ES2298791T3 - Procedimiento para adquisicion de formas a partir de celulas hep-2 y de reconocimiento por casos de celulas hep-2. - Google Patents

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Abstract

Proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen secciones celulares Hep2 como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de imágenes de secciones celulares Hep2, los que se utiliza para una base de datos comparativa destinada al reconocimiento puntual (caso por caso) de células Hep2 reproducidas en imágenes digitales, donde se puede asignar, a través de la exploración manual de los bordes de esas imágenes que a su vez quedan representadas en forma de contornos exteriores y/o interiores visibles de células Hep2, datos concretos a los bordes explorados y, por consiguiente, a las células Hep2 allí reproducidas como objetos, utilizando para ello una unidad de entrada manejada a mano y conectada a un ordenador, caracterizándose este proceso por la eliminación del desplazamiento de cado objeto, de tal modo que cada objeto será desplazado al punto de origen de un sistema de coordenadas, que cada objeto será clasificado por escalonamiento y en función de los datos asignados en este sistema de coordenadas, que al menos dos objetos serán comparados y alineados el uno con el otro, efectuándose al mismo tiempo una clasificación por escalonamiento y/o una rotación de dichos objetos, siendo determinadas las cotas de similitud como valores de distancia o de valores de similitud entre los objetos, hasta que se alcance sea un mínimo de valores de distancia, sea un máximo de valores de similitud, que en base de estos valores de distancia o de similitud serán obtenidos cantidades de objetos similares que a continuación serán clasificados, de modo jerárquico, en un dendrograma, y que este dendrograma se dividirá, en función de valores de distancia o de similitud prefijados, en varios grupos, y que será seleccionado, dentro de cada uno de esos grupos, un prototipo que a su vez consiste sea en una forma cortada en medias obtenida de las formas individuales del grupo, sea en la mediana obtenida del grupo de las formas individuales.

Description

Procedimiento para adquisición de formas a partir de células Hep2 y de reconocimiento por casos de células Hep2.
Proceso para la adquisición de formas obtenidas de secciones celulares Hep2 y para reconocimiento puntual (caso por caso) de células Hep2.
La presente invención se refiere a procesos para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen secciones celulares Hep2 como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de imágenes de secciones celulares Hep2, los que se utiliza para una base de datos comparativa destinada al reconocimiento puntual (caso por caso) de células Hep2 reproducidas en imágenes digitales; a procesos para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen, en forma de objetos, secciones celulares Hep2, y para la identificación puntual (caso por caso) de células Hep2 reproducidas como objetos en imágenes digitales; a programas informáticos contando con un código de programa y productos de software instalados en soportes procesables por máquina que permiten la realización de dichos procesos.
Respecto de configuraciones destinadas al examen automático de células, complejos celulares u otras muestras biológicas, ya se conoce las patentes DE 196 16 997 A1 (proceso para el examen automático e asistido por microscopio de muestras de tejido o de líquidos orgánicos), la DE 42 11 904 A1 (proceso y dispositivo para la elaboración de una lista de tipos para una muestra líquida) y la DE 196 39 884 A1 (sistema de identificación de muestras).
La DE 196 16 997 A1 se dedica, mediante la aplicación de redes neuronales, a la detección de los diferentes tipos de células en muestras de tejido o de líquidos orgánicas.
Por su parte, la DE 42 11 904 A1 permite detectar e identificar hasta las más pequeños animales, tales como gusanos, insectos o caracoles, siendo realizada dicha identificación mediante una comparación con objetos almacenados en una memoria de referencia. Al mismo tiempo, los objetos identificados vienen ser contados e inscritos en una lista de tipos.
A su vez, la DE 196 39 884 A1 posibilita detectar materias sólidas dentro de una corriente de muestras y clasificarlas de acuerdo a su tamaño, sobre todo en función de su longitud proyectada a lo largo de los ejes X e Y de la imagen, su perímetro y su densidad de color media.
El diagnóstico por inmuno-fluorescencia se basa en la visualización por fluorescencia de enlaces de auto-anticuerpos en secciones congeladas de células Hep2. Ese método permite obtener los resultados más fiables, por lo que constituye una sólida base para las decisiones vinculados con los diagnósticos terapéuticos.
Su desventaja actual consiste en que todavía no está automatizado, lo que requiere, además de la gran cantidad de personal y el tiempo que se necesitan para el análisis y la evaluación de los datos recogidos, mucha experiencia profesional por parte de las personas encargadas de dichos trabajos, los que incluso pueden ser susceptibles de dañar a la salud de éstas.
Un procedimiento automático lo constituye la DE 198 01 400 C2 (proceso y dispositivo para la identificación automática, descripción de propiedades e interpretación de muestras de células Hep2), pero con la restricción de que en las imágenes sólo pueden ser identificadas las formas, lo que no permite sacar conclusiones automatizadas para demás casos.
De PERNER P: "Image mining: issues, framework, a general tool and its application to medical-image diagnosis" ENGINEERING APPLICATIONS OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE, ELSEVIER UK, tomo 15, Nº 2, de abril de 2002 (2002-04), páginas 205-216, se conoce un proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen secciones celulares Hep2 como objetos y para el aprendizaje de un árbol de decisión necesario para una base de datos comparativa que permite la identificación puntual (caso por caso) de células Hep2 en imágenes digitales. Dicho proceso posibilita visualizar, en forma de objetos y mediante la exploración manual de los bordes de una imagen mediante una unidad de entrada manejada a mano y conectada a un ordenador, contornos exteriores y/o interiores visibles de células Hep2 que pueden ser atribuidos, en forma de datos, a cada una de las imágenes exploradas. Los datos así obtenidos sirven de base para un árbol de decisión, el cual se obtiene mediante la repartición recursiva de las zonas que presenten las mismas características.
