EP1495325A1 - Utilisation de derives de nucleosides comportant un groupement citrate pour la production d'anticorps ayant une affinite pour des nucleosides tri-phosphoryles - Google Patents

Utilisation de derives de nucleosides comportant un groupement citrate pour la production d'anticorps ayant une affinite pour des nucleosides tri-phosphoryles

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EP1495325A1
EP1495325A1 EP03725266A EP03725266A EP1495325A1 EP 1495325 A1 EP1495325 A1 EP 1495325A1 EP 03725266 A EP03725266 A EP 03725266A EP 03725266 A EP03725266 A EP 03725266A EP 1495325 A1 EP1495325 A1 EP 1495325A1
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EP
European Patent Office
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derivative
cells
affinity
nucleoside
ddntp
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EP03725266A
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German (de)
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EP1495325B1 (fr
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Anny Cupo
Cécile Le Saint
Jean-Pierre Vincent
Fatima Akeb
Danièle Les Jardins de Gairaut Duval
Roger Guedj
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
Original Assignee
Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
Universite de Nice Sophia Antipolis UNSA
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Publication date
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    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/44—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material not provided for elsewhere, e.g. haptens, metals, DNA, RNA, amino acids
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/5308—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for analytes not provided for elsewhere, e.g. nucleic acids, uric acid, worms, mites
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
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    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
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    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/531—Production of immunochemical test materials

Definitions

  • NUCLEOSIDE DERIVATIVES COMPRISING A CITRATE GROUP FOR THE PRODUCTION OF ANTIBODIES HAVING AN AFFINITY FOR TRI-PHOSPHORYLATED NUCLEOSIDES
  • the present invention relates to the use of nucleoside analogs comprising a citrate group for the production of antibodies having an affinity for triphosphorylated nucleosides.
  • - natural nucleoside a molecule formed by the association of a pure (adenine or guanine) or pyrimidine (cytosine, uracil and thymine) base with a pentose residue (beta-D-ribofuranose or beta-D-deoxyribofuranose).
  • ddNs any molecule composed of a modified or unmodified base, coupled to a ribose or an analog thereof.
  • ddNs - nucleoside analog
  • an analog may include modifications of the ribose molecule, such as for example those mentioned on page 607 of the aforementioned document, such as the substitution of one or more atoms, the displacement of the bond between the base.
  • nucleoside used in the text denotes without distinction a natural nucleoside or a nucleoside analog as defined above.
  • nucleosides are commonly used as anti-viral agents or as anti-cancer agents and it is known that they must be metabolized to their triphosphorylated form in order to be able to exert an antiviral or anti-cancer inhibitory activity.
  • ddNTPs triphosphorylated nucleosides
  • nucleoside analogues The problem with nucleoside analogues is different.
  • the doses administered are also important because they are imposed by the limited penetration of the precursor nucleoside into the cells.
  • the different phosphorylated metabolites of the drug will affect both viral and cellular polymerases.
  • the toxicity of the catabolites of the drug will be added to the non-specificity of the nucleoside analogues.
  • the anti-HIV treatment because of the high quantities of antivirals administered to the patients, will affect a large number of cellular compartments including those which are reserved for the differentiation of the stem cells thus inducing the side effects which render the treatments anti-HIV if restrictive and uncomfortable.
  • the plasma and intracellular levels of anti-HIV molecules are a direct reflection of the metabolism of the whole organism.
  • Good knowledge of the plasma and intracellular levels of anti-HIV molecules is essential and differs from one individual to another and from one moment to another of the disease.
  • Measuring these parameters would allow clinicians to determine the consequences of combinations, optimize their use and adjust the dosage. depending on the patient and the course of his illness. It is essential for the clinician to have access to the measurement of intracellular content which is closely related to plasma concentration and viral load. The latter has a direct impact on the therapeutic escape.
  • the present invention relates to methods for quantifying nucleoside analogs, making it possible to overcome the drawbacks of the existing assays of said compounds, which are used for example, as antiviral compounds
  • the methods for quantifying nucleosides by means of immunoassays implemented in the present invention have numerous advantages in terms of sensitivity and speed since both the preparation time of the samples and that of the assay itself are considerably reduced.
  • certain methods envisaged for obtaining such antibodies for example, antibodies directed against AZT-TP, using as i munogen a derivative of AZT-TP in which the phosphoric anhydride bonds have been substituted by bonds methylenephosphonate (or P-CH 2 - P), the methylene-bis-phosphonate group (P-CH 2 -P-CH 2 -P) has structural characteristics similar to those of the pyrophosphate group (POPOP) since the angle of the bonds phosphoric anhydride (POP) is 130 °, that of the methylenephosphonate bond is 117 °; the length of the P-0 links is 1.61 ⁇ , and that of the PC links is 1.79 A. (Saady et al.
  • the affinity of the various antibodies directed against this methylene-bis-phosphonate analogue of the AZT-TP obtained is not sufficient vis-à-vis the AZT-TP molecule to be assayed to allow its quantification, all the more since the intracellular quantities of the nucleotides are extremely small and the volume of the sample to be assayed is also reduced.
  • An objective of the present invention is therefore the preparation of antibodies for the assay of ddNTPs derivatives, recognizing them with sufficient affinity to allow their intracellular quantification.
  • these antibodies should not recognize endogenous nucleotides.
  • the Applicant has developed immunogens capable of inducing an im response in mammals, prepared from nucleoside analogs having not only a structural analogy, but also an electronic analogy with the molecule to dose for immunization of mammals, hereinafter called isosteres.
  • nucleoside triphosphates have already been described, for example for the design of a reverse transcriptase inhibitor.
  • a reverse transcriptase inhibitor e.g., R and Gilbert, IH. (1997) "The design and synthesis of nucleoside triphosphate isostere as potential inhibitors of HIV reverse transcriptase. Tetrahedron, vol.53, 5537-5562 .; Weaver, R, et al. (1996 ) "Isosteres of nucleoside triphosphate” s. Bioorg. Med. Chem. Lett. Vol. 6, 2405-2410.
  • a first object of the present invention is therefore the use of said isosteres of nucleoside triphosphates preferably, isosteres in which their phosphate group has been replaced by the citrate group, for the preparation of immunogens by coupling of said isosteres on carrier molecules.
  • the immunization of immunocompetent cells of vertebrates, in particular mammals has indeed made it possible to obtain antibodies having an affinity adapted to the assays of the ddNTPs derivatives including when these are present only at very low doses.
  • the invention therefore relates to an immunogen comprising a citrate derivative of a nucleoside or of a nucleoside analog coupled to a carrier molecule.
  • nucleoside or analog is chosen from the group comprising: Acyclovir, Adenosine, S- Adenosyl-L-methionine, 2 ', 3' -dideoxyadénosione (ddA), 2 ', 3' - didehydro-2 ', 3' - dideoxythymidine (d4T), 2 *, 3 '-dideoxy-3' - thiacytidine (3TC), 3'- Azido-3 '-deoxythymidine (AZT), Carbovir, Cordycepine, Cytidine, Cytosine-bD-arabinoside, Deoxycytidine, Deoxytubercidine, 2 '-Deoxyuridine, Formycin A, Formycin B, Ganciclovir, Guanosine, Inosine, Puromycin, Ribavirin, Sangiva ycine, Thymidine, Tubercidine, Uridine, Abacavir, 3-fluoro-2'
  • Analogs of purine bases 6-mercaptopurine, cladribine, fludarabine.
  • - Analogs of pyrimidine bases 6-mercaptopurine, cladribine, fludarabine.
  • any molecule of high molecular weight, preferably between 50,000 and 500,000 daltons, capable of inducing an immune response can be used.
  • the carrier molecule is chosen from a protein, a polypeptide phylogenetically distant from the animal species used for immunization, or a polysaccharide.
  • the carrier molecule is a protein chosen from the group comprising ovalbumin, bovine serum albumin, keyhole limpet hemocyanin, thyroglobulin, immunoglobulins, casein, hemoglobin, bacterial toxins, such as the sub- unit B of cholera toxin, tetanus toxin, diphtheria toxin, of lectins such as the B subunit of ricin.
  • the invention also relates to the use of immunogens, defined above to obtain antibodies specific for nu cleosides-citrate or nucleoside-citrate derivatives used for immunization.
  • the invention also relates to the use of the immunogens defined above for obtaining antibodies, having an affinity for said ddNTP derivative.
  • Another subject of the invention relates to a method for obtaining an antibody having an affinity for said ddNTP derivative.
  • a first method then comprises the following steps: a) immunization of an animal, with at least one immunogen of the invention, b) purification of the polyclonal antibodies produced.
  • the animal immunized in stage (a) is preferably a non-human mammal, a rodent in particular a rat or a mouse, a goat, a rabbit or a hen and the purification of the antibodies of stage (b) can s '' Perform from the blood of the immunized animal or from egg yolk in the case of the hen.
  • a second method then comprises the following steps: a) immunization of immunocompetent cells of an animal, with at least one immunogen of the invention, b) immortalization of the cells secreting antibodies having an affinity for said ddNTP derivative by means of a cell fusion of the cells of the animal immunized in step (a), with a fusion cell line, c) identification and selection of hybrid clones immortalized, hybridomas, secreting said antibodies having an affinity for said ddNTP derivative, d) purification of the antibodies produced by said hybridomas.
  • the immunocompetent cells of an animal for example, spleen cells or lymph nodes lymphatics of said animal, are immunized either in vivo or in vitro.
  • the fusion line, used in step (b) of the second method is chosen from a mouse myeloma line, a rat myeloma line or also lines allowing the preparation of heterohybrids.
  • the invention also relates to the hybridomas thus obtained, capable of synthesizing and secreting monoclonal antibodies having an affinity for a ddNTP derivative.
  • the subject of the invention is also an antibody specific for the nucleoside-citrate isosteres and in particular an anti-nucleoside-citrate antibody recognizing at least one immunogen of the invention.
  • the invention also relates to an antibody having an affinity for a ddNTP derivative obtained by any of the methods for obtaining antibodies described above.
