ES2335489T3 - PROMOTER OF II-18BP, ITS PREPARATION AND EMPLOYMENT. - Google Patents

PROMOTER OF II-18BP, ITS PREPARATION AND EMPLOYMENT. Download PDF

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Daniela Weizmann Institute of Science NOVICK
Menachem Rubinstein
Vladimir Hurgin
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Abstract

The present invention relates to the promoter of interleukin-18 binding protein (IL-18BP), to its preparation and use.

Description

Promotor de IL-18BP, su preparación y empleo.Promoter of IL-18BP, your Preparation and employment

Campo de la invenciónField of the Invention

La presente invención se refiere al promotor de la proteína de unión de interleucina-18 (IL-18BP), a su preparación y a su uso.The present invention relates to the promoter of interleukin-18 binding protein (IL-18BP), its preparation and its use.

Fundamento de la invenciónFoundation of the invention

Las proteínas de unión de citocinas (receptores de citocina solubles) son normalmente los dominios de unión del ligando extracelular de sus correspondientes receptores de citocina de la superficie de la célula. Son producidas bien sea mediante ayuste alternativo o por segmentación proteolítica del receptor de la superficie de la célula. Estos receptores solubles han sido descritos en el pasado: por ejemplo, los receptores para IL-6 y IFN\gamma (Novick et al. 1989), TNF (Engelmann et al. 1989 y Engelmann et al. 1990), IL-1 y IL-4 (Maliszewski et al. 1990) y IFN\alpha/\beta (Novick et al. 1994, Novick et al. 1992). Una proteína de unión de citocina llamada osteoprotegerina (OPG, también conocida como factor inhibidor de los osteoclastos OCIF), un miembro de la familia de TNFR/Fas, parece ser el primer ejemplo de receptor soluble que existe solamente como proteína segregada (Anderson et al. 1997, Simonet et al. 1997, Yasuda et al. 1998).Cytokine binding proteins (soluble cytokine receptors) are normally the extracellular ligand binding domains of their corresponding cell surface cytokine receptors. They are produced either by alternative support or by proteolytic segmentation of the cell surface receptor. These soluble receptors have been described in the past: for example, the receptors for IL-6 and IFNγ (Novick et al . 1989), TNF (Engelmann et al . 1989 and Engelmann et al . 1990), IL-1 and IL-4 (Maliszewski et al . 1990) and IFN? /? (Novick et al . 1994, Novick et al . 1992). A cytokine binding protein called osteoprotegerin (OPG, also known as an OCIF osteoclast inhibitor factor), a member of the TNFR / Fas family, appears to be the first example of a soluble receptor that exists only as a secreted protein (Anderson et al. 1997, Simonet et al . 1997, Yasuda et al . 1998).

Una proteína de unión de interleucina-18 (IL-18BP) fue purificada por afinidad, en una columna IL-18, a partir de orina (Novick et al. 1999). La IL-18BP anula la inducción de IL-18 de IFN\gamma, y la activación de IL-18 de NF-kB in vitro. Además, la IL-18-BP inhibe la inducción del IFN\gamma en ratones inyectados con LPS. El gen de IL-18BP fue localizado en el cromosoma 11 humano, y no pudo encontrarse ningún exón que codifique un dominio transmembrana en la secuencia genómica de 8,3 kb que comprende el gen IL-18BP. Cuatro isoformas de IL-18BP generadas por ayuste de mRNA alternativo han sido encontradas hasta ahora en seres humanos. Fueron denominadas IL-18BP a, b, c, y d, compartiendo todas ellas el mismo término N y difiriendo en el término C (Novick et al. 1999). Estas isoformas varían en su capacidad para unir IL-18 (Kim et al. 2000). De las cuatro, se sabe que las isoformas humanas IL-18BP (hIL-18BP) a y c tienen una capacidad neutralizadora para IL-18. La isoforma de IL-18BP más abundante, la isoforma variante ayustada a, muestra una alta afinidad por IL-18 con una on-rate rápida y una off-rate lenta, y una constante de disociación (Kd) de aproximadamente 0,4 nM (Kim et al. 2000). La IL-18BP se expresa constitutivamente en el bazo (Novick 1999), y circula a concentraciones en el plasma de 2,5 ng/ml (Novick et al. 2001). Los restos implicados en la interacción de la IL-18 con la IL-18BP han sido descritos mediante el uso de modelos computerizados (Kim et al. 2000) y basándose en la interacción entre la proteína similar IL-1\beta con la IL-1R tipo I (Vigers et al. 1997). De acuerdo con el modelo de unión de IL-18 a la IL-18BP, se ha propuesto que el resto Glu en posición 42 y el resto Lys en posición 89 de la IL-18 se unen a Lys-130 y Glu-114 de IL-18BP, respectivamente (Kim et al. 2000).An interleukin-18 binding protein (IL-18BP) was affinity purified, on an IL-18 column, from urine (Novick et al . 1999). IL-18BP cancels the induction of IL-18 from IFNγ, and the activation of IL-18 from NF-kB in vitro . In addition, IL-18-BP inhibits the induction of IFNγ in mice injected with LPS. The IL-18BP gene was located on human chromosome 11, and no exon could be found that encodes a transmembrane domain in the 8.3 kb genomic sequence comprising the IL-18BP gene. Four isoforms of IL-18BP generated by alternative mRNA support have been found so far in humans. They were named IL-18BP a, b, c, and d, all of them sharing the same term N and differing in the term C (Novick et al . 1999). These isoforms vary in their ability to bind IL-18 (Kim et al . 2000). Of the four, it is known that human isoforms IL-18BP (hIL-18BP) a and c have a neutralizing capacity for IL-18. The IL-18BP isoform most abundant isoform variant spliced to, a high affinity for IL18 with a rapid on-rate and off-rate slow, and a dissociation constant (Kd) of approximately 0.4 nM (Kim et al . 2000). IL-18BP is constitutively expressed in the spleen (Novick 1999), and circulates at plasma concentrations of 2.5 ng / ml (Novick et al . 2001). The residues involved in the interaction of IL-18 with IL-18BP have been described by the use of computerized models (Kim et al . 2000) and based on the interaction between similar protein IL-1? With IL- 1R type I (Vigers et al . 1997). In accordance with the IL-18 binding model to IL-18BP, it has been proposed that the Glu residue at position 42 and the Lys residue at position 89 of IL-18 bind to Lys-130 and Glu-114 of IL-18BP, respectively (Kim et al . 2000).

Como se ha indicado, la IL-18 induce el IFN\gamma del que, a su vez, recientemente se ha publicado que induce la generación in vitro de mRNA de IL-18BPa (Muhl et al 2000). Por consiguiente, la IL-18BPa podría servir como señal de "parada", terminando la respuesta inflamatoria.As indicated, IL-18 induces IFNγ which, in turn, has recently been published that induces in vitro generation of IL-18BPa mRNA (Muhl et al 2000). Therefore, IL-18BPa could serve as a "stop" signal, ending the inflammatory response.

La IL-18BP es significativamente homóloga respecto de una familia de proteínas codificadas por varios virus de viruela (Novick et al. 1999, Xiang y Moss 1999). La inhibición de la IL-18 por esta IL-18BP viral putativa puede atenuar la respuesta Th1 antiviral inflamatoria.IL-18BP is significantly homologous with respect to a family of proteins encoded by several smallpox viruses (Novick et al . 1999, Xiang and Moss 1999). Inhibition of IL-18 by this putative viral IL-18BP may attenuate the inflammatory Th1 antiviral response.

La IL-18BP en suero es significativamente elevada en la sepsis, lo que indica su papel en la regulación de respuestas inmunitarias in vivo (Novick et al. 2001). En realidad, la IL-18BP es inducida por el IFN\gamma en varias células, sugiriendo que sirve como inhibidor de la retroalimentación negativa de la respuesta inmunitaria mediada por IL-18 (Mughl et al. 2000).Serum IL-18BP is significantly elevated in sepsis, indicating its role in the regulation of immune responses in vivo (Novick et al . 2001). Actually, IL-18BP is induced by IFNγ in several cells, suggesting that it serves as an inhibitor of negative feedback of the IL-18-mediated immune response (Mughl et al . 2000).

Resultados preliminares indican que el mRNA de IL-18BP se detecta en leucocitos, colon, intestino delgado, próstata y, de un modo particular, en las células del bazo (Novick et al. 1999). Las células componentes del bazo están constituidas por macrófagos, linfocitos y células plasmáticas con células adicionales derivadas de la circulación.Preliminary results indicate that IL-18BP mRNA is detected in leukocytes, colon, small intestine, prostate and, in a particular way, in spleen cells (Novick et al . 1999). The spleen component cells consist of macrophages, lymphocytes and plasma cells with additional cells derived from the circulation.

La actividad de elementos que controlan la transcripción, promotores y mejoradores (enhancers), varía considerablemente entre tipos de células distintos. Los promotores y los mejoradores consisten en breves matrices de secuencias de DNA que interaccionan específicamente con proteínas celulares implicadas en la transcripción (revisado en Dynan y Tjian 1985, McKnight y Tjian 1986, Sassone-Corsi y Borreli 1986 y Maniatis et al. 1987). La combinación de diferentes secuencias de reconocimiento y las cantidades de factores de transcripción afines determinan la eficacia con la que se transcribe un gen dado en un tipo de célula concreto. Muchos promotores eucarióticos contienen dos tipos de secuencias de reconocimiento: la secuencia TATA ("caja TATA") y los elementos promotores secuencia arriba. Se cree que la caja TATA, situada 25-30 pb secuencia arriba del sitio de iniciación de la transcripción, está implicada en dirigir a la RNA polimerasa II para que comience la síntesis de RNA en el sitio correcto. En cambio, los elementos promotores secuencia arriba determinan la velocidad a la que se inicia la transcripción. Los elementos mejoradores pueden estimular la transcripción hasta 1000 veces a partir de los promotores homólogos o heterólogos ligados. Sin embargo, a diferencia de los elementos promotores secuencia arriba, los mejoradores son activos cuando se colocan secuencia abajo del sitio de iniciación de la transcripción o a una considerable distancia del promotor. Muchos mejoradores de genes celulares trabajan exclusivamente en un tejido o tipo de célula particular (revisado por Voss et al. 1986, Maniatis et al. 1987). Además, algunos mejoradores se hacen activos solamente bajo condiciones específicas que son generadas por la presencia de un inductor, tal como una hormona o un ion metálico (revisado por Sassone-Corsi y Borrelli 1986 y Maniatis 1987). A causa de estas diferencias en las especificidades de la células de los mejoradores celulares, la elección de los elementos promotores y mejoradores a incorporar en un vector de expresión eucariótico vendrá determinada por los tipos de células en los que se va a expresar el gen recombinante. En cambio, el uso de un vector prefabricado que contiene un promotor y un mejorador celular específicos puede limitar gravemente los tipos de células en los que puede obtenerse la expresión.The activity of elements that control transcription, promoters and enhancers , varies considerably between different cell types. Promoters and enhancers consist of brief arrays of DNA sequences that interact specifically with cellular proteins involved in transcription (reviewed in Dynan and Tjian 1985, McKnight and Tjian 1986, Sassone-Corsi and Borreli 1986 and Maniatis et al . 1987). The combination of different recognition sequences and the amounts of related transcription factors determine the efficiency with which a given gene is transcribed in a particular cell type. Many eukaryotic promoters contain two types of recognition sequences: the TATA sequence ("TATA box") and the promoter elements upstream. It is believed that the TATA box, located 25-30 bp upstream of the transcription initiation site, is involved in directing RNA polymerase II to begin RNA synthesis at the correct site. Instead, the promoter elements upstream determine the rate at which transcription begins. Enhancer elements can stimulate transcription up to 1000 times from homologous or heterologous promoters linked. However, unlike the upstream promoter elements, the enhancers are active when placed downstream of the transcription initiation site or at a considerable distance from the promoter. Many cell gene enhancers work exclusively on a particular tissue or cell type (reviewed by Voss et al . 1986, Maniatis et al . 1987). In addition, some enhancers become active only under specific conditions that are generated by the presence of an inducer, such as a hormone or a metal ion (reviewed by Sassone-Corsi and Borrelli 1986 and Maniatis 1987). Because of these differences in the cell specificities of cell enhancers, the choice of promoter and enhancer elements to be incorporated into a eukaryotic expression vector will be determined by the types of cells in which the recombinant gene is to be expressed. In contrast, the use of a prefabricated vector containing a specific promoter and cell enhancer can severely limit the types of cells in which expression can be obtained.

Muchos elementos mejoradores derivados de virus tienen una gama de hospedadores más amplia y son activos en una diversidad de tejidos, aun cuando se observan diferencias cuantitativas significativas entre los diferentes tipos de células. Por ejemplo el mejorador temprano SV40 es activo promiscuamente en muchos tipos de células derivadas de una diversidad de especies de mamíferos, y en consecuencia se han usado vectores que incorporan este mejorador (Dijkema et al. 1985). Otras dos combinaciones de mejorador y promotor que son activas en una amplia gama de células se derivan de la repetición larga (LTR) del genoma del virus del sarcoma de Rous (Gorman et al. 1982b) y del citomegalovirus humano (Boshart et al. 1985).Many virus-derived enhancing elements have a wider host range and are active in a variety of tissues, even when significant quantitative differences are observed between different cell types. For example, the SV40 early enhancer is promiscuously active in many cell types derived from a variety of mammalian species, and consequently vectors incorporating this enhancer have been used (Dijkema et al . 1985). Two other promoter and promoter combinations that are active in a wide range of cells are derived from the long repeat (LTR) of the Rous sarcoma virus genome (Gorman et al . 1982b) and the human cytomegalovirus (Boshart et al . 1985 ).

Sumario de la invenciónSummary of the invention

La invención se refiere a una secuencia de DNA que codifica el promotor de IL-18BP humana (SEC ID NO: 1), o un fragmento tal como los de las SEC ID NOS 2 o 3, o un derivado funcional de la misma, en donde el extremo 3' de dicha secuencia de DNA o fragmento de la misma comprende la SEC ID NO: 5.The invention relates to a DNA sequence. encoding the human IL-18BP promoter (SEQ ID NO: 1), or a fragment such as those of SEQ ID NOS 2 or 3, or a functional derivative thereof, wherein the 3 'end of said DNA sequence or fragment thereof comprises SEQ ID NO: 5.

Más específicamente, un derivado de acuerdo con la presente invención puede ser el DNA de la invención mutado en uno o más sitios AP1 presentes en un elemento silenciador presente en la secuencia, y la secuencia de DNA puede contener además un gen ligado operativamente al promotor de IL-18BP.More specifically, a derivative according to the present invention may be the DNA of the invention mutated in one or more AP1 sites present in a silencer element present in the sequence, and the DNA sequence may also contain a gene operatively linked to the IL-18BP promoter.

En un aspecto de la invención, el gen puede codificar p. ej. IL-18BP o una proteína heteróloga tal como luciferasa, interferón beta, TNF, eritropoietina, activador del plasminógeno tisular, factor estimulador de la colonia de granulocitos, superóxido de manganeso dismutasa, una inmunoglobulina, o un fragmento de la misma, hormona del crecimiento, y proteínas de unión con el receptor de FSH, hCG, IL-18, hsLDLR y TNF.In one aspect of the invention, the gene can encode p. ex. IL-18BP or a heterologous protein such as luciferase, interferon beta, TNF, erythropoietin, tissue plasminogen activator, colony stimulating factor  of granulocytes, manganese superoxide dismutase, a immunoglobulin, or a fragment thereof, growth, and binding proteins with the FSH receptor, hCG, IL-18, hsLDLR and TNF.

La invención proporciona un vector que comprende una secuencia de DNA que codifica el promotor de IL-18BP humana, una célula hospedadora que comprende el vector p. ej. células CHO, WISH, HepG2, Cos, CV-1, HeLA, y Hakat U937, y un método para la producción de una proteína recombinante, que comprende cultivar la célula hospedadora y aislar la proteína recombinante producida.The invention provides a vector comprising a DNA sequence encoding the promoter of Human IL-18BP, a host cell that comprises the vector p. ex. CHO, WISH, HepG2, Cos cells, CV-1, HeLA, and Hakat U937, and a method for production of a recombinant protein, which comprises cultivating the host cell and isolate the recombinant protein produced.

Además, la invención proporciona un vector de virus recombinante que comprende una porción del genoma del virus, un fragmento de DNA que codifica un gen de interés y un fragmento de DNA que comprende una secuencia de DNA que codifica el promotor de IL-18BP humana. Más específicamente, la porción de virus puede ser p. ej. un virus adeno-asociado, y un retrovirus tal como HIV, HFV, MLV, FIV y VSV.In addition, the invention provides a vector of recombinant virus comprising a portion of the virus genome, a DNA fragment encoding a gene of interest and a fragment of DNA comprising a DNA sequence encoding the promoter of Human IL-18BP. More specifically, the portion of virus can be p. ex. an adeno-associated virus, and a retrovirus such as HIV, HFV, MLV, IVF and VSV.

También la presente invención proporciona un método para regular la expresión específica de la célula de un gen de interés, que comprende transducir una célula de mamífero diana con el vector de virus de la invención en una célula diana tal como una célula troncal hematopoiética, y un monocito. El gen de interés puede ser p. ej. una proteína que confiere resistencia a la infección por HIV. La regulación de la expresión específica de la célula de un gen de interés puede usarse en el tratamiento p. ej. de la infección por el HIV, el tratamiento de trastornos hematopoiéticos tales como SCID, la enfermedad granulomatosa crónica y la talasemia.Also the present invention provides a method to regulate the specific expression of a gene cell of interest, which comprises transducing a target mammalian cell with the virus vector of the invention in a target cell such as a hematopoietic stem cell, and a monocyte. The gene of interest can be p. ex. a protein that confers resistance to HIV infection The regulation of the specific expression of the cell of a gene of interest can be used in the treatment p. ex. from HIV infection, treatment of disorders hematopoietic such as SCID, chronic granulomatous disease and thalassemia.

También se describe un método de terapia génica para el tratamiento de una enfermedad en un individuo que muestra IFN\gamma elevado en un tejido corporal, que comprende la administración de una cantidad efectiva del vector de virus de la invención, que opcionalmente comprende además la administración de factores IL-6 y/o TNF-\alpha y/o IRF y/o C/EBP\beta.A method of gene therapy is also described. for the treatment of a disease in an individual who shows High IFNγ in a body tissue, which comprises the administration of an effective amount of the virus vector of the invention, which optionally further comprises the administration of IL-6 and / or TNF-? and / or factors IRF and / or C / EBP?

En otro aspecto, la invención se refiere a ratones transgénicos que albergan la secuencia de DNA que codifica una secuencia de DNA de la invención.In another aspect, the invention relates to transgenic mice that harbor the DNA sequence that encodes a DNA sequence of the invention.

Además la invención enseña el uso de una secuencia de DNA que codifica el promotor de IL-18BP humana (SEC ID Nº: 1), o un fragmento o un derivado funcional de la misma, en donde el extremo 3' de dicha secuencia de DNA o fragmento de la misma comprende la SEC ID NO: 5, en la elaboración de un medicamento para el tratamiento de una enfermedad.In addition the invention teaches the use of a DNA sequence encoding the IL-18BP promoter human (SEQ ID NO: 1), or a fragment or functional derivative of the same, wherein the 3 'end of said DNA sequence or fragment It includes SEQ ID NO: 5, in the preparation of a medicine to treat a disease

También, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de una secuencia de DNA que codifica el promotor de la IL-18BP humana (SEC ID Nº: 1), o un fragmento o un derivado funcional de la misma, en donde el extremo 3' de dicha secuencia de DNA o fragmento de la misma comprende la SEC ID Nº: 5.Also, the invention provides a pharmaceutical composition comprising a therapeutically amount  effective of a DNA sequence encoding the promoter of the Human IL-18BP (SEQ ID NO: 1), or a fragment or a functional derivative thereof, wherein the 3 'end of said DNA sequence or fragment thereof comprises SEQ ID NO: 5.