Existe además un método de GDALYAHU Y ET AL: "Flexible Syntactic Matching of Curves and Its Application to Automatic Hierarchical Classification of Silhouettes" IEEE TRANSACTIONS ON PATTERN ANALYSIS AND MACHINE INTELLIGENCE; IEEE INC. NEW YORK, US, tomo 21, Nº 12, de diciembre de 1999 (1999-12), páginas 1312-1328, el cual que permite clasificar formas en función de su similitud o la distancia entre ellas y representarlas en un dendrograma en forma de grupos de todo tipo de vectores de caracterización, al igual que, durante la comparación de las formas, se aplica el principio de rotación.
Y gracias a la EP 0 665 507 A1 (Position and orientation estimation: neural network system and method), ya se conoce una comparación de muestras efectuada por rotación repetida.
La patente referida en las reivindicaciones 1, 4, 17 y 18 permite tanto la adquisición de modelos de forma obtenidos de imágenes que reproducen secciones celulares Hep2, los que serán utilizados en una base de datos comparativa, como la determinación automática, mediante su comparación con casos, de objetos reproducidos en imágenes digitales.
Esta tarea queda solucionada por las características especificadas en las reivindicaciones 1, 4, 17 y 18.
Los procesos para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen secciones celulares Hep2 como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de imágenes de secciones celulares Hep2, los que se utiliza para una base de datos comparativa destinada al reconocimiento puntual (caso por caso) de células Hep2 reproducidas en imágenes digitales, se destacan ante todo porque permiten obtener objetos, en forma de objetos reproducidos en imágenes y de modo semiautomática, formas individuales de secciones celulares Hep2, al igual que posibilitan obtener de esas formas individuales, de modo automático, modelos de forma abstractos situados en distintos niveles de abstracción. Los modelos de forma abstractos así aprendidos representan o formas cortadas en medias y obtenidas de grupos de objetos, o medianas reproducidas como formas individuales procedentes de grupos de células Hep2, siendo la mediana aquel objeto que esté situado más cerca de todos los demás objetos. Por tanto la mediana constituye la forma natural de una célula Hep2, mientras que la forma cortada en medias representa un objeto artificial que en realidad no existe.
La ventaja particular de ese método consiste en que la adquisición del contorno o de la forma se efectúa de modo digital, lo que permite archivar los datos así obtenidos en un fichero. A continuación, esos datos sirven para realizar determinadas operaciones, tal como el cálculo de las cotas de similitud y la descripción de ésta.
Por tanto esos procedimientos son apropiados para crear bases de datos comparativas que comprenden modelos de forma obtenidos de células Hep2. Su ventaja es que posibilitan formar automáticamente grupos de formas procedentes de células Hep2, al igual que permiten determinar y representar, de modo jerárquico, las similitudes entre ellas. Además, dichos grupos sirven para crear una mayor cantidad de modelos en distintos niveles de abstracción.
Lo posibilitan imágenes digitales que reproducen secciones celulares Hep2 cuyo contorno y/o textura presentan aspectos distintos. Mediante la exploración manual de los bordes de una imagen que, ellos, forman contornos y/o texturas, utilizando para ello una unidad de entrada manejada a mano y conectada a un ordenador, se puede adquirir esos bordes y, por consiguiente, las células Hep2 allí reproducidas, en forma de objetos que pueden ser atribuidos a datos. A su vez, dichos datos permiten obtener modelos de forma que sirven para adquirir determinados conocimientos sobre los objetos, lo que ofrece la ventaja de poder ampliar la base de datos comparativa.
Tal ampliación incluye la comparación de al menos dos células Hep2 mediante su alineación directa, siendo efectuada además una clasificación por escalamiento y/o una rotación.
De preferencia, el cálculo de la similitud se efectúa al mismo tiempo, siendo determinadas las cotas de similitud como valores de distancia o de similitud entre los objetos, hasta que se obtenga sea un mínimo de los valores de distancia, sea un máximo de los valores de similitud.
Es posible aprender grupos con modelos de forma similares procedentes de células Hep2, pero también unir los grupos similares procedentes de células Hep2. Ambos casos permiten determinar relaciones de similitud mediante la comparación de dichos grupos.
Otra ventaja de ese procedimiento consiste en que su aplicación permite asignar a la base de datos comparativa, de modo constante y en forma de objetos reproducidos en imágenes digitales, cada vez nuevos modelos de forma procedentes de células Hep2 y obtenidos de secciones celulares Hep2, lo que de hecho corresponde a una ampliación de la base de datos comparativa.
Por tanto, es posible generar una base de datos comparativa para la identificación, descripción de propiedades e interpretación automáticas de células Hep2 dentro de secciones celulares Hep2, lo que a su vez sirve par comprobar enfermedades autoinmunes. Allí se trata de enfermedades que se caracterizan por una reactividad del sistema inmunitario en relación con sustancias y estructuras orgánicas. Un fenómeno frecuente y típico de las enfermedades autoinmunes es la aparición de auto-anticuerpos. Se trata de inmunoglobulinas que obran contra las estructuras orgánicas del cuerpo. Además de los auto-anticuerpos cuya acción contrarresta las estructuras orgánicas, ha de destacarse la importancia de auto-anticuerpos cuya reactividad afecta las estructuras celulares. Por eso le incumbe un gran significado diagnóstico a la comprobación de ese tipo de auto-anticuerpos.
Para poder caracterizar la especificidad de los auto-anticuerpos, su examen se dedica a determinar los antígenos destinatorios afectados por ellos. Existen varios métodos. Uno de ellos lo constituye el diagnóstico obtenido por inmunofluorescencia, el cual se efectúa en células Hep2 y que permite conseguir los resultados más fiables. Sirve además de base sólida para tomar todo tipo de decisiones terapéuticas.
