EA045940B1 - ANTI-PD-1 ANTIBODY MOLECULES AND THEIR APPLICATIONS - Google Patents
ANTI-PD-1 ANTIBODY MOLECULES AND THEIR APPLICATIONS Download PDFInfo
- Publication number
- EA045940B1 EA045940B1 EA201691488 EA045940B1 EA 045940 B1 EA045940 B1 EA 045940B1 EA 201691488 EA201691488 EA 201691488 EA 045940 B1 EA045940 B1 EA 045940B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- amino acid
- acid sequence
- seq
- bap049
- antibody molecule
- Prior art date
Links
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 294
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 268
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 171
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 124
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 106
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 106
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 claims description 105
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 claims description 100
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 94
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 87
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 87
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 85
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 85
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 83
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 83
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 81
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 78
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 65
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 64
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 63
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 55
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 55
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 47
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 claims description 47
- 229940126547 T-cell immunoglobulin mucin-3 Drugs 0.000 claims description 46
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 claims description 45
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 claims description 44
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 42
- NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 1-methylethyl 11-methoxy-3,7,11-trimethyl-2,4-dodecadienoate Chemical compound COC(C)(C)CCCC(C)CC=CC(C)=CC(=O)OC(C)C NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 41
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 41
- 102100034922 T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Human genes 0.000 claims description 40
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 claims description 39
- 208000006265 Renal cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 38
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 claims description 37
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 claims description 35
- 102100024213 Programmed cell death 1 ligand 2 Human genes 0.000 claims description 34
- 108700030875 Programmed Cell Death 1 Ligand 2 Proteins 0.000 claims description 33
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 30
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 30
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims description 30
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 29
- 102100034458 Hepatitis A virus cellular receptor 2 Human genes 0.000 claims description 28
- 101710083479 Hepatitis A virus cellular receptor 2 homolog Proteins 0.000 claims description 28
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 28
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims description 28
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 28
- 101000611936 Homo sapiens Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 claims description 27
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 claims description 26
- 102000048362 human PDCD1 Human genes 0.000 claims description 26
- 102000017578 LAG3 Human genes 0.000 claims description 25
- 101150030213 Lag3 gene Proteins 0.000 claims description 25
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 25
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 24
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 24
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 claims description 24
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 claims description 24
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 24
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 claims description 22
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 claims description 22
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 22
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 claims description 21
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 20
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 claims description 20
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 claims description 19
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 claims description 19
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 claims description 19
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 19
- -1 LIGHT Proteins 0.000 claims description 17
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 claims description 17
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 claims description 16
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 claims description 16
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 16
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 claims description 15
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 15
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 15
- 239000000556 agonist Substances 0.000 claims description 15
- 230000000139 costimulatory effect Effects 0.000 claims description 15
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 claims description 15
- 208000032818 Microsatellite Instability Diseases 0.000 claims description 14
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 claims description 14
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 claims description 12
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 claims description 12
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 claims description 12
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 claims description 12
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 claims description 12
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 claims description 12
- 201000005787 hematologic cancer Diseases 0.000 claims description 12
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims description 12
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 claims description 12
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 claims description 12
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims description 12
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 11
- 229960002465 dabrafenib Drugs 0.000 claims description 11
- BFSMGDJOXZAERB-UHFFFAOYSA-N dabrafenib Chemical compound S1C(C(C)(C)C)=NC(C=2C(=C(NS(=O)(=O)C=3C(=CC=CC=3F)F)C=CC=2)F)=C1C1=CC=NC(N)=N1 BFSMGDJOXZAERB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 claims description 11
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 claims description 11
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 11
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 claims description 11
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 claims description 11
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 claims description 11
- 208000030808 Clear cell renal carcinoma Diseases 0.000 claims description 10
- 102000037982 Immune checkpoint proteins Human genes 0.000 claims description 10
- 108091008036 Immune checkpoint proteins Proteins 0.000 claims description 10
- 208000024770 Thyroid neoplasm Diseases 0.000 claims description 10
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 claims description 10
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 claims description 10
- 229960005386 ipilimumab Drugs 0.000 claims description 10
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 10
- 201000002510 thyroid cancer Diseases 0.000 claims description 10
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 claims description 9
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 claims description 9
- 206010073251 clear cell renal cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 9
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 9
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 9
- 208000014829 head and neck neoplasm Diseases 0.000 claims description 9
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 claims description 9
- 231100000844 hepatocellular carcinoma Toxicity 0.000 claims description 9
- 201000011330 nonpapillary renal cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 9
- 229940121358 tyrosine kinase inhibitor Drugs 0.000 claims description 9
- 239000005483 tyrosine kinase inhibitor Substances 0.000 claims description 9
- 150000004917 tyrosine kinase inhibitor derivatives Chemical class 0.000 claims description 9
- 229940125431 BRAF inhibitor Drugs 0.000 claims description 8
- 229940124647 MEK inhibitor Drugs 0.000 claims description 8
- 208000001894 Nasopharyngeal Neoplasms Diseases 0.000 claims description 8
- 206010061306 Nasopharyngeal cancer Diseases 0.000 claims description 8
- 208000003721 Triple Negative Breast Neoplasms Diseases 0.000 claims description 8
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 claims description 8
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 claims description 8
- 239000012190 activator Substances 0.000 claims description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 8
- 239000002254 cytotoxic agent Substances 0.000 claims description 8
- 239000002829 mitogen activated protein kinase inhibitor Substances 0.000 claims description 8
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 claims description 8
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 8
- 208000022679 triple-negative breast carcinoma Diseases 0.000 claims description 8
- 208000002250 Hematologic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 7
- 101000946843 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Proteins 0.000 claims description 7
- 102100040061 Indoleamine 2,3-dioxygenase 1 Human genes 0.000 claims description 7
- 101710120843 Indoleamine 2,3-dioxygenase 1 Proteins 0.000 claims description 7
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 claims description 7
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 claims description 7
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 claims description 7
- 108010065917 TOR Serine-Threonine Kinases Proteins 0.000 claims description 7
- 102000013530 TOR Serine-Threonine Kinases Human genes 0.000 claims description 7
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims description 7
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 claims description 7
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 7
- 201000010536 head and neck cancer Diseases 0.000 claims description 7
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 7
- 229960003862 vemurafenib Drugs 0.000 claims description 7
- GPXBXXGIAQBQNI-UHFFFAOYSA-N vemurafenib Chemical compound CCCS(=O)(=O)NC1=CC=C(F)C(C(=O)C=2C3=CC(=CN=C3NC=2)C=2C=CC(Cl)=CC=2)=C1F GPXBXXGIAQBQNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 102100024263 CD160 antigen Human genes 0.000 claims description 6
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 claims description 6
- 101000761938 Homo sapiens CD160 antigen Proteins 0.000 claims description 6
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 claims description 6
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 claims description 6
- 102100025390 Integrin beta-2 Human genes 0.000 claims description 6
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 6
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 6
- 101100407308 Mus musculus Pdcd1lg2 gene Proteins 0.000 claims description 6
- 239000012271 PD-L1 inhibitor Substances 0.000 claims description 6
- RITAVMQDGBJQJZ-FMIVXFBMSA-N axitinib Chemical compound CNC(=O)C1=CC=CC=C1SC1=CC=C(C(\C=C\C=2N=CC=CC=2)=NN2)C2=C1 RITAVMQDGBJQJZ-FMIVXFBMSA-N 0.000 claims description 6
- 229940126546 immune checkpoint molecule Drugs 0.000 claims description 6
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 claims description 6
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 claims description 6
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 6
- 229940121656 pd-l1 inhibitor Drugs 0.000 claims description 6
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 6
- 102100029822 B- and T-lymphocyte attenuator Human genes 0.000 claims description 5
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 claims description 5
- GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N Fluorouracil Chemical compound FC1=CNC(=O)NC1=O GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 101000864344 Homo sapiens B- and T-lymphocyte attenuator Proteins 0.000 claims description 5
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 5
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 claims description 5
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 claims description 5
- 229960003005 axitinib Drugs 0.000 claims description 5
- 229940022399 cancer vaccine Drugs 0.000 claims description 5
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 claims description 5
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 claims description 5
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 claims description 5
- 201000005243 lung squamous cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 5
- 239000002525 vasculotropin inhibitor Substances 0.000 claims description 5
- MLDQJTXFUGDVEO-UHFFFAOYSA-N BAY-43-9006 Chemical compound C1=NC(C(=O)NC)=CC(OC=2C=CC(NC(=O)NC=3C=C(C(Cl)=CC=3)C(F)(F)F)=CC=2)=C1 MLDQJTXFUGDVEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 102100027207 CD27 antigen Human genes 0.000 claims description 4
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 claims description 4
- 101000914511 Homo sapiens CD27 antigen Proteins 0.000 claims description 4
- 102000003812 Interleukin-15 Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000172 Interleukin-15 Proteins 0.000 claims description 4
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 4
- 239000002147 L01XE04 - Sunitinib Substances 0.000 claims description 4
- 239000005511 L01XE05 - Sorafenib Substances 0.000 claims description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 206010027480 Metastatic malignant melanoma Diseases 0.000 claims description 4
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 208000002495 Uterine Neoplasms Diseases 0.000 claims description 4
- 238000009566 cancer vaccine Methods 0.000 claims description 4
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 claims description 4
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 4
- 229960002949 fluorouracil Drugs 0.000 claims description 4
- 208000024200 hematopoietic and lymphoid system neoplasm Diseases 0.000 claims description 4
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 claims description 4
- 208000021039 metastatic melanoma Diseases 0.000 claims description 4
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 4
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical group [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 4
- WINHZLLDWRZWRT-ATVHPVEESA-N sunitinib Chemical compound CCN(CC)CCNC(=O)C1=C(C)NC(\C=C/2C3=CC(F)=CC=C3NC\2=O)=C1C WINHZLLDWRZWRT-ATVHPVEESA-N 0.000 claims description 4
- 206010046766 uterine cancer Diseases 0.000 claims description 4
- YPBKTZBXSBLTDK-PKNBQFBNSA-N (3e)-3-[(3-bromo-4-fluoroanilino)-nitrosomethylidene]-4-[2-(sulfamoylamino)ethylamino]-1,2,5-oxadiazole Chemical group NS(=O)(=O)NCCNC1=NON\C1=C(N=O)/NC1=CC=C(F)C(Br)=C1 YPBKTZBXSBLTDK-PKNBQFBNSA-N 0.000 claims description 3
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 102100038078 CD276 antigen Human genes 0.000 claims description 3
- 101710185679 CD276 antigen Proteins 0.000 claims description 3
- 102100035793 CD83 antigen Human genes 0.000 claims description 3
- 239000012275 CTLA-4 inhibitor Substances 0.000 claims description 3
- 101000946856 Homo sapiens CD83 antigen Proteins 0.000 claims description 3
- 101000935040 Homo sapiens Integrin beta-2 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000971538 Homo sapiens Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001138062 Homo sapiens Leukocyte-associated immunoglobulin-like receptor 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001109503 Homo sapiens NKG2-C type II integral membrane protein Proteins 0.000 claims description 3
- 101000633784 Homo sapiens SLAM family member 7 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000831007 Homo sapiens T-cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains Proteins 0.000 claims description 3
- 101000934346 Homo sapiens T-cell surface antigen CD2 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000851376 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000666896 Homo sapiens V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation Proteins 0.000 claims description 3
- 108010064593 Intercellular Adhesion Molecule-1 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100037877 Intercellular adhesion molecule 1 Human genes 0.000 claims description 3
- 206010069755 K-ras gene mutation Diseases 0.000 claims description 3
- 102100021458 Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1 Human genes 0.000 claims description 3
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 3
- 229940125563 LAG3 inhibitor Drugs 0.000 claims description 3
- 102100020943 Leukocyte-associated immunoglobulin-like receptor 1 Human genes 0.000 claims description 3
- 108010064548 Lymphocyte Function-Associated Antigen-1 Proteins 0.000 claims description 3
- 108010061593 Member 14 Tumor Necrosis Factor Receptors Proteins 0.000 claims description 3
- 102100022683 NKG2-C type II integral membrane protein Human genes 0.000 claims description 3
- 102100029198 SLAM family member 7 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100027208 T-cell antigen CD7 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100024834 T-cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains Human genes 0.000 claims description 3
- 102100025237 T-cell surface antigen CD2 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100028785 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 14 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100022153 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Human genes 0.000 claims description 3
- 101710165473 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100036857 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100038282 V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation Human genes 0.000 claims description 3
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 claims description 3
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 claims description 3
- 229950006370 epacadostat Drugs 0.000 claims description 3
- IJJVMEJXYNJXOJ-UHFFFAOYSA-N fluquinconazole Chemical compound C=1C=C(Cl)C=C(Cl)C=1N1C(=O)C2=CC(F)=CC=C2N=C1N1C=NC=N1 IJJVMEJXYNJXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 230000002489 hematologic effect Effects 0.000 claims description 3
- 201000005249 lung adenocarcinoma Diseases 0.000 claims description 3
- 229960001756 oxaliplatin Drugs 0.000 claims description 3
- DWAFYCQODLXJNR-BNTLRKBRSA-L oxaliplatin Chemical compound O1C(=O)C(=O)O[Pt]11N[C@@H]2CCCC[C@H]2N1 DWAFYCQODLXJNR-BNTLRKBRSA-L 0.000 claims description 3
- 229960003787 sorafenib Drugs 0.000 claims description 3
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 claims description 3
- 229960001796 sunitinib Drugs 0.000 claims description 3
- VVIAGPKUTFNRDU-UHFFFAOYSA-N 6S-folinic acid Natural products C1NC=2NC(N)=NC(=O)C=2N(C=O)C1CNC1=CC=C(C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 VVIAGPKUTFNRDU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 208000010507 Adenocarcinoma of Lung Diseases 0.000 claims description 2
- 206010014733 Endometrial cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 206010014759 Endometrial neoplasm Diseases 0.000 claims description 2
- 206010066476 Haematological malignancy Diseases 0.000 claims description 2
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 claims description 2
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 claims description 2
- 239000003798 L01XE11 - Pazopanib Substances 0.000 claims description 2
- 206010050513 Metastatic renal cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 238000012228 RNA interference-mediated gene silencing Methods 0.000 claims description 2
- 206010041067 Small cell lung cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 claims description 2
- CBPNZQVSJQDFBE-FUXHJELOSA-N Temsirolimus Chemical compound C1C[C@@H](OC(=O)C(C)(CO)CO)[C@H](OC)C[C@@H]1C[C@@H](C)[C@H]1OC(=O)[C@@H]2CCCCN2C(=O)C(=O)[C@](O)(O2)[C@H](C)CC[C@H]2C[C@H](OC)/C(C)=C/C=C/C=C/[C@@H](C)C[C@@H](C)C(=O)[C@H](OC)[C@H](O)/C(C)=C/[C@@H](C)C(=O)C1 CBPNZQVSJQDFBE-FUXHJELOSA-N 0.000 claims description 2
- 229940124675 anti-cancer drug Drugs 0.000 claims description 2
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 2
- 229950009791 durvalumab Drugs 0.000 claims description 2
- 229940125829 fibroblast growth factor receptor inhibitor Drugs 0.000 claims description 2
- 235000008191 folinic acid Nutrition 0.000 claims description 2
- 239000011672 folinic acid Substances 0.000 claims description 2
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 claims description 2
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 claims description 2
- 229960001691 leucovorin Drugs 0.000 claims description 2
- 229960000639 pazopanib Drugs 0.000 claims description 2
- CUIHSIWYWATEQL-UHFFFAOYSA-N pazopanib Chemical compound C1=CC2=C(C)N(C)N=C2C=C1N(C)C(N=1)=CC=NC=1NC1=CC=C(C)C(S(N)(=O)=O)=C1 CUIHSIWYWATEQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 201000010174 renal carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 2
- 208000000587 small cell lung carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 229960000235 temsirolimus Drugs 0.000 claims description 2
- QFJCIRLUMZQUOT-UHFFFAOYSA-N temsirolimus Natural products C1CC(O)C(OC)CC1CC(C)C1OC(=O)C2CCCCN2C(=O)C(=O)C(O)(O2)C(C)CCC2CC(OC)C(C)=CC=CC=CC(C)CC(C)C(=O)C(OC)C(O)C(C)=CC(C)C(=O)C1 QFJCIRLUMZQUOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229960004066 trametinib Drugs 0.000 claims 5
- LIRYPHYGHXZJBZ-UHFFFAOYSA-N trametinib Chemical compound CC(=O)NC1=CC=CC(N2C(N(C3CC3)C(=O)C3=C(NC=4C(=CC(I)=CC=4)F)N(C)C(=O)C(C)=C32)=O)=C1 LIRYPHYGHXZJBZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 5
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 claims 4
- 101000801234 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18 Proteins 0.000 claims 3
- 102100033728 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18 Human genes 0.000 claims 3
- CYOHGALHFOKKQC-UHFFFAOYSA-N selumetinib Chemical compound OCCONC(=O)C=1C=C2N(C)C=NC2=C(F)C=1NC1=CC=C(Br)C=C1Cl CYOHGALHFOKKQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 claims 3
- RDSACQWTXKSHJT-NSHDSACASA-N n-[3,4-difluoro-2-(2-fluoro-4-iodoanilino)-6-methoxyphenyl]-1-[(2s)-2,3-dihydroxypropyl]cyclopropane-1-sulfonamide Chemical compound C1CC1(C[C@H](O)CO)S(=O)(=O)NC=1C(OC)=CC(F)=C(F)C=1NC1=CC=C(I)C=C1F RDSACQWTXKSHJT-NSHDSACASA-N 0.000 claims 2
- 239000013074 reference sample Substances 0.000 claims 2
- GFMMXOIFOQCCGU-UHFFFAOYSA-N 2-(2-chloro-4-iodoanilino)-N-(cyclopropylmethoxy)-3,4-difluorobenzamide Chemical compound C=1C=C(I)C=C(Cl)C=1NC1=C(F)C(F)=CC=C1C(=O)NOCC1CC1 GFMMXOIFOQCCGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- WGPXKFOFEXJMBD-UHFFFAOYSA-N 3-[N-[3-[(dimethylamino)methyl]phenyl]-C-phenylcarbonimidoyl]-2-hydroxy-1H-indole-6-carboxamide Chemical compound CN(C)CC1=CC(=CC=C1)N=C(C2=CC=CC=C2)C3=C(NC4=C3C=CC(=C4)C(=O)N)O WGPXKFOFEXJMBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- ZGXOBLVQIVXKEB-UHFFFAOYSA-N 3-[N-[3-[(dimethylamino)methyl]phenyl]-C-phenylcarbonimidoyl]-2-hydroxy-N,N-dimethyl-1H-indole-6-carboxamide Chemical compound CN(C)CC1=CC(=CC=C1)N=C(C2=CC=CC=C2)C3=C(NC4=C3C=CC(=C4)C(=O)N(C)C)O ZGXOBLVQIVXKEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 claims 1
- 208000001976 Endocrine Gland Neoplasms Diseases 0.000 claims 1
- 101000914496 Homo sapiens T-cell antigen CD7 Proteins 0.000 claims 1
- 101000795169 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C Proteins 0.000 claims 1
- 206010061252 Intraocular melanoma Diseases 0.000 claims 1
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 claims 1
- 102100029690 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C Human genes 0.000 claims 1
- 201000005969 Uveal melanoma Diseases 0.000 claims 1
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 claims 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 claims 1
- 229960002271 cobimetinib Drugs 0.000 claims 1
- BSMCAPRUBJMWDF-KRWDZBQOSA-N cobimetinib Chemical compound C1C(O)([C@H]2NCCCC2)CN1C(=O)C1=CC=C(F)C(F)=C1NC1=CC=C(I)C=C1F BSMCAPRUBJMWDF-KRWDZBQOSA-N 0.000 claims 1
- 208000030381 cutaneous melanoma Diseases 0.000 claims 1
- VVIAGPKUTFNRDU-ABLWVSNPSA-N folinic acid Chemical compound C1NC=2NC(N)=NC(=O)C=2N(C=O)C1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 VVIAGPKUTFNRDU-ABLWVSNPSA-N 0.000 claims 1
- 208000019691 hematopoietic and lymphoid cell neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 208000029559 malignant endocrine neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 229940126601 medicinal product Drugs 0.000 claims 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 claims 1
- 201000002575 ocular melanoma Diseases 0.000 claims 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 claims 1
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims 1
- 208000015347 renal cell adenocarcinoma Diseases 0.000 claims 1
- 229950010746 selumetinib Drugs 0.000 claims 1
- 201000003708 skin melanoma Diseases 0.000 claims 1
- 239000012453 solvate Substances 0.000 claims 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 294
- 101100519207 Mus musculus Pdcd1 gene Proteins 0.000 description 133
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 60
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 54
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 53
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 52
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 48
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 47
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 42
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 31
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 25
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 25
- 101710117290 Aldo-keto reductase family 1 member C4 Proteins 0.000 description 24
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 24
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 23
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 22
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 22
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 22
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 22
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 20
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 20
- CMSMOCZEIVJLDB-UHFFFAOYSA-N Cyclophosphamide Chemical compound ClCCN(CCCl)P1(=O)NCCCO1 CMSMOCZEIVJLDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 17
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 description 17
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 17
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 15
- 102000008203 CTLA-4 Antigen Human genes 0.000 description 14
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 14
- 229960003301 nivolumab Drugs 0.000 description 14
- RJURFGZVJUQBHK-UHFFFAOYSA-N actinomycin D Natural products CC1OC(=O)C(C(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C(=O)C2CCCN2C(=O)C(C(C)C)NC(=O)C1NC(=O)C1=C(N)C(=O)C(C)=C2OC(C(C)=CC=C3C(=O)NC4C(=O)NC(C(N5CCCC5C(=O)N(C)CC(=O)N(C)C(C(C)C)C(=O)OC4C)=O)C(C)C)=C3N=C21 RJURFGZVJUQBHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 208000009956 adenocarcinoma Diseases 0.000 description 13
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 13
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 13
- 239000000463 material Substances 0.000 description 13
- AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N Doxorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N 0.000 description 12
- 101000984753 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase B-raf Proteins 0.000 description 12
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 description 12
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 12
- 102100027103 Serine/threonine-protein kinase B-raf Human genes 0.000 description 12
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 description 12
- 230000006870 function Effects 0.000 description 12
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 12
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 12
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 12
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 12
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 12
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 11
- 125000003295 alanine group Chemical group N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 description 11
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 11
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 11
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 11
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 11
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 11
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 11
- FDKXTQMXEQVLRF-ZHACJKMWSA-N (E)-dacarbazine Chemical compound CN(C)\N=N\c1[nH]cnc1C(N)=O FDKXTQMXEQVLRF-ZHACJKMWSA-N 0.000 description 10
- IDPUKCWIGUEADI-UHFFFAOYSA-N 5-[bis(2-chloroethyl)amino]uracil Chemical compound ClCCN(CCCl)C1=CNC(=O)NC1=O IDPUKCWIGUEADI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- COVZYZSDYWQREU-UHFFFAOYSA-N Busulfan Chemical compound CS(=O)(=O)OCCCCOS(C)(=O)=O COVZYZSDYWQREU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 10
- SGDBTWWWUNNDEQ-LBPRGKRZSA-N melphalan Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(N(CCCl)CCCl)C=C1 SGDBTWWWUNNDEQ-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 10
- DLGOEMSEDOSKAD-UHFFFAOYSA-N Carmustine Chemical compound ClCCNC(=O)N(N=O)CCCl DLGOEMSEDOSKAD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 208000034578 Multiple myelomas Diseases 0.000 description 9
- FOCVUCIESVLUNU-UHFFFAOYSA-N Thiotepa Chemical compound C1CN1P(N1CC1)(=S)N1CC1 FOCVUCIESVLUNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 9
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 9
- STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N daunorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(C)=O)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N 0.000 description 9
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 9
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 9
- 229940090044 injection Drugs 0.000 description 9
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 9
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 9
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 8
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 8
- 108010092160 Dactinomycin Proteins 0.000 description 8
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 8
- 108010065805 Interleukin-12 Proteins 0.000 description 8
- 102000013462 Interleukin-12 Human genes 0.000 description 8
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 8
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 8
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 8
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 8
- 238000011284 combination treatment Methods 0.000 description 8
- 229960004397 cyclophosphamide Drugs 0.000 description 8
- UUVWYPNAQBNQJQ-UHFFFAOYSA-N hexamethylmelamine Chemical compound CN(C)C1=NC(N(C)C)=NC(N(C)C)=N1 UUVWYPNAQBNQJQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 8
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 8
- 206010041823 squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 8
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 7
- STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 7-Cyan-hept-2t-en-4,6-diinsaeure Natural products C1=2C(O)=C3C(=O)C=4C(OC)=CC=CC=4C(=O)C3=C(O)C=2CC(O)(C(C)=O)CC1OC1CC(N)C(O)C(C)O1 STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 238000012492 Biacore method Methods 0.000 description 7
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 description 7
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 description 7
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 description 7
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 7
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 7
- GQYIWUVLTXOXAJ-UHFFFAOYSA-N Lomustine Chemical compound ClCCN(N=O)C(=O)NC1CCCCC1 GQYIWUVLTXOXAJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N Mytomycin Chemical compound C1N2C(C(C(C)=C(N)C3=O)=O)=C3[C@@H](COC(N)=O)[C@@]2(OC)[C@@H]2[C@H]1N2 NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N 0.000 description 7
- 102100040678 Programmed cell death protein 1 Human genes 0.000 description 7
- RJURFGZVJUQBHK-IIXSONLDSA-N actinomycin D Chemical compound C[C@H]1OC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)[C@@H](C(C)C)NC(=O)[C@H]1NC(=O)C1=C(N)C(=O)C(C)=C2OC(C(C)=CC=C3C(=O)N[C@@H]4C(=O)N[C@@H](C(N5CCC[C@H]5C(=O)N(C)CC(=O)N(C)[C@@H](C(C)C)C(=O)O[C@@H]4C)=O)C(C)C)=C3N=C21 RJURFGZVJUQBHK-IIXSONLDSA-N 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 229960002092 busulfan Drugs 0.000 description 7
- JCKYGMPEJWAADB-UHFFFAOYSA-N chlorambucil Chemical compound OC(=O)CCCC1=CC=C(N(CCCl)CCCl)C=C1 JCKYGMPEJWAADB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 7
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 7
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 7
- 230000002584 immunomodulator Effects 0.000 description 7
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 7
- 229960001055 uracil mustard Drugs 0.000 description 7
- JXLYSJRDGCGARV-CFWMRBGOSA-N vinblastine Chemical compound C([C@H](C[C@]1(C(=O)OC)C=2C(=CC3=C([C@]45[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]6(CC)C=CCN([C@H]56)CC4)(O)C(=O)OC)N3C)C=2)OC)C[C@@](C2)(O)CC)N2CCC2=C1NC1=CC=CC=C21 JXLYSJRDGCGARV-CFWMRBGOSA-N 0.000 description 7
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 description 6
- UHDGCWIWMRVCDJ-CCXZUQQUSA-N Cytarabine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-CCXZUQQUSA-N 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 6
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 6
- 208000029462 Immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 6
- 101710089372 Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 description 6
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 6
- 208000000102 Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck Diseases 0.000 description 6
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 description 6
- JXLYSJRDGCGARV-WWYNWVTFSA-N Vinblastine Natural products O=C(O[C@H]1[C@](O)(C(=O)OC)[C@@H]2N(C)c3c(cc(c(OC)c3)[C@]3(C(=O)OC)c4[nH]c5c(c4CCN4C[C@](O)(CC)C[C@H](C3)C4)cccc5)[C@@]32[C@H]2[C@@]1(CC)C=CCN2CC3)C JXLYSJRDGCGARV-WWYNWVTFSA-N 0.000 description 6
- 229940034982 antineoplastic agent Drugs 0.000 description 6
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 description 6
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 6
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 6
- 229960000640 dactinomycin Drugs 0.000 description 6
- 229960000975 daunorubicin Drugs 0.000 description 6
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 6
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 6
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 6
- 201000000459 head and neck squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 6
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 6
- 230000007813 immunodeficiency Effects 0.000 description 6
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 6
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 6
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 6
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 6
- 238000009097 single-agent therapy Methods 0.000 description 6
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 6
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 6
- 229960004528 vincristine Drugs 0.000 description 6
- OGWKCGZFUXNPDA-UHFFFAOYSA-N vincristine Natural products C1C(CC)(O)CC(CC2(C(=O)OC)C=3C(=CC4=C(C56C(C(C(OC(C)=O)C7(CC)C=CCN(C67)CC5)(O)C(=O)OC)N4C=O)C=3)OC)CN1CCC1=C2NC2=CC=CC=C12 OGWKCGZFUXNPDA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- OGWKCGZFUXNPDA-XQKSVPLYSA-N vincristine Chemical compound C([N@]1C[C@@H](C[C@]2(C(=O)OC)C=3C(=CC4=C([C@]56[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]7(CC)C=CCN([C@H]67)CC5)(O)C(=O)OC)N4C=O)C=3)OC)C[C@@](C1)(O)CC)CC1=C2NC2=CC=CC=C12 OGWKCGZFUXNPDA-XQKSVPLYSA-N 0.000 description 6
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 6
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 5
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 5
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 description 5
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 5
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 5
- 102100030704 Interleukin-21 Human genes 0.000 description 5
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 5
- 108091007960 PI3Ks Proteins 0.000 description 5
- 108090000430 Phosphatidylinositol 3-kinases Proteins 0.000 description 5
- 102000003993 Phosphatidylinositol 3-kinases Human genes 0.000 description 5
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 5
- BPEGJWRSRHCHSN-UHFFFAOYSA-N Temozolomide Chemical compound O=C1N(C)N=NC2=C(C(N)=O)N=CN21 BPEGJWRSRHCHSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000009471 action Effects 0.000 description 5
- 229940100198 alkylating agent Drugs 0.000 description 5
- 239000002168 alkylating agent Substances 0.000 description 5
- 229960000473 altretamine Drugs 0.000 description 5
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 5
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 5
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 5
- 229960005243 carmustine Drugs 0.000 description 5
- 230000008859 change Effects 0.000 description 5
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 5
- 230000034994 death Effects 0.000 description 5
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 5
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 5
- 102000015694 estrogen receptors Human genes 0.000 description 5
- 108010038795 estrogen receptors Proteins 0.000 description 5
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 5
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 5
- HOMGKSMUEGBAAB-UHFFFAOYSA-N ifosfamide Chemical compound ClCCNP1(=O)OCCCN1CCCl HOMGKSMUEGBAAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 5
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 5
- 108010074108 interleukin-21 Proteins 0.000 description 5
- HAWPXGHAZFHHAD-UHFFFAOYSA-N mechlorethamine Chemical compound ClCCN(C)CCCl HAWPXGHAZFHHAD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229960001924 melphalan Drugs 0.000 description 5
- KKZJGLLVHKMTCM-UHFFFAOYSA-N mitoxantrone Chemical compound O=C1C2=C(O)C=CC(O)=C2C(=O)C2=C1C(NCCNCCO)=CC=C2NCCNCCO KKZJGLLVHKMTCM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 5
- 229960002621 pembrolizumab Drugs 0.000 description 5
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 5
- 102000003998 progesterone receptors Human genes 0.000 description 5
- 108090000468 progesterone receptors Proteins 0.000 description 5
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 5
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- ZSJLQEPLLKMAKR-GKHCUFPYSA-N streptozocin Chemical compound O=NN(C)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O ZSJLQEPLLKMAKR-GKHCUFPYSA-N 0.000 description 5
- 229960001196 thiotepa Drugs 0.000 description 5
- 238000013414 tumor xenograft model Methods 0.000 description 5
- 210000003171 tumor-infiltrating lymphocyte Anatomy 0.000 description 5
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 5
- 229960003048 vinblastine Drugs 0.000 description 5
- 206010061424 Anal cancer Diseases 0.000 description 4
- 208000007860 Anus Neoplasms Diseases 0.000 description 4
- 241000282832 Camelidae Species 0.000 description 4
- 241000282836 Camelus dromedarius Species 0.000 description 4
- 208000000461 Esophageal Neoplasms Diseases 0.000 description 4
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 4
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 description 4
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 description 4
- 101001117317 Homo sapiens Programmed cell death 1 ligand 1 Proteins 0.000 description 4
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 4
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 4
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 4
- 239000005536 L01XE08 - Nilotinib Substances 0.000 description 4
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 4
- 206010030155 Oesophageal carcinoma Diseases 0.000 description 4
- 239000012270 PD-1 inhibitor Substances 0.000 description 4
- 239000012668 PD-1-inhibitor Substances 0.000 description 4
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 4
- 206010068771 Soft tissue neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 108091008605 VEGF receptors Proteins 0.000 description 4
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 description 4
- 102000009484 Vascular Endothelial Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 4
- 229940045799 anthracyclines and related substance Drugs 0.000 description 4
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 4
- 201000011165 anus cancer Diseases 0.000 description 4
- VSRXQHXAPYXROS-UHFFFAOYSA-N azanide;cyclobutane-1,1-dicarboxylic acid;platinum(2+) Chemical compound [NH2-].[NH2-].[Pt+2].OC(=O)C1(C(O)=O)CCC1 VSRXQHXAPYXROS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 4
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 4
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 4
- 230000000973 chemotherapeutic effect Effects 0.000 description 4
- 229960004630 chlorambucil Drugs 0.000 description 4
- 229960003901 dacarbazine Drugs 0.000 description 4
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 4
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 4
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 4
- 201000004101 esophageal cancer Diseases 0.000 description 4
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 4
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 4
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000009036 growth inhibition Effects 0.000 description 4
- 229960001101 ifosfamide Drugs 0.000 description 4
- KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N imatinib Chemical compound C1CN(C)CCN1CC1=CC=C(C(=O)NC=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)C=C1 KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 4
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 4
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 4
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 4
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 4
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 4
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 4
- GOTYRUGSSMKFNF-UHFFFAOYSA-N lenalidomide Chemical compound C1C=2C(N)=CC=CC=2C(=O)N1C1CCC(=O)NC1=O GOTYRUGSSMKFNF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 4
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 4
- 229960004961 mechlorethamine Drugs 0.000 description 4
- GLVAUDGFNGKCSF-UHFFFAOYSA-N mercaptopurine Chemical compound S=C1NC=NC2=C1NC=N2 GLVAUDGFNGKCSF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 208000037819 metastatic cancer Diseases 0.000 description 4
- 208000011575 metastatic malignant neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 229960004857 mitomycin Drugs 0.000 description 4
- 229940126619 mouse monoclonal antibody Drugs 0.000 description 4
- HHZIURLSWUIHRB-UHFFFAOYSA-N nilotinib Chemical compound C1=NC(C)=CN1C1=CC(NC(=O)C=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)=CC(C(F)(F)F)=C1 HHZIURLSWUIHRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229940121655 pd-1 inhibitor Drugs 0.000 description 4
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 4
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 4
- 239000010948 rhodium Substances 0.000 description 4
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 4
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 4
- WYWHKKSPHMUBEB-UHFFFAOYSA-N tioguanine Chemical compound N1C(N)=NC(=S)C2=C1N=CN2 WYWHKKSPHMUBEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 4
- 229940124676 vascular endothelial growth factor receptor Drugs 0.000 description 4
- UEJJHQNACJXSKW-UHFFFAOYSA-N 2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1H-isoindole-1,3(2H)-dione Chemical class O=C1C2=CC=CC=C2C(=O)N1C1CCC(=O)NC1=O UEJJHQNACJXSKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZHSKUOZOLHMKEA-UHFFFAOYSA-N 4-[5-[bis(2-chloroethyl)amino]-1-methylbenzimidazol-2-yl]butanoic acid;hydron;chloride Chemical compound Cl.ClCCN(CCCl)C1=CC=C2N(C)C(CCCC(O)=O)=NC2=C1 ZHSKUOZOLHMKEA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100033793 ALK tyrosine kinase receptor Human genes 0.000 description 3
- 101710168331 ALK tyrosine kinase receptor Proteins 0.000 description 3
- 208000024893 Acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 3
- 208000014697 Acute lymphocytic leukaemia Diseases 0.000 description 3
- 208000032791 BCR-ABL1 positive chronic myelogenous leukemia Diseases 0.000 description 3
- 108010006654 Bleomycin Proteins 0.000 description 3
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 3
- 208000010833 Chronic myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 3
- 208000011038 Cold agglutinin disease Diseases 0.000 description 3
- 102100026245 E3 ubiquitin-protein ligase RNF43 Human genes 0.000 description 3
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 3
- 206010062878 Gastrooesophageal cancer Diseases 0.000 description 3
- 206010019799 Hepatitis viral Diseases 0.000 description 3
- 101000692702 Homo sapiens E3 ubiquitin-protein ligase RNF43 Proteins 0.000 description 3
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 3
- XDXDZDZNSLXDNA-TZNDIEGXSA-N Idarubicin Chemical compound C1[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1C2=C(O)C(C(=O)C3=CC=CC=C3C3=O)=C3C(O)=C2C[C@@](O)(C(C)=O)C1 XDXDZDZNSLXDNA-TZNDIEGXSA-N 0.000 description 3
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 description 3
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 3
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000007766 Kaposi sarcoma Diseases 0.000 description 3
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 3
- 229910052765 Lutetium Inorganic materials 0.000 description 3
- 208000031422 Lymphocytic Chronic B-Cell Leukemia Diseases 0.000 description 3
- 241000282567 Macaca fascicularis Species 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- 201000003793 Myelodysplastic syndrome Diseases 0.000 description 3
- 208000033761 Myelogenous Chronic BCR-ABL Positive Leukemia Diseases 0.000 description 3
- 208000015914 Non-Hodgkin lymphomas Diseases 0.000 description 3
- 229930012538 Paclitaxel Natural products 0.000 description 3
- 208000006664 Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma Diseases 0.000 description 3
- 101710094000 Programmed cell death 1 ligand 1 Proteins 0.000 description 3
- 229940079156 Proteasome inhibitor Drugs 0.000 description 3
- 108090000315 Protein Kinase C Proteins 0.000 description 3
- 102000003923 Protein Kinase C Human genes 0.000 description 3
- 208000015634 Rectal Neoplasms Diseases 0.000 description 3
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 3
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 3
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 3
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 3
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 3
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 3
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 3
- 229940122803 Vinca alkaloid Drugs 0.000 description 3
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 3
- VWQVUPCCIRVNHF-OUBTZVSYSA-N Yttrium-90 Chemical compound [90Y] VWQVUPCCIRVNHF-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 3
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 3
- 229940098174 alkeran Drugs 0.000 description 3
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 3
- 230000000340 anti-metabolite Effects 0.000 description 3
- 239000002256 antimetabolite Substances 0.000 description 3
- 229940100197 antimetabolite Drugs 0.000 description 3
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 229940108502 bicnu Drugs 0.000 description 3
- 229960002412 cediranib Drugs 0.000 description 3
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 3
- PIQCTGMSNWUMAF-UHFFFAOYSA-N chembl522892 Chemical compound C1CN(C)CCN1C1=CC=C(NC(=N2)C=3C(NC4=CC=CC(F)=C4C=3N)=O)C2=C1 PIQCTGMSNWUMAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 3
- DQLATGHUWYMOKM-UHFFFAOYSA-L cisplatin Chemical compound N[Pt](N)(Cl)Cl DQLATGHUWYMOKM-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 229960004316 cisplatin Drugs 0.000 description 3
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 3
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 3
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 3
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 3
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 3
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 3
- 230000009266 disease activity Effects 0.000 description 3
- 229960004679 doxorubicin Drugs 0.000 description 3
- 210000003162 effector t lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 201000007281 estrogen-receptor positive breast cancer Diseases 0.000 description 3
- VJJPUSNTGOMMGY-MRVIYFEKSA-N etoposide Chemical compound COC1=C(O)C(OC)=CC([C@@H]2C3=CC=4OCOC=4C=C3[C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@@H]4O[C@H](C)OC[C@H]4O3)O)[C@@H]3[C@@H]2C(OC3)=O)=C1 VJJPUSNTGOMMGY-MRVIYFEKSA-N 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- GIUYCYHIANZCFB-FJFJXFQQSA-N fludarabine phosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC(F)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]1O GIUYCYHIANZCFB-FJFJXFQQSA-N 0.000 description 3
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 201000006974 gastroesophageal cancer Diseases 0.000 description 3
- 229960003297 gemtuzumab ozogamicin Drugs 0.000 description 3
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 3
- 210000003128 head Anatomy 0.000 description 3
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 3
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 3
- 230000003463 hyperproliferative effect Effects 0.000 description 3
- 229960002411 imatinib Drugs 0.000 description 3
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 3
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 3
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 3
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 3
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 3
- 229940063725 leukeran Drugs 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 229960002247 lomustine Drugs 0.000 description 3
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 3
- OHSVLFRHMCKCQY-UHFFFAOYSA-N lutetium atom Chemical compound [Lu] OHSVLFRHMCKCQY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000003563 lymphoid tissue Anatomy 0.000 description 3
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 3
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 3
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 3
- QZIQJVCYUQZDIR-UHFFFAOYSA-N mechlorethamine hydrochloride Chemical compound Cl.ClCCN(C)CCCl QZIQJVCYUQZDIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 229960001156 mitoxantrone Drugs 0.000 description 3
- 229940087004 mustargen Drugs 0.000 description 3
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 3
- 229940086322 navelbine Drugs 0.000 description 3
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 3
- 229960001592 paclitaxel Drugs 0.000 description 3
- 210000003800 pharynx Anatomy 0.000 description 3
- 229940063179 platinol Drugs 0.000 description 3
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 239000003207 proteasome inhibitor Substances 0.000 description 3
- 231100000654 protein toxin Toxicity 0.000 description 3
- 206010038038 rectal cancer Diseases 0.000 description 3
- 201000001275 rectum cancer Diseases 0.000 description 3
- 230000000306 recurrent effect Effects 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 210000003289 regulatory T cell Anatomy 0.000 description 3
- 229960004641 rituximab Drugs 0.000 description 3
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 229960001052 streptozocin Drugs 0.000 description 3
- RCINICONZNJXQF-MZXODVADSA-N taxol Chemical compound O([C@@H]1[C@@]2(C[C@@H](C(C)=C(C2(C)C)[C@H](C([C@]2(C)[C@@H](O)C[C@H]3OC[C@]3([C@H]21)OC(C)=O)=O)OC(=O)C)OC(=O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)C=1C=CC=CC=1)C=1C=CC=CC=1)O)C(=O)C1=CC=CC=C1 RCINICONZNJXQF-MZXODVADSA-N 0.000 description 3
- 229960004964 temozolomide Drugs 0.000 description 3
- NRUKOCRGYNPUPR-QBPJDGROSA-N teniposide Chemical compound COC1=C(O)C(OC)=CC([C@@H]2C3=CC=4OCOC=4C=C3[C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@@H]4O[C@@H](OC[C@H]4O3)C=3SC=CC=3)O)[C@@H]3[C@@H]2C(OC3)=O)=C1 NRUKOCRGYNPUPR-QBPJDGROSA-N 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 238000011287 therapeutic dose Methods 0.000 description 3
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 3
- 229960000241 vandetanib Drugs 0.000 description 3
- UHTHHESEBZOYNR-UHFFFAOYSA-N vandetanib Chemical compound COC1=CC(C(/N=CN2)=N/C=3C(=CC(Br)=CC=3)F)=C2C=C1OCC1CCN(C)CC1 UHTHHESEBZOYNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YCOYDOIWSSHVCK-UHFFFAOYSA-N vatalanib Chemical compound C1=CC(Cl)=CC=C1NC(C1=CC=CC=C11)=NN=C1CC1=CC=NC=C1 YCOYDOIWSSHVCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CILBMBUYJCWATM-PYGJLNRPSA-N vinorelbine ditartrate Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O.OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O.C1N(CC=2C3=CC=CC=C3NC=22)CC(CC)=C[C@H]1C[C@]2(C(=O)OC)C1=CC([C@]23[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]4(CC)C=CCN([C@H]34)CC2)(O)C(=O)OC)N2C)=C2C=C1OC CILBMBUYJCWATM-PYGJLNRPSA-N 0.000 description 3
- 201000001862 viral hepatitis Diseases 0.000 description 3
- YXTKHLHCVFUPPT-YYFJYKOTSA-N (2s)-2-[[4-[(2-amino-5-formyl-4-oxo-1,6,7,8-tetrahydropteridin-6-yl)methylamino]benzoyl]amino]pentanedioic acid;(1r,2r)-1,2-dimethanidylcyclohexane;5-fluoro-1h-pyrimidine-2,4-dione;oxalic acid;platinum(2+) Chemical compound [Pt+2].OC(=O)C(O)=O.[CH2-][C@@H]1CCCC[C@H]1[CH2-].FC1=CNC(=O)NC1=O.C1NC=2NC(N)=NC(=O)C=2N(C=O)C1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 YXTKHLHCVFUPPT-YYFJYKOTSA-N 0.000 description 2
- NAALWFYYHHJEFQ-ZASNTINBSA-N (2s,5r,6r)-6-[[(2r)-2-[[6-[4-[bis(2-hydroxyethyl)sulfamoyl]phenyl]-2-oxo-1h-pyridine-3-carbonyl]amino]-2-(4-hydroxyphenyl)acetyl]amino]-3,3-dimethyl-7-oxo-4-thia-1-azabicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylic acid Chemical compound N([C@@H](C(=O)N[C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)C(C(N1)=O)=CC=C1C1=CC=C(S(=O)(=O)N(CCO)CCO)C=C1 NAALWFYYHHJEFQ-ZASNTINBSA-N 0.000 description 2
- VNTHYLVDGVBPOU-QQYBVWGSSA-N (7s,9s)-9-acetyl-7-[(2r,4s,5s,6s)-4-amino-5-hydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy-6,9,11-trihydroxy-4-methoxy-8,10-dihydro-7h-tetracene-5,12-dione;2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O.O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(C)=O)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 VNTHYLVDGVBPOU-QQYBVWGSSA-N 0.000 description 2
- IAKHMKGGTNLKSZ-INIZCTEOSA-N (S)-colchicine Chemical compound C1([C@@H](NC(C)=O)CC2)=CC(=O)C(OC)=CC=C1C1=C2C=C(OC)C(OC)=C1OC IAKHMKGGTNLKSZ-INIZCTEOSA-N 0.000 description 2
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 2
- WEVYNIUIFUYDGI-UHFFFAOYSA-N 3-[6-[4-(trifluoromethoxy)anilino]-4-pyrimidinyl]benzamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CC(C=2N=CN=C(NC=3C=CC(OC(F)(F)F)=CC=3)C=2)=C1 WEVYNIUIFUYDGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XXJWYDDUDKYVKI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-fluoro-2-methyl-1H-indol-5-yl)oxy]-6-methoxy-7-[3-(1-pyrrolidinyl)propoxy]quinazoline Chemical compound COC1=CC2=C(OC=3C(=C4C=C(C)NC4=CC=3)F)N=CN=C2C=C1OCCCN1CCCC1 XXJWYDDUDKYVKI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SRSGVKWWVXWSJT-ATVHPVEESA-N 5-[(z)-(5-fluoro-2-oxo-1h-indol-3-ylidene)methyl]-2,4-dimethyl-n-(2-pyrrolidin-1-ylethyl)-1h-pyrrole-3-carboxamide Chemical compound CC=1NC(\C=C/2C3=CC(F)=CC=C3NC\2=O)=C(C)C=1C(=O)NCCN1CCCC1 SRSGVKWWVXWSJT-ATVHPVEESA-N 0.000 description 2
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N Acetamide Chemical compound CC(N)=O DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010000830 Acute leukaemia Diseases 0.000 description 2
- 229940123338 Aldosterone synthase inhibitor Drugs 0.000 description 2
- 235000002198 Annona diversifolia Nutrition 0.000 description 2
- 108010024976 Asparaginase Proteins 0.000 description 2
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 2
- 108091008875 B cell receptors Proteins 0.000 description 2
- 208000036170 B-Cell Marginal Zone Lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 208000025324 B-cell acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 2
- 208000010839 B-cell chronic lymphocytic leukemia Diseases 0.000 description 2
- 208000003950 B-cell lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 102000008096 B7-H1 Antigen Human genes 0.000 description 2
- 206010005003 Bladder cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000011691 Burkitt lymphomas Diseases 0.000 description 2
- 229960005532 CC-1065 Drugs 0.000 description 2
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- GAGWJHPBXLXJQN-UORFTKCHSA-N Capecitabine Chemical compound C1=C(F)C(NC(=O)OCCCCC)=NC(=O)N1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](C)O1 GAGWJHPBXLXJQN-UORFTKCHSA-N 0.000 description 2
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 2
- 241000251730 Chondrichthyes Species 0.000 description 2
- PTOAARAWEBMLNO-KVQBGUIXSA-N Cladribine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC(Cl)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](CO)O1 PTOAARAWEBMLNO-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 2
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 2
- ZBNZXTGUTAYRHI-UHFFFAOYSA-N Dasatinib Chemical compound C=1C(N2CCN(CCO)CC2)=NC(C)=NC=1NC(S1)=NC=C1C(=O)NC1=C(C)C=CC=C1Cl ZBNZXTGUTAYRHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WEAHRLBPCANXCN-UHFFFAOYSA-N Daunomycin Natural products CCC1(O)CC(OC2CC(N)C(O)C(C)O2)c3cc4C(=O)c5c(OC)cccc5C(=O)c4c(O)c3C1 WEAHRLBPCANXCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108050002772 E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2 Proteins 0.000 description 2
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 2
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 101000867232 Escherichia coli Heat-stable enterotoxin II Proteins 0.000 description 2
- 102100023600 Fibroblast growth factor receptor 2 Human genes 0.000 description 2
- 101710182389 Fibroblast growth factor receptor 2 Proteins 0.000 description 2
- 102100027844 Fibroblast growth factor receptor 4 Human genes 0.000 description 2
- 101710182387 Fibroblast growth factor receptor 4 Proteins 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710113864 Heat shock protein 90 Proteins 0.000 description 2
- 102100021888 Helix-loop-helix protein 1 Human genes 0.000 description 2
- NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N Histamine Chemical compound NCCC1=CN=CN1 NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101000690301 Homo sapiens Aldo-keto reductase family 1 member C4 Proteins 0.000 description 2
- 101000889276 Homo sapiens Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Proteins 0.000 description 2
- 101000897691 Homo sapiens Helix-loop-helix protein 1 Proteins 0.000 description 2
- 101000605639 Homo sapiens Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform Proteins 0.000 description 2
- 101001116548 Homo sapiens Protein CBFA2T1 Proteins 0.000 description 2
- 101000932478 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3 Proteins 0.000 description 2
- 101000617830 Homo sapiens Sterol O-acyltransferase 1 Proteins 0.000 description 2
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 2
- 241000701027 Human herpesvirus 6 Species 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VSNHCAURESNICA-UHFFFAOYSA-N Hydroxyurea Chemical compound NC(=O)NO VSNHCAURESNICA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940076838 Immune checkpoint inhibitor Drugs 0.000 description 2
- 206010062016 Immunosuppression Diseases 0.000 description 2
- 101000668058 Infectious salmon anemia virus (isolate Atlantic salmon/Norway/810/9/99) RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit Proteins 0.000 description 2
- 102000037984 Inhibitory immune checkpoint proteins Human genes 0.000 description 2
- 108091008026 Inhibitory immune checkpoint proteins Proteins 0.000 description 2
- 102100039688 Insulin-like growth factor 1 receptor Human genes 0.000 description 2
- 101710184277 Insulin-like growth factor 1 receptor Proteins 0.000 description 2
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 2
- 102100021592 Interleukin-7 Human genes 0.000 description 2
- 108010002586 Interleukin-7 Proteins 0.000 description 2
- 102000042838 JAK family Human genes 0.000 description 2
- 108091082332 JAK family Proteins 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- 239000005517 L01XE01 - Imatinib Substances 0.000 description 2
- 239000005551 L01XE03 - Erlotinib Substances 0.000 description 2
- 239000002136 L01XE07 - Lapatinib Substances 0.000 description 2
- 239000002177 L01XE27 - Ibrutinib Substances 0.000 description 2
- UIARLYUEJFELEN-LROUJFHJSA-N LSM-1231 Chemical compound C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3C(=O)NCC3=C2C2=CC=CC=C2N1[C@]1(C)[C@](CO)(O)C[C@H]4O1 UIARLYUEJFELEN-LROUJFHJSA-N 0.000 description 2
- 101500021084 Locusta migratoria 5 kDa peptide Proteins 0.000 description 2
- 208000030289 Lymphoproliferative disease Diseases 0.000 description 2
- 102000007651 Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 2
- 108010046938 Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 2
- 108010037274 Member 9 Tumor Necrosis Factor Receptor Superfamily Proteins 0.000 description 2
- 102000011769 Member 9 Tumor Necrosis Factor Receptor Superfamily Human genes 0.000 description 2
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- ZDZOTLJHXYCWBA-VCVYQWHSSA-N N-debenzoyl-N-(tert-butoxycarbonyl)-10-deacetyltaxol Chemical compound O([C@H]1[C@H]2[C@@](C([C@H](O)C3=C(C)[C@@H](OC(=O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)OC(C)(C)C)C=4C=CC=CC=4)C[C@]1(O)C3(C)C)=O)(C)[C@@H](O)C[C@H]1OC[C@]12OC(=O)C)C(=O)C1=CC=CC=C1 ZDZOTLJHXYCWBA-VCVYQWHSSA-N 0.000 description 2
- 108091008606 PDGF receptors Proteins 0.000 description 2
- 102100038332 Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform Human genes 0.000 description 2
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010004729 Phycoerythrin Proteins 0.000 description 2
- 108010038512 Platelet-Derived Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000010780 Platelet-Derived Growth Factor Human genes 0.000 description 2
- 102000011653 Platelet-Derived Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 2
- 229910052777 Praseodymium Inorganic materials 0.000 description 2
- 208000009052 Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 2
- 108010002519 Prolactin Receptors Proteins 0.000 description 2
- 102100029000 Prolactin receptor Human genes 0.000 description 2
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 2
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 2
- 102100020718 Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3 Human genes 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108091027967 Small hairpin RNA Proteins 0.000 description 2
- 206010041848 Squamous cell carcinoma of the cervix Diseases 0.000 description 2
- 102100021993 Sterol O-acyltransferase 1 Human genes 0.000 description 2
- 101000697584 Streptomyces lavendulae Streptothricin acetyltransferase Proteins 0.000 description 2
- 208000029052 T-cell acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 2
- 206010042971 T-cell lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 208000027585 T-cell non-Hodgkin lymphoma Diseases 0.000 description 2
- GKLVYJBZJHMRIY-OUBTZVSYSA-N Technetium-99 Chemical compound [99Tc] GKLVYJBZJHMRIY-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- 239000003819 Toceranib Substances 0.000 description 2
- YZCKVEUIGOORGS-NJFSPNSNSA-N Tritium Chemical compound [3H] YZCKVEUIGOORGS-NJFSPNSNSA-N 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VGQOVCHZGQWAOI-UHFFFAOYSA-N UNPD55612 Natural products N1C(O)C2CC(C=CC(N)=O)=CN2C(=O)C2=CC=C(C)C(O)=C12 VGQOVCHZGQWAOI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 229940091171 VEGFR-2 tyrosine kinase inhibitor Drugs 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010053099 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Proteins 0.000 description 2
- 102100033177 Vascular endothelial growth factor receptor 2 Human genes 0.000 description 2
- 108010003533 Viral Envelope Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- QVXFGVVYTKZLJN-KHPPLWFESA-N [(z)-hexadec-7-enyl] acetate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCOC(C)=O QVXFGVVYTKZLJN-KHPPLWFESA-N 0.000 description 2
- 238000010317 ablation therapy Methods 0.000 description 2
- 229910052767 actinium Inorganic materials 0.000 description 2
- QQINRWTZWGJFDB-UHFFFAOYSA-N actinium atom Chemical compound [Ac] QQINRWTZWGJFDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 2
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 2
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 2
- 229940009456 adriamycin Drugs 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- YBBLVLTVTVSKRW-UHFFFAOYSA-N anastrozole Chemical compound N#CC(C)(C)C1=CC(C(C)(C#N)C)=CC(CN2N=CN=C2)=C1 YBBLVLTVTVSKRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004037 angiogenesis inhibitor Substances 0.000 description 2
- 229940121369 angiogenesis inhibitor Drugs 0.000 description 2
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 2
- VGQOVCHZGQWAOI-HYUHUPJXSA-N anthramycin Chemical compound N1[C@@H](O)[C@@H]2CC(\C=C\C(N)=O)=CN2C(=O)C2=CC=C(C)C(O)=C12 VGQOVCHZGQWAOI-HYUHUPJXSA-N 0.000 description 2
- 229940044684 anti-microtubule agent Drugs 0.000 description 2
- 230000006023 anti-tumor response Effects 0.000 description 2
- 230000005975 antitumor immune response Effects 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 229910052789 astatine Inorganic materials 0.000 description 2
- RYXHOMYVWAEKHL-UHFFFAOYSA-N astatine atom Chemical compound [At] RYXHOMYVWAEKHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 229910052797 bismuth Inorganic materials 0.000 description 2
- JCXGWMGPZLAOME-UHFFFAOYSA-N bismuth atom Chemical compound [Bi] JCXGWMGPZLAOME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960001561 bleomycin Drugs 0.000 description 2
- OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O bleomycin A2 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC=C(N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCC[S+](C)C)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O 0.000 description 2
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 2
- KVUAALJSMIVURS-ZEDZUCNESA-L calcium folinate Chemical compound [Ca+2].C1NC=2NC(N)=NC(=O)C=2N(C=O)C1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC([O-])=O)C([O-])=O)C=C1 KVUAALJSMIVURS-ZEDZUCNESA-L 0.000 description 2
- 229940112129 campath Drugs 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 229960004562 carboplatin Drugs 0.000 description 2
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 2
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 2
- 201000006612 cervical squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 238000010382 chemical cross-linking Methods 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 2
- 208000024207 chronic leukemia Diseases 0.000 description 2
- 229960002436 cladribine Drugs 0.000 description 2
- 238000011278 co-treatment Methods 0.000 description 2
- 230000009137 competitive binding Effects 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000013270 controlled release Methods 0.000 description 2
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 2
- 229960000684 cytarabine Drugs 0.000 description 2
- 230000010250 cytokine signaling pathway Effects 0.000 description 2
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 description 2
- 239000000824 cytostatic agent Substances 0.000 description 2
- 229960002448 dasatinib Drugs 0.000 description 2
- 229960003334 daunorubicin citrate Drugs 0.000 description 2
- 229960003109 daunorubicin hydrochloride Drugs 0.000 description 2
- CFCUWKMKBJTWLW-UHFFFAOYSA-N deoliosyl-3C-alpha-L-digitoxosyl-MTM Natural products CC=1C(O)=C2C(O)=C3C(=O)C(OC4OC(C)C(O)C(OC5OC(C)C(O)C(OC6OC(C)C(O)C(C)(O)C6)C5)C4)C(C(OC)C(=O)C(O)C(C)O)CC3=CC2=CC=1OC(OC(C)C1O)CC1OC1CC(O)C(O)C(C)O1 CFCUWKMKBJTWLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 2
- 239000002612 dispersion medium Substances 0.000 description 2
- 239000003534 dna topoisomerase inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000004064 dysfunction Effects 0.000 description 2
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 2
- 231100000655 enterotoxin Toxicity 0.000 description 2
- 239000002532 enzyme inhibitor Substances 0.000 description 2
- 229940125532 enzyme inhibitor Drugs 0.000 description 2
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 2
- AAKJLRGGTJKAMG-UHFFFAOYSA-N erlotinib Chemical compound C=12C=C(OCCOC)C(OCCOC)=CC2=NC=NC=1NC1=CC=CC(C#C)=C1 AAKJLRGGTJKAMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960005420 etoposide Drugs 0.000 description 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 2
- 230000017188 evasion or tolerance of host immune response Effects 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- 229960005304 fludarabine phosphate Drugs 0.000 description 2
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MKXKFYHWDHIYRV-UHFFFAOYSA-N flutamide Chemical compound CC(C)C(=O)NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C(C(F)(F)F)=C1 MKXKFYHWDHIYRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 201000003444 follicular lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 2
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 2
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 2
- XGALLCVXEZPNRQ-UHFFFAOYSA-N gefitinib Chemical compound C=12C=C(OCCCN3CCOCC3)C(OC)=CC2=NC=NC=1NC1=CC=C(F)C(Cl)=C1 XGALLCVXEZPNRQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003862 glucocorticoid Substances 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000054751 human RUNX1T1 Human genes 0.000 description 2
- 229960001507 ibrutinib Drugs 0.000 description 2
- XYFPWWZEPKGCCK-GOSISDBHSA-N ibrutinib Chemical compound C1=2C(N)=NC=NC=2N([C@H]2CN(CCC2)C(=O)C=C)N=C1C(C=C1)=CC=C1OC1=CC=CC=C1 XYFPWWZEPKGCCK-GOSISDBHSA-N 0.000 description 2
- 229940099279 idamycin Drugs 0.000 description 2
- 239000012274 immune-checkpoint protein inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 2
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 2
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 2
- 230000003259 immunoinhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 2
- 229910052738 indium Inorganic materials 0.000 description 2
- APFVFJFRJDLVQX-UHFFFAOYSA-N indium atom Chemical compound [In] APFVFJFRJDLVQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000138 intercalating agent Substances 0.000 description 2
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 2
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 2
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 2
- BCFGMOOMADDAQU-UHFFFAOYSA-N lapatinib Chemical compound O1C(CNCCS(=O)(=O)C)=CC=C1C1=CC=C(N=CN=C2NC=3C=C(Cl)C(OCC=4C=C(F)C=CC=4)=CC=3)C2=C1 BCFGMOOMADDAQU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960004942 lenalidomide Drugs 0.000 description 2
- CMJCXYNUCSMDBY-ZDUSSCGKSA-N lgx818 Chemical compound COC(=O)N[C@@H](C)CNC1=NC=CC(C=2C(=NN(C=2)C(C)C)C=2C(=C(NS(C)(=O)=O)C=C(Cl)C=2)F)=N1 CMJCXYNUCSMDBY-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 2
- 201000005296 lung carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 229950002736 marizomib Drugs 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 229960001428 mercaptopurine Drugs 0.000 description 2
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 2
- CFCUWKMKBJTWLW-BKHRDMLASA-N mithramycin Chemical compound O([C@@H]1C[C@@H](O[C@H](C)[C@H]1O)OC=1C=C2C=C3C[C@H]([C@@H](C(=O)C3=C(O)C2=C(O)C=1C)O[C@@H]1O[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2O[C@H](C)[C@H](O)[C@H](O[C@@H]3O[C@H](C)[C@@H](O)[C@@](C)(O)C3)C2)C1)[C@H](OC)C(=O)[C@@H](O)[C@@H](C)O)[C@H]1C[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](C)O1 CFCUWKMKBJTWLW-BKHRDMLASA-N 0.000 description 2
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 2
- 208000025113 myeloid leukemia Diseases 0.000 description 2
- 210000003739 neck Anatomy 0.000 description 2
- 229960001346 nilotinib Drugs 0.000 description 2
- 229960004378 nintedanib Drugs 0.000 description 2
- XZXHXSATPCNXJR-ZIADKAODSA-N nintedanib Chemical compound O=C1NC2=CC(C(=O)OC)=CC=C2\C1=C(C=1C=CC=CC=1)\NC(C=C1)=CC=C1N(C)C(=O)CN1CCN(C)CC1 XZXHXSATPCNXJR-ZIADKAODSA-N 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 2
- 229960001972 panitumumab Drugs 0.000 description 2
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 2
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 2
- 108010044644 pegfilgrastim Proteins 0.000 description 2
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 2
- 229950010773 pidilizumab Drugs 0.000 description 2
- 229960000952 pipobroman Drugs 0.000 description 2
- NJBFOOCLYDNZJN-UHFFFAOYSA-N pipobroman Chemical compound BrCCC(=O)N1CCN(C(=O)CCBr)CC1 NJBFOOCLYDNZJN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000005134 plasmacytoid dendritic cell Anatomy 0.000 description 2
- 229960003171 plicamycin Drugs 0.000 description 2
- 208000017805 post-transplant lymphoproliferative disease Diseases 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- PUDIUYLPXJFUGB-UHFFFAOYSA-N praseodymium atom Chemical compound [Pr] PUDIUYLPXJFUGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AQHHHDLHHXJYJD-UHFFFAOYSA-N propranolol Chemical compound C1=CC=C2C(OCC(O)CNC(C)C)=CC=CC2=C1 AQHHHDLHHXJYJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 2
- 229940034080 provenge Drugs 0.000 description 2
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 2
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 2
- WUAPFZMCVAUBPE-IGMARMGPSA-N rhenium-186 Chemical compound [186Re] WUAPFZMCVAUBPE-IGMARMGPSA-N 0.000 description 2
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052703 rhodium Inorganic materials 0.000 description 2
- MHOVAHRLVXNVSD-UHFFFAOYSA-N rhodium atom Chemical compound [Rh] MHOVAHRLVXNVSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102200055464 rs113488022 Human genes 0.000 description 2
- NGWSFRIPKNWYAO-SHTIJGAHSA-N salinosporamide A Chemical compound C([C@@H]1[C@H](O)[C@]23C(=O)O[C@]2([C@H](C(=O)N3)CCCl)C)CCC=C1 NGWSFRIPKNWYAO-SHTIJGAHSA-N 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 239000011669 selenium Substances 0.000 description 2
- 229950003647 semaxanib Drugs 0.000 description 2
- WUWDLXZGHZSWQZ-WQLSENKSSA-N semaxanib Chemical compound N1C(C)=CC(C)=C1\C=C/1C2=CC=CC=C2NC\1=O WUWDLXZGHZSWQZ-WQLSENKSSA-N 0.000 description 2
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 2
- 125000003607 serino group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 2
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 2
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 2
- 201000002314 small intestine cancer Diseases 0.000 description 2
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- FQZYTYWMLGAPFJ-OQKDUQJOSA-N tamoxifen citrate Chemical compound [H+].[H+].[H+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O.C=1C=CC=CC=1C(/CC)=C(C=1C=CC(OCCN(C)C)=CC=1)/C1=CC=CC=C1 FQZYTYWMLGAPFJ-OQKDUQJOSA-N 0.000 description 2
- 229940069905 tasigna Drugs 0.000 description 2
- 229940061353 temodar Drugs 0.000 description 2
- 229960001278 teniposide Drugs 0.000 description 2
- 229960003087 tioguanine Drugs 0.000 description 2
- ORYDPOVDJJZGHQ-UHFFFAOYSA-N tirapazamine Chemical compound C1=CC=CC2=[N+]([O-])C(N)=N[N+]([O-])=C21 ORYDPOVDJJZGHQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 2
- 229940044693 topoisomerase inhibitor Drugs 0.000 description 2
- UCFGDBYHRUNTLO-QHCPKHFHSA-N topotecan Chemical compound C1=C(O)C(CN(C)C)=C2C=C(CN3C4=CC5=C(C3=O)COC(=O)[C@]5(O)CC)C4=NC2=C1 UCFGDBYHRUNTLO-QHCPKHFHSA-N 0.000 description 2
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 2
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 2
- 229940066958 treanda Drugs 0.000 description 2
- 229910052722 tritium Inorganic materials 0.000 description 2
- 201000005112 urinary bladder cancer Diseases 0.000 description 2
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 description 2
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 2
- 229910052720 vanadium Inorganic materials 0.000 description 2
- 229950000578 vatalanib Drugs 0.000 description 2
- KDQAABAKXDWYSZ-PNYVAJAMSA-N vinblastine sulfate Chemical compound OS(O)(=O)=O.C([C@H](C[C@]1(C(=O)OC)C=2C(=CC3=C([C@]45[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]6(CC)C=CCN([C@H]56)CC4)(O)C(=O)OC)N3C)C=2)OC)C[C@@](C2)(O)CC)N2CCC2=C1NC1=CC=CC=C21 KDQAABAKXDWYSZ-PNYVAJAMSA-N 0.000 description 2
- 229960002066 vinorelbine Drugs 0.000 description 2
- GBABOYUKABKIAF-IELIFDKJSA-N vinorelbine Chemical compound C1N(CC=2C3=CC=CC=C3NC=22)CC(CC)=C[C@H]1C[C@]2(C(=O)OC)C1=CC([C@]23[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]4(CC)C=CCN([C@H]34)CC2)(O)C(=O)OC)N2C)=C2C=C1OC GBABOYUKABKIAF-IELIFDKJSA-N 0.000 description 2
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 2
- 229940053890 zanosar Drugs 0.000 description 2
- QWPXBEHQFHACTK-KZVYIGENSA-N (10e,12e)-86-chloro-12,14,4-trihydroxy-85,14-dimethoxy-33,2,7,10-tetramethyl-15,16-dihydro-14h-7-aza-1(6,4)-oxazina-3(2,3)-oxirana-8(1,3)-benzenacyclotetradecaphane-10,12-dien-6-one Chemical compound CN1C(=O)CC(O)C2(C)OC2C(C)C(OC(=O)N2)CC2(O)C(OC)\C=C\C=C(C)\CC2=CC(OC)=C(Cl)C1=C2 QWPXBEHQFHACTK-KZVYIGENSA-N 0.000 description 1
- ZADWXFSZEAPBJS-SNVBAGLBSA-N (2r)-2-amino-3-(1-methylindol-3-yl)propanoic acid Chemical compound C1=CC=C2N(C)C=C(C[C@@H](N)C(O)=O)C2=C1 ZADWXFSZEAPBJS-SNVBAGLBSA-N 0.000 description 1
- KGWWHPZQLVVAPT-STTJLUEPSA-N (2r,3r)-2,3-dihydroxybutanedioic acid;6-(4-methylpiperazin-1-yl)-n-(5-methyl-1h-pyrazol-3-yl)-2-[(e)-2-phenylethenyl]pyrimidin-4-amine Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O.C1CN(C)CCN1C1=CC(NC2=NNC(C)=C2)=NC(\C=C\C=2C=CC=CC=2)=N1 KGWWHPZQLVVAPT-STTJLUEPSA-N 0.000 description 1
- VEEGZPWAAPPXRB-BJMVGYQFSA-N (3e)-3-(1h-imidazol-5-ylmethylidene)-1h-indol-2-one Chemical compound O=C1NC2=CC=CC=C2\C1=C/C1=CN=CN1 VEEGZPWAAPPXRB-BJMVGYQFSA-N 0.000 description 1
- MUVQOOPKPBEAJZ-VQHVLOKHSA-N (4e)-4-[(3-chloro-4-fluoroanilino)-nitrosomethylidene]-1,2,5-oxadiazol-3-amine Chemical compound NC1=NON\C1=C(N=O)/NC1=CC=C(F)C(Cl)=C1 MUVQOOPKPBEAJZ-VQHVLOKHSA-N 0.000 description 1
- FPVKHBSQESCIEP-UHFFFAOYSA-N (8S)-3-(2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranosyl)-3,6,7,8-tetrahydroimidazo[4,5-d][1,3]diazepin-8-ol Natural products C1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NCC2O)=C2N=C1 FPVKHBSQESCIEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LKJPYSCBVHEWIU-KRWDZBQOSA-N (R)-bicalutamide Chemical compound C([C@@](O)(C)C(=O)NC=1C=C(C(C#N)=CC=1)C(F)(F)F)S(=O)(=O)C1=CC=C(F)C=C1 LKJPYSCBVHEWIU-KRWDZBQOSA-N 0.000 description 1
- JRMGHBVACUJCRP-BTJKTKAUSA-N (z)-but-2-enedioic acid;4-[(4-fluoro-2-methyl-1h-indol-5-yl)oxy]-6-methoxy-7-(3-pyrrolidin-1-ylpropoxy)quinazoline Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O.COC1=CC2=C(OC=3C(=C4C=C(C)NC4=CC=3)F)N=CN=C2C=C1OCCCN1CCCC1 JRMGHBVACUJCRP-BTJKTKAUSA-N 0.000 description 1
- 102100025573 1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase Human genes 0.000 description 1
- YTRRAUACYORZLX-UHFFFAOYSA-N 1-cyclohexyl-2-(5h-imidazo[5,1-a]isoindol-5-yl)ethanol Chemical compound C12=CC=CC=C2C2=CN=CN2C1CC(O)C1CCCCC1 YTRRAUACYORZLX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- 229940123967 11-beta-hydroxylase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- NMIZONYLXCOHEF-UHFFFAOYSA-N 1h-imidazole-2-carboxamide Chemical compound NC(=O)C1=NC=CN1 NMIZONYLXCOHEF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PDMUGYOXRHVNMO-UHFFFAOYSA-N 2-[4-[3-(6-quinolinylmethyl)-5-triazolo[4,5-b]pyrazinyl]-1-pyrazolyl]ethanol Chemical compound C1=NN(CCO)C=C1C1=CN=C(N=NN2CC=3C=C4C=CC=NC4=CC=3)C2=N1 PDMUGYOXRHVNMO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZMAWJRXKGLWGS-UHFFFAOYSA-N 2-chloro-n-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-n-(3-methoxypropyl)acetamide Chemical compound S1C(N(C(=O)CCl)CCCOC)=NC(C=2C=CC(OC)=CC=2)=C1 KZMAWJRXKGLWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NDMPLJNOPCLANR-UHFFFAOYSA-N 3,4-dihydroxy-15-(4-hydroxy-18-methoxycarbonyl-5,18-seco-ibogamin-18-yl)-16-methoxy-1-methyl-6,7-didehydro-aspidospermidine-3-carboxylic acid methyl ester Natural products C1C(CC)(O)CC(CC2(C(=O)OC)C=3C(=CC4=C(C56C(C(C(O)C7(CC)C=CCN(C67)CC5)(O)C(=O)OC)N4C)C=3)OC)CN1CCC1=C2NC2=CC=CC=C12 NDMPLJNOPCLANR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FGTCROZDHDSNIO-UHFFFAOYSA-N 3-(4-quinolinylmethylamino)-N-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]-2-thiophenecarboxamide Chemical compound C1=CC(OC(F)(F)F)=CC=C1NC(=O)C1=C(NCC=2C3=CC=CC=C3N=CC=2)C=CS1 FGTCROZDHDSNIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LKKMLIBUAXYLOY-UHFFFAOYSA-N 3-Amino-1-methyl-5H-pyrido[4,3-b]indole Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C2=C1C=C(N)N=C2C LKKMLIBUAXYLOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WUIABRMSWOKTOF-OYALTWQYSA-N 3-[[2-[2-[2-[[(2s,3r)-2-[[(2s,3s,4r)-4-[[(2s,3r)-2-[[6-amino-2-[(1s)-3-amino-1-[[(2s)-2,3-diamino-3-oxopropyl]amino]-3-oxopropyl]-5-methylpyrimidine-4-carbonyl]amino]-3-[(2r,3s,4s,5s,6s)-3-[(2r,3s,4s,5r,6r)-4-carbamoyloxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)ox Chemical compound OS([O-])(=O)=O.N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC=C(N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCC[S+](C)C)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1NC=NC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C WUIABRMSWOKTOF-OYALTWQYSA-N 0.000 description 1
- AOJJSUZBOXZQNB-VTZDEGQISA-N 4'-epidoxorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-VTZDEGQISA-N 0.000 description 1
- YTXSYWAKVMZICI-PVCZSOGJSA-N 4-(carboxymethyl)-2-[(1r)-1-[[2-[(2,5-dichlorobenzoyl)amino]acetyl]amino]-3-methylbutyl]-6-oxo-1,3,2-dioxaborinane-4-carboxylic acid Chemical compound N([C@@H](CC(C)C)B1OC(CC(O)=O)(CC(=O)O1)C(O)=O)C(=O)CNC(=O)C1=CC(Cl)=CC=C1Cl YTXSYWAKVMZICI-PVCZSOGJSA-N 0.000 description 1
- ZHXCTIMNNKVMJM-JSPLCZCHSA-N 4-[(2r,3s,4r,5s,6r)-4-(dimethylamino)-3,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]-8-ethenyl-1-hydroxy-10,12-dimethoxynaphtho[1,2-c]isochromen-6-one Chemical compound C1=CC(O)=C2C(OC)=CC(C3=C(OC)C=C(C=C)C=C3C(=O)O3)=C3C2=C1[C@H]1O[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](N(C)C)[C@@H]1O ZHXCTIMNNKVMJM-JSPLCZCHSA-N 0.000 description 1
- MMBZCFJKAQZVNI-VPENINKCSA-N 4-amino-5,6-difluoro-1-[(2r,4s,5r)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one Chemical compound FC1=C(F)C(N)=NC(=O)N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 MMBZCFJKAQZVNI-VPENINKCSA-N 0.000 description 1
- ALKJNCZNEOTEMP-UHFFFAOYSA-N 4-n-(5-cyclopropyl-1h-pyrazol-3-yl)-6-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-n-[(3-propan-2-yl-1,2-oxazol-5-yl)methyl]pyrimidine-2,4-diamine Chemical compound O1N=C(C(C)C)C=C1CNC1=NC(NC=2NN=C(C=2)C2CC2)=CC(N2CCN(C)CC2)=N1 ALKJNCZNEOTEMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PLIVFNIUGLLCEK-UHFFFAOYSA-N 7-[4-(3-ethynylanilino)-7-methoxyquinazolin-6-yl]oxy-n-hydroxyheptanamide Chemical compound C=12C=C(OCCCCCCC(=O)NO)C(OC)=CC2=NC=NC=1NC1=CC=CC(C#C)=C1 PLIVFNIUGLLCEK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CJIJXIFQYOPWTF-UHFFFAOYSA-N 7-hydroxycoumarin Natural products O1C(=O)C=CC2=CC(O)=CC=C21 CJIJXIFQYOPWTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OONFNUWBHFSNBT-HXUWFJFHSA-N AEE788 Chemical compound C1CN(CC)CCN1CC1=CC=C(C=2NC3=NC=NC(N[C@H](C)C=4C=CC=CC=4)=C3C=2)C=C1 OONFNUWBHFSNBT-HXUWFJFHSA-N 0.000 description 1
- 102100033350 ATP-dependent translocase ABCB1 Human genes 0.000 description 1
- 102000012440 Acetylcholinesterase Human genes 0.000 description 1
- 108010022752 Acetylcholinesterase Proteins 0.000 description 1
- 206010069754 Acquired gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- 208000031261 Acute myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 1
- 108010000239 Aequorin Proteins 0.000 description 1
- ULXXDDBFHOBEHA-ONEGZZNKSA-N Afatinib Chemical compound N1=CN=C2C=C(OC3COCC3)C(NC(=O)/C=C/CN(C)C)=CC2=C1NC1=CC=C(F)C(Cl)=C1 ULXXDDBFHOBEHA-ONEGZZNKSA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 244000303258 Annona diversifolia Species 0.000 description 1
- 101100452478 Arabidopsis thaliana DHAD gene Proteins 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 229940122815 Aromatase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 102000015790 Asparaginase Human genes 0.000 description 1
- NOWKCMXCCJGMRR-UHFFFAOYSA-N Aziridine Chemical class C1CN1 NOWKCMXCCJGMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000004736 B-Cell Leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000028564 B-cell non-Hodgkin lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 208000032568 B-cell prolymphocytic leukaemia Diseases 0.000 description 1
- 102000005738 B7 Antigens Human genes 0.000 description 1
- 108010045634 B7 Antigens Proteins 0.000 description 1
- 108091007065 BIRCs Proteins 0.000 description 1
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 1
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 206010005949 Bone cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000018084 Bone neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 206010006143 Brain stem glioma Diseases 0.000 description 1
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229940124297 CDK 4/6 inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101100180402 Caenorhabditis elegans jun-1 gene Proteins 0.000 description 1
- GAGWJHPBXLXJQN-UHFFFAOYSA-N Capecitabine Natural products C1=C(F)C(NC(=O)OCCCCC)=NC(=O)N1C1C(O)C(O)C(C)O1 GAGWJHPBXLXJQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100025064 Cellular tumor antigen p53 Human genes 0.000 description 1
- 206010007953 Central nervous system lymphoma Diseases 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VYZAMTAEIAYCRO-BJUDXGSMSA-N Chromium-51 Chemical compound [51Cr] VYZAMTAEIAYCRO-BJUDXGSMSA-N 0.000 description 1
- 108091033380 Coding strand Proteins 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 1
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 1
- 102000016917 Complement C1 Human genes 0.000 description 1
- 108010028774 Complement C1 Proteins 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 229940124766 Cyp17 inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 208000003311 Cytochrome P-450 Enzyme Inhibitors Diseases 0.000 description 1
- 229940122280 Cytochrome P450 inhibitor Drugs 0.000 description 1
- IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N D-Luciferin Chemical compound OC(=O)[C@H]1CSC(C=2SC3=CC=C(O)C=C3N=2)=N1 IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N 0.000 description 1
- WVXNSAVVKYZVOE-UHFFFAOYSA-N DCC-2036 Chemical compound C1=NC(C(=O)NC)=CC(OC=2C=C(F)C(NC(=O)NC=3N(N=C(C=3)C(C)(C)C)C=3C=C4C=CC=NC4=CC=3)=CC=2)=C1 WVXNSAVVKYZVOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- XPDXVDYUQZHFPV-UHFFFAOYSA-N Dansyl Chloride Chemical compound C1=CC=C2C(N(C)C)=CC=CC2=C1S(Cl)(=O)=O XPDXVDYUQZHFPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUGHGUXZJWAIAS-QQYBVWGSSA-N Daunorubicin hydrochloride Chemical compound Cl.O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(C)=O)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 GUGHGUXZJWAIAS-QQYBVWGSSA-N 0.000 description 1
- CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N Dehydro-luciferin Natural products OC(=O)C1=CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000017815 Dendritic cell tumor Diseases 0.000 description 1
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MWWSFMDVAYGXBV-RUELKSSGSA-N Doxorubicin hydrochloride Chemical compound Cl.O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 MWWSFMDVAYGXBV-RUELKSSGSA-N 0.000 description 1
- 206010058314 Dysplasia Diseases 0.000 description 1
- 102000012199 E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2 Human genes 0.000 description 1
- 102100032257 E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2 Human genes 0.000 description 1
- 101150029707 ERBB2 gene Proteins 0.000 description 1
- MBYXEBXZARTUSS-QLWBXOBMSA-N Emetamine Natural products O(C)c1c(OC)cc2c(c(C[C@@H]3[C@H](CC)CN4[C@H](c5c(cc(OC)c(OC)c5)CC4)C3)ncc2)c1 MBYXEBXZARTUSS-QLWBXOBMSA-N 0.000 description 1
- 102400001368 Epidermal growth factor Human genes 0.000 description 1
- 101800003838 Epidermal growth factor Proteins 0.000 description 1
- HTIJFSOGRVMCQR-UHFFFAOYSA-N Epirubicin Natural products COc1cccc2C(=O)c3c(O)c4CC(O)(CC(OC5CC(N)C(=O)C(C)O5)c4c(O)c3C(=O)c12)C(=O)CO HTIJFSOGRVMCQR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 229910052693 Europium Inorganic materials 0.000 description 1
- HKVAMNSJSFKALM-GKUWKFKPSA-N Everolimus Chemical compound C1C[C@@H](OCCO)[C@H](OC)C[C@@H]1C[C@@H](C)[C@H]1OC(=O)[C@@H]2CCCCN2C(=O)C(=O)[C@](O)(O2)[C@H](C)CC[C@H]2C[C@H](OC)/C(C)=C/C=C/C=C/[C@@H](C)C[C@@H](C)C(=O)[C@H](OC)[C@H](O)/C(C)=C/[C@@H](C)C(=O)C1 HKVAMNSJSFKALM-GKUWKFKPSA-N 0.000 description 1
- 206010061850 Extranodal marginal zone B-cell lymphoma (MALT type) Diseases 0.000 description 1
- BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N Fivefly Luciferin Natural products OC(=O)C1CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100030708 GTPase KRas Human genes 0.000 description 1
- GYHNNYVSQQEPJS-OIOBTWANSA-N Gallium-67 Chemical compound [67Ga] GYHNNYVSQQEPJS-OIOBTWANSA-N 0.000 description 1
- 201000003741 Gastrointestinal carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- JRZJKWGQFNTSRN-UHFFFAOYSA-N Geldanamycin Natural products C1C(C)CC(OC)C(O)C(C)C=C(C)C(OC(N)=O)C(OC)CCC=C(C)C(=O)NC2=CC(=O)C(OC)=C1C2=O JRZJKWGQFNTSRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 1
- 239000004366 Glucose oxidase Substances 0.000 description 1
- 108010015776 Glucose oxidase Proteins 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 244000060234 Gmelina philippensis Species 0.000 description 1
- 108010026389 Gramicidin Proteins 0.000 description 1
- 108010017080 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100039619 Granulocyte colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 1
- 108010051696 Growth Hormone Proteins 0.000 description 1
- 208000037319 Hepatitis infectious Diseases 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 208000017604 Hodgkin disease Diseases 0.000 description 1
- 208000021519 Hodgkin lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 208000010747 Hodgkins lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 101000721661 Homo sapiens Cellular tumor antigen p53 Proteins 0.000 description 1
- 101000911952 Homo sapiens Cyclin-dependent kinase 7 Proteins 0.000 description 1
- 101000584612 Homo sapiens GTPase KRas Proteins 0.000 description 1
- 101000578784 Homo sapiens Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001117312 Homo sapiens Programmed cell death 1 ligand 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001094545 Homo sapiens Retrotransposon-like protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001050288 Homo sapiens Transcription factor Jun Proteins 0.000 description 1
- 101000955999 Homo sapiens V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1 Proteins 0.000 description 1
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 1
- 108010043766 IRX 2 Proteins 0.000 description 1
- 229940123309 Immune checkpoint modulator Drugs 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 108010043496 Immunoglobulin Idiotypes Proteins 0.000 description 1
- 102000003814 Interleukin-10 Human genes 0.000 description 1
- 102100024319 Intestinal-type alkaline phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 229940122245 Janus kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 108010043610 KIR Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000002698 KIR Receptors Human genes 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 239000005411 L01XE02 - Gefitinib Substances 0.000 description 1
- 239000002067 L01XE06 - Dasatinib Substances 0.000 description 1
- 239000002118 L01XE12 - Vandetanib Substances 0.000 description 1
- 241000282838 Lama Species 0.000 description 1
- 241000282852 Lama guanicoe Species 0.000 description 1
- 208000031671 Large B-Cell Diffuse Lymphoma Diseases 0.000 description 1
- LPGWZGMPDKDHEP-HLTPFJCJSA-N Leurosine Chemical compound C([C@]1([C@@H]2O1)CC)N(CCC=1C3=CC=CC=C3NC=11)C[C@H]2C[C@]1(C(=O)OC)C1=CC([C@]23[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]4(CC)C=CCN([C@H]34)CC2)(O)C(=O)OC)N2C)=C2C=C1OC LPGWZGMPDKDHEP-HLTPFJCJSA-N 0.000 description 1
- NNJVILVZKWQKPM-UHFFFAOYSA-N Lidocaine Chemical compound CCN(CC)CC(=O)NC1=C(C)C=CC=C1C NNJVILVZKWQKPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940123917 Lipid kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N Luciferin Natural products CCc1c(C)c(CC2NC(=O)C(=C2C=C)C)[nH]c1Cc3[nH]c4C(=C5/NC(CC(=O)O)C(C)C5CC(=O)O)CC(=O)c4c3C DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940122014 Lyase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 208000028018 Lymphocytic leukaemia Diseases 0.000 description 1
- 206010052178 Lymphocytic lymphoma Diseases 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 201000003791 MALT lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 241000282560 Macaca mulatta Species 0.000 description 1
- 208000032271 Malignant tumor of penis Diseases 0.000 description 1
- 208000025205 Mantle-Cell Lymphoma Diseases 0.000 description 1
- QWPXBEHQFHACTK-UHFFFAOYSA-N Maytansinol Natural products CN1C(=O)CC(O)C2(C)OC2C(C)C(OC(=O)N2)CC2(O)C(OC)C=CC=C(C)CC2=CC(OC)=C(Cl)C1=C2 QWPXBEHQFHACTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100028389 Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010071463 Melanoma-Specific Antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000007557 Melanoma-Specific Antigens Human genes 0.000 description 1
- 208000002030 Merkel cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 206010027406 Mesothelioma Diseases 0.000 description 1
- VFKZTMPDYBFSTM-KVTDHHQDSA-N Mitobronitol Chemical compound BrC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CBr VFKZTMPDYBFSTM-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 229930192392 Mitomycin Natural products 0.000 description 1
- 101000753280 Mus musculus Angiopoietin-1 receptor Proteins 0.000 description 1
- 101100335081 Mus musculus Flt3 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000238367 Mya arenaria Species 0.000 description 1
- 208000033776 Myeloid Acute Leukemia Diseases 0.000 description 1
- 201000007224 Myeloproliferative neoplasm Diseases 0.000 description 1
- FOFDIMHVKGYHRU-UHFFFAOYSA-N N-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-4-(4-benzofuro[3,2-d]pyrimidinyl)-1-piperazinecarbothioamide Chemical compound C12=CC=CC=C2OC2=C1N=CN=C2N(CC1)CCN1C(=S)NCC1=CC=C(OCO2)C2=C1 FOFDIMHVKGYHRU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VNBRGSXVFBYQNN-UHFFFAOYSA-N N-[4-[(2-amino-3-chloro-4-pyridinyl)oxy]-3-fluorophenyl]-4-ethoxy-1-(4-fluorophenyl)-2-oxo-3-pyridinecarboxamide Chemical compound O=C1C(C(=O)NC=2C=C(F)C(OC=3C(=C(N)N=CC=3)Cl)=CC=2)=C(OCC)C=CN1C1=CC=C(F)C=C1 VNBRGSXVFBYQNN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MVZGYPSXNDCANY-UHFFFAOYSA-N N-[4-[3-chloro-4-[(3-fluorophenyl)methoxy]anilino]-6-quinazolinyl]-2-propenamide Chemical compound FC1=CC=CC(COC=2C(=CC(NC=3C4=CC(NC(=O)C=C)=CC=C4N=CN=3)=CC=2)Cl)=C1 MVZGYPSXNDCANY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LKJPYSCBVHEWIU-UHFFFAOYSA-N N-[4-cyano-3-(trifluoromethyl)phenyl]-3-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]-2-hydroxy-2-methylpropanamide Chemical compound C=1C=C(C#N)C(C(F)(F)F)=CC=1NC(=O)C(O)(C)CS(=O)(=O)C1=CC=C(F)C=C1 LKJPYSCBVHEWIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 241001325209 Nama Species 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Chemical group 0.000 description 1
- 108010064641 ONX 0912 Proteins 0.000 description 1
- YGACXVRLDHEXKY-WXRXAMBDSA-N O[C@H](C[C@H]1c2c(cccc2F)-c2cncn12)[C@H]1CC[C@H](O)CC1 Chemical compound O[C@H](C[C@H]1c2c(cccc2F)-c2cncn12)[C@H]1CC[C@H](O)CC1 YGACXVRLDHEXKY-WXRXAMBDSA-N 0.000 description 1
- 206010071192 Oesophageal papilloma Diseases 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 108010087367 P-glycoprotein 2 Proteins 0.000 description 1
- LSPANGZZENHZNJ-UHFFFAOYSA-N PD-153035 Chemical compound C=12C=C(OC)C(OC)=CC2=NC=NC=1NC1=CC=CC(Br)=C1 LSPANGZZENHZNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012272 PD-L2 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 206010033701 Papillary thyroid cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000000821 Parathyroid Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000002471 Penile Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010034299 Penile cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000037581 Persistent Infection Diseases 0.000 description 1
- 241000233805 Phoenix Species 0.000 description 1
- 229940122016 Pim kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 208000007913 Pituitary Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 201000005746 Pituitary adenoma Diseases 0.000 description 1
- 206010061538 Pituitary tumour benign Diseases 0.000 description 1
- 108010051742 Platelet-Derived Growth Factor beta Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100026547 Platelet-derived growth factor receptor beta Human genes 0.000 description 1
- 229920002732 Polyanhydride Polymers 0.000 description 1
- 229920000954 Polyglycolide Polymers 0.000 description 1
- 229920001710 Polyorthoester Polymers 0.000 description 1
- 229940123882 Porcupine inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 208000017414 Precursor T-cell acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000007541 Preleukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000035416 Prolymphocytic B-Cell Leukemia Diseases 0.000 description 1
- 108091008611 Protein Kinase B Proteins 0.000 description 1
- 108010071563 Proto-Oncogene Proteins c-fos Proteins 0.000 description 1
- 102000007568 Proto-Oncogene Proteins c-fos Human genes 0.000 description 1
- 102100028286 Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret Human genes 0.000 description 1
- 102100033810 RAC-alpha serine/threonine-protein kinase Human genes 0.000 description 1
- 102100033479 RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Human genes 0.000 description 1
- 101710141955 RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Proteins 0.000 description 1
- GHLIFBNIGXVDHM-UHFFFAOYSA-N Ravidomycin Natural products COC1=CC(C=C)=CC(C(OC2=C34)=O)=C1C2=CC(OC)=C3C(O)=CC=C4C1OC(C)C(OC(C)=O)C(N(C)C)C1O GHLIFBNIGXVDHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710100969 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Proteins 0.000 description 1
- 102100029986 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Human genes 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- BCZUAADEACICHN-UHFFFAOYSA-N SGX-523 Chemical compound C1=NN(C)C=C1C1=NN2C(SC=3C=C4C=CC=NC4=CC=3)=NN=C2C=C1 BCZUAADEACICHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AUVVAXYIELKVAI-UHFFFAOYSA-N SJ000285215 Natural products N1CCC2=CC(OC)=C(OC)C=C2C1CC1CC2C3=CC(OC)=C(OC)C=C3CCN2CC1CC AUVVAXYIELKVAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BUGBHKTXTAQXES-UHFFFAOYSA-N Selenium Chemical compound [Se] BUGBHKTXTAQXES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000000453 Skin Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102000013380 Smoothened Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010090739 Smoothened Receptor Proteins 0.000 description 1
- 208000021712 Soft tissue sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 102000005157 Somatostatin Human genes 0.000 description 1
- 108010056088 Somatostatin Proteins 0.000 description 1
- 102100038803 Somatotropin Human genes 0.000 description 1
- 108010015330 Steroid 17-alpha-Hydroxylase Proteins 0.000 description 1
- 102000001854 Steroid 17-alpha-Hydroxylase Human genes 0.000 description 1
- ZSJLQEPLLKMAKR-UHFFFAOYSA-N Streptozotocin Natural products O=NN(C)C(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O ZSJLQEPLLKMAKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010017842 Telomerase Proteins 0.000 description 1
- 208000024313 Testicular Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010057644 Testis cancer Diseases 0.000 description 1
- 102100023132 Transcription factor Jun Human genes 0.000 description 1
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 1
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 1
- 108010009583 Transforming Growth Factors Proteins 0.000 description 1
- 102000009618 Transforming Growth Factors Human genes 0.000 description 1
- 229940122429 Tubulin inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 108060008683 Tumor Necrosis Factor Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100031988 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Human genes 0.000 description 1
- 108050002568 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Proteins 0.000 description 1
- 108091005906 Type I transmembrane proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100039094 Tyrosinase Human genes 0.000 description 1
- 108060008724 Tyrosinase Proteins 0.000 description 1
- 208000023915 Ureteral Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010046392 Ureteric cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010046431 Urethral cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010046458 Urethral neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100038929 V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1 Human genes 0.000 description 1
- 201000003761 Vaginal carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108010053096 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010053100 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-3 Proteins 0.000 description 1
- 102100033178 Vascular endothelial growth factor receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100033179 Vascular endothelial growth factor receptor 3 Human genes 0.000 description 1
- 241001416177 Vicugna pacos Species 0.000 description 1
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000282485 Vulpes vulpes Species 0.000 description 1
- 206010047741 Vulval cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000033559 Waldenström macroglobulinemia Diseases 0.000 description 1
- 102000013814 Wnt Human genes 0.000 description 1
- 108050003627 Wnt Proteins 0.000 description 1
- SPXSEZMVRJLHQG-XMMPIXPASA-N [(2R)-1-[[4-[(3-phenylmethoxyphenoxy)methyl]phenyl]methyl]pyrrolidin-2-yl]methanol Chemical compound C(C1=CC=CC=C1)OC=1C=C(OCC2=CC=C(CN3[C@H](CCC3)CO)C=C2)C=CC=1 SPXSEZMVRJLHQG-XMMPIXPASA-N 0.000 description 1
- LUJZZYWHBDHDQX-QFIPXVFZSA-N [(3s)-morpholin-3-yl]methyl n-[4-[[1-[(3-fluorophenyl)methyl]indazol-5-yl]amino]-5-methylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-6-yl]carbamate Chemical compound C=1N2N=CN=C(NC=3C=C4C=NN(CC=5C=C(F)C=CC=5)C4=CC=3)C2=C(C)C=1NC(=O)OC[C@@H]1COCCN1 LUJZZYWHBDHDQX-QFIPXVFZSA-N 0.000 description 1
- SXEHKFHPFVVDIR-UHFFFAOYSA-N [4-(4-hydrazinylphenyl)phenyl]hydrazine Chemical compound C1=CC(NN)=CC=C1C1=CC=C(NN)C=C1 SXEHKFHPFVVDIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229940022698 acetylcholinesterase Drugs 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 229930183665 actinomycin Natural products 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000011149 active material Substances 0.000 description 1
- 201000005188 adrenal gland cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000024447 adrenal gland neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000037844 advanced solid tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 229960000548 alemtuzumab Drugs 0.000 description 1
- 229940045714 alkyl sulfonate alkylating agent Drugs 0.000 description 1
- 150000008052 alkyl sulfonates Chemical class 0.000 description 1
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003281 allosteric effect Effects 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 229960002932 anastrozole Drugs 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940124650 anti-cancer therapies Drugs 0.000 description 1
- 230000000118 anti-neoplastic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 230000005809 anti-tumor immunity Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 1
- 238000011319 anticancer therapy Methods 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003080 antimitotic agent Substances 0.000 description 1
- 229940045719 antineoplastic alkylating agent nitrosoureas Drugs 0.000 description 1
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 description 1
- 238000011398 antitumor immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 210000000436 anus Anatomy 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940078010 arimidex Drugs 0.000 description 1
- 239000003886 aromatase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000010425 asbestos Substances 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000005784 autoimmunity Effects 0.000 description 1
- 229940120638 avastin Drugs 0.000 description 1
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 229960002707 bendamustine Drugs 0.000 description 1
- YTKUWDBFDASYHO-UHFFFAOYSA-N bendamustine Chemical compound ClCCN(CCCl)C1=CC=C2N(C)C(CCCC(O)=O)=NC2=C1 YTKUWDBFDASYHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001215 bendamustine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000397 bevacizumab Drugs 0.000 description 1
- 229960000997 bicalutamide Drugs 0.000 description 1
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 1
- 229920000249 biocompatible polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003443 bladder cell Anatomy 0.000 description 1
- 229960004395 bleomycin sulfate Drugs 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- RSIHSRDYCUFFLA-DYKIIFRCSA-N boldenone Chemical compound O=C1C=C[C@]2(C)[C@H]3CC[C@](C)([C@H](CC4)O)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 RSIHSRDYCUFFLA-DYKIIFRCSA-N 0.000 description 1
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 1
- 238000010322 bone marrow transplantation Methods 0.000 description 1
- 229960001467 bortezomib Drugs 0.000 description 1
- GXJABQQUPOEUTA-RDJZCZTQSA-N bortezomib Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)B(O)O)NC(=O)C=1N=CC=NC=1)C1=CC=CC=C1 GXJABQQUPOEUTA-RDJZCZTQSA-N 0.000 description 1
- UBPYILGKFZZVDX-UHFFFAOYSA-N bosutinib Chemical compound C1=C(Cl)C(OC)=CC(NC=2C3=CC(OC)=C(OCCCN4CCN(C)CC4)C=C3N=CC=2C#N)=C1Cl UBPYILGKFZZVDX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004958 brain cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000020158 breast diffuse large B-cell lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 229960000455 brentuximab vedotin Drugs 0.000 description 1
- 210000000621 bronchi Anatomy 0.000 description 1
- 239000006189 buccal tablet Substances 0.000 description 1
- 229940111214 busulfan injection Drugs 0.000 description 1
- DQXBYHZEEUGOBF-UHFFFAOYSA-N but-3-enoic acid;ethene Chemical compound C=C.OC(=O)CC=C DQXBYHZEEUGOBF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- HFCFMRYTXDINDK-WNQIDUERSA-N cabozantinib malate Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)CC(O)=O.C=12C=C(OC)C(OC)=CC2=NC=CC=1OC(C=C1)=CC=C1NC(=O)C1(C(=O)NC=2C=CC(F)=CC=2)CC1 HFCFMRYTXDINDK-WNQIDUERSA-N 0.000 description 1
- 235000008207 calcium folinate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011687 calcium folinate Substances 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 238000002619 cancer immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 229960004117 capecitabine Drugs 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 108010021331 carfilzomib Proteins 0.000 description 1
- 229960002438 carfilzomib Drugs 0.000 description 1
- BLMPQMFVWMYDKT-NZTKNTHTSA-N carfilzomib Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)[C@]1(C)OC1)NC(=O)CN1CCOCC1)CC1=CC=CC=C1 BLMPQMFVWMYDKT-NZTKNTHTSA-N 0.000 description 1
- 229940097647 casodex Drugs 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 239000002458 cell surface marker Substances 0.000 description 1
- 229940030156 cell vaccine Drugs 0.000 description 1
- AEULIVPVIDOLIN-UHFFFAOYSA-N cep-11981 Chemical compound C1=C2C3=C4CNC(=O)C4=C4C5=CN(C)N=C5CCC4=C3N(CC(C)C)C2=CC=C1NC1=NC=CC=N1 AEULIVPVIDOLIN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000019065 cervical carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000003679 cervix uteri Anatomy 0.000 description 1
- 229960005395 cetuximab Drugs 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- JXDYOSVKVSQGJM-UHFFFAOYSA-N chembl3109738 Chemical compound N1C2=CC(Br)=CC=C2CN(C)CCCCCOC2=CC3=C1N=CN=C3C=C2OC JXDYOSVKVSQGJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NDAYQJDHGXTBJL-MWWSRJDJSA-N chembl557217 Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)NC(=O)[C@@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](NC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC=O)C(C)C)CC(C)C)C(=O)NCCO)=CNC2=C1 NDAYQJDHGXTBJL-MWWSRJDJSA-N 0.000 description 1
- 238000012412 chemical coupling Methods 0.000 description 1
- 239000012829 chemotherapy agent Substances 0.000 description 1
- 238000009104 chemotherapy regimen Methods 0.000 description 1
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 208000032852 chronic lymphocytic leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000009060 clear cell adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 229910017052 cobalt Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010941 cobalt Substances 0.000 description 1
- GUTLYIVDDKVIGB-UHFFFAOYSA-N cobalt atom Chemical compound [Co] GUTLYIVDDKVIGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001338 colchicine Drugs 0.000 description 1
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 1
- 238000010668 complexation reaction Methods 0.000 description 1
- 229940127271 compound 49 Drugs 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 229940088547 cosmegen Drugs 0.000 description 1
- 229960005061 crizotinib Drugs 0.000 description 1
- KTEIFNKAUNYNJU-GFCCVEGCSA-N crizotinib Chemical compound O([C@H](C)C=1C(=C(F)C=CC=1Cl)Cl)C(C(=NC=1)N)=CC=1C(=C1)C=NN1C1CCNCC1 KTEIFNKAUNYNJU-GFCCVEGCSA-N 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000002681 cryosurgery Methods 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000035250 cutaneous malignant susceptibility to 1 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 208000017763 cutaneous neuroendocrine carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229940077926 cytarabine liposome injection Drugs 0.000 description 1
- JVHIPYJQMFNCEK-UHFFFAOYSA-N cytochalasin Natural products N1C(=O)C2(C(C=CC(C)CC(C)CC=C3)OC(C)=O)C3C(O)C(=C)C(C)C2C1CC1=CC=CC=C1 JVHIPYJQMFNCEK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZMAODHOXRBLOQO-UHFFFAOYSA-N cytochalasin-A Natural products N1C(=O)C23OC(=O)C=CC(=O)CCCC(C)CC=CC3C(O)C(=C)C(C)C2C1CC1=CC=CC=C1 ZMAODHOXRBLOQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001085 cytostatic effect Effects 0.000 description 1
- LVXJQMNHJWSHET-AATRIKPKSA-N dacomitinib Chemical compound C=12C=C(NC(=O)\C=C\CN3CCCCC3)C(OC)=CC2=NC=NC=1NC1=CC=C(F)C(Cl)=C1 LVXJQMNHJWSHET-AATRIKPKSA-N 0.000 description 1
- 229940107841 daunoxome Drugs 0.000 description 1
- RSIHSRDYCUFFLA-UHFFFAOYSA-N dehydrotestosterone Natural products O=C1C=CC2(C)C3CCC(C)(C(CC4)O)C4C3CCC2=C1 RSIHSRDYCUFFLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SJFBTAPEPRWNKH-CCKFTAQKSA-N delanzomib Chemical compound CC(C)C[C@@H](B(O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)C1=CC=CC(C=2C=CC=CC=2)=N1 SJFBTAPEPRWNKH-CCKFTAQKSA-N 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 238000002716 delivery method Methods 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 229940070968 depocyt Drugs 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 229960003957 dexamethasone Drugs 0.000 description 1
- UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N dexamethasone Chemical compound C1CC2=CC(=O)C=C[C@]2(C)[C@]2(F)[C@@H]1[C@@H]1C[C@@H](C)[C@@](C(=O)CO)(O)[C@@]1(C)C[C@@H]2O UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 206010012818 diffuse large B-cell lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 1
- ZWIBGKZDAWNIFC-UHFFFAOYSA-N disuccinimidyl suberate Chemical compound O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCCCCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O ZWIBGKZDAWNIFC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003668 docetaxel Drugs 0.000 description 1
- 229960002918 doxorubicin hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 description 1
- 239000003596 drug target Substances 0.000 description 1
- 239000012893 effector ligand Substances 0.000 description 1
- 229940099302 efudex Drugs 0.000 description 1
- 230000009881 electrostatic interaction Effects 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 229940120655 eloxatin Drugs 0.000 description 1
- 229940073038 elspar Drugs 0.000 description 1
- AUVVAXYIELKVAI-CKBKHPSWSA-N emetine Chemical compound N1CCC2=CC(OC)=C(OC)C=C2[C@H]1C[C@H]1C[C@H]2C3=CC(OC)=C(OC)C=C3CCN2C[C@@H]1CC AUVVAXYIELKVAI-CKBKHPSWSA-N 0.000 description 1
- 229960002694 emetine Drugs 0.000 description 1
- AUVVAXYIELKVAI-UWBTVBNJSA-N emetine Natural products N1CCC2=CC(OC)=C(OC)C=C2[C@H]1C[C@H]1C[C@H]2C3=CC(OC)=C(OC)C=C3CCN2C[C@H]1CC AUVVAXYIELKVAI-UWBTVBNJSA-N 0.000 description 1
- 210000000750 endocrine system Anatomy 0.000 description 1
- 201000003914 endometrial carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 229940116977 epidermal growth factor Drugs 0.000 description 1
- 229960001904 epirubicin Drugs 0.000 description 1
- 229940082789 erbitux Drugs 0.000 description 1
- 229960001433 erlotinib Drugs 0.000 description 1
- 210000003238 esophagus Anatomy 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000005038 ethylene vinyl acetate Substances 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- OGPBJKLSAFTDLK-UHFFFAOYSA-N europium atom Chemical compound [Eu] OGPBJKLSAFTDLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005167 everolimus Drugs 0.000 description 1
- 238000002710 external beam radiation therapy Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 201000001343 fallopian tube carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 1
- 229960000390 fludarabine Drugs 0.000 description 1
- 229960002074 flutamide Drugs 0.000 description 1
- 102000006815 folate receptor Human genes 0.000 description 1
- 108020005243 folate receptor Proteins 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 230000005251 gamma ray Effects 0.000 description 1
- 210000001156 gastric mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 208000017215 gastric mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 229960002584 gefitinib Drugs 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 239000007903 gelatin capsule Substances 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- QTQAWLPCGQOSGP-GBTDJJJQSA-N geldanamycin Chemical compound N1C(=O)\C(C)=C/C=C\[C@@H](OC)[C@H](OC(N)=O)\C(C)=C/[C@@H](C)[C@@H](O)[C@H](OC)C[C@@H](C)CC2=C(OC)C(=O)C=C1C2=O QTQAWLPCGQOSGP-GBTDJJJQSA-N 0.000 description 1
- 229960005277 gemcitabine Drugs 0.000 description 1
- SDUQYLNIPVEERB-QPPQHZFASA-N gemcitabine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1C(F)(F)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 SDUQYLNIPVEERB-QPPQHZFASA-N 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 210000004392 genitalia Anatomy 0.000 description 1
- 229940080856 gleevec Drugs 0.000 description 1
- 229950007540 glesatinib Drugs 0.000 description 1
- 229940084910 gliadel Drugs 0.000 description 1
- 229940116332 glucose oxidase Drugs 0.000 description 1
- 235000019420 glucose oxidase Nutrition 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000122 growth hormone Substances 0.000 description 1
- 201000009277 hairy cell leukemia Diseases 0.000 description 1
- 230000009931 harmful effect Effects 0.000 description 1
- 239000003481 heat shock protein 90 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 208000005252 hepatitis A Diseases 0.000 description 1
- MCAHMSDENAOJFZ-BVXDHVRPSA-N herbimycin Chemical compound N1C(=O)\C(C)=C\C=C/[C@H](OC)[C@@H](OC(N)=O)\C(C)=C\[C@H](C)[C@@H](OC)[C@@H](OC)C[C@H](C)[C@@H](OC)C2=CC(=O)C=C1C2=O MCAHMSDENAOJFZ-BVXDHVRPSA-N 0.000 description 1
- 229930193320 herbimycin Natural products 0.000 description 1
- 229940022353 herceptin Drugs 0.000 description 1
- 239000000833 heterodimer Substances 0.000 description 1
- 229940003183 hexalen Drugs 0.000 description 1
- 229960001340 histamine Drugs 0.000 description 1
- 230000003054 hormonal effect Effects 0.000 description 1
- 238000001794 hormone therapy Methods 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 229940088013 hycamtin Drugs 0.000 description 1
- 229940096120 hydrea Drugs 0.000 description 1
- 229960001330 hydroxycarbamide Drugs 0.000 description 1
- 229960003445 idelalisib Drugs 0.000 description 1
- YKLIKGKUANLGSB-HNNXBMFYSA-N idelalisib Chemical compound C1([C@@H](NC=2[C]3N=CN=C3N=CN=2)CC)=NC2=CC=CC(F)=C2C(=O)N1C1=CC=CC=C1 YKLIKGKUANLGSB-HNNXBMFYSA-N 0.000 description 1
- 229940090411 ifex Drugs 0.000 description 1
- 230000008004 immune attack Effects 0.000 description 1
- 230000037451 immune surveillance Effects 0.000 description 1
- 208000026278 immune system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 description 1
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 description 1
- 229940125721 immunosuppressive agent Drugs 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- APFVFJFRJDLVQX-AHCXROLUSA-N indium-111 Chemical compound [111In] APFVFJFRJDLVQX-AHCXROLUSA-N 0.000 description 1
- 229950009034 indoximod Drugs 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 239000003701 inert diluent Substances 0.000 description 1
- 201000006747 infectious mononucleosis Diseases 0.000 description 1
- 239000003978 infusion fluid Substances 0.000 description 1
- 239000007972 injectable composition Substances 0.000 description 1
- 230000010468 interferon response Effects 0.000 description 1
- 229940047124 interferons Drugs 0.000 description 1
- 229940117681 interleukin-12 Drugs 0.000 description 1
- 201000002313 intestinal cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000001361 intraarterial administration Methods 0.000 description 1
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 1
- 239000007927 intramuscular injection Substances 0.000 description 1
- 238000007913 intrathecal administration Methods 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 229940084651 iressa Drugs 0.000 description 1
- 229960004768 irinotecan Drugs 0.000 description 1
- UWKQSNNFCGGAFS-XIFFEERXSA-N irinotecan Chemical compound C1=C2C(CC)=C3CN(C(C4=C([C@@](C(=O)OC4)(O)CC)C=4)=O)C=4C3=NC2=CC=C1OC(=O)N(CC1)CCC1N1CCCCC1 UWKQSNNFCGGAFS-XIFFEERXSA-N 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940075525 iron chelating agent Drugs 0.000 description 1
- 239000000797 iron chelating agent Substances 0.000 description 1
- 229940043355 kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 229960004891 lapatinib Drugs 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 229950001845 lestaurtinib Drugs 0.000 description 1
- 229960002293 leucovorin calcium Drugs 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229960004194 lidocaine Drugs 0.000 description 1
- MPVGZUGXCQEXTM-UHFFFAOYSA-N linifanib Chemical compound CC1=CC=C(F)C(NC(=O)NC=2C=CC(=CC=2)C=2C=3C(N)=NNC=3C=CC=2)=C1 MPVGZUGXCQEXTM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000029226 lipidation Effects 0.000 description 1
- 239000008297 liquid dosage form Substances 0.000 description 1
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 239000007937 lozenge Substances 0.000 description 1
- 229940076783 lucentis Drugs 0.000 description 1
- HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N luminol Chemical compound O=C1NNC(=O)C2=C1C(N)=CC=C2 HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002697 lyase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000000527 lymphocytic effect Effects 0.000 description 1
- 208000003747 lymphoid leukemia Diseases 0.000 description 1
- 230000001589 lymphoproliferative effect Effects 0.000 description 1
- 108700021021 mRNA Vaccine Proteins 0.000 description 1
- 230000005291 magnetic effect Effects 0.000 description 1
- 208000026037 malignant tumor of neck Diseases 0.000 description 1
- 208000026045 malignant tumor of parathyroid gland Diseases 0.000 description 1
- 201000007924 marginal zone B-cell lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 208000021937 marginal zone lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 229960002868 mechlorethamine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 208000011645 metastatic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000004530 micro-emulsion Substances 0.000 description 1
- 238000012737 microarray-based gene expression Methods 0.000 description 1
- 239000003094 microcapsule Substances 0.000 description 1
- 229960005485 mitobronitol Drugs 0.000 description 1
- 230000011278 mitosis Effects 0.000 description 1
- 230000000394 mitotic effect Effects 0.000 description 1
- ZAHQPTJLOCWVPG-UHFFFAOYSA-N mitoxantrone dihydrochloride Chemical compound Cl.Cl.O=C1C2=C(O)C=CC(O)=C2C(=O)C2=C1C(NCCNCCO)=CC=C2NCCNCCO ZAHQPTJLOCWVPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000000214 mouth Anatomy 0.000 description 1
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 1
- 238000012243 multiplex automated genomic engineering Methods 0.000 description 1
- ZTLGJPIZUOVDMT-UHFFFAOYSA-N n,n-dichlorotriazin-4-amine Chemical compound ClN(Cl)C1=CC=NN=N1 ZTLGJPIZUOVDMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SWZXEVABPLUDIO-WSZYKNRRSA-N n-[(2s)-3-methoxy-1-[[(2s)-3-methoxy-1-[[(2s)-1-[(2r)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]-2-methyl-1,3-thiazole-5-carboxamide Chemical compound N([C@@H](COC)C(=O)N[C@@H](COC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)[C@]1(C)OC1)C(=O)C1=CN=C(C)S1 SWZXEVABPLUDIO-WSZYKNRRSA-N 0.000 description 1
- LBWFXVZLPYTWQI-IPOVEDGCSA-N n-[2-(diethylamino)ethyl]-5-[(z)-(5-fluoro-2-oxo-1h-indol-3-ylidene)methyl]-2,4-dimethyl-1h-pyrrole-3-carboxamide;(2s)-2-hydroxybutanedioic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)CC(O)=O.CCN(CC)CCNC(=O)C1=C(C)NC(\C=C/2C3=CC(F)=CC=C3NC\2=O)=C1C LBWFXVZLPYTWQI-IPOVEDGCSA-N 0.000 description 1
- YRCHYHRCBXNYNU-UHFFFAOYSA-N n-[[3-fluoro-4-[2-[5-[(2-methoxyethylamino)methyl]pyridin-2-yl]thieno[3,2-b]pyridin-7-yl]oxyphenyl]carbamothioyl]-2-(4-fluorophenyl)acetamide Chemical compound N1=CC(CNCCOC)=CC=C1C1=CC2=NC=CC(OC=3C(=CC(NC(=S)NC(=O)CC=4C=CC(F)=CC=4)=CC=3)F)=C2S1 YRCHYHRCBXNYNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000014399 negative regulation of angiogenesis Effects 0.000 description 1
- JWNPDZNEKVCWMY-VQHVLOKHSA-N neratinib Chemical compound C=12C=C(NC(=O)\C=C\CN(C)C)C(OCC)=CC2=NC=C(C#N)C=1NC(C=C1Cl)=CC=C1OCC1=CC=CC=N1 JWNPDZNEKVCWMY-VQHVLOKHSA-N 0.000 description 1
- 229940071846 neulasta Drugs 0.000 description 1
- 210000004498 neuroglial cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 229940080607 nexavar Drugs 0.000 description 1
- 229940085033 nolvadex Drugs 0.000 description 1
- 210000001331 nose Anatomy 0.000 description 1
- 229960003347 obinutuzumab Drugs 0.000 description 1
- 231100000590 oncogenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002246 oncogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000174 oncolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000287 oocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229950005750 oprozomib Drugs 0.000 description 1
- 239000007935 oral tablet Substances 0.000 description 1
- 229960003552 other antineoplastic agent in atc Drugs 0.000 description 1
- 230000002611 ovarian Effects 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 229940118537 p53 inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 229940090244 palladia Drugs 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 230000005298 paramagnetic effect Effects 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 229940121654 pd-l2 inhibitor Drugs 0.000 description 1
- HQQSBEDKMRHYME-UHFFFAOYSA-N pefloxacin mesylate Chemical compound [H+].CS([O-])(=O)=O.C1=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=CC(F)=C1N1CCN(C)CC1 HQQSBEDKMRHYME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001373 pegfilgrastim Drugs 0.000 description 1
- 229960002340 pentostatin Drugs 0.000 description 1
- FPVKHBSQESCIEP-JQCXWYLXSA-N pentostatin Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(N=CNC[C@H]2O)=C2N=C1 FPVKHBSQESCIEP-JQCXWYLXSA-N 0.000 description 1
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 210000004214 philadelphia chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003757 phosphotransferase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 208000021310 pituitary gland adenoma Diseases 0.000 description 1
- 208000007525 plasmablastic lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 210000004180 plasmocyte Anatomy 0.000 description 1
- HRGDZIGMBDGFTC-UHFFFAOYSA-N platinum(2+) Chemical compound [Pt+2] HRGDZIGMBDGFTC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001200 poly(ethylene-vinyl acetate) Polymers 0.000 description 1
- 229920000747 poly(lactic acid) Polymers 0.000 description 1
- 239000004633 polyglycolic acid Substances 0.000 description 1
- 229920002704 polyhistidine Polymers 0.000 description 1
- 239000004626 polylactic acid Substances 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- UVSMNLNDYGZFPF-UHFFFAOYSA-N pomalidomide Chemical compound O=C1C=2C(N)=CC=CC=2C(=O)N1C1CCC(=O)NC1=O UVSMNLNDYGZFPF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PHXJVRSECIGDHY-UHFFFAOYSA-N ponatinib Chemical compound C1CN(C)CCN1CC(C(=C1)C(F)(F)F)=CC=C1NC(=O)C1=CC=C(C)C(C#CC=2N3N=CC=CC3=NC=2)=C1 PHXJVRSECIGDHY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001131 ponatinib Drugs 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 208000016800 primary central nervous system lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 229960004919 procaine Drugs 0.000 description 1
- MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N procaine Chemical compound CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000624 procarbazine Drugs 0.000 description 1
- CPTBDICYNRMXFX-UHFFFAOYSA-N procarbazine Chemical compound CNNCC1=CC=C(C(=O)NC(C)C)C=C1 CPTBDICYNRMXFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 229960003712 propranolol Drugs 0.000 description 1
- 201000005825 prostate adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 230000005180 public health Effects 0.000 description 1
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 description 1
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 1
- 229950001626 quizartinib Drugs 0.000 description 1
- CVWXJKQAOSCOAB-UHFFFAOYSA-N quizartinib Chemical compound O1C(C(C)(C)C)=CC(NC(=O)NC=2C=CC(=CC=2)C=2N=C3N(C4=CC=C(OCCN5CCOCC5)C=C4S3)C=2)=N1 CVWXJKQAOSCOAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UOWVMDUEMSNCAV-WYENRQIDSA-N rachelmycin Chemical compound C1([C@]23C[C@@H]2CN1C(=O)C=1NC=2C(OC)=C(O)C4=C(C=2C=1)CCN4C(=O)C1=CC=2C=4CCN(C=4C(O)=C(C=2N1)OC)C(N)=O)=CC(=O)C1=C3C(C)=CN1 UOWVMDUEMSNCAV-WYENRQIDSA-N 0.000 description 1
- 239000012857 radioactive material Substances 0.000 description 1
- 239000000941 radioactive substance Substances 0.000 description 1
- 230000004223 radioprotective effect Effects 0.000 description 1
- 108010077182 raf Kinases Proteins 0.000 description 1
- 102000009929 raf Kinases Human genes 0.000 description 1
- 229960003876 ranibizumab Drugs 0.000 description 1
- GHLIFBNIGXVDHM-VQXSZRIGSA-N ravidomycin Chemical compound COC1=CC(C=C)=CC(C(OC2=C34)=O)=C1C2=CC(OC)=C3C(O)=CC=C4C1O[C@H](C)[C@H](OC(C)=O)[C@H](N(C)C)[C@H]1O GHLIFBNIGXVDHM-VQXSZRIGSA-N 0.000 description 1
- 229940124617 receptor tyrosine kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 102000027426 receptor tyrosine kinases Human genes 0.000 description 1
- 108091008598 receptor tyrosine kinases Proteins 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 239000003340 retarding agent Substances 0.000 description 1
- 229940120975 revlimid Drugs 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052895 riebeckite Inorganic materials 0.000 description 1
- 102200087780 rs77375493 Human genes 0.000 description 1
- NGWSFRIPKNWYAO-UHFFFAOYSA-N salinosporamide A Natural products N1C(=O)C(CCCl)C2(C)OC(=O)C21C(O)C1CCCC=C1 NGWSFRIPKNWYAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 229910052711 selenium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940091258 selenium supplement Drugs 0.000 description 1
- 210000000582 semen Anatomy 0.000 description 1
- 239000008299 semisolid dosage form Substances 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 1
- 229950008834 seribantumab Drugs 0.000 description 1
- 230000009131 signaling function Effects 0.000 description 1
- 201000000849 skin cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000000649 small cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007909 solid dosage form Substances 0.000 description 1
- 230000003381 solubilizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000037439 somatic mutation Effects 0.000 description 1
- NHXLMOGPVYXJNR-ATOGVRKGSA-N somatostatin Chemical compound C([C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC=2C3=CC=CC=C3NC=2)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(=O)N1)[C@@H](C)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N)C(O)=O)=O)[C@H](O)C)C1=CC=CC=C1 NHXLMOGPVYXJNR-ATOGVRKGSA-N 0.000 description 1
- 229960000553 somatostatin Drugs 0.000 description 1
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 238000011272 standard treatment Methods 0.000 description 1
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 239000000021 stimulant Substances 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 238000013268 sustained release Methods 0.000 description 1
- 229940034785 sutent Drugs 0.000 description 1
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 1
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 229940037128 systemic glucocorticoids Drugs 0.000 description 1
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 1
- 229960003454 tamoxifen citrate Drugs 0.000 description 1
- 229940120982 tarceva Drugs 0.000 description 1
- 229940127072 targeted antineoplastic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000002626 targeted therapy Methods 0.000 description 1
- RCINICONZNJXQF-XAZOAEDWSA-N taxol® Chemical compound O([C@@H]1[C@@]2(CC(C(C)=C(C2(C)C)[C@H](C([C@]2(C)[C@@H](O)C[C@H]3OC[C@]3(C21)OC(C)=O)=O)OC(=O)C)OC(=O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)C=1C=CC=CC=1)C=1C=CC=CC=1)O)C(=O)C1=CC=CC=C1 RCINICONZNJXQF-XAZOAEDWSA-N 0.000 description 1
- 229940063683 taxotere Drugs 0.000 description 1
- 108091035539 telomere Proteins 0.000 description 1
- 102000055501 telomere Human genes 0.000 description 1
- 210000003411 telomere Anatomy 0.000 description 1
- 229950003046 tesevatinib Drugs 0.000 description 1
- HVXKQKFEHMGHSL-QKDCVEJESA-N tesevatinib Chemical compound N1=CN=C2C=C(OC[C@@H]3C[C@@H]4CN(C)C[C@@H]4C3)C(OC)=CC2=C1NC1=CC=C(Cl)C(Cl)=C1F HVXKQKFEHMGHSL-QKDCVEJESA-N 0.000 description 1
- 201000003120 testicular cancer Diseases 0.000 description 1
- 229960002372 tetracaine Drugs 0.000 description 1
- GKCBAIGFKIBETG-UHFFFAOYSA-N tetracaine Chemical compound CCCCNC1=CC=C(C(=O)OCCN(C)C)C=C1 GKCBAIGFKIBETG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 1
- 229960003433 thalidomide Drugs 0.000 description 1
- 229940034915 thalomid Drugs 0.000 description 1
- 229940022511 therapeutic cancer vaccine Drugs 0.000 description 1
- 229940126585 therapeutic drug Drugs 0.000 description 1
- 230000004797 therapeutic response Effects 0.000 description 1
- 238000000015 thermotherapy Methods 0.000 description 1
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 1
- 208000030045 thyroid gland papillary carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229950002376 tirapazamine Drugs 0.000 description 1
- 229960005048 toceranib Drugs 0.000 description 1
- 238000011200 topical administration Methods 0.000 description 1
- 229960002190 topotecan hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 230000002463 transducing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 1
- 229960000575 trastuzumab Drugs 0.000 description 1
- 238000011277 treatment modality Methods 0.000 description 1
- 229950007217 tremelimumab Drugs 0.000 description 1
- IUCJMVBFZDHPDX-UHFFFAOYSA-N tretamine Chemical compound C1CN1C1=NC(N2CC2)=NC(N2CC2)=N1 IUCJMVBFZDHPDX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229950001353 tretamine Drugs 0.000 description 1
- 150000004654 triazenes Chemical class 0.000 description 1
- 239000013638 trimer Substances 0.000 description 1
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000005747 tumor angiogenesis Effects 0.000 description 1
- 102000003298 tumor necrosis factor receptor Human genes 0.000 description 1
- 229940094060 tykerb Drugs 0.000 description 1
- TUCIOBMMDDOEMM-RIYZIHGNSA-N tyrphostin B42 Chemical compound C1=C(O)C(O)=CC=C1\C=C(/C#N)C(=O)NCC1=CC=CC=C1 TUCIOBMMDDOEMM-RIYZIHGNSA-N 0.000 description 1
- ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Chemical compound C1=CC(=O)OC2=CC(O)=CC=C21 ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HFTAFOQKODTIJY-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Natural products Cc1cc2C=CC(=O)Oc2cc1OCC=CC(C)(C)O HFTAFOQKODTIJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 1
- 201000011294 ureter cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 210000003741 urothelium Anatomy 0.000 description 1
- 238000001291 vacuum drying Methods 0.000 description 1
- 238000009777 vacuum freeze-drying Methods 0.000 description 1
- 210000003556 vascular endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 229960004982 vinblastine sulfate Drugs 0.000 description 1
- 229960004355 vindesine Drugs 0.000 description 1
- UGGWPQSBPIFKDZ-KOTLKJBCSA-N vindesine Chemical compound C([C@@H](C[C@]1(C(=O)OC)C=2C(=CC3=C([C@]45[C@H]([C@@]([C@H](O)[C@]6(CC)C=CCN([C@H]56)CC4)(O)C(N)=O)N3C)C=2)OC)C[C@@](C2)(O)CC)N2CCC2=C1N=C1[C]2C=CC=C1 UGGWPQSBPIFKDZ-KOTLKJBCSA-N 0.000 description 1
- 229960002166 vinorelbine tartrate Drugs 0.000 description 1
- GBABOYUKABKIAF-IWWDSPBFSA-N vinorelbinetartrate Chemical compound C1N(CC=2C3=CC=CC=C3NC=22)CC(CC)=C[C@H]1C[C@]2(C(=O)OC)C1=CC(C23[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]4(CC)C=CCN([C@H]34)CC2)(O)C(=O)OC)N2C)=C2C=C1OC GBABOYUKABKIAF-IWWDSPBFSA-N 0.000 description 1
- 201000004916 vulva carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000013013 vulvar carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 235000012431 wafers Nutrition 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 238000013389 whole blood assay Methods 0.000 description 1
- 229940053867 xeloda Drugs 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
- 229910052727 yttrium Inorganic materials 0.000 description 1
- VWQVUPCCIRVNHF-UHFFFAOYSA-N yttrium atom Chemical compound [Y] VWQVUPCCIRVNHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Description
Перекрестная ссылка на родственные заявкиCross reference to related applications
Заявка на настоящий патент притязает на преимущество предварительной заявки США № 61/931512, поданной 24 января 2014 г., предварительной заявки США № 62/059676, поданной 3 октября 2014 г., и предварительной заявки США № 62/094834, поданной 19 декабря 2014 г., и содержание вышеупомянутых заявок включено в настоящее изобретение в качестве ссылки в полном объеме.This patent application claims the benefit of US Provisional Application No. 61/931512, filed January 24, 2014, US Provisional Application No. 62/059676, filed October 3, 2014, and US Provisional Application No. 62/094834, filed December 19, 2014. and the contents of the above applications are incorporated herein by reference in their entirety.
