ES2249452T3 - Expresion de un gen heterologo en plantas. - Google Patents

Expresion de un gen heterologo en plantas.

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ES2249452T3 ES01949376T ES01949376T ES2249452T3 ES 2249452 T3 ES2249452 T3 ES 2249452T3 ES 01949376 T ES01949376 T ES 01949376T ES 01949376 T ES01949376 T ES 01949376T ES 2249452 T3 ES2249452 T3 ES 2249452T3
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Geert Angenon
Geert De Jaeger
Alain Goossens
Anna Depicker
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Abstract

Un casete de expresión preferida en semillas que tiene los elementos génicos reguladores que comprende: el promotor de la arcelina que comprende la secuencia mostrada en la ID SEC Nº 1, el líder de arcelina 5I mostrado en la ID SEC Nº 2, el péptido señal de almacenamiento de albúmina 2S2 mostrado en la ID SEC Nº 4, un gen heterólogo de interés, y el extremo 3¿ de arcelina 5I que comprende la secuencia mostrada en la ID SEC Nº 3, en el que dicho gen heterólogo de interés se coloca entre dicha secuencia líder y dicha secuencia 3¿ de arcelina 5I.

Description

Expresión de un gen heterólogo en plantas.
La presente invención se refiere a la expresión de un gen heterólogo en plantas. Más específicamente, la invención se refiere a la expresión elevada de proteínas heterólogas en semillas, incorporando el gen entre secuencias específicas de la semilla. Preferiblemente, dicha proteína heteróloga es un fragmento variable de anticuerpo de cadena única (scFv).
La capacidad para clonar y producir una amplia gama de proteínas a partir de diversas fuentes resultó posible con la llegada de la tecnología recombinante. La selección de hospedadores de expresión para la producción comercial de proteínas heterólogas se basa en los aspectos económicos de la técnica de producción, tales como el coste de la fermentación, el coste de la purificación y la capacidad del hospedador para efectuar las modificaciones postraduccionales necesarias para la actividad biológica completa de la proteína recombinante.
Aunque en muchos casos las células hospedadoras elegidas son células procariotas, tales como Escherichia coli o células eucariotas simples tales como la levadura Saccharomyces cerevisiae, estos sistemas no son suficientes en todos los casos y pueden encontrarse problemas tanto en el rendimiento como en la actividad de la proteína producida. El problema de la actividad biológica puede resolverse mediante sistemas alternativos tales como células vegetales, células de mamífero y células de insecto, pero se resienten de un alto coste de fermentación y un bajo rendimiento.
Las plantas transgénicas pueden producir varios tipos de polipéptidos heterólogos, incluyendo anticuerpos (ac) y fragmentos de anticuerpo (Whitelam y col., 1993; Goddijn y Pen, 1995; Hemming, 1995). Los anticuerpos y fragmentos de anticuerpo son interesantes desde un punto de vista industrial: pueden producirse contra prácticamente cada tipo de molécula orgánica y se unen a este antígeno de forma muy específica. Sin embargo, el principal inconveniente es el coste de producción. Las plantas y las células vegetales son una alternativa interesante para la producción de estas moléculas y de otros polipéptidos que son difíciles de producir en otras células procarióticas o eucarióticas.
El documento US5804694 describe la producción comercial de la \beta-glucuronidasa en plantas colocando el gen de la \beta-glucuronidasa detrás de un promotor de ubiquitina. Con esta construcción, el 0,1% de la proteína total extraída es \beta-glucuronidasa. Puede mejorarse la acumulación, especialmente para ac y fragmentos de ac, dirigiendo la proteína heteróloga al retículo endoplásmico. El uso del promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor da lugar a un nivel de expresión de Fv de anticuerpos de cadena única (scFv) de hasta el 4-6,8% de la proteína soluble total en hojas (Fiedler y col., 1997).
Gran número de esfuerzos se han centrado en las semillas para la producción de proteínas en plantas. De hecho, las semillas, especialmente de legumbres y cereales, contienen grandes cantidades de proteínas; éstas son principalmente proteínas de almacenamiento, que pueden constituir hasta el 7-15% del peso en seco de los cereales y hasta el 20-40% de las legumbres. Además, las proteínas de almacenamiento son limitadas en número y algunas de ellas pueden ser responsables de hasta el 20% del contenido total de proteína de la semilla (Vitale y Bollini, 1995), lo que puede tener importantes ventajas para el procedimiento de purificación. A este respecto, se consideró que los promotores que codifican las proteínas de almacenamiento son herramientas ideales para obtener niveles elevados de expresión de proteínas en semilla (Fiedler y col., 1997).
El documento US5504200 describe el uso del promotor de la faseolina para la expresión de genes heterólogos en plantas y células vegetales. El documento WO9113993 describe la expresión de genes animales o del gen de la proteína de almacenamiento 2S del coco de brasil, usando un promotor seleccionado entre el grupo compuesto por el promotor de la faseolina, la subunidad \alpha' del promotor de la \beta-conglicinina y el promotor de la \beta-zeina El gen se une a una señal poli-A seleccionada del grupo compuesto por la señal poli-A de la faseolina y la señal poli-A animal.
Sin embargo, ninguno de estos sistemas conduce a una expresión elevada de proteína heteróloga. El documento WO9729200 describe un nivel de expresión específico de semillas del 1,9% de proteína heteróloga en la proteína soluble total, usando el promotor específico de la legumina B4. Las mejoras adicionales de los casetes de expresión llevan a una expresión del 3-4% de anticuerpos scFv en semillas maduras de tabaco (Fiedler y col., 1997).
