FR2686882A1 - Oligothionucleotides - Google Patents

Oligothionucleotides Download PDF

Info

Publication number
FR2686882A1
FR2686882A1 FR9201275A FR9201275A FR2686882A1 FR 2686882 A1 FR2686882 A1 FR 2686882A1 FR 9201275 A FR9201275 A FR 9201275A FR 9201275 A FR9201275 A FR 9201275A FR 2686882 A1 FR2686882 A1 FR 2686882A1
Authority
FR
France
Prior art keywords
sep
radical
group
derivatives
compounds
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
FR9201275A
Other languages
French (fr)
Other versions
FR2686882B1 (en
Inventor
Jean-Louis Barascut
Jean-Louis Imbach
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
Original Assignee
Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Centre National de la Recherche Scientifique CNRS filed Critical Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
Priority to FR9201275A priority Critical patent/FR2686882B1/en
Priority to FR9211103A priority patent/FR2687679B1/en
Priority to DE69307495T priority patent/DE69307495T2/en
Priority to US08/284,484 priority patent/US5639873A/en
Priority to CA002129364A priority patent/CA2129364A1/en
Priority to JP5513826A priority patent/JPH07506345A/en
Priority to EP93904155A priority patent/EP0625986B1/en
Priority to AT93904155T priority patent/ATE147752T1/en
Priority to PCT/FR1993/000115 priority patent/WO1993016095A1/en
Publication of FR2686882A1 publication Critical patent/FR2686882A1/en
Application granted granted Critical
Publication of FR2686882B1 publication Critical patent/FR2686882B1/en
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/02Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with ribosyl as saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6816Hybridisation assays characterised by the detection means
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/32Chemical structure of the sugar
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/32Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/3222'-R Modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/33Chemical structure of the base
    • C12N2310/337Chemical structure of the base in alpha-anomeric form
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/353Nature of the modification linked to the nucleic acid via an atom other than carbon
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/353Nature of the modification linked to the nucleic acid via an atom other than carbon
    • C12N2310/3531Hydrogen

Abstract

The subject of the present invention is chemical compounds consisting of an alpha or beta oligo-4'-thio-2'-deoxyribonucleotide or oligo-4'-thioribonucleotide, characterised in that they contain a chain of 4'-thio-2'-deoxyribonucleotides or 4'-thioribonucleotides respectively, it being possible for the chain to be optionally linked to an effector, especially a radical corresponding to an intercalating agent or a chemical or photoactivable radical, such as a radical carrying a functional group which reacts directly or indirectly with the nucleotide chains or a radical whose presence permits an easy and sensitive detection. It also relates to processes for preparing these compounds and their therapeutic or diagnostic applications or their applications as laboratory reagents.

Description

OLIGOTHIONUCLEOTIDES
La présente invention concerne des composés chimiques nouveaux, ainsi que leurs applications. Les composés chimiques selon la présente invention sont constitués par un oligo 4'-thio-ribonucléotide ou un oligo 4'-thio-2'désoxyribonucléotide comportant un enchaînement de 4'thionucléotides.
oligothionucleotides
The present invention relates to novel chemical compounds and their applications. The chemical compounds according to the present invention are constituted by an oligo 4'-thio-ribonucleotide or an oligo 4'-thio-2'desoxyribonucleotide comprising a sequence of 4 'thionucleotides.

Les composés selon l'invention peuvent présenter la configuration anomérique naturelle bêta ou la configuration anomérique non naturelle alpha. The compounds according to the invention may have the natural anomeric beta configuration or the unnatural anomeric alpha configuration.

Ainsi sont représentés par les formules (a) et (b) respectivement des 4'-thionucléotides alpha(a) et beta(b)

Figure img00010001

(a) et (b) représentent des 4'-thionucléosides, il faut rajouter un phosphate en 5' poiir obtenir des nucléotides.Thus are represented by the formulas (a) and (b) respectively 4'-thionucleotides alpha (a) and beta (b)
Figure img00010001

(a) and (b) represent 4'-thionucleosides, it is necessary to add a phosphate in 5 'to obtain nucleotides.

Dans ces conditions, de multiples utilisations à finalités biologiques et même pharmacologiques déjà connues pour les oligonucléotides peuvent être envisagées et ceci avec plus d'efficacité. Under these conditions, multiple uses for biological and even pharmacological purposes already known for oligonucleotides can be envisaged and this with more efficiency.

Plus précisément, la présente invention a pour objet des composés chimiques constitués par un oligo4'-thioribonucléotide ou un oligo-4'-thio-2'désoxyribonucléotide, caractérisés en ce qu 'ils comportent un enchaînement de 4'-thioribonucléotides ou 4'-thio-2 'désoxyribonucléo- tides respectivement, enchaînement pouvant être facultativement lié à un agent effecteur, notamment un radical correspondant à un agent d'intercalation ou un radical chimique ou photoactivable, tel qu'un radical porteur d'une fonction réagissant directement ou indirectement avec les chaînes de nucléotides ou un radical dont la présence permet une détection facile et sensible. More specifically, the subject of the present invention is chemical compounds consisting of an oligo4'-thioribonucleotide or an oligo-4'-thio-2'-deoxyribonucleotide, characterized in that they comprise a sequence of 4'-thioribonucleotides or 4'-thioribonucleotides. thio-2 'deoxyribonucleotides respectively, which sequence may optionally be linked to an effector agent, in particular a radical corresponding to an intercalating agent or a chemical or photoactivatable radical, such as a radical carrying a function reacting directly or indirectly with nucleotide chains or a radical whose presence allows easy and sensitive detection.

En particulier, l'invention a pour objet les nouveaux dérivés oligo-4'-thionucléotides, leur préparation et leur emploi notamment comme sondes permettant la détection d'une séquence définie d'acides nucléiques, comme nucléases artificielles spécifiques de séquences d'ADN ou d'ARN ou bien comme agents de blocage sélectif de l'expression d'un gène qu'il soit endogène (par exemple, gène oncogène) ou exogène (par exemple ADN ou
ARN de virus, de parasites ou de bactéries).
In particular, the subject of the invention is the novel oligo-4'-thionucleotide derivatives, their preparation and their use especially as probes allowing the detection of a defined sequence of nucleic acids, as artificial nucleases specific for DNA sequences or RNA or as selective blocking agents for the expression of a gene whether it is endogenous (for example, oncogenic gene) or exogenous (for example DNA or
RNA from viruses, parasites or bacteria).

Dans les demandes de brevet français FR 8301223 (2 540 122) et FR 8411795. (2 568 254) ont été décrits des composés chimiqties constitués par un oligonucléotide ou un oligodésoxynucléotide comportant un enchaînement de nucléotides naturels ou modifiés, c'est-à-dire des bêta-nucléotides, sur lesquel se trouve fixé par une liaison covalente au moins un groupe intercalant, qui possèdent la propriété de bloquer sélectivement l'expression d'un gène et qui, de ce fait, sont particulièrement utiles en thérapeutique comme substances antivirales, antibiotiques, antiparasitaires ou antitumorales. In French patent applications FR 8301223 (2,540,122) and FR 8411795. (2,568,254) have been described chemical compounds consisting of an oligonucleotide or an oligodeoxynucleotide comprising a sequence of natural or modified nucleotides, that is to say to say beta-nucleotides, on which is fixed by a covalent bond at least one intercalating group, which have the property of selectively block the expression of a gene and which, therefore, are particularly useful in therapy as antiviral substances , antibiotics, antiparasitic or antitumor.

Dans la demande internationale PCT WO 83/01451 a été décrite une méthode pour bloquer la traduction de 1'ARN messager (ARNm) en protéine par hybridation de l'ARNm avec un oligonucléotide ayant la séquence complémentaire de l'ARNm, l'oligonucléotide étant stabilisé sous forme phosphotriester. In PCT International Application WO 83/01451 has been described a method for blocking the translation of messenger RNA (mRNA) into protein by hybridization of the mRNA with an oligonucleotide having the sequence complementary to the mRNA, the oligonucleotide being stabilized in phosphotriester form.

Dans la demande internationale WO 88/04301 ont été décrits des oligonucléotides de configuration anomérique alpha présentant des appariements parallèles avec des séquences complémentaires. In the international application WO 88/04301 have been described oligonucleotides of alpha anomeric configuration having parallel pairings with complementary sequences.

I1 a aussi été décrit dans la technique antérieure des dérivés de composés oligonucléotides résistant mieux aux dégradations enzymatiques dont la partie phosphate était modifiée en thiophosphate ou méthylphosphonate notamment. It has also been described in the prior art derivatives of oligonucleotide compounds better resistant to enzymatic degradation whose phosphate part was modified thiophosphate or methylphosphonate in particular.

Toutefois ces dérivés présentent une chiralité au niveau du phosphate susceptible de générer des diastéréoisomères insolubles.  However, these derivatives have a chirality at the phosphate level capable of generating insoluble diastereoisomers.

Il a maintenant été trouvé, et c'est ce qui fait l'objet de la présente invention, que la substitution de l'oxygène par un soufre sur la partie sucre des nucléosides plutôt que sur le groupement phosphate d'une part, assure la solubilité des oligomères et, d'autre part, pourrait accroître leur pénétration dans la cellule cible, la substitution de l'oxygène par l'élément soufre rendant la molécule plus lipophile. It has now been found, and this is the subject of the present invention, that the substitution of oxygen by a sulfur on the sugar part of the nucleosides rather than on the phosphate group on the one hand, ensures the solubility of the oligomers and, on the other hand, could increase their penetration into the target cell, the substitution of oxygen by the sulfur element making the molecule more lipophilic.

Les dérivés de 4'-thionucléotides forment des complexes d'hybridation avec les séquences complémentaires d'ARN beaucoup plus stables que ceux formés avec l'ADN et que, vis-à-vis des ARNs, les dérivés de 4'-thionucléotides forment des complexes d'hybridation plus stables que les dérivés de bêta-nucléotides naturels. The 4'-thionucleotide derivatives form hybridization complexes with the RNA complementary sequences that are much more stable than those formed with DNA and that, with respect to the RNAs, the 4'-thionucleotide derivatives form Hybridization complexes more stable than natural beta-nucleotide derivatives.

Parmi les composés, selon la présente invention, on peut citer plus particulièrement les composés oligomères bêta de formule. -

Figure img00030001

dans laquelle
les radicaux B peuvent être identiques ou différents et représentent chacun une base d'un acide nucléique éventuellement modifiée, activable et/ou comportant un groupement intercalant
les radicaux X peuvant être identiques ou différents et représentent chacun un oxoanion O ~, un thioanion S ~, un groupe alkyle, un groupe alcoxy, aryloxy, un groupe aminoalkyle, un groupe aminoalcoxy, un groupe thioalkyle, un radical alkyle ou alcoxy substitué par un hétérocycle azoté ou un groupement -Y-Z
R et R', qui peuvent être identiques ou différents, représentent chacun un atome d'hydrogène ou un groupement -Y-Z ou Y'-Z'
Y et Y' identiques ou différents représentent chacun un radical alcoylène droit ou ramifié -alk- ou un radical choisi parmi
Figure img00040001

alk-O-alk
Figure img00040002

avec U = O, S ou N
En particulier, Y et Y' représentent un radical choisi parmi
Figure img00040003

avec U = O, S ou N
E peut avoir les mêmes significations que X excepté Y-Z ou
Y'-Z' ;
L représente O, S ou -NH-;;
n représente un nombre entier y compris 0
J représente un atome d'hydrogène ou un groupe hydroxy
Z et Z', identiques ou différents, représentent chacun un radical correspondant à un agent effecteur, notamment un radical correspondant à un agent d'intercalation ou un radical porteur d'une fonction qui réagit directement ou indirectement avec les chaînes de nucléotides ou un radical dont la présence permet une détection facile et sensible.Among the compounds according to the present invention, there may be mentioned more particularly the oligomeric compounds beta of formula. -
Figure img00030001

in which
the radicals B may be identical or different and each represent a base of an optionally modified, activatable and / or intercalating nucleic acid
the X radicals may be identical or different and each represents an oxoanion O ~, a thionanion S ~, an alkyl group, an alkoxy group, an aryloxy group, an aminoalkyl group, an aminoalkoxy group, a thioalkyl group, an alkyl or alkoxy radical substituted by a nitrogen heterocycle or a group -YZ
R and R ', which may be identical or different, each represent a hydrogen atom or a group -YZ or Y'-Z'
Y and Y ', which are identical or different, each represent a straight or branched alkylene radical -alk- or a radical chosen from
Figure img00040001

alk-O-alk
Figure img00040002

with U = O, S or N
In particular, Y and Y 'represent a radical chosen from
Figure img00040003

with U = O, S or N
E can have the same meanings as X except YZ or
Y'-Z ';
L is O, S or -NH-;
n represents an integer including 0
J represents a hydrogen atom or a hydroxyl group
Z and Z ', which are identical or different, each represent a radical corresponding to an effector agent, in particular a radical corresponding to an intercalating agent or a radical carrying a function which reacts directly or indirectly with the nucleotide chains or a radical whose presence allows easy and sensitive detection.

Dans cette formule I, on utilise la représentation condensée des nucléotides suivante

Figure img00040004

qui correspond à la formule développée
Figure img00050001

sur laquelle ont été mentionnées les extrémités (3') et (5').In this formula I, the following condensed representation of nucleotides is used:
Figure img00040004

which corresponds to the developed formula
Figure img00050001

on which the ends (3 ') and (5') have been mentioned.

I1 convient de remarquer que la formule I représente un enchaînement de 4'-thionucléotides qui peuvent être identiques ou différents, de configuration D ou L, n indiquant simplement le nombre de nucléotides compris dans la molécule ; n est de préférence un nombre compris entre I et 50, et de préférence encore entre I et 25. It should be noted that formula I represents a sequence of 4'-thionucleotides which may be identical or different, of D or L configuration, n simply indicating the number of nucleotides included in the molecule; n is preferably a number between I and 50, and more preferably between I and 25.

On cite en particulier les produits pour lesquels L représente l'oxygène ; R et R' représentent l'hydrogène et B une base nucléique naturelle, soit adénine, thymine, cytosine ou guanine quand J = H et adénine, uracile, cytosine et guanine quand J = OH. In particular, mention is made of the products for which L represents oxygen; R and R 'represent hydrogen and B a natural nucleotide base, ie adenine, thymine, cytosine or guanine when J = H and adenine, uracil, cytosine and guanine when J = OH.

Les agents d'intercalation sont des produits connus dans les techniques relatives aux acides nucléiques ; ce sont des composés capables de "s'intercaler" dans la structure des ADN ou des ARN, c'est-à-dire capables de s'insérer entre les plateaux de base des acides nucléiques. Interleavers are known products in nucleic acid techniques; they are compounds capable of "intercalating" in the structure of DNAs or RNAs, that is to say capable of being inserted between the base plates of the nucleic acids.

Les agents d'intercalation peuvent être choisis parmi les composés polycycliques ayant une configuration plane tels que l'acridine et ses dérivés, la furocoumarine et ses dérivés, la daunomycine et les autres dérivés de l'anthracycline, la l,10-phénanthroline, la phénanthridine et ses dérivés, la proflavine, les porphyrines, les dérivés du dipyrido [1,2-a 3',2'-d] imidazole, l'ellipticine ou l'ellipticinium et leurs dérivés et le diazapyrène et ses dérivés. The intercalating agents may be chosen from polycyclic compounds having a planar configuration such as acridine and its derivatives, furocoumarin and its derivatives, daunomycin and the other anthracycline derivatives, 1,10-phenanthroline, phenanthridine and its derivatives, proflavine, porphyrins, derivatives of dipyrido [1,2-a 3 ', 2'-d] imidazole, ellipticine or ellipticinium and their derivatives and diazapyrene and its derivatives.

Les radicaux chimiques réactifs peuvent être des radicaux pouvant réagir directement ou indirectement avec une chaîne de nucléotides pour former une liaison covalente ou pour la modifier chimiquement, ou pour la couper. De préférence, ces radicaux chimiques réactifs sont activables, par exemple, par voie chimique, biochimique ou photochimique.  The reactive chemical radicals can be radicals that can react directly or indirectly with a nucleotide chain to form a covalent bond or to modify it chemically, or to cut it. Preferably, these reactive chemical radicals are activatable, for example, chemically, biochemically or photochemically.

Les radicaux réactifs activables peuvent être choisis parmi l'acide éthylène-diamine-tétraacétique, l'acide diéthylène-triaminepentaacétique, les porphyrines, la l,10-phénanthroline, l'azido-4 acétophénone, ltéthylène-imine, la bêta-chloroéthylamine, le psoralène et leurs dérivés, et les composés aromatiques absorbant les radiations du proche ultra-violet ou du visible ou pouvant réagir chimiquement avec les constituants nucléiques. The activatable reactive radicals may be chosen from ethylene-diamine tetraacetic acid, diethylene triaminepentaacetic acid, porphyrins, 1,10-phenanthroline, 4-azidoacetophenone, ethyleneimine and beta-chloroethylamine. psoralen and their derivatives, and aromatic compounds absorbing near ultraviolet or visible radiation or chemically reactive with the nucleic constituents.

Plus particulièrement, les radicaux chimiquement activables en présence d'ions métalliques, d'oxygène et d'un agent réducteur (acide éthylène-diamine-tétraacétique, acide diéthylène-tri-amine-pentaacétique, porphyrine, phénanthroline) induisent la coupure dans des séquences d'acides nucléiques situées dans leur voisinage. More particularly, the radicals that are chemically activatable in the presence of metal ions, oxygen and a reducing agent (ethylene-diamine-tetraacetic acid, diethylene-tri-amine-pentaacetic acid, porphyrin, phenanthroline) induce cleavage in sequences. nucleic acids located in their vicinity.

Par irradiation dans le domaine du visible ou du proche ultra-violet, il est possible d'activer les dérivés qui absorbent ces radiations et de réaliser des réactions de pontage ou des réactions photo-induites (coupure et modification des bases nucléiques) des acides nucléiques sur lesquels est fixé l'oligothionucléotide porteur du groupement activable. By irradiation in the visible or near-ultraviolet region, it is possible to activate the derivatives which absorb these radiations and to carry out bridging reactions or photoinduced reactions (nucleic acid cleavage and modification) of the nucleic acids. on which the oligothionucleotide carrying the activatable group is attached.

Parmi les radicaux Z et Z' peuvent être plus particulièrement cites
- les radicaux dérivés de l'acide éthylène-diamine-tétra-acétique de
formule

Figure img00060001

- les radicaux dérivés de l'acide diéthylène-triamine-pentaacétique, - les radicaux dérivés de la méthylpyrroporphyrine de formule
Figure img00070001

- les radicaux dérivés de la phénanthroline de formule
Figure img00070002

- les radicaux dérivés de l'acridine ::
Figure img00070003

- les radicaux dérivés de la proflavine
Figure img00080001
Among the radicals Z and Z 'can be more particularly cited
radicals derived from ethylene diamine tetraacetic acid
formula
Figure img00060001

radicals derived from diethylenetriaminepentaacetic acid; radicals derived from methylpyrroporphyrin of formula
Figure img00070001

radicals derived from phenanthroline of formula
Figure img00070002

radicals derived from acridine ::
Figure img00070003

- radicals derived from proflavine
Figure img00080001

R représentant un groupement amino (NH2) ou azido (N3) - les radicaux dérivés de la biotine

Figure img00080002

- les radicaux dérivés de l'azido-4 acétophénone de formule
Figure img00080003
R representing an amino (NH 2) or azido (N 3) group - radicals derived from biotin
Figure img00080002

the radicals derived from 4-azidoacetophenone of formula
Figure img00080003

Le radical B peut être, de préférence, choisi parmi les bases nucléiques naturelles (thymine, adénine, cytosine, guanine, uracile) mais il est possible d'utiliser des bases nucléiques modifiées.Peuvent être cités l'amino-2 adénine et ses dérivés substitués, par exemple, sur l'atome d'azoute N6 par un radical aminoalkylène ou par un radical azidophénylalkylène, la guanine substitué sur l'atome d'oxygène 06, par exemple, par un groupement (w-alkylène)-9-acridine, la (w-aminoalkyl)-amino-8-adénine et ses dérivés substitués sur le radical amino en w par un groupe acridine, ou les dérivés halogénés ou azidés tels que le bromo-5 uracile, l'azido-8 adénine, la 7-déazaadénine, la 7-déazaguanine. I1 est possible également d'utiliser des dérivés des bases nucléiques comportant un groupement intercalant ou un groupement chimiquement ou photochimiquement activable. The radical B may preferably be chosen from natural nucleic bases (thymine, adenine, cytosine, guanine, uracil) but it is possible to use modified nucleic bases. Amino-2-adenine and its derivatives may be mentioned. substituted, for example, on the N6 azure atom by an aminoalkylene radical or by an azidophenylalkylene radical, the guanine substituted on the oxygen atom 06, for example, by a (w-alkylene) -9-acridine group (6-aminoalkyl) -amino-8-adenine and its derivatives substituted on the amino group in w by an acridine group, or the halogenated or azidated derivatives such as 5-bromo-uracil, 8-azadenadine, 7-deazaadenine, 7-deazaguanine. It is also possible to use derivatives of the nucleic bases comprising an intercalating group or a chemically or photochemically activatable group.

Ainsi, la fonctionnalisation de C ou T par un groupement aziridine en position 4 conduit à la formation de pontages covalents
CH2-CH2 entre les deux brins complémentaires sur respectivement G et A.
Thus, the functionalization of C or T by an aziridine group at the 4-position leads to the formation of covalent bridges
CH2-CH2 between the two complementary strands on respectively G and A.

Donc, plus particulièrement, le radical B est alors choisi parmi la 4-azido-cytosine ou la 4-azido-thymine.Thus, more particularly, the radical B is then chosen from 4-azido-cytosine or 4-azido-thymine.

De préférence, le radical X représente un oxoanion. Preferably, the radical X represents an oxoanion.

Cependant, le radical X peut représenter un radical alkyle contenant 1 à 7 atomes de carbone (méthyle, éthyle, propyle), un radical alcoxy dont la partie alkyle contient 1 à 7 atomes de carbone (méthoxy, éthoxy, diméthyl-2,2 propyloxy), un radical aminoalkyle ou aminoalcoxy de formule générale RlR2N-alk-A- dans laquelle A représente une liaison ou un atome d'oxygène, -alk- représente un radical alkylène contenant 1 à 10 atomes de carbone et R1 et R2, identiques ou différents, représentent un atome d'hydrogène ou un radical alkyle contenant 1 à 7 atomes de carbone ou forment ensemble avec l'atome d'azote auquel ils sont liés un hétérocycle azoté saturé à 5 ou 6 chaînons, étant entendu que le groupement R R N- peut être quaternarisé, ou un radical alcoylthio dont la partie alcoyle contient 1 à 7 atomes de carbone.However, the radical X may represent an alkyl radical containing 1 to 7 carbon atoms (methyl, ethyl, propyl), an alkoxy radical in which the alkyl part contains 1 to 7 carbon atoms (methoxy, ethoxy, 2,2-dimethylpropyloxy). ), an aminoalkyl or aminoalkoxy radical of the general formula R1R2N-alk-A- in which A represents a bond or an oxygen atom, -alk- represents an alkylene radical containing 1 to 10 carbon atoms and R1 and R2, which are identical or different, represent a hydrogen atom or an alkyl radical containing 1 to 7 carbon atoms or form together with the nitrogen atom to which they are bound a saturated nitrogenous heterocycle with 5 or 6 members, it being understood that the group RR N can be quaternized, or an alkylthio radical whose alkyl part contains 1 to 7 carbon atoms.

Dans la formule (I), le radical -alk- est de préférence un radical alcoylène droit ou ramifié ayant de 1 à 10 atomes de carbone. In the formula (I), the radical -alk- is preferably a straight or branched alkylene radical having from 1 to 10 carbon atoms.

En particulier, à partir des fonctions alcool terminales 3' ou 5' de l'oligothionucléotide, l'effecteur Z peut donc être introduit via une chaîne (CH2)n liée à une fonctionnalisation Z', de natures diverses à la partie osidique de l'oligomère.  In particular, from the terminal alcohol functions 3 'or 5' of the oligothionucleotide, the effector Z can therefore be introduced via a chain (CH 2) n linked to a functionalization Z 'of various natures to the saccharide part of the oligonucleotide. oligomer.

A partir de la formule suivante
3'
ou -O-Z'-(CH2)n-effecteur (Z)
5' on obtiendra, selon ce que représente Z1 , par exemple - un phosphate ou méthyl phosphonate de formule

Figure img00100001
From the following formula
3 '
or -O-Z '- (CH2) n-effector (Z)
From Z1, for example, a phosphate or methyl phosphonate of formula
Figure img00100001

U = O, N ou S - un éther de formule générale

Figure img00100002

- un ester de formule générale :
-O-(CO)-(CH2)n-Z ou encore - un carbamate de formule générale :
-O-(CO)-(CH2)n-Z
La présente invention concerne également les composés précédents sous forme de sel avec des bases ou des acides, et les composés sous forme racémique, ou sous forme d'isomètres R ou S optiques purifiés ou en mélange, de formule (I).U = O, N or S - an ether of general formula
Figure img00100002

an ester of general formula
-O- (CO) - (CH2) nZ or else - a carbamate of general formula:
-O- (CO) - (CH2) nZ
The present invention also relates to the above compounds in salt form with bases or acids, and compounds in racemic form, or in the form of purified or mixed optical isomers R or S, of formula (I).

La présente invention concerne de préférence les composés précédents de formule (I) dans la série D. The present invention preferably relates to the above compounds of formula (I) in series D.

On cite en particulier les produits composés D-oligothionucléotide de formule générale

Figure img00110001

dans laquelle J et X sont définis comme dans la revendication 3 et B représente une base nucléique naturelle.In particular mention is made of D-oligothionucleotide compounds of general formula
Figure img00110001

wherein J and X are defined as in claim 3 and B is a natural nucleobase.

Les nouveaux produits de formule générale (I) peuvent être préparés par voie chimique par des procédés connus et, en particulier, ceux qui sont décrits dans les demandes de procédés connus et, en particulier, ceux qui sont décrits dans les demandes de brevets français FR 8301223 (2 540 122) et FR 8411795 (2 568 254), WO 88/04301 et FR 88 122648.  The new products of general formula (I) can be prepared chemically by known methods and, in particular, those described in the known process applications and, in particular, those described in the French patent applications FR 8301223 (2540122) and FR 8411795 (2568254), WO 88/04301 and FR 88122648.

Les composés de formule (I) peuvent être préparés par voie chimique par des procédés dans lesquels on applique des synthèses au phosphodiester, au phosphotriester, au phosphoramidite ou à l'hydrogéno- phosphonate classiques pour des oligonucléotides. The compounds of formula (I) can be prepared chemically by methods in which conventional phosphodiester, phosphotriester, phosphoramidite or hydrogen phosphonate syntheses are applied to oligonucleotides.

Dans ces procédés, on prépare tout d'abord la chaîne de 4'-thionucléotides, les différents groupements non mis en oeuvre étant protégés, puis on élimine enfin les groupements protecteurs pour obtenir les produits recherchés. In these processes, the 4'-thionucleotide chain is first prepared, the various non-used groups being protected, and finally the protecting groups are finally removed to obtain the desired products.

