FR2721032A1 - New protein from Bombyx mori that binds bacterial lipopoly-saccharide - Google Patents
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Abstract
Description
i La présente invention a pour objet une protéine liantThe subject of the present invention is a protein binding
le complexe lipopolysaccharidique (LPS). the lipopolysaccharide complex (LPS).
Elle est en outre relative aux applications de cette protéine, en particulier dans une plante transgénique exprimant cette protéine. Les attaques mécaniques, par exemple des insectes phytopathogènes, et les infections par les champignons, les bactéries et les virus induisent dans les tissus des plantes atteintes la synthèse de protéines appelées "Pathogenis It also relates to the applications of this protein, in particular in a transgenic plant expressing this protein. Mechanical attacks, for example of phytopathogenic insects, and infections by fungi, bacteria and viruses induce in the tissues of affected plants the synthesis of proteins called "Pathogenis
related protein" (protéines PR).related protein ".
Les P-1,3 glucanases sont parmi les plus connues et les mieux étudiées de ces protéines PR. Cette observation et le fait que les P-1,3 glucanes constituent les composants majoritaires des parois des cellules fongiques ont conduit à émettre l'hypothèse d'une implication des P- 1,3 glucanases P-1,3 glucanases are among the best known and best studied of these PR proteins. This observation and the fact that P-1,3 glucans constitute the majority components of the walls of fungal cells led to the hypothesis of an implication of P-1,3 glucanases
dans les défenses moléculaires des plantes. in the molecular defenses of plants.
Plusieurs auteurs ont suggéré que de tels enzymes constituaient des facteurs de résistance aux maladies et agissaient en attaquant les parois cellulaires des champignons Several authors have suggested that such enzymes constitute factors for resistance to disease and act by attacking the cell walls of fungi.
pathogènes induisant ainsi la lyse ou des effets inhibiteurs. pathogens thus inducing lysis or inhibitory effects.
Si le mécanisme théorique de certaines P-1,3 glucanases a été étudié, aucune application pratique de ce type d'enzyme If the theoretical mechanism of some P-1,3 glucanases has been studied, no practical application of this type of enzyme
n'a jusqu'à présent été proposée. has so far been proposed.
Ainsi, à la connaissance du demandeur, aucune plante transgénique codant pour des /-1,3 glucanases exogènes n'a été Thus, to the knowledge of the applicant, no transgenic plant coding for / -1.3 exogenous glucanases has been
décrite dans l'état de la technique. described in the state of the art.
On notera que si la présence de P-1,3 glucanase a été Note that if the presence of P-1,3 glucanase has been
remarquée dans des plantes et des bactéries, aucune 0-1,3- noted in plants and bacteria, none 0-1.3-
glucanase, ni /-1,3-1,4 glucanase, n'est à la connaissance du glucanase, ni / -1.3-1.4 glucanase, is not known to
demandeur, synthétisée chez les animaux. Applicant, synthesized in animals.
Chez l'homme et chez certains animaux, les infections par des bactéries gram-négatives peuvent provoquer de graves modifications pathologiques liées au choc septique. Par exemple, aux Etats-Unis le choc septique est responsable de In humans and some animals, infections with gram-negative bacteria can cause serious pathological changes related to septic shock. For example, in the United States septic shock is responsible for
100.000 morts environ par an.About 100,000 deaths per year.
A la connaissance des demandeurs, aucun médicament efficace n'est actuellement disponible contre de telles affections. Des protéines d'un arthropède marin (Xiphosma) appelé communément crabe des Moluques (Horseshoe crab en anglais) ont To the applicants' knowledge, no effective medication is currently available against such ailments. Proteins from a marine arthropede (Xiphosma) commonly known as the Moluccan crab (Horseshoe crab)
été proposées comme médicaments. have been proposed as drugs.
Les hémocytes de ces crustacés étaient connus pour The hemocytes of these crustaceans were known to
agréger les endotoxines bactériennes. aggregate bacterial endotoxins.
AKETAGAWA et al. ont mis en évidence en 1986, (The Journal of Biological Chemistry, 261, n'16, 7357-7365), la structure d'une protéine de l'espèce japonaise (Tachypleus AKETAGAWA et al. have highlighted in 1986 (The Journal of Biological Chemistry, 261, n'16, 7357-7365), the structure of a protein of the Japanese species (Tachypleus
tridentatus) présentant une activité anti- tridentatus) with anti-activity
lipopolysaccharidique. Le séquençage d'une protéine, présentant une identité de séquence de 83% avec la précédente, a été effectué à partir de l'espèce américaine (Limulus Polyphemus) par Muta et al. (J. Biochem. 101, 1321-1330, lipopolysaccharide. The sequencing of a protein, having a sequence identity of 83% with the previous one, was carried out from the American species (Limulus Polyphemus) by Muta et al. (J. Biochem. 101, 1321-1330,
1987).1987).
Dans la demande internationale PCT/JP 88/00823, une protéine ayant une forte affinité pour le complexe lipopolysaccharidique est en outre décrite, ainsi que son utilisation pour éliminer les endotoxines bactériennes et In international application PCT / JP 88/00823, a protein having a strong affinity for the lipopolysaccharide complex is also described, as well as its use for eliminating bacterial endotoxins and
comme agent thérapeutique contre les infections bactériennes. as a therapeutic agent against bacterial infections.
Néanmoins, ces protéines présentent l'inconvénient notable d'être issues d'organismes très éloignés des However, these proteins have the notable disadvantage of being from organisms far removed from
mammifères et en particulier de l'homme. mammals and in particular humans.
Il est donc nécessaire de trouver de nouvelles molécules permettant de prévenir et de combattre de manière efficace le choc septique du aux infections, notamment par des It is therefore necessary to find new molecules making it possible to effectively prevent and combat septic shock due to infections, in particular by
bactéries gram-négatives.gram-negative bacteria.
Le complexe lipopolysaccharidique (LPS) des bactéries gram-négatives peut d'autre part constituer un contaminant de divers fluides tant biologiques que synthétiques, et en The lipopolysaccharide complex (LPS) of gram-negative bacteria can also constitute a contaminant of various fluids, both biological and synthetic, and
particulier des liquides injectables dans le corps humain. especially liquids injectable into the human body.
Les molécules connues pour lier le complexe lipopolysaccharidique (LPS), appelées LPSBP (en anglais LPS binding protein), et mentionnées ci-dessus pour leur effet thérapeutique ont déjà été proposées pour l'élimination du LPS The molecules known to bind the lipopolysaccharide complex (LPS), called LPSBP (in English LPS binding protein), and mentioned above for their therapeutic effect have already been proposed for the elimination of LPS
de préparations o elles pourraient être présentes. preparations where they might be present.
Néanmoins, il est nécessaire de trouver des molécules présentant une plus grande spécificité et une plus grande sensibilité pour leurs liaisons vis-à-vis du complexe lipopolysaccharidique. Le demandeur s'est donc attaché à trouver un moyen permettant d'une part de combattre le choc septique chez les mammifères et en particulier chez l'homme et d'autre part de Nevertheless, it is necessary to find molecules having greater specificity and greater sensitivity for their bonds with respect to the lipopolysaccharide complex. The plaintiff therefore endeavored to find a means allowing on the one hand to combat septic shock in mammals and in particular in humans and on the other hand to
combattre les bactéries phytopathogènes. fight phytopathogenic bacteria.
Le demandeur a mis en évidence que le ver à soie de l'espèce Bombyx mori produit une protéine répondant à ces deux exigences. Il a ainsi mis en évidence que cette protéine permet de combattre le choc septique induit par la présence de complexe lipopolysaccharidique (LPS) et d'autre part d'éliminer ce complexe des préparations destinées à être injectées en The applicant has demonstrated that the Bombyx mori silkworm produces a protein meeting these two requirements. He thus demonstrated that this protein makes it possible to combat the septic shock induced by the presence of lipopolysaccharide complex (LPS) and on the other hand to eliminate this complex from the preparations intended to be injected in
particulier à l'homme.peculiar to man.
Il a aussi montré que l'intégration dans le génome des plantes d'un gène codant pour cette protéine permet de He also showed that the integration into the genome of plants of a gene coding for this protein allows
combattre les infections fongiques phytopathogènes. fight phytopathogenic fungal infections.
La présente invention a pour objet une protéine caractérisée en ce qu'elle comprend en totalité ou en partie la séquence SEQ ID N'1 suivante: Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe The subject of the present invention is a protein characterized in that it comprises in whole or in part the following sequence SEQ ID N'1: Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe
Gln Gly Asn Leu.Gln Gly Asn Leu.
Elle est en outre relative à une protéine caractérisée en ce qu'elle comprend en partie ou en totalité la séquence SEQ ID N'2 suivante: Phe His Thr Tyr Ser Val Gln Trp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu It also relates to a protein characterized in that it partly or wholly comprises the following sequence SEQ ID N'2: Phe His Thr Tyr Ser Val Gln Trp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu
Ser Val Asp Gly.Ser Val Asp Gly.
De telles protéines présentent avantageusement un poids moléculaire de l'ordre de 50 kD. Elles comprennent préférentiellement la séquence SEQ ID N'3 ou une partie de la séquence SEQ ID N'3 suivante: Lys Ile Ser Tyr Ala Gln Met Pro Asp Val Lys Ile Gln Ala Phe Arg Pro Lys Gly Leu Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe Gln Gly Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val Gly Thr Leu Ser Ala Glu Val Leu Asp Pro Val Asn Gly Arg Trp Val Tyr Glu Glu Pro Asp Leu Lys Leu Lys Val Lys Asp Val Val Tyr Tyr Asn Ala Val Phe Ser Ile Asn Lys Lys Ile Tyr Glu Lys Thr Asn Gln Gln Phe Thr Val Thr Glu Leu Glu Asp Pro Asn Ala Ser Thr Asp Ser Gln Lys Pro Glu Cys Lys Pro Thr Lys Thr Arg Val Arg Gly Gly Lys Ala Cys Ala Gly Gln Thr Ile Phe Glu Glu Gln Phe Asp Ser Leu Asp Glu Asn Val Trp Gln Ile Glu Gln Tyr Ile Pro Ile Tyr His Pro Glu Tyr Pro Phe Val Ser Tyr Gln Arg Asn Asn Leu Thr Val Ser Thr Ala Asp Gly Asn Leu His Ile Asn Ala Lys Leu Gln Gln His Met Pro Gly Phe Leu Asp Asp Ser Ile Tyr Ser Gly Thr Leu Asn Leu Phe Ser Gly Cys Thr Ser Ser Ala Glu Ala Cys Ile Lys Gln Ala Ser Gly Ala Asp Ile Leu Pro Pro Ile Val Ser Gly Arg Ile Thr Ser Ile Gly Phe Ala Phe Thr Tyr Gly Thr Val Glu Ile Arg Ala Lys Leu Pro Gln Gly Asp Trp Leu Tyr Pro Glu Ile Leu Leu Glu Pro Phe Leu Lys Lys Tyr Gly Ser Met Asn Tyr Ala Ser Gly Val Val Lys Ile Ala Cys Ala Arg Gly Asn Ala Glu Leu Tyr Ser Gly Pro Asn Asp Tyr Ser Asn Thr Val Leu Tyr Gly Gly Pro Ile Met Asp Leu Glu Cys Arg Glu Asn Phe Leu Ser Thr Lys Arg Arg Arg Asp Gly Thr Ser Trp Gly Asp Ser Phe His Thr Tyr Ser Val Gln Trp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu Ser Val Asp Gly Glu Glu Trp Ala Arg Val Glu Ala Pro Arg Asp Ala Leu Pro Ala Val Cys Ala His Ala Pro Arg His Leu Leu Gln Ala Gly Ser Gln Met Ala Pro Phe Asp Asp His Phe Tyr Ile Thr Leu Gly Val Ala Ala Gly Gly Ile Thr Glu Phe Arg Asp Gly Ser Ile Thr Ser Gly Gly Val Thr Lys Pro Trp Arg Asp Ser Ala Arg Lys Ala Ser Val His Phe Trp Arg His Met Ser Asp Trp Phe Pro Arg Trp Ser Gln Pro Ser Leu Ile Val Asp Phe Val Lys Val Ile Ala Leu Les dites protéines peuvent aussi présenter la séquence ID N'5 ou une partie de la SEQ ID N'5 suivante: Met Gly Gly Arg Val Leu Cys Leu Ile Leu Phe Ile Lys Ile Ser Tyr Ala Gln Met Pro Asp Val Lys Ile Gln Ala Phe Arg Pro Lys Gly Leu Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe Gln Gly Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val Gly Thr Leu Ser Ala Glu Val Leu Asp Pro Val Asn Gly Arg Trp Val Tyr Glu Glu Pro Asp Leu Lys Leu Lys Val Lys Asp Val Val Tyr Tyr Asn Ala Val Phe Ser Ile Asn Lys Lys Ile Tyr Glu Lys Thr Asn Gln Gln Phe Thr Val Thr Glu Leu Glu Asp Pro Asn Ala Ser Thr Asp Ser Gln Lys Pro Glu Cys Lys Pro Thr Lys Thr Arg Val Arg Gly Gly Lys Ala Cys Ala Gly Gln Thr Ile Phe Glu Glu Gln Phe Asp Ser Leu Asp Glu Asn Val Trp Gln Ile Glu Gln Tyr Ile Pro Ile Tyr His Pro Glu Tyr Pro Phe Val Ser Tyr Gln Arg Asn Asn Leu Thr Val Ser Thr Ala Asp Gly Asn Leu His Ile Asn Ala Lys Leu Gln Gln His Met Pro Gly Phe Leu Asp Asp Ser Ile Tyr Ser Gly Thr Leu Asn Leu Phe Ser Gly Cys Thr Ser Ser Ala Glu Ala Cys Ile Lys Gln Ala Ser Gly Ala Asp Ile Leu Pro Pro Ile Val Ser Gly Arg Ile Thr Ser Ile Gly Phe Ala Phe Thr Tyr Gly Thr Val Glu Ile Arg Ala Lys Leu Pro Gln Gly Asp Trp Leu Tyr Pro Glu Ile Leu Leu Glu Pro Phe Leu Lys Lys Tyr Gly Ser Met Asn Tyr Ala Ser Gly Val Val Lys Ile Ala Cys Ala Arg Gly Asn Ala Glu Leu Tyr Ser Gly Pro Asn Asp Tyr Ser Asn Thr Val Leu Tyr Gly Gly Pro Ile Met Asp Leu Glu Cys Arg Glu Asn Phe Leu Ser Thr Lys Arg Arg Arg Asp Gly Thr Ser Trp Gly Asp Ser Phe His Thr Tyr Ser Val Gln Trp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu Ser Val Asp Gly Glu Glu Trp Ala Arg Val Glu Ala Pro Arg Asp Ala Leu Pro Ala Val Cys Ala His Ala Pro Arg His Leu Leu Gln Ala Gly Ser Gln Met Ala Pro Phe Asp Asp His Phe Tyr Ile Thr Leu Gly Val Ala Ala Gly Gly Ile Thr Glu Phe Arg Asp Gly Ser Ile Thr Ser Gly Gly Val Thr Lys Pro Trp Arg Asp Ser Ala Arg Lys Ala Ser Val His Phe Trp Arg His Met Ser Asp Trp Phe Pro Arg Trp Ser Gln Pro Ser Leu Ile Val Asp Phe Val Lys Val Ile Ala Leu Cette dernière proteine présente avantageusement une glycosylation, en particulier en position 182 de sa séquence Such proteins advantageously have a molecular weight of the order of 50 kD. They preferably include the sequence SEQ ID N'3 or a part of the following sequence SEQ ID N'3: Lys Ile Ser Tyr Ala Gln Met Pro Asp Val Lys Ile Gln Ala Phe Arg Pro Lys Gly Leu Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe Gln Gly Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val Gly Thr Leu Ser Ala Glu Val Leu Asp Pro Val Asn Gly Arg Trp Val Tyr Glu Glu Pro Asp Leu Lys Leu Lys Val Lys Asp Val Val Tyr Tyr Asn Ala Val Phe Ser Ile Asn Lys Lys Ile Tyr Glu Lys Thr Asn Gln Gln Phe Thr Val Thr Glu Leu Glu Asp Pro Asn Ala Ser Thr Asp Ser Gln Lys Pro Glu Cys Lys Pro Thr Lys Thr Arg Val Arg Gly Gly Lys Ala Cys Ala Gly Gln Thr Ile Phe Glu Glu Gln Phe Asp Ser Leu Asp Glu Asn Val Trp Gln Ile Glu Gln Tyr Ile Pro Ile Tyr His Pro Glu Tyr Pro Phe Val Ser Tyr Gln Arg Asn Asn Leu Thr Val Ser Thr Ala Asp Gly Asn Leu His Ile Asn Ala Lys Leu Gln Gln His Met Pro Gly Phe Leu Asp Asp Ser Ile Tyr Ser Gly Thr Leu Asn Leu Phe Ser Gly Cys Thr Ser Ser Ala Glu Ala Cys Ile Lys Gln Ala Ser Gl y Ala Asp Ile Leu Pro Pro Ile Val Ser Gly Arg Ile Thr Ser Ile Gly Phe Ala Phe Thr Tyr Gly Thr Val Glu Ile Arg Ala Lys Leu Pro Gln Gly Asp Trp Leu Tyr Pro Glu Ile Leu Glu Pro Phe Leu Lys Lys Tyr Gly Ser Met Asn Tyr Ala Ser Gly Val Val Lys Ile Ala Cys Ala Arg Gly Asn Ala Glu Leu Tyr Ser Gly Pro Asn Asp Tyr Ser Asn Thr Val Leu Tyr Gly Gly Gly Pro Ile Met Asp Leu Glu Cys Arg Glu Asn Phe Leu Ser Thr Lys Arg Arg Arg Asp Gly Thr Ser Trp Gly Asp Ser Phe His Thr Tyr Ser Val Gln Trp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu Ser Val Asp Gly Glu Glu Trp Ala Arg Val Glu Ala Pro Arg Asp Ala Leu Pro Ala Val Cys Ala His Ala Pro Arg His Leu Leu Gln Ala Gly Ser Gln Met Ala Pro Phe Asp Asp His Phe Tyr Ile Thr Leu Gly Val Ala Ala Gly Gly Ile Thr Glu Phe Arg Asp Gly Ser Ile Thr Ser Gly Gly Val Thr Lys Pro Trp Arg Asp Ser Ala Arg Lys Ala Ser Val His Phe Trp Arg His Met Ser Asp Trp Phe Pro Arg Trp Ser Gln Pro Ser Leu Ile Val Asp Phe Val Lys Val Ile Ala Leu Said proteins can also have the sequence ID N'5 or part of the following SEQ ID N'5: Met Gly Gly Arg Val Leu Cys Leu Ile Leu Phe Ile Lys Ile Ser Tyr Ala Gln Met Pro Asp Val Lys Ile Gln Ala Phe Arg Pro Lys Gly Leu Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe Gln Gly Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val Gly Thr Leu Ser Ala Glu Val Leu Asp Pro Val Asn Gly Arg Trp Val Tyr Glu Glu Pro Asp Leu Lys Leu Lys Val Lys Asp Val Val Tyr Tyr Asn Ala Val Phe Ser Ile Asn Lys Lys Ile Tyr Glu Lys Thr Asn Gln Gln Phe Thr Val Thr Glu Leu Glu Asp Pro Asn Ala Ser Thr Asp Ser Gln Lys Pro Glu Cys Lys Pro Thr Lys Thr Arg Val Arg Gly Gly Lys Ala Cys Ala Gly Gln Thr Ile Phe Glu Glu Gln Phe Asp Ser Leu Asp Glu Asn Val Trp Gln Ile Glu Gln Tyr Ile Pro Ile Tyr His Pro Glu Tyr Pro Phe Val Ser Tyr Gln Arg Asn Asn Leu Thr Val Ser Thr Ala Asp Gly Asn Leu His Ile Asn Ala Lys Leu Gln Gln His Met Pro Gly Phe Leu Asp Asp Ser Ile Tyr Ser Gly Thr Leu Asn Leu Phe Ser Gly Cys Thr Ser Ser Ala Glu Ala Cys Ile Lys Gln Ala Ser Gly Ala Asp Ile Leu Pro Pro Ile Val Ser Gly Arg Ile Thr Ser Ile Gly Phe Ala Phe Thr Tyr Gly Thr Val Glu Ile Arg Ala Lys Leu Pro Gln Gly Asp Trp Leu Tyr Pro Glu Ile Leu Leu Glu Pro Phe Leu Lys Lys Tyr Gly Ser Met Asn Tyr Ala Ser Gly Val Val Lys Ile Ala Cys Ala Arg Gly Asn Ala Glu Leu Tyr Ser Gly Pro Asn Asp Tyr Ser Asn Thr Val Leu Tyr Gly Gly Pro Ile Met Asp Leu Glu Cys Arg Glu Asn Phe Leu Ser Thr Lys Arg Arg Arg Asp Gly Thr Ser Trp Gly Asp Ser Phe His Thr Tyr Ser Val Gln Trp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu Ser Val Asp Gly Glu Glu Trp Ala Arg Val Glu Ala Pro Arg Asp Ala Leu Pro Ala Val Cys Ala His Ala Pro Arg His Leu Leu Gln Ala Gly Ser Gln Met Ala Pro Phe Asp Asp His Phe Tyr Ile Thr Leu Gly Val Ala Ala Gly Gly Ile Thr Glu Phe Arg Asp Gly Ser Ile Thr Ser Gly Gly Val Thr Lys Pro Trp Arg Asp Ser Ala Arg Lys Ala Ser Val His Phe Trp Arg His Met Ser Asp Trp Phe Pro Arg Trp Ser Gln Pro Ser Leu Ile Val Asp Phe Val Lys Val Ile Ala Leu The latter protein advantageously has glycosylation, in particular in pos ition 182 of its sequence
d'acides aminés.amino acids.
