ES2349856T3 - Estearoil-coa desaturasa para identificar agentes terapéuticos que reducen los trigliceridos. - Google Patents
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Abstract
Un método para identificar un agente de modulación de estearoil-CoA desaturasa (SCD1), que comprende: a) poner en contacto, en condiciones fisiológicas, a un agente químico y una fracción de membrana microsómico que tiene actividad de SCD1 o a dicho agente químico y una célula que tiene actividad de SCD1; b) detectar un cambio de dicha actividad de SCD1 debido a dicha puesta en contacto; c) ensayar dicho agente químico para seleccionar adicionalmente compuestos que no inhiban en un ser humano la actividad biológica de delta-5-desaturasa o delta-6-desaturasa, identificando de este modo un agente de modulación de SCD1.
Description
Estearoil-CoA desaturasa para
identificar agentes terapéuticos que reducen los triglicéridos
La presente invención se refiere en general al
campo de la estearoil-CoA desaturasa y su
implicación en diversas enfermedades humanas. La
estearoil-CoA desaturasa es útil para la
identificación y el desarrollo de agentes terapéuticos para el
tratamiento de dichas enfermedades.
Las enzimas acil desaturasas catalizan la
formación de dobles enlaces en ácidos grasos obtenidos de fuentes
alimenticias o de síntesis de novo en el hígado. Los
mamíferos sintetizan cuatro desaturasas de diferente especificidad
por la longitud de la cadena, que catalizan la adición de dobles
enlaces en las posiciones \Delta9, \Delta6, \Delta5 y
\Delta4. Las estearoil-CoA desaturasas (SCD)
introducen un doble enlace en la posición \Delta9 de ácidos
grasos saturados. Los sustratos preferidos son
palmitoil-CoA (16:0) y estearoil-CoA
(18:0), que se convierten en palmitoleoil-CoA
(16:1) y oleoil-CoA (18:1), respectivamente. Los
ácidos grasos monoinsaturados resultantes son sustratos para la
incorporación en fosfolípidos, triglicéridos y ésteres de
colesterol.
Se han clonado una serie de genes de SCD de
mamífero. Por ejemplo, se han clonado dos genes de rata (SCD1,
SCD2) y cuatro genes de SCD se han aislado de ratón (SCD1, 2, 3 y
4). Un único gen de SCD, SCD1, se ha caracterizado en seres
humanos.
Aunque el papel bioquímico básico de SCD es
conocido en ratas desde los años 70 (Jeffcoat R. y James, AT. 1984.
Elsevier Science, 4: 85-112; de Antueno, RJ. 1993.
Lipids 28 (4) 285-290), no se ha implicado, antes
de esta invención, directamente en los procesos de enfermedades
humanas. Los estudios en animales no humanos oscurecieron nuestra
compresión del papel de SCD en seres humanos debido a las bien
documentadas diferencias en los procesos bioquímicos en diferentes
especies. En roedores, por ejemplo, el metabolismo de lípidos y del
colesterol está particularmente oscurecido por la ausencia de la
Proteína Transportadora de Ésteres de Colesterol (CETP) (véase
Foger, B. et al. 1999. J. Biol. Chem. 274 (52) 36912).
Además, la existencia de múltiples genes de SCD
en ratones y ratas añade complejidad adicional para determinar el
papel específico de cada uno de estos genes en procesos de
enfermedad. Las diferencias en perfiles de expresión tisular,
especificidad por sustrato, regulación génica y estabilidad
enzimática pueden ser importantes para aclarar qué gen de SCD
desempeña el papel dominante en cada trastorno. La mayoría de los
estudios de SCD previos evalúan la función del gen de SCD midiendo
los niveles de ARNm o midiendo niveles de ácidos grasos
monoinsaturados como medición indirecta de la actividad enzimática
de SCD. En estos dos casos, este análisis puede conducir a error.
En el último método ha sido particularmente inductor a errores y
difícil de discernir la contribución relativa de SCD1 al índice de
desaturación en plasma (la proporción de ácidos grasos
monoinsaturados respecto a ácidos grasos saturados de una longitud
de cadena específica) debido a que múltiples enzimas SCD pueden
contribuir a la producción de ácidos grasos monoinsaturados.
Anteriormente a esta invención, se desconocía las contribuciones
relativas de las múltiples isoformas de SCD al índice de
desaturación. En resumen, los estudios previos no diferenciaron qué
isoformas de SCD desempeñan un papel principal en la actividad
desaturasa total, según lo medido mediante el índice de
desaturación.
Un reciente trabajo en cultivo celular de
hepatocitos de pollo in vitro relaciona la actividad de
delta-9 desaturasa con la secreción alterada de
triacilglicerol (Legrand, P. y Hermier, D. (1992) Int. J. Obesity
16, 289-294; Legrand, P., Mallard, J.,
Bernard-Griffiths, M. A., Douaire, M., y Lemarchal,
P. Comp. Biochem. Physio. 87B, 789-792; Legrand,
P., Catheline, D., Fichot, M.-C., Lemarchal, P. (1997) J. Nutr. 127,
249-256). Este trabajo no distinguía entre las
isoformas de delta-9 desaturasa que pueden existir
en el pollo, no consiguiendo, una vez más, implicar directamente
una enzima SCD específica que suponga un efecto biológico
particular, en este caso, la secreción alterada de
triglicéridos.
Este trabajo in vitro tampoco se
correlaciona bien con seres humanos debido a que existen diferencias
sustanciales entre el metabolismo de lipoproteínas de pollo y de
ser humano in vivo. Dichas diferencias incluyen la
presencia, en el pollo, de lipoproteínas completamente diferentes,
tales como vitelogenina, y distintos procesos tales como la
inducción masiva de síntesis de triglicéridos hepática durante la
ovulación. Otras diferencias tales como el tipo de lipoproteínas
usadas para el transporte de colesterol y el proceso de secreción
de triglicéridos de la dieta en quilomicrones están bien
documentados. Estas principales diferencias entre aves y mamíferos
suponen que la extrapolación desde las aves a los mamíferos en el
área del metabolismo de triglicéridos debe considerarse provisional
y pendiente de la confirmación en seres humanos.
Otras dos áreas de la técnica antecedente forman
una importante base para la presente invención. En primer lugar,
esta invención se refiere al metabolismo del colesterol y de
lípidos, que en seres humanos se ha estudiado de forma exhaustiva.
Dado que el colesterol es altamente apolar, es transportado a través
del torrente sanguíneo en forma de lipoproteínas constituidas
esencialmente por un núcleo de moléculas apolares tales como éster
de colesterol y triglicérido rodeado por una envuelta de lípidos
anfipáticos, principalmente fosfolípidos. En seres humanos,
aproximadamente el 66% del colesterol se transporta en partículas de
lipoproteína de baja densidad (LDL), aproximadamente el 20% en
partículas de lipoproteína de alta densidad (HDL), y el resto en
partículas de lipoproteína de muy baja densidad (VLDL). Una
excelente referencia a la bioquímica básica del metabolismo del
colesterol en seres humanos y otros organismos se encuentra en el
documento Biology of Cholesterol. Ed. Yeagle, P. CRC Press, Boca
Raton, Fla., 1988.
En segundo lugar, esta invención aprovecha los
nuevos descubrimientos en el ratón Asebia (Gates, et al.
(1965) Science. 148: 1471-3). Este ratón es un
ratón con variante genética de origen natural que tiene un defecto
bien conocido en las glándulas sebáceas, dando como resultado la
pérdida de peso y piel escamosa. Recientemente se ha descubierto
que el ratón Asebia tiene una deleción en SCD1 que da como resultado
la formación de un sitio de terminación temprano en el exón 3 del
gen de SCD1. Los animales homocigotos para esta mutación, o un
alelo de deleción distinto que abarque los exones
1-4, no expresan cantidades detectables del
transcrito de ARNm de SCD1 de tipo silvestre (Noviembre de 1999.
Nature Genetics. 23: 268 y siguientes; y publicación de patente PCT
WO 00/09754)]. Dado que se desconoce el alcance completo de esta
deleción de origen natural, también se desconoce si otros genes
colindantes a SCD1, o en algún otro lugar en el genoma, también
podían estar implicados en el fenotipo de Asebia. Para estudiar
específicamente la actividad de SCD1 en los procesos de enfermedad,
se requiere un ratón específico knock-out para SCD1.
El anterior trabajo sobre esta variante se centraba en el papel de
esta mutación en trastornos cutáneos y no en el metabolismo de
triglicéridos o VLDL.
El documento J. Biol. Chem. Vol. 251, Nº 23
págs. 7468 a 7473 se refiere a una investigación de oxigenasas
microsómicas de procesos biosintéticos. El documento US 5.336.496 se
refiere a un método para inhibir la delta
5-desaturasa en un animal. El documento J. Biol.
Chem. Vol. 275, Nº 39 págs. 30132 a 30138, 2000 se refiere a la
biosíntesis de ésteres de colesterol y triglicéridos hepáticos que
está alterada en ratones con una alteración del gen para
estearoil-CoA desaturasa 1.
Es un objeto de la presente invención
identificar enfermedades y trastornos que estén vinculados
específicamente a la actividad biológica de SCD1 en seres humanos
y, en una realización preferida, enfermedades y trastornos del
metabolismo de triglicéridos. Es un objeto adicional desarrollar
ensayos de cribado para identificar y desarrollar fármacos para
tratar esas enfermedades, trastornos y afecciones relacionadas.
Además, es un objeto de esta invención proporcionar composiciones
para su uso en el tratamiento de estas enfermedades, trastornos y
afecciones relacionadas.
Esta invención se refiere a un método para
identificar un agente modulador de estearoil-CoA
desaturasa (SCD1) de acuerdo con la reivindicación 1. En las
reivindicaciones 2 a 10 se especifican realizaciones preferidas.
Esta invención describe, por primera vez, el
papel de la estearoil-CoA desaturasa 1 humana
("hSCD1") en una amplia gama de enfermedades y trastornos
humanos. En particular, la actividad biológica de SCD1 en seres
humanos está relacionada directamente con los niveles en suero de
triglicéridos y VLDL. Además, la actividad biológica de SCD1
también afecta a los niveles en suero de HDL, LDL y/o colesterol
total, al transporte inverso de colesterol y a la producción de
secreciones de membranas mucosas, ácidos grasos monoinsaturados,
ésteres de cera y/o similares.
Es un objeto de la presente invención
proporcionar un proceso o ensayo de cribado para identificar, a
partir de una biblioteca de compuestos de ensayo, un agente
terapéutico que module la actividad biológica de dicha
estearoil-CoA desaturasa humana (hSCD1) y sea útil
para tratar un trastorno o afección humana relacionada con los
niveles en suero de triglicéridos o VLDL. Preferentemente, el ensayo
de cribado identifica inhibidores de hSCD1 que rebajan los niveles
de triglicéridos en suero y proporcionan un importante beneficio
cardioprotector para los seres humanos.
Es también un objeto de la presente invención
proporcionar un proceso o ensayo de cribado para identificar, a
partir de una biblioteca de compuestos de ensayo, un agente
terapéutico que module la actividad biológica de dicha
estearoil-CoA desaturasa humana (hSCD1) y sea útil
para tratar un trastorno o afección humana relacionada con los
niveles en suero de HDL, LDL y/o colesterol total, el transporte
inverso de colesterol o la producción de secreciones a partir de
membranas mucosas, ácidos grasos monoinsaturados, ésteres de cera
y/o similares.
En un aspecto, la presente invención utiliza
vectores que comprenden genes y secuencias promotoras de
estearoil-CoA desaturasa humana (hSCD1) y células
eucariotas y líneas celulares recombinantes, preferentemente células
de mamífero y de la forma más preferente células y líneas celulares
humanas, transfectadas para comprender dichos vectores y/o dichos
polinucleótidos y en las que dichas células expresan hSCD1. En este
documento se describe la secuencia promotora de longitud completa
para hSCD1, SEC ID Nº 1.
Es también un objeto de la presente invención
proporcionar agentes capaces de modular la actividad y/o expresión
de estearoil-CoA desaturasa 1 humana (hSCD1) como se
describe en este documento, especialmente cuando dicha capacidad
moduladora se determinó en primer lugar usando un ensayo que
comprende actividad biológica de hSCD1 o un gen que codifica hSCD1.
Se contemplan específicamente composiciones farmacéuticas que
comprenden dichos agentes.
Es un objeto adicional más de la presente
invención proporcionar agentes en los que dicho agente es útil para
tratar, prevenir y/o diagnosticar una enfermedad o trastorno
relacionado con la actividad biológica de hSCD1.
Figura 1. Generación de ratones
knock-out para SCD1 (A) Estrategia de fijación como
objetivo de SCD1. Se muestra un mapa parcial del locus genómico que
rodea al locus de Scd1. La recombinación homóloga dio como resultado
la sustitución de los exones 1-6 por el gen neo 7.
Los eventos de fijación como objetivo de genes se comprobaron
mediante análisis de transferencia de Southern usando EcoRl y la
sonda A o B o mediante análisis por PCR. (B) Análisis por PCR que
demuestra ratones SCD-/-. Al cruzar heterocigotos, nacieron
heterocigotos y homocigotos de tipo silvestre de manera mendeliana
(+/+:+/-:-/- = 21:43:20 x^{2} = 0,395). (C) Análisis de
transferencia de Northern. 20 \mug de ARN total se aislaron del
hígado y se sometieron a análisis por transferencia de Northern.
Las transferencias se sondearon con una SCD1 de ratón y 2 fragmentos
de ADNc. (D) El ensayo de inmunotransferencia del hígado mostró la
ausencia de SCD inmunorreactiva en ratones SCD1-/-, mientras que la
proteína SCD1 se detectó en tejido hepático tanto de ratones de
tipo silvestre como heterocigotos de manera dependiente de la
dosificación génica. (E) La actividad de SCD en el hígado se
suprimía en ratones SCD-/-. Como se ha mencionado anteriormente,
los heterocigotos presentan un fenotipo intermedio en comparación
con los miembros de la camada de tipo silvestre y
knock-out. La actividad enzimática se representa
como nanomoles de sustrato desaturado por miligramo de proteína por
minuto. Los datos se indican como la media \pm SD (n = 3).
Figura 2. Perfiles de lipoproteína en plasma en
ratones macho Knock-out para SCD1 y Asebia. Los dos
paneles superiores representan el contenido de triglicéridos de las
fracciones de lipoproteína, los dos paneles inferiores representan
el contenido de colesterol de las fracciones de lipoproteína.
Figura 3. Niveles de
VLDL-triglicéridos en ratones Asebia (SCD1-/-) y
SCD1+/-. Las lipoproteínas del plasma se separaron mediante
cromatografía en fase líquida rápida y se midió la distribución de
triglicéridos entre las lipoproteínas en las diversas fracciones de
densidad del ratón (n = 3). SCD-/- (círculos vacíos), SCD1+/-
(círculos llenos). Se indican los picos de lipoproteína para VLDL,
LDL y HDL.
Figura 4. La proporción de ácido grasos
monoinsaturados respecto a saturados en plasma de ratón (el índice
de desaturación) disminuye de manera directamente proporcional al
nivel de actividad de SCD1. Comparación de ratones
knock-out para SCD1 y Asebia con sus respectivos
controles.
Figura 5 muestra un análisis de regresión lineal
usando una serie de datos humanos. La proporción de 18:1/18:0
mostraba una relación significativa con los niveles de TG (r^{2} =
0,39, p < 0,0001) (Panel A), así como correlaciones
significativas con los niveles de HDL (r^{2} = 0,12, p = 0,0006)
(Panel B). Los detalles experimentales se describen adicionalmente
en el Ejemplo 2.
Figura 6 muestra un análisis de regresión lineal
que indica que se observó una débil relación entre el nivel
relativo de 16:1/16:0 con los niveles de TG en plasma (r^{2} =
0,05, p = 0,03). Los detalles experimentales se encuentran en el
Ejemplo 2.
Figura 7 muestra un análisis de regresión lineal
de aquellos individuos con un fenotipo alto de HDL (> 90º
percentil). Estos individuos demostraron una relación significativa
entre la proporción 18:1/18:0 y los niveles de TG (r^{2} = 0,40,
p < 0,005).
Figura 8 muestra una relación observada entre
18:1/18:0 y los niveles de TG que se observó en una familia
(HA-1) que segrega un fenotipo alto de HDL. Usando
un análisis de regresión lineal, se observó una relación
significativa entre 18:1/18:0 y TG (r^{2} = 0,36, p = 0,005 (Panel
A)). El Panel B muestra una relación significativa entre la
proporción 18:1/18:0 y los niveles de HDL en esta familia (r^{2} =
0,32, p = 0,009).
Figura 9 muestra la relación observada entre la
proporción 18:1/18:0 y los niveles de TG (r^{2} = 0,49, p =
0,0009) cuando solamente se tienen en consideración personas con
bajo HDL (< 5º percentil).
Figura 10 muestra un análisis de una familia
(NL-001), que segregaba un fenotipo bajo de HDL de
etiología genética desconocida y tendía hacia las relaciones
observadas en las Figuras 5-9.
Figura 11 muestra un análisis de la familia
NL-0020 que segregaba una mutación ABCA1 y tendía
hacia las relaciones observadas en las Figuras
5-9.
Figura 12 es un análisis de ácidos grasos en
plasma que muestra la relación entre la proporción 18:1/18:0 y los
niveles de TG (r^{2} = 0,56, p = 0,02) (Panel A), los niveles de
HDL (r^{2} = 0,64, p = 0,0095) (Panel B) y los niveles de
colesterol total (r^{2} = 0,50, p = 0,03) en nueve personas con
Hiperlipidemia Combinada Familiar (FCHL) (Panel C).
Figura 13 es un análisis de ácidos grasos en
plasma que muestra una proporción significativamente elevada de
18:1/18:0 en ratones hiperlipidémicos (HcB-19) en
comparación con controles no afectados de la cepa parental
(C3H).
Figura 14. Ubicación de secuencias reguladoras y
sitios de unión en la región homóloga de las regiones promotora y
flanqueante en 5' de SCD1 de ratón y SCD1 humano. La escala superior
indica la posición relativa con respecto al sitio de inicio de la
transcripción. Se indican importantes elementos de la secuencia
promotora.
Figura 15. Células HepG2 humanas cultivadas y
tratadas con una gama de dosis de ácido araquidónico, DHA o 10
\mug/ml de colesterol o EPA como se indica. El ARNm total se aisló
y se cuantificó.
Figura 16. TLC de extractos de lípidos de la
piel (A y B) y los párpados (C y D) de ratones de tipo silvestre,
heterocigotos y SCD-/-. Los lípidos totales se extrajeron de los
párpados de ratones de tipo silvestre, heterocigotos y SCD-/-. Los
extractos de lípidos se reunieron y se analizaron mediante TLC de
alto rendimiento (HPTLC, A y C; éter de hexano/éter/ácido acético =
90:25:1, B y D; Benceno:hexano; 65:35). Las mismas cantidades de
extracto de lípido (a partir de 0,5 mg de párpado) se sometieron en
cada pista. Cada pista representa lípidos de los párpados de dos
ratones.
Figura 17 muestra un ensayo para la actividad de
SCD1 desaturasa cuantificando la transferencia de ^{3}H de
estearato a agua. La figura muestra una evolución temporal de la
producción de ^{3}H-agua a temperatura ambiente.
Se usaron microsomas de hígados de tipo silvestre para este
experimento. Un número de recambio para la actividad de SCD1 en
estas condiciones se estimó en 2 nmol/min/mg de proteína, que es
aproximadamente la mitad del observado a 37ºC.
Figura 18 muestra la validación de que el ensayo
monitoriza específicamente la desaturación de
estearoil-CoA dependiente de SCD1. Los hígados se
recogieron de ratones de tipo silvestre y knock-out
para SCD1 después de 3 días con una dieta rica en carbohidratos y
sin grasas (esto induce la expresión de SCD1 en el hígado en
aproximadamente 50 veces), se homogeneizaron y se usó una porción
para la purificación de microsomas. Se determinó la producción de
^{3}H-agua durante 15 minutos a RT (temperatura
ambiente) en preparaciones tanto de homogenado como de microsoma a
una concentración de proteínas equivalente, seguida por la
interrupción de la reacción con ácido y usando carbón vegetal para
separar el sustrato del producto. La inactivación de la muestra con
ácido antes de la adición de sustrato ofrece un blanco, o control
que contiene radiactividad de fondo sin ninguna reacción de
desaturación. La figura muestra que la actividad de desaturación en
los microsomas se enriquece enormemente en comparación con el
homogenado para hígados de tipo silvestre, mientras que los
microsomas para el animal knockout para -/-SCD1 tenían muy poca
actividad. La "ventana", o desaturación dependiente de SCD1 en
este ensayo, es una diferencia altamente visible y significativa de
160 veces entre los microsomas de tipo silvestre y de
knock-out para SCD1.
Figura 19 muestra la inhibición de SCD1 con 3
inhibidores de ácidos grasos conocidos. Se usaron microsomas de
ratones de tipo silvestre para ensayar la eficacia de tres
inhibidores conocidos de SCD1: ácido linoleico conjugado (CLA),
ácido 9-tia esteárico (9-thia) y
ácido estercúlico (SA). El panel A muestra que cuando se añaden
como ácido graso libre ninguno era eficaz para suprimir la actividad
de SCD1. Sin embargo, el panel B muestra que si se conjugan
previamente a CoA (realizado incubando los microsomas con CoA y ATP
antes de la adición de
3H-estearoil-CoA) los tres
inhibidores muestran inhibición graduada de SCD1 con el ácido
estercúlico suprimiendo casi el 100% de la actividad para el estado
de preincubación. Este experimento establece que la actividad de
SCD1 puede inhibirse con inhibidores conocidos, pero parece que
estos requieren conjugación con CoA. Un uso importante de este
ensayo de cribado es descubrir moléculas pequeñas que sean potentes
inhibidores de la actividad biológica de SCD1 sin conjugación a
CoA.
