ES2698570T3 - Methods and compositions related to p62 for the treatment and prophylaxis of cancer - Google Patents

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Alexander Shneider
Franco Venanzi
Michael Sherman
Victor Shifrin
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Abstract

Un agente que comprende: a. al menos 30 aminoácidos consecutivos de un polipéptido p62/SQSTM1; b. un ácido nucleico que codifica p62/SQSTM1, en el que dicho ácido nucleico que codifica p62/SQSTM1 codifica al menos 30 aminoácidos consecutivos de un polipéptido p62/SQSTM1; c. un polipéptido p62/SQSTM1 al menos el 90% idéntico a la SEQ ID NO. 2; d. un polipéptido p62/SQSTM1 con al menos una o más deleciones de dominio; e. un ácido nucleico p62/SQSTM1 que codifica un polipéptido al menos 90% idéntico a la SEQ ID NO: 2; o f. un ácido nucleico p62/SQSTM1 que codifica un polipéptido con al menos una o más deleciones de dominio; para su uso en el tratamiento, alivio, mejora, paliación, retraso en el inicio, inhibición de la progresión, reducción de la gravedad y/o reducción de la incidencia de uno o más síntomas de un cáncer en un sujeto.An agent that comprises: a. at least 30 consecutive amino acids of a p62 / SQSTM1 polypeptide; b. a nucleic acid encoding p62 / SQSTM1, wherein said nucleic acid encoding p62 / SQSTM1 encodes at least 30 consecutive amino acids of a p62 / SQSTM1 polypeptide; c. a p62 / SQSTM1 polypeptide at least 90% identical to SEQ ID NO. two; d. a p62 / SQSTM1 polypeptide with at least one or more domain deletions; and. a p62 / SQSTM1 nucleic acid encoding a polypeptide at least 90% identical to SEQ ID NO: 2; or f. a p62 / SQSTM1 nucleic acid encoding a polypeptide with at least one or more domain deletions; for use in the treatment, relief, improvement, palliation, delay in onset, inhibition of progression, reduction of severity and / or reduction of the incidence of one or more symptoms of a cancer in a subject.

Description

DESCRIPCIÓNDESCRIPTION

Métodos y composiciones relacionadas con p62 para el tratamiento y la profilaxis del cáncerMethods and compositions related to p62 for the treatment and prophylaxis of cancer

Referencia transversal a solicitudes de patentes relacionadasCross-reference to related patent applications

Campo de la invenciónField of the invention

Esta invención se refiere en general al campo de la prevención y el tratamiento del cáncer. Más específicamente, la invención se refiere a la prevención y el tratamiento del cáncer mediante la activación de la respuesta contra el cáncer utilizando composiciones de p62.This invention relates in general to the field of cancer prevention and treatment. More specifically, the invention relates to the prevention and treatment of cancer by activating the cancer response using compositions of p62.

Antecedentes de la invenciónBACKGROUND OF THE INVENTION

El cáncer es la segunda causa más común de muerte en los Estados Unidos y la Unión Europea (National Vital Statistics Reports, vol. 60, No. 4, 2012) y la primera causa más común de muerte entre personas de 45 a 64 años, tanto para hombres como para mujeres, en la Unión Europea. La prevalencia estimada del cáncer en los Estados Unidos a partir del 1 de enero de 2008 fue de 5.506.000 casos de tumores invasivos para hombres y 6.452.000 casos para mujeres.Cancer is the second most common cause of death in the United States and the European Union (National Vital Statistics Reports, vol 60, No. 4, 2012) and the first most common cause of death among people aged 45 to 64 years, for both men and women, in the European Union. The estimated prevalence of cancer in the United States as of January 1, 2008 was 5,506,000 cases of invasive tumors for men and 6,452,000 cases for women.

Las vacunas contra el cáncer están bajo investigación, con algunas en estudios de eficacia en Fase III (Rosenberg et al., Nat Med., 10: 909 (2004), Johnson et al., Expert Rev Anticancer Ther., 9:67 (2009) 3,4). Varias vacunas contra el cáncer están dirigidas contra tumores sólidos: cáncer de melanoma, próstata, pulmón, mama y colorrectal. Dos poblaciones de alto riesgo se beneficiarán particularmente de las vacunas preventivas contra el cáncer: los pacientes con tumores extirpados quirúrgicamente que pertenecen a tipos de cáncer que se sabe que tienen un alto potencial metastásico (por ejemplo, ovario o algunos tipos de cáncer de mama) y también portadores de mutaciones conocidas, asociado con un mayor riesgo del cáncer (por ejemplo, mutaciones en los genes BRCA1 y BRCA2 para los cánceres de mama y ovario, gen RAD51 para el cáncer de ovario, etc.). La vacunación preventiva selectiva de mujeres de alto riesgo es una tarea importante de salud pública.Cancer vaccines are under investigation, with some in Phase III efficacy studies (Rosenberg et al., Nat Med., 10: 909 (2004), Johnson et al., Expert Rev Anticancer Ther., 9:67 ( 2009) 3,4). Several cancer vaccines are directed against solid tumors: melanoma, prostate, lung, breast and colorectal cancer. Two high-risk populations will particularly benefit from preventive vaccines against cancer: patients with surgically excised tumors that belong to types of cancer that are known to have a high metastatic potential (eg, ovarian or some types of breast cancer) and also carriers of known mutations, associated with an increased risk of cancer (eg, mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes for breast and ovarian cancers, RAD51 gene for ovarian cancer, etc.). Selective preventive vaccination of high-risk women is an important public health task.

p62 es una proteína multifuncional que se une a la ubiquitina y regula la activación de la vía de señalización del factor nuclear kappa-B (NF-kB). La proteína funciona como una proteína de estructura/adaptador en concierto con el factor 6 asociado al receptor de TNF para mediar la activación de NF-kB en respuesta a las señales en sentido ascendente. Alternativamente, se han identificado variantes de transcripción empalmadas que codifican isoformas iguales o diferentes para este gen.p62 is a multifunctional protein that binds to ubiquitin and regulates the activation of the signaling pathway of nuclear factor kappa-B (NF-kB). The protein functions as a structure / adapter protein in concert with factor 6 associated with the TNF receptor to mediate the activation of NF-kB in response to signals upstream. Alternatively, spliced transcript variants encoding isoforms identical or different for this gene have been identified.

p62 se identificó como una proteína de 62 kDa que se unía al dominio de homología src 2 (SH2) de la tirosina quinasa Lckp56 de manera independiente de la fosfotirosina (Park et al., Proc Natl Acad Sci USA., 92: 12338 (1995)). La secuencia primaria de p62 es conocida (Joung et al., Proc Natl Acad Sci USA., 93: 5991, (1996)), y se demostró que se unía a la ubiquitina (Vadlamudi et al., J. Biol. Chem., 271: 20235 (1996)). Puede accederse a la secuencia de ADN de p62 humano, secuencia de Homo sapiens sequestosome 1 (SQSTM1), variante de transcripción 1, ARNm, en la secuencia de referencia de NCBI: n M_003900.4. Se puede acceder a la secuencia de aminoácidos de p62 humana, isquorma 1 del sequestosoma-1 [Homo sapiens], en la secuencia de referencia NCBI: NP_003891.1. p62 no tiene homología con hidrolasas C-terminales de ubiquitina ni con la subunidad S5a del complejo proteasoma 26 S, las únicas proteínas conocidas que se unen a la ubiquitina de manera no covalente. Estos resultados sugieren que p62 pertenece a una nueva clase de proteínas de unión a ubiquitina.p62 was identified as a 62 kDa protein that bound to the src 2 homology domain (SH2) of Lckp56 tyrosine kinase independently of phosphotyrosine (Park et al., Proc Natl Acad Sci USA., 92: 12338 (1995 )). The primary sequence of p62 is known (Joung et al., Proc Natl Acad Sci USA., 93: 5991, (1996)), and it was shown to bind to ubiquitin (Vadlamudi et al., J. Biol. Chem. , 271: 20235 (1996)). The DNA sequence of human p62, sequence of Homo sapiens sequestosome 1 (SQSTM1), transcript variant 1, mRNA, can be accessed in the NCBI reference sequence: n M_003900.4. The amino acid sequence of human p62, isquorm 1 of the sequestosome-1 [Homo sapiens], can be accessed in the NCBI reference sequence: NP_003891.1. p62 has no homology to C-terminal hydrolases of ubiquitin or to the S5a subunit of the 26 S proteasome complex, the only known proteins that bind to ubiquitin non-covalently. These results suggest that p62 belongs to a new class of ubiquitin binding proteins.

La p62 es un componente de los cuerpos de inclusión que se encuentra en las enfermedades de agregación de proteínas en el cerebro y el hígado: la p62 se encuentra secuestrada en cuerpos de inclusión citoplásmicos, llamados sequestosomas. Estos agregados de proteínas que contienen p62 se degradan por autofagia. Se sugirió que esta función de p62 puede tener un efecto protector sobre la muerte celular inducida por huntingtina (Bj^rk^y et al., J Cell Biol., 171: 603 (2005)). Las mutaciones en el gen p62 se han asociado con la enfermedad de Paget familiar y esporádica (Jenny Chung et al., Semin Arthritis Rheum., 41: 619 (2012)), una enfermedad ósea metabólica.P62 is a component of the inclusion bodies that is found in protein aggregation diseases in the brain and liver: p62 is sequestered in cytoplasmic inclusion bodies, called sequestosomes. These aggregates of p62-containing proteins are degraded by autophagy. It was suggested that this function of p62 may have a protective effect on cell death induced by huntingtin (Bj ^ rk ^ et al., J Cell Biol., 171: 603 (2005)). Mutations in the p62 gene have been associated with familial and sporadic Paget's disease (Jenny Chung et al., Semin Arthritis Rheum., 41: 619 (2012)), a metabolic bone disease.

Sumario de la invenciónSummary of the invention

En el presente documento se proporcionan métodos para tratar, aliviar, mejorar, aliviar, retrasar la aparición, inhibir la progresión, reducir la gravedad y/o reducir la incidencia de uno o más síntomas de un cáncer en un sujeto administrando al sujeto un agente que tiene (a) un polipéptido p62 o (b) un ácido nucleico que codifica p62. El agente puede tener (a) una o más deleciones de dominio, (b) un ácido nucleico que codifica p62 que es al menos un 95% idéntico a la s Eq ID NO. 1, o (c) un polipéptido p62 que es al menos un 98% idéntico a la SeQ ID NO: 2. Las eliminaciones del dominio del método pueden ser una o más de las siguientes: PB1, ZZ, NLS2, TB, NLS1, NES, LIR, KIR y UBA. El método puede usar un polipéptido de fusión o un ácido nucleico que codifica un polipéptido de fusión, respectivamente. El método puede usar un polipéptido p62 que se modifique después de la traducción.In the present document methods are provided for treating, alleviating, improving, alleviating, delaying the onset, inhibiting progression, reducing the severity and / or reducing the incidence of one or more symptoms of a cancer in a subject by administering to the subject an agent that has (a) a p62 polypeptide or (b) a nucleic acid encoding p62. The agent may be (a) one or more deletions domain, (b) a nucleic acid encoding p62 is at least 95% identical to s E q ID NO. 1, or (c) a p62 polypeptide that is at least 98% identical to S e Q ID NO: 2. Removals from the domain of the method can be one or more of the following: PB1, ZZ, NLS2, TB, NLS1, NES, LIR, KIR and UBA. The method can use a fusion polypeptide or a nucleic acid encoding a fusion polypeptide, respectively. The method can use a p62 polypeptide that is modified after translation.

El agente puede administrarse por cualquiera de las siguientes vías: por vía parenteral, oral, nasal, rectal, transdérmica, intravaginal o inhalatoria a través de un aerosol. Las vías parenterales pueden ser cualquiera de las siguientes: intravascular, intravenosa, intraarterial, intramuscular, intraocular, intraperitoneal, intradérmica y subcutánea, o pueden administrarse a un órgano o tumor. El método puede incluir además cualquiera y todos los siguientes: administración de adyuvantes, administración de componentes coestimulantes, administración de una o más moléculas que bloquean mecanismos inmunitarios supresores o reguladores negativos, o administración de una o más terapias anticancerosas a dicho sujeto.The agent can be administered by any of the following routes: parenterally, orally, nasally, rectally, transdermally, intravaginally or inhaled through an aerosol. Parenteral routes can be any of the following: intravascular, intravenous, intraarterial, intramuscular, intraocular, intraperitoneal, intradermal and subcutaneous, or can be administered to an organ or tumor. The method may further include any and all of the following: administration of adjuvants, administration of costimulatory components, administration of one or more molecules that block suppressive or negative regulatory immune mechanisms, or administration of one or more anti-cancer therapies to said subject.

El método puede usarse para tratar cualquier tipo de cáncer en un sujeto que incluye: cáncer de mama, cáncer de pulmón, cáncer de próstata, cáncer gástrico, cáncer colorrectal, cáncer de piel, cáncer de cabeza y cuello, cáncer de bronquios, cáncer de páncreas, cáncer de vejiga urinaria, cáncer cerebral, cáncer del sistema nervioso central, cáncer del sistema nervioso periférico, cáncer de esófago, cáncer de la cavidad bucal o faringe, cáncer de hígado, cáncer de riñón, cáncer de testículo, cáncer del tracto biliar, cáncer de intestino delgado o apéndice, cáncer de ovario, cáncer de útero, cáncer de glándula salivar, cáncer de glándula tiroides, cáncer de glándula tiroides, cáncer de glándula suprarrenal, osteosarcoma, condrosarcoma, sarcoma y cáncer de tejidos hematológicos. El sujeto puede ser: un sujeto diagnosticado con cáncer, un sujeto previamente tratado para el cáncer, un sujeto con antecedentes familiares de cáncer o un sujeto predispuesto al cáncer.The method can be used to treat any type of cancer in a subject that includes: breast cancer, lung cancer, prostate cancer, gastric cancer, colorectal cancer, skin cancer, head and neck cancer, bronchial cancer, cancer pancreas, urinary bladder cancer, brain cancer, central nervous system cancer, peripheral nervous system cancer, esophageal cancer, cancer of the oral cavity or pharynx, liver cancer, kidney cancer, testicular cancer, cancer of the biliary tract , cancer of the small intestine or appendix, ovarian cancer, cancer of the uterus, cancer of the salivary gland, cancer of the thyroid gland, cancer of the thyroid gland, cancer of the adrenal gland, osteosarcoma, chondrosarcoma, sarcoma and cancer of the hematological tissues. The subject may be: a subject diagnosed with cancer, a subject previously treated for cancer, a subject with a family history of cancer or a subject predisposed to cancer.

El método puede incluir un agente que es un ácido nucleico que codifica p62 y el ácido nucleico puede incluirse en un plásmido o un vector viral. El método también puede incluir una estrategia para mejorar la eficiencia de la inmunización basada en ácidos nucleicos.The method can include an agent which is a nucleic acid encoding p62 and the nucleic acid can be included in a plasmid or a viral vector. The method may also include a strategy for improving the efficiency of nucleic acid-based immunization.

En este documento también se proporcionan agentes para tratar, aliviar, mejorar, calmar, retrasar la aparición, inhibir la progresión, reducir la gravedad y/o reducir la incidencia de uno o más síntomas de un cáncer en un sujeto que es un polipéptido p62 o un ácido nucleico que codifica p62, que tiene al menos una o más deleciones de dominio, o compuesto de uno o más dominios de un polipéptido p62 o un ácido nucleico que codifica uno o más dominios de un p62. El uno o más dominios pueden estar entre los siguientes: PB1, ZZ, NLS2, TB, NLS1, NES, LIR, KIR y UBA. El agente puede incluir un polipéptido de fusión o un ácido nucleico codificante, respectivamente. El polipéptido p62 puede modificarse después de la traducción.Also provided in this document are agents for treating, alleviating, ameliorating, calming, delaying the onset, inhibiting progression, reducing the severity and / or reducing the incidence of one or more symptoms of a cancer in a subject that is a p62 or a nucleic acid encoding p62, having at least one or more domain deletions, or composed of one or more domains of a p62 polypeptide or a nucleic acid encoding one or more domains of a p62. The one or more domains can be between the following: PB1, ZZ, NLS2, TB, NLS1, NES, LIR, KIR and UBA. The agent may include a fusion polypeptide or a coding nucleic acid, respectively. The p62 polypeptide can be modified after translation.

El agente puede incluir además uno o más adyuvantes, uno o más componentes coestimulantes, o una o más moléculas que bloquean mecanismos inmunitarios supresores o reguladores negativos, una o más moléculas quimioterapéuticas o moléculas antiangiogénicas.The agent may further include one or more adjuvants, one or more costimulatory components, or one or more molecules that block suppressive or negative regulatory immune mechanisms, one or more chemotherapeutic molecules or anti-angiogenic molecules.

El agente puede ser un ácido nucleico que codifica p62 además que es un componente de un plásmido o un vector viral.The agent can be a nucleic acid encoding p62 in addition which is a component of a plasmid or a viral vector.

En este documento también se proporcionan composiciones que incluyen el agente adecuado para la administración a un sujeto.Also included in this document are compositions that include the agent suitable for administration to a subject.

Breve descripción de los dibujosBRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS

La Fig. 1 muestra una secuencia de ácido nucleico natural de p62 humano (SEQ ID NO: 1).Fig. 1 shows a natural p62 human nucleic acid sequence (SEQ ID NO: 1).

La Fig. 2 muestra una secuencia de aminoácidos natural de la p62 humana codificada por la secuencia de ácido nucleico (SEQ ID NO: 2).Fig. 2 shows a natural amino acid sequence of human p62 encoded by the nucleic acid sequence (SEQ ID NO: 2).

La Fig. 3 muestra una representación de la estructura de dominio del p62 humano.Fig. 3 shows a representation of the domain structure of human p62.

La Fig. 4 muestra una comparación de un curso temporal de formación de tumores en un modelo de cáncer de mama en ratones para ratones inyectados con una vacuna de ADN de p62, HER2 (control positivo) o vector solo (control negativo).Fig. 4 shows a comparison of a time course of tumor formation in a breast cancer model in mice for mice injected with a p62 DNA vaccine, HER2 (positive control) or vector alone (negative control).

La Fig. 5 muestra la tinción con hematoxilina y eosina (HE) de tumores de animales inmunizados con p62. El panel superior: las flechas apuntan a múltiples focos de necrosis. El panel inferior: las flechas apuntan a una malla de células inflamatorias.Fig. 5 shows hematoxylin and eosin (HE) staining of tumors from animals immunized with p62. The upper panel: the arrows point to multiple foci of necrosis. The lower panel: the arrows point to a mesh of inflammatory cells.

La Fig. 6 muestra la tinción inmuno-histoquímica de tumores de animales inmunizados con HER2 y p62. Los paneles de la izquierda muestran la tinción HE, los paneles centrales muestran la tinción anti-CD3 y los paneles de la derecha muestran la tinción anti-CD11b.Fig. 6 shows the immunohistochemical staining of tumors from animals immunized with HER2 and p62. The panels on the left show HE staining, the central panels show anti-CD3 staining and the panels on the right show anti-CD11b staining.

La Fig. 7 muestra una línea de tiempo gráfica de la administración de la vacuna de ADN p62 en un modelo de cáncer de mama de rata T5:Fig. 7 shows a graphical timeline of the administration of the p62 DNA vaccine in a rat T5 breast cancer model:

La Fig. 8 muestra un curso temporal del volumen del tumor en ratas vacunadas con p62 y de control con carcinoma de mama transplantable T5.FIG. 8 shows a temporal course of tumor volume in rats vaccinated with p62 and control with T5 transplantable breast carcinoma.

La Fig. 9 muestra el curso temporal de la inhibición del crecimiento tumoral en ratas vacunadas con p62 y de control con carcinoma de mama transplantable con T5. Fig. 9 shows the time course of the inhibition of tumor growth in rats vaccinated with p62 and control with transplantable breast cancer with T5.

La Fig. 10 muestra un curso temporal de la supervivencia de ratas en ratas vacunadas con p62 y de control con carcinoma de mama transplantable T5.Fig. 10 shows a time course of rat survival in rats vaccinated with p62 and control with T5 transplantable breast carcinoma.

La Fig. 11 muestra secciones de tumores de ratas vacunadas con p62 y vector control con carcinoma de mama transplantable T5.Fig. 11 shows sections of tumors of rats vaccinated with p62 and control vector with T5 transplantable breast carcinoma.

La Fig. 12 muestra la tinción con hematoxilina y eosina (HE) de las secciones tumorales de ratas vacunadas con p62 y vector control con carcinoma de mama transplantable con T5.Fig. 12 shows hematoxylin and eosin (HE) staining of the tumor sections of rats vaccinated with p62 and control vector with T5 transplantable breast carcinoma.

La Fig. 13 muestra una comparación del número de metástasis del carcinoma de pulmón de Lewis entre ratones vacunados con p62 y vector control.Fig. 13 shows a comparison of the number of metastases of Lewis lung carcinoma among mice vaccinated with p62 and control vector.

