FI88309B - Ny biotest - Google Patents

Ny biotest Download PDF

Info

Publication number
FI88309B
FI88309B FI891899A FI891899A FI88309B FI 88309 B FI88309 B FI 88309B FI 891899 A FI891899 A FI 891899A FI 891899 A FI891899 A FI 891899A FI 88309 B FI88309 B FI 88309B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
cell
plasmid
recombinant dna
protein
dna
Prior art date
Application number
FI891899A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI891899A0 (fi
FI891899A (fi
FI88309C (sv
Inventor
Matti Karp
Matti Korpela
Original Assignee
Bio Orbit Oy
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Bio Orbit Oy filed Critical Bio Orbit Oy
Priority to FI891899A priority Critical patent/FI88309C/sv
Publication of FI891899A0 publication Critical patent/FI891899A0/fi
Priority to PCT/FI1990/000112 priority patent/WO1990012887A1/en
Priority to DE69023642T priority patent/DE69023642T2/de
Priority to US07/768,741 priority patent/US6475719B1/en
Priority to EP90906232A priority patent/EP0469021B1/en
Priority to ES90906232T priority patent/ES2081981T3/es
Publication of FI891899A publication Critical patent/FI891899A/fi
Application granted granted Critical
Publication of FI88309B publication Critical patent/FI88309B/fi
Publication of FI88309C publication Critical patent/FI88309C/sv

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/025Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/67General methods for enhancing the expression
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6897Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids involving reporter genes operably linked to promoters

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Claims (21)