Recientemente, se aisló y clonó el gen de la arcelina 5I (arc5I) de Phaseolus vulgaris. Este gen es responsable de la producción de la proteína de almacenamiento de semillas Arcelina 5a (ARC5a) que se acumula en plantas de tipo silvestre hasta el 24-32% del contenido de proteína total de la semilla (Goossens y col. 1994; Goossens y col., 1995). La expresión del gen en Arabidopsis thaliana y Phaseolus acutifolius indicaba que la proteína de almacenamiento de semillas ARC5a puede expresarse hasta el 15%, respectivamente el 25% de la proteína soluble total (Goossens y col., 1999), cuando se usaban las propias señales promotoras y de expresión. Sin embargo, no se mostraban evidencias de que el promotor pudiera dar una expresión eficaz con otras proteínas. De forma sorprendente, encontramos que el uso del promotor de arcelina 5I o del promotor de faseolina, en combinación con la secuencia líder de arcelina 5I o el líder omega del virus del mosaico del tabaco (TMV) y la secuencia 3' de arcelina 5I, podía dar lugar a un nivel de expresión de proteína heteróloga de hasta el 12% de la proteína total de la semilla, que es mucho más alta que las conocidas en la técnica anterior.
\newpage
Un primer aspecto de la presente invención es proporcionar un casete de expresión preferida en semillas que tiene elementos reguladores del gen que comprenden
- el promotor de la arcelina que comprende la secuencia mostrada en la ID SEC Nº 1
- el líder de arcelina 5I mostrado en la ID SEC Nº 2
- el péptido señal de almacenamiento de albúmina 2S2 mostrado en la ID SEC Nº 4.
- el extremo 3' de arcelina 5I que comprende la secuencia mostrada en la ID SEC Nº 3, en el que
dicho gen heterólogo de interés se sitúa entre dicha secuencia líder y dicha secuencia 3' de arcelina 5I.
Preferiblemente, dicho gen de interés se fusiona con la secuencia que codifica el péptido señal de almacenamiento de albúmina 2S2. En una realización preferida, el gen de interés es un gen que codifica un anticuerpo scFv.
Otro aspecto de la invención es proporcionar un procedimiento para obtener la expresión preferida en semillas de una proteína heteróloga usando el casete de expresión preferida de semillas de la invención, a un nivel de al menos el 10%, preferiblemente a un nivel de al menos el 15%, 20%, 25%, 30%, 35% o 40% de la proteína total soluble de la semilla, a condición de que dicha proteína heteróloga no sea una proteína de almacenamiento de semilla sin modificar tal como Arcelina 5a. Preferiblemente, dicha proteína heteróloga no es una Arcelina, Faseolina o Zeina sin modificar. Otra realización preferida es un procedimiento según la invención, por el cual dicha proteína heteróloga es un scFv.
Aún otro aspecto de la invención es una célula vegetal, transformada con un casete de expresión según la invención o una planta transgénica que comprende un casete de expresión de acuerdo con la invención. De hecho, el casete de expresión puede incorporarse y transformarse en una célula vegetal o en una planta, usando procedimientos conocidos por el experto en la materia. Dichos procedimientos incluyen, pero no de forma limitante, la transformación mediada por ADN-T de Agrobacterium, bombardeo de partículas, electroporación y captación directa de ADN.
Definiciones
Las definiciones siguientes se exponen para ilustrar y definir el significado y el alcance de los diversos términos usados para describir la presente invención.
Expresión preferida en semillas significa que la expresión preferiblemente tiene lugar en la semilla, pero no excluye la expresión en otros órganos de la planta.
Gen de interés como se usa aquí significa la secuencia codificadora de un gen del cual se quiere obtener la expresión preferida en semillas.
Líder como se usa aquí significa la secuencia sin traducir del extremo 5'.
Péptido señal indica la función inicial del péptido en la proteína de almacenamiento de albúmina 2S2 pero no implica necesariamente que el péptido tenga la misma función y sea procesado de la misma forma cuando se fusiona con el gen de interés.
Proteína heteróloga se refiere a cualquier proteína que puede expresarse en semillas pero que no es una proteína de almacenamiento de semilla sin modificar. Por el contrario, las proteínas de almacenamiento de semillas modificadas (mutantes específicos, proteínas de fusión, proteínas de almacenamiento de semillas mejoradas...) son parte de la presente invención y, de ese modo, se incluyen en dicha definición.
Breve descripción de las figuras
Figura 1: Visión general de los vectores de ADN-T para la evaluación de producción de scFv en semillas de Arabidopsis thaliana.
LB y RB = límite izquierdo y límite derecho del ADN-T.
pVS1 = inserción plasmídica de Pseudomonas aeruginosa para la estabilidad y replicación del vector en Agrobacterium tumefaciens.
pBR = origen de replicación en Escherichia coli.
NptII = marcador de selección neomicina fosfotransferasa II bajo el control del promotor nos y de las señales de terminación 3' ocs y de poliadenilación.
SmISpR = gen de resistencia bacteriana a espectinomicina y estreptomicina.
Figura 2: Construcción de pBluescript (2S2-G4).
Figura 3: Construcción de patag5 (3'-arc5I).
Figura 4: Construcción de pSP72 (Parc5I/ARC5a^{cs}).
Figura 5: Amplificación de fragmentos de ADN para la construcción del vector.
Figura 6: Construcción de pParc5I-G4. Este vector, de acuerdo con el Tratado de Budapest, se ha depositado en las Belgian Coordinated Collections of Microorganisms - BCCM^{TM} Laboratorium voor Moleculaire Biologie-Plasmidencollectie (LMPB), Universidad de Gent, K.L. Ledeganckstraat 35, B-9000 Gent, Bélgica por la Dra. Ann Depicker, Molenstraat 61, 9820 Merelbeke, Bélgica (dirección de trabajo: K.L. Ledeganckstraat 35, 9000 Gent, Bélgica) y tiene el número de acceso: LMBP 4128.
Figura 7: Construcción de pParc5I-\Omega-G4.
Figura 8: Construcción de pP35S-G4.
Figura 9: Construcción de pP\beta-phas-G4.
Figura 10: Resultados de la cuantificación de scFv-G4 en los extractos de semillas por inmunotransferencia cuantitativa. Se cargaron 500 ng de proteína de extractos de semillas A, P y \Omega y 2,5 \mug de proteína de extractos 35S y Col O en un gel SDS-PAGE al 10%. Las proteínas G4 se detectaron con anticuerpos monoclonales anti-c-myc y anti-ratón conjugados con fosfatasa alcalina. ColO = control negativo.
