FR2581655A2 - Papillomavirus probes and method for the in vitro diagnosis of papillomavirus infections. - Google Patents

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Abstract

The invention relates to papillomaviruses, in particular HPV DNAs obtained from these papillomaviruses whose physical structures are derived from figure 10, or alternatively to probes containing these HPV DNAs or to fragments obtained from the latter. It also relates to boxes or "kits" containing distinct groups of probes containing one of these HPV DNAs or HPV DNA fragments as well as to a method for the detection and identification of papillomaviruses using these different probes.

Description

Sondes à papillomayirus et procede de diagnostic in vitro d'infections à papillomavirus
L'invention concerne des ADNs de papillomavirus, et plus particullerement des sondes derivees de ces papillo virus. ainsi que des procédés les mettant en oeuvre pour le diagnostic in vitro d'infections a papillomavirus L expression "papillomavirus" recouvre un g grand nombre de virus ayant en commun d'étre tenus pour rssFon- sables de plusieurs formes d'infections virales s'etageant entre les verrues cutanés ou de muqueuses relativement bénignes et des hyperplasies susceptibles de dégénérer en néoplasies intra-epitheliales et en cancers cutanés. Parmi des infections å papillomavirus. on mentionnera également plus particulierement l'epidermodysplasie verruciforme.
Papillomayirus probes and method for in vitro diagnosis of papillomavirus infections
The invention relates to papillomavirus DNAs, and more particularly to probes derived from these papillo viruses. as well as methods implementing them for the in vitro diagnosis of papillomavirus infections The expression "papillomavirus" covers a large number of viruses having in common the fact that they are held responsible for several forms of viral infections. etagant between skin warts or relatively benign mucous membranes and hyperplasias likely to degenerate into intraepithelial neoplasias and skin cancers. Among papillomavirus infections. mention will also be made more particularly of epidermodysplasia verruciformis.

qui sera quelquefois ci-apres designée sous L'expression "EV"
Un certain nombre de types de papillomavirus a déJa etc decrit. Dans le cadre du brevet principal ont été dé- crits de nombreux types et sous-types nouveaux de papillo- mavirus qui ont ete isoles a partir de verrues ou lesions maculaires disseminées, susceptibles de donner lieu au développement precoce de cancers de la peau chez d'importantes proportions des malades qui en sont affec- tés.
which will sometimes be referred to below as "EV"
A number of types of papillomavirus have already been described. In the main patent, numerous new types and subtypes of papillomavirus have been described which have been isolated from warts or disseminated macular lesions, which may give rise to the early development of skin cancer in humans. 'large proportions of patients affected by it.

Des études récentes ont revele l importance de facteurs immunitaires et le r@le mateur de divers types de virus de papillomes humains (HPV) ces facteurs s'ajoutant au role dejà decrit dans la littérature de facteurs géne- tiques divers et des rayonnements actiniques dans la pathogenese des infections aux papillomavirus. Recent studies have revealed the importance of immune factors and the role of various types of human papillomavirus (HPV), these factors adding to the role already described in the literature of various genetic factors and actinic radiation in the pathogenesis of papillomavirus infections.

L'invention du brevet principal decoulait des observations qui avaient été faites quant aux comportements relatifs d'un grand nombre de papillomavirus nouvellement isoles. dont les caractéristiques génomiques essentielles ont été définies ci-apres.  The invention of the main patent was based on observations which had been made as to the relative behavior of a large number of newly isolated papillomaviruses. the essential genomic characteristics of which have been defined below.

Un nombre important de types et sous-types de papi Ilomavirus nouveaux ont etc decrits dans le brevet princi- pal. Il en a ete de meme de l'utilisation des ADNs de ces papillomavirus nouveaux, pris isolement ou en association, entre eux et/ou avec des ADNs d'HPV antérieurement connus, dans des techniques de diagnostic in vitro plus affinees. A significant number of new Ilomavirus papi types and subtypes have been described in the main patent. The same was true of the use of the DNAs of these new papillomaviruses, taken alone or in combination, with each other and / or with previously known HPV DNAs, in more refined in vitro diagnostic techniques.

D une facon generale. il a ete remarque dans le brevet principal que le; papillomavirus. bien que tres differents entre eux, avaient des tailles de l'ordre de 7000-8000 paires de bases. En outre, leurs génomes peuvent neanmoins présenter certains degres d homologle, evalues en pourcentages d'homologies entre type; et sous-types de papillomavirus, dans des essais d'hybridation realisés dans des conditions dites non strlngente ou non strictes ou encore dans des conditions d'hybridation stringente ou stricte. Generally speaking. it was noted in the main patent that the; papillomavirus. although very different from each other, had sizes in the range of 7000-8000 base pairs. In addition, their genomes may nevertheless present certain degrees of homologation, evaluated as percentages of homologies between types; and papillomavirus subtypes, in hybridization tests carried out under so-called non-stringent or non-strict conditions or even under stringent or strict hybridization conditions.

Il a ete dit que les papillomavirus qui présentent des pourcentages d'homologie inferieurs à 50 % dans des conditions strictes ou stringentes appartenaient a des types differents. Les virus pour lesquels on observe. dans ces conditions strictes ou stringentes, des pourcentages d'homologie superieurs a 50 % sont consideres comme appar. It has been said that the papillomaviruses which present percentages of homology lower than 50% under strict or stringent conditions belong to different types. The viruses for which we observe. under these strict or stringent conditions, percentages of homology greater than 50% are considered to be apparent.

tenant au même type. Ils peuvent former des sous-types différents au sein de ce même type
es essais d'horidation dans les conditions non strictes ou non stringentes impliquent la mise en contact mutuelle d'ADNs provenant de deux isolats de virus dans les conditions suivantes decrites par HEILMA.N C.A. et al, 1980. J. Virol., 38, 385-407. et CROISSANT et al. 1382.
belonging to the same type. They can form different subtypes within this same type
heidization tests under non-strict or non-stringent conditions involve the mutual contacting of DNAs from two virus isolates under the following conditions described by HEILMA.N CA et al, 1980. J. Virol., 38, 385-407. and CROISSANT et al. 1382.

C.R. Acad. Sc. Paris, 234. 581-585 (molecules heteroduplexes).C.R. Acad. Sc. Paris, 234. 581-585 (heteroduplex molecules).

