FR2778922A1 - Polynucleotide useful for regulating gene expression in bacteria, especially Clostridium, e.g. for vaccine production - Google Patents
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Abstract
Description
La présente invention a pour objet la séquence de gènes de régulation deThe subject of the present invention is the gene sequence for regulating
la synthèse de toxines produites par des bactéries du synthesis of toxins produced by bacteria from
genre Clostridium.genus Clostridium.
Elle est en outre relative à des polynucléotides comprenant ces séquences ainsi qu'à des microorganismes portant ces vecteurs. Les toxines tétanique et botulique sont des neurotoxines sécrétées par des bactéries du genre Clostridium, respectivement It also relates to polynucleotides comprising these sequences as well as to microorganisms carrying these vectors. Tetanus and botulinum toxins are neurotoxins secreted by bacteria of the genus Clostridium, respectively
C.tetani et C. botulinum.C. tetani and C. botulinum.
Les gènes de structure de ces toxines ont été caractérisés dans The structural genes of these toxins have been characterized in
0o diverses souches.0o various strains.
Dans le cas de la toxine botulique, les gènes de structure sont associés à des gènes codant pour des protéines non toxiques, ainsi qu'à des gènes de régulation au sein d'opérons chargés de produire ces toxines. L'organisation est sensiblement identique dans les sept groupes de toxines connus (A, B, C1, D, E, F et G). Elle a entre autres été décrite par HAUSER et al. (1994, Mol. Gen.Genet, 243, 631-640), EAST et al. (1994, System. Appl.Microbiol., 17, 306-312) ou encore In the case of botulinum toxin, the structural genes are associated with genes coding for non-toxic proteins, as well as regulatory genes within operons responsible for producing these toxins. The organization is substantially identical in the seven groups of known toxins (A, B, C1, D, E, F and G). Among other things, it has been described by HAUSER et al. (1994, Mol. Gen. Genet, 243, 631-640), EAST et al. (1994, System. Appl. Microbiol., 17, 306-312) or even
EAST et al. (1996, Int. J.Syst. Bacteriol., 46, 1005-1012). EAST et al. (1996, Int. J. System. Bacteriol., 46, 1005-1012).
Un gène a été identifié dans le toxinotype Cl. Puis, ce gène prédit pour être un gène de régulation de l'expression des toxines a été A gene was identified in the C1 toxinotype. Then, this gene predicted to be a gene for regulating the expression of toxins was
mis en évidence par BHANDARI et al. (1997, Curr. Microbiol., 35;207- highlighted by BHANDARI et al. (1997, Curr. Microbiol., 35; 207-
214) dans des souches de C. botulinum de type B. Ce gène a été appelé 214) in strains of C. botulinum type B. This gene was called
P-21, mais est encore connu sous la dénomination Orf21 ou BolR. P-21, but is still known by the name Orf21 or BolR.
L'organisation des gènes exprimant la toxine chez C.tetani est The organization of genes expressing the toxin in C.tetani is
bien moins complexe que celle mise en évidence chez C.botulinum. much less complex than that demonstrated in C.botulinum.
Ainsi, les opérons ou groupes de gènes commandant la synthèse de la Thus, the operons or groups of genes controlling the synthesis of
toxine tétanique ne comprennent qu'un seul gène de structure. tetanus toxin include only one structural gene.
BHANDARI et al. (1997, précédemment cité) font remarquer qu'il existe une homologie entre le gène de régulation appelé P-21 chez Clostridium botulinum, et l'extrémité C-terminale (29 acides aminés) d'une protéine codée en amont du gène de structure de la toxine chez Clostridium tetani. Néanmoins, il s'agit simplement d'une hypothèse et aucune preuve ne vient confirmer l'appartenance de cette séquence de 29 BHANDARI et al. (1997, previously cited) point out that there is a homology between the regulatory gene called P-21 in Clostridium botulinum, and the C-terminal end (29 amino acids) of a protein encoded upstream of the structural gene toxin in Clostridium tetani. However, this is simply a hypothesis and there is no evidence to confirm that this sequence of 29
acides aminés à une protéine de régulation. amino acids to a regulatory protein.
En tout état de cause la séquence complète de ce gène n'est In any event, the complete sequence of this gene is not
pas décrite.not described.
L'étude de la synthèse de ces toxines et de son organisation génétique présente pourtant un grand intérêt pharmaceutique, du fait de leur nature. En effet, la production de ces toxines, ou de leurs fragments, a été tentée dans divers microorganismes tels qu'Escherichia coi, Lactococcus lactis, Baculovirus et Pichia Pastoris, mais ces productions se sont révélées insuffisantes pour que ces microorganismes soient The study of the synthesis of these toxins and its genetic organization, however, is of great pharmaceutical interest, due to their nature. Indeed, the production of these toxins, or their fragments, has been attempted in various microorganisms such as Escherichia coi, Lactococcus lactis, Baculovirus and Pichia Pastoris, but these productions have proved to be insufficient for these microorganisms to be
utilisés à une échelle industrielle. used on an industrial scale.
1o Les inventeurs ont montré qu'il existe un gène de régulation chez Clostridium tetani, permettant une régulation positive de la 1o The inventors have shown that there is a regulatory gene in Clostridium tetani, allowing positive regulation of the
synthèse de la toxine de cette bactérie. synthesis of the toxin of this bacterium.
Ils ont en outre montré que ce gène, ainsi que d'autres gènes de régulation de bactéries du genre Clostridium, pouvaient être utilisés pour la production de diverses protéines par des bactéries du genre Clostridium. La présente invention a donc pour objet une séquence présentant une identité d'au moins 60%, et préférentiellement 75%, avec au moins une partie substantielle du gène de régulation tetR présentant la séquence SEQ ID N 1 suivante, ou s'hybridant en conditions They also showed that this gene, as well as other genes for regulating bacteria of the genus Clostridium, could be used for the production of various proteins by bacteria of the genus Clostridium. The subject of the present invention is therefore a sequence having an identity of at least 60%, and preferably 75%, with at least a substantial part of the tetR regulatory gene having the sequence SEQ ID N 1 following, or hybridizing under conditions
stringentes,( ou rigoureuses), avec cette partie. stringent, (or rigorous), with this part.
Les pourcentages d'identité indiqués dans la présente invention The percentages of identity indicated in the present invention
ont été calculés par le programme Best Phit (logiciel GCG). were calculated by the Best Phit program (GCG software).
SEQ ID N 1:SEQ ID N 1:
AACTATATTA ATATACACAT CCTCGGTAAT ATATCAATAC AATACATGTA AACTATATTA ATATACACAT CCTCGGTAAT ATATCAATAC AATACATGTA
ATTAATAATG TTTTTTGTAA AAGMTTAAGC TTAGTGGTTT ACTTTCAAAA ATTAATAATG TTTTTTGTAA AAGMTTAAGC TTAGTGGTTT ACTTTCAAAA
TATAATAAAA CGTTAATTAT AGAAAAGTGA AAGTAAGGTG ATG CTT ATG GAA TATAATAAAA CGTTAATTAT AGAAAAGTGA AAGTAAGGTG ATG CTT ATG GAA
AAT CTA TTT GTA AAA ATT AAG ACA TTA AAA AAT AAT AAT AAA GAA TTT AAT CTA TTT GTA AAA ATT AAG ACA TTA AAA AAT AAT AAT AAA GAA TTT
GAA GTA ATT ATT ATA CAT TTC AAA AAT ACT GTA AAT ATA CTTATT CGA GAA GTA ATT ATT ATA CAT TTC AAA AAT ACT GTA AAT ATA CTTATT CGA
AAG TAT AAT TTA GAA AGTCAT TAT AAT GAT ATC TTA TAT CATTTA TGG AAG TAT AAT TTA GAA AGTCAT TAT AAT GAT ATC TTA TAT CATTTA TGG
AAT ATA CTT AAA AAA ATT GAT TTG AAT AAA TTT AAT ACA GAA AAT GAT AAT ATA CTT AAA AAA ATT GAT TTG AAT AAA TTT AAT ACA GAA AAT GAT
TTA CAC AAA TAT ATT AGTAGA TCT TTA AAA AGA TAT TGC TTA GAT ATT TTA CAC AAA TAT ATT AGTAGA TCT TTA AAA AGA TAT TGC TTA GAT ATT
TGT AAT AAA AAA AAT AGG GAT AAA AAA ATA ATA TAT AAC TCA GAA ATT TGT AAT AAA AAA AAT AGG GAT AAA AAA ATA ATA TAT AAC TCA GAA ATT
ACA AAT ATA AAA TTA AAT TTA ATG GAA AAT AGT TGC TCA AAT TAT TTA ACA AAT ATA AAA TTA AAT TTA ATG GAA AAT AGT TGC TCA AAT TAT TTA
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GCT AAG CTT CAT ATG AGT CGT CAA GCT GTA TAT AAA AAT AAG GTT TTA GCT AAG CTT CAT ATG AGT CGT CAA GCT GTA TAT AAA AAT AAG GTT TTA
GCA TTA AAA AAA TTA GAA CCT ATA GTA AAT AAA TTA ATT AAT ATA T GCA TTA AAA AAA TTA GAA CCT ATA GTA AAT AAA TTA ATT AAT ATA T
AGTTTTTATA ATTTAATTAT GAATAATATT CTTAAGATAA AAAGTAAATT AGTTTTTATA ATTTAATTAT GAATAATATT CTTAAGATAA AAAGTAAATT
TTTAAAAAAT TTAAATTTTC AGTTTACAAA AAATAACCTG ATTATGTTAT TTTAAAAAAT TTAAATTTTC AGTTTACAAA AAATAACCTG ATTATGTTAT
ATGTAATTGT AAAAAACATA TAAAAAATCA GAAAAATTTA GGAGGTATAT ATGTAATTGT AAAAAACATA TAAAAAATCA GAAAAATTTA GGAGGTATAT
TATTAATGGA TTAAATAATA ATTTTTTAAT TTACTTTTGA TTAATAAATA TATTAATGGA TTAAATAATA ATTTTTTAAT TTACTTTTGA TTAATAAATA
TTAAATGTTT ATTTTAATTA GGAGATGATA CGTATGCC TTAAATGTTT ATTTTAATTA GGAGATGATA CGTATGCC
Une telle séquence comprend de manière préférentielle au Such a sequence preferably comprises at least
moins une partie de l'extrémité 3' de la séquence SEQ ID N 1. minus part of the 3 'end of the sequence SEQ ID N 1.
Le terme " partie " ou " fragment " de l'acide nucléique désigne tout acide nucléique comportant au moins une partie de la séquence concernée (par exemple la séquence SEQ ID N 1) et conservant une activité de régulation. La partie de la séquence comprend avantageusement 50 pb au moins, plus préférentiellement au moins 100 pb. Ces " parties " peuvent être générées aisément par les techniques classiques de la biologie moléculaire, soit par clivage et digestion enzymatiques à partir des fragments décrits, soit par synthèse The term "part" or "fragment" of the nucleic acid designates any nucleic acid comprising at least a part of the sequence concerned (for example the sequence SEQ ID N 1) and retaining a regulatory activity. The part of the sequence advantageously comprises at least 50 bp, more preferably at least 100 bp. These "parts" can be easily generated by conventional techniques of molecular biology, either by enzymatic cleavage and digestion from the fragments described, or by synthesis
en utilisant des synthétiseurs d'acides nucléiques. using nucleic acid synthesizers.
Le terme " hybridant " désigne au sens de l'invention toute hybridation dans des conditions normales, rigoureuses ou non, telles que définies ci-après. Des conditions d'hybridation rigoureuses ou stringentes sont par exemple: hybridation à 42 C, 50% de formamide, 5 X SSC, 1 X Denhardt; lavage à 65 C en 0,1 x SSC, 0,1% SDS. Des conditions non rigoureuses sont notamment: hybridation à 37 C, 40% de formamide, 5 x SSC, 1 x Denhardt; lavage à 50 C en 1 x SSC, 0,1 % SDS. Les conditions rigoureuses sont particulièrement adaptées lorsque les acides nucléiques sont présents en faibles quantités et/ou sous forme peu purifiée. Les conditions non rigoureuses sont plus adaptées lorsque l'acide nucléique est présent en quantités plus importantes et se The term “hybridizer” designates, within the meaning of the invention, any hybridization under normal conditions, rigorous or not, as defined below. Rigorous or stringent hybridization conditions are for example: hybridization at 42 ° C., 50% of formamide, 5 × SSC, 1 × Denhardt; washing at 65 C in 0.1 x SSC, 0.1% SDS. Non-stringent conditions include: hybridization at 37 C, 40% formamide, 5 x SSC, 1 x Denhardt; washing at 50 C in 1 x SSC, 0.1% SDS. The rigorous conditions are particularly suitable when the nucleic acids are present in small quantities and / or in poorly purified form. Non-stringent conditions are more suitable when the nucleic acid is present in larger quantities and is
trouve sous forme significativement représentée dans l'échantillon. found in the form significantly represented in the sample.
Avantageusement, les séquences " hybridant " sont des séquences qui hybrident en conditions rigoureuses, et qui possèdent donc un degré d'homologie structurale élevé avec la séquence concernée (par exemple Advantageously, the "hybridizing" sequences are sequences which hybridize under rigorous conditions, and which therefore have a high degree of structural homology with the sequence concerned (for example
la séquence SEQ ID N 1) ou ses fragments. the sequence SEQ ID N 1) or its fragments.
Les protéines ou peptides présentant une identité d'au moins 60% et préférentiellement 75%, avec une protéine ou un peptide comprenant une partie substantielle de la séquence SEQ ID N 2 Proteins or peptides having an identity of at least 60% and preferably 75%, with a protein or peptide comprising a substantial part of the sequence SEQ ID N 2
suivante, constituent un autre objet de la présente invention. next, constitute another object of the present invention.
SEQ ID N 2:SEQ ID N 2:
Met Leu Met Glu Asn Leu Phe Val Lys lie Lys Thr Leu Lys Asn Asn Asn Lys Glu Glu Val lie lie lie His Phe Lys Asn Thr Val Asn lile Leu lie Arg Lys Tyr Asn Leu Glu Ser His Tyr Asn Asp lie Leu Tyr His Leu Trp Asn lie Leu Lys Lys lie Asp Leu Asn Lys Phe Asn Thr Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr lie Ser Arg Ser Leu Lys Arg Tyr Cys Leu Asp lie Cys Asn Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys lie lie Tyr Asn Ser Glu lie Thr Asn lie Lys Leu Asn Leu Met Glu Asn Ser Cys Ser Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu lie Ser lie Leu Pro Glu Asn GIn Arg Lys lie Leu Tyr Met Lys Phe Phe Glu Tyr Met Lys Glu Cys Asp lie Ala Lys Leu His Met Ser Arg Gln Ala Val Tyr Lys Asn Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Pro lie Val Asn Lys Leu lie Asn lie De manière avantageuse, une telle protéine ou un tel peptide, présente une identité de séquence d'au moins 60% avec une protéine ou un peptide comprenant une partie substantielle de la séquence constituée par l'enchaînement des acides aminés en positions 125 à 175 Met Leu Met Glu Asn Leu Phe Val Lys lie Lys Thr Leu Lys Asn Asn Asn Lys Glu Glu Val lie lie lie His Phe Lys Asn Thr Val Asn lile Leu lie Arg Lys Tyr Asn Leu Glu Ser His Tyr Asn Asp lie Leu Tyr His Leu Trp Asn lie Leu Lys Lys lie Asp Leu Asn Lys Phe Asn Thr Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr lie Ser Arg Ser Leu Lys Arg Tyr Cys Leu Asp lie Cys Asn Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys lie lie Tyr Asn Ser Glu lie Thr Asn lie Lys Leu Asn Leu Met Glu Asn Ser Cys Ser Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu lie Ser lie Leu Pro Glu Asn GIn Arg Lys lie Leu Tyr Met Lys Phe Phe Glu Tyr Met Lys Glu Cys Asp lie Ala Lys Leu His Met Ser Arg Gln Ala Val Tyr Lys Asn Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Pro bind Val Asn Lys Leu bind Asn bind Advantageously, such a protein or such a peptide has a sequence identity of at least 60 % with a protein or peptide comprising a substantial part of the sequence constituted by the sequence of amino acids in positions 125 to 175
de la séquence SEQ ID N 2.of the sequence SEQ ID N 2.
La présente invention est en outre relative à des polynucléotides comprenant tout ou partie d'au moins une séquence de régulation d'un opéron de synthèse de toxines produites par une bactérie du genre Clostridium, sous une forme isolée du reste des gènes compris dans ledit opéron. Selon un mode de mise en oeuvre préférentiel de l'invention, ladite séquence de régulation est celle d'un opéron, ou groupe de gènes, intervenant dans la synthèse des toxines des espèces C. botulinum et C.tetani, ou une séquence présentant une identité d'au moins 60% avec The present invention further relates to polynucleotides comprising all or part of at least one regulatory sequence of a synthetic operon for toxins produced by a bacterium of the genus Clostridium, in a form isolated from the rest of the genes included in said operon . According to a preferred embodiment of the invention, said regulatory sequence is that of an operon, or group of genes, involved in the synthesis of toxins of the species C. botulinum and C.tetani, or a sequence having a identity of at least 60% with
0o cette séquence.0o this sequence.
De manière avantageuse, un tel polynucléotide est présent, Advantageously, such a polynucleotide is present,
dans des conditions appropriées, sous forme de multicopies. under appropriate conditions, in the form of multiple copies.
Un polynucléotide est considéré comme étant présent sous forme de multicopies lorsqu'il est présent à raison de 200 à 300 copies par bactérie. En fonction des utilisations un oligonucléotide selon la présente invention peut néanmoins être présent sous un plus faible A polynucleotide is considered to be present in the form of multicopy when it is present in an amount of 200 to 300 copies per bacterium. Depending on the uses, an oligonucleotide according to the present invention may nevertheless be present at a lower level.
nombre de copies, par exemple à raison de 20 à 30 copies par bactérie. number of copies, for example 20 to 30 copies per bacteria.
Un tel polynucléotide présente avantageusement une taille comprise entre 4 et 15 kb, et encore plus préférentiellement entre 6 et 9 Such a polynucleotide advantageously has a size between 4 and 15 kb, and even more preferably between 6 and 9
2o kb.2o kb.
Il comprend une partie d'une séquence de régulation, qui peut être le gène tet/R (SEQ ID N 1), ou une séquence s'hybridant en conditions rigoureuses (stringentes) avec SEQ ID N 1, mais qui peut être celle de tout autre gène de régulation d'une bactérie du genre Clostridium, et en particulier les gènes botR/C ou botR/A ou parties de ces gènes, ou des séquences s'hybridant en conditions rigoureuses It comprises part of a regulatory sequence, which can be the tet / R gene (SEQ ID N 1), or a sequence hybridizing under stringent conditions (stringent) with SEQ ID N 1, but which can be that of any other regulatory gene for a bacterium of the genus Clostridium, and in particular the botR / C or botR / A genes or parts of these genes, or sequences which hybridize under rigorous conditions
avec ces séquences.with these sequences.
Un tel polynucléotide peut aussi comprendre deux, ou plus de Such a polynucleotide can also include two or more
deux séquences de régulation, jusqu'à 10 séquences de régulation. two regulation sequences, up to 10 regulation sequences.
Il peut aussi comprendre au moins une séquence de régulation d'un opéron de synthèse de toxines produites par une bactérie du genre Clostridium, une séquence promotrice adaptée, et un gène de structure codant pour une protéine homologue ou hétérologue vis-à-vis de la It can also include at least one regulatory sequence of a toxin synthesis operon produced by a bacterium of the genus Clostridium, a suitable promoter sequence, and a structural gene coding for a protein homologous or heterologous with respect to the
séquence de régulation, ou une partie d'une de ces protéines. regulatory sequence, or part of one of these proteins.
On entend par " protéine homologue " une protéine de By "homologous protein" is meant a protein of
structure issue du même microorganisme que la séquence de régulation. structure from the same microorganism as the regulatory sequence.
On entend par " protéine hétérologue " une protéine de structure issue d'un microorganisme différent que la séquence de régulation. Une " partie d'une protéine " peut être un fragment d'une The term “heterologous protein” is understood to mean a structural protein derived from a microorganism different from the regulatory sequence. A "part of a protein" can be a fragment of a
toxine dépourvu d'activité toxique. toxin lacking toxic activity.
On entend par " toxine " au sens de l'invention tout peptide, polypeptide ou protéine produit par une bactérie pathogène, et impliqué io dans ladite activité pathogène. Il peut s'agir d'un facteur directement “Toxin” is understood to mean, within the meaning of the invention, any peptide, polypeptide or protein produced by a pathogenic bacteria, and involved in said pathogenic activity. It can be a factor directly
responsable de la toxicité de la bactérie, ou participant à cette toxicité. responsible for the toxicity of the bacteria, or participating in this toxicity.
Un " fragment " de toxine peut être constitué de toute partie d'une toxine, ayant conservé certains motifs immunogéniques de la toxine. En particulier, il a été décrit que les toxines bactériennes présentent souvent différents domaines fonctionnels distincts, et notamment un domaine impliqué dans l'activité toxique (site catalytique) distinct d'autres domaines impliqués dans la reconnaissance de sites ou dans des interactions avec des partenaires. Un " fragment " de toxine selon l'invention est constitué avantageusement d'un domaine dépourvu d'activité toxique, mais conservant un pouvoir immunogène. Un variant de toxine peut être constitué par exemple d'un dérivé résultant de modifications génétiques de la séquence codant pour ladite toxine ou fragment de toxine. De telles modifications génétiques sont par exemple des mutations, délétions, fusions, etc. Généralement, les mutations affectent de 1 à 10 résidus, de préférence de 1 à 5 résidus. Ces mutations sont des mutations modifiant l'acide aminé codé, et donc la séquence de la protéine. Les délétions peuvent être des délétions internes ou terminales. Elles peuvent affecter jusqu'à 40% de la séquence entière. Les fusions consistent à introduire des régions supplémentaires en 5' et/ou en 3' de la séquence, ou éventuellement à insérer de telles régions au sein de la séquence. Ces modifications peuvent être effectuées dans le but soit de diminuer, voire supprimer la toxicité de ces protéines, soit d'améliorer leur production ou leur stabilité par exemple. De telles modifications génétiques peuvent être réalisées selon les conditions classiques de la biologie moléculaire, et sont A toxin "fragment" can consist of any part of a toxin, having retained certain immunogenic motifs of the toxin. In particular, it has been described that bacterial toxins often have different distinct functional domains, and in particular one domain involved in toxic activity (catalytic site) distinct from other domains involved in site recognition or in interactions with partners. . A toxin "fragment" according to the invention advantageously consists of a domain devoid of toxic activity, but retaining an immunogenic power. A toxin variant can consist, for example, of a derivative resulting from genetic modifications of the sequence coding for said toxin or fragment of toxin. Such genetic modifications are for example mutations, deletions, fusions, etc. Generally, mutations affect from 1 to 10 residues, preferably from 1 to 5 residues. These mutations are mutations modifying the encoded amino acid, and therefore the sequence of the protein. Deletions can be internal or terminal deletions. They can affect up to 40% of the entire sequence. Mergers consist of introducing additional regions 5 'and / or 3' of the sequence, or possibly inserting such regions within the sequence. These modifications can be carried out with the aim of either reducing or even eliminating the toxicity of these proteins, or improving their production or their stability for example. Such genetic modifications can be carried out according to the conventional conditions of molecular biology, and are
illustrées dans l'état de la technique. illustrated in the state of the art.