Figura 11: Cuantificación de scFv-G4 en extractos de semillas de transformantes por inmersión floral por inmunotransferencia cuantitativa. Se muestran los resultados de 10 variedades de semillas T2 segregadas transformadas con pParc5I-G4 (transferencia superior) y 4 variedades de semillas T2 segregadas transformadas con pP\beta-phas-G4 (transferencia inferior). Cargamos 1 microgramo de proteínas de semillas de A1, A7, F28, F31, F38 y F39, 1,5 microgramos de A3, A5, A8, A15, A22 y A42 y 2 microgramos de A14 y A16 en un gel SDS-PAGE al 10%. Las proteínas G4 se detectaron con anticuerpos monoclonales anti-c-myc y anti-ratón conjugados con fosfatasa alcalina. M = marcadores de peso molecular.
Figura 12: Gel SDS-PAGE teñido con azul de Coomassie que muestra las proteínas separadas de semillas de Arabidopsis de transgénicos F28 (carriles 3 y 7), F31 (carriles 4 y 8), F38 (carriles 5 y 9), F39 (carriles 6 y 10), transformados con pP\beta-phas-G4 y de una planta de control no transformada (carril 2). Los carriles 3, 4, 5 y 6 contienen 30 microgramos de proteína y los carriles 7, 8, 9 y 10 contienen 20 microgramos de proteína. La flecha indica la banda de la proteína scFv recombinante. El carril 1 contiene el marcador de peso molecular. En base a las bandas de proteína teñidas con Coomassie en carriles separados, el software ImageMaster VDS midió los siguientes contenidos de G4 para cada carril: 9,9% para F28 (11,3% por inmunotransferencia), 15,4% para F31 (20,0% por inmunotransferencia), 16,0% para F38 (19,0% por inmunotransferencia) y 9,6% para F39 (12,0% por inmunotransferencia).
Figura 13: Representación esquemática del ensayo de ELISA usado para analizar la actividad de unión al antígeno de las proteínas scFv extraídas ex planta y extraídas de E. coli. (1) Recubrimiento de pocillo de microvaloración con anticuerpo monoclonal 9E10 unido a la etiqueta c-myc del scFv; (2) incubación conjunta de varias cantidades de scFv de semillas o de E. coli con un exceso del antígeno dihidroflavonol-4-reductasa (DFR) de Petunia hybrida; detección de la DFR unida con (3) antisuero policlonal de ratón contra DFR y (4) suero policlonal anti-conejo conjugado con fosfatasa alcalina (FA).
Figura 14: Resultados del análisis por ELISA de la actividad de unión al antígeno de proteínas scFv extraídas de semillas y de E. coli. El ensayo de ELISA (figura 12) se realizó con diferentes concentraciones de G4 (eje X) en presencia o ausencia (controles) del antígeno DFR. El eje Y representa la señal del ELISA (\DeltaUF/min).
Figura 15: Construcción de patag6 (3'-arc5I).
Figura 16: Construcción de pParc5I-G4bis.
Figura 17: Cuantificación de scFv-G4 en semillas diferentes (3/2, 3/3, 3/4 y 3/5) de una única planta de Phaseolus acutifolius transgénica. Cargamos 3 (carriles a) o 4 (carriles b) microgramos de proteínas de semillas de cada extracto de semillas en un gel SDS-PAGE al 10%. Las proteínas G4 se detectaron con anticuerpos monoclonales anti-c-myc y anti-ratón conjugados con fosfatasa alcalina. M = marcador de peso molecular.
Ejemplos Ejemplo 1 Clonación de los vectores de ADN-T para la evaluación de la producción de scFv en Arabidopsis thaliana bajo el control de las señales de expresión de arc5I de Phaseolus vulgaris
Se construyeron cuatro vectores de ADN-T para evaluar y comparar la producción de scFv bajo el control de las señales de expresión de arc5I (vectores pParc5I y pParc5I-\Omega-G4), el promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor (vector pP35S-G4) y el promotor del gen de la faseolina \beta de Phaseolus vulgaris (vector pP\beta-phas-G4)(figura 1). Una primera etapa en el procedimiento de clonación consistió en la construcción de tres vectores piloto: pBluescript (2S2-G4) (figura 2), patag5 (3'-arc5I)(figura 3) y pSP72 (Parc5I/ARC5a^{cs})(figura 4).
Construcción de pBluescript(2S2-G4)(figura 2)
La secuencia codificadora del fragmento G4 de scFv, fusionada en su extremo 3' con la secuencia codificadora de la etiqueta c-myc (Evan y col., 1985) y la señal KDEL de retención de RE (Denecke y col., 1992), se cortó a partir del vector pG4ER de ADN-T (De Jaeger y col., 1999) por los sitios de restricción NcoI y XbaI. Además, se creó un oligonucleótido que codifica la secuencia señal de almacenamiento de proteínas de semillas 2S2 de Arabidopsis thaliana (Krebbers y col., 1988). Este oligonucleótido estaba flanqueado en su extremo 3' por el extremo "cohesivo" del sitio de restricción NcoI y estaba flanqueado en su extremo 5' por un extremo "cohesivo" que complementa el sitio de restricción XbaI pero lo destruye tras el ligamiento, seguido de los sitios de restricción EcoRI, BglII y HindIII. El fragmento G4 y el oligonucleótido se clonaron conjuntamente en el vector pBluescriptKS (Stratagene, La Jolla, CA), tras cortar con HindIII y XbaI. Se analizó la secuencia de la inserción y se seleccionó un clon que contenía una inserción correcta para etapas de clonación adicionales. De este modo, obtuvimos el vector piloto pBluescript (2S2-G4), que contenía la secuencia codificadora de G4, precedida de una serie de sitios de restricción únicos que podrían usarse para la inserción de los diferentes promotores en combinación con una secuencia líder de
ARNm.
