FR2749308A1 - NUCLEOTID PROBES AND METHOD FOR DETERMINING THE HLA DQB1 TYPING - Google Patents

NUCLEOTID PROBES AND METHOD FOR DETERMINING THE HLA DQB1 TYPING Download PDF

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Abstract

Nucleotide probe selected in particular among the following: TG <u>CGT TAT GTG ACC AGA</u>, GT<u>G CGT CTT GTG ACC AGA</u>, GT <u>CTT GTA ACC AGA CAC</u> AT, CG<u>T CTT GTA ACC AGA TAC</u> AT, CG<u>T CTT GTG AGC AGA AGC</u> AT, CG <u>ACC GAG CTC GTG CGG CG</u>T G, G T<u>AC CGG GCA GTG AC</u>G C, G A<u>CG CCG CTG GGI CCG CCT G</u>, G A<u>CG CCG CTG GGG CCG CCT G</u>, G G<u>AG GGI ACC CIG GCI GA</u>G T, G G<u>AG GGG ACC CGG GCG GA</u>G T, TC<u>G GTG GAC ACC GTA TGC AG</u>A C, GG <u>ACG GAG CGC GTG </u>CG, C <u>ATC TAT AAC CGA GA</u>, and their complementary sequences, being understood that the said probes have at least the underlined sequence, and can further contain one or two bases selected, respecting the sequence continuity, among the non-underlined bases. These probes are useful for determining a person's HLA DQ beta genotype. They have in particular the advantage of being useable at a single hybridization temperature, in particular 37 DEG C.

Description

La présente invention a pour objet un procédé, des sondes et des kits pour déterminer le génotype HLA DQ bêta (DQB) d'un individu. The present invention relates to a method, probes and kits for determining the HLA DQ beta (DQB) genotype of an individual.

Les procédés, sondes et kits de l'invention se rapportent plus particulièrement à la détection des gènes polymorphes HLA DQB i. Ces procédé, sondes et kits de l'invention sont notamment applicables au typage HLA en transplantation, au diagnostic médical, à la médecine légale, mais la présence ou l'absence d'allèles EA DQBI peut également servir comme indicateur de la sensibilité à certaines maladies, telles que le diabète insulino-dépendant. The methods, probes and kits of the invention relate more particularly to the detection of polymorphic HLA DQB i genes. These method, probes and kits of the invention are particularly applicable to HLA typing in transplantation, medical diagnosis, forensic medicine, but the presence or absence of EA DQBI alleles can also serve as an indicator of the sensitivity to certain types. diseases, such as insulin-dependent diabetes.

Le système HLA (antigène des lymphocytes humains) est codé par le complexe d'histocompatibilité majeur chez l'homme. Il constitue une contrainte très importante au cours des transplantations d'organes entre les individus en effectuant une distinction entre le soi et le non soi. Les antigènes du système WA ont donc été utilisés dans des procédés de typage pour déterminer les caractéristiques entre donneur et receveur lors de transplantations d'organes, ainsi que la prédisposition d'un individu à certaines maladies. The HLA (human lymphocyte antigen) system is encoded by the major histocompatibility complex in humans. It constitutes a very important constraint during organ transplants between individuals by making a distinction between self and non-self. WA system antigens have therefore been used in typing methods to determine donor-recipient characteristics during organ transplants, as well as an individual's predisposition to certain diseases.

D'un point de vue génétique, le système HLA est bien caractérisé et consiste en un ensemble de loci plus ou moins polymorphes situés dans un intervalle d'environ 2 centimorgans sur le bras court du chromosome 6. Trois loci dans ce système (HLA-A, B et C) codent pour une classe d'allo-antigènes exprimés de façon co-dominante (Classe I). Une autre région (HLA-D) qui contient en fait plusieurs gènes code pour une seconde classe d'allo-antigènes exprimés de façon co-dominante avec un degré important de polymorphisme (Classe II). From a genetic point of view, the HLA system is well characterized and consists of a set of more or less polymorphic loci located in an interval of about 2 centimorgans on the short arm of chromosome 6. Three loci in this system (HLA- A, B and C) encode a class of alloantigens expressed in a co-dominant manner (Class I). Another region (HLA-D) which in fact contains several genes encodes a second class of alloantigens expressed in a co-dominant manner with a significant degree of polymorphism (Class II).

Plusieurs autres loci qui contrôlent notamment les composants C 2, C 4 et le facteur Bf de la cascade du complément appartiennent également au système HLA (Classe III). Le succès des greffes d'organes dépend dans une grande mesure de l'identité HLA (Classes I et II) entre receveur et donneur. En conséquence, le typage fILA doit être le plus exact possible. Ce besoin concerne principalement les transplantations de reins et les greffes de moelle osseuse. Dans le cadre de la greffe de moelle osseuse, l'identité parfaite au niveau des antigènes HLA Classe II représente un facteur déterminant pour le succès de la greffe, c'est à dire pour éviter un rejet du greffon ou le développement d'une maladie greffon-contre-hôte.Several other loci which control in particular the components C 2, C 4 and factor Bf of the complement cascade also belong to the HLA system (Class III). The success of organ transplants depends to a large extent on the HLA (Class I and II) identity between recipient and donor. Consequently, the fILA typing must be as exact as possible. This need mainly concerns kidney transplants and bone marrow transplants. In the context of bone marrow transplantation, the perfect identity at the level of HLA Class II antigens represents a determining factor for the success of the transplant, that is to say to avoid a rejection of the transplant or the development of a disease. graft versus host.

Le polymorphisme des produits d'expression des gènes de la région HLA-D était défini habituellement par des techniques sérologiques basées sur l'analyse par des allo-antisera des produits des gènes HLA exprimés à la surface des cellules. Cependant, même dans les meilleures conditions, un grand nombre d'allèles existants ne sont pas détectables par ces techniques sérologiques. The polymorphism of the expression products of the HLA-D region genes was usually defined by serological techniques based on the analysis by allo-antisera of the products of the HLA genes expressed on the surface of the cells. However, even under the best conditions, a large number of existing alleles are not detectable by these serological techniques.

Les polymorphismes au niveau du locus HLA DQBI ont été détectés en utilisant des réactifs de typage sérologique qui définissent les spécificités DQ wl, 2, 3 et 4 (WHO
Nomenclature Committee, 1990). La spécificité DQ wl a été ensuite subdivisée en sous-types sérologiques DQ wS et 6, et DQ w3 a été subdivisée en DQ w7, 8 et 9. Cependant, avec les techniques de sérotypage utilisées en routine, seulement les spécificités DQ wl, DQ w2 et
DQ w3 peuvent être distinguées.
Polymorphisms at the HLA DQBI locus were detected using serologic typing reagents that define DQ specificities w1, 2, 3 and 4 (WHO
Nomenclature Committee, 1990). DQ wl specificity was then subdivided into DQ wS and 6 serological subtypes, and DQ w3 was subdivided into DQ w7, 8 and 9. However, with the serotyping techniques used routinely, only DQ wl, DQ specificities w2 and
DQ w3 can be distinguished.

Grâce à la biologie moléculaire, on sait maintenant qu'il existe un plus grand nombre de gènes HLA qu'on ne le supposait auparavant et, surtout, beaucoup plus d'allèles différents. Thanks to molecular biology, we now know that there are more HLA genes than previously assumed and, above all, many more different alleles.

Cette diversité est maintenant caractérisée au niveau des séquences d'ADN des différents gènes et allèles. Les structures, séquences et polymorphismes connus dans la région HLA-D ont été répertoriés par TROWSDALE et ai, 1985. Immunol. Rev. 85 : 5-43.This diversity is now characterized at the level of the DNA sequences of the various genes and alleles. The structures, sequences and polymorphisms known in the HLA-D region have been listed by TROWSDALE et al., 1985. Immunol. Rev. 85: 5-43.

L'analyse génotypique est une nouvelle approche permettant d'analyser la diversité du système HLA Classe II, et en particulier HLADQ, directement au niveau des gènes. Genotypic analysis is a new approach for analyzing the diversity of the HLA Class II system, and in particular HLADQ, directly at the gene level.

L'analyse génotypique est basée sur le principe de l'hybridation moléculaire et la première approche qui fut proposée est la technique dite "RFLP" qui consiste à fragmenter l'ADN par utilisation d'enzymes de restriction et à analyser la taille des fragments obtenus ; voir par exemple le brevet US 4 582 788.Genotypic analysis is based on the principle of molecular hybridization and the first approach which was proposed is the so-called "RFLP" technique which consists in fragmenting the DNA by use of restriction enzymes and in analyzing the size of the fragments obtained. ; see, for example, U.S. Patent 4,582,788.

L'approche RFLP est utilisable pour l'identification de 7 spécificités DQ. Cependant, l'analyse par RFLP ne permet de reconnaître que certaines des différences alléliques indétectables par la sérologie, et les possibilités offertes par cette technique sont limitées. En effet, un allèle est identifiable seulement si la mutation qui le caractérise est située dans le site de reconnaissance de l'enzyme de restriction utilisée et ainsi un grand nombre d'allèles ne sont pas reconnus par cette analyse. De plus, l'analyse RFLP met rarement en évidence une modification dans une séquence codante et ne fournit pas d'informations sur la nature exacte de la modification. Enfin, cette technique est longue et difficile à mettre en oeuvre. The RFLP approach can be used for the identification of 7 DQ specificities. However, RFLP analysis can only recognize some of the allelic differences undetectable by serology, and the possibilities offered by this technique are limited. Indeed, an allele is identifiable only if the mutation which characterizes it is located in the recognition site of the restriction enzyme used and thus a large number of alleles are not recognized by this analysis. In addition, RFLP analysis rarely demonstrates a change in a coding sequence and does not provide information on the exact nature of the change. Finally, this technique is long and difficult to implement.

