EA046175B1 - AN ISOLATED ANTIBODY OR ITS ANTIGEN-BINDING FRAGMENT THAT SPECIFICALLY BINDS TO AN EPITOPE OF THE ZIKA VIRUS, THEIR PREPARATION AND APPLICATIONS - Google Patents
AN ISOLATED ANTIBODY OR ITS ANTIGEN-BINDING FRAGMENT THAT SPECIFICALLY BINDS TO AN EPITOPE OF THE ZIKA VIRUS, THEIR PREPARATION AND APPLICATIONS Download PDFInfo
- Publication number
- EA046175B1 EA046175B1 EA201990243 EA046175B1 EA 046175 B1 EA046175 B1 EA 046175B1 EA 201990243 EA201990243 EA 201990243 EA 046175 B1 EA046175 B1 EA 046175B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- antibody
- antigen
- binding fragment
- amino acid
- seq
- Prior art date
Links
- 241000907316 Zika virus Species 0.000 title claims description 298
- 239000012634 fragment Substances 0.000 title claims description 287
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title description 7
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 423
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 327
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 300
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 298
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 298
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 190
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 179
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 130
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 130
- 208000020329 Zika virus infectious disease Diseases 0.000 claims description 111
- 208000001455 Zika Virus Infection Diseases 0.000 claims description 99
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 98
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 85
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 78
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 75
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims description 69
- 241000725619 Dengue virus Species 0.000 claims description 57
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 53
- 208000035332 Zika virus disease Diseases 0.000 claims description 50
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 43
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 37
- 102000018071 Immunoglobulin Fc Fragments Human genes 0.000 claims description 36
- 108010091135 Immunoglobulin Fc Fragments Proteins 0.000 claims description 36
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 28
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 23
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 22
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 claims description 21
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 claims description 21
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 20
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 20
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 20
- 108010003533 Viral Envelope Proteins Proteins 0.000 claims description 18
- 206010012310 Dengue fever Diseases 0.000 claims description 17
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 16
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 claims description 15
- 208000025729 dengue disease Diseases 0.000 claims description 14
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 claims description 13
- 208000001490 Dengue Diseases 0.000 claims description 12
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 11
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 11
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 11
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 10
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 8
- 229910052720 vanadium Inorganic materials 0.000 claims description 8
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 claims description 8
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 claims description 7
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 claims description 6
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 claims description 6
- 229940076838 Immune checkpoint inhibitor Drugs 0.000 claims description 5
- 239000012274 immune-checkpoint protein inhibitor Substances 0.000 claims description 5
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 5
- 229940124743 Zika virus vaccine Drugs 0.000 claims description 4
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims description 3
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 claims description 3
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims description 2
- 101710128560 Initiator protein NS1 Proteins 0.000 description 78
- 101710144127 Non-structural protein 1 Proteins 0.000 description 78
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 76
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 67
- 101500010375 Zika virus Non-structural protein 1 Proteins 0.000 description 65
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 60
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 60
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 57
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 54
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 47
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 46
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 46
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 38
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 38
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 38
- 101710204837 Envelope small membrane protein Proteins 0.000 description 37
- 101710145006 Lysis protein Proteins 0.000 description 37
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 36
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 36
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 36
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 36
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 35
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 32
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 30
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 30
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 30
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 28
- 102100024952 Protein CBFA2T1 Human genes 0.000 description 27
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 27
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 27
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 25
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 22
- 210000004180 plasmocyte Anatomy 0.000 description 22
- 241000710831 Flavivirus Species 0.000 description 21
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 21
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 21
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 21
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 20
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 20
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 19
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 18
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 18
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 18
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 17
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 17
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 17
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 16
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 16
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 16
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 16
- 230000006870 function Effects 0.000 description 16
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 16
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 15
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 15
- 210000003501 vero cell Anatomy 0.000 description 15
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 14
- 241000710772 Yellow fever virus Species 0.000 description 14
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 14
- 229940051021 yellow-fever virus Drugs 0.000 description 14
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 13
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 13
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 13
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 13
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 12
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 12
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 12
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 12
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 12
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 12
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 12
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 12
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 12
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 12
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 12
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 12
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 11
- -1 NS2B Proteins 0.000 description 11
- 241000710886 West Nile virus Species 0.000 description 11
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 11
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 11
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 11
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 11
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 11
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 11
- 239000000463 material Substances 0.000 description 11
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 11
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 11
- 102100034349 Integrase Human genes 0.000 description 10
- 241000710771 Tick-borne encephalitis virus Species 0.000 description 10
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 10
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 10
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 10
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 10
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 10
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 10
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 10
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 10
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 9
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 9
- 102100026120 IgG receptor FcRn large subunit p51 Human genes 0.000 description 9
- 241000710842 Japanese encephalitis virus Species 0.000 description 9
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 9
- 230000006287 biotinylation Effects 0.000 description 9
- 238000007413 biotinylation Methods 0.000 description 9
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 9
- 230000008859 change Effects 0.000 description 9
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 9
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 9
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 9
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 9
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 9
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 9
- 230000002064 post-exposure prophylaxis Effects 0.000 description 9
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 9
- 108010083359 Antigen Receptors Proteins 0.000 description 8
- 102000006306 Antigen Receptors Human genes 0.000 description 8
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 8
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 8
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 8
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 8
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 8
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 8
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 8
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 7
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 7
- 101710177940 IgG receptor FcRn large subunit p51 Proteins 0.000 description 7
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 7
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 7
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 7
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 7
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 7
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 7
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 7
- 208000004141 microcephaly Diseases 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 7
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 7
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 7
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 7
- 238000012340 reverse transcriptase PCR Methods 0.000 description 7
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 7
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 7
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 7
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 7
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 6
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 6
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 6
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 6
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 6
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 6
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 6
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 6
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 6
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 description 6
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 6
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 6
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 6
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 6
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 6
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 6
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 6
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 5
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 5
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 description 5
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 description 5
- 208000009714 Severe Dengue Diseases 0.000 description 5
- 230000010056 antibody-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 5
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 5
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 5
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 5
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 5
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 5
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 5
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 5
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 5
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 5
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 5
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 5
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 5
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 5
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 5
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 5
- 238000003032 molecular docking Methods 0.000 description 5
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 5
- 230000010807 negative regulation of binding Effects 0.000 description 5
- 238000011275 oncology therapy Methods 0.000 description 5
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 5
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 5
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 5
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 description 5
- 230000008569 process Effects 0.000 description 5
- 238000011160 research Methods 0.000 description 5
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 5
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 5
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 5
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 5
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 5
- 239000012103 Alexa Fluor 488 Substances 0.000 description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 4
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 4
- 108700004715 Flavivirus NS1 Proteins 0.000 description 4
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 4
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 4
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 4
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 4
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 4
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 4
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 4
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 4
- 230000002301 combined effect Effects 0.000 description 4
- 238000004624 confocal microscopy Methods 0.000 description 4
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 4
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 4
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 4
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 description 4
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 4
- 210000001163 endosome Anatomy 0.000 description 4
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 4
- 210000003979 eosinophil Anatomy 0.000 description 4
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 4
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 4
- 150000004676 glycans Chemical group 0.000 description 4
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 4
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 4
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 4
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 4
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 4
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 4
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 4
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 4
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 4
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 4
- JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M sodium periodate Chemical compound [Na+].[O-]I(=O)(=O)=O JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- JUJBNYBVVQSIOU-UHFFFAOYSA-M sodium;4-[2-(4-iodophenyl)-3-(4-nitrophenyl)tetrazol-2-ium-5-yl]benzene-1,3-disulfonate Chemical compound [Na+].C1=CC([N+](=O)[O-])=CC=C1N1[N+](C=2C=CC(I)=CC=2)=NC(C=2C(=CC(=CC=2)S([O-])(=O)=O)S([O-])(=O)=O)=N1 JUJBNYBVVQSIOU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 4
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 4
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 4
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 4
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 4
- WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N Benzyl alcohol Chemical compound OCC1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241001502567 Chikungunya virus Species 0.000 description 3
- 206010010356 Congenital anomaly Diseases 0.000 description 3
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 3
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 3
- 101000917824 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-b Proteins 0.000 description 3
- 108091006905 Human Serum Albumin Proteins 0.000 description 3
- 102000008100 Human Serum Albumin Human genes 0.000 description 3
- 108010073807 IgG Receptors Proteins 0.000 description 3
- 102000009490 IgG Receptors Human genes 0.000 description 3
- 102000006496 Immunoglobulin Heavy Chains Human genes 0.000 description 3
- 108010019476 Immunoglobulin Heavy Chains Proteins 0.000 description 3
- 102100029205 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-b Human genes 0.000 description 3
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 3
- 108090000526 Papain Proteins 0.000 description 3
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 3
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 3
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 3
- 108010004729 Phycoerythrin Proteins 0.000 description 3
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 3
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 3
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 3
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 3
- 229940045024 blockade Drugs 0.000 description 3
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 3
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000002354 daily effect Effects 0.000 description 3
- 201000002950 dengue hemorrhagic fever Diseases 0.000 description 3
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 3
- 210000003038 endothelium Anatomy 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N glycerol group Chemical group OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 3
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 3
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 3
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 3
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 3
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 3
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 3
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 3
- 108010082117 matrigel Proteins 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 210000001806 memory b lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-NJFSPNSNSA-N methanone Chemical compound O=[14CH2] WSFSSNUMVMOOMR-NJFSPNSNSA-N 0.000 description 3
- 230000000116 mitigating effect Effects 0.000 description 3
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 3
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 3
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 3
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 3
- 229940055729 papain Drugs 0.000 description 3
- 235000019834 papain Nutrition 0.000 description 3
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 3
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 3
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 3
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 3
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 3
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 3
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 3
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 3
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 3
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 3
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 3
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 description 3
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 3
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 3
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 3
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 3
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 3
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 3
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 3
- 238000011200 topical administration Methods 0.000 description 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 3
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 3
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- HZZOUWBMMWVPTR-UHFFFAOYSA-N 2-[[6-[bis(carboxymethyl)amino]-1,4-dioxocan-6-yl]-(carboxymethyl)amino]acetic acid Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)C1(N(CC(O)=O)CC(O)=O)CCOCCOC1 HZZOUWBMMWVPTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 4',6-Diamino-2-phenylindol Chemical compound C1=CC(C(=N)N)=CC=C1C1=CC2=CC=C(C(N)=N)C=C2N1 FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CJIJXIFQYOPWTF-UHFFFAOYSA-N 7-hydroxycoumarin Natural products O1C(=O)C=CC2=CC(O)=CC=C21 CJIJXIFQYOPWTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000012440 Acetylcholinesterase Human genes 0.000 description 2
- 108010022752 Acetylcholinesterase Proteins 0.000 description 2
- 108010000239 Aequorin Proteins 0.000 description 2
- 108010032595 Antibody Binding Sites Proteins 0.000 description 2
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 2
- 206010003399 Arthropod bite Diseases 0.000 description 2
- 108091008875 B cell receptors Proteins 0.000 description 2
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 description 2
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 2
- 102100035360 Cerebellar degeneration-related antigen 1 Human genes 0.000 description 2
- 201000009182 Chikungunya Diseases 0.000 description 2
- 229920002261 Corn starch Polymers 0.000 description 2
- 229940046168 CpG oligodeoxynucleotide Drugs 0.000 description 2
- 241000006460 Cyana Species 0.000 description 2
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 2
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 2
- IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N D-Luciferin Chemical compound OC(=O)[C@H]1CSC(C=2SC3=CC=C(O)C=C3N=2)=N1 IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Polymers OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 2
- 101100447432 Danio rerio gapdh-2 gene Proteins 0.000 description 2
- XPDXVDYUQZHFPV-UHFFFAOYSA-N Dansyl Chloride Chemical compound C1=CC=C2C(N(C)C)=CC=CC2=C1S(Cl)(=O)=O XPDXVDYUQZHFPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N Dehydro-luciferin Natural products OC(=O)C1=CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000710829 Dengue virus group Species 0.000 description 2
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 2
- 101150074432 EDE1 gene Proteins 0.000 description 2
- BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N Fivefly Luciferin Natural products OC(=O)C1CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150112014 Gapdh gene Proteins 0.000 description 2
- 208000035895 Guillain-Barré syndrome Diseases 0.000 description 2
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 description 2
- 206010062767 Hypophysitis Diseases 0.000 description 2
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 2
- 244000308605 Irvingia smithii Species 0.000 description 2
- 235000002222 Irvingia smithii Nutrition 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 2
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 2
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 2
- DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N Luciferin Natural products CCc1c(C)c(CC2NC(=O)C(=C2C=C)C)[nH]c1Cc3[nH]c4C(=C5/NC(CC(=O)O)C(C)C5CC(=O)O)CC(=O)c4c3C DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 2
- 238000000585 Mann–Whitney U test Methods 0.000 description 2
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 2
- 206010049567 Miller Fisher syndrome Diseases 0.000 description 2
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 2
- SEQKRHFRPICQDD-UHFFFAOYSA-N N-tris(hydroxymethyl)methylglycine Chemical compound OCC(CO)(CO)[NH2+]CC([O-])=O SEQKRHFRPICQDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 208000012902 Nervous system disease Diseases 0.000 description 2
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 2
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 2
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 2
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Polymers 0.000 description 2
- 229920002873 Polyethylenimine Polymers 0.000 description 2
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 2
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 2
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N Sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 2
- HDOVUKNUBWVHOX-QMMMGPOBSA-N Valacyclovir Chemical compound N1C(N)=NC(=O)C2=C1N(COCCOC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C=N2 HDOVUKNUBWVHOX-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 2
- 108700042112 West Nile virus nonstructural protein 1 Proteins 0.000 description 2
- 229940022698 acetylcholinesterase Drugs 0.000 description 2
- 230000033289 adaptive immune response Effects 0.000 description 2
- 210000005006 adaptive immune system Anatomy 0.000 description 2
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 2
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 2
- 210000004100 adrenal gland Anatomy 0.000 description 2
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 2
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 2
- 230000003281 allosteric effect Effects 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 description 2
- 238000004873 anchoring Methods 0.000 description 2
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 2
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 2
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 239000007900 aqueous suspension Substances 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 239000013602 bacteriophage vector Substances 0.000 description 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 2
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 2
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical group 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 2
- 229920006317 cationic polymer Polymers 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 239000000919 ceramic Substances 0.000 description 2
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 2
- 239000005515 coenzyme Substances 0.000 description 2
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 230000009918 complex formation Effects 0.000 description 2
- 239000008120 corn starch Substances 0.000 description 2
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 2
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 2
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 2
- 239000006071 cream Substances 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 2
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 210000002242 embryoid body Anatomy 0.000 description 2
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 2
- 108010048367 enhanced green fluorescent protein Proteins 0.000 description 2
- 239000002532 enzyme inhibitor Substances 0.000 description 2
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000003203 everyday effect Effects 0.000 description 2
- 210000001508 eye Anatomy 0.000 description 2
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 2
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 150000002314 glycerols Polymers 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 2
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 2
- 230000004957 immunoregulator effect Effects 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 229910052738 indium Inorganic materials 0.000 description 2
- APFVFJFRJDLVQX-UHFFFAOYSA-N indium atom Chemical compound [In] APFVFJFRJDLVQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001361 intraarterial administration Methods 0.000 description 2
- 238000007913 intrathecal administration Methods 0.000 description 2
- 238000007914 intraventricular administration Methods 0.000 description 2
- PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N iodine Chemical compound II PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012804 iterative process Methods 0.000 description 2
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 231100000636 lethal dose Toxicity 0.000 description 2
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 2
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 2
- 239000006194 liquid suspension Substances 0.000 description 2
- 238000001325 log-rank test Methods 0.000 description 2
- HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N luminol Chemical compound O=C1NNC(=O)C2=C1C(N)=CC=C2 HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 2
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 2
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 230000034217 membrane fusion Effects 0.000 description 2
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 2
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 2
- 235000010446 mineral oil Nutrition 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- ZTLGJPIZUOVDMT-UHFFFAOYSA-N n,n-dichlorotriazin-4-amine Chemical compound ClN(Cl)C1=CC=NN=N1 ZTLGJPIZUOVDMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 2
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 2
- 108010068617 neonatal Fc receptor Proteins 0.000 description 2
- 210000005155 neural progenitor cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000002674 ointment Substances 0.000 description 2
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 2
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 2
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 2
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 2
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 2
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 2
- 235000019271 petrolatum Nutrition 0.000 description 2
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 2
- 210000003635 pituitary gland Anatomy 0.000 description 2
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical compound [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001583 poly(oxyethylated polyols) Polymers 0.000 description 2
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 2
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 2
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 2
- 229950008882 polysorbate Drugs 0.000 description 2
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 2
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 150000003141 primary amines Chemical class 0.000 description 2
- 229940124272 protein stabilizer Drugs 0.000 description 2
- 230000005180 public health Effects 0.000 description 2
- 239000012857 radioactive material Substances 0.000 description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 2
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 2
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 2
- 210000003079 salivary gland Anatomy 0.000 description 2
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 2
- 230000037432 silent mutation Effects 0.000 description 2
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 2
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 2
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 2
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 150000005846 sugar alcohols Chemical class 0.000 description 2
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 2
- 239000000375 suspending agent Substances 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 2
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- 210000001685 thyroid gland Anatomy 0.000 description 2
- 238000003146 transient transfection Methods 0.000 description 2
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Chemical compound C1=CC(=O)OC2=CC(O)=CC=C21 ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HFTAFOQKODTIJY-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Natural products Cc1cc2C=CC(=O)Oc2cc1OCC=CC(C)(C)O HFTAFOQKODTIJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 2
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 2
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 2
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 2
- 239000001993 wax Substances 0.000 description 2
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 2
- 229910052727 yttrium Inorganic materials 0.000 description 2
- VWQVUPCCIRVNHF-UHFFFAOYSA-N yttrium atom Chemical compound [Y] VWQVUPCCIRVNHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QZTKDVCDBIDYMD-UHFFFAOYSA-N 2,2'-[(2-amino-2-oxoethyl)imino]diacetic acid Chemical compound NC(=O)CN(CC(O)=O)CC(O)=O QZTKDVCDBIDYMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IHPYMWDTONKSCO-UHFFFAOYSA-N 2,2'-piperazine-1,4-diylbisethanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCN1CCN(CCS(O)(=O)=O)CC1 IHPYMWDTONKSCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YMHOBZXQZVXHBM-UHFFFAOYSA-N 2,5-dimethoxy-4-bromophenethylamine Chemical compound COC1=CC(CCN)=C(OC)C=C1Br YMHOBZXQZVXHBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OTLLEIBWKHEHGU-UHFFFAOYSA-N 2-[5-[[5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy]-3,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-4-phosphonooxyhexanedioic acid Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C(C(C1O)O)OC1COC1C(CO)OC(OC(C(O)C(OP(O)(O)=O)C(O)C(O)=O)C(O)=O)C(O)C1O OTLLEIBWKHEHGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OWMCODAXNFNLCU-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-(1h-imidazol-5-yl)ethylamino]methyl]phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1CNCCC1=CN=CN1 OWMCODAXNFNLCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJTVSSFTXWNIRG-UHFFFAOYSA-N 2-[bis(2-hydroxyethyl)amino]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+](CCO)CCS([O-])(=O)=O AJTVSSFTXWNIRG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXFQFBNBSPQBJW-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-methylpropane-1,3-diol Chemical compound OCC(N)(C)CO UXFQFBNBSPQBJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ACERFIHBIWMFOR-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-3-[(1-hydroxy-2-methylpropan-2-yl)azaniumyl]propane-1-sulfonate Chemical compound OCC(C)(C)NCC(O)CS(O)(=O)=O ACERFIHBIWMFOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LVQFQZZGTZFUNF-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-3-[4-(2-hydroxy-3-sulfonatopropyl)piperazine-1,4-diium-1-yl]propane-1-sulfonate Chemical compound OS(=O)(=O)CC(O)CN1CCN(CC(O)CS(O)(=O)=O)CC1 LVQFQZZGTZFUNF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LEACJMVNYZDSKR-UHFFFAOYSA-N 2-octyldodecan-1-ol Chemical compound CCCCCCCCCCC(CO)CCCCCCCC LEACJMVNYZDSKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DVLFYONBTKHTER-UHFFFAOYSA-N 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCCN1CCOCC1 DVLFYONBTKHTER-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- INEWUCPYEUEQTN-UHFFFAOYSA-N 3-(cyclohexylamino)-2-hydroxy-1-propanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CC(O)CNC1CCCCC1 INEWUCPYEUEQTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NUFBIAUZAMHTSP-UHFFFAOYSA-N 3-(n-morpholino)-2-hydroxypropanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CC(O)CN1CCOCC1 NUFBIAUZAMHTSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RZQXOGQSPBYUKH-UHFFFAOYSA-N 3-[[1,3-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)propan-2-yl]azaniumyl]-2-hydroxypropane-1-sulfonate Chemical compound OCC(CO)(CO)NCC(O)CS(O)(=O)=O RZQXOGQSPBYUKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XCBLFURAFHFFJF-UHFFFAOYSA-N 3-[bis(2-hydroxyethyl)azaniumyl]-2-hydroxypropane-1-sulfonate Chemical compound OCCN(CCO)CC(O)CS(O)(=O)=O XCBLFURAFHFFJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XNPKNHHFCKSMRV-UHFFFAOYSA-N 4-(cyclohexylamino)butane-1-sulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCCCNC1CCCCC1 XNPKNHHFCKSMRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IDDDVXIUIXWAGJ-DDSAHXNVSA-N 4-[(1r)-1-aminoethyl]-n-pyridin-4-ylcyclohexane-1-carboxamide;dihydrochloride Chemical compound Cl.Cl.C1CC([C@H](N)C)CCC1C(=O)NC1=CC=NC=C1 IDDDVXIUIXWAGJ-DDSAHXNVSA-N 0.000 description 1
- LOJNFONOHINEFI-UHFFFAOYSA-N 4-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]butane-1-sulfonic acid Chemical compound OCCN1CCN(CCCCS(O)(=O)=O)CC1 LOJNFONOHINEFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004042 4-aminobutyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N([H])[H] 0.000 description 1
- 108010068327 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase Proteins 0.000 description 1
- 239000007991 ACES buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007988 ADA buffer Substances 0.000 description 1
- 101150035093 AMPD gene Proteins 0.000 description 1
- 108010066676 Abrin Proteins 0.000 description 1
- 208000032484 Accidental exposure to product Diseases 0.000 description 1
- 206010069754 Acquired gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 241000256111 Aedes <genus> Species 0.000 description 1
- 206010001881 Alveolar proteinosis Diseases 0.000 description 1
- 108700016232 Arg(2)-Sar(4)- dermorphin (1-4) Proteins 0.000 description 1
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100038080 B-cell receptor CD22 Human genes 0.000 description 1
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 239000007992 BES buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007989 BIS-Tris Propane buffer Substances 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 239000008000 CHES buffer Substances 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 238000000685 Carr-Purcell-Meiboom-Gill pulse sequence Methods 0.000 description 1
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 1
- 101710094648 Coat protein Proteins 0.000 description 1
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 1
- 206010010430 Congenital cytomegalovirus infection Diseases 0.000 description 1
- 206010050685 Cytokine storm Diseases 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 206010011831 Cytomegalovirus infection Diseases 0.000 description 1
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 description 1
- 101710112752 Cytotoxin Proteins 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- 101900355199 Dengue virus type 4 Envelope protein E Proteins 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 1
- 101710121417 Envelope glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 102000003974 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 1
- 108090000379 Fibroblast growth factor 2 Proteins 0.000 description 1
- 108091006027 G proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000030782 GTP binding Human genes 0.000 description 1
- 108091000058 GTP-Binding Proteins 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100021181 Golgi phosphoprotein 3 Human genes 0.000 description 1
- 102000004457 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- OWXMKDGYPWMGEB-UHFFFAOYSA-N HEPPS Chemical compound OCCN1CCN(CCCS(O)(=O)=O)CC1 OWXMKDGYPWMGEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007996 HEPPS buffer Substances 0.000 description 1
- 238000001321 HNCO Methods 0.000 description 1
- 101000884305 Homo sapiens B-cell receptor CD22 Proteins 0.000 description 1
- 101000889276 Homo sapiens Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000917826 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-a Proteins 0.000 description 1
- 101000917858 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A Proteins 0.000 description 1
- 101000917839 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Proteins 0.000 description 1
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CPELXLSAUQHCOX-UHFFFAOYSA-N Hydrogen bromide Chemical class Br CPELXLSAUQHCOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 description 1
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 description 1
- 206010056254 Intrauterine infection Diseases 0.000 description 1
- OWIKHYCFFJSOEH-UHFFFAOYSA-N Isocyanic acid Chemical compound N=C=O OWIKHYCFFJSOEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010023126 Jaundice Diseases 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 1
- 102100029185 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Human genes 0.000 description 1
- 239000007993 MOPS buffer Substances 0.000 description 1
- 241000282553 Macaca Species 0.000 description 1
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000016285 Movement disease Diseases 0.000 description 1
- FSVCELGFZIQNCK-UHFFFAOYSA-N N,N-bis(2-hydroxyethyl)glycine Chemical compound OCCN(CCO)CC(O)=O FSVCELGFZIQNCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DBXNUXBLKRLWFA-UHFFFAOYSA-N N-(2-acetamido)-2-aminoethanesulfonic acid Chemical compound NC(=O)CNCCS(O)(=O)=O DBXNUXBLKRLWFA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MKWKNSIESPFAQN-UHFFFAOYSA-N N-cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCNC1CCCCC1 MKWKNSIESPFAQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JOCBASBOOFNAJA-UHFFFAOYSA-N N-tris(hydroxymethyl)methyl-2-aminoethanesulfonic acid Chemical compound OCC(CO)(CO)NCCS(O)(=O)=O JOCBASBOOFNAJA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012565 NMR experiment Methods 0.000 description 1
- 238000011887 Necropsy Methods 0.000 description 1
- 208000025966 Neurological disease Diseases 0.000 description 1
- 101800001030 Non-structural protein 2A Proteins 0.000 description 1
- 101710144111 Non-structural protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 101800001020 Non-structural protein 4A Proteins 0.000 description 1
- 101800001019 Non-structural protein 4B Proteins 0.000 description 1
- 101710144121 Non-structural protein 5 Proteins 0.000 description 1
- 102000007999 Nuclear Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010089610 Nuclear Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101710141454 Nucleoprotein Proteins 0.000 description 1
- 241000337007 Oceania Species 0.000 description 1
- 101001028244 Onchocerca volvulus Fatty-acid and retinol-binding protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 239000007990 PIPES buffer Substances 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000282579 Pan Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 239000004264 Petrolatum Substances 0.000 description 1
- 240000001846 Pinus cembra Species 0.000 description 1
- 229920000954 Polyglycolide Polymers 0.000 description 1
- 229920001214 Polysorbate 60 Polymers 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 101710083689 Probable capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N Propionic acid Chemical class CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 101800001554 RNA-directed RNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 208000035415 Reinfection Diseases 0.000 description 1
- 208000006289 Rett Syndrome Diseases 0.000 description 1
- 108010039491 Ricin Proteins 0.000 description 1
- 241000315672 SARS coronavirus Species 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 101100043638 Solanum tuberosum SS3 gene Proteins 0.000 description 1
- HVUMOYIDDBPOLL-XWVZOOPGSA-N Sorbitan monostearate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1O HVUMOYIDDBPOLL-XWVZOOPGSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-NQAPHZHOSA-N Sorbitol Polymers OCC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-NQAPHZHOSA-N 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- UZMAPBJVXOGOFT-UHFFFAOYSA-N Syringetin Natural products COC1=C(O)C(OC)=CC(C2=C(C(=O)C3=C(O)C=C(O)C=C3O2)O)=C1 UZMAPBJVXOGOFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007994 TES buffer Substances 0.000 description 1
- 101800001690 Transmembrane protein gp41 Proteins 0.000 description 1
- 239000007997 Tricine buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 208000034953 Twin anemia-polycythemia sequence Diseases 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000545067 Venus Species 0.000 description 1
- 206010058874 Viraemia Diseases 0.000 description 1
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 description 1
- 101500019615 West Nile virus Non-structural protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 241001454727 Xenos Species 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 231100000818 accidental exposure Toxicity 0.000 description 1
- 108010076089 accutase Proteins 0.000 description 1
- 150000001242 acetic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- UDMBCSSLTHHNCD-KQYNXXCUSA-N adenosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O UDMBCSSLTHHNCD-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 125000003172 aldehyde group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 210000004381 amniotic fluid Anatomy 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 1
- 239000008135 aqueous vehicle Substances 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N azane;(2e)-3-ethyl-2-[(e)-(3-ethyl-6-sulfo-1,3-benzothiazol-2-ylidene)hydrazinylidene]-1,3-benzothiazole-6-sulfonic acid Chemical compound [NH4+].[NH4+].S/1C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N(CC)C\1=N/N=C1/SC2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N1CC OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N 0.000 description 1
- 150000001558 benzoic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 235000019445 benzyl alcohol Nutrition 0.000 description 1
- 102000012740 beta Adrenergic Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010079452 beta Adrenergic Receptors Proteins 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007998 bicine buffer Substances 0.000 description 1
- 238000013357 binding ELISA Methods 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 239000006177 biological buffer Substances 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000008512 biological response Effects 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 1
- OWMVSZAMULFTJU-UHFFFAOYSA-N bis-tris Chemical compound OCCN(CCO)C(CO)(CO)CO OWMVSZAMULFTJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HHKZCCWKTZRCCL-UHFFFAOYSA-N bis-tris propane Chemical compound OCC(CO)(CO)NCCCNC(CO)(CO)CO HHKZCCWKTZRCCL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000036760 body temperature Effects 0.000 description 1
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 1
- BPKIGYQJPYCAOW-FFJTTWKXSA-I calcium;potassium;disodium;(2s)-2-hydroxypropanoate;dichloride;dihydroxide;hydrate Chemical compound O.[OH-].[OH-].[Na+].[Na+].[Cl-].[Cl-].[K+].[Ca+2].C[C@H](O)C([O-])=O BPKIGYQJPYCAOW-FFJTTWKXSA-I 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000000234 capsid Anatomy 0.000 description 1
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 238000003570 cell viability assay Methods 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000007541 cellular toxicity Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 229940081733 cetearyl alcohol Drugs 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 108010062119 complement 1q receptor Proteins 0.000 description 1
- 230000024203 complement activation Effects 0.000 description 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 239000000599 controlled substance Substances 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 1
- 230000001054 cortical effect Effects 0.000 description 1
- 206010052015 cytokine release syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 description 1
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000002254 cytotoxic agent Substances 0.000 description 1
- 239000002619 cytotoxin Substances 0.000 description 1
- 201000009892 dengue shock syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000008021 deposition Effects 0.000 description 1
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 description 1
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000000104 diagnostic biomarker Substances 0.000 description 1
- 229910003460 diamond Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010432 diamond Substances 0.000 description 1
- KCFYHBSOLOXZIF-UHFFFAOYSA-N dihydrochrysin Natural products COC1=C(O)C(OC)=CC(C2OC3=CC(O)=CC(O)=C3C(=O)C2)=C1 KCFYHBSOLOXZIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 239000002270 dispersing agent Substances 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 239000008298 dragée Substances 0.000 description 1
- 230000008482 dysregulation Effects 0.000 description 1
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000002500 effect on skin Effects 0.000 description 1
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 1
- 230000001804 emulsifying effect Effects 0.000 description 1
- 239000008387 emulsifying waxe Substances 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 206010014599 encephalitis Diseases 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 230000017188 evasion or tolerance of host immune response Effects 0.000 description 1
- 231100000776 exotoxin Toxicity 0.000 description 1
- 239000002095 exotoxin Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 1
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 1
- 235000019634 flavors Nutrition 0.000 description 1
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000037406 food intake Effects 0.000 description 1
- 235000003599 food sweetener Nutrition 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 150000002303 glucose derivatives Polymers 0.000 description 1
- 150000002304 glucoses Polymers 0.000 description 1
- 125000002791 glucosyl group Polymers C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 230000003862 health status Effects 0.000 description 1
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000000833 heterodimer Substances 0.000 description 1
- 238000000990 heteronuclear single quantum coherence spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000012510 hollow fiber Substances 0.000 description 1
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 1
- 150000003840 hydrochlorides Chemical class 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000032226 immune complex clearance Effects 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000003832 immune regulation Effects 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 1
- 230000009851 immunogenic response Effects 0.000 description 1
- 229940027941 immunoglobulin g Drugs 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 239000005414 inactive ingredient Substances 0.000 description 1
- 210000004263 induced pluripotent stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 108091008042 inhibitory receptors Proteins 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000005305 interferometry Methods 0.000 description 1
- 238000002075 inversion recovery Methods 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- 210000001865 kupffer cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 1
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 1
- 239000006210 lotion Substances 0.000 description 1
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 1
- 238000007403 mPCR Methods 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 1
- 230000036244 malformation Effects 0.000 description 1
- 150000002690 malonic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 description 1
- 210000003071 memory t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 239000011325 microbead Substances 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 238000007431 microscopic evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000002941 microtiter virus yield reduction assay Methods 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 229940042472 mineral oil Drugs 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 1
- 238000000329 molecular dynamics simulation Methods 0.000 description 1
- 238000012900 molecular simulation Methods 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- OHDXDNUPVVYWOV-UHFFFAOYSA-N n-methyl-1-(2-naphthalen-1-ylsulfanylphenyl)methanamine Chemical compound CNCC1=CC=CC=C1SC1=CC=CC2=CC=CC=C12 OHDXDNUPVVYWOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000003988 neural development Effects 0.000 description 1
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 description 1
- 230000000926 neurological effect Effects 0.000 description 1
- 230000005156 neurotropism Effects 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 102000045246 noggin Human genes 0.000 description 1
- 108700007229 noggin Proteins 0.000 description 1
- 230000036963 noncompetitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000000655 nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000012587 nuclear overhauser effect experiment Methods 0.000 description 1
- GLDOVTGHNKAZLK-UHFFFAOYSA-N octadecan-1-ol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCO GLDOVTGHNKAZLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 239000007935 oral tablet Substances 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 1
- 125000000913 palmityl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000010412 perfusion Effects 0.000 description 1
- KHIWWQKSHDUIBK-UHFFFAOYSA-N periodic acid Chemical compound OI(=O)(=O)=O KHIWWQKSHDUIBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940066842 petrolatum Drugs 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 1
- 230000007505 plaque formation Effects 0.000 description 1
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920000747 poly(lactic acid) Polymers 0.000 description 1
- 108010052044 polyclonal B cell activator Proteins 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 description 1
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 description 1
- 239000000244 polyoxyethylene sorbitan monooleate Substances 0.000 description 1
- 239000001818 polyoxyethylene sorbitan monostearate Substances 0.000 description 1
- 235000010989 polyoxyethylene sorbitan monostearate Nutrition 0.000 description 1
- 229920001451 polypropylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229940068977 polysorbate 20 Drugs 0.000 description 1
- 229940113124 polysorbate 60 Drugs 0.000 description 1
- 229940068968 polysorbate 80 Drugs 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 229940071643 prefilled syringe Drugs 0.000 description 1
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 1
- 235000013772 propylene glycol Nutrition 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 201000003489 pulmonary alveolar proteinosis Diseases 0.000 description 1
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 238000003118 sandwich ELISA Methods 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000013515 script Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 230000001953 sensory effect Effects 0.000 description 1
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 239000012679 serum free medium Substances 0.000 description 1
- 230000005582 sexual transmission Effects 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- 239000008354 sodium chloride injection Substances 0.000 description 1
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 230000037439 somatic mutation Effects 0.000 description 1
- 239000001587 sorbitan monostearate Substances 0.000 description 1
- 235000011076 sorbitan monostearate Nutrition 0.000 description 1
- 229940035048 sorbitan monostearate Drugs 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 1
- 150000003467 sulfuric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 description 1
- 238000011285 therapeutic regimen Methods 0.000 description 1
- 210000000115 thoracic cavity Anatomy 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000010981 turquoise Substances 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
- 239000003871 white petrolatum Substances 0.000 description 1
Description
Настоящее изобретение относится к антителам и их антигенсвязывающим фрагментам, которые связываются специфически с эпитопами вируса Зика (ZIKV). Такие антитела (I) потенциально нейтрализуют инфекцию, вызванную вирусом Зика (ZIKV), или (II) направлены к NS1 ZIKV и могут использоваться в качестве диагностических средств. Изобретение также относится к нуклеиновым кислотам, которые кодируют антитела и иммортализуют В-клетки, которые продуцируют такие антитела и фрагменты антител. Дополнительно, изобретение относится к применению антител и фрагментов антител согласно изобретению в способах диагностики, предотвращения и лечения инфекции ZIKV.The present invention relates to antibodies and antigen-binding fragments thereof that bind specifically to epitopes of the Zika virus (ZIKV). Such antibodies (I) potentially neutralize Zika virus (ZIKV) infection or (II) target ZIKV NS1 and can be used as diagnostic tools. The invention also relates to nucleic acids that encode antibodies and immortalize B cells that produce such antibodies and antibody fragments. Additionally, the invention relates to the use of antibodies and antibody fragments according to the invention in methods of diagnosing, preventing and treating ZIKV infection.
Вирус Зика (ZIKV), передаваемый комарами флавивирус, представляет собою чрезвычайную ситуацию в области здравоохранения. ZIKV впервые был выделен от макак в 1947 году в лесах Зика (Zika) в Уганде (G. W. A. Dick, S.F. Kitchen, A.J. Haddow, Zika virus. I. Isolations and serological specificity. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 46, 509-520 (1952)) и первое инфицирование человека было описано в Нигерии в 1954 г. F.N. Macnamara, Zika virus: a report on three cases of human infection during an epidemic of jaundice in Nigeria. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 48, 139-145 (1954)). С того времени, инфекции, вызванные ZIKV, спорадически возникали в Африке и юго-восточной Азии (D. Musso, Van Mai Cao-Lormeau, D.J. Gubler, Zika virus: following the path of dengue and chikungunya? The Lancet. 386, 243-244 (2015)), но эпидемии были описаны в Микронезии в 2007 г. (M.R. Duffy и др., Zika virus outbreak on Yap Island, Federated States of Micronesia. N Engl J Med. 360, 2536-2543 (2009)) и во Французской Полинезии 2013-14 гг., впоследствии вирус распространился в другие страны Океании (V.-M. Cao-Lormeau, D. Musso, Emerging arboviruses in the Pacific. Lancet. 384, 1571-1572 (2014); D. Musso, E.J. Nilles, V.-M. Cao-Lormeau, Rapid spread of emerging Zika virus in the Pacific area. Clin. Microbiol. Infect. 20, 0595-6 (2014)). После его интродукции в Бразилии в 2015 г., ZIKV быстро распространился и в феврале 2016 г. Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) задекларировала это как чрезвычайную ситуацию в области здравоохранения международного значения (L. R. Baden, L.R. Petersen, D.J. Jamieson, A.M. Powers, M.A. Honein, Zika Virus. N. Engl. J. Med. 374, 1552-1563 (2016); A.S. Fauci, D.M. Morens, Zika Virus in the Americas - Yet Another Arbovirus Threat. N Engl J Med, 160113142101009 (2016); D. L. Heymann и др., Zika virus and microcephaly: why is this situation a PHEIC? Lancet. 387, 719-721 (2016)). Главным путем инфицирования ZIKV являются укусы комаров Aedes, но также вирус может передаваться половым путем (D. Musso и др., Potential sexual transmission of Zika virus. Emerg Infect Dis. 21, 359-361 (2015)) и передаваться вертикально (J. Mlakar и др., Zika Virus Associated with Microcephaly. N Engl J Med. 374, 951-958 (2016)). Несмотря на то, что большинство инфекций, вызванных ZIKV, являются асимптоматическими или вызывают только незначительные симптомы, существуют доказательства того, что инфицирование ZIKV может приводить к неврологическим осложнениям, таким как синдром Гиена-Барре у взрослых (V.-M. Cao-Lormeau и др., Guillain-Barre Syndrome outbreak associated with Zika virus infection in French Polynesia: a case-control study. Lancet. 0 (2016), doi:10.1016/S0140-6736(16)00562-6) и врожденным порокам развития, включая микроцефалию в развивающихся эмбрионов G. Calvet, R.S. Aguiar, A. Melo, S.A. Sampaio, Detection and sequencing of Zika virus from amniotic fluid of fetuses with microcephaly in Brazil: a case study. Lancet Infect Dis (2016), doi:10.1016/s1473-3099(16)00095-5; J. Mlakar и др., Zika Virus Associated with Microcephaly. N Engl J Med. 374, 951-958 (2016); E.J. Rubin, M.F. Greene, L.R. Baden, Zika Virus and Microcephaly. N Engl J Med (2016), doi:10.1056/NEJMel601862), возможно, вследствие его способности инфицировать нейральные клетки-предшественники человека (Н. Tang и др., Zika Virus Infects Human Cortical Neural Progenitors and Attenuates Their Growth. Stem Cell, 1-5 (2016)).Zika virus (ZIKV), a mosquito-borne flavivirus, is a public health emergency. ZIKV was first isolated from macaques in 1947 in the Zika forests of Uganda (G. W. A. Dick, S. F. Kitchen, A. J. Haddow, Zika virus. I. Isolations and serological specificity. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 46 , 509-520 (1952)) and the first human infection was described in Nigeria in 1954 by F.N. Macnamara, Zika virus: a report on three cases of human infection during an epidemic of jaundice in Nigeria. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 48, 139-145 (1954). Since that time, ZIKV infections have occurred sporadically in Africa and southeast Asia (D. Musso, Van Mai Cao-Lormeau, D.J. Gubler, Zika virus: following the path of dengue and chikungunya? The Lancet. 386, 243- 244 (2015)), but epidemics were described in Micronesia in 2007 (M.R. Duffy et al., Zika virus outbreak on Yap Island, Federated States of Micronesia. N Engl J Med. 360, 2536-2543 (2009)) and in French Polynesia 2013-14, the virus subsequently spread to other countries in Oceania (V.-M. Cao-Lormeau, D. Musso, Emerging arboviruses in the Pacific. Lancet. 384, 1571-1572 (2014); D. Musso , E. J. Nilles, V.-M. Cao-Lormeau, Rapid spread of emerging Zika virus in the Pacific area. Clin. Microbiol. Infect. 20, 0595-6 (2014). Following its introduction in Brazil in 2015, ZIKV spread rapidly and was declared a public health emergency of international concern by the World Health Organization (WHO) in February 2016 (L. R. Baden, L. R. Petersen, D. J. Jamieson, A. M. Powers, M. A. Honein , Zika Virus. N. Engl. J. Med. 374, 1552-1563 (2016); A. S. Fauci, D. M. Morens, Zika Virus in the Americas - Yet Another Arbovirus Threat. N Engl. J. Med., 160113142101009 (2016); D. L. Heymann et al., Zika virus and microcephaly: why is this situation a PHEIC? Lancet. 387, 719-721 (2016)). The main route of ZIKV infection is through the bites of Aedes mosquitoes, but the virus can also be sexually transmitted (D. Musso et al., Potential sexual transmission of Zika virus. Emerg Infect Dis. 21, 359-361 (2015)) and transmitted vertically (J. Mlakar et al., Zika Virus Associated with Microcephaly. N Engl J Med. 374, 951-958 (2016). Although most ZIKV infections are asymptomatic or cause only minor symptoms, there is evidence that ZIKV infection can lead to neurological complications such as Guillain-Barré syndrome in adults (V.-M. Cao-Lormeau and al., Guillain-Barre Syndrome outbreak associated with Zika virus infection in French Polynesia: a case-control study. Lancet. 0 (2016), doi:10.1016/S0140-6736(16)00562-6) and congenital malformations, including microcephaly in developing embryos G. Calvet, R.S. Aguiar, A. Melo, S.A. Sampaio, Detection and sequencing of Zika virus from amniotic fluid of fetuses with microcephaly in Brazil: a case study. Lancet Infect Dis (2016), doi:10.1016/s1473-3099(16)00095-5; J. Mlakar et al., Zika Virus Associated with Microcephaly. N Engl J Med. 374, 951-958 (2016); E.J. Rubin, M.F. Greene, L.R. Baden, Zika Virus and Microcephaly. N Engl J Med (2016), doi:10.1056/NEJMel601862), possibly due to its ability to infect human neural progenitor cells (N. Tang et al., Zika Virus Infects Human Cortical Neural Progenitors and Attenuates Their Growth. Stem Cell, 1 -5 (2016)).
ZIKV относится к роду флавивирусов, который также включает вирус лихорадки Западного Нила, вирус денге, вирус клещевого энцефалита, вирус желтой лихорадки, и некоторые другие вирусы, которые могут вызывать энцефалиты. Флавивирусы имеют оболочку, с икосаэдрической и сферической геометрией.ZIKV belongs to the flavivirus genus, which also includes West Nile virus, dengue virus, tick-borne encephalitis virus, yellow fever virus, and several other viruses that can cause encephalitis. Flaviviruses have an envelope, with icosahedral and spherical geometry.
Диаметр составляет приблизительно 50 нм. Геномы представляют собой положительнуюсмысловую РНК и несегментированы, длиной приблизительно 10-11 тысяч пар оснований. Геном флавивирусов кодирует 3 структурных белка (Капсид, prM, и Оболочка) и 8 неструктурных белков (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, NS5 и NS5B).The diameter is approximately 50 nm. The genomes are positive sense RNA and are non-segmented, approximately 10-11 kilobases in length. The flavivirus genome encodes 3 structural proteins (Capsid, prM, and Envelope) and 8 nonstructural proteins (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, NS5, and NS5B).
В то время как белки оболочки флавивирусов (envelope, E) опосредуют слияние и являются основной мишенью нейтрализирующих антител, неструктурный белок 1 (NS1) секретируется инфицированными клетками и вовлечен в уклонение от распознавания иммунной системой и патогенезе (D.A. Muller, P.R. Young, The flavivirus NS1 protein: molecular and structural biology, immunology, role in pathogenesis and application as a diagnostic biomarker. Antiviral Res. 98, 192-208 (2013)). Два недавних структурных исследования показали высокий уровень структурного сходства между Е белком ZIKV и такими же белками других флавивирусов, таких как вирус денге (DENV), вирус желтой лихорадки (YFV) и вирус лихорадки Западного Нила (WNV), но также обнаружили уникальные характерные особенности, относящиеся к нейротропизму ZIKV ( L. Dai и др., Structures of the Zika Virus envelope protein and Its Complex with a Flavivirus Broadly Protective Antibody. Cell Host Microbe (2016), doi:10.1016/j.chom.2016.04.013; D. Sirohi и др., The 3.8 A resolution cryo-EM structure of Zika virus. Science, aaf5316 (2016)). Аналогичным образом, структурный анализ ZIKV NS1 обнаружил консервативные особенности NS1, характерные другим флавивирусами, хотя с различными электростатическими характеристиками (J. Kim и др., Zika virus NS1While flavivirus envelope proteins (envelope, E) mediate fusion and are the primary target of neutralizing antibodies, nonstructural protein 1 (NS1) is secreted by infected cells and is involved in immune evasion and pathogenesis (D.A. Muller, P.R. Young, The flavivirus NS1 protein: molecular and structural biology, immunology, role in pathogenesis and application as a diagnostic biomarker. Antiviral Res. 98, 192-208 (2013)). Two recent structural studies have shown a high level of structural similarity between the ZIKV E protein and those of other flaviviruses, such as dengue virus (DENV), yellow fever virus (YFV), and West Nile virus (WNV), but also revealed unique characteristic features related to ZIKV neurotropism ( L. Dai et al., Structures of the Zika Virus envelope protein and Its Complex with a Flavivirus Broadly Protective Antibody. Cell Host Microbe (2016), doi:10.1016/j.chom.2016.04.013; D. Sirohi et al., The 3.8 A resolution cryo-EM structure of Zika virus. Science, aaf5316 (2016). Similarly, structural analysis of ZIKV NS1 revealed conserved features of NS1 shared by other flaviviruses, although with different electrostatic characteristics (J. Kim et al., Zika virus NS1
- 1 046175 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses, 1-6 (2016)).- 1 046175 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses, 1-6 (2016)).
Феномен, который является характерным для определенных флавивирусов, состоит в активности, усиливающей заболевание, перекрестно-реагирующих антител, выработка которых вызывается предшествующим инфицированием гетерологическими вирусами. В случае вируса денге (DENV), для которого известно 4 серотипа, существует эпидемиологическое подтверждение, что первичное инфицирование защищает от повторной инфекции тем же самым серотипом, но представляет собой фактор риска развития тяжелого заболевания при повторном инфицировании другим серотипом (S.B. Halstead, Dengue Antibody-Dependent Enhancement: Knowns and Unknowns. Microbiol Spectr. 2, 249-271 (2014)). Это усугубленное заболевание запускается Е и prM-специфическими антителами, которые не могут нейтрализовать входящий вирус, но вместо этого усиливают его захват клетками, экспрессирующими Fc рецептор (FcR+), что приводит к усилению вирусной репликации и активации перекрестно-реагирующих Т-клеток памяти. Полагают, что развивающаяся вследствие этого цитокиновый шторм является основой наиболее тяжелой формы заболевания, известной как геморрагическая лихорадка денге/синдром шока денге (S.B. Halstead, Neutralization and antibody-dependent enhancement of dengue viruses. Adv Virus Res. 60, 421-467 (2003); G. Screaton, J. Mongkolsapaya, S. Yacoub, С. Roberts, New insights into the immunopathology and control of dengue virus infection. Nat Rev Immunol. 15, 745-759 (2015). Роль антител при тяжелых формах денге подтверждается исследованиями, указывающими на то, что затухающие уровни материнских антител у новорожденных являются более высоким фактором риска развития тяжелой болезни денге (S.B. Halstead, Neutralization and antibody-dependent enhancement of dengue viruses. Adv Virus Res. 60, 421-467 (2003); S. B. Halstead и др., Dengue hemorrhagic fever in infants: research opportunities ignored. Emerging Infect Dis. 8, 1474-1479 (2002); Т.Н. Nguyen и др., Dengue hemorrhagic fever in infants: a study of clinical and cytokine profiles. J Infect Dis. 189, 221-232 (2004); A.L. Rothman, Dengue: defining protective versus pathologic immunity. J Clin Invest. 113, 946-951 (2004)).A phenomenon that is characteristic of certain flaviviruses is the activity of disease-enhancing cross-reactive antibodies, the production of which is caused by previous infection with heterologous viruses. In the case of dengue virus (DENV), for which 4 serotypes are known, there is epidemiological evidence that primary infection protects against re-infection with the same serotype, but is a risk factor for severe disease if re-infected with a different serotype (SB Halstead, Dengue Antibody- Dependent Enhancement: Knowns and Unknowns. Microbiol Spectr. 2, 249-271 (2014). This aggravated disease is triggered by E and prM-specific antibodies that fail to neutralize incoming virus but instead enhance its uptake by Fc receptor (FcR + )-expressing cells, leading to increased viral replication and activation of cross-reacting memory T cells. The resulting cytokine storm is believed to be the basis of the most severe form of the disease, known as dengue hemorrhagic fever/dengue shock syndrome (SB Halstead, Neutralization and antibody-dependent enhancement of dengue viruses. Adv Virus Res. 60, 421-467 (2003) ; G. Screaton, J. Mongkolsapaya, S. Yacoub, S. Roberts, New insights into the immunopathology and control of dengue virus infection. Nat Rev Immunol. 15, 745-759 (2015). The role of antibodies in severe forms of dengue is supported by research. , indicating that waning levels of maternal antibodies in newborns are a higher risk factor for the development of severe dengue disease (SB Halstead, Neutralization and antibody-dependent enhancement of dengue viruses. Adv Virus Res. 60, 421-467 (2003); SB Halstead et al., Dengue hemorrhagic fever in infants: research opportunities ignored. Emerging Infect Dis. 8, 1474-1479 (2002); T. N. Nguyen et al., Dengue hemorrhagic fever in infants: a study of clinical and cytokine profiles. J Infect Dis. 189, 221-232 (2004); AL Rothman, Dengue: defining protective versus pathologic immunity. J Clin Invest. 113, 946-951 (2004).
В последнее время было показано, что большинство антител, которые реагируют с белком оболочки DENV, также связываются с ZIKV, но те, которые распознают основной линейный эпитоп слияние-петля (FLE), не нейтрализуют ZIKV, а вместо этого способствуют антителозависимому усилению (ADE) инфекции ZIKV (Dejnirattisai W, Supasa P, Wongwiwat W, Rouvinski A, Barba-Spaeth G, Duangchinda T, Sakuntabhai A, Cao-Lormeau VM, Malasit P, Rey FA, Mongkolsapaya J, Screaton GR: Denge virus sero-crossreactivity drives antibody-dependent enhancement of infection with zika virus. Nat Immunol. 2016 Jun 23. doi: 10.1038/ni.3515. [предварительная электронная публикация]).Recently, it has been shown that most antibodies that react with the DENV envelope protein also bind to ZIKV, but those that recognize the major linear fusion-loop epitope (FLE) do not neutralize ZIKV but instead promote antibody-dependent enhancement (ADE) ZIKV infections (Dejnirattisai W, Supasa P, Wongwiwat W, Rouvinski A, Barba-Spaeth G, Duangchinda T, Sakuntabhai A, Cao-Lormeau VM, Malasit P, Rey FA, Mongkolsapaya J, Screaton GR: Denge virus sero-crossreactivity drives antibody -dependent enhancement of infection with zika virus. Nat Immunol. 2016 Jun 23. doi: 10.1038/ni.3515. [advance electronic publication]).
Кроме того, в соответствии с ВОЗ, повышение в последнее время случаев микроцефалии и других неврологических нарушений, связанных с инфекцией, вызванной вирусом Зика, способствует увеличению потребности лабораторного тестирования для обнаружения инфекции, вызванной вирусом Зика. В связи с этим, необходима высокая специфичность антитела для того, чтобы отличить инфекцию, вызванную ZIKV, от инфекции, вызванной другими флавивирусами. Тем не менее, известные антитела к вирусу Зика типично перекрестно реагируют с другими флавивирусами и, следовательно, не пригодны для дифференцировки инфекции, вызванной ZIKV, от инфекции, вызванной другими флавивирусами.Additionally, according to WHO, the recent increase in the incidence of microcephaly and other neurological disorders associated with Zika virus infection is increasing the need for laboratory testing to detect Zika virus infection. Therefore, high antibody specificity is required to distinguish infection caused by ZIKV from infection caused by other flaviviruses. However, known Zika virus antibodies typically cross-react with other flaviviruses and are therefore not useful for differentiating ZIKV infection from infection with other flaviviruses.
Учитывая вышеизложенное, задачей настоящего изобретения является обеспечение новых антител, которые специфически связываются с эпитопами ZIKV. Также задачей настоящего изобретения является обеспечение эффективно нейтрализирующих антител к ZIKV. Такие антитела предпочтительно не способствуют антителозависимому усилению (ADE) инфекции, вызванной вирусом Зика. Также задачей настоящего изобретения является обеспечение высоко специфических антител к ZIKV, пригодных для диагностики и тестирования инфекции ZIKV и способов диагностики, используя такие антитела.In view of the above, it is an object of the present invention to provide new antibodies that specifically bind to ZIKV epitopes. It is also an object of the present invention to provide effective neutralizing antibodies to ZIKV. Such antibodies preferably do not contribute to antibody-dependent enhancement (ADE) of Zika virus infection. It is also an object of the present invention to provide highly specific anti-ZIKV antibodies useful for diagnosing and testing ZIKV infection and diagnostic methods using such antibodies.
Задача, лежащая в основе настоящего изобретения, решается с помощью объектов, раскрытых в заявляемой формуле изобретения.The problem underlying the present invention is solved using the objects disclosed in the claimed claims.
Несмотря на то, что настоящее изобретение более подробно описано ниже, подразумевается, что оно не ограничивается конкретными методологиями, протоколами и реагентами, раскрытыми в настоящей заявке, так как они могут изменяться. Также подразумевается, что терминология, используемая в настоящей заявке, не предназначена для ограничения объема настоящего изобретения, которое определяется только пунктами приложенной формулы изобретения. Если специально не указано иначе, все технические и научные термины, используемые в настоящей заявке, имеют такие же значения, что и обычно подразумеваются квалифицированным специалистом в данной области техники.Although the present invention is described in more detail below, it is intended that it is not limited to the specific methodologies, protocols and reagents disclosed herein, as they may vary. It is also understood that the terminology used in this application is not intended to limit the scope of the present invention, which is defined only by the appended claims. Unless specifically stated otherwise, all technical and scientific terms used in this application have the same meaning as commonly understood by one skilled in the art.
Далее будут описаны элементы настоящего изобретения. Эти элементы перечислены в специфических вариантах осуществления, тем не менее, следует принять во внимание, что они могут комбинироваться любым образом и в любом количестве. Это описание следует понимать как поддерживающее и охватывающее варианты осуществления, которое объединяет конкретно описанные варианты осуществления с любым количеством описанных и/или предпочтительных элементов. Кроме того, любые перестановки и комбинации всех описанных элементов в настоящей заявке следует считать раскрытыми описанием настоящей заявке, если в контексте не указано другое.Next, elements of the present invention will be described. These elements are listed in specific embodiments, however, it should be appreciated that they can be combined in any manner and in any quantity. This description is to be understood as supporting and covering embodiments that combine the specifically described embodiments with any number of described and/or preferred elements. In addition, any permutations and combinations of all described elements in this application should be considered as disclosed by the description of this application, unless the context indicates otherwise.
Для всего описания и пунктов приложенной формулы изобретения, если из контекста не следует иначе, термин содержат, и такие как вариации, как содержит и содержащий, подразумевают включение указанного компонента, целого числа или стадии, но не исключение любого другого компонента,For the entire specification and claims attached, unless the context otherwise requires, the term contain, and such variations as contains and containing, are intended to include the specified component, integer, or step, but not to exclude any other component,
- 2 046175 целого числа или стадии. Термин состоит из является конкретным вариантом осуществления термина содержит, где любой другой неуказанный компонент, целое число или стадия исключены. В контексте настоящего изобретения, термин содержит охватывает термин состоит из. Следовательно, термин содержащий охватывает включающий, а также состоящий, например, композиция содержащая X, может состоять только из X или может включать некоторые дополнительные элементы, например, X+Y.- 2 046175 integer or stage. The term consists of is a specific embodiment of the term contains, where any other unspecified component, integer or step is excluded. In the context of the present invention, the term contains includes the term consists of. Therefore, the term containing covers including as well as consisting, for example, a composition containing X may consist only of X or may include some additional elements, for example X+Y.
Термины в единственном числе, используемые в контексте описания изобретения (в особенности в контексте пунктов формулы изобретения) следует рассматривать как охватывающие как единственное число, так и множественное число, если специально не указано иначе в настоящей заявке или очевидно не противоречит контексту. Перечисление диапазонов значений в настоящей заявке только предназначено в качестве сокращенного способа ссылки индивидуально на каждое отдельное значение, подпадающее под указанный диапазон. Если специально не указано иначе в настоящей заявке, то каждое индивидуальное значение включено в описание, таким образом, если бы оно было индивидуально процитировано в настоящей заявке. Никакие слова в описании не должны рассматриваться как указание любого незаявленного элемента, важного для практического осуществления изобретения.Terms in the singular number used in the context of the description of the invention (especially in the context of the claims) should be considered to cover both the singular and the plural unless specifically stated otherwise in this application or clearly inconsistent with the context. The listing of ranges of values in this application is only intended as a shorthand way of referring individually to each individual value falling within the specified range. Unless specifically stated otherwise herein, each individual value is included in the specification in the same manner as if it were individually cited herein. Nothing in the specification should be construed as indicating any unclaimed element important to the practice of the invention.
Выражение по существу не исключает полностью например, композиция, которая по существу не содержит Y, может полностью не содержать Y. При необходимости, выражение по существу может быть пропущено из определения согласно изобретению.The expression essentially does not completely exclude, for example, a composition that is substantially free of Y may be completely free of Y. If necessary, the expression essentially may be omitted from the definition according to the invention.
Термин приблизительно по отношению к числовой величине х обозначает х±10%.The term approximately in relation to the numerical value of x means x±10%.
Термин заболевание, как используется в настоящей заявке, в целом является синонимом и используется взаимозаменяемо с терминами нарушение и состояние (в качестве медицинского состояния), в том смысле, что все отражают аномальное состояние организма человека или животного или одной из его частей, в которой нарушено нормальное функционирование, типично проявляется отличающимися признаками и симптомами, и вызывает у человека или животного уменьшенную продолжительность или качество жизни.The term disease, as used herein, is generally synonymous with and is used interchangeably with the terms disorder and condition (as a medical condition), in the sense that all reflect an abnormal condition of the human or animal body or one of its parts in which there is a disorder. normal functioning, typically manifests with varying signs and symptoms, and causes the person or animal to have a reduced length or quality of life.
Как используется в настоящей заявке, ссылка на лечение субъекта или пациента включает предотвращение, профилактику, ослабление, облегчение и терапию. Термины субъект или пациент используются взаимозаменяемо в настоящей заявке для обозначения всех млекопитающих, включая людей. Примеры субъектов включают людей, коров, собак, котов, лошадей, коз, овец, свиней и кроликов. В одном варианте осуществления, пациентом является человек.As used herein, reference to treating a subject or patient includes prevention, prophylaxis, mitigation, relief and therapy. The terms subject or patient are used interchangeably in this application to refer to all mammals, including humans. Examples of subjects include humans, cows, dogs, cats, horses, goats, sheep, pigs and rabbits. In one embodiment, the patient is a human.
Как используется в настоящей заявке, термины антигенсвязывающий фрагмент, фрагмент и фрагмент антитела используются взаимозаменяемо по отношению к любому фрагменту антитела согласно изобретению, которое сохраняет антигенсвязывающую активность антитела. Примеры фрагментов антител включают, но, не ограничиваясь только ими, одноцепочечное антитело, Fab, Fab', F(ab')2, Fv или scFv. Кроме того, термин антитело как используется в настоящей заявке, включает как антитела, так и их антигенсвязывающие фрагменты.As used herein, the terms antigen binding fragment, fragment and antibody fragment are used interchangeably to refer to any antibody fragment of the invention that retains the antigen binding activity of the antibody. Examples of antibody fragments include, but are not limited to, single chain antibody, Fab, Fab', F(ab')2, Fv or scFv. In addition, the term antibody as used herein includes both antibodies and antigen-binding fragments thereof.
Как используется в настоящей заявке, термин антитело охватывает различные формы антител, включая, но, не ограничиваясь только ими, цельные антитела, фрагменты антител, в особенности антигенсвязывающие фрагменты, человеческие антитела, химерные антитела, гуманизированные антитела, рекомбинантные антитела и генетически сконструированные антитела (вариантные или мутантные антитела), при условии, что сохраняются все характерные свойства изобретения. Предпочтительными являются человеческие антитела и моноклональные антитела и более предпочтительными являются человеческие моноклональные антитела, в особенности рекомбинантные человеческие моноклональные антитела.As used herein, the term antibody covers various forms of antibodies, including, but not limited to, whole antibodies, antibody fragments, especially antigen binding fragments, human antibodies, chimeric antibodies, humanized antibodies, recombinant antibodies and genetically engineered antibodies (variant antibodies). or mutant antibodies), provided that all the characteristic properties of the invention are retained. Preferred are human antibodies and monoclonal antibodies, and more preferred are human monoclonal antibodies, especially recombinant human monoclonal antibodies.