Breve descripción de las figurasBrief description of the figures

La figura 1 muestra una representación esquemática de la región del promotor del gen IL-18BP, incluyendo los 5 elementos reguladores.Figure 1 shows a representation schematic of the gene promoter region IL-18BP, including the 5 elements regulators

La figura 2 muestra la cinética de la inducción de IL-18BP y el sinergismo con TNF\alpha y IL-6. (A) IFN\gamma induce IL-18BP de una manera dependiente de la dosis y del tiempo en células WISH humanas. Las células se incuban con las concentraciones indicadas de IFN\gamma durante 24 y 48 h. (B) Efectos sinérgicos de TNF\alpha IL-6 y su combinación en IL-18BP inducida por IFN\gamma. Células HepG2 fueron incubadas con las combinaciones indicadas de IFN\gamma (100 U/ml), TNF\alpha (20 ng/ml) y IL-6 (300 U/ml). La inducción de IL-18BP por cada combinación fue significativamente más alta (p < 0,05) que la inducción por IFN\gamma sólo. Los datos son medias \pm SD (n = 3, para A; n = 4, para B).Figure 2 shows the kinetics of induction of IL-18BP and synergism with TNFα and IL-6. ( A ) IFNγ induces IL-18BP in a dose and time dependent manner in human WISH cells. The cells are incubated with the indicated concentrations of IFNγ for 24 and 48 h. ( B ) Synergistic effects of TNFα IL-6 and its combination in IFNγ-induced IL-18BP. HepG2 cells were incubated with the indicated combinations of IFNγ (100 U / ml), TNFα (20 ng / ml) and IL-6 (300 U / ml). The induction of IL-18BP for each combination was significantly higher (p <0.05) than the induction by IFNγ only. Data are means ± SD (n = 3, for A ; n = 4, for B ).

La figura 3 muestra una representación esquemática de la organización exón-intrón conservada de los genes de IL-18BP humanos y de ratón. El gen humano de IL-18BPa fue comparado con el gen IL-18BPd de ratón. Los exones están indicados. El sitio de inicio de la transcripción, el sitio de inicio de la traducción (ATG), el codón de parada (Stop) y la señal de poliadenilación (PAS) están indicados para el gen humano de IL-18BPa.Figure 3 shows a representation schematic of the exon-intron organization conserved of human IL-18BP genes and of mouse. The human IL-18BPa gene was compared with the mouse IL-18BPd gene. The exons are indicated. The transcription initiation site, the site of Start of translation (ATG), stop codon (Stop) and signal Polyadenylation (PAS) are indicated for the human gene of IL-18BPa.

La figura 4 muestra que la inducción de IL-18BP por IFN\gamma es a nivel transcripcional y depende de la síntesis de proteína de novo. (A) RT-PCR semicuantitativa de mRNA de IL-18BP a partir de células HepG2 que fueron pre-incubadas con actinomicina D (1 \mug/ml, 30 min), lavadas e incubadas con IFN\gamma (100 U/ml) durante los tiempos indicados. La RT-PCR de mRNA de \beta actina se muestra como testigo (B) RT-PCR semi-cuantitativa de mRNA de IL-18BP a partir de células HepG2 que fueron pre-incubadas con cicloheximida (20 \mug/ml) y IFN\gamma (100 U/ml) durante los tiempos indicados.Figure 4 shows that the induction of IL-18BP by IFNγ is transcriptional and depends on de novo protein synthesis . (A) Semi-quantitative RT-PCR of IL-18BP mRNA from HepG2 cells that were pre-incubated with actinomycin D (1 µg / ml, 30 min), washed and incubated with IFNγ (100 U / ml) during the indicated times. RT-PCR of β-actin mRNA is shown as a control (B) semi-quantitative RT-PCR of IL-18BP mRNA from HepG2 cells that were pre-incubated with cycloheximide (20 µg / ml) and IFN γ (100 U / ml) during the indicated times.

La figura 5 muestra la actividad basal e inducida por IFN\gamma, de vectores informadores de luciferasa que llevan el promotor de la IL-18BP humana. El tamaño del inserto, que se extiende desde el sitio de inicio de la transcripción (+1), se da entre paréntesis. Los números en círculos representan los diversos elementos de respuesta: 1. GAS. 2. IRF-E. 3. C/EBP-E (2 sitios). 4. Silenciador. 5. Mejorador distal. Los cuadrados rellenos representan mutación en un elemento de respuesta específica. Células HepG2 fueron co-transfectadas con el vector informador indicado y pSV40 \betaGAL. Todos los valores de luciferasa fueron normalizados a actividad de \beta-galactosidasa. (A) actividad de luciferasa en extractos de células no inducidas relativa a la de células transfectadas con vector pGL3-Basic. (B) actividad de luciferasa en células transfectadas con los vectores seleccionados e inducidas con IFN\gamma. El número de veces de inducción es sobre la actividad basal como se da en (A).Figure 5 shows the basal and IFNγ-induced activity of luciferase reporter vectors carrying the human IL-18BP promoter. The size of the insert, which extends from the transcription start site (+1), is given in parentheses. The numbers in circles represent the various response elements: 1. GAS. 2. IRF-E. 3. C / EBP-E (2 sites). 4. Silencer 5. Distal improver. Filled squares represent mutation in a specific response element. HepG2 cells were co-transfected with the indicated reporter vector and pSV40? GAL. All luciferase values were normalized to β-galactosidase activity. ( A ) Luciferase activity in non-induced cell extracts relative to that of cells transfected with pGL3-Basic vector. (B) Luciferase activity in cells transfected with the vectors selected and induced with IFNγ. The number of times of induction is about the basal activity as given in (A).

La figura 6 muestra que el IRF-1 es esencial para la expresión de IL-18BP en ratones. IL-18BP en suero, de ratones C57BI/6 IRF-1^{-/-} y testigo C57 BI/6 que fueron inyectados intraperitonealmente con IFN\gamma murino (53.000 u/ratón). Los ratones fueron sangrados antes de la inyección y 24 h después de la inyección. La IL-18BP en suero se determinó mediante ELISA. Los datos son media \pm SE (n = 6 para cada grupo). Las diferencias entre la IL-18BP en suero en el testigo y en ratones deficientes en IRF, así como la inducción de IL-18BP en los ratones testigo, fueron estadísticamente significativas (p < 0,05).Figure 6 shows that IRF-1 It is essential for the expression of IL-18BP in mice. Serum IL-18BP, from C57BI / 6 mice IRF-1 - / - and control C57 BI / 6 that were injected intraperitoneally with murine IFNγ (53,000 u / mouse). The mice were bled before injection and 24 h after the injection. Serum IL-18BP is determined by ELISA. Data are mean ± SE (n = 6 for each group). The differences between IL-18BP in serum in the control and in IRF-deficient mice, as well as the induction of IL-18BP in control mice, were statistically significant (p <0.05).

La figura 7 muestra el papel de IRF-1 y C/EBP\beta en la inducción del gen IL-18BP y su asociación. (A) ensayo de desplazamiento de la movilidad electroforética (EMSA Ejemplo 18) de sondas de DNA ds (DNA de cadena doble) correspondientes a las bases -33 a -75 (IRF-E, panel izquierdo) y -8 a -55 (GAS, panel derecho). Células HepG2 fueron tratadas con IFN\gamma durante los tiempos indicados y se dejó que los extractos nucleares reaccionasen con las sondas de IRF-E o GAS. Las bandas desplazadas se indican también por puntas de flecha rellenas. El complejo GAS fue también sometido a superdesplazamiento con los anticuerpos indicados. La banda superdesplazada está indicada por una punta de flecha abierta. (B) RT-PCR semicuantitativa de mRNA de IL-18BP de células HepG2 que fueron transfectadas con las combinaciones indicadas de vectores de expresión de IRF-1 o C/EBP\beta. Cuando se indica, se añadió IFN\gamma y las células se recolectaron 5 h más tarde. Los valores se normalizaron a mRNA de \beta actina. (C) actividad de luciferasa en células transfectadas con el vector informador de la luciferasa pGL3 (1272), que contiene el promotor completo de IL-18BP, junto con la concentración indicada de pCDNA3-IRF-1 (círculos) y 1 \mug/10^{6} células de pCDNA3-C/EBP\beta. Alternativamente, las células fueron transfectadas con la concentración indicada de pCDNA3-C/EBP\beta (cuadrados) y 0,1 \mug/10^{6} células de pCDNA3-IRF-1. La actividad de la luciferasa fue normalizada por la actividad de \beta Gal. (D) inmunotransferencias de extractos nucleares y citoplásmicos (véase el Ejemplo 17 para la preparación de los extractos) de células tratadas con IFN\gamma (100 U/ml, 2 h). Los extractos fueron inmunoprecipitados (IP) e inmunotransferidos (IB: ImmunoBlotted) con los anticuerpos indicados.Figure 7 shows the role of IRF-1 and C / EBP? In the induction of the IL-18BP gene and its association. ( A ) electrophoretic mobility shift test (EMSA Example 18) of ds DNA probes (double stranded DNA) corresponding to bases -33 to -75 (IRF-E, left panel) and -8 to -55 ( GAS, right panel). HepG2 cells were treated with IFNγ during the indicated times and the nuclear extracts were allowed to react with the IRF-E or GAS probes. Shifted bands are also indicated by filled arrowheads. The GAS complex was also subjected to super displacement with the indicated antibodies. The super displaced band is indicated by an open arrowhead. ( B ) Semi-quantitative RT-PCR of IL-18BP mRNA of HepG2 cells that were transfected with the indicated combinations of IRF-1 or C / EBP? Expression vectors. When indicated, IFNγ was added and the cells were harvested 5 h later. Values were normalized to β actin mRNA. (C) Luciferase activity in cells transfected with the luciferase reporter vector pGL3 (1272), which contains the complete IL-18BP promoter, together with the indicated concentration of pCDNA3-IRF-1 (circles) and 1 / mug / 10 6 pCDNA3-C / EBP? Cells. Alternatively, the cells were transfected with the indicated concentration of pCDNA3-C / EBPβ (squares) and 0.1 µg / 10 6 cells of pCDNA3-IRF-1. Luciferase activity was normalized by β Gal activity. ( D ) immunoblotting of nuclear and cytoplasmic extracts (see Example 17 for the preparation of extracts) of IFNγ-treated cells (100 U / ml, 2 h). The extracts were immunoprecipitated (IP) and immunoblotted (IB: ImmunoBlotted) with the indicated antibodies.

La figura 8 muestra los factores que se unen al promotor de IL-18BP en la inducción con IFN\gamma (A) EMSA con el C/EBP\beta E proximal y extractos de células completas después del tratamiento con IFN\gamma. Cuando se indica, los extractos fueron superdesplazados con los anticuerpos indicados. (B) EMSA con una sonda correspondiente al mejorador distal y extractos de células completas después del tratamiento con IFN\gamma. Cuando se indica, los extractos fueron superdesplazados con los anticuerpos indicados, con o sin competición con ds DNA correspondiente a la mitad proximal de la sonda. Las bandas desplazadas se indican mediante puntas de flecha rellenas y la banda super desplazada se indican mediante puntas de flecha vacías.Figure 8 shows the factors that bind to IL-18BP promoter in induction with IFNγ (A) EMSA with the proximal C / EBP? E and cell extracts complete after treatment with IFNγ. When indicates, the extracts were super displaced with the antibodies indicated. (B) EMSA with a probe corresponding to the improver distal and whole cell extracts after treatment with IFNγ. When indicated, the extracts were super displaced with the indicated antibodies, with or without competition with ds DNA corresponding to the proximal half of the probe. Shifted bands are indicated by arrowheads filled and super displaced band are indicated by tips empty arrow

Descripción detallada de la invenciónDetailed description of the invention

La presente invención se refiere al promotor de la IL-18BP humana. Este promotor impulsa la expresión constitutiva de IL-18BP en células concretas, por ejemplo en monocitos y la inducción mediada por IFN\gamma de la expresión de IL-18BP en muchas células. El promotor de IL-18BP humana es capaz de dirigir la expresión constitutiva y la inducida por IFN\gamma de una proteína heteróloga.The present invention relates to the promoter of the human IL-18BP. This promoter drives the constitutive expression of IL-18BP in cells concrete, for example in monocytes and induction mediated by IFNγ of IL-18BP expression in many cells. The human IL-18BP promoter is capable of direct constitutive and IFNγ-induced expression of a heterologous protein

La invención se refiere a una secuencia de DNA que codifica el promotor de la IL-18BP humana (SEC ID Nº: 1), o un fragmento o un derivado funcional de la misma, en donde el extremo 3' de dicha secuencia de DNA o fragmento de la misma comprende la SEC ID N: 5.The invention relates to a DNA sequence. encoding the human IL-18BP promoter (SEC ID No.: 1), or a fragment or a functional derivative thereof, in wherein the 3 'end of said DNA sequence or fragment of the It comprises SEQ ID N: 5.

El mRNA de IL-18BP se detecta en leucocitos, colon, intestino delgado, próstata y principalmente en las células del bazo (Novick et al. 1999). En uno de los ejemplos que se exponen más adelante se demuestra que la proteína IL-18 se expresa constitutivamente en los monocitos. Se ha encontrado que la expresión de IL-18BP está inducida por IFN\gamma, no sólo en los monocitos sino también en muchas células diferentes, y que esta inducción podría mejorarse mediante la adición de IL-6 y TNF\alpha.IL-18BP mRNA is detected in leukocytes, colon, small intestine, prostate and mainly in spleen cells (Novick et al . 1999). In one of the examples set forth below, it is shown that the IL-18 protein is constitutively expressed in monocytes. It has been found that the expression of IL-18BP is induced by IFNγ, not only in monocytes but also in many different cells, and that this induction could be improved by the addition of IL-6 and TNFα.

Se encontró que la síntesis de proteína de novo es esencial para la activación del gen IL-18BP por IFN\gamma.It was found that de novo protein synthesis is essential for activation of the IL-18BP gene by IFNγ.

El sitio de inicio de la transcripción del mRNA de la IL-18BPa humana fue determinado mediante 5' RACE.The mRNA transcription initiation site of human IL-18BPa was determined by 5 ' RACE

El mRNA 3' de la proteína dedo de zinc (Zn finger) localizado secuencia arriba del gen IL-8BP se encontró así limitando la secuencia reguladora potencial secuencia arriba de IL-18BPa a 1601 bases secuencia arriba de la base 1.The 3 'mRNA of the zinc finger protein ( Zn finger ) located upstream of the IL-8BP gene was thus found by limiting the potential regulatory sequence upstream of IL-18BPa to 1601 bases upstream of base 1.

Se han identificado seis elementos reguladores (figura 1) dentro de esta región (de la transcripción proximal a la transcripción distal): 1- secuencias gamma activadas (GAS; Gamma Activated Sequences) en las bases -24 a -32, 2- Un elemento de respuesta IRF-1,2 (IRF-E) que abarca las bases -57 a -69, 3- y 4- dos elementos de respuesta C/EBP\beta en las bases -309 a -322 y -621 a- 634, 5- un silenciador en los restos -625 a -1106 y 6- un elemento mejorador que abarca las bases -1106 a -1272. Una serie de vectores informadores de luciferasa con truncamientos progresivos en el extremo 5' del fragmento de 1601 pb fueron ensayados en células HepG2 (una línea de carcinoma hepatocelular humano). La región de 1272 kb expuesta en SEC ID NO: 1 dirige tanto una expresión basal observada en algunos tejidos y tipos de células, como la inducción por IFN\gamma. Las pruebas de actividad del promotor en fragmentos de DNA truncados sucesivamente dentro de esta región demostraron que un fragmento de DNA de 122 pb, proximal al sitio de iniciación de la transcripción expuesto en la SEC ID NO: 3 comprende el promotor mínimo. Este promotor mínimo es también inducible. Sin embargo, otras secuencias reguladoras secuencia arriba de este promotor mínimo sí que contribuyeron a la cuantía de la inducción. Se encontró que un fragmento de DNA de 635 pb que contiene, además de los elementos IRF-1 y GAS, dos elementos C/EBPp, expuesto en la SEC ID NO: 2, confiere inducción máxima de la expresión de luciferasa por IFN\gamma.Six regulatory elements have been identified (Figure 1) within this region (from transcription proximal to the distal transcription): 1- activated gamma sequences (GAS; Gamma Activated Sequences) in the bases -24 to -32, 2- An element of IRF-1.2 response (IRF-E) covering the bases -57 to -69, 3- and 4- two response elements C / EBP? In the bases -309 to -322 and -621 to- 634, 5- a silencer in the remains -625 to -1106 and 6- an improvement element covering bases -1106 to -1272. A series of vectors Luciferase reporters with progressive truncation in the 5 'end of the 1601 bp fragment were tested in cells HepG2 (a line of human hepatocellular carcinoma). The region of 1272 kb set forth in SEQ ID NO: 1 addresses both a basal expression observed in some tissues and cell types, such as induction by IFNγ. The promoter's activity tests in DNA fragments truncated successively within this region demonstrated that a 122 bp DNA fragment, proximal to the site of initiation of transcription set forth in SEQ ID NO: 3 It comprises the minimum promoter. This minimum promoter is also inducible However, other sequence regulatory sequences above this minimum promoter yes they contributed to the amount of induction It was found that a 635 bp DNA fragment that contains, in addition to the IRF-1 and GAS elements, two C / EBPp elements, set out in SEQ ID NO: 2, confers induction Maximum expression of luciferase by IFNγ.

Experimentos in-vivo llevados a cabo con ratones deficientes en IRF-1, confirmaron la importancia de IRF-1 como mediador de la expresión basal de IL 18BP, así como de la inducida por IFN\gamma. In-vivo experiments carried out with mice deficient in IRF-1, confirmed the importance of IRF-1 as a mediator of basal expression of IL 18BP, as well as that of IFN-induced.

Se ha encontrado que, en la inducción por IFN\gamma, se induce la expresión del factor IRF-1 y el factor se compleja con C/EBP\beta que está constitutivamente presente en las células. El complejo se une al elemento promotor GAS proximal y a su elemento promotor adyacente IRF-E.It has been found that, in induction by IFNγ, expression of the IRF-1 factor is induced and the factor is complexed with C / EBP? which is constitutively present in the cells. The complex binds to the promoter element GAS proximal and its adjacent promoter element IRF-E.

Se encontró que el mejorador presente en el extremo distal del sitio de transcripción interacciona con el promotor basal a través de IRF-1.It was found that the improver present in the distal end of the transcription site interacts with the basal promoter through IRF-1.

La presente invención se refiere al promotor de IL18BP de la SEC ID Nº: 1 o un fragmento del mismo y a métodos para regular la expresión génica. Más en particular, la presente invención se refiere a las secuencias de DNA aisladas de IL-18BP 1272 pb (SEC ID Nº: 1) o un fragmento de la misma tal como 635 pb (SEC ID NO: 2) y 122 pb (SEC ID NO: 3) que son capaces de dirigir la expresión del gen.The present invention relates to the promoter of IL18BP of SEQ ID NO: 1 or a fragment thereof and to methods for regulate gene expression. More particularly, the present invention relates to DNA sequences isolated from IL-18BP 1272 bp (SEQ ID NO: 1) or a fragment of the same as 635 bp (SEQ ID NO: 2) and 122 bp (SEQ ID NO: 3) that They are capable of directing gene expression.

Esta región del promotor de IL-18BP ha sido clonada y secuenciada y corresponde a nucleótidos en los 1272 pb secuencia arriba del sitio de inicio de la transcripción de IL-18BP (SEQ. ID. NO: 1).This region of the promoter of IL-18BP has been cloned and sequenced and corresponds to nucleotides at 1272 bp upstream of the start site of the transcription of IL-18BP (SEQ. ID. NO: 1).

La presente invención incluye el promotor de IL-18BP entero (SEC ID Nº: 1), pero también las secuencias de DNA que comprenden un fragmento del mismo (SEC ID Nº: 2, SEC ID Nº: 3), capaz de dirigir la transcripción, y por tanto finalmente la expresión del gen, y puede usarse con otras porciones de la región del promotor de IL-18BP, o alternativamente con promotores heterólogos o elementos promotores heterólogos para controlar la transcripción del gen. Este promotor o fragmento del mismo es capaz de inducción por el IFN\gamma. Tal inducción puede mejorarse más por sobreexpresión de IRF-1 y/o C/EBP\beta y/o por tratamiento con IL-6 y/o TNF\alpha.The present invention includes the promoter of Whole IL-18BP (SEQ ID NO: 1), but also the DNA sequences comprising a fragment thereof (SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3), capable of directing transcription, and therefore finally gene expression, and can be used with other portions from the IL-18BP promoter region, or alternatively with heterologous promoters or promoter elements heterologists to control gene transcription. This promoter or fragment thereof is capable of induction by IFNγ. Such induction can be further enhanced by overexpression of IRF-1 and / or C / EBP? And / or by treatment with IL-6 and / or TNFα.