On cite en particulier un procédé de synthèse de composés selon l'invention sans agent effecteur, caractérisé en ce qu'on réalise une synthèse supportée selon la méthode au phosphoroamidite comportant - une protection en 3' et 5' des 4'-thionucléotides ou oligo4'-thionucléo-
tides de départ avec par exemple du diméthoxytrityl en 5' et de
diisopropylaminophosphoramidite de méthyle en 3', - la fonctionnalisation d'un support solide incorporant un dérivé 4'-thio
nucléosidique par un lien par exemple succinyle entre le groupement
hydroxyle-3' du dérivé 4'-thionucléosidique et un groupement amino du
support solide, - l'élongation de la chaîne oligothionucléotidique dans un réacteur
synthétiseur, - enfin le décrochage, la déprotection et la purification de l'oligothionu-
cléotide prolongé.
In particular, a process for synthesizing compounds according to the invention without an effector agent is described, characterized in that a synthesis supported by the phosphoroamidite method comprising a 3 'and 5' protection of the 4'-thionucleotides or oligo4 is carried out. '-thionucléo-
starting materials with for example dimethoxytrityl 5 'and
3 'methyl diisopropylaminophosphoramidite, functionalization of a solid support incorporating a 4'-thio derivative
nucleoside by a bond for example succinyl between the grouping
hydroxyl-3 'of the 4'-thionucleoside derivative and an amino group of
solid support, - the elongation of the oligothionucleotide chain in a reactor
synthesizer, - finally the stall, the deprotection and the purification of the oligothionu-
prolonged cleft.

On cite également un procédé de synthèse de composés incorporant un agent effecteur selon l'invention caractérisé en ce que l'on part d'un oligothionucléotide sans agent effecteur protégé en 5', dont on fait réagir la terminaison OH 3' avec une fonction non protégée d'un bras difonctionnel dont la deuxième fonction est protégée et après déprotection du produit résultant, on lie ledit produit à l'agent effecteur par la deuxième fonction libre du bras difonctionnel. A process for synthesizing compounds incorporating an effector agent according to the invention is also mentioned, characterized in that one starts from an oligothionucleotide without a 5 'protected effector agent, the OH 3' terminus being reacted with a non-functional function. protected from a difunctional arm whose second function is protected and after deprotection of the resulting product, said product is linked to the effector agent by the second free function of the difunctional arm.

La terminaison OH 3' de l'oligomère protégé en 5' peut être estérifiée avec un acide aminohexanoîque, dont la fonction amine est protégée.  The 3 'OH terminus of the 5' protected oligomer can be esterified with an aminohexanoic acid, whose amine function is protected.

Un procédé en phase solide selon la méthode au phosphoramidite, objet dela présente invention, comporte les étapes essentielles suivantes
- On immobilise un dérivé 4'-thionucléoside protégé par
l'intermédiaire d'une de ses fonctions hydroxyle en 3' ou, le
cas échéant, 2' sur un support solide.
A solid phase method according to the phosphoramidite method, object of the present invention, comprises the following essential steps
A 4'-thionucleoside derivative protected by
via one of its hydroxyl functions at 3 'or, the
where appropriate, 2 'on a solid support.

- On assemble sur ce support dans un réacteur synthétiseur
manuel ou automatique la chaîne d'oligothionucléotide
protégée par condensation de monomères constitués de
4'-thionucléosides protégés substitués par des groupes
phosphoramidites en 3', le cas échéant, la fonction
hydroxyle en 2' des riboses étant protégée par les groupes
Ctmp ou TBDMS.
- We assemble on this support in a synthesizer reactor
manual or automatic oligothionucleotide chain
protected by condensation of monomers consisting of
Protected 4'-thionucleosides substituted with groups
phosphoramidites in 3 ', where appropriate, the function
hydroxyl at 2 'riboses being protected by groups
Ctmp or TBDMS.

- Les oligothionucléotides sont obtenus après décrochage de
l'oligomère obtenu du support et élimination des groupes
protecteurs.
Oligothionucleotides are obtained after stalling
the oligomer obtained from the support and elimination of the groups
protectors.

De façon appropriée, l'assemblage de l'oligothionucléotide se fait par condensation, en présence d'un agent activateur, desdits monomères entre leur fonction en 3' et la fonction 5' du composé 4'-thionucléoside immobilisé pour le premier monomère ou d'un composé intermédiaire polythionucléotide protégé fixé sur ledit composé thionucléoside immobilisé pour les mono mères suivants. Suitably, the assembly of the oligothionucleotide is carried out by condensation, in the presence of an activating agent, of said monomers between their 3 'function and the 5' function of the immobilized 4'-thionucleoside compound for the first monomer or d a protected polythionucleotide intermediate compound attached to said immobilized thionucleoside compound for the following monomers.

Notamment, l'agent activateur pour la condensation desdits mono mères peut être choisi parmi le tétrazole et ses dérivés, tels que le para-nitrophényl tétrazole. In particular, the activating agent for the condensation of said monomers may be chosen from tetrazole and its derivatives, such as para-nitrophenyl tetrazole.

Avantageusement, le groupe phosphoramidite en 3' desdits monomères est un groupe N,N dialkylaminophosphoramidite de formule

Figure img00130001

avec R1 qui représente un alkyle en C1 à C7 éventuellement substitué identique ou différent, tel que CH3, (CH3)2CH. Advantageously, the 3 'phosphoramidite group of said monomers is an N, N dialkylaminophosphoramidite group of formula
Figure img00130001

with R1 which represents an optionally substituted C1 to C7 alkyl identical or different, such as CH3, (CH3) 2CH.

R2 qui représente un alkyle en C1 à C7 éventuellement substitué, tel que CH3, CH2CH2CN. R2 which represents optionally substituted C1-C7 alkyl, such as CH3, CH2CH2CN.

En particulier, le groupe phosphoramidite en 3' desdits monomères est le diisopropylaminophosphoramidite de méthyl (R1 1 (CH3)2CH et R2 = CH3) ou le cyano-2 éthyl diisopropylaminophosphite (R1 = (CH 3)2CH et R2 = CH2CH2CN). In particular, the 3 'phosphoramidite group of said monomers is methyl diisopropylaminophosphoramidite (R 1 1 (CH 3) 2 CH and R 2 = CH 3) or 2-cyanoethyl diisopropylaminophosphite (R 1 = (CH 3) 2 CH and R 2 = CH 2 CH 2 CN).

De façon appropriée, les groupes hydroxyles desdits monomères et dudit composé 4'-thionucléoside immobilisé peuvent être protégés en 5' par le groupe DmTr. Suitably, the hydroxyl groups of said monomers and said immobilized 4'-thionucleoside compound can be protected at 5 'by the DmTr group.

Le composé 4'thionucléoside immobilisé peut être fixé sur le support solide via un groupe divalent succinyle entre un de ses groupements
OH en 2' ou 3' qui se trouve ainsi estérifié, et un groupement amino du support.
The immobilized 4 'thionucleoside compound can be attached to the solid support via a divalent succinyl group between one of its groups
OH at 2 'or 3' which is thus esterified, and an amino group of the support.

Le support solide peut être constitué par une longue chaîne alkylamine fixée sur un polymère, un gel de silice ou des billes de verre poreuses. The solid support may consist of a long alkylamine chain attached to a polymer, a silica gel or porous glass beads.

On peut citer comme groupe fonctionnel permettant la fixation ou étant lié sur support solide doté d'un groupe amino, le groupe de formule

Figure img00140001
As a functional group allowing the attachment or being bound on a solid support having an amino group, the group of formula
Figure img00140001

avec p = 1 à 5, dans lequel R4 représente H un groupe d'activation tel que C6Cl5 ou un radical NH lié à un support solide tel que le radical NH d'une chaîne alkylamine fixée sur un polymère, gel de silice ou billes de verre poreuses. with p = 1-5, wherein R4 represents H an activating group such as C6Cl5 or an NH radical bound to a solid support such as the NH radical of an alkylamine chain attached to a polymer, silica gel or silica gel. porous glass.

Un intérêt des composés selon la présente invention, constitués d'une chaîne d'oligo-thio-nucléotides, est aussi de pouvoir envisager leur utilisation indépendamment d'agents effecteurs, notamment d'agents intercalants, puisque ces nouvelles substances oligonucléotides assurent la reconnaisance de la séquence d'acide nucléique complémentaire, notamment d'ARN, avec une stabilité très accrue ; la fonction de l'agent intercalant étant d'augmenter la stabilité du complexe d'hybridation, sa présence n'est plus obligatoire.  An advantage of the compounds according to the present invention, constituted by an oligo-thio-nucleotide chain, is also to be able to envisage their use independently of effector agents, in particular intercalating agents, since these new oligonucleotide substances ensure the recognition of the complementary nucleic acid sequence, in particular RNA, with a very increased stability; the function of the intercalating agent being to increase the stability of the hybridization complex, its presence is no longer mandatory.

Les composés selon l'invention, par leur grande affinité spécifique pour des séquences nucléiques complémentaires, sont en effet supérieurs aux oligonucléotides actuels dont l'affinité pour les séquences complémentaires est plus faible. The compounds according to the invention, by their high specific affinity for complementary nucleic acid sequences, are indeed superior to the current oligonucleotides whose affinity for the complementary sequences is lower.

Les composés, selon la présente invention, sont donc utilisables de manière plus efficace, à titre de sondes d'hybridation, mais également comme composants de purification pour des séquences déterminées d'ADN ou d'ARN. The compounds according to the present invention can therefore be used more effectively as hybridization probes, but also as purification components for specific sequences of DNA or RNA.

Ces composés peuvent également être utilisés pour détecter des mutations au niveau d'un ADN ou d'un ARN de manière plus efficace. These compounds can also be used to detect mutations at a DNA or RNA level more efficiently.

Les composés de la présente invention, par leur propriété de se fixer fortement sur la séquence nucléique complémentaire, puis d'induire la coupure de la chaîne d'acides nucléiques en ce site, lorsqu'ils sort couplés à un agent de coupure, sont utilisables à titre de nucléases artificielles spécifiques de séquences. Ils peuvent être utilisés comme réactifs en biologie moléculaire ou en génie génétique. The compounds of the present invention, by their property of binding strongly on the complementary nucleic acid sequence, and then of inducing the cleavage of the nucleic acid chain at this site, when they are coupled coupled to a cleavage agent, are usable. as artificial nucleases specific for sequences. They can be used as reagents in molecular biology or genetic engineering.

L'objet de la présente invention est également l'application de ces composés pour réaliser le blocage spécifique des gènes cellulaires ou d'agents pathogènes préalablement choisis (virus, bactéries, parasites). The object of the present invention is also the application of these compounds to achieve the specific blocking of previously selected cell genes or pathogens (viruses, bacteria, parasites).

Les composés selon l'invention sont donc aussi utilisables à titre de médicaments. The compounds according to the invention are therefore also usable as medicaments.

Les nouveaux produits de formule générale (I) selon l'invention et les produits de formule générale (I) dans laquelle L représente un atome d'oxygène, R et R' représentent chacun un atome d'hydrogène et B représente une base nucléique naturelle forment des complexes d'hybridation avec les séquences complémentaires d'ARN beaucoup plus stables que ceux qui sont formés avec l'ADN.  The novel products of general formula (I) according to the invention and the products of general formula (I) in which L represents an oxygen atom, R and R 'each represent a hydrogen atom and B represents a natural nucleic base form hybridization complexes with RNA complementary sequences much more stable than those formed with DNA.

En particulier, les produits de formule (I) dans lesquels J = OH (oligothioribonucléotides) s'apparient de manière plus stable avec des séquences d'ARN complémentaires que les produits de formule (I) dans lesquels J = H (oligothiodésoxyribonucléotides). In particular, the products of formula (I) in which J = OH (oligothioribonucleotides) more stably associate with complementary RNA sequences than the products of formula (I) in which J = H (oligothiodeoxyribonucleotides).

Compte tenu du fait que les cibles des molécules anti-sens en thérapies sont les gènes ARN messagers, cette propriété des oligothioribonucléotides est tout à fait intéressante.  Given that the targets of antisense molecules in therapies are the messenger RNA genes, this property of oligothioribonucleotides is quite interesting.

Cette différence de stabilité des complexes d'hybridation permet une inhibition préférentielle des ARNs messagers et des ARNs viraux sans risque important de provoquer des effets indésirables au niveau de l'ADN du génome. This difference in stability of the hybridization complexes allows preferential inhibition of messenger RNAs and viral RNAs without any significant risk of causing undesirable effects on the genome DNA level.

De plus, vis-à-vis des ARNs, les produits selon l'invention forment généralement des complexes plus stables que ceux qui sont obtenus à partir des oligonucléotides naturels. In addition, vis-à-vis the RNAs, the products according to the invention generally form more stable complexes than those obtained from natural oligonucleotides.

Les séquences des oligothionucléotides, couplés ou non à un agent intercalant ou à un groupement activable chimiquement ou photochimiquement, comportant un enchaînement de nucléosides pyrimidiques sont capables de se fixer sur une double hélice d'ADN ou d'ARN comportant une séquence de bases puriques adjacentes associées par liaison hydrogène à la séquence complémentaire des bases pyrimidiques. Cettefixation implique la formation locale d'une triple hélice dans laquelle les bases pyrimidiques de l'oligothionucléotide forment des liaisons hydrogène (de type Hoogsteen ou Hoogsteen inversé) avec les bases puriques de la double hélice. Dans ce contexte, les oligothionucléotides forment des complexes plus stables que les oligonucléotides correspondants et ils permettent d'induire des réactions irréversibles (pontage, modification ou coupure) sur une double hélice d'ARN ou d'ADN. The sequences of the oligothionucleotides, coupled or not with an intercalating agent or a chemically or photochemically activatable group, comprising a chain of pyrimidine nucleosides, are capable of binding to a DNA or RNA double helix comprising an adjacent purine base sequence. hydrogen bonded to the complementary sequence of the pyrimidine bases. This attachment involves the local formation of a triple helix in which the pyrimidine bases of the oligothionucleotide form hydrogen bonds (of the Hoogsteen or reverse Hoogsteen type) with the purine bases of the double helix. In this context, the oligothionucleotides form more stable complexes than the corresponding oligonucleotides and they make it possible to induce irreversible reactions (bridging, modification or cleavage) on an RNA or DNA double helix.

Les nouveaux produits de formule générale (I) selon l'invention et les produits de formule générale (I) dans laquelle L représente un atome d'oxygène, R et R' représentent chacun un atome d'hydrogène et B représente une base nucléique naturelle, qui possèdent la propriété de se fixer fortement sur la séquence nucléique complémentaire, peuvent être utilisés comme sondes pour détecter la présence d'une chaîne de nucléotides complémentaires. Cette détection est facilitée par la présence d'un groupe fluorescent ou d'un groupe biotine dans ces molécules. The novel products of general formula (I) according to the invention and the products of general formula (I) in which L represents an oxygen atom, R and R 'each represent a hydrogen atom and B represents a natural nucleic base , which possess the property of binding strongly on the complementary nucleic sequence, can be used as probes to detect the presence of a complementary nucleotide chain. This detection is facilitated by the presence of a fluorescent group or a biotin group in these molecules.

La structure non naturelle des oligothionucléotides confère des propriétés d'antigénicité rendant ainsi possible la préparation d'anticorps spécifiques dirigés contre des oligothionucléotides éventuellement couplés à un agent intercalant ou contre leurs complexes avec un
ADN ou un ARN naturels.
The unnatural structure of the oligothionucleotides confers antigenicity properties thus making possible the preparation of specific antibodies directed against oligothionucleotides optionally coupled to an intercalating agent or against their complexes with a
DNA or natural RNA.

Dans un but diagnostique ou pronostique, les oligothionucléotides, éventuellement couplés à un agent intercalant, peuvent être attachés de façon covalente à un support solide. Le couplage à un marqueur luminescent ou générateur d'une réaction colorée, luminescente ou fluorescente permet de les utiliser comme sondes de séquences d'ADN ou d'ARN dans un but diagnostique ou pronostique. For diagnostic or prognostic purpose, oligothionucleotides, optionally coupled to an intercalating agent, may be covalently attached to a solid support. Coupling to a luminescent marker or generating a colored, luminescent or fluorescent reaction makes it possible to use them as probes of DNA or RNA sequences for diagnostic or prognostic purposes.

Les oligothionucléotides selon l'invention sont beaucoup plus résistants vis-à-vis des nucléases que les dérivés de nucléosides naturels. The oligothionucleotides according to the invention are much more resistant to nucleases than natural nucleoside derivatives.

Cette stabilité vis-à-vis de l'hydrolyse enzymatique permet l'utilisation des produits de formule générale (I) dans des expérimentations in vivo ou in vitro en présence de nucléases. De ce fait, les oligothionucléotides selon l'invention présentent des avantages incontestables sur les dérivés de bêta-nucléosides dà connus.This stability with respect to the enzymatic hydrolysis allows the use of the products of general formula (I) in in vivo or in vitro experiments in the presence of nucleases. As a result, the oligothionucleotides according to the invention have undeniable advantages over known beta-nucleoside derivatives.

Les composés oligothioribonucléotides de formule (I) pour lesquels J = OH sont plus résitants à la dégradation enzymatiques que les composés oligothiodésoxyribonucléotides de formule I pour lesquels J = H. The oligothioribonucleotide compounds of formula (I) for which J = OH are more resistant to enzymatic degradation than the oligothiodeoxyribonucleotide compounds of formula I for which J = H.

Dès lors, comme on l'a vu, un autre objet de la présente invention concerne l'application des nouveaux produits de formule générale (I) selon l'invention et des produits de formule générale (I) dans laquelle L représente un atome d'oxygène, R et R' représentent chacun un atome d'hydrogène et B représente une base nucléique naturelle, en particulier les produits pour lesquels J = OH, au blocage spécifique de gènes cellulaires ou d'agents pathogènes préalablement choisis (virus, bactéries, parasites), en particulier les ARNm. Therefore, as we have seen, another object of the present invention relates to the application of the novel products of general formula (I) according to the invention and products of general formula (I) in which L represents a hydrogen atom. oxygen, R and R 'each represent a hydrogen atom and B represents a natural nucleic base, in particular the products for which J = OH, to the specific blocking of previously selected cell genes or pathogens (viruses, bacteria, parasites), in particular the mRNAs.

Les nouveaux produits de formule générale (I) selon l'invention et les produits de formule générale (I) dans laquelle L représente un atome d'oxygène, R et R' représentent chacun un atome d'hydrogène et B représente une base nucléique naturelle, en particulier les produits pour lesquels J = OH, sont particulièrement utiles comme médicaments permettant de bloquer les gènes indésirables exogènes (virus, bactéries, parasites) ou endogènes (gènes cellulaires, oncogènes), en particulier les ARNm.L'expression de ces gènes peut être bloquée en agissant soit directement sur l'ADN ou L'ART porteur de l'information génétique, soit sur L'ART messager, copie du gène, en bloquant alors toute traduction par hybridation ou par hybridation puis pontage ou modification ou coupure de L'ART messager ou viral choisi comme cible. The novel products of general formula (I) according to the invention and the products of general formula (I) in which L represents an oxygen atom, R and R 'each represent a hydrogen atom and B represents a natural nucleic base , in particular the products for which J = OH, are particularly useful as medicaments making it possible to block the exogenous (viruses, bacteria, parasites) or endogenous (cellular genes, oncogenes) genes, in particular the mRNAs. The expression of these genes can be blocked by acting either directly on the DNA or the ART carrying the genetic information, or on the messenger ART, copy of the gene, while blocking any translation by hybridization or by hybridization then bypass or modification or cut of The messenger or viral ART chosen as target.

Ce blocage peut être réalisé en utilisant un produit de formule générale (I) selon l'invention ou un produit de formule générale (I) dans laquelle L représente un atome d'oxygène, R et R' représentent chacun un atome d'hydrogène et B représente une base nucléique naturelle, en particulier les produits pour lesquels J = OH, dont la séquence est complémentaire de celle d'une région non complexée d'un ARN ou d'un
AND et, en particulier, d'un ARN messager. L'hybridation, suivie ou non du pontage, de la modification ou de la coupure de L'ART messager ou viral, empêche la synthèse de L'ART ou de la protéine correspondante ou l'expression des fonctions virales ou parasitaires.
This blocking can be carried out using a product of general formula (I) according to the invention or a product of general formula (I) in which L represents an oxygen atom, R and R 'each represent a hydrogen atom and B represents a natural nucleotide base, in particular the products for which J = OH, the sequence of which is complementary to that of an uncomplexed region of an RNA or a
AND, and in particular, a messenger RNA. Hybridization, followed or not by bridging, modification or cleavage of messenger or viral ART, prevents the synthesis of ART or the corresponding protein or the expression of viral or parasitic functions.

Si cet ARN ou cette protéine est vital pour le virus, la bactérie ou le parasite, les produits de formule générale (I) selon l'invention et les produits de formule générale (I) dans laquelle L représente un atome d'oxygène, R et R' représentent chacun un atome d'hydrogène et B représente une base nucléique naturelle, en prticulier les produits pour lesquels J = OH, constitueront des médicaments à activité antivirale, antibactérienne ou antiparasitaire. If this RNA or this protein is vital for the virus, the bacterium or the parasite, the products of general formula (I) according to the invention and the products of general formula (I) in which L represents an oxygen atom, R and R 'each represent a hydrogen atom and B represents a natural nucleic base, in particular the products for which J = OH, will constitute antiviral, antibacterial or antiparasitic drugs.

Si cet ARN ou cette protéine n'est pas vital pour l'organisme, il est possible d'en supprimer sélectivement les effets. Dans ce cas, les produits de formule générale (I) selon l'invention et les produits de formule générale (I) dans laquelle L représente un atome d'oxygène, R et R' représentent chacun un atome d'hydrogène et B représente une base nucléique naturelle, en particulier les produits pour lesquels J = OH, constitueront soit des médicaments à activité antitumorale lorsque le gène visé ou son ARN messager code pour une protéine impliquée dans la transformation cellulaire, soit des médicaments capables de supprimer le caractère de résistance aux antiviraux, aux antibiotiques ou aux antiparasitaires lorsque la protéine codée est responsable de l'inactivation des antibiotiques, des antiviraux ou des antiparasitaires.  If this RNA or protein is not vital to the body, it is possible to selectively remove the effects. In this case, the products of general formula (I) according to the invention and the products of general formula (I) in which L represents an oxygen atom, R and R 'each represent a hydrogen atom and B represents a natural nucleic acid, in particular the products for which J = OH, will constitute either anti-tumor drugs when the targeted gene or its messenger RNA encodes a protein involved in the cellular transformation, or drugs capable of suppressing the resistance character to antivirals, antibiotics or antiparasitics when the encoded protein is responsible for the inactivation of antibiotics, antivirals or antiparasitics.

Des effets cytotoxiques spécifiques peuvent être obtenus par action d'un produit selon l'invention ou d'un produit de formule générale (I) dans laquelle L représente un atome d'oxygène, R et R' représentent chacun un atome d'hydrogène et B représente une base naturelle, en particulier les produits pour lesquels J = OH, sur une fonction cellulaire indispensable à la cellule cible. Specific cytotoxic effects may be obtained by the action of a product according to the invention or of a product of general formula (I) in which L represents an oxygen atom, R and R 'each represent a hydrogen atom and B represents a natural base, in particular the products for which J = OH, on a cell function essential to the target cell.

D'autres caractéristiques et avantages de la présente invention apparaîtront à la lumière des exemples qui vont suivre. Other features and advantages of the present invention will become apparent from the following examples.

La Figure 1 représente la courbe de stabilité thermique du duplex bêtadT5(SrT)dT6/bêtadC2A12C2 comparativement à celle du duplex naturel bêtadT12/bêtadC2A12C2.  Figure 1 shows the thermal stability curve of the betadT5 (SrT) duplex dT6 / betadC2A12C2 compared to that of the natural duplex betadT12 / betadC2A12C2.

La Figure 2 représente la courbe de digestion enzymatique de bêta(SrT)dT îî.  Figure 2 shows the enzymatic digestion curve of beta (SrT).

Dans la description qui suit, l'abrétiation rS ou Sr précède un thioribunucléotide.  In the following description, the abbreviation rS or Sr precedes a thioribunucleotide.

I-SYNTEIESE DE THIONUCLEOTIDES. I-SYNTEESE OF THIONUCLEOTIDES.

I. 1- Les premières synthèses de thiosucres ont été effectuées entre 1960 et 1970. I. The first syntheses of thiosugars were made between 1960 and 1970.

Deux exemples sont donnés:
La synthèse de derivés du 4-thio-D-ribofurannose se fait selon le schema 1:

Figure img00200001
Two examples are given:
The synthesis of derivatives of 4-thio-D-ribofuranose is according to scheme 1:
Figure img00200001

SCHEMA 1
Ce composé est obtenu en 8 étapes à partir du =-Lyxose avec un rendement global de 6 %.
SCHEME 1
This compound is obtained in 8 steps from = -Lyxose with an overall yield of 6%.

- R. L. WHISTLER, W. E. DICK, T. R. INGLE, R. M. ROWELL et B. URBAS, J. Org.R. WHISTLER, W. E. DICK, T. INGLE, R. M. ROWELL and B. URBAS, J. Org.

Chem., 1964, 29, 3723-3725.Chem., 1964, 29, 3723-3725.

- B. URBAS et R. L. WHISTLER, J. Org. Chem., 1966, 31, 813-816.B. URBAS and R. L. WHISTLER, J. Org. Chem., 1966, 31, 813-816.

- E. J. REIST, D. E. GUEFFROY et L. GOODMAN, J. Am. Chem. Soc., 1964, 86, 5658-5663.E.J. REIST, D. E. GUEFFROY and L. GOODMAN, J. Am. Chem. Soc., 1964, 86, 5658-5663.

- R. L. WHISTLER et J. N. BeMILLER dans " Methods in Carbohydrate Chemistry", R.R. L. WHISTLER and J. N. BeMILLER in "Methods in Carbohydrate Chemistry", R.

L. WHISTLER et M. L. WOLFROM, Eds., Academic Press, Inc., New york, 1962, Vol.L. WHISTLER and M. WOLFROM, Eds., Academic Press, Inc., New York, 1962, Vol.

I, p.79. I, p.79.

Les dérivés du 4-thio-2-déso2çy-D-nbofurannose ont été obtenus selon le schema 2

Figure img00210001
The derivatives of 4-thio-2-deoxy-D-nbofuranose were obtained according to scheme 2
Figure img00210001

SCHEMA 2
Cette synthèse en 14 étapes conduit au methyl 2-désoxy 4-thio-D-erythro-pentofurannoside avec un rendement global de 8 %.
SCHEME 2
This 14-step synthesis leads to methyl 2-deoxy 4-thio-D-erythro-pentofuranoside with an overall yield of 8%.

- Y. L. FU et M. BOBEK, J. Org. Chem., 1976, 41, 3831-3834.Y. L. FU and M. BOBEK, J. Org. Chem., 1976, 41, 3831-3834.

- Y. L. FU et M. BOBEK, dans " Nucleic Acid Chemistry ", L. TOWSEND et R. S.- Y. L. FU and M. BOBEK, in "Nucleic Acid Chemistry", L. TOWSEND and R. S.