Construcción de patag5(3'-arc5I)(figura 3)
Se creó un oligonucleótido para insertar algunos sitios de restricción únicos en el vector de ADN-T patag4 (Goossens y col., 1999). El oligonucleótido contenía los siguientes sitios de restricción desde su extremo 5' a su extremo 3': el extremo 5' "cohesivo" de EcoRI, los sitios de restricción XbaI, XhoI y BglII y un extremo 3' "cohesivo" que complementa a XbaI pero que lo destruye tras el ligamiento. El oligonucleótido se ligó en patag4, tras cortar con EcoRI y XbaI. Esto da lugar al vector patag5. Se analizó la secuencia del oligonucleótido insertado y se seleccionó un clon con la inserción correcta para etapas de clonación adicionales. Usando XbaI y EcoRI, cortamos las señales 3' de expresión de arc5I(3'-arc5I) a partir del vector pBluescript(arc5I) (Goossens y col., 1995), que contenía la secuencia genómica del gen arc5I. El fragmento 3' de arc5I se ligó en patag5, tras cortar con XbaI y EcoRI. Esto dio lugar al vector de ADN-T patag5(3'-arc5I).
Construcción de pSP72(Parc5I/ARC5a^{cs})(figura 4)
El promotor arc5I y la secuencia codificadora de la proteína ARC5a (ARC5a^{cs}) se cortaron de pBluescript(arc5I). Este fragmento se ligó en el vector de clonación pSP72 (Promega, Madison, WI) tras cortar con EcoRI y XbaI. Esto dio lugar al vector pSP72 (Parc5I/ARC5a^{cs}), que contenía el promotor arc5I precedido de los sitios de restricción EcoRI y BglII.
Además de estos tres vectores piloto, se amplificaron mediante PCR cuatro fragmentos de ADN. Estos fragmentos se denominaron PCR1, PCR2, PCR3 y PCR4 (figura 5). Los fragmentos PCR1 y PCR2 se amplificaron a partir de los extremos 3' del promotor 5' de arc5I (Parc5I) en pBluescript (arc5I). PCR1 contenía el extremo 3' del Parc5I seguido de la secuencia "líder" de arc5I y el extremo 5' de la secuencia señal 2S2. PCR2 contenía el mismo extremo 3' de Parc5I, pero seguido de la secuencia "líder" \Omega y el extremo 5' de la secuencia señal 2S2. Ambos fragmentos estaban flanqueados por los sitios de restricción SacI y HindIII. PCR3 se obtuvo amplificando el promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor del vector pGEJAE1 (De Jaeger y col., 1999). En el extremo 3' del promotor 35S, incorporamos el "líder" de arc5I, seguido del extremo 5' de la secuencia señal 2S2. PCR3 está flanqueado por los sitios de restricción BglII y HindIII. PCR4 contenía el promotor del gen de la faseolina \beta de Phaseolus vulgaris, amplificado a partir del vector pBluescript (P\beta-phas) (van der Geest y col., 1994). En el extremo 3' de PCR4, incorporamos el "líder" de arc5I seguido del extremo 5' de la secuencia señal 2S2. Este fragmento estaba flanqueado por los sitios de restricción XhoI y HindIII. Los vectores pilotos y los cuatro fragmentos de PCR se usaron para clonar los cuatro vectores de ADN-T de la figura 1.
Construcción de pParc5I-G4 (figura 6)
Primero se cortó el extremo 5' del promotor de arc5I a partir del vector pSP72 (Parc5I/ARC5a^{cs}) usando las enzimas BglII y SacI. Este fragmento promotor, junto con el fragmento PCR1, se ligó en el vector pBluescript (2S2-G4), tras la digestión de restricción con BglII y HindIII. Esto dio lugar al vector pBluescript (Parc5I- "líder" arc5I-2S2-G4). Se analizó la secuencia del fragmento PCR1 insertado y se seleccionó un clon con inserción correcta para etapas de clonación adicionales. Finalmente, el promotor arc5I con el "líder" arc5I y la secuencia que codifica G4, se cortó de la construcción anterior por los sitios de restricción BglII y XbaI y se ligó en el vector patag5(3'-arc5I), tras la digestión con BglII y XbaI. Esto dio lugar al vector de ADN-T pParc5I-G4. Este plásmido transformado en E. coli MC1061 se depositó en el BCCM con el número de depósito LMBP 4128. El plásmido contiene el promotor arc5I completo y el extremo 3' de arc5I completo, como se usa en los casetes de expresión que comprenden el promotor arc5I y el extremo 3' de arc5I.
Construcción de pParc5I-\Omega-G4 (figura 7)
Primero se cortó el extremo 5' del promotor arc5I a partir del vector pSP72 (Parc5I/ARC5a^{cs}) por digestión de restricción con BglII y SacI. Este fragmento promotor, junto con el fragmento PCR2, se ligó en el vector pBluescript (2S2-G4), tras la digestión de restricción con BglII y HindIII. Esto dio lugar al vector pBluescript (Parc5I-"líder" \Omega-2S2-G4). Se analizó la secuencia del fragmento PCR2 insertado y se seleccionó un clon con inserción correcta para etapas de clonación adicionales. Finalmente, se cortó el promotor arc5I con el "líder" \Omega y la secuencia que codifica G4 a partir de la construcción anterior en los sitios de restricción BglII y XbaI y se ligó en el vector patag5 (3'-arc5I), tras la digestión con BglII y XbaI. Esto dio lugar al vector de ADN-T pParc5I-\Omega-G4.
Construcción de pP35S-G4 (figura 8)
El fragmento PCR3 se ligó en el vector pBluescript (2S2-G4), tras la digestión de restricción con BglII y HindIII. Esto dio lugar al vector pBluescript (P35S-"líder" arc5I-2S2-G4). Se analizó la secuencia del fragmento PCR3 insertado y se seleccionó un clon con la inserción correcta para etapas de clonación adicionales. Finalmente, con el promotor 35S con el "líder" de arc5I y la secuencia codificadora de G4 se cortó de la construcción anterior en los sitios de BglII y XBaI y se ligaron al vector patag5 (3' arc5I), tras la digestión con BglII y XbaI. Esto dio lugar al vector de ADN-T pP35S-G4.