  • the affinity of the antibodies of the invention for the ddTP derivative against which they were prepared is greater than 10 "7 , all pre erentially greater than 10 " 9 and most preferably greater than 10 " 10 .
  • the IC 50 is defined by the concentration of unlabeled antigen capable of inhibiting 50% of the antigen-antibody bond.
  • the IC 50 is a good reflection of affinity.
  • the affinity is determined by the Scatchard method.
  • the present invention also relates to an antibody fragment having an affinity for a ddNTP derivative. comprising at least one variable part of an antibody molecule having the same affinity for said ddNTP derivative as said unfragmented antibody molecule.
  • fragments are for example fragments Fv, Fab, Fab ', F (ab) 2 , F (ab') 2 , which can be obtained by enzymatic digestions or by chemical cleavages from non-strandt antibodies, by techniques known to those skilled in the art.
  • a subject of the invention is also recombinant immunoglobulins, their heavy and / or light chains or fragments thereof which can be obtained by recombinant isolated nucleic acids encoding the heavy and / or light chains or functional fragments of these, monoclonal antibodies described above, by expressing said recombinant nucleic acids in a prokaryotic cell host such as E. coli or in a eukaryotic host such as yeasts or in a mammalian cell.
  • the invention also relates to an immunological assay method for triphosphorylated nucleoside derivatives.
  • triphosphorylated derivatives are formed in particular during the metabolism of nucleosides used in anti-viral therapies and in particular anti-HIV therapies, but also during anticancer treatments.
  • triphosphorylated derivatives are for example triphosphorylated derivatives of AZT, F3dThd, IdUrd, AraA, virazole, acyclovir, DHPG or ganciclovir, d4T, 3TC, ddA, and the diphosphorylated derivative of Tenofovir.
  • This method of immunological assay of the triphosphorylated nucleoside derivative by means of antibodies having an affinity for said derivative allows the determination of a large number of samples. Thanks to its sensitivity, it does not require a large sample volume. Indeed, the Applicant has been able to quantify the in vitro triphosphorylated derivative ddATP in 10 6 to 4xl0 6 PBMC preincubated with varying concentrations of ddl (10 -7 to 10 "9 M).
  • the method for assaying triphosphorylated nucleosides according to the invention makes it possible to dispense with the additional steps necessary in the other methods, such as the enzymatic degradation or the purification on Sep- Pa C18 cartridge
  • the method for assaying a ddNTP derivative according to the invention comprises the following steps: a) bringing into contact at least one antibody having an affinity for a ddNTP derivative of the invention , with a sample capable of containing said nucleoside triphosphate or an analog thereof, optionally in the presence of a labeled tracer. b) separation of the complex formed by the antibody having an affinity for said ddNTP derivative linked to said ddNTP derivative of said free ddNTP derivative, c) measuring the ratio between the amount of ddNTP derivative linked by the antibody versus the unbound ddNTP derivative .
  • the tracer is chosen from a derivative of the nucleoside to be detected comprising a motif capable of being labeled, chosen from a motif comprising a tyrosine, a histidine or any amino acid or group having an amide function, preferably capable of introducing a radioactive element or capable of being so, such as for example the Bolton-Hunter reagent.
  • a particularly preferred tracer comprises a dipeptide motif Tyr-Lys or a motif Lys-Tyr.
  • the tracer can be labeled using an enzyme, a chromophore, a dye, a fluorophore, a particle, such as a metallic or magnetic particle, a pigment or a radioactive atom.
  • the invention finally relates to the use of the method for assaying a ddNTP derivative according to the invention for the assay of a ddNTP derivative in a biological sample.
  • the assay of the ddNTP derivative is carried out in a biological fluid.
  • Said biological fluid can be blood, plasma, serum, cerebrospinal fluid (CSF), urine, lymph, saliva.
  • CSF cerebrospinal fluid
  • the assay of the ddNTP derivative is carried out in a biological sample comprising cells.
  • the assay for the ddNTP derivative is an assay of the histological type on a section of tissue, such as the ganglionic tissue or on a spread of cells. The visualization of the direct or indirectly labeled antibody then makes it possible to observe the localization and the distribution of the ddNTP derivative in the target tissue.
  • fixatives can be of several types such as succinic anhydride vapors, paraformaldehyde, glutaraldehyde or carbodiimides.
  • the method for assaying a ddNTP derivative of the invention is applicable to the assay of said derivatives in a patient who has undergone antiviral therapy with nucleoside analogs, in particular in the context of anti-HIV therapies, but it can also be used for the assay of a ddNTP derivative formed in an individual subjected to anti-cancer treatments which also use nucleoside derivatives as active agents.
  • the invention is illustrated with the aid of experimental work which describes the implementation of the invention for a nucleoside analog, ddATP.
  • FIG. 1 represents the determination of the nature of the immunoreactive material present in the culture supernatant by chromatography on an anionic cartridge and radioimmunological detection
  • FIG. 2 represents the determination of the nature of the immunoreactive material present in the cells, purified by chromatography on an anionic cartridge and detected by RIA,
  • FIG. 3 shows the characterization of the immunoreactive material present in a cell extract by chromatography on an anionic cartridge Sep Pak and radioimmunological detection
  • FIG. 4 shows the immunoreactivity profile of the fractions probably corresponding to ddAMP and ddADP before and after dephosphorylation.
  • FIG. 5 shows the analog ddATP and an isostere thereof in which the triphosphate group is substituted by the citrate group to lead to 5'- 0- (3, 4-dicarboxy-3-hydroxy) butanoate-2 ' , 3 '-dideoxyadenosine.
  • FIG. 6 illustrates the molecular modeling which confirms that the molecule resulting from the coupling of 2-hydroxy-2,3-allyloxycarbonylbutanoic acid at the 5 ′ position of ddA has structural and electronic characteristics close to those of ddATP.
  • - Figure 7 shows a diagram of obtaining the allyl diester of citric acid 5 in four stages.
  • - Figure 8 shows the coupling of ddA to 2-hydroxy-2,3-allyloxycarbonylbutanoic acid in the presence of dicyclohexylcarbodiimide (DCC) and l-hydroxy-7-azabenzotriazole (HOAt) in tetrahydrofuran for preparation of 5 '-O- ((3, 4-diallyloxycarboxy1) -3- hydroxy) butanoate-2', 3 '-dideoxyadenosine.
  • DCC dicyclohexylcarbodiimide
  • HOAt l-hydroxy-7-azabenzotriazole
  • FIG. 9 illustrates the characteristics of anti-isostere antibodies to ddATP in RIA test with the tracer dd-A-HS- (Y * -K).
  • FIG. 9a illustrates the ratio of bound antigen versus free antigen as a function of the final dilutions of the antibodies and makes it possible to determine the titer of said antibodies.
  • FIG. 9b shows the analysis of the specificity of the anti-isostere antibody of ddATP.
  • the applicant has developed a dosage of 2 ', 3' -dideoxyadenosine-5 '- triphosphate or ddATP, active metabolite of ddl used as agent antiviral, by producing antibodies directed against an isosteric molecule, derived from ddATP, having structural and electronic analogies with it.
  • nucleoside triphosphate isosteres as potential inhibitors of HIV reverse transcriptase
  • the preparation of 2-hydroxy-2, 3-allyloxycarbonylbutanoic acid is carried out in 4 stages: a) the formation of oxalactone 1 by treatment of citric acid with paraf ormaldehyde, b) cyclization of the diacid 2 in anhydride 3 by exchange with acetic anhydride. c) obtaining the allyl monoester 4 by opening the anhydride 3 with allyl alcohol. d) obtaining the allylic diester of citric acid 5 by opening the lactone and hydrolyzing the methylene dioxy (FIG. 7).
  • the Applicant has thus improved the conditions for coupling ddA to 2-hydroxy-2, 3-allyloxycarbonylbutanoic acid by carrying out this coupling in the presence of dicyclohexylcarbodiimide (DCC) and 1-hydroxy-7-azabenzotriazole (HOAt) in the tetrahydrofuran for lead to the formation of 5'-0- ((3,4-diallyloxycarboxyl) -3-hydroxy) butanoate-2 ', 3' -dideoxyadenosine ( Figure 8).
  • DCC dicyclohexylcarbodiimide
  • HOAt 1-hydroxy-7-azabenzotriazole
  • Coupling to a carrier protein involves the activation of one or more carboxylate groups of the hapten.
  • L 1 activation of this carboxylate is carried out either with an alkyl chloroformate (generally ethyl chloroformate) or an alkyl chlorocarbonate or a carbodiimide in the presence of N-hydroxysuccinimide for increasing the coupling efficiency to carrier protein.
  • alkyl chloroformate generally ethyl chloroformate
  • an alkyl chlorocarbonate or a carbodiimide in the presence of N-hydroxysuccinimide for increasing the coupling efficiency to carrier protein.
  • nucleosides having a carboxylate group activation of the latter can be carried out with the reagents previously described.
  • an chloroformate or an alkyl chlorocarbonate the activation reaction induces the release of hydrochloric acid in the reaction medium.
  • the glycosidic bond of the nucleosides is sensitive to the acid medium. It is therefore important to trap this acid by adding a base to the reaction medium, for example triethylamine.
  • a base for example triethylamine.
  • the molar ratio between carrier molecule and hapten is an important parameter which makes it possible to obtain a conjugate where the incorporation rate of the hapten is high enough to induce a maximum immune response leading to the stimulation and activation of the immunocompetent clones.
  • . “Cupo A. et al. (1984) "Quantitation and localization of Met-enkephalin-Arg-Gly-Leu in rat brain using highly sensitive antibodies”.
  • the immune sera were obtained by immunization of 2 albino rabbits (Combes breeding center, Ain, France).
  • the immunogen is administered to the animal by the intradermal route, but it can also be administered by the subcutaneous, intramuscular or intraperitoneal routes at a rate of 500 ⁇ g of immunogens per immunization and per diluted rabbit. half with full Freund's adjuvant.
