EA202192547A1 - Способы и композиции для редактирования нуклеотидных последовательностей - Google Patents

Способы и композиции для редактирования нуклеотидных последовательностей

Info

Publication number
EA202192547A1
EA202192547A1 EA202192547A EA202192547A EA202192547A1 EA 202192547 A1 EA202192547 A1 EA 202192547A1 EA 202192547 A EA202192547 A EA 202192547A EA 202192547 A EA202192547 A EA 202192547A EA 202192547 A1 EA202192547 A1 EA 202192547A1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
editing
primer
rna
proteins
dna
Prior art date
Application number
EA202192547A
Other languages
English (en)
Inventor
Дэвид Р. Лиу
Эндрю Вито Анзалоун
Пейтон Рэндольф
Джеймс Нельсон
Original Assignee
Зе Броуд Инститьют, Инк.
Президент Энд Феллоуз Оф Гарвард Колледж
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Зе Броуд Инститьют, Инк., Президент Энд Феллоуз Оф Гарвард Колледж filed Critical Зе Броуд Инститьют, Инк.
Priority claimed from PCT/US2020/023713 external-priority patent/WO2020191234A1/en
Publication of EA202192547A1 publication Critical patent/EA202192547A1/ru

Links

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

Описаны композиции и способы для осуществления праймерного редактирования молекулы-мишени ДНК (например генома), которые обеспечивают встраивание нуклеотидного изменения и/или осуществление нацеленного мутагенеза. Нуклеотидное изменение может включать изменение одного нуклеотида (например любую транзицию или трансверсию), вставку одного или нескольких нуклеотидов, или делецию одного или нескольких нуклеотидов. Более конкретно, описаны слитые белки, включающие программируемые нуклеиновой кислотой ДНК-связывающие белки ("napDNAbp") и полимеразу (например обратную транскриптазу), которые направляются к определенной последовательности ДНК с помощью модифицированной направляющей РНК, обозначенной как PEgRNA. PEgRNA модифицирована (относительно стандартной направляющей РНК) для включения удлиненной части, которая включает последовательность матрицы для синтеза ДНК, которая кодирует одноцепочечный ДНК-флэп, который является гомологичным цепи являющейся мишенью подвергаемой редактированию эндогенной последовательности ДНК, но который содержит требуемое одно или несколько нуклеотидных изменений и который за счет синтеза на основе полимеразы (например обратной транскриптазы) становится встроенным в молекулу-мишень ДНК. Также описаны различные способы, включающие использование праймерного редактирования, включая лечение заболеваний, связанных с экспансией тринуклеотидных повторов, внесение нацеленных пептидных меток, лечение прионного заболевания с помощью внесения защитных мутаций, манипулирование РНК-кодирующими генами для внесения РНК-меток для управления функцией и экспрессией РНК, использование праймерного редактирования для конструирования сложных библиотек генов, использование праймерного редактирования для вставки иммуноэпитопов в белки, использование праймерного редактирования для внесения индуцируемых доменов димеризации в белки-мишени, и способы доставки, помимо прочего.
EA202192547A 2020-03-17 2020-03-19 Способы и композиции для редактирования нуклеотидных последовательностей EA202192547A1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US202063100548P 2020-03-17 2020-03-17
PCT/US2020/023713 WO2020191234A1 (en) 2019-03-19 2020-03-19 Methods and compositions for editing nucleotide sequences

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA202192547A1 true EA202192547A1 (ru) 2022-02-01

Family

ID=80631320

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA202192547A EA202192547A1 (ru) 2020-03-17 2020-03-19 Способы и композиции для редактирования нуклеотидных последовательностей

Country Status (1)

Country Link
EA (1) EA202192547A1 (ru)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
MX2021011325A (es) Metodos y composiciones para editar secuencias de nucleotidos.
EP1817413B1 (en) Oligonucleotide ladder assembly and system for generating molecular diversity
KR20230003467A (ko) 지시된 게놈 편집을 위한 방법 및 조성물
US20170298450A1 (en) Reconstruction of ancestral cells by enzymatic recording
US9850481B2 (en) Method for genome complexity reduction and polymorphism detection
Thieme et al. Quick and clean cloning: a ligation-independent cloning strategy for selective cloning of specific PCR products from non-specific mixes
Mader et al. Reverse transcriptase template switching during reverse transcriptase–polymerase chain reaction: artificial generation of deletions in ribonucleotide reductase mRNA
US20140228556A1 (en) Ribozyme for identifying modification on rna sequence and rna cleavage method using same
Slavov et al. Phylogenetic comparison of the pre-mRNA adenosine deaminase ADAR2 genes and transcripts: conservation and diversity in editing site sequence and alternative splicing patterns
Ferreira da Silva et al. Click editing enables programmable genome writing using DNA polymerases and HUH endonucleases
US9834762B2 (en) Modified polymerases for replication of threose nucleic acids
JPH05502789A (ja) ムチンヌクレオチド
Kamiya Mutagenicities of 8-hydroxyguanine and 2-hydroxyadenine produced by reactive oxygen species
EA202192547A1 (ru) Способы и композиции для редактирования нуклеотидных последовательностей
Sakane et al. A simple protocol for loss-of-function analysis in Xenopus tropicalis founders using the CRISPR-cas system
JP2022519020A (ja) 非天然塩基対を用いて核酸を配列決定する方法
WO2021058145A1 (en) Phage t7 promoters for boosting in vitro transcription
Koay et al. CRISPR activator approaches to study endogenous androglobin gene regulation
US20020055148A1 (en) Cloning method for DNA fragments using arbitrarily primed PCR
Wimberger Improving integration efficiency and precision of CRISPR/Cas9-mediated genome editing
Kumar Molecular cloning and expression of high GC-rich novel tumor suppressor gene HIC-1
CN115725650B (zh) 实现a到c和/或a到t碱基突变的碱基编辑系统及其应用
KR101406153B1 (ko) 연속적인 올리고뉴클리오타이드 프라이머를 이용한 유전자의 합성 방법
Li et al. Creation of DNA overhangs by using modified DNA overhang cloning method
WO2024211883A1 (en) Click-to-install genome editing