ES2319768T3 - Polipeptidos antimicrobianos. - Google Patents
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Abstract
Polipéptido con actividad antimicrobiana, que comprende la secuencia de aminoácidos: ** ver secuencia** en donde X1 = L, I, W o M; X 2 = L, F, W o V; X3 = S, G, K, T, R, I, N, D o E; X 4 = K, T, F, I, R, M, L o S; X5 = L o I; X6 = K, G, R, M o E; X7 = K, S, I, R, T o M; X8 = A, K, T, N, R o E; X 9 = A, G, S, I, L, T, V, M o W; X10 = S, R, K o E; X 11 = K, M, R, H, I, N o T; X12 = A, V, I, L, Y, F o T; X 13 = L, A, G, C, F, V o W; X14 = K, Q, A, S, R o E; X15 = H, G, N, R, S, M, I, V o D; X16 = V, I, A o F; G-X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15-X16-Z; Z = X17 -R-W-L; donde X17 = F, L, R, A, G, V, Y, C o P; y donde los aminoácidos que forman el polipéptido son independientemente seleccionados de las formas D o L.
Description
Polipéptidos antimicrobianos.
En los últimos años, la variedad de agentes
antimicrobianos ha aumentado sustancialmente, con un aumento
paralelo en microorganismos patógenos resistentes. La resistencia
es ahora reconocida contra todos los agentes antimicrobianos
clínicamente disponibles. La respuesta a la resistencia
antimicrobiana en la comunidad médica ha sido el uso de nuevos
antibióticos o alternativos no usados previamente contra las
bacterias resistentes. Este enfoque ha requerido el desarrollo
continuo de antibióticos nuevos, bien como modificaciones de
compuestos que existen habitualmente o como combinaciones de
compuestos que pueden inhibir o derivar los mecanismos de
resistencia bacteriana.
Tossi et al. "Design of synthetic
antimicrobial peptides based on sequence analogy and
amphipathicity", Eur J Biochem, Vol. 250 (2), págs.
549-558 (1997) describieron cuatro péptidos
antimicrobianos sintéticos \alpha-helicoidales
basados en un estudio de las secuencias N-terminales
de péptidos antimicrobianos \alpha-helicoidales
de familias de insectos, de ranas y de mamíferos. Tres de estos
péptidos fueron derivados de la familia de la catelicidina
mamífera.
Hong et al. "Solution structure of a
designed amphipathic antimicrobial synthetic peptide, PGAa",
Biochem Biophys Res Commun, Vol. 276 (3), págs.
1278-1285 (2000) describieron un estudio del péptido
\alpha-helicoidal antimicrobiano sintético, PGAa,
que presenta actividad antifúngica y actividad antibacteriana
contra gram-positivas. El análisis de la estructura
de solución de PGAa fue determinado por espectroscopia CD y
RMN.
Huttner et al., "Localization and
genomic organization of sheep antimicrobial peptide genes",
Gene, Vol. 206 (1), págs. 85-91 (1998) describieron
diez péptidos antimicrobianos potenciales de oveja - dos
\beta-defensinas y ocho catelicidinas. La
disposición genómica de los genes que codifican estos péptidos fue
discutida.
Es un objeto de la presente invención el hecho
de proporcionar polipéptidos nuevos que tengan actividad
antimicrobiana mejorada y polinucleótidos que codifican los
polipéptidos.
En un primer aspecto la presente invención se
refiere a polipéptidos que tienen actividad antimicrobiana, que
comprende la secuencia de aminoácidos:
G-X_{1}-X_{2}-X_{3}-X_{4}-X_{5}-X_{6}-X_{7}-X_{8}-X_{9}-X_{10}-X_{11}-X_{12}-X_{13}-X_{14}-X_{15}-X_{16}-Z;
donde X_{1} = L, I, W o M;
X_{2} = L, F, W o V; X_{3} = S, G, K, T, R, I, N, D o E; X_{4}
= K, T, F, I, R, M, L o S; X_{5} =L o I; X_{6} = K, G, R, M o
E; X_{7} = K, S, I, R, T o M; X_{8} = A, K, T, N, R o E;
X_{9} = A, G, S, I, L, T, V, M o W; X_{10} = S, R, K o E;
X_{11} = K, M, R, H, I, N o T; X_{12} = A, V, I, L, Y, F o T;
X_{13} = L, A, G, C, F, V o W; X_{14} = K, Q, A, S, R o E;
X_{15} = H, G, N, R, S, M, I, V o D; X_{16} = V, I, A o F; Z =
X_{17}-R-W-L;
donde X_{17} = F, L, R, A, G, V, Y, C o P; y donde los aminoácidos
que conforman el polipéptido son independientemente seleccionados
de formas D o
L.
En un segundo aspecto la presente invención se
refiere a polinucleótidos que tienen una secuencia de nucleótidos
que codifica para el polipéptido de la invención.
En un tercer aspecto la presente invención se
refiere a un constructo de ácidos nucleicos que comprende la
secuencia de nucleótidos, que codifica para el polipéptido de la
invención, operativamente enlazado a una o más secuencias de
control que dirigen la producción del polipéptido en un huésped
adecuado.
En un cuarto aspecto la presente invención se
refiere a un vector de expresión recombinante que comprende el
constructo de ácidos nucleicos de la invención.
En un quinto aspecto la presente invención se
refiere a una célula huésped recombinante que comprende el
constructo de ácidos nucleicos de la invención.
En un sexto aspecto la presente invención se
refiere a un método para la producción de un polipéptido de la
invención, el método comprendiendo:
- (a)
- cultivo de una célula huésped recombinante de la invención bajo condiciones propicias para la producción del polipéptido; y
- (b)
- recuperación del polipéptido.
Otros aspectos de la presente invención serán
aparentes de la descripción siguiente y de las reivindicaciones
anexas.
Antes de discutir la presente invención con más
detalle, se definirán en primer lugar los términos y convenciones
siguientes:
- \quad
- Actividad antimicrobiana: el término "actividad antimicrobiana" se define aquí como una actividad que es capaz de matar o de inhibir el crecimiento de células microbianas. En el contexto de la presente invención, el término "antimicrobiano" se destina a significar que hay un efecto bactericida y/o bacteriostático y/o fungicida y/o fungistático y/o un efecto virucida, donde el término "bactericida" debe ser entendido como capaz de matar a las células bacterianas. El término "bacteriostático" debe ser entendido como capaz de inhibir el crecimiento bacteriano, es decir, de inhibir el crecimiento de las células bacterianas. El término "fungicida" debbe ser entendido como capaz de matar a las células micóticas. El término "fungistático" debe ser entendido como capaz de inhibir el crecimiento fúngico, es decir, de inhibir el crecimiento de células micóticas. El término "virucida" debe ser entendido como capaz de inactivar virus. El término "células microbianas" se refiere a células bacterianas o micóticas (incluidas las levaduras).
En el contexto de la presente invención el
término "inhibir el crecimiento de células microbianas" se
destina a significar que las células están en el estado de no
crecimiento, es decir, que éstas no son capaces de reproducirse.
Para objetivos de la presente invención, la
actividad antimicrobiana puede ser determinada según el
procedimiento descrito por Lehrer et al., Journal of
Immunological Methods, Vol. 137 (2) págs. 167-174
(1991).
Los polipéptidos que tienen actividad
antimicrobiana pueden ser capaces de reducir el número de células
de Escherichia coli vivas (DSM 1576) a 1/100 después de 8
horas (preferiblemente después de 4 horas, más preferiblemente
después de 2 horas, de la forma más preferible después de 1 hora, y
en particular después de 30 minutos) incubación a 20ºC en una
solución acuosa del 25%(p/p); preferiblemente en una solución acuosa
del 10%(p/p); más preferiblemente en una solución acuosa del
5%(p/p); incluso más preferiblemente en una solución acuosa del
1%(p/p); de la forma más preferible en una solución acuosa del
0,5%(p/p); y en particular en una solución acuosa del 0,1%(p/p) de
los polipéptidos que tienen actividad antimicrobiana.
Los polipéptidos que tienen actividad
antimicrobiana pueden también ser capaces de inhibir la excrecencia
de Escherichia coli (DSM 1576) durante 24 horas a 25ºC en un
sustrato de crecimiento microbiano, añadido en una concentración de
1000 ppm; preferiblemente añadido en una concentración de 500 ppm;
más preferiblemente añadido en una concentración de 250 ppm;
incluso más preferiblemente cuando se añade en una concentración de
100 ppm; de la forma más preferible añadido en una concentración de
50 ppm; y en particular cuando se añade en una concentración de 25
ppm.
Los polipéptidos que tienen actividad
antimicrobiana pueden ser capaces de reducir el número de células
vivas de Bacillus subtilis (ATCC 6633) a 1/100 después de 8
horas (preferiblemente después de 4 horas, más preferiblemente
después de 2 horas, de la forma más preferible después de 1 hora, y
en particular después de 30 minutos) incubación a 20ºC en una
solución acuosa del 25%(p/p); preferiblemente en una solución acuosa
del 10%(p/p); más preferiblemente en una solución acuosa del
5%(p/p); incluso más preferiblemente en una solución acuosa del
1%(p/p); de la forma más preferible en una solución acuosa del
0,5%(p/p); y en particular en una solución acuosa del 0,1%(p/p) de
los polipéptidos que tienen actividad antimicrobiana.
Los polipéptidos que tienen actividad
antimicrobiana pueden también ser capaces de inhibir la excrecencia
de Bacillus subtilis (ATCC 6633) durante 24 horas a 25ºC en
un sustrato de crecimiento microbiano, añadido en una concentración
de 1000 ppm; preferiblemente añadido en una concentración de 500
ppm; más preferiblemente añadido en una concentración de 250 ppm;
incluso más preferiblemente cuando se añade en una concentración de
100 ppm; de la forma más preferible añadido en una concentración de
50 ppm; y en particular cuando se añade en una concentración de 25
ppm.
Los polipéptidos de la presente invención
deberían preferiblemente tener como mínimo el 20% de la actividad
antimicrobiana del polipéptido que consiste en la secuencia de
aminoácidos mostrada como aminoácidos 1 a 21 de cualquiera de SEC
ID NO:38 a SEC ID NO:46. En una forma de realización particular
preferida, los polipéptidos deberían tener como mínimo el 40%, tal
como al menos el 50%, preferiblemente al menos el 60%, tal como al
menos el 70%, más preferiblemente al menos el 80%, tal como al
menos el 90%, de la forma más preferible al menos el 95%, tal como
aproximadamente o al menos el 100% de la actividad antimicrobiana
del polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos
mostrada como aminoácidos 1 a 21 de cualquiera de la SEC ID NO:38 a
la SEC ID NO:46.
Variante alélica: en el contexto
presente, el término "variante alélica" denota cualquiera de
las dos o formas más alternativas de un gen que ocupa el mismo
locus cromosómico. Variación alélica surge naturalmente a través de
la mutación, y puede resultar en polimorfismo dentro de las
poblaciones. Las mutaciones génicas pueden ser silenciosas (ningún
cambio en el polipéptido codificado) o puede codificar polipéptidos
que tienen secuencias de aminoácidos alteradas. Una variante
alélica de un polipéptido es un polipéptido codificado por una
variante alélica de un gen.
Polinucleótido sustancialmente puro: el
término "polinucleótido sustancialmente puro" como se utiliza
en este caso se refiere a una preparación polinucleótida, donde el
polinucleótido ha sido eliminado de su medio genético natural, y
está por lo tanto libre de otras secuencias de codificación
extrañas o indeseadas y está en una forma adecuada para el uso
dentro de sistemas de producción de proteínas creados genéticamente.
Así, un polinucleótido sustancialmente puro contiene como mucho el
10% en peso de otro material polinucleótido con el cual está
originalmente asociado (porcentajes inferiores de otro material
polinucleótido son preferidos, p. ej. como mucho el 8% en peso,
como mucho el 6% en peso, como mucho el 5% en peso, como mucho el
4%, como mucho el 3% en peso, como mucho el 2% en peso, como mucho
el 1% en peso, y como mucho ½% en peso). Un polinucleótido
sustancialmente puro puede, no obstante, incluir regiones no
traducidas 5' y 3' de origen natural, tales como promotores y
terminadores. Se prefiere que el polinucleótido sustancialmente
puro tenga al menos un 92% de pureza, es decir que el
polinucleótido constituya al menos el 92% en peso del material
polinucleótido total presente en la preparación, y porcentajes más
altos son preferidos tales como al menos el 94% de pureza, al menos
el 95% de pureza, al menos el 96% de pureza, al menos el 96% de
pureza, al menos el 97% de pureza, al menos el 98% de pureza, al
menos el 99%, y como mucho el 99,5% de pureza. Los polinucleótidos
descritos aquí están preferiblemente en una forma sustancialmente
pura. En particular, se prefiere que los polinucleótidos descritos
aquí estén en "forma esencialmente pura", es decir que la
preparación polinucleótida esté esencialmente libre de otro material
polinucleótido con el cual está asociado originalmente. Aquí, el
término "polinucleótido sustancialmente puro" es sinónimo de
los términos "polinucleótido aislado" y "polinucleótido en
forma aislada".
Modificación(es): en el contexto
de la presente invención el término "modificación(es)"
se destina a significar cualquier modificación química del
polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos mostrada
como aminoácidos 1 a 21 de cualquiera de la SEC ID NO:38 a la SEC
ID NO:46 al igual que la manipulación genética del ADN que codifica
los polipéptidos. La(s) modificación(s)
puede(n) ser sustitución(es) de la(s)
cadena(s) lateral(es) de aminoácidos o
sustitución(es) en el(los) aminoácidos) de interés tal
y como se define en la reivindicación 1. En particular
la(s)
modificación(es) puede(n) ser amidaciones, tales como la amidación del C-término.
modificación(es) puede(n) ser amidaciones, tales como la amidación del C-término.
ADNc: el término "ADNc" cuando se
usa en el presente contexto, se destina a cubrir una molécula de
ADN que puede ser preparada por transcripción inversa de una
molécula de ARNm, madura, dividida, derivada de una célula
eucariótica. El ADNc carece de las secuencias de intrones que están
normalmente presentes en el ADN genómico correspondiente. La
transcripción de ARN primario inicial es un precursor para ARNm y
pasa a través de una serie de eventos de tratamiento antes de
aparecer como ARNm maduro dividido. Estos eventos incluyen la
eliminación de secuencias de intrones por un proceso llamado de
empalme. Cuando el ADNc es derivado de ARNm en consecuencia carece
de secuencias de intrones.
Constructo de ácidos nucleicos: cuando se
usa aquí, el término "constructo de ácidos nucleicos"
significa una molécula de ácido nucleico, bien mono o bicatenario,
que es aislado de un gen de origen natural o que ha sido modificado
para contener segmentos de ácidos nucleicos de un modo que de lo
contrario no existiría en la naturaleza. El término constructo de
ácidos nucleicos es sinónimo del término "cassette de
expresión" cuando el constructo de ácidos nucleicos contiene las
secuencias de control requeridas para la expresión de una secuencia
codificante de la presente invención.
Secuencia de control: el término
"secuencias de control" se define aquí para incluir todos los
componentes, que son necesarios o ventajosos para la expresión de
un polipéptido de la presente invención. Cada secuencia de control
puede ser nativa o foránea a la secuencia de nucleótidos que
codifica el polipéptido. Tales secuencias de control incluyen, pero
no se limitan a, una secuencia líder, una secuencia de
poliadenilación, secuencia de propéptido, promotor, secuencia de
péptido señal, y terminador de la transcripción. Como mínimo, las
secuencias de control incluyen un promotor, y señales de parada
transcripcional y traduccional. Las secuencias de control pueden ser
provistas de enlaces con el propósito de introducir sitios de
restricción específicos que facilitan la ligadura de las secuencias
de control con la región codificante de la secuencia de nucleótidos
que codifica un polipéptido.
Operativamente enlazado: el término
"operativamente enlazado" se define aquí como una
configuración donde una secuencia de control es colocada
apropiadamente en una posición correspondiente a la secuencia
codificante de la secuencia de ADN de manera que la secuencia de
control dirige la expresión de un polipéptido.