  • immunizations were performed as a booster every three weeks over a period of four months. The bleeding was done ten days after each booster in a heparin tube to avoid blood clotting. After centrifugation, the plasma is collected and stored at -20 ° C.
  • Antibodies with an affinity for ddNTPs derivatives can be identified by immunological techniques, either using enzyme-linked immunosorbent assays or radioimmunological assays (RIA). The antibodies obtained were characterized by radioimmunoassay using as tracer 5'-0- hemisuccinate-2 ', 3' -dideoxyadenosine coupled to the dipeptide Tyrosyl-Lysine radiolabelled with iodine 125.
  • IC 50 (M) affinity or sensitivity
  • ni not immunoreactive up to concentrations of 10 "3 M.
  • the separation by anionic chromatography of the various phosphorylated metabolites derived from the cellular metabolism of ddl is carried out on an Sep Pak anionic cartridge using a step gradient using different concentrations of KC1 (6 ml KC1 50 mM, 10 ml KC1 100 mM and 6 ml 250 mM).
  • the immunoassay of ddATP involves the separation of the latter from the other phosphorylated metabolites of ddA using a KC1 gradient. Consequently, we have checked that the concentrations of KC1 used and even much higher (up to 2.5 M) do not inhibit the antigen-antibody interaction.
  • Monoclonal antibodies against each nucleoside analog were prepared by fusion of spleen cells from immunized animals with the corresponding immunogens, followed by immortalization of stimulated cells, secreting antibodies, using fusion with mouse yelomatous lines. This merger is followed by a selection of the hybrid clones secreting the antibodies which exhibit an affinity for the said nucleoside analog.
  • myeloma lines such as X63ag 8, SP2, NS, Y3 can be used, according to the technique described by Kohler G. and Milstein C. (1975) "Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity". Nature. 1975 Aug 7; 256 (5517): 495-7, as well as the protocols described in CUPO A. and KALDY P. (1987) "Monoclonal antiidiotypic antibodies which recognized the binding site of delta receptor: fine specificity of the antiidiotypic antibodies". in “Progress in opioids Research” J.W. Holaday, P. Y. Law and A. Herz eds. Nida (Rockville, Maryland, USA) pp 25-28. and CUPO A., et al .. (1992) "Monoclonal antiidiotypic antibodies against ⁇ opioid receptors as an electron microscopy probe". Eur. J. Cell. Biol. 57, 273-284.
  • V Intracellular determination of ddATP. Validation on an in vitro cell model.
  • the antibodies thus obtained were used for the implementation of immunoassays applied for the intracellular assay of the active forms of the nucleosides, in particular in human monocytes of the peripheral blood where they are present at very low concentrations.
  • the immunoreactivity, present in the supernatant, is expressed in equivalents (eq.) Ddl established with respect to a reference curve ddl and illustrated in table 2 below.
  • the ddATP immunoreactivity corresponds to the sum of the immunoreactivities present in fractions 32-37 resulting from the separation of the intracellular content on an anionic Sep Pak cartridge. It is expressed in ddATP equivalents with respect to a ddATP reference curve and also illustrated in Table 2 below.
  • DdATP is present in fractions 32-37 corresponding to the elution volume of standard ddATP.
  • the amount of ddATP detected in these fractions after dephosphorylation represents 93% of the amount of ddATP before treatment.
  • fractions 24 to 26 and fractions 27 to 30 are fractions whose immunoreactivity is greatly increased after treatment with acid phosphatase, indicating that they contain the ddA motif releasable by the enzymatic treatment.
  • the increase in immunoreactivity by a factor of 5 could reflect the crossing factor which exists between the mono- and diphosphorylated analogs with respect to ddATP.
  • the plasma concentrations determined in the 4 patients are relatively comparable and vary from 2 to 6.10 -6 M. They are illustrated in Table 3 below.
  • Each cell sample was processed as follows. After lyophilization, the cell extract is taken up in 1 ml of distilled water. 100 ⁇ l are subjected to treatment with acid phosphatase and the ddA content is determined. 200 ⁇ l will be reserved for direct dosing and without purification on a cartridge. The remaining 700 ⁇ l are subjected to chromatography on an anionic Sep Pak cartridge under the elution conditions described above. 500 ⁇ l fractions are collected. Each fraction is diluted 1.6 times with distilled water and then fractionated in two. 400 ⁇ l will be used for direct dosing, 400 ⁇ l will be dephosphorylated using acid phosphatase in the presence of 1 M sodium acetate at 37 ° C for 30 minutes. The results of the direct and indirect gross assays are presented in summary table 6.
  • the immunoreactivity in ddATP equivalent is mainly at the level of fractions 24-31, 32-39 and 42.
  • the summary table 6 below illustrates the results of the intracellular assays after purification, on an anionic cartridge, of the products derived from the cellular metabolism of ddl.
  • ddATP was undoubtedly detected in 4 patients. In one patient, no phosphorylated form of ddA was detected, while in 2 of 4 patients, only the mono- and diphosphorylated forms were detected. It is likely that in these patients, either ddATP is not yet synthesized, or the kinases involved in the third stage of phosphorylation are deficient.
  • the repeated dosing at regular intervals in patients will correlate the variations in the intracellular concentration of ddATP observed with the indications on the progress of HIV infection, on previous treatments and on the therapeutic escape. possible and will allow for better therapeutic monitoring.
  • the embodiments of the invention show that the immunological assay of the nucleoside analogues, object of the present invention with the antibodies also prepared according to a method used in the context of the invention can be used for the quantification of all phosphorylated metabolites of ddA.

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Abstract

La présente invention concerne l'utilisation d'analogues de nucléosides comportant un groupement citrate pour l'obtention d'immunogènes aptes pour la production d'anticorps ayant une affinité pour des nucléosides triphosphorylées. Elle concerne également les applications des anticorps ainsi obtenus pour la mise en oeuvre des méthodes immunologiques sensibles de dosage desdits dérivés nucléosidiques triphosphorylés.

Description

UTILISATION DE DERIVES DE NUCLEOSIDES COMPORTANT UN GROUPEMENT CITRATE POUR LA PRODUCTION D'ANTICORPS AYANT UNE AFFINITE POUR DES NUCLEOSIDES TRI-PHOSPHORYLES
La présente invention concerne l'utilisation d'analogues de nucléosides comportant un groupement citrate pour la production d'anticorps ayant une affinité pour des nucléosides triphosphorylées.
Dans le cadre de la présente invention on entend par :
- nucleoside naturel : une molécule constituée par l'association d'une base purigue (adénine ou guanine) ou pyrimidique (cytosine , uracile et thymine) avec un résidu pentose (béta-D-ribofuranose ou béta-D-deoxyribofuranose) .
- analogue nucléosidique (ddNs): toute molécule composée d'une base modifiée ou non, couplée à un ribose ou à un analogue de celui-ci. Des tels analogues sont par exemple décrits dans le document :Périgaud, C. et al. Nucléosides and Nucleotides 1992, vol. 11(2-4), pages 903-945).
Ainsi par rapport à un nucleoside naturel, un analogue peut comporter des modifications de la molécule du ribose, comme par exemple celles mentionnées page 607 du document précité, telles que la substitution d'un ou plusieurs atomes, le déplacement de la liaison entre la base et le sucre, des inversions anomériques (béta-alpha) , l'addition de fonctions diverses, l'inversion, substitution ou élimination de groupements hydroxyles, la modification de la taille du cycle (pyranose), l'inversion de la configuration (D—L) ou encore la rupture du cycle ( acyclonucléosides ) ou des modifications de la base hétérocyclique comme par exemple celles indiquées page 908 dudit document, pour les analogues -Fura, FdUrd, Thi-Gua, 6- MP, AraC ou Fludarabine phosphate.
Dans le cadre de la présente invention, le terme nucleoside employé dans le texte désigne indistinctement un nucleoside naturel ou un analogue nucléosidique tels que ci- dessus définis.
Certains nucléosides sont couramment employés en tant qu'agents anti-viraux ou en tant qu'agents anticancéreux et on connaît qu'ils doivent être métabolisés en leur forme triphosphorylée pour pouvoir exercer une activité inhibitrice antivirale ou anticancéreuse.
Dans le cadre des traitements anti-viraux et notamment dans les thérapies anti-VIH, il est important de quantifier ces formes triphosphorylées des analogues nucléosidiques .
Ainsi, dans le but de quantifier la forme active des analogues nucléosidiques, il est essentiel d'utiliser des méthodes de dosage sensibles et spécifiques desdits nucléosides triphosphorylés, ci-après désignés ddNTPs.
Un des facteurs déterminants de l'échec thérapeutique des traitements anti-VIH s ' expliquerait par une altération du métabolisme cellulaire pour les nucléosides ( ddNs ) , ce qui entraînerait une concentration insuffisante de la molécule active dans le milieu intracellulaire, cause majeure des échappements thérapeutiques. Par conséquent, un des moyens d'appréhender l'échappement thérapeutique serait la détermination de la concentration intracellulaire de ces molécules (nucléosides triphosphorylés et antiprotéases) par dosages immunologiques. Le suivi thérapeutique, des patients ou TDM (Therapeutic Drug Monitoring) peut être alors envisagé pour optimiser l'administration de ces molécules en proposant des traitements personnalisés mais aussi permettre d'évaluer les associations.
Le catabolisme très important des antiprotéases par les enzymes hépatiques et intestinales ainsi que les mécanismes d'efflux conduisent à administrer des doses d' antiviraux très importantes aux malades pouvant générer des effets secondaires redoutables.