Une autre technique d'analyse génotypique de HLA Classe II a été proposée, qui est la méthode dite "de typage par oligonucléotides" : grâce à la connaissance des séquences d'ADN des gènes HLA Classe II et en particulier des gènes DQ B, on utilise comme traceurs pour l'analyse du polymorphisme des oligonucléotides qui s'hybrident spécifiquement en un site donné de la séquence du gène. Ces oligonucléotides sont choisis de façon que leur hybridation ou leur absence d'hybridation fournisse le plus grand nombre possible d'informations et permette l'identification des différents allèles, sur la base de leurs différences de séquence. Toute différence de séquence, même celles portant sur un seul nucléotide, doit pouvoir être détectée. Another technique for genotypic analysis of HLA Class II has been proposed, which is the so-called “oligonucleotide typing” method: thanks to the knowledge of the DNA sequences of the HLA Class II genes and in particular of the DQ B genes, it is possible to uses as tracers for the analysis of the polymorphism of oligonucleotides which hybridize specifically at a given site of the gene sequence. These oligonucleotides are chosen so that their hybridization or their absence of hybridization provides the greatest possible amount of information and allows the identification of the various alleles, on the basis of their differences in sequence. Any difference in sequence, even those relating to a single nucleotide, must be able to be detected.

La technique de typage par oligonucléotides peut être appliquée aussi bien à l'ADN, comme décrit dans la publication d'ANGELINI et ai Proc. Nat. Acad. Sci. USA vol. 83 : 44894493 (1986), qu'à l'ARN (voir C. UCLA, J. J. VAN ROOD, J. GORSKI, B. MACH (1987) J. The oligonucleotide typing technique can be applied to DNA as well, as described in the publication by ANGELINI et al. Proc. Nat. Acad. Sci. USA vol. 83: 44894493 (1986), than with RNA (see C. UCLA, J. J. VAN ROOD, J. GORSKI, B. MACH (1987) J.

Clin. Invest. 80, 1155).Clin. Invest. 80, 1155).

Les méthodes d'amplification d'acides nucléiques, telles que la PCR, ont facilité l'analyse de l'ADN HLA Classe II d'un individu. La première application de typage par oligonucléotides pour le HLA Classe II a été présentée par ANGELINI et al dans la publication précédemment citée, avec utilisation de la technique dite "SOUTHERN" selon laquelle l'ADN cible est déposé sur une membrane de nylon et la détection est effectuée à l'aide d'une sonde oligonucléotidique marquée. La technique a ensuite été appliquée à la détection d'allèles HLA
Classe II non identifiables par sérologie de routine (Voir J.M. TIERCY, J. GORSKI, M.
Nucleic acid amplification methods, such as PCR, have facilitated the analysis of an individual's HLA Class II DNA. The first oligonucleotide typing application for HLA Class II was presented by ANGELINI et al in the previously cited publication, with use of the so-called "SOUTHERN" technique according to which the target DNA is deposited on a nylon membrane and the detection is carried out using a labeled oligonucleotide probe. The technique was then applied to the detection of HLA alleles
Class II not identifiable by routine serology (See JM TIERCY, J. GORSKI, M.

JEANNET et B. MACH (1988) Proc. Natl. Acad Sci. USA 85, 198 et J.M. TIERCY, J.JEANNET and B. MACH (1988) Proc. Natl. Acad Sci. USA 85, 198 and J.M. TIERCY, J.

GORSKI, H. BETUEL, A.C. FREIDEL, L. GEBUHRER, M. JEANNET et B. MACH (1989)
Human Immunol. 24, 1). Une autre application directe au typage HLA Classe II est celle décrite dans la demande de brevet PCT WO 89/11547 utilisant la technique dite "Dot Blot". La méthode dite "Reverse Dot", qui consiste à fixer sur une membrane de papier ou de nitrocellulose, une sonde nucléotidique et à effectuer la détection d'une hybridation avec une cible marquée, a été appliquée au typage HLA DQ A et à la détection des mutations de la bêta-thalassémie méditerranéenne (R.K.SAIKI et ai Proc. Nat. Acad. Sci. USA vol : 86, p. 6230-6234 ; (1989)).
GORSKI, H. BETUEL, AC FREIDEL, L. GEBUHRER, M. JEANNET and B. MACH (1989)
Human Immunol. 24, 1). Another direct application to HLA Class II typing is that described in PCT patent application WO 89/11547 using the so-called “Dot Blot” technique. The so-called "Reverse Dot" method, which consists in fixing a nucleotide probe on a paper or nitrocellulose membrane and in carrying out the detection of a hybridization with a labeled target, was applied to the HLA DQ A typing and to the detection. mutations in Mediterranean beta-thalassemia (RKSAIKI et al. Proc. Nat. Acad. Sci. USA vol: 86, p. 6230-6234; (1989)).

Le typage cellulaire nécessite la détection de mutations ponctuelles dans le génome et implique la mise au point de sondes suffisamment sensibles pour détecter et différencier des séquences homologues à un nucléotide près. On utilise pour cela des sondes de courte taille, généralement de moins de 30 nucléotides, qui confèrent au test une grande spécificité, tout en conservant une bonne sensibilité. L'utilisation d'oligonucléotides de courte taille permet de disposer d'un grand éventail de sélectivité. Cell typing requires the detection of point mutations in the genome and involves the development of probes sensitive enough to detect and differentiate homologous sequences down to one nucleotide. Short probes are used for this, generally less than 30 nucleotides, which give the test high specificity, while retaining good sensitivity. The use of oligonucleotides of short size makes it possible to have a wide range of selectivity.

Par ailleurs, il est souhaitable de mettre au point un procédé de typage qui non seulement présente une grande spécificité et une bonne sensibilité, mais qui de plus soit simple à mettre en oeuvre, d'exécution rapide, peu onéreux et facilement automatisable. Moreover, it is desirable to develop a typing method which not only has great specificity and good sensitivity, but which is also simple to implement, to perform quickly, inexpensively and easily automate.

La présente invention concerne un procédé, ainsi que des sondes et des kits pour le typage HLA DQB 1 qui répondent à ces exigences. The present invention relates to a method, as well as probes and kits for HLA DQB 1 typing which meet these requirements.

Le procédé de l'invention peut être utilisé pour typer des échantillons hétérozygotes d'origines diverses, incluant des matrices d'ADNc, et peut être utilisé pour détecter des variants alléliques qui ne peuvent pas être distingués par les méthodes sérologiques conventionnelles. The method of the invention can be used to type heterozygous samples of various origins, including cDNA templates, and can be used to detect allelic variants which cannot be distinguished by conventional serological methods.

Les sondes de l'invention qui seront définies ci-après, peuvent être utilisées sous la forme de sondes de détection (marquées avec un agent traceur usuel) dans les techniques de type
Southern, ou, de préférence, sous la forme de sondes de capture (technique Sandwich ou
Reverse Dot Blot) immobilisées sur un support solide.
The probes of the invention which will be defined below can be used in the form of detection probes (labeled with a usual tracing agent) in techniques of the type
Southern, or, preferably, in the form of capture probes (Sandwich technique or
Reverse Dot Blot) immobilized on a solid support.

Le système de typage de la présente invention utilise de préférence le protocole dit "sandwich", tel que décrit à l'origine par DUNN A.R, HASSEL J. A. (Cell, 12, 23, 1977) et qui consiste à utiliser une première sonde nucléotidique, appelée sonde de capture, fixée sur un support solide, et spécifique du gène cible de l'échantillon, ainsi qu'une deuxième sonde, marquée, appelée sonde de détection, complémentaire d'une autre région de la cible et permettant la détection d'une hybridation par révélation à l'aide du marqueur. Dans le système de la présente invention, le marqueur est par exemple une enzyme telle que la peroxydase de raifort, étant entendu que tout autre marqueur approprié peut être utilisé. The typing system of the present invention preferably uses the so-called "sandwich" protocol, as originally described by DUNN AR, HASSEL JA (Cell, 12, 23, 1977) and which consists in using a first nucleotide probe, called capture probe, fixed on a solid support, and specific for the target gene of the sample, as well as a second probe, labeled, called detection probe, complementary to another region of the target and allowing the detection of hybridization by visualization using the marker. In the system of the present invention, the label is for example an enzyme such as horseradish peroxidase, it being understood that any other suitable label can be used.

Le procédé de l'invention est fondé sur la sélection de sondes oligonucléotidiques dont la longueur et la composition ont été choisies non seulement pour leur conférer la spécificité et la sensibilité nécessaires, mais aussi de façon à permettre leur utilisation à une température déterminée. Ainsi, le système de typage de la présente invention présente notamment l'avantage de permettre d'opérer à une température unique de 37"C + 20C. The method of the invention is based on the selection of oligonucleotide probes whose length and composition have been chosen not only to give them the necessary specificity and sensitivity, but also so as to allow their use at a determined temperature. Thus, the typing system of the present invention has the particular advantage of making it possible to operate at a single temperature of 37 "C + 20C.

Il est toutefois évident que, même dans le cas de sondes destinées à détecter, à une température donnée, des mutations ponctuelles, il est possible d'envisager l'utilisation de sondes dont la longueur peut varier dans une certaine mesure, grâce notamment à l'emploi de solutions tampons favorisant plus ou moins la stabilité des complexes d'hybridation. Les sondes de l'invention sont donc définies par une séquence dont la longueur pourra généralement être considérée comme maximum, en particulier si on souhaite travailler à une température avoisinant 37"C, mais différente de 37"C (ce qui est souvent le cas en pratique compte tenu des erreurs d'étalonnage de la température), avec en outre l'indication d'une séquence optimum pour une température de 37"C. It is however obvious that, even in the case of probes intended to detect point mutations at a given temperature, it is possible to envisage the use of probes whose length can vary to a certain extent, thanks in particular to the 'use of buffer solutions favoring more or less the stability of the hybridization complexes. The probes of the invention are therefore defined by a sequence whose length can generally be considered as maximum, in particular if it is desired to work at a temperature of around 37 "C, but different from 37" C (which is often the case in practical taking into account temperature calibration errors), with the addition of the indication of an optimum sequence for a temperature of 37 "C.