Secuencia codificante: cuando se usa aquí
el término "secuencia codificante" se destina a cubrir una
secuencia de nucleótidos, que directamente especifica la secuencia
de aminoácidos de su producto proteínico. Los límites de la
secuencia codificante están generalmente determinados por un marco
de lectura abierto, que normalmente se inicia con el codón de
iniciación ATG. La secuencia codificante normalmente incluye ADN,
ADNc, y secuencias de nucleótidos recombinantes.
Expresión: en el presente contexto, el
término "expresión" incluye cualquier fase implicada en la
producción del polipéptido incluyendo, pero sin limitarse a, la
transcripción, modificación postranscripcional, traducción, y
modificación post-traduccional. Preferiblemente, la
expresión también comprende la secreción del polipéptido.
Vector de expresión: en el contexto
presente, el término "vector de expresión" cubre una molécula
de ADN, lineal o circular, que comprende un segmento que codifica
un polipéptido de la invención, y que está operativamente enlazado
a segmentos adicionales que proveen su transcripción.
Célula huésped: el término "célula
huésped", como se utiliza en este caso, incluye cualquier tipo
de célula que es susceptible de transformación con un constructo de
ácidos nucleicos.
Los términos, "sonda polinucleótida",
"hibridación" al igual que las varias condiciones de
astringencia están definidas en la sección titulada "Polipéptidos
con actividad antimicrobiana".
En un primer aspecto, la presente invención se
refiere a polipéptidos que tienen actividad antimicrobiana y donde
los polipéptidos comprenden, preferiblemente consisten en la
secuencia de aminoácidos:
G-X_{1}-X_{2}-X_{3}-X_{4}-X_{5}-X_{6}-X_{7}-X_{8}-X_{9}-X_{10}-X_{11}-X_{12}-X_{13}-X_{14}-X_{15}-X_{16}-Z;
donde X_{1} = L, I, W o M;
X_{2} = L, F, W o V; X_{3} = S, G, K, T, R, I, N, D o E; X_{4}
= K, T, F, I, R, M, L o S; X_{5} = L o I; X_{6} = K, G, R, M o
E; X_{7} = K, S, I, R, T o M; X_{8} = A, K, T, N, R o E;
X_{9} = A, G, S, I, L, T, V, M o W; X_{10} = S, R, K o E;
X_{11} = K, M, R, H, I, N o T; X_{12} = A, V, I, L, Y, F o T;
X_{13} = L, A, G, C, F, V o W; X_{14} = K, Q, A, S, R o E;
X_{15} = H, G, N, R, S, M, I, V o D; X_{16} = V, I, A o F; Z =
X_{17} -R-W-L; donde X_{17} = F,
L, R, A, G, V, Y, C o P; o donde los polipéptidos comprenden,
preferiblemente consisten en los aminoácidos 1 a 21 de cualquiera
de la SEC ID NO:38 a la SEC ID
NO:46.
El término "cualquiera de la SEC ID NO:38 a la
SEC ID NO:46" se destina a significar SEC ID NO:38, SEC ID
NO:39, SEC ID NO:40, SEC ID NO:41, SEC ID NO:42, SEC ID NO:43, SEC
ID NO:44, SEC ID NO:45 o SEC ID NO:46.
En otra forma de realización preferida, el
polipéptido de la presente invención comprende los aminoácidos 1 a
21 de cualquiera de la SEC ID NO:38 a la SEC ID NO:46. En una forma
de realización adicional preferida, el polipéptido consiste en los
aminoácidos 1 a 21 de alguna de la SEC ID NO:38 a SEC ID NO:46.
Los aminoácidos que componen los polipéptidos de
la invención pueden independientemente ser seleccionados de formas
D o L.
\vskip1.000000\baselineskip
Una extensión N-terminal de los
polipéptidos de la invención puede de manera adecuada consistir en
1 a 50 aminoácidos, preferiblemente 2-20
aminoácidos, especialmente 3-15 aminoácidos. En una
forma de realización, la extensión peptídica
N-terminal no contiene un Arg (R). En otra forma de
realización la extensión N-terminal comprende un
sitio kex2 o un sitio de seccionamiento tipo kex2 como será definido
más abajo. En una forma de realización preferida la extensión
N-terminal es un péptido, comprendiendo al menos
dos residuos de aminoácidos Glu (E) y/o Asp (D), tal como una
extensión N-terminal comprendiendo una de las
siguientes secuencias: EAE, EE, DE y DD.
\vskip1.000000\baselineskip
Los sitios Kex2 (véase, p. ej., Methods in
Enzymology Vol 185, ed. D. Goeddel, Academic Press Inc. (1990), San
Diego, CA, "Gene Expression Technology") y los sitios tipo
kex2 son sitios di-básicos de reconocimiento (es
decir, sitios de seccionamiento) encontrados entre la región
codificante propéptida y la región madura de algunas proteínas.
La inserción de un sitio kex2 o un sitio tipo
kex2 ha demostrado en determinados casos que mejora el tratamiento
de la endopeptidasa correcto en el sitio de ruptura
pro-péptido dando como resultado niveles de
secreción de proteína aumentados.
En el contexto de la invención la inserción de
un sito kex2 o tipo kex2 supone la posibilidad de obtener el
seccionamiento en una posición determinada en la extensión
N-terminal dando como resultado un polipéptido
antimicrobiano que se extiende en comparación con el polipéptido
maduro mostrado como los aminoácidos 1 a 21 de cualquiera de la SEC
ID NO:38 a SEC ID NO:46.
\vskip1.000000\baselineskip
Los polipéptidos de la presente invención
también incluyen polipéptidos fusionados o polipéptidos de fusión
divisibles donde otro polipéptido es fusionado en el
N-término o en el C-término del
polipéptido de la invención o un fragmento del mismo. Un
polipéptido fusionado es producido fusionando una secuencia de
nucleótidos (o una parte de la misma) que codifica otro polipéptido
a una secuencia de nucleótidos (o una parte de la misma) de la
presente invención. Las técnicas para producir polipéptidos de
fusión son conocidas en la técnica, e incluyen ligar las secuencias
codificantes que codifican los polipéptidos de modo que éstas estén
en el marco y que la expresión del polipéptido fusionado esté bajo
control del(los) mismo(s) promotor(es) y
terminador.
La presente invención también se refiere a
polinucleótidos que tienen una secuencia de nucleótidos que
codifica para un polipéptido de la invención. En particular, la
presente invención se refiere a polinucleótidos que consisten en
una secuencia de nucleótidos que codifica para un polipéptido de la
invención. Debido a la degeneración del código genético, el experto
en la materia fácilmente reconocerá que diferentes secuencias de
nucleótidos que codifican cada uno de los polipéptidos de la
invención pueden ser preparadas. Es bien conocido en la técnica que
los nucleótidos componen codones que codifican los aminoácidos de
los polipéptidos de la invención.
La secuencia de nucleótidos puede ser obtenida
por procedimientos de clonación estándares usados en ingeniería
genética para recolocar la secuencia de nucleótidos de una
ubicación a un sitio diferente donde será reproducida. Los
procedimientos de clonación pueden implicar escisión y aislamiento
de un fragmento deseado que comprende la secuencia de nucleótidos
que codifica el polipéptido, inserción del fragmento en una
molécula del vector, e incorporación del vector recombinante en una
célula huésped donde copias múltiples o clones de la secuencia de
nucleótidos serán replicados. La secuencia de nucleótidos puede ser
de origen genómico, ADNc, ARN, semisintético, sintético, o
cualquier combinación de los mismos.
La modificación de una secuencia de nucleótidos
que codifica un polipéptido de la presente invención puede ser
necesaria para la síntesis de un polipéptido, que comprende una
secuencia de aminoácidos que tiene al menos una sustitución elegida
de los residuos aminoácidos posibles tal y como se define en
reivindicación 1 en comparación con los aminoácidos 1 a 21 de
cualquiera de la SEC ID NO:38 a SEC ID NO:46. Estas variantes
artificiales pueden diferir en alguna vía creada genéticamente del
polipéptido aislado de su fuente nativa, p. ej., variantes que
difieren en actividad específica, termostabilidad, pH óptimo, o
similar.
Además, una secuencia de nucleótidos que
codifica un polipéptido de la presente invención puede ser
modificada por introducción de sustituciones de nucleótidos que no
dan lugar a otra secuencia de aminoácidos del polipéptido
codificado por la secuencia de nucleótidos, pero que corresponden al
uso del codón del organismo huésped destinado a la producción de la
enzima.
La introducción de una mutación en la secuencia
de nucleótidos para intercambiar un nucleótido por otro nucleótido
puede ser realizada por mutagénesis dirigida usando cualquiera de
los métodos conocidos en la técnica. Es particularmente útil el
procedimiento que utiliza un vector de ADN bicatenario
superenrollado con un inserto de interés y dos cebadores sintéticos
que contienen la mutación deseada. Los cebadores oligonucleótidos,
cada uno complementario con cadenas opuestas del vector, se
extiende durante la variación cíclica de la temperatura mediante
Pfu ADN polimerasa. En incorporación de los cebadores, un plásmido
mutado que contiene cortes en bisel es generado. Después de la
variación cíclica de la temperatura, el producto es tratado con
DpnI que es específica para ADN metilado y hemimetilado para
digerir el molde de ADN parental y para seleccionar ADN sintetizado
conteniendo una mutación. Otros procedimientos conocidos pueden
también ser usados en la técnica. Para una descripción general de
sustitución de nucleótidos, véase, p. ej., Ford et al.,
1991, Protein Expression and Purification 2:
95-107.
La presente invención también se refiere a
constructos de ácidos nucleicos que comprenden una secuencia de
nucleótidos de la presente invención operativamente enlazada a una
o más secuencias de control que dirigen la expresión de la
secuencia codificante en una célula huésped adecuada bajo
condiciones compatibles con las secuencias de control.
Una secuencia de nucleótidos que codifica un
polipéptido de la presente invención puede ser manipulada en una
variedad de vías para proporcionar la expresión del polipéptido. La
manipulación de la secuencia de nucleótidos antes de su inserción
en un vector puede ser deseable o necesaria dependiendo del vector
de expresión. Las técnicas para modificar secuencias de nucleótidos
utilizando métodos de ADN recombinante son bien conocidos en la
técnica.
La secuencia de control puede ser una secuencia
del promotor apropiada, una secuencia de nucleótidos que es
reconocida por una célula huésped para la expresión de la secuencia
de nucleótidos. La secuencia del promotor contiene secuencias de
control transcripcionales, que median la expresión del polipéptido.
El promotor puede ser cualquier secuencia de nucleótidos que muestre
actividad transcripcional en la célula huésped de elección
incluyendo promotores mutantes, truncados, e híbridos, y pueden ser
obtenidos de genes que codifican polipéptidos extracelulares o
intracelulares bien homólogos o heterólogos a la célula
huésped.
Ejemplos de promotores adecuados para dirigir la
transcripción de los constructos de ácidos nucleicos de la presente
invención, especialmente en una célula huésped bacteriana, son los
promotores obtenidos del operón lac de E. coli, gen
de agarasa (dagA) de Streptomyces coelicolor, gen de
levansucrasa de Bacillus subtilis (sacB), gen de
alfa-amilasa (amyL) de Bacillus
licheniformis, gen de amilasa maltogénica (amyM) de
Bacillus stearothermophilus, gen de
alfa-amilasa (amyQ) de Bacillus
amyloliquefaciens, gen de penicilinasa (penP) de
Bacillus licheniformis, genes xylA y xylB de
Bacillus subtilis, y gen de beta-lactamasa
procariótica (Villa-Kamaroff et al., 1978,
Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75:
3727-3731), al igual que el promotor tac (DeBoer
et al., 1983, Proceedings of the National Academy of
Sciences USA 80: 21-25). Otros promotores están
descritos en "Useful proteins from recombinant bacteria" en
Scientific American, 1980, 242: 74-94; y en
Sambrook et al., 1989, supra.
Ejemplos de promotores adecuados para dirigir la
transcripción de los constructos de ácidos nucleicos de la presente
invención en una célula huésped filamentosa fúngica son promotores
obtenidos de los genes para TAKA amilasa de Aspergillus
oryzae, proteinasa aspártica de Rhizomucor miehei,
alfa-amilasa neutra de Aspergillus niger,
alfa amilasa ácido estable de Aspergillus niger,
glucoamilasa (glaA) de Aspergillus niger o de
Aspergillus awamori, lipasa de Rhizomucor miehei,
proteasa alcalina de Aspergillus oryzae, triosa fosfato
isomerasa de Aspergillus oryzae, acetamidasa de
Aspergillus nidulans, y proteasa de tipo tripsina de
Fusarium oxysporum (WO 96/00787), al igual que el promotor
NA2-tpi (un híbrido de los promotores de los genes
para alfa-amilasa neutra de Aspergillus niger
y triosa fosfato isomerasa de Aspergillus oryzae), y
promotores mutantes, truncados, e híbridos de los mismos.
En un huésped de levadura, los promotores útiles
son obtenidos de los genes para enolasa de Saccharomyces
cerevisiae (ENO-1), galactoquinasa de
Saccharomyces cerevisiae (GAL1), alcohol deshidrogenasa de
Saccharomyces
cerevisiae/gliceraldehído-3-fosfato
deshidrogenasa (ADH2/GAP), y 3-fosfoglicerato
quinasa de Saccharomyces cerevisiae. Otros promotores útiles
para células huéspedes de levadura están descritos por Romanos et
al., 1992, Yeast 8, 423-488.
La secuencia de control puede también ser una
secuencia del terminador de la transcripción adecuada, una
secuencia reconocida por una célula huésped para terminar la
transcripción. La secuencia del terminador es operativamente
enlazada al término 3' de la secuencia de nucleótidos que codifica
el polipéptido. Cualquier terminador que es funcional en la célula
huésped de elección puede ser usado en la presente invención.
Terminadores preferidos para células huéspedes
filamentosas fúngicas son obtenidos de los genes para TAKA amilasa
de Aspergillus oryzae, glucoamilasa de Aspergillus
niger, antranilato sintasa de Aspergillus nidulans,
alfa-glucosidasa de Aspergillus niger, y
proteasa de tipo tripsina de Fusarium oxysporum.
Terminadores preferidos para células huéspedes
de levadura son obtenidos de los genes para enolasa de
Saccharomyces cerevisiae, citocromo C (CYC1) de
Saccharomyces cerevisiae, y
gliceraldehido-3-fosfato
deshidrogenasa de Saccharomyces cerevisiae. Otros
terminadores útiles para células huéspedes de levadura están
descritos por Romanos et al., 1992, supra.
La secuencia de control puede también ser una
secuencia líder adecuada, una región no traducida de un ARNm que es
importante para la traducción por la célula huésped. La secuencia
líder está operativamente enlazada al término 5' de la secuencia de
nucleótidos que codifica el polipéptido. Cualquier secuencia líder
que es funcional en la célula huésped de elección puede ser usada
en la presente invención.
Los líderes preferidos para células huéspedes
filamentosas fúngicas son obtenidos de los genes para TAKA amilasa
de Aspergillus oryzae y triosa fosfato isomerasa de
Aspergillus nidulans.
Los líderes adecuados para células huéspedes de
levadura son obtenidos de los genes para enolasa
(ENO-1) de Saccharomyces cerevisiae,
3-fosfoglicerato quinasa de Saccharomyces
cerevisiae, factor alfa de Saccharomyces cerevisiae, y
alcohol
deshidrogenasa/gliceraldehido-3-fosfato
deshidrogenasa (ADH2/GAP) de Saccharomyces cerevisiae.
La secuencia de control puede también ser una
secuencia de poliadenilación, una secuencia operativamente enlazada
al término 3' de la secuencia de nucleótidos y que cuando se
transcribe, es reconocida por la célula huésped como una señal para
añadir residuos de poliadenosina para ARNm transcrito. Cualquier
secuencia de poliadenilación que es funcional en la célula huésped
de elección puede ser usada en la presente invención.
Secuencias de poliadenilación preferidas para
células huéspedes filamentosas fúngicas son obtenidas de los genes
para TAKA amilasa de Aspergillus oryzae, glucoamilasa de
Aspergillus niger, antranilato sintasa de Aspergillus
nidulans, proteasa de tipo tripsina de Fusarium
oxysporum, y alfa-glucosidasa de Aspergillus
Niger.