TIPSON,Eds., 1978, Part I pp. 183-194.TIPSON, Eds., 1978, Part I pp. 183-194.

- U. G. NAYAK et R.L. WHISTLER, Liebigs Ann. Chem., 1970, 741, 131-138.U. G. NAYAK and R. WHISTLER, Liebigs Ann. Chem., 1970, 741, 131-138.

De façon semblable, les dérivés du 4-thio-D-arabinofurannose ont été obtenus: - R. L. WHISTLER, U. G. NAYAK et A. W. PERKIN Jr., J. Org., Chem., 1970, 35, 519-521.Similarly, the 4-thio-D-arabinofuranose derivatives were obtained: R. L. WHISTLER, U. G. NAYAK and A. W. PERKIN, Jr., J. Org., Chem., 1970, 35, 519-521.

I. 2. Les nucléosides correspondants ont ensuite été synthétisés:
a) En serie 4'-thio-2'-désoxy-D-ribofurannose
- Y. L. FU et M. BOBEK dans " Nucleic Acid Chemistry ",L. TOWSEND, R. L.
I. 2. The corresponding nucleosides were then synthesized:
a) In series 4'-thio-2'-deoxy-D-ribofuranose
YL FU and M. BOBEK in "Nucleic Acid Chemistry", L. TOWSEND, RL

TIPSON, Eds., John Wiley & Sons, New York, 1978, p. 317.TIPSON, Eds., John Wiley & Sons, New York, 1978, p. 317.

b) En serie 4'-thio-D-ribofuramiose
- E. J. REIST, D. E. GUEFFROY et L. GOODMAN, J. Am. Chem. Soc. , 1964, 86, 5658-5663.
b) In series 4'-thio-D-ribofuramiasis
EJ REIST, DE GUEFFROY and L. GOODMAN, J. Am. Chem. Soc. , 1964, 86, 5658-5663.

- E. J. REIST, D. E. GUEFFROY et L. GOODMAN, Chem. Ind., 1964, 13641365. - E.J. REIST, D. E. GUEFFROY and L. GOODMAN, Chem. Ind., 1964, 13641365.

- B. URBAS et R. L. WHISTLER, J. Org. Chem., 1966, 31, 813-816. B. URBAS and R. L. WHISTLER, J. Org. Chem., 1966, 31, 813-816.

- M. BOBEK, R. L. WHISTLER et A. BLOCH, J. Med. Chem., 1970, 23, 411-413
- M. BOBEK, A. BLOCH, R. PARTHASARATHY et R. L. WHISTLER, J. Med.
- Mr BOBEK, RL WHISTLER and A. BLOCH, J. Med. Chem., 1970, 23, 411-413
- M. BOBEK, A. BLOCH, R. PARTHASARATHY and RL WHISTLER, J. Med.

Chem., 1975, 18, 784
- M. BOBEK, R. L. WHISTLER et A. BLOCH, J. Med. Chem., 1972, 15, 168171.
Chem., 1975, 18, 784
- Mr BOBEK, RL WHISTLER and A. BLOCH, J. Med. Chem., 1972, 15, 168171.

- N. OTOTANI et R. L. WHISTLER, J. Med. Chem., 1974, 17 535
- M. W. PICKERING, J. T. WITKOWSKI et R. K. ROBBINS, J. Med. Chem., 1976, 19, 841-842.
N. OTOTANI and RL WHISTLER, J. Med. Chem., 1974, 17,535
MW PICKERING, JT WITKOWSKI and RK ROBBINS, J. Med. Chem., 1976, 19, 841-842.

- A. K. M. ANISUZZAMAN et M. D. AMIN, J. Bangladesh Acad. Sci.,1978, 2 59-64
c) Dans d'autres series:
- R.G.S. RITCHIE et W. A. SZAREK, J. Chem. Soc. Chem. Commun., 1973, 686.
- AKM ANISUZZAMAN and MD AMIN, J. Bangladesh Acad. Sci., 1978, 2 59-64
c) In other series:
RGS RITCHIE and WA SZAREK, J. Chem. Soc. Chem. Commun., 1973, 686.

- E. J. REIST, L. V. FISCHER et L. GOODMAN, J. Org. Chem., 1968, 33 189
- R. L. WHISTLER, L. W. DONER et U. G. NAYAK, J. Org. Chem., 1971, 36, 108
Ces nucléosides sont obtenus par les voies traditionnelles de la synthèse des nucléosides en série oxygénée.
- EJ REIST, LV FISCHER and L. GOODMAN, J. Org. Chem., 1968, 33,189
RL WHISTLER, LW DONER and UG NAYAK, J. Org. Chem., 1971, 36, 108
These nucleosides are obtained by the traditional routes of nucleoside synthesis in oxygenated series.

Soit par la méthode aux sels de métaux lourds:
Traitement de l'hétérocycle chloromercurique avec le chlorosucre correspondant.
Either by the heavy metal salt method:
Treatment of the chloromercuric heterocycle with the corresponding chlorosugar.

- M. BOBEK, R. L. WHISTLER et A. BLOCH, J. Med. Chem., 1972, 15 168-171.- Mr BOBEK, R. L. WHISTLER and A. BLOCH, J. Med. Chem., 1972, 168-171.

- D. E. GUEFFROY et L. GOODMAN, Chem. & Ind., 1964, 1364-1365. - D. E. GUEFFROY and L. GOODMAN, Chem. & Ind., 1964, 1364-1365.

- E. J. REIST, M. BOBEK, R. L. WHISTLER et A. BLOCH, J. Med. Chem., 1970, 13 411-413.- E.J. REIST, M. BOBEK, R. L. WHISTLER and A. BLOCH, J. Med. Chem., 1970, 411-413.

- E. J. REIST, D. E. GUEFFROY et L. GOODMAN, J. Am. Chem.Soc., 1964, 86 5658-5663.E.J. REIST, D. E. GUEFFROY and L. GOODMAN, J. Am. Chem. Sac., 1964, 86 5658-5663.

- E. J. REIST, L. V. FISCHER et L. GOODMAN, J. Org. Chem., 1968, 33, 189-192.- E.J. REIST, L. V. FISCHER and L. GOODMAN, J. Org. Chem., 1968, 33, 189-192.

Soit par la méthode de HILBERT et JOHNSON, - par condensation de la base pyrimidinique avec le thiochlorosucre correspondant. Either by the method of HILBERT and JOHNSON, - by condensation of the pyrimidine base with the corresponding thiochlorosugar.

- B. URBAS et R. L. WHISTLER, J. Org. Chem., 1966, 31 813-816.B. URBAS and R. L. WHISTLER, J. Org. Chem., 1966, 31813-816.

- par condensation des dérivés silylés des bases et des thiochlorosucres correspondants.by condensation of the silylated derivatives of the bases and the corresponding thiochlorosucres.

- M. BOBEK, A. BLOCH, R. PARTHASARATHY et R. L. WHISTLER, J.M. BOBEK, A. BLOCH, R. PARTHASARATHY and R. L. WHISTLER, J.

Med.,Chem., 1975, 18 784-787.Med., Chem., 1975, 784-787.

- R. L. WHISTLER, L. W. DONER et U. G. NAYAK, J. Org. Chem., 1971, 36, 108110.R. WHISTLER, L. W. DONER and U. G. NAYAK, J. Org. Chem., 1971, 36, 108110.

- N. OTOTANI et R. L. WHISTLER, J. Med Chem., 1974, 17 535-537.N. OTOTANI and R. L. WHISTLER, J. Med Chem., 1974, 17 535-537.

- par la reaction de fusion du 3-cyano 1,2,4 triazole et du 1,2,3,5 tétra-O-acétyl-4- thio-D-ribofurannose. by the fusion reaction of 3-cyano-1,2,4-triazole and 1,2,3,5-tetra-O-acetyl-4-thio-D-ribofuranose.

- M. V. PICKERING, J. T. WITKOWSKI et R. K. ROBINS, J. Med. Chem., 1976, 19 841-842.M. V. PICKERING, J. T. WITKOWSKI and R. K. ROBINS, J. Med. Chem., 1976, 841-842.

- par la méthode de VORBRUGGEN et NIEDBAILLA par condensation de l'adenine et du 1,2,3,5 tetra-O-acetyl thioribofurannose en présence de catalyseur
FRIEDEL et CRAFTS.
by the method of VORBRUGGEN and NIEDBAILLA by condensation of adenine and 1,2,3,5 tetra-O-acetyl thioribofuranose in the presence of catalyst
FRIEDEL and CRAFTS.

- A. K. M. ANISUZZAMAN et M. D. AMEN, J. Bangladesh Acad. Sci., 1978, 2 59-64.- A. K. M. ANISUZZAMAN and M. D. AMEN, J. Bangladesh Acad. Sci., 1978, 59-64.

Depuis peu, la synthèse de thionucléosides a de nouveau connu de l'intérêt. Recently, the synthesis of thionucleosides has again been of interest.

Ainsi, le 2',3',5' tn-O-benzyl 4'-thio-ss-D-xylofurannosyl uracile a été obtenu par une voie originale selon le schema 3: - M. W. BREDENKAMP, C. W. HOLZAPFEL et A. D. SWANEPOEL, Tétrahedron
Lett., 1990, li, 2759-2762, - M. W. BREDENKAMP, C. W. HOLZAPFEL et A. D. SWANEPOEL, S. Afr. J.
Thus, 2 ', 3', 5 'tn-O-benzyl 4'-thio-ss-D-xylofuranosyl uracil was obtained by an original route according to scheme 3: - MW BREDENKAMP, CW HOLZAPFEL and AD SWANEPOEL, Tetrahedron
Lett., 1990, li, 2759-2762, MW BREDENKAMP, CW HOLZAPFEL and AD SWANEPOEL, S. Afr. J.

Chem., 1991, 44 31-33.

Figure img00240001
Chem., 1991, 44, 31-33.
Figure img00240001

(i = oxyde de dibutyl étain; ii = MsCI; iii = BnCI; iv = iodure de tetra-butylairnonium, carbonate de barium; v = Hg(OAc)2 / AcOH; vi = Méthode d'HILBERT JOHNSON modifiée.)
SCHEMA 3
La synthèse d'analogues pyrimidiniques de 4'-tbio 2'-désoxy nucléosides a été publiée.
(i = dibutyl tin oxide, ii = MsCI, iii = BnCl, iv = tetra-butylairnonium iodide, barium carbonate, v = Hg (OAc) 2 / AcOH, vi = modified HILBERT JOHNSON method.)
SCHEME 3
The synthesis of pyrimidine analogues of 4'-tbio 2'-deoxy nucleosides has been published.

- M. R. DYSON, P. L. COE et R. T. WALKER, J. Med. Chem., 1991 34, 2782-2786.- R. R. DYSON, P. L. COE and R. T. WALKER, J. Med. Chem., 1991 34, 2782-2786.

par la méthode de HORTON et MARKOVS.by the method of HORTON and MARKOVS.

- D. HORTON et R. A. MARKOVS, Carbohydrate Res., 1980, 80,356.D. HORTON and R. A. MARKOVS, Carbohydrate Res., 1980, 80,356.

Elle est illustrée par le schéma 4:

Figure img00240002
It is illustrated in Figure 4:
Figure img00240002

SCHEMA 4
D'une façon semblable, les 2'-désoxy-4'-thiocytidine, 2' 2'-désoxy-4'-thiouridine et 4'thiothymidine ont été obtenus par J. A. SECRIST III et Coll. (J. A. SECRIST, K. N.
SCHEMA 4
In a similar manner, 2'-deoxy-4'-thiocytidine, 2'2'-deoxy-4'-thiouridine and 4'thiothymidine were obtained by JA SECRIST III et al. (JA SECRIST, KN

TIWARI, J. M. RIORDAN et J. A. MONTGOMERY, J. Med. Chem., 1991, 34, 2361
2366); (J. A. MONTGOMERY et J. A. SECRIST III, PCT Int. Appl. WO 9104.033 ) à
partir du 2-désoxy-4-thio-ss-érythro-pentafurannose synthétisé selon BOBEK et Coll. (Y.
TIWARI, JM RIORDAN and JA MONTGOMERY, J. Med. Chem., 1991, 34, 2361
2366); (JA MONTGOMERY and JA SECRIST III, PCT Int Appl. WO 9104,033) to
from 2-deoxy-4-thio-ss-erythro-pentafuranose synthesized according to BOBEK et al. (Y.

L. FU, M. BOBEK, J. Org. Chem;, 1976, 41, 3831-3834.) en utilisant le TMSTf comme
catalyseur de couplage.
L. FU, M. BOBEK, J. Org. Chem., 1976, 41, 3831-3834.) Using the TMSTf as
coupling catalyst.

La synthèse du 4'-thio 2'-désoxy-D- ribofurannose a fait l'objet d'un brevet et de publications: - European Patent Application, 0421 777 Al R. T. WALKER. The synthesis of 4'-thio 2'-deoxy-D-ribofuranose has been the subject of a patent and publications: - European Patent Application, 0421 777 Al R. T. WALKER.

- M. R. DYSON, P. L. COE et R. T. WALKER, J. Chem. Soc. Chem. Comm., 1991,741-742.- R. R. DYSON, P. L. COE and R. T. WALKER, J. Chem. Soc. Chem. Comm., 1991,741-742.

- M. R. DYSON, P. L. COE et R. T. WALKER, Carbohydrate Res., 1991, 216, 237-248.- R. DYSON, P. L. COE and R. T. WALKER, Carbohydrate Res., 1991, 216, 237-248.

Elle est décrite sur le schéma 5:

Figure img00250001

(i = HCl/MeOH, ii = BuBr/THF, iii = BnSH/HCl, iv = Ph3P/DEAD/BzOH/THF, v = MeONa/
MeOH / CH2Cl2, vi = MsCl I Pyr., vii = Nal I CO3Ba / Acetone, viii = BCl3 / CH2C12, ix = p
toluoylCl, x = Ac2O/H2SO4)
SCHEMA 5
Des ribothionucléosides derivés des pyrimidines ont fait l'objet du même brevet. Mais la synthèse du thioribofurannose de départ a été réalisée selon la méthode de E. J. REIST.It is described in Figure 5:
Figure img00250001

(i = HCl / MeOH, ii = BuBr / THF, iii = BnSH / HCl, iv = Ph3P / DEAD / BzOH / THF, v = MeONa /
MeOH / CH2Cl2, vi = MsCl I Pyr, vii = Nal I CO3Ba / Acetone, viii = BCl3 / CH2Cl2, ix = p
toluoylCl, x = Ac2O / H2SO4)
SCHEME 5
Ribothionucleosides derived from pyrimidines were the subject of the same patent. But the synthesis of the starting thioribofuranose was carried out according to the method of EJ REIST.

- E. J. REIST, D. E. GUEFFROY et L. GOODMAN, J. Am. Chem. Soc., 1964, 84 5658.E.J. REIST, D. E. GUEFFROY and L. GOODMAN, J. Am. Chem. Soc., 1964, 84-5658.

I. 3.SYNTHESE DES SYNTHONS DU 4'-THIO-BETA-D-RIBOFURANNOSE
NECESSAIRES A L'OBTENTION DE THIOOLIGOMERES.
I. 3. SYNTHESIS OF SYNTHESIS OF 4'-THIO-BETA-D-RIBOFURANNOSE
NECESSARY FOR THE PRODUCTION OF THIOOLIGOMERS.

On a réalisé la synthèse du L-thioLyxofurannose et du D-thioRibofurannose en 7 étapes à partir du D-ribose et du L-lyxose respectivement avec 29 et 21 % de rendement respectivement. Cette synthèse est illustrée sur le schéma 6.

Figure img00260001
Synthesis of L-thioLyxofuranose and D-thioRibofuranose in 7 steps from D-ribose and L-lyxose was performed respectively with 29 and 21% yield respectively. This synthesis is illustrated in Figure 6.
Figure img00260001

(i = MeOH, HCI; ji = BnBr, KOH; iii = HCL,H20,dioxane; iv = BnSH, HCI; v = MesCL, pyr.; vi =
NBu4I, BaCO3; vii = Hg(OAc)2)
SCHEMA 6
Notre synthèse pour obtenir le thio-D-ribofurannose utilise le L-lyxose comme produit de départ comme dans la synthèse de WHISTLER (page 19). Cette stratégie est appelée stratégie C1 ----C4 . En effet, l'atome de soufre est tout d'abord introduit en position anomère et une substitution nucléophile SN2 entre l'atome de soufre porté par le carbone anomère (C1) et le carbone C4 porteur d'un OH activé par un groupement Mesyl (Ms) est ensuite effectuée.Cette stratégie appliquée à la synthèse du 4-thio-D-ribofurannose et du 4-thio-L-lyxofurannose ressemble à celle que WALKER a utilisé pour parvenir à la série 2-desoxy-D-ribofurannose ( Brevet
Eur. Pat. 0421 777 A 1 page 6). Par exemple, le produit 5 (Schéma 5) de WALKER est semblable à notre produit 10 (Schema 6) en série L-Lyxofurannose.

Figure img00270001
(i = MeOH, HCl, Li = BnBr, KOH, iii = HCl, H2O, dioxane, iv = BnSH, HCl, v = MesCL, pyr, vi =
NBu4I, BaCO3; vii = Hg (OAc) 2)
SCHEME 6
Our synthesis for thio-D-ribofuranose uses L-lyxose as a starting material as in the WHISTLER synthesis (page 19). This strategy is called strategy C1 ---- C4. In fact, the sulfur atom is first introduced into the anomeric position and a nucleophilic substitution SN2 between the sulfur atom carried by the anomeric carbon (C1) and the C4 carbon carrying an activated OH by a Mesyl group. (Ms) is then carried out.This strategy applied to the synthesis of 4-thio-D-ribofuranose and 4-thio-L-lyxofuranose resembles that which WALKER used to achieve the 2-desoxy-D-ribofuranose series ( Patent
Eur. Pat. 0421 777 A 1 page 6). For example, WALKER product 5 (Scheme 5) is similar to our product (Schema 6) in L-Lyxofuranose series.
Figure img00270001

13 B = T 14a 14 B = T 18 < t 18ss
B = U 15&alpha;, 15ss B = U 19&alpha;, 19ss
B = C 18&alpha;, 18ss B = C 20&alpha;, 20ss
B = A 17a 17,' B = A 21&alpha;, 21ss
(i = BSA, TMSTf,CH3CN; ii = BBr3, CH2CI2)
SCHEMA 7
La synthèse des thionucléosides de l'uracile, de la thymine et de la cytosine a été effectuée en utilisant le bis-triméthylsilyl acétamide (BSA) comme agent silylant et le triméthylsily trifluorométhane sulfonate (TMSTf) comme agent de couplage. Les nucléosides a et B ont été obtenus avec 74 , 77 et 70 % de rendement respectivement .La synthèse des thionucleosides de l'adenine a été réalisée par le SnCl4 dans l'acetonitrile. Les nucleosides a et B sont obtenus avec 58 % de rendement (Schéma 7).
13 B = T 14a 14 B = T 18 <t 18ss
B = U 15 &alpha;, 15ss B = U 19 &alpha;, 19ss
B = C 18 &alpha;, 18ss B = C 20 &alpha;
B = A 17a 17, 'B = A 21 &alpha;, 21ss
(i = BSA, TMSTf, CH3CN, ii = BBr3, CH2Cl2)
SCHEME 7
Synthesis of thionucleosides of uracil, thymine and cytosine was performed using bis-trimethylsilyl acetamide (BSA) as silylating agent and trimethylsily trifluoromethanesulfonate (TMSTf) as coupling agent. The nucleosides a and B were obtained with 74, 77 and 70% of yield respectively. The synthesis of the adenine thionucleosides was carried out by SnCl4 in acetonitrile. Nucleosides a and B are obtained with 58% yield (Scheme 7).

II. SYNTHESE D'OLIGO-THIONUCLEOTIDES SUR SUPPORT SOLIDE.II. SYNTHESIS OF OLIGO-THIONUCLEOTIDES ON SOLID SUPPORT.

La synthèse supportée des B oligothioribonucléotides a été effectuée à l'aide d'un synthétiseur GENE modèle APPLIED BIOSYSTEM 318A selon la méthode aux phosphoramidites.The supported synthesis of B oligothioribonucleotides was carried out using a GENE model APPLIED BIOSYSTEM 318A synthesizer according to the phosphoramidite method.

Elle est semblable à celle décrite pour la série B oligodésoxyribonucléotide naturelle par
CARUTHERS et Coll. (S. L. BEAUCAGE et M. H. CARUTHERS, Tétrahedron Lett., 1981, 22, 1859-1862; L. J. Mc BRIDE et M. H. CARUTHERS, Tétrahedron Lett., 1983, 24, 245-248.) et à celle décrite par USMAN et Coll.pour les oligoribonucléotides (N. USMAN, K. K.
It is similar to that described for series B oligodeoxyribonucleotide by
CARUTHERS et al. (SL BEAUCAGE and MH CARUTHERS, Tetrahedron Lett., 1981, 22, 1859-1862, LJ Mc BRIDE and MH CARUTHERS, Tetrahedron Lett., 1983, 24, 245-248.) And to that described by USMAN et al. oligoribonucleotides (N. USMAN, KK

OGILVIE, M. Y. JIANG et R. J. CEDERGREN, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 78457854.). OGILVIE, M. Y. JIANG and R. J. CEDERGREN, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 78457854.).

Cette synthèse a nécessité:
I) La préparation de synthons B thioribonucléoside phosphoramidites 5 correspondant aux bases T, U, C, A et G.
This synthesis required:
I) The preparation of synthons B thioribonucleoside phosphoramidites corresponding to the bases T, U, C, A and G.

II) La fonctionnalisation du support solide incorporant un dérivé B thioribonucléosidique.  II) Functionalization of the solid support incorporating a thioribonucleoside B derivative.

III) L'élongation de la chaîne oligothioribonucléotidique à l'aide d'un synthétiseur automatique. III) The elongation of the oligothioribonucleotide chain using an automatic synthesizer.

IV) Enfin, au terme du nombre requis de cycles de synthèse, l'oligothionucléotide a été décroché de son support, déprotégé et purifié. IV) Finally, at the end of the required number of synthesis cycles, the oligothionucleotide was removed from its support, deprotected and purified.

II.1 - Synthèse du phosphoramidite des beta-thioribonucléoside 26 a-d. II.1 - Synthesis of phosphoramidite of beta-thioribonucleoside 26 a-d.

Il. 1. 1 Synthèse des dérivés 5'-DmTr-2'-O-TBDMS (Schéma 8)
Le problème majeur dans la synthèse chimique des oligoribonucléosides est la présence de l'hydroxyle en 2' dans le cycle ribose ou thioribose qui demande une protection sélective.
He. 1. Synthesis of 5'-DmTr-2'-O-TBDMS derivatives (Scheme 8)
The major problem in the chemical synthesis of oligoribonucleosides is the presence of the 2 'hydroxyl in the ribose or thioribose ring which requires selective protection.

La sélection d'un groupement protecteur pour l'hydroxyle en 2' doit correspondre à plusieurs critères, il doit être stable:
- sous les conditions de couplage pendant la déprotection des groupements protecteurs en 5' pour permettre l'extension de la chaîne.
The selection of a protecting group for the hydroxyl in 2 'must correspond to several criteria, it must be stable:
under the coupling conditions during the deprotection of the 5 'protecting groups to allow the extension of the chain.

- pendant l'oxydation dans le cas de la méthode aux phosphites triesters. during oxidation in the case of the phosphite triester method.

- pendant le masquage qui suit le couplage. during the masking following the coupling.

- pendant la déprotection des groupements protecteurs des amines exocycliques. during the deprotection of the protective groups of the exocyclic amines.

- pendant la déprotection des phosphates. during the deprotection of phosphates.

- et dans le cas des synthèses sur support solide pendant le clivage de l'oligomère du support. and in the case of syntheses on a solid support during the cleavage of the oligomer of the support.

Finalement ce groupement protecteur doit être enlevé sous des conditions très douces pour éviter une attaque de la fonction hydroxyle en 2' libérée sur la liaison phosphodiester adjacente.Finally this protecting group must be removed under very mild conditions to avoid an attack of the 2 'hydroxyl function released on the adjacent phosphodiester linkage.

Un nombre important de stratégies pour protéger les hydroxyles en 2' ont été développées et illustrent les difficultés dans le choix du schéma de protection des groupements hydroxylés.A large number of strategies for protecting the hydroxyls in 2 'have been developed and illustrate the difficulties in the choice of the protection scheme for hydroxyl groups.

(C. B. REESE, Nucléosides Nucléotides, 1985, 4, 117-127; R. KIERZECK, M. H.(C. B. REESE, Nucleotide Nucleotides, 1985, 4, 117-127, R. KIERZECK, M. H.

CARUTHERS, C. E. LONGFELLOW, D. SWINTON, D. H. TURNIER et S. M.CARUTHERS, C. E. LONGFELLOW, D. SWINTON, D. H. TURNIER and S. M.

FREIER, Biochemistry, 1986, 25, 7840-7846; S. IWAI et E. OHTSUKA, Nucleic Acids
Res., 1988, 16, 9443-9456;
C. LEHMANN, Y. Z. XU, C. CHRISTODOULOU, Z. K. TAN et M. J. GAIT, Nucleic
Acids Res., 1989, 17, 2379-2390; T. TANAKA, S. TAMATSUKURI, et M. IKEHARA, NucleîcAcîdsRes., 1986, 14, 6265-6279.).
FREIER, Biochemistry, 1986, 25, 7840-7846; S. IWAI and E. OHTSUKA, Nucleic Acids
Res., 1988, 16, 9443-9456;
C. LEHMANN, YZ XU, C. CHRISTODOULOU, ZK TAN and MJ GAIT, Nucleic
Acids Res., 1989, 17, 2379-2390; T. TANAKA, S. TAMATSUKURI, and M. IKEHARA, Nucleic Acids R., 1986, 14, 6265-6279.).

L'utilisation de groupements protecteurs alkylsilyl et notamment le tert-butyldiméthylsilyl (TBDMS) pour l'hydroxyle en 2' a facilité la synthèse des oligoribonucléotides. Le groupement TBDMS est suffisament stable dans des conditions acides ou basiques et est facilement enlevé par le fluorure de tétra-butyl ammonium dans le THF pour être utilisé dans la stratégie en phase solide (N. USMAN, K. K. OGILVIE, M. Y. JIANG et R. L.The use of alkylsilyl protecting groups and in particular tert-butyldimethylsilyl (TBDMS) for the 2 'hydroxyl facilitated the synthesis of oligoribonucleotides. The TBDMS group is sufficiently stable under acidic or basic conditions and is easily removed by tetra-butyl ammonium fluoride in THF for use in solid phase strategy (N. USMAN, K. K. OGILVIE, M. Y. JIANG and R. L.

LEDERGEN, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 7845-7854; N. USMAN, K.LEDERGEN, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 7845-7854; N. USMAN, K.