Антитела человека хорошо известны в данной области техники (van Dijk, М.А., и van de Winkel, J.G., Curr. Opin. Chem. Biol. 5 (2001) 368-374). Антитела человека также могут быть получены у трансгенных животных (например, мышей), которые способны, при иммунизации, вырабатывать полный набор или определенные антитела человека при отсутствии выработки эндогенного иммуноглобулина. Перенос генетической информации иммуноглобулина зародышевой линии человека в такие мутантные зародышевые линии мышей будет приводить к выработке антитела человека при стимуляции антигеном (см., например, Jakobovits, А., и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (1993) 2551-2555; Jakobovits, А., и др., Nature 362 (1993) 255-258; Bruggemann, M., и др., Year Immunol. 7 (1993) 3340). Антитела человека также могут быть получены методом библиотек фагового дисплея (Hoogenboom, H.R., и Winter, G., J. Mol. Biol. 227 (1992) 381-388; Marks, J.D., и др., J. Mol. Biol. 222 (1991) 581-597). Методы Cole и др. и Boerner и др. также применимы для получения моноклональных антител человека (Cole и др., Monoclonal antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985); и Boerner, P., и др., J. Immunol. 147 (1991) 86-95). Предпочтительно, моноклональные антитела человека приготавливают с помощью улучшенной иммортализации EBV-B клеток, как описано в Traggiai E, Becker S, Subbarao К, Kolesnikova L, Uematsu Y, Gismondo MR, Murphy BR, Rappuoli R, Lanzavecchia A. (2004): An efficient method to make human monoclonal antibodies from memory В cells: potent neutralization of SARS coronavirus. Nat Med. 10(8):871-5. Термин антитело человека, как используется в настоящей заявке, также охватывает такие антитела, которые были модифицированы, например, в вариабельном участке, для получения свойства в соответствии с изобретением, как описано в настоящей заявке. Как используется в настоящей заявке, термин вариабельный участок (вариабельный участок легкой цепи (VL), вариабельный участок тяжелой цепи (VH)) обозначает каждыйHuman antibodies are well known in the art (van Dijk, M.A., and van de Winkel, J.G., Curr. Opin. Chem. Biol. 5 (2001) 368-374). Human antibodies can also be obtained from transgenic animals (eg mice) that are capable, when immunized, of producing the full range or specific human antibodies in the absence of endogenous immunoglobulin production. Transfer of human germline immunoglobulin genetic information into such mutant mouse germlines will result in the production of human antibody upon antigen stimulation (see, e.g., Jakobovits, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (1993) 2551-2555; Jakobovits, A., et al., Nature 362 (1993) 255-258; Bruggemann, M., et al., Year Immunol. 7 (1993) 3340). Human antibodies can also be produced by the phage display library method (Hoogenboom, H.R., and Winter, G., J. Mol. Biol. 227 (1992) 381-388; Marks, J.D., et al., J. Mol. Biol. 222 (1991) 581-597). The methods of Cole et al. and Boerner et al. are also applicable to the production of human monoclonal antibodies (Cole et al., Monoclonal antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985); and Boerner, P., et al. , J. Immunol. 147 (1991) 86-95). Preferably, human monoclonal antibodies are prepared by improved immortalization of EBV-B cells, as described in Traggiai E, Becker S, Subbarao K, Kolesnikova L, Uematsu Y, Gismondo MR, Murphy BR, Rappuoli R, Lanzavecchia A. (2004): An efficient method to make human monoclonal antibodies from memory in cells: potent neutralization of SARS coronavirus. Nat Med. 10(8):871-5. The term human antibody, as used herein, also covers those antibodies that have been modified, for example in the variable region, to obtain properties in accordance with the invention, as described in this application. As used herein, the term variable region (light chain variable region (VL), heavy chain variable region (VH)) refers to each
- 3 046175 пару легкой и тяжелой цепей, которые непосредственно вовлечены в связывание антитела с антигеном.- 3 046175 a pair of light and heavy chains that are directly involved in the binding of the antibody to the antigen.
Антитела могут представлять собой любой изотип (например, IgA, IgG, IgM, то есть α, γ или μ тяжелую цепь), но предпочтительно представляют собой IgG. В пределах IgG изотипа, антитела могут быть из подкласса IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4, где предпочтительным является IgG1. Антитела согласно изобретению могут иметь к или λ легкую цепь.The antibodies can be any isotype (eg, IgA, IgG, IgM, ie α, γ or μ heavy chain), but are preferably IgG. Within the IgG isotype, antibodies may be from the IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4 subclass, with IgG1 being preferred. Antibodies of the invention may have a k or λ light chain.
Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут представлять собой очищенное антитело, одноцепочечное антитело, Fab, Fab', F(ab')2, Fv или scFv.Preferably, the antibody or antigen binding fragment thereof may be a purified antibody, single chain antibody, Fab, Fab', F(ab') 2 , Fv or scFv.
Таким образом, антитела могут представлять собой предпочтительно антитела человека, моноклональные антитела, моноклональные антитела человека, рекомбинантные антитела или очищенные антитела. Изобретение также обеспечивает фрагменты антител согласно изобретению, в особенности фрагменты, которые сохраняют антигенсвязывающую активность антител. Такие фрагменты включают, но, не ограничиваясь только ими, одно-цепочечные антитела, Fab, Fab', F(ab')2, Fv или scFv. Тем не менее, в описании, включая пункты формулы изобретения, в некоторых местах, приведены указания на антигенсвязывающий(е) фрагмент(ы), фрагмент(ы) антитела(л), вариант(ы) и/или производное(ые) антител, это обозначает, что термин антитело или антитело согласно изобретению включает все категории антител, а именно, антигенсвязывающий(ы) фрагмент(ы), фрагмент(ы) антитела(л), вариант(ы) и производное(ые) антител.Thus, the antibodies may preferably be human antibodies, monoclonal antibodies, human monoclonal antibodies, recombinant antibodies or purified antibodies. The invention also provides antibody fragments of the invention, particularly fragments that retain the antigen binding activity of the antibodies. Such fragments include, but are not limited to, single chain antibodies, Fab, Fab', F(ab')2, Fv or scFv. However, in the description, including the claims, in some places, references are made to antigen-binding fragment(s), antibody fragment(s), variant(s) and/or derivative(s) of antibodies, this means that the term antibody or antibody of the invention includes all categories of antibodies, namely, antigen binding fragment(s), antibody fragment(s), antibody variant(s), and antibody derivative(s).
Фрагменты антител могут быть получены из антител с помощью методов, которые включают расщепление ферментами, такими как пепсин или папаин, и/или расщепление дисульфидных связей с помощью химического восстановления. Альтернативно, фрагменты антител могут быть получены путем клонирования и экспрессии части последовательностей тяжелых или легких цепей. Фрагменты антител включают Fab, Fab', F(ab')2 и Fv фрагменты, одноцепочечные Fv фрагменты (scFv), имеющие происхождение из тяжелых и легких цепей антитела согласно изобретению, например, scFv, содержащие CDR из антитела согласно изобретению, а также мономеры и димеры тяжелых и легких цепей, однодоменную тяжелую цепь антитела, однодоменную легкую цепь антитела, а также одно-цепочечные антитела, например, одноцепочечный Fv, в котором вариабельные домены тяжелой и легкой цепи соединены пептидным линкером.Antibody fragments can be produced from antibodies using methods that include digestion with enzymes such as pepsin or papain and/or cleavage of disulfide bonds by chemical reduction. Alternatively, antibody fragments can be produced by cloning and expressing portions of the heavy or light chain sequences. Antibody fragments include Fab, Fab', F(ab') 2 and Fv fragments, single chain Fv fragments (scFv) derived from the heavy and light chains of an antibody of the invention, for example, scFvs containing CDRs from an antibody of the invention, as well as monomers and dimers of heavy and light chains, single-domain antibody heavy chain, single-domain antibody light chain, as well as single-chain antibodies, for example, single-chain Fv, in which the heavy and light chain variable domains are connected by a peptide linker.
Фрагменты антител могут осуществлять моновалентные или мультивалентные взаимодействия и могут содержаться в различных структурах, как описано выше. Например, могут синтезироваться scFv молекулы для создания тривалентного триатела или четырехвалентного тетратела. scFv молекулы включают домен Fc фрагмент, приводящий к образованию двухвалентных минител. Дополнительно, последовательности компонентом мультиспецифических молекул, в которых последовательности нацеливают на соответствующие эпитопы и другие участки молекулы, связывающиеся с другими мишенями. Примеры молекул включают, но, не ограничиваясь только ими, биспецифические Fab2, триспецифические Fab3, биспецифические scFv, и диатела (Holliger и Hudson, 2005, Nature Biotechnology 9: 1126-1136).Antibody fragments can make monovalent or multivalent interactions and can be contained in various structures, as described above. For example, scFv molecules can be synthesized to create a trivalent tribody or a tetravalent tetrabody. scFv molecules include an Fc domain fragment, leading to the formation of divalent minibodies. Additionally, the sequences are components of multispecific molecules, in which the sequences target corresponding epitopes and other regions of the molecule that bind to other targets. Examples of molecules include, but are not limited to, bispecific Fab2, trispecific Fab3, bispecific scFv, and diabodies (Holliger and Hudson, 2005, Nature Biotechnology 9: 1126-1136).
Антитела могут быть в очищенной форме. Типично, антитело будет присутствовать в композиции, которая по существу не содержит других полипептидов, например, где меньше, чем 90% (по весу), обычно меньше, чем 60% и более предпочтительно, меньше, чем 50% композиции состоит из других полипептидов.Antibodies can be in purified form. Typically, the antibody will be present in a composition that is substantially free of other polypeptides, for example, where less than 90% (by weight), typically less than 60%, and more preferably less than 50% of the composition consists of other polypeptides.
Антитела могут быть иммуногенными у людей и/или у отличающихся от людей (или гетерологических) хозяев, например, у мышей. Например, антитела могут иметь идиотоп, которые является иммуногенным у хозяев, отличающихся от людей, но не у человека-хозяина. Антитела для применения на человеке включают те антитела, которые не могут быть легко выделены из таких хозяев, как мыши, козы, кролики, крысы, млекопитающие, не являющиеся приматами, и др., и не могут быть в целом получены путем гуманизации или из ксено-мышей.Antibodies may be immunogenic in humans and/or in non-human (or heterologous) hosts, such as mice. For example, antibodies may have an idiotope that is immunogenic in non-human hosts but not in the human host. Antibodies for use in humans include those antibodies that cannot be readily isolated from hosts such as mice, goats, rabbits, rats, non-primate mammals, etc., and cannot generally be obtained by humanization or from xenos. -mice.
Как используется в настоящей заявке, нейтрализирующее антитело представляет собой антитело, которое нейтрализирует, то есть, предотвращает, ингибирует, уменьшает, затрудняет или препятствует, способности патогена инициировать и/или закреплять инфекцию в хозяине. Термины нейтрализирующее антитело и антитело, которое нейтрализирует или антитела, которые нейтрализируют, используются взаимозаменяемо в настоящей заявке. Эти антитела могут использоваться отдельно, или в комбинации, в качестве профилактических или терапевтических агентов в подходящих препаратах, в сочетании с активной вакцинацией, в качестве диагностического средства, или в качестве производственного средства, как описано в настоящей заявке.As used herein, a neutralizing antibody is an antibody that neutralizes, that is, prevents, inhibits, reduces, impedes or interferes with, the ability of a pathogen to initiate and/or establish infection in a host. The terms neutralizing antibody and antibody that neutralizes or antibodies that neutralize are used interchangeably throughout this application. These antibodies may be used alone, or in combination, as prophylactic or therapeutic agents in suitable formulations, in combination with active vaccination, as a diagnostic agent, or as a manufacturing agent, as described herein.
Дозы часто выражаются по отношению к весу тела. Таким образом, доза, которая выражается в виде [г, мг или другая единица]/кг (или г, мг и т.д.) обычно относится к [г, мг или другая единица] на кг (или г, мг и др.) веса тела, даже если термин вес тела конкретно не указан.Doses are often expressed in relation to body weight. Thus, a dose that is expressed as [g, mg, or other unit]/kg (or g, mg, etc.) usually refers to [g, mg, or other unit] per kg (or g, mg, etc. .) body weight, even if the term body weight is not specifically stated.
Термин специфическое связывание и сходная ссылка не охватывает неспецифическое прилипание.The term specific binding and similar references do not cover non-specific adhesion.
Термин вакцина, как используется в настоящей заявке, типично подразумевается как профилактический или терапевтический материал, обеспечивающий по меньшей мере один антиген, предпочтительно иммуноген. Антиген или иммуноген может иметь происхождение из любого материала, который пригоден для вакцинации. Например, антиген или иммуноген может иметь происхождение из патогена,The term vaccine, as used herein, is typically meant as a prophylactic or therapeutic material providing at least one antigen, preferably an immunogen. The antigen or immunogen can be derived from any material that is suitable for vaccination. For example, an antigen or immunogen may be derived from a pathogen,
- 4 046175 такого как бактерия или вирусные частицы и др., или из опухолевой или раковой ткани. Антиген или иммуноген стимулирует адаптивную иммунную систему организма обеспечивать адаптивный иммунный ответ. В особенности, антиген или иммуноген относится типично к веществу, которое может распознаваться иммунной системой, предпочтительно адаптивной иммунной системой, и которое способно запускать антигенспецифический иммунный ответ, например, путем образования антител и/или антигенспецифических Т-клеток в качестве части адаптивного иммунного ответа. Типично, антиген может представлять собой или может содержать пептид или белок, который может презентироваться МНС Тклеткам.- 4 046175 such as bacteria or viral particles, etc., or from tumor or cancerous tissue. An antigen or immunogen stimulates the body's adaptive immune system to provide an adaptive immune response. In particular, an antigen or immunogen typically refers to a substance that can be recognized by the immune system, preferably the adaptive immune system, and that is capable of triggering an antigen-specific immune response, for example, by producing antibodies and/or antigen-specific T cells as part of the adaptive immune response. Typically, the antigen may be or may contain a peptide or protein that can be presented to MHC T cells.
Как используется в настоящей заявке, вариант последовательности (также обозначается как вариант) относится к любому изменению в последовательности, таким образом, ссылочная последовательность представляет собой любую из последовательностей, перечисленных в Таблице Последовательностей и Номеров SEQ ID (перечень последовательностей), то есть, SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 407. Таким образом, термин вариант последовательности включает варианты нуклеотидных последовательностей и варианты аминокислотных последовательностей. Следует отметить, что варианты последовательностей, указанные в настоящей заявке, представляют собой, в особенности, варианты функциональных последовательностей, то есть, варианты последовательностей, сохраняющие биологическую функцию, например, антитела. В контексте настоящего изобретения, такая биологическая функция представляет собой предпочтительно нейтрализацию инфекции ZIKV, связывание антитела с ZIKV E белком и/или связывание антитела с ZIKV NS1 белком. Таким образом, предпочтительные варианты последовательностей представляют собой варианты функциональных последовательностей, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей к сравнительной последовательности. Фраза ее вариант функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей, как используется в настоящей заявке, обозначает (I), что вариант последовательности является функциональным, как описано в настоящей заявке, и (II) более высокий % идентичность последовательностей, тем более предпочтительный вариант последовательности.As used herein, a sequence variant (also referred to as a variant) refers to any change in a sequence, such that a reference sequence is any of the sequences listed in the Table of Sequences and SEQ ID Numbers (sequence listing), that is, SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 407. Thus, the term sequence variant includes nucleotide sequence variants and amino acid sequence variants. It should be noted that the sequence variants specified in this application are, in particular, functional sequence variants, that is, sequence variants that retain biological function, for example, antibodies. In the context of the present invention, such biological function is preferably neutralization of ZIKV infection, binding of the antibody to the ZIKV E protein and/or binding of the antibody to the ZIKV NS1 protein. Thus, preferred sequence variants are functional sequence variants having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity to the comparative sequence. Phrase its functional sequence variant having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity, as used herein, indicates (I) that the sequence variant is functional as described in this application, and (II) the higher the % sequence identity, the more preferred the sequence variant.
Другими словами, фраза ее вариант функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей, обозначает, в особенности, что вариант функциональной последовательности имеет по меньшей мере 70% идентичность последовательностей, предпочтительно по меньшей мере 75% идентичность последовательностей, предпочтительно по меньшей мере 80% идентичность последовательностей, более предпочтительно по меньшей мере 85% идентичность последовательностей, более предпочтительно по меньшей мере 88% идентичность последовательностей, еще более предпочтительно по меньшей мере 90% идентичность последовательностей, еще более предпочтительно по меньшей мере 92% идентичность последовательностей, еще более предпочтительно по меньшей мере 95% идентичность последовательностей, еще более предпочтительно по меньшей мере 96% идентичность последовательностей, особенно предпочтительно по меньшей мере 97% идентичность последовательностей, особенно предпочтительно по меньшей мере 98% идентичность последовательностей и наиболее предпочтительно по меньшей мере 99% идентичность последовательностей к соответствующей сравнительной последовательности.In other words, a phrase of its functional sequence variant having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92 %, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity means, in particular, that the functional sequence variant has at least 70% identity sequence identity, preferably at least 75% sequence identity, preferably at least 80% sequence identity, more preferably at least 85% sequence identity, more preferably at least 88% sequence identity, even more preferably at least 90% sequence identity , even more preferably at least 92% sequence identity, even more preferably at least 95% sequence identity, even more preferably at least 96% sequence identity, especially preferably at least 97% sequence identity, especially preferably at least 98 % sequence identity and most preferably at least 99% sequence identity to the corresponding comparative sequence.
Термин вариант последовательности включает, в особенности, такие варианты, которые содержат мутации и/или замены по сравнению со сравнительной последовательностью. Типичные варианты последовательности Fc компонента включают, но, не ограничиваясь только ими, те, которые имеют замену L на А в положении СН2 4, СН2 5 или оба.The term sequence variant includes in particular those variants that contain mutations and/or substitutions compared to the reference sequence. Exemplary Fc component sequence variants include, but are not limited to, those that have an L to A substitution at the CH2 4, CH 2 5, or both positions.
Идентичность последовательностей обычно рассчитывается по отношению к полной длине последовательности сравнения (то есть последовательности, процитированной в заявке). Процентное значение идентичности, как упоминается в настоящей заявке, может быть определено, например, используя BLAST, используя параметры по умолчанию, указанные NCBI (Национальный центр биотехнологической информации; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) [Blosum 62 матрица; штраф за открытие гэпа=11 и штраф за продление гэпа=1].Sequence identity is typically calculated relative to the full length of the reference sequence (ie the sequence cited in the application). Percentage identity as referred to herein can be determined, for example, using BLAST using the default parameters specified by NCBI (National Center for Biotechnology Information; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) [Blosum 62 matrix; penalty for opening a gap=11 and penalty for extending a gap=1].
Как используется в настоящей заявке, вариант нуклеотидной последовательности имеет измененную последовательность, в которой один или несколько нуклеотидов в сравнительной последовательности делетировано или заменено, или один или несколько нуклеотидов вставлены в последовательность сравнительной нуклеотидной последовательности. Нуклеотиды обозначаются в настоящей заявке с помощью стандартного однобуквенного обозначения (А, С, G, или Т). Вследствие вырожденности генетического кода, вариант нуклеотидной последовательности может либо привести к изменению в соответствующей сравнительной аминокислотной последовательности, то есть в варианте аминокислотной поAs used herein, a variant nucleotide sequence has an altered sequence in which one or more nucleotides in the comparative sequence are deleted or replaced, or one or more nucleotides are inserted into the sequence of the comparative nucleotide sequence. Nucleotides are designated herein using a standard single letter designation (A, C, G, or T). Due to the degeneracy of the genetic code, a variant of the nucleotide sequence can either lead to a change in the corresponding comparative amino acid sequence, that is, in the amino acid variant
- 5 046175 следовательности или нет. Предпочтительные варианты последовательностей представляют собой такие варианты нуклеотидных последовательностей, которые не приводят к вариантам аминокислотных последовательностей (молчащие мутации), но возможны не молчащие мутации, а также мутантные нуклеотидные последовательности, которые приводят к получению аминокислотной последовательности, которая имеет по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 90%, более предпочтительно по меньшей мере 95% последовательности, идентичной сравнительной последовательности.- 5 046175 sequence or not. Preferred sequence variants are those nucleotide sequence variants that do not result in amino acid sequence variants (silent mutations), but non-silent mutations are possible, as well as mutant nucleotide sequences that result in an amino acid sequence that is at least 80% preferably at least 90%, more preferably at least 95% sequence identical to the comparative sequence.
Вариант аминокислотной последовательности имеет измененную последовательность, в которой одна или несколько аминокислот в сравнительной последовательности делетирована или замещена, или одна или несколько аминокислот вставлены в последовательность сравнительной аминокислотной последовательности. В результате таких изменений, вариант аминокислотной последовательности имеет аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична сравнительной последовательности, предпочтительно, по меньшей мере на 90% идентична, более предпочтительно по меньшей мере на 95% идентична, наиболее предпочтительно по меньшей мере на 99% идентична сравнительной последовательности. Вариантные последовательности, которые являются идентичными по меньшей мере на 90%, имеют не более чем 10 изменений, то есть любую комбинацию делеций, инсерций или замещений, на 100 аминокислот сравнительной последовательности.An amino acid sequence variant has an altered sequence in which one or more amino acids in the comparative sequence are deleted or substituted, or one or more amino acids are inserted into the comparative amino acid sequence. As a result of such changes, the amino acid sequence variant has an amino acid sequence that is at least 80% identical to the comparative sequence, preferably at least 90% identical, more preferably at least 95% identical, most preferably at least 99 % is identical to the comparative sequence. Variant sequences that are at least 90% identical have no more than 10 changes, that is, any combination of deletions, insertions or substitutions, per 100 amino acids of the comparative sequence.
В то время возможны неконсервативные аминокислотные замены, предпочтительно, чтобы замены представляли собой консервативные аминокислотные замены, в которых замененная аминокислота имела сходные структурные или химические свойства с соответствующей аминокислотой в сравнительной последовательности. В качестве примера, консервативные аминокислотные замены включают замену одной из алифатических или гидрофобных аминокислот, например, аланина, валина, лейцина и изолейцина, на другую; замену одной из гидроксилсодержащих аминокислот, например, серина и треонина, на другую; замену одного кислотного остатка, например, глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты, на другой; замену одного амидсодержащего остатка, например, аспарагина и глутамина, на другой; замену одного ароматического остатка, например, фенилаланина и тирозина, на другой; замену одного щелочного остатка, например, лизина, аргинина и гистидина, на другой и замену одной небольшой аминокислоты, например, аланина, серина, треонина, метионина, и глицина, на другой.While non-conservative amino acid substitutions are possible, it is preferred that the substitutions be conservative amino acid substitutions in which the replaced amino acid has similar structural or chemical properties to the corresponding amino acid in the comparative sequence. By way of example, conservative amino acid substitutions include replacing one of the aliphatic or hydrophobic amino acids, for example, alanine, valine, leucine and isoleucine, with another; replacing one of the hydroxyl-containing amino acids, for example, serine and threonine, with another; replacing one acid residue, for example, glutamic acid or aspartic acid, with another; replacing one amide-containing residue, for example, asparagine and glutamine, with another; replacing one aromatic residue, for example, phenylalanine and tyrosine, with another; replacing one alkaline residue, such as lysine, arginine, and histidine, with another; and replacing one small amino acid, such as alanine, serine, threonine, methionine, and glycine, with another.
Инсерции аминокислотных последовательностей включают амино- и/или карбоксилконцевые слияния, располагающиеся по длине от одного остатка в полипептидах, состоящих из сотни или более остатков, а также инсерции внутри последовательности одного или множественных аминокислотных остатков. Примеры концевых инсерций включают слияния на N- или С-конце аминокислотной последовательности с репортерной молекулой или ферментом.Amino acid sequence insertions include amino- and/or carboxyl-terminal fusions ranging in length from a single residue in polypeptides consisting of a hundred or more residues, as well as intrasequence insertions of single or multiple amino acid residues. Examples of terminal insertions include fusions at the N- or C-terminus of an amino acid sequence with a reporter molecule or enzyme.
Важно, что изменения в вариантах последовательностей не нарушают функциональность соответствующей сравнительной последовательности, в данном случае, например, функциональность последовательности антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, связываться с тем же самым эпитопом и/или в достаточной нейтрализации инфекции, вызванной ZIKV. Методологические принципы определения того, какие нуклеотиды и аминокислотные остатки, соответственно, могут быть замещены, вставлены или делетированы без нарушения указанной функциональности, можно найти с помощью компьютерных программ, хорошо известных в данной области техники.It is important that changes in the sequence variants do not interfere with the functionality of the corresponding reference sequence, in this case, for example, the functionality of the antibody sequence or antigen binding fragment thereof, to bind to the same epitope and/or to sufficiently neutralize a ZIKV infection. Methodological principles for determining which nucleotides and amino acid residues, respectively, can be substituted, inserted or deleted without affecting the specified functionality, can be found using computer programs well known in the art.
Как используется в настоящей заявке, последовательность нуклеиновых кислот или аминокислотная последовательность, имеющая происхождение из указанной нуклеиновой кислоты, пептида, полипептида или белка, относится к происхождению нуклеиновой кислоты, пептида, полипептида или белка. Предпочтительно, последовательность нуклеиновых кислот или аминокислотная последовательность, которая имеет происхождение из конкретной последовательности, имеет аминокислотную последовательность, которая по существу идентична этой последовательности или его части, из которой она происходит, на основании чего по существу идентичная включает варианты последовательностей, как определено выше. Предпочтительно, последовательность нуклеиновых кислот или аминокислотная последовательность, которая имеет происхождение из конкретного пептида или белка, имеет происхождение из соответствующего домена в конкретном пептиде или белке. Таким образом, соответствующий относится, в частности, к той же самой функциональности. Например, внеклеточный домен соответствует другому внеклеточному домену (другого белка), или трансмембранный домен соответствует другому трансмембранному домену (другого белка). Следовательно, соответствующие части пептидов, белков и нуклеиновых кислот легко идентифицируемы для квалифицированного специалиста в данной области техники. Аналогичным образом, последовательности, имеющие происхождение из другой последовательности, обычно легко идентифицируются квалифицированным специалистом в данной области техники, как имеющие свое происхождение из последовательности.As used herein, a nucleic acid sequence or amino acid sequence having the origin of said nucleic acid, peptide, polypeptide or protein refers to the origin of the nucleic acid, peptide, polypeptide or protein. Preferably, the nucleic acid sequence or amino acid sequence that is derived from a particular sequence has an amino acid sequence that is substantially identical to that sequence or portion thereof from which it is derived, whereby substantially identical includes sequence variants as defined above. Preferably, the nucleic acid sequence or amino acid sequence that is derived from a particular peptide or protein is derived from a corresponding domain in the particular peptide or protein. Thus, corresponding refers in particular to the same functionality. For example, the extracellular domain corresponds to another extracellular domain (of another protein), or the transmembrane domain corresponds to another transmembrane domain (of another protein). Therefore, the corresponding portions of the peptides, proteins and nucleic acids are readily identifiable to one skilled in the art. Likewise, sequences having their origin from another sequence are usually readily identified by one skilled in the art as having their origin from the sequence.
Предпочтительно, последовательность нуклеиновых кислот или аминокислотная последовательность, имеющая происхождение из другой нуклеиновой кислоты, пептида, полипептида или белка, может быть идентична исходной нуклеиновой кислоте, пептиду, полипептиду или белку (из которой она имеет происхождение). Тем не менее, последовательность нуклеиновых кислот или аминокислотная последовательность, имеющая происхождение из другой нуклеиновой кислоты, пептида, полипептида или белка, также может иметь одну или несколько мутации относительно исходной нуклеиновой кислоты,Preferably, the nucleic acid sequence or amino acid sequence having its origin from another nucleic acid, peptide, polypeptide or protein may be identical to the original nucleic acid, peptide, polypeptide or protein (from which it originates). However, a nucleic acid sequence or amino acid sequence derived from another nucleic acid, peptide, polypeptide or protein may also have one or more mutations relative to the original nucleic acid,
- 6 046175 пептида, полипептида или белка (из которой она имеет происхождение), в особенности последовательность нуклеиновых кислот или аминокислотная последовательность, имеющая происхождение из другой нуклеиновой кислоты, пептида, полипептида или белка, может представлять собой вариант функциональной последовательности, как описано выше, исходной нуклеиновой кислоты, пептида, полипептида или белка (из которой она имеет происхождение). Например, в пептиде/белка один или несколько аминокислотных остатков могут быть заменены другими аминокислотными остатками или могут происходить инсерции или делеции одного или нескольких аминокислотных остатков.- 6 046175 peptide, polypeptide or protein (from which it is derived), in particular a nucleic acid sequence or amino acid sequence derived from another nucleic acid, peptide, polypeptide or protein, may be a variant of the functional sequence, as described above, of the original nucleic acid, peptide, polypeptide or protein (from which it originates). For example, in a peptide/protein, one or more amino acid residues may be replaced by other amino acid residues, or insertions or deletions of one or more amino acid residues may occur.
Как используется в настоящей заявке, термин мутация относится к изменению в последовательности нуклеиновых кислот и/или в аминокислотной последовательности по сравнению со сравнительной последовательностью, например, соответствующей геномной последовательностью. Мутация, например, по сравнению с геномной последовательностью, может представляться собой, например, (встречающуюся в природе) соматическую мутацию, самопроизвольную мутацию, индуцированную мутацию, например, индуцированную ферментами, химическими веществами или облучением, или мутацию, полученную путем сайт-направленного мутагенеза (с помощью молекулярно-биологических способов получения специфических и преднамеренных изменений в последовательности нуклеиновых кислот и/или в аминокислотной последовательности). Таким образом, термины мутация или мутирование должны пониматься как также охватывающие физически осуществление мутации, например, в последовательности нуклеиновых кислот или в аминокислотной последовательности. Мутация включает замену, делецию и инсерцию одного или нескольких нуклеотидов или аминокислот, а также инсерцию нескольких последовательных нуклеотидов или аминокислот. Для получения мутации в аминокислотной последовательности, предпочтительно мутация может быть интродуцирована в нуклеотидной последовательности, кодирующей указанную аминокислотную последовательность, для экспрессии (рекомбинантного) мутированного полипептида. Мутация может быть осуществлена, например, путем изменения, например, с помощью сайт-направленного мутагенеза, кодона молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующего одну аминокислоту, с получением кодона, кодирующего другую аминокислоту, или путем синтеза варианта последовательности, например, с известной нуклеотидной последовательности молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид и путем синтеза молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, кодирующую вариант полипептид без необходимости мутирования одного или нескольких нуклеотидов молекулы нуклеиновой кислоты.As used herein, the term mutation refers to a change in the nucleic acid sequence and/or amino acid sequence compared to a reference sequence, for example, a corresponding genomic sequence. The mutation, for example, compared to the genomic sequence, may be, for example, a (naturally occurring) somatic mutation, a spontaneous mutation, an induced mutation, for example, induced by enzymes, chemicals or radiation, or a mutation obtained by site-directed mutagenesis ( using molecular biological techniques to produce specific and deliberate changes in the nucleic acid sequence and/or amino acid sequence). Thus, the terms mutation or mutation should be understood to also cover the physical occurrence of a mutation, for example, in a nucleic acid sequence or in an amino acid sequence. A mutation includes the substitution, deletion and insertion of one or more nucleotides or amino acids, as well as the insertion of several consecutive nucleotides or amino acids. To produce a mutation in an amino acid sequence, preferably the mutation may be introduced into a nucleotide sequence encoding said amino acid sequence to express the (recombinant) mutated polypeptide. The mutation can be carried out, for example, by changing, for example, using site-directed mutagenesis, a codon of a nucleic acid molecule encoding one amino acid to produce a codon encoding a different amino acid, or by synthesizing a sequence variant, for example, from a known nucleotide sequence of a nucleic acid molecule an acid encoding a polypeptide and by synthesizing a nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence encoding a variant polypeptide without the need to mutate one or more nucleotides of the nucleic acid molecule.
Некоторые документы процитированы в тексте настоящего описания. Каждый из документов, процитированных в настоящей заявке (включая все патенты, патентные заявки, научные публикации, спецификации производителей, инструкции и др.), не зависимо от того, ранее или в дальнейшем, таким образом полностью включены в качестве ссылки. Ничто из содержащегося в настоящей заявке не следует рассматривать как допуск того, что изобретение дает право датировать задним числом такой раскрытие, основываясь на более раннем изобретении.Some documents are cited in the text of this description. Each of the documents cited in this application (including all patents, patent applications, scientific publications, manufacturer's specifications, instructions, etc.), whether previously or hereinafter, is hereby incorporated by reference in its entirety. Nothing contained in this application should be construed as an admission that the invention gives the right to backdate such disclosure based on an earlier invention.
Подразумевается, что настоящее изобретение не ограничивается конкретной методологией, протоколами и реагентами, описанными в настоящей заявке, так как они могут изменяться. Также следует понимать, что терминология, используемая в настоящей заявке, предназначена только для описания предпочтительных вариантов осуществления, и не предназначена для ограничения объема настоящего изобретения, так как оно будет ограничиваться только пунктами приложенной формулы изобретения. Если специально не указано иначе, то все технические и научные термины, используемые в настоящей заявке, будут иметь такие же значения, как обычно используются квалифицированным специалистом в данной области техники.It is intended that the present invention is not limited to the specific methodology, protocols and reagents described in this application, as they may vary. It should also be understood that the terminology used in this application is intended to describe preferred embodiments only, and is not intended to limit the scope of the present invention, as it will be limited only by the claims appended. Unless specifically stated otherwise, all technical and scientific terms used in this application will have the same meanings as commonly used by one skilled in the art.
Антитела, эффективно нейтрализирующие инфекцию, вызванную вирусом Зика.Antibodies that effectively neutralize infection caused by the Zika virus.
Настоящее изобретение основывается, среди других находок, на открытии и выделении антител, которые связываются специфически с эпитопами вируса Зика. Такие антитела либо являются (I) чрезвычайно эффективными для нейтрализации вируса Зика, если нацелены на антигенную детерминанту белка оболочки (Е) вируса Зика или на ZIKV четвертичный эпитоп или (II) пригодны для диагностики инфекции, вызванной вирусом Зика, если направлены на NS1 белок вируса Зика. Такие антитела являются желательными, так как только очень небольшие количества антител необходимы для нейтрализации вируса Зика. В особенности, в настоящее время не существует способов предотвращения и лечения инфекции, вызванной вирусом Зика. Антитела в соответствии с настоящим изобретением являются чрезвычайно эффективными для предотвращения, а также для лечения или ослабления инфекции, вызванной вирусом Зика. Кроме того, вследствие специфичности антител к вирусу Зика, они не вызывают ADE, а наоборот блокируют ADE. Для диагностики, специфические антитела к вирусу Зика обеспечивают важные средства для дифференцировки инфекции, вызванной вирусом Зика, от инфекций, вызванных другими флавивирусами, такими как вирус денге.The present invention is based, among other findings, on the discovery and isolation of antibodies that bind specifically to epitopes of the Zika virus. Such antibodies are either (i) extremely effective in neutralizing Zika virus if targeted to the antigenic determinant of the Zika virus envelope (E) protein or the ZIKV quaternary epitope or (ii) useful for diagnosing Zika virus infection if targeted to the NS1 protein of the virus Zika. Such antibodies are desirable since only very small amounts of antibodies are needed to neutralize the Zika virus. In particular, there is currently no way to prevent or treat Zika virus infection. The antibodies of the present invention are extremely effective in preventing as well as treating or mitigating Zika virus infection. In addition, due to the specificity of antibodies to the Zika virus, they do not cause ADE, but rather block ADE. For diagnosis, Zika virus-specific antibodies provide an important means of differentiating Zika virus infection from infections caused by other flaviviruses such as dengue virus.
В первом аспекте настоящее изобретение обеспечивает выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с эпитопом вируса Зика и нейтрализируют инфекцию, вызванную вирусом Зика, которое содержат аминокислотные последовательности CDRH1, CDRH2 и CDRH3 и аминокислотные последовательности CDRL1, CDRL2 и CDRL3 (i) в соответствии с SEQ ID NO: 1-5 и 7 или (ii) в соответствии с SEQ ID NO: 1-4 и 6-7. Предпочтительно они ингибируютIn a first aspect, the present invention provides an isolated antibody or antigen binding fragment thereof that specifically binds to an epitope of the Zika virus and neutralizes an infection caused by the Zika virus, which comprises the amino acid sequences CDRH1, CDRH2 and CDRH3 and the amino acid sequences CDRL1, CDRL2 and CDRL3 (i) according to with SEQ ID NO: 1-5 and 7 or (ii) in accordance with SEQ ID NO: 1-4 and 6-7. Preferably they inhibit
- 7 046175 этап жизненного цикла вируса после присоединения вируса Зика к клеточной мембране.- 7 046175 stage of the virus life cycle after the Zika virus attaches to the cell membrane.
Другими словами, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением, уменьшает вирусную инфекционность вируса Зика.In other words, the antibody or antigen binding fragment thereof of the present invention reduces the viral infectivity of the Zika virus.
Для изучения и количественного определения вирусной инфекционности (или нейтрализации) в лаборатории квалифицированный специалист в данной области техники знает различные стандартные анализы на нейтрализацию. Для анализа на нейтрализацию, вирусы животных типично размножают в клетках и/или клеточных линиях. В контексте настоящего изобретения, предпочтительным является анализ на нейтрализацию, в котором культивированные клетки инкубируют с фиксированным количеством вируса Зика (ZIKV) в присутствии (или отсутствии) тестируемого антитела. Для считывания данных, можно использовать, например, проточную цитометрию. Альтернативно, также возможны другие варианты считывания данных, такие как определение количества неструктурных белков ZIKV (такого как ZIKV NS1), секретируемых в культуральный супернатант. Например, тест (TCID50-ELISA) захвата антигена ZIKV неструктурного белка 1 (NS1) на основании инфицирующей дозы-50 (TCID50) для культивируемой ткани с помощью твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA), можно использовать в качестве альтернативы стандартному анализу бляшкообразования для титрования вирус Зика - сходным образом, как описано для вируса денге (DENV) авторами Li J, Hu D-M, Ding X-X, Chen Y, Pan Y-X, Qiu L-W, Che X-Y: Enzyme-linked immunosorbent assay - format tissue culture infectious dose-50 test for titrating virus denge. PLoS ONE 2011, 6:e22553. В таком анализе, можно благоприятно использовать, например, ZIKV №1-связывающие антитела, как описано в настоящей заявке.To study and quantify viral infectivity (or neutralization) in the laboratory, one skilled in the art is familiar with various standard neutralization assays. For neutralization assays, animal viruses are typically propagated in cells and/or cell lines. In the context of the present invention, a neutralization assay is preferred in which cultured cells are incubated with a fixed amount of Zika virus (ZIKV) in the presence (or absence) of a test antibody. To read the data, you can use, for example, flow cytometry. Alternatively, other readouts are also possible, such as determining the amount of ZIKV non-structural proteins (such as ZIKV NS1) secreted into the culture supernatant. For example, the ZIKV nonstructural protein 1 (NS1) antigen capture test (TCID50-ELISA) based on cultured tissue infectious dose-50 (TCID50) enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) can be used as an alternative to the standard plaque assay for Zika virus titration - in a similar manner as described for dengue virus (DENV) by Li J, Hu D-M, Ding X-X, Chen Y, Pan Y-X, Qiu L-W, Che X-Y: Enzyme-linked immunosorbent assay - format tissue culture infectious dose-50 test for titrating virus denge. PLoS ONE 2011, 6:e22553. In such an assay, it may be advantageous to use, for example, ZIKV No. 1 binding antibodies, as described herein.
Предпочтительно в анализе на нейтрализацию ZIKV культивированные клетки, например, клетки Vero, инкубируют с фиксированным количеством ZIKV в присутствии или отсутствии тестируемого антитела, например, приблизительно в течение четырех дней. После инкубирования, клетки можно промыть и дополнительно культивировать. Для измерения вирусной инфекционности, можно использовать проточную цитометрию. Для этого, клетки можно фиксировать, например, с помощью 2% формальдегида, пермеабилизировать, например, в PBS (фосфатно-солевой буферный раствор) 1% FCS (фетальная телячья сыворотка) 0,5% сапонин, и окрашивать, например, с помощью мышиного антитела 4G2. После этого клетки можно инкубировать с козьим анти-мышиным IgG, конъюгированным с красителем, таким как Alexa Fluor488, и анализировать путем проточной цитометрии. Альтернативно, жизнеспособные клетки можно обнаруживать с помощью проточной цитометрии, используя, например, реагент WST-1 (Roche). Предпочтительный ZIKV штамм, который используют в таком анализе на нейтрализацию, представляет собой ZIKV H/PF/2013.Preferably, in a ZIKV neutralization assay, cultured cells, eg Vero cells, are incubated with a fixed amount of ZIKV in the presence or absence of a test antibody, for example, for about four days. After incubation, the cells can be washed and further cultured. To measure viral infectivity, flow cytometry can be used. To do this, cells can be fixed, for example, with 2% formaldehyde, permeabilized, for example, in PBS (phosphate buffered saline) 1% FCS (fetal calf serum) 0.5% saponin, and stained, for example, with mouse 4G2 antibodies. The cells can then be incubated with goat anti-mouse IgG conjugated to a dye such as Alexa Fluor488 and analyzed by flow cytometry. Alternatively, viable cells can be detected by flow cytometry using, for example, WST-1 reagent (Roche). The preferred ZIKV strain used in such a neutralization assay is ZIKV H/PF/2013.
Описанное в заявке антитело и антигенсвязывающий фрагмент имеют высокую нейтрализирующую эффективность. Концентрация антитела, необходимая для нейтрализации вируса Зика на 50% (IC50), по сравнению с контролями без антител, составляет, например, вплоть до приблизительно 3 мкг/мл или вплоть до приблизительно 1 мкг/мл. Предпочтительно, концентрация антитела, необходимая для нейтрализации на 50% ZIKV (IC50), составляет вплоть до приблизительно 500 нг/мл, более предпочтительно концентрация антитела согласно изобретению, необходимая для нейтрализации на 50% ZIKV (IC50), составляет вплоть до приблизительно 250 нг/мл, еще более предпочтительно концентрация антитела согласно изобретению, необходимая для нейтрализации на 50% ZIKV (IC50), составляет вплоть до приблизительно 150 нг/мл. Наиболее предпочтительно, концентрация антитела, необходимая для нейтрализации на 50% ZIKV (IC50), составляет приблизительно 100 нг/мл или меньше, например, приблизительно 90 нг/мл или меньше, приблизительно 80 нг/мл или меньше, приблизительно 70 нг/мл или меньше, приблизительно 60 нг/мл или меньше, приблизительно 50 нг/мл или меньше, приблизительно 45 нг/мл или меньше, приблизительно 40 нг/мл или меньше, приблизительно 35 нг/мл или меньше, приблизительно 30 нг/мл или меньше, приблизительно 25 нг/мл или меньше, приблизительно 20 нг/мл или меньше или, особенно предпочтительно, приблизительно 15 нг/мл или меньше. В особенности, концентрация антитела, необходимая для нейтрализации на 50% ZIKV (IC50), составляет предпочтительно приблизительно 50 нг/мл или меньше. Это обозначает, что только низкие концентрации антитела необходимы для нейтрализации на 50% ZIKV. Концентрация антитела, необходимая для нейтрализации на 50% ZIKV (IC50), может быть измерена с применением стандартных анализов на нейтрализацию, как известно квалифицированному специалисту в данной области техники или, в особенности, как описано выше.The antibody and antigen-binding fragment described in the application have high neutralizing efficiency. The antibody concentration required to neutralize Zika virus by 50% (IC 50 ) compared to no antibody controls is, for example, up to about 3 μg/ml or up to about 1 μg/ml. Preferably, the concentration of antibody required to neutralize 50% of ZIKV (IC 50 ) is up to about 500 ng/ml, more preferably the concentration of the antibody of the invention required to neutralize 50% of ZIKV (IC 50 ) is up to about 250 ng /ml, even more preferably, the concentration of the antibody according to the invention required to neutralize 50% of ZIKV (IC 50 ) is up to about 150 ng/ml. Most preferably, the antibody concentration required to neutralize 50% of ZIKV (IC 50 ) is about 100 ng/ml or less, for example, about 90 ng/ml or less, about 80 ng/ml or less, about 70 ng/ml or less, about 60 ng/ml or less, about 50 ng/ml or less, about 45 ng/ml or less, about 40 ng/ml or less, about 35 ng/ml or less, about 30 ng/ml or less , about 25 ng/ml or less, about 20 ng/ml or less, or, especially preferably, about 15 ng/ml or less. In particular, the antibody concentration required to neutralize 50% of ZIKV (IC50) is preferably about 50 ng/ml or less. This means that only low concentrations of antibody are needed to achieve 50% neutralization of ZIKV. The antibody concentration required to neutralize 50% of ZIKV (IC 50 ) can be measured using standard neutralization assays as known to one of ordinary skill in the art, or particularly as described above.
В большинстве случаев, связывание антитела может быть оценено с помощью стандартного ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ), который хорошо известен квалифицированному специалисту в данной области техники. Типичный стандартный ELISA может быть осуществлен следующим образом: ELISA планшеты могут быть покрыты (например, в течение ночи при 4°C) достаточным количеством (например, 1 мкг/мл) белка/комплекса/частицы, с которым связывается тестируемое антитело (например, для связывания DENV, как описано ниже, используют DENV E белки и/или DENV VLP), например, в PBS. После этого планшеты можно блокировать, например, с помощью 1% мас./об. раствора бычьего сывороточного альбумина (BSA) в PBS, и инкубировать с тестируемым антителом (например, приблизительно в течение 1,5 часа при комнатной температуре). После промывания, можно определять связывание антитела, например, используя козьи анти-человеческие IgG, связанные со щелочной фосфатазой. После этого планшеты можно промывать, можно добавлять необходимый субстрат (например, pIn most cases, antibody binding can be assessed using a standard ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), which is well known to one skilled in the art. A typical standard ELISA can be performed as follows: ELISA plates can be coated (eg overnight at 4°C) with a sufficient amount (eg 1 μg/ml) of the protein/complex/particle to which the test antibody binds (eg for DENV binding, as described below, uses DENV E proteins and/or DENV VLPs), for example, in PBS. The plates can then be blocked, for example with 1% w/v. bovine serum albumin (BSA) solution in PBS, and incubate with the test antibody (eg, approximately 1.5 hours at room temperature). After washing, antibody binding can be determined, for example, using goat anti-human IgG coupled to alkaline phosphatase. After this, the plates can be washed, the necessary substrate can be added (for example, p
- 8 046175- 8 046175
NPP) и планшеты можно анализировать, например, при 405 нм. Относительные аффинности связывание антитела можно определить путем измерения концентрации mAb (EC50), необходимой для достижения 50% максимального связывания при насыщении. ЕС50 значения можно рассчитать путем интерполяции кривых связывания, подогнанных с помощью нелинейной регрессии по четырем параметрам с изменяемым наклоном.NPP) and plates can be analyzed, for example, at 405 nm. The relative binding affinities of an antibody can be determined by measuring the mAb concentration (EC 50 ) required to achieve 50% of maximum binding at saturation. EC 50 values can be calculated by interpolating binding curves fitted using nonlinear slope-variable four-parameter regression.
Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением по существу не связываются с вирусоподобными частицами денге, и/или с оболочечным белком денге. Таким образом, по существу не связывается обозначает, что для антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, ЕС50 значений вплоть до 102 нг/мл, предпочтительно вплоть до 103 нг/мл, более предпочтительно вплоть до 5х103 нг/мл, еще более предпочтительно вплоть до 8х103 нг/мл, и наиболее предпочтительно вплоть до 104 нг/мл может быть определено в стандартном ELISA к частицам, подобным вирусу денге (DENV VLP) и/или к оболочечному белку денге (DENV E белок). Другими словами, концентрация антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, необходимая для достижения 50% максимального связывания при насыщении (EC50) к частицам, подобным вирусу денге (DENV VLP) и/или к оболочечному белку денге (DENV E белок) в стандартном ELISA типично составляет больше, чем 102 нг/мл, предпочтительно больше, чем 103 нг/мл, более предпочтительно больше, чем 5х103 нг/мл, еще более предпочтительно больше, чем 8х103 нг/мл, и наиболее предпочтительно больше, чем 104 нг/мл.Preferably, the antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention does not substantially bind to dengue virus-like particles and/or dengue envelope protein. Thus, substantially no binding means that for an antibody or antigen-binding fragment thereof, EC 50 values up to 10 2 ng/ml, preferably up to 10 3 ng/ml, more preferably up to 5x10 3 ng/ml, even more preferably up to 8x10 3 ng/ml, and most preferably up to 10 4 ng/ml can be determined in a standard ELISA for dengue virus-like particles (DENV VLP) and/or dengue envelope protein (DENV E protein). In other words, the concentration of antibody or antigen binding fragment required to achieve 50% maximum saturation binding (EC50) to dengue virus-like particles (DENV VLP) and/or dengue envelope protein (DENV E protein) in a standard ELISA is typically greater more than 10 2 ng/ml, preferably greater than 10 3 ng/ml, more preferably greater than 5 x 10 3 ng/ml, even more preferably greater than 8 x 10 3 ng/ml, and most preferably greater than 10 4 ng /ml.
Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением не способствует антителозависимому усилению (ADE) инфекции, вызванной вирусом Зика.Preferably, the antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention does not promote antibody-dependent enhancement (ADE) of Zika virus infection.
ADE может быть оценено с помощью анализа на основании проточной цитометрии, используя, например, культивированные клетки или клеточные линии, такие как K562 клетки. Например, тестируемые антитела и ZIKV могут быть смешаны в течение 1 ч при 37°C и добавлены к 5000 K562 клеткам/лунку. Через четыре дня, клетки могут быть фиксированы, пермеабилизированы, и окрашены с помощью m4G2, например, как описано выше для анализов на нейтрализацию. Количество инфицированных клеток определяли путем проточной цитометрии, как описано выше для анализов на нейтрализацию.ADE can be assessed by flow cytometry-based analysis using, for example, cultured cells or cell lines such as K562 cells. For example, test antibodies and ZIKV can be mixed for 1 hour at 37°C and added to 5000 K562 cells/well. After four days, cells can be fixed, permeabilized, and stained with m4G2, for example, as described above for neutralization assays. The number of infected cells was determined by flow cytometry as described above for neutralization assays.
Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением представляет собой антитело человека.Preferably, the antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention is a human antibody.
Предпочтительно, антитело в соответствии с настоящим изобретением, или его антигенсвязывающий фрагмент содержат Fc компонент. Более предпочтительно, Fc компонент.Preferably, the antibody of the present invention, or an antigen binding fragment thereof, contains an Fc component. More preferably, an Fc component.
Как используется в настоящей заявке, термин Fc компонент относится к последовательности, имеющей происхождение из участка тяжелой цепи иммуноглобулина, начинающегося в шарнирной области сразу против хода транскрипции сайта расщепления папаином (например, остаток 216 в нативном IgG, принимая первый остаток константного участка тяжелой цепи за номер 114) и оканчивающийся на С-конце тяжелой цепи иммуноглобулина. Таким образом, Fc компонент может представлять полный Fc компонент или его часть (например, домен). Полный Fc компонент содержит по меньшей мере шарнирный домен, СН2 домен, и CH3 домен (например, EU положения аминокислот 216-446). Иногда присутствует дополнительный лизиновый остаток (K) в самом С-конце Fc компонента, но часто он отщепляется от зрелого антитела. Каждое из положений аминокислот в пределах Fc компонента было пронумеровано в соответствии с известной в данной области техники EU системой нумерации Кэбота, см., например, Kabat и др., в Sequences of Proteins of Immunological Interest, Министерство здравоохранения и социального обеспечения США (U.S. Dept. Health and Human Services), 1983 и 1987.As used herein, the term Fc component refers to a sequence originating from the immunoglobulin heavy chain region beginning in the hinge region immediately upstream of the papain cleavage site (e.g., residue 216 in native IgG, taking the first residue of the heavy chain constant region as the number 114) and ending at the C-terminus of the immunoglobulin heavy chain. Thus, the Fc component may represent the entire Fc component or a portion thereof (eg, a domain). A complete Fc component contains at least a hinge domain, a CH2 domain, and a CH3 domain (eg, EU amino acid positions 216-446). Sometimes an additional lysine residue (K) is present at the very C-terminus of the Fc component, but this is often cleaved from the mature antibody. Each of the amino acid positions within the Fc component has been numbered in accordance with the EU Cabot numbering system known in the art, see, for example, Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, U.S. Dept. .Health and Human Services), 1983 and 1987.
В контексте настоящего изобретения Fc компонент содержит по меньшей мере один: шарнирный (например, верхняя, средняя и/или нижняя шарнирная область) домен, СН2 домен, CH3 домен, или его вариант, часть или фрагмент. В предпочтительных вариантах осуществления, Fc компонент содержит по меньшей мере шарнирный домен, СН2 домен или CH3 домен. Более предпочтительно, Fc компонент представляет собой полный Fc компонент. Fc компонент также может содержать одну или несколько аминокислотных инсерций, делеций или замен по сравнению с встречающимся в природе Fc компонентом. Например, по меньшей мере один из шарнирного домена, СН2 домена или CH3 домена (или его часть) может быть делетирован. Например, Fc компонент может содержать или состоять из: (I) шарнирный домен (или его часть), слитый с СН2 доменом (или его частью), (II) шарнирный домен (или его часть), слитый с CH3 доменом (или его частью), (III) CH2 домен (или его часть), слитый с CH3 доменом (или его частью), (IV) шарнирный домен (или его часть), (V) СН2 домен (или его часть), или (VI) CH3 домен или его часть.In the context of the present invention, the Fc component contains at least one: a hinge (eg, upper, middle and/or lower hinge region) domain, a CH2 domain, a CH3 domain, or a variant, portion or fragment thereof. In preferred embodiments, the Fc component comprises at least a hinge domain, a CH2 domain, or a CH3 domain. More preferably, the Fc component is a complete Fc component. The Fc component may also contain one or more amino acid insertions, deletions or substitutions compared to the naturally occurring Fc component. For example, at least one of the hinge domain, CH2 domain, or CH3 domain (or a portion thereof) may be deleted. For example, an Fc component may contain or consist of: (I) a hinge domain (or part thereof) fused to a CH2 domain (or part thereof), (II) a hinge domain (or part thereof) fused to a CH3 domain (or part thereof) ), (III) CH2 domain (or part thereof) fused to a CH3 domain (or part thereof), (IV) hinge domain (or part thereof), (V) CH2 domain (or part thereof), or (VI) CH3 domain or part thereof.
Для квалифицированного специалиста в данной области техники будет понятно, что Fc компонент может быть модифицирован таким образом, что он различается по аминокислотной последовательности от полного Fc компонента встречающейся в природе молекулы иммуноглобулина, при этом сохраняя по меньшей мере одну желательную функцию, предоставляемую встречающимся в природе Fc компонентом. Такие функции включают связывание Fc рецептора (FcR), модуляция периода полужизни антитела, ADCC функцию, связывание белка А, связывание белка G, и связывание комплемента. Части встречающихся в природе Fc компонентов, которые отвечают и/или являются важными для таких функций, хороOne skilled in the art will appreciate that the Fc component can be modified such that it differs in amino acid sequence from the full Fc component of a naturally occurring immunoglobulin molecule while retaining at least one desired function provided by the naturally occurring Fc component. Such functions include Fc receptor (FcR) binding, antibody half-life modulation, ADCC function, protein A binding, protein G binding, and complement fixation. Parts of naturally occurring Fc components that are responsible and/or essential for such functions are well
- 9 046175 шо известны квалифицированным специалистам в данной области техники.- 9 046175 which are known to those skilled in the art.
Например, для активации каскада реакций комплемента C1q связывается с по меньшей мере двумя молекулами IgG1 или одной молекулой IgM, присоединенной к антигенной мишени (Ward, E.S., и Ghetie, V., Ther. Immunol. 2 (1995) 77-94). Burton, D.R., описали (Mol. Immunol. 22 (1985) 161-206), что участок тяжелой цепи, содержащий аминокислотные остатки с 318 до 337, вовлечен в фиксацию комплемента. Duncan, A.R., и Winter, G. (Nature 332 (1988) 738-740), используя сайт-направленный мутагенез, описали, что Glu318, Lys320 и Lys322 образуют сайт связывания с C1q. Роль Glu318, Lys320 и Lys322 остатков в связывании C1q подтверждается способностью короткого синтетического пептида, содержащего эти остатки, ингибировать лизис, опосредованный комплементом.For example, to activate the complement cascade, C1q binds to at least two IgG1 molecules or one IgM molecule attached to an antigenic target (Ward, E. S., and Ghetie, V., Ther. Immunol. 2 (1995) 77-94). Burton, D.R., described (Mol. Immunol. 22 (1985) 161-206) that the heavy chain region containing amino acid residues 318 to 337 is involved in complement fixation. Duncan, A.R., and Winter, G. (Nature 332 (1988) 738-740), using site-directed mutagenesis, described that Glu318, Lys320 and Lys322 form a binding site for C1q. The role of Glu318, Lys320 and Lys322 residues in C1q binding is supported by the ability of a short synthetic peptide containing these residues to inhibit complement-mediated lysis.
Например, FcR связывание может опосредоваться путем взаимодействия Fc компонента (антитела) с Fc рецепторами (FcR), которые представляют собой специализированные рецепторы клеточной поверхности на гемопоэтических клетках. Fc рецепторы относятся к суперсемейству иммуноглобулинов, и известно, что они опосредуют как удаление патогенов, покрытых антителами, путем фагоцитоза иммунных комплексов, так и лизис эритроцитов и других различных клеточных мишеней (например, опухолевых клеток), покрытых соответствующим антителом, путем антителозависимой клеточноопосредованной цитотоксичности (ADCC; Van de Winkel, J.G., и Anderson, C.L., J. Leukoc. Biol. 49 (1991) 511-524). FcR определяются по их специфичности для классов иммуноглобулинов; Fc рецепторы для IgG антител обозначаются как FcyR, для IgE как FcεR, для IgA как FcaR и так далее, и неонатальные Fc рецепторы обозначаются как FcRn. Связывание Fc рецептора описано, например, в Ravetch, J.V., и Kinet, J.P., Annu. Rev. Immunol. 9 (1991) 457-492; Capel, P.J., и др., Immunomethods 4 (1994) 25-34; de Haas, M., и др., J Lab. Clin. Med. 126 (1995) 330-341; и Gessner, J.E., и др., Ann. Hematol. 76 (1998) 231-248.For example, FcR binding can be mediated by the interaction of an Fc component (antibody) with Fc receptors (FcRs), which are specialized cell surface receptors on hematopoietic cells. Fc receptors belong to the immunoglobulin superfamily and are known to mediate both the removal of antibody-coated pathogens by phagocytosis of immune complexes and the lysis of red blood cells and various other cellular targets (such as tumor cells) coated with the appropriate antibody by antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity ( ADCC; Van de Winkel, J. G., and Anderson, C. L., J. Leukoc. Biol. 49 (1991) 511-524). FcRs are defined by their immunoglobulin class specificity; Fc receptors for IgG antibodies are designated FcyR, for IgE as FcεR, for IgA as FcaR, and so on, and neonatal Fc receptors are designated FcRn. Fc receptor binding is described, for example, in Ravetch, J.V., and Kinet, J.P., Annu. Rev. Immunol. 9 (1991) 457-492; Capel, P.J., et al., Immunomethods 4 (1994) 25-34; de Haas, M., et al., J Lab. Clin. Med. 126 (1995) 330-341; and Gessner, J.E., et al., Ann. Hematol. 76 (1998) 231-248.
Перекрестное связывание рецепторов с помощью Fc домена нативных IgG антител (FcyR) запускает разнообразные эффекторные функции, включая фагоцитоз, антителозависимую клеточную цитотоксичность, и высвобождение воспалительных медиаторов, а также клиренс иммунного комплекса и регуляцию продукции антител. Следовательно, предпочтительными являются Fc компоненты, обеспечивающие перекрестное связывание рецепторов (FcyR). У людей, было охарактеризовано три класса FcyR, которые представляют собой: (I) FcyRI (CD64), которые связывают мономерные IgG с высокой аффинностью и экспрессируются на макрофагах, моноцитах, нейтрофилах и эозинофилах; (II) FcyRII (CD32), связывающие комплексные IgG со средней или низкой аффинностью, широко экспрессируются, в особенности, на лейкоцитах, и известно, что они являются ключевым элементом в опосредованной антителами иммуногенности, и они могут быть разделены на FcyRIIA, FcyRIIB и FcyRIIC, которые осуществляют различные функции в иммунной системе, но связываются со сходной низкой активностью с IgG-Fc, и эктодомены этих рецепторов являются высоко гомологичными; и (III) FcyRIII (CD16), которые связывают IgG со средней или низкой аффинностью и существуют в виде двух типов: FcyRIIIA, обнаруженные на NK клетках, макрофагах, эозинофилах и некоторых моноцитах и Т-клетках и опосредующие ADCC и FcyRIIIB, которые высоко экспрессируются на нейтрофилах. FcyRIIA были обнаружены на многих клетках, вовлеченных в уничтожение (например, макрофаги, моноциты, нейтрофилы) и полагают, что они способны активировать процесс уничтожения. Полагают, что FcyRIIB принимают участие в ингибирующих процессах, и они были обнаружены на В-клетках, макрофагах и на тучных клетках и эозинофилах. Важно, что 75% всех FcyRIIB было обнаружено в печени (Ganesan, L.P. и др., 2012: FcYRIIb on liver sinusoidal endothelium clears small immune complexes. Journal of Immunology 189: 4981-4988). FcyRIIB в большом количестве экспрессируется в синусоидальном эндотелии печени, называемом LSEC, и в купферовских клетках в печени и LSEC представляют собой основной сайт клиренса небольших иммунных комплексов (Ganesan, L.P. и др., 2012: FcYRIIb on liver sinusoidal endothelium clears small immune complexes. Journal of Immunology 189: 4981-4988).Cross-linking of receptors by the Fc domain of native IgG antibodies (FcyR) triggers a variety of effector functions, including phagocytosis, antibody-dependent cellular cytotoxicity, and release of inflammatory mediators, as well as immune complex clearance and regulation of antibody production. Therefore, Fc components that provide receptor cross-linking (FcyR) are preferred. In humans, three classes of FcyRs have been characterized, which are: (i) FcyRI (CD64), which bind monomeric IgG with high affinity and are expressed on macrophages, monocytes, neutrophils and eosinophils; (II) FcyRII (CD32), which bind complex IgG with medium to low affinity, are widely expressed, especially on leukocytes, and are known to be a key element in antibody-mediated immunogenicity, and they can be divided into FcyRIIA, FcyRIIB and FcyRIIC , which perform different functions in the immune system, but bind with similar low activity to IgG-Fc, and the ectodomains of these receptors are highly homologous; and (III) FcyRIII (CD16), which binds IgG with moderate to low affinity and exists as two types: FcyRIIIA, found on NK cells, macrophages, eosinophils and some monocytes and T cells and mediating ADCC and FcyRIIIB, which is highly expressed on neutrophils. FcyRIIA have been found on many cells involved in killing (eg, macrophages, monocytes, neutrophils) and are believed to be capable of activating the killing process. FcyRIIBs are believed to be involved in inhibitory processes and have been found on B cells, macrophages, and on mast cells and eosinophils. Importantly, 75% of all FcyRIIB was found in the liver (Ganesan, L.P. et al., 2012: FcYRIIb on liver sinusoidal endothelium clears small immune complexes. Journal of Immunology 189: 4981-4988). FcyRIIB is abundantly expressed in liver sinusoidal endothelium, called LSEC, and in Kupffer cells in the liver, and LSEC represent the major site of clearance of small immune complexes (Ganesan, L.P. et al., 2012: FcYRIIb on liver sinusoidal endothelium clears small immune complexes. Journal of Immunology 189: 4981-4988).
Таким образом, предпочтительными являются такие антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые способны связываться с FcYRIIb, например, антитела, содержащие Fc компонент для связывания с FcYRIIb, в особенности Fc фрагмент, такие как, например, антитела IgG-типа. Кроме того, представляется возможным конструировать Fc компонент для усиления FcyRIIB связывания путем интродуцирования мутаций S267E и L328F, как описано Chu, S.Y. и др., 2008: Inhibition of В cell receptor-mediated activation of primary human В cells by coengagement of CD19 и FcgammaRIIb with Fc-engineered antibodies. Molecular Immunology 45, 3926-3933. Таким образом, может быть усилен клиренс иммунных комплексов (Chu, S., и др., 2014: Accelerated Clearance of IgE In Chimpanzees Is Mediated By Xmab7195, An FcEngineered Antibody With Enhanced Affinity For Inhibitory Receptor FcYRIIb. Am J Respir Crit, American Thoracic Society International Conference Abstracts). Таким образом, в контексте настоящего изобретения предпочтительными являются такие антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, которые содержат сконструированный Fc компонент с мутациями S267E и L328F, в особенности, как описано Chu, S.Y. и др., 2008: Inhibition of В cell receptor - mediated activation of primary human В cells by coengagement of CD19 и FcgammaRIIb with Fc-engineered antibodies. Molecular Immunology 45, 3926-3933.Thus, preference is given to those antibodies and antigen-binding fragments thereof that are capable of binding to FcYRIIb, for example, antibodies containing an Fc component for binding to FcYRIIb, especially an Fc fragment, such as, for example, IgG-type antibodies. In addition, it appears possible to engineer the Fc component to enhance FcyRIIB binding by introducing the S267E and L328F mutations, as described by Chu, S.Y. et al., 2008: Inhibition of B cell receptor-mediated activation of primary human B cells by coengagement of CD19 and FcgammaRIIb with Fc-engineered antibodies. Molecular Immunology 45, 3926-3933. Thus, clearance of immune complexes may be enhanced (Chu, S., et al., 2014: Accelerated Clearance of IgE In Chimpanzees Is Mediated By Xmab7195, An FcEngineered Antibody With Enhanced Affinity For Inhibitory Receptor FcYRIIb. Am J Respir Crit, American Thoracic Society International Conference Abstracts). Thus, in the context of the present invention, those antibodies or antigen binding fragments thereof are preferred which contain an engineered Fc component with the S267E and L328F mutations, particularly as described by Chu, S.Y. et al., 2008: Inhibition of B cell receptor - mediated activation of primary human B cells by coengagement of CD19 and FcgammaRIIb with Fc-engineered antibodies. Molecular Immunology 45, 3926-3933.
Полагают, что на В-клетках их функция состоит в подавлении дальнейшей продукции иммуноглоIt is believed that on B cells their function is to suppress further production of immunoglobulins.