Los derivados funcionales del promotor expuestos en la SEC ID Nº: 1, o el fragmento del mismo tal como la SEC ID Nº: 2 o la SEC ID Nº: 3, son mutantes en los que de 1 a 10, preferentemente de 1 a 5, más preferentemente 1 nucleótido, es reemplazado con otro, o es borrado, y que son capaces de dirigir la expresión del gen y la inducción por IFN\gamma.The functional derivatives of the promoter exposed in SEQ ID NO: 1, or the fragment thereof such as SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3, are mutants in which from 1 to 10, preferably 1 to 5, more preferably 1 nucleotide, is replaced with another, or it is deleted, and they are able to direct the gene expression and induction by IFNγ.

Las secuencias de DNA de la presente invención que comprenden un promotor de IL-18BP (SEC ID NO: 1) o un fragmento del mismo tal como el de la SEC ID Nº: 2 o la SEC ID Nº: 3, pueden ser aisladas usando diversos métodos conocidos en la técnica. Pueden emplearse al menos tres métodos principales alternativos:The DNA sequences of the present invention comprising an IL-18BP promoter (SEQ ID NO: 1) or a fragment thereof such as that of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID No.: 3, can be isolated using various methods known in the technique. At least three main methods can be used alternatives:

(1) el aislamiento de la secuencia de DNA a partir de DNA genómico que contiene la secuencia; (2) la síntesis química de la secuencia de DNA; y (3) la síntesis de la secuencia de DNA mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR).(1) DNA sequence isolation a starting from genomic DNA containing the sequence; (2) the synthesis DNA sequence chemistry; and (3) the synthesis of the sequence of DNA by polymerase chain reaction (PCR).

En el primer método, puede cribarse una genoteca de DNA genómico humano con el fin de identificar una secuencia de DNA que comprende un promotor de IL-18BP o elemento promotor de IL-18BP.In the first method, a library can be screened of human genomic DNA in order to identify a sequence of DNA comprising an IL-18BP promoter or element IL-18BP promoter.

En el segundo método, puede sintetizarse químicamente una secuencia de DNA que comprende un promotor de IL-18BP o un elemento promotor de IL-18BP. Por ejemplo, puede sintetizarse una secuencia de DNA que comprende una región del promotor de IL-18BP o un promotor de IL-18BP como una serie de 100 oligonucleótidos de base que pueden ser ligados secuencialmente (mediante los apropiados sitios de restricción terminal) para formar la secuencia lineal de nucleótidos correcta.In the second method, it can be synthesized chemically a DNA sequence comprising a promoter of IL-18BP or a promoter element of IL-18BP. For example, one can synthesize a DNA sequence comprising a promoter region of IL-18BP or an IL-18BP promoter as a series of 100 base oligonucleotides that can be sequentially linked (through the appropriate sites of terminal restriction) to form the linear sequence of correct nucleotides

En el tercer método, puede sintetizarse una secuencia de DNA que comprende una región de promotor de IL-18BP o un promotor de IL-18BP usando PCR. De forma resumida, pares de oligonucleótidos de DNA sintéticos, de al menos 15 bases de longitud (cebadores para PCR), que se hibridan con cadenas opuestas de la secuencia diana de DNA, pueden usarse para amplificar o multiplicar enzimáticamente la región interpuesta de DNA en la secuencia diana. Ciclos repetidos de desnaturalización por el calor del molde, apareamiento de los cebadores y alargamiento de los términos 3' de los cebadores apareados, con una DNA polimerasa, tienen por resultado la amplificación del segmento definido por los extremos 5' de los cebadores de PCR. Véanse las patentes de EE.UU. nº 4.683.195 y 4.683.202.In the third method, a DNA sequence comprising a promoter region of IL-18BP or an IL-18BP promoter using PCR. In summary, pairs of DNA oligonucleotides synthetic, at least 15 bases in length (PCR primers), that hybridize with opposite strands of the DNA target sequence, can be used to amplify or enzymatically multiply the interposed region of DNA in the target sequence. Repeated cycles of denaturation by the heat of the mold, mating of the primers and elongation of the 3 'terms of the primers paired, with a DNA polymerase, result in segment amplification defined by the 5 'ends of the PCR primers. See US patents. No. 4,683,195 and 4,683,202.

Se demostró que el promotor de IL-18BP de la invención es capaz de conferir expresión basal y también expresión inducida por IFN\gamma de un gen heterólogo. Así, el promotor de IL-18BP tiene ambas actividades, basal e inducible.It was shown that the promoter of IL-18BP of the invention is capable of conferring basal expression and also IFNγ-induced expression of a heterologous gene Thus, the IL-18BP promoter has both activities, basal and inducible.

Aunque la secuencia de nucleótidos del promotor se expone en la SEQ. ID. NO. 1 o fragmentos del mismo que tienen actividades de promotor y se hace referencia a tal secuencia en la memoria descriptiva, se reconoce que pueden prepararse derivados de nucleótidos que no afectan a la función del promotor o del elemento promotor. Estas secuencias de nucleótidos modificadas pueden prepararse, por ejemplo, mutando la secuencia de nucleótidos de manera que la mutación tenga por resultado el borrado (deleción), la sustitución, la inserción, la inversión o la adición de uno o más nucleótidos usando varios métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, pueden emplearse los métodos de mutagénesis dirigida al sitio descritos en Taylor, J. W. et al., Nucl. Acids Res. 13, 8749-8764 (1985) y Kunkel, J. A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 482-492 (1985). Además, en firmas comerciales pueden adquirirse kits para la mutagénesis dirigida al sitio. Por ejemplo, un kit para la realización de mutagénesis dirigida al sitio puede adquirirse de Amersham Corp. (Arlington Heights, Ils.). La presente invención incluye DNA que contiene secuencias al menos un 50% idénticas y preferentemente un 75% idénticas y más preferentemente un 90% idénticas a la SEC ID Nº: 1, SEC ID Nº: 2 y SEC ID Nº: 3 respectivamente, con la condición de que la actividad del promotor sea retenida y/o mejorada. Uno de tales derivados, p. ej. en la SEC ID NO: 1, es el mutado en uno o en los tres sitios API presentes en la región del silenciador.Although the nucleotide sequence of the promoter is set forth in SEQ. ID. NO. 1 or fragments thereof that have promoter activities and such sequence is referred to in the specification, it is recognized that nucleotide derivatives that do not affect the function of the promoter or the promoter element can be prepared. These modified nucleotide sequences can be prepared, for example, by mutating the nucleotide sequence so that the mutation results in deletion (deletion), substitution, insertion, inversion or addition of one or more nucleotides using several known methods. in the technique For example, the site directed mutagenesis methods described in Taylor, JW et al ., Nucl. Acids Res. 13, 8749-8764 (1985) and Kunkel, JA, Proc. Natl Acad. Sci. USA 82, 482-492 (1985). In addition, kits for site-directed mutagenesis can be purchased at commercial firms. For example, a kit for performing site-directed mutagenesis can be purchased from Amersham Corp. (Arlington Heights, Ils.). The present invention includes DNA containing at least 50% identical sequences and preferably 75% identical and more preferably 90% identical to SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 3 respectively, with the condition that the promoter's activity be retained and / or improved. One such derivative, e.g. ex. in SEQ ID NO: 1, it is the mutated at one or all three API sites present in the muffler region.

La secuencia de nucleótidos que comprende el promotor de IL-18BP, un fragmento del mismo y/o un derivado del mismo puede ser enlazada operativamente a la región codificante de cualquier gen de interés para expresar ese gen en una célula hospedadora apropiada. Por enlazada operativamente se entiende enlazada operativamente para promotor y elementos. Para la expresión de un gen de interés, se prefiere que el promotor de IL-18BP entero en SEQ. ID. Nº: 1 o un fragmento del mismo tal como en SEC ID Nº: 2 o SEC ID Nº: 3 o un derivado del mismo, esté enlazado operativamente al gen de interés. Como se muestra más adelante en la sección de ejemplo, el promotor de IL-18BP, o un fragmento del mismo tal como el de la SEC ID Nº: 2 o SEC ID Nº: 3 es capaz de dirigir la expresión de genes heterólogos. También se contempla la expresión de genes homólogos con el promotor de la invención.The nucleotide sequence comprising the IL-18BP promoter, a fragment thereof and / or a derivative thereof can be operatively linked to the region coding of any gene of interest to express that gene in an appropriate host cell. By operationally linked it understood operatively linked to promoter and elements. For the expression of a gene of interest, it is preferred that the promoter of Whole IL-18BP in SEQ. ID. Nº: 1 or a fragment of same as in SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3 or a derivative of It is operatively linked to the gene of interest. How I know shown later in the example section, the promoter of IL-18BP, or a fragment thereof such as that of the SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3 is capable of directing the expression of heterologous genes Gene expression is also contemplated homologues with the promoter of the invention.

El promotor puede contener además un intrón, por ejemplo el primer intrón de IL-18BP.The promoter may also contain an intron, for example the first intron of IL-18BP.

Un promotor o elemento promotor de IL-18BP "ligado operativamente" dirigirá la transcripción de una molécula de ácido nucleico juntada en el marco de lectura apropiado. Con respecto a los promotores heterólogos, los promotores y elementos de la invención están ligados operativamente cuando controlan la función de tales promotores
heterólogos.
An "operably linked" IL-18BP promoter or promoter element will direct the transcription of a coupled nucleic acid molecule into the appropriate reading frame. With respect to heterologous promoters, the promoters and elements of the invention are operatively linked when they control the function of such promoters.
heterologists

Como se señaló anteriormente, el promotor de IL-18BP, un fragmento del mismo y secuencias derivadas del mismo de la presente invención, pueden utilizarse para expresar cualquier gen de interés. Típicamente, se usa para este propósito un vector de expresión. Así pues, la presente invención concierne además a vectores de expresión que comprenden una secuencia de DNA aislada capaz de dirigir la expresión del gen, que comprende un promotor de IL-18BP o un fragmento del mismo o un derivado del mismo. Los vectores de expresión contienen preferentemente un promotor de IL-18BP un fragmento del mismo o un derivado del mismo, que tiene una secuencia de nucleótidos correspondiente a la SEC ID Nº: 1, SEC ID Nº: 2 o SEC ID Nº: 3, respectivamente, o fragmentos del mismo y/o derivados. También se prefieren vectores de expresión que comprenden además un gen homólogo o heterólogo ligado operativamente al promotor de IL-18BP o un fragmento del mismo y/o un derivado del mismo secuencia de nucleótidos modificada del mismo.As noted above, the promoter of IL-18BP, a fragment thereof and sequences derived therefrom from the present invention, can be used to express any gene of interest. Typically, it is used for This purpose an expression vector. So, the present invention further concerns expression vectors comprising an isolated DNA sequence capable of directing gene expression, comprising an IL-18BP promoter or fragment of the same or a derivative thereof. Expression vectors preferably contain an IL-18BP promoter a fragment thereof or a derivative thereof, which has a sequence nucleotide corresponding to SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3, respectively, or fragments thereof and / or derivatives. Expression vectors are also preferred which comprise also a homologous or heterologous gene operatively linked to IL-18BP promoter or a fragment thereof and / or a derived from the same modified nucleotide sequence of same.

Los vectores de expresión de utilidad en la presente invención están frecuentemente en forma de "plásmidos", que se refieren a DNAs circulares de doble cadena que, en su forma de vector, no están unidos al cromosoma. Sin embargo, se entiende que la invención incluye estas otras formas de vectores de expresión que sirven para funciones equivalentes y que subsiguientemente se hacen conocidas en la técnica.Expression vectors useful in the present invention are frequently in the form of "plasmids", which refer to circular double stranded DNAs which, in their vector form, are not attached to the chromosome. Without However, it is understood that the invention includes these other forms of expression vectors that serve equivalent functions and that subsequently they become known in the art.

Los vectores de expresión útiles en la presente invención contienen típicamente un origen de replicación, un promotor de IL-18BP localizado enfrente (i. e., secuencia arriba) del gen de interés, secuencias de terminación de la transcripción y el vector restante. Los vectores de expresión pueden incluir también otras secuencias de DNA conocidas en la técnica, por ejemplo, secuencias conductoras de estabilidad que proporcionan estabilidad del producto de expresión, secuencias conductoras excretoras que proporcionan la secreción del producto de expresión, secuencias que permiten la expresión del gen estructural que se ha de modular (p. ej., por la presencia o la ausencia de nutrientes u otros inductores en el medio de crecimiento), secuencias marcadoras que son capaces de proporcionar la selección fenotípica en células hospedadoras transformadas, y secuencias que proporcionan sitios para la segmentación por endonucleasas de restricción. Las características del actual vector de expresión usado han de ser compatibles con la célula hospedadora que se va a emplear. Un vector de expresión como se contempla por la presente invención es al menos capaz de dirigir la transcripción, y preferentemente la expresión, del gen de interés dictada por la región del promotor de IL-18BP o promotor de IL-18BP o una secuencia de nucleótidos modificada de la misma. Los orígenes de replicación adecuados incluyen, por ejemplo, el del virus del simio 40 (SV40). Las secuencias de terminación adecuadas incluyen, por ejemplo, la del virus del simio 40 (SV40). El promotor de la invención puede emplearse para la expresión de prácticamente cualquier gen de interés, por ejemplo, los que codifican productos terapéuticos tales como interferón-beta, TNF, eritropoietina, activador del plasminógeno tisular, factor estimulador de las colonias de granulocitos, superóxido de manganeso dismutasa, una inmunoglobulina, o fragmento de la misma, hormona del crecimiento, hsLDLR, FSH, hCG, IL-18, proteínas de unión del receptor de TNF y proteínas de unión de IL-18. Todos estos materiales son conocidos en la técnica y muchos de ellos son disponibles comercialmente.Expression vectors useful herein invention typically contain an origin of replication, a IL-18BP promoter located opposite (i. e., sequence above) of the gene of interest, termination sequences of the transcript and the remaining vector. Expression vectors they can also include other DNA sequences known in the technique, for example, stability conducting sequences that provide stability of the expression product, sequences excretory conductors that provide product secretion from  expression, sequences that allow the expression of the structural gene to be modulated (e.g., by the presence or absence of nutrients or other inducers in the growth medium), marker sequences that are capable of providing selection phenotypic in transformed host cells, and sequences that provide sites for endonuclease segmentation of restriction. The characteristics of the current expression vector used must be compatible with the host cell that is going to use. An expression vector as contemplated herein. invention is at least capable of directing transcription, and preferably the expression of the gene of interest dictated by the IL-18BP promoter region or promoter of IL-18BP or a modified nucleotide sequence Of the same. Suitable origins of replication include, by example, that of simian virus 40 (SV40). The sequences of Suitable termination include, for example, that of the ape virus 40 (SV40). The promoter of the invention can be used for the expression of virtually any gene of interest, for example, those encoding therapeutic products such as interferon-beta, TNF, erythropoietin, activator of tissue plasminogen, colony stimulating factor of granulocytes, manganese superoxide dismutase, a immunoglobulin, or fragment thereof, growth hormone, hsLDLR, FSH, hCG, IL-18, protein binding TNF receptor and IL-18 binding proteins. Everybody these materials are known in the art and many of them are commercially available.

Los vectores de expresión adecuados que contienen las secuencias codificadoras y de control adecuadas pueden construirse usando técnicas de DNA recombinante estándar conocidas en la técnica, muchas de las cuales se describen en Sambrook, et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª edición, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N. Y. (1989).Suitable expression vectors containing the appropriate coding and control sequences can be constructed using standard recombinant DNA techniques known in the art, many of which are described in Sambrook, et al ., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1989).

La presente invención concierne adicionalmente a células hospedadoras que contienen un vector de expresión que comprende una secuencia de DNA aislada capaz de dirigir la expresión génica, que comprende una región del promotor de IL-18BP o un promotor de IL-18BP o secuencia de nucleótidos modificada del mismo. Preferentemente, la región del promotor de IL-18BP tiene la secuencia de nucleótidos correspondiente a 1272 pb secuencia arriba del sitio de inicio de la transcripción de IL-18BP expuesta en la SEC ID Nº: 1, o un fragmento de la misma tal como la secuencia de nucleótidos correspondiente a 635 pb secuencia arriba del sitio de inicio de la transcripción expuesta en la SEC ID NO: 2 o un fragmento de la misma tal como la secuencia de nucleótidos de 122 pb secuencia arriba del sitio de inicio de la transcripción expuesta en la SEC ID Nº: 3. También se prefieren células hospedadoras que contienen un vector de expresión, que además comprenden un gen homólogo o heterólogo ligado operativamente a la región del promotor de IL-18BP o la IL-18BP expuesta en la SEC ID Nº: 1 o un fragmento de la misma. Las células hospedadoras adecuadas incluyen, por ejemplo, células humanas HeLa o células del mono verde africano CV-1 y COS-1, células CHO, HepG2, células WISH, Hakat U937, etc.The present invention further concerns host cells that contain an expression vector that comprises an isolated DNA sequence capable of directing expression gene, which comprises a promoter region of IL-18BP or an IL-18BP promoter or modified nucleotide sequence thereof. Preferably, the IL-18BP promoter region has the sequence of nucleotides corresponding to 1272 bp upstream of the site of start of transcription of IL-18BP exposed in the SEQ ID NO: 1, or a fragment thereof such as the sequence of nucleotides corresponding to 635 bp upstream of the site of commencement of the transcript set forth in SEQ ID NO: 2 or a fragment thereof such as the 122 bp nucleotide sequence sequence above the start site of the exposed transcript in SEQ ID NO: 3. Host cells are also preferred which they contain an expression vector, which also comprise a gene homologous or heterologous operatively linked to the region of the IL-18BP promoter or IL-18BP set forth in SEQ ID NO: 1 or a fragment thereof. The cells Suitable hosts include, for example, human HeLa cells or CV-1 African green monkey cells and COS-1, CHO cells, HepG2, WISH cells, Hakat U937, etc.

Se prefieren células hospedadoras que contienen receptores para IFN\gamma, que permiten la inducción del promotor de IL-18BP y por consiguiente la expresión mejorada del gen de interés.Host cells containing IFNγ receptors, which allow promoter induction of IL-18BP and therefore improved expression of the gene of interest.

Los vectores de expresión pueden ser introducidos en las células hospedadoras por varios métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, puede llevarse a cabo la transfección de las células hospedadoras con vectores de expresión por el método de precipitación con fosfato cálcico. Sin embargo, también pueden emplearse otros métodos para introducir vectores de expresión en células hospedadoras, por ejemplo, electroporación, fusión biolística, fusión liposomal, inyección nuclear e infección viral o por fagos.Expression vectors can be introduced into host cells by various methods known in the art. For example, the transfection of host cells with expression vectors by the calcium phosphate precipitation method. But nevertheless, other methods can also be used to introduce vectors of expression in host cells, for example, electroporation, biolistic fusion, liposomal fusion, nuclear injection and infection viral or phage.

Una vez que un vector de expresión ha sido introducido en una célula hospedadora apropiada, la célula hospedadora puede ser cultivada y el polipéptido codificado por el gen de interés puede ser aislado. Alternativamente, una vez que ha sido introducido un vector de expresión en una célula hospedadora apropiada, la célula puede ser cultivada y, después de llegar a la densidad celular deseada, las células pueden ser estimuladas con IFN\gamma y puede ser aislado el polipéptido codificado por el gen de interés.Once an expression vector has been introduced into an appropriate host cell, the cell host can be cultured and the polypeptide encoded by the gene of interest can be isolated. Alternatively, once you have an expression vector has been introduced into a host cell appropriate, the cell can be cultured and, after reaching the desired cell density, cells can be stimulated with IFNγ and the polypeptide encoded by the gene of interest

Las células hospedadoras que contienen un vector de expresión que contiene una secuencia de DNA que codifica un gen de interés pueden ser identificadas usando varios métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, hibridación DNA-DNA, establecimiento de la presencia o ausencia de funciones de gen marcador, establecimiento del nivel de transcripción medido por la producción de transcriptos de mRNA del gen de interés en la célula hospedadora, y detección del producto génico inmunológicamente.Host cells that contain a vector expression that contains a DNA sequence that encodes a gene of interest can be identified using several known methods in the technique For example, DNA-DNA hybridization, establishment of the presence or absence of gene functions marker, setting the level of transcription measured by the mRNA transcript production of the gene of interest in the cell host, and detection of the gene product immunologically.