Las secuencias de poliadenilación útiles para
células huéspedes de levadura están descritas por Guo y Sherman,
1995, Molecular Cellular Biology 15: 5983-5990.
La secuencia de control puede también ser una
región codificante del péptido señal que codifica para una
secuencia de aminoácidos enlazada al término amino de un
polipéptido y dirige el polipéptido codificado en la vía secretora
de la célula. El extremo 5' de la secuencia codificante de la
secuencia de nucleótidos puede intrínsecamente contener una región
codificante del péptido señal naturalmente enlazada en el marco de
lectura de traducción con el segmento de la región codificante que
codifica el polipéptido segregado. De forma alternativa, el extremo
5' de la secuencia codificante puede contener una región
codificante del péptido señal que es foráneo a la secuencia
codificante. La región codificante del péptido señal foráneo puede
ser requerida donde la secuencia codificante naturalmente no
contiene una región codificante del péptido señal. De forma
alternativa, la región codificante del péptido señal foráneo puede
simplemente reemplazar la región codificante del péptido señal
natural para aumentar la secreción del polipéptido. No obstante,
cualquier región codificante del péptido señal que dirige el
polipéptido expresado en la vía secretora de una célula huésped de
elección puede ser usada en la presente invención.
Las regiones codificantes del péptido señal
eficaces para células huéspedes bacterianas son las regiones
codificantes del péptido señal obtenidas de los genes para amilasa
maltogénica de NCIB 11837 de Bacillus,
alfa-amilasa de Bacillus stearothermophilus,
subtilisina de Bacillus licheniformis,
beta-lactamasa de Bacillus licheniformis,
proteasas neutras de Bacillus stearothermophilus (nprT,
nprS, nprM), y prsA de Bacillus subtilis. Otros péptidos
señales están descritos por Simonen y Palva, 1993, Microbiological
Reviews 57, 109-137.
Las regiones codificantes del péptido señal
eficaces para células huéspedes filamentosas fúngicas son las
regiones codificantes del péptido señal obtenidas de los genes para
TAKA amilasa de Aspergillus oryzae, amilasa neutra de
Aspergillus niger, glucoamilasa de Aspergillus niger,
proteinasa aspártica de Rhizomucor miehei, celulasa de
Humicola insolens, y lipasa de Humicola
lanuginosa.
Los péptidos señales útiles para células
huéspedes de levadura son obtenidos de los genes para factor alfa
de Saccharomyces cerevisiae e invertasa de Saccharomyces
cerevisiae. Otras regiones codificantes del péptido señal
útiles están descritas por Romanos et al., 1992,
supra.
La secuencia de control puede también ser una
región codificante del propéptido que codifica para una secuencia
de aminoácidos situada en el término amino de un polipéptido. El
polipéptido resultante es conocido como una proenzima o
propolipéptido (o un zimógeno en algunos casos). Un propolipéptido
es generalmente inactivo y puede ser convertido a un polipéptido
maduro activo por seccionamiento catalítico o autocatalítico del
propéptido del propolipéptido. La región codificante del propéptido
puede ser obtenida de los genes para proteasa alcalina de
Bacillus subtilis (aprE), proteasa neutra de Bacillus
subtilis (nprT), alfa-factor de Saccharomyces
cerevisiae, proteinasa aspártica de Rhizomucor miehei, y
lacasa de Myceliophthora thermophila (WO 95/33836).
Cuando tanto las regiones del péptido señal como
del propéptido están presentes en el término amino de un
polipéptido, la región del propéptido está situada junto al término
amino de un polipéptido y la región de péptido señal está situada
junto al término amino de la región del propéptido.
Puede también ser deseable añadir secuencias
reguladoras que permitan la regulación de la expresión del
polipéptido con respecto al crecimiento de la célula huésped.
Ejemplos de sistemas reguladores son los que causan que la
expresión del gen sea activada o desactivada en respuesta a un
estímulo químico o físico, incluyendo la presencia de un compuesto
regulador. Sistemas reguladores en sistemas procarióticos incluyen
los sistemas del operador lac, tac, y trp. En
levadura, el sistema ADH2 o sistema GAL1 puede ser usado. En hongos
filamentosos, el promotor de TAKA alfa-amilasa, el
promotor de glucoamilasa de Aspergillus niger, y el promotor
de glucoamilasa de Aspergillus oryzae pueden ser usados como
secuencias reguladoras. Otros ejemplos de secuencias reguladoras
son los que permiten la amplificación génica. En sistemas
eucarióticos, estos incluyen el gen de
dihidrofolato-reductasa que es amplificado en
presencia de metotrexato, y los genes de metalotioneína que son
amplificados con metales pesados. En estos casos, la secuencia de
nucleótidos que codifica el polipéptido sería operativamente
enlazada con la secuencia reguladora.
La presente invención también se refiere a
vectores de expresión recombinantes que comprenden el constructo de
ácidos nucleicos de la invención. Las varias secuencias del
nucleótido y de control anteriormente descritas pueden ser unidas
para producir un vector de expresión recombinante que puede incluir
uno o más sitios de restricción convenientes para permitir la
inserción o sustitución de la secuencia de nucleótidos que codifica
el polipéptido en estos sitios. De forma alternativa, la secuencia
de nucleótidos de la presente invención puede ser expresada
insertando la secuencia de nucleótidos o un constructo de ácidos
nucleicos que comprende la secuencia en un vector apropiado para la
expresión. En la creación del vector de expresión, la secuencia
codificante está localizada en el vector de modo que la secuencia
codificante está operativamente enlazada con las secuencias de
control apropiadas para la expresión.
El vector de expresión recombinante puede ser
cualquier vector (p. ej., un plásmido o virus) que puede ser
convenientemente sometido a procedimientos de ADN recombinante y
puede provocar la expresión de la secuencia de nucleótidos. La
elección del vector normalmente dependerá de la compatibilidad del
vector con la célula huésped en la que el vector debe ser
introducido. Los vectores pueden ser plásmidos circulares lineales o
cerrados.
El vector puede ser un vector de replicación
autónoma, es decir, un vector que existe como una entidad
extracromosómica, cuya replicación es independiente de replicación
cromosómica, p. ej., un plásmido, un elemento extracromosómico, un
minicromosoma, o un cromosoma artificial.
El vector puede contener cualquier medio para
asegurar la autorreplicación. De forma alternativa, el vector puede
ser uno que, al ser introducido en la célula huésped, se integre en
el genoma y se replique con el(los) cromosoma(s)
donde ha sido integrado. Además, un único vector o plásmido o dos o
más vectores o plásmidos que juntos contienen el ADN total para ser
introducidos en el genoma de la célula huésped, o un transposón
puede ser usado.
Los vectores de la presente invención
preferiblemente contienen uno o más marcadores seleccionables que
permiten una selección fácil de células transformadas. Un marcador
seleccionable es un gen cuyo producto proporciona resistencia
biocida o vírica, resistencia a metales pesados, prototrofía a
auxótrofos, y similares.
Ejemplos de marcadores seleccionables
bacterianos son los genes dal de Bacillus subtilis o
Bacillus licheniformis, o marcadores que confieren
resistencia antibiótica tal como resistencia a la ampicilina,
canamicina, cloranfenicol o tetraciclina. Marcadores adecuados para
células huéspedes de levadura son ADE2, HIS3, LEU2, LYS2, MET3,
TRP1, y URA3. Los marcadores seleccionables para el uso en una
célula huésped filamentosa fúngica incluyen, pero no se limitan a,
amdS (acetamidasa), argB
(ornitina-carbamoiltransferasa), bar
(fosfonitricina acetiltransferasa), hygB (higromicina
fosfotransferasa), niaD (nitrato-reductasa),
pyrG
(orotidina-5'-fosfato-descarboxilasa),
sC (sulfato adeniltransferasa), trpC (antranilato
sintasa), al igual que equivalentes de los mismos.
Preferidos para el uso en una célula de
Aspergillus son los genes amdS y pyrG de
Aspergillus nidulans o Aspergillus oryzae y el gen bar
de Streptomyces hygroscopicus.
Los vectores de la presente invención
preferiblemente contienen un(os) elemento(s) que
permite(n) la integración estable del vector en el genoma de
la célula huésped o la replicación autónoma del vector en la célula
independiente del genoma.
Para la integración en el genoma de la célula
huésped, el vector puede depender de la secuencia de nucleótidos
que codifica el polipéptido o cualquier otro elemento del vector
para la integración estable del vector en el genoma por
recombinación homóloga o no homóloga. De forma alternativa, el
vector puede contener secuencias de nucleótidos adicionales para
dirigir la integración por recombinación homóloga en el genoma de
la célula huésped. Las secuencias de nucleótidos adicionales
permiten que el vector sea integrado en el genoma de la célula
huésped en una(s) ubica-
ción(es) precisa(s) en el(los) cromosoma(s). Para aumentar la probabilidad de integración en una ubicación precisa, los elementos integracionales deberían preferiblemente contener un número suficiente de nucleótidos, tal como 100 a 1.500 pares de bases, preferiblemente 400 a 1.500 pares de bases, y de la forma más preferible 800 a 1.500 pares de bases, que son altamente homólogos a la secuencia diana correspondiente para aumentar la probabilidad de recombinación homóloga. Los elementos integracionales pueden ser cualquier secuencia que sea homóloga a la secuencia diana en el genoma de la célula huésped. Además, los elementos integracionales pueden ser secuencias de nucleótidos no codificantes o codificantes. Por un lado, el vector puede ser integrado en el genoma de la célula huésped por recombinación no homóloga.
ción(es) precisa(s) en el(los) cromosoma(s). Para aumentar la probabilidad de integración en una ubicación precisa, los elementos integracionales deberían preferiblemente contener un número suficiente de nucleótidos, tal como 100 a 1.500 pares de bases, preferiblemente 400 a 1.500 pares de bases, y de la forma más preferible 800 a 1.500 pares de bases, que son altamente homólogos a la secuencia diana correspondiente para aumentar la probabilidad de recombinación homóloga. Los elementos integracionales pueden ser cualquier secuencia que sea homóloga a la secuencia diana en el genoma de la célula huésped. Además, los elementos integracionales pueden ser secuencias de nucleótidos no codificantes o codificantes. Por un lado, el vector puede ser integrado en el genoma de la célula huésped por recombinación no homóloga.
Para la replicación autónoma, el vector puede
además comprender un origen de replicación que permite que el
vector se replique de manera autónoma en la célula huésped en
cuestión. Ejemplos de orígenes bacterianos de replicación son los
orígenes de replicación de plásmidos pBR322, pUC19; pACYC177, y
pACYC184 que permiten la replicación en E. coli, y pUB110;
pE194, pTA1060, y pAMf\beta1 que permiten la replicación en
Bacillus. Ejemplos de orígenes de replicación para el uso en
una célula huésped de levadura son el origen de replicación de 2
micras, ARS1, ARS4, la combinación de ARS1 y CEN3, y la combinación
de ARS4 y CENE. El origen de replicación puede ser uno que tenga
una mutación que hace su temperatura de funcionamiento sensible en
la célula huésped (véase, p. ej., Ehrlich, 1978, Proceedings of the
National Academy of Sciences USA 75: 1433).
Más de una copia de una secuencia de nucleótidos
de la presente invención puede ser insertada en la célula huésped
para aumentar la producción del producto genético. Un aumento en el
número de copias de la secuencia de nucleótidos puede ser obtenido
integrando al menos una copia adicional de la secuencia en el
genoma de la célula huésped o mediante la inclusión de un gen
marcador seleccionable amplificable con la secuencia de nucleótidos
donde las células que contienen copias amplificadas del gen
marcador seleccionable, y por lo tanto copias adicionales de la
secuencia de nucleótidos, pueden ser seleccionadas para cultivar
las células en presencia del agente seleccionable apropiado.
Los procedimientos usados para enlazar los
elementos anteriormente descritos para construir los vectores de
expresión recombinantes de la presente invención son bien conocidos
por un experto en la materia (véase, p. ej., Sambrook et
Al., 1989, supra).
La presente invención también se refiere a una
célula huésped recombinante que comprende el constructo de ácidos
nucleicos de la invención, que se usa ventajosamente en la
producción recombinante de los polipéptidos. Un vector que
comprende una secuencia de nucleótidos de la presente invención es
introducido en una célula huésped de modo que el vector es
mantenido como un integrante cromosómico o como un vector
extracromosómico que se duplica como se ha descrito antes.
La célula huésped puede ser un microorganismo
unicelular, p. ej., un procariota, o un microorganismo no
unicelular, p. ej., un eucariota.
Las células unicelulares útiles son células
bacterianas tales como bacterias gram positivas incluyendo, pero no
limitadas a, una célula de Bacillus, p. ej., Bacillus
alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus
circulans, Bacillus clausii, Bacillus coagulans, Bacillus lautus,
Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium,
Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis, y Bacillus
thuringiensis; o una célula de Streptomyces, p. ej.,
Streptomyces lividans o Streptomyces murinus, o
bacterias gram negativas tales como E. coli y Pseudomonas
sp. En una forma de realización preferida, la célula huésped
bacteriana es una célula de Bacillus lentus, Bacillus
licheniformis, Bacillus stearothermophilus, o de Bacillus
subtilis. En otra forma de realización preferida, la célula de
Bacillus es una Bacillus alcalofílica.
La introducción de un vector en una célula
huésped bacteriana puede, por ejemplo, ser efectuada por
transformación de protoplastos (véase, p. ej., Chang y Cohen, 1979,
Molecular General Genetics 168: 111-115), que usa
células competentes (véase, p. ej., Young y Spizizin, 1961, Journal
of Bacteriology 81:, o Dubnau y Davidoff-Abelson,
1971, Journal of Molecular Biology 56: 209-221),
electroporación (véase, p. ej., Shigekawa y Dower, 1988,
Biotechniques 6: 742-751), o conjugación (véase, p.
ej., Koehler y Thorne, 1987, Journal of Bacteriology 169:
5771-5278).
La célula huésped puede ser una eucariota, tal
como una célula de mamífero, de insecto, vegetal, o fúngica.
En una forma de realización preferida, la célula
huésped es una célula fúngica. "Fungi" como se utiliza en este
caso incluye los filos Ascomycota, Basidiomycota, Chytridiomycota,
y Zygomycota (como se define por Hawkswort et al., en,
Ainsworth and Bisby's Dictionary of The Fungi, 8th edition, 1995,
CAB International, University Press, Cambridge, UK) al igual que el
Oomycota (como se cita en Hawksworth et al., 1995,
supra, página 171) y todos los hongos mitospóricos
(Hawksworth et al., 1995, supra).
En una forma de realización más preferida, la
célula huésped fúngica es una célula de levadura. "Levadura"
como se utiliza en este caso incluye levadura ascosporogénea
(Endomycetales), levadura basidiosporogénea, y levadura de los
Hongos Imperfectos (Blastomycetes). Puesto que la clasificación de
levadura puede cambiar en el futuro, para los objetivos de esta
invención, la levadura será definida como se describe en biología y
actividades de levadura (Skinner, F.A., Passmore, S.M., y
Davenport, R.R., eds, Soc. App. Bacteriol. Serie de simposio nº.
9,1980).
En una forma de realización aún más preferida,
la célula huésped de levadura es una célula de Candida,
Hansenula, Kluyveromyces,Pichia, Saccharomyces,
Schizosaccharomyces, o Yarrowia.
En una forma de realización más preferida, la
célula huésped de levadura es una célula de Saccharomyces
carlsbergensis, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces
diastaticus, Saccharomyces douglasii, Saccharomyces kluyveri,
Saccharomyces norbensis o Saccharomyces oviformis. En
otra forma de realización más preferida, la célula huésped de
levadura es una célula de Kluyveromyces lactis. En otra forma
de realización más preferida, la célula huésped de levadura es una
célula de Yarrowia lipolytica.
En otra forma de realización más preferida, la
célula huésped fúngica es una célula micótica filamentosa.