- 10 046175 булинов и переключении изотипа, например, на IgE класс. На макрофагах, FcyRIIB действуют путем ингибирования фагоцитоза, что опосредуется с помощью FcyRIIA. На эозинофилах и тучных клетках, b форма может помогать подавлять активацию этих клеток путем IgE связывания с его отдельным рецептором.- 10 046175 bulins and switching the isotype, for example, to the IgE class. On macrophages, FcyRIIB acts by inhibiting phagocytosis, which is mediated by FcyRIIA. On eosinophils and mast cells, the b form may help suppress the activation of these cells by IgE binding to its distinct receptor.
При рассмотрении FcyRI связывания, модификация в нативном IgG по меньшей мере одного из E233-G236, Р238, D265, N297, А327 и Р329 уменьшает связывание с FcyRI. IgG2 остатки в положениях 233-236, замещенные в IgG1 и IgG4, уменьшают связывание с FcyRI в 103-раз и элиминируют ответ моноцитов человека на сенсибилизированные антителами эритроциты (Armour, K.L., и др. Eur. J. Immunol. 29 (1999) 2613-2624). При рассмотрении FcyRII связывания, уменьшенное связывание для FcyRIIA было обнаружено, например, для IgG мутации по меньшей мере одного из E233-G236, Р238, D265, N297, А327, Р329, D270, Q295, А327, R292 и K414. При рассмотрении FcyRIII связывания, уменьшенное связывание с FcyRIIIA было обнаружено, например, для мутации по меньшей мере одного из E233-G236, Р238, D265, N297, А327, Р329, D270, Q295, А327, S239, Е269, Е293, Y296, V303, А327, K338 и D376. Картирование сайтов связывания на IgG1 человека для Fc рецепторов, вышеуказанные сайты мутаций и способы для определения связывания с FcyRI и FcyRIIA описано в Shields, R.L., и др., J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604.When considering FcyRI binding, modification in the native IgG of at least one of E233-G236, P238, D265, N297, A327 and P329 reduces binding to FcyRI. IgG2 residues at positions 233-236, substituted in IgG1 and IgG4, reduce binding to FcyRI by 10 3 -fold and eliminate the response of human monocytes to antibody-sensitized red blood cells (Armour, KL, et al. Eur. J. Immunol. 29 (1999) 2613-2624). When considering FcyRII binding, reduced binding for FcyRIIA was found, for example, for IgG mutations of at least one of E233-G236, P238, D265, N297, A327, P329, D270, Q295, A327, R292 and K414. When considering FcyRIII binding, reduced binding to FcyRIIIA was found, for example, for mutation of at least one of E233-G236, P238, D265, N297, A327, P329, D270, Q295, A327, S239, E269, E293, Y296, V303 , A327, K338 and D376. Mapping of binding sites on human IgG1 for Fc receptors, the above mutation sites, and methods for determining binding to FcyRI and FcyRIIA are described in Shields, RL, et al., J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604.
При рассмотрении связывания с чрезвычайно важным FcyRII, полагают, что два участка нативного IgG Fc являются ключевыми для взаимодействий FcyRII и IgG, а именно (I) нижний шарнирный сайт IgG Fc, в особенности аминокислотные остатки L, L, G, G (234-237, EU нумерация), и (II) смежный участок СН2 домена IgG Fc, в особенности петля и цепи в верхнем СН2 домене, смежные с нижней шарнирной областью, например, в участке Р331 (Wines, B.D., и др., J. Immunol. 2000; 164: 5313-5318). Кроме того, полагают, что FcyRI связывается с тем же самым сайтом на IgG Fc, в то время как FcRn и белок А связываются с другим сайтом на IgG Fc, что, по всей видимости, является на поверхности раздела CH2-CH3 (Wines, B.D., и др., J. Immunol. 2000; 164: 5313-5318).When considering binding to the extremely important FcyRII, two regions of the native IgG Fc are believed to be key for FcyRII and IgG interactions, namely (I) the lower hinge site of the IgG Fc, especially the amino acid residues L, L, G, G (234-237 , EU numbering), and (ii) the adjacent CH2 region of the IgG Fc domain, especially the loop and chains in the upper CH2 domain adjacent to the lower hinge region, for example, in the P331 region (Wines, B.D., et al., J. Immunol. 2000;164:5313-5318). In addition, FcyRI is believed to bind to the same site on the IgG Fc, while FcRn and protein A bind to a different site on the IgG Fc, which appears to be at the CH2-CH3 interface (Wines, B.D. , et al., J Immunol 2000;164:5313-5318).
Например, Fc компонент может содержать или состоять из по меньшей мере части Fc компонента, которая, как известно в данной области, необходима для FcRn связывания или удлинения периода полужизни. Альтернативно или дополнительно, Fc компонент антитела может содержать по меньшей мере часть, которая, как известно в данной области, является необходимой для связывания белка А и/или Fc компонент антитела может содержать по меньшей мере часть Fc молекулы, которая, как известно в данной области, необходима для связывания белка G. Предпочтительно, сохраненная функция представляет собой нейтрализацию инфекции, вызванной вирусом Зика, которая, как полагают, опосредуется связыванием FcyR. Таким образом, предпочтительный Fc компонент может содержать по меньшей мере часть, которая, как известно в данной области, является необходимой для FcyR связывания. Таким образом, как указано выше, предпочтительный Fc компонент может по меньшей мере содержать (I) нижний шарнирный сайт нативного IgG Fc, в особенности аминокислотные остатки L, L, G, G (234-237, EU нумерация), и (II) смежный участок СН2 домена нативного IgG Fc, в особенности петлю и цепи в верхнем СН2 домене, смежные с нижней шарнирной областью, например, в участке Р331, например, участок по меньшей мере из 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, или 10 последовательных аминокислот в верхнем СН2 домене нативного IgG Fc около Р331, например, между аминокислотами 320 и 340 (EU нумерация) нативного IgG Fc.For example, the Fc component may contain or consist of at least a portion of the Fc component that is known in the art to be required for FcRn binding or half-life extension. Alternatively or additionally, the Fc component of the antibody may contain at least a portion that is known in the art to be necessary for protein A binding and/or the Fc component of the antibody may contain at least a portion of an Fc molecule that is known in the art , is required for G protein binding. Preferably, the retained function is the neutralization of Zika virus infection, which is believed to be mediated by FcyR binding. Thus, a preferred Fc component may contain at least a portion that is known in the art to be necessary for FcyR binding. Thus, as stated above, a preferred Fc component may at least comprise (i) the lower hinge site of the native IgG Fc, particularly amino acid residues L, L, G, G (234-237, EU numbering), and (ii) an adjacent the CH2 domain region of a native IgG Fc, especially the loop and strands in the upper CH2 domain adjacent to the lower hinge region, for example in the P331 region, for example a region of at least 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10 consecutive amino acids in the upper CH2 domain of the native IgG Fc around P331, for example, between amino acids 320 and 340 (EU numbering) of the native IgG Fc.
Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением содержит Fc фрагмент. Как используется в настоящей заявке, термин Fc фрагмент относится к части иммуноглобулина, образованной двумя или более Fc компонентами тяжелых цепей антитела. Например, Fc фрагмент может представлять собой мономерный или одноцепочечный Fc фрагмент (то есть, scFc фрагмент). Одноцепочечные Fc фрагменты состоят из Fc компонентов, связанных в пределах одной полипептидной цепи (например, кодируемые в одной непрерывной последовательности нуклеиновых кислот). Типичные scFc фрагменты описаны в WO 2008/143954 А2. Предпочтительно, Fc фрагмент представляет собой димерный Fc фрагмент. Димерный Fc фрагмент или dcFc относится к димеру, образованному Fc компонентами двух отдельных тяжелых цепей иммуноглобулинов. Димерный Fc фрагмент может представлять собой гомодимер двух идентичных Fc компонентов (например, Fc фрагмент встречающегося в природе иммуноглобулина) или гетеродимер двух неидентичных Fc компонентов.Preferably, the antibody or antigen binding fragment thereof according to the present invention contains an Fc fragment. As used herein, the term Fc fragment refers to the portion of an immunoglobulin formed by two or more Fc components of an antibody heavy chain. For example, the Fc fragment may be a monomeric or single chain Fc fragment (ie, a scFc fragment). Single-stranded Fc fragments consist of Fc components linked within a single polypeptide chain (eg, encoded in a single contiguous nucleic acid sequence). Typical scFc fragments are described in WO 2008/143954 A2. Preferably, the Fc fragment is a dimeric Fc fragment. A dimeric Fc fragment or dcFc refers to a dimer formed by the Fc components of two separate immunoglobulin heavy chains. The dimeric Fc fragment may be a homodimer of two identical Fc components (eg, an Fc fragment of a naturally occurring immunoglobulin) or a heterodimer of two non-identical Fc components.
Fc компоненты Fc фрагмента могут быть из одного и того же или различных классов и/или подклассов. Например, Fc компоненты могут иметь происхождение из иммуноглобулина (например, иммуноглобулина человека) IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4 подкласса. Предпочтительно, Fc компоненты Fc фрагмента есть одного и тоже класса и подкласса. Тем не менее, Fc фрагмент (или один или несколько Fc компонентов Fc фрагмента) также может быть химерным, вследствие чего химерный Fc фрагмент может содержать Fc компоненты, имеющие происхождение из различных классов и/или подклассов иммуноглобулинов. Например, по меньшей мере два из Fc компонентов димерного или одноцепочечного Fc фрагмента могут быть из различных классов и/или подклассов иммуноглобулинов. Дополнительно или альтернативно, химерные Fc фрагменты могут содержать один или несколько химерных Fc компонентов. Например, химерный Fc фрагмент или компонент может содержать одну или несколько частей, имеющих происхождение из иммуноглобулина первого подкласса (например, IgG1, IgG2, или IgG3 подкласса), в то время как оставшаяся часть Fc фрагмента или компонента является из другого подкласса. Например, Fc фрагмент или компонент Fc полипептида может содержать СН2 и/или CH3 домен, имеющийThe Fc components of an Fc fragment may be from the same or different classes and/or subclasses. For example, the Fc components may be of immunoglobulin (eg, human immunoglobulin) origin of the IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 subclass. Preferably, the Fc components of the Fc fragment are of the same class and subclass. However, the Fc fragment (or one or more Fc components of the Fc fragment) may also be chimeric, whereby the chimeric Fc fragment may contain Fc components originating from different classes and/or subclasses of immunoglobulins. For example, at least two of the Fc components of a dimeric or single chain Fc fragment may be from different classes and/or subclasses of immunoglobulins. Additionally or alternatively, the chimeric Fc fragments may contain one or more chimeric Fc components. For example, a chimeric Fc fragment or component may contain one or more portions originating from an immunoglobulin of the first subclass (eg, IgG1, IgG2, or IgG3 subclass), while the remaining portion of the Fc fragment or component is from a different subclass. For example, an Fc fragment or component of an Fc polypeptide may contain a CH2 and/or CH3 domain having
- 11 046175 происхождение из иммуноглобулина первого подкласса (например, IgG1, IgG2 или IgG4 подкласса) и шарнирную область из иммуноглобулина второго подкласса (например, IgG3 подкласса). Например, Fc фрагмент или компонент может содержать шарнир и/или СН2 домен, имеющий происхождение из иммуноглобулина первого подкласса (например, IgG4 подкласса) и CH3 домен из иммуноглобулина второго подкласса (например, IgG1, IgG2, или IgG3 подкласса). Например, химерный Fc фрагмент может содержать Fc компонент (например, полный Fc компонент) из иммуноглобулина первого подкласса (например, IgG4 подкласса) и Fc компонент из иммуноглобулина второго подкласса (например, IgG1, IgG2 или IgG3 подкласса). Например, Fc фрагмент или компонент может содержать СН2 домен из IgG4 иммуноглобулина и CH3 домен из IgG1 иммуноглобулина. Например, Fc фрагмент или компонент может содержать СН1 домен и СН2 домен из IgG4 молекулы и CH3 домен из IgG1 молекулы. Например, Fc фрагмент или компонент может содержать часть СН2 домена из предпочтительного подкласса антитела, например, EU положения 292-340 СН2 домена. Например, Fc фрагмент или компонент может содержать аминокислоты в положениях 292-340 СН2, имеющего происхождение из IgG4 компонента, и оставшуюся часть СН2, имеющую происхождение из IgG1 компонента (альтернативно, 292-340 из СН2 могут иметь происхождение из IgG1 компонента и оставшуюся часть СН2, имеющую происхождение из IgG4 компонента).- 11 046175 origin from an immunoglobulin of the first subclass (for example, IgG1, IgG2 or IgG4 subclass) and a hinge region from an immunoglobulin of the second subclass (for example, IgG3 subclass). For example, the Fc fragment or component may comprise a hinge and/or CH2 domain derived from a first subclass immunoglobulin (eg, IgG4 subclass) and a CH3 domain from a second subclass immunoglobulin (eg, IgG1, IgG2, or IgG3 subclass). For example, a chimeric Fc fragment may comprise an Fc component (eg, a complete Fc component) from a first subclass immunoglobulin (eg, an IgG4 subclass) and an Fc component from a second subclass immunoglobulin (eg, an IgG1, IgG2, or IgG3 subclass). For example, the Fc fragment or component may comprise a CH2 domain from an IgG4 immunoglobulin and a CH3 domain from an IgG1 immunoglobulin. For example, the Fc fragment or component may comprise a CH1 domain and a CH2 domain from an IgG4 molecule and a CH3 domain from an IgG1 molecule. For example, the Fc fragment or component may comprise part of a CH2 domain from a preferred subclass of the antibody, for example EU positions 292-340 of the CH2 domain. For example, the Fc fragment or component may contain amino acids at positions 292-340 of CH2 originating from the IgG4 component and the remainder of CH2 originating from the IgG1 component (alternatively, 292-340 of CH2 may be originating from the IgG1 component and the remainder CH2 , originating from the IgG4 component).
Кроме того, Fc фрагмент или компонент может содержать (дополнительно или альтернативно) например, химерную шарнирную область. Например, химерный шарнир может иметь происхождение, например, частично, из IgG1, IgG2, или IgG4 молекулы (например, верхней и нижней серединной шарнирной последовательности) и, частично, из IgG3 молекулы (например, серединной шарнирной последовательности). В другом примере, Fc фрагмент или компонент может содержать химерный шарнир, имеющий происхождение, частично, из IgG1 молекулы и, частично, из IgG4 молекулы. В другом примере, химерный шарнир может содержать верхний и нижний шарнирные домены из IgG4 молекулы и серединный шарнирный домен из IgG1 молекулы. Такой химерный шарнир может быть получен, например, путем интродуцирования пролиновой замены (Ser228Pro) в EU положении 228 в серединном шарнирном домене IgG4 шарнирной области. В другом варианте осуществления, химерный шарнир может содержать аминокислоты в EU положениях 233-236 из IgG2 антитела и/или Ser228Pro мутацию, где оставшиеся аминокислоты шарнира имеют происхождение из IgG4 антитела (например, химерный шарнир последовательности ESKYGPPCPPCPAPPVAGP). Другие химерные шарниры, которые могут использоваться в Fc компоненте антитела в соответствии с настоящим изобретением, описаны в US 2005/0163783 А1.In addition, the Fc fragment or component may further or alternatively comprise, for example, a chimeric hinge region. For example, a chimeric hinge may be derived, for example, in part from an IgG1, IgG2, or IgG4 molecule (eg, an upper and lower middle hinge sequence) and, in part, from an IgG3 molecule (eg, a middle hinge sequence). In another example, the Fc fragment or component may comprise a chimeric hinge derived in part from an IgG1 molecule and in part from an IgG4 molecule. In another example, the chimeric hinge may comprise top and bottom hinge domains from an IgG4 molecule and a middle hinge domain from an IgG1 molecule. Such a chimeric hinge can be obtained, for example, by introducing a proline substitution (Ser228Pro) at EU position 228 in the middle hinge domain of the IgG4 hinge region. In another embodiment, the chimeric hinge may contain amino acids at EU positions 233-236 from an IgG2 antibody and/or a Ser228Pro mutation, where the remaining hinge amino acids are of origin from an IgG4 antibody (eg, chimeric hinge sequence ESKYGPPPPPCPAPPVAGP). Other chimeric hinges that may be used in the Fc component of an antibody of the present invention are described in US 2005/0163783 A1.
Fc компонент или Fc фрагмент может содержать или состоять из аминокислотной последовательности, имеющей происхождение из последовательности иммуноглобулина человека (например, из Fc фрагмента или Fc компонента из молекулы IgG человека). Тем не менее, полипептиды могут содержать одну или несколько аминокислот из других видов млекопитающих. Например, Fc компонент примата или сайт связывания примата может быть включен в заявляемые полипептиды. Альтернативно, одна или несколько мышиных аминокислот могут присутствовать в Fc компоненте или в Fc фрагменте.An Fc component or Fc fragment may contain or consist of an amino acid sequence derived from a human immunoglobulin sequence (eg, an Fc fragment or Fc component from a human IgG molecule). However, the polypeptides may contain one or more amino acids from other mammalian species. For example, a primate Fc component or a primate binding site may be included in the claimed polypeptides. Alternatively, one or more murine amino acids may be present in the Fc component or Fc fragment.
Предпочтительно, антитело может содержать, в особенности дополнительно к Fc компоненту, как описано выше, другие части, имеющие происхождение из константного участка, в особенности из константного участка IgG, предпочтительно из константного участка IgG1, более предпочтительно из константного участка IgG1 человека. Более предпочтительно, антитело в соответствии может содержать, в особенности дополнительно к Fc компоненту, как описано выше, все другие части константных участков, в особенности все другие части константных участков IgG, предпочтительно все другие части константных участков IgG1, более предпочтительно все другие части константных участков IgG1 человека.Preferably, the antibody may contain, in particular in addition to the Fc component as described above, other parts derived from the constant region, in particular from the IgG constant region, preferably from the IgG1 constant region, more preferably from the human IgG1 constant region. More preferably, the antibody accordingly may comprise, especially in addition to the Fc component as described above, all other constant region parts, in particular all other IgG constant region parts, preferably all other IgG1 constant region parts, more preferably all other constant region parts Human IgG1.
В особенности предпочтительные последовательности константных участков могут представлять собой аминокислотные последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 145-148 (последовательности нуклеиновых кислот в соответствии с SEQ ID NO: 149-152). Предпочтительно, аминокислотная последовательность из IgG1 CH1-CH2-CH3 может представлять собой последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 145 или ее вариант функциональной последовательности. Еще более предпочтительно, аминокислотная последовательность IgG1 CH1-CH2-CH3 может представлять собой последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 146 или ее вариант функциональной последовательности, как описано в настоящей заявке, где поддерживается LALA мутация.Particularly preferred constant region sequences may be amino acid sequences according to SEQ ID NOs: 145-148 (nucleic acid sequences according to SEQ ID NOs: 149-152). Preferably, the amino acid sequence of IgG1 CH1-CH2-CH3 may be the sequence according to SEQ ID NO: 145 or a functional sequence variant thereof. Even more preferably, the amino acid sequence of IgG1 CH1-CH2-CH3 may be the sequence according to SEQ ID NO: 146 or a functional sequence variant thereof, as described herein, where the LALA mutation is supported.
Как указано выше, особенно предпочтительное антитело в соответствии с настоящим изобретением содержит (полный) Fc фрагмент, имеющий происхождение из IgG1 человека. Однако антитело может содержать, в особенности дополнительно к (полному) Fc фрагменту, имеющему происхождение из IgG1 человека, также все другие части константных участков IgG, предпочтительно все другие части константных участков IgG1, более предпочтительно все другие части константных участков IgG1 человека.As stated above, a particularly preferred antibody according to the present invention contains a (full) Fc fragment derived from human IgG1. However, the antibody may contain, in particular in addition to the (full) Fc fragment originating from human IgG1, also all other parts of the IgG constant regions, preferably all other parts of the IgG1 constant regions, more preferably all other parts of the human IgG1 constant regions.
Не желая ограничиваться какой-либо теорией, полагают, что антителозависимое усиление (ADE) инфекции, вызванной вирусом Зика, обусловлено, вероятно, связыванием Fc компонента антитела, в особенности, Fc компонента тяжелой цепи молекулы IgG, с Fc рецептором, например, Fcy рецептором на клетке-хозяине. Таким образом, является предпочтительным, что антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать одну или несколько мутаций в Fc компоненте. Мутация(и) может(гут) представлять собой любую мутацию, которая уменьшает связывание антитела с Fc рецептором (FcR). Таким образом, предпочтительно, что антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать однуWithout wishing to be bound by theory, it is believed that antibody-dependent enhancement (ADE) of Zika virus infection is likely due to the binding of the Fc component of the antibody, particularly the Fc component of the heavy chain of the IgG molecule, to an Fc receptor, e.g., the Fcy receptor on host cell. Thus, it is preferred that the antibody or antigen binding fragment thereof may contain one or more mutations in the Fc component. The mutation(s) may be any mutation that reduces the binding of the antibody to the Fc receptor (FcR). Thus, it is preferred that the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise one
- 12 046175 или несколько мутаций в Fc компоненте, которая(ые) (I) уменьшает(ют) связывание антитела с Fcy рецептором, но не нарушает(ют) взаимодействие с FcRn. Одним из примеров такой мутации является LALA мутация, описанная ниже.- 12 046175 or several mutations in the Fc component, which (s) reduce(s) the binding of the antibody to the Fcy receptor, but does not disrupt the interaction with FcRn. One example of such a mutation is the LALA mutation, described below.
Как правило, связывание антитела с Fc рецептором может быть оценено с помощью различных способов, известных квалифицированному специалисту в данной области техники, таких как ELISA (Hessell AJ, Hangartner L, Hunter M, Havenith CEG, Beurskens FJ, Bakker JM, Lanigan CMS, Landucci G, Forthal DN, Parren PWHI, и др.: Fc receptor but not complement binding is important in antibody protection against HIV. Nature 2007, 449:101-104; Grevys A, Bern M, Foss S, Bratlie DB, Moen A, Gunnarsen KS, Aase A, Michaelsen ТЕ, Sandlie I, Andersen JT: Fc Engineering of Human IgG1 for Altered Binding to the Neonatal Fc Receptor Affects Fc Effector Functions. 2015, 194:5497-5508) или проточной цитометрии (Perez LG, Costa MR, Todd CA, Haynes BF, Montefiori DC: Utilization of immunoglobulin G Fc receptors by human immunodeficiency virus type 1: a specific role for antibodies against the membrane-proximal external region of gp41. J Virol 2009, 83:7397-7410; Piccoli L, Campo I, Fregni CS, Rodriguez BMF, Minola A, Sallusto F, Luisetti M, Corti D, Lanzavecchia A: Neutralization and clearance of GM-CSF by autoantibodies in pulmonary alveolar proteinosis. Nat Commun 2015, 6:1-9).In general, antibody binding to the Fc receptor can be assessed using various methods known to one skilled in the art, such as ELISA (Hessell AJ, Hangartner L, Hunter M, Havenith CEG, Beurskens FJ, Bakker JM, Lanigan CMS, Landucci G, Forthal DN, Parren PWHI, et al: Fc receptor but not complement binding is important in antibody protection against HIV. Nature 2007, 449:101-104; Grevys A, Bern M, Foss S, Bratlie DB, Moen A, Gunnarsen KS, Aase A, Michaelsen TE, Sandlie I, Andersen JT: Fc Engineering of Human IgG1 for Altered Binding to the Neonatal Fc Receptor Affects Fc Effector Functions. 2015, 194:5497-5508) or flow cytometry (Perez LG, Costa MR , Todd CA, Haynes BF, Montefiori DC: Utilization of immunoglobulin G Fc receptors by human immunodeficiency virus type 1: a specific role for antibodies against the membrane-proximal external region of gp41. J Virol 2009, 83:7397-7410; Piccoli L , Campo I, Fregni CS, Rodriguez BMF, Minola A, Sallusto F, Luisetti M, Corti D, Lanzavecchia A: Neutralization and clearance of GM-CSF by autoantibodies in pulmonary alveolar proteinosis. Nat Commun 2015, 6:1-9).
Антитело может быть гликозилированным. N-связанные гликаны, присоединенные к СН2 домену тяжелой цепи, например, могут оказывать влияние на C1q и FcR связывание, с агликозилированными антителами, имеющими более низкую аффинность к этим рецепторам. Таким образом, СН2 домен Fc компонента антитела может содержать одну или несколько мутаций, в которых гликозилированный остаток заменен на негликозилированный остаток. Структура гликана также может оказывать влияние на активность, например, можно наблюдать различия в комплементопосредованной клеточной гибели в зависимости от количества галактозных сахаров (0, 1 или 2) на концах двухантенной цепи гликана. Предпочтительно, гликаны антител не приводят к иммуногенным ответным реакциям у человека после введения.The antibody may be glycosylated. N-linked glycans attached to the heavy chain CH2 domain, for example, can influence C1q and FcR binding, with aglycosylated antibodies having lower affinity for these receptors. Thus, the CH2 domain of the Fc component of an antibody may contain one or more mutations in which a glycosylated residue is replaced by a non-glycosylated residue. Glycan structure can also influence activity; for example, differences in complement-mediated cell death can be observed depending on the number of galactose sugars (0, 1, or 2) at the ends of the biantennary glycan chain. Preferably, the antibody glycans do not result in immunogenic responses in humans following administration.
Кроме того, антитело в соответствии с настоящим изобретением может быть модифицировано путем интродуцирования случайных аминокислотных мутаций в конкретный участок СН2 домена тяжелой цепи для изменения их аффинности связывания для FcR и/или их времени полужизни в сыворотке крови по сравнению с немодифицированными антителами.In addition, the antibody of the present invention can be modified by introducing random amino acid mutations into a specific region of the heavy chain CH2 domain to change their FcR binding affinity and/or their serum half-life compared to unmodified antibodies.
Особенно предпочтительно, Fc компонент антитела может содержать замену в положениях СН2 4, СН2 5, или обоих. Как правило, аминокислота в положениях 4 и 5 СН2 дикого типа IgG1 и IgG3 представляет собой лейцин (L). Предпочтительно, антитело в соответствии с настоящим изобретением содержит обе, СН2 L4A и СН2 L5A замены. Такие антитела обозначаются в настоящей заявке как LALA вариант. Чрезвычайно интересен тот факт, что такая LALA мутация в Fc компоненте не только приводит к отсутствию вклада соответствующего антитела в антителозависимое усиление (ADE) инфекции, вызванной вирусом Зика, но также блокирует антителозависимое усиление (ADE) инфекции, вызванной вирусом Зика. Типичная аминокислотная последовательность IgG1 CH1-CH2-CH3, содержащая LALA мутацию, представляет собой последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 146. Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, связывается с доменом III белка оболочки вируса Зика (EDIII, также обозначается как DIII). Другими словами, предпочтительно, что антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с эпитопом белка оболочки вируса Зика, который включает один или несколько аминокислотных остатков домена III белка оболочки вируса Зика (EDIII). ZIKV включает нуклеокапсидное ядро, которое содержит одноцепочечную РНК, обернутую ядерными белками. Нуклеокапсидное ядро инкапулировано липидной двухслойной мембраной с мембранными белками и оболочечными белками. Белок оболочки ZIKV (E белок) представляет собой доминантный антиген. Эктодомен белка оболочки содержит три различных домена: домен I Е белка (EDI), домен II Е белка (EDII), и домен III E белка (EDIII). EDIII является высоко консервативным среди различных ZIKV штаммов (см. фиг. 12 относительно выравнивания аминокислотных последовательностей EDIII различных штаммов ZIKV).Particularly preferably, the Fc component of the antibody may contain a substitution at the CH2 4, CH2 5, or both positions. Typically, the amino acid at positions 4 and 5 of wild-type IgG1 and IgG3 CH2 is leucine (L). Preferably, the antibody of the present invention contains both CH2 L4A and CH2 L5A substitutions. Such antibodies are referred to herein as the LALA variant. It is extremely interesting that such a LALA mutation in the Fc component not only results in a lack of contribution of the corresponding antibody to antibody-dependent enhancement (ADE) of Zika virus infection, but also blocks antibody-dependent enhancement (ADE) of Zika virus infection. A typical amino acid sequence of an IgG1 CH1-CH2-CH3 containing a LALA mutation is the sequence according to SEQ ID NO: 146. Preferably, the antibody, or antigen binding fragment thereof, binds to domain III of the Zika virus envelope protein (EDIII, also referred to as DIII) . In other words, it is preferred that the antibody or antigen binding fragment thereof binds to an epitope of the Zika virus envelope protein that includes one or more amino acid residues of the Zika virus envelope protein domain III (EDIII). ZIKV includes a nucleocapsid core that contains single-stranded RNA wrapped in nuclear proteins. The nucleocapsid core is encapsulated by a lipid bilayer membrane with membrane proteins and envelope proteins. The ZIKV envelope protein (E protein) is the dominant antigen. The coat protein ectodomain contains three distinct domains: E protein domain I (EDI), E protein domain II (EDII), and E protein domain III (EDIII). EDIII is highly conserved among different ZIKV strains (see FIG. 12 for amino acid sequence alignment of EDIII of different ZIKV strains).
Таким образом, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент более предпочтительно связывается с доменом III белка оболочки вируса Зика (EDIII) с EDIII, имеющим следующую аминокислотную последовательность (SEQ ID NO: 401):Thus, the antibody or antigen binding fragment thereof more preferably binds to domain III of the Zika virus envelope protein (EDIII) with EDIII having the following amino acid sequence (SEQ ID NO: 401):
TAAFTFTKXPAEXXHGTVTVEXQYXGXDGPCKXPXQMAVDXQTLTPVGRLITATAAFTFTKXPAEXXHGTVTVEXQYXGXDGPCKXPXQMAVDXQTLTPVGRLITA
NPVITEXTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGXGXKKITHHWHRS где X может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту.NPVITEXTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGXGXKKITHHWHRS where X can be any (naturally occurring) amino acid.
Также является предпочтительным, что антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением связывается с доменом III белка оболочки вируса Зика (EDIII) с EDIII, имеющим следующую аминокислотную последовательность (SEQ ID NO: 407):It is also preferred that the antibody or antigen binding fragment thereof of the present invention binds to domain III of the Zika virus envelope protein (EDIII) with EDIII having the following amino acid sequence (SEQ ID NO: 407):
X1GX2X3YSLCTAAFTFTKX4PAEX5X6HGTVTVEX7QYX8GX9DGPCKX1oPXiiQMX 1 GX2X3YSLCTAAFTFTKX 4 PAEX 5 X 6 HGTVTVEX7QYX 8 GX9DGPCKX 1 oPXiiQM
AVDXuQTLTPVGRLITANPVITEXBTXMNSKMMLELDPPFGDSYIVIGXisGXieAVDXuQTLTPVGRLITANPVITEXBTXMNSKMMLELDPPFGDSYIVIGXisGXie
X17KITHHWHRSG где X1 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтиX 17 KITHHWHRSG where X1 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably
- 13 046175 тельно K, А, или Е;- 13 046175 specifically K, A, or E;
Х2 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно V, F, или L;X2 may be any (naturally occurring) amino acid, preferably V, F, or L;
X3 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно S или F;X3 may be any (naturally occurring) amino acid, preferably S or F;
Х4 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно I или V;X 4 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably I or V;
Х5 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно Т или V;X 5 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably T or V;
Х6 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно L или D;X 6 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably L or D;
Х7 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно V или G;X 7 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably V or G;
Х8 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно или G;X 8 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably or G;
Х9 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, за исключением R, предпочтительно Т или А;X 9 can be any (naturally occurring) amino acid except R, preferably T or A;
Х10 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно V или I;X 10 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably V or I;
X11 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно или V;X 11 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably or V;
Х12 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно М или Т;X 12 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably M or T;
Х13 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно S или G;X 13 may be any (naturally occurring) amino acid, preferably S or G;
Х14 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно Е или K;X 14 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably E or K;
X15 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно V или I;X 15 may be any (naturally occurring) amino acid, preferably V or I;
Х16 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно Е, А, K, или D; иX 16 can be any naturally occurring amino acid, preferably E, A, K, or D; And
Х17 может представлять собой любую (встречающуюся в природе) аминокислоту, предпочтительно Е, А, или K, более предпочтительно K или А.X 17 can be any (naturally occurring) amino acid, preferably E, A, or K, more preferably K or A.
Например, EDIII простирается от аминокислоты 309 до аминокислоты 403 Е белка ZIKV штамма ZIKV H/PF/2013 (номер доступа Genbank KJ776791). Таким образом, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент наиболее предпочтительно связывается с доменом III белка оболочки вируса Зика (EDIII) с EDIII, имеющим следующую аминокислотную последовательность (SEQ ID NO: 402):For example, EDIII extends from amino acid 309 to amino acid 403 of the E protein of ZIKV strain ZIKV H/PF/2013 (Genbank accession number KJ776791). Thus, the antibody or antigen binding fragment thereof most preferably binds to domain III of the Zika virus envelope protein (EDIII) with EDIII having the following amino acid sequence (SEQ ID NO: 402):
TAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITATAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITA
NPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRS.NPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRS.
Неожиданно, изобретателями настоящего изобретения было обнаружено, что связывание антитела с доменом III белка оболочки вируса Зика (EDIII) проявляет (I) повышенную нейтрализацию ZIKV и (II) сниженную перекрестную реакционную способность с DENV (в особенности по существу отсутствие перекрестной реакционной способности с DENV), по сравнению со связыванием антитела с доменом I/II белка оболочки вируса Зика (EDI/II).Surprisingly, the inventors of the present invention have discovered that antibody binding to domain III of the Zika virus envelope protein (EDIII) exhibits (i) increased neutralization of ZIKV and (ii) reduced cross-reactivity with DENV (specifically, essentially no cross-reactivity with DENV) , compared to antibody binding to domain I/II of the Zika virus envelope protein (EDI/II).
Более предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением связывается с эпитопом белка оболочки вируса Зика, который включает один или несколько аминокислотных остатков латерального гребня (LR) в EDIII и/или один или несколько аминокислотных остатков EDI-EDIII шарнирной области. EDIII латеральный гребень и EDI-EDIII шарнирная область известны квалифицированному специалисту в данной области техники и описаны, например, в Zhao, H., Fernandez, E., Dowd, K.A., Speer, S.D., Platt, D.J., Gorman, M.J., Govero, J., Nelson, C.A., Pierson, T.C., Diamond, M.S., и др. (2016). Structural Basis of Zika Virus-Specific Antibody Protection. Cell 166(4): 1016-27 и в Kostyuchenko VA, Lim EX, Zhang S, Fibriansah G, Ng TS, Ooi JS, Shi J, Lok SM. Structure of the thermally stable Zika virus. Nature. 2016 May 19;533(7603):425-8. He желая ограничиваться какой-либо теорией, полагают, что (I) связывание с LR может ингибировать слияние путем задержки переходного состояния слияния вируса и (II) связывание с EDI-EDIII шарниром и EDIII может препятствовать движению EDIII с образованием трехмерной структуры после слияния, останавливая таким образом мембранный синтез.More preferably, the antibody or antigen binding fragment thereof of the present invention binds to an epitope of the Zika virus envelope protein that includes one or more lateral ridge (LR) amino acid residues in EDIII and/or one or more amino acid residues EDI-EDIII in the hinge region. The EDIII lateral ridge and the EDI-EDIII hinge region are known to one skilled in the art and are described, for example, in Zhao, H., Fernandez, E., Dowd, K.A., Speer, S.D., Platt, D.J., Gorman, M.J., Govero, J., Nelson, C. A., Pierson, T. C., Diamond, M. S., et al. (2016). Structural Basis of Zika Virus-Specific Antibody Protection. Cell 166(4): 1016-27 and in Kostyuchenko VA, Lim EX, Zhang S, Fibriansah G, Ng TS, Ooi JS, Shi J, Lok SM. Structure of the thermally stable Zika virus. Nature. 2016 May 19;533(7603):425-8. Without wishing to be bound by theory, it is believed that (i) binding to LR may inhibit fusion by delaying the viral fusion transition state and (ii) binding to the EDI-EDIII hinge and EDIII may interfere with the movement of EDIII to form a three-dimensional structure after fusion, stopping thus membrane synthesis.
Таким образом, заявленное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (способны) ингибировать этап после присоединения ZIKV). После присоединения типично относится к любому этапу инфекции ZIKV после присоединения ZIKV к клеточной мембране (клетки, на которую нацелен ZIKV). Например, они предпочтительно они способны предотвращать мембранный синтез. Кроме того, предThus, the claimed antibody or antigen-binding fragment thereof (is capable of) inhibiting the ZIKV post-attachment step). Postattachment typically refers to any stage of ZIKV infection after ZIKV has attached to the cell membrane (the cell targeted by ZIKV). For example, they are preferably capable of preventing membrane synthesis. In addition, before
- 14 046175 почтительно описанные в заявке антитело или его антигенсвязывающий фрагмент способны вызывать агрегацию ZIKV (частиц), а также ингибировать этап после присоединения ZIKV и (II) вызывать агрегацию ZIKV (частиц).- 14 046175 respectfully described in the application, the antibody or antigen-binding fragment thereof is capable of causing aggregation of ZIKV (particles), as well as inhibiting the post-attachment step of ZIKV and (ii) causing aggregation of ZIKV (particles).
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент также могут связываться с четвертичным эпитопом, представленным на ZIKV инфекционном вирионе. Несмотря на значительную нейтрализирующую активность, такие антитела проявляют типично не обнаруживаемое связывание с рекомбинатным Е белком ZIKV или с ZIKV EDIII в стандартном ELISA (как описано выше), то есть, при тестировании в условиях in vitro, в особенности в очищенной форме (то есть Е белок ZIKV за пределами/без вириона, вирусоподобной частицы или др.). Таким образом, не обнаруживаемое связывание типично обозначает, что EC50 вплоть до 10000 нг/мл не обнаруживается в стандартном ELISA. Другими словами, если ЕС50, обнаруживаемое в стандартном ELISA, составляет выше 10000 нг/мл, то это обозначается как не обнаруживаемое связывание.The antibody or antigen binding fragment thereof can also bind to a quaternary epitope present on the ZIKV infectious virion. Despite significant neutralizing activity, such antibodies typically exhibit undetectable binding to recombinant ZIKV E protein or ZIKV EDIII in a standard ELISA (as described above), that is, when tested in vitro, especially in purified form (i.e., E ZIKV protein outside/without virion, virus-like particle, etc.). Thus, undetectable binding typically means that EC50 up to 10,000 ng/ml is undetectable in a standard ELISA. In other words, if the EC50 detected in a standard ELISA is above 10,000 ng/ml, then this is designated as undetectable binding.
Таким образом, такие антитела также обозначаются в настоящей заявке как нейтрализирующие, но не связывающие Е (NNB) антитела. Четвертичный эпитоп, экспонированный на инфекционном вирионе ZIKV, типично представляет собой конформационный эпитоп. Например, четвертичный эпитоп, экспонированный на инфекционном вирионе ZIKV, может быть образован на поверхности раздела мономеров двух оболочечных белков, образуя димер (оболочечный димерный эпитоп; EDE) или он может быть образован в пределах соседних димеров (эпитоп по типу елочки).Thus, such antibodies are also referred to herein as neutralizing but non-E binding (NNB) antibodies. The quaternary epitope displayed on the infectious ZIKV virion is typically a conformational epitope. For example, a quaternary epitope exposed on an infectious ZIKV virion may be formed at the monomer interface of two envelope proteins, forming a dimer (envelope dimer epitope; EDE), or it may be formed within adjacent dimers (herringbone epitope).
Как правило, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, предпочтительно содержать (по меньшей мере) три участки, определяющие комплементарность (CDR) на тяжелой цепи и (по меньшей мере) три CDR на легкой цепи. Как правило, участки, определяющие комплементарность (CDR) представляют собой гипервариабельные участки, присутствующие на вариабельных доменах тяжелой цепи и вариабельных доменах легкой цепи. Типично, CDR тяжелой цепи и связанной легкой цепи антитела совместно образуют антигенный рецептор. Обычно, три CDR (CDR1, CDR2, и CDR3) расположены непоследовательно в вариабельном домене. Поскольку антигенные рецепторы типично состоят из двух вариабельных доменов (на двух различных полипептидных цепях, то есть тяжелой и легкой цепи), существует шесть CDR для каждого антигенного рецептора (тяжелая цепь: CDRH1, CDRH2, и CDRH3; легкая цепь: CDRL1, CDRL2, и CDRL3). Единичная молекула антитела обычно имеет два антигенных рецептора и, следовательно, содержит двенадцать CDR. CDR на тяжелой и/или легкой цепи могут быть разделены каркасными участками, тем самым каркасный участок (FR) представляет собой участок в вариабельном домене, который является менее вариабельным, чем CDR. Например, цепь (или каждая цепь, соответственно) может состоять из четырех каркасных участков, разделенных тремя CDR.In general, the antibody or antigen binding fragment thereof preferably contains (at least) three complementarity determining regions (CDRs) on the heavy chain and (at least) three CDRs on the light chain. Typically, complementarity determining regions (CDRs) are hypervariable regions present on the heavy chain variable domains and the light chain variable domains. Typically, the CDRs of the heavy chain and the associated light chain of an antibody together form an antigen receptor. Typically, three CDRs (CDR1, CDR2, and CDR3) are located non-sequentially in the variable domain. Because antigen receptors typically consist of two variable domains (on two different polypeptide chains, i.e., heavy and light chain), there are six CDRs for each antigen receptor (heavy chain: CDRH1, CDRH2, and CDRH3; light chain: CDRL1, CDRL2, and CDRL3). A single antibody molecule typically has two antigen receptors and therefore contains twelve CDRs. The CDRs on the heavy and/or light chain may be separated by framework regions, whereby a framework region (FR) is a region in a variable domain that is less variable than a CDR. For example, a chain (or each chain, respectively) may consist of four framework regions separated by three CDRs.
Последовательности тяжелых цепей и легких цепей типичных антител, содержащие три различные CDR на тяжелой цепи и три различные CDR на легкой цепи, были определены. Положения аминокислот CDR определены в соответствии с системой нумерации IMGT (IMGT: http://www.imgt.org/; cf. Lefranc, M.-P. и др. (2009) Nucleic Acids Res. 37, D1006-D1012).The heavy chain and light chain sequences of typical antibodies, containing three different CDRs on the heavy chain and three different CDRs on the light chain, have been determined. CDR amino acid positions are defined according to the IMGT numbering system (IMGT: http://www.imgt.org/; cf. Lefranc, M.-P. et al. (2009) Nucleic Acids Res. 37, D1006-D1012).
В табл. 1 представлены SEQ ID NO для аминокислотных последовательностей CDR тяжелых цепей (CDRH1, CDRH2, и CDRH3) и вариабельного участка тяжелой цепи (обозначаемого как VH) типичных антител в соответствии с настоящим изобретением.In table 1 provides SEQ ID NOs for the heavy chain CDR amino acid sequences (CDRH1, CDRH2, and CDRH3) and the heavy chain variable region (denoted VH) of exemplary antibodies in accordance with the present invention.
- 15 046175- 15 046175
Таблица 1Table 1
- 16 046175- 16 046175
В табл. 2 ниже представлены SEQ ID NO для аминокислотных последовательностей CDR легких цепей (CDRL1, CDRL2, и CDRL3) и вариабельного участка легкой цепи (обозначаемого как VL) типичных антител в соответствии с настоящим изобретением.In table 2 below sets forth SEQ ID NOs for the amino acid sequences of the light chain CDRs (CDRL1, CDRL2, and CDRL3) and the light chain variable region (referred to as VL) of exemplary antibodies in accordance with the present invention.
Таблица 2table 2
Таким образом, предпочтительно антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно изобретению содержат вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 8 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 9 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.Thus, preferably, the antibody or antigen binding fragment thereof of the invention comprises a heavy chain variable region (VH) with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 9 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least at least 98% or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут также содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности, как указано в любой из SEQThe antibody or antigen binding fragment thereof may also comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence as specified in any of SEQ
- 17 046175- 17 046175
ID NO: 3, 75, 39, 21, 57, 239, 243, 247, 251, 255, 259, 263, 267, 271, 275, 279, 283, 287, 291, 295, 299, 303, 307, 311, 315, 319, 323, 327, 331, 335, 339, 343, 347, 351, 355, 359, 363, 367, 371, 375, 379, 383, 387, 391, 395, и 399, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.ID NO: 3, 75, 39, 21, 57, 239, 243, 247, 251, 255, 259, 263, 267, 271, 275, 279, 283, 287, 291, 295, 299, 303, 307, 311 , 315, 319, 323, 327, 331, 335, 339, 343, 347, 351, 355, 359, 363, 367, 371, 375, 379, 383, 387, 391, 395, and 399, or a variant of its functional sequence having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95% , at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности, как указано в любой из SEQ ID NO: 3, 21, 39, 57 и 75 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности, как указано в любой из SEQ ID NO: 3, 21, 39 и 75 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 3 или в соответствии с SEQ ID NO: 75; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 21 или в соответствии с SEQ ID NO: 39; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Кроме того, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 3 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 3, 21, 39, 57 and 75 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 3, 21, 39 and 75 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96% , at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 3 or according to SEQ ID NO: 75; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. Also, the antibody or antigen-binding fragment thereof may comprise a heavy chain containing at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 21 or according to SEQ ID NO: 39; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. In addition, the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one at least one CDRL3, wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 3 or a functional sequence variant thereof having at least 70% 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97% , at least 98% or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 1, 19, 37, 55, 73, 237, 241, 245, 249, 253, 257, 261, 265, 269, 273, 277, 281, 285, 289, 293, 297, 301, 305, 309, 313, 317, 321, 325, 329, 333, 337, 341, 345, 349, 353, 357, 361, 365, 369, 373, 377, 381, 385, 389, 393, и 397, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичThe antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 1, 19, 37, 55, 73, 237, 241, 245, 249, 253, 257, 261, 265 , 269, 273, 277, 281, 285, 289, 293, 297, 301, 305, 309, 313, 317, 321, 325, 329, 333, 337, 341, 345, 349, 353, 357, 361, 3 65 , 369, 373, 377, 381, 385, 389, 393, and 397, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, of at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical
- 18 046175 ность последовательностей;- 18 046175 number of sequences;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 2, 20, 38, 56, 74, 238, 242, 246, 250, 254, 258, 262, 266, 270, 274, 278, 282, 286, 290, 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, и 398, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 3, 21, 39, 57, 75, 239, 243, 247, 251, 255, 259, 263, 267, 271, 275, 279, 283, 287, 291, 295, 299, 303, 307, 311, 315, 319, 323, 327, 331, 335, 339, 343, 347, 351, 355, 359, 363, 367, 371, 375, 379, 383, 387, 391, 395, и 399, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 2, 20, 38, 56, 74, 238, 242, 246, 250, 254, 258, 262, 266, 270, 274 , 278, 282, 286, 290, 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 3 74 , 378, 382, 386, 390, 394, and 398, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88% , at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 3, 21, 39, 57, 75, 239, 243, 247, 251, 255, 259, 263, 267, 271, 275, 279, 283, 287, 291, 295, 299, 303, 307, 311, 315, 319, 323, 327, 331, 335, 339, 343, 347, 351, 355, 359, 363 , 367, 371, 375, 379, 383, 387, 391, 395, and 399, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity.
А также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 1, 19, 37, 55 и 73 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;An antibody or an antigen-binding fragment thereof may also contain a heavy chain containing at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 1, 19, 37, 55 and 73 or a functional sequence variant thereof having at least 70% of at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 2, 20, 38, 56 и 74 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 3, 21, 39, 57 и 75 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 2, 20, 38, 56 and 74 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 3, 21, 39, 57 and 75 or a functional sequence variant thereof having at least 70% of at least at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97 %, at least 98% or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, кроме того, могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 1, 19, 37 и 73 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;The antibody or antigen binding fragment thereof may further comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 1, 19, 37 and 73 or a functional sequence variant thereof having at least 70% of at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 2, 20, 38 и 74 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 3, 21, 39 и 75 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 2, 20, 38 and 74 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 3, 21, 39 and 75 or a functional sequence variant thereof having at least 70% of at least 75 %, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity.
Наконец, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшейFinally, the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one
- 19 046175 мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 1 или в соответствии с SEQ ID NO: 73; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;- 19 046175 at least one CDRL3, wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 1 or in accordance with SEQ ID NO: 73; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 2 или в соответствии с SEQ ID NO: 74; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 3 или в соответствии с SEQ ID NO: 75; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 2 or in accordance with SEQ ID NO: 74; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 3 or according to SEQ ID NO: 75; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 19 или в соответствии с SEQ ID NO: 37; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;Also, the antibody or antigen-binding fragment thereof may comprise a heavy chain containing at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 19 or according to SEQ ID NO: 37; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 20 или в соответствии с SEQ ID NO: 38; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 21 или в соответствии с SEQ ID NO: 39; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 20 or according to SEQ ID NO: 38; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 21 or according to SEQ ID NO: 39; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 1 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 1 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 2 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 3 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(ii) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 2 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 3 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, according to at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкуюThe antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain
- 20 046175 цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 4, 22, 40, 58 и 76 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;- 20 046175 a chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, where (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence as specified in any of SEQ ID NO: 4, 22, 40, 58 and 76 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 5, 6, 23, 24, 41, 42, 59, 60, 77 и 78 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 7, 25, 43, 61 и 79 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 5, 6, 23, 24, 41, 42, 59, 60, 77 and 78 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96% , at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 7, 25, 43, 61 and 79 or a functional sequence variant thereof having at least 70% 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97% , at least 98% or at least 99% sequence identity.
К тому же антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 4, 22, 40 и 76 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;In addition, the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one at least one CDRL3, wherein (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 4, 22, 40 and 76 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75 %, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 5, 6, 23, 24, 41, 42, 77 и 78 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 7, 25, 43 и 79 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 5, 6, 23, 24, 41, 42, 77 and 78 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, according to at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 7, 25, 43 and 79 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75% , at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, according to at least 98% or at least 99% sequence identity.
Кроме того, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 4 или в соответствии с SEQ ID NO: 76; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;In addition, the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one at least one CDRL3, where (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 4 or in accordance with SEQ ID NO: 76; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 5, 6, 77 и 78 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 7 или в соответствии с SEQ ID NO: 79; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 5, 6, 77 and 78 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 7 or in accordance with SEQ ID NO: 79; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
- 21 046175- 21 046175
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 22 или в соответствии с SEQ ID NO: 40; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;Also, the antibody or antigen-binding fragment thereof may comprise a heavy chain containing at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, where (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 22 or in accordance with SEQ ID NO: 40; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 23, 24, 41 и 42 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 25 или в соответствии с SEQ ID NO: 43; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 23, 24, 41 and 42 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 25 or in accordance with SEQ ID NO: 43; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Кроме того, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут также содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 4 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;In addition, the antibody or antigen binding fragment thereof may also comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, where (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 4 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 5 или 6, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 7 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 5 or 6, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 7 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, описанное в данной заявке, могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 1-3; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) в соответствии с SEQ ID NO: 19-21; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) в соответствии с SEQ ID NO: 37-39; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IV) в соответствии с SEQ ID NO: 55-57; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (V) в соответствии с SEQ ID NO: 73-75; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшейThe antibody or antigen binding fragment thereof described herein may comprise CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences (I) according to SEQ ID NO: 1-3; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (II) in accordance with SEQ ID NO: 19-21; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (III) in accordance with SEQ ID NO: 37-39; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (IV) in accordance with SEQ ID NO: 55-57; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (V) in accordance with SEQ ID NO: 73-75; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least
- 22 046175 мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VI) в соответствии с SEQ ID NO: 237-239; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VII) в соответствии с SEQ ID NO: 241-243; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VIII) в соответствии с SEQ ID NO: 245-247; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IX) в соответствии с SEQ ID NO: 249-251; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (X) в соответствии с SEQ ID NO: 253-255; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XI) в соответствии с SEQ ID NO: 257-259; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XII) в соответствии с SEQ ID NO: 261-263; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XIII) в соответствии с SEQ ID NO: 265-267; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XIV) в соответствии с SEQ ID NO: 269-271; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XV) в соответствии с SEQ ID NO: 273-275; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XVI) в соответствии с SEQ ID NO: 277-279; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XVII) в соответствии с SEQ ID NO: 281-283; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XVIII) в соответствии с SEQ ID NO: 285-287; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XIX) в соответствии с SEQ ID NO: 289-291; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XX) в соответствии с SEQ ID NO: 293-295; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей- 22 046175 at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; (VI) in accordance with SEQ ID NO: 237-239; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VII) in accordance with SEQ ID NO: 241-243; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VIII) in accordance with SEQ ID NO: 245-247; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (IX) in accordance with SEQ ID NO: 249-251; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (X) in accordance with SEQ ID NO: 253-255; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XI) in accordance with SEQ ID NO: 257-259; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XII) in accordance with SEQ ID NO: 261-263; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XIII) in accordance with SEQ ID NO: 265-267; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XIV) in accordance with SEQ ID NO: 269-271; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XV) in accordance with SEQ ID NO: 273-275; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XVI) in accordance with SEQ ID NO: 277-279; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XVII) in accordance with SEQ ID NO: 281-283; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XVIII) in accordance with SEQ ID NO: 285-287; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XIX) in accordance with SEQ ID NO: 289-291; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XX) in accordance with SEQ ID NO: 293-295; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to less
- 23 046175 мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXI) в соответствии с SEQ ID NO: 297-299; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXII) в соответствии с SEQ ID NO: 301-303; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXIII) в соответствии с SEQ ID NO: 305-307; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXIV) в соответствии с SEQ ID NO: 309-311; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXV) в соответствии с SEQ ID NO: 313-315; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXVI) в соответствии с SEQ ID NO: 317-319; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXVII) в соответствии с SEQ ID NO: 321-323; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXVIII) в соответствии с SEQ ID NO: 325-327; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXIX) в соответствии с SEQ ID NO: 329-331; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXX) в соответствии с SEQ ID NO: 333-335; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXI) в соответствии с SEQ ID NO: 337-339; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXII) в соответствии с SEQ ID NO: 341-343; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXIII) в соответствии с SEQ ID NO: 345-347; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXIV) в соответствии с SEQ ID NO: 349-351; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXV) в соответствии с SEQ ID NO: 353-355; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере- 23 046175 at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; (XXI) in accordance with SEQ ID NO: 297-299; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXII) in accordance with SEQ ID NO: 301-303; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXIII) in accordance with SEQ ID NO: 305-307; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXIV) in accordance with SEQ ID NO: 309-311; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXV) in accordance with SEQ ID NO: 313-315; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXVI) in accordance with SEQ ID NO: 317-319; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXVII) in accordance with SEQ ID NO: 321-323; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXVIII) in accordance with SEQ ID NO: 325-327; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXIX) in accordance with SEQ ID NO: 329-331; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXX) in accordance with SEQ ID NO: 333-335; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXXI) in accordance with SEQ ID NO: 337-339; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXXII) in accordance with SEQ ID NO: 341-343; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXXIII) in accordance with SEQ ID NO: 345-347; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXXIV) in accordance with SEQ ID NO: 349-351; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXXV) in accordance with SEQ ID NO: 353-355; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least
- 24 046175- 24 046175
85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXVI) в соответствии с SEQ ID NO: 357-359; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXVII) в соответствии с SEQ ID NO: 361 - 363; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXVIII) в соответствии с SEQ ID NO: 365-367; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXXIX) в соответствии с SEQ ID NO: 369-371; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XL) в соответствии с SEQ ID NO: 373-375; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XLI) в соответствии с SEQ ID NO: 377-379; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XLII) в соответствии с SEQ ID NO: 381-383; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XLIII) в соответствии с SEQ ID NO: 385-387; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XLIV) в соответствии с SEQ ID NO: 389-391; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XLV) в соответствии с SEQ ID NO: 393-395; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (XLVI) в соответствии с SEQ ID NO: 397-399; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; (XXXVI) in accordance with SEQ ID NO: 357-359; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXXVII) in accordance with SEQ ID NO: 361 - 363; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXXVIII) in accordance with SEQ ID NO: 365-367; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXXIX) in accordance with SEQ ID NO: 369-371; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XL) in accordance with SEQ ID NO: 373-375; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XLI) in accordance with SEQ ID NO: 377-379; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XLII) in accordance with SEQ ID NO: 381-383; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XLIII) in accordance with SEQ ID NO: 385-387; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XLIV) in accordance with SEQ ID NO: 389-391; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XLV) in accordance with SEQ ID NO: 393-395; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (XLVI) in accordance with SEQ ID NO: 397-399; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Таким образом, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности и CDRL1, CDRL2, и CDRL3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 1-5 и 7; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) в соответствии с SEQ ID NO: 1-4 и 6-7; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) в соответствии с SEQ ID NO: 19-23 и 25; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или поThus, the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences and CDRL1, CDRL2, and CDRL3 amino acid sequences (I) according to SEQ ID NOs: 1-5 and 7; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (II) in accordance with SEQ ID NO: 1-4 and 6-7; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (III) in accordance with SEQ ID NO: 19-23 and 25; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or according
- 25 046175 меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IV) в соответствии с SEQ ID NO: 19-22 и 24-25; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (V) в соответствии с SEQ ID NO: 37-41 и 43; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VI) в соответствии с SEQ ID NO: 37-40 и 42-43; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VII) в соответствии с SEQ ID NO: 55-59 и 61; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VIII) в соответствии с SEQ ID NO: 55-58 и 60-61; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IX) в соответствии с SEQ ID NO: 73-77 и 79; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (X) в соответствии с SEQ ID NO: 73-76 и 78-79; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.- 25 046175 at least 99% sequence identity; (IV) in accordance with SEQ ID NO: 19-22 and 24-25; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (V) in accordance with SEQ ID NO: 37-41 and 43; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VI) in accordance with SEQ ID NO: 37-40 and 42-43; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VII) in accordance with SEQ ID NO: 55-59 and 61; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VIII) in accordance with SEQ ID NO: 55-58 and 60-61; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (IX) in accordance with SEQ ID NO: 73-77 and 79; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (X) in accordance with SEQ ID NO: 73-76 and 78-79; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности и CDRL1, CDRL2, и CDRL3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 1-5 и 7; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) в соответствии с SEQ ID NO: 1-4 и 6-7; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) в соответствии с SEQ ID NO: 19-23 и 25; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IV) в соответствии с SEQ ID NO: 19-22 и 24-25; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (V) в соответствии с SEQ ID NO: 37-41 и 43; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VI) в соответствии с SEQ ID NO: 37-40 и 42-43; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VII) в соответствии с SEQ ID NO: 73-77 и 79; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (VIII) в соответствии с SEQ ID NO: 73-76 и 78-79; или варианты их функциональной последоThe antibody or antigen binding fragment thereof may comprise CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences and CDRL1, CDRL2, and CDRL3 amino acid sequences (I) according to SEQ ID NOs: 1-5 and 7; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (II) in accordance with SEQ ID NO: 1-4 and 6-7; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (III) in accordance with SEQ ID NO: 19-23 and 25; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (IV) in accordance with SEQ ID NO: 19-22 and 24-25; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (V) in accordance with SEQ ID NO: 37-41 and 43; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VI) in accordance with SEQ ID NO: 37-40 and 42-43; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VII) in accordance with SEQ ID NO: 73-77 and 79; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (VIII) in accordance with SEQ ID NO: 73-76 and 78-79; or variants of their functional sequence
- 26 046175 вательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.- 26 046175 of activity having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Еще антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности и CDRL1, CDRL2, и CDRL3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 1-5 и 7; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) в соответствии с SEQ ID NO: 1-4 и 6-7; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) в соответствии с SEQ ID NO: 73-77 и 79; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (IV) в соответствии с SEQ ID NO: 73-76 и 78-79; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.Another antibody or antigen binding fragment thereof may contain CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences and CDRL1, CDRL2, and CDRL3 amino acid sequences (I) in accordance with SEQ ID NOs: 1-5 and 7; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (II) in accordance with SEQ ID NO: 1-4 and 6-7; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (III) in accordance with SEQ ID NO: 73-77 and 79; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (IV) in accordance with SEQ ID NOs: 73-76 and 78-79; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности и CDRL1, CDRL2, и CDRL3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 19-23 и 25; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) в соответствии с SEQ ID NO: 19-22 и 24-25; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) в соответствии с SEQ ID NO: 37-41 и 43; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (VI) в соответствии с SEQ ID NO: 3740 и 42-43; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.Also, the antibody or antigen binding fragment thereof may contain CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences and CDRL1, CDRL2, and CDRL3 amino acid sequences (I) in accordance with SEQ ID NOs: 19-23 and 25; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (II) in accordance with SEQ ID NO: 19-22 and 24-25; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (III) in accordance with SEQ ID NO: 37-41 and 43; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (VI) in accordance with SEQ ID NO: 3740 and 42-43; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности и CDRL1, CDRL2, и CDRL3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 1-5 и 7; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (II) в соответствии с SEQ ID NO: 1-4 и 6-7; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences and CDRL1, CDRL2, and CDRL3 amino acid sequences (I) according to SEQ ID NOs: 1-5 and 7; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (II) in accordance with SEQ ID NO: 1-4 and 6-7; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Дополнительно антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать вариабельный участок тяжелой цепи (VH) и, необязательно, вариабельный участок легкой цепи (VL), где вариабельный участок тяжелой цепи (VH) содержит или состоит из аминокислотной последовательности, как указано в любой из SEQ ID NO: 8, 26, 44, 62, 80, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284, 288, 292, 296, 300, 304, 308, 312, 316, 320, 324, 328, 332, 336, 340, 344, 348, 352, 356, 360, 364, 368, 372, 376, 380, 384, 388, 392, 396, и 400; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.Additionally, the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain variable region (VH) and, optionally, a light chain variable region (VL), wherein the heavy chain variable region (VH) contains or consists of an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO : 8, 26, 44, 62, 80, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284, 288, 292, 296, 300, 304, 308, 312, 316 , 320, 324, 328, 332, 336, 340, 344, 348, 352, 356, 360, 364, 368, 372, 376, 380, 384, 388, 392, 396, and 400; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
- 27 046175- 27 046175
Кроме того, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать (I) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 8 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 9 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 26 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 27 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 44 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 45 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IV) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 62 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 63 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (V) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 80 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 81 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.In addition, the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise (I) a heavy chain variable region (VH) with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least at least 98% or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 9 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75% , at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, according to at least 98% or at least 99% sequence identity; (II) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 26 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85 %, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical sequences and/or a light chain variable region (VL) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 27 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; (III) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 44 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85 %, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical sequences and/or a light chain variable region (VL) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 45 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; (IV) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 62 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85 %, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical sequences and/or a light chain variable region (VL) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 63 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; or (V) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 80 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 81 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать (I) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 8 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 9 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 26 или вариант его функциональной последоваThe antibody or antigen binding fragment thereof may comprise (I) a heavy chain variable region (VH) with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity and/or a light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 9 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98 % or at least 99% sequence identity; (II) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 26 or a variant of a functional sequence thereof
- 28 046175 тельности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 27 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 44 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 45 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (IV) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 80 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 81 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.- 28 046175 of at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 27 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (III) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 44 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85 %, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical sequences and/or a light chain variable region (VL) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 45 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; or (IV) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 80 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 81 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity.
Еще антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать (I) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 8 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 9 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (II) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 80 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 81 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.Another antibody or antigen-binding fragment thereof may comprise (I) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 8 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98 % or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 9 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, according to at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; or (II) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 80 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 81 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать (I) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 26 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 27 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (II) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 44 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, поAlso, the antibody or antigen binding fragment thereof may contain (I) a heavy chain variable region (VH) with the amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 26 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98 % or at least 99% sequence identity and/or a light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 27 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, according to at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; or (II) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 44 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, according to
- 29 046175 меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 45 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.- 29 046175 at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity and/or a light chain variable region (VL) with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 8 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 9 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain variable region (VH) with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 9 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80% , at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or according at least 99% sequence identity.
Таким образом, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут представлять собой gZKA190, gZKA64, gZKA230, gZKA185 или gZKA78.Thus, the antibody or antigen binding fragment thereof may be gZKA190, gZKA64, gZKA230, gZKA185 or gZKA78.
Изобретатели настоящего изобретения выделили моноклональные антитела (mAb), которые обозначаются в настоящей заявке как ZKA190, ZKA64, ZKA230, ZKA185 и ZKA78 (см. табл. 1 и 2, Пример 1). На основании этих антител, в особенности на VH и VL генах этих антител, термины gZKA190, gZKA64, gZKA230, gZKA185 и gZKA78, как используется в настоящей заявке, относятся к соответствующим родовым антителам или их антигенсвязывающим фрагментам.The inventors of the present invention have isolated monoclonal antibodies (mAbs), which are referred to herein as ZKA190, ZKA64, ZKA230, ZKA185 and ZKA78 (see Tables 1 and 2, Example 1). Based on these antibodies, particularly the VH and VL genes of these antibodies, the terms gZKA190, gZKA64, gZKA230, gZKA185 and gZKA78, as used herein, refer to the corresponding generic antibodies or antigen-binding fragments thereof.