Перечень последовательностейList of sequences
В изобретении содержится перечень последовательностей, который был представлен в электронном виде в формате ASCII и включен в настоящее изобретение в качестве ссылки в полном объеме. Указанная копия файла ASCII, созданная 12 января 2015 г. под названием C2160-7000WO_SL.txt, имеет размер 191589 байт.The invention contains a sequence listing that has been provided electronically in ASCII format and is incorporated herein by reference in its entirety. The specified copy of the ASCII file, created on January 12, 2015, called C2160-7000WO_SL.txt, is 191589 bytes in size.
Уровень изобретенияLevel of invention
Способность Т-клеток опосредовать иммунный ответ на воздействие антигена требует двух разных сигнальных взаимодействий (Viglietta, V. et al. (2007) Neurotherapeutics 4:666-675; Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-339). Во-первых, происходит представление антигена, который выставлен на поверхности антиген-представляющих клеток (АРС), на антиген-специфичные наивные Т-клетки CD4'. Такое представление доставляет сигнал посредством Т-клеточного рецептора (TCR), который направляет Т-клетки для инициации иммунного ответа, специфичного к представленному антигену. Вовторых, различные костимуляторные и ингибирующие сигналы, опосредованные путем взаимодействия между АРС и различными молекулами Т-клеточной поверхности, запускают активацию и пролиферацию Т-клеток и, в конечном счете, их ингибирование.The ability of T cells to mediate an immune response to antigen requires two distinct signaling interactions (Viglietta, V. et al. (2007) Neurotherapeutics 4:666-675; Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297- 339). First, the antigen that is exposed on the surface of antigen presenting cells (APCs) is presented to antigen-specific naïve CD4' T cells. This presentation delivers a signal through the T cell receptor (TCR), which directs T cells to initiate an immune response specific to the presented antigen. Second, various costimulatory and inhibitory signals, mediated through interactions between APC and various T cell surface molecules, trigger T cell activation and proliferation and, ultimately, their inhibition.
Иммунная система находится под строгим контролем сети костимуляторных и коингибирующих лигандов и рецепторов. Эти молекулы подают второй сигнал для активации Т-клеток и обеспечивают сбалансированную совокупность положительных и отрицательных сигналов, чтобы максимально увеличить иммунный ответ против инфекции, ограничивая при этом аутоиммунитет (Wang, L. et al. (Epub Mar. 7, 2011) J. Exp. Med. 208(3):577-92; Lepenies, B. et al. (2008) Endocrine, Metabolic & Immune Disorders Drug Targets 8:279-288). Примеры костимуляторных сигналов включают связывание между лигандами В7.1 (CD80) и В7.2 (CD86) в клетках АРС и между рецепторами CD28 и CTLA-4 Т-лимфоцитов CD4+ (Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126; Lindley, P. S. et al. (2009) Immunol. Rev. 229:307-321). Связывание В7.1 или В7.2 с CD28 стимулирует активацию Т-клеток, а связывание В7.1 или В7.2 к CTLA-4 ингибирует такую активацию (Dong, С. et al. (2003) Immunolog. Res. 28(1):39-48; Greenwald, R. J. et al. (2005) Ann. Rev. Immunol. 23:515-548). Молекула CD28 конститутивно экспрессируется на поверхности Т-клеток (Gross, J. et al. (1992) J. Immunol. 149: 380-388), тогда как экспрессия CTLA-4 быстро активируется после Т-клеточной активации (Linsley, P. et al. (1996) Immunity 4: 535-543).The immune system is tightly controlled by a network of costimulatory and coinhibitory ligands and receptors. These molecules provide a second signal to activate T cells and provide a balanced mix of positive and negative signals to maximize the immune response against infection while limiting autoimmunity (Wang, L. et al. (Epub Mar. 7, 2011) J. Exp Med 208(3):577-92 Lepenies, B. et al (2008) Endocrine, Metabolic & Immune Disorders Drug Targets 8:279-288). Examples of costimulatory signals include binding between ligands B7.1 (CD80) and B7.2 (CD86) in APC cells and between CD28 and CTLA-4 receptors on CD4+ T cells (Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126; Lindley, P. S. et al (2009) Immunol. Rev. 229:307-321). Binding of B7.1 or B7.2 to CD28 stimulates T cell activation, and binding of B7.1 or B7.2 to CTLA-4 inhibits such activation (Dong, S. et al. (2003) Immunolog. Res. 28(1 ):39-48; Greenwald, R. J. et al. (2005) Ann. Rev. Immunol. 23:515-548). The CD28 molecule is constitutively expressed on the surface of T cells (Gross, J. et al. (1992) J. Immunol. 149: 380-388), while CTLA-4 expression is rapidly upregulated following T cell activation (Linsley, P. et al. al (1996) Immunity 4: 535-543).
Другие лиганды рецептора CD28 включают группу родственных В7-молекул, также называемую суперсемейством В7 (Coyle, A. J. et al. (2001) Nature Immunol. 2(3): 203-209; Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126; Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7; Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-339). Известны несколько членов суперсемейства В7, включающих В7.1 (CD80), В7.2 (CD86), индуцируемый костимуляторный лиганд (ICOS-L), лиганд программируемой смерти-1 (PD-L1; В7-Н1), лиганд программируемой смерти-2 (PD-L2; B7-DC), В7-НЗ, Н4-В7 и В7-Н6 (Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7).Other ligands of the CD28 receptor include a group of related B7 molecules, also called the B7 superfamily (Coyle, A. J. et al. (2001) Nature Immunol. 2(3): 203-209; Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol 2:116-126; Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7; Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-339). Several members of the B7 superfamily are known, including B7.1 (CD80), B7.2 (CD86), inducible costimulatory ligand (ICOS-L), programmed death ligand-1 (PD-L1; B7-H1), programmed death ligand-2 (PD-L2; B7-DC), B7-NZ, H4-B7 and B7-H6 (Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7).
Белок программируемой смерти-1 (PD-1) является ингибирующим членом расширенного CD28/CTLA-4 семейства Т-клеточных регуляторов (Okazaki et al. (2002) Curr Opin Immunol 14: 39177982; Bennett et al. (2003) J. Immunol. 170:711-8). Другие члены семейства CD28 включают CD28, CTLA-4, ICOS и BTLA. Предполагается, что белок PD-1 существует в виде мономера, в котором отсутствует непарный остаток цистеина, что является свойством других членов семейства CD28. Белок PD-1 экспрессируется на активированных В-клетках, Т-клетках и моноцитах.Programmed death protein-1 (PD-1) is an inhibitory member of the expanded CD28/CTLA-4 family of T-cell regulators (Okazaki et al. (2002) Curr Opin Immunol 14: 39177982; Bennett et al. (2003) J. Immunol. 170:711-8). Other members of the CD28 family include CD28, CTLA-4, ICOS, and BTLA. The PD-1 protein is predicted to exist as a monomer lacking the unpaired cysteine residue, a feature shared by other CD28 family members. The PD-1 protein is expressed on activated B cells, T cells and monocytes.
Ген PD-1 кодирует трансмембранный белок типа I в 55 кДа (Agata et al. (1996) Int Immunol. 8:76572). Несмотря на структурное сходство с CTLA-4, в белке PD-1 отсутствует мотив MYPPY (SEQ ID NO: 236), что является важным для связывания с В7-1 и В7-2. Идентифицированы два лиганда для PD-1, а именно PD-L1 (В7-Н1) и PD-L2 (B7-DC), которые достоверно подавляют активацию Т-клеток после связывания с PD-1 (Freeman et al. (2000) J. Exp. Med. 192:1027-34; Carter et al. (2002) Eur. J. Immunol. 32:63443). Оба лиганда PD-L1 и PD-L2 являются гомологами В7, которые связываются с PD-1, но не связываются с другими членами семейства CD28. PD-L1 в избытке выявляется при различных злокачественных опухолях человека (Dong et al. (2002) Nat. Med. 8:787-9).The PD-1 gene encodes a 55 kDa type I transmembrane protein (Agata et al. (1996) Int Immunol. 8:76572). Despite its structural similarity to CTLA-4, the PD-1 protein lacks the MYPPY motif (SEQ ID NO: 236), which is important for binding to B7-1 and B7-2. Two ligands for PD-1 have been identified, namely PD-L1 (B7-H1) and PD-L2 (B7-DC), which significantly suppress T cell activation after binding to PD-1 (Freeman et al. (2000) J Exp Med 192:1027-34 Carter et al (2002 Eur J Immunol 32:63443). Both PD-L1 and PD-L2 ligands are B7 homologs that bind to PD-1 but not to other CD28 family members. PD-L1 is found in excess in various human malignancies (Dong et al. (2002) Nat. Med. 8:787-9).
Белок PD-1 представляет собой иммуноингибирующий белок, который отрицательно регулирует сигналы TCR (Ishida, Y. et al. (1992) EMBO J. 11:3887-3895; Blank, C. et al. (Epub 2006 Dec. 29) Immunol. Immunother. 56(5):739-745). Взаимодействие между PD-1 и PD-L1 может действовать как иммунная контрольная точка, и может вызывать, например, уменьшение инфильтрации опухоли лимфоцитами, снижение пролиферации, опосредуемой Т-клеточным рецептором, и/или ускользание раковых клеток от иммунологического надзора (Dong et al. (2003) J. Mol. Med. 81:281-7; Blank et al. (2005) Cancer Immunol. Immunother. 54:307-314; Konishi et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10:5094-100). Обратное развитие иммуносупрессии может быть достигнуто путем ингибирования локального взаимодействия PD-1 с PD-L1 или PDThe PD-1 protein is an immunoinhibitory protein that negatively regulates TCR signaling (Ishida, Y. et al. (1992) EMBO J. 11:3887-3895; Blank, C. et al. (Epub 2006 Dec. 29) Immunol. Immunother 56(5):739–745). The interaction between PD-1 and PD-L1 may act as an immune checkpoint, and may cause, for example, decreased tumor lymphocyte infiltration, decreased T-cell receptor-mediated proliferation, and/or escape of cancer cells from immunosurveillance (Dong et al. (2003) J Mol Med 81:281-7 Blank et al (2005 Cancer Immunol Immunother 54:307-314 Konishi et al (2004 Clin Cancer Res 10:5094-100) ). Reversal of immunosuppression can be achieved by inhibiting the local interaction of PD-1 with PD-L1 or PD
- 1 045940- 1 045940
L2; этот эффект является аддитивным, если при этом также блокируется взаимодействие PD-1 с PD-L2 (Iwai et al. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99:12293-7; Brown et al. (2003) J. Immunol. 170:1257-66).L2; this effect is additive if the interaction of PD-1 with PD-L2 is also blocked (Iwai et al. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99:12293-7; Brown et al. (2003) J. Immunol 170:1257–66).
С учетом важности сигнальных путей иммунной контрольно точки в регуляции иммунного ответа, существует необходимость в разработке новых веществ, которые модулируют активность иммуноингибирующих белков, таких как PD-1, тем самым вызывая активацию иммунной системы. Такие вещества могут иметь применение, например, для иммунотерапии рака и лечения других заболеваний, таких как хронические инфекции.Given the importance of immune checkpoint signaling pathways in regulating the immune response, there is a need to develop new substances that modulate the activity of immunoinhibitory proteins such as PD-1, thereby causing activation of the immune system. Such substances may have applications, for example, in cancer immunotherapy and the treatment of other diseases such as chronic infections.
Сущность изобретенияThe essence of the invention
Настоящее изобретение относится к молекулам антител (например, к молекулам гуманизированных антител), которые связываются с белками программируемой смерти-1 (PD-1) с высокой степенью аффинности и специфичности. В одном варианте осуществления молекулы антитела против PD-1 содержат новую комбинацию каркасных областей (например, FW1, FW2, FW3 и/или FW4), например, новые комбинации каркасных областей тяжелой цепи и/или каркасных областей легкой цепи. Также изобретение относится к молекулам нуклеиновых кислот, кодирующим упомянутые молекулы антитела, к экспрессирующим векторам, клеткам-хозяевам и способам получения молекул антитела. Также изобретение относится к иммуноконъюгатам, молекулам мультиспецифичных или биспецифичных антител и к фармацевтическим композициям, содержащим молекулы антитела. Описанные в изобретении молекулы антитела против PD-1 могут быть использованы (в качестве единственного средства или в комбинации с другими веществами или терапевтическими средствами) для лечения, профилактики и/или диагностики заболеваний, таких как злокачественные заболевания (например, солидные опухоли и опухоли мягких тканей), а также инфекционных заболеваний (например, хронические инфекционные болезни или сепсис). Таким образом, настоящее изобретение относится к композициям и способам обнаружения PD-1, а также к способам лечения различных заболеваний, включающих рак и/или инфекционные болезни, с помощью молекул антитела анти-PD-T.The present invention relates to antibody molecules (eg, humanized antibody molecules) that bind to programmed death-1 (PD-1) proteins with a high degree of affinity and specificity. In one embodiment, anti-PD-1 antibody molecules comprise a novel combination of framework regions (eg, FW1, FW2, FW3 and/or FW4), for example, novel combinations of heavy chain framework regions and/or light chain framework regions. The invention also relates to nucleic acid molecules encoding said antibody molecules, expression vectors, host cells and methods for producing antibody molecules. The invention also relates to immunoconjugates, multispecific or bispecific antibody molecules and pharmaceutical compositions containing antibody molecules. The anti-PD-1 antibody molecules described herein can be used (as a single agent or in combination with other substances or therapeutic agents) for the treatment, prevention and/or diagnosis of diseases such as malignancies (eg, solid and soft tissue tumors ), as well as infectious diseases (for example, chronic infectious diseases or sepsis). Thus, the present invention relates to compositions and methods for detecting PD-1, as well as methods for treating various diseases, including cancer and/or infectious diseases, using anti-PD-T antibody molecules.
Соответственно, в одном аспекте настоящее изобретение относится к молекуле антитела (например, молекуле выделенного или рекомбинантного антитела), которая обладает одним или несколькими из следующих свойств:Accordingly, in one aspect, the present invention provides an antibody molecule (e.g., an isolated or recombinant antibody molecule) that has one or more of the following properties:
(I) связывается с PD-1, например, с человеческим PD-1, с высокой аффинностью, например, с константой аффинности, составляющей по меньшей мере приблизительно 107 М-1, обычно приблизительно 108 М-1, и более типично, приблизительно от 109 М-1 до 1010 М-1, или с более высокой аффинностью;(I) binds to PD-1, e.g., human PD-1, with high affinity, e.g., with an affinity constant of at least about 10 7 M -1 , typically about 10 8 M -1 , and more typically, from about 10 9 M -1 to 10 10 M -1 , or higher affinity;
(II) по существу не связывается с CD28, CTLA-4, ICOS или BTLA;(ii) does not substantially bind to CD28, CTLA-4, ICOS or BTLA;
(III) ингибирует или уменьшает связывание PD-1 с лигандом PD-1, например, с PD-L1 или PD-L2, или с двумя указанными лигандами;(III) inhibits or reduces the binding of PD-1 to a PD-1 ligand, for example, PD-L1 or PD-L2, or two of these ligands;
(IV) специфично связывается с эпитопом на PD-1, например, с тем же самым или аналогичным эпитопом, который распознается мышиным моноклональным антителом ВАР049 или химерным антителом ВАР049, например, BAP049-chi или BAP049-chi-Y;(IV) specifically binds to an epitope on PD-1, for example, the same or a similar epitope that is recognized by the mouse monoclonal antibody BAP049 or a chimeric BAP049 antibody, for example, BAP049-chi or BAP049-chi-Y;
(V) проявляет такую же или аналогичную аффинность связывания или специфичность, или оба этих параметра, как и любое из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, BAP049-iltoh-G. BAP049-iltoh-D или ВАР049-клон-Е;(V) exhibits the same or similar binding affinity or specificity, or both, as any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07 , BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP0 49 -iltoh-G. BAP049-iltoh-D or BAP049-clone-E;
(VI) проявляет такую же или аналогичную аффинность связывания или специфичность, или оба этих параметра, как и молекула антитела (например, вариабельная область легкой цепи и вариабельная область тяжелой цепи), описанная в табл. 1;(VI) exhibits the same or similar binding affinity or specificity, or both, as the antibody molecule (eg, light chain variable region and heavy chain variable region) described in table. 1;
(VII) проявляет такую же или аналогичную аффинность связывания или специфичность, или оба этих параметра, как и молекулы антитела (например, вариабельная область тяжелой цепи и вариабельная область легкой цепи), имеющая аминокислотную последовательность, которая показана в табл. 1;(VII) exhibits the same or similar binding affinity or specificity, or both, as antibody molecules (eg, heavy chain variable region and light chain variable region) having the amino acid sequence that is shown in table. 1;
(VIII) показывает ту же или аналогичную аффинность связывания или специфичности, или оба этих параметра, как и молекула антитела (например, вариабельная область тяжелой цепи и вариабельная область легкой цепи), кодируемая нуклеотидной последовательностью, которая показана в табл. 1;(VIII) exhibits the same or similar binding affinity or specificity, or both, as the antibody molecule (eg, heavy chain variable region and light chain variable region) encoded by the nucleotide sequence that is shown in table. 1;
(IX) ингибирует, например, конкурентно ингибирует связывание второй молекулы антитела с PD-1, при этом вторая молекула антитела представляет собой молекулу антитела, описанную в настоящем изобретении, например, молекулу антитела, выбранную, например, среди любого из антител BAP049hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клонG, ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е;(IX) inhibits, for example competitively inhibits, the binding of a second antibody molecule to PD-1, wherein the second antibody molecule is an antibody molecule described in the present invention, for example, an antibody molecule selected, for example, from any of the antibodies BAP049hum01, BAP049- hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049hum13, B AP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-cloneG, BAP049-clone-O, or BAP049-clone-E;
(X) связывается со второй молекулой антитела к PD-1 посредством того же эпитопа или перекрывающегося эпитопа, при этом вторая молекула антитела представляет собой молекулу антитела, описанную в настоящем изобретении, например, молекулу антитела, выбранную, например, среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049(X) binds to a second anti-PD-1 antibody molecule via the same epitope or an overlapping epitope, wherein the second antibody molecule is an antibody molecule described in the present invention, for example, an antibody molecule selected, for example, from any of the antibodies BAP049- hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049
- 2 045940 hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клонВ, ВАР049-клон-С, BAP049-KaOH-D или ВАР049-клон-Е;- 2 045940 hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-cloneB, BAP049-clone-C, BAP049-KaOH-D or BAP049-clone-E;
(XI) конкурирует за связывание и/или связывается со второй молекулой антитела к PD-1 посредством того же эпитопа, при этом вторая молекула антитела представляет собой молекулу антитела, описанную в изобретении, например, молекулу антитела, выбранную, например, среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06,(XI) competes for binding and/or binds to a second anti-PD-1 antibody molecule via the same epitope, wherein the second antibody molecule is an antibody molecule described in the invention, for example an antibody molecule selected from, for example, any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06,
BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12,BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12,
BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е;BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP04 9-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, BAP049-clone-E, or BAP049-clone-E;
(XII) имеет одно или несколько биологических свойств молекулы антитела, описанной в изобретении, например, молекулы антитела, выбранной, например, среди любого из антител ВАP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-О, ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е;(XII) has one or more biological properties of an antibody molecule described in the invention, for example, an antibody molecule selected, for example, from any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049 -hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone- A, VAR049 -clone-B, VAR049-clone-O, VAR049-clone-O or VAR049-clone-E;
(XIII) имеет одно или несколько фармакокинетических свойств молекулы антитела, описанной в изобретении, например, молекулы антитела, выбранной, например, среди любого из антител BAP049hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клонG, ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е;(XIII) has one or more pharmacokinetic properties of an antibody molecule described in the invention, for example, an antibody molecule selected, for example, from any of the antibodies BAP049hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06 , BAP049hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP04 9-clone-B, VAR049 -cloneG, BAP049-clone-O or BAP049-clone-E;
(XIV) ингибирует одно или несколько действий PD-1, что приводит, например, к одному или нескольким результатам: увеличение инфильтрации опухоли лимфоцитами, увеличение опосредуемой Тклеточным рецептором пролиферации или уменьшение ускользания раковых клеток от иммунологиче ского надзора;(XIV) inhibits one or more actions of PD-1, resulting in, for example, one or more of the following: increased tumor infiltration by lymphocytes, increased T-cell receptor-mediated proliferation, or decreased evasion of cancer cells from immunosurveillance;
(XV) связывается с человеческим PD-1 и перекрестно реагирует с PD-1 обезьян циномолгус;(XV) binds to human PD-1 and cross-reacts with cynomolgus monkey PD-1;
(XVI) связывается с одним или несколькими остатками в пределах цепи С, петли СС', цепи С' или в петле FG из PD-1, или с комбинацией из двух, трех или всех из перечисленных из цепи С-, петли СС', цепи С' или петли FG из PD-1, например, при этом связывание анализируют с помощью иммуноферментного анализа ELISA или анализа Biacore; или (XVII) имеет VL область, которая более значима для связывания с PD-1, чем VH область.(XVI) binds to one or more residues within the C chain, CC' loop, C' chain, or FG loop of PD-1, or a combination of two, three, or all of these from the C- chain, CC' loop, C' chains or FG loops of PD-1, for example, wherein binding is analyzed by ELISA or Biacore assay; or (XVII) has a VL region that is more significant for binding to PD-1 than a VH region.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения молекула антитела связывается с PD-1 с высокой аффинностью, например, с константой диссоциации KD, которая приблизительно такая же, или выше или ниже приблизительно по меньшей мере на 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 или на 90%, чем KD молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1, например, молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1, описанной в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления KD молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1 составляет меньше, чем приблизительно 0,4, 0,3, 0,2, 0,1 или 0,05 нмоль, что измеряют, например, способом Biacore. В некоторых вариантах осуществления KD молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1 составляет меньше, чем приблизительно 0,2 нмоль, например, приблизительно 0,135 нмоль. В других вариантах осуществления KD молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1 составляет меньше, чем приблизительно 10, 5, 3, 2 или 1 нмоль, что измеряют, например, путем связывания на клетках, экспрессирующих PD-1 (например, на клетках 300.19). В некоторых вариантах осуществления KD молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1 составляет меньше, чем приблизительно 5 нмоль, например, приблизительно 4,60 нмоль (или приблизительно 0,69 мкг/мл).In some embodiments of the present invention, the antibody molecule binds to PD-1 with high affinity, for example, with a dissociation constant K D that is approximately the same as, or higher or lower by at least about 10, 20, 30, 40, 50, 60 , 70, 80 or 90% than the KD of a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule, for example, a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule described in the present invention. In some embodiments, the KD of the murine or chimeric anti-PD-1 antibody molecule is less than about 0.4, 0.3, 0.2, 0.1, or 0.05 nmol, as measured, for example, by the Biacore method. In some embodiments, the KD of the murine or chimeric anti-PD-1 antibody molecule is less than about 0.2 nmol, such as about 0.135 nmol. In other embodiments, the KD of a murine or chimeric anti-PD-1 antibody molecule is less than about 10, 5, 3, 2, or 1 nmol, as measured, for example, by binding to cells expressing PD-1 (e.g., 300.19 cells ). In some embodiments, the KD of the murine or chimeric anti-PD-1 antibody molecule is less than about 5 nmol, such as about 4.60 nmol (or about 0.69 μg/ml).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 связывается с PD-1 с константой диссоциации Koff, которая ниже чем 1х10-4, 5х10-5 или 1x10-5s-1, например, приблизительно 1, 65x10-5s-1. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 связывается с PD-1 с константой скорости ассоциации Kon, которая выше, чем 1 х 104, 5х104, 1 х 105 или 5x105 M-1s-1, например, приблизительно 1,23x105 M-1s-1.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule binds to PD-1 with a dissociation constant Koff that is lower than 1x10 -4 , 5x10 -5 or 1x10 -5 s -1 , such as approximately 1.65x10 -5 s -1 . In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule binds to PD-1 with an association rate constant K on that is greater than 1 x 10 4 , 5 x 10 4 , 1 x 10 5 or 5 x 105 M -1 s -1 , for example, approximately 1.23x105 M -1 s -1 .
В некоторых вариантах осуществления уровень экспрессии молекулы антитела превышает, например, по меньшей мере, приблизительно в 0,5, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или в 10 раз уровень экспрессии молекулы мышиного или химерного антитела, например, молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1, описанной в изобретении. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела экспрессируется в клетках СНО.In some embodiments, the expression level of the antibody molecule is, for example, at least about 0.5, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10 times the expression level of the murine or chimeric antibody molecule , for example, a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule described in the invention. In some embodiments, the antibody molecule is expressed in CHO cells.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 уменьшает одно или несколько PD-1-ассоциированных действий со значением IC50 (концентрация при 50% ингибировании), которое приблизительно равно или ниже, например, по меньшей мере, приблизительно на 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 или 90%, чем значение IC50 молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1, например, молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1, описанной в изобретении. В некоторых вариантах осуществления значение IC50 молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule reduces one or more PD-1-associated activities with an IC 50 value (concentration at 50% inhibition) that is approximately equal to or lower, for example, by at least about 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 or 90% than the IC 50 value of a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule, for example, a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule described in the invention. In some embodiments, the IC50 value of a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule
- 3 045940 составляет меньше, чем приблизительно 6, 5, 4, 3, 2 или 1 нмоль, которое измерено, например, путем связывания на клетках, экспрессирующих PD-1 (например, на клетках 300.19). В некоторых вариантах осуществления значение IC50 молекулы мышиного или химерного антитела против PD-1 составляет меньше, чем приблизительно 4 нмоль, например, приблизительно 3,40 нмоль (или приблизительно 0,51 мкг/мл). В некоторых вариантах осуществления снижение PD-1-ассоциированной активности представляет собой связывание PD-L1 и/или PD-L2 с PD-1. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 связывается с мононуклеарными клетками периферической крови (РВМС), активированными стафилококковым энтеротоксином В (SEB). В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 повышает экспрессию интерлейкина IL-2 в цельной крови, активированной SEB. Например, антитело против PD-1 повышает экспрессию IL-2, по меньшей мере приблизительно в 2, 3, 4 или в 5 раз, по сравнению с экспрессией IL-2 при использовании контрольного изотипа (например, IgG4).- 3045940 is less than about 6, 5, 4, 3, 2 or 1 nmol, as measured, for example, by binding to cells expressing PD-1 (eg, 300.19 cells). In some embodiments, the IC 50 value of a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule is less than about 4 nmol, such as about 3.40 nmol (or about 0.51 μg/ml). In some embodiments, the reduction in PD-1-associated activity is the binding of PD-L1 and/or PD-L2 to PD-1. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule binds to peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) activated by staphylococcal enterotoxin B (SEB). In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule increases interleukin IL-2 expression in SEB-activated whole blood. For example, an anti-PD-1 antibody increases IL-2 expression by at least about 2-, 3-, 4-, or 5-fold compared to IL-2 expression using an isotype control (eg, IgG4).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 имеет улучшенную стабильность, например, является более стабильной по меньшей мере приблизительно в 0,5, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или в 10 раз в условиях in vivo или in vitro, чем молекула мышиного или химерного антитела против PD-1, например, молекула мышиного или химерного антитела против PD-1, описанная в изобретении.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule has improved stability, such as being at least about 0.5, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10 times more stable. conditions in vivo or in vitro than a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule, for example, a mouse or chimeric anti-PD-1 antibody molecule described in the invention.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 представляет собой молекулу гу манизированного антитела и имеет оценку риска на основе анализа Т-клеточного эпитопа, которая составляет от 300 до 700, от 400 до 650, от 450 до 600 или оценку риска согласно изобретению.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is a humanized antibody molecule and has a T cell epitope assay-based risk score of 300 to 700, 400 to 650, 450 to 600, or a risk score of the invention.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере один антигенсвязывающий участок, например, вариабельную область, или их антигенсвязывающий фрагмент, из антитела по изобретению, например, антитела, выбраннного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клон-В, BAP049-ikioh-G, BAP049-kioh-D или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1; или последовательность, коди руемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises at least one antigen binding region, e.g., a variable region, or an antigen binding fragment thereof, from an antibody of the invention, e.g., an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP0 49-hum14, BAP049- hum15, BAP049-hum16, BAP04 9-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-ikioh-G, BAP049-kioh-D or BAP049-clone-E; or according to the description from table. 1; or the sequence encoded by the nucleotide sequence from the table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну, две, три или четыре вариабельных области из антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон^, ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises at least one, two, three, or four variable regions from an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP0 49-hum15, BAP049- hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone^, BAP049-clone-O, or BAP049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну или две вариабельные области тяжелой цепи из антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10,In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises at least one or two heavy chain variable regions from an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049- hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10,
BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16,BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16,
ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон^, ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей.VAR049-clone-A, VAR049-clone-B, VAR049-clone^, VAR049-clone-O, or VAR049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну или две вариабельные области легкой цепи из антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из BAP049-hum01, ВАР049-1шт02. BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клонА, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон^, ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises at least one or two light chain variable regions from an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049-1m02. BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049 -hum14, BAP049-hum15, BAP049- hum16, BAP049-cloneA, BAP049-clone-B, BAP049-clone^, BAP049-clone-O, or BAP049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает константную область тяжелой цепи для IgG4, например, человеческого IgG4. В одном варианте осуществления человеческий IgG4 включает замену в положении 228, в соответствии с нумерацией по системе EU (например, замену Ser на Pro). Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает конIn yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes a heavy chain constant region for IgG4, such as human IgG4. In one embodiment, human IgG4 includes a substitution at position 228, in accordance with the EU numbering system (eg, replacing Ser with Pro). In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes con
- 4 045940 стантную область тяжелой цепи для IgG1, например, человеческого IgG1. В одном варианте осуществления человеческий IgG1 включает замену в положении 297 в соответствии с нумерацией EU (например, замену Asn на Ala). В одном варианте осуществления человеческий IgG1 включает замену в положении 265 в соответствии с нумерацией EU, замену в положении 329 в соответствии с нумерацией EU, или обе замены (например, замену Asp на Ala в положении 265 и/или замену Pro на Ala в положении 329). В одном варианте осуществления человеческий IgG1 включает замену в положении 234, в соответствии с нумерацией EU, замену в положении 235, в соответствии с нумерацией EU или обе замены (например, замену Leu на Ala в положении 234 и/или замену Leu на Ala в положения 235). В одном варианте осуществления константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, представленную в табл. 3, или последовательность, по существу идентичную (например, идентичную по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или выше) по отношению к указанной последовательности.- 4 045940 heavy chain constant region for IgG1, for example human IgG1. In one embodiment, human IgG1 includes a substitution at position 297 in accordance with EU numbering (eg, replacing Asn with Ala). In one embodiment, human IgG1 includes a substitution at position 265 according to the EU numbering, a substitution at position 329 according to the EU numbering, or both substitutions (e.g., replacing Asp with Ala at position 265 and/or replacing Pro with Ala at position 329 ). In one embodiment, human IgG1 includes a substitution at position 234, consistent with the EU numbering, a substitution at position 235, consistent with the EU numbering, or both substitutions (e.g., substituting Leu for Ala at position 234 and/or substituting Leu for Ala at position 235). In one embodiment, the heavy chain constant region contains the amino acid sequence presented in table. 3, or a sequence substantially identical (eg, at least 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 97%, 98%, 99% identical or greater) to said sequence.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает константную область легкой цепи каппа, например, константную область человеческой легкой каппа-цепи. В одном варианте осуществления константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, представленную в таблице 3, или последовательность, по существу идентичную (например, идентичную по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или выше) по отношению к указанной последовательности.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a kappa light chain constant region, for example, a human kappa light chain constant region. In one embodiment, the light chain constant region comprises the amino acid sequence presented in Table 3, or a sequence substantially identical (e.g., at least 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 97%, 98%, 99% identical or greater) in relation to the specified sequence.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает константную область тяжелой цепи для IgG4, например, человеческого IgG4, и константную область легкой цепи-каппа, например, константную область человеческую легкой каппа-цепи, например, константную область тяжелой и легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, представленную в табл. 3, или последовательность, по существу идентичную (например, идентичную по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или выше) по отношению к указанной последовательности. В одном варианте осуществления человеческий IgG4 включает замену в положении 228, в соответствии с нумерацией EU (например, замену Ser на Pro). Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает константную область тяжелой цепи для IgG1, например, человеческого IgG1, и константную область легкой цепикаппа, например константную область человеческой легкой каппа-цепи, например, константную область тяжелой и легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, представленную в табл. 3, или последовательность, по существу идентичную (например, идентичную по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или выше) по отношению к указанной последовательности. В одном варианте осуществления человеческий IgG1 включает замену в положении 297 в соответствии с нумерацией EU (например, замену Asn на Ala). В одном варианте осуществления человеческий IgG1 включает замену в положении 265 в соответствии с нумерацией EU, замену в положении 329 в соответствии с нумерацией EU, или обе замены (например, замену Asp на Ala в положении 265 и/или замену Pro на Ala в положении 329). В одном варианте осуществления человеческий IgG1 включает замену в положении 234, в соответствии с нумерацией EU, замену в положении 235, в соответствии с нумерацией EU, или обе замены (например, замену Leu на Ala в положении 234 и/или замену Leu на Ala в положении 235).In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes a heavy chain constant region for IgG4, e.g., human IgG4, and a kappa light chain constant region, e.g., a human kappa light chain constant region, e.g., a heavy and light chain constant region, containing the amino acid sequence presented in table. 3, or a sequence substantially identical (eg, at least 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 97%, 98%, 99% identical or greater) to said sequence. In one embodiment, human IgG4 includes a substitution at position 228, in accordance with the EU numbering (eg, replacing Ser with Pro). In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes a heavy chain constant region for IgG1, e.g., human IgG1, and a kappa light chain constant region, e.g., a human kappa light chain constant region, e.g., a heavy and light chain constant region comprising an amino acid the sequence presented in table. 3, or a sequence substantially identical (eg, at least 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 97%, 98%, 99% identical or greater) to said sequence. In one embodiment, human IgG1 includes a substitution at position 297 in accordance with EU numbering (eg, replacing Asn with Ala). In one embodiment, human IgG1 includes a substitution at position 265 according to the EU numbering, a substitution at position 329 according to the EU numbering, or both substitutions (e.g., replacing Asp with Ala at position 265 and/or replacing Pro with Ala at position 329 ). In one embodiment, human IgG1 includes a substitution at position 234, consistent with EU numbering, a substitution at position 235, consistent with EU numbering, or both substitutions (e.g., replacing Leu with Ala at position 234 and/or replacing Leu with Ala at position 235).
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает вариабельный домен тяжелой цепи и константную область, вариабельный домен легкой цепи и константную область, или оба таких варианта, которые содержат аминокислотную последовательность из ВАР049-клон-А, ВАР049клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, идентичную по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или выше) по отношению к любой из указанных выше последовательностей. Необязательно, молекула антитела против PD-1 содержит лидерную последовательность из тяжелой цепи, легкой цепи, или из обеих цепей, как показано в табл. 4, или по существу идентичную последовательность.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a heavy chain variable domain and constant region, a light chain variable domain and constant region, or both, which comprises the amino acid sequence of BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone -C, VAR049-clone-E or VAR049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 97%, 98%, 99% identical or greater) to any of the above sequences. Optionally, the anti-PD-1 antibody molecule contains a leader sequence from a heavy chain, a light chain, or both, as shown in Table 1. 4, or a substantially identical sequence.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере один, два или три гипервариабельных участков (CDR, областей, определяющих комплиментарность) из вариабельной области тяжелой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, BAP049-ktoh-G. ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three hypervariable regions (CDRs, complementarity determining regions) from the heavy chain variable region of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of the antibodies BAP049- hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12 , BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-ktoh-G. VAR049-clone-E or VAR049-clone-E; or according to the description from the table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две или три области CDR (или в совокупности все области CDR) из вариабельной области тяжелой цепи, которые содержат аминокислотную последовательность, представленную в табл. 1, или кодируемую нуклеотидной последовательностью, представленной в табл. 1. В одном варианте осуществления одна или несколько областей CDR (или в совокупности все области CDR) несут одно, две, три, четыре, пять, шесть или более шести изменений, например, аминокислотные замены или делеции, по сравнениюIn yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three CDR regions (or collectively all CDR regions) from the heavy chain variable region that contain the amino acid sequence presented in table. 1, or encoded by the nucleotide sequence presented in table. 1. In one embodiment, one or more CDR regions (or collectively all CDR regions) carry one, two, three, four, five, six, or more than six changes, such as amino acid substitutions or deletions, compared
- 5 045940 с аминокислотной последовательностью, представленной в табл. 1, или кодируемой нуклеотидной последовательностью, представленной в табл. 1.- 5 045940 with the amino acid sequence presented in table. 1, or the encoded nucleotide sequence presented in table. 1.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две или три CDR из вариабельной области легкой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител ВАР049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, BAP049-k.toh-G. ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three CDRs from the light chain variable region of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03 , BAP049hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP0 49-hum15, BAP049hum16, VAR049-clone -A, BAP049-clone-B, BAP049-k.toh-G. VAR049-clone-O or VAR049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две или три CDR (или в совокупности все области CDR) из вариабельной области легкой цепи, которые содержат аминокислотную последовательность, представленную в табл. 1, или кодируемую нуклеотидной последовательностью, представленной в табл. 1. В одном варианте осуществления одна или несколько CDR (или в совокупности все области CDR) несут одно, два, три, четыре, пять, шесть или более шести изменений, например, аминокислотные замены или делеции, по сравнению с аминокислотной последовательности, представленной в табл. 1, или кодируемой нуклеотидной последовательностью, представленной в табл. 1. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 включает замену в легкой цепи CDR, например, одну или несколько замен в CDR1, CDR2 и/или CDR3 легкой цепи. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает замену в легкой цепи CDR3 в положении 102 из вариабельной области легкой цепи, например, замену остатков цистеина на тирозин или остатков цистеина на серин, в положении 102 вариабельной области легкой цепи, согласно табл. 1 (например, SEQ ID NO: 16 или 24 для мышиной или химерной, немодифицированной последовательности, или любой из SEQ ID NO: 34, 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74 или 78 для модифицированной последовательности).In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three CDRs (or collectively all CDR regions) from the light chain variable region that contain the amino acid sequence presented in table. 1, or encoded by the nucleotide sequence presented in table. 1. In one embodiment, one or more CDRs (or collectively all CDR regions) carry one, two, three, four, five, six, or more than six changes, such as amino acid substitutions or deletions, compared to the amino acid sequence presented in table 1, or the encoded nucleotide sequence presented in table. 1. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule includes a substitution in the light chain of a CDR, such as one or more substitutions in the light chain CDR1, CDR2, and/or CDR3. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes a light chain substitution of CDR3 at position 102 of the light chain variable region, for example, a substitution of cysteine residues with tyrosine or cysteine residues with serine residues, at position 102 of the light chain variable region, as shown in Table. 1 (e.g., SEQ ID NO: 16 or 24 for a murine or chimeric, unmodified sequence, or any of SEQ ID NO: 34, 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74, or 78 for a modified sequence).
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть областей CDR (или в совокупности все области CDR) из вариабельной области тяжелой и легкой цепи, которые содержат аминокислотную последовательность, представленную в табл. 1, или кодируемую нуклеотидной последовательностью, представленной в табл. 1. В одном варианте осуществления одна или несколько CDR (или в совокупности все области CDR) несут одно, два, три, четыре, пять, шесть или более шести изменений, например, аминокислотные замены или делеции, по сравнению с аминокислотной последовательностью, представленной в табл. 1, или кодируемую нуклеотидной последовательностью, представленной в табл. 1.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two, three, four, five, or six CDR regions (or collectively all CDR regions) from a heavy chain variable region and a light chain variable region that comprise the amino acid sequence set forth in table 1, or encoded by the nucleotide sequence presented in table. 1. In one embodiment, one or more CDRs (or collectively all CDR regions) carry one, two, three, four, five, six, or more than six changes, such as amino acid substitutions or deletions, compared to the amino acid sequence presented in table 1, or encoded by the nucleotide sequence presented in table. 1.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает все шесть CDR из антитела по изобретению, например, из антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-B, ВАР049-клон-О, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1, или близко родственные области CDR, например, CDR, которые идентичны или имеют по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции или инсерции, например, консервативные замены). В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 может включать любую CDR, описанную в изобретении. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 включает замену в легкой цепи CDR, например, одну или несколько замен в CDR1, CDR2 и/или CDR3 из легкой цепи. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает замену в легкой цепи CDR3 в положении 102 из вариабельной области легкой цепи, например, замену остатков цистеина на тирозин или цистеина на серин в положении 102 вариабельной области легкой цепи в соответствии с таблицей 1 (например, SEQ ID NO: 16 или 2 4 для мышиной или химерной немодифицированной последовательности, или любую из SEQ ID NO: 34, 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74 или 78 для модифицированной последовательности). В другом варианте осуществления молекула антитела анти-PD-1 включает по меньшей мере одну, две или три области CDR, в соответствии с системой нумерации Kabat et al. (например, по меньшей мере, одну, две или три CDR, в соответствии с определением по Kabat, как это указано в табл. 1), из вариабельной области тяжелой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител ВАР049-1шш01. BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049humll, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клонА, ВАР049-клон-В, ВАР049-клонЮ. ВАР049-клонЮ или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99%In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes all six CDRs from an antibody of the invention, for example, from an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049 -hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone- A, VAR049 -clone-B, VAR049-clone-O, VAR049-clone-E or VAR049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1, or closely related CDR regions, eg, CDRs that are identical or have at least one amino acid alteration, but no more than two, three or four alterations (eg, substitutions, deletions or insertions, eg, conservative substitutions). In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule may include any CDR described in the invention. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule includes a substitution in the light chain of a CDR, such as one or more substitutions in CDR1, CDR2, and/or CDR3 of the light chain. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes a light chain substitution of CDR3 at position 102 of the light chain variable region, such as a substitution of cysteine to tyrosine or cysteine to serine residues at position 102 of the light chain variable region according to Table 1 (e.g. , SEQ ID NO: 16 or 2 4 for a mouse or chimeric unmodified sequence, or any of SEQ ID NO: 34, 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74 or 78 for a modified sequence). In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three CDR regions, in accordance with the numbering system of Kabat et al. (e.g., at least one, two or three CDRs, as defined by Kabat as set forth in Table 1), from the heavy chain variable region of an antibody of the invention, e.g., an antibody selected from any of BAP049- 1шш01. BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049humll, BAP049-hum12, BAP049- hum13, BAP049-hum14, BAP049- hum15, BAP049-hum16, VAR049-cloneA, VAR049-clone-B, VAR049-cloneYu. VAR049-cloneY or VAR049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (e.g., at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99%
- 6 045940 или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей; или последовательность, которая несет по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции или инсерции, например, консервативные замены) по сравнению с одной, двумя или тремя областями CDR в соответствии с Kabat et al., что указано в табл. 1.- 6 045940 or higher identity) to any of the above sequences; or a sequence that carries at least one amino acid alteration, but no more than two, three, or four alterations (e.g., substitutions, deletions, or insertions, e.g., conservative substitutions) compared to one, two, or three CDR regions according to Kabat et al., as indicated in table. 1.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две или три CDR в соответствии с нумерацией Kabat et al. (например, по меньшей мере, одну, две или три CDR в соответствии с определением Kabat, как это указано в табл. 1) из вариабельной области легкой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клонG, BAP049-kioh-D или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей; или последовательность, которая несет по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции или инсерции, например, консервативные замены) по сравнению с одной, двумя или тремя областями CDR в соответствии с Kabat et al., что указано в табл. 1.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three CDRs according to the numbering of Kabat et al. (e.g., at least one, two or three CDRs as defined by Kabat as set forth in Table 1) from the light chain variable region of an antibody of the invention, e.g., an antibody selected from any one of antibodies BAP049hum01, BAP049-hum02 , BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049hum13, BAP0 49-hum14, BAP049-hum15, BAP049 -hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-cloneG, BAP049-kioh-D, or BAP049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences; or a sequence that carries at least one amino acid alteration, but no more than two, three, or four alterations (e.g., substitutions, deletions, or insertions, e.g., conservative substitutions) compared to one, two, or three CDR regions according to Kabat et al., as indicated in table. 1.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть областей CDR в соответствии с нумерацией Kabat et al. (например, по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть CDR, в соответствии с определением Kabat, как это указано в табл. 1) из вариабельных областей тяжелой и легкой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, ВАР049-Шт03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-В или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей; или последовательность, которая несет по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции или инсерции, например, консервативные замены) по сравнению с одной, двумя, тремя, четырьмя, пятью или шестью областями CDR в соответствии с Kabat et al., что указано в табл. 1.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two, three, four, five, or six CDR regions as numbered by Kabat et al. (e.g., at least one, two, three, four, five or six CDRs, as defined by Kabat as set forth in Table 1) from the heavy and light chain variable regions of an antibody of the invention, e.g., an antibody selected from any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-Sht03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12 , BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, BAP049-clone-B, or BAP049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences; or a sequence that carries at least one amino acid alteration, but no more than two, three, or four alterations (e.g., substitutions, deletions, or insertions, e.g., conservative substitutions) compared to one, two, three, four, five, or six CDR regions in accordance with Kabat et al., as indicated in table. 1.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает все шесть CDR в соответствии с нумерацией Kabat et al. (например, все шесть CDR, в соответствии с определением Kabat, как это указано в табл. 1) из вариабельных областей тяжелой и легкой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, ВАР049hum03, ВАР049-Иит04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, BAP049-ikioh-G, ВАР049-к.юн-1) или ВАР049клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей; или последовательность, которая несет по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции или инсерции, например, консервативные замены) по сравнению со всеми шестью CDR, в соответствии с Kabat et al., как указано в табл. 1. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 может включать любую область CDR, описанную в настоящем изобретении.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes all six CDRs as numbered by Kabat et al. (e.g., all six CDRs as defined by Kabat as set forth in Table 1) from the heavy and light chain variable regions of an antibody of the invention, e.g., an antibody selected from any one of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049hum03 , VAR049-Iit04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP 049hum15, BAP049-hum16, VAR049 -clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-ikioh-G, BAP049-k.yun-1) or BAP049clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences; or a sequence that carries at least one amino acid alteration, but no more than two, three or four alterations (eg, substitutions, deletions or insertions, eg, conservative substitutions) compared to all six CDRs, according to Kabat et al. , as indicated in table. 1. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule may include any CDR region described in the present invention.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две, или три гипервариабельные петли в соответствии с определением Chothia (например, по меньшей мере одну, две или три гипервариабельные петли в соответствии с определением Chothia, как это указано в табл. 1), из вариабельной области тяжелой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С. ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или, по меньшей мере, аминокислоты из этих гипервариабельных петель, которые контактируют с PD1; или петли, несущие по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции и инсерции, например, консервативные замены), по сравнению с одной, двумя или тремя гипервариабельными петлями, в соответствии с определением ChoIn another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two, or three hypervariable loops as defined by Chothia (e.g., at least one, two, or three hypervariable loops as defined by Chothia as defined in table 1), from the variable region of the heavy chain of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07 , BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, VAR049-clone-A, VAR049-clone-B, VAR0 49 -clone-S. VAR049-clone-E or VAR049-clone-E; or according to the description from table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or at least amino acids from these hypervariable loops that contact PD1; or loops carrying at least one amino acid alteration, but no more than two, three or four alterations (eg, substitutions, deletions and insertions, such as conservative substitutions), compared to one, two or three hypervariable loops, in accordance with Cho definition
- 7 045940 thia et al., как указано в табл. 1.- 7 045940 thia et al., as indicated in table. 1.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две, или три гипервариабельные петли по Chothia (например, по меньшей мере одну, две или три гипервариабельные петли в соответствии с определением Chothia, как указано в табл. 1) из вариабельной области легкой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из BAP049-hum01, ВАР049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1 или, по меньшей мере, аминокислоты из этих гипервариабельных петель, которые контактируют с PD-1; или петли, несущие по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции и инсерции, например, консервативные замены), по сравнению с одной, двумя или тремя гипервариабельными петлями, в соответствии с определением Chothia et al., как указано в табл. 1.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two, or three Chothia hypervariable loops (e.g., at least one, two, or three Chothia hypervariable loops as defined in Table 1) from the light chain variable region of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049 -hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, VAR049-clone-A, VAR049-clone-B, VAR049-clone-C VAR049- clone-E or VAR049-clone-E; or according to the description from table. 1, or encoded by the nucleotide sequence from table. 1 or at least amino acids from these hypervariable loops that contact PD-1; or loops carrying at least one amino acid alteration, but no more than two, three or four alterations (eg, substitutions, deletions and insertions, such as conservative substitutions), compared to one, two or three hypervariable loops, in accordance with definition by Chothia et al., as indicated in table. 1.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть гипервариабельных петель (например, по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть гипервариабельных петель в соответствии с определением Chothia, как это указано в табл. 1) из вариабельных областей тяжелой и легкой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-6, BAP049-ikioh-D или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию из табл. 1, или кодируемые нуклеотидной последовательностью из табл. 1 или, по меньшей мере, аминокислоты из этих гипервариабельных петель, которые контактируют с PD-1; или петли, несущие по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции и инсерции, например, консервативные замены), по сравнению с одной, двумя, тремя, четырьмя, пятью или шестью гипервариабельными петлями, в соответствии с определением Chothia et al., как указано в табл. 1.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two, three, four, five, or six hypervariable loops (e.g., at least one, two, three, four, five, or six hypervariable loops according to by detecting Chothia as set forth in Table 1) from the heavy and light chain variable regions of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05 V AR049-clone-A , BAP049-clone-B, BAP049-clone-6, BAP049-ikioh-D or BAP049-clone-E; or according to the description from the table. 1, or encoded by the nucleotide sequence from table. 1 or at least amino acids from these hypervariable loops that contact PD-1; or loops carrying at least one amino acid alteration, but no more than two, three, or four alterations (e.g., substitutions, deletions, and insertions, e.g., conservative substitutions), compared with one, two, three, four, five, or six hypervariable loops, as defined by Chothia et al., as indicated in table. 1.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает все шесть гипервариабельных петель (например, все шесть гипервариабельных петель в соответствии с определением Chothia, как это указано в табл. 1) из антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клонВ, ВАР049-клон^, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е, или близко родственные гипервариабельные петли, например, идентичные гипервариабельные петли, или несущие по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции или инсерции, например, консервативные замены); или петли, несущие по меньшей мере одну аминокислотну альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции или инсерции, например, консервативные замены) по сравнению со всеми шестью гипервариабельными петлями в соответствии с определением Chothia et al., как указано в табл. 1. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 может включать любую описанную в изобретении гипервариабельную петлю.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises all six hypervariable loops (e.g., all six hypervariable loops as defined by Chothia as defined in Table 1) from an antibody of the invention, e.g., an antibody selected from any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP04 9hum12, BAP049-hum13, BAP049- hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-cloneB, BAP049-clone^, BAP049-clone-E or BAP049-clone-E, or closely related hypervariable loops, e.g. identical hypervariable loops, or having at least one amino acid alteration, but not more than two, three or four alterations (eg, substitutions, deletions or insertions, eg, conservative substitutions); or loops carrying at least one amino acid alteration, but no more than two, three or four alterations (eg, substitutions, deletions or insertions, eg, conservative substitutions) compared to all six hypervariable loops as defined by Chothia et al. , as indicated in table. 1. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule may include any hypervariable loop described in the invention.
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две или три гипервариабельные петли, которые имеют те же канонические структуры, что и соответствующая гипервариабельная петля антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон^, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е, например, те же самые канонические структуры, как по меньшей мере петля 1 и/или петля 2 из вариабельных доменов тяжелой и/или легкой цепи антитела по изобретению. Описание канонических структур гипервариабельных петель см., например, Chothia et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:799-817; Tomlinson et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:776-798. Эти структуры можно определить путем анализа таблиц, приведенных в указанных ссылках.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three hypervariable loops that have the same canonical structures as the corresponding hypervariable loop of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of the BAP049- hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12 , BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone^, BAP049-clone-E or BAP049-clone-E, for example, the same canonical structures as at least loop 1 and/or loop 2 of the heavy and/or light chain variable domains of an antibody of the invention. For a description of canonical hypervariable loop structures, see, for example, Chothia et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:799-817; Tomlinson et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:776-798. These structures can be determined by analyzing the tables provided in these references.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 включает комбинацию областей CDR или гипервариабельных петель, определенных по системам Kabat et al. и Chothia et al.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule includes a combination of CDR regions or hypervariable loops as defined by the systems of Kabat et al. and Chothia et al.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две или три области CDR или гипервариабельные петли из вариабельной области тяжелой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, ВАР049hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-kioh-A, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-О, ВАР049клон-D или BAP049-kioh-E, в соответствии с определениями по Kabat и Chothia (например, по меньшейIn one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three CDR regions or hypervariable loops from the heavy chain variable region of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049hum02, BAP049- hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049hum14, B AP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-kioh-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-O, BAP049-clone-D, or BAP049-kioh-E, as defined by Kabat and Chothia (e.g., at least
- 8 045940 мере одну, две или три области CDR или гипервариабельные петли в соответствии с определениями по Kabat и Chothia, как указано в табл. 1); или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или с более высокой идентичностью) по отношению к любой из вышеперечисленных последовательностей; или имеющие по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более чем две, три или четыре альтерации (например, замены, делеции и инсерции, например, консервативные замены) по сравнению с одной, двумя или тремя областями CDR или гипервариабельными петлями, в соответствии с определениями по Kabat и Chothia, как указано в табл. 1).- 8 045940 at least one, two or three CDR regions or hypervariable loops in accordance with the definitions of Kabat and Chothia, as indicated in table. 1); or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, at least 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% or greater identity) to any of the above sequences; or having at least one amino acid alteration, but no more than two, three or four alterations (e.g., substitutions, deletions and insertions, e.g., conservative substitutions) compared to one, two or three CDR regions or hypervariable loops, in accordance with definitions according to Kabat and Chothia, as indicated in table. 1).
Например, молекула антитела против PD-1 может включать VH CDR1 по системе Kabat и др., или гипервариабельную петлю 1 из VH по системе Chothia и др., или их комбинации, например, как показано в табл. 1. В одном варианте осуществления комбинация CDR из VH CDR1 по Kabat и Chothia содержит аминокислотную последовательность GYTFTTYWMH (SEQ ID NO: 224), или аминокислотную последовательность, по существу идентичную ей (например, несущую по меньшей мере одну аминокислотную альтерацию, но не более двух, трех или четырех альтераций (например, замены, делеции или вставки, например, консервативные замены)). Молекула антитела против PD-1 может дополнительно включать, например, области VH CDR 2-3 в соответствии с Kabat и др., и области VL CDR 1-3 в соответствии с Kabat и др., например, как показано в табл. 1. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления каркасные области определяются на основе комбинации CDR, определенной по системе Kabat и др., и гипервариабельные петли определяются по системе Chothia и др. Например, молекула антитела против PD1 может включать область VH FR1, определенную на основе гипервариабельной петли 1 из VH по системе Chothia и др., и область VH FR2, определенную на основе VH CDR 1-2 по системе Rabat и др., например, как показано в табл. 1. Молекула антитела против PD-1 может дополнительно включать, например, области VH FR 3-4, определенные на основе областей VH CDR 2-3 по системе Kabat и др., и области VL FR 1-4, определенные на основе VL CDR 1-3 по системе Kabat и др.For example, an anti-PD-1 antibody molecule may include VH CDR1 according to the system of Kabat et al., or hypervariable loop 1 of VH according to the system of Chothia et al., or combinations thereof, for example, as shown in table. 1. In one embodiment, the combination of CDRs from Kabat and Chothia's VH CDR1 comprises the amino acid sequence GYTFTTYWMH (SEQ ID NO: 224), or an amino acid sequence substantially identical thereto (e.g., bearing at least one amino acid alteration, but not more than two , three or four alterations (eg substitutions, deletions or insertions, eg conservative substitutions)). The anti-PD-1 antibody molecule may further include, for example, VH CDR 2-3 regions according to Kabat et al., and VL CDR 1-3 regions according to Kabat et al., for example, as shown in table. 1. Thus, in some embodiments, framework regions are defined based on a combination of CDRs defined by the system of Kabat et al., and hypervariable loops are defined by the system of Chothia et al. For example, an anti-PD1 antibody molecule may include a VH FR1 region defined based on hypervariable loop 1 from VH according to the system of Chothia et al., and the VH FR2 region determined on the basis of VH CDR 1-2 according to the system of Rabat et al., for example, as shown in table. 1. The anti-PD-1 antibody molecule may further include, for example, VH FR 3-4 regions defined on the basis of VH CDR 2-3 regions according to the system of Kabat et al., and VL FR 1-4 regions defined on the basis of VL CDR 1-3 according to the Kabat et al. system.
Молекула антитела против PD-1 может содержать любую комбинацию областей CDR или гипервариабельных петель в соответствии с определениями по Kabat и Chothia. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает по меньшей мере одну, две или три области CDR из вариабельной области легкой цепи антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клонВ, BAP049-ictoh-G. ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е, в соответствии с определениями по Kabat и Chothia (например, по меньшей мере одну, две или три области CDR в соответствии с определениями по Kabat и Chothia, как указано в табл. 1).An anti-PD-1 antibody molecule may contain any combination of CDR regions or hypervariable loops as defined by Kabat and Chothia. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes at least one, two or three CDR regions from the light chain variable region of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03 , BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP0 49-hum15, BAP049-hum16, VAR049 -clone-A, BAP049-cloneB, BAP049-ictoh-G. BAP049-clone-O or BAP049-clone-E, as defined by Kabat and Chothia (eg, at least one, two or three CDR regions as defined by Kabat and Chothia, as set forth in Table 1).
В одном варианте осуществления, например, в варианте, содержащем вариабельную область, область CDR (например, CDR по Chothia или CDR по Kabat), или другую последовательность, упоминаемую в изобретении, например, в табл. 1, молекула антитела представляет собой молекулу моноспецифичного антитела, молекулу биспецифичного антитела или молекулу антитела, которая содержит антигенсвязывающий фрагмент антитела, например, полуантитело или антигенсвязывающий фрагмент полуантитела. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела представляет собой молекулу биспецифичного антитела, имеющую первую специфичность связывания для PD-1 и вторую специфичность связывания для TIM-3, LAG-3, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1 и/или СЕАСАМ-5), PD-L1 или PD-L2.In one embodiment, for example, an embodiment comprising a variable region, a CDR region (eg, Chothia CDR or Kabat CDR), or other sequence mentioned in the invention, for example, in table. 1, the antibody molecule is a monospecific antibody molecule, a bispecific antibody molecule, or an antibody molecule that contains an antigen binding fragment of an antibody, such as a half-antibody or an antigen binding fragment of a semi-antibody. In some embodiments, the antibody molecule is a bispecific antibody molecule having a first binding specificity for PD-1 and a second binding specificity for TIM-3, LAG-3, SEACAM (e.g., SEACAM-1 and/or SEACAM-5), PD- L1 or PD-L2.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает:In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes:
(a) вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 4, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5 и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33;(a) a heavy chain variable region (VH) which comprises VHCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 4, VHCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 5 and VHCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and a light chain variable region (VL) which comprises VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 14, and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 33;
(b) VH, которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 1; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32;(b) VH, which contains VHCDR1 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 11 and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 32;
(c) VH, которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5, и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33; или (d) VH, которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью(c) VH, which contains VHCDR1 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 224, VHCDR2 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 5, and VHCDR3 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 14, and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 33; or (d) VH, which contains VHCDR1 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 with the amino acid sequence
- 9 045940- 9 045940
SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32.SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 11, and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 32.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит VH, содержащую VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 4, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5 и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, содержащую VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a VH comprising VHCDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, VHCDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, and VHCDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3; and VL comprising VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 14 and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 33.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит VH, содержащую VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 1; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, содержащую VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a VH comprising VHCDR1 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL comprising VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 11 and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 32.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит VH, содержащую VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5 и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, содержащую VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a VH comprising VHCDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224, VHCDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, and VHCDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3; and VL comprising VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 14 and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 33.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит VH, содержащую VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, содержащую VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 1 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a VH comprising VHCDR1 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL comprising VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 1 and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 32.
В одном варианте осуществления молекула антитела представляет собой молекулу гуманизированного антитела. В другом варианте осуществления молекула антитела представляет собой молекулу моноспецифичного антитела. Еще в одном варианте осуществления молекула антитела представляет собой молекулу биспецифичного антитела.In one embodiment, the antibody molecule is a humanized antibody molecule. In another embodiment, the antibody molecule is a monospecific antibody molecule. In yet another embodiment, the antibody molecule is a bispecific antibody molecule.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает:In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes:
(I) вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая включает аминокислотную последовательность VHCDR1, выбранную из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 224; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и (II) вариабельную область легкой цепи (VL), которая включает VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32.(I) a heavy chain variable region (VH) which includes the amino acid sequence of VHCDR1 selected from SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 224; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and (II) a light chain variable region (VL), which includes VLCDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11, and VLCDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 32.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает:In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises:
(I) вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая включает аминокислотную последовательность VHCDR1, выбранную из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 224; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5 и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и (II) вариабельную область легкой цепи (VL), которая включает VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33.(I) a heavy chain variable region (VH) which includes the amino acid sequence of VHCDR1 selected from SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 224; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 5 and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and (II) a light chain variable region (VL), which includes VLCDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and VLCDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 33.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 1. В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 4. Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains VHCDR1 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 1. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains VHCDR1 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 4. In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains VHCDR1 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 4. In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains VHCDR1 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 4. PD-1 contains VHCDR1 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 224.
В одном варианте осуществления вариабельная каркасная область легкой или тяжелой цепи (например, область, охватывающая по меньшей мере FR1, FR2, FR3 и необязательно FR4) в молекуле антитела против PD-1 может быть выбрана из: (а) вариабельной каркасной области легкой или тяжелой цепи, содержащей, по меньшей мере, 80, 85, 87, 90, 92, 93, 95, 97, 98% или предпочтительно 100% аминокислотных остатков из человеческой вариабельной каркасной области легкой или тяжелой цепи, например, остаток из вариабельной каркасной области легкой или тяжелой цепи из человеческого зрелого антитела, человеческой зародышевой последовательности или человеческой консенсусной последовательности; (b) вариабельной каркасной области легкой или тяжелой цепи, включающей от 20 до 80%, от 40 до 60%, от 60 до 90% или от 70 до 95% аминокислотных остатков из вариабельной каркасной области человеческой легкой или тяжелой цепи, например, остаток из вариабельной каркасной области легкой или тяжелой из человеческого зрелого антитела, человеческой зародышевой последовательности или человеческой конIn one embodiment, the light or heavy chain variable framework (e.g., the region spanning at least FR1, FR2, FR3, and optionally FR4) in the anti-PD-1 antibody molecule may be selected from: (a) a light or heavy variable framework a chain containing at least 80, 85, 87, 90, 92, 93, 95, 97, 98% or preferably 100% of the amino acid residues from the human variable framework light or heavy chain, for example, a residue from the variable framework light or a heavy chain from a human mature antibody, a human germline sequence or a human consensus sequence; (b) a light or heavy chain variable framework comprising from 20 to 80%, from 40 to 60%, from 60 to 90%, or from 70 to 95% amino acid residues from the human light or heavy chain variable framework, e.g. from a light or heavy variable framework region from a human mature antibody, human germline sequence or human con
- 10 045940 сенсусной последовательности; (с) нечеловеческой каркасной области (например, каркасной области грызунов); или (d) нечеловеческой каркасной области, которая была модифицирована, например, для удаления антигенных или цитотоксических детерминант, например, деиммунизирована или частично гуманизирована. В одном варианте осуществления вариабельная каркасная область легкой или тяжелой цепи (в частности, FR1, FR2 и/или FR3) включает последовательность вариабельной каркасной области легкой или тяжелой цепи, которая идентична по меньшей мере на 70, 75, 80, 85, 87, 88, 90, 92, 94, 95, 96, 97, 98, 99% или идентична каркасным областям участков VL или VH гена зародышевой линии человека.- 10 045940 sensus sequence; (c) a non-human framework region (eg, a rodent framework region); or (d) a non-human framework region that has been modified, for example, to remove antigenic or cytotoxic determinants, for example, deimmunized or partially humanized. In one embodiment, the light or heavy chain variable framework (specifically, FR1, FR2, and/or FR3) comprises a light or heavy chain variable framework sequence that is at least 70, 75, 80, 85, 87, 88 identical , 90, 92, 94, 95, 96, 97, 98, 99% or identical to the frame regions of the human germline VL or VH gene regions.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит вариабельный домен тяжелой цепи, несущий по меньшей мере одно, два, три, четыре, пять, шесть, семь, десять, пятнадцать, двадцать или больше изменений, например, аминокислотных замен или делеций, из химерной аминокислотной последовательности BAP049-chi-HC, например, FR-аминокислотной последовательности во всей вариабельной области, например, как показано на фиг. 9А-9В, или SEQ ID NO: 18, 20, 22 или 30. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий одно или несколько из следующего: Е в положении 1, V в положении 5, А в положении 9, V в положении 11, K в положении 12, K в положении 13, Е в положении 16, L в положении 18, R в положении 19, I или V в положении 20, G в положении 24, I в положения 37, А или S в положении 40, Т в положении 41, S в положении 42, R в положении 43, М или L в положении 48, V или F в положении 68, Т в положении 69, I в положении 70, S в положении 71, А или R в положении 72, K или N в положении 74, Т или K в положении 76, S или N в положении 77, L в положении 7 9, L в положении 81, Е или Q в положении 82, М в положении 83, S или N в положении 84, R в положении 87, А в положении 88, или Т в положении 91 в аминокислотной последовательности BAP049-chi-HC, например, FRаминокислотной последовательности во всей вариабельной области, например, показано на фиг. 9А-9В, или SEQ ID NO: 18, 20, 22 или 30.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a heavy chain variable domain having at least one, two, three, four, five, six, seven, ten, fifteen, twenty or more changes, such as amino acid substitutions or deletions, from the chimeric amino acid sequence BAP049-chi-HC, for example, the FR amino acid sequence throughout the variable region, for example, as shown in FIG. 9A-9B, or SEQ ID NO: 18, 20, 22 or 30. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains a heavy chain variable domain having one or more of the following: E at position 1, V at position 5, A in position 9, V in position 11, K in position 12, K in position 13, E in position 16, L in position 18, R in position 19, I or V in position 20, G in position 24, I in positions 37, A or S in position 40, T in position 41, S in position 42, R in position 43, M or L in position 48, V or F in position 68, T in position 69, I in position 70, S in position 71, A or R in position 72, K or N in position 74, T or K in position 76, S or N in position 77, L in position 7 9, L in position 81, E or Q in position 82, M at position 83, S or N at position 84, R at position 87, A at position 88, or T at position 91 in the amino acid sequence of BAP049-chi-HC, for example, the FR amino acid sequence throughout the variable region, for example, shown in FIG. 9A-9B, or SEQ ID NO: 18, 20, 22 or 30.
Альтернативно, или в комбинации с описанными в изобретении заменами в тяжелой цепи BAP049chi-HC, молекула антитела против PD-1 содержит вариабельный домен легкой цепи, несущий по меньшей мере одно, два, три, четыре, пять, шесть, семь, десять, пятнадцать, двадцать или больше аминокислотных изменений, например, аминокислотных замен или делеций, из аминокислотной последовательности BAP049-chi-LC, например, аминокислотной последовательности, показанной на фиг. 10А-10В, или SEQ ID NO: 24 или 26. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий одно или несколько из следующего: Е в положении 1, V в положении 2, Q в положении 3, L в положении 4, Т в положении 7, D или L или А в положении 9, F или Т в положении 10, Q в положении 11, S или Р в положении 12, L или А в положении 13, S в положении 14, Р или L или V в положении 15, K в положении 16, Q или D в положении 17, R в положении 18, А в положении 19, S в положении 20, I или L в положении 21, Т в положении 22, L в положении 43, K в положении 48, А или S в положении 49, R или Q в положении 51, Y в положении 55, I в положении 64, S или Р в положении 66, S в положении 69, Y в положении 73, G в положении 74, Е в положении 7 6, F в положении 79, N в положении 82, N в положении 83, L или I в положении 84, Е в положении 85, S или Р в положении 86, D в положении 87, А или F, или I в положении 89, Т или Y в положении 91, F в положении 93, или Y в положении 102 в аминокислотной последовательности BAP049-chi-LC, например, аминокислотной последовательности, показанной на фиг. 10А-10В, или SEQ ID NO: 24 или 26.Alternatively, or in combination with the BAP049chi-HC heavy chain substitutions described herein, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a light chain variable domain having at least one, two, three, four, five, six, seven, ten, fifteen , twenty or more amino acid changes, such as amino acid substitutions or deletions, from the BAP049-chi-LC amino acid sequence, such as the amino acid sequence shown in FIG. 10A-10B, or SEQ ID NO: 24 or 26. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains a heavy chain variable domain having one or more of the following: E at position 1, V at position 2, Q at position 3 , L in position 4, T in position 7, D or L or A in position 9, F or T in position 10, Q in position 11, S or P in position 12, L or A in position 13, S in position 14 , P or L or V in position 15, K in position 16, Q or D in position 17, R in position 18, A in position 19, S in position 20, I or L in position 21, T in position 22, L in position 43, K in position 48, A or S in position 49, R or Q in position 51, Y in position 55, I in position 64, S or P in position 66, S in position 69, Y in position 73, G in position 74, E in position 7 6, F in position 79, N in position 82, N in position 83, L or I in position 84, E in position 85, S or P in position 86, D in position 87, A or F or I at position 89, T or Y at position 91, F at position 93, or Y at position 102 in the amino acid sequence of BAP049-chi-LC, for example the amino acid sequence shown in FIG. 10A-10B, or SEQ ID NO: 24 or 26.
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 включает одну, две, три или четыре каркасные области тяжелой цепи (например, аминокислотную последовательность VHFW, показанную в табл. 2, или кодируемую нуклеотидной последовательностью, показанной в табл. 2), или последовательность, по существу идентичную ей.In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule includes one, two, three, or four heavy chain framework regions (e.g., the VHFW amino acid sequence shown in Table 2, or encoded by the nucleotide sequence shown in Table 2), or a sequence essentially identical to it.
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 включает одну, две, три, или четыре каркасные области легкой цепи (например, аминокислотную последовательность VLFW, показанную в табл. 2, или кодируемую нуклеотидной последовательностью, показанной в табл. 2), или последовательность, по существу идентичную ей.In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule includes one, two, three, or four light chain framework regions (e.g., the VLFW amino acid sequence shown in Table 2, or encoded by the nucleotide sequence shown in Table 2), or the sequence , essentially identical to it.
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 включает одну, две, три или четыре каркасные области тяжелой цепи (например, аминокислотную последовательность VHFW, показанную в табл. 2, или кодируемую нуклеотидной последовательностью, показанной в табл. 2), или последовательность, по существу идентичную ей; и одну, две, три или четыре каркасные области легкой цепи (например, аминокислотную последовательность VLFW, показанную в табл. 2, или кодируемую нуклеотидной последовательностью, показанной в табл. 2), или последовательность, по существу идентичную ей.In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule includes one, two, three, or four heavy chain framework regions (e.g., the VHFW amino acid sequence shown in Table 2, or encoded by the nucleotide sequence shown in Table 2), or a sequence essentially identical to it; and one, two, three or four light chain framework regions (eg, the amino acid sequence VLFW shown in Table 2, or encoded by the nucleotide sequence shown in Table 2), or a sequence substantially identical thereto.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область 1 тяжелой цепи (VHFW1) из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 147). В некоторых вариантах осуществления указанная молекула антитела содержит каркасную область 1 тяжелой цепи (VHFW1) из BAP049-hum14 или BAP049-hum15 (например, SEQ ID NO: 151).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework 1 (VHFW1) of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049- hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum15, BAP049-hum16, VAR049-clone-A, VAR049-clone-B, VAR049-clone-C, VAR049- clone-E or BAP049-clone-E (eg, SEQ ID NO: 147). In some embodiments, said antibody molecule comprises heavy chain framework 1 (VHFW1) from BAP049-hum14 or BAP049-hum15 (eg, SEQ ID NO: 151).
- 11 045940- 11 045940
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область 2 тяжелой цепи (VHFW2) из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum09, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 153). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 2 тяжелой цепи (VHFW2) из BAP049-hum03, BAP049-hum04, ВАР049-hum08, BAP049-hum10, BAP049-hum14, BAP049-hum15 или ВАР049-клон-Э (например, SEQ ID NO: 157). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 2 тяжелой цепи (VHFW2) из BAP049-hum16 (например, SEQ ID NO: 160).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework 2 (VHFW2) of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum09, BAP049-hum11, BAP049- hum12, BAP049-hum13, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, or BAP049-clone-E (eg, SEQ ID NO: 153). In some embodiments, the antibody molecule comprises heavy chain framework 2 (VHFW2) of BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum08, BAP049-hum10, BAP049-hum14, BAP049-hum15, or BAP049-clone-E (e.g., SEQ ID NO: 157). In some embodiments, the antibody molecule comprises heavy chain framework 2 (VHFW2) from BAP049-hum16 (eg, SEQ ID NO: 160).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область 3 тяжелой цепи (VHFW3) из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum09, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 162). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 3 тяжелой цепи (VHFW3) из BAP049-hum03, BAP049-hum04, ВАР049-hum08, BAP049-hum10, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16 или BAP049-k.toh-D (например, SEQ ID NO: 166).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework 3 (VHFW3) of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum09, BAP049-hum11, BAP049- hum12, BAP049-hum13, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, or BAP049-clone-E (eg, SEQ ID NO: 162). In some embodiments, the antibody molecule comprises heavy chain framework 3 (VHFW3) of BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum08, BAP049-hum10, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, or BAP049-k.toh- D (eg SEQ ID NO: 166).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область 4 тяжелой цепи (VHFW4) из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-В или ВАР049-клон-С (например, SEQ ID NO: 169).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework 4 (VHFW4) of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049- hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, VAR04 9-clone-A, VAR049-clone-B, VAR049-clone -C, BAP049-clone-B, or BAP049-clone-C (eg, SEQ ID NO: 169).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область 1 легкой цепи (VLFW1) из BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum15, BAP049-hum16 или ВАР049-клон-С (например, SEQ ID NO: 174). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 1 легкой цепи (VLFW1) из BAP049-hum01, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum07, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum14, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, BAP049-k.toh-D или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 177). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 1 легкой цепи (VLFW1) из BAP049-hum06 (например, SEQ ID NO: 181). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 1 легкой цепи (VLFW1) из BAP049-hum13 (например, SEQ ID NO: 183). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 1 легкой цепи (VLFW1) из BAP04 9hum02, BAP049-hum03 или BAP049-hum12 (например, SEQ ID NO: 185).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises light chain framework 1 (VLFW1) from BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum15, BAP049-hum16, or BAP049-clone-C (e.g., SEQ ID NO: 174) . In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework region 1 (VLFW1) of BAP049-hum01, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum07, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum14, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-k.toh-D, or BAP049-clone-E (eg, SEQ ID NO: 177). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework 1 (VLFW1) from BAP049-hum06 (eg, SEQ ID NO: 181). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework 1 (VLFW1) from BAP049-hum13 (eg, SEQ ID NO: 183). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework 1 (VLFW1) from BAP049hum02, BAP049-hum03, or BAP049-hum12 (eg, SEQ ID NO: 185).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область 2 легкой цепи (VLFW2) из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum06, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клон-В, BAP049-k.toh-D или ВАР049-клон-С (например, SEQ ID NO: 187). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 2 легкой цепи (VLFW2) из BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum07, BAP049-hum13 или ВАР049клон-С (например, SEQ ID NO: 191). В некоторых вариантах осуществления эти молекула антитела содержит каркасные области 2 легкой цепи (VLFW2) из BAP049-hum12 (например, SEQ ID NO: 194).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises light chain framework 2 (VLFW2) of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum06, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049- hum11, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP04 9-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-k.toh-D or BAP049-clone-C (eg, SEQ ID NO: 187). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework 2 (VLFW2) regions from BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum07, BAP049-hum13, or BAP049 clone-C (eg, SEQ ID NO: 191). In some embodiments, the antibody molecule comprises the light chain framework 2 (VLFW2) regions of BAP049-hum12 (eg, SEQ ID NO: 194).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область 3 легкой цепи (VLFW3) из BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 196). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 3 легкой цепи (VLFW3) из BAP049-hum02 или BAP049-hum03 (например, SEQ ID NO: 200). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 3 легкой цепи (VLFW3) из BAP049hum01 или ВАР049-клон-А (например, SEQ ID NO: 202). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область 3 легкой цепи VLFW3 из BAP049-hum04, ВАР049-hum05 или ВАР049-клон-В (например, SEQ ID NO: 205).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises light chain framework 3 (VLFW3) of BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049- hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-C, BAP049-clone-E, or BAP049-clone-E (eg, SEQ ID NO: 196). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework 3 (VLFW3) from BAP049-hum02 or BAP049-hum03 (eg, SEQ ID NO: 200). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework 3 (VLFW3) from BAP049hum01 or BAP049-clone-A (eg, SEQ ID NO: 202). In some embodiments, the antibody molecule comprises VLFW3 light chain framework 3 of BAP049-hum04, BAP049-hum05, or BAP049-clone-B (eg, SEQ ID NO: 205).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область 4 легкой цепи (VLFW4) из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, BAP049-khoh-D или BAP049-khoh-G (например, SEQ ID NO: 208).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises light chain framework 4 (VLFW4) of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049- hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, VAR04 9-clone-A, VAR049-clone-B, VAR049-clone -C, BAP049-khoh-D or BAP049-khoh-G (for example, SEQ ID NO: 208).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелых цепей из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP-hum07, BAP049-hum09, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 1-3 тяжелых цепей из BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum08, BAP049-hum10 илиIn some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises the heavy chain framework regions 1-3 of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP-hum07, BAP049-hum09, BAP049-hum11, BAP049-hum12 , BAP049-hum13, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, or BAP049-clone-E (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) and SEQ ID NO: 162 (VHFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 of BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum08, BAP049-hum10, or
- 12 045940- 12 045940
ВАР049-клон-Э (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)). В некоторых вариантах осуществления эта молекула антитела содержит каркасные области 13 тяжелых цепей из BAP049-hum14 или BAP049-hum15 (например, SEQ ID NO: 151 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)). В некоторых вариантах осуществления эта молекула антитела содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из ВАР049-hum16 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 160 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела дополнительно содержит каркасную область 4 тяжелой цепи (VHFW4) из BAP049-hum01, BAP049-hum02, ВАР049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клон-В,VAR049-clone-E (for example, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW) and SEQ ID NO: 166 (VHFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises the 13 heavy chain framework regions of BAP049-hum14 or BAP049-hum15 (e.g., SEQ ID NO: 151 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3) ). In some embodiments, the antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum16 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 160 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3)). In some embodiments, the antibody molecule further comprises heavy chain framework 4 (VHFW4) of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049 -hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, VAR04 9-clone-A, VAR049-clone-B,
ВАР049-клон-С, BAP049-k.toh-D или BAP049-k.toh-G (например, SEQ ID NO: 169).BAP049-clone-C, BAP049-k.toh-D, or BAP049-k.toh-G (eg, SEQ ID NO: 169).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum01 или ВАР049-клон-А (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 202 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum02 или ВАР049-hum03 (например, SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 200 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 1-3 легких цепей из BAP049-hum04, BAP049-hum05 или ВАР049-клон-В (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2) и SEQ ID NO: 205 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления эта молекула антитела содержит каркасные области 1-3 легкой цепи из ВАР049-hum06 (например, SEQ ID NO: 181 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum07 (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 1-3 легких цепей из BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049hum15, BAP049-hum16 или ВАР049-клон-С (например, SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 1-3 легких цепей из BAP049-hum10, ВАР049-hum11, BAP049-hum14, ВАР049клон-D или ВАР049-клон-С (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 1-3 легких цепей из BAP049-hum12 (например, SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 194 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum13 (например, SEQ ID NO: 183 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела дополнительно содержит каркасную область 4 легкой цепи (VLFW4) из BAP049-hum01, BAP049hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049клон-D или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 208).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 from BAP049-hum01 or BAP049-clone-A (e.g., SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2), and SEQ ID NO: 202 (VLFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum02 or BAP049-hum03 (e.g., SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2), and SEQ ID NO: 200 (VLFW3 )). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum04, BAP049-hum05, or BAP049-clone-B (e.g., SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2), and SEQ ID NO: 205 (VLFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 from BAP049-hum06 (e.g., SEQ ID NO: 181 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum07 (e.g., SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049hum15, BAP049-hum16, or BAP049-clone-C (e.g., SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum14, BAP049clone-D, or BAP049clone-C (e.g., SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum12 (e.g., SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 194 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). In some embodiments, the antibody molecule comprises light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum13 (e.g., SEQ ID NO: 183 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)). In some embodiments, the antibody molecule further comprises light chain framework 4 (VLFW4) of BAP049-hum01, BAP049hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP 049 -hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, VAR04 9-clone-A, VAR049-clone-B, VAR049-clone-C, VAR049clone-D or VAR049- clone-E (eg, SEQ ID NO: 208).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum01 или ВАР049-клон-А (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049hum01 или ВАР049-клон-А (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 202 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum01 or BAP049-clone-A (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2), and SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), and light chain framework regions 1-3 of BAP049hum01 or BAP049-clone-A (e.g., SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) and SEQ ID NO: 202 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum02 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum02 (например, SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 200 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum02 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2), and SEQ ID NO: 162 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum02 (eg, SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2), and SEQ ID NO: 200 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum03 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum03 (например, SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 200 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum03 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum03 (eg, SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2), and SEQ ID NO: 200 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum04 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum04 (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2) и SEQ ID NO: 205 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum04 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum04 (eg, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2), and SEQ ID NO: 205 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелых цепей из BAP049-hum05 или ВАР049-клон-В (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи BAP049-hum05 или ВАР049-клон-В (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2) и SEQ ID NO: 205 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum05 or BAP049-clone-B (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2), and SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum05 or BAP049-clone-B (e.g., SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2) and SEQ ID NO : 205 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum06 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2)In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum06 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2)
- 13 045940 и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum06 (например, SEQ ID NO: 181 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).- 13 045940 and SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum06 (for example, SEQ ID NO: 181 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) and SEQ ID NO : 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum07 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum07 (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum07 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2), and SEQ ID NO: 162 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum07 (eg, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum08 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum08 (например, SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum08 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum08 (eg, SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелых цепей из BAP049-hum09 или ВАР049-клон-С (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легких цепей из BAP049hum09 или ВАР049-клон-С (например, SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum09 or BAP049-clone-C (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2), and SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), and light chain framework regions 1-3 from BAP049hum09 or BAP049-clone-C (e.g., SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелых цепей из BAP049-hum10 или ВАР049-клон-Э (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легких цепей из BAP049hum10 или ВАР049-клон-Э (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum10 or BAP049-clone-E (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3)), and light chain framework regions 1-3 from BAP049hum10 or BAP049-clone-E (e.g., SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелых цепей из BAP049-hum11 или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легких цепей из BAP049hum11 или ВАР049-клон-Е (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum11 or BAP049-clone-E (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2), and SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), and light chain framework regions 1-3 from BAP049hum11 or BAP049-clone-E (e.g., SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum12 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum12 (например, SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 194 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum12 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2), and SEQ ID NO: 162 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum12 (eg, SEQ ID NO: 185 (VLFW1), SEQ ID NO: 194 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелых цепей из BAP049-hum13 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2) и SEQ ID NO: 162 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легких цепей из BAP049-hum13 (например, SEQ ID NO: 183 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises the heavy chain framework regions 1-3 of BAP049-hum13 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 153 (VHFW2), and SEQ ID NO: 162 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum13 (eg, SEQ ID NO: 183 (VLFW1), SEQ ID NO: 191 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum14 (например, SEQ ID NO: 151 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum14 (например, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum14 (e.g., SEQ ID NO: 151 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum14 (eg, SEQ ID NO: 177 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum15 (например, SEQ ID NO: 151 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum15 (например, SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum15 (e.g., SEQ ID NO: 151 (VHFW1), SEQ ID NO: 157 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum15 (eg, SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасные области 1-3 тяжелой цепи из BAP049-hum16 (например, SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 160 (VHFW2) и SEQ ID NO: 166 (VHFW3)), и каркасные области 1-3 легкой цепи из BAP049-hum16 (например, SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2) и SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises heavy chain framework regions 1-3 from BAP049-hum16 (e.g., SEQ ID NO: 147 (VHFW1), SEQ ID NO: 160 (VHFW2), and SEQ ID NO: 166 (VHFW3 )), and light chain framework regions 1-3 of BAP049-hum16 (eg, SEQ ID NO: 174 (VLFW1), SEQ ID NO: 187 (VLFW2), and SEQ ID NO: 196 (VLFW3)).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 дополнительно содержит каркасную область 4 тяжелой цепи (VHFW4) из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или BAP049-i<.toh-G (например, SEQ ID NO: 169), и каркасную область 4 легкой цепи (VLFW4) из BAP049-hum01, BAP049hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, BAP049-icioh-G. ВАР049клон-D или ВАР049-клон-С (например, SEQ ID NO: 208).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule further comprises heavy chain framework 4 (VHFW4) of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049 -hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone -C, BAP049-clone-E or BAP049-i<.toh-G (e.g., SEQ ID NO: 169), and light chain framework 4 (VLFW4) of BAP049-hum01, BAP049hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04 , BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049hum14, BAP049-hum15, BAP0 49-hum16, VAR049-clone-A , BAP049-clone-B, BAP049-icioh-G. BAP049clone-D or BAP049-clone-C (eg, SEQ ID NO: 208).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит каркасную область тяжелой цепи, несущую комбинацию каркасных областей FW1, FW2 и FW3, как показано на фиг. 5 или 7. В другом варианте осуществления молекула антитела содержит каркасную область легкой цепи, несущую комбинацию каркасных областей FW1, FW2 и FW3, как показано на фиг. 5 или 7. В других вариантах осуществления молекула антитела содержит каркасную область тяжелой цепи, несущую комбинацию каркасных областей FW1, FW2 и FW3, как показано на фиг. 5 или 7, и каркасную область легкой цепи, несущую комбинацию каркасных областей FW1, FW2 и FW3, как показано на фиг. 5 или 7.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises a heavy chain framework region bearing a combination of the FW1, FW2 and FW3 framework regions, as shown in FIG. 5 or 7. In another embodiment, the antibody molecule comprises a light chain framework region bearing a combination of framework regions FW1, FW2 and FW3, as shown in FIG. 5 or 7. In other embodiments, the antibody molecule comprises a heavy chain framework region bearing a combination of framework regions FW1, FW2 and FW3, as shown in FIG. 5 or 7, and a light chain framework region carrying a combination of framework regions FW1, FW2 and FW3, as shown in FIG. 5 or 7.