La base de datos comparativa para la identificación, descripción de propiedades e interpretación automáticas de células Hep2 dentro de secciones celulares Hep2 es también utilizada para comprobar enfermedades autoinmunes. Estas últimas son enfermedades que se caracterizan por une reactividad del sistema inmunitario con respecto a sustancias y estructuras orgánicas. Se trata de inmunoglobulinas que obran contra las estructuras orgánicas del cuerpo. Además de los auto-anticuerpos cuya acción contrarresta las estructuras orgánicas, ha de destacarse la importancia de auto-anticuerpos cuya reactividad afecta las estructuras celulares. Por eso le incumbe un gran significado diagnóstico a la comprobación de ese tipo de auto-anticuerpos.
Para poder caracterizar la especificidad de los auto-anticuerpos, su examen se dedica a determinar los antígenos destinatarios afectados por ellos. Existen varios métodos. Uno de ellos lo constituye el diagnóstico obtenido por inmunofluorescencia, el cual se efectúa en células Hep2 y que permite conseguir los resultados más fiables. Sirve además de base sólida para tomar todo tipo de decisiones terapéuticas.
Por tanto, las bases de datos comparativas constituyen la base de la identificación puntual (caso por caso) y la determinación automáticas, en forma de objetos reproducidos en imágenes digitales, de células Hep2 dentro de secciones celulares Hep2.
Entonces, la imagen del caso seleccionado y la imagen de gradientes de la imagen digital contando con objetos vienen ser convertidas en pirámides de varios planes focales. A continuación, los planes focales están comparados entre ellos, empezando con los que están situados en lo más alto. Resulta que los planes focales situados más arriba son a la vez los más desenfocados que cuentan con la menor cantidad de datos, de tal modo que la comparación entre ellos requiere el menor volumen de cálculos. Asimismo, la imagen del caso seleccionado viene ser comparada sucesivamente con cada objeto de la imagen digital. Durante la comparación entre los objetos de cada imagen y la imagen del caso se efectúa una alineación y una clasificación por escalonamiento y/o una rotación de la imagen del caso, siendo calculada al mismo tiempo la similitud entre ellos.
La ventaja particular de dicho procedimiento consiste en la adquisición digital del contorno o de la forma y en la posibilidad de archivar los datos obtenidos en un fichero. A continuación, esos datos permiten realizar varias operaciones, tales como el cálculo de las cotas de similitud y/o la determinación de la misma similitud como grado de concordancia entre la imagen del caso y la del objeto. Dicho grado de concordancia va reduciéndose en función de la cota de similitud descendiente, es decir que la similitud de la imagen del objeto con la de la imagen del caso va disminuyendo cada vez más.
De preferencia, los procesos de la presente invención son disponibles para los usuarios en forma de un programa informático, el cual cuenta con un código de programa que permite ejecutar dichos procesos, así como en forma de productos de software instalados en soportes procesables por máquina, los que también permiten ejecutar esos procesos.
Las reivindicaciones 2, 3 y de 5 a 16 se refieren a unas configuraciones ventajosas de la presente invención.
La evolución de la reivindicación 2 ofrece la ventaja de que los valores de distancia o de similitud van creando una matriz de distancia o de similitud.
Por su parte, la evolución de la reivindicación 3 permite representar los valores de distancia o de similitud, mediante el método "single-linkage" y de modo jerárquico, en un dendrograma.
La evolución de la reivindicación 5 asegura la comparación de al menos dos casos respectivos, los cuales serán alineados el uno con el otro, al igual que se efectúa su clasificación por escalonamiento y/o su rotación. Esto ofrece la ventaja de que el cálculo de la similitud está realizado al mismo tiempo, siendo determinados los valores de distancia o de similitud como valores de distancia o de similitud, hasta que se obtenga sea un mínimo de valores de distancia, sea un máximo de valores de similitud.
Gracias a la evolución de la reivindicación 6, la escala de similitud del dendrograma viene ser cortada automáticamente y al menos una vez, de acuerdo con valores umbrales prefijados o específicos del usuario, lo que conlleva la formación de grupos. Tras asignar a estos grupos las formas individuales correspondientes, se selecciona un prototipo en cada grupo, el cual consiste o en una forma cortada en medias obtenida de las formas individuales, o en la mediana obtenida del grupo de las formas individuales. Eso permite un control visual de los diferentes grupos y/o objetos. La forma cortada en medias o la mediana del grupo serán visualizadas en la pantalla de la unidad de visualización, mientras que sus puntos de contorno serán guardados en forma de cantidad de datos en el ordenador.
La evolución de la reivindicación 7 tiene el efecto positivo de que conlleva una reducción de los datos adquiridos durante la exploración manual de los bordes y, por consiguiente, de los puntos que constituyen los contornos exteriores y/o interiores visibles, siendo obtenida la menor cantidad de datos por su interpolación con un polinomio.
Gracias a la evolución de la reivindicación 8, los casos asignados a los bordes explorados vienen ser transformados de tal modo que el centro de cada caso corresponde al punto de origen de coordenadas 0, 0. Asimismo, los casos serán alineados dentro de un sistema de coordenadas, lo que facilita su comparación destinada a determinar sus similitudes.
El cálculo de las similitudes se basa en la determinación de cotas de similitud, comparando cada vez al menos un caso con un objeto. Durante dicha operación, los casos están alineados con los objetos, efectuándose al mismo tiempo su clasificación por escalonamiento y/o su rotación, al igual que se efectúa el cálculo de la similitud que a su vez será determinada como valores de distancia o valores de similitud entre el caso y el objeto. Según la evolución de la reivindicación 9, este cálculo dura hasta que se obtenga sea un mínimo de valores de distancia, sea un máximo de valores de similitud.