"Hongos filamentosos" incluyen todas las formas filamentosas
de la subdivisión Eumycota y Oomycota (como se define por
Hawksworth et al., 1995, supra). Los hongos
filamentosos se caracterizan por una pared micelial compuesta por
quitina, celulosa, glucano, quitosano, manano, y otros
polisacáridos complejos. El crecimiento vegetativo se efectúa por
alargamiento hifal y el catabolismo de carbono es estrictamente
aeróbico. Por el contrario, el crecimiento vegetativo por levaduras
tales como Saccharomyces cerevisiae es por injerto de un
talo unicelular y el catabolismo de carbono puede ser
fermentativo.
En una forma de realización aún más preferida,
la célula huésped filamentosa fúngica es una célula de una especie
de, pero no limitada a, Acremonium, Aspergillus, Fusarium,
Humicola, Mucor, Myceliophthora, Neurospora, Penicillium,
Thielavia, Tolypocladium, o Trichoderma.
En una forma de realización más preferida, la
célula huésped filamentosa fúngica es una célula de Aspergillus
awamori, Aspergillus foetidus, Aspergillus japonicus, Aspergillus
nidulans, Aspergillus niger o de Aspergillus oryzae. En
otra forma de realización más preferida, la célula huésped
filamentosa fúngica es una célula de Fusarium bactridioides,
Fusarium cerealis, Fusarium crookwellense, Fusarium culmorum,
Fusarium graminearum, Fusarium graminum, Fusarium heterosporum,
Fusarium negundi, Fusarium oxysporum, Fusarium reticulatum,
Fusarium roseum, Fusarium sambucinum, Fusarium sarcochroum,
Fusarium sporotrichioides, Fusarium sulphureum, Fusarium torulosum,
Fusarium trichothecioides, o Fusarium venenatum. En una
forma de realización incluso más preferida, la célula madre
filamentosa fúngica es una célula de Fusarium venenatum
(Nirenberg sp. nov.). En otra forma de realización más
preferida, la célula huésped filamentosa fúngica es una célula de
Humicola insolens, Humicola lanuginosa, Mucor miehei,
Myceliophthora thermophila, Neurospora crassa, Penicillium
purpurogenum, Thielavia terrestris, Trichoderma harzianum,
Trichoderma koningii, Trichoderma longibrachiatum, Trichoderma
reesei, o Trichoderma viride.
Las células micóticas pueden ser transformadas
por un proceso que implica formación de protoplastos,
transformación de los protoplastos, y regeneración de la pared
celular en cierto modo conocido per se. Los procedimientos
adecuados para la transformación de células huéspedes de
Aspergillus están descritos en EP 238 023 y Yelton et
al., 1984, Proceedings of the National Academy of Sciences USA
81, 1470-1474. Métodos adecuados para transformar
especies de Fusarium están descritas por Malardier et al.,
1989, Gene 78, 147-156 y WO 96/00787. La levadura
puede ser transformada usando los procedimientos descritos por
Becker y Guarente, en Abelson, J.N. y Simon, M.I., editores, Guide
to Yeast Genetics and Molecular Biology, Methods in Enzymology,
volumen 194, págs 182-187, Academic Press, Inc., New
York; Ito et al., 1983, Journal of Bacteriology 153: 163; y
Hinnen et al., 1978, Proceedings of the National Academy of
Sciences USA 75: 1920.
La presente invención también se refiere a
métodos para producir un polipéptido de la presente invención
comprendiendo (a) cultivo de una célula huésped bajo condiciones
propicias para la producción del polipéptido; y (b) recuperación
del polipéptido.
En los métodos de producción de la presente
invención, las células son cultivadas en un medio nutritivo
adecuado para la producción del polipéptido usando métodos
conocidos en la técnica. Por ejemplo, la célula puede ser cultivada
por cultivo en frasco de agitación, fermentación a pequeña escala o
a gran escala (incluyendo fermentaciones continuas, por lotes, en
flujo discontinuo, o en estado sólido) en fermentadores de
laboratorio o industriales realizados en un medio adecuado y bajo
condiciones que permiten que el polipéptido sea expresado y/o
aislado. El cultivo se desarrolla en un medio nutritivo adecuado
comprendiendo fuentes de nitrógeno y de carbono y sales
inorgánicas, usando procedimientos conocidos en la técnica. Los
medios adecuados están disponibles de proveedores comerciales o
pueden ser preparados según composiciones publicadas (p. ej., en
catálogos de la American Type Culture Collection). Si el
polipéptido es segregado en el medio nutritivo, el polipéptido puede
ser recuperado directamente del medio. Si el polipéptido no es
segregado, éste puede ser recuperado de lisados celulares.
Los polipéptidos pueden ser detectados usando
métodos conocidos en la técnica que son específicos para los
polipéptidos. Estos métodos de detección pueden incluir el uso de
anticuerpos específicos, formación de un producto enzimático, o
desaparición de un sustrato enzimático. Por ejemplo, un ensayo
enzimático puede ser usado para determinar la actividad del
polipéptido como se describe en este caso.
El polipéptido resultante puede ser recuperado
por métodos conocidos en la técnica. por ejemplo, el polipéptido
puede ser recuperado del medio nutritivo por procedimientos
convencionales incluyendo, pero sin limitarse a, centrifugado,
filtración, extracción, secado por pulverización, evaporación, o
precipitación.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
ser purificados por una variedad de procedimientos conocidos en la
técnica incluyendo, pero sin limitarse a, cromatografía (p. ej.,
por intercambio iónico, por afinidad, hidrofóbica, por
cromatoenfoque, y de exclusión por tamaños), procedimientos
electroforéticos (p. ej., isoelectroenfoque preparatorio),
solubilidad diferencial (p. ej., precipitación de sulfato amónico),
SDS-PAGE, o extracción (véase, p. ej., Protein
Purification, J.-C. Janson and Lars Ryden, editors, VCH Publishers,
New York, 1989).
La presente invención también se refiere a una
planta transgénica, parte de la planta, o célula vegetal que ha
sido transformada con una secuencia de nucleótidos que codifica un
polipéptido que tiene actividad antimicrobiana de la presente
invención para expresar y producir el polipéptido en cantidades
recuperables. El polipéptido puede ser recuperado de la planta o
parte de la planta. De forma alternativa, la planta o parte de la
planta conteniendo el polipéptido recombinante puede ser usada como
tal para mejorar la calidad de un alimento o alimento, p. ej.,
mejorando el valor nutritivo, apetecibilidad, y propiedades
reológicas, o para destruir un factor antinutritivo. El polipéptido
recuperado, planta o parte de la planta puede también ser usado para
mejorar o alterar la flora digestiva en animales y
ganado.
ganado.
La planta transgénica puede ser dicotiledónea
(una dicot) o monocotiledónea (una monocot). Ejemplos de plantas
monocotiledóneas son hierbas, tales como la poa de los prados (poa
pratense, Poa), hierba forrajera tal como festuca, lolium, hierba
de clima templado, tal como agrostis, y cereales, p. ej., trigo,
avena, centeno, cebada, arroz, sorgo, y (mazorca) de maíz.
Ejemplos de plantas dicotiledóneas son el
tabaco, la patata, la remolacha azucarera, las legumbres, tales
como las altramuces, el guisante, la judía y la semilla de soja, y
plantas crucíferas (familia Brassicaceae), tales como la
coliflor, la semilla de colza, y el organismo modelo cercanamente
relacionado Arabidopsis thaliana.
Ejemplos de partes de plantas son tallo, callo,
hojas, raíz, frutos, semillas, y tubérculos. También tejidos
vegetales específicos, tales como cloroplasto, apoplasto,
mitocondria, vacuola, peroxisomas, y citoplasma están considerados
como una parte de la planta. Además, cualquier célula vegetal,
cualquiera que sea el origen del tejido, está considerada como una
parte de la planta.
También se incluye dentro del campo de la
presente invención la progenie de tales plantas, partes de la
planta y células vegetales.
La planta transgénica o célula vegetal que
expresa un polipéptido de la presente invención puede ser
construida conforme a métodos conocidos en la técnica. Brevemente,
la planta o célula vegetal es construida incorporando uno o más
constructos de expresión que codifican un polipéptido de la presente
invención en el genoma huésped de la planta y que propagan la
planta modificada resultante o la célula vegetal en una planta
transgénica o célula vegetal.
Convenientemente, el constructo de expresión es
un constructo de ácidos nucleicos que comprende una secuencia de
nucleótidos que codifica un polipéptido de la presente invención
operativamente enlazada con secuencias apropiadas reguladoras
requeridas para la expresión de la secuencia de nucleótidos en la
planta o parte de la planta de elección. Además, el constructo de
expresión puede comprender un marcador seleccionable útil para
identificar células huéspedes en el que el constructo de expresión
ha sido integrado y las secuencias de ADN necesarias para la
introducción del constructo en la planta en cuestión (esto depende
del método para la introducción del ADN que se utilice).
La elección de secuencias reguladoras, tales
como secuencias del promotor y del terminador y opcionalmente
secuencias señal o de tránsito se determina, por ejemplo, basándose
en cuándo, dónde, y cómo se desea que el polipéptido sea expresado.
Por ejemplo, la expresión del gen que codifica un polipéptido de la
presente invención puede ser constitutiva o inducible, o puede ser
desarrollable, fase- o tejido-específica, y el
producto genético puede estar dirigido a un tejido o parte de
planta específicos tales como semillas u hojas. Las secuencias
reguladoras están, por ejemplo, descritas por Tague et al.,
1988, Plant Physiology 86: 506.
Para la expresión constitutiva, el promotor
35S-CaMV puede ser usado (Franck et al.,
1980, Cell 21, 285-294). Promotores órgano
específicos pueden ser, por ejemplo, un promotor de tejidos
sumidero de almacenamiento tales como semillas, tubérculos de
patata, y frutas (Edwards & Coruzzi, 1990, Ann. Rev. Genet. 24,
275-303), o de tejidos sumidero metabólicos tales
como meristemas (Ito et Al., 1994, Plant Mol. Biol. 24,
863-878), un promotor
semilla-específico, tal como el promotor de la
glutelina, prolamina, globulina, o albúmina de arroz (Wu et
Al., 1998, Plant and Cell Physiology 39:
885-889), un promotor de Vicia faba de la legumina
B4 y el gen de proteína de semilla desconocido de Vicia faba
(Conrad et al., 1998, Journal of Plant Physiology 152:
708-711), un promotor de una proteína del cuerpo
graso de semilla (Chen et al., 1998, Plant and Cell
Physiology 39: 935-941), el promotor napA de
proteína de almacenamiento de Brassica napus, o cualquier
otro promotor semilla-específico conocido en la
técnica, p. ej., como se describe en WO 91/14772. Además, el
promotor puede ser un promotor hoja-específico tal
como el promotor rbcs de arroz o tomate (Kyozuka et
al., 1993, Plant Physiology 102: 991-1000, el
promotor del gen de la adenina metiltransferasa del virus de la
chlorella (Mitra y Higgins, 1994, Plant Molecular Biology 26,
85-93), o el promotor aldP del gen de arroz
(Kagaya et al., 1995, Molecular and General Genetics 248:
668-674), o un promotor dañado inducible tal como el
promotor pin2 de la patata (Xu et al., 1993, Plant
Molecular Biology 22, 573-588).
Un elemento potenciador del promotor puede
también ser usado para conseguir una mayor expresión de la enzima
en la planta. Por ejemplo, el elemento potenciador del promotor
puede ser un intrón que se coloca entre el promotor y la secuencia
de nucleótidos que codifica un polipéptido de la presente
invención. Por ejemplo, Xu et al., 1993, supra
describen el uso del primer intrón del gen de la actina 1 de arroz
para potenciar la expresión.
El gen marcador seleccionable y cualquier otra
parte del constructo de expresión pueden ser elegidos entre
aquellos disponibles en la técnica.
El constructo de ácidos nucleicos es incorporado
en el genoma de la planta según las técnicas convencionales
conocidas en la técnica, incluyendo la transformación mediada por
Agrobacterium, la transformación mediada por virus,
microinyección, bombardeo de partículas, transformación biolística,
y electroporación (Gasser et al., 1990, Science 244: 1293;
Potrykus, 1990, BiolTechnology 8: 535; Shimamoto et al.,
1989, Nature 338: 274).
Actualmente, la transferencia de genes mediada
por Agrobacterium turnefaciens es el método elegido para
generar dicotiledóneas transgénicas (para una revisión, véase
Hooykas y Schilperoort, 1992, Plant Molecular Biology 19:
15-38). No obstante esto puede también ser usado
para transformar monocotiledóneas, aunque generalmente se prefieren
otros métodos de transformación para estas plantas. Actualmente, el
método de elección para generar monocotiledóneas transgénicas es el
bombardeo de partículas (partículas de oro microscópico o tungsteno
revestidas con el ADN transfomante) de callos embrionarios o
embriones en desarrollo (Christou, 1992, Plant Journal 2:
275-281; Shimamoto, 1994, Current Opinion
Biotechnology 5: 158-162; Vasil et al., 1992,
Bio/Technology 10: 667-674). Un método alternativo
para la transformación de monocotiledóneas se basa en la
transformación de protoplastos como se describe por Omirulleh et
al., 1993, Plant Molecular Biology 21:
415-428.
Después de la transformación, los transformantes
que tienen incorporado en su interior el constructo de expresión
son seleccionados y regenerados en plantas enteras según métodos
bien conocidos en la técnica.
La presente invención también se refiere a
métodos para producir un polipéptido de la presente invención
comprendiendo (a) cultivo de una planta transgénica o una célula
vegetal comprendiendo una secuencia de nucleótidos que codifica un
polipéptido con actividad antimicrobiana de la presente invención
bajo condiciones propicias para la producción del polipéptido; y (b)
recuperación del polipéptido.
En otro aspecto ulterior, la presente invención
se refiere a composiciones, tales como composiciones farmacéuticas,
que comprenden un polipéptido antimicrobiano de la invención.
La composición puede comprender un polipéptido
de la invención como el componente polipeptidíco más importante, p.
ej., una composición monocomponente. De forma alternativa, la
composición puede comprender actividades enzimáticas múltiples,
tales como una aminopeptidasa, amilasa, carbohidrasa,
carboxipeptidasa, catalasa, celulasa, quitinasa, cutinasa,
ciclodextrina glicosiltransferasa, desoxirribonucleasa, esterasa,
alfa-galactosidasa,
beta-galactosidasa, glucoamilasa,
alfa-glucosidasa, beta-glucosidasa,
haloperoxidasa, invertasa, lacasa, lipasa, manosidasa, oxidasa,
enzima pectinolítica, peptidoglutaminasa, peroxidasa, fitasa,
polifenoloxidasa, enzima proteolítica, ribonucleasa,
transglutaminasa, o xilanasa.
Las composiciones pueden además comprender otro
agente farmacéuticamente activo, tal como un agente biocida
adicional, tal como otro polipéptido antimicrobiano que presenta
actividad antimicrobiana tal como se ha definido anteriormente. El
agente biocida puede ser un antibiótico, como se conoce en la
técnica. Clases de antibióticos incluyen penicilinas, p. ej.
bencilpenicilina, penicilina V, meticilina, oxacilina,
carbenicilina, nafcilina, ampicilina, etc.; penicilinas en
combinación con inhibidores de beta-lactamasa,
cefalosporinas, p. ej., cefaclor, cefazolina, cefuroxima,
moxalactamo, etc.; carbapenemos; monobactamos; aminoglicosidos;
tetraciclina; macrólidos; lincomicinas; polimixinas; sulfonamidas;
quinolonas; cloranfenical; metronidazol; espectinomicina;
trimetoprima; vancomicina; etc. El agente biocida puede también ser
un agente antimicótico, incluyendo polienos, p. ej. anfotericina B,
nistatina; 5-flucosina; y azotes, p. ej. miconazol,
cetoconazol, itraconazol y fluconazol.
En una forma de realización el agente biocida es
un agente químico no enzimático. En otra forma de realización el
agente biocida es un agente químico no polipeptídico.