NICOGHOSIAN, R. L. CEDERGREN et K. K. OGILVIE, Proc. Natl. Sci. USA, 1988, 85, 5764-5768.; S. A. SCARINGE, C. F. FRANCKLYN et N. USMAN, Nucleic Acids
Res., 1990, 18, 5433-5441.;K. K. OGILVIE et M. J. NEMER, Tétrahedron Lett., 1980, 21, 4159; R. T. PON et K. K. OGILVIE, Nucléosides Nucléotides, 1984, 3, 485; R. T.
NICOGHOSIAN, RL CEDERGREN and KK OGILVIE, Proc. Natl. Sci. USA, 1988, 85, 5764-5768; SA SCARINGE, CF FRANCKLYN and N. USMAN, Nucleic Acids
Res., 1990, 18, 5433-5441, KK O'GILVIE and MJ NEMER, Tetrahedron Lett., 1980, 21, 4159; RT PON and KK OGILVIE, Nucleotide Nucleotides, 1984, 3, 485; RT

PON et K. K. OGILVIE, Tétrahedron Lett., 1984, 25, 713.).PON and K. K. OGILVIE, Tetrahedron Lett., 1984, 25, 713.).

On a donc appliqué en série B oligothioribonucléotide le schéma de protection utilisé pour les nucléosides oxygénés (Schéma 8).Thus, the protection scheme used for the oxygenated nucleosides was applied in series B oligothioribonucleotide (Scheme 8).

A savoir les protections
- Benzoyl pour l'adénine et la cytosine, isoButyl pour la guanine en tant que protection des groupements amino exocycliques.
Namely the protections
Benzoyl for adenine and cytosine, isoButyl for guanine as protection for exocyclic amino groups.

- Diméthoxytrityl (DmTr) pour protéger les hydroxyles primaires en 5'. Dimethoxytrityl (DmTr) to protect the 5 'primary hydroxyls.

- tert-butyldiméthymsilyl (TBDMS) pour protéger l'hydroxyle secondaire en 2'. tert-butyldimethylsilyl (TBDMS) to protect the secondary hydroxyl in 2 '.

- Methoxy pour la protection des phosphates. - Methoxy for the protection of phosphates.

La première étape permet de protéger l'hydroxyle libre en 5' par un groupement acide labile le DmTr (Schéma 8).The first step makes it possible to protect the 5 'free hydroxyl with a labile acidic group DmTr (Scheme 8).

Ainsi le dérivé nucléosidique 22 est traité par le chlorure de diméthoxytrityle ( 1,27 équivalents molaires) dans la pyridine anhydre sous atmosphère inerte. Après traitement usuel du mélange réactionnel, le dérivé diméthoxytritylé 23 est purifié par chromatographie sur gel de silice et isolé avec des rendements variant de 70 à 80 %
Les caractéristiques physico-chimiques de ces dérivés 23 ( R.M.N., Masse) sont en accord avec les strutures proposées.

Figure img00300001
Thus, the nucleoside derivative 22 is treated with dimethoxytrityl chloride (1.27 molar equivalents) in anhydrous pyridine under an inert atmosphere. After customary treatment of the reaction mixture, the dimethoxytrityl derivative 23 is purified by chromatography on silica gel and isolated with yields ranging from 70 to 80%.
The physicochemical characteristics of these derivatives 23 (NMR, Mass) are in agreement with the proposed structures.
Figure img00300001

(i = DmTrCI, pyr. ii = TBDMSC1, pyr.)
Les abréviations ont les significations suivantes: a-B = T = Thymine b- B = U = Uracile.
(i = DmTrCI, pyr, ii = TBDMSC1, pyr.)
The abbreviations have the following meanings: aB = T = Thymine b- B = U = Uracil.

c- B = CBz = N-Benzoyl-4-Cytosine.c- B = CBz = N-Benzoyl-4-Cytosine.

d- B = ABz = N-Benzoyl-6-Adenine.d = B = ABz = N-Benzoyl-6-Adenine.

e- B = GPal = N-Palmitoyl-2-Guanine.e-B = GPal = N-Palmitoyl-2-guanine.

Dmtr = Diméthoxy-4,4'-trityl. iPr = Isopropyl. Bz = Benzoyl. TBDMS = tert butyldiméthylsilyl. (iPr)2P(Cl)OMe = Chloro, (N,N diisopropylamino,méthoxyphosphine) . . Dmtr = Dimethoxy-4,4'-trityl. iPr = Isopropyl. Bz = Benzoyl. TBDMS = tert butyldimethylsilyl. (iPr) 2 P (Cl) OMe = Chloro, (N, N diisopropylamino, methoxyphosphine). .

SCHEMA 8
La deuxième étape (Schéma 8) consiste en la protection de l'hydroxyle secondaire en 2'.
SCHEME 8
The second step (Scheme 8) consists of the protection of the secondary hydroxyl in 2 '.

Or, durant la silylation un mélange de 2'-O-silyl 24 et de son régioisomère 3'-O-silyl 25 est obtenu (K. K. OGILVIE et D. W. ENTWISTLE, Carbohyd. Res., 1981, 89, 203-210;
K. K. OGILVIE, A. L. SCHIFMAN et C. L. PENNEY, Can. J. Chem., 1979, 57, 2230;
G. H. HAKIMELAHI, Z. A. PROBA et K. K. OGILVIE, Can. J. Chem., 1982, 60, 1106.). Ces isomères doivent eAtre séparés avec beaucoup de soins sur colonne de gel de silice afin d'obtenir le dérivé 2'-O-TBDMS 24 avec une pureté supérieure à 99,95 % mesurée par CLPH.
During silylation, a mixture of 2'-O-silyl and its 3'-O-silyl regioisomer is obtained (KK OGILVIE and DW ENTWISTLE, Carbohyd Res., 1981, 89, 203-210;
KK OGILVIE, AL SCHIFMAN and CL PENNEY, Can. J. Chem., 1979, 57, 2230;
GH HAKIMELAHI, ZA PROBA and KK OGILVIE, Can. J. Chem., 1982, 60, 1106.). These isomers must be carefully separated on a silica gel column in order to obtain the 2'-O-TBDMS 24 derivative with a purity greater than 99.95% measured by HPLC.

En effet, si ce n'est pas le cas, les étapes ultérieures nous conduiront à des mélanges d'oligothionucléotide 5'-3' attendus avec l'isomère indésirable 5'-2'. Indeed, if this is not the case, the subsequent steps will lead us to the expected 5'-3 'oligothionucleotide mixtures with the undesirable 5'-2' isomer.

En conséquence, la pureté du 5'-O-DmTr-2'-O-silyl 24 est primordiale pour une bonne synthèse.Accordingly, the purity of 5'-O-DmTr-2'-O-silyl 24 is paramount for good synthesis.

Ainsi, l'obtention des composés 5'-DmTr-2'-O-TBDMS 24 a tout d'abord été réalisée selon la méthode d'OGILVIE et Coll. (K. K. OGILVIE, A. L. SCHIFMAN et C. L. PENNEY,
Can. J. Chem., 1979, 57, 2230.) qui consiste à condenser 23 avec du chlorure de tert butyldiméthylsilyle (TBDMSC1) (1,2 equivalent molaire) dans la pyridine en présence d'imidazole (2,6 equivalents molaires). En fin de réaction, on obtient un mélange de dérivé 2'-O-TBDMS 24 et de son isomère 3'-O-TBDMS 25. Le composé attendu 24 est séparé du mélange par chromatographie sur colonne de gel de silice.
Thus, obtaining compounds 5'-DmTr-2'-O-TBDMS 24 was first performed according to the method of OGILVIE et al. (KK OGILVIE, AL SCHIFMAN and CL PENNEY,
Can. J. Chem., 1979, 57, 2230.) which consists in condensing 23 with tert-butyldimethylsilyl chloride (TBDMSC1) (1.2 molar equivalent) in pyridine in the presence of imidazole (2.6 molar equivalents). At the end of the reaction, a mixture of derivative 2'-O-TBDMS 24 and its isomer 3'-O-TBDMS 25 is obtained. The expected compound 24 is separated from the mixture by chromatography on a column of silica gel.

Il est ensuite possible par une réaction d'équilibration d'obtenir 24 à partir de son isomère 3'-O-TBDMS 25 (S. S. JONES et C. B. REESE, J. Chem. Soc. Perkin Trans I, 1979, 2762.). Cette migration du groupement TBDMS est intramoléculaire et s'effectue via un intermédiaire possédant un atome de silicium pentavalent. L'isomérisation du dérivé 3'-O
TBDMS obtenu précédemment aprés une première séparation chromatographique est effectuée dans l'éthanol à température ambiante pendant une nuit. Les deux isomères de position ainsi obtenus sont à nouveau séparés par chromatographie sur colonne de gel de silice. Cette opération d'isomérisation suivie d'une purification est répétée trois fois.
It is then possible, by an equilibration reaction, to obtain 24 from its 3'-O-TBDMS isomer (SS JONES and CB REESE, J. Chem Soc., Perkin Trans I, 1979, 2762.). This migration of the TBDMS group is intramolecular and is carried out via an intermediate having a pentavalent silicon atom. Isomerization of the 3'-O derivative
TBDMS obtained previously after a first chromatographic separation is carried out in ethanol at room temperature overnight. The two position isomers thus obtained are again separated by silica gel column chromatography. This isomerization operation followed by purification is repeated three times.

Cependant les rendements en 5'-DmTr-2'-O-TBDMS 24 obtenus par cette méthode (40 à 50 % selon les bases) ne nous ont pas paru satisfaisants. Nous en avons utilisé une autre, plus récente, mise au point par OGILVIE ( G. H. HAKIMELAHI, Z. A. PROBA et K. K.However the yields of 5'-DmTr-2'-O-TBDMS 24 obtained by this method (40 to 50% depending on the bases) did not seem satisfactory to us. We used another, more recent, developed by OGILVIE (G. H. HAKIMELAHI, Z. A. PROBA and K. K.

OGILVIE, Can. J. Chem., 1982, 60, 1106.) qui permet l'introduction préférentielle du
TBDMS en position 2' des ribonucléosides B. Cette technique préconise l'utilisation de sels d'argents.
OGILVIE, Can. J. Chem., 1982, 60, 1106) which allows the preferential introduction of the
TBDMS at the 2 'position of ribonucleosides B. This technique recommends the use of silver salts.

Ainsi le 5'-diméthoxytrityl 23 est condensé avec du chlorure de TBDMS (1,3 équivalents molaires) en présence de nitrate d'argent (1,2 équivaIent molaires) et de 3,7 équivalents de pyridine dans le THF anhydre. Après purification par chromatographie sur colonne de gel de silice on obtient 56 % de rendement en 24 et 27 % en 5'-DmTr-3'-O-TBDMS 25.Thus, 5'-dimethoxytrityl 23 is condensed with TBDMS chloride (1.3 molar equivalents) in the presence of silver nitrate (1.2 molar equivalents) and 3.7 equivalents of pyridine in anhydrous THF. After purification by chromatography on a silica gel column, 56% yield is obtained at 24 and 27% at 5'-DmTr-3'-O-TBDMS 25.

En conséquence, le 5'-DmTr-2'-O-TBDMS 24 est obtenu dans ces nouvelles conditions en une seule étape avec un meilleur rendement, mais la sélectivité d'introduction du groupement TBDMS en 2' n'est pas améliorée.As a result, 5'-DmTr-2'-O-TBDMS 24 is obtained under these new conditions in a single step with a better yield, but the selectivity of introduction of the 2 'TBDMS group is not improved.

II.1.2 Synthèse des dérivés phosphoramidites 26 a-d (Schéma 9)
Les quatre B thioribonucléosides phosphoramidites N-protégés 26a-d sont ensuite obtenus à partir des 5'-DmTr-2'-O-TBDMS B thioribonucléosides N-protégés correspondants 24 (Schéma 9).
II.1.2 Synthesis of the Phosphoramidite Derivatives 26 ad (Scheme 9)
The N-protected four N-protected phosphoribonucleosides 26a-d are then obtained from the corresponding N-protected 5'-DmTr-2'-O-TBDMS B thioribonucleosides 24 (Scheme 9).

Le dérivé nucléosidique 24 a été traité par du chloro N, N diisopropylamino méthoxy phosphine ( 2,5 équivalents molaires) en présence de N,N,N diisopropyl éthylamine (DIEA) dans le dichlorométhane sous atmosphère inerte. Le dérivé phosphoramidite 26 a été purifié par chromatographie sur gel de silice et lyophilisé dans le benzène, les phosphoramidites 26 a-d sont obtenus avec des rendements variant de 78 à 80 % selon la nature de la base.

Figure img00320001
The nucleoside derivative 24 was treated with chloro N, N diisopropylamino methoxy phosphine (2.5 molar equivalents) in the presence of N, N, N diisopropyl ethylamine (DIEA) in dichloromethane under an inert atmosphere. The phosphoramidite derivative 26 was purified by chromatography on silica gel and lyophilized in benzene, the phosphoramidites 26 ad are obtained with yields ranging from 78 to 80% depending on the nature of the base.
Figure img00320001

i = (iPr)2P(Cl)OMe, DIEA, DMAP, cH2C12)
SCHEMA 9
Les analyses des spectres de RMN du 31p et du 1H de 26 montrent clairement que nous obtenons une seule paire de diastéréoisomères ce qui établit la pureté régioisomèrique des composés obtenus.
i = (iPr) 2P (Cl) OMe, DIEA, DMAP, cH2Cl2)
SCHEME 9
Analyzes of the 31p and 1H NMR spectra of 26 clearly show that we obtain a single pair of diastereoisomers which establishes the regioisomeric purity of the compounds obtained.

En effet, quelques auteurs (R. KIERZEK, M. H. CARUTHERS, C. E. LONGFELLOW,
D. SWINION, D. H. TURNER et S. M. FREIER, Biochemistry, 1986, 25, 7840-7846.) avaient émis l'hypothèse que les groupements silylés en position 2' n'étaient pas stables dans les conditions de la phosphorylation. Cependant, il a été montré (W. K. KOHLER,
W. SCHLOSSERM, G. CHARUBALA et W. PFLEIDLERER, Chemistry and Biology of
Nucléosides and Nucléotides, Academic Press, New York, 1978, pp 347-358; K. K.
Indeed, some authors (R. KIERZEK, MH CARUTHERS, CE LONGFELLOW,
D. SWINION, DH TURNER and SM FREIER, Biochemistry, 1986, 25, 7840-7846.) Had hypothesized that silyl groups at the 2 'position were not stable under the conditions of phosphorylation. However, it has been shown (WK KOHLER,
W. SCHLOSSERM, G. CHARUBALA and W. PFLEIDLERER, Chemistry and Biology of
Nucleosides and Nucleotides, Academic Press, New York, 1978, pp 347-358; KK

OGILVIE et D. W. ENTWISTLE, Carbohydrate Res., 1981, 89, 203-210; N. USMAN,
K. K. OGILVIE, M. Y. JIANG et R. J. CEDERGREN, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 7845-7854.) que les groupes aLkylsilyles migrent dans les solvants protiques comme le méthanol ou dans les solutions aqueuses comme le mélange pyridine/eau, mais ces groupements silylés sont stables dans les solvants anhydres et notamment dans les bases non protiques comme la pyridine anhydre (K. K. OGILVIE, D. W. ENTWISTLE,
Carbohydrate Res., 1981, 89, 203-210; W. KOHLER, W. SCHLOSSER, G.
OGILVIE and DW ENTWISTLE, Carbohydrate Res., 1981, 89, 203-210; N. USMAN,
KK OGILVIE, MY JIANG and RJ CEDERGREN, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 7845-7854.) That alkylsilyl groups migrate in protic solvents such as methanol or in aqueous solutions such as pyridine / water mixture, but these silyl groups are stable in anhydrous solvents and especially in non-protic bases such as anhydrous pyridine (KK OGILVIE, DW ENTWISTLE,
Carbohydrate Res., 1981, 89, 203-210; W. KOHLER, W. SCHLOSSER, G.

CHARUBALA et W. PFLEIDERER, Chemistry and Biology of Nucleosides and Nucleotîdes, Academic Press, New York, 1978, pp 347-358.). D'autre part, il a été clairement démontré en série ribonucléotide que l'utilisation des 2'-O-silyl ribonucléosides dans la synthèse d'oligoribonucléotides conduit exclusivement à des liaisons 5'-3' (K. K. CHARUBALA and W. PFLEIDERER, Chemistry and Biology of Nucleosides and Nucleotides, Academic Press, New York, 1978, pp 347-358.). On the other hand, it has been clearly demonstrated in ribonucleotide series that the use of 2'-O-silyl ribonucleosides in the synthesis of oligoribonucleotides leads exclusively to 5'-3 'bonds (K.K.

OGILVIE, M. J. NEMER, Tetrahedron Lett., 1980, 21, 4159; R. T. PON et K. K.OGILVIE, M.J. NEMER, Tetrahedron Lett., 1980, 21, 4159; R. T. PON and K. K.

OGILVIE, Tetrahedron Lett., 1984, 25, 713; R. T. PON, et K. OGILVIE, Tetrahedron Lett., 1984, 25, 713; R. T. PON, and K.

K. OGILVIE, Nucleosides Nucleotides, 1984, 3, 485;P. J. GAREGG, I. LINDH, I. K. OGILVIE, Nucleoside Nucleotides, 1984, 3, 485; J. GAREGG, I. LINDH, I.

STAWINSKI, et R. STROMBERG, Tetrahedron Lett., 1986, 27, 4055-4058). La synthèse de phosphoramidites n'est pas stéréospécifique et la formation en quantités égales des deux diastéréoisomères est due à la chiralité de l'atome de phosphore de configuration R ou S. La formation de ces deux produits n'est pas génante dans la mesure où les réactions d'oxydation ultérieures suppriment cette chiralité.STAWINSKI, and R. STROMBERG, Tetrahedron Lett., 1986, 27, 4055-4058). The synthesis of phosphoramidites is not stereospecific and the formation in equal amounts of the two diastereoisomers is due to the chirality of the phosphorus atom of R or S configuration. The formation of these two products is not annoying insofar as subsequent oxidation reactions suppress this chirality.

II.2. PARTIE EXPERIMENTALE
Méthode générale pour la préparation des 5'-O-diméthoxytrityl N-acyl 4'-thio-B-Dribonucléosides 23a-d.
II.2. EXPERIMENTAL PART
General Method for the Preparation of 5'-O-Dimethoxytrityl N-acyl 4'-thio-B-Dribonucleosides 23a-d.

A une solution de N-acyl B-D-thioribonucMoside 23 a-d (immole) dans la pyridine anhydre (5.6ml) est ajouté du chlorure de diméthoxytrityle (1.27mmole, 430mg). Le mélange réactionnel est agité à température ambiante sous atmosphère inerte pendant 90 à 120 min puis du méthanol (lml) est ajouté. Après 10 minutes d'agitation supplémentaire, le mélange réactionnel est versé sur une solution aqueuse saturée de bicarbonate de sodium (25ml) et les produits sont extraits avec du dichlorométhane (2 x 20ml). Les phases organiques sont lavées avec de l'eau (2 x 100ml) puis séchées sur sulfate de sodium et filtrées. Le filtrat est évaporé sous pression réduite et le résidu obtenu est chromatographié sur une colonne de gel de silice.L'élution est effectuée avec un mélange CH2Cl2/MeOH: 98/2 en présence de triéthylamine 1 %; les fractions contenant le produit sont évaporées à sec et les nucléosides 23 a-d sont obtenus sous forme d'une huile.To a solution of N-acyl B-D-thioribonucleoside 23 a-d (immolate) in anhydrous pyridine (5.6 ml) is added dimethoxytrityl chloride (1.27 mmol, 430 mg). The reaction mixture is stirred at ambient temperature under an inert atmosphere for 90 to 120 min and then methanol (1 ml) is added. After stirring for a further 10 minutes, the reaction mixture is poured into a saturated aqueous solution of sodium bicarbonate (25 ml) and the products are extracted with dichloromethane (2 × 20 ml). The organic phases are washed with water (2 × 100 ml) and then dried over sodium sulphate and filtered. The filtrate is evaporated off under reduced pressure and the residue obtained is chromatographed on a column of silica gel. The elution is carried out with a CH 2 Cl 2 / MeOH: 98/2 mixture in the presence of 1% triethylamine; the fractions containing the product are evaporated to dryness and the nucleosides 23 a-d are obtained in the form of an oil.

1-[4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]Thymine 23 a
Rendement: 68 %.
1- [4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl] Thymine 23a
Yield: 68%.

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z = 577 [M+H]+, 303 [DmTr]+
RMN 1H (DMSOd6, 360MHz) 6 11,24, (s, 1 H, NH); 7,44, ( s, 1 H, H6); 6,87-7,30, ( m, 13 H, H Aromatiques); 5,83, (d, 1 H, H1, J1,2' = 7,0); 5,53, (d, 1 H, OH2#, JOH,2' = 5,8); 5,30, (d, 1 H, OH3', JOH,3' = 4,7); 4,14, (dd, 1 H, H2, J2',1 = 6,9, J2',3' = 3,0); 4,00, (t, 1 H, H3, J3',2' = 3,0, J3',4' = 3,0); 3,69, ( s, 6 H, OMe); 3,30, (dd, 1H, H4'); 3,13, (m, 2 H, H5', H5"); 1,60, (s, 3 H, CH3).
FAB mass spectrometry> 0 NOBA m / z = 577 [M + H] +, 303 [DmTr] +
1H NMR (DMSOd6, 360MHz) δ 11.24, (s, 1H, NH); 7.44, (s, 1H, H6); 6.87-7.30, (m, 13H, H aromatics); 5.83, (d, 1H, H1, J1.2 '= 7.0); 5.53, (d, 1 H, OH 2,, JOH, 2 '= 5.8); 5.30, (d, 1H, OH3 ', JOH, 3' = 4.7); 4.14, (dd, 1H, H2, J2 ', 1 = 6.9, J2', 3 '= 3.0); 4.00, (t, 1H, H3, J3 ', 2' = 3.0, J3 ', 4' = 3.0); 3.69, (s, 6H, OMe); 3.30, (dd, 1H, H4 '); 3.13, (m, 2H, H 5, H 5 -); 1.60, (s, 3H, CH 3).

1-[4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]Uracile 23 b.1- [4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl] Uracil 23 b.

Rendement 70%.Yield 70%.

RMN 1H (DMSOd6, 360 MHz) 6 11.31, (s, 1 H, NH); 7.70, (d, 1 H, H6, J6,5 = 8.0), 7.40-6.89, (m, 13 H, H aromatiques du groupement dmTr); 5.84, (d, 1 H, H1,, J1',2' = 5.7), 5.53, (d, 1 H, OH2', JOH2',2'= 5.6), 5.48, (d, 1 H, Hs, J5,6 = 8.0); 5.26, (d, 1 H,
OH3', JOH3',3' = 4.45); 4.02, (m, 2 H, H2, H3'); 3.74, (s, 6 H, OMe); 3.31, (m, 3 H,
H4', H5', H5").
1H NMR (DMSOd6, 360 MHz) δ 11.31, (s, 1H, NH); 7.70, (d, 1H, H6, J6.5 = 8.0), 7.40-6.89, (m, 13H, aromatic H of the dmTr group); 5.84, (d, 1H, H1, J1 ', 2' = 5.7), 5.53, (d, 1H, OH2 ', JOH2', 2 '= 5.6), 5.48, (d, 1H, Hs, J5.6 = 8.0); 5.26, (d, 1H,
OH3 ', JOH3', 3 '= 4.45); 4.02, (m, 2H, H2, H3 '); 3.74, (s, 6H, OMe); 3.31, (m, 3H,
H4 ', H5', H5 ").

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z = 563 [M+HJ +, 303 [DmTr]+ 1-[4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]N-4-benzoylCytosine 23 c
Rendement 69 %.
Mass spectrometry FAB> 0 NOBA m / z = 563 [M + H] +, 303 [DmTr] + 1- [4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl] N-4-benzoylCytosine 23 c
Yield 69%.

RMN 1H (DMSOd6, 250 MHz) S 11.32, (s, 1H, NH); 8.40, (d, 1H, H6, J6,5 = 7.5); 8.01, (d, 2H, Ho du groupement benzoyle); 7.63, (d, 1H, Hs, J5,6 = 7.3); 7.44, (m, 17H,
H aromatiques du groupement DmTr et Hm,p du groupement benzoyle); 5.88,(d, 1H, H1',
J1',2' = 4.1); 5.73, (d, 1H, OH2', JOH,2' = 5.2); 5.27,(d, 1H, OH3s, JOH,H3' = 5.7); 4.06, (m, H2', J2',1' = 4.0, J2',3' = 3.7, J2',OH = 5.2); 4.03, (m, H3', J3',2' = 3.7, J = 5.3, J3',OH = 5.7); 3.76,(s, 6H, OCH3 du groupement DmTr); 3.43,(m, 3H,
H4', H5' et H5").
1H NMR (DMSOd6, 250 MHz) S 11.32, (s, 1H, NH); 8.40, (d, 1H, H6, J6.5 = 7.5); 8.01, (d, 2H, Ho of the benzoyl group); 7.63, (d, 1H, Hs, J5.6 = 7.3); 7.44, (m, 17H,
Aromatic H of the group DmTr and Hm, p of the benzoyl group); 5.88, (d, 1H, H1 ',
J1 ', 2' = 4.1); 5.73, (d, 1H, OH2 ', JOH, 2' = 5.2); 5.27, (d, 1H, OH3s, OJH, H3 '= 5.7); 4.06, (m, H 2 ', J 2', 1 '= 4.0, J 2', 3 '= 3.7, J 2', OH = 5.2); 4.03, (m, H3 ', J3', 2 '= 3.7, J = 5.3, J3', OH = 5.7); 3.76, (s, 6H, OCH 3 from the DmTr group); 3.43, (m, 3H,
H4 ', H5' and H5 ").

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z = 666 [M+HJ+, 517 [M+H-#CONH2]+, 303 [DmTrj+ 1-[4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]N6-benzoylAdénine 23 d
Rendement 70 %
RMN 1H (DMSOd6, 250 MHz) S 11.25,( s, 1H, NH); 8.63, (s, 1H, H8); 8.57, (s, 1H,
H2); 8.04, (d, 2H, Ho du groupement benzoyle); 7.51, (m, 13H, H aromatiques du groupement DmTr); 6.92, (d, 3H, Hm,p du groupement benzoyle); 5.98, (d, 1H, H1R, J1,,2, = 5 8); 5.75, (d, 1H, OH2', JOH,2' = 3.5); 5.45, (d, 1H, OH3', JOH,3' = 2.5); 4.70, (m, 1H, H2'); 4.26, (m, 1H, H3'); 3.74,( s, 6H, OCH3 du groupement DmTr); 3.53, (m, 3H, H4, H5 et H5").
Mass spectrometry FAB> 0 NOBA m / z = 666 [M + H + +, 517 [M + H-CONH]] +, 303 [DmTrj + 1- [4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D- ribofuranosyl] N6-benzoylAdenine 23 d
Yield 70%
1H NMR (DMSOd6, 250 MHz) δ 11.25, (s, 1H, NH); 8.63, (s, 1H, H8); 8.57, (s, 1H,
H2); 8.04, (d, 2H, Ho of the benzoyl group); 7.51, (m, 13H, aromatic H of the DmTr group); 6.92, (d, 3H, Hm, p of the benzoyl group); 5.98, (d, 1H, H1R, J1, 2, = 58); 5.75, (d, 1H, OH 2 ', JOH, 2' = 3.5); 5.45, (d, 1H, OH3 ', JOH, 3' = 2.5); 4.70, (m, 1H, H2 '); 4.26, (m, 1H, H3 '); 3.74, (s, 6H, OCH3 from the DmTr group); 3.53, (m, 3H, H4, H5 and H5 -).