1. Förfarande för bestämning av en faktor, som inverkar pä en encellig organism, säsom tili exempel en mikrob- eller jästcell, vilken faktor inverkar direkt eller indirekt pä 5 cellens DNA, RNA och/eller proteiner eller deras syntesme-kanismer, kännetecknat av att a) intill cellen införs en rekombinant-DNA-plasmid, vars initiationsställe eller -ställen av dupliceringsmekanism 10 ansvarig för replikationen är avhängiga av en regulerbar promotor, som kan kontrolleras antingen med en positiv eller en negativ feedback; b) cellen innehällande rekombinant-DNA-plasmiden bringas i 15 kontakt med en effektiv faktor, tili exempel genom att inku- bera dem tillsammans; c) den effektiva faktorn tkr inverka pä cellen innehdllande rekombinant-DNA-plasmiden för en lämplig tid, varefter pro- 20 motorn, som reglerar initiationsstället av dupliceringsme- kanismen ansvarig för rekombinant-DNA-plasmidens replikation aktiveras, varvid plasmidens kopital börjar öka i cellen, om den effektiva faktorn inte har inverkat pä ett hindrande sätt pä plasmidens replikation; 25 d) ändring av rekombinant-DNA-plasmidens kopital i cellen bestäms direkt eller indirekt; e) kopitalet jämförs med ett kontrollprov, väri ingen effek-30 tiv faktor var närvarande och/eller den fanns i en känd mängd i reaktionen, varvid närvaron och/eller mängden av den effektiva faktorn kan bestämmas.
2. Förfarande enligt patentkravet l, kännetecknat av att <’> rekombinant-DNA-plasmiden innehäller en DNA-sekvens, som ko- dar en eller flera selektiva proteiner eller en för biolo-gisk aktivitet väsentlig del därav av en virus, prokariot-cell eller eukariotcell och plasmiden kan innehälla en eller 4i 8 8 309 flera DNA-sekvenser, som gör cellen resistent mot anti-biotika, tungmetaller och/eller toxiner.
3. Förfarande enligt patentkravet 2, k&nnetecknat av att 5 DNA-sekvensen som kodar proteinet är avhängig av en reguler- bar promotor, som kontrolleras antingen med en positiv eller en negativ feedback och är regulerbar i använda mikrobcellen samt aktiveras samtidigt eller pä önskad tidpunkt efter ak-tiveringen av promotorn som reglerar initiationsstället av 10 replikationen.
4. Förfarande enligt patentkravet 3, k&nnetecknat av att faktoren som skall bestämmas är en faktor som inverkar pä rekombinant-DNA-plasmidens DNA biosyntes eller replikation,
5. Förfarande enligt patentkravet 4, k&nnetecknat av att cellen är Escherichia coli och dupliceringsmekanismen ansva- 25 rig för rekombinant-DNA-plasmidens replikation i bakterie kan strängt regleras med en kraftig promotor, säsom lambda λ. PL- och lac-promotorer.
6. Förfarande för bestämning av en faktor som inverkar pä 30 en cell, vilken faktor inverkar direkt eller indirekt pä cellens DNA, RNA och/eller proteiner eller deras syntesme-kanismer,'k&nnetecknat av att a) intill cellen införs en rekombinant-DNA-plasmid, som 35 finns i cellen pä flera kopior och plasmiden innehäller som markerprotein en DNA-sekvens, som kodar ett protein eller en för biologisk aktivitet väsentlig del därav av en virus, prokariotcell eller eukariotcell, vilken DNA-sekvens är av- 42 8 8 3 ϋ 9 hängiga av en regulerbar promotor och är kontrollerad antin- gen med en positiv eller en negativ feedback; b) cellen innehällande rekombinant-DNA-plasmiden bringas i 5 kontakt med en effektiv faktor, tili exempel genom att inku-bera dem tillsammans; c) den effektiva faktorn fär inverka pä cellen innehällande rekombinant-DNA-plasmiden för en lämplig tid, varefter den 10 regulerbara promotorn, som kontrollerar expression av rekom-binant-DNA-plasmidens markerprotein aktiveras, varvid mar-kerproteinets mängd börjar oka i cellen, om den effektiva faktorn inte har inverkat direkt eller indirekt pä protein-syntesen; 15 d) ändring av markerproteinet i rekombinant-DNA-plasmiden mäts; e) markerproteinets mängd jämförs med ett kontrollprov, väri 20 ingen effektiv faktor var närvarande och/eller den fanns i en känd mängd i reaktionen, varvid närvaron och/eller mäng-den av den effektiva faktorn kan bestämmas.
7. Förfarande enligt patentkrav l eller 6, kannetecknat av 25 att cellen är en gramnegativ eller grampositiv bakterie som hör tili gruppen Enterobacteriaceae, företrädesvis Escherichia coli eller tili gruppen Bacillus, företrädesvis Bacillus subtilis. 30
8. Förfarande enligt patentkraven 1-3, 6 eller 7, kanne tecknat av att promotorns reguleringsfaktorer produceras utav värdcellens kromosomala DNA, utav en andra tili en annan inkombatibilitetsklass hörande plasmid i cellen, utav densamma plasmiden, utav en lytisk eller lysogenisk fag el-35 ler virus eller reguleringsfaktorer tillsätts utifrän celler säsom tili exempel genom tillsättning av kemiska föreningar, förändring av temperaturen eller genom strälning. 43 8 8 3 C 9
9. Förfarande enligt patentkravet 8, kannetecknat av att rekombinant-DNA-plasmiden kan innehälla en eller flera DNA-sekvenser, som gör cellen resistent mot antibiotika, tungme-taller och/eller toxiner. 5
10. Förfarande enligt patentkravet 1 eller 6, kannetecknat av att provet som skall undersökas är i en flytande eller fast form eller provet innehäller radioaktiv strälning eller ultravioletsträlning. 10
11. Förfarande enligt patentkravet 1 eller 6, k&nnetecknat av att cellerna är lyofiliserade och de rehydreras före bes-tämningen med en lämplig buffert eller odlingslösning. 15
12. Förfarande enligt patentkravet 6, kännetecknat av att den effektiva faktorn är en faktor som inverkar pä rekom-binant-DNA-plasmidens DNA-biosyntes, RNA-biosyntes, transkription, translation, cellmembraner eller metabolism, säsom mutagener, antibiotika, tungmetaller eller toxiner. 20
13. Förfarande enligt patentkravet 12, k&nnetecknat av att cellen är Bacillus subtilis.
14. Förfarande enligt patentkravet 13, k&nnetecknat av att 25 markerproteinet i rekombinant-DNA-plasmiden är avhängig av en regulerbar stark promotor, säsom ol05, och markerproteinet är en alfa-amylas, alkalisk fosfatas eller luciferas.
15. Förfarande enligt patentkravet 12, k&nnetecknat av att 30 cellen är Escherichia coli.
15 RNA-biosyntes, transkription, translation, cellmembraner, metabolism eller enzyxnaktivitet, säsom tili exempel aflato-xiner, tungmetaller, etidiumbromid, nalidixinsyra, trimeto-prim, fluorokinoloner, aminoglykosider, penicilliner, kefa-losporiner, rifampicin, kloramfenikol, tetracykliner, sul-20 fonamider och den använda cellen är sensitiv mot de bestämda antibiotika.
16. Förfarande enligt patentkravet 5 eller 15, k&nnetecknat av att rekombinant-DNA-plasmiden innehäller en DNA-sek-vens, som kodar ett protein eller en för biologisk aktivi- '35 tet väsentlig del därav av en virus, prokariotcell eller eukariotcell, och proteinets expression kan kontrolleras med en regulerbar promotor, säsom tili exempel lac eller lambda 44 8 8 3 G 9
17. Förfarande enligt patentkravet 16, kännetecknat av att proteinet är luciferas, beta-galaktosidas, alkalisk fosfa-tas, peroksidas eller T4-lysozym. 5
18. Förfarande enligt patentkravet 17, kännetecknat av att rekombinant-DNA-plasmiden kodar luciferas av Vibrio harvey eller en annan bakterieluciferas.
19. Förfarande enligt patentkravet 18, kännetecknat av att 10 rekombinant-DNA-plasmiden är plasmiden pCSS112.
20. Förfarande enligt nägot av patentkraven 17-19, känne-tecknad av att aldehyd tillsätts tili reaktionen när mängden av det uttryckta luciferasenzymet i bakterien mäts. 15
21. Förfarande enligt patentkravet 4 eller 12, kännetecknat av att bestämningen görs utav mjölk, serum eller vatten.
FI891899A 1989-04-20 1989-04-20 Ny biotest FI88309C (sv)

