EP2329273A1 - Stable cell clone expressing a prion - Google Patents

Stable cell clone expressing a prion

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Publication number
EP2329273A1
EP2329273A1 EP09741370A EP09741370A EP2329273A1 EP 2329273 A1 EP2329273 A1 EP 2329273A1 EP 09741370 A EP09741370 A EP 09741370A EP 09741370 A EP09741370 A EP 09741370A EP 2329273 A1 EP2329273 A1 EP 2329273A1
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EP
European Patent Office
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cell
cells
infection
atnc
marker
Prior art date
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Withdrawn
Application number
EP09741370A
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German (de)
French (fr)
Inventor
Bruno You
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Institut National de la Recherche Agronomique INRA
LFB Biotechnologies SAS
Original Assignee
Institut National de la Recherche Agronomique INRA
LFB Biotechnologies SAS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
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Publication date
Application filed by Institut National de la Recherche Agronomique INRA, LFB Biotechnologies SAS filed Critical Institut National de la Recherche Agronomique INRA
Publication of EP2329273A1 publication Critical patent/EP2329273A1/en
Withdrawn legal-status Critical Current

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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/10Cells modified by introduction of foreign genetic material
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • G01N33/6896Neurological disorders, e.g. Alzheimer's disease
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/67General methods for enhancing the expression
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
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    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/28Neurological disorders
    • G01N2800/2814Dementia; Cognitive disorders
    • G01N2800/2828Prion diseases

Definitions

  • the present invention relates to a cell clone derived from the MovS6 line expressing a PrP prion protein and capable of supporting the replication or propagation of the PrPsc pathological form of said PrP, as well as its application, in particular to an evaluation method and / or in vitro control of the effectiveness of a process for obtaining or treating a biological product or a method of evaluation and / or in vitro control of a decontamination procedure or an evaluation method or screening of compounds with an activity modulating the infectivity associated with "unconventional transmissible agents" ATNC.
  • TSEs Transmissible spongiform encephalopathies
  • CJD central nervous system
  • NCTA unconventional transmissible agents
  • PrPsc This abnormal pathological form of PrP, called PrPsc, is co-purified with infectivity and its accumulation precedes the appearance of histological lesions. It results from a modification of the conformation of the prion protein PrP. There has been no evidence of altering the expression of the gene encoding PrP or altering its translation (Prusiner, Biochemistry 1992; 31: 12277-88).
  • NCTAs prevents the use of inactivation processes conventionally used, such as the Tween-TNBP solvent / detergent treatment, which have proved their effectiveness in reducing the viral load of blood derivatives.
  • inactivation processes conventionally used such as the Tween-TNBP solvent / detergent treatment
  • cryoprecipitable plasma proteins factor VIII, von Willebrand factor, etc.
  • plasma coagulation proteins Since obtaining or processing biological products, such as plasma coagulation proteins, must incorporate viral elimination / inactivation steps for therapeutic use, the blood-derived pharmaceutical industry seeks today to evaluate the theoretical risk of transmission of variant CJD by blood products.
  • the method of titration of the NCTI-related infectious disease conventionally used uses an in vivo titration method in golden hamster, by intracerebral injection of different dilutions of a product to be tested charged with NCTA.
  • an infectious titer Depending on the number of affected animals in the different groups corresponding to the dilutions made, one can calculate an infectious titer and establish the reduction factor of a given method from an untreated reference.
  • this method has the disadvantage of being long (about one year), expensive and not compatible with a development on an industrial scale which we want to quickly know the effectiveness vis-à-vis the elimination of the prion.
  • PrPsc pathological protein
  • PrP normal protein
  • PMCA Protein misfolding cyclic amplification
  • WO 2005/022148 discloses an in vitro titration method, called "tissue culture infectivity assay” (TCIA), of an ATNC in a biological product, by means of bringing into contact stable transgenic cells supporting replication said ATNC with the biological product, and then culturing these cells during one or more passages to amplify the amount of ATNC present in the biological product by replicating the ATNC.
  • TCIA involves contacting successive dilutions of an infectious homogenate (e.g., scrapie strain 127-S) with cells in multi-well plate culture, 5 wells per dilution.
  • infectious homogenate e.g., scrapie strain 127-S
  • the number of positive wells is then evaluated by detection of PrPsc (indissociable marker of infectivity) after 8 to 10 passages, and the titre determined by the Spearman - Karber method. Reproducibility of titres obtained from the same infectious sample (brain homogenate) shows the feasibility of such an approach.
  • the cell line used in this in vitro assay method the MovS6 line, consists of a heterogeneous population of cells. Eventually, this heterogeneity is likely to alter the stability of the line and consequently the reproducibility of the TCIA process.
  • the invention now provides a novel cell clone derived from the MovS6 line expressing a PrP prion protein and capable of supporting the replication or propagation of the PrPsc pathological form of said PrP, characterized in that it exhibits a stability of its production of PrPsc at least until 6 th passage, preferably over at least between the 6 th and the 100 th passage.
  • the inventors have in fact demonstrated that it is possible to have clone strongly responding to the infection and showing a PrPsc production stability, that is to say without significant variation in the level of PrPsc production.
  • the cell lysate derived from infected culture of this clone has, from 6 weeks after infection, a titre in marker of infection greater than or equal to 3 log 10 TCID 50 per million cells, preferably higher or equal to 4 log 10 TCID 50 per million cells, preferably greater than or equal to 6 log 10 TCID 50 per million cells, preferably greater than 7 log 10 TCID 50 per million cells.
  • the cell lysate of an infected culture has, from 6 weeks, a titre in marker of the infection greater than 3 log 10 TCID 50 / million cells, preferably between 4, 5 log 10 TCID 50 and 6 log 10 TCID 50 per million cells.
  • the cell lysate of an infected culture has, from 6 weeks has a marker titre of infection greater than 3 logio TCID50 per million cells, preferably between 4 , 5 logio TCID50 and 5.5 logio TCID50 per million cells.
  • the cell lysate derived from infected culture of this clone has, from 6 weeks after infection, a titre in marker of the infection greater than or equal to 2 logio units Western Blot / million of cells (uWB / million cells), preferably greater than or equal to 3 log 10 uWB / million cells.
  • the cell clone of the invention is designated MovS6-4 in the experimental results set out below, and was deposited on February 22, 2008 under number CNCM 1-3922 in the National Collection of Cultures of Microorganisms ( CNCM, Pasteur Institute, 25 rue du Dondel Roux, F-75724 Paris Cedex 15, FRANCE).
  • the invention also relates to an in vitro method for detecting and / or titrating the infectivity of an unconventional transmissible agent (ATNC) whose marker is a pathological conformation protein, in a sample, comprising the steps of: ) contacting said sample with a cell clone as described above, ii) culturing said cell clones to amplify the amount of ATC present in said sample by replicating said ATNC, iii) determining the presence and / or amount of the ATNC in the sample, the step ii) of culture being carried out during one or more passages.
  • ATNC unconventional transmissible agent
  • step (iii) comprises the following steps: a) contacting the NCTA thus amplified at the end of step ii) with a source of substrate for PrP and / or ATNC, b) incubating the reaction medium allowing the transformation of the non-pathological conformer of the PrP in pathological conformation and / or amplification of the ATNC, c) disaggregate aggregates possibly formed in step i) or ii), d) determine the presence and / or quantity of the NCTA in the sample, steps (a) to (c) constituting a cycle of operations that is repeated at least twice before step (d).
  • Another subject of the invention is an in vitro method of evaluation and / or control of a process for obtaining or treating a biological product or material likely to be contaminated by an NCTA, method wherein to said biological or material product, (A) upstream and (B) downstream of said process, a titration method as defined above, and that the two values (A) and (B) title obtained.
  • the invention also relates to an in vitro method for evaluating and / or controlling a procedure for decontaminating a biological product or a material, in which method it is applied to said biological or material product, (A) upstream and (B) downstream of said procedure, a titration method as defined above, and that the two obtained values (A) and (B) of title are compared.
  • Yet another subject of the invention is an in vitro method for evaluating a compound capable of inhibiting the infectivity of an infectious biological product, in which method is applied to said infectious biological product, (A) in the presence and (B) in the absence of said compound to be evaluated, a titration method as defined above, and in that the two obtained values (A) and (B) of title are compared.
  • Yet another subject of the invention is an in vitro method for diagnosing a transmissible spongiform encephalopathy in a human or non-human animal, comprising detecting the presence in a biological sample of said subject of a non-transmissible transmissible agent.
  • conventional (ATNC) which is a pathological conformational protein, by the method as defined above.
  • ATNC a pathological conformational protein
  • the figure is an autoradiogram showing the detection of PrPsc in the cell lysate of 13 clones (numbered 1 to 13) with PM: molecular weight indicator.
  • MovS6 line denotes a cell line expressing the PrP prion protein, derived from cell isolation made from a transgenic mouse dorsal root ganglion overexpressing the ovine PrP gene.
  • the transgenic mouse overexpressing the ovine PrP gene from which the MovS6 cell line originates is derived from a cross between a tg301 mouse overexpressing the ovine PrP gene (Vilotte et al (2001), J. Virol, Vol. 75, p5977-5984) and a prpO / 0 mouse expressing the SV40 T-tag antigen (Schwarz et al (1991), Bio Cell 73: 7-14).
  • the manufacture of the MovS6 cell line is described in Archer et al. (2004), J. Virol., P. 482-490.
  • the MovS6 cell line is a heterogeneous cell population, not only in terms of functional properties, but also biological properties. Indeed, the dorsal root ganglion from which it was isolated brings together different cell populations, including glial cells, different types of neurons, and so on.
  • the expression "cell clone derived from the MovS6 line” represents the set of daughter cells derived by cell division from a single parent cell belonging to the MovS6 line, and having a genetic inheritance identical to that of the mother cell.
  • the isolation of the clones can be done using a technique known to those skilled in the art, for example by limiting dilution or flow cytometer, this list is not limiting.
  • a "Prion Prion Protein” is usually a plasma membrane-anchored sialoglycoprotein by a phosphatidyl glycolipid (GPI), naturally occurring in cells and involved in their normal functioning.
  • GPI phosphatidyl glycolipid
  • PrP sc pathological form of PrP generally refers to an isoform of the non-pathological protein and represents the marker of prion diseases.
  • This pathological form associated with physicochemical properties to the prion protein which result notably in a greater resistance to the usual means of disinfection and sterilization (heat, chemicals, enzymes, etc.).
  • the pathological prion protein thus acquires self-aggregating abilities and can thus form deposits, especially in the brain, causing neuronal death.
  • the agent responsible for the replication or propagation of the pathological prion protein would be the pathological prion protein itself as able to "propagate or multiply" in an "exponential” manner, by deforming the healthy prion proteins into pathological prion proteins.
  • the so-called "pathological" form of PrP is therefore the form of the protein whose conformation is correlated with the appearance of an EST in the infected human or non-human animal.
  • telomeres By “capable of supporting the replication or propagation of the PrPsc pathological form of said PrP” is meant the ability of the cellular clone of the invention to produce pathological prion proteins from non-pathological prion proteins transformed into pathological proteins in the presence of NCTA.
  • the pathological form of the produced prion protein is detected in the cytosol (lysate) or in the culture supernatant. All or part of this cytosolic pathological form can be recovered in the cell lysate.
  • the "marker titre of NCTA infection” is determined by the infectivity dose in a sample that allows infection in 50% of the inoculation trials.
  • the infectivity dose is visualized by the titre of a marker of infection, for example PrP.
  • the marker titre of the infection may be determined by the titration method described in WO 04/02179.
  • the marker titre of the infection may also be determined by methods well known to those skilled in the art. For example, serial dilutions of the material to be titrated are injected intracerebrally, this at the rate of a dilution of the material per group of animals. Depending on the incubation time of the disease in each group of animals and the number of animals affected, an infective titre can be deduced from it by statistical methods known to those skilled in the art, for example, and preferably, the method. of Karber or that of Spearman-Karber.
  • marker titre stability of infection is meant an infectious agent productivity (PrPsc) that does not decay significantly over time, i.e. no significant loss of productivity can be measured .
  • a significant loss is a decrease in infectious agent productivity greater than or equal to 1 log uWB / ml.
  • a "passage” is generally the transplantation of all or part of the cells of a culture dish into another box containing new culture medium. Each passage makes it possible to control the size of a cell population and to provide a quantity of substrate adapted to its size.
  • the cell clone of the invention is characterized in that it has a stability of the title as a marker of infection by a transmissible agent.
  • unconventional NCTA at least until 6 th passage, preferably over at least between the 6 th and the 100 th passage.
  • the cell clone of the invention has a stability of the title infection marker with an NCTA until at least 7 th passage, more preferably at least up to 8 th passage, more preferably at least until at 9 th passage, more preferably at least until 10 th passage, more preferably at least until H th passage, more preferably at least until 12 th passage, more preferably at least until 13 th passage, more preferably at least until 14 th passage, more preferably at least until 22 th passage, more preferably at least until 23 th passage, more preferably at least until 45th passage, more preferably at least up to 46 th passage, more preferably at least up to 47 th passage, more preferably at least up to 48 th passage, more preferably at least up to 49 th passage, more preferably at least up to 50 th passage.
  • TID50 is meant the infectious dose which causes the infection of 50% of the inoculations tested. These doses are preferably measured using the TCIA method.
  • uWB Transverse-blot unit
  • a titre in marker of the infection greater than or equal to 2 logio units Western blot / million cells (uWB / million cells), preferably greater than or equal to 3 logio uWB / million cells is equivalent to a titre in infectivity greater than or equal to 3.5 log10, preferably greater than or equal to 5 logio TdD 5 o / ml
  • the term "ATNC” represents any unconventional transmissible agent, such as those responsible in humans for familial or sporadic CJD, Kuru disease or variant CJD, or those officials in natural TSE animals, such as ovine scrapie, bovine or feline spongiform encephalopathy, chronic wasting of deer or spongiform encephalopathy of mink, or EST strains experimentally adapted to laboratory animals .
  • the ATNC is also referred to as "infectious agent”.
  • sample means any source of material that may be contaminated by a NCTA.
  • a source of material may for example be a liquid, a food product, a beverage, a cosmetic product or a product resulting from genetic engineering, a molecule capable of modulating the infectivity of an NCTA, this list not being limiting.
  • it is a biological sample, for example a biological fluid or tissue or tissue extract.
  • tissue may be a tissue of the brain, vertebral column, or tonscillary tissue, this list not being limiting.
  • the sample may also be a composition derived from a human or animal source, such as growth hormones or cell extracts, such as pituitary extracts.
  • Such a composition can indeed be contaminated by an NCTA.
  • a biological fluid it may be blood, lymph, urine or milk, this list not being limiting.
  • the sample is a blood product or a derivative, for example a plasma derivative or a plasma protein concentrate.
  • the cell clone of the invention may advantageously be used in an in vitro method for detecting and / or assaying the infectivity of an unconventional transmissible agent (ATNC) whose marker is a pathological conformational protein, in a sample.
  • ATNC unconventional transmissible agent
  • the cell clone of the invention is contacted with the sample that may be infected with a test NCTA, or with an infectious material containing IATNC as reference material, for example extracts of brains from infected animals. by a test NCTA, or with an infectious material containing IATNC as reference material, for example extracts of brains from infected animals. by a test NCTA, or with an infectious material containing IATNC as reference material, for example extracts of brains from infected animals. by a test NCTA, or with an infectious material containing IATNC as reference material, for example extracts of brains from infected animals. by a test NCTA, or with an infectious material containing IATNC as reference material, for example extracts of brains from infected animals. by a test NCTA, or with an infectious material containing IATNC as reference material, for example extracts of brains from infected animals. by a test NCTA, or with an infectious material containing IATNC as reference material, for example extracts of brains from
  • ATNC such as a sheep prion.
  • the bringing into contact is carried out according to known methods those skilled in the art (see WO / 2005/022148 or also for example Archer et al., Journal of Virology, Jan. 2004, pp. 482-490),
  • the cell clone is then cultured for one or more passages to allow the ATNC to replicate or propagate.
  • the cell clone can be contacted with at least one dilution of the sample susceptible to be infected by the ATNC in a biologically acceptable aqueous solution, in particular with several dilutions, especially with serial dilutions or successive. These dilutions make it possible to refine the quantification of the infectivity in the sample tested.
  • the step of culturing cell clones potentially infected with the biological product is required for the replication of the ATNC, thus to amplify an insufficient amount of ATNC initially to be detected.
  • the cell cloning step ii) performed to amplify the amount of ATNC present in said biological sample by replication of the ATNC is carried out in DMEM (Dulbecco's Modified Eagle's Medium) + Ham- F12 (Life Technologies, Cergy Pontoise, France) (4: 1) supplemented with glutamine and fetal calf serum (5% final).
  • DMEM Dulbecco's Modified Eagle's Medium
  • Ham- F12 Life Technologies, Cergy Pontoise, France
  • the cells are incubated at 37 ° C. under 5% CO 2 .
  • a passage of the cells (with a ratio of re-ratio of: 1 to 10, ie 1 cell out of 10 put back in culture) is carried out every week.
  • the product resulting from the culturing of cellular clones contains PrP in its pathological form, the quantity of which is greater than the quantity initially present in the biological sample, if it contains one.
  • PrP in its pathological form and NCTA accumulate within the infected cells, and are excreted in the culture medium or exposed on the surface of the cells.
  • the cultivation step ii) can be carried out during one or more passages, for example between 2 and 10 passages, preferably between 4 and 10 passages.
  • the method may directly comprise a step of determining the presence and / or amount of prion or ATNC (step iii)), or being coupled to a contact with a source of substrate for PrP and / or NCTA.
  • Step ii) of the method of the invention may be followed by contacting the product resulting from culturing the cells with a substrate source for the non-pathological conformation of PrP and / or the ATNC amplified during step ii).
  • This source of substrate may be provided for example in the form of a product of animal origin, for example a healthy brain homogenate, or material derived from in vitro culture.
  • This material may for example be derived from cells, such as MovS, N2A (Weissmann et al., (2003), PNAS vol.100 No. 20, p1666-1 1671), Rov for example, or even yeasts, fungi, or bacteria, this list not being limiting.
  • This material derived from in vitro culture can be expressed in various cellular compartments, such as the extracellular compartment (for example the supernatant, the exosomes, this list not being limiting) and / or membrane and / or cytosolic compartments (cell lysate). for example).
  • This step serves to allow in vitro amplification PrPsc and / or the ATNC harvested during step ii) accompanying the conversion of the non-pathological form of PrP (contained in the substrate ) in pathological form, a self-conversion of the non-pathological form being theoretically impossible. PrP under its pathological form thus initiates the transformation of the non-pathological form into a pathological form.
  • the unconverted non-pathological form is not detected by the detection system, as will be explained later.
  • step (a) is followed by incubation of the cell culture product of step (ii) with a substrate source for PrP and / or ATNC for a period of time. sufficient to allow at least a portion of the proteins having a non-pathological form, to be transformed into a pathological form of the protein, and to enhance the NCTA.
  • each incubation step is carried out for a period of between 10 seconds and 4 hours, preferably between 20 minutes and 1 hour, and particularly preferably for 30 minutes.
  • the amplification medium is advantageously constituted by a buffer (PBS Ix), NaCl 15OmM, Triton 1%) supplemented with non-pathological PrP substrate (for example a volume 10 times greater than the volume of the sample to be amplified) .
  • step c) of the method of the invention consists in the disaggregation of the aggregates possibly formed during the preceding steps, so as to release the particles of PrP of pathological form so that they can convert other non-pathological proteins.
  • a solvent such as sodium dodecyl sulphate, dimethyl sulphoxide, acetonitrile, guanidine, urea, trifluoroethanol, diluted trifuroacetic acid, diluted formic acid, this list is not limiting
  • modification of the physicochemical characteristics of the solution such as pH, temperature, ionic strength, dielectric constant, as well as physical methods, such as sonication, irradiation with laser, freezing / thawing, autoclave incubation, high pressure, gentle homogenization, or other sources of irradiation, this list not being limiting.
  • sonication is used. Sonication is a method known to those skilled in the art, and often used in PrP sc purification methods, by making it possible to increase the solubility of the aggregates.
  • the disintegration is carried out for a time sufficient to allow at least a portion of the aggregates formed during the contacting of step iii) and the incubation / amplification. It is possible that not all aggregates are disaggregated when implementing a single disintegration step. In this case, the concentration of pathological proteins increases as the disintegration steps progress.
  • the duration of the disintegration step is readily determinable by those skilled in the art, and may depend on the method of disintegration chosen. Preferably, the duration of the disintegration step is between 1 second and 60 minutes, more preferably between 5 seconds and 30 minutes, and more particularly between 5 seconds and 30 seconds.