Figura 20 (A) Demostración de que la masa de
estearoil-CoA limita la cinética y la magnitud de la
señal de producción de 3H que estamos tomando como medida de la
desaturación dependiente de SCD1. Este experimento es esencialmente
una repetición del mostrado en la figura 17 con la excepción de que
a los 30 minutos se añadió una alícuota adicional de masa de
estearoil-CoA/radiactividad, dando como resultado la
segunda producción exponencial de señal de 3H. Esto muestra que la
cantidad de estearoil-CoA limita la reacción como se
esperaba para la desaturación catalizada por SCD1. (B) Demostración
de que el experimento es adaptable a alto rendimiento. Todos los
experimentos anteriores se realizaron con un volumen total de
reacción de 1,1 ml (0,2 ml de tampón de reacción que contenía
microsomas, 0,2 ml de PCA al 6% para interrumpir la reacción y 0,7
ml de solución de carbón vegetal al 10% para sedimentar el sustrato
que no reaccionó). El experimento ilustrado en B se realizó con un
volumen de reacción total de 0,31 ml (0,1 ml de tampón de reacción
con microsomas, 0,01 ml de PCA al 60% para interrumpir y 0,2 ml de
carbón vegetal al 10% para sedimentar).
"Aislado" en el contexto de la presente
invención con respecto a polipéptidos o polinucleótidos significa
que el material se retira de su entorno original (por ejemplo, el
entorno natural si éste es de origen natural). Por ejemplo, un
polinucleótido o polipéptido de origen natural presente en un
organismo vivo no está aislado, pero el mismo polinucleótido o
polipéptido, separado de alguno o todos los materiales coexistentes
en el sistema natural, está aislado. Dichos polinucleótidos podrían
formar parte de un vector y/o dichos polinucleótidos o polipéptidos
podrían formar parte de una composición, y seguir estando aislados,
ya que dicho vector o composición no forma parte de su entorno
natural. Los polipéptidos y polinucleótidos de la presente invención
se proporcionan preferentemente en una forma aislada, y
preferentemente están purificados hasta la homogeneidad.
Los ácidos nucleicos y productos de expresión de
polipéptidos descritos de acuerdo con la presente invención, así
como los vectores de expresión que contienen dichos ácidos nucleicos
y/o dichos polipéptidos, pueden estar en "forma enriquecida".
Como se usa en este documento, el término "enriquecido"
significa que la concentración del material es al menos
aproximadamente 2, 5, 10, 100 ó 1000 veces su concentración natural
(por ejemplo), ventajosamente el 0,01% en peso, preferentemente al
menos aproximadamente el 0,1% en peso. También se contemplan
preparaciones enriquecidas de aproximadamente el 0,5%, 1%, 5%, 10% y
el 20% en peso. Las secuencias, construcciones, vectores, clones y
otros materiales que comprende la presente invención pueden estar
ventajosamente en forma enriquecida o aislada.
Los polinucleótidos y polipéptidos recombinantes
o inmunógenos, descritos de acuerdo con la presente invención
también pueden estar en forma "purificada". El término
"purificada" no requiere una pureza absoluta; en vez de esto,
se entiende como una definición relativa, y puede incluir
preparaciones que están altamente purificadas o preparaciones que
solamente están parcialmente purificadas, como entienden estos
términos los expertos en la materia. Por ejemplo, clones
individuales aislados a partir de una biblioteca de ADNc se han
purificado convencionalmente hasta homogeneidad electroforética. La
purificación del material de partida o material natural hasta al
menos un orden de magnitud, preferentemente dos o tres órdenes, y
más preferentemente cuatro o cinco órdenes de magnitud se contempla
expresamente. Además, el polipéptido reivindicado que tiene una
pureza de preferentemente el 0,001%, o al menos el 0,01% o el 0,1%;
e incluso deseablemente el 1% en peso o más, se contempla
expresamente.
La expresión "región codificante" se
refiere a esa parte de un gen que, de forma natural o normalmente,
codifica el producto de expresión de ese gen en su entorno genómico
natural, es decir la región que codifica in vivo el producto
de expresión nativo del gen. La región codificante puede ser de un
gen normal, mutado o alterado, o puede ser incluso de una secuencia
de ADN, o gen, completamente sintetizado en el laboratorio usando
métodos bien conocidos por los expertos en la materia de la
síntesis de ADN.
De acuerdo con la presente invención, la
expresión "secuencia de nucleótidos" se refiere a un
heterodímero de desoxirribonucleótidos (para ADN) o ribonucleótidos
(para ARN). Generalmente, los segmentos de ADN que codifican las
proteínas proporcionadas por esta invención se ensamblan a partir de
fragmentos de ADNc y cortos enlazadores de oligonucleótidos, o a
partir de una serie de oligonucleótidos, para proporcionar un gen
sintético que es capaz de expresarse en una unidad transcripcional
recombinante que comprende elementos reguladores obtenidos de un
operón microbiano o viral.
La expresión "producto de expresión"
significa ese polipéptido o proteína que es el producto de la
traducción natural del gen y cualquier secuencia de ácido nucleico
que codifica equivalentes resultantes de la degeneración del código
genético y que, por lo tanto, codifican el(los)
mismo(s) aminoácido(s).
El término "fragmento", cuando se refiere a
una secuencia codificante, significa una porción de ADN que
comprende menos que la región codificante completa cuyo producto de
expresión conserva esencialmente la misma función o actividad
biológica que el producto de expresión de la región codificante
completa.
El término "cebador" significa una corta
secuencia de ácido nucleico que se empareja con una cadena de ADN y
proporciona un extremo OH en 3' libre en el cual una ADN polimerasa
comienza la síntesis de una cadena de desoxirribonucleótido.
El término "promotor" significa una región
de ADN implicada en la unión de ARN polimerasa para iniciar la
transcripción, e incluye todos los nucleótidos cadena arriba (5')
del sitio de inicio de transcripción.
Como se usa en este documento, la referencia a
una secuencia de ADN incluye ADN tanto de cadena sencilla como de
cadena doble. Por lo tanto, la secuencia específica, a no ser que el
contexto indique otra cosa, se refiere al ADN de cadena sencilla de
dicha secuencia, el emparejamiento de dicha secuencia con su
complemento (ADN de cadena doble) y el complemento de dicha
secuencia.
La presente invención se refiere además a un
polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos deducida, así
como fragmentos, análogos y derivados de dicho polipéptido.
Los términos "fragmento", "derivado" y
"análogo" cuando se refieren al polipéptido, significan un
polipéptido que conserva esencialmente la misma función o actividad
biológica que dicho polipéptido. Por lo tanto, un análogo incluye
una pro-proteína que puede activarse mediante
escisión de la porción de pro-proteína para
producir un polipéptido maduro activo. Dichos fragmentos, derivados
y análogos deben tener la suficiente similitud con respecto al
polipéptido de SCD1, de modo que esa actividad del polipéptido
nativo se conserve.
El polipéptido de la presente invención puede
ser un polipéptido recombinante, un polipéptido natural o un
polipéptido sintético, y es preferentemente un polipéptido
recombinante.
El fragmento, derivado o análogo del polipéptido
de SCD1 puede ser (i) uno en el que uno o más de los restos de
aminoácidos se sustituyen por un resto de aminoácido conservado o no
conservado (preferentemente un resto de aminoácido conservado) y
dicho resto de aminoácido sustituido puede ser o no uno codificado
por el código genético, o (ii) uno en el que uno o más de los
restos de aminoácidos incluye un grupo sustituyente, o (iii) uno en
el que el polipéptido maduro está fusionado a otro compuesto, tal
como un compuesto para aumentar la semi-vida del
polipéptido (por ejemplo, polietilenglicol), o (iv) uno en el que
los aminoácidos adicionales están fusionados al polipéptido maduro,
tal como una secuencia líder o secretora o una secuencia que se
emplea para la purificación del polipéptido maduro o una secuencia
de pro-proteína. Se considera que dichos fragmentos,
derivados y análogos están dentro del alcance de los expertos en la
materia a partir de las enseñanzas de este documento.
Como se conoce en la técnica, la
"similitud" entre dos polipéptidos se determina comparando la
secuencia de aminoácidos y sus sustitutos de aminoácidos
conservados de un polipéptido con la secuencia de un segundo
polipéptido.
De acuerdo con lo anterior, la presente
invención también se refiere a una estearoil-CoA
desaturasa aislada codificada por el polinucleótido aislado de la
invención.
Pueden emplearse fragmentos o porciones de los
polipéptidos de la presente invención para producir el polipéptido
de longitud completa correspondiente mediante síntesis peptídica;
por lo tanto, los fragmentos pueden emplearse como intermedios para
producir los polipéptidos de longitud completa. Pueden usarse
fragmentos o porciones de los polinucleótidos de la presente
invención para sintetizar polinucleótidos de longitud completa de la
presente invención.
Como se usa en este documento, los términos
"porción", "segmento" y "fragmento", cuando se usan
en relación con polipéptidos, se refieren a una secuencia continua
de restos, tales como restos de aminoácidos, secuencia que forma un
subconjunto de una secuencia mayor. Por ejemplo, si un polipéptido
se sometiera a tratamiento con cualquiera de las endopeptidasas
comunes, tales como tripsina o quimotripsina, los oligopéptidos que
resultan de dicho tratamiento representarían porciones, segmentos o
fragmentos del polipéptido de partida. Cuando se usan con respecto
a polinucleótidos, dichos términos se refieren a los productos
producidos mediante el tratamiento de dichos polinucleótidos con
cualquiera de las endonucleasas comunes.
La presente invención se refiere a la actividad
de estearoil-CoA desaturasa 1 humana en procesos de
enfermedad humana. De acuerdo con esto, los compuestos que modulan
específicamente la actividad o el nivel de expresión de
estearoil-CoA desaturasa 1 humana son útiles en el
tratamiento de un trastorno o afección humana relacionada con los
niveles en suero de triglicéridos o VLDL, y proporcionan un
importante beneficio cardioprotector cuando se administra a seres
humanos. Los compuestos que modulan la actividad o expresión de
hSCD1 también son útiles para modular los niveles en suero de HDL,
LDL y/o colesterol total, y/o el transporte inverso de colesterol.
Finalmente, los compuestos que modulan la actividad o expresión de
hSCD1 también son útiles para modular la producción de secreciones
de las membranas mucosas, ácidos grasos monoinsaturados, ésteres de
cera y similares.
La estearoil-CoA desaturasa 1
humana (también llamada SCD1, hSCD y hSCD1) ha sido identificada con
la secuencia de ADNc de longitud completa hecha pública por primera
vez en el GenBank como la entrada al GenBank Y13647 (también
NM005063) con fecha del 6 de junio de 1997. Descripciones
adicionales de SCD1, incluyendo secuencias promotoras parciales
pueden encontrarse en el GenBank con los siguientes números de
entrada: gblAF097514.1IAF097514; dbjlAB032261.1IAB032261; gb
IAF116616.1 IAF116616; reflXM_005719.1I;
gbIAF113690.1IAF113690; y gblS70284.1IS70284.
gbIAF113690.1IAF113690; y gblS70284.1IS70284.
En un aspecto, la presente invención se refiere
a usos de un polinucleótido aislado que comprende un polinucleótido
no genómico que tiene al menos el 90% de identidad, preferentemente
el 95% de identidad, de la forma más preferente al menos un 98% de
identidad con la secuencia de estearoil-CoA
reductasa 1 humana, especialmente cuando dichas secuencias son
iguales e incluyen cualquiera de los componentes de cualquiera de
las anteriores.
La secuencia promotora completa de hSCD1 es la
SEC ID Nº 1 y la figura 14 ilustra los elementos funcionales
conservados entre las regiones promotoras de SCD1 de ratón y
humana.
En un aspecto, la presente invención se refiere
a usos de un polipéptido aislado que tiene al menos el 90% de
identidad, preferentemente el 95% de identidad, de la forma más
preferente al menos un 98% de identidad con
estearoil-CoA reductasa 1 humana, especialmente
cuando dichas secuencias son iguales. La secuencia del polipéptido
se ha descrito previamente y puede encontrarse en las siguientes
series de entradas de la base de datos SwissProtein: Nº de entrada
000767; PID g3023241; VERSION 000767 GI: 3023241; DBSOURCE:
swissprot: locus ACOD_HUMAN, entrada 000767. Como alternativa, la
secuencia del polipéptido puede determinarse a partir de las
referencias de la secuencia de ADNc proporcionadas
anteriormente.
Como se describe en este documento, una serie de
enfermedades y trastornos humanos son el resultado de actividad
biológica de SCD1 aberrante y pueden mejorar mediante la modulación
de la actividad biológica de SCD1 usando agentes terapéuticos.
La enseñanza más significativa de la presente
descripción se refiere al papel de SCD1 en la modulación de los
niveles en suero de triglicéridos y VLDL en seres humanos. En este
documento, se establecen dos descubrimientos principales. En primer
lugar, el Ejemplo 1 a continuación muestra que los perfiles de
lipoproteína de ratones knock-out para SCD1
demuestran una reducción del 65% en los niveles de triglicéridos y
VLDL en suero. Estos corresponden a los perfiles de lipoproteínas
de ratones Asebia que también están incluidos en este documento.
Los perfiles de lipoproteína tanto de los ratones Asebia como de los
ratones knock-out para SCD1 no se conocían
previamente pero debido a la naturaleza dirigida y específica de la
mutación diseñada, la correlación de la actividad de SCD1 y los
niveles de triglicéridos en suero puede extraerse con certidumbre.
Aunque otras isoformas de SCD pueden desempeñar un papel en los
niveles de triglicéridos, este dato indica que SCD1,
específicamente, desempeña el papel principal en este proceso.
Existen diferencias significativas en el
metabolismo de lipoproteínas entre el ratón y los seres humanos, y
aunque los anteriores datos son convincentes en el ratón para un
papel principal y específico para SCD1 en la modulación de los
niveles de triglicéridos, sigue existiendo la necesidad de
experimentos que lo confirmen en seres humanos. El segundo
descubrimiento principal, por lo tanto, presentado en el Ejemplo 2,
a continuación, demuestra una correlación significativa entre la
actividad de SCD en seres humanos y los niveles de triglicéridos en
el suero. Por lo tanto, se ha descubierto que la actividad biológica
de SCD1 en seres humanos está relacionada directamente con los
niveles de triglicéridos en el suero.
De acuerdo con la presente invención, el
fenotipo del ratón Asebia (descrito en primer lugar por Gates, et
al. (1965) Science 148: 1471-3) muestra una
alteración principal y significativa en el perfil de lipoproteínas
en el suero incluyendo una gran reducción de los niveles de
triglicéridos y VLDL. Además, estos animales presentan un gran
descenso del contenido de ésteres de colesterol en el hígado. De
acuerdo con esto, la inhibición eficaz de la actividad de SCD1
conduciría a una reducción de los niveles de triglicéridos, debido a
una menor disponibilidad de ácidos grasos monoinsaturados. Los
ácidos grasos monoinsaturados son el sustrato preferido para la
enzima responsable de la síntesis
de triglicéridos (TG) a partir de ácidos grasos y fosfato de glicerol (es decir, glicerolfosfato aciltransferasa (GPAT)).
de triglicéridos (TG) a partir de ácidos grasos y fosfato de glicerol (es decir, glicerolfosfato aciltransferasa (GPAT)).
También de acuerdo con la descripción en este
documento, la esterificación aumentada de colesterol previene la
acumulación tóxica de colesterol libre en el hígado, y el aumento de
la disponibilidad de ésteres de colesterol y triglicéridos también
facilita su secreción en forma de VLDL. La esterificación de
colesterol aumentada en macrófagos también puede potenciar la
formación de macrófagos espumosos y, de este modo, contribuir al
desarrollo de una lesión aterosclerótica. Por lo tanto, la
inhibición de la actividad de SCD puede tener el efecto añadido de
reducir el nivel de partículas de VLDL en el torrente sanguíneo e
inhibir la aterosclerosis.
También de acuerdo con la presente invención, la
inhibición de SCD1 también es ventajosa para aumentar la formación
de HDL en los tejidos periféricos. En un individuo sano, el
colesterol celular está de forma predominante en forma
esterificada, con bajos niveles de colesterol libre. La
Acil-CoA:colesterol aciltransferasa (ACAT) es la
enzima responsable de esterificar colesterol usando
acil-CoA graso monoinsaturado como sustrato
preferido. La SCD genera los productos monoinsaturados, que están
entonces disponibles para la esterificación de colesterol por la
ACAT. Se piensa que el flujo aumentado de colesterol libre fuera de
células y a través de HDL es terapéuticamente beneficioso dado que
podría significar un aumento del "transporte inverso de
colesterol" (RCT).
La inhibición de SCD1 también es útil para
aumentar el transporte inverso de colesterol (RCT) sin elevar
necesariamente el nivel de HDL en el suero. El nivel de HDL en el
suero es un marcador sustituto para el proceso de RCT, que de hecho
se mide preferentemente mediante el flujo global de colesterol desde
los tejidos periféricos al hígado. La invención identifica
moduladores de la actividad biológica de SCD1 como agentes
terapéuticos eficaces para aumentar el RCT. El RCT puede medirse
directamente, por ejemplo, inyectando éter de colesterol
radiomarcado en partículas de HDL directamente en la sangre, y
midiendo la velocidad de eliminación (la velocidad a la que es
captada en el hígado de un organismo).
De acuerdo con la presente invención, se ha
descubierto que la modulación de la actividad de SCD1 en el hígado
y otros tejidos da como resultado un aumento de
SR-B1, un receptor hepático que retira HDL de la
circulación, aumentando de este modo el RCT con efectos menos
obvios sobre los niveles de HDL en la sangre. El vínculo entre la
actividad biológica de SCD1 y la expresión de ARNm de
SR-B1 no se ha identificado previamente. Trabajos
anteriores establecieron que los ratones que sobreexpresan
SR-B1 están cardioprotegidos, demostrando una
aterogénesis reducida y enfermedad cardiovascular reducida. Esta
interpretación también sugiere por primera vez que algunos agentes
terapéuticos, tales como inhibidores de la actividad biológica de
SCD1, pueden aumentar el RCT sin ningún cambio obvio en los niveles
de HDL. Esto se consigue obteniendo un aumento equilibrado tanto de
la formación de HDL en tejidos periféricos como de la retirada de
HDL por el hígado.
El experimento comparaba la expresión de ARNm de
SR-B1 en el hígado de ratones +/+ frente a -/- para
SCD1 (cepas como se describen en los Ejemplos a continuación).
Cuando se expresaban con respecto al animal +/+ con una dieta a
base de pienso, los resultados muestran lo siguiente para los
cambios en los niveles de ARNm de ABCA1 y
SR-B1:
Los cambios en ABC1 no son significativos
mientras que aquellos mostrados para SR-B1 con una
dieta a base de pienso si que lo son. Un aumento de la expresión de
SR-B1 indica un mayor flujo, o RCT, de colesterol al
hígado y puede explicar porqué no se observa HDL-C
elevado en el plasma de los ratones -/- para SCD1. Un mayor RCT se
confirma además por el descubrimiento de que los animales -/- con
una dieta rica en colesterol tienen una vesícula biliar de
aproximadamente 10 veces el tamaño de la de los animales +/+ y que
están congestionados de bilis. Estas observaciones son coherentes
con una mayor retirada de colesterol por parte del hígado y, por lo
tanto, un mayor RCT. Además, el aumento aparentemente idéntico de
SR-B1 en ratones +/+ y -/- puede no reflejar un
fenotipo o proceso biológico idéntico en estos animales.
La inhibición de la expresión de SCD también
puede afectar a la composición de ácidos grasos de los fosfolípidos
de la membrana, así como a triglicéridos y ésteres de colesterol. La
composición de ácidos grasos de los fosfolípidos determina
finalmente la fluidez de la membrana, mientras que los efectos sobre
la composición de triglicéridos y ésteres de colesterol pueden
afectar al metabolismo de lipoproteínas y a la adiposidad.
La presente invención también se refiere a la
implicación de SCD1 en otros trastornos o afecciones humanas
relacionadas con los niveles en suero de HDL, LDL y colesterol
total, así como al papel de SCD1 en otros trastornos o afecciones
humanas relacionadas con la producción de secreciones de las
membranas mucosas, ácidos grasos monoinsaturados, ésteres de cera y
similares. La invención abarca moduladores de SCD1 que son útiles
para tratar estos trastornos.
Trabajos anteriores que no usan sujetos humanos
han demostrado que la actividad biológica de SCD aberrante en esos
organismos (pero sin especificar qué isoforma de SCD era
responsable) puede estar implicada en diversas enfermedades
cutáneas, así como diversas enfermedades tales como cáncer y
esclerosis múltiple, diabetes mellitus no dependiente de insulina,
hipertensión, enfermedades neurológicas, enfermedades cutáneas,
enfermedades oculares, trastornos inmunes y cáncer. Los moduladores
descubiertos usando los procesos de la presente invención también
serían útiles, de este modo, en el tratamiento de esas enfermedades
y trastornos en sujetos humanos.
En el Ejemplo 4, se identifican proteínas que
regulan la transcripción de SCD1. Estas proteínas son dianas para
compuestos que aumentan o reducen la expresión de SCD1 en las
células, influyendo de este modo, positiva o negativamente, en la
actividad biológica de SCD1 de las células.
PPAR-gamma y SREBP son ejemplos. Los compuestos que
se sabe que actúan mediante dichos reguladores de la transcripción
pueden identificarse ahora como relevantes para tratar las
enfermedades y trastornos relacionados con SCD1 identificados ahora
en seres humanos.
La presente invención proporciona ensayos de
cribado que emplean el gen y/o proteína de hSCD1 para su uso en la
identificación de agentes terapéuticos para su uso en el tratamiento
de un trastorno o afección relacionada con los niveles en suero de
triglicéridos, VLDL, HDL, LDL, colesterol total, transporte inverso
de colesterol, la producción de secreciones de membranas mucosas,
ácidos grasos monoinsaturados, ésteres de cera y similares.