Descripción detallada de la invenciónDetailed description of the invention

En este documento se proporcionan composiciones de p62 y métodos para el tratamiento del cáncer. Aunque no se desea estar vinculado a ninguna teoría, los inventores han encontrado que al administrar el ácido nucleico que codifica p62 a un sujeto, el mecanismo de defensa inmune del huésped se estimula para atacar a las células neoplásicas. En consecuencia, las vacunas de ADN que codifican un polipéptido p62, o polipéptidos p62, administradas a un sujeto pueden estimular una respuesta inmune contra el cáncer. La presente invención se define por las reivindicaciones 1-15.In this document p62 compositions and methods for the treatment of cancer are provided. Although not wishing to be bound by any theory, the inventors have found that by administering the nucleic acid encoding p62 to a subject, the immune defense mechanism of the host is stimulated to attack the neoplastic cells. Accordingly, DNA vaccines encoding a p62 polypeptide, or p62 polypeptides, administered to a subject can stimulate an immune response against cancer. The present invention is defined by claims 1-15.

Como se usa en el presente documento, "polipéptido p62" significa un polipéptido que corresponde a la proteína p62/SQSTM1 de longitud completa. El término incluye todos los homólogos, análogos, fragmentos o derivados de la proteína p62/SQSTM1. En una realización, el polipéptido p62 aislado tiene una secuencia de aminoácidos como se muestra en la FIG. 2 (SEQ ID NO: 2). Un "ácido nucleico que codifica p62" significa un ADN o ARN que codifica un polipéptido p62.As used herein, "p62 polypeptide" means a polypeptide corresponding to the full length p62 / SQSTM1 protein. The term includes all homologs, analogs, fragments or derivatives of the p62 / SQSTM1 protein. In one embodiment, the isolated p62 polypeptide has an amino acid sequence as shown in FIG. 2 (SEQ ID NO: 2). A "p62-encoding nucleic acid" means a DNA or RNA that encodes a p62 polypeptide.

En algunas realizaciones, el sujeto es un ser humano. En otras realizaciones, el sujeto es un mamífero no humano, por ejemplo, un caballo, una vaca, una oveja, un cerdo, un ciervo, un perro, un gato, una rata o un ratón.In some embodiments, the subject is a human being. In other embodiments, the subject is a non-human mammal, for example, a horse, a cow, a sheep, a pig, a deer, a dog, a cat, a rat or a mouse.

Además de la secuencia de aminoácidos de longitud completa, los polipéptidos de la presente invención también pueden incluir fragmentos o truncamientos, análogos y homólogos del polipéptido p62 y sus truncamientos, como se describe en el presente documento. Los fragmentos pueden incluir péptidos de al menos 5, al menos 10, al menos 15, al menos 20, al menos 25 o al menos 30 residuos de aminoácidos del polipéptido de longitud completa.In addition to the full-length amino acid sequence, the polypeptides of the present invention may also include fragments or truncations, analogs and homologs of the p62 polypeptide and its truncations, as described herein. The fragments may include peptides of at least 5, at least 10, at least 15, at least 20, at least 25 or at least 30 amino acid residues of the full-length polypeptide.

También se incluyen deleciones de uno o más aminoácidos, o porciones discretas de la secuencia de aminoácidos de la proteína p62/SQSTM1. Los aminoácidos eliminados pueden o no ser contiguos. La longitud límite inferior del análogo resultante con una mutación por deleción es de aproximadamente 10, aproximadamente 20, aproximadamente 50 o aproximadamente 100 aminoácidos.Deletions of one or more amino acids, or discrete portions of the amino acid sequence of the p62 / SQSTM1 protein are also included. The eliminated amino acids may or may not be contiguous. The lower limit length of the resulting analogue with a deletion mutation is about 10, about 20, about 50 or about 100 amino acids.

En algunas realizaciones, el polipéptido p62 tiene uno o más dominios eliminados. Si bien no se desea estar vinculado a ninguna teoría, los inventores sostienen que la eliminación de uno o más dominios del polipéptido p62 proporciona un polipéptido más compacto y manipulable para dirigir una respuesta inmune. Por ejemplo, al interrumpir o eliminar uno o más de los dominios de un polipéptido p62, la inmunogenicidad puede mantenerse (o mejorarse, si el dominio eliminado o interrumpido no contribuye a la inmunogenicidad) en una molécula más compacta y potencialmente aumentar el número de epítopos presentados para alojar anticuerpos en una base por peso. Además, la eliminación o reordenación de los dominios responsables para el compromiso con otros procesos celulares o su propia degradación de proteínas intracelulares puede mejorar su efecto anticancerígeno. El polipéptido p62 tiene una estructura de dominio como se proporciona en la Tabla 1 a continuación y como se muestra en la FIG. 3:In some embodiments, the p62 polypeptide has one or more deleted domains. While not wishing to be bound by any theory, the inventors contend that the removal of one or more domains of the p62 polypeptide provides a more compact and manipulable polypeptide to direct an immune response. For example, by interrupting or eliminating one or more of the domains of a p62 polypeptide, immunogenicity can be maintained (or improved, if the deleted or disrupted domain does not contribute to immunogenicity) in a more compact molecule and potentially increase the number of epitopes. presented to house antibodies on a basis by weight. In addition, the elimination or rearrangement of the domains responsible for the commitment to other cellular processes or their own degradation of intracellular proteins can improve their anticarcinogenic effect. The p62 polypeptide has a domain structure as provided in Table 1 below and as shown in FIG. 3:

Tabla 1. Estructura del dominio del polipéptido p62Table 1. Structure of the p62 polypeptide domain

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Numeración de la secuencia: NP_003891 (isoterma 1 de sequestosoma-1 [Homo sapiens]).Sequence numbering: NP_003891 (isotherm 1 of sequestosome-1 [Homo sapiens]).

En algunas realizaciones, se eliminan uno o más de los dominios anteriores a partir de un polipéptido p62 en los codones correspondientes para las regiones de ácido nucleico del ácido nucleico p62 (deleciones en el marco), como se presenta a continuación en la Tabla 2.In some embodiments, one or more of the above domains are deleted from a p62 polypeptide at the corresponding codons for the nucleic acid regions of the p62 nucleic acid (deletions in frame), as presented below in Table 2.

Tabla 2. Eliminaciones en p62Table 2. Eliminations in p62

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Los números de nucleótidos se refieren a la secuencia de referencia de NCBI p62 NP_003891 (sequestosoma-1 isoterma 1 [Homo sapiens)].The nucleotide numbers refer to the reference sequence of NCBI p62 NP_003891 (sequestosoma-1 isotherm 1 [Homo sapiens)].

Por ejemplo, cualquier supresión de la secuencia de ácido nucleico codificante que comience en el nucleótido 102 hasta el nucleótido 122 y termine en 167 hasta 183 se considera una deleción ZZ. Por lo tanto, por ejemplo, un 110­ 175 es una eliminación Zz . Los expertos en la técnica conocen bien las técnicas para crear eliminaciones en marco. En algunas realizaciones, el polipéptido p62 (o el polipéptido p62 codificado por un ácido nucleico) está compuesto por uno o más de los dominios anteriores. En algunas realizaciones, el polipéptido p62 (o el polipéptido p62 codificado por un ácido nucleico) está compuesto por dos o más de los dominios anteriores y aún más realizaciones, los dominios son los que componen el polipéptido en un orden de extremo N- a C-terminal diferente que el presentado en el polipéptido p62 natural.For example, any deletion of the coding nucleic acid sequence starting at nucleotide 102 to nucleotide 122 and ending at 167 to 183 is considered a ZZ deletion. Therefore, for example, a 110 175 is a Z z elimination. Those skilled in the art are well aware of the techniques for creating in-frame eliminations. In some embodiments, the p62 polypeptide (or the p62 polypeptide encoded by a nucleic acid) is composed of one or more of the above domains. In some embodiments, the p62 polypeptide (or the p62 polypeptide encoded by a nucleic acid) is composed of two or more of the above domains and even more embodiments, the domains are those that make up the polypeptide in an N-to-C end order -terminal different than that presented in the natural p62 polypeptide.

Como se usa en este documento, "biológicamente activo o inmunológicamente activo" se refiere a polipéptidos que tienen una función estructural similar (pero no necesariamente en el mismo grado), y/o una función reguladora similar (pero no necesariamente en el mismo grado), y/o función bioquímica similar (pero no necesariamente en el mismo grado) y/o actividad inmunológica (pero no necesariamente en el mismo grado) que los polipéptidos naturales individuales.As used herein, "biologically active or immunologically active" refers to polypeptides that have a similar structural function (but not necessarily to the same degree), and / or a similar regulatory function (but not necessarily to the same degree) , and / or similar biochemical function (but not necessarily to the same degree) and / or immunological activity (but not necessarily to the same degree) as the individual natural polypeptides.

Como se usa en este documento, una "eliminación" se define como un cambio en la secuencia de aminoácidos en la que uno o más residuos de aminoácidos están ausentes en comparación con la proteína natural.As used herein, a "deletion" is defined as a change in the amino acid sequence in which one or more amino acid residues are absent as compared to the natural protein.

Como se usa en este documento, una "inserción" o "adición" es un cambio en una secuencia de aminoácidos que ha resultado en la adición de uno o más residuos de aminoácidos en comparación con la proteína natural.As used herein, an "insertion" or "addition" is a change in an amino acid sequence that has resulted in the addition of one or more amino acid residues as compared to the native protein.

Como se usa en este documento, "sustitución" resulta del reemplazo de uno o más aminoácidos por diferentes aminoácidos, respectivamente, en comparación con la proteína natural. En algunas realizaciones, la mutación de sustitución es C145R o Q418R.As used herein, "substitution" results from the replacement of one or more amino acids by different amino acids, respectively, as compared to the natural protein. In some embodiments, the substitution mutation is C145R or Q418R.

Como se usa en este documento, el término "variante" significa cualquier polipéptido que tenga una sustitución, supresión o adición de uno (o más) aminoácidos de la secuencia o a la secuencia (o cualquiera de sus combinaciones), incluidas las variaciones alélicas, en comparación con la proteína natural, siempre que la proteína resultante retenga al menos el 75%, al menos el 80%, al menos el 85%, al menos el 90%, al menos el 95%, o al menos el 99% de la actividad inmunogénica en comparación con las proteínas naturales como se usan en la presente invención. Típicamente, las variantes de los polipéptidos abarcados por la presente invención tendrán al menos un 80%, al menos un 85%, al menos un 90%, al menos un 91%, al menos un 92%, al menos un 93%, al menos un 94%, al menos un 95%, al menos un 96%, al menos un 97%, al menos un 98% o al menos un 99% de identidad de secuencia con respecto a la SEQ. ID. NO. 2.As used herein, the term "variant" means any polypeptide having a substitution, deletion or addition of one (or more) amino acids of the sequence or sequence (or any combination thereof), including allelic variations, in comparison with the natural protein, provided that the protein result retains at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99% of the immunogenic activity compared to natural proteins as use in the present invention. Typically, variants of the polypeptides encompassed by the present invention will have at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 91%, at least 92%, at least 93%, at least less 94%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity with respect to the SEQ. ID. DO NOT. two.

La identidad de secuencia u homología se puede determinar utilizando técnicas estándar conocidas en la técnica, como el programa de secuencia Best Fit descrito por Devereux et al., Nucl. Acid Res. 12; 387-395 (1984) o el programa BLASTX (Altschul et al., J Mol. Biol. 215, 403-410). La alineación puede incluir la introducción de huecos en las secuencias a alinear. Además, para las secuencias que contienen más o menos aminoácidos que las proteínas descritas en el presente documento, se entiende que el porcentaje de homología se determinará en función del número de aminoácidos homólogos en relación con el número total de aminoácidos.The sequence identity or homology can be determined using standard techniques known in the art, such as the Best Fit sequence program described by Devereux et al., Nucl. Acid Res. 12; 387-395 (1984) or the BLASTX program (Altschul et al., J Mol. Biol. 215, 403-410). The alignment may include the insertion of gaps in the sequences to be aligned. In addition, for sequences that contain more or fewer amino acids than the proteins described herein, it is understood that the percentage of homology will be determined as a function of the number of homologous amino acids in relation to the total number of amino acids.

En algunas realizaciones, las variantes o derivados de los polipéptidos de la presente invención mantienen la hidrofobicidad/hidrofilicidad de la secuencia de aminoácidos. Se pueden hacer sustituciones de aminoácidos conservativas, por ejemplo de 1, 2 ó 3 a 10, 20 ó 30 sustituciones, siempre que la secuencia modificada retenga la capacidad de actuar como un inmunógeno. Las sustituciones de aminoácidos pueden incluir el uso de análogos no naturales; por ejemplo, para aumentar la vida media en el plasma sanguíneo. Las sustituciones conservativas son conocidas en la técnica.In some embodiments, the variants or derivatives of the polypeptides of the present invention maintain the hydrophobicity / hydrophilicity of the amino acid sequence. Conservative amino acid substitutions may be made, for example 1, 2 or 3 to 10, 20 or 30 substitutions, provided that the modified sequence retains the ability to act as an immunogen. Amino acid substitutions may include the use of non-natural analogues; for example, to increase the half-life in the blood plasma. Conservative substitutions are known in the art.

El término "derivado", como se usa en el presente documento en relación con la secuencia de aminoácidos, significa la modificación química de un polipéptido de la invención.The term "derivative", as used herein in relation to the amino acid sequence, means the chemical modification of a polypeptide of the invention.

Los ejemplos no limitantes de tales modificaciones pueden incluir, entre otros, ésteres o amidas alifáticos del extremo carboxilo o de residuos que contienen cadenas laterales carboxilo, derivados O-acilo de residuos que contienen grupos hidroxilo y derivados de N-acilo de los residuos que contienen grupos aminoácidos aminoterminales o amino; por ejemplo, lisina o arginina.Non-limiting examples of such modifications may include, among others, aliphatic esters or amides of the carboxyl terminus or residues containing carboxyl side chains, O-acyl derivatives of residues containing hydroxyl groups and N-acyl derivatives of the residues they contain. amino-terminal amino acid groups or amino; for example, lysine or arginine.

Las modificaciones adicionales pueden incluir, por ejemplo, la producción de un polipéptido conjugado con polietilenglicol (PEG), o la adición de PEG durante la síntesis química de un polipéptido como se describe en este documento.Additional modifications may include, for example, the production of a polypeptide conjugated with polyethylene glycol (PEG), or the addition of PEG during the chemical synthesis of a polypeptide as described herein.

Las modificaciones de los polipéptidos o sus porciones también pueden incluir la reducción/alquilación; acoplamiento químico a un vehículo adecuado o tratamiento con formalina suave.Modifications of the polypeptides or their portions may also include reduction / alkylation; chemical coupling to a suitable vehicle or treatment with mild formalin.

El término "modificado", como se usa en el presente documento, se refiere a la presencia de una modificación postraduccional en un polipéptido. El término "(modificado)" significa que los polipéptidos que se están discutiendo están opcionalmente modificados; es decir, los polipéptidos en discusión pueden modificarse o no modificarse. La expresión "modificado después de la traducción" y "modificado" se refiere a cualquier modificación de un aminoácido natural o no natural que se produce en dicho aminoácido después de que se haya incorporado en una cadena polipeptídica. El término abarca, solo a modo de ejemplo, modificaciones in vivo co-traduccionales, modificaciones in vivo post-traduccionales, y modificaciones in vitro post-traduccionales.The term "modified", as used herein, refers to the presence of a post-translational modification in a polypeptide. The term "(modified)" means that the polypeptides being discussed are optionally modified; that is, the polypeptides under discussion can be modified or not modified. The term "modified after translation" and "modified" refers to any modification of a natural or non-natural amino acid that occurs in said amino acid after it has been incorporated into a polypeptide chain. The term encompasses, by way of example only, co-translational in vivo modifications, post-translational in vivo modifications, and post-translational in vitro modifications.

Otros derivados de los polipéptidos de la presente invención incluyen la incorporación de residuos de aminoácidos no naturales, o residuos de aminoácidos fosforilados, tales como residuos de fosfotirosina, fosfoserina o fosfotreonina. Otras modificaciones potenciales incluyen la sulfonación, la biotinilación o la adición de otros restos, particularmente aquellos que tienen formas moleculares similares a los grupos fosfato.Other derivatives of the polypeptides of the present invention include incorporation of non-natural amino acid residues, or phosphorylated amino acid residues, such as phosphotyrosine, phosphoserine or phosphothreonine residues. Other potential modifications include sulfonation, biotinylation or the addition of other moieties, particularly those that have molecular forms similar to phosphate groups.

Los derivados también incluyen polipéptidos modificados por glicosilación. Estos se pueden hacer modificando los patrones de glicosilación durante la síntesis y el procesamiento en varios sistemas de expresión de huéspedes eucarióticos alternativos, o durante otras etapas de procesamiento. Los métodos para producir modificaciones de glicosilación incluyen exponer el polipéptido p62 a enzimas glicosiladas derivadas de células que normalmente llevan a cabo dicho procesamiento, como las enzimas de glicosilación de mamíferos. Alternativamente, se pueden usar enzimas de desglicosilación para eliminar los carbohidratos unidos durante la producción en sistemas de expresión eucarióticos. Además, también se puede modificar la secuencia de codificación para que se agreguen los sitios de glicosilación o se eliminen o deshabiliten los sitios de glicosilación. Además, si no se desea ninguna glicosilación, las proteínas pueden producirse en un sistema de expresión de huésped procariótico.The derivatives also include polypeptides modified by glycosylation. These can be done by modifying the glycosylation patterns during synthesis and processing in various alternative eukaryotic host expression systems, or during other processing steps. Methods for producing glycosylation modifications include exposing the p62 polypeptide to glycosylated enzymes derived from cells that normally carry out such processing, such as mammalian glycosylation enzymes. Alternatively, deglycosylation enzymes can be used to remove bound carbohydrates during production in eukaryotic expression systems. In addition, the coding sequence can also be modified so that the glycosylation sites are added or the glycosylation sites are deleted or disabled. In addition, if no glycosylation is desired, the proteins can be produced in a prokaryotic host expression system.

Las variantes y/o derivados de los polipéptidos de la invención se pueden preparar por síntesis química o mediante el uso de mutagénesis dirigida (Gillman et al., Gene 8:81 (1979); Roberts et al, Nature 328: 731 (1987) o Innis (Ed.), 1990, PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Academic Press, New York, NY) o el método de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR; Saiki et al, Science 239: 487 (1988)), como se ilustra por Daugherty et al (Nucleic Acids Res. 19: 2471 (1991)) para modificar los ácidos nucleicos que codifican los polipéptidos p62 de la invención. Variants and / or derivatives of the polypeptides of the invention can be prepared by chemical synthesis or by the use of site-directed mutagenesis (Gillman et al., Gene 8:81 (1979); Roberts et al, Nature 328: 731 (1987)). or Innis (Ed.), 1990, PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Academic Press, New York, NY) or the polymerase chain reaction method (PCR; Saiki et al, Science 239: 487 ( 1988)), as illustrated by Daugherty et al (Nucleic Acids Res. 19: 2471 (1991)) to modify the nucleic acids encoding the p62 polypeptides of the invention.

Los polipéptidos de la presente invención pueden contener una secuencia de señal heteróloga en su extremo N-terminal. En ciertas células huésped (por ejemplo, células huésped de mamífero), la expresión y/o la secreción de la proteína de fusión puede incrementarse mediante el uso de una secuencia de señal heteróloga. Las secuencias de señales se caracterizan típicamente por un núcleo de aminoácidos hidrófobos, que generalmente se escinden de la proteína madura durante la secreción en uno o más eventos de escisión. Dichos péptidos señal contienen sitios de procesamiento que permiten la escisión de la secuencia señal de las proteínas maduras a medida que pasan a través de la vía secretora. Por lo tanto, la invención se refiere a los polipéptidos descritos que tienen una secuencia señal, así como a polipéptidos a partir de los cuales la secuencia señal ha sido escindida proteolíticamente (es decir, los productos de escisión).The polypeptides of the present invention may contain a heterologous signal sequence at its N-terminus. In certain host cells (e.g., mammalian host cells), the expression and / or secretion of the fusion protein can be increased by the use of a heterologous signal sequence. The signal sequences are typically characterized by a core of hydrophobic amino acids, which are generally cleaved from the mature protein during secretion at one or more cleavage events. Such signal peptides contain processing sites that allow excision of the signal sequence of mature proteins as they pass through the secretory pathway. Therefore, the invention relates to the described polypeptides having a signal sequence, as well as to polypeptides from which the signal sequence has been proteolytically cleaved (ie, the cleavage products).

Con el fin de mejorar la estabilidad y/o reactividad, los polipéptidos de la presente invención también pueden modificarse para incorporar uno o más polimorfismos en la secuencia de aminoácidos que resulta de la variación alélica natural. Además, los D-aminoácidos, aminoácidos no naturales o análogos no de aminoácidos pueden sustituirse o agregarse para producir un polipéptido p62 modificado.In order to improve the stability and / or reactivity, the polypeptides of the present invention can also be modified to incorporate one or more polymorphisms in the amino acid sequence resulting from the natural allelic variation. In addition, the D-amino acids, non-natural amino acids or non-amino acid analogs can be substituted or added to produce a modified p62 polypeptide.

Los polipéptidos de la presente invención se pueden producir mediante la expresión de una secuencia de nucleótidos que los codifica en un sistema de expresión adecuado.The polypeptides of the present invention can be produced by the expression of a nucleotide sequence encoding them in a suitable expression system.