Construcción de pP\beta-phas-G4 (figura 9)
El fragmento PCR4 se ligó en el vector pBluescript (2S2-G4), tras la digestión de restricción con XhoI y HindIII. Esto dio lugar al vector pBluescript (P\betaphas-"líder" de arc5I-2S2-G4). Tras analizar la secuencia de ADN del fragmento PCR4 insertado, encontramos en el promotor de faseolina \beta algunos pares de bases que diferían de la secuencia original (Bustos y col., 1991; número de acceso del Genbank J01263). Sin embargo, el extremo 3' de la secuencia promotora clonada, empezando desde el sitio NdeI, era exactamente igual a la secuencia dada. Por tanto, se cortó este fragmento, junto con la secuencia codificadora del scFv G4, a partir del vector pBluescript (P\betaphas-"líder" arc5I-2S2-G4) usando los sitios de restricción NdeI y XbaI. Además, se cortó el extremo 5' del promotor de la faseolina \beta a partir de pBluescript (P\beta-phas) por los sitios de restricción XhoI y NdeI. Se ligaron ambos fragmentos de ADN en patag5(3'-arc5I), tras la digestión de restricción con XhoI y XbaI. Esto dio lugar al vector final pP\beta-phas-G4. Una vez más analizamos la secuencia del promotor de la faseolina \beta y encontramos las mismas diferencias con la secuencia original. La secuencia entre el sitio XhoI y el sitio NdeI, como se usa en la construcción se describe en la ID
SEC Nº 5.
Los cuatro vectores de ADN-T se purificaron a partir de Escherichia coli y se electroporaron en Agrobacterium tumefaciens C58C1Rif^{R} (pMP90). Tras la purificación de la colonia, se purificaron los plásmidos a partir de Agrobacterium y se analizaron. En la transformación de Arabidopsis se usaron cepas de Agrobacterium.
Ejemplo 2 Transformación de Arabidopsis thaliana y regeneración de plantas transgénicas
Se transformó Arabidopsis thaliana (genotipo O de Columbia) por transformación de raíces (Valvekens y col., 1988) con las construcciones pParc5I-G4, pParc5I-\Omega-G4, pP35S-G4 y pP\beta-phas-G4. Tras la selección de los callos transformados en medio selectivo con kanamicina, se transfirieron 150 callos a medio inductor de la germinación. Finalmente, los brotes se transfirieron a medio inductor de enraizamiento. Tras la formación de las raíces, las plantas se transfirieron al semillero y se recogieron las semillas de los siguientes números de plantas de Arabidopsis transgénicas: 36 para pParc5I-G4, 4 para pP35S-G4, 18 para pP\beta-phas-G4 y 13 para pParc5I-\Omega-G4.
En paralelo, se usaron las mismas construcciones para la transformación de Arabidopsis por "inmersión floral" (Clough y Bent, 1998). Se seleccionaron plantas T1 transformadas en medio selectivo que contiene kanamicina, se transfirieron al semillero y se recogieron las semillas.
Ejemplo 3 Acumulación de scFv en semillas de Arabidopsis transgénicas Extracción de semillas y cuantificación de proteína
Los extractos crudos de proteínas de semillas se obtuvieron siguiendo una modificación del protocolo de extracción de van der Klei y col. (1995) (Goossens y col., 1999). Las semillas molidas se extrajeron dos veces con hexano para eliminar los lípidos. El residuo se liofilizó y posteriormente se extrajo dos veces con Tris/HCl 50 mM, NaCl 200 mM, EDTA 5 mM, Tween 20 al 0,1%, pH 8 (Fiedler y col., 1997) durante 15 minutos a temperatura ambiente con agitación continua. Para prevenir la degradación de las proteínas, se añadió al tampón de extracción una mezcla de inhibidores de proteasas (2xC\diametermplete^{TM}, Roche Molecular Biochemicals, Alemania). Se retiró el sedimento por centrifugación a 20.000 x g y se combinaron los sobrenadantes. La cantidad de proteína total en los extractos crudos se determinó por el procedimiento de Lowry usando el ensayo de la proteína DC (BioRad, Hercules, EE.UU.) con BSA como patrón (Tabla 1). La fiabilidad de la cuantificación de proteína en semillas de Arabidopsis por este procedimiento se verificó según describen Goossens y col., 1999.
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TABLA 1
Concentración de proteína total en extractos de semillas transgénicas (500 microlitros) a partir de 10 mg
de semillas de Arabidopsis transgénicas.
A 1 A 105 A 140 A 143 A 165A
3.665 3.395 3.042 3.708 3.675
\mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul
P 3A P 5 P 15 P 22A P 102B
2.852 4.028 3.623 3.151 3.339
\mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul
\Omega 7A \Omega 33 \Omega 65C \Omega 98A \Omega 130
3.873 3.527 3.184 3.754 3.517
\mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul
35S 93 35S 101 35S 116 35S 131A Col O
3.945 3.837 3.879 3.906 3.215
\mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul \mug/\mul
Col O = genotipo 0 de Columbia no transformada como control.