Les essais d'hybridation dans les conditions strictes ou stringentes impliquent la mise en contact mutuelle d'ADNS provenant de deux isolats de virus dans les conditions decrites par KREMSDORF, D. et al. ((1982). Hybridization tests under strict or stringent conditions involve the mutual contacting of DNAs coming from two virus isolates under the conditions described by KREMSDORF, D. et al. ((1982).

a, Virol. 43:436-447 et 1383, a. Virol. 48:340-351) et
DAVIS R.W. et al., 1971, Methods Enzymol., 21, 413-428 (molécules hétéroduplexes)
Partant de ces considérations, plusieurs virus nouveaux ont fait l'obJet d'une description dans le brevet principal. De même ont été décrits des recombinants génétiques comprenant tout ou partie des génomes (dénommés
ADN-HPVs) de ces virus.L'invention du brevet principal concernait par conséquent chacun des ADN-HPVs choisis parmi l'ensemble des ADNs qui présentent des tailles qui s'etagent entre 7000 et 8000 paires de bases et sont caractérisés par les cartes de restriction qui apparaissent dans les dessins également reproduits dans cette demande, en ce qui concerne plus particuliérement les
ADN-HPVs obtenus a partir des papillomavirus et qui répondent aux désignations HPV-2d, HPV-10b, HPV-14a,
HPV-14b, HPV-15, HPV-17a, HPV-17b, HPV-19, HPV-20, HPV-21 HPV-22, HPV-23, HPV-24, HPV-28, HPV-29, HPV-31 et HPV-32.
a, Virol. 43: 436-447 and 1383, s. Virol. 48: 340-351) and
DAVIS RW et al., 1971, Methods Enzymol., 21, 413-428 (heteroduplex molecules)
Based on these considerations, several new viruses have been described in the main patent. Likewise, genetic recombinants have been described comprising all or part of the genomes (called
DNA-HPVs) of these viruses. The invention of the main patent therefore concerned each of the DNA-HPVs chosen from all of the DNAs which have sizes which range between 7000 and 8000 base pairs and are characterized by the maps of restriction which appear in the drawings also reproduced in this application, with regard more particularly to the
DNA-HPVs obtained from papillomaviruses and which correspond to the designations HPV-2d, HPV-10b, HPV-14a,
HPV-14b, HPV-15, HPV-17a, HPV-17b, HPV-19, HPV-20, HPV-21 HPV-22, HPV-23, HPV-24, HPV-28, HPV-29, HPV-31 and HPV-32.

L'invention du brevet principal concernait également des mélanges ou "cocktails" d'ADN-HPVs isolés a partir des papillomavirus nouveaux ou antérieurement connus. 9 la date de depot du brevet principal, ou des sondes d' hybridation les contenant susceptibles d'ètre mis en oeuvre plus efficacement pour le diagnostic de diverses catégories d'infections, voire des niveaux de risques qu'accompagnent la decouverte chez un patient de papillo- mavirus déterminés.Le nombre des sondes a papillomavirus décrites dans le brevet principal, auxquelles s'ajoutaient celles constituées a partir des ADNs génomiques de papillomavirus dé7a isoles précedemment et leurs associations dans des mélanges détermines, permet donc la réalisation de diagnostics affinés, notamment une grande discrimination des diverses catégories d'infections imputables aux divers types de papillomavirus ou susceptibles de se développer sous l'effet de ces derniers types et, au sein d'une catégorie d'infections déterminées, de mieux pronostiquer le degré de risque que ces derniéres se transforment en des maladies plus redoutables.En particulier. l'invention du brevet principal fournissait des moyens permettant, dans le cas des infections se manifestant par des épidermodysplasies verruciformes, de mieux apprécier le degré de risque que ces derniéres évoluent vers des cancers cutanés. The invention of the main patent also related to mixtures or "cocktails" of DNA-HPVs isolated from new or previously known papillomaviruses. 9 the date of filing of the main patent, or hybridization probes containing them likely to be implemented more effectively for the diagnosis of various categories of infections, or even of the levels of risk which the discovery in a patient of The number of papillomavirus probes described in the main patent, to which were added those constituted from the genomic DNAs of papillomavirus previously isolated and their associations in determined mixtures, therefore makes it possible to carry out refined diagnoses, in particular great discrimination between the various categories of infections attributable to the various types of papillomavirus or likely to develop as a result of the latter types and, within a given category of infections, to better predict the degree of risk than these the latter turn into more formidable diseases. In particular. the invention of the main patent provided means making it possible, in the case of infections manifested by epidermodysplasia verruciformis, to better appreciate the degree of risk that these latter evolve towards skin cancers.

A ce titre, 1' invention du brevet principal concer nait plus particulierement des compositions de diagnostic; un groupe de compositions préférées était défini comme contenant 1) au moins l'ADN de l'HPV2d, 2) au moins l'un des ADNs de HPV10b, 28 et 29, 3) au moins l'un des ADNs de HPV17, 24, 4) au moins l'un des ADNS de HPV14, 15, 17, 19, 20. 21, 22
et 23, 5) au moins l'un des ADNs de HPV15 et 17, 6) l'ADN de HPV24, 7) l'ADN de HPV14, 32, 8) l'ADN de HPV31, 9) l'ADN de HPV32, étant entendu que les ADNs des neuf groupes étaient choisis de façon à être en toutes circonstances différents les uns des autres.
As such, the invention of the main patent relates more particularly to diagnostic compositions; a group of preferred compositions was defined as containing 1) at least the DNA of HPV2d, 2) at least one of the DNAs of HPV10b, 28 and 29, 3) at least one of the DNAs of HPV17, 24 , 4) at least one of the DNAs of HPV14, 15, 17, 19, 20. 21, 22
and 23, 5) at least one of the DNAs of HPV15 and 17, 6) the DNA of HPV24, 7) the DNA of HPV14, 32, 8) the DNA of HPV31, 9) the DNA of HPV32 , it being understood that the DNAs of the nine groups were chosen so as to be in all circumstances different from each other.

Dans les figures t a 9 des dessins ci-annexés, sont représentées les cartes physiques de restriction des
ADN-HPVs concernes.
In Figures ta 9 of the accompanying drawings, the physical restriction maps of the
DNA-HPVs concerned.

Les cartes physiques donnent la position de sites de coupure par diverses endonucléases de restriction. The physical maps give the position of sites of cleavage by various restriction endonucleases.

L'origine des cartes est genéralement constituée par un site unique de coupure. Les distances a l'origine sont exprimées en pourcentage de longueur de génome.The origin of the cards is generally made up of a single clipping site. Distances to origin are expressed as a percentage of genome length.

La présente invention concerne des papillomavirus nouvellement isolés, les ADNs génomiques qui peuvent en être extraits ou des fragments de ces ADNs génomiques, ainsi que de nouvelles sondes d'hybridation qui peuvent etre formées a partir de ces ADN-HPVs ou fragments d'ADN-HPVs. The present invention relates to newly isolated papillomaviruses, genomic DNAs which can be extracted therefrom or fragments of these genomic DNAs, as well as new hybridization probes which can be formed from these DNA-HPVs or DNA fragments. HPVs.