А именно, gZKA190 относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, имеющему CDRH1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 1, CDRH2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 2, CDRH3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 3, CDRL1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 4, CDRL2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 5 или 6, и CDRL3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 7. Вариабельный участок тяжелой цепи (VH) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 8 и вариабельный участок легкой цепи (VL) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 9.Namely, gZKA190 refers to an antibody or antigen binding fragment thereof having a CDRH1 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 1, a CDRH2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 2, a CDRH3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 3, CDRL1 an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 4, a CDRL2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 5 or 6, and a CDRL3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 7. The heavy chain variable region (VH) preferably has an amino acid sequence in according to SEQ ID NO: 8 and the light chain variable region (VL) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 9.
gZKA64 относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, имеющему CDRH1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 73, CDRH2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 74, CDRH3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 75, CDRL1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 76, CDRL2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 77 или 78, и CDRL3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 79. Вариабельный участок тяжелой цепи (VH) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 80 и вариабельный участок легкой цепи (VL) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 81.gZKA64 refers to an antibody or antigen binding fragment thereof having a CDRH1 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 73, a CDRH2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 74, a CDRH3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 75, a CDRL1 amino acid sequence according to according to SEQ ID NO: 76, a CDRL2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 77 or 78, and a CDRL3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 79. The heavy chain variable region (VH) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 80 and the light chain variable region (VL) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 81.
gZKA230 относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, имеющему CDRH1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 37, CDRH2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 38, CDRH3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 39, CDRL1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 40, CDRL2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 41 или 42, и CDRL3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 43. Вариабельный участок тяжелой цепи (VH) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 44 и вариабельный участок легкой цепи (VL) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 45.gZKA230 refers to an antibody or antigen binding fragment thereof having a CDRH1 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 37, a CDRH2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 38, a CDRH3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 39, a CDRL1 amino acid sequence according to according to SEQ ID NO: 40, CDRL2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 41 or 42, and CDRL3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 43. The heavy chain variable region (VH) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 44 and the light chain variable region (VL) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 45.
gZKA185 относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, имеющему CDRH1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 19, CDRH2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 20, CDRH3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 21, CDRL1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 22, CDRL2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 23 или 24, и CDRL3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 25. Вариабельный участок тяжелой цепи (VH) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 26 и вариабельный участок легкой цепи (VL) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 27.gZKA185 refers to an antibody or antigen binding fragment thereof having a CDRH1 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 19, a CDRH2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 20, a CDRH3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 21, a CDRL1 amino acid sequence according to according to SEQ ID NO: 22, CDRL2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 23 or 24, and CDRL3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 25. The heavy chain variable region (VH) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 26 and the light chain variable region (VL) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 27.
- 30 046175 gZKA78 относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, имеющему CDRH1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 55, CDRH2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 56, CDRH3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 57, CDRL1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 58, CDRL2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 59 или 60, и CDRL3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 61. Вариабельный участок тяжелой цепи (VH) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 62 и вариабельный участок легкой цепи (VL) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 63.- 30 046175 gZKA78 refers to an antibody or antigen binding fragment thereof having a CDRH1 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 55, a CDRH2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 56, a CDRH3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 57, CDRL1 an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 58, a CDRL2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 59 or 60, and a CDRL3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 61. The heavy chain variable region (VH) preferably has an amino acid sequence in according to SEQ ID NO: 62 and the light chain variable region (VL) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 63.
Как уже отмечалось, предпочтительно антитело согласно изобретению представляет собой одноцепочечное антитело, Fab, Fab', F(ab')2, Fv или scFv.As noted, preferably the antibody of the invention is a single chain antibody, Fab, Fab', F(ab')2, Fv or scFv.
Вторым объектом данного изобретения является применение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента согласно изобретению для предотвращения или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика. Предпочтительно у субъектов с диагностированной инфекцией, вызванной вирусом Зика, или у субъектов, проявляющих симптомы инфекции Зика или у субъекта, не проявляющего симптомов инфекции Зика. Предпочтительно субъектом может быть беременная женщина.A second object of the present invention is the use of an antibody or an antigen binding fragment thereof according to the invention to prevent or treat an infection caused by the Zika virus. Preferably in subjects with a diagnosed Zika virus infection, or in subjects exhibiting symptoms of Zika infection, or in a subject not exhibiting symptoms of Zika infection. Preferably, the subject may be a pregnant woman.
Третьим объектом данного изобретения является применение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента согласно изобретению для мониторинга качества вакцины против вируса Зика путем проверки, что антиген указанной вакцины содержит специфический эпитоп в правильной конформации.A third aspect of the present invention is the use of an antibody or an antigen-binding fragment thereof according to the invention to monitor the quality of a Zika virus vaccine by verifying that the antigen of said vaccine contains a specific epitope in the correct conformation.
Молекула нуклеиновой кислоты.Nucleic acid molecule.
В другом аспекте, изобретение также обеспечивает молекулу нуклеиновой кислоты, содержащую полинуклеотид, кодирующий антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением, как описано выше.In another aspect, the invention also provides a nucleic acid molecule comprising a polynucleotide encoding an antibody or antigen binding fragment thereof, in accordance with the present invention, as described above.
Примеры молекул нуклеиновых кислот и/или полинуклеотидов включают, например, рекомбинантный полинуклеотид, вектор, олигонуклеотид, молекулу РНК, такую как рРНК, мРНК, микроРНК, миРНК, или тРНК, или молекулу ДНК, такую как кДНК. Предпочтительными являются последовательности нуклеиновых кислот, кодирующие части или все легкие и тяжелые цепи и CDR антител согласно настоящему изобретению.Examples of nucleic acid molecules and/or polynucleotides include, for example, a recombinant polynucleotide, a vector, an oligonucleotide, an RNA molecule such as rRNA, mRNA, microRNA, siRNA, or tRNA, or a DNA molecule such as cDNA. Preferred are nucleic acid sequences encoding portions or all of the light and heavy chains and CDRs of the antibodies of the present invention.
Предпочтительна молекула нуклеиновой кислоты, полинуклеотидная последовательность которой содержит или состоит из последовательности нуклеиновых кислот в соответствии с любой из SEQ ID NO: 10-18, 28-36, 46-54, 64-72, и 82-90; или вариант ее функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.Preferred is a nucleic acid molecule whose polynucleotide sequence contains or consists of a nucleic acid sequence according to any of SEQ ID NOs: 10-18, 28-36, 46-54, 64-72, and 82-90; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Таким образом, предпочтительно в настоящей заявке обеспечиваются последовательности нуклеиновых кислот, кодирующие части или все легкие и тяжелые цепи, в особенности VH и VL последовательности и CDR типичных антител согласно изобретению. В табл. 1 и 2 представлены номера SEQ ID для аминокислотных последовательностей CDR и VH и VL описанных в заявке антител.Thus, preferably provided herein are nucleic acid sequences encoding parts or all of the light and heavy chains, especially the VH and VL sequences and CDRs of exemplary antibodies of the invention. In table 1 and 2 present the SEQ ID numbers for the CDR and VH and VL amino acid sequences of the antibodies described in the application.
В табл. 3 ниже представлены номера SEQ ID последовательностей нуклеиновых кислот, кодирующих CDR и VH и VL раскрытых в заявке антител.In table 3 below are the SEQ ID numbers of the nucleic acid sequences encoding the CDRs and VH and VL of the antibodies disclosed in the application.
Молекула нуклеиновой кислоты представляет собой молекулу, содержащую, предпочтительно состоящую из компонентов нуклеиновых кислот. Термин молекула нуклеиновой кислоты предпочтительно относится к молекулам ДНК и РНК. В особенности, он используется синонимично с термином полинуклеотид. Предпочтительно, молекула нуклеиновой кислоты представляет собой полимер, содержащий или состоящий из нуклеотидных мономеров, которые ковалентно связаны друг с другом с помощью фосфодиэфирных связей сахарофосфатного остова. Термин молекула нуклеиновой кислоты также охватывает модифицированные молекулы нуклеиновых кислот, такие как молекулы ДНК или РНК с модифицированными основаниями, модифицированными сахарами или модифицированным остовом, и т.д.A nucleic acid molecule is a molecule containing, preferably consisting of, nucleic acid components. The term nucleic acid molecule preferably refers to DNA and RNA molecules. In particular, it is used synonymously with the term polynucleotide. Preferably, the nucleic acid molecule is a polymer containing or consisting of nucleotide monomers that are covalently linked to each other via phosphodiester bonds of the sugar phosphate backbone. The term nucleic acid molecule also covers modified nucleic acid molecules, such as DNA or RNA molecules with modified bases, modified sugars or modified backbones, etc.
В табл. 3 представлены типичные последовательности нуклеиновых кислот CDR и вариабельного участка тяжелой цепи (VH) и вариабельного участка легкой цепи (VL) пяти типичных антител в соответствии с настоящим изобретением (ZKA190, ZKA64, ZKA230, ZKA185, ZKA78).In table 3 shows representative CDR and variable heavy chain (VH) and variable light chain (VL) nucleic acid sequences of five representative antibodies according to the present invention (ZKA190, ZKA64, ZKA230, ZKA185, ZKA78).
- 31 046175- 31 046175
Т аблица 3Table 3
- 32 046175- 32 046175
- 33 046175- 33 046175
- 34 046175- 34 046175
Итак, последовательность молекулы нуклеиновой кислоты может содержать или состоять из последовательности нуклеиновых кислот в соответствии с любой из SEQ ID NO: 10-18, 28-36, 46-54, 64-72, и 82-90; или ее вариант функциональной последовательности.Thus, the nucleic acid molecule sequence may comprise or consist of a nucleic acid sequence according to any of SEQ ID NOs: 10-18, 28-36, 46-54, 64-72, and 82-90; or its variant of the functional sequence.
Также последовательности нуклеиновых кислот могут включать последовательности нуклеиновых кислот, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность по отношению к нуклеиновой кислоте, кодирующей CDR, VH последовательность и/или VL последовательность, используемой в (типичном) антителе, например, в последовательностях, представленных в табл. 3.Nucleic acid sequences may also include nucleic acid sequences having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identity with respect to the nucleic acid encoding the CDR, VH sequence and/or VL sequence, used in a (typical) antibody, for example, in the sequences presented in table. 3.
В целом, с молекулой нуклеиновой кислоты можно манипулировать для инсерции, делеции или изменения определенных последовательностей нуклеиновых кислот. Изменения при такой манипуляции включают, но, не ограничиваясь только ими, изменения для интродуцирования сайтов рестрикции, для изменения частоты используемого кодона, для добавления или оптимизации транскрипции и/или трансляции регуляторных последовательностей и др. Также представляется возможным изменять нуклеиновую кислоту для изменения кодируемых аминокислот. Например, может быть полезным интродуцировать одну или несколько (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 и т.д.) аминокислотных замен, делеций и/или инсерций в аминокислотную последовательность антитела. Такие точечные мутации могут модифицировать эффекторные функции, аффинность связывания антигена, посттрансляционные модификации, иммуногенность, и т.д., могут интродуцировать аминокислоты для присоединения ковалентных групп (например, меток) или могут интродуцировать хвосты (например, для очистки). Мутации можно интродуцировать в специфические сайты или можно интродуцировать случайно, с последующей селекцией (например, молекулярная эволюция). Например, одну или несколько нуклеиновых кислот, кодирующих CDR участки, VH последовательность и/или VL последовательность (типичного) антитела можно случайно или направленно изменять для интродуцирования различных свойств в кодируемые аминокислоты. Такие изменения могут приводить к итеративному процессу, в котором сохраняются исходные изменения и новые изменения в другие нуклеотидные положения интродуцируются. Более того, изменения, осуществляемые на независимых этапах, можно комбинировать. Различные свойства, интродуцируемые в кодируемые аминокислоты, могут включать, но, не ограничиваясь только ими, измененную аффинность.In general, a nucleic acid molecule can be manipulated to insert, delete, or alter certain nucleic acid sequences. Changes in such manipulation include, but are not limited to, changes to introduce restriction sites, to change the frequency of the codon used, to add or optimize transcription and/or translation of regulatory sequences, etc. It is also possible to modify the nucleic acid to change the encoded amino acids. For example, it may be useful to introduce one or more (eg, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, etc.) amino acid substitutions, deletions and/or insertions into the amino acid sequence of the antibody. Such point mutations may modify effector functions, antigen binding affinity, post-translational modifications, immunogenicity, etc., may introduce amino acids for attachment of covalent groups (eg, tags), or may introduce tails (eg, for purification). Mutations can be introduced at specific sites, or they can be introduced randomly, followed by selection (eg, molecular evolution). For example, one or more nucleic acids encoding the CDR regions, VH sequence and/or VL sequence of a (typical) antibody can be randomly or specifically altered to introduce various properties into the encoded amino acids. Such changes can lead to an iterative process in which the original changes are maintained and new changes are introduced at other nucleotide positions. Moreover, changes carried out at independent stages can be combined. Various properties introduced into the encoded amino acids may include, but are not limited to, altered affinity.
Вектор.Vector.
Еще одним объектом настоящего изобретения является экспрессионный вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением.Another object of the present invention is an expression vector containing a nucleic acid molecule in accordance with the present invention.
Термин вектор относится к молекуле нуклеиновой кислоты, предпочтительно к рекомбинантной молекуле нуклеиновой кислоты, то есть молекуле нуклеиновой кислоты, которая не встречается в природе. Вектор в контексте настоящего изобретения является подходящим для инкорпорирования или заякоривания желательной последовательности нуклеиновых кислот. Такие векторы могут представлять собой векторы для хранения, экспрессионные векторы, клонирующие векторы, трансферные векторы и др. Вектор для хранения представляет собой вектор, который предоставляет возможность подходящего храThe term vector refers to a nucleic acid molecule, preferably a recombinant nucleic acid molecule, that is, a nucleic acid molecule that does not occur in nature. A vector in the context of the present invention is suitable for incorporating or anchoring a desired nucleic acid sequence. Such vectors may be storage vectors, expression vectors, cloning vectors, transfer vectors, etc. A storage vector is a vector that allows suitable storage
- 35 046175 нения молекулы нуклеиновой кислоты. Таким образом, вектор может содержать последовательность, соответствующую, например, желательному антителу или его фрагменту антитела. Экспрессионный вектор может использоваться для получения продуктов экспрессии, таких как РНК, например, мРНК, или пептиды, полипептиды или белки. Например, экспрессионный вектор может содержать последовательности, необходимые для транскрипции последовательности, такие как промоторная последовательность. Клонирующий вектор типично представляет собой вектор, содержащий клонирующий сайт, который может использоваться для инкорпорации последовательностей нуклеиновых кислот в вектор. Клонирующий вектор может представлять собой, например, плазмидный вектор или бактериофаговый вектор. Трансферный вектор может представлять собой вектор, который пригоден для переноса молекул нуклеиновых кислот в клетки или организмы, например, вирусные векторы. Вектор в контексте настоящего изобретения может представлять собой, например, РНК вектор или ДНК вектор. Предпочтительно, вектор представляет собой молекулу ДНК. Например, вектор в контексте настоящей заявки содержит сайт клонирования, селектируемый маркер, такой как фактор резистентности к антибиотику, и последовательность, подходящую для размножения вектора, такую как точка начала репликации. Предпочтительно, вектор в контексте настоящей заявки представляет собой плазмидный вектор.- 35 046175 nucleic acid molecule. Thus, the vector may contain a sequence corresponding to, for example, a desired antibody or antibody fragment thereof. An expression vector can be used to produce expression products such as RNA, eg mRNA, or peptides, polypeptides or proteins. For example, the expression vector may contain sequences necessary for transcription of the sequence, such as a promoter sequence. A cloning vector is typically a vector containing a cloning site that can be used to incorporate nucleic acid sequences into the vector. The cloning vector may be, for example, a plasmid vector or a bacteriophage vector. A transfer vector may be a vector that is suitable for transferring nucleic acid molecules into cells or organisms, such as viral vectors. The vector in the context of the present invention may be, for example, an RNA vector or a DNA vector. Preferably, the vector is a DNA molecule. For example, a vector in the context of the present application contains a cloning site, a selectable marker, such as an antibiotic resistance factor, and a sequence suitable for propagation of the vector, such as an origin of replication. Preferably, the vector in the context of the present application is a plasmid vector.
Клетки.Cells.
Наконец, настоящее изобретение также относится к клетке, экспрессирующей антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением; и содержащей вектор в соответствии с настоящим изобретением.Finally, the present invention also relates to a cell expressing an antibody or antigen binding fragment thereof according to the present invention; and containing a vector in accordance with the present invention.
Примеры таких клеток включают, но, не ограничиваясь только ими, эукариотические клетки, например, клетки дрожжей, клетки животных или клетки растений. Предпочтительно, клетки представляют собой клетки млекопитающих, более предпочтительно клеточную линию млекопитающих. Предпочтительные примеры включают клетки человека, СНО клетки, HEK293T клетки, PER.C6 клетки, NS0 клетки, клетки печени человека, миеломные клетки или гибридомные клетки.Examples of such cells include, but are not limited to, eukaryotic cells, such as yeast cells, animal cells, or plant cells. Preferably, the cells are mammalian cells, more preferably a mammalian cell line. Preferred examples include human cells, CHO cells, HEK293T cells, PER.C6 cells, NS0 cells, human liver cells, myeloma cells or hybridoma cells.
В особенности, клетка может быть трансфектирована экспрессионным вектором в соответствии с настоящим изобретением. Термин трансфекция относится к интродукции молекул нуклеиновой кислоты, таких как молекулы ДНК или РНК (например, мРНК), в клетки, предпочтительно в эукариотические клетки. В контексте настоящего изобретения, термин трансфекция охватывает любой способ, известный квалифицированному специалисту для интродукции молекул нуклеиновой кислоты в клетки, предпочтительно в эукариотические клетки, например, в клетки млекопитающих. Такие способы охватывают, например, электропорацию, липофекцию, например, на основании катионных липидов и/или липосом, осаждение фосфатом кальция, трансфекцию на основании наночастиц, трансфекцию на основании вирусов, или трансфекцию на основании катионных полимеров, такие как DEAE-декстран или полиэтиленимин и др. Предпочтительно, интродукция является невирусной.In particular, the cell can be transfected with an expression vector in accordance with the present invention. The term transfection refers to the introduction of nucleic acid molecules, such as DNA or RNA molecules (eg, mRNA), into cells, preferably eukaryotic cells. In the context of the present invention, the term transfection covers any method known to the skilled person for introducing nucleic acid molecules into cells, preferably eukaryotic cells, for example, mammalian cells. Such methods include, for example, electroporation, lipofection, for example, based on cationic lipids and/or liposomes, calcium phosphate precipitation, nanoparticle-based transfection, virus-based transfection, or transfection based on cationic polymers, such as DEAE-dextran or polyethylenimine and etc. Preferably, the introduction is non-viral.
Клетки могут быть трансфектированы стабильно или временно вектором в соответствии с настоящим изобретением, например, для экспрессии антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, в соответствии с настоящим изобретением. Предпочтительно, клетки стабильно трансфектируют вектором, кодирующим антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. Альтернативно, также является предпочтительным, что клетки временно трансфектируют вектором в, кодирующим антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.Cells can be stably or transiently transfected with a vector in accordance with the present invention, for example, to express an antibody or antigen binding fragment thereof, in accordance with the present invention. Preferably, the cells are stably transfected with a vector encoding an antibody or an antigen binding fragment thereof. Alternatively, it is also preferred that the cells are transiently transfected with vector B encoding an antibody or an antigen binding fragment thereof.
Необязательные дополнительные характерные особенности антител.Optional additional characteristic features of antibodies.
Антитела могут быть связаны, например, с лекарственным средством для доставки в сайт лечения или связаны с обнаруживаемой меткой для облегчения визуализации сайта, содержащего клетки, представляющие интерес. Способы связывания антител с лекарственными средствами и обнаруживаемыми метками хорошо известны в данной области техники, также как и способы визуализации, используя обнаруживаемые метки. Меченые антитела могут применяться в различных анализах, используя разнообразные метки. Обнаружение образования комплекса антитело-антиген между антителом и эпитопом, представляющим интерес, может быть облегчено путем присоединения обнаруживаемого вещества к антителу. Подходящее обнаружение обозначает включение применения меток, таких как радионуклиды, ферменты, коферменты, флуоресцентные вещества, хемилюминесцентные вещества, хромогены, субстраты ферментов или кофаторы, ингибиторы ферментов, простетические группы комплексов, свободные радикалы, частицы, красители и другие. Примеры подходящих ферментов включают пероксидазу хрена, щелочную фосфатазу, β-галактозидазу, или ацетилхолинэстеразу; примеры подходящих простетических групп комплексов включают стрептавидин/биотин и авидин/биотин; примеры подходящих флуоресцентных материалов включают умбеллиферон, флуоресцеин, флуоресцеин изотиоцианат, родамин, дихлортриазиниламин флуоресцеин, дансил хлорид или фикоэритрин; примером люминесцентного материала является люминол; примеры биолюминесцентных материалов включают люциферазу, люциферин, и экворин; и примеры подходящих радиоактивных материалов включают 125I, 131I, 35S, или 3H. Такие меченые реагенты могут использоваться в различных хорошо известных исследованиях, таких как радиоиммунологические анализы, иммуноферментные анализы, например, ELISA, флуоресцентные иммуноанализы, и др. Следовательно, меченые антитела могут использоваться в таких анализах, например, как описано в US 3,766,162; US 3,791,932; US 3,817,837; и US 4,233,402.Antibodies can be associated, for example, with a drug for delivery to the treatment site or associated with a detectable label to facilitate visualization of the site containing cells of interest. Methods for binding antibodies to drugs and detectable labels are well known in the art, as are methods of imaging using detectable labels. Labeled antibodies can be used in a variety of assays using a variety of labels. Detection of the formation of an antibody-antigen complex between an antibody and an epitope of interest can be facilitated by coupling the detectable substance to the antibody. Suitable detection refers to the inclusion of the use of labels such as radionuclides, enzymes, coenzymes, fluorescent substances, chemiluminescent substances, chromogens, enzyme substrates or cofators, enzyme inhibitors, prosthetic group complexes, free radicals, particles, dyes and others. Examples of suitable enzymes include horseradish peroxidase, alkaline phosphatase, β-galactosidase, or acetylcholinesterase; examples of suitable prosthetic group complexes include streptavidin/biotin and avidin/biotin; examples of suitable fluorescent materials include umbelliferone, fluorescein, fluorescein isothiocyanate, rhodamine, dichlorotriazinylamine fluorescein, dansyl chloride or phycoerythrin; an example of a luminescent material is luminol; examples of bioluminescent materials include luciferase, luciferin, and aequorin; and examples of suitable radioactive materials include 125I, 131I, 35S, or 3H. Such labeled reagents can be used in a variety of well-known assays, such as radioimmunoassays, enzyme-linked immunosorbent assays, eg ELISA, fluorescent immunoassays, etc. Therefore, labeled antibodies can be used in such assays, for example, as described in US 3,766,162; US 3,791,932; US 3,817,837; and US 4,233,402.
- 36 046175- 36 046175
Антитело может быть конъюгировано с терапевтическим компонентом, таким как цитотоксин, терапевтическое средство, или радиоактивный ион металла или радиоактивный изотоп. Примеры радиоактивных изотопов включают, но, не ограничиваясь только ими, I-131, I-123, I-125, Y-90, Re-188, Re-186, At-211, Cu-67, Bi-212, Bi-213, Pd-109, Tc-99, In-111, и др. Такие конъюгаты антител можно использовать для модификации данной биологической ответной реакции; лекарственный компонент не следует рассматривать как ограниченный только классическими химическими терапевтическими средствами. Например, лекарственный компонент может представлять собой белок или полипептид, обладающий желательной биологической активностью. Такие белки могут включать, например, токсин, такой как абрин, рицин А, экзотоксин синегнойной палочки, или дифтерийный токсин.The antibody may be conjugated to a therapeutic moiety, such as a cytotoxin, a therapeutic agent, or a radioactive metal ion or radioactive isotope. Examples of radioactive isotopes include, but are not limited to, I-131, I-123, I-125, Y-90, Re-188, Re-186, At-211, Cu-67, Bi-212, Bi- 213, Pd-109, Tc-99, In-111, etc. Such antibody conjugates can be used to modify a given biological response; the drug component should not be considered as limited to classical chemical therapeutics. For example, the drug component may be a protein or polypeptide having a desired biological activity. Such proteins may include, for example, a toxin such as abrin, ricin A, Pseudomonas aeruginosa exotoxin, or diphtheria toxin.
Технологии конъюгирования такого терапевтического компонента к антителам хорошо известны. См., например, Arnon и др. (1985) (1985) Monoclonal Antibodies for Immunotargeting of Drugs in Cancer Therapy, в Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, под ред. Reisfeld и др. (Alan R. Liss, Inc.), cc. 243256; под ред. Hellstrom и др. (1987) Antibodies for Drug Delivery, в Controlled Drug Delivery, под ред. Robinson и др. (2-ое изд.; Marcel Dekker, Inc.), cc. 623-653; Thorpe (1985) Antibody Carriers of Cytotoxic Agents in Cancer Therapy: A Review, в Monoclonal Antibodies '84: Biological and Clinical Applications, под ред. Pinchera и др. сс. 475-506 (Editrice Kurtis, Milano, Italy, 1985); Analysis, Results, and Future Prospective of the Therapeutic Use of Radiolabeled Antibody in Cancer Therapy, в Monoclonal Antibodies for Cancer Detection and Therapy, под ред. Baldwin и др. (Academic Press, New York, 1985), cc. 303-316; и Thorpe и др. (1982) Immunol. Rev. 62:119-158.Technologies for conjugating such a therapeutic component to antibodies are well known. See, for example, Arnon et al. (1985) Monoclonal Antibodies for Immunotargeting of Drugs in Cancer Therapy, in Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, ed. Reisfeld et al. (Alan R. Liss, Inc.), cc. 243256; edited by Hellstrom et al (1987) Antibodies for Drug Delivery, in Controlled Drug Delivery, ed. Robinson et al. (2nd ed.; Marcel Dekker, Inc.), cc. 623-653; Thorpe (1985) Antibody Carriers of Cytotoxic Agents in Cancer Therapy: A Review, in Monoclonal Antibodies '84: Biological and Clinical Applications, ed. Pinchera et al. ss. 475-506 (Editrice Kurtis, Milano, Italy, 1985); Analysis, Results, and Future Prospective of the Therapeutic Use of Radiolabeled Antibodies in Cancer Therapy, in Monoclonal Antibodies for Cancer Detection and Therapy, ed. Baldwin et al. (Academic Press, New York, 1985), cc. 303-316; and Thorpe et al. (1982) Immunol. Rev. 62:119-158.
Альтернативно, антитело или его фрагмент антитела могут быть конъюгированы со вторым антителом или его фрагментом антитела, с образованием гетероконъюгата антитела, как описано в US 4,676,980. Дополнительно, можно использовать линкеры между метками и антителами согласно изобретению, например, как описано в US 4,831,175. Антитела или их антигенсвязывающие фрагменты могут быть непосредственно мечены радиоактивным йодом, индием, иттрием или другой радиоактивной частицей, известной в данной области техники, например, как описано в US 5,595,721. Лечение может состоять из комбинации лечения с применением конъюгированных и неконъюгированных антител, вводимых одновременно или последовательно, например, как описано в WO 00/52031; WO 00/52473.Alternatively, the antibody or antibody fragment thereof can be conjugated to a second antibody or antibody fragment thereof to form an antibody heteroconjugate, as described in US Pat. No. 4,676,980. Additionally, linkers can be used between tags and antibodies according to the invention, for example, as described in US 4,831,175. Antibodies or antigen binding fragments thereof can be directly labeled with radioactive iodine, indium, yttrium or other radioactive species known in the art, for example, as described in US 5,595,721. Treatment may consist of a combination of treatments using conjugated and unconjugated antibodies, administered simultaneously or sequentially, for example, as described in WO 00/52031; WO 00/52473.
Антитела также могут быть присоединены к твердой подложке. Дополнительно, антитела согласно изобретению или их функциональные фрагменты антител, могут быть химически модифицированы путем ковалентного конъюгирования с полимером, например, повышая их циркулирующий период полужизни. Примеры полимеров и способы их присоединения к пептидам представлены в US 4,766,106; US 4,179,337; US 4,495,285 и US 4,609,546. В некоторых вариантах осуществления, полимеры могут быть выбраны из полиоксиэтилированных полиолов и полиэтиленгликоля (PEG). PEG растворим в воде при комнатной температуре, и имеет общую формулу: R(O-CH2-CH2)nO-R, где R может представлять собой водород или защитную группу, такую как алкильная или алканольная группа. Предпочтительно, защитная группа может иметь от 1 и 8 углеродов. Например, защитная группа представляет собой метил. Символ n представляет собой положительное целое число. В одном варианте осуществления n находится в диапазоне от 1 до 1000. В другом варианте осуществления n находится в диапазоне от 2 до 500. Предпочтительно, PEG имеет средний молекулярный вес в диапазоне от 1000 до 40000, более предпочтительно PEG имеет молекулярный вес в диапазоне от 2000 до 20000, еще более предпочтительно PEG имеет молекулярный вес в диапазоне от 3000 до 12000. Кроме того, PEG может иметь по меньшей мере одну гидрокси группу, например, PEG может иметь концевую гидрокси группу. Например, она представляет собой концевую гидрокси группу, которая активируется для реакции со свободной аминогруппой на ингибиторе. Тем не менее, следует принять во внимание, что тип и количество реакционно-способных групп может изменяться для достижения ковалентного конъюгированного PEG/антитело.Antibodies can also be attached to a solid support. Additionally, the antibodies of the invention, or functional antibody fragments thereof, can be chemically modified by covalent conjugation to a polymer, for example, increasing their circulating half-life. Examples of polymers and methods for attaching them to peptides are presented in US 4,766,106; US 4,179,337; US 4,495,285 and US 4,609,546. In some embodiments, the polymers may be selected from polyoxyethylated polyols and polyethylene glycol (PEG). PEG is soluble in water at room temperature, and has the general formula: R(O-CH 2 -CH 2 ) n OR, where R can represent hydrogen or a protecting group such as an alkyl or alkanol group. Preferably, the protecting group may have between 1 and 8 carbons. For example, the protecting group is methyl. The symbol n represents a positive integer. In one embodiment, n is in the range from 1 to 1000. In another embodiment, n is in the range from 2 to 500. Preferably, PEG has an average molecular weight in the range of 1000 to 40,000, more preferably PEG has a molecular weight in the range of 2000 to 20,000, even more preferably PEG has a molecular weight in the range from 3000 to 12000. In addition, PEG may have at least one hydroxy group, for example, PEG may have a terminal hydroxy group. For example, it is a terminal hydroxy group that is activated to react with the free amino group on the inhibitor. However, it should be taken into account that the type and number of reactive groups can be varied to achieve a covalent PEG/antibody conjugation.
Водорастворимые полиоксиэтилированные полиолы в данном случае также пригодны. Они включают полиоксиэтилированный сорбит, полиоксиэтилированную глюкозу, полиоксиэтилированный глицерин (POG), и др. В одном варианте осуществления, используют POG. Не желая ограничиваться какойлибо теорией, поскольку глицериновый остов полиоксиэтилированного глицерина представляет собой такой же остов, что и встречающийся в природе, например, у животных и людей в моно-, ди-, триглицеридах, то это разветвление не следует рассматривать как чужеродный агент в организме. POG может иметь молекулярный вес в таком же диапазоне, что и PEG. Другая система для доставки лекарственного средства, которая может использоваться для повышения циркулирующего периода полужизни, представляет собой липосому. Способы приготовления липосомных систем доставки известны квалифицированному специалисту в данной области техники. Другие системы доставки лекарственных средств известны в данной области и описаны, например, в ссылках в Poznansky и др. (1980) и Poznansky (1984).Water-soluble polyoxyethylated polyols are also suitable in this case. These include polyoxyethylated sorbitol, polyoxyethylated glucose, polyoxyethylated glycerol (POG), and others. In one embodiment, POG is used. Without wishing to be bound by any theory, since the glycerol backbone of polyoxyethylated glycerol is the same backbone that occurs naturally in, for example, animals and humans in mono-, di-, triglycerides, this branch should not be considered a foreign agent in the body. POG may have a molecular weight in the same range as PEG. Another drug delivery system that can be used to increase circulating half-life is the liposome. Methods for preparing liposome delivery systems are known to one skilled in the art. Other drug delivery systems are known in the art and are described, for example, in references in Poznansky et al. (1980) and Poznansky (1984).
Предпочтительно антитела согласно изобретению могут быть в очищенной форме. Типично, антитело будут присутствовать в композиции, когда они по существу не содержат других полипептидов, например, где меньше, чем 90% (по весу), обычно меньше, чем 60% и более предпочтительно меньше, чем 50% композиции состоит из других полипептидов.Preferably, the antibodies of the invention may be in purified form. Typically, antibodies will be present in the composition when they are substantially free of other polypeptides, for example, where less than 90% (by weight), typically less than 60%, and more preferably less than 50% of the composition consists of other polypeptides.
Антитела могут быть иммуногенными у хозяев, отличающихся от людей (или гетерологичных), например, у мышей. В особенности, антитела могут иметь идиотоп, который является иммуногенным уAntibodies may be immunogenic in non-human (or heterologous) hosts, such as mice. In particular, antibodies may have an idiotope that is immunogenic in
- 37 046175 хозяев, отличающихся от людей, но не у человека-хозяина. В особенности, антитела включают те антитела, которые не могут быть легко выделены из таких хозяев, как мыши, козы, кролики, крысы, млекопитающие, отличающиеся от приматов, и др., и обычно не могут быть получены путем гуманизации или из ксено-мышей.- 37 046175 hosts that differ from humans, but not from a human host. In particular, antibodies include those antibodies that cannot be readily isolated from hosts such as mice, goats, rabbits, rats, non-primate mammals, etc., and generally cannot be obtained by humanization or from xeno-mice .
Получение антител.Obtaining antibodies.
Антитела могут быть получены с помощью любого способа, известного в данной области техники. Например, обычная методология получения моноклональных антител с применением гибридомной технологии хорошо известна (Kohler, G. и Milstein, С., 1975; Kozbar и др. 1983). Можно также использовать альтернативный способ EBV иммортализации, описанный в WO 2004/076677.Antibodies can be obtained using any method known in the art. For example, the conventional methodology for producing monoclonal antibodies using hybridoma technology is well known (Kohler, G. and Milstein, S., 1975; Kozbar et al. 1983). An alternative EBV immortalization method described in WO 2004/076677 can also be used.
Предпочтительный способ описан в WO 2004/076677. В этом способе В-клетки, продуцирующие антитело, трансформируют с помощью EBV и поликлонального активатора В-клеток. Дополнительные стимуляторы клеточного роста и дифференциации необязательно можно добавлять на этапе трансформации для усиления эффективности. Эти стимуляторы могут представлять собой цитокины, такие как IL2 и IL-15. В одном аспекте, IL-2 добавляют во время стадии иммортализации для дальнейшего улучшения эффективности иммортализации, но их применение не является существенным. После этого иммортализованные В-клетки, полученные с использованием этих способов, можно культивировать с помощью методов, известных в данной области техники и на основании этого выделять антитела.A preferred method is described in WO 2004/076677. In this method, antibody-producing B cells are transformed with EBV and a polyclonal B cell activator. Additional stimulators of cell growth and differentiation may optionally be added during the transformation step to enhance efficacy. These stimulators may be cytokines such as IL2 and IL-15. In one aspect, IL-2 is added during the immortalization step to further improve the immortalization efficiency, but their use is not essential. The immortalized B cells obtained using these methods can then be cultured using methods known in the art and antibodies can be isolated therefrom.
Другой предпочтительный способ описан в WO 2010/046775. В этом способе плазматические клетки культивируют в ограниченных количествах, или в виде единичных плазматических клеток в микролуночных культуральных планшетах. Антитела могут быть выделены из культуры плазматических клеток. Кроме того, из культур плазматических клеток, может быть экстрагирована РНК и может быть осуществлена ПЦР с применением способов, известных в данной области техники. VH и VL участки антител могут быть амплифицированы с помощью ОТ-ПЦР (ПЦР с обратной транскриптазой), секвенированы, и клонированы в экспрессионном векторе, который затем трансфектируют в HEK293T клетки или другие клетки-хозяева. Клонирование нуклеиновой кислоты в экспрессионных векторах, трансфекция клетокхозяев, культивирование трансфектированных клеток-хозяев и выделение продуцированного антитела может быть осуществлено с использованием любых способов, известных квалифицированному специалисту в данной области техники.Another preferred method is described in WO 2010/046775. In this method, plasma cells are cultured in limited quantities, or as single plasma cells in microwell culture plates. Antibodies can be isolated from plasma cell cultures. In addition, RNA can be extracted from plasma cell cultures and PCR can be performed using methods known in the art. The VH and VL regions of the antibodies can be amplified by RT-PCR (reverse transcriptase PCR), sequenced, and cloned into an expression vector, which is then transfected into HEK293T cells or other host cells. Cloning nucleic acid into expression vectors, transfecting host cells, culturing transfected host cells, and isolating the resulting antibody can be accomplished using any methods known to one skilled in the art.
Антитела могут быть дополнительно очищены, при необходимости, используя фильтрацию, центрифугирование и различные хроматографические методы, такие как ВЭЖХ или аффинная хроматография. Технологии очистки антител, например, моноклональных антител, включая технологии получения антител фармацевтической степени чистоты, хорошо известны в данной области техники.Antibodies can be further purified, if necessary, using filtration, centrifugation and various chromatographic techniques such as HPLC or affinity chromatography. Technologies for purifying antibodies, such as monoclonal antibodies, including technologies for producing pharmaceutical grade antibodies, are well known in the art.
Фрагменты антител могут быть получены из антител с помощью способов, которые включают расщепление ферментами, такими как пепсин или папаин, и/или расщепление дисульфидных связей путем химического восстановления. Альтернативно, фрагменты антител могут быть получены путем клонирования и экспрессирования части последовательностей тяжелых или легких цепей. Фрагменты антитело согласно изобретению предпочтительно включают Fab, Fab', F(ab')2 и Fv фрагменты.. Одноцепоченные Fv фрагменты - scFv, могут содержать CDR антитела. В уровне техники также описаны мономеры и димеры тяжелых и легких цепей, однодоменная тяжелая цепь антитела, однодоменная легкая цепь антитела, а также одно-цепочечные антитела, например, одноцепочечный Fv, в котором вариабельные домены тяжелой и легкой цепи соединены пептидным линкером.Antibody fragments can be prepared from antibodies by methods that include digestion with enzymes such as pepsin or papain and/or cleavage of disulfide bonds by chemical reduction. Alternatively, antibody fragments can be produced by cloning and expressing portions of the heavy or light chain sequences. The antibody fragments of the invention preferably include Fab, Fab', F(ab')2 and Fv fragments. Single chain Fv fragments, scFv, may contain antibody CDRs. The prior art also describes monomers and dimers of heavy and light chains, single-domain antibody heavy chain, single-domain antibody light chain, as well as single-chain antibodies, for example, single-chain Fv, in which the heavy and light chain variable domains are connected by a peptide linker.
Фрагменты антител могут передавать моновалентные или мультивалентные взаимодействия и содержаться в различных структурах, как описано выше. Например, могут быть синтезированы scFv молекулы для создания трехвалентного триатела или четырехвалентного тетратела. scFv молекулы могут включать домен Fc фрагмента, что приводит к получению двухвалентных минител. Дополнительно, последовательности могут быть компонентом мультиспецифических молекул, в которых последовательности нацеливают эпитопы и другие участки молекулы на связывание с другими мишенями. Типичные молекулы включают, но, не ограничиваясь только ими, биспецифические Fab2, триспецифические Fab3, биспецифические scFv, и диатела (Holliger и Hudson, 2005, Nature Biotechnology 9: 1126-1136).Antibody fragments can convey monovalent or multivalent interactions and are contained in various structures, as described above. For example, scFv molecules can be synthesized to create a trivalent tribody or a tetravalent tetrabody. scFv molecules can include an Fc domain fragment, resulting in divalent minibodies. Additionally, the sequences can be a component of multispecific molecules, in which the sequences target epitopes and other regions of the molecule for binding to other targets. Typical molecules include, but are not limited to, bispecific Fab2, trispecific Fab3, bispecific scFv, and diabodies (Holliger and Hudson, 2005, Nature Biotechnology 9: 1126-1136).
Стандартные методики молекулярной биологии можно использовать для приготовления ДНК последовательностей, кодирующих антитела или фрагменты антител. Желательные ДНК последовательности могут быть синтезированы полностью или частично, используя методики олигонуклеотидного синтеза. В качестве подходящих можно использовать методики сайт-направленного мутагенеза и полимеразной цепной реакции (ПЦР).Standard molecular biology techniques can be used to prepare DNA sequences encoding antibodies or antibody fragments. Desired DNA sequences can be synthesized in whole or in part using oligonucleotide synthesis techniques. Site-directed mutagenesis and polymerase chain reaction (PCR) techniques can be used as suitable techniques.
Любую подходящую систему клетка-хозяин/вектор можно использовать для экспрессии ДНК последовательностей, кодирующих молекулы антитела или их фрагменты. Бактериальные, например, Е. coli, и другие микробные системы можно использовать, в частности, для экспрессии фрагментов антител, таких как Fab и F(ab')2 фрагменты, и в особенности Fv фрагменты и одноцепочечные фрагменты антител, например, одноцепочечные Fv. Экспрессионные системы на основании эукариотических, например, млекопитающих, клеток-хозяев, можно использовать для получения больших молекул антител, включая полные молекулы антител. Подходящие клетки-хозяева млекопитающих включают, но, не ограничиваясь только ими, СНО, HEK293T, PER.C6, NS0, миеломные или гибридомные клетки.Any suitable host cell/vector system can be used to express DNA sequences encoding antibody molecules or fragments thereof. Bacterial, eg E. coli, and other microbial systems can be used in particular for the expression of antibody fragments such as Fab and F(ab')2 fragments, and in particular Fv fragments and single chain antibody fragments, eg single chain Fv. Expression systems based on eukaryotic, eg mammalian, host cells can be used to produce large antibody molecules, including complete antibody molecules. Suitable mammalian host cells include, but are not limited to, CHO, HEK293T, PER.C6, NS0, myeloma or hybridoma cells.
- 38 046175- 38 046175
Способ получения молекулы антитела включает культивирование клетки-хозяина, содержащей вектор, кодирующий нуклеиновую кислоту в условиях, подходящих для экспрессии белка из ДНК, кодирующей молекулу антитела, и выделения молекулы антитела.A method for producing an antibody molecule involves culturing a host cell containing a vector encoding a nucleic acid under conditions suitable for expressing a protein from DNA encoding the antibody molecule and isolating the antibody molecule.
Молекула антитела может содержать только полипептид тяжелой и легкой цепи, в этом случае только последовательность, кодирующую полипептид тяжелой цепи или легкой цепи, необходимо использовать для трансфекции клеток-хозяев. Для получения продуктов, содержащих как тяжелые, так и легкие цепи, клеточную линию можно трансфектировать двумя векторами, первым вектором, кодирующим полипептид легкой цепи, и вторым вектором, кодирующим полипептид тяжелой цепи. Альтернативно, можно использовать единственный вектор, который включает последовательности, кодирующие полипептиды легкой цепи и тяжелой цепи.An antibody molecule may contain only a heavy and light chain polypeptide, in which case only the sequence encoding the heavy chain or light chain polypeptide needs to be used to transfect host cells. To produce products containing both heavy and light chains, a cell line can be transfected with two vectors, a first vector encoding a light chain polypeptide and a second vector encoding a heavy chain polypeptide. Alternatively, a single vector may be used that includes sequences encoding light chain and heavy chain polypeptides.
Альтернативно, антитела могут быть получены путем (I) экспрессии последовательности нуклеиновых кислот в клетке-хозяине, например, путем применения вектора, и (II) выделения экспрессируемого продукта антитела. Дополнительно, способ может включать (III) очистку выделенного антитела. Трансформированные В-клетки и культивируемые плазматические клетки можно подвергать скринингу для обнаружения тех, которые продуцируют антитела с желательной специфичностью или функцией.Alternatively, antibodies can be produced by (i) expressing a nucleic acid sequence in a host cell, for example, by use of a vector, and (ii) isolating the expressed antibody product. Additionally, the method may include (iii) purifying the isolated antibody. Transformed B cells and cultured plasma cells can be screened to find those that produce antibodies with the desired specificity or function.
Стадию скрининга можно осуществлять путем иммунологического анализа, например, ELISA, путем окрашивания тканей или клеток (включая трансфектированные клетки), путем анализа на нейтрализацию или с помощью одного из различных других способов, известных в данной области техники для идентификации желательной специфичности или функции. Анализ можно выбирать на основании простого распознавания одного или нескольких антигенов, или можно выбрать на основании желательной функции, например, для выбора нейтрализирующих антител, которые не только связываются с антигеном, для выбора антител, которые могут изменять характеристики целевых клеток, такие как их каскады передачи сигналов, их форму, их скорость роста, их способность оказывать влияние на другие клетки, их ответную реакции на воздействие других клеток или других реагентов или на изменение условий, их дифференцированные состояния, и т.д.The screening step can be performed by an immunoassay, such as an ELISA, by staining tissues or cells (including transfected cells), by a neutralization assay, or by one of various other methods known in the art to identify the desired specificity or function. The assay can be selected based on simple recognition of one or more antigens, or can be selected based on desired function, for example, to select neutralizing antibodies that not only bind to an antigen, to select antibodies that can alter characteristics of target cells, such as their transmission cascades signals, their shape, their growth rate, their ability to influence other cells, their response to the influence of other cells or other reagents or to changes in conditions, their differentiated states, etc.
После этого можно получать индивидуальные трансформированные клоны В-клеток из положительно трансформированной культуры В-клеток. Этап клонирования для разделения индивидуальных клонов из смеси положительных клеток можно осуществлять с использованием серийного разведения, микроманипуляции, депонирования единичной клетки путем сортировки клеток или другого способа, известного в данной области техники.Individual transformed B cell clones can then be obtained from the positively transformed B cell culture. The cloning step to separate individual clones from a mixture of positive cells can be accomplished using serial dilution, micromanipulation, single cell deposition by cell sorting, or other method known in the art.
Нуклеиновую кислоту из культивируемых плазматических клеток можно выделять, клонировать и экспрессировать в HEK293T клетках или других известных клетках-хозяевах, используя способы, известные в данной области техники.Nucleic acid from cultured plasma cells can be isolated, cloned and expressed in HEK293T cells or other known host cells using methods known in the art.
Иммортализованные клоны В-клеток или трансфектированные клетки-хозяева можно использовать различными путями, например, в качестве источника моноклональных антител, в качестве источника нуклеиновой кислоты (ДНК или мРНК), кодирующей моноклональное антитело, представляющее интерес, для исследования, и т.д.Immortalized B cell clones or transfected host cells can be used in various ways, for example, as a source of monoclonal antibodies, as a source of nucleic acid (DNA or mRNA) encoding a monoclonal antibody of interest for research, etc.
Возможно получение композиции, содержащей иммортализованные В-клетки памяти или трансфектированные клетки-хозяева, которые продуцируют антитела в соответствии с настоящим изобретением.It is possible to prepare a composition containing immortalized memory B cells or transfected host cells that produce antibodies in accordance with the present invention.
Иммортализованный клон В-клеток или культивируемые плазматические клетки также можно использовать в качестве источника нуклеиновой кислоты для клонирования генов антител для последующей рекомбинантной экспрессии. Экспрессия из рекомбинантных источников является более распространенной для фармацевтических целей, чем экспрессия из В-клеток или гибридом, например, по соображениям стабильности, воспроизводимости, простоты культивирования и т.д.An immortalized B cell clone or cultured plasma cells can also be used as a source of nucleic acid to clone antibody genes for subsequent recombinant expression. Expression from recombinant sources is more common for pharmaceutical purposes than expression from B cells or hybridomas, for example, for reasons of stability, reproducibility, ease of culture, etc.
Таким образом, способ получения рекомбинантной клетки может включать этапы: (I) получения одной или нескольких нуклеиновых кислот (например, мРНК тяжелой и/или легкой цепи) из клона Вклеток или культивируемых плазматических клеток, которые кодируют антитело, представляющее интерес; (II) инсертирования нуклеиновой кислоты в экспрессионный вектор и (III) трансфекции вектора в клетку-хозяин для разрешения экспрессии антитела, представляющего интерес, в этой клетке-хозяине.Thus, a method for producing a recombinant cell may include the steps of: (i) obtaining one or more nucleic acids (eg, heavy and/or light chain mRNA) from a clone of B cells or cultured plasma cells that encode an antibody of interest; (II) inserting a nucleic acid into an expression vector; and (III) transfecting the vector into a host cell to permit expression of the antibody of interest in that host cell.
Аналогичным образом, способ получения рекомбинантной клетки может включать этапы: (I) секвенирования нуклеиновой(ых) кислоты (кислот) из клона В-клеток или культивируемых плазматических клеток, которые кодируют антитело, представляющее интерес; и (II) использования информации последовательности со стадии (I) для приготовления нуклеиновой(ых) кислоты (кислот) для инсерции в клетку-хозяин для разрешения экспрессии антитела, представляющего интерес, в этой клетке-хозяине. Нуклеиновую кислоту можно, но не обязательно, подвергать манипуляциям между этапами (I) и (II) для интродукции рестрикционных сайтов, для изменения частоты использования кодона, и/или для оптимизации транскрипции и/или трансляции регуляторных последовательностей.Likewise, a method for producing a recombinant cell may include the steps of: (I) sequencing nucleic acid(s) from a clone of B cells or cultured plasma cells that encode an antibody of interest; and (II) using the sequence information from step (I) to prepare nucleic acid(s) for insertion into a host cell to permit expression of the antibody of interest in that host cell. The nucleic acid may, but not necessarily, be manipulated between steps (I) and (II) to introduce restriction sites, to change codon usage frequency, and/or to optimize transcription and/or translation of regulatory sequences.
Кроме того, способ получения трансфектированной клетки-хозяина может включать этап трансфекции клетки-хозяина одной или несколькими нуклеиновыми кислотами, которые кодируют антитело, представляющее интерес, где нуклеиновые кислоты представляют собой нуклеиновые кислоты, которые имеют происхождение из клона иммортализованных В-клеток или культивируемых плазматических клеток согласно изобретению. Таким образом, процедуры для первого приготовления нуклеиновой(ых) киIn addition, the method of producing a transfected host cell may include the step of transfecting the host cell with one or more nucleic acids that encode an antibody of interest, where the nucleic acids are nucleic acids that are derived from a clone of immortalized B cells or cultured plasma cells according to the invention. Thus, the procedures for the first preparation of nucleic acid(s)
- 39 046175 слоты(т) и последующего использования ее для трансфекции клетки-хозяина, можно осуществлять в различное время различными людьми в различных местах (например, в различных странах).- 39 046175 slot(s) and its subsequent use for transfection of a host cell, can be carried out at different times by different people in different places (eg, in different countries).
Затем эти рекомбинантные клетки можно использовать для экспрессии и культивирования. Они в особенности пригодны для экспрессии антител для фармацевтического получения в промышленном масштабе. Также их можно использовать в качестве активного компонента фармацевтической композиции. Можно использовать любую подходящую методику культивирования, включая, но, не ограничиваясь только ими, статическую культуру, культуру во вращающемся флаконе, асцитной жидкости, картридж биореактора по типу полых волокон, модульный миниферментер, смесительный бак, культуру на микроносителе, перфузию керамического стержня и др.These recombinant cells can then be used for expression and culture. They are particularly suitable for the expression of antibodies for pharmaceutical production on an industrial scale. They can also be used as an active component of a pharmaceutical composition. Any suitable culture technique may be used, including, but not limited to, static culture, spinner flask culture, ascites fluid, hollow fiber bioreactor cartridge, modular minifermenter, mixing tank, microcarrier culture, ceramic rod perfusion, etc.
Способы получения и секвенирования генов иммуноглобулинов из В-клеток или плазматических клеток хорошо известны в данной области техники (например, см. Раздел 4 Kuby Immunology, 4oe изд., 2000).Methods for obtaining and sequencing immunoglobulin genes from B cells or plasma cells are well known in the art (eg, see Section 4 of Kuby Immunology, 4th ed., 2000).
Трансфектированная клетка-хозяин может представлять собой эукариотическую клетку, включая клетки дрожжей и животных, в особенности клетки млекопитающих (например, СНО клетки, NS0 клетки, клетки человека, такие как PER.C6 или HKB-11 клетки, миеломные клетки, или клетку печени человека), а также клетки растений, при этом предпочтительными являются клетки млекопитающих. Предпочтительные хозяева для экспрессии могут гликозилировать антитело, в особенности с углеводными структурами, которые сами не являются иммуногенными для людей. В одном варианте осуществления трансфектированная клетка-хозяин способна расти в бессывороточной среде. В дальнейшем варианте осуществления трансфектированная клетка-хозяин способна расти без присутствия продуктов, имеющих происхождение из животных. Трансфектированная клетка-хозяин также может культивироваться с получением клеточной линии.The transfected host cell may be a eukaryotic cell, including yeast and animal cells, especially mammalian cells (eg, CHO cells, NS0 cells, human cells such as PER.C6 or HKB-11 cells, myeloma cells, or a human liver cell ), as well as plant cells, with mammalian cells being preferred. Preferred hosts for expression may glycosylate the antibody, particularly with carbohydrate structures that are not themselves immunogenic in humans. In one embodiment, the transfected host cell is capable of growing in a serum-free medium. In a further embodiment, the transfected host cell is capable of growing without the presence of products of animal origin. The transfected host cell can also be cultured to produce a cell line.
Способ получения одной или нескольких молекул нуклеиновых кислот (например, генов тяжелой и легкой цепей), которые кодируют антитело, представляющее интерес может содержать этапы: (I) приготовления иммортализованного клона В-клеток или культивирование плазматических клеток; (II) получения из клона В-клеток или культивируемых плазматических клеток нуклеиновой кислоты, которая кодирует антитело, представляющее интерес. Кроме того, способ получения последовательности нуклеиновых кислот, которая кодирует антитело, представляющее интерес, может включать этапы: (I) приготовления иммортализованного клона В-клеток или культивирование плазматических клеток в соответствии с изобретением; (II) секвенирования нуклеиновой кислоты из клона В-клеток или культивируемых плазматических клеток, которые продуцируют антитело, представляющее интерес.A method of producing one or more nucleic acid molecules (eg, heavy and light chain genes) that encode an antibody of interest may comprise the steps of: (i) preparing an immortalized B cell clone or culturing plasma cells; (ii) obtaining from a clone of B cells or cultured plasma cells a nucleic acid that encodes an antibody of interest. In addition, a method of obtaining a nucleic acid sequence that encodes an antibody of interest may include the steps of: (I) preparing an immortalized B cell clone or culturing plasma cells in accordance with the invention; (ii) sequencing nucleic acid from a clone of B cells or cultured plasma cells that produce the antibody of interest.
Способ получения молекулы нуклеиновой(ых) кислоты(т), которая(ые) кодируют антитело, представляющее интерес, может включать стадию получения нуклеиновой кислоты из трансформированного клона В-клеток или культивированных плазматических клеток. Таким образом, процедуры получения сначала клона В-клеток или культивируемой плазматической клетки, а затем получения нуклеиновой(ых) кислоты(т) из клона В-клеток или культивируемых плазматических клеток можно осуществлять в различное время различными людьми в различных местах (например, в различных странах).A method of obtaining a nucleic acid molecule(s) that encodes an antibody of interest may include the step of obtaining the nucleic acid from a transformed clone of B cells or cultured plasma cells. Thus, the procedures for first obtaining a B cell clone or cultured plasma cell and then obtaining nucleic acid(s) from the B cell clone or cultured plasma cells can be performed at different times by different people in different places (for example, in different countries).
Способ получения антитела (например, для фармацевтического применения), может включать этапы: (I) получения и/или секвенирование одной или нескольких нуклеиновых кислот (например, генов тяжелой и легкой цепи) из выбранного клона В-клеток или культивируемых плазматических клеток, экспрессирующих антитело, представляющее интерес; (II) инсертирования нуклеиновой(ых) кислоты (кислот) в или использования последовательности(ей) нуклеиновой(ых) кислоты (кислот) для приготовления экспрессионного вектора; (III) трансфектирования клетки-хозяина, которая может экспрессировать антитело, представляющее интерес; (IV) культивирования или суб-культивирование трансфектированных клеток-хозяев в условиях, в которых экспрессируется антитело, представляющее интерес; и, необязательно, (V) очистку антитела, представляющего интерес.A method of producing an antibody (eg, for pharmaceutical use) may include the steps of: (i) obtaining and/or sequencing one or more nucleic acids (eg, heavy and light chain genes) from a selected clone of B cells or cultured plasma cells expressing the antibody , of interest; (II) inserting the nucleic acid(s) into or using the nucleic acid(s) sequence(s) to prepare an expression vector; (III) transfecting a host cell that can express the antibody of interest; (iv) culturing or sub-culturing the transfected host cells under conditions in which the antibody of interest is expressed; and, optionally, (V) purifying the antibody of interest.
Способ получения антитела может включать этапы: культивирования или субкультивирование трансфектированной популяции клеток-хозяев, например, стабильно трансфектированной популяции клеток-хозяев, в условиях, в которых экспрессируется антитело, представляющее интерес, и, необязательно, очистку антитела, представляющего интерес, где указанная трансфектированная популяция клеток-хозяев была получена с помощью (I) обеспечения нуклеиновой(ых) кислоты(т), кодирующей(их) выбранное антитело, представляющее интерес, которое продуцируется клоном В-клеток или культивируемых плазматических клеток, приготовленных, как описано выше, (II) инсертирования нуклеиновой(ых) кислоты(т) в экспрессионный вектор, (III) трансфектирования вектора в клетку-хозяин, которая может экспрессировать антитело, представляющее интерес, и (IV) культивирования или субкультивирования трансфектированной клетки-хозяина, содержащей инсертированные нуклеиновые кислоты для получения антитела, представляющего интерес. Таким образом, процедуры приготовления сначала рекомбинантной клетки-хозяина и последующего ее культивирования для экспрессии антитела можно осуществлять в самое различное время различными людьми в различных местах (например, в различных странах).A method for producing an antibody may include the steps of: culturing or subculturing a transfected population of host cells, e.g., a stably transfected population of host cells, under conditions in which the antibody of interest is expressed, and optionally purifying the antibody of interest, wherein said transfected population host cells was obtained by (I) providing nucleic acid(s) encoding the selected antibody of interest that is produced by a clone of B cells or cultured plasma cells prepared as described above, (II) inserting the nucleic acid(s) into an expression vector, (III) transfecting the vector into a host cell that can express the antibody of interest, and (IV) culturing or subculturing the transfected host cell containing the inserted nucleic acids to produce the antibody , of interest. Thus, the procedures for first preparing a recombinant host cell and then culturing it for antibody expression can be performed at very different times by different people in different places (eg, different countries).
Фармацевтическая композиция.Pharmaceutical composition.
Объектом настоящего изобретения также является фармацевтическая композиция, содержащая:The present invention also provides a pharmaceutical composition containing:
- 40 046175 (I) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением;- 40 046175 (I) an antibody or an antigen-binding fragment thereof in accordance with the present invention;
(II) нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело или его антигенсвязывающий в соответствии с настоящим изобретением;(II) a nucleic acid encoding an antibody or antigen-binding agent thereof according to the present invention;
(III) вектор экспрессии, содержащий нуклеиновую кислоту в соответствии с настоящим изобретением; или (IV) клетку, экспрессирующую антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением или содержащую вектор в соответствии с настоящим изобретением;(III) an expression vector containing a nucleic acid in accordance with the present invention; or (IV) a cell expressing an antibody or antigen-binding fragment thereof in accordance with the present invention or containing a vector in accordance with the present invention;
(V) фармацевтически приемлемый наполнитель, разбавитель или носитель.(V) a pharmaceutically acceptable excipient, diluent or carrier.
Несмотря на то, что носитель или наполнитель могут облегчать введение, он не должен собственно индуцировать продукцию антител, вредных для индивидуума, получающего композицию. Также он не должен быть токсичным. Подходящие носители могут представлять собой большие, медленно метаболизируемые макромолекулы, такие как белки, полипептиды, липосомы, полисахариды, полимолочные кислоты, полигликолевые кислоты, полимерные аминокислоты, сополимеры аминокислот и инактивированные вирусные частицы. В целом, фармацевтически приемлемые носители в фармацевтической композиция могут представлять собой активные компоненты или неактивные компоненты. Предпочтительно, фармацевтически приемлемый носитель в фармацевтической композиции представляет собой неактивный компонент по отношению к инфекции, вызванной вирусом Зика.Although the carrier or excipient may facilitate administration, it should not actually induce the production of antibodies harmful to the individual receiving the composition. It should also not be toxic. Suitable carriers may be large, slowly metabolized macromolecules such as proteins, polypeptides, liposomes, polysaccharides, polylactic acids, polyglycolic acids, polymeric amino acids, copolymers of amino acids and inactivated viral particles. In general, pharmaceutically acceptable carriers in a pharmaceutical composition may be active ingredients or inactive ingredients. Preferably, the pharmaceutically acceptable carrier in the pharmaceutical composition is an inactive component against Zika virus infection.
Можно использовать фармацевтически приемлемые соли, например, соли минеральных кислот, такие как гидрохлориды, гидробромиды, фосфаты и сульфаты, или соли органических кислот, такие как ацетаты, пропионаты, малонаты и бензоаты.Pharmaceutically acceptable salts may be used, for example salts of mineral acids such as hydrochlorides, hydrobromides, phosphates and sulfates, or salts of organic acids such as acetates, propionates, malonates and benzoates.
Фармацевтически приемлемые носители в фармацевтической композиции могут дополнительно содержать жидкости, такие как вода, солевой раствор, глицерин и этанол. Дополнительно, в таких композициях могут присутствовать вспомогательные вещества, такие как смачивающие или эмульгирующие агенты или рН-буферные вещества. Такие носители предоставляют возможность приготавливать фармацевтические композиции в виде таблеток, пилюль, драже, капсул, жидкостей, гелей, сиропов, взвесей и суспензий, для проглатывания субъектом.Pharmaceutically acceptable carriers in the pharmaceutical composition may further contain liquids such as water, saline, glycerin and ethanol. Additionally, auxiliary substances such as wetting or emulsifying agents or pH buffering agents may be present in such compositions. Such carriers enable pharmaceutical compositions to be prepared in the form of tablets, pills, dragees, capsules, liquids, gels, syrups, slurries and suspensions for ingestion by a subject.
Фармацевтические композиции могут быть приготовлены в различных формах. Например, композиции могут быть приготовлены в виде препаратов для инъекций, либо в виде жидких растворов или суспензий. Также могут быть приготовлены твердые формы, подходящие для превращения в раствор или в суспензию в жидких наполнителях перед инъекцией (например, лиофилизированная композиция, подобная Synagis™ и Herceptin™, для восстановления стерильной водой, содержащая консервант). Композиция может быть приготовлена для местного введения, например, в виде мази, крема или порошка. Композиция может быть приготовлена для перорального введения, например, в виде таблетки или капсулы, в виде спрея или в виде сиропа (необязательно ароматизированного). Композиция может быть приготовлена для легочного введения, например, в виде ингалятора, используя тонкоизмельченный порошок или спрей. Композиция может быть приготовлена в виде суппозитория или пессария. Композиция может быть приготовлена для назального, ушного или глазного введения, например, в виде капель. Композиция может быть в форме набора, созданного таким образом, чтобы комбинированная композиция восстанавливалось только перед введением субъекту. Например, лиофилизированное антитело может обеспечиваться в форме набора со стерильной водой или стерильным буфером.Pharmaceutical compositions can be prepared in various forms. For example, the compositions may be formulated as injectables, or as liquid solutions or suspensions. Solid forms suitable for solution or suspension in liquid excipients prior to injection may also be prepared (eg, a lyophilized composition like Synagis™ and Herceptin™ for reconstitution with sterile water containing a preservative). The composition may be prepared for topical administration, for example, in the form of an ointment, cream or powder. The composition may be prepared for oral administration, for example, in the form of a tablet or capsule, in the form of a spray, or in the form of a syrup (optionally flavored). The composition can be prepared for pulmonary administration, for example, in the form of an inhaler, using a fine powder or spray. The composition can be prepared in the form of a suppository or pessary. The composition can be prepared for nasal, ear or ocular administration, for example, in the form of drops. The composition may be in the form of a kit designed such that the combination composition is reconstituted only before administration to a subject. For example, the lyophilized antibody may be provided in the form of a kit with sterile water or sterile buffer.
Если активный компонент в композиции представляет собой молекулу антитела, фрагмент антитела или их варианты и производные, то он чувствителен к деградации в желудочно-кишечном тракте. Следовательно, если композицию вводят путем с использованием желудочно-кишечного тракта, то композиция может содержать агенты, которые защищают антитело от разложения, но которые высвобождают антитело после того, как оно было абсорбировано из желудочно-кишечного тракта.If the active component in the composition is an antibody molecule, an antibody fragment, or variants and derivatives thereof, it is susceptible to degradation in the gastrointestinal tract. Therefore, if the composition is administered by the gastrointestinal tract, the composition may contain agents that protect the antibody from degradation, but which release the antibody after it has been absorbed from the gastrointestinal tract.
Всестороннее обсуждение фармацевтически приемлемых носителей доступно в Gennaro (2000) Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 20-ое изд., ISBN: 0683306472.A comprehensive discussion of pharmaceutically acceptable carriers is available in Gennaro (2000) Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 20th ed., ISBN: 0683306472.