  • steps a) to c) are repeated at least twice, preferably between 5 and 100 times, preferably between 20 and 60 times.
  • This cycle of steps iii) to v) repeated between 2 and 100 times constitutes a series of amplification cycles.
  • a series can also be repeated several times. In this case, the new series will be initiated from a volume of the previous series in place of the original NCTA sample.
  • Step d) of detecting PrP pathological proteins can be carried out by any method known to those skilled in the art.
  • the specific detection of PrPsc can be carried out by a first step of separation of the two isoforms PrPc and PrPsc. This separation is carried out on the basis of the biochemical properties of PrPsc which make it possible to distinguish it from non-pathological proteins, in
  • the first step after amplification is preferably the separation of the PrPc (non-pathological soluble normal form of PrP) from the sample, which can be effected for example by means of protease treatment, for example proteinase K or by centrifugation to separate soluble forms (PrPc) from insoluble forms (PrPsc).
  • PrPc non-pathological soluble normal form of PrP
  • digestion with proteinase K is a step prior to Western Blot, because it leads to digestion mainly PrPc and little or no PrPsc. It is indeed a property of the PrPsc to be more resistant to PK compared to the PrPc. The subsequent detection step therefore no longer detects the non-pathological form of the protein because it has been digested by the protease.
  • the detection step can be carried out using the following methods: immunocytochemistry (for example by labeling cells or Facscan) or immunochemistry (as the Western blot or an ELISA test), immunoblot method after a step of SDS -PAGE, radioactivity test, fiuoresence test, electron microscopy, and turbidimetry test for aggregates, as well as structural tests including NMR (nuclear magnetic resonance), circular dichroism, Raman spectroscopy, UV absorption, a monoclonal antibody recognizing the pathological form of the protein, this list is not limiting.
  • an antibody specifically recognizing the pathological form and not the non-pathological form can itself be marked to make detection easier.
  • an antibody may be for example the antibody
  • the detection of the pathological form of PrP may be associated with a determination of the amount of PrPsc present in the sample.
  • the titration can be carried out using any titration method known to those skilled in the art. In particular, it can be performed on the model of the methods described in the documents WO2005022148 and WO2006117483 (in particular reference examples A and B).
  • the set of Western-blot results for the different dilutions and the different replicates can be analyzed by a statistical method known to those skilled in the art for establishing an infectious titer, such as the method of Spearman Karber (Schmidt NJ , Emmous RW, Diagnosis Procedures for Viral, Rickettsial and Chlaveydial Infection, 1989, 6th Edition).
  • the method of calculating the title is the method of
  • Xo logio of the reciprocal value of the lowest dilution at which all test inocula are positive.
  • d log10 of the dilution factor, also referred to as "no dilution” (i.e. the difference between log dilution intervals).
  • n number of test inocula used at each dilution.
  • R 1 number of positive inocula of test (on ni).
  • the estimated standard deviation is calculated using the following formula:
  • the method of the invention makes it possible to quantify the infectivity associated with NCTAs over a range of 4 log, that is, 10,000 infectious units in vitro. This may, for example, make it possible to satisfy the criteria for validating the efficiency of the processes for obtaining biological products with respect to the elimination of NCTAs.
  • the invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a method of evaluation and / or in vitro control of a process for obtaining or treating a biological product likely to be contaminated. by an NCTA.
  • This evaluation and / or control method is characterized in that a titration method according to the invention, as described above, is applied to the biological product, upstream and downstream of said process, and in that the we compare the two title values obtained. By comparison between the two measurements, the degree of elimination or the reduction factor of the NCTA is determined.
  • the titration method according to the invention has the capacity to be easily applicable to any type of process for obtaining or purifying biological products, in particular blood products, such as blood plasma derivatives, using for example, chromatography or nanofiltration, in particular the chromatographies described in documents EP 0 359 593 and WO 02/092632.
  • the implementation of the method of the invention makes it possible to evaluate and / or control the efficiency of a process (or a part of a process) for obtaining or treating, or even purifying of any biological product likely to be contaminated by an NCTA, in the elimination of this NCTA, by means of a titration using specific transgenic cell lines, promoting the replication of the ATNC, brought into contact with an infectious material or potentially infectious containing the ATNC to be tested.
  • the amounts of NCTA are measured upstream and downstream of the process (or part of the process) whose performance with respect to the NCTA is to be assessed. By comparing the two measurements, the degree of elimination of the pathogen is determined.
  • the implementation of the present method can be carried out during a process for obtaining a biological product or in the context of an elimination treatment of the NCTA according to obtaining the biological product.
  • the invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a method of evaluation and / or in vitro control of a procedure for decontaminating a material.
  • the ATNC titre of a biological product containing an NCTA is determined using the titration method of the invention.
  • This infected biological product is then contacted with the material to be decontaminated and the decontamination procedure is applied to this material.
  • the title of the biological product having undergone the decontamination procedure is again determined.
  • the two titration measurements performed upstream and downstream of the decontamination procedure are compared to evaluate the effectiveness of the decontamination procedure.
  • the material may, for example, be purification equipment, in particular a chromatography column, or be the sanitization of a chromatography column using sodium hydroxide.
  • the invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a selection procedure and / or method for evaluating a compound making it possible to reduce the titre of the infectious material.
  • the ATNC titre of a biological product containing an NCTA is determined using the titration method of the invention.
  • We This infected biological product is then contacted with the test compound and the title of the biological product having undergone the decontamination procedure is determined again.
  • the two titration measurements made upstream and downstream of the contacting of the sample with the test compound are compared.
  • the invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a selection procedure and / or evaluation method of a compound capable of modulating the infectivity of an ATNC.
  • the ATNC titre of a biological product containing an NCTA is determined, in the presence and then in the absence of the compound to be evaluated, by means of the titration method according to the invention.
  • the methods for bringing the compound into contact are determined according to whether the action of the compound prevents the initiation of an infectious cycle or blocks an infectious cycle already initiated. In all cases, the title of the biological product is determined with and without treatment with the product to be tested.
  • the two titration measurements performed are compared to evaluate the modulatory activity of the NCTA infectivity of the compound.
  • the invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a method of identifying a compound for modulating the transformation of the non-pathological form into the pathological form of the ATNC, for example the transformation of PrP into PrP sc .
  • the ATNC titre of a biological product containing an NCTA is determined using the titration method of the invention.
  • This infected biological product is then contacted with the test compound and the titration method of the invention is applied to again determine the title of the biological product.
  • the two titration measurements made upstream and downstream of the contact with the compound are compared to evaluate the effectiveness of the test compound.
  • the cell lysate or culture supernatant produced by the cell clone of the invention can be standardized in infectious units per dose by methods known to those skilled in the art.
  • infected cell lysate stocks can be prepared for ??
  • this cell lysate or culture supernatant may be used as an infecting inoculum for a method of evaluating and / or controlling a process for obtaining or treating a biological product that may be contaminated by an ATNC, in particular a method for purifying blood plasma derivatives, in particular still chromatographies or nanofiltration.
  • this cell lysate or culture supernatant may be used as an infecting inoculum for a method of evaluating and / or controlling a procedure for decontaminating material that may be contaminated by an NCTA.
  • this cell lysate or culture supernatant can be used as an infecting inoculum for a method for evaluating a compound that inhibits the infectivity of an NCTA.
  • the infectious material (that is to say the inoculum prepared from the cell clone of the invention) makes it possible to overcome the use of ovine or bovine brain collections infected with sheep scrapie or Bovine Spongiform Encephalopathy.
  • the infectious material can be used as an infecting inoculum in a method of evaluation and / or in vitro control of a procedure for decontaminating a material.
  • the material may, for example, be a purification material, in particular a chromato graphy column.
  • the decontamination procedure may, for example, be the sanitization of a chromato graphy column using soda.
  • the invention also relates to the use of the infective material as an infecting inoculum for a method of evaluating a compound modulating the infectivity of an NCTA.
  • the ability to modulate the infectivity of an ATNC according to the invention is tested in the presence or absence of the compound capable of modulating this infectivity the infectivity of an ATNC.
  • the invention also relates to the use of the infectious material as an infecting inoculum for a method of evaluating and / or controlling a procedure for confining infectious material, in particular a P3 procedure and equipment.
  • MovS6 cells (Archer F. et al., 2004) were selected as replication-supporting cells for ATNCs, and Scrapie 127-S strain adapted for transgenic mice.
  • Tg301 has been used as a source of natural infectivity (Vilotte JL et al., 2001).
  • the cells were cultured in DMEM / Ham F-12 (3: 1) supplemented with glutamine
  • the source of initial infectivity was a homogenate of mouse brains infected at 200 mg / ml (lot: LN-3326 under 6.17 log 10 uWB / ml).
  • the cells were brought into contact with 150 ⁇ l of the different dilutions of the inoculum for 24 hours, then 1 ml of new culture medium was added. The cells were maintained in culture for 72 additional hours, until the first passage where all the cells were re-seeded in 10 cm 2 wells (6-well plate format). When cell culture was continued, the culture medium was changed once a week and the cells were transplanted with a ratio of 1 in 10. The cells that were not started were stored at -80 ° C. in the form of a dry pellet. These cell pellets kept at each passage, allowed to search the PrPsc produced by the cells. The detection of the PrPsc produced was carried out directly by Western-blot
  • Cell pellet samples were thawed and taken up in 60 ⁇ l of PBS.
  • the cells were lysed by sonication for 15 "using a sonic bath (power: 15W) .20 ⁇ l of sonicated cell lysate were taken to be treated with Proteinase K.
  • the product of the digestion was denatured and then analyzed by polyacrylamide gel electrophoresis under denaturing conditions (SDS-PAGE). Proteins migrated in the gel were transferred to a PVDF membrane by electrotransfer.
  • the PrPsc present on the membranes was detected by incubation with the antibody 6H4 (Prionics) and then a secondary antibody labeled with alkaline phosphatase (goat antibody "anti-mouse antibody”).
  • the labeled membranes were revealed by chemiluminescence.
  • One sample was considered positive if the electrophoretic profile with the three forms of glycosylated PrPsc was visible on autoradiograms.
  • the volume of sample actually deposited in the gel track was 4.35 ⁇ l.
  • PrPsc was assayed by limiting dilution of the aliquot and Western blot analysis as described in paragraph 4.
  • the first dilution of the sample no longer showing specific PrPsc signals was considered to contain 1 Western Blot unit.
  • the titer of the sample was then calculated as the inverse of the limiting dilution, taking into account the volume of the aliquot actually deposited on the electrophoresis gel.
  • 3.10 6 cells taken up in 60 ⁇ l of PBS corresponded to 3.10 6 cell / 0.06ml or 50.10 6 cell./ml.
  • the signal observed on the track corresponding to the "undiluted" sample in the dilution range came from 4.35 ⁇ l of the cell pellet suspension taken up in PBS and undiluted either 0.22 ⁇ 10 6 cells.
  • NT Not tested In each of these titration assays, no trace of infectivity was observed in any of the replicates of cells inoculated with the uninfected brain homogenate sample (Neg. Control). Conversely increasing PrPsc production was observed with cells inoculated with the LN-3326 reference sample.
  • the LN-3326 reference homogenate sample at the titration repeats with the LC-46 lot of cells shows an average infectious titer of 6.4 log 10 TdD 5 o / ml (range 6.3 to 6.5 logio TCID 5 o / ml) .
  • the infectious titre of the reference sample measured with the two batches of cells: LC46 and LC59, shows a difference of 3.1 log. This difference is significant.
  • MovS6 used for in vitro titration.
  • the clones MovS6- 2 - 3 - 5 - 7 - 8 - 9 - 12 present a specific signal of the PrPsc of medium intensity.
  • the MovS6- 1 - 6 - 11 clones show a signal specific to the high intensity PrPsc.
  • the MovS6-4 clone shows a specific signal of the PrPsc of very strong intensity.
  • the corresponding uninfected cell aliquot (LC-82-4) was thawed and maintained in culture to form a primary library (LC-91) and 2 secondary libraries (LC-93 and LC-94).
  • PrPsc In order to evaluate the stability of PrPsc production by infected MovS6-4 cells, 5.10 5 cells aged 2 passages after thawing were seeded under 10 ml of 25 cm 2 fiask culture medium and inoculated with an inoculum. PrPsc of 3.0 logiouWB, ie with a multiplicity of infection (MOI) of 1: 500. The infected culture was maintained for 37 passages each week with a split ratio of 1: 10. At each passage, from the non-re-seeded cells, an aliquot was stored at -80 ° C.
  • MOI multiplicity of infection
  • the cells were maintained in culture for 72 additional hours, until the first passage where all the cells were re-seeded in 10 cm 2 wells (6-well plate format). When cell cultures were continued, the culture medium was changed once a week and the cells transplanted with a ratio of 1 in 10. The cells were not ensemmencées were kept at -80 0 C as a dry pellet. These cell pellets kept at each passage, allowed to search the PrPsc produced by the cells. The detection of the PrPsc produced was carried out directly by Western-blotting as described in paragraph 4 °
  • Table 6 Title (logio) of the PrPsc measured in the lysate of infected cells.
  • the reference homogenate sample LN-3326 when titrated with MovS6-4 cells showed an infectious titer of 4.7 log 10 TdD 5 / ml.
  • the infectious titre of the reference sample measured with the two cells MovS6 (lot LC-46) and MovS6-4, shows a difference of 1.7 log. This difference is significant, it confirms that the infectious titre is dependent on the cell used for in vitro titration.
  • the titration data of the reference brain homogenate sample (LN-3326) showed that the infectious titer of a sample is dependent on the MovS6 cell batch used.
  • the titration system, tissue culture infectivity assay (TCIA), performed with The oldest cells (lot: LC-59) were characterized by a loss of sensitivity compared to the titration system performed with the older cells (batch: LC-46).
  • TCIA tissue culture infectivity assay
  • the production of PrPsc declined over time since a significant loss of productivity was observed between the 6 th and 23 rd passage postinoculation .
  • Clones MovS6-l and MovS6-10 showed no PrPSc production to 6 th week after inoculation while a high production level was observed with MovS6-4 clone.
  • the cells were brought into contact with 150 ⁇ l of the different dilutions of the inoculum for 24 hours, then 1 ml of new culture medium was added. The cells were maintained in culture for an additional 72 hours, until the first passage where all of the cells were reseeded in 10 cm 2 wells (6-well plate format). During the continuation of the cell cultures, the culture medium was changed once a week and the cells were subcultured with a ratio of 1 in 10. The non-reseeded cells were stored at -80 ° C. in the form of a dry pellet. These cell pellets kept at each passage, allowed to search the PrPsc produced by the cells. The detection of the PrPsc produced was carried out directly by Western blotting as described in paragraph 4 above.
  • the titer of the reference brain homogenate sample (LN-3326) determined with the "young" MovS6 cells is not significantly different from the infectious titer determined with the "aged" MovS6-4 cells (the difference between the securities is below the difference threshold of 1 logio commonly considered as the threshold value for a significant difference).
  • the titer of the reference brain homogenate sample (LN-3326) determined with the "aged" MovS6 cells is significantly different from the infectious titer determined with the "aged" MovS6-4 cells.
  • LC-46 and LC-59 were used. These 2 lots differ only in their "age” (expressed as the number of freeze / thaw cycles and the number of cell passages before inoculation).
  • the LC-46 lot is 5 passages and a single freeze / thaw cycle while the LC-59 lot is 7 passes and 2 freeze / thaw cycles.
  • Titration data from the reference brain homogenate sample (LN-3326) showed that the infectious titer of a sample is age dependent on the MovS6 cell used.
  • the titration system TCIA ("Tissue Culture Infectivity Assay"), performed with the aged cells (batch: LC-59), was characterized by a significant loss of sensitivity compared to the titration system performed with the older cells ( lot: LC-46).
  • MovS6-4 clone unlike MovS6, is stable in particular as regards its permissiveness to infection by a prion strain.

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Abstract

The invention relates to a cell clone from the MovS6 cell line, said cell clone expressing a prion protein PrP and being capable of supporting the replication or the propagation of the pathological form PrPsc of said Prp, characterized in that it has a titer stability to at least the sixth passage in a marker for infection by a non-conventional transmissible agent (NCTA).

Description

Clone cellulaire stable exprimant un prion Stable cell clone expressing a prion
La présente invention concerne un clone cellulaire issu de la lignée MovS6 exprimant une protéine prion PrP et capable de supporter la réplication ou la propagation de la forme pathologique PrPsc de ladite PrP, ainsi que son application, notamment à une méthode d'évaluation et/ou de contrôle in vitro de l'efficacité d'un procédé d'obtention ou de traitement d'un produit biologique ou à une méthode d'évaluation et/ou de contrôle in vitro d'une procédure de décontamination ou à une méthode d'évaluation ou screening de composés dotés d'une activité modulatrice de l'infectiosité liée aux "agents transmissibles non conventionnels" ATNC.The present invention relates to a cell clone derived from the MovS6 line expressing a PrP prion protein and capable of supporting the replication or propagation of the PrPsc pathological form of said PrP, as well as its application, in particular to an evaluation method and / or in vitro control of the effectiveness of a process for obtaining or treating a biological product or a method of evaluation and / or in vitro control of a decontamination procedure or an evaluation method or screening of compounds with an activity modulating the infectivity associated with "unconventional transmissible agents" ATNC.
Etat de la technique :State of the art:
Les encéphalopathies spongiformes transmissibles (EST) regroupent un ensemble de maladies génétiques ou acquises caractérisées par une dégénérescence du système nerveux central (SNC). La forme la plus fréquente chez l'homme est la maladie de Creutzfeldt- Jakob (MCJ), mais il existe également des EST chez de nombreux mammifères (notamment la tremblante du mouton et l'encéphalopathie spongiforme bovine). L'agent étiologique de ces maladies est classé dans la catégorie des "agents transmissibles non conventionnels" (ATNC). La signature de la maladie est la présence d'une protéine extracellulaire, appelée protéine prion (PrP), qui est transformée au cours de la maladie en une forme insoluble, résistante aux protéases telles que la protéinase K, et qui s'accumule dans le système nerveux central. Cette forme anormale pathologique de la PrP, appelée PrPsc, est co-purifîée avec l'infectiosité et son accumulation précède l'apparition des lésions histologiques. Elle résulte d'une modification de la conformation de la protéine prion PrP. Il n'a pas été mis en évidence de modification de l'expression du gène codant pour Ia PrP, ni d'altération de sa traduction (Prusiner, Biochemistry 1992 ; 31 : 12277-88 ).Transmissible spongiform encephalopathies (TSEs) are groups of genetic or acquired diseases characterized by degeneration of the central nervous system (CNS). The most common form in humans is Creutzfeldt-Jakob disease (CJD), but there are also TSEs in many mammals (including scrapie and bovine spongiform encephalopathy). The etiologic agent of these diseases is classified as "unconventional transmissible agents" (NCTA). The signature of the disease is the presence of an extracellular protein, called prion protein (PrP), which is transformed during the disease into an insoluble form, resistant to proteases such as proteinase K, and which accumulates in the body. central nervous system. This abnormal pathological form of PrP, called PrPsc, is co-purified with infectivity and its accumulation precedes the appearance of histological lesions. It results from a modification of the conformation of the prion protein PrP. There has been no evidence of altering the expression of the gene encoding PrP or altering its translation (Prusiner, Biochemistry 1992; 31: 12277-88).
Les données actuellement disponibles ne permettent pas de démontrer que l'agent transmissible responsable des EST se trouve sous une forme infectante dans les dérivés sanguins (Brown et al, 2001, Semin Hematol.;38 (4 Suppl 9):2-6). Toutefois, on ne peut conclure à son absence, cette incertitude résultant, d'une part, de la probable concentration très faible dans le sang et, d'autre part, de la très longue période d'incubation cliniquement silencieuse caractéristique de ces maladies, qui précède l'apparition des signes cliniques.The data currently available do not demonstrate that the transmissible agent responsible for TSEs is in an infective form in blood derivatives (Brown et al., 2001, Semin Hematol., 38 (4 Suppl 9): 2-6). However, we can not conclude from its absence, this uncertainty resulting, on the one hand, from the probable very low concentration in the blood and, on the other hand, from the very long period of clinically silent incubation characteristic of these diseases, which precedes the appearance of clinical signs.