A = línea de Arabidopsis transformada con pParc5I-G4
P = línea de Arabidopsis transformada con pP\beta-phas-G4
35S = línea de Arabidopsis transformada con pP35S-G4
\Omega = línea de Arabidopsis transformada con pParc5I-\Omega-G4
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3.2 Cuantificación de la acumulación de scFv-G4
Las proteínas se separaron en SDS-PAGE y se determinaron los niveles de acumulación de scFv-G4 por análisis por Western-blot cuantitativo usando el anticuerpo monoclonal anti-c-myc 9E10 (Evan y col., 1995) seguido de IgG anti-ratón conjugada con fosfatasa alcalina (Sigma, St. Louis, MO, EE.UU.), según De Jaeger y col., 1999 (figura 10). Se usaron como patrones diferentes cantidades de proteínas scFv-G4 purificadas a partir de Escherichia coli (De Jaeger y col., 1999). Las construcciones pParc5I-G4, pParc5I-\Omega-G4 y pP\beta-phas-G4 dan niveles elevados de acumulación de scFv-G4 en semillas de Arabidopsis, en el intervalo del 10% de proteína total soluble de la semilla. Estos son los niveles más elevados de proteínas scFv producidas en plantas que se han documentado. Además, se encontraron fácilmente líneas con estos elevados niveles a pesar de que sólo se analizaron 5 líneas para cada construcción, lo cual es un indicio de que los casetes de expresión no son muy sensibles al silenciamiento.
TABLA 2
Niveles de acumulación de scFv-G4 en semillas de Arabidopsis transgénicas.
pParc5I-G4 pP\beta-phas-G4 pParc5I-\Omega-G4 pP35S-G4
Línea Nivel de G4 Línea Nivel de G4 Línea Nivel de G4 Línea Nivel de G4
(*) (*) (*) (*)
A 1 < 4% P 3A 10% \Omega 7A 12% 35S93 <0,8%
A 105 10% P 5 10% \Omega 33 < 4% 35S 3%
101
A 140 6% P 15 < 4% \Omega 65C 6% 35S <0,8%
116
A 143 8% P 22A 12% \Omega 98A < 4% 35S <0,8%
131A
A 165A 8% P 102B 12% \Omega 130 < 4%
(*) \begin{minipage}[t]{145mm} nivel de acumulación como % del contenido de proteína total soluble de semillas transgénicas\end{minipage}
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Ejemplo 4 Transformación de Arabidopsis thaliana por "inmersión floral" y regeneración de plantas transgénicas
Arabidopsis thaliana (genotipo O de Columbia) se transformó por "inmersión floral)" (Clough y Bent, 1998) con los construcciones pParc5I-G4, pParc5I-\Omega-G4, pP35S-G4 y pP\beta-phas-G4. Se seleccionaron plantas T1 transformadas en medio selectivo que contenía kanamicina, se transfirieron al semillero y se recogieron las variedades de semillas segregadas T2.
Acumulación de scFv en variedades de semillas segregadas T2 Extracción de semillas y cuantificación de proteína
La extracción de semillas y la cuantificación de proteína se determinaron como se describe en el ejemplo 3.
Cuantificación de la acumulación de scFv-G4
Las proteínas se separaron en SDS-PAGE y se determinaron los niveles de acumulación de proteínas scFv-G4 por análisis por Western-blot cuantitativo usando el anticuerpo monoclonal anti-c-myc 9E10 (Evan y col., 1995) seguido de IgG anti-ratón conjugada con fosfatasa alcalina (Sigma, St. Louis, MO, EE.UU.), según describen De Jaeger y col., 1999 (figura 11). Se usaron como patrones diferentes cantidades de proteínas scFv-G4KDEL purificadas a partir de Escherichia coli. La mayoría de las variedades de semillas se analizaron al menos dos veces. Las construcciones pParc5I-G4 y pP\beta-phas-G4 dieron niveles de acumulación de scFv-G4 muy elevados en semillas de Arabidopsis, en el intervalo de 5-10% y 10%-20% de proteína total soluble de la semilla, respectivamente (tabla 3). El uso del líder no traducido de arc5I en pParc5I-G4 o el líder del TMV(omega) en pParc5I-\Omega-G4 daban niveles de acumulación similares (tabla 3), mostrando que ambos líderes permiten un inicio de la traducción eficaz en semillas. Además, la variación intertransgénica es baja para las cuatro construcciones, lo cual es una indicación de que los casetes de expresión no son muy sensibles al silenciamiento. Los extractos de semillas de cuatros líneas de plantas pP\beta-phas-G4 con la acumulación más elevada de G4 mayor se analizaron adicionalmente por SDS-PAGE y tinción con azul de Coomassie (figura 12). Pudo identificarse una banda de proteína scFv clara del tamaño esperado, que estaba ausente en la línea control sin transformar. Usando el software ImageMaster VDS (Pharmacia, Uppsala, Suecia) se midió el porcentaje de scFv en la proteína total soluble de la semilla en cada carril. Se obtuvieron niveles de acumulación de scFv similares en los carriles que los obtenidos con el análisis por inmunotransferencia
cuantitativa.
TABLA 3
\begin{minipage}[t]{155mm} Niveles de acumulación de scFv-G4 en variedades de semillas segregadas T2 de Arabidopsis transgénicas. Se {}\hskip0,2cm analizaron 20 variedades de semillas independientes, los niveles de scFv se clasificaron de mayor a menor. \end{minipage}
pParc5I-G4 Pp\beta-phas-G4 pParc5I-\Omega-G4 pP35S-G4
(*) (*) (*) (*)
8,0 \pm 1,4 20,0 \pm 0,0 5,8 \pm 0,4 1,1 \pm 0,1
7,8 \pm 0,4 19,0 \pm 1,4 4,9 \pm 0,2 1,1 \pm 0,1
6,7 \pm 0,1 12,0 \pm 0,0 4,5 \pm 0,7 1,1 \pm 0,1
6,4 \pm 0,5 11,3 \pm 1,8 4,0 \pm 0,0 1,0 \pm 0,0
5,3 \pm 1,8 7,2 \pm 0,2 3,9 \pm 0,2 1,0 \pm 0,0
4,7 \pm 0,5 5,4 \pm 0,9 3,9 \pm 0,2 0,8 \pm 0,1
4,5 \pm 0,7 5,0 \pm 0,0 3,5 \pm 0,2 0,7 \pm 0,1
3,9 \pm 0,2 4,5 \pm 0,7 3,2 \pm 0,2 0,7 \pm 0,1
3,8 \pm 0,4 4,4 \pm 0,5 3,1 \pm 0,6 0,7 \pm 0,1
3,7 \pm 0,5 4,0 \pm 1,0 3,0 \pm 0,0 0,7 \pm 0,0
2,4 \pm 0,5 3,9 \pm 0,2 3,0 \pm 0,0 0,7 \pm 0,1
1,7 \pm 0,5 3,8 \pm 0,3 2,7 \pm 0,4 0,7 \pm 0,1
1,3 \pm 0,4 1,8 \pm 0,4 1,6 \pm 0,4 0,6 \pm 0,0
0,9 \pm 0,2 1,8 \pm 0,3 1,5 0,5 \pm 0,1
0,8 \pm 0,0 1,6 1,4 \pm 0,1 0,5 \pm 0,0
0,5 \pm 0,1 1,3 0,7 \pm 0,0 0,4 \pm 0,0
0,5 \pm 0,1 1,2 0,6 \pm 0,1 0,3 \pm 0,0
0,4 \pm 0,1 0,8 0,3 0,2 \pm 0,1
<0,3 <0,4 0,2 0,1
<0,3 n.d. 0,1 n.d.