L'expression de tels gènes peut être gouvernée par le promoteur d'origine, mais ce promoteur peut être remplacé par tout autre promoteur permettant une expression du gène. Les polynucléotides selon la présente invention doivent en outre contenir des séquences permettant leur multiplication au sein des The expression of such genes can be governed by the original promoter, but this promoter can be replaced by any other promoter allowing expression of the gene. The polynucleotides according to the present invention must also contain sequences allowing their multiplication within the
bactéries, ainsi que de manière générale leur fonctionnement. bacteria, as well as their functioning in general.
Ainsi, de tels polynucléotides doivent comprendre une origine 0o de réplication, qui selon un mode de mise en oeuvre particulier de l'invention peut permettre d'obtenir un grand nombre de copies de ces Thus, such polynucleotides must include an origin 0o of replication, which according to a particular embodiment of the invention can make it possible to obtain a large number of copies of these
vecteurs au sein d'une même bactérie. vectors within the same bacteria.
La séquence promotrice peut être celle du gène de la toxine iota ou du gène de régulation tetR ou d'un gène d'une toxine de The promoter sequence may be that of the iota toxin gene or of the tetR regulatory gene or of a gene of a toxin of
Clostridium telle que citée ci-après. Clostridium as cited below.
Un oligonucléotide selon l'invention peut être contenu dans un An oligonucleotide according to the invention can be contained in a
vecteur ou plasmide.vector or plasmid.
Un tel vecteur peut être le pMRP309 (botR/A), le pMRP365 (tet/R), le pMRP319(botR/C), qui sont des plasmides obtenus par clonage des fragments d'ADN présentant les séquences SEQ ID N 16, SEQ ID N 12 et SEQ ID N 14 suivantes, dans le site Smal du vecteur Such a vector can be pMRP309 (botR / A), pMRP365 (tet / R), pMRP319 (botR / C), which are plasmids obtained by cloning DNA fragments having the sequences SEQ ID N 16, SEQ ID N 12 and SEQ ID N 14 below, in the Smal site of the vector
pAT1 8.pAT1 8.
SEQ ID N 12:SEQ ID N 12:
AAGCTTATTT TACATTAAAT TACTTTTATT GATAAAAATA TATTTTTTGT AAGCTTATTT TACATTAAAT TACTTTTATT GATAAAAATA TATTTTTTGT
ATTTATATAG AGATTTTCTT TGTCATATAC TGTATAATAT TTATATAATA ATTTATATAG AGATTTTCTT TGTCATATAC TGTATAATAT TTATATAATA
TTAATACATA ATATTATAAC TAAATTCAAA ATAGAAAGGA TTAATACATA ATATTATAAC TAAATTCAAA ATAGAAAGGA
GGTTATCTTATGTTAAAAAG AAAAATTTAA AATACTATTT TCATTATTTG GGTTATCTTATGTTAAAAAG AAAAATTTAA AATACTATTT TCATTATTTG
AAGATTGAAT CTTAAATAAA CTTGAATTAG GAGGGAGTAC CC ATG AAGATTGAAT CTTAAATAAA CTTGAATTAG GAGGGAGTAC CC ATG
GTT ATG GAAAAT CTA TTT GTA AAA ATT AAG ACA TTA AAA AAT AAT GTT ATG GAAAAT CTA TTT GTA AAA ATT AAG ACA TTA AAA AAT AAT
AAT AAA GAA TTT GAA GTA ATT ATT ATA CAT TTC AAA AAT ACT GTA AAT AAA GAA TTT GAA GTA ATT ATT ATA CAT TTC AAA AAT ACT GTA
AAT ATA CTT ATT CGA AAG TAT AAT TTA GAA AGT CAT TAT AAT GAT AAT ATA CTT ATT CGA AAG TAT AAT TTA GAA AGT CAT TAT AAT GAT
ATC TTA TAT CAT TTA TGG AAT ATA CTT AAA AAA ATT GAT TTG AAT ATC TTA TAT CAT TTA TGG AAT ATA CTT AAA AAA ATT GAT TTG AAT
AAA TTT AAT ACA GAA AAT GAT TTA CAC AAA TAT ATT AGT AGA TCT AAA TTT AAT ACA GAA AAT GAT TTA CAC AAA TAT ATT AGT AGA TCT
TTA AAA AGA TAT TGC TTA GAT ATT TGT AAT AAA AAA AAT AGG GAT TTA AAA AGA TAT TGC TTA GAT ATT TGT AAT AAA AAA AAT AGG GAT
AAA AAA ATA ATA TAT AAC TCA GAA ATT ACA AAT ATA AAA TTA AAT AAA AAA ATA ATA TAT AAC TCA GAA ATT ACA AAT ATA AAA TTA AAT
TTA ATG GAA AAT AGT TGC TCA AAT TAT TTA AAC TTC GAA TTT AAT TTA ATG GAA AAT AGT TGC TCA AAT TAT TTA AAC TTC GAA TTT AAT
GAT TTA ATA TCC ATA TTA CCT GAA AAT CAA AGA AAA ATT TTA TAT GAT TTA ATA TCC ATA TTA CCT GAA AAT CAA AGA AAA ATT TTA TAT
ATG AAA TTT TTT GAA TAT ATG AAA GAA TGT GAT ATA GCT AAG CTT ATG AAA TTT TTT GAA TAT ATG AAA GAA TGT GAT ATA GCT AAG CTT
CAT ATG AGT CGT CAA GCT GTA TAT AAA AAT AAG GTT TTA GCA TTA AAA AAA TTA GAA CCT ATA GTA AAT AAA TTA ATT AAT ATC TGCAGATAAA AATTATATTT AAAATTATTA ATAAATATCA AAATTAATAA 5 AGCTAGTTAT TCATACTGGC TACCTATATA AATATTTCTC GATTACTTAC AGAGGATGTC AATAATTTTG TGTAAACTAT CTAAAGAAAT CAT ATG AGT CGT CAA GCT GTA TAT AAA AAT AAG GTT TTA GCA TTA AAA AAA TTA GAA CCT ATA GTA AAT AAA TTA ATT AAT ATC TGCAGATAAA AATTATATTT AAAATTATTA ATAAATATCA AAATTAATAA 5 AGCTAGTTAT TCATACTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT
ATATTGAAAT TTGTTGAGGT TTAGATAATA TTTTATTTAA ACCTTAATTT TCTTTTTATG TAATTATAGT GAATATAAAT TGTACAAAAA CTAGAGATAT TTCTAGA10 ATATTGAAAT TTGTTGAGGT TTAGATAATA TTTTATTTAA ACCTTAATTT TCTTTTTATG TAATTATAGT GAATATAAAT TGTACAAAAA CTAGAGATAT TTCTAGA10
SEQ ID N 14:SEQ ID N 14:
AAGCTTATTT TACATTAAAT TACTTTTATT GATAAAAATA TATTTTTTGT ATTTATATAG AGATTTTCTT TGTCATATAC TGTATAATAT TTATATAATA AAGCTTATTT TACATTAAAT TACTTTTATT GATAAAAATA TATTTTTTGT ATTTATATAG AGATTTTCTT TGTCATATAC TGTATAATAT TTATATAATA
TTAATACATA ATATTATAAC TAAATTCAAA ATAGAAAGGA GGTTATCTTA TGTTAAAAAG AAAAATTTAA AATATATTTT CATTATTTGA AGATTGAATC TTAAATAAAC TTGAATTAGG AGGGAGTACC20 ATGGGCAGCA GCCATCATCA TCATCATCAC AGCAGCGGCC TGGTGCCGCG CGGCAGCCAT ATG AAT GAT TTA TTT TAT GCT ATA TTAATACATA ATATTATAAC TAAATTCAAA ATAGAAAGGA GGTTATCTTA TGTTAAAAAG AAAAATTTAA AATATATTTT CATTATTTGA AGATTGAATC TTAAATAAAC TTGAATTAGG AGGGAGTACC20 ATGGGCAGCA GCCATCATCA TCATCAT TAG CGT AGT
GAA AAT TTA AAG CAT GAT AAC CAG CAC TTT AAC TTT ATT GAA ATG TCT CTA AAA AAA TAT ATT GAA AAA ACT TCT AAA AAG TAT AAT TTA TAT TAT GAT TAT TAT AAT GAT ATA CTG TAT CAT TTA TGG AAA GAA25 CTT ATT GAA ATT AAC TTA AAG AAT TTT AAT TCT GAA TTA GAT TTA AGA AAA TAT ATT AGT ACA AGT ATA AAA AGA TAT TGT ATA AAT ATT GAA AAT TTA AAG CAT GAT AAC CAG CAC TTT AAC TTT ATT GAA ATG TCT CTA AAA AAA TAT ATT GAA AAA ACT TCT AAA AAG TAT AAT TTA TAT TAT GAT TAT TAT AAT GAT ATA CTG TAT CAT TTA TGG AAA GAA25 CTT ATT GAA ATT A TTA AAG AAT TTT AAT TCT GAA TTA GAT TTA AGA AAA TAT ATT AGT ACA AGT ATA AAA AGA TAT TGT ATA AAT ATT
TGT AAG AAA AAA AAT AGG GAT AAG AAA ATT ATA TAT AAT TCA GAA GTA ACA TAT AAA AAA TTG GAT GT GGTA AAT GTT TAT TCT TTA TAT TGT GAT AAT TTC GAG TTT TTG GAT TTG ATA TCC ATA TTA AAC30 TAC AAG GAA AAG CAA ATT ATA TAT ATG AAA TTT TTT GAA GGT AGA AAA GAT AAT GAA ATA GCT ATA AGG CTT CGT TTA AGT CGT CAA TCT TGT AAG AAA AAA AAT AGG GAT AAG AAA ATT ATA TAT AAT TCA GAA GTA ACA TAT AAA AAA TTG GAT GT GGTA AAT GTT TAT TCT TTA TAT TGT GAT AAT TTC GAG TTT TTG GAT TTG ATA TCC ATA TTA AAC30 TAC AAG GAA AAG CA ATA TAT ATG AAA TTT TTT GAA GGT AGA AAA GAT AAT GAA ATA GCT ATA AGG CTT CGT TTA AGT CGT CAA TCT
ATA TAT AAG ATT AGA ATT ACG TCT TTA AAA AAG TTG TAT CCT ATA GTA ATG CAA TTA GTT AAT ATT T GACTGCAGAT AAAAATTATA TTTAAAATTA TTAATAAATA TCAAAATTAA TAAAGCTAGT TATTCATACT35 GGCTACCTAT ATAAATATTT CTCGATTACT TACAGAGGAT GTCAATAATT TTGTGTAAAC TATCTAAAGA AATATATTGA AATTTGTTGA ATA TAT AAG ATT AGA TCT TTA AAA AAG TTG TAT CCT ATA GTA ATG CAA TTA GTT AAT ATT T GACTGCAGAT AAAAATTATA TTTAAAATTA TTAATAAATA TCAAAATTAA TAAAGCTAGT TATTCATACTATATATATATATATATATATTA
GGTTTAGATA ATATTTTATT TAAACCTTAA TTTTCTTTTT ATGTAATTAT AGTGAATATA AATTGTACAA AAACTAGAGA TATTTCTAGA GGTTTAGATA ATATTTTATT TAAACCTTAA TTTTCTTTTT ATGTAATTAT AGTGAATATA AATTGTACAA AAACTAGAGA TATTTCTAGA
SEQ ID N 16:SEQ ID N 16:
GGTAGAAAAG TTCTTTCAAC TGGACATATA ATTCACCTCT TTATAAATTA GGTAGAAAAG TTCTTTCAAC TGGACATATA ATTCACCTCT TTATAAATTA
GATGATAGTA CTCATATTAA ATCTTTGTTG ATATTAATTT TATGGGTTAC GAATATTCCA TTTCTGATTA TCATCTCCAT GATAATTAAA TACTTGAATA GATGATAGTA CTCATATTAA ATCTTTGTTG ATATTAATTT TATGGGTTAC GAATATTCCA TTTCTGATTA TCATCTCCAT GATAATTAAA TACTTGAATA
GCAGTTCCGT TTGCTGTTTG GCTGTTATAT AAATCTAGAT CCATACTTTT TATTTTATAA GCAGCTTTAT TAGAATCATA TATAAGTCTC CATCTTTCAA GGTAATTTCT AGTTTGTTGA AATAAGCTAA CGTTACCGGC AACTTGATAA GCAGTTCCGT TTGCTGTTTG GCTGTTATAT AAATCTAGAT CCATACTTTT TATTTTATAA GCAGCTTTAT TAGAATCATA TATAAGTCTC CATCTTTCAA GGTAATTTCT AGTTTGTTGA AATAAGCTAA CGTTACCGGC AACTTGATAA
AAAAATAAAT TAGTATCGGC CTTACAGGAG ATGGTAACAA TTITGTCATT AAAAATAAAT TAGTATCGGC CTTACAGGAG ATGGTAACAA TTITGTCATT
TAATGAATTT TGGATTACTG AATAGTGTTC CATTATGATT CCTCCTTTAT TAATGAATTT TGGATTACTG AATAGTGTTC CATTATGATT CCTCCTTTAT
TTAAGAATTA ATCTTACATA TAACATATAA CATAATCAAG TTATTTTTTG TTAAGAATTA ATCTTACATA TAACATATAA CATAATCAAG TTATTTTTTG
TAAACCTAAA ATTTAAATAT ATCAAATIT TATTAGTATG TTTACATAAT TAAACCTAAA ATTTAAATAT ATCAAATIT TATTAGTATG TTTACATAAT
TGATTATGGA TATTTCGTAA AAATGGCTTA TTAAAAATTT AAAGGCAATT TGATTATGGA TATTTCGTAA AAATGGCTTA TTAAAAATTT AAAGGCAATT
AGTTTATTTA TAGTATAATA AAACAATAAT ATGTATATTA TGGAGGGATA AGTTTATTTA TAGTATAATA AAACAATAAT ATGTATATTA TGGAGGGATA
GTGGTAAAT ATG AAT AAG TTG TTT TTA CAA ATT AAA ATG TTA AAA AAT GTGGTAAAT ATG AAT AAG TTG TTT TTA CAA ATT AAA ATG TTA AAA AAT
GAC AAC GAG GAG TTT CAA GAA ATT mT AAG CAT T GAA AAA ACT ATA GAC AAC GAG GAG TTT CAA GAA ATT mT AAG CAT T GAA AAA ACT ATA
AAT ATA TTT ACT AGA AAA TAT AAT ATA TAT GAT AAT TAC AAT GAT ATT AAT ATA TTT ACT AGA AAA TAT AAT ATA TAT GAT AAT TAC AAT GAT ATT
TTG TAC CAT TTA TGG TAT ACA CTT AAA AAA GTT GAT TTG AGC AAT TTC TTG TAC CAT TTA TGG TAT ACA CTT AAA AAA GTT GAT TTG AGC AAT TTC
AAT ACA CAA AAT GAT TTA GAG AGA TAT ATT AGT AGG ACT TTA AAA AGA AAT ACA CAA AAT GAT TTA GAG AGA TAT ATT AGT AGG ACT TTA AAA AGA
TAT TGC TTA GAT ATT TGC AAT AAA AGA AAG ATT GAT AAG AAA ATA ATA TAT TGC TTA GAT ATT TGC AAT AAA AGA AAG ATT GAT AAG AAA ATA ATA
TAT AAT TCA GAA ATT GCA GAT AAG AAA TTA AGC TTA ATA GCA AAT AGT TAT AAT TCA GAA ATT GCA GAT AAG AAA TTA AGC TTA ATA GCA AAT AGT
TAT TCA AGT TAT TCA GAA T GAA TTT AAT GAT TTA ATA TCC ATA TTA TAT TCA AGT TAT TCA GAA T GAA TTT AAT GAT TTA ATA TCC ATA TTA
CCT GAC GAT CAA AAG AAA ATT ATA TAT ATG AAA T GTT GAA GAT ATT CCT GAC GAT CAA AAG AAA ATT ATA TAT ATG AAA T GTT GAA GAT ATT
AAG GAG ATA GAT ATA GCT AAA AAA CTT AAT ATA AGT CGT CAA TCT GTA AAG GAG ATA GAT ATA GCT AAA AAA CTT AAT ATA AGT CGT CAA TCT GTA
TAT AAA AAT AAA ATA ATG GCT TTA GAG AGA TTA GAA CCC ATA TTG AAA TAT AAA AAT AAA ATA ATG GCT TTA GAG AGA TTA GAA CCC ATA TTG AAA
AAA TTA ATT AAT ATG T AGTTATATT TTTAAAAAAT TMAGGTMA AAA TTA ATT AAT ATG T AGTTATATT TTTAAAAAAT TMAGGTMA
CAAAAAATAG TGTGGCTATG TTATATATAA ATGATAAGAA TATACTGAAA CAAAAAATAG TGTGGCTATG TTATATATAA ATGATAAGAA TATACTGAAA
AATGTATCCA AAATTAAGG GGGCGTGTAT AGTAAATAAT TAAAAGTATG AATGTATCCA AAATTAAGG GGGCGTGTAT AGTAAATAAT TAAAAGTATG
TGCGTTGAAA TAAATTTAGG AGAGTGGTTA GATATGAATA TAAATGACAA TGCGTTGAAA TAAATTTAGG AGAGTGGTTA GATATGAATA TAAATGACAA
CTTAAGTATA AATTCCCCGG TAGATAATAA AAATGTT CTTAAGTATA AATTCCCCGG TAGATAATAA AAATGTT
Le pMRP309 est un plasmide recombinant permettant l'expression du gène régulateur BotR/A de C. botulinum A sous contrôle de son propre promoteur. Le fragment d'ADN (nucleotides 2479 à 4425 de la séquence déposée à l'EMBL sous le numéro d'accès L42537) a été amplifié par PCR à partir de la souche de C. botulinum A 62 et cloné dans le vecteur pAT18 au site Smal. Ce fragment d'ADN contient les régions codantes pour les gènes de botR/A (dénommé aussi Orf21 ou OrfX) et le composant de 34 kDa de l'hémaglutinine (HA34). Le gène de I'hémaglutinine a été excisé par digestion aux sites Xbal et EcoRV PMRP309 is a recombinant plasmid allowing expression of the BotR / A regulatory gene for C. botulinum A under the control of its own promoter. The DNA fragment (nucleotides 2479 to 4425 of the sequence deposited at the EMBL under the access number L42537) was amplified by PCR from the strain of C. botulinum A 62 and cloned in the vector pAT18 at the site Smal. This DNA fragment contains the coding regions for the botR / A genes (also known as Orf21 or OrfX) and the 34 kDa component of hemaglutinin (HA34). The hemaglutinin gene was excised by digestion at the Xbal and EcoRV sites
(délétion des nucléotides 2664 à 3253) et religation du plasmide sur lui- (deletion of nucleotides 2664 to 3253) and religation of the plasmid on it-
même. Le site Xbal du vecteur avait été au préalable éliminé par even. The Xbal site of the vector had previously been eliminated by
coupure aux sites BamHI-Sall et religation du vecteur sur lui même. cleavage at BamHI-Sall sites and religation of the vector on itself.
région 3450 - 3473 région promoteur du gène BotR/A région 3474 - 4210 région codante pour BotR/A (179 acides aminés) région 4211 -4425 partie 3' non codante du gène BotR/A La construction est illustrée par la figure 16 qui représente les séquences des trois régions mentionnées ci-dessus. La partie insérée dans pAT18 correspond à la séquence SEQ ID N 16. Le plasmide pMRP365 contient la region codante pour le gène régulateur tetR sous contrôle du promoteur du gène de la toxine iota de region 3450 - 3473 promoter region of the BotR / A gene region 3474 - 4210 coding region for BotR / A (179 amino acids) region 4211 -4425 3 'non-coding part of the BotR / A gene The construction is illustrated by FIG. 16 which represents the sequences of the three regions mentioned above. The part inserted into pAT18 corresponds to the sequence SEQ ID N 16. The plasmid pMRP365 contains the coding region for the regulatory gene tetR under the control of the promoter of the toxin gene iota de
C. perfringens et la partie 3' du gène de la toxine iota de C. perfringens. C. perfringens and the 3 'part of the iota toxin gene from C. perfringens.
La région promoteur de gène de la toxine iota de C. perfringens io (nucléotides 1241 à 1464 de la séquence déposée à l'EMBL sous le numéro d'accès X73562) a été amplifiée par PCR à partir de la souche de C. perfringens E NCIB10748 en ajoutant un site HindIll à l'extrémité 5' et le site Ncol à la partie 3'. Les régions -10 et -35 du promoteur ont été The iota toxin gene promoter region of C. perfringens io (nucleotides 1241 to 1464 of the sequence deposited at the EMBL under the access number X73562) was amplified by PCR from the strain of C. perfringens E NCIB10748 by adding a HindIII site at the 5 'end and the Ncol site at the 3' part. The promoter -10 and -35 regions have been
déterminées par la technique d'extension d'amorce. determined by the primer extension technique.