En outre, l'exceptionnelle résistance des ATNC empêche le recours à des procédés d'inactivation classiquement mis en œuvre, tels que le traitement solvant/détergent Tween- TNBP, qui ont fait la preuve de leur efficacité pour réduire la charge virale des dérivés sanguins, tels que les protéines cryoprécipitables du plasma (facteur VIII, facteur von Willebrand, etc.). Etant donné que l'obtention ou le traitement de produits biologiques, tels que les protéines plasmatiques de la coagulation, doit incorporer des étapes d'élimination/inactivation virales en vue d'un usage thérapeutique, l'industrie pharmaceutique des médicaments dérivés du sang cherche aujourd'hui à évaluer le risque théorique de transmission du variant de la MCJ par les produits dérivés du sang.In addition, the exceptional resistance of NCTAs prevents the use of inactivation processes conventionally used, such as the Tween-TNBP solvent / detergent treatment, which have proved their effectiveness in reducing the viral load of blood derivatives. , such as cryoprecipitable plasma proteins (factor VIII, von Willebrand factor, etc.). Since obtaining or processing biological products, such as plasma coagulation proteins, must incorporate viral elimination / inactivation steps for therapeutic use, the blood-derived pharmaceutical industry seeks today to evaluate the theoretical risk of transmission of variant CJD by blood products.
Actuellement, la méthode de titrage de l'infectiosté liée aux ATNC classiquement mise en œuvre utilise une méthode de titrage in vivo chez le hamster doré, par injection intracérébrale de différentes dilutions d'un produit à tester chargé en ATNC. Selon le nombre d'animaux atteints dans les différents groupes correspondant aux dilutions effectuées, on peut calculer un titre infectieux et établir le facteur de réduction d'un procédé donné à partir d'une référence non traitée. Cependant, cette méthode présente l'inconvénient d'être longue (environ un an), coûteuse et peu compatible avec un développement à l'échelle industrielle dont on veut connaître rapidement l'efficacité vis-à-vis de l'élimination du prion.Currently, the method of titration of the NCTI-related infectious disease conventionally used uses an in vivo titration method in golden hamster, by intracerebral injection of different dilutions of a product to be tested charged with NCTA. Depending on the number of affected animals in the different groups corresponding to the dilutions made, one can calculate an infectious titer and establish the reduction factor of a given method from an untreated reference. However, this method has the disadvantage of being long (about one year), expensive and not compatible with a development on an industrial scale which we want to quickly know the effectiveness vis-à-vis the elimination of the prion.
En outre, il est souvent nécessaire d'introduire une étape de concentration de l'agent infectieux de façon à augmenter la sensibilité des méthodes de titrage. Toutes les procédures de concentration d'agents infectieux responsables de l'EST passent aujourd'hui par une purification de la PrPsc.In addition, it is often necessary to introduce a step of concentration of the infectious agent so as to increase the sensitivity of the titration methods. All the procedures for the concentration of infectious agents responsible for the TSE now pass through PrPsc purification.
D'autres méthodes ont été proposées pour le titrage in vitro des agents infectieux des EST. Les techniques de détection de la PrPsc par Western-Blot (Mac Gregor, Transfusion J. Médecine 2001 ; 11, 3-14) ou par ELISA nécessitent généralement une digestion préalable de l'échantillon à analyser par la Protéinase K, ou une dénaturation par des agents chaotropiques pour distinguer la protéine pathologique (PrPsc) de la protéine normale (PrP).Other methods have been proposed for the in vitro titration of infectious agents of TSEs. Techniques for detecting PrPsc by Western-Blot (Mac Gregor, Transfusion J. Medicine 2001; 11, 3-14) or by ELISA generally require prior digestion of the sample to be analyzed by Proteinase K, or denaturation by chaotropic agents to distinguish the pathological protein (PrPsc) from the normal protein (PrP).
Une autre méthode de titrage a récemment été développée basée sur l'utilisation des anticorps spécifiques de la PrPsc ne reconnaissant pas la PrP (Korth et al, Nature 1997 Nov6, 390 (6655) : 74-7).Another assay method has recently been developed based on the use of PrPsc-specific antibodies not recognizing PrP (Korth et al, Nature 1997 Nov6, 390 (6655): 74-7).
Le brevet US 6,150,583 décrit quant à lui la production d'animaux transgéniques exprimant une PrP marquée par un épitope hétérologue exposé ou non à la surface de la protéine prion, selon la conformation de cette dernière.US Pat. No. 6,150,583 for its part describes the production of transgenic animals expressing a PrP labeled with a heterologous epitope exposed or not on the surface of the prion protein, according to the conformation of the latter.
Le procédé appelé « PMCA » (Protein misfolding cyclic amplification), décrit dans le document Saborio et al. (Nature ; 2001, 411, 810-3) prévoit la mise en contact de formes pathologiques provenant d'un tissu ou d'un fluide issu d'un animal contaminé avec une forme non pathologique de la protéine d'ATNC, afin de convertir cette dernière en une forme pathologique. La méthode de la PMCA, bien qu'encore en développement, s'avère au moins aussi sensible que le bioessai. Néanmoins elle ne fournit aucune preuve sur l'infectiosité de la PrPsc détectée et s'avère difficile à mettre en oeuvre avec des matrices plasmatiques. En outre il a été rapporté une reproductibilité incertaine et des résultats faussement positifs.The process called "PMCA" (Protein misfolding cyclic amplification), described in the document Saborio et al. (Nature, 2001, 411, 810-3) provides for contacting pathological forms from tissue or fluid from a contaminated animal with non-pathological form of ATNC protein to convert the latter in a pathological form. The PMCA method, although still in development, is at least as sensitive as the bioassay. Nevertheless, it provides no evidence on the infectivity of the PrPsc detected and is difficult to implement with plasma matrices. In addition, unreliable reproducibility and false positive results have been reported.
Le document WO 2005/022148 décrit une méthode de titrage in vitro, appelée « TCIA » ("tissue culture infectivity assay"), d'un ATNC dans un produit biologique, au moyen de la mise en contact de cellules transgéniques stables supportant la réplication dudit ATNC avec le produit biologique, puis la culture de ces cellules pendant un ou plusieurs passages pour amplifier la quantité d'ATNC présente dans le produit biologique par réplication de l'ATNC. Plus précisément, le TCIA consiste à mettre en contact des dilutions successives d'un homogénat infectieux (par exemple la souche de tremblante 127-S) avec des cellules en culture sur plaque multi-puits, à raison de 5 puits par dilution. Le nombre de puits positifs est alors évalué par détection de la PrPsc (marqueur indissociable de l'infectiosité) au bout de 8 à 10 passages, et le titre déterminé par la méthode de Spearman - Karber. La reproductibilité des titres obtenus à partir d'un même échantillon infectieux (homogénat de cerveau) montre la faisabilité d'une telle approche. Toutefois, la lignée cellulaire utilisée dans cette méthode de titrage in vitro, la lignée MovS6, est constituée d'une population hétérogène de cellules. A terme, cette hétérogénéité est susceptible d'altérer la stabilité de la lignée et par voie de conséquence la reproductibilité du procédé TCIA.WO 2005/022148 discloses an in vitro titration method, called "tissue culture infectivity assay" (TCIA), of an ATNC in a biological product, by means of bringing into contact stable transgenic cells supporting replication said ATNC with the biological product, and then culturing these cells during one or more passages to amplify the amount of ATNC present in the biological product by replicating the ATNC. Specifically, TCIA involves contacting successive dilutions of an infectious homogenate (e.g., scrapie strain 127-S) with cells in multi-well plate culture, 5 wells per dilution. The number of positive wells is then evaluated by detection of PrPsc (indissociable marker of infectivity) after 8 to 10 passages, and the titre determined by the Spearman - Karber method. Reproducibility of titres obtained from the same infectious sample (brain homogenate) shows the feasibility of such an approach. However, the cell line used in this in vitro assay method, the MovS6 line, consists of a heterogeneous population of cells. Eventually, this heterogeneity is likely to alter the stability of the line and consequently the reproducibility of the TCIA process.
II existe donc encore un fort besoin de disposer d'un ou plusieurs clones stables issus de la lignée MovS6 afin d'améliorer la stabilité du procédé TCIA dans le temps.There is therefore still a strong need to have one or more stable clones from the MovS6 line to improve the stability of the TCIA process over time.
Résumé de l'invention :Summary of the invention
L'invention fournit maintenant un nouveau clone cellulaire issu de la lignée MovS6 exprimant une protéine prion PrP et capable de supporter la réplication ou la propagation de la forme pathologique PrPsc de ladite PrP, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité de sa production de PrPsc au moins jusqu'au 6eme passage, de préférence sur une période au moins comprise entre le 6eme et le 100eme passage.The invention now provides a novel cell clone derived from the MovS6 line expressing a PrP prion protein and capable of supporting the replication or propagation of the PrPsc pathological form of said PrP, characterized in that it exhibits a stability of its production of PrPsc at least until 6 th passage, preferably over at least between the 6 th and the 100 th passage.
Les inventeurs ont en effet en mis en évidence qu'il est possible de disposer de clone répondant fortement à l'infection et montrant une stabilité de production de PrPsc, c'est-à- dire sans variation significative du niveau de production de PrPsc.The inventors have in fact demonstrated that it is possible to have clone strongly responding to the infection and showing a PrPsc production stability, that is to say without significant variation in the level of PrPsc production.
De préférence, le lysat cellulaire issu de culture infectée de ce clone, possède, à partir de 6 semaines après l'infection, un titre en marqueur de l'infection supérieur ou égal à 3 logio TCID50 par million de cellules, de préférence supérieur ou égal à 4 logio TCID50 par million de cellules, de préférence supérieur ou égal à 6 logio TCID50 par million de cellules, de préférence supérieur à 7 logio TCID50 par million de cellules. Dans un mode de réalisation particulier de l'invention, le lysat cellulaire d'une culture infectée possède, à partir de 6 semaines un titre en marqueur de l'infection supérieur à 3 logio TCID50/millions de cellules, de préférence compris entre 4,5 log10 TCID50 et 6 log10 TCID50 par million de cellules.Preferably, the cell lysate derived from infected culture of this clone, has, from 6 weeks after infection, a titre in marker of infection greater than or equal to 3 log 10 TCID 50 per million cells, preferably higher or equal to 4 log 10 TCID 50 per million cells, preferably greater than or equal to 6 log 10 TCID 50 per million cells, preferably greater than 7 log 10 TCID 50 per million cells. In a particular embodiment of the invention, the cell lysate of an infected culture has, from 6 weeks, a titre in marker of the infection greater than 3 log 10 TCID 50 / million cells, preferably between 4, 5 log 10 TCID 50 and 6 log 10 TCID 50 per million cells.
Dans un mode de réalisation particulier de l'invention, le lysat cellulaire d'une culture infectée possède, à partir de 6 semaines possède un titre en marqueur de l'infection supérieur à 3 logio TCID50 par million de cellules, de préférence compris entre 4,5 logio TCID50 et 5,5 logio TCID50 par million de cellules.In a particular embodiment of the invention, the cell lysate of an infected culture has, from 6 weeks has a marker titre of infection greater than 3 logio TCID50 per million cells, preferably between 4 , 5 logio TCID50 and 5.5 logio TCID50 per million cells.
Dans un autre mode de réalisation, le lysat cellulaire issu de culture infectée de ce clone, possède, à partir de 6 semaines après l'infection, un titre en marqueur de l'infection supérieur ou égal à 2 logio unités Western Blot/million de cellules (uWB/million de cellules), de préférence supérieur ou égal à 3 logio uWB/million de cellules.In another embodiment, the cell lysate derived from infected culture of this clone, has, from 6 weeks after infection, a titre in marker of the infection greater than or equal to 2 logio units Western Blot / million of cells (uWB / million cells), preferably greater than or equal to 3 log 10 uWB / million cells.
De manière particulièrement préférée, le clone cellulaire de l'invention est désigné MovS6- 4 dans les résultats expérimentaux exposés ci-dessous, et a été déposé le 22 février 2008 sous le numéro CNCM 1-3922 à la Collection Nationale de Cultures des Microorganismes (CNCM, Institut Pasteur, 25 rue du Docteur Roux, F-75724 Paris Cedex 15, FRANCE).Particularly preferably, the cell clone of the invention is designated MovS6-4 in the experimental results set out below, and was deposited on February 22, 2008 under number CNCM 1-3922 in the National Collection of Cultures of Microorganisms ( CNCM, Pasteur Institute, 25 rue du Docteur Roux, F-75724 Paris Cedex 15, FRANCE).
L'invention vise également une méthode in vitro de détection et/ou titrage de l'infectiosité d'un agent transmissible non conventionnel (ATNC) dont le marqueur est une protéine de conformation pathologique, dans un échantillon, comportant les étapes consistant à : i) mettre ledit échantillon en contact avec un clone cellulaire tel que décrit ci-dessus, ii) cultiver lesdits clones cellulaires pour amplifier la quantité dATNC présente dans ledit échantillon par réplication dudit ATNC, iii) déterminer la présence et/ou la quantité de l'ATNC dans l'échantillon, l'étape ii) de culture étant réalisée pendant un ou plusieurs passages.The invention also relates to an in vitro method for detecting and / or titrating the infectivity of an unconventional transmissible agent (ATNC) whose marker is a pathological conformation protein, in a sample, comprising the steps of: ) contacting said sample with a cell clone as described above, ii) culturing said cell clones to amplify the amount of ATC present in said sample by replicating said ATNC, iii) determining the presence and / or amount of the ATNC in the sample, the step ii) of culture being carried out during one or more passages.
Avantageusement, l'étape (iii) comporte les étapes suivantes : a) mettre en contact l'ATNC ainsi amplifié à l'issue de l'étape ii) avec une source de substrat pour la PrP et / ou l'ATNC, b) incuber le milieu réactionnel permettant la transformation du conformère non pathologique de la PrP en conformère pathologique et/ou l'amplification de l'ATNC, c) désagréger les agrégats éventuellement formés lors de l'étape i) ou ii), d) déterminer la présence et/ou la quantité de l'ATNC dans l'échantillon, les étapes (a) à (c) constituant un cycle d'opérations qui est répété au moins deux fois avant l'étape (d).Advantageously, step (iii) comprises the following steps: a) contacting the NCTA thus amplified at the end of step ii) with a source of substrate for PrP and / or ATNC, b) incubating the reaction medium allowing the transformation of the non-pathological conformer of the PrP in pathological conformation and / or amplification of the ATNC, c) disaggregate aggregates possibly formed in step i) or ii), d) determine the presence and / or quantity of the NCTA in the sample, steps (a) to (c) constituting a cycle of operations that is repeated at least twice before step (d).
Un autre objet de l'invention est une méthode in vitro d'évaluation et/ou de contrôle d'un procédé d'obtention ou de traitement d'un produit biologique ou d'un matériel susceptible d'être contaminé par un ATNC, méthode dans laquelle on applique audit produit biologique ou matériel, (A) en amont et (B) en aval dudit procédé, une méthode de titrage telle que définie ci-dessus, et en ce que l'on compare les deux valeurs (A) et (B) de titre obtenues.Another subject of the invention is an in vitro method of evaluation and / or control of a process for obtaining or treating a biological product or material likely to be contaminated by an NCTA, method wherein to said biological or material product, (A) upstream and (B) downstream of said process, a titration method as defined above, and that the two values (A) and (B) title obtained.
L'invention vise également une méthode in vitro d'évaluation et/ou de contrôle d'une procédure de décontamination d'un produit biologique ou d'un matériel, méthode dans laquelle on applique audit produit biologique ou matériel, (A) en amont et (B) en aval de ladite procédure, une méthode de titrage telle que définie ci-dessus, et en ce que l'on compare les deux valeurs (A) et (B) de titre obtenues.The invention also relates to an in vitro method for evaluating and / or controlling a procedure for decontaminating a biological product or a material, in which method it is applied to said biological or material product, (A) upstream and (B) downstream of said procedure, a titration method as defined above, and that the two obtained values (A) and (B) of title are compared.
Encore un autre objet de l'invention est une méthode in vitro d'évaluation d'un composé susceptible d'inhiber l'infectiosité d'un produit biologique infectieux, méthode dans laquelle on applique audit produit biologique infectieux, (A) en présence et (B) en absence dudit composé à évaluer, une méthode de titrage telle que définie ci-dessus, et en ce que l'on compare les deux valeurs (A) et (B) de titre obtenues.Yet another subject of the invention is an in vitro method for evaluating a compound capable of inhibiting the infectivity of an infectious biological product, in which method is applied to said infectious biological product, (A) in the presence and (B) in the absence of said compound to be evaluated, a titration method as defined above, and in that the two obtained values (A) and (B) of title are compared.
Encore un autre objet de l'invention est une méthode in vitro de diagnostic d'une encéphalopathie spongiforme transmissible chez un sujet humain ou animal non-humain, comprenant la détection de la présence dans un échantillon biologique dudit sujet, d'un agent transmissible non conventionnel (ATNC) qui est une protéine de conformation pathologique , par la méthode telle que définie ci-dessus. Le clone cellulaire de l'invention permet la production stable dans le temps et d'un matériel infectieux synthétique et standardisé de type prion, immédiatement disponible puisqu'il a été détecté dans le cytosol (lysat) et dans le surnageant de culture infectée.Yet another subject of the invention is an in vitro method for diagnosing a transmissible spongiform encephalopathy in a human or non-human animal, comprising detecting the presence in a biological sample of said subject of a non-transmissible transmissible agent. conventional (ATNC) which is a pathological conformational protein, by the method as defined above. The cell clone of the invention allows the stable production over time and a synthetic and standardized infectious material of the prion type, immediately available since it has been detected in the cytosol (lysate) and in the infected culture supernatant.
Légende de la Figure :Legend of the Figure:
La figure est un autoradiogramme montrant la détection de la PrPsc dans le lysat cellulaire de 13 clones (numérotés de 1 à 13) avec PM : indicateur de poids moléculaire.The figure is an autoradiogram showing the detection of PrPsc in the cell lysate of 13 clones (numbered 1 to 13) with PM: molecular weight indicator.
Description détaillée de l'invention :Detailed description of the invention
DéfinitionsDefinitions
Par « lignée MovS6 », on désigne une lignée cellulaire exprimant la protéine prion PrP, provenant d'un isolement de cellules réalisé à partir d'un ganglion de racine dorsale de souris transgénique sur-exprimant le gène de la PrP ovine. La souris transgénique surexprimant le gène de la PrP ovine dont provient la lignée cellulaire MovS6 est issue d'un croisement entre une souris tg301 sur-exprimant le gène de la PrP ovine (Vilotte et al. (2001), J. Virol. Vol. 75, p5977-5984) et une souris prpO/0 exprimant l'antigène T (Tag) du SV40 (Schwarz et al. (1991), Bio CeIl vol. 73 :7-14). La fabrication de la lignée cellulaire MovS6 est décrite dans le document Archer et al. (2004), J. Virol., p. 482-490. La lignée cellulaire MovS6 est une population hétérogène de cellules, non seulement en terme de propriétés fonctionnelles, mais aussi de propriétés biologiques. En effet, le ganglion de la racine dorsale à partir duquel elle a été isolé réunit des populations cellulaires différentes, notamment des cellules gliales, différents types de neurones, etc.The term "MovS6 line" denotes a cell line expressing the PrP prion protein, derived from cell isolation made from a transgenic mouse dorsal root ganglion overexpressing the ovine PrP gene. The transgenic mouse overexpressing the ovine PrP gene from which the MovS6 cell line originates is derived from a cross between a tg301 mouse overexpressing the ovine PrP gene (Vilotte et al (2001), J. Virol, Vol. 75, p5977-5984) and a prpO / 0 mouse expressing the SV40 T-tag antigen (Schwarz et al (1991), Bio Cell 73: 7-14). The manufacture of the MovS6 cell line is described in Archer et al. (2004), J. Virol., P. 482-490. The MovS6 cell line is a heterogeneous cell population, not only in terms of functional properties, but also biological properties. Indeed, the dorsal root ganglion from which it was isolated brings together different cell populations, including glial cells, different types of neurons, and so on.
Dans le cadre de l'invention, l'expression « clone cellulaire issu de la lignée MovS6 » représente l'ensemble des cellules filles dérivées par divisions cellulaires d'une cellule mère unique appartenant à la lignée MovS6, et possédant un patrimoine génétique identique à celui de la cellule mère. L'isolement des clones peut se faire au moyen d'une technique connue de l'homme du métier, par exemple par dilution limite ou en cytomètre en flux, cette liste n'étant pas limitative.In the context of the invention, the expression "cell clone derived from the MovS6 line" represents the set of daughter cells derived by cell division from a single parent cell belonging to the MovS6 line, and having a genetic inheritance identical to that of the mother cell. The isolation of the clones can be done using a technique known to those skilled in the art, for example by limiting dilution or flow cytometer, this list is not limiting.