L' invention concerne encore des "cocktails" nouveaux de sondes les contenant ou leur utilisation dans des "CLCKtails" de sondes déjà decrits dans le brevet princi. The invention also relates to novel "cocktails" of probes containing them or their use in "CLCKtails" of probes already described in the main patent.

pal, cependant complétés avec l'un ou l'autre des ADN-HPVs faisant l'obJet de la présente demande et. par consequent, des trousses ou "kits" de diagnostie encnre davantage perfectionnes.pal, however supplemented with one or other of the DNA-HPVs which are the subject of the present application and. therefore, more sophisticated diagnostic kits or "kits" are available.

L ADN-HPVs selon la presente invention sont caracterises par les cartes de restrictions faisant les omets de la figure 10 et respectivement dénommés HPV-IP2 et
HPV-IP4.
The DNA-HPVs according to the present invention are characterized by the restriction maps making the omits in FIG. 10 and respectively called HPV-IP2 and
HPV-IP4.

Une sonde d'hydridation construite a partir du gé- nome d HPV-IP2 est particulièrement utile pour le diag- nos tic et/ou le depistage in vitro, dans les conditions qui ont éte décrites dans le brevet principal et qui seront encore décrites plus loin, des types de papillomavi- rus qui conxtitjent un risque pour la developpement de néoplasmes genitales et. en particulier, de cancers du col de l'utérus.  A hydridation probe constructed from the genome of HPV-IP2 is particularly useful for diagnosis and / or in vitro screening, under the conditions which have been described in the main patent and which will be described further. far, types of papillomavirus which conxtitj a risk for the development of genital neoplasms and. in particular, cervical cancer.

Une sonde d hybridation construite a partir de
HPV-IP4 est particulierement utile pour le diagnostic et/ou le dépistage in vitro des types de papillomsvirus constituant un risque pour le développement de leaions précancéreuses ou cancéreuses de la peau,
Cas sonde d' hybridation seront avantageusement incorporées aux mélanges de diagnostic des affections du mème type sur lesquels il sera revenu plus loin.
A hybridization probe constructed from
HPV-IP4 is particularly useful for the diagnosis and / or the screening in vitro of the types of papilloms virus constituting a risk for the development of precancerous or cancerous leaions of the skin,
Hybridization probe cases will advantageously be incorporated into the diagnostic mixtures of affections of the same type to which it will be discussed later.

L'invention concerne également des fragments des
ADN HPVs précédents ou capables de s'hybrider avec ceux- ci. notamment dans des conditions strictes. De même, elle concerne les ADNs recombinants contenant tout ou partie de chacun des ADN-HPVs sus-indiqués. et plus particulièrement des ADNs recombinants contenant des fragments correspondant aux gênes El, E6-E7, L1 et L2 respectivement ou encore des fragments contenant des séquences correspondant aux régions intergéniques desdits ADN-MPvs. Elle concerne enf;n les sondes qui peuvent être constituées a partir de ces ADN-HPVs respectifs ou a partir des fragments correspondants et les procédés de diagnostic in vltro mettant en Jeu lesdites sonde s
Les préparstions d ADN viral or:: ete extraites selon les techniques qui seront decrites ci-apresdans les exemples 1 et 2.
The invention also relates to fragments of
DNA HPVs previous or able to hybridize with these. especially under strict conditions. Likewise, it relates to the recombinant DNAs containing all or part of each of the DNA-HPVs mentioned above. and more particularly recombinant DNAs containing fragments corresponding to the genes El, E6-E7, L1 and L2 respectively or alternatively fragments containing sequences corresponding to the intergenic regions of said DNA-MPvs. Finally, it relates to the probes which can be constituted from these respective DNA-HPVs or from the corresponding fragments and the in vltro diagnostic methods involving said probes.
The preparations of viral DNA or :: were extracted according to the techniques which will be described below in Examples 1 and 2.

Dans ce qui suit seront decrites de facon plus precise les condition; dans lesquelles les virus ont ete isoles. puis les condition-, dans lesqaelles ont eté obtenus les ADN-HPVs a partir de ces virus
Clonage moléculaire et caractérisation d'@@ nouveau type d'HPV associé a des neoplasies et a des cancers oenitaux (HPV IP2).
In what follows, the conditions will be described more precisely; in which viruses have been isolated. then the conditions, in which the DNA-HPVs were obtained from these viruses
Molecular cloning and characterization of @@ new type of HPV associated with neoplasias and enenital cancers (HPV IP2).

Un nouveau type d'HPV a ete mis en évidence dans l'ADN extrait d'un cancer du col de 1 uteras. par hy@ri- dation. dans des conditions non strietes avec une sonde radioactive specifique du HPV type 16. Aucune hybridation croisée n'etart détectable lorsque l'hyoridation etait effectuez dans des conditions strictes d'hybridation. ce etude de la sensibilite de l'ADN de cet HPV à plusieurs enzymes de restrrction a montre que l'enzyme Bglll coupait une fois l'ADN viral. Après digestion de l'ADN extrait de la tumeur par l'endonucléase Bglll. la fraction renfermant des molecuîes d'ADN de 8kb (taille d'un génome de papillo- mavirus) ont éte purifies par centrifugation dans un gradient de saccharose.Les molécules de Skb ont éte insé- rées, par le site Bgill. dans un vecteur constitue du plasmide PL15.5 (renfermant un site unique de coupure par
BglII et par BamHI) inséré par son site BamHI. dans l'ADN du bactériophage lambda L47.1. Après encapsidation de l'ADN recombinant et infection de bactéries hôtes (Escherichia coli, souche LA101), les plages de lyse correspondant à des phages recombinants ont été détectées par hybridation de répliques des cultures bactériennes infectees, avec un ADN de HPV16 radioactif, dans des conditions non strictes.Plusieurs bactériophages recombinants, contenant la totalité des séquences virales. ont été isolés la coupure de l'ADN phagique par l'enzyme d'insertion
BglII engendre un fragment de Ekb hybridant avec la sonde HPV16 dans des conditions non strictes ; la coupure de l'ADN des phages recombinants et de l'ADN de la tumeur d'origine par melange des enzymes BglII et PstI engendre les mêmes 5 fragments dans la somme des poids moléculaires est égale à la taille d'un génome des papillomavirus.
A new type of HPV has been detected in DNA extracted from cervical cancer from 1 uteras. by hy @ ridation. under non-striated conditions with a radioactive probe specific for HPV type 16. No cross-hybridization is detectable when the hybridization was carried out under strict hybridization conditions. this study of the sensitivity of the DNA of this HPV to several restriction enzymes showed that the enzyme Bglll cut the viral DNA once. After digestion of the DNA extracted from the tumor with the Bgl11 endonuclease. the fraction containing 8kb DNA molecules (size of a papillomavirus genome) were purified by centrifugation in a sucrose gradient. The Skb molecules were inserted via the Bgill site. in a vector constitutes plasmid PL15.5 (containing a single site for cleavage by
BglII and by BamHI) inserted by its BamHI site. in the DNA of bacteriophage lambda L47.1. After packaging of the recombinant DNA and infection of host bacteria (Escherichia coli, strain LA101), the lysis plaques corresponding to recombinant phages were detected by hybridization of replicates of the infected bacterial cultures, with a radioactive HPV16 DNA, in non-strict conditions. Several recombinant bacteriophages, containing all the viral sequences. have been isolated the cut of phage DNA by the insertion enzyme
BglII generates an Ekb fragment hybridizing with the HPV16 probe under non-strict conditions; cutting the DNA of the recombinant phages and the DNA of the original tumor by mixing the enzymes BglII and PstI generates the same 5 fragments in the sum of the molecular weights is equal to the size of a genome of the papillomaviruses.