La région codante du gène de TetR (nucléotides 56 à 604) a été amplifiée par PCR à partir de la souche de C. tetani CN655, en ajoutant un site Ncol en partie 5' au niveau du codon intial de traduction et un site Pstl en partie 3' juste en aval du codon de terminaison. Cette partie code pour 179 acides aminés. Le deuxième acide aminé Leu de la séquence initiale a été changé en Val du fait de l'introduction du site Ncol. La partie 3' du gène de la toxine iota de C. perfringens a été amplifiée par PCR (nucléotides 5504 à 5739 de la séquence X73562) en introduisant un site Pstl en partie 5' et un site Xbal en partie 3'. Cette partie non codante est indispensable pour l'expression de gènes de Clostridium dans les vecteurs navettes pAT18 ou pJIR750 transformés The coding region of the TetR gene (nucleotides 56 to 604) was amplified by PCR from the strain of C. tetani CN655, by adding an Ncol site in part 5 ′ at the level of the initial translation codon and a Pstl site in part 3 'just downstream of the termination codon. This part codes for 179 amino acids. The second amino acid Leu of the initial sequence was changed to Val due to the introduction of the Ncol site. The 3 'part of the iota toxin gene from C. perfringens was amplified by PCR (nucleotides 5504 to 5739 of the sequence X73562) by introducing a PstI site in part 5' and an Xbal site in part 3 '. This non-coding part is essential for the expression of Clostridium genes in the transformed pAT18 or pJIR750 shuttle vectors.
dans Clostridium.in Clostridium.
Les fragments d'ADN ont été agencés dans le vecteur navette DNA fragments were arranged in the shuttle vector
pAT18 entre les sites Hindlll et Xbal. pAT18 between the Hindlll and Xbal sites.
Région 1241 à 1464 Promoteur de la toxine iota de C. perfringens E Région 56 à 604 code pour les acides aminés 1 à 179 de la Region 1241 to 1464 Promoter of the toxin iota of C. perfringens E Region 56 to 604 code for amino acids 1 to 179 of the
protéine régulatrice tetR de C. tetani. tetR regulatory protein of C. tetani.
1l Région 5504 à 5739 Partie 3' du gène de la toxine iota de C. perfringens E. La construction est illustrée par la figure 17 qui représente les séquences des trois régions mentionnées ci-dessus. La partie insérée dans pAT18 correspond à la séquence SEQ ID N 12. Le plasmide pMRP319 est un plasmide recombinant permettant l'expression du gène régulateur BotR/C de C. botulinum C sous contrôle 111 Region 5504 to 5739 Part 3 'of the iota toxin gene from C. perfringens E. The construction is illustrated in FIG. 17 which represents the sequences of the three regions mentioned above. The part inserted into pAT18 corresponds to the sequence SEQ ID N 12. The plasmid pMRP319 is a recombinant plasmid allowing the expression of the regulatory gene BotR / C of C. botulinum C under control
du promoteur du gène de la toxine iota de C. perfringens. of the promoter of the iota toxin gene from C. perfringens.
La région promoteur de gène de la toxine iota de C. perfringens 0o (nucléotides 1241 à 1464 de la séquence déposée à l'EMBL sous le numéro d'accès X73562) a été amplifiée par PCR à partir de la souche de C. perfringens E NCIB10748 en ajoutant un site HindIll à l'extrémité 5' et le site Ncol à la partie 3'. Les régions -10 et -35 du promoteur ont été The iota toxin gene promoter region of C. perfringens 0o (nucleotides 1241 to 1464 of the sequence deposited at the EMBL under the access number X73562) was amplified by PCR from the strain of C. perfringens E NCIB10748 by adding a HindIII site at the 5 'end and the Ncol site at the 3' part. The promoter -10 and -35 regions have been
déterminées par la technique d'extension d'amorces. determined by the primer extension technique.
1 5 La région codante du gène BotR/C (dénommé aussi Orf22) correspondant aux nucléotides 302 à 841 (acides aminés 1 à 179) de la séquence de l'EMBL ayant le numéro d'accès X72793 a été amplifiée en générant à l'extrémité 5' le site Ndel et à l'extrémité 3' le site Pstl à partir de la souche de C. botulinum C468. Ce fragment d'ADN a été cloné 2o dans le vecteur pET28b (Novagen) et le fragment Ncol-Pstl a été incldu dans le plasmide pMRP319. De ce fait, le fragment Ncol-Ndel du vecteur 1 5 The coding region of the BotR / C gene (also known as Orf22) corresponding to nucleotides 302 to 841 (amino acids 1 to 179) of the sequence of the EMBL having the access number X72793 was amplified by generating at 5 'end the Ndel site and at the 3' end the Pstl site from the strain of C. botulinum C468. This DNA fragment was cloned 2o in the vector pET28b (Novagen) and the Ncol-Pstl fragment was included in the plasmid pMRP319. Therefore, the Ncol-Ndel fragment of the vector
pET28b reste en amont du gène de BotR/C. pET28b remains upstream of the BotR / C gene.
La partie 3' du gène de la toxine iota de C. perfringens a été amplifiée par PCR (nucléotides 5504 à 5739 de la séquence X73562) en introduisant un site Pstl en partie 5' et un site Xbal en partie 3'. Cette partie non codante est indispensable pour l'expression de gène de Clostridium dans les vecteurs navettes pAT18 ou pJIR750 transformés The 3 'part of the iota toxin gene from C. perfringens was amplified by PCR (nucleotides 5504 to 5739 of the sequence X73562) by introducing a PstI site in part 5' and an Xbal site in part 3 '. This non-coding part is essential for the expression of Clostridium gene in the transformed pAT18 or pJIR750 shuttle vectors.
dans Clostridium.in Clostridium.
Les fragments d'ADN ont été agencés dans le vecteur navette DNA fragments were arranged in the shuttle vector
pAT18 entre les sites Hindlll etXbal. pAT18 between the Hindlll and Xbal sites.
Région 1241 à 1464 Promoteur de la toxine iota de C. perfringens E Région Ndel-Ncol de pET28b Région 302 - 841 Région codante de BotR/C Region 1241 to 1464 Promoter of the iota toxin of C. perfringens E Nde-Ncol region of pET28b Region 302 - 841 Coding region of BotR / C
(acides aminés 1 à 179).(amino acids 1 to 179).
Région 5504 à 5739 Partie 3' du gène de la toxine iota de C.perfringens E La construction est illustrée par la figure 18 qui représente les séquences des quatre régions mentionnées ci-dessus. La partie insérée Region 5504 to 5739 Part 3 'of the iota toxin gene from C.perfringens E The construction is illustrated in FIG. 18 which represents the sequences of the four regions mentioned above. The inserted part
dans pAT18 correspond à la séquence SEQ ID N 14. in pAT18 corresponds to the sequence SEQ ID N 14.
Ces plasmides sont compris dans les bactéries E. Coli déposées le 12.Mai 1998 auprès de la Collection Nationale de Cultures de Microorganismes de l'institut Pasteur (CNCM) respectivement sous These plasmids are included in the E. Coli bacteria deposited on May 12, 1998 with the National Collection of Cultures of Microorganisms of the Pasteur Institute (CNCM) respectively under
les n 1-2010 (pMRP309), 1-2012 (pMRP 365) et 1-2011 (pMRP319). n 1-2010 (pMRP309), 1-2012 (pMRP 365) and 1-2011 (pMRP319).
is lis sont aussi compris dans les bactéries C. tetani CN655 déposées le 18 Mai 1998 auprès de la Collection Nationale de Cultures de Microorganismes de l'institut Pasteur (CNCM) respectivement sous They are also included in the bacteria C. tetani CN655 deposited on May 18, 1998 with the National Collection of Cultures of Microorganisms of the Pasteur Institute (CNCM) respectively under
les n 1-2020 (pMRP309), 1-2022 (pMRP365) et 1-2021 (pMRP319). n 1-2020 (pMRP309), 1-2022 (pMRP365) and 1-2021 (pMRP319).
Un tel vecteur peut en outre porter un gène de structure codant pour une protéine hétérologue vis-à-vis de la séquence de régulation, ou pour une partie d'une protéine homologue, telle que la partie C-terminale Such a vector can also carry a structural gene coding for a protein heterologous with respect to the regulatory sequence, or for a part of a homologous protein, such as the C-terminal part.
de la toxine tétanique.tetanus toxin.
La présente invention a de plus pour objet un microorganisme caractérisé en ce qu'il comprend au moins un vecteur, un polynucléotide ou une séquence tels que décrits ci-dessus. Avantageusement, un tel microorganisme porte un gène codant pour une protéine hétérologue, The present invention further relates to a microorganism characterized in that it comprises at least one vector, a polynucleotide or a sequence as described above. Advantageously, such a microorganism carries a gene coding for a heterologous protein,
une protéine homologue ou des parties de ces protéines. a homologous protein or parts of these proteins.
Une protéine hétérologue peut être toute protéine de structure issu d'un microorganisme différent de celui de la séquence de régulation, et en particulier des toxines butyliques, ou des fragments de ces toxines, tels que des fragments correspondant fonctionnellement au fragment C de la toxine tétanique, ou des toxines de Clostridium ou des variants A heterologous protein can be any structural protein derived from a microorganism different from that of the regulatory sequence, and in particular butyl toxins, or fragments of these toxins, such as fragments corresponding functionally to fragment C of the tetanus toxin , or Clostridium toxins or variants
immunogènes mais non toxiques à usage vaccinal. immunogenic but non-toxic for vaccine use.
Une protéine homologue peut être par exemple une partie dépourvue d'activité toxique, d'une toxine produite par une bactérie du A homologous protein can be for example a part devoid of toxic activity, of a toxin produced by a bacteria of the
genre Clostridium.genus Clostridium.
Comme indiqué ci-dessus le polynucléotide peut comporter d'une part le gène de régulation et d'autre part un gène de structure codant pour une protéine homologue ou hétérologue ou une partie de ces protéines. Néanmoins, ces deux gènes peuvent être portés par des vecteurs indépendants, présents tous les deux au sein du microorganisme. De manière particulièrement avantageuse, un tel microorganisme est une bactérie du genre Clostridium choisie parmi C. absonum, C. baratii, C. bifermentans, C. chauvei, C. difficile, G. ghonii, C. lituseburense, C. novyi, C. perfringens, C. septicum, C. sordellii, C. As indicated above, the polynucleotide may comprise on the one hand the regulatory gene and on the other hand a structural gene coding for a homologous or heterologous protein or a part of these proteins. However, these two genes can be carried by independent vectors, both present within the microorganism. In a particularly advantageous manner, such a microorganism is a bacterium of the genus Clostridium chosen from C. absonum, C. baratii, C. bifermentans, C. chauvei, C. difficile, G. ghonii, C. lituseburense, C. novyi, C. perfringens, C. septicum, C. sordellii, C.
subterminale et C. tetani.subterminale and C. tetani.
De manière préférentielle, un tel microorganisme appartient à l'espèce C. tetani, C. perfringens ou E. coli. Il peut être ainsi en particulier une souche de C.tetani, débarrassée du plasmide codant naturellement Preferably, such a microorganism belongs to the species C. tetani, C. perfringens or E. coli. It can thus be in particular a strain of C. tetani, freed from the plasmid naturally encoding
pour la toxine tétanique.for tetanus toxin.
L'utilisation des polynucléotides selon la présente invention, portant au moins une partie d'un gène de régulation, permet d'obtenir une augmentation importante des rendements de production en protéine dont la synthèse est mise sous le contrôle des séquences de régulation adéquates des gènes de synthèse des toxines, par rapport à des The use of the polynucleotides according to the present invention, carrying at least part of a regulatory gene, makes it possible to obtain a significant increase in the production yields of protein, the synthesis of which is put under the control of the adequate regulatory sequences of the genes. toxin synthesis, compared to
bactéries ne portant pas ces polynucléotides. bacteria not carrying these polynucleotides.
De ce fait, il est possible de modifier les souches de C. tetani afin d'améliorer les rendements de production de la toxine tétanique, ou de produire d'autres protéines telles que des fragments de toxine tétanique qui ne sont plus toxiques mais qui retiennent l'immunogénicité As a result, it is possible to modify the strains of C. tetani in order to improve the production yields of tetanus toxin, or to produce other proteins such as fragments of tetanus toxin which are no longer toxic but which retain immunogenicity
de la toxine entière.whole toxin.
Ainsi, la surexpression du gène tetR à l'aide d'un vecteur multicopies (100 à 200 copies pour pAT19) permet d'augmenter au Thus, the overexpression of the tetR gene using a multicopy vector (100 to 200 copies for pAT19) makes it possible to increase the
minimum d'un facteur de 10 à 20 la production de toxine tétanique. minimum of a factor of 10 to 20 the production of tetanus toxin.
Comme le gène de la toxine tétanique est porté sur un plasmide de grande taille chez les souches sauvages, des souches dérivées sans plasmide et non toxinogènes peuvent être facilement obtenues. Il est alors possible d'introduire, à l'aide d'un vecteur navette tel que pJIR750 décrit ci-après (marqueur de sélection: chloramphénicol), des gènes recombinants codant pour un fragment non toxique de toxine tétanique io (fragment Hc) ou pour une autre protéine, sous contrôle du promoteur du gène de la toxine tétanique. Le gène régulateur TetR est surexprimé par transformation de ces souches avec le vecteur pAT19 décrit ci-après (sélection: erythromycine) portant ce gène. Les deux vecteurs pJIR750 As the tetanus toxin gene is carried on a large plasmid in wild strains, derived strains without plasmid and non-toxigenic can be easily obtained. It is then possible to introduce, using a shuttle vector such as pJIR750 described below (selection marker: chloramphenicol), recombinant genes coding for a non-toxic fragment of tetanus toxin io (fragment Hc) or for another protein, under the control of the promoter of the tetanus toxin gene. The TetR regulatory gene is overexpressed by transformation of these strains with the vector pAT19 described below (selection: erythromycin) carrying this gene. The two vectors pJIR750
et pAT19 peuvent coexister.and pAT19 can coexist.
Une telle propriété présente un avantage considérable, dans le cas de production industrielle de l'une de ces protéines. Such a property has a considerable advantage, in the case of industrial production of one of these proteins.
En outre, I'utilisation de bactéries du genre Clostridium permet de récupérer les protéines dans le surnageant de culture, car ces In addition, the use of bacteria of the genus Clostridium makes it possible to recover the proteins in the culture supernatant, because these
protéines sont sécrétées par ces microorganismes. proteins are secreted by these microorganisms.
La présente invention a ainsi pour objet un procédé de production d'une ou plusieurs protéines hétérologues ou homologues comprenant les étapes suivantes: - mise en culture d'un microorganisme tel que décrit cidessus, et The present invention thus relates to a process for the production of one or more heterologous or homologous proteins comprising the following steps: - culturing a microorganism as described above, and
- récupération desdites protéines. - recovery of said proteins.
De manière avantageuse, ces protéines sont récupérées dans Advantageously, these proteins are recovered in
le surnageant de culture des microorganismes. the culture supernatant of microorganisms.
Bien que la présente invention soit particulièrement destinée à la production de protéines d'intérêt pharmaceutique, ce procédé peut être utilisé pour toute protéine pouvant être exprimée, et si possible Although the present invention is particularly intended for the production of proteins of pharmaceutical interest, this process can be used for any protein which can be expressed, and if possible
sécrétée par des bactéries du genre Clostridium. secreted by bacteria of the genus Clostridium.
La présente invention est néanmoins particulièrement destinée The present invention is nevertheless particularly intended
à la production de protéines d'intérêt pharmaceutique. the production of proteins of pharmaceutical interest.
Plus particulièrement, I'invention est adaptée à la production des toxines ou variants suivants: Toxine bêta 2 de Clostridium peffringens ou tout fragment immunogène. Le profil d'hydrophilicité de la toxine bêta 2 fait apparaître plusieurs régions hydrophiles qui définissent des fragments particuliers au sens de l'invention. Ces régions sont notamment localisées au niveau des résidus d'acides aminés 40-55, 105- 120, 160-170, 175-188, 200-210 et 250-260. Par ailleurs, des fragments de la toxine bêta 2 dépourvus de More particularly, the invention is suitable for the production of the following toxins or variants: Beta 2 toxin from Clostridium peffringens or any immunogenic fragment. The hydrophilicity profile of the beta 2 toxin reveals several hydrophilic regions which define particular fragments within the meaning of the invention. These regions are located in particular at the amino acid residues 40-55, 105-120, 160-170, 175-188, 200-210 and 250-260. In addition, fragments of the beta 2 toxin lacking
toxicité sont notamment les fragments trypsiques de 24, 15 et 13 kDa. toxicity include the tryptic fragments of 24, 15 and 13 kDa.
Toxine bêta 1 de Clostridium perfringens ou tout fragment immunogène. La séquence de cette toxine a été décrite par HUNTER et Clostridium perfringens beta 1 toxin or any immunogenic fragment. The sequence of this toxin has been described by HUNTER and
Io al. (1993, Infect. Immun. 61, 3958-3965). Io al. (1993, Infect. Immun. 61, 3958-3965).
Toxines iota de Clostridium perfringens ou tout fragment immunogène. La séquence des gènes codant pour les toxines iota1 (gène la) et iota2 (gène lb) a été décrite par PERELLE et al. (1993, Iota toxins from Clostridium perfringens or any immunogenic fragment. The sequence of the genes coding for the toxins iota1 (gene la) and iota2 (gene lb) has been described by PERELLE et al. (1993,
Infect. Immun. 61, 5147-5156).Infect. Immun. 61, 5147-5156).
1 5 Toxine alpha de C. novyi ou tout fragment immunogène. La séquence du gène de cette toxine (gène tcna) a été décrite par HOFMANN et al. (1995, Mol. Gen. Genet 247 670-679). Toxine alpha de C. septicum ou tout fragment immunogène. La séquence du gène de cette toxine a été décrite par BALLARD et al. 1 5 Alpha toxin from C. novyi or any immunogenic fragment. The gene sequence for this toxin (tcna gene) has been described by HOFMANN et al. (1995, Mol. Gen. Genet 247 670-679). Alpha toxin from C. septicum or any immunogenic fragment. The gene sequence for this toxin has been described by BALLARD et al.
(1995, Infect. Immun. 63, 340-344).(1995, Infect. Immun. 63, 340-344).
Toxines a et B de C. difficile ou tout fragment immunogène. La séquence du gène de ces toxines a été décrite dans la littérature, ainsi que différentes régions immunogènes par VON EICHEL-STREIBER et al. (1992, Mol. Gen. Genet 233, 260-268), VON EICHEL-STREIBER et al. (1989, J. Gen. Microbio. 135, 55-64); VON EICHEL-STREIBER et al. Toxins a and B of C. difficile or any immunogenic fragment. The gene sequence of these toxins has been described in the literature, as well as different immunogenic regions by VON EICHEL-STREIBER et al. (1992, Mol. Gen. Genet 233, 260-268), VON EICHEL-STREIBER et al. (1989, J. Gen. Microbio. 135, 55-64); VON EICHEL-STREIBER et al.
(1992, J. Bacteriol. 174, 6707-6710). (1992, J. Bacteriol. 174, 6707-6710).
Toxine epsilon de C. perfringens (WORTHINGTON et al.1973, C. perfringens epsilon toxin (WORTHINGTON et al. 1973,
Onderstepoort J. Vet. Res. 40(4) 145-152; HUNTER et al.1992, Infect. Onderstepoort J. Vet. Res. 40 (4) 145-152; HUNTER et al. 1992, Infect.
Immun. 60, 102-110).Immun. 60, 102-110).
Entérotoxine de C. perfringens (McCLANE, Toxicon 34,1996, Enterotoxin from C. perfringens (McCLANE, Toxicon 34,1996,
1335-1343).1335-1343).
Toxine de C. chauvoei (CRICHTON et al.1986, Australian Vet. C. chauvoei toxin (CRICHTON et al. 1986, Australian Vet.
J. 63, 68).J. 63, 68).
Cytotoxine L de C. sordellii ou tout fragment immunogène. La séquence du gène de cette toxine a été décrite par GREEN et al. (1995, Gene 161, 57-61), ainsi que différentes régions immunogènes. En particulier, cette toxine est constituée d'une protéine de 270 kDa environ Cytotoxin L from C. sordellii or any immunogenic fragment. The gene sequence for this toxin has been described by GREEN et al. (1995, Gene 161, 57-61), as well as various immunogenic regions. In particular, this toxin consists of a protein of approximately 270 kDa
et différents fragments antigéniques ont été décrits. and different antigenic fragments have been described.
Toxine tétanique, toxine botulique, en particulier le fragment C de ces toxines qui est le fragment immunogène (MAKOFF et al.1989, Bio/Technology 7, 1043; FIGUEIREDO et ai. Infect. Immun. 63 1995, 3218- 3221; WELLS et al., 1993, Molecular Microbiol. 8, 1155-1162; BOUCHER et al., 1994, Infect. Immun. 62, 449-456; CLARE et al. 1991, Tetanus toxin, botulinum toxin, in particular the fragment C of these toxins which is the immunogenic fragment (MAKOFF et al. 1989, Bio / Technology 7, 1043; FIGUEIREDO et al. Infect. Immun. 63 1995, 3218-3221; WELLS and al., 1993, Molecular Microbiol. 8, 1155-1162; BOUCHER et al., 1994, Infect. Immun. 62, 449-456; CLARE et al. 1991,
Bio/Technology 9, 455; CLAYTON et al.1995, Infect. Immun.63, 2738- Bio / Technology 9, 455; CLAYTON et al. 1995, Infect. Immun. 63, 2738-
1o 2742).1o 2742).
Toxine de Bordetella pertussis ou tout autre toxine bactérienne. Bordetella pertussis toxin or any other bacterial toxin.
La présente invention a donc pour objet un vaccin ou un médicament caractérisé en ce qu'il contient un polynucléotide, une séquence, un vecteur, un microorganisme, ou une protéine obtenue par culture d'un microorganisme selon la présente invention, ou d'une The subject of the present invention is therefore a vaccine or a medicament, characterized in that it contains a polynucleotide, a sequence, a vector, a microorganism, or a protein obtained by culture of a microorganism according to the present invention, or of a
protéine obtenue par culture de ce microorganisme. protein obtained by culture of this microorganism.
Un tel vaccin est particulièrement adapté aux infections par Such a vaccine is particularly suitable for infections by
C. tetani.C. tetani.
Elle est en outre relative à une composition pharmaceutique caractérisée en ce qu'elle contient une quantité pharmacologiquement efficace d'un polynucléotide, d'une séquence, d'un vecteur, d'un microorganisme ou d'une protéine obtenue par culture de ce It also relates to a pharmaceutical composition characterized in that it contains a pharmacologically effective amount of a polynucleotide, of a sequence, of a vector, of a microorganism or of a protein obtained by culture of this
microorganisme, et des excipients pharmaceutiquement acceptables. microorganism, and pharmaceutically acceptable excipients.
