at pH 2.5.

Exemple 4 : Préparation du polypeptide SEO ID N6 selon l'invention : Le polypeptide est exprimé en utilisant le protocole décrit dans l'exemple 3 puis purifié selon le mode opératoire décrit ci-dessous. EXAMPLE 4 Preparation of SEO ID N6 Polypeptide According to the Invention The polypeptide is expressed using the protocol described in Example 3 and then purified according to the procedure described below.

Le culot cellulaire, formé des bactéries récoltées dans 500ml de milieu de culture, est décongelé et repris dans 100ml de tampon Tris-HCI 50mM à pH8,0 en présence d'un inhibiteur de protéase (Péfabloc, Interchim) à la concentration de lOOuM. Du lysozyme est ajouté à la concentration de lOOug/mI et le mélange est incubé 30 minutes à température ambiante avec agitation. Les cellules sont ensuite cassées par sonication (4 cycles de deux minutes) avec une puissance approximative de 150 Watts. On ajoute ensuite de la benzonase (DNase, Merck) avec du MgC12 1 mM et on incube le mélange 20 min à température ambiante avec agitation. Après centrifugation (20 min à 10000g), le polypeptide selon l'invention se trouve majoritairement dans la fraction soluble. Après filtration sur un filtre de porosité 0, 45 um, la fraction est chargée sur une colonne Hi-Trap 1ml (Pharmacia). Après lavage, l'élution est réalisée avec du tampon Tris-HCI 50mM pH8,0 + imidazole 500mM. La fraction éluée est ensuite dialysée contre du tampon tampon Tris-HCI 50mM pH 8,0. The cell pellet, formed of the bacteria collected in 500 ml of culture medium, is thawed and taken up in 100 ml of 50 mM Tris-HCl buffer at pH 8.0 in the presence of a protease inhibitor (Péfabloc, Interchim) at a concentration of 100 μM. Lysozyme is added at the concentration of 100 μg / ml and the mixture is incubated for 30 minutes at room temperature with stirring. The cells are then broken by sonication (4 cycles of two minutes) with an approximate power of 150 Watts. Benzonase (DNase, Merck) is then added with 1 mM MgCl2 and the mixture is incubated for 20 minutes at room temperature with stirring. After centrifugation (20 min at 10,000 g), the polypeptide according to the invention is predominantly in the soluble fraction. After filtration on a 0.45 μm porosity filter, the fraction is loaded onto a 1ml Hi-Trap column (Pharmacia). After washing, the elution is carried out with 50 mM Tris-HCl buffer pH 8.0 + 500 mM imidazole. The eluted fraction is then dialyzed against 50 mM Tris-HCl buffer buffer pH 8.0.

Le polypeptide à une concentration de 0,4mg/ml est ensuite placé dans un tampon formate de sodium 50mM à pH 2,5. Un mélange TFE/polypeptide est préparé par addition de 1 vol. de TFE pour 1 vol. de solution de polypeptide. Le mélange ainsi obtenu est incubé à température ambiante pendant 15 min. 6mg de phosphate d'Al sont ajoutés ainsi que du tampon formate de sodium 50mM pour obtenir un volume final de 0,5 ml. The polypeptide at a concentration of 0.4 mg / ml is then placed in a 50 mM sodium formate buffer at pH 2.5. A TFE / polypeptide mixture is prepared by adding 1 vol. TFE for 1 vol. of polypeptide solution. The mixture thus obtained is incubated at room temperature for 15 minutes. 6 mg of Al phosphate are added together with 50 mM sodium formate buffer to obtain a final volume of 0.5 ml.

Le mélange est ensuite incubé à 4 C sous agitation pendant un temps qui peut varier entre 15 min. et 3 heures de façon à permettre l'adsorption totale de la protéine sur le phosphate d'aluminium. Après l'étape d'adsorption, le mélange est centrifugé pendant 5 minutes à environ 10000g. Le surnageant est éliminé et le culot est resuspendu dans le volume initial en ajoutant la quantité nécessaire de tampon PBS. Une deuxième centrifugation et une The mixture is then incubated at 4 ° C. with stirring for a time which can vary between 15 min. and 3 hours to allow total adsorption of the protein on the aluminum phosphate. After the adsorption step, the mixture is centrifuged for 5 minutes at about 10000g. The supernatant is removed and the pellet is resuspended in the original volume by adding the necessary amount of PBS buffer. A second centrifugation and a

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reprise dans le même tampon permet d'éliminer les dernières traces d'acide formique et de TFE.  recovery in the same buffer eliminates the last traces of formic acid and TFE.