(*) \begin{minipage}[t]{155mm} nivel de acumulación de scFv como % del contenido de proteína soluble en semillas transgénicas, con desviación típica. n.d. = no se detecta. \end{minipage}
Acumulación de scFv en variedades de semillas homocigotas transgénicas T3
Para cada construcción, se analizaron genéticamente 10 variedades de semillas T2 que contenían los niveles de G4 más elevados por análisis de segregación. Se germinaron 72 semillas de cada variedad de semilla en medio selectivo, que contenía kanamicina e identificamos por análisis estadístico líneas vegetales que contenían un emplazamiento de ADN-T único. Para las construcciones pParc5I-G4 y pP\beta-phas-G4, se eligieron 4 líneas que contenía un emplazamiento de ADN-T único para cultivar y seleccionar variedades de semillas homocigotas. Se cultivaron 10 plantas T2 por línea, se recogieron semillas T3 y se seleccionaron variedades de semillas T3 homocigotas cultivando las plantas en medios selectivos que contenían kanamicina. No se encontraron semillas homocigotas de una de las cuatro líneas que contenían la construcción pParc5I-G4. La acumulación de G4 se midió por inmunotransferencia cuantitativa en variedades de semillas T3 segregadas y T3 homocigotas.
La mayoría de las variedades de semillas homocigotas de pParc5I-G4 y todas las de pP\beta-phas-G4 daban niveles de G4 mayores que las correspondientes variedades T3 segregadas (tabla 4). Se obtuvieron variedades de semillas homocigotas tanto para la construcción pParc5I-G4 como para la pP\beta-phas-G4 que contenían G4 a más del 10% de la proteína total soluble de la semilla. La variedad de semilla homocigota, transformada con pP\beta-phas-G4, contenía niveles de G4 extraordinariamente elevados, hasta el 36,5% de la PTS en semillas. Este es el nivel de proteína heteróloga más alto jamás documentado para plantas.
TABLA 4
Niveles de acumulación de scFv-G4 en variedades de semillas T3 segregadas y homocigotas de Arabidopsis
Línea vegetal Variedades de semillas Variedades de semillas Variedades de semillas
T2 segregadas (*) T3 segregadas (*) T3 homocigotas (*)
A1 8,0 \pm 1,4 8,2 \pm 1,0 4,4 \pm 0,8
6,7 \pm 0,7 12,5 \pm 1,9
A15 4,7 \pm 0,5 5,6 \pm 1,0 6,4 \pm 1,4
4,7 \pm 0,0 7,7 \pm 1,4
A16 4,5 \pm 0,7 3,8 \pm 0,7 6,0 \pm 1,0
5,1 \pm 1,4 3,5 \pm 0,4
F3 4,5 \pm 0,7 5,8 18,0
F24 5,0 \pm 0,0 7,0 \pm 1,4 13,5 \pm 2,1
4,9 \pm 0,2 15,0 \pm 1,4
F28 11,3 \pm 1,8 13,0 \pm 1,4 21,0 \pm 4,2
10,5 \pm 0,7 18,5 \pm 0,7
F38 19,0 \pm 1,4 17,5 \pm 0,7 36,5 \pm 3,4
17,5 \pm 3,5
(*) \begin{minipage}[t]{155mm} Nivel de acumulación de scFv como % del contenido de proteína soluble total en semillas transgénicas, con desviación típica. n.d. = no se detecta. Se analizó para la mayoría de las líneas más de una variedad de T3 segregada y homocigota. A1, A15 y A16 son líneas vegetales transformadas con la construcción pParc5I-G4. Las líneas F3, F28 y F38 se transformaron con pP\beta-phas-G4. \end{minipage}
Análisis de la calidad de scFv en extractos de semillas
Se midió la actividad de unión al antígeno de las proteínas G4 extraídas de semillas y se comparó por ELISA con G4 extraída de E. coli. Usamos extracto de semillas de la variedad de semilla "Phas" que contenía G4 al 36,5% (tabla 4). Se incubaron diferentes cantidades de scFv con el antígeno dihidroflavonol-4-reductasa en exceso y se midió el antígeno unido por ELISA de tipo sándwich (figura 13). Se establecieron curvas de señal de ELISA tanto para la scFv bacteriana como para la vegetal y se compararon. Las curvas se superponían entre sí (figura 14), lo que indicaba que la scFv producida en planta tenía similar actividad de unión al antígeno que la scFv bacteriana.
Ejemplo 5 Transformación de Phaseolus acutifolius y acumulación de scFv en semillas de judía segregada transgénica
Phaseolus acutifolius TB1 se transformó con pParc5I-G4bis (figura 16). pParc5I-G4bis contiene el mismo ADN-T que pParc5I-G4, excepto en que éste contiene una construcción P35S-GUS adicional para el análisis de la segregación de las plantas transgénicas.