Además, o como alternativa, los polipéptidos pueden producirse utilizando métodos químicos para sintetizar la secuencia de aminoácidos deseada, en su totalidad o en parte. Por ejemplo, los polipéptidos pueden sintetizarse mediante técnicas en fase sólida, escindirse de la resina y purificarse mediante cromatografía líquida preparativa de alto rendimiento (por ejemplo, Creighton (1983) Proteins Structures And Molecular Principles, WH Freeman y Co, New York N.Y.). La composición de los polipéptidos sintéticos se puede confirmar mediante análisis de aminoácidos o secuenciación (por ejemplo, el procedimiento de degradación de Edman). Además, la secuencia de aminoácidos de un polipéptido p62, o cualquiera de sus partes, puede alterarse durante la síntesis directa y/o combinarse usando métodos químicos con una secuencia de otras subunidades, o cualquiera de sus partes, para producir un polipéptido variante.In addition, or alternatively, the polypeptides can be produced using chemical methods to synthesize the desired amino acid sequence, in whole or in part. For example, the polypeptides can be synthesized by solid phase techniques, cleaved from the resin and purified by preparative high performance liquid chromatography (e.g., Creighton (1983) Proteins Structures and Molecular Principles, WH Freeman and Co, New York N.Y.). The composition of the synthetic polypeptides can be confirmed by amino acid analysis or sequencing (e.g., the Edman degradation procedure). In addition, the amino acid sequence of a p62 polypeptide, or any of its parts, can be altered during direct synthesis and / or combined using chemical methods with a sequence of other subunits, or any of its parts, to produce a variant polypeptide.

Los ensayos para medir la actividad inmunológica de cualquier homólogo, derivado o variante de cualquier polipéptido de la presente invención son muy conocidos en la técnica.Assays for measuring the immunological activity of any homologue, derivative or variant of any polypeptide of the present invention are well known in the art.

Como se usa en el presente documento, la expresión "proteínas de fusión" se refiere a proteínas quiméricas que comprenden secuencias de aminoácidos de dos o más proteínas diferentes. Típicamente, las proteínas de fusión resultan de técnicas recombinantes in vitro muy conocidas en la técnica.As used herein, the term "fusion proteins" refers to chimeric proteins that comprise amino acid sequences of two or more different proteins. Typically, the fusion proteins result from in vitro recombinant techniques well known in the art.

Las proteínas de fusión de la presente invención pueden comprender además uno o más dominios polipeptídicos adicionales añadidos para facilitar la purificación de proteínas, para aumentar la expresión de la proteína recombinante, o para aumentar la solubilidad de la proteína recombinante. Dichos dominios que facilitan la purificación/expresión/solubilidad incluyen, entre otros, péptidos quelantes de metales, como los módulos de histidina-triptófano que permiten la purificación en metales inmovilizados (Porath J (1992) Protein Expr Purif 3­ .26328 1), dominios de proteína A que permiten la purificación de inmunoglobulina inmovilizada, y el dominio utilizado en el sistema de purificación de extensión/afinidad FLAGS (Immunex Corp, Seattle, Washington). La inclusión de una secuencia enlazadora escindible, como el Factor Xa o la enterocinasa (Invitrogen, San Diego, CA) entre el dominio de purificación y un polipéptido p62 es útil para facilitar la purificación.The fusion proteins of the present invention may further comprise one or more additional polypeptide domains added to facilitate the purification of proteins, to increase the expression of the recombinant protein, or to increase the solubility of the recombinant protein. Said domains that facilitate purification / expression / solubility include, among others, metal chelating peptides, such as histidine-tryptophan modules that allow purification on immobilized metals (Porath J (1992) Protein Expr Purif 3 .26328 1), domains of protein A that allow the purification of immobilized immunoglobulin, and the domain used in the FLAGS extension / affinity purification system (Immunex Corp, Seattle, Washington). The inclusion of a cleavable linker sequence, such as Factor Xa or enterokinase (Invitrogen, San Diego, CA) between the purification domain and a p62 polypeptide is useful to facilitate purification.

Los vectores de expresión de fusión adicionales incluyen pGEX (Pharmacia, Piscataway, NJ), pMAL (New England Biolabs, Beverly, Mass.) y pRITS (Pharmacia, Piscataway, NJ) que fusionan la glutatión S transferasa (GST), la proteína de unión a la maltosa B, o la proteína A, respectivamente, a la proteína recombinante diana. También se pueden utilizar EBV, BKV y otros vectores de expresión episómicos (Invitrogen).Additional fusion expression vectors include pGEX (Pharmacia, Piscataway, NJ), pMAL (New England Biolabs, Beverly, Mass.) And pRITS (Pharmacia, Piscataway, NJ) that fuse glutathione S transferase (GST), the protein of binding to maltose B, or protein A, respectively, to the target recombinant protein. EBV, BKV and other episomal expression vectors (Invitrogen) can also be used.

En ciertas realizaciones, se utiliza una molécula de ácido nucleico que codifica el polipéptido p62. La molécula de ácido nucleico puede comprender o consistir en una secuencia de nucleótidos que codifica uno o más polipéptidos p62, o fragmentos (que incluyen fragmentos que codifican dominios en cualquier orden o polipéptidos en los que uno o más dominios están eliminados o interrumpidos) o sus derivados, tales como los contenidos en un inserto de ADN en un depósito ATCC. La expresión "secuencia de ácido nucleico" o "molécula de ácido nucleico" se refiere a una secuencia de ADN o ARN. La expresión abarca moléculas formadas a partir de cualquiera de los análogos de bases de ADN y ARN conocidos, tales como, pero sin limitarse a, 4-acetilcitosina, 8-hidroxi-N6-metiladenosina, aziridinilcitosina, pseudoisocitosina, 5-(carboxihidroxilmetil) uracilo, 5-fluorouracilo, 5-bromouracilo, 5-carboximetilaminometil-2-tiouracilo, 5-carboxi-metilaminometiluracilo, dihidrouracilo, inosina, N6-iso-penteniladenina, 1-metiladenina, 1-metilpseudouracilo, 1-metil-guanina, 1 -metillinosina, 2,2-dimetil-guanina, 2-metiladenina, 2-metilguanina, 3-metilcitosina, 5-metilcitosina, N6-metiladenina, 7-metilguanina, 5-metilaminometiluracilo, 5-metoxiamino-metil-2-tiouracilo, beta-D-manosilqueosina, 5'-metoxicarbonil-metiluracilo, 5-metoxiuracilo, 2-metiltio-N6-isopenteniladenina, metiléster del ácido uracil-5-oxiacético, ácido uracil-5-oxiacético, oxibutoxosina, pseudouracilo, queosina, 2-tiocitosina, 5-metil-2-tiouracilo, 2-tiouracilo, 4-tiouracilo, 5-metiluracilo, metiléster del ácido N-uracil-5-oxiacético, ácido uracil-5-oxiacético, pseudouracilo, queosina, 2-tiocitosina y 2,6-diaminopurina, entre otros. In certain embodiments, a nucleic acid molecule encoding the p62 polypeptide is used. The nucleic acid molecule may comprise or consist of a nucleotide sequence encoding one or more p62 polypeptides, or fragments (including fragments encoding domains in any order or polypeptides in which one or more domains are deleted or interrupted) or their derivatives, such as those contained in a DNA insert in an ATCC deposit. The term "nucleic acid sequence" or "nucleic acid molecule" refers to a DNA or RNA sequence. The term encompasses molecules formed from any of the known DNA and RNA base analogs, such as, but not limited to, 4-acetylcytosine, 8-hydroxy-N6-methyladenosine, aziridinylcytosine, pseudoisocytosine, 5- (carboxyhydroxylmethyl) uracil , 5-fluorouracil, 5-bromouracil, 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouracil, 5-carboxy-methylaminomethyluracil, dihydrouracil, inosine, N6-iso-pentenyladenine, 1-methyladenine, 1-methylpseudouracil, 1-methyl-guanine, 1-methyllinosine , 2,2-dimethylguanine, 2-methyladenine, 2-methylguanine, 3-methylcytosine, 5-methylcytosine, N6-methyladenine, 7-methylguanine, 5-methylaminomethyluracil, 5-methoxyamino-methyl-2-thiouracil, beta-D - mannosylkeosine, 5'-methoxycarbonylmethyluracil, 5-methoxyuracil, 2-methylthio-N6-isopentenyladenine, uracil-5-oxyacetic acid methyl ester, uracil-5-oxyacetic acid, oxybutoxosine, pseudoouracil, kerosine, 2-thiocytosine, 5- methyl-2-thiouracil, 2-thiouracil, 4-thiouracil, 5-methyluracil, acid methyl ester N-uracil-5-oxyacetic acid, uracil-5-oxyacetic acid, pseudouracil, kerosine, 2-thiocytosine and 2,6-diaminopurine, among others.

Los vectores se pueden usar para transferir una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido a una célula. Un vector es cualquier molécula utilizada para transferir una secuencia de ácido nucleico a una célula huésped. En ciertos casos, se utiliza un vector de expresión. Un vector de expresión es una molécula de ácido nucleico que es adecuada para la introducción y/o propagación en una célula huésped y contiene secuencias de ácido nucleico que dirigen y/o controlan la expresión de las secuencias de ácido nucleico transferidas. La expresión incluye, pero no se limita a, procesos tales como la transcripción, la traducción y el empalme, si hay intrones presentes. Los vectores de expresión comprenden típicamente una o más secuencias flanqueantes unidas operativamente a una secuencia de ácido nucleico heteróloga que codifica un polipéptido. Las secuencias flanqueantes pueden ser homólogas (es decir, de la misma especie y/o cepa que la célula huésped), heterólogas (es decir, de una especie distinta de la especie o cepa de la célula huésped), híbridas (es decir, una combinación de secuencias flanqueantes de más de una fuente), o sintética, por ejemplo.The vectors can be used to transfer a nucleic acid sequence encoding a polypeptide to a cell. A vector is any molecule used to transfer a nucleic acid sequence to a host cell. In certain cases, an expression vector is used. An expression vector is a nucleic acid molecule that is suitable for introduction and / or propagation in a host cell and contains nucleic acid sequences that direct and / or control the expression of the transferred nucleic acid sequences. Expression includes, but is not limited to, processes such as transcription, translation and splicing, if introns are present. Expression vectors typically comprise one or more flanking sequences operably linked to a heterologous nucleic acid sequence encoding a polypeptide. The flanking sequences may be homologous (i.e., of the same species and / or strain as the host cell), heterologous (i.e., of a species other than the species or strain of the host cell), hybrid (i.e., a combination of flanking sequences from more than one source), or synthetic, for example.

Una secuencia flanqueante es preferiblemente capaz de efectuar la replicación, transcripción y/o traducción de la secuencia de codificación y está unida operativamente a una secuencia de codificación. Tal como se usa en el presente documento, la expresión “operativamente unido” se refiere a un enlace de elementos polinucleótidos en una relación funcional. Por ejemplo, un promotor o potenciador está unido operativamente a una secuencia de codificación si afecta a la transcripción de la secuencia de codificación. Sin embargo, una secuencia flanqueante no tiene por qué ser necesariamente contigua a la secuencia de codificación, siempre que funcione correctamente. Por lo tanto, por ejemplo, pueden estar presentes secuencias transcritas sin traducir aún intervinientes entre una secuencia promotora y la secuencia codificante y la secuencia promotora todavía puede considerarse unida operativamente a la secuencia codificante. De manera similar, una secuencia potenciadora se puede ubicar en sentido ascendente o descendente de la secuencia de codificación y afectar a la transcripción de la secuencia. A flanking sequence is preferably capable of effecting the replication, transcription and / or translation of the coding sequence and is operably linked to a coding sequence. As used herein, the term "operably linked" refers to a linkage of polynucleotide elements in a functional relationship. For example, a promoter or enhancer is operably linked to a coding sequence if it affects the transcription of the coding sequence. However, a flanking sequence does not necessarily have to be contiguous with the coding sequence, as long as it works correctly. Thus, for example, intervening untranslated transcribed sequences can still be present between a promoter sequence and the coding sequence and the promoter sequence can still be considered operably linked to the coding sequence. Similarly, an enhancer sequence can be located upstream or downstream of the coding sequence and affect the transcription of the sequence.

En ciertas realizaciones, se prefiere que la secuencia flanqueante sea una región reguladora de la transcripción que impulse la expresión génica de alto nivel en la célula diana. La región reguladora de la transcripción puede comprender, por ejemplo, un promotor, potenciador, silenciador, elemento represor, o sus combinaciones. La región reguladora de la transcripción puede ser constitutiva, específica del tejido, específica del tipo de célula (es decir, la región es impulsora a niveles más altos de transcripción en un tipo de tejido o célula en comparación con otro), o regulable (es decir, sensible a la interacción con una molécula). La fuente de una región reguladora de la transcripción puede ser cualquier organismo procariótico o eucariótico, cualquier organismo vertebrado o invertebrado, o cualquier planta, siempre que la secuencia flanqueante funcione en una célula causando la transcripción de un ácido nucleico dentro de esa célula. Se puede utilizar una amplia variedad de regiones reguladoras de la transcripción.In certain embodiments, it is preferred that the flanking sequence be a transcriptional regulatory region that drives high level gene expression in the target cell. The regulatory region of transcription may comprise, for example, a promoter, enhancer, silencer, repressor element, or combinations thereof. The transcriptional regulatory region can be constitutive, tissue-specific, cell type-specific (i.e., the region is driving at higher levels of transcription in one type of tissue or cell compared to another), or regulatable (ie say, sensitive to the interaction with a molecule). The source of a transcriptional regulatory region can be any prokaryotic or eukaryotic organism, any vertebrate or invertebrate organism, or any plant, so long as the flanking sequence functions in a cell causing the transcription of a nucleic acid within that cell. A wide variety of regulatory regions of transcription can be used.

Las regiones reguladoras de la transcripción adecuadas incluyen, por ejemplo, el promotor de CMV (es decir, el promotor temprano inmediato de CMV); promotores de genes eucarióticos (es decir, el gen de la ovoalbúmina de pollo inducible por estrógenos, los genes de interferón, el gen de la tirosina aminotransferasa inducible por glucocorticoides y el gen de la timidina quinasa); y los principales promotores del gen del adenovirus temprano y tardío; la región promotora temprana de SV40 (Bernoist y Chambon, 1981, Nature 290: 304-10); el promotor contenido en la repetición terminal larga 3' (LTR) del virus del sarcoma de Rous (RSV) (Yamamoto, et al., 1980, Cell 22: 787-97); el promotor de la timidina quinasa del virus del herpes simple (HSV-TK) (Wagner et al., 1981, Proc. Natl Acad Sci. U.S.A. 78: 1444-45); las secuencias reguladoras del gen de la metalotionina (Brinster et al., 1982, Nature 296: 39-42); vectores de expresión procarióticos tales como el promotor de beta-lactamasa (VIIIa-Kamaroff et al., 1978, Proc. Natl Acad Sci. U.S.A., 75: 3727-31); o el promotor tac (DeBoer et al., 1983, Proc. Natl Acad Sci. U.S.A., 80: 21-25). Las regiones de control de la transcripción específicas de tipo celular y/o de tejido incluyen, por ejemplo, la región de control del gen de la elastasa I que es activa en células acinares pancreáticas (Swift et al., 1984, Cell 38: 639-46; Ornitz et al., 1986, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 50:399-409 (1986); MacDonald, 1987, Hepalology 7: 425-515); la región de control del gen de la insulina que es activa en las células beta pancreáticas (Hanahan, 1985, Nature 315: 115-22); la región de control del gen de la inmunoglobulina que es activa en células linfoides (Grosschedl et al., 1984, Cell 38: 647-58; Adames et al., 1985, Nature 318: 533-38; Alexander et al., 1987, Mol. Cell. Biol., 7: 1436-44); la región de control del virus del tumor mamario de ratón en las células testiculares, mamarias, linfoides y mastocitos (Leder et al., 1986, Cell 45: 485-95); la región de control del gen de la albúmina en el hígado (Pinkert et al., 1987, Genes and Devel. 1: 268-76); la región de control del gen de la proteína alfa-feto en el hígado (Krumlauf et al., 1985, Mol. Cell. Biol., 5: 1639-48; Hammer et al., 1987, Science 235: 53-58); la región de control del gen de alfa 1 -antitripsina en el hígado (Kelsey et al., 1987, Genes and Devel. 1: 161-71); la región de control del gen de la beta-globina en células mieloides (Mogram et al., 1985, Nature 315: 338-40; Kollias et al., 1986, Cell 46: 89-94); la región de control del gen de la proteína básica de la mielina en las células de oligodendrocitos en el cerebro (Readhead et al., 1987, Cell 48: 703-12); la región de control del gen de la cadena ligera-2 de la miosina en el músculo esquelético (Sani, 1985, Nature 314: 283-86); la región de control del gen de la hormona liberadora gonadotrópica en el hipotálamo (Mason et al., 1986, Science 234: 1372-78) y el promotor de la tirosinasa en células de melanoma (Hart, I. Semin Oncol 1996 febrero; 23 (1): 1548; Siders, et al. Cancer Gene Ther 1998 septiembreoctubre; 5 (5): 281-91), entre otros. También se pueden utilizar promotores inducibles que se activan en presencia de una determinada molécula o condición, como la luz, el calor, la radiación, la tetraciclina o las proteínas de choque térmico, por ejemplo (véase, por ejemplo, el documento WO 00/10612). Otros promotores adecuados son conocidos en la técnica. Suitable transcriptional regulatory regions include, for example, the CMV promoter (ie, the CMV immediate early promoter); promoters of eukaryotic genes (ie, estrogen-inducible chicken ovalbumin gene, interferon genes, glucocorticoid-inducible tyrosine aminotransferase gene and thymidine kinase gene); and the major promoters of the early and late adenovirus gene; the SV40 early promoter region (Bernoist and Chambon, 1981, Nature 290: 304-10); the promoter contained in the 3 'long terminal repeat (LTR) of the Rous sarcoma virus (RSV) (Yamamoto, et al., 1980, Cell 22: 787-97); the thymidine kinase promoter of herpes simplex virus (HSV-TK) (Wagner et al., 1981, Proc. Natl Acad Sci. USA 78: 1444-45); the regulatory sequences of the metallothionin gene (Brinster et al., 1982, Nature 296: 39-42); prokaryotic expression vectors such as the beta-lactamase promoter (VIIIa-Kamaroff et al., 1978, Proc. Natl Acad Sci. USA, 75: 3727-31); or the tac promoter (DeBoer et al., 1983, Proc. Natl Acad Sci. USA, 80: 21-25). The specific transcription control regions of cell type and / or tissue include, for example, the control region of the elastase I gene that is active in pancreatic acinar cells (Swift et al., 1984, Cell 38: 639 -46; Ornitz et al., 1986, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 50: 399-409 (1986); MacDonald, 1987, Hepalology 7: 425-515); the control region of the insulin gene that is active in pancreatic beta cells (Hanahan, 1985, Nature 315: 115-22); the control region of the immunoglobulin gene that is active in lymphoid cells (Grosschedl et al., 1984, Cell 38: 647-58; Adames et al., 1985, Nature 318: 533-38; Alexander et al., 1987 , Mol, Cell, Biol., 7: 1436-44); the control region of the mouse mammary tumor virus in testicular, mammary, lymphoid and mast cell (Leder et al., 1986, Cell 45: 485-95); the control region of the albumin gene in the liver (Pinkert et al., 1987, Genes and Devel., 1: 268-76); the control region of the alpha-feto protein gene in the liver (Krumlauf et al., 1985, Mol Cell. Biol., 5: 1639-48; Hammer et al., 1987, Science 235: 53-58) ; the control region of the alpha 1 -antitrypsin gene in the liver (Kelsey et al., 1987, Genes and Devel. 1: 161-71); the control region of the beta-globin gene in myeloid cells (Mogram et al., 1985, Nature 315: 338-40, Kollias et al., 1986, Cell 46: 89-94); the control region of the myelin basic protein gene in the oligodendrocyte cells in the brain (Readhead et al., 1987, Cell 48: 703-12); the control region of the myosin light chain-2 gene in skeletal muscle (Sani, 1985, Nature 314: 283-86); the control region of the gonadotropic releasing hormone gene in the hypothalamus (Mason et al., 1986, Science 234: 1372-78) and the tyrosinase promoter in melanoma cells (Hart, I. Semin Oncol 1996 February; 23 (1): 1548, Siders, et al.Cancer Gene Ther 1998 SeptemberOctober; 5 (5): 281-91), among others. It is also possible to use inducible promoters that are activated in the presence of a certain molecule or condition, such as light, heat, radiation, tetracycline or heat shock proteins, for example (see, for example, WO 00 / 10612). Other suitable promoters are known in the art.