Фармацевтические композиции обычно имеют значение рН в диапазоне от 5,5 до 8,5, в некоторых вариантах осуществления оно может составлять от 6 до 8, и в других вариантах осуществления приблизительно 7. рН может поддерживаться путем применения буфера. Композиция может быть стерильной и/или апирогенной. Композиция может быть изотонической по отношению к людям. В одном варианте осуществления фармацевтические композиции согласно изобретению поставляются в герметически запечатанных контейнерах.Pharmaceutical compositions typically have a pH in the range of 5.5 to 8.5, in some embodiments it may be from 6 to 8, and in other embodiments about 7. The pH may be maintained by the use of a buffer. The composition may be sterile and/or pyrogen-free. The composition may be isotonic in relation to humans. In one embodiment, the pharmaceutical compositions of the invention are supplied in hermetically sealed containers.
Композиции могут быть представлены в различных формах введения; формы включают, но, не ограничиваясь только ими, те формы, которые пригодны для парентерального введения, например, путем инъекции или инфузии, например, путем болюсной инъекции или непрерывной инфузии. Если продукт предназначен для инъекции или инфузии, то он может находиться в форме суспензии, раствора или эмульсии в масляном или водном носителе, и он может содержать вспомогательные агенты для приготовления препаратов, такие как суспендирующие, консервирующие, стабилизирующие и/или диспергирующие агенты. Альтернативно, молекула антитела может быть в безводной форме, для восстановления перед применением с подходящей стерильной жидкостью. Под наполнителем типично понимают материал, который является подходящим для хранения, транспортировки и/или введения соединения, такогоThe compositions may be presented in various forms of administration; forms include, but are not limited to, those forms that are suitable for parenteral administration, for example, by injection or infusion, for example, by bolus injection or continuous infusion. If the product is intended for injection or infusion, it may be in the form of a suspension, solution or emulsion in an oily or aqueous vehicle, and it may contain formulation auxiliaries such as suspending, preservative, stabilizing and/or dispersing agents. Alternatively, the antibody molecule may be in anhydrous form for reconstitution with a suitable sterile liquid before use. By excipient is typically meant a material that is suitable for storing, transporting and/or administering a compound such
- 41 046175 как фармацевтически активное соединение, в особенности антитела в соответствии с настоящим изобретением. Например, наполнитель может представлять собой физиологически приемлемую жидкость, которая пригодна для хранения, транспортировки и/или введения фармацевтически активного соединения, в особенности антитела. После приготовления, композиции могут вводить непосредственно субъекту. В одном варианте осуществления композиции адаптированы для введения млекопитающим, например, субъектам-людям.- 41 046175 as a pharmaceutically active compound, in particular an antibody according to the present invention. For example, the excipient may be a physiologically acceptable liquid that is suitable for storing, transporting and/or administering a pharmaceutically active compound, especially an antibody. Once prepared, the compositions may be administered directly to the subject. In one embodiment, the compositions are adapted for administration to mammals, such as human subjects.
Фармацевтические композиции могут вводить различными путями, включая, но, не ограничиваясь только ими, пероральный, внутривенный, внутримышечный, внутриартериальный, костномозговой, внутрибрюшинный, интратекальный, внутрижелудочковый, трансдермальный, чрескожный, местный, подкожный, интраназальный, энтеральный, сублингвальный, интравагинальный или ректальный пути. Безигольные шприцы также можно использовать для введения фармацевтических композиций. Предпочтительно, фармацевтическая композиция может быть приготовлена для парентерального введения, например, в виде таблеток, капсул и др., для местного введения, или в виде инъецируемых препаратов, например, в виде жидких растворов или суспензий, при этом является особенно предпочтительным, когда фармацевтическая композиция представляет собой инъецируемый препарат. Также предпочтительными являются твердые формы, подходящие для приготовления раствора или суспензии в жидких носителях перед инъекцией, например, когда фармацевтическая композиция представлена в лиофилизированной форме.Pharmaceutical compositions may be administered by a variety of routes, including, but not limited to, oral, intravenous, intramuscular, intraarterial, bone marrow, intraperitoneal, intrathecal, intraventricular, transdermal, transdermal, topical, subcutaneous, intranasal, enteral, sublingual, intravaginal, or rectal routes. . Needleless syringes can also be used to administer pharmaceutical compositions. Preferably, the pharmaceutical composition may be prepared for parenteral administration, for example, in the form of tablets, capsules, etc., for topical administration, or in the form of injectable preparations, for example, in the form of liquid solutions or suspensions, and it is particularly preferred when the pharmaceutical composition is an injectable drug. Also preferred are solid forms suitable for preparation of a solution or suspension in liquid carriers before injection, for example when the pharmaceutical composition is presented in lyophilized form.
Для инъекции, например, внутривенной, кожной или подкожной инъекции, или инъекции в участок заболевания, активный компонент предпочтительно будет находиться в форме парентерально приемлемого водного раствора, который является апирогенным и имеет подходящее значение рН, изотоничность и стабильность. Квалифицированные специалисты в данной области техники могут приготовить подходящие растворы, используя, например, изотонические наполнители, таких как хлорид натрия для инъекций, раствор Рингера для инъекций, лактатный раствор Рингера для инъекций, При необходимости, можно добавлять консерванты, стабилизаторы, буферы, антиоксиданты и/или другие вспомогательные вещества. Независимо от того, полипептид, пептид или молекула нуклеиновой кислоты, или другое фармацевтически пригодное соединение, которое будет вводиться индивидууму, введение предпочтительно осуществлять в профилактически эффективном количестве или терапевтически эффективном количестве (в зависимости от определенной ситуации), которого достаточно для проявления преимущества у индивидуума. Действительное вводимое количество, и скорость и динамика введения во времени, будут зависеть от природы и тяжести состояния, подлежащего лечению. Для инъекции, фармацевтическая композиция в соответствии с настоящим изобретением может содержаться, например, в предварительно заполненном шприце.For injection, for example intravenous, dermal or subcutaneous injection, or injection into a disease site, the active ingredient will preferably be in the form of a parenterally acceptable aqueous solution that is pyrogen-free and has a suitable pH, isotonicity and stability. Those skilled in the art can prepare suitable solutions using, for example, isotonic excipients such as sodium chloride injection, Ringer's solution for injection, lactated Ringer's solution for injection. If necessary, preservatives, stabilizers, buffers, antioxidants and/or or other excipients. Regardless of whether the polypeptide, peptide or nucleic acid molecule, or other pharmaceutically acceptable compound to be administered to an individual, administration is preferably in a prophylactically effective amount or a therapeutically effective amount (depending on the particular situation) sufficient to produce benefit in the individual. The actual amount administered, and the rate and time course of administration, will depend on the nature and severity of the condition being treated. For injection, the pharmaceutical composition in accordance with the present invention may be contained, for example, in a pre-filled syringe.
Фармацевтическая композиция может вводиться перорально в любой перорально приемлемой дозированной форме, включая, но, не ограничиваясь только ими, капсулы, таблетки, водные суспензии или растворы. В случае таблеток для перорального применения, носители, которые обычно используются, включают лактозу и кукурузный крахмал. Также типично добавляют смазывающие вещества, такие как стеарат магния. Для перорального введения в форме капсулы, пригодный разбавители включают лактозу и безводный кукурузный крахмал. Когда для перорального введения необходимы водные суспензии, то транспортную карго-конъюгированную молекулу комбинируют с эмульгирующими и суспендирующими средствами. При необходимости, также можно добавлять определенные подсластители, ароматизаторы или красители.The pharmaceutical composition may be administered orally in any orally acceptable dosage form, including, but not limited to, capsules, tablets, aqueous suspensions or solutions. In the case of oral tablets, carriers commonly used include lactose and corn starch. Lubricants such as magnesium stearate are also typically added. For oral administration in capsule form, suitable diluents include lactose and anhydrous corn starch. When aqueous suspensions are required for oral administration, the transport cargo-conjugated molecule is combined with emulsifying and suspending agents. If necessary, certain sweeteners, flavors or colors may also be added.
Фармацевтическая композиция также могут вводить местно, в особенности, если цель лечения включает области или органы, достижимые местным введением, например, включая заболевания кожи или любой другой достижимой эпителиальной ткани. Подходящие местные препараты легко приготавливают для каждых из этих областей или органов. Для местных применений, фармацевтическая композиция может быть приготовлена в виде подходящей мази, содержащей фармацевтическую композицию, в особенности ее компоненты, как определено выше, суспендированые или растворенные в одном или нескольких носителях. Носители для местного введения включают, но, не ограничиваясь только ими, минеральное масло, жидкий вазелин, белый вазелин, пропиленгликоль, полиоксиэтилен, полиоксипропиленовое соединение, эмульгирующий воск и воск. Альтернативно, фармацевтическая композиция может быть приготовлена в подходящем лосьоне или креме. Подходящие носители включают, но, не ограничиваясь только ими, минеральное масло, сорбитан моностеарат, полисорбат 60, воск цетиловых эфиров, цетеариловый спирт, 2-октилдодеканол, бензиловый спирт и вода.The pharmaceutical composition may also be administered topically, particularly if the target of treatment involves areas or organs that can be reached by local administration, for example, including diseases of the skin or any other epithelial tissue that can be reached. Suitable topical preparations are readily prepared for each of these areas or organs. For topical applications, the pharmaceutical composition may be formulated as a suitable ointment containing the pharmaceutical composition, particularly its components as defined above, suspended or dissolved in one or more carriers. Carriers for topical administration include, but are not limited to, mineral oil, liquid petrolatum, white petrolatum, propylene glycol, polyoxyethylene, polyoxypropylene compound, emulsifying wax and wax. Alternatively, the pharmaceutical composition may be formulated in a suitable lotion or cream. Suitable carriers include, but are not limited to, mineral oil, sorbitan monostearate, polysorbate 60, wax cetyl esters, cetearyl alcohol, 2-octyldodecanol, benzyl alcohol and water.
Дозовое лечение может представлять собой схему с единичными дозами или схему с множественными дозами. В предпочтительном варианте осуществления изобретения фармацевтическая композиция представляет собой продукт в виде одной дозы. Предпочтительно, количество антитела в такой фармацевтической композиции не превышает 500 мг.Dosage treatment may be a single dose regimen or a multiple dose regimen. In a preferred embodiment of the invention, the pharmaceutical composition is a single dose product. Preferably, the amount of antibody in such a pharmaceutical composition does not exceed 500 mg.
Например, фармацевтическая композиция может вводиться каждый день, например, один или несколько раз в сутки, например, один, два, три или четыре раза в сутки, предпочтительно один или два раза в сутки, более предпочтительно один раз в сутки, в течение 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или 21 или больше дней, например, каждый день в течение 1, 2, 3, 4, 5, 6 месяцев. Предпочтительно, фармацевтическая композиция может вводиться каждую неделю, например, один илиFor example, the pharmaceutical composition may be administered every day, for example, once or more times a day, for example, once, twice, three or four times a day, preferably once or twice a day, more preferably once a day, for 1. 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 or 21 or more days, for example, every day for 1 , 2, 3, 4, 5, 6 months. Preferably, the pharmaceutical composition may be administered every week, for example once or
- 42 046175 два раза в неделю, в течение 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или 21 или больше недель, например, каждую неделю в течение 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 месяцев или каждую неделю в течение 2, 3, 4 или 5 лет. Кроме того, фармацевтическая композиция предпочтительно может вводиться каждый месяц, например, один раз в месяц или, более предпочтительно, раз в два месяца в течение 1, 2, 3, 4 или 5 или больше лет. Также является предпочтительным, что введение продолжается в течение периода жизни. Дополнительно, также предусмотрено только одно однократное введение, в особенности в отношении определенных показаний, например, для предотвращения инфекции, вызванной вирусом Зика, в случае случайного воздействия, например, у неимунизированных субъектов. Тем не менее, наиболее предпочтительная схема лечения представляет собой постконтактную профилактику (PEP), где одну или несколько однократных доз вводят максимально быстро, насколько это возможно, после инфицирования вирусом Зика. Также предпочтительной является профилактическая схема, где одну или несколько однократных доз вводят для предотвращения инфицирования вирусом Зика (то есть перед инфицированием вирусом Зика, в особенности у субъектов, не иммунизированных к вирусу Зика).- 42 046175 twice a week, for 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 or 21 or more weeks, such as every week for 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 or 12 months or every week for 2, 3, 4 or 5 years. In addition, the pharmaceutical composition may preferably be administered every month, for example once a month or more preferably every two months for 1, 2, 3, 4 or 5 or more years. It is also preferred that administration continues throughout the life period. Additionally, only one single administration is also provided, especially for certain indications, for example, to prevent Zika virus infection in case of accidental exposure, for example, in non-immunized subjects. However, the most preferred treatment regimen is post-exposure prophylaxis (PEP), where one or more single doses are administered as quickly as possible after Zika virus infection. Also preferred is a prophylactic regimen where one or more single doses are administered to prevent Zika virus infection (ie, prior to Zika virus infection, particularly in subjects not immunized to Zika virus).
В особенности, является предпочтительным, что для однократной дозы, например, ежедневной, еженедельной или ежемесячной дозы, предпочтительно для еженедельной дозы, количество антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, в фармацевтической композиции может не превышать 1 г, предпочтительно не превышает 500 мг, более предпочтительно не превышает 200 мг, еще более предпочтительно не превышает 100 мг, и особенно предпочтительно не превышает 50 мг.In particular, it is preferred that for a single dose, for example a daily, weekly or monthly dose, preferably for a weekly dose, the amount of antibody or antigen binding fragment thereof in the pharmaceutical composition may not exceed 1 g, preferably does not exceed 500 mg, more preferably not exceeds 200 mg, even more preferably does not exceed 100 mg, and especially preferably does not exceed 50 mg.
Фармацевтические композиции типично включают эффективное количество одного или нескольких антител, то есть количество, которого достаточно для лечения, облегчения, ослабления или предотвращения желательного заболевания или состояния, или для проявления обнаруживаемого терапевтического эффекта. Терапевтические эффекты также включают уменьшение или ослабление патогенной силы или физических симптомов. Точное эффективное количество для любого конкретного субъекта будет зависеть от их размера, веса и состояния здоровья, природы и распространения состояния, и лекарственных средств или комбинации лекарственных средств, выбранных для введения. Эффективное количество для данной ситуации определяется обычными экспериментами и находится в компетенции лечащего врача. Эффективная доза обычно будет составлять от приблизительно 0,005 до приблизительно 100 мг/кг, предпочтительно от приблизительно 0,0075 до приблизительно 50 мг/кг, более предпочтительно от приблизительно 0,01 - приблизительно 10 мг/кг, и еще более предпочтительно от приблизительно 0,02 до приблизительно 5 мг/кг, антитела настоящего изобретения (например, количество антитела в фармацевтической композиции) по отношению к весу тела (например, в кг) индивидуума, которому ее вводят.Pharmaceutical compositions typically include an effective amount of one or more antibodies, that is, an amount sufficient to treat, ameliorate, ameliorate, or prevent a desired disease or condition, or to produce a detectable therapeutic effect. Therapeutic effects also include reduction or attenuation of pathogenic strength or physical symptoms. The exact effective amount for any particular subject will depend on their size, weight and health status, the nature and extent of the condition, and the drugs or combination of drugs chosen for administration. The effective amount for a given situation is determined by routine experimentation and is within the discretion of the attending physician. An effective dose will generally be from about 0.005 to about 100 mg/kg, preferably from about 0.0075 to about 50 mg/kg, more preferably from about 0.01 to about 10 mg/kg, and even more preferably from about 0. 02 to about 5 mg/kg, of the antibody of the present invention (eg, the amount of antibody in the pharmaceutical composition) relative to the body weight (eg, in kg) of the individual to whom it is administered.
Кроме того, фармацевтическая композиция также может содержать дополнительный активный компонент, который может представлять собой дополнительное антитело или компонент, который не представляет собой антитело. Дополнительный активный компонент предпочтительно представляет собой ингибитор контрольных точек. Также является предпочтительным, что ZIKV нейтрализирующее антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно комбинировать с ZIKV №1-связывающим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом в качестве дополнительного активного компонента (соагента). Таким образом, может блокироваться патогенная роль NS1, дополнительно к нейтрализации ZIKV. Фармацевтическая композиция может содержать один или несколько дополнительных активных компонентов, например, как описано ниже, в качестве коагентов в контексте комбинированной терапии.In addition, the pharmaceutical composition may also contain an additional active component, which may be an additional antibody or a component that is not an antibody. The additional active component is preferably a checkpoint inhibitor. It is also preferred that the ZIKV neutralizing antibody or antigen binding fragment thereof can be combined with the ZIKV No. 1 binding antibody or antigen binding fragment thereof as an additional active component (coagent). Thus, the pathogenic role of NS1 may be blocked, in addition to neutralizing ZIKV. The pharmaceutical composition may contain one or more additional active ingredients, for example as described below, as coagents in the context of combination therapy.
Антитело или антигенсвязывающий фрагмент может присутствовать либо в той же самой фармацевтической композиции в качестве дополнительного активного компонента или, предпочтительно, антитело или антигенсвязывающий фрагмент составляют первую фармацевтическую композицию, а дополнительный активный компонент составляет вторую фармацевтическую композицию, отличающуюся от первой фармацевтической композиции. Таким образом, если предусматривается больше одного дополнительного активного компонента, то каждый дополнительный активный компонент и антитело или антигенсвязывающий фрагмент, предпочтительно, составляют другую фармацевтическую композицию. Такие разные фармацевтические композиции могут вводиться либо комбинированно/одновременно или в разные периоды времени или в разные расположения (например, разделенные части тела).The antibody or antigen binding fragment may be present either in the same pharmaceutical composition as an additional active component or, preferably, the antibody or antigen binding fragment constitutes a first pharmaceutical composition and the additional active component constitutes a second pharmaceutical composition different from the first pharmaceutical composition. Thus, if more than one additional active ingredient is provided, each additional active ingredient and antibody or antigen binding fragment preferably constitutes a different pharmaceutical composition. Such different pharmaceutical compositions may be administered either in combination/simultaneously or at different periods of time or at different locations (eg, separate body parts).
Предпочтительно, антитело или антигенсвязывающий фрагмент и дополнительный активный компонент обеспечивают аддитивный терапевтический эффект или, предпочтительно, синергический терапевтический эффект. Термин синергия используется для описания комбинированного эффекта двух или более активных агентов, который больше, чем сумма индивидуальных эффектов каждого соответствующего активного агента. Таким образом, если комбинированный эффект двух или более агентов приводит к синергетическому ингибированию активности или процесса, то это обозначает, что ингибирование активности или процесса больше, чем сумма ингибирующих эффектов каждого соответствующего активного агента. Термин синергетический терапевтический эффект относится к терапевтическому эффекту, наблюдаемому при комбинировании двух или более терапий, где терапевтический эффект (как измеряется с помощью любого из различных параметров) больше, чем сумма индивидуальных терапевтических эффектов, наблюдаемых при соответствующих индивидуальных терапиях.Preferably, the antibody or antigen binding fragment and the additional active component provide an additive therapeutic effect or, preferably, a synergistic therapeutic effect. The term synergy is used to describe the combined effect of two or more active agents that is greater than the sum of the individual effects of each respective active agent. Thus, if the combined effect of two or more agents results in synergistic inhibition of an activity or process, then this means that the inhibition of the activity or process is greater than the sum of the inhibitory effects of each respective active agent. The term synergistic therapeutic effect refers to the therapeutic effect observed when two or more therapies are combined, where the therapeutic effect (as measured by any of the various parameters) is greater than the sum of the individual therapeutic effects observed in the respective individual therapies.
Фармацевтическая композиция может содержать антитело в соответствии с gZKA190, gZKA64, gZKA230, gZKA185, gZKA78 или его антигенсвязывающий фрагмент и фармацевтически приемлемыйThe pharmaceutical composition may contain an antibody according to gZKA190, gZKA64, gZKA230, gZKA185, gZKA78 or an antigen binding fragment thereof and a pharmaceutically acceptable
- 43 046175 носитель.- 43 046175 carrier.
Композиция может включать антитела, где антитела могут составлять по меньшей мере 50% по весу (например, 60%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или больше) общего белка в композиции. В такой композиции, антитела предпочтительно находятся в очищенной форме.The composition may include antibodies, where antibodies may comprise at least 50% by weight (e.g., 60%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99 % or more) of the total protein in the composition. In such a composition, the antibodies are preferably in purified form.
Способ приготовления фармацевтической композиции может включать этапы: (I) приготовления антитела; и (II) смешивания очищенного антитела с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми носителями.A method for preparing a pharmaceutical composition may include the steps of: (I) preparing an antibody; and (ii) mixing the purified antibody with one or more pharmaceutically acceptable carriers.
Способ получения фармацевтической композиции также может включать стадии: смешивания антитела с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми носителями, где антитело представляет собой моноклональное антитело, которое получают из трансформированной В-клетки или культивируемой плазматической клетки согласно изобретению.The method of preparing a pharmaceutical composition may also include the steps of: mixing the antibody with one or more pharmaceutically acceptable carriers, where the antibody is a monoclonal antibody that is obtained from a transformed B cell or cultured plasma cell according to the invention.
В качестве альтернативы доставки антител или В-клеток для терапевтических целей, представляется возможным доставлять нуклеиновую кислоту (типично ДНК), которая кодирует представляющее интерес моноклональное антитело (или его активный фрагмент), имеющее происхождение из В-клетки или культивируемых плазматических клеток субъекту, таким образом, что нуклеиновая кислота может экспрессироваться у субъектов in situ, обеспечивая желательный терапевтический эффект. Подходящая генная терапия и векторы для доставки нуклеиновых кислот известны в данной области техники.As an alternative to delivering antibodies or B cells for therapeutic purposes, it is possible to deliver a nucleic acid (typically DNA) that encodes a monoclonal antibody of interest (or an active fragment thereof) originating from a B cell or cultured plasma cell to a subject, thereby that the nucleic acid can be expressed in situ in subjects to provide the desired therapeutic effect. Suitable gene therapy and vectors for delivering nucleic acids are known in the art.
Фармацевтические композиции могут включать антимикробное средство, в особенности, если упакованы в формат с многократными дозами. Они могут содержать детергент, например, Tween (полисорбат), такой как Tween 80. Детергенты обычно присутствуют в низких количествах, например, меньше, чем 0,01%. Композиции также могут включать соли натрия (например, хлорид натрия) для придания тоничности. Например, типичной является концентрация 10±2 мг/мл NaCl.Pharmaceutical compositions may include an antimicrobial agent, particularly if packaged in a multiple dose format. They may contain a detergent, for example, Tween (polysorbate), such as Tween 80. Detergents are usually present in low amounts, for example less than 0.01%. The compositions may also include sodium salts (eg, sodium chloride) to impart tonicity. For example, a concentration of 10 ± 2 mg/ml NaCl is typical.
Кроме того, фармацевтические композиции могут содержать сахарный спирт (например, маннит) или дисахарид (например, сахарозу или трегалозу) например, в количестве около 15-30 мг/мл (например, 25 мг/мл), в особенности, если они будут лиофилизированы или если они включают материал, который восстанавливают из лиофилизированного материала. Значение рН композиции для лиофилизации можно доводить в диапазоне от 5 до 8, или в диапазоне от 5,5 до 7, или приблизительно 6,1 перед лиофилизацией.In addition, the pharmaceutical compositions may contain a sugar alcohol (eg, mannitol) or disaccharide (eg, sucrose or trehalose), for example, in an amount of about 15-30 mg/ml (eg, 25 mg/ml), especially if they are lyophilized or if they include material that is reconstituted from lyophilized material. The pH of the lyophilization composition can be adjusted to a range of 5 to 8, or a range of 5.5 to 7, or approximately 6.1 prior to lyophilization.
Композиции также могут содержать один или несколько иммунорегулирующих агентов в частности, один или несколько иммунорегулирующих агентов включает(ют) адъювант.The compositions may also contain one or more immunoregulatory agents, in particular, the one or more immunoregulatory agents include(s) an adjuvant.
Медицинские лечения, наборы и применения.Medical treatments, kits and applications.
Медицинские лечения.Medical treatments.
Еще одним объектом настоящего изобретения является способ предотвращения или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика, у субъекта, предусматривающий введение ему антитела или его антигенсвязывающего фрагмента в соответствии с настоящим изобретением, нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением, вектора в соответствии с настоящим изобретением, клетки или фармацевтической композиции в соответствии с настоящим изобретением.Another aspect of the present invention is a method of preventing or treating an infection caused by the Zika virus in a subject, comprising administering to the subject an antibody or antigen binding fragment thereof according to the present invention, a nucleic acid according to the present invention, a vector according to the present invention, a cell or pharmaceutical composition in accordance with the present invention.
А также изобретение относится к такому объекту, как применение нуклеиновой кислоты согласно изобретению, вектора согласно изобретению, клетки согласно изобретению и фармацевтической композиции согласно изобретению для предотвращения или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика.The invention also relates to the use of a nucleic acid according to the invention, a vector according to the invention, a cell according to the invention and a pharmaceutical composition according to the invention for the prevention or treatment of infection caused by the Zika virus.
Кроме того, объектом данного является применение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента согласно изобретению и нуклеиновой кислоты согласно изобретению для диагностики инфекции, вызванной вирусом Зика.It is further an object of this invention to use an antibody or an antigen-binding fragment thereof according to the invention and a nucleic acid according to the invention for diagnosing an infection caused by the Zika virus.
Способы диагностики могут включать контактирование антитела или фрагмента антитела с образцом. Такие образцы могут быть выделены из субъекта, например, выделенный образец ткани, взятый из, например, носовых ходов, полостей придаточных пазух носа, слюнных желез, легких, печени, поджелудочной железы, почек, уха, глаза, плаценты, пищеварительного тракта, сердца, яичников, гипофиза, надпочечников, щитовидной железы, головного мозга, кожи или крови, предпочтительно плазмы или сыворотки. Способы диагностики также могут включать обнаружение комплекса антиген/антитело, в особенности после контактирования антитела или фрагмента антитела с образцом. Такую стадию обнаружения типично осуществляют в лаборатории, то есть без какого-либо контактирования с организмом человека или животного. Примеры способов обнаружения хорошо известны квалифицированным специалистам в данной области техники и включают, например, ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ).Diagnostic methods may involve contacting an antibody or antibody fragment with a sample. Such samples may be isolated from a subject, for example, an isolated tissue sample taken from, for example, the nasal passages, sinus cavities, salivary glands, lungs, liver, pancreas, kidneys, ear, eye, placenta, digestive tract, heart, ovaries, pituitary gland, adrenal glands, thyroid gland, brain, skin or blood, preferably plasma or serum. Diagnostic methods may also include detection of an antigen/antibody complex, particularly after contact of the antibody or antibody fragment with a sample. This detection step is typically carried out in a laboratory, that is, without any contact with the human or animal body. Examples of detection methods are well known to those skilled in the art and include, for example, ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay).
Предотвращение инфекции, вызванной вирусом Зика, относится в особенности к профилактическим установкам, где у субъекта не была диагностирована инфекция, вызванная вирусом Зика, (либо не осуществлялась диагностика или результаты диагностики были отрицательными) и/или у субъекта не проявляются симптомы инфекции, вызванной вирусом Зика. Таким образом, предотвращение инфекции, вызванной вирусом Зика, включает постконтактную профилактику (PEP), то есть превентивное лечения после возможной инфекция, вызванная вирусом Зика, например, после укуса комара в области, пораженной вирусом Зика. Предпочтительно предотвращение инфекции, вызванной вирусом Зика, для субъектов с высоким риском, таких как беременные женщины.Prevention of Zika virus infection refers specifically to preventive settings where the subject has not been diagnosed with Zika virus infection (either not diagnosed or tested negative) and/or the subject is not exhibiting symptoms of Zika virus infection . Thus, preventing Zika virus infection involves post-exposure prophylaxis (PEP), which is preventive treatment after a possible Zika virus infection, such as a mosquito bite in an area affected by the Zika virus. Prevention of Zika virus infection is preferable for high-risk subjects such as pregnant women.
В отличие от этого, при терапевтических установках, субъект типично инфицирован вирусом Зика, у него диагностирована инфекция, вызванная вирусом Зика, и/или проявляются симптомы инфекции,In contrast, in a therapeutic setting, the subject is typically infected with Zika virus, is diagnosed with Zika virus infection, and/or exhibits symptoms of infection,
- 44 046175 вызванной вирусом Зика. Несомненно, термины лечение и терапия/терапевтический инфекции ZIKV включают (полное) лечение, а также ослабление инфекции ZIKV.- 44 046175 caused by the Zika virus. Of course, the terms treatment and therapy/therapeutic ZIKV infections include (complete) treatment as well as mitigation of ZIKV infection.
Предпочтительные способы диагностики инфекции, вызванной вирусом Зика, представляют собой способы диагностики, такие как например, предполагающие использование нейтрализирующего антитела или его антигенсвязывающего фрагмента и/или ZIKV №1-связывающего антитела или его антигенсвязывающего фрагмента.Preferred methods for diagnosing Zika virus infection are diagnostic methods such as, for example, those involving the use of a neutralizing antibody or antigen binding fragment thereof and/or a ZIKV #1 binding antibody or antigen binding fragment thereof.
Таким образом, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением, нуклеиновую кислоту в соответствии с настоящим изобретением, вектор в соответствии с настоящим изобретением, клетку в соответствии с настоящим изобретением или фармацевтическую композицию в соответствии с настоящим изобретением предпочтительно применяют для лечения инфекции, вызванной вирусом Зика у субъектов у субъектов, проявляющих симптомы инфекции Зика.Thus, an antibody or an antigen binding fragment thereof according to the present invention, a nucleic acid according to the present invention, a vector according to the present invention, a cell according to the present invention or a pharmaceutical composition according to the present invention is preferably used for treating an infection, caused by the Zika virus in subjects in subjects exhibiting symptoms of Zika infection.
Также предпочтительно, что антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением, нуклеиновую кислоту в соответствии с настоящим изобретением, вектор в соответствии с настоящим изобретением, клетку в соответствии с настоящим изобретением или фармацевтическую композицию в соответствии с настоящим изобретением применяют для предотвращения и/или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика у субъектов без симптомов. У этих субъектов может быть диагностирована или не диагностирована инфекция, вызванная вирусом Зика.It is also preferred that an antibody or antigen binding fragment thereof according to the present invention, a nucleic acid according to the present invention, a vector according to the present invention, a cell according to the present invention or a pharmaceutical composition according to the present invention is used to prevent and/or treatment of Zika virus infection in asymptomatic subjects. These subjects may or may not have been diagnosed with Zika virus infection.
Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением, нуклеиновую кислоту в соответствии с настоящим изобретением, вектор в соответствии с настоящим изобретением, клетку в соответствии с настоящим изобретением или фармацевтическую композицию в соответствии с настоящим изобретением применяют для предотвращения и/или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика у беременных женщин, в особенности для предотвращения внутриутробной инфекции. Например, это может быть осуществлено сходным образом, как для предотвращения внутриутробной инфекции HCMV, как описано в Nigro G, Adler SP, La Torre R, Best AM, Congenital Cytomegalovirus Collaborating Group: Passive immunization during pregnancy for congenital cytomegalovirus infection; N Engl J Med 2005, 353:1350-1362.Preferably, an antibody or antigen binding fragment thereof according to the present invention, a nucleic acid according to the present invention, a vector according to the present invention, a cell according to the present invention or a pharmaceutical composition according to the present invention is used to prevent and/or treat an infection caused by the Zika virus in pregnant women, especially to prevent intrauterine infection. For example, this could be done in a similar manner to preventing intrauterine HCMV infection, as described in Nigro G, Adler SP, La Torre R, Best AM, Congenital Cytomegalovirus Collaborating Group: Passive immunization during pregnancy for congenital cytomegalovirus infection; N Engl J Med 2005, 353:1350-1362.
He желая ограничиваться какой-либо теорией, полагают, что антитело, или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением может проходить через плаценту путем взаимодействия с FcRn при введении беременной женщине, например, путем (в/в) инъекции или другим путем введения. Важно то, что взаимодействие LALA вариантов антител с FcRn не нарушается. Полагают, что FcRn уже экспрессируются в первом триместре в плаценте.Without wishing to be limited by theory, it is believed that the antibody, or antigen binding fragment thereof, in accordance with the present invention can cross the placenta by interacting with FcRn when administered to a pregnant woman, for example, by (iv) injection or other route of administration. It is important that the interaction of LALA antibody variants with FcRn is not disrupted. It is believed that FcRn is already expressed in the first trimester in the placenta.
Альтернативно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент также можно вводить в экстраамниотическое пространство.Alternatively, the antibody or antigen-binding fragment thereof can also be administered into the extra-amniotic space.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, нуклеиновую кислоту, вектор, клетку или фармацевтическую композицию можно применять для предотвращения или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика, путем введения вплоть до семи дней после (возможного) инфицирования вирусом Зика, предпочтительно вплоть до пяти дней после (возможного) инфицирования вирусом Зика, более предпочтительно вплоть до четырех дней после (возможного) инфицирования вирусом Зика, еще более предпочтительно вплоть до трех дней после (возможного) инфицирования вирусом Зика, и наиболее предпочтительно вплоть до одного дня после (возможного) инфицирования вирусом Зика. Такая схема лечения может быть пригодной в терапевтических установках, а также в профилактических установках, в особенности для постконтактной профилактики (PEP).The antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition thereof can be used to prevent or treat Zika virus infection by administration up to seven days after (possible) Zika virus infection, preferably up to five days after (possible) Zika virus infection. infection with Zika virus, more preferably up to four days after (possible) infection with Zika virus, even more preferably up to three days after (possible) infection with Zika virus, and most preferably up to one day after (possible) infection with Zika virus. Such a treatment regimen may be suitable in therapeutic settings as well as in prophylactic settings, particularly for post-exposure prophylaxis (PEP).
При PEP типично первое введение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции следует осуществлять максимально быстро, насколько это возможно, после возможного инфицирования ZIKV, например, после укуса комара на территории, пораженной ZIKV. Таким образом, при PEP первое введение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции типично можно осуществлять вплоть в течение одного или нескольких дней после (возможного) инфицирования ZIKV, как описано выше.In PEP, typically the first administration of an antibody or antigen-binding fragment, nucleic acid, vector, cell, or pharmaceutical composition should be administered as quickly as possible after a possible ZIKV infection, for example, after a mosquito bite in a ZIKV-affected area. Thus, in PEP, the first administration of an antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition thereof can typically be administered up to one or more days after (possible) ZIKV infection, as described above.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, нуклеиновую кислоту, вектор, клетку или фармацевтическую композицию для предотвращения и/или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика, можно вводить вплоть до трех месяцев перед (возможной) инфекцией, вызванной вирусом Зика, предпочтительно вплоть до одного месяца перед (возможной) инфекцией, вызванной вирусом Зика, более предпочтительно вплоть до двух недель перед (возможной) инфекцией, вызванной вирусом Зика, еще более предпочтительно вплоть до одной недели перед (возможной) инфекцией, вызванной вирусом Зика, и наиболее предпочтительно вплоть до одного дня перед (возможной) инфекцией, вызванной вирусом Зика. Такая схема лечения относится в особенности к профилактическим установкам.Also, an antibody or antigen-binding fragment, nucleic acid, vector, cell, or pharmaceutical composition thereof for preventing and/or treating Zika virus infection may be administered up to three months before (possible) Zika virus infection, preferably up to one month before (possible) Zika virus infection, more preferably up to two weeks before (possible) Zika virus infection, even more preferably up to one week before (possible) Zika virus infection, and most preferably up to one day before (possible) Zika virus infection. This treatment regimen applies especially to preventive settings.
В целом - и в особенности при PEP - после первого введения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновую кислоту, вектора, клетки или фармацевтической композиции, затем можно осуществлять одно или несколько последующих введений, предпочтительно однократной дозы в сутки или через день в течение 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1, 15, 16, 17, 18, 19, 20, или 21 дней. Также после первого введения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновой кислоты, векIn general - and especially with PEP - after the first administration of an antibody or antigen-binding fragment thereof, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition, one or more subsequent administrations can then be made, preferably a single dose per day or every other day for 1, 2 , 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1, 15, 16, 17, 18, 19, 20, or 21 days. Also, after the first administration of an antibody or an antigen-binding fragment, nucleic acid,
- 45 046175 тора, клетки или фармацевтической композиции, затем можно осуществлять одно или несколько последующих введений, предпочтительно однократной дозы один или два раза в неделю в течение 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или 21 недели. После первого введения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции, затем можно осуществлять одно или несколько последующих введений, предпочтительно однократной дозы каждые 2 или 4 недели в течение 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или 21 недель. Также после первого введения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции, затем можно осуществлять одно или несколько последующих введений, предпочтительно однократной дозы каждые два или четыре месяца в течение 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1, 15, 16, 17, 18, 19, 20, или 21 месяца. Также после первого введения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции, затем можно осуществлять одно или несколько последующих введений, предпочтительно однократной дозы один раз или два раза в год 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, или 10 лет.- 45 046175 torus, cell or pharmaceutical composition, then one or more subsequent administrations can be made, preferably a single dose once or twice a week for 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1, 15, 16, 17, 18, 19, 20 or 21 weeks. After the first administration of an antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition, one or more subsequent administrations can then be made, preferably a single dose every 2 or 4 weeks for 1, 2, 3, 4, 5, 6. 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1, 15, 16, 17, 18, 19, 20 or 21 weeks. Also, after the first administration of an antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition, one or more subsequent administrations may then be made, preferably a single dose every two or four months for 1, 2, 3, 4, 5, 6 , 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1, 15, 16, 17, 18, 19, 20, or 21 months. Also, after the first administration of an antibody or antigen-binding nucleic acid fragment thereof, vector, cell or pharmaceutical composition, one or more subsequent administrations may then be made, preferably a single dose once or twice a year 1, 2, 3, 4, 5, 6. 7, 8, 9, or 10 years.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно изобретению, нуклеиновую кислоту согласно изобретению, вектор согласно изобретению, клетку согласно изобретению или фармацевтическую композицию согласно изобретению вводят вплоть до семи дней после (возможного) инфицирования вирусом Зика., Предпочтительно антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением, нуклеиновую кислоту в соответствии с настоящим изобретением, вектор в соответствии с настоящим изобретением, клетку в соответствии с настоящим изобретением или фармацевтическую композицию в соответствии с настоящим изобретением вводят в (единичной) дозе от 0,005 до 100 мг/кг веса тела.In a preferred embodiment of the invention, an antibody or antigen-binding fragment thereof of the invention, a nucleic acid of the invention, a vector of the invention, a cell of the invention or a pharmaceutical composition of the invention is administered up to seven days after (possible) infection with the Zika virus. Preferably, the antibody or antigen-binding fragment thereof , in accordance with the present invention, a nucleic acid in accordance with the present invention, a vector in accordance with the present invention, a cell in accordance with the present invention or a pharmaceutical composition in accordance with the present invention is administered in a (unit) dose of 0.005 to 100 mg/kg body weight bodies.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, нуклеиновую кислоту, вектор, клетку или фармацевтическую композицию можно вводить любым из возможных различных путей, таким как пероральный, внутривенный, внутримышечный, внутриартериальный, костномозговой, внутрибрюшинный, интратекальный, внутрижелудочковый, трансдермальный, транскожный, местный, подкожный, интраназальный, энтеральный, сублингвальный, интравагинальный или ректальный пути. Предпочтительным является внутривенное введение, или подкожное введение или внутримышечное введение и более предпочтительным является внутривенное введение или подкожное введение.The antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition can be administered by any of the various possible routes, such as oral, intravenous, intramuscular, intraarterial, bone marrow, intraperitoneal, intrathecal, intraventricular, transdermal, transdermal, topical, subcutaneous, intranasal , enteral, sublingual, intravaginal or rectal routes. Preferred is intravenous administration or subcutaneous administration or intramuscular administration, and more preferable is intravenous administration or subcutaneous administration.
Беременным женщинам антитело или его антигенсвязывающий фрагмент также можно вводить интра- или экстра-амниотически, например, путем инъекции.In pregnant women, the antibody or antigen-binding fragment thereof can also be administered intra- or extra-amniotically, for example by injection.
Комбинированная терапия.Combination therapy.
Введение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции в способах и применениях можно осуществлять отдельно или в комбинации с коагентом (также обозначаемым как дополнительный активный компонент в настоящей заявке), который особенно пригоден для предотвращения и/или лечения инфекции ZIKV.Administration of an antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition in the methods and uses can be performed alone or in combination with a coagent (also referred to as an additional active component in this application) that is particularly useful for preventing and/or treating infection ZIKV.
Антитело или его Антигенсвязывающий фрагмент, нуклеиновую кислоту, вектор, клетку или фармацевтическую композицию, можно вводить субъекту перед, одновременно или последовательно с другими терапевтическими схемами или коагентами, пригодными для лечения и/или предотвращения инфекции ZIKV. Указанное антитело, нуклеиновую кислоту, вектор, клетку или фармацевтическую композицию, которую вводят одновременно с указанными коагентами, можно вводить в одной и той же или различных композициях и одним и тем же или различными путями введения.The antibody or Antigen-binding fragment, nucleic acid, vector, cell, or pharmaceutical composition thereof may be administered to a subject prior to, concurrently, or sequentially with other therapeutic regimens or coagents useful for treating and/or preventing ZIKV infection. The specified antibody, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition, which is administered simultaneously with the specified coagents, can be administered in the same or different compositions and by the same or different routes of administration.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения коагенты могут представлять собой, например, ингибиторы контрольных точек.In a preferred embodiment of the invention, the coagents may be, for example, checkpoint inhibitors.
Таким образом, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, нуклеиновую кислоту, вектор, клетку или фармацевтическую композицию можно вводить в комбинации с ингибитором контрольных точек для (медицинских) применений как описано в настоящей заявке.Thus, an antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition thereof can be administered in combination with a checkpoint inhibitor for (medical) applications as described herein.
Ингибиторы контрольных точек направлены на блокаду PD-1/PD-L1 и/или CTLA4 и, следовательно, включают αнтu-PD-1 антитела, анти-PD-LT антитела и анти-CTLA4 антитела.Checkpoint inhibitors aim to block PD-1/PD-L1 and/or CTLA4 and therefore include αntu-PD-1 antibodies, anti-PD-LT antibodies and anti-CTLA4 antibodies.
ZIKV нейтрализирующее антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно комбинировать с ZIKV №1-связывающим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, в качестве дополнительного активного компонента (соагента). Таким образом, может блокироваться патогенная роль NS1, дополнительно к нейтрализации ZIKV. Таким образом, ZIKV №1-связывающее антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может служить предпочтительным дополнительным активным компонентом (коагентом).A ZIKV neutralizing antibody or antigen binding fragment thereof can be combined with a ZIKV #1 binding antibody or antigen binding fragment thereof as an additional active component (coagent). Thus, the pathogenic role of NS1 may be blocked, in addition to neutralizing ZIKV. Thus, the ZIKV #1 binding antibody or antigen binding fragment thereof may serve as a preferred additional active component (coagent).
Антитело или антигенсвязывающий фрагмент может присутствовать либо в той же самой фармацевтической композиции в качестве дополнительного активного компонента (коагента) или, предпочтительно, антитело, или антигенсвязывающий фрагмент составляют первую фармацевтическую композицию, а дополнительный активный компонент (коагент) составляет вторую фармацевтическую композицию, отличающуюся от первой фармацевтической композиции. Таким образом, если предусматривается больше одного дополнительного активного компонента (коагента), то каждый дополнительный активный компонент (коагент) и антитело или антигенсвязывающий фрагмент составляют другую фармацевтическую композицию. Такие фармацевтические композиции могут вводиться либо комбинированThe antibody or antigen binding fragment may be present either in the same pharmaceutical composition as an additional active component (coagent) or, preferably, the antibody or antigen binding fragment constitutes the first pharmaceutical composition and the additional active component (coagent) constitutes a second pharmaceutical composition different from the first. pharmaceutical composition. Thus, if more than one additional active ingredient (coagent) is provided, then each additional active ingredient (coagent) and antibody or antigen binding fragment constitutes a different pharmaceutical composition. Such pharmaceutical compositions can be administered either in combination
- 46 046175 но/одновременно или в разное время или в разные локализации (например, разделенные части организма).- 46 046175 but/at the same time or at different times or in different locations (for example, separated parts of the body).
Антитело или антигенсвязывающий фрагмент и дополнительный активный компонент (коагент) могут обеспечивать аддитивный терапевтический эффект или, предпочтительно, синергический терапевтический эффект. Термин синергия используется для описания комбинированного эффекта двух или более активных агентов, который больше, чем сумма индивидуальных эффектов каждого соответствующего активного агента. Таким образом, если комбинированный эффект двух или более агентов приводит к синергетическому ингибированию активности или процесса, то это обозначает, что ингибирование активности или процесса больше, чем сумма ингибирующих эффектов каждого соответствующего активного агента. Термин синергетический терапевтический эффект относится к терапевтическому эффекту, наблюдаемому при комбинировании двух или более терапий, где терапевтический эффект (как измеряется с помощью любого из различных параметров) больше, чем сумма индивидуальных терапевтических эффектов, наблюдаемых при соответствующих индивидуальных терапиях.The antibody or antigen binding fragment and the additional active component (coagent) may provide an additive therapeutic effect or, preferably, a synergistic therapeutic effect. The term synergy is used to describe the combined effect of two or more active agents that is greater than the sum of the individual effects of each respective active agent. Thus, if the combined effect of two or more agents results in synergistic inhibition of an activity or process, then this means that the inhibition of the activity or process is greater than the sum of the inhibitory effects of each respective active agent. The term synergistic therapeutic effect refers to the therapeutic effect observed when two or more therapies are combined, where the therapeutic effect (as measured by any of the various parameters) is greater than the sum of the individual therapeutic effects observed in the respective individual therapies.
Дополнительное применение и наборы.Additional uses and kits.
Как уже отмечалось, еще одним объектом данного изобретения является применение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, в соответствии с настоящим изобретением, нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением, вектора в соответствии с настоящим изобретением, клетки или фармацевтической композиции в соответствии с настоящим изобретением для мониторинга качества вакцины против вируса Зика путем проверки, что антиген указанной вакцины содержит специфический эпитоп в правильной конформации. Вакцина против вируса Зика подлежит проверке, включает ли она ZIKV белок оболочки или любую другую молекулу/комплекс, содержащий или состоящий из (I) домена III E белка ZIKV (EDIII), как описано выше или (II) четвертичного ZIKV эпитопа, как описано выше.As already noted, another aspect of the present invention is the use of an antibody or antigen binding fragment thereof in accordance with the present invention, a nucleic acid in accordance with the present invention, a vector in accordance with the present invention, a cell or a pharmaceutical composition in accordance with the present invention for quality monitoring Zika virus vaccine by verifying that the vaccine antigen contains the specific epitope in the correct conformation. The Zika virus vaccine is subject to testing whether it includes the ZIKV envelope protein or any other molecule/complex containing or consisting of (I) ZIKV E protein domain III (EDIII) as described above or (II) a ZIKV quaternary epitope as described above .
Кроме того, настоящее изобретение относится к применению антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, в соответствии с настоящим изобретением, нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением для диагностики инфекции, вызванной вирусом Зика.In addition, the present invention relates to the use of an antibody or an antigen-binding fragment thereof according to the present invention, a nucleic acid according to the present invention, for diagnosing an infection caused by the Zika virus.
Антитело или его антигенсвязывающей фрагмент, нуклеиновая кислота, вектор, клетка или фармацевтическая композиция могут также использоваться для определения того, является ли выделенный образец крови (например, цельная кровь, сыворотка и/или плазма) инфицирован вирусом Зика.An antibody or antigen-binding fragment, nucleic acid, vector, cell, or pharmaceutical composition thereof may also be used to determine whether an isolated blood sample (eg, whole blood, serum, and/or plasma) is infected with Zika virus.
Как описано выше, способы диагностики могут включать контактирование антитела или фрагмента антитела с образцом. Такие образцы могут быть выделены из субъекта, например, выделенный образец ткани, взятый из, например, носовых ходов, полостей придаточных пазух носа, слюнных желез, легких, печени, поджелудочной железы, почек, уха, глаза, плаценты, пищеварительного тракта, сердца, яичников, гипофиза, надпочечников, щитовидной железы, головного мозга, кожи или крови, предпочтительно плазмы или сыворотки. Способы диагностики также могут включать обнаружение комплекса антиген/антитело, в особенности после контактирования антитела или фрагмента антитела с образцом. Такую стадию обнаружения типично осуществляют в лаборатории, то есть без какого-либо контактирования с организмом человека или животного. Примеры способов обнаружения хорошо известны квалифицированным специалистам в данной области техники и включают, например, ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ).As described above, diagnostic methods may involve contacting an antibody or antibody fragment with a sample. Such samples may be isolated from a subject, for example, an isolated tissue sample taken from, for example, the nasal passages, sinus cavities, salivary glands, lungs, liver, pancreas, kidneys, ear, eye, placenta, digestive tract, heart, ovaries, pituitary gland, adrenal glands, thyroid gland, brain, skin or blood, preferably plasma or serum. Diagnostic methods may also include detection of an antigen/antibody complex, particularly after contact of the antibody or antibody fragment with a sample. This detection step is typically carried out in a laboratory, that is, without any contact with the human or animal body. Examples of detection methods are well known to those skilled in the art and include, for example, ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay).
Последним объектом настоящим изобретением является набор для предотвращения или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика, содержащий по меньшей мере одно антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением, по меньшей мере одну нуклеиновую кислоту в соответствии с настоящим изобретением, по меньшей мере один вектор в соответствии с настоящим изобретением, по меньшей мере одну клетку в соответствии с настоящим изобретением или по меньшей мере одну фармацевтическую композицию в соответствии с настоящим изобретением и инструкцию по их применению. Дополнительно, набор может содержать средства для введения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции, такие как шприц или флакон, листок-вкладыш и/или коагент для введения, как описано выше.A final aspect of the present invention is a kit for preventing or treating infection caused by the Zika virus, comprising at least one antibody or antigen binding fragment thereof in accordance with the present invention, at least one nucleic acid in accordance with the present invention, at least one vector in in accordance with the present invention, at least one cell in accordance with the present invention or at least one pharmaceutical composition in accordance with the present invention and instructions for their use. Additionally, the kit may contain means for administering the antibody or antigen binding fragment thereof, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition, such as a syringe or vial, package insert and/or administration coagent as described above.
Антитела, специфически связывающиеся с NS1 белком вируса Зика.Antibodies that specifically bind to the NS1 protein of the Zika virus.
Описанное в заявке выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV).The isolated antibody or antigen-binding fragment described herein specifically binds to the NS1 protein of the ZIKV virus.
ZIKV NS1 белок (неструктурный белок 1) встречается внутриклеточно, секретируется и связанные на клеточной поверхности и в особенности, секретируемый ZIKV NS1 белок типично обнаруживается в жидкостях организма, таких как сыворотка, слюна, моча и др., субъектов, инфицированных ZIKV. Секретируемые и ассоциированные на клеточной поверхности NS1 являются чрезвычайно иммуногенными и вызывают образование антител. Известно, что NS1 является важным биомаркером для ранней диагностики инфекции ZIKV. Таким образом, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), пригодны, например, для диагностики инфекции ZIKV.ZIKV NS1 protein (non-structural protein 1) is found intracellularly, secreted and associated on the cell surface, and in particular, the secreted ZIKV NS1 protein is typically found in body fluids, such as serum, saliva, urine, etc., of ZIKV-infected subjects. Secreted and associated on the cell surface, NS1 is extremely immunogenic and induces the formation of antibodies. NS1 is known to be an important biomarker for the early diagnosis of ZIKV infection. Thus, an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to the NS1 protein of ZIKV virus is suitable, for example, for diagnosing ZIKV infection.
В целом, связывание может быть оценено с помощью стандартного ELISA, как известно специалисту в данной области техники и как описано выше. Таким образом, относительные аффинности связывания антитела можно определить путем измерения концентрации антитела (EC50), необходимой для достижения 50% максимального связывания при насыщении. Предпочтительно, ЕС50 антитела или его антиIn general, binding can be assessed using a standard ELISA, as known to one skilled in the art and as described above. Thus, the relative binding affinities of an antibody can be determined by measuring the antibody concentration (EC50) required to achieve 50% of maximum binding at saturation. Preferably EC50 antibody or anti
- 47 046175 генсвязывающего фрагмента к NS1 белку ZIKV составляет не более, чем 50 нг/мл, предпочтительно указанная EC50 составляет не более, чем 25 нг/мл, более предпочтительно указанная EC50 составляет не более чем 15 нг/мл, еще более предпочтительно указанная ЕС50 составляет не более, чем 10 нг/мл, и наиболее предпочтительно указанная ЕС50 составляет не более, чем 5 нг/мл, такая как, например, приблизительно 2 или 3 нг/мл.- 47 046175 gene binding fragment to the ZIKV NS1 protein is no more than 50 ng/ml, preferably said EC 50 is no more than 25 ng/ml, more preferably said EC 50 is no more than 15 ng/ml, even more preferably the said EC 50 is no more than 10 ng/ml, and most preferably the said EC 50 is no more than 5 ng/ml, such as, for example, about 2 or 3 ng/ml.
Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), по существу не связывается с NS1 белком вируса денге (DENV). Таким образом, по существу нет связывания обозначает, что для антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нет ЕС50-значения вплоть до 102 нг/мл, предпочтительно вплоть до 103 нг/мл, более предпочтительно вплоть до 5х103 нг/мл, еще более предпочтительно вплоть до 8х103 нг/мл, и наиболее предпочтительно вплоть до 104 нг/мл, что может быть определено в стандартном ELISA к NS1 белку вируса денге (DENV). Другими словами, концентрация антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, необходимая для достижения 50% максимального связывания при насыщении (ЕС50) к NS1 белку вируса денге (DENV) в стандартном ELISA типично составляет больше, чем 102 нг/мл, предпочтительно больше, чем 103 нг/мл, более предпочтительно больше, чем 5х103 нг/мл, еще более предпочтительно больше, чем 8х103 нг/мл, и наиболее предпочтительно больше, чем 104 нг/мл.Preferably, an antibody or antigen binding fragment thereof that specifically binds to the NS1 protein of ZIKV virus (ZIKV) does not substantially bind to the NS1 protein of dengue virus (DENV). Thus, substantially no binding means that for an antibody or antigen-binding fragment thereof, there is no EC 50 value of up to 10 2 ng/ml, preferably up to 10 3 ng/ml, more preferably up to 5x10 3 ng/ml, yet more preferably up to 8x10 3 ng/ml, and most preferably up to 10 4 ng/ml, which can be determined in a standard ELISA for dengue virus (DENV) NS1 protein. In other words, the concentration of antibody or antigen-binding fragment required to achieve 50% maximum binding at saturation (EC 50 ) to dengue virus (DENV) NS1 protein in a standard ELISA is typically greater than 10 2 ng/ml, preferably greater than 10 3 ng/ml, more preferably greater than 5 x 10 3 ng/ml, even more preferably greater than 8 x 10 3 ng/ml, and most preferably greater than 10 4 ng/ml.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), по существу не связываются с NS1 белком вируса желтой лихорадки (YFV), NS1 белком вируса лихорадки Западного Нила (WNV), NS1 белком вируса японского энцефалита (JEV) и/или NS1 белком вируса клещевого энцефалита (TBEV). Таким образом, по существу нет связывания обозначает, что для антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нет ЕС50-значения вплоть до 102 нг/мл, предпочтительно вплоть до 103 нг/мл, более предпочтительно вплоть до 5х103 нг/мл, еще более предпочтительно вплоть до 8х103 нг/мл, и наиболее предпочтительно вплоть до 104 нг/мл, что может быть определено в стандартном ELISA к NS1 белку вируса желтой лихорадки (YFV), NS1 белку вируса лихорадки Западного Нила (WNV), NS1 белку вируса японского энцефалита (JEV) и/или NS1 белку вируса клещевого энцефалита (TBEV). Другими словами, концентрация антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, необходимая для достижения 50% максимального связывания при насыщении (ЕС50) к NS1 белку вируса желтой лихорадки (YFV), NS1 белку вируса лихорадки Западного Нила (WNV), NS1 белку вируса японского энцефалита (JEV) и/или NS1 белку вируса клещевого энцефалита (TBEV) в стандартном ELISA типично составляет больше, чем 102 нг/мл, предпочтительно больше, чем 103 нг/мл, более предпочтительно больше, чем 5х103 нг/мл, еще более предпочтительно больше, чем 8х103 нг/мл, и наиболее предпочтительно больше, чем 104 нг/мл.Also, an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to the NS1 protein of ZIKA virus (ZIKV) does not bind substantially to the NS1 protein of yellow fever virus (YFV), NS1 protein of West Nile virus (WNV), or NS1 protein of Japanese encephalitis virus (JEV). ) and/or NS1 protein of tick-borne encephalitis virus (TBEV). Thus, substantially no binding means that for an antibody or antigen-binding fragment thereof, there is no EC 50 value of up to 10 2 ng/ml, preferably up to 10 3 ng/ml, more preferably up to 5x10 3 ng/ml, yet more preferably up to 8x10 3 ng/ml, and most preferably up to 10 4 ng/ml, which can be determined in a standard ELISA for yellow fever virus (YFV) NS1 protein, West Nile virus (WNV) NS1 protein, NS1 protein Japanese encephalitis virus (JEV) and/or NS1 protein of tick-borne encephalitis virus (TBEV). In other words, the concentration of an antibody or antigen-binding fragment required to achieve 50% of the maximum saturation binding (EC50) to yellow fever virus (YFV) NS1 protein, West Nile virus (WNV) NS1 protein, Japanese encephalitis virus (JEV) NS1 protein and/or NS1 protein of tick-borne encephalitis virus (TBEV) in a standard ELISA is typically greater than 10 2 ng/ml, preferably greater than 10 3 ng/ml, more preferably greater than 5x10 3 ng/ml, even more preferably greater than 8x10 3 ng/ml, and most preferably greater than 10 4 ng/ml.
Предпочтительно, антитело, которое специфически связывается с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), представляет собой антитело человека. Антитело, которое специфически связывается с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), может быть моноклональным антителом, предпочтительно моноклональным антителом человека. Кроме того, антитело которое специфически связывается с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV) может быть рекомбинантным антителом.Preferably, the antibody that specifically binds to the NS1 protein of ZIKV virus is a human antibody. The antibody that specifically binds to the ZIKV NS1 protein may be a monoclonal antibody, preferably a human monoclonal antibody. In addition, an antibody that specifically binds to the NS1 protein of ZIKV virus may be a recombinant antibody.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), могут содержать Fc компонент. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), кроме того, могут содержать СН2 L4A мутацию, СН2 L5A мутацию, или обе.An antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to the ZIKA virus (ZIKV) NS1 protein may contain an Fc component. An antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to the ZIKV NS1 protein may further contain a CH2 L4A mutation, a CH2 L5A mutation, or both.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), могут не содержать Fc компонент. Предпочтительно антитело в соответствии с настоящим изобретением или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), представляют собой очищенное антитело, одноцепочечное антитело, Fab, Fab', F(ab')2, Fv или scFv. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), можно метить например, биотинилировать Fab, Fab' или F(ab')2 фрагменты.An antibody or antigen binding fragment thereof that specifically binds to the NS1 protein of ZIKV virus may not contain an Fc component. Preferably, the antibody of the present invention or antigen binding fragment thereof that specifically binds to the ZIKV NS1 protein is a purified antibody, single chain antibody, Fab, Fab', F(ab') 2 , Fv or scFv. An antibody or antigen binding fragment thereof that specifically binds to the ZIKV NS1 protein can be labeled, for example, by biotinylation of Fab, Fab' or F(ab') 2 fragments.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), могут связываться с антигенной детерминантой S1 и/или с антигенной детерминантой S2 NS1 белка вируса Зика. Изобретатели настоящего изобретения неожиданно обнаружили, что антитела к NS1 ZIKV, связывающиеся с антигенной детерминантой S1 и/или с антигенной детерминантой S2 для NS1 белка ZIKV, перекрестно не реагируют с NS1 белком вируса денге (DENV NS1). Анти- ZIKV NS1 антитела, которые не связываются ни с антигенной детерминантой S1, ни с антигенной детерминантой S2 для NS1 белка ZIKV, в отличие от этого, типично перекрестно реагируют с DENV NS1. Это неожиданное обнаружение указывает на то, что антигенные детерминанты S1 и S2 на ZIKV NS1 можно использовать для различения ZIKV №1-специфических антител от антител, перекрестно реагирующих с DENV NS1.An antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to the ZIKA virus (ZIKV) NS1 protein can bind to the S1 antigenic determinant and/or to the S2 antigenic determinant of the Zika virus NS1 protein. The inventors of the present invention have surprisingly discovered that anti-ZIKV NS1 antibodies that bind to the S1 antigenic determinant and/or the S2 antigenic determinant of the ZIKV NS1 protein do not cross-react with the dengue virus NS1 protein (DENV NS1). Anti-ZIKV NS1 antibodies, which bind to neither the S1 antigenic determinant nor the S2 antigenic determinant of the ZIKV NS1 protein, in contrast, typically cross-react with DENV NS1. This unexpected finding indicates that the S1 and S2 antigenic determinants on ZIKV NS1 can be used to distinguish ZIKV #1-specific antibodies from antibodies that cross-react with DENV NS1.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с NS1 белком вируса ЗИКА (ZIKV), могут связываться с антигенной детерминантой S2 NS1 белка вируса Зика. Антигенная детерминанта S2 является высоко консервативной во множественных линиях ZIKV, но неAn antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to the ZIKA virus (ZIKV) NS1 protein can bind to the S2 antigenic determinant of the Zika virus NS1 protein. The S2 antigenic determinant is highly conserved across multiple ZIKV lineages, but not
- 48 046175 является гомологичной по последовательности и структуре с соответствующим сайтом NS1 других флавивирусов, таким образом, обеспечивая уникальную специфичность для ZIKV.- 48 046175 is homologous in sequence and structure to the corresponding NS1 site of other flaviviruses, thus providing unique specificity for ZIKV.
Антигенные детерминанты S1 и S2 NS1 белка ZIKV были идентифицированы изобретателями настоящего изобретения, как описано в примере 3, фиг. 6. Независимо от того, связывается ли антитело с антигенной детерминантой S1 и/или S2, оно легко может быть идентифицировано специалистом в данной области техники, используя исследования перекрестной конкуренции, например, как описано ниже или в Примере 3, где S1-специфическое антитело с соответствии с gZKA15 (SEQ ID NO: 91-99) и/или S2специфическое антитело с соответствии с gZKA35 (SEQ ID NO: 127-135) можно использовать в качестве второго антитела. В таком конкурентном анализе, наличие любой конкуренции (полной или частичной) с gZKA15 и/или gZKA35 указывает на то, что тестируемое антитело связывается с антигенной детерминантой S1 и/или с антигенной детерминантой S2, соответственно.The S1 and S2 antigenic determinants of the ZIKV NS1 protein were identified by the inventors of the present invention as described in Example 3, FIG. 6. Regardless of whether an antibody binds to the antigenic determinant S1 and/or S2, it can be readily identified by one skilled in the art using cross-competition studies, for example as described below or in Example 3, where the S1-specific antibody with according to gZKA15 (SEQ ID NO: 91-99) and/or S2 specific antibody according to gZKA35 (SEQ ID NO: 127-135) can be used as the second antibody. In such a competition assay, the presence of any competition (total or partial) with gZKA15 and/or gZKA35 indicates that the test antibody binds to the S1 antigenic determinant and/or to the S2 antigenic determinant, respectively.
В целом, для конкурентного анализа можно использовать коммерчески доступные системы для характеристики белок-белкового связывания, такие как, например, Octet® RED96 System, поставляемую ForteBio, в частности, согласно инструкциям производителя.In general, commercially available protein-protein binding characterization systems, such as, for example, the Octet® RED96 System supplied by ForteBio, can be used for competitive analysis, particularly according to the manufacturer's instructions.
В типичном конкурентном анализе, например, используя Octet® RED96 System, поставляемую ForteBio, ZIKV-NS1 белок (например, разведенный до 2,5 мкг/мл в PBS) можно иммобилизировать (например, в течение 7-9 мин) на поверхности APS покрытого сенсорного типа. После этого покрытые биосенсоры можно помещать в лунки, содержащие блокирующий буфер (например, 0,1% BSA в PBS; например, в течение 6 мин) для блокирования свободных сайтов связывания Biosensor. После этого покрытые Biosensors можно инкубировать (например, в течение 8 мин) с антителом/тестируемыми антителами (например, разведенными в блокирующем буфере, например, при 10 мкг/мл). После связывания тестируемых антител (этап 1), Biosensors передвигали на лунки, содержащие вторые антитела, например, gZKA15 и/или gZKA35 (например, в течение 8 мин) (этап 2). Таким образом, можно определить конкуренцию, частичную конкуренцию или отсутствие конкуренции на этапе 2, в зависимости от того, что было обнаружено: отсутствие ассоциации (конкуренция), низкая ассоциация (частичная конкуренция) или (сильная) ассоциация (отсутствие конкуренции).In a typical competition assay, for example, using the Octet® RED96 System supplied by ForteBio, ZIKV-NS1 protein (eg, diluted to 2.5 μg/ml in PBS) can be immobilized (eg, for 7-9 min) on the surface of a coated APS sensory type. The coated biosensors can then be placed into wells containing a blocking buffer (eg, 0.1% BSA in PBS; eg, for 6 min) to block unoccupied Biosensor binding sites. The coated Biosensors can then be incubated (eg for 8 min) with the antibody/test antibodies (eg diluted in blocking buffer, eg at 10 μg/ml). After binding of test antibodies (step 1), Biosensors were moved to wells containing second antibodies, eg gZKA15 and/or gZKA35 (eg, for 8 min) (step 2). Thus, it is possible to determine competition, partial competition, or no competition in step 2, depending on whether no association (competition), low association (partial competition), or (strong) association (no competition) was found.