La evolución de la reivindicación 10 tiene la ventaja de que, mediante una detección de bordes de los objetos de cada imagen digital, se produce una imagen de gradientes, siendo asignados dichos gradientes a los cambios importantes del tono acromático, tanto en dirección vertical como horizontal, mientras que ningún gradiente será asignado a las superficies homogéneas, ya que las superficies homogéneas son de color negro. El resultado lo constituye una imagen cuyos objetos presentan bordes blancos, mientras que las superficies limitadas por los bordes de los objetos y las superficies contiguas a los bordes de los objetos son negras. En consecuencia, la cantidad de datos de la imagen digital queda bastante inferior a la de una imagen digital que contiene tonos acromáticos. Significa además una reducción considerable del tiempo necesario para la comparación, la cual se obtiene por el cálculo de la similitud efectuado mediante la determinación de las cotas de similitud, de cada objeto con un caso seleccionado. Asimismo, los objetos superpuestos e incluso parcialmente solapados de una imagen digital pueden ser determinados con más facilidad, al compararlos con un caso seleccionado.
Según la evolución de la reivindicación 11, tanto la imagen del caso como la del objeto forman una imagen de gradientes, la cual será convertida en una cadencia piramidal de imágenes con varios planos focales, siendo sucesivamente comparados, mediante la formación de productos, los vectores de dirección pertenecientes a los planos focales con cada caso y con cada objeto. El principio piramidal también aporta a disminuir considerablemente el volumen de las operaciones de cálculo. Cada uno de los planos focales reproducidos en cada pirámide vienen ser representados con una trama que aparece dos veces más gruesa que la normal, tomando en cuenta sólo cada segundo punto de una línea y sólo cada segunda línea, los que serán ensamblados en forma de planos focales de una nueva imagen. Por su parte, el teorema de muestreo utilizado para dicha operación, asegura que la trama inicial más fina podrá ser exactamente reconstruida desde la trama más gruesa. De preferencia, la comparación entre el caso y el objeto empieza con la trama más gruesa de los planes focales situados en lo más alto de cada imagen. En función del resultado obtenido durante la comparación de la similitud, se procede después a comparar sucesivamente los planes focales con cada trama más fina. Esta operación puede ser interrumpida en cualquier momento, por lo que se obtiene una reducción considerable del tiempo necesario para los cálculos respectivos.
La evolución de la reivindicación 12 permite una clasificación ventajosa de casos individuales en un dendrograma donde los casos individuales vienen ser jerárquicamente clasificados por grupos. La imagen del caso constituye un prototipo de un grupo de casos individuales, consistiendo dichos grupos en cantidades de casos individuales similares con determinados valores de distancia o de similitud. A su vez, el caso más similar va determinando la rama del dendrograma que comprende los casos similares, los que a su vez sirven para definir el objeto. El prototipo puede ser tanto una forma cortada en medias obtenida de las formas individuales, como la mediana del grupo procedente de las formas individuales. La mediana es aquel caso que tenga la menor distancia de todos los demás casos. Por tanto la mediana constituye la forma natural de una célula Hep2, mientras que la forma cortada en medias representa un objeto artificial que en realidad no existe. No obstante, la imagen del caso también puede representar una imagen individual del objeto.
Mediante la determinación del vector de dirección entre dos puntos o entre los puntos contiguos de los bordes de la imagen del caso o la del objeto, tal como lo posibilita la evolución de la reivindicación 13, la dirección del borde viene ser determinada como punto de orientación local, de tal modo que los componentes de dirección de ese punto de orientación local y las características respecto a la altitud y la pendiente del borde también forman parte de la descripción del mismo. Eso ofrece la ventaja de poder incluir en el cálculo de similitud hasta el entorno de la compleja estructura ya existente de la información de la imagen. Durante el cálculo de la similitud, las cotas de similitud vienen ser determinadas tanto como vectores de dirección, como en forma de valores de distancia o de similitud entre las imágenes de cada caso y cada objeto. Dicho cálculo de la similitud permite tomar en cuenta mayores cantidades de información suministrada por la imagen digital.
La evolución de la reivindicación 14 comprende un índice que sirve para clasificar los prototipos o los casos en función de sus relaciones de similitud memorizadas en la base de datos comparativa. Dicho índice es un registro que contiene los prototipos y/o los casos individuales o agrupados, lo que permite localizar rápidamente, dentro de una determinada cantidad de prototipos y/o de casos, el prototipo o el caso más similar al objeto de la imagen.
De preferencia, el cálculo de la similitud se efectúa mediante la fórmula especificada en la evolución de la reivindicación 15.
Finalmente, la evolución de la reivindicación 16 ofrece la ventaja de que se puede determinar, de modo manual, como caso incluso objetos desiguales y asignarlos al dendrograma junto con los casos determinados. Por tanto, la base de datos comparativa puede ser constantemente ampliada.
Siguen en adelante algunos ejemplos de ejecución de la presente invención, incluso las figuras que los ilustran. Son los siguientes:
Fig. 1 muestra imágenes de contornos etiquetados y aproximados de secciones celulares Hep2,
Fig. 2 muestra imágenes numeradas de las secciones celulares Hep2 procedentes de la fig. 1, y la
Fig. 3 muestra un dendrograma con estas células Hep2.
En un primer ejemplo de ejecución, un proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes digitales que reproducen secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8 con células Hep2, las que vienen ser representadas como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de células Hep2 que sirven para crear una base de datos comparativa destinada a la identificación puntual (caso por caso) de células Hep2 dentro de imágenes digitales, será explicado en forma más detallada como ejemplo de la presente invención, significando las tres letras "Hep" el término "Human Epithel".
Allí queda representada mediante una unidad de visualización ya conocida que consiste en una pantalla conectada a un ordenador, una imagen de una sección celular Hep2 numerada de 1 a 8 cuyos contornos pueden ser distintos.
La Fig. 1 muestra una imagen de contornos etiquetados y aproximados de secciones celulares Hep2.
La exploración manual de los bordes de la imagen digital mediante una unidad de entrada manejada a mano y conectada a la pantalla de la unidad de visualización, permite obtener datos que pueden ser asignados a los bordes explorados. En este caso, los bordes constituyen contornos exteriores y/o interiores visibles de secciones celulares Hep2 representadas como objetos.