Como se describió anteriormente, los potenciadores también pueden ser secuencias flanqueantes adecuadas. Los potenciadores son elementos del ADN que actúan en cis, generalmente de aproximadamente 10-300 pb de longitud, que actúan sobre el promotor para aumentar la transcripción. Los potenciadores son típicamente independientes de la orientación y la posición, ya que se han identificado tanto en 5' como en 3' para secuencias de codificación controladas. Se conocen varias secuencias potenciadoras disponibles de genes de mamíferos (es decir, globina, elastasa, albúmina, alfa-feto-proteína e insulina). De manera similar, el potenciador de SV40, el potenciador del promotor temprano de citomegalovirus, el potenciador de polioma y los potenciadores de adenovirus son útiles con secuencias promotoras eucariotas. Mientras que un potenciador puede ser empalmado en el vector en una posición 5' o 3' a la secuencia codificante de ácido nucleico, típicamente se ubica en un sitio 5' del promotor. Otros potenciadores adecuados son conocidos en la técnica y serían aplicables a la presente descripción.As described above, the enhancers may also be suitable flanking sequences. Enhancers are elements of DNA that act in cis, generally about 10-300 bp in length, which act on the promoter to increase transcription. The enhancers are typically independent of orientation and position, since they have been identified both in 5 'and 3' for controlled coding sequences. Several available enhancer sequences of mammalian genes are known (ie, globin, elastase, albumin, alpha-fetus-protein and insulin). Similarly, the SV40 enhancer, the cytomegalovirus early promoter enhancer, the polyoma enhancer and the adenovirus enhancers are useful with eukaryotic promoter sequences. While an enhancer can be spliced into the vector at a position 5 'or 3' to the nucleic acid coding sequence, it is typically located at a 5 'site of the promoter. Other suitable enhancers are known in the art and would be applicable to the present disclosure.

En ciertas realizaciones, puede ser ventajoso combinar un polipéptido p62 o una secuencia de ácido nucleico que codifique un polipéptido p62, o su derivado con uno o más componente(s) coestimulantes, tales como proteínas de la superficie celular, citoquinas, quimiocinas o moléculas de señalización en una composición descrita en este documento. El componente coestimulador puede incluirse en la composición como un polipéptido o como un ácido nucleico que codifica el polipéptido, por ejemplo. Las moléculas coestimuladoras adecuadas incluyen, por ejemplo, polipéptidos que se unen a miembros de la familia CD28 (es decir, CD28, ICOS; Hutloff, et al. Nature 1999, 397: 263-265; Peach, et al. J Exp Med 1994, 180: 2049-2058) tales como los polipéptidos de unión a CD28 B7.1 (CD80; Schwartz, 1992; Chen et al, 1992; Ellis, et al. J. Immunol., 156 (8): 2700-9) y B7.2 (CD86; Ellis, et al. J. Immunol., 156 (8): 2700-9); polipéptidos que se unen a miembros de la familia integrina (es decir, LFA-1 (CD11a/CD18); Sedwick, et al. J Immunol 1999, 162: 1367-1375; Wulfing, et al. Science 1998, 282: 2266-2269; Lub, et al., Immunol Today 1995, 16: 479-483) incluidos los miembros de la familia ICAM (es decir, ICAM-1, -2 o -3); polipéptidos que se unen a miembros de la familia CD2 (es decir, CD2, molécula de activación de linfocitos de señalización (CDw150 o "SLAM"; Aversa, et al. J Immunol 1997, 158: 4036-4044)) como CD58 (LFA-3; ligando CD2; Davis, et al., Immunol Today 1996, 17: 177-187) o ligandos de SLAM (Sayos, et al. Nature 1998, 395: 462-469); polipéptidos que se unen al antígeno estable al calor (HSA o CD24; Zhou, et al. Eur J Immunol 1997, 27: 2524-2528); polipéptidos que se unen a miembros de la familia del receptor de TNF (TNFR) (es decir, 4-1BB (CD137; Vinay, et al. Semin Immunol 1998, 10: 481-489), OX40 (CD134; Weinberg, et al. Semin Immunol 1998, 10: 471-480; Higgins, et al J Immunol 1999, 162: 486-493), y CD27 (Lens, et al. Semin Immunol 1998, 10: 491-499)) como 4-1BBL (ligando 4-1BB; Vinay et al. Semin Immunol 1998, 10: 481-48; DeBenedette, et al. J Immunol 1997, 158: 551-559), factor 1 asociado a TNFR (TRAF-1; ligando 4-1BB; Saoulli, et al. J Exp Med 1998, 187: 1849-1862, Arch, et al. Mol Cell Biol 1998, 18: 558-565), TRAF-2 (4-1BB y ligando OX40; Saoulli, et al. J Exp Med 1998, 187: 1849-1862; Oshima, et al. Int Immunol 1998, 10: 517-526, Kawamata, et al., J Biol Chem 1998, 273: 5808-5814), TRAF-3 (4-1BB y ligando OX40); Arch, et al., Mol Cell Biol 1998, 18: 558-565; Jang, et al., Biochem Biophys Res Commun 1998, 242: 613-620; Kawamata S, et al., J Biol Chem 1998, 273: 5808-5814), OX4OL (ligando oX40; Gramaglia, et al. J Immunol 1998, 161: 6510-6517), TRAF-5 (ligando OX40; Arch, et al. Mol Cell Biol 1998, 18: 558-565; Kawamata, et al. J Biol Chem 1998, 273: 5808-5814), y Cd 70 (CD27, ligando; Couderc, et al. Cancer Gene Ther., 5 (3): 163-75). CD154 (ligando CD40 o "CD4OL"; Gurunathan, et al., J. Immunol., 1998, 161: 4563-4571; Sine, et al., Hum. Gene Ther., 2001, 12: 1091-1102) también puede ser adecuado.In certain embodiments, it may be advantageous to combine a p62 polypeptide or a nucleic acid sequence encoding a p62 polypeptide, or its derivative with one or more costimulatory component (s), such as cell surface proteins, cytokines, chemokines or signage in a composition described in this document. The co-stimulatory component can be included in the composition as a polypeptide or as a nucleic acid encoding the polypeptide, for example. Suitable costimulatory molecules include, for example, polypeptides that bind to members of the CD28 family (ie, CD28, ICOS; Hutloff, et al., Nature 1999, 397: 263-265; Peach, et al., J Exp Med 1994 , 180: 2049-2058) such as the CD28 binding polypeptides B7.1 (CD80, Schwartz, 1992, Chen et al, 1992, Ellis, et al., J. Immunol., 156 (8): 2700-9). and B7.2 (CD86; Ellis, et al., J. Immunol., 156 (8): 2700-9); polypeptides that bind to members of the integrin family (i.e., LFA-1 (CD11a / CD18); Sedwick, et al., J Immunol 1999, 162: 1367-1375; Wulfing, et al., Science 1998, 282: 2266- 2269; Lub, et al., Immunol Today 1995, 16: 479-483) including members of the ICAM family (ie, ICAM-1, -2 or -3); polypeptides that bind to members of the CD2 family (ie, CD2, signaling lymphocyte activation molecule (CDw150 or "SLAM"; Aversa, et al., J Immunol 1997, 158: 4036-4044)) as CD58 (LFA -3; CD2 ligand; Davis, et al., Immunol Today 1996, 17: 177-187) or SLAM ligands (Sayos, et al., Nature 1998, 395: 462-469); polypeptides that bind to the heat stable antigen (HSA or CD24; Zhou, et al., Eur J Immunol 1997, 27: 2524-2528); polypeptides that bind to members of the TNF receptor family (TNFR) (ie, 4-1BB (CD137; Vinay, et al., Semin Immunol 1998, 10: 481-489), OX40 (CD134; Weinberg, et al. Semin Immunol 1998, 10: 471-480, Higgins, et al J Immunol 1999, 162: 486-493), and CD27 (Lens, et al., Semin Immunol 1998, 10: 491-499)) as 4-1BBL ( ligand 4-1BB; Vinay et al., Semin Immunol 1998, 10: 481-48; DeBenedette, et al., J Immunol 1997, 158: 551-559), factor 1 associated with TNFR (TRAF-1; ligand 4-1BB; Saoulli, et al J Exp Med 1998, 187: 1849-1862, Arch, et al Mol Cell Biol 1998, 18: 558-565), TRAF-2 (4-1BB and OX40 ligand, Saoulli, et al. Exp Med 1998, 187: 1849-1862; Oshima, et al., Immunol 1998, 10: 517-526, Kawamata, et al., J Biol Chem 1998, 273: 5808-5814), TRAF-3 (4-1BB and ligand OX40); Arch, et al., Mol Cell Biol 1998, 18: 558-565; Jang, et al., Biochem Biophys Res Commun 1998, 242: 613-620; Kawamata S, et al., J Biol Chem 1998, 273: 5808-5814), OX4OL (ligand oX40, Gramaglia, et al., J Immunol 1998, 161: 6510-6517), TRAF-5 (ligand OX40; Arch, et. al Mol Cell Biol 1998, 18: 558-565; Kawamata, et al., J Biol Chem 1998, 273: 5808-5814), and C d 70 (CD27, ligand; Couderc, et al., Cancer Gene Ther., 5 (3): 163-75). CD154 (ligand CD40 or "CD4OL"; Gurunathan, et al., J. Immunol., 1998, 161: 4563-4571; Sine, et al., Hum. Gene Ther., 2001, 12: 1091-1102) can also be adequate

También pueden ser componentes coestimulantes o "adyuvantes" adecuados una o más citoquinas, ya sea como polipéptidos o bien están codificados por ácidos nucleicos contenidos en las composiciones de la presente invención (Parmiani, et al. Immunol Lett 2000 Sep. 15; 74(1): 41-4; Berzofsky, et al. Nature Immunol 1: 209-219). Las citocinas adecuadas incluyen, por ejemplo, interleucina-2 (IL-2) (Rosenberg, et al. Nature Med. 4: 321-327 (1998)), IL-4, IL-7, IL-12 (revisado por Pardoll, 1992; Harries, et al. J. Gene Med. 2000 Julio-Agosto; 2 (4): 243-9; Rao, et al. J. Immunol.Also suitable co-stimulant components or "adjuvants" are one or more cytokines, either as polypeptides or are encoded by nucleic acids contained in the compositions of the present invention (Parmiani, et al., Immunol Lett 2000 Sep. 15; 74 (1 ): 41-4, Berzofsky, et al., Nature Immunol 1: 209-219). Suitable cytokines include, for example, interleukin-2 (IL-2) (Rosenberg, et al., Nature Med. 4: 321-327 (1998)), IL-4, IL-7, IL-12 (reviewed by Pardoll , 1992; Harries, et al., J. Gene Med. 2000, July-August; 2 (4): 243-9; Rao, et al., J. Immunol.

156: 3357-3365 (1996)), IL-15 (Xin, et al. Vaccine, 17: 858-866, 1999), IL-16 (Cruikshank, et al. J. Leuk Biol. 67(6): 757-66, 2000), IL-18 (J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2001. 127(12): 718-726), GM-CSF (CSF (Disis, et al. Blood, 88: 202-210 (1996)), factor de necrosis tumoral alfa (TNF-a), o interferones como el IFN-a, o INF-y. También pueden ser adecuadas otras citocinas, como se conoce en la técnica.156: 3357-3365 (1996)), IL-15 (Xin, et al., Vaccine, 17: 858-866, 1999), IL-16 (Cruikshank, et al., J. Leuk Biol. 67 (6): 757 -66, 2000), IL-18 (J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2001. 127 (12): 718-726), GM-CSF (CSF (Disis, et al., Blood, 88: 202-210 ( 1996)), tumor necrosis factor alpha (TNF-a), or interferons such as IFN-a, or INF- and other cytokines, as is known in the art, may also be suitable.

También se pueden utilizar quimiocinas. Por ejemplo, se ha demostrado que las proteínas de fusión que comprenden CXCL10 (IP-10) y CCL7 (MCP-3) fusionadas a un autoantígeno tumoral inducen inmunidad antitumoral (Biragyn, et al. Nature Biotech. 1999, 17: 253-258). Las quimiocinas CCL3 (MIP-1a) y CCL5 (RANTES) (Boyer, et al. Vaccine, 1999, 17 (Supp. 2): S53-S64) también pueden ser útiles. Otras quimiocinas adecuadas son conocidas en la técnica.Chemokines can also be used. For example, it has been shown that fusion proteins comprising CXCL10 (IP-10) and CCL7 (MCP-3) fused to a tumor autoantigen induce antitumor immunity (Biragyn, et al., Nature Biotech, 1999, 17: 253-258). ). The chemokines CCL3 (MIP-1a) and CCL5 (RANTES) (Boyer, et al., Vaccine, 1999, 17 (Supp.2): S53-S64) may also be useful. Other suitable chemokines are known in the art.

Una "molécula de señalización" es un compuesto químico biológico involucrado en la transmisión de información entre células. Dichas moléculas se liberan desde la célula enviando la señal, cruzan la brecha entre las células por difusión e interactúan con receptores específicos en otra célula, lo que desencadena una respuesta en esa célula activando una serie de reacciones controladas por enzimas que conducen a cambios dentro de la célula. Por ejemplo, el sulfuro de hidrógeno es producido en pequeñas cantidades por algunas células del cuerpo humano y tiene una serie de funciones de señalización biológica. Solo ejemplos incluyen el óxido nítrico y el monóxido de carbono.A "signaling molecule" is a biological chemical compound involved in the transmission of information between cells. These molecules are released from the cell sending the signal, cross the gap between the cells by diffusion and interact with specific receptors in another cell, which triggers a response in that cell activating a series of reactions controlled by enzymes that lead to changes within the cell. the cell. For example, hydrogen sulfide is produced in small quantities by some cells of the human body and has a series of biological signaling functions. Only examples include nitric oxide and carbon monoxide.

También se sabe en la técnica que los mecanismos inmunitarios supresores o reguladores negativos pueden estar bloqueados, dando como resultado respuestas inmunitarias mejoradas. Por ejemplo, el tratamiento con anticuerpo anti-CTLA-4 (Shrikant, et al. Immunity, 1996, 14: 145-155; Sutmuller, et al. J. Exp. Med., 2001, 194: 823-832), anticuerpo anti-CD25 (Sutmuller, supra), anticuerpo anti-CD4 (Matsui, et al. J. Immunol., 1999, 163: 184-193), la proteína de fusión IL13Ra2-Fc (Terabe, et al. Nature Immunol., 2000, 1: 515-520), y sus combinaciones (es decir, anticuerpos anti-CTLA-4 y anti-CD25, Sutmuller, supra) se ha demostrado que aumentan las respuestas inmunes antitumorales y sería adecuado en la práctica de la presente invención.It is also known in the art that immune suppressor or negative regulatory mechanisms may be blocked, resulting in improved immune responses. For example, treatment with anti-CTLA-4 antibody (Shrikant, et al., Immunity, 1996, 14: 145-155; Sutmuller, et al., J. Exp. Med., 2001, 194: 823-832), anti-CD25 antibody (Sutmuller, supra), anti-CD4 antibody (Matsui, et al., J. Immunol., 1999, 163: 184-193), the IL13Ra2-Fc fusion protein (Terabe, et al., Nature Immunol. , 2000, 1: 515-520), and their combinations (ie, anti-CTLA-4 and anti-CD25 antibodies, Sutmuller, supra) have been shown to increase antitumor immune responses and would be suitable in the practice of the present invention.

Cualquiera de estos componentes se puede usar solos o en combinación con otros agentes. Por ejemplo, se ha demostrado que una combinación de CD80, ICAM-1 y LFA-3 ("TRICOM") puede potenciar las respuestas inmunitarias contra el cáncer (Hodge, et al. Cancer Res. 59: 5800-5807 (1999). Otras combinaciones efectivas incluyen, por ejemplo, IL-12 Gm -CSF (Ahlers, et al. J. Immunol., 158: 3947-3958 (1997); Iwasaki, et al. J. Immunol 158: 4591-4601 (1997)), IL-12 GM-CSF TNF-a. (Ahlers, et al. Int. Immunol 13: 897-908 (2001)), CD80 IL-12 (Fruend, et al. Int. J. Cancer, 85: 508-517 (2000); Rao, et al. supra), y CD86 GM-CSF IL-12 (Iwasaki, supra). Cualquier experto en la técnica conocerá combinaciones adicionales útiles en la presente invención. Además, el experto en la materia estaría al tanto de reactivos o métodos adicionales que se pueden usar para modular tales mecanismos. Estos reactivos y métodos, así como otros conocidos por los expertos en la técnica, pueden utilizarse en la presente invención.Any of these components can be used alone or in combination with other agents. For example, it has been shown that a combination of CD80, ICAM-1 and LFA-3 ("TRICOM") can enhance immune responses against cancer (Hodge, et al., Cancer Res. 59: 5800-5807 (1999). Other effective combinations include, for example, IL-12 Gm -CSF (Ahlers, et al., J. Immunol., 158: 3947-3958 (1997); Iwasaki, et al., J. Immunol 158: 4591-4601 (1997). ), IL-12 GM-CSF TNF-a. (Ahlers, et al., Int. Immunol 13: 897-908 (2001)), CD80 IL-12 (Fruend, et al. Int. J. Cancer, 85: 508 -517 (2000), Rao, et al., Supra), and CD86 GM-CSF IL-12 (Iwasaki, supra.) Any person skilled in the art will know of additional combinations useful in the present invention. with additional reagents or methods that can be used to modulate such mechanisms These reagents and methods, as well as others known to those skilled in the art, can be used in the present invention.

También se pueden usar otras estrategias para mejorar la eficiencia de la inmunización basada en ácidos nucleicos, incluido, por ejemplo, el uso de replicones virales autorreplicantes (Caley, et al. 1999. Vaccine, 17: 3124-2135; Dubensky, et al. 2000. Mol. Med. 6: 723-732; Leitner, et al. 2000. Cancer Res. 60: 51-55), optimización de codones (Liu, et al. 2000. Mol. Ther., 1: 497-500; Dubensky, supra; Huang, et al. 2001. J. Virol. 75: 4947-4951), electroporación in vivo (Widera, et al. 2000, J. Immunol. 164: 4635-3640), incorporación de motivos estimulantes de CpG (Gurunathan, et al. Ann. Rev. Immunol., 2000, 18: 927-974; Leitner, supra; Cho, et al. J. Immunol 168 (10): 4907-13), secuencias para la orientación de las vías de procesamiento de ubiquitina o endocítica (Thomson, et al.Other strategies can also be used to improve the efficiency of nucleic acid-based immunization, including, for example, the use of self-replicating viral replicons (Caley, et al., 1999. Vaccine, 17: 3124-2135; Dubensky, et al. 2000. Mol. Med. 6: 723-732; Leitner, et al., 2000. Cancer Res. 60: 51-55), codon optimization (Liu, et al., 2000. Mol. Ther., 1: 497-500. Dubensky, supra; Huang, et al., 2001. J. Virol., 75: 4947-4951), electroporation in vivo (Widera, et al., 2000, J. Immunol. 164: 4635-3640), incorporation of stimulant motifs of CpG (Gurunathan, et al., Ann. Rev. Immunol., 2000, 18: 927-974; Leitner, supra; Cho, et al., J. Immunol 168 (10): 4907-13), sequences for the orientation of the ubiquitin or endocytic processing pathways (Thomson, et al.

1998, J. Virol. 72: 2246-2252; Velders, et al. 2001, J. Immunol 166: 5366-5373), secuencias VP22 del virus de la enfermedad de Marek tipo 1 (J. Virol. 76 (6): 2676-82, 2002), regímenes de estimulación primaria (Gurunathan, supra; Sullivan, et al. 2000, Nature, 408: 605-609; Hanke, et al. 1998, Vaccine, 16: 439-445; Amara, et al. 2001, Science, 292: 69-74), y el uso de vectores de administración de la mucosa como Salmonella (Darji, et al. 1997. Cell, 91: 765-775; Woo, et al. 2001, Vaccine, 19: 2945-2954). Otros métodos son conocidos en la técnica, algunos de los cuales se describen a continuación.1998, J. Virol. 72: 2246-2252; Velders, et al. 2001, J. Immunol 166: 5366-5373), VP22 sequences of the Marek's disease virus type 1 (J. Virol. 76 (6): 2676-82, 2002), primary stimulation regimes (Gurunathan, supra; Sullivan , et al., 2000, Nature, 408: 605-609, Hanke, et al., 1998, Vaccine, 16: 439-445, Amara, et al., 2001, Science, 292: 69-74), and the use of vectors. of mucosal administration such as Salmonella (Darji, et al., 1997. Cell, 91: 765-775; Woo, et al., 2001, Vaccine, 19: 2945-2954). Other methods are known in the art, some of which are described below.