- 14 045940- 14 045940
В одном варианте осуществления вариабельный домен тяжелой или легкой цепи, или обеих цепей, из молекулы антитела против PD-1 включает аминокислотную последовательность, которая по существу идентична аминокислотной последовательности, раскрытой в настоящем изобретении, например, идентична по меньшей мере на 80, 85, 90, 92, 95, 97, 98, 99% или в более высокой степени, вариабельной области антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител ВАР049hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049клон-D или ВАР049-клон-Е; или согласно описанию в табл. 1, или последовательность, кодируемую нуклеотидной последовательностью из табл. 1; или последовательность, которая отличается по меньшей мере на 1 или 5 остатков, но меньше чем на 40, 30, 20 или 10 остатков, от вариабельной области антитела по изобретению.In one embodiment, the heavy or light chain variable domain, or both, of an anti-PD-1 antibody molecule comprises an amino acid sequence that is substantially identical to the amino acid sequence disclosed herein, e.g., at least 80, 85, 90 identical , 92, 95, 97, 98, 99% or a higher degree, of the variable region of an antibody according to the invention, for example, an antibody selected from any of the antibodies BAP049hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-clone-A, BAP049- clone-B, VAR049- clone-C, BAP049clone-D or BAP049-clone-E; or as described in table. 1, or the sequence encoded by the nucleotide sequence from table. 1; or a sequence that differs by at least 1 or 5 residues, but less than 40, 30, 20 or 10 residues, from the variable region of an antibody of the invention.
В одном варианте осуществления вариабельная область тяжелой или легкой цепи, или обеих цепей, из молекулы антитела против PD-1 включает аминокислотную последовательность, кодируемую последовательностью нуклеиновых кислот, описанной в изобретении, или последовательностью нуклеиновых кислот, которая гибридизуется с последовательностью нуклеиновых кислот, описанной в изобретении (например, последовательностью нуклеиновых кислот, показанной в табл. 1 и 2), или с ее комплементом, например, в условиях низкой строгости, средней строгости или высокой строгости, или других условиях гибридизации, описанных в изобретении.In one embodiment, the heavy or light chain variable region, or both, of an anti-PD-1 antibody molecule comprises an amino acid sequence encoded by a nucleic acid sequence described in the invention, or a nucleic acid sequence that hybridizes to a nucleic acid sequence described in the invention (eg, the nucleic acid sequence shown in Tables 1 and 2), or its complement, eg, under low stringency, medium stringency or high stringency conditions, or other hybridization conditions described in the invention.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере один, два, три или четыре антигенсвязывающих участка, например, вариабельные области, имеющие аминокислотную последовательность, как указано в табл. 1, или последовательность, по существу идентичную этой последовательности (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, или отличающуюся от последовательностей, представленных в табл. 1, не более чем на 1, 2, 5, 10 или 15 аминокислотных остатков. В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает VH-домен и/или VL-домен, кодируемый нуклеиновой кислотой, которая имеет нуклеотидную последовательность, представленную в табл. 1, или последовательность, по существу идентичную указанным последовательностям (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, или отличающуюся от последовательностей, представленных в табл. 1, не более чем на 3, 6, 15, 30 или 45 нуклеотидов Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну, дву или три области CDR из вариабельной области тяжелой цепи, которые имеют аминокислотную последовательность, представленную в табл. 1, или последовательность, по существу гомологичную указанным последовательностям (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну, две, три или больше замен, делеций или инсерций, например, консервативных замен). Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну, две или три области CDR из вариабельной области легкой цепи, которые имеют аминокислотную последовательность, представленную в табл. 1, или последовательность, по существу гомологичную указанным последовательностям (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну, две, три или больше замен, делеций или инсерций, например, консервативных замен). Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну две, три, четыре, пять или шесть областей CDR из вариабельных областей тяжелой и легкой цепи, которые имеют аминокислотную последовательность, представленную в табл. 1), или последовательность по существу гомологичную указанным последовательностям (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну, две, три или больше замен, инсерций или делеций, например, консервативных замен).In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains at least one, two, three or four antigen binding regions, for example, variable regions having the amino acid sequence as set forth in table. 1, or a sequence substantially identical to that sequence (e.g., a sequence identical to at least about 85, 90, 95, 99% or more, or different from the sequences presented in Table 1 by no more than 1, 2 , 5, 10, or 15 amino acid residues. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes a VH domain and/or a VL domain encoded by a nucleic acid that has the nucleotide sequence set forth in Table 1, or a sequence substantially identical to the specified sequences (for example, a sequence identical to at least about 85, 90, 95, 99% or more, or different from the sequences presented in Table 1 by no more than 3, 6, 15, 30 or 45 nucleotides In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises at least one, two or three heavy chain variable region CDR regions that have the amino acid sequence set forth in Table. 1, or a sequence substantially homologous to said sequences (e.g., a sequence identical to at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one, two, three or more substitutions, deletions or insertions, e.g. , conservative substitutions). In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises at least one, two or three light chain variable region CDR regions that have the amino acid sequence set forth in Table. 1, or a sequence substantially homologous to said sequences (e.g., a sequence identical to at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one, two, three or more substitutions, deletions or insertions, e.g. , conservative substitutions). In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises at least one two, three, four, five or six CDR regions of the heavy and light chain variable regions that have the amino acid sequence presented in table. 1), or a sequence substantially homologous to said sequences (e.g., a sequence identical to at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one, two, three or more substitutions, insertions or deletions, e.g. , conservative substitutions).
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну, две или три CDR, и/или гипервариабельные петли из вариабельной области тяжелой цепи, которые имеют аминокислотную последовательность антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клонB, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е, как представлено в табл. 1, или последовательность, по существу, идентичную указанным последовательностям (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну, две, три или больше замен, инсерций или делеций, например, консервативных замен). В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну, две или три CDR, и/или гипервариабельные петли из вариабельной области легкой цепи, которые имеют аминокислотную последовательность антитела по изобретению, например, антитела, выбранного среди любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06,In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule comprises at least one, two or three CDRs, and/or heavy chain variable region hypervariable loops that have the amino acid sequence of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of BAP049- hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049hum12, B AP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP04 9-clone-A, BAP049-cloneB, BAP049-clone-C, BAP049-clone-E or BAP049-clone-E, as presented in table. 1, or a sequence substantially identical to said sequences (e.g., a sequence identical to at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one, two, three or more substitutions, insertions or deletions, for example, conservative substitutions). In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains at least one, two or three CDRs, and/or light chain variable region hypervariable loops that have the amino acid sequence of an antibody of the invention, for example, an antibody selected from any of the BAP049 antibodies -hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06,
BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12,BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12,
- 15 045940- 15 045940
BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-О или ВАР049-клон-Е, как представлено в таблице, или последовательность, по существу идентичную указанным последовательностям (например, последовательность, идентичную по меньшей мере на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну, две, три и больше замен, инсерций и делеций, например, консервативных замен). В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 содержит включает все шесть CDR и/или гипервариабельных петель, описанных в изобретении, например, представленных в табл. 1.BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, BAP049-clone-O or BAP049-clone-E, as presented in the table , or a sequence substantially identical to said sequences (e.g., a sequence identical to at least 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one, two, three or more substitutions, insertions and deletions, such as conservative replacements). In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule contains all six CDRs and/or hypervariable loops described in the invention, for example, those presented in table. 1.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 имеет вариабельную область, последовательность которой идентична или отличается на 1, 2, 3 или 4 аминокислоты от вариабельной области по изобретению (например, FR-области, раскрытой в изобретении).In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule has a variable region whose sequence is identical to or differs by 1, 2, 3 or 4 amino acids from the variable region of the invention (eg, the FR region disclosed in the invention).
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 представляет собой полное антитело или его фрагмент (например, Fab, F(ab')2, Fv или одноцепочечный Fv- фрагмент (ScFv)). В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 представляет собой моноклональное антитело или антитело с единственной специфичностью. Молекула антитела против PD-1 может также представлять собой гуманизированную, химерную, верблюжью, акулью или созданную in vitro молекулу антитела. В одном варианте осуществления такая молекула антитела против PD-1 представляет собой молекулу гуманизированного антитела. Тяжелые и легкие цепи молекулы антитела против PD-1 могут быть полноразмерными (например, антитело может включать по меньшей мере одну, и предпочтительно два полноразмерные тяжелые цепи и по меньшей мере одну, и предпочтительно две полноразмерные легкие цепи) или может включать антигенсвязывающий фрагмент (например, Fab, F(ab')2, Fv, одноцепочечный Fv-фрагмент, однодоменное антитело, диатело (dAb), бивалентное антитело или биспецифичное антитело или их фрагмент, их однодоменный вариант или верблюжье антитело).In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is a complete antibody or a fragment thereof (eg, Fab, F(ab') 2 , Fv, or single chain Fv fragment (ScFv)). In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is a monoclonal antibody or a single specificity antibody. The anti-PD-1 antibody molecule may also be a humanized, chimeric, camel, shark, or in vitro generated antibody molecule. In one embodiment, such an anti-PD-1 antibody molecule is a humanized antibody molecule. The heavy and light chains of an anti-PD-1 antibody molecule may be full-length (e.g., the antibody may include at least one, and preferably two, full-length heavy chains and at least one, and preferably two, full-length light chains) or may include an antigen-binding moiety (e.g. , Fab, F(ab') 2 , Fv, single chain Fv fragment, single domain antibody, diabody (dAb), bivalent antibody or bispecific antibody or fragment thereof, single domain variant thereof or camel antibody).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 представляет собой молекулу биспецифичного или мультиспецифичного антитела. В одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела имеет первую связывающую специфичность для PD-1 и вторую связывающую специфичность для TIM-3, LAG-3, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 И/или СЕАСАМ-5), PD-L1 или PD-L2. В одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела связывается с PD-1 и TIM-3. В другом варианте молекула биспецифичного антитела связывается с PD-1 и LAG-3. В другом варианте молекула биспецифичного антитела связывается с PD-1 и СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 и/или СЕАСАМ-5). В другом варианте молекула биспецифичная антитело связывается с PD-1 и СЕАСАМ-1. Еще в одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела связывается с PD-1 и СЕАСАМ-5. В другом варианте осуществления молекула биспецифичного антитела связывается с PD-1 и PD-L1. Еще в одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела связывается с PD-1 и PD-L2. Можно получать любую комбинацию вышеуказанных молекул в молекуле мультиспецифичного антитела, например, триспецифичного антитела, которое включает первую связывающую специфичность для PD-1, и вторую и третью специфичность связывания для одной или нескольких из следующих молекул: TIM-3, LAG-3, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 или СЕАСАМ-5), PD-L1 или PD-L2.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is a bispecific or multispecific antibody molecule. In one embodiment, the bispecific antibody molecule has a first binding specificity for PD-1 and a second binding specificity for TIM-3, LAG-3, SEACAM (e.g., SEACAM-1, SEACAM-3 and/or SEACAM-5), PD-L1 or PD-L2. In one embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and TIM-3. In another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and LAG-3. In another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and SEACAM (eg, SEACAM-1, SEACAM-3 and/or SEACAM-5). In another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and SEACAM-1. In yet another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and CEACAM-5. In another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and PD-L1. In yet another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and PD-L2. Any combination of the above molecules can be produced in a multispecific antibody molecule, for example, a trispecific antibody, which includes a first binding specificity for PD-1, and a second and third binding specificity for one or more of the following molecules: TIM-3, LAG-3, CEACAM ( for example, SEACAM-1, SEACAM-3 or SEACAM-5), PD-L1 or PD-L2.
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 используется в комбинации с биспецифичной молекулой, содержащей одно или несколько из следующего: TIM-3, LAG-3, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 или СЕАСАМ-5), PD-L1 или PD-L2. В одном варианте осуществления используемая в комбинации молекула биспецифичного антитела связывается с СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 и/или СЕАСАМ-5) и LAG-3. В другом варианте осуществления используемая в комбинации молекула биспецифичного антитела связывается с СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 и/или СЕАСАМ-5) и TIM-3. В другом варианте осуществления используемая в комбинации молекула биспецифичного антитела связывается с LAG-3 и TIM-3.In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with a bispecific molecule comprising one or more of the following: TIM-3, LAG-3, SEACAM (e.g., SEACAM-1, SEACAM-3, or SEACAM-5), PD -L1 or PD-L2. In one embodiment, the bispecific antibody molecule used in combination binds to SEACAM (eg, SEACAM-1, SEACAM-3, and/or SEACAM-5) and LAG-3. In another embodiment, the bispecific antibody molecule used in combination binds to SEACAM (eg, SEACAM-1, SEACAM-3 and/or SEACAM-5) and TIM-3. In another embodiment, the bispecific antibody molecule used in combination binds to LAG-3 and TIM-3.
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 имеет константную область тяжелой цепи (Fc), выбранную, например, из константных областей тяжелой цепи IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD и IgE; в частности, выбранную, например, из константных областей тяжелой цепи IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, и, более конкретно, из константной области тяжелой цепи IgG1 или IgG2 (например, человеческого IgG1, IgG2 или IgG4). В одном варианте осуществления константная область тяжелой цепи принадлежит человеческому IgG1. В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1 имеет константную область легкой цепи, выбранную, например, из константных областей легкой цепи каппа или лямбда, предпочтительно, из каппа-цепи (например, человеческой каппа-цепи). В одном варианте осуществления константная область является измененной, например, подвергается мутации, с целью модификации свойств молекулы антитела против PD-1 (например, для увеличения или уменьшения одного или нескольких из следующих свойств: связывание с Fc-рецептором, гликозилирование антитела, число остатков цистеина, функция эффекторных клеток или функция комплемента). Например, константная область подвергается мутации в положениях 296 (М на Y), 298 (S на Т), 300 (Т на Е), 477 (Н на K) и 478 (N на F) для изменения связывания с Fc-рецептором (например, мутантные положения соответствуют положениям 132 (М на Y), 134 (S на Т), 136 (Т на Е), 313 (Н на K) и 314 (N на F) из SEQ ID NO: 212 или 214; или положениям 135 (М на Y), 137 (S на Т), 139 (Т на Е), 316 (Н на K) и 317 (N на F) изIn other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule has a heavy chain constant region (Fc) selected from, for example, the heavy chain constant regions of IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD, and IgE; in particular selected from, for example, the heavy chain constant regions of IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, and more particularly from the heavy chain constant region of IgG1 or IgG2 (eg, human IgG1, IgG2 or IgG4). In one embodiment, the heavy chain constant region is human IgG1. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule has a light chain constant region selected, for example, from kappa or lambda light chain constant regions, preferably from a kappa chain (eg, human kappa chain). In one embodiment, the constant region is modified, e.g., mutated, to modify the properties of the anti-PD-1 antibody molecule (e.g., to increase or decrease one or more of the following properties: Fc receptor binding, antibody glycosylation, number of cysteine residues , effector cell function or complement function). For example, the constant region is mutated at positions 296 (M to Y), 298 (S to T), 300 (T to E), 477 (H to K), and 478 (N to F) to alter binding to the Fc receptor ( for example, the mutant positions correspond to positions 132 (M to Y), 134 (S to T), 136 (T to E), 313 (H to K), and 314 (N to F) of SEQ ID NO: 212 or 214; or positions 135 (M to Y), 137 (S to T), 139 (T to E), 316 (H to K) and 317 (N to F) from
- 16 045940- 16 045940
SEQ ID NO: 215, 216, 217 или 218). В другом варианте осуществления константная область тяжелой цепи из IgG4, например, человеческого IgG4, подвергается мутации в положении 228, в соответствии с нумерацией EU (например, S на Р), например, как показано в табл. 3. В некоторых вариантах осуществления молекулы антитела против PD-1 содержат человеческий IgG4 с мутацией в положении 228, в соответствии с нумерацией EU (например, S на Р), например, как показано в табл. 3, и константную область легкой цепи каппа, например, как показано в табл. 3. Еще в одном варианте осуществления константная область тяжелой цепи из IgG1, например, человеческого IgG1, подвергается мутации в одном или нескольких положениях: в положении 297 согласно нумерации EU (например, N на А), в положении 265 согласно нумерации EU (например, D на А), в положении 329 согласно нумерации EU (например, Р на А), в положении 234 согласно нумерации EU (например, L на А), или в положении 235 в соответствии с нумерацией EU (например, L на А), например, как показано в табл. 3. В некоторых вариантах осуществления молекулы антитела против PD-1 содержат человеческий IgG1 с мутацией в одном или нескольких из указанных положений, например, как показано в табл. 3, и константную область легкой цепи каппа, например, как показано в табл. 3.SEQ ID NO: 215, 216, 217 or 218). In another embodiment, the heavy chain constant region of an IgG4, eg, human IgG4, is mutated at position 228 according to EU numbering (eg, S to P), for example, as shown in Table 1. 3. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecules comprise human IgG4 with a mutation at position 228, according to EU numbering (eg, S to P), for example, as shown in Table. 3, and a kappa light chain constant region, for example, as shown in Table. 3. In yet another embodiment, the heavy chain constant region of an IgG1, e.g., human IgG1, is mutated at one or more positions: at EU numbering position 297 (e.g., N to A), at EU numbering position 265 (e.g., D to A), at position 329 according to the EU numbering (for example, P to A), at position 234 according to the EU numbering (for example, L to A), or at position 235 according to the EU numbering (for example, L to A), for example, as shown in table. 3. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecules comprise human IgG1 with a mutation at one or more of these positions, for example, as shown in table. 3, and a kappa light chain constant region, for example, as shown in Table. 3.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 является выделенной или рекомбинантной.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is isolated or recombinant.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 представляет собой молекулу гуманизированного антитела. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 имеет оценку риска на основе анализа Т-клеточного эпитопа менее 700, 600, 500, 400 или меньше.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is a humanized antibody molecule. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule has a T cell epitope assay-based risk score of less than 700, 600, 500, 400, or less.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 представляет собой молекулу гуманизированного антитела и имеет оценку риска на основе анализа Т-клеточного эпитопа от 300 до 700, от 400 до 650, от 450 до 600, или оценку риска согласно изобретению.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is a humanized antibody molecule and has a T cell epitope assay-based risk score of 300 to 700, 400 to 650, 450 to 600, or a risk score of the invention.
Изобретение также относится к молекуле нуклеиновой кислоты, содержащей одну или обе нуклеотидные последовательности, которые кодируют вариабельные области тяжелой и легкой цепи, области CDR, гипервариабельные петли, каркасные участки молекул антител против PD-1, согласно изобретению. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность, которая кодирует молекулу антитела против PD-1, является молекулой с оптимизированным кодоном. Например, настоящее изобретение относится к первой и второй нуклеиновым кислотам, кодирующим вариабельные области тяжелой и легкой цепи, соответственно, в молекуле антитела против PD-1, выбранного среди одного или нескольких антител, например, среди любого из BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, ВАР049-1шт04. BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР04 9-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВЛР049-к.юн-1) или ВАР049-клон-Е, как указано в табл. 1, или последовательность, по существу идентичную указанным последовательностям. Например, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, приведенную в табл. 1 и 2, или последовательность, по существу идентичную указанным последовательностям (например, последовательность, которая идентична по меньшей мере на 85, 90, 95, 99% и больше, или которая отличается не более чем на 3, 6, 15, 30 или 45 нуклеотидов, показанных в табл. 1 и 2).The invention also relates to a nucleic acid molecule containing one or both nucleotide sequences that encode heavy and light chain variable regions, CDR regions, hypervariable loops, framework regions of anti-PD-1 antibody molecules according to the invention. In some embodiments, the nucleotide sequence that encodes the anti-PD-1 antibody molecule is a codon optimized molecule. For example, the present invention provides first and second nucleic acids encoding heavy and light chain variable regions, respectively, in an anti-PD-1 antibody molecule selected from one or more antibodies, for example, any of BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, VAR049-1pc04. BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP0 49-hum16, VAR04 9 -clone-A, VAR049-clone-B, VAR049-clone-C, VLR049-k.yun-1) or VAR049-clone-E, as indicated in table. 1, or a sequence substantially identical to the above sequences. For example, the nucleic acid may contain the nucleotide sequence shown in table. 1 and 2, or a sequence substantially identical to those sequences (e.g., a sequence that is at least 85, 90, 95, 99% or more identical, or that differs by no more than 3, 6, 15, 30, or 45 nucleotides shown in Tables 1 and 2).
В других вариантах осуществления эта молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, которая кодирует вариабельный домен тяжелой цепи и/или константную область тяжелой цепи, содержащие аминокислотную последовательность из ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е; или, как описано в табл. 1; или нуклеотидную последовательность из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше) по отношению к любой из указанных выше последовательностей.In other embodiments, the nucleic acid molecule contains a nucleotide sequence that encodes a heavy chain variable domain and/or a heavy chain constant region comprising the amino acid sequence of BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, BAP049- clone-E or VAR049-clone-E; or, as described in table. 1; or nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, a sequence identical to at least about 85%, 90%, 95%, 99% or more) to any of the above sequences.
В других вариантах осуществления эта молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, которая кодирует вариабельный домен легкой цепи и/или константную область легкой цепи, содержащие аминокислотную последовательность из ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е; или, как описано в табл. 1; или нуклеотидную последовательность из табл. 1; или последовательность, по существу идентичную (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше) по отношению к любой из указанных выше последовательностей.In other embodiments, the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence that encodes a light chain variable domain and/or a light chain constant region comprising the amino acid sequence of BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, BAP049- clone-E or VAR049-clone-E; or, as described in table. 1; or nucleotide sequence from table. 1; or a sequence substantially identical (eg, a sequence identical to at least about 85%, 90%, 95%, 99% or more) to any of the above sequences.
Указанные нуклеотидные последовательности, кодирующие вариабельный домен и константные области тяжелой и легкой цепи антитела против PD-1, могут присутствовать в виде отдельной молекулы нуклеиновой кислоты, или в этой же молекуле нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления молекулы нуклеиновых кислот содержат нуклеотидную последовательность, которая кодирует лидерную последовательность, например, лидерную последовательность, приведенную в табл. 4, или последовательность, по существу идентичную указанной последовательности.These nucleotide sequences encoding the variable domain and heavy and light chain constant regions of an anti-PD-1 antibody may be present as a separate nucleic acid molecule or within the same nucleic acid molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecules contain a nucleotide sequence that encodes a leader sequence, for example, the leader sequence shown in table. 4, or a sequence substantially identical to said sequence.
В некоторых вариантах осуществления эта молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три области CDR, или гипервариабельные петли, из вариабельной области тяжелой цепи, которая имеет аминокислотную последовательность, приведенную в табл. 1, или последовательность, по существу гомологичную указанной последоваIn some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding at least one, two or three CDR regions, or hypervariable loops, from a heavy chain variable region that has the amino acid sequence set forth in Table. 1, or a sequence substantially homologous to said sequence
- 17 045940 тельности (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну, две, три или больше замен, инсерций или делеций, например, консервативных замен).- 17 045940 identity (for example, a sequence that is at least about 85, 90, 95, 99% identical or more, and/or having one, two, three or more substitutions, insertions or deletions, for example, conservative substitutions).
В другом варианте осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три CDR или гипервариабельные петли из вариабельной области легкой цепи, которая имеет аминокислотную последовательность, приведенную в табл. 1, или последовательность, по существу гомологичную указанной последовательности (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну, две, три или больше замен, делеций или инсерций, например, консервативных замен).In another embodiment, the nucleic acid molecule contains a nucleotide sequence encoding at least one, two or three CDRs or hypervariable loops from a light chain variable region that has the amino acid sequence shown in table. 1, or a sequence substantially homologous to said sequence (e.g., a sequence identical to at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one, two, three or more substitutions, deletions or insertions, e.g. , conservative substitutions).
Еще в одном варианте осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть CDR, или гипервариабельные петли, из вариабельных областей тяжелой и легкой цепи, которые имеют аминокислотную последовательность, как указано в табл. 1, или последовательность, по существу гомологичную указанным последовательностям (например, последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше и/или имеющую одну, две, три или больше замен, инсерций или делеций, например, консервативных замен).In yet another embodiment, the nucleic acid molecule contains a nucleotide sequence encoding at least one, two, three, four, five or six CDRs, or hypervariable loops, from heavy and light chain variable regions that have the amino acid sequence as set forth in Table . 1, or a sequence substantially homologous to said sequences (e.g., a sequence identical to at least about 85, 90, 95, 99% or more and/or having one, two, three or more substitutions, insertions or deletions, e.g. conservative substitutions).
В одном варианте осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую молекулу антитела против PD-1, которая включает замену в легкой цепи CDR3 в положении 102 вариабельной области легкой цепи, например, замену остатка цистеина на тирозин, или остатка цистеина на серин, в положении 102 вариабельной области легкой цепи, в соответствии с табл. 1 (например, SEQ ID NO: 16 или 2 4 для мышиной или химерной, немодифицированной последовательности, или любую из SEQ ID NO: 34, 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74 или 78 для модифицированной последовательности).In one embodiment, the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding an anti-PD-1 antibody molecule that includes a change in the light chain of CDR3 at position 102 of the light chain variable region, for example, a change of a cysteine residue to a tyrosine, or a cysteine residue to a serine, at position 102 variable region of the light chain, in accordance with table. 1 (e.g., SEQ ID NO: 16 or 24 for a murine or chimeric, unmodified sequence, or any of SEQ ID NO: 34, 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74, or 78 for a modified sequence) .
В другом варианте осуществления молекула нуклеиновой кислоты включает одну или несколько каркасных областей тяжелой цепи (например, любую из VHFW1 (тип a), VHFW1 (тип b), VHFW2 (тип а), VHFW2 (тип b), VHFW2 (тип с), VHFW3 (тип а), VHFW3 (тип b), или VHFW4, или любую их комбинацию, например, комбинацию каркасных областей, описанных в изобретении) для любого из антител BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, ВАР049-клон-Э или ВАР049-клон-Е, приведенных в табл. 1 и 2, или последовательность, по существу идентичную указанным последовательностям. Например, молекула нуклеиновой кислоты может содержать нуклеотидную последовательность, представленную в табл. 1 и 2, или последовательность, по существу идентичную ей (например, последовательность, которая идентична ей по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, или отличается от последовательностей, представленных в табл. 1 и 2, не более чем на 3, 6, 15, 30 или 45 нуклеотидов).In another embodiment, the nucleic acid molecule includes one or more heavy chain framework regions (e.g., any of VHFW1 (type a), VHFW1 (type b), VHFW2 (type a), VHFW2 (type b), VHFW2 (type c), VHFW3 (type a), VHFW3 (type b), or VHFW4, or any combination thereof, for example, a combination of framework regions described in the invention) for any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049-hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-hum07, BAP049-hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049-hum14, BAP049-hum15, BAP0 49-hum16, VAR049- clone-A, VAR049-clone-B, VAR049-clone-C, VAR049-clone-E or VAR049-clone-E, given in table. 1 and 2, or a sequence substantially identical to these sequences. For example, a nucleic acid molecule may contain the nucleotide sequence presented in table. 1 and 2, or a sequence substantially identical thereto (e.g., a sequence that is at least about 85, 90, 95, 99% or more identical, or differs from the sequences presented in Tables 1 and 2 by no more than than 3, 6, 15, 30 or 45 nucleotides).
В другом варианте осуществления молекула нуклеиновой кислоты включает одну или несколько каркасных областей легкой цепи (например, любую из VLFW1 (тип a), VLFW1 (тип b), VLFW1 (тип с), VLFW1 (тип d), VLFW1 (тип е), VLFW2 (тип а), VLFW2 (тип b), VLFW2 (тип с), VLFW3 (тип а), VLFW3 (тип b), VLFW3 (тип с), VLFW3 (тип d), или VLFW4, или любую их комбинацию, например, комбинацию каркасных областей, описанных в изобретении) для любого из антител BAP049-hum01, BAP049hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-humO7, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10, BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, ВАР049-клон-А, ВАР049-клон-В, ВАР049-клон-С, BAP049клон-D или ВАР049-клон-Е, как указано в табл. 1 и 2, и последовательность, по существу идентичную указанным последовательностям. Например, молекула нуклеиновой кислоты может содержать нуклеотидную последовательность, приведенную в табл. 1 и 2, или последовательность, которая по существу идентична ей (например, последовательность, идентичную по меньшей мере на 85, 90, 95, 99% и больше %, или отличающуюся от последовательностей из табл. 1 и 2 не более чем на 3, 6, 15, 30 или 45 нуклеотидов).In another embodiment, the nucleic acid molecule includes one or more light chain framework regions (e.g., any of VLFW1 (type a), VLFW1 (type b), VLFW1 (type c), VLFW1 (type d), VLFW1 (type e), VLFW2 (type a), VLFW2 (type b), VLFW2 (type c), VLFW3 (type a), VLFW3 (type b), VLFW3 (type c), VLFW3 (type d), or VLFW4, or any combination thereof, for example, a combination of framework regions described in the invention) for any of the antibodies BAP049-hum01, BAP049hum02, BAP049-hum03, BAP049-hum04, BAP049-hum05, BAP049-hum06, BAP049-humO7, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10 , BAP049-hum11, BAP049-hum12, BAP049-hum13, BAP049hum14, BAP049-hum15, BAP049-hum16, BAP049-clone-A, BAP049-clone-B, BAP049-clone-C, BAP049-clone-D or BAP049-clone-E, as indicated in table. 1 and 2, and a sequence substantially identical to said sequences. For example, a nucleic acid molecule may contain the nucleotide sequence shown in table. 1 and 2, or a sequence that is essentially identical to it (for example, a sequence that is at least 85, 90, 95, 99% or more% identical, or differs from the sequences from Tables 1 and 2 by no more than 3, 6, 15, 30 or 45 nucleotides).
В другом варианте осуществления молекула нуклеиновой кислоты включает одну или несколько каркасных областей тяжелой цепи и одну или несколько каркасных областей легкой цепи, описанных в настоящем изобретении. Каркасные области тяжелой и легкой цепи могут находиться в одном и том же векторе или в разных векторах.In another embodiment, the nucleic acid molecule includes one or more heavy chain framework regions and one or more light chain framework regions described in the present invention. The heavy and light chain framework regions may be in the same vector or in different vectors.
В другом аспекте настоящая заявка относится к клеткам-хозяевам и векторам, несущим нуклеиновые кислоты, описанные в настоящей заявке. Нуклеиновые кислоты могут находиться в одном и том же векторе или в разных векторах, присутствующих в одной и той же клетке-хозяине или в разных клеткаххозяевах. Клетка-хозяин может представлять собой эукариотическую клетку, например, клетку млекопитающего, клетку насекомого, дрожжевую клету или прокариотическую клетку, например, E.coli. Например, клетка млекопитающего может быть культивируемой клетки или клеточной линией. Примеры клеток млекопитающих включают лимфоцитарный клеточные линии (например, NSO), клетки яичника китайского хомяка (СНО), клетки COS, клетки - ооциты и клетки от трансгенного животного, например,In another aspect, the present application relates to host cells and vectors carrying the nucleic acids described herein. The nucleic acids may be in the same vector or in different vectors present in the same host cell or in different host cells. The host cell may be a eukaryotic cell, such as a mammalian cell, an insect cell, a yeast cell, or a prokaryotic cell, such as E. coli. For example, the mammalian cell may be a cultured cell or a cell line. Examples of mammalian cells include lymphocytic cell lines (eg, NSO), Chinese hamster ovary (CHO) cells, COS cells, oocyte cells, and cells from a transgenic animal, e.g.
- 18 045940 эпителиальные клетки млекопитающих.- 18 045940 mammalian epithelial cells.
В одном из аспектов настоящее изобретение относится к способу получения молекулы антитела по изобретению. Этот способ включает следующее: получение PD-1 - антигена (например, антигена, содержащего по меньшей мере часть эпитопа PD-1); получение молекулы антитела, которое специфично связывается с полипептидом PD-1; и определение факта специфичного связывания молекулы антитела с полипептидом PD-1, или оценку эффективности действия молекулы антитела на модуляцию, например, на ингибирование активности PD-1. Указанный способ может дополнительно включать введение молекулы антитела субъекту, например, человеку или животному не человеческого происхождения.In one aspect, the present invention relates to a method for producing an antibody molecule of the invention. This method includes the following: obtaining a PD-1 antigen (eg, an antigen containing at least a portion of a PD-1 epitope); providing an antibody molecule that specifically binds to a PD-1 polypeptide; and determining whether the antibody molecule specifically binds to the PD-1 polypeptide, or assessing the effectiveness of the antibody molecule to modulate, for example, inhibit PD-1 activity. The method may further include administering the antibody molecule to a subject, such as a human or non-human animal.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к композициям, например, фармацевтическим композициям, которые включают фармацевтически приемлемый носитель, наполнитель или стабилизатор, и, по меньшей мере, одну из молекул антитела против PD-1 по изобретению. В одном варианте осуществления композиция, например, фармацевтическая композиция, включает комбинацию молекулы антитела, и одно или несколько веществ, например, терапевтическое средство или молекулу другого антитела, согласно изобретению. В одном варианте осуществления молекула антитела конъюгирована с меткой или терапевтическим средством.In another aspect, the present invention relates to compositions, for example, pharmaceutical compositions, which include a pharmaceutically acceptable carrier, excipient or stabilizer, and at least one of the anti-PD-1 antibody molecules of the invention. In one embodiment, the composition, for example, a pharmaceutical composition, includes a combination of an antibody molecule, and one or more substances, for example, a therapeutic agent or another antibody molecule, according to the invention. In one embodiment, the antibody molecule is conjugated to a label or therapeutic agent.
Молекулы антитела против PD-1 по изобретению могут ингибировать, снижать или нейтрализовать одно или несколько из действия PD-1, что приводит к блокаде или уменьшению иммунной контрольной точки. В одном варианте осуществления молекула антитела вызывает один или несколько из следующих эффектов: увеличение инфильтрации опухоли лимфоцитами, увеличение опосредуемой Т-клеточным рецептором пролиферации, уменьшение ускользания раковых клеток от иммунологического надзора, восстановление функции эффекторных клеток (например, одного или нескольких из следующих действий: Т-клеточная пролиферация, секреция IFN-гамма или цитолитическая функция), подавление регуляторной функции Т-клеток или действие на активность различных типов клеток, таких как регуляторные Т-клетки, эффекторные Т-клетки и NK-клетки). Таким образом, эти молекулы антитела могут быть использованы для лечения или профилактики болезней, при которых желательно усилить иммунный ответ у субъекта.The anti-PD-1 antibody molecules of the invention can inhibit, reduce or neutralize one or more of the actions of PD-1, resulting in blockade or reduction of the immune checkpoint. In one embodiment, the antibody molecule causes one or more of the following effects: increased tumor infiltration by lymphocytes, increased T-cell receptor-mediated proliferation, decreased immune evasion of cancer cells, restoration of effector cell function (e.g., one or more of the following: T -cell proliferation, IFN-gamma secretion or cytolytic function), suppression of regulatory T cell function or effects on the activity of various cell types such as regulatory T cells, effector T cells and NK cells). Thus, these antibody molecules can be used to treat or prevent diseases in which it is desirable to enhance the immune response in a subject.
Применения молекул антител против PD-1.Applications of anti-PD-1 antibody molecules.
Соответственно, в другом аспекте изобретение относится к способу модуляции иммунного ответа у субъекта. Способ включает введение субъекту молекулы антитела против PD-1, описанной в изобретении (например, терапевтически эффективного количества молекулы антитела против PD-1), в виде единственного препарата, или в комбинации с одним или несколькими веществами или процедурами, таким образом, что происходит модуляция иммунного ответа у субъекта. В одном варианте осуществления молекула антитела усиливает, стимулирует или повышает иммунный ответ у субъекта. Субъектом может быть млекопитающее, например, примат, предпочтительно высший примат, например, человек (например, пациент, страдающий заболеванием или имеющий риск возникновения заболевания, описанного в изобретении). В одном варианте осуществления субъект нуждается в усилении иммунного ответа.Accordingly, in another aspect, the invention relates to a method of modulating an immune response in a subject. The method includes administering to a subject an anti-PD-1 antibody molecule described in the invention (e.g., a therapeutically effective amount of an anti-PD-1 antibody molecule), as a single formulation, or in combination with one or more substances or procedures, such that modulation occurs immune response in the subject. In one embodiment, the antibody molecule enhances, stimulates, or enhances the immune response in a subject. The subject may be a mammal, such as a primate, preferably a great ape, such as a human (eg, a patient suffering from or at risk of developing a disease described in the invention). In one embodiment, the subject requires an enhanced immune response.
В одном варианте осуществления субъект страдает заболеванием или имеет риск возникновения заболевания, упомянутого в изобретении, такого как рак или инфекционное заболевание, упомянутое в изобретении. В некоторых вариантах осуществления субъект страдает иммунодефицитом или имеет риск возникновения иммунодефицита. Например, субъект проходит или предварительно прошел химиотерапевтическое лечение и/или лучевую терапию. Альтернативно или в комбинации, субъект имеет иммунодефицит или риск возникновения иммунодефицита в результате инфекции.In one embodiment, the subject suffers from or is at risk of developing a disease mentioned in the invention, such as cancer or an infectious disease mentioned in the invention. In some embodiments, the subject is immunocompromised or is at risk for immunodeficiency. For example, the subject is undergoing or has previously undergone chemotherapy treatment and/or radiation therapy. Alternatively or in combination, the subject has an immunodeficiency or is at risk of developing an immunodeficiency as a result of an infection.
В одном аспекте изобретение относится к способу лечения рака или опухоли у субъекта (например, к одному или нескольким из следующих эффектов: снижение, ингибирование или замедление прогрессирования). Способ содержит введение субъекту молекулы антитела против PD-1 по изобретению, например, терапевтически эффективного количества молекулы антитела против PD-1, по в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими веществами или процедурами. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с модулятором костимулирующей молекулы (например, с агонистом костимулирующей молекулы) или модулятором ингибирующей молекулы (например, с ингибитором ингибитора иммунной контрольной точки), например, согласно настоящему изобретению.In one aspect, the invention relates to a method of treating cancer or a tumor in a subject (eg, one or more of the following effects: reducing, inhibiting or slowing progression). The method comprises administering to a subject an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, for example, a therapeutically effective amount of an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with one or more substances or procedures. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a costimulatory molecule modulator (eg, a costimulatory molecule agonist) or an inhibitory molecule modulator (eg, an immune checkpoint inhibitor inhibitor), for example, according to the present invention.
В некоторых вариантах осуществления рак, который лечится молекулой антитела против PD-1, включает без ограничения солидные опухоли, гематологическое раковое заболевание (например, лейкоз, лимфому, миелому, например, множественную миелому) и метастатическое поражение. В одном варианте осуществления рак представляет собой солидную опухоль. Примеры солидных опухолей включают злокачественные опухоли, например, саркомы и карциномы, например, аденокарциномы различных органов и систем, такие, как опухоли, поражающие легкие, молочные железы, яичники, лимфоидную ткань, желудочно-кишечный тракт (например, толстую кишку), анальные, генитальные и мочеполовые пути (например, почки, уротелий, клетки мочевого пузыря, предстательную железу), глотку, ЦНС (например, головной мозг, нервные или глиальные клетки), опухоли головы и шеи, кожи (например, меланома) и поджелудочной железы, а также аденокарциномы, которые включают злокачественные опухоли, такие как рак толстой кишки, рак прямой кишки, почечно-клеточную карциному, рак печени, немелкоIn some embodiments, the cancer that is treated with the anti-PD-1 antibody molecule includes, but is not limited to, solid tumors, hematologic cancers (eg, leukemia, lymphoma, myeloma, eg, multiple myeloma), and metastatic disease. In one embodiment, the cancer is a solid tumor. Examples of solid tumors include malignant tumors, such as sarcomas and carcinomas, such as adenocarcinomas of various organs and systems, such as tumors affecting the lungs, breasts, ovaries, lymphoid tissue, gastrointestinal tract (eg, colon), anal, genital and genitourinary tract (eg, kidney, urothelium, bladder cells, prostate), pharynx, central nervous system (eg, brain, nerve or glial cells), tumors of the head and neck, skin (eg, melanoma), and pancreas, and also adenocarcinomas, which include malignant tumors such as colon cancer, rectal cancer, renal cell carcinoma, liver cancer, non-small
- 19 045940 клеточный рак легкого, рак тонкой кишки и рак пищевода. Рак может быть на ранней, промежуточной, поздней стадии или представлять собой метастатический рак.- 19 045940 cell lung cancer, small intestine cancer and esophageal cancer. The cancer may be early, intermediate, advanced, or metastatic.
В одном варианте осуществления рак выбран из следующего: рак легкого (например, немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) (например, NSCLC плоскоклеточного гистологического типа и/или неплоскоклеточного гистологического типа или NSCLC аденокарцинома)), меланома (например, прогрессирующая меланома), рак почки (например, почечно-клеточный рак), рак печени, миелома (например, множественная миелома), рак предстательной железы, рак молочной железы (например, рак молочной железы, при котором отсутствует экспрессия одного, двух или всех эстрогеновых рецепторов, прогестероновых рецепторов или HER2/neu, например, тройной отрицательный рак молочной железы), колоректальный рак, рак поджелудочной железы, рак головы и шеи (например, (HNSCC), анальный рак, гастроэзофагальный рак, рак щитовидной железы, рак шейки матки, лимфопролиферативная болезнь (например, посттрансплантационная лимфопролиферативная болезнь) или гематологический рак, Т-клеточная лимфома, В-клеточная лимфома, неходжкинская лимфома или лейкоз (например, миелолейкоз или лимфолейкоз).In one embodiment, the cancer is selected from the following: lung cancer (eg, non-small cell lung cancer (NSCLC) (eg, NSCLC squamous histological type and/or non-squamous histological type or NSCLC adenocarcinoma)), melanoma (eg, advanced melanoma), kidney cancer ( eg, renal cell carcinoma), liver cancer, myeloma (eg, multiple myeloma), prostate cancer, breast cancer (eg, breast cancer that lacks expression of one, two, or all of the estrogen receptors, progesterone receptors, or HER2/ neu, eg, triple negative breast cancer), colorectal cancer, pancreatic cancer, head and neck cancer (eg, (HNSCC), anal cancer, gastroesophageal cancer, thyroid cancer, cervical cancer, lymphoproliferative disease (eg, post-transplant lymphoproliferative disease) or hematologic cancer, T-cell lymphoma, B-cell lymphoma, non-Hodgkin's lymphoma, or leukemia (eg, myeloid leukemia or lymphocytic leukemia).
В другом варианте осуществления рак выбран из карциномы (например, прогрессирующей или метастатической карциномы), меланомы или карциномы легкого, например, немелкоклеточной карциномы легкого.In another embodiment, the cancer is selected from carcinoma (eg, advanced or metastatic carcinoma), melanoma, or lung carcinoma, eg, non-small cell lung carcinoma.
В одном варианте осуществления рак представляет собой рак легкого, например, немелкоклеточный рак легкого или мелкоклеточный рак легкого.In one embodiment, the cancer is a lung cancer, such as non-small cell lung cancer or small cell lung cancer.
В одном варианте осуществления рак представляет собой меланому, например, прогрессирующую меланому. В одном варианте осуществления рак представляет собой прогрессирующую или неоперабельную меланому, которая не реагирует на другие виды лечения. В других вариантах осуществления рак представляет собой меланому с мутацией BRAF (например, с мутацией BRAF V600). В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят после лечения антителом против CTLA4 (например, ипилимумаб) с ингибитором BRAF (например, вемурафениб или дабрафениб) или без такого ингибитора.In one embodiment, the cancer is melanoma, for example, advanced melanoma. In one embodiment, the cancer is an advanced or inoperable melanoma that does not respond to other treatments. In other embodiments, the cancer is BRAF mutation melanoma (eg, BRAF V600 mutation). In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered following treatment with an anti-CTLA4 antibody (eg, ipilimumab) with or without a BRAF inhibitor (eg, vemurafenib or dabrafenib).
В другом варианте осуществления рак представляет собой гепатокарциному, например, прогрессирующую гепатокарциному, сопровождающуюся вирусной инфекцией, например, хроническим вирусным гепатитом, или без вирусной инфекции.In another embodiment, the cancer is a hepatocarcinoma, such as advanced hepatocarcinoma, with or without viral infection, such as chronic viral hepatitis.
В другом варианте осуществления рак представляет собой рак предстательной железы, например, прогрессирующий рак предстательной железы.In another embodiment, the cancer is prostate cancer, such as advanced prostate cancer.
Еще в одном варианте осуществления рак представляет собой миелому, например, множественную миелому.In yet another embodiment, the cancer is myeloma, such as multiple myeloma.
Еще в одном варианте осуществления рак представляет собой рак почки, например, почечноклеточный рак (RCC) (например, метастатический RCC или светлоклеточную почечно-клеточную карциному (CCRCC)).In yet another embodiment, the cancer is a kidney cancer, such as renal cell carcinoma (RCC) (eg, metastatic RCC or clear cell renal cell carcinoma (CCRCC)).
В одном варианте осуществления в раковой микросреде существует повышенный уровень экспрессии PD-L1. Альтернативно, или в комбинации, в раковой микросреде может быть повышенный уровень экспрессии IFN-гамма и/или CD8.In one embodiment, there is an increased level of PD-L1 expression in the cancer microenvironment. Alternatively, or in combination, there may be increased expression levels of IFN-gamma and/or CD8 in the cancer microenvironment.
В некоторых вариантах осуществления субъект имеет опухоль, или идентифицирован как имеющий опухоль, в которой выявлено одно или несколько свойств, таких как высокой уровень PD-L1 или повышенная экспрессия PD-L1, или эта опухоль является проницаемой для лимфоцитов (TIL)+ (например, в ней имеется повышенное количество проникающих в опухоль лимфоцитов (TIL)), или оба этих свойства. В некоторых вариантах осуществления субъект имеет опухоль, или идентифицирован как имеющий опухоль, в которой выявлен высокий уровень PD-L1 или повышенная экспрессия PD-L1, и которая представляет собой TIL+ опухоль. В некоторых вариантах осуществления способы, описанные в изобретении, дополнительно включают идентификацию субъекта, основанную на наличии у него опухоли, в которой выявлено одно или несколько свойств, таких как высокой уровень PD-L1 или повышенная экспрессия PD-L1, или эта опухоль является TIL+, или оба этих свойства. В некоторых вариантах осуществления способы, описанные в изобретении, дополнительно включают идентификацию субъекта, основанную на наличии у него опухоли, в которой выявлено одно или несколько свойств, таких как высокой уровень PD-L1 или повышенная экспрессия PD-L1, или эта опухоль является TIL+. В некоторых вариантах осуществления опухоли, которые представляют собой TIL+ опухоли, являются положительными на наличие CD8 и IFN-гамма. В некоторых вариантах осуществления субъект имеет, или идентифицирован как имеющий высокий процент клеток, которые положительны на наличие одного, двух или более двух из PD-L1, CD8 и/или IFN-гамма. В некоторых вариантах осуществления субъект имеет или идентифицирован как имеющий высокий процент клеток, которые являются положительными на наличие всех из PD-L1, CD8 и IFN-гамма.In some embodiments, the subject has a tumor, or is identified as having a tumor that exhibits one or more properties, such as high levels of PD-L1 or increased expression of PD-L1, or the tumor is leaky lymphocyte (TIL)+ (e.g., it has an increased number of tumor-infiltrating lymphocytes (TILs)), or both. In some embodiments, the subject has a tumor, or is identified as having a tumor, that exhibits high levels of PD-L1 or increased expression of PD-L1 and is a TIL+ tumor. In some embodiments, the methods described in the invention further include identifying the subject based on whether the subject has a tumor that exhibits one or more properties, such as high levels of PD-L1 or increased expression of PD-L1, or the tumor is TIL+, or both of these properties. In some embodiments, the methods described in the invention further include identifying a subject based on whether the subject has a tumor that exhibits one or more properties, such as high levels of PD-L1 or increased expression of PD-L1, or the tumor is TIL+. In some embodiments, tumors that are TIL+ tumors are positive for CD8 and IFN-gamma. In some embodiments, the subject has, or is identified as having, a high percentage of cells that are positive for the presence of one, two, or more than two of PD-L1, CD8, and/or IFN-gamma. In some embodiments, the subject has or is identified as having a high percentage of cells that are positive for all of PD-L1, CD8, and IFN-gamma.
В некоторых вариантах осуществления способы, описанные в изобретении, дополнительно включают идентификацию субъекта, основанную на наличии высокого процента клеток, которые положительны на один, два или более двух из PD-L1, CD8 и/или IFN-гамма. В некоторых вариантах осуществления способы, описанные в изобретении, дополнительно включают идентификацию субъекта, основанIn some embodiments, the methods described in the invention further include identifying a subject based on the presence of a high percentage of cells that are positive for one, two, or more than two of PD-L1, CD8, and/or IFN-gamma. In some embodiments, the methods described in the invention further include identifying the subject based on
- 20 045940 ную на наличии высокого процента клеток, которые являются положительными для всех из PD-L1, CD8 и IFN-гамма. В некоторых вариантах осуществления у субъекта выявлено, или субъект идентифицирован как имеющий одно, два или более двух из PD-L1, CD8 и/или IFN-гамма, и одну или несколько патологий, таких как рак легкого, например, плоскоклеточный рак легкого или аденокарцинома легкого, рак головы и шеи, плоскоклеточный рак шейки матки, рак желудка, рак пищевода, рак щитовидной железы, меланома, и/или рак носоглотки (NPC). В некоторых вариантах осуществления способы, описанные в изобретении, дополнительно описывают идентификацию субъекта, основанную на наличии у него одного, двух или более двух из PD-L1, CD8 и/или IFN-гамма, и одной или нескольких патологий, таких как рак легкого, например, плоскоклеточный рак легкого или аденокарцинома легкого, рак головы и шеи, плоскоклеточный рак шейки матки, рак желудка, рак щитовидной железы, меланома и/или рак носоглотки.- 20 045940 evidenced by the presence of a high percentage of cells that are positive for all of PD-L1, CD8 and IFN-gamma. In some embodiments, the subject is detected, or the subject is identified as having one, two, or more than two of PD-L1, CD8, and/or IFN-gamma, and one or more pathologies, such as lung cancer, such as squamous cell lung cancer or adenocarcinoma lung, head and neck cancer, squamous cell carcinoma of the cervix, stomach cancer, esophageal cancer, thyroid cancer, melanoma, and/or nasopharyngeal cancer (NPC). In some embodiments, the methods described in the invention further describe identifying a subject based on the presence of one, two, or more than two of PD-L1, CD8, and/or IFN-gamma, and one or more pathologies, such as lung cancer, for example, squamous cell lung cancer or lung adenocarcinoma, head and neck cancer, squamous cell carcinoma of the cervix, gastric cancer, thyroid cancer, melanoma and/or nasopharyngeal cancer.
Способы и композиции, раскрытые в изобретении, являются полезными для лечения метастатических поражений, обусловленных вышеупомянутыми видами рака.The methods and compositions disclosed herein are useful for the treatment of metastatic lesions caused by the above-mentioned types of cancer.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения инфекционного заболевания у субъекта, и указанный способ содержит введение субъекту терапевтически эффективного количества молекулы антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими веществами или процедурами. В одном варианте осуществления инфекционное заболевание выбрано из гепатита (например, инфекционного гепатита С) или сепсиса.In another aspect, the present invention provides a method of treating an infectious disease in a subject, which method comprises administering to the subject a therapeutically effective amount of an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more agents or procedures. In one embodiment, the infectious disease is selected from hepatitis (eg, infectious hepatitis C) or sepsis.
Кроме того, настоящее изобретение относится к способу усиления у субъекта иммунного ответа на антиген, и указанный способ содержит введение субъекту: (I) антигена, и (II) молекулы антитела против PD-1, таким образом, что у субъекта происходит усиление иммунного ответа на антиген. Антиген может представлять собой, например, опухолевый антиген, вирусный антиген, бактериальный антиген или антиген из патогена.Furthermore, the present invention provides a method of enhancing a subject's immune response to an antigen, which method comprises administering to the subject: (I) an antigen, and (II) an anti-PD-1 antibody molecule such that the subject's immune response to an antigen is enhanced. antigen. The antigen may be, for example, a tumor antigen, a viral antigen, a bacterial antigen, or an antigen from a pathogen.
Путь введения субъекту молекулы антитела против PD-1 может быть системным (например, пероральным, парентеральным, подкожным, внутривенным, ректальным, внутримышечным, внутрибрюшинным, интраназальным, трансдермальным или ингаляционным или быть в виде внутриполостной установки), местным или в виде нанесения на слизистые оболочки, например, слизистые носа, горла и бронхов.The route of administration of the anti-PD-1 antibody molecule to a subject may be systemic (e.g., oral, parenteral, subcutaneous, intravenous, rectal, intramuscular, intraperitoneal, intranasal, transdermal, or inhalational or intracavitary), topical, or mucosal. , for example, mucous membranes of the nose, throat and bronchi.
Дозы и схемы введения молекулы антитела против PD-1 могут быть определены специалистом в данной области. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят путем инъекции (например, подкожно или внутривенно) в дозе приблизительно от 1 до 30 мг/кг, например, приблизительно от 5 до 25 мг/кг, приблизительно от 10 до 20 мг/кг, приблизительно от 1 до 5 мг/кг или приблизительно 3 мг/кг. Схема введения может варьироваться, например, от введения один раза в неделю до одного раза каждые 2, 3 или 4 недели. В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе приблизительно от 10 до 20 мг/кг каждые две недели.Dosages and schedules of administration of the anti-PD-1 antibody molecule can be determined by one skilled in the art. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered by injection (e.g., subcutaneously or intravenously) at a dose of about 1 to 30 mg/kg, e.g., about 5 to 25 mg/kg, about 10 to 20 mg/kg , about 1 to 5 mg/kg or about 3 mg/kg. The schedule of administration may vary, for example, from once a week to once every 2, 3 or 4 weeks. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered at a dose of approximately 10 to 20 mg/kg every two weeks.
Описанные в изобретении молекулы антитела являются предпочтительными для использования в способах, описанных в изобретении, хотя возможно использование и других антител против PD-1 вместо или в комбинации с молекулой антитела против PD-1 по изобретению.The antibody molecules described herein are preferred for use in the methods described herein, although other anti-PD-1 antibodies may be used instead of or in combination with the anti-PD-1 antibody molecule of the invention.
Комбинированная терапия.Combination therapy.
Способы и композиции, описанные в изобретении, могут быть использованы в комбинации с другими веществами или терапевтическими методиками. В одном варианте осуществления описанные в изобретении способы включают введение субъекту молекулы антитела против PD-1 по изобретению, в комбинации с веществом или терапевтической процедурой или методикой, в количестве, эффективном для лечения или профилактики заболевания. Молекулу антитела против PD-1-антитело и вещество, или терапевтическую процедуру или методику можно назначать одновременно или последовательно в любом порядке. Можно применять любую комбинацию и последовательность молекул антител против PD-1 и других терапевтических средств, процедур или методик (например, описанных в изобретении). Молекулу антитела и/или другие терапевтические средства, процедуры и методики можно применять в течение периода активности заболевания, или в течение периода ремиссии или снижения активности заболевания. Молекулу антитела можно вводить перед другим лечением, одновременно с другим лечением, после лечения или во время ремиссии заболевания.The methods and compositions described in the invention may be used in combination with other substances or therapeutic techniques. In one embodiment, the methods described herein include administering to a subject an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, in combination with a substance or therapeutic procedure or technique, in an amount effective to treat or prevent a disease. The anti-PD-1 antibody molecule and agent, or therapeutic procedure or technique, can be administered simultaneously or sequentially in any order. Any combination and sequence of anti-PD-1 antibody molecules and other therapeutic agents, procedures or techniques (eg, those described in the invention) can be used. The antibody molecule and/or other therapeutic agents, procedures and techniques can be used during a period of disease activity, or during a period of remission or decreased disease activity. The antibody molecule can be administered before another treatment, simultaneously with another treatment, after treatment, or during remission of the disease.
В некоторых вариантах осуществления способы и композиции, описанные в изобретении, применяют в комбинации с одним или несколькими методиками, такими как введение молекул других антител, химиотерапия, другая противоопухолевая терапия (например, противоопухолевые препараты направленного действия, генная терапия, вирусная терапия, РНК-терапия, трансплантация костного мозга, нанотерапия или онколитические лекарственные средства), цитотоксические вещества, иммунные препараты (например, цитокины или иммунные препараты на клеточной основе), хирургические вмешательства (например, люмпэктомия или мастэктомия) или процедуры лучевой терапии, или комбинацией любых из вышеперечисленных методик. Дополнительные виды лечения могут быть в виде адъювантного или неоадъювантного средства. В некоторых вариантах осуществления дополнительный препарат представляет собой ферментативный ингибитор (например, ферментативный ингибитор на основе малой молекулы) или метастатический ингибитор. Примеры цитотоксических веществ, которые могут быть введены в комбинации, включают антимикротрубочковые вещества, ингибиторы топоизомеразы, антиметаболиты,In some embodiments, the methods and compositions described in the invention are used in combination with one or more techniques, such as administration of other antibody molecules, chemotherapy, other anticancer therapies (e.g., targeted anticancer drugs, gene therapy, viral therapy, RNA therapy , bone marrow transplantation, nanotherapy or oncolytic drugs), cytotoxic agents, immune drugs (eg, cytokines or cell-based immune drugs), surgery (eg, lumpectomy or mastectomy) or radiation therapy procedures, or a combination of any of the above. Additional treatments may be in the form of an adjuvant or neoadjuvant agent. In some embodiments, the additional drug is an enzyme inhibitor (eg, a small molecule enzyme inhibitor) or a metastatic inhibitor. Examples of cytotoxic agents that may be administered in combination include antimicrotubule agents, topoisomerase inhibitors, antimetabolites,
- 21 045940 ингибиторы митоза, алкилирующие вещества, антрациклины, алкалоиды барвинка, интеркалирующие вещества, вещества, способные нарушать пути трансдукции сигнала, вещества, стимулирующие апоптоз, ингибиторы протеосом, а также облучение (например, местное облучение или полное облучение всего тела (например, гамма-облучение). В других вариантах осуществления дополнительным видом лечения является хирургическое вмешательство или облучение, или их комбинация. В других вариантах осуществления дополнительным видом лечения является терапия, нацеленная на одну или несколько мишеней, таких как путь PI3K/AKT/mTOR, ингибитор HSP90 или ингибитор тубулина.- 21 045940 mitosis inhibitors, alkylating agents, anthracyclines, vinca alkaloids, intercalating agents, substances capable of disrupting signal transduction pathways, substances that stimulate apoptosis, proteasome inhibitors, as well as irradiation (for example, local irradiation or total body irradiation (for example, gamma -irradiation).In other embodiments, the additional treatment is surgery or radiation, or a combination thereof. In other embodiments, the additional treatment is a therapy targeting one or more targets, such as the PI3K/AKT/mTOR pathway, an HSP90 inhibitor, or tubulin inhibitor.
В качестве альтернативы, или в сочетании с вышеуказанными комбинациями, способы и композиции по изобретению могут применяться в комбинации с одним или несколькими из следующего: иммуномодулятор (например, активатор костимулирующей молекулы или ингибитор ингибирующей молекулы, например, молекулы иммунной контрольной точки), вакцина, например, терапевтическая противоопухолевая вакцина, или другие формы клеточной иммунотерапии.Alternatively, or in combination with the above combinations, the methods and compositions of the invention may be used in combination with one or more of the following: an immunomodulator (e.g., a co-stimulatory molecule activator or an inhibitor of an inhibitory molecule, e.g., an immune checkpoint molecule), a vaccine, e.g. , a therapeutic tumor vaccine, or other forms of cellular immunotherapy.
Приведенные в качестве примера неограничивающие комбинации и применения молекул антител против PD-1 включают следующее.Exemplary, non-limiting combinations and uses of anti-PD-1 antibody molecules include the following.
В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с модулятором костимулирующей молекулы или ингибирующей молекулы, например, с коингибирующим лигандом или рецептором.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a co-stimulatory molecule or inhibitory molecule modulator, such as a coinhibitory ligand or receptor.
В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с модулятором, например, агонистом костимулирующей молекулы. В одном варианте осуществления агонист костимулирующей молекулы выбран из агониста (например, агонистического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, или способного к растворению слияния), такого как ОХ40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1 ВВ (CD137), GITR, CD30, CD40, BAPFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3 или лиганда CD83.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a modulator, such as a costimulatory molecule agonist. In one embodiment, the agonist of the co-stimulatory molecule is selected from an agonist (e.g., an agonist antibody or antigen-binding fragment or solubilizing fusion thereof) such as OX40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1 BB (CD137), GITR, CD30, CD40, BAPFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3 or CD83 ligand.
В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором ингибирующей молекулы (или молекулы иммунной контрольной точки), выбранной из PD-L1, PDL2, CTLA-4, TIM-3, LAG-3, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3, и/или СЕАСАМ-5), VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2В4 и/или TGFR-бета. Ингибирование ингибирующей молекулы может осуществляться путем ингибирования на уровне ДНК, РНК или белка. В вариантах осуществления можно использовать ингибирующую нуклеиновую кислоту (например, dsPHK (двухцепочечную РНК), siPHK (малую интерферирующую РНК) или shPHK (короткую шпилечную РНК)) для ингибирования экспрессии ингибирующей молекулы. В других вариантах осуществления ингибитор ингибирующего сигнала представляет собой полипептид, например, растворимый лиганд, или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, который связывается с ингибирующей молекулой. В одном варианте осуществления ингибитор представляет собой растворимый лиганд (например, CTLA-4-Ig) или антитело или фрагмент антитела, которые связываются с PD-L1, PD-L2 или CTLA-4. Например, молекулу антитела против PD-1 можно вводить в комбинации с антителом против CTLA-4, например, с препаратом ипилимумаб, например, для лечения рака (например, рака, выбранного из: меланомы, например, метастатической меланомы, рака легкого, например, немелкоклеточной карциномы легкого, или рака предстательной железы). В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят после лечения антителом против CTLA-4 (таким как ипилимумаб) с ингибитором BRAF (таким как вемурафениб (vemurafenib) или дабрафениб (dabrafenib) или без указанного ингибитора.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an inhibitory molecule (or immune checkpoint molecule) selected from PD-L1, PDL2, CTLA-4, TIM-3, LAG-3, SEACAM (e.g., SEACAM -1, SEACAM-3, and/or SEACAM-5), VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 and/or TGFR-beta. Inhibition of an inhibitory molecule can be accomplished by inhibition at the DNA, RNA or protein level. In embodiments, an inhibitory nucleic acid (eg, dsRNA, siRNA, or shRNA) may be used to inhibit expression of the inhibitory molecule. In other embodiments, an inhibitory signal inhibitor is a polypeptide, such as a soluble ligand, or an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to an inhibitory molecule. In one embodiment, the inhibitor is a soluble ligand (eg, CTLA-4-Ig) or antibody or antibody fragment that binds PD-L1, PD-L2, or CTLA-4. For example, an anti-PD-1 antibody molecule may be administered in combination with an anti-CTLA-4 antibody, e.g., the drug ipilimumab, e.g., for the treatment of cancer (e.g., cancer selected from: melanoma, e.g., metastatic melanoma, lung cancer, e.g. non-small cell lung carcinoma or prostate cancer). In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered following treatment with an anti-CTLA-4 antibody (such as ipilimumab) with or without a BRAF inhibitor (such as vemurafenib or dabrafenib).
В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с антителом против LAG-3 или его антигенсвязывающим фрагментом.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an anti-LAG-3 antibody or an antigen-binding fragment thereof.
В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с антителом против TIM-3 или его антигенсвязывающим фрагментом.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an anti-TIM-3 antibody or an antigen-binding fragment thereof.
В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с антителом против LAG-3 и антителом против TIM-3 (или их антигенсвязывающими фрагментами).In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an anti-LAG-3 antibody and an anti-TIM-3 antibody (or antigen-binding fragments thereof).
В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором СЕАСАМ (например, ингибитором СЕАСАМ-1 и/или СЕАСАМ-5), например, с молекулой антитела против СЕАСАМ. В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором СЕАСАМ-1, например, молекулой антитела против СЕАСАМ-1. В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором СЕАСАМ-5, например, с молекулой антитела против СЕАСАМ-5.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a SEACAM inhibitor (eg, a SEACAM-1 and/or SEACAM-5 inhibitor), for example, an anti-CEACAM antibody molecule. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a CEACAM-1 inhibitor, for example, an anti-CEACAM-1 antibody molecule. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a CEACAM-5 inhibitor, for example, an anti-CEACAM-5 antibody molecule.
Комбинация антител, упомянутых в изобретении, может быть введена раздельно, например, в виде отдельных антител или их антигенсвязывающих фрагментов, или в соединенном виде, например, в виде молекулы биспецифичного или триспецифичного антитела. В одном варианте осуществления вводят биспецифичное антитело, которое включает молекулу антитела против PD-1 и антитело против TIM-3, против СЕАСАМ (например, антитело против СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 и/или против СЕАСАМ-5) или антитело против LAG-3 или антигенсвязывающие фрагменты указанных антител. В некоторых вариантах осуществления комбинация антител, упомянутых в изобретении, применяется для лечения рака, например, рака, указанного в изобретении (например, солидной опухоли или гематологического злокачественного заболевания).The combination of antibodies mentioned in the invention can be administered separately, for example, in the form of individual antibodies or antigen-binding fragments thereof, or in combined form, for example, in the form of a bispecific or trispecific antibody molecule. In one embodiment, a bispecific antibody is administered that includes an anti-PD-1 antibody molecule and an anti-TIM-3 antibody, an anti-SEACAM antibody (e.g., an anti-SEACAM-1, an anti-SEACAM-3, and/or an anti-SEACAM-5 antibody), or an anti-LAG- 3 or antigen-binding fragments of these antibodies. In some embodiments, a combination of antibodies mentioned in the invention is used to treat a cancer, for example, a cancer specified in the invention (eg, a solid tumor or a hematological malignancy).
- 22 045940- 22 045940
В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с цитокином. Цитокин можно вводить в виде молекулы, слитой с молекулой антитела против PD-1, или в раздельных композициях. В одном варианте осуществления антитело против PD-1 вводят в комбинации с одним, двумя, тремя или несколькими цитокинами, например, в виде слитой молекулы или в виде раздельных композиций. В одном варианте осуществления цитокин представляет собой интерлейкин (IL), выбранный из одного, двух, трех или нескольких интерлейкинов из IL-1, IL-2, IL-12, IL-15 или IL-21. В одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитело имеет первую специфичность связывания с первой мишенью (например, для PD-1), вторую специфичность связывания со второй мишенью (например, для LAG-3 или TIM-3) и, необязательно, связана с доменом интерлейкина (например, IL12), например, полноразмерного IL-12 или с его частью. В некоторых вариантах осуществления используется комбинация молекулы антитела против PD-1 и цитокина, описанного в изобретении, для лечения рака, например, рака, указанного в изобретении (например, солидной опухоли).In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a cytokine. The cytokine can be administered as a molecule fused to an anti-PD-1 antibody molecule or in separate compositions. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody is administered in combination with one, two, three or more cytokines, for example, as a fusion molecule or in separate compositions. In one embodiment, the cytokine is an interleukin (IL) selected from one, two, three, or more of the interleukins IL-1, IL-2, IL-12, IL-15, or IL-21. In one embodiment, the bispecific antibody molecule has a first binding specificity for a first target (for example, for PD-1), a second binding specificity for a second target (for example, for LAG-3 or TIM-3), and is optionally associated with an interleukin domain ( for example, IL12), for example, full-length IL-12 or with part thereof. In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody molecule and a cytokine of the invention is used to treat a cancer, such as a cancer of the invention (eg, a solid tumor).
В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с антителом, специфичным против антигена человеческих лейкоцитов С (HLA С), таким как антитело, специфичное к иммуноглобулин-подобным рецепторам клеток-киллеров (также называемое в изобретении антителом против KIR). В некоторых вариантах осуществления комбинация молекулы антитела против PD-1 и антитела против KIR используется для лечения рака, например, рака, указанного в изобретении (например, солидной опухоли, например, прогрессирующей солидной опухоли).In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an anti-human leukocyte antigen C (HLA C)-specific antibody, such as a killer cell immunoglobulin-like receptor-specific antibody (also referred to herein as an anti-KIR antibody). In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody molecule and an anti-KIR antibody is used to treat a cancer, such as a cancer of the invention (eg, a solid tumor, eg, an advanced solid tumor).
В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с клеточной иммунотерапией (например, с препаратом Провендж (Provenge®), например, Сипулейцел-Т (SipuleucelT)), и, необязательно, в комбинации с циклофосфамидом. В некоторых вариантах осуществления комбинация молекулы антитела против PD-1, препаратов Провендж® и/или циклофосфамид используется для лечения рака, например, рака, указанного в изобретении (например, рака предстательной железы, например, прогрессирующего рака предстательной железы).In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a cellular immunotherapy (eg, Provenge®, e.g., SipuleucelT), and optionally in combination with cyclophosphamide. In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody molecule, Provenge® and/or cyclophosphamide is used to treat a cancer, such as a cancer of the invention (eg, prostate cancer, eg, advanced prostate cancer).
В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с вакциной, например, противоопухолевой вакциной (например, с вакциной на основе дендритных клеток против почечной карциномы (DC-RCC). В одном варианте осуществления вакцина сделана на пептидной основе, на основе ДНК, на основе РНК или на основе антигена, или их комбинации. В некоторых вариантах осуществления вакцина содержит один или несколько пептидов, нуклеиновых кислот (например, ДНК или РНК), антигенов, или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления комбинация молекулы антитела против PD-1 и вакцины DC-RCC применяется для лечения рака, например, рака, указанного в изобретении (например, рака почки, например, метастатической почечно-клеточной карциномы (RCC) или светлоклеточной почечно-клеточной карциномы (CCRCC)).In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a vaccine, e.g., a tumor vaccine (e.g., dendritic cell renal carcinoma (DC-RCC) vaccine. In one embodiment, the vaccine is made from a peptide based DNA-based, RNA-based or antigen-based, or a combination thereof. In some embodiments, the vaccine contains one or more peptides, nucleic acids (e.g., DNA or RNA), antigens, or a combination thereof. In some embodiments, the combination of an anti-PD antibody molecule -1 and the DC-RCC vaccine are used to treat cancer, for example, the cancer specified in the invention (for example, kidney cancer, for example, metastatic renal cell carcinoma (RCC) or clear cell renal cell carcinoma (CCRCC)).
В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с адъювантом.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an adjuvant.
Еще в одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с химиотерапевтическим и/или иммунотерапевтическим средством. Например, молекулу антитела против PD-1 можно применять для лечения миеломы, в качестве единственного средства или в комбинации с одной или несколькими из следующих методик: химиотерапевтические или другие противоопухолевые средства (например, аналоги талидомида, например, леналидомид), антитела против TIM-3, опухолевый антиген - импульсные дендритные клетки, слияния (например, электрослияния) опухолевых клеток и дендритных клеток, или вакцинация с использованием идиотипа иммуноглобулина, продуцируемого злокачественными плазматическими клетками. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с антителом против TIM-3 для лечения миеломы, например, множественной миеломы.In yet another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a chemotherapeutic and/or immunotherapy agent. For example, an anti-PD-1 antibody molecule may be used to treat myeloma, either alone or in combination with one or more of the following: chemotherapeutic or other antineoplastic agents (eg, thalidomide analogues, eg, lenalidomide), anti-TIM-3 antibodies , tumor antigen - pulsed dendritic cells, fusions (eg, electrofusion) of tumor cells and dendritic cells, or vaccination using an immunoglobulin idiotype produced by malignant plasma cells. In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with an anti-TIM-3 antibody to treat myeloma, such as multiple myeloma.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 используется в комбинации с химиотерапией для лечения рака легкого, например, немелкоклеточного рака легкого. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется со стандартной легочной химиотерапией, например, применяемой при NSCLC, например, терапии дублетами препаратов платины, для лечения рака легкого. В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 используется в комбинации с ингибитором индоламин-пиррол-2,3 диоксигеназы (IDO), (например, (4Е)-4-[(3-хлор-4фторанилино)-нитрозометилиден]-1,2,5-оксадиазол-3-амин (также известный как INCB24360), индоксимод (1-метил-Э-триптофан), а-циклогексил-5Н-имидазо[5,1-а]изоиндол-5-этанол (также известный как NLG919) и т.д.) для применения у субъекта с распространенным или метастатическим раком (например, у больного метастатическим и рецидивирующим раком NSCL).In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with chemotherapy to treat lung cancer, such as non-small cell lung cancer. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used with standard pulmonary chemotherapy, such as that used for NSCLC, such as platinum doublet therapy, to treat lung cancer. In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with an indoleamine-pyrrole-2,3 dioxygenase (IDO) inhibitor (e.g., (4E)-4-[(3-chloro-4fluoroanilino)-nitrosomethylidene]-1, 2,5-Oxadiazol-3-amine (also known as INCB24360), indoximod (1-methyl-E-tryptophan), α-cyclohexyl-5H-imidazo[5,1-a]isoindole-5-ethanol (also known as NLG919), etc.) for use in a subject with advanced or metastatic cancer (eg, a patient with metastatic and recurrent NSCL cancer).
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 используется в комбинации с одной или несколькими из следующих методик: иммунологический подход (например, интерлейкин-2 или интерферон-α), вещество направленного действия (например, ингибитор VEGF, такой как моноклональное антитело к VEGF); ингибитор тирозинкиназы VEGF, такой как сунитиниб, сорафениб, акситиниб и пазопаниб; ингибитор РНК-интерференции; или ингибитор медиатора, расположенного ниже по ходу сигнального пути VEGF, например, ингибитор мишени рапамицина у млекопитающих (mTOR),In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with one or more of the following techniques: an immunological approach (e.g., interleukin-2 or interferon-α), a targeted agent (e.g., a VEGF inhibitor, such as an anti-VEGF monoclonal antibody ); a VEGF tyrosine kinase inhibitor such as sunitinib, sorafenib, axitinib and pazopanib; RNA interference inhibitor; or an inhibitor of a mediator located downstream of the VEGF signaling pathway, for example, a mammalian target of rapamycin (mTOR) inhibitor,
- 23 045940 например, эверолимус и темсиролимус. Любая из таких комбинаций может применяться для лечения рака почек, например, почечно-клеточной карциномы (RCC) (например, светлоклеточной почечной карциномы (CCRCC)) или метастатической RCC.- 23 045940 e.g. everolimus and temsirolimus. Any of these combinations may be used to treat kidney cancer, such as renal cell carcinoma (RCC) (eg, clear cell renal carcinoma (CCRCC)) or metastatic RCC.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, используется в комбинации с ингибитором MEK (например, ингибитором MEK, указанным в изобретении). В некоторых вариантах осуществления комбинация антитела против PD-1 и ингибитора MEK применяется для лечения рака (например, рака, указанного в изобретении). В некоторых вариантах осуществления рак, который подвергается комбинированному лечению, выбран из меланомы, колоректального рака, немелкоклеточный рака легкого, рака яичника, рака молочной железы, рака предстательной железы, рака поджелудочной железы, гематологического злокачественного заболевания или почечно-клеточной карциномы. В некоторых вариантах осуществления рак включает мутацию BRAF (например, мутацию BRAF V600E), BRAF дикого типа, KRAS дикого типа или активирующую мутацию KRAS. Рак может быть на ранней, промежуточной или поздней стадии.In some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, such as an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, is used in combination with a MEK inhibitor (eg, a MEK inhibitor of the invention). In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody and a MEK inhibitor is used to treat cancer (eg, a cancer of the invention). In some embodiments, the cancer that is subject to the combination treatment is selected from melanoma, colorectal cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, breast cancer, prostate cancer, pancreatic cancer, hematologic malignancy, or renal cell carcinoma. In some embodiments, the cancer includes a BRAF mutation (eg, BRAF V600E mutation), wild-type BRAF, wild-type KRAS, or an activating KRAS mutation. Cancer can be early, intermediate or late stage.
В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 используют в комбинации с одним, двумя или всеми из нижеперечисленного: оксалиплатин, лейковорин или 5-ФУ (например, совместное лечение по программе FOLFOX). В качестве альтернативы или в сочетании, эта комбинация дополнительно включает ингибитор VEGF (например, ингибитор VEGF по изобретению). В некоторых вариантах осуществления комбинация антитела против PD-1, совместное лечение по программе FOLFOX и ингибитор VEGF используют для лечения рака (например, рака, указанного в изобретении). В некоторых вариантах осуществления рак, который подвергается комбинированному лечению, выбран из меланомы, колоректального рака, немелкоклеточного рака легкого, рака яичника, рака молочной железы, рака предстательной железы, рака поджелудочной железы, гематологического злокачественного заболевания или почечно-клеточной карциномы. Рак может быть на ранней, средней или поздней стадии.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with one, two, or all of the following: oxaliplatin, leucovorin, or 5-FU (eg, FOLFOX co-treatment). Alternatively or in combination, the combination further includes a VEGF inhibitor (eg, a VEGF inhibitor of the invention). In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody, a FOLFOX co-treatment, and a VEGF inhibitor is used to treat cancer (eg, a cancer of the invention). In some embodiments, the cancer that is subject to the combination treatment is selected from melanoma, colorectal cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, breast cancer, prostate cancer, pancreatic cancer, hematologic malignancy, or renal cell carcinoma. Cancer can be at an early, middle or late stage.
В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят с ингибитором тирозинкиназы (например, с акситинибом) для лечения почечно-клеточной карциномы и других солидных опухолей.In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered with a tyrosine kinase inhibitor (eg, axitinib) for the treatment of renal cell carcinoma and other solid tumors.
В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят с веществом, нацеленным на рецептор 4-1ВВ (например, с антителом, которое стимулирует передачу сигнала посредством 41ВВ (CD-137), например, PF-2566). В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором тирозинкиназы (например, с акситинибом) и веществом, нацеленным на рецептор 4-1ВВ.In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered with an agent that targets the 4-1BB receptor (eg, an antibody that stimulates 41BB signaling (CD-137), eg, PF-2566). In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a tyrosine kinase inhibitor (eg, axitinib) and an agent targeting the 4-1BB receptor.
Молекула антитела против PD-1 может быть связана с веществом, например, с цитотоксическим веществом или компонентом (например, с терапевтическим лекарственным средством, соединением, испускающим излучение, с молекулами растительного, грибкового или бактериального происхождения, или с биологическим белком (например, с белковым токсином) или с частицей (например, с рекомбинантной вирусной частицей, например, посредством белка вирусной оболочки). Например, антитело может быть соединено с радиоактивным изотопом, таким как α-, β- или γ-эмиттер, или β- или γ-эмиттер.The anti-PD-1 antibody molecule may be associated with a substance, for example, a cytotoxic substance or component (for example, a therapeutic drug, a radiation-emitting compound, molecules of plant, fungal or bacterial origin, or a biological protein (for example, a protein toxin) or particle (e.g., a recombinant viral particle, e.g., via a viral envelope protein). For example, the antibody may be coupled to a radioactive isotope such as an α-, β-, or γ-emitter, or a β- or γ-emitter .
Можно использовать любую комбинацию и последовательность молекул антител против PD-1 и других терапевтических средств, процедур или методик (например, описанных в изобретении). Молекулу антитела и/или другие терапевтические вещества, процедуры или методики можно применять в периоде активного заболевания, или в периоде ремиссии или в периоде снижения активности заболевания. Молекулу антитела можно вводить перед другим видом лечения, параллельно с этим лечением, после лечения или в период ремиссии заболевания.Any combination and sequence of anti-PD-1 antibody molecules and other therapeutic agents, procedures or techniques (eg, those described in the invention) can be used. The antibody molecule and/or other therapeutic agents, procedures or techniques can be used during a period of active disease, or during a period of remission or decrease in disease activity. The antibody molecule can be administered before another treatment, in parallel with that treatment, after treatment, or during remission of the disease.
Дополнительные комбинированные виды лечения.Additional combination treatments.
Способы и композиции, описанные в изобретении (например, антитела против PD-1 и способы их применения) могут быть использованы в комбинации с другими веществами или терапевтическими методиками, например, со вторым терапевтическим средством, выбранным из одного или нескольких средств, перечисленных в табл. 7. В одном варианте осуществления способы, описанные в изобретении, включают введение субъекту молекулы антитела против PD-1 по изобретению (необязательно в комбинации с одним или несколькими ингибиторами PD-L1, LAG-3, TIM-3, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1 и/или СЕАСАМ-5), или CTLA-4)), и дополнительно включают введение второго терапевтического средства, выбранного из одного или нескольких средств, перечисленных в табл. 7, в количестве, эффективном для лечения или профилактики заболевания, например, упомянутого в изобретении заболевания, такого как рак. При введении в комбинации, молекулу антитела против PD-1, дополнительное вещество (например, второе или третье вещество), или все из упомянутых веществ могут быть введены в количестве или в дозе, которые являются более высокими, более низкими или такими же, как количество или доза каждого вещества, применяемого по отдельности, например, в качестве монотерапии. В некоторых вариантах осуществления вводимое количество или доза антитела против PD-1, дополнительного вещества (например, второго или третьего вещества), или всех упомянутых веществ, являются более низкими (например, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40% или по меньшей мере на 50%), чем количество или доза каждого вещества, применяемого по отдельности, например, в качестве монотерапии. В других вариантах осуществления количество или доза антитела против PD-1,The methods and compositions described in the invention (eg, anti-PD-1 antibodies and methods of using them) can be used in combination with other substances or therapeutic techniques, for example, with a second therapeutic agent selected from one or more of the agents listed in table. 7. In one embodiment, the methods described in the invention include administering to a subject an anti-PD-1 antibody molecule of the invention (optionally in combination with one or more PD-L1, LAG-3, TIM-3, SEACAM inhibitors (e.g., SEACAM- 1 and/or SEACAM-5), or CTLA-4)), and additionally include the introduction of a second therapeutic agent selected from one or more of the agents listed in table. 7, in an amount effective for treating or preventing a disease, for example, a disease mentioned in the invention, such as cancer. When administered in combination, an anti-PD-1 antibody molecule, an additional agent (e.g., a second or third agent), or all of the agents may be administered in an amount or dose that is higher, lower, or the same as the amount or the dose of each substance used separately, for example, as monotherapy. In some embodiments, the administered amount or dose of the anti-PD-1 antibody, an additional substance (e.g., a second or third substance), or all of the substances, is lower (e.g., by at least 20%, by at least 30%, at least 40% or at least 50%) than the amount or dose of each substance used separately, for example, as monotherapy. In other embodiments, the amount or dose of anti-PD-1 antibody,
- 24 045940 дополнительного вещества (например, второго или третьего вещество), или всех упомянутых веществ, которые вызывают желаемый эффект (например, лечение рака), являются более низкими (например, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40% или по меньшей мере на 50% ниже).- 24 045940 additional substance (for example, a second or third substance), or all of the mentioned substances that cause the desired effect (for example, cancer treatment) are lower (for example, by at least 20%, by at least 30%, at least 40% or at least 50% lower).
В других вариантах осуществления второе терапевтическое средство выбрано из одного или нескольких веществ, перечисленных в табл. 7. В одном варианте осуществления рак выбран из рака легкого ((например, такого вида рака, как немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) (например, NSCLC плоскоклеточного гистологического типа и/или неплоскоклеточного гистологического типа или NSCLC аденокарциномы)), или раскрытого в публикации, указанной в табл. 7. В некоторых вариантах осуществления второе терапевтическое средство выбрано из одного или нескольких следующих веществ: 1) ингибитор протеинкиназы С (PKC); 2) ингибитор белка теплового шока 90 (HSP90); 3) ингибитор фосфоинозитид 3киназы (PI3K) и/или мишени рапамицина (mTOR); 4) ингибитор цитохрома Р450 (например, ингибитор CYP17 или ингибитор 17 альфа-гидроксилазы/С17-20 лиазы); 5) вещество, хелатирующее железо; б) ингибитор ароматазы; 7) ингибитор р53, например, ингибитор взаимодействия p53/Mdm2; 8) индуктор апоптоза; 9) ингибитор ангиогенеза; 10) ингибитор альдостеронсинтазы; 11) ингибитор рецептора Smoothened (SMO); 12) ингибитор рецептора пролактина (PRLR); 13) ингибитор сигнала Wnt; 14) ингибитор CDK4/6; 15) ингибитор рецептора фактора роста фибробластов 2 (FGFR2)/рецептора фактора роста фибробластов 4 (FGFR4); 16) ингибитор макрофагального колониестимулирующего фактора (М-CSF); 17) один или несколько из ингибиторов c-KIT, высвобождения гистамина, Flt3 (например, FLK2/STK1) или РКС; 18) один или несколько из ингибиторов VEGFR-2 (например, FLK-1/KDR), PDGFRbeta, c-KIT или Raf-киназы С; 19) агонист соматостатина и/или ингибитор высвобождения гормона роста; 20) ингибитор киназы анапластической лимфомы (ALK); 21) ингибитор рецептора инсулино-подобного фактора роста 1 (IGF-1R); 22) ингибитор Р-гликопротеина 1; 23) ингибитор рецептора фактора роста эндотелия сосудов (VEGFR); 24) ингибитор киназы BCR-ABL; 25) ингибитор FGFR; 26) ингибитор CYP11B2; 27) ингибитор HDM2, например, ингибитор взаимодействия HDM2-p53; 28) ингибитор тирозинкиназы; 29) ингибитор с-МЕТ; 30) ингибитор JAK; 31) ингибитор DAC; 32) ингибитор 11в-гидроксилазы; 33) ингибитор IAP; 34) ингибитор киназы PIM; 35) ингибитор Porcupine; 36) ингибитор BRAF, например, BRAF V600E или BRAF дикого типа; 37) ингибитор HER3; 38) ингибитор MEK; или 39) ингибитор липидной киназы, например, как описано в изобретении и в табл. 7.In other embodiments, the second therapeutic agent is selected from one or more of the substances listed in table. 7. In one embodiment, the cancer is selected from lung cancer ((eg, a cancer such as non-small cell lung cancer (NSCLC) (eg, NSCLC squamous histological type and/or non-squamous histological type or NSCLC adenocarcinoma)), or disclosed in a publication, set forth in Table 7. In some embodiments, the second therapeutic agent is selected from one or more of the following: 1) a protein kinase C (PKC) inhibitor; 2) heat shock protein 90 (HSP90) inhibitor; 3) inhibitor of phosphoinositide 3 kinase (PI3K) and/or target of rapamycin (mTOR); 4) a cytochrome P450 inhibitor (for example, a CYP17 inhibitor or a 17 alpha-hydroxylase/C17-20 lyase inhibitor); 5) iron chelating agent; b) aromatase inhibitor; 7) a p53 inhibitor, for example a p53/Mdm2 interaction inhibitor; 8) apoptosis inducer; 9) angiogenesis inhibitor; 10) aldosterone synthase inhibitor; 11) Smoothened receptor inhibitor (SMO); 12) prolactin receptor inhibitor (PRLR); 13) Wnt signal inhibitor; 14) CDK4/6 inhibitor; 15) fibroblast growth factor receptor 2 (FGFR2)/fibroblast growth factor receptor 4 (FGFR4) inhibitor; 16) inhibitor of macrophage colony-stimulating factor (M-CSF); 17) one or more of inhibitors of c-KIT, histamine release, Flt3 (eg, FLK2/STK1) or PKC; 18) one or more of VEGFR-2 inhibitors (eg, FLK-1/KDR), PDGFRbeta, c-KIT or Raf kinase C; 19) somatostatin agonist and/or growth hormone release inhibitor; 20) anaplastic lymphoma kinase (ALK) inhibitor; 21) inhibitor of insulin-like growth factor 1 receptor (IGF-1R); 22) P-glycoprotein 1 inhibitor; 23) vascular endothelial growth factor receptor (VEGFR) inhibitor; 24) BCR-ABL kinase inhibitor; 25) FGFR inhibitor; 26) CYP11B2 inhibitor; 27) an HDM2 inhibitor, for example an HDM2-p53 interaction inhibitor; 28) tyrosine kinase inhibitor; 29) c-MET inhibitor; 30) JAK inhibitor; 31) DAC inhibitor; 32) 11β-hydroxylase inhibitor; 33) IAP inhibitor; 34) PIM kinase inhibitor; 35) Porcupine inhibitor; 36) a BRAF inhibitor, for example BRAF V600E or wild type BRAF; 37) HER3 inhibitor; 38) MEK inhibitor; or 39) a lipid kinase inhibitor, for example, as described in the invention and in table. 7.
В одном варианте осуществления второе терапевтическое средство выбрано из одного или нескольких следующих соединений: соединение А8, соединение А17, соединение А23, соединение А24, соединение А27, соединение А29, соединение A33 и соединение А13.In one embodiment, the second therapeutic agent is selected from one or more of the following compounds: compound A8, compound A17, compound A23, compound A24, compound A27, compound A29, compound A33, and compound A13.
В одном варианте осуществления второе терапевтическое средство выбрано из одного или нескольких следующих соединений: соединение А5, соединение А8, соединение А17, соединение А23, соединение А24, соединение А29 и соединение А40.In one embodiment, the second therapeutic agent is selected from one or more of the following compounds: compound A5, compound A8, compound A17, compound A23, compound A24, compound A29 and compound A40.
В одном варианте осуществления второе терапевтическое средство выбрано из одного или нескольких следующих соединений: соединение А9, соединение А16, соединение А17, соединение А21, соединение А22, соединение А25, соединение А28, соединение А48 и соединение 49.In one embodiment, the second therapeutic agent is selected from one or more of the following compounds: compound A9, compound A16, compound A17, compound A21, compound A22, compound A25, compound A28, compound A48, and compound 49.
В вариантах осуществления второе терапевтическое средство вводят в терапевтической дозе или в дозе ниже терапевтической. В некоторых вариантах осуществления концентрация второго терапевтического средства, которая требуется для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, является более низкой при введении второго терапевтического средства в комбинации с молекулой антитела против PD-1, чем при введении второго терапевтического средства в качестве отдельного препарата. В некоторых вариантах осуществления концентрация молекулы антитела против PD-1, которая необходима для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, является более низкой при введении молекулы антитела против PD-1 в комбинации со вторым терапевтическим средством, чем при введении молекулы антитела против PD-1 в качестве отдельного препарата. В некоторых вариантах осуществления, в комбинированной терапии, концентрация второго терапевтического вещества, которая требуется для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, ниже терапевтической дозы второго лекарственного вещества, применяемого в виде монотерапии, например, ниже на 10-20%, 20-30%, 3040%, 40-50%, 50-60%, 60-70%, 70-80% или ниже на 80-90%. В некоторых вариантах осуществления, в комбинированной терапии, концентрация молекулы антитела против PD-1, которая необходима для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, ниже терапевтической дозы молекулы антитела анти-PD-1, применяемой в виде монотерапии, например, ниже на 10-20%, 20-30%, 30-40%, 40-50%, 50-60%, 60-70%, 70-80% или ниже на 80-90%.In embodiments, the second therapeutic agent is administered at a therapeutic dose or at a subtherapeutic dose. In some embodiments, the concentration of the second therapeutic agent that is required to achieve inhibition, such as growth inhibition, is lower when the second therapeutic agent is administered in combination with an anti-PD-1 antibody molecule than when the second therapeutic agent is administered as a separate drug. In some embodiments, the concentration of the anti-PD-1 antibody molecule that is required to achieve inhibition, e.g., growth inhibition, is lower when the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a second therapeutic agent than when the anti-PD-1 antibody molecule is administered as a separate drug. In some embodiments, in a combination therapy, the concentration of the second therapeutic agent that is required to achieve inhibition, e.g., growth inhibition, is lower than the therapeutic dose of the second drug administered as monotherapy, e.g., 10-20%, 20-30% lower. , 3040%, 40-50%, 50-60%, 60-70%, 70-80% or lower by 80-90%. In some embodiments, in a combination therapy, the concentration of the anti-PD-1 antibody molecule that is required to achieve inhibition, e.g., growth inhibition, is lower than the therapeutic dose of the anti-PD-1 antibody molecule administered as monotherapy, e.g., 10-10% lower. 20%, 20-30%, 30-40%, 40-50%, 50-60%, 60-70%, 70-80% or lower by 80-90%.
Обнаружение.Detection.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам обнаружения присутствия PD-1 в образце, например, in vitro или in vivo (например, в биологическом образце, например, в сыворотке, сперме или моче, или в биоптате ткани, например, ткани из области гиперпролиферативного или ракового поражения). Рассматриваемый способ может быть использован для оценки (например, для контроля за ходом лечения или прогрессирования, диагностики и/или стадии заболевания, упомянутого в изобретении, например, гиперпролиферативного или ракового заболевания у субъекта). Этот способ включает: (I)In another aspect, the present invention provides methods for detecting the presence of PD-1 in a sample, e.g., in vitro or in vivo (e.g., a biological sample, e.g., serum, semen, or urine, or a tissue biopsy, e.g., tissue from an area of hyperproliferative or cancer). The subject method can be used for evaluation (eg, to monitor the progress of treatment or the progression, diagnosis and/or stage of a disease mentioned in the invention, for example, a hyperproliferative or cancerous disease in a subject). This method includes: (I)
- 25 045940 контактирование образца с молекулой антитела по изобретению (и, необязательно, эталонного, например, контрольного образца), или введение субъекту молекулы антитела по изобретению, в условиях, которые позволяют осуществляться взаимодействию, и (II) обнаружение образования комплекса между молекулой антитела и образцом (и необязательно, с эталонным, например, с контрольным образцом). Образование комплекса свидетельствует о присутствии PD-1, и может указать на приемлемость или необходимость лечения, описанного в изобретении. Способ может охватывать иммуногистохимические, иммуноцитохимические методики, анализ в клеточном сортере с возбуждением флуоресценции (FACS), образование комплексов молекул антитела и магнитных шариков, анализы ELISA, ПЦР-технологии (например, ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР)).- 25 045940 contacting a sample with an antibody molecule of the invention (and, optionally, a reference, for example, a control sample), or administering to the subject an antibody molecule of the invention, under conditions that allow interaction to occur, and (ii) detecting the formation of a complex between the antibody molecule and sample (and optionally with a reference, for example, with a control sample). Formation of the complex indicates the presence of PD-1, and may indicate the acceptability or need for the treatment described in the invention. The method may include immunohistochemical, immunocytochemical techniques, fluorescence excited cell sorter (FACS) analysis, complexation of antibody molecules and magnetic beads, ELISA assays, PCR technologies (eg, reverse transcription-PCR (RT-PCR)).
Обычно молекула антитела, используемая в способах диагностики in vivo и in vitro, подвергается прямому или опосредованному мечению детектируемым веществом, что способствует обнаружению связанного или несвязанного связывающего вещества. Подходящие детектируемые вещества включают различные биологически активные ферменты, простетические группы, флуоресцентные материалы, люминесцентные материалы, парамагнитные (например, активные материалы для ядерного магнитного резонанса) и радиоактивные материалы.Typically, an antibody molecule used in in vivo and in vitro diagnostic methods is labeled directly or indirectly with a detectable substance, which facilitates the detection of bound or unbound binder. Suitable detectable substances include various biologically active enzymes, prosthetic groups, fluorescent materials, luminescent materials, paramagnetic (eg, nuclear magnetic resonance active materials) and radioactive materials.
Дополнительные варианты осуществления относятся к способу лечения рака, который содержит: определение у субъекта или в образце (например, в образце от субъекта, содержащем раковые клетки и, необязательно, клетки иммунной системы, такие как TIL-клетки) наличия одного, двух или всех из PDL1, CD8 или IFN-γ, тем самым обеспечивая показатели для одного, двух или всех PD-L1, CD8 и IFN-γ. Способ может дополнительно включать сравнение значения PD-L1, CD8 и/или IFN-γ с эталонным значением, например, с контрольным значением. Если показатели PD-L1, CD8+ и/или IFN-γ выше, чем эталонное значение, например, контрольные значения, то субъекту вводят терапевтически эффективное количество антитела против PD-1 (например, антитела против PD-1 по изобретению), необязательно в комбинации с одним или несколькими другими веществами, и тем самым осуществляют лечение рака. Рак может представлять собой, например, рак, упомянутый в изобретении, например, рак легкого (плоскоклеточный), рак легкого (аденокарцинома), рак головы и шеи, рак шейки матки (плоскоклеточный), рак желудка, рак щитовидной железы, меланома, рак носоглотки или рак молочной железы, например, тройной отрицательный (TN) рак молочной железы, например, иммуномодулирующий тройной отрицательный рак (IM-TN) рак молочной железы. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой ER+ рак молочной железы или рак поджелудочной железы.Additional embodiments relate to a method of treating cancer, which comprises: determining in a subject or sample (for example, a sample from the subject containing cancer cells and, optionally, cells of the immune system, such as TIL cells) the presence of one, two or all of PDL1, CD8, or IFN-γ, thereby providing indicators for one, two, or all of PD-L1, CD8, and IFN-γ. The method may further include comparing the PD-L1, CD8 and/or IFN-γ value with a reference value, such as a control value. If the PD-L1, CD8+ and/or IFN-γ values are higher than a reference value, e.g., control values, then the subject is administered a therapeutically effective amount of an anti-PD-1 antibody (e.g., an anti-PD-1 antibody of the invention), optionally in combination with one or more other substances, and thereby treat cancer. The cancer may be, for example, a cancer mentioned in the invention, for example, lung cancer (squamous cell), lung cancer (adenocarcinoma), head and neck cancer, cervical cancer (squamous cell), stomach cancer, thyroid cancer, melanoma, nasopharyngeal cancer or breast cancer, such as triple negative (TN) breast cancer, such as immunomodulatory triple negative (IM-TN) breast cancer. In some embodiments, the cancer is ER+ breast cancer or pancreatic cancer.
