EP2178834A1 - Three-functional pseudo-peptidic reagent, and uses and applications thereof - Google Patents

Three-functional pseudo-peptidic reagent, and uses and applications thereof

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Publication number
EP2178834A1
EP2178834A1 EP08836332A EP08836332A EP2178834A1 EP 2178834 A1 EP2178834 A1 EP 2178834A1 EP 08836332 A EP08836332 A EP 08836332A EP 08836332 A EP08836332 A EP 08836332A EP 2178834 A1 EP2178834 A1 EP 2178834A1
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
unit
trifunctional
reagent
function
luminescent
Prior art date
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Withdrawn
Application number
EP08836332A
Other languages
German (de)
French (fr)
Inventor
Guillaume Clave
Pierre-Yves Renard
Anthony Romieu
Hervé VOLLAND
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Universite de Rouen
Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA
Original Assignee
Commissariat a lEnergie Atomique CEA
Universite de Rouen
Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA
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Filing date
Publication date
Application filed by Commissariat a lEnergie Atomique CEA, Universite de Rouen, Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA filed Critical Commissariat a lEnergie Atomique CEA
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Withdrawn legal-status Critical Current

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    • C07D207/02Heterocyclic compounds containing five-membered rings not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom with only hydrogen or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
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    • G01N33/533Production of labelled immunochemicals with fluorescent label

Definitions

  • the present invention relates to a trifunctional pseudopeptide reagent, for its various uses, in particular for the preparation of luminescent reagents or bioconjugates, optionally luminescent, the use of these reagents and bioconjugates for the functionalization of solid supports, as well as for the use of the solid supports thus functionalized for the detection of molecules of interest.
  • bioconjugates derived from biopolymers involve being able to covalently (reversibly or non-reversibly) attaching these bioconjugates to a second molecular architecture (biopolymer, solid support,. ..) and to detect and / or quantify them accurately (optical detection, radioactive, ).
  • a second molecular architecture biopolymer, solid support,. ..
  • it is essential to have tools for effectively combining a biopolymer with other (macro) molecules without significantly altering the properties of each of the partners involved in the resulting and targeted molecular architecture.
  • bifunctional cross-linking reagents For this purpose, many small bifunctional molecules (better known as "bifunctional cross-linking reagents") have been developed. A large number are marketed by Pierce. However, it is interesting to note that several academic groups continue to work on the development of new bifunctional reagents that are increasingly sophisticated and allow the development of ever more complex bioconjugates.
  • the sulfo-SBED is not entirely satisfactory inasmuch as it is not possible to modulate the hydrophobic / hydrophilic nature and especially the third functional unit (ie biotin) allows only strong interaction (quasi -covalent) with partners previously conjugated to avidin (glycoprotein) or streptavidin, which greatly limits its use.
  • trifunctional reagents for preparing bioconjugates consisting of a trifunctional central unit selected from triaminobenzene, tricarboxybenzene, dicarboxyaniline and diaminobenzoic acid, on which three affinity ligands, a biomolecule-reactive group and an effector agent are attached via three distinct linker arms.
  • This reagent has the disadvantage of having a trifunctional central unit consisting of at least two identical chemical functions (ie, carboxylic acid or amine functions) which restricts the choice of the complementary functions carried by the connecting arms which may have a limiting effect.
  • trifunctional reagents comprising three distinct functional poles, namely a luminescent group (L), a molecule (B) selected from the analyte to be detected, an analogue or a fragment thereof and finally a function ensuring the attachment of said trifunctional reagent to the surface of a solid support
  • L luminescent group
  • B molecule
  • the present invention therefore firstly relates to a trifunctional pseudopeptide reagent, characterized in that it comprises at least the following three reactive structural units A, B and C:
  • a unit A consisting of a hydrophilic chain of pseudopoly (ethylene glycol) (pseudo-PEG chain) interrupted by at least one amide function and having two ends E1 and E2, said E1 end being free and having a pattern terminal selected from amino group (-NH 2 ), activated carbamates and activated esters, and said E2 end having a terminal carbon atom carrying a carbonyl function, said carbon atom being engaged in an amide function (-C (O) -NH-) formed with the nitrogen atom of an ⁇ -amine function carried by the unit B;
  • a unit B consisting of an amino acid chosen from ⁇ -amino acids of the L, D series and their racemic mixtures, said amino acid having on its side chain at least one oxyamine function protected by a protecting group or at least one minus a masked aldehyde function; and (c) a unit C consisting of an amino acid selected from ⁇ -amino acids of the L, D series and their racemic mixtures, said amino acid having on its side chain at least one thiol, maleimide, iodoacetyl, azide unit, true alkyne, phosphane or cyclooctyne; said units B and C being linked to one another via an amide function formed between the carbon atom carrying the carbonyl function of the ⁇ -amino acid constituting the unit B and the nitrogen atom of the ⁇ -amine function of the ⁇ -amino acid constituting the unit C.
  • the main originality of these structures lies in the combination of amino acids (natural or modified) protected on their side chains by selected protective groups, and a functionalized pseudo-PEG chain whose length is easily adjustable. Even if the presence of several chemical functions (protected or not) necessarily entails problems during the preparation of these reagents (incompatibilities between functions, degradation and / or premature deprotection of certain protective groups, ...), the structure segmented into three Separate structural units (prepared independently of each other and then coupled together in the final steps of developing the trifunctional reagent) allows for a highly convergent synthesis strategy that minimizes the simultaneous presence of incompatible chemical motifs between them. Furthermore, a large structural diversity (modulation of geometry, length, physicochemical properties and solubility in particular, etc.) is accessible by modifying only one of the three structural units of the trifunctional reagent.
  • the term "pseudo" -PEG string a string having great similarities of structure with the PEG chain: but which differs by the presence of one or more functional groups (ester, amide, carbamate, urea, ...) within it.
  • the term "true” alkyne is understood to mean an alkyne whose triple bond is monosubstituted by a R: R 3 group.
  • the three reactive structural units constituting the trifunctional reagents according to the present invention make it possible to carry out reactions totally chemo-selective under mild conditions (especially in aqueous media in which biopolymers are soluble).
  • the activated carbamate or activated ester unit which may be present at the free E-terminus of the pseudo-PEG chain constituting unit A is reactive with respect to compounds having a complementary reactive unit such as an amine function (generally a primary amine aliphatic). Moreover, the primary amine function which may alternatively be present at the free E-terminus of the pseudo-PEG chain constituting unit A is reactive with respect to compounds having a complementary unit such as a carbamate or an activated ester .
  • This end E1 allows in particular the fixation of biological macromolecules which comprise, naturally or not, said complementary reactive functions (antibodies, nucleic acids or analogs, polysaccharides, proteins, peptides, radionuclides, toxins, enzyme inhibitors, haptens, etc.). .).
  • unit B after possible activation, that is to say after deprotection in the case of the oxyamine function or after unmasking in the case of the aldehyde function, under mild conditions compatible with the stability of the various partners involved, is reactive vis-à-vis compounds or materials having one or more carbonyl groups (aldehyde, ...) or alternatively amine.
  • aldehyde Among such compounds, mention may in particular be made of macromolecules such as antibodies, nucleic acids or the like, liposomes, polysaccharides, proteins, peptides, active principles, radionuclides, toxins, fluorophores, enzyme inhibitors, haptens, etc.
  • the thiol unit defined as a possible side substituent for the ⁇ -amino acid constituting the unit C is reactive with respect to the compounds or materials comprising a maleimide or iodoacetyl unit.
  • the maleimide and iodoacetyl units, defined as possible side substituents of the ⁇ -amino acid constituting the unit C, are reactive with respect to the compounds or materials having a thiol function or a cysteine after their possible deprotection.
  • the azide unit defined as possible lateral substituent of the ⁇ -amino acid constituting the unit C is reactive with respect to the compounds or materials having a true alkyne unit, phosphane or cyclooctyne and alternatively the true alkyne units, phosphane or cyclooctyne defined as possible side substituents of the ⁇ -amino acid constituting unit C are reactive with respect to compounds or materials having an azide pattern.
  • This reaction site can in particular be used for the attachment of a fluorophore group carrying a complementary functional group reactive with the thiol, maleimide iodoacetyl, azide, true alkyne, phosphane or cyclooctyne units present on the C unit.
  • the pseudo-PEG chain of unit A is chosen from the following chains of formula (A-I):
  • Ri represents a primary amine, an activated carbamate unit or an activated ester unit
  • n identical or different, are integers between 2 and 10 inclusive,
  • p is an integer from 1 to 10 inclusive
  • the arrow represents the covalent bond connecting the amide function of the E2 end of the pseudo-PEG chain to the unit B or C.
  • activated carbamate groups that may be present at the E1 end of the pseudo-PEG chain of unit A, mention may in particular be made of N-hydroxysuccinimidyl carbamate, N-hydroxysuccinimidyl carbamate, N-carbamate and the like. hydroxyphthalimidyl, N-hydroxypiperidinyl carbamate, ⁇ -nitrophenyl carbamate and pentafluorophenyl carbamate; N-hydroxysuccinimidyl carbamate being very particularly preferred.
  • the activated ester groups that may be present at the E1 end of the pseudo-PEG chain of unit A, there may be mentioned in particular the N-hydroxysuccinimidyl ester, the N-hydroxysuccinimidyl sulfo ester, the ester cyanomethyl, the N-hydroxyphthalimidyl ester, the N-hydroxypiperidinyl ester, the p-nitrophenyl ester, the pentafluorophenyl ester, the benzotriazole esters, the hydroxybenzotriazole esters and the hydroxyazabenzotriazole esters; the N-hydroxysuccinimidyl ester being particularly preferred.
  • DABA 2,4-diaminobutanoic acid
  • lysine is particularly preferred.
  • ⁇ -amino acids which can be used for unit C, there may be mentioned in particular lysine, cysteine, homolysine, ornithine, 2,4-diaminobutanoic acid (DABA), 2,3-diaminobutanoic acid (DABA), diaminopropanoic acid, aminomercaptoacetic acid, Thomocysteine, 5-mercapto-norvaline, 6-mercapto-norleucine, 2-amino-7-mercapto-heptanoic acid, and 2-amino-8-mercaptoacetic acid; octanoic.
  • DABA 2,4-diaminobutanoic acid
  • DABA 2,3-diaminobutanoic acid
  • diaminopropanoic acid aminomercaptoacetic acid
  • aminomercaptoacetic acid Thomocysteine, 5-mercapto-norvaline, 6-mercapto-norleucine, 2-amin
  • lysine and cysteine are particularly preferred.
  • the protective groups for the oxyamine function of the side chain of the ⁇ -amino acid constituting the unit B are preferably chosen from labile protective groups under mild conditions such as 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), benzyloxycarbonyl (Z ), allyloxycarbonyl (Alloc), trichloroethoxycarbonyl (Troc), trimethylsilylethoxycarbonyl (Teoc), pyridyldithioethoxycarbonyl (Pydec), 2- (2-nitrophenyl) -propyloxycarbonyl ( ⁇ PPOC), azomethyloxycarbonyl (Azoc), 2 - (trimethylsilyl) ethanesulfonyl (Ses) and phthalimide.
  • labile protective groups under mild conditions such as 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), benzyloxycarbonyl (Z ), allyloxycarbonyl
  • the groups Fmoc and phthalimide are particularly preferred.
  • the term "masked aldehyde function" any aldehyde or ketone function included in a molecule organic compound selected from serine or any organic molecule containing the 1,2-diol (-CH (OH) -CH (OH) -), 1,2-amino-alcohol or 1,2-hydroxythiol moiety.
  • organic molecules there may be mentioned tartaric acid, glyceric acid, 2,3-dihydroxypropanoic acid, 3,4-dihydroxybutanoic acid, 4,5-dihydroxypentanoic acid and the acid. 3-amino-2-hydroxypropanoic acid.
  • the term "mild conditions" the use of oxyamine function deprotection reagents or unmasking function of the aldehyde function at room temperature and at neutral pH or in a pH range between about 5 and 9 inclusive.
  • HIO 4 periodic acid
  • NaIO 4 sodium metaperiodate
  • KIO 4 potassium metaperiodate
  • R 1, m, n and p have the same meanings as those indicated above for the unit of formula (A-I),
  • Proc is a protecting group selected from 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), benzyloxycarbonyl (Z), allyloxycarbonyl (Alloc), trichloroethoxycarbonyl (Troc), trimethylsilylethoxycarbonyl (Teoc), pyridyldithioethoxycarbonyl (Pydec), 2- ( 2-nitrophenyl) -propyloxycarbonyle (NPPOC), azomethyloxycarbonyl (Azoc), 2- (trimethylsilyl) ethanesulfonyl (Ses) and phthalimide;
  • - Func is a thiol, maleimide, iodoacetyl, azide, true alkyne, phosphane or cyclooctyne unit.
  • Xi is an n-butyl chain.
  • X 2 is an ethyl or n-butyl chain.
  • the compounds of formula (I) above are chosen from the following compounds of formulas (I-1) to (1-6):
  • the trifunctional reagents according to the invention can be prepared according to convergent synthesis methods according to which each of the units A, B and C is prepared individually, these being then assembled to lead to the expected trifunctional reagent.
  • These convergent synthesis methods implement conventional reactions well known to those skilled in the art and the details of which are given in the synthesis examples illustrating the present application.
  • the reagents according to the present invention and as described above can have multiple uses and applications.
  • the trifunctional reagents according to the present invention can firstly be used for the preparation of bioconjugates.
  • Another object of the present invention is the use of at least one trifunctional reagent as defined above for the preparation of a bioconjugate.
  • bioconjugate means any trifunctional reagent as described above on which at least one biological molecule of interest is attached.
  • the fixation of the molecule (s) of interest may be carried out at the level of the primary amine function or the activated carbamate or activated ester unit present at the free end of the pseudo-PEG chain constituting the unit A which is reactive vis-a-vis the with respect to biological molecules having an acid function (or carbamate) or a reactive amine function (generally an aliphatic primary amine).
  • the binding of the biological molecule of interest can also be carried out at unit B, after deprotection of the oxyamine function or unmasking of the aldehyde function, which then become reactive with respect to the biological molecules having one or more carbonyl groups (aldehyde, etc.) respectively oxyaminated. It is thus possible to set one or two biological molecules, identical or different, trifunctional reagent according to the present invention.
  • Another object of the invention is thus a bioconjugate characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined above in which the primary amine unit, activated carbamate or activated ester present at the free end of the pseudo-chain.
  • PEG constituting the unit A and / or the oxyamine or aldehyde function carried by the unit B after deprotection or unmasking is (are) functionalized by a biological molecule of interest.
  • bioconjugates it is therefore possible to have the following three types of bioconjugates: i) a bioconjugate constituted by a trifunctional reagent in which only the amine function or only the activated carbamate or activated ester unit present at the free end of the pseudo chain -PEG constituting the unit A is functionalized by a biological molecule, ii) a bioconjugate constituted by a trifunctional reagent in which only the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from the unit B is functionalized by a biological molecule, and iii) a bioconjugate comprising two biological molecules, constituted by a trifunctional reagent in which the primary amine function or the activated carbamate or activated ester unit present at the free end of the pseudo-PEG chain constituting the unit A and the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from unit B are each functionalized by a biological molecule; in the latter case the bioconjugate comprises two
  • bioconjugates can be made conventionally by reacting a trifunctional reagent according to the invention with the biological molecule or molecules of interest to be fixed, while using the methods well known in the technical state for reacting by example:
  • the tri functional reagents according to the present invention can also be used for the preparation of luminescent reagents, in particular fluorescent reagents.
  • Another object of the present invention is therefore the use of at least one trifunctional reagent as defined above, for the preparation of a luminescent reagent, in particular fluorescent reagents.
  • the grafting of a luminescent group (L) can be carried out: i) by reacting the thiol, maleimide, iodoacetyl, azide, true alkyne, phosphane or cyclooctyne unit carried by the unit C with a maleimide complementary function , iodoacetyl (if unit C has a thiol function), thiol (if unit C has a maleimide or iodoacetyl unit) or true alkyne, phosphane or cyclooctyne (if unit C has an azide function), or else azide (if the unit C comprises a true alkyne function, phosphane or cyclooctyne), said complementary function being carried, naturally or not, by said luminescent group, and / or ii) by reacting the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from the unit B with
  • luminescent reagents comprising: i) a single luminescent group attached to the unit B via the deprotected oxyamine function or the unmasked aldehyde function or on the unit C via the thiol function or maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide units; ii) two luminescent groups, one being attached to the unit B via the deprotected oxyamine function or the unmasked aldehyde function and the other being attached to the unit C via the thiol function or maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide units.
  • the nature of the luminescent group or groups that can be used according to the invention is not critical from the moment when they naturally comprise or are functionalisable by a thiol or carbonyl function, or by a maleimide, iodoacetyl or alkyne unit. true, phosphane, cyclooctyne or even azide.
  • the term luminescent group any substance which, when excited at a given wavelength or by a given chemical compound, is capable of emitting a photon, for example fluorophore or rare earth.
  • luminescent groups including fluorophores
  • fluorophores with polymethine chains (ie polyene chain); fluorescent cyanines such as those sold under the references Cy3, Cy3.5, Cy3B, Cy5, Cy5.5 and Cy7 by the company GE Healthcare; fluorescein (sodium fluorescein) and its derivatives such as fluorescein isothiocyanate (FITC) and 6-carboxyfluorescein (6-Fam); rhodamine and its derivatives such as tetramethyl rhodamine isothiocyanate (TRITC); water-soluble derivatives of rhodamine in the form of N-hydroxysuccinimide ester, such as the products sold under the trade name Alexa Fluor® by Invitrogen, for example Alexa Fluor® 488, 500, 514, 532, 546, 555, 568, 594, 610-X, 633, 647, 660, 6
  • the trifunctional reagents according to the present invention can also be used for the preparation of reagents luminescent, in particular fluorescent, also comprising an "acceptor compound" (Q) of the luminescence of the luminescent group
  • reagents constitute what is known as an energy transfer cassette (or FRET cassette ) usable especially for the sequencing of DNA.
  • Another object of the present invention is therefore the use of at least one trifunctional reagent as defined above for the preparation of a power transfer cassette.
  • the grafting of the luminescent group will be carried out on the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from the unit B or via the thiol function or the maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide units of the unit C, and the grafting of the acceptor compound (Q) will be carried out respectively via the thiol function or the maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide units of the unit C or on the deprotected or aldehyde oxyamine function unmasked from unit B.
  • the invention therefore also relates to a transfer cassette of energy, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined above, said reagent comprising a luminescent group (L) and an acceptor compound (Q ) of the luminescence of the luminescent group, L and Q being respectively and indifferently fixed on said trifunctional reagent via the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from the unit B and the function thiol or the units maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide unit C.
  • a transfer cassette of energy characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined above, said reagent comprising a luminescent group (L) and an acceptor compound (Q ) of the luminescence of the luminescent group, L and Q being respectively and indifferently fixed on said trifunctional reagent via the deprotected oxyamine or aldeh
  • the luminescent group (L) that can be used in these energy transfer cassettes may in particular be chosen from the luminescent groups (L) mentioned above and that can be used for the preparation of the luminescent trifunctional reagents in accordance with the present invention.
  • the term "acceptor compound" (Q) is understood to mean any molecule making it possible to reduce or disappear the luminescence of the luminescent group (L) under certain conditions.
  • This compound of various natures, can in particular be a chemical compound (luminescent or not and such as for example fluorescent proteins), a heavy atom or a nanoparticle.
  • acceptor compounds Q
  • fluorescent compounds such as those mentioned above for L groups, in particular rhodamine and its derivatives such as tetramethyl rhodamine (TMR) and Rhodamine 6G (R6G).
  • TMR tetramethyl rhodamine
  • R6G Rhodamine 6G
  • QSY® 7, QSY® 9 and QSY® 21 dyes (Molecular Probes); but also non-fluorescent molecules of the family of azo dyes, such as the compounds sold under the trade names Black HoIe Quencher® (BHQ), for instance BHQ-O, BHQ-I, BHQ-2 and BHQ-3 (Biosearch Technologies); gold particles such as those having a diameter of 1.5 nm sold under the trade name Nanogold Particles ® (Nanoprobes); disazo dyes such as the products sold under the trade names Eclipse Dark Quencher® (Epoch Bioscience) or QSY® 35 (Molecular Probes); the ElleQuencher ® commercial product (Eurogentec); malachite green and the acceptor compounds ("Quenchers") of the cyanine family, such as the compounds sold under the trade names Cy5Q or Cy7Q by the company GE Healthcare.
  • BHQ Black HoIe Quencher®
  • BHQ-O BHQ-O
  • BHQ-I BHQ-2 and BHQ-3
  • the luminescent group (L) and the acceptor compound (Q) are chosen from the following pairs (L / Q): Cy3 / Cy5, Cy5 / Cy7, Cy5 / Alexa Fluor ® 750, Cy3 / Cy5Q, Cy3 / QSY ® 7, Cy3 / QSY ® 9, Cy5 / Cy7Q, Cy5 / QSY ® 21, Cy5 / Cy5, Cy5.5 / Cy5.5, Cy7 / Cy7, R6 ) / Cy5, R6G / Alexa Fluor ® 647, R6G / QSY ® 21, Alexa Fluor ® 532 / Cy5, Alexa Fluor ® 532 / Alexa Fluor ® 647, Alexa Fluor ® 532 / QSY ® 21, Alexa Fluor ® 555 / Cy5, Alexa Fluor ® 555 / Alexa Fluor ® 647, Alexa Fluor ® 555 / Cy5, Alexa Fluor ® 555 /
  • the trifunctional reagents can be used for the preparation of mixed bioconjugates comprising at least one biological molecule and at least one luminescent group.
  • the present invention therefore also relates to a mixed bioconjugate, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined above on which are fixed at least one biological molecule and at least one luminescent group.
  • these mixed bioconjugates may also comprise an acceptor compound (Q) for the luminescence of the luminescent group (L).
  • These mixed bioconjugates are therefore chosen from the trifunctional reagents on which are fixed: i) one or two biological molecules of interest and a luminescent group; or ii) a biological molecule of interest, and two luminescent groups; iii) a biological molecule of interest, a luminescent group, and an acceptor compound (Q) of the luminescence of the luminescent group; said biological molecules and said luminescent moieties and acceptor compound (Q) being attached to the functional reagent at the terminal ends of units A, B and C as described above.
  • Trifunctional reagents and bioconjugates according to the present invention modified or not by a luminescent group at unit C, and in which the oxyamine or aldehyde function of unit B is free (ie non-functionalized by a biological molecule of interest, a fluorescent group or an acceptor compound) can be used for the functionalization of solid supports comprising at least one surface having one or more carbonyl groups, in particular one or more aldehyde or ketone functions or one or more oxyamine functions, respectively.
  • the subject of the present invention is also a solid support, characterized in that it comprises at least one surface functionalized, covalently, with one or more trifunctional reagents, and / or with one or more bioconjugates, said reagents trifunctional and bioconjugated being optionally modified by a luminescent group at the level of the unit C and as defined above.
  • the nature of the solid support is not critical from the moment when it comprises at least one surface having, naturally or after chemical modification, one or more carbonyl groups, in particular one or more aldehyde or ketone functions or respectively one or more primary amine functions, said groups or functions being able to react with the deprotected oxyamine function or respectively with the unmasked aldehyde function of the unit B of the tri functional reagent or the bioconjugate.
  • Such supports there may be mentioned glass, plastic, and metals.
  • the solid support comprises at least one surface functionalized with at least one bioconjugate and then constitutes a biochip such as for example a nucleic acid chip, a protein chip, a polysaccharide chip or a peptide chip, or a biosensor such as for example an immunosensor.
  • a biochip such as for example a nucleic acid chip, a protein chip, a polysaccharide chip or a peptide chip, or a biosensor such as for example an immunosensor.
  • Such supports can be prepared according to a process comprising the following steps: deprotection of the protected oxyamine function, or respectively the unmasking of the masked aldehyde function, present on unit B of at least one trifunctional reagent or from less a bioconjugate according to the invention to obtain a trifunctional reagent or a bioconjugate bearing a deprotected oxyamine function, respectively undefined aldehyde, - the formation of an oxyme bond by contacting said reagent or said bioconjugate carrying the oxyamine function deprotected or respectively aldehyde unmasked with a solid support of which at least one surface has a or more carbonyl groups, respectively primary amine, said oxyme bond ensuring the covalent attachment of said reagent or said bioconjugate to the surface of the support.
  • Such supports may in particular be used for the detection of molecules of interest, in particular for the detection of analytes in a liquid medium.
  • the invention also relates to the use of at least one trifunctional reagent as described above for the preparation of a probe for functional proteomics.
  • Another object of the present invention is therefore a probe for functional proteomics, characterized in that it consists of a trifunctional reagent comprising:
  • reporter tag a group allowing detection (or visualization) and / or purification of a target protein (reporter tag or "reporter tag”)
  • the target protein is an enzyme
  • the pattern recognized by the enzyme and the reactive group allowing a covalent link with the active site of this enzyme belong to the same entity.
  • the other two units of said trifunctional reagent can be used to fix a group allowing detection (fluorophore for example) and a group facilitating purification (biotin, poly tag (histidine), ).
  • the three entities can be fixed indifferently on any unit of the trifunctional pseudopeptide reagent according to the invention.
  • the pattern recognized by the enzyme and the reactive group do not belong to the same entity and are therefore carried by two distinct units of the trifunctional pseudopeptide reagent according to the invention.
  • the last unit of the trifunctional pseudopeptide reagent according to the invention will be used to fix the group allowing detection and / or purification.
  • the unit A is a pseudo-PEG binding arm having an activated carbamate unit reactive with respect to the compounds having a primary amine function
  • unit B is a lysine bearing on its side chain an oxyamine function protected by a Fmoc group, reactive with respect to surfaces having aldehyde functions
  • - Unit C is a lysine having on its side chain a maleimide unit, reactive vis-à-vis the compounds having a thiol function.
  • the strategy for synthesizing the compound (1-1) consists in separately preparing three correctly protected precursors (AI), (BI) and (CI) and then assembling them via coupling reactions to obtain the trifunctional reagent of formula (I-1 ) above according to the present invention.
  • the precursor (AI) is a hydrophilic linker having four ethylene glycol units as well as a carboxylic acid function which will allow the subsequent coupling with the units (BI) and (CI) and a primary amino function that it It is essential to keep protected until the last conversion stage to "activated carbamate". It results from the combination of two molecules of 8-amino-3,6-dioxaoctanoic acid, said molecules having been prepared according to the methods described by Rensen, PC N et al, J. Med. Chem., 2004, 47, 5798-5808; Dondoni, A. et al, J. Org. Chem., 2005, 70, 5508-5518 or Dhawan, R.
  • the reaction mixture was then acidified by adding about 25 ml of a 1 M aqueous potassium hydrogen sulfate solution (KHSO 4 ). This solution was then extracted with 3 times 50 ml of ethyl acetate. The organic phase was dried over sodium sulphate (Na 2 SO 4 ) and then evaporated to dryness. The resulting oily residue was purified by column chromatography on silica gel (40 g) using a gradient of methanol (0 to 6%) in CH 2 Cl 2 as the mobile phase. Compound (7) (0.50 g, 1.87 mmol) was obtained as a colorless oil (50% yield).
  • KHSO 4 a 1 M aqueous potassium hydrogen sulfate solution
  • the precursor (BI) was synthesized in two steps from the protected N-Fmoc derivative of the aminooxyacetic acid (8) previously prepared by reaction between the commercial aminooxyacetic acid and the chloroformate of 9-fluorenylmethanol under Schotten-Baumann conditions (Cipolla L. et al, Bioorg Med Chem, 2002, 10, 1639-1646).
  • the precursor (CI) was synthesized in four steps from ⁇ -Boc- ⁇ -ZL-lysine (11); in this compound Z represents the benzyloxycarbonyl group.
  • the carboxylic acid function is converted to carboxamide (12) by reaction of ammonia with the mixed anhydride intermediately formed according to the method described, for example, by Hofmann, K. et al., J. Am. Chem. Soc., 1978, 100, 3585-3590.
  • the ⁇ -NH 2 function protected by a Z group was released (13) by catalytic hydrogenation in order to be able to couple the maleimide derivative of glycine (14) previously prepared by reaction between glycine and N- (methyloxycarbonyl) maleimide according to the method described by Keller O. et al, HeIv. Chim. Acta, 1975, 58, 531-541.
  • the maleimide derivative (15) was then isolated by chromatography on silica gel with a yield of 51%. Finally, the N-terminus was deprotected by treatment with trifluoroacetic acid to yield the precursor (CI).
  • a voluminous white precipitate immediately formed; this was recovered by filtration and washed with 25 ml of distilled water and then with 25 ml of pentane. The residual water was removed by lyophilization to yield 0.705 g (1.86 mmol) of the compound (12).
  • the filtrate was, moreover, taken up in 20 ml of ethyl acetate, washed with 20 ml of distilled water, dried over Na 2 SO 4 and evaporated to dryness.
  • the white solid obtained was washed with twice 25 ml of pentane and dried under vacuum. An additional amount of compound (12) (0.25 g, 0.66 mmol) was thus obtained. The total yield was 95%.
  • N-Maleoyl-L-Glycine (14) 0.5 g of glycine (6.7 mmol) was dissolved in aqueous NaHCO 3 (2.8 g in 32 ml) and the solution was then cooled to room temperature. 0 ° C (NaCl / ice bath).
  • the TFA was then evaporated and the product was precipitated with ether, washed with ether and lyophilized.
  • the crude TFA salt of precursor (CI) was purified by reversed-phase flash chromatography on a grafted silica column Ci 8 (20 g, elution with an aqueous solution of 0.1% TFA). Fractions containing the product were lyophilized to give 91 mg (0.22 mmol, 27% yield) of the expected precursor (Cl) as a white solid.
  • the trifunctional compound (1-1) was synthesized in 5 steps from the precursors (AI), (BI) and (CI) prepared above in the previous steps.
  • the synthesis protocol of the compound (1-1) is summarized (the three main steps only) in the following scheme 2:
  • the coupling between the precursors (BI) and (CI) was carried out after pre-activation of the precursor (BI) in the form of hydroxysuccinimide ester according to the method described for example in the article by Knorr, R. et al. Tetrahedron Lett., 1989, 30, 1927-1930.
  • the activated ester was then reacted with the precursor (CI) to yield a coupling product (16) which was isolated by silica gel chromatography in 32% yield.
  • treatment with TFA made it possible to eliminate the Boc group and thus obtain the precursor (BlC-1).
  • the final coupling between the precursor (AI) and the precursor (BlC-1) was carried out using the BOP as a coupling reagent.
  • the expected product in still protected form, was purified by chromatography on silica gel. After deprotection, by treatment with trifluoroacetic acid, the N-terminus was converted to activated carbamate by treatment with TV, 4'-disuccinimidyl carbonate (DSC) in anhydrous DMF in the presence of triethylamine. Total conversion of the pseudo-peptide to the compound of formula (I-1) was observed after 30 minutes.
  • the compound of formula (1-1) expected was then purified by flash reverse phase chromatography on a grafted silica column Ci 8 .
  • 0.2 g (0.36 mmol) of the precursor (BI) obtained above in step 2) d) were dissolved in 2 ml of anhydrous acetonitrile. 67.4 ⁇ l (0.38 mmol) of DIEA and 1.16 mg (0.38 mmol) of O- (N-succinimidyl) -N, N, N ', N'-tetramethyl-uronium tetrafluoroborate were then added. (TSTU) and the reaction mixture was stirred at room temperature for 45 minutes under an argon atmosphere. The conversion of the precursor (BI) to its N-hydroxysuccinimide ester was monitored by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH, 85:15, v / v).