Los agentes quimioterapéuticos, la radiación, las moléculas antiangiogénicas u otros agentes también pueden utilizarse para tratar y/o prevenir el cáncer usando polipéptidos p62 o ácidos nucleicos que codifican p62 (Sebti, et al. Oncogene 2000 Dec. 27; 19(56):6566-73). Por ejemplo, en el tratamiento del cáncer de mama metastásico, los agentes quimioterapéuticos útiles incluyen ciclofosfamida, doxorubicina, paclitaxel, docetaxel, navelbina, capecitabina y mitomicina C, entre otros. Los regímenes quimioterapéuticos combinados también han demostrado ser efectivos, incluyendo ciclofosfamida metotrexato 5-fluorouracilo; ciclofosfamida doxorrubicina 5-fluorouracilo; o, ciclofosfamida doxorubicina, por ejemplo. Se han utilizado otros compuestos tales como la prednisona, un taxano, navelbina, mitomicina C o vinblastina por varias razones. La mayoría de los pacientes con cáncer de mama tienen tumores con receptores de estrógeno positivos (ER+) y en estos pacientes, se prefiere la terapia endocrina (es decir, el tamoxifeno) frente a la quimioterapia. Para tales pacientes, se prefiere el tamoxifeno o, como terapia de segunda línea, las progestinas (acetato de medroxiprogesterona o acetato de megestrol). Los inhibidores de la aromatasa (es decir, la aminoglutetimida y sus análogos, como el letrozol) disminuyen la disponibilidad de estrógenos necesarios para mantener el crecimiento del tumor y se pueden usar como terapia endocrina de segunda o tercera línea en ciertos pacientes.Chemotherapeutic agents, radiation, anti-angiogenic molecules or other agents can also be used to treat and / or prevent cancer using p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 (Sebti, et al., Oncogene 2000 Dec. 27; 19 (56): 6566-73). For example, in the treatment of metastatic breast cancer, useful chemotherapeutic agents include cyclophosphamide, doxorubicin, paclitaxel, docetaxel, navelbine, capecitabine and mitomycin C, among others. Combined chemotherapeutic regimens have also been shown to be effective, including cyclophosphamide methotrexate 5-fluorouracil; cyclophosphamide doxorubicin 5-fluorouracil; or, cyclophosphamide doxorubicin, for example. Other compounds such as prednisone, a taxane, navelbine, mitomycin C or vinblastine have been used for several reasons. Most patients with breast cancer have tumors with estrogen receptor positive (ER +) and in these patients, endocrine therapy (ie, tamoxifen) is preferred over chemotherapy. For such patients, tamoxifen is preferred or, as a second-line therapy, progestins (medroxyprogesterone acetate or megestrol acetate). Aromatase inhibitors (ie, aminoglutethimide and its analogs, such as letrozole) decrease the availability of estrogen needed to maintain tumor growth and can be used as second or third line endocrine therapy in certain patients.

Otros cánceres pueden requerir diferentes regímenes quimioterapéuticos. Por ejemplo, el cáncer colorrectal metastásico suele tratarse con Camptosar (irinotecan o CPT-11), 5-fluorouracilo o leucovorina, solos o en combinación entre sí. Los inhibidores de proteinasas y de integrina, como los inhibidores de la MMP marimastata (British Biotech), COL-3 (Collagenex), Neovastat (Aeterna), AG3340 (Agouron), BMS-275291 (Bristol Myers Squibb), CGS 27023A (Novartis) o los inhibidores de integrina Vitaxin (Medimmune), o MED1522 (Merck KgaA) también puede ser adecuado para su uso. Como tal, la selección inmunológica de dianas inmunogénicas asociadas con el cáncer colorrectal se podría realizar en combinación con un tratamiento utilizando esos agentes quimioterapéuticos. De manera similar, los agentes quimioterapéuticos usados para tratar otros tipos de cáncer son bien conocidos en la técnica y pueden combinarse con las dianas inmunogénicas descritas en este documento.Other cancers may require different chemotherapeutic regimens. For example, metastatic colorectal cancer is usually treated with Camptosar (irinotecan or CPT-11), 5-fluorouracil or leucovorin, alone or in combination with each other. Inhibitors of proteinases and integrin, such as the MMP inhibitors marimastata (British Biotech), COL-3 (Collagenex), Neovastat (Aeterna), AG3340 (Agouron), BMS-275291 (Bristol Myers Squibb), CGS 27023A (Novartis) ) or the integrin inhibitors Vitaxin (Medimmune), or MED1522 (Merck KgaA) may also be suitable for use. As such, the immunological selection of immunogenic targets associated with colorectal cancer could be performed in combination with a treatment using those chemotherapeutic agents. Similarly, chemotherapeutic agents used to treat other types of cancer are well known in the art and can be combined with the immunogenic targets described herein.

Muchos agentes antiangiogénicos son conocidos en la técnica y serían adecuados para la administración conjunta con el ácido nucleico p62 o las vacunas de polipéptidos (ver, por ejemplo, Timar, et al. 2001. Pathology Oncol. Res., 7 (2): 85-94). Tales agentes incluyen, por ejemplo, agentes fisiológicos tales como factores de crecimiento (es decir, ANG-2, NK1, 2, 4 (HGF), factor de crecimiento transformante beta (TGF-p)), citoquinas (es decir, interferones tales como IFN-a, -p, -y, factor plaquetario 4 (PF-4), PR-39), proteasas (es decir, AT-III escindido, fragmento de colágeno XVIII (endostatina)), fragmento de plasmina HmwKallikrein-d5 (angiostatina), protrombina-F1-2, TSP-1), inhibidores de proteasa (es decir, inhibidores tisulares de metaloproteasas como TIMP-1, -2 o -3; maspin; activadoresinhibidores de plasminógeno tales como PAI-1; factor derivado del epitelio pigmentario (PEDf )), Tumstatina (disponible a través de ILEX, Inc.), productos de anticuerpos (es decir, los anticuerpos de unión a colágeno HUIV26, HUI77, XL313; anti-VEGF; anti-integrina (es decir, Vitaxin, (Lxsys))) y glicosidasas (es decir, heparinasa-I, -III). Las moléculas que son antagonistas de los antígenos asociados a la angiogénesis (incluidas las proteínas y los polipéptidos) también son adecuadas y pueden incluir, pero no se limitan a, moléculas dirigidas contra VEGF, receptor de VEGF, EGFR, bFGF, PDGF-B, PD-ECGF, TGF incluidos TGF-a, endoglina, proteínas Id, diversas proteasas, óxido nítrico sintasa, aminopeptidasa, trombospondinas, k-ras, Wnt, quinasas dependientes de ciclina, microtúbulos, proteínas de choque térmico, factores de unión a heparina, sintasas, receptores de colágeno, integrinas, y proteoglicano de superficie NG2. Los agentes "químicos" o fisiológicos modificados que se sabe o se cree que tienen potencial anti-angiogénico incluyen, por ejemplo, vinblastina, taxol, ketoconazol, talidomida, dolestatina, combrestatina A, rapamicina (Guba, et al. 2002, Nature Med., 8: 128-135), CEP-7055 (disponible en Cephalon, Inc.), flavona ácido acético, Bay 12-9566 (Bayer Corp.), AG3340 (Agouron, Inc.), CGS. 27023A (Novartis), derivados de tetracilcina (es decir, COL-3 (Collagenix, Inc.)), Neovastat (Aeterna), BMS-275291 (Bristol-Myers Squibb), dosis baja 5-FU, dosis baja de metotrexato (MTX), irsofladina, radicicol, ciclosporina, captopril, celecoxib, polisacárido sulfatado D45152, proteína catiónica (protamina), péptido catiónico-VEGF, suramina (naftil urea polisulfonada), compuestos que interfieren con la función o producción de VEGF (es decir, SU5416 o SU686)), PTK787/ZK22584 (Novartis), Distamicina A, Angiozima (ribozima), isoflavinoides, derivados de estaurosporina, genisteína, EMD121974 (Merck KcgaA), tirfostinas, isoquinolonas, ácido retinoico, carboxiamidotriazol, TNP-470, octreótido, 2-metoxiestradiol, aminosteroles (es decir, escualamina), análogos de glutatión (es decir, N-acetil-L-cisteína), combretastatina A-4 (Oxigene), agentes bloqueadores del receptor Eph (Nature, 414: 933-938, 2001), Rhangiostatina, Rh-Endostatina (documento WO 01/93897), péptido RGD cíclico, acutina-desintegrina, benzodiazepenos, anticuerpo anti-avb3 humanizado, Rh-PAI-2, amilorida, p-amidobenzamidina, anticuerpo anti-uPA, anticuerpo anti-uPAR, L-fenilalanina-N-metilamidas (es decir, Batimistat, Marimastat), AG3340 y minociclina. Muchos otros agentes adecuados son conocidos en la técnica.Many anti-angiogenic agents are known in the art and would be suitable for co-administration with p62 nucleic acid or polypeptide vaccines (see, for example, Timar, et al., 2001. Pathology Oncol. Res., 7 (2): 85 -94). Such agents include, for example, physiological agents such as growth factors (ie, ANG-2, NK1, 2, 4 (HGF), transforming growth factor beta (TGF-p)), cytokines (ie, interferons such as IFN-a, -p, -y, platelet factor 4 (PF-4), PR-39), proteases (ie, cleaved AT-III, collagen fragment XVIII (endostatin)), plasmin fragment HmwKallikrein-d5 (angiostatin), prothrombin-F1-2, TSP-1), protease inhibitors (ie, tissue inhibitors of metalloproteases such as TIMP-1, -2 or -3; maspin; plasminogen inhibitor activators such as PAI-1; of pigmentary epithelium (PED f )), Tumstatin (available through ILEX, Inc.), antibody products (ie, collagen binding antibodies HUIV26, HUI77, XL313; anti-VEGF; anti-integrin (ie , Vitaxin, (Lxsys))) and glycosidases (ie, heparinase-I, -III). Molecules that are antagonists of antigens associated with angiogenesis (including proteins and polypeptides) are also suitable and may include, but are not limited to, molecules directed against VEGF, VEGF receptor, EGFR, bFGF, PDGF-B, PD-ECGF, TGF including TGF-a, endoglin, Id proteins, various proteases, nitric oxide synthase, aminopeptidase, thrombospondins, k-ras, Wnt, cyclin-dependent kinases, microtubules , heat shock proteins, heparin binding factors, synthases, collagen receptors, integrins, and NG2 surface proteoglycan. Modified "chemical" or physiological agents that are known or believed to have anti-angiogenic potential include, for example, vinblastine, taxol, ketoconazole, thalidomide, dolestatin, combrestatin A, rapamycin (Guba, et al., 2002, Nature Med. , 8: 128-135), CEP-7055 (available from Cephalon, Inc.), flavone acetic acid, Bay 12-9566 (Bayer Corp.), AG3340 (Agouron, Inc.), CGS. 27023A (Novartis), tetracycline derivatives (ie, COL-3 (Collagenix, Inc.)), Neovastat (Aeterna), BMS-275291 (Bristol-Myers Squibb), low dose 5-FU, low dose methotrexate (MTX ), irsofladin, radicicol, cyclosporine, captopril, celecoxib, sulfated polysaccharide D45152, cationic protein (protamine), cationic peptide-VEGF, suramin (naphthyl urea polysulfonated), compounds that interfere with the function or production of VEGF (ie, SU5416 or SU686)), PTK787 / ZK22584 (Novartis), Distamycin A, Angiozyme (ribozyme), isoflavinoids, staurosporine derivatives, genistein, EMD121974 (Merck KcgaA), tyrphostins, isoquinolones, retinoic acid, carboxyamidotriazole, TNP-470, octreotide, 2- methoxyestradiol, aminosterols (ie, squalamine), glutathione analogues (ie, N-acetyl-L-cysteine), combretastatin A-4 (Oxigene), Eph receptor blocking agents (Nature, 414: 933-938, 2001) , Rhangiostatin, Rh-Endostatin (WO 01/93897), cyclic RGD peptide or, acutin-disintegrin, benzodiazepenes, humanized anti-avb3 antibody, Rh-PAI-2, amiloride, p-amidobenzamidine, anti-uPA antibody, anti-uPAR antibody, L-phenylalanine-N-methylamides (ie, Batimistat, Marimastat ), AG3340 and minocycline. Many other suitable agents are known in the art.

También puede utilizarse en combinación con métodos "no tradicionales" para tratar el cáncer. Por ejemplo, se ha demostrado que la administración de ciertas bacterias anaeróbicas puede ayudar a retardar el crecimiento del tumor. En un estudio, se modificó Clostridium novyi para eliminar un gen de toxina en un episoma de fago y se administró a ratones con tumores colorrectales (Dang, et al. P.N.A.S. USA, 98 (26): 15155-15160, 2001). En combinación con la quimioterapia, se demostró que el tratamiento causaba necrosis tumoral en los animales. Los reactivos y metodologías descritos en esta solicitud pueden combinarse con dichas metodologías de tratamiento.It can also be used in combination with "non-traditional" methods to treat cancer. For example, it has been shown that the administration of certain anaerobic bacteria can help slow the growth of the tumor. In one study, Clostridium novyi was modified to remove a toxin gene in a phage episome and was administered to mice with colorectal tumors (Dang, et al P.N.A.S. USA, 98 (26): 15155-15160, 2001). In combination with chemotherapy, it was shown that the treatment caused tumor necrosis in animals. The reagents and methodologies described in this application can be combined with said treatment methodologies.

Los ácidos nucleicos que codifican los polipéptidos p62 pueden administrarse a los pacientes por cualquiera de las diversas técnicas disponibles. Diversos vectores virales que se han utilizado con éxito para introducir ácidos nucleicos en huéspedes incluyen retrovirus, adenovirus, virus adenoasociados (AAV), virus del herpes y virus de la viruela, entre otros. Se entiende en la técnica que muchos de estos vectores virales están disponibles en la técnica. Los vectores de la presente invención pueden construirse usando técnicas recombinantes estándar ampliamente disponibles para los expertos en la técnica. Dichas técnicas se pueden encontrar en referencias comunes de biología molecular, como Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Sambrook, et al., 1989, Cold Spring Harbor Laboratory Press), Gene Expression Technology (Methods in Enzymology, Vol. 185, edited by D. Goeddel, 1991. Academic Press, San Diego, Calif.), and PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (Innis, et al. 1990. Academic Press, San Diego, Calif.).The nucleic acids encoding p62 polypeptides can be administered to patients by any of the various techniques available. Various viral vectors that have been used successfully to introduce nucleic acids into hosts include retroviruses, adenoviruses, adeno-associated viruses (AAV), herpes viruses and smallpox viruses, among others. It is understood in the art that many of these viral vectors are available in the art. The vectors of the present invention can be constructed using standard recombinant techniques widely available to those skilled in the art. Such techniques can be found in common molecular biology references, such as Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Sambrook, et al., 1989, Cold Spring Harbor Laboratory Press), Gene Expression Technology (Methods in Enzymology, Vol. 185, edited by D Goeddel, 1991. Academic Press, San Diego, Calif.), And PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (Innis, et al., 1990. Academic Press, San Diego, Calif.).

Los vectores retrovirales adecuados incluyen derivados de lentivirus así como derivados de retrovirus murinos o aviares. Los ejemplos de vectores retrovirales adecuados incluyen, por ejemplo, virus de la leucemia murina de Moloney (MoMuLV), virus del sarcoma murino de Harvey (HaMuSV), virus del tumor mamario murino (MuMTV), SIV, BIV, VIH y virus del sarcoma de Rous (RSV). Varios vectores retrovirales pueden incorporar múltiples secuencias de ácido nucleico exógenas. Como los retrovirus recombinantes son defectuosos, requieren asistencia para producir partículas de vectores infecciosas. Esta asistencia puede ser proporcionada, por ejemplo, por líneas celulares auxiliares que codifican genes estructurales de retrovirus. Las líneas de células auxiliares adecuadas incluyen. PSI.2, PA317 y PA12, entre otras. Los viriones vectoriales producidos utilizando dichas líneas celulares pueden usarse luego para infectar una línea celular de tejido, como las células NIH 3T3, para producir grandes cantidades de viriones retrovirales quiméricos. Los vectores retrovirales pueden administrarse mediante métodos tradicionales (es decir, inyección) o mediante la implantación de una "línea celular productora" cerca de la población de células diana (Culver, K., et al., 1994, Hum. Gene Ther., 5 (3): 343-79; Culver, K., et al., Cold Spring Harb. Symp; Quant. Biol., 59: 685-90); Oldfield, E., 1993, Hum. Gene Ther., 4 (1): 39-69). La línea celular productora está diseñada para producir un vector viral y libera partículas virales cerca de la célula objetivo. Una porción de las partículas virales liberadas se ponen en contacto con las células diana e infectan esas células, administrado por lo tanto un ácido nucleico de la presente invención a la célula diana. Tras la infección de la célula diana, se produce la expresión del ácido nucleico del vector.Suitable retroviral vectors include lentivirus derivatives as well as derivatives of murine or avian retroviruses. Examples of suitable retroviral vectors include, for example, Moloney murine leukemia virus (MoMuLV), Harvey's murine sarcoma virus (HaMuSV), murine mammary tumor virus (MuMTV), SIV, BIV, HIV and sarcoma virus. de Rous (RSV). Several retroviral vectors can incorporate multiple exogenous nucleic acid sequences. As the recombinant retroviruses are defective, they require assistance to produce infectious vector particles. This assistance may be provided, for example, by helper cell lines that encode retrovirus structural genes. Suitable helper cell lines include. PSI.2, PA317 and PA12, among others. The vector virions produced using said cell lines can then be used to infect a tissue cell line, such as NIH 3T3 cells, to produce large amounts of chimeric retroviral virions. Retroviral vectors can be administered by traditional methods (i.e., injection) or by implantation of a "producer cell line" near the target cell population (Culver, K., et al., 1994, Hum. Gene Ther., 5 (3): 343-79; Culver, K., et al., Cold Spring Harb. Symp; Quant. Biol., 59: 685-90); Oldfield, E., 1993, Hum. Gene Ther., 4 (1): 39-69). The producer cell line is designed to produce a viral vector and releases viral particles near the target cell. A portion of the viral particles released are contacted with the target cells and infect those cells, thus administering a nucleic acid of the present invention to the target cell. Upon infection of the target cell, expression of the vector nucleic acid occurs.

Los vectores adenovirales han demostrado ser especialmente útiles para la transferencia de genes a células eucariotas (Rosenfeld, M., et al., 1991, Science, 252 (5004): 431-4; Crystal, R., et al., 1994, Nat. Genet., 8 (1): 42­ 51), el estudio de la expresión de genes eucarióticos (Levrero, M., et al., 1991, Gene, 101 (2): 195-202), el desarrollo de vacunas (Graham, F. y Prevec, L., 1992, Biotechnology, 20: 363-90), y en modelos animales (Stratford-Perricaudet, L., et al., 1992, Bone Marrow Transplant., 9 (Suppl. 1): 151-2; Rich, D., et al., 1993, Hum. Gene Ther., 4 (4): 461-76). Las rutas experimentales para administrar adenovirus recombinantes a diferentes tejidos in vivo han incluido la instilación intratraqueal (Rosenfeld, M., et al., 1992, Cell, 68 (1): 143-55), la inyección en el músculo (Quantin, B., et al. 1992, Proc. Natl Acad Sci. U.S.A., 89 (7): 2581-4), la inyección intravenosa periférica (Herz, J., y Gerard, R., 1993, Proc. Natl Acad Sci. U.S.A., 90 (7): 2812-6) y la inoculación estereotáctica al cerebro (Le Gal La Salle, G., et al., 1993, Science, 259 (5097): 988-90), entre otros. Adenoviral vectors have proved to be especially useful for gene transfer to eukaryotic cells (Rosenfeld, M., et al., 1991, Science, 252 (5004): 431-4; Crystal, R., et al., 1994, Nat. Genet., 8 (1): 42 51), the study of the expression of eukaryotic genes (Levrero, M., et al., 1991, Gene, 101 (2): 195-202), the development of vaccines (Graham, F. and Prevec, L., 1992, Biotechnology, 20: 363-90), and in animal models (Stratford-Perricaudet, L., et al., 1992, Bone Marrow Transplant., 9 (Suppl. ): 151-2; Rich, D., et al., 1993, Hum. Gene Ther., 4 (4): 461-76). Experimental routes to administer recombinant adenoviruses to different tissues in vivo have included intratracheal instillation (Rosenfeld, M., et al., 1992, Cell, 68 (1): 143-55), injection into muscle (Quantin, B ., et al., 1992, Proc. Natl Acad Sci. USA, 89 (7): 2581-4), peripheral intravenous injection (Herz, J., and Gerard, R., 1993, Proc. Natl Acad Sci. USA , 90 (7): 2812-6) and stereotactic inoculation to the brain (Le Gal La Salle, G., et al., 1993, Science, 259 (5097): 988-90), among others.

El virus adenoasociado (AAV) demuestra infectividad de alto nivel, un amplio rango de hospedadores y especificidad en la integración en el genoma de la célula hospedadora (Hermonat, P., et al., 1984, Proc. Natl Acad Sci. U.S.A., 81 (20): 6466-70). Y el virus del herpes simple tipo 1 (HSV-1) es otro sistema vectorial atractivo, especialmente para su uso en el sistema nervioso debido a su propiedad neurotrópica (Geller, A., et al., 1991, Trends Neurosci., 14 (10): 428-32; Glorioso, et al., 1995, Mol. Biotechnol., 4 (1): 87-99; Glorioso, et al., 1995, Annu. Rev. Microbiol., 49: 675­ 710).The adeno-associated virus (AAV) demonstrates high-level infectivity, a broad range of hosts and specificity in the integration into the host cell genome (Hermonat, P., et al., 1984, Proc. Natl Acad Sci. USA, 81 (20): 6466-70). And the herpes simplex virus type 1 (HSV-1) is another attractive vectorial system, especially for its use in the nervous system due to its neurotropic property (Geller, A., et al., 1991, Trends Neurosci., 14 ( 10): 428-32; Glorioso, et al., 1995, Mol. Biotechnol., 4 (1): 87-99; Glorioso, et al., 1995, Annu., Rev. Microbiol., 49: 675 710).