La "actividad biológica de SCD1" como se
usa en este documento, especialmente en relación con ensayos de
cribado, se interpreta ampliamente y contempla todas las
actividades biológicas directa o indirectamente medibles del gen y
la proteína de SCD1. En relación con la proteína de SCD1 purificada,
la actividad biológica de SCD1 incluye, aunque sin limitarse a,
todos aquellos procesos biológicos, interacciones, comportamiento de
unión, relaciones de actividad de unión, pKa, pD, cinética
enzimática, estabilidad y evaluaciones funcionales de la proteína.
En relación con la actividad biológica de SCD1 en fracciones
celulares, fracciones celulares reconstituidas o células completas,
estas actividades incluyen, aunque no se limitan a, la velocidad con
la que la SCD introduce un doble enlace en posición cis en sus
sustratos palmitoil-CoA (16:0) y
estearoil-CoA (18:0), que se convierten en
palmitoleoil-CoA (16:1) y oleoil-CoA
(18:1), respectivamente, y todas las consecuencias medibles de este
efecto, tales como la síntesis de triglicéridos, colesterol u otros
lípidos, composición y comportamiento de la membrana, crecimiento
celular, desarrollo de comportamiento y otros efectos directos o
indirectos de la actividad de SCD1. En relación con los genes de
SCD1 y la transcripción, la actividad biológica de SCD1 incluye la
velocidad, escala o alcance de la transcripción de ADN genómico para
generar ARN; el efecto de proteínas reguladoras sobre dicha
transcripción, el efecto de moduladores de dichas proteínas
reguladoras sobre dicha transcripción; más la estabilidad y
comportamiento de transcritos de ARNm, procesamiento
post-transcripcional, cantidades y recambio de
ARNm, y todas las mediciones de la traducción de ARNm en secuencias
polipeptídicas. En relación con la actividad biológica de SCD1 en
organismos, ésta incluye, aunque sin limitarse a, actividades
biológicas que se identifican por su ausencia o deficiencia de
procesos de enfermedad o trastornos causados por actividad
biológica de SCD1 aberrante en esos organismos. En términos
generales, la actividad biológica de SCD1 puede determinarse
mediante todos estos y otros medios para analizar propiedades
biológicas de proteínas y genes que se conocen en la técnica.
Los ensayos de cribado contemplados por la
presente invención también pueden emplear isoformas de SCD de seres
humanos u otros organismos que demuestren actividad biológica
similar a hSCD1, siempre que consigan identificar con éxito agentes
terapéuticos para enfermedades humanas. La equivalencia funcional de
delta-9 desaturasas de vertebrados ha sido
reconocida por los expertos en la materia. Por consiguiente,
realizaciones específicas de la presente invención pueden emplear
una o más enzimas delta-9 desaturasa funcionalmente
equivalentes de otras especies de vertebrados para identificar
agentes terapéuticos útiles para seres humanos. Las desaturasas
funcionalmente equivalentes incluyen todas las SCD de ratón, rata,
vaca, cerdo o pollo identificadas anteriormente, además de los
genes identificados en el grupo UniGene Cluster Hs. 119597
SCD para Estearoil-CoA desaturasa
(delta-9 desaturasa). Véase también LocusLink: 6319;
OMIM: 604031 o HomoloGene:Hs. 119597. Otras delta-9
desaturasas conocidas incluyen cerdo: 002858
(swiss-prot); y vaca: AF188710 (NCBI, [6651449,
Genbank])
\vskip1.000000\baselineskip
Similitudes de proteínas del
organismo modelo seleccionado (organismo, referencia de
proteína
y porcentaje de identidad y longitud de la región de aminoácidos (aa) alineada)
y porcentaje de identidad y longitud de la región de aminoácidos (aa) alineada)
La presente descripción facilita el desarrollo
de ensayos de cribado que pueden basarse en células, extractos
celulares (es decir ensayos microsómicos), ensayos sin células (es
decir transcripcionales), y ensayos de actividad de proteínas
sustancialmente purificadas. Dichos ensayos se basan habitualmente
en radiactividad o fluorescencia (es decir polarización por
fluorescencia o transferencia de energía por resonancia de
fluorescencia o FRET), o pueden medir el comportamiento celular
(viabilidad, crecimiento, actividad, forma, fluidez de la membrana,
sensibilidad a la temperatura, etc.). Los ensayos de cribado pueden
ser ensayos manuales o de bajo rendimiento, o pueden ser cribados
de alto rendimiento que están mejorados mecánica/robóticamente.
Los procesos mencionados anteriormente
proporcionan la base para los procesos de cribado, incluyendo
procesos de cribado de alto rendimiento, para determinar la
eficacia de potenciales fármacos terapéuticos y de diagnóstico para
tratar las enfermedades descritas en este documento, preferentemente
enfermedades en las que una mayor o menor actividad o expresión de
estearoil-CoA desaturasa (hSCD1 de la invención)
desempeña un papel clave en la mediación de dicha enfermedad.
Como tal, esta invención se refiere a un método
para identificar, tal como a partir de una biblioteca de compuestos
de ensayo, un agente terapéutico que es útil en seres humanos para
el tratamiento de un trastorno o afección relacionada con los
niveles en suero de triglicéridos VLDL, HDL, LDL, colesterol total o
la producción de secreciones de las membranas mucosas, ácidos
grasos monoinsaturados, ésteres de cera y similares, que
comprende
- a)
- proporcionar un ensayo de cribado que tiene actividad biológica de SCD1;
- b)
- poner en contacto a dicho ensayo de cribado con un compuesto de ensayo; y
- c)
- posteriormente, medir dicha actividad biológica;
en el que un compuesto de ensayo que modula
dicha actividad biológica se denomina agente terapéutico, o un
análogo del mismo.
\vskip1.000000\baselineskip
En un aspecto, la presente invención se refiere
a un proceso para identificar, a partir de una biblioteca de
compuestos de ensayo, un agente terapéutico que es útil en seres
humanos para el tratamiento de un trastorno o afección relacionada
con los niveles en suero de triglicéridos o lipoproteína de muy baja
densidad (VLDL) que comprende
- a)
- proporcionar un ensayo de cribado que tiene actividad biológica de estearoil-Coenzima A desaturasa de tipo 1 (SCD1) como componente del mismo;
- b)
- poner en contacto a dicha actividad de SCD1 con un compuesto de ensayo;
- c)
- administrar a un ser humano un compuesto que se haya descubierto que modula dicha actividad en (b); y
- d)
- detectar un cambio en el nivel en suero de triglicéridos o VLDL en dicho ser humano después de dicha administración;
identificando de este modo un agente útil en el
tratamiento de un trastorno o afección relacionada con los niveles
en suero de triglicéridos o lipoproteínas de muy baja densidad
(VLDL).
\vskip1.000000\baselineskip
En una realización, dicho agente es un
antagonista o inhibidor de la actividad biológica de SCD1. En otra
realización específica de la misma, dicho agente es un antagonista
de la actividad biológica de SCD1.
En otra realización, en la que dicho modulador
es un inhibidor, dicho inhibidor no inhibe la actividad biológica
en un ser humano de una delta-5 desaturasa,
delta-6 desaturasa o ácido graso sintetasa.
En una realización de la presente invención, el
proceso de ensayo comprende además la etapa de ensayar dicho agente
terapéutico para seleccionar adicionalmente compuestos que no
inhiban en un ser humano la actividad de delta-5
desaturasa, delta-6 desaturasa o ácido graso
sintetasa.
En realizaciones específicas, la presente
invención también abarca un proceso en el que dicha actividad
biológica de SCD1 se mide mediante un ensayo seleccionado
entre:
- a)
- afinidad de unión a polipéptido de SCD1;
- b)
- actividad desaturasa de SCD1 en microsomas;
- c)
- actividad desaturasa de SCD1 en un ensayo en célula completa
- d)
- cuantificación del nivel de expresión génica de SCD1; y
- e)
- cuantificación del nivel de proteínas de SCD1.
Las realizaciones específicas de dicho ensayo
pueden emplear una célula recombinante como se describe en este
documento.
La presente invención también se refiere a un
proceso en el que el compuesto identificado se selecciona además
entre aquellos compuestos que no inhiben en seres humanos la
actividad biológica de delta-5 desaturasa,
delta-6 desaturasa o ácido graso sintetasa.
En otras realizaciones específicas, la presente
invención contempla emplear ácido nucleico de SCD1 como se describe
en este documento y/o polipéptido de SCD1 como se describe en este
documento para su uso en la identificación de compuestos útiles
para el tratamiento de un trastorno o afección relacionada con los
niveles en suero de triglicéridos o VLDL.
Los ensayos descritos en este documento
requieren esencialmente la medición, directa o indirectamente, de
una actividad biológica de SCD1. Los expertos en la materia pueden
desarrollar dichos ensayos en base a modelos bien conocidos, y
existen muchos ensayos potenciales. Para medir la actividad en
células completas de SCD1 directamente, los métodos que pueden
usarse para medir cuantitativamente la actividad de SCD incluyen por
ejemplo, realizar mediciones de cromatografía en capa fina de
productos de reacción de SCD a lo largo del tiempo. Este método y
otros métodos adecuados para medir la actividad de SCD son bien
conocidos (Henderson Henderson RJ, et al. 1992. Lipid
Analysis: A Practical Approach. Hamilton S. Eds. Nueva York y Tokio,
Oxford University Press. págs. 65-111.) La
cromatografía de gases también es útil para distinguir a los
monoinsaturados de los saturados, por ejemplo oleato (18:1) y
estearato (18:0) pueden distinguirse usando este método. Una
descripción de este método se da en los ejemplos a continuación.
Estas técnicas pueden usarse para determinar si un compuesto de
ensayo ha influido en la actividad biológica de SCD1, o la velocidad
a la cual la SCD introduce un doble enlace en posición cis en su
sustrato palmitato (16:0) o estearato (18:0) para producir
palmitolieoil-CoA (16:1) u
oleioil-CoA (18:1), respectivamente.
En una realización preferida, la invención
emplea un ensayo microsómico que tiene una actividad biológica de
SCD1 medible. Un ensayo adecuado puede tomarse modificando y
aumentando a escala el ensayo microsómico de hígado de rata como
fue descrito por Shimomura et al. (Shimomura, I., Shimano,
H., Korn, B. S., Bashmakov, Y., y Horton, J. D. (1998). Los tejidos
se homogeneizan en 10 volúmenes de tampón A (tampón de potasio 0,1
M, pH 7,4). Las fracciones de membrana microsómica (sedimento de
100.000 x g) se aíslan mediante centrifugado secuencial. Las
reacciones se realizan a 37ºC durante 5 minutos con 100 \mug de
homogenado de proteína y 60 \muM de
[1^{-14}C]-estearoil-CoA (60.000
dpm), 2 mM de NADH, 0,1 M de tampón Tris/HCl (pH 7,2). Después de
la reacción, se extraen los ácidos grasos y a continuación se
metilan con cloruro acético/metanol al 10%. Los ésteres metílicos
de ácido graso saturado y ácido graso monoinsaturado se separan
mediante TLC impregnada con AgNO_{3} al 10% usando hexano/éter
dietílico (9:1) como solución de desarrollo. Las placas se rocían
con 2',7'-diclorofluoresceína al 0,2% en etanol al
95% y los lípidos se identifican en luz UV. Las fracciones se
raspan para retirarlas de la placa, y la radiactividad se mide
usando un contador de centelleo líquido.
Las realizaciones específicas de dicho ensayo de
actividad biológica de SCD1 se aprovechan del hecho de que la
reacción de SCD produce, además del producto de
acil-CoA graso monoinsaturado, H_{2}O. Si se
introduce ^{3}H en las posiciones C-9 y
C-10 del sustrato graso acil-CoA,
entonces algunos de los protones radiactivos de esta reacción
terminarán en el agua. Por lo tanto, la medición de la actividad
implicaría las mediciones de agua radiactiva. Para separar el agua
marcada del estearato, los investigadores pueden emplear sustratos
tales como carbón vegetal, perlas hidrófobas, o simplemente
anticuados disolventes planos en pH ácido.
En una realización preferida, los ensayos de
cribado miden la actividad biológica de SCD1 indirectamente. Los
ensayos de cribado de alto rendimiento convencionales se centran en
ensayos de ligando-receptor. Estos pueden estar
basados en fluorescencia o basados en luminescencia o detección de
radiomarcas. Los inmunoensayos enzimáticos pueden realizarse en una
amplia variedad de formatos para identificar compuestos que
interactúan con proteínas de SCD1. Estos ensayos pueden emplear
inmunoensayos de fluorescencia súbita o fluorescencia resuelta en
el tiempo que se conocen bien. El ATP marcado con P^{32}, se usa
habitualmente para ensayos de proteína quinasa. Los productos
fosforilados pueden separarse para contarlos mediante diversos
métodos. La tecnología de ensayo de proximidad por centelleo es un
método mejorado de ensayo con radiomarcas. Todos estos tipos de
ensayo son particularmente apropiados para ensayos de compuestos que
interactúan con proteína de SCD1 purificada o
semi-purificada.
En una realización preferida, el ensayo utiliza
3H-estearoil CoA (con el 3H en los átomos de carbono
9 y 10), el sustrato para SCD1. Las desaturación mediante SCD1,
produce oleoil CoA y moléculas de 3H-agua. La
reacción se realiza a temperatura ambiente, se interrumpe con ácido
y a continuación se usa carbón vegetal activado para separar el
sustrato sin reaccionar del producto de agua radiactiva. El carbón
vegetal se sedimenta y la cantidad de radiactividad en el
sobrenadante se determina mediante recuento de centelleo líquido.
Este ensayo es específico para la desaturación dependiente de SCD1,
según se considera por la diferencia observada al comparar la
actividad en tejidos de tipo silvestre y knock-out
para SCD1. Además, el método se adapta fácilmente a alto
rendimiento ya que está libre de células, se realiza a temperatura
ambiente y es relativamente breve (periodo de tiempo de reacción de
1 hora frente al anterior periodo de 2 días). Este procedimiento se
ilustra con más detalle en las figuras 17 a 20.
Aunque la presente descripción muestra una
realización de trabajo eficaz de la invención, los expertos en la
materia son capaces de optimizar el ensayo de diversas maneras,
todas las cuales son abarcadas por la invención. Por ejemplo, el
carbón vegetal es muy eficaz (> 98%) para retirar la parte no
usada de estearoil-CoA pero presenta la desventaja
de ser sucio y en algunas condiciones difícil de manejar con
pipetas. Puede no ser necesario usar carbón vegetal si el complejo
de estearoil-CoA se agrega lo suficiente cuando se
acidifica y se centrifuga con una fuerza g moderada. Esto puede
ensayarse midiendo la proporción de señal/ruido con y sin carbón
vegetal después de una reacción de desaturación. También existen
otros reactivos que sedimentarían eficazmente
estearoil-CoA para separarla del producto de
3H-agua.
Como se muestra en la figura 20 (Panel A) la
cantidad de estearoil-CoA limita la cinética y
magnitud de la señal de ^{3}H-DPM monitorizada
como actividad de desaturación dependiente de SCD1. Sin embargo, no
toda la estearoil-CoA fue consumida por SCD1; >
90% permanece indisponible para SCD1 dado que otras enzimas
presentes en los microsomas (por ejemplo, reacciones de acil
transferasa) la utilizan como sustrato y compiten con SCD1 y/o
estearoil-CoA es inestable en las condiciones del
experimento. Estas posibilidades pueden examinarse monitorizando la
incorporación de la marca en fosfolípidos o incluyendo una mezcla
tampón (Mg++, ATP y CoA) que regeneraría la
estearoil-CoA a partir de estearato y CoA.
Como se muestra en la figura 20 (Panel B) el
ensayo puede realizarse en un pequeño volumen apropiado para
cribado de alto rendimiento. Una realización preferida emplearía una
microcentrífuga satisfactoria para centrifugar placas de 96
pocillos.
Los siguientes ensayos también son adecuados
para medir la actividad biológica de SCD1 en presencia de
potenciales agentes terapéuticos. Estos ensayos también son
valiosos como cribas secundarias para seleccionar adicionalmente
moduladores, inhibidores o agonistas específicos de SCD1 a partir de
una biblioteca de potenciales agentes terapéuticos.
También pueden usarse ensayos de desaturación
basados en células. Al rastrear la conversión de estearato en
oleato en las células (se sabe que los adipocitos 3T3L1 tienen una
alta expresión de SCD1 y captan fácilmente estearato cuando se
compleja con BSA) podemos evaluar compuestos que se descubrió que
eran inhibidores en el cribado primario para cantidades o
características adicionales tales como si son permeables a las
células, letales para las células, y/o competentes para inhibir la
actividad de SCD1 en las células. Este ensayo basado en células
puede emplear una línea celular recombinante que contiene una
delta-9 desaturasa, preferentemente hSCD1 (SCD1
humana). El gen recombinante está opcionalmente bajo el control de
un promotor inducible y la línea celular
sobre-expresa preferentemente la proteína SCD1.
Podrían desarrollarse otros ensayos para
rastrear otras isoformas de SCD. Por ejemplo, la SCD2 de rata y de
ratón se expresa en el cerebro. En una realización preferida, se
prepara una preparación de microsoma a partir del cerebro como se
ha hecho anteriormente para SCD1 a partir del hígado. El objeto
puede ser descubrir compuestos que serían específicos para SCD1.
Esta criba podría comparar el efecto inhibidor del compuesto para
SCD1 frente a SCD2.
\newpage
Aunque improbable, es posible que un compuesto
"afectado" en el ensayo de SCD1 podría resultar de la
estimulación de una enzima presente en la preparación de microsoma
que utiliza de forma competitiva estearoil-CoA a
expensas de aquella disponible para la desaturación dependiente de
SCD1. Esto podría interpretarse erróneamente como inhibición de
SCD1. Una posibilidad para examinar este problema sería la
incorporación en fosfolípidos del lípido insaturado (estearato). Al
determinar los efectos de los compuestos sobre la estimulación de la
incorporación de estearato en los lípidos, los investigadores son
capaces de evaluar esta posibilidad.
Pueden preferirse los ensayos basados en
células, ya que dejan al gen de SCD1 en su formato nativo.
Particularmente prometedores para el análisis de SCD1 en estos
tipos de ensayo son los ensayos de polarización por fluorescencia.
La medida en la que la luz permanece polarizada depende del grado en
el cual la marca ha rotado en el intervalo de tiempo entre la
excitación y la emisión. Dado que la medición es sensible a la tasa
de pérdida de estabilidad de las moléculas, puede usarse para medir
cambios de las características de fluidez de la membrana que son
inducidos por la actividad de SCD1, concretamente la actividad de
delta-9 desaturación de la célula. Un ensayo
alternativo para SCD1 implica un ensayo FRET. Los ensayos FRET miden
la transferencia de energía de resonancia por fluorescencia que se
produce entre un donador de molécula fluorescente y un aceptor, o
inactivador. Dicho ensayo puede ser adecuado para medir cambios en
las características de fluidez de la membrana o sensibilidad a la
temperatura inducidos por la actividad biológica de SCD1.
Los ensayos de cribado de la invención pueden
realizarse usando sistemas robóticos de alto rendimiento. En el
futuro, los ensayos preferidos pueden incluir dispositivos de chip
desarrollados por, entre otros, Caliper, Inc., ACLARA BioSciences,
Cellomics, Inc., Aurora Biosciences Inc., y otros.
En otras realizaciones de la presente invención,
la actividad biológica de SCD1 también puede medirse mediante un
ensayo de flujo de salida de colesterol que mide la capacidad de las
células para transferir colesterol a una molécula aceptora
extracelular y depende de la función de ABCA1. Un ensayo de flujo de
salida de colesterol convencional se muestra en Marcil et
al., Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 19:
159-169, 1999, incorporado como referencia en este
documento para cualquier fin.
Los ensayos preferidos se adaptan fácilmente al
formato usado para el cribado de fármacos, que puede estar
constituido por un formato de múltiples pocillos (por ejemplo 96
pocillos, 384 pocillos o 1536 pocillos o más). La modificación del
ensayo para optimizarlo para el cribado de fármacos incluiría
reducir a escala y racionalizar el procedimiento, modificar el
método de marcado, alterar el tiempo de incubación, y cambiar el
método de cálculo de la actividad biológica de SCD1 etc. En todos
estos casos, el ensayo de actividad biológica de SCD1 sigue siendo
conceptualmente el mismo, aunque pueden realizarse modificaciones
experimentales.
Otro ensayo basado en células preferido es un
ensayo de viabilidad celular para el aislamiento de inhibidores de
SCD1. La sobre-expresión de SCD reduce la viabilidad
celular. Este fenotipo puede aprovecharse para identificar
compuestos inhibidores. Esta citotoxicidad puede deberse a la
alteración de la composición de ácidos grasos de la membrana
plasmática. En una realización preferida, el ADNc de SCD1 humana se
pondría bajo el control de un promotor inducible, tal como el
sistema de expresión génica inducible Tet-On
Tet-Off (Clontech). Este sistema implica
preparar una línea celular doble estable. La primera transfección
introduce un plásmido regulador y la segunda introduciría la
construcción de expresión de SCD inducible. La integración
cromosómica de ambas construcciones en el genoma del huésped
estaría favorecida al poner a las células transfectadas bajo
presión selectiva en presencia del antibiótico apropiado. Una vez
establecida la línea celular doble estable, se induciría la
expresión de SCD1 usando tetraciclina o un derivado de tetraciclina
(por ejemplo Doxiciclina). Una vez que se ha inducido la expresión
de SCD1, las células se expondrían a una biblioteca de compuestos
químicos para HTS (cribado de alto rendimiento) de
inhibidores potenciales. Después de un periodo de tiempo definido,
se mediría a continuación la viabilidad por medio de un tinte
fluorescente u otro enfoque (por ejemplo turbidez del medio de
cultivo tisular). Aquellas células expuestas a compuestos que actúan
para inhibir la actividad de SCD1 mostrarían una mayor viabilidad,
por encima de la supervivencia de fondo. Por lo tanto, dicho ensayo
sería una selección positiva para inhibidores de la actividad de
SCD1 en base a la expresión inducible de SCD1 y la medición de la
viabilidad celular.