L'ADN du nouvel HPV a été excisé de l'ADN des bactériophages recombinants, purifié par électroélution, et recloné dans le plasmide PL15.5. Une carte de restriction de l'ADN viral a été établie à partir de la sensibilité de cet ADN à 18 endonucléases de restriction, ce qui a permis de localiser 21 sites de coupure (figure 9). La carte ainsl établie est differente de la carte des génomes des HPV identifiés à ce Jour. L'homologie de séquence entre l'ADN du nouvel HPV et l'ADN des HPV identifiés à ce Bour a été analyse par des expériences d'hybridation moleculaire sur réplique effectuees dans des conditions strictes. L'homologie détectée toujours été inférieure à 5 7., la plus grande homologie étant détectée avec le génome du HPV16.The DNA of the new HPV was excised from the DNA of the recombinant bacteriophages, purified by electroelution, and recloned in the plasmid PL15.5. A restriction map of viral DNA was established from the sensitivity of this DNA to 18 restriction endonucleases, which made it possible to locate 21 cleavage sites (FIG. 9). The map thus established is different from the map of the genomes of the HPVs identified to date. The sequence homology between the DNA of the new HPV and the DNA of the HPVs identified with this Bour was analyzed by replica molecular hybridization experiments carried out under strict conditions. The homology detected was always less than 5 7, the greatest homology being detected with the genome of HPV16.

Le nouveau virus caractérisé à partir d'un cancer du col de l'utérus constitue donc un nouveau type d'HPV, provisoirement dénommé HPVIP2.The new virus characterized from cervical cancer therefore constitutes a new type of HPV, provisionally known as HPVIP2.

L'analyse, au microscope électronique. de molécules héréroduplexes formees, dans différentes conditions, entre l'ADN de HPVIP2 et l'ADN du HPVI a permis d'aligner les cartes physiques de ces 2 genomes et de définir la position théorique des différents gènes portés par l'ADN de l'HPVIP2.  Analysis, using an electron microscope. of hereroduplex molecules formed, under different conditions, between the DNA of HPVIP2 and the DNA of HPVI made it possible to align the physical maps of these 2 genomes and to define the theoretical position of the different genes carried by the DNA of the HPVIP2.

LOCALISATION PUTATIVE DES PRINCIPAUX GENES ET DE LA REGION INTRAGENIQUE DU HPV-IP2 SUR LA CARTE DE CE GENOME
Coordonnées des extrémités
5' 3'
E6-E7 62 71,5
El 71 95
E2 95.5 11.5
L2 11 30.5 L1 31,5 52
Région intergénique 52 63,5
L'utilisation de sondes radioactlves préparées à partir de l'ADN de l HPVIP2 purifié a permis de determiner le pouvoir pathogène de ces virus. L ADN du HPVIP2 a été mis en évidence dans un cas de papules bowenoïdes des organes génitaux externes sur les 14 étudiés. dans 2 cancers invasifs du col de l'utérus sur les 51 etudiés et dans 1 cas de néoplasie intraépithéliale du col de l'utérus sur les 28 étudiés.HPVIP2 constitue donc un type d'HPV à tropisme génital présentant un potentiel oncogène. dont la fréquence est un peu inférieure à celle du HPV'a, et nettement inférieure å celle du HPV16. Il est nécessaire de l incorporer à tout mélange d'ADN d'HPV destine a la préparation de sondes moléculaires, en vue du diagnostic ou du dépistage des types d'HPV constituant un risque pour le développement de néoplasies génitales et. en particulier, de cancers du col de l'utérus,
Clonaae moléculaire et caractérisation d'un nouveau tvoe d'HPV associé à des lésions Drécancéreuses de la peau (HPV
IP4).
PUTATIVE LOCATION OF THE MAIN GENES AND THE INTRAGENIC REGION OF HPV-IP2 ON THE MAP OF THIS GENOME
End coordinates
5 '3'
E6-E7 62 71.5
El 71 95
E2 95.5 11.5
L2 11 30.5 L1 31.5 52
Intergenic region 52 63.5
The use of radioactive probes prepared from the DNA of the purified HPVIP2 made it possible to determine the pathogenic power of these viruses. HPVIP2 DNA was detected in one case of bowenoid papules of the external genitalia out of the 14 studied. in 2 invasive cervical cancers out of the 51 studied and in 1 case of intraepithelial cervical neoplasia out of the 28 studied. HPVIP2 therefore constitutes a type of HPV with genital tropism presenting an oncogenic potential. whose frequency is slightly lower than that of HPV'a, and much lower than that of HPV16. It is necessary to incorporate it into any mixture of HPV DNA intended for the preparation of molecular probes, with a view to the diagnosis or screening of the types of HPV constituting a risk for the development of genital neoplasias. in particular, cervical cancer,
Molecular clonaae and characterization of a new HPV tvoe associated with Cancerous skin lesions (HPV
IP4).

Un nouveau type d'HPV a été mis en évidence dans lADN extrait d'une biopsie de kératose actinique. une lésion précancéreuse cutanée, par hybridation moléculaire. A new type of HPV has been detected in DNA extracted from a biopsy of actinic keratosis. a precancerous skin lesion, by molecular hybridization.

dans des conditions strictes, avec un mélange avec des sondes radioactives spécifiques des HPV type 5, 8 et 14. under strict conditions, with a mixture with radioactive probes specific for HPV type 5, 8 and 14.