El virus de la viruela es otro vector de expresión útil (Smith, et al. 1983, Gene, 25 (1): 21-8; Moss, et al, 1992, Biotechnology, 20: 345-62; Moss, et al, 1992, Curr. Top. Microbiol. Immunol., 158: 25-38; Moss, et al. 1991. Science, 252: 1662-1667). Los virus de la viruela que se muestran útiles incluyen vaccinia, NYVAC, viruela aviar, difteria aviar, viruela del canario, ALVAC y ALVAC (2), entre otros.The smallpox virus is another useful expression vector (Smith, et al., 1983, Gene, 25 (1): 21-8; Moss, et al, 1992, Biotechnology, 20: 345-62; Moss, et al, 1992, Curr Top, Microbiol, Immunol., 158: 25-38, Moss, et al., 1991. Science, 252: 1662-1667). The smallpox viruses that are useful include vaccinia, NYVAC, fowlpox, avian diphtheria, canarypox, ALVAC and ALVAC (2), among others.

NYVAC (vP866) se derivó de la cepa de vacuna de Copenhague del virus vaccinia al eliminar seis regiones no esenciales del genoma que codificaban factores de virulencia conocidos o potenciales (ver, por ejemplo, las patentes de EE. UU. Números 5.364.773 y 5.494.807). Los loci de eliminación también se diseñaron como loci receptores para la inserción de genes ajenos. Las regiones eliminadas son: el gen de la timidina quinasa (TK; J2R); la región hemorrágica (u; B13R B14R); la región del cuerpo de inclusión tipo A (ATI; A26L); el gen de la hemaglutinina (HA; A56R); la región del gen del rango del huésped (C7L-K1L); y la ribonucleótido reductasa, subunidad grande, (I4L). NYVAC es una cepa del virus vaccinia diseñada por ingeniería genética que se generó mediante la eliminación específica de dieciocho marcos de lectura abiertos que codificaban los productos genéticos asociados con la virulencia y el rango del huésped. Se ha demostrado que NYVAC es útil para la expresión de TA (véase, por ejemplo, la Patente de Estados Unidos N° 6.265.189). NYVAC (vP866), vP994, vCP205, vCP1433, placZH6H4Lreverse, pMPC6H6K3E3 y pC3H6FHVB también fueron depositados en el ATCC bajo los términos del Tratado de Budapest, números de entrada VR-2559, VR-2558, VR-2557, VR-2556, ATCC-97913, ATCC-97912 y ATCC-97914, respectivamente.NYVAC (vP866) was derived from the Copenhagen vaccine strain of the vaccinia virus by eliminating six nonessential regions of the genome that encoded known or potential virulence factors (see, for example, U.S. Patent Nos. 5,364,773 and 5,494,807). The elimination loci were also designed as receptor loci for the insertion of foreign genes. The eliminated regions are: the thymidine kinase gene (TK; J2R); the hemorrhagic region (u; B13R B14R); the inclusion body region type A (ATI; A26L); the hemagglutinin gene (HA, A56R); the gene region of the host range (C7L-K1L); and the ribonucleotide reductase, large subunit, (I4L). NYVAC is a genetically engineered vaccinia virus strain that was generated by specifically removing eighteen open reading frames that encoded the gene products associated with the virulence and range of the host. It has been shown that NYVAC is useful for the expression of TA (see, for example, U.S. Patent No. 6,265,189). NYVAC (vP866), vP994, vCP205, vCP1433, placZH6H4Lreverse, pMPC6H6K3E3 and pC3H6FHVB were also deposited with the ATCC under the terms of the Budapest Treaty, entry numbers VR-2559, VR-2558, VR-2557, VR-2556, ATCC -97913, ATCC-97912 and ATCC-97914, respectively.

Los virus recombinantes basados en ALVAC (es decir, ALVAC-1 y ALVAC-2) también son adecuados para su uso en la práctica de la presente invención (véase, por ejemplo, la Patente de Estados Unidos N° 5.756.103). ALVAC (2) es idéntico a ALVAC (1), excepto que el genoma de ALVAC (2) comprende los genes E3L y K3L de vaccinia bajo el control de los promotores de la vacuna (Patente de Estados Unidos N° 6.130.066; Beattie et al., 1995a, 1995b, 1991; Chang et al., 1992; Davies et al., 1993). Se ha demostrado que tanto ALVAC (1) como ALVAC (2) son útiles para expresar secuencias de ADN ajenas, tales como TA (Tartaglia et al., 1993 a, b; Patente de Estados Unidos N° 5.833.975). ALVAC se depositó bajo los términos del Tratado de Budapest con la American Type Culture Collection (ATCC), 10801 University Boulevard, Manassas, Va. 20110-2209, EE. Uu ., Número de entrada ATCC VR-2547. ALVAC-based recombinant viruses (i.e., ALVAC-1 and ALVAC-2) are also suitable for use in the practice of the present invention (see, for example, U.S. Patent No. 5,756,103). ALVAC (2) is identical to ALVAC (1), except that the ALVAC genome (2) comprises the vaccinia E3L and K3L genes under the control of the vaccine promoters (US Pat. No. 6,130,066; Beattie et al., 1995a, 1995b, 1991; Chang et al., 1992; Davies et al., 1993). It has been shown that both ALVAC (1) and ALVAC (2) are useful for expressing foreign DNA sequences, such as TA (Tartaglia et al., 1993 a, b; U.S. Patent No. 5,833,975). ALVAC was deposited under the terms of the Budapest Treaty with the American Type Culture Collection (ATCC), 10801 University Boulevard, Manassas, Va. 20110-2209, USA U u ., Entry number ATCC VR-2547.

Otro vector del virus de la viruela útil es el TROVAC. El TROVAC se refiere a una viruela aviar atenuada que fue un aislado clonado en placa derivado de la cepa de vacuna FP-1 de la viruela aviar que está autorizada para la vacunación de pollitos de 1 día. TROVAC también se depositó bajo los términos del Tratado de Budapest con la ATCC, número de acceso 2553.Another vector of the useful smallpox virus is TROVAC. TROVAC refers to an attenuated fowlpox that was isolated cloned in plaque derived from the FP-1 vaccine strain of fowlpox that is authorized for the vaccination of day-old chicks. TROVAC was also deposited under the terms of the Budapest Treaty with the ATCC, access number 2553.

Los vectores plasmídicos "no virales" también pueden ser adecuados. Los vectores plasmídicos adecuados son compatibles con células huésped bacterianas, de insectos y/o de mamíferos. Tales vectores incluyen, por ejemplo, PCR-II, pCR3 y pcDNA3.1 (Invitrogen, San Diego, California), pBSIl (Stratagene, La Jolla, California), pET15 (Novagen, Madison, Wisconsin), pGEX (Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ), pEGFP-N2 (Clontech, Palo Alto, California), pETL (BlueBaclI, Invitrogen), pDSR-alfa (publicación PCT No. WO 90/14363) y pFastBacDual (Gibco-BRL, Grand Island, NY), así como derivados plásmidos Bluescript® (un fagémido basado en COLE1 de alto número de copias, Stratagene Cloning Systems, La Jolla, Calif ), plásmidos para la clonación por PCR diseñados para clonar productos de la PCR amplificados con Taq (p. ej., el kit TOPO™ tA Cloning®, derivados plasmídicos de PCR2.1®, Invitrogen, Carlsbad, California). También se pueden usar vectores bacterianos. Estos vectores incluyen, por ejemplo, Shigella, Salmonella, Vibrio cholerae, Lactobacillus, Bacille calmette guerin (BCG) y Streptococcus (véase, por ejemplo, los documentos WO 88/6626; WO 90/0594; WO 91/13157; WO 92/1796; y WO 92/21376). Muchos otros vectores y sistemas de expresión de plásmidos no virales son conocidos en la técnica y podrían usarse."Non-viral" plasmid vectors may also be suitable. Suitable plasmid vectors are compatible with bacterial, insect and / or mammalian host cells. Such vectors include, for example, PCR-II, pCR3 and pcDNA3.1 (Invitrogen, San Diego, California), pBSIl (Stratagene, La Jolla, California), pET15 (Novagen, Madison, Wisconsin), pGEX (Pharmacia Biotech, Piscataway , NJ), pEGFP-N2 (Clontech, Palo Alto, California), pETL (BlueBaclI, Invitrogen), pDSR-alpha (PCT Publication No. WO 90/14363) and pFastBacDual (Gibco-BRL, Grand Island, NY), as well as as plasmid derivatives Bluescript® (a phagemid based on high copy number COLE1, Stratagene Cloning Systems, La Jolla, Calif), plasmids for PCR cloning designed to clone Taq-amplified PCR products (eg, the TOPO ™ t A Cloning® kit, plasmid derivatives of PCR2.1®, Invitrogen, Carlsbad, California). Bacterial vectors can also be used. These vectors include, for example, Shigella, Salmonella, Vibrio cholerae, Lactobacillus, Bacille calmette guerin (BCG) and Streptococcus (see, for example, WO 88/6626, WO 90/0594, WO 91/13157, WO 92 / 1796; and WO 92/21376). Many other vectors and expression systems of non-viral plasmids are known in the art and could be used.

Las técnicas de administración de ácidos nucleicos adecuadas incluyen complejos de ADN-ligando, complejos de adenovirus-ligando-ADN, inyección directa de ADN, precipitación con CaPO4, técnicas con pistolas de genes, electroporación y sistemas de dispersión coloidal, entre otros. Los sistemas de dispersión coloidal incluyen complejos de macromoléculas, nanocápsulas, microesferas, perlas y sistemas a base de lípidos que incluyen emulsiones de aceite en agua, micelas, micelas mixtas y liposomas. El sistema coloidal preferido es un liposoma, que son vesículas de membranas artificiales útiles como vehículos de administración in vitro e in vivo. El ARN, el ADN y los viriones intactos se pueden encapsular dentro del interior acuoso y administrarse a las células en una forma biológicamente activa (Fraley, R., et al., 1981, Trends Biochem. Sci., 6: 77). La composición del liposoma es generalmente una combinación de fosfolípidos, particularmente fosfolípidos con altas temperaturas de transición de fase, generalmente en combinación con esteroides, especialmente con colesterol. También se pueden usar otros fosfolípidos u otros lípidos. Las características físicas de los liposomas dependen del pH, la fuerza iónica y la presencia de cationes divalentes. Los ejemplos de lípidos útiles en la producción de liposomas incluyen compuestos de fosfatidilo, tales como fosfatidilglicerol, fosfatidilcolina, fosfatidilserina, fosfatidiletanolamina, esfingolípidos, cerebrosidos y gangliósidos. Particularmente útiles son los diacilfosfatidilgliceroles, donde el resto lipídico contiene de 14 a 18 átomos de carbono, particularmente de 16 a 18 átomos de carbono, y está saturado. Los fosfolípidos ilustrativos incluyen fosfatidilcolina de huevo, dipalmitoilfosfatidilcolina y diestearoilfosfatidilcolina.Suitable nucleic acid delivery techniques include DNA-ligand complexes, adenovirus-ligand-DNA complexes, direct DNA injection, CaPO4 precipitation, gene gun techniques, electroporation and colloidal dispersion systems, among others. Colloidal dispersion systems include complexes of macromolecules, nanocapsules, microspheres, beads and lipid-based systems including oil-in-water emulsions, micelles, mixed micelles and liposomes. The preferred colloidal system is a liposome, which are artificial membrane vesicles useful as delivery vehicles in vitro and in vivo. RNA, DNA and intact virions can be encapsulated within the aqueous interior and administered to the cells in a biologically active form (Fraley, R., et al., 1981, Trends Biochem. Sci., 6: 77). The composition of the liposome is generally a combination of phospholipids, particularly phospholipids with high phase transition temperatures, generally in combination with steroids, especially cholesterol. Other phospholipids or other lipids can also be used. The physical characteristics of the liposomes depend on the pH, the ionic strength and the presence of divalent cations. Examples of lipids useful in the production of liposomes include phosphatidyl compounds, such as phosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, phosphatidylserine, phosphatidylethanolamine, sphingolipids, cerebrosides and gangliosides. Particularly useful are the diacylphosphatidylglycerols, where the lipid moiety contains from 14 to 18 carbon atoms, particularly from 16 to 18 carbon atoms, and is saturated. Illustrative phospholipids include egg phosphatidylcholine, dipalmitoylphosphatidylcholine and distearoylphosphatidylcholine.

También se puede administrar una diana inmunogénico en combinación con uno o más adyuvantes para estimular la respuesta inmune. Los adyuvantes ejemplares se muestran en la Tabla 3 a continuación:An immunogenic target can also be administered in combination with one or more adjuvants to stimulate the immune response. Exemplary adjuvants are shown in Table 3 below:

Tabla 3. Tipos de adyuvantes inmunológicosTable 3. Types of immunological adjuvants

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En algunas realizaciones, los polipéptidos p62 o los ácidos nucleicos que codifican p62 de acuerdo con la presente invención se pueden usar para tratar, aliviar, mejorar, aplacar, retrasar el inicio (profilaxis), inhibir la progresión, reducir la gravedad y/o reducir la incidencia de uno o más síntomas o características de una enfermedad, trastorno o afección. En algunas realizaciones, los polipéptidos p62 o los ácidos nucleicos que codifican p62 se pueden usar para tratar tumores sólidos, por ejemplo, cáncer y/o células cancerosas. El término "cáncer" incluye cánceres premalignos y malignos. Los cánceres incluyen, entre otros, cáncer de próstata, cáncer gástrico, cáncer colorrectal, cáncer de piel, por ejemplo, melanomas o carcinomas de células basales, cáncer de pulmón, cáncer de mama, cáncer de ovario, cáncer uterino, cánceres de cabeza y cuello, cáncer bronquial, cáncer de páncreas, cáncer de vejiga urinaria, cáncer de cerebro o del sistema nervioso central, cáncer del sistema nervioso periférico, cáncer de esófago, cáncer de la cavidad oral o faringe, cáncer de hígado, cáncer de riñón, cáncer de testículo, cáncer del tracto biliar, cáncer del intestino delgado o del apéndice, cáncer de la glándula salival, cáncer de tiroides, cáncer de la glándula suprarrenal, osteosarcoma, condrosarcoma, sarcoma, cáncer de tejidos hematológicos y similares. Las "células cancerosas" pueden estar en forma de un tumor, pueden existir solas dentro de un sujeto (por ejemplo, células de leucemia o ascitis), o pueden ser líneas celulares derivadas de un cáncer.In some embodiments, p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 according to the present invention can be used to treat, alleviate, ameliorate, placate, delay onset (prophylaxis), inhibit progression, reduce severity and / or reduce the incidence of one or more symptoms or characteristics of a disease, disorder or condition. In some embodiments, p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 can be used to treat solid tumors, for example, cancer and / or cancer cells. The term "cancer" includes premalignant and malignant cancers. Cancers include, among others, prostate cancer, gastric cancer, colorectal cancer, skin cancer, for example, melanomas or basal cell carcinomas, lung cancer, breast cancer, ovarian cancer, uterine cancer, head cancers and neck, bronchial cancer, pancreatic cancer, cancer urinary bladder, brain or central nervous system cancer, peripheral nervous system cancer, esophageal cancer, cancer of the oral cavity or pharynx, liver cancer, kidney cancer, testicular cancer, biliary tract cancer, bowel cancer thin or appendix, salivary gland cancer, thyroid cancer, cancer of the adrenal gland, osteosarcoma, chondrosarcoma, sarcoma, cancer of blood tissues and the like. The "cancer cells" may be in the form of a tumor, may exist alone within a subject (e.g., leukemia cells or ascites), or may be cell lines derived from a cancer.

El cáncer puede estar asociado con una variedad de síntomas físicos. Los síntomas del cáncer generalmente dependen del tipo y la ubicación del tumor. Por ejemplo, el cáncer de pulmón puede causar tos, dificultad para respirar y dolor en el pecho, mientras que el cáncer de colon a menudo causa diarrea, estreñimiento y sangre en las heces. Sin embargo, para dar solo algunos ejemplos, los siguientes síntomas generalmente se asocian con muchos tipos de cáncer: fiebre, escalofríos, sudores nocturnos, tos, disnea, pérdida de peso, pérdida de apetito, anorexia, náuseas, vómitos, diarrea, anemia, ictericia, hepatomegalia, hemoptisis, fatiga, malestar, disfunción cognitiva, depresión, trastornos hormonales, neutropenia, dolor, úlceras no cicatrizadas, ganglios linfáticos agrandados, neuropatía periférica y disfunción sexual.Cancer can be associated with a variety of physical symptoms. Cancer symptoms usually depend on the type and location of the tumor. For example, lung cancer can cause coughing, shortness of breath, and chest pain, while colon cancer often causes diarrhea, constipation, and blood in the stool. However, to give just a few examples, the following symptoms are usually associated with many types of cancer: fever, chills, night sweats, cough, dyspnea, weight loss, loss of appetite, anorexia, nausea, vomiting, diarrhea, anemia, jaundice, hepatomegaly, hemoptysis, fatigue, malaise, cognitive dysfunction, depression, hormonal disorders, neutropenia, pain, unhealed ulcers, enlarged lymph nodes, peripheral neuropathy and sexual dysfunction.

En un aspecto de la invención, se proporciona un método para el tratamiento del cáncer (por ejemplo, el cáncer de próstata o de mama). En algunas realizaciones, el tratamiento del cáncer comprende administrar una cantidad terapéuticamente eficaz de polipéptidos p62 o p62 que codifican ácidos nucleicos a un sujeto que lo necesite, en tales cantidades y durante el tiempo que sea necesario para lograr el resultado deseado. En ciertas realizaciones, una "cantidad terapéuticamente eficaz" de una partícula dirigida es aquella cantidad efectiva para tratar, aliviar, mejorar, paliar, retrasar la aparición, inhibir la progresión, reducir la gravedad y/o reducir la incidencia de uno o más síntomas o características del cáncer.In one aspect of the invention, a method for the treatment of cancer (e.g., prostate or breast cancer) is provided. In some embodiments, the treatment of cancer comprises administering a therapeutically effective amount of p62 or p62 polypeptides encoding nucleic acids to a subject in need thereof, in such amounts and for as long as necessary to achieve the desired result. In certain embodiments, a "therapeutically effective amount" of a targeted particle is that amount effective to treat, alleviate, ameliorate, alleviate, delay the onset, inhibit progression, reduce the severity and / or reduce the incidence of one or more symptoms or characteristics of cancer.

En un aspecto de la invención, se proporciona un método para administrar polipéptidos p62 o p62 que codifican ácidos nucleicos a un sujeto que padece cáncer (por ejemplo, cáncer de mama) o una recaída. En algunas realizaciones, los polipéptidos p62 o los ácidos nucleicos que codifican p62 se administran a un sujeto en tales cantidades y durante el tiempo que sea necesario para lograr el resultado deseado (es decir, el tratamiento del cáncer). En ciertas realizaciones, una "cantidad terapéuticamente eficaz" de polipéptidos p62 y ácidos nucleicos que codifican p62 es aquella cantidad eficaz para tratar, aliviar, mejorar, paliar, retrasar la aparición, inhibir la progresión, reducir la gravedad y/o reducir la incidencia de uno o más síntomas o características del cáncer. En algunas realizaciones, los polipéptidos p62 o los ácidos nucleicos que codifican p62 de la invención se administran a un sujeto tratado previamente por cáncer. En algunas realizaciones, los polipéptidos p62 o los ácidos nucleicos que codifican p62 de la invención se administran a un sujeto con antecedentes familiares de cáncer. En algunas realizaciones, los polipéptidos p62 o los ácidos nucleicos que codifican p62 de la invención se administran a un sujeto con una cierta predisposición para el cáncer. Por ejemplo, un sujeto que es BRCA positivo está genéticamente predispuesto a ciertas formas de cáncer de mama.In one aspect of the invention, there is provided a method for administering p62 or p62 polypeptides encoding nucleic acids to a subject suffering from cancer (e.g., breast cancer) or a relapse. In some embodiments, p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 are administered to a subject in such amounts and for as long as necessary to achieve the desired result (ie, cancer treatment). In certain embodiments, a "therapeutically effective amount" of p62 polypeptides and nucleic acids encoding p62 is that amount effective to treat, alleviate, ameliorate, alleviate, delay the onset, inhibit progression, reduce severity, and / or reduce the incidence of one or more symptoms or characteristics of cancer. In some embodiments, the p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 of the invention are administered to a subject previously treated for cancer. In some embodiments, p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 of the invention are administered to a subject with a family history of cancer. In some embodiments, p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 of the invention are administered to a subject with a certain predisposition for cancer. For example, a subject who is BRCA positive is genetically predisposed to certain forms of breast cancer.

Los protocolos terapéuticos incluyen administrar una cantidad terapéuticamente efectiva de polipéptidos p62 o ácidos nucleicos que codifican p62 a un individuo sano (es decir, un sujeto que no presenta ningún síntoma de cáncer y/o que no ha sido diagnosticado con cáncer). Por ejemplo, los individuos sanos pueden ser "inmunizados" con polipéptidos p62 o ácidos nucleicos que codifican p62 antes del desarrollo del cáncer y/o la aparición de síntomas de cáncer; individuos en riesgo (por ejemplo, pacientes con antecedentes familiares de cáncer; pacientes con una o más mutaciones genéticas asociadas con el desarrollo del cáncer; pacientes con un polimorfismo genético asociado con el desarrollo del cáncer; pacientes infectados por un virus asociado con el desarrollo del cáncer; los pacientes con hábitos y/o estilos de vida asociados con el desarrollo de cáncer; etc.) pueden tratarse de manera sustancialmente contemporánea (p. ej., dentro de las 48 horas, dentro de las 24 horas o dentro de las 12 horas de la aparición de los síntomas del cáncer). Por supuesto, las personas que se sabe que tienen cáncer pueden recibir un tratamiento innovador en cualquier momento.The therapeutic protocols include administering a therapeutically effective amount of p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 to a healthy individual (i.e., a subject who does not exhibit any symptoms of cancer and / or who has not been diagnosed with cancer). For example, healthy individuals can be "immunized" with p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 before the development of cancer and / or the onset of cancer symptoms; individuals at risk (eg, patients with a family history of cancer, patients with one or more genetic mutations associated with the development of cancer, patients with a genetic polymorphism associated with the development of cancer, patients infected with a virus associated with the development of the cancer, patients with habits and / or lifestyles associated with the development of cancer, etc.) can be treated in a substantially contemporaneous manner (eg, within 48 hours, within 24 hours or within 12 hours). hours of the onset of cancer symptoms). Of course, people who are known to have cancer can receive innovative treatment at any time.