On notera que la présente invention concerne non It will be noted that the present invention relates not
seulement les protéines dont la séquence est indiquée ci- only proteins whose sequence is shown above
dessus mais aussi leurs fragments ainsi que tous les variants de ces protéines qui consisteraient en des modifications dans la structure ne modifiant pas la fonction de ces protéines, que ce soit en particulier une fonction de protection des plantes contre les phytopathogènes, de traitement de choc above but also their fragments as well as all the variants of these proteins which would consist in modifications in the structure not modifying the function of these proteins, that it is in particular a function of protection of plants against phytopathogens, of shock treatment
septique ou de liaison du LPS.septic tank or LPS connection.
Notamment, de tels variants peuvent consister en des substitutions d'un acide aminé par un autre acide aminé présentant une formule différente mais une fonction In particular, such variants can consist of substitutions of an amino acid by another amino acid having a different formula but a function
sensiblement identique.substantially identical.
L'ouvrage de Lehninger (Biochimie, Bases moléculaires de la structure et des fonctions cellulaires, seconde édition 1979, Flammarion Médecine Science Ed.) précise que les vingt acides aminés les plus fréquemment rencontrés peuvent être subdivisés en quatre groupes, en fonction de leurs structures chimiques. On notera que selon la présente invention, la Lehninger's book (Biochemistry, Molecular Bases of Cellular Structure and Functions, second edition 1979, Flammarion Médecine Science Ed.) Specifies that the twenty most frequently encountered amino acids can be subdivided into four groups, according to their structures chemicals. Note that according to the present invention, the
substitution d'un acide aminé d'une des protéines décrites ci- substitution of an amino acid for one of the proteins described above
dessus par un autre acide aminé appartenant au même groupe n'introduit pas un changement fonctionnel dans la structure de la protéine, et que les protéines dans lesquelles il existe une simple substitution de ce type, appelée aussi substitution above by another amino acid belonging to the same group does not introduce a functional change in the structure of the protein, and that proteins in which there is a simple substitution of this type, also called substitution
conservative, rentrent dans le cadre de la présente invention. conservative, fall within the scope of the present invention.
Ceci n'implique pas pour autant que des substitutions d'un acide aminé d'un groupe donné par un autre acide aminé appartenant à un autre groupe aient pour effet d'écarter de This does not imply, however, that substitutions of an amino acid from a given group by another amino acid belonging to another group have the effect of
telles protéines modifiées du cadre de la présente invention. such modified proteins within the scope of the present invention.
En effet, la présente invention concerne toute molécule présentant une structure similaire et dont la fonction telle Indeed, the present invention relates to any molecule having a similar structure and whose function as
que définie ci-dessus est conservée. as defined above is retained.
La présente invention est en outre relative à des oligonucléotides, et en particulier des molécules d'ADN codant au moins pour l'une des protéines ou l'un de ses fragments décrits ci-dessus, et est relative en particulier à la molécule d'ADN comprenant la séquence SEQ ID N'4 suivante: The present invention also relates to oligonucleotides, and in particular DNA molecules encoding at least one of the proteins or one of its fragments described above, and relates in particular to the molecule DNA comprising the following sequence SEQ ID N'4:
GAGGATCCGG GTACC ATG GGT GGA CGC GTG TTG TGT CTG ATT TTA TTT GAGGATCCGG GTACC ATG GGT GGA CGC GTG TTG TGT CTG ATT TTA TTT
ATA AAA ATA TCG TAC GCT CAA ATG CCC GAT GTG AAA ATA CAA GCT ATA AAA ATA TCG TAC GCT CAA ATG CCC GAT GTG AAA ATA CAA GCT
TTT CGC CCG AAA GGA CTT CGA ATA TCC GTT CAA GAT GTC CCC AAA TTT CGC CCG AAA GGA CTT CGA ATA TCC GTT CAA GAT GTC CCC AAA
ATG ACA CTG TTC GCG TTC CAA GGC AAC TTG AAC CAT AAA CTG GAC ATG ACA CTG TTC GCG TTC CAA GGC AAC TTG AAC CAT AAA CTG GAC
AGC ACC AGC GTC GGG ACA CTG AGT GCA GAG GTA CTG GAT CCA GTC AGC ACC AGC GTC GGG ACA CTG AGT GCA GAG GTA CTG GAT CCA GTC
AAC GGC CGA TGG GTG TAC GAA GAG CCC GAT CTT AAA CTA AAA GTC AAC GGC CGA TGG GTG TAC GAA GAG CCC GAT CTT AAA CTA AAA GTC
AAG GAC GTC GTC TAT TAT AAC GCG GTC TTC TCA ATC AAC AAG AAA AAG GAC GTC GTC TAT TAT AAC GCG GTC TTC TCA ATC AAC AAG AAA
ATA TAC GAG AAA ACA AAC CAA CAG TTC ACC GTA ACA GAG CTA GAA ATA TAC GAG AAA ACA AAC CAA CAG TTC ACC GTA ACA GAG CTA GAA
GAT CCT AAT GCA AGC ACA GAT TCT CAG AAA CCA GAA TGT AAG CCA GAT CCT AAT GCA AGC ACA GAT TCT CAG AAA CCA GAA TGT AAG CCA
ACA AAG ACG AGA GTG CGA GGC GGC AAA GCG TGT GCC GGA CAA ACA ACA AAG ACG AGA GTG CGA GGC GGC AAA GCG TGT GCC GGA CAA ACA
ATA TTC GAG GAG CAA TTT GAT TCC CTG GAC GAA AAC GTT TGG CAA ATA TTC GAG GAG CAA TTT GAT TCC CTG GAC GAA AAC GTT TGG CAA
ATC GAG CAG TAT ATA CCG ATT TAT CAC CCC GAA TAC CCC TTC GTG ATC GAG CAG TAT ATA CCG ATT TAT CAC CCC GAA TAC CCC TTC GTG
TCC TAC CAG CGT AAT AAT TTA ACA GTA TCT ACC GCA GAT GGA AAC TCC TAC CAG CGT AAT AAT TTA ACA GTA TCT ACC GCA GAT GGA AAC
CTA CAT ATT AAC GCC AAA CTT CAA CAA CAT ATG CCC GGC TTT CTG CTA CAT ATT AAC GCC AAA CTT CAA CAA CAT ATG CCC GGC TTT CTG
GAC GAC TCT ATA TAT TCT GGC ACA CTT AAT TTG TTC AGT GGG TGT GAC GAC TCT ATA TAT TCT GGC ACA CTT AAT TTG TTC AGT GGG TGT
ACT TCG TCA GCA GAG GCA TGC ATC AAA CAG GCT TCC GGT GCT GAT ACT TCG TCA GCA GAG GCA TGC ATC AAA CAG GCT TCC GGT GCT GAT
ATT CTA CCA CCA ATC GTC AGC GGC AGA ATC ACA TCA ATA GGA TTT ATT CTA CCA CCA ATC GTC AGC GGC AGA ATC ACA TCA ATA GGA TTT
GCA TTT ACG TAC GGA ACA GTC GAA ATC AGA GCG AAA TTA CCG CAA GCA TTT ACG TAC GGA ACA GTC GAA ATC AGA GCG AAA TTA CCG CAA
GGG GAC TGG CTG TAT CCG GAA ATT CTA TTG GAG CCG TTC TTA AAG GGG GAC TGG CTG TAT CCG GAA ATT CTA TTG GAG CCG TTC TTA AAG
AAG TAT GGA AGT ATG AAT TAT GCG TCC GGC GTA GTG AAG ATA GCG AAG TAT GGA AGT ATG AAT TAT GCG TCC GGC GTA GTG AAG ATA GCG
TGT GCG CGC GGT AAT GCA GAA CTC TAT TCC GGA CCT AAT GAC TAC TGT GCG CGC GGT AAT GCA GAA CTC TAT TCC GGA CCT AAT GAC TAC
AGC AAT ACG GTT TTG TAC GGA GGA CCG ATC ATG GAT CTG GAG TGC AGC AAT ACG GTT TTG TAC GGA GGA CCG ATC ATG GAT CTG GAG TGC
CGC GAG AAC TTT CTC TCC ACA AAA AGA CGC AGA GAC GGC ACG TCG CGC GAG AAC TTT CTC TCC ACA AAA AGA CGC AGA GAC GGC ACG TCG
TGG GGC GAC AGT TTT CAT ACA TAT TCC GTT CAA TGG ACA CCT GAT TGG GGC GAC AGT TTT CAT ACA TAT TCC GTT CAA TGG ACA CCT GAT
TTC ATA GCC CTG TCT GTG GAC GGC GAG GAG TGG GCG CGA GTG GAG TTC ATA GCC CTG TCT GTG GAC GGC GAG GAG TGG GCG CGA GTG GAG
GCG CCG CGG GAC GCC CTG CCG GCT GTC TGC GCG CAC GCC CCG CGG GCG CCG CGG GAC GCC CTG CCG GCT GTC TGC GCG CAC GCC CCG CGG
CAC CTG CTG CAG GCC GGC TCG CAG ATG GCG CCA TTC GAT GAC CAC CAC CTG CTG CAG GCC GGC TCG CAG ATG GCG CCA TTC GAT GAC CAC
TTC TAC ATA ACG CTA GGC GTG GCG GCA GGA GGC ATA ACG GAG TTC TTC TAC ATA ACG CTA GGC GTG GCG GCA GGA GGC ATA ACG GAG TTC
CGC GAC GGG TCT ATA ACC TCC GGG GGA GTC ACC AAG CCC TGG AGA CGC GAC GGG TCT ATA ACC TCC GGG GGA GTC ACC AAG CCC TGG AGA
GAC AGC GCT CGG AAG GCA TCC GTA CAT TTC TGG CGG CAC ATG TCC GAC AGC GCT CGG AAG GCA TCC GTA CAT TTC TGG CGG CAC ATG TCC
GAT TGG TTC CCA CGG TGG AGT CAG CCA TCT TTA ATC GTG GAC TTT GAT TGG TTC CCA CGG TGG AGT CAG CCA TCT TTA ATC GTG GAC TTT
GTC AAA GTT ATC GCC TTA TGATCTAGTC ATTTAGATTT TGTATAATTA GTC AAA GTT ATC GCC TTA TGATCTAGTC ATTTAGATTT TGTATAATTA
AGTTATTAGT ATAGTTTCTG CAGGCAAAAT TAATTGCATT CTGAGTTTTT AGTTATTAGT ATAGTTTCTG CAGGCAAAAT TAATTGCATT CTGAGTTTTT
ATTGTCAAAC TACAATTTAA AATTTAATTC CTAAAAGATC TCTCTTCTTT ATTGTCAAAC TACAATTTAA AATTTAATTC CTAAAAGATC TCTCTTCTTT
CTAAATCTGT AATTTAGCTA ATTTTATTTG TATCATTTTC TTTTTTTAAA CTAAATCTGT AATTTAGCTA ATTTTATTTG TATCATTTTC TTTTTTTAAA
TTTTGATAGA GCGGCGAATG ACTAGAAGAT GTGATCTGCG AAAATAAAAC TTTTGATAGA GCGGCGAATG ACTAGAAGAT GTGATCTGCG AAAATAAAAC
TAAGTGACAT GCATGCAAAG GCATACACAC AACAGAGTTT TGCATTATTA TAAGTGACAT GCATGCAAAG GCATACACAC AACAGAGTTT TGCATTATTA
TTACCTTTCT TGAGCGAGAT GAGGACTACT GACGTGACCT GGAGTGATAT TTACCTTTCT TGAGCGAGAT GAGGACTACT GACGTGACCT GGAGTGATAT
TTTGGAGCAA GCCTAAGACA GGGTCAAGTG GAGACAGCTC TAAGGCCCCT TTTGGAGCAA GCCTAAGACA GGGTCAAGTG GAGACAGCTC TAAGGCCCCT
ATGTACCGGC GGGGTGTCTT AGGGCTGCAA TAACAACATT ACCTTTCTTA ATGTACCGGC GGGGTGTCTT AGGGCTGCAA TAACAACATT ACCTTTCTTA
ACCAAACAGC GATATTATCT GTAATATTAT AGTTAGAAAG CCTGCATCTT ACCAAACAGC GATATTATCT GTAATATTAT AGTTAGAAAG CCTGCATCTT
ATACTCTTAT TGACACACGT ACCTGGATGA TTTTAACGAT GAAGAAATAA ATACTCTTAT TGACACACGT ACCTGGATGA TTTTAACGAT GAAGAAATAA
CATCGTGTAA AAAATTTAGC TGGAAAAGAT TTTGAGGAAT CAAGAAATAC CATCGTGTAA AAAATTTAGC TGGAAAAGAT TTTGAGGAAT CAAGAAATAC
CCTATGAACC AGCACAGGTA CGTGTCACCA CTCTGGCTAA TTCTGCCACG CCTATGAACC AGCACAGGTA CGTGTCACCA CTCTGGCTAA TTCTGCCACG
TTGCGGTTGG TTTGAAGTTT GAGACAACCT TTGCACGATA CAATTGAGAC TTGCGGTTGG TTTGAAGTTT GAGACAACCT TTGCACGATA CAATTGAGAC
TAAGACCTCA TGGCTCGGAG TGAGTGGAGT CATTCAAGTT GCGACTGGCT TAAGACCTCA TGGCTCGGAG TGAGTGGAGT CATTCAAGTT GCGACTGGCT
CCAGTAACCA CTTATAACCA GGTAGATCGT GAGCCTATCA GCTCATTTAG CCAGTAACCA CTTATAACCA GGTAGATCGT GAGCCTATCA GCTCATTTAG
AGCAACAAAA AACAAAATAA TGTACTCTTG AAAAAATCAT TTTAATAAAA AGCAACAAAA AACAAAATAA TGTACTCTTG AAAAAATCAT TTTAATAAAA
GACCAGAGTG AAAAAAAAAA AAAAAGACCAGAGTG AAAAAAAAAAAA AAAAA
La présente invention a de plus pour objet des cellules eucaryotes ou procaryotes exprimant une des protéines décrites ci-dessus ou un de leurs fragments, ou portant au moins une The present invention further relates to eukaryotic or prokaryotic cells expressing one of the proteins described above or one of their fragments, or carrying at least one
partie d'un oligonucléotide mentionné ci-dessus. part of an oligonucleotide mentioned above.
L'une des cellules est avantageusement une cellule bactérienne ou une cellule végétale, par exemple issue d'une plante appartenant à la famille de la vigne, du tabac, de la One of the cells is advantageously a bacterial cell or a plant cell, for example from a plant belonging to the family of the vine, tobacco,
tomate ou de la pomme de terre.tomato or potato.
Un autre objet de la présente invention est un procédé d'obtention d'une des protéines décrites ci-dessus ou d'un de leurs fragments, caractérisé en ce qu'un oligonucléotide, tel qu'un de ceux mentionnés ci- dessus, est exprimé dans une Another object of the present invention is a process for obtaining one of the proteins described above or one of their fragments, characterized in that an oligonucleotide, such as one of those mentioned above, is expressed in a
cellule procaryote ou eucaryote adaptée. adapted prokaryotic or eukaryotic cell.
Les protéines, objets de la présente invention peuvent néanmoins être obtenues par toute autre méthode à la disposition de l'homme du métier, telle que la synthèse chimique, et en particulier celles répertoriées dans le manuel général: "Molecular cloning: A Laboratory manual" (Sambrook et al, 1989, Cold Spring Harbor Lab., Cold Spring Harbor, NY, The proteins which are the subject of the present invention can nevertheless be obtained by any other method available to those skilled in the art, such as chemical synthesis, and in particular those listed in the general manual: "Molecular cloning: A Laboratory manual" (Sambrook et al, 1989, Cold Spring Harbor Lab., Cold Spring Harbor, NY,
2ème édition) et dans ses rééditions récentes. 2nd edition) and in its recent re-editions.