Aucune hybridation croisée n'a été détectée lorsque l'hybridation a été effectuée des sondes specifiques des types 1,2,3,7,10,13,16,18,28, IP1 (précédemment denommé HPV31
IP2, et IP3 (précédemment dénommé HPV32).
No cross-hybridization was detected when the hybridization was carried out with specific probes of the 1,2,3,7,10,13,16,18,28, IP1 types (previously called HPV31
IP2, and IP3 (previously called HPV32).

Une etude de la sensibilité de l'ADN de cet HPV a plusieurs enzymes de restriction a montré que l'enzyme
EcoRI coupe une fois l'ADN viral. Apres digestion de l'ADN extrait de la biopsie par l'endonuclease EeoRI. la friction renfermant des molécules d'ADN de skb (taille d'an génome de pap;llomavirus) a eté purifies par centrifags un dans un gradient de saccharose. Les mosecules 8kb ont carte insérees. par le site EcoRI, dans l'ADN du bacteriophage ss gt wes. B.Après encapsidation de l'ADN recombi- nant et infection de bactéries hotes (Escherichia col, souche LA101), les plages de lyse correspondant à des phages recombinants ont été detectées par hybridation de répliques des cultures bacteriennes infe mélange radioactif des ADN de HPVs, 8. et 14. dans des conditions non strictes.Plusieurs bacteriophages recombinants. contenant la totalite des sequences virales ont été isolés : la coupure de l'ADN phagique par l'enzyme dinsertion EcoR 1 engendre un fragment de 9kb hybridant avec la sonde spécifique des HPV5,S et 14 dans des conditions non strictes : la coupure de 1 ADN de phages recom- binants et de l'ADN de la lesion d'origine par le mélange des enzymes EcoRI et PstI engendre les mêmes 6 fragments dont la somme des polds moléculaires est égale a la taille d'un génome des paplliomavlrus. L'ADN du nouvel HPV a été excisé de l'ADN d'un bactériophage recombinant, purifié par électroélution. et recloné dans le plasmide P@P65. Une carte- de restriction de l'ADN viral a eté établie à partir de la sensibilité de cet ADN à 15 endonotléases de res- triction, ce qui a permis de localiser 23 sites de coupure (figure 10). La carte ainsi établié est différente de la carte des gnomes des HPV identifiés a' ce jour.
A study of the DNA sensitivity of this HPV to several restriction enzymes has shown that the enzyme
EcoRI cuts viral DNA once. After digestion of the DNA extracted from the biopsy by the endonuclease EeoRI. friction containing skb DNA molecules (pap genome size; llomavirus) was purified by centrifugation in a sucrose gradient. The 8kb mosecules have card inserted. by the EcoRI site, in the DNA of bacteriophage ss gt wes. B. After packaging of the recombinant DNA and infection of host bacteria (Escherichia col, strain LA101), the lysis plaques corresponding to recombinant phages were detected by hybridization of replicates of the bacterial cultures by radioactive mixture of the DNA of HPVs , 8. and 14. under non-strict conditions. Several recombinant bacteriophages. containing all the viral sequences have been isolated: the cleavage of phage DNA by the insertion enzyme EcoR 1 generates a fragment of 9kb hybridizing with the specific probe of HPV5, S and 14 under non-strict conditions: the cleavage of 1 DNA from recombinant phages and DNA from the original lesion by mixing the enzymes EcoRI and PstI generates the same 6 fragments whose sum of molecular polds is equal to the size of a genome of paplliomavlrus. The DNA of the new HPV was excised from the DNA of a recombinant bacteriophage, purified by electroelution. and recloned into the plasmid P @ P65. A restriction map of viral DNA was established on the basis of the sensitivity of this DNA to 15 restriction endonotlases, which made it possible to locate 23 cleavage sites (FIG. 10). The map thus established is different from the map of HPV gnomes identified to date.

L'homologie de séquence entre l'ADN du nouvel HPV et l'ADN des HPV identifiés à ce Jour a été analysée par de expériences d'hybridation moléculaire sur réplique effectuées dans des conditions strictes. Une homologie, inférieure à 50 Z. a eté détectée entre l'ADN du nouvel HPV et l'ADN de certains types d'HPV precedemment identifiés dans des lesions d'epidermodysplasie verruciforme @@PV5.8.12.14. - 19.20,21 et 25), mais aucune homologie n'a été détectée avec les autres types d'HPV Le nouveau virus caractérisé a partir d'une kératose actinique constitue donc n nou- veau type d'HPV provisoirement denommé HPVIP4.The sequence homology between the DNA of the new HPV and the DNA of the HPVs identified to date has been analyzed by replica molecular hybridization experiments carried out under strict conditions. A homology of less than 50% has been detected between the DNA of the new HPV and the DNA of certain types of HPV previously identified in lesions of epidermodysplasia verruciformis @@ PV5.8.12.14. - 19.20, 21 and 25), but no homology was detected with the other types of HPV The new virus characterized from actinic keratosis therefore constitutes a new type of HPV provisionally called HPVIP4.

L utilisation d'une sonde radioactive preparée a partir de l'ADN de l'HPVIP4 purifie a permis de mettre en evidence HPVIP4 cnez 42 % des 17 patients atteints d'épidermodysplasie verruciforme etudies et dans x sur y des biopsies de kératose actinique analysées. Du fait de sa grande frequence chez les malades atteints d épidermodys- plasie verruciforme. une maladie caractérisee par le dé veloppement fréquent de cancers cutanes, et de son asso- ciation a une fraction des lès ions de keratose actinique considerees comme précurseurs de cancers spinocelluiarres de la peau, HPVIP4 constitue un type d'HPV a tropisome cutane présentant un potentiel oncogene.Il est nécessaire de l'incorporer a tout melange d ADN d'HPV destiné a la preparation de sondes moleculaires en vue du diagnostic ou du depistage des types d'HPV constituant an risque pour le développement de lésions precancereuses ou cancéreuses de la peau. The use of a radioactive probe prepared from purified HPVIP4 DNA made it possible to demonstrate HPVIP4 in 42% of the 17 patients with wart-shaped epidermodysplasia studied and in x out of y biopsies of actinic keratosis analyzed. Because of its great frequency in patients suffering from epidermodysplasia verruciformis. a disease characterized by the frequent development of skin cancers, and its association with a fraction of the lesions of actinic keratosis considered as precursors of squamous cell cancer of the skin, HPVIP4 constitutes a type of HPV with tropisome cutaneous presenting a potential It is necessary to incorporate it into any mixture of HPV DNA intended for the preparation of molecular probes for the diagnosis or screening of the types of HPV constituting a risk for the development of precancerous or cancerous lesions of the skin. .