Mediante la unidad de entrada que puede consistir en el cursor manejado mediante un ratón o un teclado, en un lápiz luminoso equipado con fotodetector, así como en un escáner y/o en una combinación de un lápiz luminoso con un escáner, es posible adquirir, en forma de coordenadas X e Y y/o de tonos acromáticos o de color, los datos de los puntos de contorno de cada borde de las células Hep2, los que a su vez pueden ser asignados a objetos. Otro ejemplo de ejecución lo constituye la combinación de un lápiz luminoso con una pantalla táctil. Como este tipo de unidades de entrada ya es de conocimiento general, al igual que varios procesos para la adquisición de datos que pueden ser asignados a bordes, no serán evocados con más detalles.
La exploración de los contornos se efectúa de modo manual y mediante la unidad de entrada también manejada a mano, quedando visualizados sus resultados en forma de imágenes reproducidas en la pantalla de la unidad de visualización. Además, la unidad de visualización permite reproducir los contornos explorados en forma etiquetada, quedando visualizados los contornos y/o los bordes explorados, o por lo menos una parte de éstos, como zonas, lo que facilita el control de los bordes explorados en la pantalla de la unidad de visualización. Con ello se evita además que se produzcan errores o disfunciones provocados, por ejemplo, tanto por falta de concentración y atención, como por distracción o cansancio de las personas encargadas de la exploración de los contornos y/o bordes de los casos respectivos.
Entonces, cada una de las células Hep2 determinadas por dicha exploración de contornos será clasificada, como objeto y mediante su escalonamiento, en un sistema de coordenadas donde el centro de cada objeto corresponde al punto de origen de coordenadas X = 0 et Y = 0.
La similitud de las secciones celulares Hep2 será calculada mediante su alineación por parejas, de tal modo que la cota de similitud queda inalterada, al igual que se efectúa su clasificación por escalonamiento y/o su rotación para calcular la similitud. Durante el cálculo de la similitud, las cotas de similitud serán determinadas como valores de distancia o de similitud entre los objetos, hasta que se obtenga sea un mínimo de los valores de distancia, sea un máximo de los valores de similitud. Sirve de base para el cálculo de la similitud la fórmula siguiente:
1
siendo
P y O - los objetos,
\Theta - la matriz de rotación,
\mu_{p} y \mu_{o} - los centros de los objetos P y O así como
\delta_{p} y \delta_{o} - las sumas de los cuadrados de las distancias entre cada punto y los centros.
A su vez, los valores de distancia o de similitud van creando una matriz de distancia o de similitud.
Una vez calculados los valores de similitud, éstos forman cantidades de objetos similares y los clasifican, de forma jerárquica, en un dendrograma. La fig. 2 muestra imágenes numeradas de las secciones celulares Hep2 procedentes de la fig. 1. Entonces, el dendrograma será cortado en secciones que a su vez vienen ser limitadas por valores umbrales prefijados o específicos del usuario, lo que conlleva la formación de grupos. En caso de haber valores umbrales prefijados, el corte seccional del dendrograma viene ser efectuado automáticamente, siendo asignadas las formas individuales a los grupos correspondientes, al igual que se selecciona un prototipo dentro de cada uno de los grupos. Dicho prototipo representa o una forma cortada en medias y obtenida de formas individuales, o la mediana del grupo de la formas individuales. El prototipo del grupo será visualizado en la pantalla de la unidad de visualización, mientras que los puntos de contorno del mismo prototipo serán memorizados en el ordenador. La fig. 3 muestra un dendrograma de esta sección celular Hep2 numerada de 1 a 8.
Dicho procedimiento también se aplica en otras imágenes, por lo que se produce una base de datos comparativa que comprende modelos de forma representados como prototipos con formas cortadas en medias y obtenidas de formas individuales y/o con medianas obtenidas de grupos de formas individuales.
En una versión del presente ejemplo de ejecución, los datos de bordes exteriores y/o interiores visibles cuya adquisición se efectúa con ayuda de las diferentes unidades de entrada conectadas a la unidad de visualización, vienen ser reducidos mediante su interpolación en la imagen digital. Dicha interpolación se desarrolla como sigue:
- en una primera fase será asignado el punto inicial al aquel punto del borde de cada objeto que anteriormente haya sido determinado y clasificado por el sistema de coordenadas,
- en una segunda fase será trazada, en forma de un segundo punto, una línea virtual hacia un punto contiguo,
- en una tercera fase será determinada la distancia entre esta línea virtual y el segmento correspondiente al contorno del objeto anterior,
- en una cuarta fase esta distancia será comparada como valor con un valor por defecto, y
- en una quinta fase el punto inicial será asignado al segundo punto para poder trazar una línea virtual hacia el punto siguiente.
Las fases tres, cuarto y cinco serán repetidas a lo largo de todo el contorno del objeto.
Otra versión del mismo ejemplo de ejecución posibilita representar los valores de distancia o de similitud mediante el método "single-linkage" y de modo jerárquico en un dendrograma.
Un segundo ejemplo de ejecución de la presente invención comprende la descripción detallada de un proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes digitales, que reproducen secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8 con células Hep2 representadas como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de células Hep2.
La base de datos comparativa con los casos representados como imágenes del caso, las que se obtiene mediante un proceso para la adquisición de formas procedentes de imágenes digitales que reproducen secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8 con células Hep2 representadas como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de células Hep2 del primer ejemplo de ejecución, sirve de base para la identificación puntual (caso por caso) de células Hep2 que a su vez vienen ser representadas como objetos de imágenes digitales.