De manière générale, l'homme du métier se référera aussi à ce manuel pour la mise en oeuvre de la présente invention. Outre les objets mentionnés ci-dessus, la présente invention est relative à un médicament contenant une des protéines décrites ci-dessus ou un de leurs fragments et l'utilisation d'une telle protéine pour la fabrication d'un médicament pour le traitement des affections liées au complexe lipopolysaccharidique, et en particulier pour traiter le choc septique. On notera que la distance génétique entre les mammifères et le ver à soie est plus faible que celle entre les mammifères et les Xiphosma. Les protéines objets de la présente invention, qui sont dérivées d'une protéine du ver à soie seront donc mieux acceptées par les mammifères, et en particulier l'homme, que les protéines extraites de Limulus, ou, d'espèces voisines, dont l'utilisation est proposée dans In general, those skilled in the art will also refer to this manual for the implementation of the present invention. In addition to the objects mentioned above, the present invention relates to a medicament containing one of the proteins described above or one of their fragments and the use of such a protein for the manufacture of a medicament for the treatment of affections linked to the lipopolysaccharide complex, and in particular to treat septic shock. Note that the genetic distance between mammals and the silkworm is smaller than that between mammals and Xiphosma. The proteins which are the subject of the present invention, which are derived from a silkworm protein, will therefore be better accepted by mammals, and in particular humans, than the proteins extracted from Limulus, or, from neighboring species, of which l is proposed in
PCT/JP88/00823.PCT / JP88 / 00823.
L'administration des protéines selon l'invention pourra se faire par toute méthode appropriée, préférentiellement par injection afin de combattre rapidement les effets du choc septique. Un autre objet de la présente invention est un procédé d'élimination du complexe lipopolysaccharidique de préparations contenant ce dernier, ledit procédé consistant à lier ledit complexe à une des protéines décrites ci-dessus ou The proteins according to the invention can be administered by any suitable method, preferably by injection, in order to rapidly combat the effects of septic shock. Another object of the present invention is a process for removing the lipopolysaccharide complex from preparations containing the latter, said process consisting in binding said complex to one of the proteins described above or
à un de leurs fragments.to one of their fragments.
Un tel procédé peut notamment être mis en oeuvre en Such a method can in particular be implemented in
fixant sur un support la protéine liant ledit complexe. fixing on a support the protein binding said complex.
La présente invention a encore pour objet une plante portant au moins un gène codant pour une protéine exogène The present invention also relates to a plant carrying at least one gene coding for an exogenous protein
ayant une activité (-1,3 glucanase. having an activity (-1.3 glucanase.
Une telle protéine est avantageusement une des protéines définies ci-dessus ou un de ses fragments. Le gène porté par la plante peut quant à lui comprendre au moins une Such a protein is advantageously one of the proteins defined above or one of its fragments. The gene carried by the plant can, for its part, comprise at least one
partie d'un ADN défini ci-dessus.part of a DNA defined above.
Une telle plante appartient de manière préférentielle à la famille de la vigne, du tabac, de la tomate ou de la pomme Such a plant preferably belongs to the family of the vine, tobacco, tomato or apple
de terre.earthen.
Enfin, la présente invention est relative à l'utilisation de fragments des oligonucléotides décrits ci- dessus pour l'amplification génique. Une telle amplification peut être mise en oeuvre selon la méthode décrite dans la Finally, the present invention relates to the use of fragments of the oligonucleotides described above for gene amplification. Such an amplification can be implemented according to the method described in the
demande FR-92.13.562.request FR-92.13.562.
La présente invention est illustrée sans pour autant être limitée par les exemples qui suivent et en référence aux dessins annexés dans lesquels: La figure lA représente un gel SDS-PAGE d'extraits de bactéries gram-négatives. Le puits 1 correspond à un mélange de marqueurs protéiques (phosphorylase b, 92 kD; sérum albumine bovine 66,2 kD; ovalbumine 43 kD; anhydrase carbonique 30 kD). Le puits 2 est un témoin du test de liaison effectué sans hémolymphe (bactéries seules). Le puits 3 est un test de liaison effectué avec de l'hémolymphe immune (immunisation par injection de E. cloacae). Le puits 4 correspond à un test de liaison effectué avec de l'hémolymphe immune, l'immunisation ayant été effectuée par abrasion The present invention is illustrated without however being limited by the examples which follow and with reference to the appended drawings in which: FIG. 1A represents an SDS-PAGE gel of extracts of gram-negative bacteria. Well 1 corresponds to a mixture of protein markers (phosphorylase b, 92 kD; bovine serum albumin 66.2 kD; ovalbumin 43 kD; carbonic anhydrase 30 kD). Well 2 is a witness to the binding test carried out without hemolymph (bacteria alone). Well 3 is a binding test performed with immune hemolymph (immunization by injection of E. cloacae). Well 4 corresponds to a binding test carried out with immune hemolymph, the immunization having been carried out by abrasion
procuticulaire et application topique de E. cloacae. procuticular and topical application of E. cloacae.
La figure lB est une cartographie peptidique effectuée en CHLP à la suite de la digestion in situ de la protéine P-50 par l'endopeptidase Lys-C. Les pics peptidiques indiqués par les flèches noires et blanches ont été soumis à une analyse de FIG. 1B is a peptide mapping carried out in CHLP following the in situ digestion of the protein P-50 by the endopeptidase Lys-C. The peptide peaks indicated by the black and white arrows were subjected to an analysis of
leur séquence en acides aminés.their amino acid sequence.
La figure 2 illustre un test de liaison effectué en utilisant de l'hémolymphe non-immune (puits 3) ou de l'hémolymphe immune (puits 1, 2, 4, 5 et 6). Les temps d'incubation du test de liaison sont d'une minute (puits 1); de 2,5 minutes (puits 2 et 3), de 5 minutes (puits 4), de 15 minutes (puits 5), et de 30 minutes (puits 6). Le puits 7 correspond à des marqueurs de poids moléculaire dont les Figure 2 illustrates a binding test performed using non-immune hemolymph (well 3) or immune hemolymph (well 1, 2, 4, 5 and 6). The incubation times for the binding test are one minute (well 1); 2.5 minutes (wells 2 and 3), 5 minutes (wells 4), 15 minutes (wells 5), and 30 minutes (wells 6). Well 7 corresponds to molecular weight markers whose
tailles sont indiquées en kD.sizes are indicated in kD.
La figure 3A illustre la position des deux paires d'amorces dégénérées (P1 et P3 pour le brin sens et P2 et P4 FIG. 3A illustrates the position of the two pairs of degenerate primers (P1 and P3 for the sense strand and P2 and P4
pour le brin anti-sens).for the anti-sense strand).
La figure 3B représente l'analyse des produits MOPAC sur un gel d'agarose à 2%. Le puits 1 correspond à un aliquote de 10 pl du produit MOPAC obtenu en utilisant P1 et P4. Le puits 2 correspond à un aliquote de 10p1 du produit MOPAC obtenu en utilisant P3 et P2. Le puits 3 correspond au marqueur de poids moléculaire (100 pb Ladder Pharmacia). La FIG. 3B represents the analysis of the MOPAC products on a 2% agarose gel. Well 1 corresponds to a 10 μl aliquot of the MOPAC product obtained using P1 and P4. Well 2 corresponds to an aliquot of 10p1 of the MOPAC product obtained using P3 and P2. Well 3 corresponds to the molecular weight marker (100 bp Ladder Pharmacia). The
flèche indique la position du produit de 160 paires de base. arrow indicates the product position of 160 base pairs.
La figure 4 représente une carte de restriction utilisée pour l'analyse du cDNA P-50 lambdaBP5001. La région FIG. 4 represents a restriction map used for the analysis of cDNA P-50 lambdaBP5001. The region
de la protéine codante est indiquée en blanc. of the coding protein is indicated in white.
La figure 5 illustre l'analyse de l'hydropathie de la protéine P-50. Les numéros des résidus aminoacides sont indiqués sur la ligne horizontale tandis que l'hydrophobie et FIG. 5 illustrates the analysis of the hydropathy of the P-50 protein. The numbers of the amino acid residues are indicated on the horizontal line while the hydrophobicity and
l'hydrophilie sont indiquées respectivement au-dessus et en- hydrophilicity are indicated above and respectively
dessous de la ligne horizontale.below the horizontal line.
La figure 6 illustre les similarités et les identités Figure 6 illustrates similarities and identities
de séquences entre la P-50 et diverses glucanases. of sequences between P-50 and various glucanases.
La signification des abréviations est comme suit: Bci: 13-1,3 glucanase de Bacillus circulans, Fsu:f-1,3-1,4 glucanase de Fibrobacter succinogenes; Cth: 0-1,3-1,4 glucanase de Clostridium thermocellum; Bsu: P-1,3-1,4 glucanase de Bacillus subtilis; Bam:3-1,3-1,4 glucanase de Bacillus amylofiquefaciens; Bma: P-1,3-1,4 glucanase de Bacillus macerans; Bli: 1-1,3-1,4 glucanase de Bacillus licheniformis. La figure 7 illustre les similarités et les identités de séquences entre P-50 et les domaines de liaison du LPS des protéines LBP et BPI humaines, telles que décrites par SCHUMANN et al. (1990, Science, 249, 1429) et HOESS et al. The meanings of the abbreviations are as follows: Bci: 13-1.3 glucanase from Bacillus circulans, Fsu: f-1,3-1,4 glucanase from Fibrobacter succinogenes; Cth: 0-1.3-1.4 glucanase from Clostridium thermocellum; Bsu: P-1,3-1,4 glucanase from Bacillus subtilis; Bam: 3-1.3-1.4 glucanase from Bacillus amylofiquefaciens; Bma: P-1,3-1,4 glucanase from Bacillus macerans; Bli: 1-1.3-1.4 glucanase from Bacillus licheniformis. Figure 7 illustrates the similarities and sequence identities between P-50 and the LPS binding domains of human LBP and BPI proteins, as described by SCHUMANN et al. (1990, Science, 249, 1429) and HOESS et al.
(1993, EMBO J., 12, N'9, 3351-3356). (1993, EMBO J., 12, N'9, 3351-3356).
Dans ces deux dernières figures les similarités et les identités entre les acides aminés sont indiquées par des cadres. Les acides aminés identiques sont quant à eux indiqués par des points. Les nombres indiqués sur la gauche se réfèrent In these last two figures, the similarities and identities between the amino acids are indicated by boxes. Identical amino acids are indicated by dots. The numbers shown on the left refer to
à la position du résidu dans chaque protéine. at the position of the residue in each protein.
La figure 8 est une photographie d'un gel SDS-PAGE fluorographié de produits de traduction d'ARN messagers codant pour la protéine P-50 (puits 1). Le puits 2 correspond à un témoin sans ARN messagers. Les poids moléculaires de référence Figure 8 is a photograph of a fluorographed SDS-PAGE gel of messenger RNA translation products encoding the P-50 protein (well 1). Well 2 corresponds to a control without messenger RNA. Reference molecular weights
sont indiqués sur la droite de la figure. are shown on the right of the figure.
La figure 9A est un autoradiogramme d'un transfert d'ARN messagers hybridés avec le fragment Pst I/EcoRI de FIG. 9A is an autoradiogram of a transfer of messenger RNA hybridized with the Pst I / EcoRI fragment of
lambdaBP5001 (1,2 kb).lambdaBP5001 (1.2 kb).
Les puits 1,3 et 5 correspondent à 'ARN total extrait de corps gras de larves et les puits 2,4 et 6 correspondent à ARN total extrait de cellules épidermiques, avant abrasion procuticulaire (puits 1 et 2) et six heures après l'abrasion en présence de bactéries (puits 3 et 4) ou six heures après Wells 1.3 and 5 correspond to total RNA extracted from fatty larvae and wells 2.4 and 6 correspond to total RNA extracted from epidermal cells, before procuticular abrasion (wells 1 and 2) and six hours after abrasion in the presence of bacteria (wells 3 and 4) or six hours after
l'abrasion sans bactéries (puits 5 et 6). abrasion without bacteria (wells 5 and 6).
La taille de marqueur de poids moléculaire est indiquée The size of molecular weight marker is indicated
sur la gauche de l'autoradiogramme.on the left of the autoradiogram.
La figure 9B représente le même transfert déshybridé puis réhybridé avec une sonde correspondant à l'ADN complémentaire de l'a- tubuline (flèche blanche) et avec une FIG. 9B represents the same dehybridized transfer then rehybridized with a probe corresponding to the DNA complementary to the α-tubulin (white arrow) and with a
sonde correspondant au gène de la cécropine B2 (flèche noire). probe corresponding to the cecropin B2 gene (black arrow).
EXEMPLE 1:EXAMPLE 1:
Détermination de la séquence de la protéine P-50 Determination of the P-50 protein sequence
A) MATERIELS ET METHODESA) MATERIALS AND METHODS
1. Réactifs chimiques et instruments Les réactifs ont été fournis par Bio-Rad Labs 1. Chemical reagents and instruments The reagents were supplied by Bio-Rad Labs
(Richmond, CA) pour l'acrylamide, la N,N'- (Richmond, CA) for acrylamide, N, N'-
méthylènebisacrylamide, le persulfate d'ammonium, le N,N,N', N'-tétraméthyléthylènediamine, le Tris, la glycine et le Bleu de Bromophénol, par Wako Pure Chemical Industries Ltd. (Tokyo, Japon) pour le 2-mercaptoéthanol, par Scharz/Mann Biotech (Cleveland, OH) pour la tricine, par Fluka Biochemika (Buchs, Allemagne), pour le sulfate de dodécyle sodique, par Perkin-Elmer Cetus pour la polymérase de Thermus aquaticus, par Sigma (St, Louis MO) pour Ponceau S, par Boehringer pour l'endopeptidase Lys-C, par Amersham pour le système ECL, par BRL pour la transcriptase inverse du MuLV, par Stratagène pour la trousse de clonage par PCR, par Amersham pour le système de marquage de l'ADN Mega Prime, par Stratagène pour le kit de transcription des ARN, par Pharmacia pour le kit de séquençage T7, par Promega pour la trousse de séquençage Taq Track, par Pharmacia-LKB (Uppsala, Suede) pour le mélange de marqueurs de poids moléculaire, et par Applied Biosystems (Foster City, methylenebisacrylamide, ammonium persulfate, N, N, N ', N'-tetramethylethylenediamine, Tris, glycine and Bromophenol Blue, by Wako Pure Chemical Industries Ltd. (Tokyo, Japan) for 2-mercaptoethanol, by Scharz / Mann Biotech (Cleveland, OH) for tricin, by Fluka Biochemika (Buchs, Germany), for dodecyl sodium sulfate, by Perkin-Elmer Cetus for polymerase Thermus aquaticus, by Sigma (St, Louis MO) for Ponceau S, by Boehringer for endopeptidase Lys-C, by Amersham for the ECL system, by BRL for reverse transcriptase of MuLV, by Stratagene for the PCR cloning kit , by Amersham for the Mega Prime DNA labeling system, by Stratagene for the RNA transcription kit, by Pharmacia for the T7 sequencing kit, by Promega for the Taq Track sequencing kit, by Pharmacia-LKB (Uppsala , Sweden) for mixing molecular weight markers, and by Applied Biosystems (Foster City,
CA), pour la membrane à haute capacité Milli-ProBlott PVDF. CA), for the Milli-ProBlott PVDF high capacity membrane.
Tous les autres produits chimiques sont des produits All other chemicals are chemicals
commerciaux de grande qualité.high quality commercial.
2. Orqanismes, cellules, immunisation et récupération de l'hémolymphe Les vers à soie Bombyx mori (Asahi x Tokai) ont été 2. Organisms, cells, immunization and recovery of the hemolymph Bombyx mori silkworms (Asahi x Tokai) were
fournis par Toyo Sangyo Consulting, Inc., Tokyo, Japon. supplied by Toyo Sangyo Consulting, Inc., Tokyo, Japan.
Ils ont été cultivés sur un milieu artificiel (poudre They were grown on an artificial medium (powder
de mûrier) à 23'C avec une photopériode de 14 heures. mulberry) at 23 ° C with a 14 hour photoperiod.
Des larves au cinquième stade de la mue sont cultivées jusqu'au 5ème jour de ce stade et immunisées par injection de pl d'Enterobacter cloacae (souche 57-9, Collection de l'Institut Pasteur) en fin de phase de croissance logarithmique. Les larves sont alors conservées 24 heures en Larvae in the fifth molt stage are cultivated until the 5th day of this stage and immunized by injection of pl of Enterobacter cloacae (strain 57-9, Collection of the Pasteur Institute) at the end of the logarithmic growth phase. The larvae are then kept 24 hours in
présence de nourriture puis l'hémolymphe est récupérée. presence of food then the hemolymph is recovered.
L'immunisation par abrasion cuticulaire et application de bactéries est effectuée comme décrite par Brey et al. Immunization by cuticular abrasion and application of bacteria is carried out as described by Brey et al.
(1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA.90. 6275-6279). (1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA.90. 6275-6279).
Pour certaines expérimentations, les vers à soie sont aussi cultivés dans des conditions axéniques (Brey et al., For some experiments, silkworms are also cultivated under axenic conditions (Brey et al.,
1993, précédemment cités).1993, previously cited).
L'hémolymphe est récupérée en effectuant une incision du corps des larves dans des tubes contenant quelques cristaux de phénylthiourée puis est centrifugée à 4000 g durant 10 The hemolymph is recovered by making an incision of the body of the larvae in tubes containing a few phenylthiourea crystals then is centrifuged at 4000 g for 10
minutes à 4'C.minutes at 4'C.
Le surnageant, constitué du plasma de l'hémolymphe, est The supernatant, made up of hemolymph plasma, is
utilisé immédiatement ou stocké & - 80'C. used immediately or stored & - 80'C.
3. Test de liaison des bactéries in vitro Le test de liaison in vitro bactérie-plasma de l'hémolymphe a été effectué de manière substantielle comme 3. Bacteria in vitro binding test The in vitro bacteria-plasma hemolymph binding test was carried out substantially as
décrit par Sun et al. (1990, Science, 250: 1729-1732). described by Sun et al. (1990, Science, 250: 1729-1732).
ml de bactéries gram-négatives E. cloacae ou gram- ml of gram-negative E. cloacae or gram bacteria
positive Bacillus licheniformis en fin de phase de croissance logarithmique sont centrifugées, lavées et finalement resuspendues dans 200pl de Tris-HCl, 10 mM, pH 8 selon Sun et positive Bacillus licheniformis at the end of the logarithmic growth phase are centrifuged, washed and finally resuspended in 200 μl of Tris-HCl, 10 mM, pH 8 according to Sun and
al.(1990, précédemment cités).al. (1990, previously cited).
La suspension bactérienne est ajoutée à 1 ml de plasma d'hémolymphe immune et incubée à température ambiante avec une The bacterial suspension is added to 1 ml of immune hemolymph plasma and incubated at room temperature with a
agitation modérée durant des périodes données. moderate agitation during given periods.