  • Example 1 a convergent synthesis strategy, as in Example 1) of separately preparing the precursors (A), (B) and (C) and to assemble them.
  • precursor (A) the precursor (AI) synthesized in Example 1) above was used.
  • precursor (B) a precursor of formula (BI) was synthesized in a substantially different route and improved with respect to that used for the synthesis of the precursor (BI) of Example 1).
  • the synthesis of the precursor (C-2) was carried out from the commercial Boc-Cys (SEt) -OH. 1) Synthesis of the Precursor (BI): ⁇ -Frn-butyloxyearbonyl-1-fluorenylmethyloxycarboxyl-aminooxy-acetyl-L-lysine
  • the precursor (B-I) was synthesized from the protected N-Fmoc derivative of the aminooxyacetic acid (8) previously prepared as in Example 1), step 2) a).
  • the precursor (C-2) was synthesized in two steps from 7V- (tert-butyloxycarbonyl) -S- (S-ethyl) -cysteine (19) according to scheme 3 below:
  • the carboxylic acid function of the compound (19) is converted into carboxamide (20) by reaction of the ammonia with the mixed anhydride intermediately formed according to the method described for example by Hofmann, K. and al, J. Am. Chem. Soc., 1978, 100, 3585-3590.
  • the N-terminus of the compound (20) is deprotected by treatment with trifluoroacetic acid to yield the precursor (C-2).
  • the compound (20) obtained above in the preceding step was slowly dissolved in 14 ml of a mixture of TFA / H 2 O (95: 5 v / v) with stirring at a temperature of between 0 ° C. and room temperature for 1 hour.
  • the reaction was checked by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH 90:10 v / v) and the reaction mixture was evaporated to dryness. A minimum amount of osmosis water was then added and the resulting aqueous solution was lyophilized to yield the precursor (C-2) as a yellowish powder with a yield of 89%.
  • the reagent (1-2) was synthesized in three steps from the precursors (A-I), (B-I) and (C-2) previously synthesized according to scheme 4 below:
  • the coupling between the precursors (BI) and (C-2) was carried out after pre-activation of the precursor (BI) in the form of hydroxybenzotriazole ester according to the method described for example in the article by Konig, W. and al, Chem. Ber., 1970, 103, 788-798.
  • the activated ester was then reacted with the precursor (CI) to yield a coupling product (21).
  • a base DIEA
  • the intermediate (BlC-2) was purified by chromatography on silica gel with a yield of 61%.
  • the expected compound (22) was purified by HPLC-PI (System C, i.e. using a Varian column Kromasil ® Ci 8 to 10 microns and of dimensions 21.2 x 250 mm eluting with a mixture of acetonitrile and water osmosis by passing 90% of RO water for 5 minutes, then a linear gradient ranging from 10 to 40% of CH 3 CN in 15 minutes, then from 40% to 70% of CH 3 CN, with a flow rate of 20.0 ml / min, a dual UV detection was made at 254 and 305 nm) .
  • HPLC-PI System C, i.e. using a Varian column Kromasil ® Ci 8 to 10 microns and of dimensions 21.2 x 250 mm eluting with a mixture of acetonitrile and water osmosis by passing 90% of RO water for 5 minutes, then a linear gradient ranging from 10 to 40% of CH 3 CN in 15 minutes, then from 40% to 70% of CH 3 CN, with

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Abstract

The invention relates to a three-functional pseudo-peptidic reagent, to the various uses thereof, in particular for preparing bioluminescent reagents or optionally luminescent bio-conjugates, to the use of said reagents and bio-conjugates for functionalising solid substrates, and to the use of solid substrates thus functionalised in the detection of molecules of interest.

Description

RÉACTIF PSEUDO PEPTIDIQUE TRIFONCTIONNEL, SES UTILISATIONS TRIFUNCTIONAL PEPTIDE PSEUDO REAGENT, ITS USES
ET APPLICATIONSAND APPLICATIONS
La présente Invention est relative à un réactif trifonctionnel pseudopeptidique, à ses diverses utilisations, notamment pour la préparation de réactifs luminescents ou de bioconjugués éventuellement luminescents, à l'utilisation de ces réactifs et bioconjugués pour la fonctionnalisation de supports solides, ainsi qu'à l'utilisation des supports solides ainsi fonctionnalisés pour la détection de molécules d'intérêt.The present invention relates to a trifunctional pseudopeptide reagent, for its various uses, in particular for the preparation of luminescent reagents or bioconjugates, optionally luminescent, the use of these reagents and bioconjugates for the functionalization of solid supports, as well as for the use of the solid supports thus functionalized for the detection of molecules of interest.
De nombreuses applications mettant en jeu des bioconjugués dérivés de biopolymères (acides nucléiques, protéines, polysaccharides, ...) impliquent de pouvoir fixer de façon covalente (fixation réversible ou non) ces bioconjugués à une seconde architecture moléculaire (biopolymère, support solide, ...) et de les détecter et/ou les quantifier avec précision (détection optique, radioactive, ...). Ainsi, il est indispensable de disposer d'outils permettant d'associer efficacement un biopolymère à d'autres (macro)molécules sans trop altérer les propriétés de chacun des partenaires impliqués dans l'architecture moléculaire résultante et ciblée.Many applications involving bioconjugates derived from biopolymers (nucleic acids, proteins, polysaccharides, etc.) involve being able to covalently (reversibly or non-reversibly) attaching these bioconjugates to a second molecular architecture (biopolymer, solid support,. ..) and to detect and / or quantify them accurately (optical detection, radioactive, ...). Thus, it is essential to have tools for effectively combining a biopolymer with other (macro) molecules without significantly altering the properties of each of the partners involved in the resulting and targeted molecular architecture.
Dans ce but, de nombreuses petites molécules bifonctionnelles (plus connues sous l'expression anglaise de "bifunctional cross-linking reagents") ont été développées. Un grand nombre est commercialisé par la société Pierce. Cependant, il est intéressant de noter que plusieurs groupes académiques continuent de travailler au développement de nouveaux réactifs bifonctionnels toujours plus sophistiqués et permettant l'élaboration de bioconjugués toujours plus complexes.For this purpose, many small bifunctional molecules (better known as "bifunctional cross-linking reagents") have been developed. A large number are marketed by Pierce. However, it is interesting to note that several academic groups continue to work on the development of new bifunctional reagents that are increasingly sophisticated and allow the development of ever more complex bioconjugates.
Comme mentionné précédemment, il est parfois indispensable de disposer non pas de deux mais de trois fonctions orthogonales (i.e., chaque fonction est capable de réagir sélectivement avec un partenaire ciblé). Ainsi, le développement de réactifs trifonctionnels s'impose.As mentioned above, it is sometimes necessary to have not two but three orthogonal functions (i.e., each function is able to react selectively with a targeted partner). Thus, the development of trifunctional reagents is required.
C'est ainsi qu'il a déjà été décrit, par exemple dans les articles de Alley, S. C. et al, J. Am. Chem. Soc, 2000, 122, 6126-6127 et de Sinz, A. et al, J. Am. Soc. Mass Spectrom., 2005, 16, 1921-1931, l'utilisation de différents types de réactifs trifonctionnels parmi lesquels figure notamment le sulfo-SBED disponible auprès de la société Pierce (Rockford, IL, USA), c'est-à-dire le sulfosuccinimidyl-2- [6(biotinamido)-2-(p-azidobenzimidazo)-hexanoamido]éthyl- 1 ,3 '-dithiopropionate, pour l'étude des interactions protéines/protéines. Ce réactif trifonctionnel est composé d'une aminé réactive et d'un site photoréactif. Le sulfo-SBED possède la structure suivante :Thus it has already been described, for example in the articles by Alley, SC et al., J. Am. Chem. Soc., 2000, 122, 6126-6127 and Sinz, A. et al., J. Am. Soc. Mass Spectrom., 2005, 16, 1921-1931, the use of various types of trifunctional reagents, including, in particular, sulfo-SBED available from the company Pierce (Rockford, IL, USA), that is to say sulfosuccinimidyl-2- [6 (biotinamido) -2- (p-azidobenzimidazo) -hexanoamido] ethyl-1,3'-dithiopropionate, for the study of protein / protein interactions. This trifunctional reagent is composed of a reactive amine and a photoreactive site. The sulfo-SBED has the following structure:
Site photoréactif Cependant, le sulfo-SBED ne donne pas entièrement satisfaction dans la mesure où il n'est pas possible d'en moduler le caractère hydrophobe/hydrophile et surtout le troisième motif fonctionnel (i.e. la biotine) permet uniquement une interaction forte (quasi-covalente) avec des partenaires préalablement conjugués à l'avidine (glycoprotéine) ou la streptavidine, ce qui en limite fortement l'utilisation.Photoreactive site However, the sulfo-SBED is not entirely satisfactory inasmuch as it is not possible to modulate the hydrophobic / hydrophilic nature and especially the third functional unit (ie biotin) allows only strong interaction (quasi -covalent) with partners previously conjugated to avidin (glycoprotein) or streptavidin, which greatly limits its use.
Il a également déjà été décrit, notamment dans la demande internationale WO 00/02050, des réactifs trifonctionnels permettant de préparer des bioconjugués constitués d'un motif central trifonctionnel choisi parmi le triaminobenzène, le tricarboxybenzène, la dicarboxyaniline et l'acide diaminobenzoïque, sur lequel sont rattachées, par l'intermédiaire de trois bras de liaisons distincts, un ligand d'affinité, un groupement réactif vis-à-vis d'une biomolécule et un agent effecteur. Ce réactif présente cependant l'inconvénient de posséder un motif central trifonctionnel constitué d'au moins deux fonctions chimiques identiques (i.e., fonctions acide carboxylique ou aminé) ce qui restreint le choix des fonctions complémentaires portées par les bras de liaison ce qui peut avoir un effet limitant.It has also already been described, especially in International Application WO 00/02050, trifunctional reagents for preparing bioconjugates consisting of a trifunctional central unit selected from triaminobenzene, tricarboxybenzene, dicarboxyaniline and diaminobenzoic acid, on which three affinity ligands, a biomolecule-reactive group and an effector agent are attached via three distinct linker arms. This reagent, however, has the disadvantage of having a trifunctional central unit consisting of at least two identical chemical functions (ie, carboxylic acid or amine functions) which restricts the choice of the complementary functions carried by the connecting arms which may have a limiting effect.
Dans d'autres applications, notamment pour la détection d'analytes par immunofluorescence en phase hétérogène, il a déjà été proposé d'utiliser des réactifs trifonctionnels (tripodes) comportant trois pôles fonctionnels distincts, à savoir un groupement luminescent (L), une molécule (B) choisie parmi l'analyte à détecter, un analogue ou un fragment de celui-ci et enfin une fonction assurant la fixation dudit réactif trifonctionnel sur la surface d'un support solide (voir notamment la demande de brevet français publiée sous le n° FR 2 847 984 et l'article correspondant de Volland, H. et al, Anal. Chem., 2005, 77, 1986-1904). Ces réactifs ne sont cependant pas utilisables dans tout type d'application.In other applications, particularly for the detection of analytes by immunofluorescence in the heterogeneous phase, it has already been proposed to use trifunctional reagents (tripods) comprising three distinct functional poles, namely a luminescent group (L), a molecule (B) selected from the analyte to be detected, an analogue or a fragment thereof and finally a function ensuring the attachment of said trifunctional reagent to the surface of a solid support (see in particular French patent application published under No. FR 2,847,984 and the corresponding article by Volland, H. et al., Anal. Chem., 2005, 77, 1986-1904). These reagents are however not usable in any type of application.
Le développement des nouvelles technologies toujours plus pointues nécessite la création et l'utilisation de bioconjugués toujours plus sophistiqués qu'il n'est pas facile (voir impossible) d'atteindre avec les réactifs bi fonctionnel s ou trifonctionnels actuellement disponibles sur le marché.The development of ever more advanced technologies requires the creation and use of ever more sophisticated bioconjugates that it is not easy (impossible to achieve) to achieve with the bi functional or trifunctional reagents currently available on the market.
C'est donc afin de remédier à l'ensemble de ces inconvénients et de pourvoir en particulier à une nouvelle famille de réactifs trifonctionnels dans lesquels il est possible de faire varier de façon très large la nature de chaque fonction pour pouvoir associer efficacement un biopolymère à d'autres (macro)molécules sans altérer trop les propriétés de chacun des partenaires impliqués dans l'architecture moléculaire résultante et ciblée, que les Inventeurs ont mis au point ce qui fait l'objet de la présente Invention. De façon plus précise, les Inventeurs se sont donnés pour but de pourvoir à un réactif trifonctionnel permettant de lier de façon covalente (fixation réversible ou non) un bioconjugué à une seconde architecture moléculaire telle qu'un biopolymère ou un support solide.It is therefore in order to remedy all of these disadvantages and to provide in particular a new family of trifunctional reagents in which it is possible to vary very broadly the nature of each function to be able to effectively associate a biopolymer with other (macro) molecules without unduly altering the properties of each of the partners involved in the resulting and targeted molecular architecture, that the inventors have developed what is the subject of the present invention. More specifically, the inventors have set themselves the goal of providing a trifunctional reagent for covalently binding (reversible binding or not) a bioconjugate to a second molecular architecture such as a biopolymer or a solid support.
La présente Invention a donc pour premier objet un réactif trifonctionnel pseudopeptidique, caractérisé par le fait qu'il comprend au moins les trois unités structurales réactives A, B et C suivantes :The present invention therefore firstly relates to a trifunctional pseudopeptide reagent, characterized in that it comprises at least the following three reactive structural units A, B and C:
(a) une unité A constituée d'une chaîne hydrophile de pseudo- poly(éthylène glycol) (chaîne pseudo-PEG) interrompue par au moins une fonction amide et possédant deux extrémités El et E2, ladite extrémité El étant libre et comportant un motif terminal choisi parmi le groupement amino (-NH2), les carbamates activés et les esters activés, et ladite extrémité E2 comportant un atome de carbone terminal porteur d'une fonction carbonyle, ledit atome de carbone étant engagé dans une fonction amide (-C(O)-NH-) formée avec l'atome d'azote d'une fonction α-amine portée par l'unité B ;(a) a unit A consisting of a hydrophilic chain of pseudopoly (ethylene glycol) (pseudo-PEG chain) interrupted by at least one amide function and having two ends E1 and E2, said E1 end being free and having a pattern terminal selected from amino group (-NH 2 ), activated carbamates and activated esters, and said E2 end having a terminal carbon atom carrying a carbonyl function, said carbon atom being engaged in an amide function (-C (O) -NH-) formed with the nitrogen atom of an α-amine function carried by the unit B;
(b) une unité B constituée d'un acide aminé choisi parmi les acides α-aminés de la série L, D et leurs mélanges racémiques, ledit acide aminé possédant sur sa chaîne latérale au moins une fonction oxyamine protégée par un groupement protecteur ou au moins une fonction aldéhydique masquée ; et (c) une unité C constituée d'un acide aminé choisi parmi les acides α-aminés de la série L, D et leurs mélanges racémiques, ledit acide aminé possédant sur sa chaîne latérale au moins un motif thiol, maléimide, iodoacétyle, azoture, alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne ; lesdites unités B et C étant liées entre elles par l'intermédiaire d'une fonction amide formée entre l'atome de carbone porteur de la fonction carbonyle de l'acide α-aminé constituant l'unité B et l'atome d'azote de la fonction α-amine de l'acide α-aminé constituant l'unité C.(b) a unit B consisting of an amino acid chosen from α-amino acids of the L, D series and their racemic mixtures, said amino acid having on its side chain at least one oxyamine function protected by a protecting group or at least one minus a masked aldehyde function; and (c) a unit C consisting of an amino acid selected from α-amino acids of the L, D series and their racemic mixtures, said amino acid having on its side chain at least one thiol, maleimide, iodoacetyl, azide unit, true alkyne, phosphane or cyclooctyne; said units B and C being linked to one another via an amide function formed between the carbon atom carrying the carbonyl function of the α-amino acid constituting the unit B and the nitrogen atom of the α-amine function of the α-amino acid constituting the unit C.
L'originalité principale de ces structures réside dans l'association d'acides aminés (naturels ou modifiés) protégés sur leurs chaînes latérales par des groupes protecteurs sélectionnés, et d'une chaîne pseudo-PEG fonctionnalisée dont la longueur est facilement modulable. Même si la présence de plusieurs fonctions chimiques (protégées ou non) entraîne nécessairement des problèmes lors de la préparation de ces réactifs (incompatibilités entre fonctions, dégradation et/ou déprotection prématurée de certains groupes protecteurs, ...), la structure segmentée en trois unités structurales distinctes (préparées indépendamment les unes des autres puis couplées entre elles lors des étapes finales d'élaboration du réactif trifonctionnel) permet une stratégie de synthèse hautement convergente qui limite au maximum la présence simultanée de motifs chimiques incompatibles entre eux. Par ailleurs, une grande diversité structurale (modulation de la géométrie, de la longueur, des propriétés de physicochimiques et la solubilité en particulier, ...) est accessible en modifiant uniquement l'une des trois unités structurale du réactif trifonctionnel.The main originality of these structures lies in the combination of amino acids (natural or modified) protected on their side chains by selected protective groups, and a functionalized pseudo-PEG chain whose length is easily adjustable. Even if the presence of several chemical functions (protected or not) necessarily entails problems during the preparation of these reagents (incompatibilities between functions, degradation and / or premature deprotection of certain protective groups, ...), the structure segmented into three Separate structural units (prepared independently of each other and then coupled together in the final steps of developing the trifunctional reagent) allows for a highly convergent synthesis strategy that minimizes the simultaneous presence of incompatible chemical motifs between them. Furthermore, a large structural diversity (modulation of geometry, length, physicochemical properties and solubility in particular, etc.) is accessible by modifying only one of the three structural units of the trifunctional reagent.
Selon l'Invention, on entend par chaîne "pseudo"-PEG, une chaîne ayant de grandes similitudes de structure avec la chaîne PEG : mais qui diffère par la présence de un ou plusieurs groupements fonctionnels (ester, amide, carbamate, urée, ...) en son sein.According to the invention, the term "pseudo" -PEG string, a string having great similarities of structure with the PEG chain: but which differs by the presence of one or more functional groups (ester, amide, carbamate, urea, ...) within it.
Selon l'Invention, on entend par alcyne "vrai", un alcyne dont la triple liaison est monosubstituée par un groupement R : R ^ H Les trois unités structurales réactives constituants les réactifs trifonctionnels conformes à la présente Invention permettent de réaliser des réactions totalement chimio sélectives dans des conditions douces (en particulier dans les milieux aqueux dans lesquels sont solubles les biopolymères).According to the invention, the term "true" alkyne is understood to mean an alkyne whose triple bond is monosubstituted by a R: R 3 group. The three reactive structural units constituting the trifunctional reagents according to the present invention make it possible to carry out reactions totally chemo-selective under mild conditions (especially in aqueous media in which biopolymers are soluble).
Le motif carbamate activé ou ester activé pouvant être présent à l'extrémité El libre de la chaîne pseudo-PEG constituant l'unité A est réactif vis-à-vis des composés possédant un motif réactif complémentaire tel qu'une fonction aminé (généralement une aminé primaire aliphatique). Par ailleurs, la fonction aminé primaire pouvant alternativement être présente à l'extrémité El libre de la chaîne pseudo-PEG constituant l'unité A est réactive vis-à-vis des composés possédant un motif complémentaire tel qu'un carbamate ou un ester activé. Cette extrémité El permet notamment la fixation de macromolécules biologiques qui comportent, naturellement ou non, lesdites fonctions réactives complémentaires (anticorps, acides nucléiques ou analogues, polysaccharides, protéines, peptides, radionucléides, toxines, inhibiteurs d'enzymes, haptènes, ...etc.).The activated carbamate or activated ester unit which may be present at the free E-terminus of the pseudo-PEG chain constituting unit A is reactive with respect to compounds having a complementary reactive unit such as an amine function (generally a primary amine aliphatic). Moreover, the primary amine function which may alternatively be present at the free E-terminus of the pseudo-PEG chain constituting unit A is reactive with respect to compounds having a complementary unit such as a carbamate or an activated ester . This end E1 allows in particular the fixation of biological macromolecules which comprise, naturally or not, said complementary reactive functions (antibodies, nucleic acids or analogs, polysaccharides, proteins, peptides, radionuclides, toxins, enzyme inhibitors, haptens, etc.). .).
Le groupement de l'unité B, après activation éventuelle, c'est-à-dire après déprotection dans le cas de la fonction oxyamine ou après démasquage dans le cas de la fonction aldéhydique, dans des conditions douces compatibles avec la stabilité des différents partenaires impliqués, est réactif vis-à-vis des composés ou des matériaux possédant un ou plusieurs groupements carbonylés (aldéhyde, ...) ou alternativement aminés. Parmi de tels composés, on peut notamment citer les macromolécules telles qu'anticorps, acides nucléiques ou analogues, liposomes, polysaccharides, protéines, peptides, principes actifs, radionucléides, toxines, fluorophores, inhibiteurs d'enzymes, haptènes, ...etc.The grouping of unit B, after possible activation, that is to say after deprotection in the case of the oxyamine function or after unmasking in the case of the aldehyde function, under mild conditions compatible with the stability of the various partners involved, is reactive vis-à-vis compounds or materials having one or more carbonyl groups (aldehyde, ...) or alternatively amine. Among such compounds, mention may in particular be made of macromolecules such as antibodies, nucleic acids or the like, liposomes, polysaccharides, proteins, peptides, active principles, radionuclides, toxins, fluorophores, enzyme inhibitors, haptens, etc.
Le motif thiol défini comme substituant latéral possible de l'acide α- aminé constituant l'unité C, est réactif vis-à-vis des composés ou des matériaux comportant un motif maléimide ou iodoacétyle. Les motifs maléimide et iodoacétyle, définis comme substituants latéraux possibles de l'acide α-aminé constituant l'unité C, sont réactifs vis-à-vis des composés ou des matériaux possédant une fonction thiol ou une cystéine après leur déprotection éventuelle. Enfin, le motif azoture défini comme substituant latéral possible de l'acide α-aminé constituant l'unité C est réactif vis-à-vis des composés ou des matériaux possédant un motif alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne et alternativement les motifs alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne définis comme substituants latéraux possibles de l'acide α-aminé constituant l'unité C sont réactifs vis-à-vis des composés ou des matériaux possédant un motif azoture. Ce site réactionnel peut notamment être utilisé pour la fixation d'un groupement fluorophore porteur d'une fonction complémentaire réactive vis-à-vis des motifs thiol, maléimide iodoacétyle, azoture, alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne présents sur l'unité C.The thiol unit defined as a possible side substituent for the α-amino acid constituting the unit C is reactive with respect to the compounds or materials comprising a maleimide or iodoacetyl unit. The maleimide and iodoacetyl units, defined as possible side substituents of the α-amino acid constituting the unit C, are reactive with respect to the compounds or materials having a thiol function or a cysteine after their possible deprotection. Finally, the azide unit defined as possible lateral substituent of the α-amino acid constituting the unit C is reactive with respect to the compounds or materials having a true alkyne unit, phosphane or cyclooctyne and alternatively the true alkyne units, phosphane or cyclooctyne defined as possible side substituents of the α-amino acid constituting unit C are reactive with respect to compounds or materials having an azide pattern. This reaction site can in particular be used for the attachment of a fluorophore group carrying a complementary functional group reactive with the thiol, maleimide iodoacetyl, azide, true alkyne, phosphane or cyclooctyne units present on the C unit.
Selon une forme de réalisation particulière de la présente Invention, la chaîne pseudo-PEG de l'unité A est choisie parmi les chaînes de formule (A-I) suivante :According to a particular embodiment of the present invention, the pseudo-PEG chain of unit A is chosen from the following chains of formula (A-I):
(A-I) dans laquelle : (AI) in which:
- Ri représente une aminé primaire, un motif carbamate activé ou un motif ester activé,Ri represents a primary amine, an activated carbamate unit or an activated ester unit,
- m et n, identiques ou différents, sont des nombres entiers compris entre 2 et 10 inclusivement,- m and n, identical or different, are integers between 2 and 10 inclusive,
- p est un nombre entier compris entre 1 et 10 inclusivement,p is an integer from 1 to 10 inclusive,
- la flèche représente la liaison covalente reliant la fonction amide de l'extrémité E2 de la chaîne pseudo-PEG à l'unité B ou C.the arrow represents the covalent bond connecting the amide function of the E2 end of the pseudo-PEG chain to the unit B or C.
Selon une forme de réalisation préférée de l'Invention, la chaîne pseudo-PEG est choisie parmi les chaînes pseudo-PEG de formule (A-I) ci-dessus dans lesquelles m = n = 2 et p = 1.According to a preferred embodiment of the invention, the pseudo-PEG chain is chosen from the pseudo-PEG chains of formula (A-I) above in which m = n = 2 and p = 1.
Parmi les groupements carbamates activés pouvant être présents à l'extrémité El de la chaîne pseudo-PEG de l'unité A, on peut en particulier citer le carbamate de N-hydroxysuccinimidyle, le carbamate de sulfo N-hydroxysuccinimidyle, le carbamate de N-hydroxyphtalimidyle, le carbamate de N-hydroxypipéridinyle, le carbamate de />-nitrophényle et le carbamate de pentafluorophényle ; le carbamate de N-hydroxysuccinimidyle étant tout particulièrement préféré. Parmi les groupements esters activés pouvant être présents à l'extrémité El de la chaîne pseudo-PEG de l'unité A, on peut en particulier citer l'ester de N-hydroxysuccinimidyle, l'ester de sulfo N-hydroxysuccinimidyle, l'ester de cyanométhyle, l'ester de N-hydroxyphtalimidyle, l'ester de N-hydroxypipéridinyle, l'ester de p-nitrophényle, l'ester de pentafluorophényle, les esters de benzotriazole, les esters d'hydroxybenzotriazole et les esters d'hydroxyazabenzotriazole ; l'ester de N-hydroxysuccinimidyle étant particulièrement préféré.Among the activated carbamate groups that may be present at the E1 end of the pseudo-PEG chain of unit A, mention may in particular be made of N-hydroxysuccinimidyl carbamate, N-hydroxysuccinimidyl carbamate, N-carbamate and the like. hydroxyphthalimidyl, N-hydroxypiperidinyl carbamate, β-nitrophenyl carbamate and pentafluorophenyl carbamate; N-hydroxysuccinimidyl carbamate being very particularly preferred. Among the activated ester groups that may be present at the E1 end of the pseudo-PEG chain of unit A, there may be mentioned in particular the N-hydroxysuccinimidyl ester, the N-hydroxysuccinimidyl sulfo ester, the ester cyanomethyl, the N-hydroxyphthalimidyl ester, the N-hydroxypiperidinyl ester, the p-nitrophenyl ester, the pentafluorophenyl ester, the benzotriazole esters, the hydroxybenzotriazole esters and the hydroxyazabenzotriazole esters; the N-hydroxysuccinimidyl ester being particularly preferred.
Parmi les acides α-aminés utilisables pour l'unité B, on peut notamment citer la lysine, l'homolysine, l'ornithine, l'acide 2,4-diaminobutanoïque (DABA) et l'acide 2,3-diaminopropanoïque.Among the α-amino acids that can be used for unit B, there may be mentioned lysine, homolysine, ornithine, 2,4-diaminobutanoic acid (DABA) and 2,3-diaminopropanoic acid.
Parmi de tels acides α-aminés, la lysine est particulièrement préférée.Among such α-amino acids, lysine is particularly preferred.
Parmi les acides α-aminés utilisables pour l'unité C, on peut notamment citer la lysine, la cystéine, l'homolysine, l'ornithine, l'acide 2,4-diaminobutanoïque (DABA), l'acide 2,3-diaminopropanoïque, l'acide aminomercapto-acétique, Thomocystéine, la 5-mercapto-norvaline, la 6-mercapto- norleucine, l'acide 2-amino-7-mercapto-heptanoïque, et l'acide 2-amino-8-mercapto- octanoïque.Among the α-amino acids which can be used for unit C, there may be mentioned in particular lysine, cysteine, homolysine, ornithine, 2,4-diaminobutanoic acid (DABA), 2,3-diaminobutanoic acid (DABA), diaminopropanoic acid, aminomercaptoacetic acid, Thomocysteine, 5-mercapto-norvaline, 6-mercapto-norleucine, 2-amino-7-mercapto-heptanoic acid, and 2-amino-8-mercaptoacetic acid; octanoic.
Parmi de tels acides aminés, la lysine et la cystéine sont particulièrement préférées.Among such amino acids, lysine and cysteine are particularly preferred.
Les groupements protecteurs de la fonction oxyamine de la chaîne latérale de l'acide α-aminé constituant l'unité B, sont de préférence choisis parmi les groupements protecteurs labiles en conditions douces tels que le 9-fluorénylméthoxycarbonyle (Fmoc), le benzyloxycarbonyle (Z), l'allyloxycarbonyle (Alloc), le trichloroéthoxycarbonyle (Troc), le triméthylsilyléthoxycarbonyle (Teoc), le pyridyldithioéthoxycarbonyle (Pydec), le 2-(2-nitrophényl)-propyloxycarbonyle (ΝPPOC), l'azométhyloxycarbonyle (Azoc), le 2-(triméthylsilyl)éthanesulfonyle (Ses) et le phtalimide.The protective groups for the oxyamine function of the side chain of the α-amino acid constituting the unit B, are preferably chosen from labile protective groups under mild conditions such as 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), benzyloxycarbonyl (Z ), allyloxycarbonyl (Alloc), trichloroethoxycarbonyl (Troc), trimethylsilylethoxycarbonyl (Teoc), pyridyldithioethoxycarbonyl (Pydec), 2- (2-nitrophenyl) -propyloxycarbonyl (ΝPPOC), azomethyloxycarbonyl (Azoc), 2 - (trimethylsilyl) ethanesulfonyl (Ses) and phthalimide.
Parmi de tels groupements protecteurs, les groupements Fmoc et phtalimide sont particulièrement préférés.Among such protective groups, the groups Fmoc and phthalimide are particularly preferred.
Au sens de la présente Invention, on entend par "fonction aldéhydique masquée", toute fonction aldéhyde ou cétone incluse dans une molécule organique choisie parmi la serine ou n'importe qu'elle molécule organique contenant le motif 1,2-diol (-CH(OH)-CH(OH)-), 1 ,2-amino-alcool ou 1,2-hydroxythiol. Parmi de telles molécules organiques, on peut notamment citer l'acide tartrique, l'acide glycérique, l'acide 2,3-dihydroxypropanoïque, l'acide 3,4-dihydroxybutanoïque, l'acide 4,5-dihydroxypentanoïque et l'acide 3-amino-2-hydroxypropanoïque.For the purpose of the present invention, the term "masked aldehyde function", any aldehyde or ketone function included in a molecule organic compound selected from serine or any organic molecule containing the 1,2-diol (-CH (OH) -CH (OH) -), 1,2-amino-alcohol or 1,2-hydroxythiol moiety. Among such organic molecules, there may be mentioned tartaric acid, glyceric acid, 2,3-dihydroxypropanoic acid, 3,4-dihydroxybutanoic acid, 4,5-dihydroxypentanoic acid and the acid. 3-amino-2-hydroxypropanoic acid.
Au sens de la présente Invention, on entend par "conditions douces", l'utilisation de réactifs de déprotection de la fonction oxyamine ou de démasquage de la fonction aldéhydique fonctionnant à température ambiante et à pH neutre ou dans une gamme de pH comprise entre environ 5 et 9 inclusivement.For the purposes of the present invention, the term "mild conditions", the use of oxyamine function deprotection reagents or unmasking function of the aldehyde function at room temperature and at neutral pH or in a pH range between about 5 and 9 inclusive.