En ce qui concerne les analogues nucléosidiques, le problème est différent. Les doses administrées sont là aussi importantes car imposées par la pénétration limitée du nucleoside précurseur dans les cellules. Les différents métabolites phosphoryles du médicament affecteront tout aussi bien les polymérases virales que cellulaires. La toxicité des catabolites du médicament viendra se surajouter à la non- spécificité des analogues nucléosidiques. Dans ce contexte, le traitement anti-VIH, à cause des quantités élevées d' antiviraux administrées aux malades, affectera un grand nombre de compartiments cellulaires y compris ceux qui sont réservés à la différentiation des cellules souches induisant ainsi les effets secondaires qui rendent les traitements anti-VIH si contraignants et inconfortables. Ainsi les taux plasmatiques et intracellulaires des molécules anti-VIH, utilisées le plus souvent en association, sont le reflet direct du métabolisme de l'organisme entier. La bonne connaissance des taux plasmatiques et intracellulaires des molécules anti-VIH est essentielle et diffère d'un individu à l'autre et d'un moment à l'autre de la maladie.
La mesure de ces paramètres permettrait aux cliniciens de déterminer les conséquences des associations, d'en optimiser leur utilisation et d'en adapter la posologie en fonction du malade et de l'évolution de sa maladie. Il est essentiel pour le clinicien d'avoir accès à la mesure du contenu intracellulaire qui est en étroite relation avec la concentration plasmatique et la charge virale. Cette dernière a un impact direct sur l'échappement thérapeutique.
Des méthodes de dosages intracellulaires des dérivés nucléosidiques ont été développées, Robbins, BL, et al. (1996) "Quantification of intracellular zidovudine phosphates by use of combined cartridge-radioimmunoassay methodology". Antimicrob. Agents Chemother. 40, 2651-2654.; Goujon, L. et al. (1998) "Monitoring of intracellular levels of 5 ' -monophosphate-AZT using an enzyme immunoassay" . J . Immunol. Methods, 218, 19-30.; Robbins, BL. et al. (1998) A. "Development of a new cartridge radioimmunoassay for détermination of intracellular levels of lamivudine triphosphate in the peripheral blood mononuclear cells of human immunodeficiency virus) infected patients". Antimicrob. Agents Chemother. 42, 2656-2660.).
Mais ces méthodes n'offrent pas des performances suffisantes du point de vue de la sensibilité du test, nécessaires notamment pour détecter les faibles concentrations des analogues nucléosidiques présents dans les compartiments cellulaires et disponibles dans des échantillons de faible taille.
La présente invention a pour objet des méthodes de quantification des analogues nucléosidiques, permettant de pallier les inconvénients des dosages existants desdits composés, qui sont utilisés par exemple, en tant que composés antiviraux Les méthodes de quantification des nucléosides au moyen de dosages immunologiques mis en œuvre dans la présente invention présentent de nombreux avantages en termes de sensibilité et de rapidité car tant le temps de préparation des échantillons comme celui du dosage lui-même sont considérablement réduits.
Ils sont de plus, applicables à un grand nombre d'échantillons de taille réduite, tant en volume qu'en nombre de cellules. Ils constituent une méthode de quantification réalisable en mélange complexe, sensible, adaptée aux concentrations intracellulaires faibles, rapide et adaptée au suivi de patients en milieu hospitalier.
II existe peu de travaux prenant en compte le métabolisme intracellulaire des nucléosides en raison de l'instabilité des dérivés triphosphorylés du fait que les liaisons pyrophosphates sont sensibles à l'hydrolyse et rapidement dégradées.
Bien qu'il existe pour les nucléosides une méthode de mesure par HPLC et EC (électrophorèse capillaire). Elle reste cependant difficilement applicable pour le suivi thérapeutique des patients. Cette dernière nécessitant une préparation minutieuse des échantillons, implique un temps d'analyse long et un volume sanguin important pour permettre le dosage des taux intracellulaires faibles. D'autre part, les coûts de l'investissement nécessaire à l'achat de l'appareillage et du fonctionnement de ce dernier, tels que les solvants ou les colonnes, représentent un inconvénient majeur pour les laboratoires et les hôpitaux.
En ce qui concerne les dérivés phosphoryles des analogues nucléosidiques, il n'existe pas de méthode de dosage chromatographique. En revanche, il existe des méthodes immunologiques mais elles sont indirectes et nécessitent plusieurs étapes, entre autres, la purification des métabolites phosphoryles, la déphosphorylation enzymatique, ou encore l'élimination des sels et réactifs. (Robbins, BL, et al. (1996) "Quantification of intracellular zidovudine phosphates by use of combined cartridge-radioimmunoassay methodology". Antimicrob. Agents Chemother. 40, 2651-2654.; Goujon, L. et al. (1998) "Monitoring of intracellular levels of 5 ' '-monophosphate -AZT using an enzyme immunoassay" . J. Immunol. Methods, 218, 19-30.; Robbins, BL. et al. (1998) A. "Development of a new cartridge radioimmunoassay for détermination of intracellular levels of lami vudine triphosphate in the peripheral blood mononuclear cells of human immunodeficiency virus) infected patients". Antimicrob. Agents Chemother. 42, 2656-2660).
Par ailleurs, certaines méthodes envisagées pour obtenir de tels anticorps, par exemple, des anticorps dirigés contre l'AZT-TP, en utilisant comme i munogène un dérivé de l'AZT-TP dans lequel on a substitué les liaisons anhydride phosphorique par des liaisons méthylènephosphonate (ou P-CH2- P), le groupement méthylène-bis-phosphonate (P-CH2-P-CH2-P) possède des caractéristiques structurales voisines de celles du groupement pyrophosphate (P-O-P-O-P) puisque l'angle des liaisons anhydride phosphorique (P-O-P) est de 130°, celui de la liaison méthylènephosphonate est de 117°; la longueur des liaisons P-0 est de 1,61Â, et celle des liaisons P-C est de 1,79 A. (Saady et al. (1995), "First synthesis of fully deprotected diimidotriphosphoric acid and derivatives designed for the synthesis of « PNPNP » nucleotides and dinucleotides" .J.Org.Chem. vol 60, pp 3685-3691).
Cependant, l'affinité des différents anticorps dirigés contre cet analogue méthylène-bis-phosphonate de l'AZT-TP obtenus, n'est pas suffisante vis-à-vis de la molécule d'AZT-TP à doser pour permettre sa quantification, d'autant plus que les quantités intracellulaires des nucleotides sont extrêmement faibles et que le volume de l'échantillon à doser est également réduit.
Un objectif de la présente invention est donc la préparation d'anticorps pour le dosage des dérivés ddNTPs, les reconnaissant avec une affinité suffisante pour permettre leur quantification intracellulaire.
De plus, ces anticorps ne devront pas reconnaître les nucleotides endogènes.
Pour atteindre ce but, la demanderesse a mis au point des immunogènes, susceptibles d'induire une réponse im une chez des mammifères, préparés à partir d'analogues de nucléosides présentant non seulement une analogie structurale, mais également une analogie électronique avec la molécule à doser pour l'immunisation de mammifères, appelés ci-après des isostères.
De tels isostères de nucléosides triphosphates ont déjà été décrits, par exemple pour la conception d'un inhibiteur de la transcriptase inverse. ( eaver, R and Gilbert, IH. (1997) "The design and synthesis of nucleoside triphosphate isostere as potential inhibitors of HIV reverse transcriptase " . Tetrahedron, vol.53, 5537-5562.; Weaver, R, et al. (1996) " Isosteres of nucleoside triphosphate "s. Bioorg. Med. Chem. Lett. Vol. 6, 2405-2410.
Un premier objet de la présente invention est donc l'utilisation desdits isostères de nucléosides triphosphates de préférence, des isostères dans lesquels leur groupement phosphate a été remplacé par le groupement citrate, pour la préparation d'immunogènes par couplage desdits isostères sur des molécules porteuses.
L'avantage de cette approche consiste en ce que l'on obtient une meilleure détection de la molécule triphosphorylée car l'anticorps a été produit contre une molécule isostère présentant des analogies structurales et électroniques avec ledit dérivé triphosphorylé et ressemblant d'avantage à celui-ci.
L'immunisation de cellules immunocompétentes de vertébrés, notamment de mammifères, a en effet, permis d'obtenir des anticorps ayant une affinité adaptée aux dosages des dérivés ddNTPs y compris lorsque ceux-ci ne sont présents qu'à des très faibles doses.
L'invention concerne donc un immunogène comportant un dérivé citrate d'un nucleoside ou d'un analogue de nucleoside couplé à une molécule porteuse.
De préférence ledit nucleoside ou analogue est choisi parmi le groupe comprenant: Acyclovir, Adénosine, S- Adenosyl-L-methionine, 2 ' , 3 ' -didéoxyadénosione (ddA) , 2 ' , 3 ' - didehydro-2 ' ,3 ' -didéoxythymidine (d4T), 2 * , 3 ' -dideoxy-3 ' - thiacytidine (3TC), 3'- Azido-3 ' -deoxythymidine (AZT), Carbovir, Cordycepine, Cytidine, Cytosine-b-D-arabinoside, Deoxycytidine, Deoxytubercidine, 2 ' -Deoxyuridine, Formycine A, Formycine B, Ganciclovir, Guanosine, Inosine, Puromycine, Ribavirine, Sangiva ycine, Thymidine, Tubercidine, Uridine, Abacavir, 3-fluoro-2 ', 3 '.-didéoxythymidine (FLT), Fura, FdUrd, Thi-Gua, 6-MP, AraC ou Fludarabine phosphate. Ainsi que des produits anti-cancéreux antimétaboliques tels que :
Les analogues des bases puriques : 6-mercaptopurine, cladribine, fludarabine. - Les analogues des bases pyrimidiques :
5-fluoro-uracile, cytarabine, gemcitabine, Tenofovir.
En tant que molécule porteuse on peut utiliser toute molécule de haut poids moléculaire, de préférence comprise entre 50000 et 500000 daltons, capable d'induire une réponse immune. De préférence, la molécule porteuse est choisie parmi une protéine, un polypeptide phylogenétiquement éloignés de l'espèce animale utilisée pour l'immunisation, ou un polysaccharide.
Tout préférentiellement la molécule porteuse est une protéine choisie parmi le groupe comprenant l'ovalbumine, le sérum albumine bovine, 1 'hémocyanine de patelle, la thyroglobuline, des immunoglobulines , la caséine, l'hémoglobine, des toxines bactériennes, telles que la sous- unité B de la toxine du choléra, la toxine tétanique, la toxine diphtérique, de lectines telles que la sous-unité B de la ricine.