Как описано выше, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, предпочтительно содержат (по меньшей мере) три участка, определяющих комплементарность (CDR) на тяжелой цепи и (по меньшей мере) три CDR на легкой цепи. В целом, участки, определяющие комплементарность (CDR), представляют собой гипервариабельные участки, присутствующие в вариабельных доменах тяжелой цепи и вариабельных доменах легкой цепи. Типично, CDR тяжелой цепи и связанная легкая цепь антитела совместно образуют антигенный рецептор. Обычно, три CDR (CDR1, CDR2, и CDR3) расположены не последовательно в вариабельном домене. Поскольку антигенные рецепторы типично состоят из двух вариабельных доменов (на двух различных полипептидных цепях, то есть тяжелой и легкой цепи), существует шесть CDR для каждого антигенного рецептора (тяжелая цепь: CDRH1, CDRH2, и CDRH3; легкая цепь: CDRL1, CDRL2, и CDRL3). Единичная молекула антитела обычно имеет два антигенных рецептора и, следовательно, содержит двенадцать CDR. CDR на тяжелой и/или легкой цепи могут быть разделены каркасными участками, в соответствии с чем каркасный участок (FR) представляет собой участок в вариабельном домене, который является менее вариабельным, чем CDR. Например, цепь (или каждая цепь, соответственно) может состоять из четырех каркасных участков, разделенных тремя CDR.As described above, the antibody or antigen binding fragment thereof preferably contains (at least) three complementarity determining regions (CDRs) on the heavy chain and (at least) three CDRs on the light chain. In general, complementarity determining regions (CDRs) are hypervariable regions present in the heavy chain variable domains and the light chain variable domains. Typically, the heavy chain CDR and associated light chain of an antibody together form an antigen receptor. Typically, the three CDRs (CDR1, CDR2, and CDR3) are not sequentially located in the variable domain. Because antigen receptors typically consist of two variable domains (on two different polypeptide chains, i.e., heavy and light chain), there are six CDRs for each antigen receptor (heavy chain: CDRH1, CDRH2, and CDRH3; light chain: CDRL1, CDRL2, and CDRL3). A single antibody molecule typically has two antigen receptors and therefore contains twelve CDRs. The CDRs on the heavy and/or light chain may be separated by framework regions, whereby a framework region (FR) is a region in the variable domain that is less variable than the CDRs. For example, a chain (or each chain, respectively) may consist of four framework regions separated by three CDRs.
Заявителем были определены последовательности тяжелых цепей и легких цепей пяти типичных антител, содержащие три различные CDR на тяжелой цепи и три различные CDR на легкой цепи. Положения аминокислот CDR определены в соответствии с системой нумерации IMGT (IMGT: http://www.imgt.org/; cf. Lefranc, M.-P. и др. (2009) Nucleic Acids Res. 37, D1006-D1012).The Applicant has determined the heavy chain and light chain sequences of five representative antibodies, containing three different CDRs on the heavy chain and three different CDRs on the light chain. CDR amino acid positions are defined according to the IMGT numbering system (IMGT: http://www.imgt.org/; cf. Lefranc, M.-P. et al. (2009) Nucleic Acids Res. 37, D1006-D1012).
В табл. 4 представлены SEQ ID NO для аминокислотных последовательностей CDR тяжелых цепей (CDRH1, CDRH2, и CDRH3) и вариабельного участка тяжелой цепи (обозначаемого как VH) типичных антител в соответствии с настоящим изобретением.In table 4 provides SEQ ID NOs for the amino acid sequences of the heavy chain CDRs (CDRH1, CDRH2, and CDRH3) and the heavy chain variable region (denoted VH) of exemplary antibodies in accordance with the present invention.
- 49 046175- 49 046175
Таблица 4Table 4
В табл. 5 ниже представлены SEQ ID NO для аминокислотных последовательностей CDR легких цепей (CDRL1, CDRL2, и CDRL3) и вариабельного участка легкой цепи (обозначаемого как VL) типичных антител в соответствии с настоящим изобретением.In table 5 below sets forth SEQ ID NOs for the amino acid sequences of the light chain CDRs (CDRL1, CDRL2, and CDRL3) and the light chain variable region (referred to as VL) of exemplary antibodies in accordance with the present invention.
Таблица 5Table 5
Таким образом, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать аминокислотные последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность к по меньшей мере одной из последовательностей CDR, VH последовательности и/или VL последовательности, представленных в табл. 4 и/или в табл. 5.Thus, an antibody or antigen binding fragment thereof may comprise amino acid sequences having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% identity to at least one of the CDR sequences, VH sequences and/or VL sequences presented in table. 4 and/or in table. 5.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности, как указано в любой из SEQ ID NO: 93, 111, 129, 155, 159, 163, 167, 171, 175, 179, 183, 187, 191, 195, 199, 203, 207, 211, 215, 219, 223, 227, 231, и 235; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мереThe antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 93, 111, 129, 155, 159, 163, 167, 171, 175 , 179, 183, 187, 191, 195, 199, 203, 207, 211, 215, 219, 223, 227, 231, and 235; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least
- 50 046175- 50 046175
90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности, как указано в любой из SEQ ID NO: 93, 111 и 129, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Таким образом, является предпочтительным, что по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 93 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Также является предпочтительным, что по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 111 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Кроме того, также является предпочтительным, что по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 129 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 93, 111 and 129, or a functional sequence variant thereof having at least 70 %, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. Thus, it is preferred that at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 93 or a functional sequence variant thereof having at least 70% at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. It is also preferred that at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 111 or a functional sequence variant thereof having at least 70% 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97% , at least 98% or at least 99% sequence identity. In addition, it is also preferred that at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 129 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где по меньшей мере один CDR, предпочтительно по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи, содержит или состоит из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 129, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein at least one CDR, preferably at least one heavy chain CDRH3, contains or consists of an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 129, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75% , at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, according to at least 98% or at least 99% sequence identity.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 91, 109, 127, 153, 157, 161, 165, 169, 173, 177, 181, 185, 189, 193, 197, 201, 205, 209, 213, 217, 221, 225, 229, и 233; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;Also, the antibody or antigen-binding fragment thereof may comprise a heavy chain containing at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 91, 109, 127, 153, 157, 161, 165, 169, 173, 177, 181, 185, 189, 193, 197, 201, 205, 209, 213, 217, 221, 225, 229, and 233; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 92, 110, 128, 154, 158, 162, 166, 170, 174, 178, 182, 186, 190, 194, 198, 202, 206, 210, 214, 218, 222, 226, 230, и 234; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 93, 111, 129, 155, 159, 163, 167, 171, 175, 179, 183, 187, 191, 195, 199, 203, 207, 211, 215, 219, 223, 227, 231, и 235; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность после(II) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 92, 110, 128, 154, 158, 162, 166, 170, 174, 178, 182, 186, 190, 194, 198 , 202, 206, 210, 214, 218, 222, 226, 230, and 234; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO: 93, 111, 129, 155, 159, 163, 167, 171, 175, 179, 183, 187, 191, 195, 199, 203, 207, 211, 215, 219, 223, 227, 231, and 235; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical after
- 51 046175 довательностей.- 51 046175 evidence.
Еще антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 91, 109 и 127, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;Another antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 91, 109 and 127, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75% , at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, according to at least 98% or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 92, 110 и 128, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 93, 111 и 129, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 92, 110 and 128, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80 %, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 93, 111 and 129, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75% , at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, according to at least 98% or at least 99% sequence identity.
Еще антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 91 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;Another antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 91 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, according to at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 92 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 93 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(ii) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 92 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 93 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, according to at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 109 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;Also, the antibody or antigen-binding fragment thereof may comprise a heavy chain containing at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein (I) at least one heavy chain CDRH1 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 109 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, according to at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 110 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 111 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(ii) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 110 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 111 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, according to at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую поThe antibody or antigen-binding fragment thereof may comprise a heavy chain containing
- 52 046175 меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRH1 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 127 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;- 52 046175 at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, where (I) at least one Heavy chain CDRH1 contains the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 127 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88% , at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRH2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 128 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRH3 тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 129 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(ii) at least one CDRH2 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 128 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one heavy chain CDRH3 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 129 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, according to at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 94, 112 и 130, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 94, 112 and 130, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98 % or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 95, 96, 113, 114, 131 и 132, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность, как указано в любой из SEQ ID NO: 97, 115 и 133, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 95, 96, 113, 114, 131 and 132, or a functional sequence variant thereof having at least 70% of at least 75 %, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NOs: 97, 115 and 133, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least at least 98% or at least 99% sequence identity.
Еще антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 94 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;Another antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, wherein (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 94 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 95 или 96, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 97 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 95 or 96, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 97 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, гдеAlso, the antibody or antigen-binding fragment thereof may comprise a heavy chain containing at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain containing at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3, where
- 53 046175 (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 112 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;- 53 046175 (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 112 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 113 или 114, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 115 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 113 or 114, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 115 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRH1, по меньшей мере один CDRH2 и по меньшей мере один CDRH3 и легкую цепь, содержащую по меньшей мере один CDRL1, по меньшей мере один CDRL2 и по меньшей мере один CDRL3, где (I) по меньшей мере один CDRL1 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 130 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей;The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain comprising at least one CDRH1, at least one CDRH2 and at least one CDRH3 and a light chain comprising at least one CDRL1, at least one CDRL2 and at least one CDRL3 wherein (I) at least one CDRL1 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 130 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85 %, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical sequences;
(II) по меньшей мере один CDRL2 содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 131 или 132, или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; и/или (III) по меньшей мере один CDRL3 амино содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 133 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.(II) at least one CDRL2 contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 131 or 132, or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; and/or (III) at least one CDRL3 amino contains an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 133 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 91-93; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) в соответствии с SEQ ID NO: 109-111; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) в соответствии с SEQ ID NO: 127-129; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IV) в соответствии с SEQ ID NO: 153-155; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (V) в соответствии с SEQ ID NO: 157 - 159; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VI) в соответствии с SEQ ID NO: 161-163; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VII) в соответствии с SEQ ID NO: 165-167; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, поThe antibody or antigen binding fragment thereof may comprise CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences (I) according to SEQ ID NO: 91-93; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (II) in accordance with SEQ ID NO: 109-111; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (III) in accordance with SEQ ID NO: 127-129; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (IV) in accordance with SEQ ID NO: 153-155; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (V) in accordance with SEQ ID NO: 157 - 159; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VI) in accordance with SEQ ID NO: 161-163; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (VII) in accordance with SEQ ID NO: 165-167; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, of
- 54 046175 меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (VIII) в соответствии с SEQ ID NO: 169-171; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IX) в соответствии с SEQ ID NO: 173-175; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (X) в соответствии с SEQ ID NO: 177-179; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XI) в соответствии с SEQ ID NO: 181-183; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XII) в соответствии с SEQ ID NO: 185-187; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XIII) в соответствии с SEQ ID NO: 189-191; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XIV) в соответствии с SEQ ID NO: 193-195; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XV) в соответствии с SEQ ID NO: 197-199; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XVI) в соответствии с SEQ ID NO: 201-203; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XVII) в соответствии с SEQ ID NO: 205-207; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XVIII) в соответствии с SEQ ID NO: 209-211; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XIX) в соответствии с SEQ ID NO: 213215; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XX) в соответствии с SEQ ID NO: 217-219; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXI) в соответствии с SEQ ID NO: 221-223; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXII) в соответствии с SEQ ID NO: 225-227; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере- 54 046175 at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical sequences; (VIII) in accordance with SEQ ID NO: 169-171; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (IX) in accordance with SEQ ID NO: 173-175; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (X) in accordance with SEQ ID NO: 177-179; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XI) in accordance with SEQ ID NO: 181-183; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XII) in accordance with SEQ ID NO: 185-187; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XIII) in accordance with SEQ ID NO: 189-191; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XIV) in accordance with SEQ ID NO: 193-195; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XV) in accordance with SEQ ID NO: 197-199; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XVI) in accordance with SEQ ID NO: 201-203; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XVII) in accordance with SEQ ID NO: 205-207; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XVIII) in accordance with SEQ ID NO: 209-211; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XIX) in accordance with SEQ ID NO: 213215; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XX) in accordance with SEQ ID NO: 217-219; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXI) in accordance with SEQ ID NO: 221-223; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (XXII) in accordance with SEQ ID NO: 225-227; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least
- 55 046175- 55 046175
85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (XXIII) в соответствии с SEQ ID NO: 229-231; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (XXIV) в соответствии с SEQ ID NO: 233-235; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; (XXIII) in accordance with SEQ ID NO: 229-231; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (XXIV) in accordance with SEQ ID NO: 233-235; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности и CDRL1, CDRL2, и CDRL3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 91-95 и 97; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) в соответствии с SEQ ID NO: 91-94 и 96-97; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (III) в соответствии с SEQ ID NO: 109-113 и 115; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (IV) в соответствии с SEQ ID NO: 109-112 и 114-115; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (V) в соответствии с SEQ ID NO: 127-131 и 133; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (VI) в соответствии с SEQ ID NO: 127-130 и 132-133; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences and CDRL1, CDRL2, and CDRL3 amino acid sequences (I) according to SEQ ID NOs: 91-95 and 97; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (II) in accordance with SEQ ID NO: 91-94 and 96-97; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (III) in accordance with SEQ ID NO: 109-113 and 115; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (IV) in accordance with SEQ ID NO: 109-112 and 114-115; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (V) in accordance with SEQ ID NO: 127-131 and 133; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (VI) in accordance with SEQ ID NO: 127-130 and 132-133; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности и CDRL1, CDRL2, и CDRL3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 127-131 и 133; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (II) в соответствии с SEQ ID NO: 127-130 и 132-133; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences and CDRL1, CDRL2, and CDRL3 amino acid sequences (I) according to SEQ ID NOs: 127-131 and 133; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (II) in accordance with SEQ ID NO: 127-130 and 132-133; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Также антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать вариабельный участок тяжелой цепи (VH) и, необязательно, вариабельный участок легкой цепи (VL), где вариабельный участок тяжелой цепи (VH) содержит или состоит из аминокислотной последовательности, как указано в любой из SEQ ID NO: 98, 116, 134, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, и 236; или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.Also, the antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain variable region (VH) and, optionally, a light chain variable region (VL), wherein the heavy chain variable region (VH) contains or consists of an amino acid sequence as defined in any of SEQ ID NO : 98, 116, 134, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, and 236; or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать (I) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 98 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мереThe antibody or antigen binding fragment thereof may comprise (I) a heavy chain variable region (VH) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 98 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least
- 56 046175- 56 046175
92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 99 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; (II) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 116 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 117 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (III) вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 134 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 135 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 99 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; (II) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 116 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85 %, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identical sequences and/or a light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 117 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity; or (III) a heavy chain variable region (VH) with an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 134 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 135 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99 % sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут содержать вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 134 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 135 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей.The antibody or antigen binding fragment thereof may comprise a heavy chain variable region (VH) with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 134 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 135 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80% , at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or according at least 99% sequence identity.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут представлять собой gZKA15, gZKA25, или gZKA35, более предпочтительно антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут представлять собой gZKA25 или gZKA35, еще более предпочтительно антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может представлять собой gZKA35.The antibody or antigen binding fragment thereof may be gZKA15, gZKA25, or gZKA35, more preferably the antibody or antigen binding fragment thereof may be gZKA25 or gZKA35, even more preferably the antibody or antigen binding fragment thereof may be gZKA35.
Изобретатели настоящего изобретения выделили моноклональное антитело (mAb) в соответствии с настоящим изобретением, которые обозначаются в настоящей заявке как ZKA15, ZKA25 и ZKA35 (см. табл. 4 и 5, Пример 1). На основании этих антител, в особенности на VH и VL генах этих антител, термины gZKA15, gZKA25 и gZKA35, как используется в настоящей заявке, относятся к соответствующим родовым антителам или их антигенсвязывающим фрагментам.The inventors of the present invention have isolated a monoclonal antibody (mAb) in accordance with the present invention, which are referred to herein as ZKA15, ZKA25 and ZKA35 (see Tables 4 and 5, Example 1). Based on these antibodies, particularly the VH and VL genes of these antibodies, the terms gZKA15, gZKA25 and gZKA35, as used herein, refer to the corresponding generic antibodies or antigen-binding fragments thereof.
А именно, gZKA15 относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, имеющему CDRH1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 91, CDRH2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 92, CDRH3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 93, CDRL1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 94, CDRL2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 95 или 96, и CDRL3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 97. Вариабельный участок тяжелой цепи (VH) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 98 и вариабельный участок легкой цепи (VL) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 99.Namely, gZKA15 refers to an antibody or an antigen binding fragment thereof having a CDRH1 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 91, a CDRH2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 92, a CDRH3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 93, CDRL1 an amino acid sequence according to SEQ ID NO: 94, a CDRL2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 95 or 96, and a CDRL3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 97. The heavy chain variable region (VH) preferably has an amino acid sequence in according to SEQ ID NO: 98 and the light chain variable region (VL) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 99.
gZKA25 относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, имеющему CDRH1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 109, CDRH2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 110, CDRH3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 111, CDRL1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 112, CDRL2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 113 или 114, и CDRL3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 115. Вариабельный участок тяжелой цепи (VH) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO:gZKA25 refers to an antibody or antigen binding fragment thereof having a CDRH1 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 109, a CDRH2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 110, a CDRH3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 111, a CDRL1 amino acid sequence according to according to SEQ ID NO: 112, CDRL2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 113 or 114, and CDRL3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 115. The heavy chain variable region (VH) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO:
- 57 046175- 57 046175
116 и вариабельный участок легкой цепи (VL) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 117.116 and the light chain variable region (VL) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 117.
gZKA35 относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, имеющему CDRH1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 127, CDRH2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 128, CDRH3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 129, CDRL1 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 130, CDRL2 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 131 или 132, и CDRL3 аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 133. Вариабельный участок тяжелой цепи (VH) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 134 и вариабельный участок легкой цепи (VL) имеет предпочтительно аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 135.gZKA35 refers to an antibody or antigen binding fragment thereof having a CDRH1 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 127, a CDRH2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 128, a CDRH3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 129, a CDRL1 amino acid sequence according to according to SEQ ID NO: 130, CDRL2 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 131 or 132, and CDRL3 amino acid sequence according to SEQ ID NO: 133. The heavy chain variable region (VH) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 134 and the light chain variable region (VL) preferably has the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 135.
Подробное описание, приведенное выше, озаглавленное как получение антител (раздел выше получение антител) и необязательные дополнительные характерные особенности антител (раздел выше необязательные дополнительные характерные особенности антител) применятся ко всем антителам, и их антигенсвязывающим фрагментам, как описано в настоящей заявке - то есть эти разделы применяются не только к нейтрализирующим антителам, и их антигенсвязывающим фрагментам, но также и к антителам, связывающим №1-белок, и их антиген-связывающим фрагментам.The detailed description given above entitled Preparation of Antibodies (Section above Preparation of Antibodies) and Optional Additional Features of Antibodies (section above Optional Additional Features of Antibodies) apply to all antibodies, and antigen binding fragments thereof, as described herein - that is, these sections apply not only to neutralizing antibodies and their antigen-binding fragments, but also to No. 1 protein-binding antibodies and their antigen-binding fragments.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут быть меченым, например, биотинилированым.The antibody or antigen binding fragment thereof may be labeled, for example biotinylated.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно конъюгировать с ферментом, таким как пероксидаза хрена (HRP). Конъюгирование антител с HRP описано, например, в Wisdom GB. Conjugation antibodies to horseradish peroxidase. Methods Mol Biol. 2005;295:127-30 или в Antibodies - a laboratory manual. Под ред. Edward A. Greenfield, второе издание 2012, Cold Spring Harbor Laboratory Press, ISBN: 9781936113811.The antibody or antigen binding fragment thereof can be conjugated to an enzyme such as horseradish peroxidase (HRP). Conjugation of antibodies to HRP is described, for example, in Wisdom GB. Conjugation antibodies to horseradish peroxidase. Methods Mol Biol. 2005;295:127-30 or in Antibodies - a laboratory manual. Ed. Edward A. Greenfield, second edition 2012, Cold Spring Harbor Laboratory Press, ISBN: 9781936113811.
Антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, могут быть связаны с обнаруживаемой меткой, например, для обеспечения возможности измерения, например, для количественного определения или для облегчения визуализации. Меченые антитела можно применять в разнообразных анализа, в особенности в иммунологических анализах, применяя большое количество меток. Предпочтительные метки включают радионуклиды, ферменты, коферменты, флуоресцентные вещества, хемилюминесцентные вещества, хромогены, субстраты ферментов или кофакторы, ингибиторы ферментов, простетические группы комплексов, свободные радикалы, частицы, красители (например, флуоресцентные красители, тандемные красители), и др. Примеры подходящих ферментов включают пероксидазу хрена (HRP), щелочную фосфатазу, β-галактозидазу, или ацетилхолинэстеразу; примеры подходящих простетических групп комплексов включают стрептавидин/биотин и авидин/биотин; примеры подходящих флуоресцентных материалов включают умбеллиферон, флуоресцеин, флуоресцеин изотиоцианат, родамин, дихлортриазиниламин флуоресцеин, дансил хлорид или фикоэритрин; примером люминесцентного материала является люминол; примеры биолюминесцентных материалов включают люциферазу, люциферин, и экворин; и примеры подходящих радиоактивных материалов включают 125I, 131I, 35S, или 3H. Такие меченые реагенты могут использоваться в различных хорошо известных исследованиях, таких как радиоиммунологические анализы, иммуноферментные анализы, например, ELISA, флуоресцентные иммуноанализы, и др, предпочтительно в ELISA. Следовательно, меченые антитела в соответствии с настоящим изобретением могут использоваться в таких анализах, например, как описано в US 3,766,162; US 3,791,932; US 3,817,837; и US 4,233,402.Antibodies, or antigen-binding fragments thereof, may be associated with a detectable label, for example, to enable measurement, such as quantitation, or to facilitate visualization. Labeled antibodies can be used in a variety of assays, especially immunoassays, using a large number of labels. Preferred labels include radionuclides, enzymes, coenzymes, fluorescent substances, chemiluminescent substances, chromogens, enzyme substrates or cofactors, enzyme inhibitors, prosthetic group complexes, free radicals, particles, dyes (eg, fluorescent dyes, tandem dyes), etc. Examples of suitable ones enzymes include horseradish peroxidase (HRP), alkaline phosphatase, β-galactosidase, or acetylcholinesterase; examples of suitable prosthetic group complexes include streptavidin/biotin and avidin/biotin; examples of suitable fluorescent materials include umbelliferone, fluorescein, fluorescein isothiocyanate, rhodamine, dichlorotriazinylamine fluorescein, dansyl chloride or phycoerythrin; an example of a luminescent material is luminol; examples of bioluminescent materials include luciferase, luciferin, and aequorin; and examples of suitable radioactive materials include 125I, 131I, 35S, or 3H. Such labeled reagents can be used in a variety of well known assays such as radioimmunoassays, enzyme immunoassays such as ELISA, fluorescence immunoassays, etc., preferably ELISA. Therefore, labeled antibodies in accordance with the present invention can be used in such assays, for example, as described in US 3,766,162; US 3,791,932; US 3,817,837; and US 4,233,402.
Предпочтительные метки включают (I) ферменты, как описано выше, например, пероксидазу хрена (HRP) или щелочную фосфатазу, в особенности в анализе блокировки связывания, вестерн-блоттинге, ELISA и иммуногистохимии; (II) простетические группы комплексов, как описано выше, например, стрептавидин/биотин и авидин/биотин, в особенности в ELISA и иммуногистохимии; (III) флуоресцентные вещества, как описано выше, такие как флуоресцентные красители и флуоресцентные белки (например, (усиленный) зеленый флуоресцентный белок (EGFP); TagBFP, Turquoise, Venus, KO2, Cherry, Apple, Kate2), в особенности в иммунофлуоресценции и проточной цитометрии; и (IV) тандемные красители в проточной цитометрии.Preferred labels include (I) enzymes as described above, for example horseradish peroxidase (HRP) or alkaline phosphatase, especially in binding blocking assays, Western blots, ELISAs and immunohistochemistry; (ii) prosthetic group complexes as described above, for example streptavidin/biotin and avidin/biotin, especially in ELISA and immunohistochemistry; (III) fluorescent substances as described above, such as fluorescent dyes and fluorescent proteins (eg (enhanced) green fluorescent protein (EGFP); TagBFP, Turquoise, Venus, KO2, Cherry, Apple, Kate2), especially in immunofluorescence and flow cytometry; and (IV) tandem dyes in flow cytometry.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут быть биотинилированными. Биотинилирование является быстрым, специфическим и, вряд ли нарушает естественную функцию молекулы вследствие небольшого размера биотина (MB = 244,31 г/моль). Биотин связывается со стрептавидином и авидином с чрезвычайно высокой аффинностью, с быстрой скоростью прямой реакции и высокой специфичностью. Связывание биотина со стрептавидином и авидином резистентно к чрезмерному нагреванию, рН и протеолизу, что делает возможным захват биотинилированных молекул в разнообразных условиях. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут быть биотинилированы химически или ферментативно. В химическом биотинилировании используют различные конъюгационные химические взаимодействия для получения неспецифического биотинилирования аминов (например, NHS-связывание обеспечивает биотинилирование любых первичных аминов в антителе, см. ниже). Ферментативное биотинилирование приводит к биотинилированию специфического лизина с пределах определенной последоваThe antibody or antigen binding fragment thereof may be biotinylated. Biotinylation is rapid, specific, and unlikely to interfere with the natural function of the molecule due to the small size of biotin (MB = 244.31 g/mol). Biotin binds to streptavidin and avidin with extremely high affinity, fast forward reaction rates and high specificity. Biotin binding to streptavidin and avidin is resistant to excessive heat, pH, and proteolysis, making it possible to trap biotinylated molecules under a variety of conditions. The antibody or antigen binding fragment thereof may be biotinylated chemically or enzymatically. Chemical biotinylation uses various conjugative chemistries to achieve non-specific biotinylation of amines (e.g. NHS coupling ensures biotinylation of any primary amines in the antibody, see below). Enzymatic biotinylation leads to biotinylation of a specific lysine within a certain sequence
- 58 046175 тельности путем применения бактериальной биотинлигазы.- 58 046175 activity by using bacterial biotin ligase.
Антитело или его фрагмент, также можно использовать в качестве метки. В этом случае, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент конъюгируют со вторым антителом или его фрагментом антитела, с образованием гетероконъюгата антитела, как описано, например, в US 4,676,980. В этом случае, второе антитело необязательно может быть мечено.The antibody or its fragment can also be used as a label. In this case, the antibody or antigen-binding fragment thereof is conjugated to a second antibody or antibody fragment thereof to form an antibody heteroconjugate, as described, for example, in US 4,676,980. In this case, the second antibody may optionally be labeled.
Способы для связывания антител с метками хорошо известны в данной области техники. Например, в антителе или в его антигенсвязывающем фрагменте, боковую цепь лизина, которая оканчивается на первичный амин (-NH2), можно использовать для ковалентного присоединения меток к антителу или в его антигенсвязывающий фрагмент. Различные варианты процедур мечения описаны в литературе. Например, подходящий подход для введения метки может быть выбран из группы, включающей NHS сложные эфиры, гетеробифункциональные реагенты, карбодиимиды и перйодат натрия.Methods for linking antibodies to tags are well known in the art. For example, in an antibody or antigen binding fragment thereof, a lysine side chain that terminates in a primary amine (-NH2) can be used to covalently attach tags to the antibody or antigen binding fragment thereof. Various labeling procedures have been described in the literature. For example, a suitable labeling approach may be selected from the group consisting of NHS esters, heterobifunctional reagents, carbodiimides, and sodium periodate.
NHS сложные эфиры можно использовать особенно в случае меток флуоресцентными красителями. Метку с флуоресцентным красителем можно закупать в активированной форме метки с встроенным NHS сложным эфиром (также называемый 'сукцинимидильный сложный эфир'). Активированный краситель можно подвергать реакции в подходящих условиях с антителом или с его антигенсвязывающим фрагментом (например, посредством лизиновой группы). Избыток реакционного красителя можно удалить (например, путем колоночной хроматографии) перед тем, как меченое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент будут использовать в иммунологическом анализе.NHS esters can be used especially for labeling with fluorescent dyes. The fluorescent dye tag can be purchased in an activated form of the tag with an integrated NHS ester (also called 'succinimidyl ester'). The activated dye can be reacted under suitable conditions with the antibody or an antigen-binding fragment thereof (eg, via a lysine group). Excess reaction dye can be removed (eg, by column chromatography) before the labeled antibody or antigen binding fragment thereof is used in an immunoassay.
Гетеробифункциональные реагенты можно использовать в том случае, если метка представляет собой белковую молекулу (например, HRP, щелочная фосфатаза или фикоэритрин). В этом случае, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент и метка могут иметь множественные амины. В этой ситуации, некоторые из лизинов в одной молекуле (например, на антителе или на его антигенсвязывающем фрагменте) можно модифицировать для создания новой реакционноспособной группы (X) и лизины на метке для создания другой реакционноспособной группы (Y) (или наоборот). После этого 'гетеробифункциональный реагент' используют для интродуцирования Y групп, которые впоследствии реагируют с X группами при смешивании антитела и метки, создавая, таким образом, гетеродимерные конъюгаты.Heterobifunctional reagents can be used when the label is a protein molecule (eg, HRP, alkaline phosphatase, or phycoerythrin). In this case, the antibody or antigen binding fragment and label thereof may have multiple amines. In this situation, some of the lysines on one molecule (eg, on an antibody or on its antigen-binding fragment) can be modified to create a new reactive group (X) and the lysines on a tag to create a different reactive group (Y) (or vice versa). The 'heterobifunctional reagent' is then used to introduce Y groups, which subsequently react with X groups when the antibody and tag are mixed, thereby creating heterodimeric conjugates.
Карбодиимиды, такие как EDC, особенно можно использовать для создания ковалентных связей между амин- и карбоксил-содержащими молекулами. Карбодиимиды активируют карбоксильные группы, и затем активированное промежуточное соединение атакуется амином (например, обеспечиваемым лизиновым остатком на антителе или его антигенсвязывающем фрагменте). Карбодиимиды особенно можно использовать для конъюгирования антител с карбоксилированными частицам (например, латексными частицам, магнитными шарикам), и с другими карбоксилированными поверхностям, таким как микролуночные планшеты или поверхности чипов. Карбодиимиды также можно использоваться для присоединения красителей или белковых меток к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам.Carbodiimides, such as EDC, can especially be used to create covalent bonds between amine- and carboxyl-containing molecules. Carbodiimides activate carboxyl groups, and the activated intermediate is then attacked by an amine (eg, provided by a lysine residue on an antibody or antigen-binding fragment thereof). Carbodiimides can especially be used to conjugate antibodies to carboxylated particles (eg, latex particles, magnetic beads), and to other carboxylated surfaces such as microwell plates or chip surfaces. Carbodiimides can also be used to attach dyes or protein tags to antibodies or antigen-binding fragments thereof.
Перйодат натрия можно использовать в особенности для мечения с помощью пероксидазы хрена (HRP). Перйодат активирует углеводные цепи на молекуле HRP с созданием альдегидных групп, которые способны реагировать с лизинами на антителе или его антигенсвязывающем фрагменте. Поскольку HRP сама имеет только немного лизинов, то относительно легко создать конъюгаты антитело-HRP без существенной HRP полимеризации.Sodium periodate can be used particularly for horseradish peroxidase (HRP) labeling. Periodate activates carbohydrate chains on the HRP molecule to create aldehyde groups that are able to react with lysines on the antibody or antigen-binding fragment. Because HRP itself has only a few lysines, it is relatively easy to create antibody-HRP conjugates without significant HRP polymerization.
Линкеры, необязательно, можно использовать между метками и антителами согласно изобретению, например, как описано в US 4,831,175. Антитела или их антиген-связывающие фрагменты можно непосредственно метить с помощью радиоактивного йода, индия, иттрия или других радиоактивных частиц, известных в данной области техники, например, как описано в US 5,595,721.Linkers can optionally be used between tags and antibodies of the invention, for example as described in US 4,831,175. Antibodies or antigen-binding fragments thereof can be directly labeled with radioactive iodine, indium, yttrium or other radioactive species known in the art, for example, as described in US 5,595,721.
Таким образом, можно получать комплекс, содержащий (I) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением; и (II) метку, как описано выше.Thus, it is possible to obtain a complex containing (I) an antibody or an antigen-binding fragment thereof, in accordance with the present invention; and (II) a label as described above.
Такой комплекс предпочтительно с помощью метки конъюгирован с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом. Предпочтительно, метка и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут быть ковалентно связаны.Such a complex is preferably conjugated with a label to an antibody or an antigen-binding fragment thereof. Preferably, the label and the antibody or antigen binding fragment thereof may be covalently linked.
Например, комплекс может представлять собой слитый белок, содержащий (I) антитело в соответствии с настоящим изобретением и (II) метку, которая представляет собой пептид или белок, такой как флуоресцентный пептид или белок, например, EGFP.For example, the complex may be a fusion protein comprising (i) an antibody of the present invention and (ii) a tag that is a peptide or protein, such as a fluorescent peptide or protein, such as EGFP.
Молекула нуклеиновой кислоты, содержащая полинуклеотид, кодирующий антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, или комплекс могут представлять собой слитый белок.The nucleic acid molecule containing a polynucleotide encoding an antibody or an antigen binding fragment or complex thereof may be a fusion protein.
Примеры молекул нуклеиновых кислот и/или полинуклеотидов включают, например, рекомбинантный полинуклеотид, вектор, олигонуклеотид, молекулу РНК, такую как рРНК, мРНК, микроРНК, миРНК, или тРНК, или молекулу ДНК, такую как кДНК.Examples of nucleic acid molecules and/or polynucleotides include, for example, a recombinant polynucleotide, a vector, an oligonucleotide, an RNA molecule such as rRNA, mRNA, microRNA, siRNA, or tRNA, or a DNA molecule such as cDNA.
В табл. 4 и 5 представлены номера SEQ ID для аминокислотных последовательностей для CDR и VH и VL типичных антител.In table 4 and 5 provide SEQ ID numbers for the amino acid sequences for the CDRs and VH and VL of representative antibodies.
В табл. 6 ниже представлены номера SEQ ID для типичных последовательностей нуклеиновых кислот, кодирующих CDR и VH и VL типичных антител.In table 6 below provides SEQ ID numbers for exemplary nucleic acid sequences encoding the CDRs and VH and VL of exemplary antibodies.
Молекула нуклеиновой кислоты может представлять собой молекулу, содержащую, предпочтиThe nucleic acid molecule may be a molecule containing, preferably
- 59 046175 тельно состоящую из компонентов нуклеиновых кислот. Термин молекула нуклеиновой кислоты предпочтительно относится к молекулам ДНК и РНК. В особенности, он используется синонимично с термином полинуклеотид. Молекула нуклеиновой кислоты может представлять собой полимер, содержащий или состоящий из нуклеотидных мономеров, которые ковалентно связаны друг с другом с помощью фосфодиэфирных связей сахарофосфатного остова. Термин молекула нуклеиновой кислоты также охватывает модифицированные молекулы нуклеиновых кислот, такие как молекулы ДНК или РНК с модифицированными основаниями, модифицированными сахарами или модифицированным остовом, и т.д.- 59 046175 consisting entirely of nucleic acid components. The term nucleic acid molecule preferably refers to DNA and RNA molecules. In particular, it is used synonymously with the term polynucleotide. A nucleic acid molecule may be a polymer containing or consisting of nucleotide monomers that are covalently linked to each other via phosphodiester bonds of the sugar phosphate backbone. The term nucleic acid molecule also covers modified nucleic acid molecules, such as DNA or RNA molecules with modified bases, modified sugars or modified backbones, etc.
В табл. 6 представлены типичные последовательности нуклеиновых кислот CDR и вариабельного участка тяжелой цепи (VH) и вариабельного участка легкой цепи (VL) трех типичных антител в соответствии с настоящим изобретением (ZKA15, ZKA25, ZKA35).In table 6 shows representative CDR and variable heavy chain (VH) and variable light chain (VL) nucleic acid sequences of three representative antibodies of the present invention (ZKA15, ZKA25, ZKA35).
Таблица 6Table 6
- 60 046175- 60 046175
- 61 046175- 61 046175
Последовательность молекулы нуклеиновой кислоты может содержать или состоять из последовательности нуклеиновых кислот в соответствии с любой из SEQ ID NO: 100-108, 118-126, и 136-144.The nucleic acid molecule sequence may comprise or consist of a nucleic acid sequence according to any of SEQ ID NOs: 100-108, 118-126, and 136-144.
Также последовательности нуклеиновых кислот могут включать последовательности нуклеиновых кислот, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность по отношению к нуклеиновой кислоте, кодирующей CDR, VH последовательность и/или VL последовательность, используемой в (типичном) антителе например, к последовательностям, представленным в табл. 6.Nucleic acid sequences may also include nucleic acid sequences having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% or at least 99% identity with respect to the nucleic acid encoding the CDR, VH sequence and/or VL sequence, used in a (typical) antibody, for example, to the sequences presented in table. 6.
В целом, с молекулой нуклеиновой кислоты можно манипулировать для инсерции, делеции или изменения определенных последовательностей нуклеиновых кислот. Изменения при такой манипуляции включают, но, не ограничиваясь только ими, изменения для интродуцирования сайтов рестрикции, для изменения частоты используемого кодона, для добавления или оптимизации транскрипции и/или трансляции регуляторных последовательностей и др. Также представляется возможным изменять нуклеиновую кислоту для изменения кодируемых аминокислот. Например, может быть полезным интродуцировать одну или несколько (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 и т.д.) аминокислотных замен, делеций и/или инсерций в аминокислотную последовательность антитела. Такие точечные мутации могут модифицировать эффекторные функции, аффинность связывания антигена, посттрансляционные модификации, иммуногенность, и т.д., могут интродуцировать аминокислоты для присоединения ковалентных групп (например, меток) или могут интродуцировать хвосты (например, для очистки). Мутации можноIn general, a nucleic acid molecule can be manipulated to insert, delete, or alter certain nucleic acid sequences. Changes in such manipulation include, but are not limited to, changes to introduce restriction sites, to change the frequency of the codon used, to add or optimize transcription and/or translation of regulatory sequences, etc. It is also possible to modify the nucleic acid to change the encoded amino acids. For example, it may be useful to introduce one or more (eg, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, etc.) amino acid substitutions, deletions and/or insertions into the amino acid sequence of the antibody. Such point mutations may modify effector functions, antigen binding affinity, post-translational modifications, immunogenicity, etc., may introduce amino acids for attachment of covalent groups (eg, tags), or may introduce tails (eg, for purification). Mutations are possible
- 62 046175 интродуцировать в специфические сайты или можно интродуцировать случайно, с последующей селекцией (например, молекулярная эволюция). Например, одну или несколько нуклеиновых кислот, кодирующих CDR участки, VH последовательность и/или VL последовательность (типичного) антитела согласно изобретению можно случайно или направленно мутировать для интродуцирования различных свойств в кодируемые аминокислоты. Такие изменения могут приводить к итеративному процессу, в котором сохраняются исходные замены, а новые замены интродуцируются в другие нуклеотидные положения. Более того, замены, осуществляемые на независимых этапах, можно комбинировать. Различные свойства, интродуцируемые в кодируемые аминокислоты, могут включать, но, не ограничиваясь только ими, измененную аффинность.- 62 046175 introduced into specific sites or can be introduced randomly, followed by selection (eg molecular evolution). For example, one or more nucleic acids encoding the CDR regions, VH sequence and/or VL sequence of a (typical) antibody of the invention may be randomly or targetedly mutated to introduce different properties into the encoded amino acids. Such changes may result in an iterative process in which the original substitutions are maintained and new substitutions are introduced at other nucleotide positions. Moreover, substitutions carried out at independent stages can be combined. Various properties introduced into the encoded amino acids may include, but are not limited to, altered affinity.
Также изобретение относится к экспрессионным векторам, содержащим молекулу нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением.The invention also relates to expression vectors containing a nucleic acid molecule in accordance with the present invention.
Термин вектор относится к молекуле нуклеиновой кислоты, предпочтительно к рекомбинантной молекуле нуклеиновой кислоты, то есть молекуле нуклеиновой кислоты, которая не встречается в природе. Вектор в контексте настоящего изобретения является подходящим для инкорпорирования или заякоривания желательной последовательности нуклеиновых кислот. Такие векторы могут представлять собой векторы для хранения, экспрессионные векторы, клонирующие векторы, трансферные векторы и др. Вектор для хранения представляет собой вектор, который предоставляет возможность подходящего хранения молекулы нуклеиновой кислоты. Таким образом, вектор может содержать последовательность, соответствующую, например, желательному антителу или его фрагменту. Экспрессионный вектор может использоваться для получения продуктов экспрессии, таких как РНК, например, мРНК, или пептиды, полипептиды или белки. Например, экспрессионный вектор может содержать последовательности, необходимые для транскрипции последовательности сильнее вектора, такой как промоторная последовательность. Клонирующий вектор типично представляет собой вектор, содержащий клонирующий сайт, который может использоваться для инкорпорации последовательностей нуклеиновых кислот в вектор. Клонирующий вектор может представлять собой, например, плазмидный вектор или бактериофаговый вектор. Трансферный вектор может представлять собой вектор, который пригоден для переноса молекул нуклеиновых кислот в клетки или организмы, например, вирусные векторы. Вектор в контексте настоящего изобретения может представлять собой, например, РНК вектор или ДНК вектор. Предпочтительно, вектор представляет собой молекулу ДНК. Например, вектор в контексте настоящей заявки содержит сайт клонирования, селектируемый маркер, такой как фактор резистентности к антибиотику, и последовательность, подходящую для размножения вектора, такую как точка начала репликации.The term vector refers to a nucleic acid molecule, preferably a recombinant nucleic acid molecule, that is, a nucleic acid molecule that does not occur in nature. A vector in the context of the present invention is suitable for incorporating or anchoring a desired nucleic acid sequence. Such vectors may be storage vectors, expression vectors, cloning vectors, transfer vectors, etc. A storage vector is a vector that enables suitable storage of a nucleic acid molecule. Thus, the vector may contain a sequence corresponding to, for example, a desired antibody or fragment thereof. An expression vector can be used to produce expression products such as RNA, eg mRNA, or peptides, polypeptides or proteins. For example, an expression vector may contain sequences necessary for transcription of a sequence stronger than the vector, such as a promoter sequence. A cloning vector is typically a vector containing a cloning site that can be used to incorporate nucleic acid sequences into the vector. The cloning vector may be, for example, a plasmid vector or a bacteriophage vector. A transfer vector may be a vector that is suitable for transferring nucleic acid molecules into cells or organisms, such as viral vectors. The vector in the context of the present invention may be, for example, an RNA vector or a DNA vector. Preferably, the vector is a DNA molecule. For example, a vector in the context of the present application contains a cloning site, a selectable marker, such as an antibiotic resistance factor, and a sequence suitable for propagation of the vector, such as an origin of replication.
Предпочтительно, вектор в контексте настоящей заявки представляет собой плазмидный вектор.Preferably, the vector in the context of the present application is a plasmid vector.
Изобретение также относится к клетке, экспрессирующей антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением; и содержащей вектор в соответствии с настоящим изобретением.The invention also relates to a cell expressing an antibody or antigen binding fragment thereof in accordance with the present invention; and containing a vector in accordance with the present invention.
Примеры таких клеток включают, но, не ограничиваясь только ими, эукариотические клетки, например, клетки дрожжей, клетки животных или клетки растений. Предпочтительно, клетки представляют собой клетки млекопитающих, более предпочтительно клеточную линию млекопитающих. Предпочтительные примеры включают клетки человека, СНО клетки, HEK293T клетки, PER.C6 клетки, NS0 клетки, клетки печени человека, миеломные клетки или гибридомные клетки.Examples of such cells include, but are not limited to, eukaryotic cells, such as yeast cells, animal cells, or plant cells. Preferably, the cells are mammalian cells, more preferably a mammalian cell line. Preferred examples include human cells, CHO cells, HEK293T cells, PER.C6 cells, NS0 cells, human liver cells, myeloma cells or hybridoma cells.
В особенности, клетка может быть трансфектирована экспрессионным вектором. Термин трансфекция относится к интродукции молекул нуклеиновой кислоты, таких как молекулы ДНК или РНК (например, мРНК), в клетки, предпочтительно в эукариотические клетки. В контексте настоящего изобретения, термин трансфекция охватывает любой способ, известный квалифицированному специалисту для интродукции молекул нуклеиновой кислоты в клетки, предпочтительно в эукариотические клетки, например, в клетки млекопитающих. Такие способы охватывают, например, электропорацию, липофекцию, например, на основании катионных липидов и/или липосом, осаждение фосфатом кальция, трансфекцию на основании наночастиц, трансфекцию на основании вирусов, или трансфекцию на основании катионных полимеров, такие как DEAE-декстран или полиэтиленимин и др. Предпочтительно, интродукция является невирусной.In particular, the cell can be transfected with an expression vector. The term transfection refers to the introduction of nucleic acid molecules, such as DNA or RNA molecules (eg, mRNA), into cells, preferably eukaryotic cells. In the context of the present invention, the term transfection covers any method known to the skilled person for introducing nucleic acid molecules into cells, preferably eukaryotic cells, for example, mammalian cells. Such methods include, for example, electroporation, lipofection, for example, based on cationic lipids and/or liposomes, calcium phosphate precipitation, nanoparticle-based transfection, virus-based transfection, or transfection based on cationic polymers, such as DEAE-dextran or polyethylenimine and etc. Preferably, the introduction is non-viral.
Клетки могут быть трансфектированы стабильно или временно вектором, например, для экспрессии антитела или его антигенсвязывающего фрагмента. Клетки можно стабильно трансфектироватьт вектором, кодирующим антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. Альтернативно, клетки можно временно трансфектировать вектором, кодирующим антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.Cells can be stably or transiently transfected with a vector, for example, to express an antibody or an antigen-binding fragment thereof. Cells can be stably transfected with a vector encoding an antibody or an antigen-binding fragment thereof. Alternatively, cells can be transiently transfected with a vector encoding an antibody or an antigen-binding fragment thereof.
Также изобретение относится к фармацевтической композиции, как описано выше в контексте нейтрализирующих антител, при этом подробное описание, как описано выше, применяется таким образом к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, которые связываются с NS1 белком ZIKV. Тем не менее, композицию также можно использовать для нефармацевтических целей, таких как для диагностики (инфекции ZIKV) или для аналитических целей.The invention also relates to a pharmaceutical composition as described above in the context of neutralizing antibodies, wherein the detailed description as described above thus applies to an antibody or antigen binding fragment thereof that binds the ZIKV NS1 protein. However, the composition can also be used for non-pharmaceutical purposes, such as for diagnosis (ZIKV infection) or for analytical purposes.
Предпочтительно, композиция может быть представлена в жидкой форме, например, для обеспечения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента в жидкости, например, в диагностическом анализе. Жидкость (носитель) может быть выбран в соответствии с целью, например, в зависимости от аналиPreferably, the composition may be presented in liquid form, for example, to provide an antibody or antigen-binding fragment thereof in a liquid, for example, in a diagnostic assay. The liquid (carrier) can be selected according to the purpose, e.g. depending on the analysis
- 63 046175 за. Предпочтительно, композиция может содержать PBS (фосфатно-солевой буферный раствор) или другой буфер. Такие буферы предпочтительно представляют собой биологические буферы, и, следовательно, композиция может содержать любой из MES, BIS-TRIS, ADA, PIPES, ACES, MOPsO, BIS-TRIS пропана, BES, MOPS, TES, HEPES, DIPSO, TAPSO, Trizma, POPSO, HEPPS, TRICINE, Gly-Gly, BICINE, HEPBS, TAPS, AMPD, AMPSO, CHES, CAPSO, AMP, CAPS и CABS. Также композиция может содержать раствор Рингера. Дополнительно, композиция также может содержать Tris, например, Tris-HCl.- 63 046175 for. Preferably, the composition may contain PBS (phosphate buffered saline) or other buffer. Such buffers are preferably biological buffers, and therefore the composition may contain any of MES, BIS-TRIS, ADA, PIPES, ACES, MOPsO, BIS-TRIS propane, BES, MOPS, TES, HEPES, DIPSO, TAPSO, Trizma, POPSO, HEPPS, TRICINE, Gly-Gly, BICINE, HEPBS, TAPS, AMPD, AMPSO, CHES, CAPSO, AMP, CAPS and CABS. The composition may also contain Ringer's solution. Additionally, the composition may also contain Tris, for example Tris-HCl.
Композиция также может содержать детергент, например, Tween (полисорбат), такой как Tween 20 или Tween 80. Детергенты предпочтительно присутствуют в низких количествах, например, меньше, чем 0,01%. Композиции также может включать соли натрия (например, хлорид натрия) для придания тоничности. Например, типичная концентрация NaCl составляет 10±2 мг/мл.The composition may also contain a detergent, for example, Tween (polysorbate), such as Tween 20 or Tween 80. The detergents are preferably present in low amounts, for example less than 0.01%. The compositions may also include sodium salts (eg, sodium chloride) to impart tonicity. For example, a typical NaCl concentration is 10 ± 2 mg/ml.
Дополнительно, композиция необязательно может содержать стабилизатор белка, BSA (бычий сывороточный альбумин) или HSA (сывороточный альбумин человека). Другими примерами стабилизаторов белков, которые необязательно могут быть включены в композицию, включают буферы, например, как описано выше; соли, такие как хлорид натрия; аминокислоты, такие как гистидин, глицин и аргинин; полиолы/дисахариды/полисахариды, такие как трегалоза и сахароза (дисахариды), маннит и сорбит (сахароспирты); поверхностно-активные вещества, такие как полисорбат 20, полисорбат 80, и белки, такие как HSA или BSA; полимеры, такие как декстран и полиэтиленгликоль; и антиоксиданты.Additionally, the composition may optionally contain a protein stabilizer, BSA (bovine serum albumin) or HSA (human serum albumin). Other examples of protein stabilizers that may optionally be included in the composition include buffers, for example, as described above; salts such as sodium chloride; amino acids such as histidine, glycine and arginine; polyols/disaccharides/polysaccharides such as trehalose and sucrose (disaccharides), mannitol and sorbitol (sugar alcohols); surfactants such as polysorbate 20, polysorbate 80, and proteins such as HSA or BSA; polymers such as dextran and polyethylene glycol; and antioxidants.
Кроме того, композиция необязательно может содержать консервант, такой как азид натрия. Консерванты типично используют для предотвращения загрязнения микроорганизмами.In addition, the composition may optionally contain a preservative such as sodium azide. Preservatives are typically used to prevent contamination by microorganisms.
Изобретение также относится к набору, содержащему антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, он необязательно может содержать один или несколько следующих компонентов:The invention also relates to a kit containing an antibody or an antigen-binding fragment thereof, it may optionally contain one or more of the following components:
(I) один или несколько растворов, например, для применения в диагностическим анализе, например, для разведения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента;(I) one or more solutions, for example, for use in a diagnostic assay, for example, for diluting an antibody or antigen-binding fragment thereof;
(II) листок-вкладыш, например, с инструкциями по применению;(ii) package insert, for example, with instructions for use;
(III) метку, как описано выше и, необязательно, растворы и/или другие компоненты, необходимые для мечения; и/или (IV) флаконы или устройства, например, пригодные для диагностического анализа, например, один или несколько планшетов ELISA.(III) a label as described above and, optionally, solutions and/or other components necessary for labeling; and/or (IV) vials or devices, for example, suitable for diagnostic analysis, for example, one or more ELISA plates.
Предпочтительно, набор, как описано выше, также может содержать субстрат для проявления цвета. Примеры такого субстрата включают p-NPP, в особенности, в случае обнаружения с помощью щелочной фосфатазы; или фермент, такой как ABTS, ТМВ или OPD, в особенности, в случае применения пероксидазы хрена (HRP). Необязательно, субстрат может быть разведен в подходящем буфере, например, буфере, как описано выше в контексте композиции в соответствии с настоящим изобретением. Альтернативно, субстрат и буфер могут быть представлены в качестве отдельных компонентов в наборе.Preferably, the kit as described above may also contain a color development substrate. Examples of such a substrate include p-NPP, especially when detected by alkaline phosphatase; or an enzyme such as ABTS, TMB or OPD, especially in the case of horseradish peroxidase (HRP). Optionally, the substrate can be diluted in a suitable buffer, for example, a buffer as described above in the context of the composition in accordance with the present invention. Alternatively, the substrate and buffer may be provided as separate components in the kit.
Что касается метки, то набор также может содержать фермент, конъюгированный со стрептавидином, или другую систему для обнаружения связывания зондового антитело. Например, зондовое антитело может быть приготовлено в мышиной форме и в этом случае связывание может быть обнаружено с помощью антимышиного вторичного антитела - без необходимости биотинилирования. Антимышиное вторичное антитело представляет собой типично поликлональное и/или перекрестно-абсорбируемое для того, чтобы не реагировать с антителами человека.As for the label, the kit may also contain a streptavidin-conjugated enzyme or other system to detect binding of the probe antibody. For example, the probe antibody can be formulated in murine form, in which case binding can be detected by an anti-mouse secondary antibody—without the need for biotinylation. The anti-mouse secondary antibody is typically polyclonal and/or cross-absorbable so as not to react with human antibodies.
Кроме того, набор может содержать один или несколько планшетов ELISA. Более предпочтительно, эти планшеты ELISA предварительно покрыты ZIKV-NS1 белком. Необязательно, такие предварительно покрытые ELISA-планшеты могут быть предварительно блокированы.In addition, the kit may contain one or more ELISA plates. More preferably, these ELISA plates are pre-coated with ZIKV-NS1 protein. Optionally, such pre-coated ELISA plates can be pre-blocked.
Диагностика инфекции, вызванной вирусом Зика.Diagnosis of infection caused by the Zika virus.
Антитело или его антигенсвязывающей фрагмент, которые связываются с NS1 белком ZIKV, набор или композиция могут использоваться для диагностики инфекции, вызванной вирусом Зика (ZIKV).An antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the ZIKV NS1 protein, kit or composition can be used to diagnose Zika virus (ZIKV) infection.
Диагностику инфекции, вызванной вирусом Зика (ZIKV), типично осуществляют in vitro, например, в выделенном образце субъекта, подлежащего диагностике. Предпочтительные выделенные образцы субъекта включают образцы жидкости организма и образцы тканей. Более предпочтительным является образец жидкости организма. Предпочтительные жидкости организма для диагностики инфекции ZIKV включают кровь (например, цельная кровь, плазма, сыворотка), слюна и моча. Наиболее предпочтительной является кровь, в особенности плазма или сыворотка.Diagnosis of Zika virus (ZIKV) infection is typically performed in vitro, for example, in an isolated sample from the subject being diagnosed. Preferred isolated subject samples include body fluid samples and tissue samples. A body fluid sample is preferred. Preferred body fluids for diagnosing ZIKV infection include blood (eg, whole blood, plasma, serum), saliva, and urine. Most preferred is blood, especially plasma or serum.
Таким образом, применение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с NS1 белком ZIKV, комплекса, композиции или набора позволяет определить, является ли выделенный образец (жидкости организма), такой как выделенный образец крови, инфицирован вирусом Зика, как описано выше, Предпочтительные жидкости организма для диагностики инфекции ZIKV включают кровь (например, цельная кровь, плазма, сыворотка), слюна и моча. Наиболее предпочтительной является кровь, в особенности плазма или сыворотка.Thus, the use of an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the ZIKV NS1 protein, complex, composition or kit allows one to determine whether an isolated sample (body fluid), such as an isolated blood sample, is infected with Zika virus, as described above, Preferred Fluids organisms used to diagnose ZIKV infection include blood (eg, whole blood, plasma, serum), saliva, and urine. Most preferred is blood, especially plasma or serum.
Для диагностики инфекции, вызванной вирусом Зика, можно применять различные диагностические анализы. Предпочтительные диагностические анализы представляют собой иммунологические анализы. Предпочтительные примеры иммунологических анализов включают ELISA, иммунофлуоресценцию, иммуногистохимию и проточную цитометрию. Предпочтительно, диагностика включает ELISA.Various diagnostic tests can be used to diagnose Zika virus infection. Preferred diagnostic tests are immunoassays. Preferred examples of immunoassays include ELISA, immunofluorescence, immunohistochemistry and flow cytometry. Preferably, the diagnosis includes ELISA.
- 64 046175- 64 046175
Например, можно использовать стандартный ELISA, сэндвич-ELISA или анализ блокады связывания.For example, a standard ELISA, a sandwich ELISA, or a binding blockade assay can be used.
Предпочтительно, диагностический анализ обнаруживает (I) (наличие) самого NS1 белка ZIKV; и/или (II) (наличие) анти-ZIKV NS1 антитела в (выделенном) образце субъекта, подлежащего диагностике.Preferably, the diagnostic assay detects (I) the ZIKV NS1 protein itself; and/or (II) the (presence of) anti-ZIKV NS1 antibody in the (isolated) sample of the subject to be diagnosed.
Предпочтительно, используют анализ блокировки связывания. В этом анализе, выделенный образец от субъекта, подлежащего диагностике, (например, образец жидкости организма, такой как кровь (например, цельная кровь, плазма, сыворотка), слюна и моча) добавляют в планшет ELISA, покрытый NS1 белком ZIKV, и инкубируют (например, в течение по меньшей мере приблизительно 30 минут или по меньшей мере приблизительно одного часа) для предоставления возможности связывания. После этого, добавляют антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (в качестве зондового антитело), которые предпочтительно метят, например, биотинилируют или конъюгируют с пероксидазой хрена (HRP). После дополнительного времени инкубирования (например, по меньшей мере приблизительно 1 мин, предпочтительно по меньшей мере приблизительно 3 мин, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 5 мин, еще более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 10 мин, наиболее предпочтительно по меньшей мере приблизительно 15 мин), может быть определено ингибирование связывания антитела или его антигенсвязывающий фрагмент в соответствии с настоящим изобретением.Preferably, a binding blocking assay is used. In this assay, an isolated sample from the subject to be diagnosed (e.g., a sample of body fluid such as blood (e.g., whole blood, plasma, serum), saliva, and urine) is added to an ELISA plate coated with ZIKV NS1 protein and incubated ( for example, for at least about 30 minutes or at least about one hour) to allow binding. Thereafter, an antibody or antigen-binding fragment thereof is added (as a probe antibody), which is preferably labeled, for example biotinylated or conjugated with horseradish peroxidase (HRP). After additional incubation time (e.g., at least about 1 minute, preferably at least about 3 minutes, more preferably at least about 5 minutes, even more preferably at least about 10 minutes, most preferably at least about 15 minutes) , the inhibition of binding of an antibody or antigen binding fragment thereof can be determined in accordance with the present invention.
В целом, ингибирование связывания показывает наличие анти-ZIKV NS1 антител в образце субъекта, таким образом, указывая на инфицирование субъекта ZIKV. В отличие от этого, в образцах неинфицированных субъектов типично не предполагают ингибирования связывания. Важным является тот факт, что такой анализ с использованием ZIKV №1-связывающихся антител не дает положительных результатов у субъектов, которые уже были инфицированы другими флавивирусами. Флавивирусы типично индуцируют большое количество антител, которые перекрестно реагируют с ZIKV. Другими словами, этот анализ является высоко специфическим и не зависит от перекрестно-реагирующих Ab.In general, inhibition of binding indicates the presence of anti-ZIKV NS1 antibodies in the subject's sample, thus indicating ZIKV infection of the subject. In contrast, binding inhibition is typically not expected in samples from uninfected subjects. Importantly, this assay using ZIKV #1-binding antibodies does not yield positive results in subjects who have already been infected with other flaviviruses. Flaviviruses typically induce large amounts of antibodies that cross-react with ZIKV. In other words, this assay is highly specific and independent of cross-reacting Abs.
Таким образом, возможен анализ блокировки связывания для диагностики in-vitro инфекции, вызванной вирусом Зика, включающий следующие стадии:Thus, a binding block assay for in-vitro diagnosis of Zika virus infection is possible, involving the following steps:
(I) добавление выделенного образца от субъекта, подлежащего диагностике, на планшет, покрытый NS1 белком ZIKV, и инкубирование указанного образца на указанном планшете, (II) добавление антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или комплекса, (III) определение ингибирования связывания указанного антитела или его антиген-связывающего фрагмента.(I) adding an isolated sample from the subject to be diagnosed to a plate coated with the ZIKV NS1 protein and incubating said sample on said plate, (II) adding an antibody or antigen binding fragment or complex thereof, (III) determining whether said antibody or complex is inhibited from binding by antigen-binding fragment.
Предпочтительно, выделенный образец от субъекта, подлежащего диагностике, выбирают из крови, слюны или мочи; предпочтительно образец представляет собой образец крови, такой как цельная кровь, плазма или сыворотка.Preferably, the isolated sample from the subject to be diagnosed is selected from blood, saliva or urine; preferably the sample is a blood sample, such as whole blood, plasma or serum.
Также является предпочтительным, что антитело, или его антигенсвязывающий фрагмент, добавляемый на стадии (II), является меченным, предпочтительно биотинилированный или конъюгированный с пероксидазой хрена (HRP).It is also preferred that the antibody, or antigen binding fragment thereof, added in step (II) is labeled, preferably biotinylated or horseradish peroxidase (HRP) conjugated.
Кроме того, выделенный образец от субъекта, подлежащего диагностике, предпочтительно разводят, например, 1:5 - 1:50, предпочтительно 1:5-1:25, например, 1:10.In addition, the isolated sample from the subject to be diagnosed is preferably diluted, for example, 1:5 - 1:50, preferably 1:5-1:25, for example, 1:10.
Предпочтительно, время инкубирования на стадии (I) составляет по меньшей мере 5 мин, предпочтительно по меньшей мере 15 мин, более предпочтительно по меньшей мере 30 мин, еще более предпочтительно по меньшей мере 45 мин и наиболее предпочтительно по меньшей мере 60 мин.Preferably, the incubation time in step (I) is at least 5 minutes, preferably at least 15 minutes, more preferably at least 30 minutes, even more preferably at least 45 minutes and most preferably at least 60 minutes.
На стадии (II) после добавления антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно инкубировать в течение по меньшей мере 1 мин, предпочтительно, по меньшей мере 3 мин, более предпочтительно по меньшей мере 5 мин, еще более предпочтительно по меньшей мере 10 мин и наиболее предпочтительно по меньшей мере 15 мин.In step (II), after adding the antibody or antigen binding fragment thereof, the antibody or antigen binding fragment thereof may be incubated for at least 1 minute, preferably at least 3 minutes, more preferably at least 5 minutes, even more preferably at least 10 minutes and most preferably at least 15 minutes.
Предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые используют в качестве зондового антитела в анализе блокировки связывания, представляет собой предпочтительное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. Например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент предпочтительно могут представлять собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, связывающиеся с антигенной детерминантой S2 NS1 белка вируса Зика. Наиболее предпочтительно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые используют в качестве зондового антитела в анализе блокировки связывания, являются антителом или его антигенсвязывающий фрагментом, содержащим CDRH1, CDRH2, и CDRH3 аминокислотные последовательности и CDRL1, CDRL2, и CDRL3 аминокислотные последовательности (I) в соответствии с SEQ ID NO: 127-131 и 133; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей; или (II) в соответствии с SEQ ID NO: 127-130 и 132-133; или варианты их функциональной последовательности, имеющие по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Особенно предпочтительно,Preferably, the antibody or antigen binding fragment thereof that is used as a probe antibody in the binding blocking assay is a preferred antibody or antigen binding fragment thereof. For example, the antibody or antigen binding fragment thereof may preferably be an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to the S2 NS1 antigenic determinant of the Zika virus protein. Most preferably, the antibody or antigen binding fragment thereof that is used as a probe antibody in a binding blocking assay is an antibody or antigen binding fragment thereof comprising CDRH1, CDRH2, and CDRH3 amino acid sequences and CDRL1, CDRL2, and CDRL3 amino acid sequences (I) according to with SEQ ID NOs: 127-131 and 133; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity; or (II) in accordance with SEQ ID NO: 127-130 and 132-133; or functional sequence variants thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, according to at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. Particularly preferably
- 65 046175 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в соответствии с настоящим изобретением, которые используют в качестве зондового антитела в анализе блокировки связывания, представляют собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащий вариабельный участок тяжелой цепи (VH) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 134 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей и/или вариабельный участок легкой цепи (VL) с аминокислотной последовательностью в соответствии с SEQ ID NO: 135 или вариант его функциональной последовательности, имеющий по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичность последовательностей. Например, ингибирование связывания типичных биотинилированных антител или их антигенсвязывающих фрагментов может быть оценено путем определения оптимальной концентрации антитела или его антигенсвязывающего фрагмента в соответствии с настоящим изобретением для достижения 70% максимального связывания с NS1 белком ZIKV. Например, оптимальные концентрации типичных антител gZKA15, gZKA25 и gZKA35 для достижения 70% максимального связывания с NS1 белком ZIKV могут составлять 38, 17 и 7 нг/мл, соответственно. После осуществления вышеописанного анализа блокировки связывания, можно добавлять субстрат, такой как p-NPP, и ELISA планшет можно анализировать при 405 нм и рассчитывать процентное значение ингибирования связывания согласно следующему уравнению (I):- 65 046175 The antibody or antigen binding fragment thereof, in accordance with the present invention, which is used as a probe antibody in a binding blocking assay, is an antibody or antigen binding fragment thereof containing a heavy chain variable region (VH) with the amino acid sequence in accordance with SEQ ID NO: 134 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92 %, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity and/or light chain variable region (VL) with the amino acid sequence according to SEQ ID NO: 135 or a functional sequence variant thereof having at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85%, at least 88%, at least 90%, at least 92%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. For example, the inhibition of binding of typical biotinylated antibodies or antigen binding fragments thereof can be assessed by determining the optimal concentration of the antibody or antigen binding fragment thereof in accordance with the present invention to achieve 70% maximum binding to the ZIKV NS1 protein. For example, the optimal concentrations of typical antibodies gZKA15, gZKA25 and gZKA35 to achieve 70% maximum binding to the ZIKV NS1 protein may be 38, 17 and 7 ng/ml, respectively. After performing the above binding inhibition assay, a substrate such as p-NPP can be added and the ELISA plate can be run at 405 nm and the percentage binding inhibition value can be calculated according to the following equation (I):
(I) % ингиб = (1-[(ОП образца-ОП отриц контр)/ (ОП полож контр-ОП отриц контр)]) х 100 где % ингиб относится к процентному значению ингибирования связывания антитела или его антигенсвязывающего фрагмента в соответствии с настоящим изобретением с NS1 белком ZIKV; ОП образца относится к оптической плотности образца; ОП отриц контр относится к оптической плотности отрицательного контроля; и ОП полож контр относится к оптической плотности положительного контроля.(I) % Inhibit = (1-[(OD of sample - OD of negative counter)/ (OD of positive counter - OD of negative counter)]) x 100 where % inhibition refers to the percentage inhibition of binding of an antibody or antigen-binding fragment according to this invention with ZIKV NS1 protein; The OD of a sample refers to the optical density of the sample; The OD of negative control refers to the optical density of the negative control; and OD positive control refers to the optical density of the positive control.
Этот анализ обеспечивает определенные преимущества, такие как способность обнаруживать клинические, субклинические и асимптоматические инфекции ZIKV на уровне популяции, и при этом можно их отличать от инфекций, вызванных другими флавивирусами, такими как DENV. В особенности, диагностический анализ в соответствии с настоящим изобретением обеспечивает более высокую точность, чем прямые анализы ELISA связывания.This assay provides certain advantages, such as the ability to detect clinical, subclinical, and asymptomatic ZIKV infections at the population level while distinguishing them from infections caused by other flaviviruses such as DENV. In particular, the diagnostic assay in accordance with the present invention provides higher accuracy than direct binding ELISA assays.
Кроме того, диагностику (in vitro) инфекции Зика (в выделенном образце) можно осуществлять с помощью антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с NS1 белком ZIKV, комплекса, композиции или набора для определения, является ли выделенный образец (жидкости организма), такой как выделенный образец крови, инфицирован вирусом Зика.In addition, diagnosis (in vitro) of Zika infection (in an isolated sample) can be performed using an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to the ZIKV NS1 protein, complex, composition or kit to determine whether the isolated sample (body fluid) is such as the isolated blood sample is infected with the Zika virus.
Предпочтительные выделенные образцы (субъекта) включают образцы жидкости организма и образцы тканей. Более предпочтительным является образец жидкости организма. Предпочтительные жидкости организма для диагностики инфекции ZIKV включают кровь (например, цельная кровь, плазма, сыворотка), слюна и моча. Наиболее предпочтительной является кровь, в особенности плазма или сыворотка. Кроме того, предпочтительные диагностические анализы представляют собой иммунологические анализы. Предпочтительные примеры иммунологических анализов включают ELISA, иммунофлуоресценцию, иммуногистохимию и проточную цитометрию. Предпочтительно, диагностика включает ELISA. Наиболее предпочтительно, используют анализ блокировки связывания, как описано выше.Preferred isolated (subject) samples include body fluid samples and tissue samples. A body fluid sample is preferred. Preferred body fluids for diagnosing ZIKV infection include blood (eg, whole blood, plasma, serum), saliva, and urine. Most preferred is blood, especially plasma or serum. In addition, preferred diagnostic tests are immunoassays. Preferred examples of immunoassays include ELISA, immunofluorescence, immunohistochemistry and flow cytometry. Preferably, the diagnosis includes ELISA. Most preferably, a binding blocking assay is used as described above.
Предпочтительно, способ (in vitro) диагностики инфекции Зика (в выделенном образце) может включать этапы:Preferably, the method (in vitro) for diagnosing Zika infection (in an isolated sample) may comprise the steps of:
(I) контактирование выделенного образца с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которое связывается с NS1 белком ZIKV, комплексом или композицией.(I) contacting the isolated sample with an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the ZIKV NS1 protein, complex or composition.
Более предпочтительно, способ (in vitro) диагностики инфекции Зика (в выделенном образце) может включать следующие этапы:More preferably, the method (in vitro) for diagnosing Zika infection (in an isolated sample) may include the following steps:
(0) добавление выделенного образца от субъекта, подлежащего диагностике, (например, образца жидкости организма, такого как кровь (например, цельная кровь, плазма, сыворотка), слюна и моча) на ELISA планшет, покрытый NS1 белком ZIKV;(0) adding an isolated sample from the subject to be diagnosed (eg, a sample of a body fluid such as blood (eg, whole blood, plasma, serum), saliva and urine) onto an ELISA plate coated with the ZIKV NS1 protein;
(I') дальнейшее добавление антитела или его антигенсвязывающего фрагмента на ELISA планшет, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент предпочтительно меченное, например, биотинилированное;(I') further adding the antibody or antigen binding fragment thereof to the ELISA plate, wherein the antibody or antigen binding fragment thereof is preferably labeled, for example biotinylated;
(II) необязательно, промывание планшета ELISA; и (III) определение ингибирования связывания антитела или его антигенсвязывающего фрагмента.(II) optionally, washing the ELISA plate; and (III) determining inhibition of binding of the antibody or antigen-binding fragment thereof.
Настоящее изобретение также предполагает применение нейтрализирующего антитела или его антигенсвязывающего фрагмента нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции для лечения или предотвращения инфекции ZIKV у субъектов с диагностированной инфекцией, выThe present invention also provides the use of a neutralizing antibody or antigen-binding nucleic acid fragment thereof, vector, cell or pharmaceutical composition for the treatment or prevention of ZIKV infection in subjects with a diagnosed infection, you
- 66 046175 званной вирусом Зика.- 66 046175 called the Zika virus.
Предложенный способ предотвращения и/или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика, может включать следующие стадии:A proposed method for preventing and/or treating Zika virus infection may include the following steps:
(I) диагностику инфекции, вызванной вирусом Зика, у субъекта путем применения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которое связывается с NS1 белком ZIKV, комплекса, композиции, или набора; и (II) введение указанному субъекту нейтрализирующего антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции.(I) diagnosing a Zika virus infection in a subject by administering an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the ZIKV NS1 protein, complex, composition, or kit; and (II) administering to said subject a neutralizing antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell, or pharmaceutical composition.
Предпочтительно, в этом способе предотвращения и/или лечения инфекции, вызванной вирусом Зика, стадию (I) диагностику инфекции, вызванной вирусом Зика, можно осуществлять в виде in-vitro диагностики на выделенном образце (жидкости организма), таком как выделенный образец крови.Preferably, in this method of preventing and/or treating Zika virus infection, step (I) diagnosing the Zika virus infection can be performed as an in-vitro diagnosis on an isolated sample (body fluid), such as an isolated blood sample.
Составной комплект (набор), содержащий (I) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которое связывается с NS1 белком ZIKV, комплекс, композицию; и (II) нейтрализирующее антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, нуклеиновую кислоту, вектор, клетку или фармацевтическую композицию, пригоден для использования в способе, как описано выше. Путем применения такого способа и/или такого набора, ZIKV инфекция может быть специфически диагностироваться, а также предотвращаться и/или лечиться.A composite kit (kit) containing (I) an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to the ZIKV NS1 protein, complex, composition; and (II) the neutralizing antibody or antigen binding fragment, nucleic acid, vector, cell or pharmaceutical composition thereof, suitable for use in the method as described above. By using such a method and/or such a kit, ZIKV infection can be specifically diagnosed as well as prevented and/or treated.
Описание фигурDescription of the figures
Фиг. 1 показывает реакционную способность (ELISA) и ZIKV и DENV1 нейтрализирующую активность антител, полученных от четырех ZIKV иммунокомпетентных доноров (ZKA, ZKB, ZKC и ZKD) к Е белку ZIKV и DENV1-4 и к EDIII-домену Е белка ZIKV; NNB -нейтрализирующие, но не связывающие Е белок, антитела.Fig. 1 shows the reactivity (ELISA) of both ZIKV and DENV1 neutralizing activity of antibodies obtained from four ZIKV immunocompetent donors (ZKA, ZKB, ZKC and ZKD) to the ZIKV E protein and DENV1-4 and to the EDIII domain of the ZIKV E protein; NNB - neutralizing, but not E protein binding, antibodies.
Фиг. 2 показывает реакционную способность (ELISA) антител, полученных от четырех ZIKV иммунокомпетентных доноров (ZKA, ZKB, ZKC и ZKD) к NS1 белку из ZIKV, DENV1-4 и других флавивирусов. YFV - вирус желтой лихорадки; WVN - вирус лихорадки Западного Нила; JEV - вирус японского энцефалита; и TBEV - вирус клещевого энцефалита (но, не определяли).Fig. 2 shows the reactivity (ELISA) of antibodies obtained from four ZIKV immunocompetent donors (ZKA, ZKB, ZKC and ZKD) to the NS1 protein from ZIKV, DENV1-4 and other flaviviruses. YFV - yellow fever virus; WVN - West Nile virus; JEV - Japanese encephalitis virus; and TBEV - tick-borne encephalitis virus (but not determined).
Фиг. 3 показывает связывание ZKA190, ZKA78 и ZKA64 антител с ZIKV и DENV1 Е и с ZIKV ED III белками, как измерено с помощью ELISA.Fig. 3 shows the binding of ZKA190, ZKA78 and ZKA64 antibodies to ZIKV and DENV1 E and to ZIKV ED III proteins as measured by ELISA.
Фиг. 4 показывает связывание ZKA185 и ZKA190 антител с ZIKV E, DENV1 VLP и с ZIKV EDIII белками, как измерено с помощью ELISA.Fig. 4 shows the binding of ZKA185 and ZKA190 antibodies to ZIKV E, DENV1 VLP and ZIKV EDIII proteins as measured by ELISA.
Фиг. 5 показывает связывание к ZKA15, ZKA25 и ZKA35 антител с ZIKV и DENV1-4 NS1 белками, как измерено с помощью ELISA.Fig. 5 shows the binding of ZKA15, ZKA25 and ZKA35 antibodies to ZIKV and DENV1-4 NS1 proteins as measured by ELISA.
Фиг. 6 показывает для примера 3 картирование антигенной детерминанты ZIKV NS1 белка, используя исследования перекрестно-конкурентного Octet-связывания. (А-В) Перекрестно конкурирующую матрицу осуществляли с помощью Octet на 24 mAb, специфических для ZIKV NS1 (А) или перекрестнореагирующий с DENV NS1 (В). +, отсутствие связывания вторичного Ab; +/-, частичная потеря связывания вторичного mAb; -, связывание вторичного mAb. Перечеркнутые клетки, не тестировали. (С) Карта антигенных детерминант, нацеленных на ZIKV №1-специфических mAb, как определено с использованием BLI (Octet) перекрестной конкуренции.Fig. 6 shows for Example 3 mapping of the ZIKV NS1 antigenic determinant protein using cross-competitive Octet binding assays. (A-B) Cross-competition array was performed using Octet 24 mAbs specific for ZIKV NS1 (A) or cross-reactive with DENV NS1 (B). +, absence of secondary Ab binding; +/-, partial loss of secondary mAb binding; -, secondary mAb binding. Crossed out cells were not tested. (C) Map of antigenic determinants targeted by ZIKV #1-specific mAbs as determined using BLI (Octet) cross-competition.
Фиг. 7 показывает для примера 4 анализ блокады связывания, используя mAb ZKA35 в качестве зонда для обнаружения ZIKV NS1 в плазме ZIKV-иммунных (n=4), DENV- иммунных (n=5) и контрольных доноров (n=48) (1/10 разведение). Образцы плазмы тестировали для определения их способности связываться с NS1 (прозрачные кружечки) и ингибировать связывание биотинилированного mAb ZKA35 с NS1 (зарисованные кружечки).Fig. 7 shows for Example 4 a binding blockade assay using mAb ZKA35 as a probe to detect ZIKV NS1 in the plasma of ZIKV-immune (n=4), DENV-immune (n=5) and control donors (n=48) (1/10 breeding). Plasma samples were tested to determine their ability to bind NS1 (open circles) and inhibit the binding of biotinylated mAb ZKA35 to NS1 (solid circles).
Фиг. 8 показывает для примера 5 нейтрализирующую активность ZKA190, ZKA64, ZKA64-LALA, ZKA230 и ZKA78 антител по отношению к ZIKV (H/PF/2013 штамм) и DENV1 на клетках Vero, как определено путем проточной цитометрии (% инфицированных клеток).Fig. 8 shows for Example 5 the neutralizing activity of ZKA190, ZKA64, ZKA64-LALA, ZKA230 and ZKA78 antibodies against ZIKV (H/PF/2013 strain) and DENV1 on Vero cells as determined by flow cytometry (% cells infected).
Фиг. 9 показывает для примера 5 нейтрализирующую активность ZKA190, ZKA64, ZKA185, ZKA230 и ZKA78 антител по отношению к ZIKV (H/PF/2013 штамм) на клетках Vero, как определено путем анализа жизнеспособности клеток (wst-1, Roche).Fig. 9 shows for Example 5 the neutralizing activity of ZKA190, ZKA64, ZKA185, ZKA230 and ZKA78 antibodies against ZIKV (H/PF/2013 strain) on Vero cells as determined by cell viability assay (wst-1, Roche).
Фиг. 10 показывает для примера 6 активность усиления инфицирования (ADE, антителозависимое усиление) ZKA190, ZKA64, ZKA64-LALA, ZKA185, ZKA230 и ZKA78 антител для ZIKV (H/PF/2013 штамм) на непермиссивных K562 клетках, как определено путем проточной цитометрии (% инфицированных клеток).Fig. 10 shows for Example 6 the infection enhancing activity (ADE, antibody dependent enhancement) of ZKA190, ZKA64, ZKA64-LALA, ZKA185, ZKA230 and ZKA78 antibodies for ZIKV (H/PF/2013 strain) on non-permissive K562 cells as determined by flow cytometry (% infected cells).
Фиг. 11 показывает для примера 6, что четыре ZIKV-иммунных плазмы и одна DENV-иммунная плазма проявляют сходную активность усиления ZIKV инфекции K562 клеток (верхняя панель). Этот ADE эффект полностью блокируется во всех пяти иммунных плазмах с помощью EDIII-специфического ZKA64-LALA антитела (нижняя панель).Fig. 11 shows for Example 6 that four ZIKV-immune plasmas and one DENV-immune plasma exhibited similar activity in enhancing ZIKV infection of K562 cells (top panel). This ADE effect was completely blocked in all five immune plasmas by the EDIII-specific ZKA64-LALA antibody (lower panel).
Фиг. 12 показывает выравнивание аминокислот EDIII участка для 39 ZIKV штаммов из азиатских линий с 2013 г. (включая прототипный штамм MR766 африканской линии, выделенный в 1947 г).Fig. 12 shows the amino acid alignment of the EDIII region for 39 ZIKV strains from Asian lineages since 2013 (including the prototype strain MR766 of the African lineage, isolated in 1947).
Фиг. 13 показывает для примера 5 нейтрализирующую активность ZKA190 и ZKA190-LALA антиFig. 13 shows for example 5 the neutralizing activity of ZKA190 and ZKA190-LALA anti
- 67 046175 тело по отношению к трем штаммам ZIKV (H/PF/2013, MR766 и MRS_OPY_Martinique_PaRi_2015) на клетках Vero, как определено путем проточной цитометрии (% инфицированных клеток).- 67 046175 body against three ZIKV strains (H/PF/2013, MR766 and MRS_OPY_Martinique_PaRi_2015) on Vero cells as determined by flow cytometry (% of cells infected).
Фиг. 14 показывает для примера 7 NS1 анализ блокировки связывания для резидентов Европы. Представлены ВОВ значения для образцов, собранных в Италии и Швейцарии. Графически представлены ВОВ значения в образцах от ZIKV, первично и вторично DENV-, WNV-, и CHIKV-инфицированных индивидуумов и панель образцов крови здоровых доноров со Швейцарии.Fig. 14 shows for Example 7 NS1 a binding block analysis for European residents. BOB values are presented for samples collected in Italy and Switzerland. VACV values in samples from ZIKV, primary and secondary DENV-, WNV-, and CHIKV-infected individuals and a panel of blood samples from healthy donors from Switzerland are graphically presented.
Фиг. 15 показывает для примера 8 нейтрализацию ZKA190 и С8 mAb, тестируемых по отношению к панели четырех штаммов ZIKV, как определено в процентах инфицированных клеток Vero в присутствии возрастающих количеств mAb (А). Также представлены IC50 значения (В) и статистика (С). Данные репрезентативны для по меньшей мере двух независимых экспериментов.Fig. 15 shows for Example 8 the neutralization of ZKA190 and C8 mAbs tested against a panel of four ZIKV strains, as determined by the percentage of Vero cells infected in the presence of increasing amounts of mAb (A). IC 50 values (B) and statistics (C) are also presented. Data are representative of at least two independent experiments.
Фиг. 16 показывает для примера 9 нейтрализацию и усиление инфекции ZIKV с помощью антитела ZKA190. (А) Нейтрализация инфекции ZIKV PRVABC59 штамма hNPC с помощью ZKA190, ZKA190LALA и контрольного mAb, как определяли путем анализа бляшкообразования на клетках Vero (левая панель) и непрямой иммунофлуоресценции инфицированных hNPC, используя меченное флуорофором анти-Е антитело (правая панель). (В) ADE инфекции ZIKV непермиссивных K562 клеток с помощью ZKA190 и ZKA190-LALA. (С) ADE индуцировали в K562 клетках, если ZIKV предварительно инкубировали с серийными разведениями плазмы сыворотки от различных ZIKV-положительных пациентов (левая панель). Если ZKA190 LALA добавляли к комплексам ZIKV-сыворотка, то ADE ингибировалось (правая панель). (D) ADE индуцировалось в K562 клетках, если ZIKV предварительно инкубировали с серийными разведениями prM перекрестно-реагирующих mAb (DV62), имеющих происхождение из DENV-иммунокомпетентного донора. ZKA190-LALA ингибирует ADE от ZIKV, если образует комплексы с prM-реакционноспособным антителом DV62. (Е) Влияние на ADE, индуцированное пиковым усиленным разведением DENV2 плазмы (левая панель) или анти-prM DV62 mAb (правая панель) с помощью серийных разведений указанных mAb.Fig. 16 shows for Example 9 neutralization and enhancement of ZIKV infection by antibody ZKA190. (A) Neutralization of ZIKV PRVABC59 strain hNPC infection by ZKA190, ZKA190LALA, and control mAb, as determined by plaque formation assay on Vero cells (left panel) and indirect immunofluorescence of infected hNPCs using fluorophore-labeled anti-E antibody (right panel). (B) ADE of ZIKV infection of nonpermissive K562 cells with ZKA190 and ZKA190-LALA. (C) ADE was induced in K562 cells when ZIKV was preincubated with serial dilutions of plasma serum from various ZIKV-positive patients (left panel). When ZKA190 LALA was added to ZIKV-serum complexes, ADE was inhibited (right panel). (D) ADE was induced in K562 cells when ZIKV was preincubated with serial dilutions of prM cross-reacting mAb (DV62) derived from a DENV-immunocompetent donor. ZKA190-LALA inhibits ADE from ZIKV when complexed with the prM-reactive antibody DV62. (E) Effect on ADE induced by peak enhanced dilution of plasma DENV2 (left panel) or anti-prM DV62 mAb (right panel) using serial dilutions of the indicated mAbs.
Фиг. 17 показывает для примера 10 идентификацию ZKA190 эпитопа и анализ его консервативности в ZIKV штаммах. (А) Наложение [15N/1H]-HSQC спектров ^-меченного ZIKV EDIII при отсутствии (черный) или присутствии (красный) немеченого ZKA190 Fab. Различия идентифицируют EDIII остатки, задействованные в связывание антитела. (В) ЯМР картирование эпитопа ZKA190 Fab в комплексе с ZKV EDIII. Пертурбацию химического сдвига (CSP, у-ось) графически представляли относительно номеров EDIII остатков. Остатки, задействованные в связывание антитела, выделенные красным цветом. (С) Остатки в FG петле, идентифицированные с помощью ЯМР картирования эпитопа, частично скрыты в Е белке мол А, но в значительной степени экспонируются в молекулах В и С. EDIII E белка выделенный синим цветом. Остатки, идентифицированные с помощью ЯМР картирования эпитопа, окрашены в пурпурный цвет, за исключением тех в FG петли, которые окрашены в зеленый цвет. Смежные Е белки показаны в виде серой поверхности. (D) Уровень консервативности аминокислотных остатков в ZKA190 эпитопе, как рассчитано с помощью анализа последовательностей из 217 ZIKV штаммов, обнаруженных в базе данных источников ZIKV (NCBI) на 24 ноября 2016 г. (Е) Открытая репрезентация, демонстрирующая загрузку комплементарности между эпитопом и паратопом в результате причаливания. Границы эпитопа и паратопа очерчены зеленым цветом. Границы между тяжелыми и легкими цепями Fab и их соответствующие области узнавания на EDIII показаны желтыми пунктирными линиями.Fig. 17 shows for example 10 the identification of the ZKA190 epitope and analysis of its conservation in ZIKV strains. (A) Overlay of [ 15 N/ 1 H]-HSQC spectra of ^-labeled ZIKV EDIII in the absence (black) or presence (red) of unlabeled ZKA190 Fab. The differences identify the EDIII residues involved in antibody binding. (B) NMR epitope mapping of ZKA190 Fab in complex with ZKV EDIII. Chemical shift perturbation (CSP, y-axis) was graphically represented relative to the numbers of EDIII residues. Residues involved in antibody binding are highlighted in red. (C) Residues in the FG loop identified by NMR epitope mapping are partially buried in the E protein of mol A but are largely exposed in molecules B and C. EDIII E protein is highlighted in blue. Residues identified by NMR epitope mapping are colored magenta, except for those in the FG loop, which are colored green. Adjacent E proteins are shown as a gray surface. (D) Level of conservation of amino acid residues in the ZKA190 epitope, as calculated by sequence analysis of 217 ZIKV strains found in the ZIKV Source Database (NCBI) as of November 24, 2016. (E) Open representation showing complementarity loading between epitope and paratope as a result of mooring. The epitope and paratope boundaries are outlined in green. The boundaries between Fab heavy and light chains and their respective recognition regions on EDIII are shown as yellow dashed lines.
Фиг. 18 показывает для примера 10 ZKA190 эпитоп, идентифицированный с помощью ЯМР и причаливания. (А) Схематическое представление 12 ЯМР структур с наиболее низкой энергией ZIKV EDIII, с остатками, задействованными в ZKA190 связывание, выделенными красным цветом. Видно гибкость на N-конце конструкции. (В) Модель комплекса ZKA190:EDIII, полученного при моделировании причаливания и молекулярной симуляции, одобренные результатами ЯМР. Эпитоп на EDIII (серый), идентифицированный с помощью ЯМР, выделено красным цветов. Тяжелая и легкая цепь ZKA190 обозначены темно- и светло-зеленым цветом, соответственно. EDIII остатки, которые задействованные или не задействованные в связывание антитела, если мутированы, показаны оранжевыми и синими палочками, соответственно. (С) Идентифицированный ЯМР ZKA190 эпитоп (красный) доступный на поверхности вируса (белый).Fig. 18 shows for example 10 the ZKA190 epitope identified by NMR and docking. (A) Schematic representation of the 12 lowest energy NMR structures of ZIKV EDIII, with residues involved in ZKA190 binding highlighted in red. Flexibility is visible at the N-terminus of the structure. (B) Model of the ZKA190:EDIII complex obtained from mooring and molecular simulations, supported by NMR results. The epitope on EDIII (gray) identified by NMR is highlighted in red. The heavy and light chains of ZKA190 are indicated in dark and light green, respectively. EDIII residues that are or are not involved in antibody binding, if mutated, are shown as orange and blue sticks, respectively. (C) NMR identified ZKA190 epitope (red) accessible on the virus surface (white).
Фиг. 19 показывает для примера 10 связывание дт или мутированного EDIII с ZKA190 IgG. Представлены SPR данные и кинетики связывания. Показаны EDIII мутанты, которые задействованы (выделенные красным) или не задействованы в связывание, как представлено на фигуре.Fig. 19 shows for Example 10 the binding of wt or mutated EDIII to ZKA190 IgG. SPR data and binding kinetics are presented. Shown are EDIII mutants that are involved (in red) or not involved in binding as shown in the figure.
Фиг. 20 показывает для примера 11 результаты экспериментов конфокальной микроскопии. ZIKV инкубировали при концентрации, превышающей в 10 тыс. раз IC50 значение либо ZKA190 Fab или полноразмерных IgG, добавленных в клетки Vero. Комплекс ZIKV:антитело обнаруживали внутри клеток (зеленый) и локализованные совместно с эндосомами (красные, желтое перекрытие). Эндосомы и кислотные органеллы обозначены Lysotracker красным; Alexa-488 конъюгированные ZKA190 представлены зеленым цветом. Ядра окрашивали с помощью DAPI (синий).Fig. 20 shows for example 11 the results of confocal microscopy experiments. ZIKV was incubated at 10 thousand times the IC50 value of either ZKA190 Fab or full-length IgG spiked into Vero cells. The ZIKV:antibody complex was found intracellularly (green) and colocalized with endosomes (red, yellow overlap). Endosomes and acidic organelles are indicated by Lysotracker in red; Alexa-488 conjugated ZKA190 is represented in green. Nuclei were stained with DAPI (blue).
Фиг. 21 показывает для примера 12 профилактическую и терапевтическую эффективность ZKA190. (A) ZKA190 эффективно защитный по отношению к инфицированию ZIKV при введении профилактически мышам (А129 в (А) и AG129 в (В)), при воздействии летальной дозы ZIKV штамма МР17451. В эксFig. 21 shows for Example 12 the prophylactic and therapeutic efficacy of ZKA190. (A) ZKA190 is effectively protective against ZIKV infection when administered prophylactically to mice (A129 in (A) and AG129 in (B)) when exposed to a lethal dose of ZIKV strain MP17451. In ex
- 68 046175 периментах использовали N=4-8 мышей на группы. Представлены кривые выживания Каплан-Мейера (А). Достоверность определяли с помощью Mantel-Cox логарифмического рангового критерия. Панель А, слева вверху: ZKA190 в дозе 5, 1 и 0,2 мг/кг отн. Контр mAb, Р = 0,0031; ZKA190 в дозе 0,04 мг/кг отн. Контр mAb, Р = 0,0116; ZKA190-LALA в дозе 5, 1, 0,2 и 0,04 мг/кг отн. Контр mAb, P = 0,0031. Панель А, справа вверху: Оценка заболеваемости мышей при наблюдении в течение 14-15 дней (использовали два различных способа оценки; см. (Dowall, S.D., Graham, V.A., Rayner, E., Atkinson, В., Hall, G., Watson, R.J., Bosworth, A., Bonney, L.C., Kitchen, S., и Hewson, R. (2016). A Susceptible Mouse Model for Zika Virus Infection. PLoS Negl Trop Dis 10, e0004658-13). Панель А, нижние панели: масса тела мышей. Панели В: ZKA190 или ZKA190-LALA вводили в дозе 15 мг/кг в различные периоды времени после инфицирования ZIKV. Панель В, слева вверху: А Показана кривая выживания Каплан-Мейера. В экспериментах использовали N=5 мышей на группу. Достоверность определяли с помощью Mantel-Cox логарифмического рангового критерия. ZKA190 и ZKA190-LALA вводили либо в день 1, 2, 3 или 4 отн. Контр., Р = 0,0016. Панель В, справа вверху: Оценка заболеваемости мышей при наблюдении в течение 14 дней в соответствии с (Dowall и др., 2016). За мышами наблюдали в течение периода 14 дней для определения потери массы тела (Панель В, нижние панели). Контрольное антитело представляло собой МРЕ8, специфическое для RSV F белка (Corti, D., и др. Cross-neutralization of four paramyxoviruses by a human monoclonal antibody. Nature 501, 439-443 (2013)).- 68 046175 experiments used N=4-8 mice per group. Kaplan-Meier survival curves are shown (A). Significance was determined using the Mantel-Cox log-rank test. Panel A, top left: ZKA190 at 5, 1 and 0.2 mg/kg rel. Control mAb, P = 0.0031; ZKA190 at a dose of 0.04 mg/kg rel. Control mAb, P = 0.0116; ZKA190-LALA at a dose of 5, 1, 0.2 and 0.04 mg/kg rel. Control mAb, P = 0.0031. Panel A, top right: Morbidity assessment of mice observed for 14-15 days (two different assessment methods were used; see Dowall, S.D., Graham, V.A., Rayner, E., Atkinson, B., Hall, G., Watson, R. J., Bosworth, A., Bonney, L. C., Kitchen, S., and Hewson, R. (2016). A Susceptible Mouse Model for Zika Virus Infection. PLoS Negl Trop Dis 10, e0004658-13). bottom panels: body weight of mice Panel B: ZKA190 or ZKA190-LALA administered at 15 mg/kg at various time points after ZIKV infection Panel B, top left: A Kaplan-Meier survival curve shown Experiments used N=5 mice per group. Significance was determined using the Mantel-Cox log-rank test. ZKA190 and ZKA190-LALA were administered on either day 1, 2, 3, or 4 rel. Control, P = 0.0016. Panel B, top right: Incidence estimates mice were observed for 14 days according to (Dowall et al., 2016).Mice were observed for a period of 14 days to determine body weight loss (Panel B, bottom panels). The control antibody was MPE8, specific for RSV F protein (Corti, D., et al. Cross-neutralization of four paramyxoviruses by a human monoclonal antibody. Nature 501, 439-443 (2013)).
Фиг. 22 показывает для примера 12 профилактическую эффективность анти-ZIKV EDIIIспецифических mAb ZKA190 по отношению к ZIKV штаммами МР1741. (А) Представлена вирусемия, измеренная в виде БОЕ/мл в день 5 в крови всех животных. (В) Вирусную нагрузку измеряли в виде геномных копий/мл с помощью количественной ПЦР в день 5 в крови всех животных и в крови и указанных тканях, если животных отбраковывали при окончании исследования или если достигали гуманных конечных точек. (С) За мышами наблюдали в течение 14 дневного периода для определения потери массы тела (D) Концентрация IgG в сыворотке крови человека в день 5 образцы крови. Достоверность определяли по сравнению с контрольным антителом, обработка с помощью непараметрического неспаренного критерия Манна-Уитни-Уилкоксона. *р < 0,05; **р < 0,01; ***р<0,001.Fig. 22 shows for Example 12 the preventive efficacy of anti-ZIKV EDIII-specific mAb ZKA190 against ZIKV strains MP1741. (A) Viremia measured as PFU/mL on day 5 in the blood of all animals is shown. (B) Viral load was measured as genomic copies/ml by qPCR on day 5 in the blood of all animals and in the blood and designated tissues if animals were discarded at the end of the study or if humane endpoints were met. (C) Mice were observed over a 14-day period to determine body weight loss (D) IgG concentrations in human serum on day 5 blood samples. Significance was determined in comparison with a control antibody using the nonparametric unpaired Mann-Whitney-Wilcoxon test. *p < 0.05; **p < 0.01; ***p<0.001.
Фиг. 23 показывает для примера 12 терапевтическую эффективность анти-ZIKV EDIIIспецифических mAb ZKA190. (А) Вирусные нагрузки измеряли в виде БОЕ в день 5 в крови всех животных. (В) Вирусные нагрузки измеряли в виде геномных копий с помощью количественной ПЦР в день 5 в крови всех животных и в крови и указанных тканях, если животных отбраковывали при окончании исследования или если достигали гуманных конечных точек. Достоверность определяли по сравнению с контрольным антителом, обработка с помощью непараметрического неспаренного критерия МаннаУитни-Уилкоксона. *р < 0,05; **р < 0,01. (С) Концентрация IgG в сыворотке крови человека в день 5 образцы крови.Fig. 23 shows for Example 12 the therapeutic efficacy of the anti-ZIKV EDIII-specific mAb ZKA190. (A) Viral loads were measured as PFU on day 5 in the blood of all animals. (B) Viral loads were measured as genomic copies by qPCR on day 5 in the blood of all animals and in the blood and designated tissues if animals were discarded at the end of the study or if humane endpoints were met. Significance was determined in comparison with a control antibody using the nonparametric unpaired Mann-Whitney-Wilcoxon test. *p < 0.05; **p < 0.01. (C) IgG concentration in human serum on day 5 blood samples.
ПримерыExamples
В последующих примерах представлены иллюстративные варианты осуществления настоящего изобретения. Последующие примеры представлены только с целью иллюстрации и помощи квалифицированному специалисту в данной области техники для использования изобретения. Примеры никоим образом не предназначены для ограничений другим путем объема изобретения.The following examples present illustrative embodiments of the present invention. The following examples are presented for the purpose of illustration only and to assist one skilled in the art in using the invention. The examples are not intended to limit the scope of the invention in any other way.
Пример 1. Выделение ZIKV-специфических антител и продукция моноклональных антител.Example 1. Isolation of ZIKV-specific antibodies and production of monoclonal antibodies.
IgG+ В-клетки памяти выделяли из криоконсервированных мононуклеаров периферической крови (РВМС) от четырех ZIKV-инфицированных доноров (ZKA, ZKB, ZKC и ZKD), используя CD22 микрошарики (Miltenyi Biotec), с последующим истощением клеток, несущих IgM, IgD и IgA, путем сортировки клеток. После этого В-клетки памяти от ZIKV-инфицированных доноров иммортализовали с EBV (вирус Эпштейна-Барра) и CpG (CpG олигодезоксинуклеотид 2006) во множественных параллельных лунках, как было описано ранее (Traggiai, E. и др., Nat. Med. 10, 871-875, 2004) и затем культуральные супернатанты тестировали в первичном скрининге, используя параллельно микро-анализ на нейтрализацию на основании 384 лунок и анализ связывания (ELISA) для тестирования их связывания с NS1 белком ZIKV или с Е белком ZIKV. Результаты анализа связывания представлены на фиг. 1 (связывание с Е белком ZIKV) и фиг. 2 (связывание с NS1 белком ZIKV).IgG+ memory B cells were isolated from cryopreserved peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from four ZIKV-infected donors (ZKA, ZKB, ZKC, and ZKD) using CD22 microbeads (Miltenyi Biotec), followed by depletion of cells bearing IgM, IgD, and IgA. by cell sorting. Memory B cells from ZIKV-infected donors were then immortalized with EBV (Epstein-Barr virus) and CpG (CpG oligodeoxynucleotide 2006) in multiple parallel wells as previously described (Traggiai, E. et al., Nat. Med. 10 , 871-875, 2004) and then the culture supernatants were tested in a primary screen using a parallel 384-well microneutralization assay and binding assay (ELISA) to test their binding to the ZIKV NS1 protein or to the ZIKV E protein. The results of the binding assay are presented in FIG. 1 (binding to ZIKV E protein) and FIG. 2 (binding to ZIKV NS1 protein).
Анализы на нейтрализацию проводили на клетках Vero. В планшете на 384 лунки, ZIKV H/PF/2013, что приводило к заражению (m.o.i, множественность заражения) 0,35, инкубировали с супернатантами в течение 1 ч при 37% (5% СО2) перед добавлением предварительно высеянных 5 тыс. клеток Vero. Их инкубировали дополнительно в течение 5 дней, после этого супернатант удаляли и добавляли WST-1 реагент (Roche). Положительные культуры собирали и размножали. Из положительных культур получали VH и VL последовательности с помощью ОТ-ПЦР. Антитела клонировали в человеческих IgG1 и Ig каппа или Ig лямбда экспрессионных векторах (предоставленными Michel Nussenzweig, Rockefeller University, New York, US), по существу, как описано (Tiller T, Meffre E, Yurasov S, Tsuiji M, Nussenzweig MC, Wardemann H (2008) Efficient generation of monoclonal antibodies from single human В cells by single cell RT-PCR and expression vector cloning. J Immunol Methods 329: 112-124). Моноклональные антитела получали из EBV-иммортализованых В-клеток или путем временной трансфекции 293 Freestyle клеток (Invitrogen). Супернатанты из В-клеток или трансфектированных клеток собирали и IgG аффинно очищали сNeutralization assays were performed on Vero cells. In a 384-well plate, ZIKV H/PF/2013, which resulted in an infection (moi, multiplicity of infection) of 0.35, was incubated with supernatants for 1 hour at 37% (5% CO 2 ) before adding pre-plated 5 thousand. Vero cells. They were incubated for an additional 5 days, after which the supernatant was removed and WST-1 reagent (Roche) was added. Positive cultures were collected and propagated. From positive cultures, VH and VL sequences were obtained by RT-PCR. Antibodies were cloned into human IgG1 and Ig kappa or Ig lambda expression vectors (provided by Michel Nussenzweig, Rockefeller University, New York, US) essentially as described (Tiller T, Meffre E, Yurasov S, Tsuiji M, Nussenzweig MC, Wardemann H (2008) Efficient generation of monoclonal antibodies from single human B cells by single cell RT-PCR and expression vector cloning. J Immunol Methods 329: 112-124). Monoclonal antibodies were generated from EBV immortalized B cells or by transient transfection of 293 Freestyle cells (Invitrogen). Supernatants from B cells or transfected cells were collected and IgG affinity purified with
- 69 046175 помощью хроматографии на Белке А или Белке G (GE Healthcare) и обессоливали по отношению к PBS.- 69 046175 using Protein A or Protein G chromatography (GE Healthcare) and desalted against PBS.
На фиг. 1 представлен обзор выбранных ZIKV нейтрализирующих антител (см. табл. 1 и 2 для аминокислотных последовательностей их CDR и вариабельных участков тяжелых/легких цепей). Две последние колонке на фиг. 1 описывают активности нейтрализации (IC50) для ZIKV и DENV1 (если их определяли). Другие колонки обеспечивают активности связывания (ЕС50) антител к ZIKV E белку (ZIKV E), DENV1 Е белку (DENV1 Е), DENV2 Е белку (DENV2 Е), DENV3 Е белку (DENV3 Е), DENV4 Е белку (DENV4 Е), DENV1 вирусоподобной частице (DENV1 VLP), DENV2 вирусоподобной частице (DENV2 VLP), DENV3 вирусоподобной частице (DENV3 VLP), DENV4 вирусоподобной частице (DENV4 VLP), и к EDIII-домену Е белка ZIKV (DIII ZKA).In fig. 1 provides an overview of selected ZIKV neutralizing antibodies (see Tables 1 and 2 for their CDR amino acid sequences and heavy/light chain variable regions). The last two columns in Fig. 1 describes the neutralization activities (IC 50 ) for ZIKV and DENV1 (if determined). Other columns provide binding activities (EC 50 ) of antibodies to ZIKV E protein (ZIKV E), DENV1 E protein (DENV1 E), DENV2 E protein (DENV2 E), DENV3 E protein (DENV3 E), DENV4 E protein (DENV4 E) , DENV1 virus-like particle (DENV1 VLP), DENV2 virus-like particle (DENV2 VLP), DENV3 virus-like particle (DENV3 VLP), DENV4 virus-like particle (DENV4 VLP), and to the EDIII domain of the ZIKV E protein (DIII ZKA).
Выделяли дополнительные антитела для определения их способности связываться с NS1 белком ZIKV (см. фиг. 2). Положительные культуры собирали и размножали. Из положительных культур получали VH и VL последовательности с помощью ОТ-ПЦР. Антитела клонировали в человеческих IgG1 и Ig каппа или Ig лямбда экспрессионных векторах (предоставленных Michel Nussenzweig, Rockefeller University, New York, US), по существу, как описано (Tiller T, Meffre E, Yurasov S, Tsuiji M, Nussenzweig MC, Wardemann H (2008) Efficient generation of monoclonal antibodies from single human В cells by single cell RT-PCR and expression vector cloning. J Immunol Methods 329: 112-124). Моноклональные антитела получали из EBV-иммортализованных В-клеток или путем временной трансфекции 293 Freestyle клеток (Invitrogen). Супернатанты из В клеток или трансфектированных клеток собирали и IgG аффинно очищали с помощью хроматографии на Белке А или Белке G (GE Healthcare) и обессоливали по отношению к PBS.Additional antibodies were isolated to determine their ability to bind to the ZIKV NS1 protein (see Fig. 2). Positive cultures were collected and propagated. From positive cultures, VH and VL sequences were obtained by RT-PCR. Antibodies were cloned into human IgG1 and Ig kappa or Ig lambda expression vectors (provided by Michel Nussenzweig, Rockefeller University, New York, US) essentially as described (Tiller T, Meffre E, Yurasov S, Tsuiji M, Nussenzweig MC, Wardemann H (2008) Efficient generation of monoclonal antibodies from single human B cells by single cell RT-PCR and expression vector cloning. J Immunol Methods 329: 112-124). Monoclonal antibodies were generated from EBV immortalized B cells or by transient transfection of 293 Freestyle cells (Invitrogen). Supernatants from B cells or transfected cells were collected and IgG affinity purified by Protein A or Protein G chromatography (GE Healthcare) and desalted against PBS.
На фиг. 2 представлено обзор выбранных антител, связывающих №1-белок ZIKV (см. табл. 4 и 5 для аминокислотных последовательностей их CDR и вариабельных участков тяжелых/легких цепей). В частности, на фиг. 2 представлены активности связывания (EC50) антител с NS1 белком ZIKV (ZIKV NS1), NS1 белку DENV1 (DENV1 NS1), NS1 белку DENV2 (DENV2 NS1), NS1 белку DENV3 (DENV3 NS1), NS1 белку DENV4 (DENV4 NS1), NS1 белку вируса желтой лихорадки (YFV NS1), S1 белку вируса лихорадки Западного Нила N (WNV NS1), NS1 белку вируса японского энцефалита (JEV NS1), и к NS1 белку вируса клещевого энцефалита (TBEV NS1).In fig. 2 provides an overview of selected antibodies that bind the ZIKV #1 protein (see Tables 4 and 5 for their CDR amino acid sequences and heavy/light chain variable regions). In particular, in FIG. Figure 2 shows the binding activity (EC 50 ) of antibodies to the NS1 protein of ZIKV (ZIKV NS1), NS1 protein of DENV1 (DENV1 NS1), NS1 protein of DENV2 (DENV2 NS1), NS1 protein of DENV3 (DENV3 NS1), NS1 protein of DENV4 (DENV4 NS1), NS1 protein of yellow fever virus (YFV NS1), S1 protein of West Nile virus N (WNV NS1), NS1 protein of Japanese encephalitis virus (JEV NS1), and NS1 protein of tick-borne encephalitis virus (TBEV NS1).
Пример 2. Характеристика антител ZKA190, ZKA185, ZKA230, ZKA64 и ZKA78.Example 2. Characterization of antibodies ZKA190, ZKA185, ZKA230, ZKA64 and ZKA78.
В примере 1, было идентифицировано большое количество ZIKV-нейтрализирующих антител и они были охарактеризованы в отношении их специфичности к ZIKV, в особенности Е белка ZIKV и ZIKV EDIII, а также в отношении их перекрестной реакционной способности к DENV. После этого антитела ZKA190 (SEQ ID NO: 1-18), ZKA185 (SEQ ID NO: 19-36), ZKA230 (SEQ ID NO: 37-54), ZKA64 (SEQ ID NO: 73-90) и ZKA 78 (SEQ ID NO: 55-72), описанные в Примере 1, отбирали и в дальнейшем тестировали по отношению к Е белку ZIKV (ZIKV), ZIKV EDIII (DIIIZI) и также тестировали по отношению к Е белку вируса денге (DENV, номер серотипа 1) с помощью ELISA. Для этого, использовали стандартный ELISA. Вкратце, ELISA планшеты покрывали Е белком ZIKV при концентрации 1 или 3 мкг/мл, блокировали с помощью 10% FCS в PBS, инкубировали с сывороткой или антителами человека и промывали. Связанные антитела обнаруживали путем инкубирования с АР-конъюгированными козьими античеловеческими IgG (Southern Biotech). После этого планшеты промывали, добавляли субстрат (р-NPP, Sigma) и планшеты анализировали при 405 нм. Относительные аффинности связывания моноклонального антитела определяли путем измерения концентрации антитела (ЕС50), необходимой для достижения 50% максимального связывания при насыщении.In Example 1, a large number of ZIKV neutralizing antibodies were identified and characterized with respect to their specificity for ZIKV, particularly ZIKV E protein and ZIKV EDIII, as well as their cross-reactivity with DENV. Subsequently, antibodies ZKA190 (SEQ ID NO: 1-18), ZKA185 (SEQ ID NO: 19-36), ZKA230 (SEQ ID NO: 37-54), ZKA64 (SEQ ID NO: 73-90) and ZKA 78 ( SEQ ID NO: 55-72) described in Example 1 were selected and further tested against the E protein of ZIKV (ZIKV), ZIKV EDIII (DIIIZI) and also tested against the E protein of dengue virus (DENV, serotype number 1 ) using ELISA. For this purpose, a standard ELISA was used. Briefly, ELISA plates were coated with ZIKV E protein at 1 or 3 μg/ml, blocked with 10% FCS in PBS, incubated with human serum or antibodies, and washed. Bound antibodies were detected by incubation with AP-conjugated goat anti-human IgG (Southern Biotech). After this, the plates were washed, the substrate (p-NPP, Sigma) was added and the plates were analyzed at 405 nm. The relative binding affinities of the monoclonal antibody were determined by measuring the antibody concentration (EC 50 ) required to achieve 50% maximum binding at saturation.
Результаты представлены на фиг. 3 и 4. Следует отметить, что ZKA64 и ZKA190 связываются с ZIKV E и ZIKV EDIII (DIII ZI) с низкими значениями ЕС50, таким образом указывая на то, что ZKA64 и ZKA190 связываются с доменом III E белка ZIKV (EDIII). ZKA78 связываются с ZIKV E, но не с ZIKV EDIII, указывая на то, что ZKA78 связывается с ZIKV E, но не нацелен на EDIII участок. Несмотря на их значительную ZIKV нейтрализирующую активность (см. фиг. 1), антитела ZKA185 и ZKA230 не проявляют какого-либо обнаруживаемого связывания с ZIKV E и ZIKV EDIII (фиг. 4). Таким образом, ZKA185 и ZKA230 обозначаются как нейтрализирующие, но не связывающие Е белок (NNB) антитела. Те NNB антитела предположительно распознают четвертичные эпитопы, которые экспонированы на ZIKV инфекционных вирионах, но не на растворимых белках.The results are presented in Fig. 3 and 4. It is noteworthy that ZKA64 and ZKA190 bind to ZIKV E and ZIKV EDIII (DIII ZI) with low EC 50 values, thus indicating that ZKA64 and ZKA190 bind to domain III of the ZIKV E protein (EDIII). ZKA78 binds to ZIKV E but not to ZIKV EDIII, indicating that ZKA78 binds to ZIKV E but is not targeted to the EDIII region. Despite their significant ZIKV neutralizing activity (see Fig. 1), antibodies ZKA185 and ZKA230 did not show any detectable binding to ZIKV E and ZIKV EDIII (Fig. 4). Thus, ZKA185 and ZKA230 are designated as neutralizing but non-E protein binding (NNB) antibodies. Those NNB antibodies presumably recognize quaternary epitopes that are displayed on ZIKV infectious virions, but not on soluble proteins.
Кроме того, ни одно из ZKA190, ZKA185, ZKA230, и ZKA64 не проявляют какого-либо обнаруживаемого связывания с DENV E белками (фиг. 1, DENV1-4 серотипы, и фиг. 3 и 4), указывая на то, что ZKA190, ZKA185, ZKA230, и ZKA64 являются специфическими к ZIKV и перекрестно не реагируют с вирусом денге. В отличие от этого, ZKA78, который предположительно связывается с ZIKV EDI/II, но не с ZIKV E DIII (см. фиг. 3), связывается с DENV белками (фиг. 1 и 3), указывая на то, что ZKA78 представляет собой перекрестно-реагирующее антитело, связывающееся с обоими, ZIKV и DENV.In addition, none of ZKA190, ZKA185, ZKA230, and ZKA64 exhibited any detectable binding to DENV E proteins (Fig. 1, DENV1-4 serotypes, and Figs. 3 and 4), indicating that ZKA190, ZKA185, ZKA230, and ZKA64 are specific to ZIKV and do not cross-react with dengue virus. In contrast, ZKA78, which is predicted to bind to ZIKV EDI/II but not ZIKV E DIII (see Fig. 3), binds to DENV proteins (Figs. 1 and 3), indicating that ZKA78 is cross-reactive antibody that binds to both ZIKV and DENV.
Для дополнительного подтверждения этих результатов, связывающиеся с Е белком ZIKV антитела ZKA190, ZKA64 и ZKA78 дополнительно тестировали по отношению к Е белку вируса денге (DENV, номера серотипов 1-4). ZKA64 и ZKA190 не связываются с Е белком DENV1-4, таким образом подтверждая тот факт, что ZKA64 и ZKA190 являются специфическими к ZIKV. В отличие от этого, ZKA78 связывается с DENV1-4 Е, подтверждая тот факт, что ZKA78 представляет собой перекрестно-реагирующее антитело, связывающееся с Е белком обоих ZIKV и DENV (см. фиг. 1).To further confirm these results, ZIKV E protein-binding antibodies ZKA190, ZKA64, and ZKA78 were further tested against the E protein of dengue virus (DENV, serotype numbers 1-4). ZKA64 and ZKA190 do not bind to the E protein of DENV1-4, thus confirming that ZKA64 and ZKA190 are specific to ZIKV. In contrast, ZKA78 binds to DENV1-4 E, confirming that ZKA78 is a cross-reactive antibody that binds to the E protein of both ZIKV and DENV (see Fig. 1).
- 70 046175- 70 046175
Пример 3. Характеристики ZIKV NSl-специфических антител для серологической диагностики.Example 3. Characteristics of ZIKV NSl-specific antibodies for serological diagnostics.
В примере 1, было идентифицировано большое количество №1-реакционноспособных антител и затем они были охарактеризованы в отношении их специфичности к ZIKV NS1 и перекрестной реакционной способности к другим белкам NS1 флавивирусов (фиг. 2). После этого антитела ZKA15 (SEQ ID NO: 91-108), ZKA25 (SEQ ID NO: 109 - 126) и ZKA35 (SEQ ID NO: 127-144) были дополнительно охарактеризованы в отношении их связывания с ZIKV NS1 и DENV1 NS1, DENV2 NS1, DENV3 NS1 и DENV4 NS1. Для этого использовали стандартный ELISA. Вкратце, ELISA планшеты покрывали NS1 белком ZIKV в концентрации 1 мкг/мл, блокировали с помощью 10% FCS в PBS, инкубировали с сывороткой или антителами человека и промывали. Связанные антитела обнаруживали путем инкубирования с АР-конъюгированными козьими анти-человеческими IgG (Southern Biotech). После этого планшеты промывали, добавляли субстрат (p-NPP, Sigma) и планшеты анализировали при 405 нм. Относительные аффинности связывания моноклонального антитела определяли путем измерения концентрации антитела (ЕС50), необходимой для достижения 50% максимального связывания при насыщении.In Example 1, a large number of #1-reactive antibodies were identified and then characterized with respect to their specificity for ZIKV NS1 and cross-reactivity with other flavivirus NS1 proteins (Fig. 2). Subsequently, antibodies ZKA15 (SEQ ID NO: 91-108), ZKA25 (SEQ ID NO: 109 - 126) and ZKA35 (SEQ ID NO: 127-144) were further characterized with respect to their binding to ZIKV NS1 and DENV1 NS1, DENV2 NS1, DENV3 NS1 and DENV4 NS1. For this purpose, a standard ELISA was used. Briefly, ELISA plates were coated with 1 μg/ml ZIKV NS1 protein, blocked with 10% FCS in PBS, incubated with human serum or antibodies, and washed. Bound antibodies were detected by incubation with AP-conjugated goat anti-human IgG (Southern Biotech). After this, the plates were washed, substrate (p-NPP, Sigma) was added and the plates were analyzed at 405 nm. The relative binding affinities of the monoclonal antibody were determined by measuring the antibody concentration (EC 50 ) required to achieve 50% maximum binding at saturation.
Результаты представлены на фиг. 5. Все три антитела (ZKA15, ZKA25 и ZKA35) связываются с высокой аффинностью с ZIKV NS1, но не с DENV1-4 NS1 антигенами (фиг. 5).The results are presented in Fig. 5. All three antibodies (ZKA15, ZKA25 and ZKA35) bind with high affinity to ZIKV NS1, but not to DENV1-4 NS1 antigens (Fig. 5).
Для дальнейшего исследования связывания антител с ZIKV NS1, использовали бислойные интерферометрические конкурентные анализы. Создавали перекрестно конкурирующую матрицу, используя бислойную интерферометрию (BLI; Octet) на 13 антителах, специфических для ZIKV NS1 (то есть перекрестно не реагирующий с DENV NS1), а именно антитела ZKA24, ZKA15, ZKA32, ZKA19, ZKA50, ZKA37, ZKA46, ZKA10, ZKA48, ZKA35, ZKA25, ZKA44, и ZKA30 (см. фиг. 6А). Как можно увидеть на фиг. 2 не одно из этих 13 антител не проявляет обнаруживаемого связывания с DENV NS1.To further investigate antibody binding to ZIKV NS1, bilayer interferometric competition assays were used. Created a cross-competitive array using bilayer interferometry (BLI; Octet) on 13 antibodies specific for ZIKV NS1 (i.e., not cross-reactive with DENV NS1), namely antibodies ZKA24, ZKA15, ZKA32, ZKA19, ZKA50, ZKA37, ZKA46, ZKA10 , ZKA48, ZKA35, ZKA25, ZKA44, and ZKA30 (see Fig. 6A). As can be seen in FIG. 2, none of these 13 antibodies exhibited detectable binding to DENV NS1.
Конкурентные анализы и определение антигенных детерминант осуществляли при 37°C с помощью системы Octet RED96, ForteBio. ZIKV-NS1 белок, разведенный до 2,5 мкг/мл в PBS, иммобилизовали в течение 7-9 мин на поверхности APS покрытого сенсорного чипа. Покрытые биосенсоры помещали в лунки, содержащие блокирующий буфер (0,1% BSA в PBS) в течение 6 мин для блокирования свободных сайтов связывания Biosensor. После этого покрытие Biosensors инкубировали в течение 8 мин с набором единичных очищенных mAb, специфических для ZIKV-NS1, разведенных в блокирующем буфере при 10 мкг/мл. После связывания первой партии mAb (этап 1), Biosensors передвигали в лунки, содержащие различные mAb в течение 8 мин (этап 2). Ассоциация второго mAb приводило к распознаванию различной антигенной детерминанты по сравнению с первым mAb (например, не конкурентное). Конкуренцию или частичную конкуренцию определяли на этапе 2, где не обнаруживали ассоциацию или незначительную ассоциацию, соответственно. Создавали перекрестно конкурирующую матрицу путем множественных прогонов конкуренций для предсказания картирования антигенной детерминанты на ZIKV NS1.Competition assays and determination of antigenic determinants were performed at 37°C using the Octet RED96 system, ForteBio. ZIKV-NS1 protein, diluted to 2.5 μg/ml in PBS, was immobilized for 7-9 min on the surface of an APS-coated sensor chip. Coated biosensors were placed in wells containing blocking buffer (0.1% BSA in PBS) for 6 min to block unoccupied Biosensor binding sites. The Biosensors coating was then incubated for 8 min with a set of single purified ZIKV-NS1-specific mAbs diluted in blocking buffer at 10 μg/ml. After binding the first batch of mAbs (step 1), Biosensors were moved into wells containing different mAbs for 8 min (step 2). Association of the second mAb resulted in recognition of a different antigenic determinant compared to the first mAb (eg, non-competitive). Competition or partial competition was determined at step 2, where no association or minor association was found, respectively. A cross-competition matrix was generated by multiple competition runs to predict antigenic determinant mapping on ZIKV NS1.
Результаты представлены на фиг. 6А и 6С. Сначала, все из тестированных ZIKV NS1специфических антител связывались с антигенной(ыми) детерминантой(ами) S1 и/или S2 (фиг. 6А). Тем не менее, некоторые из антител не конкурировали с другими. Например, ZKA15 не конкурировало за связывание с ZKA25 и ZKA35 и наоборот (фиг. 6А). Таким образом, антителу ZKA15 присваивали антигенную детерминанту S1, в тоже время как антителам ZKA25 и ZKA35 присваивали антигенные детерминанты S2 (фиг. 6С). В заключение, на основании используемых антител, идентифицировали антигенные детерминанты (S1 и S2) на ZIKV NS1 (фиг. 6С).The results are presented in Fig. 6A and 6C. First, all of the ZIKV NS1-specific antibodies tested bound to the S1 and/or S2 antigenic determinant(s) (Fig. 6A). However, some of the antibodies did not compete with others. For example, ZKA15 did not compete for binding with ZKA25 and ZKA35 and vice versa (Fig. 6A). Thus, the ZKA15 antibody was assigned the S1 antigenic determinant, while the ZKA25 and ZKA35 antibodies were assigned the S2 antigenic determinants (Fig. 6C). Finally, based on the antibodies used, antigenic determinants (S1 and S2) on ZIKV NS1 were identified (Fig. 6C).
Дополнительно, исследовали связывание 10 антител, перекрестно реагирующих с NS1 белком ZIKV и с NS1 белком DENV (а именно, ZKA18, ZKA29, ZKA39, ZKA53, ZKA54, ZKB19, ZKB23, ZKC29, ZKC33, и ZKC34; фиг. 6В) с антигенными детерминантами S1 и/или S2 на ZIKV NS1. Как можно увидеть на фиг. 2 все эти 10 антител проявляют связывание с DENV NS1. Эти 10 перекрестно-реагирующих антител тестировали в перекрестном конкурентном анализе, как описано выше (для ZIKV NS1специфических антител) по отношению к ZIKV NS1 S1-специфическому антителу ZKA15 и по отношению к ZIKVNS1 S2-специфическому антителу ZKA35.Additionally, the binding of 10 antibodies cross-reacting with the ZIKV NS1 protein and with the DENV NS1 protein (namely, ZKA18, ZKA29, ZKA39, ZKA53, ZKA54, ZKB19, ZKB23, ZKC29, ZKC33, and ZKC34; Fig. 6B) to antigenic determinants was examined. S1 and/or S2 on ZIKV NS1. As can be seen in FIG. 2, all of these 10 antibodies exhibit binding to DENV NS1. These 10 cross-reacting antibodies were tested in a cross-competition assay as described above (for ZIKV NS1-specific antibodies) against the ZIKV NS1 S1-specific antibody ZKA15 and against the ZIKVNS1 S2-specific antibody ZKA35.
Результаты представлены на фиг. 6В. Интересным является тот факт, что ни одно из десяти тестируемых перекрестно-реагирующих антител не конкурирует с ZKA 15 и/или ZKA35 за связывание с антигенной(ыми) детерминантой(ами) S1 и/или S2 на ZIKV NS1 (фиг. 6В). Эти результаты свидетельствуют о том, что антигенная детерминанта ZKA15 и ZKA35 не нацелена на NS1 перекрестно-реагирующих антител. Таким образом, NS1 антигенные детерминанты S1 и S2 нацелены на ZIKV-специфические, но не перекрестно реагирующие антитела.The results are presented in Fig. 6B. Of interest, none of the ten cross-reacting antibodies tested competed with ZKA 15 and/or ZKA35 for binding to the S1 and/or S2 antigenic determinant(s) on ZIKV NS1 (Fig. 6B). These results suggest that the antigenic determinant of ZKA15 and ZKA35 is not targeted by NS1 cross-reacting antibodies. Thus, the NS1 antigenic determinants S1 and S2 are targeted by ZIKV-specific, but not cross-reacting, antibodies.
Пример 4. Применение ZIKV №1-специфических антител для диагностики инфекции ZIKV.Example 4. Use of ZIKV No. 1-specific antibodies for the diagnosis of ZIKV infection.
В данном примере, исследовали применимость ZIKV №1-специфических антител согласно настоящему изобретению для диагностики инфекции ZIKV. Более специфически определяли применение ZIKV №1-специфических антител согласно настоящему изобретению для специфического обнаружения наличия или отсутствия антител, вырабатываемых к ZIKV NS1 в образцах плазмы ZIKV-или DENVинфицированных доноров.In this example, the utility of the ZIKV No. 1-specific antibodies of the present invention for the diagnosis of ZIKV infection was examined. More specifically, the use of ZIKV No. 1-specific antibodies according to the present invention to specifically detect the presence or absence of antibodies produced to ZIKV NS1 in plasma samples of ZIKV- or DENV-infected donors was determined.
Для этого, использовали анализ блокады связывания. В особенности, определяли способность ZIKV №1-реакционно-способных антител в плазме ингибировать связывание биотинилированного антитела ZKA35 с ZIKV NS1. Для этого, ZIKV №1-специфическое антитело ZKA35 биотинилировали,For this purpose, a binding blockade assay was used. Specifically, the ability of ZIKV #1-reactive antibodies in plasma to inhibit the binding of biotinylated ZKA35 antibody to ZIKV NS1 was determined. For this purpose, ZIKV No. 1-specific antibody ZKA35 was biotinylated,
- 71 046175 используя EZ-Link NHS-PEO набор твердофазного биотинилирования (Pierce). Меченное ZKA35 тестировали относительно связывания с ZIKV NS1 -определяли оптимальную концентрацию ZKA35 для достижения 70% максимального связывания. Образцы плазмы от ZIKV- (n=4), DENV-иммунных (n=5) доноров и контрольной (n=48) плазмы (1/10 разведение) добавляли в ELISA планшеты, покрытые ZIKV NS1. Через 1 ч, биотинилированное анти-ZIKV NS1 антитело ZKA35 добавляли при концентрации, обеспечивающей 70% максимального связывания, и смесь инкубировали при комнатной температуре в течение 15 минут. Планшеты промывали, добавляли субстрат (p-NPP, Sigma) и планшеты анализировали при 405 нм. Процентное значение ингибирования рассчитывали следующим образом: (1-[(ОП образца - ОП отриц контр)/(ОП полож контр - ОП отриц контр)])х 100.- 71 046175 using EZ-Link NHS-PEO solid phase biotinylation kit (Pierce). Tagged ZKA35 was tested for binding to ZIKV NS1 and the optimal concentration of ZKA35 to achieve 70% maximum binding was determined. Plasma samples from ZIKV- (n=4), DENV-immune (n=5) and control (n=48) donors (1/10 dilution) were added to ZIKV NS1-coated ELISA plates. After 1 h, biotinylated anti-ZIKV NS1 antibody ZKA35 was added at a concentration providing 70% maximum binding, and the mixture was incubated at room temperature for 15 minutes. The plates were washed, substrate (p-NPP, Sigma) was added and the plates were analyzed at 405 nm. The percentage inhibition value was calculated as follows: (1-[(OD of sample - OD of negative counter)/(OD of positive counter - OD of negative counter)])x 100.
Результаты представлены на фиг. 7. Следует отметить, что связывание антитела ZKA35 с антигенной детерминантой S2 на NS1 ингибируется только образцами плазмы от ZIKV-иммунокомпетентных доноров, но не DENV-иммунокомпетентных доноров, и это связывание также не ингибируется 48 контрольными образцами плазмы (фиг. 7). Таким образом, это исследование можно использовать для специфического обнаружения клинических и субклинических ZIKV инфекций на уровне популяции.The results are presented in Fig. 7. It should be noted that binding of the ZKA35 antibody to the S2 antigenic determinant on NS1 was inhibited only by plasma samples from ZIKV-immunocompetent donors, but not by DENV-immunocompetent donors, and this binding was also not inhibited by 48 control plasma samples (Fig. 7). Therefore, this study can be used to specifically detect clinical and subclinical ZIKV infections at the population level.