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z = 690 [M+H]+, 303 [DmTrj+
Méthode générale pour la préparation des 2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-4'-thio-5'-O- diméthoxytrityl-N-acyl-ss-D-ribonucléosides 24 a-e et de leur isomère 3 '-TBDMS 25 a-e.
FAB mass spectrometry> 0 NOBA m / z = 690 [M + H] +, 303 [DmTrj +
General method for the preparation of 2'-O-tert-butyldimethylsilyl-4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-N-acyl-ss-D-ribonucleosides 24 ae and their isomer 3 '-TBDMS 25 ae.

A une solution de 5'-O-diméthoxytrityl 4'-thio N-acyl B-D-ribonucléoside 23a-d (immole) dans le 'I'HF anhydre (lOml) est ajouté du nitrate d'argent (1.2mmole, 203mg). Le mélange réactionnel est alors agité 5 minutes à température ambiante avant l'addition du chlorure de tert-butyldiméthylsilyle (TBDMSCI, 1.3mmole, 195mg) et de la pyridine anhydre (3.7mmole, 0.193ml). L'agitation à température ambiante est alors prolongée pendant 24 h, puis la solution hétérogène est filtrée avant d'être versée dans une solution aqueuse de bicarbonate de sodium à 5% (30ml). Les produits sont extraits avec du dichlorométhane (3x20ml) et les phases organiques sont lavées avec de l'eau puis séchées sur sulfate de sodium et filtrées.Le filtrat est évaporé à sec et le résidu est chromatographié sur une colonne de gel de silice en utilisant comme éluant un mélange de CH2Cl2/AcOEt: 95/5 puis de CH2Cl2/AcOEt:80/20 . Les fractions contenant le produit désiré (2'-O-TBDMS, 24 m)a- sont regroupées et évaporées à sec. L'isomère 3'-O-TBDMS 25 a-d est ensuite obtenu.To a solution of 5'-O-dimethoxytrityl 4'-thio N-acyl B-D-ribonucleoside 23a-d (immolate) in anhydrous HF (10 ml) is added silver nitrate (1.2 mmol, 203 mg). The reaction mixture is then stirred for 5 minutes at room temperature before the addition of tert-butyldimethylsilyl chloride (TBDMSCI, 1.3 mmol, 195 mg) and anhydrous pyridine (3.7 mmol, 0.193 ml). The stirring at room temperature is then prolonged for 24 h, then the heterogeneous solution is filtered before being poured into a 5% aqueous solution of sodium bicarbonate (30 ml). The products are extracted with dichloromethane (3 × 20 ml) and the organic phases are washed with water then dried over sodium sulphate and filtered. The filtrate is evaporated to dryness and the residue is chromatographed on a column of silica gel using as eluent a mixture of CH2Cl2 / AcOEt: 95/5 then of CH2Cl2 / AcOEt: 80/20. The fractions containing the desired product (2'-O-TBDMS, 24 m) are combined and evaporated to dryness. The 3'-O-TBDMS isomer α-d is then obtained.

1-[2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]
Thymine 24 a.
1- [2'-O-tert-butyldimethylsilyl-4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl]
Thymine 24a.

Rendement: 33 %.Yield: 33%.

Spectrométrie de masse FAB > O NOBA m/z = 691 [M+Hj+, 713 lM+Na]+. FAB mass spectrometry> O NOBA m / z = 691 [M + H + +, 713 1M + Na] +.

RMN 1H (DMSOd6, 300MHz): # 11,36, (s, 1 H, NH); 7,58, (s, 1 H, H6); 7,33-6,90, ( m, 13 H, H Aromatiques); 5,89, (s, 1 H, H1,, J1',2' = 6,1); 5,27, (m, 1 H, OH3'); 4,20, (dd, 1 H, H2', J2#,1# = = 6,10, J2',3' = 3,5); 3,97, (m, 1 H, H3'); 3,73, ( s, 6 H, OMe); 3,36, ( m, 1 H, H4'); 3,25, ( m, 2 H, H5', H5"); 1,58, ( s, 3 H, CH3); 0,81, ( s, 9 H, tert-butyl); 0,0, (d, 6 H, Me2Si).1H NMR (DMSOd6, 300MHz): # 11.36, (s, 1H, NH); 7.58, (s, 1H, H6); 7.33-6.90, (m, 13H, H aromatics); 5.89, (s, 1H, H1, J1 ', 2' = 6.1); 5.27, (m, 1H, OH3 '); 4.20, (dd, 1H, H2 ', J2 #, 1 # = = 6.10, J2', 3 '= 3.5); 3.97, (m, 1H, H3 '); 3.73, (s, 6H, OMe); 3.36, (m, 1H, H4 '); 3.25, (m, 2H, H5 ', H5-); 1.58, (s, 3H, CH3); 0.81, (s, 9H, tert-butyl); d, 6H, Me 2 Si).

1-[2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]
Uracile 24 b.
1- [2'-O-tert-butyldimethylsilyl-4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl]
Uracil 24 b.

Rendement 56% .Yield 56%.

Tf = 114 C.Tf = 114 C.

RMN 1H (DMSOd6, 360 MHz): S 11.20, (s, 1 H, NH); 7.81, (d, 1 H , H6, J6,5 = 8.1); 7.30-6.89, (m, 13 H, H aromatiques du groupement dmTr) 5.84, (d, 1 H, H1,, J1',2# = 5.5); 5.50, (d, 1 H, Hs, J5,6 = 8.1); 5.23, (d, 1 H, OH3', JOH3',3' =4,7); 4.11, (q, 1H,
H2', J2 = 5.5, J2,,3' = 3.5); 3.95, (m, 1 H, H3'); 3.74, (s, 6 H, OMe); 3.38, (m, 2 H, H4, H5' J4, 5, = 3.28, (m, 1 H, H5"); 0.82, (s, 9 H, tert-butyl); 0.05, (m, 6 H, Me2Si).
1H NMR (DMSOd6, 360 MHz): δ 11.20 (s, 1H, NH); 7.81, (d, 1H, H6, J6.5 = 8.1); 7.30-6.89, (m, 13 H, aromatic H of the group dmTr) 5.84, (d, 1H, H1, J1 ', 2 # = 5.5); 5.50, (d, 1H, Hs, J5.6 = 8.1); 5.23, (d, 1H, OH3 ', JOH3', 3 '= 4.7); 4.11, (q, 1H,
H2 ', J2 = 5.5, J2,, 3' = 3.5); 3.95, (m, 1H, H3 '); 3.74, (s, 6H, OMe); 3.38, (m, 2H, H4, H5, J4, 5, = 3.28, (m, 1H, H5-); 0.82, (s, 9H, tert-butyl); 0.05, (m, 6H, 2 Si).

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z = 677 [M+H]+, 619 [M+H-tert-butane]+, 303 [dmTr]+ 1-[2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]
N4-benzoylCytosine 24c.
Mass spectrometry FAB> NOBA m / z = 677 [M + H] +, 619 [M + H-tert-butane] +, 303 [dmTr] + 1- [2'-O-tert-butyldimethylsilyl-4 'thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl]
N4-BenzoylCytosine 24c.

Rendement 32%.Yield 32%.

RMN 1H (DMSOd6, 250 MHz): # 11.31, (s, 1H, NH); 8.51, (d, 1H, H6, J6,5 = 7.3); 8.01, (d, 2H, Ho du groupement benzoyle); 7.51, (m, 14H, H aromatiques du groupement
DmTr et H5); 6.93,( d, 3H, Hm,p du groupement benzoyle); 5.93,(d, 1H, H1,, J1',2' = 3.0); 5.20,(d, 1H, OH3', JOH,H3' = 5.0); 4.14,(m, 1H, H2'); 4.00,(m, 1H, H3'); 3.76,(s, 6H, OCH3 du groupement DmTr); 3.38,(m, 3H, H4', H5' et H5"); 0.86, (s, 9H, tertbutyl); 0.60, (d, 6H, Me2Si).
1H NMR (DMSOd6, 250 MHz): # 11.31, (s, 1H, NH); 8.51, (d, 1H, H6, J6.5 = 7.3); 8.01, (d, 2H, Ho of the benzoyl group); 7.51, (m, 14H, aromatic H of the group
DmTr and H5); 6.93, (d, 3H, Hm, p of the benzoyl group); 5.93, (d, 1H, H1, J1 ', 2' = 3.0); 5.20, (d, 1H, OH3 ', OJH, H3' = 5.0); 4.14, (m, 1H, H2 '); 4.00, (m, 1H, H3 '); 3.76, (s, 6H, OCH 3 from the DmTr group); 3.38, (m, 3H, H4 ', H5' and H5 "), 0.86, (s, 9H, tert-butyl), 0.60, (d, 6H, Me2Si).

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z 780 [M+Hl+, 303 [DmTr]+ 1-[2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]
N6-benzoylAdénine 24 d.
Mass spectrometry FAB> 0 NOBA m / z 780 [M + H + +, 303 [DmTr] + 1- [2'-O-tert-butyldimethylsilyl-4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl] ]
N6-benzoylAdenine 24 d.

Rendement 35 %
RMN 1H (DMSOd6, 250 MHz): 6 11.25,( s, 1H, NH); 8.64, (s, 1H, H8); 8.61, (s, 1H,
H2); 8.04, (d, 2H, Ho du groupement benzoyle); 7.51, (m, 13H, H aromatiques du groupement DmTr); 6.95, (d, 3H, Hm,p du groupement benzoyle); 6.01, (d, 1H, H1X,
J1',2' = 5.8); 5.48, (d, 1H, OH3', JOH,3' = 2.5); 4.70, (m, 1H, H2'); 4.26, (m, 1H, H3'); 3.75,( s, 6H, OCH3 du groupement DmTr); 3.53, (m, 3H, H4',H5' et H5"); 0.82, (s, 9H, tert-butyl); 0.50, (d, 6H, Me2Si).
Yield 35%
1H NMR (DMSOd6, 250 MHz): δ 11.25, (s, 1H, NH); 8.64, (s, 1H, H8); 8.61, (s, 1H,
H2); 8.04, (d, 2H, Ho of the benzoyl group); 7.51, (m, 13H, aromatic H of the DmTr group); 6.95, (d, 3H, Hm, p of the benzoyl group); 6.01, (d, 1H, H1X,
J1 ', 2' = 5.8); 5.48, (d, 1H, OH3 ', JOH, 3' = 2.5); 4.70, (m, 1H, H2 '); 4.26, (m, 1H, H3 '); 3.75, (s, 6H, OCH 3 from the DmTr group); 3.53, (m, 3H, H4 ', H5' and H5-), 0.82, (s, 9H, tert-butyl), 0.50, (d, 6H, Me2Si).

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z 804 [M+HJ+, 303 [M+H]+ 1-[2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]
Thymine 25 a.
Mass spectrometry FAB> 0 NOBA m / z 804 [M + H] +, 303 [M + H] + 1- [2'-O-tert-butyldimethylsilyl-4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D] -ribofurannosyl]
Thymine a.

Rendement 13 %. Yield 13%.

RMN 1H (DMSOd6, 360 MHz): S 11.34, (s, 1H; NH); 7.46, (s, 1H, H6); 7.89-7.30, (m, 13H, H aromatiques); 5.87,(d, 1H, H1f, J1',2' = 7.8); 5.46, (d, 1H, OH2', JOH,2' = 5.1); 4.13, (m, 1H, H3'); 4.11,(m, 1H, H2', J2',1' = 7.8, 8, JOH,2# = 5.1); 3.73, (s, 6H, OMe); 1.66, (s, 3H, CH3); 0.84,(s, 9H, ten-butyl); 0,50,(d, 6H, Me2Si).1H NMR (DMSOd6, 360 MHz): S, 11.34, (s, 1H, NH); 7.46, (s, 1H, H6); 7.89-7.30, (m, 13H, aromatic H); 5.87, (d, 1H, Hf, J1 ', 2' = 7.8); 5.46, (d, 1H, OH2 ', JOH, 2' = 5.1); 4.13, (m, 1H, H3 '); 4.11, (m, 1H, H2 ', J2', 1 '= 7.8, 8, OJH, 2 # = 5.1); 3.73, (s, 6H, OMe); 1.66, (s, 3H, CH3); 0.84, (s, 9H, ten-butyl); 0.50, (d, 6H, Me 2 Si).

1-[3'-O-tert-butyldiméthylsilyl-4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]
Uracile 25 b.
1- [3'-O-tert-butyldimethylsilyl-4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl]
Uracil 25 b.

Rendement 27%
Tf = 109C.
Yield 27%
Tf = 109C.

RMN 1H (DMSOd6, 360 MHz): S 11.30,(s, 1 H, NH); 7.70, (d, 1 H, H6, J6,5 = 8.0); 7.30-6.89, (13 H, H aromatiques du groupe-ment dmTr); 5.84, (d, 1 H, H1', J1',2' = 7.3); 5.57, (d, 1 H, H5, J5,6 = 8.0); 5.46, (d, I H, OH2s, JOH2',2' = 5.1); 4.12, (t, 1 H, H3, J3',2, = 3.1, J3',4' = 3.1); 4.03, (m, 1 H, H2'); 3.74, (s, 6 H, OMe); 3.41, (m, 1 H, H4'); 3.21, (m, 2 H, H5', H5"); 0.08, (s, 9 H, tert-butyl); 0.02, (m, 6 H, Me2Si).1 H NMR (DMSOd6, 360 MHz): δ 11.30, (s, 1H, NH); 7.70, (d, 1H, H6, J6.5 = 8.0); 7.30-6.89, (13 H, aromatic H group-ment dmTr); 5.84, (d, 1H, H1 ', J1', 2 '= 7.3); 5.57, (d, 1H, H5, J5.6 = 8.0); 5.46, (d, I H, OH 2s, JOH 2 ', 2' = 5.1); 4.12, (t, 1H, H3, J3 ', 2, = 3.1, J3', 4 '= 3.1); 4.03, (m, 1H, H2 '); 3.74, (s, 6H, OMe); 3.41, (m, 1H, H4 '); 3.21, (m, 2H, H5 ', H5-); 0.08, (s, 9H, tert-butyl), 0.02, (m, 6H, Me2Si).

Spectrométrie de masse FAB > O NOBA m/z 677 [M+HJ+, 619 [M+H-tert-butanej+, 303 [dmTr]+.FAB mass spectrometry> O NOBA m / z 677 [M + H +, 619 [M + H-tert-butane] +, 303 [dmTr] +.

Ce composé a été mis en présence avec une solution éthanol/triéthylamine 0.25% (v/v) pendant une 12 h à température ambiante pour donner en proportion égale un mélange 24 b et 25 b.This compound was brought into contact with a 0.25% ethanol / triethylamine (v / v) solution for 12 hours at room temperature to give an equal proportion of a mixture 24b and 25b.

1-[3'-O-tert-butyldiméthylsilyl-4'-thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]
N4-benzoyl Cytosine 25 c.
1- [3'-O-tert-butyldimethylsilyl-4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl]
N4-benzoyl Cytosine 25 c.

Rendement 31 %.Yield 31%.

RMN 1H (DMSOd6, 250 MHz): s 11.33, (s, 1H, NH); 8.40, (d, 1H, H6, J6 s = 7.4); 8.01, (d, 2H, Ho du groupement benzoyle); 7.60, (m, 14H, H aromatiques du groupement
DmTr et Hs); 6.92, ( d, 3H, Hm,p du groupement benzoyle); 5.92,(d, 1H, H1s, J1',2' = 5.3); 5.60,(d, 1H, OH2', JOH,2' = 5.0); 4.15, (m, 2H, H2', H3'); 3.75, (s, 6H, OCH3 du groupement DmTr); 3.38,(m, 3H, H4, HsXet H5"); 0.79, (s, 9H, tert-butyl); 0.00, (d, 6H,
Me2Si).
1H NMR (DMSOd6, 250 MHz): δ 11.33, (s, 1H, NH); 8.40, (d, 1H, H6, J6 s = 7.4); 8.01, (d, 2H, Ho of the benzoyl group); 7.60, (m, 14H, aromatic H of the group
DmTr and Hs); 6.92, (d, 3H, Hm, p of the benzoyl group); 5.92, (d, 1H, H 21, J ', 2' = 5.3); 5.60, (d, 1H, OH2 ', JOH, 2' = 5.0); 4.15, (m, 2H, H2 ', H3'); 3.75, (s, 6H, OCH 3 from the DmTr group); 3.38, (m, 3H, H4, HsX and H5-); 0.79, (s, 9H, tert-butyl); 0.00, (d, 6H,
2 Si).

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z 780 [M+H]+, 303 [DmTrj+ 1-C3' -O-terr-butyldiméthylsilyl-4 '-thio-5' -O-diméthoxytrityl B-D-ribofurannosylj
N6-benzoyl Adénine 25 d.
Mass spectrometry FAB> NOBA m / z 780 [M + H] +, 303 [DmTrj + 1-C3'-O-terr-butyldimethylsilyl-4'-thio-5'-O-dimethoxytrityl BD-ribofuranosyl]
N6-benzoyl adenine d.

Rendement 29% .Yield 29%.

RMN 1H (DMSOd6, 250 MHz): S 11.25,( s, 1H, NH); 8.64, (s, 1H, H8); 8.61, (s, 1H,
H2); 8.04, (d, 2H, Ho du groupement benzoyle); 7.51, (m, 13H, H aromatiques du groupement DmTr); 6.95, (d, 3H, Hm,p du groupement benzoyle); 6.01, (d, 1H, H1,,
J1',2' = 5.8); 5.79, (d, 1H, OH2, JOH,2' = 3.5); 4.70, (m, 1H, H2,); 4.26, (m, 1H, H3'); 3.75,( s, 6H, OCH3 du groupement DmTr); 3.53, (m, 3H, H4', H5' et H5"); 0.82, (s, 9H, tert-butyl); 0.01, (d, 6H, Me2Si).
1H NMR (DMSOd6, 250 MHz): δ 11.25, (s, 1H, NH); 8.64, (s, 1H, H8); 8.61, (s, 1H,
H2); 8.04, (d, 2H, Ho of the benzoyl group); 7.51, (m, 13H, aromatic H of the DmTr group); 6.95, (d, 3H, Hm, p of the benzoyl group); 6.01, (d, 1H, H1,
J1 ', 2' = 5.8); 5.79, (d, 1H, OH2, JOH, 2 '= 3.5); 4.70, (m, 1H, H2,); 4.26, (m, 1H, H3 '); 3.75, (s, 6H, OCH 3 from the DmTr group); 3.53, (m, 3H, H4 ', H5' and H5 "), 0.82, (s, 9H, tert-butyl), 0.01, (d, 6H, Me2Si).

Spectrométrie de masse FAB > O NOBA m/z 804 [M+H]+, 303 [M+H]+
Méthode générale de préparation des B-D-ribonucléoside phosphoramidites 26 a-d.
FAB mass spectrometry> O NOBA m / z 804 [M + H] +, 303 [M + H] +
General method of preparation of BD-ribonucleoside phosphoramidites ad.

A une solution des composés 24 a-d (1 mmole) dans du dichlorométhane anhydre (3.8ml) sont ajoutés sous atmosphère inerte d'argon la N,N,N-diisopropyléthylamine (4 mmoles, 0.7ml), la chloro N,N-diisopropylaminométhoxyphosphine (2.5mmole), 0.48ml) et la 4
N,N-diméthylaminopyridine (0.2mmole, 24.4mg). Le mélange réactionnel est agité de 40 à 90 minutes à température ambiante puis est dilué avec de l'acétate d'éthyle (35ml). La solution résultante est lavée avec de la saumure (4xS0ml) puis avec de l'eau (2x50ml). La phase organique est séchée sur sulfate de sodium, filtrée et évaporée sous pression réduite.
To a solution of the compounds 24 ad (1 mmol) in anhydrous dichloromethane (3.8 ml) are added under argon inert atmosphere N, N, N-diisopropylethylamine (4 mmol, 0.7 ml), chloro N, N-diisopropylaminomethoxyphosphine (2.5mmole), 0.48ml) and the 4
N, N-dimethylaminopyridine (0.2mmol, 24.4mg). The reaction mixture is stirred for 40 to 90 minutes at room temperature and is then diluted with ethyl acetate (35 ml). The resulting solution is washed with brine (4xS0ml) and then with water (2x50ml). The organic phase is dried over sodium sulfate, filtered and evaporated under reduced pressure.

Le résidu est chromatographié sur colonne de gel de silice et l'élution est réalisée à l'aide d'un mélange de cyclohexane, de dichlorométhane et de triéthylamine (100/0/0.1 à 50/50/0.1). Les produits 26 a-d sont obtenus sous la forme d'une poudre blanche après lyophilisation dans le benzène.The residue is chromatographed on a column of silica gel and the elution is carried out using a mixture of cyclohexane, dichloromethane and triethylamine (100/0 / 0.1 to 50/50 / 0.1). The products 26 a-d are obtained in the form of a white powder after lyophilization in benzene.

1-[2'-O-tert-butyldiméthylsily-3'-N,N-diisopropylméthoxyphosphoramidite-4'thio5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]Thymine 26 a (mélange diastéréoisomérique)
Rendement: 89 %.
1- [2'-O-tert-butyldimethylsily-3'-N, N-diisopropylmethoxyphosphoramidite-4'thio5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl] Thymine 26a (diastereoisomeric mixture)
Yield: 89%.

RMN 31p (CD3CN): s 151,32 et 150,03.31p NMR (CD3CN): s, 151.32 and 150.03.

RMN 1H: s 7.99, (s, 1 H, NH), 7.65, (d, 1 H, H6); 7,35-6.80, (m, 13 H, H aromatiques ); 5.97, (m, 1 H, H1'); 4,25, (m, 1 H, H2'); 4.13, (m, 1 H, H3'); 3.78, (s, 6 H, OMe); 3.68, (m, 1 H, H4'); 3.54, (m, 2 H, H5, H5"); 3.35 (m, 3 H, MeO du groupement phosphoramidite); 3,25, (m, 2 H, CH des groupements isopropyle); 1,60, (m, 3 H, CH3); 1.15, (m, 12 H, CH3 des groupements isopropyle); 0.86, (s, 9 H, ten-butyl); 0.05, (m, 6
H, Me2Si).Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z = 852 [M+H]+ 1-[2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-3'-N,N-diisopropylméthoxyphosphoramidite4'thio-5' -O-diméthoxytrityle-B-D-ribofurannosyU Uracile 26 b (mélange diastéréoisomérique)
Rendement 78 %.
1 H NMR: δ 7.99, (s, 1H, NH), 7.65, (d, 1H, H 6); 7.35-6.80, (m, 13H, aromatic H); 5.97, (m, 1H, H1 '); 4.25, (m, 1H, H2 '); 4.13, (m, 1H, H3 '); 3.78, (s, 6H, OMe); 3.68, (m, 1H, H4 '); 3.54, (m, 2H, H5, H5-); 3.35 (m, 3H, MeO phosphoramidite group); 3.25, (m, 2H, CH isopropyl groups); 1.60, (m, 3H, CH 3); 1.15, (m, 12H, CH 3 isopropyl groups), 0.86, (s, 9H, ten-butyl), 0.05, (m, 6H, CH 3);
H, Me 2 Si) FAB mass spectrometry 0 NOBA m / z = 852 [M + H] + 1- [2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-N, N-diisopropylmethoxyphosphoramidite4thio-5'-O -dimethoxytrityl-BD-ribofuranosyU Uracil 26b (diastereoisomeric mixture)
Yield 78%.

RMN 31p (CDCl3): s 150.65 et 150.50.31 P NMR (CDCl 3): s 150.65 and 150.50.

RMN 1H (CD3CN,250 MHz): S 7.99, (s, 1 H, NH), 7.22, (m, 1 H, H6); 7.30-6.89, (m, 13 H, H aromatiques du groupement DmTr); 5.90, (m, 1 H, H1'); 5.50, (m, 1 H, Hs); 4.13, (m, 2 H, H2', H3'); 3.80, (s, 6 H, OMe du groupe DmTr); 3.58, (m, 3 H, H4', H5',
H5"); 3.42, (m, 2 H, 2 CH des groupements isopropyle); 3.30 (m, 3 H, MeO du groupement DmTr); 1.19, (m, 12 H, CH3 des groupements isopropyle); 0.84, (s, 9 H, tert-butyl); 0.05, (m, 6 H, Me2Si).
1H NMR (CD3CN, 250 MHz): δ 7.99, (s, 1H, NH), 7.22, (m, 1H, H6); 7.30-6.89, (m, 13 H, aromatic H of the DmTr group); 5.90, (m, 1H, H1 '); 5.50, (m, 1H, Hs); 4.13, (m, 2H, H2 ', H3'); 3.80, (s, 6H, OMe from the DmTr group); 3.58, (m, 3H, H4 ', H5',
H5 "); 3.42, (m, 2H, 2 CH isopropyl groups); 3.30 (m, 3H, MeO of the DmTr group); 1.19, (m, 12H, CH3 isopropyl groups); 0.84, (s 9H, tert-butyl) 0.05 (m, 6H, Me 2 Si).

Spectrométrie de masse FAB > 0 NOBA m/z = 534 [M+H-DmTrH]+ 1-[2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-3'-N,N-diisopropylméthoxyphosphoramidite4'thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl] N4benzoyl Cytosine 26c.FAB mass spectrometry> NOBA m / z = 534 [M + H-DmTrH] + 1- [2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-N, N-diisopropylmethoxyphosphoramidite4thio-5'-O-dimethoxytrityl] ss-D-ribofuranosyl] N4benzoyl Cytosine 26c.

Rendement 75% .Yield 75%.

RMN 31p (CD3CN): S 151,30 et 150,05
Spectrométrie de masse FAB > O PEG m/z 941 [M+H]+, 637 [M+H-DmTrH] 303 [D,Tr]+.
31 P NMR (CD3CN): δ 151.30 and 150.05
Mass spectrometry FAB> O PEG m / z 941 [M + H] +, 637 [M + H-DmHrH] 303 [D, Tr] +.

1-[2'-O-tert-butyldiméthylsilyl-3'-N,N-diisopropylméthoxyphosphoramidite4'thio-5'-O-diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl] N6benzoyl Adénine 26 d. 1- [2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-N, N-diisopropylmethoxyphosphoramidite4'thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl] N6benzoyl Adenine d.

Rendement 71%. Yield 71%.

RMN 31p (CDCl3): s 151,26 et 150,01
Spectrométrie de masse FAB > O PEG m/z 964 [M+H]+, 600 [M+H-DmTrH]' 303 [DmTrJ+.
31 P NMR (CDCl 3): s, 151.26 and 150.01
Mass spectrometry FAB> O PEG m / z 964 [M + H] +, 600 [M + H-Dm Hr] 303 [DmTrJ +.

Il. 3 Fonctionalisation du support solide (Schéma 10). He. 3 Functionalization of the solid support (Diagram 10).