Elle est enfin relative à l'utilisation de ces polynucléotides, séquences, vecteurs, microorganismes ou protéines obtenues par culture de ces microorganismes pour l'immunisation à l'encontre de maladies liées aux bactéries du genre Clostridium, ou pour le traitement Finally, it relates to the use of these polynucleotides, sequences, vectors, microorganisms or proteins obtained by culture of these microorganisms for immunization against diseases linked to bacteria of the genus Clostridium, or for the treatment
de ces maladies.of these diseases.
La présente invention est illustrée sans pour autant être limitée The present invention is illustrated without however being limited
par les exemples suivants.by the following examples.
La figure 1 représente la séquence nucléotidique et la FIG. 1 represents the nucleotide sequence and the
séquence en acides aminés déduite du gène tetR. amino acid sequence deduced from the tetR gene.
* La figure 2 illustre les identités de séquence entre les différents* Figure 2 illustrates the sequence identities between the different
gènes régulateurs et le gène tetR. regulatory genes and the tetR gene.
La figure 3 illustre l'activité léthale de surnageants de culture des souches CN655 (souche sauvage, WT), CN655-OE surexprimant le FIG. 3 illustrates the lethal activity of culture supernatants of the CN655 strains (wild strain, WT), CN655-OE overexpressing the
gène tetR, CN655-botR/A surexprimant le gène BotR/A et CN655- tetR gene, CN655-botR / A overexpressing the BotR / A gene and CN655-
BotR/C surexprimant le gène BotR/C sur des souris. L'activité léthale (LD50) de ces surnageants est mesurée en fonction de la densité BotR / C overexpressing the BotR / C gene in mice. The lethal activity (LD50) of these supernatants is measured as a function of the density
optique à 600 nm de chaque culture. optics at 600 nm from each culture.
La figure 4 illustre la production de TeTx mise en évidence par Western Blot à l'aide d'anticorps anti TeTx, respectivement dans la source CN655 sauvage (figure 4A), la souche surexprimant le gène îo BotR/A (figure 4B), la souche surexprimant le gène BotR/C (figure 4C), et la souche surexprimant le gène tetR (figure 4D). Les surnageants de chacune des cultures ont été concentrés par précipitation. 20pg de protéines ont été chargés dans le puits 1 et des dilutions de moitié effectuées en série, ont été chargées dans les puits suivants (puits 2 à 4). Dans les figures 4B et 4D la bande supérieure correspond à la TeTx entière et la bande inférieure à la chaîne lourde H. La figure 5 représente une électrophorèse sur gel de polyacrylamide de protéines extracellulaires de la souche sauvage CN655 de C.tetani (puits 1) et de la souche recombinante surexprimant le gène tetR (puits 2). La bande identifiée par H correspond à la chaîne FIG. 4 illustrates the production of TeTx demonstrated by Western Blot using anti-TeTx antibodies, respectively in the wild-type CN655 source (FIG. 4A), the strain overexpressing the gene BotR / A (FIG. 4B), strain overexpressing the BotR / C gene (FIG. 4C), and the strain overexpressing the tetR gene (FIG. 4D). The supernatants of each of the cultures were concentrated by precipitation. 20 g of protein were loaded into well 1 and half dilutions made in series were loaded into the following wells (wells 2 to 4). In FIGS. 4B and 4D the upper band corresponds to the entire TeTx and the lower band to the heavy chain H. FIG. 5 represents an electrophoresis on a polyacrylamide gel of extracellular proteins of the wild strain CN655 from C.tetani (well 1) and of the recombinant strain overexpressing the tetR gene (well 2). The band identified by H corresponds to the string
lourde de TeTx, tandis que L correspond à la chaîne légère. heavy with TeTx, while L corresponds to the light chain.
La figure 6 représente des hybridations ponctuelles (dot blots) d'ARNs messagers de la souche sauvage CN655 (WT), et des souches recombinantes surexprimant le gène tetR (OE), le gène botR/A, et le gène botR/C. L'hybridation est effectuée à l'aide de sondes spécifiques FIG. 6 represents point hybridizations (dot blots) of messenger RNAs of the wild strain CN655 (WT), and recombinant strains overexpressing the tetR gene (OE), the botR / A gene, and the botR / C gene. Hybridization is carried out using specific probes
du gène TeTx. Les quantités d'ARNs messagers sont indiquées au- of the TeTx gene. The amounts of messenger RNAs are indicated below.
dessus de chaque colonne (20 pg, 10pg, 5 pg et 2,5 pg). above each column (20 pg, 10pg, 5 pg and 2.5 pg).
La figure 7 est une représentation schématique du site codant pour les neurotoxines botuliniques de types A, B, C et D de C. botulinum FIG. 7 is a schematic representation of the site coding for the botulinum neurotoxins of types A, B, C and D of C. botulinum
et du type G de C.argentinense.and type G of C. argentinense.
La figure 8 illustre la stratégie utilisée pour construire le gène Figure 8 illustrates the strategy used to build the gene
codant pour l'ARN messager anti-sens pour le gène botR/A. encoding anti-sense messenger RNA for the botR / A gene.
La figure 9 illustre la toxicité chez la souris de surnageants de culture respectivement de la souche sauvage 62, de la souche recombinante 62-OE surexprimant le gène botR/A et de la souche recombinante 62-AS produisant des ARNs messagers anti-sens pour le gène botR/A. La toxicité (LD 50) est mesurée en fonction de la densité FIG. 9 illustrates the toxicity in mice of culture supernatants respectively of the wild strain 62, of the recombinant strain 62-OE overexpressing the botR / A gene and of the recombinant strain 62-AS producing antisense messenger RNAs for the botR / A gene. Toxicity (LD 50) is measured as a function of density
optique des cultures.crop optics.
Les figures 10 à 10C illustrent respectivement la production de BoNT/A, dosée par hybridation de type Western, à l'aide d'anticorps anti- BoNT/A, respectivement par la souche sauvage 62 (figure 10A), par la souche 62-OE (figure 10B) et par la souche 62-AS (figure 10C). Le surnageant de chaque culture a été chargé dans les puits N I1 et des dilutions de moitié ont été chargées dans les puits suivants. Les flèches indiquent les positions correspondant à la neurotoxine entière (BoNT), la FIGS. 10 to 10C respectively illustrate the production of BoNT / A, assayed by Western type hybridization, using anti-BoNT / A antibodies, respectively by the wild strain 62 (FIG. 10A), by the strain 62- OE (Figure 10B) and by the strain 62-AS (Figure 10C). The supernatant of each culture was loaded into wells N I1 and half dilutions were loaded into the following wells. The arrows indicate the positions corresponding to the whole neurotoxin (BoNT), the
chaîne lourde (H) et la chaîne légère (L). heavy chain (H) and light chain (L).
La figure 11 illustre la production de protéines non toxiques Figure 11 illustrates the production of non-toxic proteins
NTNH, dosée par hybridation de type Western à l'aide d'anticorps anti- NTNH, assayed by Western type hybridization using anti-
NTNH dans la souche sauvage (figure 11A), la souche 62-OE (figure NTNH in the wild strain (Figure 11A), strain 62-OE (Figure
11B) et la souche 62-AS (figure 11C). 11B) and strain 62-AS (Figure 11C).
Les figures 12A à 12C illustrent respectivement la production des protéines HA34 et de HA70 partiellement clivées par hybridation de type Western, respectivement dans la souche sauvage (figure 12A) dans FIGS. 12A to 12C respectively illustrate the production of the HA34 and HA70 proteins partially cleaved by Western type hybridization, respectively in the wild strain (FIG. 12A) in
la souche 62-OE (figure 12B) et dans la souche 62-AS (figure 12C). strain 62-OE (Figure 12B) and in strain 62-AS (Figure 12C).
La figure 13 représente des dosages par dot blots d'ARNs messagers des souches sauvages 62 (wt), 62-OE (oe) et 62-AS (as) à l'aide de sondes spécifiques des gènes bont/A, ntnh, ha70, et ha34. La quantité totale d'ARN messager chargée dans chaque puits est indiquée FIG. 13 represents dot blot assays of messenger RNAs of wild strains 62 (wt), 62-OE (oe) and 62-AS (as) using probes specific for the bont / A, ntnh, ha70 genes , and ha34. The total amount of messenger RNA loaded in each well is indicated
(20 à 0,1 pg).(20 to 0.1 pg).
La figure 14A représente un test de mobilité sur gel. Un fragment d'ADN marqué correspondant au promoteur ntnh (puits 2) a été mélangé avec un extrait cellulaire de la souche 62-OE (puits 3). La mobilité observée avec l'extrait cellulaire n'est plus observée lors de l'addition d'un excès d'ADN non marqué (puits 1). L'addition d'anticorps polyclonal dirigée contre BotR/C à l'extrait cellulaire et à l'ADN marqué Figure 14A shows a gel mobility test. A labeled DNA fragment corresponding to the ntnh promoter (well 2) was mixed with a cell extract of the strain 62-OE (well 3). The mobility observed with the cell extract is no longer observed when adding an excess of unlabeled DNA (well 1). Addition of polyclonal antibodies to BotR / C to cell extract and labeled DNA
augmente le retard du gel (puits 4). increases the gel delay (well 4).
La figure 14B illustre la spécificité d'anticorps polyclonaux anti- FIG. 14B illustrates the specificity of anti-polyclonal antibodies
BotR/C par hybridation de type Western. Les extraits cellulaires de la souche sauvage 62 (puits 1) et de la souche recombinante 62-OE (puits 2) ont été mis à migrer sur un gel PAGE-SDS puis transférés sur BotR / C by Western type hybridization. The cell extracts of wild strain 62 (well 1) and of recombinant strain 62-OE (well 2) were put to migrate on a PAGE-SDS gel and then transferred to
nitrocellulose et hybridés avec un anticorps anti-BotR/C. nitrocellulose and hybridized with an anti-BotR / C antibody.
La figure 15 illustre l'immunoprécipitation de la protéine botR/A liée au promoteur des gènes ntnh (figure 15A) et ha (figure 15B), mais pas aux régions codantes du gène botR/A (figure 15C). Des extraits cellulaires de la souche 62-OE ont été incubés avec des fragments d'ADN marqués, des anticorps anti-BotR/C immunopurifiés et ont été immunoprécipités avec des billes d'agarose-protéine A (puits 1). Les bandes d'ADN marquées ont été visualisees par autoradiographie du gel 1o SDS-PAGE séchees (figures 15A à 15C) et les protéines ont été FIG. 15 illustrates the immunoprecipitation of the botR / A protein linked to the promoter of the ntnh (FIG. 15A) and ha genes (FIG. 15B), but not to the coding regions of the botR / A gene (FIG. 15C). Cell extracts of strain 62-OE were incubated with labeled DNA fragments, immunopurified anti-BotR / C antibodies and were immunoprecipitated with agarose protein A beads (well 1). The labeled DNA bands were visualized by autoradiography of the dried SDS-PAGE 1o gel (FIGS. 15A to 15C) and the proteins were
visualisées par hybridation de type Western avec des anticorps anti- visualized by Western type hybridization with anti-
BotR/C puis par chimioluminescence (figure 15D, figure 15E et figure F). Les témoins négatifs comprenant des fragments d'ADN marqués incubés avec des anticorps anti-BotR/C et dépourvus d'extrait cellulaire (puits 2) avec des extraits cellulaires et sans anticorps anti-BotR/C (puits 3) et avec des extraits cellulaires et des immunoglobulines de lapin non spécifiques (puits 4) ont été effectués. Des témoins positifs consistant en de l'ADN marqué mélangé avec l'extrait cellulaire sans BotR / C then by chemiluminescence (Figure 15D, Figure 15E and Figure F). Negative controls comprising labeled DNA fragments incubated with anti-BotR / C antibodies and devoid of cell extract (well 2) with cell extracts and without anti-BotR / C antibody (well 3) and with cell extracts and non-specific rabbit immunoglobulins (well 4) were performed. Positive controls consisting of labeled DNA mixed with the cell extract without
l'immunoprécipitation par l'agarose-protéine A ont été effectués (puits 5). immunoprecipitation with agarose-protein A were carried out (well 5).
BotR/A a été immunoprécipité dans les trois dosages (figure 15D, figure E et figure 15F). Les fragments d'ADN des régions promotrices de ntnh et de ha ont été co-immunoprécipités avec BotR/A, tandis que le fragment d'ADN d'une taille identique de la région codante de bont/A BotR / A was immunoprecipitated in all three assays (Figure 15D, Figure E and Figure 15F). The DNA fragments of the promoter regions of ntnh and of ha were co-immunoprecipitated with BotR / A, while the DNA fragment of an identical size of the coding region of bont / A
(figure 15C) n'était pas immunoprécipité. (Figure 15C) was not immunoprecipitated.
Les figures 16, 17 et 18 illustrent les constructions Figures 16, 17 and 18 illustrate the constructions
respectivement des plasmides pMRP309, pMRP365 et pMRP319. plasmids pMRP309, pMRP365 and pMRP319 respectively.
Les matériels et méthodes utilisés sont les suivants. The materials and methods used are as follows.
Matériels et méthodesMaterials and methods
Souches batériennes et plasmides.Batériennes strains and plasmids.
La souche de C. tetani CN655 et les souches recombinantes ont été cultivées dans du milieu contenant de la trypticase (30 9/l), de l'extrait de levure (20 9/l), du glucose (5 9/l) et de la cystéine HCI (0,5 9/l) (pH 7,2) dans des conditions anaérobies. L'ADN de Clostridium a été extrait et purifié comme décrit précédemment POPOFF et al. (1985, J. The C. tetani CN655 strain and the recombinant strains were cultivated in medium containing trypticase (30 9 / l), yeast extract (20 9 / l), glucose (5 9 / l) and HCI cysteine (0.5 9 / l) (pH 7.2) under anaerobic conditions. Clostridium DNA was extracted and purified as previously described POPOFF et al. (1985, J.
1o Gen. Microbiol, 131:1697-1703).1o Gen. Microbiol, 131: 1697-1703).
Techniques de bioloqie moléculaire. Molecular biology techniques.
Les ligatures, transformations, séquençages et préparations d'ADN plasmidique à partir d'Escherichia coli ont été effectués selon les procédures habituellement utilisées et décrites par SAMBROOK et al., (1989 Molecular Cloning: a Laboratory Manual, 2nd edition. Cold Spring The ligations, transformations, sequencing and preparations of plasmid DNA from Escherichia coli were carried out according to the procedures usually used and described by SAMBROOK et al., (1989 Molecular Cloning: a Laboratory Manual, 2nd edition. Cold Spring
Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.). Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.).
Transformation de C, tetani et de C. botulinum par électroporation. Transformation of C, tetani and C. botulinum by electroporation.
Des cellules compétentes de C.tetani CN655 ont été préparées en conditions anaérobies. Des bactéries d'une culture dans du TGY (100 ml) ont été centrifugées au milieu de leur phase de croissance exponentielle, lavées dans de l'eau distillée et suspendues dans 0,5 ml de Na2HPO4, pH 7,4, contenant MgCI2 (1 mM) et du saccharose (270 mM). L'ADN plasmidique (1 à 5 pg) produit dans la souche d'E.coli HB101, a été ajouté à 50 pl de suspension cellulaire. L'électroporation a été effectuée en conditions non-anaérobies en utilisant l'appareillage commercialisé sous la dénomination " gene pulser " par Bio-Rad (2,5 kV, 200 O et 25 mF) et en utilisant une cuvette hermétiquement scellée en atmosphère anaérobie. Les bactéries ont été diluées dans du TGY, incubées durant 3 heures à 37 C et étalées sur de l'agar TGY contenant pg/ml d'érythromycine dans des conditions anaérobies. L'électroporation des cellules de la souche de C.botulinum A NCTC 2916 et 62 a été effectuée comme indiqué précédemment pour Competent cells of C. tetani CN655 were prepared under anaerobic conditions. Bacteria from a culture in TGY (100 ml) were centrifuged in the middle of their exponential growth phase, washed in distilled water and suspended in 0.5 ml of Na2HPO4, pH 7.4, containing MgCI2 ( 1 mM) and sucrose (270 mM). The plasmid DNA (1 to 5 μg) produced in the E. coli HB101 strain was added to 50 μl of cell suspension. The electroporation was carried out under non-anaerobic conditions using the apparatus marketed under the name "gene pulser" by Bio-Rad (2.5 kV, 200 O and 25 mF) and using a hermetically sealed cuvette in an anaerobic atmosphere. . The bacteria were diluted in TGY, incubated for 3 hours at 37 ° C. and spread on TGY agar containing pg / ml of erythromycin under anaerobic conditions. The electroporation of the cells of the C.botulinum A NCTC 2916 and 62 strain was carried out as indicated previously for
les souches de C.tetani.strains of C. tetani.
Les témoins de transformation sont pGK12 et pAT19 qui peuvent être transférés dans diverses bactéries Gram-positive. L'efficacité de transformation de la souche NCTC2916 de C.botulinum par le plasmide pGK12 est de 102 à 103, et de 10 à 102 transformant par pg d'ADN pour le plasmide pAT19 isolé à partir de la souche The transformation controls are pGK12 and pAT19 which can be transferred into various Gram-positive bacteria. The transformation efficiency of the NCTC2916 strain of C.botulinum by the plasmid pGK12 is from 102 to 103, and from 10 to 102 transforming per pg of DNA for the plasmid pAT19 isolated from the strain
d'Escherichia coli HB101.of Escherichia coli HB101.
Construction du plasmide d'expression du gène BotR/A Un fragment d'ADN contenant le gène BotR/A et sa région promotrice (entre les positions 3250 et 4426 numérotées selon la séquence du site de la neurotoxine botulique de la souche NCTC2916 correspondant au numéro L42537 de GenBank tel que décrit par HENDERSON et al.,( 1996, FEMS Microbiol. Lett. 140, 151-158)) a été amplifié par PCR à l'aide des amorces présentant les séquences SEQ ID N 7 et SEQ ID N 8 à partir de la souche de C. botulinum NCTC2916 et a été inséré dans le plasmide pUC18 au site Smal. Le fragment a été éliminé par digestion avec KpnI-Pstl et a été ensuite inséré entre les sites Kpnlet Pstl de pAT19. Le plasmide résultant (pMR309) a été transformé dans la souche 62 de C.botulinum et a donné naissance à la Construction of the BotR / A gene expression plasmid A DNA fragment containing the BotR / A gene and its promoter region (between positions 3250 and 4426 numbered according to the sequence of the botulinum neurotoxin site of the strain NCTC2916 corresponding to the number L42537 from GenBank as described by HENDERSON et al. (1996, FEMS Microbiol. Lett. 140, 151-158)) was amplified by PCR using primers having the sequences SEQ ID N 7 and SEQ ID N 8 from the strain of C. botulinum NCTC2916 and was inserted into the plasmid pUC18 at the SmaI site. The fragment was removed by digestion with KpnI-Pstl and was then inserted between the Kpnlet Pstl sites of pAT19. The resulting plasmid (pMR309) was transformed into strain 62 of C.botulinum and gave rise to the
souche 62-OE.strain 62-OE.
Le plasmide pMRP309 a fait l'objet d'un dépôt, dans la souche SURe d'Escherichia coli auprès de la Collection Nationale de Culture de The plasmid pMRP309 was the subject of a deposit, in the SURe strain of Escherichia coli with the National Culture Collection of
Microorganismes de l'lnstitut Pasteur le 12 Mai 1998 sous le N 1-2010. Microorganisms of the Pasteur Institute on May 12, 1998 under the N 1-2010.
Construction des plasmides pour l'expression des gènes tetR et Construction of plasmids for the expression of the tetR and
botR/C.botR / C.
Un fragment d'ADN contenant les régions codant pour le gène TetR a été amplifié par la technique d'amplification PCR à partir de la souche CN655 de C tetani à l'aide des amorces présentant les séquences SEQ ID N 3 et SEQ ID N 4 suivantes (P516 et P517): A DNA fragment containing the regions coding for the TetR gene was amplified by the PCR amplification technique from the CN655 strain of C tetani using primers having the sequences SEQ ID N 3 and SEQ ID N 4 following (P516 and P517):
SEQ ID N 3SEQ ID N 3
NCOINCOI
(P516) CCATGG TTA TGG AAA-ATC TAT TTG TAA AAA (P516) CCATGG TTA TGG AAA-ATC TAT TTG TAA AAA
SEQID N 4SEQID N 4
PstlPstl
(P517) CTGCAG CTA TAT ATT AAT TAA TTT ATT TAC TAT AGG (P517) CTGCAG CTA TAT ATT AAT TAA TTT ATT TAC TAT AGG
Le produit d'amplification coupé par Ncol et Pstl a été clone dans un vecteur multicopies pAT19 en aval du promoteur du gène de la toxine iota de C.perfringens et en amont de la partie 3' du gène ibp de la toxine iota comme décrit ci-dessus pour l'expression du gène BotR/A The amplification product cut by Ncol and Pst1 was cloned into a multicopy vector pAT19 downstream of the promoter of the iota toxin gene of C.perfringens and upstream of the 3 ′ part of the ibp gene of iota toxin as described below. above for expression of the BotR / A gene
(pMRP306).(pMRP306).
Le plasmide résultant pMRP365 a été transféré dans la souche The resulting plasmid pMRP365 was transferred to the strain
C.tetani CN655 donnant naissance à la souche CN655-OE. C.tetani CN655 giving rise to the CN655-OE strain.
La souche d'Escherichia coli SURe contenant pMRP365 a fait l'objet d'un dépôt auprès de la Collection Nationale de Cultures de The Escherichia coli SURe strain containing pMRP365 has been deposited with the National Collection of Cultures of
Microorganismes de l'institut Pasteur le 12 Mai 1998 sous le n 1-2012. Microorganisms of the Pasteur Institute on May 12, 1998 under the number 1-2012.
Une construction similaire a été effectuée avec BotR/C. A similar construction was carried out with BotR / C.
La région codante de BotR/C a été amplifiée par PCR à partir The BotR / C coding region was amplified by PCR from
de la souche de C. botilinum 468 HAUSER et al. ( 1994, Mol. Gen. of C. botilinum 468 HAUSER et al. (1994, Mol. Gen.
Genet, 243:631-640), en utilisant les amorces de séquences SEQ ID N 5 et SEQ ID N 6 suivantes: Genet, 243: 631-640), using the following primers of sequences SEQ ID N 5 and SEQ ID N 6:
SEQID N 5SEQID N 5
(P392) CATATG AATGATTTATTTTATGCTATAG (P392) CATATG AATGATTTATTTTATGCTATAG
SEQ ID N06SEQ ID N06
(P326) CTGCAGTCAAATATTAACTAATTGCATTAC (P326) CTGCAGTCAAATATTAACTAATTGCATTAC
Le produit d'amplification a été ensuite cloné et a donné The amplification product was then cloned and gave
naissance à pMRP319.birth at pMRP319.