En otras realizaciones, los polipéptidos p62 o los ácidos nucleicos que codifican p62 de la presente invención se pueden usar para inhibir el crecimiento de células cancerosas, por ejemplo, células de cáncer de mama. Como se usa en este documento, la expresión "inhibe el crecimiento de células cancerosas" o "que inhibe el crecimiento de células cancerosas" se refiere a cualquier desaceleración de la tasa de proliferación y/o migración de células cancerosas, la detención de la proliferación y/o migración de células cancerosas, o la muerte de células cancerosas, de manera que la tasa de crecimiento de las células cancerosas se reduce en comparación con la tasa observada o predicha de crecimiento de una célula cancerosa de control no tratada. La expresión "inhibe el crecimiento" también puede referirse a una reducción en el tamaño o la desaparición de una célula cancerosa o tumor, así como a una reducción en su potencial metastásico. Preferiblemente, tal inhibición a nivel celular puede reducir el tamaño, detener el crecimiento, reducir la agresividad, o prevenir o inhibir la metástasis de un cáncer en un paciente. Los expertos en la materia pueden determinar fácilmente, mediante cualquiera de una variedad de indicios adecuados, si se inhibe el crecimiento de las células cancerosas.In other embodiments, p62 polypeptides or nucleic acids encoding p62 of the present invention can be used to inhibit the growth of cancer cells, e.g., breast cancer cells. As used herein, the expression "inhibits the growth of cancer cells" or "which inhibits the growth of cancer cells" refers to any deceleration of the rate of proliferation and / or migration of cancer cells, arrest of proliferation and / or migration of cancer cells, or death of cancer cells, so that the growth rate of the cancer cells is reduced compared to the observed or predicted rate of growth of an untreated control cancer cell. The expression "inhibits growth" may also refer to a reduction in the size or disappearance of a cancer cell or tumor, as well as to a reduction in its metastatic potential. Preferably, such inhibition at the cellular level can reduce the size, stop the growth, reduce the aggressiveness, or prevent or inhibit the metastasis of a cancer in a patient. Those skilled in the art can easily determine, by any of a variety of suitable indications, whether the growth of cancer cells is inhibited.

La inhibición del crecimiento de las células cancerosas se puede evidenciar, por ejemplo, mediante la detención de células cancerosas en una fase particular del ciclo celular, por ejemplo, la detención en la fase G2/M del ciclo celular. La inhibición del crecimiento de células cancerosas también puede evidenciarse por medición directa o indirecta de las células cancerosas o del tamaño del tumor. En pacientes humanos con cáncer, tales mediciones generalmente se realizan utilizando métodos de imagen bien conocidos, como la resonancia magnética, la tomografía axial computarizada y los rayos X. El crecimiento de las células cancerosas también se puede determinar indirectamente, por ejemplo, al determinar los niveles de antígeno carcinoembrionario circulante, antígeno específico de la próstata u otros antígenos específicos del cáncer que se correlacionan con el crecimiento de las células cancerosas. La inhibición del crecimiento del cáncer también se correlación generalmente con una supervivencia prolongada y/o mayor salud y bienestar del sujeto.The inhibition of the growth of cancer cells can be evidenced, for example, by the arrest of cancer cells in a particular phase of the cell cycle, for example, the arrest in the G2 / M phase of the cell cycle. The inhibition of the growth of cancer cells can also be evidenced by direct or indirect measurement of the cancer cells or the size of the tumor. In human patients with cancer, such measurements They are usually performed using well-known imaging methods, such as MRI, computerized axial tomography and X-rays. The growth of cancer cells can also be determined indirectly, for example, by determining levels of circulating carcinoembryonic antigen, specific antigen. of the prostate or other cancer-specific antigens that correlate with the growth of cancer cells. Inhibition of cancer growth is also generally correlated with prolonged survival and / or greater health and well-being of the subject.

Los compuestos y composiciones descritos en el presente documento pueden administrarse como un producto farmacéutico o un medicamento formulado con un vehículo farmacéuticamente aceptable. Por consiguiente, los compuestos y las composiciones pueden usarse en la fabricación de un medicamento o una composición farmacéutica. Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden formularse como soluciones o polvos liofilizados para la administración parenteral. Los polvos pueden reconstituirse mediante la adición de un diluyente adecuado u otro vehículo farmacéuticamente aceptable antes de su uso. Las formulaciones líquidas pueden ser soluciones tamponadas, isotónicas, acuosas. Los polvos también se pueden rociar en forma seca. Ejemplos de diluyentes adecuados son solución salina isotónica normal, dextrosa estándar al 5% en agua o solución de acetato de sodio o amonio tamponada. Dichas formulaciones son especialmente adecuadas para la administración parenteral, pero también pueden usarse para la administración oral o estar contenidas en un inhalador de dosis medida o nebulizador para insuflación. Puede ser deseable agregar excipientes tales como polivinilpirrolidona, gelatina, hidroxi celulosa, acacia, polietilenglicol, manitol, cloruro de sodio, citrato de sodio y similares.The compounds and compositions described herein may be administered as a pharmaceutical product or a medicament formulated with a pharmaceutically acceptable carrier. Accordingly, the compounds and compositions can be used in the manufacture of a medicament or a pharmaceutical composition. The pharmaceutical compositions of the invention can be formulated as lyophilized solutions or powders for parenteral administration. The powders can be reconstituted by the addition of a suitable diluent or other pharmaceutically acceptable carrier before use. The liquid formulations can be buffered, isotonic, aqueous solutions. The powders can also be sprayed in dry form. Examples of suitable diluents are normal isotonic saline, 5% standard dextrose in water or buffered ammonium or sodium acetate solution. Said formulations are especially suitable for parenteral administration, but may also be used for oral administration or be contained in a metered dose inhaler or nebulizer for insufflation. It may be desirable to add excipients such as polyvinyl pyrrolidone, gelatin, hydroxy cellulose, acacia, polyethylene glycol, mannitol, sodium chloride, sodium citrate, and the like.

Alternativamente, los compuestos y las composiciones pueden encapsularse, comprimirse o prepararse en una emulsión o jarabe para la administración oral. Se pueden añadir vehículos sólidos o líquidos farmacéuticamente aceptables para mejorar o estabilizar la composición, o para facilitar la preparación de la composición. Los vehículos sólidos incluyen almidón, lactosa, sulfato de calcio dihidratado, terra alba, estearato de magnesio o ácido esteárico, talco, pectina, acacia, agar o gelatina. Los vehículos líquidos incluyen jarabe, aceite de maní, aceite de oliva, solución salina y agua. El vehículo también puede incluir un material de liberación sostenida tal como monoestearato de glicerilo o diestearato de glicerilo, solo o con una cera. La cantidad de vehículo sólido varía pero, preferiblemente, estará entre aproximadamente 20 mg y aproximadamente 1 g por unidad de dosificación. Las preparaciones farmacéuticas se realizan siguiendo las técnicas convencionales de farmacia que incluyen moler, mezclar, granular y comprimir, cuando sea necesario, para formas en tabletas; o molienda, mezcla y relleno para formas en cápsulas de gelatina dura. Cuando se usa un vehículo líquido, la preparación puede estar en la forma de un jarabe, elixir, emulsión o una suspensión acuosa o no acuosa. Para la administración rectal, los compuestos de la invención pueden combinarse con excipientes tales como manteca de cacao, glicerina, gelatina o polietilenglicoles y moldearse en un supositorio.Alternatively, the compounds and compositions may be encapsulated, compressed or prepared in an emulsion or syrup for oral administration. Pharmaceutically acceptable solid or liquid carriers can be added to improve or stabilize the composition, or to facilitate the preparation of the composition. Solid carriers include starch, lactose, calcium sulfate dihydrate, terra alba, magnesium stearate or stearic acid, talc, pectin, acacia, agar or gelatin. Liquid vehicles include syrup, peanut oil, olive oil, saline and water. The vehicle can also include a sustained release material such as glyceryl monostearate or glyceryl distearate, alone or with a wax. The amount of solid carrier varies but, preferably, will be between about 20 mg and about 1 g per dosage unit. The pharmaceutical preparations are made following conventional pharmacy techniques which include grinding, mixing, granulating and compressing, when necessary, for tablet forms; or grinding, mixing and filling for forms in hard gelatin capsules. When a liquid carrier is used, the preparation may be in the form of a syrup, elixir, emulsion or an aqueous or non-aqueous suspension. For rectal administration, the compounds of the invention can be combined with excipients such as cocoa butter, glycerin, gelatin or polyethylene glycols and molded into a suppository.

Los compuestos y composiciones pueden formularse para incluir otros fármacos o agentes biológicos de utilidad médica. Los compuestos y composiciones también pueden administrarse junto con la administración de otros fármacos o agentes biológicos útiles para la enfermedad o afección a la que se dirigen los compuestos y composiciones de la invención.The compounds and compositions can be formulated to include other drugs or biological agents of medical utility. The compounds and compositions may also be administered in conjunction with the administration of other drugs or biological agents useful for the disease or condition to which the compounds and compositions of the invention are directed.

Tal como se emplea en el presente documento, la frase "una cantidad eficaz" se refiere a una dosis suficiente para proporcionar concentraciones lo suficientemente altas para impartir un efecto beneficioso en el receptor de ésta. El nivel de dosis terapéuticamente eficaz específico para cualquier sujeto en particular dependerá de una variedad de factores que incluyen el trastorno que se está tratando, la gravedad del trastorno, la actividad del compuesto o composición específica, la vía de administración, la velocidad de eliminación del compuesto o la composición, la duración del tratamiento, los fármacos utilizados en combinación o coincidentes con el compuesto o la composición, la edad, el peso corporal, el sexo, la dieta y la salud general del sujeto, y factores similares bien conocidos en las artes y las ciencias médicas. Los expertos en la técnica conocen varias consideraciones generales que se tienen en cuenta para determinar la "cantidad terapéuticamente efectiva" y se describen, por ejemplo, en Gilman et al., Eds., Goodman And Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8a ed., Pergamon Press, 1990; y Remington's Pharmaceutical Sciences, 17a edición, Mack Publishing Co., Easton, Pensilvania, 1990. Los niveles de dosificación generalmente se encuentran en el intervalo de aproximadamente 0,001 hasta 100 mg/kg/día; con niveles en el intervalo de aproximadamente 0,05 hasta 10 mg/kg/día son generalmente aplicables. Un compuesto o composición puede administrarse por vía parenteral, tal como intravascular, intravenosa, intraarterial, intramuscular, intraocular, intradérmica, subcutánea o similar. La administración también puede ser oral, nasal, rectal, transdérmica, intravaginal o inhalatoria a través de un aerosol. Se puede administrar un compuesto o una composición al órgano que tiene el tumor (o al objetivo potencial del tumor) o al tumor mismo. El compuesto o la composición puede administrarse como un bolo o infundirse lentamente, o administrarse como una inyección intradérmica, subcutánea, intramuscular o intraperitoneal.As used herein, the phrase "an effective amount" refers to a dose sufficient to provide sufficiently high concentrations to impart a beneficial effect on the receptor thereof. The specific therapeutically effective dose level for any particular subject will depend on a variety of factors including the disorder being treated, the severity of the disorder, the activity of the specific compound or composition, the route of administration, the rate of elimination of the compound or composition, duration of treatment, drugs used in combination or coincident with the compound or composition, age, body weight, sex, diet and general health of the subject, and similar factors well known in the art. arts and medical sciences. Those skilled in the art are aware of several general considerations that are taken into account in determining the "therapeutically effective amount" and are described, for example, in Gilman et al., Eds., Goodman And Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8th ed. ., Pergamon Press, 1990; and Remington's Pharmaceutical Sciences, 17th edition, Mack Publishing Co., Easton, Pa., 1990. Dosage levels are generally in the range of about 0.001 to 100 mg / kg / day; with levels in the range of about 0.05 to 10 mg / kg / day are generally applicable. A compound or composition can be administered parenterally, such as intravascularly, intravenously, intraarterially, intramuscularly, intraocularly, intradermally, subcutaneously or the like. The administration can also be oral, nasal, rectal, transdermal, intravaginal or inhalation through an aerosol. A compound or composition can be administered to the organ having the tumor (or the potential target of the tumor) or to the tumor itself. The compound or composition can be administered as a bolus or infused slowly, or administered as an intradermal, subcutaneous, intramuscular or intraperitoneal injection.

Una dosis terapéuticamente efectiva se puede estimar inicialmente a partir de ensayos de cultivo celular determinando un nivel de expresión de p62 tras la introducción de un ácido nucleico que codifica un polipéptido p62. Luego se puede formular una dosis en modelos animales para lograr una respuesta inmune adecuada y/o protección contra el crecimiento del tumor. Dicha información se puede utilizar para determinar con mayor precisión las dosis iniciales útiles en humanos. El propio médico puede elegir la formulación exacta, la vía de administración y la dosis en función del estado del paciente. A therapeutically effective dose can be estimated initially from cell culture assays by determining a level of p62 expression upon introduction of a nucleic acid encoding a p62 polypeptide. Then a dose can be formulated in animal models to achieve an adequate immune response and / or protection against tumor growth. This information can be used to determine more precisely the initial doses useful in humans. The doctor himself can choose the exact formulation, the route of administration and the dose depending on the patient's condition.

EjemplosExamples

Ejemplo 1Example 1

Líneas celulares y construcción de vectoresCell lines and vector construction

Una línea celular de tumor de mama 233-VSGA1, que sobreexpresa el oncogén HER/2 neu de rata activado, se derivó de un carcinoma mamario de ratón que surge en ratones transgénicos FVB/neu NT. Esta línea celular se mantuvo como se describe (Nanni P, Pupa S M, Nicoletti G y otros, Int J Cancer 2000; 87: 186). Las células HeLa (ATCC # CCL-2.2 ™) se propagaron en medio de crecimiento completo ATCC (ATCC MD-6108).A breast tumor cell line 233-VSGA1, which overexpresses the activated rat HER / 2 neu oncogene, was derived from a mouse mammary carcinoma arising in transgenic FVB / NT NT mice. This cell line was maintained as described (Nanni P, Pupa S M, Nicoletti G et al., Int J Cancer 2000; 87: 186). HeLa cells (ATCC # CCL-2.2 ™) were propagated in complete growth medium ATCC (ATCC MD-6108).

El dominio extracelular de HER2/neu de rata se amplificó por PCR y se clonó en el vector pcDNA3.1 (Invitrogen) como se describe (F M Venanzi, A Barucca, K Havas, M Capitani, M Provinciali S Scotti, A Concetti. Vaccine 2010 (22); 3841-7).The extracellular domain of rat HER2 / neu was amplified by PCR and cloned into the vector pcDNA3.1 (Invitrogen) as described (FM Venanzi, A Barucca, K Havas, M Capitani, M Provinciali S Scotti, A Concetti. 2010 (22); 3841-7).

Como fuente de cDNA que codifica p62, se extrajo el RNA total de las células HeLa. El ADNc de longitud completa que codifica la isoforma más larga de p62 (Variante de Transcripción 1, número de referencia de GenBank NP — 003891) se amplificó mediante PCR (HotStar HiFidelity Polymerase Kit Qiagen) utilizando los siguientes cebadores: FW: 5-CCCGCTAGCATGGCGTCGCTCACCGTG-3 and REV: 5'-CCCAAGCTTTCACAACGGCGGGGGATGCTTTG-3'. Los productos de la PCR se purificaron y los fragmentos digeridos con Nhe I-Hind III se clonaron en pcDNA3.1. Las secuencias del ADN de p62 insertado se confirmaron mediante secuenciación (MGWBiotech/M-medical, Martinsried, Alemania). Se observó que el polipéptido codificado difería de la secuencia de aminoácidos natural por dos mutaciones de sustitución: C145R y Q418R.As a source of cDNA encoding p62, the total RNA was extracted from HeLa cells. The full-length cDNA encoding the longest isoform of p62 (Transcript Variant 1, GenBank reference number NP-003891) was amplified by PCR (HotStar HiFidelity Polymerase Kit Qiagen) using the following primers: FW: 5-CCCGCTAGCATGGCGTCGCTCACCGTG- 3 and REV: 5'-CCCAAGCTTTCACAACGGCGGGGGATGCTTTG-3 '. The PCR products were purified and fragments digested with Nhe I-Hind III were cloned into pcDNA3.1. The inserted p62 DNA sequences were confirmed by sequencing (MGWBiotech / M-medical, Martinsried, Germany). It was observed that the encoded polypeptide differed from the natural amino acid sequence by two substitution mutations: C145R and Q418R.

Ejemplo 2. Efecto antitumoral preventivo de la inmunización p62 en un modelo de cáncer de mama en ratón Los ratones FVB/N se dividieron en tres grupos (15 ratones por grupo) y se inmunizaron con:Example 2. Preventive antitumor effect of p62 immunization in a breast cancer model in mouse FVB / N mice were divided into three groups (15 mice per group) and immunized with:

1. pcDNA.3.1 (vector de plásmido vacío, control negativo);1. pcDNA.3.1 (empty plasmid vector, negative control);

2. pcDNA.3.1 con pHER2 (control positivo); o,2. pcDNA.3.1 with pHER2 (positive control); or,

3. pcDNA.3.1 con p62 (experimento).3. pcDNA.3.1 with p62 (experiment).

Se anestesiaron hembras FVB/N y, después de la exposición del cuadriceps femoral, se inyectaron 100 |jg de ADN (1 mg/mL) en solución salina con una jeringa de insulina. Los ratones se inmunizaron dos veces (a las 4 y 2 semanas antes de la exposición al tumor). Los ratones fueron estimulados intradérmicamente con 3 x 105 células tumorales 233-VSGA1/100 pl de tampón PBS en la extremidad. En todos los casos, los tumores se midieron determinando dos diámetros perpendiculares con un calibrador tres veces a la semana. Los ratones se sacrificaron cuando el tumor se ulceró o alcanzó 1 cm en cualquier diámetro.FVB / N females were anaesthetized and, after exposure of the femoral quadriceps, 100 μg of DNA (1 mg / mL) was injected in saline with an insulin syringe. The mice were immunized twice (at 4 and 2 weeks before exposure to the tumor). Mice were stimulated intradermally with 3 x 10 5 tumor cells 233-VSGA1 / 100 pl of PBS buffer in the limb. In all cases, the tumors were measured by determining two perpendicular diameters with a calibrator three times a week. The mice were sacrificed when the tumor ulcerated or reached 1 cm in any diameter.

El 100% de los ratones vacunados con un vector de plásmido vacío (control negativo) desarrollaron tumores el día 13 después de la exposición. La vacunación con plásmido codificante de HER2 dio una protección del 40% (Figura 4). Al mismo tiempo, el plásmido que codificaba p62 demostró una protección del 100% el día 13, que se redujo gradualmente al 70%. En consecuencia, se demostró el efecto protector del plásmido que codificaba p62 en un modelo de ratón de cáncer de mama transplantable. Por lo tanto, el efecto preventivo de la vacuna p62 se demostró para el cáncer de mama en un modelo de ratón. Los inventores plantean la hipótesis de que se podría mantener una protección del 100% si se continuaran las vacunas.100% of the mice vaccinated with an empty plasmid vector (negative control) developed tumors on day 13 after exposure. Vaccination with plasmid coding for HER2 gave a protection of 40% (Figure 4). At the same time, the plasmid encoding p62 showed 100% protection on day 13, which was gradually reduced to 70%. Accordingly, the protective effect of the plasmid encoding p62 was demonstrated in a mouse model of transplantable breast cancer. Therefore, the preventive effect of the p62 vaccine was demonstrated for breast cancer in a mouse model. The inventors hypothesize that 100% protection could be maintained if the vaccines were continued.

A los animales que se inmunizaron con un vector plasmídico que codificaba HER2 o p62 y no desarrollaron tumores después de la primera prueba de células cancerosas se les administraron la misma cantidad de células cancerosas en el día 50. Todos los animales vacunados con plásmido codificante de HER2 desarrollaron tumores, mientras que no aparecieron tumores en animales vacunados con p62. En consecuencia, la inmunización con p62 mantuvo la memoria inmunológica, mientras que HER2 no lo hizo.Animals that were immunized with a plasmid vector encoding HER2 or p62 and did not develop tumors after the first cancer cell test were administered the same amount of cancer cells on day 50. All animals vaccinated with plasmid encoding HER2 they developed tumors, while no tumors appeared in animals vaccinated with p62. Consequently, immunization with p62 maintained immunological memory, whereas HER2 did not.