Etant donné la grande diversité des HPVs suscepti- bles d'étre isolés à partir des différentes formes de ver r@es ou autres lésions cutanées ou de muqueuses. il est cependant préféré d'utiliser, pour le diagnostic de chaque type d'affection mentionne dans le tableau, des me anges comportant plus d'un ou deux ADN-HPVs, des lors que d'au- tres ADN-HPVs ont et reconnus cumme pouvant également ln- tervenir dans le développement du même type d'affection. Given the great diversity of HPVs capable of being isolated from the different forms of worms or other skin or mucosal lesions. it is however preferred to use, for the diagnosis of each type of affection mentioned in the table, angels comprising more than one or two DNA-HPVs, when other DNA-HPVs have and recognized it can also be used in the development of the same type of affection.

Le diagnostic de la nature de l'infection et de son evolution possible sera d'autant plus efficace que le nombre de sondes utilisées sera plus élevé. En outre, des essais d'hybridation réalisés avec des mélanges différents de sondes permettra des diagnostics différentiels présentant un degré de probabilité également plus important de la nature du mal dont souffre le patient.The diagnosis of the nature of the infection and its possible evolution will be all the more effective as the number of probes used will be higher. In addition, hybridization tests carried out with different mixtures of probes will allow differential diagnoses having an equally greater degree of probability of the nature of the disease from which the patient suffers.

L'invention concerne donc plus particuliérement encore des mélanges ou cocktails de différents ADNs-HPVs (ou sondes contenant ces ADNs-HPVs ou de séquences de ces dernlers), susceptibles d'etre utilisés en combina son pour réaliser des diagnostics globaux des différentes formes d'infections a papillomavirus éventuellement aux fins de pronostiquer l'évolution possible de l'infection. The invention therefore relates more particularly still to mixtures or cocktails of different DNAs-HPVs (or probes containing these DNAs-HPVs or of sequences of these latter), capable of being used in combination to carry out global diagnostics of the different forms of papillomavirus infections possibly for the purpose of predicting the possible course of the infection.

Des mélanges preférés conformes à 1' invention sont identifiés dans le tableau ci-après TASLEAU
CARACTERISTIQUES DES MELANGES D'ADN D'HPV UTILISABLES POUR LE DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE
D'INFECTIONS A PAPILLOMAVIRUS Désifgnation Constitution ) Maladies à diagnostiquer des mélanges 1 1,2d*,4 Verrues cutanées ou mugueueses
(en particulier, verrues vulgaires et plantaires).
Preferred mixtures in accordance with the invention are identified in the table below TASLEAU
CHARACTERISTICS OF HPV DNA MIXTURES FOR USE IN VIROLOGICAL DIAGNOSIS
PAPILLOMAVIRUS INFECTIONS Designation Constitution) Diseases to be diagnosed with mixtures 1 1,2d *, 4 Warts of the skin or thrush
(in particular, common and plantar warts).

Diagnostic différentiel de l'épidermodysplasie
verruciforme.
Differential diagnosis of epidermodysplasia
verruciform.

2 3,10a,10b*,28*,29* Verrues planes ou intermédiaires cutanées ou mu
queuses. Néoplasies intraépithéliales et cancers
cutanés. Diagnostic différentiel de l'épidermodys
plasie verruciforme.
2 3.10a, 10b *, 28 *, 29 * Flat or intermediate skin warts or mu
women. Intraepithelial neoplasias and cancers
skin. Differential diagnosis of epidermodys
warty plasia.

3 5,17a*, 24* Epidermodysplasie verruciforme. Néoplasies intra
épithéliales et cancers cutanés.
3 5.17a *, 24 * Epidermodysplasia verruciformis. Intra neoplasias
epithelial and skin cancer.

4 5,8,12,14a*,14b*,19*,20*,21*,22*,IP4 Epidermodysplasie verruciforme.4 5,8,12,14a *, 14b *, 19 *, 20 *, 21 *, 22 *, IP4 Epidermodysplasia verruciformis.

5 9,15*,17a*,17b Epidermodysplasie verruciforme.5 9.15 *, 17a *, 17b Epidermodysplasia verruciformis.

6 24* Epidermodysplasie verruciforme.6 24 * Epidermodysplasia verruciformis.

7 5,8,14b*,32* ,IP4 Cancers cutanés de l'épidermodysplasie verruciforme.7 5,8,14b *, 32 *, IP4 Skin cancer of epidermodysplasia verruciformis.

Néoplasies intraépithéliales et cancers cutanés. Intraepithelial neoplasia and skin cancer.

8 13,31* Hyperplasie épithéliale focale orale ; Diagnostic
différentiel des néoplasies intraépithéliales
orales.
8 13.31 * Oral focal epithelial hyperplasia; Diagnostic
differential of intraepithelial neoplasias
oral.

9 32*, IP4 Néoplasies intraépithéliales et cancers cutanés. 9 32 *, IP4 Intraepithelial neoplasias and skin cancers.

1) Les nouveaux types d'HPV entrant dans la constitution des mélanges de sondes sont indigués par un astérisoue
Le tableau susdit indique également les natures des affections susceptibles d'être plus particulièrement diagnostiquées par l'utilisation des mélanges figurant dans la partie gauche du tableau. Il est rappele que les cartes de restriction des autres ADN-HPVs identifies dans le tableau qui précede sont contenues dans les figures 1 à 9.
1) The new types of HPV used in the constitution of probe mixtures are indicated by an asterisk
The above table also indicates the natures of the conditions likely to be more particularly diagnosed by the use of the mixtures appearing on the left part of the table. It is recalled that the restriction maps of the other DNA-HPVs identified in the above table are contained in Figures 1 to 9.

Il est a remarquer que le HPV-IP2 peut etre consi- déré comme particuliérement representatif de sondes utilisables pour la detection des risqoes de développement de neoplasies genitales et en particul@er. de cancers du col de l'uterus. It should be noted that the HPV-IP2 can be considered as particularly representative of probes usable for the detection of the risks of development of genital neoplasias and in particular. cervical cancer.

L'invention concerne donc plas particuliérement encore des trousses ou "kits" de diegnostic comprenant au moins 10 groupes figurant dans les groupes numerote-s de t à 10 dans le tableau sous la rubrique "Designation des mélanges"
Dans ce qui precéde. on a surtout envisage- l'utili- sation, à titre de sondes. des ADN MPVs entiers clones.
The invention therefore relates more particularly to kits or "kits" for diagnosis comprising at least 10 groups appearing in groups numbered from t to 10 in the table under the heading "Designation of mixtures"
In the above. we mainly considered the use, as probes. whole cloned DNA MPVs.

Ceux-ci peuvent cependant être ubstitues par de fragments clonés de ces differents ADNs. notamment par les gènes El ou L1 et par les gènes E6-E7.These can however be ubstituted by cloned fragments of these different DNAs. in particular by the El or L1 genes and by the E6-E7 genes.