Une « protéine prion PrP » est généralement une sialoglycoprotéine ancrée à la membrane plasmique par un phosphatidyl glycolipide (GPI), présente à l'état naturel dans les cellules et impliquée dans leur fonctionnement normal. La forme normale de la protéine, c'est-à- dire non pathologique, est généralement appelée Prpc. Elle est impliquée dans le développement du système nerveux chez l'embryon. Chez l'adulte, elle est exprimée essentiellement dans le cerveau et la moelle épinière (neurones et glie). Elle est impliquée dans les processus de différenciation et d'adhésion des cellules. Elle aurait aussi un rôle protecteur antioxydant et vis-à-vis de la mort cellulaire programmée (apoptose). Cette protéine aurait également un rôle dans le repliement d'autres protéines.A "Prion Prion Protein" is usually a plasma membrane-anchored sialoglycoprotein by a phosphatidyl glycolipid (GPI), naturally occurring in cells and involved in their normal functioning. The normal form of the protein, i.e. non-pathological, is generally called Prpc. It is involved in the development of the nervous system in the embryo. In adults, it is expressed primarily in the brain and spinal cord (neurons and glia). It is involved in the processes of cell differentiation and adhesion. It would also have an antioxidant protective role and vis-à-vis programmed cell death (apoptosis). This protein also has a role in the folding of other proteins.
La « forme pathologique PrPsc de la PrP » désigne généralement un isoforme de la protéine non pathologique et représente le marqueur des maladies à prions. Cette forme pathologique, associée à des propriétés physico-chimiques à la protéine prion qui se traduisent notamment par une plus -grande résistance aux moyens de désinfection et de stérilisation habituels (chaleur, produits chimiques, enzymes, etc). La protéine prion pathologique acquiert ainsi des capacités d'auto-agrégation et peut ainsi former des dépôts, notamment dans le cerveau, provoquant la mort neuronale. L'agent responsable de la réplication ou propagation de la protéine prion pathologique serait la protéine prion pathologique elle-même car capable de se « propager ou multiplier » de façon « exponentielle », en déformant les protéines prion saines en protéines prion pathologique. La forme dite « pathologique » de la PrP, est donc la forme de la protéine dont la conformation est corrélée à l'apparition d'une EST chez l'animal humain ou non-humain infecté.The "PrP sc pathological form of PrP" generally refers to an isoform of the non-pathological protein and represents the marker of prion diseases. This pathological form, associated with physicochemical properties to the prion protein which result notably in a greater resistance to the usual means of disinfection and sterilization (heat, chemicals, enzymes, etc.). The pathological prion protein thus acquires self-aggregating abilities and can thus form deposits, especially in the brain, causing neuronal death. The agent responsible for the replication or propagation of the pathological prion protein would be the pathological prion protein itself as able to "propagate or multiply" in an "exponential" manner, by deforming the healthy prion proteins into pathological prion proteins. The so-called "pathological" form of PrP is therefore the form of the protein whose conformation is correlated with the appearance of an EST in the infected human or non-human animal.
Par « capable de supporter la réplication ou la propagation de la forme pathologique PrPsc de ladite PrP » on désigne la faculté du clone cellulaire de l'invention de produire des protéines prion pathologiques à partir de protéines prion non pathologiques, transformées en protéines pathologiques en présence de l'ATNC. La forme pathologique de la protéine prion produite est détectée dans le cytosol (lysat) ou dans le surnageant de culture. Tout ou partie de cette forme pathologique cytosolique peut être récupérée dans le lysat cellulaire.By "capable of supporting the replication or propagation of the PrPsc pathological form of said PrP" is meant the ability of the cellular clone of the invention to produce pathological prion proteins from non-pathological prion proteins transformed into pathological proteins in the presence of NCTA. The pathological form of the produced prion protein is detected in the cytosol (lysate) or in the culture supernatant. All or part of this cytosolic pathological form can be recovered in the cell lysate.
Le « titre en marqueur de l'infection par un ATNC » est déterminé par la dose d'infectiosité dans un échantillon qui permet l'infection dans 50% des essais d'inoculation. La dose d'infectiosité est visualisée par le titre d'un marqueur de l'infection, par exemple la PrP. Le titre en marqueur de l'infection peut être déterminé par la méthode de titrage décrite dans le document WO 04/02179.The "marker titre of NCTA infection" is determined by the infectivity dose in a sample that allows infection in 50% of the inoculation trials. The infectivity dose is visualized by the titre of a marker of infection, for example PrP. The marker titre of the infection may be determined by the titration method described in WO 04/02179.
Le titre en marqueur de l'infection peut également être déterminé par des méthodes bien connues de l'homme du métier. Par exemple, des dilutions sériées du matériel à titrer sont injectées par voie intracérébrale, ceci à raison d'une dilution du matériel par groupe d'animaux. Suivant le temps d'incubation de la maladie dans chaque groupe d'animaux et le nombre d'animaux atteints, on peut en déduire un titre infectieux par des méthodes statistiques connues de l'homme du métier, comme par exemple et de préférence la méthode de Karber ou encore celle de Spearman-Karber.The marker titre of the infection may also be determined by methods well known to those skilled in the art. For example, serial dilutions of the material to be titrated are injected intracerebrally, this at the rate of a dilution of the material per group of animals. Depending on the incubation time of the disease in each group of animals and the number of animals affected, an infective titre can be deduced from it by statistical methods known to those skilled in the art, for example, and preferably, the method. of Karber or that of Spearman-Karber.
Par « stabilité du titre en marqueur de l'infection » on désigne une productivité en agent infectieux (PrPsc) qui ne décline pas signifîcativement au cours du temps, c'est-à-dire qu'aucune perte significative de productivité ne peut être mesurée. Une perte significative est une diminution de la productivité en agent infectieux supérieure ou égale à 1 logio uWB/ml.By "marker titre stability of infection" is meant an infectious agent productivity (PrPsc) that does not decay significantly over time, i.e. no significant loss of productivity can be measured . A significant loss is a decrease in infectious agent productivity greater than or equal to 1 log uWB / ml.
Un "passage" est généralement le repiquage de tout ou partie des cellules d'une boîte de culture dans une autre boîte contenant du milieu de culture neuf. Chaque passage permet contrôler l'effectif d'une population cellulaire et de lui fournir une quantité de substrat adaptée à son effectif.A "passage" is generally the transplantation of all or part of the cells of a culture dish into another box containing new culture medium. Each passage makes it possible to control the size of a cell population and to provide a quantity of substrate adapted to its size.
Dans un mode réalisation particulier, le clone cellulaire de l'invention est caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 6eme passage, de préférence sur une période au moins comprise entre le 6eme et le 100eme passage. De préférence le clone cellulaire de l'invention présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un ATNC au moins jusqu'au 7eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 8eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 9eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 10eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au Heme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 12eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 13eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 14eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 22eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 23eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 45eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 46eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 47eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 48eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 49eme passage, de préférence encore au moins jusqu'au 50eme passage.In a particular embodiment, the cell clone of the invention is characterized in that it has a stability of the title as a marker of infection by a transmissible agent. unconventional (NCTA) at least until 6 th passage, preferably over at least between the 6 th and the 100 th passage. Preferably the cell clone of the invention has a stability of the title infection marker with an NCTA until at least 7 th passage, more preferably at least up to 8 th passage, more preferably at least until at 9 th passage, more preferably at least until 10 th passage, more preferably at least until H th passage, more preferably at least until 12 th passage, more preferably at least until 13 th passage, more preferably at least until 14 th passage, more preferably at least until 22 th passage, more preferably at least until 23 th passage, more preferably at least until 45th passage, more preferably at least up to 46 th passage, more preferably at least up to 47 th passage, more preferably at least up to 48 th passage, more preferably at least up to 49 th passage, more preferably at least up to 50 th passage.
Par « TCID50» on désigne la dose infectieuse qui entraine l'infection de 50% des inoculations testées. Ces doses sont mesurées préférentiellement au moyen du procédé TCIA.By "TCID50" is meant the infectious dose which causes the infection of 50% of the inoculations tested. These doses are preferably measured using the TCIA method.
Par « uWB» (Unité Western-blot) on désigne une quantité de PrPsc détectable par Western- blot.By "uWB" (Western-blot unit) is meant an amount of PrPsc detectable by Western blotting.
Généralement, il existe une différence de sensibilité entre les méthodes de titrage par Western-blot et par TCIA. Compte -tenu de cette différence, un titre en marqueur de l'infection supérieur ou égal à 2 logio unités Western Blot/million de cellules (uWB/million de cellules), de préférence supérieur ou égal à 3 logio uWB/million de cellules est équivalent à un titre en infectiosité supérieur ou égal 3.5 loglO, de préférence supérieur ou égal à 5 logio TdD5o/mlGenerally, there is a difference in sensitivity between Western-blot and TCIA titration methods. Considering this difference, a titre in marker of the infection greater than or equal to 2 logio units Western blot / million cells (uWB / million cells), preferably greater than or equal to 3 logio uWB / million cells is equivalent to a titre in infectivity greater than or equal to 3.5 log10, preferably greater than or equal to 5 logio TdD 5 o / ml
Dans le cadre de l'invention, le terme "ATNC" représente tout agent transmissible non conventionnel, tels que ceux responsables chez l'être humain de la MCJ familiale ou sporadique, de la maladie du Kuru ou du variant MCJ, ou bien encore ceux responsables chez les animaux d'EST naturelles, telles que la tremblante ovine, l'encéphalopathie spongiforme bovine ou féline, le dépérissement chronique des cervidés ou l'encéphalopathie spongiforme du vison, ou enfin de souches d'EST expérimentalement adaptées à l'animal de laboratoire. Dans le contexte de l'invention, l'ATNC est également désigné par le terme «agent infectieux ».In the context of the invention, the term "ATNC" represents any unconventional transmissible agent, such as those responsible in humans for familial or sporadic CJD, Kuru disease or variant CJD, or those officials in natural TSE animals, such as ovine scrapie, bovine or feline spongiform encephalopathy, chronic wasting of deer or spongiform encephalopathy of mink, or EST strains experimentally adapted to laboratory animals . In the context of the invention, the ATNC is also referred to as "infectious agent".
Par « échantillon», on désigne toute source de matière susceptible d'être contaminée par un ATNC. Une telle source de matière peut par exemple être un liquide, un produit alimentaire, une boisson, un produit cosmétique ou un produit issu du génie génétique, une molécule susceptible de moduler l'infectiosité d'un ATNC, cette liste n'étant pas limitative. De préférence il s'agit d'un échantillon biologique, par exemple un liquide biologique ou un tissu ou extrait de tissu. Un tel tissu peut être un tissu du cerveau, de colonne vertébrale, ou tissu tonscillaire, cette liste n'étant pas limitative. L'échantillon peut également être une composition dérivée d'une source humaine ou animale, comme les hormones de croissance ou les extraits cellulaires, comme les extraits pituitaires. Une telle composition peut en effet être contaminée par un ATNC. Dans le cas d'un liquide biologique, celui-ci peut être le sang, la lymphe, l'urine ou le lait, cette liste n'étant pas limitative. De manière préférentielle, l'échantillon est un produit sanguin ou un dérivé, par exemple un dérivé plasmatique ou un concentré de protéine plasmatique."Sample" means any source of material that may be contaminated by a NCTA. Such a source of material may for example be a liquid, a food product, a beverage, a cosmetic product or a product resulting from genetic engineering, a molecule capable of modulating the infectivity of an NCTA, this list not being limiting. . Preferably it is a biological sample, for example a biological fluid or tissue or tissue extract. Such a tissue may be a tissue of the brain, vertebral column, or tonscillary tissue, this list not being limiting. The sample may also be a composition derived from a human or animal source, such as growth hormones or cell extracts, such as pituitary extracts. Such a composition can indeed be contaminated by an NCTA. In the case of a biological fluid, it may be blood, lymph, urine or milk, this list not being limiting. Preferably, the sample is a blood product or a derivative, for example a plasma derivative or a plasma protein concentrate.
Le clone cellulaire de l'invention peut avantageusement être mis en œuvre dans une méthode in vitro de détection et/ou de titrage de l'infectiosité d'un agent transmissible non conventionnel (ATNC) dont le marqueur est une protéine de conformation pathologique, dans un échantillon.The cell clone of the invention may advantageously be used in an in vitro method for detecting and / or assaying the infectivity of an unconventional transmissible agent (ATNC) whose marker is a pathological conformational protein, in a sample.
Mise en contact du clone cellulaire avec l'échantillon à tester :Contacting the cell clone with the test sample:
Le clone cellulaire de l'invention est mis en contact avec l'échantillon susceptible d'être infecté par un ATNC à tester, ou avec un matériel infectieux contenant IATNC en tant que matériel de référence, par exemple des extraits de cerveaux d'animaux infectés par unThe cell clone of the invention is contacted with the sample that may be infected with a test NCTA, or with an infectious material containing IATNC as reference material, for example extracts of brains from infected animals. by a
ATNC, tels qu'un prion d'ovin. La mise en contact est réalisée selon des méthodes connues de l'homme du métier (voir WO/2005/022148 ou aussi par exemple Archer et al. Journal of Virology, Jan. 2004, p. 482-490),ATNC, such as a sheep prion. The bringing into contact is carried out according to known methods those skilled in the art (see WO / 2005/022148 or also for example Archer et al., Journal of Virology, Jan. 2004, pp. 482-490),
Le clone cellulaire est ensuite cultivé pendant un ou plusieurs passages pour permettre à l'ATNC de se répliquer ou se propager.The cell clone is then cultured for one or more passages to allow the ATNC to replicate or propagate.
De manière avantageuse, le clone cellulaire peut être mis en contact avec au moins une dilution de l'échantillon susceptible d'être infecté par l'ATNC dans une solution aqueuse biologiquement acceptable, en particulier avec plusieurs dilutions, tout particulièrement avec des dilutions sériées ou successives. Ces dilutions permettent d'affiner la quantification de l'infectiosité dans l'échantillon testé.Advantageously, the cell clone can be contacted with at least one dilution of the sample susceptible to be infected by the ATNC in a biologically acceptable aqueous solution, in particular with several dilutions, especially with serial dilutions or successive. These dilutions make it possible to refine the quantification of the infectivity in the sample tested.
Plusieurs réplicats de clones peuvent être mis en contact avec la même dilution du produit biologique, afin de permettre une résolution statistique plus fine des résultats.Several replicates of clones can be brought into contact with the same dilution of the biological product, in order to allow a finer statistical resolution of the results.
Culture des clones cellulaires (étape H)) :Culture of cell clones (step H)):
L'étape de culture des clones cellulaires potentiellement infectés par le produit biologique, selon toute technique connue de l'homme du métier, est requise pour la réplication de l'ATNC, donc pour amplifier une quantité d'ATNC insuffisante initialement pour être détectée.The step of culturing cell clones potentially infected with the biological product, according to any technique known to those skilled in the art, is required for the replication of the ATNC, thus to amplify an insufficient amount of ATNC initially to be detected.
Dans un exemple de réalisation, l'étape ii) de culture des clones cellulaires effectuée pour amplifier la quantité d'ATNC présente dans ledit échantillon biologique par réplication de l'ATNC, est réalisée en milieu DMEM (Dulbecco's Modified Eagle's Médium) + Ham-F12 (Life Technologies, Cergy Pontoise, France) (4 :1) complémenté en glutamine et sérum de veau fœtal (5% final). Les cellules sont incubées à 37°C sous 5% de CO2. Un passage des cellules (avec un taux de réensemencement (split ratio) de : 1 pour 10, soit 1 cellule sur 10 remise en culture) est réalisé chaque semaine.In an exemplary embodiment, the cell cloning step ii) performed to amplify the amount of ATNC present in said biological sample by replication of the ATNC is carried out in DMEM (Dulbecco's Modified Eagle's Medium) + Ham- F12 (Life Technologies, Cergy Pontoise, France) (4: 1) supplemented with glutamine and fetal calf serum (5% final). The cells are incubated at 37 ° C. under 5% CO 2 . A passage of the cells (with a ratio of re-ratio of: 1 to 10, ie 1 cell out of 10 put back in culture) is carried out every week.
Le produit résultant de la mise en culture des clones cellulaires contient la PrP sous sa forme pathologique, dont la quantité est supérieure à la quantité initialement présente dans l'échantillon biologique, si celui-ci en contient. La PrP sous sa forme pathologique et l'ATNC s'accumulent au sein des cellules infectées, puis sont excrétés dans le milieu de culture ou exposés à la surface des cellules.The product resulting from the culturing of cellular clones contains PrP in its pathological form, the quantity of which is greater than the quantity initially present in the biological sample, if it contains one. PrP in its pathological form and NCTA accumulate within the infected cells, and are excreted in the culture medium or exposed on the surface of the cells.
L'étape ii) de culture peut être réalisée pendant un ou plusieurs passages, par exemple entre 2 et 10 passages, de préférence entre 4 et 10 passages.The cultivation step ii) can be carried out during one or more passages, for example between 2 and 10 passages, preferably between 4 and 10 passages.
Détermination de la présence et/ou de la quantité deprion ou d'ATNC (étape Hi)) :Determination of the presence and / or amount of deprion or ATNC (step Hi)):
Le procédé peut comprendre directement une étape de détermination de la présence et/ou de la quantité de prion ou d'ATNC (étape iii)), ou être couplé à une mise en contact avec une source de substrat pour la PrP et/ou l'ATNC.The method may directly comprise a step of determining the presence and / or amount of prion or ATNC (step iii)), or being coupled to a contact with a source of substrate for PrP and / or NCTA.
Mise en contact avec une source de substrat pour la PrP et /ou l'ATNC (étape a)) :Contacting a substrate source for PrP and / or ATNC (step a)):
L'étape ii) de la méthode de l'invention peut être suivie de la mise en contact du produit résultant de la mise en culture des cellules avec une source de substrat pour le conformère non-pathologique de la PrP et / ou l'ATNC amplifiés durant l'étape ii).Step ii) of the method of the invention may be followed by contacting the product resulting from culturing the cells with a substrate source for the non-pathological conformation of PrP and / or the ATNC amplified during step ii).
Cette source de substrat peut être apportée par exemple sous la forme d'un produit d'origine animale, par exemple un homogénat de cerveau sain, ou encore de matériel issu de culture in vitro. Ce matériel peut être par exemple issu de cellules, telles que MovS, N2A (Weissmann et al. (2003), PNAS vol.100 n°20 pl666-l 1671), Rov par exemple, ou encore des levures, des mycètes, ou des bactéries, cette liste n'étant pas limitative. Ce matériel issu de culture in vitro peut être exprimé dans divers compartiments cellulaires, comme le compartiment extracellulaire (par exemple le surnageant, les exosomes, cette liste n'étant pas limitative) et/ou des compartiments membranaires et/ou cytosoliques (lysat de cellules par exemple). Cette étape a pour fonction de permettre l'amplification in vitro la PrPsc et / ou de l'ATNC récolté au cours de l'étape ii) s 'accompagnant de la conversion de la forme non-pathologique de la PrP (contenue dans le substrat) en forme pathologique, une autoconversion de la forme non-pathologique étant théoriquement impossible. La PrP sous sa forme pathologique initie ainsi la transformation de la forme non-pathologique en forme pathologique.This source of substrate may be provided for example in the form of a product of animal origin, for example a healthy brain homogenate, or material derived from in vitro culture. This material may for example be derived from cells, such as MovS, N2A (Weissmann et al., (2003), PNAS vol.100 No. 20, p1666-1 1671), Rov for example, or even yeasts, fungi, or bacteria, this list not being limiting. This material derived from in vitro culture can be expressed in various cellular compartments, such as the extracellular compartment (for example the supernatant, the exosomes, this list not being limiting) and / or membrane and / or cytosolic compartments (cell lysate). for example). This step serves to allow in vitro amplification PrPsc and / or the ATNC harvested during step ii) accompanying the conversion of the non-pathological form of PrP (contained in the substrate ) in pathological form, a self-conversion of the non-pathological form being theoretically impossible. PrP under its pathological form thus initiates the transformation of the non-pathological form into a pathological form.
En fin de réaction de conversion, la forme non-pathologique non convertie n'est pas détectée par le système de détection, comme il sera expliqué plus loin.At the end of the conversion reaction, the unconverted non-pathological form is not detected by the detection system, as will be explained later.
Incubation du milieu réactionnel et/ou amplification de VATNC (étape b))Incubation of the reaction medium and / or amplification of VATNC (step b))
Dans un mode de réalisation préféré, l'étape (a) est suivie d'une incubation du produit de la culture cellulaire de l'étape (ii) avec une source de substrat pour la PrP et / ou de l'ATNC pendant une durée suffisante pour permettre à au moins une partie des protéines possédant une forme non pathologique, d'être transformée en une forme pathologique de la protéine, et à l'ATNC de s'amplifier. De préférence, chaque étape d'incubation est effectuée pendant une durée comprise entre 10 secondes et 4 heures, préférentiellement entre 20 minutes et 1 heure, et de manière particulièrement préférée pendant 30 minutes.In a preferred embodiment, step (a) is followed by incubation of the cell culture product of step (ii) with a substrate source for PrP and / or ATNC for a period of time. sufficient to allow at least a portion of the proteins having a non-pathological form, to be transformed into a pathological form of the protein, and to enhance the NCTA. Preferably, each incubation step is carried out for a period of between 10 seconds and 4 hours, preferably between 20 minutes and 1 hour, and particularly preferably for 30 minutes.