Entonces, una imagen del caso con su descripción respectiva será seleccionada en la base de datos comparativa. La imagen del caso puede ser o un prototipo de un grupo de casos individuales, o una imagen individual de un caso. Los grupos de casos individuales consisten en cantidades de casos individuales similares que cuentan con determinantes valores de distancia o de similitud, los cuales aparecen clasificadas de modo jerárquico en un dendrograma. Es que el caso más similar va determinando la rama del dendrograma donde aparecen los casos clasificados. El propio prototipo constituye o una forma cortada en medias obtenida de las formas individuales del grupo, o la mediana del grupo de las formas individuales. La imagen del caso será convertida en una cadencia piramidal de imágenes con planes focales de la imagen del caso. Dicha cadencia de imágenes con varios planes focales ayuda a evitar el crecimiento excesivo de las operaciones de cálculo. Mediante la aplicación de operaciones de nivelado, las que aseguran que todos los números de onda queden por debajo de la mitad del número de la onda límite, y gracias al teorema del muestreo, las imágenes del caso pueden ser representas, una tras otra, con una trama que está dos veces más gruesa que su trama inicial, sin provocar la menor pérdida de información. Durante esa operación se selecciona sólo cada segundo punto de la misma línea y sólo cada segunda línea para formar una nueva imagen, lo que garantiza que la trama inicialmente más fina pueda exactamente ser reconstruida desde la trama más gruesa. La aplicación de las operaciones de nivelado se efectúa de modo iterativo, con el resultado de que se produce una secuencia de imágenes cuya superficie va reduciéndose por el factor cuatro. Paralelamente, los planes focales también disminuyen cada vez más para finalmente tomar la forma de una pirámide que comprende planos focales superpuestos.
A continuación, la actual imagen digital que reproduce secciones celulares Hep2 representadas como objetos será transformada en una imagen de gradientes. Dicha imagen de gradientes viene ser generada mediante una detección de los bordes de los objetos de la imagen digital, siendo asignados los cambios importantes del valor acromático, tanto vertical como horizontalmente, a gradientes, mientras que ningún gradiente será asignado a las superficies homogéneas. Por eso las superficies homogéneas son negras.
Asimismo, la imagen de gradientes será transformada en una cadencia piramidal de imágenes con varios focales.
Luego la imagen del caso será desplazada sucesivamente hacia cada imagen del objeto perteneciente a la imagen de gradientes, empezando con aquellos planes focales de las imágenes del caso y del objeto que estén situados en lo más alto, y comparando cada imagen del caso con la del objeto de la imagen de gradientes. Durante dicha comparación, la imagen del caso viene ser alineada con la imagen del objeto, produciéndose al mismo tiempo una clasificación por escalonamiento y/o una rotación de la imagen del caso. Será además calculada, mientras dure la comparación entre las imágenes del caso y del objeto, la similitud entre las imágenes del caso y del objeto, siendo determinadas las cotas de similitud entre las imágenes del caso y del objeto como valores de distancia o de similitud, hasta que se obtenga sea un mínimo de los valores de distancia, sea un máximo de los valores de similitud. Son las cotas de similitud que van determinando el grado de concordancia entre las imágenes del caso y del objeto, siendo reducido este grado de concordancia en función de la cota de similitud descendiente, es decir que la imagen del objeto quedará siempre más distinta de la imagen del caso.
La particularidad de otra versión de ese ejemplo de ejecución consiste en que el vector de dirección entre dos puntos ó dos puntos contiguos ya está calculado para la imagen del caso, mientras que para la imagen del objeto este cálculo todavía está pendiente. Durante el cálculo de la similitud, las cotas de similitud vienen ser determinadas tanto como vectores de dirección como en forma de valores de distancia o de similitud entre las imágenes del caso y del objeto.
Entonces, las células Hep2 representadas como casos serán clasificadas en la base de datos mediante un índice y en función de sus relaciones de similitud, de tal modo que, dentro de una cantidad de prototipos o casos, se podrá localizar fácilmente el prototipo o el caso más similar a cada objeto de la imagen.
Tanto el prototipo representado como forma cortada en medias o como mediana del grupo, como la imagen individual, serán visualizados en la pantalla de una unidad de visualización conectada a un ordenador. Además, los puntos de contorno de la forma cortada en medias o de la mediana de la imagen serán almacenados por el ordenador como cantidad de datos.
Otra versión del mismo ejemplo de ejecución permite convertir cada imagen del caso y del objeto en una imagen de gradientes. Dichas imágenes de gradientes serán transformadas en una cadencia piramidal de imágenes con varios planes focales, al igual que serán comparados sucesivamente, mediante la formación de productos, los vectores de dirección situados en los planes focales de cada imagen del caso y del objeto.
Un tercer ejemplo de ejecución lo constituye un programa informático contando con un código de programa que permite realizar
- sea un proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes digitales que reproducen secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8, y para el aprendizaje de modelos de forma obtenidos de células Hep2 y reproducidas en imágenes, tal que está descrito en el primer ejemplo de ejecución,
- sea un proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes digitales que reproducen secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8 y representadas con casos, y para la identificación puntual (caso por caso) de células Hep2 representadas como objetos en imágenes digitales, tal que está descrito en el segundo ejemplo de ejecución, siempre y cuando que el programa sea ejecutado por un ordenador.
Un cuarto ejemplo de ejecución consiste en un producto de software instalado en un soporte procesable por máquina, el cual permite realizar
- sea un proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes digitales que reproducen secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8, y para el aprendizaje de modelos de forma obtenidos de células Hep2 y reproducidas en imágenes, tal que está descrito en el primer ejemplo de ejecución,
- sea un proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes digitales que reproducen secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8 y representadas con casos, y para la identificación puntual (caso por caso) de células Hep2 representadas como objetos en imágenes digitales, tal que está descrito en el segundo ejemplo de ejecución, siempre y cuando que el programa sea ejecutado por un ordenador.
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Referencias citadas en la descripción
La lista de referencias citada por el solicitante lo es solamente para utilidad del lector, no formando parte de los documentos de patente europeos. Aún cuando las referencias han sido cuidadosamente recopiladas, no pueden excluirse errores u omisiones y la OEP rechaza toda responsabilidad a este respecto.