Le mélange est centrifugé durant 2 minutes à 10.000 g, à 4' C, et le surnageant est éliminé avant d'effectuer un autre The mixture is centrifuged for 2 minutes at 10,000 g, at 4 ° C, and the supernatant is removed before carrying out another
test de liaison.bond test.
Le culot est lavé successivement avec 200 p1 d'une solution de NaCl dans laquelle la concentration en NaCl est augmentée de manière arithmétique après chaque lavage (0,1; 0,2; 0,3; 0,4 et 0,5 M en NaCl) ou lavé deux fois dans 500 p1 d'une solution de NaCl 0,5 M et finalement élué avec 200 p1 d'une solution comprenant 0,5 M de NaCl et 0,1 M d'acétate The pellet is washed successively with 200 μl of a NaCl solution in which the NaCl concentration is increased arithmetically after each washing (0.1; 0.2; 0.3; 0.4 and 0.5 M in NaCl) or washed twice in 500 p1 of a 0.5 M NaCl solution and finally eluted with 200 p1 of a solution comprising 0.5 M NaCl and 0.1 M acetate
d'ammonium, pH 4,0.ammonium, pH 4.0.
L'éluant est utilisé pour effectuer un gel SDS/PAGE. The eluent is used to make an SDS / PAGE gel.
4. Electrophorèse et immobilisation des protéines L'électrophorèse sur le gel SDS-Polyacrylamide est effectuée par la méthode de Laemmli (1970, Nature 227:680) en utilisant un appareillage d'électrophorèse BioRad 4. Electrophoresis and immobilization of the proteins The electrophoresis on the SDS-Polyacrylamide gel is carried out by the method of Laemmli (1970, Nature 227: 680) using an apparatus for electrophoresis BioRad
miniprotéane.miniprotein.
Le séquençage de l'extrémité N-terminale de la protéine intacte ainsi que des fragments peptidiques obtenus par clivage enzymatique in situ a été effectué à l'aide du gel The sequencing of the N-terminal end of the intact protein as well as of the peptide fragments obtained by enzymatic cleavage in situ was carried out using the gel.
Tricine SDS-PAGE (Ploug, 1989, Anal. Biochem. 181: 33-39). Tricin SDS-PAGE (Ploug, 1989, Anal. Biochem. 181: 33-39).
Les protéines séparées par électrophorèse sont transférées sur une membrane mini-Problott PVDF selon les The proteins separated by electrophoresis are transferred onto a mini-Problott PVDF membrane according to the
instructions du fabricant.manufacturer's instructions.
5. Clivage enzymatique in situ et cartographie peptidique des séquences internes Après électrophorèse, le gel est fixé dans une solution contenant 50% de méthanol et 10% d'acide acétique et teint par 5. In situ enzymatic cleavage and peptide mapping of internal sequences After electrophoresis, the gel is fixed in a solution containing 50% methanol and 10% acetic acid and stained with
du noir amide durant 2 minutes.amide black for 2 minutes.
Les bandes protéiques sont coupées et lavées dans de l'eau de qualité Milli Q puis remises dans le même tube et déshydratées à l'aide d'un Speed-Vac. The protein bands are cut and washed in Milli Q quality water, then put back in the same tube and dehydrated using a Speed-Vac.
La digestion par l'Endopeptidase Lys-C (concentration finale: 2 pg/ml) est effectuée dans 300 pl de Tris-HCl, 0,1 M, Digestion with Endopeptidase Lys-C (final concentration: 2 μg / ml) is carried out in 300 μl of Tris-HCl, 0.1 M,
pH 8,8, contenant 0,03% de SDS à 30'C durant 18 heures. pH 8.8, containing 0.03% SDS at 30 ° C for 18 hours.
Après digestion, le milieu total de réaction est centrifugé et le surnageant est immédiatement injecté sur une colonne de Chromatographie Liquide Haute Pression (CLHP) (Vydac, 2,1 x 250 mm). Les fragments peptidiques sont séparés sur un gradient linéaire d'acétonitrile (0-55%) contenant 0,1% After digestion, the total reaction medium is centrifuged and the supernatant is immediately injected onto a High Pressure Liquid Chromatography (HPLC) column (Vydac, 2.1 x 250 mm). The peptide fragments are separated on a linear gradient of acetonitrile (0-55%) containing 0.1%
d'acide trifluoroacétique durant plus de 60 minutes. trifluoroacetic acid for more than 60 minutes.
Un flux de 200 pl/min. est appliqué et l'absorbance est mesurée à 214 et 280 nm. Chaque pic est récupéré manuellement A flow of 200 pl / min. is applied and the absorbance is measured at 214 and 280 nm. Each peak is collected manually
et stocké à -20'C pour une analyse ultérieure. and stored at -20 ° C for later analysis.
6. Analyse des séquences en acides aminés La protéine intacte immobilisée sur la membrane de PVDF ou les peptides issus de la digestion enzymatique sont séparés 6. Analysis of amino acid sequences The intact protein immobilized on the PVDF membrane or the peptides resulting from the enzymatic digestion are separated
par CHLP et sont ensuite soumis à un séquençage automatique. by CHLP and are then subjected to automatic sequencing.
La dégradation d'Edman automatique est effectuée sur un microséquenceur à phase gazeuse 477A (Applied Biosystems), Automatic Edman degradation is carried out on a gas phase microsequencer 477A (Applied Biosystems),
connecté à un analyseur à phénylthiohydantoïne (modèle 120A). connected to a phenylthiohydantoin analyzer (model 120A).
7. Analyse des ADN complémentaires obtenus par amplification dans un mélange d'oliqo-nucléotides 7. Analysis of the complementary DNAs obtained by amplification in a mixture of oligonucleotides
(analyse MOPAC).(MOPAC analysis).
Toutes les manipulations d'ADN et d'ARN ont été effectuées en utilisant des techniques standard décrites par Sambrook et al., (1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Lab., Cold Spring Harbor, NY, 2nd Ed.). Deux paires d'amorces ont été synthétisées: P1 (brin sens) présentant la séquence suivante: All DNA and RNA manipulations were performed using standard techniques described by Sambrook et al., (1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Lab., Cold Spring Harbor, NY, 2nd Ed. ). Two pairs of primers were synthesized: P1 (sense strand) having the following sequence:
P1:5'-AA(A,G)ATGAC(A,C,G,T)(C,T)T(A,C,G,T)TT(T,C)GC(A,C,G,T) P1: 5'-AA (A, G) ATGAC (A, C, G, T) (C, T) T (A, C, G, T) TT (T, C) GC (A, C, G, T)
TT-3 et P2 qui est l'anti-sens de Pi: Ces deux séquences comprennent des séquences internes complémentaires de tous les codons possibles pour la séquence TT-3 and P2 which is the anti-sense of Pi: These two sequences include internal sequences complementary to all possible codons for the sequence
d'acides aminés Lys-Met-Thr-Leu-Phe-Ala-Phe. amino acid Lys-Met-Thr-Leu-Phe-Ala-Phe.
Deux autres amorces P3 (brin sens) et P4 (brin anti- Two other primers P3 (sense strand) and P4 (anti-strand
sens) ont d'autre part été synthétisées. P3 présente la séquence suivante: meaning) have on the other hand been synthesized. P3 has the following sequence:
P3;5'-GT(A,C,G,T)TA(T,C)TA(T,C)AA(T,C)GC(A,C,G,T)GT(A,C,G,T) P3; 5'-GT (A, C, G, T) TA (T, C) TA (T, C) AA (T, C) GC (A, C, G, T) GT (A, C, G , T)
TT-3'TT-3 '
P3 et P4 comprennent des séquences correspondant à toutes les possibilités de codons pour la séquence peptidique Val-Tyr-Tyr-Asn-Ala- Val-Phe. Pour la préparation de l'ARN matrice, une larve de ver à soie au 5ème stade (jour 5) a été immunisée avec 10 pl d'une P3 and P4 comprise sequences corresponding to all the possibilities of codons for the peptide sequence Val-Tyr-Tyr-Asn-Ala- Val-Phe. For the preparation of template RNA, a silkworm larva in the 5th stage (day 5) was immunized with 10 μl of a
solution du complexe lipopolysaccharidique (2 mg/ml). solution of the lipopolysaccharide complex (2 mg / ml).
Après 6 heures le corps gras est récupéré et l'ARN total est extrait comme décrit par Auffray et Rougeon (1980, After 6 hours, the fatty substance is recovered and the total RNA is extracted as described by Auffray and Rougeon (1980,
Eur. J. Biochem. 107: 303-314).Eur. J. Biochem. 107: 303-314).
L'ADN complémentaire simple brin est synthétisé à partir de l'ARN total en utilisant les amorces anti-sens (P2 Single-stranded complementary DNA is synthesized from total RNA using antisense primers (P2
ou P4) et la transcriptase inverse du MuLV (BRL). or P4) and MuLV reverse transcriptase (BRL).
L'ADN complémentaire simple brin est amplifié avec 1 mM des oligonucléotides assemblés en paires (P1 et P4, ou P2 et P3) dans une solution contenant 10 mM de Tris-HCl, pH 8, 50 mM KCl, 1,5 mM MgC12, 200 MM dNTP et 2,5 unités de polymérase de Thermus aquaticus (Lee et al. 1988, Science 239: 1288-1291, et The complementary single-stranded DNA is amplified with 1 mM of the oligonucleotides assembled in pairs (P1 and P4, or P2 and P3) in a solution containing 10 mM of Tris-HCl, pH 8, 50 mM KCl, 1.5 mM MgC12, 200 MM dNTP and 2.5 polymerase units from Thermus aquaticus (Lee et al. 1988, Science 239: 1288-1291, and
Lee et Caskey 1992, Methods in Enzymology 216: 69-72). Lee and Caskey 1992, Methods in Enzymology 216: 69-72).
La réaction de polymérisation en chaîne (PCR) est effectuée en dénaturant à une température de 94 C durant 30 secondes, un annelant à 52'C durant 1 minute, puis en effectuant l'extension à 72'C durant 2 minutes, durant 30 The polymerase chain reaction (PCR) is carried out by denaturing at a temperature of 94 ° C. for 30 seconds, ringing at 52 ° C. for 1 minute, then carrying out the extension at 72 ° C. for 2 minutes, for 30 seconds.
cycles en utilisant le Tempcycler II, Model 110P (Coy Corp.). cycles using the Tempcycler II, Model 110P (Coy Corp.).
* Les aliquotes des mélanges amplifiés sont analysés sur des gels d'agarose à 2%. Les bandes teintes à l'aide de bromure d'éthidium sont découpées à partir du gel et l'ADN isolé est cloné dans le plasmide pCR-Script SK (+) en utilisant la trousse de clonage PCR commercialisée par Stratagene. 8. Criblaqe des ADN complémentaires Une librairie d'ADN complémentaires obtenue à partir du corps gras de Bombyx mori auquel on a injecté 10 heures avant des bactéries E. cloacae tuées par la chaleur, est préparée en* The aliquots of the amplified mixtures are analyzed on 2% agarose gels. The bands dyed using ethidium bromide are cut from the gel and the isolated DNA is cloned into the plasmid pCR-Script SK (+) using the PCR cloning kit marketed by Stratagene. 8. Screening of complementary DNAs A library of complementary DNAs obtained from the Bombyx mori fatty substance, which was injected 10 hours before heat-killed E. cloacae bacteria, is prepared in
utilisant la trousse de synthèse d'ADN complémentaire lambda- using the lambda- complementary DNA synthesis kit
gt-10 commercialisée par Amersham.gt-10 marketed by Amersham.
Un produit de PCR d'une longueur de 160 paires de base obtenu par analyse MOPAC (combinaisons de P1 et de P4) a été marqué au phosphore 32 par marquage aléatoire (Mega Prime DNA Labeling System, Amersham) et utilisé afin de cribler la A PCR product with a length of 160 base pairs obtained by MOPAC analysis (combinations of P1 and P4) was labeled with phosphorus 32 by random labeling (Mega Prime DNA Labeling System, Amersham) and used to screen the
banque d'ADN complémentaires.complementary DNA bank.
Environ 75.000 colonies ont été étalées à une densité d'environ 2.500 colonies par boite de 90 mm de diamètre et About 75,000 colonies were spread at a density of about 2,500 colonies per 90 mm diameter dish and
criblées en utilisant des filtres de Nylon (Amersham Hybond- screened using Nylon filters (Amersham Hybond-
N). L'hybridation est effectuée en utilisant une solution comprenant 6 x SSC, 2 x solution de Denhardt, 0,1% SDS, 50% NOT). Hybridization is carried out using a solution comprising 6 x SSC, 2 x Denhardt solution, 0.1% SDS, 50%
formamide et de l'ADN de sperme de saumon soniqué à 100 mg/ml. formamide and DNA from salmon sperm sonicated at 100 mg / ml.
Elle est effectuée à 42'C durant 14 heures avec une sonde ayant une radioactivité de 106 cpm/Ml. (1 x SSC = 0,15M NaCl/0.015M citrate de sodium, pH 7; solution de Denhardt 0,02%, polyvinylpyrrolidone 0, 02%, Ficoll 0,02%, sérum It is carried out at 42 ° C. for 14 hours with a probe having a radioactivity of 106 cpm / Ml. (1 x SSC = 0.15M NaCl / 0.015M sodium citrate, pH 7; Denhardt solution 0.02%, polyvinylpyrrolidone 0.02%, Ficoll 0.02%, serum
albumine bovine).bovine albumin).
Les filtres sont lavés de manière brève dans une solution contenant 2 x SSC, SDS 0,1% à température ambiante puis sont lavés deux fois à 50 C dans une solution contenant 2 x SSC, SDS 0,1% durant 1 heure et autoradiographiés à -70 C en The filters are briefly washed in a solution containing 2 x SSC, 0.1% SDS at room temperature and are then washed twice at 50 ° C. in a solution containing 2 x SSC, 0.1% SDS for 1 hour and autoradiographed at -70 C in
utilisant des écrans intensifiants. using intensifying screens.
Les colonies sont hybridées avec la sonde puis The colonies are hybridized with the probe then
recriblées et sélectionnées par séquençage. re-screened and selected by sequencing.
9. Sous-clonage et stratégies de séquençage Un des clones lambda gt 10 positif contenant 2,3 kb a 9. Subcloning and sequencing strategies One of the lambda gt 10 positive clones containing 2.3 kb a
été sous-cloné dans des vecteurs pBluescript. has been subcloned into pBluescript vectors.
Deux fragments de digestion Pst I, de 0,8 kb et 0,3 kb respectivement, ont été à nouveau sous-clonés dans des Two Pst I digestion fragments, 0.8 kb and 0.3 kb respectively, were again subcloned into
vecteurs pBluescript. Le fragment de 1,2 kb issu du sous- pBluescript vectors. The 1.2 kb fragment from the sub-
clonage initial a été religaturé (figure 4). initial cloning was religated (Figure 4).
Le séquençage des deux brins a été effectué avec une amorce universelle M13, une amorce T3 et des amorceurs synthétiques en utilisant le kit de séquençage T7 commercialisé par Pharmacia ou le kit de séquençage Taq Track The sequencing of the two strands was carried out with a universal primer M13, a primer T3 and synthetic primers using the sequencing kit T7 marketed by Pharmacia or the sequencing kit Taq Track
commercialisé par Promega.marketed by Promega.
10. Analyse par la technique de transfert de Northern L'ARN total a été extrait à partir du corps gras et & partir des cellules épidermiques par précipitation directe dans une solution contenant LiCl 3M et de l'urée 6M (Auffray 10. Analysis by the Northern Transfer Technique The total RNA was extracted from the fatty substance and from the epidermal cells by direct precipitation in a solution containing 3M LiCl and 6M urea (Auffray
et Rougeon, 1980 précédemment cités). and Rougeon, 1980 previously cited).
L'ARN est séparé par électrophorèse dénaturante sur un gel d'agarose 1%formaldéhyde avec du tampon MOPS puis est The RNA is separated by denaturing electrophoresis on a 1% formaldehyde agarose gel with MOPS buffer and then is
transféré sur des membranes de Nylon (Hybond-N, Amersham). transferred to nylon membranes (Hybond-N, Amersham).
Le filtre est tout d'abord hybridé durant une nuit à 42'C avec de l'ADN complémentaire digéré par EcoRl/Pst 1 et est marqué d'une manière aléatoire par du phosphate 32 (fragment correspondant aux séquences de lecture ouvertes du fragment de 1,2 kb codant la majorité de la séquence de la protéine P-50) dans une solution contenant: 50% de formamide, 5 x SSC, 2x solution de Denhardt, 100 pg/ml d'ADN de sperme de The filter is firstly hybridized overnight at 42 ° C. with complementary DNA digested with EcoRI / Pst 1 and is randomly labeled with phosphate 32 (fragment corresponding to the open reading sequences of the fragment of 1.2 kb encoding the majority of the P-50 protein sequence) in a solution containing: 50% formamide, 5 x SSC, 2x Denhardt solution, 100 µg / ml sperm DNA
saumon dénaturé et 0,1% de SDS.denatured salmon and 0.1% SDS.
Le filtre est ensuite lavé de manière brève avec une solution contenant 4 x SSC et 0,1% SDS à température ambiante, deux fois à 50'C durant 20 minutes et finalement par une solution contenant 2 x SSC et 0,1% SDS durant 20 minutes à C. Apres autoradiographie le filtre est déshybridé selon les instructions du fabricant et réhybridé avec la sonde Cecropin B24 de Bombyx mori (Taniai et al. 1992, Biochem. Biophys. Acta, 1132: 203-206; Brey et al. 1993,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 6275- 6279) et la sonde d'a-tubuline comme The filter is then briefly washed with a solution containing 4 x SSC and 0.1% SDS at room temperature, twice at 50 ° C for 20 minutes and finally with a solution containing 2 x SSC and 0.1% SDS for 20 minutes at C. After autoradiography the filter is dehybridized according to the manufacturer's instructions and rehybridized with the Cecropin B24 probe from Bombyx mori (Taniai et al. 1992, Biochem. Biophys. Acta, 1132: 203-206; Brey et al. 1993 , Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 6275-6279) and the α-tubulin probe as
témoin interne (Kalfayan et Winsink, 1981, Cell 24: 97-106). internal witness (Kalfayan and Winsink, 1981, Cell 24: 97-106).
11. TranscriDtion in vitro, traduction in vitro et fluoroqraphie La synthèse d'ARN messagers synthétiques a été effectuée en utilisant un pBluescript linéarisé contenant l'insert P-50 et une ARN polymérase ADN dépendante codée par la bactériophage T7 polymérase et en utilisant la trousse de 11. In vitro transcriDtion, in vitro translation and fluorography The synthesis of synthetic messenger RNA was carried out using a linearized pBluescript containing the P-50 insert and an RNA polymerase dependent DNA coded by bacteriophage T7 polymerase and using the kit of
transcription d'ARN commercialisée par Stratagene. RNA transcription marketed by Stratagene.