La préparation ainsi obtenue forme la composition pharmaceutique administrable. The preparation thus obtained forms the administrable pharmaceutical composition.

Exemple 5 : Analyse par DSC des polypeptides selon l'invention Les analyses ont été réalisées sur un microcalorimètre VP (Microcal, Northampton, Massachusetts, USA) de la façon suivante : Préparation des échantillons : Concentration en polypeptide : 0,4-0, 7mg/ml, déterminée par la méthode MicroBCA (Pierce, Rockford, Illinois, USA). Le polypeptide est filtré avant analyse (seuil de coupure de 0, 22gm), dégazé pendant 8 min. dans le Thermovac (Microcal, Northampton, Massachusetts, USA) puis thermostaté à 24 C. Les échantillons sont en tampon formate de Na 50mM pH2, 5. EXAMPLE 5 Analysis by DSC of the Polypeptides According to the Invention The analyzes were carried out on a VP microcalorimeter (Microcal, Northampton, Massachusetts, USA) as follows: Preparation of the samples: Polypeptide concentration: 0.4-0.7 mg / ml, determined by the MicroBCA method (Pierce, Rockford, Illinois, USA). The polypeptide is filtered before analysis (cutoff threshold of 0.22 gm), degassed for 8 min. in the Thermovac (Microcal, Northampton, Massachusetts, USA) and then thermostated at 24 C. The samples are in 50mM Na formate buffer pH2.5.

Enregistrement : Après l'échauffement de l'appareil qui consiste en 6-10 thermocycles du tampon contre tampon, le polypeptide est placé dans la cellule de mesure quand la température de la cellule est de 25 C. Recording: After warming up the device which consists of 6-10 thermocycles of the buffer against buffer, the polypeptide is placed in the measuring cell when the temperature of the cell is 25 C.

Les paramètres des thermocycles sont les suivants : (1) 15 min. d'équilibrage à 5 C ; (2) augmentation de la température de 5 C-130 C avec une vitesse de 85 C/H ; (3) 3 min d'équilibrage à 130 C et (4) refroidissement de 130 C à 5 C (vitesse maximale) comprenant l'étape de chargement de l'échantillon suivant à la température de 25 C pour la mesure suivante. The parameters of the thermocycles are as follows: (1) 15 min. balancing at 5 C; (2) increasing the temperature of 5 C-130 C with a speed of 85 C / H; (3) balancing at 130 ° C. and (4) cooling at 130 ° C. at 5 ° C. (maximum speed) comprising the step of loading the next sample at a temperature of 25 ° C. for the next measurement.

L'analyse a été réalisée sur l'ectodomaine de la gp41 LAI constitué des acides aminés AA25-AA157 et sur les polypeptides SEQ ID N031 et SEQ ID N030 selon l'invention.  The analysis was carried out on the ectodomain of gp41 LAI consisting of amino acids AA25-AA157 and on the polypeptides SEQ ID N031 and SEQ ID No. 30 according to the invention.

La concentration protéique était de 0,51 mg/ml pour l'ectodomaine entier de gp41 et de 0,63 mg/ml pour les polypeptides selon l'invention. The protein concentration was 0.51 mg / ml for the whole ectodomain of gp41 and 0.63 mg / ml for the polypeptides according to the invention.

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Les résultats représentés à la figure 2 sont donnés dans le tableau 2 ci-dessous : Tableau 2 :

Figure img00220001
The results shown in Figure 2 are given in Table 2 below: Table 2:
Figure img00220001