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Las secuencias de DNA de los vectores de expresión, plásmidos o moléculas de DNA de la presente invención pueden determinarse por varios métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, puede emplearse el método de terminación de la cadena didesoxi que se describe en Sanger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74, 5463-5467 (1977), o el método de Maxam-Gilbert que se describe in Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74, 560-564 (1977).The DNA sequences of the expression vectors, plasmids or DNA molecules of the present invention can be determined by several methods known in the art. For example, the dideoxy chain termination method described in Sanger et al ., Proc. Natl Acad. Sci. USA 74, 5463-5467 (1977), or the Maxam-Gilbert method described in Proc. Natl Acad. Sci. USA 74, 560-564 (1977).

Se ha de entender que nucleótidos específicos o regiones dentro del promotor de IL-18BP pueden ser identificados como necesarios para la regulación. Estas regiones o nucleótidos pueden localizarse por disección estructural fina de los elementos, y pueden estudiarse por experimentos que analizan la capacidad funcional de mutantes del promotor. Por ejemplo, pueden generarse mutaciones de un solo par de bases de elementos del promotor o deleciones progresivas, tales como las empleadas en la sección de ejemplo más adelante, empleando PCR. De esta manera, se amplifican varias regiones del promotor mutadas o construcciones de deleción, y después se clonan de nuevo en construcciones informadoras y se evalúan con técnicas de transfección y de ensayo de luciferasa (como se exponen en la sección de ejemplo más adelante). Estos fragmentos amplificados pueden ser clonados de nuevo en el contexto del promotor de IL-18BP y también en las construcciones del promotor heterólogo. De esta forma se identifican las secuencias exactas de nucleótidos que son importantes para dirigir la transcripción del gen.It is to be understood that specific nucleotides or regions within the IL-18BP promoter can be identified as necessary for regulation. These regions or nucleotides can be located by fine structural dissection of the elements, and can be studied by experiments that analyze the functional capacity of promoter mutants. For example, they can generate mutations of a single base pair of elements of the promoter or progressive deletions, such as those used in the Example section below, using PCR. In this way, it amplify several mutated promoter regions or constructs of deletion, and then cloned back into constructions informants and are evaluated with transfection and testing techniques of luciferase (as discussed in the example section below) ahead). These amplified fragments can be cloned from new in the context of the IL-18BP promoter and also in the constructions of the heterologous promoter. This form the exact nucleotide sequences that are important to direct gene transcription.

Este análisis identificará también cambios de nucleótidos que no afectan a la función del promotor, o que pueden aumentar la función del promotor. Así, pueden construirse también promotores derivados funcionales y elementos promotores.This analysis will also identify changes in nucleotides that do not affect the function of the promoter, or that may Increase the function of the promoter. Thus, they can also be built. functional derivative promoters and promoter elements.

El análisis funcional de la región del promotor o el promotor puede facilitarse por estudios de la huella (footprint) y de desplazamiento de gel. El conocimiento de los pares de bases exactos importantes para mediar en la unión de proteínas proporciona evidencia de las bases importantes para mediar en la respuesta transcriptional.Functional analysis of the promoter or promoter region can be facilitated by footprint and gel displacement studies. Knowledge of the exact base pairs important for mediating protein binding provides evidence of the important bases for mediating the transcriptional response.

La invención, por tanto, comprende además los pares de bases importantes en la interacción DNA-proteína. Tales pares de bases pueden ser explicados. Pueden emplearse fragmentos genómicos que contienen las áreas de interés en experimentos de obtención de huella (footprinting) in vitro [Galas et al., Nucleic Acids Res. 9, 6505-6525 (1981)]. El fragmento de restricción aislado puede ser radiomarcado y subsiguientemente incubado con extractos nucleares hechos con técnicas establecidas a partir de células que se espera que contengan proteínas de unión a DNA, que se unirán al fragmento [por ejemplo, Dignam et al., Nucleic Acids Res. 11, 1475-1489 (1983)]. Los fragmentos de DNA marcados se incuban con los extractos nucleares, se digieren con DNAsa I, y se someten a electroforesis en un gel de poliacrilamida desnaturalizante. Las proteínas de unión a DNA en el extracto celular se unen a su secuencia de reconocimiento contenida en el fragmento de restricción marcado, y protege al DNA de la digestión por la DNAsa. Las regiones de protección delinean el sitio de unión. Pueden usarse reacciones de secuenciación del fragmento de Maxam y Gilbert como marcador para definir los nucleótidos protegidos de la digestión por la DNAsa.The invention, therefore, further comprises the base pairs important in the DNA-protein interaction. Such base pairs can be explained. Genomic fragments containing the areas of interest in obtaining footprint experiments (footprinting) in vitro [Galas et al, Nucleic Acids Res. 9, 6505-6525 (1981).] Can be used. The isolated restriction fragment can be radiolabeled and subsequently incubated with nuclear extracts made with established techniques from cells that are expected to contain DNA binding proteins, which will bind to the fragment [eg, Dignam et al ., Nucleic Acids Res 11, 1475-1489 (1983)]. The labeled DNA fragments are incubated with the nuclear extracts, digested with DNAse I, and electrophoresed in a denaturing polyacrylamide gel. The DNA-binding proteins in the cell extract bind to their recognition sequence contained in the labeled restriction fragment, and protects the DNA from DNAse digestion. Protection regions delineate the binding site. Sequencing reactions of the Maxam and Gilbert fragment can be used as a marker to define the nucleotides protected from digestion by DNase.

La invención se dirige también a la identificación y caracterización de factores de actuación trans que interaccionan con el promotor o elementos del promotor. Las secuencias reguladoras de actuación cis sirven de sitios de unión para proteínas que se denominan factores de transacción (TAF) [Dynan W. S., Tjian T. Nature 316, 774-778 (1985); Maniatis, T. et al., Science 236, 1237-1245 (1987)]. Se supone que cada gen se une a una o más proteínas en cada una de sus secuencias reguladoras, y estas proteínas interaccionan con otra y RNA polimerasa II de una manera que controla la transcripción.The invention is also directed to the identification and characterization of trans performance factors that interact with the promoter or promoter elements. The cis-acting regulatory sequences serve as binding sites for proteins called transaction factors (TAF) [Dynan WS, Tjian T. Nature 316, 774-778 (1985); Maniatis, T. et al ., Science 236, 1237-1245 (1987)]. It is assumed that each gene binds to one or more proteins in each of its regulatory sequences, and these proteins interact with another and RNA polymerase II in a manner that controls transcription.

Se han identificado TAFs en extractos nucleares por su capacidad para unirse a fragmentos de DNA de secuencia de actuación cis y retrasar su movilidad electroforética. [Dignam, J. D. et al., Nucleic Acids Res. 11, 1475-1489 (1983); Dynan, W., Cell 58, 1-4 (1989); Fletcher, C. et al., Cell 773-781 (1987); Scheidereit, C. et al., Cell 51, 783-793 (1987)].TAFs in nuclear extracts have been identified for their ability to bind to DNA fragments of cis-acting sequence and delay their electrophoretic mobility. [Dignam, JD et al ., Nucleic Acids Res. 11, 1475-1489 (1983); Dynan, W., Cell 58, 1-4 (1989); Fletcher, C. et al ., Cell 773-781 (1987); Scheidereit, C. et al ., Cell 51, 783-793 (1987)].

Las secuencias de actuación cis son útiles en ensayos de retardo en gel para determinar la actividad de unión en extractos nucleares. La tecnología para ensayos de desplazamiento de gel se describe en la bibliografía e incluye muchos de los mismos reactivos usados en experimentos de "footprinting" o de huella genética [Fried, M. et al. , Nucleic Acids Res. 9, 6505-6525 (1981); Revzin, A., Biotechniques 7,346-355 (1989); Strauss, F. A. et al., Cell 37, 889-901 (1984)]. Fragmentos de restricción marcados con 32 P, o bien pares alineados de oligos complementarios, son incubados con extractos nucleares y poli d (I-C) en un tampón de unión, y los productos de esta reacción se someten a electroforesis en un gel de poliacrilamida no desnaturalizante. La posición del fragmento de DNA en el gel, determinada con autorradiografía, se retarda en los casos en los que la proteína se ha unido al DNA. La cuantía del retardo es función relativa del tamaño de la proteína.The cis actuation sequences are useful in gel retardation assays to determine binding activity in nuclear extracts. The technology for gel displacement assays is described in the literature and includes many of the same reagents used in footprinting or genetic fingerprint experiments [Fried, M. et al . , Nucleic Acids Res. 9, 6505-6525 (1981); Revzin, A., Biotechniques 7,346-355 (1989); Strauss, FA et al ., Cell 37, 889-901 (1984)]. Restriction fragments labeled with 32 P, or aligned pairs of complementary oligos, are incubated with nuclear extracts and poly d (IC) in a binding buffer, and the products of this reaction are electrophoresed in a non-denaturing polyacrylamide gel . The position of the DNA fragment in the gel, determined with autoradiography, is delayed in cases where the protein has bound to the DNA. The amount of the delay is a relative function of the protein size.

Las proteínas de unión así identificadas pueden entonces ser purificadas y finalmente clonadas usando técnicas conocidas.The binding proteins so identified can then be purified and finally cloned using techniques known.

El promotor de IL-18BP encuentra también uso en estudios transgénicos. Los ratones transgénicos proporcionan un poderoso modelo genético para el estudio de varias enfermedades humanas entre las que se incluye el cáncer. También han proporcionado un importante método in vivo para estudios de regulación génica que han confirmado y ampliado observaciones hechas con experimentos de gen informador de transfección (p. ej. luciferasa) [Palmiter, F. L. et al., Ann. Rev. Genet. 20, 465-499 (1986)]. Estudios con la intención de diseccionar las señales que permiten la relación en cuanto al desarrollo de la expresión génica pueden realizarse raras veces en modelos de cultivo de células y probablemente se estudia mejor con un modelo transgénico. Este tipo de experimento es posible debido a la notable conservación de secuencias reguladoras entre las especies, de manera que las señales reguladoras humanas son interpretadas con precisión por la maquinaria de transcripción de los ratones.The IL-18BP promoter also finds use in transgenic studies. Transgenic mice provide a powerful genetic model for the study of several human diseases, including cancer. They have also provided an important in vivo method for gene regulation studies that have confirmed and expanded observations made with transfection reporter gene experiments (eg luciferase) [Palmiter, FL et al ., Ann. Rev. Genet. 20, 465-499 (1986)]. Studies with the intention of dissecting the signals that allow the relationship in terms of the development of gene expression can rarely be performed in cell culture models and are probably best studied with a transgenic model. This type of experiment is possible due to the remarkable conservation of regulatory sequences between species, so that human regulatory signals are accurately interpreted by the transcription machinery of mice.

Las construcciones expresadas en ratones transgénicos podrían por tanto proporcionar mucha información acerca de la regulación del gen de la IL-18BP.The constructs expressed in mice GMOs could therefore provide a lot of information about  of the regulation of the IL-18BP gene.

Pueden obtenerse ratones transgénicos por métodos conocidos en la técnica. El método más usado por el cual se han producido animales transgénicos implica inyectar una molécula de DNA en el pronúcleo masculino de un huevo fertilizado [Brinster et al., Cell 27, 223 (1981); Costantini et al., Nature 294, 982 (1981); Harpers et al., Nature 293, 540 (1981); Wagner et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78, 5016 (1981); Gordon et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 73, 1260 (1976)].Transgenic mice can be obtained by methods known in the art. The most widely used method by which transgenic animals have been produced involves injecting a DNA molecule into the male pronucleus of a fertilized egg [Brinster et al ., Cell 27, 223 (1981); Costantini et al ., Nature 294, 982 (1981); Harpers et al ., Nature 293, 540 (1981); Wagner et al ., Proc. Natl Acad. Sci. USA 78, 5016 (1981); Gordon et al ., Proc. Natl Acad. Sci. USA 73, 1260 (1976)].

Una vez que la molécula de DNA ha sido inyectada en la célula del huevo fertilizado, la célula es implantada en el útero de la hembra receptora y se deja desarrollar en un animal. Así, todas las células del animal resultante deben contener la secuencia génica introducida.Once the DNA molecule has been injected in the fertilized egg cell, the cell is implanted in the uterus of the recipient female and allowed to develop in an animal. Thus, all cells of the resulting animal must contain the gene sequence introduced.

Los ratones transgénicos resultantes o fundadores pueden ser criados y la progenie se puede analizar para establecer líneas a partir de los fundadores, que expresen el transgén. En los animales transgénicos, pueden someterse a cribaje múltiples tejidos para observar la existencia de expresión génica. Estudios del RNA en las diversas líneas de ratones permitirán la evaluación de independencia del sitio de integración para los niveles de expresión del transgén. Véanse Hogan, B. et al. Manipulating the mouse embryo: a laboratory manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N. Y. (1986).The resulting or founding transgenic mice can be bred and the progeny can be analyzed to establish lines from the founders, which express the transgene. In transgenic animals, multiple tissues can be screened to observe the existence of gene expression. RNA studies in the various mouse lines will allow the evaluation of site integration independence for transgene expression levels. See Hogan, B. et al . Manipulating the mouse embryo: a laboratory manual , Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY (1986).

El promotor de IL-18BP y elementos promotores pueden proporcionar también un medio útil de llevar a cabo la terapia génica.The IL-18BP promoter and promoter elements can also provide a useful means of carry out gene therapy.

La "terapia génica" es la administración de material genético para modificar o manipular la expresión de un producto génico para alterar las propiedades biológicas de células vivas para uso terapéutico."Gene therapy" is the administration of genetic material to modify or manipulate the expression of a gene product to alter the biological properties of cells live for therapeutic use.

Las células pueden ser alogénicas o autólogas. Las células pueden ser modificadas ex-vivo para la subsiguiente administración al sujeto, o alteradas in vivo por productos de terapia génica dados directamente al sujeto.The cells can be allogeneic or autologous. Cells can be modified ex-vivo for subsequent administration to the subject, or altered in vivo by gene therapy products given directly to the subject.

Para la mayor parte, las construcciones que comprenden el promotor de IL-18BP o un fragmento del mismo y/o un derivado del mismo serán utilizadas para dirigir la expresión génica en aquellas células cuando el gen IL-18BP se expresa normalmente, por ejemplo células mononucleares. Puede utilizarse cualquier medio disponible en la técnica para la transferencia de las construcciones a animales, incluyendo seres humanos. Esto incluye vectores virales, en particular vectores retrovirales (véanse, por ejemplo, Zweibel et al, Science 243, 220 (1989), y las referencias citadas en ella), así como otros métodos.For the most part, constructs comprising the IL-18BP promoter or a fragment thereof and / or a derivative thereof will be used to direct gene expression in those cells when the IL-18BP gene is normally expressed, for example cells. mononuclear Any means available in the art can be used for the transfer of the constructions to animals, including humans. This includes viral vectors, in particular retroviral vectors (see, for example, Zweibel et al , Science 243, 220 (1989), and references cited therein), as well as other methods.

Los vectores recombinantes AAV se han mostrado bastante prometedores para al suministro de genes terapéuticos en hígado y musculatura esquelética (Snyder et al. 1997, Murphy et al. 1997, Song et al. 1998, Snyder et al. 1999, Herzog et al. 1997). Los ratones generados por rotura del gen del factor de coagulación IX muestran trastornos hemorrágicos graves y se parecen mucho al fenotipo observado en pacientes de hemofilia B. Se ha publicado (Wang et al. 1999) una única inyección intraportal de un vector de virus adeno-asociado (AAV) recombinante que codifica cDNA del factor IX canino bajo el control de un mejorador/promotor específico del hígado, conduce a una corrección a largo plazo y completa del trastorno hemorrágico.Recombinant AAV vectors have shown quite promise for the delivery of therapeutic genes in liver and skeletal muscles (Snyder et al . 1997, Murphy et al . 1997, Song et al . 1998, Snyder et al . 1999, Herzog et al . 1997 ). Mice generated by rupture of the clotting factor IX gene show severe bleeding disorders and closely resemble the phenotype observed in hemophilia B patients. A single intraportal injection of a adeno virus vector has been published (Wang et al . 1999). Recombinant associated (AAV) encoding canine factor IX cDNA under the control of a specific liver enhancer / promoter, leads to a long-term and complete correction of the bleeding disorder.

Los vectores retrovirales, derivados de oncorretrovirus tales como el virus de la leucemia murina (MVL), han sido los vectores más ampliamente utilizados para transferir genes, porque el genoma del vector se integra en los cromosomas de las células diana, resultando la expresión estable de los transgenes (I. M. Verma y N. Somia. Nature 389, 239 (1997)) aun cuando se probó que estos vectores son buenos especialmente para dividir células. Los vectores de lentivirus, tales como los vectores de HIV, se están utilizando en la actualidad para células no en división (Mioshi et al. Science 1999 283: 682-686). La capacidad de los lentivirus para infectar células no en división, tales como macrófagos, hace de ellos buenos candidatos para su uso como herramientas de transferencia de genes. Los vectores de HIV facilitan la transducción de células troncales hematopoiéticas humanas en reposo (HSCs: hematopoietic stem cells).Retroviral vectors, derived from oncorretroviruses such as murine leukemia virus (MVL), have been the most widely used vectors to transfer genes, because the vector genome is integrated into the chromosomes of the target cells, resulting in stable expression of the transgenes (IM Verma and N. Somia. Nature 389, 239 (1997)) even when it was proved that these vectors are good especially for dividing cells. Lentivirus vectors, such as HIV vectors, are currently being used for non-dividing cells (Mioshi et al . Science 1999 283: 682-686). The ability of lentiviruses to infect non-dividing cells, such as macrophages, makes them good candidates for use as gene transfer tools. HIV vectors facilitate the transduction of resting human hematopoietic stem cells (HSCs: hematopoietic stem cells).

Las células troncales hematopoiéticas (HSC) son una diana atractiva para la terapia génica de trastornos hematopoiéticos heredados, así como otros trastornos adquiridos, porque estas células tienen la facultad de regenerar el sistema hematopoiético completo. Por ejemplo las células troncales hematopoiéticas pueden regenerar células monolíticas que se sabe que están implicadas en la patogénesis del virus de la inmunodeficiencia humana 1 (HIV-1).Hematopoietic stem cells (HSC) are an attractive target for gene therapy of disorders inherited hematopoietic, as well as other acquired disorders, because these cells have the power to regenerate the system complete hematopoietic. For example stem cells hematopoietic can regenerate monolithic cells that is known that are involved in the pathogenesis of the virus human immunodeficiency 1 (HIV-1).

A pesar de más de 15 años de investigación en el campo de la terapia génica usando células troncales hematopoiéticas, el mayor obstáculo sigue siendo la incapacidad para insertar genes de forma eficiente y estable en estas células. Los vectores retrovirales basados en el virus de la leucemia murina de Moloney (MLV) han sido los más ampliamente usados, pero dan una transferencia de genes relativamente baja a HSC pluripotenciales humanas y una expresión génica que con frecuencia es insatisfactoria.Despite more than 15 years of research in the field of gene therapy using hematopoietic stem cells,  the biggest obstacle remains the inability to insert genes efficiently and stably in these cells. Vectors retrovirals based on Moloney murine leukemia virus (MLV) have been the most widely used, but give a relatively low gene transfer to pluripotential HSCs human and a gene expression that is often unsatisfactory

Recientemente, se han hecho intentos de modificación genética de células troncales hematopoiéticas con genes que inhiben la replicación del HIV-1, para el desarrollo de monocitos resistentes a la infección por HIV-1 (Kohn et al. 1999).Recently, attempts have been made to genetically modify hematopoietic stem cells with genes that inhibit HIV-1 replication, for the development of monocytes resistant to HIV-1 infection (Kohn et al . 1999).

Teóricamente, la inserción de un gen capaz de conferir resistencia al HIV-1 en células troncales hematopoiéticas tendría por resultado que ese gen estaría presente en los monocitos maduros de la descendencia y otras células susceptibles al HIV-1. Así, el uso de un promotor que es activo en células monolíticas, tal como el promotor de IL-18BP o un fragmento del mismo, para la terapia génica del HIV-1, es ventajoso.Theoretically, the insertion of a gene capable of confer resistance to HIV-1 in stem cells hematopoietic would result in that gene would be present in mature monocytes of offspring and other cells susceptible to HIV-1. Thus, the use of a promoter which is active in monolithic cells, such as the promoter of IL-18BP or a fragment thereof, for therapy HIV-1 gene is advantageous.