Le système de lysat de réticulocyte de lapin (Promega) a été utilisé pour la traduction d'ARN messagers synthétiques The rabbit reticulocyte lysate system (Promega) was used for the translation of synthetic messenger RNA
en utilisant de la méthionine marquée au soufre 35S. using 35S sulfur labeled methionine.
Les produits de traduction in vitro ont été séparés sur gel SDS-PAGE. Après électrophorèse le gel est traité avec The in vitro translation products were separated on an SDS-PAGE gel. After electrophoresis the gel is treated with
En3Hance (DuPont) et fluorographié à -70'C. En3Hance (DuPont) and fluorographed at -70'C.
12. Analyse informatique des homologies de séquence Les logiciels FASTA, TFASTA et SwissProt ont été utilisés pour déterminer les homologies de séquences entre la P-50 et d'autres protéines connues (Argos, 1990, Methods in 12. Computer analysis of sequence homologies The FASTA, TFASTA and SwissProt software were used to determine the sequence homologies between P-50 and other known proteins (Argos, 1990, Methods in
Enzymol. 182: 751-776).Enzymol. 182: 751-776).
Le logiciel DNA strider 1.1 a été utilisé pour DNA strider 1.1 software was used to
l'analyse de l'hydrophobie.hydrophobicity analysis.
B. RESULTATSB. RESULTS
1. Test de liaison1. Link test
Un test de liaison avec une bactérie gram-négative (E. A binding test with a gram-negative bacterium (E.
cloacae), ou gram-positive (B. licheniformis), suivi par un lavage avec NaCl (temps d'incubation de 2,5 minutes) et une extraction acide a été effectué afin de purifier de manière sélective les protéines de l'hémolymphe ayant une affinité cloacae), or gram-positive (B. licheniformis), followed by washing with NaCl (incubation time 2.5 minutes) and acid extraction was carried out in order to selectively purify the proteins of the hemolymph having an affinity
importante pour les surfaces bactériennes. important for bacterial surfaces.
Les essais de bactéries ont été ensuite analysés sur The bacteria tests were then analyzed on
gel SDS-PAGE. Le gel SDS-PAGE d'extraits de bactéries gram- SDS-PAGE gel. The SDS-PAGE gel of gram bacteria extracts
négatives montre une bande prédominante correspondant à une negative shows a predominant band corresponding to a
protéine de 50 kD (figure 1A).50 kD protein (Figure 1A).
En comparant la liaison des protéines d'hémolymphe immune (figure 2, puits 2) et d'hémolymphe non-immune (figure 2, puits 3), on observe un accroissement significatif de la By comparing the binding of proteins from immune hemolymph (Figure 2, well 2) and non-immune hemolymph (Figure 2, well 3), a significant increase in the
quantité de protéine de 50 kD (P-50) dans l'hémolymphe immune. amount of 50 kD protein (P-50) in the immune hemolymph.
Quand on incube l'hémolymphe immune avec la bactérie testée durant différents temps d'incubation (1, 2, 5, 5, 15 et minutes), la quantité de P-50 augmente avec le temps jusqu'à un temps d'incubation de 15 minutes et devient ainsi la protéine la plus abondante liée à la surface bactérienne When the immune hemolymph is incubated with the bacteria tested during different incubation times (1, 2, 5, 5, 15 and minutes), the amount of P-50 increases over time up to an incubation time of 15 minutes and thus becomes the most abundant protein linked to the bacterial surface
(figure 2, colonnes 1, 2, 4, 5 et 6). (Figure 2, columns 1, 2, 4, 5 and 6).
Dans ce test de liaison in vitro (figure 2), les bactéries sont lavées deux fois avec une solution de 0,5 M de NaCl, au lieu d'effectuer des lavages successifs, en raison du In this in vitro binding test (FIG. 2), the bacteria are washed twice with a 0.5 M NaCl solution, instead of performing successive washes, due to the
nombre important d'échantillons.large number of samples.
Après la période d'incubation de 10 minutes, le surnageant du test de liaison est réincubé avec un nouveau lot de bactéries afin de déterminer s'il reste de la P-50 dans le surnageant. Seulement des quantités non significatives de P-50 peuvent être détectées au cours de la seconde incubation de 10 minutes. Ainsi, la P-50 est en grande partie éliminée de l'hémolymphe immune durant la première incubation de 10 minutes. Un P-1,3-glucane insoluble (curdlan) a été mis en oeuvre dans d'autres tests de liaison in vitro, à des concentrations finales de 3 mg/ml d'hémolymphe immune. Après une incubation de 10 minutes, le culot est lavé deux fois avec une solution de NaCl 0,5 M et l'extrait acide est analysé sur SDS-PAGE. La P-50 est détectée, avec des protéines After the 10 minute incubation period, the binding test supernatant is reincubated with a new batch of bacteria to determine if P-50 remains in the supernatant. Only insignificant amounts of P-50 can be detected during the second 10-minute incubation. Thus, P-50 is largely eliminated from the immune hemolymph during the first 10-minute incubation. An insoluble P-1,3-glucan (curdlan) was used in other in vitro binding tests, at final concentrations of 3 mg / ml of immune hemolymph. After a 10-minute incubation, the pellet is washed twice with 0.5 M NaCl solution and the acid extract is analyzed on SDS-PAGE. P-50 is detected, with proteins
contaminantes mineures.minor contaminants.
2. Purification et séquençaqe des acides aminés Les protéines éluées lors du test de liaison sont séparées sur Tricine-SDS-PAGE et la bande de protéine correspondant à un poids moléculaire de 50 kD est soumise à une digestion par une protéinase in situ afin d'effectuer une analyse de la séquence en aminoacides interne, car la protéine de 50 kD intacte n'est pas sensible à la dégradation d'Edman 2. Purification and sequencing of amino acids The proteins eluted during the binding test are separated on Tricine-SDS-PAGE and the protein band corresponding to a molecular weight of 50 kD is subjected to digestion with a proteinase in situ in order to perform an internal amino acid sequence analysis, as the intact 50 kD protein is not sensitive to Edman degradation
en raison de ses groupes a-aminés bloqués. due to its blocked a-amino groups.
Une série de bandes correspondant à la P-50 (environ 15 pg) est découpée à partir du gel, déshydratée et digérée in A series of strips corresponding to P-50 (approximately 15 μg) is cut from the gel, dehydrated and digested in
situ en utilisant l'endopeptidase Lys-C. situ using endopeptidase Lys-C.
Les fragments peptidiques résultant sont séparés par CHLP en phase inverse (figure lB) et leur structure primaire est déterminée par un séquençage automatique des acides aminés. Les séquences qui ont été déterminées sont les suivantes: - pic correspondant à la flèche noire: 2 bandes - bande majeure: DVVYYNAVFSINK - bande mineure: MTLFAFXGNLNXK - pic correspondant à la flèche blanche: The resulting peptide fragments are separated by reverse phase CHLP (FIG. 1B) and their primary structure is determined by automatic sequencing of the amino acids. The sequences which have been determined are as follows: - peak corresponding to the black arrow: 2 bands - major band: DVVYYNAVFSINK - minor band: MTLFAFXGNLNXK - peak corresponding to the white arrow:
LDSTSVGTLSAEVLDPVNGRXVYEEPDLKLDSTSVGTLSAEVLDPVNGRXVYEEPDLK
3. Analyse MOPAC et isolement de l'ADN complémentaire codant pour la PEn utilisant les données obtenues concernant la séquence interne en amino acides de la P-50, des amorces dégénérées ont été synthétisées (P 1 et P3 pour le brin sens, 3. MOPAC analysis and isolation of the complementary DNA coding for PEn using the data obtained concerning the internal amino acid sequence of P-50, degenerate primers were synthesized (P 1 and P3 for the sense strand,
P 2 et P 4 pour le brin anti-sens) (Figure 3A). P 2 and P 4 for the anti-sense strand) (Figure 3A).
Une amplification PCR est effectuée comme décrit dans le chapitre Matériels et Méthodes en utilisant de l'ADN complémentaire simple brin de corps gras de vers à soie immuns (combinaison de P 1 et P 4 ou P3 et P2). Seule une combinaison d'amorces (P 1 et P 4) donne naissance à un produit de 160 PCR amplification is carried out as described in the Materials and Methods chapter using complementary single-stranded DNA from fatty bodies of immune silkworms (combination of P 1 and P 4 or P3 and P2). Only a combination of primers (P 1 and P 4) gives rise to a product of 160
paires de base (pb) comme le montre la figure 3B. base pairs (bp) as shown in Figure 3B.
Le produit de 160 paires de base est cloné et séquencé. The 160 base pair product is cloned and sequenced.
La séquence en acides aminés déduite de la séquence de 160 paires de base contient les trois fragments peptidiques de la P-50, comme analysé par la dégradation d'Edman. La banque d'ADN complémentaire construite à partir de corps gras de ver à soie immunisé est criblée en utilisant le produit de 160 paires de base marqué d'une manière aléatoire par du phosphore 32, comme sonde. clones positifs sont isolés après criblage d'environ 75.000 clones indépendants. Parmi treize clones positifs choisis de manière aléatoire, tous ont le même insert de taille identique (2,3 kb) à l'exception d'un clone qui The amino acid sequence deduced from the 160 base pair sequence contains the three peptide fragments of P-50, as analyzed by Edman degradation. The complementary DNA library constructed from an immunized silkworm fatty substance is screened using the product of 160 base pairs randomly labeled with phosphorus 32, as probe. positive clones are isolated after screening of approximately 75,000 independent clones. Among thirteen positive clones chosen at random, all have the same insert of identical size (2.3 kb) with the exception of one clone which
présente un insert de 1,8 kb.has a 1.8 kb insert.
La séquence nucléotidique d'un de ces clones (lambda The nucleotide sequence of one of these clones (lambda
BP5OO1) contenant un des inserts de 2,3 kb a été analysée ci- BP5OO1) containing one of the 2.3 kb inserts has been analyzed above
dessous. 4. Séquence nucléotidique et séquence en acides aminés déduite below. 4. Nucleotide sequence and deduced amino acid sequence
Le fragment EcoR I du clone lambdaBP5001 a été sous- The EcoR I fragment of the lambdaBP5001 clone was sub-
cloné dans le plasmide pBluescript. cloned into the plasmid pBluescript.
Des sous-clonages ont été effectués comme décrits dans le chapitre Matériels et Méthodes. La carte de restriction Subcloning has been carried out as described in the Materials and Methods chapter. The restriction card
utilisée pour le sous-clonage est celle de la figure 4. used for subcloning is that of FIG. 4.
La séquence nucléotidique et la séquence en amino acides déduite sont celles répertoriées SEQ ID N' 1 et SEQ ID N'2. La séquence de lambdaPB5001 contient une région non codante à son extrémité 5' et une phase de lecture ouverte de 1401 nucleotides correspondant à 467 acides aminés. Une région non traduite de 1100 nucleotides est aussi présente entre le codon stop et le site de polyadénylation. Cette séquence contient deux signaux possibles de polyadénylation (AATAAA), ce qui pourrait correspondre à l'existence d'ARN messagers de The nucleotide sequence and the deduced amino acid sequence are those listed SEQ ID N ′ 1 and SEQ ID N'2. The lambdaPB5001 sequence contains a non-coding region at its 5 'end and an open reading phase of 1401 nucleotides corresponding to 467 amino acids. An untranslated region of 1100 nucleotides is also present between the stop codon and the polyadenylation site. This sequence contains two possible polyadenylation signals (AATAAA), which could correspond to the existence of messenger RNAs from
différentes tailles.different sizes.
On a aussi trouvé six séquences ATTTA dans la région proche de l'extrémité 3' de la phase de lecture ouverte, ce qui suggère une certaine instabilité des ARN messagers de la Six ATTTA sequences were also found in the region near the 3 'end of the open reading phase, suggesting some instability of the messenger RNAs of the
protéine P-50.protein P-50.
Le poids moléculaire calculé de la protéine déduite de The calculated molecular weight of the protein deduced from
la séquence d'ADN complémentaire est de 52.225D. the complementary DNA sequence is 52.225D.
L'analyse de l'hydrophobicité de la séquence montre que les dix huit premiers aminoacides correspondent à un profil typique de peptide signal (figure 5). La partie C-terminale de la protéine P-50 est aussi très hydrophobe ce qui suggère l'existence d'un ancrage membranaire. La protéine déduite contient aussi un site potentiel de N-glycosylation sur son acide aminé en position Analysis of the hydrophobicity of the sequence shows that the first eighteen amino acids correspond to a typical signal peptide profile (Figure 5). The C-terminal part of the P-50 protein is also very hydrophobic, which suggests the existence of a membrane anchor. The deduced protein also contains a potential N-glycosylation site on its amino acid in position
182.182.
5. Comparaison de la séquence en acides aminés de la protéine P-50 et d'autres protéines L'ADN complémentaire de la protéine P-50 a une homologie de séquence significative avec certains domaines de quatre protéines différentes présentant une relation du point de vue immun: 3-1, 3 glucanase bactérienne, protéine liant le complexe lipopolysaccharidique humain (LBP), protéine 5. Comparison of the amino acid sequence of the P-50 protein and other proteins The complementary DNA of the P-50 protein has significant sequence homology with certain domains of four different proteins presenting a point of view immune: 3-1, 3 bacterial glucanase, protein that binds the human lipopolysaccharide complex (LBP), protein
augmentant la perméabilité humaine (BPI) et CD14 humain. increasing human permeability (BPI) and human CD14.
a) B-1,3 glucanase L'homologie de séquence la plus importante est obtenue avec l'ADN complémentaire de la P-1,3 glucanase A1 de Bacillus circulans WL-12 (Yahata et al., 1990, Gene 86, 113-117). 34% d'identité et 56% de similarité sur un ensemble de 124 amino a) B-1,3 glucanase The most important sequence homology is obtained with the DNA complementary to P-1,3 glucanase A1 from Bacillus circulans WL-12 (Yahata et al., 1990, Gene 86, 113 -117). 34% identity and 56% similarity across 124 amino acids
acides (figure 6).acids (Figure 6).
Cette région de 124 amino acides contient le site actif supposé hautement conservé (19 acides aminés) d'aussi bien les P-1,3-1,4 glucanases que les /-1,3-1,4 glucanases (Schimming et al., 1992,Eur. J. Biochem., 204, 13-19; Hofemeister et al., This region of 124 amino acids contains the supposedly highly conserved active site (19 amino acids) of both P-1,3-1,4 glucanases and / -1,3-1,4 glucanases (Schimming et al. , 1992, Eur. J. Biochem., 204, 13-19; Hofemeister et al.,
1986, Gene 49: 177-187) comme le montre la figure 6. 1986, Gene 49: 177-187) as shown in Figure 6.
Dans cette région, la P-50 montre une identité de structure de 53% et une similarité de 63% avec la 3-1,3 glucanase de Bacillus circulans et une identité de 53% et une similarité de 90% avec la P-1,3- 1,4 glucanase de Fibrobacter In this region, P-50 shows a structural identity of 53% and a similarity of 63% with 3-1.3 glucanase from Bacillus circulans and an identity of 53% and a similarity of 90% with P-1 , 3- 1,4 Fibrobacter glucanase
succinogenes (Teather et Erfle, 1990, J. Bacteriol. 172: 3837- succinogenes (Teather and Erfle, 1990, J. Bacteriol. 172: 3837-
3841) incluant les résidus histidine et acide aspartique 3841) including histidine and aspartic acid residues
strictement conservés du site actif supposé. strictly retained from the assumed active site.
b) LBP/BPI On observe aussi une homologie de séquence significative avec le domaine de liaison du LPS des LBP et BPI humaines (Schumann et al., 1990, Science 249:1429; Hoess et al., 1993, EMBO J. Vol. 12 N 9 3351-3356) comme le montre la figure 7. Dans ce domaine de 19 acides aminés, on observe une identité de 21%, et une similarité de 47% avec la LBP et une b) LBP / BPI A significant sequence homology is also observed with the LPS binding domain of human LBP and BPI (Schumann et al., 1990, Science 249: 1429; Hoess et al., 1993, EMBO J. Vol. 12 N 9 3351-3356) as shown in Figure 7. In this domain of 19 amino acids, we observe an identity of 21%, and a similarity of 47% with LBP and a
identité de 21% et une similarité de 53% avec la BPI. 21% identity and 53% similarity to BPI.
Si le domaine de liaison consensus de la LBP ou de la BPI est comparé avec la P-50 on obtient une identité de 37% et If the consensus binding domain of LBP or BPI is compared with P-50, an identity of 37% is obtained and
une similarité de 68%. (figure 7).68% similarity. (figure 7).
c) CD14 Une autre protéine humaine impliquée dans le complexe c) CD14 Another human protein involved in the complex
de liaison LPS/LBP ou dans la liaison du LPS est le CD14. LPS / LBP binding or in the LPS binding is CD14.
Cette protéine montre une identité de 21% et une similarité de 46%. 6. Traduction in vitro Afin de confirmer l'identité du produit du gène clone, le lambdaBP5001 est linéarisé par digestion Bgl II et la This protein shows an identity of 21% and a similarity of 46%. 6. In Vitro Translation In order to confirm the identity of the cloned gene product, lambdaBP5001 is linearized by Bgl II digestion and the
transcription est effectuée in vitro. transcription is performed in vitro.
Les ARN messagers résultants sont traduits in vitro en utilisant le lysat de réticulocyte de lapin en présence de S-methionine. The resulting messenger RNAs are translated in vitro using the rabbit reticulocyte lysate in the presence of S-methionine.
Les mélanges réactionnels sont ensuite séparés par SDS- The reaction mixtures are then separated by SDS-
PAGE et fluorographiés. La protéine traduite a un poids moléculaire estimé de l'ordre de 52 kD comme le montre la figure 8. Ceci est en accord avec le poids moléculaire calculé PAGE and fluorographed. The translated protein has an estimated molecular weight of around 52 kD as shown in Figure 8. This is in agreement with the calculated molecular weight
à partir de la séquence en acides aminés déduite. from the deduced amino acid sequence.
7. Induction d'ARN messaqers codant pour la P-50 en réponse à l'infection bactérienne en utilisant des larves de Bombyx mori axéniques La quantité de protéine P-50 dans l'hémolymphe augmente de manière importante après mise en contact avec des bactéries 7. Induction of messaqer RNA encoding P-50 in response to bacterial infection using axenic Bombyx mori larvae The amount of P-50 protein in the hemolymph increases significantly after contact with bacteria
comme le montre la figure 1.as shown in figure 1.
L'induction des ARN messagers codant pour la P-50 suivant l'abrasion procuticulaire a été examinée avec des The induction of messenger RNAs encoding P-50 following prothicular abrasion was examined with
larves de Bombyx mori axéniques.axenic Bombyx mori larvae.