El agente biocida puede ser capaz de reducir el
número de células vivas de Escherichia coli (DSM 1576) a
1/100 después de 8 horas (preferiblemente después de 4 horas, más
preferiblemente después de 2 horas, de la forma más preferible
después de 1 hora, y en particular después de 30 minutos)
incubación a 20ºC en una solución acuosa de 25%(p/p);
preferiblemente en una solución acuosa de 10%(p/p); más
preferiblemente en una solución acuosa del 5%(p/p); incluso más
preferiblemente en una solución acuosa del 1%(p/p); de la forma más
preferible en una solución acuosa del 0,5%(p/p); y en particular en
una solución acuosa del 0,1%(p/p) del agente biocida.
El agente biocida puede también ser capaz de
inhibir la excrecencia de Escherichia coli (DSM 1576)
durante 24 horas a 25ºC en un sustrato de crecimiento microbiano,
añadido en una concentración de 1000 ppm; preferiblemente añadido
en una concentración de 500 ppm; más preferiblemente añadido en una
concentración de 250 ppm; incluso más preferiblemente cuando se
añade en una concentración de 100 ppm; de la forma más preferible
añadido en una concentración de 50 ppm; y en particular cuando se
añade en una concentración de 25 ppm.
El agente biocida puede también ser capaz de
reducir el número de células vivas de Bacillus subtilis
(ATCC 6633) a 1/100 después de 8 horas (preferiblemente después de
4 horas, más preferiblemente después de 2 horas, de la forma más
preferible después de 1 hora, y en particular después de 30
minutos) incubación a 20ºC en una solución acuosa del 25%(p/p);
preferiblemente en una solución acuosa del 10%(p/p); más
preferiblemente en una solución acuosa del 5%(p/p); incluso más
preferiblemente en una solución acuosa del 1%(p/p); de la forma más
preferible en una solución acuosa del 0,5%(p/p); y en particular en
una solución acuosa del 0,1%(p/p) del agente biocida.
El agente biocida puede también ser capaz de
inhibir la excrecencia de Bacillus subtilis (ATCC 6633)
durante 24 horas a 25ºC en un sustrato de crecimiento microbiano,
añadido en una concentración de 1000 ppm; preferiblemente añadido
en una concentración de 500 ppm; más preferiblemente añadido en una
concentración de 250 ppm; incluso más preferiblemente cuando se
añade en una concentración de 100 ppm; de la forma más preferible
añadido en una concentración de 50 ppm; y en particular cuando se
añade en una concentración de 25 ppm.
Las composiciones pueden comprender un material
portador adecuado. Las composiciones pueden también comprender un
vehículo de entrega adecuado capaz de entregar los polipéptidos
antimicrobianos de la invención al locus deseado cuando las
composiciones son usadas como un medicamento.
Las composiciones pueden ser preparadas conforme
a métodos conocidos en la técnica y pueden estar en forma de un
líquido o una composición seca. Por ejemplo, la composición
polipeptídica puede estar en forma de un granulado o un
microgranulado. El polipéptido para ser incluido en la composición
puede ser estabilizado conforme a métodos conocidos en la
técnica.
Se proveen ejemplos más abajo de usos preferidos
de las composiciones polipeptídicas de la invención. La
dosificación de la composición polipeptídica de la invención y
otras condiciones bajo las cuales se usa la composición pueden ser
determinadas basándose en métodos conocidos en la técnica.
La presente invención también comprende varios
usos de los polipéptidos antimicrobianos de la invención. Los
polipéptidos antimicrobianos son normalmente útiles en cualquier
locus sometido a contaminación por bacterias, hongos, levadura o
algas. Normalmente, los loci están en sistemas acuosos tales como
sistemas de agua de refrigeración, agua de enjuague para
lavandería, sistemas de aceites tales como aceites de corte,
lubricantes, campos de aceite y similares, microorganismos donde
los microorganismos necesitan ser matados o donde su crecimiento
necesita ser controlado. No obstante, la presente invención puede
también ser usada en todas las aplicaciones para las cuales las
composiciones antimicrobianas conocidas son útiles, tales como
protección de madera, látex, adhesivo, pegamento, papel, cartón,
tela, cuero, plástico, calafateo, y pienso.
Otros usos incluyen conservación de alimentos,
bebidas, cosméticos tales como lociones, cremas, geles, pomadas,
jabones, champús, acondicionadores, antitranspirantes,
desodorantes, enjuague bucal, productos para lentes de contacto,
formulaciones enzimáticas, o ingredientes alimentarios.
Así, los polipéptidos antimicrobianos de la
invención pueden ser útiles como un desinfectante, p. ej., en el
tratamiento de acné, infecciones en el ojo o la boca, infecciones
de la piel; en antitranspirantes o desodorantes; en sales de baño
para pies; para limpiar y desinfectar lentes de contacto,
superficies duras, dientes (cuidado bucal), lesiones, magulladuras
y similares.
En general se contempla que los polipéptidos
antimicrobianos de la presente invención sean útiles para limpieza,
desinfección o inhibición del crecimiento microbiano en cualquier
superficie dura. Ejemplos de superficies, que pueden ser
contactadas ventajosamente con los polipéptidos antimicrobianos de
la invención son superficies de equipamiento para el procesamiento
usado p. ej. queserías, plantas de procesamiento químico o
farmacéutico, sistemas de saneamiento del agua, plantas de
procesamiento de aceite, plantas de procesamiento de pasta de
papel, plantas de tratamiento de agua, y torres de enfriamiento.
Los polipéptidos antimicrobianos de la invención deberían ser
usados en una cantidad, que sea eficaz para la limpieza,
desinfección o inhibición del crecimiento microbiano en la
superficie en cuestión.
Además, se contempla que los polipéptidos
antimicrobianos de la invención puedan ser usados ventajosamente en
un sistema de limpieza en sitio (C.I.P.) para la limpieza de
cualquier tipo de equipamiento de procesamiento.
Los polipéptidos antimicrobianos de la invención
pueden adicionalmente ser usados para limpiar superficies y
utensilios de cocina en plantas de procesamiento de alimentos y en
cualquier área donde se preparan o sirven alimentos tales como
hospitales, clínicas, restaurantes, especialmente restaurantes de
comida rápida, delicatessens y similares. Puede también ser usado
como un agente antimicrobiano en productos alimentarios y sería
especialmente útil como un antimicrobiano de superficies en quesos,
frutas y verduras y alimentos en barras saladas.
Puede también ser usado como un agente de
conservación o un agente de desinfección en pinturas al agua.
Los polipéptidos antimicrobianos de la presente
invención son también útiles para el control microbiano en
conductos de agua, y para la desinfección del agua, en particular
para la desinfección del agua industrial.
La invención también expone el uso de un
polipéptido antimicrobiano o composición de la invención como un
medicamento. Además, un polipéptido antimicrobiano o composición de
la invención pueden también ser usados para la producción de un
medicamento para controlar o combatir microorganismos, tales como
organismos fúngicos o bacterias, preferiblemente bacterias gram
positivas.
La composición y polipéptido antimicrobiano de
la invención pueden ser usados como un agente veterinario
antimicrobiano o terapéutico humano o profiláctico. Así, la
composición y el polipéptido antimicrobiano de la invención pueden
ser usados en la preparación de agentes veterinarios o terapéuticos
humanos o agentes profilácticos para el tratamiento de infecciones
microbianas, tales como infecciones bacterianas o fúngicas,
preferiblemente infecciones bacterianas gram positivas. En
particular, las infecciones microbianas pueden estar asociadas a
enfermedades pulmonares incluyendo, pero sin limitarse a,
tuberculosis, pulmonía y fibrosis cística; y enfermedades de
transmisión sexual incluyendo, pero sin limitarse a, gonorrea y
clamidia.
La composición de la invención comprende una
cantidad eficaz del polipéptido antimicrobiano de la invención.
El término "cantidad eficaz" cuando se usa
aquí se destina a significar una cantidad del polipéptido
antimicrobiano que comprende la secuencia de aminoácidos mostrada
como aminoácidos 1 a 21 de cualquiera de la SEC ID NO:38 a SEC ID
NO:46, que es suficiente para inhibir el crecimiento de los
microorganismos en cuestión.
La invención también se refiere a composiciones
de cicatrización de una herida o productos tales como dispositivos
médicos, de bendaje tales como, p. ej., catéteres y otros para
productos capilares anticaspa, tales como champús.
Las formulaciones de los polipéptidos
antimicrobianos de la invención son administradas a un huésped que
sufre de o que está predispuesto a una infección microbiana. La
administración puede ser tópica, localizada o sistémica,
dependiendo del microorganismo específico, preferiblemente será
localizada. Generalmente la dosis de los polipéptidos
antimicrobianos de la invención será suficiente para reducir la
población microbiana al menos aproximadamente un 50%, normalmente
al menos un 1 log, y pueden ser por 2 o más logs de muerte. Los
compuestos de la presente invención son administrados en una
dosificación que reduce la población microbiana mientras que se
minimiza cualquier efecto secundario. Está contemplado que la
composición será obtenida y usada bajo el control de un médico para
el uso in vivo. Los polipéptidos antimicrobianos de la
invención son particularmente útiles para matar bacterias gram
negativas, incluyendo Pseudomonas aeruginosa, y Chlamydia
trachomatis; y bacterias gram-positivas,
incluyendo varios estafilococos y estreptococos.
Los polipéptidos antimicrobianos de la invención
son también útiles para formulaciones in vitro para matar
microbios, particularmente donde no se desea introducir cantidades
de antibióticos convencionales. Por ejemplo, los polipéptidos
antimicrobianos de la invención pueden ser añadidos a preparaciones
alimentarias para animales y/o humanos; o éstas pueden ser
incluidas como un aditivo para cultivos in vitro de células,
para prevenir el crecimiento excesivo de microbios en el cultivo de
tejidos.
La susceptibilidad a la muerte de un microbio
particular con los polipéptidos antimicrobianos de la invención
puede ser determinada por una prueba in vitro, como se
detalla en la sección experimental. Normalmente un cultivo del
microbio está combinada con el polipéptido antimicrobiano en
concentraciones variables durante un periodo temporal suficiente
para permitir que la proteína actúe, normalmente entre
aproximadamente una hora y un día. Los microbios viables son luego
contados, y el nivel de muerte determinado.
Los microbios de interés incluyen, pero no se
limitan a, bacterias gram-negativas, por ejemplo:
Citrobacter sp.; Enterobacter sp.; Escherichia sp., p. ej.
E. coli, Klebsiella sp.; Morganella sp.; Proteus sp.; Providencia
sp.; Salmonella sp., p. ej. S. typhi, S. typhimurium;
Serratia sp.; Shigella sp.; Pseudomonas sp, p. ej. P.
aeruginosa; Yersinia sp., p. ej. Y. pestis, Y.
pseudotuberculosis, Y. enterocolitica; Franciscella sp.; Pasturella
sp.; Vibrio sp., p. ej. V. cholerae, V. parahemolyticus;
Campylobacter sp., p. ej. C. jejuni; Haemophilus sp., p.
ej. H. influenzae, H. ducreyi; Bordetella sp., p. ej. B.
pertussis, B. bronchiseptica, B. parapertussis; Brucella sp.,
Neisseria sp., p. ej. N. gonorrhoeae, N. meningitidis,
etc. Otras bacterias de interés incluyen Legionella sp., p.
ej. L. pneumophila; Listeria sp, p. ej. L. monocytogenes;
Mycoplasma sp., p. ej. M. hominis, M. pneumoniae;
Mycobacterium sp., p. ej. M. tuberculosis, M. leprae;
Treponema sp., p. ej. T. pallidum; Borrelia sp., p. ej.
B. burgdorferi; Leptospirae sp.; Rickettsia sp., p. ej.
R. rickettsii, R. typhi; Chlamydia sp., p. ej. C.
trachomatis, C. pneumoniae, C. psittaci; Helicobacter sp., p.
ej. H. pylori, etc.
Los patógenos no bacterianos de interés incluyen
patógenos fúngicos y de protozoo, p. ej. Plasmodia sp., p.
ej. P. falciparum, Trypanosoma sp., p. ej. T. brucei;
shistosomes; Entaemoeba sp., Cryptococcus sp., Candida sp., p.
ej. C. albicans; etc.
Varios métodos para la administración pueden ser
empleados. La formulación polipeptídica puede ser dada oralmente, o
puede ser inyectada intravascularlmente, subcutáneamente,
peritonealmente, por aerosol, oftálmicamente,
intra-vejiga, tópicamente, etc. Por ejemplo, los
métodos de administración por inhalación son bien conocidos en la
técnica. La dosificación de la formulación terapéutica variará
mucho, dependiendo del polipéptido específico antimicrobiano que
debe ser administrado, la naturaleza de la enfermedad, la
frecuencia de administración, la forma de administración, el
aclaramiento del agente del huésped, y similares. La dosis inicial
puede ser mayor, seguido de dosis de mantenimiento más pequeñas. La
dosis puede ser administrada de manera tan poco frecuente como
semanal o bisemanalmente, o fraccionada en dosis más pequeñas y
administrada una vez o varias veces al día,
semi-semanalmente, etc. para mantener un nivel de
dosificación eficaz. En muchos casos, la administración oral
requerirá una dosis más alta que si se administra por vía
intravenosa. Los enlaces amida, al igual que los términos amino y
carboxi, pueden ser modificados para una mayor estabilidad en la
administración oral. Por ejemplo, el término carboxi puede ser
amidado.
Los compuestos de esta invención pueden ser
incorporados en una variedad de formulaciones para la
administración terapéutica. Más particularmente, los compuestos de
la presente invención pueden ser formulados en composiciones
farmacéuticas por combinación con portadores o diluyentes
apropiados aceptables farmacéuticamente, y pueden ser formulados en
preparaciones en formas sólida, semi-sólida, líquida
o gaseosa, tales como comprimidos, cápsulas, polvos, gránulos,
pomadas, cremas, espumas, soluciones, supositorios, inyecciones,
inhalantes, geles, microesferas, lociones, y aerosoles. Como tal,
la administración de los compuestos puede ser conseguida de varias
maneras, incluidas la administración oral, bucal, rectal,
parenteral, intraperitoneal, intradérmica, transdérmica, intraqueal,
etc.. Los polipéptidos antimicrobianos de la invención pueden ser
sistémicos después de la administración o pueden ser localizados
por el uso de un implante u otra formulación que actúa para retener
la dosis activa en el sitio de implantación.
En una forma de realización, una formulación
para uso tópico comprende un agente quelante que reduce la
concentración eficaz de cationes bivalentes, particularmente calcio
y magnesio. Por ejemplo, agentes tales como citrato, EGTA o EDTA,
pueden ser incluidos, donde se prefiere el citrato. La
concentración de citrato usualmente será de aproximadamente 1 a 10
mM.
Los compuestos de la presente invención pueden
ser administrados solos, en combinación uno con otro, o pueden ser
usados en combinación con otros compuestos conocidos (p. ej.,
perforina, agentes anti-inflamatorios,
antibióticos, etc.) en formas de dosificación farmacéuticas, los
compuestos pueden ser administrados en forma de sus sales
farmacéuticamente aceptables. Los métodos y excipientes siguientes
son meramente ejemplares y de ninguna manera limitadores.
Para preparaciones orales, los compuestos pueden
ser usados solos o en combinación con aditivos apropiados para
hacer comprimidos, polvos, gránulos o cápsulas, por ejemplo, con
aditivos convencionales, tales como lactosa, manitol, almidón de
maíz o almidón de patata; con aglutinantes, tales como celulosa
cristalina, derivados de celulosa, acacia, almidón de maíz o
gelatinas; con desintegradores, tales como almidón de maíz, almidón
de patata o carboximetilcelulosa sódica; con lubricantes, tal como
talco o estearato de magnesio; y si se desea, con diluyentes,
agentes amortiguadores, agentes humectantes, agentes conservantes y
aromatizantes.
Los compuestos pueden ser formulados en
preparaciones para inyecciones disolviéndolas, suspendiéndolas o
emulsionándolas en un solvente acuoso o no acuoso, tal como aceites
vegetales u otros similares, glicéridos de ácidos sintéticos
alifáticos, ésteres de ácidos alifáticos mayores o propilenoglicol;
y si se desea, con aditivos convencionales tales como
solubilizantes, agentes isotónicos, agentes de suspensión, agentes
emulsionantes, estabilizadores y conservantes.