Priority Applications (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI891899A FI88309C (sv) 1989-04-20 1989-04-20 Ny biotest
PCT/FI1990/000112 WO1990012887A1 (en) 1989-04-20 1990-04-20 Determination of factors affecting gene regulation and/or gene replication
DE69023642T DE69023642T2 (de) 1989-04-20 1990-04-20 Bestimmung der die genregelung und/oder genreplikation betreffenden faktoren.
US07/768,741 US6475719B1 (en) 1989-04-20 1990-04-20 Determination of factors affecting gene regulation and/or gene replication
EP90906232A EP0469021B1 (en) 1989-04-20 1990-04-20 Determination of factors affecting gene regulation and/or gene replication
ES90906232T ES2081981T3 (es) 1989-04-20 1990-04-20 Determinacion de los factores que afectan la regulacion y/o replicacion de genes.

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI891899A FI88309C (sv) 1989-04-20 1989-04-20 Ny biotest
FI891899 1989-04-20

Publications (4)

Publication Number Publication Date
FI891899A0 FI891899A0 (fi) 1989-04-20
FI891899A FI891899A (fi) 1990-10-21
FI88309B true FI88309B (fi) 1993-01-15
FI88309C FI88309C (sv) 1993-04-26

Family

ID=8528282

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI891899A FI88309C (sv) 1989-04-20 1989-04-20 Ny biotest

Country Status (6)

Country Link
US (1) US6475719B1 (sv)
EP (1) EP0469021B1 (sv)
DE (1) DE69023642T2 (sv)
ES (1) ES2081981T3 (sv)
FI (1) FI88309C (sv)
WO (1) WO1990012887A1 (sv)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ATE280219T1 (de) * 1992-03-16 2004-11-15 Jacob Nathaniel Wohlstadter Mutagenese und selektionsmethoden in den selben wirtszellen
FI95484C (sv) * 1994-01-17 1996-02-12 Marko Virta Förvarande för bestämning av metall i provet
WO1996001899A1 (en) * 1994-07-08 1996-01-25 Schering Corporation METHOD FOR IDENTIFYING NUCLEIC ACIDS ENCODING c-fos PROMOTER ACTIVATING PROTEINS
US5504093A (en) * 1994-08-01 1996-04-02 Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd. Method for inhibiting nucleoside and nucleobase transport in mammalian cells, and method for inhibition of DNA virus replication
US5736331A (en) * 1995-07-08 1998-04-07 Schering Corporation Method for identifying nucleic acids encoding c-fos promoter activating proteins
US7132247B1 (en) 1998-09-17 2006-11-07 Regents Of The University Of Minnesota Composite devices incorporating biological material and methods
WO2000037676A1 (en) * 1998-12-22 2000-06-29 Isis Innovation Limited Method of sequence identification
GB9910499D0 (en) * 1999-05-06 1999-07-07 Azur Env Ltd Assay reagent
DE602004029868D1 (de) * 2003-03-05 2010-12-16 Chemo Sero Therapeut Res Inst Verfahren zur herstellung eines heterologen proteins in e. coli
EP2363025A1 (en) 2003-03-27 2011-09-07 PTC Therapeutics, Inc. Targeting enzymes of the TRNA splicing pathway for identification of anti-fungal and/or anti-proliferative molecules
JP4634371B2 (ja) 2003-03-27 2011-02-16 ピーティーシー セラピューティクス,インコーポレーテッド tRNAスプライシングエンドヌクレアーゼに標的化する化合物の同定方法、および該化合物の抗増殖剤としての使用
WO2005014805A1 (en) 2003-08-08 2005-02-17 Regents Of The University Of Minnesota A structured material for the production of hydrogen