Un enfoque alternativo es interferir en el
sistema de desaturasa. El sistema de desaturasa tiene tres proteínas
principales: citocromo b_{5}, NADH (P)-citocromo
b_{5} reductasa, y desaturasa terminal sensible al cianuro. La
desaturasa terminal sensible al cianuro es el producto del gen de
SCD. La actividad de SCD depende de la formación de un complejo
estable entre los tres componentes mencionados anteriormente. Por lo
tanto, cualquier agente que interfiera en la formación de este
complejo o cualquier agente que interfiera en el apropiado
funcionamiento de cualquiera de los tres componentes del complejo
inhibiría eficazmente la actividad de SCD.
Otro tipo de modulador de la actividad de SCD1
implica un dominio de desestabilización de 33 aminoácidos situado
en el extremo amino terminal de la proteína pre-SCD1
(Mziaut et al., PNAS 2000, 97: p 8883-8888).
Es posible que este dominio pueda escindirse de la proteína de SCD1
mediante una proteasa como las ya conocidas. Esta supuesta
actividad proteolítica actuaría, por lo tanto, para aumentar la
estabilidad y la semi-vida de SCD1. La inhibición
de la supuesta proteasa, por otro lado, provocaría una reducción de
la estabilidad y semi-vida de SCD1. Los compuestos
que bloquean o modulan la retirada del dominio de desestabilización
conducirán, por lo tanto, a reducciones de los niveles de proteína
de SCD1 en una célula. Por lo tanto, en algunas realizaciones de la
invención, un ensayo de cribado empleará una medición de la
actividad proteasa para identificar moduladores de la actividad
proteasas de SCD1. La primera etapa es identificar la proteasa
específica que es responsable de la escisión de SCD1. Esta proteasa
puede integrarse a continuación en un ensayo de cribado. Los ensayos
de proteasa convencionales se basan a menudo en el corte y empalme
de un sitio de escisión de proteasa (es decir, un péptido que
contiene la secuencia de escisión que pertenece al la proteasa en
cuestión) en una proteína, que se desactiva después de la escisión.
Para este fin puede usarse una proteína de flujo de salida de
tetraciclina. Una quimera que contiene la secuencia insertada se
expresa en E. coli. Una vez escindida la proteína, la
resistencia a tetraciclina se pierde en la bacteria. Se han
desarrollado ensayos in vitro en los que un péptido que
contiene un sitio de escisión apropiado se inmoviliza en un extremo
sobre una fase sólida. El otro extremo está marcado con un
radioisótopo, fluoróforo, u otra marca. La pérdida de señal mediada
por enzimas desde la fase sólida es paralela a la actividad de
proteasa. Estas técnicas pueden usarse tanto para identificar a la
proteasa responsable de generar la proteína de SCD1 madura, como
para identificar moduladores de esta proteasa para su uso en la
reducción de los niveles de SCD1 en una célula.
En otro aspecto, la presente invención se
refiere a un proceso para determinar la capacidad de un agente para
modular la actividad de una estearoil-CoA desaturasa
humana, que comprende las etapas de:
- (a)
- poner en contacto al agente en condiciones adecuadas con la estearoil-CoA desaturasa humana de la invención a un nivel predeterminado de dicho agente;
- (b)
- determinar si la actividad de dicha estearoil-CoA desaturasa cambia después de dicho contacto,
determinando de este modo si dicho agente ha
modulado dicha actividad.
\vskip1.000000\baselineskip
Dicho ensayo puede realizarse como un ensayo sin
células empleando una fracción celular, tal como una fracción
microsómica, obtenida mediante métodos convencionales de
fraccionamiento celular diferencial, de la forma más habitual
mediante métodos de ultracentrifugado. En realizaciones específicas,
dicha modulación puede ser un aumento o reducción de la actividad
de la desaturasa.
Estos resultados sugieren que los inhibidores de
la actividad biológica de SCD, tal como hSCD1, en un ser humano,
pueden presentar el efecto beneficioso de reducir los niveles de
triglicéridos y/o aumentar los de HDL. Además, una mayor actividad
de SCD también se asocia con un mayor índice de masa corporal. Este
resultado identifica a hSCD1 como un objetivo útil para identificar
agentes para modular la obesidad y afecciones relacionadas. En
estos resultados de datos humanos, la actividad biológica de SCD se
midió mediante el marcador sustituto de la proporción de ácidos
grasos 18:1 respecto a 18:0 en la fracción de lípidos en plasma
total. Este marcador mide indirectamente la actividad biológica de
hSCD1.
En un aspecto adicional, la presente invención
se refiere a un proceso para determinar la capacidad de un agente
para modular la actividad de una estearoil-CoA
desaturasa humana en células que expresan la
estearoil-CoA desaturasa humana de la invención,
que comprende las etapas de:
- (a)
- poner en contacto al agente en condiciones adecuadas con una célula eucariota que expresa la estearoil-CoA desaturasa humana de la invención a un nivel predeterminado de dicho agente y en condiciones en las que dicho agente puede o no modular el nivel de expresión de dicha desaturasa;
- (b)
- determinar si la actividad de dicha estearoil-CoA desaturasa cambia después de dicho contacto,
determinando de este modo si dicho agente ha
modulado dicho nivel de expresión.
\vskip1.000000\baselineskip
En realizaciones específicas de dichos procesos,
la modulación puede ser un aumento o una reducción de la actividad
de la desaturasa y las células útiles en estos procesos son
preferentemente células de mamífero, de la forma más preferente
células humanas, e incluyen cualquiera de las células recombinantes
descritas en este documento.
En algunas realizaciones, la presente invención
contempla el uso de un gen o proteína de SCD1 en una línea celular
recombinante. Las líneas celulares recombinantes de SCD1 pueden
generarse usando técnicas conocidas en la técnica, y aquellas
mostradas más específicamente a continuación.
La presente invención también se refiere a
vectores que contienen polinucleótidos de la presente invención, y
células huésped que están manipuladas genéticamente con vectores de
la invención, especialmente cuando dichas células dan como
resultado una línea celular que puede usarse para el ensayo de la
actividad de hSCD1, y la producción de polipéptidos de SCD1
mediante técnicas recombinantes.
Las células huésped son preferentemente células
eucariotas, preferentemente células de insecto de la especie
Spodoptera, de la forma más especial células SF9. Las células
huésped se manipulan genéticamente (se transducen o transforman o
transfectan) con los vectores, especialmente baculovirus) de esta
invención que pueden ser, por ejemplo, un vector de clonación o un
vector de expresión. Dichos vectores pueden incluir plásmidos, virus
y similares. Las células huésped manipuladas se cultivan en medios
nutrientes convencionales modificados según sea apropiado para
activar promotores, seleccionar transformantes o amplificar los
genes de la presente invención. Las condiciones de cultivo, tales
como temperatura, pH y similares, son las usadas previamente con la
célula huésped seleccionada para la expresión, y serán evidentes
para el experto en la materia.
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden emplearse para producir polipéptidos mediante técnicas
recombinantes. Por lo tanto, por ejemplo, el polinucleótido puede
estar incluido en uno cualquiera de diversos vectores de expresión
para expresar un polipéptido. Dichos vectores incluyen secuencias
cromosómicas, no cromosómicas y de ADN sintético, por ejemplo
derivados de SV40; plásmidos bacterianos; ADN de fago; baculovirus;
plásmido de levadura; vectores obtenidos de combinaciones de
plásmidos y ADN de fagos, ADN viral tal como de virus vaccinia,
adenovirus, virus de la viruela aviar, y virus pseudorabies. Sin
embargo, puede usarse cualquier otro vector, siempre que sea
replicable y viable en el huésped.
La secuencia de ADN apropiada puede insertarse
en el vector mediante diversos procedimientos. En general, la
secuencia de ADN se inserta en un sitio(s)
apropiado(s) de endonucleasa de restricción mediante
procedimientos conocidos en la técnica. Se considera que dichos
procedimientos y otros están dentro del alcance de los expertos en
la materia.
La secuencia de ADN en el vector de expresión
está unida de forma operativa a una secuencia(s) de control
de la expresión apropiada(s) (promotor) para dirigir la
síntesis de ARNm. Como ejemplos representativos de dichos
promotores, pueden mencionarse: el promotor LTR o SV40, el promotor
de E. coli. lac o trp, el promotor P_{L} de
fago lambda y otros promotores que se sabe que controlan la
expresión de genes en células procariotas o eucariotas o sus virus.
El vector de expresión también contiene un sitio de unión al
ribosoma para el inicio de la traducción y un terminador de la
transcripción. El vector también puede incluir secuencias apropiadas
para amplificar la expresión.
Además, los vectores de expresión contienen
preferentemente uno o más genes marcadores seleccionables para
proporcionar un rasgo fenotípico para la selección de células
huésped transformadas tal como dihidrofolato reductasa o
resistencia a neomicina para el cultivo de células eucariotas, o tal
como resistencia a tetraciclina o ampicilina en E. coli.
El vector que contiene la secuencia de ADN
apropiada como se ha descrito anteriormente en este documento, así
como un promotor o secuencia de control apropiada, puede emplearse
para transformar un huésped apropiado para permitir que el huésped
exprese la proteína. Dicha transformación será permanente y, por lo
tanto, dará origen a una línea celular que puede usarse para
ensayos adicionales. Dichas líneas celulares usadas para ensayar
serán habitualmente células de mamífero, especialmente células
humanas.
Como ejemplos representativos de huéspedes
apropiados, pueden mencionarse células de Spodoptera Sf9 (y
otros sistemas de expresión en insecto) y animales tales como CHO,
COS o melanoma de Bowes; adenovirus; células vegetales, en incluso
células bacterianas, etc., todas las cuales son capaces de expresar
los polinucleótidos descritos en este documento. Se considera que
la selección de un huésped apropiado está dentro del conocimiento
de los expertos en la materia en base a las enseñanzas de este
documento. Para su uso en los métodos de ensayo descritos en este
documento, se prefieren células de mamífero, especialmente células
humanas.
Más particularmente, la presente invención
también incluye construcciones recombinantes que comprenden una o
más de las secuencias como se ha descrito de forma amplia
anteriormente. Las construcciones comprenden un vector, tal como un
plásmido o vector viral, especialmente cuando se usa el sistema de
expresión de Baculovirus/vector SF9, en el que se ha insertado una
secuencia, en una orientación directa o inversa. En un aspecto
preferido de esta realización, la construcción comprende además
secuencias reguladoras, incluyendo, por ejemplo, un promotor, unido
de forma operativa a la secuencia. Gran cantidad de vectores y
promotores adecuados son conocidos por los expertos en la materia,
y están disponibles en el mercado. Los siguientes vectores se
proporcionan a modo de ejemplo; Bacterianos: pQE70, pQE60,
pQE-9 (Qiagen), pBS, pD10, phagescript, psiX174,
pBluescript SK, pBSKS, pNH8A, pNH16a, pNH18A, pNH46A (Stratagene);
pTRC99a, pKK223-3, pKK233-3, pDR540,
pRIT5 (Pharmacia); Eucariotas: pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXT1, pSG
(Stratagene) pSVK3, pBPV, pMSG, pSVL (Pharmacia). Sin embargo,
puede usarse cualquier otro plásmido o vector, siempre que sean
replicables y viables en el huésped.
Pueden seleccionarse regiones promotoras de
cualquier gen deseado usando vectores de CAT (cloranfenicol
transferasa) u otros vectores con marcadores seleccionables. Dos
vectores apropiados son pKK232-8 y pCM7. Los
promotores bacterianos nombrados particulares incluyen lacl, lacZ,
T3, T7, gpt, lambda P_{R}, P_{L} y trp. Los promotores
eucariotas incluyen el inmediato temprano de CMV, HSV timidina
quinasa, temprano y tardío de SV40, secuencias LTR de retrovirus, y
metalotioneína-l de ratón. La selección del vector y
promotor apropiado está dentro del nivel de especialización
habitual en la técnica.
En una realización adicional, la presente
invención se refiere a células huésped que contienen las
construcciones descritas anteriormente. La célula huésped puede ser
una célula eucariota superior, tal como una célula de mamífero, o
una célula eucariota inferior, tal como una célula de levadura, o la
célula huésped puede ser una célula procariota, tal como una célula
bacteriana. La introducción de la construcción en la célula huésped
puede realizarse mediante transfección con fosfato cálcico,
transfección mediada por DEAE-Dextrano, o
electroporación (Davis, L., Dibner, M., Battey, I., Basic Methods
in Molecular Biology, (1986)). Una realización preferida utiliza
expresión a partir de células de insecto, especialmente células SF9
de Spodoptera frugiperda.
Las construcciones en células huésped pueden
usarse de manera convencional para producir el producto génico
codificado por la secuencia recombinante. Como alternativa, los
polipéptidos de la invención pueden producirse sintéticamente
mediante síntesis peptídica convencional.
Las proteínas maduras pueden expresarse en
células de mamífero, levaduras, bacterias u otras células bajo el
control de promotores apropiados. Los sistemas de traducción sin
células también pueden emplearse para producir dichas proteínas
usando ARN obtenidos de las construcciones de ADN de la presente
invención. Vectores de clonación y expresión apropiados para su uso
con huéspedes procariotas y eucariotas son descritos, por ejemplo,
por Sambrook, et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual,
Segunda Edición, Cold Spring Harbor, N. Y., (1989), Wu et
al, Methods in Gene Biotechnology (CRC Press, Nueva York, NY,
1997), Recombinant Gene Expression Protocols, en Methods in
Molecular Biology, Vol. 62, (Tuan, ed., Humana Press, Totowa, NJ,
1997) y Current Protocols in Molecular Biology, (Ausabel et
al, Eds.,), John Wiley & Sons, NY
(1994-1999), cuyas descripciones se incorporan por
la presente como referencia en su totalidad.
La transcripción del ADN que codifica los
polipéptidos de la presente invención por células eucariotas,
especialmente células de mamífero, de la forma más especial células
humanas, aumenta al insertar una secuencia potenciadora en el
vector. Los potenciadores son elementos de ADN que actúan en
posición cis, habitualmente aproximadamente de 10 a 300 pb que
actúan sobre un promotor para aumentar su transcripción. Los
ejemplos incluyen el potenciador de SV40 en el lado tardío del
origen de replicación pb 100 a 270, un potenciador del promotor
temprano de citomegalovirus, el potenciador de polioma en el lado
tardío del origen de replicación, y potenciadores de
adenovirus.
Generalmente, los vectores de expresión
recombinantes incluirán orígenes de replicación y marcadores
seleccionables que permiten la transformación de la célula huésped,
por ejemplo el gen de resistencia a ampicilina de E. coli y
S. cerevisiae, gen Trp1, y un promotor obtenido de un gen
altamente expresado para dirigir la transcripción de una secuencia
estructural cadena abajo. Dichos promotores pueden obtenerse de
operones que codifican enzimas glucolíticas tales como
3-fosfoglicerato quinasa (PGK), factor \alpha,
fosfatasa ácida, o proteínas de choque térmico, entre otras. La
secuencia estructural heteróloga se ensambla en la fase apropiada
con secuencias de inicio y terminación de la traducción, y
preferentemente, una secuencia líder capaz de dirigir la secreción
de proteína traducida en el espacio periplásmico o medio
extracelular. Opcionalmente, la secuencia heteróloga puede
codificar una proteína de fusión que incluye un péptido de
identificación N-terminal o
C-terminal que otorga características deseadas, por
ejemplo, estabilización o purificación simplificada del producto
recombinante expresado.
El uso de un sistema de expresión basado en
Baculovirus es un método preferido y conveniente de formación de
los recombinantes descritos en este documento. Los baculovirus
representan una gran familia de virus de ADN que infectan en su
mayoría a insectos. El prototipo es el virus de poliedrosis nuclear
(AcMNPV) de Autographa californica, que infecta a una serie
de especies de lepidópteros. Una ventaja del sistema de baculovirus
es que los baculovirus recombinantes pueden producirse in
vivo. Después de la cotransfección con un plásmido de
transferencia, la mayor parte de la progenie tiende a ser de tipo
silvestre y gran cantidad del procesamiento posterior implica el
cribado. Para ayudar a identificar las placas, están disponibles
sistemas especiales que utilizan mutantes de deleción. A modo de
ejemplo no limitante, se ha descrito en la bibliografía un derivado
de AcMNPV recombinante (llamado BacPAK6) que incluye sitios diana
para la nucleasa de restricción Bsu36I cadena arriba del gen de
polihedrina (y con el ORF (marco abierto de lectura) 1629)
que codifica un gen de la cápsida (esencial para la viabilidad del
virus). Bsf36I no se corta en ningún otro punto del genoma y la
digestión del BacPAK6 deleciona una porción del ORF 1629, haciendo
de este modo al virus no viable. Por lo tanto, con un protocolo que
implica un sistema como ADN de BacPAK6 cortado con Bsu36I, la mayor
parte de la progenie no es viable de modo que la única progenie
obtenida después de la co-transfección del plásmido
de transferencia y BacPAK6 digerido es la recombinante, dado que el
plásmido de transferencia, que contiene el ADN exógeno, se inserta
en el sitio Bsu36I, haciendo de este modo al recombinante resistente
a la enzima. [véase Kitts y Possee, A method for producing
baculovirus expression vectors at high frequency, BioTechniques, 14,
810-817 (1993). Para procedimientos generales,
véase King y Possee, The Baculovirus Expression System: A Laboratory
Guide, Chapman y Hall, Nueva York (1992) y Recombinant Gene
Expression Protocols, en Methods in Molecular Biology, Vol. 62,
(Tuan, ed., Humana Press, Totowa, NJ, 1997), en el capítulo 19, págs
235-246.
De acuerdo con lo anterior, la presente
invención se refiere además a vectores que comprenden un
polinucleótido de la invención y a células eucariotas recombinantes
que expresan la estearoil-CoA desaturasa de la
presente invención, preferentemente donde dicha célula es una
célula de mamífero, de la forma más preferente una célula
humana.
La presente invención se refiere además a
procesos para usar los polinucleótidos, enzimas y células descritos
en este documento en un proceso para determinar la capacidad de un
agente para modular la expresión de dicha
estearoil-CoA desaturasa humana en células que
expresan dicha estearoil-CoA desaturasa humana de la
invención, que comprende las etapas de:
- (a)
- poner en contacto al agente en condiciones adecuadas con una célula eucariota que expresa la estearoil-CoA desaturasa humana de la invención a un nivel predeterminado de dicho agente;
- (b)
- determinar si el nivel de expresión de dicha estearoil-CoA desaturasa cambia después de dicho contacto,
determinando de este modo si dicho agente ha
modulado dicho nivel de expresión.
\vskip1.000000\baselineskip
Como alternativa, el ensayo de cribado puede
emplear una construcción de vector que comprende la secuencia
promotora de hSCD1 de la SEC ID Nº 3 unida de forma operativa a un
gen informador. Dicho vector puede usarse para estudiar el efecto
de potenciales proteínas reguladoras de la transcripción, y el
efecto de compuestos que modulan el efecto de esas proteínas
reguladoras, sobre la transcripción de SCD1. Un ejemplo de este tipo
de vector es el plásmido pSCD-500 descrito en los
ejemplos a continuación. Las construcciones de gen informador tales
como ésta se usan habitualmente para indicar si un compuesto de
ensayo ha tenido éxito en la activación de la transcripción de
genes bajo el control de un promotor particular.
En realizaciones específicas, la presente
invención contempla un proceso en el que dicha modulación es un
aumento o reducción de dicho nivel de expresión y donde dicha célula
puede ser una célula de mamífero, especialmente una célula humana,
incluyendo cualquiera de las células recombinantes descritas en este
documento. En una realización, el nivel de expresión se determina
determinando el nivel de ARN mensajero producido después del
contacto de dicha célula con dicho agente.
Los factores que pueden modular la expresión
génica incluyen factores de transcripción tales como, aunque sin
limitarse a, receptores X de retinoide (RXR), factores de
transcripción del receptor activado por la proliferación de
peroxisomas (PPAR), las proteínas de unión al elemento de respuesta
a esteroides (SREBP-1 y SREBP-2),
REV-ERB\alpha, ADD-1,
EBP\alpha, proteína de unión a CREB, P300, HNF 4, RAR, LXR, y
ROR\alpha, NF-Y, C/EBPalfa,
PUFA-RE y proteínas y reguladores de la
transcripción relacionados. Los ensayos de cribado diseñados para
evaluar la capacidad de los compuestos de ensayo para modular la
capacidad de estos factores de transcripción para transcribir SCD1
también son contemplados por esta invención.
Los beneficios fisiológicos de un aumento o
reducción de la actividad o expresión de hSCD1 incluyen, aunque sin
limitarse a, menos triglicéridos en plasma y/o más HDL en plasma que
conduce a un beneficio cardioprotector, beneficio terapéutico en
diabetes de tipo II, pérdida de peso, secreciones glandulares
mejoradas, y una menor probabilidad de desarrollar tumores. Por lo
tanto, la determinación de la capacidad de agentes de modular dicha
actividad o expresión produce la oportunidad de descubrir agentes
terapéuticos útiles que producen dichos efectos.
Además, las variaciones de la expresión génica,
función, estabilidad, actividad catalítica y otras características
de hSCD1 pueden deberse a variaciones alélicas en las secuencias de
polinucleótidos que codifican dichas enzimas. Los procesos
descritos de acuerdo con la presente invención pueden usarse, del
mismo modo, para determinar dichos efectos genómicos sobre la
expresión de hSCD1. Usando los procesos de la presente invención,
dichas variaciones pueden determinarse a nivel de polimorfismo de
ADN con el gen y/o secuencias promotoras de hSCD1. Dichos efectos
conducen al esclarecimiento de asociaciones entre dichos
polimorfismos y la predisposición al cáncer, enfermedad
neurológica, enfermedad cutánea, obesidad, diabetes, función inmune
y metabolismo de lípidos mediante análisis genéticos basados en la
población y en la familia.