Los compuestos pueden ser utilizados en
formulación de aerosol para ser administrados por inhalación. Los
compuestos de la presente invención pueden ser formulados en
propulsores presurizados aceptables tales como
diclorodifluorometano, propano, nitrógeno y similares.
Los compuestos pueden ser usados como lociones,
por ejemplo para prevenir la infección de quemaduras, por
formulación con aditivos convencionales tales como solubilizantes,
agentes isotónicos, agentes de suspensión, agentes emulsionantes,
estabilizadores y conservantes.
Además, los compuestos pueden ser hechos en
supositorios mediante la mezcla con una variedad de bases tales
como bases emulsionantes o bases hidrosolubles. Los compuestos de
la presente invención pueden ser administrados por vía rectal por
medio de un supositorio. El supositorio puede incluir vehículos
tales como manteca de cacao, carboceras y politilenglicoles, que se
funden a la temperatura corporal, pero son solidificados a la
temperatura ambiente.
Formas de dosificación unitaria para
administración oral o rectal tales como jarabes, elixires, y
suspensiones pueden ser proporcionadas donde cada unidad de
dosificación, por ejemplo, cucharadita, cucharada, pastilla o
supositorio, contiene una cantidad predeterminada de la composición
que contiene uno o más compuestos de la presente invención. De
forma similar, las formas de dosificación unitarias para inyección
o administración intravenosa pueden comprender el compuesto de la
presente invención en una composición como una solución en agua
estéril, solución salina normal o otro portador farmacéuticamente
aceptable.
Implantes para formulaciones de liberación
sostenida son bien conocidos en la técnica. Los implantes son
formulados como microesferas, bloques, etc. con polímeros
biodegradables o no biodegradables. Por ejemplo, polímeros de ácido
láctico y/o ácido glicólico forman un polímero erosionable que es
bien tolerado por el huésped. El implante que contiene los
polipéptidos antimicrobianos de la invención es colocado en la
proximidad del sitio de infección, de modo que la concentración
local de agente activo es aumentada con respecto al resto del
cuerpo.
El término "forma de dosificación
unitaria", como se utiliza en este caso, se refiere a unidades
físicamente específicas adecuadas como dosificaciones unitarias
para sujetos humanos y animales, cada unidad conteniendo una
cantidad predeterminada de compuestos de la presente invención
calculada en una cantidad suficiente para producir el efecto
deseado en asociación con un diluyente, portador o vehículo
aceptable farmacéuticamente. Las especificaciones para las formas
de dosificación unitaria de la presente invención dependen del
compuesto particular empleado y del efecto que debe ser conseguido,
y a la farmacodinámica asociada al compuesto en el huésped.
Los excipientes aceptables farmacéuticamente,
tales como vehículos, adyuvantes, portadores o diluyentes, están
fácilmente disponibles al público. Además, las sustancias
auxiliares aceptables farmacéuticamente, tales como agentes de
ajuste del pH y amortiguadores, agentes de tonicidad,
estabilizadores, agentes de humidificación y similares, están
fácilmente disponibles al público.
Las dosificaciones típicas para la
administración sistémica variarán de 0,1 pg a 100 miligramos por kg
peso de sujeto por administración. Una dosificación típica puede
ser una pastilla tomada de dos a seis veces al día, o una cápsula
de liberación en el tiempo o pastilla tomada una vez al día y
conteniendo un contenido proporcionalmente más alto de sustancia
activa. El efecto de liberación de tiempo puede ser obtenido por
materiales de cápsula que se disuelven a valores de pH diferentes,
por cápsulas que se liberan lentamente por presión osmótica, o por
cualquier otro medio conocido de liberación controlada.
Los expertos apreciarán fácilmente que los
niveles de las dosis pueden variar como función del compuesto
específico, la gravedad de los síntomas y la susceptibilidad del
sujeto a los efectos secundarios. Algunos compuestos específicos
son más potentes que otros. Las dosificaciones preferidas para un
compuesto dado son fácilmente determinables por los expertos en la
técnica por una variedad de medios. Un medio preferido es medir la
fuerza fisiológica de un compuesto dado.
El uso de liposomas como un vehículo de entrega
es un método de interés. Los liposomas se fusionan con las células
del sitio diana y entregan el contenido del lumen
intracelularmente. Los liposomas son mantenidos en contacto con las
células durante el tiempo suficiente para la fusión, usando varios
medios para mantener el contacto, tales como aislamiento, agentes
aglutinantes, y similares. En un aspecto de la invención, los
liposomas están diseñados para ser aerosolizados para la
administración pulmonar. Los liposomas pueden ser preparados con
proteínas purificadas o péptidos que median la fusión de membranas,
tales como el virus Sendai o el virus de la gripe, etc. Los lípidos
pueden ser cualquier combinación útil de lípidos que forman
liposomas, incluyendo lípidos catiónicos o zwitteriónicos, tales
como la fosfatidilcolina. El lípido restante será normalmente
lípido neutro o acídico, tal como colesterol, fosfatidilserina,
fosfatidilglicerol, y similares.
Para preparar los liposomas, puede ser usado el
procedimiento descrito por Kato et al. (1991) J. Biol. Chem.
266:3361. Brevemente, los lípidos y composición de lumen que
contiene péptidos son combinados en un medio acuoso apropiado,
convenientemente un medio de solución salina donde los sólidos
totales estarán en la gama de aproximadamente 1-10
por ciento en peso. Después de períodos cortos de tiempo de
agitación intensa, de aproximadamente 5-60 seg., el
tubo es colocado en un baño maría caliente, de aproximadamente
25-40ºC y este ciclo es repetido aproximadamente
5-10 veces. La composición es luego sometida a un
baño de ultrasonidos durante un periodo temporal conveniente,
generalmente de aproximadamente 1-10 seg. y puede
ser adicionalmente agitada por agitación en vórtex. El volumen es
luego expandido añadiendo un medio acuoso, generalmente aumentando
el volumen aproximadamente de 1-2 veces, seguido de
agitación y enfriamiento. Este método permite la incorporación en
el lumen de moléculas de alto peso molecular.
Para el uso en los métodos dependientes, los
polipéptidos antimicrobianos de la invención pueden ser formulados
con otros agentes farmacéuticamente activos, particularmente otros
agentes antimicrobianos. Otros agentes de interés incluyen una
amplia variedad de antibióticos, como se conoce en la técnica.
Clases de antibióticos incluyen penicilinas, p. ej. penicilina G,
penicilina V, meticilina, oxacilina, carbenicilina, nafcilina,
ampicilina, etc.; penicilinas en combinación con inhibidores de
beta-lactamasa, cefalosporinas, p. ej., cefaclor,
cefazolina, cefuroxima, moxalactamo, etc.; carbapenemos;
monobactamos; aminoglicósidos; tetraciclina; macrólidos;
lincomicinas; polimixinas; sulfonamidas; quinolonas; cloranfenical;
metronidazol; espectinomicina; trimetoprima; vancomicina; etc.
Agentes antimicóticos son también útiles,
incluyendo polienos, p. ej. anfotericina B, nistatina;
5-flucosina; y azotes, p. ej. miconazol,
cetoconazol, itraconazol y fluconazol. Fármacos antituberculóticos
incluyen isoniazida, etambutol, estreptomicina y rifampicina. Las
citoquinas pueden también ser incluidas en una formulación de los
polipéptidos antimicrobianos de la invención, p. ej. interferón
gamma, factor alfa de necrosis tumoral, interleuquina 12, etc.
Los péptidos antimicrobianos de la invención
pueden ser preparados por síntesis in vitro, usando métodos
convencionales conocidos en la técnica. Varios aparatos comerciales
sintéticos están disponibles, por ejemplo sintetizadores
automatizados por Applied Biosysttems Inc., Beckman, etc. Usando
sintetizadores, los aminoácidos de origen natural pueden ser
sustituidos con aminoácidos innaturales, particularmente isómeros D
(o formas D) p. ej. D-alanina y
D-isoleucina, diastereoisómeros, cadenas laterales
que tienen longitudes o funciones diferentes, y similares. La
secuencia particular y la forma de preparación será determinada por
conveniencia, economía, pureza requerida, y
similares.
similares.
La unión química puede ser proporcionada para
varios péptidos o proteínas que comprenden funciones convenientes
para el enlace, tales como grupos amino para la formación de amida
o amina sustituida, p. ej. aminación reductiva, grupos tiol para la
formación de tioéter o disulfuro, grupos carboxilo para la
formación de amida, y similares.
Si se desea, se pueden introducir varios grupos
en el péptido durante la síntesis o durante la expresión, lo que
permite la conexión con otras moléculas o con una superficie. Así
las cisteínas pueden utilizarse para hacer tioéteres, las
histidinas para conectarse a un complejo de iones metálicos, los
grupos carboxilo para formar amidas o ésteres, los grupos amino
para formar amidas, y similares.
Los polipéptidos pueden también ser aislados y
purificados conforme a métodos convencionales de síntesis
recombinante. Un lisado del huésped de expresión puede ser preparado
y el lisado puede ser purificado usando HPLC, cromatografía de
exclusión, electroforesis en gel, cromatografía de afinidad, u otra
técnica de purificación. En su mayor parte, las composiciones que
son usadas comprenderán al menos el 20% en peso del producto
deseado, más normalmente al menos aproximadamente el 75% en peso,
preferiblemente al menos aproximadamente el 95% en peso, y para
fines terapéuticos, normalmente al menos aproximadamente el 99,5%
en peso, en relación con contaminantes relacionados con el método
de preparación del producto y su purificación. Normalmente, los
porcentajes se basarán en el total de proteína
La presente invención está también dirigida a
métodos para usar polipéptidos que tienen actividad antimicrobiana
en alimento para animales, al igual que a composiciones de piensos
y aditivos para piensos que comprenden los polipéptidos
antimicrobianos de la invención.
El término animales incluye todos los animales,
incluidos los seres humanos. Ejemplos de animales son no rumiantes,
y rumiantes, tales como vacas, ovejas y caballos. En una forma de
realización particular, el animal es un animal no rumiante. Los
animales no rumiantes incluyen animales monogástricos, p. ej.
cerdos o puercos (incluidos, pero sin limitarse a, lechones, cerdos
en crecimiento, y cerdas); aves tales como pavos y pollos
(incluidos, pero sin limitarse a, pollos para asar, ponedores);
terneros jóvenes; y peces (incluido, pero sin limitarse a,
salmón).
El término pienso o composición de pienso
significa cualquier compuesto, preparación, mezcla, o composición
adecuada para, o destinada para la ingesta por un animal.
En el uso según la invención el polipéptido
antimicrobiano puede ser provisto al animal antes, después, o
simultáneamente con la dieta. Se prefiere ésta última opción.
En una forma de realización particular, el
polipéptido antimicrobiano, en la forma en la que se añade al
pienso, o cuando se incluye en un aditivo para pienso, está bien
definido. Bien definido significa que la preparación polipeptídica
antimicrobiana tiene al menos el 50% de pureza según se determina
por cromatografía de exclusión por tamaños (véase ejemplo 12 de WO
01/58275). En otras formas de realización particulares la
preparación polipeptídica antimicrobiana tiene al menos un 60, 70,
80, 85, 88, 90, 92, 94, o al menos un 95% de pureza según se
determina por este método.
Una preparación polipeptídicca antimicrobiana
bien definida es ventajosa. Por ejemplo, es mucho más fácil
dosificar correctamente en el pienso un polipéptido antimicrobiano
que esté esencialmente libre de interferir o contaminar otros
polipéptidos antimicrobianos. El término dosis se refiere
correctamente en particular al objetivo de obtener resultados
consistentes y constantes, y la capacidad de optimizar la
dosificación basándose en el efecto deseado.
Para el uso en el alimento para animales, no
obstante, el polipéptido antimicrobiano no necesita ser puro; puede
p. ej. incluir otras enzimas, en cuyo caso podría ser denominado
una preparación polipeptídica antimicrobiana.
La preparación polipeptídica antimicrobiana
puede ser (a) añadida directamente al pienso (o usada directamente
en un proceso de tratamiento de proteínas vegetales), o (b) puede
ser usada en la producción de una o más composiciones intermedias
tal como aditivos o premezclas para piensos que posteriormente se
añaden al pienso (o se usa en un proceso de tratamiento). El grado
de pureza anteriormente descrito se refiere a la pureza de la
preparación polipeptídica antimicrobiana original, si se usa según
(a) o (b) arriba.
Preparaciones polipeptídicas antimicrobianas con
purezas de este orden de magnitud son en particular obtenibles
usando métodos recombinantes de producción, mientras que éstas no
son tan fácilmente obtenidas y también sometidas a una variación
entre lotes mucho más alta cuando el polipéptido antimicrobiano es
producido por métodos de fermentación tradicionales.
Tal preparación polipeptídica antimicrobiana
puede por supuesto ser mezclada con otras enzimas.
El término proteínas vegetales como se utiliza
en este caso se refiere a cualquier compuesto, composición,
preparación o mezcla que incluye al menos una proteína derivada de
u originada a partir de un vegetal, incluyendo proteínas
modificadas y derivados proteínicos. En formas de realización
particulares, el contenido de proteína de las proteínas vegetales es
al menos 10, 20, 30, 40, 50, 0 60% (p/p).
Las proteínas vegetales pueden ser derivadas de
fuentes de proteína vegetal, tales como leguminosas y cereales, por
ejemplo materiales de plantas de las familias Fabaceae
(Leguminosae), Cruciferaceae, Chenopodiaceae, y Poaceae
tales como harina de soja, harina de lupino y harina de semilla de
colza.
En una forma de realización particular, la
fuente de proteína vegetal es materia de una o más plantas de la
familia Fabaceae, p. ej. semilla de soja, altramuz,
guisante, o judía.
En otra forma de realización particular, la
fuente de proteína vegetal es materia de una o más plantas de la
familia Chenopodiaceae, p. ej. remolacha, remolacha
azucarera, espinaca o quinoa.
Otros ejemplos de fuentes de proteína vegetal
son semilla de colza, y repollo.
Semilla de soja es una fuente de proteína de
vegetal preferida.
Otros ejemplos de fuentes de proteína vegetal
son cereales tal como cebada, trigo, centeno, avena, maíz
(mazorca), arroz, y sorgo.
El polipéptido antimicrobiano puede ser añadido
al pienso en cualquier forma, tal como un polipéptido
antimicrobiano relativamente puro, o en aditivo con otros
componentes destinados a la adición en el alimento para animales,
es decir, en forma de aditivos para alimento para animales, tal como
las denominadas premezclas para alimento para animales.
En otro aspecto la presente invención se refiere
a composiciones para el uso en alimento para animales, tal como
alimento para animales, y aditivos de alimento para animales, p.
ej. premezclas.
Aparte del polipéptido antimicrobiano de la
invención, los aditivos para alimento para animales de la invención
contienen al menos una vitamina soluble en grasa, y/o al menos una
vitamina soluble en agua, y/o al menos un oligoelemento, y/o al
menos un macromineral.
Además, los ingredientes de aditivo para pienso
opcionales son agentes colorantes, compuestos de aroma,
estabilizadores, y/o al menos otra enzima seleccionada entre
fitasas EC 3.1.3.8 o 3.1.3.26; xilanasas EC 3.2.1.8; galactanasas
EC 3.2.1.89; y/o beta-glucanasas EC 3.2.1.4.
En una forma de realización particular estas
otras enzimas están bien definidas (como se ha definido arriba para
preparaciones polipeptídicas antimicrobianas).
Ejemplos de otros péptidos antimicrobianos
(AMP's) son CAP18, Leucocina A, Tritrpticina,
Protegrina-1, Tanatina, Defensina, Ovispirina tal
como Novispirin (Robert Lehrer, 2000), y variantes, o fragmentos de
los mismos que retienen actividad antimicrobiana.
Ejemplos de otros polipéptidos antifungicidas
(AFP's) son los péptidos de Aspergillus giganteus, y
Aspergillus niger, al igual que variantes y fragmentos de
los mismos que retienen actividad antifúngica, como se describe en
WO 94/01459 y WO 02090384.