L'invention a également pour objet l'utilisation des immunogènes, ci-dessus définis pour obtenir des anticorps spécifiques des nu cléosides-citrate ou des dérivés nucléosides-citrate utilisés pour l'immunisation.
L'invention a également pour objet l'utilisation des immunogènes ci-dessus définis pour obtenir des anticorps, ayant une affinité pour ledit dérivé ddNTP. Un autre objet de l'invention concerne un procédé d'obtention d'un anticorps ayant une affinité pour ledit dérivé ddNTP.
Il peut s'agir d'anticorps polyclonaux, un tel premier procédé comprend alors les étapes suivantes : a) l'immunisation d'un animal, avec au moins un immunogène de l'invention, b) la purification des anticorps polyclonaux produits .
L'animal immunisé à l'étape (a) est de préférence un mammifère non humain, un rongeur notamment un rat ou une souris, une chèvre, un lapin ou une poule et la purification des anticorps de l'étape (b) peut s'effectuer à partir du sang de l'animal immunisé ou à partir du jaune d'oeuf dans le cas de la poule.
Il peut s'agir d'anticorps monoclonaux, un tel second procédé comprend alors les étapes suivantes : a) l'immunisation de cellules immunocompétentes d'un animal, avec au moins un immunogène de l'invention, b) l'immortalisation des cellules sécrétant des anticorps ayant une affinité pour ledit dérivé ddNTP au moyen d'une fusion cellulaire des cellules de l'animal immunisées à l'étape (a), avec une lignée cellulaire de fusion, c) l'identification et la sélection des clones hybrides immortalisés, hybridomes, sécrétant lesdits anticorps ayant une affinité pour ledit dérivé ddNTP, d) la purification des anticorps produits par lesdits hybridomes.
Selon des mises en œuvre particulières de ce second procédé, les cellules immunocompétentes d'un animal, par exemple, des cellules de la rate ou des ganglions lymphatiques dudit animal, sont immunisées soit in vivo soit in vitro.
De préférence, la lignée de fusion, utilisée à l'étape (b) du second procédé est choisie parmi une lignée myélomateuse de souris, une lignée myélomateuse de rat ou encore des lignées permettant la préparation des hétérohybrides .
L'invention concerne également les hybridomes ainsi obtenus, susceptibles de synthétiser et de sécréter des anticorps monoclonaux ayant une affinité par un dérivé ddNTP.
L'invention a aussi pour objet un anticorps spécifique des isostères nucléoside-citrate et en particulier un anticorps anti-nucléoside-citrate reconnaissant au moins un immunogène de l'invention.
L'invention concerne aussi un anticorps ayant une affinité pour un dérivé ddNTP obtenu par l'un quelconque des procédés d'obtention d'anticorps décrits ci-dessus.
De préférence, l'affinité des anticorps de l'invention par le dérivé ddTP contre lequel ils ont été préparés, définie par son IC50, est supérieure à 10"7, tout pré érentiellement supérieure à 10"9 et tout préférentiellement supérieure à 10"10.
L'IC 50 est définie par la concentration d'antigène non marqué capable d'inhiber 50 % de la liaison antigène-anticorps. L'IC 50 est un bon reflet de l'affinité. L'affinité est déterminée par la méthode de Scatchard.
La présente invention concerne également un fragment d'anticorps ayant une affinité pour un dérivé ddNTP comprenant au moins une partie variable d'une molécule d'un anticorps ayant la même affinité pour ledit dérivé ddNTP que ladite molécule d'anticorps non fragmentée.
De tels fragments sont par exemple des fragments Fv, Fab, Fab', F(ab)2, F(ab')2, qui peuvent être obtenus par digestions enzymatiques ou par clivages chimiques à partir des anticorps non-frag entés, par des techniques connues de 1' homme du métier.
L'invention a également pour objet des immunoglobulines recombinantes, leurs chaînes lourdes et/ou légères ou des fragments de celles-ci que l'on peut obtenir en recombinant des acides nucléiques isolés codant pour les chaînes lourdes et/ou légères ou des fragments fonctionnels de celles-ci, des anticorps monoclonaux décrits ci-dessus, en exprimant lesdites acides nucléiques recombinés dans un hôte cellulaire procaryote tel qu'E.coli ou dans un hôte eucaryote tel que les levures ou encore dans une cellule de mammifère.
L'invention a également pour objet un procédé de dosage immunologique de dérivés triphosphorylés nucléosidiques .
Ces dérivés triphosphorylés sont formés notamment lors du métabolisme des nucléosides utilisés dans les thérapies anti-virales et en particulier des thérapies anti- VIH, mais aussi lors des traitements anticancéreux.
Des tels dérivés triphosphorylés sont par exemple des dérivés triphosphorylés d'AZT, F3dThd, IdUrd, AraA, virazole, acyclovir, DHPG ou ganciclovir, d4T, 3TC, ddA, et le dérivé diphosphorylé du Tenofovir. Ce procédé de dosage immunologique du dérivé nucléosidique triphosphorylé au moyen des anticorps ayant une affinité pour ledit dérivé permet le dosage d'un grand nombre d'échantillons. Grâce à sa sensibilité, il ne nécessite pas un volume d'échantillon important. En effet, la Demanderesse a pu quantifier in vitro le dérivé triphosphorylé ddATP dans 106 à 4xl06 CMSP préalablement incubées avec des concentrations variables de ddl (10~7 à 10"9M) .
Selon un mode de réalisation préféré, dans la mesure où ces anticorps détectent le dérivé triphosphorylée, la méthode de dosage de nucléosides triphosphorylés selon l'invention permet de s'affranchir des étapes supplémentaires nécessaires dans les autres méthodes, telles que la dégradation enzymatique ou la purification sur cartouche Sep- Pa C18
Selon un mode de mise en œuvre préféré, le procédé de dosage d'un dérivé ddNTP selon l'invention comporte les étapes suivantes : a) la mise en contact d'au moins un anticorps ayant une affinité pour un dérivé ddNTP de l'invention, avec un échantillon susceptible de contenir ledit nucleoside triphosphate ou un analogue de celui-ci, éventuellement en présence d'un traceur marqué. b) la séparation du complexe formé par l'anticorps ayant une affinité pour ledit dérivé ddNTP lié audit dérivé ddNTP dudit dérivé ddNTP libre, c) la mesure du rapport entre la quantité de dérivé ddNTP lié par l'anticorps versus le dérivé ddNTP non lié.
De préférence le traceur est choisi parmi un dérivé du nucleoside à détecter comportant un motif susceptible d' être marqué, choisi parmi un motif comprenant une tyrosine, une histidine ou tout acide aminé ou groupement possédant une fonction amide, de préférence susceptible d'introduire un élément radioactif ou susceptible de l'être, tel que par exemple le réactif de Bolton-Hunter.
Un traceur particulièrement préféré comporte un motif dipeptidique Tyr-Lys ou un motif Lys-Tyr.
Le traceur peut être marqué au moyen d'une enzyme, un chromophore, un colorant, un fluorophore, une particule, comme une particule métallique ou magnétique, un pigment ou un atome radioactif.
L'invention concerne enfin l'utilisation du procédé de dosage d'un dérivé ddNTP selon l'invention pour le dosage d'un dérivé ddNTP dans un échantillon biologique.
Selon un premier mode de réalisation, le dosage du dérivé ddNTP est effectué dans un fluide biologique.
Ledit fluide biologique peut être du sang, du plasma, du sérum, du liquide céphalorachidien (LCR), des urines, de la lymphe, de la salive.
Selon un deuxième mode de réalisation, le dosage du dérivé ddNTP est effectué dans un échantillon biologique comprenant des cellules.
De préférence lesdites cellules sont des lymphocytes, des monocytes périphériques, des cellules de Langehrans, des cellules dendritiques , des cellules présentatrices, des cellules souches, des adipocytes, des cellules immunitaires, éventuellement triées, telles que des cellules CD4+ ou CD8+. Selon un troisième mode de réalisation, le dosage du dérivé ddNTP est un dosage de type histologique sur une coupe de tissu, tel que le tissu ganglionnaire ou sur un étalement de cellules. La visualisation de l'anticorps direct ou indirectement marqué permet alors d'observer la localisation et la distribution du dérivé ddNTP dans le tissu cible.
La révélation des antiviraux se fait alors après fixation des cellules par différents réactifs visant à immobiliser les molécules à révéler au site cellulaire où ils sont localisés. Ces fixateurs peuvent être de plusieurs types comme les vapeurs d'anhydride succinique, le paraformaldéhyde, la glutaraldéhyde ou les carbodiimides.
Le procédé de dosage d'un dérivé ddNTP de l'invention est applicable au dosage desdits dérivés chez un patient ayant fait l'objet d'une thérapie antivirale avec des analogues nucléosidiques, notamment dans le cadre des thérapies anti-VIH, mais il peut être également utilisé pour le dosage d'un dérivé ddNTP formé chez un individu soumis à des traitements anti-cancéreux qui utilisent aussi des dérivés nucléosidiques en tant qu'agents actifs.
L'invention est illustrée à l'aide des travaux expérimentaux qui décrivent la mise en œuvre de 1 ' invention pour un analogue nucléosidique, le ddATP.
Bien entendu, il est possible d'adapter cette méthodologie pour la production d'anticorps susceptibles de détecter n'importe quel analogue nucléosidique triphosphorylé et de concevoir un procédé de dosage immunologique les mettant en œuvre. Cet exemple, non limitatif, de mise en œuvre de l'invention, concernant le dérivé ddATP et détaillé ci-après et à l'aide des figures en annexe dans lesquelles :
- la figure 1 représente la détermination de la nature du matériel immunoreactif présent dans le surnageant de culture par chromatographie sur cartouche anionique et détection radioimmunologique,
- la figure 2 représente la détermination de la nature du matériel immunoreactif présent dans les cellules, purifié par chromatographie sur cartouche anionique et détecté par RIA,
- la figure 3 montre la caractérisation du matériel immunoreactif présent dans un extrait cellulaire par chromatographie sur cartouche anionique Sep Pak et détection radioimmunologique,
- la figure 4 montre le profil d' immunoréactivité des fractions correspondant probablement au ddAMP et ddADP avant et après déphosphorylation.