Il est évident pour les spécialistes qu'à chaque sonde oligonucléotidique particulière correspond une sonde complémentaire qui, bien entendu, est capable de jouer le même rôle en tant que sonde de capture ou de détection. L'invention s'étend donc aux sondes ayant une séquence complémentaire de celle des sondes décrites ci-après, et aux procédés utilisant ces complémentaires. It is obvious to those skilled in the art that each particular oligonucleotide probe corresponds to a complementary probe which, of course, is capable of playing the same role as a capture or detection probe. The invention therefore extends to probes having a sequence complementary to that of the probes described below, and to methods using these complements.

L'invention a pour objet des sondes ayant une séquence nucléotidique choisie pour répondre aux exigences précitées. Plus particulièrement, la présente invention se rapporte à des sondes nouvelles, dont l'utilisation combinée permet d'effectuer la discrimination entre différents alléles et même d'identifier si nécessaire les différentes spécificités HLA DQ connues à ce jour (Nomenclature for factors of the HLA system, 1995, Bodmer Julia G et al. Tissue Antigens 1995, 46, 1-18). The subject of the invention is probes having a nucleotide sequence chosen to meet the aforementioned requirements. More particularly, the present invention relates to new probes, the combined use of which makes it possible to discriminate between different alleles and even to identify, if necessary, the different HLA DQ specificities known to date (Nomenclature for factors of the HLA system, 1995, Bodmer Julia G et al. Tissue Antigens 1995, 46, 1-18).

Les sondes nucléotidiques de l'invention sont choisies notamment parmi celles qui sont représentées ci-après (la séquence lue de gauche à droite va de l'extrémité 5' à l'extrémité 3'). Les lettres représentent les nucléotides (ou bases) selon la nomenclature habituelle. La séquence soulignée représente la séquence optimale dans les conditions opératoires préconisées selon l'invention. Les sondes contiennent donc au minimum la séquence soulignée, et peuvent contenir en outre une ou deux bases supplémentaires choisies parmi les bases non soulignées, c'est-à-dire, selon les cas (et en respectant bien entendu la continuité de la séquence), soit une ou deux bases supplémentaires à l'extrémité 5', soit une ou deux bases supplémentaires à l'extrémité 3', soit encore une base supplémentaire à l'extrémité 5' et une base supplémentaire à l'extrémité 3' On sait en effet qu'il est possible de modifier la longueur des sondes utilisées en fonction des conditions opératoires qui permettent de faire varier les forces de liaison d'hybridation, telles que les températures d'hybridation et de lavage, et la nature des tampons d'hybridation et/ou de lavage. L'introduction dans les sondes de bases modifiées (par exemple inosine) peut jouer un rôle analogue. Les sondes de l'invention sont notamment choisies parmi les suivantes (pour chaque sonde, on a indiqué les spécificités reconnues)
TG CGT TAT GTG ACC AGA (26B), qui reconnaît les spécificités DQBI 06011, 06012, 0301, 0304,
GTG CGT CTT GTG ACC AGA (26C) : spécificités DQB1 0602, 0302, 03032
GT CTT GTA ACC AGA CAC AT (26D): spécificités DQBI 0603, 0604, 0607, 0608,
CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT (26F): spécificités DRQBI 06051, 06052, 0606 et 0609,
CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT (26E): spécificités 0201,0202,
GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G (23A) : spécificité DQB1 0401,
G TAC CGG GCA GTG ACG C (49A): spécificité DQB1 0501,
G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G (55A): spécificités DQB1 0301, 0302, 03032, 0304, 0305,
G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G (55'A): spécificités DQB1 0301, 0302, 03032, 0304, 0305,
G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T (70A) : spécificités DQB1 0602, 0603, 0608,
G GAG GGG ACC CGG GCG GAG T (70'A): spécificités DQBI 0602, 0603, 0608,
TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C (70B) : spécificités DQB1 0401,0402.
The nucleotide probes of the invention are chosen in particular from those which are represented below (the sequence read from left to right goes from the 5 'end to the 3' end). The letters represent the nucleotides (or bases) according to the usual nomenclature. The underlined sequence represents the optimum sequence under the operating conditions recommended according to the invention. The probes therefore contain at least the underlined sequence, and can also contain one or two additional bases chosen from the non-underlined bases, that is to say, according to the cases (and while respecting of course the continuity of the sequence) , either one or two additional bases at the 5 'end, or one or two additional bases at the 3' end, or an additional base at the 5 'end and an additional base at the 3' end. in fact, it is possible to modify the length of the probes used as a function of the operating conditions which make it possible to vary the hybridization binding forces, such as the hybridization and washing temperatures, and the nature of the buffers of hybridization and / or washing. The introduction into the probes of modified bases (for example inosine) can play a similar role. The probes of the invention are chosen in particular from the following (for each probe, the recognized specificities have been indicated)
TG CGT TAT GTG ACC AGA (26B), which recognizes the specific features of DQBI 06011, 06012, 0301, 0304,
GTG CGT CTT GTG ACC AGA (26C): specificities DQB1 0602, 0302, 03032
GT CTT GTA ACC AGA CAC AT (26D): specificities DQBI 0603, 0604, 0607, 0608,
CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT (26F): specificities DRQBI 06051, 06052, 0606 and 0609,
CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT (26E): specificities 0201,0202,
GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G (23A): specificity DQB1 0401,
G TAC CGG GCA GTG ACG C (49A): specificity DQB1 0501,
G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G (55A): specificities DQB1 0301, 0302, 03032, 0304, 0305,
G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G (55'A): specificities DQB1 0301, 0302, 03032, 0304, 0305,
G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T (70A): specificities DQB1 0602, 0603, 0608,
G GAG GGG ACC CGG GCG GAG T (70'A): specificities DQBI 0602, 0603, 0608,
TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C (70B): specificities DQB1 0401.0402.

Bien entendu, la distinction entre certaines spécificités pourra etre effectuée, si désiré, à l'aide d'autres sondes utilisées comme sondes supplémentaires, comme le montre aisément l'examen des tableaux 1 et 2 annexés. Of course, the distinction between certain specificities can be made, if desired, using other probes used as additional probes, as easily shown by examination of the attached Tables 1 and 2.

Les nouvelles sondes de l'invention comprennent aussi les sondes HRP I et HRP 2 qui seront définies ci-après. The new probes of the invention also include the HRP I and HRP 2 probes which will be defined below.

Dans les séquences des sondes oligonucléotidiques décrites ci-dessus, I symbolise l'inosine. L'inosine est un nucléotide non naturel utilisé dans certaines sondes de l'invention, pour augmenter le pouvoir discriminant d'une sonde en déstabilisant davantage les hybrides que forme cette sonde avec des séquences d'acide nucléique non strictement identiques à celle de la cible recherchée dans l'échantillon avec cette sonde. In the sequences of the oligonucleotide probes described above, I symbolizes inosine. Inosine is an unnatural nucleotide used in certain probes of the invention, to increase the discriminating power of a probe by further destabilizing the hybrids formed by this probe with nucleic acid sequences not strictly identical to that of the target sought in the sample with this probe.

Dans la description de la présente demande, les appellations arbitraires comprenant un nombre suivi d'une lettre, telles que 23A, 26A, 26B, etc., ou des lettres suivies d'un chiffre (telles que HRP 1), désignent globalement toutes les sondes ainsi définies (celles comprenant uniquement la séquence soulignée et celles comprenant en outre une ou deux bases supplémentaires non soulignées), sauf dans la partie expérimentale ci-après et dans les tableaux annexés où ces appellations désignent uniquement les sondes ayant la séquence optimale soulignée. In the description of the present application, the arbitrary designations comprising a number followed by a letter, such as 23A, 26A, 26B, etc., or letters followed by a number (such as HRP 1), generally designate all the probes thus defined (those comprising only the underlined sequence and those further comprising one or two additional non-underlined bases), except in the experimental part below and in the appended tables where these names designate only the probes having the optimal underlined sequence.

La présente invention a aussi pour objet un procédé pour déterminer au moins partiellement le typage DQB 1 d'un acide nucléique présent dans un échantillon, dans lequel on effectue des essais d'hybridation, selon les méthodes connues, dudit acide nucléique de l'échantillon avec des sondes oligonucléotidiques, et dans lequel on retient comme essais positifs les essais pour lesquels on observe effectivement une hybridation à une température unique égale à 37+2 C, lesdites sondes oligonucléotidiques comprenant au moins une sonde choisie dans le groupe consistant en
TG CGT TAT GTG ACC AGA (26B),
GTG CGT CTT GTG ACC AGA (26C),
GT CTT GTA ACC AGA CAC AT (26D),
CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT (26F),
CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT (26E),
GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G (23 A),
G TAC CGG GCA GTG ACG C (49A),
G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G (55A),
G GAG GGI ACC CIG GCl GAG T (70A), TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C (70B),
ou leurs complémentaires, étant entendu que lesdites sondes contiennent au minimum la séquence soulignée et peuvent contenir en outre une ou deux bases supplémentaires choisies, en respectant la continuité de la séquence, parmi les bases non soulignées.
A subject of the present invention is also a method for at least partially determining the DQB 1 typing of a nucleic acid present in a sample, in which hybridization tests are carried out, according to known methods, of said nucleic acid of the sample. with oligonucleotide probes, and in which the tests for which hybridization is actually observed at a single temperature equal to 37 + 2 C are retained as positive tests, said oligonucleotide probes comprising at least one probe chosen from the group consisting of
TG CGT TAT GTG ACC AGA (26B),
GTG CGT CTT GTG ACC AGA (26C),
GT CTT GTA ACC AGA CAC AT (26D),
CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT (26F),
CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT (26E),
GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G (23 A),
G TAC CGG GCA GTG ACG C (49A),
G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G (55A),
G GAG GGI ACC CIG GCl GAG T (70A), TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C (70B),
or their complementaries, it being understood that said probes contain at least the underlined sequence and can also contain one or two additional bases chosen, while respecting the continuity of the sequence, from the non-underlined bases.