Documentos de patente citado en la descripción
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Claims (18)

1. Proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen secciones celulares Hep2 como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de imágenes de secciones celulares Hep2, los que se utiliza para una base de datos comparativa destinada al reconocimiento puntual (caso por caso) de células Hep2 reproducidas en imágenes digitales, donde se puede asignar, a través de la exploración manual de los bordes de esas imágenes que a su vez quedan representadas en forma de contornos exteriores y/o interiores visibles de células Hep2, datos concretos a los bordes explorados y, por consiguiente, a las células Hep2 allí reproducidas como objetos, utilizando para ello una unidad de entrada manejada a mano y conectada a un ordenador, caracterizándose este proceso por la eliminación del desplazamiento de cada objeto, de tal modo que cada objeto será desplazado al punto de origen de un sistema de coordenadas, que cada objeto será clasificado por escalonamiento y en función de los datos asignados en este sistema de coordenadas, que al menos dos objetos serán comparados y alineados el uno con el otro, efectuándose al mismo tiempo una clasificación por escalonamiento y/o una rotación de dichos objetos, siendo determinadas las cotas de similitud como valores de distancia o de valores de similitud entre los objetos, hasta que se alcance sea un mínimo de valores de distancia, sea un máximo de valores de similitud, que en base de estos valores de distancia o de similitud serán obtenidos cantidades de objetos similares que a continuación serán clasificados, de modo jerárquico, en un dendrograma, y que este dendrograma se dividirá, en función de valores de distancia o de similitud prefijados, en varios grupos, y que será seleccionado, dentro de cada uno de esos grupos, un prototipo que a su vez consiste sea en una forma cortada en medias obtenida de las formas individuales del grupo, sea en la mediana obtenida del grupo de las formas individuales.
2. Proceso según la reivindicación 1, caracterizado por la creación de una matriz de similitud en base de los valores de distancia o de similitud.
3. Proceso según la reivindicación 1, caracterizado por la representación jerárquica, mediante el método "single-linkage" y en un dendrograma, de los valores de distancia o de similitud.
4. Proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen secciones celulares Hep2 como casos, y para la identificación puntual (caso por caso) de células Hep2 representadas como objetos en imágenes digitales, lo que sirve de base para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen casos, y para el aprendizaje de modelos de forma procedentes de esos casos que luego serán introducidos en una base de datos comparativa, donde se obtiene, mediante una exploración y con ayuda de una unidad de entrada manejada a mano y conectada a un ordenador, de los bordes de esas imágenes que a su vez consisten en contornos exteriores y/o interiores visibles de los cuales cada uno representa un caso, datos concretos que pueden ser asignados a esos bordes (casos), caracterizándose este proceso por la comparación y la alineación simultáneas, mediante el desplazamiento y la clasificación por escalonamiento de cada caso, de al menos dos casos, que al mismo tiempo se calcula la similitud, determinando las cotas de similitud correspondientes, que se obtiene, en función de las cotas de similitud determinadas, cantidades de casos similares que serán representadas de modo jerárquico un dendrograma, que este dendrograma se dividirá, en función de valores de distancia o de similitud prefijados, en varios grupos, que será seleccionado un prototipo dentro de cada uno de esos grupos, y que para identificar un objeto en una imagen digital que reproduce objetos procedentes de la base de datos comparativa, será seleccionado un caso como imagen del caso contando con una descripción del mismo, produciéndose a la vez tanto una cadencia piramidal de imágenes con los planes focales de la imagen del caso, como una imagen de gradientes de la actual imagen digital, la que también será transformada en una cadencia piramidal de imágenes con varios planes focales, que la imagen del caso será desplazada sucesivamente hacia cada imagen del objeto de la imagen de gradientes, empezando con los planes focales situados en lo más alto y comparando la imagen del caso con cada imagen del objeto de la imagen de gradientes, efectuándose al mismo tiempo, mediante la determinación de las cotas de similitud, el cálculo de la similitud, siendo determinado el grado de concordancia entre las imágenes del caso y del objeto por la cota de similitud.
5. Proceso según la reivindicación 4, caracterizado por la eliminación del desplazamiento de cada objeto, de tal modo que cada objeto será desplazado al punto de origen de un sistema de coordenadas, que al menos dos objetos serán comparados y alineados el uno con el otro, efectuándose al mismo tiempo una clasificación por escalonamiento y/o una rotación de dichos objetos, siendo determinadas las cotas de similitud como valores de distancia o de valores de similitud entre los objetos, hasta que se alcance sea un mínimo de valores de distancia, sea un máximo de valores de similitud, que en base de estos valores de distancia o de similitud serán obtenidas cantidades de objetos similares que a continuación serán clasificados de modo jerárquico en un dendrograma, que este dendrograma se dividirá, en función de valores de distancia o de similitud prefijados, en varios grupos, y que será seleccionado, dentro de cada uno de esos grupos, un prototipo que a su vez consiste sea en una forma cortada en medias obtenida de las formas individuales del grupo, sea en la mediana obtenida del grupo de las formas individuales.
6. Proceso según la reivindicación 1 ó 4, caracterizado en que la escala de similitud del dendrograma será cortada automáticamente y al menos una vez, de acuerdo con valores umbrales prefijados o específicos del usuario, lo que conlleva la formación de grupos, que a estos grupos serán asignadas las formas individuales correspondientes, que será seleccionado un prototipo dentro de cada grupo, el cual consiste sea en una forma cortada en medias obtenida de las formas individuales, sea en la mediana obtenida del grupo de las formas individuales, que la forma cortada en medias o la mediana del grupo serán visualizadas en la pantalla de una o la unidad de visualización, y que los puntos de contorno de la forma cortada en medias o de la mediana serán almacenados como cantidad de datos en el ordenador.