Настоящее изобретение также относится к способу лечения рака, который содержит: проведение анализов у субъекта или в образце (например, в образце от субъекта, содержащем раковые клетки) на наличие PD-L1, таким образом определяют значение PD-L1, сравнивают значение PD-L1 с контрольным значением, и если значение PD-L1 превышает контрольное значение, введение субъекту терапевтически эффективного количества антитела против PD-1 (например, антитела против PD-1 по изобретению), необязательно в комбинации с одним или несколькими другими веществами, и таким образом осуществляют лечение рака. Рак может представлять собой, например, рак, упомянутый в изобретении, например, рак представляет собой немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) - аденокарциному (АСА), NSCLC плоскоклеточную карциному (SCC) или гепатоцеллюлярную карциному (НСС).The present invention also provides a method of treating cancer, which comprises: testing a subject or a sample (eg, a sample from a subject containing cancer cells) for the presence of PD-L1, thereby determining the PD-L1 value, comparing the PD-L1 value with a control value, and if the PD-L1 value exceeds the control value, administering to the subject a therapeutically effective amount of an anti-PD-1 antibody (e.g., an anti-PD-1 antibody of the invention), optionally in combination with one or more other substances, and thereby cancer treatment. The cancer may be, for example, a cancer mentioned in the invention, for example, the cancer is non-small cell lung cancer (NSCLC)-adenocarcinoma (ACA), NSCLC squamous cell carcinoma (SCC) or hepatocellular carcinoma (HCC).
В другом аспекте настоящее изобретение относится к диагностическим или терапевтическим наборам, которые включают молекулы антитела по изобретению и инструкции по применению.In another aspect, the present invention provides diagnostic or therapeutic kits that include antibody molecules of the invention and instructions for use.
Все публикации, заявки на патенты, патенты и другие ссылки, упомянутые в изобретении, включены в качестве ссылки во всей их полноте.All publications, patent applications, patents and other references mentioned in the invention are incorporated by reference in their entirety.
Другие признаки, задачи и преимущества настоящего изобретения будут очевидны из описания и чертежей, а также из формулы изобретения.Other features, objects and advantages of the present invention will be apparent from the description and drawings, as well as from the claims.
Краткое описание фигурBrief description of the figures
На фиг. 1 показаны аминокислотные последовательности вариабельных областей легкой и тяжелой цепи мышиного моноклонального антитела против PD-1 mAb BAP049. Указанные вверху и внизу последовательности получены в двух независимых анализах. Подчеркнуты CDR последовательности легкой и тяжелой цепи, приведенные на основе нумерации по Kabat. Жирным курсивом выделены CDR последовательности легкой и тяжелой цепи, приведенные на основе нумерации по Chothia. Непарный Cys остаток в положении 102 последовательности легкой цепи показан в рамке. Последовательности SEQ ID NO: 8, 228, 16 и 229 показаны, соответственно, в порядке появления.In fig. 1 shows the amino acid sequences of the light and heavy chain variable regions of the mouse anti-PD-1 monoclonal antibody mAb BAP049. The sequences shown above and below were obtained from two independent analyses. Light and heavy chain CDR sequences based on Kabat numbering are underlined. The light and heavy chain CDR sequences shown in bold italics are based on Chothia numbering. The unpaired Cys residue at position 102 of the light chain sequence is shown in the box. SEQ ID NOs: 8, 228, 16 and 229 are shown, respectively, in order of appearance.
На фиг. 2А показаны аминокислотные последовательности вариабельных областей легкой и тяжелой цепи мышиного моноклонального антитела (Mu mAb) против PD-1 mAb BAP049, выровненные с зародышевыми последовательностями. Указанные вверху и внизу последовательности представляют собой последовательности зародышевой линии (GL) и ВАР049 (Mu mAb), соответственно. Подчеркнуты CDR последовательности легкой и тяжелой цепи, приведенные на основе нумерации по Kabat. Жирным курсивом выделены CDR последовательности легкой и тяжелой цепи, приведенные на основе нумерации по Chothia. В кавычках - показаны идентичные аминокислотные остатки. Последовательности SEQ ID NO: 230, 8, 231 и 16, представлены, соответственно, в порядке появления.In fig. 2A shows the amino acid sequences of the light and heavy chain variable regions of the murine monoclonal antibody (Mu mAb) anti-PD-1 mAb BAP049 aligned with germline sequences. The sequences indicated at the top and bottom are germline (GL) and BAP049 (Mu mAb) sequences, respectively. Light and heavy chain CDR sequences based on Kabat numbering are underlined. Bold italics indicate light and heavy chain CDR sequences based on Chothia numbering. Identical amino acid residues are shown in quotation marks. Sequences SEQ ID NOs: 230, 8, 231 and 16 are presented, respectively, in order of appearance.
- 26 045940- 26 045940
На фиг. 2В показана последовательность мышиного гена kJ2 и соответствующая мутация в мышином моноклональном антителе против PD-1 mAb BAP049. Кавычки - указывают на идентичный нуклеотидный остаток. Последовательности, представленные как SEQ ID NO: 233, 232, 234 и 235, показаны, соответственно, в порядке появления.In fig. 2B shows the sequence of the mouse kJ2 gene and the corresponding mutation in the mouse monoclonal antibody against PD-1 mAb BAP049. Quotation marks indicate an identical nucleotide residue. The sequences shown as SEQ ID NO: 233, 232, 234 and 235 are shown in order of appearance, respectively.
На фиг. 3A-3B показано конкурентное связывание между флуоресцентно меченым мышиным моноклональным антителом против PD-1 mAb BAP049 (Mu mAb) и тремя химерными версиями ВАР049 (Chi mAb). Эксперимент проводен дважды, и результаты показаны на фиг. 3A и 3B соответственно. Три химерные антитела ВАР049 (Chi mAb (Cys), Chi mAb (Tyr) и Chi mAb (Ser)) имеют остатки Cys, Tyr и Ser в положении 102 вариабельной области легкой цепи, соответственно. Также Chi mAb (Cys), Chi мАт (Tyr) и Chi mAb (Ser) обозначены как BAP049-chi, BAP049-chi-Y и BAP049-chi-S, соответственно.In fig. 3A-3B show competitive binding between the fluorescently labeled mouse monoclonal antibody against PD-1 mAb BAP049 (Mu mAb) and three chimeric versions of BAP049 (Chi mAb). The experiment was carried out twice and the results are shown in Fig. 3A and 3B respectively. The three chimeric BAP049 antibodies (Chi mAb (Cys), Chi mAb (Tyr) and Chi mAb (Ser)) have Cys, Tyr and Ser residues at position 102 of the light chain variable region, respectively. Also Chi mAb (Cys), Chi mAb (Tyr) and Chi mAb (Ser) are designated as BAP049-chi, BAP049-chi-Y and BAP049-chi-S, respectively.
Фиг. 4 представляет собой гистограмму, показывающую результаты FACS анализа связывания для шестнадцати гуманизированных клонов ВАР049 (BAP049-hum01 - BAP049-hum16). Концентрация антител составляет 200, 100, 50, 25 и 12,5 нг/мл от крайнего левого столбца до крайнего левого столбца для каждого тестируемого mAb.Fig. 4 is a bar graph showing the results of FACS binding analysis for sixteen humanized BAP049 clones (BAP049-hum01 - BAP049-hum16). Antibody concentrations are 200, 100, 50, 25, and 12.5 ng/mL from leftmost column to leftmost column for each mAb tested.
На фиг. 5 изображен структурный анализ гуманизированных клонов ВАР049 (а, b, с, d и е представляют различные типы последовательностей каркасных областей). Также показаны значения концентрации mAb в образцах.In fig. 5 shows structural analysis of humanized BAP049 clones (a, b, c, d and e represent different types of framework sequences). The mAb concentrations in the samples are also shown.
На фиг. 6А-6В показана аффинность связывания и специфичность гуманизированного mAb BAP049, измеренная в анализе конкурентного связывания с использованием мышиных mAb ВАР049 в константной концентрации с меткой Alexa 488, серийных разведений тестируемых антител и PD-1экспрессирующих клеток 300.19. Эксперимент проводили дважды, и результаты показаны на фиг. 6А и 6В соответственно.In fig. 6A-6B show the binding affinity and specificity of humanized mAb BAP049 measured in a competitive binding assay using murine mAb BAP049 at a constant concentration with Alexa 488 tag, serial dilutions of test antibodies and PD-1 expressing 300.19 cells. The experiment was performed twice and the results are shown in FIG. 6A and 6B respectively.
На фиг. 7 показано ранжирование гуманизированных клонов ВАР049 на основе данных анализов FACS, конкурентного связывания и структурного анализа. Также показаны значения концентрации mAb в образцах.In fig. 7 shows the ranking of humanized BAP049 clones based on FACS, competitive binding, and structural analyses. The mAb concentrations in the samples are also shown.
Фиг. 8А-8В показывают блокирование связывания лиганда с PD-1 с помощью выбранных гуманизированных клонов ВАР049.Fig. 8A-8B show blocking of ligand binding to PD-1 by selected humanized BAP049 clones.
Блокирование связывания PD-L1-Ig и PD-L2-Ig с PD-1 показано на фиг. 8А. Блокирование связывания PD-L2-Ig с PD-1 показано на фиг. 8В. Проанализированы BAP049-hum01, BAP049-hum05, ВАР049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10 и BAP049-hum11. Также в анализ были включены мышиные mAb BAP049 и химерные mAb, имеющих Tyr в положении 102 вариабельной области легкой цепи.The blocking of PD-L1-Ig and PD-L2-Ig binding to PD-1 is shown in FIG. 8A. Blocking PD-L2-Ig binding to PD-1 is shown in FIG. 8B. BAP049-hum01, BAP049-hum05, BAP049hum08, BAP049-hum09, BAP049-hum10 and BAP049-hum11 were analyzed. Also included in the analysis were mouse mAb BAP049 and chimeric mAbs having a Tyr at position 102 of the light chain variable region.
Фиг. 9А-9В показывают выравнивание последовательностей вариабельных доменов тяжелой цепи для шестнадцати гуманизированных клонов ВАР049 и химерных ВАР049 (BAP049-chi). На фиг. 9А все последовательности, (SEQ ID NO: 22, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 50, 50, 50, 50, 82, 82 и 86 показаны, соответственно, в порядке появления). На фиг. 9В показаны только аминокислотные последовательности, которые отличаются от мышиной последовательности (SEQ ID NO: 22, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 50, 50, 50, 50, 82, 82 и 86 указаны, соответственно, в порядке появления).Fig. 9A-9B show the sequence alignment of the heavy chain variable domains for sixteen humanized BAP049 clones and chimeric BAP049 (BAP049-chi). In fig. 9A all sequences, (SEQ ID NO: 22, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 50, 50, 50, 50, 82, 82 and 86 are shown, respectively, in order of appearance) . In fig. 9B shows only amino acid sequences that differ from the mouse sequence (SEQ ID NOs: 22, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 38, 50, 50, 50, 50, 82, 82 and 86 indicated , respectively, in order of appearance).
Фиг. 10А-10В показывают выравнивание последовательностей вариабельного домена легкой цепи для шестнадцати гуманизированных клонов ВАР049 и химерных ВАР049 (BAP049-chi). На фиг. 10А все последовательности (SEQ ID NO: 24, 66, 66, 66, 66, 70, 70, 70, 58, 62, 78, 74, 46, 46, 42, 54 и 54 показаны соответственно, в порядке появления). На фиг. 10В показаны только аминокислотные последовательности, которые отличаются от мышиной последовательности (SEQ ID NO: 24, 66, 66, 66, 66, 70, 70, 70, 58, 62, 78, 74, 46, 46, 42, 54 и 54 указаны, соответственно, в порядке появления).Fig. 10A-10B show a light chain variable domain sequence alignment for sixteen humanized BAP049 clones and chimeric BAP049 (BAP049-chi). In fig. 10A all sequences (SEQ ID NOs: 24, 66, 66, 66, 66, 70, 70, 70, 58, 62, 78, 74, 46, 46, 42, 54 and 54 are shown, respectively, in order of appearance). In fig. 10B shows only amino acid sequences that differ from the mouse sequence (SEQ ID NOs: 24, 66, 66, 66, 66, 70, 70, 70, 58, 62, 78, 74, 46, 46, 42, 54 and 54 indicated , respectively, in order of appearance).
На фиг. 11 показаны иллюстативные виды раковых заболеваний, при которых имеется относительно большая доля пациентов с тройной положительной реакцией на PD-L1/CD8/IFN-Y.In fig. 11 shows exemplary cancers in which there is a relatively large proportion of patients who are triple positive for PD-L1/CD8/IFN-Y.
На фиг. 12 показан пример ER+ рака молочной железы и рака поджелудочной железы, при которых имеется относительно низкая доля пациентов с тройной положительной реакцией на PD-L1/CD8/IFN-Y.In fig. Figure 12 shows an example of ER+ breast cancer and pancreatic cancer, which have a relatively low proportion of patients who are triple positive for PD-L1/CD8/IFN-Y.
На фиг. 13 показана доля типичных больных раком молочной железы, у которых выявлена тройная положительная реакция на PD-L1/CD8/IFN-Y.In fig. Figure 13 shows the proportion of typical breast cancer patients who are triple positive for PD-L1/CD8/IFN-Y.
На фиг. 14 показана доля типичных больных раком толстой кишки, у которых выявлена тройная положительная реакция на PD-L1/CD8/IFN-Y.In fig. Figure 14 shows the proportion of typical colon cancer patients who are triple positive for PD-L1/CD8/IFN-Y.
На фиг. 15 графически представлены результаты проточной цитометрии поверхностной экспрессии PD-L1 в клетках ЕВС-1 in vitro после введения соединения А17 или без такого введения. Клетки ЕВС-1 являются раковыми клетками немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) с амплификацией сМЕТ.In fig. 15 graphically presents the results of flow cytometry of surface expression of PD-L1 in EBC-1 cells in vitro with or without administration of Compound A17. EBC-1 cells are non-small cell lung cancer (NSCLC) cancer cells with cMET amplification.
На фиг. 16 графически представлена экспрессия мРНК PD-L1 в клетках Hs.746.T в модели ксенотрансплантата опухоли после введения соединения А17 или без такого введения. Клетки Hs.746.T представляют собой клетки рака желудка с амплификацией с-МЕТ и мутацией с-МЕТ.In fig. 16 graphically shows the expression of PD-L1 mRNA in Hs.746.T cells in a tumor xenograft model with or without administration of Compound A17. Hs.746.T cells are gastric cancer cells with c-MET amplification and c-MET mutation.
На фиг. 17 графически представлена экспрессия мРНК PD-L1 в клетках Н3122 in vitro после введения соединения А23 или без такого введения. Клетки Н3122 представляют собой клетки немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) с транслокацией ALK.In fig. 17 graphically shows the expression of PD-L1 mRNA in H3122 cells in vitro with or without administration of Compound A23. H3122 cells are non-small cell lung cancer (NSCLC) cells with ALK translocation.
На фиг. 18 графически представлена экспрессия мРНК PD-L1 в клетках LOXIMV1 (клетки меланоIn fig. 18 graphically shows the expression of PD-L1 mRNA in LOXIMV1 cells (melano cells
- 27 045940 мы с BRAF мутацией) в модели ксенотрансплантата опухоли после введения соединения А29 или без такого введения.- 27 045940 we with BRAF mutation) in a tumor xenograft model after administration of compound A29 or without such administration.
На фиг. 19 графически представлена экспрессия мРНК PD-L1 в клетках HEYA8 (клетки рака яичников с KRAS мутацией) в модели ксенотрансплантата опухоли после введения соединения А34 или без такого введения.In fig. 19 graphically depicts PD-L1 mRNA expression in HEYA8 cells (KRAS mutation ovarian cancer cells) in a tumor xenograft model with or without administration of Compound A34.
На фиг. 20 графически представлена экспрессия мРНК PD-L1 в клетках UKE-1 (мутантные клетки JAK2 V617F миелопролиферативного новообразования) в модели ксенотрансплантата опухоли после введения соединения А18 или без такого введения.In fig. 20 graphically depicts PD-L1 mRNA expression in UKE-1 cells (JAK2 V617F mutant myeloproliferative neoplasm cells) in a tumor xenograft model with or without administration of Compound A18.
Краткое описание таблицBrief description of tables
В табл. 1 приведены аминокислотные и нуклеотидные последовательности для молекул мышиных, химерных и гуманизированных антител против PD-1. Эти молекулы антител включают мышиные моноклональные антитела mAb BAP049, химерные mAb, BAP049-chi и BAP049-chi-Y и гуманизированные mAb ВАР049-hum01 - BAP049-hum16 и ВАР049-клон-А - ВАР049-клон-Е. В табл. 1 приведены аминокислотные и нуклеотидные последовательности областей CDR тяжелой и легкой цепи, аминокислотные и нуклеотидные последовательности вариабельных областей тяжелой и легкой цепи, и аминокислотные и нуклеотидные последовательности тяжелой и легкой цепей.In table Figure 1 shows the amino acid and nucleotide sequences for mouse, chimeric and humanized antibody molecules against PD-1. These antibody molecules include the mouse monoclonal antibodies mAb BAP049, the chimeric mAbs BAP049-chi and BAP049-chi-Y, and the humanized mAbs BAP049-hum01 - BAP049-hum16 and BAP049-clone-A - BAP049-clone-E. In table 1 shows the amino acid and nucleotide sequences of the heavy and light chain CDR regions, the amino acid and nucleotide sequences of the heavy and light chain variable regions, and the amino acid and nucleotide sequences of the heavy and light chains.
В табл. 2 представлены аминокислотные и нуклеотидные последовательности каркасных областей тяжелой и легкой цепи для гуманизированных mAb BAP049-hum01 - BAP049-hum16 и ВАР049-клон-А ВАР049-клон-Е.In table Figure 2 shows the amino acid and nucleotide sequences of the heavy and light chain framework regions for the humanized mAbs BAP049-hum01 - BAP049-hum16 and BAP049-clone-A BAP049-clone-E.
В табл. 3 представлены аминокислотные последовательности константных областей тяжелых цепей человеческого IgG и человеческой легкой цепи каппа.In table Figure 3 shows the amino acid sequences of the constant regions of the heavy chains of human IgG and the human kappa light chain.
В табл. 4 представлены аминокислотные последовательности лидерных последовательностей тяжелой и легкой цепи из гуманизированных mAb ВАР049-клон-А - ВАР049-клон-Е.In table Figure 4 shows the amino acid sequences of the heavy and light chain leader sequences from the humanized mAbs BAP049-clone-A - BAP049-clone-E.
В табл. 5 представлены полученное количество, титры, содержание мономеров и уровни эндотоксинов для выбранных гуманизированных моноклональных антител ВАР049, экспрессируемых в клетках СНО.In table 5 shows the amounts obtained, titers, monomer content and endotoxin levels for selected humanized monoclonal antibodies BAP049 expressed in CHO cells.
В табл. 6 представлены заряженные изоформы, детекцию которых проводят с помощью анализа изоэлектрического фокусирования Novex ИЭФ для выбранных гуманизированных mAb ВАР049, экспрессируемых в клетках СНО.In table 6 shows the charged isoforms detected by the Novex IEF isoelectric focusing assay for selected humanized mAbs BAP049 expressed in CHO cells.
В табл. 7 представлены выбранные терапевтические средства, которые могут быть введены в комбинации с молекулой антитела против PD-1 и другими иммуномодуляторами (например, с одним или несколькими из следующего: активатор костимулирующей молекулы и/или ингибитор молекулы иммунной контрольной точки), описанные в настоящем изобретении. В табл. 7 приведено следующее (слева направо): обозначение соединения - второго терапевтического средства, структура этого соединения и патентная опубликованная заявка (публикация), раскрывающая это соединение.In table 7 depicts selected therapeutic agents that can be administered in combination with an anti-PD-1 antibody molecule and other immunomodulators (eg, one or more of the following: costimulatory molecule activator and/or immune checkpoint molecule inhibitor) described in the present invention. In table 7 shows the following (from left to right): the designation of the second therapeutic agent compound, the structure of this compound, and the published patent application (publication) disclosing this compound.
Подробное описаниеDetailed description
Белок программируемой смерти 1 (PD-1) является членом семейства CD28/CTLA-4 и экспрессируется на активированных CD4' и CD8+ Т-клетках, Т-регуляторных клетках (Treg) и В-клетках. Этот белок отрицательно регулирует сигнальный путь и функцию эффекторных Т-клеток. PD-1 индуцируется на Тклетках, проникающих в опухоль, что приводит к функциональному истощению или дисфункции ((Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat. Rev. Cancer 12(4):252-64).Programmed death protein 1 (PD-1) is a member of the CD28/CTLA-4 family and is expressed on activated CD4' and CD8+ T cells, T regulatory cells (T reg ), and B cells. This protein negatively regulates the signaling pathway and function of effector T cells. PD-1 is induced on tumor-infiltrating T cells, resulting in functional exhaustion or dysfunction ((Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat. Rev. Cancer 12(4):252–64).
Белок PD-1 доставляет коингибирующий сигнал после связывания с любым из двух его лигандов, лигандом 1 программируемой смерти (PD-L1) или лигандом 2 программируемой смерти (PD-L2). Белок PD-L1 экспрессируется на Т-клетках, клетках - естественных киллерах (NK), макрофагах, дендритных клетках (DC), В-клетках, эпителиальных клетках, клетках эндотелия сосудов, а также во многих типах опухолей. Высокая экспрессия PD-L1 на клетках мышиных и человеческих опухолей связана с неблагоприятными клиническими исходами при различных формах рака ((Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat. Rev. Cancer 12(4):252-64). PD-L2 экспрессируется на дендритных клетках, макрофагах и в некоторых опухолях.The PD-1 protein delivers a coinhibitory signal upon binding to either of its two ligands, programmed death ligand 1 (PD-L1) or programmed death ligand 2 (PD-L2). The PD-L1 protein is expressed on T cells, natural killer (NK) cells, macrophages, dendritic cells (DC), B cells, epithelial cells, vascular endothelial cells, and in many types of tumors. High expression of PD-L1 on murine and human tumor cells is associated with adverse clinical outcomes in various forms of cancer ((Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat. Rev. Cancer 12(4):252–64) PD-L2 is expressed on dendritic cells, macrophages, and some tumors.
Для целей противоопухолевой иммунотерапии была проведена предварительная доклиническая и клиническая оценка блокады пути PD-1. И в доклинических и в клинических исследованиях было показано, что блокада пути PD-1 восстанавливает активность эффекторных Т-клеток и вызывает надежную противоопухолевую реакцию. Например, блокада сигнального пути PD-1 при их истощении/дисфункции эффекторных функций Т-клеток восстанавливает эти функции (например, пролиферацию, секрецию IFNγ или цитолитическую функцию) и ингибирует функции Tr^-клеток (Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat. Rev. Cancer 12(4):252-64).Preliminary preclinical and clinical evaluation of PD-1 pathway blockade has been performed for antitumor immunotherapy purposes. In both preclinical and clinical studies, blockade of the PD-1 pathway has been shown to restore effector T cell activity and induce a robust antitumor response. For example, blockade of the PD-1 signaling pathway when T cell effector functions are exhausted/dysfunction restores these functions (e.g., proliferation, IFNγ secretion, or cytolytic function) and inhibits Tr^ cell functions (Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol 26:677–704 Pardoll et al (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252–64
Соответственно, настоящее изобретение относится, по меньшей мере, частично, к молекулам антитела (например, к молекулам гуманизированного антитела), которые связываются с белками программируемой смерти - 1 (PD-1) с высокой аффинностью и специфичностью. В одном варианте осуществления в изобретении раскрыты гуманизированные антитела против PD-1, которые показывают удивительно низкую иммуногенность. Например, было выявлено, что показатель риска гуманизированных антител ВАР049 ниже 650, 600, 550 или ниже 500, исходя из анализов Т-клеточного эпитопа, описанных в изоAccordingly, the present invention relates, at least in part, to antibody molecules (eg, humanized antibody molecules) that bind to programmed death proteins 1 (PD-1) with high affinity and specificity. In one embodiment, the invention discloses humanized anti-PD-1 antibodies that exhibit surprisingly low immunogenicity. For example, humanized BAP049 antibodies have been found to have a risk score of less than 650, 600, 550, or less than 500 based on T cell epitope assays described in ISO
- 28 045940 бретении. В других вариантах осуществления было показано, что выбранная комбинация каркасных областей, например, показанная на фиг. 5 и 7, имеет разные показатели эффективности продукции и связывающие свойства.- 28 045940 Bretting. In other embodiments, it has been shown that a selected combination of frame regions, such as those shown in FIG. 5 and 7, has different product performance indicators and binding properties.
Дополнительные аспекты настоящего изобретения включают молекулы нуклеиновых кислот, кодирующие молекулы антитела, векторы экспрессии, клетки-хозяева и способы получения молекул антитела. Также изобретение относится к иммуноконъюгатам, мультиспецифичным или биспецифичным молекулам и фармацевтическим композициям, содержащие молекулы антитела. Молекулы антитела против PD-1 по изобретению могут быть использованы для лечения, профилактики и/или диагностики раковых или злокачественных заболеваний (таких как солидные опухоли и опухоли мягких тканей, меланома, например, прогрессирующая меланома, гепатоцеллюлярная карцинома, рак поджелудочной железы, почечно-клеточная карцинома (RCC), например, метастатическая RCC или светлоклеточная ПКР, глиомы или глиобластомы, множественная миелома, рак толстой кишки и рак легкого, например, немелкоклеточная карцинома), а также инфекционных заболеваний (например, инфекционных болезней, таких как гепатит, например, гепатит С (например, хронический вирусный гепатит), сепсис). Таким образом, в изобретении раскрыты способы обнаружения PD-1, а также способы лечения различных заболеваний, в том числе рака и инфекционных заболеваний, с помощью молекул антитела против PD-1.Additional aspects of the present invention include nucleic acid molecules encoding antibody molecules, expression vectors, host cells, and methods for producing antibody molecules. The invention also relates to immunoconjugates, multispecific or bispecific molecules and pharmaceutical compositions containing antibody molecules. The anti-PD-1 antibody molecules of the invention can be used for the treatment, prevention and/or diagnosis of cancer or malignant diseases (such as solid and soft tissue tumors, melanoma, e.g. advanced melanoma, hepatocellular carcinoma, pancreatic cancer, renal cell carcinoma (RCC), such as metastatic RCC or clear cell RCC, gliomas or glioblastomas, multiple myeloma, colon cancer, and lung cancer, such as non-small cell carcinoma), and infectious diseases (such as infectious diseases such as hepatitis, e.g. C (for example, chronic viral hepatitis), sepsis). Thus, the invention discloses methods for detecting PD-1, as well as methods for treating various diseases, including cancer and infectious diseases, using anti-PD-1 antibody molecules.
Термин белок программируемой смерти - 1 или PD-1 включает изоформы, PD-1 млекопитающих, например, человеческие PD-1, видовые гомологи человеческого PD-1 и его аналоги, содержащие по меньшей мере один общий эпитоп с PD-1.The term programmed death protein-1 or PD-1 includes isoforms of mammalian PD-1, for example, human PD-1, species homologs of human PD-1, and analogues thereof containing at least one common epitope with PD-1.
Аминокислотная последовательность PD-1, например, человеческого PD-1, известна в данной области, см., например, публикации Shinohara T et al. (1994) Genomics 23(3):704-6; Finger LR, et al. Gene (1997) 197(1-2):177-87.The amino acid sequence of PD-1, for example human PD-1, is known in the art, see, for example, the publications of Shinohara T et al. (1994) Genomics 23(3):704-6; Finger LR, et al. Gene (1997) 197(1-2):177-87.
Определения дополнительных терминов приведены ниже и далее в тексте настоящего изобретения.Definitions of additional terms are given below and further in the text of the present invention.
Используемые в изобретении формы единственного числа относятся к одному или более чем к одному (например, по меньшей мере одному) грамматическому объекту из параграфа изобретения.As used in the invention, the singular forms refer to one or more than one (eg, at least one) grammatical entity from a paragraph of the invention.
Используемый в изобретении союз или означает и/или и используется взаимозаменяемо с указанными союзами, если из контекста явно не указано иное.As used herein, the conjunction or means and/or and is used interchangeably with the above conjunctions unless the context clearly indicates otherwise.
Около и приблизительно обычно означают приемлемую степень погрешности для измеряемой величины с учетом характера или точности измерений. Примерная степень ошибки находится в пределах 20 процентов (%), обычно в пределах 10%, и более типично, в пределах 5% от заданного значения или диапазона значений.Near and approximately usually mean an acceptable degree of error for the quantity being measured, taking into account the nature or accuracy of the measurements. The approximate degree of error is within 20 percent (%), typically within 10%, and more typically within 5% of a specified value or range of values.
Композиции и способы по настоящему изобретению охватывают полипептиды и нуклеиновые кислоты, имеющие указанные последовательности, или последовательности, по существу, идентичные или сходные с указанными, например, последовательности, идентичные по меньшей мере на 85, 90, 95% или с более высокой степенью идентичности к указанной последовательности. По отношению к аминокислотной последовательности, термин по существу идентичный используется в изобретении для обозначения первой аминокислоты, содержащей достаточное или минимальное число аминокислотных остатков, которые: I) являются идентичными, или II) представляют собой консервативные замены выровненных аминокислотных остатков во второй аминокислотной последовательности, таким образом, что первая и вторая аминокислотные последовательности могут иметь общий структурный домен и/или общую функциональную активность. Например, аминокислотные последовательности, которые содержат общий структурный домен, являются идентичными по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или на 99% по отношению к референс-последовательности, например, последовательности, представленной в изобретении.The compositions and methods of the present invention include polypeptides and nucleic acids having the specified sequences, or sequences substantially identical or similar to the specified ones, for example, sequences that are at least 85, 90, 95% identical or with a higher degree of identity to the specified sequence. With respect to an amino acid sequence, the term substantially identical is used herein to mean a first amino acid containing a sufficient or minimal number of amino acid residues that: i) are identical, or ii) are conservative substitutions of aligned amino acid residues in a second amino acid sequence, such that that the first and second amino acid sequences may have a common structural domain and/or a common functional activity. For example, amino acid sequences that contain a common structural domain are at least about 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% identical, or 99% identical to a reference sequence, e.g. sequence presented in the invention.
По отношению к нуклеотидной последовательности, понятие по существу идентичная используется в изобретении для обозначения первой последовательности нуклеиновой кислоты, содержащей достаточное или минимальное число нуклеотидов, которые идентичны выровненным нуклеотидам во второй последовательности нуклеиновой кислоты, таким образом, что первая и вторая нуклеотидные последовательности кодируют полипептид, имеющий общую функциональную активность, или кодируют общий структурный домен полипептида, или общую функциональную полипептидную активностью. Например, нуклеотидные последовательности, которые идентичны по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% по отношению к референс-последовательности, например, последовательности, представленной в изобретении.With respect to a nucleotide sequence, the term substantially identical is used herein to mean a first nucleic acid sequence containing a sufficient or minimum number of nucleotides that are identical to aligned nucleotides in a second nucleic acid sequence such that the first and second nucleic acid sequences encode a polypeptide having common functional activity, or encode a common structural domain of a polypeptide, or a common functional polypeptide activity. For example, nucleotide sequences that are at least about 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 or 99% identical to a reference sequence, for example, the sequence provided in the invention.
Термин функциональный вариант относится к полипептидам, которые имеют аминокислотную последовательность, по существу идентичную природной последовательности, или кодируются по существу идентичной последовательностью нуклеотидов, и которые способны иметь одно или несколько действий, характерных для природной последовательности.The term functional variant refers to polypeptides that have an amino acid sequence substantially identical to the natural sequence, or are encoded by a substantially identical nucleotide sequence, and which are capable of having one or more actions characteristic of the natural sequence.
Подсчет степени гомологии или идентичности последовательностей между последовательностями (эти термины используются в изобретении как взаимозаменяемые) выполняются следующим образом.Calculation of the degree of homology or sequence identity between sequences (these terms are used interchangeably in the invention) is performed as follows.
Для определения процента идентичности двух аминокислотных последовательностей или двух последовательностей нуклеиновых кислот, последовательности выравнивают с целью оптимального сравнения (например, могут быть введены пробелы в одной или в обеих, то есть, в первой и второй аминоTo determine the percentage identity of two amino acid sequences or two nucleic acid sequences, the sequences are aligned for optimal comparison (for example, gaps may be introduced in one or both, that is, in the first and second amino
- 29 045940 кислотной последовательности или последовательностей нуклеиновых кислот для оптимального выравнивания, и негомологичными последовательностями можно пренебречь для целей сравнения). В предпочтительном варианте осуществления длина референс-последовательности, выровненной для сравнения, составляет по меньшей мере 30%, предпочтительно по меньшей мере 40%, более предпочтительно по меньшей мере 50, 60%, и еще более предпочтительно, по меньшей мере 70, 80, 90, 100% от длины исходной последовательности. Затем проводят сравнение аминокислотных остатков или нуклеотидов в соответствующих положениях аминокислот или положениях нуклеотидов. Если положение в первой последовательности занято тем же аминокислотным остатком или нуклеотидом, что и соответствующее положение во второй последовательности, то молекулы в этом положении являются идентичными (согласно изобретению, идентичность аминокислоты или нуклеиновой кислоты эквивалентна гомологии аминокислоты или нуклеиновой кислоты).- 29 045940 acid sequence or nucleic acid sequences for optimal alignment, and non-homologous sequences can be neglected for comparison purposes). In a preferred embodiment, the length of the reference sequence aligned for comparison is at least 30%, preferably at least 40%, more preferably at least 50, 60%, and even more preferably at least 70, 80, 90 , 100% of the length of the original sequence. Comparisons are then made between amino acid residues or nucleotides at corresponding amino acid positions or nucleotide positions. If a position in the first sequence is occupied by the same amino acid residue or nucleotide as the corresponding position in the second sequence, then the molecules at that position are identical (according to the invention, the identity of an amino acid or nucleic acid is equivalent to homology of the amino acid or nucleic acid).
Процент идентичности между двумя последовательностями зависит от числа идентичных положений, общих для этих последовательностей, с учетом количества пробелов и длины каждого пробела, которые необходимо ввести для оптимального выравнивания двух последовательностей.The percentage identity between two sequences depends on the number of identical positions shared by the sequences, taking into account the number of gaps and the length of each gap that must be introduced to optimally align the two sequences.
Сравнение последовательностей и определение процента идентичности между двумя последовательностями может быть выполнено с использованием математического алгоритма. В предпочтительном варианте осуществления процент идентичности между двумя аминокислотными последовательностями определяется с помощью алгоритма Needleman and Wunsch ((1970) J. Mol. Biol. 48:444-453), который входит в программу GAP в пакете программного обеспечения GCG (доступного на портале http://www.gcg.com), с использованием или матрицы Blossum 62 или матрицы РАМ250, и следующих параметров: штраф за открытие гэпа 16, 14, 12, 10, 8, 6 или 4, и штраф за продолжение гэпа, равный 1, 2, 3, 4, 5 или 6. В другом предпочтительном варианте осуществления процент идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями определяется с помощью программы GAP в пакете программного обеспечения GCG (доступен на http://www.gcg.com), с использованием матрицы NWSgapdna.CMP, штрафа за открытие гэпа 40, 50, 60, 70 или 80, и штрафа за продолжение гэпа 1, 2, 3, 4, 5 или 6. Особенно предпочтительный набор параметров (и набор, который следует использовать, если не указано иное) представляет собой матрицу замен Blossum 62 со следующими параметрами: штраф за пропуск 12, штраф за продление гэпа 4 и штраф за пропуск сдвига рамки 5.Comparing sequences and determining the percent identity between two sequences can be done using a mathematical algorithm. In a preferred embodiment, the percentage identity between two amino acid sequences is determined using the algorithm of Needleman and Wunsch ((1970) J. Mol. Biol. 48:444-453), which is included in the GAP program in the GCG software package (available at http: //www.gcg.com), using either the Blossum 62 matrix or the RAM250 matrix, and the following parameters: a penalty for opening a gap of 16, 14, 12, 10, 8, 6 or 4, and a penalty for continuing a gap equal to 1, 2, 3, 4, 5 or 6. In another preferred embodiment, the percentage identity between two nucleotide sequences is determined using the GAP program in the GCG software package (available at http://www.gcg.com), using the NWSgapdna matrix. CMP, a penalty for opening a gap of 40, 50, 60, 70, or 80, and a penalty for opening a gap of 1, 2, 3, 4, 5, or 6. A particularly preferred set of parameters (and the set that should be used unless otherwise noted) is a Blossum 62 substitution matrix with the following parameters: omission penalty 12, gap extension penalty 4, and frameshift omission penalty 5.
Процент идентичности между двумя аминокислотными или нуклеотидными последовательностями может быть определен с помощью алгоритма Е. Meyers и W. Miller ((1989) CABIOS, 4: 11-17), который входит в программу ALIGN (версия 2.0), используя таблицу весов замен остатков РАМ120, штраф за продление гэпа 12 и штраф за пропуск 4.The percentage of identity between two amino acid or nucleotide sequences can be determined using the algorithm of E. Meyers and W. Miller ((1989) CABIOS, 4: 11-17), which is included in the ALIGN program (version 2.0), using the PAM120 residue substitution weight table , the penalty for extending the gap is 12 and the penalty for missing is 4.
Последовательности нуклеиновых кислот и белков, описанные в изобретении, могут быть использованы в качестве запрашиваемой последовательности, чтобы выполнить поиск с помощью общедоступных баз данных, например, для идентификации других членов семейства или родственных последовательностей. Такие поиски могут быть выполнены с помощью программы NBLAST и XBLAST (версия 2.0), согласно публикации Altschul et al. (1990), J. Mol. Biol. 215: 403-10. Нуклеотидные поиски BLAST могут быть выполнены с помощью программы NBLAST, коэффициент=100, длина слова=12, для получения нуклеотидных последовательностей, гомологичных молекулам нуклеиновой кислоты (SEQ ID NO: 1) по изобретению. Поиск белков согласно BLAST может быть выполнен с помощью программы XBLAST, коэффициент=50, длина слова=3, для получения аминокислотных последовательностей, гомологичных белковым молекулам по изобретению. Для получения содержащих пропуски выравниваний, для целей сравнения, можно использовать программу Gapped BLAST, описанную авторами Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. 25: 3389-3402. При использовании программ BLAST и Gapped BLAST можно задействовать параметры по умолчанию соответствующих программ (например, XBLAST и NBLAST). См. http://www.ncbi.nlm.nih.gov.The nucleic acid and protein sequences described in the invention can be used as query sequences to search public databases, for example, to identify other family members or related sequences. Such searches can be performed using NBLAST and XBLAST (version 2.0) as published by Altschul et al. (1990), J. Mol. Biol. 215:403-10. Nucleotide BLAST searches can be performed using the NBLAST program, coefficient=100, word length=12, to obtain nucleotide sequences homologous to the nucleic acid molecules (SEQ ID NO: 1) of the invention. A BLAST protein search can be performed using the XBLAST program, coefficient=50, word length=3, to obtain amino acid sequences homologous to the protein molecules of the invention. To obtain gap-containing alignments for comparison purposes, the Gapped BLAST program described by Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. can be used. 25: 3389-3402. When using the BLAST and Gapped BLAST programs, you can use the default settings of the corresponding programs (for example, XBLAST and NBLAST). See http://www.ncbi.nlm.nih.gov.
Используемое в настоящем изобретении понятие гибридизуется в условиях низкой строгости, средней строгости, высокой строгости или в условиях очень высокой строгости описывает условия гибридизации и промывки. Руководство для проведения реакций гибридизации можно найти в издании Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6, которое включено в изобретение в качестве ссылки. В указанном издании описаны водные и неводные способы, и можно использовать любой из них. Конкретные условия гибридизации, ссылка на которые упомянута в изобретении, представляют собой следующее: 1) условия гибридизации низкой степени строгости представляют собой 6ххлорид натрия/цитрат натрия (SSC) приблизительно при 45°C, с последующими двумя промывками в 0,2xSSC, 0,1% SDS, по меньшей мере при 50°C (для низкой степени строгости температуру промывок можно повышать до 55°C); 2) условия гибридизации средней степени строгости представляют собой 6xSSC приблизительно при 45°C, с последующими одной или несколькими промывками в 0,2xSSC, 0,1% SDS при 60°C; 3) условия гибридизации высокой строгости представляют собой 6xSSC приблизительно при 45°C, с последующими одной или несколькими промывками в 0,2xSSC, 0,1% SDS при 65°C; и, предпочтительно, 4) условия гибридизации очень высокой строгости представляют собой 0,5М фосфат натрия, 7% SDS при 65°C, с последующими одной или несколькими промывками приAs used herein, the term hybridizes under low stringency, medium stringency, high stringency, or very high stringency conditions describes the hybridization and washing conditions. Guidance for performing hybridization reactions can be found in Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6, which is incorporated herein by reference. This publication describes aqueous and non-aqueous methods, and any of them can be used. The specific hybridization conditions referenced in the invention are as follows: 1) low stringency hybridization conditions are 6xsodium chloride/sodium citrate (SSC) at approximately 45°C, followed by two washes in 0.2xSSC, 0.1 % SDS, at least 50°C (for low severity, wash temperatures can be increased to 55°C); 2) medium stringency hybridization conditions are 6xSSC at approximately 45°C, followed by one or more washes in 0.2xSSC, 0.1% SDS at 60°C; 3) high stringency hybridization conditions are 6xSSC at approximately 45°C, followed by one or more washes in 0.2xSSC, 0.1% SDS at 65°C; and, preferably 4) very high stringency hybridization conditions are 0.5 M sodium phosphate, 7% SDS at 65°C, followed by one or more washes at
- 30 045940- 30 045940
0,2xSSC, 1% SDS при 65°C. Предпочтительными условиями являются условия очень высокой строгости (4) и условия, которые следует использовать, если не указано иное.0.2xSSC, 1% SDS at 65°C. The preferred conditions are the very high stringency conditions (4) and the conditions that should be used unless otherwise noted.
Следует понимать, что молекулы по настоящему изобретению могут иметь дополнительные консервативные замены или замены заменимых аминокислот, которые не оказывают существенного влияния на их функции.It should be understood that the molecules of the present invention may have additional conservative substitutions or substitutions of nonessential amino acids that do not significantly affect their functions.
Предполагается, что термин аминокислота охватывает все молекулы, как природные, так и синтетические, которые включают одновременно амино-функциональность и кислотную функциональность, и могут быть включены в полимер из аминокислот природного происхождения. Примеры аминокислот включают природные аминокислоты, их аналоги, производные и родственные аминокислоты; аминокислотные аналоги, имеющие вариантные боковые цепи; и все стереоизомеры любого из вышеперечисленных примеров. Используемый в изобретении термин аминокислота включает и D- и L-оптические изомеры и пептидомиметики.The term amino acid is intended to encompass all molecules, both natural and synthetic, that include both amino functionality and acid functionality and can be incorporated into a polymer of naturally occurring amino acids. Examples of amino acids include natural amino acids, analogs, derivatives and related amino acids; amino acid analogues having variant side chains; and all stereoisomers of any of the above examples. As used herein, the term amino acid includes both D- and L-optical isomers and peptidomimetics.
Консервативная аминокислотная замена представляет собой замену, в которой аминокислотный остаток заменен на аминокислотный остаток, имеющий сходную боковую цепь. В данной области были определены семейства аминокислотных остатков, имеющих сходные боковые цепи. Эти семейства включают аминокислоты с основными боковыми цепями (например, лизин, аргинин, гистидин), кислотными боковыми цепями (например, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота), незаряженными полярными боковыми цепями (например, глицин, аспарагин, глутамин, серин, треонин, тирозин, цистеин), неполярными боковыми цепями (например, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин, триптофан), бета-разветвленными боковыми цепями (например, треонин, валин, изолейцин) и ароматическими боковыми цепями (например, тирозин, фенилаланин, триптофан, гистидин).A conservative amino acid substitution is a substitution in which an amino acid residue is replaced by an amino acid residue having a similar side chain. In this area, families of amino acid residues having similar side chains have been identified. These families include amino acids with basic side chains (e.g., lysine, arginine, histidine), acidic side chains (e.g., aspartic acid, glutamic acid), uncharged polar side chains (e.g., glycine, asparagine, glutamine, serine, threonine, tyrosine, cysteine), non-polar side chains (e.g. alanine, valine, leucine, isoleucine, proline, phenylalanine, methionine, tryptophan), beta-branched side chains (e.g. threonine, valine, isoleucine) and aromatic side chains (e.g. tyrosine, phenylalanine , tryptophan, histidine).
Термины полипептид, пептид и белок (при единственной цепи) используются в изобретении взаимозаменяемо для обозначения аминокислотных полимеров любой длины. Такой полимер может быть линейным или разветвленным, он может содержать модифицированные аминокислоты, и он может прерываться не аминокислотами. Эти термины также охватывают аминокислотный полимер, который был модифицирован, например, путем образования дисульфидной связи, гликозилирования, липидирования, ацетилирования, фосфорилирования или любой другой манипуляцией, такой как конъюгация с компонентом для мечения. Полипептид может быть выделен из природных источников, может быть получен рекомбинантными способами из эукариотического или прокариотического хозяина, или может быть продуктом синтеза.The terms polypeptide, peptide and protein (when single chain) are used interchangeably in the invention to refer to amino acid polymers of any length. Such a polymer may be linear or branched, it may contain modified amino acids, and it may be interrupted by non-amino acids. These terms also include an amino acid polymer that has been modified, for example, by disulfide bond formation, glycosylation, lipidation, acetylation, phosphorylation, or any other manipulation such as conjugation to a labeling moiety. The polypeptide may be isolated from natural sources, may be produced recombinantly from a eukaryotic or prokaryotic host, or may be the product of synthesis.
Термины нуклеиновая кислота, последовательность нуклеиновой кислоты, нуклеотидная последовательность или полинуклеотидная последовательность и полинуклеотид используются взаимозаменяемо. Эти термины относятся к полимерной форме нуклеотидов любой длины, или дезоксирибонуклеотидов или рибонуклеотидов, или их аналогов. Полинуклеотид может быть одноцепочечным или двухцепочечным, и если он является одноцепочечным, может представлять собой кодирующую цепь или некодирующую (антисмысловую) цепь. Полинуклеотид может содержать модифицированные нуклеотиды, такие как метилированные нуклеотиды и нуклеотидные аналоги. Последовательность нуклеотидов может прерываться не нуклеотидными компонентами. Полинуклеотид может быть дополнительно модифицирован после полимеризации, например, путем конъюгации с компонентом для мечения. Нуклеиновая кислота может представлять собой рекомбинантный полинуклеотид, может происходить из кДНК или быть полинуклеотидом геномного, полусинтетического или синтетического происхождения, который или не встречается в природе, или связан с другим полинуклеотидом в неестественной конфигурации.The terms nucleic acid, nucleic acid sequence, nucleotide sequence or polynucleotide sequence and polynucleotide are used interchangeably. These terms refer to the polymeric form of nucleotides of any length, or deoxyribonucleotides or ribonucleotides, or analogs thereof. The polynucleotide may be single-stranded or double-stranded, and if single-stranded, may be a coding strand or a non-coding (antisense) strand. The polynucleotide may contain modified nucleotides, such as methylated nucleotides and nucleotide analogues. The nucleotide sequence may be interrupted by non-nucleotide components. The polynucleotide may be further modified after polymerization, for example, by conjugation with a labeling component. The nucleic acid may be a recombinant polynucleotide, may be derived from cDNA, or may be a polynucleotide of genomic, semisynthetic, or synthetic origin that is either not naturally occurring or is linked to another polynucleotide in an unnatural configuration.
Термин выделенный, используемый в изобретении, относится к материалу, который был перемещен из исходной или нативной среды (например, из природной среды, если этот материал имеет природное происхождение). Например, природный полинуклеотид или полипептид, присутствующий в живом организме животного, не является выделенным, но тот же самый полинуклеотид или полипептид, отделенный посредством вмешательства человека от некоторых или всех совместно существующих в природной системе материалов, является выделенным. Такие полинуклеотиды могут быть частью вектора, и/или такие полинуклеотиды или полипептиды могут быть частью композиции, и, тем не менее, являться выделенными в таком векторе или композиции, которые не являются частью среды, в которой они находятся в природе.The term isolated, as used herein, refers to material that has been removed from its original or native environment (eg, from the natural environment if the material is of natural origin). For example, a naturally occurring polynucleotide or polypeptide present in a living animal is not isolated, but the same polynucleotide or polypeptide separated by human intervention from some or all of the co-existing materials in the natural system is isolated. Such polynucleotides may be part of a vector, and/or such polynucleotides or polypeptides may be part of a composition and yet be isolated in such a vector or composition that are not part of the environment in which they naturally occur.
Различные аспекты настоящего изобретения описаны более подробно ниже. Дополнительные определения изложены в тексте описания.Various aspects of the present invention are described in more detail below. Additional definitions are set out in the description text.
Молекулы антител.Antibody molecules.
В одном варианте осуществления молекула антитела связывается с PD-1 млекопитающего, например, человека. Например, молекула антитела специфично связывается с эпитопом на PD-1, например, с линейным или конформационным эпитопом (например, эпитопом, описанным в изобретении).In one embodiment, the antibody molecule binds to PD-1 of a mammal, such as a human. For example, the antibody molecule specifically binds to an epitope on PD-1, such as a linear or conformational epitope (eg, an epitope described in the invention).
Используемое в изобретении понятие молекула антитела относится к белку, например, к цепи иммуноглобулина или его фрагмента, содержащей, по меньшей мере одну последовательность вариабельного домена иммуноглобулина. В понятие молекула антитела включено, например, моноклональное антитело (в том числе полноразмерное антитело, которое имеет Fc-область иммуноглобулина). ВAs used herein, the term antibody molecule refers to a protein, for example an immunoglobulin chain or fragment thereof, containing at least one immunoglobulin variable domain sequence. The term antibody molecule includes, for example, a monoclonal antibody (including a full-length antibody that has an immunoglobulin Fc region). IN
- 31 045940 одном варианте осуществления молекула антитела содержит полноразмерное антитело, или полноразмерную цепь иммуноглобулина. В одном варианте осуществления молекула антитела содержит антигенсвязывающий фрагмент или функциональный фрагмент полноразмерного антитела или полноразмерной цепи иммуноглобулина.- 31 045940 In one embodiment, the antibody molecule contains a full-length antibody, or a full-length immunoglobulin chain. In one embodiment, the antibody molecule contains an antigen-binding fragment or a functional fragment of a full-length antibody or a full-length immunoglobulin chain.
В одном варианте осуществления молекула антитела представляет собой молекулу моноспецифичного антитела и связывается с единственным эпитопом. Например, молекула моноспецифичного антитела может иметь множество иммуноглобулиновых последовательностей вариабельных доменов, каждая из которых связывается с одним и тем же эпитопом.In one embodiment, the antibody molecule is a monospecific antibody molecule and binds to a single epitope. For example, a monospecific antibody molecule may have multiple immunoglobulin variable domain sequences, each of which binds to the same epitope.
В одном варианте осуществления молекула антитела представляет собой молекулу мультиспецифичного антитела, например, она содержит множество последовательностей вариабельных областей иммуноглобулина, при этом первая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина из этого множества обладает специфичностью связывания в отношении первого эпитопа, и вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина из этого множества обладает специфичностью связывания в отношении второго эпитопа. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы расположены на одном и том же антигене, например, на одном и том же белке (или субъединице мультимерного белка). В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы перекрываются. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы не перекрывают друг друга. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы расположены на разных антигенах, например, на разных белках (или на разных субъединицах мультимерного белка). В одном варианте осуществления молекула мультиспецифичного антитела содержит третий, четвертый или пятый вариабельный домен иммуноглобулина. В одном варианте осуществления молекула мультиспецифичного антитела представляет собой молекулу биспецифичного антитела, молекулу триспецифичного антитела или молекулу тетраспецифичного антитела.In one embodiment, the antibody molecule is a multispecific antibody molecule, for example, it contains a plurality of immunoglobulin variable region sequences, wherein a first immunoglobulin variable domain sequence of the plurality has binding specificity for a first epitope, and a second immunoglobulin variable domain sequence of the plurality has binding specificity for the second epitope. In one embodiment, the first and second epitopes are located on the same antigen, for example, on the same protein (or subunit of a multimeric protein). In one embodiment, the first and second epitopes overlap. In one embodiment, the first and second epitopes do not overlap each other. In one embodiment, the first and second epitopes are located on different antigens, for example, on different proteins (or on different subunits of a multimeric protein). In one embodiment, the multispecific antibody molecule comprises a third, fourth, or fifth immunoglobulin variable domain. In one embodiment, the multispecific antibody molecule is a bispecific antibody molecule, a trispecific antibody molecule, or a tetraspecific antibody molecule.
В одном варианте осуществления молекула мультиспецифичного антитела представляет собой молекулу биспецифичного антитела. Биспецифичное антитело обладает специфичностью в отношении не более двух антигенов. Молекула биспецифичного антитела характеризуется наличием первой последовательности вариабельного домена иммуноглобулина, которая обладает специфичностью связывания в отношении первого эпитопа, и второй последовательности вариабельного домена иммуноглобулина, которая обладает специфичностью связывания в отношении второго эпитопа. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы расположены на одном и том же антигене, например, на одном и том же белке (или субъединице мультимерного белка). В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы перекрываются. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы не перекрывают друг друга. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы расположены на разных антигенах, например, на разных белках (или разных субъединицах мультимерного белка). В одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи и последовательность вариабельного домена легкой цепи, которые имеют специфичность связывания в отношении первого эпитопа, и последовательности вариабельного домена тяжелой цепи и последовательность вариабельного домена легкой цепи, которые имеют специфичность связывания в отношении второго эпитопа. В одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела содержит полуантитело, обладающее специфичностью связывания с первым эпитопом, и полуантитело, обладающее специфичностью связывания со вторым эпитопом. В одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела содержит полуантитело или его фрагмент, обладающие специфичностью связывания с первым эпитопом, и полуантитело или его фрагмент, обладающие специфичностью связывания со вторым эпитопом. В одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела содержит ScFv или его фрагмент, обладающий специфичностью связывания с первым эпитопом, и ScFv или его фрагмент, обладающий специфичностью связывания со вторым эпитопом. В одном варианте осуществления первый эпитоп расположен на PD-1, а второй эпитоп расположен на TIM-3, LAG-3, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1 и/или СЕАСАМ-5), PD-L1 или PD-L2.In one embodiment, the multispecific antibody molecule is a bispecific antibody molecule. A bispecific antibody has specificity for no more than two antigens. A bispecific antibody molecule is characterized by having a first immunoglobulin variable domain sequence that has binding specificity for a first epitope and a second immunoglobulin variable domain sequence that has binding specificity for a second epitope. In one embodiment, the first and second epitopes are located on the same antigen, for example, on the same protein (or subunit of a multimeric protein). In one embodiment, the first and second epitopes overlap. In one embodiment, the first and second epitopes do not overlap each other. In one embodiment, the first and second epitopes are located on different antigens, for example, on different proteins (or different subunits of a multimeric protein). In one embodiment, the bispecific antibody molecule comprises a heavy chain variable domain sequence and a light chain variable domain sequence that have binding specificity for a first epitope, and a heavy chain variable domain sequence and a light chain variable domain sequence that have binding specificity for a second epitope. . In one embodiment, the bispecific antibody molecule comprises a half-antibody having binding specificity for a first epitope and a half-antibody having binding specificity for a second epitope. In one embodiment, a bispecific antibody molecule comprises a half-antibody or fragment thereof having a binding specificity for a first epitope and a half-antibody or fragment thereof having a binding specificity for a second epitope. In one embodiment, the bispecific antibody molecule comprises a ScFv or fragment thereof having binding specificity for a first epitope, and a ScFv or fragment thereof having binding specificity for a second epitope. In one embodiment, the first epitope is located on PD-1 and the second epitope is located on TIM-3, LAG-3, SEACAM (eg, SEACAM-1 and/or SEACAM-5), PD-L1, or PD-L2.
В одном варианте осуществления молекула антитела содержит диатело и одноцепочечную молекулу, а также антигенсвязывающий фрагмент антитела (например, Fab, F (ab')2 и Fv). Например, молекула антитела может включать последовательность вариабельного домена тяжелой (Н) цепи (сокращенно обозначенной в изобретении как VH) и последовательность вариабельного домена легкой (L) цепи (сокращенно обозначенной в изобретении как VL). В одном варианте осуществления молекула антитела содержит или состоит из тяжелой цепи и легкой цепи (называемой в изобретении полуантителом). В другом примере, молекула антитела включает две последовательности вариабельного домена тяжелой (Н) цепи и две последовательности вариабельного домена легкой (L) цепи, образуя тем самым два антигенсвязывающих участка, такие как Fab, Fab', F(ab')2, Fc, Fd, Fd', Fv, одноцепочечные антитела (ScFv, например), антитела с единственным вариабельным доменом, диатела (Dab) (бивалентные и биспецифичные) и химерные (например, гуманизированные) антитела, которые могут быть получены путем модификации целых антител или синтезированы de novo с помощью рекомбинантных ДНК-технологий. Эти функциональные фрагменты антитела сохраняют способность селективно связываться с их соответствующим антигеном или рецептором. Антитела и фрагменты антител могут относиться к любому типуIn one embodiment, the antibody molecule comprises a diabody and a single chain molecule, as well as an antigen binding fragment of the antibody (eg, Fab, F(ab') 2 and Fv). For example, an antibody molecule may include a heavy (H) chain variable domain sequence (abbreviated herein as VH) and a light chain variable domain (L) sequence (abbreviated herein as VL). In one embodiment, the antibody molecule contains or consists of a heavy chain and a light chain (referred to herein as a semi-antibody). In another example, an antibody molecule includes two heavy (H) chain variable domain sequences and two light (L) chain variable domain sequences, thereby forming two antigen binding regions, such as Fab, Fab', F(ab') 2 , Fc, Fd, Fd', Fv, single chain antibodies (ScFv, for example), single variable domain antibodies, diabodies (Dab) (bivalent and bispecific) and chimeric (for example, humanized) antibodies, which can be obtained by modifying whole antibodies or synthesized de novo using recombinant DNA technologies. These functional antibody fragments retain the ability to selectively bind to their corresponding antigen or receptor. Antibodies and antibody fragments can be of any type
- 32 045940 антител, включая без ограничения IgG, IgA, IgM, IgD и IgE, и к любому подтипу антител (например, IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4). Препарат из молекул антитела может быть моноклональным или поликлональным. Молекула антитела также может представлять собой человеческое, гуманизированное, CDRтрансплантированное или созданное in vitro антитело. Антитело может иметь константную область тяжелой цепи, выбранную, например, из IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4. Антитело также может иметь легкую цепь, выбранную, например, из цепей каппа или лямбда. Термин иммуноглобулин (Ig) используется взаимозаменяемо с термином антитело.- 32 045940 antibodies, including without limitation IgG, IgA, IgM, IgD and IgE, and to any subtype of antibodies (for example, IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4). The antibody molecule preparation may be monoclonal or polyclonal. The antibody molecule may also be a human, humanized, CDR-transplanted or in vitro generated antibody. The antibody may have a heavy chain constant region selected from, for example, IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4. The antibody may also have a light chain selected from, for example, kappa or lambda chains. The term immunoglobulin (Ig) is used interchangeably with the term antibody.
Примеры антигенсвязывающих фрагментов молекулы антитела включают: (I) Fab-фрагмент, моновалентный фрагмент, состоящий из доменов VL, VH, CL и СН1; (II) F(ab')2-фрагмент, бивалентный фрагмент, содержащий два Fab-фрагмента, связанных дисульфидным мостиком в шарнирной области; (III) Fd фрагмент, состоящий из доменов VH и СН1; (IV) Fv фрагмент, состоящий из доменов VL и VH одного плеча антитела; (V) фрагмент диатела (dAb), который состоит из домена VH; (VI) верблюжий или камелизированный вариабельный домен; (VII) одноцепочечный Fv (ScFv), см., например, публикации Bird et al. (1988) Science 242: 423-426; и Huston et al. (1988), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 5879-5883); (VIII) однодоменное антитело. Указанные фрагменты антител получены с помощью общепринятых способов, известных специалистам в данной области, и эти фрагменты подвергают скринингу на полезность таким же образом, как и интактные антитела.Examples of antigen binding fragments of an antibody molecule include: (I) Fab fragment, a monovalent fragment consisting of VL, VH, CL and CH1 domains; (II) F(ab') 2 fragment, a bivalent fragment containing two Fab fragments linked by a disulfide bridge in the hinge region; (III) Fd fragment consisting of VH and CH1 domains; (IV) Fv fragment consisting of the VL and VH domains of one arm of the antibody; (V) a diabody fragment (dAb), which consists of a VH domain; (VI) camelized or camelized variable domain; (VII) single chain Fv (ScFv), see, for example, Bird et al. (1988) Science 242: 423-426; and Huston et al. (1988), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 5879-5883); (VIII) single domain antibody. These antibody fragments are prepared using conventional methods known to those skilled in the art, and these fragments are screened for utility in the same manner as intact antibodies.
Термин антитело включает интактные молекулы, а также их функциональные фрагменты. Константные области антител могут быть изменены, например, подвергаться мутации для изменения свойств антитела (например, для увеличения или уменьшения одного или нескольких следующих свойств: связывание с Fc-рецептором, гликозилирование антитела, число цистеиновых остатков, функция эффекторных клеток или функция комплемента).The term antibody includes intact molecules as well as functional fragments thereof. Antibody constant regions may be altered, eg, mutated, to change properties of the antibody (eg, to increase or decrease one or more of the following properties: Fc receptor binding, antibody glycosylation, number of cysteine residues, effector cell function, or complement function).
Молекулы антитела также могут представлять собой однодоменные антитела. Однодоменные антитела могут включать антитела, в которых гипервариабельные области являются частью однодоменного полипептида. Примеры включают без ограничения антитела с тяжелой цепью, антитела, в природе не имеющие легких цепей, однодоменные антитела, полученные из обычных 4-цепочечных антител, сконструированные антитела и однодоменные каркасы, отличных от каркасов из антител. Однодоменные антитела могут быть любыми антителами из существующего уровня техники, или любыми однодоменными антителами, полученными в будущем. Однодоменные антитела могут быть получены из любых видов, включая без ограничения мышь, человека, верблюда, ламу, рыбу, акулу, козу, кролика и крупный рогатый скот. В соответствии с другим аспектом настоящего изобретения, однодоменное антитело представляет собой встречающееся в природе однодоменное антитело, известное как антитело с тяжелой цепью, лишенное легких цепей. Такие однодоменные антитела, описаны, например, в WO 9404678. Для ясности, такой вариабельный домен, полученный из тяжелой цепи антитела, которое в природе не имеет легкой цепи, называется в изобретении VHH или нанотелом, в отличие от обычной VH четырехцепочечных иммуноглобулинов. Такая молекула VHH может быть получена из антител, которые вырабатываются у видов Camelidae, например, у верблюдов, лам, одногорбых верблюдов, альпака и гуанако. Другие виды, кроме Camelidae, могут вырабатывать антитела с тяжелыми цепями, в природе не имеющие легкой цепи; такие VHH входят в объем настоящего изобретения.Antibody molecules can also be single domain antibodies. Single domain antibodies may include antibodies in which the hypervariable regions are part of a single domain polypeptide. Examples include, but are not limited to, heavy chain antibodies, antibodies that do not naturally have light chains, single domain antibodies derived from conventional 4 chain antibodies, engineered antibodies, and single domain scaffolds other than antibody scaffolds. Single domain antibodies can be any antibodies in the prior art, or any single domain antibodies produced in the future. Single domain antibodies can be obtained from any species, including, without limitation, mouse, human, camel, llama, fish, shark, goat, rabbit and cattle. According to another aspect of the present invention, the single domain antibody is a naturally occurring single domain antibody known as a heavy chain antibody lacking light chains. Such single-domain antibodies are described, for example, in WO 9404678. For clarity, such a variable domain derived from the heavy chain of an antibody that does not naturally have a light chain is referred to in the invention as a VHH or nanobody, in contrast to the conventional VH of four-chain immunoglobulins. Such a VHH molecule can be derived from antibodies produced in Camelidae species such as camels, llamas, dromedary camels, alpacas and guanacos. Species other than Camelidae can produce heavy chain antibodies that do not naturally have a light chain; such VHH are included within the scope of the present invention.
Области VH и VL подразделяют на участки гипервариабельности, называемые гипервариабельными областями (CDR), чередующиеся с участками, которые являются более консервативными и называются каркасными областями (FR или FW).The VH and VL regions are divided into regions of hypervariability, called hypervariable regions (CDR), interspersed with regions that are more conserved, called framework regions (FR or FW).
Протяженность каркасной области и областей CDR точно установлена с помощью ряда способов (см. Kabat, E.A., et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242; Chothia, С et al. (1987) J. Mol. Biol. 196:901917; и определение AbM, используемое в программном обеспечении Oxford Molecular для моделирования антител AbM. См. общую информацию, например, Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains. в издании: Antibody Engineering Lab Manual (Ed.: Duebel, S. and Kontermann, R., Springer-Verlag, Heidelberg).The extent of the framework and CDR regions has been accurately determined by a number of methods (see Kabat, E.A., et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242 Chothia, C et al (1987) J Mol Biol 196:901917 and the definition of AbM used in Oxford Molecular software for modeling AbM antibodies See general information, e.g. Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains in: Antibody Engineering Lab Manual (Ed.: Duebel, S. and Kontermann, R., Springer-Verlag, Heidelberg).
Термины область, определяющая комплементарность и CDR, используемые в изобретении, относятся к последовательностям аминокислот в пределах вариабельных участков антитела, которые придают антигенную специфичность и аффинность связывания. Обычно три области CDR имеются в каждой вариабельной области тяжелой цепи (HCDR1, HCDR2, HCDR3), и три области CDR имеются в каждой вариабельной области легкой цепи (LCDR1, LCDR2, LCDR3).The terms complementarity determining region and CDR as used herein refer to amino acid sequences within the variable regions of an antibody that confer antigen specificity and binding affinity. Typically, three CDR regions are present in each heavy chain variable region (HCDR1, HCDR2, HCDR3), and three CDR regions are present in each light chain variable region (LCDR1, LCDR2, LCDR3).
Точные границы аминокислотной последовательности рассматриваемой CDR могут быть определены с использованием любой из ряда общеизвестных схем, в том числе с помощью систем, описанных Kabat et al. (1991), Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (схема нумерации no Kabat), Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (схема нумерации по Chothia). Согласно изобретению, определенные с пмощью системы нумерации по Chothia области CDR также иногда называются гипервариабельными петлями.The precise boundaries of the amino acid sequence of the CDR in question can be determined using any of a number of well-known schemes, including the systems described by Kabat et al. (1991), Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (numbering scheme no Kabat), Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (numbering scheme no. Chothia). According to the invention, CDR regions defined using the Chothia numbering system are also sometimes referred to as hypervariable loops.
Например, согласно системе Kabat, аминокислотные остатки CDR в вариабельной области тяжелой цепи (VH) имеют нумерацию 31-35 (HCDR1), 50-65 (HCDR2) и 95-102 (HCDR3); и аминокислотные осFor example, according to the Kabat system, the CDR amino acid residues in the heavy chain variable region (VH) are numbered 31-35 (HCDR1), 50-65 (HCDR2) and 95-102 (HCDR3); and amino acids
- 33 045940 татки CDR в вариабельной области легкой цепи (VL) имеют нумерацию 24-34 (LCDR1), 50-56 (LCDR2) и 89-97 (LCDR3). Согласно системе Chothia, аминокислотные остатки CDR в VH имеют нумерацию 26-32 (HCDR1), 52-56 (HCDR2) и 95-102 (HCDR3); и аминокислотные остатки в VL имеют нумерацию 26-32 (LCDR1), 50-52 (LCDR2) и 91-96 (LCDR3). При объединении определений CDR в соответствии с нумерацией по Kabat и с нумерацией по Chothia получают следующую схему нумерации: CDR состоят из аминокислотных остатков 26-35 (HCDR1), 50-65 (HCDR2) и 95-102 (HCDR3) в человеческой VH, и из аминокислотных остатков 24-34 (LCDR1), 50-56 (LCDR2) и 89-97 (LCDR3) в человеческой VL.- 33 045940 The CDRs in the light chain variable region (VL) are numbered 24-34 (LCDR1), 50-56 (LCDR2) and 89-97 (LCDR3). According to the Chothia system, the CDR amino acid residues in VH are numbered 26-32 (HCDR1), 52-56 (HCDR2) and 95-102 (HCDR3); and amino acid residues in VL are numbered 26-32 (LCDR1), 50-52 (LCDR2) and 91-96 (LCDR3). When combining the CDR definitions according to the Kabat numbering and the Chothia numbering, the following numbering scheme is obtained: CDRs consist of amino acid residues 26-35 (HCDR1), 50-65 (HCDR2) and 95-102 (HCDR3) in human VH, and from amino acid residues 24-34 (LCDR1), 50-56 (LCDR2) and 89-97 (LCDR3) in human VL.
В общем, если специально не указано, то молекулы антитела против PD-1 могут включать любую комбинацию из одной или нескольких областей CDR по Kabat и/или гипервариабельных петель по Chothia, например, указанных в табл. 1. В одном варианте осуществления используются следующие определения для молекул антитела против PD-1, указанных в табл. 1: HCDR1 в соответствии с объединенными определениями CDR и по системе Kabat и по системе Chothia, и области HCCDR 2-3 и LCCDR 1-3 в соответствии с определением CDR по системе Kabat. В соответствии со всеми определениями, каждая из VH и VL обычно включает три области CDR и четыре FR, расположенные от амино-конца к карбоксиконцу в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4.In general, unless specifically stated, anti-PD-1 antibody molecules may include any combination of one or more Kabat CDR regions and/or Chothia hypervariable loops, such as those listed in Table 1. 1. In one embodiment, the following definitions are used for the anti-PD-1 antibody molecules listed in Table. 1: HCDR1 according to the combined Kabat and Chothia CDR definitions, and HCCDR 2-3 and LCCDR 1-3 regions according to the Kabat CDR definition. By all definitions, each of VH and VL typically includes three CDR regions and four FRs, arranged from amino terminus to carboxy terminus in the following order: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4.
Используемое в изобретении понятие последовательность вариабельного домена иммуноглобулина относится к аминокислотной последовательности, которая может образовывать структуру вариабельного домена иммуноглобулина. Например, последовательность может включать все или часть аминокислотной последовательности природного вариабельного домена. Например, последовательность может не включать или может включать одну, две или больше N- или С-концевых аминокислот, или может включать другие изменения, которые совместимы с образованием структуры белка.As used herein, the term immunoglobulin variable domain sequence refers to an amino acid sequence that can form the structure of an immunoglobulin variable domain. For example, the sequence may include all or part of the amino acid sequence of a natural variable domain. For example, the sequence may not include or may include one, two or more N- or C-terminal amino acids, or may include other changes that are compatible with the formation of the protein structure.
Термин антиген-связывающий сайт относится к части молекулы антитела, содержащей детерминанты, образующие поверхность, которая связывается с PD-1 полипептидом или с его эпитопом. В отношении белков (или белковых миметиков), антиген-связывающий сайт обычно включает одну или несколько петель (по меньшей мере четырех аминокислот или аминокислотных мимиков), образующих поверхность, которая связывается с полипептидом PD-1. Обычно антиген-связывающий сайт молекулы антитела включает по меньшей мере одну или две области CDR и/или гипервариабельные петли, или более типично, по меньшей мере три, четыре, пять или шесть областей CDR и/или гипервариабельных петель.The term antigen-binding site refers to the portion of an antibody molecule containing surface-forming determinants that binds to a PD-1 polypeptide or an epitope thereof. For proteins (or protein mimics), the antigen-binding site typically includes one or more loops (of at least four amino acids or amino acid mimics) forming a surface that binds to the PD-1 polypeptide. Typically, the antigen binding site of an antibody molecule includes at least one or two CDR regions and/or hypervariable loops, or more typically at least three, four, five or six CDR regions and/or hypervariable loops.
Термины конкурировать или перекрестно конкурировать используются в изобретении взаимозаменяемо для обозначения способности молекулы антитела препятствовать связыванию молекулы антитела против PD-1, например, молекулы антитела против PD-1 по изобретению, с мишенью, например, с человеческим PD-1. Препятствие для связывания может быть прямым или опосредованным (например, путем аллостерической модуляции молекулы антитела или мишени). Степень, с которой молекула антитела может препятствовать связыванию другой молекулы антитела с мишенью, и, следовательно, возможность считать это конкуренцией, может быть определена с помощью анализа конкурентного связывания, например, анализа FACS, анализов ELISA или BIACORE. В некоторых вариантах осуществления анализ конкурентного связывания представляет собой количественный анализ конкуренции. В некоторых вариантах осуществления считается, что первая молекула антитела против PD-1 конкурирует за связывание с мишенью со второй молекулой антитела против PD-1, если связывание первой молекулы антитела с мишенью снижается на 10% или больше, например, на 20% или больше, на 30% или больше, наThe terms compete or cross-compete are used interchangeably herein to refer to the ability of an antibody molecule to interfere with the binding of an anti-PD-1 antibody molecule, such as an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, to a target, such as human PD-1. The interference with binding may be direct or indirect (eg, through allosteric modulation of the antibody molecule or target). The extent to which an antibody molecule can interfere with the binding of another antibody molecule to a target, and therefore whether it can be considered competition, can be determined using a competitive binding assay, such as a FACS assay, ELISA or BIACORE assay. In some embodiments, the competitive binding assay is a quantitative competition assay. In some embodiments, the first anti-PD-1 antibody molecule is considered to compete for target binding with a second anti-PD-1 antibody molecule if binding of the first anti-PD-1 antibody molecule to the target is reduced by 10% or more, such as by 20% or more, by 30% or more, by
40% или больше, на 50% или больше, на 55% или больше, на 60% или больше, на 65% или больше, на40% or more, 50% or more, 55% or more, 60% or more, 65% or more,
70% или больше, на 75% или больше, на 80% или больше, на 85% или больше, на 90% или больше, на70% or more, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more,
95% или больше, на 98% или больше, на 99% или больше, согласно анализу конкурентного связывания (например, описанному в изобретении конкурентному анализу).95% or greater, 98% or greater, 99% or greater, according to a competitive binding assay (eg, a competitive binding assay described herein).
Термины моноклональное антитело или композиция моноклонального антитела в контексте настоящего изобретения относятся к препарату из молекул антител единой молекулярной композиции. Композиция моноклональнах антител проявляет единственную специфичность связывания и аффинность к конкретному эпитопу. Моноклональные антитела могут быть получены путем гибридомной технологии или с помощью способов, в которых не применяется гибридомная технология (например, рекомбинантными способами).The terms monoclonal antibody or monoclonal antibody composition in the context of the present invention refer to a preparation of antibody molecules of a single molecular composition. A monoclonal antibody composition exhibits a single binding specificity and affinity for a particular epitope. Monoclonal antibodies can be produced by hybridoma technology or by methods that do not use hybridoma technology (eg, recombinant methods).
Эффективно человеческий белок представляет собой белок, который не вызывает ответ, нейтрализующий антитело, например, ответ человеческого анти-мышиного антитела (НАМА). В ряде случает использование НАМА может быть проблематичным, например, если молекулу антитела вводят повторно, например, при лечении хронического или рецидивирующего патологического состояния.Effectively, a human protein is a protein that does not elicit a neutralizing antibody response, such as a human anti-mouse antibody (HAMA) response. In some cases, the use of NAMA can be problematic, for example, if the antibody molecule is repeatedly administered, for example, in the treatment of a chronic or recurrent pathological condition.
Ответ HAMA может сделать повторное введение антител потенциально неэффективным по причине повышенного клиренса антител из сыворотки (см., например, Saleh et al., Cancer Immunol. Immunother., 32:180-190 (1990)), а также по причине потенциальных аллергических реакций (см., например, LoBuglio et al., Hybridoma, 5:5117-5123 (1986)).The HAMA response may render repeated antibody administration potentially ineffective due to increased antibody clearance from serum (see, e.g., Saleh et al., Cancer Immunol. Immunother., 32:180-190 (1990)), as well as potential allergic reactions. (See, for example, LoBuglio et al., Hybridoma, 5:5117-5123 (1986)).
Молекула антитела может быть поликлональным или моноклональным антителом. В других вариантах осуществления антитело может быть получено рекомбинантным способом, например, получено с помощью фагового дисплея или комбинаторными способами.The antibody molecule may be a polyclonal or monoclonal antibody. In other embodiments, the antibody may be produced recombinantly, such as by phage display or combinatorial methods.
- 34 045940- 34 045940
Способы фагового дисплея и комбинаторные способы создания антител известны в данной области (и описаны, например, в следующих публикациях: Ladner et al. патент США № 5223409; Kang et al. Международная опубликованная заявка № WO 92/18619; Dower et al. Международная опубликованная заявка No. WO 91/17271; Winter et al. Международная опубликованная заявка WO 92/20791; Markland et al. Международная опубликованная заявка No. WO 92/15679; Breitling et al. Международная опубликованная заявка WO 93/01288; McCafferty et al. Международная опубликованная заявка WO 92/01047; Garrard et al. Международная опубликованная заявка WO 92/09690; Ladner et al. Международная опубликованная заявка WO 90/02809; Fuchs et al. (1991) Bio/Technology 9:1370-1372; Hay et al. (1992) Hum. Antibod. Hybridomas 3:81-85; Huse et al. (1989) Science 246:1275-1281; Griffths et al. (1993) EMBO J 12:725-734; Hawkins et al. (1992) J. Mol. Biol. 226:889-896; Clackson et al. (1991) Nature 352:624-628; Gram et al. (1992) PNAS 89:3576-3580; Garrad et al. (1991) Bio/Technology 9:1373-1377; Hoogenboom et al. (1991) Nuc. Acid Res. 19:4133-4137; и Barbas et al. (1991) PNAS 88:7978-7982, и содержание всех из указанных публикаций включено в изобретение в качестве ссылки).Phage display methods and combinatorial methods for generating antibodies are known in the art (and are described, for example, in the following publications: Ladner et al. US Patent No. 5223409; Kang et al. International Published Application No. WO 92/18619; Dower et al. International Published Application Application No. WO 91/17271; Winter et al. International Published Application WO 92/20791; Markland et al. International Published Application No. WO 92/15679; Breitling et al. International Published Application WO 93/01288; McCafferty et al. International Published Application WO 92/01047 Garrard et al International Published Application WO 92/09690 Ladner et al International Published Application WO 90/02809 Fuchs et al (1991) Bio/Technology 9:1370-1372 Hay et al al (1992) Hum Antibod Hybridomas 3:81-85 Huse et al (1989) Science 246:1275-1281 Griffths et al (1993) EMBO J 12:725-734 Hawkins et al ( 1992) J Mol Biol 226:889-896 Clackson et al (1991) Nature 352:624-628 Gram et al (1992) PNAS 89:3576-3580 Garrad et al. (1991) Bio/Technology 9:1373-1377; Hoogenboom et al. (1991) Nuc. Acid Res. 19:4133-4137; and Barbas et al. (1991) PNAS 88:7978-7982, and the contents of all of these publications are incorporated by reference).
В одном варианте осуществления антитело представляет собой полностью человеческое антитело (например, антитело, полученное в мышах, которые были созданы генно-инженерным способом для получения антитела из человеческой последовательности иммуноглобулина), или антитело, не являющееся человеческим, например, антитело грызунов (мышей или крыс), козы, приматов, (например, обезьяны), верблюда. Предпочтительно антитело, не являющееся человеческим, представляет собой антитело грызунов (мышиное или крысиное антитело). Способы получения антител грызунов известны в данной области.In one embodiment, the antibody is a fully human antibody (e.g., an antibody produced in mice that have been genetically engineered to produce the antibody from a human immunoglobulin sequence), or a non-human antibody, such as an antibody from a rodent (mice or rat) ), goats, primates (e.g. monkeys), camels. Preferably, the non-human antibody is a rodent antibody (mouse or rat antibody). Methods for producing rodent antibodies are known in the art.
Человеческие моноклональные антитела могут быть получены с использованием трансгенных мышей, несущих гены человеческого иммуноглобулина, в отличие от мышиной системы. Спленоциты таких трансгенных мышей, иммунизированных представляющим интерес антигеном, используют для получения гибридом, которые секретируют человеческие mAb с конкретной аффинностью к эпитопам из человеческого белка (см., например, Wood et al. Международная заявка WO 91/00906, Kucherlapati et al. Опубликованная заявка РСТ WO 91/10741; Lonberg et al. Международная заявка WO 92/03918; Kay et al. Международная заявка 92/03917; Lonberg, N. et al. 1994 Nature 368:856-859; Green, L.L. et al. 1994 Nature Genet. 7:13-21; Morrison, S.L. et al. 1994 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855; Bruggeman et al. 1993 Year Immunol. 7:33-40; Tuaillon et al. 1993 PNAS 90:3720-3724; Bruggeman et al. 1991 Eur. J. Immunol 21:1323-1326).Human monoclonal antibodies can be produced using transgenic mice carrying human immunoglobulin genes, as opposed to the mouse system. Splenocytes from such transgenic mice immunized with the antigen of interest are used to produce hybridomas that secrete human mAbs with specific affinities for epitopes from human proteins (see, for example, Wood et al. International Application WO 91/00906, Kucherlapati et al. Published Application PCT WO 91/10741; Lonberg et al. International application WO 92/03918; Kay et al. International application 92/03917; Lonberg, N. et al. 1994 Nature 368:856-859; Green, L.L. et al. 1994 Nature Genet 7:13-21; Morrison, S. L. et al. 1994 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855; Bruggeman et al. 1993 Year Immunol. 7:33-40; Tuaillon et al. 1993 PNAS 90:3720-3724; Bruggeman et al 1991 Eur J Immunol 21:1323-1326).
Антитело может представлять собой антитело, в котором вариабельная область или ее часть, например, CDR, создается не в человеческом организме, например, в организме крысы или мыши. В объем настоящего изобретения входят химерные, CDR-трансплантированные и гуманизированные антитела. В объем настоящего изобретения входят антитела, которые получены не в человеческом организме, например, в организме крысы или мыши, а затем модифицированы, например, в вариабельной каркасной области или в константной области, с целью уменьшить антигенности для человека.The antibody may be an antibody in which the variable region or part thereof, such as a CDR, is generated in a non-human body, such as a rat or mouse. The present invention includes chimeric, CDR-grafted and humanized antibodies. The present invention includes antibodies that are produced in a non-human body, for example in a rat or mouse, and then modified, for example in the variable framework or constant region, to reduce antigenicity in humans.
Химерные антитела могут быть получены способами в рекомбинантной ДНК, известными в данной области (см. Robinson et al.,, Международная опубликованная патентная заявка PCT/US86/02269; Akira, et al., заявка на Европейский патент 184187; Taniguchi, M., заявка на Европейский патент 171496; Morrison et al., заявка на Европейский патент 173494; Neuberger et al., Международная заявка WO 86/01533; Cabilly et al. патент США № 4816567; Cabilly et al., заявка на Европейский патент 125023; Better et al. (1988 Science 240:1041-1043); Liu et al. (1987) PNAS 84:3439-3443; Liu et al., 1987, J. Immunol. 139:35213526; Sun et al. (1987) PNAS 84:214-218; Nishimura et al., 1987, Cane. Res. 47:999-1005; Wood et al. (1985) Nature 314:446-449; и Shaw et al., 1988, J. Natl. Cancer Inst. 80:1553-1559).Chimeric antibodies can be produced by methods in recombinant DNA known in the art (see Robinson et al., International Patent Application Published PCT/US86/02269; Akira, et al., European Patent Application 184187; Taniguchi, M., European Patent Application 171496; Morrison et al., European Patent Application 173494; Neuberger et al., International Application WO 86/01533; Cabilly et al., US Patent No. 4816567; Cabilly et al., European Patent Application 125023; Better et al (1988 Science 240:1041-1043) Liu et al (1987) PNAS 84:3439-3443 Liu et al 1987 J Immunol 139:35213526 Sun et al (1987) PNAS 84:214-218; Nishimura et al., 1987, Cane. Res. 47:999-1005; Wood et al. (1985) Nature 314:446-449; and Shaw et al., 1988, J. Natl. Cancer Inst. 80:1553–1559).
Гуманизированное или CDR-трансплантированное антитело будет иметь по меньшей мере одну или две, но обычно все три области CDR - реципиенты (из тяжелых и/или легких цепей иммуноглобулина), которые заменены на области CDR - доноры. В антителе можно ввести замены, которые представляют собой по меньшей мере часть из нечеловеческой CDR, или только некоторые из областей CDR могут быть заменены нечеловеческими CDR. Нужно только заменить некоторые области CDR, необходимые для связывания гуманизированного антитела с PD-1. Предпочтительно, чтобы донором являлось антитело грызунов, например, крысиное или мышиное антитело, и реципиентом являлся бы человеческий каркас или человеческий консенсусный каркас. Обычно иммуноглобулин, несущий CDR, называется донором, а иммуноглобулин, несущий каркас, называется акцептором. В одном варианте осуществления иммуноглобулин-донор не является человеческим (например, получен от грызунов). Каркас-акцептор имеет каркас природного происхождения (например, человеческий), или консенсусный каркас, или последовательность, которая идентична им приблизительно на 85% или выше, предпочтительно на 90, 95, 99% или с более высокой степенью идентичности.A humanized or CDR-grafted antibody will have at least one or two, but typically all three, recipient CDR regions (from immunoglobulin heavy and/or light chains) that are replaced by donor CDR regions. Substitutions can be introduced into an antibody that are at least a portion of the non-human CDR, or only some of the CDR regions can be replaced with non-human CDRs. It is only necessary to replace certain CDR regions required for the humanized antibody to bind to PD-1. Preferably, the donor is a rodent antibody, such as a rat or mouse antibody, and the recipient is a human scaffold or human consensus scaffold. Typically, the immunoglobulin carrying the CDR is called the donor, and the immunoglobulin bearing the scaffold is called the acceptor. In one embodiment, the donor immunoglobulin is non-human (eg, derived from rodents). The acceptor framework has a naturally occurring (eg, human) framework or consensus framework or sequence that is approximately 85% or greater identical thereto, preferably 90, 95, 99% or higher identical.
Используемый в изобретении термин консенсусная последовательность относится к последовательности, образованной из наиболее часто встречающихся аминокислот (или нуклеотидов) в семействе родственных последовательностей (см., например, Winnaker, From Genes to Clones (Verlagsgesellschaft, Weinheim, Germany 1987). В семействе белков каждое положение в консенсусной последовательности занято аминокислотой, наиболее часто встречающейся в этом положении в этом семействе. Если двеAs used herein, the term consensus sequence refers to a sequence formed from the most frequently occurring amino acids (or nucleotides) in a family of related sequences (see, for example, Winnaker, From Genes to Clones (Verlagsgesellschaft, Weinheim, Germany 1987). In a family of proteins, each position in the consensus sequence is occupied by the amino acid most frequently found at that position in that family.If two
- 35 045940 аминокислоты встречаются одинаково часто, каждая из них может быть включена в консенсусную последовательность. Термин консенсусный каркас относится к каркасной области в консенсусной последовательности иммуноглобулина.- 35 045940 amino acids are equally common, each of them can be included in the consensus sequence. The term consensus framework refers to a framework region in an immunoglobulin consensus sequence.
Антитело можно гуманизировать способами, известными в данной области (см., например, Morrison, S. L., 1985, Science 229:1202-1207, Oi et al., 1986, BioTechniques 4:214, Queen et al., патенты США US 5585089, US 5693761 и US 5693762, и содержание всех из указанных публикаций включено в настоящее изобретение в качестве ссылки).The antibody can be humanized by methods known in the art (see, for example, Morrison, S. L., 1985, Science 229:1202-1207, Oi et al., 1986, BioTechniques 4:214, Queen et al., US patents US 5585089, US 5693761 and US 5693762, and the contents of all of these publications are incorporated into the present invention by reference).
Гуманизированные или CDR-трансплантированные антитела могут быть получены путем трансплантации CDR или замены CDR, при этом могут быть заменены одна, две или все области CDR из цепи иммуноглобулина. См., например, патент США 5225539; Jones et al. 1986 Nature 321:552-525; Verhoeyan et al. 1988 Science 239:1534; Beidler et al. 1988 J. Immunol. 141:4053-4060; Winter, патент США 5225539, и содержание всех из указанных публикаций включено в настоящее изобретение в качестве ссылки. Автором Winter описан способ трансплантации CDR, которые можно применять для получения гуманизированных антител по настоящему изобретению (патентная заявка Великобритании GB 2188638A, поданная 26 марта 1987 г., Winter, патент US 5225539), содержание которых включено в изобретение в качестве ссылки.Humanized or CDR-grafted antibodies can be produced by CDR grafting or CDR replacement, wherein one, two, or all of the CDR regions of an immunoglobulin chain can be replaced. See, for example, US Pat. No. 5,225,539; Jones et al. 1986 Nature 321:552-525; Verhoeyan et al. 1988 Science 239:1534; Beidler et al. 1988 J. Immunol. 141:4053-4060; Winter, US Pat. No. 5,225,539, and the contents of all of these publications are incorporated herein by reference. Winter has described a method for transplanting CDRs that can be used to produce humanized antibodies of the present invention (GB Patent Application GB 2188638A, filed March 26, 1987, Winter US Patent 5,225,539), the contents of which are incorporated by reference herein.
Также в объем настоящего изобретения входят гуманизированные антитела, в которых были заменены, удалены или добавлены специфичные аминокислоты. Критерии отбора аминокислот от донора описаны в патенте США 5585089, например, в столбцах 12-16 из патента США 5585089, например, в столбцах 12-16 из патента США 5585089, содержание которого включено в изобретение в качестве ссылки. Другие способы гуманизации антител описаны авторами Padlan et al., ЕР 519596 A1, дата публикации 23 декабря 1992 г.Also included within the scope of the present invention are humanized antibodies in which specific amino acids have been replaced, deleted, or added. Criteria for selecting amino acids from a donor are described in US Pat. No. 5,585,089, for example in columns 12-16 of US Pat. No. 5,585,089, for example in columns 12-16 of US Pat. No. 5,585,089, the contents of which are incorporated herein by reference. Other methods for humanizing antibodies are described by Padlan et al., EP 519596 A1, publication date December 23, 1992.
Молекула антитела может представлять собой одноцепочечное антитело. Одноцепочечное антитело (ScFv) может быть создано генно-инженерным способом (см., например, Colcher, D. et al. (1999) Алл. N. Y. Acad. Sci . 880:263-80; и Reiter, Y. (1996) Clin. Cancer Res. 2:245-52). Одноцепочечное антитело может подвергаться димеризации или мультимеризации для создания поливалентных антител, обладающих специфичностью в отношении разных эпитопов одного и того же белка-мишени.The antibody molecule may be a single chain antibody. A single chain antibody (ScFv) can be generated by genetic engineering (see, for example, Colcher, D. et al. (1999) All. N. Y. Acad. Sci. 880:263-80; and Reiter, Y. (1996) Clin Cancer Res 2:245-52). A single chain antibody can undergo dimerization or multimerization to create multivalent antibodies that have specificity for different epitopes of the same target protein.
В других вариантах осуществления молекула антитела имеет константную область тяжелой цепи, которая выбрана, например, из константных областей тяжелой цепи IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD и IgE; в частности, выбрана, например, из константных областей тяжелой цепи IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4 (например, из человеческих последовательностей). В другом варианте осуществления молекула антитела имеет константную область легкой цепи, которая выбрана, например, из константных областей легкой каппа-цепи или лямбда-цепи (например, из человеческих последовательностей). Константная область может быть изменена, например, подвергается мутации для модификации свойств антитела (например, для увеличения или уменьшения одного или нескольких из следующих свойств: связывание с Fc-рецептором, гликозилирование антитела, число остатков цистеина, функция эффекторных клеток и/или функция комплемента). В одном варианте осуществления антитело обладает эффекторной функцией и может фиксировать комплемент. В других вариантах осуществления антитело не рекрутирует эффекторные клетки или не фиксирует комплемент. В другом варианте осуществления у антитела снижена или отсутствует способность к связыванию с Fc-рецептором. Например, оно является изотипом или подтипом, фрагментом или другим мутантом, который не обладает способностью к связыванию с Fcрецептором, например, в нем имеется мутантная область связывания с Fc-рецептором или делеция этой области.In other embodiments, the antibody molecule has a heavy chain constant region that is selected, for example, from the heavy chain constant regions of IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD, and IgE; in particular, selected from, for example, the heavy chain constant regions of IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4 (eg, human sequences). In another embodiment, the antibody molecule has a light chain constant region that is selected, for example, from kappa light chain or lambda chain constant regions (eg, human sequences). The constant region may be altered, e.g., mutated, to modify properties of the antibody (e.g., to increase or decrease one or more of the following properties: Fc receptor binding, antibody glycosylation, number of cysteine residues, effector cell function, and/or complement function) . In one embodiment, the antibody has effector function and can fix complement. In other embodiments, the antibody does not recruit effector cells or fix complement. In another embodiment, the antibody has reduced or absent ability to bind to the Fc receptor. For example, it is an isotype or subtype, fragment or other mutant that lacks the ability to bind to the Fc receptor, for example, it has a mutant Fc receptor binding region or a deletion of this region.
Способы изменения константной области антитела известны в данной области. Антитела с измененной функцией, например, с измененной аффинностью к эффекторному лиганду, такому как FcR на клетке, или С1 компонент комплемента, могут быть получены путем замены по меньшей мере одного аминокислотного остатка в константной части антитела на другой остаток (см., например, патент ЕР 388151 А1, патент США 5624821 и патент США № 5648260, содержание которых включено в настоящее изобретение в качестве ссылки). Можно описать сходный тип изменений, введение которых в мышиный иммуноглобулин или в другие виды иммуноглобулина будет приводить к снижению или устранению указанных функций.Methods for altering the constant region of an antibody are known in the art. Antibodies with altered function, for example, with altered affinity for an effector ligand, such as an FcR on a cell, or a C1 complement component, can be obtained by replacing at least one amino acid residue in the constant portion of the antibody with another residue (see, for example, the patent EP 388151 A1, US Patent 5624821 and US Patent No. 5648260, the contents of which are incorporated by reference herein). It is possible to describe a similar type of change, the introduction of which into murine immunoglobulin or other types of immunoglobulin will lead to a decrease or elimination of these functions.
Молекула антитела может быть дериватизирована или присоединена к другой функциональной молекуле (например, к другому пептиду или белку). Используемый в изобретении термин дериватизированная молекула антитела относится к модифицированной молекуле. Способы дериватизации включают без ограничения добавление флуоресцентного фрагмента, радионуклида, токсина, фермента или аффинного лиганда, такого как биотин. Таким образом, предполагается, что молекулы антитела по изобретению включают дериватизированные и иным образом модифицированные формы антител по изобретению, в том числе молекулы иммуноадгезии. Например, молекула антитела может быть функционально связана (путем химического присоединения, генетического слияния, нековалентной ассоциации или другим способом) с одним или несколькими другими молекулярными частицами, такими как другое антитело (например, биспецифичное антитело или диатело), детектируемое вещество, цитотоксическое вещество, фармацевтическое вещество и/или белок или пептид, который может опосредовать ассоциацию антиThe antibody molecule may be derivatized or attached to another functional molecule (eg, another peptide or protein). As used herein, the term derivatized antibody molecule refers to a modified molecule. Derivatization methods include, but are not limited to, the addition of a fluorescent moiety, radionuclide, toxin, enzyme, or affinity ligand such as biotin. Thus, it is intended that the antibody molecules of the invention include derivatized and otherwise modified forms of the antibodies of the invention, including immunoadhesion molecules. For example, an antibody molecule may be operably linked (by chemical coupling, genetic fusion, non-covalent association, or other means) to one or more other molecular entities, such as another antibody (e.g., a bispecific antibody or diabody), a detectable substance, a cytotoxic substance, a pharmaceutical substance and/or protein or peptide that can mediate the association of anti
- 36 045940 тела или части антитела с другой молекулой (например, с коровым участком стрептавидина или полигистидиновой меткой).- 36 045940 body or part of an antibody with another molecule (for example, with a streptavidin core region or a polyhistidine tag).
Один тип дериватизированной молекулы антитела получают путем сшивания двух или нескольких антител (одного и того же типа или разных типов, например, для создания биспецифичных антител). Подходящие сшивающие вещества включают гетеробифункциональные вещества, которые имеют две различные реактивные группы, разделенные подходящим спейсером (таким как сложный эфир тмалеимидобензоил-Ы-гидроксисукцинимида), или гомобифункциональные вещества (например, дисукцинимидилсуберат). Такие линкеры доступны от компании Pierce Chemical, III.One type of derivatized antibody molecule is made by linking two or more antibodies (of the same type or different types, for example to create bispecific antibodies). Suitable cross-linking agents include heterobifunctional agents that have two different reactive groups separated by a suitable spacer (such as tmaleimidobenzoyl-N-hydroxysuccinimide ester), or homobifunctional agents (for example, disuccinimidyl suberate). Such linkers are available from Pierce Chemical, III.
Полезные детектируемые вещества, с которыми можно дериватизировать (или сделать меченую) молекулу антитела по изобретению, включают флуоресцентные соединения, различные ферменты, простетические группы, люминесцентные материалы, биолюминесцентные материалы, атомы металлов, испускающие флуоресцентное излучение, например, европий (Eu), и другие антаниды и радиоактивные вещества (описанные ниже). Иллюстративные флуоресцентные детектируемые вещества включают флуоресцеин, изотиоцианат флуоресцеина, родамин, 5-диметиламин-1-хлорид-нафталенсульфонил хлорид, фикоэритрин и тому подобное. Антитело может быть также дериватизировано с помощью детектируемых ферментов, таких как щелочная фосфатаза, пероксидаза хрена, β-галактозидаза, ацетилхолинэстераза, глюкозооксидаза и тому подобное. При дериватизации антитела с детектируемым ферментом его обнаружение проводят путем добавления дополнительных реагентов, которые фермент задействует для выработки выявляемого продукта реакции. Например, если присутствует детектируемое вещество пероксидаза хрена, добавление перекиси водорода и диаминобензидина приводит к получению окрашенного продукта реакции, который может быть обнаружен. Молекула антитела также может быть дериватизирована с простетической группой (например, стрептавидин/биотин и авидин/биотин). Например, антитело может быть дериватизировано с использованием биотина, и обнаружение проводят посредством непрямого измерения связывания авидина или стрептавидина. Примеры подходящих флуоресцентных материалов включают умбеллиферон, флуоресцеин, флуоресцеин изотиоцианат, родамин, флуоресцеин дихлортриазиниламин, дансилхлорид или фикоэритрин; пример люминесцентного материала включает люминол; и примеры биолюминисцентных материалов включают люциферазу, люциферин и экворин.Useful detectable substances with which the antibody molecule of the invention can be derivatized (or labeled) include fluorescent compounds, various enzymes, prosthetic groups, luminescent materials, bioluminescent materials, metal atoms that emit fluorescent radiation, such as europium (Eu), and others antanides and radioactive substances (described below). Exemplary fluorescent detectable substances include fluorescein, fluorescein isothiocyanate, rhodamine, 5-dimethylamine-1-chloride-naphthalene sulfonyl chloride, phycoerythrin and the like. The antibody can also be derivatized with detectable enzymes such as alkaline phosphatase, horseradish peroxidase, β-galactosidase, acetylcholinesterase, glucose oxidase and the like. When an antibody is derivatized with a detectable enzyme, its detection is accomplished by adding additional reagents that the enzyme uses to produce the detectable reaction product. For example, if the detectable substance horseradish peroxidase is present, the addition of hydrogen peroxide and diaminobenzidine results in a colored reaction product that can be detected. The antibody molecule can also be derivatized with a prosthetic group (eg, streptavidin/biotin and avidin/biotin). For example, the antibody can be derivatized using biotin, and detection is carried out by indirect measurement of avidin or streptavidin binding. Examples of suitable fluorescent materials include umbelliferone, fluorescein, fluorescein isothiocyanate, rhodamine, fluorescein dichlorotriazinylamine, dansyl chloride or phycoerythrin; an example of a luminescent material includes luminol; and examples of bioluminescent materials include luciferase, luciferin and aequorin.
Меченую молекулу антитела можно использовать, например, для следующих диагностических и/или экспериментальных целей, включающих:The labeled antibody molecule can be used, for example, for the following diagnostic and/or experimental purposes, including:
(I) выделение заданного антигена стандартными способами, такими как аффинная хроматография или иммунопреципитация;(I) isolating a given antigen by standard methods such as affinity chromatography or immunoprecipitation;
(II) обнаружение заданного антигена (например, в клеточном лизате или супернатанте клеток) для оценки относительного содержания и характера экспрессии белка;(ii) detection of a given antigen (eg, in a cell lysate or cell supernatant) to assess the relative abundance and expression pattern of the protein;
(III) контроль уровни белка в тканях, как часть методики клинического анализа, например, для определения эффективности данной схемы лечения.(III) monitoring protein levels in tissues as part of a clinical analysis technique, for example, to determine the effectiveness of a given treatment regimen.
Молекулы антитела могут быть конъюгированы с другой молекулярной частицей, обычно меткой, или с терапевтическим (например, цитотоксическим или цитостатическим) средством или функциональным фрагментом. В диагностических или терапевтических целях могут применяться радиоактивные изотопы. Радиоактивные изотопы, которые могут быть присоединены к антителу против PD-1, включают без ограничения эмиттеры α-, β-или γ-излучения. Такие радиоактивные изотопы включают без ограничения йод (131I или 125I), иттрий (90Y), лютеций (177Lu), актиний (225Ас), празеодим, астатин (211At), рений (186Re), висмут (212Bi или 213Bi), индий (111In), технеций (99mTC), фосфор (32Р), родий (188Rh), серу (35S), углерод (14С), тритий (3Н), хром (51Cr), хлор (36Cl), кобальт (57Со или 58Со), железо (59Fe), селен (75Se) или галлий (67Ga). Применяемые в качестве терапевтических средств радиоактивные изотопы включают иттрий (90Y), лютеций (177Lu), актиний (225Ас), празеодим, астатин (211At), рений (186Re), висмут (212Bi или 213Bi) и родий (188Rh). Радиоактивные изотопы, используемые в качестве меток, например, для применения в диагностике, включают йод (131I или 125I), индий (111В), технеций (99mTC), фосфор (32Р), углерод (14С) и тритий (3Н), или один или несколько вышеперечисленных терапевтических изотопов.The antibody molecules may be conjugated to another molecular entity, typically a label, or to a therapeutic (eg, cytotoxic or cytostatic) agent or functional moiety. Radioactive isotopes can be used for diagnostic or therapeutic purposes. Radioactive isotopes that can be attached to the anti-PD-1 antibody include, but are not limited to, α-, β-, or γ-ray emitters. Such radioactive isotopes include, but are not limited to, iodine ( 131 I or 125 I), yttrium ( 90 Y), lutetium ( 177 Lu), actinium ( 225 Ac), praseodymium, astatine ( 211 At), rhenium ( 186 Re), bismuth ( 212 Bi or 213 Bi), indium (111In), technetium ( 99 mTC), phosphorus ( 32 P), rhodium ( 188 Rh), sulfur ( 35 S), carbon ( 14 C), tritium ( 3 H), chromium ( 51 Cr), chlorine ( 36 Cl), cobalt ( 57 Co or 58 Co), iron ( 59 Fe), selenium ( 75 Se) or gallium ( 67 Ga). Radioactive isotopes used as therapeutic agents include yttrium ( 90 Y), lutetium ( 177 Lu), actinium ( 225 Ac), praseodymium, astatine ( 211 At), rhenium ( 186 Re), bismuth ( 212 Bi or 213 Bi), and rhodium ( 188 Rh). Radioactive isotopes used as tracers, for example for diagnostic applications, include iodine ( 131 I or 125 I), indium (111B), technetium ( 99 mTC), phosphorus ( 32 P), carbon ( 14 C) and tritium ( 3 H), or one or more of the above therapeutic isotopes.
Настоящее изобретение относится к радиомеченым молекулам антител и к способам их мечения. В одном варианте осуществление раскрыт способ мечения молекулы антитела. Способ включает контактирование молекулы антитела с хелатирующим веществом, в результате чего получают конъюгированное антитело. К конъюгированному антителу присоединяют радиоактивную метку с радиоизотопом, например, 111индии, 90иттрии и 177лютеции, и таким образом получают молекулу меченого антитела.The present invention relates to radiolabeled antibody molecules and methods for labeling them. In one embodiment, a method of labeling an antibody molecule is disclosed. The method involves contacting an antibody molecule with a chelating agent, resulting in a conjugated antibody. A radiolabel with a radioisotope, for example, 111 indium, 90 yttrium and 177 lutetium, is attached to the conjugated antibody, thereby obtaining a labeled antibody molecule.