Le milieu d'amplification est avantageusement constitué d'un tampon (PBS Ix), NaCl 15OmM, Triton 1%) additionné de substrat de PrP non pathologique (par exemple d'un volume 10 fois supérieur au volume de l'échantillon à amplifier).The amplification medium is advantageously constituted by a buffer (PBS Ix), NaCl 15OmM, Triton 1%) supplemented with non-pathological PrP substrate (for example a volume 10 times greater than the volume of the sample to be amplified) .
Séparation des agrégats :Separation of aggregates:
II s'avère que les protéines converties en formes pathologiques (type PrPsc) peuvent s'agréger entre elles et aux autres particules de forme pathologique (PrPsc), empêchant la conversion d'autres protéines de forme non pathologique en forme pathologique. Ceci est un inconvénient car la méthode pourrait ainsi être ralentie par le faible nombre de « foyers de conversion » présents dans le milieu réactionnel.It turns out that the proteins converted into pathological forms (PrP sc type) can aggregate with each other and with other particles of pathological form (PrP sc ), preventing the conversion of other non-pathological form proteins into pathological form. This is a drawback because the method could thus be slowed down by the small number of "conversion foci" present in the reaction medium.
Ainsi, l'étape c) de la méthode de l'invention consiste en la désagrégation des agrégats éventuellement formés lors des étapes précédentes, de manière à libérer les particules de PrP de forme pathologique pour que celles-ci puissent convertir d'autres protéines non pathologiques.Thus, step c) of the method of the invention consists in the disaggregation of the aggregates possibly formed during the preceding steps, so as to release the particles of PrP of pathological form so that they can convert other non-pathological proteins.
De nombreuses méthodes peuvent être utilisées pour désagréger les agrégats durant l'étape c) de la méthode de l'invention. On peut citer à titre d'exemple le traitement avec un solvant (comme le dodecyl sulfate de sodium, le dimethylsulfoxide, l'acétonitrile, la guanidine, l'urée, le trifiuoroéthanol, l'acide trifuroacétique dilué, l'acide formique dilué, cette liste n'étant pas limitative), la modification des caractéristiques physico-chimiques de la solution, telles que le pH, la température, la force ionique, la constante diélectrique, ainsi que les méthodes physiques, comme la sonication, l'irradiation au laser, la congélation/décongélation, l'incubation en autoclave, la haute pression, l'homogénéisation douce, ou encore d'autres sources d'irradiation, cette liste n'étant pas limitative. Préférentiellement, on utilise la sonication. La sonication est une méthode connue de l'homme du métier, et souvent mise en œuvre dans les méthodes de purification de la PrPsc, en permettant d'augmenter la solubilité des agrégats.Many methods can be used to disaggregate aggregates during step c) of the method of the invention. By way of example, mention may be made of treatment with a solvent (such as sodium dodecyl sulphate, dimethyl sulphoxide, acetonitrile, guanidine, urea, trifluoroethanol, diluted trifuroacetic acid, diluted formic acid, this list is not limiting), modification of the physicochemical characteristics of the solution, such as pH, temperature, ionic strength, dielectric constant, as well as physical methods, such as sonication, irradiation with laser, freezing / thawing, autoclave incubation, high pressure, gentle homogenization, or other sources of irradiation, this list not being limiting. Preferably, sonication is used. Sonication is a method known to those skilled in the art, and often used in PrP sc purification methods, by making it possible to increase the solubility of the aggregates.
La désagrégation est mise en œuvre pendant un temps suffisant pour permettre à au moins une partie des agrégats formés pendant la mise en contact de l'étape iii) et l'incubation /amplification. Il est possible que tous les agrégats ne soient pas désagrégés lors de la mise en œuvre d'une seule étape de désagrégation. Dans ce cas, la concentration de protéines pathologiques augmente au fur et à mesure des étapes de désagrégation.The disintegration is carried out for a time sufficient to allow at least a portion of the aggregates formed during the contacting of step iii) and the incubation / amplification. It is possible that not all aggregates are disaggregated when implementing a single disintegration step. In this case, the concentration of pathological proteins increases as the disintegration steps progress.
La durée de l'étape de désagrégation est aisément déterminable par l'homme du métier, et elle peut dépendre de la méthode de désagrégation choisie. De manière préférentielle, la durée de l'étape de désagrégation est comprise entre 1 seconde et 60 minutes, plus préférentiellement entre 5 secondes et 30 minutes, et plus particulièrement entre 5 secondes et 30 secondes.The duration of the disintegration step is readily determinable by those skilled in the art, and may depend on the method of disintegration chosen. Preferably, the duration of the disintegration step is between 1 second and 60 minutes, more preferably between 5 seconds and 30 minutes, and more particularly between 5 seconds and 30 seconds.
Avantageusement, les étapes a) à c) sont répétées au moins 2 fois, préférentiellement entre 5 et 100 fois, de préférence entre 20 et 60 fois. Ce cycle d'étapes iii) à v) répétés entre 2 et 100 fois constitue une série de cycle d'amplifications. Une série peut également être répétée plusieurs fois. Dans ce cas, la nouvelle série sera initiée à partir d'un volume de la série précédente à la place de l'échantillon d'ATNC initial.Advantageously, steps a) to c) are repeated at least twice, preferably between 5 and 100 times, preferably between 20 and 60 times. This cycle of steps iii) to v) repeated between 2 and 100 times constitutes a series of amplification cycles. A series can also be repeated several times. In this case, the new series will be initiated from a volume of the previous series in place of the original NCTA sample.
Détection des protéines :Protein detection:
L'étape d) de détection des protéines pathologiques de PrP peut être effectuée par toute méthode connue de l'homme du métier. La détection spécifique de la PrPsc peut être réalisée par une première étape de séparation des deux isoformes PrPc et PrPsc. Cette séparation est effectuée sur la base de propriétés biochimiques de la PrPsc qui permettent de la distinguer des protéines non pathologiques, enStep d) of detecting PrP pathological proteins can be carried out by any method known to those skilled in the art. The specific detection of PrPsc can be carried out by a first step of separation of the two isoforms PrPc and PrPsc. This separation is carried out on the basis of the biochemical properties of PrPsc which make it possible to distinguish it from non-pathological proteins, in
particulier le fait que la PrPsc est résistante aux traitements à base de protéases et est moins soluble voire insoluble même en présence de détergents. Ainsi, la première étape après l'amplification est de préférence la séparation de la PrPc (forme normale soluble non pathologique de la PrP) de l'échantillon, qui peut être effectuée par exemple au moyen de traitement par protéase, par exemple la protéinase K, ou par centrifugation pour séparer les formes solubles (PrPc) des formes insolubles (PrPsc).particularly the fact that PrPsc is resistant to protease-based treatments and is less soluble or insoluble even in the presence of detergents. Thus, the first step after amplification is preferably the separation of the PrPc (non-pathological soluble normal form of PrP) from the sample, which can be effected for example by means of protease treatment, for example proteinase K or by centrifugation to separate soluble forms (PrPc) from insoluble forms (PrPsc).
Dans un mode de réalisation particulier, la digestion par la protéinase K (PK) est une étape préalable au Western Blot, car elle conduit à la digestion principalement la PrPc et pas ou peu de la PrPsc. C'est en effet une propriété de la PrPsc que d'être davantage résistante à la PK comparativement à la PrPc. L'étape de détection ultérieure ne détecte donc plus la forme non pathologique de la protéine car celle-ci a été digérée par la protéase.In a particular embodiment, digestion with proteinase K (PK) is a step prior to Western Blot, because it leads to digestion mainly PrPc and little or no PrPsc. It is indeed a property of the PrPsc to be more resistant to PK compared to the PrPc. The subsequent detection step therefore no longer detects the non-pathological form of the protein because it has been digested by the protease.
L'étape de détection peut être effectuée à l'aide des méthodes suivantes : immunocytochimie (par exemple par marquage des cellules ou Facscan) ou immunochimie (comme le Western-blot ou un test ELISA), procédé d'immunoblot après une étape de SDS-PAGE, test de radioactivité, test de fiuoresence, microscopie électronique, et test de turbidimétrie pour détecter les agrégats, ainsi que des tests structurels incluant la RMN (résonance magnétique nucléaire), le dichroïsme circulaire, la spectroscopie de Raman, l'absorption UV, un anticorps monoclonal reconnaissant la forme pathologique de la protéine, cette liste n'étant pas limitative.The detection step can be carried out using the following methods: immunocytochemistry (for example by labeling cells or Facscan) or immunochemistry (as the Western blot or an ELISA test), immunoblot method after a step of SDS -PAGE, radioactivity test, fiuoresence test, electron microscopy, and turbidimetry test for aggregates, as well as structural tests including NMR (nuclear magnetic resonance), circular dichroism, Raman spectroscopy, UV absorption, a monoclonal antibody recognizing the pathological form of the protein, this list is not limiting.
Il est également possible de détecter la forme pathologique des protéines au moyen d'un anticorps reconnaissant spécifiquement la forme pathologique et pas la forme non pathologique. Pour rendre sa détection plus aisé, cet anticorps peut être lui-même marqué pour en rendre la détection plus aisée. Un tel anticorps peut être par exemple l'anticorpsIt is also possible to detect the pathological form of the proteins by means of an antibody specifically recognizing the pathological form and not the non-pathological form. To make its detection easier, this antibody can itself be marked to make detection easier. Such an antibody may be for example the antibody
15B3 (Korth et al, 1997, Nature 1997 Nov6, 390 (6655) : 74-7). L'utilisation d'un tel anticorps est pertinent pour détecter par cytométrie de flux la protéine prion présente sur la surface des cellules infectées vivantes15B3 (Korth et al., 1997, Nature 1997 Nov6, 390 (6655): 74-7). The use of such an antibody is relevant for detecting by flow cytometry the prion protein present on the surface of living infected cells.
Titrage des ATNC :Titration of NCTAs:
La détection de la forme pathologique de la PrP peut être associée à une détermination de la quantité de PrPsc présent dans l'échantillon.The detection of the pathological form of PrP may be associated with a determination of the amount of PrPsc present in the sample.
Le titrage peut être effectué au moyen de toute méthode de titrage connue de l'homme du métier. En particulier il peut être effectué sur le modèle des méthodes décrites dans les documents WO2005022148 et WO2006117483 (notamment les exemples de référence A et B).The titration can be carried out using any titration method known to those skilled in the art. In particular, it can be performed on the model of the methods described in the documents WO2005022148 and WO2006117483 (in particular reference examples A and B).
L'ensemble des résultats de Western-blot pour les différentes dilutions et les différents réplicats peut être analysé par une méthode statistique connue de l'homme du métier permettant d'établir un titre infectieux, comme par exemple la méthode de Spearman Karber (Schmidt N.J., Emmous R.W., Diagnostic Procédures for viral, ricketsial and chlaveydial Infection, 1989, 6ème Edition).The set of Western-blot results for the different dilutions and the different replicates can be analyzed by a statistical method known to those skilled in the art for establishing an infectious titer, such as the method of Spearman Karber (Schmidt NJ , Emmous RW, Diagnosis Procedures for Viral, Rickettsial and Chlaveydial Infection, 1989, 6th Edition).
Dans un mode de réalisation de l'invention, la méthode de calcul du titre est la méthode deIn one embodiment of the invention, the method of calculating the title is the method of
Spearman - Karber. Cette méthode suppose la dilution de l'échantillon à tester selon une progression géométrique, c'est-à-dire de raison constante entre les dilutions successives, et un ensemencement d'un volume constant (en général 0,150 ml) de chaque dilution dans cinq puits au moins. Le facteur de dilution le plus couramment utilisé est le facteur décimal.Spearman - Karber. This method supposes the dilution of the sample to be tested according to a geometric progression, that is to say of constant reason between the successive dilutions, and sowing a constant volume (usually 0.150 ml) of each dilution in at least five wells. The most commonly used dilution factor is the decimal factor.
Pour que la formule de Spearman-Karber soit applicable, il est nécessaire d'utiliser un nombre constant de puits ensemencés à l'aide de chaque dilution, un facteur de dilution constant et une gamme de dilutions suffisamment large pour encadrer à la fois les dilutions de part et d'autres desquelles cent pour cent des puits donneront une réaction positive, et les dilutions de part et d'autre desquelles cent pour cent des puits donneront une réaction négative.For the Spearman-Karber formula to be applicable, it is necessary to use a constant number of wells inoculated with each dilution, a constant dilution factor and a range of dilutions large enough to control both the dilutions on the one hand and others of which one hundred per cent of the wells will give a positive reaction, and the dilutions on either side of which one hundred per cent of the wells will give a negative reaction.
Si une ou plusieurs de ces conditions ne sont pas satisfaites, on suppose parfois que pour un facteur de dilution constant, la dilution supérieure ou inférieure venant après la dernière effectuée aurait donné le résultat souhaité. Une telle "fabrication" de données ne repose sur aucun fondement théorique, mais si elle est appliquée avec suffisamment de prudence, elle n'est pas dangereuse. Cependant, il est préférable de répéter le titrage avec une gamme plus appropriée de dilutions, ce qui est indispensable s'il y a de graves lacunes dans les données.If one or more of these conditions are not satisfied, it is sometimes assumed that for a constant dilution factor, the higher or lower dilution following the last performed would have given the desired result. Such "manufacturing" of data is not based on any theoretical basis, but if applied with sufficient caution, it is not dangerous. However, it is best to repeat the titration with a more appropriate range of dilutions, which is essential if there are serious data gaps.
Selon la formule de Spearman-Karber:According to Spearman-Karber's formula:
Logio dose médiane = (Xo) - (d/2) + dS (V1Zn1)Median dose logio = (Xo) - (d / 2) + dS (V 1 Zn 1 )
où:or:
Xo= logio de la valeur réciproque de la dilution la plus basse à laquelle tous les inoculums d'épreuve sont positifs.Xo = logio of the reciprocal value of the lowest dilution at which all test inocula are positive.
d= loglO du facteur de dilution, dit aussi « pas de dilution » (c'est-à-dire la différence entre les intervalles des logarithmes de dilution).d = log10 of the dilution factor, also referred to as "no dilution" (i.e. the difference between log dilution intervals).
n = nombre d'inoculums d'épreuve utilisés à chaque dilution .n = number of test inocula used at each dilution.
R1= nombre d'inoculums positifs d'épreuve (sur ni). S (T1Zn1) =S (P) = somme de la proportion d'épreuves positives commençant à la dilution la plus basse et donnant cent pour cent de résultats positifs.R 1 = number of positive inocula of test (on ni). S (T 1 Zn 1 ) = S (P) = sum of the proportion of positive tests starting at the lowest dilution and giving one hundred percent of positive results.
La sommation commence à la dilution Xo.The summation begins at Xo dilution.
L'écart-type estimatif est calculé à l'aide de la formule suivante:The estimated standard deviation is calculated using the following formula:
Log écart-type = d*V (E(p*(l-p)/(ni-l)))Log standard deviation = d * V (E (p * (l-p) / (ni-1)))
Avec p = X1In1 = proportion d'épreuves positives (c'est-à-dire de cupules d'inoculum présentant une réaction) à chaque dilution.With p = X 1 In 1 = proportion of positive assays (i.e. inoculum cups with reaction) at each dilution.
La méthode de l'invention permet de quantifier l'infectiosité liée aux ATNC sur une gamme de 4 log, c'est-à-dire de 10000 unités infectieuses in vitro. Ceci peut, par exemple, permettre de satisfaire aux critères de validation de l'efficacité des procédés d'obtention de produits biologiques vis-à-vis de l'élimination des ATNC.The method of the invention makes it possible to quantify the infectivity associated with NCTAs over a range of 4 log, that is, 10,000 infectious units in vitro. This may, for example, make it possible to satisfy the criteria for validating the efficiency of the processes for obtaining biological products with respect to the elimination of NCTAs.
Applications de la méthode de détection ou titrage de l'infectiosité liée aux ATNC :Applications of the method of detection or titration of NCTA infectivity:
L'invention concerne également l'application de la méthode de titrage selon l'invention à une méthode d'évaluation et/ou de contrôle in vitro d'un procédé d'obtention ou de traitement d'un produit biologique susceptible d'être contaminé par un ATNC. Cette méthode d'évaluation et/ou de contrôle est caractérisée en ce qu'on applique au produit biologique, en amont et en aval dudit procédé, une méthode de titrage selon l'invention, telle que décrite précédemment, et en ce que l'on compare les deux valeurs de titre obtenues. Par comparaison entre les deux mesures, on détermine le degré d'élimination ou le facteur de réduction de l'ATNC.The invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a method of evaluation and / or in vitro control of a process for obtaining or treating a biological product likely to be contaminated. by an NCTA. This evaluation and / or control method is characterized in that a titration method according to the invention, as described above, is applied to the biological product, upstream and downstream of said process, and in that the we compare the two title values obtained. By comparison between the two measurements, the degree of elimination or the reduction factor of the NCTA is determined.
En particulier, la méthode de titrage selon l'invention a la capacité d'être aisément applicable à tout type de procédé d'obtention ou de purification de produits biologiques, en particulier de produits sanguins, tels que les dérivés de plasma sanguins, utilisant par exemple les chromatographies ou la nanofiltration, en particulier les chromatographies décrites dans les documents EP 0 3 59 593 et WO 02/092632.In particular, the titration method according to the invention has the capacity to be easily applicable to any type of process for obtaining or purifying biological products, in particular blood products, such as blood plasma derivatives, using for example, chromatography or nanofiltration, in particular the chromatographies described in documents EP 0 359 593 and WO 02/092632.
Ainsi, la mise en œuvre de la méthode de l'invention permet d'évaluer et/ou de contrôler l'efficacité d'un procédé (ou d'une partie d'un procédé) d'obtention ou de traitement, voire de purification, de tout produit biologique, susceptible d'être contaminé par un ATNC, dans l'élimination de cet ATNC, grâce à un titrage utilisant des lignées cellulaires transgéniques spécifiques, favorisant la réplication de l'ATNC, mises en contact avec un matériel infectieux ou potentiellement infectieux contenant l'ATNC à tester. On mesure les quantités d'ATNC en amont et en aval du procédé (ou de la partie du procédé) dont on veut apprécier l'efficacité à l'égard de l'ATNC. Par comparaison des deux mesures, on détermine le degré d'élimination de l'agent pathogène. Ainsi, la mise en œuvre de la présente méthode peut être effectuée au cours d'un procédé d'obtention d'un produit biologique ou dans le cadre d'un traitement d'élimination de l'ATNC suivant l'obtention du produit biologique.Thus, the implementation of the method of the invention makes it possible to evaluate and / or control the efficiency of a process (or a part of a process) for obtaining or treating, or even purifying of any biological product likely to be contaminated by an NCTA, in the elimination of this NCTA, by means of a titration using specific transgenic cell lines, promoting the replication of the ATNC, brought into contact with an infectious material or potentially infectious containing the ATNC to be tested. The amounts of NCTA are measured upstream and downstream of the process (or part of the process) whose performance with respect to the NCTA is to be assessed. By comparing the two measurements, the degree of elimination of the pathogen is determined. Thus, the implementation of the present method can be carried out during a process for obtaining a biological product or in the context of an elimination treatment of the NCTA according to obtaining the biological product.
L'invention concerne également l'application de la méthode de titrage selon l'invention à une méthode d'évaluation et/ou de contrôle in vitro d'une procédure de décontamination d'un matériel. Dans ce cas, on détermine le titre en ATNC d'un produit biologique contenant un ATNC au moyen de la méthode de titrage selon l'invention. On met ensuite en contact ce produit biologique infecté avec le matériel à décontaminer puis on applique la procédure de décontamination à ce matériel. Enfin, on détermine à nouveau le titre du produit biologique ayant subi la procédure de décontamination. Les deux mesures de titre effectuées en amont et en aval de la procédure de décontamination sont comparées pour évaluer l'efficacité de la procédure de décontamination. Le matériel peut, par exemple, être un matériel de purification, en particulier une colonne de chromatographie, ou encore être la sanitisation d'une colonne de chromatographie à l'aide de soude.The invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a method of evaluation and / or in vitro control of a procedure for decontaminating a material. In this case, the ATNC titre of a biological product containing an NCTA is determined using the titration method of the invention. This infected biological product is then contacted with the material to be decontaminated and the decontamination procedure is applied to this material. Finally, the title of the biological product having undergone the decontamination procedure is again determined. The two titration measurements performed upstream and downstream of the decontamination procedure are compared to evaluate the effectiveness of the decontamination procedure. The material may, for example, be purification equipment, in particular a chromatography column, or be the sanitization of a chromatography column using sodium hydroxide.