<tb>
<tb> Echantillon <SEP> T) <SEP> AH <SEP> AHVH
<tb> [écart <SEP> type <SEP> 0, <SEP> 2 C] <SEP> (Kcal/mol) <SEP> (Kcal/mol)
<tb> Ectodomaine <SEP> entier <SEP> de <SEP> gp41
<tb> 110, <SEP> 4 <SEP> 61 <SEP> 228
<tb> Polypeptide <SEP> SEQ <SEP> ID <SEP> N031
<tb> 101, <SEP> 9 <SEP> 58 <SEP> 140
<tb> Polypeptide <SEP> SEQ <SEP> ID <SEP> N030
<tb> 90, <SEP> 3 <SEP> 59 <SEP> 152
<tb>
Exemple 6 : Analyse par dichroïsme circulaire des polypeptides selon l'invention
Les analyses ont été réalisées sur un spectropolarimètre (Jasco, Tokyo, Japan) dans les conditions suivantes : temp : 25 C ; Cuve : trajet optique : O, lmm ; Concentration en polypeptide : 1-2 mg/ml. Le polypeptide est placé dans la cuve et le spectre est enregistré à une vitesse de balayage de 10nm/min. Les spectres obtenus sont analysés par le logiciel Spectra Analysis de Jasco. Le spectre du tampon est utilisé pour corriger le bruit de fond.
<Tb>
<tb> Sample <SEP> T) <SEP> AH <SEP> AHVH
<tb> [difference <SEP> type <SEP> 0, <SEP> 2 C] <SEP> (Kcal / mol) <SEP> (Kcal / mol)
<tb> Ectodomain <SEP> integer <SEP> of <SEP> gp41
<tb> 110, <SEP> 4 <SEP> 61 <SEP> 228
<tb> Polypeptide <SEP> SEQ <SEP> ID <SEP> N031
<tb> 101, <SEP> 9 <SEP> 58 <SEP> 140
<tb> Polypeptide <SEP> SEQ <SEP> ID <SEP> N030
<tb> 90, <SEP> 3 <SEP> 59 <SEP> 152
<Tb>
Example 6 Circular Dichroism Analysis of the Polypeptides According to the Invention
The analyzes were carried out on a spectropolarimeter (Jasco, Tokyo, Japan) under the following conditions: temp: 25 C; Vessel: optical path: O, lmm; Concentration of polypeptide: 1-2 mg / ml. The polypeptide is placed in the vat and the spectrum is recorded at a scanning rate of 10 nm / min. The spectra obtained are analyzed by Spectra Analysis software from Jasco. The spectrum of the buffer is used to correct the background noise.

L'analyse a été réalisé sur l'ectodomaine entier de la gp41 LAI (i. e. AA25-157) et sur le polypeptide SEQ ID ? 31 selon l'invention.  The assay was performed on the entire ectodomain of LAI gp41 (e.g., AA25-157) and the SEQ ID? 31 according to the invention.

Les résultats représentés à la figure 3 montrent que l'ectodomaine entier présente un taux d'hélicité de 69%, le polypeptide selon l'invention présente un taux d'hélicité de 70% et le polypeptide mélangé au TFE présente un taux d'hélicité de 100%.  The results shown in FIG. 3 show that the entire ectodomain has a helicity rate of 69%, the polypeptide according to the invention has a helicity rate of 70% and the polypeptide mixed with TFE has a helicity rate. 100%.

Exemple 7 : Test d'immunisation chez le cobaye Huit groupes de cinq cobayes sont immunisés trois fois par voie intramusculaire à trois

Figure img00220002

semaines d'intervalle (dans les cuisses) à raison de 0, 25ml dans le biceps femoris de chaque cuisse, avec 20ug des polypeptides SEQ ID Ni28, SEQ ID N32, SEQ ID ? 30 ou SEQ ID ? 31 selon l'invention, traités ou non par 30% de TFE, en présence de 6mg de phosphate d'aluminium. Les sérums des animaux sont prélevés avant immunisation après deux immunisations et en fin de test de façon à suivre la montée des anticorps. Example 7: Guinea pig immunization test Eight groups of five guinea pigs are immunized three times intramuscularly at three
Figure img00220002

weeks apart (in the thighs) at a rate of 0, 25 ml in the biceps femoris of each thigh, with 20 μg of the polypeptides SEQ ID Ni28, SEQ ID N32, SEQ ID? 30 or SEQ ID? 31 according to the invention, treated or not with 30% TFE, in the presence of 6 mg of aluminum phosphate. The sera of the animals are taken before immunization after two immunizations and at the end of the test in order to follow the rise of the antibodies.

Le pouvoir neutralisant des anticorps obtenus est déterminé par la technique de C. Moog telle que décrite précédemment.The neutralizing power of the antibodies obtained is determined by the technique of C. Moog as described above.

Claims (15)