A titre de réactif de déprotection ou de démasquage, on peut notamment citer l'acide périodique (HIO4), les métaperiodates tels que le métaperiodate de sodium (NaIO4) et le métaperiodate de potassium (KIO4), ainsi que les periodates de tétraalkylammonium.As a deprotection or unmasking reagent, mention may in particular be made of periodic acid (HIO 4 ), metaperiodates such as sodium metaperiodate (NaIO 4 ) and potassium metaperiodate (KIO 4 ), as well as the periodates of tetraalkylammonium.
Parmi les réactifs trifonctionnels conformes à l'Invention, on peut tout particulièrement citer ceux qui sont choisis parmi les composés de formule (I) suivante :Among the trifunctional reagents according to the invention, mention may be made especially of those selected from compounds of formula (I) below:
(I) dans laquelle :(I) in which:
- Ri, m, n et p ont les mêmes significations que celles indiquées ci- dessus pour l'unité de formule (A-I),R 1, m, n and p have the same meanings as those indicated above for the unit of formula (A-I),
- Xi et X2, identiques ou différents et conjointement avec l'atome de carbone auxquels ils sont liés, représentent la chaîne hydrocarbonée d'un acide α-aminé,- X 1 and X 2 , which are identical or different and, together with the carbon atom to which they are bonded, represent the hydrocarbon chain of an α-amino acid,
Proc est un groupement protecteur choisi parmi le 9-fluorénylméthoxycarbonyle (Fmoc), le benzyloxycarbonyle (Z), l'allyloxycarbonyle (Alloc), le trichloroéthoxycarbonyle (Troc), le triméthylsilyléthoxycarbonyle (Teoc), le pyridyldithioéthoxycarbonyle (Pydec), le 2-(2-nitrophényl)-propyloxycarbonyle (NPPOC), l'azométhyloxycarbonyle (Azoc), le 2-(triméthylsilyl)éthanesulfonyle (Ses) et le phtalimide;Proc is a protecting group selected from 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), benzyloxycarbonyl (Z), allyloxycarbonyl (Alloc), trichloroethoxycarbonyl (Troc), trimethylsilylethoxycarbonyl (Teoc), pyridyldithioethoxycarbonyl (Pydec), 2- ( 2-nitrophenyl) -propyloxycarbonyle (NPPOC), azomethyloxycarbonyl (Azoc), 2- (trimethylsilyl) ethanesulfonyl (Ses) and phthalimide;
- Fonc est un motif thiol, maléimide, iodoacétyle, azoture, alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne.- Func is a thiol, maleimide, iodoacetyl, azide, true alkyne, phosphane or cyclooctyne unit.
Selon une forme de réalisation particulièrement préférée de l'Invention Xi est une chaîne n-butyle.According to a particularly preferred embodiment of the invention, Xi is an n-butyl chain.
Selon une autre forme de réalisation particulièrement préférée de l'Invention, X2 est une chaîne éthyle ou n-butyle.According to another particularly preferred embodiment of the invention, X 2 is an ethyl or n-butyl chain.
Selon une forme de réalisation particulièrement préférée de l'Invention, les composés de formule (I) ci-dessus sont choisis parmi les composés de formules (I- 1) à (1-6) suivantes :According to a particularly preferred embodiment of the invention, the compounds of formula (I) above are chosen from the following compounds of formulas (I-1) to (1-6):
(M) (M)
(1-2) (1-2)
(1-5) (1-5)
(1-6).(1-6).
Les réactifs trifonctionnels conformes à l'Invention peuvent être préparés selon des méthodes de synthèse convergentes selon lesquelles chacune des unités A, B et C est préparée individuellement, celles-ci étant ensuite assemblées pour conduire au réactif trifonctionnel attendu. Ces méthodes de synthèse convergentes mettent en œuvre des réactions classiques bien connues de l'homme du métier et dont le détail est donné dans les exemples de synthèse illustrant la présente demande.The trifunctional reagents according to the invention can be prepared according to convergent synthesis methods according to which each of the units A, B and C is prepared individually, these being then assembled to lead to the expected trifunctional reagent. These convergent synthesis methods implement conventional reactions well known to those skilled in the art and the details of which are given in the synthesis examples illustrating the present application.
Grâce à leur trifonctionnalité, les réactifs conformes à la présente Invention et tels que décrits ci-dessus peuvent avoir de multiples utilisations et applications.Thanks to their trifunctionality, the reagents according to the present invention and as described above can have multiple uses and applications.
Les réactifs trifonctionnels conformes à la présente Invention peuvent en premier lieu être utilisés pour la préparation de bioconjugués.The trifunctional reagents according to the present invention can firstly be used for the preparation of bioconjugates.
Un autre objet de la présente Invention est donc l'utilisation d'au moins un réactif trifonctionnel tel que défini précédemment pour la préparation d'un bioconjugué.Another object of the present invention is the use of at least one trifunctional reagent as defined above for the preparation of a bioconjugate.
Au sens de la présente Invention, on entend par bioconjugué, tout réactif trifonctionnel tel que décrit précédemment sur lequel est fixée au moins une molécule biologique d'intérêt. La fixation de la ou des molécules d'intérêt peut être effectuée au niveau de la fonction aminé primaire ou du motif carbamate activé ou ester activé présent à l'extrémité libre de la chaîne pseudo-PEG constituant l'unité A qui est réactif vis-à-vis des molécules biologiques possédant une fonction acide (ou carbamate) ou une fonction aminé réactive (généralement une aminé primaire aliphatique). La fixation de la molécule biologique d'intérêt peut également être effectuée au niveau de l'unité B, après déprotection de la fonction oxyamine ou démasquage de la fonction aldéhydique, qui deviennent alors réactives vis-à-vis des molécules biologiques possédant un ou plusieurs groupements carbonylés (aldéhyde, ...) respectivement oxyaminés. II est ainsi possible de fixer une ou deux molécules biologiques, identiques ou différentes, par réactif trifonctionnel conforme à la présente Invention.For the purposes of the present invention, the term "bioconjugate" means any trifunctional reagent as described above on which at least one biological molecule of interest is attached. The fixation of the molecule (s) of interest may be carried out at the level of the primary amine function or the activated carbamate or activated ester unit present at the free end of the pseudo-PEG chain constituting the unit A which is reactive vis-a-vis the with respect to biological molecules having an acid function (or carbamate) or a reactive amine function (generally an aliphatic primary amine). The binding of the biological molecule of interest can also be carried out at unit B, after deprotection of the oxyamine function or unmasking of the aldehyde function, which then become reactive with respect to the biological molecules having one or more carbonyl groups (aldehyde, etc.) respectively oxyaminated. It is thus possible to set one or two biological molecules, identical or different, trifunctional reagent according to the present invention.
Parmi les molécules biologiques pouvant être fixées sur les réactifs trifonctionnels conformes à la présente Invention, on peut notamment citer les anticorps, les molécules d'acides nucléiques et leurs analogues, les polysaccharides, les protéines, les peptides, les radionucléides, les toxines, les inhibiteurs d'enzymes, les haptènes, ...etc. Un autre objet de l'Invention est donc un bioconjugué caractérisé par le fait qu'il consiste en un réactif trifonctionnel tel que défini précédemment dans lequel le motif aminé primaire, carbamate activé ou ester activé présent à l'extrémité libre de la chaîne pseudo-PEG constituant l'unité A et/ou la fonction oxyamine ou aldéhydique portée par l'unité B après sa déprotection, respectivement son démasquage, est(sont) fonctionnalisé(s) par une molécule biologique d'intérêt.Among the biological molecules that can be attached to the trifunctional reagents according to the present invention, there may be mentioned in particular antibodies, nucleic acid molecules and their analogues, polysaccharides, proteins, peptides, radionuclides, toxins, enzyme inhibitors, haptens, ... etc. Another object of the invention is thus a bioconjugate characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined above in which the primary amine unit, activated carbamate or activated ester present at the free end of the pseudo-chain. PEG constituting the unit A and / or the oxyamine or aldehyde function carried by the unit B after deprotection or unmasking is (are) functionalized by a biological molecule of interest.
Selon l'Invention, on peut donc avoir les trois types de bioconjugués suivants : i) un bioconjugué constitué par un réactif trifonctionnel dans lequel seule la fonction aminé ou seul le motif carbamate activé ou ester activé présent à l'extrémité libre de la chaîne pseudo-PEG constituant l'unité A est fonctionnalisé par une molécule biologique, ii) un bioconjugué constitué par un réactif trifonctionnel dans lequel seule la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B est fonctionnalisée par une molécule biologique, et iii) un bioconjugué comportant deux molécules biologiques, constitué par un réactif trifonctionnel dans lequel la fonction aminé primaire ou le motif carbamate activé ou ester activé présent à l'extrémité libre de la chaîne pseudo- PEG constituant l'unité A et la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B sont chacun fonctionnalisés par une molécule biologique ; dans ce dernier cas le bioconjugué comporte deux molécules biologiques qui peuvent être identiques ou différentes l'une de l'autre. Il peut en particulier s'agir de deux molécules biologiques identiques mais modifiées par deux marqueurs différents.According to the invention, it is therefore possible to have the following three types of bioconjugates: i) a bioconjugate constituted by a trifunctional reagent in which only the amine function or only the activated carbamate or activated ester unit present at the free end of the pseudo chain -PEG constituting the unit A is functionalized by a biological molecule, ii) a bioconjugate constituted by a trifunctional reagent in which only the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from the unit B is functionalized by a biological molecule, and iii) a bioconjugate comprising two biological molecules, constituted by a trifunctional reagent in which the primary amine function or the activated carbamate or activated ester unit present at the free end of the pseudo-PEG chain constituting the unit A and the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from unit B are each functionalized by a biological molecule; in the latter case the bioconjugate comprises two biological molecules that may be identical or different from each other. It may in particular be two identical biological molecules but modified by two different markers.
La préparation de ces bioconjugués peut être faite de façon classique en faisant réagir un réactif trifonctionnel conforme à l'Invention avec la ou les molécules biologiques d'intérêt à fixer, tout en utilisant les méthodes bien connues de l'état technique pour faire réagir par exemple :The preparation of these bioconjugates can be made conventionally by reacting a trifunctional reagent according to the invention with the biological molecule or molecules of interest to be fixed, while using the methods well known in the technical state for reacting by example:
- un carbamate activé ou ester activé avec une fonction aminé (Hermanson, G. T., Bioconjugate Techniques, 1996, Académie Press, Inc.) ou - une fonction oxyamine avec un groupement carbonylé (Sing, Y. et al, Org. Biomol. Chem., 2006, 4, 1413-1419 ou Zatsepin, T. S. et al, Bioconjugate Chem., 2005, 16, 471-489. Les réactifs tri fonctionnel s conformes à la présente Invention peuvent également être utilisés pour la préparation de réactifs luminescents, en particulier fluorescents.an activated carbamate or amino-activated ester (Hermanson, GT, Bioconjugate Techniques, 1996, Academy Press, Inc.) or an oxyamine function with a carbonyl group (Sing, Y. et al, Org Biomol Chem. , 2006, 4, 1413-1419 or Zatsepin, TS et al, Bioconjugate Chem., 2005, 16, 471-489. The tri functional reagents according to the present invention can also be used for the preparation of luminescent reagents, in particular fluorescent reagents.
Un autre objet de la présente Invention est donc l'utilisation d'au moins un réactif trifonctionnel tel que défini précédemment, pour la préparation d'un réactif luminescent, en particulier de réactifs fluorescents.Another object of the present invention is therefore the use of at least one trifunctional reagent as defined above, for the preparation of a luminescent reagent, in particular fluorescent reagents.
Dans ce cas, le greffage d'un groupement luminescent (L) peut être effectué : i) en faisant réagir le motif thiol, maléimide, iodoacétyle, azoture, alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne porté par l'unité C avec une fonction complémentaire maléimide, iodoacétyle (si l'unité C comporte une fonction thiol), thiol (si l'unité C comporte un motif maléimide ou iodoacétyle) ou alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne (si l'unité C comporte une fonction azoture), ou bien encore azoture (si l'unité C comporte une fonction alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne), ladite fonction complémentaire étant portée, naturellement ou non, par ledit groupement luminescent, et/ou ii) en faisant réagir la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B avec un groupement luminescent porteur d'une fonction carbonylée telle qu'une fonction aldéhyde ou cétone ou respectivement avec une fonction oxyamine.In this case, the grafting of a luminescent group (L) can be carried out: i) by reacting the thiol, maleimide, iodoacetyl, azide, true alkyne, phosphane or cyclooctyne unit carried by the unit C with a maleimide complementary function , iodoacetyl (if unit C has a thiol function), thiol (if unit C has a maleimide or iodoacetyl unit) or true alkyne, phosphane or cyclooctyne (if unit C has an azide function), or else azide (if the unit C comprises a true alkyne function, phosphane or cyclooctyne), said complementary function being carried, naturally or not, by said luminescent group, and / or ii) by reacting the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from the unit B with a luminescent group carrying a carbonyl function such as an aldehyde or ketone function or with an oxyamine function, respectively.
Dans ces deux cas, il peut être éventuellement nécessaire de fonctionnaliser préalablement le groupement luminescent à faire réagir par un motif complémentaire de la fonction avec laquelle on veut le faire réagir. La préparation de ces réactifs luminescents peut être faite de façon classique selon les réactions connues de l'homme de l'art.In these two cases, it may be necessary to previously functionalize the luminescent group to react by a complementary pattern of the function with which it wants to react. The preparation of these luminescent reagents can be made conventionally according to the reactions known to those skilled in the art.
Il est ainsi possible d'obtenir des réactifs luminescents comportant : i) un seul groupement luminescent fixé sur l'unité B par l'intermédiaire de la fonction oxyamine déprotégée ou de la fonction aldéhydique démasquée ou sur l'unité C par l'intermédiaire de la fonction thiol ou des motifs maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture; ii) deux groupements luminescents, l'un étant fixé sur l'unité B par l'intermédiaire de la fonction oxyamine déprotégée ou de la fonction aldéhydique démasquée et l'autre étant fixé sur l'unité C par l'intermédiaire de la fonction thiol ou des motifs maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture.It is thus possible to obtain luminescent reagents comprising: i) a single luminescent group attached to the unit B via the deprotected oxyamine function or the unmasked aldehyde function or on the unit C via the thiol function or maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide units; ii) two luminescent groups, one being attached to the unit B via the deprotected oxyamine function or the unmasked aldehyde function and the other being attached to the unit C via the thiol function or maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide units.
Ces réactifs trifonctionnels luminescents constituent un autre objet de l'Invention.These trifunctional luminescent reagents constitute another object of the invention.
La nature du ou des groupements luminescents utilisables selon l'Invention n'est pas critique à partir du moment où ils comportent naturellement, ou qu'ils sont fonctionnalisables par, une fonction thiol ou carbonylée, ou bien par un motif maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture.The nature of the luminescent group or groups that can be used according to the invention is not critical from the moment when they naturally comprise or are functionalisable by a thiol or carbonyl function, or by a maleimide, iodoacetyl or alkyne unit. true, phosphane, cyclooctyne or even azide.
Selon l'Invention, on entend par groupement luminescent toute substance qui, quand elle est excitée à une longueur d'onde donnée ou par un composé chimique donné, est capable d'émettre un photon, par exemple fluorophore ou terre rare.According to the invention, the term luminescent group any substance which, when excited at a given wavelength or by a given chemical compound, is capable of emitting a photon, for example fluorophore or rare earth.
Parmi les groupements luminescents (dont fluorophores) utilisables selon l'Invention, on peut en particulier citer les fluorophores à chaînes polyméthine (i.e. chaîne polyénique) ; les cyanines fluorescentes telles que celles commercialisées sous les références Cy3, Cy3.5, Cy3B, Cy5, Cy5.5 et Cy7 par la société GE Healthcare ; la fluorescéine (fluorescéinate de sodium) et ses dérivés tels que l'isothiocyanate de fluorescéine (FITC) et la 6-carboxyfiuorescéine (6-Fam) ; la rhodamine et ses dérivés tels que la tetraméthyl rhodamine isothiocyanate (TRITC) ; les dérivés hydrosolubles de la rhodamine sous forme d'ester de N- hydroxysuccinimide tels que les produits vendus sous la dénomination commerciale Alexa Fluor ® par la société Invitrogen comme par exemple les Alexa Fluor ® 488, 500, 514, 532, 546, 555, 568, 594, 610-X, 633, 647, 660, 680, 700, 750 et 790 ; les rhodols et leurs dérivés ; les dérivés de coumarine tels que la 7-amino-coumarine ; la 9-aminoacridine et l'acide 9-acridinecarboxylique ; les colorants fluorescents à aminés réactives tels que l'ester succinimidylique de l'acide 6-((7-amino-4-méthylcoumarin-3- acétyl)amino) hexanoïque (AMCA) ; les difluorures de bore de dipyrrométhène vendus sous les dénominations commerciales BODIPY ® tels que BODIPY® FR-Br2, BODIPY ® R6G, BODIPY® TMR, BODIPY ® TR et les BODIPY ® 530/550 (longueur d'onde d'excitation/longueur d'onde d'émission, en nm), 558/567, 564/570, 576/589, 581/591, 630/650 et 650/665 vendus par la société Bio-Rad Inc. (USA) ; les fluorophores dérivés du pyrène tels que par exemple les colorants Cascade Blue (vendus par exemple par les sociétés Trilink BioTechnologies (USA) ou Invitrogen ; les dérivés diazoïques tels que le DABCYL® ; les dérivés du danzyle tels que l'EDANS® (Eurogentec, BE) ; l'éosine ; l'érythrosine et les dérivés de sulforhodamine tels que le chlorure/sulfonyl de sulforhodamine 101 également connu sous le nom de Texas Red. Les réactifs trifonctionnels conformes à la présente Invention peuvent également être utilisés pour la préparation de réactifs luminescents, en particulier fluorescents comportant également un "composé accepteur" (Q) de la luminescence du groupement luminescent. Dans ce cas, de tels réactifs constituent ce qu'il est convenu d'appeler une cassette de transfert d'énergie (ou cassette FRET) utilisables notamment pour le séquençage de l'ADN.Among the luminescent groups (including fluorophores) that can be used according to the invention, mention may be made in particular of the fluorophores with polymethine chains (ie polyene chain); fluorescent cyanines such as those sold under the references Cy3, Cy3.5, Cy3B, Cy5, Cy5.5 and Cy7 by the company GE Healthcare; fluorescein (sodium fluorescein) and its derivatives such as fluorescein isothiocyanate (FITC) and 6-carboxyfluorescein (6-Fam); rhodamine and its derivatives such as tetramethyl rhodamine isothiocyanate (TRITC); water-soluble derivatives of rhodamine in the form of N-hydroxysuccinimide ester, such as the products sold under the trade name Alexa Fluor® by Invitrogen, for example Alexa Fluor® 488, 500, 514, 532, 546, 555, 568, 594, 610-X, 633, 647, 660, 680, 700, 750 and 790; rhodols and their derivatives; coumarin derivatives such as 7-amino-coumarin; 9-aminoacridine and 9-acridinecarboxylic acid; reactive amine fluorescent dyes such as 6 - ((7-amino-4-methylcoumarin-3-acetyl) amino) hexanoic acid succinimidyl ester (AMCA); dipyrromethene boron difluorides sold under the trade names BODIPY® such as BODIPY® FR-Br 2 , BODIPY® R6G, BODIPY® TMR, BODIPY® TR and BODIPY® 530/550 (excitation wavelength / emission wavelength, in nm), 558/567, 564/570, 576/589 , 581/591, 630/650 and 650/665 sold by Bio-Rad Inc. (USA); fluorophores derived from pyrene, such as, for example, Cascade Blue dyes (sold for example by Trilink BioTechnologies (USA) or Invitrogen), disazo derivatives such as DABCYL®, danzyl derivatives such as EDANS® (Eurogentec, BE), eosin, erythrosine and sulforhodamine derivatives such as sulforhodamine chloride / sulphonyl 101 also known as Texas Red The trifunctional reagents according to the present invention can also be used for the preparation of reagents luminescent, in particular fluorescent, also comprising an "acceptor compound" (Q) of the luminescence of the luminescent group In this case, such reagents constitute what is known as an energy transfer cassette (or FRET cassette ) usable especially for the sequencing of DNA.
Un autre objet de la présente Invention est donc l'utilisation d'au moins un réactif trifonctionnel tel que défini précédemment pour la préparation d'une cassette de transfert d'énergie.Another object of the present invention is therefore the use of at least one trifunctional reagent as defined above for the preparation of a power transfer cassette.
Dans ce cas, le greffage du groupement luminescent sera effectué sur la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B ou bien via la fonction thiol ou les motifs maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture de l'unité C, et le greffage du composé accepteur (Q) sera respectivement effectué via la fonction thiol ou les motifs maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture de l'unité C ou bien sur la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B.In this case, the grafting of the luminescent group will be carried out on the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from the unit B or via the thiol function or the maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide units of the unit C, and the grafting of the acceptor compound (Q) will be carried out respectively via the thiol function or the maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide units of the unit C or on the deprotected or aldehyde oxyamine function unmasked from unit B.
L'Invention a donc également pour objet une cassette de transfert d'énergie, caractérisée par le fait qu'elle est constituée d'un réactif trifonctionnel tel que défini précédemment, ledit réactif comportant un groupement luminescent (L) et un composé accepteur (Q) de la luminescence du groupement luminescent, L et Q étant respectivement et indifféremment fixés sur ledit réactif trifonctionnel via la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B et la fonction thiol ou les motifs maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture de l'unité C.The invention therefore also relates to a transfer cassette of energy, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined above, said reagent comprising a luminescent group (L) and an acceptor compound (Q ) of the luminescence of the luminescent group, L and Q being respectively and indifferently fixed on said trifunctional reagent via the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from the unit B and the function thiol or the units maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide unit C.
Dans ces deux cas, il peut être éventuellement nécessaire de fonctionnaliser préalablement le composé accepteur (Q) à faire réagir par un motif complémentaire de la fonction avec laquelle on veut le faire réagir.In these two cases, it may be necessary to previously functionalize the acceptor compound (Q) to react by a complementary pattern of the function with which it wants to react.
Le groupement luminescent (L) utilisable dans ces cassettes de transfert d'énergie peut notamment être choisis parmi les groupements luminescents (L) cités précédemment et utilisables pour la préparation des réactifs trifonctionnels luminescents conformes à la présente Invention. Selon l'Invention, on entend par "composé accepteur" (Q), toute molécule permettant la diminution ou la disparition de la luminescence du groupement luminescent (L) dans certaines conditions. Ce composé, de natures diverses, peut notamment être un composé chimique (luminescent ou non et tel que par exemple les protéines fluorescentes), un atome lourd ou une nanoparticule. Parmi de tels composés accepteurs (Q), on peut en particulier citer les composés fluorescents tels que ceux cités ci-dessus pour les groupements L, en particulier la rhodamine et ses dérivés tels que la tetraméthyl rhodamine (TMR), la Rhodamine 6G (R6G) et les colorants QSY ® 7, QSY ® 9 et QSY ® 21 (Molecular Probes) ; mais également des molécules non-fluorescentes de la famille des colorants azoïques telles que les composés vendus sous les dénominations commerciales Black HoIe Quencher ® (BHQ) comme par exemple les BHQ-O, BHQ-I, BHQ-2 et BHQ-3 (Biosearch Technologies) ; les particules d'or telles que celles ayant un diamètre de 1,5 nm vendues sous la dénomination commerciale Nanogold Particules ® (Nanoprobes) ; les colorants diazoïques tels que les produits vendus sous les dénominations commerciales Eclipse Dark Quencher ® (Epoch Bioscience) ou QSY ® 35 (Molecular Probes) ; le produit commercial ElleQuencher ® (Eurogentec) ; le vert de malachite et les composés accepteurs ("Quenchers") de la famille des cyanines tels que le composés vendus sous les dénominations commerciales Cy5Q ou Cy7Q par la société GE Healthcare. Selon une forme de réalisation particulièrement avantageuse de ces cassettes de transfert d'énergie, le groupement luminescent (L) et le composé accepteur (Q) sont choisis parmi les couples suivants (L/Q) : Cy3/Cy5, Cy5/Cy7, Cy5/Alexa Fluor® 750, Cy3/Cy5Q, Cy3/QSY® 7, Cy3/QSY® 9, Cy5/Cy7Q, Cy5/QSY® 21, Cy5/Cy5, Cy5.5/Cy5.5, Cy7/Cy7, R6)/Cy5, R6G/Alexa Fluor® 647, R6G/QSY® 21, Alexa Fluor® 532/Cy5, Alexa Fluor® 532/Alexa Fluor® 647, Alexa Fluor® 532/QSY® 21, Alexa Fluor® 555/Cy5, Alexa Fluor® 555/Alexa Fluor® 647, Alexa Fluor® 555/QSY® 21.The luminescent group (L) that can be used in these energy transfer cassettes may in particular be chosen from the luminescent groups (L) mentioned above and that can be used for the preparation of the luminescent trifunctional reagents in accordance with the present invention. According to the invention, the term "acceptor compound" (Q) is understood to mean any molecule making it possible to reduce or disappear the luminescence of the luminescent group (L) under certain conditions. This compound, of various natures, can in particular be a chemical compound (luminescent or not and such as for example fluorescent proteins), a heavy atom or a nanoparticle. Among such acceptor compounds (Q), mention may in particular be made of fluorescent compounds such as those mentioned above for L groups, in particular rhodamine and its derivatives such as tetramethyl rhodamine (TMR) and Rhodamine 6G (R6G). ) and QSY® 7, QSY® 9 and QSY® 21 dyes (Molecular Probes); but also non-fluorescent molecules of the family of azo dyes, such as the compounds sold under the trade names Black HoIe Quencher® (BHQ), for instance BHQ-O, BHQ-I, BHQ-2 and BHQ-3 (Biosearch Technologies); gold particles such as those having a diameter of 1.5 nm sold under the trade name Nanogold Particles ® (Nanoprobes); disazo dyes such as the products sold under the trade names Eclipse Dark Quencher® (Epoch Bioscience) or QSY® 35 (Molecular Probes); the ElleQuencher ® commercial product (Eurogentec); malachite green and the acceptor compounds ("Quenchers") of the cyanine family, such as the compounds sold under the trade names Cy5Q or Cy7Q by the company GE Healthcare. According to a particularly advantageous embodiment of these energy transfer cassettes, the luminescent group (L) and the acceptor compound (Q) are chosen from the following pairs (L / Q): Cy3 / Cy5, Cy5 / Cy7, Cy5 / Alexa Fluor ® 750, Cy3 / Cy5Q, Cy3 / QSY ® 7, Cy3 / QSY ® 9, Cy5 / Cy7Q, Cy5 / QSY ® 21, Cy5 / Cy5, Cy5.5 / Cy5.5, Cy7 / Cy7, R6 ) / Cy5, R6G / Alexa Fluor ® 647, R6G / QSY ® 21, Alexa Fluor ® 532 / Cy5, Alexa Fluor ® 532 / Alexa Fluor ® 647, Alexa Fluor ® 532 / QSY ® 21, Alexa Fluor ® 555 / Cy5, Alexa Fluor ® 555 / Alexa Fluor ® 647, Alexa Fluor ® 555 / QSY ® 21.
Selon une autre forme de réalisation particulière de l'Invention, les réactifs trifonctionnels peuvent être utilisés pour la préparation de bioconjugués mixtes comportant au moins une molécule biologique et au moins un groupement luminescent. La présente Invention a donc également pour objet un bioconjugué mixte, caractérisé par le fait qu'il consiste en un réactif trifonctionnel tel que défini précédemment sur lequel sont fixés au moins une molécule biologique et au moins un groupement luminescent. En outre, ces bioconjugués mixtes peuvent également comporter un composé accepteur (Q) de la luminescence du groupement luminescent (L).According to another particular embodiment of the invention, the trifunctional reagents can be used for the preparation of mixed bioconjugates comprising at least one biological molecule and at least one luminescent group. The present invention therefore also relates to a mixed bioconjugate, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined above on which are fixed at least one biological molecule and at least one luminescent group. In addition, these mixed bioconjugates may also comprise an acceptor compound (Q) for the luminescence of the luminescent group (L).
Ces bioconjugués mixtes sont donc choisis parmi les réactifs trifonctionnels sur lesquels sont fixés : i) une ou deux molécules biologiques d'intérêt et un groupement luminescent ; ou ii) une molécule biologique d'intérêt, et deux groupements luminescents ; iii) une molécule biologique d'intérêt, un groupement luminescent, et un composé accepteur (Q) de la luminescence du groupement luminescent ; lesdites molécules biologiques et lesdits groupements luminescents et composé accepteurs (Q) étant fixés sur le réactif fonctionnel au niveau des extrémités terminales des unités A, B et C comme décrit ci-dessus.These mixed bioconjugates are therefore chosen from the trifunctional reagents on which are fixed: i) one or two biological molecules of interest and a luminescent group; or ii) a biological molecule of interest, and two luminescent groups; iii) a biological molecule of interest, a luminescent group, and an acceptor compound (Q) of the luminescence of the luminescent group; said biological molecules and said luminescent moieties and acceptor compound (Q) being attached to the functional reagent at the terminal ends of units A, B and C as described above.
Les réactifs trifonctionnels et les bioconjugués conformes à la présente Invention, modifiés ou non par un groupement luminescent au niveau de l'unité C, et dans lesquels la fonction oxyamine ou respectivement aldéhydique de l'unité B est libre (c'est-à-dire non fonctionnalisée par une molécule biologique d'intérêt, un groupement fluorescent ou un composé accepteur) peuvent être utilisés pour la fonctionnalisation de supports solides comportant au moins une surface possédant un ou plusieurs groupements carbonylés, en particulier une ou plusieurs fonctions aldéhyde ou cétone ou respectivement une ou plusieurs fonctions oxyamine. Par conséquent, la présente Invention a également pour objet un support solide, caractérisé par le fait qu'il comporte au moins une surface fonctionnalisée, de façon covalente, par un ou plusieurs réactifs trifonctionnels, et/ou par un ou plusieurs bioconjugués, lesdits réactifs trifonctionnels et bioconjugués étant éventuellement modifiés par un groupement luminescent au niveau de l'unité C et tels que définis précédemment.Trifunctional reagents and bioconjugates according to the present invention, modified or not by a luminescent group at unit C, and in which the oxyamine or aldehyde function of unit B is free (ie non-functionalized by a biological molecule of interest, a fluorescent group or an acceptor compound) can be used for the functionalization of solid supports comprising at least one surface having one or more carbonyl groups, in particular one or more aldehyde or ketone functions or one or more oxyamine functions, respectively. Consequently, the subject of the present invention is also a solid support, characterized in that it comprises at least one surface functionalized, covalently, with one or more trifunctional reagents, and / or with one or more bioconjugates, said reagents trifunctional and bioconjugated being optionally modified by a luminescent group at the level of the unit C and as defined above.
Selon l'Invention, la nature du support solide n'est pas critique à partir du moment où il comprend au moins une surface possédant, naturellement ou après modification chimique, un ou plusieurs groupements carbonylés, en particulier une ou plusieurs fonctions aldéhyde ou cétone ou respectivement une ou plusieurs fonctions aminé primaire, lesdits groupements ou fonctions étant aptes à réagir avec la fonction oxyamine déprotégée ou respectivement avec la fonction aldéhydique démasquée de l'unité B du réactif tri fonctionnel ou du bioconjugué.According to the invention, the nature of the solid support is not critical from the moment when it comprises at least one surface having, naturally or after chemical modification, one or more carbonyl groups, in particular one or more aldehyde or ketone functions or respectively one or more primary amine functions, said groups or functions being able to react with the deprotected oxyamine function or respectively with the unmasked aldehyde function of the unit B of the tri functional reagent or the bioconjugate.