Le plasmide résultant a été transféré dans la souche CN655 de The resulting plasmid was transferred to the CN655 strain of
C.tetani et la souche résultante a -été appelée CN655-BotR/C. C. tetani and the resulting strain was named CN655-BotR / C.
La souche d'Escherichia coli SURe contenant ce plasmide a été The Escherichia coli SURe strain containing this plasmid was
déposée auprès de la CNCM le 12 Mai 1998 sous le n 1-2011. filed with the CNCM on May 12, 1998 under number 1-2011.
Construction d'un vecteur codant les ARNs messagers anti-sense Construction of a vector encoding anti-sense messenger RNAs
pour le gène BotR/A.for the BotR / A gene.
Un fragment nucléotidique de 73 paires de bases contenant le site de liaison du ribosome et les 18 premiers codons 5' du gène BotR/A a été amplifié par la méthode PCR et a été inséré dans une orientation inverse dans le plasmide pAT19 en aval du promoteur du gène de la toxine iota de C.perfringens, et en amont de l'extrémité 3' du gène lb de A 73 base pair nucleotide fragment containing the ribosome binding site and the first 18 5 'codons of the BotR / A gene was amplified by the PCR method and was inserted in a reverse orientation into the plasmid pAT19 downstream of the promoter of the iota toxin gene of C.perfringens, and upstream of the 3 'end of the lb gene
la toxine iota décrit dans l'article de PERRELLE et al..(1993, Infect. the iota toxin described in the article by PERRELLE et al. (1993, Infect.
Immun., 61, 5147-5156), comme le montre la figure 8. Immun., 61, 5147-5156), as shown in Figure 8.
Le plasmide recombinant pMRP306 a été introduit dans la souche 62 de C. botulinum par électroporation. La souche recombinante The recombinant plasmid pMRP306 was introduced into strain 62 of C. botulinum by electroporation. The recombinant strain
a été appelée 62-AS.was called 62-AS.
Isolement de I'ARN et dot blots d'ARN. RNA isolation and dot RNA blots.
L'ARN total a été extrait à partir de cultures de C.tetani en milieu de phase de croissance en utilisant du Trizol (GIBCO BRL, Cergy, Total RNA was extracted from cultures of C. tetani in the middle of the growth phase using Trizol (GIBCO BRL, Cergy,
Pontoise, France).Pontoise, France).
Le culot bactérien d'une culture de 10 ml a été lavé deux fois dans de l'eau distillée et suspendu dans 200 ml de Tris-HCI 10 mM (pH The bacterial pellet of a 10 ml culture was washed twice in distilled water and suspended in 200 ml of 10 mM Tris-HCl (pH
7)-EDTA (10 mM) saccharose (20%), contenant 1 mg de lysozyme. 7) -EDTA (10 mM) sucrose (20%), containing 1 mg of lysozyme.
Le mélange a été incubé durant 30 mn à 37 C et centrifugé. Le culot a été suspendu dans 1 ml de Trizol et incubé durant 5 mn à température ambiante. Les étapes suivantes ont été effectuées selon les The mixture was incubated for 30 min at 37 ° C. and centrifuged. The pellet was suspended in 1 ml of Trizol and incubated for 5 min at room temperature. The following steps were carried out according to the
recommandations du fabricant.manufacturer's recommendations.
Des dilutions en série de l'ARN total dans du SSCx20 ont été transférées sur des membranes de Hybond N+ (Amersham, Paris, France), ont été incubées à 60 C durant deux heures dans un tampon rapide d'hybridation (Amersham) et les fragments amplifiés par PCR correspondant au gène tetx marqués au 32p en utilisant le kit Megaprime (Amersham). Les membranes ont été lavées dans du SSC x 0,1- SDS (0,1%) à 60 C et exposées au rayonnement X. Serial dilutions of total RNA in SSCx20 were transferred to Hybond N + membranes (Amersham, Paris, France), were incubated at 60 ° C for two hours in rapid hybridization buffer (Amersham) and the PCR amplified fragments corresponding to the tetx gene labeled with 32p using the Megaprime kit (Amersham). The membranes were washed in SSC x 0.1-SDS (0.1%) at 60 ° C and exposed to X-rays.
PAGE et immunotransferts.PAGE and immunoblots.
1o Les protéines ont été précipitées à partir des surnageants de cultures (densité optique 1,8) de la souche sauvage et des souches 1o The proteins were precipitated from culture supernatants (optical density 1.8) of the wild strain and the strains
recombinantes de C. tetani à l'aide d'acide trichloroacétique à 10%. C. tetani recombinants using 10% trichloroacetic acid.
Les précipités ont été récupérés par centrifugation et ont été The precipitates were collected by centrifugation and were
lavés avec de l'acétone.washed with acetone.
Les protéines solubilisées dans du Tris-HCI 50 mM, pH 8, et des dilutions en série ont été mises à migrer sur un gel d'acrylamide à The proteins solubilized in 50 mM Tris-HCl, pH 8, and serial dilutions were put to migrate on an acrylamide gel to
% SDS-PAGE.% SDS-PAGE.
Le procédé d'immunotransfert est celui décrit par BURNETTE et ai. (1981, Anal. Biochem., 112, 115-203). Les protéines, séparées à l'aide du gel SDS-PAGE, ont été transférées sur des feuilles de nitrocellulose (Hybond C, Amersham). Les feuilles de nitrocellulose ont été incubées durant 1 heure dans un tampon salin de phosphate contenant 5% de lait en poudre et ont été incubées durant une nuit à température ambiante avec des anticorps anti-Tetx de lapin avec une dilution 1:400. Les anticorps liés ont été détectés à l'aide de protéine A marquée par la peroxydase et du kit de chimioluminescence The immunoblot method is that described by BURNETTE et al. (1981, Anal. Biochem., 112, 115-203). The proteins, separated using the SDS-PAGE gel, were transferred onto nitrocellulose sheets (Hybond C, Amersham). The nitrocellulose sheets were incubated for 1 hour in a phosphate buffered saline containing 5% milk powder and were incubated overnight at room temperature with rabbit anti-Tetx antibodies at a dilution of 1: 400. Bound antibodies were detected using peroxidase-labeled protein A and the chemiluminescence kit
commercialisé par Amersham.marketed by Amersham.
Electrophorèse et immunoprécipitation. Electrophoresis and immunoprecipitation.
La souche 62-OE de C.botulinum a été mise en culture dans du TGY jusqu'à obtenir une densité optique de 0,6 à 600 nm. Les cellules bactériennes ont été centrifugées et resuspendues dans du HEPES 10 mM, pH 7,8, contenant KCI (10 mM), EDTA (100 mM), EGTA (100 mM), PMSF (0,5 mM) et DTT (1 mM). Les bactéries ont été traitées par ultrasons durant 4 minutes et centrifugées. Le surnageant est constitué C.botulinum strain 62-OE was cultured in TGY until an optical density of 0.6 at 600 nm was obtained. The bacterial cells were centrifuged and resuspended in 10 mM HEPES, pH 7.8, containing KCI (10 mM), EDTA (100 mM), EGTA (100 mM), PMSF (0.5 mM) and DTT (1 mM ). The bacteria were treated with ultrasound for 4 minutes and centrifuged. The supernatant consists
de l'extrait cellulaire.cell extract.
Des fragments d'ADN de 194 et 82 paires de bases correspondant aux régions promotrices des gènes ntnh et ha34 ont été amplifiés par PCR en utilisant les amorces présentant les séquences SEQ ID N 7 à 10 suivantes: DNA fragments of 194 and 82 base pairs corresponding to the promoter regions of the ntnh and ha34 genes were amplified by PCR using the primers having the following sequences SEQ ID N 7 to 10:
SEQ ID N 7SEQ ID N 7
io (P369) CAAGATTTTTATTATCTACCGGGGio (P369) CAAGATTTTTATTATCTACCGGGG
SEQ ID N 8SEQ ID N 8
(P419) GGTTTACAAAAAATAGTGTGGCTATG(P419) GGTTTACAAAAAATAGTGTGGCTATG
SEQ ID N 9SEQ ID N 9
(P259) CATTATGATTCCTCCTTTATTTAA(P259) CATTATGATTCCTCCTTTATTTAA
SEQ ID N 10SEQ ID N 10
(P530) ATTTTAGGTTTACAAAAAATAAC(P530) ATTTTAGGTTTACAAAAAATAAC
Les amorces présentant les séquences SEQ ID N 7 et SEQ ID N 8 ont été utilisées pour amplifier la région promotrice de ntnh, tandis que les amorces présentant les séquences SEQ ID N 9 et SEQ ID N 10 The primers having the sequences SEQ ID N 7 and SEQ ID N 8 were used to amplify the promoter region of ntnh, while the primers having the sequences SEQ ID N 9 and SEQ ID N 10
ont été utilisées pour amplifier la séquence promotrice du gène ha34. have been used to amplify the promoter sequence of the ha34 gene.
Les amorces ont été marquées par du [Y32P]ATP en utilisant o0 une polynucléotide kinase (Pharmacia), avant l'amplification par la méthode PCR. Les produits d'amplification ont été extraits par un mélange phénolchloroforme et précipités par de I'éthanol (HURME et al. 1996, J. Biol. Chem., 271, 12626-12631). Les culots d'ADN ont été The primers were labeled with [Y32P] ATP using o0 a polynucleotide kinase (Pharmacia), before amplification by the PCR method. The amplification products were extracted with a phenolchloroform mixture and precipitated with ethanol (HURME et al. 1996, J. Biol. Chem., 271, 12626-12631). DNA pellets have been
dissous dans de l'eau et la radioactivité a été comptée. dissolved in water and radioactivity was counted.
Les extraits cellulaires (10 pg de protéines totales) ont été rajoutés aux fragments d'ADN marqués radioactivement (1-10 ng, 10000 cpm) dans du TBE x 5 (Tris-HCI, 89 mM, pH 8,3, borate 89 mM, EDTA (2 mM); contenant MgCI2 (1 mM) NaCI, (50 mM) glycérol (5%), 4pg d'ADN de sperme de saumon et 2 pg de sérum albumine bovine acétylée (BSA) Cell extracts (10 pg total protein) were added to the radioactively labeled DNA fragments (1-10 ng, 10,000 cpm) in TBE x 5 (Tris-HCl, 89 mM, pH 8.3, borate 89 mM , EDTA (2 mM); containing MgCI2 (1 mM) NaCI, (50 mM) glycerol (5%), 4 g of salmon sperm DNA and 2 g of acetylated bovine serum albumin (BSA)
dans un volume total de 30 pl.in a total volume of 30 pl.
Le mélange a été incubé durant 20 minutes à 37 C puis chargé sur un gel à 5 % de polyacrylamide (29:1 acrylamide-bisacrylamide) et soumis à une électrophorèse dans du TBE x 5 à 10 V.cm'1 durant 4 heures à 4 C. Les gels ont été séchés et autoradiographiés. Après une étape de préincubation de 20 min en présence de 1 pg d'ADN non marqué, les sondes marquées ont été ajoutées. Des anticorps anti BotR/C ont été ajoutés à une dilution de 1:100 dans le milieu réactionnel. Les anticorps anti-BotR/C ont été obtenus en utilisant la protéine BotR/C fusionnée à His-tag dans le vecteur pET28b (Novagen), produite dans la souche d'Escherichia coli BL21 et purifiée sur une colonne Ni. Pour l'immunopurification des anticorps anti-BotR/C, l'extrait cellulaire de la souche de C.botulinum 62-OE a été soumis à une The mixture was incubated for 20 minutes at 37 ° C. and then loaded onto a 5% polyacrylamide gel (29: 1 acrylamide-bisacrylamide) and subjected to electrophoresis in TBE x 5 at 10 V.cm'1 for 4 hours at 4 C. The gels were dried and autoradiographed. After a 20 min preincubation step in the presence of 1 μg of unlabeled DNA, the labeled probes were added. Anti BotR / C antibodies were added at a 1: 100 dilution in the reaction medium. Anti-BotR / C antibodies were obtained using the BotR / C protein fused to His-tag in the vector pET28b (Novagen), produced in the Escherichia coli BL21 strain and purified on an Ni column. For the immunopurification of anti-BotR / C antibodies, the cell extract of the C.botulinum 62-OE strain was subjected to a
électrophorèse sur PAGE 10% SDS 0,1%, et transféré sur nitrocellulose. electrophoresis on PAGE 10% SDS 0.1%, and transferred to nitrocellulose.
La bande de 21 kD a été considérée comme le seuil (cut off). La réaction a été bloquée par incubation dans du PBS contenant 5% de lait puis dans du sérum 1:10 anti BotR/C. Après lavage avec du PBS, les anticorps spécifiques ont été élués avec de l'acide acétique 0,1 M et The 21 kD band was considered to be the cut off. The reaction was blocked by incubation in PBS containing 5% milk and then in 1:10 anti BotR / C serum. After washing with PBS, the specific antibodies were eluted with 0.1 M acetic acid and
neutralisés avec du Tris-HCI 3M à pH8. neutralized with 3M Tris-HCI at pH8.
Les immunoprécipitations ont été effectuées en incubant des Immunoprecipitations were performed by incubating
fragments d'ADN amplifiés par PCR et marqués au 32p comme décrit ci- DNA fragments amplified by PCR and labeled with 32p as described above
dessus (2x105 cpm), I'extrait cellulaire de C.botulinum 62-OE (10 pg de protéines totales) dans un tampon B Tris-HCI 20 mM, pH 7,5, contenant MgCI2 10 mM et 250 pg/ml d'ADN de sperme de saumon dans un above (2x105 cpm), the cellular extract of C.botulinum 62-OE (10 μg of total proteins) in a buffer B Tris-HCl 20 mM, pH 7.5, containing MgCl 2 10 mM and 250 μg / ml of Salmon sperm DNA in a
volume final de 60 pl, durant 20 min à température ambiante. final volume of 60 μl, for 20 min at room temperature.
A titre de témoin négatif des fragments d'ADN de la région codante du gène bont/A (positions 3638 à 3769 de la séquence M30196) ont été amplifiés par PCR. Les anticorps anti-botR/C immunopurifiés (400 ng) ont été ajoutés dans chaque échantillon et ont été incubés durant 4 min à température ambiante. De l'agarose-protéine A (Sigma) (20 pg) a été ajouté et a été incubé durant 1 h à 4 C. Les billes ont été isolées par centrifugation puis lavées trois fois avec le tampon B. Elles ont été mélangées avec 15 pl de tampon d'échantillon, chauffées à 100 C durant deux minutes et o0 chargées sur un gel PAGE 10% SDS-0,1%. Les expériences ont été effectuées en double. Un gel a été séché et exposé au rayon X durant 4 jours afin de visualiser l'ADN 32p, et l'autre gel a été transféré sur de la nitrocellulose, hybride avec les anticorps anti- BotR/C immunopurifiés et les protéines ont été détectées à l'aide d'une trousse de As a negative control, DNA fragments of the coding region of the bont / A gene (positions 3638 to 3769 of the sequence M30196) were amplified by PCR. Immunopurified anti-botR / C antibodies (400 ng) were added to each sample and were incubated for 4 min at room temperature. Agarose-protein A (Sigma) (20 μg) was added and was incubated for 1 h at 4 C. The beads were isolated by centrifugation and then washed three times with buffer B. They were mixed with 15 μl of sample buffer, heated at 100 ° C. for two minutes and loaded onto a 10% SDS-0.1% PAGE gel. The experiments were performed in duplicate. One gel was dried and exposed to X-ray for 4 days in order to visualize the 32p DNA, and the other gel was transferred to nitrocellulose, hybridized with the immunopurified anti-BotR / C antibodies and the proteins were detected. using a kit
chimioluminescence.chemiluminescence.
Toxicité chez la souris.Toxicity in mice.
Des dilutions de moitié en série des échantillons (0,5 ml), dans du tampon phosphate sodium 50 mM (pH 3) contenant 0,2% (poids/volume) de gélatine, ont été injectées au travers du péritoine (i.p.) Serial dilutions of half the samples (0.5 ml), in 50 mM sodium phosphate buffer (pH 3) containing 0.2% (weight / volume) of gelatin, were injected through the peritoneum (i.p.)
dans des souris de 18 à 20 g.in mice from 18 to 20 g.
Quatre souris ont été utilisées pour chaque dilution. Les souris ont été observées après quatre jours et le nombre de morts a été Four mice were used for each dilution. The mice were observed after four days and the death toll was
compté.account.
EXEMPLE 1EXAMPLE 1
Caractérisation du gène tetR et surexpression de ce gène dans Characterization of the tetR gene and overexpression of this gene in
C. tetani.C. tetani.
1) Caractérisation du gène tetR La séquence nucléotidique et la séquence en acides aminés déduite de cette séquence nucléotidique (respectivement séquences SEQ ID N 1 et SEQ ID N 2) du gène TetR sont représentées sur la 1) Characterization of the tetR gene The nucleotide sequence and the amino acid sequence deduced from this nucleotide sequence (respectively sequences SEQ ID N 1 and SEQ ID N 2) of the TetR gene are represented on the
figure 1.figure 1.
La protéine déduite a une masse moléculaire calculée de 21.562 Da et est composée de-178 acides aminés. Elle montre une similarité de séquence de 50 à 65% avec les protéines correspondantes des souches de C. botulinum, comme il ressort de l'alignement de The deduced protein has a calculated molecular mass of 21,562 Da and is composed of -178 amino acids. It shows a sequence similarity of 50 to 65% with the corresponding proteins of the strains of C. botulinum, as can be seen from the alignment of
séquences de la figure 2.sequences of figure 2.
Cette protéine présente les caractéristiques des protéines se This protein has the characteristics of proteins
liant à l'ADN.binding to DNA.
2) Surexpression du gène tetR dans C.tetani Afin d'analyser la fonction de la protéine, le gène tetR a été 2) Overexpression of the tetR gene in C.tetani In order to analyze the function of the protein, the tetR gene was
surexprimé dans C.tetani.overexpressed in C.tetani.
Le gène tetR de C. tetani a été mis sous contrôle du promoteur du gène de la toxine iota de C. perfringens cloné dans le vecteur navette pAT19 (marqueur de sélection: érythromycine). Un segment de 200 bp correspondant à la partie 3' du gène de la toxine iota est inséré en partie The tetR gene of C. tetani was placed under the control of the promoter of the iota toxin gene of C. perfringens cloned into the shuttle vector pAT19 (selection marker: erythromycin). A 200 bp segment corresponding to the 3 'part of the iota toxin gene is inserted in part
3' du gène tetR (plasmide pmRP365). 3 'of the tetR gene (plasmid pmRP365).
Le gène tetR pourrait aussi être mis sous contrôle de son propre promoteur par: - amplification par PCR du promoteur de tetR (143 nucléotides en amont de l'atg de tetR) en générant un site HindIll en partie 5' et Ncol en partie 3', et - remplacement du fragment Hindll-Ncol (promoteur du gène de la toxine iota) de pmRP365 par le fragment amplifié Hindll-Ncol The tetR gene could also be placed under the control of its own promoter by: - PCR amplification of the tetR promoter (143 nucleotides upstream of the tetR atg) by generating a HindIII site in part 5 'and Ncol in part 3' , and - replacement of the Hindll-Ncol fragment (promoter of the iota toxin gene) of pmRP365 with the amplified Hindll-Ncol fragment
(promoteur de tetR).(tetR promoter).
La région codante de tetR a donc été amplifiée par PCR et clonée dans le vecteur contenant le promoteur du gène iap de C.perfringens. Le plasmide résultant, pMRP365 a été transféré par électroporation dans C. tetani CN655, donnant naissance à la souche The coding region of tetR was therefore amplified by PCR and cloned into the vector containing the promoter of the iap gene from C.perfringens. The resulting plasmid, pMRP365, was transferred by electroporation into C. tetani CN655, giving rise to the strain.
CN655-OE.CN655-OE.
La production de TeTx a été suivie chez la souche sauvage (CN655) et la souche recombinante (CN655-OE) par détermination de la léthalité chez la souris. Comme le montre la figure 3, I'activité dans les surnageants de culture durant la phase exponentielle de croissance est 6 à 8 fois supérieure dans la souche CN655-OE, par rapport à la souche sauvage. L'augmentation de la production de TeTx dans la souche CN655-OE est confirmée par hybridation de type Western (Western blot) en utilisant des anticorps spécifiques contre TeTx, comme le montre la The production of TeTx was monitored in the wild strain (CN655) and the recombinant strain (CN655-OE) by determination of the lethality in mice. As shown in FIG. 3, the activity in the culture supernatants during the exponential growth phase is 6 to 8 times higher in the CN655-OE strain, compared to the wild strain. The increase in the production of TeTx in the CN655-OE strain is confirmed by Western type hybridization (Western blot) using specific antibodies against TeTx, as shown in
figure 4.figure 4.
Ces résultats indiquent que le gène tetR, présent en nombre de copies important et en position trans dans C.tetani, induit une augmentation de la production de TeTx. Aucune autre protéine 0o extracellulaire ne sembleavoir été surproduite comme le montre la figure 5. Les ARNs messagers spécifiques du gène TeTx ont été cherchés par la technique d'hybridation ponctuelle (dot blot) dans la These results indicate that the tetR gene, present in large copy number and in trans position in C.tetani, induces an increase in the production of TeTx. No other extracellular 0o protein seems to have been overproduced as shown in FIG. 5. The messenger RNAs specific for the TeTx gene were sought by the dot blot technique in the
souche sauvage et dans la souche recombinante CN655-OE. wild strain and in the recombinant strain CN655-OE.
La quantité d'ARN messager spécifique de TeTx est approximativement quatre fois supérieure dans la souche recombinante par rapport à la souche sauvage, comme le montre la figure 5. Ce résultat est en accord avec l'augmentation du niveau de TeTx dans le surnageant de culture mesuré par l'activité léthale chez la souris et The amount of TeTx specific messenger RNA is approximately four times higher in the recombinant strain compared to the wild strain, as shown in FIG. 5. This result is in agreement with the increase in the level of TeTx in the culture supernatant. measured by lethal activity in mice and
l'immunohybridation.immunohybridization.
Ces résultats montrent clairement que le gène tetR active These results clearly show that the tetR gene activates
l'expression de TeTx au niveau transcriptionnel. the expression of TeTx at the transcriptional level.