L'invention concerne également l'application de la méthode de titrage selon l'invention à une procédure de sélection et/ou méthode d'évaluation d'un composé permettant de réduire le titre du matériel infectieux. Dans ce cas, on détermine le titre en ATNC d'un produit biologique contenant un ATNC au moyen de la méthode de titrage selon l'invention. On met ensuite en contact ce produit biologique infecté avec le composé à tester puis on détermine à nouveau le titre du produit biologique ayant subi la procédure de décontamination. Les deux mesures de titre effectuées en amont et en aval de la mise en contact de l'échantillon avec le composé à tester sont comparées.The invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a selection procedure and / or method for evaluating a compound making it possible to reduce the titre of the infectious material. In this case, the ATNC titre of a biological product containing an NCTA is determined using the titration method of the invention. We This infected biological product is then contacted with the test compound and the title of the biological product having undergone the decontamination procedure is determined again. The two titration measurements made upstream and downstream of the contacting of the sample with the test compound are compared.
L'invention concerne également l'application de la méthode de titrage selon l'invention à une procédure de sélection et/ou méthode d'évaluation d'un composé susceptible de moduler l'infectiosité d'un ATNC. Dans ce cas, on détermine le titre en ATNC d'un produit biologique contenant un ATNC, en présence puis en absence du composé à évaluer, au moyen de la méthode de titrage selon l'invention. Les modalités de la mise en présence du composé sont déterminées selon que l'action du composé prévient l'initiation d'un cycle infectieux ou bloque un cycle infectieux déjà initié. Dans tous les cas, on détermine le titre du produit biologique avec et sans traitement avec le produit à tester. Les deux mesures de titre effectuées sont comparées pour évaluer l'activité modulatrice de l'infectiosité d'un ATNC du composé.The invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a selection procedure and / or evaluation method of a compound capable of modulating the infectivity of an ATNC. In this case, the ATNC titre of a biological product containing an NCTA is determined, in the presence and then in the absence of the compound to be evaluated, by means of the titration method according to the invention. The methods for bringing the compound into contact are determined according to whether the action of the compound prevents the initiation of an infectious cycle or blocks an infectious cycle already initiated. In all cases, the title of the biological product is determined with and without treatment with the product to be tested. The two titration measurements performed are compared to evaluate the modulatory activity of the NCTA infectivity of the compound.
L'invention concerne également l'application de la méthode de titrage selon l'invention à une méthode d'identification d'un composé permettant de moduler la transformation de la forme non-pathologique en la forme pathologique de l'ATNC, par exemple la transformation de PrP en PrPsc. Dans ce cas, on détermine le titre en ATNC d'un produit biologique contenant un ATNC au moyen de la méthode de titrage selon l'invention. On met ensuite en contact ce produit biologique infecté avec le composé à tester puis on applique la méthode de titrage de l'invention afin de déterminer à nouveau le titre du produit biologique. Les deux mesures de titre effectuées en amont et en aval de la mise en contact avec le composé sont comparées pour évaluer l'efficacité du composé à tester.The invention also relates to the application of the titration method according to the invention to a method of identifying a compound for modulating the transformation of the non-pathological form into the pathological form of the ATNC, for example the transformation of PrP into PrP sc . In this case, the ATNC titre of a biological product containing an NCTA is determined using the titration method of the invention. This infected biological product is then contacted with the test compound and the titration method of the invention is applied to again determine the title of the biological product. The two titration measurements made upstream and downstream of the contact with the compound are compared to evaluate the effectiveness of the test compound.
Matériel infectieux et standardisé de type prion produit par le clone cellulaireInfectious and standardized material of the prion type produced by the cell clone
Le lysat cellulaire ou surnageant de culture produit par le clone cellulaire de l'invention peut être standardisé en unités infectieuses par dose par des méthodes connues de l'homme du métier. Des stocks de lysat cellulaire infectés peuvent par exemple être préparés pour ??The cell lysate or culture supernatant produced by the cell clone of the invention can be standardized in infectious units per dose by methods known to those skilled in the art. For example, infected cell lysate stocks can be prepared for ??
contenir 3 logio TCID50 par millilitre. La disponibilité de stocks standardisés permet alors la stricte comparaison de résultats d'essais distincts.contain 3 logio TCID50 per milliliter. The availability of standardized stocks then allows the strict comparison of separate test results.
En outre, il peut être stabilisé par congélation, séchage, lyophilisation, atomisation, en présence éventuellement de substances connues de l'homme du métier et destinées a éviter une perte du titre infectieux selon le mode de stabilisation mis en œuvre.In addition, it can be stabilized by freezing, drying, lyophilization, atomization, possibly in the presence of substances known to those skilled in the art and intended to prevent loss of infectious titer depending on the stabilization method used.
Avantageusement, ce lysat cellulaire ou surnageant de culture peut être utilisé en tant qu'inoculum infectant pour une méthode d'évaluation et/ou de contrôle d'un procédé d'obtention ou de traitement d'un produit biologique susceptible d'être contaminé par un ATNC, en particulier un procédé de purification de dérivés du plasma sanguin, en particulier encore les chromatographies ou la nanofiltration.Advantageously, this cell lysate or culture supernatant may be used as an infecting inoculum for a method of evaluating and / or controlling a process for obtaining or treating a biological product that may be contaminated by an ATNC, in particular a method for purifying blood plasma derivatives, in particular still chromatographies or nanofiltration.
Avantageusement, ce lysat cellulaire ou surnageant de culture peut être utilisé en tant qu'inoculum infectant pour une méthode d'évaluation et/ou de contrôle d'une procédure de décontamination d'un matériel susceptible d'être contaminé par un ATNC.Advantageously, this cell lysate or culture supernatant may be used as an infecting inoculum for a method of evaluating and / or controlling a procedure for decontaminating material that may be contaminated by an NCTA.
Avantageusement, ce lysat cellulaire ou surnageant de culture peut être utilisé en tant qu'inoculum infectant pour une méthode d'évaluation d'un compose inhibant l'infectiosité d'un ATNC.Advantageously, this cell lysate or culture supernatant can be used as an infecting inoculum for a method for evaluating a compound that inhibits the infectivity of an NCTA.
Avantageusement, le matériel infectieux (c'est-à-dire l'inoculum préparé à partir du clone cellulaire de l'invention) permet de s'affranchir de l'utilisation de collections de cerveaux ovins ou bovins infectés par la Tremblante du Mouton ou l'Encéphalopathie Spongiforme Bovine.Advantageously, the infectious material (that is to say the inoculum prepared from the cell clone of the invention) makes it possible to overcome the use of ovine or bovine brain collections infected with sheep scrapie or Bovine Spongiform Encephalopathy.
Le matériel infectieux peut être utilisé en tant qu'inoculum infectant dans une méthode d'évaluation et/ou de contrôle in vitro d'une procédure de décontamination d'un matériel.The infectious material can be used as an infecting inoculum in a method of evaluation and / or in vitro control of a procedure for decontaminating a material.
Le matériel peut, par exemple, être un matériel de purification, en particulier une colonne de chromato graphie. La procédure de décontamination peut, par exemple, être la sanitisation d'une colonne de chromato graphie l'aide de soude.The material may, for example, be a purification material, in particular a chromato graphy column. The decontamination procedure may, for example, be the sanitization of a chromato graphie column using soda.
L'invention concerne également l'utilisation du matériel infectieux en tant qu'inoculum infectant pour une méthode d'évaluation d'un compose modulant l'infectiosité d'un ATNC. Dans ce cas, la capacité modulatrice de l'infectiosité d'un ATNC, selon l'invention est testée en présence ou non du composé susceptible de moduler cette infectiosité l'infectiosité d'un ATNC.The invention also relates to the use of the infective material as an infecting inoculum for a method of evaluating a compound modulating the infectivity of an NCTA. In this case, the ability to modulate the infectivity of an ATNC according to the invention is tested in the presence or absence of the compound capable of modulating this infectivity the infectivity of an ATNC.
L'invention concerne également l'utilisation du matériel infectieux en tant qu'inoculum infectant pour une méthode d'évaluation et/ou de contrôle d'une procédure de confinement de matériel infectieux, en particulier une procédure et un équipement de type P3.The invention also relates to the use of the infectious material as an infecting inoculum for a method of evaluating and / or controlling a procedure for confining infectious material, in particular a P3 procedure and equipment.
La méthode de l'invention sera mieux comprise à l'aide du complément de description qui va suivre, qui ne limite pas la portée de l'invention.The method of the invention will be better understood using the additional description which follows, which does not limit the scope of the invention.
EXEMPLES :EXAMPLES
Matériels et MéthodesMaterials and methods
1 ° Cellules et matériel infectieux :1 ° Cells and infectious material:
Les cellules MovS6 (Archer F. et al. 2004) ont été sélectionnées comme cellules supportant la réplication des ATNC, et la souche de Scrapie 127-S adaptée aux souris transgéniquesMovS6 cells (Archer F. et al., 2004) were selected as replication-supporting cells for ATNCs, and Scrapie 127-S strain adapted for transgenic mice.
Tg301 a été utilisée comme source d'infectiosité naturelle (Vilotte JL et al. 2001). Les cellules étaient cultivées en milieu DMEM / Ham F- 12 (3 :1) complémenté en glutamineTg301 has been used as a source of natural infectivity (Vilotte JL et al., 2001). The cells were cultured in DMEM / Ham F-12 (3: 1) supplemented with glutamine
(2mM final) et sérum de veau fœtal (5% final).(2mM final) and fetal calf serum (5% final).
La source d'infectiosité initiale consistait en un homogénat de cerveaux de souris infectées à 200 mg / ml (lot : LN-3326 au titre de 6.17 logio uWB/ml).The source of initial infectivity was a homogenate of mouse brains infected at 200 mg / ml (lot: LN-3326 under 6.17 log 10 uWB / ml).
2° Culture : Les cellules MovS6 ont été mises en culture pour constituer après 15 jours d'incubation 2 banques primaires (codées : LC- 19 et LC-21). Un aliquot de LC- 19 a été décongelé et mis en culture pendant 3 passages pour permettre de constituer 3 banques secondaires, codées : LC-46, LC-47 et LC-48. Un aliquot de LC-46 a été décongelé et mis en culture pendant 2 passages pour constituer une banque tertiaire codée LC-59.2 ° Culture: The MovS6 cells were cultured to constitute, after 15 days of incubation, 2 primary libraries (coded: LC-19 and LC-21). An aliquot of LC-19 was thawed and cultured for 3 passages to make up 3 secondary libraries, coded: LC-46, LC-47 and LC-48. An LC-46 aliquot was thawed and cultured for 2 passages to form an LC-59 coded tertiary library.
3° Comparaison de Titrage in vitro d'un échantillon de référence avec 2 lots de cellules3 ° Comparison of in vitro titration of a reference sample with 2 batches of cells
MovS6 :MovS6:
Un aliquot des cellules lot LC-46 et LC-59 a été décongelé et entretenu en parallèle pendant 2 passages. Avec chacun de ces lots de cellules, des plaques de titrages au format 24 puits (2cm2/puit) ont alors été ensemencées en parallèle à raison de 100 000 cellules par puits. Après 24 heures d'incubation, des dilutions sériées de l'homogénat de cerveaux de souris LN-3326 étaient préparées avec du milieu de culture et suivant un pas de dilution de 10 en 10 (de 10"1 à 10'8). Pour chaque dilution de l'inoculum, 5 puits de chacun des lots de cellules étaient infectés.An aliquot of batch cells LC-46 and LC-59 was thawed and maintained in parallel for 2 passages. With each of these lots of cells, 24-well assay plates ( 2 cm 2 / well) were then inoculated in parallel at the rate of 100,000 cells per well. After 24 hours of incubation, serial dilutions of the homogenate of LN-3326 mouse brains were prepared with culture medium and not in a dilution of 10 by 10 (10 "1-10 '8). For each dilution of the inoculum, 5 wells of each of the cell lots were infected.
Les cellules étaient mises en contact avec 150 μl des différentes dilutions de l'inoculum durant 24 heures, puis 1 ml de milieu de culture neuf était ajouté. Les cellules étaient maintenues en culture 72 heures supplémentaires, jusqu'au premier passage où la totalité des cellules était re-ensemencée dans des puits de 10cm2 (format de plaque 6 puits). Lors de la poursuite des cultures cellulaires, le milieu de culture était changé une fois par semaine et les cellules repiquées avec un ratio de 1 sur 10. Les cellules non re- ensemmencées étaient conservées à -800C sous forme de culot sec. Ces culots cellulaires conservés à chaque passage, permettaient de rechercher la PrPsc produite par les cellules. La détection de la PrPsc produite était réalisée directement par Western-blotThe cells were brought into contact with 150 μl of the different dilutions of the inoculum for 24 hours, then 1 ml of new culture medium was added. The cells were maintained in culture for 72 additional hours, until the first passage where all the cells were re-seeded in 10 cm 2 wells (6-well plate format). When cell culture was continued, the culture medium was changed once a week and the cells were transplanted with a ratio of 1 in 10. The cells that were not started were stored at -80 ° C. in the form of a dry pellet. These cell pellets kept at each passage, allowed to search the PrPsc produced by the cells. The detection of the PrPsc produced was carried out directly by Western-blot
4° Détection de la PrPsc dans les cellules :4 ° Detection of PrPsc in cells:
Les échantillons de culots cellulaires étaient décongelés et repris dans 60μl de PBS. Les cellules étaient lysées par sonication pendant 15" à l'aide d'un bain à sonication (puissance: 15W). 20μl de lysat cellulaire soniqué étaient prélevés pour être traités par la Protéinase K. Le produit de la digestion était dénaturé puis analysé par électrophorèse en gel de poly-acrylamide en conditions dénaturantes (SDS-PAGE). Les protéines ayant migrées dans le gel étaient transférées sur une membrane PVDF par électrotransfert. La PrPsc présente sur les membranes était détectée par incubation avec l'anticorps 6H4 (Prionics) puis un anticorps secondaire marqué à la phosphatase alcaline (anticorps de chèvre « anti-anticorps de souris »). Les membranes marquées étaient révélées par chemi- luminescence. Un échantillon était considéré comme positif si le profil électrophorétique avec les trois formes de PrPsc glycosylée était visible sur les autoradiogrammes. Compte tenu des dilutions de l'échantillon dans les différents réactifs nécessaires au Western-blot, le volume d'échantillon effectivement déposé dans la piste du gel était de 4,35μl.Cell pellet samples were thawed and taken up in 60μl of PBS. The cells were lysed by sonication for 15 "using a sonic bath (power: 15W) .20μl of sonicated cell lysate were taken to be treated with Proteinase K. The product of the digestion was denatured and then analyzed by polyacrylamide gel electrophoresis under denaturing conditions (SDS-PAGE). Proteins migrated in the gel were transferred to a PVDF membrane by electrotransfer. The PrPsc present on the membranes was detected by incubation with the antibody 6H4 (Prionics) and then a secondary antibody labeled with alkaline phosphatase (goat antibody "anti-mouse antibody"). The labeled membranes were revealed by chemiluminescence. One sample was considered positive if the electrophoretic profile with the three forms of glycosylated PrPsc was visible on autoradiograms. Considering the dilutions of the sample in the different reagents necessary for the Western blot, the volume of sample actually deposited in the gel track was 4.35μl.
Pour chaque analyse par Western Blot, des témoins négatifs (cellules MovS6 non infectées) étaient traités en parallèle des échantillons. A chacun des passages cellulaires, l'ensemble des puits de plaques de culture était testé. Lorsque l'ensemble des réplicats de cultures cellulaires inoculées avec une dilution donnée de l'inoculum était retrouvé positif pour la PrPsc lors de deux passages successifs, ces cultures n'étaient plus testées lors des passages suivants.For each Western Blot analysis, negative controls (uninfected MovS6 cells) were processed in parallel with the samples. At each of the cell passages, all the wells of culture plates were tested. When all the replicates of cell cultures inoculated with a given dilution of the inoculum were found to be positive for the PrPsc during two successive passages, these cultures were no longer tested during the following passages.
5° Reproductibilité d'un Titrage in vitro :5 ° Reproducibility of an in vitro titration:
Pour évaluer la reproductibilité du système de tirage in vitro, le titrage de l'échantillon de référence LN-3326 a été reproduit 2 autres fois avec pour chaque titrage un nouvel aliquot du lot de cellule LC-46. Les titrages étaient réalisés comme décrit ci-dessus.To evaluate the reproducibility of the in vitro extraction system, the titration of the LN-3326 reference sample was repeated twice more with a new aliquot of the LC-46 cell batch for each assay. Assays were performed as described above.
6° Stabilité de la production de PrPsc par la cellule MovS6 (lot LC-46) infectée :6 ° Stability of PrPsc production by infected cell MovS6 (lot LC-46):
Afin d'évaluer la stabilité de la production de PrPsc par des cellules MovS6 infectées, 5.105 cellules (lot LC-46) âgées de 4 passages après leur décongélation, ont été ensemencées sous 10ml de milieu de culture en flask de25cm2 et inoculée par une charge en PrPsc de 2.21ogiouWB, soit avec une multiplicité d'infection (MOI) de 1:3100. La culture infectée a été maintenue pendant 23 passages avec chaque semaine un passage réalisé suivant un split ratio de 1 :10. A chaque passage, à partir des cellules non ré-ensemencées, un aliquot de 3.106 cellules était conservé à -800C sous forme d'un culot sec pour permettre d'effectuer en fin d'essai un titrage par Western-blot de la PrPsc dans les lysats cellulaires récoltés à différents passage.In order to evaluate the stability of the production of PrPsc by infected MovS6 cells, 5.10 5 cells (lot LC-46) aged 4 passages after thawing, were seeded in 10 ml of 25 cm 2 flask culture medium and inoculated with a PrPsc load of 2.21 μGiouWB, ie with a multiplicity of infection (MOI) of 1: 3100. The infected culture was maintained for 23 passages each week with a split ratio of 1: 10. At each passage, from the non-re-seeded cells, an aliquot of 3 × 10 6 cells was stored at -80 ° C. in the form of a dry pellet to allow at the end of the test, a Western-blot assay of the PrPsc in the cell lysates harvested at different passages.
La PrPsc était dosée par dilution limite de l'aliquot et analyse par Western-blot comme décrit au paragraphe 4°. La première dilution de l'échantillon ne présentant plus de signaux spécifiques de la PrPsc était considérée comme contenant 1 unité Western Blot. Le titre de l'échantillon était alors calculé comme l'inverse de la dilution limite, en prenant en compte le volume de l'aliquot effectivement déposé sur le gel d'électrophorèse. Ainsi 3.106 cellules repris dans 60μl de PBS correspondait à 3.106cell/0.06ml soit 50.106cell./ml. Dans les conditions d'analyse par Western Blot (WB) décrites au paragraphe 4, le signal observé sur la piste correspondant à l'échantillon « non dilué » dans la gamme de dilution, provenait de 4,35μl de suspension de culot cellulaire repris en PBS et non diluée soit de 0,22.106 cellules. A titre d'exemple si la première dilution à laquelle le signal n'était plus détecté correspond à la dilution l/81eme, le titre en PrPsc dans le culot cellulaire était de 81 uWB/4,35μl soit 81x1000/4.35 = 18620 uWB/ml soit exprimé en logarithme décimal 4,27 logio Uwb/ml, ou encore 81/0.22 uWB/million de cellules, soit 368 uWB/million de cellules soit exprimé en logarithme décimal 2,57 logio uWB/million de cellules.PrPsc was assayed by limiting dilution of the aliquot and Western blot analysis as described in paragraph 4. The first dilution of the sample no longer showing specific PrPsc signals was considered to contain 1 Western Blot unit. The titer of the sample was then calculated as the inverse of the limiting dilution, taking into account the volume of the aliquot actually deposited on the electrophoresis gel. Thus 3.10 6 cells taken up in 60μl of PBS corresponded to 3.10 6 cell / 0.06ml or 50.10 6 cell./ml. Under the Western Blot (WB) analysis conditions described in Section 4, the signal observed on the track corresponding to the "undiluted" sample in the dilution range, came from 4.35 μl of the cell pellet suspension taken up in PBS and undiluted either 0.22 × 10 6 cells. For example if the first dilution at which the signal was no longer detected corresponds to the dilution l / 81 Similarly, the title PrPsc in the cell pellet was 81 uWB / 4,35μl is 81x1000 / 4.35 = 18620 uWB / ml is expressed in logarithm decimal 4,27 logio Uwb / ml, or 81 / 0.22 uWB / million cells, or 368 uWB / million cells is expressed in log logarithm 2.57 logio uWB / million cells.