La terapia génica de la mayor parte de los trastornos genéticos de la sangre (p. ej. la enfermedad granulomatosa crónica SCID, talasemia etc.) requiere transferencia de genes ex vivo a linajes de células transplantables, HSCs autorrenovables, y regulación de la expresión transgénica en uno o más linajes de células. La corrección de trastornos que afectan a una progenie específica de HSCs (p. ej. hemoglobinopatías o talasemias, infección por HIV-1) requiere restringir la expresión de genes terapéuticos de una manera específica del linaje de la célula (Iotti et al. 2002). En estos casos, el direccionamiento transcripcional del gen transferido es obligado. La expresión del gen en diferentes tipos de células es dependiente de la fuerza relativa del promotor usado.Gene therapy of most genetic disorders of the blood (eg chronic granulomatous disease SCID, thalassemia etc.) requires transfer of ex vivo genes to transplantable cell lineages, self-renewing HSCs, and regulation of transgenic expression in one or more cell lineages. Correction of disorders that affect a specific progeny of HSCs (eg hemoglobinopathies or thalassemias, HIV-1 infection) requires restricting the expression of therapeutic genes in a specific way of the cell lineage (Iotti et al . 2002) . In these cases, the transcriptional addressing of the transferred gene is required. The expression of the gene in different types of cells is dependent on the relative strength of the promoter used.

No obstante, la mayor parte de los estudios preclínicos llevados a cabo hasta ahora se han apoyado en el uso de promotores virales constitutivos para impulsar la expresión trasgénica. Por ejemplo en el vector HIV-1 usa promotor interno de CMV y el promotor de CMV murino el vector retroviral murino LTR. La regulación transgénica apropiada en el marco de un vector retroviral es una tarea difícil debido a la interferencia transcriptional entre la repetición terminal larga (LTR) y los mejoradores-promotores internos y la inestabilidad genética de secuencias reguladoras complejas. En la presente invención el promotor de IL-18BP, que se sabe que impulsa la transcripción en las células mononucleares, se usa para impulsar la expresión transgénica en HSCs, el precursor de tales células mononucleares.However, most of the studies Preclinical carried out so far have relied on the use of constitutive viral promoters to boost expression transgenic For example in the HIV-1 vector use CMV internal promoter and CMV promoter murine the vector murine retroviral LTR. The appropriate transgenic regulation in the frame of a retroviral vector is a difficult task due to the transcriptional interference between long terminal repetition (LTR) and internal promoters-promoters and the genetic instability of complex regulatory sequences. In the present invention the IL-18BP promoter, which is knows that it drives transcription in mononuclear cells, it used to boost transgenic expression in HSCs, the precursor of such mononuclear cells.

La modificación genética de células troncales hematopoiéticas con "genes anti HIV" podría conducir al desarrollo de linfocitos y monocitos resistentes a la infección por HIV después del trasplante. Pueden recuperarse HSC de pacientes infectados por HIV-1, aislarse la células CD34+, ser transducidas in vitro con un vector retroviral que lleva una proteína inhibidora de HIV-1 bajo el control del promotor de IL-18BP (en vez del promotor retroviral) y reinfundir estas células en estos pacientes (Kohn et al. 1999).Genetic modification of hematopoietic stem cells with "anti HIV genes" could lead to the development of lymphocytes and monocytes resistant to HIV infection after transplantation. HSC can be recovered from HIV-1 infected patients, CD34 + cells can be isolated, transduced in vitro with a retroviral vector carrying an HIV-1 inhibitor protein under the control of the IL-18BP promoter (instead of the retroviral promoter) and reinfuse these cells in these patients (Kohn et al . 1999).

La fuente de HSC más comúnmente usada son las células troncales hematopoiéticas de la sangre periférica (PBSC: peripheral blood stem cells), que han reemplazado en gran medida a la médula ósea en el marco del trasplante autólogo (Gale et al. 1992 y Kessinger et al. 1991). Las PBSC se movilizan desde la médula ósea a la circulación periférica mediante la administración de factores tales como G-CSF o GM-CSF durante 3 a 5 días y entonces pueden ser recolectadas mediante leucoaféresis. Varios estudios han señalado que el injerto tiene lugar más rápidamente cuando se trasplantan células troncales sanguíneas periféricas en vez de células de la médula ósea (Henon et al. 1992 y Chao et al. 1993).The most commonly used source of HSC are peripheral blood stem cells hematopoietic stem cells (PBSC), which have largely replaced the bone marrow in the context of autologous transplantation (Gale et al . 1992 and Kessinger et al . 1991). The PBSC are mobilized from the bone marrow to the peripheral circulation by administering factors such as G-CSF or GM-CSF for 3 to 5 days and can then be collected by leukoapheresis. Several studies have indicated that grafting occurs more quickly when peripheral blood stem cells are transplanted instead of bone marrow cells (Henon et al . 1992 and Chao et al . 1993).

Las células progenitoras clonogénicas contenidas en PBSC movilizadas con el factor G-CSF son bastante susceptibles a la transferencia de genes mediada por retrovirus, mientras que la tasa de transducción de células troncales con reconstitución a largo plazo en PBSC no es mejor que en la médula ósea (Breni et al. 1992, Cassel et al. 1993, Dunbar et al. 1995). Se ha observado que sujetos infectados por HIV-1 pueden tener una movilización exitosa y recolección de PBSC movilizadas con G-CSF sin aumento alguno de los niveles de HIV-1 endógeno, al menos durante las etapas tempranas de la enfermedad (Junker et al. 1997 y Slobod et al. 1996).Clonogenic progenitor cells contained in PBSC mobilized with the G-CSF factor are quite susceptible to retrovirus-mediated gene transfer, while the transduction rate of stem cells with long-term reconstitution in PBSC is no better than in the bone marrow. (Breni et al . 1992, Cassel et al . 1993, Dunbar et al . 1995). It has been observed that HIV-1 infected subjects can have a successful mobilization and collection of PBSC mobilized with G-CSF without any increase in endogenous HIV-1 levels, at least during the early stages of the disease (Junker et al . 1997 and Slobod et al . 1996).

Otra fuente de células troncales hematopoiéticas es la sangre del cordón umbilical (UCB) que se ha demostrado que es susceptible a la transducción retroviral, potencialmente incluso más que las células de la médula ósea (Moritz et al. 1993 y Hao et al. 1995). El uso de células HSC de la UCB podría ser particularmente beneficioso para los neonatos infectados con HIV-1. Como la transmisión es en su mayor parte perinatal, la sangre del cordón umbilical debe contener números y función normales de células troncales hematopoiéticas, que pueden estar disminuidas en la médula ósea de niños y adultos infectados por HIV-1 (Kearns et al. 1997).Another source of hematopoietic stem cells is umbilical cord blood (UCB) which has been shown to be susceptible to retroviral transduction, potentially even more than bone marrow cells (Moritz et al . 1993 and Hao et al . 1995) . The use of UCB HSC cells could be particularly beneficial for infants infected with HIV-1. Since transmission is mostly perinatal, umbilical cord blood must contain normal numbers and function of hematopoietic stem cells, which may be diminished in the bone marrow of HIV-1 infected children and adults (Kearns et al . 1997) .

Se ha desarrollado un gran número de genes sintéticos que pueden suprimir la replicación del HIV-1 ("genes anti-HIV-1"), entre los que se incluye: antisentido, ribozimas, mutantes dominantes-negativos (p. ej. RevMIO), señuelos de RNA (RNA decoys), anticuerpos intracelulares para prevenir la expresión de proteínas virales o co-receptores celulares, etc. (Veres et al. 1996, Zhou et al. 1994, Couture et al 1996, Malim et al. 1989, Bahner et al 1993 y Sullenger et al. 1990, Lee et al. 1994, Marasco et al. 1997 y Chen et al. 1997). En muchos casos, se ha demostrado en sistemas modelo que estos genes anti-HIV-1 son capaces de suprimir significativamente la replicación del HIV-1 y en algunos casos incluso de limitar la entrada del virus en las células (36, 39-44). Si esencialmente el 100% de las HSC de un paciente y las células monocíticas resultantes pudiesen hacerse incapaces de soportar la replicación del HIV-1, es probable que resultarían cargas víricas disminuidas. Teóricamente, se requeriría la inhibición activa de la replicación del HIV-1 en el 99,9% de las células susceptibles para producir una reducción 3-log de la carga de virus, un efecto con frecuencia producido por la terapia anti-retroviral altamente efectiva. Sin embargo, con las capacidades limitadas para transducir efectivamente altos porcentajes de células troncales hematopoiéticas humanas, actualmente no es posible proteger la mayoría de células susceptibles. Un mecanismo alternativo para la eficacia se basa en la posibilidad de que células modificadas por ingeniería genética para que sean incapaces soportar la replicación activa del HIV-1 puedan ser protegidas de la citopaticidad inducida viralmente, y por tanto tener una ventaja de supervivencia selectiva en comparación con las células no protegidas. En ese caso, un número modesto de células protegidas puede comprender un porcentaje aumentado de todos los monocitos, llevando a cierta preservación de la función inmunitaria.A large number of synthetic genes have been developed that can suppress HIV-1 replication ("anti-HIV-1 genes"), including: antisense, ribozymes, dominant-negative mutants (eg RevMIO) , RNA decoys , intracellular antibodies to prevent the expression of viral proteins or cellular co-receptors, etc. (Veres et al . 1996, Zhou et al . 1994, Couture et al 1996, Malim et al . 1989, Bahner et al 1993 and Sullenger et al . 1990, Lee et al . 1994, Marasco et al . 1997 and Chen et al. . 1997). In many cases, it has been demonstrated in model systems that these anti-HIV-1 genes are capable of significantly suppressing HIV-1 replication and in some cases even limiting the entry of the virus into cells (36, 39-44) . If essentially 100% of a patient's HSC and the resulting monocytic cells could become unable to support HIV-1 replication, it is likely that decreased viral loads would result. Theoretically, active inhibition of HIV-1 replication in 99.9% of susceptible cells would be required to produce a 3-log reduction in virus load, an effect often produced by highly effective anti-retroviral therapy. . However, with the limited capabilities to effectively transduce high percentages of human hematopoietic stem cells, it is currently not possible to protect most susceptible cells. An alternative mechanism for efficacy is based on the possibility that genetically engineered cells so that they are unable to support the active replication of HIV-1 can be protected from virally induced cytopaticity, and therefore have a selective survival advantage in comparison With unprotected cells. In that case, a modest number of protected cells may comprise an increased percentage of all monocytes, leading to some preservation of immune function.

La presente invención se refiere también a composiciones farmacéuticas que comprenden un vehículo aceptable farmacéuticamente y un virus que comprende una secuencia de la presente invención correspondiente a la región del promotor de IL-18BP o promotor ligado operativamente a un gen de interés que codifica un fármaco adecuado. Estas composiciones pueden usarse preferentemente para dirigir un fármaco a tejidos en los que los niveles de IFN\gamma son elevados.The present invention also relates to pharmaceutical compositions comprising an acceptable vehicle pharmaceutically and a virus comprising a sequence of the present invention corresponding to the promoter region of IL-18BP or promoter operably linked to a gene of interest that encodes a suitable drug. These compositions they can preferably be used to direct a drug to tissues in which IFNγ levels are high.

Habiendo descrito ahora la invención, se entenderá más fácilmente haciendo referencia a los ejemplos que siguen, que se proporcionan a título de ilustración y que no se pretende que sean limitantes de la presente invención.Having now described the invention, understand more easily by referring to the examples that continue, which are provided by way of illustration and not It is intended to be limiting of the present invention.

Ejemplos Examples Ejemplo 1Example 1 Expresión basal de IL-18BP en monocitosBasal expression of IL-18BP in monocytes

El mRNA de IL-18BP de detecta en los leucocitos, colon, intestino delgado, próstata y en particular en las células esplénicas (Novick et al. 1999). Las células esplénicas consisten en macrófagos, linfocitos y células plasmáticas con células adicionales derivadas de la circulación.The IL-18BP mRNA is detected in leukocytes, colon, small intestine, prostate and in particular in splenic cells (Novick et al . 1999). Spleen cells consist of macrophages, lymphocytes and plasma cells with additional cells derived from the circulation.

Con el fin de determinar la expresión de la proteína IL-18BP en las células, se usó una prueba ELISA específica (Ejemplo 12). Se encontró que las células mononucleares de la sangre periférica humana (PBMC peripheral blood mononuclear cells) producen constitutivamente IL-18BP (0,7-1,5 ng/ml). Las células U-937, una línea de células derivada de células malignas obtenidas de la efusión pleural de un paciente de linfoma histiocítico, no expresaron nada de IL-18BP. Las células U-937 pueden ser inducidas a diferenciación monolítica terminal por el tratamiento con ésteres de forbol. Una expresión basal de IL-18BP de 0,07 \pm 0,01 ng/ml fue detectada solamente después de la diferenciación de las células en células tipo macrófago por estimulación con TPA (10 ng/ml). Estos resultados indican que la IL-18BP se produce constitutivamente en monocitos y macrófagos.In order to determine the expression of the IL-18BP protein in cells, a test was used Specific ELISA (Example 12). It was found that the cells human peripheral blood mononuclear (PBMC peripheral blood mononuclear cells) constitutively produce IL-18BP (0.7-1.5 ng / ml). The cells U-937, a cell line derived from cells malignancies obtained from pleural effusion of a lymphoma patient histiocytic, they expressed no IL-18BP. The U-937 cells can be induced to differentiation terminal monolithic treatment with forbol esters. A baseline expression of IL-18BP of 0.07 ± 0.01 ng / ml was detected only after cell differentiation in macrophage-like cells by stimulation with TPA (10 ng / ml). These results indicate that IL-18BP is produced constitutively in monocytes and macrophages.

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Ejemplo 2Example 2 Inducción de la expresión de IL-18BP en varias células diferentesInduction of IL-18BP expression in several different cells

Con anterioridad se ha publicado que el IFN\gamma indujo mRNA de L-18BP y proteína en varias líneas de células tales como la línea de células de queratinocitos, una línea de células de carcinoma de colon, y en células mesangiales renales primarias (Muhl et al. 2000). Se estudió la inducción de IL-18BP en varias líneas de células humanas y en células mononucleares de la sangre periférica (PBMC) por IFN\gamma y otras citocinas. La expresión de IL-18BP inducida por IFN\gamma (véase el Ejemplo 11 para la monitorización del mRNA y el Ejemplo 12 para el ELISA) en una manera dependiente de la dosis, mostrando un valor de EC50 a 50 U/ml en células WISH y HepG2 (figura 2 A y B). La IL-18BP aparentemente se acumuló en los sobrenadantes del cultivo de células WISH, ya que su concentración era más alta a las 48 h en comparación con las 24 h (figura 2 A).It has been previously reported that IFNγ induced L-18BP mRNA and protein in several cell lines such as the keratinocyte cell line, a colon carcinoma cell line, and in primary renal mesangial cells (Muhl et al . 2000). The induction of IL-18BP in several human cell lines and in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) by IFNγ and other cytokines was studied. IFNγ-induced IL-18BP expression (see Example 11 for mRNA monitoring and Example 12 for ELISA) in a dose-dependent manner, showing an EC50 value at 50 U / ml in WISH cells and HepG2 (Figure 2 A and B). IL-18BP apparently accumulated in the supernatants of the WISH cell culture, since its concentration was higher at 48 hours compared to 24 hours (Figure 2A).

Las células mononucleares de la sangre periférica humana (PBMC) produjeron constitutivamente IL-18BP (0,7-1,5 ng/ml), y el tratamiento con IFN\gamma (100 U/ml) hizo aumentar el nivel de IL-18BP en 1,7 \pm 0,1 y 2,1 \pm 0,3 veces a 24 y 48 h, respectivamente (p < 0,05, n = 4). No se observó ningún efecto sobre la producción de IL-18BP al hacer el pre-tratamiento de las PBMC con TPA.Mononuclear blood cells Human peripheral (PBMC) constitutively produced IL-18BP (0.7-1.5 ng / ml), and the IFNγ treatment (100 U / ml) increased the level of IL-18BP at 1.7 ± 0.1 and 2.1 ± 0.3 times at 24 and 48 h, respectively (p <0.05, n = 4). No observed effect on the production of IL-18BP when doing the pre-treatment of PBMC with TPA.

La inducción de IL-18BP por IFN\gamma fue ensayada en la línea de células U937. El IFN\gamma no indujo IL-18BP en células U937 no diferenciadas, sin embargo, después de la diferenciación con éster de forbol (TPA, 10 ng/ml) en células de tipo macrófago, se obtuvo un nivel basal de IL-18BP (0,07 \pm 0,01 ng/ml), y aumentó en 4,6 \pm 0,05 veces al hacer la inducción con IFN\gamma (100 U/ml, 24 h), aumentando más a las 96 h (no mostrado).The induction of IL-18BP by IFNγ was assayed in the U937 cell line. IFNγ did not induce IL-18BP in undifferentiated U937 cells, however, after differentiation with forbol ester (TPA, 10 ng / ml) in macrophage-like cells, a baseline level of IL-18BP (0.07 ± 0.01 ng / ml), and increased by 4.6 ± 0.05 times when inducing with IFNγ (100 U / ml, 24 h), increasing more at 96 h (not shown).

El efecto de otras citocinas, tales como IFN\alpha2, IFN\beta, IL-1, IL-6, IL-12, IL-18 y TNF\alpha, sobre la expresión de IL-18BP, fue ensayado en células HepG2 (figura 2B). Los resultados obtenidos después de la incubación de las células con las distintas citocinas en presencia o en ausencia de IFN\gamma (Fig. 1 en la web PNAS) muestra que IFN\alpha2, IFN\beta, IL-1, IL-6, IL-12, IL-18 y TNF\alpha no indujeron IL-18BP solos. Sin embargo, en células HepG2 la IL-6 y el TNF\alpha actuaron sinérgicamente con IFN\gamma, proporcionando un aumento de IL-18BP estadísticamente significativo.The effect of other cytokines, such as IFNα2, IFNβ, IL-1, IL-6, IL-12, IL-18 and TNFα, on the expression of IL-18BP, was tested in HepG2 cells (Figure 2B). The results obtained after incubation of the cells with the different cytokines in the presence or absence of IFNγ (Fig. 1 on the PNAS website) shows that IFN? 2, IFN?, IL-1, IL-6, IL-12, IL-18 and TNFα did not induce IL-18BP alone. Without However, in HepG2 cells IL-6 and TNF? acted synergistically with IFNγ, providing an increase of statistically significant IL-18BP.

Estos resultados indican que la IL-18BP puede ser inducida por IFN\gamma, en monocitos y en muchas células diferentes. La inducción de IL-18BP por IFN\gamma se intensifica más mediante la adición de IL-6 y TNF\alpha.These results indicate that the IL-18BP can be induced by IFNγ, in monocytes and in many different cells. Induction of IL-18BP by IFNγ is further enhanced by the addition of IL-6 and TNFα.

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Ejemplo 3Example 3 El gen de IL-18BP está regulado transcripcionalmente por el IFN\gamma, requiriendo síntesis de proteínas de novo The IL-18BP gene is transcriptionally regulated by IFNγ, requiring de novo protein synthesis

Con el fin de comprobar si la inducción de mRNA de IL-18BP por el IFN\gamma es a nivel de la transcripción, se midió el efecto del interferón en células HepG2 y Wish en presencia de un inhibidor de la traducción, actinomicina D (Fig. 3A). El aumento de los niveles de mRNA de IL-18BP fue detectable por medio de RT-PCR semicuantitativa después de 3 h de tratamiento con IFN\gamma en células HepG2, y solamente después de 5 h en células Hakat y WISH. El pretratamiento de las células HepG2 y WISH con actinomicina D antes de la estimulación con IFN\gamma anuló la expresión de MRNA de IL-18BP en varios valores del tiempo, lo que indica que el IFN\gamma estimula la síntesis de mRNA de novo.In order to verify whether the induction of IL-18BP mRNA by IFNγ is at the level of transcription, the effect of interferon on HepG2 and Wish cells was measured in the presence of a translation inhibitor, actinomycin D (Fig. 3A). The increase in IL-18BP mRNA levels was detectable by semi-quantitative RT-PCR after 3 h of treatment with IFNγ in HepG2 cells, and only after 5 h in Hakat and WISH cells. Pretreatment of HepG2 and WISH cells with actinomycin D before stimulation with IFNγ suppressed the MRNA expression of IL-18BP at various time values, indicating that IFNγ stimulates de novo mRNA synthesis .