Finalmente, los expertos en la materia son
capaces de confirmar la relevancia de hSCD1 para la salud humana
mediante analogía con modelos animales. Modelos de enfermedad en
animales bien conocidos pueden usarse para evaluar el efecto de un
modulador de hSCD1 sobre el crecimiento, desarrollo, o proceso de
enfermedad en estos animales. Adicionalmente, los modelos incluyen
animales multicelulares modificados genéticamente, tales como
ratones knock-out o knock-in (como
se detalla en los ejemplos a continuación). En un aspecto general,
la presente invención se refiere a un proceso para identificar un
agente modulador de SCD1, que comprende:
- a)
- poner en contacto en condiciones fisiológicas un agente químico y una molécula que tiene o induce actividad de SCD1;
- b)
- detectar un cambio en la actividad de dicha molécula que tiene o induce actividad de SCD1 después de dicha puesta en contacto;
identificando de este modo un agente modulador
de SCD1.
\vskip1.000000\baselineskip
En realizaciones específicas de la invención,
dicha molécula que tiene o induce actividad de SCD1 es un
polipéptido que tiene dicha actividad, o un polinucleótido que
codifica un polipéptido que tiene dicha actividad, o un polipéptido
que modula la actividad de un polinucleótido que codifica un
polipéptido que tiene dicha actividad.
En realizaciones específicas, dicho cambio de
actividad es un aumento de la actividad o es una reducción de la
actividad.
En procesos in vivo, dicho cambio de
actividad de SCD1 en dicho animal es una reducción de la actividad,
preferentemente donde dicho agente modulador de SCD1 no inhibe
sustancialmente la actividad biológica de una
delta-5 desaturasa, delta-6
desaturasa o ácido graso sintetasa.
En procesos tales como los que se acaban de
describir, el cambio detectado de actividad de SCD1 se detecta
detectando un cambio de cualquiera, algunas o todas de las
siguientes:
- a)
- afinidad de unión al polipéptido de SCD1;
- b)
- actividad de SCD1 desaturasa en microsomas;
- c)
- actividad de SCD1 desaturasa en una célula completa;
- d)
- expresión génica de SCD1; o
- e)
- nivel de proteínas de SCD1.
De acuerdo con lo anterior, la presente
invención también utiliza una línea celular recombinante que
comprende una proteína de SCD1 recombinante como se describe en
este documento. En una realización semejante, la célula completa de
(c) anteriormente se obtiene de dicha línea celular, preferentemente
en la que dicho agente modulador de SCD1 no inhibe en seres humanos
la actividad biológica de delta-5 desaturasa,
delta-6 desaturasa o ácido graso sintetasa.
Una línea celular recombinante de la invención
también puede comprender la secuencia de ácido nucleico promotora
de SCD1 de la SEC ID Nº 1 unida de forma operativa a una
construcción de gen informador. En una realización específica de la
misma, la célula completa de (c) anteriormente se obtiene de una
célula recombinante de dicha línea celular.
De acuerdo con la descripción de este documento,
la presente invención también utiliza una
estearoil-CoA desaturasa aislada codificada por la
secuencia de polinucleótidos que comprende la SEC ID Nº [ADNc de
SCD1] así como una construcción de gen informador que comprende la
secuencia de ácido nucleico promotora de SCD1 de la SEC ID Nº 1
unida de forma operativa a un gen informador, que incluye
ventajosamente vectores útiles que comprenden dichos ácidos
nucleicos y construcciones de los mismos. Del mismo modo, la
presente invención también contempla un polipéptido aislado que
tiene actividad de estearoil-CoA reductasa y un
proceso como se describe en este documento que identifica con éxito
un agente químico que se une a, o interactúa con, dicho polipéptido,
proceso que comprende:
- a)
- poner en contacto a dicho un polipéptido, o una célula que expresa dicho polipéptido, con un agente químico; y
- b)
- detectar la unión o interacción del agente químico con dicho polipéptido.
En realizaciones específicas de los procesos
recién descritos, la unión del agente químico al polipéptido se
detecta mediante un método seleccionado entre el grupo constituido
por:
- a)
- una detección directa de la unión de agente químico/polipéptido;
- b)
- detección de la unión mediante un ensayo de unión competitiva; y
- c)
- detección de la unión mediante un ensayo de la actividad biológica de SCD1.
En dichos procesos, la modulación de la
actividad de dicho polipéptido se detecta mediante un proceso que
comprende poner en contacto al polipéptido o una célula que expresa
el polipéptido con un compuesto que se une al polipéptido en
cantidad suficiente para modular la actividad del polipéptido. En
realizaciones específicas de este proceso, la molécula que tiene o
induce actividad de SCD1 se selecciona entre el grupo constituido
por un ácido nucleico de SCD1 y/o un polipéptido de SCD1 como se
describe en este documento.
Después de la identificación de agentes químicos
que tienen la actividad moduladora deseada, estos pueden usarse en
un proceso para tratar a un animal, especialmente un ser humano, tal
como un paciente humano, aquejado de una enfermedad o afección
relacionada con los niveles en suero de triglicéridos o VLDL que
comprende inhibir la actividad de SCD1 en dicho ser humano. En una
realización preferida, dicha inhibición de la actividad de SCD1 no
está acompañada por la inhibición de la actividad de
delta-5 desaturasa, delta-6
desaturasa o ácido graso sintetasa. Un paciente humano aquejado de
un trastorno o afección relacionada con los niveles en suero de
triglicéridos o VLDL puede tratarse administrando a dicho paciente
una cantidad terapéuticamente eficaz de un agente cuya actividad
terapéutica se identificó en primer lugar mediante el proceso de la
invención.
De acuerdo con lo anterior, la presente
invención también se refiere a un modulador de la actividad de SCD1
y que es útil en seres humanos para el tratamiento de un trastorno o
afección relacionada con los niveles en suero de triglicéridos o
VLDL, donde dicha actividad se identificó en primer lugar por su
capacidad para modular la actividad de SCD1, especialmente donde
dicha modulación se detectó en primer lugar usando un proceso como
se describe en este documento de acuerdo con la presente invención.
En una realización preferida de la misma, dicho agente de
modulación no inhibe la ácido graso sintetasa,
delta-5 desaturasa o delta-6
desaturasa de seres humanos.
Por lo tanto, la presente invención también se
refiere a un proceso para identificar un agente de modulación de
delta-9 estearoil-CoA desaturasa de
vertebrado, que comprende:
- a)
- poner en contacto en condiciones fisiológicas a un agente químico y una molécula que tiene o induce actividad de delta-9 estearoil-CoA desaturasa de vertebrado;
- b)
- detectar un cambio en la actividad de dicha molécula que tiene o induce actividad de delta-9 estearoil-CoA desaturasa de vertebrado después de dicha puesta en contacto;
identificando de este modo un agente de
modulación de delta-9 estearoil-CoA
desaturasa de vertebrado.
\vskip1.000000\baselineskip
De acuerdo con lo anterior, el agente de
modulación de SCD1 identificado mediante el método de la presente
invención puede usarse en un proceso para tratar a un paciente
humano aquejado de una enfermedad o trastorno relacionado con los
niveles en suero de triglicéridos, VLDL, HDL, LDL, colesterol total,
transporte inverso de colesterol o producción o secreción de las
membranas mucosas, ácidos grasos monoinsaturados, ésteres de cera,
y parámetros similares, que comprende administrar a dicho paciente
humano una cantidad eficaz terapéutica de un agente para el que
dicha actividad terapéutica se identificó mediante un proceso como
se describe en este documento de acuerdo con la invención.
En una realización preferida de dichos procesos,
el agente de modulación no inhibe sustancialmente la ácido graso
sintetasa, delta-5 desaturasa o
delta-6 desaturasa de seres humanos.
De acuerdo con lo anterior, la presente
invención también se refiere a agentes terapéuticos y/o de
diagnóstico, independientemente del tamaño o peso, eficaz para
tratar y/o diagnosticar y/o prevenir cualquiera de las enfermedades
descritas en este documento, preferentemente donde dichos agentes
tienen la capacidad de modular la actividad y/o expresión de la
hSCD1 descrita en este documento, y de la forma más preferente donde
se ha determinado que dichos agentes tiene dicha actividad,
mediante al menos uno de los ensayos de cribado descritos de acuerdo
con la presente invención.
Los compuestos de ensayo se compilan
generalmente en bibliotecas de dichos compuestos, y un objeto clave
de los ensayos de cribado de la invención es seleccionar qué
compuestos son relevantes a partir de bibliotecas que tienen
cientos de miles, o millones de compuestos que tienen eficacia
terapéutica desconocida.
Los expertos en el campo del descubrimiento y
desarrollo de fármacos entenderán que la fuente precisa de extractos
o compuestos de ensayo no es crítica para el(los)
procedimiento(s) de cribado de la invención. Por
consiguiente, puede cribarse virtualmente cualquier número de
extractos o compuestos químicos usando los métodos ejemplares
descritos en este documento. Los ejemplos de dichos extractos o
compuestos incluyen, aunque sin limitarse a, extractos a base de
plantas, hongos, procariotas o animales, caldos de fermentación, y
compuestos sintéticos, así como la modificación de compuestos
existentes. También están disponibles muchos métodos para generar
síntesis aleatoria o dirigida (por ejemplo
semi-síntesis o síntesis total) de cualquier número
de compuestos químicos, incluyendo, aunque sin limitarse a,
compuestos a base de sacáridos, lípidos, péptidos y ácidos
nucleicos. Hay bibliotecas de compuestos sintéticos disponibles en
el mercado de Brandon Associates (Merrimack, NH) y Aldrich Chemical
(Milwaukee, WI). Como alternativa, hay bibliotecas de compuestos
naturales en forma de extractos bacterianos, fúngicos, vegetales y
animales disponibles en el mercado de una serie de fuentes,
incluyendo Biotics (Sussex, UK), Xenova (Slough, UK), Harbor Branch
Oceangraphics Institute (Ft. Pierce, FL), y PharmaMar, EE.UU.
(Cambridge, MA). Además, se producen bibliotecas producidas de forma
natural y sintética, si se desea, de acuerdo con métodos conocidos
en la técnica, por ejemplo mediante métodos de extracción y
fraccionamiento convencionales. Además, si se desea, cualquier
biblioteca o compuesto se modifica fácilmente usando métodos
químicos, físicos o bioquímicos convencionales.
Por lo tanto, en un aspecto la presente
invención se refiere a agentes capaces de modular la actividad y/o
expresión de estearoil-CoA desaturasa humana 1
(hSCD1) como se describe en este documento, especialmente donde
dicha actividad de modulación se determinó en primer lugar usando un
ensayo que comprende hSCD1 o un gen que codifica hSCD1, o un ensayo
que mide la actividad de hSCD1. Como se usa en este documento, la
expresión "capaz de modular" se refiere a la característica de
dicho agente por la cual dicho agente tiene el efecto de cambiar la
actividad biológica global de hSCD1, aumentando o reduciendo dicha
actividad, en condiciones adecuadas de temperatura, presión, pH y
similares para facilitar dicha modulación hasta un punto en que
puede ser detectada cualitativa o cuantitativamente y donde dicha
modulación puede ocurrir en un entorno in vitro o in
vivo. Además, aunque el término "modulación" se usan en
este documento para indicar un cambio de actividad, más
específicamente un aumento o una reducción de dicha actividad, el
término "actividad" no debe limitarse a actividad enzimática
específica en solitario (por ejemplo, según se mide en unidades por
miligramo o alguna otra unidad adecuada de actividad específica)
sino que incluye otros efectos directos e indirectos de la proteína,
incluyendo aumentos de la actividad enzimática debidos no a cambios
de la actividad enzimática específica sino debidos a cambios (es
decir, modulación) de la expresión de polinucleótidos que codifican
y expresan dicha enzima hSCD1. La actividad de SCD1 humana también
puede estar influida por agentes que se unen específicamente a
sustratos de hSCD1. Por lo tanto, el término "modulación" como
se usa en este documento significa un cambio de la actividad de
hSCD1 independientemente del nivel genético molecular de dicha
modulación, sea éste un efecto de la enzima per se o un
efecto de los genes que codifican la enzima o sobre el ARN,
especialmente ARNm, implicado en la expresión de los genes que
codifican dicha enzima. Por lo tanto, la modulación por dichos
agentes puede producirse a nivel del ADN, ARN o proteína enzimática
y puede determinarse in vivo o ex vivo.
\newpage
En realizaciones específicas del mismo, dicho
ensayo es cualquiera de los ensayos descritos en este documento de
acuerdo con la invención. Además, el(los) agente(s)
contemplado(s) por la presente descripción incluyen agentes
de cualquier tamaño o carácter químico, moléculas grandes o
pequeñas, incluyendo proteínas, tales como anticuerpos, ácidos
nucleicos, ARN o ADN, y pequeñas estructuras químicas, tales como
pequeñas moléculas orgánicas.
En otros aspectos, la presente invención
contempla agentes en los que dicho agente es útil para tratar,
prevenir y/o diagnosticar una enfermedad o afección que se
identifica como relacionada con SCD1 de acuerdo con esta invención.
Realizaciones específicas se refieren a situaciones en las que la
enfermedad o afección incluye, aunque sin limitarse a, niveles en
suero de triglicéridos, VLDL, HDL, LDL, colesterol total, transporte
inverso de colesterol o producción de secreciones de membranas
mucosas, ácidos grasos monoinsaturados, ésteres de cera, y
similares, trastornos de colesterol, lipidemias, enfermedad
cardiovascular, diabetes, obesidad, calvicie, enfermedades
cutáneas, cáncer y esclerosis múltiple, especialmente donde la
enfermedad es una enfermedad cardiovascular o una enfermedad
cutánea o donde la afección es calvicie. En una realización
preferida, dichos agentes aumentarán los niveles de HDL en un
paciente y/o reducirán los niveles de triglicéridos en un paciente.
Cualquiera o ambos efectos están asociados directamente con un
riesgo reducido de enfermedad cardiovascular y enfermedad de
arteria coronaria.
Algunos de los moduladores conocidos de la
actividad de SCD1 incluyen ácido linoleico conjugado, especialmente
el isómero trans-10, cis-12, y
compuestos de tiazoladindiona tales como troglitazona.
Aunque está previsto que pueda usarse cualquier
mecanismo adecuado para la inhibición o modulación de la actividad
de SCD1, se prevén tres ejemplos específicos de clases de
inhibidores. Una clase incluye aquellos inhibidores que inhiben
eficazmente la expresión de SCD1, tal como compuestos de
tiazoladindiona y ácidos grasos poliinsaturados. Una segunda clase
incluye aquellos inhibidores que inhiben eficazmente la actividad
enzimática de SCD1, tal como tia-ácidos grasos, ácidos grasos
ciclopropenoides, y algunos isómeros de ácido linoleico conjugado.
Finalmente, la tercera clase de inhibidores incluye aquellos
agentes que son capaces de interferir en las proteínas esenciales
para el sistema de desaturasa, tales como aquellos agentes que
interfieren con citocromo b_{5}, NADH
(P)-citocromo b_{5} reductasa, y desaturasa
terminal sensible a cianuro.
Para inhibir eficazmente la expresión del gen de
SCD1, se prevé que podría utilizarse cualquier agente capaz de
alterar la transcripción del gen de SCD1. Dado que SCD1 está
regulada por varios factores de transcripción conocidos (por
ejemplo PPAR-\gamma, SREBP), puede usarse
cualquier agente que afecte a la actividad de dichos factores de
transcripción para alterar la expresión del gen de SCD1. Un grupo de
dichos agentes incluye compuestos de tiazoladina que se sabe que
activan PPAR-\gamma e inhiben la transcripción de
SCD1. Estos compuestos incluyen Pioglitazona, Ciglitazona,
Englitazona, Troglitazona, y BRL49653. Otros agentes inhibidores
pueden incluir ácidos grasos poliinsaturados, tales como ácido
linoleico, ácido araquidónico y ácido dodecahexanoico, que también
inhiben la transcripción de SCD1.
Para inhibir eficazmente la actividad enzimática
de la proteína SCD1, está previsto que podría utilizarse cualquier
agente capaz de alterar la actividad de la proteína SCD1. Por
ejemplo, algunos isómeros de ácido linoleico conjugado son
inhibidores eficaces de la actividad de SCD1. Específicamente, se
sabe que el ácido linoleico conjugado Cis-12,
trans-10 inhibe eficazmente la actividad enzimática
de SCD y reduce la abundancia de ARNm de SCD1, mientras que el
ácido linoleico conjugado Cis-9,
trans-11 no. También se sabe que los ácidos grasos
ciclopropenoides, tales como los descubiertos en semillas de
esterculia y algodón, inhiben la actividad de SCD. Por ejemplo, el
ácido estercúlico (ácido
8-(2-octil-ciclopropenil)octanoico)
y el ácido malválico (ácido
7-(2-octil-ciclopropenil)heptanoico)
son derivados de C18 y C16 de ácidos grasos eterculoil y malvaloil,
respectivamente, que tienen anillos de ciclopropeno en sus posición
\Delta9. Estos agentes inhiben la actividad de SCD inhibiendo la
desaturación de \Delta9. Otros agentes incluyen tia-ácido grasos,
tales como ácido 9-tiaesteárico (también llamado
ácido 8-noniltiooctanoico) y otros ácidos grasos con
un resto sulfoxi.
Los moduladores conocidos de la actividad
delta-9 desaturasa o no se sabe que sean útiles para
tratar las enfermedades y trastornos vinculados a la actividad
biológica de SCD1 como se reivindica en esta invención, o son por
otra causa agentes terapéuticos insatisfactorios. Los tia-ácidos
grasos, ácidos linoleicos conjugados y ácidos grasos de
ciclopropeno (ácido malválico y ácido estercúlico) no son útiles a
dosis fisiológicas razonables, ni son inhibidores específicos de la
actividad biológica de SCD1, en su lugar demuestran inhibición
cruzada de otras desaturasas, en particular las desaturasas
delta-5 y delta-6 mediante los
ácidos grasos de ciclopropeno. Estos compuestos pueden ser útiles
para establecer moduladores de control o prueba de los ensayos de
cribado de la invención, pero no están sometidos a las
reivindicaciones de esta invención. Los moduladores de SCD1
preferidos de la invención no tienen ningún impacto significativo o
sustancial sobre clases no relacionadas de proteínas. En algunos
casos, ensayos específicos para otras proteínas, tales como
actividad de delta-5 y delta-6,
también deberán ensayarse para asegurar que los compuestos
identificados de la invención no demuestran inhibición cruzada
significativa o sustancial.
Los inhibidores no específicos conocidos de SCD1
pueden ser útiles en el diseño racional de un agente terapéutico
adecuado para la inhibición de SCD1. Los tres inhibidores tienen
diversas sustituciones entre los carbonos Nº 9 y Nº 10;
adicionalmente requieren la conjugación a Co-A para
ser eficaces; y están situados probablemente en un sitio activo
relativamente hidrófobo. Esta información combinada con las
coordenadas de rayos X conocidas para el sitio activo de SCD de
vegetales (soluble) puede ayudar al proceso "simulado por
ordenador" del diseño racional de fármacos para inhibidores
terapéuticamente aceptables específicos para SCD1.
\newpage
Esta invención también proporciona un anticuerpo
que se une específicamente a SCD1 humana que tiene la secuencia de
aminoácidos mostrada en los números de entrada de SwissProt
enumerados anteriormente, y que, de este modo, inhibe la actividad
de SCD1. El presente anticuerpo puede ser un anticuerpo policlonal,
un anticuerpo monoclonal, o un fragmento de unión a SCD de los
mismos. En una realización, el anticuerpo está aislado, es decir es
un anticuerpo libre de cualesquiera otros anticuerpos. Los métodos
para preparar y aislar anticuerpos se conocen bien en la técnica
(Harlow, et al. 1988. Antibodies: A Laboratory Manual; Cold
Spring Harbor, NY, Cold Spring Harbor
Laboratory).
Laboratory).
Esta invención también proporciona un
oligonucleótido antisentido que se une específicamente a ARNm de
SCD1 humana, y que, de este modo, reduce el nivel de transcripción
génica de SCD1. Los métodos para preparar y usar moléculas
antisentido contra genes diana conocidos se conocen en la técnica
(Agarwal, S. (1996) Antisense Therapeutics. Totowa, NJ, Humana
Press, Inc.)
Típicamente, un ensayo de cribado, tal como un
ensayo de cribado de alto rendimiento, identificará varios o
incluso muchos compuestos que modulan la actividad de la proteína de
ensayo. El compuesto identificado por el ensayo de cribado puede
modificarse adicionalmente antes de usarlo en seres humanos como
agente terapéutico. Típicamente, se realiza química combinatoria
sobre el modulador, para identificar posibles variantes que tengan
absorción, biodistribución, metabolismo y/o excreción mejoradas, u
otros aspectos terapéuticos importantes. Lo invariable y esencial
es que los compuestos mejorados comparten un grupo o grupos activos
particulares que son necesarios para la modulación deseada de la
proteína diana. Muchas técnicas de química combinatoria y química
medicinal se conocen bien en la técnica. Cada una añade o retira uno
o más restos constituyentes del compuesto para generar un análogo
modificado, análogo que se somete a ensayo de nuevo para identificar
compuestos de la invención. Por lo tanto, como se usa esta
invención, los compuestos terapéuticos identificados usando un
ensayo de barrido de SCD1 de la invención incluyen compuestos reales
identificados de este modo, y cualesquiera análogos y
modificaciones realizadas a un compuesto que se haya identificado de
este modo que sean útiles para el tratamiento de los trastornos
reivindicados en este documento.
En otro aspecto, la presente invención se
refiere a composiciones que comprenden los polinucleótidos,
polipéptidos u otros agentes químicos, incluyendo agentes
terapéuticos, profilácticos o de diagnóstico, tales como pequeñas
moléculas orgánicas, descritas en este documento de acuerdo con la
presente invención donde dichos polinucleótidos, polipéptidos u
otros agentes se suspenden en un vehículo farmacéuticamente
aceptable, vehículo que incluye cualquier diluyente o excipiente
farmacológicamente aceptable. Los vehículos farmacéuticamente
aceptables incluyen, aunque sin limitarse a, líquidos tales como
agua, solución salina, glicerol y etanol, y similares, incluyendo
vehículos útiles para formar pulverizadores para administración
nasal y otra administración por el tracto respiratorio o para
administración al sistema oftálmico. Una exhaustiva discusión de
vehículos, diluyentes y otros excipientes farmacéuticamente
aceptables se presenta en el documento REMINGTON'S PHARMACEUTICAL
SCIENCES (Mack Pub. Co., N. J. última edición).