EXEMPLE 2EXAMPLE 2
Surexpression des gènes botR/A et botR/C dans C.tetani Les gènes TetR et BotR présentant une homologie importante, il a semblé intéressant de déterminer si ces gènes sont Overexpression of the botR / A and botR / C genes in C.tetani Since the TetR and BotR genes have significant homology, it seemed interesting to determine whether these genes are
fonctionnellement identiques.functionally identical.
Il avait été montré que le plasmide pMRP309 contenant le gène botR/A sous le contrôle de son propre promoteur induit une augmentation significative de la production de botNT/A et des protéines non toxiques (ANTP), ainsi que des ARNs messagers correspondant It had been shown that the plasmid pMRP309 containing the botR / A gene under the control of its own promoter induces a significant increase in the production of botNT / A and non-toxic proteins (ANTP), as well as corresponding messenger RNAs
dans C.botulinum.in C.botulinum.
La souche CN655 de C.tetani a été transformée par électroporation avec le plasmide pMRP309 donnant naissance à la souche CN655-BotR/A. Une augmentation comparable de Tetx, dosée par le test de léthalité de la souris et par immunohybridation a été observée durant la phase exponentielle de croissance de CN655-BotR/A et CN655-OE, comme le montrent les figures 3 et 4. L'activité léthale The CN655 strain of C.tetani was transformed by electroporation with the plasmid pMRP309 giving rise to the CN655-BotR / A strain. A comparable increase in Tetx, measured by the mouse lethality test and by immunohybridization was observed during the exponential growth phase of CN655-BotR / A and CN655-OE, as shown in Figures 3 and 4. The activity lethal
chez la souris des surnageants de culture de CN655-OE et CN655- in mice culture supernatants of CN655-OE and CN655-
BotR/A est approximativement 8 fois supérieure à l'activité des BotR / A is approximately 8 times greater than the activity of
surnageants de la souche sauvage, comme le montre la figure 3. supernatants from the wild strain, as shown in Figure 3.
La surproduction de Tetx dosée par immunohybridation est 16 The overproduction of Tetx dosed by immunohybridization is 16
fois supérieure dans CN655-OE et 8 fois supérieure dans CN655- times higher in CN655-OE and 8 times higher in CN655-
BotR/A, par rapport à la souche sauvage, comme l'illustre la figure 4. De plus, la quantité d'ARNs messagers du gène Tetx est 4 fois supérieure dans les deux souches, comme l'illustre la figure 6. Ceci montre que BotR/A permet de réguler de manière positive le gène Tetx dans BotR / A, compared to the wild strain, as illustrated in FIG. 4. In addition, the quantity of messenger RNAs of the Tetx gene is 4 times higher in the two strains, as illustrated in FIG. 6. This shows that BotR / A can up-regulate the Tetx gene in
C. tetani.C. tetani.
L'effet de BotR/C qui présente moins de parenté avec TetR (identité de 50%) que BotR/A (identité de 60%) a été analysé chez C.tetani. Le plasmide pMRP319 correspondant au vecteur pAT19 contenant la région codante de botR/C, sous le contrôle du promoteur du gène iap a été transféré dans la souche CN655 par électroporation, donnant naissance à la source CN655-botR/C. La production de Tetx, dosée par l'activité léthale chez la souris est trois fois supérieure dans la souche CN655- BotR/C que dans la souche sauvage, et huit fois The effect of BotR / C which is less related to TetR (50% identity) than BotR / A (60% identity) was analyzed in C.tetani. The plasmid pMRP319 corresponding to the vector pAT19 containing the coding region of botR / C, under the control of the promoter of the iap gene was transferred into the strain CN655 by electroporation, giving rise to the source CN655-botR / C. The production of Tetx, measured by lethal activity in mice is three times greater in the CN655-BotR / C strain than in the wild strain, and eight times
supérieure si elle est dosée par l'immunohybridation (figures 3 et 4). higher if assayed by immunohybridization (Figures 3 and 4).
Aucune augmentation significative du taux d'ARN messager spécifique de Tetx n'est détectée dans le surnageant de culture de la No significant increase in the level of Tetx-specific messenger RNA is detected in the culture supernatant of the
souche CN655-BotR/C, comme l'illustre la figure 6. strain CN655-BotR / C, as shown in Figure 6.
Ces résultats montrent que BotR/C stimule l'expression du These results show that BotR / C stimulates the expression of
gène Tetx, mais de manière moins importante que le gène BotR/A. Tetx gene, but less important than the BotR / A gene.
EXEMPLE 3EXAMPLE 3
Activité du gène de régulation BotR/A 1) Surexpression du gène botR/A dans la souche A 62 de Activity of the BotR / A regulatory gene 1) Overexpression of the botR / A gene in strain A 62 of
C. botulinum.C. botulinum.
Le gène botR/A a été surexprimé dans C.botulinum en l'insérant sous le contrôle de son propre promoteur dans un vecteur à 1o grand nombre de copies pAT19. Le plasmide recombinant a été utilisé pour transformer la souche 62 par électroporation et a donné naissance à la souche 62-OE. Le niveau de transcription du gène botR/A dans la souche 620E est supérieur à celui obtenu dans la souche sauvage 62, comme le montrent les dosages d'ARNs messagers effectués par dot The botR / A gene was overexpressed in C.botulinum by inserting it, under the control of its own promoter, into a vector with a large number of pAT19 copies. The recombinant plasmid was used to transform strain 62 by electroporation and gave rise to strain 62-OE. The level of transcription of the botR / A gene in strain 620E is higher than that obtained in wild strain 62, as shown by the assays of messenger RNAs carried out by dot
blot avec le gène botR/A marqué par du 32p. blot with the botR / A gene labeled with 32p.
La toxicité du surnageant de culture vis-à-vis des souris durant la phase de croissance de la souche sauvage et de la souche 62-OE est illustrée par la figure 9. La souche recombinante surexprimant botR/A en trans est plus léthale vis-à-vis des souris (5 à 12 fois) que la souche sauvage. L'activité léthale chez les souris est due à la présence de BoNT/A dans le surnageant de culture du sérotype A de C.botulinum. Il a en outre été montré par hybridation de type Western (figure 10) qu'il y a 16 à 32 fois plus de BoNT/A dans le surnageant de culture de la souche 62-OE que dans celui de la souche sauvage, après purification partielle The toxicity of the culture supernatant towards mice during the growth phase of the wild strain and of the 62-OE strain is illustrated in FIG. 9. The recombinant strain overexpressing botR / A in trans is more lethal towards with the mice (5 to 12 times) than the wild strain. The lethal activity in mice is due to the presence of BoNT / A in the culture supernatant of serotype A of C.botulinum. It has also been shown by Western type hybridization (FIG. 10) that there are 16 to 32 times more BoNT / A in the culture supernatant of the 62-OE strain than in that of the wild strain, after purification. partial
par précipitation par de l'acide.by acid precipitation.
Afin de déterminer si botR/A régule aussi l'expression du gène antp, des hybridations de type Western ont été effectuees sur les surnageants de culture partiellement purifiés par précipitation acide de la souche 62- OE et de la souche sauvage. Un anti-sérum dirigé à I'encontre des protéines non toxiques NTNH a permis de détecter deux bandes de tailles respectives de 106 et 13 kDa, correspondant aux protéines NTNH ayant subi une maturation. Ces bandes sont moins intenses pour la souche 62-OE que pour la souche sauvage, comme le In order to determine whether botR / A also regulates the expression of the antp gene, Western type hybridizations were carried out on the culture supernatants partially purified by acid precipitation of the strain 62-OE and of the wild strain. An antiserum directed against the non-toxic proteins NTNH made it possible to detect two bands of respective sizes of 106 and 13 kDa, corresponding to the NTNH proteins which have undergone maturation. These bands are less intense for the 62-OE strain than for the wild strain, such as
montre la figure 11.shows figure 11.
De même, I'hybridation de type Western avec des anticorps dirigés contre des composants de type hémagglutinine montre que les protéines HA34 et HA70, qui sont partiellement clivées en HA52 sont Similarly, Western-type hybridization with antibodies directed against hemagglutinin-like components shows that the proteins HA34 and HA70, which are partially cleaved in HA52 are
surproduites dans la souche 62-OE, comme l'illustre la figure 12. overproduced in strain 62-OE, as illustrated in Figure 12.
Le niveau de surproduction de HA70 et de.HA52 dans la The level of overproduction of HA70 and .HA52 in the
1o souche 62-OE est de 8 à 16 fois supérieur à celui de la protéine HA34. 1o strain 62-OE is 8 to 16 times higher than that of the HA34 protein.
Une bande faible correspondant à HA34 fusionne partiellement avec la bande immédiatement au-dessus, et est observée dans les puits 1 et 2 de l'hybridation de type Western de la souche sauvage (figure 12A) tandis que la bande HA34 est bien plus visible (figure 12B, puits 1 et 2) A weak band corresponding to HA34 partially fuses with the band immediately above, and is observed in wells 1 and 2 of the Western-type hybridization of the wild strain (FIG. 12A) while the band HA34 is much more visible ( Figure 12B, wells 1 and 2)
avec la souche 62-OE.with strain 62-OE.
Ceci montre que la surexpression de botR/A en trans est This shows that the overexpression of botR / A in trans is
responsable de la surproduction de BoNT/A et des protéines ANTPs. responsible for the overproduction of BoNT / A and ANTPs proteins.
Les taux d'ARNs messagers pour les protéines BoNT/A et ANTPs, mesurés par dot blot, sont de manière significative supérieurs 2o dans la souche 62-OE, par rapport à la souche sauvage, comme l'illustre The levels of messenger RNAs for the proteins BoNT / A and ANTPs, measured by dot blot, are significantly greater 2o in the 62-OE strain, compared to the wild strain, as illustrated
la figure 13.Figure 13.
Les niveaux d'ARNs messagers pour les protéines boNT/A, NTNH et HA70 sont 8 fois supérieurs dans la souche 62-OE par rapport à la souche sauvage 62. Ceci est cohérent avec la toxicité supérieure vis-à-vis de souris, et les niveaux supérieurs de NTNH et de HA70 The levels of messenger RNAs for the proteins boNT / A, NTNH and HA70 are 8 times higher in the strain 62-OE compared to the wild strain 62. This is consistent with the higher toxicity vis-à-vis mice, and higher levels of NTNH and HA70
détectés par immunohybridation pour la souche 62-OE. detected by immunohybridization for strain 62-OE.
2) Inhibition partielle de l'expression du gène botR/A et effet sur la 2) Partial inhibition of the expression of the botR / A gene and effect on the
production des protéines boNT/A et ANTP. production of the proteins boNT / A and ANTP.
Des ARNs messagers anti-sens ont été utilisés pour inhiber I'expression du gène botR/A. Le fragment d'ADN utilisé pour produire des ARNs messagers anti-sens (figure 8) contient le site de liaison au ribosome et les 18 premiers codons du gène botR/A, et ne forme aucune Anti-sense messenger RNAs have been used to inhibit the expression of the botR / A gene. The DNA fragment used to produce antisense messenger RNAs (Figure 8) contains the ribosome binding site and the first 18 codons of the botR / A gene, and does not form any
structure secondaire.secondary structure.
La toxicité du surnageant de culture de la souche 62-AS qui 1o contient le plasmide pMRP306 est 4 à 10 fois inférieure a celle de la souche sauvage. Cette diminution de la toxicité est plus significative dans l'étape précoce de culture (figure 9). L'inhibition du gène boNT/A est aussi observée dans la souche 62-AS par immunohybridation The toxicity of the culture supernatant of strain 62-AS which 1o contains the plasmid pMRP306 is 4 to 10 times lower than that of the wild strain. This decrease in toxicity is more significant in the early culture stage (Figure 9). Inhibition of the boNT / A gene is also observed in strain 62-AS by immunohybridization
comme l'illustre la figure 10.as shown in Figure 10.
Des niveaux inférieurs de NTNH et de HA35 ont été mesurés dans la souche 62-AS (figures 11 et 12). Cependant, la diminution en HA70 et HA52 est moins marquée. Les tests de détection par dot blot des ARNs messagers montrent que la transcription des gènes boNT/A et antp est partiellement inhibée (d'un facteur 4 à 16), comme le montre la Lower levels of NTNH and HA35 were measured in strain 62-AS (Figures 11 and 12). However, the decrease in HA70 and HA52 is less marked. The dot blot detection tests for messenger RNAs show that the transcription of the boNT / A and antp genes is partially inhibited (by a factor of 4 to 16), as shown in
figure 13.figure 13.
3) Liaison du gène BotR/A et de la région promotrice des gènes 3) Linkage of the BotR / A gene and the promoter region of the genes
ntnh et ha34.ntnh and ha34.
Dans les toxinotypes A de C.botulinum, les complexes géniques codant pour la toxine botulique sont organisés en deux opérons polycistroniques, comme l'illustre la figure 7. Les régions promotrices des gènes ntnh- bont/A et ha34 présentent des séquences à In the toxinotypes A of C.botulinum, the gene complexes coding for the botulinum toxin are organized into two polycistronic operons, as illustrated in FIG. 7. The promoter regions of the ntnh- bont / A and ha34 genes have sequences with
-35 et à -10 conservées en amont de chaque opéron. -35 and -10 kept upstream of each operon.
Comme BotR/A active l'expression des deux opérons, la protéine pourrait directement interagir avec les régions promotrices des As BotR / A activates the expression of the two operons, the protein could directly interact with the promoter regions of
gènes ntnh-bont/A et ha34, régulant ainsi leur transcription. ntnh-bont / A and ha34 genes, thereby regulating their transcription.
Afin de mettre en évidence ce processus, des expériences de retardement de la mobilité sur gel ont été effectuées avec BotR/A surproduite dans la souche 62-OE et des fragments d'ADN In order to demonstrate this process, gel mobility retardation experiments were carried out with overproduced BotR / A in strain 62-OE and DNA fragments.
correspondant aux régions promotrices des gènes nt-nh et ha34. corresponding to the promoter regions of the nt-nh and ha34 genes.
L'extrait cellulaire de la souche 62-OE surexprimant le gène botR/A Cell extract of strain 62-OE overexpressing the botR / A gene
retarde le fragment d'ADN du promoteur de ntnh (figure 14A) et de ha34. retards the DNA fragment from the promoter of ntnh (Figure 14A) and ha34.
La spécificité de ce test a été mise en évidence par compétition avec de The specificity of this test was demonstrated by competition with
l'ADN non marqué (figure 14A).unlabeled DNA (Figure 14A).
De plus, des anticorps polyclonaux anti-BotR/C, qui reconnaissent seulement BotR/A dans l'extrait cellulaire du toxinotype A de C. botulinum (figure 14B) ont été utilisés pour confirmer la spécificité i des effets de BotR/A dans l'extrait cellulaire de la souche 62-OE. Une augmentation de la mobilité a été observée quand l'ADN marqué et l'extrait de 62-OE ont été incubés en présence d'anticorps anti-BotR/C (figure 14A, puits 4), tandis que les anticorps dirigés à l'encontre d'un extrait de Clostridium n'induisent aucun retard dans la mobilité de l'ADN In addition, anti-BotR / C polyclonal antibodies, which recognize only BotR / A in the cell extract of toxinotype A of C. botulinum (Figure 14B) were used to confirm the specificity of the effects of BotR / A in cell extract of strain 62-OE. An increase in mobility was observed when the labeled DNA and the 62-OE extract were incubated in the presence of anti-BotR / C antibodies (FIG. 14A, well 4), while the antibodies directed to the against a Clostridium extract do not cause any delay in DNA mobility
2o marqué.2o marked.
Des expériences additionnelles montrant la liaison de BotR/A avec l'ADN du promoteur ont été effectuées par immunoprécipitation en utilisant des anticorps immunopurifiés spécifiques de BotR/C qui réagissent de manière croisée avec BotR/A. Une co-immunoprécipitation de botR/A et des fragments d'ADN correspondant aux régions promotrices de ntnh et de ha34 a été observée, tandis qu'un fragment d'ADN de taille similaire à celle de la région codant pour bont/A n'a pas été immunoprécipité dans les mêmes conditions, comme l'illustre la Additional experiments showing the binding of BotR / A with promoter DNA were performed by immunoprecipitation using immunopurified antibodies specific for BotR / C which cross-react with BotR / A. Co-immunoprecipitation of botR / A and DNA fragments corresponding to the promoter regions of ntnh and ha34 was observed, while a DNA fragment of size similar to that of the region coding for good / A n ' has not been immunoprecipitated under the same conditions, as illustrated by
figure 15.figure 15.
EXEMPLE 4EXAMPLE 4
Construction d'un plasmide pour l'expression du fragment C de la Construction of a plasmid for the expression of fragment C of the
toxine tétanique.tetanus toxin.
La séquence nucléotidique correspondant au fragment C terminal de la toxine tétanique a déjà été clonée et utilisée dans des bactéries Figueiredo et al., (1995, Infect. Immun., 63, 3218-3221; Clare The nucleotide sequence corresponding to the terminal fragment C of the tetanus toxin has already been cloned and used in bacteria Figueiredo et al., (1995, Infect. Immun., 63, 3218-3221; Clare
et al., 1991, Biotechnology, 9, 455-460). et al., 1991, Biotechnology, 9, 455-460).
o0 La construction d'un plasmide permettant l'expression de ce fragment C dans C.tetani peut être effectuée par le procédé comprenant les étapes suivantes: - Amplification de la région promotrice du gène de la toxine tétanique (140 nucléotides en amont du codon ATG du gène de la toxine tétanique) en générant un site Sphl en partie 5' et les sites Ncol-Pstl en o0 The construction of a plasmid allowing the expression of this fragment C in C.tetani can be carried out by the process comprising the following steps: - Amplification of the promoter region of the tetanus toxin gene (140 nucleotides upstream of the ATG codon of the tetanus toxin gene) by generating a Sphl site in part 5 ′ and the Ncol-Pstl sites in
partie 3' dont Ncol correspondant à l'ATG initial. part 3 'including Ncol corresponding to the initial ATG.
- Clonage du fragment Sphl-Pstl dans les sites correspondant du polylinker du vecteur pJIR750 (marqueur de sélection: chloramphénicol). Amplification par PCR de la partie 3' du gène de la toxine tétanique codant pour la partie C-terminale (50 kDa) de la toxine tétanique et les 250 nucléotides non codant en aval du codon stop de ce gène, en générant un site Ncol en partie 5' et en phase avec la - Cloning of the Sphl-Pstl fragment into the corresponding sites of the polylinker of the vector pJIR750 (selection marker: chloramphenicol). Amplification by PCR of the 3 'part of the tetanus toxin gene coding for the C-terminal part (50 kDa) of the tetanus toxin and the 250 non-coding nucleotides downstream of the stop codon of this gene, by generating an Ncol site in part 5 'and in line with the
séquence codante, et un site Pstl en partie 3'. coding sequence, and a PstI site in part 3 '.
- Clonage du fragment Ncol-Pstl dans les sites correspondant - Cloning of the Ncol-Pstl fragment in the corresponding sites
du plasmide recombinant pMRP365.of the recombinant plasmid pMRP365.
* - Transformation par électroporation d'une souche de C. tetani ayant perdu son plasmide de grande taille portant le gène de la toxine tétanique et de ce fait non toxinogène, avec le plasmide pMRP365 ou le* - Transformation by electroporation of a strain of C. tetani having lost its large plasmid carrying the tetanus toxin gene and therefore non-toxinogenic, with the plasmid pMRP365 or the
plasmide équivalent avec tetR sous contrôle de son propre promoteur. equivalent plasmid with tetR under the control of its own promoter.
Sélection des transformants en chambre anaérobie sur des boîtes d'érythromycine (10 mg/ml). Repiquage d'un clone transformant et Selection of transformants in an anaerobic chamber on erythromycin boxes (10 mg / ml). Transplanting a transforming clone and
vérification de son contenu en plasmide recombinant. verification of its recombinant plasmid content.
- Transformation du clone obtenu avec le plasmide contenant le gène du fragment C et sélection en chambre anaérobie sur boites de Pétri contenant de l'érythromycine (10 mg/ml) et du chloramphénicol (20 mg/ml). Repiquage d'un transformant et vérification de son contenu en - Transformation of the clone obtained with the plasmid containing the gene for fragment C and selection in an anaerobic chamber on Petri dishes containing erythromycin (10 mg / ml) and chloramphenicol (20 mg / ml). Transplanting a transformant and checking its content in
plasmides recombinants.recombinant plasmids.
- Contrôle de la production du fragment C par électrophorèse en gel de polyacrylamide et Western blot avec des anticorps anti toxine - Control of the production of fragment C by electrophoresis in polyacrylamide gel and Western blot with anti-toxin antibodies
tétanique à partir du surnageant de culture de la souche recombinante. tetanus from the culture supernatant of the recombinant strain.