Parmi de tels supports, on peut notamment citer le verre, le plastique, et les métaux.Among such supports, there may be mentioned glass, plastic, and metals.
Selon une forme de réalisation particulière de l'Invention, le support solide comprend au moins une surface fonctionnalisée par au moins un bioconjugué et constitue alors une biopuce telle que par exemple une puce à acide nucléique, une puce à protéine, une puce à polysaccharide ou une puce à peptide, ou bien un biocapteur tel que par exemple un immunosenseur.According to a particular embodiment of the invention, the solid support comprises at least one surface functionalized with at least one bioconjugate and then constitutes a biochip such as for example a nucleic acid chip, a protein chip, a polysaccharide chip or a peptide chip, or a biosensor such as for example an immunosensor.
De tels supports peuvent être préparés selon un procédé comprenant les étapes suivantes : - la déprotection de la fonction oxyamine protégée, ou respectivement le démasquage de la fonction aldéhydique masquée, présente sur l'unité B d'au moins un réactif trifonctionnel ou d'au moins un bioconjugué conforme à l'Invention pour obtenir un réactif trifonctionnel ou un bioconjugué porteur d'une fonction oxyamine déprotégée, respectivement aldéhydique démasquée, - la formation d'une liaison oxyme par mise en contact dudit réactif ou dudit bioconjugué porteur de la fonction oxyamine déprotégée ou respectivement aldéhydique démasquée avec un support solide dont au moins une surface possède un ou plusieurs groupements carbonylés, respectivement aminé primaire, ladite liaison oxyme assurant la fixation covalente dudit réactif ou dudit bioconjugué à la surface du support.Such supports can be prepared according to a process comprising the following steps: deprotection of the protected oxyamine function, or respectively the unmasking of the masked aldehyde function, present on unit B of at least one trifunctional reagent or from less a bioconjugate according to the invention to obtain a trifunctional reagent or a bioconjugate bearing a deprotected oxyamine function, respectively undefined aldehyde, - the formation of an oxyme bond by contacting said reagent or said bioconjugate carrying the oxyamine function deprotected or respectively aldehyde unmasked with a solid support of which at least one surface has a or more carbonyl groups, respectively primary amine, said oxyme bond ensuring the covalent attachment of said reagent or said bioconjugate to the surface of the support.
De tels supports peuvent notamment être utilisés pour la détection de molécules d'intérêt, notamment pour la détection d'analytes en milieu liquide.Such supports may in particular be used for the detection of molecules of interest, in particular for the detection of analytes in a liquid medium.
Selon une autre forme de réalisation, l'Invention a également pour objet l'utilisation d'au moins un réactif trifonctionnel tel que décrit précédemment pour la préparation d'une sonde destinée à la protéomique fonctionnelle.According to another embodiment, the invention also relates to the use of at least one trifunctional reagent as described above for the preparation of a probe for functional proteomics.
Un autre objet de la présente Invention est donc une sonde pour la protéomique fonctionnelle, caractérisée par le fait qu'elle constituée d'un réactif trifonctionnel comportant :Another object of the present invention is therefore a probe for functional proteomics, characterized in that it consists of a trifunctional reagent comprising:
- un groupement permettant la détection (ou visualisation) et/ou la purification d'une protéine cible (étiquette rapporteuse ou "reporter tag"),a group allowing detection (or visualization) and / or purification of a target protein (reporter tag or "reporter tag"),
- un motif reconnu par ladite protéine cible (unité de reconnaissance ou "récognition unit"), eta pattern recognized by said target protein (recognition unit or "recognition unit"), and
- un groupe réactif permettant d'établir un lien de covalence avec le site actif de la protéine ciblée (groupe réactif).a reactive group making it possible to establish a covalent link with the active site of the targeted protein (reactive group).
Selon l'Invention, on entend par "motif reconnu par ladite protéine cible", tout ligand de la protéine ciblée ou tout substrat s'il s'agit d'une enzyme (séquence peptidique par exemple).According to the invention, the term "pattern recognized by said target protein", any ligand of the targeted protein or any substrate if it is an enzyme (peptide sequence for example).
Selon une forme de réalisation préférée de l'Invention la protéine cible est une enzyme.According to a preferred embodiment of the invention the target protein is an enzyme.
Selon une première forme de réalisation de ces sondes pour la protéomique fonctionnelle et lorsque la protéine cible est une enzyme, le motif reconnu par l'enzyme et le groupe réactif permettant un lien de covalence avec le site actif de cette enzyme appartiennent à la même entité (c'est le cas par exemple des inhibiteurs irréversibles et/ou les substrats suicides utilisés en chimie médicinale) et sont donc portés par la même unité du réactif trifonctionnel pseudopeptidique conforme à l'Invention. Dans ce cas les deux autres unités dudit réactif trifonctionnel peuvent être utilisées pour fixer un groupement permettant la détection (fluorophore par exemple) et un groupement facilitant la purification (biotine, tag poly(histidine), ...). Selon cette forme de réalisation, les trois entités peuvent être fixées indifféremment sur n'importe quelle unité du réactif trifonctionnel pseudopeptidique conforme à l'Invention.According to a first embodiment of these probes for functional proteomics and when the target protein is an enzyme, the pattern recognized by the enzyme and the reactive group allowing a covalent link with the active site of this enzyme belong to the same entity. (This is the case for example irreversible inhibitors and / or suicidal substrates used in medicinal chemistry) and are therefore carried by the same unit of trifunctional pseudopeptide reagent according to the invention. In this case the other two units of said trifunctional reagent can be used to fix a group allowing detection (fluorophore for example) and a group facilitating purification (biotin, poly tag (histidine), ...). According to this embodiment, the three entities can be fixed indifferently on any unit of the trifunctional pseudopeptide reagent according to the invention.
Selon une seconde forme de réalisation de ces sondes pour la protéomique fonctionnelle et lorsque la protéine cible est une enzyme, le motif reconnu par l'enzyme et le groupe réactif n'appartiennent pas à la même entité et sont donc portés par deux unités distinctes du réactif trifonctionnel pseudopeptidique conforme à l'Invention. Dans ce cas, il est préférable de les fixer sur les deux unités les plus proches l'une de l'autre (B et C) afin que la réaction du groupe réactif ait bien lieu dans le site (actif) ciblé. Ainsi la dernière unité du réactif trifonctionnel pseudopeptidique conforme à l'Invention sera utilisée pour fixer le groupement permettant la détection et/ou la purification.According to a second embodiment of these probes for functional proteomics and when the target protein is an enzyme, the pattern recognized by the enzyme and the reactive group do not belong to the same entity and are therefore carried by two distinct units of the trifunctional pseudopeptide reagent according to the invention. In this case, it is preferable to fix them on the two units closest to each other (B and C) so that the reaction of the reactive group takes place in the targeted (active) site. Thus the last unit of the trifunctional pseudopeptide reagent according to the invention will be used to fix the group allowing detection and / or purification.
Outre les dispositions qui précèdent, l'Invention comprend encore d'autres dispositions qui ressortiront de la description qui va suivre, qui se réfère à des exemples de synthèse de réactifs trifonctionnels conformes à l'Invention. EXEMPLE 1 : PRÉPARATION D'UN RÉACTIF TRIFONCTIONNEL CONFORME A L'INVENTIONIn addition to the foregoing, the invention also comprises other provisions which will emerge from the description which follows, which refers to examples of synthesis of trifunctional reagents according to the invention. EXAMPLE 1 PREPARATION OF A TRIFUNCTIONAL REAGENT CONFORMING TO THE INVENTION
Dans cet exemple est décrite la synthèse d'un réactif trifonctionnel (1-1) conforme à la présente Invention et répondant à la formule (1-1) suivante :In this example is described the synthesis of a trifunctional reagent (1-1) according to the present invention and corresponding to the following formula (1-1):
(M) dans lequel :(M) wherein:
- l'unité A est un bras de liaison de type pseudo-PEG possédant un motif carbamate activé réactif vis-à-vis des composés possédant une fonction aminé primaire,the unit A is a pseudo-PEG binding arm having an activated carbamate unit reactive with respect to the compounds having a primary amine function,
- l'unité B est une lysine portant sur sa chaîne latérale une fonction oxyamine protégée par un groupement Fmoc, réactive vis-à-vis des surfaces possédant des fonctions aldéhyde, et - l'unité C est une lysine possédant sur sa chaîne latérale un motif maléimide, réactif vis-à-vis des composés possédant une fonction thiol.unit B is a lysine bearing on its side chain an oxyamine function protected by a Fmoc group, reactive with respect to surfaces having aldehyde functions, and - Unit C is a lysine having on its side chain a maleimide unit, reactive vis-à-vis the compounds having a thiol function.
La stratégie de synthèse du composé (1-1) consiste à préparer séparément trois précurseurs correctement protégés (A-I), (B-I) et (C-I) puis de les assembler via des réactions de couplage pour obtenir le réactif trifonctionnel de formule (I- 1) ci-dessus conforme à la présente Invention. 1) Synthèse du précurseur (A-I) : Bras du bras de liaison de type Boc-PEGThe strategy for synthesizing the compound (1-1) consists in separately preparing three correctly protected precursors (AI), (BI) and (CI) and then assembling them via coupling reactions to obtain the trifunctional reagent of formula (I-1 ) above according to the present invention. 1) Synthesis of the precursor (A-I): Boc-PEG link arm
Précurseur (A-I) Le précurseur (A-I) est un bras de liaison hydrophile possédant quatre unités éthylèneglycol ainsi qu'une fonction acide carboxylique qui va permettre le couplage ultérieur avec les unités (B-I) et (C-I) et une fonction aminé primaire qu'il est indispensable de conserver protégée jusqu'à la dernière étape de conversion en "carbamate activé". Il résulte de l'association de deux molécules d'acide 8-amino-3,6- dioxaoctanoïque, lesdites molécules ayant été préparées selon les méthodes décrites par Rensen, P. C. N et al, J. Med. Chem., 2004, 47, 5798-5808 ; Dondoni, A. et al, J. Org. Chem., 2005, 70, 5508-5518 ou Dhawan, R. et al Bioconjugate Chem., 2000, 11, 14-21. Cet acide aminé a ensuite été converti en deux dérivés protégés (dérivé N- Boc (6) et ester méthylique (7)) selon les méthodes décrites par exemple par Nakatani, K. et al, Bioorg. Med. Chem. Lett, 2004, 14, 1 105-1108 ou Rachele, J., J. Org. Chem., 1963, 28, 2898, qui ont pu être couplés entre eux selon la méthode décrite par exemple par Han, S. -Y. et al, Tetrahedron, 2004, 60, 2447-2467 pour conduire, après saponification, au précurseur (A-I) recherché. a) Première étape : Synthèse du 2-(2-(2-azidoéthoxy)éthoxy)éthanol (3) Precursor (AI) The precursor (AI) is a hydrophilic linker having four ethylene glycol units as well as a carboxylic acid function which will allow the subsequent coupling with the units (BI) and (CI) and a primary amino function that it It is essential to keep protected until the last conversion stage to "activated carbamate". It results from the combination of two molecules of 8-amino-3,6-dioxaoctanoic acid, said molecules having been prepared according to the methods described by Rensen, PC N et al, J. Med. Chem., 2004, 47, 5798-5808; Dondoni, A. et al, J. Org. Chem., 2005, 70, 5508-5518 or Dhawan, R. et al Bioconjugate Chem., 2000, 11, 14-21. This amino acid was then converted into two protected derivatives (N-Boc derivative (6) and methyl ester (7)) according to the methods described for example by Nakatani, K. et al, Bioorg. Med. Chem. Lett, 2004, 14, 105-1108 or Rachele, J., J. Org. Chem., 1963, 28, 2898, which could be coupled together according to the method described for example by Han, S. -Y. et al, Tetrahedron, 2004, 60, 2447-2467 to conduct, after saponification, the precursor (AI) sought. a) First step: Synthesis of 2- (2- (2-azidoethoxy) ethoxy) ethanol (3)
1,29 ml (8,9 mmol) de 2-(2-(2-chloroéthoxy)éthoxy)éthanol ont été ajoutés à une suspension d'azoture de sodium (0,7 g, 10,7 mmol) et d'iodure de sodium (0,14 g, 0,93 mmol) dans de l'éthanol anhydre. Le mélange jaune résultant a été chauffé au reflux pendant 5 jours sous atmosphère d'argon. On a contrôlé que la réaction était complète par chromatographie sur couche mince (CCM) vendues sous la référence DC Kieselgel 60 F254 par la société Merck en utilisant un mélange solvant dichlorométhane/méthanol (9:1, v/v). Le mélange a ensuite été filtré sur Celite 545 afin d'éliminer les sels de sodium, puis évaporé. Le résidu huileux résultant a été dissous dans environ 10 ml de dichlorométhane puis stocké à une température de 4°C pendant 1 heure. Après filtration sur coton et concentration, le composé (3) attendu a été obtenu sous la forme d'une huile incolore (rendement quantitatif).1.29 ml (8.9 mmol) of 2- (2- (2-chloroethoxy) ethoxy) ethanol were added to a suspension of sodium azide (0.7 g, 10.7 mmol) and iodide sodium (0.14 g, 0.93 mmol) in anhydrous ethanol. The resulting yellow mixture was refluxed for 5 days under an argon atmosphere. The reaction was checked for completeness by thin layer chromatography (TLC) sold under the reference DC Kieselgel 60 F254 by Merck using a dichloromethane / methanol solvent mixture (9: 1, v / v). The mixture was then filtered through Celite 545 to remove the sodium salts and then evaporated. The resulting oily residue was dissolved in about 10 ml of dichloromethane and stored at a temperature of 4 ° C for 1 hour. After filtration on cotton and concentration, the expected compound (3) was obtained in the form of a colorless oil (quantitative yield).
Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ = 2,63 (t, J = 6,0 Hz, IH, OH), 3,43 (t, J = 4,9 Hz, 2H), 3,61-3,77 (m, 10H). 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3 ): δ = 2.63 (t, J = 6.0 Hz, 1H, OH), 3.43 (t, J = 4.9 Hz, 2H), 3, 61-3.77 (m, 10H).
VV) Deuxième étape : Synthèse de l'acide 2-(2-(2-azidoéthoxy) éthoxy)acétique (4)VV) Second step: Synthesis of 2- (2- (2-azidoethoxy) ethoxy) acetic acid (4)
1,56 g (8,9 mmol) du composé (3) obtenu ci-dessus à l'étape précédente ont été dissous dans 90 ml d'acétone et la solution résultante a été refroidie jusqu'à une température de 4°C. 8,9 ml de réactif de Jones 3 M fraîchement préparé (par exemple par dissolution de 26,72 g de CrO3 dans 23 ml d'acide sulfurique concentré puis ajout d'eau jusqu'à un volume de 100 ml) ont ensuite été ajoutés goutte à goutte (un précipité vert a immédiatement été formé), puis le mélange réactionnel résultant a été agité à température ambiante pendant 1 heure. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM comme à l'étape précédente et la réaction a été stoppée par ajout de d'environ 4 ml de propan-2-ol. Après 15 min, on a ajouté 100 ml d'acétone et le précipité vert de sels de Cr(III) a été éliminé par filtration sur Celite® 545. Le filtrat a ensuite été évaporé à sec. Le résidu huileux résultant a été purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (50 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de méthanol (0 à 5 %) dans le dichlorométhane. On a obtenu 1,53 g (8,1 mmol) du composé (4) sous la forme d'une huile jaune (rendement 91 %). Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ = 3,43 (t, J = 4,9 Hz, 2H),1.56 g (8.9 mmol) of the compound (3) obtained above in the previous step were dissolved in 90 ml of acetone and the resulting solution was cooled to a temperature of 4 ° C. 8.9 ml of freshly prepared Jones 3M reagent (for example by dissolving 26.72 g of CrO 3 in 23 ml of concentrated sulfuric acid and then adding water to a volume of 100 ml) were then added dropwise (a green precipitate was immediately formed), and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The reaction was checked for completeness by TLC as in the previous step and the reaction was stopped by adding about 4 ml of propan-2-ol. After 15 min, 100 ml of acetone was added and the green precipitate of Cr (III) salts was removed by filtration through Celite ® 545. The filtrate was then evaporated to dryness. The resulting oily residue was purified by column chromatography on silica gel (50 g) using a gradient of methanol (0-5%) in dichloromethane as the mobile phase. Compound (4) (1.53 g, 8.1 mmol) was obtained as a yellow oil (91% yield). 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3 ): δ = 3.43 (t, J = 4.9 Hz, 2H),
3,66-3,80 (m, 6H), 4,19 (s, 2H).3.66-3.80 (m, 6H), 4.19 (s, 2H).
A Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CDCl3) : δ = 50,7 ; 68,6 ; 70,2 70,6 ; 71,4 ; 174,2. c) Troisième étape : Synthèse de l'acide 2-(2-aminoéthoxy)éthoxy) acétique (5) 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CDCl 3 ): δ = 50.7; 68.6; 70.2, 70.6; 71.4; 174.2. c) Third step: Synthesis of 2- (2-aminoethoxy) ethoxy) acetic acid (5)
Un mélange de 1,53 g (8,2 mmol) du composé (4) obtenu ci-dessus à l'étape précédente et de 2,5 ml (65,5 mmol) d'acide formique a été dissous dans 150 ml d'éthanol, puis la solution obtenue a été refroidie jusqu'à une température de 4°C.A mixture of 1.53 g (8.2 mmol) of the compound (4) obtained above in the previous step and 2.5 ml (65.5 mmol) of formic acid was dissolved in 150 ml of ethanol, and the resulting solution was cooled to a temperature of 4 ° C.
0,32 g de palladium/charbon (Pd/C) à 10% de Pd ont été ajoutés à cette solution et le mélange réactionnel résultant a été agité à température ambiante pendant 12 heures sous atmosphère d'hydrogène. On a ensuite contrôlé que la réaction était complète par0.32 g of Pd / C (Pd / C) 10% Pd was added to this solution and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 12 hours under a hydrogen atmosphere. It was then checked that the reaction was complete by
CCM comme à l'étape précédente mais en utilisant un mélange 8:2 (v/v) de dichlorométhane (CH2Cl2)/méthanol (MeOH), puis le mélange a été filtré sur Celite® TLC as in the previous step but using an 8: 2 (v / v) mixture of dichloromethane (CH 2 Cl 2 ) / methanol (MeOH), then the mixture was filtered through Celite ®
545 pour éliminer le Pd/C. Le filtrat a ensuite été évaporé à sec jusqu'à obtention d'un résidu huileux qui a été séché sous vide pour conduire au composé (5) attendu sous la forme d'une huile jaune (rendement quantitatif). d) Quatrième étape : Synthèse de l'ester méthylique de l'acide 2-(2-aminoéthoxy) éthoxy) acétique (6)545 to remove Pd / C. The filtrate was then evaporated to dryness to an oily residue which was dried in vacuo to yield the expected compound (5) as a yellow oil (quantitative yield). (d) Fourth step: Synthesis of 2- (2-aminoethoxy) ethoxy) acetic acid methyl ester (6)
0,48 g (2,92 mmol) du composé (5) obtenu ci-dessus à l'étape précédente ont été mis en suspension dans 20 ml de 2,2-diméthoxypropane, puis on a ajouté 2,92 ml d'acide chlorhydrique concentré (HCl à 37 %)). Le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 1 heure. On a ensuite contrôlé que la réaction était totale par CCM en utilisant un mélange CH2Cl2/Me0H/triéthylamine (TEA) 80:20:2 (v/v/v) puis le mélange a été évaporé à sec. Le résidu huileux résultant a ensuite subi 4 lyophilisations successives avec ajout de 10 ml d'eau osmosée à chaque fois pour finalement obtenir le produit attendu sous la forme d'une huile jaune (rendement quantitatif).0.48 g (2.92 mmol) of the compound (5) obtained above in the preceding step were suspended in 20 ml of 2,2-dimethoxypropane, then 2.92 ml of acid were added. concentrated hydrochloric acid (37% HCl)). The resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The reaction was then checked for total TLC using CH 2 Cl 2 / MeOH / triethylamine (TEA) 80: 20: 2 (v / v / v) and the mixture was evaporated to dryness. The resulting oily residue was then subjected to 4 successive lyophilizations with the addition of 10 ml of osmosis water each time to finally obtain the expected product in the form of a yellow oil (quantitative yield).
Analyse RMN 1H (300 MHz, CD3CN + 5% D2O) : δ = 3,08 (t, J = 5,3 Hz, 2H), 3,56-3,76 (m, 1 IH), 4,13 (s, 2H). e) Cinquième étape : Synthèse de l'acide 2-(2-tert-butyloxycarbonyl)aminoéthoxy) éthoxy) acétique (7) 1 H NMR analysis (300 MHz, CD 3 CN + 5% D 2 O): δ = 3.08 (t, J = 5.3 Hz, 2H), 3.56 to 3.76 (m, 1 H) , 4.13 (s, 2H). e) Fifth step: Synthesis of 2- (2-tert-butyloxycarbonyl) aminoethoxy) ethoxy) acetic acid (7)
0,78 g (3,75 mmol) du composé (5) obtenu ci-dessus à l'étape c) ont été dissous dans 12 ml d'un mélange tetrahydrofurane (THF)/H2O (2:1, v/v). 5 ml d'une solution aqueuse de soude 2 M fraîchement préparée ont ensuite été ajoutés et la solution obtenue a été refroidie à 4°C. 0,89 g (4,12 mmol) de dicarbonate de di-t- butyle ont ensuite été ajoutés et le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 1 heure. On a ensuite contrôlé que la réaction était totale par CCM en utilisant un mélange CH2Cl2/Me0H (7:3, v/v). Le mélange réactionnel a ensuite été acidifié par ajout d'environ 25 ml d'une solution aqueuse d'hydrogénosulfate de potassium 1 M (KHSO4). Cette solution a ensuite été extraite avec 3 fois 50 ml d'acétate d'éthyle. La phase organique a été séchée sur sulfate de sodium (Na2SO4) puis évaporée à sec. Le résidu huileux résultant a été purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (40 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de méthanol (0 à 6 %) dans le CH2Cl2. On a obtenu 0,50 g (1,87 mmol) du composé (7) sous la forme d'une huile incolore (rendement 50 %).0.78 g (3.75 mmol) of the compound (5) obtained above in stage c) were dissolved in 12 ml of a mixture of tetrahydrofuran (THF) / H 2 O (2: 1, v / v). 5 ml of a freshly prepared aqueous solution of 2 M sodium hydroxide was then added and the resulting solution was cooled to 4 ° C. 0.89 g (4.12 mmol) of di-t-butyl dicarbonate was then added and the reaction mixture was stirred at room temperature for 1 hour. It was then checked that the reaction was complete by TLC using CH 2 Cl 2 / MeOH (7: 3, v / v). The reaction mixture was then acidified by adding about 25 ml of a 1 M aqueous potassium hydrogen sulfate solution (KHSO 4 ). This solution was then extracted with 3 times 50 ml of ethyl acetate. The organic phase was dried over sodium sulphate (Na 2 SO 4 ) and then evaporated to dryness. The resulting oily residue was purified by column chromatography on silica gel (40 g) using a gradient of methanol (0 to 6%) in CH 2 Cl 2 as the mobile phase. Compound (7) (0.50 g, 1.87 mmol) was obtained as a colorless oil (50% yield).
Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ - 1 ,44 (s, 9H), 3,34 (bm, 2H), 3,50-3,77 (m, 6H), 4,17 (s, 2H), 4,97 (bs, IH, NH). f) Cinquième étape : Synthèse du précurseur (A-I) 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3): δ - 1, 44 (s, 9H), 3.34 (bm, 2H), 3.50 to 3.77 (m, 6H), 4.17 (s , 2H), 4.97 (bs, 1H, NH). f) Fifth step: Synthesis of the precursor (AI)
0,15 g (0,83 mmol) du composé (7) obtenu ci-dessus à l'étape précédente et 0,23 g (0,87 mmol) du composé (6) obtenu ci-dessus à l'étape d) ont été dissous dans 8 ml d'acétonitrile anhydre. On a ensuite ajouté 0,44 ml (2,5 mmol) de yV.Λf-diisopropyléthylamine (DIEA) et 0,37 g (0,83 mmol) d'hexafluorophosphate de benzotriazol-l-yl-Λf-oxytris(diméthyl-amino)-phosphonium (BOP) puis le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant une nuit sous atmosphère d'argon. On a ensuite contrôlé que la réaction était totale par CCM en utilisant un mélange CH2Cl2/Me0H (8:2, v/v), puis le mélange réactionnel a été évaporé à sec. Le résidu résultant a ensuite été repris dans 75 ml d'acétate d'éthyle, lavé successivement avec 50 ml d'une solution aqueuse d'acide citrique à 10 %, 50 ml d'une solution saturée de bicarbonate de sodium (NaHCO3) et 50 ml d'une solution aqueuse saturé de NaCl pour être ensuite séché sur Na2SO4 et évaporé à sec. Le résidu huileux orange a ensuite été dissous dans 5 ml de MeOH et la solution a été refroidie à 4 °C. 0,83 ml d'une solution aqueuse de soude 1 M ont alors été ajoutés et le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 30 min. On a ensuite contrôlé que la réaction était totale par CCM en utilisant un mélange CH2Cl2/Me0H (7:3, v/v). Le mélange réactionnel a ensuite été acidifié par ajout d'environ 1 ml d'une solution aqueuse de KHSO4 1 M. La solution a ensuite été évaporée à sec sans chauffage et le résidu résultant a été purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (30 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de méthanol (0-50 %) dans le CH2Cl2. On a ainsi obtenu 0,17 g (0,42 mmol) du précurseur du bras de liaison (A-I) sous la forme d'une huile incolore avec un rendement de 80 %. Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ = 1,43 (s, 9 H), 3,30 (bm,0.15 g (0.83 mmol) of the compound (7) obtained above in the preceding step and 0.23 g (0.87 mmol) of the compound (6) obtained above in step d) were dissolved in 8 ml of anhydrous acetonitrile. 0.44 ml (2.5 mmol) of 4,4'-diisopropylethylamine (DIEA) and 0.37 g (0.83 mmol) of benzotriazol-1-yl-Λf-oxytris hexafluorophosphate (dimethyl) were then added. amino) -phosphonium (BOP) then the reaction mixture was stirred at room temperature overnight under an argon atmosphere. It was then checked that the reaction was complete by TLC using a CH 2 Cl 2 / MeOH mixture (8: 2, v / v), and then the reaction mixture was evaporated to dryness. The resulting residue was then taken up in 75 ml of ethyl acetate, washed successively with 50 ml of a 10% aqueous solution of citric acid, 50 ml of a saturated solution of sodium bicarbonate (NaHCO 3 ) and 50 ml of a saturated aqueous solution of NaCl and then dried over Na 2 SO 4 and evaporated to dryness. The orange oily residue was then dissolved in 5 ml of MeOH and the solution was cooled to 4 ° C. 0.83 ml of a 1M aqueous sodium hydroxide solution was then added and the reaction mixture was stirred at room temperature for 30 minutes. It was then checked that the reaction was complete by TLC using CH 2 Cl 2 / MeOH (7: 3, v / v). The reaction mixture was then acidified by addition of about 1 ml of an aqueous solution of 1 M KHSO 4. The solution was then evaporated to dryness without heating and the resulting residue was purified by chromatography on a gel column. silica (30 g) using as mobile phase a gradient of methanol (0-50%) in CH 2 Cl 2 . 0.17 g (0.42 mmol) of the linker precursor (AI) was thus obtained in the form of a colorless oil with a yield of 80%. 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3): δ = 1.43 (s, 9H), 3.30 (bm,
2H), 3,47-3,66 (m, 14H), 4,01 (s, 2H), 4,04 (s, 2H), 5,16 (bs, IH, NH), 7,34 (bs, IH, NH).2H), 3.47-3.66 (m, 14H), 4.01 (s, 2H), 4.04 (s, 2H), 5.16 (bs, 1H, NH), 7.34 (bs); , 1H, NH).
Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CDCl3) : δ = 28,8 (3C) ; 38,9 ; 70,3 (3C) ; 70,5 (3C) ; 71,1 (3C) ; 79,8 ; 156,5 ; 171,6 ; 175,0. MS (ESI, mode positif) m/z : 431 ,27 (M+Na)+, 453,27 (M-H+2Na)+. 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CDCl 3 ): δ = 28.8 (3C); 38.9; 70.3 (3C); 70.5 (3C); 71.1 (3C); 79.8; 156.5; 171.6; 175.0. MS (ESI, positive mode) m / z: 431.27 (M + Na) + , 453.27 (M-H + 2Na) + .