REVENDICATIONS.CLAIMS. 1.-Polypeptide comprenant une séquence de formule 1 : [N-Sl] n-C- [S2-N] m dans laquelle : N représente la séquence des acides aminés 30 à 77 de la gp41, C représente la séquence des acides aminés 117 à 154 de la gp41, SI et S2 sont indépendamment l'un de l'autre soit absents, soit représentent une séquence A polypeptide comprising a sequence of formula 1: wherein N represents the amino acid sequence 30 to 77 of gp41, C represents the amino acid sequence 117 to 154 of gp41, SI and S2 are independently of each other either absent or represent a sequence
Figure img00230001
Figure img00230001
d'acides aminés telle que la séquence de formule 1 adopte une conformation en hélice alpha telle que déterminée par le logiciel SOPMA dans les conditions suivantes : nombre d'états conformationnels = 4 Limite de similarité = 8 et, Largeur de la fenêtre = 70  of amino acids such that the sequence of formula 1 adopts an alpha helix conformation as determined by the SOPMA software under the following conditions: number of conformational states = 4 Similarity limit = 8 and, Width of the window = 70
Figure img00230002
Figure img00230002
n = 0 ou 1 ; m = 0 ou 1 et m + n = 1 ou 2. n = 0 or 1; m = 0 or 1 and m + n = 1 or 2.
2.-Polypeptide selon la revendication 1 dans lequel SI est absent ou représente la séquence d'acides aminés D, DQ, DQQ, DQQL ou DNNMT et S2 est absent ou représente la séquence d'acides aminés W, WA, WAS, WASL ou WASLW. 2. A polypeptide according to claim 1 wherein SI is absent or represents the amino acid sequence D, DQ, DQQ, DQQL or DNNMT and S2 is absent or represents the amino acid sequence W, WA, WAS, WASL or WASLW. 3.-Polypeptide selon la revendication 1 ou 2 dans lequel m+n=l. The polypeptide of claim 1 or 2 wherein m + n = 1. 4.-Polypeptide selon l'une quelconque des revendications 1 à 3 dans lequel N représente SEQ ID N26 et C représente SEQ ID ? 27. 4. A polypeptide according to any one of claims 1 to 3 wherein N is SEQ ID N26 and C is SEQ ID? 27. 5.-Polypeptide selon l'une quelconque des revendications 1 à 4 comprenant une séquence supplémentaire de formule (G) a-S- (H) b dans laquelle G représente un résidu glycine, H représente un résidu histidine, a est supérieur ou égal à 4 et b est supérieur ou égal à 6, ladite séquence étant liée par liaison amide à l'extrémité NH2-ou COOH-terminale du polypeptide. 5. A polypeptide according to any one of claims 1 to 4 comprising a further sequence of formula (G) aS- (H) b wherein G represents a glycine residue, H represents a histidine residue, a is greater than or equal to 4 and b is greater than or equal to 6, said sequence being amide bonded to the NH 2 or COOH terminus of the polypeptide. <Desc/Clms Page number 24> <Desc / Clms Page number 24> 6. - Conjugué comprenant un polypeptide selon l'une quelconque des revendications 1 à 5, conjugué à une protéine ou un peptide porteur.  6. Conjugate comprising a polypeptide according to any one of claims 1 to 5, conjugated to a protein or a carrier peptide. 7.-Séquence d'ADN codant pour un polypeptide selon l'une quelconque des revendications 1 à 5 ou pour un conjugué selon la revendication 6. 7. A DNA sequence coding for a polypeptide according to any one of claims 1 to 5 or a conjugate according to claim 6. 8.-Vecteur d'expression comprenant la séquence d'ADN selon la revendication 7.  An expression vector comprising the DNA sequence of claim 7. 9.-Cellule hôte contenant le vecteur selon la revendication 8. 9.-host cell containing the vector according to claim 8. 10.-Procédé de préparation d'un polypeptide selon l'une quelconque des revendications 1 à 5 comprenant l'expression dudit polypeptide à partir d'une cellule hôte telle que définie dans la revendication 9. 10. A process for the preparation of a polypeptide according to any one of claims 1 to 5 comprising the expression of said polypeptide from a host cell as defined in claim 9. 11.-Composition pharmaceutique comprenant au moins un polypeptide selon l'une des revendications 1 à 5, ou au moins un conjugué selon la revendication 6 ou au moins un vecteur d'expression selon la revendication 8, un excipient pharmaceutiquement acceptable et éventuellement un adjuvant. 11. A pharmaceutical composition comprising at least one polypeptide according to one of claims 1 to 5, or at least one conjugate according to claim 6 or at least one expression vector according to claim 8, a pharmaceutically acceptable excipient and optionally an adjuvant. . 12.-Composition pharmaceutique selon la revendication 11 administrable par voie orale. 12. Pharmaceutical composition according to claim 11 orally administrable. 13.-Composition pharmaceutique selon la revendication 11 ou 12 comprenant en outre un support pharmaceutiquement acceptable. 13. The pharmaceutical composition of claim 11 or 12 further comprising a pharmaceutically acceptable carrier. 14.-Polypeptide selon l'une quelconque des revendications 1 à 5 pour son utilisation à titre de médicament. A polypeptide according to any one of claims 1 to 5 for use as a medicament. 15.-Polypeptide selon la revendication 14 pour l'immunisation du corps humain contre les infections liées au VIH15.-Polypeptide according to claim 14 for the immunization of the human body against HIV-related infections
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