Los inhibidores utilizados anteriormente pueden
suministrarse a un sujeto usando cualquiera de los sistemas de
administración utilizados habitualmente conocidos en la técnica,
según sea apropiado para el inhibidor seleccionado. Los sistemas de
administración preferidos incluyen inyección intravenosa o
administración oral, dependiendo de la capacidad del inhibidor
seleccionado de ser absorbido en el tracto digestivo. También puede
usarse cualquier otro sistema de administración apropiado para la
administración de pequeñas moléculas, tales como parches cutáneos,
según sea apropiado.
En la realización de los procedimientos de la
presente invención, debe entenderse, por supuesto, que la referencia
a tampones, medios, reactivos, células, condiciones de cultivo
particulares y similares no pretenden ser limitantes, sino que
deben leerse como incluyentes de todos los materiales relacionados
que un experto en la materia reconocería como de interés o valor en
el contexto particular en el que se presenta esa discusión. Por
ejemplo, a menudo es posible sustituir un sistema tampón o medio de
cultivo por otro y seguir obteniendo resultados similares, si no
idénticos. Los expertos en la materia tendrán suficiente
conocimiento de dichos sistemas y metodologías para ser capaces,
sin excesiva experimentación, de realizar dichas sustituciones para
que sirvan de forma óptima a sus propósitos para usar los métodos y
procedimientos descritos en este documento.
Al aplicar la descripción, debe tenerse muy en
cuenta que otras y diferentes realizaciones de los métodos
descritos de acuerdo con la presente invención sin duda se les
sugerirán por sí mismas a los expertos en la materia.
Este ejemplo identifica, por primera vez,
actividades biológicas de SCD1 específicas en ratón caracterizando
un ratón knock-out para un gen específico de
SCD1.
Para investigar las funciones fisiológicas de
SCD, generamos ratones knock-out para SCD1
(SCD1-/-). El perfil de lipoproteínas de los ratones
knock-out para SCD1 (knock-out)
demuestra una llamativa reducción de los niveles de triglicéridos
(es decir, VLDL) mientras se mantienen niveles de HDL y LDL
aproximadamente normales. Este resultado confirma que una mutación
en SCD1 es una mutación causante de un perfil bajo de triglicéridos
(TG) en ratones, y es distinto de otras isoformas de SCD en el
ratón a este respecto. Debido a la severidad de este fenotipo, está
claro que es improbable que otras isoformas de SCD afecten a los
niveles de TG en una medida tan grande.
La figura 1A muestra la estrategia usada para
hacer knock-out al gen SCD1. El gen SCD1 de
ratón incluye 6 exones. Los 6 primeros exones del gen se
sustituyeron por una casete resistente a neomicina mediante
recombinación homóloga, dando como resultado la sustitución de la
región codificante completa del gen de SCD1 (figura 1A). El vector
se sometió a electroporación en células madre embrionarias y los
clones que integraban la casete neo se seleccionaron mediante
crecimiento en geneticina. Se inyectaron clones ES dirigidos en
blastocistos C57BI/6 produciendo cuatro líneas de ratones
quiméricos que transmitían el alelo alterado a través de la línea
germinal. Los ratones mutantes eran viables y fértiles y se
multiplicaron con las distribuciones mendelianas predichas. Un
cribado basado en PCR para evaluar la fijación como objetivo con
éxito de genes del locus de SCD1 se muestra en la figura 1 B. Para
determinar si la expresión del gen de SCD1 se había suprimido
realizamos análisis de transferencia de Northern (figura 1C) el
ARNm de SCD1 es indetectable en el hígado de ratones SCD1-/- y se
reduce en aproximadamente el 50% en ratones SCD +/-. El ARNm de SCD2
se expresaba a niveles bajos tanto en ratones SCD1-/- como en
ratones de tipo silvestre. De forma coherente con los resultados de
la transferencia de Northern, el análisis de transferencia de
Western no mostró ninguna proteína de SCD inmunorreactiva en el
hígado de ratones SCD-/-, mientras que la proteína de SCD1 era
detectable en el tejido hepático tanto de heterocigotos como de
tipo silvestre de manera dependiente de la dosificación génica. La
actividad enzimática de SCD en el hígado, según se mide mediante la
velocidad de conversión de [1-^{14}C]
estearoil-CoA en [1-^{14}C]
oleato (figura 1E) que era alta en los ratones de tipo silvestre
pero era indetectable en los extractos totales de hígados de los
ratones SCD1-/-.
El análisis del éster de colesterol en el hígado
(0,8 \pm 0,1 frente a 0,3 \pm 0,1 mg/g de hígado) y
triglicéridos en el hígado (12,6 \pm 0,3 frente a 7,5 \pm 0,6
mg/g de hígado) mostraba que los animales KO para SCD1 tienen
menores cantidades tanto de ésteres de colesterol como de
triglicéridos que los controles de tipo silvestre. El análisis de
lipoproteínas en plasma mostraba una reducción de los triglicéridos
en plasma (120,6 \pm 6,8 frente a 45,4 \pm 3,8) en ratones
SCD-/- en comparación con los controles normales. Estos
descubrimientos son similares a los descubrimientos en ratones
Asebia. La figura 2 registra el perfil de lipoproteínas en plasma
obtenido usando cromatografía en fase líquida rápida. Los ratones
Knock-Out para SCD1 mostraban una reducción del 65%
de triglicéridos en la fracción de VLDL; pero poca o ninguna
diferencia significativa en los niveles de LDL o HDL.
Los ratones Asebia se comparan con los ratones
Knock-Out para SCD1 en la figura 2. Los
descubrimientos son marcadamente similares. Las lipoproteínas en
plasma de ratones Asebia se separaron mediante cromatografía en
fase líquida rápida y se muestra la distribución de triglicéridos
entre las lipoproteínas en las diversas fracciones de densidad de
los ratones (n = 3). La figura 3 muestra un ejemplo adicional de un
perfil de lipoproteínas de ratón Asebia. Estos perfiles mostraban
una diferencia principal en la distribución de triglicéridos en la
fracción de VLDL de los ratones SCD-/- y SCD-/+. Los niveles de
triglicéridos en los SCD-/+ eran de 25 mg/dl en la VLDL, con
niveles muy bajos en las fracciones de LDL y HDL. En contraste, los
SCD-/- tenían niveles muy bajos de triglicéridos en las tres
fracciones de lipoproteínas.
También determinamos los niveles de ácidos
grasos monoinsaturados en diversos tejidos. La Tabla 1 muestra la
composición de ácidos grasos de varios tejidos en ratones de tipo
silvestre y SCD-/-. Las cantidades relativas de palmitoleato
(16:1n-7) en hígado y plasma de ratones SCD-/- se
redujeron en un 55% y un 47% mientras que las de oleato
(18:1n-9) se redujeron en un 35% y un 32%,
respectivamente. La cantidad relativa de palmitoleato en el tejido
adiposo blanco y en la piel de ratones SCD-/- se redujeron en más
del 70%, mientras que la reducción de oleato en estos tejidos era
inferior al 20% aunque la reducción era estadísticamente
significativa. Estos cambios en los niveles de ácidos grasos
monoinsaturados daban como resultado la reducción de los índices de
desaturación indicando reducción de la actividad de desaturasa. En
contraste con estos tejidos, el cerebro, que expresa de forma
predominante la isoforma SCD2, tenía una composición de ácidos
grasos similar y un índice de desaturación inalterado en ratones
tanto de tipo silvestre como SCD-/-. Llegamos a la conclusión de que
SCD1 desempeña un papel principal en la producción de ácidos grasos
monoinsaturados en el hígado.
\newpage
La figura 4 (cuantificada en la Tabla 2)
demuestra que SCD1 es un contribuyente principal a los índices de
desaturación del plasma (proporción en plasma de 18:1/18:0 ó
16:1/16:0 en la fracción de lípidos total), según se considera
mediante el análisis de ácidos grasos en plasma tanto de ratones KO
para SCD1 como de Asebia. En ambos modelos animales, se observa una
reducción de aproximadamente el 50% o más en los índices de
desaturación en plasma. Esto demuestra que el índice de
desaturación en plasma depende en gran medida de la función de
SCD1
El ADN genómico de ratón para el vector de
dirección se clonó a partir de la biblioteca genómica 129/SV. La
construcción de vector de dirección se generó mediante inserción de
un fragmento Xba I/Sac I de 1,8 kb con homología en 3' como brazo
corto y un fragmento Cla I/Hind III de 4,4 kb con homología en 5'
clonado adyacente a la casete de expresión de neo. La construcción
también contiene una casete de HSV timidina quinasa en posición 3'
respecto al brazo de homología de 1,8 kb, permitiendo la selección
positiva/negativa. El vector de dirección se linealizó mediante Not
I y se electroporó en células madre embrionarias. Se realizó la
selección con geneticina y ganciclovir. Los clones resistentes a
geneticina y ganciclovir se analizaron mediante transferencia de
Southern después de la digestión con enzima de restricción EcoRl e
hibridaron con una sonda de 0,4 kb situada cadena debajo de las
secuencias del vector. Para el genotipado por PCR, el ADN se
amplificó con el cebador A
5'-GGGTGAGCATGGTGCTCAGTCCCT-3' | (SEC ID Nº 2) |
que está ubicado en el exón 6,
cebador
B
5'-ATAGCAGGCATGCTGGGGAT-3' | (SEC ID Nº 3) |
que está ubicado en el gen neo
(producto de 425 pb, alelo fijado como objetivo), y cebador
C
5'-CACACCATATCTGTCCCCGACAAATGTC-3' | (SEC ID Nº 4) |
que está ubicado cadena abajo del
gen de dirección (producto de 600 pb, alelo de tipo silvestre). Las
condiciones de PCR eran 35 ciclos, cada uno de 45 segundos a 94ºC,
30 segundos a 62ºC y 1 minuto a 72ºC. Las células fijadas como
objetivo se microinyectaron en blastocistos C57BI/6, y se cruzaron
ratones quiméricos con hembras C57BL/6 o 129/SvEv de Taconic, y
dieron una transmisión de la línea germinal. Los ratones se
mantuvieron en un ciclo de 12 h de oscuridad/luz y se alimentaron
con una dieta a base de pienso normal, una dieta
semi-purificada o una dieta que contenía el 50% (%
de ácidos grasos totales) de trioleno, tripalmitoleina o
trieicosenoina. La dieta semi-purificada se
adquirió de Harlan Teklad (Madison, WI) y contenía: el 20% de
caseína libre de vitaminas, el 5% de aceite de soja, el 0,3% de
L-cistina, el 13,2% de Maltodextrina, el 51,7% de
sacarosa, el 5% de celulosa, el 3,5% de mezcla de minerales
(AIN-93G-MX), el 1,0% de mezcla de
vitaminas (AIN-93-VX), y el 0,3%
bitartrato de colina. La composición de ácidos grasos de las dietas
experimentales se determinó mediante cromatografía de
gas-líquido. La dieta de control contenía el 11% de
ácido palmítico (16:0), el 23% de ácido oleico
(18:1n-9), el 53% de ácido linoleico
(18:2n-6) y el 8% de ácido linolénico
(18:3n-3). La dieta rica en trioleno contenía el 7%
de 16:0, el 50% de 18:1n-9, el 35% de
18:2n-6 y el 5% de
18:3n-3.
Se obtuvo [-^{32}P] dCTP radiactivo (3000
Ci/mmol) de DuPont Corp. (Wilmington, DE). Las placas de
cromatografía en capa fina (TLC Silica Gel G60) eran de (Darmstadt,
Alemania). La
[1-^{14}C]-estearoil-CoA
se adquirió de American Radiolabeled Chemicals, Inc. (St Louis,
MO). Las membranas de transferencia Immobilon-P eran
de Millipore (Danvers, MA). El kit de detección de transferencia de
Western ECL era de Amersham-Pharmacia Biotech, Inc.
(Piscataway, NJ). Todos los demás productos químicos se adquirieron
de Sigma (St Louis, MO).
Los lípidos totales se extrajeron del hígado y
el plasma de acuerdo con el método de Bligh y Dyer (Bligh y Dyer,
1959), y los fosfolípidos, ésteres de cera, colesterol libre,
triglicéridos y ésteres de colesterol se separaron mediante TLC de
alto rendimiento en gel de sílice. Se usó Hexano de petróleo/éter
dietílico/ácido acético (80:30:1) o benceno/hexano (65:35) como
disolvente de desarrollo (Nicolaides y Santos, 1985). Las manchas
se visualizaron mediante 2',7'-diclorofluoresceína
al 0,2% en etanol al 95% o mediante sulfato cúprico al 10% en ácido
fosfórico al 8%. Las manchas de triéster de cera, éster de
colesterol y triglicérido se rasparon, se añadió 1 ml de
HCl-metanol al 5% y se calentó a 100ºC durante 1 h
(Miyazaki et al., 2000). Los ésteres metílicos se analizaron
mediante cromatografía de gas-líquido usando
heptadecanoato de colesterol, triheptadecanoato y ácido
heptadecanoico como patrón interno. Los contenidos de colesterol
libre, éster de colesterol y triglicéridos del párpado y el plasma
se determinaron mediante ensayos enzimáticos (Sigma St Louis, MO y
Wako Chemicals, Japón).
El ARN total se aisló de hígados usando el
método de extracción ácida de
guanidinio-fenol-cloroformo
(Bernlohr et al., 1985). Veinte microgramos de ARN total se
separaron mediante electroforesis en gel de agarosa al
1,0%/formaldehído 2,2 M y se transfirieron a una membrana de nylon.
La membrana se hibridó con sondas de SCD1 y SCD2 marcadas con 32P.
La sonda pAL15 se usó como control para una carga igualitaria
(Miyazaki, M., Kim, Y. C., Gray-Keller, M. P.,
Attie, A. D., y Ntambi, J. M. (2000). La biosíntesis de ésteres de
colesterol y triglicéridos hepáticos está alterada en ratones con
una alteración del gen para estearil CoA desaturasa 1. J Biol Chem
275, 30132-8).
La actividad de estearoil-CoA
desaturasa se midió en microsomas hepáticos esencialmente como
describen Shimomura et al. (Shimomura, I., Shimano, H.,
Korn, B. S., Bashmakov, Y., y Horton, J. D. (1998). Las proteínas de
unión al elemento regulador de esterol nuclear activan a genes
responsables de todo el programa de biosíntesis de ácidos grasos
insaturados en el hígado de ratón transgénico. J Biol Chem 273,
35299-306.). Los tejidos se homogeneizaron en 10
volúmenes de tampón A (tampón potasio 0,1 M, pH 7,4). Las fracciones
de la membrana microsómica (sedimento de 100.000 x g) se aislaron
mediante centrifugado secuencial. Las reacciones se realizaron a
37ºC durante 5 minutos con 100 \mug de homogenado de proteínas y
60 \muM de
[1-^{14}C]-estearoil-CoA
(60.000 dpm), 2 mM de NADH, 0,1 M de tampón Tris/HCl (pH 7,2).
Después de la reacción, se extrajeron los ácidos grasos y a
continuación se metilaron con cloruro acético/metanol al 10%. Los
ésteres metílicos de ácidos grasos saturados y ácidos grasos
monoinsaturados se separaron mediante TLC impregnada con AgNO_{3}
al 10% usando hexano/éter dietílico (9:1) como solución de
desarrollo. Las placas se pulverizaron con
2',7'-diclorofluoresceína al 0,2% en etanol al 95%
y los lípidos se identificaron en luz UV. Las fracciones se
retiraron raspando de la placa, y la radiactividad se midió usando
un contador de centelleo líquido. La actividad enzimática se expresó
como nmoles min^{-1} mg^{-1} de proteína.
Se prepararon membranas hepáticas reunidas de 3
ratones de cada grupo como se describe por Heinemann et al
(Heinemann y Ozols, 1998). La misma cantidad de proteína (25 \mug)
de cada fracción se sometió a electroforesis en gel de
SDS-poliacrilamida al 10% y se transfirió a
membranas de transferencia Immobilon-P a 4ºC.
Después del bloqueo con leche desnatada al 10% en tampón TBS (pH
8,0) más Tween a 4ºC durante una noche, la membrana se lavó y se
incubó con SCD de conejo anti-rata como anticuerpo
primario y conjugado de IgG-HRP de cabra
anti-conejo como anticuerpo secundario. La
visualización de la proteína de SCD se realizó con el kit de
detección de transferencia de Western ECL.
Los tejidos se fijaron con formalina tamponada
neutra, se incluyeron en parafina, se seccionaron y se tiñeron con
hematoxilina y eosina.
Este trabajo estaba apoyado por una subvención
de la American Heart Association-Wisconsin
affiliate y en parte por la subvención nº
DAMD17-99-9451 de DOD.
Ratones Asebia homocigotos (ab J/ab J o -/-) y
heterocigotos (+/ab J o +/-) se obtuvieron del laboratorio Jackson
Laboratory (Bar Harbor, ME) y se criaron en las instalaciones
University of Wisconsin Animal Care Facility. En este
estudio, se realizan comparaciones entre los ratones homocigotos
(-/-) y heterocigotos (+/-), dado que estos últimos son
indistinguibles de los ratones normales. Los ratones se alojaron en
una instalación barrera libre de patógenos que funcionaba con un
ciclo de 12 h de luz/12 h de oscuridad. A las 3 semanas de edad,
estos ratones se alimentaron ad libitum durante 2 semanas o 2
meses, con una dieta de pienso de laboratorio o con una dieta
semi-purificada que contenía el 50% (% de ácidos
grasos totales) de trioleno o tripalmitoleina. La dieta
semipurificada se adquirió de Harlan Teklad (Madison, WI) y
contenía: el 18% de caseína libre de vitaminas, el 5% de aceite de
soja, el 33,55% de almidón de maíz, el 33,55% de sacarosa, el 5% de
celulosa, el 0,3% de L metionina, el 0,1% de cloruro de colina,
mezcla de sales (AIN-76A) y mezcla de vitaminas
(AIN-76A). La composición ácidos grasos de las
dietas experimentales se determinó mediante cromatografía de
gas-líquido. La dieta de control contenía el 11% de
palmítico (16:0), el 23% de ácido oleico (18:1n-9),
el 53% de ácido linoleico (18:2n-6) y el 8% de ácido
linoleico (18:3n-3). La dieta rica en trioleno
contenía el 7% de 16:0, el 50% de 18:1n-9, el 35% de
18:2n-6 y el 5% de 18:3n-3. La dieta
rica en tripalmitoleína contenía el 6% de 16:0, el 49% de ácido
palmitoleico (16:1n-7), el 12% de
18:1n-9, el 27% de 18:2n-6 y el 4%
de 18:3n-3.
Los animales se anestesiaron a aproximadamente
las 10:00 a.m. mediante inyección intraperitoneal de pentobarbital
sódico (0,08 mg/g de peso corporal) Nembutal, Abbot, North Chicago,
IL). El hígado se aisló inmediatamente, se pesó, y se guardó en
nitrógeno líquido. Se obtuvieron muestras de sangre de la vena
abdominal.
[\alpha-^{32}P] dCTP
radiactivo (3000 Ci/mmol) se obtuvo de Dupont Corp. (Wilmington,
DE). Las placas de cromatografía en capa fina (TLC Silica Gel G60)
fueron de Merck (Darmstadt, Alemania).
[1-^{14}C]-estearoil-CoA,
[^{3}H] colesterol y [1-^{14}C]
oleoil-CoA se adquirieron de American Radiolabeled
Chemicals, Inc. (St Louis, MO). Las membranas de transferencia
Immobilon-P eran de Millipore (Danvers, MA). El kit
de detección de transferencia de Western ECL era de
Amersham-Pharmacia Biotech, Inc. (Piscataway, NJ).
El reactivo de transfección LT-1 era de PanVera
(Madison, WI). Todos los demás productos químicos se adquirieron de
Sigma (St Louis, MO). El anticuerpo para microsoma hepático de rata
de SCD fue suministrado por el Dr. Juris Ozols en el centro
University of Connecticut Health Center. El vector de
expresión de pcDNA3-1, SCD1 fue proporcionado por
el Dr. Trabis Knight de la Iowa state university.
Los lípidos totales se extrajeron del hígado y
el plasma de acuerdo con el método de Bligh y Dyer (Bligh, E. G., y
Dyer, W. J. (1959) Can J Biochem Physiol 37,
911-917.), y los fosfolípidos, colesterol libre,
triglicéridos y ésteres de colesterol se separaron mediante TLC en
gel de sílice. Se usó éter de petróleo/éter dietílico/ácido acético
(80:30:1) como disolvente de desarrollo. Las manchas se visualizaron
mediante 2',7'-diclorofluoresceína al 0,2% en
etanol al 95% o mediante sulfato cúprico al 10% en ácido fosfórico
al 8%. Las manchas de fosfolípidos, éster de colesterol y
triglicérido se rasparon, se añadió 1 ml de
HCl-metanol al 5% y se calentó a 100ºC durante 1 h.
los ésteres metílicos se analizaron mediante cromatografía de
gas-líquido usando heptadecanoato de colesterol
como patrón interno (Lee, K. N., Pariza, M. W., y Ntambi, J. M.
(1998) Biochem. Biophys. Res. Commun. 248, 817-821;
Miyazaki, M., Huang, M. Z., Takemura, N., Watanabe, S., y Okuyama,
H. (1998) Lipids 33, 655-61). Los contenidos de
colesterol libre, éster de colesterol y triglicéridos del hígado y
el plasma se determinaron mediante ensayos enzimáticos (Sigma St
Louis, MO y Wako Chemicals, Japón).