L'invention concerne également un procédé tel que défini précédemment, dans lequel on effectue en outre des essais d'hybridation de l'acide nucléique de l'échantillon avec au moins une des sondes suivantes
ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG (26A), spécificités DQBI reconnues: 0501, 0502, 05031, 05032, 0603, 0604, 0607, 0608,
GG CCT GTT GCC GAG TAC T (57A), spécificités DQBI reconnues: 0501, 0604, 06051, 0606, 0608, 0609,
CGG CCT AGC GCC GAG TAC T (57B), spécificités DQB1 reconnues: 0502, 0504,
CGG CCT GAT GCC GAG TAC (57C); spécificités DQBI reconnues: 05032, 0602, 0603, 0607, et éventuellement
GC GAC GTG GAG GTG TAC CG (45A), spécificités DQBI reconnues: 0301, 0304,
A GAG GAG GAC GTG CGC TT (37A), spécificités DQB1 reconnues: 06011, 06012, ou leurs complémentaires.
The invention also relates to a method as defined above, in which further tests are carried out for hybridization of the nucleic acid of the sample with at least one of the following probes
ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG (26A), recognized DQBI specificities: 0501, 0502, 05031, 05032, 0603, 0604, 0607, 0608,
GG CCT GTT GCC GAG TAC T (57A), recognized DQBI specificities: 0501, 0604, 06051, 0606, 0608, 0609,
CGG CCT AGC GCC GAG TAC T (57B), DQB1 specificities recognized: 0502, 0504,
CGG CCT GAT GCC GAG TAC (57C); DQBI specificities recognized: 05032, 0602, 0603, 0607, and possibly
GC GAC GTG GAG GTG TAC CG (45A), recognized DQBI specificities: 0301, 0304,
A GAG GAG GAC GTG CGC TT (37A), DQB1 specificities recognized: 06011, 06012, or their complementaries.

Bien entendu, les essais retenus comme positifs sont encore ceux indiqués précédemment. Of course, the tests retained as positive are also those indicated above.

Dans le procédé de l'invention, les conditions d'hybridation utilisées sont évidemment des conditions prédéterminées telles que l'hybridation avec chaque sonde ne se produise, à la température unique choisie, que si la cible contient une séquence parfaitement complémentaire de celle de ladite sonde. Ces conditions peuvent être déterminées par de simples expériences de routine. La cible est bien entendu l'acide nucléique présent dans l'échantillon et contenant des régions polymorphes de gènes HLA DQ d'un individu. In the method of the invention, the hybridization conditions used are obviously predetermined conditions such that hybridization with each probe only occurs, at the single temperature chosen, if the target contains a sequence perfectly complementary to that of said probe. These conditions can be determined by simple routine experiments. The target is of course the nucleic acid present in the sample and containing polymorphic regions of HLA DQ genes of an individual.

Les spécialistes comprendront aisément que les diverses sondes utilisables dans le procédé de l'invention peuvent être, selon les techniques choisies, soit des sondes marquées, soit des sondes couplées à un ligand destiné à faciliter leur fixation sur un support solide, soit encore des sondes déjà fixées sur un support solide. En particulier, les sondes peuvent être soit immobilisées, soit immobilisables, selon les méthodes connues, sur des supports solides, et sont alors utilisables comme sondes de capture. Those skilled in the art will easily understand that the various probes which can be used in the method of the invention can be, depending on the techniques chosen, either labeled probes, or probes coupled to a ligand intended to facilitate their attachment to a solid support, or else probes. already fixed on a solid support. In particular, the probes can be either immobilized or immobilized, according to known methods, on solid supports, and can then be used as capture probes.

Selon un mode de réalisation particulier, on effectue les essais d'hybridation en utilisant les sondes indiquées ci-dessus comme sondes de capture, c'est-à-dire fixées à un support solide. According to a particular embodiment, the hybridization tests are carried out using the probes indicated above as capture probes, that is to say fixed to a solid support.

Pour révéler la présence éventuelle d'acide nucléique, fixé sur le support solide par hybridation avec une sonde de capture donnée, on peut utiliser une sonde de détection marquée capable de s'hybrider avec une région de la cible autre que celle reconnue par ladite sonde de capture. On peut utiliser notamment des sondes de détection choisies parmi les suivantes (la partie soulignée correspond comme précédemment à la séquence minimale)
GG ACG GAG CGC GTG CG (HRP1),
C ATC TAT AAC CGA GA (HRP2),
CGC TTC GAC AGC GAC GTG G (HRP3).
To reveal the possible presence of nucleic acid, fixed on the solid support by hybridization with a given capture probe, it is possible to use a labeled detection probe capable of hybridizing with a region of the target other than that recognized by said probe. capture. Detection probes chosen from among the following can be used in particular (the underlined part corresponds as previously to the minimum sequence)
GG ACG GAG CGC GTG CG (HRP1),
C ATC TAT AAC CGA GA (HRP2),
CGC TTC GAC AGC GAC GTG G (HRP3).

L'examen du tableau I annexé permet de déterminer aisément lesquelles, parmi ces sondes de détection, sont utilisables avec une sonde de capture donnée. Examination of the appended Table I makes it possible to easily determine which, among these detection probes, can be used with a given capture probe.

Selon le procédé de l'invention, l'identification d'un allèle peut être déduite à partir d'un modèle de liaison d'un ensemble de sondes, chaque sonde individuelle de l'ensemble étant spécifique de différentes parties du gène HLA DQ. Grâce au choix de plusieurs sondes, le procédé de typage par oligonucléotides de la présente invention permet d'identifier si désiré tous les alléles DQB 1 Au cas où de nouveaux alléles seraient découverts, ceux-ci seraient alors répertoriés dans un registre de séquence HLA Classe II, permettant d'actualiser la collection de sondes spécifiques à l'aide de sondes supplémentaires, et donc d'adapter la méthodologie à la détection de tout nouvel allèle. According to the method of the invention, the identification of an allele can be deduced from a binding model of a set of probes, each individual probe of the set being specific for different parts of the HLA DQ gene. Thanks to the choice of several probes, the oligonucleotide typing method of the present invention makes it possible to identify, if desired, all the DQB 1 alleles. In the event that new alleles are discovered, these would then be listed in an HLA Class sequence register. II, making it possible to update the collection of specific probes using additional probes, and therefore to adapt the methodology to the detection of any new allele.

Pour rationaliser le typage HLA Classe II complet, on peut effectuer tout d'abord une première étape de typage DQB, lequel permet, avec un nombre déterminé de sondes, d'identifier les principales spécificités HLA DQB. To rationalize the complete HLA Class II typing, we can first of all perform a first DQB typing step, which makes it possible, with a determined number of probes, to identify the main HLA DQB specificities.

Cette étape est souvent suffisante pour un grand nombre d'applications cliniques. This step is often sufficient for a large number of clinical applications.

Toutefois, la présente invention permet également une deuxième étape du typage DQB qui, avec un nombre plus important de sondes, permet de reconnaître toutes les spécificités HLA DQB connues à ce jour.However, the present invention also allows a second step of DQB typing which, with a larger number of probes, makes it possible to recognize all the HLA DQB specificities known to date.

L'analyse des spécificités HLA DQB par la technique de typage par oligonucléotides de la présente invention peut être appliquée dans les laboratoires d'histocompatibilité pour le typage DQB de routine, en remplacement de la sérologie, notamment pour effectuer le typage
DQB de patients en liste d'attente pour une greffe rénale ou le typage de donneurs de reins potentiels, le typage DQB de patients leucémiques, pour lesquels une greffe de moelle osseuse est envisagée, ainsi que le typage des membres de leur famille ou des donneurs potentiels non apparentés, les typages DQB à grande échelle pour la constitution de registres de donneurs de moelle volontaires, ou pour déterminer des associations entre des maladies et le système HLA, par exemple dans le cas du diabète insulino-dépendant, pour des applications en médecine prédictive ou encore pour des recherches de paternité et autres identifications judiciaires.
Analysis of HLA DQB specificities by the oligonucleotide typing technique of the present invention can be applied in histocompatibility laboratories for routine DQB typing, replacing serology, in particular for performing typing.
DQB of patients on the waiting list for a kidney transplant or the typing of potential kidney donors, the DQB typing of leukemia patients, for whom a bone marrow transplant is considered, as well as the typing of their family members or donors unrelated potentials, large-scale DQB typing for building voluntary bone marrow donor registries, or for determining associations between diseases and the HLA system, for example in insulin-dependent diabetes, for applications in medicine predictive or for paternity searches and other forensic identifications.

Tout type de tissu contenant de l'acide nucléique FILA DQB peut être utilisé comme échantillon dans le procédé de l'invention. Il est aussi possible d'utiliser des fragments d'acides nucléiques (ADN ou ARN) obtenus après coupure chimique, enzymatique ou analogue de l'acide nucléique présent dans un échantillon. Cependant, en pratique, une étape préalable d'amplification de l'ADN ou de l'ARN doit être effectuée. Any type of tissue containing FILA DQB nucleic acid can be used as a sample in the method of the invention. It is also possible to use fragments of nucleic acids (DNA or RNA) obtained after chemical, enzymatic or analog cleavage of the nucleic acid present in a sample. However, in practice, a preliminary step of amplifying the DNA or the RNA must be carried out.

L'invention a également pour objet un kit pour le typage HLA DQB1 d'un individu, ledit kit comprenant l'une au moins des sondes suivantes : 26B, 26C, 26D, 26F, 26E, 23A, 49A, 55A, 70A, 70B, HRP1 et HRP2, et pouvant contenir en outre une ou plusieurs sondes choisies parmi 26A, 57B, 57C, 37A, 45A, 57A et HRP3. A subject of the invention is also a kit for the HLA DQB1 typing of an individual, said kit comprising at least one of the following probes: 26B, 26C, 26D, 26F, 26E, 23A, 49A, 55A, 70A, 70B , HRP1 and HRP2, and may also contain one or more probes selected from 26A, 57B, 57C, 37A, 45A, 57A and HRP3.