- la figure 5 montre l'analogue ddATP et un isostère de celui-ci dans lequel le groupement triphosphate est substitué par le groupement citrate pour conduire au 5'- 0- ( 3, 4-dicarboxy-3-hydroxy)butanoate-2 ' , 3 ' -didésoxyadénosine . la figure 6 illustre la modélisation moléculaire qui confirme que la molécule résultante du couplage de l'acide 2-hydroxy-2,3-allyloxycarbonylbutanoïque sur la position 5' de la ddA possède des caractéristiques structurales et électroniques voisines de celles du ddATP.
- la figure 7 montre un schéma de l'obtention du diester allylique de l'acide citrique 5 en quatre étapes. - la figure 8 montre le couplage de la ddA à l'acide 2-hydroxy-2,3-allyloxycarbonylbutanoïque en présence de dicyclohexylcarbodiimide (DCC) et de l-hydroxy-7- azabenzotriazole (HOAt) dans le tétrahydrofurane pour la préparation du 5 ' -O- ( ( 3 , 4-diallyloxycarboxy1 ) -3- hydroxy)butanoate-2 ' , 3 ' -didésoxyadénosine .
- la figure 9 illustre les caractéristiques des anticorps anti-isostère du ddATP en test RIA avec le traceur dd-A-HS-(Y*-K) . La figure 9a illustre le rapport antigène lié versus antigène libre en fonctions des dilutions finales des anticorps et permet de déterminer le titre desdits anticorps. La figure 9b montre l'analyse de la spécificité de l'anticorps anti-isostère du ddATP.
PARTIE EXPERIMENTALE
Dans le cadre des travaux expérimentaux réalisés lors de la mise en œuvre de l'invention, la demanderesse a mis au point un dosage du 2 ' , 3 ' -didésoxyadénosine-5 ' - triphosphate ou ddATP, métabolite actif de la ddl utilisée comme agent antiviral, en produisant des anticorps dirigés contre une molécule isostère, dérivée du ddATP, possédant des analogies structurales et électroniques avec celle-ci.
I. Préparation du dérivé 5 ' -0-( 3, 4-dicarboxy-3- hydroxy ) butanoate-2 ' , 3 ' -didésoxyadénosine .
Dans cet analogue du ddATP, le groupement triphosphate est substitué par le groupement citrate pour conduire au 5 ' -0-(3,4-dicarboxy-3-hydroxy)butanoate-2 ' ,3 ' - didésoxyadénosine (Figure 5)
La modélisation moléculaire confirme que la molécule résultante du couplage de l'acide 2-hydroxy-2,3- allyloxycarbonylbutanoïque sur la position 5' de la ddA possède des caractéristiques structurales et électroniques voisines de celles du ddATP. (Figure 6)
La synthèse de 5 ' -O- ( 3 , 4-dicarboxy-3- hydroxy)butanoate-2 ' , 3 '-didésoxyadénosine requiert d'abord la protection de deux des fonctions acides carboxyliques de l'acide citrique sous forme d'ester allylique.
La synthèse de l'acide 2-hydroxy-2 , 3- allyloxycarbonylbutanoïque est réalisée selon la méthode décrite par Weaver, R. et Gilbert, IH. (Tetrahedron, (1997),
53, 5537-5562. The design and synthesis of nucleoside triphosphate isosteres as potential inhibitors of HIV reverse transcriptase) .
La préparation de l'acide 2-hydroxy-2 , 3- allyloxycarbonylbutanoïque est réalisée en 4 étapes : a) la formation de l'oxalactone 1 par traitement de l'acide citrique avec le paraf ormaldéhyde , b) la cyclisation du diacide 2 en anhydride 3 par échange avec l'anhydride acétique. c) l'obtention du monoester allylique 4 par ouverture de l'anhydride 3 par l'alcool allylique. d) l'obtention du diester allylique de l'acide citrique 5 par ouverture de la lactone et hydrolyse du méthylène dioxy (Figure 7).
Les conditions de couplage de la ddA à l'acide 2- hydroxy-2 , 3-allyloxycarbonylbutanoïque décrites dans l'article de Weaver R. (1997) et al. précité ne sont pas satisfaisantes, car le rendement de couplage est très faible et s'accompagne de la dégradation partielle du produit à cause de la déshydratation du β-hydroxyester en milieu basique.
La demanderesse a ainsi amélioré les conditions de couplage de la ddA à l'acide 2-hydroxy-2 , 3- allyloxycarbonylbutanoïque en effectuant ce couplage en présence de dicyclohexylcarbodiimide (DCC) et de l-hydroxy-7- azabenzotriazole (HOAt) dans le tétrahydrofurane pour conduire à la formation de 5'-0-( (3,4-diallyloxycarboxyl)-3- hydroxy)butanoate-2 ' , 3 ' -didésoxyadénosine (Figure 8 ) .
Dans ces conditions, on élimine la réaction de déshydratation. Ce couplage est effectué en présence de pyridine pour des raisons de solubilité de la ddA. La déprotection des fonctions acides carboxyliques est effectuée en présence de tétrakis(triρhénylphosphine) palladium (0) et de diéthylamine dans du chlorure de méthylène. Le 5'-0-(3,4-dicarboxy-3-hydroxy)butanoate-2 ' ,3'- didésoxyadénosine est obtenu avec un rendement quantitatif après lavage de la phase aqueuse puis recristallisation.
Le même protocole a été utilisé pour l'AZT- citrate, le d4T-Citrate et le 3TC-Citrate.
II . Préparation d'immunogènes. Procédés de couplage ou activation de l'haptene et couplage à la protéine porteuse
Le couplage à une protéine porteuse implique 1 ' activation d'un ou plusieurs groupements carboxylate de l'haptene. L1 activation de ce carboxylate s'effectue soit par un chloroformiate d'alkyle (généralement le chloroformiate d'éthyle), soit par un chlorocarbonate d'alkyle soit un carbodiimide en présence de N-hydroxysuccinimide permettant d'augmenter le rendement de couplage à la protéine porteuse. Concernant les nucléosides possédant un groupement carboxylate, 1 ' activation de ce dernier est réalisable avec les réactifs précédemment décrit. En revanche, avec un chloroformiate ou un chlorocarbonate d'alkyle, la réaction d' activation induit la libération d'acide chlorhydrique dans le milieu réactionnel. Or la liaison glycosidique des nucléosides est sensible au milieu acide. Il est donc important de piéger cet acide en ajoutant au milieu réactionnel une base comme par exemple la triéthylamine. (Kaul, S., et al. 1996. Spécifie radioimmunoassays for the measurement of stavudine in human plasma and urine. J Pharm Biomed Anal. 15:165-174. et Ferrua, B. et al. 1994. Measurement of the anti-HIV agent 2 ' , 3 ' -didehydro-2 ' , 3 ' - didéoxythymidine (D4T) by compétitive ELISA. J Immunol Methods. 176:103-110.)
Cinq mg de 5 ' -O- ( 3 , 4-dicarboxy-3-didésoxy-3- hydroxy )butanoate-2 ' , 3 ' -adénosine (12 μmoles) sent solubilisés dans 320 μl de DMF anhydre. On ajoute 8 mg de dicyclohexylcarbodiimide (3,6 équivalent) et 5 mg de N- hydroxysuccinimide (3,6 équivalent). Le mélange réactionnel est agité à 4°C pendant 3 heures. On solubilise 15 mg de KLH dans 1 ml de tampon Tris 10 mM à pH 7,7. Puis on ajoute goutte-à-goutte la solution contenant l'ester activé à la solution de KLH préalablement refroidie dans la glace. Le mélange réactionnel est agité pendant 4 heures à 4°C. Cette solution est conservée à -20 °C.
Le même protocole a été utilisé pour l'AZT, le d4T et le 3TC.
Le rapport molaire entre molécule porteuse et haptène est un paramètre important qui permet l'obtention d'un conjugué où le taux d'incorporation de l'haptene est suffisamment élevé pour induire une réponse immunitaire maximale entraînant la stimulation et l' activation des clones immunocompétents. (Cupo A. et al. (1984) "Quantitation and localization of Met-enkephalin-Arg-Gly-Leu in rat brain using highly sensitive antibodies ". Neuropeptides 4, 389-401.; Cupo A. et al. (1984) "A new immunological approach to the détection and the quantification of the Met5-enkephalin precursors in rat brain". Neuropeptides 4, 375-387.; Cupo et al. (1985) Détection of methionine-enkephaline at the 10-16 mole level . J. Neuroi munology, 8 : 57-67.; Cupo A. et al. (1987) "A new immunization procédure for the obtention of anti-leucine enkephalin antibodies . Part I. Immunization procédure and physicochemical characteristics of antibodies". Neuropeptides 8, 207-219.) ; Cucumel K. et al. (1996) "Production and characterization of site- directed antibodies against dermorphin and dermorphin related peptides " Peptides 17, 973-982.; Garreau I., et al. (1997) " Radioimmuno as s ay against the C-part of W-hemorphin 7 peptide : An alternative assay for Cathepsin D activity" Peptides 18, 293-300.).
III Préparation d'anticorps polyclonaux Les anticorps polyclonaux ont été produits chez le lapin.
Les immunsérums ont été obtenus par immunisation de 2 lapins albinos (Centre d'élevage des Combes, Ain, France ) .
111.1 - Protocole d'immunisation.
Lors de l'immunisation primaire, l' immunogène est administré à l'animal par voie intradermique, mais on peut également l'administrer par voies sous-cutanée, intramusculaire ou intrapéritonéale à raison de 500 μg d'immunogènes par immunisation et par lapin dilué au demi avec de l'adjuvant complet de Freund.