MS (ESI, mode négatif) m/z : 407,47 (M-H)" calculé pour C17H32N2O9 408,45. 2) Synthèse du précurseur (B-I)MS (ESI, negative mode) m / z: 407.47 (MH) - calcd for C 17 H 32 N 2 O 9 408.45 2) Synthesis of the precursor (BI)
Précurseur (B-I) Precursor (BI)
Le précurseur (B-I) a été synthétisé en deux étapes à partir du dérivé protégé N-Fmoc de l'acide aminooxyacétique (8) préalablement préparé par réaction entre l'acide aminooxyacétique commercial et le chloroformiate de 9-fluorénylméthanol dans les conditions de Schotten-Baumann (Cipolla L. et al, Bioorg. Med. Chem., 2002, 10, 1639-1646). a) Première étape préalable : Synthèse de l'acide 9-fluorénylméthoxycarbonyl- aminooxyacétique (8)The precursor (BI) was synthesized in two steps from the protected N-Fmoc derivative of the aminooxyacetic acid (8) previously prepared by reaction between the commercial aminooxyacetic acid and the chloroformate of 9-fluorenylmethanol under Schotten-Baumann conditions (Cipolla L. et al, Bioorg Med Chem, 2002, 10, 1639-1646). a) First preliminary step: Synthesis of 9-fluorenylmethoxycarbonylaminooxyacetic acid (8)
0,5 g (4,6 mmol) d'hémichlorhydrate de carboxyméthoxylamine ont été dissous dans 20 ml d'une solution aqueuse contenant 1,2 g de Na2CO3 puis la solution résultante a été refroidie à 4°C. 1,31 g (5,0 mmol) de chloroformiate de 9- fluorénylméthyle dans 10 ml de dioxane anhydre ont alors été ajoutés goutte à goutte au milieu réactionnel qui a ensuite été maintenu sous agitation à température ambiante pendant une nuit. Le mélange réactionnel a été concentré, acidifié jusqu'à pH 4-5 par ajout d'environ 5 ml d'une solution aqueuse d'acide chlorhydrique à 5 % et le produit a précipité dans la solution. Il a été récupéré par filtration et lavé 1 fois avec 20 ml d'eau distillée puis 1 fois avec 20 ml de pentane. L'eau résiduelle a été éliminée par lyophilisation pour conduire à 1,05 g (3,4 mmol) du composé (8) sous forme brute. Après purification par chromatographie sur une colonne de gel de silice (30 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de méthanol (0-50 %) dans le dichlorométhane, on a obtenu 0,64 g (2,0 mmol) du composé (8) sous la forme d'une mousse blanche (rendement 43 %). Analyse RMN 1H (300 MHz, CD3OD) : δ = 4,22-4,27 (m, 3H), 4,440.5 g (4.6 mmol) of carboxymethoxylamine hemihydrochloride was dissolved in 20 ml of an aqueous solution containing 1.2 g of Na 2 CO 3 and then the resulting solution was cooled to 4 ° C. 1.31 g (5.0 mmol) of 9-fluorenylmethyl chloroformate in 10 ml of anhydrous dioxane were then added dropwise to the reaction medium, which was then stirred at room temperature overnight. The reaction mixture was concentrated, acidified to pH 4-5 by addition of about 5 ml of 5% aqueous hydrochloric acid solution and the product precipitated in the solution. It was recovered by filtration and washed once with 20 ml of distilled water and then once with 20 ml of pentane. The residual water was removed by lyophilization to afford 1.05 g (3.4 mmol) of the compound (8) in crude form. After purification by chromatography on a column of silica gel (30 g) using a mobile gradient gradient of methanol (0-50%) in dichloromethane, 0.64 g (2.0 mmol) of the compound ( 8) as a white foam (yield 43%). 1 H NMR analysis (300 MHz, CD 3 OD): δ = 4.22-4.27 (m, 3H), 4.44
(d, J = 6,8 Hz, 2H), 7,29-7,42 (m, 4H), 7,64 (d, J = 7,5 Hz, 2H), 7,80 (d, J = 7,5 Hz, 2H). b) Deuxième étape préalable : Synthèse de la ^-(tert-butyloxycarbonyD-L-lysine (10)(d, J = 6.8 Hz, 2H), 7.29-7.42 (m, 4H), 7.64 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.80 (d, J = 7.5 Hz, 2H). b) Second Preliminary Step: Synthesis of N - (tert-butyloxycarbonyl) -L-lysine (10)
1,0 g (2,63 mmol) de iy^:Ctert-butyJoxycarbony.l):N!-: 1.0 g (2.63 mmol) iy ^: Ctert-butyJoxycarbony. l) : N! -:
(benzyloxycarbonyl)):Lτly_sine (produit commercial) a été dissous dans 50 ml d'acétate d'éthyle puis la solution a été refroidie à 4°C. On a ensuite ajouté 0,1 g de Pd/C à 10 % de Pd puis le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 21 heures sous atmosphère d'hydrogène. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM (CH2Cl2/Me0H 85:15, v/v) puis le mélange réactionnel a été filtré sur Celite 545 pour éliminer le Pd/C. En raison de la faible solubilité du composé (10) dans l'acétate d'éthyle, on a réalisé des lavages de la Celite® 545 avec 2 fois 50 ml de méthanol pour récupérer le composé (10). Le filtrat a été évaporé à sec et le résidu huileux obtenu a été séché sous vide pour conduire à 0,41 g (1,67 mmol) du composé (10) sous la forme d'une mousse blanche avec un rendement de 64%. c) Première étape : Synthèse de l'ester succinimidylique de l'acide 9-fluorénylméthoxycarbonyl-aminooxyacétique (9) (benzyloxycarbonyl)): The ly_sine τ (commercial product) was dissolved in 50 ml of ethyl acetate and then the solution was cooled to 4 ° C. 0.1 g Pd / C at 10% Pd was then added and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 21 hours under a hydrogen atmosphere. The reaction was checked for completeness by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH 85:15, v / v) and then the reaction mixture filtered through Celite 545 to remove Pd / C. Due to the low solubility of the compound (10) in ethyl acetate was conducted washes Celite ® 545 with 2 times 50 ml of methanol to recover the compound (10). The filtrate was evaporated to dryness and the resulting oily residue was dried in vacuo to afford 0.41 g (1.67 mmol) of the compound (10) as a white foam in 64% yield. (c) First step: Synthesis of 9-fluorenylmethoxycarbonylaminooxyacetic acid succinimidyl ester (9)
0,560 g (1,80 mmol du composé (8) obtenu ci-dessus à l'étape a) ont été dissous dans 15 ml d'un mélange acétate d'éthyle/dioxane (2:1, v/v), puis la solution a été refroidie jusqu'à une température de 4°C. 0,225 g (1,95 mmol) de N-hydroxysuccinimide et 0,404 g de ΛζN'-dicyclohexylcarbodiimide (DCC) ont été ajoutés successivement à cette solution et le milieu réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant une nuit sous atmosphère d'argon. La conversion du composé (8) en ester N-hydroxysuccinimidylique correspondant (9) a été contrôlée par chromatographie liquide haute performance en phase inverse (HPLC-PI) sur une colonne Thermo Hypersil GOLD" Ci8 de 5 μm et de dimensions 4,6 x 150 mm, en utilisant de l'acétonitrile et une solution aqueuse d'acide trifluoroacétique (TFA) à 0,1 % (v/v, pH 2) comme éluants (80 % de solution aqueuse de TFA à 0,1 % avec un gradient linéaire de 20 à 90 % d'acétonitrile en 35 minute, à un débit de 1,0 ml/min. Une double détection UV a été effectuée à 210 et 254 nm. Le composé (9) (?R = 20,72 min) a ensuite été immédiatement utilisé dans la réaction suivante de couplage sans purification. d) Deuxième étape : Synthèse de la Na-(tert-butyloxycarbonyl)- Nβ-^-fluorénylméthoxycarbonyl-aminooxyacétvQ-L-lysine (B- 1 )0.560 g (1.80 mmol of the compound (8) obtained above in step a) were dissolved in 15 ml of a mixture of ethyl acetate / dioxane (2: 1, v / v), then the solution was cooled to a temperature of 4 ° C. 0.225 g (1.95 mmol) of N-hydroxysuccinimide and 0.404 g of Λζ N'-dicyclohexylcarbodiimide (DCC) were added successively to this solution and the resulting reaction medium was stirred at room temperature overnight under an atmosphere of argon. Converting the compound (8) N-hydroxysuccinimidyl ester corresponding (9) was monitored by high performance reverse phase liquid chromatography (RP-HPLC) on a Thermo Hypersil GOLD column "Ci 8 5 .mu.m and dimensions 4.6 x 150 mm, using acetonitrile and a 0.1% (v / v, pH 2) aqueous solution of trifluoroacetic acid (TFA) as eluents (80% 0.1% aqueous TFA solution with a linear gradient of 20 to 90% acetonitrile in a minute, at a flow rate of 1.0 ml / min Double UV detection was performed at 210 and 254 nm The compound (9) ( R = 20, 72 min) was then immediately used in the subsequent coupling reaction without purification. d) Second step: Synthesis of N a - (tert -butyloxycarbonyl) - N β - ^ - fluorenylmethoxycarbonyl-aminooxyacétvQ-L-lysine (B- 1)
A une suspension de Λ^-Boc-L-lysine (10) (0,41 g, 1,67 mmol) dans 6 ml d'un mélange de DMF/NMP (5:1, v/v) anhydre, on a successivement ajouté la DIEA (0,29 ml, 1,67 mmol) et la solution brute d'ester de N-hydroxysuccinimide (9) obtenu ci-dessus à l'étape précédente. Le milieμ réactionnel résultant a été agité à température ambiante pendant 30 minutes. Une solution aqueuse de DIEA (0,15 ml dans 5 ml) a été alors ajoutée et la solution résultante a été agitée à température ambiante pendant 90 minutes. La réaction a été suivie par HPLC-PI (système identique à celui utilisé ci-dessus à l'étape précédente pour l'analyse du composé (9)). Le mélange réactionnel a été acidifié jusqu'à pH 5-6 par ajout d'une solution aqueuse de HCl à 5% (~ 3 ml) puis évaporé à sec. Le résidu ainsi obtenu a été repris dans 50 ml d'acétate d'éthyle et le résidu solide insoluble (précipité de DCU) éliminé par filtration sur Celite® 545. Le filtrat a été lavé avec 30 ml d'une solution aqueuse d'acide citrique à 10 %, séché sur Na2SO4 puis évaporé à sec. Le résidu jaune huileux ainsi obtenu a été purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (45 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de MeOH (0-6%) dans le dichlorométhane. On a obtenu 310 mg (0,57 mmol) de composé (B-I) sous la forme d'une mousse blanche avec un rendement de 34%. Analyse RMN 1H (300 MHz, CD3CN) : δ = 1,37-1,83 (m, 15H),To a suspension of β1-Boc-L-lysine (10) (0.41 g, 1.67 mmol) in 6 ml of anhydrous DMF / NMP (5: 1, v / v) mixture was added. DIEA (0.29 ml, 1.67 mmol) and the crude solution of N-hydroxysuccinimide ester (9) obtained above in the previous step were successively added. The resulting reaction medium was stirred at room temperature for 30 minutes. An aqueous solution of DIEA (0.15 ml in 5 ml) was then added and the resulting solution was stirred at room temperature for 90 minutes. The reaction was followed by HPLC-PI (system identical to that used above in the previous step for the analysis of the compound (9)). The reaction mixture was acidified to pH 5-6 by addition of a 5% aqueous solution of HCl (~ 3 ml) and then evaporated to dryness. The residue thus obtained was taken up in 50 ml of ethyl acetate and the insoluble solid residue (precipitated DCU) removed by filtration on Celite ® 545. The filtrate was washed with 30 ml of an aqueous acid solution 10% citric, dried over Na 2 SO 4 and then evaporated to dryness. The oily yellow residue thus obtained was purified by chromatography on a column of silica gel (45 g) using a gradient of MeOH (0-6%) in dichloromethane as the mobile phase. 310 mg (0.57 mmol) of compound (BI) was obtained in the form of a white foam with a yield of 34%. 1 H NMR analysis (300 MHz, CD 3 CN): δ = 1.37-1.83 (m, 15H),
3,18 (q, J = 6,4 Hz, J = 12,6 Hz, 2H), 4,00 (m, IH, α-CH), 4,04 (s, 2H), 4,26 (t, J = 6,8 Hz, IH), 4,49 (d, J = 6,8 Hz, 2H), 5,61 (bd, J = 7,5 Hz, IH, NH), 7,31-7,44 (m, 4H), 7,51 (bs, IH, NH), 7,63 (d, J= 7,5 Hz, 2H), 7,83 (d, J= 7,5 Hz, 2H), 8,9 (bs, IH, NH). Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CD3CN) : δ = 23,5 ; 28,5 (3C) ; 29,53.18 (q, J = 6.4 Hz, J = 12.6 Hz, 2H), 4.00 (m, 1H, α-CH), 4.04 (s, 2H), 4.26 (t. , J = 6.8 Hz, 1H), 4.49 (d, J = 6.8 Hz, 2H), 5.61 (bd, J = 7.5 Hz, 1H, NH), 7.31-7 , 44 (m, 4H), 7.51 (bs, 1H, NH), 7.63 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.83 (d, J = 7.5 Hz, 2H) , 8.9 (bs, 1H, NH). 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CD 3 CN): δ = 23.5; 28.5 (3C); 29.5
; 31,6 ; 38,9 ; 47,7 ; 54,2 ; 68,0 ; 76,3 ; 79,8 ; 120,9 (2C) ; 126,0 (2C) ; 128,1 (2C) ; 128,7 (2C), 142,1 (2C) ; 144,6 (2C) ; 156,7 ; 158,9 ; 169,3 ; 174,5.; 31.6; 38.9; 47.7; 54.2; 68.0; 76.3; 79.8; 120.9 (2C); 126.0 (2C); 128.1 (2C); 128.7 (2C), 142.1 (2C); 144.6 (2C); 156.7; 158.9; 169.3; 174.5.
MS (Maldi-TOF, mode positif) m/z : 564,5709 (M+Na)+, 580,5535 (M+K)+, calculé pour C28H35N3O8 541,61. 3) Synthèse du précurseur (C-I)MS (Maldi-TOF, positive mode) m / z: 564.5709 (M + Na) + , 580.5535 (M + K) + , calculated for C 28 H 35 N 3 O 8 541.61. 3) Synthesis of the precursor (CI)
Cette synthèse est représentée sur le Schéma 1 ci-dessous :This synthesis is represented in Diagram 1 below:
SCHEMA 1 Ainsi que cela apparaît sur ce schéma 1, le précurseur (C-I) a été synthétisé en quatre étapes à partir la Λ^-Boc-Λ^-Z-L-lysine (11) ; dans ce composé Z représente le groupement benzyloxycarbonyl. Dans un premier temps, la fonction acide carboxylique est convertie en carboxamide (12) par réaction de l'ammoniaque sur l'anhydride mixte intermédiairement formé selon la méthode décrite par exemple par Hofmann, K. et al, J. Am. Chem. Soc, 1978, 100, 3585-3590. Ensuite, la fonction ε-NH2 protégée par un groupement Z a été libérée (13) par hydrogénation catalytique afin de pouvoir coupler le dérivé maléimide de la glycine (14) préalablement préparé par réaction entre la glycine et le N-(méthyloxycarbonyl)maléimide selon la méthode décrite par Keller O. et al, HeIv. Chim. Acta, 1975, 58, 531-541. Le dérivé maléimide (15) a ensuite été isolé par chromatographie sur gel de silice avec un rendement de 51%. Enfin, l'extrémité N-terminale a été déprotégée par traitement à l'acide trifluoroacétique pour conduire au précurseur (C-I). a) Première étape : Synthèse du /^-(tert-butyloxycarbonvD-Λ^- (benzyloxycarbonyl))7L:lysine-carbpxamideχi2J 1,0 g (2,63 mmol) de ^"-(tert-butyloxycarbonyl)-^-As shown in Scheme 1, the precursor (CI) was synthesized in four steps from β-Boc-β-ZL-lysine (11); in this compound Z represents the benzyloxycarbonyl group. In a first step, the carboxylic acid function is converted to carboxamide (12) by reaction of ammonia with the mixed anhydride intermediately formed according to the method described, for example, by Hofmann, K. et al., J. Am. Chem. Soc., 1978, 100, 3585-3590. Then, the ε-NH 2 function protected by a Z group was released (13) by catalytic hydrogenation in order to be able to couple the maleimide derivative of glycine (14) previously prepared by reaction between glycine and N- (methyloxycarbonyl) maleimide according to the method described by Keller O. et al, HeIv. Chim. Acta, 1975, 58, 531-541. The maleimide derivative (15) was then isolated by chromatography on silica gel with a yield of 51%. Finally, the N-terminus was deprotected by treatment with trifluoroacetic acid to yield the precursor (CI). a) First step: Synthesis of N - (tert-butyloxycarbonyl) -2- (benzyloxycarbonyl) 7 L : lysine-carboxamide 2 1.0 g (2.63 mmol) of n - (tert-butyloxycarbonyl) -
(benzyloxycarbonyl)-L-lysine (11) a été dissous dans 18 ml d'acétate d'éthyle anhydre et la solution a été refroidie à -15°C dans un bain composé de carboglace (CO2 solide) et d'éthylèneglycol. 0,29 ml (2,63 mmol) de N-méthylmorpholine (NMM) et 0,34 ml (2,63 mmol) de chloroformiate d'isobutyle ont ensuite été ajoutés et le milieu réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à -15°C pendant 10 minutes sous atmosphère d'argon. On a ensuite ajouté à ce mélange 1 ,3 ml d'ammoniaque aqueux (50 % ; v/v) et le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à une température de 0°C pendant 1 heure. Un précipité blanc volumineux s'est immédiatement formé ; celui-ci a été récupéré par filtration et lavé avec 25 ml d'eau distillée puis avec 25 ml de pentane. L'eau résiduelle a été éliminée par lyophilisation pour conduire à 0,705 g (1,86 mmol) du composé (12). Le filtrat a par ailleurs été repris dans 20 ml d'acétate d'éthyle, lavé avec 20 ml d'eau distillée, séché sur Na2SO4 et évaporé à sec. Le solide blanc obtenu a été lavé avec 2 fois 25 ml de pentane et séché sous vide. Une quantité supplémentaire de composé (12) (0,25 g, 0,66 mmol) a ainsi été obtenue. Le rendement total était de 95 %.(Benzyloxycarbonyl) -L-lysine (11) was dissolved in 18 ml of anhydrous ethyl acetate and the solution was cooled to -15 ° C in a bath consisting of dry ice (solid CO 2 ) and ethylene glycol. 0.29 ml (2.63 mmol) of N-methylmorpholine (NMM) and 0.34 ml (2.63 mmol) of isobutyl chloroformate was then added and the resulting reaction medium was stirred at -15 ° C for 10 minutes under argon atmosphere. Then 1.3 ml of aqueous ammonia (50% v / v) was added to this mixture and the reaction mixture was stirred at 0 ° C for 1 hour. A voluminous white precipitate immediately formed; this was recovered by filtration and washed with 25 ml of distilled water and then with 25 ml of pentane. The residual water was removed by lyophilization to yield 0.705 g (1.86 mmol) of the compound (12). The filtrate was, moreover, taken up in 20 ml of ethyl acetate, washed with 20 ml of distilled water, dried over Na 2 SO 4 and evaporated to dryness. The white solid obtained was washed with twice 25 ml of pentane and dried under vacuum. An additional amount of compound (12) (0.25 g, 0.66 mmol) was thus obtained. The total yield was 95%.
Analyse RMN 1H (300 MHz, CD3CN) : δ = 1,31-7,78 (m, 15H), 3,10 (q, J = 6,4 Hz, J= 12,9 Hz, IH), 3,92 (m, IH, α-CH), 5,06 (s, 2H, CH2-Bn), 5,53 (bs, 1Η, NH), 5,66 (bs, IH, NH), 5,71 (bs, IH, NH), 6,31 (bs, IH, NH), 7,30-7,42 (m, 5H). b) Deuxième étape : Synthèse de la A^-(tert-butyloxycarbonyO-L-lysine-carboxamide (13) 1 H NMR analysis (300 MHz, CD 3 CN): δ = 1.31-7.78 (m, 15H), 3.10 (q, J = 6.4 Hz, J = 12.9 Hz, 1H) , 3.92 (m, 1H, α-CH), 5.06 (s, 2H, CH 2 -Bn), 5.53 (bs, 1Η, NH), 5.66 (bs, 1H, NH), 5.71 (bs, 1H, NH), 6.31 (bs, 1H, NH), 7.30-7.42 (m, 5H). b) Second step: Synthesis of N - (tert-butyloxycarbonyl-L-lysine-carboxamide (13)
0,95 g (2,5 mmol) du composé (12) obtenu ci-dessus à l'étape précédente ont été dissous dans 50 ml d'un mélange acétate d'éthyle/éthanol (4:1, v/v) et la solution a été refroidie à 4°C. 0,1 g de Pd/C à 10 % de Pd a été ajouté et le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 3 heures sous atmosphère d'argon. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM (CH2Cl2/Me0H 9:1, v/v) puis le mélange a été filtré sur Celite® 545 pour éliminer le Pd/C. Le filtrat a ensuite été évaporé à sec pour conduire à un résidu huileux qui a ensuite été évaporé sous vide pour conduire au composé (13) attendu sous la forme d'un solide blanc (rendement quantitatif).0.95 g (2.5 mmol) of the compound (12) obtained above in the previous step were dissolved in 50 ml of a mixture of ethyl acetate / ethanol (4: 1, v / v) and the solution was cooled to 4 ° C. 0.1 g Pd / C at 10% Pd was added and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 3 hours under an argon atmosphere. Was checked that the reaction was complete by TLC (CH 2 Cl 2 / Me0H 9: 1, v / v) and the mixture was filtered through Celite ® 545 to remove Pd / C. The filtrate was then evaporated to dryness to give an oily residue which was then evaporated in vacuo to yield the expected compound (13) as a white solid (quantitative yield).
RMN 1H (300 MHz, CD3OD) : δ = 1,40-1,80 (m, 15H), 2,70 (t, J = 1 H NMR (300 MHz, CD 3 OD): δ = 1.40-1.80 (m, 15H), 2.70 (t, J =
6,8 Hz, 1 H), 4,03 (q, J = 4,9 Hz, J = 12, 1 Hz, 1 H, α-CH). c) Etape annexe : Synthèse de la N-maléoyl-L-Glycine (14) i) étape préliminaire : Préparation de la N- (m4thyApΛycarpony.ljmaléimide6.8 Hz, 1H), 4.03 (q, J = 4.9 Hz, J = 12, 1 Hz, 1H, α-CH). c) Step Schedule: Synthesis of N-maleoyl-L-Glycine (14) i) preliminary step: Preparation of N- (m4thyApΛycarpony ljmaléimide.
1 g (10,3 mmol) de maléimide a été dissous dans 20 ml d'acétate d'éthyle anhydre puis la solution a été refroidie à 4°C. 1,13 ml de NMM (10,3 mmol) et 0,80 ml (10,3 mmol) de chloroformiate de méthyle ont ensuite été ajoutés puis le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 1 heure. Un précipité volumineux de couleur blanche de NMM.HC1 s'est immédiatement formé ; il a été éliminé par filtration et lavé avec environ 20 ml d'acétate d'éthyle. Le filtrat a été lavé par 30 ml de solution aqueuse saturée de NaCl, séché sur Na2SO4 et évaporé à sec. Le résidu huileux résultant a été séché sous vide pour conduire à la N-(méthyloxycarbonyl)maléimide sous la forme d'un solide brun pourpre (1,16 g, 7,5 mmol, rendement 73 %). ii) Préparation de la .N-maléoyl-L-Glyçine (14) 0,5 g de glycine (6,7 mmol), a été dissous dans une solution aqueuse de NaHCO3 (2,8 g dans 32 ml) et la solution a ensuite été refroidie à 0°C (NaCl/bain de glace). 1 ,04 g (6,7 mmol) de la W-(méthyloxycarbonyl)maléimide obtenue à l'étape i) ci-dessus ont été ajoutés et le mélange réactionnel résultant a été mélangé vigoureusement à une température de 0 °C pendant 20 minutes. Ensuite, 60 ml d'eau distillée ont été ajoutés et la solution aqueuse résultante a été laissée à température ambiante pendant une nuit. Le mélange réactionnel a alors été acidifié jusqu'à pH 6 par ajout d'H2SO4 puis partiellement évaporé. Une quantité supplémentaire de H2SO4 a ensuite été ajoutée pour atteindre un pH 1-2 puis la solution aqueuse a été extraite à l'acétate d'éthyle (2 x 50 ml). La phase organique a été lavée avec une solution aqueuse saturée de NaCl (50 ml), séchée sur Na2SO4 et évaporée à sec. Le résidu huileux résultant a été purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (25 g) en utilisant comme phase mobile un mélange de CHCl3/AcOH (95:5, v/v). Finalement, les traces de AcOH ont été éliminées par lyophilisation. La N-maléoyl-L- glycine (14) a ensuite été obtenue sous la forme d'un solide incolore (0,61 g, 3,6 mmol, rendement 54 %). Ce composé (14) a ensuite été immédiatement utilisé dans la troisième étape qui est décrite ci-dessous. Analyse RMN 1H (300 MHz, acétone-d6) : δ= 4,29 (s, 2H, CH2- GIy), 7,02 (s, 2H, CH-MaI).1 g (10.3 mmol) of maleimide was dissolved in 20 ml of anhydrous ethyl acetate and then the solution was cooled to 4 ° C. 1.13 ml of NMM (10.3 mmol) and 0.80 ml (10.3 mmol) of methyl chloroformate were then added and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 1 hour. A large white precipitate of NMM.HC1 immediately formed; it was removed by filtration and washed with about 20 ml of ethyl acetate. The filtrate was washed with 30 ml of saturated aqueous NaCl solution, dried over Na 2 SO 4 and evaporated to dryness. The resulting oily residue was dried under vacuum to give N- (methyloxycarbonyl) maleimide as a purplish brown solid (1.16 g, 7.5 mmol, 73% yield). ii) Preparation of the . N-Maleoyl-L-Glycine (14) 0.5 g of glycine (6.7 mmol) was dissolved in aqueous NaHCO 3 (2.8 g in 32 ml) and the solution was then cooled to room temperature. 0 ° C (NaCl / ice bath). 1.04 g (6.7 mmol) of the W- (methyloxycarbonyl) maleimide obtained in step i) above was added and the resulting reaction mixture was stirred vigorously at 0 ° C for 20 minutes. . Then, 60 ml of distilled water was added and the resulting aqueous solution was left at room temperature overnight. The reaction mixture was then acidified to pH 6 by adding H 2 SO 4 and then partially evaporated. Additional H 2 SO 4 was then added to pH 1-2, and the aqueous solution was extracted with ethyl acetate (2 x 50 mL). The organic phase was washed with saturated aqueous NaCl solution (50 ml), dried over Na 2 SO 4 and evaporated to dryness. The resulting oily residue was purified by column chromatography on silica gel (25 g) using as the mobile phase a mixture of CHCl 3 / AcOH (95: 5, v / v). Finally, traces of AcOH were removed by lyophilization. N-Maleoyl-L-glycine (14) was then obtained as a colorless solid (0.61 g, 3.6 mmol, 54% yield). This compound (14) was then immediately used in the third step which is described below. 1 H NMR analysis (300 MHz, acetone-d 6): δ = 4.29 (s, 2H, CH 2 - Gly), 7.02 (s, 2H, CH-May).
Analyse RMN 13C (75,5 MHz, acétone-d6) : δ = 39,6, 136,3 (2C), 169,8 (2C), 171 ,7 (1C). d) Troisième étape : Synthèse du 7Vα-(tert-butyloxycarbonyl)-./V£-(N-maléoyl-L- glycyl)-L-lysine-carboxamide (15) 13 C NMR analysis (75.5 MHz, 6 -acetone): δ = 39.6, 136.3 (2C), 169.8 (2C), 171.7 (1C). d) Third step: Synthesis of 7V α - (tert-butyloxycarbonyl) - / V £ - (N-maleoyl-L-glycyl) -L-lysine-carboxamide (15).
0,29 g (1,73 mmol) de N-maléoyl-L-glycine (14) obtenue précédemment a été dissous dans 5 ml de CH3CN anhydre. Une solution de Λ^-Boc-L- lysine-NH2 (11) (0,55 g, 2,24 mmol) dans 5 ml de DMF anhydre a été ajoutée et la solution résultante a été refroidie à 4°C. 0,23 g (1,73 mmol) d'hydroxybenzotriazole monohydraté (HOBt) et 0,39 g (1,90 mmol) de DCC ont été ajoutés. Le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant une nuit sous atmosphère d'argon. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM (CH2Cl2/Me0H 8:2, v/v) et le mélange a été filtré sur Celite® 545 pour éliminer le précipité blanc de 7V,N'-dicyclohexylurée (DCU). Le filtrat a ensuite été évaporé à sec puis séché sous vide pour éliminer le DMF. Le résidu résultant a ensuite été repris dans 50 ml d'acétate d'éthyle, lavé avec 30 ml de NaHCO3 saturé, 30 ml d'une solution aqueuse saturée de NaCl, puis séché sur Na2SO4 et évaporé à sec. Le résidu résultant a été purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (30 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de méthanol (0-15%) dans le dichlorométhane, pour conduire à 0,35 g (0,88 mmol) du composé (15) attendu sous la forme d'une solide blanc avec un rendement de 51 %.0.29 g (1.73 mmol) of N-maleoyl-L-glycine (14) obtained above was dissolved in 5 ml of anhydrous CH 3 CN. A solution of β-Boc-L-lysine-NH 2 (11) (0.55 g, 2.24 mmol) in 5 ml of anhydrous DMF was added and the resulting solution was cooled to 4 ° C. 0.23 g (1.73 mmol) of hydroxybenzotriazole monohydrate (HOBt) and 0.39 g (1.90 mmol) of DCC were added. The resulting reaction mixture was stirred at room temperature overnight under an argon atmosphere. Was checked that the reaction was complete by TLC (CH 2 Cl 2 / Me0H 8: 2, v / v) and the mixture was filtered through Celite ® 545 to remove the white precipitate of 7V, N'-dicyclohexylurea (DCU) . The filtrate was then evaporated to dryness and dried under vacuum to remove DMF. The resulting residue was then taken up in 50 ml of ethyl acetate, washed with 30 ml of saturated NaHCO 3 , 30 ml of a saturated aqueous solution of NaCl, then dried over Na 2 SO 4 and evaporated to dryness. The resulting residue was purified by column chromatography on silica gel (30 g) using a gradient of methanol (0-15%) in dichloromethane as mobile phase, to yield 0.35 g (0.88 mmol). ) of the expected compound (15) as a white solid with a yield of 51%.
Analyse IR (KBr) vmax 835, 1063, 1166, 1256, 1432, 1525, 1555, 1665 (large), 1710 (large), 2926, 3218, 3342 (large), 3416 cm'1. Analyse RMN 1H (300 MHz, CD3CN) : δ = 1 ,29-1 ,78 (m, 15H),IR analysis (KBr) v max 835, 1063, 1166, 1256, 1432, 1525, 1555, 1665 (broad), 1710 (broad), 2926, 3218, 3342 (broad), 3416 cm -1 . 1 H NMR analysis (300 MHz, CD 3 CN): δ = 1, 29-1, 78 (m, 15H),
3,15 (q, J= 6,4 Hz, J= 13,0 Hz, IH), 3,88-3,95 (m, IH, α-CH), 4,05 (s, 2H), 5,52 (bs, IH, NH), 5,72 (bs, IH, NH), 6,34 (bs, IH, NH), 6,62 (bs, IH, NH), 6,85 (s, 2H).3.15 (q, J = 6.4 Hz, J = 13.0 Hz, 1H), 3.88-3.95 (m, 1H, α-CH), 4.05 (s, 2H), , 52 (bs, 1H, NH), 5.72 (bs, 1H, NH), 6.34 (bs, 1H, NH), 6.62 (bs, 1H, NH), 6.85 (s, 2H). ).
Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CD3CN) : δ = 24,1, 29,0 (3C), 30,1 , 33,0, 40,1, 41,4, 55,7, 80,2, 136,1 (2C), 157,1, 167,8, 172,1, 176,0. e) Quatrième étape : Synthèse du N£-(7V-maléoyl-L-glycyl)-L-lvsine-carboxamide 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CD 3 CN): δ = 24.1, 29.0 (3C), 30.1, 33.0, 40.1, 41.4, 55.7, 80, 2, 136.1 (2C), 157.1, 167.8, 172.1, 176.0. e) Fourth step: Synthesis of N £ - (7V-maleoyl-L-glycyl) -L-lvsine-carboxamide
(Précurseur C-I)(Precursor C-I)
0,33 g (0,83 mmol) de ^-(tert-butyloxycarbonyO-Λ^-OM-maléoyl-L- glycyl)-L-lysine-carboxamide (15) a été dissous dans 7 ml d'un mélange TFA/H2O (95:5, v/v) puis la solution a été laissée à température ambiante pendant 90 minutes.0.33 g (0.83 mmol) of N - (tert-butyloxycarbonyl) -N, -OM-maleoyl-L-glycyl) -L-lysine-carboxamide (15) was dissolved in 7 ml of a TFA / H 2 O (95: 5, v / v) then the solution was left at room temperature for 90 minutes.
Le TFA a ensuite été évaporé et le produit a été précipité à l'éther, lavé à l'éther et lyophilisé. Le sel de TFA brut du précurseur (C-I) a été purifié par flash chromatographie en phase inverse sur une colonne de silice greffée Ci8 (20 g, élution avec une solution aqueuse de TFA à 0,1 %). Les fractions contenant le produit ont été lyophilisées pour donner 91 mg (0,22 mmol, rendement 27 %) du précurseur (C-I) attendu sous la forme d'un solide blanc.The TFA was then evaporated and the product was precipitated with ether, washed with ether and lyophilized. The crude TFA salt of precursor (CI) was purified by reversed-phase flash chromatography on a grafted silica column Ci 8 (20 g, elution with an aqueous solution of 0.1% TFA). Fractions containing the product were lyophilized to give 91 mg (0.22 mmol, 27% yield) of the expected precursor (Cl) as a white solid.