L'invention concerne en particulier un kit comprenant les sondes (notamment sondes de capture) suivantes : 26B, 26C, 26D, 26E, 26F, 23A, 49A, 55A, 70A, 70B , 26A, 57B, 57C, 37A et éventuellement l'une au moins des sondes 45A et 57A. Ce kit peut contenir en outre une ou plusieurs sondes de détection choisies parmi HRPI, HRP2 et HRP3. The invention relates in particular to a kit comprising the following probes (in particular capture probes): 26B, 26C, 26D, 26E, 26F, 23A, 49A, 55A, 70A, 70B, 26A, 57B, 57C, 37A and optionally the at least one of the probes 45A and 57A. This kit can also contain one or more detection probes chosen from HRPI, HRP2 and HRP3.

Les informations recueillies grâce à l'emploi de ces sondes sont ensuite utilisées pour déterminer le typage en fonction d'un plan de typage établi, tenant compte des sondes utilisées et de la connaissance des types HLA DQB et/ou sous types associés répertoriés. Ce travail est simplifié par l'utilisation d'un plan de typage, c'est à dire un tableau donnant directement les types et/ou sous types en fonction des réponses positives (hybridations) observées. Pour l'ensemble des sondes de la présente invention un tel tableau est représenté dans le tableau 3 annexé. The information collected through the use of these probes is then used to determine the typing based on an established typing plan, taking into account the probes used and knowledge of the HLA DQB types and / or associated subtypes listed. This work is simplified by the use of a typing plan, ie a table giving directly the types and / or sub types according to the positive responses (hybridizations) observed. For all the probes of the present invention, such a table is shown in Table 3 attached.

Les sondes utilisées dans la présente invention sont des oligonucléotides spécifiques d'une séquence (OSS) qui, dans des conditions appropriées, peuvent se lier spécifiquement à leur séquence complémentaire. Si une sonde particulière peut être utilisée pour identifier uniquement un allèle, la sonde est alors appelée OSA c'est à dire oligonucléotide spécifique d'un allèle. The probes used in the present invention are sequence specific oligonucleotides (OSS) which, under appropriate conditions, can bind specifically to their complementary sequence. If a particular probe can be used to identify only one allele, then the probe is called OSA, ie allele specific oligonucleotide.

Comme déjà remarqué précédemment, il est possible qu'une seule sonde ne soit pas capable d'identifier à elle seule un allèle spécifique DQ B.As already noted previously, it is possible that a single probe alone will not be able to identify a specific DQ B allele.

On donne ci-après quelques définitions de termes utilisés dans la présente demande:
"Génotypique" fait réfërence aux caractéristiques du génome d'un individu par opposition au "phénotype" qui est une caractéristique d'un individu telle qu'elle ressort de l'analyse des produits d'expression des gènes, notamment les protéines.
Some definitions of terms used in the present application are given below:
"Genotypic" refers to the characteristics of the genome of an individual as opposed to the "phenotype" which is a characteristic of an individual as it emerges from the analysis of the expression products of genes, in particular proteins.

"Alléle" désigne les différentes formes alternatives d'un meme gène qui présente des différences au niveau de la séquence nucléique. Ces différences se manifestent au niveau de l'ADN, de l'ARN et de leur traduction en protéines. “Alléle” designates the various alternative forms of the same gene which exhibits differences at the level of the nucleic sequence. These differences are manifested in DNA, RNA and their translation into proteins.

"Polymorphisme" caractérise la diversité introduite dans une population par l'existence d'allèles différents pour un même gène. "Polymorphism" characterizes the diversity introduced into a population by the existence of different alleles for the same gene.

"Oligonucléotide" tel qu'utilisé ici désigne des amorces, des sondes ou des fragments d'acide nucléique devant être détectés... Les oligonucléotides peuvent être préparés par toute méthode appropriée connue. "Oligonucleotide" as used herein refers to primers, probes or nucleic acid fragments to be detected ... Oligonucleotides can be prepared by any suitable known method.

Dans la présente description et dans la partie expérimentale qui suit, il est fait référence aux tableaux 1 à 4 annexés. il convient d'attirer l'attention sur le fait qu'une même appellation de sonde (telle que 26A, HRP3, etc.) peut désigner non seulement une séquence permettant de définir plusieurs sondes avec indication d'une séquence minimum soulignée (comme c'est le cas dans la description ci-dessus), mais aussi une séquence correspondant à la séquence minimum soulignée (comme c'est le cas dans les exemples ci-après et dans les tableaux 1 à 4 annexés). In the present description and in the experimental part which follows, reference is made to the attached Tables 1 to 4. attention should be drawn to the fact that the same probe designation (such as 26A, HRP3, etc.) can designate not only a sequence making it possible to define several probes with indication of an underlined minimum sequence (such as c 'is the case in the description above), but also a sequence corresponding to the minimum sequence underlined (as is the case in the examples below and in Tables 1 to 4 appended).

On a représenté dans le tableau 1 annexé les alignements de l'ADN des différents allèles du gène DQB dans le but de définir les positions des mutations correspondant à des mutations d'acides aminés (désignés à l'aide du code à une lettre) représentées dans le tableau 2, par rapport à la séquence consensus choisie, qui est DQBI*0501. Les mutations de l'ADN peuvent être des mutations non silencieuses, c'est à dire des mutations dont la traduction conduit à un changement d'acide aminé. The attached table 1 shows the DNA alignments of the various alleles of the DQB gene with the aim of defining the positions of the mutations corresponding to amino acid mutations (designated using the one-letter code) represented in Table 2, relative to the chosen consensus sequence, which is DQBI * 0501. DNA mutations can be non-silent mutations, ie mutations whose translation leads to an amino acid change.

Dans le cas de typage des différents allèles, on utilise le plus souvent les mutations sur l'ADN correspondant aux mutations non silencieuses, qui sont évidemment les plus importantes, mais il est possible de détecter une mutation de type silencieux, par exemple dans le but de différencier deux allèles très proches. In the case of typing the different alleles, we most often use the mutations on the DNA corresponding to the non-silent mutations, which are obviously the most important, but it is possible to detect a mutation of the silent type, for example with the aim of to differentiate two very close alleles.

Dans les tableaux 1 et 2, on a représenté les alignements en nucléotides et acides aminés du gène DQB I pour tous les alléles connus et publiés dans la littérature connue à ce jour. Tables 1 and 2 show the nucleotide and amino acid alignments of the DQB I gene for all the alleles known and published in the literature known to date.

Le tableau 3 annexé résume la correspondance entre les sondes et les spécificités reconnues : lorsque sur une ligne, une case est noircie, cela signifie que la spécificité mentionnée à cette ligne est reconnue par la sonde de la colonne correspondante. Table 3 appended summarizes the correspondence between the probes and the recognized specificities: when a box is blackened in a row, this means that the specificity mentioned in this row is recognized by the probe of the corresponding column.

Le tableau 4 annexé reprend la correspondance entre sonde et spécificités
HLA DQB 1 avec en outre l'indication des mutations silencieuses ou des acides aminés variants.
The attached table 4 shows the correspondence between probe and specificities
HLA DQB 1 with further indication of silent mutations or variant amino acids.

Les exemples suivants illustrent l'invention. The following examples illustrate the invention.

Erentple 1:
On a préparé diverses sondes liées à un ligand favorisant leur fixation sur un support solide. Le ligand utilisé est un composé disponible dans le commerce, dénommé Aminolink 2, et commercialisé par la société Applied Biosystems sous la référence 400808.
Erentple 1:
Various probes bound to a ligand have been prepared which promote their attachment to a solid support. The ligand used is a commercially available compound called Aminolink 2, and marketed by the company Applied Biosystems under the reference 400808.

Le couplage du ligand à un oligonucléotide est effectué selon le protocole général suivant
Un oligonucléotide est synthétisé sur un appareil automatique 381 A de la société
Applied Biosystems en utilisant la chimie des phosphoramidites selon le protocole du constructeur. Le ligand phosphoramidite dissous dans de l'acétonitrile anhydre à une concentration de 0,2M est placé en position X du synthétiseur et l'addition du ligand se fait par l'extrémité 5' de l'oligonucléotide selon le protocole standard de la synthèse automatique lorsque la synthèse de l'oligonucléotide est achevée.
The coupling of the ligand to an oligonucleotide is carried out according to the following general protocol
An oligonucleotide is synthesized on an automatic 381 A device from the company
Applied Biosystems using phosphoramidite chemistry according to manufacturer's protocol. The phosphoramidite ligand dissolved in anhydrous acetonitrile at a concentration of 0.2M is placed in the X position of the synthesizer and the addition of the ligand is done through the 5 'end of the oligonucleotide according to the standard protocol of automatic synthesis. when the synthesis of the oligonucleotide is complete.

Après déprotection une nuit à 550C dans une solution d'ammoniaque à 33 %, suivie d'une précipitation dans de l'éthanol à -20 C, l'oligonucléotide modifié (lié au ligand) est séché sous vide et repris dans 1 ml d'eau. After deprotection overnight at 550 ° C. in a 33% ammonia solution, followed by precipitation in ethanol at -20 ° C., the modified oligonucleotide (bound to the ligand) is dried under vacuum and taken up in 1 ml of 'water.

L'oligonucléotide modifié à son extrémité 5' est purifié par chromatographie liquide haute performance en phase inverse sur une colonne de Brownlee RP 18 (iOmm-25cm). The oligonucleotide modified at its 5 'end is purified by reverse phase high performance liquid chromatography on a Brownlee RP 18 column (10 mm-25 cm).