RésultatsResults
Les résultats des titrages de l'homogénat de cerveaux de référence (lot LN-3326) avec chacun des lots de cellules MovS6 (LC-46 et LC-59) sont résumés dans les tableaux 1 et 2. The results of titrations of the reference brain homogenate (lot LN-3326) with each of the MovS6 cell batches (LC-46 and LC-59) are summarized in Tables 1 and 2.
Tableau n°l. Titrage de l'homogénat de cerveaux de souris infectées de référence (LN- 3326) avec le lot de cellule LC-59.Table No. 1. Titration of the homogenate of infected mouse brains (LN-3326) with the LC-59 cell batch.
NT : Non testéNT: Not tested
Tableau n°2. Titrage de l'homogénat de cerveaux de souris infectées de référence (LN- 3326) avec le lot de cellule LC-46.Table n ° 2. Titration of homogenate of brains from infected reference mice (LN-3326) with LC-46 cell batch.
NT : Non testéNT: Not tested
Les résultats du titrage répété de l'échantillon de référence LN-3326 sont résumés dans les tableaux 3 et 4 ci-dessous : Tableau n°3. Répétition du Titrage de l'homogénat de cerveaux de souris infectées de référence (LN-3326) avec le lot de cellule LC-46The results of repeated titration of the LN-3326 reference sample are summarized in Tables 3 and 4 below: Table n ° 3. Repetition of Homogenate Titration of Infected Mouse Brains (LN-3326) with LC-46 Cell Lot
NT : Non testéNT: Not tested
Tableau n°4. Répétition du Titrage de l'homogénat de cerveaux de souris infectées de référence (LN-3326) avec le lot de cellule LC-46Table n ° 4. Repetition of Homogenate Titration of Infected Mouse Brains (LN-3326) with LC-46 Cell Lot
NT : Non testé Au cours de chacun de ces essais de titrage, aucune trace d'infectiosité n'a été observée dans aucun des 5 réplicats de cellules inoculées avec l'échantillon d'homogénat de cerveau non infecté (Témoin Nég.). Inversement une production de PrPsc croissante était observée avec les cellules inoculées avec l'échantillon de référence LN-3326. Ces résultats confirment que le système de titrage in vitro permet de mettre en évidence une production de PrPsc de novo par des cellules infectées.NT: Not tested In each of these titration assays, no trace of infectivity was observed in any of the replicates of cells inoculated with the uninfected brain homogenate sample (Neg. Control). Conversely increasing PrPsc production was observed with cells inoculated with the LN-3326 reference sample. These results confirm that the in vitro titration system makes it possible to demonstrate production of PrPsc de novo by infected cells.
L'échantillon d'homogénat de référence LN-3326 lors des répétitions du titrage avec le lot de cellules LC-46 montre un titre infectieux moyen de 6.4 log10 TdD5o/ml (range 6.3 à 6.5 logio TCID5o/ml).The LN-3326 reference homogenate sample at the titration repeats with the LC-46 lot of cells shows an average infectious titer of 6.4 log 10 TdD 5 o / ml (range 6.3 to 6.5 logio TCID 5 o / ml) .
L'échantillon d'homogénat de référence LN-3326 lors du titrage avec le lot de cellules LC-The LN-3326 reference homogenate sample when titrated with the LC-33 cell batch
59 montre un titre infectieux de 3.3 logio TCIDso/ml.59 shows an infectious titer of 3.3 log 10 TCID 50 / ml.
Le titre infectieux de l'échantillon de référence, mesuré avec les 2 lots de cellules : LC46 et LC59, montre une différence de 3.1 logio. Cette différence est significative.The infectious titre of the reference sample, measured with the two batches of cells: LC46 and LC59, shows a difference of 3.1 log. This difference is significant.
Cette différence de titre indique que le titre infectieux est dépendant du lot de celluleThis difference in title indicates that the infectious titer is dependent on the cell lot
MovS6 utilisé pour le titrage in vitro.MovS6 used for in vitro titration.
7° Stabilité de la production de PrPsc par les cellules MovS6 : La cinétique du titre de la PrPsc mesuré dans une quantité constante de cellules MovS6 inoculées est résumée dans le tableau 5.7. Stability of PrPsc Production by MovS6 Cells: The kinetics of the PrPsc titre measured in a constant amount of inoculated MovS6 cells is summarized in Table 5.
Tableau 5 : Titre en PrPsc mesuré dans un lysat de cellules infectéesTable 5: Title in PrPsc measured in a lysate of infected cells
Légende : PI : post-inoculationLegend: PI: post-inoculation
Ces données indiquent un titre moyen 5,5 logio uWB/ml. L'écart type (σ) est de ± 0,6 logio uWB/ml. La variation du titre en PrPsc dans le lysat cellulaire au cours du temps, exprimée par l' écart-type est supérieure à la variabilité de la méthode de titrage par Western-blot de ± 0,5 logio. Ces données indiquent donc une baisse significative du titre dans le lysat des cellules récoltées entre le 6eme passage et le 23eme passage après l'inoculation.These data indicate a mean titre 5.5 log uWB / ml. The standard deviation (σ) is ± 0.6 logio uWB / ml. Variation of the PrPsc titre in the cell lysate over time, expressed by the standard deviation is greater than the variability of the Western blot titration method of ± 0.5 log. These data indicate a significant reduction of the title in the lysate of cells harvested between the 6 th passage and the 23 th passage after inoculation.
8° Sous clonage :8 ° Under cloning:
Un aliquot de LC-46 a été décongelé et mis en culture pendant 8 jours. A partir de cette culture, un ensemencement de 5 plaques de 96 puits a été réalisé à raison de 0.3 cellule/puit. Après 37 jours de culture, 13 clones ont été isolés et re-ensemencés (split ratio : 100%) sur plaque 24 puits (2cm2/puit). Après 8 jours d'incubation, chacune de ces cultures a été partagée en 2 lots. Le premier a été entretenu en flacon de 25cm2 jusqu'à la constitution d'une pré -banque (LC-82-1 à LC-82-13) et l'autre déposé sur plaque 24 puits pour être infecté comme suit : Chaque culture de clone a été ajustée à 100 000 cellules/puits puis inoculée par une charge identique de PrPsc de 1.9 logio uWB. Ces cultures ont été maintenues durant 6 passages. Au terme de ce délai, les cellules de chaque culture étaient récoltées et ajustées à une concentration de 106 cellules/ml. Ces suspensions cellulaires ont été conservées à -800C sous forme de culot sec.An aliquot of LC-46 was thawed and cultured for 8 days. From this culture, seeding of 96-well plates was performed at the rate of 0.3 cell / well. After 37 days of culture, 13 clones were isolated and re-seeded (split ratio: 100%) on a 24-well plate ( 2 cm 2 / well). After 8 days of incubation, each of these cultures was divided into 2 lots. The first was maintained in a 25cm 2 vial until a pre-bank (LC-82-1 to LC-82-13) was formed and the other was plated on a 24-well plate to become infected as follows: Each Clone culture was adjusted to 100,000 cells / well then inoculated with an identical PrPsc load of 1.9 log uWB. These cultures were maintained during 6 passages. At the end of this time, the cells of each culture were harvested and adjusted to a concentration of 10 6 cells / ml. These cell suspensions were stored at -80 ° C. in the form of a dry pellet.
8.1° Sélection des clones :8.1 ° Selection of clones:
Pour évaluer par Western-Blot l'intensité de la réponse à l'infection de chacun des clones, un aliquot de culot sec de chacun des clones a été décongelé, soniqué et analysé parTo evaluate by Western Blot the intensity of the infection response of each of the clones, a dry pellet aliquot of each of the clones was thawed, sonicated, and analyzed by
Western-blot. La détection de la PrPsc dans les différents lysats de clone, est figurée sur l' autoradiogramme (Figure).Western blotting. Detection of PrPsc in the different clone lysates is shown on the autoradiogram (Figure).
Ces données montrent que la réponse à l'infection de chacun des clones, mesurée 6 semaines après l'inoculation, est hétérogène entre les clones. Les clones MovS6-13 et -10 ne présentent aucun signal spécifique de la PrPsc.These data show that the response to infection of each of the clones, measured 6 weeks after inoculation, is heterogeneous between the clones. The MovS6-13 and -10 clones have no specific PrPsc signal.
Les clones MovS6- 2 - 3 - 5 - 7 - 8 - 9 - 12 présentent un signal spécifique de la PrPsc d'intensité moyenne.The clones MovS6- 2 - 3 - 5 - 7 - 8 - 9 - 12 present a specific signal of the PrPsc of medium intensity.
Les clones MovS6- 1 - 6 - 11 montrent un signal spécifique de la PrPsc de forte intensité.The MovS6- 1 - 6 - 11 clones show a signal specific to the high intensity PrPsc.
Le clone MovS6-4 montre un signal spécifique de la PrPsc de très forte intensité. L'aliquot de cellules non infectées correspondant (LC-82-4) a été décongelé et entretenu en culture pour constituer une banque primaire (LC-91) et de 2 banques secondaires (LC-93 et LC-94).The MovS6-4 clone shows a specific signal of the PrPsc of very strong intensity. The corresponding uninfected cell aliquot (LC-82-4) was thawed and maintained in culture to form a primary library (LC-91) and 2 secondary libraries (LC-93 and LC-94).
8.2° Stabilité de la production de PrPsc par les cellules du clone MovS6-4 :8.2 ° Stability of the production of PrPsc by the cells of the clone MovS6-4:
Afin d'évaluer la stabilité de la production de PrPsc par des cellules MovS6-4 infectées, 5.105 cellules âgées de 2 passages après leur décongélation, ont été ensemencées sous 10ml de milieu de culture en fiask de 25cm2 et inoculée par une charge en PrPsc de 3.0 logiouWB, soit avec une multiplicité d'infection (MOI) de 1:500. La culture infectée a été maintenue pendant 37 passages avec chaque semaine un passage réalisé suivant un split ratio de 1 :10. A chaque passage, à partir des cellules non ré-ensemencées, un aliquot était conservé à -800C sous forme d'un culot sec pour permettre d'effectuer en fin d'essai un titrage par Western -b lot de la PrPsc dans les lysats cellulaires récoltés à différents passage. Au terme de cet essai la PrPsc dans les lysats était titrée par dilution limite et Western-blot comme décrit au paragraphe 6°.In order to evaluate the stability of PrPsc production by infected MovS6-4 cells, 5.10 5 cells aged 2 passages after thawing were seeded under 10 ml of 25 cm 2 fiask culture medium and inoculated with an inoculum. PrPsc of 3.0 logiouWB, ie with a multiplicity of infection (MOI) of 1: 500. The infected culture was maintained for 37 passages each week with a split ratio of 1: 10. At each passage, from the non-re-seeded cells, an aliquot was stored at -80 ° C. in the form of a dry pellet to make it possible to carry out, at the end of the assay, a Western-b lot assay of the PrPsc in cell lysates harvested at different passage. At the end of this test the PrPsc in the lysates was titrated by limit dilution and Western-blot as described in paragraph 6 °.
8.3° Comparaison de Titrage in vitro d'un échantillon de référence avec les cellules MovS6 et MovS6-4 :8.3 ° Comparison of in vitro titration of a reference sample with MovS6 and MovS6-4 cells:
Un aliquot de cellules MovS6-4 (LC-94) a été décongelé et entretenu pendant 5 passages. Des plaques de titrages au format 24 puits (2cm2/puit) ont alors été ensemencées à raison de 100 000 cellules par puits. Après 24 heures d'incubation, des dilutions sériées de l'homogénat de cerveaux de souris LN-3326 étaient préparées avec du milieu de culture et suivant un pas de dilution de 10 en 10 (de 10 à 10'8). Pour chaque dilution de l'inoculum, 5 puits de cellules étaient infectés. Les cellules étaient mises en contact avec 150 μl des différentes dilutions de l'inoculum durant 24 heures, puis 1 ml de milieu de culture neuf était ajouté. Les cellules étaient maintenues en culture 72 heures supplémentaires, jusqu'au premier passage où la totalité des cellules était re-ensemencée dans des puits de 10cm2 (format de plaque 6 puits). Lors de la poursuite des cultures cellulaires, le milieu de culture était changé une fois par semaine et les cellules repiquées avec un ratio de 1 sur 10. Les cellules non re- ensemmencées étaient conservées à -800C sous forme de culot sec. Ces culots cellulaires conservés à chaque passage, permettaient de rechercher la PrPsc produite par les cellules. La détection de la PrPsc produite était réalisée directement par Western-blot comme décrit au paragraphe 4°An aliquot of MovS6-4 cells (LC-94) was thawed and maintained for 5 passages. 24-well assay plates ( 2 cm 2 / well) were then inoculated at a rate of 100,000 cells per well. After 24 hours of incubation, serial dilutions of the homogenate of LN-3326 mouse brains were prepared with culture medium and after a step of dilution from 10 to 10 (10 ~ ι 10 '8). For each dilution of the inoculum, 5 wells of cells were infected. The cells were brought into contact with 150 μl of the different dilutions of the inoculum for 24 hours, then 1 ml of new culture medium was added. The cells were maintained in culture for 72 additional hours, until the first passage where all the cells were re-seeded in 10 cm 2 wells (6-well plate format). When cell cultures were continued, the culture medium was changed once a week and the cells transplanted with a ratio of 1 in 10. The cells were not ensemmencées were kept at -80 0 C as a dry pellet. These cell pellets kept at each passage, allowed to search the PrPsc produced by the cells. The detection of the PrPsc produced was carried out directly by Western-blotting as described in paragraph 4 °
RésultatsResults
La cinétique du titre de la PrPsc mesurée dans une quantité constante de cellules MovS6-4 inoculées est résumée dans le tableau 6.The kinetics of the PrPsc titer measured in a constant amount of inoculated MovS6-4 cells is summarized in Table 6.
Tableau 6 : Titre (logio) de la PrPsc mesuré dans le lysat de cellules infectées.Table 6: Title (logio) of the PrPsc measured in the lysate of infected cells.
Ces données indiquent un titre moyen 4.6 logio uWB/ml. L'écart type (σ) est de ± 0.3 logio uWB/ml. La variation du titre en PrPsc dans le lysat cellulaire au cours du temps, exprimée par l'écart-type est inférieure à la variabilité de la méthode de titrage par Western-blot de ± 0.5 logio. Ces données indiquent donc une stabilité du titre dans le lysat des cellules récoltées entre le 6eme passage et le 47eme passage après l'inoculation. Bien que ces données indiquent un titre mesuré par Western-blot et exprimé en unité Westerne Blot (uWB), on peut considérer que le titre infectieux des cellules infectées (lysats de cellules) est également stable au cours de la période étudiée. Compte tenu de l'écart de sensibilité entre les méthodes de titrage par Western Blot et TCIA, l'infectiosité entre le 6ème et le 47ème passage serait d'environ 6.21ogio TCID5o/ml. Les résultats des titrages de l'homogénat de cerveaux de référence (lot LN-3326) avec les différents lots de cellules MovS6 et le clone MovS6-4 est résumé dans le tableau 7.These data indicate a mean titre 4.6 log uWB / ml. The standard deviation (σ) is ± 0.3 log uWB / ml. The variation in PrPsc titre in the cell lysate over time, expressed as the standard deviation, is less than the variability of the Western-blot assay method of ± 0.5 log. These data indicate stability of the title in the lysate of cells harvested between the 6 th passage and the 47 th passage after inoculation. Although these data indicate a Western-blot measured titre expressed in Westerne Blot (uWB) units, the infectious titer of infected cells (cell lysates) can also be considered to be stable over the study period. Given the difference in sensitivity between the assay methods by Western Blot and TCIA, infectivity between the 6 th and 47 th passage would be about 6.21ogio TCID 5 o / mL. The results of the titrations of the reference brain homogenate (batch LN-3326) with the different batches of MovS6 cells and the MovS6-4 clone are summarized in Table 7.
Tableau n°7. Titrage de l'homogénat de cerveaux de souris infectées de référence (LN- 3326) avec les différents lots de cellules MovS6 (LC-46, LC-59) et la clone MovS6-4 (lot LC-94).Table n ° 7. Titration of the homogenate of infected mouse brains of reference (LN-3326) with the different batches of MovS6 cells (LC-46, LC-59) and the clone MovS6-4 (batch LC-94).
L'échantillon d'homogénat de référence LN-3326 lors des répétitions du titrage avec les cellules MovS6 (lot : LC-46) a montré un titre infectieux moyen de 6.4 logio TCID5o/mlThe LN-3326 reference homogenate sample at the repetitions of the titration with MovS6 cells (batch: LC-46) showed an average infectious titer of 6.4 log 10 TCID 5 o / ml
(range 6.3 à 6.5 logio TdD5o/ml) voir tableaux 3 et 4.(range 6.3 to 6.5 logio TdD 5 o / ml) see tables 3 and 4.
L'échantillon d'homogénat de référence LN-3326 lors du titrage avec les cellules MovS6-4 a montré un titre infectieux de 4.7 logio TdD5o/ml.The reference homogenate sample LN-3326 when titrated with MovS6-4 cells showed an infectious titer of 4.7 log 10 TdD 5 / ml.
Le titre infectieux de l'échantillon de référence, mesuré avec les 2 cellules MovS6 (lot LC- 46) et MovS6-4, montre une différence de 1.7 logio. Cette différence est significative, elle confirme que le titre infectieux est dépendant de la cellule utilisée pour le titrage in vitro.The infectious titre of the reference sample, measured with the two cells MovS6 (lot LC-46) and MovS6-4, shows a difference of 1.7 log. This difference is significant, it confirms that the infectious titre is dependent on the cell used for in vitro titration.
Conclusionsconclusions
Au cours de cette étude, 2 lots de cellules de la lignée MovS6, désignés respectivement ; LC-46 et LC-59, ont été utilisés. Ces 2 lots diffèrent par l'âge de leurs cellules à l'inoculation. Le lot LC-46 est âgé 5 passages et d'un seul cycle de congélationDuring this study, 2 batches of cells of the MovS6 line, designated respectively; LC-46 and LC-59, were used. These 2 lots differ in age from their cells to inoculation. Lot LC-46 is aged 5 passes and a single freeze cycle
/décongélation tandis que le lot LC-59 est âgé de 7 passages et 2 cycles de congélation/décongélation.defrosting while batch LC-59 is 7 passes and 2 cycles of freezing / thawing.
Les données de titrage de l'échantillon d'homogénat de cerveau de référence (LN-3326) ont montré que le titre infectieux d'un échantillon est dépendant du lot de cellule MovS6 utilisé. Le système de titrage, TCIA (tissue culture infectivity Assay), réalisé avec les cellules les plus âgées (lot : LC-59) se caractérisait en effet par une perte de sensibilité par rapport au système de titrage réalisé avec les cellules moins âgées (lot : LC-46). Par ailleurs les données de cette étude montrent qu'après inoculation des cellules MovS6 (lot LC-46), la production de PrPsc déclinait au cours du temps puisqu'une perte significative de productivité était observée entre le 6eme et le 23eme passage postinoculation.The titration data of the reference brain homogenate sample (LN-3326) showed that the infectious titer of a sample is dependent on the MovS6 cell batch used. The titration system, tissue culture infectivity assay (TCIA), performed with The oldest cells (lot: LC-59) were characterized by a loss of sensitivity compared to the titration system performed with the older cells (batch: LC-46). Moreover, the data from this study show that after inoculation of MovS6 cells (batch LC-46), the production of PrPsc declined over time since a significant loss of productivity was observed between the 6 th and 23 rd passage postinoculation .
Ces 2 observations montrent un effet de l'âge des cellules, exprimé en nombre de passages et de cycles de congélation / décongélation, sur les propriétés biologiques de la lignée MovS6. Cet effet de l'âge consiste en une baisse de la permissivité des cellules à l'infection et une perte de productivité en PrPsc par les cellules infectées.These two observations show an effect of cell age, expressed in number of passages and freeze / thaw cycles, on the biological properties of the MovS6 line. This age effect consists of a decrease in the permissiveness of cells to infection and a loss of PrPsc productivity by the infected cells.
Les clones MovS6-l et MovS6-10 ne présentaient aucune production de PrPsc à la 6eme semaine après l'inoculation alors qu'un niveau de production élevé était observé avec le clone MovS6-4.Clones MovS6-l and MovS6-10 showed no PrPSc production to 6 th week after inoculation while a high production level was observed with MovS6-4 clone.