Para la construcción de este vector de ADN-T, primero hicimos la construcción piloto patag6(3'-arc5I) (figura 15) según el procedimiento de la etapa de clonación usado para patag5(3'-arc5I) (figura 3). Se creó un oligonucleótido para insertar algunos sitios de restricción únicos en el vector de ADN-T patag3 (Goossens y col., 1999). El oligonucleótido contenía los siguientes sitios de restricción desde su extremo 5' a su extremo 3': el extremo 5' "cohesivo" de EcoRI, los sitios de restricción XbaI, XhoI y BglII y un extremo 3' "cohesivo" que complementa a XbaI pero que lo destruye tras el ligamiento. El oligonucleótido se ligó en patag3, tras cortar con EcoRI y XbaI. Esto dio lugar al vector patag6. Se analizó la secuencia del oligonucleótido insertado y se seleccionó un clon con la inserción correcta para etapas de clonación adicionales. A partir del vector pBluescript (arc5I) (Goossens y col., 1995), que contenía la secuencia genómica del gen arc5I, cortamos las señales de expresión 3' de arc5I (3'-arc5I) usando XbaI y EcoRI. El fragmento 3' de arc5I se ligó en patag6, tras cortar con XbaI y EcoRI. Esto dio lugar al vector patag6 (3'-arc5I). Esta construcción piloto se usó para hacer pParc5I-G4bis (figura 16). La secuencia "líder" de arc5I y la secuencia codificadora de G4 se cortaron a partir del vector pBluescript (Parc5I-"líder" de arc5I-2S2-G4) (figura 6) por los sitios de restricción BglII y XbaI y se ligaron en el vector patag6 (3'-arc5I) tras la digestión con BglII y XbaI. Esto dio lugar al vector de ADN-T pParc5I-G4bis.
Se obtuvieron tres plantas transgénicas usando el protocolo de Dillen y col. (1997). Como las tres plantas se regeneraron a partir del mismo callo, se esperaba que fueran clones del mismo suceso de transformación. Se recogieron semillas y se hicieron extractos proteicos de estas semillas separadas en el mismo tampón que para la extracción de semillas de Arabidopsis y según describen Goossens y col. (1999). La concentración de proteína total soluble se midió espectrofotométricamente a 280 nm y se determinó la acumulación de G4 por inmunotransferencia cuantitativa.
Se detectó G4 como una banda única de proteína (figura 17) en, por término medio, 3 de 4 semillas de las tres variedades de semillas segregadas. Por tanto, los más probable es que estos transformantes contengan un único emplazamiento de ADN-T. Todas las semillas que acumulaban G4 analizadas contenían G4 al 2-2,5% de la proteína total soluble o 2-2,5 miligramos de scFv por gramo de peso fresco de semillas. Hasta ahora, sólo una publicación informaba de la producción de scFv en una especie de leguminosas. Perrin y col. (2000) obtuvieron 9 microgramos de scFv por gramo de peso fresco de semillas de guisantes con el promotor legA. De este modo, la acumulación con la construcción con el promotor arc5I es de 200 a 300 veces mayor que los niveles informados con el promotor legA. Puesto que nosotros sólo obtuvimos una línea vegetal transgénica, lo más probable es que puedan obtenerse líneas vegetales con niveles de scFv incluso mayores. Goossens y col. (1999) ya obtuvieron niveles 4 veces más elevados de proteína ARC5I en variedades de semillas homocigotas comparadas con variedades de semillas segregadas y esto bajo el control del mismo promotor arc5I. Por tanto, tras obtener más líneas transgénicas y seleccionar líneas homocigotas, esperamos alcanzar niveles de scFv del 10% en Phaseolus acutifolius, usando esta construcción con el promotor arc5I.
Referencias
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\vskip0.400000\baselineskip
<213> Phaseolus vulgaris
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<400> 1
1
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<210> 2
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<211> 13
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<212> ADN
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<213> Phaseolus vulgaris
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<400> 2
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\hskip-.1em\dddseqskip
tgaatgcatg atc
\hfill
13
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<210> 3
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<211> 1280
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<212> ADN
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<213> Phaseolus vulgaris
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<400> 3
2
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<210> 4
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<211> 63
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<212> ADN
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<213> Arabidopsis thaliana
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<400> 4
3
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<210> 5
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<211> 1415
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<212> ADN
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<213> Phaseolus vulgaris
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<400> 5
4

Claims (7)

1. Un casete de expresión preferida en semillas que tiene los elementos génicos reguladores que comprende:
- el promotor de la arcelina que comprende la secuencia mostrada en la ID SEC Nº 1,
- el líder de arcelina 5I mostrado en la ID SEC Nº 2,
- el péptido señal de almacenamiento de albúmina 2S2 mostrado en la ID SEC Nº 4,
- un gen heterólogo de interés, y
- el extremo 3' de arcelina 5I que comprende la secuencia mostrada en la ID SEC Nº 3, en el que dicho gen heterólogo de interés se coloca entre dicha secuencia líder y dicha secuencia 3' de arcelina 5I.
2. Un casete de expresión preferida en semillas según la reivindicación 1, por medio del cual dicho gen de interés se fusiona con la secuencia que codifica el péptido señal de almacenamiento de albúmina 2S2.
3. Un casete de expresión preferida en semillas según la reivindicación 1 ó 2, por medio del cual el gen heterólogo de interés codifica un fragmento de Fv de cadena única.
4. Un procedimiento para obtener la expresión preferida en semillas de una proteína heteróloga, usando un casete de expresión según cualquiera de las reivindicaciones 1-3, a un nivel de al menos el 10% de la proteína total soluble de la semilla, a condición de que dicha proteína heteróloga no sea una proteína de almacenamiento de semillas sin modificar.
5. Un procedimiento según la reivindicación 4 en el que dicho nivel es de al menos el 15% de la proteína total soluble de la semilla.
6. Una célula vegetal transformada con un casete de expresión según cualquiera de las reivindicaciones 1-3.
7. Una planta transgénica que comprende un casete de expresión según cualquiera de las reivindicaciones 1-3.
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