Conditions: débit 4,6 ml/min
Gradient 10 % à 35 % de tampon A en 30 min.
Conditions: flow rate 4.6 ml / min
Gradient 10% to 35% Buffer A in 30 min.

35 % à 100 % de tampon B en 3 min. 35% to 100% buffer B in 3 min.

Tampon A : 0,1 molaire Triéthylammoniumacétate (TEAA), pH 7
Tampon B . 50 % Tampon A + 50 % CH3CN.
Buffer A: 0.1 molar Triethylammoniumacetate (TEAA), pH 7
Buffer B. 50% Buffer A + 50% CH3CN.

Eveniple 2 : Prépar Eveniple 2: Prep

Exemple 3: Amplification de l'ADN cible. Example 3: Amplification of target DNA.

L'amplification est réalisée par PCR en utilisant les amorces suivantes
- amorce 1 : 5'C ATG TGC TAC TTC ACC AAC GG 3'
- amorce 2: 5' CTG GTA GTT GTG TCT GCA CAC 3'
Ces amorces sont désignées dans le tableau 1 par les appellations DQBAMP-A et
DQBAMP-B.
Amplification is carried out by PCR using the following primers
- primer 1: 5'C ATG TGC TAC TTC ACC AAC GG 3 '
- primer 2: 5 'CTG GTA GTT GTG TCT GCA CAC 3'
These primers are designated in Table 1 by the names DQBAMP-A and
DQBAMP-B.

Exemple 4:
Dans les puits d'une plaque de microtitration (Nunc 43454) sont déposés 100 l d'une solution d'un oligonucléotide de capture d'une spécificité DQ donnée (à raison d'un oligonucléotide de capture par puits) à une concentration de 10 à 400 nM dans du PBS 3 x (0,45
M NaCI, 0,15 M phosphate de sodium, pH 7). On utilise donc autant de puits que de sondes de capture nécessaires pour le typage. Les plaques sont incubées pendant 2 heures à 37 C ou pendant 15 à 22 heures à température ambiante.
Example 4:
In the wells of a microtiter plate (Nunc 43454) are deposited 100 l of a solution of a capture oligonucleotide of a given DQ specificity (at the rate of one capture oligonucleotide per well) at a concentration of 10 at 400 nM in 3x PBS (0.45
M NaCl, 0.15 M sodium phosphate, pH 7). As many wells are therefore used as there are capture probes necessary for the typing. The plates are incubated for 2 hours at 37 C or for 15 to 22 hours at room temperature.

Dans tous les cas un contrôle positif est ajouté afin de vérifier l'étape d'amplification et celle de détection. La sonde de capture qui est utilisée comme contrôle positif (désignée par
C+) est présente sur tous les alléles connus à ce jour. Sa séquence est la suivante S'GAGTACTGG AACAGCCAGAAGGA3'.
In all cases, a positive control is added in order to verify the amplification step and the detection step. The capture probe that is used as a positive control (designated as
C +) is present on all alleles known to date. Its sequence is the following S'GAGTACTGG AACAGCCAGAAGGA3 '.

Une sonde de capture est utilisée comme contrôle négatif (désignée par C-) et a la séquence suivante. 5' TAT GAA ACT TAT GGG GAT AC 3'
La plaque est lavée trois fois avec 300 Ill de PBS Tween (0,15 M NaCl, 0,05M phosphate de sodium, pH 7 ; 0,5 % Tween 20 (Merck 822184). Le produit d'amplification est dénaturé dans 10 l de NaOH 2N pendant 5 min à température ambiante. 10 pl d'acide acétique 2N puis 2,3 ml de tampon d'hybridation (PEG : Phosphate de sodium 0,1M, pH 7, NaCI 0,5M,
Tween 20 0,65 %, ADN de sperme de saumon (Sigma D 9156) 0,14 mg/ml, PEG 4000 (Merck 807490 2 %) et 0,25 ml d'une sonde de détection marquée (conjugué oligonucléotideperoxydase) sont additionnés successivement à cette solution. La solution finale est répartie dans chaque puits à raison de 0,1 ml par puits. Les plaques sont incubées pendant 60 min. à 370C. Les plaques sont lavées trois fois avec 300 ol de PBS Tween. 100 ol de substrat orthophénylènediamine (OPD) (Cambridge Medical Biotechnology ref. 456) dans un tampon
OPD (0,05 M acide citrique, 0,1 M Na2HP04, pH 4,9) à la concentration de 4 mg/ml, auquel est additionné extemporanément du peroxyde d'hydrogène à 30 volumes dilué au 1/1000, sont ajoutés par puits. Après 20 min. de réaction, l'activité enzymatique est bloquée par 100 Ill d'H2S04 IN et la lecture est effectuée à 492 nm.
A capture probe is used as a negative control (designated as C-) and has the following sequence. 5 'TAT GAA ACT TAT GGG GAT AC 3'
The plate is washed three times with 300 µl of PBS Tween (0.15 M NaCl, 0.05 M sodium phosphate, pH 7; 0.5% Tween 20 (Merck 822184). The amplification product is denatured in 10 µl. of 2N NaOH for 5 min at room temperature. 10 μl of 2N acetic acid then 2.3 ml of hybridization buffer (PEG: 0.1M sodium phosphate, pH 7, 0.5M NaCl,
Tween 20 0.65%, DNA from salmon sperm (Sigma D 9156) 0.14 mg / ml, PEG 4000 (Merck 807490 2%) and 0.25 ml of a labeled detection probe (oligonucleotide peroxidase conjugate) are added successively to this solution. The final solution is distributed in each well at the rate of 0.1 ml per well. The plates are incubated for 60 min. at 370C. The plates are washed three times with 300 µl of PBS Tween. 100ol orthophenylenediamine (OPD) substrate (Cambridge Medical Biotechnology ref. 456) in buffer
OPD (0.05 M citric acid, 0.1 M Na2HP04, pH 4.9) at a concentration of 4 mg / ml, to which is added extemporaneously hydrogen peroxide at 30 volumes diluted to 1/1000, are added by well. After 20 min. reaction, the enzymatic activity is blocked by 100 µl of IN 2 SO 4 and the reading is taken at 492 nm.

exemple 5:
10 ADN sont amplifiés selon la technique PCR. On effectue ensuite le typage. Le protocole de typage est généralement conforme à celui décrit ci-dessus. On effectue les hybridations selon la méthode sandwich.
example 5:
10 DNAs are amplified according to the PCR technique. Typing is then performed. The typing protocol generally conforms to that described above. Hybridizations are carried out according to the sandwich method.

Le protocole de typage utilise les sondes de capture indiquées ci-après et, selon les cas, les sondes de détection HRPI, HRP2 ou HRP3. The typing protocol uses the capture probes indicated below and, depending on the case, the HRPI, HRP2 or HRP3 detection probes.

La méthode décrite permet de typer les 10 ADN testés. Quelques résultats de typage sont donnés ci-après à titre d'illustration. The method described makes it possible to type the 10 DNAs tested. Some typing results are given below by way of illustration.

Cas n" 1
Sondes DO x 1000 (492 nm)
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57C 12
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70B 12
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Résultat : Le patient est DQB1*0201 ou 0202/0302 ou 0303
Cas n 2
Sondes DO x 1000 (492 nm)
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Résultat : Le patient est DQB1*0502/0401 Tableau 1