Un mois après l'immunisation primaire, les immunisations ont été effectuées à raison de un rappel toutes les trois semaines sur une période de quatre mois. Les saignées ont été réalisées dix jours après chaque rappel dans un tube héparine pour éviter la coagulation du sang. Après centrifugation, le plasma est recueilli et conservé à —20°C.
111.2 Caractérisation et sélection des anticorps ayant une affinité pour les dérivés ddNTPs. Les anticorps ayant une affinité pour les dérivés ddNTPs peuvent être identifiés par des techniques immunologiques, soit à l'aide de dosages immunoenzymatiques, soit des dosages radioimmunologiques (RIA) . Les anticorps obtenus ont été caractérisés par dosage radioimmunologique en utilisant comme traceur le 5'-0- hémisuccinate-2 ' ,3 '-didésoxyadénosine couplé au dipeptide Tyrosyl-Lysine radiomarqué à l'iode 125.
La comparaison des structures de l' isostère du ddATP et de l 'hémisuccinate de la ddA montre des analogies confirmées par la modélisation moléculaire. Cette analogie structurale a été démontrée expérimentalement par le fait que le dérivé ddA-HS-K-125IY est parfaitement reconnu par les anticorps anti-isostère du ddATP, de même que le dérivé non radiomarqué .
La spécificité de ces anticorps a été étudiée vis-à-vis de différents analogues du ddATP. Les caractéristiques de ces anticorps sont exprimées en termes d'affinité ou de sensibilité (ou IC 50 (M)) et présentées dans la table 1 ci-dessous. L'IC 50 (M) correspond à la concentration d'antigène non marqué qui inhibe 50 % de la liaison antigène-anticorps.
Table 1
ni : non immunoreactif jusqu'à des concentrations de 10"3M.
La séparation par chromatographie anionique des différents métabolites phosphoryles issus du métabolisme cellulaire de la ddl (ddlMP, ddAMP, ddADP et ddATP) est réalisée sur cartouche anionique Sep Pak à l'aide d'un gradient par palier utilisant différentes concentrations de KC1 (6 ml KC1 50 mM, 10 ml KC1 100 mM et 6 ml 250 mM) .
Le dosage immunologique du ddATP implique la séparation de ce dernier des autres métabolites phosphoryles de la ddA à l'aide d'un gradient de KC1. Par conséquent, nous avons contrôlé que les concentrations de KC1 utilisées et même bien supérieure (jusqu'à 2,5 M) n'inhibent pas 1 ' interaction antigène-anticorps .
IV. Préparation d'anticorps monoclonaux.
Des anticorps monoclonaux dirigés contre chaque analogue nucléosidique ont été préparés par fusion de cellules de la rate des animaux immunisées avec les immunogènes correspondants, puis immortalisation des cellules stimulées, sécrétant des anticorps, au moyen d'une fusion avec des lignées yélomateuses de souris. Cette fusion est suivie d'une sélection des clones hybrides sécrétant les anticorps qui présentent une affinité par ledit analogue nucléosidique .
Pour effectuer la fusion cellulaire on peut utiliser des lignées myélomateuses telles que X63ag 8, SP2, NS, Y3 , selon la technique décrite par Kohler G. et Milstein C. (1975) « Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity ». Nature. 1975 Aug 7;256(5517) :495-7, ainsi que les protocoles décrits dans CUPO A. and KALDY P. (1987) "Monoclonal antiidiotypic antibodies which recognized the binding site of delta receptor : fine specificity of the antiidiotypic antibodies". in "Progress in opioids Research" J.W. Holaday, P. Y. Law and A. Herz eds . Nida (Rockville, Maryland, USA) pp 25-28. et CUPO A., et al.. (1992) "Monoclonal antiidiotypic antibodies against δ opioid receptors as an électron microscopy probe". Eur. J. Cell. Biol. 57, 273-284.
V. Dosage intracellulaire du ddATP. Validation sur un modèle cellulaire in vitro.
Les anticorps ainsi obtenus ont été utilisés pour la mise en œuvre de dosages immunologiques appliqués pour le dosage intracellulaire des formes actives des nucléosides, notamment dans les monocytes humains du sang périphérique ou ils sont présents à de très faibles concentrations.
Un certain nombre de contrôles ont été réalisés sur un modèle de cellules in vi tro . Après séparation par gradient de densité sur Ficoll, des cellules monocytaires du sang ont été incubées avec différentes concentrations de ddl dans du RPMI (à raison de 5.105 cellules par ml).
L'immunoréactivité, présente dans le surnageant, est exprimée en équivalents (éq.) ddl établis par rapport à une courbe de référence ddl et illustrée dans le tableau 2 ci-dessous. L' immunoréactivité ddATP correspond à la somme des immunoréactivités présentes dans les fractions 32-37 issues de la séparation du contenu intracellulaire sur cartouche anionique Sep Pak. Elle est exprimée en équivalents ddATP par rapport à une courbe de référence ddATP et illustrée également sur le tableau 2 ci-dessous.
Tableau 2
La nature du matériel immunoreactif présent dans le surnageant de culture et dans le milieu intracellulaire a été contrôlée par chromatographie sur cartouche anionique Sep Pak et détectée par dosage radioimmunologique . L' immunoanalyse de plusieurs surnageants de culture (n=4) montre que 100 % de 1 ' immunoréactivité est retrouvée dans les fractions 1 à 5, correspondant au volume d'élution de la ddl et illustré dans la figure 1 en annexe. L'analyse des contenus intracellulaires montre que le matériel immunoreactif présent dans les cellules est élue au volume d'élution correspondant au ddATP avec un rendement de 92 % est illustré figure 2 en annexe. L'absence de matériel immunoreactif au temps de rétention de la ddl indique que la ddl n'est pas détectable dans les cellules. Pour détecter la présence éventuelle de ddAMP et de ddADP dans les contenus intracellulaires, il a été réalisé, après séparation sur cartouche anionique Sep Pak, un dosage après déphosphorylation des échantillons (dosage indirect exprimé en équivalents ddA) . Ce dosage a été comparé à celui effectué sur les mêmes fractions non déphosphorylées (dosage direct en équivalents ddATP). Les résultats sont rapportés dans les figures 3 et 4 en annexe. Elles correspondent à l'analyse d'un extrait cellulaire obtenu après incubation des cellules avec une concentration de ddl de 1,5.10"4M.
Le ddATP est présent dans les fractions 32-37 correspondant au volume d'élution du ddATP standard. La quantité de ddATP détectée au niveau de ces fractions après déphosphorylation représente 93 % de la quantité de ddATP avant traitement.
Lorsque ces résultats sont retraités en modifiant l'échelle des immunoréactivités, au niveau des fractions précédant les fractions contenant le ddATP, on observe deux épaulements qui pourraient correspondre respectivement au ddAMP et au ddADP. En effet, les fractions 24 à 26 et les fractions 27 à 30 sont des fractions dont 1 'immunoréactivité est fortement augmentée après traitement à la phosphatase acide, indiquant qu'elles contiennent le motif ddA libérable par le traitement enzymatique. L'augmentation de 1 ' immunoréactivité d'un facteur 5 pourrait traduire le facteur de croisement qui existe entre les analogues mono- et diphosphorylés par rapport au ddATP.
VI. Dosage des nucléosides dans les échantillons biologiques. Applications cliniques. Les prélèvements des échantillons sanguins de malades infectés par le VIH-1 et suivant un traitement comprenant la ddl ont été réalisés dans le service du Pr. P. Dellamonica à l'Hôpital L'Archet de Nice. Les prélèvements sanguins sont réalisés dans des tubes CPT à raison de 2 tubes de 4 ml pour les 4 patients faisant partie de cette étude. Pour chaque patient, le dosage de la ddl a été réalisé dans le plasma et sera exprimé en équivalents ddl. Le dosage intracellulaire de ddATP a été réalisé après chromatographie (sur cartouche anionique Sep Pak) des lysats cellulaires. Pour chaque fraction (500 μl), le contenu cellulaire en ddATP sera déterminé directement et exprimé en équivalents ddATP et après déphosphorylation et exprimé en équivalents ddA.
V .1. Dosages plasmatiques du ddATP
Les concentrations plasmatiques déterminées chez les 4 patients sont relativement comparables et varient de 2 à 6.10-6 M. Elles sont illustrées dans le tableau 3 ci- dessous.
Tableau 3
VI.2. Dosages intracellulaires du ddATP. Les éléments figurés du sang sont isolés par centrifugation dans des tubes pour préparations cellulaires (Cell préparation tubes ou CPT, VacutainerR) . Les cellules mononuclées sont lavées par 2 fois 15 ml de milieu RPMI, centrifugées et comptées, le dénombrement des cellules pour chacun des échantillons de l'étude est indiqué dans la table 4 ci-dessous, puis le culot cellulaire est congelé à -70°C.
Table 4
Chaque échantillon cellulaire a été traité de la façon suivante. Après lyophilisation, l'extrait cellulaire est repris par 1 ml d'eau distillée. 100 μl sont soumis au traitement par la phosphatase acide et le contenu en ddA est déterminé. 200 μl seront réservés au dosage direct et sans purification sur cartouche. Les 700 μl restants sont soumis à une chromatographie sur cartouche anionique Sep Pak dans les conditions d'élution précédemment décrites. Des fractions de 500 μl sont collectées. Chaque fraction est diluée 1,6 fois avec de l'eau distillée puis fractionnée en deux. 400 μl seront destinés au dosage direct, 400 μl seront déphosphorylés à l'aide de la phosphatase acide en présence d'acétate de sodium 1 M à 37°C pendant 30 minutes. Les résultats des dosages bruts direct et indirect sont présentés dans la table récapitulative 6.
Après puri ication sur cartouche anionique, 1 ' immunoréactivité en équivalent ddATP se situe principalement au niveau des fractions 24-31, 32-39 et 42.