Le support solide ou LCA-CPG (Long Chain Aikylamine Controlled Pore Glass) P-1 a tout d'abord été activé par une solution d'acide trichloroacétique à 3 % dans le dichlorométhane à température ambiante pendant 2 à 3 heures afin de libérer le plus grand nombre de groupements amino, ce qui conduit au maximum de sites réactifs sur la surface des billes de verre. Le support ainsi activé P-2 est alors fonctionnalisé par couplage avec de l'anhydride succinique dans la pyridine en présence de 4-DMAP ce qui conduit à P-3. Dans l'étape suivante, le nucléoside 3'-silylé 25 est utilisé puisqu' il a été obtenu pendant la réaction de silylation des thioribonucléosides et n'est pas nécessaire pour la synthèse d'oligothionucléotides contenant la liaison phosphodiester 3'-5'.Ainsi, P-3 activé par le 1 (3-diméthylaminopropyl) 3-éthylcarbodiimide (DEC) en présence de 4-DMAP est mis en réaction dans la pyridine anhydre avec le 5'-O-DmTr-3'-OTBDMS ss-D-thioribonucléoside 25. Les sites non utilisés du support sont masqués à l'aide de pipéridine. Une dernière étape de masquage à l'anhydride acétique en présence de collidine dans le THF conduit à P-6. La quantité de nucléoside fixée sur le support est déterminée par spectrophotométrie U. V. en mesurant la quantité de cation diméthoxytrityle libéré après un traitement par une solution à
10 % d'acide trichloroacétique dans le dichlorométhane. Le degré de fonctionnalisation varie de 21 à 38 pmole par gramme de support suivant la nature de la base nucléosidique.

Figure img00390001
The solid support or LCA-CPG (Long Chain Alkylamine Controlled Pore Glass) P-1 was first activated by a solution of trichloroacetic acid at 3% in dichloromethane at room temperature for 2 to 3 hours in order to release the greater number of amino groups, which leads to the maximum of reactive sites on the surface of the glass beads. The support thus activated P-2 is then functionalized by coupling with succinic anhydride in pyridine in the presence of 4-DMAP, which leads to P-3. In the next step, the 3'-silyl nucleoside is used since it was obtained during the silylation reaction of the thioribonucleosides and is not necessary for the synthesis of oligothionucleotides containing the 3'-5 'phosphodiester linkage. Thus, P-3 activated with 1 (3-dimethylaminopropyl) 3-ethylcarbodiimide (DEC) in the presence of 4-DMAP is reacted in anhydrous pyridine with 5'-O-DmTr-3'-OTBDMS ss-D. -thioribonucleoside 25. The unused sites of the support are masked with piperidine. A last step of masking with acetic anhydride in the presence of collidine in THF leads to P-6. The amount of nucleoside bound to the support is determined by UV spectrophotometry by measuring the amount of dimethoxytrityl cation released after treatment with a solution of
10% trichloroacetic acid in dichloromethane. The degree of functionalization varies from 21 to 38 pmol per gram of support depending on the nature of the nucleoside base.
Figure img00390001

(i = TCA3%, CH2C12; ii = anhydride succinique, DMAP, Pyr.; iii = 51o-DrnTr4'-thio-3'o-TBDMS-I3-
D-ribonucléoside, DMAP, NEt3, DEC Pyr.; iv = pentachlorophénol;
v = pipéridine; vi = Ac1O 0.5M dans THF)
SCHEMA 10
II. 4. Synthèse automatisée des thiooligonucléotides (Schéma 11).
(i = TCA3%, CH2Cl2, ii = succinic anhydride, DMAP, Pyr, iii = 51o-DrnTr4'-thio-3'o-TBDMS-I3-
D-ribonucleoside, DMAP, NEt3, DEC Pyr .; iv = pentachlorophenol;
v = piperidine; vi = Ac1O 0.5M in THF)
SCHEME 10
II. 4. Automated Synthesis of Thiooligonucleotides (Scheme 11).

Les thiooligonucléotides ont été synthétisés sur un synthétiseur à ADN (Applied Biosystems
modèle 381 A). Le cycle d'élongation comporte quatre étapes importantes:
Détritylation du nucléoside ou de l'oligonucléotide fixé sur le support solide.
Thiooligonucleotides were synthesized on a DNA synthesizer (Applied Biosystems
model 381 A). The elongation cycle has four important steps:
Detritylation of the nucleoside or oligonucleotide attached to the solid support.

Condensation du phosphoramidite activé par le tétrazole sur l'hydroxyle 5' libre du nucléoside ou de l'oligonuciéotide.  Condensation of tetrazole-activated phosphoramidite on the free 5 'hydroxyl of the nucleoside or oligonucleotide.

Masquage des fonctions 5'-hydroxyles qui n'ont pas réagi. Masking of 5'-hydroxyl functions that have not reacted.

Oxydation des fonctions phosphitetriester en phosphotriester.

Figure img00400001
Oxidation of phosphitetriester functions in phosphotriester.
Figure img00400001

SCHEMA 11
Chaque synthèse a été effectuée sur une colonne contenant 40 mg de support solide. Le rendement de chaque incorporation est de 98 % évalué en mesurant la concentration des cations diméthoxytrityles récupérés après chaque couplage par traitement du support à l'acide trichloroacétique.
SCHEME 11
Each synthesis was carried out on a column containing 40 mg of solid support. The yield of each incorporation is 98% evaluated by measuring the concentration of the dimethoxytrityl cations recovered after each coupling by treatment of the support with trichloroacetic acid.

Des lavages sont effectués entre chaque étape. et la durée d'un cycle d'élongation est de 21,1 minutes pour la synthèse de l'homododécamère 4'-thio-B-D-ribonucléotide (BrSU12) (Tableau 1).

Figure img00410001
Washings are carried out between each step. and the duration of an elongation cycle is 21.1 minutes for the synthesis of the 4'-thio-BD-ribonucleotide homododecamer (BrSU12) (Table 1).
Figure img00410001

<tb><Tb>

Numéro <SEP> Etape <SEP> Temps <SEP> (sec.) <SEP> Solvant <SEP> et <SEP> Réactifs
<tb> <SEP> 1 <SEP> Séchage <SEP> et <SEP> 24 <SEP> MeCN-Argon
<tb> <SEP> Lavage
<tb> <SEP> 2 <SEP> Détritylation <SEP> 80 <SEP> TCA <SEP> à <SEP> 3% <SEP> dans <SEP> CH2Cl2 <SEP>
<tb> <SEP> 3 <SEP> Séchage <SEP> et <SEP> 74 <SEP> MeCN-Argon
<tb> <SEP> Lavage
<tb> <SEP> 4 <SEP> Couplage <SEP> 915 <SEP> amidite <SEP> 0.1M(24eq.)+MeCN <SEP>
<tb> <SEP> +tétrazole <SEP> 0.5M(10eq.)+MeCN
<tb> <SEP> 5 <SEP> Séchage <SEP> 45 <SEP> argon
<tb> <SEP> 6 <SEP> Masquage <SEP> 23 <SEP> Méthyimidazole-THF
<tb> <SEP> Ac2O/lutidine/THF::1/1/8
<tb> <SEP> 7 <SEP> Séchage <SEP> 11 <SEP> argon
<tb> <SEP> 8 <SEP> Oxydation <SEP> 43 <SEP> 12 <SEP> <SEP> 0.1M <SEP> dans <SEP> THF/Pyr./H2O <SEP>
<tb> <SEP> 40/10/1 <SEP>
<tb> <SEP> 9 <SEP> Lavage <SEP> 53 <SEP> MeCN
<tb>
TABLEAU 1: Cycle d'élongation utilisé pour la synthèse du BrSU12.
Number <SEP> Step <SEP> Time <SEP> (sec.) <SEP> Solvent <SEP> and <SEP> Reagents
<tb><SEP> 1 <SEP> Dry <SEP> and <SEP> 24 <SEP> MeCN-Argon
<tb><SEP> Wash
<tb><SEP> 2 <SEP> Detritylation <SEP> 80 <SEP> TCA <SEP> to <SEP> 3% <SEP> in <SEP> CH2Cl2 <SEP>
<tb><SEP> 3 <SEP> Dry <SEP> and <SEP> 74 <SEP> MeCN-Argon
<tb><SEP> Wash
<tb><SEP> 4 <SEP> Coupling <SEP> 915 <SEP> amidite <SEP> 0.1M (24eq.) + MeCN <SEP>
<tb><SEP> + tetrazole <SEP> 0.5M (10eq.) + MeCN
<tb><SEP> 5 <SEP> Drying <SEP> 45 <SEP> argon
<tb><SEP> 6 <SEP> Masking <SEP> 23 <SEP> Methyimidazole THF
<tb><SEP> Ac2O / lutidine / THF :: 1/1/8
<tb><SEP> 7 <SEP> Drying <SEP> 11 <SEP> argon
<tb><SEP> 8 <SEP> Oxidation <SEP> 43 <SEP> 12 <SEP><SEP> 0.1M <SEP> in <SEP> THF / Pyr. / H2O <SEP>
<tb><SEP> 40/10/1 <SEP>
<tb><SEP> 9 <SEP> Washing <SEP> 53 <SEP> MeCN
<Tb>
TABLE 1: Elongation cycle used for synthesis of BrSU12.

II. 5. Décrochage, Déprotection et Purification du thiooligomère. II. 5. Stall, deprotection and purification of the thiooligomer.

Après avoir réalisé les étapes de déprotection des méthoxyphosphate diesters au thiophénol, le décrochage du dodécamère du support solide par l'ammoniaque, la déprotection des hydroxyles par le TBAF, le thiooligomère a été dessalé sur une colonne d'exclusion G-25
DEAE Sephadex où sur une colonne ionique A-25 Sephadex DEAE et purifié par CLHP en phase inverse.
After having carried out the deprotection steps of methoxyphosphate diesters with thiophenol, the stalling of the solid support dodecamer with ammonia, the deprotection of the hydroxyls with TBAF, the thiooligomer was desalted on a G-25 exclusion column.
DEAE Sephadex where on an A-25 Sephadex DEAE ion column and purified by reverse phase HPLC.

La synthèse des 4'-thio-oligonbonucléotides utilise la méthode de synthèse sur support solide en stratégie méthoxyphosphoroamidite bien connue en série oxygénée.The synthesis of the 4'-thio-oligonucleotides uses the solid support synthesis method in methoxyphosphoroamidite strategy, well known in the oxygenated series.

Cependant, les oligomères modifiés obtenus sont tout à fait nouveaux à ce jour. However, the modified oligomers obtained are quite new to date.

III. PARTIE EXPERIMENTALE. III. EXPERIMENTAL PART.

Exemple I: Synthèse de l'homododecamère BrSU12.Example I: Synthesis of the homododecamer BrSU12.

1-1 Synthèse du support solide:
Le support solide P-1 (2,415 g) est mis en suspension avec une solution (50 ml) d'acide trichloroacétique à 3 % dans CH2C12 anhydre. Après 4 h 15 d'agitation, 50 ml d'une solution de triethylamine et de diisopropylamine (9:1) est ajoutée et après 5 mn d'agitation la solution est filtrée. Le support solide P-2 ainsi obtenu est lavé par du dichlorométhane (2 x 50 ml) puis par de l'éther (50 ml) et mis à sécher.
1-1 Synthesis of the solid support:
The solid support P-1 (2.415 g) is suspended with a solution (50 ml) of 3% trichloroacetic acid in anhydrous CH 2 Cl 2. After 4 h stirring, 50 ml of a solution of triethylamine and diisopropylamine (9: 1) is added and after 5 minutes of stirring the solution is filtered. The solid support P-2 thus obtained is washed with dichloromethane (2 × 50 ml) and then with ether (50 ml) and dried.

Le support solide P-2 est ensuite mis en suspension dans de la pyridine anhydre (14,5 ml) en prèsence d'anhydride succinique (0,48 g) et de DMAP (0,0805 g). La suspension est agitée pendant 20 heures puis filtrée. Le support solide P-3 est alors lavé avec de la pyridine anhydre (50 ml), du dichlorométhane (2 x 50 ml) et de l'éther (2 x 50 ml) puis mis à sécher sous vide.The solid support P-2 is then suspended in anhydrous pyridine (14.5 ml) in the presence of succinic anhydride (0.48 g) and DMAP (0.0805 g). The suspension is stirred for 20 hours and then filtered. The solid support P-3 is then washed with anhydrous pyridine (50 ml), dichloromethane (2 x 50 ml) and ether (2 x 50 ml) and then dried under vacuum.

Condensation du support solide P-3 avec le 1-[3'-O-tert-butyldiméthylsilyl-2'- hydroxy-4' thio-5 ' -O-dimethoxytrityle-B-D-ribofurannosyU Uracile 25 b
Un mélange de P-3 (2,415 g) de 1-[3'-O-tert-butyldiméthylsilyl-2'-hydroxy-4'thio-5'-O- diméthoxytrityle-ss-D-ribofurannosyl]Uracile 25 b (333 mg, 1 éq.) de la DMAP (29,5 mmg, 0,5 éq.) de la triethylamine (0,146 mg, 202 l, 0,003 éq.) et du DEC (920 mg, 10 éq.) dans 29 ml de pyridine anhydre est agité 3 jours à température ambiante.
Condensation of the solid support P-3 with 1- [3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-hydroxy-4'thio-5'-O-dimethoxytrityl-BD-ribofuranosyU Uracil 25b
A mixture of P-3 (2,415 g) 1- [3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-hydroxy-4'thio-5'-O-dimethoxytrityl-ss-D-ribofuranosyl] Uracil 25b (333 mg, 1 eq) of DMAP (29.5 mm, 0.5 eq) of triethylamine (0.146 mg, 202 l, 0.003 eq.) and DEC (920 mg, 10 eq.) in 29 ml of Anhydrous pyridine is stirred for 3 days at room temperature.

On ajoute ensuite du pentachlorophénol (321 mg, 2,5 éq.) et on laisse sous agitation 24 heures supplémentaires. Le support solide est alors filtré, rincé avec de la pyridine anhydre (2 x 50 ml) puis avec du dichlorométhane (2 x 50 ml) et de l'éther (2 x 50 ml). Pentachlorophenol (321 mg, 2.5 eq.) Is then added and the mixture is left stirring for another 24 hours. The solid support is then filtered, rinsed with anhydrous pyridine (2 x 50 ml) then with dichloromethane (2 x 50 ml) and ether (2 x 50 ml).

Immédiatement après, on traite le support solide P-5 par 25 ml de pipéridine. Après agitation à température ambiante pendant 24 heures, le support solide est filtré, lavé par du dvichlorométhane (2 x 50 ml) puis de l'éther (2 x50 ml) et mis à sécher sous vide.Immediately afterwards, the solid support P-5 is treated with 25 ml of piperidine. After stirring at room temperature for 24 hours, the solid support is filtered, washed with dichloromethane (2 × 50 ml) and then with ether (2 × 50 ml) and dried under vacuum.

Le support solide sec (2,415 g) est mis en prèsence d'une solution d'anhydride acétique (0,5 M) dans le THE (15 ml) et d'une solution de collidine (0,5 M) dans le THF (15 ml). The dry solid support (2.415 g) is placed in the presence of a solution of acetic anhydride (0.5 M) in TE (15 ml) and a solution of collidine (0.5 M) in THF ( 15 ml).

Après 4 heures de réaction, le support solide est lavé avec de la pyridine anhydre (2 x 50 mi), du dichlorométhane (2 x 50 ml), du TNF (2 x 50 ml) et de l'éther (2 x 50 ml). After 4 hours of reaction, the solid support is washed with anhydrous pyridine (2 × 50 ml), dichloromethane (2 × 50 ml), TNF (2 × 50 ml) and ether (2 × 50 ml). ).

P-6 ainsi obtenu est mis à sécher sous vide.P-6 thus obtained is dried under vacuum.

I-2) Détermination du taux de fonctionnalisation du support solide P-6. I-2) Determination of the functionalization rate of the solid support P-6.

Cette détermination s'effectue par dosage des groupements DmTr libérés en milieu acide.This determination is carried out by assaying the DmTr groups released in acidic medium.

On pèse exactement 38,0 mg de P-6 qui sont mis en suspension dans 3,4 ml d'une solution d'acide para-toluène sulfonique (0,1 M) dans l'acétonitrile. Le mélange est agité 15 mn puis soniqué pendant 2 mn.Exactly 38.0 mg of P-6 are weighed and suspended in 3.4 ml of a solution of para-toluenesulphonic acid (0.1 M) in acetonitrile. The mixture is stirred for 15 minutes and then sonicated for 2 minutes.

On ajuste alors le volume à 10 ml avec la solution 0,1 M d'acide para-toluène sulfonique dans l'acétonitrile. On prélève 0,3 ml de cette solution à laquelle on ajoute 5 ml de la solution 0,1 M d'acide para-toluène sulfonique. La lecture de la DO (0,317 unité de DO) à 500 nm nous permet de calculer le degré de fonctionnalisation du support P-6 qui est dans ce cas de 21 ,umole/gramme de support solide.The volume is then adjusted to 10 ml with the 0.1 M solution of para-toluenesulfonic acid in acetonitrile. 0.3 ml of this solution is taken to which 5 ml of the 0.1 M solution of para-toluenesulphonic acid is added. Reading the OD (0.317 OD unit) at 500 nm allows us to calculate the degree of functionalization of the support P-6 which in this case is 21 μmol / g of solid support.

I-3) Synthèse automatisée de l'homododécamère BrSU12.  I-3) Automated synthesis of the homododecamer BrSU12.

La synthèse est effectuée sur une colonne contenant 39,8 mg de support solide fonctionnalisé à 21 mole/g de résine, soit 0,835 ,umole (1 éq) de 4'-thiouridine.The synthesis is carried out on a column containing 39.8 mg of solid support functionalized at 21 mol / g of resin, ie 0.835 μmol (1 eq) of 4'-thiouridine.

Chaque cycle d'élongation nécessite un excés de synthon phosphoramidite (20 pmole, 24 é) soit 240 ,umole au total pour la synthèse du dodécamère. Le synthétiseur prélevant 200y1 d'une solution 0,1 M de synthon dans l'acétonitrile par incorporation.Each elongation cycle requires an excess of phosphoramidite synthon (20 pmol, 24%), ie 240 μmol in total for the synthesis of the dodecamer. The synthesizer taking 200 μl of a 0.1 M solution of synthon in acetonitrile by incorporation.

La durée d'un cycle d'élongation est de 21,1 mn (Tableau 1).The duration of an elongation cycle is 21.1 minutes (Table 1).

L'étape de couplage a été considérablement augmentée (900 s contre 45 s dans le cas d'un désoxynucléoside) à cause de la moindre réactivité du synthon ribonucléotide.The coupling step was considerably increased (900 s against 45 s in the case of a deoxynucleoside) because of the lower reactivity of the ribonucleotide synthon.

Le dosage des cations diméthoxytrityles libérés à chaque étape de détritylation a permis d'évaluer le rendement moyen d'incorporation de l'unité thioribonucléotidique à 98,7 %.The determination of the dimethoxytrityl cations released at each detritylation stage made it possible to evaluate the average efficiency of incorporation of the thioribonucleotide unit at 98.7%.

I-4) Décrochage, déprotection et purification du thio homododécamère BrSU12.  I-4) Stall, deprotection and purification of thio homododecamer BrSU12.

Le support solide portant le thio-homododécamère BrSU12 est traité par 5 ml d'une solution de thiophénol, triéthylamine, dioxane 1, 2 (1/2/2) pendant une demi-heure à température ambiante.The solid support carrying the thio-homododecamer BrSU12 is treated with 5 ml of a solution of thiophenol, triethylamine, dioxane 1, 2 (1/2/2) for half an hour at room temperature.

La solution de thiophénol est alors filtrée et le support lavé par une solution d'ammoniaque 32 % dans l'ethanol 95 (3/1: v/v) (3 x 500 l) pour décrocher le thio-homododécamère du support solide. La solution ainsi obtenue est évaporée, reprise par 500 tLl d'eau puis lyophilisée.The solution of thiophenol is then filtered and the support washed with a solution of 32% ammonia in ethanol 95 (3/1: v / v) (3 x 500 l) to unhook the thio-homododecamer from the solid support. The solution thus obtained is evaporated, taken up in 500 ml of water and then freeze-dried.

L'oligomère est alors dissout dans 300 l d'une solution de TBAF (1,1 M) dans le THF. Le mélange réactionnel est laissé sous agitation pendant 24 heures. La réaction est alors stoppée avec 300 Cll d'une solution aqueuse d'acétate d'ammonium (0,05 M). The oligomer is then dissolved in 300 l of a solution of TBAF (1.1 M) in THF. The reaction mixture is stirred for 24 hours. The reaction is then stopped with 300 μl of an aqueous solution of ammonium acetate (0.05 M).

La solution est évaporée à sec, coévaporée 3 fois avec de l'eau et le résidu chromatographié sur colonne de gel d'exclusion Sephadex G-25. Les fractions contenant le thiooligomère sont rassemblées, évaporées à sec et analysées par CLPH.The solution is evaporated to dryness, coevaporated 3 times with water and the residue chromatographed on Sephadex G-25 exclusion gel column. The fractions containing thiooligomer are pooled, evaporated to dryness and analyzed by HPLC.

Analyse et Purification du thio-oligomère BrSU12 obtenu.Analysis and purification of the thio-oligomer BrSU12 obtained.

L'analyse CLPH du thiooligomère a été éffectuée sur une colonne Beckman C-18 RP 3 IL x
LODS Ultrasphère dans les conditions de gradient suivantes:
A: 10 % d'acétonitrile dans une solution aqueuse 0,05 M d'acétate de triéthylammonium.
HPLC analysis of the thiooligomer was performed on a Beckman C-18 RP 3 IL x column
LODS Ultrasphere under the following gradient conditions:
A: 10% acetonitrile in a 0.05 M aqueous solution of triethylammonium acetate.

B: 15 % d'acétonitrile dans une solution aqueuse 0,05 M d'acétate de triéthylammonium.B: 15% acetonitrile in a 0.05 M aqueous solution of triethylammonium acetate.

Gradient: A#B#B#A
20' 10' 5'
Temps d'analyse: 30'.
Gradient: A # B # B # A
20 '10' 5 '
Analysis time: 30 '.

Dans ces conditions, on constate que le thiooligomère est pur à 92,73 %.Under these conditions, it is found that the thiooligomer is pure at 92.73%.

On effectue alors une purification de BrSU12 sur colonne semi-préparative Nucléosyl avec un gradient: A#B#B#A
15' 10' 5'
On obtient dans ces conditions le BrSU12 avec une pureté de 94,42 % suffisante pour les études ultérieures.
A purification of BrSU12 on a Nucleosyl semi-preparative column is then carried out with a gradient: A # B # B # A
15 '10' 5 '
Under these conditions, BrSU12 is obtained with a purity of 94.42% sufficient for subsequent studies.

Exemple II: Synthèse du dodècamère B (SrT)1 dT11.Example II Synthesis of dodecamper B (SrT) 1 dT11.

11-1) Synthèse du support solide. 11-1) Synthesis of the solid support.

Le support solide fonctionnalisé à 1 Immole pour 35 mg de résine de 2'-désoxythymidine ainsi que les synthons 1-[ 5'-O-DmTr-3'-O-N,N-diisopropylamino cyanoéthyl phosphine, 2'-désoxy-B-D-ribofurannosyl thymine sont commercialisés par Applied Biosystems.The solid support functionalized at 1 Immole for 35 mg of 2'-deoxythymidine resin as well as the synthons 1- [5'-O-DmTr-3'-ON, N-diisopropylamino cyanoethyl phosphine, 2'-deoxy-BD-ribofuranosyl thymine are marketed by Applied Biosystems.

II-2) Synthèse automatisée de B (SrT)1 dT11. II-2) Automated synthesis of B (SrT) 1 dT11.

La synthèse est effectuée sur une colonne contenant 35 mg de support solide soit 1 immole de 2'-désoxythymidine. Chaque cycle d'élongation nécessite un excès de synthons phosphoramidite (20 moles, 20 éq) soit 220 mole de synthons 2'-désoxythymidine et 20 moles de synthon 4'-thio-thymidine 5. Le synthétiseur prélevant 200 Immoles par incorporation d'une solution 0,1 M de chaque synthon dans 1'acétonitrile. La durée d'un cycle d'incorporation d'une unité désoxythymidine est de 5,5 mn .Alors qu'elle est de 20,1 mn pour un cycle d'incorporation du synthon 4'-thiothymidine. The synthesis is carried out on a column containing 35 mg of solid support, ie 1 immole of 2'-deoxythymidine. Each elongation cycle requires an excess of phosphoramidite synthons (20 mol, 20 eq), ie 220 mol of 2'-deoxythymidine synthons and 20 mol of 4'-thio-thymidine synthon 5. The synthesizer taking up 200 Immoles by incorporation of a 0.1 M solution of each synthon in acetonitrile. The duration of a cycle of incorporation of a deoxythymidine unit is 5.5 minutes. While it is 20.1 minutes for a synthesis cycle of the synthon 4'-thiothymidine.

L'augmentation de la durée du cycle d'incorporation du synthon chimère est due à l'étape de couplage de 909 ' contre 36 'pour le synthon 2'-désoxythymidine.The increase in the duration of the incorporation cycle of the chimeric synthon is due to the coupling step of 909 'against 36' for the synthon 2'-deoxythymidine.

Le dosage des cations diméthoxytrityles libérés à chaque étape de détritylation a permis d'évaluer le rendement moyen d'incorporation de l'unité 2'-désoxythymidine à 98,5 % et 93,5 % pour le synthon 4'-thiothymidine.The determination of the dimethoxytrityl cations released at each detritylation stage made it possible to evaluate the average incorporation efficiency of the 2'-deoxythymidine unit at 98.5% and 93.5% for the synthon 4'-thiothymidine.

II-3) Décrochage,déprotection et purification du B (SrT)1 dT11
Le support solide portant l'oligomère B (SrT)1 dT11 est traité par une solution d'ammoniaque (32 %) dans l'ethanol 95 (3/1, v/v) (3 x 500 Cll) pendant 3 cycles de 20 mn chacun afin de décrocher 1'oligomère de son support, puis le dodécamère est incubé pendant 2 hr dans une étuve sèche dans le même mélange afin de déprotéger les fonctions cyanoéthyl et méthoxy.
II-3) Stall, deprotection and purification of B (SrT) 1 dT11
The solid support carrying oligomer B (SrT) 1 dT11 is treated with a solution of ammonia (32%) in ethanol 95 (3/1, v / v) (3 × 500 μl) for 3 cycles of 20 minutes. each to remove the oligomer from its support, then the dodecamer is incubated for 2 hr in a dry oven in the same mixture to deprotect the cyanoethyl and methoxy functions.

L'oligomère est ensuite évaporé sous vide, repris par 500 i1 d'eau et lyophilisé.The oligomer is then evaporated under vacuum, taken up in 500 ml of water and freeze-dried.

La déprotection des groupements TBDMS est effectuée selon le protocole mis au point dans l'exemple I.The deprotection of the TBDMS groups is carried out according to the protocol developed in Example I.

Le résidu obtenu est chromatographié sur colonne de gel de DEAE Sephadex A-25. Les fractions contenant l'oligomère sont rassemblées, évaporées à sec et analysées par CLPH.The residue obtained is chromatographed on a gel column of DEAE Sephadex A-25. Fractions containing the oligomer are pooled, evaporated to dryness and analyzed by HPLC.