Los ratones se mantuvieron en ayunas un mínimo
de 4 horas y se sacrificaron mediante asfixia con CO2 y/o
dislocación cervical. Se recogió sangre de forma aséptica mediante
punción cardiaca directa y se centrifugó (13.000 x g, 5 minutos,
4ºC) para recoger el plasma. Las lipoproteínas se fraccionaron en
una columna de FPLC Superose 6HR 10/30 (Pharmacia). Las muestras de
plasma se diluyeron a 1:1 con PBS, se filtraron (filtro de jeringa
Cameo 3AS, 0,22 \mum) y se inyectaron en la columna que se había
equilibrado con PBS que contenía EDTA 1 mM y NaN3 al 0,02%. El
equivalente de 100 \mul de plasma se inyectó en la columna. El
caudal se ajustó para hacerlo constante a 0,3 ml/min. Se recogieron
fracciones de 500 \mul y se usaron para las mediciones de
triglicéridos totales (Sigma). Los valores presentados son para la
masa de triglicéridos total por fracción. Las identidades de las
lipoproteínas se han confirmado utilizando inmunorreactividad
anti-ApoB para LDL e inmunorreactividad
Anti-Apo A1 para HDL (no se muestra).
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo demuestra, por primera vez, que la
actividad de delta-9 desaturasa en seres humanos se
correlaciona directamente con los niveles en suero de triglicéridos
(VLDL) e inversamente con el nivel de HDL en suero y el colesterol
total en suero.
El plasma de un total de 97 individuos se
analizó en busca del contenido de ácidos grasos mediante
cromatografía de gases (GC). El contenido de ácidos grasos libres
(FFA) total se midió y las proporciones de oleato con respecto a
estearato (18:1/18:0) y palmitoleato con respecto a palmitato
(16:1/16:0) se computaron, definidas como los índices de
desaturación, como anteriormente. Buscábamos descubrir una relación
entre estas proporciones y tres indicadores clínicos; niveles de TG
(triglicéridos) en plasma, niveles de HDL (lipoproteína de alta
densidad) en plasma, y colesterol total en plasma.
La muestra del paciente se seleccionó para
maximizar la diversidad fenotípica en términos de HDL. Dentro de
nuestra cohorte, 21 individuos mostraban un fenotipo alto en HDL
(> 90º percentil para edad y sexo), 12 individuos mostraban un
fenotipo bajo en HDL de etiología desconocida (< 5º percentil
para edad y sexo), mientras que seis mostraban un fenotipo bajo en
HDL debido a mutaciones en el gen ABCA1. 33 individuos estaban
dentro de parámetros para HDL normales (< 90º y > 5º percentil
para edad y sexo).
También intentamos diversificar nuestra muestra
en términos de niveles de TG, incluyendo 9 individuos con
Hiperlipidemia Combinada Familiar (FCHL) que tienen alto nivel de TG
y/o colesterol así como 16 individuos de control adicionales con
niveles de TG normales.
En algunos casos, se ensayaron múltiples
individuos de la misma familia. Cinco de los seis individuos con
una mutación en ABCA1 forman parte de la misma familia
(NL-020). También se ensayaron múltiples individuos
de otros árboles genealógicos que segregaban un fenotipo bajo en HDL
que no está vinculado genéticamente a ABCA1. En esta categoría, se
ensayaron dos individuos afectados de NL-008,
mientras que se ensayaron cuatro individuos afectados de
NL-001. Los seis individuos restantes con un
fenotipo bajo en HDL no están relacionados entre sí, y se
seleccionaron de distintos árboles genealógicos. De esos individuos
con alto HDL, siete de ellos no estaban relacionados entre sí. Aún
no está claro si el alto HDL observado en estos individuos tiene
una base genética clara en los miembros de la familia. Los 14
individuos restantes con un fenotipo alto en HDL, seis de los
cuales son de la familia HA-1 y ocho de una familia
distinta, HA-3. También se ensayaron individuos no
afectados relacionados con esos, tanto con HDL bajo como alto.
Nuestra cohorte muestra una amplia variación en
los niveles de TG y HDL. En general, los individuos con bajo HDL
tienen altos niveles de TG y aquellos con altos niveles de TG
tienden a tener bajos niveles de HDL. Esta relación entre TG y HDL
se ha observado anteriormente en la bibliografía (Davis et
al., 1980).
El análisis de los ésteres de ácidos grasos se
determinó de la siguiente manera. Las células de muestras del
paciente se lavaron dos veces con solución salina tamponada con
fosfato fría y los lípidos celulares totales se extrajeron tres
veces con CHCl3/MeOH (2:1 v/v). Las tres extracciones de lípidos se
combinaron en un tubo de vidrio con tapón de rosca, se secaron en
gas N2 a 40ºC en un bloque calentador, y se resuspendieron en
tolueno. Se produjeron ésteres metílicos de ácidos grasos a partir
de BCl3/MeOH (Alltech, Deerfield IL), se extrajeron con hexano, se
secaron y se resuspendieron en hexano. Los ésteres metílicos de
ácidos grasos se identificaron usando un cromatógrafo de gases
Hewlett-Packard 6890 equipado con un
auto-inyector 7683 y una columna
HP-5 (30 m' 0,25 mm, 0,25 \mum de grosor de
película) conectado a un detector de ionización de llama ajustado a
275ºC. El inyector se mantuvo a 250ºC. La temperatura de la columna
se mantuvo a 180ºC durante 2 minutos después de la inyección, se
elevó a 200ºC a 8ºC/min, se mantuvo a 200ºC durante 15 minutos, y a
continuación se elevó a 250ºC a 8ºC/min. En estas condiciones, los
ésteres metílicos ?9? 16:1?, 16:0?, ?9?18:1 y 18:0 se eluyeron a
9,2 minutos, 9,7 minutos, 15,3 minutos, y 16,4 minutos,
respectivamente. Véase Lee et al. (1998). Biochem. Biophys.
Res. Commun. 248: 817-821; Miyazaki et al.
(1998) Lipids 33: 655-661; y Miyazaki M, Kim YC,
Gray-Keller MP, Attie AD, Ntambi JM. 2000. J Biol
Chem. 275 (39): 30132-8.
El análisis de regresión lineal se realizó
usando todo el conjunto de datos en ser humano. La proporción de
18:1/18:0 mostraba una relación significativa con los niveles de TG
(r^{2} = 0,39, p < 0,0001) (figura 5a), así como correlaciones
significativas con los niveles de HDL (r^{2} = 0,12, p = 0,0006)
(figura 5b).
La proporción en plasma de ácido grasos de
16:1/16:0 se midió de manera similar, aunque los resultados no eran
tan llamativos. Se observó una relación débil entre el nivel
relativo de 16:1/16:0 respecto a los niveles de TG en plasma
(r^{2} = 0,05, p = 0,03) (figura 6), mientras que la relación
entre la proporción de 16:1/16:0 y los niveles de HDL no alcanzó la
significación (no se muestra). Al contrario que la proporción
18:1/18:0, la proporción 16:1/16:0 explicaba una parte de la
varianza en los niveles de colesterol total (r^{2} = 0,06, p =
0,02) (no se muestra).
En conjunto, la proporción 18:1/18:0 suponía el
18% de la varianza del contenido de ácidos grasos en plasma total
(p = 0,005) mientras que la proporción 16:1/16:0 suponía el 8% de la
variación de este valor (p = 0,02), cuando los individuos con FCHL
y sus controles asociados se excluyeron del análisis (no se muestra
en la figura).
Finalmente, para la parte de nuestra muestra
para la cual los valores de Índice de Masa Corporal (IMC) estaban
disponibles, medimos una correlación positiva entre las proporciones
de 18:1/18:0 y el IMC (r^{2} = 0,13, p = 0,00) (no se muestran
los datos).
\newpage
La muestra se estratificó en base a los niveles
de HDL para determinar si la relación entre la actividad de SCD
(según lo medido mediante la proporción 18:1/18:0) y los niveles de
TG era independiente de la causa primaria de la dislipidemia
observada.
Se observó una correlación positiva entre
18:1/18:0 y los TG en personas con alto HDL.
El análisis de aquellos individuos con un
fenotipo alto en HDL (> 90º percentil) demostró una relación
significativa entre la proporción de 18:1/18:0 y los niveles de TG
(r^{2} = 0,40, p < 0,005) (figura 7). La relación entre la
proporción de 18:1/18:0 y los niveles de HDL en este grupo no
alcanzó significación (no se muestran los datos). La proporción de
16:1/16:0 no suponía una proporción significativa de la varianza en
el colesterol total, los niveles de TG o HDL en este subconjunto de
nuestra cohorte.
Para determinar si una relación más fuerte entre
el índice de 18:1/18:0 y los niveles de TG sería evidente en un
trasfondo genéticamente homogéneo, las familias HA-1
y HA-3 se analizaron por separado. Se incluyeron
miembros de las familias tanto afectados como no afectados en el
análisis. En ambas familias, se observó una relación similar entre
18:1/18:0 y los niveles de TG (HA-1: r^{2} = 0,36,
p = 0,005 (figura 8a), HA-3: r^{2} = 0,32, p =
0,009 (no se muestra en la figura)). La fuerza de estas relaciones
era similar a la observada en toda la cohorte. Las proporciones de
18:1/18:0 también se correlacionaban con niveles de HDL en
HA-1, aunque esta relación no alcanzó significación
en HA-3 (HA-1: r^{2} = 0,32, p =
0,009 (figura 8b), HA-3: r^{2} = 0,10, p = 0,22
(no se muestra)).
También se observó una correlación positiva
entre 18:1/18:0 y TG en aquellos con bajo HDL. Cuando todos los
individuos con bajo HDL (< 5º percentil) se analizaron como un
grupo, se observó una relación significativa entre la proporción de
18:1/18:0 y los niveles de TG (r^{2} = 0,49, p = 0,0009) (figura
9). Como se observó en nuestro análisis del subconjunto de
pacientes con alto HDL, la relación entre la proporción de 18:1/18:0
y HDL no alcanzó la significación en el grupo de bajo HDL (no se
muestran los datos). Además, no se observó ningún resultado
significativo cuando la proporción 16:1/16:0 se sometía a regresión
con valores de HDL, TG y colesterol total.
El análisis de la familia
NL-001, que se segregaba en un fenotipo de bajo HDL
de etiología genética desconocida, y la familia
NL-0020, que segregaba una mutación ABCA1, tendía
hacia las relaciones observadas anteriormente entre las
proporciones de ácidos grasos y los parámetros lipídicos cuando se
consideraban individuos afectados en cada familia. Sin embargo,
estos resultados no alcanzaron significación estadística debido al
pequeño número de individuos analizados en cada caso
(NL-001: Figura 10 a, b y NL0020: Figura 11 a, b).
Se observó una tendencia general hacia mayores proporciones de
18:1/18:0 en pacientes de enfermedad de Tangier de mayor edad. Esto
podría ser un efecto independiente de la enfermedad, aunque no se
observó un efecto dependiente de la edad en la proporción de
18:1/18:0 ni en las familias HA-1 y
HA-3 ni en toda la cohorte (no se muestra en la
figura 11).
La figura 12 muestra la relación entre la
proporción de 18:1/18:0 y los niveles de TG (r^{2} = 0,56, p =
0,03) (figura 12a), los niveles de HDL (r^{2} = 0,64, p=0,009)
(figura 12b) y los niveles de colesterol total (r^{2} = 0,50, p =
0,03) en personas con Hiperlipidemia Combinada Familiar (FCHL)
(figura 12c).
Nuestro análisis es la primera demostración en
seres humanos de que la función de SCD, según lo medido mediante
los índices de desaturación de 16:1/16:0 y 18:1/18:0, se
correlaciona positivamente con los niveles de TG en plasma e
inversamente con el HDL en plasma. En gran medida, observamos esta
correlación independientemente de la causa subyacente de hiper o
hipo-trigliceridemia, sugiriendo que la relación
entre la actividad de SCD y los niveles de TG es un efecto
generalizado. Por lo tanto, la inhibición de la actividad de SCD en
seres humanos está vinculada a niveles de TG (o VLDL) en suero
reducidos, niveles de colesterol total reducidos, niveles de HDL
aumentados, y un índice de masa corporal reducido (IMC),
independiente de la causa principal de la elevación de TG. En gran
medida, los inhibidores de SCD1 podrían usarse como terapia de
combinación en pacientes que también están siendo tratados para
FCHL.
En resumen, cuando se toman conjuntamente, los
Ejemplos 1 y 2 establecen por primera vez una correlación positiva
entre la actividad de SCD1 y los niveles de TG en mamíferos, así
como una correlación inversa entre la actividad de SCD1 y HDL en
seres humanos. Nuestro análisis de los ratones Asebia y KO para SCD1
son definitivos en su implicación de SCD1 como el principal
contribuyente al índice de desaturación. Hemos usado este índice
como sustituto para la actividad de SCD1 en nuestros estudios en
seres humanos. Por lo tanto, es probable que los inhibidores de la
función de SCD1 en mamíferos, incluyendo seres humanos, rebajen los
TG y eleven las HDL.
\vskip1.000000\baselineskip
Para confirmar la relación descrita
anteriormente observada en seres humanos entre el índice de
desaturación de 18:1/18:0 y los niveles de TG. También realizamos
análisis de ácidos grasos en plasma en un modelo en ratón de la
enfermedad humana FCHL. En la cepa de ratón hiperlipidémico
("hyplip") los niveles de TG son elevados en
comparación con el tipo silvestre.
\newpage
El ratón hiperlipidémico HcB-19
mostraba un índice de desaturación de 18:1/18:0 elevado. Este modelo
en ratón de hiperlipidemia combinada familiar
(HcB-19) muestra niveles elevados de TG, colesterol,
así como una mayor secreción de VLDL y apoB (Castellani et
al, Mapping a gene for combined hyperlipidaemia in a mutant
mouse strain. Nat Genet; 18 (4): 374-7 (1998).
Los análisis de ácidos grasos en plasma
demostraron que estos animales tienen una proporción de 18:1/18:0
significativamente elevada en comparación con controles no afectados
de la cepa parental (figura 13). Los animales
HcB-19 no mostraron, sin embargo, una elevación
significativa del índice 16:1/16:0 en comparación con los
controles. Por lo tanto, observamos una correlación positiva entre
el índice de desaturación de 18:1/18:0 y los niveles de TG en este
modelo animal de FCHL.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo presenta, por primera vez, la
secuencia completa del promotor genómico de SCD1 humana. Este
promotor es útil en este caso para identificar elementos
reguladores que modulan y controlan la expresión de SCD1 en seres
humanos, e identifica proteínas reguladoras que son dianas adecuadas
para la intervención de moléculas pequeñas para modular la
expresión de SCD1 en seres humanos.
La secuencia promotora de SCD1 humana se muestra
en la SEC ID Nº 1. Esta secuencia no se ha anotado de forma precisa
en el Genbank y se ha presentado como 5'UTR en una serie de
registros.
La figura 14 ilustra la ubicación de secuencias
reguladoras y sitios de unión en la región homóloga del promotor de
SCD1 de ratón y SCD1 humana y las regiones flanqueantes 5'. La
escala superior indica la posición con respecto al sitio de inicio
de la transcripción. Se indican elementos importantes de la
secuencia promotora.
La estructura del promotor de SCD1 humana es
similar a la de la isoforma de SCD1 de ratón y contiene secuencias
reguladoras conservadas para la unión de varios factores de
transcripción, incluyendo la proteína de unión al elemento
regulador de esterol (SREBP), proteína-alfa de unión
al potenciador de CCAAT (C/EBPa) y factor nuclear-1
(NF-1) que han demostrado transactivar la
transcripción del gen de SCD de ratón. El colesterol y los ácidos
grasos poliinsaturados (PUFA) redujeron la actividad de luciferasa
del promotor de SCD cuando se transfectaban transitoriamente en
células HepG2. La reducción de la actividad promotora en la
construcción informadora se correlacionaba con reducciones en los
niveles de ARNm y proteínas de SCD endógena. La
co-transfección transitoria en células HepG2 de la
construcción gen de luciferasa-promotor de SCD
humana junto con el vector de expresión para SREBP mostraba que
SREBP trans-activa al promotor de SCD humana.
Nuestros estudios indican que, al igual que el gen de SCD1 de
ratón, el gen de SCD humano está regulado por ácidos grasos
poliinsaturados y colesterol a nivel de la transcripción génica y
que SREBP desempeña un papel en la activación transcripcional de
este gen.
Una biblioteca genómica de placenta humana en
bacterias-fago I EMBL3 se cribó con un inserto de
Pstl de 2,0 kb del ADNc de pC3 de ratón (Ntambi, J. M., Buhrow, S.
A., Kaestner, K. H., Christy, R. J., Sibley, E., Kelly, T. J. Jr.,
y M. D. Lane. 1988. Differentiation-induced gene
expression in 3T3-L1 preadipocytes: Characterization
of a differentially expressed gene encoding
stearoyl-CoA desaturase. J. Biol. Chem. 263:
17291-17300), como sonda radiactiva y se aislaron
siete placas. Dos de estas placas se purificaron hasta homogeneidad,
el ADN se aisló y se designó HSCD1 y HSCD3. Un cebador de ADN
basado en la secuencia correspondiente al primer exón del ADNc del
gen de estearoil-CoA desaturasa humana publicado
(Zhang, L., G. E. Lan, S. Parimoo, K. Stenn y S. M. Proutey. 1999.
Human stearyl CoA desaturase: alternative transcripts generated from
a single gene by usage of tandem polyadenylation sites. Biochem. J.
340: 255-264) se sintetizó y se usó para secuenciar
los dos clones del fago mediante el método de terminación de la
cadena con un didesoxinucleótido. Se generó una secuencia
preliminar y se diseñaron cebadores cadena arriba
5' NNNNGGTACCTTNNGAAAAGAACAGCGCCC 3' | SEC ID Nº 5 |
y cadena
abajo:
5' NNNNAGATCTGTGCGTGGAGGTCCCCG 3' | SEC ID Nº 6 |
para amplificar aproximadamente 540
bases de la región promotora cadena arriba del sitio de inicio de la
transcripción: Estos cebadores contienen sitios de enzima de
restricción insertados (subrayados), Kpn1 para cadena arriba, y
BglII para cadena abajo, con una región colgante de 4 bases para
permitir la digestión con enzimas de restricción. A continuación se
realizó una PCR en los clones del fago y el fragmento de 500 pb
amplificado se aisló a partir de un gel de agarosa al
1%.
El fragmento amplificado se digirió con Kpn1 y
BglII y a continuación se clonaron en los sitios de Kpn1 y BglII
del vector básico de pGL3 (Promega) que contiene el gen informador
de luciferasa y se transformaron en células de E. coli DH5
competentes. El ADN plasmídico se purificó en columnas Qiagen y se
secuenció mediante el método de terminación de la cadena con un
didesoxinucleótido usando como cebadores correspondientes a
secuencias de ADN en el sitio de clonación múltiple pero flanqueando
el ADN insertado. La construcción génica de
luciferasa-promotor de SCD que se generó se designó
como pSCD-500.
El ARN total se aisló a partir de células HepG2
usando el método de extracción con guanidinio
ácido-fenol-cloroformo. Se
separaron veinte microgramos de ARN total mediante electroforesis en
gel con agarosa al 0,8%/formaldehído 2,2 M y se transfirieron a una
membrana de nylon. La membrana se hibridó con una sonda de ADNc de
SCD humana marcada con ^{32}P generada mediante PCR de la
siguiente manera: la sonda pAL15 se usó como control para una carga
igualitaria.
Se prepararon extractos celulares a partir de
células HepG2 que se habían tratado con los diversos ácidos grasos
o colesterol como se describe por Heinemann et al (17). La
misma cantidad de proteína (60 \mug) de cada fracción se sometió
a electroforesis en gel de SDS al 10%-poliacrilamida y se
transfirieron a membranas de transferencia
Immobilon-P a 4ºC. Después del bloqueo con leche
desnatada al 10% en tampón TBS (pH 8,0) más Tween al 0,5% a 4ºC
durante una noche, la membrana se lavó y se incubó con SCD de conejo
anti-rata como anticuerpo primario (17) y conjugado
IgG-HRP de cabra anti-conejo como
anticuerpo secundario. La visualización de la proteína SCD se
realizó con el kit de detección de transferencia de Western ECL.
Se cultivaron células HepG2, en medio DMEM bajo
en glucosa suplementado con Suero Fetal Bovino al 10% y solución de
Penicilina/estreptomicina al 1% y se mantuvo a 37ºC, CO_{2} al 5%
en una incubadora humidificada. Las células se pasaron a placas de
6 cm para dar el 40-70% de confluencia en
aproximadamente 12-16 horas. Las células se
transfectaron a continuación con 5 \mug de ADN plasmídico por
placa de pSCD-500 o el informador Basic PGL3 así
como el pRL-TK, controles internos (Promega) usando
el reactivo de transfección LT-1 (Pan Vera).
Después de 48 horas, las células se aclararon con PBS y a
continuación se trataron en medio E de Williams, un medio libre de
ácidos grasos, que contiene insulina, dexametasona, y
concentraciones apropiadas de ácidos grasos conjugados a albúmina
según se indica en las figuras y las leyendas. Las células también
se trataron con etanol en solitario (como control) o colesterol (10
\mug/ml) y 25-OH colesterol (11 \mug/ml)
disuelto en etanol. Después de 24 h adicionales, se prepararon
extractos y se ensayó su actividad de luciferasa. Se usaron células
no transfectadas como blanco y se usó luciferasa de Renilla como
control interno. Se ensayaron los extractos celulares en busca de
la presencia de proteínas de acuerdo con Lowry, y todos los
resultados se normalizaron con la concentración de proteínas así
como con recuentos de luciferasa de Renilla. Cada experimento se
repitió al menos tres veces, y todos los datos se expresan como
medias + SEM.
La secuencia de la región promotora amplificada
del gen de SCD1 se muestra en la SEC ID Nº 1.