Как описано выше, молекула антитела может быть конъюгирована с терапевтическим средством. Терапевтические активные радиоизотопы упомянуты выше. Примеры других терапевтических веществ включают таксол, цитохалазин, грамицидин D, бромид этидия, эметин, митомицин, этопозид, тенопозид, винкристин, винбластин, колхицин, доксорубицин, даунорубицин, дигидроксиантрациндион, митоксантрон, митрамицин, актиномицин D, 1-дегидротестостерон, глюкокортикоиды, прокаин, тетракаин, лидокаин, пропранолол, пуромицин, майтанзиноиды, например, майтанзинол (см. патент США 5208020), СС1065 (см. патенты США 5475092, 5585499, 5846545) и их аналоги или гомологи. Терапевтические средства включают без ограничения антиметаболиты (например, метотрексат, 6-меркаптопурин, 6-тиогуанин,As described above, the antibody molecule can be conjugated to a therapeutic agent. Therapeutic active radioisotopes are mentioned above. Examples of other therapeutic agents include taxol, cytochalasin, gramicidin D, ethidium bromide, emetine, mitomycin, etoposide, tenoposide, vincristine, vinblastine, colchicine, doxorubicin, daunorubicin, dihydroxyanthracinedione, mitoxantrone, mithramycin, actinomycin D, 1-dehydrotestosterone, glucocorticoids, procaine, tetracaine, lidocaine, propranolol, puromycin, maytansinoids, for example, maytansinol (see US patent 5208020), CC1065 (see US patents 5475092, 5585499, 5846545) and their analogs or homologues. Therapeutics include, but are not limited to, antimetabolites (eg, methotrexate, 6-mercaptopurine, 6-thioguanine,
- 37 045940 цитарабин, 5-фторурацил, дакарбазин), алкилирующие вещества (например, мехлорэтамин, тиотепа, хлорамбуцил, СС-1065, мелфалан, кармустин (BSNU) и ломустин (CCNU), циклофосфамид, бусульфан, дибромманнитол, стрептозотоцин, митомицин С и цис-дихлордиамин платины (II) (DDP) цисплатин), антрациклины (например, даунорубицин (ранее дауномицин) и доксорубицин), антибиотики (например, дактиномицин (ранее актиномицин), блеомицин, митрамицин и антрамицин (АМС)), и антимитотические вещества (например, винкристин, винбластин, таксол и майтанзиноиды).- 37 045940 cytarabine, 5-fluorouracil, dacarbazine), alkylating agents (e.g. mechlorethamine, thiotepa, chlorambucil, CC-1065, melphalan, carmustine (BSNU) and lomustine (CCNU), cyclophosphamide, busulfan, dibromomannitol, streptozotocin, mitomycin C and platinum(II) cis-dichlorodiamine (DDP) cisplatin), anthracyclines (eg, daunorubicin (formerly daunomycin) and doxorubicin), antibiotics (eg, dactinomycin (formerly actinomycin), bleomycin, mithramycin and anthramycin (AMC)), and antimitotic agents ( e.g. vincristine, vinblastine, taxol and maytansinoids).
В одном из аспектов настоящее изобретение относится к способу получения связывающей молекулы направленного действия, которая специфично связывается с рецептором PD-1. Например, связывающая молекула направленного действия представляет собой молекулу антитела. Указанный способ включает: получение белка-мишени, в котором содержится по меньшей мере часть нечеловеческого белка, часть, которая гомологична (по меньшей мере идентична на 70, 75, 80, 85, 87, 90, 92, 94, 95, 96, 97, 98%) соответствующей части человеческого белка-мишени, но отличается по меньшей мере одной аминокислотой (например, по меньшей мере на одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять или аминокислот); получение молекулы антитела, которое специфично связывается с антигеном; и оценку эффективности связывающего вещества в модулирования активности белка-мишени. Способ может дополнительно включать введение человеку связывающего вещества (например, молекулы антитела) или его производного (например, молекулы гуманизированного антитела).In one aspect, the present invention provides a method for producing a targeted binding molecule that specifically binds to the PD-1 receptor. For example, the targeting binding molecule is an antibody molecule. The method includes: obtaining a target protein that contains at least a portion of the non-human protein, a portion that is homologous (at least 70, 75, 80, 85, 87, 90, 92, 94, 95, 96, 97 identical) , 98%) of the corresponding portion of the human target protein, but differs in at least one amino acid (eg, by at least one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine or amino acids); producing an antibody molecule that specifically binds to an antigen; and assessing the effectiveness of the binder in modulating the activity of the target protein. The method may further include administering to a human a binder (eg, an antibody molecule) or a derivative thereof (eg, a humanized antibody molecule).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела представляет собой мультиспецифичную (например, биспецифичную или триспецифичную) молекулу антитела. Протоколы создания биспецифичных или гетеродимерных молекул антитела известны в данной области и включают без ограничения, например, подход выступ во впадину, описанный, например, в патенте США 5731168; спаривание Fc электростатическим взаимодействием, как описано, например, в заявках WO 09/089004, WO 06/106905 и WO 2010/129304; образование гетеродимера способом SEED (Strand Exchange Engineered Domains - домены, сконструированные обменом цепей), как описано, например, в WO 07/110205; замена плеча Fab, как описано, например, в заявках WO 08/119353, WO 2011/131746 и WO 2013/060867; конъюгат двойного антитела, например, сшивание антитела с амино-реакционноспособной группой и сульфгидрильной реакционноспособной группой для создания биспецифичной структуры с использованием гетеробифункционального реагента, как описано, например, в патенте США 4433059; детерминанты биспецифичного антитела, созданные путем рекомбинации полуантител (пар тяжелых - легких цепей или FABS) от разных антител через цикл восстановления и окисления дисульфидных связей между двумя тяжелыми цепями, как описано, например, в патенте США 4444878; трифункциональные антитела, например, три Fab'-фрагмента, сшитые через сульфгидрильные реакционноспособные группы, как описано, например, в патенте США 5273743; биосинтетические связывающие белки, например, пара scFvs, сшитая через Сконцевые хвосты предпочтительно посредством химического сшивания в реакции с дисульфидом или амином, как описано, например, в патенте США 5534254; бифункциональные антитела, например, Fabфрагменты с разной специфичностью связывания, димеризованные посредством лейциновых застежекмолний (например, c-fos и c-jun), которые заменяют константный домен, как описано, например, в патенте США 5582996; биспецифичные и олигоспецифичные моно- и олиговалентные рецепторы, например, VH-CH1 области двух антител (два Fab-фрагмента), соединенные через полипептидный спейсер между СН1 областью одного антитела и VH областью другого антитела, обычно с ассоциированными легкими цепям, как описано, например, в патенте США 559182 8; биспецифичные конъюгаты ДНК-антитело, например, сшивание антител или Fab-фрагментов с помощью двухцепочечного участка ДНК, как описано, например, в патенте США 5635602; биспецифичные слитые белки, например, экспрессионная конструкция, содержащая два scFv с гидрофильным спиральным пептидным линкером между ними и полной константной областью, как описано, например, в патенте США 5637481; мультивалентные и мультиспецифичные связывающие белки, например, димер из полипептидов, имеющих первый домен со связывающей областью из вариабельной области тяжелой цепи Ig, и второй домен со связывающей областью из вариабельной области легкой цепи Ig, которые обычно называются димерами (также раскрыты структуры высшего порядка, образующие биспецифичные, триспецифичные или тетраспецифичные молекулы, как описано, например, в патенте США 5837242); конструкции минитела со связанными цепями VL и VH, дополнительно присоединенные через пептидные спейсеры к шарнирной области антитела и к области СНЗ, которые могут быть димеризованы для образования биспецифичной/поливалентной молекулы, как описано, например, в патенте США 5837821; VH и VL домены, связанные через короткий пептидный линкер (например, длиной 5 или 10 аминокислот), или вообще без линкера в любой ориентации, которые могут образовывать димеры с образованием биспецифичных диател; тримеры и тетрамеры, как описано, например, в патенте США 5844094; нить доменов VH (или доменов VL в членах семейства), соединенных пептидными связями со сшиваемыми группами на С-конце, дополнительно связанной с доменами VL, для образования серии из FV (или из scFv), как описано, например, в патенте США 5864019; и одноцепочечные связывающие полипептиды с доменом VH и доменом VL, связанные через пептидный линкер, объединены в поливалентные структуры посредством нековалентного или химического сшивания с образованием, например, гомобивалентных, гетеробивалентных, трехвалентных и четырехвалентных структур, в которых задействован и формат типа ScFv или формат типа диатела, какIn some embodiments, the antibody molecule is a multispecific (eg, bispecific or trispecific) antibody molecule. Protocols for creating bispecific or heterodimeric antibody molecules are known in the art and include, but are not limited to, for example, the prong-to-valley approach described, for example, in US Pat. No. 5,731,168; pairing Fc by electrostatic interaction, as described, for example, in applications WO 09/089004, WO 06/106905 and WO 2010/129304; formation of a heterodimer by the SEED (Strand Exchange Engineered Domains) method, as described, for example, in WO 07/110205; replacing the Fab arm as described, for example, in WO 08/119353, WO 2011/131746 and WO 2013/060867; a double antibody conjugate, for example, cross-linking an antibody with an amino-reactive group and a sulfhydryl-reactive group to create a bispecific structure using a heterobifunctional reagent, as described, for example, in US Pat. No. 4,433,059; bispecific antibody determinants created by recombination of semi-antibodies (heavy-light chain pairs or FABS) from different antibodies through a cycle of reduction and oxidation of disulfide bonds between two heavy chains, as described, for example, in US patent 4444878; trifunctional antibodies, for example, three Fab' fragments cross-linked through sulfhydryl reactive groups, as described, for example, in US patent 5273743; biosynthetic binding proteins, for example, a pair of scFvs cross-linked through terminal tails, preferably by chemical cross-linking in reaction with a disulfide or amine, as described, for example, in US patent 5534254; bifunctional antibodies, eg, Fab fragments with different binding specificities, dimerized through leucine zippers (eg, c-fos and c-jun), which replace the constant domain, as described, for example, in US patent 5582996; bispecific and oligospecific mono- and oligovalent receptors, for example, the VH-CH1 region of two antibodies (two Fab fragments), connected through a polypeptide spacer between the CH1 region of one antibody and the VH region of another antibody, usually with associated light chains, as described, for example, in US patent 559182 8; bispecific DNA-antibody conjugates, for example, cross-linking antibodies or Fab fragments using a double-stranded DNA region, as described, for example, in US patent 5635602; bispecific fusion proteins, for example, an expression construct containing two scFvs with a hydrophilic coiled-coil peptide linker between them and a full constant region, as described, for example, in US Pat. No. 5,637,481; multivalent and multispecific binding proteins, for example, a dimer of polypeptides having a first domain with an Ig heavy chain variable region binding region, and a second domain with an Ig light chain variable region binding region, which are commonly referred to as dimers (higher order structures forming bispecific, trispecific or tetraspecific molecules, as described, for example, in US patent 5837242); minibody constructs with linked VL and VH chains, further attached via peptide spacers to the antibody hinge region and the CH3 region, which can be dimerized to form a bispecific/multivalent molecule, as described, for example, in US Pat. No. 5,837,821; VH and VL domains linked via a short peptide linker (eg, 5 or 10 amino acids long), or no linker at all, in any orientation, which can form dimers to form bispecific diabodies; trimers and tetramers, as described, for example, in US patent 5844094; a string of VH domains (or VL domains in family members) linked by peptide bonds with stitchable groups at the C-terminus, further linked to VL domains to form a series of FVs (or scFvs), as described, for example, in US Pat. No. 5,864,019; and single chain VH domain and VL domain binding polypeptides linked through a peptide linker are combined into multivalent structures by non-covalent or chemical cross-linking to form, for example, homobivalent, heterobivalent, trivalent and tetravalent structures involving both the ScFv-type format or the diabody-type format , How
- 38 045940 описано, например, в патенте США 5869620. Дополнительные примеры мультиспецифичных и биспецифичных молекул и способы их получения можно найти, например, в патентах и опубликованных патентных заявках №№ US 5910573, US 5932448, US 5959083, US 5989830, US 6005079, US 6239259, US- 38 045940 is described, for example, in US patent 5869620. Additional examples of multispecific and bispecific molecules and methods for their preparation can be found, for example, in patents and published patent applications Nos. US 5910573, US 5932448, US 5959083, US 5989830, US 6005079, US 6239259, US
6294353, US 6333396, US 6476198, US 6511663, US 6670453, US 6743896, US 6809185, US 6833441, US6294353, US 6333396, US 6476198, US 6511663, US 6670453, US 6743896, US 6809185, US 6833441, US
7129330, US 7183076, US 7521056, US 7527787, US 7534866, US 7612181, US 2002004587 A1, US7129330, US 7183076, US 7521056, US 7527787, US 7534866, US 7612181, US 2002004587 A1, US
2002076406 A1, US2002076406 A1, US
2004220388 A1, US2004220388 A1, US
2005079170 A1, US2005079170 A1, US
2005266425 А1, US2005266425 A1, US
2007004909 A1, US2007004909 A1, US
2007274985 A1, US2007274985 A1, US
2008241884 A1, US2008241884 A1, US
2009155275 A1, US2009155275 A1, US
2002103345 A1, US2002103345 A1, US
2004242847 A1, US2004242847 A1, US
2005100543 A1, US2005100543 A1, US
2006083747 A1, US2006083747 A1, US
2007087381 A1, US2007087381 A1, US
2008050370 A1, US2008050370 A1, US
2008254512 A1, US2008254512 A1, US
2009162359 A1, US2009162359 A1, US
2003207346 А1, US2003207346 A1, US
2005003403 A1, US2005003403 A1, US
2005136049 A1, US2005136049 A1, US
2006120960 A1, US2006120960 A1, US
2007128150 A1, US2007128150 A1, US
2008069820 A1, US2008069820 A1, US
2008260738 A1, US2008260738 A1, US
2009162360 А1, US2009162360 A1, US
2003211078 A1, US2003211078 A1, US
2005004352 A1, US2005004352 A1, US
2005136051 A1, US2005136051 A1, US
2006204493 A1, US2006204493 A1, US
2007141049 A1, US2007141049 A1, US
2008152645 A1, US2008152645 A1, US
2009130106 A1, US2009130106 A1, US
2009175851 A1, US2009175851 A1, US
2004219643 A1, US2004219643 A1, US
2005069552 A1, US2005069552 A1, US
2005163782 А1, US2005163782 A1, US
2006263367 А1, US2006263367 A1, US
2007154901 A1, US2007154901 A1, US
2008171855 A1, US2008171855 A1, US
2009148905 A1, US2009148905 A1, US
2009175867 А1, US2009175867 A1, US
2009232811 A1, US 2009234105 A1, US 2009263392 А1, US 2009274649 А1, ЕР 346087 А2, WO 0006605 A2, WO 02072635 А2, WO 04081051 A1, WO 06020258 A2, WO 2007044887 A2, WO 2007095338 A2, WO 2007137760 А2, WO 2008119353 A1, WO 2009021754 A2, WO 2009068630 А1, WO 9103493 A1, WO2009232811 A1, US 2009234105 A1, US 2009263392 A1, US 2009274649 A1, EP 346087 A2, WO 0006605 A2, WO 02072635 A2, WO 04081051 A1, WO 06020258 A 2, WO 2007044887 A2, WO 2007095338 A2, WO 2007137760 A2, WO 2008119353 A1 , WO 2009021754 A2, WO 2009068630 A1, WO 9103493 A1, WO
9323537 A1, WO 9409131 A1, WO 9412625 A2, WO 9509917 A1, WO 9637621 A2, WO 9964460 A1. Содержание указанных выше заявок включено в изобретении в качестве ссылки в полном объеме.9323537 A1, WO 9409131 A1, WO 9412625 A2, WO 9509917 A1, WO 9637621 A2, WO 9964460 A1. The contents of the above applications are incorporated in the invention by reference in their entirety.
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 (например, молекула моноспецифичного, биспецифичного или мультиспецифичного антитела) ковалентно связана, например, слита, с другим партнером, например, с белком, например, с одним, двумя или несколькими цитокинами, например, в виде слитой молекулы, например, слитого белка. В других вариантах осуществления слитая молекула содержит один или несколько белков, например, один, два или несколько цитокинов. В одном варианте осуществления цитокин представляет собой интерлейкин (IL), выбранный из одного, двух, трех или нескольких интерлейкинов IL-1, IL-2, IL-12, IL-15 или IL-21. В одном варианте осуществления молекула биспецифичного антитела обладает первой связывающей специфичностью по отношению к первой мишени (например, PD-1), второй связывающей специфичностью по отношению ко второй мишени (например, LAG-3 или TIM-3), и необязательно связана с доменом интерлейкина (например, IL-12), например, полноразмерного IL-12 или его части.In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule (e.g., a monospecific, bispecific, or multispecific antibody molecule) is covalently linked, e.g., fused, to another partner, e.g., a protein, e.g., one, two, or more cytokines, e.g. form of a fusion molecule, for example a fusion protein. In other embodiments, the fusion molecule contains one or more proteins, such as one, two, or more cytokines. In one embodiment, the cytokine is an interleukin (IL) selected from one, two, three or more interleukins IL-1, IL-2, IL-12, IL-15 or IL-21. In one embodiment, the bispecific antibody molecule has a first binding specificity for a first target (eg, PD-1), a second binding specificity for a second target (eg, LAG-3 or TIM-3), and is optionally associated with an interleukin domain (eg IL-12), eg full-length IL-12 or a portion thereof.
Понятия слитый белок и слитый полипептид относятся к полипептиду, имеющему, по меньшей мере, две ковалентно связанных друг с другом части, причем каждая из частей представляет собой полипептид с разными свойствами. Свойством может быть биологическое свойство, такое как активность в условиях in vitro или in vivo. Свойство также может представлять собой простое химическое или физическое свойство, например, связывание с молекулой-мишенью, катализ реакции и т.д. Эти две части могут быть связаны напрямую посредством единственной пептидной связи или через пептидный линкер, но располагаться в рамке считывания друг с другом.The terms fusion protein and fusion polypeptide refer to a polypeptide having at least two moieties covalently linked to each other, each moiety being a polypeptide with different properties. The property may be a biological property, such as activity in vitro or in vivo. The property may also be a simple chemical or physical property, such as binding to a target molecule, catalyzing a reaction, etc. The two moieties may be linked directly through a single peptide bond or through a peptide linker but be in frame with each other.
Настоящее изобретение относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей вышеуказанную молекулу антитела, векторы и их клетки-хозяева. Молекула нуклеиновой кислоты включает без ограничения РНК, геномную ДНК и кДНК.The present invention relates to an isolated nucleic acid molecule encoding the above antibody molecule, vectors and their host cells. The nucleic acid molecule includes, but is not limited to, RNA, genomic DNA, and cDNA.
Примеры молекул антитела против PD-1.Examples of anti-PD-1 antibody molecules.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 включает:In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule includes:
(а) вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 4, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5 и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33;(a) a heavy chain variable region (VH) which comprises VHCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 4, VHCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 5 and VHCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and a light chain variable region (VL) which comprises VLCDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14 and VLCDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 33;
(b) VH, которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью, выбранную из SEQ ID NO: 1, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2 и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32;(b) VH, which contains VHCDR1 with an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 1, VHCDR2 with an amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and VHCDR3 with an amino acid sequence of SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 11 and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 32;
(c) VH, которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5 и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14 и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33; или (d) VH, которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32.(c) VH, which contains VHCDR1 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224, VHCDR2 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 and VHCDR3 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 13, VLCDR2 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 14 and VLCDR3 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 33; or (d) VH, which contains VHCDR1 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 11, and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 32.
- 39 045940- 39 045940
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит:In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises:
(I) вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая содержит аминокислотную последовательность VHCDR1, выбранную из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 или SeQ ID NO: 224; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и (II) вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32.(I) a heavy chain variable region (VH) that contains the amino acid sequence of VHCDR1 selected from SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 or SeQ ID NO: 224; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and (II) a light chain variable region (VL) which comprises VLCDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11, and VLCDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 32.
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 содержит:In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule comprises:
(I) вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая содержит аминокислотную последовательность VHCDR1, выбранную из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 224, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5, VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и (II) вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33.(I) a heavy chain variable region (VH) which contains the amino acid sequence of VHCDR1 selected from SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 224, VHCDR2 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, VHCDR3 with the amino acid sequence sequence SEQ ID NO: 3; and (II) a light chain variable region (VL) which comprises VLCDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and VLCDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 33.
В вариантах осуществления вышеуказанных молекул антитела область VHCDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1. В других вариантах осуществления VHCDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4. В других вариантах осуществления VHCDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 224.In embodiments of the above antibody molecules, the VHCDR1 region comprises the amino acid sequence SEQ ID NO: 1. In other embodiments, VHCDR1 comprises the amino acid sequence SEQ ID NO: 4. In other embodiments, VHCDR1 comprises the amino acid sequence SEQ ID NO: 224.
В вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела имеют вариабельную область тяжелой цепи, содержащую по меньшей мере одну каркасную область (FW), которая содержит любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 147, 151, 153, 157, 160, 162, 166 или 169, или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 90% идентичную указанным последовательностям, или имеющую не более двух аминокислотных замен, инсерций или делеции по сравнению с любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 147, 151, 153, 157, 160, 162, 166 или 169.In embodiments, the above antibody molecules have a heavy chain variable region comprising at least one framework (FW) region that contains any amino acid sequence of SEQ ID NO: 147, 151, 153, 157, 160, 162, 166, or 169, or an amino acid sequence that is at least 90% identical to the specified sequences, or having no more than two amino acid substitutions, insertions or deletions compared to any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 147, 151, 153, 157, 160, 162, 166 or 169 .
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела имеют вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит по меньшей мере одну каркасную область, содержащую любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 147, 151, 153, 157, 160, 162, 166 или 169.In other embodiments, the above antibody molecules have a heavy chain variable region that contains at least one framework region comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 147, 151, 153, 157, 160, 162, 166, or 169.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела имеют вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит по меньшей мере две, три, или четыре каркасные области, содержащие любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 147, 151, 153, 157, 160, 162, 166 или 169.In other embodiments, the above antibody molecules have a heavy chain variable region that contains at least two, three, or four framework regions containing any amino acid sequence of SEQ ID NO: 147, 151, 153, 157, 160, 162, 166, or 169.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат VHFW1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 147 или 151, VHFW2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 153, 157 или 160, и VHFW3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 162 или 166, и, необязательно, дополнительно содержат VHFW4 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 169.In other embodiments, the above antibody molecules comprise VHFW1 having amino acid sequence SEQ ID NO: 147 or 151, VHFW2 having amino acid sequence SEQ ID NO: 153, 157 or 160, and VHFW3 having amino acid sequence SEQ ID NO: 162 or 166, and optionally , additionally contain VHFW4 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 169.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела имеют вариабельную область легкой цепи, содержащую по меньшей мере одну каркасную область, которая содержит любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 174, 177, 181, 183, 185, 187, 191, 194, 196, 200, 202, 205 или 208, или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 90% идентичную указанным последовательностям, или имеющую не более чем две аминокислотные замены, инсерции или делеции по сравнению с любой аминокислотной последовательностью из 174, 177, 181, 183, 185, 187, 191, 194, 196, 200, 202, 205 или 208.In other embodiments, the above antibody molecules have a light chain variable region comprising at least one framework region that contains any amino acid sequence of SEQ ID NO: 174, 177, 181, 183, 185, 187, 191, 194, 196, 200 , 202, 205 or 208, or an amino acid sequence that is at least 90% identical to these sequences, or having no more than two amino acid substitutions, insertions or deletions compared to any amino acid sequence of 174, 177, 181, 183, 185, 187, 191, 194, 196, 200, 202, 205 or 208.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела имеют вариабельную область легкой цепи, которая содержит по меньшей мере одну каркасную область, содержащую любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 174, 177, 181, 183, 185, 187, 191, 194, 196, 200, 202, 205 или 208.In other embodiments, the above antibody molecules have a light chain variable region that contains at least one framework region comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 174, 177, 181, 183, 185, 187, 191, 194, 196, 200 , 202, 205 or 208.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела имеют вариабельную область легкой цепи, которая содержит по меньшей мере две, три, или четыре каркасные области, содержащие любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 174, 177, 181, 183, 185, 187, 191, 194, 196, 200, 202, 205 или 208.In other embodiments, the above antibody molecules have a light chain variable region that contains at least two, three, or four framework regions containing any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 174, 177, 181, 183, 185, 187, 191, 194, 196, 200, 202, 205 or 208.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат аминокислотную последовательность VLFW1 из SEQ ID NO: 174, 177, 181, 183, или 185, аминокислотную последовательность VLFW2 из SEQ ID NO: 187, 191 или 194, и аминокислотную последовательность VLFW3 из SEQ ID NO: 196, 200, 202 или 205, и, необязательно, дополнительно содержит VLFW4 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 208.In other embodiments, the above antibody molecules comprise the amino acid sequence of VLFW1 from SEQ ID NO: 174, 177, 181, 183, or 185, the amino acid sequence of VLFW2 from SEQ ID NO: 187, 191, or 194, and the amino acid sequence of VLFW3 from SEQ ID NO: 196, 200, 202 or 205, and optionally further comprises VLFW4 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 208.
В других вариантах осуществления вышеуказанные антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 85% идентична любой из SEQ ID NO: 38, 50, 82 или 86.In other embodiments, the above antibodies comprise a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence that is at least 85% identical to any of SEQ ID NO: 38, 50, 82, or 86.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельныйIn other embodiments, the above antibody molecules comprise a variable
- 40 045940 домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 38, 50, 82 или 86.- 40 045940 heavy chain domain containing the amino acid sequences of SEQ ID NO: 38, 50, 82 or 86.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 85% идентична любой из SEQ ID NO: 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74 или 78.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising an amino acid sequence that is at least 85% identical to any of SEQ ID NO: 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74, or 78.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74 или 78.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 42, 46, 54, 58, 62, 66, 70, 74, or 78.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 91.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52 или SEQ ID NO: 102.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52 or SEQ ID NO: 102.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 82.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 82.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 84.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 86.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 88.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 88.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержают легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 44.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 46.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 62.
В других вариантах осуществления вышеуказанные антитела содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64.In other embodiments, the above antibodies comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 64.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 70.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 70.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 72.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 72.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 74.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 74.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 76.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 76.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 78.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 78.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 80.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельныйIn other embodiments, the above antibody molecules comprise a variable
- 41 045940 домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42.- 41 045940 a heavy chain domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38, and a light chain variable domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain variable domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащмй аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 70.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain variable domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 70.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 70.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 70.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 46.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 46.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 62.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 74.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 74.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 78.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 78.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 82, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 70.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 82 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 70.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 82, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 82 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 86 and a light chain variable domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 91 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 44.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 91 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 91 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 72.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 91 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 72.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 72.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 72.
- 42 045940- 42 045940
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 44.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 64.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 72.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 72.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 72.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 72.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 76.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 76.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 80.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 72.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 84 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 72.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 84 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 88, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 88 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела выбраны из Fab, F(ab')2, Fv или одноцепочечного Fv-фрагмента (ScFv).In other embodiments, the above antibody molecules are selected from Fab, F(ab') 2 , Fv, or single chain Fv fragment (ScFv).
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат константную область тяжелой цепи, выбранную из IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a heavy chain constant region selected from IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат константную область легкой цепи, выбранную из константных областей легкой цепи каппа или лямбда.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a light chain constant region selected from kappa or lambda light chain constant regions.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат константную область тяжелой цепи IgG4 человека с мутацией в положении 228 в соответствии с нумерацией EU, или в положении 108 в последовательности SEQ ID NO: 212 или 214, и константную область легкой цепи каппа.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a human IgG4 heavy chain constant region mutated at position 228 according to EU numbering, or at position 108 in SEQ ID NO: 212 or 214, and a kappa light chain constant region.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат константную область тяжелой цепи IgG4 человека с мутацией замены серина на пролин в положении 228 в соответствии с нумерацией EU, или в положении 108 в последовательности SEQ ID NO: 212 или 214, и константную область легкой цепи каппа.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a human IgG4 heavy chain constant region with a serine to proline substitution mutation at position 228 according to EU numbering, or at position 108 in SEQ ID NO: 212 or 214, and a kappa light chain constant region.
- 43 045940- 43 045940
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат константную область тяжелой цепи IgG1 человека с мутацией замены аспарагина на аланин в положении 297 в соответствии с нумерацией EU, или в положении 180 в SEQ ID NO: 216, и константную область легкой цепи каппа.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a human IgG1 heavy chain constant region with an asparagine to alanine substitution mutation at position 297 according to EU numbering, or at position 180 in SEQ ID NO: 216, and a kappa light chain constant region.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат константную область тяжелой цепи IgG1 человека с мутацией замены аспартата на аланин в положении 265 в соответствии с нумерацией EU, или в положении 148 в SEQ ID NO: 217, и мутацией замены пролина на аланин в положении 329 в соответствии с нумерацией EU, или в положении 212 в SEQ ID NO: 217, и константную область легкой цепи каппа.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a human IgG1 heavy chain constant region with an aspartate-to-alanine mutation at position 265 in accordance with EU numbering, or at position 148 in SEQ ID NO: 217, and a proline-to-alanine mutation at position 329 in according to EU numbering, or at position 212 in SEQ ID NO: 217, and a kappa light chain constant region.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела содержат константную область тяжелой цепи IgG1 человека с мутацией замены лейцина на аланин в положении 234 в соответствии с нумерацией EU, или в положении 117 в SEQ ID NO: 218, и мутацией замены лейцина на аланин в положении 235 в соответствии с нумерацией EU, или в положение 118 в SEQ ID NO: 218, и константную область легкой цепи каппа.In other embodiments, the above antibody molecules comprise a human IgG1 heavy chain constant region with a leucine-to-alanine mutation at position 234 in accordance with EU numbering, or at position 117 in SEQ ID NO: 218, and a leucine-to-alanine mutation at position 235 in according to the EU numbering, or at position 118 in SEQ ID NO: 218, and the kappa light chain constant region.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела способны связываться с человеческим PD-1 с константой диссоциации (KD) менее чем приблизительно 0,2 нмоль.In other embodiments, the above antibody molecules are capable of binding to human PD-1 with a dissociation constant ( KD ) of less than about 0.2 nmol.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются с человеческим PD-1 с KD, которая ниже, чем приблизительно 0,2, 0,15, 0,1, 0,05 или 0,02 нмоль, например, составляет приблизительно от 0,13 нмоль до 0,03 нмоль, например, приблизительно от 0,077 нмоль до 0,088 нмоль, например, приблизительно 0,083 нмоль, и значение KD измеряют, например, способом Biacore.In some embodiments, the above antibody molecules bind to human PD-1 with a K D that is lower than about 0.2, 0.15, 0.1, 0.05, or 0.02 nmol, such as about 0. 13 nmol to 0.03 nmol, for example about 0.077 nmol to 0.088 nmol, for example about 0.083 nmol, and the K D value is measured, for example, by the Biacore method.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются с PD-1 обезьян циномолгус с KD, которая ниже, чем приблизительно 0,2, 0,15, 0,1, 0,05 или 0,02 нмоль, например, составляет приблизительно от 0,11 до 0,08 нмоль, например, приблизительно 0,093 нмоль, и значение KD измеряют, например, способом Biacore.In other embodiments, the above antibody molecules bind to cynomolgus PD-1 with a K D that is lower than about 0.2, 0.15, 0.1, 0.05 or 0.02 nmol, for example, is about 0 11 to 0.08 nmol, for example approximately 0.093 nmol, and the KD value is measured, for example, by the Biacore method.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются и с человеческим PD-1 и с PD-1 обезьян циномолгус с одинаковой KD, например, с порядком измерения в нмоль, и KD измеряют, например, способом Biacore. В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются со слитым белком человеческого PD-1-Ig с KD, которая ниже, чем приблизительно 0,1, 0,075, 0,05, 0,025 или 0,01 нмоль, например, приблизительно 0,04 нмоль, и значение KD измеряют, например, с помощью анализа ELISA.In some embodiments, the above antibody molecules bind to both human PD-1 and cynomolgus monkey PD-1 with the same K D , eg, in nmol order, and the K D is measured, eg, by the Biacore method. In some embodiments, the above antibody molecules bind to a human PD-1-Ig fusion protein with a K D that is lower than about 0.1, 0.075, 0.05, 0.025, or 0.01 nmol, such as about 0.04 nmol , and the K D value is measured, for example, using an ELISA assay.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются с клетками Jurkat, которые экспрессируют человеческий PD-1 (например, с клетками Jurkat, трансфицированными человеческим PD-1) с KD, значение которой ниже, чем приблизительно 0,1, 0,075, 0,05, 0,025 или 0,01 нмоль, например, приблизительно 0,06 нмоль, и значение KD измеряют, например, с помощью анализа FACS.In some embodiments, the above antibody molecules bind to Jurkat cells that express human PD-1 (e.g., Jurkat cells transfected with human PD-1) with a KD value of less than about 0.1, 0.075, 0.05, 0.025 or 0.01 nmol, for example approximately 0.06 nmol, and the KD value is measured, for example, by FACS analysis.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются с Тклетками обезьян циномолгус с KD, значение которой ниже, чем приблизительно 1, 0,75, 0,5, 0,25 или 0,1 нмоль, например, составляет приблизительно 0,4 нмоль, например, при измерении с помощью анализа FACS.In some embodiments, the above antibody molecules bind to cynomolgus monkey T cells with a K D value that is lower than about 1, 0.75, 0.5, 0.25 or 0.1 nmol, for example, is about 0.4 nmol, for example, when measured using FACS analysis.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются с клетками, которые экспрессируют PD-1 обезьян циномолгус (например, клетки, трансфицированные PD-1 обезьян циномолгус) с KD, значение которой ниже, чем приблизительно 1, 0,75, 0,5, 0,25 или 0,01 нмоль, например, составляет приблизительно 0,6 нмоль, например, при измерении с помощью анализа FACS.In some embodiments, the above antibody molecules bind to cells that express cynomolgus PD-1 (e.g., cells transfected with cynomolgus PD-1) with a KD value of less than about 1, 0.75, 0.5, 0 .25 or 0.01 nmol, for example, is approximately 0.6 nmol, for example, when measured by FACS analysis.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела не проявляют перекрестной реакции с мышиным или крысиным PD-1. В других вариантах осуществления вышеуказанные антитела перекрестно реагируют с PD-1 макак-ресусов. Например, перекрестная реактивность может быть измерена с помощью способа Biacore или с помощью анализа связывания с использованием клеток, которые экспрессируют PD-1 (например, с человеческими PD-1-экспрессирующими клетками 300.19). В других вариантах осуществления указанные выше молекулы антитела связываются с внеклеточным Igподобным доменом PD-1.In some embodiments, the above antibody molecules do not cross-react with murine or rat PD-1. In other embodiments, the above antibodies cross-react with rhesus macaque PD-1. For example, cross-reactivity can be measured using the Biacore method or using a binding assay using cells that express PD-1 (eg, human PD-1-expressing 300.19 cells). In other embodiments, the above antibody molecules bind to the extracellular Ig-like domain of PD-1.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела способны уменьшать связывание PD-1 с PD-L1, PD-L2, или с обоими лигандами, или с клетками, которые экспрессируют PD-L1, PD-L2, или с обоими типами клеток. В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела уменьшают (например, блокируют) связывание PD-L1 с клеткой, экспрессирующей PD-1 (например, с человеческими PD-1-экспрессирующими клетками 300.19) с IC50, значение которой ниже чем приблизительно 1,5, 1, 0,8, 0,6, 0,4, 0,2 или 0,1 нмоль, например, составляет приблизительно от 0,79 нмоль приблизительно до 1,09 нмоль, например, приблизительно 0,94 нмоль, или приблизительно 0,78 нмоль или меньше, например, приблизительно 0,3 нмоль. В некоторых вариантах осуществления указанные выше антитела уменьшают (например, блокируют) связывание PD-L2 с клеткой, экспрессирующей PD-1 (например, с человеческими PD-1-экспрессирующими клетками 300.19) с IC50, значение которой ниже, чем приблизительно 2, 1,5, 1, 0,5 или 0,2 нмоль, например, составляет приблизительно от 1,05In other embodiments, the above antibody molecules are capable of reducing the binding of PD-1 to PD-L1, PD-L2, or both ligands, or to cells that express PD-L1, PD-L2, or both cell types. In some embodiments, the above antibody molecules reduce (e.g., block) the binding of PD-L1 to a PD-1-expressing cell (e.g., human PD-1-expressing 300.19 cells) with an IC 50 value of less than about 1.5. 1, 0.8, 0.6, 0.4, 0.2 or 0.1 nmol, for example, is from about 0.79 nmol to about 1.09 nmol, for example, about 0.94 nmol, or about 0 .78 nmol or less, for example approximately 0.3 nmol. In some embodiments, the above antibodies reduce (eg, block) the binding of PD-L2 to a PD-1-expressing cell (eg, human PD-1-expressing 300.19 cells) with an IC 50 value that is lower than about 2.1 .5, 1, 0.5 or 0.2 nmol, for example, is between approximately 1.05
- 44 045940 нмоль приблизительно до 1,55 нмоль, или приблизительно 1,3 нмоль или меньше, например, приблизительно 0,9 нмоль.- 44045940 nmol to about 1.55 nmol, or about 1.3 nmol or less, for example about 0.9 nmol.
В других вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела способны усиливать антиген-специфичный Т-клеточный ответ.In other embodiments, the above antibody molecules are capable of enhancing an antigen-specific T cell response.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела представляет собой молекулу моноспецифичного антитела или молекулу биспецифичного антитела. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела обладает первой специфичностью связывания с PD-1 и второй специфичностью связывания с TIM-3, LAG-3, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 и/или СЕАСАМ-5), PD-L1 или PD-L2. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела содержит антигенсвязывающий фрагмент антитела, например, полуантитела, или антигенсвязывающий фрагмент полуантитела.In some embodiments, the antibody molecule is a monospecific antibody molecule or a bispecific antibody molecule. In some embodiments, the antibody molecule has a first binding specificity for PD-1 and a second binding specificity for TIM-3, LAG-3, SEACAM (e.g., SEACAM-1, SEACAM-3, and/or SEACAM-5), PD-L1, or PD-L2. In some embodiments, the antibody molecule comprises an antigen binding fragment of an antibody, such as a semi-antibody, or an antigen binding fragment of a semi-antibody.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антител увеличивают экспрессию IL-2 из клеток, активированных стафилококковым энтеротоксином В (SEB) (например, в концентрации 25 мкг/мл), по меньшей мере приблизительно в 2, 3, 4, 5 раз, например, приблизительно от 2 до 3 раз, например, приблизительно от 2 до 2,6 раза, например, приблизительно в 2,3 раза, по сравнению с экспрессией IL-2 с использованием контрольного изотипа (например, IgG4) например, при измерении в анализе Т-клеточной активации посредством SEB или в анализе цельной крови человека ex vivo.In some embodiments, the above antibody molecules increase IL-2 expression from staphylococcal enterotoxin B (SEB)-activated cells (e.g., at a concentration of 25 μg/ml) by at least about 2-fold, 3-fold, 4-fold, 5-fold, such as about 2 to 3 times, e.g., about 2 to 2.6 times, e.g., about 2.3 times, compared to IL-2 expression using an isotype control (e.g., IgG4) e.g., as measured in a T-assay cellular activation by SEB or in ex vivo human whole blood assays.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антител увеличивают экспрессию IFN-γ из Т-клеток, стимулированных антителом против CD3 (например, в дозе 0,1 мкг/мл), по меньшей мере приблизительно в 2, 3, 4, 5 раз, например, приблизительно от 1,2 до 3,4 раза, например, приблизительно в 2,3 раза, по сравнению с экспрессией IFN-γ при использовании контрольного изотипа (например, IgG4), что определяют, например, при измерении в анализе активности IFN-γ.In some embodiments, the above antibody molecules increase IFN-γ expression from T cells stimulated with an anti-CD3 antibody (e.g., at a dose of 0.1 μg/ml) by at least about 2-fold, 3-fold, 4-fold, 5-fold, e.g. approximately 1.2- to 3.4-fold, e.g., approximately 2.3-fold, compared to IFN-γ expression using an isotype control (e.g., IgG4), as measured, for example, in an IFN-γ activity assay .
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антител увеличивают экспрессию IFN-γ из Т-клеток, активированных SEB (например, в концентрации 3 мкг/мл), по меньшей мере приблизительно в 2, 3, 4, 5 раз, например, приблизительно от 0,5 до 4,5 раз, например, приблизительно в 2,5 раза, по сравнению с экспрессией IFN-γ при использовании контрольного изотипа (например, IgG4), что определяют, например, при измерении в анализе активности IFN-γ.In some embodiments, the above antibody molecules increase IFN-γ expression from SEB-activated T cells (e.g., at a concentration of 3 μg/ml) by at least about 2-fold, 3-fold, 4-fold, 5-fold, such as from about 0. 5 to 4.5-fold, eg, approximately 2.5-fold, compared to IFN-γ expression using an isotype control (eg, IgG4), as measured, for example, in an IFN-γ activity assay.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антител увеличивают экспрессию IFN-γ из Т-клеток, активированных пептидом цитомеголовируса (CMV), по меньшей мере приблизительно в 2, 3, 4, 5 раз, например, приблизительно от 2 до 3,6 раза, например, приблизительно в 2,8 раз, по сравнению с экспрессией IFN-γ при использовании контрольного изотипа (например, IgG4), что определяют, например, при измерении в анализе активности IFN-γ.In some embodiments, the above antibody molecules increase IFN-γ expression from cytomegolovirus (CMV) peptide-activated T cells by at least about 2-fold, 3-fold, 4-fold, 5-fold, e.g., about 2-fold to 3.6-fold, e.g. , approximately 2.8-fold compared to IFN-γ expression when using an isotype control (eg, IgG4), as determined, for example, when measured in an IFN-γ activity assay.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела увеличивают пролиферацию CD8' Т-клеток, активированных пептидом CMV, по меньшей мере приблизительно в 1, 2, 3, 4, 5 раз, например, приблизительно в 1,5 раза, по сравнению с пролиферацией CD8' T-клеток при использовании контрольного изотипа (например, IgG4), что определяют, например, при измерении процента CD8+ Т-клеток, которые прошли по меньшей мере n клеточных делений (например, n=2 или 4).In some embodiments, the above antibody molecules increase the proliferation of CMV peptide-activated CD8' T cells by at least about 1-, 2-, 3-, 4-, 5-fold, such as about 1.5-fold, compared to CD8' proliferation T cells using an isotype control (eg, IgG4), which is determined, for example, by measuring the percentage of CD8+ T cells that have undergone at least n cell divisions (eg, n=2 or 4).
В некоторых вариантах осуществления максимальная концентрация (Cmax) вышеуказанных молекул антитела составляет приблизительно от 100 мкг/мл приблизительно до 500 мкг/мл, приблизительно от 150 мкг/мл приблизительно до 450 мкг/мл, приблизительно от 250 мкг/мл приблизительно до 350 мкг/мл, или приблизительно от 200 мкг/мл приблизительно до 400 мкг/мл, например, приблизительно 292,5 мкг/мл, например, при измерении у обезьян.In some embodiments, the maximum concentration ( Cmax ) of the above antibody molecules is from about 100 μg/ml to about 500 μg/ml, from about 150 μg/ml to about 450 μg/ml, from about 250 μg/ml to about 350 μg /ml, or from about 200 μg/ml to about 400 μg/ml, for example, about 292.5 μg/ml, for example, when measured in monkeys.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антител имеет период полувыведения Т1/2 приблизительно от 250 ч приблизительно до 650 ч, приблизительно от 300 ч приблизительно до 600 ч, приблизительно от 350 ч приблизительно до 550 ч, или приблизительно от 400 ч приблизительно до 500 ч, например, приблизительно 465,5 ч, например, при измерении у обезьян.In some embodiments, the above antibody molecules have a T1 /2 half-life of about 250 hours to about 650 hours, about 300 hours to about 600 hours, about 350 hours to about 550 hours, or about 400 hours to about 500 hours , for example, approximately 465.5 hours, for example, when measured in monkeys.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются с PD-1 с константой диссоциации Kd, значение которой ниже, чем 5х10-4, 1х 10-4, 5х10-5 или 1х 10-5 s-1, например, приблизительно 2,13х10-4 s-1, например, при измерении способом Biacore. В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела связываются с PD-1 с константой ассоциации Ка, значение которой выше, чем 1х 104, 5х104, 1х105 или 5х105 M-1s-1, например, приблизительно 2,78х105 M-1s-1, например, при измерении способом Biacore.In some embodiments, the above antibody molecules bind to PD-1 with a dissociation constant Kd that is lower than 5x10 -4 , 1x 10 -4 , 5x10 -5 or 1x 10 -5 s -1 , such as about 2.13x10 - 4 s -1 , for example, when measured using the Biacore method. In some embodiments, the above antibody molecules bind to PD-1 with an association constant Ka that is greater than 1x104 , 5x104 , 1x105, or 5x105 M -1 s -1 , such as approximately 2.78x105 M - 1 s -1 , for example, when measuring using the Biacore method.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные молекулы антитела против PD-1 связываются с одним или несколькими остатками в пределах цепи С, петли СС', цепи С' и петли FG из PD-1. Описание доменной структуры PD-1 можно найти, например, в публикации Cheng et al., Structure and Interactions of the Human Programmed Cell Death 1 Receptor J. Biol. Chem. 2013, 288:11771-11785. Как описано авторами Cheng et al., цепь С содержит остатки F43-M50, петля СС' содержит остатки S51-N54, С' цепь содержит остатки B55-F62, и петля FG содержит остатки L108-I114 из PD-1 (нумерация аминокислот приведена в соответствии с Cheng et al., см. выше). Соответственно, в некоторых вариантах осуществления антитело против PD-1 по изобретению связывается по меньшей мере с одним остатком в одном или нескольких промежутках F43-M50, S51-N54, B55-F62 и L108-I114 из PD-1. В некоторых вариантах осуществления антитело против PD-1 по изобретению связывается по меньшей мере с одним осIn some embodiments, the above anti-PD-1 antibody molecules bind to one or more residues within the C chain, CC' loop, C' chain, and FG loop of PD-1. A description of the domain structure of PD-1 can be found, for example, in Cheng et al., Structure and Interactions of the Human Programmed Cell Death 1 Receptor J. Biol. Chem. 2013, 288:11771-11785. As described by Cheng et al., the C strand contains residues F43-M50, the CC' loop contains residues S51-N54, the C' strand contains residues B55-F62, and the FG loop contains residues L108-I114 from PD-1 (amino acid numbers are given according to Cheng et al., supra). Accordingly, in some embodiments, an anti-PD-1 antibody of the invention binds to at least one residue in one or more of the F43-M50, S51-N54, B55-F62, and L108-I114 spans of PD-1. In some embodiments, an anti-PD-1 antibody of the invention binds to at least one
- 45 045940 татком в двух, трех или всех четырех промежутках F43-M50, S51-N54, Q55-F62 и L108-I114 из PD-1. В некоторых вариантах осуществления антитело против PD-1 связывается с остатком в PD-1, который также является частью сайта связывания для одного из PD-L1 и PD-L2 или для обоих лигандов.- 45 045940 tatcom in two, three or all four spaces F43-M50, S51-N54, Q55-F62 and L108-I114 from PD-1. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody binds to a residue in PD-1 that is also part of the binding site for one of PD-L1 and PD-L2 or both ligands.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей любую из вышеуказанных молекул антител, векторов и их клеток-хозяев.In another aspect, the present invention relates to an isolated nucleic acid molecule encoding any of the above antibody molecules, vectors and host cells thereof.
Изобретение также относится к выделенной нуклеиновой кислоте, кодирующей вариабельную область тяжелой цепи или вариабельную область легкой цепи антитела, или обе эти области, в любой из вышеуказанных молекул антител.The invention also relates to an isolated nucleic acid encoding the heavy chain variable region or the light chain variable region of an antibody, or both, in any of the above antibody molecules.
В одном варианте осуществления выделенная нуклеиновая кислота кодирует области CDR 1-3 тяжелой цепи, при этом указанная нуклеиновая кислота содержит нуклеотидные последовательности SEQ ID NO: 108-112, 223, 122-126, 133-137 или 144-146.In one embodiment, the isolated nucleic acid encodes the heavy chain CDR 1-3 regions, wherein said nucleic acid comprises the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 108-112, 223, 122-126, 133-137, or 144-146.
В другом варианте осуществления выделенная нуклеиновая кислота кодирует области CDR-1-3 легкой цепи, при этом указанная нуклеиновая кислота содержит нуклеотидные последовательности SEQ ID NO: 113-120, 127-132 или 138-143.In another embodiment, the isolated nucleic acid encodes the light chain CDR-1-3 regions, wherein said nucleic acid comprises the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 113-120, 127-132, or 138-143.
В других вариантах осуществления вышеупомянутая нуклеиновая кислота дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую вариабельный домен тяжелой цепи, при этом указанная нуклеотидная последовательность идентична по меньшей мере на 85% по отношению к любой из SEQ ID NO: 39, 51, 83, 87, 90, 95 или 101.In other embodiments, said nucleic acid further comprises a nucleotide sequence encoding a heavy chain variable domain, wherein said nucleotide sequence is at least 85% identical to any of SEQ ID NO: 39, 51, 83, 87, 90, 95 or 101.
В других вариантах осуществления вышеупомянутая нуклеиновая кислота дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую вариабельный домен тяжелой цепи, при этом указанная нуклеотидная последовательность содержит любую из SEQ ID NO: 39, 51, 83, 87, 90, 95 или 101.In other embodiments, said nucleic acid further comprises a nucleotide sequence encoding a heavy chain variable domain, said nucleotide sequence comprising any of SEQ ID NO: 39, 51, 83, 87, 90, 95, or 101.
В других вариантах осуществления вышеупомянутая нуклеиновая кислота дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую тяжелую цепь, при этом указанная нуклеотидная последовательность по меньшей мере на 85% идентична любой из SEQ ID NO: 41, 53, 85, 89, 92, 96 или 103.In other embodiments, said nucleic acid further comprises a nucleotide sequence encoding a heavy chain, wherein said nucleotide sequence is at least 85% identical to any of SEQ ID NO: 41, 53, 85, 89, 92, 96, or 103.
В других вариантах осуществления вышеупомянутая нуклеиновая кислота дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую тяжелую цепь, при этом указанная нуклеотидная последовательность содержит любую из SEQ ID NO: 41, 53, 85, 89, 92, 96 или 103.In other embodiments, said nucleic acid further comprises a nucleotide sequence encoding a heavy chain, wherein said nucleotide sequence comprises any of SEQ ID NO: 41, 53, 85, 89, 92, 96, or 103.
В других вариантах осуществления вышеупомянутая нуклеиновая кислота дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую вариабельный домен легкой цепи, при этом указанная нуклеотидная последовательность по меньшей мере на 85% идентична любой из SEQ ID NO: 45, 49, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 94, 98, 100, 105 или 107.In other embodiments, the aforementioned nucleic acid further comprises a nucleotide sequence encoding a light chain variable domain, wherein said nucleotide sequence is at least 85% identical to any of SEQ ID NO: 45, 49, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 94, 98, 100, 105 or 107.
В других вариантах осуществления вышеупомянутая нуклеиновая кислота дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую вариабельный домен легкой цепи, при этом указанная нуклеотидная последовательность содержит любую из SEQ ID NO: 45, 49, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 94, 98, 100, 105 или 107.In other embodiments, said nucleic acid further comprises a nucleotide sequence encoding a light chain variable domain, said nucleotide sequence comprising any of SEQ ID NO: 45, 49, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 94, 98, 100, 105 or 107.
В других вариантах осуществления вышеупомянутая нуклеиновая кислота дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую легкую цепь, при этом указанная нуклеотидная последовательность по меньшей мере на 85% идентична любой из SEQ ID NO: 45, 49, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 94, 98, 100, 105 или 107.In other embodiments, the above nucleic acid further comprises a nucleotide sequence encoding a light chain, wherein said nucleotide sequence is at least 85% identical to any of SEQ ID NO: 45, 49, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 94, 98, 100, 105 or 107.
В других вариантах осуществления вышеупомянутая нуклеиновая кислота дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую легкую цепь, при этом указанная нуклеотидная последовательность содержит любую из SEQ ID NO: 45, 49, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 94, 98, 100, 105 или 107.In other embodiments, said nucleic acid further comprises a nucleotide sequence encoding a light chain, wherein said nucleotide sequence comprises any of SEQ ID NO: 45, 49, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 94, 98, 100, 105 or 107.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к одному или нескольким экспрессионным векторам и клеткам-хозяевам, содержащим вышеуказанные нуклеиновые кислоты.In some embodiments, the invention relates to one or more expression vectors and host cells containing the above nucleic acids.
Изобретение также относится к способу получения молекулы антитела или его фрагмента, и указанный способ содержит культивирование клетки-хозяина, как описано в изобретении, в условиях, подходящих для экспрессии генов.The invention also relates to a method for producing an antibody molecule or fragment thereof, which method comprises culturing a host cell as described in the invention under conditions suitable for gene expression.
Фармацевтические композиции и наборы.Pharmaceutical compositions and kits.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к композициям, например, к фармацевтически приемлемым композиции, которые включают молекулу антитела по изобретению, в рецептуре совместно с фармацевтически приемлемым носителем. Используемый в изобретении термин фармацевтически приемлемый носитель включает любой и все растворители, дисперсионные среды, изотонические и замедляющие абсорбцию вещества и т.п., которые являются физиологически совместимыми. Носитель может подходить для внутривенного, внутримышечного, подкожного, парентерального, ректального, спинального или эпидермального введения (например, путем инъекции или инфузии).In another aspect, the present invention relates to compositions, for example, pharmaceutically acceptable compositions, which include an antibody molecule of the invention, formulated together with a pharmaceutically acceptable carrier. As used herein, the term pharmaceutically acceptable carrier includes any and all solvents, dispersion media, isotonic and absorption retarding agents, and the like that are physiologically compatible. The carrier may be suitable for intravenous, intramuscular, subcutaneous, parenteral, rectal, spinal, or epidermal administration (eg, by injection or infusion).
Композиции по настоящему изобретению могут быть в различных формах. К ним относятся, например, жидкие, полутвердые и твердые лекарственные формы, такие как жидкие растворы (например, инъекционные и инфузионные растворы), дисперсии или суспензии, липосомы и суппозитории.The compositions of the present invention can be in various forms. These include, for example, liquid, semi-solid and solid dosage forms such as liquid solutions (eg injections and infusions), dispersions or suspensions, liposomes and suppositories.
Предпочтительная форма зависит от предполагаемого способа введения и терапевтического применения. Лекарственной формой типичных предпочтительных композиций являются инъекционные или инфузионные растворы. Предпочтительным способом введения является парентеральный (например,The preferred form depends on the intended route of administration and therapeutic use. The dosage form of typical preferred compositions are injections or infusion solutions. The preferred route of administration is parenteral (e.g.
- 46 045940 внутривенный, подкожный, внутрибрюшинный, внутримышечный). В предпочтительном варианте осуществления антитело вводят путем внутривенной инфузии или инъекции. В другом предпочтительном варианте осуществления антитело вводят путем внутримышечной или подкожной инъекции.- 46 045940 intravenous, subcutaneous, intraperitoneal, intramuscular). In a preferred embodiment, the antibody is administered by intravenous infusion or injection. In another preferred embodiment, the antibody is administered by intramuscular or subcutaneous injection.
Выражения парентеральное введение и вводимый парентерально, используемые в изобретении, означают способы введения, отличные от энтерального и местного введения, и обычно представляют собой инъекционное введение, и включают, без ограничения, внутривенные, внутримышечные, внутриартериальные, интратекальные, интракапсулярные, интраорбитальные, внутрисердечные, внутрикожные, внутрибрюшинные, чрестрахеальные, подкожные, подэпидермисные, внутрисуставные, субкапсулярные, субарахноидальные, интраспинальные, эпидуральные и внутригрудинные инъекции и инфузии.The expressions parenteral administration and parenterally administered as used in the invention mean methods of administration other than enteral and topical administration and are typically injection administration and include, but are not limited to, intravenous, intramuscular, intraarterial, intrathecal, intracapsular, intraorbital, intracardiac, intradermal , intraperitoneal, transtracheal, subcutaneous, subepidermal, intraarticular, subcapsular, subarachnoid, intraspinal, epidural and intrathoracic injections and infusions.
Предназначенные для лечения композиции обычно должны быть стерильными и стабильными в условиях производства и хранения. Композиция может быть приготовлена в виде раствора, микроэмульсии, дисперсии, липосомы или другой упорядоченной структуры, подходящей для высокой концентрации антител. Стерильные инъекционные растворы можно изготовлять путем введения активного соединения (т.е. антитела или части антитела) в требуемом количестве в подходящий растворитель с одним ингредиентом или с комбинацией вышеперечисленных ингредиентов, с последующей стерилизацией фильтрованием, если это необходимо. Обычно дисперсии делают путем введения активного соединения в стерильный носитель, который содержит основную дисперсионную среду и другие необходимые ингредиенты из перечисленных выше. При использовании стерильных порошков для приготовления стерильных инъекционных растворов предпочтительными способами приготовления являются вакуумная сушка и сушка вымораживанием, в результате чего получают порошок активного ингредиента плюс любой дополнительный желательный ингредиент из раствора, предварительно прошедшего стерилизацию фильтрацией. Надлежащую текучесть раствора можно поддерживать, например, путем использования покрытия, такого как лецитин, путем поддержания требуемого размера частиц в случае дисперсии и путем использования поверхностно-активных веществ. Замедленная абсорбция инъекционных композиций может достигаться путем включения в композицию вещества, которое замедляет абсорбцию, например солей моностеарата и желатина.Compositions intended for treatment generally must be sterile and stable under the conditions of manufacture and storage. The composition may be formulated as a solution, microemulsion, dispersion, liposome, or other ordered structure suitable for high concentrations of antibodies. Sterile injection solutions can be prepared by introducing the active compound (ie, antibody or portion of an antibody) in the required amount into a suitable solvent with one ingredient or a combination of the above ingredients, followed by sterilization by filtration, if necessary. Typically, dispersions are made by introducing the active compound into a sterile vehicle that contains the basic dispersion medium and other necessary ingredients listed above. When using sterile powders to prepare sterile injectable solutions, the preferred methods of preparation are vacuum drying and freeze drying, resulting in a powder of the active ingredient plus any additional desired ingredient from a solution that has previously been sterilized by filtration. Proper fluidity of the solution can be maintained, for example, by the use of a coating such as lecithin, by maintaining the required particle size in the case of a dispersion, and by the use of surfactants. Delayed absorption of injectable compositions can be achieved by including in the composition a substance that retards absorption, for example monostearate and gelatin salts.
Молекулы антител могут быть введены различными способами, известными в данной области, вместе с тем, для многих терапевтических применений предпочтительный путь/способ введения представляет собой внутривенную инъекцию или инфузию. Например, молекулы антитела могут быть введены путем внутривенной инфузии со скоростью, превышающей 20 мг/мин, например, от 20 до 40 мг/мин, и, обычно со скоростью, равной или превышающей 40 мг/мин, до достижения дозы приблизительно от 35 до 440 мг/м2, обычно приблизительно от 70 до 310 мг/м2, и более типично, приблизительно от 110 до 130 мг/м2 В некоторых вариантах осуществления молекулы антитела могут быть введены путем внутривенной инфузии со скоростью менее 10 мг/мин, предпочтительно со скоростью, равной или меньшей, чем 5 мг/мин, до достижения дозы приблизительно от 1 до 100 мг/м2, предпочтительно приблизительно от 5 до 50 мг/м2, приблизительно от 7 до 25 мг/м2, и более предпочтительно приблизительно от 10 мг/м2. Специалисту в данной области будет очевидно, что путь введения и/или способ введения может меняться в зависимости от желаемых результатов. В некоторых вариантах осуществления активное соединение может быть приготовлено с носителем, который будет защищать это соединение от быстрого высвобождения, например, в виде композиций с регулируемым высвобождением, включающих имплантаты, трансдермальные пластыри и системы доставки в микрокапсулах. Можно использовать биоразлагаемые, биосовместимые полимеры, такие как этиленвинилацетат, полиангидриды, полигликолевая кислота, коллаген, полиортоэфиры и полимолочная кислота. Многие способы приготовления таких композиций запатентованы или в целом известны специалистам в данной области. См., например, Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, J. R. Robinson, ed., Marcel Dekker, Inc., New York, 1978.Antibody molecules can be administered in a variety of ways known in the art, however, for many therapeutic applications, the preferred route/mode of administration is intravenous injection or infusion. For example, antibody molecules can be administered by intravenous infusion at a rate greater than 20 mg/min, such as 20 to 40 mg/min, and typically at a rate equal to or greater than 40 mg/min, to achieve a dose of approximately 35 to 440 mg/m 2 , typically about 70 to 310 mg/m 2 , and more typically about 110 to 130 mg/m 2 In some embodiments, the antibody molecules may be administered by intravenous infusion at a rate of less than 10 mg/minute, preferably at a rate equal to or less than 5 mg/min until a dose of about 1 to 100 mg/ m2 , preferably about 5 to 50 mg/ m2 , about 7 to 25 mg/ m2 , or more is achieved preferably from about 10 mg/m 2 . One skilled in the art will appreciate that the route of administration and/or mode of administration may vary depending on the desired results. In some embodiments, the active compound may be formulated with a carrier that will protect the compound from rapid release, for example, in controlled release formulations including implants, transdermal patches, and microcapsule delivery systems. Biodegradable, biocompatible polymers such as ethylene vinyl acetate, polyanhydrides, polyglycolic acid, collagen, polyorthoesters and polylactic acid can be used. Many methods for preparing such compositions are patented or generally known to those skilled in the art. See, for example, Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, J. R. Robinson, ed., Marcel Dekker, Inc., New York, 1978.
В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела можно вводить перорально, например, с инертным разбавителем или усваиваемым съедобным носителем. Соединение (и другие ингредиенты, если это желательно) также могут быть заключены в желатиновую капсулу с твердой или мягкой оболочкой, спрессованы в таблетки или непосредственно включены в рацион субъекта. Для перорального введения соединения с целью лечения это соединение можно объединять с эксципиентами и использовать в виде таблеток для приема внутрь, буккальных таблеток, пастилок, капсул, эликсиров, суспензий, сиропов, вафель и тому подобного. Для введения соединения по изобретению способами, отличными от парентерального введения, может быть необходимым наносить покрытие на соединение, или вводить соединение совместно с материалом для предотвращения его инактивации. Предназначенные для лечения композиции можно также вводить с помощью медицинских устройств, известных в данной области.In some embodiments, the antibody molecule can be administered orally, for example, with an inert diluent or digestible edible carrier. The compound (and other ingredients, if desired) may also be enclosed in a hard or soft shell gelatin capsule, compressed into tablets, or directly included in the subject's diet. For oral administration of a compound for the purpose of treatment, the compound can be combined with excipients and used in the form of oral tablets, buccal tablets, lozenges, capsules, elixirs, suspensions, syrups, wafers and the like. To administer a compound of the invention by routes other than parenteral administration, it may be necessary to coat the compound, or co-administer the compound with a material to prevent inactivation. Compositions intended for treatment can also be administered using medical devices known in the art.
Схемы введения подбираются таким образом, чтобы обеспечить оптимальную желаемую реакцию (например, терапевтический ответ). Например, можно вводить единственный болюс, можно вводить несколько разделенных доз в течение периода времени, или дозу можно пропорционально уменьшать или увеличивать, в соответствии с требованиями клинической ситуации. Особенно предпочтительной является рецептура парентеральных композиций в стандартной лекарственной форме для простоты введения и однородности дозы. Используемая в изобретении стандартная лекарственная форма относится к физически дискретным единицам, подходящим в качестве единичных доз для субъектов, подлежащих лечеDosing regimens are selected to provide the optimal desired response (eg, therapeutic response). For example, a single bolus may be administered, multiple divided doses may be administered over a period of time, or the dose may be proportionally decreased or increased as required by the clinical situation. Particularly preferred is the formulation of parenteral compositions in unit dosage form for ease of administration and dose uniformity. The unit dosage form used in the invention refers to physically discrete units suitable as unitary dosages for the subjects being treated.
- 47 045940 нию, при этом каждая единица содержит предварительно определенное количество активного соединения, рассчитанное на достижение желаемого терапевтического эффекта, в комбинации с необходимым фармацевтическим носителем. Спецификация стандартных лекарственных форм по изобретению определяется и напрямую зависит от: (а) уникальных характеристик активного соединения и планируемого для достижения конкретного терапевтического эффекта, и (b) ограничений, свойственных для области составления смесей с этим активным соединением для лечения чувствительности у людей.- 47 045940 nuyu, wherein each unit contains a predetermined amount of the active compound, calculated to achieve the desired therapeutic effect, in combination with the necessary pharmaceutical carrier. The specification of the unit dosage forms of the invention is determined by and is directly dependent on: (a) the unique characteristics of the active compound and the specific therapeutic effect intended to achieve, and (b) the limitations inherent in the field of formulating this active compound for the treatment of sensitivity in humans.
Приведенный в качестве неограничивающего примера диапазон терапевтически эффективного или профилактически эффективного количества молекулы антитела составляет от 0,1 до 30 мг/кг, более предпочтительно, от 1 до 25 мг/кг. Специалист в данной области может определять схемы лечения и дозы молекулы антитела против PD-1. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят путем инъекции (например, подкожно или внутривенно) в дозе приблизительно от 1 до 40 мг/кг, например, от 1 до 30 мг/кг, например, приблизительно от 5 до 25 мг/кг, приблизительно от 10 до 20 мг/кг, приблизительно от 1 до 5 мг/кг, от 1 до 10 мг/кг, от 5 до 15 мг/кг, от 10 до 20 мг/кг, от 15 до 25 мг/кг, или приблизительно 3 мг/кг. Схема введения может варьироваться, например, от одного раза в неделю до одного раза каждые 2, 3 или 4 недели. В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе приблизительно от 10 до 20 мг/кг каждые две недели. Молекулу антитела можно вводить путем внутривенной инфузии со скоростью более чем 20 мг/мин, например, со скоростью от 20 до 40 мг/мин, и обычно со скоростью, равной или превышающей 40 мг/мин, до достижения дозы приблизительно от 35 до 440 мг/м2, обычно приблизительно от 70 до 310 мг/м2, и более типично, приблизительно от 110 до 130 мг/м2. В некоторых вариантах осуществления скорость инфузии, составляющая приблизительно от 110 до 130 мг/м2, достигает уровня приблизительно 3 мг/кг. В других вариантах осуществления молекулу антитела можно вводить путем внутривенной инфузии со скоростью менее 10 мг/мин, например, со скоростью, составляющей 5 мг/мин или меньше, до достижения дозы приблизительно от 1 до 100 мг/м2, например, приблизительно от 5 до 50 мг/м2, приблизительно от 7 до 25 мг/м2, или приблизительно 10 мг/м2. В некоторых вариантах осуществления инфузию антитела проводят в течение приблизительно 30 мин. Следует отметить, что величина дозы может варьироваться в зависимости от типа и тяжести состояния, подлежащего облегчению. Следует также понимать, что для любого конкретного субъекта необходимо корректировать конкретную схему введения на протяжении времени в соответствии с индивидуальной потребностью и профессиональной оценкой лица, назначающего или руководящего введением композиций, и что диапазоны доз, указанные в изобретении, приведены только в качестве примера и не предназначены для ограничения объема или применения заявленной композиции.As a non-limiting example, the range of a therapeutically effective or prophylactically effective amount of an antibody molecule is from 0.1 to 30 mg/kg, more preferably from 1 to 25 mg/kg. One of ordinary skill in the art can determine treatment regimens and dosages of the anti-PD-1 antibody molecule. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered by injection (eg, subcutaneously or intravenously) at a dose of about 1 to 40 mg/kg, such as 1 to 30 mg/kg, such as about 5 to 25 mg/kg. kg, approximately 10 to 20 mg/kg, approximately 1 to 5 mg/kg, 1 to 10 mg/kg, 5 to 15 mg/kg, 10 to 20 mg/kg, 15 to 25 mg/kg kg, or approximately 3 mg/kg. The administration schedule may vary, for example, from once a week to once every 2, 3 or 4 weeks. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered at a dose of approximately 10 to 20 mg/kg every two weeks. The antibody molecule can be administered by intravenous infusion at a rate greater than 20 mg/minute, for example, at a rate of 20 to 40 mg/minute, and typically at a rate equal to or greater than 40 mg/minute, to achieve a dose of approximately 35 to 440 mg /m 2 , typically from about 70 to 310 mg/m 2 , and more typically from about 110 to 130 mg/m 2 . In some embodiments, the infusion rate of about 110 to 130 mg/m 2 reaches a level of about 3 mg/kg. In other embodiments, the antibody molecule can be administered by intravenous infusion at a rate of less than 10 mg/minute, such as at a rate of 5 mg/minute or less, to achieve a dose of from about 1 to 100 mg/m 2 , for example, from about 5 up to 50 mg/m 2 , approximately 7 to 25 mg/m 2 , or approximately 10 mg/m 2 . In some embodiments, the antibody infusion is administered over approximately 30 minutes. It should be noted that the dose may vary depending on the type and severity of the condition being alleviated. It should also be understood that for any particular subject, the specific dosage regimen will need to be adjusted over time according to individual need and the professional judgment of the person prescribing or directing the administration of the compositions, and that the dosage ranges set forth in the invention are given by way of example only and are not intended to to limit the scope or use of the claimed composition.
Фармацевтические композиции по настоящему изобретению могут включать терапевтически эффективное количество или профилактически эффективное количество антитела или части антитела по изобретению. Термин терапевтически эффективное количество относится к количеству, эффективному в дозах и в течение периодов времени, которое необходимо для достижения желаемого терапевтического результата. Терапевтически эффективное количество модифицированного антитела или фрагмента антитела может меняться в зависимости от таких факторов, как клиническое состояние, возраст, пол и вес человека, а также от способности антитела или части антитела вызывать желаемую реакцию у человека. Терапевтически эффективное количество также является количеством, при котором терапевтически полезные эффекты модифицированного антитела или фрагмента антитела перевешивают их любые токсические или вредные эффекты. Терапевтически эффективная доза предпочтительно ингибирует измеримый параметр, например, скорость роста опухоли, по меньшей мере приблизительно на 20%, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно на 40%, еще более предпочтительно по меньшей мере приблизительно на 60%, и еще более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно на 80%, по сравнению с субъектами, не получавшими лечение. Способность соединения ингибировать измеряемый параметр, например, рак, может быть оценена с помощью системы животной модели для прогнозирования эффективности при человеческих опухолях. Альтернативно, это свойство композиции может быть оценено с помощью анализа ингибирующей способности соединения, и такое ингибирование анализируют in vitro способами, известными специалисту в данной области.The pharmaceutical compositions of the present invention may include a therapeutically effective amount or a prophylactically effective amount of an antibody or antibody portion of the invention. The term therapeutically effective amount refers to an amount effective in doses and for periods of time necessary to achieve the desired therapeutic result. The therapeutically effective amount of the modified antibody or antibody fragment may vary depending on factors such as the clinical condition, age, sex and weight of the individual, as well as the ability of the antibody or antibody portion to elicit the desired response in the individual. A therapeutically effective amount is also an amount at which the therapeutically beneficial effects of the modified antibody or antibody fragment outweigh any toxic or harmful effects thereof. The therapeutically effective dose preferably inhibits a measurable parameter, e.g., tumor growth rate, by at least about 20%, more preferably by at least about 40%, even more preferably by at least about 60%, and even more preferably by at least at least approximately 80% higher than in untreated subjects. The ability of a compound to inhibit a measurable parameter, such as cancer, can be assessed using an animal model system to predict efficacy in human tumors. Alternatively, this property of the composition can be assessed by analyzing the inhibitory ability of the compound, and such inhibition is analyzed in vitro by methods known to one skilled in the art.
Профилактически эффективное количество относится к количеству, эффективному в дозах и в течение периодов времени, которое необходимо для достижения желаемого профилактического результата. Обычно профилактически эффективное количество будет меньше, чем терапевтически эффективное количество, поскольку профилактическую дозу применяют у субъектов до заболевания или на ранней стадии заболевания.A prophylactically effective amount refers to an amount effective in doses and for periods of time necessary to achieve the desired prophylactic result. Typically, the prophylactically effective amount will be less than the therapeutically effective amount because the prophylactic dose is administered to subjects pre-disease or early stage of the disease.
Также в объем настоящего изобретения входит набор, содержащий молекулу антитела, описанную в изобретении. В набор могут быть включены один или несколько других компонентов, в том числе: инструкции по применению, другие реагенты, например, метка, терапевтическое средство или вещество, полезное для хелатирующей реакции или другого способа присоединения, антитело к метке или терапевтическому средству, или радиозащитная композиция, устройства или другие материалы для подготовки антитела к введению, фармацевтически приемлемые носители, и устройства или другие материалы для введения субъекту.Also included within the scope of the present invention is a kit containing an antibody molecule described in the invention. One or more other components may be included in the kit, including: instructions for use, other reagents such as a tag, a therapeutic agent or substance useful for chelating or other mode of attachment, an antibody to the tag or therapeutic agent, or a radioprotective composition , devices or other materials for preparing the antibody for administration, pharmaceutically acceptable carriers, and devices or other materials for administration to a subject.
- 48 045940- 48 045940
Применения молекул антитела против PD-1.Applications of anti-PD-1 antibody molecules.
Молекулы антитела против PD-1 по изобретению имеют диагностические, а также терапевтические и профилактические применения in vitro и in vivo. Например, эти молекулы можно вводить в клеточные культуры в условиях in vitro или ex vivo, или их можно вводить субъекту, например, человеку, для лечения, профилактики и/или диагностики различных заболеваний, таких как рак и инфекционные заболевания.The anti-PD-1 antibody molecules of the invention have diagnostic as well as therapeutic and prophylactic applications in vitro and in vivo. For example, these molecules can be introduced into cell cultures under in vitro or ex vivo conditions, or they can be administered to a subject, such as a human, for the treatment, prevention and/or diagnosis of various diseases, such as cancer and infectious diseases.
Соответственно, в одном аспекте настоящее изобретение относится к способу модификации иммунного ответа у субъекта, и указанный способ содержит введение субъекту молекулы антитела по изобретению, таким образом, что у субъекта происходит модификация иммунного ответа. В одном варианте осуществления происходит усиления, стимуляция или повышающая регуляция иммунного ответа. В одном варианте осуществления молекулы антитела усиливают иммунный ответ у субъекта путем блокады PD-1.Accordingly, in one aspect, the present invention provides a method for modifying an immune response in a subject, the method comprising administering to the subject an antibody molecule of the invention such that the immune response is modified in the subject. In one embodiment, the immune response is enhanced, stimulated, or upregulated. In one embodiment, the antibody molecules enhance the immune response in a subject by blocking PD-1.
Используемый в изобретении термин субъект включает человека и животных нечеловеческого происхождения. В одном варианте осуществления субъектом является человек, например, больной человек, имеющий болезнь или состояние, характеризующееся патологическим функционированием PD-1. Понятие животные нечеловеческого происхождения включает млекопитающих и не-млекопитающих, например, приматов нечеловеческого происхождения. В одном варианте осуществления субъектом является человек. В одном варианте осуществления субъектом является больной человек, нуждающийся в повышении иммунного ответа. В одном варианте осуществления у субъекта наблюдается иммунодефицит, например, субъект проходит химиотерапию или лучевую терапию, или ранее подвергался такому лечению. В качестве альтернативы, или в комбинации, у субъекта имеется иммунодефицит, или он подвергается риску возникновения иммунодефицита в результате инфекции. Способы и композиции, описанные в изобретении, подходят для лечения больных людей, страдающих болезнью, которую можно лечить путем повышения иммунного ответа, опосредуемого Т-клетками. Например, способы и композиции, описанные в изобретении, могут количественно увеличивать иммунные действия. В одном варианте осуществления у субъекта увеличивается количество и/или активность Т-лимфоцитов, проникающих в опухоль (TIL). В другом варианте осуществления у субъекта наблюдается повышенная экспрессия или активность интерферона-гамма (IFN-γ). Еще в одном варианте осуществления у субъекта наблюдается сниженная экспрессия или активность PD-L1.As used herein, the term subject includes human and non-human animals. In one embodiment, the subject is a human, for example, a diseased human having a disease or condition characterized by abnormal functioning of PD-1. Non-human animals include mammals and non-mammals, such as non-human primates. In one embodiment, the subject is a human. In one embodiment, the subject is a sick person in need of an enhanced immune response. In one embodiment, the subject has an immunodeficiency, for example, the subject is undergoing chemotherapy or radiation therapy, or has previously been subjected to such treatment. Alternatively, or in combination, the subject has an immunodeficiency or is at risk of developing an immunodeficiency as a result of an infection. The methods and compositions described in the invention are suitable for the treatment of sick people suffering from a disease that can be treated by enhancing the immune response mediated by T cells. For example, the methods and compositions described in the invention can quantitatively increase immune actions. In one embodiment, the subject has an increase in the number and/or activity of tumor infiltrating lymphocytes (TILs). In another embodiment, the subject has increased interferon-gamma (IFN-γ) expression or activity. In yet another embodiment, the subject has decreased PD-L1 expression or activity.
Терапевтические применения.Therapeutic applications.
Рак.Cancer.
Блокада PD-1 может усиливать иммунную реакцию субъекта на раковые клетки. Лиганд для PD-1, PD-L1, не экспрессируется в нормальных клетках человека, но широко распространен в различных злокачественных опухолях человека (Dong et al. (2 002) Nat. Med. 8:787-9). Взаимодействие между PD-1 и PD-L1 может вызывать уменьшение инфильтрации опухоли лимфоцитами, снижение опосредуемой рецептором пролиферации Т-клеток и/или ускользание раковых клеток от иммуннологического надзора (Dong et al. (2003) J Mol Med 81:281-7; Blank et al. (2005) Cancer Immunol. Immunother. 54:307-314; Konishi et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10:5094-100). Обратное развитие иммуносупрессии может быть достигнуто путем ингибирования локального взаимодействия PD-1 с PD-L1; это эффект является аддитивным, если одновременно блокируется взаимодействие PD-1 с PD-L2 (Iwai et al. (2002) PNAS 99:12293-7; Brown et al. (2003) J. Immunol. 170:1257-66).Blockade of PD-1 may enhance a subject's immune response to cancer cells. The ligand for PD-1, PD-L1, is not expressed in normal human cells, but is widely distributed in various human malignancies (Dong et al. (2002) Nat. Med. 8:787-9). The interaction between PD-1 and PD-L1 may cause decreased tumor lymphocyte infiltration, decreased receptor-mediated T-cell proliferation, and/or evasion of cancer cells from immune surveillance (Dong et al. (2003) J Mol Med 81:281-7; Blank et al. (2005) Cancer Immunol. Immunother. 54:307-314; Konishi et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10:5094-100). Reversal of immunosuppression can be achieved by inhibiting the local interaction of PD-1 with PD-L1; this effect is additive if the interaction of PD-1 with PD-L2 is simultaneously blocked (Iwai et al. (2002) PNAS 99:12293-7; Brown et al. (2003) J. Immunol. 170:1257-66).
Таким образом, ингибирование PD-1 может приводить к усилению иммунного ответа.Thus, inhibition of PD-1 may lead to an enhanced immune response.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к лечению субъекта in vivo путем применения молекулы антитела против PD-1 таким образом, что ингибируется или уменьшается рост раковых опухолей. Антитело против PD-1 можно применять в качестве единственного средства для ингибирования роста раковых опухолей. Альтернативно, антитело против PD-1 можно применять в комбинации с одной или несколькими следующими методиками: стандартная медицинская помощь (например, в случае рака или инфекционных болезней), другое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, иммуномодулятор (например, активатор костимулирующей молекулы или ингибитор ингибирующей молекулы), вакцина, например, терапевтическая противоопухолевая вакцина, или другие формы клеточной иммунотерапии, как описано ниже.In one aspect, the present invention relates to treating a subject in vivo by using an anti-PD-1 antibody molecule in such a way that the growth of cancerous tumors is inhibited or reduced. An anti-PD-1 antibody can be used as a single agent to inhibit the growth of cancerous tumors. Alternatively, an anti-PD-1 antibody may be used in combination with one or more of the following: standard medical care (eg, cancer or infectious diseases), another antibody or antigen-binding fragment thereof, an immunomodulator (eg, co-stimulatory molecule activator or inhibitory molecule inhibitor). ), a vaccine, such as a therapeutic tumor vaccine, or other forms of cellular immunotherapy, as described below.
Соответственно, в одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу ингибирования роста опухолевых клеток у субъекта, и указанный способ содержит введение субъекту терапевтически эффективного количества молекулы антитела против PD-1 по изобретению.Accordingly, in one embodiment, the present invention provides a method of inhibiting the growth of tumor cells in a subject, which method comprises administering to the subject a therapeutically effective amount of an anti-PD-1 antibody molecule of the invention.
В одном варианте осуществления эти способы подходят для лечения рака in vivo. Для достижения антигенспецифичного повышения иммунитета молекулу антитела против PD-1 можно вводить вместе с представляющим интерес антигеном. При введении антител против PD-1 в комбинации с одним или несколькими веществами, эту комбинацию можно вводить в любом порядке или одновременно.In one embodiment, these methods are suitable for treating cancer in vivo. To achieve antigen-specific enhancement of immunity, the anti-PD-1 antibody molecule can be administered together with the antigen of interest. When administering anti-PD-1 antibodies in combination with one or more agents, the combination may be administered in any order or simultaneously.
Типы раковых заболеваний; лечебно-диагностические способы.Types of cancer; therapeutic and diagnostic methods.
В другом аспекте изобретение относится к способу лечения субъекта, например, к уменьшению или облегчению гиперпролиферативных состояний или заболеваний (например, рака) у субъекта, таких как солидная опухоль, гематологический рак, опухоль мягких тканей или метастатическое поражение. СпоIn another aspect, the invention relates to a method of treating a subject, for example, reducing or ameliorating a hyperproliferative condition or disease (eg, cancer) in a subject, such as a solid tumor, hematologic cancer, soft tissue tumor, or metastatic lesion. Spo
- 49 045940 соб включает введение субъекту одной или нескольких молекул антитела против PD-1 по изобретению в виде единственного средства или в комбинации с другими веществами или терапевтическими методиками.- 49 045940 involves administering to a subject one or more anti-PD-1 antibody molecules of the invention, either alone or in combination with other agents or therapeutic modalities.
Используемый в изобретении термин рак включает все виды раковых новообразований или онкогенных явлений, метастатические ткани или злокачественно трансформированные клетки, ткани или органы, независимо от гистологического типа или стадии поражения. Примеры раковых заболеваний включают без ограничения солидные опухоли, гематологические раковые заболевания, опухоли мягких тканей и метастатические поражения. Примеры солидных опухолей включают возникающие в различных органах и системах злокачественные опухоли, например, саркомы и карциномы (включая аденокарциномы и плоскоклеточные карциномы), например, поражающие печень, легкие, молочные железы, лимфоидную ткань, желудочно-кишечный тракт (например, толстую кишку), мочеполовой тракт (например, почки, уротелиальные клетки), предстательную железу и глотку. Аденокарциномы включают злокачественные опухоли, такие как большинство видов рака толстой кишки, рак прямой кишки, почечно-клеточная карцинома, рак печени, немелкоклеточная карцинома легкого, рак тонкой кишки и рак пищевода. Плоскоклеточные карциномы включают злокачественные опухоли, например, поражающие легкие, пищевод, кожу, голову и шею, полость рта, анус и шейку матки. В одном варианте осуществления рак представляет собой меланому, например, меланому в прогрессирующей стадии. С помощью способов и композиций по изобретению также можно осуществлять лечение или профилактику метастатических поражений при вышеуказанных видах рака.As used herein, the term cancer includes all types of cancerous neoplasms or oncogenic phenomena, metastatic tissues or malignantly transformed cells, tissues or organs, regardless of the histological type or stage of the lesion. Examples of cancers include, but are not limited to, solid tumors, hematologic cancers, soft tissue tumors, and metastatic lesions. Examples of solid tumors include malignancies arising in various organs and systems, such as sarcomas and carcinomas (including adenocarcinomas and squamous cell carcinomas), such as those affecting the liver, lungs, breasts, lymphoid tissue, gastrointestinal tract (eg, colon), genitourinary tract (eg, kidneys, urothelial cells), prostate and pharynx. Adenocarcinomas include malignant tumors such as most colon cancers, rectal cancer, renal cell carcinoma, liver cancer, non-small cell lung carcinoma, small bowel cancer, and esophageal cancer. Squamous cell carcinomas include malignant tumors such as those affecting the lungs, esophagus, skin, head and neck, mouth, anus, and cervix. In one embodiment, the cancer is melanoma, for example, advanced melanoma. Using the methods and compositions of the invention, it is also possible to treat or prevent metastatic lesions in the above types of cancer.
Типичные раковые новообразования, рост которых может быть подавлен с помощью молекул антител по изобретению, включают виды рака, обычно восприимчивые к иммунотерапии.Typical cancers whose growth can be inhibited by the antibody molecules of the invention include cancers typically responsive to immunotherapy.
Неограничивающие примеры предпочтительных для лечения видов рака включают меланому (например, метастазирующую злокачественную меланому), рак почек (например, светлоклеточную карциному), рак предстательной железы (например, гормоно-рефрактерную аденокарциному предстательной железы), рак молочной железы, рак толстой кишки и рак легкого (например, немелкоклеточный рак легкого). Дополнительно, рефрактерные или рецидивирующие злокачественные опухоли можно лечить с помощью молекул антитела, описанных в изобретении.Non-limiting examples of cancers preferred for treatment include melanoma (eg, metastatic malignant melanoma), kidney cancer (eg, clear cell carcinoma), prostate cancer (eg, hormone-refractory prostate adenocarcinoma), breast cancer, colon cancer, and lung cancer (eg, non-small cell lung cancer). Additionally, refractory or relapsed cancers can be treated with the antibody molecules described in the invention.
Можно лечить другие раковые заболевания, включающие, в качестве примера, следующие виды рака: рак кости, рак поджелудочной железы, рак кожи, рак головы или шеи, кожную или внутриглазную злокачественную меланому, рак матки, рак яичников, рак прямой кишки, анальный рак, гастроэзофагальный рак, рак желудка, рак яичка, рак матки, карциному фаллопиевых труб, карциному эндометрия, карциному шейки матки, карциному влагалища, карциному вульвы, рак из клеток Меркеля, ходжкинскую лимфому, неходжкинскую лимфому, рак пищевода, рак тонкой кишки, рак эндокринной системы, рак щитовидной железы, рак паращитовидной железы, рак надпочечника, саркому мягких тканей, рак уретры, рак пениса, хронический или острый лейкоз, включающий острый миелоидный лейкоз, хронический миелоидный лейкоз, острый лимфобластный лейкоз, хронический лимфоцитарный лейкоз, солидные опухоли детского возраста, лимфоцитарную лимфому, рак мочевого пузыря, множественную миелому, миелодиспластический синдром, рак почки или мочеточника, карциному почечной лоханки, новообразования центральной нервной системы (ЦНС), первичную лимфому ЦНС, опухолевый ангиогенез, опухоль оси позвоночника, глиому ствола мозга, аденому гипофиза, саркому Капоши, эпидермоидный рак, плоскоклеточный рак, Т-клеточную лимфому, обусловленный экологией рак, включая рак, индуцированный асбестом (например, мезотелиома), и комбинации указанных видов рака.Other cancers may be treated, including, by way of example, the following cancers: bone cancer, pancreatic cancer, skin cancer, head or neck cancer, cutaneous or intraocular malignant melanoma, uterine cancer, ovarian cancer, rectal cancer, anal cancer, gastroesophageal cancer, stomach cancer, testicular cancer, uterine cancer, fallopian tube carcinoma, endometrial carcinoma, cervical carcinoma, vaginal carcinoma, vulvar carcinoma, Merkel cell cancer, Hodgkin's lymphoma, non-Hodgkin's lymphoma, esophageal cancer, small intestine cancer, endocrine system cancer , thyroid cancer, parathyroid cancer, adrenal cancer, soft tissue sarcoma, urethral cancer, penile cancer, chronic or acute leukemia, including acute myeloid leukemia, chronic myeloid leukemia, acute lymphoblastic leukemia, chronic lymphocytic leukemia, solid tumors of childhood, lymphocytic lymphoma, bladder cancer, multiple myeloma, myelodysplastic syndrome, kidney or ureter cancer, renal pelvic carcinoma, central nervous system (CNS) neoplasms, primary CNS lymphoma, tumor angiogenesis, spinal axis tumor, brainstem glioma, pituitary adenoma, Kaposi's sarcoma, epidermoid carcinoma, squamous cell carcinoma, T-cell lymphoma, environmental cancers, including asbestos-induced cancers (eg, mesothelioma), and combinations of these cancers.
Лечение метастатических видов рака, например, метастатических видов рака с экспрессией PD-L1 (Iwai et al. (2005) Int. Immunol. 17:133-144), можно проводить с использованием молекул антитела, описанных в изобретении. В одном варианте осуществления при раке наблюдается повышенный уровень экспрессии PD-L1, IFN-γ и/или CD8.Treatment of metastatic cancers, for example, metastatic cancers expressing PD-L1 (Iwai et al. (2005) Int. Immunol. 17:133-144), can be carried out using the antibody molecules described in the invention. In one embodiment, increased expression levels of PD-L1, IFN-γ and/or CD8 are observed in cancer.
Без связи с какой-либо теорией, в некоторых вариантах осуществления пациент будет предположительно реагировать на лечение иммуномодулятором (необязательно в комбинации с одним или несколькими веществами, упомянутыми в изобретении), если у пациента выявлен рак с высокой экспрессией PD-L1, и/или если раковая опухоль инфильтрирована противоопухолевыми иммунными клетками, например, TIL-клетками. Противоопухолевые иммунные клетки могут быть положительными для CD8, PDL1 и/или IFN-γ; таким образом, уровни CD8, PD-L1 и/или IFN-γ могут служить показателями уровня TIL в микроокружении. В некоторых вариантах осуществления раковое микроокружение имеет тройной положительный фенотип в отношении PD-L1/CD8/IFN-Y.Without being bound by any theory, in some embodiments, a patient will presumably respond to treatment with an immunomodulator (optionally in combination with one or more substances mentioned in the invention) if the patient has a cancer with high expression of PD-L1, and/or if the cancerous tumor is infiltrated with antitumor immune cells, such as TIL cells. Antitumor immune cells may be positive for CD8, PDL1, and/or IFN-γ; thus, CD8, PD-L1, and/or IFN-γ levels may serve as indicators of TIL levels in the microenvironment. In some embodiments, the cancer microenvironment has a triple positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-Y.
Таким образом, в некоторых аспектах, настоящая заявка относится к способам определения, является ли образец опухоли положительным в отношении одного или нескольких из PD-L1, CD8 и IFN-γ, и, в случае положительного результата на содержание одного или нескольких, например, двух, или всех трех указанных маркеров в образце опухоли, пациенту вводят терапевтически эффективное количество молекулы антитела против PD-1, необязательно в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами или противоопухолевыми веществами.Thus, in some aspects, the present application provides methods for determining whether a tumor sample is positive for one or more of PD-L1, CD8 and IFN-γ, and, if positive for one or more, for example, two , or all three of these markers in a tumor sample, the patient is administered a therapeutically effective amount of an anti-PD-1 antibody molecule, optionally in combination with one or more other immunomodulators or antitumor agents.
Далее приведены показания к применению у большой доли пациентов с тройным положительнымThe following are indications for use in a large proportion of triple positive patients:
- 50 045940 фенотипом в отношении PD-L1/CD8/IFN-y, представляющие собой: рак легкого (плоскоклеточный), рак легкого (аденокарцинома), рак головы и шеи, рак желудка, NSCLC, HNSCC, рак желудка (например, с высокой микросателлитной нестабильностью MSIhi и/или положительный на вирус Эпштейна-Барра EBV+); колоректальный рак (CRC, например, MSIhi), назофарингеальный рак (NPC), рак шейки матки (например, плоскоклеточный), рак щитовидной железы, например, папиллярный рак щитовидной железы, меланома, тройной отрицательный (TN) рак молочной железы и DLBCL (диффузная В-клеточная лимфома). Обычно при раке молочной железы и обычно при раке толстой кишки умеренная доля больных имеет тройной положительный фенотип в отношении PD-L1/CD8/IFN-Y.- 50 045940 phenotype in relation to PD-L1/CD8/IFN-y, representing: lung cancer (squamous cell), lung cancer (adenocarcinoma), head and neck cancer, gastric cancer, NSCLC, HNSCC, gastric cancer (for example, with high microsatellite instability MSIhi and/or positive for Epstein-Barr virus EBV+); colorectal cancer (CRC, e.g. MSIhi), nasopharyngeal cancer (NPC), cervical cancer (e.g. squamous cell), thyroid cancer, e.g. papillary thyroid cancer, melanoma, triple negative (TN) breast cancer and DLBCL (diffuse B-cell lymphoma). Typically in breast cancer and typically in colon cancer, a moderate proportion of patients have a triple positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-Y.
Дополнительные показания у небольшой доли пациентов с тройным положительным фенотипом в отношении PD-L1/CD8/IFN-Y представляют собой: ER+ рак молочной железы, рак поджелудочной железы. Эти результаты рассмотрены в примере 4. Независимо от того, большая или малая доля пациентов имеет тройной положительный фенотип по указанным маркерам, скрининг пациентов по этим маркерам позволяет определить долю пациентов с особенно высокой вероятностью положительного реагирования на лечение антителом против PD-1 (например, антителом, блокирующим PD-1), необязательно в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами (такими как молекула антитела против TIM-3, молекула антитела против LAG-3 или молекула антитела против PD-L1) и/или противоопухолевыми веществами, например, веществами, указанными в табл. 7 и раскрытыми в публикациях, перечисленных в табл. 7.Additional indications in a small proportion of patients with the PD-L1/CD8/IFN-Y triple positive phenotype are: ER+ breast cancer, pancreatic cancer. These results are discussed in Example 4. Regardless of whether a large or small proportion of patients have a triple positive phenotype for these markers, screening patients for these markers allows us to determine the proportion of patients who are particularly likely to respond positively to treatment with an anti-PD-1 antibody (e.g. , blocking PD-1), optionally in combination with one or more other immunomodulators (such as an anti-TIM-3 antibody molecule, an anti-LAG-3 antibody molecule or an anti-PD-L1 antibody molecule) and/or anti-tumor agents, e.g. indicated in table. 7 and disclosed in the publications listed in table. 7.
В некоторых вариантах осуществления образец рака по классификации относится к тройному положительному фенотипу по PD-L1/CD8/IFN-Y. Эту классификацию можно условно разбить на два пороговых уровня: когда отдельная клетка классифицируется как положительная, и когда образец в целом классифицируется как положительный. Во-первых, в масштабах отдельной клетки можно измерить уровень PD-L1, CD8 и/или IFN-γ. В некоторых вариантах осуществления клетка, которая является положительной по одному или нескольким из указанных маркеров, представляет собой клетку, которая имеет более высокий уровень маркера по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением. Например, в некоторых вариантах осуществления высокий уровень PD-L1 в данной клетке является более высоким уровнем, чем уровень PD-L1 в соответствующей нераковой ткани у пациента. В качестве другого примера, в некоторых вариантах осуществления высокий уровень CD8 или IFN-γ в данной клетке представляет собой уровень этого белка, обычно наблюдаемый в TIL-клетках. Во-вторых, можно также измерить процент клеток в образце, которые являются положительными на PD-L1, CD8 и/или IFN-γ. (Одна клетка не обязательно экспрессирует все три маркера). В некоторых вариантах осуществления тройной положительный образец представляет собой образец, в котором имеется высокий процент положительных по указанным маркерам клеток, например, более высокий, чем эталонное значение, или более высокий, чем в контрольном образце.In some embodiments, the cancer sample is classified as a PD-L1/CD8/IFN-Y triple positive phenotype. This classification can be roughly broken down into two threshold levels: when an individual cell is classified as positive, and when the sample as a whole is classified as positive. First, PD-L1, CD8, and/or IFN-γ levels can be measured at the single-cell scale. In some embodiments, a cell that is positive for one or more of these markers is a cell that has a higher level of the marker compared to a control cell or reference value. For example, in some embodiments, the high level of PD-L1 in a given cell is a higher level than the level of PD-L1 in the corresponding noncancerous tissue in the patient. As another example, in some embodiments, the high level of CD8 or IFN-γ in a given cell represents the level of this protein typically observed in TIL cells. Second, the percentage of cells in the sample that are positive for PD-L1, CD8, and/or IFN-γ can also be measured. (One cell does not necessarily express all three markers.) In some embodiments, a triple positive sample is a sample that has a high percentage of cells positive for specified markers, eg, higher than a reference value or higher than a control sample.
В других вариантах осуществления можно измерять уровни PD-L1, CD8 и/или IFN-γ в образце в целом. В этом случае высокий уровень CD8 или IFN-γ в образце может представлять собой уровень этого белка, который обычно наблюдается в TIL-инфильтрированной опухоли. Аналогично, высокий уровень PD-L1 может представлять собой уровень этого белка, который обычно наблюдается в образце опухоли, например, в опухолевом микроокружении.In other embodiments, the levels of PD-L1, CD8 and/or IFN-γ in the sample as a whole can be measured. In this case, the high level of CD8 or IFN-γ in the sample may represent the level of this protein that is typically observed in a TIL-infiltrated tumor. Likewise, a high level of PD-L1 may represent the level of this protein that is typically observed in a tumor sample, such as in the tumor microenvironment.
При определении подгрупп пациентов, которые имеют тройной положительный фенотип по PDLl/CD8/IFN-y, как показано в примере 4 настоящего изобретения, выявлены определенные субпопуляции пациентов с возможной реакцией на лечение антителом против PD-1. Например, многие больные раком молочной железы IM-TN (иммуномодулирующим, тройным отрицательным раком) имеют тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-y. Рак молочной железы IM-TN описан, например, авторами Brian D. Lehmann et al., Identification of human triple-negative breast cancer subtypes and preclinical models for selection of targeted therapies, J Clin. Invest. Jul 1, 2011; 121(7): 2750-2767. Тройной отрицательный рак молочной железы относится к видам рака, при которых отсутствует экспрессия рецептора эстрогена (ER), рецептора прогестерона (PR) и HER2/Neu. Эти виды рака трудно поддаются лечению, потому что обычно они не реагируют на вещества, нацеленные на ER, PR и HER2/Neu. Тройной отрицательный рак молочной железы можно дополнительно подразделять на различные классы, к одному из которых относится иммуномодулирующий рак. Как описано авторами Lehmann и др., при IM-TN раке молочной железы в обилии присутствуют факторы, вовлеченные в функции клеток иммунной системы, такие как один или несколько сигнальных путей иммунных клеток (например, путь Th1/Th2, путь NK-клеток, сигнальный путь В-клеточного рецептора, путь дендритный клеток (DC) и сигнальный путь Т-клеточного рецептора), сигнальный путь цитокина (например, путь цитокина, путь IL-12 и путь IL-7), процессинг и презентация антигена, передача сигналов через коровые пути трансдукции иммунного сигнала (например, сигнальные пути TNF (фактора некроза опухоли), NFkB, и JAK/STAT), вовлеченные в функционирование Т-клеток гены, иммунная транскрипция, реакции интерферона (IFN) и процессинг антигена. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления рак, подвергаемый лечению, представляет собой рак, который является положительным или определен в качестве положительного в отношении одного или нескольких маркеров IM-TN рака молочной железы, например, фактора, который стимулирует один илиBy identifying subgroups of patients who have a triple positive PDLl/CD8/IFN-y phenotype, as shown in Example 4 of the present invention, certain subpopulations of patients with a possible response to anti-PD-1 antibody treatment have been identified. For example, many patients with IM-TN (immunomodulatory, triple-negative) breast cancer have a triple-positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-γ. IM-TN breast cancer is described, for example, by Brian D. Lehmann et al., Identification of human triple-negative breast cancer subtypes and preclinical models for selection of targeted therapies, J Clin. Invest. July 1, 2011; 121(7): 2750-2767. Triple negative breast cancer refers to cancers that lack expression of estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), and HER2/Neu. These cancers are difficult to treat because they typically do not respond to agents that target the ER, PR, and HER2/Neu. Triple negative breast cancer can be further subdivided into various classes, one of which is immunomodulatory cancer. As described by Lehmann et al., in IM-TN breast cancer, factors involved in immune cell function, such as one or more immune cell signaling pathways (eg, Th1/Th2 pathway, NK cell pathway, B cell receptor pathway, dendritic cell (DC) pathway, and T cell receptor signaling pathway), cytokine signaling pathway (e.g., cytokine pathway, IL-12 pathway, and IL-7 pathway), antigen processing and presentation, core signaling immune signal transduction pathways (eg, TNF (tumor necrosis factor), NFkB, and JAK/STAT signaling pathways), genes involved in T cell function, immune transcription, interferon (IFN) responses, and antigen processing. Accordingly, in some embodiments, the cancer being treated is a cancer that is positive or determined to be positive for one or more breast cancer IM-TN markers, e.g., a factor that stimulates one or
- 51 045940 несколько сигнальных путей иммунных клеток (например, путь Th1/Th2, путь NK-клеток, сигнальный путь В-клеточного рецептора, путь DC и сигнальный путь Т-клеточного рецептора), сигнальный путь цитокина (например, путь цитокина, путь IL-12 и путь IL-7), процессинг и презентацию антигена, передаче сигнала через коровые пути трансдукции иммунного сигнала (например, сигнальные пути NFKB, TNF и JAK/STAT), гены, вовлеченные в функционирование Т-клеток, иммунную транскрипцию, реакции интерферона (IFN) и процессинг антигена.- 51 045940 multiple immune cell signaling pathways (eg Th1/Th2 pathway, NK cell pathway, B cell receptor signaling pathway, DC pathway and T cell receptor signaling pathway), cytokine signaling pathway (eg cytokine pathway, IL pathway -12 and IL-7 pathway), antigen processing and presentation, signaling through core immune signal transduction pathways (e.g., NFKB, TNF, and JAK/STAT signaling pathways), genes involved in T cell function, immune transcription, interferon responses (IFN) and antigen processing.
В качестве другого примера, в изобретении показано, что пациенты из подгруппы рака толстой кишки с высокой MSI (микросателлитной нестабильностью) также имеют тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-Y. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления антитело против PD1, например, антитело против PD-1 по изобретению (необязательно в комбинации с одним или несколькими иммуномодуляторами, такими как антитело против LAG-3, антитело против TIM-3 или антитело против PD-L1, и с одним или несколькими противоопухолевыми веществами, например, противоопухолевым веществом, указанным в табл. 7 или в перечне публикаций из табл. 7), вводят пациенту, у которого имеется или определено, что имеется рак толстой кишки с высокой MSI, и тем самым осуществляют лечение рака. В некоторых вариантах осуществления клетка с высокой MSI представляет собой клетку, уровень MSI в которой превышает эталонное значение, или выше, чем в контрольной клетке, например, нераковой клетке из ткани того же типа, что и раковая клетка.As another example, the invention shows that patients in the high MSI (microsatellite instability) subgroup of colon cancer also have a triple PD-L1/CD8/IFN-Y positive phenotype. Accordingly, in some embodiments, an anti-PD1 antibody, such as an anti-PD-1 antibody of the invention (optionally in combination with one or more immunomodulators, such as an anti-LAG-3 antibody, an anti-TIM-3 antibody, or an anti-PD-L1 antibody, and with one or more antitumor agents, e.g., an antineoplastic agent listed in Table 7 or the list of publications in Table 7), is administered to a patient who has or is determined to have high MSI colon cancer, thereby treating cancer. In some embodiments, a high MSI cell is a cell whose MSI level is greater than a reference value, or higher than a control cell, such as a non-cancerous cell from the same tissue type as the cancer cell.
В качестве другого примера, в изобретении показано, что пациенты из подгруппы рака желудка с высоким MSI и/или с положительным результатом на вирус Эпштейна-Барра (EBV+), также имеют тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-Y. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления антитело против PD-1, например, антитело против PD-1 по изобретению (необязательно в комбинации с одним или несколькими иммуномодуляторами, такими как антитело против LAG-3, антитело против TIM-3 или антитело против PD-L1, и одно или несколько противоопухолевых средств, например, противоопухолевое вещество, указанное в табл. 7 или в перечне публикаций из табл. 7) вводят пациенту, у которого имеется или определено, что имеется рак желудка с высоким уровнем MSI и/или EBV+, осуществляя тем самым лечение рака. В некоторых вариантах осуществления клетка с высокой MSI представляет собой клетку, уровень MSI в которой превышает эталонное значение, или выше, чем в контрольной клетке, например, нераковой клетке из ткани того же типа, что и раковая клетка.As another example, the invention shows that patients in the high MSI and/or Epstein-Barr virus (EBV+) subset of gastric cancer also have a triple PD-L1/CD8/IFN-Y positive phenotype. Accordingly, in some embodiments, an anti-PD-1 antibody, such as an anti-PD-1 antibody of the invention (optionally in combination with one or more immunomodulators, such as an anti-LAG-3 antibody, an anti-TIM-3 antibody, or an anti-PD-L1 antibody , and one or more antineoplastic agents, for example, an antineoplastic agent specified in Table 7 or in the list of publications in Table 7) is administered to a patient who has or is determined to have gastric cancer with a high level of MSI and/or EBV+, performing thereby treating cancer. In some embodiments, a high MSI cell is a cell whose MSI level is greater than a reference value, or higher than a control cell, such as a non-cancerous cell from the same tissue type as the cancer cell.