Le lambdaBP5001 a été digéré par Pst 1/EcoR i et le fragment de 1, 2 kb en résultant, et contenant la majeure partie de la région codant pour la protéine P-50, a été purifié, marqué de manière aléatoire par du 32p et utilisé comme sonde pour un transfert de type Northern (Northern blot). L'ARN messager de la P-50 est exprimé de manière constitutive à faible taux dans le corps gras et dans les cellules épidermiques de larves n'ayant pas subi d'abrasion LambdaBP5001 was digested with Pst 1 / EcoR i and the resulting 1.2 kb fragment, containing the major part of the region coding for the protein P-50, was purified, randomly labeled with 32p and used as a probe for a Northern blot. P-50 messenger RNA is constitutively expressed at low levels in the fat and in the epidermal cells of non-abraded larvae
procuticulaire (figure 9A).procuticular (Figure 9A).
Six heures après l'abrasion procuticulaire en présence de bactéries, les ARN messagers sont induits de manière forte dans le corps gras et, à un degré moindre, dans les cellules épidermiques. Même une abrasion stérile en l'absence stricte de bactéries est capable d'induire des ARN messagers dans les Six hours after the abrasion of the skin in the presence of bacteria, the messenger RNAs are strongly induced in the fatty substance and, to a lesser degree, in the epidermal cells. Even sterile abrasion in the strict absence of bacteria is capable of inducing messenger RNA in
deux tissus six heures après l'abrasion (figure 9A). two tissues six hours after abrasion (Figure 9A).
Afin d'avoir un témoin positif, l'ADN transfèré (blot) est déshybridé et réhybridé avec le gène exprimé de manière constitutive de l'a- tubuline et d'une autre protéine In order to have a positive control, the transferred DNA (blot) is dehybridized and rehybridized with the gene expressed constitutively of α-tubulin and of another protein.
intervenant dans l'immunité induite, la cecropine B2. involved in induced immunity, cecropin B2.
Les résultats de la figure 9B montrent que la P-50 est une protéine de phase aiguë qui joue un râle important dans la The results of FIG. 9B show that P-50 is an acute phase protein which plays an important role in the
réponse immune de Bombyx mori.immune response from Bombyx mori.
L'ensemble des résultats de cet exemple montre que la protéine P50 lie le LPS et joue un rôle important dans la All the results of this example show that the P50 protein binds LPS and plays an important role in the
réponse immunitaire.immune response.
EXEMPLE 2:EXAMPLE 2:
1) - OBTENTION DES PLANTS DE TABAC TRANSGENIOUES ET 1) - OBTAINING TRANSGENIOUS TOBACCO PLANTS AND
MISES EN EVIDENCE DE LA RESISTANCE A l'INFECTION EVIDENCE OF RESISTANCE TO INFECTION
FONGIOUEFUNGIOUE
L'ADN complémentaire de la protéine P-50 obtenu dans l'exemple 1 est cloné dans les sites EcoRl des plasmides pMON530 et pBI 121 (Jaynes et al., 1993, Plant Science, 89, -53). L'ADN complémentaire inséré est placé sous le contrôle du promoteur de la protéinase II issue de la pomme de terre The complementary DNA of the P-50 protein obtained in Example 1 is cloned into the EcoRI sites of the plasmids pMON530 and pBI 121 (Jaynes et al., 1993, Plant Science, 89, -53). The inserted complementary DNA is placed under the control of the proteinase II promoter from the potato
(Jaynes et al. 1993, Science, 89, 43-53). (Jaynes et al. 1993, Science, 89, 43-53).
Des disques foliaires de 1 cm de diamètre environ sont découpés dans des feuilles de plants de tabac vieux de six semaines (Nicotiana tabacum var. xanthii et var. samsung) qui ont été cultivés de manière aseptique dans des boîtes de Leaf discs about 1 cm in diameter are cut from the leaves of six-week-old tobacco plants (Nicotiana tabacum var. Xanthii and var. Samsung) which have been aseptically grown in boxes of
Magenta.Magenta.
Les disques foliaires sont obtenus en poinçonnant de jeunes feuilles en utilisant un poinçon stérilisé. Les explants sont précultivés durant 1 à 2 jours sur un milieu MS104 (MSO, 7 g/l de phytoagar, 1 mg/ml de benzyladenine et 0,1 mg/ml d'acide naphtalène acétique) pour stimuler la croissance. Le milieu MSO comprend 4,3 g/l de sel de Murashige Leaf discs are obtained by punching young leaves using a sterilized punch. The explants are precultured for 1 to 2 days on an MS104 medium (MSO, 7 g / l of phytoagar, 1 mg / ml of benzyladenine and 0.1 mg / ml of naphthalene acetic acid) to stimulate growth. The MSO medium comprises 4.3 g / l of Murashige salt
et Skoog et 30 g/l de saccharose.and Skoog and 30 g / l of sucrose.
Les explants sont inoculés en les immergeant durant 2 à secondes dans une culture effectuée durant une nuit d'Agrobacterium tumefaciens. L'eau des explants est ensuite absorbée et les explants sont mis en culture sur des boites de culture nourrice. Chaque boîte de culture nourrice est préparée en utilisant du milieu MS104 auquel a été ajouté 1, 5 ml de suspension de culture de tabac. Ces boîtes sont The explants are inoculated by immersing them for 2 to seconds in an overnight culture of Agrobacterium tumefaciens. The explants' water is then absorbed and the explants are placed in culture on boxes of nurse culture. Each canister culture dish is prepared using MS104 medium to which 1.5 ml of tobacco culture suspension has been added. These boxes are
couvertes avec un morceau de papier filtre Whatman 3mm. covered with a piece of Whatman 3mm filter paper.
Les explants sont ensuite laissés à incuber durant 2 jours puis transférés sur un milieu de sélection MS (MS104, 500 mg/ml de carbénicilline ou de céfatoxime, 300 mg/ml de kanamycine). Quand les tiges apparaissent, les explants sont transférés sur un milieu d'enracinage MS (MSO avec 0,6% d'agar, 500 mg/ml de carbénicilline et 100 mg/ml de kanamycine). Les pieds sortant des explants et présentant des tiges bien définies sont découpés et repiqués dans un nouveau milieu d'enracinage. Les plantules qui développent des racines d'environ 2 semaines dans les milieux d'enracinage sont alors transférées dans un sol stérile dans des pots Jiffy et mis dans des boites The explants are then left to incubate for 2 days and then transferred to an MS selection medium (MS104, 500 mg / ml of carbenicillin or cefatoxime, 300 mg / ml of kanamycin). When the stems appear, the explants are transferred to an MS rooting medium (MSO with 0.6% agar, 500 mg / ml of carbenicillin and 100 mg / ml of kanamycin). The feet emerging from the explants and having well-defined stems are cut and transplanted into a new rooting medium. The seedlings which develop roots for around 2 weeks in the rooting medium are then transferred to sterile soil in Jiffy pots and placed in boxes
de Magenta stérilisées.of sterilized Magenta.
Après 7 à 10 jours, les couvercles des boîtes de Magenta sont réouvertes afin d'acclimater les plantes. Les plantes sont ensuite transférées dans des pots durant deux semaines puis dans des pots plus gros et mises en croissance dans une serre sous une lumière naturelle. Elles sont arrosées quotidiennement avec une solution 20:20:20 (N/K/P). La température moyenne est d'environ 32 C. Des cultures nourrice de cellules de tabac (Nicotiana tabacum var. xanthii) sont utilisées durant la co-culture des explants avec les bactéries Agrobacterium afin d'améliorer l'efficacité de transformation. Des suspensions de culture sont maintenues dans des flasques d'Erlenmeyer contenant 50 ml de suspension de culture (4,3 g/l de sel MS, 30 g/1 de saccharose, 5 ml/l de vitamine B5, 1 mg/l de 2,4-D). Les cultures sont conservées à température ambiante avec une agitation constante de 150 révolutions/minute. Les suspensions cellulaires sont maintenues en faisant des sous-cultures de 10 After 7 to 10 days, the lids of the Magenta boxes are reopened to acclimatize the plants. The plants are then transferred to pots for two weeks, then to larger pots and grown in a greenhouse under natural light. They are watered daily with a 20:20:20 solution (N / K / P). The average temperature is around 32 C. Cultures nourishing tobacco cells (Nicotiana tabacum var. Xanthii) are used during the co-culture of the explants with the Agrobacterium bacteria in order to improve the transformation efficiency. Culture suspensions are maintained in Erlenmeyer flasks containing 50 ml of culture suspension (4.3 g / l of MS salt, 30 g / l of sucrose, 5 ml / l of vitamin B5, 1 mg / l of 2,4-D). The cultures are stored at room temperature with constant stirring of 150 revolutions / minute. The cell suspensions are maintained by making subcultures of 10
ml de culture, filtrées et lavées, dans 50 ml de milieu. ml of culture, filtered and washed, in 50 ml of medium.
L'expression du gène codant pour la P-50 est mise en évidence en dosant le taux d'ARN par une analyse de transfert The expression of the gene coding for P-50 is demonstrated by measuring the RNA level by a transfer analysis.
de type Northern (Northern blot).Northern blot.
L'expression de la P-50 dans les plants de tabac est analysée en utilisant la méthode décrite par Sanchez-Serrano The expression of P-50 in tobacco plants is analyzed using the method described by Sanchez-Serrano
et al. (1987, EMBO J. 6, 303-306).et al. (1987, EMBO J. 6, 303-306).
Des pinces de dialyse sont posées sur des feuilles de plants de tabac hauts de 60 à 80 cm. Les ARN sont isolés à partir de feuilles des plants sur lesquelles ont été posées les pinces de dialyse, 6, 12 et 24 heures après la pose. Les ARN Poly(A) sont isolés en utilisant la trousse FastTrackTM oligo dT cellulose (commercialisée par Invitrogen). 10 pg par échantillon sont chargés sur le gel. L'insert d'ADN Dialysis tongs are placed on leaves of tobacco plants 60 to 80 cm high. The RNAs are isolated from the leaves of the plants on which the dialysis tongs were placed, 6, 12 and 24 hours after installation. The Poly RNAs (A) are isolated using the FastTrackTM oligo dT cellulose kit (sold by Invitrogen). 10 μg per sample are loaded onto the gel. The DNA insert
complémentaire de la P-50 de 1200 pb est utilisé comme sonde. complementary to the P-50 of 1200 bp is used as a probe.
Les protéines totales sont extraites des feuilles de tabac par une solution contenant tris-HCl (pH 6,8) 80 mM, SDS 2%, glycérol 10% et sont séparées sur des gels de polyacrylamide dénaturant à 13%, à raison de 20 Mg de protéines totales par échantillon. Les protéines sont ensuite transférées sur une membrane Immobilon-P commercialisée par Millipore. La membrane est incubée avec un antisérum dirigé contre la P- 50 en Total proteins are extracted from tobacco leaves with a solution containing 80 mM tris-HCl (pH 6.8), 2% SDS, 10% glycerol and are separated on 13% denaturing polyacrylamide gels, at a rate of 20 Mg. total protein per sample. The proteins are then transferred to an Immobilon-P membrane sold by Millipore. The membrane is incubated with an antiserum directed against P-50 in
utilisant les techniques d'analyse Western conventionnelles. using conventional Western analysis techniques.
La détection des protéines immunoréactives est effectuée en The detection of immunoreactive proteins is carried out in
utilisant la technique de luminescence Amersham ECL. using the Amersham ECL luminescence technique.
2) - RESISTANCE DES PLANTS OBTENUS A L'ENCONTRE D'UNE 2) - RESISTANCE OF PLANTS OBTAINED AGAINST A
INFECTION FONGIQUEFUNGAL INFECTION
Phytophtera syringae, qui est très virulent à Phytophtera syringae, which is very virulent at
l'encontre du tabac est utilisé dans les tests d'inoculation. Tobacco is used in inoculation tests.
Des zoospores suspendus dans de l'eau à différentes densités cellulaires sont utilisés comme inoculum. Des jeunes plants de tabac résistants à la kanamycine sont obtenus à partir de graines de la génération R1, soit témoins soit issues de plantes transgéniques pour la P50, et transplantés directement dans des pots contenant un sol artificiel (Pro- Mix) puis mis en culture dans une serre. Les plants témoins sont transgéniques pour le vecteur de transfert ne contenant pas Zoospores suspended in water at different cell densities are used as an inoculum. Young tobacco plants resistant to kanamycin are obtained from seeds of the R1 generation, either controls or derived from transgenic plants for P50, and transplanted directly into pots containing artificial soil (Pro-Mix) and then cultivated in a greenhouse. Control plants are transgenic for the transfer vector not containing
l'insert P-50.insert P-50.
Les plantes utilisées dans le test vis-à-vis de l'infection fongique sont mises à croître dans des petits pots jusqu'à ce qu'elles atteignent une hauteur d'environ 10 cm, puis la bordure de 4 à 5 feuilles est entaillée. Toutes les racines du même côté du plant, à mi- chemin entre le pied et la paroi du pot, sont coupées. Les pots sont placés dans des soucoupes et 5 ml de zoospores suspendus dans de l'eau à raison de 107 cellules par ml sont versées dans le sol. Les The plants used in the fungal infection test are grown in small pots until they reach a height of about 10 cm, then the border of 4 to 5 leaves is cut. . All the roots on the same side of the plant, halfway between the base and the wall of the pot, are cut. The pots are placed in saucers and 5 ml of zoospores suspended in water at the rate of 107 cells per ml are poured into the ground. The
plants témoins ne reçoivent que de l'eau. control plants receive only water.
Les plants sont disposés de manière aléatoire et codés afin d'obtenir des conditions de simple aveugle. Les plants sont incubés à 30'C dans des chambres de croissance et le sol est conservé humide par trempage dans des soucoupes. Le pourcentage des feuilles entaillées qui dépérissent est noté pour chaque plante, chaque jour, et le pourcentage moyen de feuilles ayant dépéri en fonction de chaque traitement est calculé. Quant toutes les feuilles entaillées Plants are randomly arranged and coded to obtain single-blind conditions. The plants are incubated at 30 ° C in growth chambers and the soil is kept moist by soaking in saucers. The percentage of notched leaves that wither away is noted for each plant, each day, and the average percentage of leaves that have perished depending on each treatment is calculated. When all the notched leaves
ont dépéri, le plant est considéré comme ayant dépéri lui- have perished, the plant is considered to have perished
même. Les nouvelles feuilles qui apparaissent durant le test ne sont pas comptées même si elles semblent dépérir de manière considérable. Les résultats sont analysés en utilisant le test des deux échantillons de Wilcoxon en comparant les valeurs even. New leaves that appear during the test are not counted even if they appear to wither away considerably. Results are analyzed using the Wilcoxon two sample test by comparing the values
moyennes entre témoins et plantes transgéniques. means between controls and transgenic plants.
Un autre test consiste à mettre les plantes du test d'inoculation en croissance dans des pots jusqu'à ce qu'elles atteignent une hauteur de 15 cm et les bords de 8 à 10 feuilles sont échancrés comme décrit ci- dessus. Chacun des plants reçoit 20 Mm d'un inoculum contenant 106 cellules/ml ou Ml d'eau appliqué par l'intermédiaire d'une blessure au couteau faite à la base. Les feuilles échancrées sur chaque plante sont estimées chaque jour pour leur degré de dépérissement. Le pourcentage de feuilles et de plantes ayant dépéri est calculé comme dans le cas de la méthode Another test is to put the inoculation test plants growing in pots until they reach a height of 15 cm and the edges of 8 to 10 leaves are notched as described above. Each of the plants receives 20 mm of an inoculum containing 106 cells / ml or ml of water applied via a knife wound made at the base. The scalloped leaves on each plant are estimated each day for their degree of decline. The percentage of leaves and plants having perished is calculated as in the case of the method
d'inoculation par les racines.root inoculation.
Le procédé décrit dans cet exemple permet d'obtenir des The process described in this example makes it possible to obtain
plantes résistantes aux infections fongiques. plants resistant to fungal infections.
EXEMPLE 3:EXAMPLE 3:
NEUTRALISATION DES ENDOTOXINESNEUTRALIZATION OF ENDOTOXINS
L'ADN complémentaire de la protéine P-50 est exprimé dans un système eucaryote ou bactérien selon les techniques The complementary DNA of the P-50 protein is expressed in a eukaryotic or bacterial system according to the techniques
décrites par Sambrook et al. (1989, précédemment cités). La P- described by Sambrook et al. (1989, previously cited). The P-
est purifiée selon les techniques décrites par Das, (1990, Methods in Enzymology 182, 93-112) et Bradley (1990, Methods in Enzymology 182, 112-132). La P-50 purifiée obtenue de cette manière est utilisée dans des tests d'activité biologique. is purified according to the techniques described by Das, (1990, Methods in Enzymology 182, 93-112) and Bradley (1990, Methods in Enzymology 182, 112-132). The purified P-50 obtained in this way is used in biological activity tests.
TEST DE NEUTRALISATION DE L'ENDOTOXINE ENDOTOXIN NEUTRALIZATION TEST
pg d'endotoxine d'Escherichia coli 0113 sont pg of endotoxin of Escherichia coli 0113 are
ajoutés à des dilutions en série de la protéine P-50. added to serial dilutions of the P-50 protein.
L'activité de l'endotoxine est quantifiée par le test turbidimetrique décrit par Novisky et al., (1985, J. Clin. The activity of the endotoxin is quantified by the turbidimetric test described by Novisky et al., (1985, J. Clin.
Micro, 20, 211-216) pour le facteur anti-LPS de Limulus. Micro, 20, 211-216) for the anti-LPS factor of Limulus.
D'autres échantillons de LPS sont testés tels que ceux de Klebsiella pneumoniae, Serratia marcesens et Serratia minnesota. La neutralisation de ces différentes espèces est effectuée avec un excès cinq fois plus important de P-50 par Other samples of LPS are tested such as those of Klebsiella pneumoniae, Serratia marcesens and Serratia minnesota. The neutralization of these different species is carried out with a five-fold excess of P-50 by
rapport au LPS.report to the LPS.
TEST DE NEUTRALISATION DU SERUMSERUM NEUTRALIZATION TEST
Afin de tester l'efficacité potentielle de la P-50 in vivo, la protéine a été testée pour sa capacité à inactiver In order to test the potential efficacy of P-50 in vivo, the protein was tested for its ability to inactivate
l'endotoxine en présence d'un sérum de rat total. endotoxin in the presence of a total rat serum.
Un test est effectué dans des plaques de 96 puits comme A test is carried out in 96-well plates as
décrit par Novitsky et al. (précédemment cités). described by Novitsky et al. (previously cited).
A chaque puits on ajoute dans l'ordre 0,05 ml de sérum ou 0,5 ml de sérum avec 25 mg/ml de P-50, puis 0,5 ml 0.05 ml of serum or 0.5 ml of serum with 25 mg / ml of P-50 is added in order to each well, then 0.5 ml
d'endotoxine d'Escherichia coli 0113. endotoxin from Escherichia coli 0113.