Ejemplo 3. La vacuna p62 estimula la inmunidad innataExample 3. The p62 vaccine stimulates innate immunity

Los tumores en los ratones que recibieron la vacuna p62 contenían grandes zonas de necrosis (Figura 5). Las células inmunes asociadas con la inflamación están abundantemente presentes dentro de las áreas necróticas. La vacuna HER2 provoca respuesta inmune adaptativa específica de antígeno y migración masiva de linfocitos (células CD3+, linfocitos infiltrantes de tumores) en el tumor (Figura 6). Al mismo tiempo, la vacunación con plásmido p62 no aumentó significativamente el nivel de linfocitos infiltrantes de tumores. Por el contrario, la inyección del plásmido p62, pero no la vacuna HER2, aumentó el nivel de células CD11B+ en el tumor (Figura 6). En consecuencia, la vacuna p62 actúa a través de la estimulación de la inmunidad innata, a diferencia de la vacuna HER2. Tumors in the mice that received the p62 vaccine contained large areas of necrosis (Figure 5). The immune cells associated with inflammation are abundantly present within the necrotic areas. The HER2 vaccine elicits antigen-specific adaptive immune response and massive migration of lymphocytes (CD3 + cells, tumor infiltrating lymphocytes) into the tumor (Figure 6). At the same time, vaccination with p62 plasmid did not significantly increase the level of tumor infiltrating lymphocytes. In contrast, the injection of plasmid p62, but not the HER2 vaccine, increased the level of CD11B + cells in the tumor (Figure 6). Consequently, the p62 vaccine acts through the stimulation of innate immunity, unlike the HER2 vaccine.

Ejemplo 4. Demostración de la actividad antitumoral de la vacuna de ADN p62 en el modelo de cáncer de mama en rata T5Example 4. Demonstration of the antitumor activity of the p62 DNA vaccine in the rat T5 breast cancer model

El cáncer de mama de rata transplantable T5 se derivó de un adenocarcinoma espontáneo de glándula mamaria de una rata Wistar en R.E. Instituto Kavetsky de Patología Experimental, Oncología y Radiobiología de la Academia Nacional de Ciencias de Ucrania. Ratas Wistar hembras de dos meses de edad (peso: 130-150 g, 10 animales por grupo) se expusieron con carcinoma de glándula mamaria de rata T5 mediante inyección subcutánea de 2,5 x 106 células tumorales/rata en 0,4 ml de PBS. Comenzando al día siguiente después del trasplante de tumor, las ratas se vacunaron tres veces una vez a la semana (Figura 7). Cada inyección contenía 78 |jg de pcDNA.3.1 (vector de plásmido vacío, control negativo) o pcDNA.3.1 con p62 (experimento).T5 transplantable rat breast cancer was derived from a spontaneous adenocarcinoma of the mammary gland of a Wistar rat in R.E. Kavetsky Institute of Experimental Pathology, Oncology and Radiobiology of the National Academy of Sciences of Ukraine. Two-month-old female Wistar rats (weight: 130-150 g, 10 animals per group) were challenged with T5 rat mammary gland carcinoma by subcutaneous injection of 2.5 x 10 6 tumor cells / rat in 0.4 ml of PBS. Beginning the next day after the tumor transplant, the rats were vaccinated three times once a week (Figure 7). Each injection contained 78 | jg of pcDNA.3.1 (empty plasmid vector, negative control) or pcDNA.3.1 with p62 (experiment).

El crecimiento tumoral se inhibió mediante la inmunización con p62 (Figura 8) con una inhibición del 70% del crecimiento tumoral en ratas vacunadas con p62 en comparación con ratas de control inyectadas con vector (p <0,004) (Figura 9).Tumor growth was inhibited by immunization with p62 (Figure 8) with a 70% inhibition of tumor growth in rats vaccinated with p62 compared to control rats injected with vector (p <0.004) (Figure 9).

La supervivencia de las ratas implantadas en el tumor (8 inmunizadas con vector y 8 inmunizadas con p62) se controló durante 75 días. El 50% de los animales en el grupo de control murió mientras no hubo muertes de animales en el grupo vacunado con p62 (FIG. 10).The survival of the rats implanted in the tumor (8 immunized with vector and 8 immunized with p62) was monitored for 75 days. 50% of the animals in the control group died while there were no animal deaths in the group vaccinated with p62 (FIG 10).

El análisis histológico de los tumores reveló zonas necróticas (figura 11). La necrosis intratumoral en ratas que recibieron la vacuna de ADN p62 fue similar a la observada en los tumores de ratones que recibieron la vacuna de ADN p62 (Figura 12).Histological analysis of the tumors revealed necrotic areas (figure 11). Intratumoral necrosis in rats receiving the p62 DNA vaccine was similar to that observed in the tumors of mice that received the p62 DNA vaccine (Figure 12).

En consecuencia, el efecto antitumoral de la vacuna de ADN p62 se demostró en el segundo modelo animal (rata), lo que indica que la vacuna de ADN p62 se puede usar para tratar el cáncer de mama.Accordingly, the antitumor effect of the p62 DNA vaccine was demonstrated in the second animal model (rat), indicating that the p62 DNA vaccine can be used to treat breast cancer.

Ejemplo 5. Potencia antimetastásica de la vacuna de ADN p62Example 5. Antimetastatic potency of p62 DNA vaccine

El carcinoma de pulmón de Lewis es un modelo aceptado oficialmente por el Comité Farmacológico de la Federación Rusa, "FDA de Rusia", para probar los medicamentos para detectar efectos antimetastásicos. Se inyectaron 100 jg de plásmido por vía intramuscular en cada ratón 4 semanas y 2 semanas antes de la exposición con trasplante de tumor, así como 1, 8 y 15 días después de la exposición. Se utilizaron quince animales por grupo. La Fig. 13 muestra que la vacunación con p62 redujo el número de metástasis en los pulmones en un 50% en comparación con el control.Lewis lung carcinoma is a model officially accepted by the Pharmacological Committee of the Russian Federation, "Russian FDA", to test drugs for anti-metastatic effects. 100 μg of plasmid was injected intramuscularly in each mouse 4 weeks and 2 weeks before exposure with tumor transplantation, as well as 1, 8 and 15 days after exposure. Fifteen animals were used per group. Fig. 13 shows that vaccination with p62 reduced the number of metastases in the lungs by 50% compared to the control.

A menos que se defina lo contrario, todos los términos técnicos y científicos utilizados en este documento tienen el mismo significado que entiende comúnmente cualquier experto en la técnica a la que pertenece esta invención. Las realizaciones descritas ilustrativamente en el presente documento pueden ponerse en práctica adecuadamente en ausencia de cualquier elemento o elementos, limitación o limitaciones, no descritos específicamente en el presente documento. Así, por ejemplo, los términos "que comprende", "que incluye", "que contiene", etc. se leerán de forma extensa y sin limitación. Además, los términos y expresiones empleados en el presente documento se han utilizado como términos de descripción y no de limitación, y no existe ninguna intención en el uso de dichos términos y expresiones de excluir ningún equivalente de las características mostradas y descritas o sus partes, aunque se reconoce que son posibles diversas modificaciones dentro del alcance de la invención reivindicada.Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used in this document have the same meaning as commonly understood by one skilled in the art to which this invention pertains. The embodiments described illustratively herein may be suitably practiced in the absence of any element or elements, limitation or limitations, not specifically described herein. Thus, for example, the terms "comprising", "including", "containing", etc. they will be read extensively and without limitation. In addition, the terms and expressions used in this document have been used as terms of description and not limitation, and there is no intention in the use of such terms and expressions to exclude any equivalent of the characteristics shown and described or their parts, although it is recognized that various modifications are possible within the scope of the claimed invention.

Por lo tanto, debe entenderse que, aunque la invención se ha descrito específicamente mediante realizaciones preferidas y características opcionales, la modificación, la mejora y la variación de las invenciones realizadas en el presente documento descritas en este documento pueden ser utilizadas por los expertos en la técnica. Los materiales, métodos y ejemplos proporcionados en este documento son representativos de las realizaciones preferidas, son ejemplares y no pretenden ser limitaciones en el alcance de la invención.Therefore, it should be understood that, although the invention has been specifically described by preferred embodiments and optional features, the modification, improvement and variation of the inventions made herein described herein may be used by the experts in the art. technique. The materials, methods and examples provided herein are representative of the preferred embodiments, are exemplary and are not intended to be limitations on the scope of the invention.

La invención se ha descrito amplia y genéricamente en este documento. Cada una de las partes más abreviadas y agrupaciones subgenéricas que formen parte de la descripción genérica también formarán parte de la invención. Esto incluye la descripción genérica de la invención con una condición o limitación negativa que elimine cualquier tema del género, independientemente de si el material extirpado se menciona específicamente en el presente documento.The invention has been described broadly and generically in this document. Each of the most abbreviated parts and subgeneric groups that are part of the generic description will also form part of the invention. This includes the generic description of the invention with a negative condition or limitation that eliminates any subject of the genre, regardless of whether the excised material is specifically mentioned in the present document.

Además, cuando las características o aspectos de la invención se describen en términos de grupos de Markush, los expertos en la técnica reconocerán que la invención también se describe en términos de cualquier miembro individual o subgrupo de miembros del grupo de Markush.In addition, when the features or aspects of the invention are described in terms of Markush groups, those skilled in the art will recognize that the invention is also described in terms of any individual member or subgroup of members of the Markush group.

La descripción anterior solo pretende transmitir una forma de entender la presente invención para los expertos en la materia, y no pretende ser limitante. Se apreciará que son posibles diversas modificaciones de las realizaciones descritas, sin apartarse del alcance de la invención. Por lo tanto, el alcance de la presente invención debe interpretarse únicamente mediante la referencia a las reivindicaciones adjuntas. The above description is only intended to convey a way of understanding the present invention to those skilled in the art, and is not intended to be limiting. It will be appreciated that various modifications of the described embodiments are possible, without departing from the scope of the invention. Therefore, the scope of the present invention should be interpreted only by reference to the appended claims.

Claims (15)

REIVINDICACIONES 1. Un agente que comprende:1. An agent comprising: a. al menos 30 aminoácidos consecutivos de un polipéptido p62/SQSTM1;to. at least 30 consecutive amino acids of a p62 / SQSTM1 polypeptide; b. un ácido nucleico que codifica p62/SQSTM1, en el que dicho ácido nucleico que codifica p62/SQSTM1 codifica al menos 30 aminoácidos consecutivos de un polipéptido p62/SQSTM1;b. a nucleic acid encoding p62 / SQSTM1, wherein said nucleic acid encoding p62 / SQSTM1 encodes at least 30 consecutive amino acids of a p62 / SQSTM1 polypeptide; c. un polipéptido p62/SQSTM1 al menos el 90% idéntico a la SEQ ID NO. 2;c. a p62 / SQSTM1 polypeptide at least 90% identical to SEQ ID NO. two; d. un polipéptido p62/SQSTM1 con al menos una o más deleciones de dominio;d. a p62 / SQSTM1 polypeptide with at least one or more domain deletions; e. un ácido nucleico p62/SQSTM1 que codifica un polipéptido al menos 90% idéntico a la SEQ ID NO: 2; o f. un ácido nucleico p62/SQSTM1 que codifica un polipéptido con al menos una o más deleciones de dominio; para su uso en el tratamiento, alivio, mejora, paliación, retraso en el inicio, inhibición de la progresión, reducción de la gravedad y/o reducción de la incidencia de uno o más síntomas de un cáncer en un sujeto.and. a p62 / SQSTM1 nucleic acid encoding a polypeptide at least 90% identical to SEQ ID NO: 2; or f. a p62 / SQSTM1 nucleic acid encoding a polypeptide with at least one or more domain deletions; for use in the treatment, relief, improvement, palliation, delay in onset, inhibition of progression, reduction of severity and / or reduction of the incidence of one or more symptoms of a cancer in a subject. 2. El agente para el uso de la reivindicación 1(d) o 1(f) en el que dicha una o más deleciones de dominio se seleccionan del grupo que consiste en PB1, ZZ, NLS2, t B, NLS1, NeS, LIR, KIR y UBA.2. The agent for the use of claim 1 (d) or 1 (f) wherein said one or more domain deletions are selected from the group consisting of PB1, ZZ, NLS2, t B, NLS1, NeS, LIR , KIR and UBA. 3. El agente para el uso de la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en el que dicho polipéptido p62/SQSTM1 o ácido nucleico que codifica p62 está comprendido en un polipéptido de fusión o ácido nucleico que codifica un polipéptido de fusión.3. The agent for the use of claim 1 or claim 2, wherein said p62 / SQSTM1 polypeptide or p62 encoding nucleic acid is comprised in a fusion polypeptide or nucleic acid encoding a fusion polypeptide. 4. El agente para el uso de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en el que dicho agente es para la administración con un adyuvante y/o uno o más componentes coestimulantes y/o una o más moléculas que bloqueen los mecanismos inmunitarios supresores o reguladores negativos; en el que dicho uno o más componentes coestimulantes se seleccionan del grupo que consiste en proteínas de la superficie celular, citoquinas, quimiocinas y moléculas de señalización; y en donde dicha una o más moléculas que bloquean mecanismos inmunitarios supresores o reguladores negativos se seleccionan del grupo que consiste en: anticuerpo anti-CTLA-4, anticuerpo anti-CD25, anticuerpo anti-CD4 y la proteína de fusión IL13Ra2-Fc.4. The agent for the use of any one of claims 1-3, wherein said agent is for administration with an adjuvant and / or one or more costimulatory components and / or one or more molecules that block suppressive immune mechanisms. or negative regulators; wherein said one or more costimulatory components are selected from the group consisting of cell surface proteins, cytokines, chemokines and signaling molecules; and wherein said one or more molecules that block suppressive or negative regulatory immune mechanisms are selected from the group consisting of: anti-CTLA-4 antibody, anti-CD25 antibody, anti-CD4 antibody and the IL13Ra2-Fc fusion protein. 5. El agente para el uso de la reivindicación 4, en el que dicho adyuvante se selecciona del grupo que consiste en: adyuvantes de tipo gel, microbianos, particulados, emulsión de aceite, basados en tensioactivo y sintéticos.The agent for the use of claim 4, wherein said adjuvant is selected from the group consisting of: gel-like, microbial, particulate, oil-emulsion, surfactant-based and synthetic adjuvants. 6. El agente para el uso de una cualquiera de las reivindicaciones 1-5, en el que dicho agente es para la administración con una o más terapias contra el cáncer.6. The agent for the use of any one of claims 1-5, wherein said agent is for administration with one or more anti-cancer therapies. 7. El agente para el uso de la reivindicación 6, en el que dicha una o más terapias contra el cáncer se selecciona del grupo que consiste en: una molécula quimioterapéutica, radiación y una molécula antiangiogénica.The agent for the use of claim 6, wherein said one or more cancer therapies is selected from the group consisting of: a chemotherapeutic molecule, radiation and an anti-angiogenic molecule. 8. El agente para el uso de la reivindicación 7, en el que dicha molécula quimioterapéutica se selecciona del grupo que consiste en: ciclofosfamida, doxorubicina, paclitaxel, docetaxel, vinblastina, metotrexato, navelbina, capecitabina, mitomicina C y 5-fluorouracilo.The agent for the use of claim 7, wherein said chemotherapeutic molecule is selected from the group consisting of: cyclophosphamide, doxorubicin, paclitaxel, docetaxel, vinblastine, methotrexate, navelbine, capecitabine, mitomycin C and 5-fluorouracil. 9. El agente para el uso de una cualquiera de las reivindicaciones 1-8, en el que dicho cáncer es un cáncer de tumor sólido, opcionalmente seleccionado del grupo que consiste en: cáncer de mama, cáncer de pulmón, cáncer de próstata, cáncer gástrico, cáncer colorrectal, cáncer de piel, cáncer de cabeza y cuello, cáncer de bronquios, cáncer de páncreas, cáncer de vejiga urinaria, cáncer de cerebro, cáncer de sistema nervioso central, cáncer del sistema nervioso periférico, cáncer de esófago, cáncer de la cavidad oral o faringe, cáncer de hígado, cáncer de riñón, cáncer de testículo, cáncer del tracto biliar, cáncer de intestino delgado o apéndice, cáncer de ovario, cáncer de útero, cáncer de glándula salival, cáncer de glándula tiroides, cáncer de glándula suprarrenal, osteosarcoma, condrosarcoma y sarcoma, o cáncer de tejidos hematológicos.The agent for the use of any one of claims 1-8, wherein said cancer is a solid tumor cancer, optionally selected from the group consisting of: breast cancer, lung cancer, prostate cancer, cancer Gastric, colorectal cancer, skin cancer, head and neck cancer, bronchial cancer, pancreatic cancer, urinary bladder cancer, brain cancer, central nervous system cancer, peripheral nervous system cancer, esophageal cancer, cancer the oral cavity or pharynx, liver cancer, kidney cancer, testicular cancer, cancer of the biliary tract, cancer of the small intestine or appendix, ovarian cancer, cancer of the uterus, cancer of the salivary gland, cancer of the thyroid gland, cancer of the adrenal gland, osteosarcoma, chondrosarcoma and sarcoma, or cancer of hematological tissues. 10. El agente para el uso de las reivindicaciones 1-9, en el que dicho sujeto se selecciona del grupo que consiste en: un sujeto diagnosticado con cáncer, un sujeto tratado previamente para el cáncer, un sujeto con antecedentes familiares de cáncer y un sujeto predispuesto al cáncer.10. The agent for the use of claims 1-9, wherein said subject is selected from the group consisting of: a subject diagnosed with cancer, a subject previously treated for cancer, a subject with a family history of cancer and a subject predisposed to cancer. 11. El agente para el uso de cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que dicho agente comprende un ácido nucleico que codifica p62/SQSTM1, en el que dicha proteína p62 codificada es al menos un 90% idéntica a la SEQ ID NO. 2, y en la que dicho ácido nucleico que codifica p62 comprende además un plásmido o un vector viral.The agent for the use of any of claims 1-10, wherein said agent comprises a nucleic acid encoding p62 / SQSTM1, wherein said encoded p62 protein is at least 90% identical to SEQ ID NO. . 2, and wherein said nucleic acid encoding p62 further comprises a plasmid or a viral vector. 12. El agente para el uso de la reivindicación 11, que además comprende: uno o más replicones virales autorreplicantes, uno o más codones optimizados, uno o más motivos estimuladores de CpG, una o más secuencias VP22 del virus de la enfermedad de Marek tipo 1, uno o más vectores de administración de la mucosa, o en donde dicho agente es para su uso en electroporación in vivo o un régimen de estimulación de cebado. The agent for the use of claim 11, further comprising: one or more self-replicating viral replicons, one or more optimized codons, one or more CpG-stimulating motifs, one or more VP22 sequences of the Marek's disease virus type 1, one or more mucosal delivery vectors, or wherein said agent is for use in in vivo electroporation or a priming stimulation regimen. 13. Una vacuna de ácido nucleico o polipéptido p62 que comprende un polipéptido p62/SQSTM1 o ácido nucleico que codifica p62/SQSTM1 o su fragmento, como se define en una cualquiera de las reivindicaciones 1 (a) - (f), 2 ó 3.13. A p62 nucleic acid or polypeptide vaccine comprising a p62 / SQSTM1 polypeptide or nucleic acid encoding p62 / SQSTM1 or its fragment, as defined in any one of claims 1 (a) - (f), 2 or 3 . 14. Una vacuna de ácido nucleico o polipéptido p62 según la reivindicación 13, que comprende además un adyuvante y/o uno o más componentes coestimulantes y/o una o más moléculas que bloquean los mecanismos inmunitarios reguladores negativos o supresores como se define en la reivindicación 4 o la reivindicación 5.14. A p62 nucleic acid or polypeptide vaccine according to claim 13, further comprising an adjuvant and / or one or more costimulatory components and / or one or more molecules that block the negative regulatory or suppressor immune mechanisms as defined in the claim. 4 or claim 5. 15. Una vacuna de ácido nucleico o polipéptido p62 según la reivindicación 13 o la reivindicación 14, que comprende un ácido nucleico que codifica p62/SQSTM1, en el que dicha proteína p62 codificada es al menos un 90% idéntica a la SEQ ID N°. 2, y en el que dicho ácido nucleico que codifica p62 comprende además un plásmido o un vector viral; y/o que comprende además uno o más replicones virales autorreplicantes, uno o más codones optimizados, uno o más motivos estimulantes de CpG, una o más secuencias VP22 del virus de la enfermedad de Marek tipo 1, uno o más vectores de administración de la mucosa, o en donde dicho agente es para su uso en electroporación in vivo o un régimen de estimulación de cebado. 15. A p62 nucleic acid or polypeptide vaccine according to claim 13 or claim 14, comprising a nucleic acid encoding p62 / SQSTM1, wherein said encoded p62 protein is at least 90% identical to SEQ ID No. . 2, and wherein said nucleic acid encoding p62 further comprises a plasmid or a viral vector; and / or further comprising one or more self-replicating viral replicons, one or more optimized codons, one or more CpG-stimulating motifs, one or more VP22 sequences of Marek's disease virus type 1, one or more administration vectors of the mucosa, or wherein said agent is for use in in vivo electroporation or a priming stimulation regimen.
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