Le principe de base des detectlons in v-ltro d'ADN-
HPV mettra naturellement en Jeu des nybridations opérees dans des conditions strictes ou moins strictes. On peut opérer par exemple comme suit. cnt @aturellement entendu que les essaIs de diagnostic décrits ne sauraient etre considérés $comme limitatifs des conditions d'emploi des sondes ou mélanges de sonde. selon l'invention.
The basic principle of DNA detection in v-ltro-
HPV will naturally put into play hybridizations operated under strict or less strict conditions. One can operate for example as follows. It was of course understood that the diagnostic tests described cannot be considered as limiting the conditions of use of the probes or mixtures of probes. according to the invention.

L'objet des examens mettant en Jea des sondes preparees a partir de mélanges d'ADNs Je YPVs clonés est de mettre en évidence un HPV et d'identifier le type d'HPV dans une biopsie, dans des cellules obtenues par grattage de lésions, ou dans des coupes de biopsies fixes par le mélange de Carnoy (éthanol. chloroforme, acide acétique 6:3:1) et incluses dans la paraffine.L'examen nécessite l'extraction préalable de l'ADN des prelevements selon des méthodes dont le principe est connu et met en Jeu l'analy- se de cet ADN par des expêrlences d'hybridation molecu- laire, effectuées dans des conditions strictes ou moins strictes, a l'aide de sondes rauioactives (marquees au 32p ou au 35S) préparees à partir de melanges d'ADN HPVs. Chaque examen requiert. en general. l'otilisation de plusieurs melanges de sondes. The purpose of examinations using probes prepared from mixtures of cloned I YPVs DNAs is to reveal an HPV and to identify the type of HPV in a biopsy, in cells obtained by scraping lesions, or in fixed biopsy sections by the Carnoy mixture (ethanol. chloroform, acetic acid 6: 3: 1) and included in the paraffin. The examination requires the prior extraction of DNA from the samples according to methods including principle is known and involves the analysis of this DNA by molecular hybridization experiments, carried out under strict or less strict conditions, using rauioactive probes (marked with 32p or 35S) from HPVs DNA mixtures. Each exam requires. in general. the use of several mixtures of probes.

Plusieurs methodes d'hybridation beuvent étre utilisées. On peut. par exemple. -,ettre -en oeuvre s méthode d'hybridation sur tache. Cette méthode comporte. apre dénaturation de l'ADN. le depêt d'une quantité aliquote d'ADN sur des membranes (nitrocellulose ou
GenescreenpIus). l'hybridation de chaque membrane. dans les conditions usuelles, avec un mélange de sondes et la detectian des hybrides radioactifs par expasition des membranes au contact d un film radiographique.On peut aussi utiliser une methode d'hybridation sur réplique,
Cette methode comprend la separation electrophorétique en gel d'agarose des fragments d'ADN engenores aprés traitement de l'ADN par des enzymes de restriction transfert des fragments, apres dénaturation alcaline. sur des membranes (nitrocellulose, Genesoreenplus) et leur hybridation, dans les conditions usuelles, avec differents mélanges de sondes, La formation d'hybrIdes radioactifs est detectée aprés exposition des membranes au contact d'un film radiographique.
Several hybridization methods can be used. We can. for example. -, be -in work s hybridization method on spot. This method includes. after denaturation of DNA. deposition of an aliquot of DNA on membranes (nitrocellulose or
GenescreenpIus). the hybridization of each membrane. under the usual conditions, with a mixture of probes and the detectian of radioactive hybrids by expasition of the membranes in contact with an x-ray film. We can also use a hybridization method on replica,
This method comprises the electrophoretic separation in agarose gel of the DNA fragments generated after treatment of the DNA with restriction enzymes transfer of the fragments, after alkaline denaturation. on membranes (nitrocellulose, Genesoreenplus) and their hybridization, under usual conditions, with different mixtures of probes, The formation of radioactive hybrids is detected after exposure of the membranes to contact with an x-ray film.

On peut aussi avoir recours à une méthode d'hybri- dation in situ. par exemple sur des coupes de tissus fixés par le mélange de Carnoy et incluses dans la paraffine. An in situ hybridization method can also be used. for example on tissue sections fixed by the Carnoy mixture and included in the paraffin.

Les sondes radioactives sont constituées soit par des ADNs d'HPVs marqués par la méthode de "nick-translation". soit par d*s ARNs préparés par transcription d'ADNs viraux insérés dans un vecteur, par exemple de type SPE. L'utilisation de sondes radioactives présente l'avantage d'une grande sensibilité. mais ceci n'exclut pas l'utilisation de sondes non radioactives par exemple biotinylées et susceptibles d'être reconnues par des anticorps soit marqués eux-memes, soit eux-memes reconnus par des anticorps portant un marqueur enzymatique, fluorescent, etc. The radioactive probes consist either of HPV DNAs labeled by the "nick-translation" method. either by RNAs prepared by transcription of viral DNAs inserted into a vector, for example of the SPE type. The use of radioactive probes has the advantage of great sensitivity. but this does not exclude the use of non-radioactive probes, for example biotinylated and capable of being recognized by antibodies either labeled themselves, or themselves recognized by antibodies carrying an enzymatic, fluorescent marker, etc.

L'invention concerne donc encore des nécessaires ou "kits" contenant une pluralité des sondes sus-indiquées, et comprennent - HPV-IP2 et HPV-IP4 respectivement pris de façons isoliées, - soit les sondes précédentes, en mélange avec d'autres. The invention therefore also relates to kits or "kits" containing a plurality of the above-mentioned probes, and comprise - HPV-IP2 and HPV-IP4 respectively taken in isolation, - either the preceding probes, mixed with others.

notamment celles définies plus haut, ces "kits" étant destiné à des études de diagnostic in vitro par hybridation entre des préparations virales obtenues a partir de patients et les divers groupes ou mélanges.in particular those defined above, these "kits" being intended for in vitro diagnostic studies by hybridization between viral preparations obtained from patients and the various groups or mixtures.