Analyse RMN 1H (300 MHz, D2O) : δ = 1,33-1,42 (m, 2H)5 1,49- 1 H NMR analysis (300 MHz, D 2 O): δ = 1.33 to 1.42 (m, 2H) 5 1,49-
1 ,59 (m, 2H), 1,83-1,90 (m, 2H), 3,21 (t, J = 6,8 Hz, 2H), 3,98 (t, J = 6,8 Hz, IH, α-1.59 (m, 2H), 1.83-1.90 (m, 2H), 3.21 (t, J = 6.8 Hz, 2H), 3.98 (t, J = 6.8 Hz). , IH, α-
CH), 4,22 (s, 2H), 6.92 (s, 2H). 4) Synthèse du réactif fonctionnel (I- 1) conforme à l'Invention et non fluorescent:CH), 4.22 (s, 2H), 6.92 (s, 2H). 4) Synthesis of the functional reagent (I-1) according to the invention and not fluorescent:
Assemblage des précurseurs (A-I), (B-I) et (C-I)Assembly of precursors (A-I), (B-I) and (C-I)
Le composé trifonctionnel (1-1) a été synthétisé en 5 étapes à partir des précurseurs (A-I), (B-I) et (C-I) préparés ci-dessus au cours des étapes précédentes. Le protocole de synthèse du composé (1-1) est résumé (les trois étapes principales uniquement) sur le schéma 2 suivant : The trifunctional compound (1-1) was synthesized in 5 steps from the precursors (AI), (BI) and (CI) prepared above in the previous steps. The synthesis protocol of the compound (1-1) is summarized (the three main steps only) in the following scheme 2:
Précurseur (B-1-C-1)Precursor (B-1-C-1)
SCHÉMA 2FIGURE 2
Le couplage entre les précurseurs (B-I) et (C-I) a été réalisé après pré-activation du précurseur (B-I) sous forme d'ester d'hydroxysuccinimide selon la méthode décrite par exemple dans l'article de Knorr, R. et al., Tetrahedron Lett., 1989, 30, 1927-1930. L'ester activé a ensuite été mis en réaction avec le précurseur (C-I) pour conduire à un produit de couplage (16) qui a été isolé par chromatographie sur gel de silice avec un rendement de 32%. Ensuite, un traitement avec du TFA a permis d'éliminer le groupement Boc et ainsi d'obtenir le précurseur (B-l-C-1). Le couplage final entre le précurseur (A-I) et le précurseur (B-l-C-1) a été réalisé en utilisant le BOP comme réactif de couplage. Le produit attendu, sous forme encore protégée, a été purifié par chromatographie sur gel de silice. Après déprotection, par traitement à l'acide trifluoroacétique, l'extrémité N-terminale a été convertie en carbamate activé par traitement avec le TV, TV'-disuccinimidyl carbonate (DSC) dans le DMF anhydre en présence de triéthylamine. Une conversion totale du pseudo-peptide en composé de formule (1-1) a été observée au bout de 30 minutes. Le composé de formule (1-1) attendu a ensuite été purifié par flash chromatographie en phase inverse sur une colonne de silice greffée Ci8. a) Première étape : Synthèse du Λ^-(tert-butyloxycarbonylV7Vg-(9- fluorénylméthyloxycarbonyl-aminooxy-acétyl)-L-lvsine-Ng-maléoyl-L-lysine- carboxamide (16)The coupling between the precursors (BI) and (CI) was carried out after pre-activation of the precursor (BI) in the form of hydroxysuccinimide ester according to the method described for example in the article by Knorr, R. et al. Tetrahedron Lett., 1989, 30, 1927-1930. The activated ester was then reacted with the precursor (CI) to yield a coupling product (16) which was isolated by silica gel chromatography in 32% yield. Then, treatment with TFA made it possible to eliminate the Boc group and thus obtain the precursor (BlC-1). The final coupling between the precursor (AI) and the precursor (BlC-1) was carried out using the BOP as a coupling reagent. The expected product, in still protected form, was purified by chromatography on silica gel. After deprotection, by treatment with trifluoroacetic acid, the N-terminus was converted to activated carbamate by treatment with TV, 4'-disuccinimidyl carbonate (DSC) in anhydrous DMF in the presence of triethylamine. Total conversion of the pseudo-peptide to the compound of formula (I-1) was observed after 30 minutes. The compound of formula (1-1) expected was then purified by flash reverse phase chromatography on a grafted silica column Ci 8 . a) First step: Synthesis of Λ ^ - (tert-butyloxycarbonylV7V g - (9- fluorenylmethyloxycarbonyl-aminooxy-acetyl) -L-lvsine-N g -maléoyl-L-lysine-carboxamide (16)
0,2 g (0,36 mmol) du précurseur (B-I) obtenu ci-dessus à l'étape 2) d) ont été dissous dans 2 ml d'acétonitrile anhydre. On a ensuite ajouté 67,4 μl (0,38 mmol) de DIEA et 1 16 mg (0,38 mmol) de tétrafluoroborate de O-(N-succinimidyl)- N,N,N',N'-tetraméthyl-uronium (TSTU) et le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 45 minutes sous atmosphère d'argon. La conversion du précurseur (B-I) en son ester de N-hydroxysuccinimide a été contrôlée par CCM (CH2Cl2/Me0H, 85:15, v/v). Une solution de 91 mg (0,23 mmol) de N°-(N- maléoyl-L-glycyl)-L-lysine-carboxamide (précurseur C-I) obtenu ci-dessus à l'étape 3 e) et de 40 μl (0,23 mmol) de DIEA dans 3 ml d'un mélange CH3CN/DMF anhydre (2:1, v/v) ont ensuite été ajoutés goutte à goutte et le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 1 heure sous atmosphère d'argon. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM (CH2Cl2/MeOH), 85:15, v/v/) puis le mélange a été évaporé sous vide pour éliminer le DMF. Le résidu huileux ainsi obtenu a été purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (25 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de MeOH (0-10%) dans le dichlorométhane. On a ainsi obtenu 60 mg (0,075 mmol) du composé (16) sous la forme d'une mousse blanche avec un rendement de 32 %.0.2 g (0.36 mmol) of the precursor (BI) obtained above in step 2) d) were dissolved in 2 ml of anhydrous acetonitrile. 67.4 μl (0.38 mmol) of DIEA and 1.16 mg (0.38 mmol) of O- (N-succinimidyl) -N, N, N ', N'-tetramethyl-uronium tetrafluoroborate were then added. (TSTU) and the reaction mixture was stirred at room temperature for 45 minutes under an argon atmosphere. The conversion of the precursor (BI) to its N-hydroxysuccinimide ester was monitored by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH, 85:15, v / v). A solution of 91 mg (0.23 mmol) of N - (N-maleoyl-L-glycyl) -L-lysine-carboxamide (precursor CI) obtained above in step 3 e) and 40 μl ( 0.23 mmol) of DIEA in 3 ml of anhydrous CH 3 CN / DMF (2: 1, v / v) was then added dropwise and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 1 hour. 1 hour under an argon atmosphere. It was checked that the reaction was complete by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH), 85:15, v / v /) and then the mixture was evaporated in vacuo to remove the DMF. The oily residue thus obtained was purified by chromatography on a column of silica gel (25 g) using a gradient of MeOH (0-10%) in dichloromethane as the mobile phase. There was thus obtained 60 mg (0.075 mmol) of the compound (16) as a white foam with a yield of 32%.
Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ ≈ 1,25-1,91 (m, 21H), 3,07-3,29 (m, 4H), 4,08-4,42 (m, 7H, 2 x α-CH, CH-Fmoc, 2 x CH2), 4,48 (d, J = 6,8 Hz, 2H5 CH2-Fm0C), 5,61 (bd, J = 6,4 Hz, IH, NH), 6,04 (bs, IH, NH), 6,74 (s, 2H), 6,81 (bs, IH, NH), 6,91 (bs, IH, NH), 7,27-7,42 (m, 4H), 7,57 (d, J = 7,5 Hz, 2H), 7,75 (d, J = 7,5 Hz, 2H), 9,2 (bs, 1 H, NH). 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3 ): δ ≈ 1.25-1.91 (m, 21H), 3.07-3.29 (m, 4H), 4.08-4.42 (m, 7H, 2 x α-CH, CH-Fmoc, 2 x CH 2 ), 4.48 (d, J = 6.8 Hz, 2H 5 CH 2 -Fm 0 C), 5.61 (bd, J = 6 , 4 Hz, 1H, NH), 6.04 (bs, 1H, NH), 6.74 (s, 2H), 6.81 (bs, 1H, NH), 6.91 (bs, 1H, NH). , 7.27-7.42 (m, 4H), 7.57 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.75 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 9.2 ( bs, 1H, NH).
MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z 706,6896 ((M-Boc)+H)+ 808,7330 (M+H)+, 828,7064 (M+Na)+, calculé pour C40H5IN7On 805,89. b) Deuxième étape : Synthèse du A^-(9-fluorénylméthyloxycarbonyl-aminooxy- acétyl)-L-lysine-./Vε-maléoyl-L-glycyl)-L-lysine-carboxamide (B-l-C-1) 60 mg (0,075 mmol) du composé (16) obtenu ci-dessus à l'étape précédente ont été dissous dans 2 ml de dichlorométhane et la solution a été refroidie jusqu'à 4°C. 306 μl (4,12 mmol) de TFA ont été ajoutés goutte à goutte et le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 90 min. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM (CH2Cl2/Me0H, 85:15, v/v) puis le mélange a été évaporé à sec. Le résidu huileux ainsi obtenu a été dissous dans 5 ml d'un mélange CH3CN/H2O (1 :1, v/v) puis lyophilisé pour donner 58 mg (0,071 mmol) du composé (B-l-C-1) sous la forme d'une poudre blanche (rendement 94 %).MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z 706.6896 ((M-Boc) + H) + 808.7330 (M + H) + , 828.7064 (M + Na) + , calculated for C 40 H 5I N 7 On 805.89. b) Second step: Synthesis of N - (9-fluorenylmethyloxycarbonyl-aminooxy- acetyl) -L-lysine - / V ε -maléoyl-L-glycyl) -L-lysine-carboxamide (BLC-1) 60 mg (0.075. mmol) of the compound (16) obtained above in the previous step were dissolved in 2 ml of dichloromethane and the solution was cooled to 4 ° C. 306 μl (4.12 mmol) of TFA was added dropwise and the mixture The resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 90 minutes. It was checked that the reaction was complete by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH, 85:15, v / v) and then the mixture was evaporated to dryness. The oily residue thus obtained was dissolved in 5 ml of CH 3 CN / H 2 O (1: 1, v / v) and then lyophilized to give 58 mg (0.071 mmol) of the compound (Bcl-1) under the form of a white powder (94% yield).
MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z 706,6488 (M+H)+, calculé pour C35H43N7O9 707,77.MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z 706.6488 (M + H) + , calcd for C 35 H 43 N 7 O 9 707.77.
Ce composé a ensuite été utilisé dans l'étape suivante sans purification. c) Troisième étape : Synthèse du réactif trifonctionnel (1-1) sous forme totalement protégéeThis compound was then used in the next step without purification. c) Third step: Synthesis of the trifunctional reagent (1-1) in totally protected form
58 mg (0,071 mmol) du composé (B-l-C-1) obtenu ci-dessus à l'étape précédente et 32 mg (0,077 mmol) du précurseur (A-I) obtenu précédemment à l'étape 1) f) ont été dissous dans 2 ml de dichlorométhane anhydre. On a ensuite ajouté 25,9 μl (0,15 mmol) de DIEA et 34,4 mg (0,077 mmol) de BOP et le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 30 minutes sous atmosphère d'argon. On a contrôlé que la réaction était complète par HPLC-PI (Système B, c'est-à-dire en utilisant une colonne Thermo Hypersil GOLD® Ci8 de 5 μm et de dimensions 4,6 x 150 mm avec comme éluant de l'acétonitrile et une solution aqueuse de TFA à 0,1 % (v/v, pH 2) en faisant passer le mélange à 80 % de TFA pendant 5 minutes puis un gradient linéaire allant de 20 à 90 % de CH3CN en 35 minutes avec un débit de 1,0 ml/min ; une double détection UV a été faite à 210 et 254 nm), puis une quantité supplémentaire de précurseur (A-I) (14,4 mg, 0,035 mmol), de DIEA (18,5 μl, 0,10 mmol) et de BOP (15,6 mg, 0,077 mmol) a été ajoutée. Après mélange à température ambiante pendant 90 minutes, le mélange réactionnel a été dissous dans 25 ml de dichlorométhane. La phase organique résultante a été lavée successivement par 25 ml d'acide citrique à 10 % et 25 ml de saumure, puis séchée sur Na2SO4 et évaporée à sec. Le résidu huileux ainsi obtenu a été purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (10 g) utilisant comme phase mobile un gradient de méthanol (0-15%) dans le dichlorométhane pour conduire à 24 mg (0,022 mmol) du composé de formule (1-1) complètement protégé sous la forme d'une mousse jaune avec un rendement de 31 %. d) Quatrième étape : Synthèse du sel de TFA du composé de formule CI-I) totalement protégé 24 mg (0,022 mmol) du composé de formule (1-1) sous forme totalement protégée et tel qu'obtenu ci-dessus à l'étape précédente ont été dissous dans 1 ml de dichlorométhane. 81 μl (1,08 mmol) de TFA ont ensuite été ajoutés goutte à goutte puis le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 1 heure. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM (CH2Cl2/Me0H, 85:15, v/v) puis le mélange a été évaporé à sec. Le sel brut de TFA du composé de formule (1-1) sous forme totalement protégée a été purifié par flash chromatographie en phase inverse sur une colonne de silice greffée Ci8 (5 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de CH3CN (0-23%) dans une solution aqueuse de TFA à 0,1 %. Les fractions contenant le produit ont été lyophilisées pour conduire à 12 mg (0,01 1 mmol du sel de TFA du réactif trifonctionnel de formule (1-1) totalement protégé sous la forme d'une mousse blanche. e) Cinquième étape : Synthèse du réactif trifonctionnel de formule (1-1)58 mg (0.071 mmol) of the compound (BlC-1) obtained above in the preceding step and 32 mg (0.077 mmol) of the precursor (AI) obtained previously in step 1) f) were dissolved in 2 ml anhydrous dichloromethane. 25.9 μl (0.15 mmol) of DIEA and 34.4 mg (0.077 mmol) of BOP were then added and the reaction mixture was stirred at room temperature for 30 minutes under an argon atmosphere. Was checked that the reaction was complete by RP-HPLC (System B, that is to say using a Thermo Hypersil GOLD ® Ci 8 column of 5 microns and of dimensions 4.6 x 150 mm with an eluent of acetonitrile and 0.1% aqueous TFA solution (v / v, pH 2) by passing the mixture to 80% TFA for 5 minutes and then a linear gradient ranging from 20 to 90% CH 3 CN minutes with a flow rate of 1.0 ml / min, a double UV detection was made at 210 and 254 nm), then an additional amount of precursor (AI) (14.4 mg, 0.035 mmol), DIEA (18, 5 μl, 0.10 mmol) and BOP (15.6 mg, 0.077 mmol) was added. After mixing at room temperature for 90 minutes, the reaction mixture was dissolved in 25 ml of dichloromethane. The resulting organic phase was washed successively with 25 ml of 10% citric acid and 25 ml of brine, then dried over Na 2 SO 4 and evaporated to dryness. The oily residue thus obtained was purified by chromatography on a column of silica gel (10 g) using as mobile phase a methanol gradient (0-15%) in dichloromethane to yield 24 mg (0.022 mmol) of the compound of formula (1-1) completely protected in the form of a yellow foam with a yield of 31%. d) Fourth step: Synthesis of the TFA salt of the compound of formula CI-I) completely protected 24 mg (0.022 mmol) of the compound of formula (1-1) in fully protected form and as obtained above at previous step were dissolved in 1 ml of dichloromethane. 81 μl (1.08 mmol) of TFA was then added dropwise and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 1 hour. It was checked that the reaction was complete by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH, 85:15, v / v) and then the mixture was evaporated to dryness. The crude TFA salt of the compound of formula (1-1) as fully protected was purified by flash reverse-phase chromatography on a grafted silica column Ci 8 (5 g) using as mobile phase a gradient of CH 3 CN (0-23%) in 0.1% aqueous TFA solution. The fractions containing the product were lyophilized to give 12 mg (0.01 mmol of the TFA salt of the trifunctional reagent of formula (1-1) completely protected as a white foam.) Step 5: Synthesis trifunctional reagent of formula (1-1)
12 mg (0,01 1 mmol) du sel de TFA du réactif trifonctionnel de formule (1-1) sous forme totalement protégée tel qu'obtenu ci-dessus à l'étape précédente ont été dissous dans 200 μl de DMF anhydre. On a ensuite ajouté 1,5 μl (0,011 mmol) de TEA et une solution du réactif DSC (4,15 mg, 0,016 mmol) dans 100 μl de DMF anhydre. Le mélange réactionnel a ensuite été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 1 heure. On a contrôlé que la réaction était complète par HPLC-PI en utilisant le système B tel que décrit ci-dessus à l'étape 4) b). Le mélange a ensuite été repris dans 5 ml d'une solution aqueuse de TFA à 0,1 % et purifié par flash chromatographie en phase inverse sur une colonne de silice greffée Ci8 (5 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de CH3CN (0-50%) dans une solution aqueuse de TFA à 0,1 %. Les fractions contenant le produit ont été lyophilisées pour conduire à 6,70 mg (0,0059 mmol) de réactif trifonctionnel de formule (1-1) attendu sous la forme d'une poudre blanche. MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z : 996,6590 ((M-NHS carbamate)+H)+, 1159,5921 (M+Na)+, 1175,5654 (M+K)+, calculé pour C52H68N10O19 12 mg (0.01 mmol) of the TFA salt of the trifunctional reagent of formula (1-1) in fully protected form as obtained above in the previous step were dissolved in 200 .mu.l of anhydrous DMF. 1.5 μl (0.011 mmol) of TEA and a solution of the DSC reagent (4.15 mg, 0.016 mmol) were then added to 100 μl of anhydrous DMF. The reaction mixture was then stirred at room temperature for 1 hour. The reaction was checked for completeness by HPLC-PI using System B as described above in step 4) b). The mixture was then taken up in 5 ml of an aqueous solution of 0.1% TFA and purified by reversed-phase flash chromatography on a grafted silica column Ci 8 (5 g) using as mobile phase a gradient of CH 3 CN (0-50%) in 0.1% aqueous TFA solution. Fractions containing the product were lyophilized to give 6.70 mg (0.0059 mmol) of the expected trifunctional reagent of formula (1-1) as a white powder. MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z: 996.6590 ((M-NHS carbamate) + H) + , 1159.5921 (M + Na) + , 1175.5654 (M + K) + , calculated for C 52 H 68 N 10 O 19
1 137,18.1,137.18.
EXEMPLE 2 : SYNTHÈSE D'UN RÉACTIF TRIFONCTIONNELEXAMPLE 2 Synthesis of a Trifunctional Reagent
PSEUDOPEPTIDIQUE CONFORME A L'INVENTION (1-2)PSEUDOPEPIECQUE COMPLIES WITH THE INVENTION (1-2)
Dans cet exemple est décrite la synthèse d'un réactif trifonctionnel pseudopeptidique (1-2) conforme à la présente Invention et répondant à la formule suivante :In this example is described the synthesis of a trifunctional pseudopeptide reagent (1-2) according to the present invention and having the following formula:
(1-2) (1-2)
Dans cet exemple, on illustre la synthèse d'un réactif trifonctionnel différent du réactif de formule (1-1) précédemment synthétisé ci-dessus à l'exemple 1) par la nature de l'acide aminé devant supporter la fixation d'un fluorophore (précurseur C). Cet exemple montre qu'il est également possible d'utiliser une cystéine dont la fonction thiol de la chaîne latérale a été protégée sous la forme de disulfure à l'aide du groupement S-éthyle (SEt), en vue de la faire réagir sur un fluorophore préalablement fonctionnalisé par un motif maléimide ou iodoacétyle.In this example, the synthesis of a trifunctional reagent different from the reagent of formula (1-1) previously synthesized above in Example 1) is illustrated by the nature of the amino acid to support the fixing of a fluorophore. (precursor C). This example shows that it is also possible to use a cysteine whose thiol function of the side chain has been protected in the form of disulphide with the aid of the S-ethyl group (SEt), in order to make it react on a fluorophore previously functionalized with a maleimide or iodoacetyl unit.
Pour ce faire, il a été utilisé une stratégie de synthèse convergente, comme dans l'exemple 1) consistant à préparer séparément les précurseurs (A), (B) et (C) puis de les assembler. A titre de précurseur (A), on a utilisé le précurseur (A-I) synthétisé à l'exemple 1) ci-dessus. A titre de précurseur (B), on a synthétisé un précurseur de formule (B-I), selon une voie sensiblement différente et améliorée par rapport à celle utilisée pour la synthèse du précurseur (B-I) de l'exemple 1). Enfin la synthèse du précurseur (C-2) a été réalisée à partir de la Boc-Cys(SEt)-OH commerciale. 1) Synthèse du précurseur (B-I) : Λ^-ftert-butyloxyearbonvIHV*-^- fluorénylméthyloxycarboxyl-aminooxy-acétvD-L-lysineTo do this, it was used a convergent synthesis strategy, as in Example 1) of separately preparing the precursors (A), (B) and (C) and to assemble them. As precursor (A), the precursor (AI) synthesized in Example 1) above was used. As a precursor (B), a precursor of formula (BI) was synthesized in a substantially different route and improved with respect to that used for the synthesis of the precursor (BI) of Example 1). Finally the synthesis of the precursor (C-2) was carried out from the commercial Boc-Cys (SEt) -OH. 1) Synthesis of the Precursor (BI): Λ -Frn-butyloxyearbonyl-1-fluorenylmethyloxycarboxyl-aminooxy-acetyl-L-lysine
Le précurseur (B-I) a été synthétisé à partir du dérivé protégé N-Fmoc de l'acide aminooxyacétique (8) préalablement préparé comme à l'exemple 1), étape 2) a).The precursor (B-I) was synthesized from the protected N-Fmoc derivative of the aminooxyacetic acid (8) previously prepared as in Example 1), step 2) a).
0,230 g (0,73 mmol) du composé (8) a été dissous dans 9 ml d'un mélange CH3CN/DMF (1 :1, v/v). On a ensuite ajouté 1 19 mg (0,88 mmol) d'hydroxybenzotriazole monohydraté et 182 mg (0,88 mmol) de DCC puis le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 2 heures sous atmosphère d'argon. Une solution de 180 mg (0,731 mol) de Λ^-Boc-L-lysine0.230 g (0.73 mmol) of compound (8) was dissolved in 9 ml of CH 3 CN / DMF (1: 1, v / v). 1,19 mg (0.88 mmol) of hydroxybenzotriazole monohydrate and 182 mg (0.88 mmol) of DCC were then added, and the reaction mixture was stirred at room temperature for 2 hours under an argon atmosphere. A solution of 180 mg (0.731 mol) of β-Boc-L-lysine
(10) telle qu'obtenue ci-dessus à l'étape 2), b) de l'exemple 1 dans 2 ml de DMF anhydre a ensuite été ajoutée et le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante sous atmosphère d'argon. On a suivi la réaction par CCM(10) as obtained above in step 2), b) of Example 1 in 2 ml of anhydrous DMF was then added and the reaction mixture was stirred at room temperature under an atmosphere of argon. The reaction was monitored by TLC
(CH2Cl2/Me0H, 80:20, v/v). Après 2 heures d'agitation, le mélange a été évaporé à sec. Le résidu ainsi obtenu a été repris dans 50 ml d'acétate d'éthyle, lavé avec 50 ml d'une solution aqueuse d'acide citrique à 10 %, 25 ml d'eau distillée, séché sur Na2SO4 et enfin purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (20 g) en utilisant comme phase mobile un gradient d'acétate d'éthyle (0-80%) dans le dichlorométhane.(CH 2 Cl 2 / MeOH, 80:20, v / v). After stirring for 2 hours, the mixture was evaporated to dryness. The residue thus obtained was taken up in 50 ml of ethyl acetate, washed with 50 ml of a 10% aqueous solution of citric acid, 25 ml of distilled water, dried over Na 2 SO 4 and finally purified. by chromatography on a column of silica gel (20 g) using a gradient of ethyl acetate (0-80%) in dichloromethane as the mobile phase.
On a obtenu 296 mg (0,36 mmol) de composé (B-I) sous la forme d'une mousse blanche avec un rendement de 50 %.296 mg (0.36 mmol) of compound (B-1) was obtained as a white foam in 50% yield.
Analyse RMN 1H (300 MHz, CD3CN) : δ = 1 ,37-1,83 (m, 15H), 1 H NMR analysis (300 MHz, CD 3 CN): δ = 1.37-1.83 (m, 15H),
3,18 (q, J = 6,4 Hz, J = 12,6 Hz, 2H), 4,00 (m, IH, α-CH), 4,04 (s, 2H), 4,26 (t, J =3.18 (q, J = 6.4 Hz, J = 12.6 Hz, 2H), 4.00 (m, 1H, α-CH), 4.04 (s, 2H), 4.26 (t. , J =
6,8 Hz, IH), 4,49 (d, J = 6,8 Hz, 2H), 5,61 (bd, J = 7,5 Hz, IH, NH), 7,31-7,44 (m,6.8 Hz, 1H), 4.49 (d, J = 6.8 Hz, 2H), 5.61 (bd, J = 7.5 Hz, 1H, NH), 7.31-7.44 (b.p. m,
4H), 7,51 (bs, IH, NH), 7,63 (d, J= 7,5 Hz, 2H), 7,83 (d, J= 7,5 Hz, 2H), 8,9 (bs, IH, NH).4H), 7.51 (bs, 1H, NH), 7.63 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.83 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 8.9 ( bs, 1H, NH).
Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CD3CN) : δ = 23,5 ; 28,5 (3C) ; 29,5 ; 31 ,6 ; 38,9 ; 47,7 ; 54,2 ; 68,0 ; 76,3 ; 79,8 ; 120,9 (2C) ; 126,0 (2C) ; 128,1 (2C) ; 128,7 (2C), 142,1 (2C) ; 144,6 (2C) ; 156,7 ; 158,9 ; 169,3 ; 174,5. 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CD 3 CN): δ = 23.5; 28.5 (3C); 29.5; 31, 6; 38.9; 47.7; 54.2; 68.0; 76.3; 79.8; 120.9 (2C); 126.0 (2C); 128.1 (2C); 128.7 (2C), 142.1 (2C); 144.6 (2C); 156.7; 158.9; 169.3; 174.5.
MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z : 564,5709 (M+Na)+, 580,5535 (M+K)+, calculé pour C28H35N3O8 541,61. 2) Synthèse du précurseur (C-2)MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z: 564.5709 (M + Na) + , 580.5535 (M + K) + , calculated for C 28 H 35 N 3 O 8 541.61. 2) Synthesis of the precursor (C-2)
Le précurseur (C-2) a été synthétisé en deux étapes à partir de la 7V-(tert-butyloxycarbonyl)-S-(S-éthyl)-cystéine (19) selon le schéma 3 ci-dessous :The precursor (C-2) was synthesized in two steps from 7V- (tert-butyloxycarbonyl) -S- (S-ethyl) -cysteine (19) according to scheme 3 below:
SCHEMA 3SCHEME 3
Selon ce schéma et dans un premier temps, la fonction acide carboxylique du composé (19) est convertie en carboxamide (20) par réaction de l'ammoniaque sur l'anhydride mixte intermédiairement formé selon la méthode décrite par exemple par Hofmann, K. et al, J. Am. Chem. Soc, 1978, 100, 3585-3590 Ensuite, l'extrémité N-terminale du composé (20) est déprotégée par traitement à l'acide trifluoroacétique pour conduire au précurseur (C-2). a) Première étape : Synthèse du N-(tert-butyloxycarbonyl)-5'-(S-éthyiycvstéine- carboxamide (6) 500 mg (1,08 mmol) de N-(tert-butyloxycarbonyl)-S-(S-éthyl)- cystéine (19) ont été dissous dans 15 ml d'acétate d'éthyle et la solution a été refroidie jusqu'à -150C dans un bain de carboglace et d'éthylèneglycol. 0,119 ml (1,08 mmol) de NMM et 0,140 mg (1,08 mmol) de chloroformiate d'isobutyle ont ensuite été ajoutés et le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à -15°C pendant 10 minutes sous atmosphère d'argon. On a ensuite ajouté à cette solution anhydre une solution aqueuse à 15 % d'ammoniaque (0,38 ml, 3,24 mmol) puis le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation pendant 30 minutes à une température de 4°C. Le mélange a ensuite été évaporé à sec et le résidu a été repris dans 30 ml d'acétate d'éthyle puis lavé avec 20 ml d'eau. Les phases organiques ont été séchées sur Na2SO4 puis évaporées à sec. On a obtenu le composé (20) avec un rendement quantitatif, sous la forme d'un solide blanc.According to this scheme and in a first step, the carboxylic acid function of the compound (19) is converted into carboxamide (20) by reaction of the ammonia with the mixed anhydride intermediately formed according to the method described for example by Hofmann, K. and al, J. Am. Chem. Soc., 1978, 100, 3585-3590. Next, the N-terminus of the compound (20) is deprotected by treatment with trifluoroacetic acid to yield the precursor (C-2). a) First step: Synthesis of N- (tert-butyloxycarbonyl) -5 '- (S-ethyl-3-carboxyamide (6) 500 mg (1.08 mmol) of N- (tert-butyloxycarbonyl) -S- (S-ethyl) Cysteine (19) was dissolved in 15 ml of ethyl acetate and the solution was cooled to -15 ° C. in a bath of dry ice and ethylene glycol 0.119 ml (1.08 mmol) NMM and 0.140 mg (1.08 mmol) of isobutyl chloroformate were then added and the reaction mixture was stirred at -15 ° C for 10 minutes under an argon atmosphere and added to this anhydrous solution. a 15% aqueous solution of ammonia (0.38 ml, 3.24 mmol) and then the mixture The reaction mixture was stirred for 30 minutes at a temperature of 4 ° C. The mixture was then evaporated to dryness and the residue was taken up in 30 ml of ethyl acetate and then washed with 20 ml of water. The organic phases were dried over Na 2 SO 4 and then evaporated to dryness. Compound (20) was obtained in quantitative yield as a white solid.
Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ = 1 ,24-1.29 (t, J = 6,8 Hz, 3H, CH3(SEt)), 1,39 (s, 9H, tBu), 2,63-2,70 (q, J = 7,1 Hz, 2H, CH2(SEt)), 2,99-3,01 (d, J= 6,0 Hz, 2H, CH2 β), 4,36-4,39 (m, IH, CH α), 5,25-5,28 (d, J = 9,0 Hz, IH, NH), 5,63 (bs, IH, NH), 6,31 (bs, IH, NH). Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CDCl3) : δ = 13,8 (CH3(SEt)), 27,8 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3 ): δ = 1, 24-1.29 (t, J = 6.8 Hz, 3H, CH 3 (SEt)), 1.39 (s, 9H, tBu), 2 , 63-2.70 (q, J = 7.1 Hz, 2H, CH 2 (SEt)), 2.99-3.01 (d, J = 6.0 Hz, 2H, CH 2 β), 4 , 36-4.39 (m, 1H, CH α), 5.25-5.28 (d, J = 9.0 Hz, 1H, NH), 5.63 (bs, 1H, NH), 6, 31 (bs, 1H, NH). 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CDCl 3 ): δ = 13.8 (CH 3 (SEt)), 27.8
(tBu), 32,0 (CH2(SEt)), 39,9 (CH2 β), 53,0 (CH α), 80,1 (Cq tBu), 155,1 (Cq), 172,6 (Cq).(tBu), 32.0 (CH 2 (SEt)), 39.9 (CH 2 β), 53.0 (CH α), 80.1 (Cq tBu), 155.1 (Cq), 172.6 (Cq).
MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z = 303,13 (M+Na)+, calculé pour Ci0H20N2O3S2-Na 303,41. b) Deuxième étape : Synthèse du précurseur (C-2) : ^(S-éthvD-cystéine-carboxamideMS (MALDI-TOF, positive mode) m / z = 303.13 (M + Na) + , calculated for C 0 H 20 N 2 O 3 S 2 -Na 303.41. (b) Second step: Synthesis of precursor (C-2): (S-ethyl-cysteine-carboxamide
Le composé (20) obtenu ci-dessus à l'étape précédente a été lentement dissous dans 14 ml d'un mélange TFA/H2O (95:5 v/v) sous agitation à une température comprise entre 0°C et la température ambiante pendant 1 heure. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM (CH2Cl2/Me0H 90:10 v/v) puis le mélange réactionnel a été évaporé à sec. Une quantité minimale d'eau osmosée a alors été ajoutée et la solution aqueuse résultante a été lyophilisées pour conduire au précurseur (C-2) sous la forme d'une poudre jaunâtre avec un rendement de 89 %.The compound (20) obtained above in the preceding step was slowly dissolved in 14 ml of a mixture of TFA / H 2 O (95: 5 v / v) with stirring at a temperature of between 0 ° C. and room temperature for 1 hour. The reaction was checked by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH 90:10 v / v) and the reaction mixture was evaporated to dryness. A minimum amount of osmosis water was then added and the resulting aqueous solution was lyophilized to yield the precursor (C-2) as a yellowish powder with a yield of 89%.
Analyse RMN 1H (300 MHz, D2O) : δ = 1,26-1,31 (t, J = 7,1 Hz, 3H, CH3(SEt)), 1,39 (s, 9H), 2,72-2,80 (q, J = 7,1 Hz, 2H, CH2(SEt)), 3,25-3,26 (d, J = 6,0 Hz, 2H, CH2 β), 4,30-4,35 (m, IH, CH α). 1 H NMR analysis (300 MHz, D 2 O): δ = 1.26-1.31 (t, J = 7.1 Hz, 3H, CH 3 (SEt)), 1.39 (s, 9H), 2.72-2.80 (q, J = 7.1 Hz, 2H, CH 2 (SEt)), 3.25-3.26 (d, J = 6.0 Hz, 2H, CH 2 β), 4.30-4.35 (m, 1H, CH α).
Analyse RMN 13C (75,5 MHz, D2O) : δ = 13,8 (CH3(SEt)), 30,1 (CH2(SEt)), 38,3 (CH2 β), 52,2 (CH α), 170,8 (Cq). 13 C NMR analysis (75.5 MHz, D 2 O): δ = 13.8 (CH 3 (SEt)), 30.1 (CH 2 (SEt)), 38.3 (CH 2 β), 52, 2 (CH α), 170.8 (Cq).
MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z = 180,00 (M+Na)+, calculé pour C5H12N2OS2-Na 180,29. 3) Synthèse du réactif trifonctionnel de formule (1-2)MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z = 180.00 (M + Na) + , calculated for C 5 H 12 N 2 OS 2 -Na 180.29. 3) Synthesis of the trifunctional reagent of formula (1-2)
Le réactif (1-2) a été synthétisé en trois étapes à partir des précurseurs (A-I), (B-I) et (C-2) précédemment synthétisés selon le schéma 4 ci-après :The reagent (1-2) was synthesized in three steps from the precursors (A-I), (B-I) and (C-2) previously synthesized according to scheme 4 below:
Réactif trifonctionnel (1-2)Trifunctional reagent (1-2)
SCHEMA 4SCHEMA 4
Le couplage entre les précurseurs (B-I) et (C-2) a été réalisé après pré-activation du précurseur (B-I) sous forme d'ester d'hydroxybenzotriazole selon la méthode décrite par exemple dans l'article de Kônig, W. et al, Chem. Ber., 1970, 103, 788-798. L'ester activé a ensuite été mis en réaction avec le précurseur (C-I) pour conduire à un produit de couplage (21). Les aminés engagées étant sous la forme de sel de TFA, il a été nécessaire d'ajouter une base (DIEA). Le composé intermédiaire (B-l-C-2) a été purifié par chromato graphie sur gel de silice avec un rendement de 61 %. L'extrémité N-terminale du réactif trifonctionnel N-Boc (22) a été déprotégée au TFA puis convertie en carbamate activé par traitement au DSC dans le DMF anhydre en présence de TEA. a) Première étape : Synthèse du TV-Ctert-butyloxycarbonvD-Λ^-CÇ- fluorénylméthyloxycarbonyl-aminooxy-acétyπ-L-lvsine-θ'-fS-éthvD-L-cystéine- carboxamide (21)The coupling between the precursors (BI) and (C-2) was carried out after pre-activation of the precursor (BI) in the form of hydroxybenzotriazole ester according to the method described for example in the article by Konig, W. and al, Chem. Ber., 1970, 103, 788-798. The activated ester was then reacted with the precursor (CI) to yield a coupling product (21). As the committed amines are in the form of TFA salt, it was necessary to add a base (DIEA). The intermediate (BlC-2) was purified by chromatography on silica gel with a yield of 61%. The N-terminus of the N-Boc trifunctional reagent (22) was deprotected with TFA and then converted to activated carbamate by DSC treatment in anhydrous DMF in the presence of TEA. (a) First step: Synthesis of CTC-tert-butyloxycarbonyl-N, N-fluorenylmethyloxycarbonylaminooxyacetyl-L-lysine-N-f-ethyl-L-cysteine carboxamide (21)
0,196 g (0,36 mmol) du compose (B-I) obtenu ci-dessus à l'issue de l'étape 1) a été dissous dans 3 ml d'un mélange CH3CN/DMF anhydre (2:1, v/v). 58,4 mg (0,43 mmol) d'hydroxybenzotriazole monohydraté et 89,1 mg (0,43 mmol) de DCC ont ensuite été ajoutés et le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 2 heures sous atmosphère d'argon. Ensuite, 1 ml d'une solution de DMF contenant 106 mg (0,36 mmol) du composé (C-2) a été ajouté et le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante sous atmosphère d'argon. Au bout de 2 heures, 31 μl (0,18 mmol) de DIEA ont été ajoutés. Au bout de 2 heures supplémentaires, on a à nouveau ajouté 31 μl (0,18 mmol) de DIEA. A nouveau après 2 heures supplémentaires, on a encore ajouté 31 μl (0,18 mol) de DIEA et 44,9 mg (0,18 mmol) de DCC. Le flacon contenant le milieu réactionnel a été stocké à une température de -20°C pendant une nuit. Le lendemain, une quantité supplémentaire de DIEA (31 μl, 0,18 mmol) et de DCC (44,9 mg, 0,18 mmol) a été ajoutée. Après 2 heures, on a jugé que la réaction était complète et le mélange réactionnel a été évaporé à sec. Le résidu résultant a été repris avec 25 ml d'acétate d'éthyle, lavé avec 25 ml d'une solution aqueuse d'acide citrique à 10 %, 25 ml de NaHCO3 saturé, 25 ml d'eau distillée, séché sur Na2SO4 et purifié par chromatographie sur une colonne de gel de silice (20 g) en utilisant comme phase mobile un gradient de MeOH (0-10%) dans le dichlorométhane. On a obtenu 222 mg (0,31 mmol) du composé (21) sous la forme d'une mousse blanche avec un rendement de 88 %). Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ = 1,26-1,31 (t, 3H, J = 7,10.196 g (0.36 mmol) of the compound (BI) obtained above at the end of step 1) was dissolved in 3 ml of an anhydrous CH 3 CN / DMF mixture (2: 1, v / v). 58.4 mg (0.43 mmol) of hydroxybenzotriazole monohydrate and 89.1 mg (0.43 mmol) of DCC were then added and the resultant reaction mixture was stirred at room temperature for 2 hours under an atmosphere of 'argon. Then, 1 ml of a DMF solution containing 106 mg (0.36 mmol) of the compound (C-2) was added and the reaction mixture was stirred at room temperature under argon atmosphere. After 2 hours, 31 μl (0.18 mmol) of DIEA were added. After another 2 hours, 31 μl (0.18 mmol) of DIEA was added again. Again after an additional 2 hours, 31 μl (0.18 mol) of DIEA and 44.9 mg (0.18 mmol) of DCC were further added. The vial containing the reaction medium was stored at a temperature of -20 ° C overnight. The next day, additional DIEA (31 μl, 0.18 mmol) and DCC (44.9 mg, 0.18 mmol) were added. After 2 hours, the reaction was judged complete and the reaction mixture was evaporated to dryness. The resulting residue was taken up with 25 ml of ethyl acetate, washed with 25 ml of a 10% aqueous citric acid solution, 25 ml of saturated NaHCO 3 , 25 ml of distilled water, dried over Na 2 SO 4 and purified by column chromatography on silica gel (20 g) using a gradient of MeOH (0-10%) in dichloromethane as the mobile phase. 222 mg (0.31 mmol) of the compound (21) was obtained as a white foam in 88% yield). 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3 ): δ = 1.26-1.31 (t, 3H, J = 7.1
Hz, CH3(SEt) Cys), 1,42 (s, 9H, tBu), 1,51-1,92 (m, 6H, CH2 β, δ, γ Lys), 2,65-2,72 (q, 2H, J = 7,5 Hz, CH2(SEt) Cys), 3,08-3,10 (d, 2H, J= 6 Hz, CH2 β Cys), 3,26-3,33 (m, 2H, CH2 ε Lys), 4,04-4,06 (t, J = 6.0 Hz, IH, CH α Lys), 4,20-4.25 (t, J= 7,2 Hz, IH, CH Fmoc), 4,33 (s, 2H), 4,49-4,51 (d, IH, J = 6.4 Hz, CH2 Fmoc), 4,71-4,78 (q, J = 6,4 Hz, 1 H, CHa Cys), 7,26-7,78 (m, 8H, CH Fmoc).Hz, CH 3 (SEt) Cys), 1.42 (s, 9H, tBu), 1.51-1.92 (m, 6H, CH 2 β, δ, γ Lys), 2.65-2.72 (q, 2H, J = 7.5 Hz, CH 2 (SEt) Cys), 3.08-3.10 (d, 2H, J = 6 Hz, CH 2 β Cys), 3.26-3.33 (m, 2H, CH 2 ε Lys), 4.04-4.06 (t, J = 6.0 Hz, 1H, CH α Lys), 4.20-4.25 (t, J = 7.2 Hz, 1H, CH Fmoc), 4.33 (s, 2H), 4.49-4.51 (d, 1H, J = 6.4 Hz, CH 2 Fmoc), 4.71-4.78 (q, J = 6.4). Hz, 1H, CH? Cys), 7.26-7.78 (m, 8H, CH Fmoc).
Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CDCl3) : δ = 14,2 (CH3(SEt) Cys), 22,3 (CH2 γ, Lys), 28,6 (CH2 δ Lys), 30,1 (CH2 (SEt) Cys), 32,4 (CH2 β Lys), 38,0 (CH2 β Cys), 39,3 (CH2 ε Lys), 46,7 (CH Fmoc), 52,3 (CH α Cys), 52,2 (CH α Lys), 68,0 (CH2 Fmoc), 76,1 (CH2), 80,8 (Cq tBu), 120,3 (Cq Fmoc), 125,1 (Cq Fmoc), 127,4 (Cq Fmoc), 128,1 (Cq Fmoc), 141,4 (Cq), 143,3 (Cq), 156,4 (Cq), 158,6 (Cq), 169,0 (Cq),172,6 (Cq), 172,8 (Cq). HPLC-PI (système B) : tR ≈ 22,3 min, pureté 84% 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CDCl 3 ): δ = 14.2 (CH 3 (SEt) Cys), 22.3 (CH 2 γ, Lys), 28.6 (CH 2 δ Lys), , 1 (CH 2 (SEt) Cys), 32.4 (CH 2 β Lys), 38.0 (CH 2 β Cys), 39.3 (CH 2 ε Lys), 46.7 (CH Fmoc), 52.3 (CH α Cys), 52.2 (CH α Lys), 68.0 (CH 2 Fmoc) ), 76.1 (CH 2 ), 80.8 (Cq tBu), 120.3 (Fmoc Cq), 125.1 (Fmoc Cq), 127.4 (Fmoc Cq), 128.1 (Fmoc Cq), 141.4 (Cq), 143.3 (Cq), 156.4 (Cq), 158.6 (Cq), 169.0 (Cq), 172.6 (Cq), 172.8 (Cq). HPLC-PI (system B): t R ≈ 22.3 min, purity 84%
Analyse MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z = 726,77 (M+Na)+, 742,74 (M+K)+ calculé pour C33H45N5O8S2-Na 726,88. b) Deuxième étape : Synthèse du produit de couplage (B-l-C-2) : l^-Q- fluorénylméthyloxycarbonyl-aminooxy-acétyl)-L-lysine-.S-(S-éthyl)-L-cvstéine- carboxamideMS analysis (MALDI-TOF, positive mode) m / z = 726.77 (M + Na) + , 742.74 (M + K) + calcd for C 33 H 45 N 5 O 8 S 2 -Na 726.88 . b) Second Step: Synthesis of Coupling Product (Bcl-2): 1- (Fluorylmethyloxycarbonylaminooxyacetyl) -L-lysine-S- (S-ethyl) -L-cysteine carboxamide
191 mg (0,27 mmol) du composé (21) obtenu ci-dessus à l'étape précédente ont été dissous dans 7 ml de dichlorométhane et la solution a été refroidie à 4°C. 1,2 ml (16,6 mmol) de TFA ont alors été ajoutés goutte à goutte et le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 90 min. On a contrôlé que la réaction était complète par CCM (CH2Cl2/Me0H, 80:20, v/v) puis le mélange réactionnel a été évaporé à sec. Le résidu huileux ainsi obtenu a été dissous dans l'eau distillée et lyophilisé. On a obtenu 199 mg (0,27 mmol) du produit de couplage (B-l-C-2) sous la forme d'une poudre blanche avec un rendement quantitatif. Ce composé a ensuite été utilisé dans l'étape suivante sans purification supplémentaire.191 mg (0.27 mmol) of the compound (21) obtained above in the previous step were dissolved in 7 ml of dichloromethane and the solution was cooled to 4 ° C. 1.2 ml (16.6 mmol) of TFA was then added dropwise and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 90 minutes. It was checked that the reaction was complete by TLC (CH 2 Cl 2 / MeOH, 80:20, v / v) and then the reaction mixture was evaporated to dryness. The oily residue thus obtained was dissolved in distilled water and lyophilized. 199 mg (0.27 mmol) of the coupling product (BlC-2) was obtained as a white powder in quantitative yield. This compound was then used in the next step without further purification.
Analyse RMN 1H (300 MHz, CD3OD) : δ = 1,26-1,28 (t, 3H, J= 3,8 Hz, CH3(SEt) Cys), 1,40-1 ,56 (m, 4H, CH2 β, γ Lys), 1,83-1,90 (m, 2H, CH2 δ Lys), 2,67-2,7 '4 (q, 2H, J = 7,2 Hz, CH2(SEt) Cys), 2,93-2,96 (d, 2H, J = 9,4 Hz, CH2 β Cys), 3,20-3,28 (m, 2H, CH2 ε Lys), 3,84-3,88 (t, J = 6,0 Hz, IH, CH α Lys), 4,23 (s, 3H, CH Fmoc, CH2), 4,46-4,48 (d, 2H, J = 6,4 Hz, CH2 Fmoc), 4,63-4,68 (q, J = 4,9 Hz, IH, CH α Cys), 7,26-7,78 (m, 8H, CH Fmoc), 8,32 (bs, IH, NH). 1 H NMR analysis (300 MHz, CD 3 OD): δ = 1.26-1.28 (t, 3H, J = 3.8 Hz, CH 3 (SEt) Cys), 1.40-1.56 ( m, 4H, CH 2 β, γ Lys), 1.83-1.90 (m, 2H, CH 2 δ Lys), 2.67-2.7 '4 (q, 2H, J = 7.2 Hz , CH 2 (SEt) Cys), 2.93-2.96 (d, 2H, J = 9.4 Hz, CH 2 β Cys), 3.20-3.28 (m, 2H, CH 2 ε Lys ), 3.84-3.88 (t, J = 6.0 Hz, 1H, CH α Lys), 4.23 (s, 3H, CH Fmoc, CH 2 ), 4.46-4.48 (d , 2H, J = 6.4 Hz, CH 2 Fmoc), 4.63-4.68 (q, J = 4.9 Hz, 1H, CH α Cys), 7.26-7.78 (m, 8H). , CH Fmoc), 8.32 (bs, 1H, NH).
Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CD3OD) : δ = 14,7 (CH3(SEt) Cys), 22,3 (CH2 γ, Lys), 30,7 (CH2 δ Lys), 32,2 (CH2 (SEt) Cys), 33,2 (CH2 β Lys), 39,5 (CH2 β Cys), 41,0 (CH2 ε Lys), 48,2 (CH Fmoc), 53,9 (CH α Cys), 54,2 (CH α Lys), 68,6 (CH2 Fmoc), 76,5 (CH2), 121,0 (CH Fmoc), 126,0 (CH Fmoc), 128,2 (CH Fmoc), 129,0 (CH Fmoc), 142,7-174,3 (Cq). HPLC-PI (système B) : /R = 16.5 min, pureté 74%. MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z = 604,70 (M+H)+, 626,68 (M+Na)+, 642,66 (M+K)+, calculé pour C28H37N5O6S2 603,76. c) Troisième étape : Synthèse du réactif trifonctionnel protégé Boc (22") 78 mg (0,19 mmol) du précurseur (A-I) tel que préparé précédemment à l'exemple 1 ont été dissous dans 2 ml de CH3CN anhydre. 31 mg (0,23 mmol) d'hydroxybenzotriazole monohydraté et 47,3 mg (0,23 mmol) de DCC ont ensuite été ajoutés et le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 2 heures sous atmosphère d'argon. On a ensuite ajouté 136,4 mg (0,19 mmol) du composé (B-l-C-2) obtenu ci-dessus à l'étape précédente puis le mélange réactionnel a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 2 heures sous atmosphère d'argon. Le ballon contenant le mélange réactionnel a été stocké à une température de -20°C pendant une nuit. Le lendemain, 32 μl (0,19 mmol) de DIEA ont été ajoutés. La réaction a été suivie par HPLC-PI (système B). Au bout de 3 heures, une quantité supplémentaire de DCC (12 mg, 58 μmol) et de DIEA (16 μl, 95 μmol) a été ajoutée. Au bout de 90 min, 16 μl (95 μmol) de DIEA ont encore été ajoutés. 2 heures plus tard, 16 μl (95 μmol) de DIEA ont été ajoutés encore une fois. La réaction a été stoppée par addition de 21 μl (360 μmol) d'acide acétique et le ballon contenant le milieu réactionnel a été stocké à une température de -2O0C pendant une nuit. Après dilution avec 2 ml d'un mélange CH3CN/H2O (2: 1, v:v), le composé (22) attendu a été purifié par HPLC-PI (système C, c'est-à-dire en utilisant une colonne Varian Kromasil® Ci8 de 10 μm et de dimensions 21,2 x 250 mm avec comme éluant un mélange d'acétonitrile et d'eau osmosée en faisant passer 90 % d'eau osmosée pendant 5 minutes puis un gradient linéaire allant de 10 à 40 % de CH3CN en 15 minutes, puis de 40 % à 70 % de CH3CN, avec un débit de 20,0 ml/min ; une double détection UV a été faite à 254 et 305 nm). Deux produits ont été obtenus et lyophilisés pour conduire respectivement à 38 mg and 66 mg de deux réactifs trifonctionnels différents (22-1) (22-2) sous la forme d'une poudre blanche avec un rendement global de 61%. Composé (22-1) = composé (22) attendu : HPLC-PI (système B): tR 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CD 3 OD): δ = 14.7 (CH 3 (SEt) Cys), 22.3 (CH 2 γ, Lys), 30.7 (CH 2 δ Lys), 32.2 (CH 2 (SEt) Cys), 33.2 (CH 2 β Lys), 39.5 (CH 2 β Cys), 41.0 (CH 2 ε Lys), 48.2 (CH Fmoc), 53.9 (CH α Cys), 54.2 (CH α Lys), 68.6 (CH 2 Fmoc), 76.5 (CH 2 ), 121.0 (CH Fmoc), 126.0 (CH Fmoc) , 128.2 (CH Fmoc), 129.0 (CH Fmoc), 142.7-174.3 (Cq). HPLC-PI (system B): / R = 16.5 min, purity 74%. MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z = 604.70 (M + H) + , 626.68 (M + Na) + , 642.66 (M + K) + , calcd for C 28 H 37 N 5 O 6 S 2 603.76. c) Third step: Synthesis of the Boc protected trifunctional reagent (22 " ) 78 mg (0.19 mmol) of the precursor (AI) as prepared previously in Example 1 were dissolved in 2 ml of anhydrous CH 3 CN. mg (0.23 mmol) of hydroxybenzotriazole monohydrate and 47.3 mg (0.23 mmol) of DCC were then added and the resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 2 hours under an argon atmosphere. 136.4 mg (0.19 mmol) of the compound (BlC-2) obtained above in the preceding step were then added, and then the reaction mixture was stirred at room temperature for 2 hours under an argon atmosphere. The flask containing the reaction mixture was stored at -20 ° C. overnight The next day 32 μl (0.19 mmol) of DIEA was added The reaction was monitored by HPLC-PI B) After 3 hours, an additional amount of DCC (12 mg, 58 μmol) and DIEA (16 μl, 95 μmol) was added After 90 minutes, 16 μl (95 μmol) of DIEA was added. 2 hours later, 16 μl (95 μmol) of DIEA was added once more. The reaction was stopped by adding 21 μl (360 μmol) of acetic acid and the flask containing the reaction medium was stored at a temperature of -20 ° C. overnight. After dilution with 2 ml of CH 3 CN / H 2 O (2: 1, v: v), the expected compound (22) was purified by HPLC-PI (System C, i.e. using a Varian column Kromasil ® Ci 8 to 10 microns and of dimensions 21.2 x 250 mm eluting with a mixture of acetonitrile and water osmosis by passing 90% of RO water for 5 minutes, then a linear gradient ranging from 10 to 40% of CH 3 CN in 15 minutes, then from 40% to 70% of CH 3 CN, with a flow rate of 20.0 ml / min, a dual UV detection was made at 254 and 305 nm) . Two products were obtained and lyophilized to yield respectively 38 mg and 66 mg of two different trifunctional reagents (22-1) (22-2) in the form of a white powder with an overall yield of 61%. Compound (22-1) = expected compound (22): HPLC-PI (system B): t R
= 20.8 min, pureté 86%, 66 mg. Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ = 1,25-1,30 (t, 3H, J = 7,1 Hz, CH3(SEt) Cys), 1 ,43 (s, 9H, tBu), 1,52-1,90 (m, 4H, CH2 γ, δ Lys), 2,32 (bs, 2H, CH2 β Lys), 2,64-2,69 (q, 2H, J = 7,2 Hz, CH2(SEt) Cys), 2,97-3,16 (m, 2H, CH2 β Cys), 3,30 (s, 2H, CH2 unité (A-I)), 3,45-3,65 (m, HH, CH2 ε Lys + 4 x CH2 unité (A-I)), 4,0 (s, 3H, CH2 unité (A-I) + CH Fmoc), 4,21-4,25 (q, J = 6,8 Hz, IH, CH α Lys), 4,34 (s, 2H, CH2), 4,44-4,50 (d, 2H, J = 10,0 Hz, CH2 Fmoc), 4,70-4,72 (q, IH, J = 2,3 Hz CH α Cys), 5,23 (bs, IH, NH), 6,08 (bs, IH, NH), 6,9 (bs, IH, NH), 7,26- 7,77 (m, 8H, CH Fmoc).= 20.8 min, purity 86%, 66 mg. 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3): δ = 1.25-1.30 (t, 3H, J = 7.1 Hz, CH 3 (SEt) Cys), 1, 43 (s, 9H, tBu ), 1.52-1.90 (m, 4H, CH 2 γ, δ Lys), 2.32 (bs, 2H, CH 2 β Lys), 2.64-2.69 (q, 2H, J = 7.2 Hz, CH 2 (SEt) Cys), 2.97-3.16 (m, 2H, CH 2 β Cys), 3.30 (s, 2H, CH 2 unit (Al)), 3.45 -3.65 (m, HH, CH 2 ε Lys + 4 x CH 2 unit (Al)), 4.0 (s, 3H, CH 2 unit (Al) + CH Fmoc), 4.21-4.25 (q, J = 6.8 Hz, 1H, CH α Lys), 4.34 (s, 2H, CH 2 ), 4.44-4.50 (d, 2H, J = 10.0 Hz, CH 2 Fmoc), 4.70-4.72 (q, 1H, J = 2.3 Hz CH α Cys), 5.23 (bs, 1H, NH), 6.08 (bs, 1H, NH), 6, 9 (bs, 1H, NH), 7.26-7.77 (m, 8H, CH Fmoc).
Analyse RMN 13C (75,5 MHz, CDCl3),: δ = 14,4 (CH3(SEt) Cys), 22,6 (CH2 γ, Lys), 27,6 (CH2 unité (A-I)), 28,5 (tBu), 28,7 (CH2 δ Lys), 31,7 (CH2 (SEt) Cys), 32,5 (CH2 β Lys), 38,6 (CH2 unité (A-I)), 38,8 (CH2 unité (A-I)), 39,6 (CH2 ε Lys), 40,4 (CH2 β Cys), 47,0 (CH2 unité (A-I)), 53,6 (CH α Lys), 68,0 (CH2 Fmoc), 70,0-71,2 (5 x CH2 unité (A-I)), 77,5 (CH2 unité (A-I)), 77,8 (CH Fmoc), 79,5 (Cq tBu), 120,2 (CH Fmoc), 125,1 (CH Fmoc), 127,3 (CH Fmoc), 128,1 (CH Fmoc), 141 ,4-173,0 (Cq). 13 C NMR analysis (75.5 MHz, CDCl 3 ): δ = 14.4 (CH 3 (SEt) Cys), 22.6 (CH 2 γ, Lys), 27.6 (CH 2 unit (Al) ), 28.5 (tBu), 28.7 (CH 2 δ Lys), 31.7 (CH 2 (SEt) Cys), 32.5 (CH 2 β Lys), 38.6 (CH 2 unit (Al) )), 38.8 (CH 2 unit (AI)), 39.6 (CH 2 ε Lys), 40.4 (CH 2 β Cys), 47.0 (CH 2 unit (Al)), 53.6 (CH α Lys), 68.0 (CH 2 Fmoc), 70.0-71.2 (5 x CH 2 unit (Al)), 77.5 (CH 2 unit (Al)), 77.8 (CH 3) Fmoc), 79.5 (Cq tBu), 120.2 (CH Fmoc), 125.1 (CH Fmoc), 127.3 (CH Fmoc), 128.1 (CH Fmoc), 141, 4-173.0 (Cq).
MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z = 1016,66 (M+Na)+, calculé pour C45H67N7Oi4S2.Na 1017,20.MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z = 1016.66 (M + Na) +, Calcd for C 45 H 67 N 7 Oi 4 S 2 .NA 1017.20.
Composé (22-2) (non attendu) : HPLC-PI (système B): /R = 21,6 min, pureté 79 %, 38 mg. MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z = 871,47 (M+Na)+, calculé pour C39H56N6OnS2-Na 871,04. d) Quatrième étape : Déprotection du composé (22-1) et synthèse du réactif trifonctionnel de formule (1-2)Compound (22-2) (not expected): HPLC-PI (System B): / R = 21.6 min, purity 79%, 38 mg. MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z = 871.47 (M + Na) + , calculated for C 39 H 56 N 6 OnS 2 -Na 871.04. d) Fourth step: Deprotection of the compound (22-1) and synthesis of the trifunctional reagent of formula (1-2)
62 mg (0,062 mmol) du composé (22-1) obtenu ci-dessus à l'étape précédente ont été dissous dans 3 ml de dichlorométhane. La solution a été refroidie à 4°C et 368 μl, (4,96 mmol) de TFA ont ensuite été ajoutés goutte à goutte. Le mélange réactionnel résultant a été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 1 heure. On a contrôlé que la réaction était complète par HPLC-PI (système B) puis le mélange a été évaporé à sec. Une quantité minimale d'eau osmosée a ensuite été ajoutée et la solution résultante a été lyophilisée pour conduire à 83 mg (0,082 mmol) du composé (22-1) (sel de TFA) sous forme déprotégée (poudre blanche). Ce composé a ensuite été utilisé dans les réactions suivantes sans purification supplémentaire.62 mg (0.062 mmol) of the compound (22-1) obtained above in the previous step were dissolved in 3 ml of dichloromethane. The solution was cooled to 4 ° C and 368 μl (4.96 mmol) of TFA was then added dropwise. The resulting reaction mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The reaction was checked for completeness by HPLC-PI (System B) and then the mixture was evaporated to dryness. A minimal amount of osmosis water was then added and the resulting solution was lyophilized to yield 83 mg (0.082 mmol) of the compound (22-1) (TFA salt) in deprotected form (white powder). This compound was then used in the following reactions without further purification.
HPLC-PI (système B): tR = 16,5 min, pureté 88 %. MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z = 894,64 (M+H)+, calculé pour C40H59N7Oi2S2 894,08.HPLC-PI (system B): t R = 16.5 min, purity 88%. MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z = 894.64 (M + H) +, calcd for C 40 H 59 N 7 Oi 2 S 2 894.08.
36 mg (36,7 μmol du sel de TFA du composé (22-1) déprotégé obtenu ci-dessus ont été dissous dans 500 μl de DMF anhydre. 5 μl (36,7 μmol) de TEA et une solution de DSC (24 mg, 91 ,75 μmol) dans 250 μL de DMF anhydre ont ensuite été ajoutés goutte à goutte et le mélange réactionnel à été maintenu sous agitation à température ambiante pendant 90 minutes. On a contrôlé que la réaction était complète par HPLC-PI (système B). Le mélange a ensuite été repris par environ 4 ml d'une solution aqueuse de TFA à 0,1% et purifié par HPLC-PI (système D, c'est- à-dire en utilisant une colonne Thermo Hypersil GOLD® C]8 de 5 μm et de dimensions 10 x 250 mm avec comme éluant un mélange acétonitrile/solution aqueuse de TFA à 0,1 % (v/v, pH 2) en faisant passer le mélange à 90 % de TFA à 0,1 % pendant 5 minutes puis un gradient linéaire allant de 10 à 40 % en CH3CN en 15 minutes, puis de 40 % à 70 % en CH3CN, avec un débit de 5,0 ml/min ; une double détection UV a été faite à 254 et 305 nm). Les fractions contenant le produit ont été lyophilisées pour conduire à 25 mg (24,2 μmol) du réactif trifonctionnel de formule (1-2) sous la forme d'une poudre amorphe blanche, avec un rendement de 74 %.36 mg (36.7 μmol) of the TFA salt of the deprotected compound (22-1) obtained above were dissolved in 500 μl of anhydrous DMF, 5 μl (36.7 μmol) of TEA and a solution of DSC (24). mg, 91, 75 μmol) in 250 μl of anhydrous DMF was then added dropwise and the reaction mixture was stirred at room temperature for 90 minutes.The reaction was checked to be complete by HPLC-PI ( B) The mixture was then taken up with about 4 ml of 0.1% aqueous TFA solution and purified by HPLC-PI (System D, ie using a Thermo Hypersil GOLD ® column. C] 8 of 5 microns and dimensions 10 x 250 mm with as eluent a mixture of acetonitrile / 0.1% aqueous solution of TFA (v / v, pH 2) by passing the mixture at 90% TFA to 0, 1% for 5 minutes, then a linear gradient from 10 to 40% of CH 3 CN in 15 minutes, then from 40% to 70% of CH 3 CN at a flow rate of 5.0 ml / min; a double d UV reaction was made at 254 and 305 nm.) The fractions containing the product were lyophilized to yield 25 mg (24.2 μmol) of the trifunctional reagent of formula (1-2) as a white amorphous powder. , with a yield of 74%.