8.4° Comparaison de la permissivité des cellules MovS6 et MovS6-4 :8.4 ° Comparison of the permissivity of MovS6 and MovS6-4 cells:
Un aliquot de cellules MovS6-4 non infectées (LC-82-4) a été décongelé et entretenu en culture pour constituer une banque primaire (LC-91).An aliquot of uninfected MovS6-4 cells (LC-82-4) was thawed and maintained in culture to form a primary library (LC-91).
Préparation de l'échantillon avant l'infection. Un aliquot de cellules MovS6-4 (LC-91) a été décongelé et entretenu en culture pour constituer quatre banques secondaires (LC-131 à LC-134).Sample preparation before infection. An aliquot of MovS6-4 cells (LC-91) was thawed and maintained in culture to form four secondary libraries (LC-131 to LC-134).
Un aliquot de cellules MovS6-4 (LC-131) a été décongelé et entretenu pendant 64 jours etAn aliquot of MovS6-4 cells (LC-131) was thawed and maintained for 64 days and
10 passages, puis congelé pour constituer la banque tertiaire (LC- 139).10 passages, then frozen to form the tertiary bank (LC-139).
Un aliquot de cellules MovS6-4 (LC-139) a été décongelé et entretenu pendant 66 jours et 10 passages, puis congelé pour constituer la banque quaternaire (LC-143).An aliquot of MovS6-4 cells (LC-139) was thawed and maintained for 66 days and 10 passages, then frozen to form the quaternary library (LC-143).
Comparaison de Titrage in vitro d'un échantillon de référence avec les cellules MovS6 et le clone MovS6-4.Comparison of in vitro titration of a reference sample with MovS6 cells and the MovS6-4 clone.
Un aliquot de cellules MovS6-4 (LC-143) a été décongelé et entretenu pendant 2 passages. Des plaques de titrages au format 24 puits (2cm /puits) ont alors été ensemencées à raison de 100 000 cellules par puits. Après 24 heures d'incubation, des dilutions sériées de l'homogénat de cerveaux de souris LN-3326 étaient préparées avec du milieu de culture et suivant un pas de dilution de 10 en 10 (de 10"1 à 10"8). Pour chaque dilution de l'inoculum, 5 puits de cellules étaient infectés.An aliquot of MovS6-4 cells (LC-143) was thawed and maintained for 2 passages. 24-well assay plates (2 cm / well) were then inoculated at a rate of 100,000 cells per well. After 24 hours of incubation, serial dilutions of the homogenate of LN-3326 mouse brains were prepared with culture medium and not in a dilution of 10 by 10 (10 "1-10" 8). For each dilution of the inoculum, 5 wells of cells were infected.
Les cellules étaient mises en contact avec 150 μl des différentes dilutions de l'inoculum durant 24 heures, puis 1 ml de milieu de culture neuf était ajouté. Les cellules étaient maintenues en culture 72 heures supplémentaires, jusqu'au premier passage où la totalité des cellules était réensemencées dans des puits de 10cm2 (format de plaque 6 puits). Lors de la poursuite des cultures cellulaires, le milieu de culture était changé une fois par semaine et les cellules repiquées avec un ratio de 1 sur 10. Les cellules non réensemencées étaient conservées à -800C sous forme de culot sec. Ces culots cellulaires conservés à chaque passage, permettaient de rechercher la PrPsc produite par les cellules. La détection de la PrPsc produite était réalisée directement par Western-blot comme décrit au paragraphe 4°ci-dessus.The cells were brought into contact with 150 μl of the different dilutions of the inoculum for 24 hours, then 1 ml of new culture medium was added. The cells were maintained in culture for an additional 72 hours, until the first passage where all of the cells were reseeded in 10 cm 2 wells (6-well plate format). During the continuation of the cell cultures, the culture medium was changed once a week and the cells were subcultured with a ratio of 1 in 10. The non-reseeded cells were stored at -80 ° C. in the form of a dry pellet. These cell pellets kept at each passage, allowed to search the PrPsc produced by the cells. The detection of the PrPsc produced was carried out directly by Western blotting as described in paragraph 4 above.
Les résultats de titrages de l'homogénat de cerveau de référence (lot LN-3326) avec les différents lots de cellules MovS6 et le clone MovS6-4 au 6eme passage après l'inoculation est résumé dans le tableau 8 suivant :The results of titrations of the reference brain homogenate (batch LN-3326) with different batches of cells and MovS6 MovS6-4 clone 6 th passage after inoculation is summarized in Table 8 below:
Tableau n°8. Titrage de l'homogénat de cerveau de souris infectées de référence (LN- 3326) avec les différents lots de cellules MovS6 (LC-46 et LC-59) et le clone MovS6-4 (LC-143).Table n ° 8. Titration of the reference infected mouse homogenate (LN-3326) with the different batches of MovS6 cells (LC-46 and LC-59) and the MovS6-4 clone (LC-143).
Les cellules MovS6 dites «jeunes » (Lot : LC-46) ont, préalablement à l'essai de titrage, subi un seul cycle de congélation/décongélation et totalisé 5 passages. Avec ces cellules l'échantillon d'homogénat de référence LN-3326 a montré un titre infectieux de 6,4 log10 The so-called "young" MovS6 cells (Lot: LC-46) had, prior to the titration test, undergone a single freeze / thaw cycle and totaled 5 passages. With these cells the LN-3326 reference homogenate sample showed an infectious titer of 6.4 log 10
TCIDso/ml. Les cellules MovS6 dites «âgées » (Lot : LC-59) ont, préalablement à l'essai de titrage, subi deux cycles de congélation/décongélation et totalisé 7 passages. Avec ces cellules l'échantillon d'homogénat de référence LN-3326 a montré un titre infectieux de 3,3 log10 TCID / ml. The so-called "aged" MovS6 cells (Lot: LC-59) had, before the titration test, undergone two cycles of freezing / thawing and totaled 7 passages. With these cells the LN-3326 reference homogenate sample showed an infectious titer of 3.3 log 10
TCIDso/ml.TCID / ml.
Les cellules MovS6-4 dites «âgées » (Lot : LC-143) ont, préalablement à l'essai de titrage, subi deux cycles de congélation et 3 cycles de décongélation et totalisé 22 passages. Avec ces cellules l'échantillon d'homogénat de référence LN-3326 a montré un titre infectieux deThe so-called "aged" MovS6-4 cells (Lot: LC-143) have, before the titration test, undergone two cycles of freezing and three cycles of thawing and totaled 22 passages. With these cells the LN-3326 reference homogenate sample showed an infectious titer of
5,82 logio TCIDso/ml (range 5,72 à 5,92).5.82 log TCID 50 / ml (range 5.72 to 5.92).
Le titre de l'échantillon d'homogénat de cerveau de référence (LN-3326) déterminé avec les cellules MovS6 «jeunes » n'est pas signifîcativement différent du titre infectieux déterminé avec les cellules MovS6-4 « âgées » (l'écart entre les titres est inférieur au seuil de différence de 1 logio considéré couramment comme la valeur seuil pour une différence significative).The titer of the reference brain homogenate sample (LN-3326) determined with the "young" MovS6 cells is not significantly different from the infectious titer determined with the "aged" MovS6-4 cells (the difference between the securities is below the difference threshold of 1 logio commonly considered as the threshold value for a significant difference).
Le titre de l'échantillon d'homogénat de cerveau de référence (LN-3326) déterminé avec les cellules MovS6 « âgées » est signifîcativement différent du titre infectieux déterminé avec les cellules « âgées » MovS6-4.The titer of the reference brain homogenate sample (LN-3326) determined with the "aged" MovS6 cells is significantly different from the infectious titer determined with the "aged" MovS6-4 cells.
Conclusion :Conclusion:
Au cours de cette étude, 2 lots de cellules de la lignée MovS6, désignés respectivement ;During this study, 2 batches of cells of the MovS6 line, designated respectively;
LC-46 et LC-59, ont été utilisés. Ces 2 lots diffèrent uniquement par leur « âge » (exprimé par le nombre de cycles de congélation/décongélation et le nombre de passages des cellules avant leur inoculation).LC-46 and LC-59, were used. These 2 lots differ only in their "age" (expressed as the number of freeze / thaw cycles and the number of cell passages before inoculation).
Le lot LC-46 est âgé de 5 passages et d'un seul cycle de congélation /décongélation tandis que le lot LC-59 est âgé de 7 passages et 2 cycles de congélation/décongélation. Les données de titrage de l'échantillon d'homogénat de cerveau de référence (LN-3326) ont montré que le titre infectieux d'un échantillon est dépendant de l'âge de la cellule MovS6 utilisé.The LC-46 lot is 5 passages and a single freeze / thaw cycle while the LC-59 lot is 7 passes and 2 freeze / thaw cycles. Titration data from the reference brain homogenate sample (LN-3326) showed that the infectious titer of a sample is age dependent on the MovS6 cell used.
Le système de titrage, TCIA (« Tissue Culture Infectivity Assay »), réalisé avec les cellules âgées (lot : LC-59) se caractérisait en effet par une perte significative de sensibilité par rapport au système de titrage réalisé avec les cellules moins âgées (lot : LC-46).The titration system, TCIA ("Tissue Culture Infectivity Assay"), performed with the aged cells (batch: LC-59), was characterized by a significant loss of sensitivity compared to the titration system performed with the older cells ( lot: LC-46).
Ces observations montrent un effet de l'âge des cellules, exprimé en nombre de passages et de cycles de congélation / décongélation, sur les propriétés biologiques de la lignée MovS6. Cet effet de l'âge consiste en une baisse de la permissivité des cellules à l'infection chez les MovS6.These observations show an effect of cell age, expressed in number of passages and freezing / thawing cycles, on the biological properties of the MovS6 line. This effect of age consists of a decrease in cell permissiveness to infection in MovS6.
Par ailleurs, ces données montrent aussi qu'après inoculation des cellules MovS6-4 (lot LC- 143), ces cellules ayant subi 2 cycles de congélation/décongélation et une décongélation supplémentaire et totalisant 22 passages, le titre infectieux d'un échantillon n'est pas affecté par l'âge de cette cellule. En conséquence, l'âge des cellules MovS6-4 (LC-143) n'a pas d'impact sur la sensibilité du système de titrage par TCIA.Furthermore, these data also show that after inoculation of the cells MovS6-4 (lot LC-143), these cells having undergone 2 cycles of freezing / thawing and additional thawing and totaling 22 passages, the infectious titre of a sample no. is not affected by the age of this cell. As a result, the age of MovS6-4 cells (LC-143) does not affect the sensitivity of the TCIA titration system.
Le système de titrage, TCIA (« Tissue Culture Infectivity Assay »), réalisé avec les cellules MovS6-4 « âgées » (lot : LC-143) se caractérisait en effet par une stabilité de la sensibilité par rapport au système de titrage réalisé avec les cellules MovS6 «jeunes » (lot : LC-46).The titration system, TCIA ("Tissue Culture Infectivity Assay"), performed with the "aged" MovS6-4 cells (batch: LC-143) was characterized by a stability of the sensitivity compared to the titration system performed with MovS6 "young" cells (lot: LC-46).
Cette observation montre que l'effet de l'âge des cellules, exprimé en nombre de passages et de cycles de congélation / décongélation, n'a aucun impact sur la permissivité des cellules à l'infection chez les MovS6-4.This observation shows that the effect of cell age, expressed as number of passages and freeze / thaw cycles, has no impact on cell permissiveness to infection in MovS6-4.
On peut donc conclure que le clone MovS6-4, contrairement aux MovS6, est stable notamment quant à sa permissivité à l'infection par une souche de prion. It can therefore be concluded that the MovS6-4 clone, unlike MovS6, is stable in particular as regards its permissiveness to infection by a prion strain.

Claims

Revendications claims
1. Clone cellulaire issu de la lignée MovS6, ledit clone cellulaire exprimant une protéine prion PrP et étant capable de supporter la réplication ou la propagation de la forme pathologique PrPsc de ladite PrP, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 6eme passage.1. A cell clone derived from the MovS6 line, said cell clone expressing a PrP prion protein and being capable of supporting the replication or propagation of the PrPsc pathological form of said PrP, characterized in that it has a stability of the marker titre. of infection by an unconventional transmissible agent (UTA) at least until 6 th passage.
2. Clone cellulaire selon la revendication 1, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) sur une période au moins comprise entre le 6eme et le 100eme passage2. cell clone according to claim 1, characterized in that it has a stability of the title infection marker by an unconventional transmissible agent (UTA) over at least between the 6 th and the 100 th passage
3. Clone cellulaire selon la revendication 1 ou 2, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 7eme passage.3. Clone cell according to claim 1 or 2, characterized in that it has a stability of the title infection marker by an unconventional transmissible agent (UTA) at least until the 7 th passage.
4. Clone cellulaire selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 8eme passage.4. Clone cell according to any one of claims 1 to 3, characterized in that it has a stability of the title infection marker by an unconventional transmissible agent (UTA) at least until 8 th passage.
5. Clone cellulaire selon l'une quelconque des revendications 1 à 4, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 10eme passage.5. Clone cell according to any one of claims 1 to 4, characterized in that it has a stability of the title infection marker by an unconventional transmissible agent (UTA) at least until the 10 th passage.
6. Clone cellulaire selon l'une quelconque des revendications 1 à 5, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 14eme passage. 6. Clone cell according to any one of claims 1 to 5, characterized in that it has a stability of the title infection marker by an unconventional transmissible agent (UTA) at least until 14 th passage.
7. Clone cellulaire selon l'une quelconque des revendications 1 à 6, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 22eme passage.7. Cell clone according to any one of claims 1 to 6, characterized in that it has a stability of the title as a marker of infection with an unconventional transmissible agent (ATNC) at least until the 22 nd passage.
8. Clone cellulaire selon l'une quelconque des revendications 1 à 7, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 23eme passage.8. Cell clone according to any one of claims 1 to 7, characterized in that it has a stability of the title marker of infection with an unconventional transmissible agent (ATNC) at least until the 23 rd passage.
9. Clone cellulaire selon l'une quelconque des revendications 1 à 8, caractérisé en ce qu'il présente une stabilité du titre en marqueur de l'infection par un agent transmissible non conventionnel (ATNC) au moins jusqu'au 47eme passage.9. Cell clone according to any one of claims 1 to 8, characterized in that it has a marker stability of the marker of infection with a non-conventional transmissible agent (ATNC) at least until the 47 th passage.
10. Clone cellulaire selon l'une quelconque des revendications 1 à 9, caractérisé en ce que le lysat cellulaire ou le surnageant de culture dudit clone cellulaire possède, à partir de 6 semaines après l'infection, un titre en marqueur de l'infection supérieur ou égal à 3 logio TCID50 par million de cellules, de préférence supérieur ou égal à 4 logio TCID50 par million de cellules, de préférence supérieur ou égal à 6 logio TCID50 par million de cellules, de préférence supérieur à 7 logio TCID50 par million de cellules.10. Cell clone according to any one of claims 1 to 9, characterized in that the cell lysate or the culture supernatant of said cell clone has, from 6 weeks after infection, a marker titre of the infection. greater than or equal to 3 logio TCID50 per million cells, preferably greater than or equal to 4 logio TCID50 per million cells, preferably greater than or equal to 6 logio TCID50 per million cells, preferably greater than 7 logio TCID50 per million cells.
11. Clone cellulaire selon l'une quelconque des revendications précédentes, déposé le 22 février 2008 sous le numéro de dépôt CNCM 1-3922 à la Collection Nationale de Cultures des Microorganismes.11. Cell clone according to any one of the preceding claims, filed February 22, 2008 under the deposit number CNCM 1-3922 to the National Collection of Cultures of Microorganisms.
12. Méthode in vitro de détection et/ou titrage de l'infectiosité d'un agent transmissible non conventionnel (ATNC) dont le marqueur est une protéine de conformation pathologique, dans un échantillon, comportant les étapes consistant à : i) mettre ledit échantillon en contact avec un clone cellulaire tel que décrit dans l'une des revendications 1 à 11, ii) cultiver ledit clone cellulaire pour amplifier la quantité dATNC présente dans ledit échantillon par réplication dudit ATNC, iii) déterminer la présence et/ou la quantité de protéine pathologique et / ou d'ATNC dans l'échantillon, l'étape ii) de culture étant réalisée pendant un ou plusieurs passages.12. In vitro method for detecting and / or titrating the infectivity of a non-conventional transmissible agent (NCTA) whose marker is a pathological conformation protein, in a sample, comprising the steps of: i) putting said sample in contact with a cell clone as described in one of claims 1 to 11, ii) cultivating said cell clone to amplify the amount of ATC present in said sample by replicating said ATNC, iii) determining the presence and / or amount of pathological protein and / or ATNC in the sample, the culturing step ii) being performed during one or more passages.
13. Méthode selon la revendication 12, dans laquelle l'étape (iii) comprend les étapes suivantes : a) mettre en contact l'ATNC ainsi amplifié à l'issue de l'étape ii) avec une source de substrat pour la protéine pathologique et / ou l'ATNC, b) incuber le milieu réactionnel permettant la transformation du conformère non pathologique en conformère pathologique et/ou l'amplification de l'ATNC, c) désagréger les agrégats éventuellement formés lors de l'étape i) ou ii), d) déterminer la présence et/ou la quantité de protéine pathologique et / ou d'ATNC dans l'échantillon, les étapes (a) à (c) constituant un cycle d'opérations qui est répété au moins deux fois avant l'étape (d).The method of claim 12, wherein step (iii) comprises the steps of: a) contacting the thus amplified ATNC at the end of step ii) with a substrate source for the pathological protein and / or the ATNC, b) incubate the reaction medium allowing the transformation of the non-pathological conformer into pathological conformation and / or the amplification of the ATNC, c) disaggregate the aggregates possibly formed during step i) or ii d) determine the presence and / or amount of pathological protein and / or ATNC in the sample, steps (a) through (c) constituting a cycle of operations which is repeated at least twice before step (d).
14. Méthode in vitro d'évaluation et/ou de contrôle d'un procédé d'obtention ou de traitement d'un produit biologique ou d'un matériel susceptible d'être contaminé par un ATNC, méthode dans laquelle on applique audit produit biologique ou matériel, (A) en amont et (B) en aval dudit procédé, une méthode de titrage selon l'une quelconque des revendications 12 ou 13, et en ce que l'on compare les deux valeurs (A) et (B) de titre obtenues.14. In vitro method for evaluation and / or control of a process for obtaining or treating a biological product or material likely to be contaminated by an NCTA, in which method it is applied to said biological product or material, (A) upstream and (B) downstream of said method, a titration method according to any one of claims 12 or 13, and in that the two values (A) and (B) are compared of title obtained.
15. Méthode in vitro d'évaluation et/ou de contrôle d'une procédure de décontamination d'un produit biologique ou d'un matériel, méthode dans laquelle on applique audit produit biologique ou matériel, (A) en amont et (B) en aval de ladite procédure, une méthode de titrage selon l'une quelconque des revendications 12 ou 13, et en ce que l'on compare les deux valeurs (A) et (B) de titre obtenues.15. In vitro method for evaluating and / or controlling a procedure for decontaminating a biological product or material, method in which it is applied to said biological or material product, (A) upstream and (B) downstream of said procedure, a titration method according to any one of claims 12 or 13, and in that the two obtained values (A) and (B) of title are compared.
16. Méthode in vitro d'évaluation d'un composé susceptible de moduler l'infectiosité d'un produit biologique infectieux, méthode dans laquelle on applique audit produit biologique infectieux, (A) en présence et (B) en absence dudit composé à évaluer, une méthode de titrage selon l'une quelconque des revendications 12 ou 13, et en ce que l'on compare les deux valeurs (A) et (B) de titre obtenues.16. In vitro method for evaluating a compound capable of modulating the infectivity of an infectious biological product, in which method it is applied to said biological product infectious, (A) in the presence and (B) in the absence of said compound to be evaluated, a titration method according to any one of claims 12 or 13, and in that the two values (A) and (B) are compared ) of title obtained.
17. Méthode in vitro de diagnostic d'une encéphalopathie spongiforme transmissible chez un sujet humain ou animal non-humain, comprenant la détection de la présence dans un échantillon biologique dudit sujet, d'un agent transmissible non conventionnel (ATNC) qui est une protéine de conformation pathologique, par la méthode telle que définie à l'une quelconque des revendications 12 ou 13. 17. In vitro method for diagnosing a transmissible spongiform encephalopathy in a human or non-human animal, comprising detecting the presence in a biological sample of said subject of a non-conventional transmissible agent (NCTA) which is a protein pathological conformation, by the method as defined in any one of claims 12 or 13.
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