LISTE DE SEQUENCESLIST OF SEQUENCES
(1) INFORMATIONS GENERALES:(1) GENERAL INFORMATION:
(i) DEPOSANT:(i) DEPOSITOR:
(A) NOM: INSTITUT PASTEUR(A) NAME: INSTITUT PASTEUR
(B) RUE: 25 RUE DU DOCTEUR ROUX(B) STREET: 25 RUE DU DOCTEUR ROUX
(C) VILLE: PARIS(C) CITY: PARIS
(E) PAYS: FRANCE(E) COUNTRY: FRANCE
(F) CODE POSTAL: 75015(F) POSTAL CODE: 75015
(ii) TITRE DE L' INVENTION: SEQUENCES (iii) NOMBRE DE SEQUENCES: 17 (iv) FORME DECHIFFRABLE PAR ORDINATEUR: (A) TYPE DE SUPPORT: Floppy disk (B) ORDINATEUR: IBM PC compatible (ii) TITLE OF THE INVENTION: SEQUENCES (iii) NUMBER OF SEQUENCES: 17 (iv) FORM DETERMINABLE BY COMPUTER: (A) TYPE OF MEDIUM: Floppy disk (B) COMPUTER: IBM PC compatible
(C) SYSTEME D' EXPLOITATION: PC-DOS/MS-DOS (C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS / MS-DOS
(D) LOGICIEL: PatentIn Release #1.0, Version #1.30 (OEB) (D) SOFTWARE: PatentIn Release # 1.0, Version # 1.30 (EPO)
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 1: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 1:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 916 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: double (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (ix) CARACTERISTIQUE: (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 916 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: double (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (gnomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO (ix) CHARACTERISTIC:
(A) NOM/CLE: CDS(A) NAME / KEY: CDS
(B) EMPLACEMENT:141..678(B) LOCATION: 141..678
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 1: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 1:
AACTATATTA ATATACACAT CCTCGGTAAT ATATCAATAC AATACATGTA ATTAATAATG 60 AACTATATTA ATATACACAT CCTCGGTAAT ATATCAATAC AATACATGTA ATTAATAATG 60
TTTTTTGTAA AAGTTTAAGC TTAGTGGTTT ACTTTCAAAA TATAATAAAA CGTTAATTAT 120 TTTTTTGTAA AAGTTTAAGC TTAGTGGTTT ACTTTCAAAA TATAATAAAA CGTTAATTAT 120
AGAAAAGTGA AAGTAAGGTG ATG CTT ATG GAA AAT CTA TTT GTA AAA ATT 170 AGAAAAGTGA AAGTAAGGTG ATG CTT ATG GAA AAT CTA TTT GTA AAA ATT 170
Met Leu Met Glu Asn Leu Phe Val Lys Ile Met Leu Met Glu Asn Leu Phe Val Lys Ile
1 5 101 5 10
AAG ACA TTA AAA AAT AAT AAT AAA GAA TTT GAA GTA ATT ATT ATA CAT 218 AAG ACA TTA AAA AAT AAT AAT AAA GAA TTT GAA GTA ATT ATT ATA CAT 218
Lys Thr Leu Lys Asn Asn Asn Lys Glu Phe Glu Val Ile Ile Ile His Lys Thr Leu Lys Asn Asn Asn Lys Glu Phe Glu Val Ile Ile Ile His
20. 2520. 25
TTC AAA AAT ACT GTA AAT ATA CTT ATT CGA AAG TAT AAT TTA GAA AGT 266 TTC AAA AAT ACT GTA AAT ATA CTT ATT CGA AAG TAT AAT TTA GAA AGT 266
Phe Lys Asn Thr Val Asn Ile Leu Ile Arg-Lys Tyr Asn Leu Glu Ser Phe Lys Asn Thr Val Asn Ile Leu Ile Arg-Lys Tyr Asn Leu Glu Ser
35 4035 40
CAT TAT AAT GAT ATC TTA TAT CAT TTA TGG AAT ATA CTT AAA AAA ATT 314 CAT TAT AAT GAT ATC TTA TAT CAT TTA TGG AAT ATA CTT AAA AAA ATT 314
His Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr His Leu Trp Asn Ile Leu Lys Lys Ile His Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr His Leu Trp Asn Ile Leu Lys Lys Ile
50 5550 55
GAT TTG AAT AAA TTT AAT ACA GAA AAT GAT TTA CAC AAA TAT ATT AGT 362 GAT TTG AAT AAA TTT AAT ACA GAA AAT GAT TTA CAC AAA TAT ATT AGT 362
Asp Leu Asn Lys Phe Asn Thr Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr Ile Ser Asp Leu Asn Lys Phe Asn Thr Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr Ile Ser
65 7065 70
AGA TCT TTA AAA AGA TAT TGC TTA GAT ATT TGT AAT AAA AAA AAT AGG 410 AGA TCT TTA AAA AGA TAT TGC TTA GAT ATT TGT AAT AAA AAA AAT AGG 410
Arg Ser Leu Lys Arg Tyr Cys Leu Asp Ile Cys Asn Lys Lys Asn Arg Arg Ser Leu Lys Arg Tyr Cys Leu Asp Ile Cys Asn Lys Lys Asn Arg
80 85 9080 85 90
GAT AAA AAA ATA ATA TAT AAC TCA GAA ATT ACA AAT ATA AAA TTA AAT 458 GAT AAA AAA ATA ATA TAT AAC TCA GAA ATT ACA AAT ATA AAA TTA AAT 458
Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Asn Ser Glu Ile Thr Asn Ile Lys Leu Asn Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Asn Ser Glu Ile Thr Asn Ile Lys Leu Asn
100 105100 105
TTA ATG GAA AAT AGT TGC TCA AAT TAT TTA AAC TTC GAA TTT AAT GAT 506 TTA ATG GAA AAT AGT TGC TCA AAT TAT TTA AAC TTC GAA TTT AAT GAT 506
Leu Met Glu Asn Ser Cys Ser Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu Met Glu Asn Ser Cys Ser Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp
115 120115 120
TTA ATA TCC ATA TTA CCT GAA AAT CAA AGA AAA ATT TTA TAT ATG AAA 554 TTA ATA TCC ATA TTA CCT GAA AAT CAA AGA AAA ATT TTA TAT ATG AAA 554
Leu Ile Ser Ile Leu Pro Glu Asn Gln Arg Lys Ile Leu Tyr Met Lys Leu Ile Ser Ile Leu Pro Glu Asn Gln Arg Lys Ile Leu Tyr Met Lys
130 135130 135
TTT TTT GAA TAT ATG AAA GAA TGT GAT ATA GCT AAG CTT CAT ATG AGT 602 TTT TTT GAA TAT ATG AAA GAA TGT GAT ATA GCT AAG CTT CAT ATG AGT 602
Phe Phe Glu Tyr Met Lys Glu Cys Asp Ile Ala Lys Leu His Met Ser Phe Phe Glu Tyr Met Lys Glu Cys Asp Ile Ala Lys Leu His Met Ser
145 150145 150
CGT CAA GCT GTA TAT AAA AAT AAG GTT TTA GCA TTA AAA AAA TTA GAA 650 CGT CAA GCT GTA TAT AAA AAT AAG GTT TTA GCA TTA AAA AAA TTA GAA 650
Arg Gln Ala Val Tyr Lys Asn Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Arg Gln Ala Val Tyr Lys Asn Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu
160 165 170160 165 170
CCT ATA GTA AAT AAA TTA ATT AAT ATA T AGTTTTTATA ATTTAATTAT 698 CCT ATA GTA AAT AAA TTA ATT AAT ATA T AGTTTTTATA ATTTAATTAT 698
Pro Ile Val _Asn Lys Leu Ile Asn Ile Pro Ile Val _Asn Lys Leu Ile Asn Ile
GAATAATATT CTTAAGATAA AAAGTAAATT TTTAAAAAAT TTAAATTTTC AGTTTACAAA 758 GAATAATATT CTTAAGATAA AAAGTAAATT TTTAAAAAAT TTAAATTTTC AGTTTACAAA 758
AAATAACCTG ATTATGTTAT ATGTAATTGT AAAAAACATA TAAAAAATCA GAAAAATTTA 818 AAATAACCTG ATTATGTTAT ATGTAATTGT AAAAAACATA TAAAAAATCA GAAAAATTTA 818
GGAGGTATAT TATTAATGGA TTAAATAATA ATTTTTTAAT TTACTTTTGA TTAATAAATA 878 GGAGGTATAT TATTAATGGA TTAAATAATA ATTTTTTAAT TTACTTTTGA TTAATAAATA 878
TTAAATGTTT ATTTTAATTA GGAGATGATA CGTATGCC 916 TTAAATGTTT ATTTTAATTA GGAGATGATA CGTATGCC 916
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 2: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 179 acides amins (B) TYPE: acide amin (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: protine (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 179 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: protein
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 2: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 2:
Met Leu Met Glu Asn Leu Phe Val Lys Ile Lys Thr Leu Lys Asn Asn Met Leu Met Glu Asn Leu Phe Val Lys Ile Lys Thr Leu Lys Asn Asn
1 5 10 151 5 10 15
Asn Lys Glu Phe Glu Val Ile Ile Ile His Phe Lys Asn Thr Val Asn Asn Lys Glu Phe Glu Val Ile Ile Ile His Phe Lys Asn Thr Val Asn
25 3025 30
Ile Leu Ile Arg Lys Tyr Asn Leu Glu Ser His Tyr Asn Asp Ile Leu Ile Leu Ile Arg Lys Tyr Asn Leu Glu Ser His Tyr Asn Asp Ile Leu
40 4540 45
Tyr His Leu Trp Asn Ile Leu Lys Lys Ile Asp Leu Asn Lys Phe Asn Tyr His Leu Trp Asn Ile Leu Lys Lys Ile Asp Leu Asn Lys Phe Asn
55 6055 60
Thr Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr Ile Ser Arg Ser Leu Lys Arg Tyr Thr Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr Ile Ser Arg Ser Leu Lys Arg Tyr
70 75 8070 75 80
Cys Leu Asp Ile Cys Asn Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Cys Leu Asp Ile Cys Asn Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Tyr Island
90 9590 95
Asn Ser Glu Ile Thr Asn Ile Lys Leu Asn Leu Met Glu Asn Ser Cys Asn Ser Glu Ile Thr Asn Ile Lys Leu Asn Leu Met Glu Asn Ser Cys
105 110105 110
Ser Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Pro Ser Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Pro
120 125120 125
Glu Asn Gln Arg Lys Ile Leu Tyr Met Lys Phe Phe Glu Tyr Met Lys Glu Asn Gln Arg Lys Ile Leu Tyr Met Lys Phe Phe Glu Tyr Met Lys
135 140135 140
Glu Cys Asp Ile Ala Lys Leu His Met Ser Arg Gln Ala Val Tyr Lys Glu Cys Asp Ile Ala Lys Leu His Met Ser Arg Gln Ala Val Tyr Lys
150 155 160150 155 160
Asn Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Pro Ile Val Asn Lys Leu Asn Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Pro Ile Val Asn Lys Leu
170 175170 175
Ile Asn IleIle Asn Ile
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 3: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 3:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 30 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 30 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 3: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 3:
CCATGGTTAT GGAAAATCTA TTTGTAAAAA 30CCATGGTTAT GGAAAATCTA TTTGTAAAAA 30
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 4: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 4:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 36 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 36 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 4: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 4:
CTGCAGCTAT ATATTAATTA ATTTATTTAC TATAGG 36 CTGCAGCTAT ATATTAATTA ATTTATTTAC TATAGG 36
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 5: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 5:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 28 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 28 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 5: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 5:
CATATGAATG ATTTATTTTA TGCTATAG 28CATATGAATG ATTTATTTTA TGCTATAG 28
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 6: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 6:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 30 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 30 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 6: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 6:
CTGCAGTCAA ATATTAACTA ATTGCATTAC 30CTGCAGTCAA ATATTAACTA ATTGCATTAC 30
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 7: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 7:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 24 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 24 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ'ID NO: 7: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ'ID NO: 7:
CAACATTTTT ATTATCTACC GGGG 24CAACATTTTT ATTATCTACC GGGG 24
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 8: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 8:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 24 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ARN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 24 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: RNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 8: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 8:
GGTAGAAAAG TTCTTTCAAC TGAC 24GGTAGAAAAG TTCTTTCAAC TGAC 24
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 9: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 9:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 26 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 26 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 9: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 9:
GGTTTACAAA AAATAGTGTG GCTATG 26GGTTTACAAA AAATAGTGTG GCTATG 26
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 10: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 10:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 24 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 24 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 10: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 10:
CATTATGATT CCTCCTTTAT TTAA 24CATTATGATT CCTCCTTTAT TTAA 24
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 11: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 11:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 23 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 23 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 11: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 11:
ATTTTAGGTT TACAAAAAAT AAC 23ATTTTAGGTT TACAAAAAAT AAC 23
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 12: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 12:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 1016 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: double (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (ix) CARACTERISTIQUE: (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 1016 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: double (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO (ix) CHARACTERISTIC:
(A) NOM/CLE: CDS(A) NAME / KEY: CDS
(B) EMPLACEMENT:233..769(B) LOCATION: 233..769
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 12: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 12:
AAGCTTATTT TACATTAAAT TACTTTTATT GATAAAAATA TATTTTTTGT ATTTATATAG 60 AAGCTTATTT TACATTAAAT TACTTTTATT GATAAAAATA TATTTTTTGT ATTTATATAG 60
AGATTTTCTT TGTCATATAC TGTATAATAT TTATATAATA TTAATACATA ATATTATAAC 120 AGATTTTCTT TGTCATATAC TGTATAATAT TTATATAATA TTAATACATA ATATTATAAC 120
TAAATTCAAA ATAGAAAGGA GGTTATCTTA TGTTAAAAAG AAAAATTTAA AATACTATTT 180 TAAATTCAAA ATAGAAAGGA GGTTATCTTA TGTTAAAAAG AAAAATTTAA AATACTATTT 180
TCATTATTTG AAGATTGAAT CTTAAATAAA CTTGAATTAG GAGGGAGTAC CC ATG 235 TCATTATTTG AAGATTGAAT CTTAAATAAA CTTGAATTAG GAGGGAGTAC CC ATG 235
MetMet
GTT ATG GAA AAT CTA TTT GTA AAA ATT AAG ACA TTA AAA AAT AAT AAT 283 GTT ATG GAA AAT CTA TTT GTA AAA ATT AAG ACA TTA AAA AAT AAT AAT 283
Val Met Glu Asn Leu Phe Val Lys Ile Lys Thr Leu Lys Asn Asn Asn Val Met Glu Asn Leu Phe Val Lys Ile Lys Thr Leu Lys Asn Asn Asn
190 195190 195
AAA GAA TTT GAA GTA ATT ATT ATA CAT TTC AAA AAT ACT GTA AAT ATA 331 AAA GAA TTT GAA GTA ATT ATT ATA CAT TTC AAA AAT ACT GTA AAT ATA 331
Lys Glu Phe Glu Val Ile Ile Ile His Phe Lys Asn Thr Val Asn Ile Lys Glu Phe Glu Val Ile Ile Ile His Phe Lys Asn Thr Val Asn Ile
205 210205 210
CTT ATT CGA AAG TAT AAT TTA GAA AGT CAT TAT AAT GAT ATC TTA TAT 379 CTT ATT CGA AAG TAT AAT TTA GAA AGT CAT TAT AAT GAT ATC TTA TAT 379
Leu Ile Arg Lys Tyr Asn Leu Glu Ser His Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr Leu Ile Arg Lys Tyr Asn Leu Glu Ser His Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr
215 220 225215 220 225
CAT TTA TGG AAT ATA CTT AAA AAA ATT GAT TTG AAT AAA TTT AAT ACA 427 CAT TTA TGG AAT ATA CTT AAA AAA ATT GAT TTG AAT AAA TTT AAT ACA 427
His Leu Trp Asn Ile Leu Lys Lys Ile Asp Leu Asn Lys Phe Asn Thr His Leu Trp Asn Ile Leu Lys Lys Ile Asp Leu Asn Lys Phe Asn Thr
230 235 240230 235 240
GAA AAT GAT TTA CAC AAA TAT ATT AGT AGA TCT TTA AAA AGA TAT TGC 475 GAA AAT GAT TTA CAC AAA TAT ATT AGT AGA TCT TTA AAA AGA TAT TGC 475
Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr Ile Ser Arg Ser Leu Lys Arg Tyr Cys Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr Ile Ser Arg Ser Leu Lys Arg Tyr Cys
245 250 255 260245 250 255 260
TTA GAT ATT TGT AAT AAA AAA AAT AGG GAT AAA AAA ATA ATA TAT AAC 523 TTA GAT ATT TGT AAT AAA AAA AAT AGG GAT AAA AAA ATA ATA TAT AAC 523
Leu Asp Ile Cys Asn Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Asn Leu Asp Ile Cys Asn Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Tyr Island Asn
265 270 275265,270,275
TCA GAA ATT ACA AAT ATA AAA TTA AAT TTA ATG GAA AAT AGT TGC TCA 571 TCA GAA ATT ACA AAT ATA AAA TTA AAT TTA ATG GAA AAT AGT TGC TCA 571
Ser Glu Ile Thr Asn Ile Lys Leu Asn Leu Met Glu Asn Ser Cys Ser Ser Glu Island Thr Asn Ile Lys Leu Asn Leu Met Glu Asn Ser Cys Ser
280 285 290280 285 290
AAT TAT TTA AAC TTC GAA TTT AAT GAT TTA ATA TCC ATA TTA CCT GAA 619 AAT TAT TTA AAC TTC GAA TTT AAT GAT TTA ATA TCC ATA TTA CCT GAA 619
Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Pro Glu Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Pro Glu
295 300 305295,300,305
AAT CAA AGA AAA ATT TTA TAT ATG AAA TTT TTT GAA TAT ATG AAA GAA 667 AAT CAA AGA AAA ATT TTA TAT ATG AAA TTT TTT GAA TAT ATG AAA GAA 667
Asn Gln Arg Lys Ile Leu Tyr Met Lys Phe Phe Glu Tyr Met Lys Glu Asn Gln Arg Lys Ile Leu Tyr Met Lys Phe Phe Glu Tyr Met Lys Glu
310 315 320310 315 320
TGT GAT ATA GCT AAG CTT CAT ATG AGT CGT CAA GCT GTA TAT AAA AAT 715 TGT GAT ATA GCT AAG CTT CAT ATG AGT CGT CAA GCT GTA TAT AAA AAT 715
Cys Asp Ile Ala Lys Leu His Met Ser Arg Gln Ala Val Tyr Lys Asn Cys Asp Ile Ala Lys Leu His Met Ser Arg Gln Ala Val Tyr Lys Asn
325 330 335 340325 330 335 340
AAG GTT TTA GCA TTA AAA AAA TTA GAA CCT ATA GTA AAT AAA TTA ATT 763 AAG GTT TTA GCA TTA AAA AAA TTA GAA CCT ATA GTA AAT AAA TTA ATT 763
Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Pro Ile Val Asn Lys Leu Ile Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Pro Ile Val Asn Lys Leu Ile
345 350 355345 350 355
AAT ATC TGCAGATAAA AATTATATTT AAAATTATTA ATAAATATCA AAATTAATAA 819 AAT ATC TGCAGATAAA AATTATATTT AAAATTATTA ATAAATATCA AAATTAATAA 819
Asn IleAsn Ile
AGCTAGTTAT TCATACTGGC TACCTATATA AATATTTCTC GATTACTTAC AGAGGATGTC 879 AGCTAGTTAT TCATACTGGC TACCTATATA AATATTTCTC GATTACTTAC AGAGGATGTC 879
AATAATTTTG TGTAAACTAT CTAAAGAAAT ATATTGAAAT TTGTTGAGGT TTAGATAATA 939 AATAATTTTG TGTAAACTAT CTAAAGAAAT ATATTGAAAT TTGTTGAGGT TTAGATAATA 939
TTTTATTTAA ACCTTAATTT TCTTTTTATG TAATTATAGT GAATATAAAT TGTACAAAAA 999 TTTTATTTAA ACCTTAATTT TCTTTTTATG TAATTATAGT GAATATAAAT TGTACAAAAA 999
CTAGAGATAT TTCTAGA 1016CTAGAGATAT TTCTAGA 1016
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 13: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 13:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 179 acides amins (B) TYPE: acide amin (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 179 amino acids (B) TYPE: amino acid
(D) CONFIGURATION: linaire -(D) CONFIGURATION: linear -
(ii) TYPE DE MOLECULE: protine(ii) TYPE OF MOLECULE: protein