HPLC-PI (system B): tR = 18,5 min, pureté 97 %. Analyse RMN 1H (300 MHz, CDCl3) : δ = 1,24-1,27 (t, 3H, J = 7,1 Hz, CH3(SEt) Cys), 1,32-1,90 (m, 6H, CH2 β, γ, δ Lys), 2,63-2,69 (q, 2H, J = 7,1 Hz, CH2(SEt) Cys), 2,81 (s, 4H, 2 x CH2 succinimidyl), 2,24-3,28 (m, 2H, CH2 β Cys), 3,24-3.69 (m, HH, 5 x CH2 unité (A-I) + CH2 ε Lys), 4,22-4,27 (t, IH, CH Fmoc), 4,32 (s, 2H, CH2), 4,51-4,53 (d, 2H, J = 6,4 Hz, CH2 Fmoc), 4,58-4,66 (q, J = 7,5 Hz, IH, CH α Lys), 4,70-4,76 (q, IH, J = 6,0 Hz CH α Cys), 6,17 (bs, IH, NH), 6,83 (s, IH, NH), 7,27-7,83 (m, 8H, CH Fmoc), 9,2 (bs, IH, NH).HPLC-PI (system B): t R = 18.5 min, purity 97%. 1 H NMR analysis (300 MHz, CDCl 3 ): δ = 1.24-1.27 (t, 3H, J = 7.1 Hz, CH 3 (SEt) Cys), 1.32-1.90 (m , 6H, CH 2 β, γ, δ Lys), 2.63-2.69 (q, 2H, J = 7.1 Hz, CH 2 (SEt) Cys), 2.81 (s, 4H, 2 x CH 2 succinimidyl), 2.24-3.28 (m, 2H, CH 2 β Cys), 3.24-3.69 (m, HH, 5 x CH 2 unit (Al) + CH 2 ε Lys), 4, 22-4.27 (t, 1H, CH Fmoc), 4.32 (s, 2H, CH 2 ), 4.51-4.53 (d, 2H, J = 6.4 Hz, CH 2 Fmoc), 4.58-4.66 (q, J = 7.5 Hz, 1H, CH α Lys), 4.70-4.76 (q, 1H, J = 6.0 Hz CH α Cys), 6.17 (bs, 1H, NH), 6.83 (s, 1H, NH), 7.27-7.83 (m, 8H, CH Fmoc), 9.2 (bs, 1H, NH).
MS (MALDI-TOF, mode positif) m/z 1035,17 (M+H)+, 1057,71 (M+Na)+, 1073,68 (M+K)+, calculé pour C45H62N8Oi6S2 1035,69 (M+H)+ Le réactif trifonctionnel de formule (1-2) peut ensuite être fonctionnalisé par tout ligand fluorescent pour conduire au réactif trifonctionnel fluorescent correspondant. MS (MALDI-TOF, positive mode) m / z 1035.17 (M + H) + , 1057.71 (M + Na) + , 1073.68 (M + K) + , calculated for C 45 H 62 N 8 Oi 6 S 2 1035.69 (M + H) + The trifunctional reagent of formula (1-2) may then be functionalized with any fluorescent ligand to yield the corresponding fluorescent trifunctional reagent.

Claims

REVENDICATIONS
1. Réactif trifonctionnel pseudopeptidique, caractérisé par le fait qu'il comprend au moins les trois unités structurales réactives A, B et C suivantes : (a) une unité A constituée d'une chaîne hydrophile de pseudo- poly(éthylène glycol) interrompue par au moins une fonction amide et possédant deux extrémités El et E2, ladite extrémité El étant libre et comportant un motif terminal choisi parmi le groupement amino, les carbamates activés et les esters activés, et ladite extrémité E2 comportant un atome de carbone terminal porteur d'une fonction carbonyle, ledit atome de carbone étant engagé dans une fonction amide (-C(O)-NH-) formée avec l'atome d'azote d'une fonction α-amine portée par l'unité B ;A trifunctional pseudopeptide reagent, characterized in that it comprises at least the following three reactive structural units A, B and C: (a) a unit A consisting of a hydrophilic chain of pseudopoly (ethylene glycol) interrupted by at least one amide function and having two ends E1 and E2, said E1 end being free and having a terminal unit selected from amino group, activated carbamates and activated esters, and said E2 end having a terminal carbon atom carrying a carbonyl function, said carbon atom being engaged in an amide function (-C (O) -NH-) formed with the nitrogen atom of an α-amine function carried by the unit B;
(b) une unité B constituée d'un acide aminé choisi parmi les acides α-aminés de la série L, D et leurs mélanges racémiques, ledit acide aminé possédant sur sa chaîne latérale au moins une fonction oxyamine protégée par un groupement protecteur ou au moins une fonction aldéhydique masquée ; et(b) a unit B consisting of an amino acid chosen from α-amino acids of the L, D series and their racemic mixtures, said amino acid having on its side chain at least one oxyamine function protected by a protecting group or at least one minus a masked aldehyde function; and
(c) une unité C constituée d'un acide aminé choisi parmi les acides α-aminés de la série L, D et leurs mélanges racémiques, ledit acide aminé possédant sur sa chaîne latérale au moins un motif thiol, maléimide, iodoacétyle, azoture, alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne ; lesdites unités B et C étant liées entre elles par l'intermédiaire d'une fonction amide formée entre l'atome de carbone porteur de la fonction carbonyle de l'acide α-aminé constituant l'unité B et l'atome d'azote de la fonction α-amine de l'acide α-aminé constituant l'unité C.(c) a unit C consisting of an amino acid selected from α-amino acids of the L, D series and their racemic mixtures, said amino acid having on its side chain at least one thiol, maleimide, iodoacetyl, azide unit, true alkyne, phosphane or cyclooctyne; said units B and C being linked to one another via an amide function formed between the carbon atom carrying the carbonyl function of the α-amino acid constituting the unit B and the nitrogen atom of the α-amine function of the α-amino acid constituting the unit C.
2. Réactif trifonctionnel selon la revendication 1 , caractérisé par le fait que la chaîne pseudo-poly(éthylène glycol) de l'unité A est choisie parmi les chaînes de formule (A-I) suivante :2. Trifunctional reagent according to claim 1, characterized in that the pseudo-poly (ethylene glycol) chain of unit A is chosen from the following chains of formula (A-I):
(A-I) dans laquelle :(HAVE) in which :
- R] représente une aminé primaire, un motif carbamate activé ou un motif ester activé,R 1 represents a primary amine, an activated carbamate unit or an activated ester unit,
- m et n, identiques ou différents, sont des nombres entiers compris entre 2 et 10 inclusivement,- m and n, identical or different, are integers between 2 and 10 inclusive,
- p est un nombre entier compris entre 1 et 10 inclusivement,p is an integer from 1 to 10 inclusive,
- la flèche représente la liaison covalente reliant la fonction amide de l'extrémité E2 de la chaîne pseudo-poly(éthylène glycol) à l'unité B ou C.the arrow represents the covalent bond connecting the amide function of the E2 end of the pseudo-poly (ethylene glycol) chain to the B or C unit.
3. Réactif trifonctionnel selon la revendication 2, caractérisé par le fait que la chaîne pseudo-poly(éthylène glycol) est choisie parmi les chaînes pseudo- poly(éthylène glycol) de formule (A-I) dans lesquelles m = n = 2 et p = 1.3. Trifunctional reagent according to claim 2, characterized in that the pseudo-poly (ethylene glycol) chain is chosen from pseudopoly (ethylene glycol) chains of formula (AI) in which m = n = 2 and p = 1.
4. Réactif trifonctionnel selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé par le fait que les groupements carbamates activés sont choisis parmi le carbamate de N-hydroxysuccinimidyle, le carbamate de sulfo N- hydroxysuccinimidyle, le carbamate de N-hydroxyphtalimidyle, le carbamate de N- hydroxypipéridinyle, le carbamate de jP-nitrophényle et le carbamate de pentafluorophényle.4. trifunctional reagent according to any one of the preceding claims, characterized in that the activated carbamate groups are chosen from N-hydroxysuccinimidyl carbamate, N-hydroxysuccinimidyl sulfo carbamate, N-hydroxyphthalimidyl carbamate, N-hydroxypiperidinyl, p-nitrophenyl carbamate and pentafluorophenyl carbamate.
5. Réactif trifonctionnel selon la revendication 4, caractérisé par le fait que le groupement carbamate activé est le carbamate de N-hydroxysuccinimidyle. 5. trifunctional reagent according to claim 4, characterized in that the activated carbamate group is N-hydroxysuccinimidyl carbamate.
6. Réactif trifonctionnel selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, caractérisé par le fait que les groupements esters activés sont choisis parmi l'ester de TV-hydroxysuccinimidyle, l'ester de sulfo N-hydroxysuccinimidyle, l'ester de cyanométhyle, l'ester de N-hydroxyphtalimidyle, l'ester de N-hydroxypipéridinyle, l'ester de p-nitrophényle, l'ester de pentafluorophényle, les esters de benzotriazole, les esters d'hydroxybenzotriazole et les esters d'hydroxyazabenzotriazole.6. trifunctional reagent according to any one of claims 1 to 3, characterized in that the activated ester groups are chosen from the ester of TV-hydroxysuccinimidyl, the sulfo-N-hydroxysuccinimidyl ester, the cyanomethyl ester, the N-hydroxyphthalimidyl ester, the N-hydroxypiperidinyl ester, the p-nitrophenyl ester, the pentafluorophenyl ester, the benzotriazole esters, the hydroxybenzotriazole esters and the hydroxyazabenzotriazole esters.
7. Réactif trifonctionnel selon la revendication 6, caractérisé par le fait que le groupement ester activé est l'ester de 7V-hydroxysuccinimidyle.7. trifunctional reagent according to claim 6, characterized in that the activated ester group is the 7V-hydroxysuccinimidyl ester.
8. Réactif trifonctionnel selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé par le fait que les acides α-aminés utilisables pour l'unité B sont choisis parmi la lysine, l'homolysine, l'ornithine, l'acide 2,4-diaminobutanoïque et l'acide 2,3-diaminopropanoïque. 8. trifunctional reagent according to any one of the preceding claims, characterized in that the α-amino acids used for the unit B are chosen from lysine, homolysine, ornithine, 2,4- diaminobutanoic acid and 2,3-diaminopropanoic acid.
9. Réactif trifonctionnel selon la revendication 8, caractérisé par le fait que l'acide α-aminé de l'unité B est la lysine.9. Trifunctional reagent according to claim 8, characterized in that the α-amino acid of unit B is lysine.
10. Réactif trifonctionnel selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé par le fait que les acides α-aminés utilisables pour l'unité C, sont choisis parmi la lysine, la cystéine, l'homolysine, l'ornithine, l'acide 2,4- diaminobutanoïque, l'acide 2,3-diaminopropanoïque, l'acide aminomercapto-acétique, l'homocystéine, la 5-mercapto-norvaline, la 6-mercapto-norleucine, l'acide 2-amino-7- mercapto-heptanoïque, et l'acide 2-amino-8-mercapto-octanoïque.10. trifunctional reagent according to any one of the preceding claims, characterized in that the α-amino acids usable for the unit C, are chosen from lysine, cysteine, homolysine, ornithine, acid 2,4-diaminobutanoic acid, 2,3-diaminopropanoic acid, aminomercapto-acetic acid, homocysteine, 5-mercapto-norvaline, 6-mercapto-norleucine, 2-amino-7-mercapto acid -heptanoic acid, and 2-amino-8-mercaptooctanoic acid.
11. Réactif trifonctionnel selon la revendication 10, caractérisé par le fait que l'acide α-aminé de l'unité C est la lysine ou la cystéine.11. Trifunctional reagent according to claim 10, characterized in that the α-amino acid of unit C is lysine or cysteine.
12. Réactif trifonctionnel selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé par le fait que les groupements protecteurs de la fonction oxyamine de la chaîne latérale de l'acide α-aminé constituant l'unité B, sont choisis parmi les groupements 9-fluorénylméthoxycarbonyle, le benzyloxycarbonyle, l'allyloxycarbonyle, le trichloroéthoxycarbonyle, le triméthylsilyléthoxycarbonyle, le pyridyldithioéthoxycarbonyle, le 2-(2-nitrophényl)-propyloxycarbonyle, l'azométhyloxycarbonyle, le 2-(triméthylsilyl)éthanesulfonyle et le phtalimide.12. Trifunctional reagent according to any one of the preceding claims, characterized in that the protective groups of the oxyamine function of the side chain of the α-amino acid constituting the unit B, are chosen from 9-fluorenylmethoxycarbonyl groups. benzyloxycarbonyl, allyloxycarbonyl, trichloroethoxycarbonyl, trimethylsilylethoxycarbonyl, pyridyldithioethoxycarbonyl, 2- (2-nitrophenyl) propyloxycarbonyl, azomethyloxycarbonyl, 2- (trimethylsilyl) ethanesulfonyl and phthalimide.
13. Réactif trifonctionnel selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé par le fait qu'il est choisi parmi les composés de formule (I) suivante :13. Trifunctional reagent according to any one of the preceding claims, characterized in that it is chosen from the following compounds of formula (I):
(I) dans laquelle :(I) in which:
- Ri, m, n et p ont les mêmes significations que celles définies à la revendication 2 ou 3 pour l'unité de formule (A-I),R 1, m, n and p have the same meanings as defined in claim 2 or 3 for the unit of formula (A-I),
- Xi et X2, identiques ou différents et conjointement avec l'atome de carbone auxquels ils sont liés, représentent la chaîne hydrocarbonée d'un acide α-amine, Proc est un groupement protecteur choisi parmi le 9-fluorénylméthoxycarbonyle, le benzyloxycarbonyle, l'allyloxycarbonyle, le trichloroéthoxycarbonyle, le triméthylsilyléthoxycarbonyle, le pyridyldithioéthoxycarbonyle, le 2-(2-nitrophényl)-propyloxycarbonyle, 1 'azométhyloxycarbonyle, le 2-(triméthylsilyl)éthanesulfonyle et le phtalimide;X 1 and X 2 , which are identical or different and, together with the carbon atom to which they are bonded, represent the hydrocarbon chain of an α-amine acid, Proc is a protecting group selected from 9-fluorenylmethoxycarbonyl, benzyloxycarbonyl, allyloxycarbonyl, trichloroethoxycarbonyl, trimethylsilylethoxycarbonyl, pyridyldithioethoxycarbonyl, 2- (2-nitrophenyl) propyloxycarbonyl, 1-azomethyloxycarbonyl, 2- (trimethylsilyl) ethanesulfonyl and phthalimide;
- Fonc est un motif thiol, maléimide, iodoacétyle, azoture, alcyne vrai, phosphane ou cyclooctyne.- Func is a thiol, maleimide, iodoacetyl, azide, true alkyne, phosphane or cyclooctyne unit.
14. Réactif trifonctionnel selon la revendication 13, caractérisé par le fait que Xi est une chaîne n-butyle.14. trifunctional reagent according to claim 13, characterized in that Xi is an n-butyl chain.
15. Réactif trifonctionnel selon la revendication 13 ou 14, caractérisé par le fait que X2 est une chaîne éthyle ou n-butyle.15. trifunctional reagent according to claim 13 or 14, characterized in that X 2 is an ethyl or n-butyl chain.
16. Réactif selon l'une quelconque des revendications 13 à 15, caractérisé par le fait que les composés de formule (I) sont choisis parmi les composés de formule (I- 1) et (1-6) suivantes :16. Reagent according to any one of claims 13 to 15, characterized in that the compounds of formula (I) are chosen from the following compounds of formula (I-1) and (1-6):
(M) ( M )
(1-2) (1-2)
(1-5)(1-5)
d-6). d-6).
17. Utilisation d'au moins un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications précédentes, pour la préparation d'un bioconjugué. 17. Use of at least one trifunctional reagent as defined in any one of the preceding claims, for the preparation of a bioconjugate.
18. Bioconjugué, caractérisé par le fait qu'il consiste en un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendication 1 à 16, dans lequel le motif aminé primaire, carbamate activé ou ester activé présent à l'extrémité libre de la chaîne pseudo-poly(éthylène glycol) constituant l'unité A et/ou la fonction oxyamine ou aldéhydique portée par l'unité B après sa déprotection, respectivement son démasquage, est(sont) fonctionnalisé(s) par une molécule biologique d'intérêt.18. Bioconjugate, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16, wherein the primary amine unit, activated carbamate or activated ester present at the free end of the pseudo-poly (ethylene glycol) chain constituting unit A and / or the oxyamine or aldehyde function carried by unit B after its deprotection or unmasking, is (are) functionalized by a biological molecule of interest .
19. Bioconjugué selon la revendication 18, caractérisé par le fait que la molécule biologique d'intérêt est choisie parmi les anticorps, les molécules d'acides nucléiques et leurs analogues, les polysaccharides, les protéines, les peptides, les radionucléides, les toxines, les inhibiteurs d'enzymes et les haptènes.19. bioconjugate according to claim 18, characterized in that the biological molecule of interest is chosen from antibodies, nucleic acid molecules and their analogues, polysaccharides, proteins, peptides, radionuclides, toxins, enzyme inhibitors and haptens.
20. Bioconjugué selon la revendication 18 ou 19, caractérisé par le fait qu'il est choisi parmi : i) un bioconjugué constitué par un réactif trifonctionnel dans lequel seul la fonction aminé primaire ou seul le motif carbamate activé ou ester activé présent à l'extrémité libre de la chaîne pseudo-poly(éthylène glycol) constituant l'unité A est fonctionnalisé par une molécule biologique, ii) un bioconjugué constitué par un réactif trifonctionnel dans lequel seule la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B est fonctionnalisée par une molécule biologique, et iii) un bioconjugué comportant deux molécules biologiques, constitué par un réactif trifonctionnel dans lequel le la fonction aminé primaire ou motif carbamate activé ou ester activé présent à l'extrémité libre de la chaîne pseudo- poly(éthylène glycol) constituant l'unité A et la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B sont chacun fonctionnalisés par une molécule biologique, lesdites molécules étant identiques ou différentes l'une de l'autre.20. Bioconjugate according to claim 18 or 19, characterized in that it is chosen from: i) a bioconjugate consisting of a trifunctional reagent in which only the primary amine function or only the activated carbamate unit or activated ester present at the free end of the pseudo-poly (ethylene glycol) chain constituting the unit A is functionalized by a biological molecule, ii) a bioconjugate consisting of a trifunctional reagent in which only the unmasked deprotected oxyamine or aldehyde function of the unit B is functionalized by a biological molecule, and iii) a bioconjugate comprising two biological molecules, consisting of a trifunctional reagent in which the primary amine function or activated carbamate or activated ester unit present at the free end of the pseudo-poly (ethylene glycol) chain. constituting unit A and the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from unit B are each a functionalized by a biological molecule, said molecules being identical or different from each other.
21. Utilisation d'au moins un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16, pour la préparation d'un réactif luminescent.21. Use of at least one trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16 for the preparation of a luminescent reagent.
22. Réactif trifonctionnel luminescent, caractérisé par le fait qu'il consiste en un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16, et qu'il comporte un seul groupement luminescent (L) fixé sur l'unité B par l'intermédiaire de la fonction oxyamine déprotégée ou de la fonction aldéhydique démasquée ou sur l'unité C par l'intermédiaire de la fonction thiol ou des motifs maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture.22. Luminescent trifunctional reagent, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16, and that it comprises a single luminescent group (L) attached to the unit B via the deprotected oxyamine function or the function aldehyde unmasked or on the unit C via the thiol function or the units maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane, cyclooctyne or even azide.
23. Réactif trifonctionnel luminescent, caractérisé par le fait qu'il consiste en un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16, et qu'il comporte deux groupements luminescents, l'un étant fixé sur l'unité B par l'intermédiaire de la fonction oxyamine déprotégée ou de la fonction aldéhydique démasquée et l'autre étant fixé sur l'unité C par l'intermédiaire de la fonction thiol ou des motifs maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture.23. trifunctional reagent luminescent, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16, and it comprises two luminescent groups, one being fixed on the unit B via the deprotected oxyamine function or the undefined aldehyde function and the other being attached to the unit C via the thiol function or the maleimide, iodoacetyl, true alkyne, phosphane or cyclooctyne units or else still azide.
24. Réactif trifonctionnel luminescent selon la revendication 22 ou 23, caractérisé par le fait que le ou les groupements luminescents sont choisis parmi les fluorophores à chaînes polyméthine ; les cyanines fluorescentes ; la fluorescéine et ses dérivés ; la rhodamine et ses dérivés ; les dérivés hydrosolubles de la rhodamine sous forme d'ester de TV-hydroxysuccinimide ; les rhodols et leurs dérivés ; les dérivés de coumarine ; les colorants fluorescents à aminés réactives ; les difluorures de bore de dipyrrométhène ; les fluorophores dérivés du pyrène ; les dérivés diazoïques ; les dérivés du danzyle ; l'éosine ; l'érythrosine et les dérivés de sulforhodamine.24. trifunctional luminescent reagent according to claim 22 or 23, characterized in that the luminescent group or groups are chosen from polymethine chain fluorophores; fluorescent cyanines; fluorescein and its derivatives; rhodamine and its derivatives; water-soluble derivatives of rhodamine in the form of a TV-hydroxysuccinimide ester; rhodols and their derivatives; coumarin derivatives; fluorescent dyes with reactive amines; dipyrromethene boron difluorides; fluorophores derived from pyrene; disazo derivatives; danzyl derivatives; eosin; erythrosine and sulforhodamine derivatives.
25. Utilisation d'au moins un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16, pour la préparation d'une cassette de transfert d'énergie.25. Use of at least one trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16, for the preparation of a transfer cassette energy.
26. Cassette de transfert d'énergie, caractérisée par le fait qu'elle est constituée d'un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16, ledit réactif comportant un groupement luminescent (L) et un composé accepteur (Q) de la luminescence du groupement luminescent, L et Q étant respectivement et indifféremment fixés sur ledit réactif trifonctionnel via la fonction oxyamine déprotégée ou aldéhydique démasquée de l'unité B et la fonction thiol ou les motifs maléimide, iodoacétyle, alcyne vrai, phosphane, cyclooctyne ou bien encore azoture de l'unité C. 26. Energy transfer cassette, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16, said reagent comprising a luminescent group (L) and an acceptor compound (Q) luminescence of the luminescent group, L and Q being respectively and indifferently attached to said trifunctional reagent via the deprotected oxyamine or aldehyde function unmasked from unit B and the thiol function or the units maleimide, iodoacetyl, alkyne true, phosphane , cyclooctyne or even azide of unit C.
27. Cassette selon la revendication 26, caractérisée par le fait que le groupement luminescent (L) est choisi parmi les fluorophores à chaînes polyméthine ; les cyanines fluorescentes ; la fluorescéine et ses dérivés ; la rhodamine et ses dérivés ; les dérivés hydrosolubles de la rhodamine sous forme d'ester de N-hydroxysuccinimide ; les rhodols et leurs dérivés ; les dérivés de coumarine ; les colorants fluorescents à aminés réactives ; les difluorures de bore de dipyrrométhène ; les fluorophores dérivés du pyrène ; les dérivés diazoïques ; les dérivés du danzyle ; l'éosine ; l'érythrosine et les dérivés de sulforhodamine.27. Cassette according to claim 26, characterized in that the luminescent group (L) is selected from polymethine chain fluorophores; fluorescent cyanines; fluorescein and its derivatives; rhodamine and its derivatives; water-soluble derivatives of rhodamine in the form of N-hydroxysuccinimide ester; rhodols and their derivatives; coumarin derivatives; fluorescent dyes with reactive amines; dipyrromethene boron difluorides; fluorophores derived from pyrene; disazo derivatives; danzyl derivatives; eosin; erythrosine and sulforhodamine derivatives.
28. Cassette selon la revendication 25 ou 26, caractérisée par le fait que le composé accepteur (Q) est choisi parmi les groupements luminescents (L) listés à la revendication 27, les molécules non-fluorescentes de la famille des colorants azoïques, les particules d'or, les colorants diazoïques, le vert de malachite et les composés accepteurs de la famille des cyanines.28. Cassette according to claim 25 or 26, characterized in that the acceptor compound (Q) is chosen from the luminescent groups (L) listed in claim 27, the non-fluorescent molecules of the family of azo dyes, the particles gold, disazo dyes, malachite green and acceptor compounds of the cyanine family.
29. Cassette selon l'une quelconque des revendications 25 à 28, caractérisée par le fait que le groupement luminescent (L) et le composé accepteur (Q) sont choisis parmi les couples suivants (L/Q) : Cy3/Cy5, Cy5/Cy7, Cy5/Alexa Fluor® 750, Cy3/Cy5Q, Cy3/QSY® 7, Cy3/QSY® 9, Cy5/Cy7Q, Cy5/QSY® 21, Cy5/Cy5, Cy5.5/Cy5.5, Cy7/Cy7, R6)/Cy5, R6G/Alexa Fluor® 647, R6G/QSY® 21, Alexa Fluor® 532/Cy5, Alexa Fluor® 532/Alexa Fluor® 647, Alexa Fluor® 532/QSY® 21, Alexa Fluor® 555/Cy5, Alexa Fluor® 555/Alexa Fluor® 647, Alexa Fluor® 555/QSY® 21.29. Cassette according to any one of claims 25 to 28, characterized in that the luminescent group (L) and the acceptor compound (Q) are chosen from the following pairs (L / Q): Cy3 / Cy5, Cy5 / Cy7, Cy5 / Alexa Fluor ® 750, Cy3 / Cy5Q, Cy3 / QSY ® 7, Cy3 / QSY ® 9, Cy5 / Cy7Q, Cy5 / QSY ® 21, Cy5 / Cy5, Cy5.5 / Cy5.5, Cy7 / Cy7 , R6) / Cy5, R6G / Alexa Fluor ® 647, R6G / QSY ® 21, Alexa Fluor ® 532 / Cy5, Alexa Fluor ® 532 / Alexa Fluor ® 647, Alexa Fluor ® 532 / QSY ® 21, Alexa Fluor ® 555 / Cy5, Alexa Fluor ® 555 / Alexa Fluor ® 647, Alexa Fluor ® 555 / QSY ® 21.
30. Utilisation d'un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16, pour la préparation d'un bioconjugué mixte comportant au moins une molécule biologique et au moins un groupement luminescent.30. Use of a trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16, for the preparation of a mixed bioconjugate comprising at least one biological molecule and at least one luminescent group.
31. Bioconjugué mixte, caractérisé par le fait qu'il consiste en un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16 sur lequel sont fixés au moins une molécule biologique et au moins un groupement luminescent.31. Mixed bioconjugate, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16 on which are fixed at least one biological molecule and at least one luminescent group.
32. Bioconjugué mixte selon la revendication 31 , caractérisé par le fait qu'il comporte en outre un composé accepteur (Q) de la luminescence du groupement luminescent. 32. Mixed bioconjugate according to claim 31, characterized in that it further comprises an acceptor compound (Q) of the luminescence of the luminescent group.
33. Bioconjugué mixte selon la revendication 31 ou 32, caractérisé par le fait qu'il est choisi parmi les réactifs trifonctionnels sur lesquels sont fixés : i) une ou deux molécules biologiques d'intérêt et un groupement luminescent ; ou ii) une molécule biologique d'intérêt, et deux groupements luminescents ; iii) une molécule biologique d'intérêt, un groupement luminescent, et un composé accepteur (Q) de la luminescence du groupement luminescent ; lesdites molécules biologiques, lesdits groupements luminescents et ledit composé accepteurs (Q) étant fixés sur le réactif fonctionnel au niveau des extrémités terminales des unités A, B et C. 33. Mixed bioconjugate according to claim 31 or 32, characterized in that it is chosen from the trifunctional reactants on which are fixed: i) one or two biological molecules of interest and a luminescent group; or ii) a biological molecule of interest, and two luminescent groups; iii) a biological molecule of interest, a luminescent group, and an acceptor compound (Q) of the luminescence of the luminescent group; said biological molecules, said luminescent moieties and said acceptor compound (Q) being attached to the functional reagent at the terminal ends of the A, B and C units.
34. Utilisation d'un réactif trifonctionnel ou d'un bioconjugué, modifiés ou non par un groupement luminescent au niveau de l'unité C, tels que définis à l'une quelconque des revendications 1 à 16, 18 à 20, 22, 24, 31 et 33, et dans lesquels la fonction oxyamine ou respectivement aldéhydique de l'unité B est libre, pour la fonctionnalisation de supports solides comportant au moins une surface possédant un ou plusieurs groupements carbonylés ou respectivement une ou plusieurs fonctions oxyamine.34. Use of a trifunctional reagent or a bioconjugate, whether or not modified with a luminescent group at unit C, as defined in any one of claims 1 to 16, 18 to 20, 22, 24 , 31 and 33, and wherein the oxyamine or respectively the aldehyde function of the unit B is free, for the functionalization of solid supports comprising at least one surface having one or more carbonyl groups or respectively one or more oxyamine functions.
35. Support solide, caractérisé par le fait qu'il comporte au moins une surface fonctionnalisée, de façon covalente, par un ou plusieurs réactifs trifonctionnels, et/ou par un ou plusieurs bioconjugués tels que définis à l'une quelconque des revendications 1 à 16, 18 à 20, 22, 24, 31 et 33, lesdits réactifs trifonctionnels et bioconjugués étant éventuellement modifiés par un groupement luminescent au niveau de l'unité C.35. Solid support, characterized in that it comprises at least one functionalized surface, covalently, with one or more trifunctional reagents, and / or with one or more bioconjugates as defined in any one of claims 1 to 16, 18 to 20, 22, 24, 31 and 33, said trifunctional and bioconjugated reagents being optionally modified by a luminescent group at the level of the unit C.
36. Support solide selon la revendication 35, caractérisé par le fait qu'il comprend au moins une surface fonctionnalisée par au moins un bioconjugué et qu'il constitue alors une biopuce ou un biocapteur.36. The solid support according to claim 35, characterized in that it comprises at least one surface functionalized with at least one bioconjugate and that it then constitutes a biochip or a biosensor.
37. Utilisation d'un support tel que défini à la revendication 35 ou 36, pour la détection de molécules d'intérêt.37. Use of a support as defined in claim 35 or 36, for the detection of molecules of interest.
38. Utilisation d'au moins un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16, pour la préparation d'une sonde destinée à la protéomique fonctionnelle. 38. Use of at least one trifunctional reagent as defined in any one of claims 1 to 16 for the preparation of a probe for functional proteomics.
39. Sonde pour la protéomique fonctionnelle, caractérisée par le fait qu'elle est constituée d'un réactif trifonctionnel tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 16, ledit réactif comportant :39. Probe for functional proteomics, characterized in that it consists of a trifunctional reagent as defined in any one of Claims 1 to 16, said reagent comprising:
- un groupement permettant la détection (ou visualisation) et/ou la purification d'une protéine cible (étiquette rapporteuse ou "reporter tag"),a group allowing detection (or visualization) and / or purification of a target protein (reporter tag or "reporter tag"),
- un motif reconnu par ladite protéine cible (unité de reconnaissance ou "récognition unit"), eta pattern recognized by said target protein (recognition unit or "recognition unit"), and
- un groupe réactif permettant d'établir un lien de covalence avec le site actif de la protéine ciblée (groupe réactif). a reactive group making it possible to establish a covalent link with the active site of the targeted protein (reactive group).
40. Sonde selon la revendication 39, caractérisée par le fait que la protéine cible est une enzyme. 40. Probe according to claim 39, characterized in that the target protein is an enzyme.
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