Les plaques sont couvertes avec un film de Parafilm afin d'éviter l'évaporation, agitées sur une plateforme d'agitation mécanique durant 15 minutes et incubées à 37'C The plates are covered with a Parafilm film to avoid evaporation, shaken on a mechanical shaking platform for 15 minutes and incubated at 37 ° C
durant 1 heure.for 1 hour.
Le film plastique couvrant les plaques est retiré puis 0,1 ml de LAL est ajouté à chaque puits qui est testé comme The plastic film covering the plates is removed and then 0.1 ml of LAL is added to each well which is tested as
décrit ci-dessus.described above.
Le LR50 est défini comme étant la moitié de la croissance maximale de la densité optique par rapport au The LR50 is defined as being half of the maximum growth of the optical density compared to the
témoin.witness.
EXEMPLE 4:EXAMPLE 4:
Protection des animaux par la protéine P-50 Des rats mâles Sprague-Dawley (230-450g) sont anesthésiés légèrement avec de l'Halothane. On leur injecte alors une solution à tester par l'intermédiaire de la veine Protection of animals with the P-50 protein Male Sprague-Dawley rats (230-450g) are lightly anesthetized with Halothane. They are then injected with a test solution through the vein
dorsale du pénis.dorsal of the penis.
Les rats témoins reçoivent une solution contenant un tampon phosphatesalin (0,15 NaCl) tamponné à pH 7,4 et contenant 0,02 M de phosphate de sodium. Un second groupe de rats reçoit du LPS (E. coli 0111: B4, Sigma Chemical Company) The control rats receive a solution containing a phosphatesaline buffer (0.15 NaCl) buffered to pH 7.4 and containing 0.02 M of sodium phosphate. A second group of rats receives LPS (E. coli 0111: B4, Sigma Chemical Company)
dans du tampon.in buffer.
Un troisième groupe de rats est testé avec une suspension de protéine P50 et de LPS mélangés dans des quantités égales en poids dans du tampon et incubé durant 1 A third group of rats is tested with a suspension of protein P50 and LPS mixed in equal amounts by weight in buffer and incubated for 1
heure à 37 C avant injection.hour at 37 C before injection.
Un quatrième groupe de rats reçoit de l'albumine mélangée avec du LPS dans des quantités égales en poids et A fourth group of rats receives albumin mixed with LPS in equal amounts by weight and
incubée d'une manière similaire.incubated in a similar manner.
Le dernier groupe de rats est traité par injection avec The last group of rats is treated by injection with
seulement la P-50 incubée dans du tampon. only P-50 incubated in buffer.
Le volume injecté (1,7 - 2,9 ml) dépend du poids du rat qui est ajusté de façon à fournir une dose de 15 mg de LPS par The volume injected (1.7 - 2.9 ml) depends on the weight of the rat which is adjusted so as to provide a dose of 15 mg of LPS per
kilo corporel.body kilo.
La survie des rats est suivie durant 24 heures. The survival of the rats is followed for 24 hours.
Le procédé décrit ci-dessus permet de mettre en évidence l'activité thérapeutique de la protéine P50, sur un The method described above makes it possible to demonstrate the therapeutic activity of the P50 protein, on a
modèle animal représentatif.representative animal model.
Conclusion Les résultats de ces quatre exemples mettent en évidence les propriétés remarquables de la protéine P50 et ses Conclusion The results of these four examples highlight the remarkable properties of the P50 protein and its
applications thérapeutiques pharmaceutiques et agronomiques. pharmaceutical and agronomic therapeutic applications.
LISTE DE SEQUENCESLIST OF SEQUENCES
(1) INFORMATION GENERALE:(1) GENERAL INFORMATION:
(i) DEPOSANT:(i) DEPOSITOR:
(A) NOM: INSTITUT PASTEUR(A) NAME: INSTITUT PASTEUR
(B) RUE: 28, rue du Docteur Roux(B) STREET: 28, rue du Docteur Roux
(C) VILLE: PARIS(C) CITY: PARIS
(E) PAYS: FRANCE(E) COUNTRY: FRANCE
(F) CODE POSTAL: 75724(F) POSTAL CODE: 75724
(G) TELEPHONE: 45688097(G) TELEPHONE: 45688097
(H) TELECOPIE: 40613017(H) FAX: 40613017
(ii) TITRE DE L' INVENTION: Protéines liant le complexe lipopolysaccharidique (LPS),et leurs utilisations (iii) NOMBRE DE SEQUENCES: 5 (iv) FORME LISIBLE PAR ORDINATEUR: (A) TYPE DE SUPPORT: Floppy disk (B) ORDINATEUR: IBM PC compatible (ii) TITLE OF THE INVENTION: Proteins binding the lipopolysaccharide complex (LPS), and their uses (iii) NUMBER OF SEQUENCES: 5 (iv) COMPUTER-READABLE FORM: (A) TYPE OF MEDIUM: Floppy disk (B) COMPUTER : IBM PC compatible
(C) SYSTEME D' EXPLOITATION: PC-DOS/MS-DOS (C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS / MS-DOS
(D) LOGICIEL: PatentIn Release $1.0, Version X1.25 (OEB) (D) SOFTWARE: PatentIn Release $ 1.0, Version X1.25 (EPO)
(2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 1: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 1:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 19 acides aminés (B) TYPE: acide aminé (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: peptide (iii) HYPOTHETIQUE: NON (vi) ORIGINE: (A) ORGANISME: Bombyx mori (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 19 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: NO (vi) ORIGIN: (A) ORGANIZATION: Bombyx mori
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 1: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 1:
Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe Gln Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe Gln
1 5 10 151 5 10 15
Gly Asn LeuGly Asn Leu
(2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 2: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 19 acides aminés (B) TYPE: acide aminé (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: peptide (iii) HYPOTHETIQUE: NON (vi) ORIGINE: (A) ORGANISME: Bombyx mori (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 19 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: NO (vi) ORIGIN: (A) ORGANIZATION: Bombyx mori
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 2: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 2:
Phe His Thr Tyr Ser Val Gln ?rp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu Ser Phe His Thr Tyr Ser Val Gln? Rp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu Ser
1 5 10 151 5 10 15
Val Asp GlyVal Asp Gly
(2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 3: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 3:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 455 acides aminés (B) TYPE: acide aminé (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: peptide (iii) HYPOTHETIQUE: NON (vi) ORIGINE: (A) ORGANISME: Bombyx mori (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 455 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: NO (vi) ORIGIN: (A) ORGANIZATION: Bombyx mori
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 3: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 3:
Lys Ile Ser Tyr Ala Gln Met Pro Asp Vai Lys Ile Gln Ala Phe Arg Lys Ile Ser Tyr Ala Gln Met Pro Asp Vai Lys Ile Gln Ala Phe Arg
1 5 10 151 5 10 15
Pro Lys Gly Leu Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Pro Lys Gly Leu Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu
25 3025 30
Phe Ala Phe Gln Glv Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val Phe Ala Phe Gln Glv Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val
40 4540 45
Gly Thr Leu Ser Ala Glu Val Leu AsD Pro Val Asn Gly Arg Trp Val Gly Thr Leu Ser Ala Glu Val Leu AsD Pro Val Asn Gly Arg Trp Val
55 5055 50
Tyr Glu Glu Pro Asp Leu Lys Leu ys Val Lys Asp Val Val Tyr Tyr Tyr Glu Glu Pro Asp Leu Lys Leu ys Val Lys Asp Val Val Tyr Tyr
70 75 8070 75 80
08ú SLE OLE08ú SLE OLE
* eTV qaN UTD JaS ÀTD e1V UTD nae- ra2 sTH EL V o:d eTV STH e1V sAD* eTV qaN UTD JaS ÀTD e1V UTD nae- ra2 sTH EL V o: d eTV STH e1V sAD
S99ú 098 SSúS99ú 098 SSú
eIA PIV ozd naz P1T dsV 61 O-c 02V niSD TeA 5SI el1 d.jL niD nID 09ú 9 8 Ot AID dsV ITA laS naz TVl el! a14 dVs oZE 11 dL a UTD leTA 2aS 2AL eIA PIV ozd naz P1T dsV 61 O-c 02V niSD TeA 5SI el1 d.jL niD nID 09ú 9 8 Ot AID dsV ITA laS naz TVl el! a14 dVs oZE 11 dL a UTD leTA 2aS 2AL
9CE CEE 9ZE9CE CEE 9ZE
q14 STH aqd 7aS ds A d ú a AID d6. i D s 5 V b6i sAz.11L OZ:ú Slú OI SOE 6aS naI aiqd usv nhiD 5V s.D n ne.a dsV eaX el o2d AID AID 1AI q14 STH aqd 7aS ds A d ú a AID d6. i D s 5 V b6i sAz.11L OZ: ú Slú OI SOE 6aS naI aiqd usv nhiD 5V s.D n ne.a dsV eaX el o2d AID AID 1AI
00ú 96Z 06Z00ú 96Z 06Z
naf1 ITA 14L us .1aS:Aú dsV USV C2o AID 2aS lAI nae nid plV USV naf1 ITA 14L us .1aS: Aú dsV USV C2o AID 2aS lAI nae nid plV USV
98Z 08Z 9LZ98Z 08Z 9LZ
AID B.1V PIV SAD 2lV alI sA, lea i2. AID. aS el1V lAI USv;al jaS AID B.1V PIV SAD 2lV alI sA, lea i2. AID. aS el1V lAI USv; al jaS
OLZ 9Z9 09ZOLZ 9Z9 09Z
AIE) zIl sÀi sAi flna a6[a o I nTL ne- n e, e:l nID ca j AL naez dli dsVÀ AID uID oad nae1 Sk 21V l 2i nED 12A z141 AID AIÀ.1 L a64d ObZ SúZ OúZ S.ZZ 21V aq{d AID all 2aS.114 el bV AID.l1as le all o.Id od na6 all dsv e1V AIED ia9S eIV uID sz auI SAD 1V nhiD 2V 2a S a aS 1qL sAD goz OoZ 961 AID zaS a4d nea usv nae1 z14 AID z9as.1AJL eli z.aS dsv dsV naz aoqd AIE) zIl sÀi sAi flna a6 [ao I nTL ne- ne, e: l nID ca j AL naez dli dsVÀ AID uID oad nae1 Sk 21V l 2i nED 12A z141 AID AIÀ.1 L a64d ObZ SúZ OúZ S.ZZ 21V aq {d AID all 2aS.114 el bV AID.l1as le all o.Id od na6 all dsv e1V AIED ia9S eIV uID sz auI SAD 1V nhiD 2V 2a S a aS 1qL sAD goz OoZ 961 AID zaS a4d nea usv nae1 z14 AID z9 .1AJL eli z.aS dsv dsV naz aoqd
061 581 081061 581 081
AID Od o ah sTH UID UID nesz elyV us eli STH nah- USV AID ds AID Od o ah sTH UID UID nesz elyV us eli STH nah- USV AID ds
SLI OLI 991SLI OLI 991
T1V J.141 1a9 IA 2L[1 na- us S usV sb. UlD zAl 2aS leA a4d o0d IA1 091 991 091 9t1 nID oad sTH 2A1 al1 od alI zAl UTD niD al UID d.zú 1eA uSV nlD 0t1 úE1 OE0 dsv naf% 6aS dsv a14d UID nID niD a2 el a 4Lu UlD AID elV sAD 21V T1V J.141 1a9 IA 2L [1 na- us S usV sb. UlD zAl 2aS leA a4d o0d IA1 091 991 091 9t1 nID oad sTH 2A1 al1 od alI zAl UTD niD al UID d.zú 1eA uSV nlD 0t1 úE1 OE0 dsv naf% 6aS dsv a14d UID nID niV aD al 21
SZI 0Z1 9S1SZI 0Z1 9S1
sAI AID AID bl. TeA 1 D2aV V 14 sAz o141i O s a sAD nlD Old sXIq UID sAI AID AID bl. TeA 1 D2aV V 14 sAz o141i O s a sAD nlD Old sXIq UID
011 901 001011 901 001
2aS dsv 1qL jaS 21v USV o -d as. nId nea n h 14d 1 12f lea 1qL atd UID 2aS dsv 1qL jaS 21v USV o -d as. nId nea n h 14d 1 12f lea 1qL atd UID
96 06 9896 06 98
UlD US at1L SAT nlO aAa 2li sAz SAT USV ali.aS a64d leA 21V USV Pro Phe Asp Asp His Phe Tyr Ile Thr Leu Gly Val Ala Ala Gly Gly UlD US at1L SAT nlO aAa 2li sAz SAT USV ali.aS a64d leA 21V USV Pro Phe Asp Asp His Phe Tyr Ile Thr Leu Gly Val Ala Ala Gly Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Ile Thr Glu Phe Arg Asp Gly Ser Ile Thr Ser Gly Gly Val Thr Lys Ile Thr Glu Phe Arg Asp Gly Ser Ile Thr Ser Gly Gly Val Thr Lys
405 410 415405 410 415
Pro Trp Arg Asp Ser Ala Arg Lys Ala Ser Val His Phe Trp Arg His Pro Trp Arg Asp Ser Ala Arg Lys Ala Ser Val His Phe Trp Arg His
420 425 430420 425 430
Met Ser Asp Trp Phe Pro Arg Trp Ser Gln Pro Ser Leu Ile Val Asp Met Ser Asp Trp Phe Pro Arg Trp Ser Gln Pro Ser Leu Ile Val Asp
435 440 445435 440 445
Phe Val Lys Val Ile Ala LeuPhe Val Lys Val Ile Ala Leu
450 455450 455
(2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 4: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 4:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 2271 paires de bases (B) TYPE: acide nucléique (C) NOMBRE DE BRINS: double (D) CONFIGURATION: lineaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc pour ARNmi (iii) HYPOTHETIQUE: NON (vi) ORIGINE: (A) ORGANISME: Bombyx mori (ix) CARACTERISTIQUE ADDITIONELLE: (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 2271 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) NUMBER OF STRANDS: double (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA for miRNA (iii ) HYPOTHETIC: NO (vi) ORIGIN: (A) ORGANISM: Bombyx mori (ix) ADDITIONAL CHARACTERISTICS:
(A) NOM/CLE: CDS(A) NAME / KEY: CDS
(B) EMPLACEMENT: 16..1415(B) LOCATION: 16..1415
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 4: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 4:
GAGGATCCGG GTACC ATG GGT GGA CGC GTG.TG TGT CTG ATT TTA TTT ATA 51 GAGGATCCGG GTACC ATG GGT GGA CGC GTG.TG TGT CTG ATT TTA TTT ATA 51
Met Gly Gly Arg Val Leu Cys Leu Ile Leu Phe Ile Met Gly Gly Arg Val Leu Cys Leu Ile Leu Phe Ile
1 5 101 5 10
AAA ATA TCG TAC GCT CAA ATG CCC GAT GTG.AkA ATA CAA GCT TTT CGC 99 Lys Ile Ser Tyr Ala Gln Met Pro Asp Val Lys Ile Gln Ala Phe Arg AAA ATA TCG TAC GCT CAA ATG CCC GAT GTG.AkA ATA CAA GCT TTT CGC 99 Lys Ile Ser Tyr Ala Gln Met Pro Asp Val Lys Ile Gln Ala Phe Arg
20 2520 25
CCG AAA GGA CTT CGA ATA TCC GTT CAA GAT GTC CCC AAA ATG ACA CTG 147 CCG AAA GGA CTT CGA ATA TCC GTT CAA GAT GTC CCC AAA ATG ACA CTG 147
Pro Lys Gly Leu Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Pro Lys Gly Leu Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu
35 4035 40
TTC GCG TTC CAA GGC AAC TTG AAC CAT AAA CTG GAC AGC ACC AGC GTC 195 TTC GCG TTC CAA GGC AAC TTG AAC CAT AAA CTG GAC AGC ACC AGC GTC 195
Phe Ala Phe Gln Gly Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val Phe Ala Phe Gln Gly Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val
50 55 6050 55 60
GGG ACA CTG AGT GCA GAG GTA CTG GAT CCA GTC AAC GGC CGA TGG GTG 243 GGG ACA CTG AGT GCA GAG GTA CTG GAT CCA GTC AAC GGC CGA TGG GTG 243
Gly Thr Leu Ser Ala Glu Val Leu Aso Pro Val Asn Gly Arg Trp Val Gly Thr Leu Ser Ala Glu Val Leu Aso Pro Val Asn Gly Arg Trp Val
70 7570 75
00ú 55Z 06Z 58Z00ú 55Z 06Z 58Z
AID 52V PIV sXD Pi a I s.; l:. LeA AID ias eP' 2AI us We ias 516 LDD DDD DDD ID- DDD VI D -D'D VED DDD DDl DDD LVI IVV DIEV iD 0OL AID 7Aî sAX sA- nea, ae ca f hi nath na aTI nID oid iAI nae dil AID 52V PIV sXD Pi a I s .; l :. LeA AID ias eP '2AI us We ias 516 LDD DDD DDD ID- DDD VI D -D'D VED DDD DDl DDD LVI IVV DIEV iD 0OL AID 7Aî sAX sA- nea, ae ca f hi nath na aTI nID oid iAI nae dil