Дополнительно, в изобретении раскрыты способы оценки рака на PD-L1 с последующим лечением этого рака с помощью антитела против PD-1. Как описано в примере 5 настоящего изобретения, образец рака может быть проанализирован на содержание белка PD-L1 или содержание мРНК. Если в образце выявлен уровень PD-L1 (белка или мРНК), который превышает эталонное значение или выше, чем контрольной клетке (например, в нераковой клетке), то этот образец может быть классифицирован как PDL1-πоложительный. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления антитело против PD-1, например, антитело против PD-1 по изобретению (необязательно в комбинации с одним или несколькими противоопухолевыми веществами) вводят пациенту, у которого имеется или определено, что имеется PD-L1 положительный рак. Рак может представлять собой, например, немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) - аденокарциному (АСА), NSCLC - плоскоклеточную карциному (SCC) или гепатоцеллюлярную карциному (НСС).Additionally, the invention discloses methods of assessing cancer for PD-L1 and then treating that cancer with an anti-PD-1 antibody. As described in Example 5 of the present invention, a cancer sample can be analyzed for PD-L1 protein content or mRNA content. If a sample has a level of PD-L1 (protein or mRNA) that is higher than the reference value or higher than a control cell (for example, a non-cancerous cell), then the sample can be classified as PDL1-positive. Accordingly, in some embodiments, an anti-PD-1 antibody, such as an anti-PD-1 antibody of the invention (optionally in combination with one or more antineoplastic agents) is administered to a patient who has or is determined to have PD-L1 positive cancer. The cancer may be, for example, non-small cell lung cancer (NSCLC)-adenocarcinoma (ACA), NSCLC-squamous cell carcinoma (SCC), or hepatocellular carcinoma (HCC).
В некоторых вариантах осуществления в способы по изобретению входит использование антитела против PD-1, например, антитела против PD-1 по изобретению, например, в виде монотерапии, для лечения рака, который является PD-L1 положительным (или определен как PD-L1 положительный). В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой рак толстой кишки (например, с высоким показателем MSI), рак желудка (например, с высоким показателем MSI и/или EBV+), назофарингеальный рак NPC, рак шейки матки, рак молочной железы (например, TN - рак молочной железы) и рак яичников. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой NSCLC, меланому или HNSCC. В некоторых вариантах осуществления антитело против PD-1 вводят в дозе, например, 1, 3, 10 или 20 мг/кг.In some embodiments, the methods of the invention include the use of an anti-PD-1 antibody, e.g., an anti-PD-1 antibody of the invention, e.g., as a monotherapy, to treat cancer that is PD-L1 positive (or determined to be PD-L1 positive ). In some embodiments, the cancer is colon cancer (eg, high MSI), gastric cancer (eg, high MSI and/or EBV+), nasopharyngeal NPC cancer, cervical cancer, breast cancer (eg, TN - breast cancer) and ovarian cancer. In some embodiments, the cancer is NSCLC, melanoma, or HNSCC. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody is administered at a dose of, for example, 1, 3, 10, or 20 mg/kg.
Как показано, например, в примере 4 настоящего изобретения, было обнаружено, что при некоторых видах рака желудка с тройным положительным результатом на PD-L1/CD8/IFN-Y также выявлен положительный результат в отношении PIK3CA. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления рак можно лечить молекулой антитела против PD-1 (необязательно в комбинации с одним или несколькими иммуномодуляторами, такими как молекула антитела против LAG-3, молекула антитела против TIM-3 или молекула антитела против PD-L1) и веществом, которое ингибирует PIK3CA. Примеры веществ этой категории описаны в публикациях Stein RC (September 2001). Prospects for phosphoinositide 3kinase inhibition as a cancer treatment. Endocrine-related Cancer 8(3): 237-48 и Marone R, Cmiljanovic V, Giese B, Wymann MP (January 2008). Targeting phosphoinositide 3-kinase: moving towards therapy. Biochimica et Biophysica Acta 1784 (1): 159-85.As shown, for example, in Example 4 of the present invention, it has been found that some PD-L1/CD8/IFN-Y triple positive gastric cancers are also PIK3CA positive. Accordingly, in some embodiments, cancer can be treated with an anti-PD-1 antibody molecule (optionally in combination with one or more immunomodulators, such as an anti-LAG-3 antibody molecule, an anti-TIM-3 antibody molecule, or an anti-PD-L1 antibody molecule) and a substance , which inhibits PIK3CA. Examples of substances in this category are described in publications by Stein RC (September 2001). Prospects for phosphoinositide 3kinase inhibition as a cancer treatment. Endocrine-related Cancer 8(3): 237-48 and Marone R, Cmiljanovic V, Giese B, Wymann MP (January 2008). Targeting phosphoinositide 3-kinase: moving towards therapy. Biochimica et Biophysica Acta 1784(1):159-85.
Как показано, например, в примере 4 настоящего изобретения, колоректальный рак (CRC), например, у пациента, у которого имеется или определено, что имеется колоректальный рак с высоким показателем MSI, можно лечить с помощью антитела против PD-1, необязательно в комбинации с терапевтическим средством, мишенью которого является один или несколько из LAG-3, RNF43 и BRAF. Например,As shown, for example, in Example 4 of the present invention, colorectal cancer (CRC), for example, in a patient who has or is determined to have colorectal cancer with a high MSI score, can be treated with an anti-PD-1 antibody, optionally in combination with a therapeutic agent that targets one or more of LAG-3, RNF43 and BRAF. For example,
- 52 045940 эти виды рака можно лечить антителом против PD-1, необязательно в комбинации с одним или несколькими терапевтическими средствами, которые нацелены на один или несколько из LAG-3, PD-1, RNF43 и BRAF. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько терапевтических средств включает иммуномодуляторы, такие как молекулы антитела против LAG-3, а также противоопухолевое вещество, указанное в табл. 7 или в перечне публикаций из табл. 7. В изобретении описаны ингибиторы LAG-3, например, антитела. Ингибирование RNF43 можно осуществлять, например, с помощью антитела, малой молекулы (например, 2-(2',3-диметил-[2,4'-бипиридин]-5-ил)-Н-(5-(пиразин-2-ил)пиридин-2ил)ацетамида (соединение А28)), siPHK или лиганда Rspo или его производного. В изобретении описаны ингибиторы BRAF (например, вемурафениб или дабрафениб).- 52 045940 these cancers can be treated with an anti-PD-1 antibody, optionally in combination with one or more therapeutic agents that target one or more of LAG-3, PD-1, RNF43 and BRAF. In some embodiments, the one or more therapeutic agents include immunomodulators, such as anti-LAG-3 antibody molecules, as well as an antitumor agent set forth in Table. 7 or in the list of publications from table. 7. The invention describes inhibitors of LAG-3, for example antibodies. Inhibition of RNF43 can be accomplished, for example, using a small molecule antibody (eg, 2-(2',3-dimethyl-[2,4'-bipyridin]-5-yl)-H-(5-(pyrazin-2- yl)pyridin-2yl)acetamide (compound A28)), siRNA or Rspo ligand or derivative thereof. The invention describes BRAF inhibitors (eg vemurafenib or dabrafenib).
Как показано, например, в примере 4 настоящего изобретения, пациент, у которого имеется (или определено, что имеется) плоскоклеточный рак легкого, может подвергаться лечению молекулой антитела против PD-1 в комбинации с терапевтическим средством, мишенью которого является LAG-3, например, молекулой антитела против LAG-3, и, необязательно, одним или несколькими противоопухолевыми веществами, такими как противоопухолевое вещество, указанное в табл. 7 или в перечне публикаций из табл. 7.As shown, for example, in Example 4 of the present invention, a patient who has (or is determined to have) squamous cell lung cancer can be treated with an anti-PD-1 antibody molecule in combination with a therapeutic agent that targets LAG-3, e.g. , an anti-LAG-3 antibody molecule, and optionally one or more antitumor agents, such as the antitumor agent listed in table. 7 or in the list of publications from table. 7.
В некоторых вариантах осуществления субъект, у которого имеется (или определено, что имеется) плоскоклеточный рак легкого, может подвергаться лечению антителом против PD-1, необязательно в комбинации с терапевтическим средством, мишенью которого является TIM-3, например, антителом против TIM-3. В изобретении описаны ингибиторы TIM-3, например, антитела.In some embodiments, a subject who has (or is determined to have) squamous cell lung cancer may be treated with an anti-PD-1 antibody, optionally in combination with a therapeutic agent that targets TIM-3, e.g., an anti-TIM-3 antibody . The invention describes TIM-3 inhibitors, for example antibodies.
Как показано, например, в пример 4 настоящего изобретения, пациент, у которого имеется (или определено, что имеется) рак щитовидной железы, может подвергаться лечению молекулой антитела против PD-1, необязательно в комбинации с терапевтическим средством, мишенью которого является BRAF, и, необязательно, в комбинации с одним или несколькими иммуномодуляторами, такими как молекула антитела против LAG-3, молекула антитела против TIM-3 и молекула антитела против PD-L1. В изобретении описаны ингибиторы BRAF (например, вемурафениб или дабрафениб), например, как указано в табл. 7 и в перечне публикаций из табл. 7.As shown, for example, in Example 4 of the present invention, a patient who has (or is determined to have) thyroid cancer may be treated with an anti-PD-1 antibody molecule, optionally in combination with a BRAF-targeted therapeutic agent, and , optionally in combination with one or more immunomodulators, such as an anti-LAG-3 antibody molecule, an anti-TIM-3 antibody molecule and an anti-PD-L1 antibody molecule. The invention describes BRAF inhibitors (eg, vemurafenib or dabrafenib), for example, as indicated in table. 7 and in the list of publications from table. 7.
В некоторых вариантах осуществления терапевтические средства по изобретению можно применять для лечения пациента, у которого имеется (или определено, что имеется) рак, связанный с инфекцией, например, с вирусной или бактериальной инфекцией. Типичные виды рака включают рак шейки матки, анальный рак, ассоциированный с вирусом папилломы человека (ВПЧ) плоскоклеточный рак головы и шеи, ВПЧ-ассоциированные папилломы пищевода, HHV6-ассоциированные лимфомы (ассоциированные с герпес-вирусом 6 типа), EBV-ассоциированные лимфомы (включая лимфому Беркитта), MALTлимфому желудка (ассоциированная со слизистой желудка лимфоидная ткань), другие связанные с инфекциями MALT-лимфомы, гепатоцеллюларную карциному НСС и саркому Капоши.In some embodiments, therapeutic agents of the invention may be used to treat a patient who has (or is determined to have) cancer associated with an infection, such as a viral or bacterial infection. Common cancers include cervical cancer, anal cancer, human papillomavirus (HPV)-associated squamous cell carcinoma of the head and neck, HPV-associated esophageal papillomas, HHV6-associated lymphomas (associated with herpes virus type 6), EBV-associated lymphomas ( including Burkitt's lymphoma), gastric MALT lymphoma (gastric mucosa-associated lymphoid tissue), other infection-associated MALT lymphomas, HCC hepatocellular carcinoma and Kaposi's sarcoma.
В других вариантах осуществления рак представляет собой гематологическое злокачественное новообразование или рак, включающий без ограничения лейкозы или лимфомы. Например, молекула антитела против PD-1 может применяться для лечения рака и злокачественных опухолей, включающих без ограничения такие патологии, как острый лейкоз, включающий без ограничения, например, В-клеточный острый лимфолейкоз (В-ОЛЛ), Т-клеточный острый лимфолейкоз (Т-ОЛЛ), острый лимфолейкоз (ОЛЛ); один или несколько хронических лейкозов, включающих без ограничения, например, хронический миелолейкоз (ХМЛ), хронический лимфолейкоз (ХЛЛ); дополнительные гематологические раковые заболевания или гематологические состояния, включающие без ограничения, например, В-клеточный пролимфоцитарный лейкоз, бластная опухоль из плазмоцитоидных дендритных клеток, лимфома Беркитта, диффузной крупноклеточная В-клеточная лимфома, фолликулярная лимфома, волосатоклеточный лейкоз, мелкоклеточная или крупноклеточная фолликулярная лимфома, злокачественные лимфопролиферативные состояния, MALT-лимфома, мантийноклеточная лимфома, лимфома маргинальной зоны, множественная миелома, миелодисплазия и миелодиспластический синдром, неходжкинская лимфома, плазмабластическая лимфома, опухоль из плазмоцитоидных дендритных клеток, макроглобулинемия Вальденстрема и предлейкозы, которые представляют собой разнородную совокупность гематологических состояний, объединенных неэффективной продукцией (или дисплазией) миелоидных клеток крови, и тому подобное.In other embodiments, the cancer is a hematologic malignancy or cancer, including but not limited to leukemias or lymphomas. For example, an anti-PD-1 antibody molecule can be used to treat cancers and malignancies, including, but not limited to, acute leukemia, including, for example, B-cell acute lymphocytic leukemia (B-ALL), T-cell acute lymphocytic leukemia ( T-ALL), acute lymphocytic leukemia (ALL); one or more chronic leukemias, including, but not limited to, chronic myeloid leukemia (CML), chronic lymphocytic leukemia (CLL); additional hematologic cancers or hematologic conditions including, but not limited to, B-cell prolymphocytic leukemia, plasmacytoid dendritic cell blast tumor, Burkitt's lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, hairy cell leukemia, small cell or large cell follicular lymphoma, malignant lymphoproliferative conditions, MALT lymphoma, mantle cell lymphoma, marginal zone lymphoma, multiple myeloma, myelodysplasia and myelodysplastic syndrome, non-Hodgkin's lymphoma, plasmablastic lymphoma, plasmacytoid dendritic cell tumor, Waldenström's macroglobulinemia and pre-leukemias, which represent a heterogeneous collection of hematological conditions united by effective products (or dysplasia) of myeloid blood cells, and the like.
В одном варианте осуществления рак выбран из следующих видов: рак легкого (например, немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) (например, NSCLC плоскоклеточного гистологического типа, и/или неплоскоклеточного гистологического типа, или NSCLC аденокарцинома)), меланома (например, прогрессирующая меланома), рак почки (например, почечно-клеточная карцинома, например, светлоклеточная почечно-клеточная карцинома), рак печени, миелома (например, множественная миелома), рак предстательной железы, рак молочной железы (например, рак молочной железы, при котором отсутствует экспрессия одного, двух или всех из рецепторов эстрогена, рецепторов прогестерона или HER2/Neu, например, тройной отрицательный рак молочной железы), колоректальный рак, рак поджелудочной железы, рак головы и шеи (например, плоскоклеточная карцинома головы и шеи (HNSCC), анальный рак, гастроэзофагальный рак, рак щитовидной железы, рак шейки матки, лимфопролиферативная болезнь (например, посттрансплантационная лимфопролиферативная болезнь) или гематологический рак, ТIn one embodiment, the cancer is selected from the following types: lung cancer (e.g., non-small cell lung cancer (NSCLC) (e.g., NSCLC squamous histological type, and/or non-squamous histological type, or NSCLC adenocarcinoma)), melanoma (e.g., advanced melanoma), kidney cancer (eg, renal cell carcinoma, eg clear cell renal cell carcinoma), liver cancer, myeloma (eg, multiple myeloma), prostate cancer, breast cancer (eg, breast cancer that lacks expression of one, two or all of estrogen receptors, progesterone receptors, or HER2/Neu, eg, triple negative breast cancer), colorectal cancer, pancreatic cancer, head and neck cancer (eg, head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC), anal cancer, gastroesophageal cancer, thyroid cancer, cervical cancer, lymphoproliferative disease (eg, post-transplant lymphoproliferative disease) or hematologic cancer, T
- 53 045940 клеточная лимфома, неходжкинская лимфома или лейкоз (например, миелолейкоз).- 53 045940 cellular lymphoma, non-Hodgkin's lymphoma or leukemia (for example, myeloid leukemia).
В другом варианте осуществления рак выбран из карциномы (например, прогрессирующей или метастатической), меланомы или карциномы легкого, например, немелкоклеточной карциномы легкого.In another embodiment, the cancer is selected from carcinoma (eg, advanced or metastatic), melanoma, or lung carcinoma, eg, non-small cell lung carcinoma.
В одном варианте осуществления рак представляет собой рак легкого, например, немелкоклеточный рак легкого.In one embodiment, the cancer is a lung cancer, such as non-small cell lung cancer.
В другом варианте осуществления рак представляет собой гепатокарциному, например, прогрессирующую гепатокарциному, без вирусной инфекции или с вирусной инфекцией, например, с хроническим вирусным гепатитом.In another embodiment, the cancer is a hepatocarcinoma, eg, advanced hepatocarcinoma, without or with a viral infection, eg, chronic viral hepatitis.
В другом варианте осуществления рак представляет собой рак предстательной железы, например, прогрессирующий рак предстательной железы.In another embodiment, the cancer is prostate cancer, such as advanced prostate cancer.
Еще в одном варианте осуществления рак представляет собой миелому, например, множественную миелому.In yet another embodiment, the cancer is myeloma, such as multiple myeloma.
Еще в одном варианте осуществления рак представляет собой рак почки, например, почечноклеточную карциному (RCC) (например, метастатический RCC или светлоклеточную почечноклеточную карциному).In yet another embodiment, the cancer is a kidney cancer, such as renal cell carcinoma (RCC) (eg, metastatic RCC or clear cell renal cell carcinoma).
В одном варианте осуществления рак представляет собой меланому, например, прогрессирующую меланому. В одном варианте осуществления рак представляет собой прогрессирующую или неоперабельную меланому, которая не реагирует на другие виды терапии. В других вариантах осуществления рак представляет собой меланому с мутацией BRAF (например, с мутацией BRAF V600). В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят после лечения антителом против CTLA-4 (например, ипилимумаб) с ингибитором BRAF (например, вемурафениб или дабрафениб) или без этого ингибитора.In one embodiment, the cancer is melanoma, for example, advanced melanoma. In one embodiment, the cancer is an advanced or inoperable melanoma that does not respond to other therapies. In other embodiments, the cancer is BRAF mutation melanoma (eg, BRAF V600 mutation). In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered following treatment with an anti-CTLA-4 antibody (eg, ipilimumab) with or without a BRAF inhibitor (eg, vemurafenib or dabrafenib).
Способы и композиции, раскрытые в изобретении, являются полезными для лечения метастатических поражений, связанных с упомянутыми выше видами рака.The methods and compositions disclosed herein are useful for treating metastatic lesions associated with the types of cancer mentioned above.
Комбинирование антител против PD-1 с противоопухолевыми вакцинами.Combining anti-PD-1 antibodies with antitumor vaccines.
Молекулы антитела против PD-1 могут быть объединены с иммуногенным веществом, таким как раковые клетки, очищенные опухолевые антигены (включающие рекомбинантные белки, пептиды и углеводные молекулы), клетки и клетки, трансфицированные генами, кодирующими иммуностимулирующие цитокины (Не et al. (2004), J. Immunol. 173: 4919-28). Неограничивающие примеры возможных для применения противоопухолевых вакцин включают пептиды с антигенами меланомы, такие как пептиды gp100, антигены MAGE, Trp-2, MART1 и/или тирозиназы, опухолевые клетки, трансфицированные для экспрессии цитокина GM-CSF, вакцины на основе ДНК, вакцины на основе РНК и вакцины на основе вирусной трансдукции. Противоопухолевая вакцина может быть профилактической или терапевтической.Anti-PD-1 antibody molecules can be combined with an immunogenic substance such as cancer cells, purified tumor antigens (including recombinant proteins, peptides and carbohydrate molecules), cells and cells transfected with genes encoding immunostimulatory cytokines (He et al. (2004) , J Immunol 173: 4919-28). Non-limiting examples of possible tumor vaccines include peptides with melanoma antigens such as gp100 peptides, MAGE, Trp-2, MART1 and/or tyrosinase antigens, tumor cells transfected to express the cytokine GM-CSF, DNA-based vaccines, RNA and vaccines based on viral transduction. A tumor vaccine can be prophylactic or therapeutic.
Блокаду PD-1 можно объединять с протоколом вакцинации. Было разработано множество стратегий для экспериментов по вакцинации против опухолей (см. Rosenberg, S., 2000, Development of Cancer Vaccines, AsCo Educational Book Spring: 60-62; Logothetis, C., 2000, ASCO Educational Book Spring: 300-302; Khayat, D. 2000, ASCO Educational Book Spring: 414-428; Foon, K. 2000, ASCO Educational Book Spring: 730-738; также см. Restifo, N. and Sznol, M., Cancer Vaccines, Ch. 61, pp. 3023-3043 in DeVita, V. et al. (eds.), 1997, Cancer: Principles and Practice of Oncology. Fifth Edition). Согласно одной из упомянутых стратегий, вакцины получают с использованием аутологичных или аллогенных опухолевых клеток. Было показано, что такие клеточные вакцины являются наиболее эффективными после трансдукции опухолевых клеток для экспрессии гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора (GMCSF). Выявлено, что GM-CSF является мощным активатором презентации антигена для противоопухолевой вакцинации (Dranoff et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 3539-43).PD-1 blockade can be combined with a vaccination protocol. Many strategies have been developed for tumor vaccination experiments (see Rosenberg, S., 2000, Development of Cancer Vaccines, AsCo Educational Book Spring: 60-62; Logothetis, C., 2000, ASCO Educational Book Spring: 300-302; Khayat, D. 2000, ASCO Educational Book Spring: 414-428; Foon, K. 2000, ASCO Educational Book Spring: 730-738; also see Restifo, N. and Sznol, M., Cancer Vaccines, Ch. 61, pp. 3023-3043 in DeVita, V. et al. (eds.), 1997, Cancer: Principles and Practice of Oncology. Fifth Edition). According to one of the mentioned strategies, vaccines are produced using autologous or allogeneic tumor cells. Such cell-based vaccines have been shown to be most effective after transducing tumor cells to express granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GMCSF). GM-CSF has been found to be a potent activator of antigen presentation for tumor vaccination (Dranoff et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 3539-43).
Блокаду PD-1 можно задействовать в комбинации с набором экспрессируемых в опухоли рекомбинантных белков и/или пептидов, с целью получения иммунного ответа на эти белки. Обычно иммунная система считает эти белки собственными антигенами, и поэтому проявляет к ним толерантность. Опухолевый антиген может также включать белок теломеразу, который необходим для синтеза теломеров хромосом и экспрессируется при более чем 85% раковых заболеваний у человека и только в ограниченном количестве соматических тканей (Kim, N et al. (1994) Science 266: 2011-2013). (Эти соматические ткани могут быть защищены от иммунной атаки различными способами). Опухолевый антиген может также представлять собой нео-антигены которые экспрессируются в раковых клетках благодаря соматическим мутациям, изменяющим последовательность белка, или создающим слитые белки между двумя неродственными последовательностями (а именно, ген bcr-abl в филадельфийской хромосоме), или идиотип из В-клеточных опухолей.PD-1 blockade can be used in combination with a set of tumor-expressed recombinant proteins and/or peptides to produce an immune response to these proteins. Typically, the immune system considers these proteins to be self-antigens and therefore develops tolerance to them. Tumor antigen may also include the protein telomerase, which is required for the synthesis of chromosomal telomeres and is expressed in more than 85% of human cancers and only in a limited number of somatic tissues (Kim, N et al. (1994) Science 266: 2011-2013). (These somatic tissues can be protected from immune attack in a variety of ways.) Tumor antigen may also be neo-antigens that are expressed in cancer cells due to somatic mutations that change the protein sequence, or create fusion proteins between two unrelated sequences (namely, the bcr-abl gene on the Philadelphia chromosome), or an idiotype from B-cell tumors .
Другие противоопухолевые вакцины могут включать белки из вирусов, причастных к человеческим раковым заболеваниям, такие как вирусы папилломы человека (ВПЧ), вирусы гепатита (HBV и HCV), вирус герпеса саркомы Капоши (KHSV) и вирус Эпштейна-Барра (EBV). Другой формой опухольспецифичного антигена, который можно использовать в комбинации с блокадой PD-1, являются очищенные белки теплового шока (HSP), выделенные непосредственно из опухолевой ткани. Эти белки теплового шока содержат фрагменты белков из опухолевых клеток, и такие HSP являются высокоэффективOther cancer vaccines may include proteins from viruses implicated in human cancers, such as human papillomaviruses (HPV), hepatitis viruses (HBV and HCV), Kaposi's sarcoma herpes virus (KHSV), and Epstein-Barr virus (EBV). Another form of tumor-specific antigen that can be used in combination with PD-1 blockade is purified heat shock proteins (HSPs) isolated directly from tumor tissue. These heat shock proteins contain protein fragments from tumor cells, and such HSPs are highly effective
- 54 045940 ными при доставке антиген-представляющих клеток для индукции противоопухолевого иммунитета (Suot, R & Srivastava, P (1995) Science 269:1585-1588; Tamura, Y. et al. (1997) Science 278:117-120).- 54 045940 useful in the delivery of antigen presenting cells to induce antitumor immunity (Suot, R & Srivastava, P (1995) Science 269:1585-1588; Tamura, Y. et al. (1997) Science 278:117-120).
Дендритные клетки (DC) являются мощными антиген-представляющими клетками, которые могут быть использованы для примирования антиген-специфичных ответов. Дендритные клетки могут быть получены ex vivo и вводиться с различными белковыми и пептидными антигенами, а также с экстрактами опухолевых клеток (Nestle, F. et al. (1998) Nature Medicine 4: 328-332). Дендритные клетки также могут подвергаться трансдукции генетическими способами, чтобы они экспрессировали в том числе и эти опухолевые антигены. Дендритные клетки также подвергались слиянию непосредственно с опухолевыми клетками в целях иммунизации (Kugler, A. Et al. (2000) Nature Medicine 6: 332-336). В качестве способа вакцинации, DC-иммунизация может быть эффективной в комбинации с блокадой PD-1, для индукции более мощных противоопухолевых ответов.Dendritic cells (DCs) are potent antigen-presenting cells that can be used to prime antigen-specific responses. Dendritic cells can be obtained ex vivo and administered with various protein and peptide antigens, as well as tumor cell extracts (Nestle, F. et al. (1998) Nature Medicine 4: 328-332). Dendritic cells can also be genetically transduced to express these tumor antigens. Dendritic cells have also been fused directly with tumor cells for immunization purposes (Kugler, A. Et al. (2000) Nature Medicine 6: 332-336). As a vaccination method, DC immunization may be effective in combination with PD-1 blockade to induce more potent antitumor responses.
В некоторых вариантах осуществления комбинация дополнительно включает ингибитор или активатор модулятора иммунной контрольной точки (например, ингибитор LAG-3 (например, молекулу антитела против LAG-3), ингибитор PD-L1 (например, молекулу антитела против PD-L1), модулятор TIM-3 (например, TIM-3 - активатор или ингибитор, например, молекулу антитела против TIM-3), или ингибитор CTLA-4 (например, антитело против CTLA-4), или любую их комбинацию.In some embodiments, the combination further comprises an immune checkpoint modulator inhibitor or activator (e.g., a LAG-3 inhibitor (e.g., an anti-LAG-3 antibody molecule), a PD-L1 inhibitor (e.g., an anti-PD-L1 antibody molecule), a TIM-modulator 3 (eg, a TIM-3 activator or inhibitor, eg, an anti-TIM-3 antibody molecule), or a CTLA-4 inhibitor (eg, an anti-CTLA-4 antibody), or any combination thereof.
Блокаду PD-1 также можно комбинировать со стандартным лечением рака. Блокада PD-1 может быть эффективна в комбинации с химиотерапевтическими схемами. В этих случаях возникает возможность уменьшения вводимой дозы химиотерапевтического реагента (Mokyr, M. et al. (1998) Cancer Research 58: 5301-5304). В некоторых вариантах осуществления способы и композиции, описанные в изобретении, вводят в комбинации с одной или несколькими из следующих методик: молекулы других антител, химиотерапия, другая противоопухолевая терапия (например, противоопухолевые средства направленного действия или онколитические средства), цитотоксические вещества, иммунологические терапевтические средства (например, цитокины), хирургическое вмешательство и/или процедуры облучения. Примеры цитотоксических веществ, которые могут быть введены в комбинации, включают противомикротрубочковые вещества, ингибиторы топоизомеразы, антиметаболиты, ингибиторы митоза, алкилирующие вещества, антрациклины, алкалоиды барвинка, интеркалирующие вещества, вещества, способные нарушать пути сигнальной трансдукции, вещества, способствующие апоптозу, ингибиторы протеосомы и облучение (например, локальное или тотальное облучение тела).PD-1 blockade can also be combined with standard cancer treatment. PD-1 blockade may be effective in combination with chemotherapy regimens. In these cases, it becomes possible to reduce the administered dose of the chemotherapeutic reagent (Mokyr, M. et al. (1998) Cancer Research 58: 5301-5304). In some embodiments, the methods and compositions described in the invention are administered in combination with one or more of the following modalities: other antibody molecules, chemotherapy, other antineoplastic therapies (eg, targeted antineoplastic agents or oncolytic agents), cytotoxic agents, immunological therapeutic agents (eg, cytokines), surgery, and/or radiation procedures. Examples of cytotoxic agents that may be administered in combination include antimicrotubule agents, topoisomerase inhibitors, antimetabolites, mitotic inhibitors, alkylating agents, anthracyclines, vinca alkaloids, intercalating agents, agents capable of disrupting signal transduction pathways, agents promoting apoptosis, proteasome inhibitors, and irradiation (for example, local or total body irradiation).
Альтернативно, или в комбинации с вышеуказанными комбинациями, способы и композиции, описанные в изобретении, можно применять в комбинации с одним или несколькими из следующих средств: иммуномодулятор (например, активатор костимулирующей молекулы или ингибитор ингибирующей молекулы), вакцина, например, терапевтическая противораковая вакцина, или другие формы клеточной иммунотерапии.Alternatively, or in combination with the above combinations, the methods and compositions described in the invention can be used in combination with one or more of the following: an immunomodulator (e.g., a co-stimulatory molecule activator or an inhibitory molecule inhibitor), a vaccine, e.g., a therapeutic cancer vaccine, or other forms of cellular immunotherapy.
Ниже в качестве примера и без ограничения приведены комбинации и применения молекул антител против PD-1.Below, by way of example and without limitation, combinations and uses of anti-PD-1 antibody molecules are provided.
В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с модулятором костимулирующей молекулы или ингибирующей молекулы, например, коингибирующего лиганда или рецептора.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a co-stimulatory molecule or inhibitory molecule modulator, such as a coinhibitory ligand or receptor.
В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с модулятором, например, с агонистом костимулирующей молекулы. В одном варианте осуществления агонист костимулирующей молекулы выбран из следующих агонистов (таких как агонистическое антитело, или его антигенсвязывающий фрагмент, или растворимое слияние): OX40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1, (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1 ВВ (CD137), GITR, CD30, CD40, BAPFR, HVEM, CD7, СВЕТ, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3 или лиганд CD83.In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a modulator, such as a costimulatory molecule agonist. In one embodiment, the costimulatory molecule agonist is selected from the following agonists (such as an agonist antibody, or an antigen binding fragment, or a soluble fusion thereof): OX40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1, (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1 BB (CD137), GITR, CD30, CD40, BAPFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3 or CD83 ligand.
В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 используют в комбинации с костимулирующей молекулой, например, с агонистом, ассоциированным с положительным сигналом, включающей костимуляторный домен из CD28, CD27, ICOS и GITR.In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with a costimulatory molecule, eg, a positive signal associated agonist, comprising a costimulatory domain of CD28, CD27, ICOS and GITR.
Примеры агонистов GITR (семейного гена глюкокортикоид-индуцированного TNF рецептора) включают, например, слитые белки GITR и антитела против GITR (например, бивалентные антитела против GITR), такие как слитый белок GITR, описанный в следующих документах: патент США № 6111090, Европейский патент № 090505В1, патент США № 8586023, опубликованные заявки РСТ WO №№ 2010/003118 и 2011/090754, или антитела против GITR, описанные, например, в следующих документах: патент США № 7025962, Европейский патент № 1947183В1, патент США № 7812135, патент США № 8388967, патент США № 8591886, Европейский патент № ЕР 1866339, опубликованные заявки РСТ № WO 2011/028683, РСТ № WO 2013/039954, РСТ № WO 2005/007190, РСТ № WO 2007/133822, РСТ № WO 2005/055808, РСТ № WO 99/40196, РСТ № WO 2001/03720, РСТ № WO 99/20758, РСТ № WO 2006/083289, РСТ WO № 2005/115451, патент США № 7618632 и опубликованная заявка РСТ № WO 2011/051726. В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором ингибирующей молекулы точки иммунного контроля. Специалистам в данной области следует понимать, что термин точка иммунного контроля означает группу молекул на поверхности CD4- и CD8- Т-клеток. Эти молекулы могут эффективно служить в качестве тормозов для понижающей модуExamples of GITR (familial glucocorticoid-induced TNF receptor) agonists include, for example, GITR fusion proteins and anti-GITR antibodies (eg, bivalent anti-GITR antibodies), such as the GITR fusion protein described in the following documents: US Patent No. 6,111,090, European Patent No. 090505B1, US Patent No. 8586023, PCT WO Published Applications Nos. 2010/003118 and 2011/090754, or anti-GITR antibodies described, for example, in the following documents: US Patent No. 7025962, European Patent No. 1947183B1, US Patent No. 7812135, US Patent No. 8388967, US Patent No. 8591886, European Patent No. EP 1866339, published applications RST No. Wo 2011/028683, PCT No. Wo 2013/039954, PCT No. WO 2005/007190, PCST No. Wo 2007/133822, PCT No. WO 2005 /055808, PCT No. WO 99/40196, PCT No. WO 2001/03720, PCT No. WO 99/20758, PCT No. WO 2006/083289, PCT WO No. 2005/115451, US Patent No. 7618632 and PCT Published Application No. WO 2011/ 051726. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an inhibitory immune checkpoint molecule inhibitor. Those skilled in the art will understand that the term immune checkpoint refers to a group of molecules on the surface of CD4 and CD8 T cells. These molecules can effectively serve as brakes for the down-mode
- 55 045940 ляции или подавления противоопухолевого иммунного ответа. Молекулы точки иммунного контроля включают без ограничения белки программируемой смерти 1 (PD-1), цитотоксический Тлимфоцитарный антиген 4 (CTLA-4), B7H1, В7Н4, ОХ-40, CD137, CD40, LAG-3 и TIM-3, которые напрямую ингибируют иммунные клетки. Полезные в способах по изобретению иммунотерапевтические средства, которые могут выступать в качестве ингибиторов точки иммунного контроля, включают без ограничения ингибиторы PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM-3, LAG-3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2В4, СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1 и/или СЕАСАМ-5) и/или TGFR-бета. Ингибирование ингибирующей молекулы может осуществляться путем ингибирования на уровне ДНК, РНК или белка. В вариантах осуществления можно использовать ингибирующую нуклеиновую кислоту (например, dsPHK (двухцепочечную РНК), siPHK (малую интерферирующую РНК) или shPHK (короткую шпилечную РНК)) для ингибирования экспрессии ингибирующей молекулы. В других вариантах осуществления ингибитор ингибирующего сигнала представляет собой полипептид, например, растворимый лиганд, или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, который связывается с ингибирующей молекулой.- 55 045940 lation or suppression of the antitumor immune response. Immune checkpoint molecules include, but are not limited to, programmed death 1 (PD-1), cytotoxic T lymphocyte antigen 4 (CTLA-4), B7H1, B7H4, OX-40, CD137, CD40, LAG-3, and TIM-3, which directly inhibit immune cells. Immunotherapeutic agents useful in the methods of the invention that can act as immune checkpoint inhibitors include, but are not limited to, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM-3, LAG-3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, SEASAM (for example, SEASAM-1 and/or SEASAM-5) and/or TGFR-beta. Inhibition of an inhibitory molecule can be accomplished by inhibition at the DNA, RNA or protein level. In embodiments, an inhibitory nucleic acid (eg, dsRNA, siRNA, or shRNA) may be used to inhibit expression of the inhibitory molecule. In other embodiments, the inhibitory signal inhibitor is a polypeptide, such as a soluble ligand, or an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to an inhibitory molecule.
В одном варианте осуществления ингибитор представляет собой растворимый лиганд (например, CTLA-4-Ig или TIM-3-Ig), или антитело или фрагмент антитела, которые связываются с PD-L1, PD-L2 или CTLA4. Например, молекулу антитела против PD-1 можно вводить в комбинации с антителом против CTLA-4, например, с препаратом ипилимумаб, например, для лечения рака (например, рака, выбранного из меланомы, например, метастатической меланомы, рака легкого, например, немелкоклеточной карциномы легкого, или рака предстательной железы). Примеры антитела против CTLA4 включают Тремелимумаб (моноклональное антитело IgG2, полученное от компании Pfizer, ранее известный как тицилимумаб, СР-675206), и ипилимумаб (антитело против CTLA-4, также известное как MDX-010, CAS № 477202-00-9). В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят после лечения, например, после лечения меланомы антителом против CTLA4 (например, препаратом ипилимумаб) без ингибитора BRAF или с ингибитором BRAF (например, с вемурафенибом или дабрафенибом). Возможные для применения дозы, включают, в качестве примера, дозу молекулы антитела против PD-1, составляющую приблизительно от 1 до 10 мг/кг, например, 3 мг/кг, и дозу антитела против CTLA, такого как ипилимумаб, составляющую приблизительно 3 мг/кг.In one embodiment, the inhibitor is a soluble ligand (eg, CTLA-4-Ig or TIM-3-Ig), or antibody or antibody fragment that binds PD-L1, PD-L2, or CTLA4. For example, an anti-PD-1 antibody molecule may be administered in combination with an anti-CTLA-4 antibody, e.g., the drug ipilimumab, e.g., for the treatment of cancer (e.g., cancer selected from melanoma, e.g., metastatic melanoma, lung cancer, e.g., non-small cell lung carcinoma or prostate cancer). Examples of anti-CTLA4 antibody include Tremelimumab (an IgG2 monoclonal antibody obtained from Pfizer, formerly known as ticilimumab, CP-675206), and ipilimumab (anti-CTLA-4 antibody, also known as MDX-010, CAS No. 477202-00-9) . In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered following treatment, for example, after treatment of melanoma with an anti-CTLA4 antibody (eg, ipilimumab) without or with a BRAF inhibitor (eg, vemurafenib or dabrafenib). Dosages that may be used include, by way of example, a dose of an anti-PD-1 antibody molecule of about 1 to 10 mg/kg, such as 3 mg/kg, and a dose of an anti-CTLA antibody such as ipilimumab of about 3 mg. /kg.
Иммунные ингибирующие молекулы, например, PD-1 и LAG-3, могут осуществлять регуляцию, например, синергическую регуляцию Т-клеточной функции, что способствует ускользанию опухолевых клеток от иммуннологического надзора. В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с антителом против LAG-3 или его антигенсвязывающим фрагментом. В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с антителом против TIM-3 или его антигенсвязывающим фрагментом. В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с антителом против LAG-3 и антителом против TIM-3, или их антигенсвязывающим фрагментом. Комбинация антител по изобретению может вводиться раздельно, например, в виде отдельных антител, или в виде связаннных между собой антител, таких как молекулы биспецифичного или триспецифичного антитела. В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором СЕАСАМ (например, с ингибитором СЕАСАМ-1, СЕАСАМ-3 и/или СЕАСАМ-5), например, с молекулой антитела против СЕАСАМ. В другом варианте молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором СЕАСАМ-1, например, с молекулой антитела против СЕАСАМ-1. В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с ингибитором СЕАСАМ-5, например, с молекулой антитела против СЕАСАМ-5. В одном варианте осуществления вводят биспецифичное антитело, которое включает молекулу антитела против PD-1 и антитело против TIM-3 или против LAG-3, или их антигенсвязывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления комбинация антител, упомянутых в изобретении, используется для лечения рака, например, рака, упомянутого в изобретении (например, солидной опухоли). Эффективность вышеуказанных комбинаций может быть протестирована на животных моделях, известных в данной области. Например, животные модели для тестирования синергетического действия антител против PD-1 и против LAG-3, описаны, например, авторами Woo et al. (2012) Cancer Res. 72(4): 917-27).Immune inhibitory molecules, such as PD-1 and LAG-3, may exert regulation, such as synergistic regulation of T cell function, which promotes tumor cell immune evasion. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an anti-LAG-3 antibody or an antigen-binding fragment thereof. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an anti-TIM-3 antibody or an antigen-binding fragment thereof. In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with an anti-LAG-3 antibody and an anti-TIM-3 antibody, or an antigen-binding fragment thereof. The antibody combination of the invention may be administered separately, for example, as individual antibodies, or as linked antibodies, such as bispecific or trispecific antibody molecules. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a SEACAM inhibitor (eg, a SEACAM-1, SEACAM-3, and/or SEACAM-5 inhibitor), for example, an anti-CEACAM antibody molecule. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a SEACAM-1 inhibitor, for example, an anti-CEACAM-1 antibody molecule. In another embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a CEACAM-5 inhibitor, for example, an anti-CEACAM-5 antibody molecule. In one embodiment, a bispecific antibody is administered that includes an anti-PD-1 antibody molecule and an anti-TIM-3 or anti-LAG-3 antibody, or an antigen-binding fragment thereof. In some embodiments, a combination of antibodies mentioned in the invention is used to treat cancer, for example, a cancer mentioned in the invention (eg, a solid tumor). The effectiveness of the above combinations can be tested in animal models known in the art. For example, animal models for testing the synergistic effects of anti-PD-1 and anti-LAG-3 antibodies are described, for example, by Woo et al. (2012) Cancer Res. 72(4): 917-27).
В одном варианте осуществления ингибитор СЕАСАМ (например, СЕАСАМ-1 и/или СЕАСАМ-5) представляет собой молекулу антитела против СЕАСАМ. Без связи с какой-либо теорией, СЕАСАМ-1 был описан в качестве лиганда и партнера TIM-3 (см., например, WO 2014/022332). Комбинация антител против TIM-3 и против СЕАСАМ-1 проявляет синергетический эффект in vivo, обнаруженный в моделях опухолевого ксенотрансплантата (см., например, WO 2014/022332). Предполагается, что в опухоли задействован СЕАСАМ-1 или СЕАСАМ-5 для ингибирования иммунной системы, как описано, например, в публикациях Markel et al. J Immunol. 2002 Mar 15; 168(6):2803-10; Markel et al. J Immunol. 2006 Nov 1; 177(9):6062-71; Markel et al. Immunology. 2009 Feb; 126(2):186-200; Markel et al. Cancer Immunol. Immunother. 2010 Feb; 59(2):215-30; Ortenberg et al. Mol Cancer Ther. 2012 Jun; 11(6):1300-10; Stern et al. J. Immunol. 2005 Jun 1; 174(11): 6692-701; Zheng et al. PLoS One. 2010 Sep 2; 5(9). pii: e12529. Таким образом, ингибиторы СЕАСАМ можно применять совместно с другими иммуномодуляторами, описанными в изобретении (например, с ингибиторами PD-1 или TIM-3) для усиления иммунного ответа против рака, например, меланомы, рака легкого (например, NSCLC), рака мочевого пузыря, толстой кишки или ракаIn one embodiment, a SEACAM inhibitor (eg, SEACAM-1 and/or SEACAM-5) is an anti-CEACAM antibody molecule. Without wishing to be bound by any theory, SEACAM-1 has been described as a ligand and partner of TIM-3 (see, for example, WO 2014/022332). The combination of anti-TIM-3 and anti-CEACAM-1 antibodies exhibits a synergistic effect in vivo, found in tumor xenograft models (see, for example, WO 2014/022332). It is assumed that tumors involve SEACAM-1 or SEACAM-5 to inhibit the immune system, as described, for example, in the publications of Markel et al. J Immunol. 2002 Mar 15; 168(6):2803-10; Markel et al. J Immunol. 2006 Nov 1; 177(9):6062-71; Markel et al. Immunology. Feb 2009; 126(2):186-200; Markel et al. Cancer Immunol. Immunother. Feb 2010; 59(2):215-30; Ortenberg et al. Mol Cancer Ther. 2012 Jun; 11(6):1300-10; Stern et al. J. Immunol. 2005 Jun 1; 174(11): 6692-701; Zheng et al. PLoS One. 2010 Sep 2; 5(9). pii: e12529. Thus, CEACAM inhibitors can be used in conjunction with other immunomodulators described in the invention (eg, PD-1 or TIM-3 inhibitors) to enhance the immune response against cancer, for example, melanoma, lung cancer (eg, NSCLC), bladder cancer , colon or cancer
- 56 045940 яичников, или других видов рака, упомянутых в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор СЕАСАМ представляет собой антитело против СЕАСАМ-1, как описано в заявках WO 2010/125571, WO 2013/82366 и WO 2014/022332, например, моноклональное антитело 34В1, 26Н7 и 5F4 или их рекомбинантную форму, как описано, например, в заявках US 2004/0047858, US 7132255 и WO 99/52552. В других вариантах осуществления антитело против СЕАСАМ представляет собой молекулу антитела против СЕАСАМ-1 и/или молекулу антитела против СЕАСАМ-5, как описано, например, в заявках WO 2010/125571, WO 2013/054331 и US 2014/0271618.- 56 045940 ovarian, or other types of cancer mentioned in the invention. In one embodiment, the CEACAM inhibitor is an anti-CEACAM-1 antibody as described in WO 2010/125571, WO 2013/82366 and WO 2014/022332, for example monoclonal antibody 34B1, 26H7 and 5F4 or a recombinant form thereof as described for example, in applications US 2004/0047858, US 7132255 and WO 99/52552. In other embodiments, the anti-CEACAM antibody is an anti-CEACAM-1 antibody molecule and/or an anti-CEACAM-5 antibody molecule, as described, for example, in WO 2010/125571, WO 2013/054331 and US 2014/0271618.
В некоторых вариантах осуществления иммунные молекулы, ингибирующие PD-1 и LAG-3 (например, молекулы антител) вводят в комбинации друг с другом, например, для лечения рака. В некоторых вариантах осуществления пациент является пациентом, у которого наблюдается прогрессирование (например, выявлен рост опухоли) в ходе лечения ингибитором PD-1 (например, молекулой антитела по изобретению) и/или ингибитором PD-L1 (например, молекулой антитела). В некоторых вариантах осуществления продолжается лечение молекулой антитела против PD-1 и/или молекулой антитела против PD-L1, и к указанному лечению добавляется иммунная молекула, ингибирующая LAG-3 (например, антитело).In some embodiments, immune molecules that inhibit PD-1 and LAG-3 (eg, antibody molecules) are administered in combination with each other, for example, to treat cancer. In some embodiments, the patient is a patient who has experienced progression (eg, tumor growth) during treatment with a PD-1 inhibitor (eg, an antibody molecule of the invention) and/or a PD-L1 inhibitor (eg, an antibody molecule). In some embodiments, treatment with an anti-PD-1 antibody molecule and/or an anti-PD-L1 antibody molecule is continued, and a LAG-3 inhibitory immune molecule (eg, an antibody) is added to said treatment.
В некоторых вариантах осуществления иммунные молекулы, ингибирующие PD-1 и TIM-3 (например, молекулы антител) вводят в комбинации друг с другом, например, для лечения рака. В некоторых вариантах осуществления пациент является пациентом, у которого наблюдается прогрессирование (например, выявлен рост опухоли) в ходе лечения ингибитором PD-1 (например, молекулой антитела по изобретению) и/или ингибитором PD-L1 (например, молекулой антитела). В некоторых вариантах осуществления продолжается лечение молекулой антитела против PD-1 и/или молекулой антитела против PD-L1, и к указанному лечению добавляется иммунная молекула, ингибирующая TIM-3 (например, антитело).In some embodiments, immune molecules that inhibit PD-1 and TIM-3 (eg, antibody molecules) are administered in combination with each other, for example, to treat cancer. In some embodiments, the patient is a patient who has experienced progression (eg, tumor growth) during treatment with a PD-1 inhibitor (eg, an antibody molecule of the invention) and/or a PD-L1 inhibitor (eg, an antibody molecule). In some embodiments, treatment with an anti-PD-1 antibody molecule and/or an anti-PD-L1 antibody molecule is continued, and an immune molecule that inhibits TIM-3 (eg, an antibody) is added to said treatment.
В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в комбинации с цитокином, таким как интерлейкин-21, интерлейкин-2, интерлейкин-12 или интерлейкин-15. В некоторых вариантах осуществления комбинацию молекулы антитела против PD-1 и цитокина, упомянутого в изобретении, применяют для лечения рака, например, рака, упомянутого в изобретении (например, солидной опухоли или меланомы).In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with a cytokine such as interleukin-21, interleukin-2, interleukin-12, or interleukin-15. In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody molecule and a cytokine of the invention is used to treat a cancer, such as a cancer of the invention (eg, solid tumor or melanoma).
Приведенные в качестве примера и без ограничения, иммуномодуляторы, которые могут применяться в комбинации с молекулой антитела против PD-1, включают, например, афутузумаб (Roche®); Пэгфилграстим (Неуласта/Neulasta®); леналидомид (СС-5013, Ревлимид®); талидомид (Таломид®), актимид (СС4047); и цитокины, например, IL-21 или IRX-2 (смесь человеческих цитокинов, включающих интерлейкин 1, интерлейкин-2 и интерферон у, CAS 951209-71-5, полученый от IRX Therapeutics).By way of example and without limitation, immunomodulators that can be used in combination with an anti-PD-1 antibody molecule include, for example, afutuzumab (Roche®); Pegfilgrastim (Neulasta®); lenalidomide (CC-5013, Revlimid®); thalidomide (Thalomid®), actimide (CC4047); and cytokines, for example, IL-21 or IRX-2 (a mixture of human cytokines including interleukin 1, interleukin-2 and interferon γ, CAS 951209-71-5, obtained from IRX Therapeutics).
В других вариантах осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с ингибитором индоламин-пиррол-2,3 диоксигеназы (IDO) (например, INCB24360) у субъекта с прогрессирующим или метастатическим раком (например, у больного метастатическим и рецидивирующим раком NSCL).In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with an indoleamine pyrrole 2,3 dioxygenase (IDO) inhibitor (eg, INCB24360) in a subject with advanced or metastatic cancer (eg, a patient with metastatic and recurrent NSCL cancer).
В других вариантах осуществления молекулы антитела против PD-1 вводят субъекту в комбинации с одной или несколькими из нижеперечисленных методик (например, перед, одновременно или после): трансплантация костного мозга, Т-клеточная абляционная терапия с применением химиотерапевтических средств, таких как флударабин, наружная дистанционная лучевая терапия (XRT), введение циклофосфамида и/или антител, таких как OKT3 или Кампат/САМРАТН. В одном варианте осуществления молекулы антитела против PD-1 вводят после В-клеточной абляционной терапии, например, после применения веществ, реагирующих с CD20, таких как Ритуксан. Например, в одном варианте осуществления пациенты могут проходить стандартное лечение высокодозной химиотерапией с последующей трансплантацией стволовых клеток периферической крови. В некоторых вариантах осуществления после трансплантации пациентам вводят молекулы антитела против PD-1. В дополнительном варианте осуществления молекулы антитела против PD-1 вводят до или после хирургического вмешательства.In other embodiments, anti-PD-1 antibody molecules are administered to a subject in combination with one or more of the following (e.g., before, concurrently, or after): bone marrow transplant, T-cell ablative therapy using chemotherapeutic agents such as fludarabine, topical External beam radiation therapy (XRT), administration of cyclophosphamide and/or antibodies such as OKT3 or Campath/CAMPATH. In one embodiment, anti-PD-1 antibody molecules are administered following B-cell ablation therapy, for example, following CD20-reactive agents such as Rituxan. For example, in one embodiment, patients may receive standard treatment with high-dose chemotherapy followed by a peripheral blood stem cell transplant. In some embodiments, patients are administered anti-PD-1 antibody molecules following transplantation. In a further embodiment, anti-PD-1 antibody molecules are administered before or after surgery.
Другим примером комбинацированного применения являются антитела против PD-1 в комбинации с декарбазином для лечения меланомы. Без связи с конкретной теорией, считается, что комбинированное применение блокады PD-1 и химиотерапии способствует гибели клеток, что является следствием цитотоксического действия большинства химиотерапевтических соединений, которое может вызывать повышение уровня опухолевого антигена в пути презентации антигена. Другие методики комбинированного лечения, которые могут приводить к эффекту синергии с блокадой PD-1 посредством гибели клеток, представляют собой облучение, хирургическое вмешательство и гормональную депривацию. При каждом из этих протоколов в организме-хозяине создается источник опухолевого антигена. В комбинации с блокадой PD-1 могут также применяться ингибиторы ангиогенеза. Ингибирование ангиогенеза приводит к гибели опухолевых клеток, которые могут доставлять опухолевый антиген в путь презентации антигена.Another example of combination use is anti-PD-1 antibodies in combination with decarbazine for the treatment of melanoma. Without being bound by specific theory, the combined use of PD-1 blockade and chemotherapy is believed to promote cell death, which is a consequence of the cytotoxic effects of most chemotherapeutic compounds, which can cause increased levels of tumor antigen in the antigen presentation pathway. Other combination treatments that may be synergistic with PD-1 blockade via cell death are radiation, surgery, and hormonal deprivation. In each of these protocols, a source of tumor antigen is created in the host. Angiogenesis inhibitors may also be used in combination with PD-1 blockade. Inhibition of angiogenesis results in the death of tumor cells that can deliver tumor antigen to the antigen presentation pathway.
Антитела, блокирующие PD-1, можно также применять в комбинации с биспецифичными антителами. Биспецифичные антитела можно использовать для нацеливания двух отдельных антигенов. НаAntibodies that block PD-1 can also be used in combination with bispecific antibodies. Bispecific antibodies can be used to target two separate antigens. On
- 57 045940 пример, биспецифичные антитела против Fc-рецептора/против опухолевого антигена (например, Her2/Neu) применяются для нацеливания макрофагов в место локализации опухоли. Это нацеливание может более эффективно активировать опухоль-специфичные реакции. Плечо Т-клетки из этих реакций будет усилено путем применения блокады PD-1. Альтернативно, антиген может быть доставлен непосредственно в дендритные клетки с помощью биспецифичных антител, которые связываются с опухолевым антигеном и специфичным маркером клеточной поверхности дендритных клеток.- 57 045940 example, anti-Fc receptor/anti-tumor antigen (eg Her2/Neu) bispecific antibodies are used to target macrophages to the tumor site. This targeting may more effectively activate tumor-specific responses. The T cell arm of these responses will be enhanced by the application of PD-1 blockade. Alternatively, the antigen can be delivered directly to dendritic cells using bispecific antibodies that bind to the tumor antigen and a specific cell surface marker of the dendritic cells.
Существует широкое разнообразие механизмов ускользания опухоли от иммуннологического надзора. Многие из этих механизмов могут быть преодолены путем инактивации белков, которые экспрессируются опухолями и являются иммунодепрессивными. К ним относятся, среди прочего, трансформирующий фактор роста TGF-бета (Kehrl, J. et al. (1986) J. Exp. Med. 163: 1037-1050), IL-10 (Howard, M. & O'Garra, A. (1992) Immunology Today 13: 198-200) и лиганд Fas (Hahne, M. et al. (1996) Science 274: 13631365).There are a wide variety of mechanisms by which tumors evade immunosurveillance. Many of these mechanisms can be overcome by inactivating proteins that are expressed by tumors and are immunosuppressive. These include, among others, transforming growth factor TGF-beta (Kehrl, J. et al. (1986) J. Exp. Med. 163: 1037-1050), IL-10 (Howard, M. & O'Garra, A. (1992) Immunology Today 13: 198-200) and Fas ligand (Hahne, M. et al. (1996) Science 274: 13631365).
Антитела или их антигенсвязывающие фрагменты против каждой из упомянутых молекул могут быть использованы в комбинации с антителом против PD-1, чтобы оказать противодействие эффектам иммуносупрессивного вещества и улучшить противоопухолевые иммунные реакции организма-хозяина.Antibodies or antigen-binding fragments thereof against each of these molecules can be used in combination with an anti-PD-1 antibody to counteract the effects of the immunosuppressive agent and improve antitumor immune responses of the host.
Другие антитела, которые можно использовать для активации иммунного отклика у хозаяна, могут применяться в комбинации с антителом против PD-1. В их число входят молекулы на поверхности дендритных клеток (DC), которые активируют функцию DC и презентацию антигена. Антитела против CD40 способны эффективно заменять действие Т-клеток - хелперов (Ridge, J. et al. (1998) Nature 393: 474-478) и могут быть использованы в комбинации с антителами против PD-1 (Ito, N. et al. (2000) Immunobiology 201(5)527-40). Антитела против Т-клеточных костимуляторных молекул, такие как CTLA-4, OX-40 (Weinberg, A. Et al. (2000) Immunol. 164: 2160-2169) (например, патент США № 5811097), 4-1ВВ (Melero, I. et al. (1997) Nature Medicine 3: 682-685 (1997) и ICOS (Hutloff, A. et al. (1999) Nature 397: 262-266) также могут создавать повышенные уровни активации Т-клеток.Other antibodies that can be used to activate an immune response in the host can be used in combination with an anti-PD-1 antibody. These include molecules on the surface of dendritic cells (DCs) that activate DC function and antigen presentation. Antibodies against CD40 can effectively replace the action of helper T cells (Ridge, J. et al. (1998) Nature 393: 474-478) and can be used in combination with antibodies against PD-1 (Ito, N. et al. (2000) Immunobiology 201(5)527-40). Antibodies against T cell costimulatory molecules such as CTLA-4, OX-40 (Weinberg, A. Et al. (2000) Immunol. 164: 2160-2169) (eg US Pat. No. 5811097), 4-1BB (Melero , I. et al. (1997) Nature Medicine 3: 682-685 (1997) and ICOS (Hutloff, A. et al. (1999) Nature 397: 262-266) can also create increased levels of T cell activation.
Дополнительный иллюстративный стандарт медицинской помощи описан в разделе под названием Виды комбинированного лечения ниже.An additional illustrative standard of care is described in the section entitled Types of Combination Treatments below.
Во всех описанных в изобретении способах блокаду PD-1 можно комбинировать с другими видами иммунотерапии, такими как введение цитокина (например, интерферонов, GM-CSF, G-CSF, IL-2, IL-21), или лечение биспецифичными антителами, результатом которого является повышение презентации опухолевых антигенов (см. Holliger (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448; Poljak (1994) Structure 2:1121-1123).In all methods described herein, PD-1 blockade can be combined with other types of immunotherapy, such as cytokine administration (eg, interferons, GM-CSF, G-CSF, IL-2, IL-21), or bispecific antibody treatment, which results in is to increase the presentation of tumor antigens (see Holliger (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448; Poljak (1994) Structure 2:1121-1123).
Способы введения молекул антитела известны в данной области и описаны ниже. Подходящие дозы используемых молекул зависят от возраста и веса субъекта и конкретного используемого лекарственного средства. Дозы и схемы лечения молекулой антитела против PD-1 могут быть определены специалистом в данной области. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят путем инъекции (например, подкожно или внутривенно) в дозе приблизительно от 1 до 30 мг/кг, например, приблизительно от 5 до 25 мг/кг, приблизительно от 10 до 20 мг/кг, приблизительно от 1 до 5 мг/кг или приблизительно 3 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе приблизительно от 1 мг/кг, приблизительно 3 мг/кг или 10 мг/кг, приблизительно 20 мг/кг, приблизительно 30 мг/кг или приблизительно 40 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе приблизительно от 1 до 3 мг/кг или приблизительно от 3 до 10 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе приблизительно от 0,5 до 2, от 2 до 4, от 2 до 5, от 5 до 15 или от 5 до 20 мг/кг. Схема введения может варьироваться, например, от одного раза в неделю до одного раза каждые 2, 3 или 4 недели. В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе приблизительно от 10 до 20 мг/кг каждые две недели.Methods for administering antibody molecules are known in the art and are described below. Suitable dosages of the molecules used depend on the age and weight of the subject and the specific drug used. Dosages and treatment regimens for the anti-PD-1 antibody molecule can be determined by one skilled in the art. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered by injection (e.g., subcutaneously or intravenously) at a dose of about 1 to 30 mg/kg, e.g., about 5 to 25 mg/kg, about 10 to 20 mg/kg , about 1 to 5 mg/kg or about 3 mg/kg. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered at a dose of about 1 mg/kg, about 3 mg/kg or 10 mg/kg, about 20 mg/kg, about 30 mg/kg, or about 40 mg/kg. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered at a dose of about 1 to 3 mg/kg, or about 3 to 10 mg/kg. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered at a dose of about 0.5 to 2, 2 to 4, 2 to 5, 5 to 15, or 5 to 20 mg/kg. The administration schedule may vary, for example, from once a week to once every 2, 3 or 4 weeks. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is administered at a dose of approximately 10 to 20 mg/kg every two weeks.
Молекулы антител могут быть использованы в неконъюгированных формах или в конъюгации со вторым веществом, например, с цитотоксическим лекарственным средством, радиоизотопом или белком, например, с белковым токсином или вирусным белком. Этот способ включает: введение субъекту, нуждающемуся в таком лечении, молекулы антитела, в виде единственной молекулы или конъюгированной с цитотоксическим лекарственным средством. Молекулы антител могут быть использованы для доставки различных терапевтических средств, например, цитотоксического компонента, например, лекарственного средства, радиоизотопа, молекул растительного, грибкового или бактериального происхождения, или биологических белков (например, белковых токсинов) или частиц (например, рекомбинантных вирусных частиц, например, посредством белка вирусной оболочки) или их смеси.Antibody molecules can be used in unconjugated forms or in conjugation with a second substance, for example, a cytotoxic drug, a radioisotope, or a protein, for example, a protein toxin or a viral protein. This method includes: administering to a subject in need of such treatment an antibody molecule, either as a single molecule or conjugated to a cytotoxic drug. Antibody molecules can be used to deliver various therapeutic agents, for example, a cytotoxic moiety, e.g., a drug, a radioisotope, molecules of plant, fungal or bacterial origin, or biological proteins (e.g., protein toxins) or particles (e.g., recombinant viral particles, e.g. , through the viral envelope protein) or a mixture thereof.
Дополнительные виды комбинированного лечения Молекула антитела против PD-1 может применяться в комбинации с другими видами лечения. Например, комбинированное лечение может включать композицию по настоящему изобретению в единой рецептуре, и/или вводимую совместно с одним или несколькими дополнительными терапевтическими средствами, например, с одним или несколькими противоопухолевыми веществами, цитотоксическими или цитостатическими веществами, гормональной терапией, вакцинами и/или другими видами иммунотерапии. В других вариантах осуществления молекулы антитела вводят в комбинации с другими методиками лечения, включающими хирургическое вмеAdditional Combination Treatments The anti-PD-1 antibody molecule may be used in combination with other treatments. For example, a combination treatment may include a composition of the present invention in a single formulation, and/or administered in conjunction with one or more additional therapeutic agents, such as one or more antineoplastic agents, cytotoxic or cytostatic agents, hormonal therapies, vaccines, and/or other treatments. immunotherapy. In other embodiments, the antibody molecules are administered in combination with other treatment modalities, including surgery
- 58 045940 шательство, лучевую терапию, криохирургию и/или термотерапию. Эти виды комбинированного лечения могут иметь преимущество в плане использования более низких доз вводимых терапевтических средств, чтобы избежать возможных осложнений или токсических эффектов, связанных с различными видами монотерапии.- 58 045940 mischief, radiation therapy, cryosurgery and/or thermotherapy. These combination treatments may have the advantage of using lower doses of therapeutic agents administered to avoid possible complications or toxic effects associated with different monotherapies.
Выражение в комбинации с не означает, что лечение или терапевтические средства должны применяться одновременно и/или быть в единой рецептуре для совместной доставки, хотя такие способы доставки входят в объем настоящего изобретения. Молекулы антитела против PD-1 можно вводить одновременно, перед или после одного или нескольких других дополнительных видов лечения или терапевтических средств. Молекулу антитела против PD-1 и другое вещество или терапевтический протокол можно применять в любом порядке. В общем, каждое вещество будет вводиться в дозе и/или в соостветствии со схемой введения, установленной для этого вещества. Также, следует понимать, что дополнительное терапевтическое средство, используемое в этой комбинации, можно вводить совместно в единой композиции или вводить по отдельности в разных композициях. В общем, предполагается, что дополнительные терапевтические средства, используемые в комбинации, можно применять в концентрации, которая не превышает уровни концентрации в случае их раздельного применения. В некоторых вариантах осуществления уровни концентрации, используемые в комбинации, будут ниже, чем при раздельном применении.The expression in combination with does not mean that the treatment or therapeutic agents must be administered simultaneously and/or be in a single formulation for co-delivery, although such delivery methods are within the scope of the present invention. The anti-PD-1 antibody molecules can be administered simultaneously, before or after one or more other additional treatments or therapeutic agents. The anti-PD-1 antibody molecule and the other agent or therapeutic protocol can be administered in any order. In general, each substance will be administered at a dose and/or according to an administration schedule established for that substance. It should also be understood that the additional therapeutic agent used in this combination may be administered together in a single composition or administered separately in different compositions. In general, it is contemplated that the additional therapeutic agents used in combination may be administered at concentrations that do not exceed the concentration levels if they were administered separately. In some embodiments, the concentration levels used in combination will be lower than those used separately.
В некоторых вариантах осуществления молекулы антитела против PD-1, описанные в изобретении, вводят в комбинации с одним или несколькими другими ингибиторами PD-1, PD-L1 и/или PD-L2, известными в данной области. Антагонист может представлять собой антитело, его антигенсвязывающий фрагмент, иммуноадгезин, слитый белок или олигопептид. В некоторых вариантах осуществления другое антитело против PD-1 выбрано из MDX-1106, Merck 3475 или СТ-011. В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-1 представляет собой иммуноадгезин (например, иммуноадгезин, содержащий внеклеточную или PD-1 связывающую часть PD-L1 или PD-L2, слитую с константной областью (например, Fc-область последовательности иммуноглобулина). В некоторых вариантах осуществления ингибитором PD-1 является АМР-224. В некоторых вариантах осуществления ингибитором PD-L1 является антитело против PD-L1. В некоторых вариантах осуществления анти-ГПАТ связывающий антагонист выбран из YW243.55.S70, MPDL3280A, MEDI-4736, MSB-0010718C или MDX-1105. MDX-1105, также известное как BMS-936559, представляет собой антитело против PD-L1, описанное в WO 2007/005874. Антитело YW243.55.S70 (последовательности вариабельной области тяжелой и легкой цепи SEQ ID NO: 20 и 21, соответственно) представляет собой антитело против PD-L1, описанное в WO 2010/077634.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecules described herein are administered in combination with one or more other PD-1, PD-L1 and/or PD-L2 inhibitors known in the art. The antagonist may be an antibody, an antigen-binding fragment thereof, an immunoadhesin, a fusion protein, or an oligopeptide. In some embodiments, the other anti-PD-1 antibody is selected from MDX-1106, Merck 3475, or CT-011. In some embodiments, the PD-1 inhibitor is an immunoadhesin (e.g., an immunoadhesin comprising an extracellular or PD-1 binding portion of PD-L1 or PD-L2 fused to a constant region (e.g., an Fc region of an immunoglobulin sequence). In some embodiments, the PD-1 inhibitor is AMP-224. In some embodiments, the PD-L1 inhibitor is an anti-PD-L1 antibody. In some embodiments, the anti-GPAT binding antagonist is selected from YW243.55.S70, MPDL3280A, MEDI-4736, MSB-0010718C or MDX-1105 MDX-1105, also known as BMS-936559, is an anti-PD-L1 antibody described in WO 2007/005874 Antibody YW243.55.S70 (heavy and light chain variable region sequences SEQ ID NO: 20 and 21, respectively) is an anti-PD-L1 antibody described in WO 2010/077634.
MDX-1106, также известное как MDX-1106-04, ONO-4538 или BMS-936558, представляет собой антитело против PD-1, описанное в WO 2006/121168. Антитело Merck-3745, также известное как MK3475 или SCH-900475, представляет собой антитело против PD-1, описанное в WO 2009/114335. Пидилизумаб (СТ-011; Cure Tech) представляет собой гуманизированное IgG1k моноклональное антитело, которое связывается с PD-1. Пидилизумаб и другие гуманизированные моноклональные антитела против PD1 описаны в WO 2009/101611. В других вариантах осуществления антитело против PD-1 представляет собой пемролизумаб. Пемролизумаб (торговое наименование: Кейтруда/Keytruda, ранее известное как ламбролизумаб, также имеет наименоване MK-3475) описан, например, в публикации Hamid, О. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44. AMP-224 (B7-DCIg; Amplimmune, например, раскрытый в WO 2010/027827 и WO 2011/066342), представляет собой PD-L2 Fc-слитый растворимый рецептор, который блокирует взаимодействие между PD-1 и В7-Н1. Другие антитела против PD-1 включают AMP 514 (Amplimmune), среди прочего, например, антитела против PD-1, раскрытые в патентах США US 8609089, US 2010028330 и/или US 20120114649.MDX-1106, also known as MDX-1106-04, ONO-4538 or BMS-936558, is an anti-PD-1 antibody described in WO 2006/121168. Merck-3745 antibody, also known as MK3475 or SCH-900475, is an anti-PD-1 antibody described in WO 2009/114335. Pidilizumab (CT-011; Cure Tech) is a humanized IgG1k monoclonal antibody that binds to PD-1. Pidilizumab and other humanized anti-PD1 monoclonal antibodies are described in WO 2009/101611. In other embodiments, the anti-PD-1 antibody is pemrolizumab. Pemrolizumab (trade name: Keytruda, formerly known as lambrolizumab, also called MK-3475) is described, for example, in Hamid, O. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44. AMP-224 (B7-DCIg; Amplimmune, for example, disclosed in WO 2010/027827 and WO 2011/066342), is a PD-L2 Fc fusion soluble receptor that blocks the interaction between PD-1 and B7-H1. Other anti-PD-1 antibodies include AMP 514 (Amplimmune), among others, for example, the anti-PD-1 antibodies disclosed in US patents US 8609089, US 2010028330 and/or US 20120114649.
В некоторых вариантах осуществления другим антителом против PD-1 является MDX-1106. Альтернативные названия для MDX-1106 включают MDX-1106-04, ONO-4538, BMS-936558 или Ниволумаб. В некоторых вариантах осуществления антителом против PD-1 является Ниволумаб (регистрационный номер CAS: 946414-94-4). Ниволумаб (также называемый BMS-936558 или MDX1106, Bristol-Myers Squibb) представляет собой полностью человеческое моноклональное антитело IgG4 человека, который специфично блокирует PD-1. Ниволумаб (клон 5С4) и другие человеческие моноклональные антитела, которые специфично связываются с PD-1, описаны в патентах US 8008449 и WO 2006/121168. Ламбролизумаб (также называемый пемролизумабом или MK03475; Merck) представляет собой гуманизированное моноклональное IgG4-анmитело, которое связывается с PD-1. Пемролизумаб и другие гуманизированные антитела против PD-1 описаны в патентах US 8354509 и WO 2009/114335. MDPL3280A (Genentech/Roche) представляет собой человеческое Fc-оптимизированное IgG1 моноклональное антитело, которое связывается с PD-L1. MDPL3280A и другие человеческие моноклональные антитела против PD-L1 раскрыты в патенте США № 7943743 и в опубликованной патентной заявке США № 20120039906. В число других анти-РВА1 связывающих веществ входят YW243.55.S70 (вариабельные области тяжелой и легкой цепи показаны в SEQ ID NO: 20 и 21, см. WO 2010/077634) и MDX-1105 (также известное как BMS-936559, и например, анти-PD-L1 связывающие вещества, раскрытые в WO 2007/005874).In some embodiments, the other anti-PD-1 antibody is MDX-1106. Alternative names for MDX-1106 include MDX-1106-04, ONO-4538, BMS-936558, or Nivolumab. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody is Nivolumab (CAS registration number: 946414-94-4). Nivolumab (also called BMS-936558 or MDX1106, Bristol-Myers Squibb) is a fully human human IgG4 monoclonal antibody that specifically blocks PD-1. Nivolumab (clone 5C4) and other human monoclonal antibodies that specifically bind to PD-1 are described in US patents 8008449 and WO 2006/121168. Lambrolizumab (also called pemrolizumab or MK03475; Merck) is a humanized monoclonal IgG4 antibody that binds to PD-1. Pemrolizumab and other humanized anti-PD-1 antibodies are described in US patents 8354509 and WO 2009/114335. MDPL3280A (Genentech/Roche) is a human Fc-optimized IgG1 monoclonal antibody that binds to PD-L1. MDPL3280A and other human monoclonal antibodies against PD-L1 are disclosed in US Patent No. 7943743 and US Patent Application Published No. 20120039906. Other anti-PBA1 binders include YW243.55.S70 (heavy and light chain variable regions shown in SEQ ID NO: 20 and 21, see WO 2010/077634) and MDX-1105 (also known as BMS-936559, and for example, anti-PD-L1 binders disclosed in WO 2007/005874).
Виды лечения рака.Types of cancer treatment.
Иллюстративные комбинации молекул антитела против PD-1 (в качестве единственного средстваExemplary combinations of anti-PD-1 antibody molecules (as a single agent
- 59 045940 или в комбинации с другими стимулирующими веществами) и стандартом лечения рака, включают по меньшей мере следующее.- 59 045940 or in combination with other stimulants) and standard cancer treatment include at least the following.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, используется в комбинации со стандартом лечения рака - химиотерапевтическим веществом, включающим без ограничения анастрозол (Аримидекс®), бикалутамид (Касодекс®), блеомицин сульфат (Бленоксан®), бусульфан (милеран®), бусульфан инъекции (Бузилвекс®), капецитабин (Кселода ®), №-пентоксикарбонил-5-дезокси-5-фторцитидин, карбоплатин (Параплатин®), кармустин (BiCNU®), хлорамбуцил (Лейкеран®), цисплатин (Платинол®), кладрибин (Леустатин®), циклофосфамид (Цитоксан® или Неосар®), цитарабин, цитозин арабинозид (цитозар-U®), цитарабин в липосомах для инъекций (DepoCyt®), дакарбазин (DTIC-Dome®), дактиномицин (актиномицин D, Космеган), даунорубицин гидрохлорид (Церубидин®), даунорубицин цитрат в липосомах для инъекций (Дауноксом®), дексаметазон, доцетаксел (Таксотер®), доксорубицин гидрохлорид (адриамицин®, Rubex ®), этопозид (Вепезид®), флударабин фосфат (Флудара®), 5-фторурацил (Адрицил®, Эфудекс®), флутамид (Эулексин®), тезацитибин, гемцитабин (дифтордеоксицитидин), гидроксимочевину (Гидреа®), идаруцибин (Идамицин®), ифосфамид (IFEX®), иринотекан (Камтозар®), L-аспарагиназу (ELSPAR®), лейковорин кальция, мелфалан (Алкеран®), 6-меркаптопурин (Пуринетол®), метотрексат (Фолекс®), митоксантрон (Новантрон®), Милотарг, паклитаксел (Таксол®), Phoenix (Иттрий90/МХ-ЭТРА), пентостатин, полифепросан 20 с кармустином, имплантат (Глиадел®), тамоксифен цитрат (Нолвадекс®), тенипозид (Вумон®), 6-тиогуанин, тиотепа, тирапазамин (Тиразон®), топотекан гидрохлорид для инъекций (Гикамтин®), винбластин (Велбан®), винкристин (Онковин®), винорелбин (Навелбин®), ибрутиниб, иделалисиб и брентуксимаб ведотин.In some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, such as an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, is used in combination with a standard of care cancer treatment chemotherapy agent including, but not limited to, anastrozole (Arimidex®), bicalutamide (Casodex®), bleomycin sulfate (Blenoxan®), busulfan (Mileran®), busulfan injection (Busilvex®), capecitabine (Xeloda®), N-pentoxycarbonyl-5-deoxy-5-fluorocytidine, carboplatin (Paraplatin®), carmustine (BiCNU®), chlorambucil ( Leukeran®), cisplatin (Platinol®), cladribine (Leustatin®), cyclophosphamide (Cytoxan® or Neosar®), cytarabine, cytosine arabinoside (Cytosar-U®), cytarabine liposome injection (DepoCyt®), dacarbazine (DTIC- Dome®), dactinomycin (Actinomycin D, Cosmegan), daunorubicin hydrochloride (Cerubidin®), daunorubicin citrate in liposomes for injection (Daunoxom®), dexamethasone, docetaxel (Taxotere®), doxorubicin hydrochloride (Adriamycin®, Rubex®), etoposide ( Vepesid®), fludarabine phosphate (Fludara®), 5-fluorouracil (Adricil®, Efudex®), flutamide (Eulexin®), tezacitibine, gemcitabine (difluorodeoxycytidine), hydroxyurea (Hydrea®), idarucibin (Idamycin®), ifosfamide (IFEX ®), irinotecan (Camtosar®), L-asparaginase (ELSPAR®), leucovorin calcium, melphalan (Alkeran®), 6-mercaptopurine (Purenetol®), methotrexate (Folex®), mitoxantrone (Novantron®), Mylotarg, paclitaxel ( Taxol®), Phoenix (Yttrium90/MX-ETRA), pentostatin, polypheprosan 20 with carmustine, implant (Gliadel®), tamoxifen citrate (Nolvadex®), teniposide (Vumon®), 6-thioguanine, thiotepa, tirapazamine (Tirazone®) , topotecan hydrochloride injection (Hycamtin®), vinblastine (Velban®), vincristine (Oncovin®), vinorelbine (Navelbine®), ibrutinib, idelalisib, and brentuximab vedotin.
Алкилирующие вещества включают, в качестве примера и без ограничения, мустаргены, производные этиленимина, алкилсульфонаты, нитрозомочевины и триазены): урацил мустард (Аминоурацил мустард®, Хлортаминацил®, Деметилдопан®, Десметилдопан®, Гемантамин®, Нордопан®, Урацил нитроген мустард®, Урациллост®, Урацилмостаза®, Урамустин/Uramustin®, Урамустин/Uramustine®), Хлорметин (Мустарген®), циклофосфамид (Cytoxan®, Heocap®, Клафен®, Эндоксан®, Процитокс®, Ревиммун™), ифосфамид (Митоксана®), мелфалан (Алкеран®), хлорамбуцил (Лейкеран®), пипоброман (Амедел/Amedel®, Верцит/Vercyte®), триэтиленмеламин (Гемел/Hemel®, Гексален®, Гексастат®), триэтилентиофосфорамин, Темозоламид (Темодар®), тиотепа (Тиоплекс®), Бусульфан (Бузилвекс®, Милеран®), Кармустин (BiCNU®), ломустин (CeeNU®), Стрептозоцин (Занозар®) и Дакарбазин (DTICDome®). Дополнительные иллюстративные алкилирующие вещества включают без ограничения оксалиплатин (Элоксатин®), Темозоламид (Темодар® и Темодал®), Дактиномицин (также известный как актиномицин-D, Космеген®), Мелфалан (также известный как L-PAM, L-сарколизин и фенилаланин мустард, Алкеран®), Алтретамин (также известный как гексаметилмеламин (HMM), Гексален®), Кармустин (BiCNU®), Бендамустин (Треанда®), Бусульфан (Бузилвекс® и Милеран®), Карбоплатин (Параплатин®), Ломустин (также известный как CCNU, CeeNU®), Цисплатин (также известный как CDDP, Платинол® и Платинол®-AQ), Хлорамбуцил (Лейкеран®), Циклофосфамид (Цитоксан® и Неосар®), Дакарбазин (также известный как DTIC, DIC и имидазол карбоксамид, DTIC-Dome®), Алтратемин (также известный как гексаметилмеламин (НММ), Гексален®), Ифосфамид (Ифлекс®), Преднумустин,Alkylating agents include, by way of example and without limitation, mustargens, ethyleneimine derivatives, alkyl sulfonates, nitrosoureas and triazenes: uracil mustard (Aminouracil mustard®, Chlortaminacyl®, Demethyldopane®, Desmethyldopane®, Hemantamine®, Nordopan®, Uracil nitrogen mustard®, Uracillost®, Uracilmostaza®, Uramustin/Uramustin®, Uramustine/Uramustine®), Chlormethine (Mustargen®), cyclophosphamide (Cytoxan®, Heocap®, Klafen®, Endoxan®, Procytox®, Revimmune™), ifosfamide (Mitoxana®), melphalan (Alkeran®), chlorambucil (Leukeran®), pipobromane (Amedel®, Vercyte®), triethylenemelamine (Hemel®, Hexalen®, Hexastat®), triethylenethiophosphoramine, Temozolamide (Temodar®), thiotepa (Thioplex ®), Busulfan (Busilvex®, Mileran®), Carmustine (BiCNU®), Lomustine (CeeNU®), Streptozocin (Zanosar®) and Dacarbazine (DTICDome®). Additional illustrative alkylating agents include, but are not limited to, oxaliplatin (Eloxatin®), Temozolamide (Temodar® and Temodal®), Dactinomycin (also known as Actinomycin-D, Cosmegen®), Melphalan (also known as L-PAM, L-sarcolysine and phenylalanine mustard , Alkeran®), Altretamine (also known as hexamethylmelamine (HMM), Hexalene®), Carmustine (BiCNU®), Bendamustine (Treanda®), Busulfan (Busilvex® and Mileran®), Carboplatin (Paraplatin®), Lomustine (also known as CCNU, CeeNU®), Cisplatin (also known as CDDP, Platinol® and Platinol®-AQ), Chlorambucil (Leukeran®), Cyclophosphamide (Cytoxan® and Neosar®), Dacarbazine (also known as DTIC, DIC and imidazole carboxamide, DTIC-Dome®), Altratemine (also known as hexamethylmelamine (HMM), Hexalene®), Ifosfamide (Iflex®), Prenumustine,
Прокарбазин (Матулан®), Мехлорэтамин (также известный как мустарген, мустин и мехлорэтамин гидрохлорид, Мустарген®), Стрептозоцин (Занозар®), Тиотепа (также известный как тиофосфамид, TESPA и TSPA, Тиоплекс®), Циклофосфамид (Эндоксан®, Цитоксан®, Неосар®, Поцитокс®, Ревиммун®) и Бендамустин гидрохлорид (Треанда®).Procarbazine (Matulan®), Mechlorethamine (also known as mustargen, mustine and mechlorethamine hydrochloride, Mustargen®), Streptozocin (Zanosar®), Thiotepa (also known as thiophosphamide, TESPA and TSPA, Thioplex®), Cyclophosphamide (Endoxan®, Cytoxan® , Neosar®, Pocytox®, Revimmune®) and Bendamustine hydrochloride (Treanda®).
Примеры антрациклинов включают, например, доксорубицин (Адриамицин® и Рубекс®), блеомицин (леноксан®), даунорубицин (даорубицин гидрохлорид, дауномицин и рубидомицин гидрохлорид, Церубидин®), липосомальный даунорубицин (даунорубицин цитрат в липосомах, DaunoXome®), митоксантрон (DHAD, Новантрон®), эпирубицин (Элленс™), идаруцибин (идамицин®, идамицин PFS®), митомицин С (Мутамицин®), гелданамицин, гербимицин, равидомицин и дезацетилравидомицин.Examples of anthracyclines include, for example, doxorubicin (Adriamycin® and Rubex®), bleomycin (Lenoxan®), daunorubicin (daunorubicin hydrochloride, daunomycin and rubidomycin hydrochloride, Cerubidin®), liposomal daunorubicin (daunorubicin citrate in liposomes, DaunoXome®), mitoxantrone (DHAD , Novantrone®), epirubicin (Ellens™), idarucibin (idamycin®, idamycin PFS®), mitomycin C (Mutamycin®), geldanamycin, herbimycin, ravidomycin and desacetylravidomycin.
Примеры алкалоидов барвинка, которые можно применять в комбинации с молекулами антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (такими как молекула антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), включают без ограничения винорелбин тартрат (Навелбин®), винкристин (Онковин®) и Виндезин (Элдизин®)), винбластин (также известный как винбластин сульфат, винкалейкобластин и VLB, Алкабан-AQ® и Велбан®) и винорелбин (Навелбин®).Examples of vinca alkaloids that can be used in combination with anti-PD-1 antibody molecules, either alone or in combination with another immunomodulator (such as an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule) include: restrictions vinorelbine tartrate (Navelbine®), vincristine (Oncovin®) and Vindesine (Eldizine®)), vinblastine (also known as vinblastine sulfate, vincaleucoblastine and VLB, Alkaban-AQ® and Velban®) and vinorelbine (Navelbine®).
Примеры ингибиторов протеосомы, которые можно применять в комбинации с молекулами антител против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), включают без ограничения бортезомиб (Велкад®), карфилзомиб (РХ-171-007, ^)-4-метил-Ы-(^)-1-((^)-4-метил-1-№)-2метилоксиран-2-ил)-1-оксопентан-2-ил)амино)-1-оксо-3-фенилпропан-2-ил)-2-(^)-2-(2Examples of proteasome inhibitors that can be used in combination with anti-PD-1 antibody molecules, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, with an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule) include without limitation bortezomib (Velcad®), carfilzomib (PX-171-007, ^)-4-methyl-N-(^)-1-((^)-4-methyl-1-N)-2methyloxiran-2-yl )-1-oxopentan-2-yl)amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl)-2-(^)-2-(2
- 60 045940 морфолинацеамидо)-4-фенилбутанамидо)-пентанамид), маризомиб (NPI-0052), иксазомиб цитрат (MLN9708), деланзомиб (СЕР-18770) и О-метил-Н-[(2-метил-5-тиазолил)карбонил|-Г-серил-О-метил-Н-[(^)2-[(2R)-2-метил-2-оксиранил]-2-оксо-1-(фенилметил)этил]-L-серинамид (ONX-0912).- 60 045940 morpholinaceamido)-4-phenylbutanamido)-pentanamide), marizomib (NPI-0052), ixazomib citrate (MLN9708), delanzomib (CEP-18770) and O-methyl-H-[(2-methyl-5-thiazolyl) carbonyl|-G-seryl-O-methyl-H-[(^)2-[(2R)-2-methyl-2-oxiranyl]-2-oxo-1-(phenylmethyl)ethyl]-L-serinamide (ONX -0912).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, применяется в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), в комбинации с ингибитором тирозинкиназы (например, ингибитором рецептора тирозинкиназы (RTK)). Ингибитор тирозинкиназы, в качестве примера и без ограничения, включает ингибитор пути эпидермального фактора роста (EGF) (например, ингибитор рецептора эпидермального фактора роста (EGFR), ингибитор пути фактора роста эндотелия сосудов (VEGF) (например, ингибитор рецептор фактора роста эндотелия сосудов (VEGFR) (например, ингибитор VEGFR-1, ингибитор VEGFR-2, ингибитор VEGFR-3)), ингибитор пути тромбоцитарного фактора роста (PDGF), (например, ингибитор рецептора тромбоцитарного фактора роста (PDGFR) (например, ингибитор PDGFR-β)), ингибитор RAF-1, ингибитор KIT и ингибитор RET. В некоторых вариантах осуществления противоопухолевое средство используется в комбинации с ингибитором hedgehog, выбранным из группы, состоящей из следующих препаратов: акситиниб (AG013736), бозутиниб (SKI-606), цедираниб (Рецентин™, AZD2171), дазатиниб (Сприцел®, BMS -354825), эрлотиниб (Тарцева®), гефитиниб (Иресса®), иматиниб (Гливек®, CGP57148B, STI-571), лапатиниб (Тикерб®, Тиверб®), лестауртиниб (СЕР-701), нератиниб (HKI-272), нилотиниб (Тасигна®), семаканиб (семаксаниб, SU5416), сунитиниб (Сутент®, SU11248), тоцераниб (Палладиа®), вандетаниб (Зактима®, ZD6474), ваталиниб (PTK787, PTK/ZK), трастузумаб (Герцептин®), бевацизумаб (Авастин®), ритуксимаб (Ритуксан®), цетуксимаб (Эрбитукс®), панитумумаб (Вектибикс®), ранибизумаб (Луцентис®), нилотиниб (TASIGNA®), сорафениб (Нексавар®), алемтузумаб (Кампат®), гемтузумаб озогамицин (Милотарг®), ENMD-2076, PCI-32765, AC220, довитиниб лактат (TKI258, CHIR-258), BIBW 2992 (TOVOK™), SGX523, PF-04217903, PF-02341066, PF-299804, BMS-777607, ABT-869, MP470, BIBF 1120 (Варгатеф®), АР24534, JNJ-26483327, MGCD265, DCC-2036, BMS-690154, СЕР-11981, тизованиб (AV-951), OSI-930, MM-121, XL-184, XL-647, XL228, АЕЕ788, AG-490, АСТ-6, BMS-599626, CUDC-101, PD153035, пелитиниб (EKB-569), вандатениб (зактима), WZ3146, WZ4002, WZ8040, АВТ869 (линифаниб), АЕЕ788, АР24534 (понатиниб), AV-951 (тивозаниб), акситиниб, BAY 73-4506 (регорафениб), бриваниб аланинат (BMS-582664), бриваниб (BMS-540215), цедираниб (AZD2171), CHIR-258 (довитиниб), СР 673451, CYC116, Е7080, Ki8751, мазитиниб (АВ1010), MGCD-265, мотесаниб дифосфат (AMG-706), MP-470, OSI-930, Пазопаниб гидрохлорид, PD173074, сорафениб тозилат (Bay 43-9006), SU 5402, TSU-68 (SU6668), ваталиниб, XL880 (GSK1363089, EXEL-2880). Избранные ингибиторы тирозинкиназы выбраны из сунитиниба, эрлотиниба, гефитиниба или сорафениба.In some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, is used alone or in combination with another immunomodulator (e.g., an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-PD-1 antibody molecule). TIM-3), in combination with a tyrosine kinase inhibitor (eg, a receptor tyrosine kinase (RTK) inhibitor). A tyrosine kinase inhibitor includes, by way of example and without limitation, an epidermal growth factor (EGF) pathway inhibitor (e.g., an epidermal growth factor receptor (EGFR) inhibitor, a vascular endothelial growth factor (VEGF) pathway inhibitor (e.g., a vascular endothelial growth factor receptor (EGF) inhibitor). VEGFR) (eg, VEGFR-1 inhibitor, VEGFR-2 inhibitor, VEGFR-3 inhibitor)), platelet-derived growth factor (PDGF) pathway inhibitor, (eg, platelet-derived growth factor receptor (PDGFR) inhibitor (eg, PDGFR-β inhibitor) ), a RAF-1 inhibitor, a KIT inhibitor, and a RET inhibitor. In some embodiments, the antineoplastic agent is used in combination with a hedgehog inhibitor selected from the group consisting of the following drugs: axitinib (AG013736), bosutinib (SKI-606), cediranib (Recentin ™, AZD2171), dasatinib (Spricel®, BMS -354825), erlotinib (Tarceva®), gefitinib (Iressa®), imatinib (Gleevec®, CGP57148B, STI-571), lapatinib (Tykerb®, Tiverb®), lestaurtinib ( CEP-701), neratinib (HKI-272), nilotinib (Tasigna®), semakanib (semaxanib, SU5416), sunitinib (Sutent®, SU11248), toceranib (Palladia®), vandetanib (Zactima®, ZD6474), vatalinib (PTK787 , PTK/ZK), trastuzumab (Herceptin®), bevacizumab (Avastin®), rituximab (Rituxan®), cetuximab (Erbitux®), panitumumab (Vectibix®), ranibizumab (Lucentis®), nilotinib (TASIGNA®), sorafenib ( Nexavar®), alemtuzumab (Kampat®), gemtuzumab ozogamicin (Mylotarg®), ENMD-2076, PCI-32765, AC220, dovitinib lactate (TKI258, CHIR-258), BIBW 2992 (TOVOK™), SGX523, PF-04217903, PF-02341066, PF-299804, BMS-777607, ABT-869, MP470, BIBF 1120 (Vargatef®), AP24534, JNJ-26483327, MGCD265, DCC-2036, BMS-690154, CEP-11981, tizovib (AV-9 51 ), OSI-930, MM-121, XL-184, XL-647, XL228, AEE788, AG-490, AST-6, BMS-599626, CUDC-101, PD153035, pelitinib (EKB-569), vandatenib (Zactima ), WZ3146, WZ4002, WZ8040, АВТ869 (линифаниб), АЕЕ788, АР24534 (понатиниб), AV-951 (тивозаниб), акситиниб, BAY 73-4506 (регорафениб), бриваниб аланинат (BMS-582664), бриваниб (BMS-540215 ), cediranib (AZD2171), CHIR-258 (dovitinib), CP 673451, CYC116, E7080, Ki8751, mazitinib (AB1010), MGCD-265, motesanib diphosphate (AMG-706), MP-470, OSI-930, Pazopanib hydrochloride , PD173074, sorafenib tosylate (Bay 43-9006), SU 5402, TSU-68 (SU6668), vatalinib, XL880 (GSK1363089, EXEL-2880). Select tyrosine kinase inhibitors are selected from sunitinib, erlotinib, gefitinib or sorafenib.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против 3-TIM), применяется в комбинации с ингибиторами рецептора фактора роста эндотелия сосудов (VEGF), включающими без ограничения Бевацизумаб (Авастин®), акситиниб (Инлита®), бриваниб аланинат (BMS582664, ^)-((Р)-1-(4-(4-фтор-2-метил-1Н-индол-5-илокси)-5-метилпирроло[2.1-Г|[1.2.4|триазин-6илокси)пропан-2-ил)2-аминопропаноат), сорафениб (Нексавар®), Пазопаниб (Вотриент®), Сунитиниб малат (Сутент®), Цедираниб (AZD2171, CAS 288383-20-1), Варгатеф (BIBF1120, CAS 928326-83-4), Форетиниб (GSK1363089), Телатиниб (BAY57-9352, CAS 332012-40-5), Апатиниб (YN968D1, CAS 81180305-1), Иматиниб (Гливек), Понатиниб (АР24534, CAS 943319-70-8), Тивозаниб (AV951, CAS 475108-180), Регорафениб (BAY73-4506, CAS 755037-03-7), Ваталиниб дигидрохлорид (PTK787, CAS 212141-510), Бриваниб (BMS-540215, CAS 649735-46-6), Вандетаниб (Капрелса® или AZD6474), Мотесаниб дифосфат (AMG706, CAS 857876-30-3, №(2,3-дигидро-3,3-диметил-1Н-индол-6-ил)-2-[(4пиридинилметил)амино|-3-пиридинкарбоксамид, описан в опубликованной заявке РСТ WO 02/066470), Довитиниб дилактат (TKI258, CAS 852433-84-2), Линфаниб (АВТ869, CAS 796967-16-3) Кабозантиниб (XL184, CAS 849217-68-1), Лестауртиниб (CAS 111358-88-4), ^[5-[[[5-(1,1-диметилэтил)-2оксазолил|метил|тио|-2-тиазолил|-4-пиперидинкарбоксамид (BMS38703, CAS 345627-80-7), (3R,4R)-4амино-1-((4-((3-метоксифенил)амино)пирроло[2,1-Г|[1,2,4|триазин-5-ил)метил)пиперидин-3-ол (BMS690514), №(3,4-дихлор-2-фторфенил)-6-метокси-7-[[(3аа,5в,6аа)-октагидро-2метилциклопента[с]пиррол-5-ил]метокси]-4-хиназолинамин (XL647, CAS 781613-23-8), 4-метил-3-[[1метил-6-(3-пиридинил)-1Н-пиразоло[3,4д]пиримидин-4-ил]амино]-Н-[3-(трифторметил)фенил]бензамид (BHG712, CAS 940310-85-0) и Афлиберцепт (Eylea®).In some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with another immunomodulator (e.g., an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-3 -TIM), is used in combination with vascular endothelial growth factor (VEGF) receptor inhibitors, including, but not limited to, Bevacizumab (Avastin®), axitinib (Inlyta®), brivanib alaninate (BMS582664, ^)-((P)-1-(4 -(4-fluoro-2-methyl-1H-indol-5-yloxy)-5-methylpyrrolo[2.1-G|[1.2.4|triazin-6yloxy)propan-2-yl)2-aminopropanoate), sorafenib (Nexavar ®), Pazopanib (Votrient®), Sunitinib malate (Sutent®), Cediranib (AZD2171, CAS 288383-20-1), Vargatef (BIBF1120, CAS 928326-83-4), Foretinib (GSK1363089), Telatinib (BAY57-9352 , CAS 332012-40-5), Apatinib (YN968D1, CAS 81180305-1), Imatinib (Gleevec), Ponatinib (AP24534, CAS 943319-70-8), Tivozanib (AV951, CAS 475108-180), Regorafenib (BAY73- 4506, CAS 755037-03-7), VALATALINIB dihydrochloride (PTK787, CAS 212141-510), Brivanib (BMS-540215, CAS 649735-46-6), Vandetanib (Kaprelesa® or AZD6474), MOTESNIB DIFOSPHATE (AMG706, CAS 857 876 -30-3, No.(2,3-dihydro-3,3-dimethyl-1H-indol-6-yl)-2-[(4pyridinylmethyl)amino|-3-pyridinecarboxamide, described in published PCT application WO 02/066470 ), Dovitinib dilactate (TKI258, CAS 852433-84-2), Linfanib (ABT869, CAS 796967-16-3) Cabozantinib (XL184, CAS 849217-68-1), Lestaurtinib (CAS 111358-88-4), ^[ 5-[[[5-(1,1-dimethylethyl)-2oxazolyl|methyl|thio|-2-thiazolyl|-4-piperidinecarboxamide (BMS38703, CAS 345627-80-7), (3R,4R)-4amino-1 -((4-((3-methoxyphenyl)amino)pyrrolo[2,1-G|[1,2,4|triazin-5-yl)methyl)piperidin-3-ol (BMS690514), No.(3,4 -dichloro-2-fluorophenyl)-6-methoxy-7-[[(3aa,5b,6aa)-octahydro-2methylcyclopenta[c]pyrrol-5-yl]methoxy]-4-quinazolinamine (XL647, CAS 781613-23- 8), 4-methyl-3-[[1methyl-6-(3-pyridinyl)-1H-pyrazolo[3,4d]pyrimidin-4-yl]amino]-H-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzamide ( BHG712, CAS 940310-85-0) and Aflibercept (Eylea®).
Примеры антитела против VEGF включают без ограничения моноклональное антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и моноклональное антитело против VEGF A4.6.1, продуцируемое гибридомой АТСС НВ 10709; рекомбинантное гуманизированное моноклональное антитело против VEGF, созданное, как описано в публикации Presta et al. (1991). Cancer Res. 57: 4593-4599. В одном варианте осуществления антитело против VEGF представляет собой бевацизумаб (BV), также известный какExamples of the anti-VEGF antibody include, but are not limited to, a monoclonal antibody that binds to the same epitope as the anti-VEGF monoclonal antibody A4.6.1 produced by hybridoma ATCC HB 10709; a recombinant humanized anti-VEGF monoclonal antibody generated as described in Presta et al. (1991). Cancer Res. 57: 4593-4599. In one embodiment, the anti-VEGF antibody is bevacizumab (BV), also known as
- 61 045940 rhuMAb VEGF или Авастин®. Этот препарат содержит мутантные каркасные области человеческого IgG1 и антигенсвязывающие определяющие комплементарность области из мышиного моноклонального антитела против hVEGF A.4.6.1, которое блокирует связывание человеческого VEGF с его рецепторами. Бевацизумаб и другие гуманизированные антитела против VEGF дополнительно описаны в патенте США № 6884879, опубликованного 26 февраля 2005 г. Дополнительные антитела включают антитела серии G6 или В20 (например, G6-31, В20-4.1), как описано в опубликованной заявке РСТ WO 2005/012359, опубликованной заявке РСТ WO 2005/044853, и содержание этих патентных заявок специально включены в описание в качестве ссылки. Информацию о дополнительных антителах можно найти в патентах США №№ 7060269, 6582959, 6703020, 6054297, WO 98/45332, в патентах WO 96/30046, WO 94/10202, ЕР 0666868В1, опубликованных заявках на патент США №№ 2006009360, 20050186208, 20030206899, 20030190317, 20030203409 и 20050112126, и в публикации Popkov et al, Journal of Immunological Methods 288: 149-164 (2004). В число других антител входят антитела, которые связываются с функциональным эпитопом на человеческом VEGF, содержащем остатки F17, Ml 8, D19, Y21, Y25, Q89, 191, Kl 01, Е1 03 и С104, или, в качестве альтернативы, содержащем остатки F17, Y21, В22, Y25, D63, 183 и Q89.- 61 045940 rhuMAb VEGF or Avastin®. This drug contains mutant human IgG1 framework regions and antigen-binding complementarity-determining regions from the murine anti-hVEGF monoclonal antibody A.4.6.1, which blocks the binding of human VEGF to its receptors. Bevacizumab and other humanized anti-VEGF antibodies are further described in US Patent No. 6,884,879, published February 26, 2005. Additional antibodies include G6 or B20 series antibodies (eg, G6-31, B20-4.1), as described in PCT published application WO 2005/ 012359, published PCT application WO 2005/044853, and the contents of these patent applications are expressly incorporated herein by reference. Information on additional antibodies can be found in US Patent Nos. 7060269, 6582959, 6703020, 6054297, WO 98/45332, WO 96/30046, WO 94/10202, EP 0666868B1, Published US Patent Applications No. 2006009360 , 20050186208, 20030206899, 20030190317, 20030203409 and 20050112126, and in Popkov et al, Journal of Immunological Methods 288: 149-164 (2004). Other antibodies include antibodies that bind to a functional epitope on human VEGF containing residues F17, Ml 8, D19, Y21, Y25, Q89, 191, Kl 01, E1 03 and C104, or alternatively containing residues F17 , Y21, B22, Y25, D63, 183 and Q89.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD- L1 или против TIM-3), применяется в комбинации с ингибитором PI3K. В одном варианте осуществления ингибитором PI3K является ингибитор дельта- и гамма-изоформы PI3K. Примеры ингибиторов PI3K, которые могут быть использованы в комбинации, описаны, например, в WO 2010/036380, WO 2010/006086, WO 09/114870, WO 05/113556, и представляют собой GSK 2126458, GDC-0980, GDC-0941, Sanofi XL147, XL756, XL147, PF46915032, BKM 120, CAL-101, CAL 263, SF1126, РХ-886 и двойной ингибитор PI3K (например, Novartis BEZ235).In some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with another immunomodulator (e.g., an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM antibody molecule -3), used in combination with a PI3K inhibitor. In one embodiment, the PI3K inhibitor is an inhibitor of the delta and gamma isoforms of PI3K. Examples of PI3K inhibitors that can be used in combination are described, for example, in WO 2010/036380, WO 2010/006086, WO 09/114870, WO 05/113556, and are GSK 2126458, GDC-0980, GDC-0941, Sanofi XL147, XL756, XL147, PF46915032, BKM 120, CAL-101, CAL 263, SF1126, PX-886 and dual PI3K inhibitor (eg, Novartis BEZ235).