Analyse et Purification du B (SrT)1 dT11 par CLPH.Analysis and purification of B (SrT) 1 dT11 by HPLC.

L'analyse CLPH de l'oligomère a été effectuée sur une colonne Beckman C 18 RP 3 CL
Ultrasphère dans les conditions de gradient suivantes:
A: 6 % d'acétonitrile dans un tampon acétate de triethyl ammonium 0,05 M.
HPLC analysis of the oligomer was performed on a Beckman C 18 RP 3 CL column.
Ultrasphere under the following gradient conditions:
A: 6% acetonitrile in a 0.05 M triethylammonium acetate buffer

B: 20 % d'acétonitrile dans un tampon acétate de triethyl ammonium 0,05 M.B: 20% acetonitrile in a 0.05 M triethylammonium acetate buffer

A#B#B
15' 10'
Temps d'analyse: 25 mm.
A # B # B
15 '10'
Analysis time: 25 mm.

Dans ces conditions, l'oligomère est pur à 49,3 %.Under these conditions, the oligomer is 49.3% pure.

une purification de B (SrT) 1 dT11 est alors éffectuée par CLPH semi-préparative avec une colonne Nucleosyl dans les conditions de gradient suivantes: A#B#B
15' 5'
Le 12-mer présente alors un temps de rétention de 12,99 mn et une pureté supérieure à 99
Exemple lit: Synthèse du dodécamère 8 dT5 (SrT) dT6 III-1) Synthèse du support solide.
Purification of B (SrT) 1 dT11 is then performed by semi-preparative HPLC with a Nucleosyl column under the following gradient conditions: A # B # B
15 '5'
The 12-mer then has a retention time of 12.99 min and a purity higher than 99
Example Lit: Synthesis of dodecamer 8 dT5 (SrT) dT6 III-1) Synthesis of the solid support.

Le support solide défini dans l'exemple II a été utilisé.The solid support defined in Example II was used.

III-2) Synthèse automatisée de B dT5 (SrT) dT6.III-2) Automated synthesis of B dT5 (SrT) dT6.

Les mêmes conditions de synthèse mises au point pour la synthèse de B (SrT)1 dTI1 ont été utilisées.The same synthesis conditions developed for the synthesis of B (SrT) 1 dTI1 were used.

Le dosage des cations diméthoxytrityles libérés à chaque étape de détritylation a permis d'évaluer le rendement moyen d'incorporation de l'unité 2'-désoxythymidine à 99,3 % et à 96,1 % pour le synthon 4'-thiothymidine.The determination of the dimethoxytrityl cations released at each detritylation stage made it possible to evaluate the average incorporation efficiency of the 2'-deoxythymidine unit at 99.3% and at 96.1% for the synthon 4'-thiothymidine.

III-3) Décrochage et purification du B dT5 (SrT) dT6
Le traitement de cet oligomère a été effectué selon le protocole mis au point dans 11 exemple II. L'analyse et la purification CLHP, réalisée dans les mêmes conditions de gradient révèle un temps de rétention de 13,18 minutes et une pureté spectrophotométrique à 260nm de 100
IV. PROPRIETE D'HYBRIDATION des B-4'-thio-oligoribonucléotides
La spectrophotométrie U. V. permet d'étudier les acides nucléiques et de mettre en
évidence la formation de duplex, la température de fusion étant une des caractéristiques
d'un duplex. L'empilement et l'appariement des bases des acides nucléiques sont
accompagnés d'une diminution de l'absorbtion U.V. (Hypochromicité).Ainsi par
spectrophotométrie U.V., il est possible de controler la formation ou la dissociation d'un
duplex. (W.SANGER, Principles of Nucleic Acid Structure, Springer-Verlag,.New
York, 1984, pp. 141-149). Lorsque la température d'une solution contenant une double
hélice (ADN ou ARN) est lentement augmentée, l'absorbtion U.V. croit nettement tout au
long de la dissociation.Le point d'inflexion de la courbe d'allure sygmoldale de la
variation d'absorbance en fonction de la température est appelée température de fusion ou
Tm et correspond à la co-existence de brins séparés et de brins appariés dans un rapport 50/50
L'analyse des courbes de fusion des duplex B-4'-thiooligoribonucléotide B-
oligodésoxyrib onucléotide et B-4' -thiooligoribonucléotide / B-oligoribonucléotide
permettra de définir la stabilité thermique de tels duplex par la mesure de la température
de fusion. Ces expériences d'hybridation sont menées en respectant une stoechiométrie 1 /
1 entre les deux brins complémentaires, en présence d'un tampon 1 M Nazi, 10 mM
cacodylate de sodium.Une forte concentration en NaCi favorise en effet, les appariements
en solvatant les charges négatives autour des atomes de phosphore des deux
oligonucléotide. Nous avons donc effectué ces expériences d'hybridation dans un autre
tampon : 0,1 M NaCî, 10 mM cacodylate de sodium.
III-3) Stall and purification of B dT5 (SrT) dT6
The treatment of this oligomer was carried out according to the protocol developed in Example II. HPLC analysis and purification performed under the same gradient conditions revealed a retention time of 13.18 minutes and a spectrophotometric purity at 260 nm of 100.
IV. HYBRIDIZATION PROPERTY of B-4'-thio-oligoribonucleotides
UV spectrophotometry makes it possible to study nucleic acids and to
evidence of duplex formation, with melting temperature being one of the characteristics
a duplex. Stacking and base pairing of nucleic acids are
accompanied by a decrease in UV absorption (Hypochromicity).
UV spectrophotometry, it is possible to control the formation or dissociation of a
duplex. (W.SANGER, Principles of Nucleic Acid Structure, Springer-Verlag, .New
York, 1984, pp. 141-149). When the temperature of a solution containing a double
helix (DNA or RNA) is slowly increased, UV absorption
along the dissociation.The inflection point of the sygmoldal
Absorbance variation as a function of temperature is called melting temperature or
Tm and corresponds to the co-existence of separate strands and paired strands in a 50/50 ratio
Analysis of the melting curves of the duplexes B-4'-thiooligoribonucleotide B-
oligodeoxyrib onucleotide and B-4'-thiooligoribonucleotide / B-oligoribonucleotide
will define the thermal stability of such duplexes by measuring the temperature
fusion. These hybridization experiments are carried out respecting a stoichiometry 1 /
1 between the two complementary strands, in the presence of a 1 M Nazi buffer, 10 mM
Sodium cacodylate.A high concentration of NaCl favors, in fact, the pairings
by solvating the negative charges around the phosphorus atoms of both
oligonucleotide. So we did these hybridization experiments in another
buffer: 0.1 M NaCl, 10 mM sodium cacodylate.

Iv. 1. RESULTATS ET DISCUSSION
Exemples I et Il : Expériences de fusion des duplex BSrU12 /polyrA et BrU12 / polyrA.
Iv. 1. RESULTS AND DISCUSSION
Examples I and II: BSrU12 / polyrA and BrU12 / polyrA duplex fusion experiments.

Ces expériences permettent de mettre en évidence l'influence de l'atome de soufre en
position 4' du dodécamère modifié sur la stabilité thermique du duplex en comparant les
Tm obtenus avec ceux du duplex naturel.
These experiments make it possible to highlight the influence of the sulfur atom in
4 'position of the modified dodecamer on the thermal stability of the duplex by comparing the
Tm obtained with those of the natural duplex.

Le tableau 2 résume les températures de fusion obtenues dans les deux expériences.

Figure img00480001
Table 2 summarizes the melting temperatures obtained in the two experiments.
Figure img00480001

<tb><Tb>

Concentration <SEP> ssSrU12/polyrA <SEP> 'C <SEP> ssrU12/polrA <SEP> 'C
<tb> <SEP> en <SEP> NaCl <SEP> Hypochromicité <SEP> % <SEP> Hypochromicité <SEP> %
<tb> <SEP> 1M <SEP> 46 C <SEP> 25% <SEP> en <SEP> cours
<tb> <SEP> 0.1M <SEP> 33 C <SEP> 25% <SEP> en <SEP> cours
<tb>
Tableau 2
Températures de fusion des duplex de dodécamères
Concentration 3 zM en chaque oligomère.
Concentration <SEP> ssSrU12 / polyrA <SEP>'C<SEP> ssrU12 / polrA <SEP>' C
<tb><SEP> in <SEP> NaCl <SEP> Hypochromicity <SEP>% <SEP> Hypochromicity <SEP>%
<tb><SEP> 1M <SEP> 46 C <SEP> 25% <SEP> in <SEP> courses
<tb><SEP> 0.1M <SEP> 33 C <SEP> 25% <SEP> in <SEP> courses
<Tb>
Table 2
Melting temperatures of dodecamer duplexes
Concentration 3 μM in each oligomer.

L'analyse de ces résultats montrent que le duplex BS rU12 / polyrA présente une bonne
stabilité thermique représentée par le Tm de 46 C obtenu à une concentration de 1 M en
NaCI.
The analysis of these results shows that the BS rU12 / polyrA duplex exhibits good
thermal stability represented by the Tm of 46 C obtained at a concentration of 1 M
NaCl.

Exemples m et IV : Expériences de fusion des duplex BSrU12 / ssdC2A12C2 et
ssrU12/ssdC2A12C2.
Examples m and IV: BSrU12 / ssdC2A12C2 duplex fusion experiments and
ssrU12 / ssdC2A12C2.

Les températures de fusion obtenues dans les deux expériences sont résumées dans le
tableau 3.

Figure img00480002
The melting temperatures obtained in the two experiments are summarized in
table 3.
Figure img00480002

<tb><Tb>

Concentration <SEP> ssSrU12/ssdC2A12C2 <SEP> 'C <SEP> ssrU12/ssdC2A12C2 <SEP> 'C
<tb> <SEP> en <SEP> NaCl <SEP> Hypochromicité <SEP> % <SEP> Hypochromicité <SEP> %
<tb> <SEP> 1M <SEP> 27 C <SEP> 9.3% <SEP> en <SEP> cours
<tb> <SEP> 0.1M <SEP> 5 C <SEP> 5.6% <SEP> en <SEP> cours
<tb>
Tableau 3
Températures de fusion des duplex de dodécamères
Concentration 3 ,uM en chaque oligomères
Exemple IV: Expérience d'autohybridation de l'oligomère ssSrU12.
Concentration <SEP> ssSrU12 / ssdC2A12C2 <SEP>'C<SEP> ssrU12 / ssdC2A12C2 <SEP>' C
<tb><SEP> in <SEP> NaCl <SEP> Hypochromicity <SEP>% <SEP> Hypochromicity <SEP>%
<tb><SEP> 1M <SEP> 27 C <SEP> 9.3% <SEP> in <SEP> courses
<tb><SEP> 0.1M <SEP> 5 C <SEP> 5.6% <SEP> in <SEP> courses
<Tb>
Table 3
Melting temperatures of dodecamer duplexes
Concentration 3, μM in each oligomer
Example IV: Autohybridization experiment of the ssSrU12 oligomer

Afin de vérifier les résultats précédents, il est nécessaire de s'assurer que le dodécamère
ssSrU12 ne conduit à aucune autohybridation. Pour cela, on a effectué une expérience
d'auto-hybridation du dodécamère BSrU12 à deux concentrations en NaCI (1 M, et 0,1
M). Les courbes d'hybridation ne présentent pas l'allure sigmoidale caractéristique mais
obéissent à l'équation A = k+T où A est l'absorbance à 260 nm, T la température et k
une constante. Aucun point d'inflexion ne peut être visualisé sur une telle droite. Nous
pouvons donc conclure que le dodécamère BSrU12 ne s'auto-apparie pas.
In order to verify the previous results, it is necessary to ensure that the dodecamer
ssSrU12 does not lead to any autohybridization. For this, we carried out an experiment
BSrU12 dodecamer auto-hybridization at two NaCl concentrations (1 M, and 0.1
M). Hybridization curves do not have the typical sigmoidal appearance but
obey the equation A = k + T where A is the absorbance at 260 nm, T the temperature and k
a constant. No inflection point can be visualized on such a line. We
We can therefore conclude that the dodecamer BSrU12 does not self-match.

La comparaison des températures de fusion des duplex BSrU12 / ssdC2A12C2 (Tableau
2) et ssSrU12/ polyrA (Tableau 3) montre une stabilité thermique de l'homoduplew
ARN/ARN (Tm = 46 C) nettement supérieure à celle de l'hétéroduplex
ARN/ADN (Tm = 27 c) d'autre part, aucune auto-hybridation de BSrU12 n'a été
constatée.
Comparison of BSrU12 / ssdC2A12C2 duplex melting temperatures (Table
2) and ssSrU12 / polyrA (Table 3) shows a thermal stability of the homoduplew
RNA / RNA (Tm = 46 C) significantly higher than that of heteroduplex
RNA / DNA (Tm = 27c), on the other hand, no self-hybridization of BSrU12 was
noted.

Exemple VI et VII: Expérience de fusion des duplex BdT5(SrT)dT6 / BdC2A12C2 et ssdT12/ssdC2A12C2
Cette expérience permet d'évaluer la stabilité thermique du duplex ssdT5(SrT)dT6 /
BdC2A12C2 comparativement à celle du duplex naturel BdT12 / BdC2A12C2 (Figure 1).
Example VI and VII: Fusion Experiment of BdT5 (SrT) duplexes dT6 / BdC2A12C2 and ssdT12 / ssdC2A12C2
This experiment makes it possible to evaluate the thermal stability of the duplex ssdT5 (SrT) dT6 /
BdC2A12C2 compared to that of the natural duplex BdT12 / BdC2A12C2 (Figure 1).

Les températures de fusion de ces duplex sont indiquées dans le
Tableau 4.

Figure img00490001
The melting temperatures of these duplexes are indicated in
Table 4.
Figure img00490001

<tb><Tb>

Concentration <SEP> ssdTs(SrT)dT6 <SEP> / <SEP> BdC2Al2C2 <SEP> C <SEP> ssdT12/ <SEP> BdC2A12C2 <SEP> C <SEP>
<tb> <SEP> en <SEP> NaCI <SEP> Hyperchromicité <SEP> % <SEP> Hyperchromicité <SEP> % <SEP>
<tb> <SEP> 1M <SEP> 40 <SEP> C <SEP> 18 <SEP> % <SEP> 45 C <SEP> 20.5 <SEP> % <SEP>
<tb>
Tableau 4
Température de fusion des duplex BdT5(SrT)dT6 / BdC2Al2C2
et ssdT12/ssdC2A12C2
Concentration en chaque oligomère 10 ,tM
Au vu de ces résultats, il apparait que la stabilité thermique du duplex modifié est inférieure à celle du duplex naturel. Cependant la différence de 5 ( C existante entre les deux températures de fusion est trop faible pour conclure à un mésappariement. En effet, certains auteurs (Y.KAWASE, S.I.WAI, H.INOUE, K.MIURA et E.OKTSUKA, Nucleic Acid
Research, 1986, 14, 7727) ont montré que l'existence d'un seul mésappariement dans un duplex de 13 unités nucléotidiques se traduisait par une diminution de Tm supérieure à
10 C.
Concentration <SEP> ssdTs (SrT) dT6 <SEP> / <SEP> BdC2Al2C2 <SEP> C <SEP> ssdT12 / <SEP> BdC2A12C2 <SEP> C <SEP>
<tb><SEP> in <SEP> NaCI <SEP> Hyperchromicity <SEP>% <SEP> Hyperchromicity <SEP>% <SEP>
<tb><SEP> 1M <SEP> 40 <SEP> C <SEP> 18 <SEP>% <SEP> 45C <SEP> 20.5 <SEP>% <SEP>
<Tb>
Table 4
BdT5 duplex temperature (SrT) dT6 / BdC2Al2C2
and ssdT12 / ssdC2A12C2
Concentration in each oligomer 10, tM
In view of these results, it appears that the thermal stability of the modified duplex is lower than that of the natural duplex. However, the 5 (C) difference between the two melting temperatures is too small to conclude that there is a mismatch, because some authors (Y.KAWASE, SIWAI, H.INOUE, K.MIURA and E.OKTSUKA, Nucleic Acid
Research, 1986, 14, 7727) have shown that the existence of a single mismatch in a duplex of 13 nucleotide units results in a decrease in Tm greater than
C.

On peut donc conclure que l'unité 4'-thio-nucléotidique s'apparie bien avec la 2'
désoxyadénosine mais avec une affinité inférieure à celle de la 2'-désoxythymidine
comme le confirme la différence de Tm de 5' C obtenue (Tableau 4).
It can therefore be concluded that the 4'-thio-nucleotide unit pairs well with the 2 '
deoxyadenosine but with a lower affinity than 2'-deoxythymidine
as confirmed by the difference in Tm of 5 ° C obtained (Table 4).

IV. 2. PARTIE EXPERIMENTALE
Méthode Générale pour les expériences d'hybridation
A - Dosage des oligomères complémentaires.
IV. 2. EXPERIMENTAL PART
General Method for Hybridization Experiments
A - Determination of complementary oligomers.

Afin de réaliser l'expérience d'hybridation, il est nécessaire de connaître la concentration en chaque oligomère pour respecter la stoechiométrie 1:1 entre les deux brins complémentaires. Selon la loi de BEER-LAMBERT A = elc, les absorbances des oligomères ont été mesurées à 80 # C afin d'éliminer le phénomène d'empilement des bases créant une perturbation de l'hyperchromicité due à l'existence de structures tertiaires. On peut donc connaitre les coefficients d'extinction moléculaire des dodécamères à 80 C selon la relation e265(SrUl2) = 12 e 265(rU). In order to perform the hybridization experiment, it is necessary to know the concentration in each oligomer to respect the 1: 1 stoichiometry between the two complementary strands. According to the BEER-LAMBERT law A = elc, the absorbances of the oligomers were measured at 80 ° C in order to eliminate the stacking phenomenon of the bases creating a disturbance of the hyperchromicity due to the existence of tertiary structures. It is therefore possible to know the molecular extinction coefficients of the dodecamers at 80 C according to the relation e265 (SrU12) = 12 and 265 (rU).

B - Conditions d'hybridation.B - Hybridization conditions.

Les expériences d'hybridation sont effectuées avec un spectrophotomètre UVIKON 810 (KONTRON), couplé à un microordinateur IBM compatible. La température est controlée par un programateur de température HUBER PD 415 connecté à un bain thermostaté (HUMER MINISTAT). Les cuves U.V. sont en quartz de 1 cm de long et une circulation continuelle d'azote est utilisée pour les températures inférieures à 20 e Ce Avant l'expérience, 3 tLM (Exemples I à V) ou 10 M (Exemples VI et VII) d'oligomères complémentaires sont mis en présence dans une quantité suffisante pour 1000 yl de tampon 1 M NaCI et 10 mM cacodylate de sodium. ajusté à pH 7 (Exemples I à VII).Ce mélange est chauffé à 80' C pendant 1 heure, puis refroidit jusqu'à - 20' C selon une pente de température de 0,5'C par minute. Les valeurs d'absorbance et de température sont collectées toutes les 30 secondes.Hybridization experiments are performed with a UVIKON 810 spectrophotometer (KONTRON), coupled to a compatible IBM microcomputer. The temperature is controlled by a HUBER PD 415 temperature programmer connected to a thermostated bath (HUMER MINISTAT). The UV cuvettes are 1 cm long quartz and a continuous circulation of nitrogen is used for temperatures below 20 e Ce Before the experiment, 3 tLM (Examples I to V) or 10 M (Examples VI and VII) Additional oligomers are combined in a sufficient amount per 1000 μl 1M NaCl buffer and 10 mM sodium cacodylate. adjusted to pH 7 (Examples I-VII). This mixture is heated at 80 ° C for 1 hour, then cooled to -20 ° C at a temperature gradient of 0.5 ° C per minute. Absorbance and temperature values are collected every 30 seconds.

La même expérience est effectuée en utilisant une quantité suffisante pour 1000 pl de tampon d'hybridation 0,1 M NaCI, 10 mM cacodylate de sodium ajusté à pH 7 (Exemples
I et V) afin d'évaluer la stabilité thermique du duplex dans ce tampon favorisant moins les appariements
Exemple I: Stabilité thermique du duplex BSrU12 / polyrA l-l Dosage des oligomères
Concentration de BSrU12 = 0.351mM
Concentration de polyrA = 4,61 tnM 1-2 Conditions d'hybridation 3 itM (8,55 l) de ssSrU12 et 3 M (7,79 l) de polyrA sont mis en présence de 983,6 l des tampons d'hybridation (1 M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium ou 0,1 M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium)
Exemple II:Stabilité thermique du duplex ssrU12 / polyrA en cours
Exemple m : Stabilité thermique du duplex BSrU12 / BdC2A12C2
III-1 Dosage des oligomères
Concentration de BSrU12 = 0,351 mM
Concentration de ssdC2A12C2 = 0,369 mM
III-2 Conditions d'hybridation 3 M (8,55 l) de ssSrU12 et 3 M (8,11 l) de ssdC2A12C2 sont mis en présence de 983,3 4 des tampons d'hybridation (1 M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium ou 0,1 M
NaCI, 10 mM cacodylate de sodium)
Exemple IV:Stabilité thermique du duplex BrU12 / BdC2A12C2 (en cours)
IV-1 Dosage des oligomères
Concentration de BrU12 =
Concentration de BdC2A12C2 = 0,369 mM 111-2 Conditions d'hybridation 3 yM ( 4) de ssrU12 et 3 M (8,11 l) de BdC2A12C2 sont mis en présence de 4 des tampons d'hybridation (1 M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium ou 0,1 M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium)
Exemple V:Expérience d'autohybridation de 1' oligomère ssSrU12
V-1 Dosage des oligomères
Concentration de ssSrU12 = 0,351 mM
V-2 Conditions d'hybridation
6 juM (17,10 l) de ssSrU12 sont mis en présence de 986,9 l des tampons d'hybridation
(1 M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium ou 0,1 M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium)
Exemple VI: Stabilité thermique du duplex BdT5(SrT)dT6 / ssdC2A12C2
VI-1 Dosage des oligomères
Concentration de ssdT(SrT)dT6 = 1,33 mM
Concentration de ssdC2A12C2 = 0,369 mM
VI-2 Conditions d'hybridation 10yM (7,49 l) de BdTs(SrT)dT6 et 10 m (22,5 l) de ssdC2A12C2 sont mis en présence de 970 4 de tampon d'hybridation 1M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium.
The same experiment is carried out using a sufficient amount for 1000 μl of 0.1 M NaCl hybridization buffer, 10 mM sodium cacodylate adjusted to pH 7 (Examples
I and V) in order to evaluate the thermal stability of the duplex in this buffer, which favors less the pairings
EXAMPLE I Thermal Stability of BSrU12 / PolyrA Duplex II Oligomer Assay
Concentration of BSrU12 = 0.351mM
Concentration of polyrA = 4.61 mM 1-2 Hybridization conditions 3 μM (8.55 l) of ssSrU12 and 3 M (7.79 l) of polyrA are combined with 983.6 l of hybridization buffers (1 M NaCl, 10 mM sodium cacodylate or 0.1 M NaCl, 10 mM sodium cacodylate)
Example II: Thermal stability of the duplex ssrU12 / polyrA in progress
Example m: Thermal stability of BSrU12 / BdC2A12C2 duplex
III-1 Determination of oligomers
Concentration of BSrU12 = 0.351 mM
Concentration of ssdC2A12C2 = 0.369 mM
III-2 Hybridization Conditions 3 M (8.55 l) of ssSrU12 and 3 M (8.11 l) of ssdC2A12C2 are brought into contact with 983.3% of the hybridization buffers (1 M NaCl, 10 mM cacodylate sodium or 0.1M
NaCl, 10 mM sodium cacodylate)
Example IV: Thermal stability of duplex BrU12 / BdC2A12C2 (in progress)
IV-1 Determination of oligomers
BrU12 concentration =
Concentration of BdC2A12C2 = 0.369 mM 111-2 Hybridization Conditions 3 μM (4) of ssrU12 and 3 M (8.11 μl) of BdC2A12C2 are brought into contact with 4 of the hybridization buffers (1 M NaCl, 10 mM cacodylate sodium or 0.1 M NaCl, 10 mM sodium cacodylate)
Example V: Autohybridization experiment of ssSrU12 oligomer
V-1 Determination of oligomers
Concentration of ssSrU12 = 0.351 mM
V-2 Hybridization conditions
6 μM (17.10 μl) of ssSrU12 are exposed to 986.9 l of hybridization buffers
(1 M NaCl, 10 mM sodium cacodylate or 0.1 M NaCl, 10 mM sodium cacodylate)
Example VI: Thermal Stability of the BdT5 (SrT) duplex dT6 / ssdC2A12C2
VI-1 Determination of oligomers
SsdT concentration (SrT) dT6 = 1.33 mM
Concentration of ssdC2A12C2 = 0.369 mM
VI-2 Hybridization Conditions 10 μM (7.49 l) of BdTs (SrT) dT6 and 10 m (22.5 l) of ssdC2A12C2 are placed in the presence of 970 μl of 1M NaCl hybridization buffer, 10 mM cacodylate. sodium.

Exemple VII: Stabilité thermique du duplex BdT12 / BdC2A12C2
VII-1 Dosage des oligomères
Concentration de ssdT12= 1,196 mM
Concentration de ssdC2A12C2= 0,369 mM
VII-2 Conditions d'hybridation 10 gM (8,36 l) de BdT12 et 10 zM (22,5 l) de BdC2A12C2 sont mis en présence de 969,1 l de tampon d'hybridation 1 M NaCl, 10 mM cacodylate de sodium
V. ETUDES ENZYMATIQUES
La reconnaissance des acides nucléiques par des enzymes est en majeure partie d'ordre structural. Le remplacement de l'hétéroatome naturel du sucre d'un oligonucléotide confére à celui-çi une forte résistance à la dégradation par les nucléases.
Example VII: Thermal stability of the duplex BdT12 / BdC2A12C2
VII-1 Determination of oligomers
Concentration of ssdT12 = 1.196 mM
Concentration of ssdC2A12C2 = 0.369 mM
VII-2 Hybridization Conditions 10 g (8.36 l) of BdT12 and 10 μM (22.5 l) of BdC2A12C2 are placed in the presence of 969.1 l of 1 M NaCl hybridization buffer, 10 mM cacodylate. sodium
V. ENZYMATIC STUDIES
The recognition of nucleic acids by enzymes is largely structural. The replacement of the natural heteroatom of the sugar of an oligonucleotide confers to it a strong resistance to degradation by nucleases.

L'étude de l'hydrolyse des 4'-thio-oligoribonucléotides B par ces nucléases permet de confirmer que le remplacement de l'oxygène intracyclique par un atome de soufre confère bien une meilleure stabilité enzymatique.The study of the hydrolysis of 4'-thio-oligoribonucleotides B by these nucleases confirms that the replacement of intracyclic oxygen with a sulfur atom confers a better enzymatic stability.

Exemple I: Etude de la dégradation enzymatique du dodécamère B(SrT)dT11 par la phosphodiestérase de rate de veau.Example I: Study of the enzymatic degradation of dodecamer B (SrT) dT11 by phosphodiesterase of calf's spleen.