L98 VDD LVI DV DV' I DI 9E D'D D LS D D L VD L V VVD DDD IV DID DDL L98 VDD LVI DV DV 'I DI 9E D'D D LS D D L VD L V VVD DDD IV DID DDL
59Z O9Z 559Z O9Z 5
dsV AID UID ozc n2l sAq TI z aTI nID TiA 141 AID 7AI q4L aad 618 DVD DDD VVD DD' 'lt V V 3D- D DLV VD DID VDV VDD DVI DD IIIL eIV a4d AID aiI 2aS -L s a-z e AiTD îas LS A aII o0d O2d na aTI I LL VDD ILi VDD VI DI VDV DI' *D' DD9 DD DV DLD DVL VDD VDD VID LIV dsV eIV AID aS rT uTD si. C- sAD eT nID h IV las jas aS q sAD úZL LVD IDD IDD DDI &D, DVD Vf DIV DDI VDD DVD VDD VDI DDL IDV LDL dsV AID UID ozc n2l sAq TI z aTI nID TiA 141 AID 7AI q4L aad 618 DVD DDD VVD DD '' lt VV 3D- D DLV VD DID VDV VDD DVI DD IIIL eIV a4d AID aiI 2aS -L s az e AiTD îas LS A aII o0d O2d na aTI I LL VDD ILi VDD VI DI VDV DI '* D' DD9 DD DV DLD DVL VDD VDD VID LIV dsV eIV AID aS rT uTD si. C- sAD eT nID h IV las jas aS q sAD úZL LVD IDD IDD DDI & D, DVD Vf DIV DDI VDD DVD VDD VDI DDL IDV LDL
OZZ 51 Z 0 1 Z SOOZZ 51 Z 0 1 Z N / A
AID.iS a4d n7 us na 141 LiTD îaS îAi alI îaS dsV dsV na' aqd 9L9 99DDD IDE DII DIT iVV ITD fD- DD3 LD DI VI VV LDI DVD DVD DLD LiL AID.iS a4d n7 us na 141 LiTD îaS îAi alI îaS dsV dsV na 'aqd 9L9 99DDD IDE DII DIT iVV ITD fD- DD3 LD DI VI VV LDI DVD DVD DLD LiL
0 961 0610 961 061
AID oîd qaK sTH UI UiD n 9- sL uIV uSV 91I STH ne- usv AID dsV LZ9 DDD DDD DIV iD YvD VrD LID VVf DDD DVV lv iVD VID DVV VDD IVD AID oîd qaK sTH UI UiD n 9- sL uIV uSV 91I STH ne- usv AID dsV LZ9 DDD DDD DIV iD YvD VrD LID VVf DDD DVV lv iVD VID DVV VDD IVD
981 081 SLI981 081 SLI
PIV qLI îaS T/ 2li4 ne- us us , 52V UiD 1Aî -'S TeA 8a4d Od îAI 6L9 VDD DDV LDL VID VDV ILI IVL ' Il ILDD DVD DVIL DDI DID DIL DDD DVI PIV qLI îaS T / 2li4 ne- us us, 52V UiD 1Aî -'S TeA 8a4d Od îAI 6L9 VDD DDV LDL VID VDV ILI IVL 'Il ILDD DVD DVIL DDI DID DIL DDD DVI
OLI 991 091OLI 991,091
nID old STH JAi alI o:d a-: A:1 ulD nid aiI UID dîL TeA usv nhi 1ú5 EVVD DDD D-D IlV 11V DDD 'VL IVI DYD DVD DIV VVD DDL LID DVV VVD nid old STH JAi alI o: d a-: A: 1 ulD nest aiI UID dîL TeA usv nhi 1ú5 EVVD DDD D-D IlV 11V DDD 'VL IVI DYD DVD DIV VVD DDL LID DVV VVD
551 05 5 L 1551 05 5 L 1
dsV nea::ras ds a4a uiD niD niD aqd aII jqL UlD AID pl sAD vIV ú8bt DVD DID DDI IYD LLi WVD DVD DYD DLI LV VD VD' D VDD DDD IDL 3DD 0 t,1 5D 0 E1 SZI sAq AID AID bi îaA 61f ql- s7 14,L o2d SA' sAD nID O d sA'I UlD 58 WVVV DDD DDD VDD DILD VDV 9D' D-v VDV VDD DVV IDL VD VDD VVV YD OZI Sll 011 zeS ds U4L niS us UsV oCa d s d nI a ne D aia a IPA q&J aqd UID L88 IDI IVLD VDV DDV YDD LVY lDD _'D VVD VeD DVD VDV VID DDV DII SYD dsV nea :: ras ds a4a uiD niD niD aqd aII jqL UlD AID pl sAD vIV ú8bt DVD DID DDI IYD LLi WVD DVD DYD DLI LV VD VD 'D VDD DDD IDL 3DD 0 t, 1 5D 0 E1 SZI sAq AID AID bi îa 61f ql- s7 14, L o2d SA 'sAD nID O d sA'I UlD 58 WVVV DDD DDD VDD DILD VDV 9D' Dv VDV VDD DVV IDL VD VDD VVV YD OZI Sll 011 zeS ds U4L niS us UsV oCa dsd nI D aia a IPA q & J aqd UID L88 IDI IVLD VDV DDV YDD LVY lDD _'D VVD VeD DVD VDV VID DDV DII SYD
501 001 96501 001 96
UID USV 2qL sAX nld Az aTl sA-r sA' usv ai: isS aud IPA eIV usV 6úú VVD DVV vDv VV DYD DVL VIY VVY DVV DVV DIV VDL DL DID DDD DVV UID USV 2qL sAX nld Az aTl sA-r sA 'usv ai: isS aud IPA eIV usV 6úú VVD DVV vDv VV DYD DVL VIY VVY DVV DVV DIV VDL DL DID DDD DVV
06 98 0806 98 08
JA&.A TVA TîA dse sA' A. sA' ne- sA' nae dsv o0d nID nlD.AI 16Z V'i Livi DID DLD DYD DV'f Di VVV &D Vv ILID V D DDD DVD VVD Dvil 9E JA & .A TVA TîA dse sA 'A. sA' ne- sA 'nae dsv o0d nID nlD.AI 16Z V'i Livi DID DLD DYD DV'f Di VVV & D Vv ILID V D DDD DVD VVD Dvil 9E
AAT GCA GAA CTC TAT TCC GGA CCT AAT GAC TAC AGC AAT ACG GTT TTG 963 AAT GCA GAA CTC TAT TCC GGA CCT AAT GAC TAC AGC AAT ACG GTT TTG 963
Asn Ala Glu Leu Tyr Ser Gly Pro Asn Asp Tyr Ser Asn Thr Val Leu Asn Ala Glu Leu Tyr Ser Gly Pro Asn Asp Tyr Ser Asn Thr Val Leu
305 310 315305 310 315
TAC GGA GGA CCG ATC ATG GAT CTG GAG TGC CGC GAG AAC TTT CTC TCC 1011 TAC GGA GGA CCG ATC ATG GAT CTG GAG TGC CGC GAG AAC TTT CTC TCC 1011
Tyr Gly Gly Pro Ile Met Asp Leu Glu Cys Arg Glu Asn Phe Leu Ser Tyr Gly Gly Pro Ile Met Asp Leu Glu Cys Arg Glu Asn Phe Leu Ser
320 325 330320 325 330
ACA AAA AGA CGC AGA GAC GGC ACG TCG TGG GGC GAC AGT TTT CAT ACA 1059 ACA AAA AGA CGC AGA GAC GGC ACG TCG TGG GGC GAC AGT TTT CAT ACA 1059
Thr Lys Arg Arg Arg Asp Gly Thr Ser Trp Gly Asp Ser Phe His Thr Thr Lys Arg Arg Arg Asp Gly Thr Ser Trp Gly Asp Ser Phe His Thr
335 340 345335 340 345
TAT TCC GTT CAA TGG ACA CCT GAT TTC ATA GCC CTG TCT GTG GAC GGC 1107 TAT TCC GTT CAA TGG ACA CCT GAT TTC ATA GCC CTG TCT GTG GAC GGC 1107
Tyr Ser Val Gin Trp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu Ser Val Asp Gly Tyr Ser Val Gin Trp Thr Pro Asp Phe Ile Ala Leu Ser Val Asp Gly
350 355 360350 355 360
GAG GAG TGG GCG CGA GTG GAG GCG CCG CGG GAC GCC CTG CCG GCT GTC 1155 GAG GAG TGG GCG CGA GTG GAG GCG CCG CGG GAC GCC CTG CCG GCT GTC 1155
Glu Glu Trp Ala Arg Val Glu Ala Pro Arg Asp Ala Leu Pro Ala Val Glu Glu Trp Ala Arg Val Glu Ala Pro Arg Asp Ala Leu Pro Ala Val
365 370 375 380365 370 375 380
TGC GCG CAC GCC CCG CGG CAC CTG CTG CAG GCC GGC TCG CAG ATG GCG 1203 TGC GCG CAC GCC CCG CGG CAC CTG CTG CAG GCC GGC TCG CAG ATG GCG 1203
Cys Ala His Ala Pro Arg His Leu Leu Gln Ala Gly Ser Gln Met Ala Cys Ala His Ala Pro Arg His Leu Leu Gln Ala Gly Ser Gln Met Ala
385 390 395385 390 395
CCA TTC GAT GAC CAC TTC TAC ATA ACG CTA GGC GTG GCG GCA GGA GGC 1251 CCA TTC GAT GAC CAC TTC TAC ATA ACG CTA GGC GTG GCG GCA GGA GGC 1251
Pro Phe Asp Asp His Phe Tyr Ile Thr Leu Gly Val Ala Ala Gly Gly Pro Phe Asp Asp His Phe Tyr Ile Thr Leu Gly Val Ala Ala Gly Gly
400 405 410400 405 410
ATA ACG GAG TTC CGC GAC GGG TCT ATA ACC TCC GGG GGA GTC ACC AAG 1299 ATA ACG GAG TTC CGC GAC GGG TCT ATA ACC TCC GGG GGA GTC ACC AAG 1299
Ile Thr Glu Phe Arg Asp Gly Ser Ile Thr Ser Gly Gly Val Thr Lys Ile Thr Glu Phe Arg Asp Gly Ser Ile Thr Ser Gly Gly Val Thr Lys
415 420 425415 420 425
CCC TGG AGA GAC AGC GCT CGG AAG GCA TCC GTA CAT TTC TGG CGG CAC 1347 CCC TGG AGA GAC AGC GCT CGG AAG GCA TCC GTA CAT TTC TGG CGG CAC 1347
Pro Trp Arg Asp Ser Ala Arg Lys Ala Ser Val His Phe Trp Arg His Pro Trp Arg Asp Ser Ala Arg Lys Ala Ser Val His Phe Trp Arg His
430 435 440430 435 440
ATG TCC GAT TGG TTC CCA CGG TGG AGT CAG CCA TCT TTA ATC GTG GAC 1395 ATG TCC GAT TGG TTC CCA CGG TGG AGT CAG CCA TCT TTA ATC GTG GAC 1395
Met Ser Asp Trp Phe Pro Arg Trp Ser Gln Pro Ser Leu Ile Val Asp Met Ser Asp Trp Phe Pro Arg Trp Ser Gln Pro Ser Leu Ile Val Asp
445 450 455 460445 450 455 460
TTT GTC AAA GTT ATC GCC TTA TGATCTAG7C ATTTAGATTT TGTATAATTA 1446 TTT GTC AAA GTT ATC GCC TTA TGATCTAG7C ATTTAGATTT TGTATAATTA 1446
Phe Val Lys Val Ile Ala LeuPhe Val Lys Val Ile Ala Leu
AGTTATTAGT ATAGTTTCTG CAGGCAAAAT TAATTGCATT CTGAGTTTTT ATTGTCAAAC 1506 AGTTATTAGT ATAGTTTCTG CAGGCAAAAT TAATTGCATT CTGAGTTTTT ATTGTCAAAC 1506
TACAATTTAA AATTTAATTC CTAAAAGATC TCTCTTCT-TT CTAAATCTGT AATTTAGCTA 1566 TACAATTTAA AATTTAATTC CTAAAAGATC TCTCTTCT-TT CTAAATCTGT AATTTAGCTA 1566
ATTTTATTTG TATCATTTTC TTTTTTTAAA TTTTGATAGA GCGGCGAATG ACTAGAAGAT 1626 ATTTTATTTG TATCATTTTC TTTTTTTAAA TTTTGATAGA GCGGCGAATG ACTAGAAGAT 1626
GTGATCTGCG.AAATAAAAC TAAGTGACAT GC-CATLGC.AAG GCATACACAC AACAGAGTTT 1686 GTGATCTGCG.AAATAAAAC TAAGTGACAT GC-CATLGC.AAG GCATACACAC AACAGAGTTT 1686
TGCATTATTA TACCTTTCT TGAGCGAGAT GAGGACTACT GACGTGACCT GGAGTGATAT 1746 TGCATTATTA TACCTTTCT TGAGCGAGAT GAGGACTACT GACGTGACCT GGAGTGATAT 1746
TTTGGAGCAA GCCTAAGACA GGGTCAAGTG GAGACAGCTC TAAGGCCCCT ATGTACCGGC 1806 TTTGGAGCAA GCCTAAGACA GGGTCAAGTG GAGACAGCTC TAAGGCCCCT ATGTACCGGC 1806
GGGGTGTCTT AGGGCTGCAA TAACAACATT ACC-TTCTA ACCAAACAGC GATATTATCT 1866 GGGGTGTCTT AGGGCTGCAA TAACAACATT ACC-TTCTA ACCAAACAGC GATATTATCT 1866
GTAATATTAT AGTTAGAAAG CCTGCATCTT ATACTCTTAT TGACACACGT ACCTGGATGA 1926 GTAATATTAT AGTTAGAAAG CCTGCATCTT ATACTCTTAT TGACACACGT ACCTGGATGA 1926
TTTTAACGAT GAAGAAATAA CATCGTGTAA AAAATTTAGC TGGAAAAGAT TTTGAGGAAT 1986 TTTTAACGAT GAAGAAATAA CATCGTGTAA AAAATTTAGC TGGAAAAGAT TTTGAGGAAT 1986
CAAGAAATAC CCTATGAACC AGCACAGGTA CGTGTCACCA CTCTGGCTAA TTCTGCCACG 2046 CAAGAAATAC CCTATGAACC AGCACAGGTA CGTGTCACCA CTCTGGCTAA TTCTGCCACG 2046
TTGCGGTTGG TTTGAAGTTT GAGACAACCT TTGCACGATA CAATTGAGAC TAAGACCTCA 2106 TTGCGGTTGG TTTGAAGTTT GAGACAACCT TTGCACGATA CAATTGAGAC TAAGACCTCA 2106
TGGCTCGGAG TGAGTGGAGT CATTCAAGTT GCGACTGGCT CCAGTAACCA CTTATAACCA 2166 TGGCTCGGAG TGAGTGGAGT CATTCAAGTT GCGACTGGCT CCAGTAACCA CTTATAACCA 2166
GGTAGATCGT GAGCCTATCA GCTCATTTAG AGCAACAAAA AACAAAATAA TGTACTCTTG 2226 GGTAGATCGT GAGCCTATCA GCTCATTTAG AGCAACAAAA AACAAAATAA TGTACTCTTG 2226
AAAAAATCAT TTTAATAAAA GACCAGAGTG AAAAAAAAAA AAAAA 2271 AAAAAATCAT TTTAATAAAA GACCAGAGTG AAAAAAAAAA AAAAA 2271
(2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 5: (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 5:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 467 acides aminés (B) TYPE: acide aminé (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: protéine (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 467 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: protein
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 5: (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 5:
Met Gly Giy Arg Val Leu Cys Leu Ile Leu Phe Ile Lys Ile Ser Tyr Met Gly Giy Arg Val Leu Cys Leu Ile Leu Phe Ile Lys Ile Ser Tyr
1 5 10 151 5 10 15
Ala Gln Met Pro Asp Val Lys Ile Gln Ala Phe Arg Pro Lys Gly Leu Ala Gln Met Pro Asp Val Lys Ile Gln Ala Phe Arg Pro Lys Gly Leu
25 3025 30
Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe Gln Arg Ile Ser Val Gln Asp Val Pro Lys Met Thr Leu Phe Ala Phe Gln
40 4540 45
Gly Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val Gly Thr Leu Ser Gly Asn Leu Asn His Lys Leu Asp Ser Thr Ser Val Gly Thr Leu Ser
55 6055 60
Ala Glu Val Leu Asp Pro Val Asn Gly Arg Trp Val Tyr Glu Glu Pro Ala Glu Val Leu Asp Pro Val Asn Gly Arg Trp Val Tyr Glu Glu Pro
70 75 8070 75 80
Asp Leu Lys Leu Lys Val Lys Asp Val Val Tyr Tyr Asn Ala Val Phe Asp Leu Lys Leu Lys Val Lys Asp Val Val Tyr Tyr Asn Ala Val Phe
90 9590 95
Ser Ile Asn Lys Lys Ile Tyr Glu Lys Thr Asn Gln Gln Phe Thr Val Ser Ile Asn Lys Lys Ile Tyr Glu Lys Thr Asn Gln Gln Phe Thr Val
105 110105 110
Thr Glu Leu Glu Asp Pro Asn Ala Ser Thr Asp Ser Gin Lys Pro Glu Thr Glu Leu Glu Asp Pro Asn Ala Ser Thr Asp Ser Gin Lys Pro Glu
120 125120 125
Cys Lys Pro Thr Lys Thr Arg Val Arg Gly Gly Lys Ala Cys Ala Gly Cys Lys Pro Thr Lys Thr Arg Val Arg Gly Gly Lys Ala Cys Ala Gly
135 140135 140
Gln Thr Ile Phe Glu Glu Gin Phe Asp Ser Leu Asp Glu Asn Val Trp Gln Thr Ile Phe Glu Glu Gin Phe Asp Ser Leu Asp Glu Asn Val Trp
150 155 160150 155 160
dsV 6z dili od SÀ7 ji _7. ff I7D jaS.WL alI u as AID dsv 6z Su'0 aqd nhid. alI a11 D TD P- T ilA TD narIa zI all zIL aUd sTH dsV 6z dili od SÀ7 ji _7. ff I7D jaS.WL alI u as AID dsv 6z Su'0 aqd nhid. alI a11 D TD P- T ilA TD narIa zI all zIL aUd sTH
00O 56ú 06ú 58E00O 56ú 06ú 58E
dsv dsV aqd Old PTV;S: ui as LITD Pl Ul nal ne1 sTH 51v ozd dsv dsV aqd Old PTV; S: ui as LITD Pl Ul nal ne1 sTH 51v ozd
08E SLE OLE08E SLE OLE
PIV STH PTV sAD IPA PT o:_c na PIV dsv bV o:d PIV nIo IPA úIV PIV STH PTV sAD IPA PT o: _c na PIV dsv bV o: d PIV nIo IPA úIV
S9ú 09úE SES9ú 09úE SE
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00E 56Z 06500E 56Z 065
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58Z 08Z SLZ58Z 08Z SLZ
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OLZ 59Z 09ZOLZ 59Z 09Z
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OZZ 51Z 01ZOZZ 51Z 01Z
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SOZ 00 561SOZ 00 561
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061 581 081061 581 081
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SLI OLI 91SLI OLI 91
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Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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FR9407083A FR2721032A1 (en) | 1994-06-09 | 1994-06-09 | New protein from Bombyx mori that binds bacterial lipopoly-saccharide |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
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FR2721032A1 true FR2721032A1 (en) | 1995-12-15 |
Family
ID=9464057
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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Country Status (1)
Country | Link |
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FR (1) | FR2721032A1 (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1999031229A2 (en) * | 1997-12-17 | 1999-06-24 | Vlaams Interuniversitair Instituut Voor Biotechnologie Vzw. | Peptides and nucleic acids derived from eisenia foetida and the use thereof |
-
1994
- 1994-06-09 FR FR9407083A patent/FR2721032A1/en active Pending
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
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WON-JAE LEE ET AL.: "Isolation and identification of cecropin antibacterial peptides from the extracellular matrix of the insect integument", ANALYTICAL BIOCHEMISTRY, vol. 217, no. 2, March 1994 (1994-03-01), NEW YORK US, pages 231 - 235 * |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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WO1999031229A2 (en) * | 1997-12-17 | 1999-06-24 | Vlaams Interuniversitair Instituut Voor Biotechnologie Vzw. | Peptides and nucleic acids derived from eisenia foetida and the use thereof |
WO1999031229A3 (en) * | 1997-12-17 | 1999-08-26 | Vlaams Interuniv Inst Biotech | Peptides and nucleic acids derived from eisenia foetida and the use thereof |
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