Пример 5. Антитела в соответствии с настоящим изобретением эффективно нейтрализуют ZIKV инфекцию.Example 5 Antibodies in accordance with the present invention effectively neutralize ZIKV infection.
Выделенные антитела ZKA190, ZKA185, ZKA230, ZKA64 и ZKA78 тестировали относительно их способности нейтрализовать инфекцию ZIKV и DENV1 in vitro.The isolated antibodies ZKA190, ZKA185, ZKA230, ZKA64 and ZKA78 were tested for their ability to neutralize ZIKV and DENV1 infection in vitro.
Нейтрализацию DENV и ZIKV инфекции с помощью антител измеряли с использованием анализа на основании микро-нейтрализации проточной цитометрии. Различные разведения антител смешивали с ZIKV (MOI 0,35) или ослабленным DENV1 (все при MOI 0,04) в течение 1 ч при 37°C и добавляли к 5000 клеток Vero/лунку в планшеты на 96 лунок с плоским дном. Через четыре дня для ZIKV и пять дней для DENV, клетки фиксировали с помощью 2% формальдегида, пермеабилизировали в PBS 1% FCS 0,5% сапонина, и окрашивали с помощью мышиного mAb 4G2. Клетки инкубировали с козьим антимышиным IgG, конъюгированным с Alexa Fluor488 (Jackson Immuno-Research, 115485164) и анализировали путем проточной цитометрии. В других случаях также определяли данные нейтрализации ZIKV, измеряя жизнеспособность клеток с использованием WST-1 реагента (Roche). Титр нейтрализации (50% ингибирующей концентрации [IC50]) выражали в виде концентрации антитела, которая уменьшает инфицирование на 50% по сравнению с контрольными лунками только с клетками.Neutralization of DENV and ZIKV infection by antibodies was measured using a flow cytometry microneutralization assay. Various antibody dilutions were mixed with ZIKV (MOI 0.35) or attenuated DENV1 (all at MOI 0.04) for 1 h at 37°C and added to 5000 Vero cells/well in 96-well flat-bottom plates. After four days for ZIKV and five days for DENV, cells were fixed with 2% formaldehyde, permeabilized in PBS 1% FCS 0.5% saponin, and stained with mouse mAb 4G2. Cells were incubated with Alexa Fluor488-conjugated goat anti-mouse IgG (Jackson Immuno-Research, 115485164) and analyzed by flow cytometry. In other cases, ZIKV neutralization data were also determined by measuring cell viability using WST-1 reagent (Roche). The neutralization titer (50% inhibitory concentration [IC 50 ]) was expressed as the concentration of antibody that reduced infection by 50% compared to cell-only control wells.
Результаты представлены на фиг. 8, 9 и 13. EDIII-специфические mAb ZKA64 и ZKA190 и NNB mAb ZKA230 чрезвычайно эффективны для нейтрализации ZIKV (штамм H/PF/2013), с IC50 значениями 93, 9 и 10 нг/мл, соответственно (фиг. 8, верхняя панель). В отличие от этого, перекрестно-реагирующее антитело ZKA78 только частично нейтрализует ZIKV инфекционность и перекрестно нейтрализует DENV1 инфекционность (фиг. 8, нижние панели). Сходные данные были получены путем изменения ZIKV-индуцированного цитопатического эффекта, определенного с помощью WST-1 реагента (фиг. 9). В этом втором анализе, NNB антитело ZKA185 также включали в панель тестируемых антител и проявляло IC50, сходное с наиболее эффективными антителами ZKA190 (EDIII-специфическим) и ZKA230 (NNB).The results are presented in Fig. 8, 9 and 13. EDIII-specific mAbs ZKA64 and ZKA190 and NNB mAb ZKA230 are extremely effective in neutralizing ZIKV (strain H/PF/2013), with IC 50 values of 93, 9 and 10 ng/ml, respectively (Fig. 8, top panel). In contrast, the cross-reactive antibody ZKA78 only partially neutralized ZIKV infectivity and cross-neutralized DENV1 infectivity (Fig. 8, bottom panels). Similar data were obtained by modifying the ZIKV-induced cytopathic effect determined using the WST-1 reagent (Fig. 9). In this second assay, the NNB antibody ZKA185 was also included in the panel of antibodies tested and exhibited an IC 50 similar to the top performing antibodies ZKA190 (EDIII-specific) and ZKA230 (NNB).
Важным является отметить, что очень эффективные ZKA64 и ZKA190 антитела, дополнительно к их способности нейтрализовать ZIKV H/PH/2013 штамм (данный пример), также связываются с Е белком и EDIII, имеющим происхождение из ZIKV штаммов MR766 и SPH2015, соответственно (фиг. 1 и фиг. 3). Подтверждено, что ZKA190 и ZKA190-LALA также эффективно нейтрализуют два дополнительных ZIKV штамма (MR766 и MRS_OPY_Martinique_PaRi_2015) (фиг. 13). Взятые в совокупности, результаты указывают на то, что чрезвычайно эффективные ZKA64 и ZKA190 антитела перекрестно реагируют с множественными штаммами ZIKV, относящимся в различным генотипах и происхождению (Восточная Африка и Азия из Уганды, Французской Полинезии, острова Мартиника и Бразилии).It is important to note that the highly effective ZKA64 and ZKA190 antibodies, in addition to their ability to neutralize the ZIKV H/PH/2013 strain (this example), also bind to the E protein and EDIII derived from ZIKV strains MR766 and SPH2015, respectively (Fig. 1 and Fig. 3). ZKA190 and ZKA190-LALA were also confirmed to effectively neutralize two additional ZIKV strains (MR766 and MRS_OPY_Martinique_PaRi_2015) (Fig. 13). Taken together, the results indicate that the extremely effective ZKA64 and ZKA190 antibodies cross-react with multiple ZIKV strains of different genotypes and origins (East Africa and Asia from Uganda, French Polynesia, Martinique and Brazil).
Пример 6. LALA мутация ингибирует антителозависимое усиление инфекции ZIKV с помощью сывороточных антител.Example 6 LALA mutation inhibits antibody-dependent enhancement of ZIKV infection by serum antibodies.
Нейтрализирующее антитела также тестировали для определения их способности усиливать инфицирования ZIKV в непермиссивных K562 клетках (анализ антителозависимого усиления, ADE анализ). ADE измеряли с помощью проточного анализа с использованием K562 клеток. Антитела и ZIKV H/PF/2013 (MOI 0,175) смешивали в течение 1 ч при 37°C и добавляли к 5000 K562 клеткам/лунку. Через четыре дня, клетки фиксировали, пермеабилизировали, и окрашивали с помощью m4G2. Количество инфицированных клеток определяли путем проточной цитометрии.Neutralizing antibodies were also tested to determine their ability to enhance ZIKV infection in nonpermissive K562 cells (antibody-dependent enhancement assay, ADE assay). ADE was measured by flow-through assay using K562 cells. Antibodies and ZIKV H/PF/2013 (MOI 0.175) were mixed for 1 h at 37°C and added to 5000 K562 cells/well. Four days later, cells were fixed, permeabilized, and stained with m4G2. The number of infected cells was determined by flow cytometry.
Результаты представлены на фиг. 10. Все антитела усиливают инфекцию ZIKV в непермиссивных K562 клетках в широком диапазоне концентраций, включая те, которые полностью нейтрализуют ZIKV инфекцию на клетках Vero (фиг. 10). Следует отметить, что в то время как EDIII-специфические антитела ZKA64 и ZKA190 полностью нейтрализуют ZIKV инфекции K562 клеток выше 1 мкг/мл, NNB антитело ZKA230 оказывается неспособным это сделать, результатом, который может быть обусловлен разными механизмами нейтрализации свободных вирусов по сравнению с Fc-гамма-рецепторинтернализованными вирусами. В отличие от этого, перекрестно реагирующее ZKA78, которое только частично нейтрализует ZIKV инфекционность, эффективно усиливает ZIKV инфицирование K562 клеток. Эти результаты свидетельствуют о том, что перекрестно-реагирующие антитела, вызываемые либоThe results are presented in Fig. 10. All antibodies enhanced ZIKV infection in nonpermissive K562 cells over a wide range of concentrations, including those that completely neutralized ZIKV infection on Vero cells (Fig. 10). It should be noted that while the EDIII-specific antibodies ZKA64 and ZKA190 completely neutralize ZIKV infection of K562 cells above 1 μg/ml, the NNB antibody ZKA230 fails to do so, a result that may be due to different mechanisms of neutralization of free viruses compared to Fc -gamma receptor internalized viruses. In contrast, cross-reacting ZKA78, which only partially neutralizes ZIKV infectivity, effectively enhances ZIKV infection of K562 cells. These results suggest that cross-reacting antibodies caused by either
- 72 046175- 72 046175
ZIKV или DENV инфекцией, могут опосредовать гетерологическое ADE.ZIKV or DENV infection may mediate heterologous ADE.
С учетом вышеизложенного, проводились исследование, может ли ADE также индуцироваться иммунной сывороткой и может ли блокироваться нейтрализирующими антителами, доставляемыми в виде LALA варианта. Для получения LALA варианта, каждую из тяжелых цепей мутировали в аминокислотах 4 и 5 СН2 домена путем замены на аланин вместо встречающегося в природе лейцина, используя сайт-направленный мутагенез. Как описано выше, LALA варианты (IgG1 человека антитела) не связываются с Fc-гамма-рецепторами и комплементом.In view of the above, it was investigated whether ADE could also be induced by immune serum and could be blocked by neutralizing antibodies delivered as the LALA variant. To produce the LALA variant, each of the heavy chains was mutated at amino acids 4 and 5 of the CH2 domain by replacing it with alanine instead of the naturally occurring leucine using site-directed mutagenesis. As described above, LALA variants (human IgG1 antibodies) do not bind to Fc-gamma receptors and complement.
Для исследования влияния ZKA64-LALA антитела в ZIKV ADE, использовали ингибирование ADE анализа. Поскольку ADE для ZIKV наблюдается при использовании ZIKV- или DENV-иммунной плазмы, ZIKV (MOI 0,175) смешивали с плазмой от первичных ZIKV- или DENV-инфицированных доноров в течение 30 мин при 37°C. ZKA64-LALA антитело добавляли при концентрации 50 мкг/мл, смешивали 5000 K562 клеток/лунку и инкубировали в течение трех дней. После этого клетки окрашивали с помощью 4G2 и анализировали путем проточной цитометрии.To investigate the effect of ZKA64-LALA antibody in ZIKV ADE, an ADE inhibition assay was used. Because ADE for ZIKV is observed when ZIKV- or DENV-immune plasma is used, ZIKV (MOI 0.175) was mixed with plasma from primary ZIKV- or DENV-infected donors for 30 min at 37°C. ZKA64-LALA antibody was added at a concentration of 50 μg/ml, 5000 K562 cells/well were mixed and incubated for three days. Cells were then stained with 4G2 and analyzed by flow cytometry.
Результаты представлены на фиг. 11. В гомологичных установках, четыре ZIKV-иммунных плазмы, собранные от выздоравливающих пациентов и одна DENV-иммунная плазма проявили сходную способность усиливать ZIKV инфицирование K562 клеток (фиг. 11, верхняя панель), и этот ADE эффект полностью блокируется EDIn-специфическим ZKA64-LALA антителом (фиг. 11, нижняя панель).The results are presented in Fig. 11. In homologous settings, four ZIKV-immune plasmas collected from convalescent patients and one DENV-immune plasma showed a similar ability to enhance ZIKV infection of K562 cells (Fig. 11, top panel), and this ADE effect was completely blocked by the EDIn-specific ZKA64- LALA antibody (Fig. 11, bottom panel).
Следует отметить, что ADE эффект ZIKV- и DENV-иммунной плазмы полностью блокируется EDIn-специфическим ZKA64-LALA антителом. Способность блокировать ADE единичного EDIIIспецифического LALA антитела может относиться не только к его способности преобладать в конкуренции с усиливающими антителами в сыворотке, но также и нейтрализовать вирус при интернализации в эндосомы.It should be noted that the ADE effect of ZIKV and DENV immune plasma is completely blocked by the EDIn-specific ZKA64-LALA antibody. The ability to block ADE of a single EDIII-specific LALA antibody may refer not only to its ability to outcompete enhancing antibodies in serum, but also to neutralize virus upon internalization into endosomes.
Эти результаты указывают на то, что эффективное нейтрализирующее антитело, такое как ZKA190, ZKA230, ZKA185 или ZKA64, разработанные в LALA форме, имеют сильный потенциал использоваться в профилактических или терапевтических установках для предотвращения врожденной ZIKV инфекции, например, у беременных женщин и/или у людей, живущих на территории с высоким риском. Применение LALA формы позволяет избегать риска ZIKV ADE и, как показано выше, также может блокировать ADE ранее существующих перекрестно-реагирующих антител, как, например, в случае пациентов, уже иммунных к DENV.These results indicate that an effective neutralizing antibody such as ZKA190, ZKA230, ZKA185 or ZKA64, developed in LALA form, has strong potential for use in prophylactic or therapeutic settings to prevent congenital ZIKV infection, for example in pregnant women and/or people living in high-risk areas. The use of the LALA form avoids the risk of ZIKV ADE and, as shown above, can also block the ADE of pre-existing cross-reacting antibodies, such as in the case of patients already immune to DENV.
Пример 7. Анализ образцов европейских резидентов с использованием ZIKV №1-специфических антител для диагностики инфекции ZIKV.Example 7: Analysis of samples from European residents using ZIKV #1-specific antibodies to diagnose ZIKV infection.
Данный Пример основан на анализе блокады связывания, описанном в примере 4. Для дальнейшей оценки специфичности ZIKV NS1 ВОВ анализа, тестировали большое количество образцов, полученных от пациентов, инфицированных DENV, WNV или вирусом чикунгунья (CHIKV).This Example is based on the binding blockade assay described in Example 4. To further evaluate the specificity of the ZIKV NS1 VACV assay, a large number of samples obtained from patients infected with DENV, WNV, or chikungunya virus (CHIKV) were tested.
Для этого, использовали анализ блокады связывания. Полистирольные планшеты покрывали в течение ночи 1 мкг/мл ZIKV NS1 и блокировали в течение 1 ч с PBS, содержащим 1% BSA. Добавляли плазму или сыворотку (1:10 разведение) к NSI-покрытым планшетам ELISA. После этого, например, через 1 ч, добавляли равный объем биотинилированного анти-К81 ZKA35, и смесь инкубировали, например, при комнатной температуре в течение 15 мин. Планшеты промывали и добавляли стрептавидин, конъюгированный со щелочной фосфатазой, например, в течение 30 мин. Планшеты снова инкубировали и добавляли субстрат. Рассчитывали процентное значение ингибирования следующим образом: (1-[(ОП образца-ОП отриц контр)/(ОП полож контр-ОП отриц контр)])х 100.For this purpose, a binding blockade assay was used. Polystyrene plates were coated overnight with 1 μg/ml ZIKV NS1 and blocked for 1 h with PBS containing 1% BSA. Plasma or serum (1:10 dilution) was added to NSI-coated ELISA plates. Thereafter, for example after 1 hour, an equal volume of biotinylated anti-K81 ZKA35 was added and the mixture was incubated, for example, at room temperature for 15 minutes. The plates were washed and alkaline phosphatase-conjugated streptavidin was added, for example, for 30 minutes. The plates were again incubated and substrate was added. The percentage inhibition value was calculated as follows: (1-[(OD of sample-OD of negative counter)/(OD of positive counter-OD of negative counter)])x 100.
Результаты представлены на фиг. 14. Тридцать один из 32 образцов (96,9%) от WNV пациентов, собранных более, чем через 10 дней после начала симптомов, были оценены отрицательно. Следует отметить, что только положительную оценку получали от образца, собранного в 2016 г. Два из 27 образцов от DENV пациентов, собранных более, чем за 10 дней после начала симптомов, оценивали положительно, и два положительных образца были получены от вторичных DENV инфекций. Дополнительно, ни один из образцов, полученных от пациентов с чикунгунья, или YFV-вакцинах оценивали положительно. Также тестировали большое количество образцов плазмы от доноров крови со Швейцарии (n=116), собранных в период между 2010 и 2016 гг. Ни один из этих образцов не был оценен положительно. Полученные результаты подтверждают и усиливают высокую чувствительность и специфичность NS1 BOB ELISA анализа.The results are presented in Fig. 14. Thirty-one of 32 samples (96.9%) from WNV patients collected more than 10 days after symptom onset were scored negative. It should be noted that only a positive assessment was obtained from a sample collected in 2016. Two of the 27 samples from DENV patients collected more than 10 days after the onset of symptoms were assessed as positive, and two positive samples were from secondary DENV infections. Additionally, none of the samples obtained from patients with chikungunya or YFV vaccines tested positive. A large number of plasma samples from Swiss blood donors (n=116) collected between 2010 and 2016 were also tested. None of these samples were rated positively. The results obtained confirm and strengthen the high sensitivity and specificity of the NS1 BOB ELISA assay.
Пример 8. Антитело в соответствии с настоящим изобретением нейтрализует ZIKV более эффективно, чем антитело из уровня техники EDE1 mAb C8.Example 8 The antibody of the present invention neutralizes ZIKV more effectively than the prior art antibody EDE1 mAb C8.
Для сравнения нейтрализирующих антител в соответствии с настоящим изобретением с эффективными нейтрализирующими анти-ZIKV антителами из уровня техники, осуществление нейтрализации ZKA190 сравнивали с такими же параметрами для эффективно нейтрализирующего mAb из уровня техники EDE1 С8 (Barba-Spaeth G, Dejnirattisai W, Rouvinski A, Vaney MC, Medits I, Sharma A, Simon-Loriere E, Sakuntabhai A, Cao-Lormeau VM, Haouz A, England P, Stiasny K, Mongkolsapaya J, Heinz FX, Screaton GR, Rey FA. Structural basis of potent Zika-denge virus antibody cross-neutralization. Nature. 2016 Aug 4;536(7614):48-53). Нейтрализация обоих антител тестировали по отношению к панели четырех различных ZIKV штаммов (H/PF/2013; MR766, MRS-OPY и PV10552).To compare the neutralizing antibodies of the present invention with the effective neutralizing anti-ZIKV antibodies of the prior art, the neutralization performance of ZKA190 was compared with the same parameters for the effective neutralizing mAb of the prior art EDE1 C8 (Barba-Spaeth G, Dejnirattisai W, Rouvinski A, Vaney MC, Medits I, Sharma A, Simon-Loriere E, Sakuntabhai A, Cao-Lormeau VM, Haouz A, England P, Stiasny K, Mongkolsapaya J, Heinz FX, Screaton GR, Rey FA. Structural basis of potent Zika-denge virus antibody cross-neutralization. Nature. 2016 Aug 4;536(7614):48-53). Neutralization of both antibodies was tested against a panel of four different ZIKV strains (H/PF/2013; MR766, MRS-OPY and PV10552).
Вкратце, измеряли нейтрализацию инфекции ZIKV с помощью mAb с использованием анализаBriefly, neutralization of ZIKV infection by mAb was measured using an assay
- 73 046175 микро-нейтрализации на основании проточной цитометрии. Различные разведения mAb смешивали с ZIKV (MOI 0,35) в течение 1 ч при 37°C и добавляли к 5000 клеткам Vero/лунку в планшеты на 96 лунок с плоским дном. Через четыре дня для ZIKV, клетки фиксировали с помощью 2% формальдегида, пермеабилизировали в PBS, содержащем 1% фетальную телячью сыворотку (Hyclone) и 0,5% сапонин, и окрашивали с помощью мышиного mAb 4G2. Клетки инкубировали с козьим анти-мышиным IgG, конъюгированным с Alexa Fluor488 (Jackson Immuno-Research, 115485164) и анализировали путем проточной цитометрии. Титр нейтрализации (50% ингибирующей концентрации [IC50]) выражали в виде концентрации антитела, которая уменьшает инфицирование на 50% по сравнению с контрольными лунками только с вирусом.- 73 046175 micro-neutralization based on flow cytometry. Various dilutions of mAb were mixed with ZIKV (MOI 0.35) for 1 h at 37°C and added to 5000 Vero cells/well in 96-well flat-bottom plates. After four days for ZIKV, cells were fixed with 2% formaldehyde, permeabilized in PBS containing 1% fetal bovine serum (Hyclone) and 0.5% saponin, and stained with mouse mAb 4G2. Cells were incubated with Alexa Fluor488-conjugated goat anti-mouse IgG (Jackson Immuno-Research, 115485164) and analyzed by flow cytometry. The neutralization titer (50% inhibitory concentration [IC 50 ]) was expressed as the concentration of antibody that reduced infection by 50% compared to virus-only control wells.
Результаты представлены на фиг. 15. ZKA190 mAb эффективно нейтрализует африканские, азиатские и африканские штаммы с IC50 в диапазоне от 0,6 до 8 нг/мл. По сравнению с этим, антитело из уровня техники С8 приблизительно в 24 раза менее эффективно.The results are presented in Fig. 15. ZKA190 mAb effectively neutralizes African, Asian and African strains with IC 50 ranging from 0.6 to 8 ng/ml. In comparison, the prior art C8 antibody is approximately 24 times less potent.
Пример 9. Дальнейшая характеристика антитела ZKA190.Example 9 Further characterization of the ZKA190 antibody.
Эффективность антитела ZKA190 в дальнейшем исследовали in vitro и in vivo. Для этого, синтезировали mAb в IgG1 формате дикого типа (дт) и в формате IgG1 Fc-LALA. Вкратце, VH и VL последовательности клонировали в человеческих IgyL IgK и Ig/.. экспрессионных векторах (любезно предоставленных Michel Nussenzweig, Rockefeller University, New York, NY, USA), по существу, как описано (Tiller T, Meffre E, Yurasov S, Tsuiji M, Nussenzweig MC, Wardemann H: Efficient generation of monoclonal antibodies from single human В cells by single cell ОТ-ПЦР and expression vector cloning. J Immunol Methods 2008, 329:112-124). Рекомбинантные mAb получали путем временной трансфекции ЕХР1293 клеток (Invitrogen), очищенных с помощью хроматографии на Белке A (GE Healthcare) и обессоленных по отношению к PBS. Для получения LALA варианта, каждую из тяжелых цепей мутировали в аминокислотах 4 и 5 СН2 домена путем замены на аланин вместо встречающегося в природе лейцина, используя сайтнаправленный мутагенез. Как описано выше, LALA варианты (IgG1 человека антитела) не связывается с Fc-гамма-рецепторами и комплементом.The effectiveness of the ZKA190 antibody was further studied in vitro and in vivo. To do this, mAbs were synthesized in wild-type (wt) IgG1 and IgG1 Fc-LALA formats. Briefly, VH and VL sequences were cloned into human IgyL IgK and Ig/.. expression vectors (kindly provided by Michel Nussenzweig, Rockefeller University, New York, NY, USA) essentially as described (Tiller T, Meffre E, Yurasov S, Tsuiji M, Nussenzweig MC, Wardemann H: Efficient generation of monoclonal antibodies from single human B cells by single cell RT-PCR and expression vector cloning. J Immunol Methods 2008, 329:112-124). Recombinant mAbs were prepared by transiently transfecting EXP1293 cells (Invitrogen) purified by Protein A chromatography (GE Healthcare) and desalted in PBS. To produce the LALA variant, each of the heavy chains was mutated at amino acids 4 and 5 of the CH2 domain by replacing it with alanine instead of the naturally occurring leucine using site-directed mutagenesis. As described above, LALA variants (human IgG1 antibodies) do not bind to Fc-gamma receptors and complement.
Как показано на фиг. 15А и описано в примере 8, ZKA190 тестировали на панели четырех ZIKV штаммов. ZKA190 mAb эффективно нейтрализует африканские, азиатские и американские штаммы с IC50 в диапазоне от 0,004 до 0,05 нМ (фиг. 15А; от 0,6 до 8 нг/мл).As shown in FIG. 15A and described in Example 8, ZKA190 was tested against a panel of four ZIKV strains. ZKA190 mAb effectively neutralized African, Asian and American strains with IC 50 ranging from 0.004 to 0.05 nM (Fig. 15A; 0.6 to 8 ng/ml).
Поскольку было показано, что ZIKV инфицирует нейтральные клетки-предшественники человека (hNPC), что приводит к повышенной клеточной токсичности, нарушению регуляции клеточного цикла и уменьшенному росте клеток, ZKA190 и ZKA190-LALA тестировали в hNPC. Для этого, фибробласты взрослых особей мужского пола, полученные от Movement Disorders Bio-Bank (Neurogenetics Unit of the Neurological Institute 'Carlo Besta', Milan), перепрограммировали, используя набор CytoTune-iPS 2.0 Sendai (Life Technologies). hiPSC поддерживали в условиях без питания в mTeSR1 (Stem Cell Technologies). Для получения эмбриоидных телец (ЕВ), диссоциированные hiPSC высевали в планшеты с низкой адгезией в mTeSR1, дополненной N2 (0,5х) (ThermoFisher Scientific), Noggin человека (0,5 мг/мл, R&D System), SB431542 (5 мкМ, Sigma), Y27632 (10 мкМ, Miltenyi Biotec) и пенициллин/стрептомицин (1%, Sigma) (как описано в Marchetto MCN, Carromeu С, Acab A, Yu D, Yeo GW, Mu Y, Chen G, Gage FH, Muotri AR: A model for neural development and treatment of Rett syndrome using human induced pluripotent stem cells. Cell 2010, 143:527-539). Для получения розеток, ЕВ высевали через 10 дней на покрытые матригелем планшеты (1:100, матригель с уменьшенными факторами роста, Corning) в DMEM/F12 (Sigma) с N2 (1:100), заменимыми аминокислотами (1%, ThermoFisher Scientific) и пенициллин/стрептомицин. Через 10 дней, клетки пассировали с аккутазой (Sigma) и высевали в покрытые матригелем колбы в NPC среду, содержащую DMEM/F12, N2 (0,25%), В27 (0,5%, ThermoFisher Scientific), пенициллин/стрептомицин и FGF2 (20 нг/мл, ThermoFisher Scientific). hNPC (3х 104) высевали на покровные стекла в планшеты на 24 лунки за 3 дня до инфицирования PRVABC59 штаммом. Маточный раствор вируса инкубировали с mAb 1 ч перед добавлением к hNPC для получения MOI 0,5. После абсорбции вируса в течение 4 ч, клеточный супернатант удаляли и повторно добавляли свежую среду, содержащую mAb. Супернатант собирали через 96 ч после инфицирования для измерения титров вируса путем анализа бляшкообразования на клетках Vero. Клетки фиксировали в 4% растворе параформальдегида (PFA, Sigma) в фосфатно-солевом буферном растворе (PBS, Euroclone) в течение 30 мин для непрямой иммунофлуоресценции. Фиксированные клетки пермеабилизировали в течение 30 мин (минут) в блокирующем растворе, содержащем 0,2% Triton Х-100 (Sigma) и 10% сыворотки осла (Sigma), и инкубировали в течение ночи при 4°C с первичными антителами в блокирующем растворе. Для обнаружения использовали следующее антитело: к оболочке (1:200, Millipore, MAB10216). После этого, клетки промывали с PBS и инкубировали в течение 1 ч с Hoechst и анти-мышиными Alexa Fluor-488 вторичными антителами (1:1,000 в блокирующем растворе, ThermoFisher Scientific). После промывания PBS, клетки снова промывали и укрепляли.Because ZIKV has been shown to infect human neutral progenitor cells (hNPCs), resulting in increased cellular toxicity, cell cycle dysregulation, and reduced cell growth, ZKA190 and ZKA190-LALA were tested in hNPCs. For this purpose, adult male fibroblasts obtained from the Movement Disorders Bio-Bank (Neurogenetics Unit of the Neurological Institute 'Carlo Besta', Milan) were reprogrammed using the CytoTune-iPS 2.0 Sendai kit (Life Technologies). hiPSCs were maintained under food-free conditions in mTeSR1 (Stem Cell Technologies). To obtain embryoid bodies (EB), dissociated hiPSCs were plated in low adhesion plates in mTeSR1 supplemented with N2 (0.5x) (ThermoFisher Scientific), human Noggin (0.5 mg/ml, R&D System), SB431542 (5 μM, Sigma), Y27632 (10 µM, Miltenyi Biotec) and penicillin/streptomycin (1%, Sigma) (as described in Marchetto MCN, Carromeu C, Acab A, Yu D, Yeo GW, Mu Y, Chen G, Gage FH, Muotri AR: A model for neural development and treatment of Rett syndrome using human induced pluripotent stem cells. Cell 2010, 143:527-539). To obtain rosettes, EBs were plated 10 days later on Matrigel-coated plates (1:100, Matrigel with reduced growth factors, Corning) in DMEM/F12 (Sigma) with N2 (1:100), nonessential amino acids (1%, ThermoFisher Scientific) and penicillin/streptomycin. After 10 days, cells were passaged with Accutase (Sigma) and seeded into Matrigel-coated flasks in NPC medium containing DMEM/F12, N2 (0.25%), B27 (0.5%, ThermoFisher Scientific), penicillin/streptomycin and FGF2 (20 ng/ml, ThermoFisher Scientific). hNPC (3x104) were seeded on coverslips in 24-well plates 3 days before infection with the PRVABC59 strain. Virus stock solution was incubated with mAb for 1 h before adding to hNPC to obtain an MOI of 0.5. After virus absorption for 4 h, the cell supernatant was removed and fresh medium containing mAb was re-added. The supernatant was collected 96 h postinfection to measure virus titers by plaque assay on Vero cells. Cells were fixed in 4% paraformaldehyde (PFA, Sigma) in phosphate-buffered saline (PBS, Euroclone) for 30 min for indirect immunofluorescence. Fixed cells were permeabilized for 30 min (minutes) in blocking solution containing 0.2% Triton X-100 (Sigma) and 10% donkey serum (Sigma) and incubated overnight at 4°C with primary antibodies in blocking solution . The following antibody was used for detection: anti-envelope (1:200, Millipore, MAB10216). Thereafter, cells were washed with PBS and incubated for 1 h with Hoechst and anti-mouse Alexa Fluor-488 secondary antibodies (1:1,000 in blocking solution, ThermoFisher Scientific). After washing with PBS, the cells were washed and strengthened again.
Результаты представлены на фиг. 16А. Оба антитела, ZKA190 и ZKA190-LALA, полностью отменяют инфицирование и репликацию ZIKV в hNPC.The results are presented in Fig. 16A. Both antibodies, ZKA190 and ZKA190-LALA, completely abolished ZIKV infection and replication in hNPCs.
Далее, тестировали способность ZKA190 и ZKA190-LALA вызывать ADE в K562 клеточной линии, как описано в примере 6. Вкратце, ADE измеряли путем проточного анализа, используя K562 клетки.Next, the ability of ZKA190 and ZKA190-LALA to induce ADE in the K562 cell line was tested as described in Example 6. Briefly, ADE was measured by flow assay using K562 cells.
- 74 046175- 74 046175
Вкратце, для ZKA190, ZKA190 и ZIKV H/PF/2013 (MOI 0,175) смешивали в течение 1 ч при 37°C и добавляли к 5000 К562 клеток/лунку. Через четыре дня, клетки фиксировали, пермеабилизировали, и окрашивали с помощью mAb m4G2. Количество инфицированных клеток определяли путем проточной цитометрии. Для ZKA190-LALA, ZIKV (MOI 0,175) смешивали с плазмой от первичных ZIKVинфицированных доноров в течение 30 мин при 37°C. ZKA190-LALA добавляли при концентрации 50 мкг/мл, смешивали 5000 K562 клеток/лунку и инкубировали в течение трех дней. После этого клетки окрашивали с помощью 4G2 и анализировали путем проточной цитометрии. Результаты представлены на фиг. 16В. ZKA190 поддерживает ADE от 0,0001-1 нМ; как предполагалось, ZKA190-LALA не проявляет какой-либо активности ADE. Также тестировали способность ZKA190-LALA ингибировать ADE, индуцированное плазмой от четырех ZIKV-иммунокомпетентных доноров в K562 клетках. Результаты представлены на фиг. 16С. Было обнаружено, что ZKA190-LALA полностью ингибировало ADE, индуцированное антителами в плазме (фиг. 16С).Briefly, for ZKA190, ZKA190 and ZIKV H/PF/2013 (MOI 0.175) were mixed for 1 h at 37°C and added to 5000 K562 cells/well. Four days later, cells were fixed, permeabilized, and stained with m4G2 mAb. The number of infected cells was determined by flow cytometry. For ZKA190-LALA, ZIKV (MOI 0.175) was mixed with plasma from primary ZIKV-infected donors for 30 min at 37°C. ZKA190-LALA was added at a concentration of 50 μg/ml, 5000 K562 cells/well were mixed and incubated for three days. Cells were then stained with 4G2 and analyzed by flow cytometry. The results are presented in Fig. 16V. ZKA190 supports ADE from 0.0001-1 nM; as predicted, ZKA190-LALA does not exhibit any ADE activity. The ability of ZKA190-LALA to inhibit ADE induced by plasma from four ZIKV-immunocompetent donors in K562 cells was also tested. The results are presented in Fig. 16C. It was found that ZKA190-LALA completely inhibited ADE induced by antibodies in plasma (Fig. 16C).
Анти-prM антитела составляют часть преобладающих антител, вырабатываемых во время иммунного ответа человека на флавивирусы, и было показано, что они усиливают вирусную инфекцию in vitro (Dejnirattisai, W., Jumnainsong, A., Onsirisakul, N., Fitton, P., Vasanawathana, S., Limpitikul, W., Puttikhunt, C, Edwards, C, Duangchinda, Т., Supasa, S., и др. (2010). Cross-reacting antibodies enhance dengue virus infection in humans. Science 328, 745-748). K562 клетки предварительно инкубировали с серийными разведениями prM перекрестно-реагирующего антитела DV62 (Beltmamello, M., Williams, K.L., Simmons, СР., Macagno, A., Simonelli, L., Quyen, N.T.H., Sukupolvi-Petty, S., Navarro-Sanchez, E., Young, P.R., de Silva, A.M., и др. (2010). The human immune response to dengue virus is dominated by highly cross-reactive antibodies endowed with neutralizing and enhancing activity. Cell Host Microbe 8, 271-283), имеющего происхождение от DENV иммунокомпетентного донора. Результаты представлены на фиг. 16D. DV62 перекрестно реагирует с ZIKV prM белком и вызывает ADE в широком диапазоне концентраций (фиг. 16D). ZKA190LALA может полностью блокировать анти-prM DV62 mAb-индуцированное ADE незрелых или частично незрелых ZIKV частиц (фиг. 16D).Anti-prM antibodies constitute part of the predominant antibodies produced during the human immune response to flaviviruses and have been shown to enhance viral infection in vitro (Dejnirattisai, W., Jumnainsong, A., Onsirisakul, N., Fitton, P., Vasanawathana, S., Limpitikul, W., Puttikhunt, C., Edwards, C., Duangchinda, T., Supasa, S., et al (2010). Cross-reacting antibodies enhance dengue virus infection in humans. Science 328, 745 -748). K562 cells were preincubated with serial dilutions of the prM cross-reactive antibody DV62 (Beltmamello, M., Williams, K.L., Simmons, S.R., Macagno, A., Simonelli, L., Quyen, N.T.H., Sukupolvi-Petty, S., Navarro -Sanchez, E., Young, P.R., de Silva, A.M., et al. (2010). The human immune response to dengue virus is dominated by highly cross-reactive antibodies endowed with neutralizing and enhancing activity. Cell Host Microbe 8, 271 -283), originating from a DENV immunocompetent donor. The results are presented in Fig. 16D. DV62 cross-reacts with the ZIKV prM protein and causes ADE over a wide range of concentrations (Fig. 16D). ZKA190LALA could completely block the anti-prM DV62 mAb-induced ADE of immature or partially immature ZIKV particles (Fig. 16D).
В завершение, тестировали способность различных концентраций ZKA190, ZKA190-LALA и ZKA190 Fab вызывать или блокировать ADE для ZIKV в присутствии возрастающих концентраций антиDENV2 в плазме человека или DV62. Результаты представлены на фиг. 16Е. ZKA190 при низких концентрациях увеличивает prM DV62-опосредованное ADE инфицирование ZIKV, что согласуется с его способностью стимулировать проникновение как незрелых, так и зрелых вирионов, в то время как при концентрациях выше 1,3 нМ (то есть, 200 нг/мл) ZKA190 блокирует ADE индуцированное как DENV плазмы, так и mAb DV62. ZKA190-LALA, также как и его Fab фрагмент, уменьшает ADE при концентрациях выше 0,06 нМ, указывая на то, что обе ингибированные вирусные инфекции находятся на этап после присоединения, таком как слияние.Finally, the ability of varying concentrations of ZKA190, ZKA190-LALA, and ZKA190 Fab to induce or block ADE for ZIKV was tested in the presence of increasing concentrations of antiDENV2 in human plasma or DV62. The results are presented in Fig. 16E. ZKA190 at low concentrations increases prM DV62 ADE-mediated ZIKV infection, consistent with its ability to promote entry of both immature and mature virions, while at concentrations above 1.3 nM (i.e., 200 ng/ml), ZKA190 blocks ADE induced by both plasma DENV and mAb DV62. ZKA190-LALA, as well as its Fab fragment, reduces ADE at concentrations above 0.06 nM, indicating that both inhibited viral infections are at a post-attachment stage, such as fusion.
Пример 10. ZKA190 связывается с консервативным и высоко доступным участком EDIII.Example 10 ZKA190 binds to the conserved and highly accessible region of EDIII.
Для определения ZKA190 эпитопа на уровне остатков, использовали разрешение ЯМР спектроскопии, как описано в Bardelli, M., Livoti, E., Simonelli, L., Pedotti, М., Moraes, A., Valente, A.P., and Varani, L. (2015). Epitope mapping by solution NMR spectroscopy. J. Mol. Recognit. 28, 393-400; Simonelli, L., Beltramello, M., Yudina, Z., Macagno, A., Calzolai, L., and Varani, L. (2010). Rapid structural characterization of human antibody-antigen complexes through experimentally validated computational docking. J Mol Biol 396, 1491-1507; and Simonelli, L., Pedotti, M., Beltramello, M., Livoti, E., Calzolai, L., Sallusto, F., Lanzavecchia, A., and Varani, L. (2013). Rational Engineering of a Human Anti-Dengue Antibody through Experimentally Validated Computational Docking. PLoS ONE 8, e55561.To determine the ZKA190 epitope at the residue level, resolution NMR spectroscopy was used as described in Bardelli, M., Livoti, E., Simonelli, L., Pedotti, M., Moraes, A., Valente, A.P., and Varani, L. (2015). Epitope mapping by solution NMR spectroscopy. J. Mol. Recognize 28, 393-400; Simonelli, L., Beltramello, M., Yudina, Z., Macagno, A., Calzolai, L., and Varani, L. (2010). Rapid structural characterization of human antibody-antigen complexes through experimentally validated computational docking. J Mol Biol 396, 1491-1507; and Simonelli, L., Pedotti, M., Beltramello, M., Livoti, E., Calzolai, L., Sallusto, F., Lanzavecchia, A., and Varani, L. (2013). Rational Engineering of a Human Anti-Dengue Antibody through Experimentally Validated Computational Docking. PLoS ONE 8, e55561.
Вкратце, спектры записывали на ЯМР спектрометре Bruker Avance 700 МГц при 300 K. Для установления каркасных резонансов при стандартных экспериментах тройных резонансов (использовали HNCO, HN(CA)CO, HN(CO)CACB, HNCACB, при этом боковые цепи аннотировали, используя HCCHTOCSY и HBHA(CO)NH эксперименты. Все ЯМР эксперименты осуществляли, используя Topspin 2.1 (Bruker Biospin) и анализировали с помощью CARA. NOESY перекрестные пики автоматически определяли, используя CYANA noeassign макро, на основании вручную определенных химических сдвигов. Ограничители верхнего расстояния, используемые для структурных расчетов на CYANA с применением стандартного протокола искусственного отжига, получали из 70 мс 15N- и 13С-разрешенных NOESY спектров. Каркасные динамики для ZIKV EDIII получали на основании измерений N релаксации, записанных на 600 и 700 МГц спектрометрах. Использовали версии обнаружения протонов CPMG (R2), инверсии-восстановления (R1) и 15Ы{1Н}-стационарного NOE. Параметры задержки для Т2 серий находились в диапазоне от 0 до 0,25 с и для Т1 серий в диапазоне от 0,02 до 2 с. В 15N{1H}-NOE эксперименте использовали задержку релаксации 5 с. R1 и R2 скорости релаксации получали на основании подгонки методом наименьших квадратов соответствующих экспоненциальных функций к измеренным данным, используя собственные написанные скрипты. Данные релаксации анализировали в безмодельном подходе, используя программное обеспечение DYNAMICS. Использовали программу ROTDIF для расчета общего времени корреляции на основании данных релаксации (8,5 нс). ЯМР картирование эпитопа осуществляли, как было описано ранее (Bardelli и др., 2015; Simonelli и др., 2010; 2013). Вкратце, перекрытие 15NHSQC спектров меченных EDIII свободных или связанных с ZKA190 Fab предоставляло возможностьBriefly, spectra were recorded on a Bruker Avance 700 MHz NMR spectrometer at 300 K. To establish framework resonances in standard triple resonance experiments (HNCO, HN(CA)CO, HN(CO)CACB, HNCACB were used, with side chains annotated using HCCHTOCSY and HBHA(CO)NH experiments. All NMR experiments were performed using Topspin 2.1 (Bruker Biospin) and analyzed using CARA. NOESY cross peaks were automatically determined using CYANA noeassign macro, based on manually determined chemical shifts. Upper distance limiters used for structural calculations on CYANA using a standard artificial annealing protocol were obtained from 70 ms 15 N- and 13 C-resolved NOESY spectra. Frame speakers for ZIKV EDIII were obtained from N relaxation measurements recorded on 600 and 700 MHz spectrometers. Proton detection versions were used CPMG (R2), inversion-recovery (R1) and 15 N { 1 H}-stationary NOE. The delay parameters for T2 series were in the range from 0 to 0.25 s and for T1 series in the range from 0.02 to 2 s . In the 15 N{1H}-NOE experiment, a relaxation delay of 5 s was used. R1 and R2 relaxation rates were obtained from a least squares fit of the corresponding exponential functions to the measured data using in-house written scripts. Relaxation data were analyzed in a model-free approach using DYNAMICS software. The ROTDIF program was used to calculate the total correlation time from the relaxation data (8.5 ns). NMR epitope mapping was performed as previously described (Bardelli et al., 2015; Simonelli et al., 2010; 2013). Briefly, overlap of 15 NHSQC spectra of EDIII-labeled free or bound ZKA190 Fabs provided the opportunity
- 75 046175 идентификации EDIII остатков, чьи ЯМР сигналы изменялись при образовании комплекса, указывая на то, что они задействованы в ZKA190 связывание. Изменения идентифицировали путем ручного наблюдения и путем пертурбации химических сдвигов (CSP), CSP=((ΔδH)2+(ΔδN/10)2)1/2. ЯМР образцы типично включали 800 мкМ [15Ы,13С]-меченных EDIII в 20 мМ фосфате натрия, 50 мМ NaCl, pH 6,0. Пердейтерированные (номинально 70%) 2H, 15N EDIII образцы использовали для ЯМР картирования эпитопа с EDIII:ZKA190 Fab соотношением 1:1.1; EDIII концентрация типично составляла 0,4 мМ.- 75 046175 identification of EDIII residues whose NMR signals changed upon complex formation, indicating that they are involved in ZKA190 binding. Changes were identified by manual observation and by chemical shift perturbation (CSP), CSP=((Δδ H ) 2 +(Δδ N /10) 2 ) 1/2 . NMR samples typically included 800 μM [ 15S , 13C ]-labeled EDIII in 20 mM sodium phosphate, 50 mM NaCl, pH 6.0. Perdeuterated (nominally 70%) 2 H, 15 N EDIII samples were used for NMR epitope mapping with EDIII:ZKA190 Fab ratio 1:1.1; The EDIII concentration was typically 0.4 mM.
Поскольку ЯМР сигнал сильно зависит от локального химического окружения, то изменения при образования комплекса идентифицируют остатки антигена, которые задействованы в связывание антитело, либо непосредственно или путем аллостерических эффектов. Путем сравнения ЯМР спектров свободного и связанного EDIII (фиг. 17А), остатки, задействованные на ZKA190, картированы на LR в EDIII, в особенности на ВС, DE и FG петли, а также в виде части EDI-EDIII шарнира (фиг. 18А). Эти остатки являются практически идентичными среди 217 известных ZIKV штаммов, за исключением замен в V341I и E393D в изоляте Уганда 1947 (фиг. 17D). Эти мутации также присутствуют в MR766 штамме, которые эффективно нейтрализуется ZKA190 (фиг. 15А). Анализ ZKA190 эпитопа на некомлексированной ZIKV структуре показал, что эпитоп легко доступный, за исключением для FG петли в 5-складчатой вершине (фиг. 18В и 17С, молекула А).Because the NMR signal is highly dependent on the local chemical environment, changes in complex formation identify antigen residues that are involved in antibody binding, either directly or through allosteric effects. By comparing the NMR spectra of free and bound EDIII (Figure 17A), the residues involved on ZKA190 are mapped to the LR in EDIII, specifically the BC, DE and FG loops, and as part of the EDI-EDIII hinge (Figure 18A) . These residues are virtually identical among the 217 known ZIKV strains, with the exception of substitutions at V341I and E393D in the Uganda 1947 isolate (Fig. 17D). These mutations are also present in the MR766 strain, which are effectively neutralized by ZKA190 (Fig. 15A). Analysis of the ZKA190 epitope on the uncomplexed ZIKV structure showed that the epitope is readily accessible except for the FG loop at the 5-pleated apex (FIGS. 18B and 17C, molecule A).
Вычислительное причаливание с последующей симуляцией молекулярной динамики, под руководством и обоснованные информацией об эпитопе на основании данных ЯМР, а также EDIII мутагенеза, показало, что ZKA190 связывается через поверхность раздела путем комплементарности формы и заряда (фиг. 18В и 17Е). Причаливание указывает на то, что отсутствуют непосредственные контакты между ZKA190 и FG петлей на EDIII, свидетельствуя о том, что изменения в его ЯМР сигналах при связывании антитело имеет происхождение от аллостерических эффектов. Эта точка зрения подтверждается тем фактом, что мутации остатков FG петли в рекомбинантном EDIII, но не в других участках эпитопа, не оказывает влияния на аффинность связывания ZKA190 для EDIII (фиг. 18В и 19).Computational docking followed by molecular dynamics simulations, guided and informed by epitope information from NMR data as well as EDIII mutagenesis, revealed that ZKA190 binds across the interface by shape and charge complementarity (Figures 18B and 17E). The docking indicates that there are no direct contacts between ZKA190 and the FG loop on EDIII, suggesting that changes in its NMR signals upon antibody binding are due to allosteric effects. This view is supported by the fact that mutation of the FG loop residues in recombinant EDIII, but not in other epitope regions, has no effect on the binding affinity of ZKA190 for EDIII (Fig. 18B and 19).
Пример 11. Механизмы ZKA190 нейтрализации.Example 11. ZKA190 neutralization mechanisms.
Способность ZKA190 эффективно нейтрализовать вирус может вовлекать ингибирование либо присоединение клеток или мембранный синтез. Дальнейший механизм может вовлекать инактивацию вируса путем перекрестного связывания вирусных частиц.The ability of ZKA190 to effectively neutralize the virus may involve inhibition of either cell attachment or membrane synthesis. A further mechanism may involve virus inactivation by cross-linking of viral particles.
ZKA190 Fab может нейтрализовать ZIKV, хоть и менее эффективно, чем соответствующий IgG. Путем связывания с EDI-EDIII линкером, ZKA190 (оба Fab и IgG) может ингибировать ~70 градусов вращение DIII, необходимое для слияние вируса с мембраной клетки-хозяина (Bressanelli, S., Stiasny, К., Allison, S.L., Stura, E.A., Duquerroy, S., Lescar, J., Heinz, F.X., and Rey, F.A. (2004). Structure of a flavivirus envelope glycoprotein in its low-pH-induced membrane fusion conformation. Embo J 23, 728-738; Modis, Y., Ogata, S., Clements, D., and Harrison, S.C. (2004). Structure of the dengue virus envelope protein after membrane fusion. Nature 427, 313-319). Альтернативно, ZKA190 может предотвращать присоединение ZIKV к клеткам-мишеням.ZKA190 Fab can neutralize ZIKV, although less efficiently than the corresponding IgG. By binding to the EDI-EDIII linker, ZKA190 (both Fab and IgG) can inhibit the ~70 degree DIII rotation required for viral fusion with the host cell membrane (Bressanelli, S., Stiasny, K., Allison, S.L., Stura, E.A. , Duquerroy, S., Lescar, J., Heinz, F. X., and Rey, F. A. (2004). Structure of a flavivirus envelope glycoprotein in its low-pH-induced membrane fusion conformation. Embo J 23, 728-738; Modis, Y., Ogata, S., Clements, D., and Harrison, S. C. (2004). Structure of the dengue virus envelope protein after membrane fusion. Nature 427, 313-319). Alternatively, ZKA190 may prevent ZIKV from attaching to target cells.
Способность ZKA190 ингибировать мембранный синтез подтверждается анализом путем конфокальной микроскопии. Для этого, клетки Vero высевали в количестве 7500 клеток/лунку на покровные стекла диаметром 12 мм в планшеты на 24 лунки и инкубировали в течение ночи. Клетки инфицировали ZIKV H/PF/2013 (MOI 100) в присутствии или отсутствии нейтрализирующих концентраций Alexa-488 конъюгированных mAb (0,7 мкмМ) при 37°C в течение 3 ч, промывали PBS, и фиксировали с помощью 2% параформальдегида в PBS в течение 30 мин при комнатной температуре. Подкисленные эндосомы идентифицировали с помощью Lysotracker красного (Invitrogen) путем добавления красителя (50 нМ) к клетках в течение последних 30 мин инкубацией перед фиксированием. После фиксации осуществляли интенсивное промывание в PBS и 50 мМ глицина и, в завершение, покровные стекла приготавливали для микроскопического анализа, используя гистологическую среду Vectashield для флуоресценции с DAPI (Vector Laboratories). Образцы анализировали путем конфокальной микроскопии, используя Leica TCS SP5 микроскоп с а 63х/1,4 N.A. объективом. Анализ и обработку изображений осуществляли с помощью программного обеспечения FIJI.The ability of ZKA190 to inhibit membrane synthesis was confirmed by confocal microscopy analysis. For this purpose, Vero cells were seeded at 7500 cells/well onto 12 mm diameter glass coverslips in 24-well plates and incubated overnight. Cells were infected with ZIKV H/PF/2013 (MOI 100) in the presence or absence of neutralizing concentrations of Alexa-488 conjugated mAb (0.7 μM) at 37°C for 3 h, washed with PBS, and fixed with 2% paraformaldehyde in PBS for 30 minutes at room temperature. Acidified endosomes were identified using Lysotracker red (Invitrogen) by adding dye (50 nM) to the cells during the last 30 min of incubation before fixation. After fixation, extensive washes were carried out in PBS and 50 mM glycine, and finally coverslips were prepared for microscopic analysis using Vectashield Fluorescence Histology Medium with DAPI (Vector Laboratories). Samples were analyzed by confocal microscopy using a Leica TCS SP5 microscope with a 63x/1.4 N.A. lens. Image analysis and processing were performed using FIJI software.
Результаты представлены на фиг. 20. Анализ путем конфокальной микроскопии показал, что ZKA190 (Fab или IgG) может входить в клетки Vero только при образовании комплекса с ZIKV, при нейтрализирующих концентрациях, превышающих IC50 в 10 тыс. раз (фиг. 20).The results are presented in Fig. 20. Analysis by confocal microscopy showed that ZKA190 (Fab or IgG) can enter Vero cells only when complexed with ZIKV, at neutralizing concentrations exceeding the IC 50 by 10 thousand times (Fig. 20).
Пример 12. Характеристика in vivo EDIII-специфического mAb ZKA190.Example 12: In vivo characterization of EDIII-specific mAb ZKA190.
Для оценки их профилактических и терапевтических свойств, ZKA190 и ZKA190-LALA тестировали на А129 мышах, получавших летальную дозу ZIKV штамм МР1751 (африканская линия).To evaluate their preventive and therapeutic properties, ZKA190 and ZKA190-LALA were tested in A129 mice treated with a lethal dose of ZIKV strain MP1751 (African strain).
Для тестирования их профилактических эффективностей, ZKA190 и ZKA190-LALA вводили за один день до вирусной провокации.To test their prophylactic efficacies, ZKA190 and ZKA190-LALA were administered one day before viral challenge.
Самкам мышей А129 (ИФН-альфа/бета рецептор -/-) и мышей дикого типа 129Sv/Ev в возрасте 58 недель вводили mAb (ZKA190, ZKA190-LALA и контрольное антитело МРЕ8 (Corti, D., et al. Crossneutralization of four paramyxoviruses by a human monoclonal antibody. Nature 501, 439-443 (2013)), разведенные в PBS в различных тканях внутрибрюшинным путем (в/б) в объеме 500 мкл. MAb вводили либоFemale A129 (IFN-alpha/beta receptor -/-) and wild-type 129Sv/Ev mice at 58 weeks of age were treated with mAbs (ZKA190, ZKA190-LALA and control antibody MPE8 (Corti, D., et al. Crossneutralization of four paramyxoviruses by a human monoclonal antibody. Nature 501, 439-443 (2013)), diluted in PBS in various tissues by intraperitoneal route (i.p.) in a volume of 500 μl. MAb was administered either
- 76 046175 за 1 день или через 1, 2, 3 или 4 дней после вирусной провокации. Животных провоцировали подкожно с применением 102 БОЕ ZIKV (штамм МР1751) и затем в течение 14 дней. Каждый день наблюдали за весом тела и температурой и клинические наблюдения записывали по меньшей мере два раза в сутки. В день 5 после провокации, от каждого животного отбирали 50 мкл крови в РНКзащищенные пробирки (Qiagen, UK) и замораживали при -80°C. После окончания исследования (через 14 дней после провокации) или когда животные достигали конечных точек гуманности, отбирали пробы органов после вскрытия, и кровь и срезы головного мозга, селезенки, печени, почек и яичников собирали для вирусологических анализов.- 76 046175 1 day or 1, 2, 3 or 4 days after viral challenge. Animals were challenged subcutaneously with 102 PFU of ZIKV (strain MP1751) and then challenged for 14 days. Body weight and temperature were monitored daily and clinical observations were recorded at least twice daily. On day 5 after challenge, 50 μl of blood was collected from each animal into RNA-protected tubes (Qiagen, UK) and frozen at -80°C. At the end of the study (14 days postchallenge) or when animals reached humane endpoints, organs were sampled after necropsy, and blood and sections from the brain, spleen, liver, kidneys, and ovaries were collected for virological analyses.
Образцы тканей от А129 мышей взвешивали и гомогенизировали в PBS, используя керамические шарики и автоматизированный гомогенизатор (Precellys, UK), используя шесть 5-ти секундных циклов при 6500 об./мин с перерывом 30 с. Двести мл гомогената ткани или раствора крови переносили в 600 мкл RLT буфера (Qiagen, UK) для экстракции РНК, используя RNeasy Mini набор для экстракции (Qiagen, UK); образцы пропускали через QIAshredder (Qiagen, UK) как на начальной стадии. Использовали ZIKV специфический анализ ОТ-ПЦР в реальном времени для обнаружения вирусной РНК от субъектовживотных. Праймерные и зондовые последовательности адаптировали от Quick и др., 2017 (Quick, J, Grubaugh ND, Pullan ST, Claro IM, Smith AD, Gangavarapu K, Oliveira G, Robles-Sikisaka R, Rogers TF, Beutler NA, и др.: Multiplex PCR method for MinION and Illumina sequencing of Zika and other virus genomes directly from clinical samples. Nat Protoc 2017, 12:1261-1276) с внутренней оптимизацией и валидацией, осуществляемой для обеспечения оптимальных условий мастер-микс и циклизации. ОТ-ПЦР в реальном времени осуществляли с использованием набора Superscript III Platinum One-step qRT-PCR (Life Technologies, UK). Конечная мастер-микс (общая реакционная смесь) (15 мкл) содержала 10 мкл 2х реакционной смеси, 1,2 мкл воды ПЦР-степени чистоты, 0,2 мкл 50 мМ MgSO4, 1 мкл каждого праймера (ZIKV 1086 и ZIKV 1162с оба при 18 мкМ рабочей концентрации), 0,8 мкл зонда (ZIKV 1107-FAM при 25 мкМ рабочей концентрации) и 0,8 мкл SSIII смеси ферментов. Пять мкл матричной РНК добавляли к мастер-микс, получая конечный реакционный объем 20 мкл. Используемые условия циклизации предусматривали 50°C в течение 10 мин, 95°C в течение 2 мин, с последующими 45 циклами 95°C в течение 10 с и 60°C в течение 40 с, плюс конечная стадия охлаждения 40°C в течение 30 с. Количественный анализ с использованием флуоресценции осуществляли после окончания каждой 60°C стадии. Реакции прогоняли и анализировали на платформе 7500 Fast (Life Technologies, UK) используя 7500 программное обеспечение, версия 2.0.6. Количественное определение вирусной нагрузки в образцах осуществляли, используя серийные разведения количественного РНК олигонуклеотида (Integrated DNA Technologies). Олигонуклеотид содержал 77 оснований ZIKV РНК, нацеленных для на этого анализа, на основании номера доступа GenBank AY632535.2 и был синтезирован в количестве 250 нмоль с ВЭЖХ очисткой.Tissue samples from A129 mice were weighed and homogenized in PBS using ceramic beads and an automated homogenizer (Precellys, UK) using six 5 s cycles at 6500 rpm with a 30 s rest period. Two hundred ml of tissue homogenate or blood solution was transferred into 600 μl of RLT buffer (Qiagen, UK) for RNA extraction using the RNeasy Mini extraction kit (Qiagen, UK); samples were passed through QIAshredder (Qiagen, UK) as in the initial stage. A ZIKV specific real-time RT-PCR assay was used to detect viral RNA from animal subjects. Primer and probe sequences were adapted from Quick et al., 2017 (Quick, J, Grubaugh ND, Pullan ST, Claro IM, Smith AD, Gangavarapu K, Oliveira G, Robles-Sikisaka R, Rogers TF, Beutler NA, et al: Multiplex PCR method for MinION and Illumina sequencing of Zika and other virus genomes directly from clinical samples. Nat Protoc 2017, 12:1261-1276) with internal optimization and validation carried out to ensure optimal master mix and cyclization conditions. Real-time RT-PCR was performed using a Superscript III Platinum One-step qRT-PCR kit (Life Technologies, UK). The final master mix (total reaction mixture) (15 µl) contained 10 µl of 2x reaction mixture, 1.2 µl of PCR grade water, 0.2 µl of 50 mM MgSO 4 , 1 µl of each primer (ZIKV 1086 and ZIKV 1162c both at 18 μM working concentration), 0.8 μl of probe (ZIKV 1107-FAM at 25 μM working concentration) and 0.8 μl of SSIII enzyme mixture. Five μl of messenger RNA was added to the master mix, resulting in a final reaction volume of 20 μl. The cyclization conditions used were 50°C for 10 min, 95°C for 2 min, followed by 45 cycles of 95°C for 10 s and 60°C for 40 s, plus a final cooling step of 40°C for 30 With. Quantitative analysis using fluorescence was performed after the end of each 60°C stage. Reactions were run and analyzed on a 7500 Fast platform (Life Technologies, UK) using 7500 software version 2.0.6. Quantification of viral load in samples was performed using serial dilutions of a quantitative RNA oligonucleotide (Integrated DNA Technologies). The oligonucleotide contained the 77 bases of ZIKV RNA targeted for this assay based on GenBank accession number AY632535.2 and was synthesized at 250 nmol with HPLC purification.
Результаты представлены на фиг. 21, 22 и 23. ZKA190 и ZKA190-LALA проявили защиту мышей от смертности и заболеваемости при концентрациях 5, 1 или 0,2 мг/кг (фиг. 21А-В). ZKA190-LALA, и в меньшей степени ZKA190, замедляли заболеваемость и смертность по сравнению с контрольной группой в дозе 0,04 мг/кг. Титры вирусов в крови и органах существенно уменьшались по сравнению с леченными животными, получавшими контрольное антитело, даже в присутствии уровней антитела в сыворотке ниже 1 мкг/мл (фиг. 22A-D).The results are presented in Fig. 21, 22 and 23. ZKA190 and ZKA190-LALA showed protection against mortality and morbidity in mice at concentrations of 5, 1 or 0.2 mg/kg (Fig. 21A-B). ZKA190-LALA, and to a lesser extent ZKA190, slowed morbidity and mortality compared to the control group at a dose of 0.04 mg/kg. Viral titers in the blood and organs were significantly reduced compared to treated animals receiving control antibody, even in the presence of serum antibody levels below 1 μg/ml (Fig. 22A-D).
Для оценки терапевтического потенциала ZKA190, мы вводили ZKA190 и ZKA190-LALA в различные моменты времени после ZIKV инфицирования. В дозе 15 мг/кг, достигали коэффициентов выживаемости 80-100%, и заболеваемость значительно уменьшилась даже при лечении четыре дня после инфицирования (фиг. 21E-G). Лечение с применением ZKA190 и ZKA190-LALA во все временные точки после инфицирования приводило к существенному уменьшению титров вируса, по сравнению с животными, леченными контрольным антителом, с заметной тенденцией большего уменьшения при раннем лечении (фиг. 23А-21С). Следует отметить, что ZKA190-LALA показало существенное уменьшение антивирусной активности в образце крови на 5 день по сравнению с ZKA190, когда mAb вводили четыре дней после инфицирования, результат, который может быть связан с нарушенной способностью LALA варианта облегчать быстрый клиренс покрытых оболочкой вирионов.To evaluate the therapeutic potential of ZKA190, we administered ZKA190 and ZKA190-LALA at different time points after ZIKV infection. At a dose of 15 mg/kg, survival rates of 80-100% were achieved, and morbidity was significantly reduced even with treatment four days after infection (Fig. 21E-G). Treatment with ZKA190 and ZKA190-LALA at all time points postinfection resulted in significant reductions in virus titers compared to control antibody-treated animals, with a notable trend toward greater reductions with early treatment (FIGS. 23A-21C). Of note, ZKA190-LALA showed a significant reduction in antiviral activity in the day 5 blood sample compared to ZKA190 when the mAb was administered four days postinfection, a result that may be related to the impaired ability of the LALA variant to facilitate rapid clearance of enveloped virions.
- 77 046175- 77 046175
Таблицы последовательностей и номеров SEQ IDTables of sequences and SEQ ID numbers
- 78 046175- 78 046175
- 79 046175- 79 046175
- 80 046175- 80 046175
- 81 046175- 81 046175
- 82 046175- 82 046175
- 83 046175- 83 046175
- 84 046175- 84 046175
- 85 046175- 85 046175
- 86 046175- 86 046175
- 87 046175- 87 046175
- 88 046175- 88 046175
- 89 046175- 89 046175
- 90 046175- 90 046175
- 91 046175- 91 046175
- 92 046175- 92 046175
- 93 046175- 93 046175
- 94 046175- 94 046175
- 95 046175- 95 046175
- 96 046175- 96 046175
- 97 046175- 97 046175
- 98 046175- 98 046175
- 99 046175- 99 046175
- 100 046175- 100 046175
- 101 046175- 101 046175
- 102 046175- 102 046175
- 103 046175- 103 046175
- 104 -- 104 -
Claims (42)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EPPCT/EP2016/066684 | 2016-07-13 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA046175B1 true EA046175B1 (en) | 2024-02-14 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11912757B2 (en) | Antibodies specifically binding to Zika virus epitopes and uses thereof | |
US11390664B2 (en) | Antibodies that potently neutralize hepatitis B virus and uses thereof | |
US11926658B2 (en) | Multispecific antibodies specifically binding to Zika virus epitopes | |
CN113817053A (en) | Antibody molecules for dengue virus and uses thereof | |
DK2828293T3 (en) | ANTIBODIES NEUTRALIZING RSV, MPV AND PVM AND USE THEREOF | |
WO2011124635A1 (en) | Binding molecules against chikungunya virus and uses thereof | |
EP2374816B1 (en) | Binding molecules against Chikungunya virus and uses thereof | |
EA046175B1 (en) | AN ISOLATED ANTIBODY OR ITS ANTIGEN-BINDING FRAGMENT THAT SPECIFICALLY BINDS TO AN EPITOPE OF THE ZIKA VIRUS, THEIR PREPARATION AND APPLICATIONS | |
EA043940B1 (en) | MULTI-SPECIFIC ANTIBODIES SPECIFIC TO ZIKA VIRUS EPITOPES AND THEIR APPLICATION | |
EA039682B1 (en) | Antibodies that neutralize rsv, mpv and pvm and uses thereof |