La acumulación de IL-18BP fue evidente a las 24 h, y más, después del tratamiento con IFN\gamma, lo que apoya una dependencia de la expresión de IL-18BP de la inducción de proteínas precedente, p. ej. factores de transcripción, por el IFN\gamma. Por consiguiente, con el fin de confirmar tal hipótesis, se empleó además un inhibidor de proteína, cicloheximida, para comprobar si la inducción del mRNA de IL-18BP por IFN\gamma requiere la síntesis de proteínas de novo. Los resultados resumidos en la figura 3B indican que el pretratamiento de las células con cicloheximida anuló la inducción del mRNA de IL-18BP. Este resultado indica que la síntesis de proteína de novo es esencial para la activación del gen de IL-18BP por el IFN\gamma.The accumulation of IL-18BP was evident at 24 h, and more, after treatment with IFNγ, which supports a dependence on IL-18BP expression on the preceding protein induction, e.g. ex. transcription factors, by IFNγ. Therefore, in order to confirm such a hypothesis, a protein inhibitor, cycloheximide, was also used to check whether the induction of the IL-18BP mRNA by IFNγ requires de novo protein synthesis . The results summarized in Figure 3B indicate that pretreatment of cells with cycloheximide canceled out the induction of the IL-18BP mRNA. This result indicates that de novo protein synthesis is essential for the activation of the IL-18BP gene by IFNγ.

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Ejemplo 4Example 4 Definir el sitio de inicio de la transcripción de IL-18BPa y su región del promotor, con el fin de cartografiar el promotor de IL-18BPDefine the transcription start site of IL-18BPa and its promoter region, in order to map the IL-18BP promoter

Para estudiar la región del promotor de IL-18BP, se requiere en primer lugar localizar específicamente el sitio de inicio de la transcripción.To study the promoter region of IL-18BP, it is first required to locate specifically the transcription start site.

El sitio de inicio de la transcripción del mRNA de IL-18BPa humana se determinó mediante 5' RACE (RACE Ejemplo 14). Solamente un producto de la PCR, correspondiente a IL-18BPa, la variante de ayuste más abundante, fue obtenido por 5' RACE. El análisis de la secuencia de DNA de este producto reveló el sitio de inicio de la transcripción y un exón adicional de 50 pb después del sitio de inicio de la transcripción en el extremo 5' del mRNA de IL-18BPa humana, correspondiente a las posiciones 785-835 del DNA genómico de IL-18BP (puede encontrarse en la base de datos de nucleótidos Entrez pubmed, nº de registro AF110798). En consecuencia, se generó un nuevo mapa exón-intrón comparando el DNA genómico con el mRNA al que se añadió el nuevo exon 5' (véase la Fig. 4).The mRNA transcription initiation site of human IL-18BPa was determined by 5 'RACE (RACE Example 14). Only one product of the corresponding PCR to IL-18BPa, the most abundant ayuste variant, was  obtained by 5 'RACE. The DNA sequence analysis of this product revealed the transcription start site and an exon additional 50 bp after transcription start site at the 5 'end of the human IL-18BPa mRNA, corresponding to positions 785-835 of the DNA genomic of IL-18BP (can be found in the base of nucleotide data Entrez pubmed, registration number AF110798). In consequently, a new exon-intron map was generated comparing the genomic DNA with the mRNA to which the new one was added exon 5 '(see Fig. 4).

Teniendo el sitio de inicio de la transcripción de IL-18BPa (base 1), pudo analizarse más intensamente el DNA genómico humano secuencia arriba de la base 1 (cromosoma llq clon: RP11-757C15, nº de registro AP000719.4 nucleótidos secuencia arriba de la base 152.178) correspondiente a la región del promotor de IL-18BP. La comparación de este DNA con la base de datos de la etiqueta de secuencia expresada (EST: Expressed Sequence Tag) en NCBI por el programa BLAST, reveló un gen secuencia arriba en la cadena +, que codifica una proteína dedo de zinc (Zinc-finger) (nº de registro AK001961). La secuencia de mRNA depositada de esta proteína dedo de zinc fue prolongada más por el programa "Instant RACE" (www. LabOnWeb.com), que escaneó una colección extensiva de ESTs humanas. El programa puso el mRNA del extremo 3' de la proteína dedo de Zn en el nucleótido 150.517 del clon genómico RP11-757C15, limitando así la secuencia reguladora secuencia arriba potencial de la IL-18BPa a 1661 bases secuencia arriba de la base 1.Having the transcription start site of IL-18BPa (base 1), human genomic DNA could be analyzed more intensely upstream of base 1 (chromosome llq clone: RP11-757C15, registration number AP000719.4 nucleotides upstream of base 152,178) corresponding to the region of the IL-18BP promoter. Comparison of this DNA with the database of the expressed sequence tag (EST: Expressed Sequence Tag) in NCBI by the BLAST program, revealed a gene upstream in the + chain, which encodes a zinc finger protein ( Zinc- finger ) (registration number AK001961). The deposited mRNA sequence of this zinc finger protein was further extended by the "Instant RACE" program (www. LabOnWeb.com), which scanned an extensive collection of human ESTs. The program placed the 3 'end mRNA of the Zn finger protein in nucleotide 150,517 of genomic clone RP11-757C15, thereby limiting the upstream potential regulatory sequence of IL-18BPa to 1661 bases upstream of base 1.

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Ejemplo 5Example 5 Explorar el promotor mínimo, secuencia arriba del gen de IL-18BP, capaz de promover la expresión constitutiva de un gen heterológoExplore the minimum promoter, sequence up the gene from IL-18BP, capable of promoting constitutive expression of a heterolologous gene

Con el fin de encontrar el fragmento mínimo de DNA, secuencia arriba del gen de IL-18BP, capaz de dirigir la expresión de un gen exógeno tal como el gen informador de la luciferasa, fueron generados un vector que contiene hasta 1601 pb correspondiente a la secuencia de DNA secuencia arriba de la base 1 y que incluye 50 pb secuencia abajo del sitio de inicio de la transcripción (SEC ID NO: 5), y vectores que tienen formas truncadas de este DNA (Fig. 5A) fusionados con el gen de la luciferasa (Ejemplo 15). La actividad de la luciferasa en células HepG2 humanas (una línea de carcinoma hepatocelular humano) transfectadas con un vector (pGL3 (1601)) que comprende el de 1601 pb corriente arriba, fue 10,3 \pm 0,9 veces más alta que la actividad obtenida con el vector pGL3 vacío. Tal actividad no fue observada cuando el mismo DNA fue insertado en la orientación opuesta (pGL3 (-1601)). Este resultado demostró que el DNA 1601 pb secuencia arriba de la base 1 tiene actividad de promotor basal. El examen de la secuencia de este fragmento de 1601 pb DNA de 1601 pb reveló que no incluye un elemento de la caja TATA, pero tenía varios dominios ricos en GC cerca del sitio de inicio de la transcripción en las bases -3 a -9, -39 a -48 y -122 a -132. El análisis de la secuencia de DNA de 1601 pb mediante el programa TFSEARCH identificó una secuencia gamma-activada (GAS) en las bases -24 a -32 (Fig. 1). Un análisis más profundo reveló un elemento de respuesta (IRF-E) IRF 1,2 que abarca las bases -57 a -69 y dos elementos de respuesta C/EBP\beta (C/EBP-E) en las bases -309 a -322 y -621 a -634.In order to find the minimum fragment of DNA, upstream of the IL-18BP gene, capable of direct the expression of an exogenous gene such as the reporter gene from luciferase, a vector containing up to 1601 bp corresponding to the DNA sequence upstream of the base 1 and that includes 50 bp downstream of the start site of transcription (SEQ ID NO: 5), and vectors that have shapes truncated from this DNA (Fig. 5A) fused with the gene of the Luciferase (Example 15). Luciferase activity in cells Human HepG2 (a line of human hepatocellular carcinoma) transfected with a vector (pGL3 (1601)) comprising that of 1601 upstream bp, was 10.3 ± 0.9 times higher than the activity obtained with the empty pGL3 vector. Such activity was not observed when the same DNA was inserted into the orientation opposite (pGL3 (-1601)). This result showed that DNA 1601 bp upstream of base 1 has basal promoter activity. He sequence examination of this 1601 bp DNA fragment of 1601 bp revealed that it does not include an item from the TATA box, but had several GC-rich domains near the start site of the transcription in the bases -3 to -9, -39 to -48 and -122 to -132. He DNA sequence analysis of 1601 bp by the program TFSEARCH identified a gamma-activated sequence (GAS) in the bases -24 to -32 (Fig. 1). A deeper analysis revealed a response element (IRF-E) IRF 1.2 that covers the bases -57 to -69 and two response elements C / EBP? (C / EBP-E) on bases -309 to -322 and -621 to -634.

Se ensayó una serie de vectores informadores de luciferasa con truncamientos progresivos en el extremo 5' del fragmento de 1601 pb. Los resultados resumidos en la figura 5A indican que todas las construcciones, incluyendo pGL3 (122), que contienen solamente los elementos IRF y GAS, fueron al menos tan efectivas como pGL3 (1601) en el apoyo a la actividad de promotor basal.A series of reporter vectors of Luciferase with progressive truncation at the 5 'end of the 1601 bp fragment. The results summarized in Figure 5A indicate that all constructions, including pGL3 (122), that they contain only the IRF and GAS elements, they were at least as effective as pGL3 (1601) in supporting promoter activity basal.

Estos resultados revelaron que el fragmento de 122 pb (SEC ID Nº: 3) que comprende los elementos IRF y GAS son suficientes para promover la actividad basal de un gen heterólogo (Fig. 5A).These results revealed that the fragment of 122 bp (SEQ ID NO: 3) comprising the IRF and GAS elements are sufficient to promote the basal activity of a heterologous gene (Fig. 5A).

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Ejemplo 6Example 6 Explorar el promotor mínimo, secuencia arriba del gen de IL-18BP, capaz de promover la expresión inducible de un gen heterólogoExplore the minimum promoter, sequence up the gene from IL-18BP, capable of promoting the inducible expression of a heterologous gene

Con el fin de identificar el fragmento de DNA mínimo, región secuencia arriba del promotor de IL-18BP capaz de promover la expresión de la luciferasa inducida por IFN\gamma, se ensayaron los vectores de DNA truncados del ejemplo precedente en células HepG2 transfectadas en presencia de IFN\gamma (figura 5B, para las transfecciones véase el ejemplo 16).In order to identify the DNA fragment minimum, upstream region of the promoter of IL-18BP capable of promoting the expression of IFNγ-induced luciferase, the vectors of Truncated DNA from the preceding example in transfected HepG2 cells in the presence of IFNγ (Figure 5B, for transfections see example 16).

Los resultados resumidos en la figura 5B indican que después de 24 h el IFN\gamma hizo aumentar la actividad de la luciferasa en 33 veces sobre el nivel de expresión basal en el vector que incluye solamente los elementos IRF-E y GAS (vector pGL3 (122)). Este resultado demuestra que el par IRF-E-GAS sólo puede mediar la inducción génica heteróloga por IFN\gamma. La inclusión de elementos C/EBP-E1 y 2 (pGL3 (656)) hizo aumentar significativamente la inducción de la actividad de la luciferasa por IFN\gamma a 88 veces sobre la actividad basal, lo que demuestra la importancia de estos elementos en la inductividad por IFN\gamma. En cambio, la inclusión de un DNA secuencia arriba adicional a tal inserto (pGL3 (1106) anuló la inducción de la actividad de la luciferasa por encima de su nivel basal. Este resultado sugirió que dentro de las bases -656 a -1106 (secuencia arriba del segundo elemento C/EBP-E1) reside un elemento silenciador. Se demostró que tres elementos de respuesta AP1 están presentes dentro de la región silenciadora y que c-Jun se une y está implicado en la silenciación del gen de IL-18BP a través de los tres elementos de respuesta AP-1.The results summarized in Figure 5B indicate that after 24 h IFN? increased the activity of the luciferase 33 times above the level of basal expression in the vector that includes only the IRF-E elements and GAS (vector pGL3 (122)). This result shows that the pair IRF-E-GAS can only mediate the heterologous gene induction by IFNγ. The inclusion of Elements C / EBP-E1 and 2 (pGL3 (656)) increased significantly inducing luciferase activity by IFNγ at 88 times over baseline activity, which demonstrates the importance of these elements in inductivity by IFNγ. Instead, the inclusion of a DNA sequence up additional to such an insert (pGL3 (1106) canceled the induction of the Luciferase activity above its baseline level. This result suggested that within the bases -656 to -1106 (sequence above the second element C / EBP-E1) resides a silencer element. It was shown that three response elements AP1 are present within the silencer region and that c-Jun joins and is involved in silencing of the IL-18BP gene through the three elements of AP-1 answer.

La extensión más profunda del promotor en 88 bases secuencia arriba del silenciador (pGL3 (1272)) restableció la respuesta a IFN\gamma, sugiriendo que en las bases -1106 a -1272 reside un elemento mejorador, y su activación por IFN\gamma suprime el efecto del silenciador vecino. Más extensión de la secuencia no afectó a la actividad basal o inducida por IFN\gamma, sugiriendo que todas las secuencias reguladoras secuencia arriba estaban localizadas dentro de las bases -1 a -1272 (SEC ID Nº: 1).The deepest extent of the promoter in 88 bases upstream of the silencer (pGL3 (1272)) restored the response to IFNγ, suggesting that in bases -1106 to -1272 an improving element resides, and its activation by IFN? suppress the effect of the neighbor silencer. More extension of the sequence did not affect basal or induced activity IFNγ, suggesting that all regulatory sequences sequence above were located within bases -1 to -1272 (SEQ ID NO: 1).

De todas las construcciones ensayadas, la inductividad del pGL3 (656) es la más alta, lo que indica que este fragmento de DNA contiene el promotor inducible óptimo de IL-18BP.Of all the constructions tested, the inductance of pGL3 (656) is the highest, indicating that this DNA fragment contains the optimal inducible promoter of IL-18BP.

Los resultados indican que el promotor inducible mínimo está situado 122 pb secuencia arriba del sitio de inicio de la transcripción (SEC ID Nº: 3) que contiene los elementos IRF-E y GAS, en donde el promotor inducible máximo y óptimo está situado 656bp secuencia arriba del sitio de inicio de la transcripción (SEC ID NO: 2) que contiene, además de los elementos IRF-E y GAS, dos elementos C/EBPp.The results indicate that the inducible promoter minimum is located 122 bp upstream of the start site of the transcript (SEQ ID NO: 3) that contains the elements IRF-E and GAS, where the maximum inducible promoter and optimal is located 656bp upstream of the start site of the transcript (SEQ ID NO: 2) that contains, in addition to the IRF-E and GAS elements, two C / EBPp elements.

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Ejemplo 7Example 7 Participación de IRF-1 en la expresión de IL-18BP in-vivo Participation of IRF-1 in the expression of IL-18BP in-vivo

Para explorar la participación de IFR-1, cuyo sitio de unión se encontró que estaba en el promotor de IL-18BP, en la expresión de IL-18BP, se estudió la expresión de IL-18BP en ratones deficientes en IRF-1.To explore the participation of IFR-1, whose binding site was found to be in the IL-18BP promoter, in the expression of IL-18BP, the expression of IL-18BP in mice deficient in IRF-1

Los niveles de IL-18BP se midieron en ratones deficientes en IRF-1 (Jackson Laboratories, Bar Harbor ME) antes y después de la administración de IFN\gamma murinay, y se compararon con los de ratones testigo C57B1/6 (Fig. 6). La IL-18BP basal en el suero en los ratones testigo C57B1/6 fue 9,1 \pm 1,9 ng/ml y fue aumentada significativamente por IFN\gamma a 22,4 \pm 2,2 ng/ml. En cambio, la IL-18BP en suero en ratones deficientes en IRF-1 estaba por debajo del límite de detección y aumentó a solamente 0,7 \pm 1,15 ng/ml con IFN\gamma. Este resultado confirmó la importancia del IRF-1 como mediador de la expresión de IL 18BP tanto basal como inducida por IFN\gamma.IL-18BP levels are measured in mice deficient in IRF-1 (Jackson Laboratories, Bar Harbor ME) before and after administration of IFNγ murinay, and were compared with those of control mice C57B1 / 6 (Fig. 6). Basal serum IL-18BP in C57B1 / 6 control mice was 9.1 ± 1.9 ng / ml and was increased significantly by IFNγ at 22.4 ± 2.2 ng / ml. In change, serum IL-18BP in deficient mice in IRF-1 it was below the detection limit and increased to only 0.7 ± 1.15 ng / ml with IFNγ. This result confirmed the importance of IRF-1 as mediator of IL 18BP expression both basal and induced IFNγ.

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Ejemplo 8Example 8 Detección de los factores de transcripción que se unen al promotor de IL-18BP bajo condiciones inductivasDetection of transcription factors that bind to IL-18BP promoter under inductive conditions

Se emplearon ensayos de desplazamiento de la movilidad electroforética (EMSA: Electrophoretic Mobility Shift Assays, Ejemplo 18) para identificar las interacciones proteína-DNA entre los diversos elementos de respuesta dentro del promotor de IL-18BP. Sondas marcadas de DNA ds (doble cadena) correspondientes a las bases -33 a -75 (que contienen el IRF-E) y -8 a -55 (que contienen el GAS) se dejaron unir con extractos nucleares de células testigo y de células tratadas con IFN\gamma. Un complejo de la sonda que contiene IRF-E y proteína o proteínas nucleares fue evidente después de la incubación de las células durante 1 h con IFN\gamma y se observó la respuesta máxima a las 3 h (Fig. 7 A, pistas 1-5). Como se esperaba, la adición de anticuerpos contra IRF-E provocó un "super-desplazamiento", mientras que los anticuerpos anti transductor de la señal y activador de transcripción 1 (STAT1) no tuvo efecto (datos no mostrados). Al contrario que con IRF-E, la sonda que contiene GAS se asoció constitutivamente con una proteína (Fig. 7 A, pista 6), y este complejo fue mejorado en la inducción de las células IFN\gamma durante 3 a 6 h (pistas 7,8). Es de esperar que GAS se una al dímero STAT1 inducido por IFN\gamma. Sin embargo, el complejo no fue afectado por anticuerpos contra STAT1 (pista 10), lo que sugiere que el dímero de STAT1 inducido por IFN\gamma no estaba asociado con este GAS. El mismo resultado negativo se obtuvo con extractos nucleares de células tratadas con IFN\gamma durante solamente 15 ó 30 min (datos no mostrados). Sorprendentemente, este complejo fue anulado por anticuerpos contra C/EBP\beta (pista 9) y fue superdesplazado con anticuerpos contra IRF-1 (pista 10). Por ello la sonda de DNA que contiene GAS parece unirse a C/EBP\beta a pesar de la falta de un C/EBP\beta E de consenso.Displacement tests of the electrophoretic mobility (EMSA: Electrophoretic Mobility Shift Assays, Example 18) to identify interactions protein-DNA between the various elements of response within the IL-18BP promoter. Probes labeled ds DNA (double strand) corresponding to the bases -33 to -75 (containing IRF-E) and -8 to -55 (which contain the GAS) were allowed to bind with nuclear extracts of control cells and cells treated with IFNγ. A complex of the probe containing IRF-E and protein or nuclear proteins was evident after incubation of the cells for 1 h with IFNγ and the response was observed maximum at 3 o'clock (Fig. 7 A, tracks 1-5). How I know I expected, the addition of antibodies against IRF-E caused a "super-displacement" while anti signal transducer and activator antibodies Transcript 1 (STAT1) had no effect (data not shown). To the contrary to IRF-E, the probe containing GAS it was constitutively associated with a protein (Fig. 7 A, lane 6), and this complex was improved in cell induction IFNγ for 3 to 6 h (lanes 7.8). Hopefully, GAS will one to the STAT1 dimer induced by IFNγ. However the complex was not affected by antibodies against STAT1 (lane 10), suggesting that the IFNγ-induced STAT1 dimer does not I was associated with this GAS. The same negative result was obtained with nuclear extracts from IFNγ treated cells during only 15 or 30 min (data not shown). Surprisingly, this complex was canceled by antibodies against C / EBP? (lane 9) and was super displaced with antibodies against IRF-1 (track 10). This is why the DNA probe containing GAS seems to bind to C / EBP? despite the lack of a C / EBP? E of consensus.