7. Proceso según la reivindicación 1 ó 4, caracterizado por una reducción que a su vez será obtenida mediante la interpolación con un polinomio, de los datos obtenidos durante la exploración de los bordes y, por consiguiente, de los puntos que, ellos, aparecen como contornos exteriores y/o interiores visibles.
8. Proceso según la reivindicación 1 ó 4, caracterizado en que los datos del objeto serán normalizados de tal modo que el centro del objeto corresponde al punto de origen de coordenadas 0, 0.
9. Proceso según la reivindicación 4, caracterizado en que será seleccionada, dentro de la base de datos comparativa, una imagen del caso con una descripción del mismo, siendo generada simultáneamente una cadencia piramidal de imágenes que comprende los planes focales del caso, que se produce una imagen de gradientes de la actual imagen digital, la cual también será transformada en cadencia piramidal de imágenes que comprende varios planes focales, que la imagen del caso será desplazada sucesivamente hacia cada imagen del objeto de la imagen de gradientes, empezando con los planes focales situados en lo más alto y comparando y alineando cada imagen del caso con cada imagen del objeto, efectuándose al mismo tiempo una clasificación y/o una rotación de la imagen del caso y el cálculo de la similitud, siendo determinadas las cotas de similitud sea como valores de distancia, sea como valores de similitud entre las imágenes del caso y del objeto, hasta que se obtenga sea un mínimo de los valores de distancia, sea un máximo de los valores de similitud, y que el grado de concordancia entre las imágenes del caso y del objeto depende de la cota de similitud, es decir que dicho grado de concordancia se reduce en función de la cota de similitud decreciente, al igual que la similitud de la imagen del objeto con la del caso.
10. Proceso según la reivindicación 4, caracterizado en que, mediante una detección de bordes de los objetos de la imagen digital, será producida la imagen de gradientes, siendo asignados dichos gradientes a los cambios importantes del tono acromático, tanto en dirección vertical como horizontal, mientras que ningún gradiente será asignado a las superficies homogéneas, ya que las superficies homogéneas son de color negro.
11. Proceso según la reivindicación 1 ó 4, caracterizado en que se obtiene, tanto de cada imagen del caso como las del objeto, una imagen de gradientes, que cada una de esas imágenes de gradientes será transformada en cadencia piramidal de imágenes que comprende varios planes focales, y que, mediante la formación de productos, los vectores de dirección de los planes de cada imagen del caso y las del objeto serán sucesivamente comparadas entre ellos.
12. Proceso según la reivindicación 1 ó 4, caracterizado en que la imagen del caso constituye un prototipo, el cual consiste o en una forma cortada en medias obtenida de las formas individuales de un grupo, o en la mediana obtenida del grupo de las formas individuales, siendo clasificados los grupos similares como casos individuales y en un dendrograma con determinados valores de distancia o de similitud, donde el caso más similar va determinando la rama dentro del dendrograma, o donde la imagen del caso constituye una imagen individual de un caso.
13. Proceso según la reivindicación 1 ó 4, caracterizado en que los vectores de dirección entre dos puntos o entre los puntos contiguos de los bordes ya quedan calculados para la imagen del caso, mientras que dicho cálculo todavía está pendiente para la imagen del objeto, y que durante el cálculo de la similitud, los valores de similitud serán determinados tanto como vectores de dirección, como en forma de valores de distancia o de similitud entre cada imagen del caso y del objeto.
14. Proceso según la reivindicación 1 ó 4, caracterizado en que, mediante un índice y en función de sus relaciones de similitud, la clasificación de los casos dentro de la base de datos comparativa será efectuada de tal modo que, dentro de una cantidad de prototipos o casos, se podrá localizar fácilmente el prototipo o el caso más similar a cada objeto de la imagen.
15. Proceso según la reivindicación 1 ó 4, caracterizado en que el cálculo de la similitud se efectúa mediante la siguiente fórmula:
1
siendo
P y O - los objetos,
\Theta - la matriz de rotación,
\mu_{p} y \mu_{o} - centros de los objetos P y O
\delta_{p} y \delta_{o} - sumas de los cuadrados que resultan de la distancia de cada punto de los centros.
\newpage
16. Proceso según las reivindicaciones 4 y 5, caracterizado en que el grado de concordancia y, por consiguiente, el de la igualdad entre la imagen del caso y la del objeto, consiste en un valor umbral determinado en función de la cota de similitud, y que un objeto que no sea igual con el caso será o rechazado, o visualizado como caso en la pantalla de la unidad de visualización, de tal modo que la exploración, mediante la unidad de entrada manejada a mano y conectada al ordenador, de los bordes que a su vez serán representados como contornos exteriores y/o interiores visibles, permite asignar datos concretos a cada caso y clasificarlos en el dendrograma.
17. Programa informático con un código de programa, el cual posibilita sea realizar el proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8 y representadas como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de células Hep2 según la reivindicación 1, sea realizar el proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que, ellas, representan casos, y para la identificación puntual (caso por caso) de objetos reproducidos en imágenes digitales según la reivindicación 4, siempre y cuando que el programa sea ejecutado en un ordenador.
18. Producto de software instalado en un soporte procesable por máquina y que sirve sea para realizar el proceso para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen células Hep2 representadas como objetos, y para el aprendizaje de modelos de forma abstractos obtenidos de secciones celulares Hep2 numeradas de 1 a 8 según la reivindicación 1, sea para la adquisición de formas obtenidas de imágenes que reproducen casos, y para la identificación puntual (caso por caso) de objetos reproducidos en imágenes digitales según la reivindicación 4, siempre y cuando que el programa sea ejecutado en un ordenador.
ES04762675T 2004-04-08 2004-08-16 Procedimiento para adquisicion de formas a partir de celulas hep-2 y de reconocimiento por casos de celulas hep-2. Active ES2298791T3 (es)

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