Normalmente, las vitaminas solubles en grasa y
en agua, al igual que los oligoelementos forman parte de una
denominada premezcla prevista para la adición al pienso, mientras
que los macrominerales son normalmente añadidos al pienso por
separado. Cualquiera de estos tipos de composición, enriquecidos
con un polipéptido antimicrobiano de la invención, es un aditivo
para alimento para animales de la invención.
En una forma de realización particular, el
aditivo para alimento para animales de la invención está destinado
a estar incluido (o prescrito como teniendo que ser incluido) en
dietas o alimento para animales a niveles de 0,01 a 10,0%; más
particularmente 0,05 a 5,0%; o 0,2 a 1,0% (% significando g de
aditivo por 100 g de pienso). Esto es así en particular para
premezclas.
A continuación hay unas listas no exclusivas de
ejemplos de estos componentes:
- \quad
- Ejemplos de vitaminas solubles en grasa son la vitamina A, vitamina D3, vitamina E, y vitamina K, p. ej. vitamina K3.
- \quad
- Ejemplos de vitaminas solubles en agua son la vitamina B12, biotina y colina, vitamina B1, vitamina B2, vitamina B6, niacina, ácido fólico y pantotenato, p. ej. Ca-D-pantotenato.
- \quad
- Ejemplos de oligoelementos son manganeso, zinc, hierro, cobre, yodina, selenio, y cobalto.
- \quad
- Ejemplos de macrominerales son calcio, fósforo y sodio.
Los requisitos nutritivos de estos componentes
(ejemplificados con ave y lechones/cerdos) están catalogados en la
Tabla A de WO 01/58275. Requisito nutritivo significa que estos
componentes deberían ser proporcionados en la dieta en las
concentraciones indicadas.
De forma alternativa, el aditivo para alimento
para animales de la invención comprende al menos uno de los
componentes individuales especificados en la Tabla A de WO
01/58275. Al menos uno significa cualquiera de, uno o más de, uno,
o dos, o tres, o cuatro etcétera hasta los trece, o hasta los
quince componentes individuales. Más específicamente, este al menos
un componente individual está incluido en el aditivo de la invención
en una cantidad tal como para proporcionar una
concentración-en-pienso dentro de
la gama indicada en la columna cuatro, o columna cinco, o columna
seis de la Tabla A.
La presente invención también se refiere a
composiciones de alimento para animales. Las composiciones o dietas
de alimento para animales tienen un contenido relativamente alto de
proteína. Las dietas para aves y cerdos pueden estar caracterizadas
como se indica en la Tabla B de WO 01/58275, columnas
2-3. Las dietas para peces pueden estar
caracterizadas como se indica en columna 4 de esta Tabla B. Además
tales dietas para peces normalmente tienen un contenido bruto de
grasa de 200-310 g/kg.
Una composición de alimento para animales según
la invención tiene un contenido bruto de proteína de
50-800 g/kg, y además comprende al menos un
polipéptido antimicrobiano como se reivindica aquí.
Además, o de forma alternativa (para el
contenido bruto de proteína indicado arriba), la composición de
alimento para animales de la invención tiene un contenido de
energía metabolizable de 10-30 MJ/kg; y/o un
contenido de calcio de 0,1-200 g/kg; y/o un
contenido de fósforo disponible de 0,1-200 g/kg;
y/o un contenido de metionina de 0,1-100 g/kg; y/o
un contenido de metionina más cisteína de 0,1-150
g/kg; y/o un contenido de lisina de 0,5-50
g/kg.
g/kg.
En formas de realización particulares, el
contenido de energía metabolizable, proteína bruta, calcio,
fósforo, metionina, metionina más cisteína, y/o lisina están dentro
de cualquiera de las gamas 2, 3, 4 o 5 en la Tabla B de WO 01/58275
(R. 2-5).
La proteína bruta es calculada como nitrógeno
(N) multiplicada por un factor 6.25, es decir proteína bruta
(g/kg)= N (g/kg) x 6.25. El contenido de nitrógeno es determinado
por el método Kjeldahl (A.O.A.C., 1984, Official Methods of Analysis
14th ed., Association of Official Analytical Chemists, Washington
DC).
La energía metabolizable puede ser calculada
basándose en la publicación de NRC Nutrient requirements in swine,
ninth revised edition 1988, subcommittee on swine nutrition,
committee on animal nutrition, board of agriculture, national
research council. National Academy Press, Washington, D.C., págs.
2-6, y la European Table of Energy Values for
Poultry Feed-stuffs, Spelderholt centre for poultry
research and extension, 7361 DA Beekbergen, Holanda. Grafisch
bedrijf Ponsen & looijen bv, Wageningen. ISBN
90-71463-12-5.
El contenido dietético de calcio, fósforo
disponible y aminoácidos en dietas para animales completas es
calculado basándose en tablas de alimentos para animales tales como
Veevoedertabel 1997, gegevens over chemische samenstelling,
verteerbaarheid en voederwaarde van voedermiddelen, Central
Veevoederbureau, Runderweg 6, 8219 pk Lelystad. ISBN
90-72839-13-7.
En una forma de realización particular, la
composición de alimento para animales de la invención contiene al
menos una proteína vegetal o fuente de proteína tal como se ha
definido anteriormente.
En otras formas de realización adicionales
particulares, la composición de alimento para animales de la
invención contiene 0-80% de maíz; y/o
0-80% de sorgo; y/o 0-70% de trigo;
y/o 0-70% de cebada; y/o 0-30% de
avena; y/o 0-40% de harina de soja; y/o
0-10% de harina de pescado; y/o
0-20% de lactosuero. Las dietas para animales
pueden p. ej. ser fabricadas como pienso triturado (no granulado) o
pienso granulado. Normalmente, los materiales de pienso molidos son
mezclados y cantidades suficientes de vitaminas esenciales y
minerales son agregados según las especificaciones para las
especies en cuestión. Las enzimas pueden ser añadidas como
formulaciones enzimáticas sólidas o líquidas. Por ejemplo, una
formulación enzimática sólida es normalmente añadida antes o
durante la fase de mezcla; y una preparación enzimática líquida es
normalmente añadida después de la fase de granulación. La enzima
puede también ser incorporada en un aditivo o premezcla
alimentario.
La concentración enzimática final en la dieta
está en la gama de 0,01-200 mg de proteína
enzimática por kg de dieta, por ejemplo en la gama de
5-30 mg de proteína enzimática por kg de dieta
animal.
El polipéptido antimicrobiano puede ser
administrado en una o más de las siguientes cantidades (gamas de
dosificación): 0,01-200; o 0,01-100;
o 0,05-100; o 0,05-50; o
0,10-10 - todas estas gamas que son en mg de
proteína de polipéptido antimicrobiano por kg (ppm) de pienso.
Para determinar mg de proteína de polipéptido
antimicrobiano por kg de pienso, el polipéptido antimicrobiano es
purificado de la composición alimentaria, y la actividad específica
del polipéptido purificado antimicrobiano es determinada usando un
ensayo pertinente (véase bajo actividad antimicrobiana, sustratos,
y ensayos). La actividad antimicrobiana de la composición
alimentaria como tal es también determinada usando el mismo ensayo,
y basándose en estas dos determinaciones, se calcula la dosificación
en mg de proteína de polipéptido antimicrobiano por kg de
pienso.
Los mismos principios se aplican para determinar
mg de proteína de polipéptido antimicrobiano en aditivos de
piensos. Por supuesto, si está disponible una muestra del
polipéptido antimicrobiano usado para preparar el aditivo de pienso
o el pienso, la actividad específica de esta muestra es determinada
(sin necesidad de purificar el polipéptido antimicrobiano de la
composición alimentaria o el aditivo).
Los polipéptidos antimicrobianos de la invención
pueden ser añadidos a y así convertirse en un componente de una
composición de detergente.
La composición de detergente de la invención
puede por ejemplo ser formulada como una composición de detergente
de lavado a mano o a máquina incluyendo una composición de aditivo
para lavandería adecuada para el pretratamiento de tejidos
manchados y una composición de suavizante añadida en el enjuague, o
ser formulada como una composición de detergente para el uso en
operaciones de limpieza doméstica de superficies duras en general,
o ser formulada para operaciones de lavado de la vajilla a mano o a
máquina.
En un aspecto específico, la invención
proporciona un aditivo de detergente que comprende los polipéptidos
antimicrobianos de la invención y un tensioactivo. El aditivo de
detergente al igual que la composición de detergente puede
comprender una o varias otras enzimas tales como una proteasa, una
lipasa, una cutinasa, una amilasa, una carbohidrasa, una celulasa,
una pectinasa, una mananasa, una arabinasa, una galactanasa, una
xilanasa, una oxidasa (tal como una lacasa), y/o una peroxidasa (tal
como una haloperoxidasa).
En general las propiedades de la(s)
enzima(s) elegida(s) deberían ser
compatible(s) con el detergente seleccionado, (es decir, pH
óptimo, compatibilidad con otros ingredientes enzimáticos y no
enzimáticos, etc.), y la(s) enzima(s)
debería(n) estar presente(s) en cantidades
eficaces.
Proteasas: proteasas adecuadas incluyen aquellas
de origen animal, vegetal o microbiano. Se prefiere el origen
microbiano. Los mutantes modificados químicamente o creados
genéticamente de proteínas están incluidos. La proteasa puede ser
una serina proteasa o una metalo proteasa, preferiblemente una
proteasa alcalina microbiana o una proteasa de tipo tripsina.
Ejemplos de proteasas alcalinas son subtilisinas, especialmente
aquellas derivadas de Bacillus, p. ej., subtilisina Novo,
subtilisina Carlsberg, subtilisina 309, subtilisina 147 y
subtilisina 168 (descrita en WO 89/06279). Ejemplos de proteasas de
tipo tripsina son tripsina (p. ej. de origen porcino o bovino) y la
proteasa de Fusarium descrita en WO 89/06270 y WO
94/25583.
Ejemplos de proteasas útiles son las variantes
descritas en WO 92/19729, WO 98/20115, WO 98/20116, y WO 98/34946,
especialmente las variantes con sustituciones en una o más de las
siguientes posiciones: 27, 36, 57, 76, 87, 97, 101, 104, 120, 123,
167, 170, 194, 206, 218, 222, 224, 235 y 274.
Lipasas: lipasas adecuadas incluyen aquellas de
origen bacteriano o de origen fúngico. Los mutantes modificados
químicamente o creados genéticamente de proteínas están incluidos.
Ejemplos de lipasas útiles incluyen lipasas de Humicola
(sinónimo Thermomyces), p. ej. de H. lanuginosa (T.
lanuginosus) como se describe en EP 258 068 y EP 305 216 o de
H. insolens como se describe en WO 96/13580, una lipasa de
Pseudomonas, p. ej. de P. alcaligenes o P.
pseudoalcaligenes (EP 218 272), P. cepacia (EP 331 376),
P. stutzeri (GB 1,372,034), P. fluorescens, Pseudomonas
sp. cepa SD 705 (WO 95/06720 y WO 96/27002), P.
wisconsinensis (WO 96/12012), una lipasa de Bacillus, p.
ej. de B. subtilis (Dartois et al. (1993), Biochemica
et Biophyisica Acta, 1131, 253-360), B.
stearothermophilus (JP 64/744992) o B. pumilus (WO
91/16422).
Otros ejemplos son variantes de lipasa tales
como aquellas descritas en WO 92/05249, WO 94/01541, EP 407 225, EP
260 105, WO 95/35381, WO 96/00292, WO 95/30744, WO 94/25578, WO
95/14783, WO 95/22615, WO 97/04079 y WO 97/07202.
Amilasas: amilasas adecuadas (alfa y/o beta)
incluyen aquellas de origen bacteriano o de origen fúngico. Los
mutantes modificados químicamente o creados genéticamente de
proteínas están incluidos. Las amilasas incluyen, por ejemplo,
alfa-amilasas obtenidas de Bacillus, p. ej.
una cepa especial de B. licheniformis, descrita con más
detalle en GB 1,296,839.
Ejemplos de amilasas útiles son las variantes
descritas en WO 94/02597, WO 94/18314, WO 96/23873, y WO 97/43424,
especialmente las variantes con sustituciones en una o más de las
siguientes posiciones: 15, 23, 105, 106, 124, 128, 133, 154, 156,
181, 188, 190, 197, 202, 208, 209, 243, 264, 304, 305, 391, 408, y
444.
Celulasas: celulasas adecuadas incluyen aquellas
de origen bacteriano o de origen fúngico. Los mutantes modificados
químicamente o creados genéticamente de proteínas están incluidos.
Las celulasas adecuadas incluyen celulasas de los géneros
Bacillus, Pseudomonas, Humicola, Fusarium, Thielavia,
Acremonium, p. ej. las celulasas fúngicas producidas de
Humicola insolens, Myceliophthora thermophila y Fusarium
oxysporum descritas en US 4,435,307, 5,648,263, 5,691,178,
5,776,757 y WO 89/09259.
Las celulasas especialmente adecuadas son las
celulasas alcalinas o neutras que tienen beneficios de cuidado del
color. Ejemplos de tales celulasas son las celulasas descritas en
EP 0 495 257, EP 0 531 372, WO 96/11262, WO 96/29397, WO 98/08940.
Otros ejemplos son variantes de celulasa tales como aquellas
descritas en WO 94/07998, EP 0 531 315, US 5,457,046, US 5,686,593,
US 5,763,254, WO 95/24471, WO 98/12307 y WO 9901544.
Peroxidasas/oxidasas: peroxidasas/oxidasas
adecuadas incluyen aquellas de origen vegetal, bacteriano o
fúngico. Los mutantes modificados químicamente o creados
genéticamente de proteínas están incluidos. Ejemplos de peroxidasas
útiles incluyen peroxidasas de Coprinus, p. ej. de C.
cinereus, y sus variantes como aquellas descritas en WO
93/24618, WO 95/10602, y WO 98/15257.
La(s) enzima(s) para detergentes
puede(n) ser incluida(s) en una composición de
detergente añadiendo aditivos separados conteniendo una o más
enzimas, o añadiendo un aditivo combinado comprendiendo todas estas
enzimas. Un aditivo de detergente de la invención, es decir un
aditivo separado o un aditivo combinado, puede ser formulado p. ej.
como un granulado, un líquido, un lodo, etc. Las formulaciones de
aditivo de detergente preferidas son granulados, en particular
granulados no pulverulentos, líquidos, en particular líquidos
estabilizados, o lodos.
Granulados no pulverulentos pueden ser
producidos, p. ej., como se describe en US 4,106,991 y 4,661,452 y
pueden opcionalmente ser revestidos por métodos conocidos en la
técnica. Ejemplos de materiales de revestimiento ceroso son
productos de poli(óxido de etileno) (polietilenglicol, PEG) con
pesos molares medios de 1000 a 20000; nonilfenoles etoxilados que
tienen de 16 a 50 unidades de óxido de etileno; alcoholes
etoxilados grasos donde el alcohol contiene de 12 a 20 átomos de
carbono y en el cual hay 15 a 80 unidades de óxido de etileno;
alcoholes grasos; ácidos grasos; y mono- y di- y triglicéridos de
ácidos grasos. Ejemplos de materiales de revestimiento formadores de
películas adecuados para la aplicación por técnicas de lecho
fluidificado están dados en GB 1483591. Preparaciones enzimáticas
líquidas pueden, por ejemplo, ser estabilizadas añadiendo un poliol
tal como propilenoglicol, un azúcar o alcohol de azúcar, ácido
láctico o ácido bórico según métodos establecidos. Las enzimas
protegidas pueden ser preparadas según el método descrito en EP
238,216.
La composición de detergente de la invención
puede estar en cualquier forma conveniente, p. ej., una barra, una
pastilla, un polvo, un gránulo, una pasta o un líquido. Un
detergente líquido puede ser acuoso, normalmente conteniendo hasta
el 70% de agua y 0-30% de solvente orgánico, o no
acuoso.
La composición de detergente comprende uno o más
tensioactivos, que pueden ser no iónicos incluyendo semipolares y/o
aniónicos y/o catiónicos y/o zwitteriónicos. Los tensioactivos
están normalmente presentes a un nivel del 0.1% al 60% en peso.