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Case n "1
DO x 1000 probes (492 nm)
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70A 32
26E
55A 316
70B 12
23A 13 **** means: saturation
Result: The patient is DQB1 * 0201 or 0202/0302 or 0303
Case n 2
DO x 1000 probes (492 nm)
26A 887 49A 12 57B 459 57C 11 37A 57 26B 80 26C 10 26D 14 26F 10 70A 14 26E 11 55A 11 70B 688 23A 302
Result: The patient is DQB1 * 0502/0401 Table 1
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<tb> 26A <SEP> H30 <SEP> C <SEP> AGA <SEP> CAC <SEP> ATC <SEP> TAT <SEP> AAC <SEP> DQB1*0501+0502+05031+05032+0603+0604+0607+0608
<tb> 26B <SEP> sil25Y26 <SEP> CGT <SEP> TAT <SEP> GTG <SEP> ACC <SEP> AGA <SEP> DQB1*06011+06012+0301+0304
<tb> 26C <SEP> sil25L26 <SEP> G <SEP> CGT <SEP> CTT <SEP> GTG <SEP> ACC <SEP> AGA <SEP> DQB1*0602+0302+03032
<tb> 26D <SEP> L26sil27 <SEP> CTT <SEP> GTA <SEP> ACC <SEP> AGA <SEP> CAC <SEP> DQB1*0603+0604+0607+0608
<tb> 26E <SEP> L26S28S30 <SEP> T <SEP> CTT <SEP> GTG <SEP> AGC <SEP> AGA <SEP> AGC <SEP> DQB1*0201+0202
<tb> 26F <SEP> sil25L26sil27Y30 <SEP> T <SEP> CTT <SEP> GTA <SEP> ACC <SEP> AGA <SEP> TAC <SEP> DQB1*06051+06052+0606+0609
<tb> 37A <SEP> D37 <SEP> AG <SEP> GAG <SEP> GAC <SEP> GTG <SEP> CGC <SEP> DQB1*06011+06012
<tb> 45A <SEP> E45 <SEP> GAC <SEP> GTG <SEP> GAG <SEP> GTG <SEP> TAC <SEP> DQB1*0301+0304
<tb> 49A <SEP> A49 <SEP> AC <SEP> CGG <SEP> GCA <SEP> GTG <SEP> AC <SEP> DOB1*0501
<tb> 55A <SEP> L53P55 <SEP> CG <SEP> CCG <SEP> CTG <SEP> GGI <SEP> CCG <SEP> CCT <SEP> G <SEP> DQB1*0301+0302+03032+0304+0305
<tb> 57A <SEP> V57 <SEP> CCT <SEP> GTT <SEP> GCC <SEP> GAG <SEP> TA <SEP> DQB1*0501+0604+06051+0606+0608+0609
<tb> 57B <SEP> S57 <SEP> G <SEP> CCT <SEP> AGC <SEP> GCC <SEP> GAG <SEP> TA <SEP> DQB1*0502+0504
<tb> 57C <SEP> D57 <SEP> G <SEP> CCT <SEP> GAT <SEP> GCC <SEP> GAG <SEP> T <SEP> DQB1*05032+0602+0603+0607
<tb> 70A <SEP> T71E74 <SEP> AG <SEP> GGI <SEP> ACC <SEP> CIG <SEP> GCI <SEP> GA <SEP> DQB1*0602+0603+0608
<tb> 70B <SEP> T77sil78 <SEP> G <SEP> GTG <SEP> GAC <SEP> ACC <SEP> GTA <SEP> TGC <SEP> AG <SEP> DQB1*0401+0402
<tb> C+ <SEP> - <SEP> GAG <SEP> TAC <SEP> TGG <SEP> AAC <SEP> AGC <SEP> CAG <SEP> AAG <SEP> GA <SEP>
C- <SEP> - <SEP> TAT <SEP> GAA <SEP> ACT <SEP> TAT <SEP> GGG <SEP> GAT <SEP> AC <SEP>
HRP1 <SEP> - <SEP> ACG <SEP> GAG <SEP> CGC <SEP> GTG <SEP>
HRP2 <SEP> - <SEP> ATC <SEP> TAT <SEP> AAC <SEP> CGA <SEP> GA <SEP>
HRP3 <SEP> - <SEP> CGC <SEP> TTC <SEP> GAC <SEP> AGC <SEP> GAC <SEP> GTG <SEP> G <SEP> C+ : contrôle positif C- : contrôle négatif sil : mutation silencieuse
Les acides aminés variants sont indiqués par le code à une lettre suivi de leur positionnement
Oligoprobes <SEP> Amino acids <SEP><SEP> Nucleotide <SEP> sequences <SEP> 5 '>3'<SEP> Specificities
<tb> variants
<tb> 23A <SEP> sil21L23 <SEP> ACC <SEP> GAG <SEP> CTC <SEP> GTG <SEP> CGG <SEP> GG <SEP> DQB1 * 0401
<tb> 26A <SEP> H30 <SEP> C <SEP> AGA <SEP> CAC <SEP> ATC <SEP> TAT <SEP> AAC <SEP> DQB1 * 0501 + 0502 + 05031 + 05032 + 0603 + 0604 + 0607 +0608
<tb> 26B <SEP> sil25Y26 <SEP> CGT <SEP> TAT <SEP> GTG <SEP> ACC <SEP> AGA <SEP> DQB1 * 06011 + 06012 + 0301 + 0304
<tb> 26C <SEP> sil25L26 <SEP> G <SEP> CGT <SEP> CTT <SEP> GTG <SEP> ACC <SEP> AGA <SEP> DQB1 * 0602 + 0302 + 03032
<tb> 26D <SEP> L26sil27 <SEP> CTT <SEP> GTA <SEP> ACC <SEP> AGA <SEP> CAC <SEP> DQB1 * 0603 + 0604 + 0607 + 0608
<tb> 26E <SEP> L26S28S30 <SEP> T <SEP> CTT <SEP> GTG <SEP> AGC <SEP> AGA <SEP> AGC <SEP> DQB1 * 0201 + 0202
<tb> 26F <SEP> sil25L26sil27Y30 <SEP> T <SEP> CTT <SEP> GTA <SEP> ACC <SEP> AGA <SEP> TAC <SEP> DQB1 * 06051 + 06052 + 0606 + 0609
<tb> 37A <SEP> D37 <SEP> AG <SEP> GAG <SEP> GAC <SEP> GTG <SEP> CGC <SEP> DQB1 * 06011 + 06012
<tb> 45A <SEP> E45 <SEP> GAC <SEP> GTG <SEP> GAG <SEP> GTG <SEP> TAC <SEP> DQB1 * 0301 + 0304
<tb> 49A <SEP> A49 <SEP> AC <SEP> CGG <SEP> GCA <SEP> GTG <SEP> AC <SEP> DOB1 * 0501
<tb> 55A <SEP> L53P55 <SEP> CG <SEP> CCG <SEP> CTG <SEP> GGI <SEP> CCG <SEP> CCT <SEP> G <SEP> DQB1 * 0301 + 0302 + 03032 + 0304 + 0305
<tb> 57A <SEP> V57 <SEP> CCT <SEP> GTT <SEP> GCC <SEP> GAG <SEP> TA <SEP> DQB1 * 0501 + 0604 + 06051 + 0606 + 0608 + 0609
<tb> 57B <SEP> S57 <SEP> G <SEP> CCT <SEP> AGC <SEP> GCC <SEP> GAG <SEP> TA <SEP> DQB1 * 0502 + 0504
<tb> 57C <SEP> D57 <SEP> G <SEP> CCT <SEP> GAT <SEP> GCC <SEP> GAG <SEP> T <SEP> DQB1 * 05032 + 0602 + 0603 + 0607
<tb> 70A <SEP> T71E74 <SEP> AG <SEP> GGI <SEP> ACC <SEP> CIG <SEP> GCI <SEP> GA <SEP> DQB1 * 0602 + 0603 + 0608
<tb> 70B <SEP> T77sil78 <SEP> G <SEP> GTG <SEP> GAC <SEP> ACC <SEP> GTA <SEP> TGC <SEP> AG <SEP> DQB1 * 0401 + 0402
<tb> C + <SEP> - <SEP> GAG <SEP> TAC <SEP> TGG <SEP> AAC <SEP> AGC <SEP> CAG <SEP> AAG <SEP> GA <SEP>
C- <SEP> - <SEP> TAT <SEP> GAA <SEP> ACT <SEP> TAT <SEP> GGG <SEP> GAT <SEP> AC <SEP>
HRP1 <SEP> - <SEP> ACG <SEP> GAG <SEP> CGC <SEP> GTG <SEP>
HRP2 <SEP> - <SEP> ATC <SEP> TAT <SEP> AAC <SEP> CGA <SEP> GA <SEP>
HRP3 <SEP> - <SEP> CGC <SEP> TTC <SEP> GAC <SEP> AGC <SEP> GAC <SEP> GTG <SEP> G <SEP> C +: positive control C-: negative control sil: silent mutation
Variant amino acids are indicated by the one-letter code followed by their position

Claims (18)