En comparación con la secuencia promotora de
SCD1 de ratón, se descubrió que varias secuencias reguladoras
funcionales identificadas en el promotor de SCD1 de ratón se
conservan absolutamente a nivel de nucleótidos y también con
respecto a su separación dentro de los promotores proximales de los
dos genes (figura 14). Tanto la homología de TTAATA, como C/EBPa y
NF-1 están en las mismas ubicaciones en los
promotores de SCD1 de ratón y humano. Además cadena arriba el
elemento regulador de esterol (SRE) y los motivos de la secuencia
CCAAT que se descubren en el elemento sensible al ácido graso
poliinsaturado (PUFA-RE) de los promotores SCD1 y
SCD2 de ratón. La separación de estos elementos se conserva en los
tres promotores.
Ensayamos si la expresión génica de SCD humana
también se reprimía mediante colesterol y ácidos grasos
poliinsaturados. Las células HepG2 humanas se cultivaron y a
continuación se trataron con ácido araquidónico 100 \muM, DHA o
10 \mug/ml de colesterol y 1 \mug/ml de
25-hidroxicolesterol colesterol como hemos descrito
anteriormente. El ARNm total se aisló y se sometió a análisis de
transferencia de Northern usando una sonda correspondiente al ADNc
humano y generada mediante el método de PCR usando cebadores basados
en la secuencia publicada de ADNc de SCD humana. La figura 15
muestra que AA, DHA y el colesterol redujeron la expresión de ARNm
de SCD humana de manera dependiente de la dosis. La transferencia
de western de los extractos de proteína de las células tratadas con
PUFA y colesterol muestra que las PUFA y el colesterol reducían los
niveles de la proteína de SCD también (no se muestran los
datos).
Para evaluar el posible efecto de unión a SREBP
sobre la actividad del promotor de SCD humana, la construcción del
promotor de luciferasa humana se cotransfectó en células HepG2 junto
con un vector de expresión que contiene SREBP1a. Después de 72 h,
se evaluó la actividad de luciferasa de las células transfectadas.
Los datos se normalizaron con el extracto celular que expresaba la
luciferasa de Renilla como control interno. Como se muestra en la
figura, la SREBP transactiva al promotor de manera dependiente de la
dosis dando origen a un aumento de hasta 40 veces. Este experimento
muestra que SREBP desempeña un papel en la regulación del gen de
SCD humana.
Los informes publicados indicaron que la forma
madura de SREBP, además de activar los genes lipogénicos, también
media en la represión por PUFA y colesterol de genes lipogénicos,
incluyendo SCD1 de ratón. Para observar los efectos reguladores de
SREBP-1a madura y PUFA sobre la actividad de
promotores de SCD, se co-transfectaron
transitoriamente células hepáticas HepG2 con 20 ng (por placa de 6
cm) de ADN plasmídico que contiene el promotor de SCD humana como
se ha descrito anteriormente, pero esta vez las transfecciones se
realizaron en presencia de colesterol para inhibir la maduración
del SREBP endógena y asegurar, de este modo, que había poca forma
madura del SREBP endógena presente en las células. Después de la
transfección, las células se trataron a continuación con, con ácido
araquidónico, EPA y DHA como complejos con albúmina, y la actividad
de luciferasa se evaluó a continuación usando un luminómetro. Si
SREBP media la represión por PUFA del gen de SCD humana, la
actividad del promotor de SCD no disminuiría después del
tratamiento de las células transfectadas con PUFA. Sin embargo, la
adición de AA, EPA o DHA seguía reprimiendo la actividad del
promotor de SCD con solamente una ligera atenuación (no se muestran
los datos). Por lo tanto, la maduración de SREBP no parece mostrar
la selectividad requerida para explicar el control por PUFA de la
transcripción génica de SCD, lo que sugiere que PUFA puede utilizar
una proteína diferente además de la SREBP para reprimir la
transcripción génica de SCD humana.
Estos resultados establecen que hSCD1 está
regulada transcripcionalmente por SREBP, NF-Y,
C/EBPalfa, PUFA-RE y proteínas alternativas y
reguladores de la transcripción. Cada una de estas proteínas será,
por lo tanto, una atractiva diana para el cribado de fármacos para
identificar compuestos que modulan la expresión de SCD1 en una
célula; siendo de este modo útiles parta tratar las enfermedades,
trastornos y afecciones humanas que enseña la presente
invención.
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Para investigar las funciones fisiológicas de
SCD, generamos ratones knock-out para SCD1
(SCD1-/-). Descubrimos que los niveles de C16:1 se reducen
drásticamente en los tejidos de ratones SCD1-/- mientras que se
observó una drástica reducción en C18:1 solamente en el hígado
donde normalmente se expresa SCD1 en solitario y no SCD2. En
tejidos tales como el del párpado, adiposo y la piel donde tanto
SCD1 como SCD2 se expresan, 18:1 solamente se reducía ligeramente.
Los niveles de ácidos grasos monoinsaturados del cerebro y el globo
ocular que no expresan SCD1 permanecían sin cambios. El hígado y la
piel de los ratones SCD-/- eran deficientes en ésteres de
colesterol y triglicéridos mientras que el párpado además era
deficiente en ésteres de cera específicos del párpado de ácidos
grasos monoinsaturados de cadena larga principalmente C20:1. Además,
el párpado de los ratones SCD-/- tenía niveles más altos de
colesterol libre. Los ratones SCD-/- mostraban anormalidades
cutáneas con glándula sebácea atrófica y fisura ocular estrecha con
glándulas de meibomio atróficas que es similar al síndrome de ojo
seco en seres humanos. Estos resultados indican que la deficiencia
de SCD1 puede afectar a la síntesis no solamente de ácidos grasos
monoinsaturados como componentes del éster de colesterol y
triglicéridos tisulares sino a otros lípidos tales como ésteres de
cera del párpado.
Los ratones SCD-/- estaban sanos y eran
fértiles, pero presentaban anormalidades cutáneas. Estas
anormalidades comenzaron aproximadamente a la edad del destete
(3-4 semanas) con piel seca, finas escamas
epidérmicas, y pérdida de pelo que se volvió más grave con la edad.
Además, los ratones mostraban estrechas fisuras oculares. El examen
patológico de la piel y los párpados mostró que los ratones de tipo
silvestre tenían unas glándulas sebáceas y de meibomio prominentes
y bien diferenciadas (no se muestran los datos). Por otro lado, en
la piel y el parpado de los SCD-/- aparecían células acinares
atróficas en las glándulas sebácea y de meibomio (no se muestran
los datos). No se descubrieron anormalidades en la córnea ni en la
retina (no se muestran los datos).
Medimos los contenidos de colesterol libre (FC)
y éster de colesterol (CE), triglicéridos y éster de cera en el
párpado. La cromatografía en capa fina (TLC) de lípidos extraídos
del párpado de ratones SCD1-/- demostró niveles marcadamente
reducidos de éster de colesterol y triglicéridos en comparación con
los lípidos extraídos del párpado de ratones de tipo silvestre
(figura 16A). La Tabla 3 compara el contenido de lípidos del párpado
entre ratones SCD-/- y de tipo silvestre.
Como se muestra en la Tabla 3, y muestra que el
contenido de éster de colesterol en el párpado y en la piel de
ratones SCD1-/- se redujo en un 74%, mientras que el colesterol
libre aumentaba 1,75 veces. Había una reducción del nivel de CE y
triglicéridos en el hígado de los SCD-/- también, pero no había
ninguna diferencia en el contenido de colesterol libre en el hígado
(no se muestran los datos). El contenido de triglicéridos y éster
de cera en el párpado de los ratones SCD-/- se redujo en un 60% y un
75%, respectivamente.
La figura 16B muestra el uso de un disolvente
diferente de acuerdo con Nicolaids et al (Nicolaides, N., y
Santos, E. C. (1985). The di-and triesters of the
lipids of steer and human meibomian glands. Lipids 20,
454-67) constituido por hexano/benceno (45:65) que
se usó para resolver los diferentes ésteres de cera muestra que el
triéster es el principal éster de cera. Estos triésteres así como
los diésteres se redujeron en un 72% en los ratones SCD-/-. El
contenido de triéster de cera del párpado se redujo en un 72% en los
ratones SCD-/-. De forma similar al párpado, el contenido de éster
de colesterol y triglicéridos en la piel de ratones SCD-/- se
redujo en un 43% y un 53%, respectivamente mientras que el
colesterol libre aumentaba en 1,9 veces (Tabla 3, y figuras 16A y
B). Finalmente, el contenido absoluto de ácidos grasos
monoinsaturados en cada fracción se redujo drásticamente en los
ratones SCD1-/- con aumentos correspondientes de los ácidos grasos
saturados (no se muestran los datos).
El oleato es uno de los ácidos grasos más
abundantes en la dieta. Los ácidos grasos monoinsaturados celulares
usados para la síntesis de éster de colesterol y triglicéridos,
podrían sintetizarse de novo mediante la ácido graso sintasa
y SCD o mediante incorporación de oleato exógeno indirectamente de
la dieta. Para determinar si el oleato de la dieta podía
sustituirse por el oleato sintetizado de forma endógena y restaurar
las anormalidades capilares, cutáneas y oculares de los ratones
SCD-/-, suplementamos a las dietas semi-purificadas
de los ratones con altos niveles de 18:1n-9 (50% de
la grasa total) como trioleno, y a continuación se dieron esas
dietas a ratones SCD-/- durante 2 semanas. Sin embargo, estas
anormalidades no se restauraban con estas dietas que contenían
muchos ácidos grasos monoinsaturados. Esto sugiere que los
inhibidores específicos de SCD1 actuarían para reducir los niveles
de TG independientemente de la dieta. En su lugar, los niveles de
éster de colesterol, éster de cera y triglicéridos en los párpados
de ratones SCD-/- alimentados con una dieta rica en
18:1n-9 seguían siendo más bajos que los de ratones
SCD +/+ (no se muestran los datos), lo que sugería que se requieren
ácidos grasos monoinsaturados sintetizados de forma endógena para la
síntesis de los ésteres de colesterol triglicéridos y ésteres de
ceras de mebo.
En el presente estudio, hemos establecido
ratones knock-out para SCD1 y hemos mostrado que la
deficiencia de SCD causaba expresión selectiva de sustrato y
selectiva de tejido. El nivel de palmitoleato en ratones SCD-/- se
reduce en más de un 50% en todos los tejidos incluyendo el hígado,
que expresaba SCD1 en ratones de tipo silvestre. Por otro lado, las
alteraciones del nivel de oleato eran específicas del tejido.
De forma similar a ratones Asebia que tienen una
mutación espontánea de SCD1, los ratones SCD-/- mostraban
anormalidades del crecimiento capilar, piel, y el ojo con
penetrancia completa. Estos fenotipos eran percibibles desde la
edad del destete. El examen histológico de la piel y el párpado
mostraba que la glándula sebácea atrófica en la piel y la glándula
de meibomio en el borde del párpado donde SCD1 se expresa de forma
abundante, carecían de lípidos sebáceos y de meibomio secretados,
los llamados, sebo y mebo, respectivamente. De hecho, descubrimos
los lípidos neutros incluyendo triglicéridos, varios tipos de
ésteres de cera y éster de colesterol que se sabe que son
componentes del sebo y mebo, estaban marcadamente reducidos en el
párpado y también en la epidermis (no se muestran los datos) de los
ratones SCD-/-.
La blefaritis crónica similar a las
anormalidades del párpado que hemos descrito en los ratones SCD-/-,
es una de las enfermedades frustrantes más comunes en seres
humanos. Shine y McCulley (Shine, W. E., y McCulley, J. P. (1998).
Keratoconjunctivitis sicca associated with meibomian secretion polar
lipid abnormality. Arch Ophthalmol 116, 849-52)
describieron que la blefaritis crónica puede deberse a anormalidades
lipídicas en el mebo. La naturaleza de estas anormalidades
lipídicas no se caracterizaron en detalle. Descubrieron sin
embargo, que el mebo de pacientes con queratoconjuntivitis de
meibomio tiene niveles reducidos de ácido oleico, un producto
principal de SCD mientras que el de pacientes con seborrea de
meibomio tiene niveles aumentados de 18:1. Estas observaciones,
junto con nuestro presente estudio, sugieren que la alteración de la
actividad de SCD puede estar implicada en blefaritis crónica. Por
lo tanto, la SCD puede convertirse en una potencial diana para el
desarrollo de fármacos terapéuticos y preventivos para el
tratamiento de enfermedades oculares.
Secuencia Promotora de
estearoil-CoA desaturasa humana 1
SEC ID Nº 1
1. Mihara, K. Structure and regulation of
rat liver microsomal stearoyl-CoA desaturase gene.
J. Biochem. (Tokio) 108, 1022-1029
(1990).
2. Thiede, M. A. &
Strittmatter, P. The induction and characterization of rat
liver stearyl-CoA desaturase mRNA. J. Biol.
Chem. 260, 14459-14463 (1985).
3. Kaestner, K. H., Ntambi, J. M.,
Kelly, T. J., Jr. & Lane, M. D. Differentiation
induced gene expression in 3T3-L1 preadipocytes. A
second differentially expressed gene encoding
stearoyl-CoA desaturase. J. Biol. Chem. 264,
14755-14761 (1989).
4. Ntambi, J. M. et al.
Differentiation-induced gene expression in
3T3-L1 preadipocytes. Characterization of a
differentially expressed gene encoding stearoyl-CoA
desaturase. J. Biol. Chem. 263, 17291-17300
(1988).
5. Zhang, L., Ge, L.,
Parimoo, S., Stenn, K. & Prouty, S. M.
Human stearyl CoA desaturase: alternative transcripts generated from
a single gene by usage of tandem polyadenylation sites. Biochem.
J. 340 (Pt 1), 255-264 (1999).
6. Zheng, Y. et al. Scd1 is
expressed in sebaceous glands and is disrupted in the asebia mouse
[carta]. Nat. Genet. 23, 268-270
(1999).
7. Sundberg, J. P. et al.
Asebia-2J (Scd1 (ab2J)): a new allele and a model
for scarring alopecia. Am. J. Pathol. 156,
2067-2075 (2000).
8. Miyazaki, M., Kim, Y. C.,
Keller, M. P., Attie, A. D. & Ntambi, J. M.
The biosynthesis of hepatic cholesterol esters and triglycerides is
impaired in mice with a disruption of the gene for
stearoyl-CoA desaturase 1. J. Biol. Chem.
(2000).
9. Spector, A. A. & Yorek, M.
A. Membrane lipid composition and cellular function. J. Lipid
Res. 26, 1015-1035 (1985).
10. Enser, M. & Roberts, J. L.
The regulation of hepatic stearoyl-coenzyme A
desaturase in obese-hyperglycaemic (ob/ob) mice by
food intake and the fatty acid composition of the diet. Biochem.
J. 206, 561-570 (1982).
11. Enser, M. The role of insulin in the
regulation of stearic acid desaturase activity in liver and adipose
tissue from obese-hyperglycaemic (ob/ob) and lean
mice. Biochem. J. 180, 551-558
(1979).
12. Enser, M. Desaturation of stearic
acid by liver and adipose tissue from
obese-hyperglycaemic mice (ob/ob). Biochem.
J. 148, 551-555 (1975).
13. Jones, B. H. et al. Adipose
tissue stearoyl-CoA desaturase mRNA is increased by
obesity and decreased by polyunsaturated fatty acids. Am. J.
Physiol 271, E44-E49 (1996).
14. Kim, Y. C., Gomez, F. E.,
Fox, B. G. & Ntambi, J. M. Differential regulation
of the stearoyl-CoA desaturase genes by
thiazolidinediones in 3T3-L1 adipocytes. J. Lipid
Res. 41, 1310-1316 (2000).
15. Li, J. et al. Partial
characterization of a cDNA for human stearoyl-CoA
desaturase and changes in its mRNA expression in some normal and
malignant tissues. Int. J. Cancer 57, 348-352
(1994).
16. Wood, C. B. et al. Reduction
in the stearic to oleic acid ratio in human malignant liver
neoplasms. Eur. J. Surg. Oncol. 11, 347-348
(1985).
17. Habib, N. A. et al. Stearic
acid and carcinogenesis. Br. J. Cancer 56,
455-458 (1987).
18. Tronstad, K. J., Berge, K.,
Bjerkvig, R., Flatmark, T. & Berge, R. K.
Metabolic effects of 3-thia fatty acid in cancer
cells. Adv. Exp. Med. Biol. 466, 201 204 (1999).
19. DeWille, J. W. & Farmer,
S. J. Postnatal dietary fat influences mRNAS involved in
myelination. Dev. Neurosci. 14, 61-68
(1992).
20. Garbay, B. et al. Regulation
of oleoyl-CoA synthesis in the peripheral nervous
system: demonstration of a link with myelin synthesis. J.
Neurochem. 71, 1719-1726 (1998).
21. Marcel, C. L., Duell, E. A.,
Rhodes, L. M. & Dunham, W. R. In vitro
model of essential fatty acid deficiency. J. Invest Dermatol.
99, 703-708 (1992).
22. Tebbey, P. W. & Buttke, T.
M. Stearoyl-CoA desaturase gene expression in
lymphocytes [la fe de erratas publicada aparece en Biochem Biophys
Res Commun 1992 Sep 16; 187 (2): 1201]. Biochem. Biophys. Res.
Commun. 186, 531-536 (1992).
23. Tebbey, P. W. & Buttke, T.
M. Molecular basis for the immunosuppressive action of stearic acid
on T cells [la fe de erratas publicada aparece en Immunology octubre
de 1990; 71 (2): 306]. Immunology 70, 379-386
(1990).
24. Stampfer et al. A prospective
study of cholesterol, apolipoproteins, and the risk of myocardial
infraction. N. Engl. J. Med. 325, 373-381
(1991).
25. Schmidt et al. Clustering of
dyslipidemia, hyperuricemia, diabetes, and hypertension and its
association with fasting insulin and central and overall obesity in
a general population. Atherosclerosis Risk in Communities Study
Investigators Metabolism 45 (6): 699-706
(1996).
26. Park et al. Inhibition of
hepatic stearoyl-CoA desaturase activity by
trans-10, cis-12 conjugated linoleic
acid and its derivatives. Biochim Biophys Acta. 1486
(2-3): 285-92 (2000).
27. Choi et al. The
trans-10, cis-12 isomer of
conjugated linoleic acid downregulates stearoyl-CoA
desaturase 1 gene expression in 3T3-L1 adipocytes.
J Nutr. 130 (8): 1920-4 (2000).
<110> Hayden, Michel R.
\hskip1cmBrownlie, Alison J.
\hskip1cmNtambi, James M.
\hskip1cmMiyazaki, Makoto
\hskip1cmGray-Keller, Mark P.
\hskip1cmAttie, Alan D.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Métodos y Composiciones que Usan
Estearoil CoA Desaturasa para Identificar Agentes Terapéuticos que
Reducen Triglicéridos
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\vskip0.400000\baselineskip
<130> 760050-7
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\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> U.S. 60/184.526
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
24-02-2000
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> U.S. 60/221.697
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
31-07-2000
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> U.S. 60/255.771
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
15-12-2000
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 617
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
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<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<230> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador de PCR para el Exón 6.
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggtgagcat ggtgctcagt ccct
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<230> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador de PCR para el gen neo.
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatagcaggca tgctggggat
\hfill20
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
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<211> 28
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<230> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador de amplificación por PCR.
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcacaccatat ctgtccccga caaatgtc
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
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<211> 30
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<230> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador cadena arriba de amplificación por PCR.
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<400> 5
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipnnnnggtacc ttnngaaaag aacagcgccc
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
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<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<230> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador cadena abajo de amplificación por PCR.
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<400> 6
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipnnnnagatct gtgcgtggag gtccccg
\hfill27
Claims (10)
1. Un método para identificar un agente de
modulación de estearoil-CoA desaturasa (SCD1), que
comprende:
- a)
- poner en contacto, en condiciones fisiológicas, a un agente químico y una fracción de membrana microsómico que tiene actividad de SCD1 o a dicho agente químico y una célula que tiene actividad de SCD1;
- b)
- detectar un cambio de dicha actividad de SCD1 debido a dicha puesta en contacto;
- c)
- ensayar dicho agente químico para seleccionar adicionalmente compuestos que no inhiban en un ser humano la actividad biológica de delta-5-desaturasa o delta-6-desaturasa,
identificando de este modo un agente de
modulación de SCD1.
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2. El método de la reivindicación 1, en el que
dicha fracción de membrana microsómica o célula que tiene actividad
de SCD1 comprende un polipéptido de SCD1.
3. El método de la reivindicación 1, en el que
dicho cambio de la actividad de SCD1 es un aumento de la actividad
de SCD1.
4. El método de la reivindicación 1, en el que
dicho cambio de la actividad de SCD1 es una reducción de la
actividad de SCD1.
5. El método de la reivindicación 1, en el que
la actividad de SCD1 en dicha fracción de membrana microsómica o
célula se determina usando un sustrato radiomarcado.
6. El método de la reivindicación 5, en el que
dicha radiomarca es tritio.
7. El método de la reivindicación 5, en el que
dicha actividad de SCD1 hace que el sustrato radiomarcado produzca
agua radiomarcada.
8. El método de la reivindicación 7, en el que
dicha agua radiomarcada es agua marcada con tritio.
9. El método de la reivindicación 5, en el que
dicho sustrato radiomarcado es estearoil-CoA
radiomarcada.
10. El método de la reivindicación 9, en el que
dicho sustrato radiomarcado es estearoil-CoA que
comprende un átomo de tritio solamente en C9 y C10.
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Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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US184526P | 2000-02-24 | ||
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Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
ES2349856T3 true ES2349856T3 (es) | 2011-01-12 |
Family
ID=43464181
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES01920143T Expired - Lifetime ES2349856T3 (es) | 2000-02-24 | 2001-02-23 | Estearoil-coa desaturasa para identificar agentes terapéuticos que reducen los trigliceridos. |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
ES (1) | ES2349856T3 (es) |
-
2001
- 2001-02-23 ES ES01920143T patent/ES2349856T3/es not_active Expired - Lifetime
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