Cuando se incluye en su interior el detergente
normalmente contendrá de aproximadamente el 1% a aproximadamente el
40% de un tensioactivo aniónico tal como alquilbencenosulfonato
lineal, alfa-olefinsulfonato, alquil sulfato
(sulfato de alcohol graso), alcohol etoxisulfato, alcanosulfonato
secundario, alfa-sulfo éster metílico de ácido
graso, ácido alquil o alquenilsuccínico o jabón.
Cuando se incluye en su interior el detergente
normalmente contendrá de aproximadamente el 0,2% a aproximadamente
el 40% de un tensioactivo no fónico tal como etoxilato de alcohol,
etoxilato de nonilfenol, alquilpoliglicósido, óxido de
alquildimetilamina, monoetanolamida de ácido graso etoxilado,
monoetanolamida de ácido graso, amida de ácido graso de
polihidroxialquilo, o derivados N-acilo
N-alquilo de glucosamina ("glucamidas").
\newpage
El detergente puede contener
0-65% de un constructor de detergente o agente
complejante tal como zeolita, difosfato, trifosfato, fosfonato,
carbonato, citrato, ácido nitrilotriacético, ácido
etilenodiaminatetraacético, ácido dietilenotriaminopentaacético,
ácido alquil o alquenilsuccínico, silicatos solubles o silicatos
estratificados (p. ej. SKS-6 de Hoechst).
El detergente puede comprender uno o más
polímeros. Ejemplos son carboximetilcelulosa,
poli(vinilpirrolidona), poli (etilenglicol),
poli(vinil alcohol),
poli(vinilpiridina-N-óxido),
poli(vinilimidazol), policarboxilatos tales como
poliacrilatos, copolímeros de ácido maléico/acrílico y copolímeros
de lauril metacrilato/ácido acrílico.
El detergente puede contener un sistema
blanqueador que puede comprender una fuente de H_{2}O_{2} tal
como perborato o percarbonato que puede ser combinada con un
activador de blanqueamiento formador de perácido tal como
tetraacetiletilenodiamina o nonanoiloxibencenosulfonato. De forma
alternativa, el sistema blanqueador puede comprender peroxiácidos de
p. ej. el tipo amida, imida, o sulfona.
La(s) enzima(s) de la composición
de detergente de la invención puede(n) ser
estabilizada(s) usando agentes convencionales estabilizantes,
p. ej., un poliol tal como propilenoglicol o glicerol, un azúcar o
alcohol de azúcar, ácido láctico, ácido bórico, o un derivado de
ácido bórico, p. ej., un éster de borato aromático, o un derivado
de ácido fenil borónico tal como ácido 4-formilfenil
borónico, y la composición puede ser formulada como se describe en
p. ej. WO 92/19709 y WO 92/19708.
El detergente puede también contener otros
ingredientes de detergentes convencionales tales como p. ej.
acondicionadores de tejidos incluyendo arcillas, reforzadores de
espuma, supresores de espuma, agentes anticorrosivos, agentes de
supensión de suciedad, agentes de antirredeposición de suciedad,
tintes, bactericidas, blanqueadores ópticos, hidrotropos,
inhibidores de decoloración, o perfumes.
Está actualmente contemplado que en las
composiciones de detergentes cualquier enzima, y los polipéptidos
antimicrobianos de la invención, pueden ser añadidos en una
cantidad correspondiente a 0,01-100 mg de proteína
enzimática por litro de solución de lavado, preferiblemente
0,05-10 mg de proteína enzimática por litro de
solución de lavado, más preferiblemente 0,1-5 mg de
proteína enzimática por litro de solución de lavado, y de la forma
más preferible 0,1-1 mg de proteína enzimática por
litro de solución de lavado.
Los polipéptidos antimicrobianos de la invención
pueden adicionalmente ser incorporados en las formulaciones de
detergentes descritas en WO 97/07202.
La presente invención está posteriormente
descrita por los ejemplos siguientes que no deberían ser
interpretados como limitadores del ámbito de la invención.
Los productos químicos usados como tampones y
sustratos fueron productos comerciales al menos de grado
reactivo.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
1
Para producir el polipéptido antimicrobiano Gen2
(SEC ID NO:2) para ensayos de actividad antimicrobiana, un gen
sintético fue hecho (véase abajo) e insertado en el vector de
expresión pET31 b+ (Novagen Inc.). El gen sintético fue constituido
por oligonucleótidos específicamente diseñados (Cebador1 y
Cebador2).
La digestión enzimática de sitios de
endonucleasa de restricción flanqueantes (AIwNI/Aval) nos permitió
clonar este gen sintético como un constructo de fusión en pET31 b+
(procedimientos estándar como se describe por el fabricante, New
England Biolabs Inc.). Todos los protocolos estándares han sido
descritos en otro lugar (Sambrook, Fritsch, y Maniatis, 1989).
pET31 b+ recombinante fue transformado en
Novablue de E. coli como se describe por el fabricante
(Novagen). El plásmido fue preparado por Mini Columnas QlAprep
(Qiagen Inc.) y secuenciado por secuenciación automatizada usando
cebadores plásmidos específicos (Cebador3 y Cebador4):
El plásmido fue transformado en
BLR-DE3 de E. coli según el fabricante
(Novagen). Las bacterias fueron cultivadas en medios LB hasta
OD_{600}\sim0,8 y la síntesis de proteínas recombinantes fue
iniciada por 1 mM de IPTG (isopropil
beta-D-Tiogalactopiranosido).
Después de 3 horas de inducción, las bacterias fueron cosechadas,
resuspendidas en tampón A de 1/10 volumenes (50 mM
tris-HCl, 1 mM EDTA, 100 mM NaCl, pH 8) y lisadas
por disrupción por presión (1500 mbar). El granulado resultante fue
lavado dos veces en tampón B (50 mM de tris-HCl, 10
mM de EDTA, 0.5% TritonX-100, 100 mM de NaCl, pH 8).
Todos los protocolos estándares han sido descritos en otro lugar
(Sambrook, Fritsch, y Maniatis, 1989).
El granulado que resulta de la purificación
anterior contenía cuerpos de inclusión purificados. Para liberar el
péptido del compañero de fusión KSI, la hidrólisis ácida fue
realizada en un sitio Asp-Pro creado genéticamente,
introducido N-terminalmente en el gen que codifica
Gen2. Los cuerpos de inclusión fueron resuspendidos en 100 mM de
fosfato sódico (pH 2.3) e incubados durante toda la noche a 85
grados Celsius. El sobrenadante resultante contenía el péptido
(PAE-Gen2). La muestra fue neutralizada añadiendo
100 mM de fosfato sódico (pH 12.3). Para madurar el péptido, el
péptido fue tratado con una glutamil-endopeptidasa I
(de B. licheniformis). El péptido madurado fue confirmado
por espectrometría de masa y purificado adicionalmente por
procedimientos cromatográficos estándares.
Las concentraciones inhibitorias mínimas de Gen2
fueron determinadas usando caldo Mueller-Hinton
ajustado por cationes (MHB) en el ensayo de dilución en microcaldo,
donde MHB fue usado con modificaciones diferentes como se
representa en la tabla 1 más abajo. El organismo de la prueba
seleccionado fue Pseudomonas aeroginosa (ATCC 27853).
\vskip1.000000\baselineskip
El nivel de muerte de Gen2 fue determinado en
MHB usando Pseudomonas aeroginosa (ATCC 27853) como el
organismo de prueba. Las bacterias fueron incubadas con Gen2 (a una
concentración 4 X MIC). En diferentes puntos temporales, diferentes
diluciones de la preparación fueron colocadas en placas y una
estimación de células viables fue determinada (CFU/ml). Los
resultados en la Tabla 2 indican que Gen2 rápidamente mata las
bacterias, con una reducción de aproximadamente
3-log en CFU en 30 minutos.
Una versión modificada de un protocolo
previamente publicado ha sido aplicada en la detección de actividad
antimicrobiana (Lehrer et al., (1991) Ultra sensitive assays
for endogenous antimicrobial polypeptides J Immunol Methods 137:
167-173). Las bacterias diana (10^{6} unidades
formadoras de colonias (CFU)) fueron añadidas a 10 ml de capa base
de agarosa (1% de agarosa de baja
electro-endósmosis, 0,03% Caldo con tripticasa de
soja, 10 mM fosfato sódico, pH 7.4, 37 grados Celsius). La
suspensión fue solidificada en una placa de Petri INTEGRID (Becton
Dickinson Labware). Un punzón para gel de 3 mm fue usado para hacer
agujeros en la capa base de agarosa (Amersham Pharmacia Biotech,
Suecia). Las muestras fueron añadidas a los agujeros e incubadas a
37 grados Celsius, 3 horas. Un recubrimiento fue vertido encima y
la placa fue incubada durante toda la noche (medios LB, 7.5% Agar).
La actividad antimicrobiana fue vista como zonas de aclaramiento
bacteriano alrededor de los pocillos. Las células vivas fueron
contracoloreadas añadiendo 10 ml, 0,2 mM de MTT (azul de tiazolilo
3-(4,5-Dimetiltiazol-2-il)-2,5-difeniltetrazolio
bromuro). Este ensayo reveló actividad antimicrobiana (<64
\mug/ml) de Gen2 tanto contra Bacillus subtilis &
Eschericia coli.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
2
Una gama de polipéptidos sintéticos
antimicrobianos fue expresada en TOP10 de E. coli
(Invitrogen) usando arabinosa como inductor, como se describe en el
ejemplo 1 de la solicitud de patente Internacional WO 00/73433 (con
modificaciones menores). La expresión de los polipéptidos
antimicrobianos de la invención resultó en la inhibición del
crecimiento de las células huéspedes.
Brevemente, los cultivos frescos durante toda la
noche crecidos en medio RM conteniendo 0,2% de glucosa y ampicilina
(100 \mug/ml) fueron diluidos 300 veces en 150 microlitros de RM
conteniendo 0,2% de glicerol y ampicilina (100 \mug/ml) y
concentraciones diferentes de arabinosa (0, 0,01% o 0,1%) en una
placa de microtitulación e incubados a 37 grados Celsius con
agitación vigorosa. La curva de crecimiento fue vigilada para medir
OD_{450} usando un lector para Microbiología Bioscreen C (Thermo
Electron Corporation) en intervalos de 30 minutos durante 14 horas
(véase protocolo de Invitrogen de los catálogos de vectores
pBAD/gIII A, B y C Nos. V450-01 para composición
del tampón y de los medios).
El porcentaje de inhibición del crecimiento fue
calculado como la medición de OD del punto final de cada muestra
dividido por la medición de OD final obtenida de células que
contienen el vector de control y multiplicado por 100. La fórmula
es la siguiente:
donde "OD de blanco"
corresponde a la OD de un pocillo
vacío.
Las secuencias de aminoácidos de Gen2 y
variantes sintéticas mejoradas seleccionadas están catalogadas en
la tabla 3.
Los resultados mostrados en la tabla 3 indican
convincentemente que todos los polipéptidos antimicrobianos
evaluados presentan fuerte actividad antimicrobiana.
\vskip1.000000\baselineskip
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<223> Gen Gen2 sintético
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<223> Secuencia del cebador 1
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<223> Secuencia del cebador 2
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<223> Secuencia del cebador 3
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<223> Secuencia del cebador 4
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\hskip-.1em\dddseqskipaccgtagttg cgcccatcg
\hfill19
Claims (20)
1. Polipéptido con actividad antimicrobiana, que
comprende la secuencia de aminoácidos:
G-X_{1}-X_{2}-X_{3}-X_{4}-X_{5}-X_{6}-X_{7}-X_{8}-X_{9}-X_{10}-X_{11}-X_{12}-X_{13}-X_{14}-X_{15}-X_{16}-Z;
donde
X_{1} = L, I, W o M;
X_{2} = L, F, W o V;
X_{3} = S, G, K, T, R, I, N, D o E;
X_{4} = K, T, F, I, R, M, L o S;
X_{5} = L o I;
X_{6} = K, G, R, M o E;
X_{7} = K, S, I, R, T o M;
X_{8} = A, K, T, N, R o E;
X_{9} = A, G, S, I, L, T, V, M o W;
X_{10} = S, R, K o E;
X_{11} = K, M, R, H, I, N o T;
X_{12} = A, V, I, L, Y, F o T;
X_{13} = L, A, G, C, F, V o W;
X_{14} = K, Q, A, S, R o E;
X_{15} = H, G, N, R, S, M, I, V o D;
X_{16} = V, I, A o F;
Z = X_{17}
-R-W-L; donde X_{17} = F, L, R, A,
G, V, Y, C o P;
y donde los aminoácidos que forman el
polipéptido son independientemente seleccionados de las formas D o
L.
2. Polipéptido según la reivindicación 1, que
consiste en la secuencia de aminoácidos como se expone en la
reivindicación 1.
3. Polipéptido según la reivindicación 1, que
comprende el aminoácido de cualquiera de la SEC ID NO:38 a la SEC
ID NO:46.
4. Polipéptido según la reivindicación 1, que
consiste en los aminoácidos de cualquiera de la SEC ID NO:38 a la
SEC ID NO:46.
5. Polinucleótido que tiene una secuencia de
nucleótidos que codifica para el polipéptido definido en cualquiera
de las reivindicaciones 1-4.
6. Constructo de ácidos nucleicos que comprende
la secuencia de nucleótidos definida en la reivindicación 5
operativamente enlazada a una o más secuencias de control que
dirigen la producción del polipéptido en un huésped adecuado.
7. Vector de expresión recombinante que
comprende el constructo de ácidos nucleicos definido en la
reivindicación 6.
8. Célula huésped recombinante que comprende el
constructo de ácidos nucleicos definido en la reivindicación 6.
9. Método para la producción de un polipéptido
tal y como se define en cualquiera de las reivindicaciones
1-4, el método comprendiendo:
- (a)
- cultivo de una célula huésped recombinante tal y como se define en la reivindicación 8 bajo las condiciones propicias para la producción del polipéptido; y
- (b)
- recuperación del polipéptido.
10. Método para matar o inhibir el crecimiento
de células microbianas, que no es un método para el tratamiento
terapéutico del cuerpo humano o animal, comprendiendo la puesta en
contacto de las células microbianas con un polipéptido
antimicrobiano tal y como se define en cualquiera de las
reivindicaciones 1-4.
11. Composición de detergente que comprende un
tensioactivo y un polipéptido antimicrobiano tal y como se define
en cualquiera de las reivindicaciones 1-4.
12. Polipéptido antimicrobiano tal y como se
define en cualquiera de las reivindicaciones 1-4
para el uso como un medicamento.
13. Polipéptido antimicrobiano tal y como se
define en cualquiera de las reivindicaciones 1-4
para el uso como un agente antimicrobiano terapéutico o
profiláctico veterinario o humano.
14. Uso de un polipéptido antimicrobiano tal y
como se define en cualquiera de las reivindicaciones
1-4 en la preparación de un agente terapéutico
humano o veterinario para el tratamiento de una infección microbiana
o para el uso profiláctico.
15. Planta transgénica, parte de la planta o
célula vegetal, que ha sido transformada con una secuencia de
nucleótidos que codifica un polipéptido que tiene actividad
antimicrobiana tal y como se define en cualquiera de las
reivindicaciones 1-4.
16. Uso de al menos un polipéptido
antimicrobiano tal y como se define en cualquiera de las
reivindicaciones 1-4 en alimentos para animales.
17. Uso de al menos un polipéptido
antimicrobiano tal y como se define en cualquiera de las
reivindicaciones 1-4 en la preparación de una
composición para el uso en alimento para animales.
18. Aditivo para alimento para animales
comprendiendo
- (a)
- al menos un polipéptido antimicrobiano tal y como se define en cualquiera de las reivindicaciones 1-4; y
- (b)
- al menos una vitamina soluble en grasa, y/o
- (c)
- al menos una vitamina soluble en agua, y/o
- (d)
- al menos un oligoelemento, y/o
- (e)
- al menos un macromineral.
19. Aditivo para alimento para animales según la
reivindicación 18, que además comprende fitasa, xilanasa,
galactanasa, y/o beta-glucanasa.
20. Composición de alimento para animales que
tiene un contenido bruto de proteína de 50 a 800 g/kg y que
comprende al menos un polipéptido antimicrobiano tal y como se
define en cualquiera de las reivindicaciones
1-4.
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