В некоторых вариантах осуществления молекулы антител против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против 3-TIM), применяются в комбинации с ингибитором mTOR, например, с одним или несколькими ингибиторами mTOR, выбранными из одного или нескольких соедующих веществ: рапамицин, темсиролимус (Торисел®), AZD8055, BEZ235, BGT226, XL765, PF4691502, GDC0980, SF1126, OSI-027, GSK1059615, KU-0063794, WYE-354, Паломид 529 (Р529), PF04691502 или PKI-587, ридафоролимус (официальное название деферолимус, (1R,2R,4S)-4-[(2R)2[(1Κ,9842845Κ,16Ε,18Κ,19Κ,21Κ,238,24Ε,26Ε,28Ζ,308,328,35Κ)-1,18-^ή.4ΡΟκμ-19,30-^€τοκ^15,17,21,23,29,35-гексаметил-2,3,10,14,20-пентаоксо-11,36-диокса-4азатрицикло[30.3.1.04,9]гексатриаконта-16,24,26,28-тетраен-12-ил]пропил]-2-метоксициклогексил диметилфосфинат, также известный как АР23573 и MK8669, и описанный в опубликованной заявке РСТ WO 03/064383), эверолимус (Афинитор/Afinitor®) или RAD001), рапамицин (AY22989, Сиролимус®), симапимод (CAS 164301-51-3), эмсиролимус, (5-{2,4-бис[^)-3-метилморфолин-4-ил]пиридо[2,3d]пиримидин-7-ил}-2-метоксифенил)метанол (AZD8055), (PF04691502, CAS 1013101-36-4), и N2-[1,4диоксо-4-[[4-(4-оксо-8-фенил-4H-1-бензопиран-2-ил)морфолин-4-ил]метокси]бутил]-L-аргинилглицил-Lα-аспартил-Е-серин- (SEQ ID NO: 237), внутренняя соль (SF1126, CAS 936487-67-1) и XL765.In some embodiments, anti-PD-1 antibody molecules of the invention, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-3-TIM antibody molecule), are used in combination with an inhibitor mTOR, for example, with one or more mTOR inhibitors selected from one or more of the following: rapamycin, temsirolimus (Torisel®), AZD8055, BEZ235, BGT226, XL765, PF4691502, GDC0980, SF1126, OSI-027, GSK1059615, KU-0063794 , WYE-354, Palomide 529 (P529), PF04691502 or PKI-587, ridaforolimus (official name deferolimus, (1R,2R,4S)-4-[(2R)2[(1Κ,9842845Κ,16Ε,18Κ,19Κ, 21Κ,238,24Ε,26Ε,28Ζ,308,328,35K)-1,18-^ή.4ΡΟκμ-19,30-^€τοκ^15,17,21,23,29,35-hexamethyl-2,3, 10,14,20-pentaoxo-11,36-dioxa-4azatricyclo[30.3.1.0 4,9 ]hexatriaconta-16,24,26,28-tetraen-12-yl]propyl]-2-methoxycyclohexyl dimethylphosphinate, also known as AP23573 and MK8669, and described in published PCT application WO 03/064383), everolimus (Afinitor® or RAD001), rapamycin (AY22989, Sirolimus®), simapimod (CAS 164301-51-3), emsirolimus, (5- {2,4-bis[^)-3-methylmorpholin-4-yl]pyrido[2,3d]pyrimidin-7-yl}-2-methoxyphenyl)methanol (AZD8055), (PF04691502, CAS 1013101-36-4) , and N 2 -[1,4dioxo-4-[[4-(4-oxo-8-phenyl-4H-1-benzopyran-2-yl)morpholin-4-yl]methoxy]butyl]-L-arginylglycyl- Lα-aspartyl-E-serine- (SEQ ID NO: 237), internal salt (SF1126, CAS 936487-67-1) and XL765.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, используется в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3) в комбинации с ингибитором BRAF, например, GSK2118436, RG7204, PLX4032, GDC-0879, PLX4720 и с препаратом сорафениб тозилат (Bay 43-9006).In some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, is used alone or in combination with another immunomodulator (e.g., an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-PD-1 antibody molecule). TIM-3) in combination with a BRAF inhibitor, for example, GSK2118436, RG7204, PLX4032, GDC-0879, PLX4720 and the drug sorafenib tosylate (Bay 43-9006).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, применяется в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3) в комбинации с ингибитором MEK. В некоторых вариантах осуществления комбинация антитела против PD-1 и ингибитора MEK применяется для лечения рака (например, рака, упомянутого в изобретении). В некоторых вариантах осуществления рак, подвергаемый лечению указанной комбинацией, выбран из следующих видов рака: меланома, колоректальный рак, немелкоклеточный рак легкого, рак яичника, рак молочной железы, рак предстательной железы, рак поджелудочной железы, гематологическая злокачественная опухоль или почечно-клеточный рак. В некоторых вариантах осуществления рак включает мутации BRAF (например, мутацию BRAF V600E), BRAF дикого типа, KRAS дикого типа или активирующую мутацию KRAS. Рак может быть на ранней, промежуточной или поздней стадии. В комбинации может быть использован любой ингибитор МЕК, включающий без ограничения ARRY-142886, G02442104 (также известный как GSK1120212), RDEA436, RDEA119/BAY 869766, AS703026, G00039805 (также известный как AZD-6244 или селуметиниб), BIX 02188, BIX 02189, CI-1040 (PD184352), PD0325901, PD98059, U0126, GDC-0973 (Метанон, [3,4-дифтор-2-[(2-фтор-4йодфенил)амино]фенил][3-гидрокси-3-(25)-2-пиперидинил-1-азетидинил]-), G-38963, G02443714 (такжеIn some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, is used alone or in combination with another immunomodulator (e.g., an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-PD-1 antibody molecule). TIM-3) in combination with a MEK inhibitor. In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody and a MEK inhibitor is used to treat cancer (eg, a cancer described in the invention). In some embodiments, the cancer treated with the combination is selected from the following cancers: melanoma, colorectal cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, breast cancer, prostate cancer, pancreatic cancer, hematologic malignancy, or renal cell cancer. In some embodiments, the cancer includes BRAF mutations (eg, BRAF V600E mutation), wild-type BRAF, wild-type KRAS, or an activating KRAS mutation. Cancer can be early, intermediate or late stage. Any MEK inhibitor may be used in combination, including but not limited to ARRY-142886, G02442104 (also known as GSK1120212), RDEA436, RDEA119/BAY 869766, AS703026, G00039805 (also known as AZD-6244 or selumetinib), BIX 02188, BIX 021 89 , CI-1040 (PD184352), PD0325901, PD98059, U0126, GDC-0973 (Methanone, [3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4iodophenyl)amino]phenyl][3-hydroxy-3-(25 )-2-piperidinyl-1-azetidinyl]-), G-38963, G02443714 (also
- 62 045940 известный как AS703206), или их фармацевтически приемлемые соли или сольваты. Дополнительные примеры ингибиторов MEK раскрыты в патентах WO 2013/019906, WO 03/077914, WO 2005/121142, WO 2007/04415, WO 2008/024725 и WO 2009/085983, содержание которых включено в настоящее описание в качестве ссылки.- 62 045940 known as AS703206), or pharmaceutically acceptable salts or solvates thereof. Additional examples of MEK inhibitors are disclosed in WO 2013/019906, WO 03/077914, WO 2005/121142, WO 2007/04415, WO 2008/024725 and WO 2009/085983, the contents of which are incorporated herein by reference.
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, используется в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3) в комбинации с ингибитором JAK2, например, СЕР-701, INCB18424, СР-690550 (тасоцитиниб).In some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, is used alone or in combination with another immunomodulator (e.g., an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-PD-1 antibody molecule). TIM-3) in combination with a JAK2 inhibitor, for example, CEP-701, INCB18424, CP-690550 (tasocitinib).
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против 3-TIM), применяется в комбинации с паклитакселом или с препаратом паклитаксела, таким как Таксол (TAXOL®), связанный с белком паклитаксел (например, Абраксан/ABRAXANE®) . Препараты паклитаксела, в качестве примера и без ограничения, включают наночастицы альбуминсвязанного паклитаксел (Абраксан, зарегистрированный компанией Abraxis Bioscience), связанный с докозагексаеновой кислотой паклитаксел (DHA-паклитаксел, Таксопрексин/Taxoprexin, зарегистрированный компанией Protarga), связанный с полиглутаматом паклитаксел (PG-паклитаксел, паклитаксел полиглумекс, СТ-2103, XYOTAX, зарегистрированный компанией Cell Therapeutic), активируемое опухолью пролекарство (ТАР), ANG105 (Ангиопеп-2, связанный с тремя молекулами паклитаксела, зарегистрированный компанией ImmunoGen), паклитаксел-ЕС-1 (паклитаксел, связанный с erbB2-распознающим пептидом ЕС-1, см. Li et al., Biopolymers (2007) 87:225-230), и конъюгированный с глюкозой паклитаксел (например, 2'-паклитаксел метил 2-глюкопиранозил сукцинат, см. Liu et al., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2007) 17:617-620).In some embodiments, the pharmaceutical composition of the invention, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-3-TIM antibody molecule), is used in combination with paclitaxel or a preparation of paclitaxel , such as Taxol (TAXOL®), protein-bound paclitaxel (eg, ABRAXANE®). Paclitaxel formulations include, by way of example and without limitation, nanoparticle albumin-bound paclitaxel (Abraxane, marketed by Abraxis Bioscience), docosahexaenoic acid-bound paclitaxel (DHA-paclitaxel, Taxoprexin, marketed by Protarga), polyglutamate-bound paclitaxel (PG-paclitaxel , paclitaxel polyglumex, CT-2103, XYOTAX, registered by Cell Therapeutic), tumor-activated prodrug (TAP), ANG105 (Angiopep-2, bound to three molecules of paclitaxel, registered by ImmunoGen), paclitaxel-EC-1 (paclitaxel, bound to erbB2 recognition peptide EC-1, see Li et al., Biopolymers (2007) 87:225-230), and glucose-conjugated paclitaxel (eg, 2'-paclitaxel methyl 2-glucopyranosyl succinate, see Liu et al. , Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2007) 17:617-620).
Лучевую терапию можно применять с помощью одного из нескольких способов или комбинации способов, включающих без ограничения наружную дистанционную лучевую терапию, внутреннюю лучевую терапию, имплантационное облучение, стереотаксическую радиохирургию, системную лучевую терапию, радиотерапию и постоянную или временную интерстициальную брахитерапию. Термин брахитерапия относится к лучевой терапии, которую осуществляют с помощью пространственно ограниченного радиоактивного материала, введенного в тело, в опухоль или вблизи опухоли, или в другое место локализации патологической пролиферативной ткани. Предполагается, что термин без ограничения включает воздействие радиоактивных изотопов (например, At-211, I-131, I-125, Y-90, Re-186, Re-188, Sm-153, Bi-212, P-32 и радиоактивных изотопов Lu). Подходящие источники излучения для использования в качестве кондиционера клеток, согласно изобретению, включают и твердые вещества и жидкости. В качестве не ограничивающего примера, источником излучения может быть радиоактивный изотоп, такой как I-125, I-131, Yb-169, Ir-192 в качестве твердого источника, I-125 в качестве твердого источника или другие радионуклиды, испускающие фотоны, бета-частицы, гамма-излучение, или другие терапевтические лучи. Радиоактивный материал может также представлять собой жидкость, которую получают из любого раствора радионуклида (радионуклидов), например, раствор I-125 или I-131, или радиоактивную жидкость можно получать с использованием суспензии подходящей жидкости, содержащей мелкие частицы твердых радионуклидов, таких как Au-198, Y-90. Более того, радионуклид (радионуклиды) могут быть помещены в гель или радиоактивные микросферы.Radiation therapy can be administered by one of several modalities or a combination of modalities, including, but not limited to, external beam radiation therapy, internal beam radiation therapy, implantation radiation, stereotactic radiosurgery, systemic radiation therapy, radiation therapy, and permanent or temporary interstitial brachytherapy. The term brachytherapy refers to radiation therapy that is delivered using a spatially confined radioactive material introduced into the body, into or near a tumor, or other site of abnormal proliferative tissue. The term is intended to include, without limitation, exposure to radioactive isotopes (e.g., At-211, I-131, I-125, Y-90, Re-186, Re-188, Sm-153, Bi-212, P-32 and radioactive Lu isotopes). Suitable radiation sources for use as a cell conditioner according to the invention include both solids and liquids. As a non-limiting example, the radiation source may be a radioactive isotope such as I-125, I-131, Yb-169, Ir-192 as a solid source, I-125 as a solid source, or other photon-emitting radionuclides, beta -particles, gamma radiation, or other therapeutic rays. The radioactive material may also be a liquid which is prepared from any solution of radionuclide(s), for example a solution of I-125 or I-131, or the radioactive liquid may be prepared using a suspension of a suitable liquid containing fine particles of solid radionuclides such as Au- 198, Y-90. Moreover, the radionuclide(s) can be placed in a gel or radioactive microspheres.
Молекулы антител против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), можно вводить в комбинации с одной или несколькими из существующие методик лечения раковых заболеваний, включающих без ограничения хирургическое вмешательство, лучевую терапию (например, наружную дистанционную лучевую терапию, в которую входит трехмерная, конформная лучевая терапия с обозначенным полем облучения, локальное облучение (например, облучение, нацеленное на заранее выбранную мишень или орган) или фокусированное облучение). Фокусированное облучение может быть выбрано из группы, состоящей из стереотаксической радиохирургии, фракционированной стереотаксической радиохирургии и лучевой терапии с модулируемой интенсивностью. Фокусированное облучение может иметь источник излучения, выбранный из группы, состоящей из пучка частиц (протонов), кобальта-60 (фотонов) и линейного ускорителя (рентгеновское излучение), например, как описано в WO 2012/177624.Anti-PD-1 antibody molecules, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), can be administered in combination with one or more of the existing techniques treatment of cancer, including but not limited to surgery, radiation therapy (eg, external beam radiation therapy, which includes three-dimensional, conformal radiation therapy with a designated radiation field, local radiation therapy (eg, radiation aimed at a preselected target or organ), or focused irradiation). Focused radiation may be selected from the group consisting of stereotactic radiosurgery, fractionated stereotactic radiosurgery, and intensity-modulated radiation therapy. Focused irradiation may have a radiation source selected from the group consisting of a particle beam (protons), cobalt-60 (photons) and a linear accelerator (x-rays), for example, as described in WO 2012/177624.
В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), вводят в комбинации с антителом к иммуноглобулинподобным рецепторам клеток-киллеров (также называемое в изобретении антителом против KIR), с пан-KIR-антителом, антителом против NKG2D и антителом против MICA. В некоторых вариантах осуществления комбинация молекулы антитела против PD-1 и антитела против KIR, пан-KIR антитела или антитела против NKG2D, упомянутых в изобретении, используется для лечения рака, например, рака, указанного в изобретении (например, солидной опухоли, например, прогрессирующей солидной опухоли).In some embodiments, an anti-PD-1 antibody molecule, alone or in combination with another immunomodulator (e.g., an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), is administered in combination with an anti-immunoglobulin-like antibody molecule. killer cell receptor (also called anti-KIR antibody in the invention), with pan-KIR antibody, anti-NKG2D antibody and anti-MICA antibody. In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody molecule and an anti-KIR antibody, pan-KIR antibody, or anti-NKG2D antibody mentioned in the invention is used to treat a cancer, such as a cancer described in the invention (e.g., a solid tumor, such as advanced solid tumor).
- 63 045940- 63 045940
В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), вводят в комбинации с клеточной иммунотерапией (например, с препаратом Провендж, например, Сипулейцел), и, необязательно, в комбинации с циклофосфамидом. В некоторых вариантах осуществления комбинация молекулы антитела против PD-1, препаратов Провендж и/или циклофосфамид используется для лечения рака, например, рака, указанного в изобретении (например, рака предстательной железы, например, прогрессирующего рака предстательной железы).In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), is administered in combination with a cellular immunotherapy ( for example, with the drug Provenge, for example, Sipuleucel), and, optionally, in combination with cyclophosphamide. In some embodiments, a combination of an anti-PD-1 antibody molecule, Provenge, and/or cyclophosphamide is used to treat a cancer, such as a cancer of the invention (eg, prostate cancer, eg, advanced prostate cancer).
В другом варианте осуществления молекулу антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), вводят в комбинации с вакциной, например, с вакциной на основе дендритных клеток против почечной карциномы (DC-RCC). В некоторых вариантах осуществления комбинацию молекулы антитела против PD-1 и вакцины DC-RCC применяют для лечения рака, например, рака, упомянутого в изобретении (например, рака почки, например, метастатического почечно-клеточного рака (RCC) или светлоклеточного почечно-клеточного рака (CCRCC)).In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), is administered in combination with a vaccine, e.g. , with a dendritic cell-based vaccine against renal cell carcinoma (DC-RCC). In some embodiments, the combination of an anti-PD-1 antibody molecule and a DC-RCC vaccine is used to treat cancer, such as a cancer mentioned in the invention (e.g., kidney cancer, such as metastatic renal cell carcinoma (RCC) or clear cell renal cell carcinoma (CCRCC)).
Еще в одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), вводят в комбинации с химиотерапией и/или иммунотерапией. Например, молекула антитела против PD-1 может применяться для лечения миеломы, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими следующими средствами: химиотерапевтические или другие противоопухолевые средства (такие как аналоги талидомида, например, леналидомид), антитело против TIM-3, опухолевый антиген - импульсные дендритные клетки, слияния (например, электрослияния) опухолевых клеток и дендритных клеток, или вакцинация с использованием идиотипа иммуноглобулина, продуцируемого злокачественными плазматическими клетками. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с антителом против TIM-3 для лечения миеломы, например, множественной миеломы.In yet another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), is administered in combination with chemotherapy and /or immunotherapy. For example, an anti-PD-1 antibody molecule may be used to treat myeloma, either alone or in combination with one or more of the following: chemotherapy or other antineoplastic agents (such as thalidomide analogues, e.g., lenalidomide), anti-TIM-3 antibody, tumor antigen - pulsed dendritic cells, fusions (eg, electrofusion) of tumor cells and dendritic cells, or vaccination using an immunoglobulin idiotype produced by malignant plasma cells. In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with an anti-TIM-3 antibody to treat myeloma, such as multiple myeloma.
В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3-), используют в комбинации с химиотерапией для лечения рака легкого, например, немелкоклеточного рака легкого. В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 применяют для лечения рака легкого вместе с терапией дублетами препаратов платины.In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), is used in combination with chemotherapy to treating lung cancer, such as non-small cell lung cancer. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used to treat lung cancer in conjunction with platinum doublet therapy.
Еще в одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3-), применяют для лечения рака почки, например, почечноклеточной карциномы (RCC) (например, светлоклеточной почечно-клеточной карциномы (CCRCC) или метастатической RCC. Молекулу антитела против PD-1 можно вводить в комбинации с одним или несколькими из следующих веществ: иммуннологическая стратегия (например, интерлейкин-2 или интерферон-α), вещество направленного действия (например, ингибитор VEGF, такой как моноклональное антитело против VEGF), ингибитор тирозинкиназы VEGF, такой как сунитиниб, сорафениб, акситиниб и пазопаниб, ингибитор РНК-интерференции) или ингибитор медиатора, расположенного ниже по ходу сигнального пути VEGF, например, ингибитор мишени рапамицина у млекопитающих (mTOR), например, эверолимус и темсиролимус.In yet another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), is used to treat kidney cancer , for example, renal cell carcinoma (RCC) (for example, clear cell renal cell carcinoma (CCRCC) or metastatic RCC. The anti-PD-1 antibody molecule can be administered in combination with one or more of the following: an immunological strategy (for example, interleukin-2 or interferon-α), a targeting agent (eg, a VEGF inhibitor such as an anti-VEGF monoclonal antibody), a VEGF tyrosine kinase inhibitor such as sunitinib, sorafenib, axitinib, and pazopanib, an RNA interference inhibitor), or an inhibitor of a downstream neurotransmitter VEGF pathways, such as mammalian target of rapamycin (mTOR) inhibitors, such as everolimus and temsirolimus.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулами антител против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения рака поджелудочной железы включают без ограничения химиотерапевтическое средство, например, паклитаксел или препарат паклитаксела (например, композиция паклитаксела, такая как Таксол, композиция паклитаксела в форме альбумин-стабилизированных наночастиц (например, Абраксан) или липосомальная композиция паклитаксела), гемцитабин (например, гемцитабин единственный или в комбинации с АХР107-11), другие химиотерапевтические средства, такие как оксалиплатин, 5-фторурацил, капецитабин, рубитекан, эпирубицин гидрохлорид, NC-6004, цисплатин, доцетаксел (например, Таксотер), митомицин С, ифосфамид; интерферон; ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор EGFR (например, эрлотиниб, панитумумаб, цетуксимаб, нимотузумаб); ингибитор HER2/Neu-рецептора (например, трастузумаб); двойной ингибитор киназы (например, бозутилиниб, саракатиниб, лапатиниб, вандетаниб); мультикиназный ингибитор (например, сорафениб, сунитиниб, XL184, пазопаниб); ингибитор VEGF (например, бевацизумаб, AV-951, бриваниб); радиоиммунотерапию (например, XR303), противоопухолевую вакцину (например, GVAX, пептид сурвивин); ингибитор СОХ-2 (например, целекоксиб); ингибитор рецептора IGF-1 (например, AMG 479, MK-0646); ингибитор mTOR (например, эверолимус, темсиролимус); ингибитор IL-6 (например, CNTO 328); ингибитор циклин-зависимой киназы (например, Р276-00, UCN-01); соединение, нацеленное на измененный энергетический метаболизм (AEMD) (например, CPI-613); ингибитор HDAC (например, вориностат); агонист TRAIL-рецептора 2 (TR-2) (например, конатумумаб); ингибитор MEK (например, AS703026, селуметиниб, GSK1120212); двойной ингибитор киназы Raf/MEK (например, RO5126766); ингибитор сигнального пути Notch (например, MK0752); слиExamples of suitable therapeutic agents for use in combination with the anti-PD-1 antibody molecules of the invention, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, with an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of pancreatic cancer include, but are not limited to, a chemotherapeutic agent, e.g., paclitaxel or a paclitaxel formulation (e.g., a paclitaxel formulation such as Taxol, an albumin-stabilized nanoparticle formulation of paclitaxel (e.g., Abraxane), or a liposomal paclitaxel formulation), gemcitabine (e.g., gemcitabine alone or in combination with AChR107-11), other chemotherapeutic agents such as oxaliplatin, 5-fluorouracil, capecitabine, rubitecan, epirubicin hydrochloride, NC-6004, cisplatin, docetaxel (eg Taxotere), mitomycin C, ifosfamide; interferon; tyrosine kinase inhibitor (eg, EGFR inhibitor (eg, erlotinib, panitumumab, cetuximab, nimotuzumab); HER2/Neu receptor inhibitor (eg, trastuzumab); dual kinase inhibitor (eg, bosutilinib, saracatinib, lapatinib, vandetanib); multikinase inhibitor (eg , sorafenib, sunitinib, XL184, pazopanib); VEGF inhibitor (eg, bevacizumab, AV-951, brivanib); radioimmunotherapy (eg, XR303), tumor vaccine (eg, GVAX, survivin peptide); COX-2 inhibitor (eg, celecoxib ); IGF-1 receptor inhibitor (eg, AMG 479, MK-0646); mTOR inhibitor (eg, everolimus, temsirolimus); IL-6 inhibitor (eg, CNTO 328); cyclin-dependent kinase inhibitor (eg, P276-00 , UCN-01); compound targeting altered energy metabolism (AEMD) (eg, CPI-613); HDAC inhibitor (eg, vorinostat); TRAIL receptor 2 (TR-2) agonist (eg, conatumumab); MEK inhibitor (eg AS703026, selumetinib, GSK1120212) dual Raf/MEK kinase inhibitor (eg RO5126766); Notch signaling pathway inhibitor (eg MK0752); if
- 64 045940 тый белок моноклональное антитело - антитело (например, L19IL2); куркумин; ингибитор HSP90 (например, танеспимицин, STA-9090); RIL-2, денилейкин дифтитокс; ингибитор топоизомеразы 1 (например, иринотекан, РЕР02); статин (например, симвастатин); ингибитор фактора VIIa (например, PCI27483); ингибитор AKT (например, RX-0201); активируемое гипоксией пролекарство (например, ТН302); метформин гидрохлорид, ингибитор гамма-секретазы (например, RO4929097); ингибитор рибонуклеотидредуктазы (например, 3-АР); иммунотоксин (например, HuC242-DM4); ингибитор PARP (например, KU-0059436, велипариб); ингибитор CTLA-4 (например, СР-675206, ипилимумаб); ADV-tk терапия (с использованием тимидинкиназы вируса простого герпеса); ингибитор протеасом (например, бортезомиб (Велкад), NPI-0052); тиазолидиндион (например, пиоглитазон); NPC-1C; ингибитор Aurora-киназы (например, R763/AS703569), ингибитор CTGF (например, FG-3019); siG12DLODER; и лучевую терапию (например, томотерапию, стереотактическое облучение, протонную терапию), хирургическое вмешательство, и их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления можно применять комбинацию паклитаксела или препарата паклитаксела и гемцитабина с молекулой антитела против PD-1 по изобретению.- 64 045940 protein monoclonal antibody - antibody (for example, L19IL2); curcumin; HSP90 inhibitor (eg tanespimycin, STA-9090); RIL-2, denileukin diftitox; topoisomerase 1 inhibitor (eg, irinotecan, PEP02); statin (eg simvastatin); factor VIIa inhibitor (eg PCI27483); AKT inhibitor (eg, RX-0201); hypoxia-activated prodrug (eg, TH302); metformin hydrochloride, a gamma secretase inhibitor (eg RO4929097); ribonucleotide reductase inhibitor (eg 3-AR); immunotoxin (eg HuC242-DM4); PARP inhibitor (eg, KU-0059436, veliparib); CTLA-4 inhibitor (eg, CP-675206, ipilimumab); ADV-tk therapy (using herpes simplex virus thymidine kinase); proteasome inhibitor (eg, bortezomib (Velcad), NPI-0052); thiazolidinedione (eg pioglitazone); NPC-1C; Aurora kinase inhibitor (eg R763/AS703569), CTGF inhibitor (eg FG-3019); siG12DLODER; and radiation therapy (eg, tomotherapy, stereotactic radiation, proton therapy), surgery, and combinations thereof. In some embodiments, a combination of paclitaxel or a drug of paclitaxel and gemcitabine with an anti-PD-1 antibody molecule of the invention may be used.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения мелкоклеточного рака легкого включают без ограничения химиотерапевтическое средство, например, этопозид, карбоплатин, цисплатин, оксалиплатин, иринотекан, топотекан, гемцитабин, липосомальный SN-38, бендамустин, темозоломид, белотекан, NK012, FR901228, флавопиридол); ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор EGFR (например, эрлотиниб, гефитиниб, цетуксимаб, панитумумаб); мультикиназный ингибитор (например, сорафениб, сунитиниб); ингибитор VEGF (например, бевацизумаб, вандетаниб); противоопухолевую вакцину (например, GVAX); ингибитор Bcl-2 (например, облимерсен натрия, АВТ-263); ингибитор протеасом (например, бортезомиб (Велкад), NPI-0052), паклитаксел или препарат паклитаксела; доцетаксел; ингибитор рецептора IGF-1 (например, AMG 479); ингибитор HGF/SF (например, AMG 102, MK-0646); хлорохин; ингибитор киназы Aurora (например, MLN8237); радиоиммунотерапию (например, TF2); ингибитор HSP90 (например, танеспимицин, STA-9090); ингибитор mTOR (например, эверолимус); биспецифичное антитело Ep-CAM-/CD3 (например, МТ110); ингибитор CK-2 (например, СХ-4945); ингибитор HDAC (например, белиностат); антагонист SMO (например, BMS 833923); пептидную противоопухолевую вакцину и лучевую терапию (например, лучевую терапию с модулируемой интенсивностью (IMRT), гипофракционированную лучевую терапию, лучевую терапию с наведением гипоксией), хирургическое вмешательство и их комбинации.Examples of suitable therapeutic agents for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, with an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of small cell lung cancer include, but are not limited to, a chemotherapeutic agent, for example, etoposide, carboplatin, cisplatin, oxaliplatin, irinotecan, topotecan, gemcitabine, liposomal SN-38, bendamustine, temozolomide, belotecan, NK012, FR901228, flavopiridol); tyrosine kinase inhibitor (eg, EGFR inhibitor (eg, erlotinib, gefitinib, cetuximab, panitumumab); multikinase inhibitor (eg, sorafenib, sunitinib); VEGF inhibitor (eg, bevacizumab, vandetanib); tumor vaccine (eg, GVAX); Bcl-inhibitor 2 (eg, oblimersen sodium, ABT-263); proteasome inhibitor (eg, bortezomib (Velcad), NPI-0052), paclitaxel or paclitaxel preparation; docetaxel; IGF-1 receptor inhibitor (eg, AMG 479); HGF/SF inhibitor (eg, AMG 102, MK-0646); chloroquine; Aurora kinase inhibitor (eg, MLN8237); radioimmunotherapy (eg, TF2); HSP90 inhibitor (eg, tanespimycin, STA-9090); mTOR inhibitor (eg, everolimus); bispecific Ep-CAM-/CD3 antibody (eg, MT110); CK-2 inhibitor (eg, CX-4945); HDAC inhibitor (eg, belinostat); SMO antagonist (eg, BMS 833923); peptide tumor vaccine and radiation therapy (eg , intensity-modulated radiation therapy (IMRT), hypofractionated radiation therapy, hypoxia-guided radiation therapy), surgery, and combinations thereof.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3) для лечения немелкоклеточного рака легкого включают без ограничения химиотерапевтическое средство, например, винорелбин, цисплатин, доцетаксел, пеметрексед динатрия, этопозид, гемцитабин, карбоплатин, липосомальный SN38, TLK286, темозоломид, топотекан, пеметрексед динатрия, азацитидин, иринотекан, тегафургимерацил-отерацил калия, сапацитабин); ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор EGFR (например, эрлотиниб, гефитиниб, цетуксимаб, панитумумаб, нецитумумаб, PF-00299804, нимотузумаб, RO5083945), ингибитор МЕТ (например, PF-02341066, ARQ 197), ингибитор PI3K киназы (например, XL147, GDC-0941), двойной ингибитор Raf/MEK киназы (например, RO5126766), двойной ингибитор PI3K/mTOR киназы (например, XL765), ингибитор SRC (например, дазатиниб), двойной ингибитор (например, BIBW 2992, GSK1363089, ZD6474, AZD0530, AG-013736, лапатиниб, MEHD7945A, линифаниб), мультикиназный ингибитор (например, сорафениб, сунитиниб, пазопаниб, AMG 706, XL184, MGCD265, BMS-690514, R935788), ингибитор VEGF (например, эндостар, эндостатин, бевацизумаб, цедираниб, BIBF 1120, акситиниб, тивозаниб, AZD2171), противоопухолевую вакцину (например, липосомальную вакцину BLP25, GVAX, рекомбинантную ДНК и аденовирус, экспрессирующий белок L523S), ингибитор Bcl-2 (например, облимерсен натрия), ингибитор протеасом (например, бортезомиб, карфилзомиб, NPI0052, MLN9708), паклитаксел или препарат паклитаксела, доцетаксел, ингибитор рецептора IGF-1 (например, циксутумумаб, MK-0646, OSI 906, СР-751871, BIIB022), гидроксихлорохин, ингибитор HSP90 (например, танеспимицин, СТА-9090, AUY922, XL888), ингибитор mTOR (например, эверолимус, темсиролимус, ридафоролимус), биспецифичное антитело Ep-CAM/CD3 (например, МТ110), ингибитор CK2 (например, СХ-4945), ингибитор HDAC (например, MS 275, LBH589, вориностат, вальпроевую кислоту, FR901228), ингибитор DHFR (например, пралатрексат), ретиноид (например, бексаротен, третиноин), конъюгат антитело - лекарственное средство (например, SGN-15), бисфосфонат (например, золедроновую кислоту), противоопухолевую вакцину (например, белагенпуматуцел-L), низкомолекулярный гепарин (НМГ) (например, тинзапарин, эноксапарин), GSK1572932A, мелатонин, талактоферрин, димесна, ингибитор топоизомеразы (например, амрубицин, этопозид, каренитецин), нелфинавир, циленгитид, ингибитор ErbB3 (например, ММ-121, U3-1287), ингибитор сурвивина (например, YM155, LY2181308), эрибулин мезилат, ингибитор СОХ-2 (например, целекоксиб), пэгфилграстим, ингибитор Polo-подобной киназы 1 (например, BI 6727), агонист TRAIL-рецептора 2 (TR-2) (например, CS-1008), конъюгат пептиExamples of suitable therapeutic agents for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule) for the treatment of non-small cell lung cancer include, but are not limited to, a chemotherapy agent, for example, vinorelbine, cisplatin, docetaxel, pemetrexed disodium, etoposide, gemcitabine, carboplatin, liposomal SN38, TLK286, temozolomide, topotecan, pemetrexed disodium, azacitidine, irinotecan, tegafurgimeracil-oteracil potassium, sapacitabine); tyrosine kinase inhibitor (eg, EGFR inhibitor (eg, erlotinib, gefitinib, cetuximab, panitumumab, necitumumab, PF-00299804, nimotuzumab, RO5083945), MET inhibitor (eg, PF-02341066, ARQ 197), PI3K kinase inhibitor (eg, XL147, GDC-0941), dual Raf/MEK kinase inhibitor (eg, RO5126766), dual PI3K/mTOR kinase inhibitor (eg, XL765), SRC inhibitor (eg, dasatinib), dual inhibitor (eg, BIBW 2992, GSK1363089, ZD6474, AZD0530 , AG-013736, lapatinib, MEHD7945A, linifanib), multikinase inhibitor (eg, sorafenib, sunitinib, pazopanib, AMG 706, XL184, MGCD265, BMS-690514, R935788), VEGF inhibitor (eg, endostar, endostatin, bevacizumab, cediranib, BIBF 1120, axitinib, tivozanib, AZD2171), tumor vaccine (eg, BLP25 liposomal vaccine, GVAX, recombinant DNA and L523S adenovirus), Bcl-2 inhibitor (eg, oblimersen sodium), proteasome inhibitor (eg, bortezomib, carfilzomib , NPI0052, MLN9708), paclitaxel or paclitaxel preparation, docetaxel, IGF-1 receptor inhibitor (eg, cixutumumab, MK-0646, OSI 906, CP-751871, BIIB022), hydroxychloroquine, HSP90 inhibitor (eg, tanespimycin, STA-9090, AUY922, XL888), mTOR inhibitor (eg, everolimus, temsirolimus, ridaforolimus), Ep-CAM/CD3 bispecific antibody (eg, MT110), CK2 inhibitor (eg, CX-4945), HDAC inhibitor (eg, MS 275, LBH589, vorinostat, valproic acid, FR901228), DHFR inhibitor (eg, pralatrexate), retinoid (eg, bexarotene, tretinoin), antibody-drug conjugate (eg, SGN-15), bisphosphonate (eg, zoledronic acid), tumor vaccine (eg , belagenpumatucel-L), low molecular weight heparin (LMWH) (eg, tinzaparin, enoxaparin), GSK1572932A, melatonin, talactoferrin, dimesna, topoisomerase inhibitor (eg, amrubicin, etoposide, carenitcin), nelfinavir, cilengitide, ErbB3 inhibitor (eg, MM- 121, U3-1287), survivin inhibitor (e.g. YM155, LY2181308), eribulin mesylate, COX-2 inhibitor (e.g. celecoxib), pegfilgrastim, Polo-like kinase 1 inhibitor (e.g. BI 6727), TRAIL receptor 2 agonist (TR-2) (e.g. CS-1008), pepti conjugate
- 65 045940 да CNGRC (SEQ ID NO: 225) - TNF альфа, дихлорацетат (DCA), ингибитор HGF (например, SCH 900105), SAR240550, агонисты PPAR-гамма (например, CS-7017), ингибитор гамма-секретазы (например, RO4929097), эпигенетические средства (например, 5-азацитидин), нитроглицерин, ингибитор MEK (например, AZD6244), ингибитор циклин-зависимой киназы (например, UCN-01), холестерин-Бш1, противомикротрубочковое вещество (например, Е7389), ингибитор фарнезил-ОН-трансферазы (например, лонафарниб), иммунотоксин (например, ВВ-10901, SS1 (dsFv) PE38), фондапаринукс, вещество, разрушающие сосуды (например, AVE8062), ингибитор PD-L1 (например, MDX-1105, MDX-1106), бетаглюкан, NGR-hTNF, EMD 521873, ингибитор MEK (например, GSK1120212), аналог эпотилона (например, иксабепилон), ингибитор кинезинового веретена (например, 4SC-205), вещество, нацеленное на теломеры (например, KML-001), ингибитор пути Р70 (например, LY2584702), ингибитор AKT (например, MK-2206), ингибитор ангиогенеза (например, леналидомид), ингибитор сигнального пути Notch (например, ОМР-21М18), лучевую терапию, хирургическое вмешательство и их комбинации.- 65 045940 yes CNGRC (SEQ ID NO: 225) - TNF alpha, dichloroacetate (DCA), HGF inhibitor (eg SCH 900105), SAR240550, PPAR gamma agonists (eg CS-7017), gamma secretase inhibitor (eg , RO4929097), epigenetic agents (e.g., 5-azacytidine), nitroglycerin, MEK inhibitor (e.g., AZD6244), cyclin-dependent kinase inhibitor (e.g., UCN-01), cholesterol-HS1, antimicrotubule agent (e.g., E7389), inhibitor farnesyl OH transferase (eg, lonafarnib), immunotoxin (eg, BB-10901, SS1 (dsFv) PE38), fondaparinux, vascular disruptor (eg, AVE8062), PD-L1 inhibitor (eg, MDX-1105, MDX -1106), betaglucan, NGR-hTNF, EMD 521873, MEK inhibitor (eg, GSK1120212), epothilone analog (eg, ixabepilone), kinesin spindle inhibitor (eg, 4SC-205), telomere-targeting agent (eg, KML- 001), P70 pathway inhibitor (eg, LY2584702), AKT inhibitor (eg, MK-2206), angiogenesis inhibitor (eg, lenalidomide), Notch signaling inhibitor (eg, OMP-21M18), radiation therapy, surgery, and combinations thereof .
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения рака яичников включают без ограничения химиотерапевтическое средство (например, паклитаксел или препарат паклитаксела; доцетаксел; карбоплатин; гемцитабин; доксорубицин; топотекан; цисплатин, иринотекан, TLK286, ифосфамид, олапариб, оксалиплатин, мелфалан, пеметрексед динатрия, SJG-136, циклофосфамид, этопозид, децитабин); антагонист грелина (например, AEZS-130), иммунотерапевтическое средство (например, АРС8024, ореговомаб, ОРТ-821), ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор EGFR (например, эрлотиниб), двойной ингибитор (например, Е7080), мультикиназный ингибитор (например, AZD0530, JI-101, сорафениб, сунитиниб, пазопаниб), ON 01910.Na), ингибитор VEGF (например, бевацизумаб, BIBF 1120, цедираниб, AZD2171), ингибитор PDGFR (например, IMC-3G3), паклитаксел, ингибитор топоизомеразы (например, каренитецин, иринотекан), ингибитор HDAC (например, вальпроат, вориностат), ингибитор фолат-рецептора (например, фарлетузумаб), ингибитор ангиопоэтина (например, AMG 386), аналог эпотилона (например, иксабепилон), ингибитор протеасом (например, карфлизомиб), ингибитор рецептора IGF-1 (например, OSI 906, AMG 479), ингибитор PARP (например, велипариб, AG014699, инипариб, MK-4827), ингибитор Aurora-киназы (например, MLN8237, ENMD-2076), ингибитор ангиогенеза (например, леналидомид), ингибитор DHFR (например, пралатрексат), радиоиммунотерапевтические средства (например, Hu3S193), статины (например, ловастатин), ингибитор топоизомеразы 1 (например, NKTR-102), противоопухолевую вакцину (например, вакцину на основе длинных синтетических пептидов р53, аутологичную вакцину ОС-DC), ингибитор mTOR (например, темсиролимус, эверолимус), ингибитор BCR/ABL (например, иматиниб), антагонист рецепторов ЕТ-А (например, ZD4054), агонист рецептора TRAIL-2 (TR-2) (например, CS-1008), ингибитор HGF/SF (например, AMG 102), Egen-001, ингибитор Polo-подобной киназы 1 (например, BI 6121), ингибитор гамма-секретазы (например, RO4929097), ингибитор Wee-1 (например, MK-1775), противомикротрубочковое вещество (например, винорелбин, Е7389), иммунотоксин (например, Денилейкин дифтитокс), SB-485232, вещество, разрушающие сосуды (например, AVE8062), ингибитор интегрина (например, EMD 525797), ингибитор кинезинового веретена (например, 4SC-205), ревлимид, ингибитор HER2 (например, MGAH22), ингибитор ErrB3 (например, ММ-121), лучевую терапию; и их комбинации.Examples of suitable therapeutic agents for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of ovarian cancer include, but are not limited to, a chemotherapy agent (eg, paclitaxel or a paclitaxel preparation; docetaxel; carboplatin; gemcitabine; doxorubicin; topotecan; cisplatin, irinotecan, TLK286, ifosfamide, olaparib, oxaliplatin, melphalan, pemetrexed disodium, SJG-136, cyclophosphamide, etoposide, decitabine); ghrelin antagonist (eg, AEZS-130), immunotherapy (eg, APC8024, Oregovomab, ORT-821), tyrosine kinase inhibitor (eg, EGFR inhibitor (eg, erlotinib), dual inhibitor (eg, E7080), multikinase inhibitor (eg, AZD0530, JI-101, sorafenib, sunitinib, pazopanib), ON 01910.Na), VEGF inhibitor (eg, bevacizumab, BIBF 1120, cediranib, AZD2171), PDGFR inhibitor (eg, IMC-3G3), paclitaxel, topoisomerase inhibitor (eg , carenitcin, irinotecan), HDAC inhibitor (eg, valproate, vorinostat), folate receptor inhibitor (eg, farletuzumab), angiopoietin inhibitor (eg, AMG 386), epothilone analogue (eg, ixabepilone), proteasome inhibitor (eg, carflizomib) , IGF-1 receptor inhibitor (eg, OSI 906, AMG 479), PARP inhibitor (eg, veliparib, AG014699, iniparib, MK-4827), Aurora kinase inhibitor (eg, MLN8237, ENMD-2076), angiogenesis inhibitor (eg , lenalidomide), DHFR inhibitor (eg, pralatrexate), radioimmunotherapies (eg, Hu3S193), statins (eg, lovastatin), topoisomerase 1 inhibitor (eg, NKTR-102), tumor vaccine (eg, long synthetic p53 peptide vaccine , autologous OC-DC vaccine), mTOR inhibitor (eg, temsirolimus, everolimus), BCR/ABL inhibitor (eg, imatinib), ET-A receptor antagonist (eg, ZD4054), TRAIL-2 receptor (TR-2) agonist ( e.g. CS-1008), HGF/SF inhibitor (e.g. AMG 102), Egen-001, Polo-like kinase 1 inhibitor (e.g. BI 6121), gamma secretase inhibitor (e.g. RO4929097), Wee-1 inhibitor ( e.g., MK-1775), antimicrotubule agent (e.g., vinorelbine, E7389), immunotoxin (e.g., Denileukin diftitox), SB-485232, vascular disruptor (e.g., AVE8062), integrin inhibitor (e.g., EMD 525797), kinesin inhibitor spindle (eg, 4SC-205), Revlimid, HER2 inhibitor (eg, MGAH22), ErrB3 inhibitor (eg, MM-121), radiation therapy; and their combinations.
В одном иллюстративном варианте осуществления молекула антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), применяется для лечения миеломы, в качестве единственного средства или в комбинации с одной или несколькими из следующих методик: химиотерапевтические или другие противоопухолевые средства (например, аналоги талидомида, например, леналидомид), трансплантация кроветворных стволовых клеток (HSCT) (Cook, R. (2008) J. Manag. Care Pharm. 14(7 Suppl):19-25), антитело против TIM-3 (Hallett, WHD et al. (2011) J. of American Society for Blood and Marrow Transplantation 17 (8):1133-145), опухолевый антиген - импульсные дендритные клетки, слияния (например, электрослияния) опухолевых клеток и дендритных клеток, или вакцинация с использованием идиотипа иммуноглобулина, продуцируемого злокачественными плазматическими клетками (см. обзор Yi, Q. (2009) Cancer J. 15 (6): 502-10).In one illustrative embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), is used to treat myeloma, in as a single agent or in combination with one or more of the following: chemotherapy or other antineoplastic agents (e.g. thalidomide analogs, e.g. lenalidomide), hematopoietic stem cell transplant (HSCT) (Cook, R. (2008) J. Manag. Care Pharm. 14(7 Suppl):19-25), anti-TIM-3 antibody (Hallett, WHD et al. (2011) J. of American Society for Blood and Marrow Transplantation 17 (8):1133-145), tumor antigen - pulsed dendritic cells, fusions (eg electrofusion) of tumor cells and dendritic cells, or vaccination using an immunoglobulin idiotype produced by malignant plasma cells (reviewed by Yi, Q. (2009) Cancer J. 15 (6): 502-10 ).
Еще в одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), применяется для лечения рака почки, например, почечноклеточной карциномы (РСС) или метастатической РСС. Молекулу антитела против PD-1 можно применять в комбинации с одной или несколькими из следующих методик: иммунологическая стратегия (например, интерлейкин-2 или интерферон-α), вещество направленного действия (например, ингибитор VEGF, такой как моноклональное антитело против VEGF, например, бевацизумаб (Rini, B.I. et al. (2010) J. Clin. Oncol. 28(13):2137-2143)); ингибитор тирозинкиназы VEGF, такой как сунитиниб, сорафениб, акситиниб и пазопаниб (см. обзор Pal. S.K. et al. (2014) Clin. Advances in Hematology & Oncology 12(2):9099)); ингибитор РНК-интерференции), или ингибитор медиатора, расположенного ниже по ходу сигнального пути VEGF, например, ингибитор мишени рапамицина у млекопитающих (mTOR), например, эвеIn yet another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), is used to treat kidney cancer. for example, renal cell carcinoma (RCC) or metastatic RCC. The anti-PD-1 antibody molecule can be used in combination with one or more of the following: an immunological strategy (e.g. interleukin-2 or interferon-α), a targeted agent (e.g. a VEGF inhibitor such as an anti-VEGF monoclonal antibody, e.g. bevacizumab (Rini, B.I. et al. (2010) J. Clin. Oncol. 28(13):2137-2143)); a VEGF tyrosine kinase inhibitor such as sunitinib, sorafenib, axitinib and pazopanib (reviewed in Pal. S.K. et al. (2014) Clin. Advances in Hematology & Oncology 12(2):9099)); RNA interference inhibitor), or an inhibitor of a downstream VEGF signaling pathway, such as a mammalian target of rapamycin (mTOR) inhibitor, such as EVE
- 66 045940 ролимус и темсиролимус (Hudes, G. et al. (2007) N. Engl. J. Med. 356 (22): 2271-2281, Motzer, R.J. et al. (2008) Lancet 372: 449-456).- 66 045940 rolimus and temsirolimus (Hudes, G. et al. (2007) N. Engl. J. Med. 356 (22): 2271-2281, Motzer, R. J. et al. (2008) Lancet 372: 449-456) .
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулами антител против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения хронического миелолейкоза (ОМЛ) в соответствии с настоящим изобретением включают без ограничения химиотерапевтическое средство (такое как цитарабин, гидроксимочевина, клорафабин, мелфалан, тиотепа, флударабин, бусульфан, этопозид, кордицепин, пентостатин, капецитабин, азацитидин, циклофосфамид, кладрибин, топотекан), ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор BCR/ABL (например, иматиниб, нилотиниб), ON 01910.Na, двойной ингибитор (например, дазатиниб, бозутиниб), мультикиназный ингибитор (например, DCC-2036, понатиниб, сорафениб, сунитиниб, RGB-286638)), интерферон-альфа, стероиды, апоптическое средство (например, омацетаксин мепесукцинат), иммунотерапевтическое средство (например, антитела против CD3/nротив CD28, связанные с аллогенными CD4+ Th1 подобными Т-клетками памяти/микрочастицами, аутологичные цитокин-индуцированные клеткикиллеры (CIK), AHN-12), вещество, нацеленное на CD52 (например, алемтузумаб), ингибитор HSP90, (например, танеспимицин, STA-9090, AUY922, XL888), ингибитор mTOR (например, эверолимус), антагонист SMO (например, BMS 833923), ингибитор рибонуклеотидредуктазы (например, 3-АР), ингибитор JAK-2 (например, INCB018424), гидроксихлорохин, ретиноид (например, фенретинид), ингибитор циклин-зависимой киназы (например, UCN-01), ингибитор HDAC (например, белиностат, вориностат, JNJ26481585), ингибитор PARP (например, велипариб), антагонист MDM2 (например, RO5045337), ингибитор Aurora В киназы (например, TAK-901), радиоиммунотерапевтическое средство (например, меченое актинием-225 антитело против CD33 HuM195), ингибитор hedgehog (например, PF-04449913), ингибитор STAT3 (например, ОРВ-31121), KB004, противоопухолевую вакцину (например, AG858), трансплантацию костного мозга, трансплантацию стволовых клеток, лучевую терапию и их комбинации.Examples of suitable therapeutic agents for use in combination with the anti-PD-1 antibody molecules of the invention, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, with an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of chronic myeloid leukemia (AML) in accordance with the present invention include, without limitation, a chemotherapeutic agent (such as cytarabine, hydroxyurea, clorafabine, melphalan, thiotepa, fludarabine, busulfan, etoposide, cordycepin, pentostatin, capecitabine, azacitidine, cyclophosphamide, cladribine, topotecan) , tyrosine kinase inhibitor (e.g., BCR/ABL inhibitor (e.g., imatinib, nilotinib), ON 01910.Na, dual inhibitor (e.g., dasatinib, bosutinib), multikinase inhibitor (e.g., DCC-2036, ponatinib, sorafenib, sunitinib, RGB- 286638)), interferon-alpha, steroids, apoptotic agent (e.g., omacetaxine mepesuccinate), immunotherapeutic agent (e.g., anti-CD3/anti-CD28 antibodies associated with allogeneic CD4+ Th1-like memory T cells/microparticles, autologous cytokine-induced killer cells ( CIK), AHN-12), CD52-targeting agent (eg, alemtuzumab), HSP90 inhibitor (eg, tanespimycin, STA-9090, AUY922, XL888), mTOR inhibitor (eg, everolimus), SMO antagonist (eg, BMS 833923), ribonucleotide reductase inhibitor (e.g. 3-AP), JAK-2 inhibitor (e.g. INCB018424), hydroxychloroquine, retinoid (e.g. fenretinide), cyclin-dependent kinase inhibitor (e.g. UCN-01), HDAC inhibitor (e.g. belinostat, vorinostat, JNJ26481585), PARP inhibitor (eg, veliparib), MDM2 antagonist (eg, RO5045337), Aurora B kinase inhibitor (eg, TAK-901), radioimmunotherapy (eg, actinium-225 labeled anti-CD33 antibody HuM195), hedgehog inhibitor (eg, PF-04449913), STAT3 inhibitor (eg, ORV-31121), KB004, tumor vaccine (eg, AG858), bone marrow transplant, stem cell transplant, radiation therapy, and combinations thereof.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения хронического лимфолейкоза (ХЛЛ) включают без ограничения химиотерапевтическое средство (например, флударабин, циклофосфамид, доксорубицин, винкристин, хлорамбуцил, бендамустин, хлорамбуцил, бусульфан, гемцитабин, мелфалан, пентостатин, митоксантрон, 5-азацитидин, динатрия пеметрексед), ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор EGFR (например, эрлотиниб), ингибитор BTK (например, PCI32765), мультикиназный ингибитор (например, MGCD265, RGB-286638), вещество, нацеленное на CD-20 (например, ритуксимаб, офатумумаб, RO5072759, LFB-R603), вещество, нацеленное на CD52 (например, алемтузумаб), преднизолон, дарбэпоэтин альфа, леналидомид, ингибитор Bcl-2 (например, АВТ-263), иммунотерапевтическое средство (например, антитела против CD3/против CD28, связанные с аллогенными CD4+ Th1 подобными Т-клетками памяти/микрочастицами, аутологичные цитокининдуцированные клетки-киллеры (CIK)), ингибитор HDAC (например, вориностат, вальпроевую кислоту, LBH589, JNJ-26481585, AR-42), ингибитор XIAP (например, AEG35156), вещество, нацеленное на CD-74 (например, милатузумаб), ингибитор mTOR (например, эверолимус), АТ-101, иммунотоксин (например, САТ-8015, анти-Тас(Ту)-РЕ38 (LMB-2)), вещество, нацеленное на CD37 (например, TRU-016), радиоиммунотерапевтическое средство (например, 131-тозитумомаб), гидроксихлорохин, перифозин, ингибитор SRC (например, дазатиниб), талидомид, ингибитор PI3K дельта (например, CAL-101), ретиноид (например, фенретинид), антагонист MDM2 (например, RO5045337), плериксафор, ингибитор Aurora киназы (например, MLN8237, TAK-901), ингибитор протеасом (например, бортезомиб), вещество, нацеленное на CD-19 (например, MEDI-551, MOR208), ингибитор MEK (например, АВТ-348), ингибитор JAK-2 (например, INCB018424), пролекарство, активируемое гипоксией (например, ТН-302), паклитаксел или препарат паклитаксела, ингибитор HSP90, ингибитор AKT (например, MK2206), ингибитор ГМГ-КоА редуктазы (например, симвастатин), GNKG186, лучевая терапия, трансплантация костного мозга, трансплантация стволовых клеток и их комбинация.Examples of suitable therapeutic agents for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of chronic lymphocytic leukemia (CLL) include, but are not limited to, a chemotherapy agent (eg, fludarabine, cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, chlorambucil, bendamustine, chlorambucil, busulfan, gemcitabine, melphalan, pentostatin, mitoxantrone, 5-azacytidine, disodium pemetrexed), a tyrosine kinase inhibitor (eg, EGFR inhibitor (eg, erlotinib), BTK inhibitor (eg, PCI32765), multikinase inhibitor (eg, MGCD265, RGB-286638), CD-20-targeting agent (eg, rituximab, ofatumumab, RO5072759, LFB-R603), agent , targeting CD52 (eg, alemtuzumab), prednisolone, darbepoetin alfa, lenalidomide, Bcl-2 inhibitor (eg, ABT-263), immunotherapy (eg, anti-CD3/anti-CD28 associated with allogeneic CD4+ Th1-like T cells memory/microparticles, autologous cytokinin-induced killer (CIK) cells), HDAC inhibitor (eg, vorinostat, valproic acid, LBH589, JNJ-26481585, AR-42), XIAP inhibitor (eg, AEG35156), CD-74 targeting agent (eg, milatuzumab), mTOR inhibitor (eg, everolimus), AT-101, immunotoxin (eg, CAT-8015, anti-Tac(Ty)-PE38 (LMB-2)), CD37-targeting agent (eg, TRU -016), radioimmunotherapy (eg, 131-tositumomab), hydroxychloroquine, perifosine, SRC inhibitor (eg, dasatinib), thalidomide, PI3K delta inhibitor (eg, CAL-101), retinoid (eg, fenretinide), MDM2 antagonist (eg , RO5045337), plerixafor, Aurora kinase inhibitor (eg, MLN8237, TAK-901), proteasome inhibitor (eg, bortezomib), CD-19-targeting agent (eg, MEDI-551, MOR208), MEK inhibitor (eg, ABT -348), JAK-2 inhibitor (eg, INCB018424), hypoxia-activated prodrug (eg, TH-302), paclitaxel or paclitaxel preparation, HSP90 inhibitor, AKT inhibitor (eg, MK2206), HMG-CoA reductase inhibitor (eg, simvastatin), GNKG186, radiation therapy, bone marrow transplantation, stem cell transplantation and a combination thereof.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулами антител против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения острого лимфолейкоза (ОЛЛ) включают без ограничения химиотерапевтическое средство (например, преднизолон, дексаметазон, винкристин, аспарагиназу, даунорубицин, циклофосфамид, цитарабин, этопозид, тиогуанин, меркаптопурин, клофарабин, липосомальный аннамицин, бусульфан, этопозид, капецитабин, децитабин, азацитидин, топотекан, темозоломид), ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор BCR/ABL (например, иматиниб, нилотиниб), ON 01910.Na, мультикиназный ингибитор (например, сорафениб)), вещество, нацеленное на CD-20 (например, ритуксимаб), вещество, нацеленное на CD52 (например, алемтузумаб), ингибитор HSP90 (например, STA-9090), ингибитор mTPOR (например, эверолимус, рапамицин), ингибитор JAK-2 (например, INCB018424), ингибитор рецептора HER2/Neu (например, трастузумаб), ингибитор протеасом (например, бортезомиб), метотрексат, аспарагиназа, вещество, нацеленное на CD-22 (например, эпратузумаб, инотузомаб), иммунотерапевтическоеExamples of suitable therapeutic agents for use in combination with the anti-PD-1 antibody molecules of the invention, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, with an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of acute lymphocytic leukemia (ALL) include, but are not limited to, a chemotherapeutic agent (e.g., prednisolone, dexamethasone, vincristine, asparaginase, daunorubicin, cyclophosphamide, cytarabine, etoposide, thioguanine, mercaptopurine, clofarabine, liposomal annamycin, busulfan, etoposide, capecitabine, decitabine, azacitidine, topotecan, temozolomide), tyrosine kinase inhibitor (eg, BCR/ABL inhibitor (eg, imatinib, nilotinib), ON 01910.Na, multikinase inhibitor (eg, sorafenib)), CD-20-targeting agent (eg, rituximab), substance CD52-targeting (eg, alemtuzumab), HSP90 inhibitor (eg, STA-9090), mTPOR inhibitor (eg, everolimus, rapamycin), JAK-2 inhibitor (eg, INCB018424), HER2/Neu receptor inhibitor (eg, trastuzumab) , proteasome inhibitor (eg, bortezomib), methotrexate, asparaginase, CD-22-targeting agent (eg, epratuzumab, inotuzomab), immunotherapy
- 67 045940 средство (аутологичные цитокин-индуцированные клетки-киллеры (CIK), AHN-12), блинатумомаб, ингибитор циклин-зависимой киназы (например, UCN-01), вещество, нацеленное на CD45, (например, ВС8), антагонист MDM2 (например, RO5045337), иммунотоксин (например, САТ-8015, DT2219ARL), ингибитор HDAC (например, JNJ-26481585), JVRS-100, паклитаксел или препарат паклитаксела, ингибитор STAT3 (например, ОРВ-31121), ингибитор PARP (например, велипариб), EZN-2285, лучевую терапию, стероид, трансплантацию костного мозга, трансплантацию стволовых клеток или их комбинацию.- 67 045940 agent (autologous cytokine-induced killer (CIK) cells, AHN-12), blinatumomab, cyclin-dependent kinase inhibitor (eg, UCN-01), CD45-targeting agent (eg, BC8), MDM2 antagonist (eg, RO5045337), immunotoxin (eg, CAT-8015, DT2219ARL), HDAC inhibitor (eg, JNJ-26481585), JVRS-100, paclitaxel or paclitaxel preparation, STAT3 inhibitor (eg, ORV-31121), PARP inhibitor (eg , veliparib), EZN-2285, radiation therapy, steroid, bone marrow transplant, stem cell transplant, or a combination thereof.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулами антител против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения острого миелоидного лейкоза (ОМЛ) включают без ограничения химиотерапевтическое средство (например, цитарабин, даунорубицин, идарубицин, клофарабин, децитабин, возароксин, азацитидин, клофарабин, рибавирин, СРХ-351, треосульфан, элацитарабин, азацитидин), ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор BCR/ABL (например, иматиниб, нилотиниб), ON 01910.Na, мультикиназный ингибитор (например, мидостаурин, SU 11248, квизартиниб, сорафиниб)), иммунотоксин (например, гемтузумаб озогамицин), слитый белок DT388IL3, ингибитор HDAC (например, вориностат, LBH589), плериксафор, ингибитор mTOR (например, эверолимус), ингибитор SRC (например, дазатиниб), ингибитор HSP90 (например, STA-9090), ретиноид (например, бексаротен, ингибитор Aurora киназы (например, BI 811283), ингибитор JAK-2 (например, INCB018424), ингибитор Polo-подобной киназы (например, BI6727), ценерсен, вещество, нацеленное на CD45 (например, ВС8), ингибитор циклин-зависимой киназы (например, UCN-01), антагонист MDM2 (например, RO5045337), ингибитор mTOR (например, эверолимус), LY573636-натрий, ZRX-101, MLN4924, леналидомид, иммунотерапевтическое средство (например, AHN-12), гистамина дигидрохлорид, лучевую терапию, трансплантацию костного мозга, трансплантацию стволовых клеток, и их комбинации.Examples of suitable therapeutic agents for use in combination with the anti-PD-1 antibody molecules of the invention, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, with an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of acute myeloid leukemia (AML) include, but are not limited to, a chemotherapy agent (e.g., cytarabine, daunorubicin, idarubicin, clofarabine, decitabine, vosaroxine, azacitidine, clofarabine, ribavirin, CPX-351, treosulfan, elacytarabine, azacitidine), a tyrosine kinase inhibitor (e.g., BCR/ABL inhibitor (eg, imatinib, nilotinib), ON 01910.Na, multikinase inhibitor (eg, midostaurin, SU 11248, quizartinib, sorafinib)), immunotoxin (eg, gemtuzumab ozogamicin), DT388IL3 fusion protein, HDAC inhibitor (eg, vorinostat, LBH589), plerixafor, mTOR inhibitor (eg, everolimus), SRC inhibitor (eg, dasatinib), HSP90 inhibitor (eg, STA-9090), retinoid (eg, bexarotene, Aurora kinase inhibitor (eg, BI 811283), JAK-2 (eg, INCB018424), Polo-like kinase inhibitor (eg, BI6727), cenersen, CD45-targeting agent (eg, BC8), cyclin-dependent kinase inhibitor (eg, UCN-01), MDM2 antagonist (eg , RO5045337), mTOR inhibitor (eg, everolimus), LY573636-sodium, ZRX-101, MLN4924, lenalidomide, immunotherapy (eg, AHN-12), histamine dihydrochloride, radiation therapy, bone marrow transplantation, stem cell transplantation, and their combinations.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулами антител против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения множественной миеломы (ММ) включают без ограничения химиотерапевтическое средство (например, мелфалан, амифостин, циклофосфамид, доксорубицин, клофарабин, бендамустин, флударабин, адриамицин, SyB L-0501), талидомид, леналидомид, дексаметазон, преднизолон, помалидомид, ингибитор протеасом (например, бортезомиб, карфлизомиб, MLN9708), противоопухолевую вакцину (например, GVAX), вещество, нацеленное на CD-40 (например, SGN-40, CHIR-12.12), перифозин, золедроновую кислоту, иммунотерапевтическое средство (например, MAGE-АЗ, NY-ESO-1, HuMax-CD38), ингибитор HDAC (например, вориностат, LBH589,-42 AR), аплидин, ингибитор циклин-зависимой киназы (например, PD-0332991, динациклиб), триоксид мышьяка, СВ3304, ингибитор HSP90 (например, KW2478), ингибитор тирозинкиназы (например, ингибитор EGFR (например, цетуксимаб), мультикиназный ингибитор (например, АТ9283)), ингибитор VEGF (например, бевацизумаб), плериксафор, ингибитор МЕК (например, AZD6244), IPH2101, аторвастатин, иммунотоксин (например, ВВ-10901), NPI-0052, радиоиммунотерапевтическое средство (например, иттрий Y90 ибритумомаб тиуксетан), ингибитор STAT3 (например, ОРВ-31121), MLN4924, ингибитор киназы Aurora (например, ENMD-2076), IMGN901, АСЕ041, ингибитор CK-2 (например, СХ-4945), лучевую терапию, трансплантацию костного мозга, трансплантацию стволовых клеток и их комбинации.Examples of suitable therapeutic agents for use in combination with the anti-PD-1 antibody molecules of the invention, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, with an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of multiple myeloma (MM) include, but are not limited to, a chemotherapy agent (eg, melphalan, amifostine, cyclophosphamide, doxorubicin, clofarabine, bendamustine, fludarabine, adriamycin, SyB L-0501), thalidomide, lenalidomide, dexamethasone, prednisolone, pomalidomide, proteasome inhibitor ( e.g., bortezomib, carflizomib, MLN9708), tumor vaccine (e.g., GVAX), CD-40-targeting agent (e.g., SGN-40, CHIR-12.12), perifosine, zoledronic acid, immunotherapy (e.g., MAGE-AZ, NY-ESO-1, HuMax-CD38), HDAC inhibitor (eg, vorinostat, LBH589,-42 AR), aplidine, cyclin-dependent kinase inhibitor (eg, PD-0332991, dinaciclib), arsenic trioxide, CB3304, HSP90 inhibitor ( e.g., KW2478), tyrosine kinase inhibitor (e.g., EGFR inhibitor (e.g., cetuximab), multikinase inhibitor (e.g., AT9283)), VEGF inhibitor (e.g., bevacizumab), plerixafor, MEK inhibitor (e.g., AZD6244), IPH2101, atorvastatin, immunotoxin (eg, BB-10901), NPI-0052, radioimmunotherapy (eg, yttrium Y90 ibritumomab tiuxetan), STAT3 inhibitor (eg, ORV-31121), MLN4924, Aurora kinase inhibitor (eg, ENMD-2076), IMGN901, ACE041, CK-2 inhibitor (eg, CX-4945), radiation therapy, bone marrow transplant, stem cell transplant, and combinations thereof.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения рака предстательной железы включают без ограничения химиотерапевтическое средство (например, доцетаксел, карбоплатин, флударабин), абиратерон, гормональнон средство (например, флутамид, бикалутамид, нилютамид, ципротерона ацетат, кетоконазол, аминоглютетимид, абареликс, дегареликс, лейпролид, гозерелин, трипторелин, бусерелин), ингибитор тирозинкиназы (например, двойной ингибитор киназы (например, лапатаниб), мультикиназный ингибитор (например, сорафениб, сунитиниб)), ингибитор VEGF (например, бевацизумаб), TAK-700, противоопухолевую вакцину (например, ВРХ-101, РЕР223), леналидомид, TOK-001, ингибитор рецептора IGF-1 (например, циксутумумаб), TRC105, ингибитор Aurora киназы (например, MLN8237), ингибитор протеасом (например, бортезомиб), OGX-011, радиоиммунотерапевтическое средство (например, HuJ591-GS), ингибитор HDAC (например, вальпроевую кислоту, SB939, LBH589), гидроксихлорохин, ингибитор mTOR (например, эверолимус), довитиниб лактат, дииндолметан, эфавиренц, OGX-427, генистеин, IMC-3G3, бафетиниб, СР-675206, лучевую терапию, хирургическое вмешательство или их комбинацию.Examples of suitable therapeutic agents for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of prostate cancer include, but are not limited to, a chemotherapy agent (e.g., docetaxel, carboplatin, fludarabine), abiraterone, a hormonal agent (e.g., flutamide, bicalutamide, nilutamide, cyproterone acetate, ketoconazole, aminoglutethimide, abarelix, degarelix, leuprolide, goserelin, triptorelin, buserelin) , tyrosine kinase inhibitor (eg, dual kinase inhibitor (eg, lapatanib), multikinase inhibitor (eg, sorafenib, sunitinib)), VEGF inhibitor (eg, bevacizumab), TAK-700, tumor vaccine (eg, BPX-101, PEP223), Lenalidomide, TOK-001, IGF-1 receptor inhibitor (eg, cixutumumab), TRC105, Aurora kinase inhibitor (eg, MLN8237), proteasome inhibitor (eg, bortezomib), OGX-011, radioimmunotherapy (eg, HuJ591-GS), HDAC inhibitor (eg, valproic acid, SB939, LBH589), hydroxychloroquine, mTOR inhibitor (eg, everolimus), dovitinib lactate, diindolemethane, efavirenz, OGX-427, genistein, IMC-3G3, bafetinib, CP-675206, radiation therapy, surgery intervention or a combination thereof.
Примеры подходящих терапевтических средств для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения HNSCC включает без ограничения одно или оба из соединения А8 по изобретению (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2010/029082) и цетуксимаб (например, Эрбитукс, зарегистрированный компанией BMS). В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство (например, соExamples of suitable therapeutic agents for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of HNSCC includes, without limitation, one or both of compound A8 of the invention (or the compound described in published PCT application No. WO 2010/029082) and cetuximab (eg, Erbitux, registered by BMS). In some embodiments, the therapeutic agent (eg, with
- 68 045940 единение А8 или соединение, родственное А8) представляет собой модулятор PI3K, например, ингибитор PI3K. В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство (например, цетуксимаб) модулирует, например, ингибирует, рецептор эпидермального фактора роста. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность PI3K или EGFR по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением.- 68 045940 compound A8 or a compound related to A8) is a PI3K modulator, for example a PI3K inhibitor. In some embodiments, the therapeutic agent (eg, cetuximab) modulates, eg, inhibits, the epidermal growth factor receptor. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, increased levels or activity of PI3K or EGFR compared to a control cell or reference value.
Пример подходящего терапевтического средства для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения рака желудка, например, рака с высокой MSI и/или EBV+ рака желудка, включает без ограничения соединение А8 по изобретению (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2010/029082). В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство (например, соединение А8 или соединение, родственное А8) представляет собой модулятор PI3K, например, ингибитор PI3K. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность PI3K по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением.An example of a suitable therapeutic agent for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of gastric cancer, for example, high MSI cancer and/or EBV+ gastric cancer, includes, without limitation, the compound A8 of the invention (or the compound described in PCT published application WO 2010/029082). In some embodiments, the therapeutic agent (eg, compound A8 or A8-related compound) is a PI3K modulator, such as a PI3K inhibitor. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, an increased level or activity of PI3K compared to a control cell or reference value.
Пример подходящего терапевтического средства для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения рака желудка, например, рака желудка с высокой MSI и/или рака желудка инактивированным RNF4 3, включает без ограничения соединение А28 по изобретению (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2010/101849). В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство (например, соединение А28 или соединение, родственное А28) представляет собой модулятор, например, ингибитор porcupine. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность porcupine по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением.An example of a suitable therapeutic agent for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of gastric cancer, for example, high MSI gastric cancer and/or inactivated RNF4 3 gastric cancer, includes, without limitation, the compound A28 of the invention (or the compound described in PCT published application WO 2010/101849). In some embodiments, the therapeutic agent (eg, compound A28 or A28-related compound) is a modulator, such as a porcupine inhibitor. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, an increased level or activity of porcupine compared to a control cell or reference value.
Пример подходящего терапевтического средства для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения стромальных опухолей желудочно-кишечного тракта (GIST) включает без ограничения соединение А16, описанное в изобретении (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 1999/003854). В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство (например, соединение А16 или соединение, родственное А16) представляет собой модулятор, например, ингибитор тирозинкиназы. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность тирозинкиназы по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением.An example of a suitable therapeutic agent for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of gastrointestinal stromal tumors (GIST) includes, without limitation, compound A16 described in the invention (or the compound described in published PCT application WO 1999/003854). In some embodiments, the therapeutic agent (eg, compound A16 or A16-related compound) is a modulator, such as a tyrosine kinase inhibitor. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, an increased level or activity of the tyrosine kinase compared to a control cell or reference value.
Пример подходящего терапевтического средства для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения немелкоклеточного рака легкого, например, плоскоклеточного рака или аденокарциномы, включает без ограничения одно или оба из соединения А17 по изобретению (или соединение, описанное в патентах США №№ 7767675 и 8420645) и соединения А23 по изобретению (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2003/077914). В некоторых вариантах осуществления соединение (например, соединение А17 или соединение, родственное А17) модулирует, например, ингибирует, с-МЕТ. В некоторых вариантах осуществления соединение (например, соединение А23 или соединение, родственное А23) модулирует, например, ингибирует, Alk. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность одного из с-МЕТ или Alk или обоих сМЕТ и Alk по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется мутация в EGFR.An example of a suitable therapeutic agent for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of non-small cell lung cancer, such as squamous cell carcinoma or adenocarcinoma, includes, without limitation, one or both of Compound A17 of the invention (or the compound disclosed in U.S. Patent Nos. 7,767,675 and 8,420,645) and Compound A23 of the invention (or the compound disclosed in published PCT application WO 2003/077914). In some embodiments, a compound (eg, compound A17 or a compound related to A17) modulates, eg, inhibits, c-MET. In some embodiments, the compound (eg, compound A23 or a compound related to A23) modulates, eg inhibits, Alk. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, an increased level or activity of one of c-MET or Alk, or both cMET and Alk, compared to a control cell or reference value. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, a mutation in EGFR.
Пример подходящего терапевтического средства для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения меланомы (например, меланомы с мутацией NRAS) включает без ограничения одно или оба из соединения А24, описанного в изобретении (или соединение, описанное в патентах США №№ 8415355 и 8685980) и соединения А34, описанного в изобретении (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2003/077914). В некоторых вариантах осуществления соединение (например, соединение А24 или соединение, родственное А24) модулирует, например, ингибирует, одно из JAK и CDK4/6 или оба из JAK и CDK4/6. В некоторых вариантах осуществления соединение (например, соединение А34 или соединение, родственное A34) модулирует, например, ингибирует, MEK. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность одного или более одного из JAK, CDK4/6 и MEK по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением.An example of a suitable therapeutic agent for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of melanomas (e.g., NRAS mutation melanomas) includes, without limitation, one or both of Compound A24 described in the invention (or the compound described in US Pat. Nos. 8,415,355 and 8,685,980) and Compound A34 described in the invention (or the compound described in published PCT application WO 2003/077914). In some embodiments, a compound (eg, compound A24 or a compound related to A24) modulates, eg, inhibits, one or both of JAK and CDK4/6. In some embodiments, the compound (eg, compound A34 or A34-related compound) modulates, eg, inhibits, MEK. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, an increased level or activity of one or more of JAK, CDK4/6, and MEK compared to a control cell or reference value.
Пример подходящего терапевтического средства для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения меланомы (например, меланомы с мутацией NRAS) включает без ограничения одно или оба из соединения А29,An example of a suitable therapeutic agent for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of melanomas (eg, NRAS mutation melanomas) includes, without limitation, one or both of compound A29,
- 69 045940 описанного в изобретении (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2011/025927) и соединения А34, описанного в изобретении (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2003/077914). В некоторых вариантах осуществления соединение (например, соединение А29 или соединение, родственное А29) модулирует, например, ингибирует, BRAF. В некоторых вариантах осуществления соединение (например, соединение A34 или соединение, родственное A34) модулирует, например, ингибирует, MEK. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность одного из BRAF и MEK или обоих из BRAF и МЕК по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением.- 69 045940 described in the invention (or the compound described in the published PCT application WO 2011/025927) and compound A34 described in the invention (or the compound described in the published PCT application WO 2003/077914). In some embodiments, the compound (eg, compound A29 or a compound related to A29) modulates, eg inhibits, BRAF. In some embodiments, a compound (eg, compound A34 or an A34-related compound) modulates, eg, inhibits, MEK. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, an increased level or activity of one of BRAF and MEK, or both of BRAF and MEK, compared to a control cell or reference value.
Пример подходящего терапевтического средства для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения плоскоклеточного NSCLC включает без ограничения соединение А5, описанное в изобретении (или соединение, описанное в патенте США 8552002). В некоторых вариантах осуществления соединение (например, соединение А5 или соединение, подственное А5) модулирует, например, ингибирует, FGFR. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность FGFR по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением.An example of a suitable therapeutic agent for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of squamous cell NSCLC includes, without limitation, compound A5 described in the invention (or the compound described in US patent 8552002). In some embodiments, a compound (eg, compound A5 or a compound related to A5) modulates, eg inhibits, FGFR. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, an increased level or activity of FGFR compared to a control cell or reference value.
Пример подходящего терапевтического средства для применения в комбинации с молекулой антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3), для лечения колоректального рака включает без ограничения одно или оба из соединения А29, описанного в изобретении (или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2011/025927) и цетуксимаб (например, Эрбитукс, зарегистрированный компанией BMS). В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство (например, соединение А29 или соединение, родственное А29) модулирует, например, ингибирует, BRAF. В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство (например, цетуксимаб) модулирует, например, ингибирует EGFR. В некоторых вариантах осуществления при раке имеется, или определено, что имеется повышенный уровень или активность BRAF или EGFR по сравнению с контрольной клеткой или эталонным значением.An example of a suitable therapeutic agent for use in combination with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (eg, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule), for the treatment of colorectal cancer includes, without limitation, one or both of compound A29 described in the invention (or the compound described in published PCT application No. WO 2011/025927) and cetuximab (for example, Erbitux, registered by BMS). In some embodiments, the therapeutic agent (eg, compound A29 or A29-related compound) modulates, eg inhibits, BRAF. In some embodiments, the therapeutic agent (eg, cetuximab) modulates, for example inhibits, EGFR. In some embodiments, the cancer has, or is determined to have, elevated levels or activity of BRAF or EGFR compared to a control cell or reference value.
Настоящее изобретение также относится к способам лечения рака соединением А8, цетуксимабомм и молекулой антитела против PD-1 (необязательно в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 или молекулой антитела против LAG-3). В некоторых вариантах осуществления пациент сначала получает лечение соединением А8 и цетуксимабом. Такое лечение продолжается в течение периода времени, например, заранее определенного периода времени, например, приблизительно 1, 2, 4, 6, 8, 10 или 12 месяцев. Затем вводят молекулу антитела против PD-1 (необязательно в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 или молекулой антитела против LAG-3). Антитело против PD-1 можно необязательно вводить в комбинации с цетуксимабом.The present invention also provides methods for treating cancer with Compound A8, cetuximabom, and an anti-PD-1 antibody molecule (optionally in combination with an anti-TIM-3 antibody molecule or an anti-LAG-3 antibody molecule). In some embodiments, the patient first receives treatment with Compound A8 and cetuximab. Such treatment is continued for a period of time, such as a predetermined period of time, such as approximately 1, 2, 4, 6, 8, 10 or 12 months. An anti-PD-1 antibody molecule is then administered (optionally in combination with an anti-TIM-3 antibody molecule or an anti-LAG-3 antibody molecule). The anti-PD-1 antibody may optionally be administered in combination with cetuximab.
В некоторых вариантах осуществления для лечения пациента сначала применяют все три средства: соединение А8, цетуксимаб и молекулу антитела против PD-1 (необязательно в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 или молекулой антитела против LAG-3). Такое лечение продолжается в течение периода времени, например, заранее определенного периода времени, например, приблизительно 6, 8, 10 или 12 месяцев. Затем дозы соединения А8 и/или цетуксимаба можно сокращать, таким образом, что поддерживающая фаза включает лечение молекулой антитела против PD-1 (например, в виде монотерапии или в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 или молекулой антитела против LAG-3), но не с соединением А8 или цетуксимабом.In some embodiments, all three of Compound A8, cetuximab, and an anti-PD-1 antibody molecule (optionally in combination with an anti-TIM-3 antibody molecule or an anti-LAG-3 antibody molecule) are first used to treat a patient. Such treatment is continued for a period of time, for example a predetermined period of time, for example approximately 6, 8, 10 or 12 months. The doses of Compound A8 and/or cetuximab can then be reduced such that the maintenance phase includes treatment with an anti-PD-1 antibody molecule (eg, as monotherapy or in combination with an anti-TIM-3 antibody molecule or an anti-LAG-3 antibody molecule), but not with compound A8 or cetuximab.
В других вариантах осуществления три соединения (соединение А8, цетуксимаб и молекула антитела против PD-1, необязательно в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 или молекулой антитела против LAG-3) вводятся последовательно в начале лечения. Например, соединение А8 и цетуксимаб можно применять в первую очередь, как описано выше. Затем к схеме лечения добавляют молекулу антитела против PD-1 (необязательно в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 или молекулой антитела против LAG-3). После этого дозы соединения А8 и/или цетуксимаба можно сокращать, как описано выше.In other embodiments, three compounds (compound A8, cetuximab, and an anti-PD-1 antibody molecule, optionally in combination with an anti-TIM-3 antibody molecule or an anti-LAG-3 antibody molecule) are administered sequentially at the start of treatment. For example, compound A8 and cetuximab can be used first as described above. An anti-PD-1 antibody molecule (optionally in combination with an anti-TIM-3 antibody molecule or an anti-LAG-3 antibody molecule) is then added to the treatment regimen. Thereafter, the doses of Compound A8 and/or cetuximab can be reduced as described above.
Примерные дозы для схем введения трех (или более трех) веществ выглядят следующим образом. Молекулу антитела против PD-1 можно вводить, например, в дозе приблизительно от 1 до 40 мг/кг, например, от 1 до 30 мг/кг, например, приблизительно от 5 до 25 мг/кг, приблизительно от 10 до 20 мг/кг, приблизительно от 1 до 5 мг/кг или приблизительно 3 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления соединение А8 вводят в дозе приблизительно от 200 до 300, от 300 до 400 или от 200 до 400 мг. В некоторых вариантах осуществления цетуксимаб вводят в начальной дозе 400 мг/м2 посредством 120-минутной внутривенной инфузии, затем в дозе 250 мг/м2 в виде еженедельной инфузии в течение 60 мин. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько веществ, таких как соединение А8, цетуксимаб и молекула антитела против PD-1, вводят в дозе, которая ниже, чем доза, при которой это вещество обычно вводят в виде монотерапии, например, приблизительно на 0-10%, 10-20%, 20-30%, 30-40%, 40-50%, 5060%, 60-70%, 70-80% или на 80-90% ниже, чем доза, при которой это вещество обычно вводят в виде монотерапии. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько веществ, таких как соединениеApproximate doses for administration regimens of three (or more than three) substances are as follows. The anti-PD-1 antibody molecule can be administered, for example, at a dose of about 1 to 40 mg/kg, for example, from 1 to 30 mg/kg, for example, about 5 to 25 mg/kg, about 10 to 20 mg/kg kg, about 1 to 5 mg/kg or about 3 mg/kg. In some embodiments, Compound A8 is administered at a dose of about 200 to 300, 300 to 400, or 200 to 400 mg. In some embodiments, cetuximab is administered at an initial dose of 400 mg/m 2 via a 120-minute intravenous infusion, followed by a dose of 250 mg/m 2 as a weekly infusion over 60 minutes. In some embodiments, one or more substances, such as Compound A8, cetuximab, and an anti-PD-1 antibody molecule, is administered at a dose that is lower than the dose at which the substance is typically administered as monotherapy, for example, about 0-10 %, 10-20%, 20-30%, 30-40%, 40-50%, 5060%, 60-70%, 70-80% or 80-90% lower than the dose at which the substance would normally be taken administered as monotherapy. In some embodiments, one or more substances, such as a compound
- 70 045940- 70 045940
А8, цетуксимаб и молекула антитела против PD-1, вводят в дозе, которая ниже, чем доза этого вещества, указанная в этом абзаце, например, приблизительно на 0-10%, 10-20%, 20-30%, 30-40%, 40-50%, 50-60%, 60-70%, 70-80% или на 80-90% ниже, чем доза этого вещества, указанная в этом абзаце. В некоторых вариантах осуществления концентрация соединения А8, которая требуется для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, является более низкой при введении соединения А8 в комбинации с одним или обоими веществами, а именно, с цетуксимабом и молекулой антитела против PD-1, чем при введении соединения А8 в качестве единственного средства. В некоторых вариантах осуществления концентрация цетуксимаба, которая требуется для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, является более низкой при введении цетуксимаба в комбинации с одним или обоими веществами, а именно, с соединением А8 и молекулой антитела против PD-1, чем при введении цетуксимаба в качестве единственного средства. В некоторых вариантах осуществления концентрация молекулы антитела против PD-1, которая требуется для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, является более низкой при введении молекулы антитела против PD-1 в комбинации с одним или обоими веществами, а именно, с цетуксимабом и соединением А8, чем при введении молекулы антитела против PD-1 в качестве единственного средства.A8, cetuximab and an anti-PD-1 antibody molecule, is administered at a dose that is lower than the dose of that substance specified in this paragraph, for example, approximately 0-10%, 10-20%, 20-30%, 30-40 %, 40-50%, 50-60%, 60-70%, 70-80%, or 80-90% lower than the dose of that substance specified in this paragraph. In some embodiments, the concentration of Compound A8 that is required to achieve inhibition, e.g., growth inhibition, is lower when Compound A8 is administered in combination with one or both of cetuximab and an anti-PD-1 antibody molecule than when administered compounds A8 as the only remedy. In some embodiments, the concentration of cetuximab that is required to achieve inhibition, e.g., growth inhibition, is lower when cetuximab is administered in combination with one or both of compound A8 and an anti-PD-1 antibody molecule than when cetuximab is administered as the only remedy. In some embodiments, the concentration of the anti-PD-1 antibody molecule that is required to achieve inhibition, e.g., growth inhibition, is lower when the anti-PD-1 antibody molecule is administered in combination with one or both of cetuximab and Compound A8 than when administering an anti-PD-1 antibody molecule as a single agent.
Дополнительно, изобретение относится к способу лечения рака с помощью молекулы антитела против PD-1, в качестве единственного средства или в комбинации с другим иммуномодулятором (например, с молекулой антитела против LAG-3, против PD-L1 или против TIM-3) и противоопухолевым средством направленного действия, например, средством, которое нацелено на один или несколько белков. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 (и, необязательно, другой иммуномодулятор (иммуномодуляторы)) вводят в первую очередь, и противоопухолевое средство направленного действия вводят во вторую очередь. Продолжительность времени между введением молекулы антитела против PD-1 и противоопухолевого средства направленного действия может составлять, например, 10, 20 или 30 мин, 1, 2, 4, 6 или 12 часов, или 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7 дней, или любой промежуток времени, в пределах указанного диапазона. В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 вводят повторно в течение определенного периода времени (например, 1, 2, 3, 4, 5 или 6 дней, или 1, 2, 4, 8, 12, 16 или 20 недель, или в течение любого промежутка времени в пределах этого диапазона) перед введением противоопухолевого средства направленного действия. В других вариантах осуществления молекулу антитела против PD-1 и противоопухолевое средство направленного действия вводят по существу одновременно.Additionally, the invention relates to a method of treating cancer with an anti-PD-1 antibody molecule, either alone or in combination with another immunomodulator (for example, an anti-LAG-3, anti-PD-L1, or anti-TIM-3 antibody molecule) and an antitumor a targeted agent, for example, an agent that targets one or more proteins. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule (and optionally other immunomodulator(s)) is administered first and the targeted antitumor agent is administered second. The length of time between administration of the anti-PD-1 antibody molecule and the targeted antitumor agent may be, for example, 10, 20, or 30 minutes, 1, 2, 4, 6, or 12 hours, or 1, 2, 3, 4, 5, 6 or 7 days, or any period of time within the specified range. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule is administered repeatedly over a period of time (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, or 6 days, or 1, 2, 4, 8, 12, 16, or 20 weeks, or for any period of time within this range) before administration of a targeted antitumor agent. In other embodiments, the anti-PD-1 antibody molecule and the targeted antitumor agent are administered substantially simultaneously.
Инфекционные заболевания.Infectious diseases.
Другие способы настоящего изобретения используются для лечения пациентов, которые подверглись воздействию определенных токсинов или патогенов. Соответственно, еще один аспект настоящего изобретения относится к способу лечения инфекционного заболевания у субъекта, и указанный способ содержит введение субъекту молекулы антитела против PD-1, и таким образом осуществляют лечение субъекта от инфекционного заболевания.Other methods of the present invention are used to treat patients who have been exposed to certain toxins or pathogens. Accordingly, another aspect of the present invention relates to a method of treating an infectious disease in a subject, the method comprising administering to the subject an anti-PD-1 antibody molecule, thereby treating the subject for the infectious disease.
При лечении инфекции (например, острой и/или хронической) введение молекул антител против PD-1 можно комбинировать с общепринятыми видами лечения в дополнение или вместо стимуляции естественной иммунной защиты организма-хозяина от инфекции. Естественные механизмы иммунной защиты организма-хозяина от инфекции включают без ограничения воспаление, лихорадку, антителоопосредуемую защиту организма-хозяина, Т-лимфоцит-опосредуемые механизмы защиты организма, включающие секрецию лимфокинов и цитотоксических Т-клеток (особенно во время вирусной инфекции), комплемент-опосредуемый лизис и опсонизацию (облегчение фагоцитоза), и фагоцитоз. Способность молекул антитела против PD-1 к реактивации дисфункциональных Т-клетки будет полезной для лечения хронических инфекций, в частности, при которых для полного выздоровления важен клеточный иммунитет.When treating an infection (eg, acute and/or chronic), the administration of anti-PD-1 antibody molecules can be combined with conventional treatments in addition to or instead of stimulating the host's natural immune defense against infection. Natural host immune defense mechanisms against infection include, but are not limited to, inflammation, fever, antibody-mediated host defense, T-lymphocyte-mediated host defense mechanisms including the secretion of lymphokines and cytotoxic T cells (especially during viral infection), complement-mediated lysis and opsonization (facilitation of phagocytosis), and phagocytosis. The ability of anti-PD-1 antibody molecules to reactivate dysfunctional T cells will be useful for the treatment of chronic infections, particularly in which cellular immunity is important for full recovery.
Антитело-опосредуемая блокада PD-1, подобно ее применению при опухолях, как описано выше, может применяться в качестве единственного средства или в качестве вспомогательного средства, в комбинации с вакцинами, в целях стимуляции иммунного ответа на патогены, токсины и аутоантигены. Примеры патогенов, для которых этот терапевтический подход может быть особенно полезным, включают патогены, для которых в настоящее время не существует эффективной вакцины, или патогены, для которых обычные вакцины не в полной мере эффективны. Такие патогены включают без ограничения ВИЧ, вирусы гепатита (А, В и С), вирусы гриппа и герпеса, лямблии, возбудители малярии, лейшмании, Staphylococcus aureus, Pseudomonas Aeruginosa. Блокада PD-1 особенно полезна против инфекций с такими возбудителями, как ВИЧ, которые представляют измененные антигены на протяжении инфекционной болезни. Эти новые эпитопы распознаются как чужеродные в момент введения антитела против человеческого PD-1, вызывая тем самым мощный Т-клеточный ответ, который не подавляются отрицательными сигналами посредством PD-1.Antibody-mediated blockade of PD-1, similar to its use in tumors as described above, can be used as a single agent or as an adjuvant, in combination with vaccines, to stimulate an immune response to pathogens, toxins and autoantigens. Examples of pathogens for which this therapeutic approach may be particularly useful include pathogens for which no effective vaccine currently exists or pathogens for which conventional vaccines are not fully effective. Such pathogens include, but are not limited to, HIV, hepatitis viruses (A, B and C), influenza and herpes viruses, Giardia, malaria, leishmania, Staphylococcus aureus, Pseudomonas Aeruginosa. PD-1 blockade is particularly useful against infections with pathogens such as HIV that present altered antigens throughout the course of the infectious disease. These new epitopes are recognized as foreign when the anti-human PD-1 antibody is administered, thereby inducing a potent T cell response that is not suppressed by negative signals through PD-1.
Вирусы.Viruses.
Для инфекций, обусловленных вирусными возбудителями, молекулы антитела против PD-1 можно комбинировать путем их применения одновременно, перед или после применения стандартных терапевтических средств для лечения вирусных инфекций. Такие стандартные терапевтические средства варьиFor infections caused by viral pathogens, anti-PD-1 antibody molecules can be combined by using them simultaneously, before or after standard therapeutic agents for the treatment of viral infections. Such standard therapeutic agents vary
- 71 045940 руются в зависимости от типа вируса, хотя почти во всех случаях может быть эффективным введение человеческой сыворотки, содержащей антитела (например, IgA, IgG), специфичные к вирусу.- 71 045940 vary depending on the type of virus, although in almost all cases the administration of human serum containing antibodies (eg IgA, IgG) specific to the virus can be effective.
Некоторые примеры патогенных вирусов, вызывающих инфекции и поддающихся лечению упомянутыми способами, включают ВИЧ, вирус гепатита (А, В или С), вирус герпеса (например, VZV, HSV-1, HAV-6, HSV-II и CMV, вирус Эпштейна-Барра), аденовирус, вирус гриппа, флавивирусы, ЕСНО-вирус, риновирус, вирус Коксаки, коронавирус, респираторно-синцитиальный вирус, вирус эпидемического паротита, ротавирус, вирус кори, вирус краснухи, парвовирус, вирус коровьей оспы, вирус HTLV, вирус денге, вирус папилломы, вирус моллюска, вирус полиомиелита, вирус бешенства, вирус JC и вирус арбовирусного энцефалита.Some examples of pathogenic viruses that cause infections and can be treated by the methods mentioned include HIV, hepatitis virus (A, B or C), herpes virus (for example, VZV, HSV-1, HAV-6, HSV-II and CMV, Epstein virus- Barr), adenovirus, influenza virus, flaviviruses, ECHO virus, rhinovirus, Coxsackie virus, coronavirus, respiratory syncytial virus, mumps virus, rotavirus, measles virus, rubella virus, parvovirus, vaccinia virus, HTLV virus, dengue virus, papilloma virus, molluscan virus, polio virus, rabies virus, JC virus and arboviral encephalitis virus.
В одном варианте осуществления инфекция представляет собой гриппозную инфекцию. Гриппозная инфекция может вызывать лихорадку, кашель, миалгию, головную боль и общее недомогание, которые часто встречаются при сезонных эпидемиях. Грипп также связан с целым рядом постинфекционных заболеваний, таких как энцефалит, миоперикардит, синдром Гудпасчера и синдром Рейе. Гриппозная инфекция также подавляет нормальные механизмы легочной антибактериальной защиты, то есть, выздоравливающий от гриппа пациент имеет повышенный риск развития бактериальной пневмонии. Поверхностные белки вируса гриппа проявляют выраженную антигенную изменчивость, обусловленную мутацией и рекомбинацией. Таким образом, цитолитические Т-лимфоциты являются основным средством организма-хозяина для устранения вируса после инфицирования. Выделяют три основных типа гриппа: А, В и С. Уникальность вируса гриппа А состоит в том, что он заражает как людей, так и многих других животных (например, свиней, лошадей, птиц и тюленей) и является основной причиной пандемии гриппа. Также, при инфицировании клетки двумя различными штаммами вируса гриппа типа А, сегментированные геномы РНК двух родительских типов вируса смешиваются в ходе репликации для создания гибридного репликанта, что приводит к появлению новых эпидемических штаммов. Вирус гриппа В не реплицируется у животных и, следовательно, имеет менее выраженную генетическую изменчивость, и вирус гриппа С имеет только один серотип.In one embodiment, the infection is an influenza infection. Influenza infection can cause fever, cough, myalgia, headache and general malaise, which are often found in seasonal epidemics. Influenza is also associated with a number of post-infectious diseases, such as encephalitis, myopericarditis, Goodpasture's syndrome and Reye's syndrome. Influenza infection also suppresses normal pulmonary antibacterial defense mechanisms, meaning that a patient recovering from influenza has an increased risk of developing bacterial pneumonia. The surface proteins of the influenza virus exhibit pronounced antigenic variability due to mutation and recombination. Thus, cytolytic T lymphocytes are the host's primary means of eliminating the virus after infection. There are three main types of influenza: A, B, and C. What makes the influenza A virus unique is that it infects both humans and many other animals (such as pigs, horses, birds, and seals) and is the leading cause of influenza pandemics. Also, when a cell is infected with two different strains of influenza A virus, the segmented RNA genomes of the two parental virus types are mixed during replication to create a hybrid replicant, resulting in the emergence of new epidemic strains. Influenza B virus does not replicate in animals and therefore has less genetic variability, and influenza C virus has only one serotype.
Большинство общепринятых видов лечения являются паллиативными, направленными на обусловленные инфекцией симптомы, при этом фактически болезнь устраняется с помощью иммунной реакции организма-хозяина. Тем не менее, некоторые штаммы (например, вируса гриппа А) могут вызывать более тяжелое заболевание и смерть. Терапевтическое и профилактическое лечение гриппа А можно осуществлять путем введения ингибиторов циклических аминов (амантадин и ремантадин), которые ингибируют репликацию вируса. Однако клиническая применимость указанных препаратов ограничена из-за относительно высокой частоты побочных реакций, узкого противовирусного спектра (исключительно вирус гриппа А), и склонности вируса к приобретению резистентности. Применение сывороточного IgG антитела против большинства гриппозных поверхностных белков, гемагглютинина и нейраминидазы может предотвращать легочную инфекцию, тогда как IgA, характерный для слизистых оболочек, необходим для профилактики инфицирования верхних дыхательных путей и трахеи. Наиболее эффективным современным лечением гриппа является вакцинация с введением вируса, инактивированного формалином или β-пропиолактоном.Most conventional treatments are palliative, targeting symptoms due to the infection, with the disease actually being eliminated by the host's immune response. However, some strains (such as influenza A virus) can cause more severe illness and death. Therapeutic and prophylactic treatment of influenza A can be carried out by administering cyclic amine inhibitors (amantadine and rimantadine), which inhibit viral replication. However, the clinical applicability of these drugs is limited due to the relatively high frequency of adverse reactions, narrow antiviral spectrum (exclusively influenza A virus), and the tendency of the virus to acquire resistance. The use of serum IgG antibodies against most influenza surface proteins, hemagglutinin and neuraminidase can prevent pulmonary infection, while mucosal IgA is necessary to prevent infection of the upper respiratory tract and trachea. The most effective modern treatment for influenza is vaccination with the introduction of a virus inactivated by formaldehyde or β-propiolactone.
В другом варианте осуществления инфекция представляет собой инфекционный гепатит, например, инфекционный гепатит В или С.In another embodiment, the infection is infectious hepatitis, such as infectious hepatitis B or C.
Вирус гепатита В (HB-V), является наиболее известным инфекционным патогеном, переносимым кровью. Этот вирус является основной причиной острого и хронического гепатита и карциномы печени, а также пожизненной хронической инфекции. После заражения вирус реплицируется в гепатоцитах, которые, в свою очередь, выделяют поверхностный антиген HBsAg. Обнаружение повышенного уровня HBsAg в сыворотке крови используется в качестве стандартного способа диагностики инфекционного гепатита. Острая инфекция может разрешиться или может развиться в хроническую персистирующую инфекцию. Современные способы лечения хронического гепатита включают α-интерферон, который повышает экспрессию человеческого лейкоцитарного антигена класса I (HLA) на поверхности гепатоцитов, способствуя тем самым их распознаванию цитотоксическими Т-лимфоцитами. Дополнительно, аналоги нуклеозидов ганцикловир, фамцикловир и ламивудин также проявляют некоторую эффективность при лечении HBV-инфекции в клинических испытаниях. Дополнительные способы лечения HBVинфкции включают пегилированный α-интерферон, аденфовир, энтекавир и телбивудин. Пассивный иммунитет может создаваться путем парентерального введения сывороточных антител против HBsAg, но вместе с тем, устойчивость к инфекции также создается путем вакцинации инактивированным или рекомбинантным HBsAg. Для достижения терапевтической преимущества молекулы антитела против PD-1 можно комбинировать с общепринятыми способами лечения инфекционного гепатита В.Hepatitis B virus (HB-V) is the most well-known infectious blood-borne pathogen. This virus is the leading cause of acute and chronic hepatitis and liver carcinoma, as well as lifelong chronic infection. After infection, the virus replicates in hepatocytes, which in turn secrete the surface antigen HBsAg. Detection of elevated serum HBsAg levels is used as a standard method for diagnosing infectious hepatitis. The acute infection may resolve or may develop into a chronic persistent infection. Current treatments for chronic hepatitis include α-interferon, which increases the expression of human leukocyte antigen class I (HLA) on the surface of hepatocytes, thereby promoting their recognition by cytotoxic T lymphocytes. Additionally, the nucleoside analogues ganciclovir, famciclovir, and lamivudine have also shown some efficacy in the treatment of HBV infection in clinical trials. Additional treatments for HBV infection include pegylated interferon-α, adenfovir, entecavir, and telbivudine. Passive immunity can be created by parenteral administration of serum antibodies against HBsAg, but at the same time, resistance to infection is also created by vaccination with inactivated or recombinant HBsAg. Anti-PD-1 antibody molecules can be combined with conventional treatments for hepatitis B infection to achieve therapeutic benefit.
Инфекция, вызванная вирусом гепатита С (HC-V), может приводить к хронической форме гепатита, исходом которого является цирроз. Несмотря на то что симптоматика похожа на инфекционный гепатит В, ярким отличием от HB-V является отсутствие симптомов у инфицированных в течение 10-20 лет. Молекулу антитела против PD-1 можно вводить в виде монотерапии или в комбинации со стандартным лечением инфекционного гепатита С. Например, молекулу антитела против PD-1 можно вводить с однимInfection with hepatitis C virus (HC-V) can lead to chronic hepatitis, which results in cirrhosis. Despite the fact that the symptoms are similar to infectious hepatitis B, the striking difference from HB-V is the absence of symptoms in those infected for 10-20 years. The anti-PD-1 antibody molecule can be administered as monotherapy or in combination with standard treatment for infectious hepatitis C. For example, the anti-PD-1 antibody molecule can be administered with one
- 72 045940 или несколькими препаратами, такими как Совалди (софосбувир), Олисио (симепревир), в комбинации с рибавирином или пегилированным интерфероном. Также одобрены схемы лечения, которые включают Инсивек (Телапревир) или Виктрелис (Боцепревир) плюс рибавирин и пегилированный интерферон, хотя они связаны с повышенными побочными эффектами и более длительным сроком лечения, и поэтому не рассматриваются в качестве предпочтительных схем лечения.- 72 045940 or several drugs, such as Sovaldi (sofosbuvir), Olicio (simeprevir), in combination with ribavirin or pegylated interferon. Treatment regimens that include Insivec (Telaprevir) or Victrelis (Boceprevir) plus ribavirin and pegylated interferon are also approved, although they are associated with increased side effects and longer treatment durations and are therefore not considered preferred treatment regimens.
Общепринятое лечение HC-V-инфекции включает введение комбинации а-интерферона и рибавирина. Перспективное потенциальное лечение HC-V- инфекции представляет собой применение ингибитора протеазы - телапревира (VX-960). Дополнительные способы лечения включают: антитело против PD-1 (MDX-1106, Medarex), бавитуксимаб (антитело, которое связывается с анионным фосфолипидом фосфатидилсерином В2-гликопротеин 1-зависимым образом, Peregrine Pharmaceuticals), антитело (антитела) против HPV вирусного оболочечного белка Е2 (например, ATL 6865-Ab68+Ab65, XTL Pharmaceuticals) и Цивацир® (поликлональный человеческий иммуноглобулин против HCV). Антитела против PDL1 по изобретению можно комбинировать с одним или несколькими способами лечения инфекционных гепатитов С в целях терапевтического преимущества. Протеазы, полимеразы и ингибиторы NS5A, которые можно использовать в комбинации с молекулами антитела против PD-1 для специфичного лечения гепатита С, включают вещества, описанные в заявке US 2013/0045202, включенной в настоящее изобретение в качестве ссылки.Conventional treatment for HC-V infection involves administering a combination of interferon-α and ribavirin. A promising potential treatment for HC-V infection is the use of the protease inhibitor telaprevir (VX-960). Additional treatments include: anti-PD-1 antibody (MDX-1106, Medarex), bavituximab (an antibody that binds to the anionic phospholipid phosphatidylserine in a B2-glycoprotein 1-dependent manner, Peregrine Pharmaceuticals), anti-HPV viral envelope protein E2 antibody(ies). (eg, ATL 6865-Ab68+Ab65, XTL Pharmaceuticals) and Civacir® (polyclonal human anti-HCV immunoglobulin). The anti-PDL1 antibodies of the invention can be combined with one or more treatments for infectious hepatitis C for therapeutic benefit. Proteases, polymerases and NS5A inhibitors that can be used in combination with anti-PD-1 antibody molecules for specific treatment of hepatitis C include those described in US application 2013/0045202, incorporated herein by reference.
В другом варианте осуществления инфекция представляет собой вирус кори. После инкубационного периода в течение 9-11 дней в организме, зараженном вирусом кори, развивается лихорадка, кашель, насморк и конъюнктивит. В течение 1-2 дней развивается эритематозная, макулопапулезная сыпь, которая быстро распространяется по всему телу. Поскольку инфекция также подавляет клеточный иммунитет, у больного возникает высокий риск развития бактериальной суперинфекции, в том числе среднего отита, пневмонии и постинфекционного энцефаломиелита. Острая инфекция характеризуется высокой заболеваемостью и смертностью, особенно у истощенных подростков.In another embodiment, the infection is a measles virus. After an incubation period of 9-11 days, the body infected with the measles virus develops fever, cough, runny nose and conjunctivitis. Within 1-2 days, an erythematous, maculopapular rash develops, which quickly spreads throughout the body. Because the infection also suppresses cellular immunity, the patient is at high risk of developing bacterial superinfections, including otitis media, pneumonia, and postinfectious encephalomyelitis. Acute infection is characterized by high morbidity and mortality, especially in malnourished adolescents.
Лечение кори включает пассивное введение пула человеческого IgG, который может предотвращать заражение неиммунизированных субъектов, даже при в/вн введении в течение одной недели после инфицирования. Вместе с тем, первичная иммунизация живым аттенуированным вирусом является наиболее эффективным способом лечения и предотвращает заболевание более чем у 95% иммунизированных пациентов. Поскольку существует единственный серотип этого вируса, однократная иммунизация или инфекция обычно формирует пожизненную защиту от последующей инфекции.Treatment of measles involves passive administration of a pool of human IgG, which can prevent infection in nonimmunized subjects, even when administered intravenously within one week of infection. However, primary immunization with a live attenuated virus is the most effective treatment and prevents disease in more than 95% of immunized patients. Because there is a single serotype of this virus, a single immunization or infection usually provides lifelong protection against subsequent infection.