Comme il va de soi et comme il résulte d'ailleurs délà de ce qui précéde, l'invention ne se limite nuilement à ceux de ses modes d'application et de réalisation qu; ont été plus specialement envisages ; elle en embrasse au contraire toutes les variantes ; notamment la référence dans les revendications à une désignation ADN-HPV suivie d'un nombre determiné, et à laquelle correspond un ADN-HPV dont la carte de restriction a été fournie dans les dessins, s'entend comme signifiant que ces revendications couvrent tous les ADN -HPVs qui ont en commun avec cet
ADN-HPV particulier de pouvoir être classés dans le meme type, selon la définition qui en a été donnée plus haut, et a fortiori aux ADN-HPV appartenant au meme sous-type.
As it goes without saying and as it follows moreover from what precedes, the invention is only limited to those of its modes of application and embodiments; have been more specifically considered; on the contrary, it embraces all its variants; in particular the reference in the claims to a DNA-HPV designation followed by a predetermined number, and to which corresponds a DNA-HPV whose restriction map has been provided in the drawings, is understood to mean that these claims cover all of the DNA -HPVs that have in common with this
DNA-HPV particular to be able to be classified in the same type, according to the definition which was given above, and a fortiori to DNA-HPV belonging to the same subtype.

On notera que les ADNs recombinants désignés ci-après ont été déposés le 3 Mai 1985 a la C.N.C.M. It will be noted that the recombinant DNAs designated below were deposited on May 3, 1985 at the C.N.C.M.

(Collection Nationale des Cultures de Micro-Organismes de l'INSTITUT PASTEUR de Paris), sous les numéros apparaissant ci-après
PLI55/IP2................ n I-450
pSP65/IP4 n I-449
(National Collection of Cultures of Micro-Organisms of the INSTITUT PASTEUR of Paris), under the numbers appearing below
PLI55 / IP2 ................ n I-450
pSP65 / IP4 n I-449

Claims (7)

REVENDICATIONS 1 - ADN-HPV ayant une taille comprise entre environ 7000 et environ 8000 paires de bases ou un fragment de cet 1 - DNA-HPV having a size of between approximately 7000 and approximately 8000 base pairs or a fragment of this ADN-HPV, cet ADN-HPV consistant en une variante desDNA-HPV, this DNA-HPV consisting of a variant of ADN-HPVs définis dans le brevet principal, cet ADN-HPV étant obtenu a partir d'un des papillomavirus repondant aux designations HPV-IP2 et HPV-IP4.DNA-HPVs defined in the main patent, this DNA-HPV being obtained from one of the papillomaviruses corresponding to the designations HPV-IP2 and HPV-IP4. 2 - Fragment d'ADN selon la revendication 1, carac térisé en ce qu'il correspond aux génes E1. E6-E7. L1 ou 2 - DNA fragment according to claim 1, charac terized in that it corresponds to the E1 genes. E6-E7. L1 or L2 ou qu il correspond encore å un fragment correspondant à une région lntergénique dudit ADN-HPV.L2 or that it still corresponds to a fragment corresponding to an intergenic region of said DNA-HPV. 3 - ADN recombinant contenant un ADN-HPV selon la revendication 1 ou un fragment selon la revendication 2. 3 - recombinant DNA containing a DNA-HPV according to claim 1 or a fragment according to claim 2. 4 - ADN, fragment ou ADN recombinant selon l'une quelconque des revendications 1, 2 ou 3 pour l'utilisation en tant que sonde de détection d ADN-HPVs,  4 - DNA, fragment or recombinant DNA according to any one of claims 1, 2 or 3 for use as a probe for detecting DNA-HPVs, 5 - Composition utilisable pour la détection de papillomavirus dans un milieu biologique le contenant, caractérisée en ce qu'elle contient un ADN-HPV conforme à la revendication 1 associé a un ou plusieurs ADN-HPVs dis- tincts. 5 - Composition usable for the detection of papillomavirus in a biological medium containing it, characterized in that it contains a DNA-HPV in accordance with claim 1 associated with one or more DNA-HPVs distinct. 5 - Nécessaire ou kit comportant une pluralité de sondes ou mélange de sondes distinctes, caractérise par 9 groupes de sondes ; chacune desquelles comporte 1) au moins l'ADN de l'HPV2d.  5 - Kit or kit comprising a plurality of probes or mixture of distinct probes, characterized by 9 groups of probes; each of which comprises 1) at least the DNA of HPV2d. 2) au moins l'un des ADNs de HPV 1Ob, 28 et 29.2) at least one of the DNAs of HPV 1Ob, 28 and 29. 3) au moins l'un des ADNs de HPV 17, 24.3) at least one of the DNAs of HPV 17, 24. 4) au moins l'un des ADNs de HPV 14, 15, 17, 19, 20. 21,4) at least one of the DNAs of HPV 14, 15, 17, 19, 20. 21, 22, 23 et IP4.  22, 23 and IP4. 5) au moins l'un des ADNs de HPV 15 et 17, 6) l'ADN de HPV 24, 7) l'ADN de l'un des ADNs de HPV 14, 32 et IP4.5) at least one of the DNAs of HPV 15 and 17, 6) the DNA of HPV 24, 7) the DNA of one of the DNAs of HPV 14, 32 and IP4. 8) l'ADN de HPV 31, 9) l'ADN de HPV 32, 8) the DNA of HPV 31, 9) the DNA of HPV 32, IO)au moins l'un des ADNs de HPV 16. 18 et IP2. IO) at least one of the DNAs of HPV 16. 18 and IP2. étant entendu que les ADNs des neuf groupes sont choisis de façon à être en toutes circonstances différents les uns des autres dans la mesure où chacun des neuf groupes serait réduit à un seul des ADNs qui le composent.it being understood that the DNAs of the nine groups are chosen so as to be in all circumstances different from each other insofar as each of the nine groups would be reduced to one of the DNAs which compose it. 7 - Procédé de détection et d'identification de papillomavirus contenus dans un échantillon biologique comprenant la realisation d'essais d'hybridation avec uo ou plusieurs -ADN-HPVs, fragments d'ADN-HPVs ou ADNs recombinants conformes à l'une quelconque des revendication' 1 a 3 ou encore plusieurs compositions distinctes conformes à la revendication 4, et la détection de ceux des 7 - Method for detecting and identifying papillomaviruses contained in a biological sample comprising carrying out hybridization tests with uo or more -DNA-HPVs, fragments of DNA-HPVs or recombinant DNAs in accordance with any one of the claim 1 to 3 or more separate compositions according to claim 4, and the detection of those of ADN-HPVs, fragments ou ADNs recomb;nants ou encore compositions qui donnent lieu a hybridation préfèrent elle avec les ADN-HPVs préalablement soutenus à partir desdits echan- tillons biologiques.DNA-HPVs, fragments or recombinant DNAs or compositions which give rise to hybridization prefer it with DNA-HPVs previously supported from said biological samples. 8 - Papillomavirus purifiés biologiquement purs. 8 - Biologically pure purified papillomaviruses. caracterisés en ce qu ils appartiennent a-u meme type que l'un de ces papillomavirus identifies dans la revendica tion 1. characterized in that they belong to the same type as one of these papillomaviruses identified in claim 1. 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