Los resultados obtenidos con EMSA indican que, en la inducción con IFN\gamma, el IRF-1 se une al elemento IRF-E en el promotor de IL-18BP. Además, se forma un complejo que comprende IRF-1 y C/EBP\beta y se une al elemento GAS.The results obtained with EMSA indicate that, in induction with IFNγ, IRF-1 binds to IRF-E element in the promoter of IL-18BP. In addition, a complex is formed comprising IRF-1 and C / EBP? And binds to the GAS element.

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Ejemplo 9Example 9 Explorar el papel del complejo IRF-1-C/EBPp en la inducción de IL-18BPExplore the role of the complex IRF-1-C / EBPp in the induction of IL-18BP

Para estudiar mejor el papel de IRF-1 y C/EBP\beta en la inducción del gen de IL-18BP, se midió el mRNA de IL-18BPa mediante PT-PCR semicuantitativa después de la sobreexpresión de IRF-1 y C/EBP\beta empleando la transfección de vectores de expresión (Ejemplo 14, Fig. 7 B). La sobreexpresión del factor de transcripción o bien de una combinación de ambos factores en células HepG2 no indujo mRNA de IL-18BP. Este resultado sugirió que se requieren factores inducidos por IFN\gamma adicionales para la activación del gen de IL-18BP. La transfección de las células con uno cualquiera de los vectores de expresión seguida por su inducción con IFN\gamma redujo realmente el mRNA de IL-18BP en comparación con IFN\gamma sólo. En cambio, la coexpresión de los dos factores de transcripción hizo aumentar la inducción de mRNA de IL-18BP por IFN\gamma. Este resultado sugirió que IRF-1 y C/EBP\beta han de estar presentes en una determinada relación, posiblemente formando un complejo dentro del complejo de iniciación de la transcripción. Para estudiar mejor la posible interacción entre IRF-1 y C/EBP se llevó a cabo una titulación de la actividad de luciferasa cotransfectando células con pGL3 (1272), una cantidad fija de un vector de expresión IRF-1 y cantidades variables de vector de expresión C/EBPR. Del mismo modo, se midió la actividad de la luciferasa cuando se mantenía constante el vector C/EBP\beta y con cantidades variables de vector IRF-1. En ambos casos se obtuvo una curva de respuesta a la dosis en forma de campana, lo que sugiere que la inducción de IL-18BP óptima requiere una relación molar fija entre estos dos factores de transcripción (Fig. 7 C).To better study the role of IRF-1 and C / EBP? In the induction of the gene of IL-18BP, the mRNA of IL-18BPa by PT-PCR semiquantitative after overexpression of IRF-1 and C / EBP? Using transfection of expression vectors (Example 14, Fig. 7 B). The overexpression of transcription factor or a combination of both factors HepG2 cells did not induce IL-18BP mRNA. This result suggested that factors induced by Additional IFNγ for gene activation of IL-18BP. The transfection of cells with one any of the expression vectors followed by its induction with IFNγ actually reduced the mRNA of IL-18BP in comparison with IFNγ only. Instead, the co-expression of two transcription factors increased mRNA induction of IL-18BP by IFNγ. This result suggested that IRF-1 and C / EBP? Must be present in a certain relationship, possibly forming a complex within the transcription initiation complex. To better study the possible interaction between IRF-1 and C / EBP led to perform a titration of luciferase activity by transfecting cells with pGL3 (1272), a fixed amount of a vector of IRF-1 expression and variable amounts of vector of C / EBPR expression. Similarly, the activity of the luciferase when the C / EBP? vector was kept constant and with varying amounts of IRF-1 vector. In both cases a dose response curve was obtained in the form of bell, suggesting that the induction of IL-18BP optimal requires a fixed molar relationship between these two factors of transcription (Fig. 7 C).

Se realizaron estudios de inmunoprecipitación con el fin de confirmar la asociación física entre IRF-1 y C/EBP\beta (Ejemplo 19, Fig. 7 D). La inmunoprecipitación (ip) seguida por inmunotransferencia (ib: immunoblotting) de proteínas nucleares y citoplásmicas (Ejemplo 15) procedentes de células tratadas con IFN\gamma, con anticuerpos contra CfEBP\beta, reveló que C/EBP\beta se expresa constitutivamente en células HepG2 y transloca al núcleo en respuesta a IFN\gamma (panel superior). Al contrario que C/EBP\beta que no se induce por IFN\gamma, la ip y la ib de extractos celulares con anticuerpos contra IRF-1 revelaron que el IFN\gamma induce la expresión de IRF-1. Pero al igual que C/EBP\beta, en la inducción por IFN\gamma, IRF-1 se transloca al núcleo (panel intermedio). La ip con anticuerpos contra C/EBP\beta, seguida por la ib con anticuerpos contra IRF-1, reveló la presencia de un complejo IRF-1-C/EBP\beta estable en la fracción nuclear (panel inferior). Estos resultados confirman la formación del IRF-1-C/EBP\beta en la inducción con IFN\gamma y es la primera demostración de la existencia de tal complejo entre estos dos factores de transcripción. Así, al tener lugar la inducción por IFN\gamma, la secuencia proximal que contiene GAS y su IRF-E adyacente se unen al complejo de C/EBP\beta y IRF-1.Immunoprecipitation studies were performed in order to confirm the physical association between IRF-1 and C / EBP? (Example 19, Fig. 7 D). Immunoprecipitation (ip) followed by immunoblotting (ib: i mmuno b lotting) of nuclear and cytoplasmic proteins (Example 15) from cells treated with IFN?, With antibodies against CfEBP? Revealed that C / EBP? Is expressed constitutively in HepG2 cells and translocates to the nucleus in response to IFNγ (upper panel). In contrast to C / EBP? That is not induced by IFN?, The ip and ib of cell extracts with antibodies against IRF-1 revealed that IFN? Induces the expression of IRF-1. But like C / EBP?, In the induction by IFN?, IRF-1 translocates to the nucleus (intermediate panel). The ip with antibodies against C / EBP?, Followed by the ib with antibodies against IRF-1, revealed the presence of a stable IRF-1-C / EBP? Complex in the nuclear fraction (lower panel). These results confirm the formation of IRF-1-C / EBP? In induction with IFN? And is the first demonstration of the existence of such a complex between these two transcription factors. Thus, upon induction by IFN?, The proximal sequence containing GAS and its adjacent IRF-E bind to the C / EBP? And IRF-1 complex.

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Ejemplo 10Example 10 Explorar el papel de los C/EBP-Es en el promotor de la actividad de IL-18BPExplore the role of C / EBP-Es in the promoter of IL-18BP activity

Los dos sitios C/EBP\beta en la posiciones -309 a -322 y -621 a -634 no tienen un IRF-E adyacente. En realidad, el EMSA (ensayo de desplazamiento de la movilidad electroforética) (Ejemplo 18) de una sonda correspondiente a los sitios C/EBP\beta en las posiciones -309 a -322 reveló una banda retardada (punta de flecha rellena) que estaba superdesplazada con anticuerpos contra C/EBP\beta (punta de flecha vacía) pero no con anticuerpos contra IRF-1 (Fig. 8 A). Por ello se sacó la conclusión de que este sitio se une a C/EBP\beta y no su complejo con IRF-1. Además, esta banda fue generada con un extracto nuclear de células HepG2 no inducidas que expresan constitutivamente C/EBP\beta, pero que carecen de IRF-1. De hecho, el IFN\gamma no hizo aumentar la expresión de C/EBP\beta en estas células (Fig. 8 D) y en consecuencia no hizo aumentar intensidad de la banda retardada (Fig. 8 A). Resultados similares fueron obtenidos con el sitio más distal C/EBP\beta (datos no mostrados).The two C / EBP? Sites in positions -309 to -322 and -621 to -634 do not have an IRF-E adjacent. Actually, the EMSA (displacement test of the electrophoretic mobility) (Example 18) of a corresponding probe  to the C / EBP? sites at positions -309 to -322 revealed a delayed band (filled arrowhead) that was super-displaced with antibodies against C / EBP? (arrowhead empty) but not with antibodies against IRF-1 (Fig. 8 TO). Therefore, the conclusion that this site joins C / EBP? And not its complex with IRF-1. Further, this band was generated with a nuclear extract of HepG2 cells not induced constitutively expressing C / EBP?, but which They lack IRF-1. In fact, the IFN? Did not increase the expression of C / EBP? in these cells (Fig. 8 D) and consequently it did not increase the intensity of the delayed band (Fig. 8 A). Similar results were obtained with the site more distal C / EBP? (data not shown).

Los resultados indican que el factor de transcripción C/EBP, a diferencia del IRF-1, se expresa constitutivamente y no es inducido por IFN\gamma, y que además de unirse a IRF-1 y a GAS, se une a los dos elementos C/EBP presentes en el promotor de IL-18BP.The results indicate that the factor of C / EBP transcription, unlike IRF-1, is constitutively expresses and is not induced by IFNγ, and that In addition to joining IRF-1 and GAS, it joins the two C / EBP elements present in the promoter of IL-18BP.

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Ejemplo 11Example 11 Estudiar el papel del mejorador en la expresión de IL-18BPStudy the role of the improver in the expression of IL-18BP

El papel regulador del mejorador distal fue estudiado mediante EMSA (Ejemplo 18) con una sonda DNA de 192 pb, correspondientes a los nucleótidos -1081 a -1272. El extracto nuclear de células HepG2 testigo formó un complejo con esta sonda (Fig. 8 B, punta de flecha rellena). En el tratamiento de las células con IFN\gamma, el complejo fue más intenso y algo más retardado. Entonces se realizó un superdesplazamiento de este complejo con anticuerpos dirigidos contra IRF-1, C/EBP\beta y cFos. De estos, solamente el anti IRF-1 provocó un superdesplazamiento (Fig. 8 B, punta de flecha vacía). Un DNA ds no marcado correspondiente a los nucleótidos -1083 a -1174 no compitió con la sonda radiomarcada, lo que indica que las proteínas nucleares estaban unidas a los restos -1175 a -1272. Como el IRF-E fue identificado solamente en la región proximal, este resultado sugiere que el mejorador distal estaba probablemente asociado con el IRF-E proximal.The regulatory role of the distal improver was studied by EMSA (Example 18) with a 192 bp DNA probe, corresponding to nucleotides -1081 to -1272. The extract Nuclear control HepG2 cell formed a complex with this probe (Fig. 8 B, filled arrowhead). In the treatment of IFNγ cells, the complex was more intense and somewhat more delayed. Then there was a super shift of this complex with antibodies directed against IRF-1, C / EBP? And cFos. Of these, only the anti IRF-1 caused an over displacement (Fig. 8 B, empty arrowhead). An unlabeled ds DNA corresponding to the nucleotides -1083 to -1174 did not compete with the radiolabeled probe, which which indicates that nuclear proteins were bound to the remains -1175 to -1272. How IRF-E was identified only in the proximal region, this result suggests that the distal improver was probably associated with the IRF-E proximal.

Estos resultados indican que el mejorador distal interacciona con el promotor basal a través de IRF-1.These results indicate that the distal improver interacts with the basal promoter through IRF-1

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Ejemplo 12Example 12 ELISA para IL-18BPELISA for IL-18BP

La IL-18BP humana se midió mediante un ELISA de doble anticuerpo como se ha descrito (Novick et al 2001). La IL-18BP de ratón se midió mediante un ELISA de doble anticuerpo usando anticuerpo policlonal purificado por afinidad de antígeno de conejo, contra IL-18BP murina y anticuerpo biotinilado, que se obtuvieron de Cytolab, Israel.Human IL-18BP was measured by a double antibody ELISA as described (Novick et al 2001). Mouse IL-18BP was measured by a double antibody ELISA using rabbit polygon affinity purified polyclonal antibody against murine IL-18BP and biotinylated antibody, which were obtained from Cytolab, Israel.

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Ejemplo 13Example 13 Aislamiento y PCR con Transcripción Inversa (RT) del RNAIsolation and PCR with Reverse Transcription (RT) of RNA

Después del tratamiento en medio libre de suero, las células HepG2 y WISH (10^{6}) fueron recolectadas en los tiempos indicados y el RNA total se extrajo usando reactivo TRI. El cDNA se preparó usando hexámeros aleatorios y SuperscriptII (Invitrogen^{TM}, Leek, Holanda) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. La PCR se llevó a cabo con los cebadores siguientes: IL-18BP humana, 5'CACGTCGTCACTCTCCTGG y 5'CGACGTGACGCTG
GACAAC; IRF-1 humana 5'GACCCTGGCTAGAGATGCAG y 5'GAGCTGCTGAGTCCATCAG; \beta Actina humana 5'GTGGGGCGCCCCAGGCACCA y 5'CTCCTTAATGTCACGCACGATTTC. Las amplificaciones se hicieron por desnaturalización inicial (92ºC, 2 min), 28 ciclos de desnaturalización (92ºC, 45 sec.), apareamiento (annealing) (62ºC, 1 min) y alargamiento (extensión) (72ºC, 1,5 min), y alargamiento final (72ºC, 10 min). Los productos de PCR resultantes fueron resueltos mediante electroforesis en gel de agarosa (1%).
After treatment in serum-free medium, HepG2 and WISH cells (10 6) were collected at the indicated times and the total RNA was extracted using TRI reagent. The cDNA was prepared using random hexamers and SuperscriptII (Invitrogen ™, Leek, The Netherlands) according to the manufacturer's instructions. PCR was carried out with the following primers: human IL-18BP, 5'CACGTCGTCACTCTCCTGG and 5'CGACGTGACGCTG
GACAAC; Human IRF-1 5'GACCCTGGCTAGAGATGCAG and 5'GAGCTGCTGAGTCCATCAG; human? Actin 5'GTGGGGCGCCCCAGGCACCA and 5'CTCCTTAATGTCACGCACGATTTC. The amplifications were made by initial denaturation (92 ° C, 2 min), 28 cycles of denaturation (92 ° C, 45 sec.), Mating (annealing) (62 ° C, 1 min) and elongation (extension) (72 ° C, 1.5 min), and final elongation (72 ° C, 10 min). The resulting PCR products were resolved by agarose gel electrophoresis (1%).

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Ejemplo 14Example 14 Amplificación (multiplicación) rápida de los extremos de cDNA 5' (5'RACE)Rapid amplification (multiplication) of the 5 'cDNA ends (5'RACE)

Se llevó a cabo 5'RACE con un sistema 5'RACE (GIBCO BRL) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. De forma resumida, el RNA total de las células WISH tratadas con IFN\gamma fue sometido a transcripción inversa (Ejemplo 13) con un cebador complementario de los nucleótidos 89 a 70 del mRNA de IL-18BPa (GenBank nº de registro AF110799) seguido por el tailing (adición de cola de nucleótidos) de los extremos recién sintetizados, con un DNA de anclaje. Después se realizó la PCR con un cebador directo complementario del DNA de anclaje y un cebador inverso anidado complementario a los nucleótidos 31 a 11 del mRNA de IL-18BPa. Los productos de la PCR fueron después subclonados y sometidos a análisis de secuencia de DNA.5'RACE was carried out with a 5'RACE system (GIBCO BRL) according to the manufacturer's instructions. In summary, the total RNA of the WISH cells treated with IFNγ was subjected to reverse transcription (Example 13) with a complementary primer of nucleotides 89 to 70 of the IL-18BPa mRNA (GenBank registration No. AF110799) followed by the tailing (addition of nucleotide tail) of the newly synthesized ends, with an anchor DNA. The PCR was then performed with a direct primer complementary to the anchor DNA and a nested reverse primer complementary to nucleotides 31 to 11 of the IL-18BPa mRNA. The PCR products were then subcloned and subjected to DNA sequence analysis.

       \vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
    
Ejemplo 15Example 15 Plásmidos y clonaciónPlasmids and cloning

La región del promotor de IL-18BPa putativa completa de 1601 pb fue obtenida por PCR del DNA genómico usando un cebador sentido (S4753.pgl) que contiene un sitio Kpn I (5' CTATATGGTACCCACCCTTCCTTTTACTTTTTCC) y un cebador inverso (R1exA) que contiene un sitio NHe I (5'TATCGCTAGCCAGTCACACAGGGAGGCAGT). El producto de la PCR fue clonado en el vector pGEM-T Easy (Promega, Madison, WI) y comprobado por análisis de la secuencia de DNA. Un fragmento Kpn I-Nhe I fue aislado del clon pGEM-T Easy y ligado en el vector pGL3-Basic (Promega) usando el kit de ligación rápida de DNA (Roche) para dar pGL3 (1601). Una serie de informadores truncados 5' (pGL3 (1454), pGL3 (1274), pGL3 (1106), pGL3 (656), pGL3 (280) y pGL3 (122) fue igualmente preparada con el mismo cebador inverso y con los siguientes cebadores sentido, respectivamente:The complete putative IL-18BPa promoter region of 1601 bp was obtained by PCR of the genomic DNA using a sense primer (S4753.pgl) containing a Kpn I site (5 'CTATATGGTACCCACCCTTCCTTTTACTTTTTCC) and a reverse primer (R1exA) containing a NHe I site (5'TATCGCTAGCCAGTCACACAGGGAGGCAGT). The PCR product was cloned into the pGEM-T Easy vector (Promega, Madison, WI) and checked by DNA sequence analysis. A Kpn I-Nhe I fragment was isolated from the pGEM-T Easy clone and ligated into the pGL3-Basic vector (Promega) using the rapid DNA ligation kit (Roche) to give pGL3 (1601). A series of 5 'truncated reporters (pGL3 (1454), pGL3 (1274), pGL3 (1106), pGL3 (656), pGL3 (280) and pGL3 (122) were also prepared with the same reverse primer and with the following primers sense, respectively:

S334. pgl 5': S334 pgl 5 ':
CTATATGGTACCCATGAACTAGACACCTAGAG;CTATATGGTACCCATGAACTAGACACCTAGAG;

       \global\parskip1.000000\baselineskip\ global \ parskip1.000000 \ baselineskip
    

S415. pgl 5': S415 pgl 5 ':
CTATATGGTACCCTACAAGAAGTTTGAGATCA;CTATATGGTACCCTACAAGAAGTTTGAGATCA;

S501. pgl 5': S501. pgl 5 ':
CTATATGGTACCCAGCCGTTGCACCCTCCCAATCAC;CTATATGGTACCCAGCCGTTGCACCCTCCCAATCAC;

lexD pgl 5': lexD pgl 5 ':
CTATATGGTACCGTCTTGGAGCTCCTAGAGG;CTATATGGTACCGTCTTGGAGCTCCTAGAGG;

S504. pgl 5': S504 pgl 5 ':
CTATATGGTACCCACCAAAGTCCTGACACTTG yCTATATGGTACCCACCAAAGTCCTGACACTTG and

Sl39. pgl 5': Sl39 pgl 5 ':
TTGGTACCCACTGAACTTTGGCTAAAGC.TTGGTACCCACTGAACTTTGGCTAAAGC.

Todos los productos de la PCR fueron también clonados en el vector pGL3-Basic en la orientación opuesta para servir de testigos.All PCR products were also cloned into the pGL3-Basic vector in orientation opposite to serve as witnesses.

       \vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
    
Ejemplo 16Example 16 Ensayos de transfección transitoriaTransient transfection assays

Células HepG2 o WISH en placas de 6 pocillos (0,5 x 10^{6}/pocillo) fueron transfectadas usando FuGENE 6 y el vector informador de luciferasa indicado (0,5 \mug/pocillo) y pSV40 (3GAL (0,2 pg/pocillo, Promega) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. En algunos casos la co-transfección se hizo con los siguientes vectores de expresión: pcDNA3-IRF-1 (0,07-1,5 \mug/pocillo, proporcionado gentilmente por el Dr. B. Levy, Technion, Israel); pcDNA3-C/EBP\beta (0,5-2,5 pg/pocillo, proporcionado gentilmente por el Dr. D. Zipori, Weizmann Institute of Science). Al cabo de 16 h las células fueron tratadas con IFN\gamma (100 U/ml), IL-6 (150 U/ml), o TNF\alpha (10 ng/ml), o sus combinaciones indicadas, en medio libre de suero, durante 24 h. Las células fueron después recolectadas y lisadas, y se midió la actividad de la luciferasa. Todos los resultados fueron normalizados frente a la actividad de p-galactosidasa.HepG2 or WISH cells in 6-well plates (0.5 x 10 6 / well) were transfected using FuGENE 6 and the Luciferase reporter vector indicated (0.5 µg / well) and pSV40 (3GAL (0.2 pg / well, Promega) according to the manufacturer's instructions In some cases the co-transfection was done with the following vectors Expression: pcDNA3-IRF-1 (0.07-1.5 µg / well, kindly provided by Dr. B. Levy, Technion, Israel); pcDNA3-C / EBP? (0.5-2.5 pg / well, kindly provided by Dr. D. Zipori, Weizmann Institute of Science). After 16 h the cells were treated with IFNγ (100 U / ml), IL-6 (150 U / ml), or TNFα (10 ng / ml), or their indicated combinations, in serum free medium, for 24 h. The cells were after collected and lysed, and luciferase activity was measured. All results were normalized against the activity of p-galactosidase.