La phosphodiestérase de rate de veau. est une exonucléase qui dégrade les oligomères à partir de leurs extremités 5' libre libérant ainsi des nucléotides 3' phosphate.The phosphodiesterase of calf's spleen. is an exonuclease that degrades oligomers from their 5 'free ends thus releasing nucleotide 3' phosphate.

Cette étude nous permettra d'évaluer la résistance à la dégradation enzymatique induite par la présence en position 5' d'une unité 4'-thionucléotidique dans l'oligomère B(SrT)dT11 comparativement à la dégradation enzymatique de l'homologue naturel oxygéné BdT12
La stabilité comparative des deux dodécamères BdT12 et B(SrT)dT11 envers l'hydrolyse par la phosphodiestérase de rate de veau est présentée dans le tableau 5.
This study will allow us to evaluate the resistance to enzymatic degradation induced by the presence in the 5 'position of a 4'-thionucleotide unit in oligomer B (SrT) dT11 compared with the enzymatic degradation of the natural oxygenated homologue BdT12
The comparative stability of the two dodecamers BdT12 and B (SrT) dT11 towards phosphodiesterase hydrolysis of calf spleen is shown in Table 5.

La différence de comportement entre les deux dodécamères est importante, en effet seulement 23% de l'oligomère B(SrT)dT11 a été hydrolysé en 25 minutes alors que dans le même laps de temps le 12-mer BdT12 a été dégradé à 93 %

Figure img00530001
The difference in behavior between the two dodecamers is important, indeed only 23% of the oligomer B (SrT) dT11 was hydrolysed in 25 minutes whereas in the same period of time the 12-mer BdT12 was degraded to 93%
Figure img00530001

<tb> .Dodécamère <SEP> Dégradation <SEP> en <SEP> 0 <SEP> min <SEP> Dégradation <SEP> en <SEP> 25 <SEP> min
<tb> <SEP> BdT12 <SEP> 0% <SEP> 93 <SEP> % <SEP>
<tb> B(SrT)dT11 <SEP> 0% <SEP> 23% <SEP>
<tb>
Tableau 5
Cinétique de dégradation de BdT12 et B(SrT)dT11 par la phosphodiestérase de rate de veau
L'évolution au cours du temps de la dégradation enzymatique des deux dodécamères a été suivie par CLHP. Nous avons pu tracer la courbe de digestion enzymatique de B(SrT)dT11 en fonction du temps : A = Ao -kt (Figure 2, A) où: -Ao est l'aire initiale du 12-mèr -A est l'aire du 12-mer à l'instant t
-t est le temps
-k est la constante de vitesse de premier ordre de la dégradation
Cette courbe (Figure 2) permet de 'calculer, en utilisant le logiciel de régression
curviligne EUREKA, k = 0,.016min~1 et le temps de demi-vie du dodécamère tl/2 = In
2/k = 43 min
De la même façon, la courbe de digestion enzymatique de BdT12 en fonction du temps : A = Ao est a pu être tracée. (Schéma 13).On constate que la cinétique de dégradation de
BdT12 est beaucoup plus rapide que celle de B(SrT)dT11; en effet le temps de demi-vie s'établit à 1 minute pour le dodécamère naturel.
<tb> .Dodecamer <SEP> Degradation <SEP> at <SEP> 0 <SEP> min <SEP> Degradation <SEP> at <SEP> 25 <SEP> min
<tb><SEP> BdT12 <SEP> 0% <SEP> 93 <SEP>% <SEP>
<tb> B (SrT) dT11 <SEP> 0% <SEP> 23% <SEP>
<Tb>
Table 5
Kinetics of degradation of BdT12 and B (SrT) dT11 by phosphodiesterase of calf spleen
The evolution over time of the enzymatic degradation of the two dodecamers was followed by HPLC. We have been able to trace the enzymatic digestion curve of B (SrT) dT11 as a function of time: A = Ao -kt (Figure 2, A) where: -Ao is the initial area of 12-mer -A is the area from 12-sea to instant t
-t is the time
-k is the first order rate constant of the degradation
This curve (Figure 2) allows to calculate, using the regression software
curvilinear EUREKA, k = 0, .016min ~ 1 and the half-life time of the dodecamer tl / 2 = In
2 / k = 43 min
In the same way, the enzymatic digestion curve of BdT12 as a function of time: A = Ao could be plotted. (Figure 13). It is noted that the kinetics of degradation of
BdT12 is much faster than B (SrT) dT11; indeed the half-life time is 1 minute for the natural dodecamer.

La cinétique de dégradation enzymatique de l'oligomére modifié B(SrT)dT11 par l'extrémité 5' présente un temps de demi-vie nettement supérieur à celui de la dégradation du BSrU12. Ces résultats montrent que l'introduction d'une unité thioribonucléotidique à l'extrémité 5' d'un oligomère stabilise ce dernier vis à vis de la phosphodiéstérase de rate de veau.The kinetics of enzymatic degradation of the modified oligomer B (SrT) dT11 by the 5 'end has a half-life time much greater than that of BSrU12 degradation. These results show that the introduction of a thioribonucleotide unit at the 5 'end of an oligomer stabilizes the latter with respect to the phosphodiesterase of calf spleen.

Exemple 1: Etude de la dégradation enzymatique du dodécamère B(SrT)dT11 par la phosphodiestérase de rate de veau.EXAMPLE 1 Study of Enzymatic Degradation of Dodecamer B (SrT) dT11 by Calf Spleen Phosphodiesterase

Une solution d'oligonucléotide (20 4, 3 unités d'absorbance à 260 nm) est diluée dans un tampon Acétate d'ammonium 0,125 M (pH 7,0), d'EDTA 2,5mM et de Tween 80 0,0625% (80 yL). On ajoute une solution commerciale de phosphodiestérase de rate de veau (2 4, concentration finale 0,008 unité/ml) et le mélange est incubé à 37 C. A des temps déterminés, des fractions aliquotes sont prélevées (5 4), chauffées à 100'C pendant une minute et analysées par CLHP.An oligonucleotide solution (4.2.3 absorbance units at 260 nm) is diluted in 0.125 M ammonium acetate buffer (pH 7.0), 2.5 mM EDTA buffer and 0.0625% Tween 80 buffer. (80 μL). A commercial solution of phosphodiesterase from calf's spleen (2 4, final concentration 0.008 units / ml) is added and the mixture is incubated at 37 ° C. At specified times, aliquots are taken (5 4), heated to 100 ° C. C for one minute and analyzed by HPLC.

Conditions d'analyse CLHP.HPLC analysis conditions.

Les analyses ont été effectuées sur une colonne PVDI (Polyvinylimidazole SPCC-Shandon) protégée par une précolonne et un préfiltre. L'élution est réalisée selon un gradient linéaire en 20 minutes de 0,1 M à 0,4 M KC1 dans 20 mM KH2P04 à pH 6 contenant 20% d'acetonitrile. Le débit était fixé à 1 ml/min et la détection U.V. à 260 nm. The analyzes were carried out on a PVDI column (Polyvinylimidazole SPCC-Shandon) protected by a precolumn and a prefilter. The elution is carried out according to a linear gradient in 20 minutes from 0.1 M to 0.4 M KCl in 20 mM KH 2 PO 4 at pH 6 containing 20% acetonitrile. The flow rate was set at 1 ml / min and U.V. detection at 260 nm.

Claims (21)

REVENDICATIONS 1. Composés chimiques constitués par un oligo-4'-thio-2'désoxyribonucléotide ou un oligo 4'-thioribonucléotide, caractérisés en ce qu'ils comportent un enchaînement de 4'-thio-2'désoxyribonucléotides ou 4'-thioribonucléotides respectivement, enchaînement pouvant être facultativement lié à un agent effecteur, notamment un radical correspondant à un agent d'intercalation ou un radical chimique ou photoactivable, tel qu'un radical porteur d'une fonction réagissant directement ou indirectement avec les chaînes de nucléotides ou un radical dont la présence permet une détection facile et sensible. 1. Chemical compounds consisting of an oligo-4'-thio-2'desoxyribonucleotide or an oligo 4'-thioribonucleotide, characterized in that they comprise a sequence of 4'-thio-2'deoxyribonucleotides or 4'-thioribonucleotides respectively, linkage optionally being linked to an effector agent, in particular a radical corresponding to an intercalation agent or a chemical or photoactivatable radical, such as a radical carrying a function reacting directly or indirectly with the nucleotide chains or a radical whose the presence allows easy and sensitive detection. 2. Composés chimiques selon la revendication 1 constitués par un oligo 4'-thioribonucléotide ou un oligo 4'-thio-2'-désoxyribonucléotide, caractérisés en ce qu'ils comportent un enchaînement de 4-thioribonucléotides ou 4-thio-2'-déoxyribonucléotides respectivement non lié à un radical effecteur. 2. Chemical compounds according to claim 1 consisting of an oligo 4'-thioribonucleotide or an oligo 4'-thio-2'-deoxyribonucleotide, characterized in that they comprise a sequence of 4-thioribonucleotides or 4-thio-2'- deoxyribonucleotides respectively not bound to an effector radical. 3. Composés selon la revendication 1 ou 2 caractérisés en ce qu'ils ont pour formule 3. Compounds according to claim 1 or 2 characterized in that they have the formula
Figure img00550001
Figure img00550001
dans laquelle  in which les radicaux B peuvent être identiques ou différents et représentent chacun une base d'un acide nucléique éventuellement modifiée, activable -et/ou comportant un groupement intercalant et rattachée au cycle glycosidique selon une configuration anomérique alpha non naturelle  the radicals B may be identical or different and each represent a base of an optionally modified, activatable nucleic acid and / or having a group intercalating and attached to the glycoside ring in an unnatural alpha anomeric configuration les radicaux X peuvent être identiques ou différents et représentent chacun un oxoanion O , un thioanion S , un groupe alkyle, un groupe alcoxy, un groupe thioalkyle, un radical alkyle ou alcoxy substitué par un hétérocycle azoté ou un groupement -Y-Z the radicals X may be identical or different and each represents an oxoanion O, a thionanion S, an alkyl group, an alkoxy group, a thioalkyl group, an alkyl or alkoxy radical substituted by a nitrogen heterocycle or a group -Y-Z R et R', qui peuvent être identiques ou différents, représentent chacun un atome d'hydrogène ou un groupement -Y-Z ou Y'-Z'  R and R ', which may be identical or different, each represent a hydrogen atom or a group -Y-Z or Y'-Z' Y et Y' identiques ou différents représentent chacun un radical alcoylène droit ou ramifié -alk- ou un radical choisi parmi Y and Y ', which are identical or different, each represent a straight or branched alkylene radical -alk- or a radical chosen from
Figure img00560001
Figure img00560001
alk-O-alk alk-O-alk
Figure img00560002
Figure img00560002
avec U = O, S ou N with U = O, S or N E peut avoir les mêmes signification que X excepté Y-Z ou E can have the same meaning as X except Y-Z or Y'-Z';Y'-Z '; J représente un atome d'hydrogène ou un groupe hydroxy; J represents a hydrogen atom or a hydroxy group; Z et Z', identiques ou différents, représentent chacun un radical correspondant à un agent effecteur, notamment un radical correspondant à un agent d'intercalation ou un radical porteur d'une fonction qui réagit directement ou indirectement avec les chaînes de nucléotides ou un radical dont la présence permet une détection facile et sensible. Z and Z ', which are identical or different, each represent a radical corresponding to an effector agent, in particular a radical corresponding to an intercalating agent or a radical carrying a function which reacts directly or indirectly with the nucleotide chains or a radical whose presence allows easy and sensitive detection. L représente un atome d'oxygène, un atome de soufre ou un groupe -NH-.  L represents an oxygen atom, a sulfur atom or an -NH- group. n est un nombre entier y compris 0 n is an integer including 0
4. Composés selon la revendication 3, caractérisés en ce que Y et Y' représentent un radical choisi parmi 4. Compounds according to claim 3, characterized in that Y and Y 'represent a radical chosen from
Figure img00570001
Figure img00570001
avec U = O, S ou N with U = O, S or N
5. Composés selon la revendication 3 caractérisés en ce que L représente l'oxygène, R et R' représentent un atome d'hydrogène et B représente une base nucléique naturelle. 5. Compounds according to claim 3, characterized in that L represents oxygen, R and R 'represent a hydrogen atom and B represents a natural nucleic base. 6. Nouveau dérivé selon l'une des revendications 3 à 5, caractérisé en ce que l'agent d'intercalation Z ou Z' est choisi parmi les composés polycycliques ayant une configuration plane. 6. New derivative according to one of claims 3 to 5, characterized in that the intercalation agent Z or Z 'is selected from polycyclic compounds having a planar configuration. 7. Nouveau dérivé selon la revendication 6 caractérisé en ce que l'agent d'intercalation Z ou Z' est choisi parmi l'acridine et ses dérivés, la furocoumarine et ses dérivés, la daunomycine et les autres dérivés de l'anthracycline, la l,10-phénanthroline, la phénanthridine et ses dérivés, la proflavine, les porphyrines, les dérivés du dipyrido [l,2-a:3'-dj imidazole, l'ellipticine ou l'ellipticinium et leurs dérivés et le diazapyrène et des dérivés. 7. New derivative according to claim 6, characterized in that the intercalation agent Z or Z 'is chosen from acridine and its derivatives, furocoumarin and its derivatives, daunomycin and other derivatives of anthracycline, l, 10-phenanthroline, phenanthridine and its derivatives, proflavine, porphyrins, dipyrido [1,2-a: 3'-d] imidazole derivatives, ellipticine or ellipticinium and their derivatives and diazapyrene and derivatives. 8. Nouveau dérivé selon l'une des revendications 3 à 5, caractérisé en ce que les groupes chimiques réactifs Z ou Z' sont choisis parmi l'acide éthylène-diamine-tétraacétique, l'acide diéthylènetriaminepentaacétique, les porphyrines, la l,l0-phénanthroline, l'azido-4 acétophénone, I'éthylène-imine, la bêta-chloroéthylamine, le psoralène et leurs dérivés. 8. New derivative according to one of claims 3 to 5, characterized in that the reactive chemical groups Z or Z 'are chosen from ethylene-diamine tetraacetic acid, diethylenetriaminepentaacetic acid, porphyrins, l, 10 -phenanthroline, 4-azidoacetophenone, ethyleneimine, beta-chloroethylamine, psoralen and their derivatives. 9. Nouveau dérivé selon l'une des revendications 3 à 8, caractérisé en ce que le radical B est un radical correspondant à la thymine, l'adénine; la 2-aminoadénine et ses dérivés substitués, la cytosine, la guanine et ses dérivés substitués, l'uracile, le bromo-5 uracile, l'azido-8 adénine, la 7-déazaadénine, la 7-déazaguanine, la 4-azido-cytosine, la 4-azido-thymine et les dérivés de ces bases comportant un groupement intercalant et/ou un groupement chimiquement ou photochimiquement activable.  9. New derivative according to one of claims 3 to 8, characterized in that the radical B is a radical corresponding to the thymine, adenine; 2-aminoadenine and its substituted derivatives, cytosine, guanine and its substituted derivatives, uracil, 5-bromo-uracil, 8-azadenaden, 7-deazaadenine, 7-deazaguanine, 4-azido -cytosine, 4-azido-thymine and derivatives of these bases having an intercalating group and / or a chemically or photochemically activatable group. 10. Composés selon l'une des revendications 1 à 9, caractérisés en ce qu'il s'agit de composés oligothioribonucléotides de formule I pour lesquels J = OH. 10. Compounds according to one of claims 1 to 9, characterized in that they are oligothioribonucleotide compounds of formula I for which J = OH. 11. Procédé de préparation ou d'oligothionucléotide, selon l'une des revendications 3 à 10, caractérisé en ce qu'on applique des synthèses au phosphodiester, phosphotriester, phosphoramidite ou hydrogénophosphonate en partant de 4thionucléosides et en ce que l'on prépare les dérivés totalement protégés et que l'on élimine les groupements protecteurs. 11. Preparation process or oligothionucleotide, according to one of claims 3 to 10, characterized in that syntheses are applied to phosphodiester, phosphotriester, phosphoramidite or hydrogenophosphonate starting from 4thionucleosides and in that they are prepared completely protected derivatives and that the protective groups are eliminated. 12. Procédé de synthèse des composés sans agent effecteur selon l'une des revendications 2 à 10, caractérisé en ce qu'on réalise une synthèse supportée selon la méthode au phospohoroamidite comportant - une protection en 3' et 5' des 4'thionucléotides ou oligo-4'thionucléotides  12. Process for synthesizing compounds without an effector agent according to one of Claims 2 to 10, characterized in that a synthesis supported by the phospohoroamidite method comprising a 3 'and 5' protection of the 4 'thionucleotides or trace 4'thionucléotides de départ avec par exemple du diméthoxytrityl en 5' et du diisopropyla starting material with for example dimethoxytrityl 5 'and diisopropyla minophosphoramidite de méthyle en 3', - la fonctionnalisation d'un support solide incorporant un dérivé 4'thio 3 'methyl minophosphoramidite, functionalization of a solid support incorporating a 4'thio derivative nucléosidique par un lien par exemple succinyle entre le groupement nucleoside by a bond for example succinyl between the grouping hydroxyle-3' du dérivé 4'thionucléosidique et un groupement amino du hydroxyl-3 'of the 4'-thionucleoside derivative and an amino group of support solide, - l'élongation de la chaîne oligothionucléotidique dans un réacteur solid support, - the elongation of the oligothionucleotide chain in a reactor synthétiseur, - enfin le décrochage, la déprotection et la purification de l'oligothio synthesizer, - finally the stall, the deprotection and the purification of the oligothio nucléotide prolongé. extended nucleotide. 13. Procédé de synthèse de composés incorporant un agent effecteur selon l'une des revendications 3 à 10, caractérisé en ce que l'on part d'un oligothionucléotide sans agent effecteur protégé en 5', dont on fait réagir la terminaison OH 3' avec une fonction non protégée d'un bras difonctionnel dont la deuxième fonction est protégée et après déprotection du produit résultant, on lie ledit produit à l'agent effecteur par la deuxième fonction libre du bras difonctionnel. 13. A method for synthesizing compounds incorporating an effector agent according to one of claims 3 to 10, characterized in that one starts from an oligothionucleotide without 5 'protected effector agent, which is reacted with the 3' OH-terminus. with an unprotected function of a difunctional arm whose second function is protected and after deprotection of the resulting product, said product is linked to the effector agent by the second free function of the difunctional arm. 14. Procédé selon la revendication 13, caractérisé en ce que la terminaison OH 3' de l'oligomère protégé en 5' est estérifiée avec un acide aminohexanoîque, dont la fonction amine est protégée.  14. The method of claim 13, characterized in that the 3 'OH terminus of the 5' protected oligomer is esterified with an aminohexanoic acid, the amine function is protected. 15. Application des composés selon l'une des revendications 3 à 10, caractérisée en ce que lesdits composés sont utilisés à titre de sondes d'hybridation ou comme composants de purification pour des séquences déterminées d'ADN ou d'ARN en simple brin ou en double hélice dans un but diagnostique ou pronostique. 15. Application of the compounds according to one of claims 3 to 10, characterized in that said compounds are used as hybridization probes or as purification components for specific sequences of DNA or RNA in single strand or double helix for diagnostic or prognostic purpose. 16. Application des composés selon l'une des revendications 3 à 10, caractérisée en ce que les composés sont utilisés pour détecter des mutations au niveau d'un ADN ou d'un ARN. 16. Application of the compounds according to one of claims 3 to 10, characterized in that the compounds are used to detect mutations at a DNA or an RNA. 17. Application des composés selon l'une des revendications 3 à 10, caractérisée en ce que ces composés sont utilisés pour réaliser le blocage spécifique de gènes cellulaires ou d'agents pathogènes préalablement choisis, tels que des virus, bactéries ou des parasites. 17. Application of the compounds according to one of claims 3 to 10, characterized in that these compounds are used to carry out specific blocking of previously selected cell genes or pathogens, such as viruses, bacteria or parasites. 18. Application d'un dérivé selon l'une des revendications 3 à 10 pour bloquer sélectivement l'expression d'un gène soit par hybridation, soit par coupure sélective, soit par modification chimique du gène ou de son 18. Application of a derivative according to one of claims 3 to 10 for selectively blocking the expression of a gene either by hybridization, by selective cleavage, or by chemical modification of the gene or its ARN messager d'origine cellulaire, virale, bactérienne ou parasitaire.Messenger RNA of cellular, viral, bacterial or parasitic origin. 19. Application d'un dérivé selon l'une des revendications 3 à 10 pour bloquer sélectivement l'expression d'un ARN viral soit par hybridation, soit par coupure, soit par modification chimique de L'ART viral ou de sont ARN messager. 19. Application of a derivative according to one of claims 3 to 10 for selectively blocking the expression of a viral RNA either by hybridization, by cleavage or by chemical modification of the viral ART or messenger RNA. 20. Application des composés selon l'une des revendications 3 à 10, caractérisée en ce qu'ils sont utilisables à titre de nucléases artificielles spécifiques de séquences. 20. Application of the compounds according to one of claims 3 to 10, characterized in that they can be used as artificial nucleases specific sequences. 21. A titre de médicaments, des composés selon l'une des revendications 3 à 10, utilisables comme antiviraux, antitumoraux, antibiotiques ou antiparasitaires ou dans toute pathologie où un gène est anormalement exprimé soit par mutation, soit par dérégulation.  21. As medicaments, compounds according to one of claims 3 to 10, used as antiviral, antitumor, antibiotic or antiparasitic or in any pathology where a gene is abnormally expressed either by mutation or by deregulation.
FR9201275A 1992-02-05 1992-02-05 OLIGOTHIONUCLEOTIDES. Expired - Fee Related FR2686882B1 (en)

Priority Applications (9)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9201275A FR2686882B1 (en) 1992-02-05 1992-02-05 OLIGOTHIONUCLEOTIDES.
FR9211103A FR2687679B1 (en) 1992-02-05 1992-09-17 OLIGOTHIONUCLEOTIDES.
US08/284,484 US5639873A (en) 1992-02-05 1993-02-04 Oligothionucleotides
CA002129364A CA2129364A1 (en) 1992-02-05 1993-02-04 Oligothionucleotides
DE69307495T DE69307495T2 (en) 1992-02-05 1993-02-04 OLIGOTHIONUCLEOTIDES
JP5513826A JPH07506345A (en) 1992-02-05 1993-02-04 oligothionucleotide
EP93904155A EP0625986B1 (en) 1992-02-05 1993-02-04 Oligothionucleotides
AT93904155T ATE147752T1 (en) 1992-02-05 1993-02-04 OLIGOTHIONUCLEOTIDES
PCT/FR1993/000115 WO1993016095A1 (en) 1992-02-05 1993-02-04 Oligothionucleotides

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9201275A FR2686882B1 (en) 1992-02-05 1992-02-05 OLIGOTHIONUCLEOTIDES.

Publications (2)

Publication Number Publication Date
FR2686882A1 true FR2686882A1 (en) 1993-08-06
FR2686882B1 FR2686882B1 (en) 1994-05-06

Family

ID=9426349

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FR9201275A Expired - Fee Related FR2686882B1 (en) 1992-02-05 1992-02-05 OLIGOTHIONUCLEOTIDES.

Country Status (1)

Country Link
FR (1) FR2686882B1 (en)

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1983001451A1 (en) * 1981-10-23 1983-04-28 Molecular Biosystems Inc Oligonucleotide therapeutic agent and methods of making same
EP0117777A1 (en) * 1983-01-27 1984-09-05 Etablissement Public dit: CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (CNRS) Compounds containing an oligonucleotide bonded to an intercallating agent, a process for their preparation and their application
EP0169787B1 (en) * 1984-07-25 1989-09-06 Centre National De La Recherche Scientifique (Cnrs) Use of oligonucleotides bonded to an intercalating agent as drugs

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1983001451A1 (en) * 1981-10-23 1983-04-28 Molecular Biosystems Inc Oligonucleotide therapeutic agent and methods of making same
EP0117777A1 (en) * 1983-01-27 1984-09-05 Etablissement Public dit: CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (CNRS) Compounds containing an oligonucleotide bonded to an intercallating agent, a process for their preparation and their application
EP0169787B1 (en) * 1984-07-25 1989-09-06 Centre National De La Recherche Scientifique (Cnrs) Use of oligonucleotides bonded to an intercalating agent as drugs

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BIOCHEMISTRY. vol. 12, no. 11, 1973, EASTON, PA US pages 2041 - 5 A.K.M. ANISUZZAMAN ET AL. '4'-Thioadenosine 3',5'-Cyclic Synthesis and Hydrolysis by Phosphodiesterase.' *
BIOCHEMISTRY. vol. 9, no. 11, 1970, EASTON, PA US pages 2367 - 2372 D.J.HOFFMAN ET AL. 'Synthesis and Properties of Nucleotides Containing 4-Thio-D-Ribofuranose.' *

Also Published As

Publication number Publication date
FR2686882B1 (en) 1994-05-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP0625986B1 (en) Oligothionucleotides
EP0698034B1 (en) Triester phosphorothioate oligonucleotides and method of preparation
AU639770B2 (en) Oligonucleotide analogs
EP0241363B1 (en) Nucleoside derivatives and their use in the synthesis of oligonucleotides
KR100211552B1 (en) Compounds and methods for inhibiting gene expression
JPH09511250A (en) Modified oligonucleotides and intermediates useful in nucleic acid therapy
FR2607507A1 (en) New alpha -D-oligonucleotide derivatives, their preparation and their use.
EP0290583B1 (en) $g(a) OLIGONUCLEOTIDES
MXPA96004355A (en) Oligonucleotides and used modified intermediaries in nucleic acids therapeuti
Seela et al. Palindromic oiigonucleotides containing 7-deaza-2'-deoxyguanosine: solid-phase synthesis of d [(p) GG* AATTCC] octamers and recognition by the endodeoxyribonnclease EcoRI
JP2002521310A (en) Oligonucleotide analogues
CN102282155A (en) Method for the synthesis of phosphorus atom modified nucleic acids
JP3653102B2 (en) Oligoribonucleotides and ribozyme analogs having terminal 3&#39;-3 &#39;and / or 5&#39;-5&#39; linkages
RU2111971C1 (en) Modified oligodeoxyribonucleotides, composition based on thereof and intermediate compounds
US8026349B2 (en) Polynucleotide synthesis labeling chemistry
EP0360626A1 (en) Process for the synthesis of alpha-oligoribonucleotides, and components useful in the process
FR2686882A1 (en) Oligothionucleotides
Ferrer et al. Synthesis of oligodeoxynucleotides containing 5-aminouracil and itsN-acetyl derivative
Mourani Synthesis, Characterization and Biological Properties of Branched RNA Fragments Containing Chiral (R [subscript] p and S [subscript] p) 2', 5'-phosphorothioate Linkages
KR20010108722A (en) Novel oligonucleotide compounds having pyrrolizine derivatives, processes for preparing them, compositions containing them and uses thereof in treatment, diagnosis and analysis of gene-related diseases
FR2612930A1 (en) alpha Oligonucleotide probes
JP2000505081A (en) Solid phase synthesis of oligonucleotides N3 &#39;→ P5&#39; phosphoramidate

Legal Events

Date Code Title Description
ST Notification of lapse