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 13: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 13:
Met Val Met Glu Asn Leu Phe Val Lys Ile Lys Thr Leu Lys Asn Asn Met Val Met Glu Asn Leu Phe Val Lys Ile Lys Thr Leu Lys Asn Asn
1 5 10 151 5 10 15
Asn Lys Glu Phe Glu Val Ile le e Ile His Phe Lys Asn Thr Val Asn Asn Lys Glu Phe Glu Val Ile le e Ile His Phe Lys Asn Thr Val Asn
25 3025 30
Ile Leu Ile Arg Lys Tyr Asn Leu Glu Ser His Tyr Asn Asp Ile Leu Ile Leu Ile Arg Lys Tyr Asn Leu Glu Ser His Tyr Asn Asp Ile Leu
40 4540 45
Tyr His Leu Trp Asn Ile Leu Lys Lys Ile Asp Leu Asn Lys Phe Asn Tyr His Leu Trp Asn Ile Leu Lys Lys Ile Asp Leu Asn Lys Phe Asn
55 6055 60
Thr Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr Ile Ser Arg Ser Leu Lys Arg Tyr Thr Glu Asn Asp Leu His Lys Tyr Ile Ser Arg Ser Leu Lys Arg Tyr
70 75 8070 75 80
Cys Leu Asp Ile Cys Asn Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Cys Leu Asp Ile Cys Asn Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Tyr Island
90 9590 95
Asn Ser Glu Ile Thr Asn Ile Lys Leu Asn Leu Met Glu Asn Ser Cys Asn Ser Glu Ile Thr Asn Ile Lys Leu Asn Leu Met Glu Asn Ser Cys
105 110105 110
Ser Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Pro Ser Asn Tyr Leu Asn Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Pro
120 125120 125
Glu Asn Gln Arg Lys Ile Leu Tyr Met Lys Phe Phe Glu Tyr Met Lys Glu Asn Gln Arg Lys Ile Leu Tyr Met Lys Phe Phe Glu Tyr Met Lys
135 140135 140
Glu Cys Asp Ile Ala Lys Leu His Met Ser Arg Gln Ala Val Tyr Lys Glu Cys Asp Ile Ala Lys Leu His Met Ser Arg Gln Ala Val Tyr Lys
150 155 160150 155 160
Asn Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Pro Ile Val Asn Lys Leu Asn Lys Val Leu Ala Leu Lys Lys Leu Glu Pro Ile Val Asn Lys Leu
170 175170 175
Ile Asn IleIle Asn Ile
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 14: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 14:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 1078 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: double (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (ix) CARACTERISTIQUE: (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 1078 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: double (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO (ix) CHARACTERISTIC:
(A) NOM/CLE: CDS(A) NAME / KEY: CDS
(B) EMPLACEMENT:291..828(B) LOCATION: 291..828
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 14: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 14:
AAGCTTATTT TACATTAAAT TACTTTTATT GATAAAAATA TATTTTTTGT ATTTATATAG 60 AAGCTTATTT TACATTAAAT TACTTTTATT GATAAAAATA TATTTTTTGT ATTTATATAG 60
AGATTTTCTT TGTCATATAC TGTATAATAT TTATATAATA TTAATACATA ATATTATAAC 120 AGATTTTCTT TGTCATATAC TGTATAATAT TTATATAATA TTAATACATA ATATTATAAC 120
TAAATTCAAA ATAGAAAGGA GGTTATCTTA TGTTAAAAAG AAAAATTTAA AATATATTTT 180 TAAATTCAAA ATAGAAAGGA GGTTATCTTA TGTTAAAAAG AAAAATTTAA AATATATTTT 180
CATTATTTGA AGATTGAATC TTAAATAAAC TTGAATTAGG AGGGAGTACC ATGGGCAGCA 240 CATTATTTGA AGATTGAATC TTAAATAAAC TTGAATTAGG AGGGAGTACC ATGGGCAGCA 240
GCCATCATCA TCATCATCAC AGCAGCGGCC TGGTGCCGCG CGGCAGCCAT ATG AAT 296 GCCATCATCA TCATCATCAC AGCAGCGGCC TGGTGCCGCG CGGCAGCCAT ATG AAT 296
Met AsnMet asn
GAT TTA TTT TAT GCT ATA GAA AAT TTA AAG CAT GAT AAC CAG CAC TTT 344 GAT TTA TTT TAT GCT ATA GAA AAT TTA AAG CAT GAT AAC CAG CAC TTT 344
Asp Leu Phe Tyr Ala Ile Glu Asn Leu Lys His Asp Asn Gln His Phe Asp Leu Phe Tyr Ala Ile Glu Asn Leu Lys His Asp Asn Gln His Phe
190 195190 195
AAC TTT ATT GAA ATG TCT CTA AAA AAA TAT ATT GAA AAA ACT TCT AAA 392 AAC TTT ATT GAA ATG TCT CTA AAA AAA TAT ATT GAA AAA ACT TCT AAA 392
Asn Phe Ile Glu Met Ser Leu Lys Lys Tyr Ile Glu Lys Thr Ser Lys Asn Phe Ile Glu Met Ser Leu Lys Lys Tyr Ile Glu Lys Thr Ser Lys
205 210205 210
AAG TAT AAT TTA TAT TAT GAT TAT TAT AAT GAT ATA CTG TAT CAT TTA 440 AAG TAT AAT TTA TAT TAT GAT TAT TAT AAT GAT ATA CTG TAT CAT TTA 440
Lys Tyr Asn Leu Tyr Tyr Asp Tyr Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr His.Leu Lys Tyr Asn Leu Tyr Tyr Asp Asp Tyr Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr His.Leu
215 220 225215 220 225
TGG AAA GAA CTT ATT GAA ATT AAC TTA AAG AAT TTT AAT TCT GAA TTA 488 TGG AAA GAA CTT ATT GAA ATT AAC TTA AAG AAT TTT AAT TCT GAA TTA 488
Trp Lys Glu Leu Ile Glu Ile Asn Leu Lys Asn Phe Asn Ser Glu Leu Trp Lys Glu Leu Ile Glu Ile Asn Leu Lys Asn Phe Asn Ser Glu Leu
230 235 240 245230 235 240 245
GAT TTA AGA AAA TAT ATT AGT ACA AGT ATA AAA AGA TAT TGT ATA AAT 536 GAT TTA AGA AAA TAT ATT AGT ACA AGT ATA AAA AGA TAT TGT ATA AAT 536
Asp Leu Arg Lys Tyr Ile Ser Thr Ser Ile Lys Arg Tyr Cys Ile Asn Asp Leu Arg Lys Tyr Ile Ser Thr Ser Ile Lys Arg Tyr Cys Ile Asn
250 255 260250 255 260
ATT TGT AAG AAA AAA AAT AGG GAT AAG AAA ATT ATA TAT AAT TCA GAA 584 ATT TGT AAG AAA AAA AAT AGG GAT AAG AAA ATT ATA TAT AAT TCA GAA 584
Ile Cys Lys Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Asn Ser Glu Ile Cys Lys Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Asn Ser Glu
265 270 275265,270,275
GTA ACA TAT AAA AAA TTG GAT GCT GTA AAT GTT TAT TCT TTA TAT TGT 632 GTA ACA TAT AAA AAA TTG GAT GCT GTA AAT GTT TAT TCT TTA TAT TGT 632
Val Thr Tyr Lys Lys Leu Asp Ala Val Asn Val Tyr Ser Leu Tyr Cys Val Thr Tyr Lys Lys Leu Asp Ala Val Asn Val Tyr Ser Leu Tyr Cys
280 285 290280 285 290
GAT AAT TTC GAG TTT TTG GAT TTG ATA TCC ATA TTA AAC TAC AAG GAA 680 GAT AAT TTC GAG TTT TTG GAT TTG ATA TCC ATA TTA AAC TAC AAG GAA 680
Asp Asn Phe Glu Phe Leu Asp Leu Ile Ser.Ile Leu Asn Tyr Lys Glu Asp Asn Phe Glu Phe Leu Asp Leu Ile Ser.Ile Leu Asn Tyr Lys Glu
295 300 305295,300,305
AAG CAA ATT ATA TAT ATG AAA TTT TTT GAA GGT AGA AAA GAT AAT GAA 728 AAG CAA ATT ATA TAT ATG AAA TTT TTT GAA GGT AGA AAA GAT AAT GAA 728
Lys Gln Ile Ile Tyr Met Lys Phe Phe Glu Gly Arg Lys Asp Asn Glu Lys Gln Ile Tyr Island Lys Phe Phe Glu Gly Arg Lys Asp Asn Glu
310 315 320 325310 315 320 325
ATA GCT ATA AGG CTT CGT TTA AGT CGT CAA TCT ATA TAT AAG ATT AGA 776 ATA GCT ATA AGG CTT CGT TTA AGT CGT CAA TCT ATA TAT AAG ATT AGA 776
Ile Ala Ile Arg Leu Arg Leu Ser Arg Gln Ser Ile Tyr Lys Ile Arg Ile Ala Ile Arg Leu Arg Leu Ser Arg Gln Ser Tyr Lys Island Arg Island
330 335 340330 335 340
ATT ACG TCT TTA AAA AAG TTG TAT CCT ATA GTA ATG CAA TTA GTT AAT 824 ATT ACG TCT TTA AAA AAG TTG TAT CCT ATA GTA ATG CAA TTA GTT AAT 824
* Ile Thr Ser Leu Lys Lys Leu Tyr Pro Ile Val Met Gln Leu Val Asn* Ile Thr Ser Leu Lys Lys Leu Tyr Pro Ile Val Met Gln Leu Val Asn
345 350 355345 350 355
ATT T GACTGCAGAT AAAAATTATA TTTAAAATTA TTAATAAATA TCAAAATTAA 878 ATT T GACTGCAGAT AAAAATTATA TTTAAAATTA TTAATAAATA TCAAAATTAA 878
IleIsle
TAAAGCTAGT TATTCATACT GGCTACCTAT ATAAATATTT CTCGATTACT TACAGAGGAT 938 TAAAGCTAGT TATTCATACT GGCTACCTAT ATAAATATTT CTCGATTACT TACAGAGGAT 938
GTCAATAATT TTGTGTAAAC TATCTAAAGA AATATATTGA AATTTGTTGA GGTTTAGATA 998 GTCAATAATT TTGTGTAAAC TATCTAAAGA AATATATTGA AATTTGTTGA GGTTTAGATA 998
ATATTTTATT TAAACCTTAA TTTTCTTTTT ATGTAATTAT AGTGAATATA AATTGTACAA 1058 ATATTTTATT TAAACCTTAA TTTTCTTTTT ATGTAATTAT AGTGAATATA AATTGTACAA 1058
AAACTAGAGA TATTTCTAGA 1078AAACTAGAGA TATTTCTAGA 1078
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 15: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 15:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 179 acides amins (B) TYPE: acide amin (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: protine (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 179 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: protein
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 15: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 15:
Met Asn Asp Leu Phe Tyr Ala Ile Glu Asn Leu Lys His Asp Asn Gln Met Asn Asp Leu Phe Tyr Ala Ile Glu Asn Leu Lys His Asp Asn Gln
1 5 10 151 5 10 15
His Phe Asn Phe Ile Glu Met Ser Leu Lys Lys Tyr Ile Glu Lys Thr His Phe Asn Phe Ile Glu Met Ser Leu Lys Lys Tyr Ile Glu Lys Thr
25 3025 30
Ser Lys Lys Tyr Asn Leu Tyr Tyr Asp Tyr Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr Ser Lys Lys Tyr Asn Leu Tyr Tyr Asp Asp Tyr Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr
40 4540 45
His Leu Trp Lys Glu Leu Ile Glu Ile Asn Leu Lys Asn Phe Asn Ser His Leu Trp Lys Glu Leu Ile Glu Ile Asn Leu Lys Asn Phe Asn Ser
55 6055 60
Glu Leu Asp Leu Arg Lys Tyr Ile Ser Thr Ser Ile Lys Arg Tyr Cys Glu Leu Asp Leu Arg Lys Tyr Ile Ser Thr Ser Ile Lys Arg Tyr Cys
70 75 8070 75 80
Ile Asn Ile Cys Lys Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Asn Ile Asn Ile Cys Lys Lys Lys Asn Arg Asp Lys Lys Ile Tyr Island Asn
90 9590 95
Ser Glu Val Thr Tyr Lys Lys Leu Asp Ala Val Asn Val Tyr Ser Leu Ser Glu Val Thr Tyr Lys Lys Leu Asp Ala Val Asn Val Tyr Ser Leu
105 110105 110
Tyr Cys Asp Asn Phe Glu Phe Leu Asp Leu Ile Ser Ile Leu Asn Tyr Tyr Cys Asp Asn Phe Glu Phe Leu Asp Leu Ile Ser Ile Leu Asn Tyr
120 125120 125
Lys Glu Lys Gln Ile Ile Tyr Met Lys Phe Phe Glu Gly Arg Lys Asp Lys Glu Lys Gln Ile Ile Tyr Met Lys Phe Phe Glu Gly Arg Lys Asp
135 140135 140
Asn Glu Ile Ala Ile Arg Leu Arg Leu Ser Arg Gln Ser Ile Tyr Lys Asn Glu Ile Ala Ile Arg Leu Arg Leu Ser Arg Gln Ser Ile Tyr Lys
150 155 160150 155 160
Ile Arg Ile Thr Ser Leu Lys Lys Leu Tyr Pro Ile Val Met Gln Leu Ile Arg Ile Thr Ser Leu Lys Lys Leu Tyr Pro Ile Val Met Gln Leu
170 175170 175
Val Asn IleVal Asn Ile
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 16: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 16:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 1361 paires de bases (B) TYPE: nuclotide (C) NOMBRE DE BRINS: double (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (gnomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (ix)CARACTERISTIQUE: (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 1361 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: double (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (gnomic) (iii ) HYPOTHETICAL: NO (ix) CHARACTERISTIC:
(A) NOM/CLE: CDS(A) NAME / KEY: CDS
(B) EMPLACEMENT:610..1144(B) LOCATION: 610..1144
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 16: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 16:
GGTAGAAAAG TTCTTTCAAC TGGACATATA ATTCACCTCT TTATAAATTA GATGATAGTA 60 GGTAGAAAAG TTCTTTCAAC TGGACATATA ATTCACCTCT TTATAAATTA GATGATAGTA 60
CTCATATTAA ATCTTTGTTG ATATTAATTT TATGGGTTAC GAATATTCCA TTTCTGATTA 120 CTCATATTAA ATCTTTGTTG ATATTAATTT TATGGGTTAC GAATATTCCA TTTCTGATTA 120
TCATCTCCAT GATAATTAAA TACTTGAATA GCAGTTCCGT TTGCTGTTTG GCTGTTATAT 180 TCATCTCCAT GATAATTAAA TACTTGAATA GCAGTTCCGT TTGCTGTTTG GCTGTTATAT 180
AAATCTAGAT CCATACTTTT TATTTTATAA GCAGCTTTAT TAGAATCATA TATAAGTCTC 240 AAATCTAGAT CCATACTTTT TATTTTATAA GCAGCTTTAT TAGAATCATA TATAAGTCTC 240
CATCTTTCAA GGTAATTTCT AGTTTGTTGA AATAAGCTAA CGTTACCGGC AACTTGATAA 300 CATCTTTCAA GGTAATTTCT AGTTTGTTGA AATAAGCTAA CGTTACCGGC AACTTGATAA 300
AAAAATAAAT TAGTATCGGC CTTACAGGAG ATGGTAACAA TTTTGTCATT TAATGAATTT 360 AAAAATAAAT TAGTATCGGC CTTACAGGAG ATGGTAACAA TTTTGTCATT TAATGAATTT 360
TGGATTACTG AATAGTGTTC CATTATGATT CCTCCTTTAT TTAAGAATTA ATCTTACATA 420 TGGATTACTG AATAGTGTTC CATTATGATT CCTCCTTTAT TTAAGAATTA ATCTTACATA 420
TAACATATAA CATAATCAAG TTATTTTTTG TAAACCTAAA ATTTAAATAT ATCAAATTTT 480 TAACATATAA CATAATCAAG TTATTTTTTG TAAACCTAAA ATTTAAATAT ATCAAATTTT 480
TATTAGTATG TTTACATAAT TGATTATGGA TATTTCGTAA AAATGGCTTA TTAAAAATTT 540 TATTAGTATG TTTACATAAT TGATTATGGA TATTTCGTAA AAATGGCTTA TTAAAAATTT 540
AAAGGCAATT AGTTTATTTA TAGTATAATA AAACAATAAT ATGTATATTA TGGAGGGATA 600 AAAGGCAATT AGTTTATTTA TAGTATAATA AAACAATAAT ATGTATATTA TGGAGGGATA 600
GTGGTAAAT ATG AAT AAG TTG TTT TTA CAA ATT AAA ATG TTA AAA AAT 648 GTGGTAAAT ATG AAT AAG TTG TTT TTA CAA ATT AAA ATG TTA AAA AAT 648
Met Asn Lys Leu Phe Leu Gln Ile Lys Met Leu Lys Asn Met Asn Lys Leu Phe Leu Gln Ile Lys Met Leu Lys Asn
185 190185 190
GAC AAC GAG GAG TTT CAA GAA ATT TTT AAG CAT TTT GAA AAA ACT ATA 696 GAC AAC GAG GAG TTT CAA GAA ATT TTT AAG CAT TTT GAA AAA ACT ATA 696
Asp Asn Glu Glu Phe Gln Glu Ile Phe Lys His Phe Glu Lys Thr Ile Asp Asn Glu Glu Phe Gln Glu Ile Phe Lys His Phe Glu Lys Thr Ile
200 205200 205
AAT ATA TTT ACT AGA AAA TAT AAT ATA TAT GAT AAT TAC AAT GAT ATT 744 AAT ATA TTT ACT AGA AAA TAT AAT ATA TAT GAT AAT TAC AAT GAT ATT 744
Asn Ile Phe Thr Arg Lys Tyr Asn Ile Tyr Asp Asn Tyr Asn Asp Ile Asn Ile Phe Thr Arg Lys Tyr Asn Ile Tyr Asp Asn Tyr Asn Asp Ile
210 215 220210 215 220
TTG TAC CAT TTA TGG TAT ACA CTT AAA AAA GTT GAT TTG AGC AAT TTC 792 TTG TAC CAT TTA TGG TAT ACA CTT AAA AAA GTT GAT TTG AGC AAT TTC 792
Leu Tyr His Leu Trp Tyr Thr Leu Lys Lys Val Asp Leu Ser Asn Phe Leu Tyr His Leu Trp Tyr Thr Leu Lys Lys Val Asp Leu Ser Asn Phe
225 230 235 240225 230 235 240
AAT ACA CAA AAT GAT TTA GAG AGA TAT ATT AGT AGG ACT TTA AAA AGA 840 AAT ACA CAA AAT GAT TTA GAG AGA TAT ATT AGT AGG ACT TTA AAA AGA 840
Asn Thr Gln Asn Asp Leu Glu Arg Tyr Ile Ser Arg Thr Leu Lys Arg Asn Thr Gln Asn Asp Leu Glu Arg Tyr Ile Ser Arg Thr Leu Lys Arg
245 250 255245 250 255
TAT TGC TTA GAT ATT TGC AAT AAA AGA AAG ATT GAT AAG AAA ATA ATA 888 TAT TGC TTA GAT ATT TGC AAT AAA AGA AAG ATT GAT AAG AAA ATA ATA 888
Tyr Cys Leu Asp Ile Cys Asn Lys Arg Lys Ile Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Cys Leu Asp Ile Cys Asn Lys Arg Lys Ile Asp Lys Lys Ile Ile
260 265 270260 265 270
TAT AAT TCA GAA ATT GCA GAT AAG AAA TTA AGC TTA ATA GCA AAT AGT 936 TAT AAT TCA GAA ATT GCA GAT AAG AAA TTA AGC TTA ATA GCA AAT AGT 936
Tyr Asn Ser Glu Ile Ala Asp Lys Lys Leu Ser Leu Ile Ala Asn Ser Tyr Asn Ser Glu Ile Ala Asp Lys Lys Leu Ser Leu Ile Ala Asn Ser
275 280 285275 280 285
TAT TCA AGT TAT TCA GAA TTT GAA TTT AAT GAT TTA ATA TCC ATA TTA 984 TAT TCA AGT TAT TCA GAA TTT GAA TTT AAT GAT TTA ATA TCC ATA TTA 984
Tyr Ser Ser Tyr Ser Glu Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Tyr Ser Ser Tyr Ser Glu Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu
290 295 300290 295 300
CCT GAC GAT CAA AAG AAA ATT ATA TAT ATG AAA TTT GTT GAA GAT ATT 1032 CCT GAC GAT CAA AAG AAA ATT ATA TAT ATG AAA TTT GTT GAA GAT ATT 1032
Pro Asp Asp Gln Lys Lys Ile Ile Tyr Met Lys Phe Val Glu Asp Ile -50 Pro Asp Asp Gln Lys Lys Ile Ile Tyr Met Lys Phe Val Glu Asp Ile -50
305 310 315 320305 310 315 320
AAG GAG ATA GAT ATA GCT AAA AAA CTT AAT ATA AGT CGT CAA TCT GTA 1080 AAG GAG ATA GAT ATA GCT AAA AAA CTT AAT ATA AGT CGT CAA TCT GTA 1080
Lys Glu Ile Asp Ile Ala Lys Lys Leu Asn Ile Ser Arg Gln Ser Val Lys Glu Ile Asp Ile Ala Lys Lys Leu Asn Ile Ser Arg Gln Ser Val
325 330 335325 330 335
TAT AAA AAT AAA ATA ATG GCT TTA GAG AGA TTA GAA CCC ATA TTG AAA 1128 TAT AAA AAT AAA ATA ATG GCT TTA GAG AGA TTA GAA CCC ATA TTG AAA 1128
Tyr Lys Asn Lys Ile Met Ala Leu Glu Arg Leu Glu Pro Ile Leu Lys Tyr Lys Asn Lys Ile Met Ala Leu Glu Arg Leu Glu Pro Ile Leu Lys
340 345 350340 345 350
-AAA TTA ATT AAT ATG T AGTTTATATT TTTAAAAAAT TTTAGGTTTA 1174 -AAA TTA ATT AAT ATG T AGTTTATATT TTTAAAAAAT TTTAGGTTTA 1174
Lys Leu Ile Asn MetLys Leu Ile Asn Met
CAAAAAATAG TGTGGCTATG TTATATATAA ATGATAAGAA TATACTGAAA AATGTATCCA 1234 CAAAAAATAG TGTGGCTATG TTATATATAA ATGATAAGAA TATACTGAAA AATGTATCCA 1234
AAATTTAAGG GGGCGTGTAT AGTAAATAAT TAAAAGTATG TGCGTTGAAA TAAATTTAGG 1294 AAATTTAAGG GGGCGTGTAT AGTAAATAAT TAAAAGTATG TGCGTTGAAA TAAATTTAGG 1294
AGAGTGGTTA GATATGAATA TAAATGACAA CTTAAGTATA AATTCCCCGG TAGATAATAA 1354 AGAGTGGTTA GATATGAATA TAAATGACAA CTTAAGTATA AATTCCCCGG TAGATAATAA 1354
AAATGTT 1361AAATGTT 1361
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 17: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 17:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 178 acides amins (B) TYPE: acide amin (D) CONFIGURATION: linaire (ii) TYPE DE MOLECULE: protine (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 178 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: protein
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 17: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 17:
Met Asn Lys Leu Phe Leu Gln Ile Lys Met Leu Lys Asn Asp Asn Glu Met Asn Lys Leu Phe Leu Gln Ile Lys Met Leu Lys Asn Asp Asn Glu
1 5 10 151 5 10 15
Glu Phe Gln Glu Ile Phe Lys His Phe Glu Lys Thr Ile Asn Ile Phe Glu Phe Gln Glu Ile Phe Lys His Phe Glu Lys Thr Ile Asn Ile Phe
25 3025 30
Thr Arg Lys Tyr Asn Ile Tyr Asp Asn Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr His Thr Arg Lys Tyr Asn Ile Tyr Asp Asn Tyr Asn Asp Ile Leu Tyr His
40 4540 45
Leu Trp Tyr Thr Leu Lys Lys Val Asp Leu Ser Asn Phe Asn Thr Gln Leu Trp Tyr Thr Leu Lys Lys Val Asp Leu Ser Asn Phe Asn Thr Gln
55 6055 60
Asn Asp Leu Glu Arg Tyr Ile Ser Arg Thr Leu Lys Arg Tyr Cys Leu Asn Asp Leu Glu Arg Tyr Ile Ser Arg Thr Leu Lys Arg Tyr Cys Leu
70 75 8070 75 80
Asp Ile Cys Asn Lys Arg Lys Ile Asp Lys Lys Ile Ile Tyr Asn Ser Asp Ile Cys Asn Lys Arg Lys Ile Asp Lys Lys Ile Tyr Asn Ser
90 9590 95
Glu Ile Ala Asp Lys Lys Leu Ser Leu Ile Ala Asn Ser Tyr Ser Ser Glu Ile Ala Asp Lys Lys Leu Ser Leu Ile Ala Asn Ser Tyr Ser Ser
105 110105 110
Tyr Ser Glu Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Pro Asp Asp Tyr Ser Glu Phe Glu Phe Asn Asp Leu Ile Ser Ile Leu Pro Asp Asp
120 125120 125
Gln Lys Lys Ile Ile Tyr Met Lys Phe Val Glu Asp Ile Lys Glu Ile Gln Lys Lys Ile Ile Tyr Met Lys Phe Val Glu Asp Ile Lys Glu Ile
135 140135 140
Asp Ile Ala Lys Lys Leu Asn Ile Ser Arg Gln Ser Val Tyr Lys Asn Asp Ile Ala Lys Lys Leu Asn Ile Ser Arg Gln Ser Val Tyr Lys Asn
150 155 160150 155 160
Lys Ile Met Ala Leu Glu Arg Leu Glu Pro Ile Leu Lys Lys Leu Ile Lys Ile Met Ala Leu Glu Arg Leu Glu Pro Ile Leu Lys Lys Leu Ile
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Asn MetAsn Met
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