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SE424090B (sv) 1981-08-18 1982-06-28 Technion Res & Dev Foundation Forfarande for bestemning av en antibiotikakoncentration
US4806471A (en) * 1982-09-16 1989-02-21 A/S Alfred Benzon Plasmids with conditional uncontrolled replication behavior
GB8308236D0 (en) 1983-03-25 1983-05-05 Celltech Ltd Dna vectors
DE3882394T2 (de) * 1987-03-03 1993-12-16 Light Oil Utilization Res Ass Plasmide.

Also Published As

Publication number Publication date
DE69023642D1 (de) 1995-12-21
EP0469021A1 (en) 1992-02-05
US6475719B1 (en) 2002-11-05
FI891899A0 (fi) 1989-04-20
DE69023642T2 (de) 1996-10-17
WO1990012887A1 (en) 1990-11-01
FI891899A (fi) 1990-10-21
ES2081981T3 (es) 1996-03-16
FI88309C (sv) 1993-04-26
EP0469021B1 (en) 1995-11-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US5683868A (en) Highly sensitive method for detecting environmental insults
Engebrecht et al. Bacterial bioluminescence: isolation and genetic analysis of functions from Vibrio fischeri
Davidov et al. Improved bacterial SOS promoter∷ lux fusions for genotoxicity detection
Price et al. Characterization of the Cpx regulon in Escherichia coli strain MC4100
Ferrières et al. The RcsC sensor kinase is required for normal biofilm formation in Escherichia coli K‐12 and controls the expression of a regulon in response to growth on a solid surface
FI88309B (fi) Ny biotest
Wei et al. Global control of GacA in secondary metabolism, primary metabolism, secretion systems, and motility in the rhizobacterium Pseudomonas aeruginosa M18
EP0793729B1 (en) Lyophilized bioluminescent bacterial reagent for the detection of toxicants
EP0922106B1 (en) Light emitting biosensor
Nosho et al. cAMP-CRP acts as a key regulator for the viable but non-culturable state in Escherichia coli
Alavi et al. [3] Surface sensing, swarmer cell differentiation, and biofilm development
Rosen et al. Microbial sensors of ultraviolet radiation based on recA’:: lux fusions
US5776681A (en) Method for determining a metal present in a sample
JP3329395B2 (ja) テトラサイクリンのスクリーニング法
CA2267999A1 (en) A small volume, highly sensitive method for detecting environmental insults
Kotova et al. Inducible specific lux-biosensors for the detection of antibiotics: Construction and main parameters
CA2279576A1 (en) A method for identifying the site of action of xenobiotic chemicals
Cao et al. Regulatory mutants of the Vibrio harveyi lux system
US20030119094A1 (en) Solubility reporter gene constructs
Peterson et al. Characterization of conserved bases in 4.5 S RNA of Escherichia coli by construction of new F′ factors
Kago et al. (p) ppGpp is required for virulence of Shigella flexneri
Troupp Optimization of bioluminescent bioreporters for macrolides
EP1364055A2 (en) Solubility reporter gene constructs
Hinde et al. The potential of site-specific recombinases as novel reporters in whole-cell biosensors of pollution
江口陽子 et al. Molecular mechanisms of multi-drug resistance induced by EvgA/EvgS, a two-component signal transduction system in Escherichia coli

Legal Events

Date Code Title Description
BB Publication of examined application
PC Transfer of assignment of patent

Owner name: LABSYSTEMS OY

FG Patent granted

Owner name: LABSYSTEMS OY