       \vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
    
Ejemplo 17Example 17 Preparación de extractos nucleares y citoplásmicosPreparation of nuclear and cytoplasmic extracts

Las células se lavaron 3x con solución salina tamponada con fosfato (PBS) enfriada con hielo e inmediatamente se congelaron en nitrógeno líquido. Los sedimentos de células fueron resuspendidos en cuatro veces el volumen de las células empaquetadas, de tampón citoplásmico (Hepes 10 mM, pH 7,9, NaCl 10 mM, EDTA 0,1 mM, 5% (en vol.) de glicerol, MgCl_{2} 1,5 mM, ditiotreitol (DTT) 1 mM, PMSF 0,5 mM, NaF 50 mM, Na_{3}VO_{4} 0,1 mM, EGTA 2 mM, EDTA 10 mM, Na_{2}Mo0_{4} 10 mM, 2 \mug/ml de cada uno de los productos leupeptina, pepstatina y aprotinina). El lisado fue centrifugado (3000 x g, 10 min.) y se recogió el sobrenadante que contiene las proteínas citoplásmicas. El sedimento fue resuspendido en 2,5 veces el volumen de las células empaquetadas, de tampón nuclear (idéntico al tampón citoplásmico excepto que el NaCl fue aumentado a 0,42 M). Los residuos de los núcleos se eliminaros por centrifugación (15.000 x g, 20 min., 4ºC), se congelaron en nitrógeno líquido partes alícuotas del sobrenadante y se almacenaron a -80ºC.The cells were washed 3x with saline. Buffered with phosphate (PBS) cooled with ice and immediately They frozen in liquid nitrogen. The cell sediments were resuspended in four times the volume of cells packaged, cytoplasmic buffer (10 mM Hepes, pH 7.9, NaCl 10 mM, 0.1 mM EDTA, 5% (in vol.) of glycerol, 1.5 mM MgCl2, 1 mM dithiothreitol (DTT), 0.5 mM PMSF, 50 mM NaF, Na 3 VO 4 0.1 mM, 2 mM EGTA, 10 mM EDTA, 10 mM Na 2 Mo 4, 2 mug / ml of each of the products leupeptin, pepstatin and aprotinin). The lysate was centrifuged (3000 x g, 10 min.) And the supernatant containing cytoplasmic proteins. Sediment it was resuspended in 2.5 times the volume of the cells packaged, nuclear buffer (identical to cytoplasmic buffer except that NaCl was increased to 0.42 M). Waste from nuclei will be removed by centrifugation (15,000 x g, 20 min., 4 ° C), aliquots of the freeze were frozen in liquid nitrogen supernatant and stored at -80 ° C.

La concentración de proteína se determinó mediante un kit de reactivos de ensayo de proteína BCA (Pierce, Rockford USA) usando albúmina de suero bovino como patrón.Protein concentration was determined by a kit of BCA protein assay reagents (Pierce, Rockford USA) using bovine serum albumin as a standard.

       \vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
    
Ejemplo 18Example 18 Ensayos de desplazamiento de la movilidad electroforéticaTesting of electrophoretic mobility displacement

Oligonucleótidos ds (doble cadena) correspondientes a elementos de respuesta seleccionados (10 pmol) fueron marcados con [^{32}P]3 ATP mediante polinucleótido cinasa (New England Biolabs). Los extractos nucleares (5 \mug de proteína) fueron preincubados (15 min., 0ºC) junto con poli (dI-dC) (Amersham Pharmacia Biotechnology) en 20 \mul de tampón EMSA (Hepes 20 mM pH 7,5; MgCl_{2} 5 mM, EDTA 2 mM, DTT 5 mM y 5% (en vol.) de glicerol). Después se añadió una sonda marcada (3 x 10^{4} cpm) y la incubación continuó durante 30 min. más a temperatura ambiente. Para los ensayos de superdesplazamiento, las muestras se incubaron con los anticuerpos indicados (4 \mug, 1 h a 0ºC) antes de la adición de la sonda. Se añadió un exceso de 200 veces de competidores de tipo silvestre y mutados, junto con la sonda de interés. Las mezclas de reacción fueron después sometidas a electroforesis en geles de poliacrilamida al 5% no desnaturalizante. Los geles se secaron bajo vacío y se autorradiografiaron durante la noche a -80ºC.Oligonucleotides ds (double chain) corresponding to selected response elements (10 pmol) were labeled with [32 P] 3 ATP by polynucleotide kinase (New England Biolabs). The nuclear extracts (5 \ mug of protein) were pre-incubated (15 min., 0 ° C) together with poly (dI-dC) (Amersham Pharmacia Biotechnology) in 20 µL of EMSA buffer (20 mM Hepes pH 7.5; 5 mM MgCl2, EDTA 2 mM, 5 mM DTT and 5% (in vol.) of glycerol). Then one was added labeled probe (3 x 10 4 cpm) and incubation continued for 30 min. more at room temperature. For the trials of super displacement, samples were incubated with antibodies indicated (4 µg, 1 h at 0 ° C) before probe addition. Be added an excess of 200 times of wild-type competitors and mutated, along with the probe of interest. Reaction mixtures were then subjected to electrophoresis in polyacrylamide gels  5% non-denaturing. The gels were dried under vacuum and autoradiographed overnight at -80 ° C.

       \vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
    
Ejemplo 19Example 19 Análisis de inmunoprecipitación (ip) e inmunotransferencia (ib)Immunoprecipitation (ip) and immunoblot analysis (ib)

Extractos de proteína nuclear o citoplásmica (80 \mug) fueron incubados con 6 \mug de los anticuerpos policlonales indicados, durante la noche, a 4ºC, y se inmunoprecipitaron con bolas de Proteína G Sepharose (Pharmacia) durante 1 h a temperatura ambiente. Las bolas se hirvieron después en tampón para muestra para SDS-PAGE que contiene 10% de DTT, y el sobrenadante se resolvió mediante SDS-PAGE (10% de acrilamida) bajo condiciones reductoras. El gel se transfirió después a una membrana de nitrocelulosa y las proteínas se detectaron con los anticuerpos indicados. Los complejos inmunitarios fueron identificados mediante el kit de detección Super Signal^{TM} (Pierce).Nuclear or cytoplasmic protein extracts (80 µg) were incubated with 6 µl of the indicated polyclonal antibodies, overnight, at 4 ° C, and immunoprecipitated with Protein G Sepharose balls (Pharmacia) for 1 h at room temperature. The balls were then boiled in sample buffer for SDS-PAGE containing 10% DTT, and the supernatant was resolved by SDS-PAGE (10% acrylamide) under reducing conditions. The gel was then transferred to a nitrocellulose membrane and the proteins were detected with the indicated antibodies. Immune complexes were identified by the Super Signal ™ detection kit (Pierce).

       \vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
    
Ejemplo 20Example 20 Preparación de r-hsLDLR de CHO usando el promotor de IL-18BPPreparation of CHO r-hsLDLR using the IL-18BP promoter

Células CHO recombinantes estables que expresan LDLR humanos solubles son generadas por cotransfección de células CHO-DUKX carentes del gen de la dihidrofolato reductasa (DHFR) (Urlaub, G. et al., 1980) con dos vectores de expresión: uno que contiene el dominio de unión con el ligando N-terminal del LDLR, que comienza en el resto de aminoácido Asp (+4) hasta Glu 291 (+291), y pDHFR, que contiene el gen murino para DHFR, DHFR controlada por el promotor temprano SV40 y gen sLDLR por el promotor de IL-18BP (SEC ID Nº: 2) y elementos de terminación de la transcripción de la región temprana SV40. La transfección se lleva a cabo mediante liposomas catiónicos usando LipofectAmine (Gibco BRL), de acuerdo con el protocolo descrito por el fabricante. Setenta y dos horas después de la transfección, la células se transfieren a un medio selectivo carente de desoxi y ribonucleósidos y suplementado con 10% de FCS dializado. Las células que expresan actividad de DHFR son capaces de formar colonias, que se aíslan levantando las células con discos de papel empapados en tripsina. Las células se desarrollan y se seleccionan por su actividad de r-hsLDLR. Las células transfectadas se someten después a amplificación génica mediante MTX, seguida por subclonación y selección de los clones productores estables.Stable recombinant CHO cells expressing soluble human LDLRs are generated by cotransfection of CHO-DUKX cells lacking the dihydrofolate reductase (DHFR) gene (Urlaub, G. et al ., 1980) with two expression vectors: one containing the domain binding to the N-terminal ligand of the LDLR, which begins in the rest of amino acid Asp (+4) to Glu 291 (+291), and pDHFR, which contains the murine gene for DHFR, DHFR controlled by the SV40 early promoter and sLDLR gene by the IL-18BP promoter (SEQ ID NO: 2) and transcription termination elements of the SV40 early region. Transfection is carried out by cationic liposomes using LipofectAmine (Gibco BRL), according to the protocol described by the manufacturer. Seventy-two hours after transfection, the cells are transferred to a selective medium devoid of deoxy and ribonucleosides and supplemented with 10% dialyzed FCS. Cells that express DHFR activity are capable of forming colonies, which are isolated by lifting the cells with trypsin-soaked paper discs. The cells develop and are selected for their activity of r-hsLDLR. Transfected cells are then subjected to gene amplification by MTX, followed by subcloning and selection of stable producing clones.

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<110> Yeda Research and Development Co. Ltd.<110> Yeda Research and Development Co. Ltd.

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Rubinstein, Menachem
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Novick, Daniela
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<120> PROMOTOR PARA IL-18BP, SU PREPARACION Y SU USO<120> PROMOTER FOR IL-18BP, ITS PREPARATION AND ITS USE

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<170> PatentIn versión 3.1<170> PatentIn version 3.1

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\hskip-.1em\dddseqskip
cccagaagca gctctggtgc tgaagagagc actgcctccc tgtgtgactg g
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cccagaagca gctctggtgc tgaagagagc actgcctccc tgtgtgactg g
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Claims (31)

1. Una secuencia de DNA que codifica el promotor de la IL-18BP humana (SEC. ID Nº: 1), o un fragmento funcional de la misma, o un derivado funcional de la misma, en donde el extremo 3' de dicha secuencia de DNA o fragmento de la misma comprende la SEC ID Nº 5.1. A DNA sequence encoding the promoter of human IL-18BP (SEQ. ID NO: 1), or a fragment functional thereof, or a functional derivative thereof, in wherein the 3 'end of said DNA sequence or fragment of the It comprises SEQ ID No. 5. 2. La secuencia de DNA según la reivindicación 1ª, en la que el derivado está mutado en uno o más de los sitios AP1 presentes en un elemento silenciador presente en la secuencia.2. The DNA sequence according to claim 1st, in which the derivative is mutated in one or more of the sites AP1 present in a silencer element present in the sequence. 3. La secuencia de DNA según la reivindicación 1ª, en la que el fragmento comprende la SEC ID NO: 2.3. The DNA sequence according to claim 1st, in which the fragment comprises SEQ ID NO: 2. 4. La secuencia de DNA según la reivindicación 1ª, en la que el fragmento comprende la SEC ID NO: 3.4. The DNA sequence according to claim 1st, in which the fragment comprises SEQ ID NO: 3. 5. La secuencia de DNA según una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 4ª, que comprende además un intrón.5. The DNA sequence according to any one of claims 1 to 4, further comprising an intron. 6. La secuencia de DNA según la reivindicación 5ª, en la que el intrón consiste en el primer intrón de IL-18BP.6. The DNA sequence according to claim 5th, in which the intron consists of the first intron of IL-18BP. 7. La secuencia de DNA según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, que contiene además un gen ligado operativamente al promotor de IL-18BP.7. The DNA sequence according to any one of the preceding claims, further containing a linked gene Operationally to the IL-18BP promoter. 8. La secuencia de DNA según la reivindicación 7ª, en la que el gen codifica IL-18BP.8. The DNA sequence according to claim 7th, in which the gene encodes IL-18BP. 9. La secuencia de DNA según la reivindicación 7ª, en la que el gen codifica una proteína heteróloga.9. The DNA sequence according to claim 7th, in which the gene encodes a heterologous protein. 10. La secuencia de DNA según la reivindicación 9ª, en la que el gen heterólogo codifica el gen de la luciferasa.10. The DNA sequence according to claim 9th, in which the heterologous gene encodes the gene of the Luciferase 11. La secuencia de DNA según la reivindicación 9ª, en la que el gen heterólogo codifica una proteína elegida entre interferón-beta, TNF, eritropoietina, activador del plasminógeno tisular, factor estimulador de las colonias de granulocitos, superóxido de manganeso dismutasa, una inmunoglobulina o un fragmento de la misma, hormona del crecimiento, FSH, hCG, IL-18, hsLDLR y proteínas de unión con el receptor del TNF.11. The DNA sequence according to claim 9th, in which the heterologous gene encodes a protein chosen from interferon-beta, TNF, erythropoietin, activator of tissue plasminogen, colony stimulating factor of granulocytes, manganese superoxide dismutase, an immunoglobulin or a fragment thereof, growth hormone, FSH, hCG, IL-18, hsLDLR and receptor binding proteins of TNF. 12. Un vector que comprende una secuencia de DNA según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes.12. A vector comprising a DNA sequence according to any one of the preceding claims. 13. Una célula hospedadora que comprende un vector según la reivindicación 12ª.13. A host cell comprising a vector according to claim 12. 14. Una célula hospedadora según la reivindicación 13ª, que es una célula de mamífero.14. A host cell according to the claim 13, which is a mammalian cell. 15. Una célula hospedadora según la reivindicación 14ª, elegida entre células CHO, WISH, HepG2, Cos, CV-1, HeLA, y Hakat U937.15. A host cell according to the claim 14, selected from CHO, WISH, HepG2, Cos, cells CV-1, HeLA, and Hakat U937. 16. Un método para la producción de una proteína recombinante, que comprende cultivar una célula hospedadora según una cualquiera de las reivindicaciones 13ª a 15ª, y aislar la proteína recombinante producida.16. A method for the production of a protein recombinant, which comprises culturing a host cell according to any one of claims 13 to 15, and isolate the recombinant protein produced. 17. Un vector de virus recombinante que comprende una porción del genoma del virus, un fragmento de DNA que codifica un gen de interés y un fragmento de DNA que comprende una secuencia de DNA que codifica el promotor de IL-18BP humana según una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 6ª, unido operativamente al gen de interés.17. A recombinant virus vector that it comprises a portion of the virus genome, a DNA fragment that encodes a gene of interest and a DNA fragment comprising a DNA sequence encoding the promoter of Human IL-18BP according to any one of the claims 1 to 6, operatively linked to the gene of interest. 18. Un vector de virus recombinante según la reivindicación 17ª, en el que el gen de interés se elige entre interferón-beta, TNF, eritropoietina, activador del plasminógeno tisular, factor estimulador de las colonias de granulocitos, superóxido de manganeso dismutasa, una inmunoglobulina o un fragmento de la misma, hormona del crecimiento, FSH, hCG, IL-18, hsLDLR y proteínas de unión con el receptor del TNF.18. A recombinant virus vector according to the claim 17, wherein the gene of interest is chosen from interferon-beta, TNF, erythropoietin, activator of tissue plasminogen, colony stimulating factor of granulocytes, manganese superoxide dismutase, an immunoglobulin or a fragment thereof, growth hormone, FSH, hCG, IL-18, hsLDLR and receptor binding proteins of TNF. 19. Un vector de virus recombinante según la reivindicación 17ª, en el que la porción del genoma del virus pertenece a un virus adenoasociado.19. A recombinant virus vector according to the claim 17, wherein the portion of the virus genome It belongs to an adeno-associated virus. 20. Un vector de virus recombinante según la reivindicación 17ª, en el que la porción del genoma del virus pertenece a un retrovirus.20. A recombinant virus vector according to the claim 17, wherein the portion of the virus genome It belongs to a retrovirus. 21. Un vector de virus recombinante según la reivindicación 20ª, en el que el retrovirus se elige entre HIV, HFV, MLV, FIV y VSV.21. A recombinant virus vector according to the claim 20, wherein the retrovirus is chosen from HIV, HFV, MLV, IVF and VSV. 22. Un método in vitro de regulación de la expresión específica de la célula de un gen de interés, que comprende transducir una célula diana de mamífero con un vector según una cualquiera de las reivindicaciones 17ª a 21ª.22. An in vitro method of regulating the specific expression of the cell of a gene of interest, which comprises transducing a mammalian target cell with a vector according to any one of claims 17 to 21. 23. Un método según la reivindicación 22ª, en el que la célula diana es una célula troncal hematopoiética.23. A method according to claim 22, in the that the target cell is a hematopoietic stem cell. 24. Un método según la reivindicación 22ª, en el que la célula diana es un monocito.24. A method according to claim 22, in the that the target cell is a monocyte. 25. Un método según la reivindicación 24ª, en el que la célula diana es un macrófago.25. A method according to claim 24, in the that the target cell is a macrophage. 26. Un método según una cualquiera de las reivindicaciones 22ª a 25ª, en el que el gen de interés codifica una proteína que confiere resistencia a la infección por el HIV.26. A method according to any one of the claims 22 to 25, wherein the gene of interest encodes a protein that confers resistance to HIV infection. 27. El uso del vector de virus recombinante según una cualquiera de las reivindicaciones 17ª a 21ª para la elaboración de un medicamento para el tratamiento de la infección por HIV, trastornos hematopoiéticos tales como SCID, enfermedad granulomatosa crónica y talasemia, y/o de una enfermedad en un individuo que muestra un IFN\gamma elevado en un tejido corporal.27. The use of the recombinant virus vector according to any one of claims 17 to 21 for the development of a medication for the treatment of infection by HIV, hematopoietic disorders such as SCID, disease chronic granulomatous and thalassemia, and / or a disease in a individual showing elevated IFNγ in a tissue bodily. 28. El uso según la reivindicación 27ª, en el que el medicamento es para el tratamiento de una enfermedad en un individuo que muestra un IFN\gamma elevado en un tejido corporal, y comprende además factores IL-6 y/o TNF\alpha y/o IRF y/o C/EBP\beta.28. The use according to claim 27, in the that the medicine is for the treatment of a disease in a individual showing elevated IFNγ in body tissue, and further comprises IL-6 and / or TNFα factors and / or IRF and / or C / EBP?. 29. Ratones transgénicos que albergan la secuencia de DNA que codifica una secuencia de DNA según una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 11ª.29. Transgenic mice that house the DNA sequence encoding a DNA sequence according to a any of claims 1 to 11. 30. El uso de una secuencia de DNA que codifica el promotor de la IL-18BP humana (SEC ID NO: 1), o un fragmento o un derivado funcional de la misma, en donde el extremo 3' de dicha secuencia de DNA o fragmento de la misma comprende la SEC ID NO: 5, en la elaboración de un medicamento para el tratamiento de una infección por HIV, trastornos hematopoiéticos tales como SCID, enfermedad granulomatosa crónica y talasemia, y/o de una enfermedad en un individuo que muestra un INF\gamma elevado en un tejido corporal.30. The use of a DNA sequence that encodes the human IL-18BP promoter (SEQ ID NO: 1), or a fragment or a functional derivative thereof, wherein the 3 'end of said DNA sequence or fragment thereof comprises SEQ ID NO: 5, in the preparation of a medicament for the treatment of an HIV infection, hematopoietic disorders such as SCID, chronic granulomatous disease and thalassemia, and / or of a disease in an individual showing an INF? elevated in body tissue. 31. Una composición farmacéutica que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de una secuencia de DNA que codifica el promotor de la IL-18BP humana (SEC ID NO: 1) o un fragmento funcional o un derivado funcional de la misma, en la que el extremo 3' de dicha secuencia de DNA o fragmento de la misma comprende la SEC ID NO: 5.31. A pharmaceutical composition comprising a therapeutically effective amount of a DNA sequence that encodes the human IL-18BP promoter (SEQ ID NO: 1) or a functional fragment or a functional derivative of the same, wherein the 3 'end of said DNA sequence or fragment It comprises SEQ ID NO: 5.
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