L' immunoréactivité, mesurée par dosage direct, localisée dans les fractions 42 n'est pas augmentée par déphosphorylation. Ceci indique la présence de ddATP dans cette fraction. En revanche, l' immunoréactivité présente au niveau des fractions 24-29 et 33-39 se trouve augmentée lors du dosage indirect ( après déphosphorylation ) indiquant que l ' on démasque l ' épitope reconnu par l ' anticorps . Ces fractions , correspondant à des produits moins retenus sur la cartouche anionique, devraient correspondre respectivement au produit mono et diphosphorylé ( ddAMP et ddADP ) , comme le montre les résultats obtenus chez le patient PRI et illustrés dans le tableau 5 ci-dessous .
Table 5
VI.3 Bilan des résultats.
Le tableau récapitulatif 6 ci-dessous illustre les résultats des dosages intracellulaires après purification, sur cartouche anionique, des produits issus du métabolisme cellulaire de la ddl.
Table 6
Dans cet exemple, du ddATP a été détecté de manière incontestable chez 4 patients. Chez un patient, il n'a pas été détecté de forme phosphorylée de la ddA, alors que chez 2 des 4 patients, uniquement les formes mono- et diphosphorylées ont été détectées. Il est probable que chez ces patients, soit le ddATP n'est pas encore synthétisé, soit les kinases impliquées dans la troisième étape de phosphorylation sont déficientes. La répétition des dosages à des intervalles réguliers chez les patients permettra de corréler les variations de la concentration intracellulaire en ddATP observées avec les indications sur l'état d'avancement de l'infection au VIH, sur les traitements antérieurs et sur l'échappement thérapeutique éventuel et permettra d'effectuer un meilleur suivi thérapeutique.
Les résultats de la quantification des dérivés phosphoryles de la ddA, obtenus par le dosage brut, direct et indirect ainsi que par le dosage après cartouche sont relativement cohérents entre eux à l'exception d'un seul échantillon.
VI. Conclusions
Les exemples de réalisation de l'invention, avec les dosages effectués sur quatre échantillons et les résultats obtenus, montrent que le dosage immunologique des analogues de nucléosides, objet de la présente invention avec les anticorps également préparés selon une méthode mise en oeuvre dans le cadre de l'invention, peut être utilisé pour la quantification de tous les métabolites phosphoryles de la ddA.
L'ensemble des résultats montre que le test immunologique mis au point avec les anticorps est spécifique du ddATP. Cette spécificité est assurée par la spécificité de l'anticorps associée à la purification des molécules à doser lorsqu'elles sont dans les mêmes compartiments (ddl, ddATP, ddADP, et ddAMP) et par le fait qu'elles sont reconnues par l'anticorps avec des affinités différentes.

Claims

REVENDICATIONS
1. immunogène, caractérisé en ce qu'il comporte un dérivé citrate d'un nucleoside couplé à une molécule porteuse .
2. Immunogène selon la revendication 1, caractérisé en ce que le nucleoside est choisi parmi le groupe comprenant les nucléosides : Acyclovir, Adénosine, S- Adenosyl-L-methionine, 2 ' ,3 ' -didéoxyadénosione (ddA), 2',3'- didehydro-2 ' ,3 '-didéoxythymidine (d4T), 2 ' , 3 ' -dideoxy-3 ' - thiacytidine (3TC), 3'- Azido-3 ' -deoxythymidine (AZT), Carbovir, Cordycepine, Cytidine, Cytosine-b-D-arabinoside, Deoxycytidine, Deoxytubercidine, 2 ' -Deoxyuridine, Formycine A, Formycine B, Ganciclovir, Guanosine, Inosine, Puromycine, Ribavirine, Sangivamycine, Thymidine, Tubercidine, Uridine, Abacavir, 3-fluoro-2' ,3 '-didéoxythymidine (FLT), Fura, FdUrd, Thi-Gua, 6-MP, AraC ou Fludarabine phosphate.
3. Immunogène selon la revendication 1, caractérisé en ce que le nucleoside est choisi parmi le groupe comprenant les analogues des bases puriques : 6-mercaptopurine, cladribine, fludarabine ou le groupe comprenant les analogues des bases pyrimidiques : 5-fluoro- uracile, cytarabine, gemcitabine, Tenofovir.
4. Immunogène selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que la molécule porteuse est choisie parmi une protéine, un polypeptide ou un polysaccharide.
5. Immunogène selon la revendication 4, caractérisé en ce que la protéine est choisie parmi le groupe comprenant : l'ovalbumine, le sérum albumine bovine, 1 ' hémocyanine de patelle, la thyroglobuline, des immunoglobulines, la caséine, l'hémoglobine, des toxines bactériennes, de préférence la sous-unité B de la toxine du choléra, la toxine tétanique, la toxine diphtérique, de lectines, de préférence la sous-unité B de la ricine.
6. Utilisation d'un immunogène défini à l'une quelconque des revendications précédentes pour la préparation d'un anticorps ayant une affinité pour un dérivé ddNTP.
7. Procédé d'obtention d'un anticorps ayant une affinité pour un dérivé ddNTP comprenant les étapes suivantes : a) l'immunisation d'un animal, avec au moins un immunogène défini à l'une quelconque des revendications 1 à
5, b) la purification des anticorps polyclonaux produits .
8. Procédé d'obtention d'un anticorps ayant une affinité par un dérivé ddNTP comprenant les étapes suivantes : a) l'immunisation de cellules immunocompétentes d'un animal, avec au moins un immunogène défini à l'une quelconque des revendications 1 à 5, b) l'immortalisation des cellules sécrétant des anticorps ayant une affinité pour ledit dérivé ddNTP au moyen d'une fusion cellulaire des cellules de l'animal immunisé, isolées à partir de la rate ou des ganglions lymphatiques, avec une lignée cellulaire de fusion, c) l'identification et sélection des clones hybrides immortalisés, hybridomes, sécrétant lesdits anticorps ayant une affinité pour ledit dérivé ddNTP, d) la purification des anticorps produits par lesdits hybridomes.
9. Procédé selon la revendication 8, caractérisé en ce que l'animal immunisé à l'étape (a) du procédé est choisi parmi un mammifère non humain, de préférence un rongeur, tout préférentiellement un rat ou une souris ou une poule.
10. Procédé d'obtention d'un anticorps selon les revendications 8 ou 9, caractérisé en ce que les cellules immunocompétentes sont immunisées in vitro.
11. Procédé d'obtention d'un anticorps selon les revendications 8 ou 9, caractérisé en ce que les immunocompétentes sont immunisées in vivo.
12. Procédé selon l'une quelconque des revendication 8 à 11, caractérisé en ce que la lignée de fusion, utilisée à l'étape (b) du procédé est choisie parmi une lignée myélomateuse de souris, une lignée myélomateuse de rat ou encore des lignées hétérohybrides .
13. Un anticorps ayant une affinité par un immunogène défini à l'une quelconque des revendications 1 à
5.
14. Un anticorps ayant une affinité par un dérivé ddNTP, obtenu par un procédé défini à l'une quelconque des revendications 7 à 12.
15. Un anticorps selon la revendication 14, caractérisé en ce que son affinité IC50(M) par le dérivé ddNTP est supérieure à 10"7, de préférence supérieure à 10"9 et tout préférentiellement supérieure à 10~10.
16. Procédé de dosage d'un dérivé ddNTP caractérisé en ce qu'il comporte les étapes suivantes : a) la mise en contact d'au moins un anticorps selon l'une quelconque des revendications 14 ou 15, avec un échantillon susceptible de contenir ledit dérivé ddNTP, éventuellement en présence d'un traceur marqué, b) la séparation du complexe constitué par ledit anticorps lié au dérivé ddNTP, dudit dérivé ddNTP non lié. c) la mesure du rapport entre la quantité du dérivé ddNTP lié par l'anticorps versus ledit dérivé ddNTP non lié.
17. Procédé de dosage selon la revendication 16, caractérisé en ce que le traceur mis en œuvre à l'étape (a) est un dérivé marqué du nucleoside à détecter.
18. Procédé selon la revendication 17, caractérisé en ce que le traceur est choisi parmi un dérivé du nucleoside à détecter comportant un motif susceptible d'être marqué, choisi parmi un motif comprenant une tyrosine, une histidine ou tout acide aminé ou groupement possédant une fonction amide.
19. Procédé selon la revendication 18, caractérisé en ce que le traceur est choisi parmi un dérivé marqué du nucleoside à détecter comportant un motif Lys-Tyr ou Tyr Lys.
20. Procédé de dosage selon l'une quelconque des revendications 16 à 19, caractérisé en ce que le traceur est marqué au moyen d'une enzyme, un chromophore, un colorant, un fluorophore, une particule, un pigment ou un atome radioactif.
21. Procédé de dosage selon l'une quelconque des revendications 16 à 20, caractérisé en ce que l'échantillon susceptible de contenir ledit dérivé ddNTP est un fluide biologique.
22. Procédé de dosage selon la revendication 21, caractérisé en ce que le fluide biologique est choisi parmi : du sang, du plasma, du sérum, du liquide céphalorachidien (LCR), des urines, de la lymphe ou de la salive.
23. Procédé de dosage selon l'une quelconque des revendications 16 à 20,. caractérisé en ce que l'échantillon susceptible de contenir ledit dérivé ddNTP est un échantillon de cellules.
24. Procédé selon la revendication 23, caractérisé en ce que les cellules sont choisies parmi : des lymphocytes, des monocytes périphériques, des cellules de Langehrans, des cellules dendritiques , des cellules présentatrices, des cellules souches, des adipocytes, des cellules immunitaires.
25. Procédé de dosage selon l'une quelconque des revendications 16 à 20, caractérisé en ce que l'échantillon susceptible de contenir ledit dérivé ddNTP est une préparation histologique'.
26. Procédé de dosage selon l'une quelconque des revendications 16 à 25, caractérisé en ce que ledit dérivé ddNTP est issu de la transformation d'un nucleoside administré à titre d'agent antiviral à un individu.
27. Procédé de dosage selon l'une quelconque des revendications 16 à 25, caractérisé en ce que ledit dérivé ddNTP est issu de la transformation d'un nucleoside administré à titre d'agent anticancéreux à un individu.
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