REVENDICATIONS 1. Sonde nucléotidique choisie parmi les suivantes 1. Nucleotide probe chosen from the following - TGCGTTATGTGACCAGA, - TGCGTTATGTGACCAGA, - GTG CGT CTT GTG ACC AGA, - GTG CGT CTT GTG ACC AGA, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT, - CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - G TAC CGG GCA GTG ACG C, - G TAC CGG GCA GTG ACG C, - G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G. - G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G. et leurs complémentaires, étant entendu que lesdites sondes ont au minimum la séquence soulignée, et peuvent contenir en outre une ou deux bases choisies, en respectant la continuité de la séquence, parmi les bases non soulignées. and their complementaries, it being understood that said probes have at least the underlined sequence, and can also contain one or two bases chosen, while respecting the continuity of the sequence, from the non-underlined bases. - CATCTATAACCGAGA, - CATCTATAACCGAGA, - GGACG GAG CGC GTG CG, - GGACG GAG CGC GTG CG, - G GAG GGG ACC CGG GCG GAG T, - TCGGTG TCACACCGTATGCAA C, - G GAG GGG ACC CGG GCG GAG T, - TCGGTG TCACACCGTATGCAA C, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G, - G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G, 2. Sonde selon la revendication 1, choisie parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes, et leurs complémentaires 2. Probe according to claim 1, chosen from those which are defined by the following sequences, and their complements - TGCGTTATGTGACCAGA, - TGCGTTATGTGACCAGA, - GTG CGT CTT GTG ACC AGA, - GTG CGT CTT GTG ACC AGA, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGTCTTGTGAGCAGAAGCAT, - CGTCTTGTGAGCAGAAGCAT, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - GTACCGGGCAGTGACGC, - GTACCGGGCAGTGACGC, - G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G. - G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G. - G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G. - G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G. - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C. - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C. - GGAGGGGACCCGGGCGGAGT, - GGAGGGGACCCGGGCGGAGT, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, 3. Sondes selon la revendication 1, choisies parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes, et leurs complémentaires 3. Probes according to claim 1, chosen from those which are defined by the following sequences, and their complementaries - GG ACG GAG CGC GTG CG, - GG ACG GAG CGC GTG CG, - C ATC TAT AAC CGA GA. - C ATC TAT AAC CGA GA. 4. Sondes selon l'une quelconque des revendications précédentes, dont la séquence correspond à la séquence soulignée, et leurs complémentaires. 4. Probes according to any one of the preceding claims, the sequence of which corresponds to the underlined sequence, and their complements. 5. Sonde selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisée par le fait que lesdites sondes sont soit marquées, soit couplées à un ligand destiné à faciliter leur fixation sur un support solide, soit fixées sur un support solide. 5. Probe according to any one of the preceding claims, characterized in that said probes are either labeled, or coupled to a ligand intended to facilitate their attachment to a solid support, or fixed to a solid support. 6. Procédé pour déterminer au moins partiellement le typage HLADQB1 d'un acide nucléique cible présent dans un échantillon, dans lequel on effectue des essais d'hybridation, selon les méthodes connues, dudit acide nucléique de l'échantillon avec des sondes oligonucléotidiques, et dans lequel on retient comme essais positifs les essais pour lesquels on observe effectivement une hybridation à une température unique égale à 37+2 C, lesdites sondes oligonucléotidiques comprenant au moins une sonde choisie parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes 6. Method for at least partially determining the HLADQB1 typing of a target nucleic acid present in a sample, in which hybridization tests are carried out, according to known methods, of said nucleic acid of the sample with oligonucleotide probes, and in which the tests for which hybridization is effectively observed at a single temperature equal to 37 + 2 ° C. are retained as positive tests, said oligonucleotide probes comprising at least one probe chosen from those which are defined by the following sequences - TG CGT TAT GTG ACC AGA, - TG CGT TAT GTG ACC AGA, - GTGCGTCTTGTGACCAGA, - GTGCGTCTTGTGACCAGA, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGTCTTGTGAGCAGAAGCAT, - CGTCTTGTGAGCAGAAGCAT, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - G TAC CGG GCA GTG ACG C, - G TAC CGG GCA GTG ACG C, - G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G, - G ACG CCG CTG GGI CCG CCT G, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C, - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C, ou leurs complémentaires, étant entendu que lesdites sondes contiennent au minimum la séquence soulignée et peuvent contenir en outre une ou deux bases supplémentaires choisies, en respectant la continuité de la séquence, parmi les bases non soulignées. or their complementaries, it being understood that said probes contain at least the underlined sequence and can also contain one or two additional bases chosen, while respecting the continuity of the sequence, from the non-underlined bases. 7. Procédé selon la revendication 6, dans lequel on effectue en outre des essais d'hybridation de l'acide nucléique de l'échantillon avec au moins une sonde choisie parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes 7. The method of claim 6, wherein the sample nucleic acid hybridization tests are also carried out with at least one probe chosen from those which are defined by the following sequences. - ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG, - ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG, - GG CCT GTT GCC GAG TAC T, - GG CCT GTT GCC GAG TAC T, - CGG CCT AGC GCC GAG TAC T, - CGG CCT AGC GCC GAG TAC T, - CGG CCT GAT GCC GAG TAC, - CGG CCT GAT GCC GAG TAC, ou leurs complémentaires. or their complementary. 8. Procédé selon l'une quelconque des revendications 6 et 7, dans lequel on effectue en outre des essais d'hybridation de la cible nucléique de l'échantillon avec au moins une sonde choisie parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes 8. Method according to any one of claims 6 and 7, in which further tests are carried out for hybridization of the nucleic target of the sample with at least one probe chosen from those which are defined by the following sequences. - GC GAC.GTG GAG .GTG.TAC CG, - GC GAC.GTG GAG .GTG.TAC CG, - A GAG GAG GAC GTG CGC TT, - A GAG GAG GAC GTG CGC TT, ou leurs complémentaires. or their complementary. 9. Procédé selon l'une quelconque des revendications 6 à 8, dans lequel on utilise lesdites sondes comme sondes de capture. 9. A method according to any one of claims 6 to 8, wherein said probes are used as capture probes. 10. Procédé selon la revendication précédente, dans lequel on révèle la présence éventuelle d'acide nucléique, fixé sur un support solide par hybridation par une sonde de capture, à l'aide d'une sonde de détection marquée capable de s'hybrider avec une région de la cible autre que celle reconnue par ladite sonde de capture. 10. Method according to the preceding claim, wherein the possible presence of nucleic acid, attached to a solid support by hybridization with a capture probe, using a labeled detection probe capable of hybridizing with is revealed. a region of the target other than that recognized by said capture probe. 11. Procédé selon la revendication précédente, dans lequel les sondes de détection sont choisies parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes, ou leurs complémentaires 11. Method according to the preceding claim, in which the detection probes are chosen from those which are defined by the following sequences, or their complementaries. - GG ACG GAG CGC GTG CG, - GG ACG GAG CGC GTG CG, - C ATC TAT AAC CGA GA, - C ATC TAT AAC CGA GA, - CGC TTC GAC AGC GAC GTG G. - CGC TTC GAC AGC GAC GTG G. 12. Procédé selon l'une quelconque des revendications 6 à 11, caractérisé par le fait que lesdites sondes sont définies comme dans la revendication 4. 12. Method according to any one of claims 6 to 11, characterized in that said probes are defined as in claim 4. 13. Kit pour le typage HLA DQB 1, comprenant au moins une sonde choisie parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes 13. Kit for HLA DQB 1 typing, comprising at least one probe chosen from among those defined by the following sequences - TG CGT TAT GTG ACC AGA, - TG CGT TAT GTG ACC AGA, - GTG CGT CTT GTG ACC AGA, - GTG CGT CTT GTG ACC AGA, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT, - CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - G TAC CGG GCA GTG ACG C, - G TAC CGG GCA GTG ACG C, - GACG CCGCTGGGI CCGCCTG. - GACG CCGCTGGGI CCGCCTG. - G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G. - G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G. ou leurs complémentaires. or their complementary. - CGC TTC GAC AGC GAC GTG G, - CGC TTC GAC AGC GAC GTG G, - GC GAC GTG GAG GTG TAC CG, - GC GAC GTG GAG GTG TAC CG, - A GAG GAG GAC GTG CGC TT, - A GAG GAG GAC GTG CGC TT, - CGG CCT GAT GCC GAG TAC, - CGG CCT GAT GCC GAG TAC, - CGG CCT AGC GCC GAG TAC T, - CGG CCT AGC GCC GAG TAC T, - GGCCTGTTGCCGAGTACT, - GGCCTGTTGCCGAGTACT, - ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG, - ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG, ou leurs complémentaires, et pouvant contenir en outre une ou plusieurs sondes choisies parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes or their complements, and may also contain one or more probes chosen from those which are defined by the following sequences - CATCTATAACCGAGA, - CATCTATAACCGAGA, - GG ACG GAG CGC GTG CG, - GG ACG GAG CGC GTG CG, - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C, - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C, - G GAG GGG ACC CGG GCG GAG T, - G GAG GGG ACC CGG GCG GAG T, - GGAGGGi ACCCIGGCIGAGT, - GGAGGGi ACCCIGGCIGAGT, 14. Kit selon la revendication précédente, comprenant les sondes définies par les séquences suivantes 14. Kit according to the preceding claim, comprising the probes defined by the following sequences - TGCGTTATGTGACCAGA, - TGCGTTATGTGACCAGA, - GTG CGT CTT GTG ACC AGA, - GTG CGT CTT GTG ACC AGA, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT, - CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - GG ACC GAG CTC GTG CGG GGT G, - G TAC CGG GCA GTG ACG C, - G TAC CGG GCA GTG ACG C, - G ACG CCG CTG GGl CCG CCT G. - G ACG CCG CTG GGl CCG CCT G. ou leurs complémentaires. or their complementary. - GC GAC GTG GAG GTG TAC CG, - GC GAC GTG GAG GTG TAC CG, - A GAG GAG GAC GTG CGC TT, - A GAG GAG GAC GTG CGC TT, - CGGCCTGATGCCGAGTAC, - CGGCCTGATGCCGAGTAC, - CGG CCT AGC GCC GAG TAC T, - CGG CCT AGC GCC GAG TAC T, - GG CCT GTT GCC GAG TAC T, - GG CCT GTT GCC GAG TAC T, - ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG, - ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG, ou leurs complémentaires, et pouvant contenir en outre une ou plusieurs sondes choisies parmi celles qui sont définies par les séquences suivantes or their complements, and may also contain one or more probes chosen from those which are defined by the following sequences - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C, - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C, - G GAG GGG ACC CGG GCG GAG T, - G GAG GGG ACC CGG GCG GAG T, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G, - G ACG CCG CTG GGG CCG CCT G, 15. Kit selon la revendication 13, comprenant les sondes définies par les séquences suivantes 15. Kit according to claim 13, comprising the probes defined by the following sequences - TG CGT TAT GTG ACC AGA, - TG CGT TAT GTG ACC AGA, - GTGCGTCTTGTGACCAGA, - GTGCGTCTTGTGACCAGA, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - GT CTT GTA ACC AGA CAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTA ACC AGA TAC AT, - CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT, - CGT CTT GTG AGC AGA AGC AT, - GGACCGAGCTC GTGCGGGGTG, - GGACCGAGCTC GTGCGGGGTG, - GTACCGGGCAGTGACGC, - GTACCGGGCAGTGACGC, - GACGCCGCTGGGICCGCCTG, - GACGCCGCTGGGICCGCCTG, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - G GAG GGI ACC CIG GCI GAG T, - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C, - TCG GTG GAC ACC GTA TGC AGA C, - ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG, - ACC AGA CAC ATC TAT AAC CG, - CGG CCT AGC GCC GAG TAC T, - CGG CCT AGC GCC GAG TAC T, - CGG CCT GAT GCC GAG TAC, - CGG CCT GAT GCC GAG TAC, - A GAG GAG GAC GTG CGC TT, - A GAG GAG GAC GTG CGC TT, ou leurs complémentaires, et éventuellement or their complementary, and possibly - GC GAC GTG GAG GTG TAC CG, - GC GAC GTG GAG GTG TAC CG, - GG CCT GTT GCC GAG TAC T, - GG CCT GTT GCC GAG TAC T, ou leurs complémentaires. or their complementary. 16. Kit selon l'une quelconque des revendications 14 et 15, dans lequel lesdites sondes sont utilisables comme sondes de capture. 16. Kit according to any one of claims 14 and 15, wherein said probes can be used as capture probes. 17. Kit selon l'une quelconque des revendications 14 à 16, contenant en outre au moins une sonde de détection marquée choisie parmi les suivantes 17. Kit according to any one of claims 14 to 16, further containing at least one labeled detection probe chosen from the following: - GG ACG GAG CGC GTG CG, - GG ACG GAG CGC GTG CG, - C ATC TAT AAC CGA GA, - C ATC TAT AAC CGA GA, - CGC TTC GAC AGC GAC GTG G. - CGC TTC GAC AGC GAC GTG G. 18. Kit selon l'une quelconque des revendications 13 à 17, dans lequel lesdites sondes sont définies comme dans la revendication 4. 18. Kit according to any one of claims 13 to 17, wherein said probes are defined as in claim 4.
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