У небольшой части инфицированных людей корь может прогрессировать до подострого склерозирующего панэнцефалита (SSPE), который представляет собой хроническое прогрессирующее неврологическое расстройство, возникающие в результате хронической инфекции центральной нервной системы. SSPE вызван клоновыми вариантами вируса кори с дефектами, которые нарушают сборку вирионов и активную репликацию вируса в результате проникновения в клетку (бадинг). Для таких больных будет желательной реактивация Т-клеток с помощью молекул антитела против PD-1 в целях облегчения выведения вируса.In a small proportion of infected people, measles can progress to subacute sclerosing panencephalitis (SSPE), which is a chronic, progressive neurological disorder resulting from chronic infection of the central nervous system. SSPE is caused by clonal variants of the measles virus with defects that impair virion assembly and active viral replication through cell entry (budding). For such patients, reactivation of T cells using anti-PD-1 antibody molecules would be desirable to facilitate viral clearance.
В другом варианте осуществления инфекция обусловлена вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ). ВИЧ поражает CD4+ клетки, в том числе Т-лимфоциты, моноциты-макрофаги, фолликулярные дендритные клетки и клетки Лангерганса, и происходит истощение CD4+ клеток хелперов/индукторов. В результате у человека возникает тяжелый дефект клеточного иммунитета. В результате заражения ВИЧ по меньшей мере у 50% людей диагностируется СПИД, который передается половым путем, при введении зараженной крови или продуктов крови, при искусственном оплодотворении зараженной спермой, при контакте с иглами или шприцами, содержащими кровь, и путем передачи вируса от инфицированной матери младенцу во время родов.In another embodiment, the infection is due to human immunodeficiency virus (HIV). HIV attacks CD4+ cells, including T cells, monocyte macrophages, follicular dendritic cells, and Langerhans cells, and depletes CD4+ helper/inducer cells. As a result, a person develops a severe defect in cellular immunity. As a result of HIV infection, at least 50% of people are diagnosed with AIDS, which is transmitted sexually, through the ingestion of contaminated blood or blood products, through artificial insemination with contaminated sperm, through contact with needles or syringes containing blood, and through transmission of the virus from an infected mother to the baby during childbirth.
У ВИЧ-инфицированного человека болезнь может протекать бессимптомно, или может развиться острое заболевание, напоминающее мононуклеоз, с лихорадкой, головной болью, болью в горле, общим недомоганием и сыпью. Симптомы могут развиваться до прогрессирующей дисфункции иммунной системы, включающей персистирующую лихорадку, ночную потливость, потерю веса, необъяснимую диарея, экзему, псориаз, себорейный дерматит, опоясывающий лишай, кандидоз полости рта и волосатоклеточную лейкоплакию полости рта. Оппортунистические инфекции, обусловленные паразитами, являются распространенным явлением у пациентов, у которых развитие дошло до стадии СПИДа.A person infected with HIV may be asymptomatic or may develop an acute illness resembling mononucleosis, with fever, headache, sore throat, malaise, and rash. Symptoms may progress to progressive immune system dysfunction, including persistent fever, night sweats, weight loss, unexplained diarrhea, eczema, psoriasis, seborrheic dermatitis, herpes zoster, oral candidiasis, and oral hairy cell leukoplakia. Opportunistic infections due to parasites are common in patients who have progressed to the AIDS stage.
Лечение ВИЧ-инфекции включает противовирусные терапевтические средства, включающие аналоги нуклеозидов, зидовудин (AST), как в качестве монотерапии, так и в комбинации с препаратами диданозин или зальцитабин, дидезоксиинозин, дидезоксицитидин, ламивудин, ставудин; ингибиторы обратной транскриптазы, такие как делавирдин, невирапин, ловирид, и ингибиторы протеаз, такие как саквинавир, ритонавир, индинавир и нелфинавир. Молекулы антитела против PD-1 можно комбинировать с общепринятыми средствами для лечения ВИЧ-инфекции в целях терапевтического преимущества.Treatment of HIV infection includes antiviral therapeutic agents, including nucleoside analogues, zidovudine (AST), either as monotherapy or in combination with the drugs didanosine or zalcitabine, dideoxyinosine, dideoxycytidine, lamivudine, stavudine; reverse transcriptase inhibitors such as delavirdine, nevirapine, loviride, and protease inhibitors such as saquinavir, ritonavir, indinavir and nelfinavir. Anti-PD-1 antibody molecules can be combined with conventional drugs for the treatment of HIV infection for therapeutic benefit.
В другом варианте осуществления инфекция обусловлена цитомегаловирусом (CMV). CMVинфекция часто ассоциируется со стойкой, скрытой и рецидивирующей инфекцией. CMV инфицирует моноциты и клетки - предшественники гранулоцитов-моноцитов и остается в них в латентной форме. Клинические симптомы CMV включают мононуклеозоподобные симптомы (например, лихорадку, опуIn another embodiment, the infection is due to cytomegalovirus (CMV). CMV infection is often associated with persistent, occult and recurrent infection. CMV infects monocytes and granulocyte-monocyte precursor cells and remains in them in a latent form. Clinical symptoms of CMV include mononucleosis-like symptoms (eg, fever,
- 73 045940 хание желез, общее недомогание) и тенденцию к развитию аллергических кожных высыпаний на введение антибиотиков. Вирус распространяется путем прямого контакта. Вирус выделяется с мочой, слюной, спермой и в меньшей степени с другими жидкостями организма. Передача вируса может также происходить от инфицированной матери к плоду или новорожденному и при переливании крови и трансплантации органов. CMV-инфекции вызывает общее нарушение клеточного иммунитета, характеризуемое нарушением реакции бласт-трансформации на неспецифичные митогены и специфичные CMV-антигены, снижением цитотоксической способности и повышением числа CD8 лимфоцитов по сравнению с числом CD4+ лимфоцитов.- 73 045940 swelling of the glands, general malaise) and a tendency to develop allergic skin rashes to the administration of antibiotics. The virus spreads through direct contact. The virus is shed in urine, saliva, semen and, to a lesser extent, other body fluids. Transmission of the virus can also occur from an infected mother to the fetus or newborn and through blood transfusions and organ transplants. CMV infection causes a general disorder of cellular immunity, characterized by impaired blast transformation response to nonspecific mitogens and specific CMV antigens, a decrease in cytotoxic ability and an increase in the number of CD8 lymphocytes compared to the number of CD4+ lymphocytes.
Лечение цитомегаловирусной инфекции включает антивирусные препараты ганцикловир, фоскарнет и цидовир, но эти лекарственные средства обычно назначают только больным с иммунодефицитом. Молекулы антитела против PD-1 можно комбинировать с обычным лечением цитомегаловирусных инфекций в целях терапевтического преимущества.Treatment for cytomegalovirus infection includes the antiviral drugs ganciclovir, foscarnet, and cidovir, but these drugs are usually only prescribed to immunocompromised patients. Anti-PD-1 antibody molecules can be combined with conventional treatments for cytomegalovirus infections for therapeutic benefit.
В другом варианте осуществления инфекция обусловлена вирусома Эпштейна-Барра (EBV). EBV может вызывать персистирующие и латентные инфекции и в первую очередь атакует В-клетки. Инфицирование EBV вызывает клиническое состояние инфекционного мононуклеоза, которое включает повышение температуры, боль в горле, часто с образованием экссудата, генерализованную лимфаденопатию и спленомегалию. Также выявляют гепатит, который может развиться до симптома желтухи.In another embodiment, the infection is due to Epstein-Barr virus (EBV). EBV can cause persistent and latent infections and primarily attacks B cells. EBV infection causes the clinical condition of infectious mononucleosis, which includes fever, sore throat, often with exudate, generalized lymphadenopathy, and splenomegaly. Hepatitis is also detected, which can develop to the symptom of jaundice.
Поскольку общепринятые способы лечения EBV-инфекции являются паллиативными и симптоматическими, EBV связан с развитием некоторых видов рака, таких как лимфома Беркитта и рак носоглотки. Таким образом, большая польза будет возникать при выведении вирусной инфекции, до возникновения указанных осложнений. Молекулы антитела против PD-1 можно комбинировать с обычными способами лечения обусловленных вирусом Эпштейна-Барра инфекций, в целях терапевтического преимущества.Because conventional treatments for EBV infection are palliative and symptomatic, EBV is associated with the development of some cancers, such as Burkitt's lymphoma and nasopharyngeal cancer. Thus, greater benefit will arise from eliminating the viral infection before these complications occur. Anti-PD-1 antibody molecules can be combined with conventional treatments for Epstein-Barr virus infections for therapeutic benefit.
В другом варианте осуществления инфекция обусловлена вирусом простого герпеса (HSV). HSV передается при непосредственном контакте с инфицированным человеком. Прямое инфицирование может протекать бессимптомно, но, обычно вызывает появление герпетических пузырьков, содержащих инфекционные частицы. Заболевание проявляется в виде циклов активных периодов болезни, во время которых появляются поражения, и периодов без проявления болезни, но в нервных ганглиях появляются очаги латентной вирусной инфекции для последующих вспышек. Поражения могут быть на лице, половых органов, глазах и/или руках. В некоторых случаях инфекция может также вызвать энцефалит.In another embodiment, the infection is due to herpes simplex virus (HSV). HSV is transmitted through direct contact with an infected person. Direct infection may be asymptomatic, but usually causes the appearance of herpetic blisters containing infectious particles. The disease manifests itself in cycles of active periods of the disease, during which lesions appear, and periods without the manifestation of the disease, but foci of latent viral infection appear in the nerve ganglia for subsequent outbreaks. Lesions may be on the face, genitals, eyes and/or hands. In some cases, the infection can also cause encephalitis.
Терапевтические средства для лечения герпетических инфекций направлены в первую очередь на борьбу с симптоматическими вспышками, и включают системные противовирусные препараты, такие как: ацикловир (например, Зовиракс®), валацикловир, фамцикловир, пенцикловир и лекарства для местного применения, такие как докозанол (Абрева®), тромантадин и зилактин. Устранение латентных герпетических инфекций будет иметь большое клиническое преимущество. Молекулы антитела против PD1 можно комбинировать с обычным лечением герпесвирусных инфекций, в целях терапевтического преимущества.Therapeutics for the treatment of herpes infections are aimed primarily at controlling symptomatic outbreaks, and include systemic antivirals such as acyclovir (eg, Zovirax®), valacyclovir, famciclovir, penciclovir, and topical medications such as docosanol (Abreva® ), tromantadine and zilactin. Elimination of latent herpes infections will have great clinical benefit. Anti-PD1 antibody molecules can be combined with conventional treatments for herpesvirus infections for therapeutic benefit.
В другом варианте осуществления инфекция обусловлена человеческим Т-лимфотропным вирусом (HTLV-1, HTLV-2). Вирусы HTLV передаются при половом контакте, кормлении грудью или при контакте с зараженной кровью. Вирус активирует подгруппу TH-клеток, называемых Th1-клетками, что вызывает из сверхпролиферацию и сверхпродукцию связанных с Th1 цитокинов (например, IFN-γ и TNFα). В свою очередь, это приводит к супрессии ТЬ2-лимФоццтов и к снижению продукции цитокинов Th2 (например, IL-4, IL-5, IL-10 и IL-13), в результате чего снижается способность инфицированного организма к формированию адекватного иммунного ответа на внедрение патогенов, для выведения которых необходим Th2-зависимый ответ (например, для устанения паразитарных инфекций, продуктов гуморальных антител и антител слизистых оболочек).In another embodiment, the infection is caused by human T-lymphotropic virus (HTLV-1, HTLV-2). HTLV viruses are transmitted through sexual contact, breastfeeding, or contact with contaminated blood. The virus activates a subset of TH cells called Th1 cells, which causes them to overproliferate and overproduce Th1-related cytokines (eg, IFN-γ and TNFα). In turn, this leads to suppression of Th2 lymphocytes and a decrease in the production of Th2 cytokines (for example, IL-4, IL-5, IL-10 and IL-13), resulting in a decrease in the ability of the infected organism to form an adequate immune response to introduction of pathogens that require a Th2-dependent response for clearance (for example, to resolve parasitic infections, humoral antibody products and mucosal antibodies).
Инфицирование вирусами HTLV приводит к условно-патогенным инфекциям, вызывающим бронхоэктазы, дерматит и суперинфекции видами Staphylococcus spp. и Strongyloides spp., в результате чего наступает смерть от полимикробного сепсиса. HTLV-инфекция может также напрямую вызывать Тклеточный лейкоз/лимфому и прогрессирующую демиелинизирующую болезнь верхних двигательных нейронов, называемую HAM/TSP. Устранение латентной инфекции HTLV будет иметь большое клиническое преимущество. Молекулы антитела против PD-1 можно комбинировать с обычными видами лечения HTLV-инфекций, в целях терапевтического преимущества.Infection with HTLV viruses leads to opportunistic infections causing bronchiectasis, dermatitis and superinfections with Staphylococcus spp. and Strongyloides spp., resulting in death from polymicrobial sepsis. HTLV infection can also directly cause T-cell leukemia/lymphoma and progressive upper motor neuron demyelinating disease called HAM/TSP. Elimination of latent HTLV infection would be of great clinical benefit. Anti-PD-1 antibody molecules can be combined with conventional treatments for HTLV infections for therapeutic benefit.
В другом варианте осуществления инфекция обусловлена вирусом папилломы человека (HPV). HPV в первую очередь поражает кератиноциты и встречается в двух формах: кожной и генитальной. Считается, что передача вируса происходит в результате прямого контакта и/или сексуального контакта. И кожная и генитальная форма HPV-инфекции могут проявляться в виде бородавок и латентных инфекций, и иногда рецидивирующих инфекций, контролируемых иммунитетом организма, при этом иммунитет человека контролирует симптомы и блокирует появление бородавок, но оставляет этого человека способным передавать инфекцию другим людям.In another embodiment, the infection is caused by human papillomavirus (HPV). HPV primarily affects keratinocytes and occurs in two forms: cutaneous and genital. Transmission of the virus is believed to occur through direct contact and/or sexual contact. Both the cutaneous and genital forms of HPV infection can manifest as warts and latent infections, and sometimes recurrent infections controlled by the body's immune system, whereby a person's immune system controls symptoms and blocks the appearance of warts, but leaves that person capable of transmitting the infection to others.
Инфицирование HPV может также вызывать некоторые виды рака, такие как рак шейки матки,HPV infection can also cause some types of cancer, such as cervical cancer,
- 74 045940 анальный рак, рак вульвы, пениса и рак ротоглотки. Не существует известных препаратов для лечения HPV-инфекции, при этом настоящее время лечение заключается в местном применении препарата Имиквимод, который стимулирует иммунную систему для атаки пораженного участка. Устранение латентной HPV-инфекции принесет большую клиническую пользу. Антитела против PD-L1 по изобретению можно комбинировать с обычными видами лечения HPV-инфекции, в целях терапевтического преимущества.- 74 045940 anal, vulvar, penile and oropharyngeal cancer. There are no known drugs to treat HPV infection, with current treatment being the topical application of the drug Imiquimod, which stimulates the immune system to attack the affected area. Elimination of latent HPV infection will provide greater clinical benefit. The anti-PD-L1 antibodies of the invention can be combined with conventional treatments for HPV infection for therapeutic benefit.
Бактериальные инфекции.Bacterial infections.
Некоторые примеры патогенных бактерий, вызывающие инфекции, которые можно лечить способами по настоящему изобретению, включают возбудитель сифилиса, хламидии, риккетсии, микобактерии, стафилококки, стрептококки, пневмококки, менингококки и гонококки, клебсиеллу, протей, сальмонеллу, бактерии Serratia, Pseudomonas, Legionella, bacilli, возбудители дифтерии, холеры, столбняка, ботулизма, сибирской язвы, чумы, лептоспироза, и болезни Лайма. Молекулы антитела против PD-1 можно использовать в комбинации с существующими методиками лечения вышеуказанных инфекций. Например, лечение сифилиса включает применение пенициллина (например, пенициллина G), тетрациклина, доксициклина, цефтриаксона и азитромицина.Some examples of pathogenic bacteria causing infections that can be treated by the methods of the present invention include syphilis, chlamydia, rickettsia, mycobacteria, staphylococci, streptococci, pneumococci, meningococci and gonococci, Klebsiella, Proteus, Salmonella, Serratia, Pseudomonas, Legionella, bacilli , the causative agents of diphtheria, cholera, tetanus, botulism, anthrax, plague, leptospirosis, and Lyme disease. Anti-PD-1 antibody molecules can be used in combination with existing treatments for the above infections. For example, treatment for syphilis includes penicillin (eg, penicillin G), tetracycline, doxycycline, ceftriaxone, and azithromycin.
Болезнь Лайма, вызываемая Borrelia burgdorferi, передается в организм человека через укус клеща. Начальным проявлением болезни является локализованная сыпь, затем возникают гриппоподобные симптомы, включающие общее недомогание, лихорадку, головная боль, ригидность затылочных мышц и артралгии. Более поздние проявления могут включать мигрирующий и полиартикулярный артрит, неврологические и кардиальные расстройства с параличами черепных нервов и радикулопатией, миокардит и аритмии. В некоторых случаях болезнь Лайма становится персистирующей, что приводит к необратимому поражению, сходному с третичным сифилисом. Современное лечение болезни Лайма включает в первую очередь введение антибиотиков. На резистентные к антибиотикам штаммы можно воздействовать гидроксихлорохином или метотрексатом. Пациентов с рефрактерностью к антибиотикам и нейропатической болью можно лечить габапентином. Миноциклин может быть полезным для лечения поздней стадии/хронической болезни Лайма с неврологическими или другими воспалительными симптомами.Lyme disease, caused by Borrelia burgdorferi, is transmitted to humans through the bite of a tick. The initial manifestation of the disease is a localized rash, followed by flu-like symptoms including general malaise, fever, headache, stiff neck and arthralgia. Later manifestations may include migratory and polyarticular arthritis, neurological and cardiac disorders with cranial nerve palsies and radiculopathy, myocarditis and arrhythmias. In some cases, Lyme disease becomes persistent, resulting in irreversible damage similar to tertiary syphilis. Current treatment for Lyme disease involves primarily administering antibiotics. Antibiotic-resistant strains can be treated with hydroxychloroquine or methotrexate. Patients who are refractory to antibiotics and have neuropathic pain can be treated with gabapentin. Minocycline may be useful for the treatment of advanced/chronic Lyme disease with neurological or other inflammatory symptoms.
Другие формы боррелиоза, например, обусловленные заражением В. recurentis, В. hermsii, В. turicatae, В. parikeri., В. hispanica, В. duttonii и В. persica, а также лептоспироза (например, L. interrogans), обычно проходят спонтанно, если титры антител в крови не достигают концентрации, вызывающей внутрипеченочную обструкцию.Other forms of borreliosis, such as those caused by infection with B. recurrentis, B. hermsii, B. turicatae, B. parikeri., B. hispanica, B. duttonii and B. persica, as well as leptospirosis (for example, L. interrogans), usually resolve spontaneously if antibody titers in the blood do not reach a concentration that causes intrahepatic obstruction.
Грибки и паразиты.Fungi and parasites.
Некоторые примеры патогенных грибков, вызывающих инфекции, которые поддаются лечению способами по изобретению, включают грибы рода Candida (albicans, krusei, glabrata, tropicalis, etc.), Cryptococcus neoformans, Aspergillus (fumigatus, niger, etc.), рода Mucorales (mucor, absidia, rhizophus), Sporothrix schenkii, Blastomyces dermatitidis, Paracoccidioides brasiliensis, Coccidioides immitis и Histoplasma capsulatum.Some examples of pathogenic fungi that cause infections that are treatable by the methods of the invention include fungi of the genus Candida (albicans, krusei, glabrata, tropicalis, etc.), Cryptococcus neoformans, Aspergillus (fumigatus, niger, etc.), the genus Mucorales (mucor, absidia, rhizophus), Sporothrix schenkii, Blastomyces dermatitidis, Paracoccidioides brasiliensis, Coccidioides immitis and Histoplasma capsulatum.
Некоторые примеры патогенных паразитов, вызывающих инфекции, которые поддаются лечению способами по изобретению, Entamoeba histolytica, Balantidium coli, Naegleriafowleri, Acanthamoeba sp., Giardia lambia, Cryptosporidium sp., Pneumocystis carinii, Plasmodium vivax, Babesia microti, Trypanosoma brucei, Trypanosoma cruzi, Leishmania donovani, Toxoplasma gondi и Nippostrongylus brasiliensis.Some examples of pathogenic parasites causing infections that are treatable by the methods of the invention are Entamoeba histolytica, Balantidium coli, Naegleriafowleri, Acanthamoeba sp., Giardia lambia, Cryptosporidium sp., Pneumocystis carinii, Plasmodium vivax, Babesia microti, Trypanosoma brucei, Trypanosoma cruzi, Leishmania donovani, Toxoplasma gondi and Nippostrongylus brasiliensis.
Дополнительные комбинированные препараты.Additional combination drugs.
Изобретение относится к комбинациям молекул антитела против PD-1 с одним или несколькими вторыми терапевтическими средствами. Многие из комбинаций, указанных в этом разделе, могут быть использованы при лечении рака, но также описаны и другие показания. В этом разделе рассмотрены комбинации молекул антитела против PD-1, необязательно в комбинации с одним или несколькими иммуномодуляторами (такими как молекула антитела против TIM-3, молекула антитела против LAG-3 или молекула антитела против PD-L1), с одним или несколькими веществами, указанными в табл. 7. В одном варианте осуществления в указанных ниже комбинациях по изобретению молекула антитела против PD1 включает:The invention relates to combinations of anti-PD-1 antibody molecules with one or more second therapeutic agents. Many of the combinations listed in this section can be used in the treatment of cancer, but other indications are also described. This section discusses combinations of anti-PD-1 antibody molecules, optionally in combination with one or more immunomodulators (such as an anti-TIM-3 antibody molecule, an anti-LAG-3 antibody molecule, or an anti-PD-L1 antibody molecule), with one or more agents , indicated in table. 7. In one embodiment, in the following combinations of the invention, the anti-PD1 antibody molecule includes:
(a) вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 4, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5, и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33;(a) a heavy chain variable region (VH) which comprises VHCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 4, VHCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 5, and VHCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and a light chain variable region (VL) which comprises VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 14, and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 33;
(b) VH, которая содержит аминокислотную последовательность VHCDR1, выбранную из SEQ ID NO: 1; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32;(b) VH, which contains the amino acid sequence of VHCDR1 selected from SEQ ID NO: 1; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 11, and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 32;
(c) VH, которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224, VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 5, и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью(c) VH, which contains VHCDR1 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 224, VHCDR2 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 5, and VHCDR3 with the amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 with the amino acid sequence
- 75 045940- 75 045940
SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 33; или (d) VH, которая содержит VHCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 224; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и VL, которая содержит VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32.SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 14, and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 33; or (d) VH, which contains VHCDR1 with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and VL, which contains VLCDR1 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 10, VLCDR2 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 11, and VLCDR3 having the amino acid sequence SEQ ID NO: 32.
В другом варианте осуществления в указанных ниже комбинациях по изобретению молекула антитела против PD-1 содержит:In another embodiment, in the following combinations of the invention, the anti-PD-1 antibody molecule comprises:
(I) вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1, выбранную из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 224; VHCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 2 или SEQ ID NO: 5; и VHCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 3; и (II) вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую VLCDR1 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 13, VLCDR2 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11 или SEQ ID NO: 14, и VLCDR3 с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 32 или SEQ ID NO: 33.(I) a heavy chain variable region (VH) containing the amino acid sequence of VHCDR1 selected from SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 224; VHCDR2 with amino acid sequence SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 5; and VHCDR3 with amino acid sequence SEQ ID NO: 3; and (II) a light chain variable region (VL) comprising VLCDR1 having amino acid sequence SEQ ID NO: 10 or SEQ ID NO: 13, VLCDR2 having amino acid sequence SEQ ID NO: 11 or SEQ ID NO: 14, and VLCDR3 having amino acid sequence SEQ ID NO: 32 or SEQ ID NO: 33.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, используется в комбинации с ингибитором протеинкиназы С (PKC), Сотрастаурином (соединение А1), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2005/039549, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором PKC является Сотрастаурин (соединение A1), или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2005/039549. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 используется в комбинации с Сотрастаурином (соединение А1), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2005/039549, для лечения заболевания, такого как рак, меланома, неходжкинская лимфома, воспалительной болезни кишечника, реакции отторжения трансплантата, офтальмологического заболевания или псориаза.In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a protein kinase C (PKC) inhibitor, Sotrastaurin (compound A1), or with a compound described in the published PCT application WO 2005/039549, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the PKC inhibitor is Sotrastaurin (compound A1), or a compound described in PCT Published Application No. WO 2005/039549. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Sotrastaurin (compound A1), or with a compound described in PCT Published Application No. WO 2005/039549, for the treatment of a disease such as cancer, melanoma, non-Hodgkin's lymphoma, inflammatory disease intestines, transplant rejection, ophthalmic disease or psoriasis.
В некоторых вариантах осуществления Сотрастаурин (соединение А1) вводят в дозе приблизительно от 20 до 600 мг, например, приблизительно от 200 приблизительно до 600 мг, приблизительно от 50 мг приблизительно до 450 мг, приблизительно от 100 до 400 мг, приблизительно от 150 до 350 мг, или приблизительно от 200 до 300 мг, например, приблизительно 50, 100, 150, 200, 300, 400, 500 или 600 мг. Схема введения может варьироваться, например, от введения через день до введения два раза или три раза в день.In some embodiments, Sotrastaurin (Compound A1) is administered at a dose of about 20 to 600 mg, such as about 200 to about 600 mg, about 50 mg to about 450 mg, about 100 to 400 mg, about 150 to 350 mg, or about 200 to 300 mg, for example about 50, 100, 150, 200, 300, 400, 500 or 600 mg. The schedule of administration may vary, for example, from administration every other day to administration twice or three times a day.
В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, используется в комбинации с ингибитором BCR-ABL, Тасигна (соединение А2) или соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2004/005281, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором BCR-ABL является Тасигна, или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2004/005281. В одном варианте осуществления молекулу антитела против PD-1 применяют в комбинации с Тасигна (соединение А2) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2004/005281, для лечения такого заболевания, как лимфобластный лейкоз, болезнь Паркинсона, рак нерной системы, меланома, рак пищеварительной системы/двенадцатиперстной кишки, колоректальный рак, миелоидный лейкоз, рак головы и шеи или легочная гипертензия.In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the BCR-ABL inhibitor, Tasigna (Compound A2) or a compound described in published PCT application No. WO 2004/005281, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the BCR-ABL inhibitor is Tasigna, or a compound described in PCT Published Application No. WO 2004/005281. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Tasigna (compound A2) or with a compound described in PCT published application WO 2004/005281 for the treatment of a disease such as lymphoblastic leukemia, Parkinson's disease, neuronal cancer, melanoma , digestive/duodenal cancer, colorectal cancer, myeloid leukemia, head and neck cancer, or pulmonary hypertension.
В одном варианте осуществления ингибитор BCR-ABL или Тасигна вводится в дозе приблизительно 300 мг (например, два раза в день, например, для вновь диагностированного Ph+ ХМЛ-CP (положительного по филадельфийской хромосоме ХЛЛ в хронической фазе), или приблизительно 400 мг, например, два раза в день, например, при резистентности или непереносимости у больных Ph+ ХМЛ-СР и ХМЛ-АР (в острой фазе)). Ингибитор BCR-ABL или соединение А2 вводят в дозе приблизительно от 300 до 400 мг.In one embodiment, the BCR-ABL inhibitor or Tasigna is administered at a dose of approximately 300 mg (e.g., twice daily, e.g., for newly diagnosed Ph+ CML-CP (Philadelphia chromosome positive chronic phase CLL), or approximately 400 mg, e.g. , twice a day, for example, in case of resistance or intolerance in patients with Ph+ CML-SR and CML-AR (in the acute phase)). The BCR-ABL inhibitor or Compound A2 is administered at a dose of approximately 300 to 400 mg.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором HSP90, таким как 5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-Ы-этил-4-(4-(морфолинометил)фенил) изоксазол-3-карбоксамид (соединение A3), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/060937 или WO 2004/072051, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор HSP90 представляет собой 5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-Ыэтил-4-(4-(морфолинометил)фенил)изоксазол-3-карбоксамид (соединение A3), или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2010/060937 или WO 2004/072051. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с 5-(2,4-дигидрокси-5изопропилфенил)-Ы-этил-4-(4-(морфолинометил)фенил)изоксазол-3-карбоксамидом (соединение A3),In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, such as an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an HSP90 inhibitor such as 5-(2. 4-dihydroxy-5-isopropylphenyl)-N-ethyl-4-(4-(morpholinomethyl)phenyl)isoxazole-3-carboxamide (compound A3), or with the compound described in published PCT application WO 2010/060937 or WO 2004/ 072051, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the HSP90 inhibitor is 5-(2,4-dihydroxy-5-isopropylphenyl)-ethyl-4-(4-(morpholinomethyl)phenyl)isoxazole-3-carboxamide (compound A3), or a compound described in published PCT application No. WO 2010/060937 or WO 2004/072051. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with 5-(2,4-dihydroxy-5-isopropylphenyl)-N-ethyl-4-(4-(morpholinomethyl)phenyl)isoxazole-3-carboxamide (Compound A3),
- 76 045940 или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/060937 или WO 2004/072051, для лечения заболевания, такого как рак, множественная миелома, немелкоклеточный рак легкого, лимфома, рак желудка, рак молочной железы, рак пищеварительной системы/рак желудочно-кишечного тракта, поджелудочной железы, колоректальный рак, солидная опухоль или нарушение гемапоэза.- 76 045940 or with a compound described in the published PCT application WO 2010/060937 or WO 2004/072051, for the treatment of a disease such as cancer, multiple myeloma, non-small cell lung cancer, lymphoma, gastric cancer, breast cancer, digestive system cancer/ cancer of the gastrointestinal tract, pancreas, colorectal cancer, solid tumor or disorder of hematopoiesis.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором PI3K и/или mTOR, Дактолисибом (соединение А4 ), или 8-(6-метокси-пиридин-3-ил)-3-метил-1-(4-пиперазин-1-ил-3трифторметил-фенил)-1,3-дигидро-имидазо[4,5-с]хинолин-2-он (соединение А41), или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2006/122806, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором PI3K и/или mTOR является Дактолисиб (соединение А4), 8-(6-метокси-пиридин-3-ил)-3-метил-1-(4-пиперазин-1-ил-3трифторметил-фенил)-1,3-дигидро-имидазо[4,5-с]хинолин-2-он (соединение А41), или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2006/122806. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Дактолисибом (соединение А4), с соединением 8-(6метокси-пиридин-3-ил)-3-метил-1-(4-пиперазин-1-ил-3-трифторметил-фенил)-1,3-дигидро-имидазо[4,5с]хинолин-2-он (соединение А41), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2006/122806, для лечения заболевания, такого как рак, рак предстательной железы, лейкоз (например, лимфолейкоз), рак молочной железы, рак головного мозга, рак мочевого пузыря, рак поджелудочной железы, рак почки, солидная опухоль или рак печени.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the PI3K and/or mTOR inhibitor, Dactolisib (compound A4), or 8-(6-methoxy-pyridin-3-yl)-3-methyl-1-(4-piperazin-1-yl-3trifluoromethyl-phenyl)-1,3-dihydro-imidazo[4,5- c]quinolin-2-one (compound A41), or the compound described in published PCT application No. WO 2006/122806, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the PI3K and/or mTOR inhibitor is Dactolisib (compound A4), 8-(6-methoxy-pyridin-3-yl)-3-methyl-1-(4-piperazin-1-yl-3-trifluoromethyl-phenyl) -1,3-dihydro-imidazo[4,5-c]quinolin-2-one (compound A41), or the compound described in published PCT application WO 2006/122806. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Dactolisib (compound A4), with the compound 8-(6methoxy-pyridin-3-yl)-3-methyl-1-(4-piperazin-1-yl-3 -trifluoromethylphenyl)-1,3-dihydro-imidazo[4,5c]quinolin-2-one (compound A41), or with the compound described in PCT Published Application No. WO 2006/122806, for the treatment of a disease such as cancer , prostate cancer, leukemia (eg, lymphocytic leukemia), breast cancer, brain cancer, bladder cancer, pancreatic cancer, kidney cancer, solid tumor, or liver cancer.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором FGFR, 3-(2,6дихлор-3,5-диметоксифенил)-1-(6-((4-(4-этилпиперазин-1 -ил)фенил)амино)пиримидин-4-ил)-1 метилмочевиной (соединение А5) или с соединением, описанным в патенте США 8552002, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором FGFR является 3-(2,6-дихлор-3,5-диметоксифенил)-1-(6-((4-(4-этилпиперазин-1ил)фенил)амино)пиримидин-4-ил)-1-метилмочевина (соединение А5) или соединение, описанное в патенте США 8552002. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением А5, или с соединением, описанным в разделе США 8552002, для лечения заболевания, такого как рак пищеварительной системы/рак желудочно-кишечного тракта, гематологический рак или солидная опухоль.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an FGFR inhibitor, 3-(2,6dichloro- 3,5-dimethoxyphenyl)-1-(6-((4-(4-ethylpiperazin-1 -yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)-1 methylurea (compound A5) or with the compound described in the US patent 8552002, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the FGFR inhibitor is 3-(2,6-dichloro-3,5-dimethoxyphenyl)-1-(6-((4-(4-ethylpiperazin-1yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)- 1-methylurea (Compound A5) or the compound described in US Pat. No. 8,552,002. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Compound A5, or the compound described in US Pat. No. 8,552,002, to treat a disease such as cancer digestive system/gastrointestinal cancer, hematological cancer or solid tumor.
В одном варианте осуществления ингибитор FGFR или 3-(2,6-дихлор-3,5-диметоксифенил)-1-(6-((4(4-этилпиперазин-1-ил)фенил)амино)пиримидин-4-ил)-1-метилмочевина (соединение А5) вводят в дозе приблизительно от 100 до 125 мг (например, в день), например, приблизительно 100 мг или приблизительно 125 мг.In one embodiment, an FGFR inhibitor or 3-(2,6-dichloro-3,5-dimethoxyphenyl)-1-(6-((4(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl) -1-methylurea (compound A5) is administered at a dose of about 100 to 125 mg (eg, per day), such as about 100 mg or about 125 mg.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором PI3K, Бупарлисибом (соединение А6) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2007/084786, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором PI3K является Бупарлисиб (соединение А6) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2007/084786. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Бупарлисибом (соединение А6) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2007/084786, для лечения такого заболевания, как рак предстательной железы, немелкоклеточный рак легкого, рак эндокринной системы, лейкоз, рак яичника, меланома, рак мочевого пузыря, рак молочной железы, рак женской репродуктивной системы, рак пищеварительной системы/двенадцатиперстной кишки, колоректальный рак, мультиформная глиобластома, солидная опухоль, неходжкинская лимфома, нарушение гемапоэза или рак головы и шеи.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a PI3K inhibitor, Buparlisib (compound A6) or a compound described in published PCT application WO 2007/084786, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the PI3K inhibitor is Buparlisib (compound A6) or a compound described in published PCT application WO 2007/084786. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Buparlisib (compound A6) or a compound described in PCT published application WO 2007/084786 for the treatment of a disease such as prostate cancer, non-small cell lung cancer, endocrine system cancer , leukemia, ovarian cancer, melanoma, bladder cancer, breast cancer, female reproductive system cancer, digestive/duodenal cancer, colorectal cancer, glioblastoma multiforme, solid tumor, non-Hodgkin's lymphoma, hematopoietic disorder, or head and neck cancer.
В одном варианте осуществления ингибитор PI3K или Бупарлисиб (соединение А6) вводят в дозе приблизительно 100 мг (например, в день).In one embodiment, the PI3K inhibitor or Buparlisib (Compound A6) is administered at a dose of approximately 100 mg (eg, per day).
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором FGFR, 8-(2,6дифтор-3,5-диметоксифенил)-Н-(4-((диметиламино)метил)-1Н-имидазол-2-ил)хиноксалин-5карбоксамидом (соединение А7) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2009/141386, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором FGFR является 8-(2,6-дифтор-3,5-диметоксифенил)-Ы-(4((диметиламино)метил)-1Н-имидазол-2-ил)хиноксалин-5-карбоксамид (соединение А7) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2009/141386. В одном варианте осуществления ингибитором FGFR является 8-(2,6-дифтор-3,5-диметоксифенил)-Н-(4-((диметиламино)метил)-1Н-имидазол-2ил)хиноксалин-5-карбоксамид (соединение А7). В одном варианте осуществления молекула антителаIn another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an FGFR inhibitor, 8-(2,6difluoro- 3,5-dimethoxyphenyl)-H-(4-((dimethylamino)methyl)-1H-imidazol-2-yl)quinoxaline-5carboxamide (compound A7) or with the compound described in published PCT application WO 2009/141386, for the treatment diseases, for example, the diseases mentioned in the invention. In one embodiment, the FGFR inhibitor is 8-(2,6-difluoro-3,5-dimethoxyphenyl)-N-(4((dimethylamino)methyl)-1H-imidazol-2-yl)quinoxaline-5-carboxamide (compound A7 ) or a compound described in published PCT application WO 2009/141386. In one embodiment, the FGFR inhibitor is 8-(2,6-difluoro-3,5-dimethoxyphenyl)-H-(4-((dimethylamino)methyl)-1H-imidazol-2yl)quinoxaline-5-carboxamide (compound A7) . In one embodiment, the antibody molecule
- 77 045940 против PD-1 применяется в комбинации с 8-(2,6-дифтор-3,5-диметоксифенил)-Ы-(4((диметиламино)метил)-1Н-имидазол-2-ил)хиноксалин-5-карбоксамидом (соединение А7) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2009/141386, для лечения заболевания, такого как рак, отличающийся ангиогенезом.- 77 045940 against PD-1 is used in combination with 8-(2,6-difluoro-3,5-dimethoxyphenyl)-N-(4((dimethylamino)methyl)-1H-imidazol-2-yl)quinoxaline-5- carboxamide (compound A7) or with a compound described in published PCT application WO 2009/141386, for the treatment of a disease such as cancer characterized by angiogenesis.
В одном варианте осуществления ингибитор FGFR или 8-(2,6-дифтор-3,5-диметоксифенил)-Ы-(4((диметиламино)метил)-1Н-имидазол-2-ил)хиноксалин-5-карбоксамид (соединение А7) вводят в дозе, например, приблизительно от 3 мг приблизительно до 5 г, более предпочтительно приблизительно от 10 мг приблизительно до 1,5 г на человека в день, и эта доза необязательно разделена на 1-3 разовые дозы, которые могут, например, быть одинаковыми.In one embodiment, an FGFR inhibitor or 8-(2,6-difluoro-3,5-dimethoxyphenyl)-N-(4((dimethylamino)methyl)-1H-imidazol-2-yl)quinoxaline-5-carboxamide (compound A7 ) is administered at a dose of, for example, about 3 mg to about 5 g, more preferably about 10 mg to about 1.5 g per person per day, and this dose is optionally divided into 1-3 unit doses, which may, for example, be the same.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором PI3K (S)-N1-(4метил-5 -(2-(1,1,1 -трифтор-2-метилпропан-2-ил)пиридин-4-ил)тиазол-2-ил)пирролидин-1,2дикарбоксамидом (соединение А8) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/029082, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором PI3K является (S)-N1- (4-метил-5-(2-(1,1,1-трифтор-2-метилпропан2-ил)пиридин-4-ил)тиазол-2-ил)пирролидин-1,2-дикарбоксамид (соединение А8) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2010/029082. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с ^)-Ы1-(4-метил-5-(2-(1,1,1-трифтор-2-метилпропан-2ил)пиридин-4-ил)пиридин-2-ил)пирролидин-1,2-дикарбоксамидом (соединение А8 ) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/029082, для лечения такого заболевания, как рак желудка, рак молочной железы, рак поджелудочной железы, рак пищеварительной системы/рак желудочнокишечного тракта, солидная опухоль и рак головы и шеи.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a PI3K inhibitor (S)-N1-(4methyl -5 -(2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl)thiazol-2-yl)pyrrolidin-1,2dicarboxamide (compound A8) or with the compound described in published PCT application WO 2010/029082, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the PI3K inhibitor is (S)-N1-(4-methyl-5-(2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan2-yl)pyridin-4-yl)thiazol-2-yl) pyrrolidine-1,2-dicarboxamide (compound A8) or the compound described in published PCT application WO 2010/029082. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with ^)-N1-(4-methyl-5-(2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2yl)pyridin-4-yl) pyridin-2-yl)pyrrolidin-1,2-dicarboxamide (compound A8) or with the compound described in the published PCT application WO 2010/029082, for the treatment of a disease such as stomach cancer, breast cancer, pancreatic cancer, digestive cancer systems/gastrointestinal cancer, solid tumor and head and neck cancer.
В одном варианте осуществления ингибитор PI3K или ^)-Ы1-(4-метил-5-(2-(1,1,1-трифтор-2метилпропан-2-ил)пиридин-4-ил)тиазол-2-ил)пирролидин-1,2-дикарбоксамид (соединение А8) вводят в дозе приблизительно от 150 до 300, от 200 до 300, от 200 до 400 или от 300 до 400 мг (например, в день), например, приблизительно 200, 300 или 400 мг.In one embodiment, a PI3K inhibitor or γ)-N1-(4-methyl-5-(2-(1,1,1-trifluoro-2methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl)thiazol-2-yl)pyrrolidine -1,2-dicarboxamide (Compound A8) is administered at a dose of about 150 to 300, 200 to 300, 200 to 400, or 300 to 400 mg (eg, per day), such as about 200, 300, or 400 mg .
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором цитохрома Р450 (например, ингибитором CYP17) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/149755, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор цитохрома Р450 (например, ингибитор CYP17) представляет собой соединение, раскрытое в опубликованной заявке РСТ № WO 2010/149755. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2010/149755, для лечения рака предстательной железы.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a cytochrome P450 inhibitor (e.g., a CYP17 inhibitor) or with a compound described in published PCT application WO 2010/149755, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, a cytochrome P450 inhibitor (eg, a CYP17 inhibitor) is a compound disclosed in PCT Published Application No. WO 2010/149755. In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with a compound described in PCT Published Application No. WO 2010/149755 for the treatment of prostate cancer.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором HDM2 (S)-1-(4хлорфенил)-7-изопропокси-6-метокси-2-(4-(метил(((1r,4S)-4-(4-метил-3 -оксопиперазин-1 ил)циклогексил)метил)амино)фенил)-1,2-дигидроизохинолин-3(4Н)-он (соединение А10) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2011/076786, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении). В одном варианте осуществления ингибитором HDM2 является (S)-1-(4-хлорфенил)-7-изопропокси-6-метокси-2-(4-(метил(((1r,4S)-4-(4-метил-3-оксопиперазин-1ил)циклогексил)метил)амино)фенил)-1,2-дигидроизохинолин-3(4Н)-он (соединение А10) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2011/076786. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением ^)-1-(4-хлорфенил)-7изопропокси-6-метокси-2-(4-(метил(((1r,4S)-4-(4-метил-3-оксопиперазин-1ил)циклогексил)метил)амино)фенил)-1,2-дигидроизохинолин-3(4Н)-он (соединение А10), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2011/076786, для лечения заболевания, такого как солидная опухоль.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an HDM2 inhibitor (S)-1-(4chlorophenyl )-7-isopropoxy-6-methoxy-2-(4-(methyl(((1r,4S)-4-(4-methyl-3-oxopiperazin-1 yl)cyclohexyl)methyl)amino)phenyl)-1, 2-dihydroisoquinolin-3(4H)-one (compound A10) or with the compound described in the published PCT application WO 2011/076786, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention). In one embodiment, the HDM2 inhibitor is (S)-1-(4-chlorophenyl)-7-isopropoxy-6-methoxy-2-(4-(methyl(((1r,4S)-4-(4-methyl-3 -oxopiperazin-1yl)cyclohexyl)methyl)amino)phenyl)-1,2-dihydroisoquinolin-3(4H)-one (compound A10) or the compound described in PCT Published Application No. WO 2011/076786. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with the compound ^)-1-(4-chlorophenyl)-7isopropoxy-6-methoxy-2-(4-(methyl(((1r,4S)-4-( 4-methyl-3-oxopiperazin-1yl)cyclohexyl)methyl)amino)phenyl)-1,2-dihydroisoquinolin-3(4H)-one (compound A10), or the compound described in published PCT application WO 2011/076786, for the treatment of a disease such as a solid tumor.
В одном из вариантов осуществления ингибитор HDM2 или ^)-1-(4-хлорфенил)-7-изопропокси-6метокси-2-(4-(метил(((1r,4S)-4-(4-метил-3-оксопиперазин-1-ил)циклогексил)метил)амино)фенил)-1,2дигидроизохинолин-3(4Н)-он (соединение А10) вводят в дозе приблизительно от 400 до 700 мг, например, вводят три раза в неделю, в течение 2 недель с перерывом на одну неделю. В некоторых вариантах осуществления доза составляет приблизительно 400, 500, 600 или 700 мг, от 400 до 500, от 500 до 600 или от 600 до 700 мг, которую вводят, например, три раза в неделю.In one embodiment, an HDM2 inhibitor or ^)-1-(4-chlorophenyl)-7-isopropoxy-6methoxy-2-(4-(methyl(((1r,4S)-4-(4-methyl-3-oxopiperazine -1-yl)cyclohexyl)methyl)amino)phenyl)-1,2dihydroisoquinolin-3(4H)-one (compound A10) is administered at a dose of approximately 400 to 700 mg, for example, administered three times a week, for 2 weeks with a break of one week. In some embodiments, the dose is about 400, 500, 600, or 700 mg, 400 to 500, 500 to 600, or 600 to 700 mg, administered, for example, three times a week.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, используется в комбинации с препаратом Деферазирокс, хелатирующим железо (также известным как Эксиджад, соединение A11) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 1997/049395, для лечения заболевания, например, заболевания, упомяIn another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the iron chelating drug Deferasirox (also known as Exjade , compound A11) or with a compound described in published PCT application WO 1997/049395, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned
- 78 045940 нутого в изобретении. В одном варианте осуществления железо хелатирующий вещество представляет собой Деферазирокс или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 1997/049395. В одном варианте осуществления препаратом, хелатирующим железо, является Деферазирокс (соединение A11). В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Деферазироксом (соединением A11), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO РСТ WO 1997/049395, для лечения перегрузки железом, гемохроматоза или миелодисплазии.- 78 045940 in the invention. In one embodiment, the iron chelating agent is Deferasirox or a compound described in published PCT application WO 1997/049395. In one embodiment, the iron chelating drug is Deferasirox (compound A11). In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Deferasirox (compound A11), or with a compound described in PCT published application WO PCT WO 1997/049395, for the treatment of iron overload, hemochromatosis or myelodysplasia.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором ароматазы Летрозолом (также известным как Фемара; соединение А12), или с соединением, описанным в патенте США 4978672, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором ароматазы является Летрозол (соединение А12) или соединение, описанное в патенте США 4978672. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Летрозолом (соединение А12), или с соединением, раскрытым в патенте США 4978672, для лечения такого заболевания, как рак, лейомиосаркома, рак эндометрия, рак молочной железы, рак женской репродуктивной системы или гормональная недостаточность.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the aromatase inhibitor Letrozole (also known as Femara; compound A12), or with a compound described in US Pat. No. 4,978,672, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the aromatase inhibitor is Letrozole (Compound A12) or a compound disclosed in US Pat. No. 4,978,672. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Letrozole (Compound A12), or a compound disclosed in US Pat. No. 4,978,672 , for the treatment of a disease such as cancer, leiomyosarcoma, endometrial cancer, breast cancer, cancer of the female reproductive system or hormonal deficiency.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором PI3K, например, ингибитором пан-РПК (4S,5R)-3-(2'-амино-2-морфолино-4'-(трифторметил)-[4,5'-бипиримидин]-6-ил)-4(гидроксиметил)-5-метилоксазолидин-2-он (соединение А13) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2013/124826, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором PI3K является (4S,5R)-3-(2'-амино-2морфолино-4'-(трифторметил)-[4,5'-бипиримидин]-6-ил)-4-(гидроксиметил)-5-метилоксазолидин-2-он (соединение А13) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2013/124826. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением (4S,5R)-3-(2'-амино-2-морфолино-4'-(трифторметил)-[4,5'-бипиримидин]-6-ил)-4-(гидроксиметил)-5метилоксазолидин-2-он (соединение А13), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2013/124826, для лечения такого заболевания, как рак или прогрессирующая солидная опухоль.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a PI3K inhibitor, e.g., a pan-PKK inhibitor ( 4S,5R)-3-(2'-amino-2-morpholino-4'-(trifluoromethyl)-[4,5'-bipyrimidin]-6-yl)-4(hydroxymethyl)-5-methyloxazolidin-2-one (compound A13) or with a compound described in published PCT application WO 2013/124826, for the treatment of a disease, for example the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the PI3K inhibitor is (4S,5R)-3-(2'-amino-2morpholino-4'-(trifluoromethyl)-[4,5'-bipyrimidin]-6-yl)-4-(hydroxymethyl)- 5-methyloxazolidin-2-one (compound A13) or the compound described in published PCT application WO 2013/124826. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with the compound (4S,5R)-3-(2'-amino-2-morpholino-4'-(trifluoromethyl)-[4,5'-bipyrimidine]-6 -yl)-4-(hydroxymethyl)-5methyloxazolidin-2-one (compound A13), or with the compound described in published PCT application WO 2013/124826, for the treatment of a disease such as cancer or advanced solid tumor.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором р53 и/или с ингибитором взаимодействия Mdm2/p53, представляющим собой ^)-5-(5-хлор-1-метил-2-оксо-1,2дигидропиридин-3-ил)-6-(4-хлорфенил)-2-(2,4-диметоксипиримидин-5-ил)-1-изопропил-5,6дигидропирроло[3,4Д]имидазол-4(1Н)-он (соединение А14), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2013/111105, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор р53 и/или ингибитор взаимодействия p53/Mdm2 представляет собой ^)-5-(5-хлор-1-метил-2-оксо-1,2-дигидропиридин-3-ил)-6-(4-хлорфенил)2-(2,4-диметоксипиримидин-5-ил)-1-изопропил-5,6-дигидропирроло[3,4Д]имидазол-4(1Н)-он (соединение А14) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2013/111105. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением ^)-5-(5-хлор1-метил-2-оксо-1,2-дигидропиридин-3-ил)-6-(4-хлорфенил)-2-(2,4-диметоксипиримидин-5-ил)-1изопропил-5,6-дигидропирроло[3,4Д]имидазол-4(1Н)-он (соединение А14), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2013/111105, для лечения такого заболевания, как рак или саркома мягких тканей.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a p53 inhibitor and/or an Mdm2/interaction inhibitor. p53, which is ^)-5-(5-chloro-1-methyl-2-oxo-1,2dihydropyridin-3-yl)-6-(4-chlorophenyl)-2-(2,4-dimethoxypyrimidin-5- yl)-1-isopropyl-5,6dihydropyrrolo[3,4D]imidazol-4(1H)-one (compound A14), or with a compound described in published PCT application WO 2013/111105, for the treatment of a disease, e.g. mentioned in the invention. In one embodiment, the p53 inhibitor and/or the p53/Mdm2 interaction inhibitor is ^)-5-(5-chloro-1-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)-6-(4- chlorophenyl)2-(2,4-dimethoxypyrimidin-5-yl)-1-isopropyl-5,6-dihydropyrrolo[3,4D]imidazol-4(1H)-one (compound A14) or a compound described in a published PCT application WO 2013/111105. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with the compound ^)-5-(5-chloro1-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)-6-(4-chlorophenyl)- 2-(2,4-dimethoxypyrimidin-5-yl)-1isopropyl-5,6-dihydropyrrolo[3,4D]imidazol-4(1H)-one (compound A14), or with the compound described in the published PCT application WO 2013 /111105, for the treatment of a disease such as cancer or soft tissue sarcoma.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором тирозинкиназы CSF-1R, 4-((2-(((^^)-2-гидроксициклогексил)амино)бензоЩтиазол-6-ил)окси)-Ыметилпиколинамидом (соединение А15), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2005/073224, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором тирозинкиназы CSF-1R является 4-((2-(((1R,2R)-2гидроксициклогексил)амино)бензоЩтиазол-6-ил)окси)-Ы-метилпиколинамид (соединение А15) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2005/073224. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с 4-((2-(((1R,2R)-2гидроксициклогексил)амино)бензоЩтиазол-6-ил)окси)-Ы-метилпиколинамидом (соединение А15) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2005/073224, для лечения заболевания, такого как рак.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a CSF-1R tyrosine kinase inhibitor, 4-(( 2-(((^^)-2-hydroxycyclohexyl)amino)benzothiazol-6-yl)oxy)-Nmethylpicolinamide (compound A15), or with the compound described in the published PCT application WO 2005/073224, for the treatment of a disease, e.g. disease mentioned in the invention. In one embodiment, the CSF-1R tyrosine kinase inhibitor is 4-((2-(((1R,2R)-2hydroxycyclohexyl)amino)benzothiazol-6-yl)oxy)-N-methylpicolinamide (compound A15) or a compound described in published PCT application No. WO 2005/073224. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with 4-((2-(((1R,2R)-2hydroxycyclohexyl)amino)benzothiazol-6-yl)oxy)-N-methylpicolinamide (compound A15) or a compound described in PCT Published Application No. WO 2005/073224 for the treatment of a disease such as cancer.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с индуктором апоптоза и/или с ингибитором ангиогенеза, таким как Иматиниб мезилат (также известный как Гливек, соединение А16),In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an apoptosis inducer and/or an angiogenesis inhibitor, such as Imatinib mesylate (also known as Gleevec, compound A16),
- 79 045940 или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 1999/003854, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления индуктор апоптоза и/или ингибитор ангиогенеза представляет собой Иматиниб мезилат (соединение А16) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 1999/003854. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с препаратом Иматиниб мезилат (соединение А16), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 1999/003854, для лечения такого заболевания, как рак, множественная миелома, рак предстательной железы, немелкоклеточный рак легкого, лимфома, рак желудка, меланома, рак молочной железы, рак поджелудочной железы, рак пищеварительной системы/желудочно-кишечного тракта, колоректальный рак, мультиформная глиобластома, рак печени, рак головы и шеи, астма, рассеянный склероз, аллергия, болезнь Альцгеймера, боковой амиотрофический склероз или ревматоидный артрит.- 79 045940 or with a compound described in published PCT application WO 1999/003854, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the apoptosis inducer and/or angiogenesis inhibitor is Imatinib mesylate (compound A16) or a compound described in PCT published application WO 1999/003854. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with the drug Imatinib mesylate (compound A16), or with a compound described in published PCT application WO 1999/003854, for the treatment of a disease such as cancer, multiple myeloma, prostate cancer , non-small cell lung cancer, lymphoma, stomach cancer, melanoma, breast cancer, pancreatic cancer, digestive/gastrointestinal cancer, colorectal cancer, glioblastoma multiforme, liver cancer, head and neck cancer, asthma, multiple sclerosis, allergies, Alzheimer's disease, amyotrophic lateral sclerosis or rheumatoid arthritis.
В некоторых вариантах осуществления Иматиниб мезилат (соединение А16) вводят в дозе приблизительно от 100 до 1000 мг, например, приблизительно от 200 до 800 мг, приблизительно от 300 до 700 мг или приблизительно от 400 до 600 мг, например, приблизительно 200, 300, 400, 500, 600 или 700 мг. Схема введения может варьироваться, например, от введения через день до введения два раза или три раза в день. В одном варианте осуществления Иматиниб мезилат вводят перорально в дозе приблизительно от 100 до 600 мг в день, например, приблизительно 100, 200, 260, 300, 400 или 600 мг в день.In some embodiments, Imatinib mesylate (Compound A16) is administered at a dose of about 100 to 1000 mg, such as about 200 to 800 mg, about 300 to 700 mg, or about 400 to 600 mg, such as about 200, 300, 400, 500, 600 or 700 mg. The administration schedule may vary, for example, from administration every other day to administration twice or three times a day. In one embodiment, Imatinib mesylate is administered orally at a dose of about 100 to 600 mg per day, such as about 100, 200, 260, 300, 400, or 600 mg per day.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором JAK, 2-фтор-Ыметил-4-(7-(хинолин-6-ил)имидазо[1,2-b][1,2,4]триазин-2-ил)бензамидом (соединение А17) или его дигидрохлоридной солью, или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2007/070514, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор JAK представляет собой 2-фтор-Ы-метил-4-(7-(хинолин-6ил)имидазо[1,2-b][1,2,4]триазин-2-ил)бензамид (соединение А17) или его дигидрохлоридную соль, или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2007/070514. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с 2-фтор-Ы-метил-4-(7-(хинолин-6ил)имидазо[1,2-b][1,2,4]триазин-2-ил)бензамидом (соединение А17) или его дигидрохлоридной солью, или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2007/070514, для лечения такого заболевания, как колоректальный рак, миелоидный лейкоз, гематологический рак, аутоиммунное заболевание, неходжкинская лимфома или тромбоцитемия.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a JAK inhibitor, 2-fluoro-Nmethyl-4 -(7-(quinolin-6-yl)imidazo[1,2-b][1,2,4]triazin-2-yl)benzamide (compound A17) or its dihydrochloride salt, or with the compound described in the published application PCT No. WO 2007/070514, for the treatment of a disease, for example the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the JAK inhibitor is 2-fluoro-N-methyl-4-(7-(quinolin-6yl)imidazo[1,2-b][1,2,4]triazin-2-yl)benzamide (compound A17) or its dihydrochloride salt, or a compound described in published PCT application WO 2007/070514. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with 2-fluoro-N-methyl-4-(7-(quinolin-6yl)imidazo[1,2-b][1,2,4]triazine-2 -yl)benzamide (compound A17) or its dihydrochloride salt, or with the compound described in PCT published application WO 2007/070514, for the treatment of a disease such as colorectal cancer, myeloid leukemia, hematological cancer, autoimmune disease, non-Hodgkin's lymphoma or thrombocythemia.
В одном варианте осуществления ингибитор JAK или 2-фтор-Ы-метил-4-(7-(хинолин-6ил)имидазо[1,2-b][1,2,4]триазин-2-ил)бензамид (соединение А17) или его дигидрохлоридную соль вводят в дозе приблизительно от 400 до 600 мг (например, в день), например, приблизительно 400, 500 или 600 мг, или приблизительно от 400 до 500 или от 500 до 600 мг.In one embodiment, a JAK inhibitor or 2-fluoro-N-methyl-4-(7-(quinolin-6yl)imidazo[1,2-b][1,2,4]triazin-2-yl)benzamide (compound A17 ) or its dihydrochloride salt is administered at a dose of about 400 to 600 mg (eg, per day), such as about 400, 500 or 600 mg, or about 400 to 500 or 500 to 600 mg.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором JAK, препаратом Руксолитиниб фосфат (также известный как JAKAFI, соединение А18), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2007/070514, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором JAK является Руксолитиниб фосфат (соединение А18) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2007/070514. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с препаратом Руксолитиниб фосфат (соединение А18), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2007/070514, для лечения заболевания, такого как рак предстательной железы, лимфоцитарный лейкоз, миеломная болезнь, лимфома, рак легкого, лейкоз, кахексия, рак молочной железы, рак поджелудочной железы, ревматоидный артрит, псориаз, колоректальный рак, миелобластный лейкоз, гематологический рак, аутоиммунное заболевание, неходжкинская лимфома или тромбоцитемия.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the JAK inhibitor drug Ruxolitinib phosphate (also known as JAKAFI, compound A18), or with a compound described in published PCT application WO 2007/070514, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the JAK inhibitor is Ruxolitinib phosphate (compound A18) or a compound described in published PCT application WO 2007/070514. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with the drug Ruxolitinib phosphate (compound A18), or with a compound described in PCT Published Application No. WO 2007/070514, for the treatment of a disease such as prostate cancer, lymphocytic leukemia, multiple myeloma, lymphoma, lung cancer, leukemia, cachexia, breast cancer, pancreatic cancer, rheumatoid arthritis, psoriasis, colorectal cancer, myeloblastic leukemia, hematologic cancer, autoimmune disease, non-Hodgkin's lymphoma, or thrombocythemia.
В одном варианте осуществления ингибитор JAK или Руксолитиниб фосфат (соединение А18) вводят в дозе приблизительно от 15 до 25 мг, например, два раза в день. В некоторых вариантах осуществления доза составляет приблизительно 15, 20 или 25 мг, или приблизительно от 15 до 20 или от 20 до 25 мг.In one embodiment, the JAK inhibitor or Ruxolitinib phosphate (Compound A18) is administered at a dose of about 15 to 25 mg, for example, twice daily. In some embodiments, the dose is about 15, 20, or 25 mg, or about 15 to 20, or 20 to 25 mg.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором деацетилазы (DAC), препаратом Панобиностат (соединение А19) или с соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2014/072493, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором DAC является Панобиностат (соединение А19) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2014/072493. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Панобиностатом (соединение А19), с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2014/072493, для лечения заболевания, такого как мелкоклеточный рак легкого, рак респираторной системы/грудной клетки, рак предстательной желеIn another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the deacetylase (DAC) inhibitor drug Panobinostat (compound A19) or with a compound disclosed in published PCT application WO 2014/072493, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the DAC inhibitor is Panobinostat (compound A19) or a compound described in published PCT application WO 2014/072493. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Panobinostat (compound A19), a compound described in PCT published application WO 2014/072493, to treat a disease such as small cell lung cancer, respiratory/chest cancer, prostate cancer
- 80 045940 зы, множественная миелома, миелодисплатический синдром, рак кости, немелкоклеточный рак легкого, рак эндокринной системы, лимфома, рак нервной системы, лейкоз, ВИЧ/СПИД, иммунное заболевание, реакция отторжения трансплантата, рак желудка, меланома, рак молочной железы, рак поджелудочной железы, колоректальный рак, мультиформная глиобластома, миелоидный лейкоз, гематологический рак, рак почки, неходжкинская лимфома, рак головы и шеи, нарушения гемопоэза или рак печени.- 80 045940 zy, multiple myeloma, myelodysplastic syndrome, bone cancer, non-small cell lung cancer, endocrine system cancer, lymphoma, nervous system cancer, leukemia, HIV/AIDS, immune disease, transplant rejection, stomach cancer, melanoma, breast cancer, pancreatic cancer, colorectal cancer, glioblastoma multiforme, myeloid leukemia, hematological cancer, kidney cancer, non-Hodgkin's lymphoma, head and neck cancer, hematopoietic disorders or liver cancer.
В одном варианте осуществления ингибитор DAC или Панобиностат (соединение А19) вводят в дозе приблизительно 20 мг (например, в день).In one embodiment, a DAC inhibitor or Panobinostat (compound A19) is administered at a dose of approximately 20 mg (eg, per day).
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с одним или несколькими из ингибиторов цитохрома Р450 (например, 11В2), альдостерона или ангиогенеза, препаратом Осилодростат (соединение А20), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2007/024945 для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления один или несколько из ингибиторов цитохрома Р450 (например, 11В2), альдостерона или ангиогенеза представляет собой Осилодростат (соединение А20) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2007/024945. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Осилодростатом (соединение А20) или с соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2007/024945, для лечения заболевания, такого как синдром Кушинга, гипертония или сердечная недостаточность.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with one or more cytochrome P450 inhibitors (e.g. 11B2), aldosterone or angiogenesis, the drug Osilodrostat (compound A20), or with a compound described in published PCT application WO 2007/024945 for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, one or more of the cytochrome P450 (eg, 11B2), aldosterone, or angiogenesis inhibitors is Osilodrostat (compound A20) or a compound described in PCT published application WO 2007/024945. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Osilodrostat (compound A20) or a compound disclosed in PCT published application WO 2007/024945 to treat a disease such as Cushing's syndrome, hypertension or heart failure.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором IAP (S)-N-((S)-1циклогексил-2-(^)-2-(4-(4-фторбензоил)тиазол-2-ил)пирролидин-1-ил)-2-оксоэтил)-2(метиламино)пропанамидом (соединение А21) или с соединением, описанным в патенте США 8552003, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором IAP является ^)-Ы-(^)-1-циклогексил-2-(^)-2-(4-(4-фторбензоил)тиазол-2ил)пирролидин-1-ил)-2-оксоэтил)-2-(метиламино) пропанамид (соединение А21) или соединение, раскрытое в патенте США 8552003. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с ^)-Н-(^)-1-циклогексил-2-(^)-2-(4-(4-фторбензоил)тиазол-2-ил)пирролидин1-ил)-2-оксоэтил)-2-(метиламино)пропанамидом (соединением А21), или с соединением, описанным в патенте США 8552003, для лечения такого заболевания, как множественная миелома, рак молочной железы, рак яичника, рак поджелудочной железы или нарушение гемопоэза.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an IAP inhibitor (S)-N-(( S)-1cyclohexyl-2-(^)-2-(4-(4-fluorobenzoyl)thiazol-2-yl)pyrrolidin-1-yl)-2-oxoethyl)-2(methylamino)propanamide (compound A21) or with a compound described in US Pat. No. 8,552,003 for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the IAP inhibitor is ^)-N-(^)-1-cyclohexyl-2-(^)-2-(4-(4-fluorobenzoyl)thiazol-2yl)pyrrolidin-1-yl)-2-oxoethyl )-2-(methylamino)propanamide (compound A21) or the compound disclosed in US Pat. No. 8,552,003. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with ^)-H-(^)-1-cyclohexyl-2- (^)-2-(4-(4-fluorobenzoyl)thiazol-2-yl)pyrrolidin1-yl)-2-oxoethyl)-2-(methylamino)propanamide (compound A21), or the compound described in US Pat. No. 8,552,003 , for the treatment of a disease such as multiple myeloma, breast cancer, ovarian cancer, pancreatic cancer or a disorder of hematopoiesis.
В одном варианте осуществления ингибитор IAP, или ^)-Ы-(^)-1-циклогексил-2-(^)-2-(4-(4фторбензоил)тиазол-2-ил)пирролидин-1-ил)-2-оксоэтил)-2-(метиламино)пропанамид (соединение А21), или соединение, описанное в патенте США 8552003, вводят в дозе приблизительно 1800 мг, например, один раз в неделю.In one embodiment, an IAP inhibitor, or ^)-N-(^)-1-cyclohexyl-2-(^)-2-(4-(4fluorobenzoyl)thiazol-2-yl)pyrrolidin-1-yl)-2- Oxoethyl)-2-(methylamino)propanamide (compound A21), or the compound described in US Pat. No. 8,552,003, is administered at a dose of approximately 1800 mg, for example, once a week.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором Smoothened (SMO), препаратом Сонидегиб фосфат (соединение А22), с соединением (Р)-2-(5-(4-(6-бензил-4.5диметилпиразин-3-ил)-2-метилпиперазин-1-ил)пиразин-2-ил)пропан-2-ол (соединение А25), или с соединением, описанным в опубликованных заявках РСТ WO 2007/131201 или WO 2010/007120, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор SMO представляет собой Сонидегиб фосфат (соединение А22), да-2-(5-(4-(6-бензил-4,5диметилпиразин-3-ил)-2-метил-пиперазин-1-ил)пиразин-2-ил)пропан-2-ол (соединение А25), или соединение, описанное в опубликованных заявках РСТ WO 2007/131201 или WO 2010/007120. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с препаратом Сонидегиб фосфат (соединение А22), с соединением ^)-2-(5-(4-(6-бензил-4,5-диметилпиразин-3-ил)-2-метилпиперазин-1-ил)пиразин-2-ил)пропан-2-ол (соединение А25) или с соединением, описанным в опубликованных заявках РСТ WO 2007/131201 или WO 2010/007120, для лечения такого заболевания, как рак, медуллобластома, мелкоклеточный рак легкого, рак предстательной железы, базально-клеточная карцинома, рак поджелудочной железы или воспаление.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the Smoothened (SMO) inhibitor drug Sonidegib phosphate ( compound A22), with compound (P)-2-(5-(4-(6-benzyl-4.5dimethylpyrazin-3-yl)-2-methylpiperazin-1-yl)pyrazin-2-yl)propan-2-ol (compound A25), or with a compound described in published PCT applications WO 2007/131201 or WO 2010/007120, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the SMO inhibitor is Sonidegib phosphate (compound A22), da-2-(5-(4-(6-benzyl-4,5dimethylpyrazin-3-yl)-2-methyl-piperazin-1-yl)pyrazine -2-yl)propan-2-ol (compound A25), or the compound described in published PCT applications WO 2007/131201 or WO 2010/007120. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with the drug Sonidegib phosphate (compound A22), with the compound ^)-2-(5-(4-(6-benzyl-4,5-dimethylpyrazin-3-yl) -2-methylpiperazin-1-yl)pyrazin-2-yl)propan-2-ol (compound A25) or with the compound described in published PCT applications WO 2007/131201 or WO 2010/007120, for the treatment of a disease such as cancer , medulloblastoma, small cell lung cancer, prostate cancer, basal cell carcinoma, pancreatic cancer or inflammation.
В некоторых вариантах осуществления Сонидегиб фосфат (соединение А22) вводится в дозе приблизительно от 20 до 500 мг, например, приблизительно от 40 до 400 мг, приблизительно от 50 до 300 мг, или приблизительно от 100 до 200 мг, например, приблизительно 50, 100, 150, 200, 250 или 300 мг. Схема введения может варьироваться, например, от введения через день до ежедневного введения один, два раза или три раза в день.In some embodiments, Sonidegib phosphate (Compound A22) is administered at a dose of about 20 to 500 mg, such as about 40 to 400 mg, about 50 to 300 mg, or about 100 to 200 mg, such as about 50, 100 , 150, 200, 250 or 300 mg. The administration schedule may vary, for example, from administration every other day to daily administration once, twice or three times a day.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором Alk, церитинибом (также известным как Зикадиа/ZYKADIA; Соединение А23) или с соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2007/131201, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого вIn another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the Alk inhibitor, ceritinib (also known as Zykadia/ ZYKADIA; Compound A23) or with a compound disclosed in published PCT application WO 2007/131201, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in
- 81 045940 изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором Alk является церитиниб (соединение А23) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2007/131201. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с церитинибом (соединение А23) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2007/131201, для лечения такого заболевания, как немелкоклеточный рак легкого или солидная опухоль.- 81 045940 invention. In one embodiment, the Alk inhibitor is ceritinib (compound A23) or a compound described in PCT Published Application No. WO 2007/131201. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with ceritinib (compound A23) or a compound described in PCT Published Application No. WO 2007/131201 to treat a disease such as non-small cell lung cancer or a solid tumor.
В одном варианте осуществления ингибитор Alk или церитиниб (соединение А23) вводят в дозе приблизительно 750 мг, например, один раз в день.In one embodiment, the Alk inhibitor or ceritinib (compound A23) is administered at a dose of approximately 750 mg, for example, once daily.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором JAK и/или CDK4/6 7-циклопентил-У№диметил-2-((5-(пиперазин-1-ил)пиридин-2-ил)амино)-7Н-пирроло[2,3^]пиримидин6-карбоксамидом (соединение А24), или с соединением, описанным в патенте США 8415355 или в патенте США 8685980 для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором JAK и/или CDK4/6 является 7-циклопентил-Ы,№диметил2-((5-(пиперазин-1-ил)пиридин-2-ил)амино)-7Н-пирроло[2,3^]пиримидин-6-карбоксамид (соединениеIn another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a JAK and/or CDK4/6 inhibitor 7- cyclopentyl-YNdimethyl-2-((5-(piperazin-1-yl)pyridin-2-yl)amino)-7H-pyrrolo[2,3^]pyrimidine6-carboxamide (compound A24), or with the compound described in US patent 8415355 or in US patent 8685980 for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the JAK and/or CDK4/6 inhibitor is 7-cyclopentyl-N,N-dimethyl2-((5-(piperazin-1-yl)pyridin-2-yl)amino)-7H-pyrrolo[2,3^ ]pyrimidine-6-carboxamide (compound
А24) или соединение, описанное в патенте США 8415355 или в патенте США № 8685980. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с 7-циклопентил-Ы,№ диметил-2-((5-(пиперазин-1-ил)пиридин-2-ил)амино)-7Н-пирроло[2,3^]пиримидин-6-карбоксамидом (соединение А24) или с соединением, описанным в патентах США US 8415355 или US 8685980, для лечения такого заболевания, как лимфома, рак нервной системы, меланома, рак молочной железы или солидная опухоль.A24) or a compound described in US Pat. No. 8,415,355 or US Pat. No. 8,685,980. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with 7-cyclopentyl-N,N-dimethyl-2-((5-(piperazine-1 -yl)pyridin-2-yl)amino)-7H-pyrrolo[2,3^]pyrimidine-6-carboxamide (compound A24) or with the compound described in US patents US 8415355 or US 8685980, for the treatment of a disease such as lymphoma, nervous system cancer, melanoma, breast cancer or solid tumor.
В одном варианте осуществления ингибитор JAK и/или CDK4/6, или 7-циклопентил-Ы,№диметил2-((5-(пиперазин-1-ил)пиридин-2-ил)амино)-7Н-пирроло[2,3^]пиримидин-6-карбоксамид (соединение А24) вводят в дозе приблизительно от 200 до 600 мг, например, в день. В одном варианте осуществления указанное соединение вводят в дозе приблизительно 200, 300, 400, 500 или 600 мг, или приблизительно от 200 до 300, от 300 до 400, от 400 до 500 или от 500 до 600 мг.In one embodiment, a JAK and/or CDK4/6 inhibitor, or 7-cyclopentyl-N,N-dimethyl2-((5-(piperazin-1-yl)pyridin-2-yl)amino)-7H-pyrrolo[2,3 ^]pyrimidine-6-carboxamide (compound A24) is administered at a dose of approximately 200 to 600 mg, for example, per day. In one embodiment, the compound is administered at a dose of about 200, 300, 400, 500, or 600 mg, or about 200 to 300, 300 to 400, 400 to 500, or 500 to 600 mg.
В другом варианте осуществления молекула антитела, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором пролактинового рецептора (PRLR), молекулой человеческого моноклонального антитела (соединение А26), раскрытого в патенте США 7867493), для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор PRLR представляет собой человеческое моноклональное антитело (соединение А26), раскрытое в патенте США 7867493. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с молекулой моноклонального человеческого антитела (соединение А26), описанной в патенте США 7867493, для лечения такого заболевания, как рак, рак предстательной железы или рак молочной железы.In another embodiment, an antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a prolactin receptor (PRLR) inhibitor, a human monoclonal antibody molecule (compound A26 ), disclosed in US patent 7867493), for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the PRLR inhibitor is a human monoclonal antibody (Compound A26) disclosed in US Pat. No. 7,867,493. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with a human monoclonal antibody molecule (Compound A26) disclosed in US Pat. No. 7,867,493 , for the treatment of a disease such as cancer, prostate cancer or breast cancer.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором PIM киназы, N-(4((Ш^^)-3-амино-5-метилциклогексил)пиридин-3-ил)-6-(2,6-дифторфенил)-5-фторпиколинамидом (соединение А27) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/026124, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором PIM киназы является №(4-((Ш^^)-3-амино-5-метилциклогексил)пиридин-3-ил)6-(2,6-дифторфенил)-5-фторпиколинамид (соединение А27) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2010/026124. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с №(4-((Ш^^)-3-амино-5-метилциклогексил)пиридин-3-ил)-6-(2,6дифторфенил)-5-фторпиколинамидом (соединение А27) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/026124, для лечения заболевания, такого как множественная миелома, миелодиспластический синдром, миелоидный лейкоз или неходжкинская лимфома.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a PIM kinase inhibitor, N-(4(( W^^)-3-amino-5-methylcyclohexyl)pyridin-3-yl)-6-(2,6-difluorophenyl)-5-fluoropicolinamide (compound A27) or the compound described in published PCT application WO 2010/026124 , for treating a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the PIM kinase inhibitor is N(4-((N^^)-3-amino-5-methylcyclohexyl)pyridin-3-yl)6-(2,6-difluorophenyl)-5-fluoropicolinamide (compound A27) or a compound described in published PCT application WO 2010/026124. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Na(4-((N^^)-3-amino-5-methylcyclohexyl)pyridin-3-yl)-6-(2,6difluorophenyl)-5- fluoropicolinamide (compound A27) or a compound described in PCT published application WO 2010/026124, for the treatment of a disease such as multiple myeloma, myelodysplastic syndrome, myeloid leukemia or non-Hodgkin's lymphoma.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором сигнального пути Wnt, 2-(2',3-диметил-[2,4'-бипиридин]-5-ил)-№(5-(пиразин-2-ил)пиридин-2-ил) ацетамидом (соединение А28) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/101849, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор сигнального пути Wnt представляет собой 2-(2',3-диметил-[2,4'-бипиридин]-5-ил)-№(5-(пиразин-2ил)пиридин-2-ил)ацетамид (соединение А28) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2010/101849. В одном варианте осуществления ингибитор сигнального пути Wnt представляет собой 2-(2',3-диметил-[2,4'-бипиридин]-5-ил)-№(5-(пиразин-2-ил)пиридин-2-ил) ацетамид (соединение А28). В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с 2-(2',3диметил-[2,4'-бипиридин]-5-ил)-№(5-(пиразин-2-ил)пиридин-2-ил)ацетамидом (соединение А28) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/101849, для лечения такого заболеваIn another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a Wnt signaling pathway inhibitor, 2-(2' ,3-dimethyl-[2,4'-bipyridin]-5-yl)-N(5-(pyrazin-2-yl)pyridin-2-yl) acetamide (compound A28) or with a compound described in a published PCT application WO 2010/101849, for the treatment of a disease, for example the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the Wnt signaling pathway inhibitor is 2-(2',3-dimethyl-[2,4'-bipyridin]-5-yl)-N(5-(pyrazin-2yl)pyridin-2-yl)acetamide (compound A28) or a compound described in published PCT application WO 2010/101849. In one embodiment, the Wnt signaling pathway inhibitor is 2-(2',3-dimethyl-[2,4'-bipyridin]-5-yl)-N(5-(pyrazin-2-yl)pyridin-2-yl ) acetamide (compound A28). In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with 2-(2',3dimethyl-[2,4'-bipyridin]-5-yl)-N(5-(pyrazin-2-yl)pyridin-2 -yl)acetamide (compound A28) or with the compound described in the published PCT application WO 2010/101849, for the treatment of such a disease
- 82 045940 ния, как солидная опухоль (например, рак головы и шеи, плоскоклеточная карцинома, рак молочной железы, рак поджелудочной железы или рак толстой кишки).- 82 045940 as a solid tumor (for example, head and neck cancer, squamous cell carcinoma, breast cancer, pancreatic cancer or colon cancer).
В некоторых вариантах осуществления 2-(2'.3-диметил-[2.4'-бипиридин|-5-ил)-Н-(5-(пиразин-2ил)пиридин-2-ил)ацетамид (соединение А28) вводят в дозе приблизительно от 1 до 50 мг, например, приблизительно от 2 до 45 мг, приблизительно от 3 до 40 мг, приблизительно от 5 до 35 мг, приблизительно от 5 до 10 мг, или приблизительно от 10 до 30 мг, например, приблизительно 2, 5, 10, 20, 30 или 40 мг. Схема введения может варьироваться, например, от введения через день до ежедневного введения один, два раза или три раза в день.In some embodiments, 2-(2'.3-dimethyl-[2.4'-bipyridin|-5-yl)-H-(5-(pyrazin-2yl)pyridin-2-yl)acetamide (Compound A28) is administered at a dose about 1 to 50 mg, for example about 2 to 45 mg, about 3 to 40 mg, about 5 to 35 mg, about 5 to 10 mg, or about 10 to 30 mg, for example about 2, 5, 10, 20, 30 or 40 mg. The administration schedule may vary, for example, from administration every other day to daily administration once, twice or three times a day.
В другом варианте осуществления молекула антитела анти-PD-i, например, молекула антитела анти-PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором BRAF, Энкорафенибом (соединение А29) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2011/025927, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор BRAF представляет собой Энкорафениб (соединение А29) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2011/025927. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Энкорафенибом (соединение А29) или соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2011/025927, для лечения такого заболевания, как немелкоклеточный рак легкого, меланома или колоректальный рак.In another embodiment, an anti-PD-i antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the BRAF inhibitor, Encorafenib (Compound A29) or with a compound described in published PCT application WO 2011/025927, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the BRAF inhibitor is Encorafenib (compound A29) or a compound described in PCT Published Application No. WO 2011/025927. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Encorafenib (compound A29) or a compound described in PCT Published Application No. WO 2011/025927 to treat a disease such as non-small cell lung cancer, melanoma or colorectal cancer.
В одном варианте осуществления ингибитор BRAF или Энкорафениб (соединение А29) вводят в дозе приблизительно от 200 до 300, от 200 до 400 или от 300 до 400 мг, например, в день. В одном варианте осуществления соединение вводят в дозе приблизительно 200, приблизительно 300 или приблизительно 400 мг.In one embodiment, the BRAF inhibitor or Encorafenib (compound A29) is administered at a dose of about 200 to 300, 200 to 400, or 300 to 400 mg, for example, per day. In one embodiment, the compound is administered at a dose of about 200, about 300, or about 400 mg.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором CDK4/6, 7циклопентил-Н,№диметил-2-((5-((Щ^)-9-метил-4-оксо-3,9-диазабицикло[4.2.1]нонан-3-ил)пиридин-2ил)амино)-7Н-пирроло[2,3М]пиримидин-6-карбоксамидом (соединение А30), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2011/101409, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор CDK4/6 представляет собой 7-циклопентил-Ы,№диметил-2-((5-((Щ^)-9-метил-4-оксо-3,9-диазабицикло[4.2.1]нонан-3ил)пиридин-2-ил)амино)-7Н-пирроло[2,3М]пиримидин-6-карбоксамид (Соединение А30) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2011/101409. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с 7-циклопентил-Ы,№диметил-2-((5-((Щ^)-9метил-4-оксо-3,9-диазабицикло[4.2.1]нонан-3-ил)пиридин-2-ил)амино)-7Н-пирроло[2,3^]пиримидин-6карбоксамидом (соединение А30) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2011/101409, для лечения такого заболевания, рак, мантийноклеточная лимфома, липосаркома, немелкоклеточный рак легкого, меланома, плоскоклеточный рак пищевода или рак молочной железы.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a CDK4/6 inhibitor, 7cyclopentyl-H,No. dimethyl-2-((5-((N^)-9-methyl-4-oxo-3,9-diazabicyclo[4.2.1]nonan-3-yl)pyridin-2yl)amino)-7H-pyrrolo[2 ,3M]pyrimidine-6-carboxamide (compound A30), or with the compound described in the published PCT application WO 2011/101409, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the CDK4/6 inhibitor is 7-cyclopentyl-N,N-dimethyl-2-((5-((N^)-9-methyl-4-oxo-3,9-diazabicyclo[4.2.1]nonane -3yl)pyridin-2-yl)amino)-7H-pyrrolo[2.3M]pyrimidine-6-carboxamide (Compound A30) or the compound described in published PCT application WO 2011/101409. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with 7-cyclopentyl-N,N-dimethyl-2-((5-((N^)-9methyl-4-oxo-3,9-diazabicyclo[4.2.1 ]nonan-3-yl)pyridin-2-yl)amino)-7H-pyrrolo[2,3^]pyrimidine-6carboxamide (compound A30) or with the compound described in the published PCT application WO 2011/101409, for the treatment of such a disease , cancer, mantle cell lymphoma, liposarcoma, non-small cell lung cancer, melanoma, squamous cell carcinoma of the esophagus, or breast cancer.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором HER3, соединением А31 или соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2012/022814, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор HER3 представляет собой соединение А31 или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2012/022814. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением А31, или соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2012/022814, для лечения заболевания, такого как рак желудка, рак пищевода, рак головы и шеи, плоскоклеточная карцинома, рак желудка, рак молочной железы (например, метастатический рак молочной железы) или рак пищеварительной системы/рак желудочно-кишечного тракта.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an HER3 inhibitor, compound A31, or a compound disclosed in published PCT application WO 2012/022814, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the HER3 inhibitor is compound A31 or a compound described in published PCT application WO 2012/022814. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with compound A31, or a compound described in PCT published application WO 2012/022814, for the treatment of a disease such as gastric cancer, esophageal cancer, head and neck cancer, squamous cell carcinoma, stomach cancer, breast cancer (eg metastatic breast cancer) or digestive system/gastrointestinal cancer.
В некоторых вариантах осуществления соединение А31 представляет собой молекулу моноклонального человеческого антитела.In some embodiments, compound A31 is a human monoclonal antibody molecule.
В одном варианте осуществления ингибитор HER3 или соединение А31 вводят в дозе приблизительно 3, 10, 20 или 40 мг/кг, например, один раз в неделю (QW). В одном варианте осуществления соединение вводят в дозе приблизительно от 3 до 10, от 10 до 20 или от 20 до 40 мг/кг.In one embodiment, the HER3 inhibitor or compound A31 is administered at a dose of about 3, 10, 20 or 40 mg/kg, for example, once a week (QW). In one embodiment, the compound is administered at a dose of about 3 to 10, 10 to 20, or 20 to 40 mg/kg.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором FGFR2 и/или FGFR4, соединением А32 или соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2014/160160 (например, конъюгат лекарственное средство молекула антитела против FGFR2 и/или FGFR4, например, mAb 12425), для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор FGFR2 и/или FGFR4 представляет собой соединение А32 или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2014/160160. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением А32 или соединением, указаннымIn another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an FGFR2 and/or FGFR4 inhibitor, compound A32, or a compound disclosed in published PCT application WO 2014/160160 (eg, an antibody molecule drug conjugate against FGFR2 and/or FGFR4, eg mAb 12425), for treating a disease, eg a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the FGFR2 and/or FGFR4 inhibitor is compound A32 or a compound described in published PCT application WO 2014/160160. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with compound A32 or a compound specified
- 83 045940 в табл. 7, для лечения заболевания, такого как рак, рак желудка, рак молочной железы, рабдомиосаркома, рак печени, рак надпочечников, рак легкого, рак пищевода, рак толстой кишки или рак эндометрия.- 83 045940 in the table. 7, for the treatment of a disease such as cancer, stomach cancer, breast cancer, rhabdomyosarcoma, liver cancer, adrenal cancer, lung cancer, esophageal cancer, colon cancer or endometrial cancer.
В некоторых вариантах осуществления соединение А32 представляет собой конъюгат лекарственное средство - молекула антитела против FGFR2 и/или FGFR4, например, mAb 12425.In some embodiments, compound A32 is a drug-antibody conjugate against FGFR2 and/or FGFR4, such as mAb 12425.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором M-CSF, соединением А33 или соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2004/045532 (например, молекула антитела или Fab-фрагмент против M-CSF), для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор M-CSF представляет собой соединение А33 или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2004/045532. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением А33 или соединение, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2004/045532, для лечения заболевания, такого как рак, рак предстательной железы, рак молочной железы или пигментный виллонодулярный синовит (PVNS).In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an M-CSF inhibitor, compound A33, or a compound disclosed in published PCT application WO 2004/045532 (eg, an antibody molecule or Fab fragment against M-CSF), for treating a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the M-CSF inhibitor is compound A33 or a compound described in published PCT application WO 2004/045532. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with compound A33 or a compound described in PCT published application WO 2004/045532 to treat a disease such as cancer, prostate cancer, breast cancer or pigmented villonodular synovitis (PVNS). ).
В некоторых вариантах осуществления соединение А33 представляет собой моноклональное антитело против молекулы М-CSF или его фрагмент (например, Fab-фрагмент). В некоторых вариантах осуществления ингибитор M-CSF или соединение А33 вводят в средней дозе приблизительно 10 мг/кг.In some embodiments, compound A33 is a monoclonal antibody against an M-CSF molecule or a fragment thereof (eg, a Fab fragment). In some embodiments, the M-CSF inhibitor or Compound A33 is administered at an average dose of approximately 10 mg/kg.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором MEK, Биниметинибом (соединение A34) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2003/077914, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором MEK является Биниметиниб (соединение С34) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2003/077914. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Биниметинибом (соединение A34) или соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2003/077914, для лечения заболевания, такого как немелкоклеточный рак легкого, мультисистемного генетическое заболевание, меланома, рак яичника, рак пищеварительной системы/двенадцатиперстной кишки, ревматоидный артрит или колоректальный рак.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a MEK inhibitor, Binimetinib (compound A34) or a compound described in published PCT application WO 2003/077914, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the MEK inhibitor is Binimetinib (compound C34) or a compound described in published PCT application WO 2003/077914. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Binimetinib (compound A34) or a compound described in published PCT application WO 2003/077914 for the treatment of a disease such as non-small cell lung cancer, multisystem genetic disease, melanoma, ovarian cancer , digestive/duodenal cancer, rheumatoid arthritis or colorectal cancer.
В одном варианте осуществления ингибитор MEK или Биниметиниб (соединение А34) вводят в дозе приблизительно 45 мг, например, два раза в день.In one embodiment, a MEK inhibitor or Binimetinib (Compound A34) is administered at a dose of approximately 45 mg, for example, twice daily.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с одним или несколькими ингибиторами, такими как ингибитор c-KIT, ингибитор высвобождения гистамина, Flt3 (например, FLK2/STK1) или ингибитор PKC, с препаратом Мидостаурин (соединение A35) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2003/037347, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором является Мидостаурин (соединение А35) или соединение, раскрытое в опубликованной заявке РСТ № WO 2003/037347. В одном варианте осуществления один или несколько ингибиторов, таких как ингибитор c-KIT, ингибитор высвобождения гистамина, Flt3 (например, FLK2/STK1) или ингибитор PKC, предствляет собой Мидостаурин. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Мидостаурином (соединение A35) или соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2003/037347, для лечения заболевания, такого как рак, колоректальный рак, миелолейкоз, миелодиспластический синдром, возрастная макулярная дегенерация, диабетическое осложнение или кожное заболевание.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, such as an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with one or more inhibitors, such as a c- inhibitor KIT, a histamine release inhibitor, Flt3 (eg FLK2/STK1) or a PKC inhibitor, with the drug Midostaurin (compound A35) or with a compound described in published PCT application WO 2003/037347, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention . In one embodiment, the inhibitor is Midostaurin (compound A35) or a compound disclosed in PCT Published Application No. WO 2003/037347. In one embodiment, one or more inhibitors, such as a c-KIT inhibitor, a histamine release inhibitor, Flt3 (eg, FLK2/STK1), or a PKC inhibitor, is Midostaurin. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Midostaurin (compound A35) or a compound disclosed in published PCT application WO 2003/037347 for the treatment of a disease such as cancer, colorectal cancer, myeloid leukemia, myelodysplastic syndrome, age-related macular degeneration, diabetic complication or skin disease.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором TOR (например, с ингибитором mTOR), препаратом Эверолимус (также известным как Афинитор, соединение A36) или с соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2014/085318, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении). В одном варианте осуществления ингибитором TOR является Эверолимус (соединение A36) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2014/085318. В одном варианте осуществления молекула антитела PD-1 применяется в комбинации с Эверолимусом (соединение A36) для лечения заболевания, такого как интерстициальная болезнь легкого, мелкоклеточный рак легкого, рак респираторной системы/грудной клетки, рак предстательной железы, множественная миелома, саркома, возрастная макулярная дегенерация, рак кости, туберозный склероз, немелкоклеточный рак легкого, рак эндокринной системы, лимфома, неврологические заболевания астроцитома, рак шейки матки, рак нервной системы, лейкоз, иммунные заболевания, реакция отторжения трансплантата, рак желудка, меланома, эпилепсия, рак молочной железы или рак мочевого пузыря.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a TOR inhibitor (e.g., an mTOR inhibitor), the drug Everolimus (also known as Afinitor, compound A36) or with a compound disclosed in published PCT application WO 2014/085318, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention). In one embodiment, the TOR inhibitor is Everolimus (compound A36) or a compound described in published PCT application WO 2014/085318. In one embodiment, the PD-1 antibody molecule is used in combination with Everolimus (compound A36) to treat a disease such as interstitial lung disease, small cell lung cancer, respiratory/chest cancer, prostate cancer, multiple myeloma, sarcoma, age-related macular degeneration, bone cancer, tuberous sclerosis, non-small cell lung cancer, endocrine system cancer, lymphoma, neurological diseases astrocytoma, cervical cancer, nervous system cancer, leukemia, immune diseases, transplant rejection, gastric cancer, melanoma, epilepsy, breast cancer or bladder cancer.
В одном варианте осуществления ингибитор TOR или Эверолимус (соединение A36) вводят в дозе приблизительно от 2,5 до 20 мг/день. В одном варианте осуществления указанное соединение вводят вIn one embodiment, a TOR inhibitor or Everolimus (compound A36) is administered at a dose of approximately 2.5 to 20 mg/day. In one embodiment, said compound is administered to
- 84 045940 дозе приблизительно 2,5, 5, 10 или 20 мг/день, например, приблизительно 2,5-5, 5-10 или 10-20 мг/день.- 84 045940 dose of approximately 2.5, 5, 10 or 20 mg/day, for example approximately 2.5-5, 5-10 or 10-20 mg/day.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с одним или несколькими ингибиторами, такими как ингибиторы VEGFR-2, PDGFR-бета, KIT или Raf-киназы С, 1-метил-5-((2-(5(трифторметил)-1Н-имидазол-2-ил)пиридин-4-ил)окси)-Н-(4-(трифторметил)фенил)-1НбензоЩимидазол-2-амин (соединение А37) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2007/030377, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления один или несколько ингибиторов, такие как ингибиторы VEGFR-2, PDGFR-бета, KIT или Raf-киназы С, представляют собой 1-метил-5-((2-(5-(трифторметил)-1Н-имидазол2-ил)пиридин-4-ил)окси)-Н-(4-(трифторметил)фенил)-1Н-бензоЩимидазол-2-амин (соединение А37) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2007/030377. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с 1-метил-5-((2-(5-(трифторметил)-1Нимидазол-2-ил)пиридин-4-ил)окси)-Н-(4-(трифторметил)фенил)-1Н-бензоЩимидазол-2-амином (соединение А37) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2007/030377, для лечения заболевания, такого как рак, меланома или солидная опухоль.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with one or more inhibitors, such as VEGFR- 2, PDGFR-beta, KIT or Raf kinase C, 1-methyl-5-((2-(5(trifluoromethyl)-1H-imidazol-2-yl)pyridin-4-yl)oxy)-H-(4 -(trifluoromethyl)phenyl)-1Hbenzoshimidazol-2-amine (compound A37) or with the compound described in the published PCT application WO 2007/030377, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, one or more inhibitors, such as VEGFR-2, PDGFR-beta, KIT or Raf kinase C inhibitors, are 1-methyl-5-((2-(5-(trifluoromethyl)-1H-imidazole2- yl)pyridin-4-yl)oxy)-H-(4-(trifluoromethyl)phenyl)-1H-benzoshimidazol-2-amine (compound A37) or the compound described in PCT published application WO 2007/030377. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with 1-methyl-5-((2-(5-(trifluoromethyl)-1Nimidazol-2-yl)pyridin-4-yl)oxy)-H-(4 -(trifluoromethyl)phenyl)-1H-benzoshimidazol-2-amine (compound A37) or with the compound described in the published PCT application WO 2007/030377, for the treatment of a disease such as cancer, melanoma or solid tumor.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с агонистом соматостатина и/или ингибитором высвобождения гормона роста, препаратом Пазиреотид диаспартат (также известный как Сигнифор, соединение А38), или с соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2002/010192 или в патенте США № 7473761, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления агонист соматостатина и/или ингибитор высвобождения гормона роста представляет собой Пазиреотид диаспартат (соединение A38) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2002/010192 или в патенте США № 7473761. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с препаратом Пазиреотид диаспартат (соединение A38) или соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2002/010192 или в патенте США № 7473761, для лечения заболевания, такого как рак предстательной железы, рак эндокринной системы, рак нервной системы, рак кожи (например, меланома), рак поджелудочной железы, рак печени, синдром Кушинга, заболевание желудочно-кишечного тракта, акромегалия, заболевание печени и желчных путей или цирроз печени.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a somatostatin agonist and/or a growth hormone release inhibitor, the drug Pasireotide diaspartate (also known as Signifor, compound A38), or with a compound disclosed in published PCT application WO 2002/010192 or US patent No. 7473761, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the somatostatin agonist and/or growth hormone release inhibitor is Pasireotide diaspartate (compound A38) or a compound described in PCT Published Application WO 2002/010192 or US Patent No. 7,473,761. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule used in combination with the drug Pasireotide diaspartate (Compound A38) or a compound disclosed in PCT Published Application WO 2002/010192 or US Patent No. 7,473,761 for the treatment of a disease such as prostate cancer, endocrine cancer, nervous system cancer, skin cancer (eg, melanoma), pancreatic cancer, liver cancer, Cushing's syndrome, gastrointestinal disease, acromegaly, liver and biliary tract disease, or cirrhosis.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с модулятором сигнальной трансдукции и/или ингибитором ангиогенеза Довитинибом (соединение A39) или с соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2009/115562, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления модулятор сигнальной трансдукции и/или ингибитор ангиогенеза представляет собой Довитиниб (соединение А39) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ № WO 2009/115562. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Довитинибом (соединение A39) или соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2009/115562, для лечения заболевания, такого как рак, рак респираторной системы/грудной клетки, множественная миелома, рак предстательной железы, немелкоклеточный рак легкого, рак эндокринной системы или неврологическое генетическое заболевание.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the signal transduction modulator and/or angiogenesis inhibitor Dovitinib ( compound A39) or with a compound disclosed in published PCT application WO 2009/115562, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the signal transduction modulator and/or angiogenesis inhibitor is Dovitinib (compound A39) or a compound described in PCT Published Application No. WO 2009/115562. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Dovitinib (compound A39) or a compound described in PCT published application WO 2009/115562 to treat a disease such as cancer, respiratory/chest cancer, multiple myeloma, prostate cancer, non-small cell lung cancer, endocrine system cancer, or a neurological genetic disorder.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором EGFR, (R,R)-N-(7хлор-1-(1 -(4-(диметиламино)бут-2-еноил)азепан-3 -ил)-1Н-бензо Щ|имидазол-2-ил)-2метилизоникотинамидом (соединение А40) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2013/184757, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор EGFR представляет собой (И,К)-К-(7-хлор-1-(1-(4(диметиламино)бут-2-еноил)азепан-3-ил)-1Н-бензоЩимидазол-2-ил)-2-метилизоникотинамид (соединение А40) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2013/184757. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с (И,К)-К-(7-хлор-1-(1-(4(диметиламино)бут-2-еноил)азепан-3-ил)-1Н-бензоЩимидазол-2-ил)-2-метилизоникотинамидом (соединение А40) или соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2013/184757, для лечения заболевания, такого как рак, например, солидная опухоль.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an EGFR inhibitor, (R,R)-N -(7chloro-1-(1 -(4-(dimethylamino)but-2-enoyl)azepan-3-yl)-1H-benzo A|imidazol-2-yl)-2methylisonicotinamide (compound A40) or with the compound described in the published PCT application WO 2013/184757, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the EGFR inhibitor is (I,K)-K-(7-chloro-1-(1-(4(dimethylamino)but-2-enoyl)azepan-3-yl)-1H-benzoSchimidazol-2- yl)-2-methylisonicotinamide (compound A40) or the compound described in published PCT application WO 2013/184757. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with (I,K)-K-(7-chloro-1-(1-(4(dimethylamino)but-2-enoyl)azepan-3-yl)- 1H-benzoshimidazol-2-yl)-2-methylisonicotinamide (compound A40) or a compound described in published PCT application WO 2013/184757, for the treatment of a disease such as cancer, eg solid tumor.
В одном варианте осуществления ингибитор EGFR или ^Д)-Ы-(7-хлор-1-(1-(4-(диметиламино)бут2-еноил)азепан-3-ил)-1Н-бензоЩимидазол-2-ил)-2-метилизоникотинамид (соединение А40) вводят в дозе от 150 до 250 мг, например, в день. В одном варианте осуществления указанное соединение вводят в дозе приблизительно 150, 200 или 250 мг, или приблизительно от 150 до 200 или от 200 до 250 мг.In one embodiment, an EGFR inhibitor or IgD)-N-(7-chloro-1-(1-(4-(dimethylamino)but2-enoyl)azepan-3-yl)-1H-benzoSchimidazol-2-yl)-2 α-methylisonicotinamide (compound A40) is administered at a dose of 150 to 250 mg, for example, per day. In one embodiment, the compound is administered at a dose of about 150, 200 or 250 mg, or about 150 to 200 or 200 to 250 mg.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или не- 85 045940 сколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором ALK, N6-(2изопропокси-5-метил-4-(1-метилпиперидин-4-ил)фенил)-Ы4-(2-(изопропилсульфонил)фенил)-Шпиразоло[3,4^]пиримидин-4,6-диамин (соединение А42) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2008/073687, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором ALK является Х3-(2-изопропокси-5-метил-4-(1метилпиперидин-4-ил)фенил)-Ы4-(2-(изопропилсульфонил)фенил)-Ш-пиразоло[3,4^]пиримидин-4,6диамин (соединение А42) или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2008/073687. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с N6-(2изопропокси-5-метил-4-(1-метилпиперидин-4-ил)фенил)-Ы4-(2-(изопропилсульфонил)фенил)-Шпиразоло[3,4^]пиримидин-4,6-диамином (соединение С42) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2008/073687, для лечения такого заболевания, как рак, анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) или нейробластома. В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором IGF-1R, 3-(4-(4-((5-хлор-4-((5-метил1Н-пиразол-3-ил)амино)пиримидин-2-ил)амино)-5-фтор-2-метилфенил)пиперидин-1-ил)тиэтан-1,1диоксид (соединение А43), 5-хлор-№-(2-фтор-5-метил-4-(1-(тетрагидро-2Н-пиран-4-ил)пиперидин-4ил)фенил)-Н4-(5-метил-1Н-пиразол-3-ил)пиримидин-2,4-диамин (соединение С44) или 5-хлор-Ы2-(4-(1этилпиперидин-4-ил)-2-фтор-5-метилфенил)-Н4-(5-метил-1Н-пиразол-3-ил)пиримидин-2,4-диамин (соединение А45), или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2010/002655, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор IGF-1R представляет собой 3-(4-(4-((5-хлор-4-((5-метил-1Н-пиразол-3ил)амино)пиримидин-2-ил)амино)-5-фтор-2-метилфенил)пиперидин-1-ил)тиэтан 1,1-диоксид (соединение А43), 5-хлор-Н2-(2-фтор-5-метил-4-(1-(тетрагидро-2Н-пиран-4-ил)пиперидин-4-ил)фенил)-Н4-(5метил-1Н-пиразол-3-ил)пиримидин-2,4-диамин (соединение С44) или 5-хлор-Ы2-(4-(1-этилпиперидин-4ил)-2-фтор-5-метилфенил)-Н4-(5-метил-1Н-пиразол-3-ил)пиримидин-2,4-диамин (соединение А45), или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2010/002655. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с 3-(4-(4-((5-хлор-4-((5-метил-1Н-пиразол-3ил)амино)пиримидин-2-ил)амино)-5-фтор-2-метилфенил)пиперидин-1-ил)тиэтан 1,1-диоксидом (соединение А43), 5-хлор-Н2-(2-фтор-5-метил-4-(1-(тетрагидро-2Н-пиран-4-ил)пиперидин-4-ил)фенил)-Н4-(5метил-1Н-пиразол-3-ил)пиримидин-2,4-диамином (соединение С44) или 5-хлор-Ы2-(4-(1-этилпиперидин4-ил)-2-фтор-5-метилфенил)-Н4-(5-метил-1Н-пиразол-3-ил)пиримидин-2,4-диамином (соединение А45) или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ № WO 2010/002655, для лечения заболевания, такого как рак или саркома.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, for example, an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an ALK inhibitor, No. 6 - (2-isopropoxy-5-methyl-4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl)-I 4 -(2-(isopropylsulfonyl)phenyl)-Spirazolo[3,4^]pyrimidin-4,6-diamine (compound A42 ) or with a compound described in published PCT application WO 2008/073687, for the treatment of a disease, for example, a disease mentioned in the invention. In one embodiment, the ALK inhibitor is X 3 -(2-isopropoxy-5-methyl-4-(1methylpiperidin-4-yl)phenyl)-N 4 -(2-(isopropylsulfonyl)phenyl)-III-pyrazolo[3,4 ^]pyrimidine-4,6diamine (compound A42) or the compound described in published PCT application WO 2008/073687. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with N 6 -(2isopropoxy-5-methyl-4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl)-N 4 -(2-(isopropylsulfonyl)phenyl)- Spirazolo[3,4^]pyrimidine-4,6-diamine (compound C42) or with the compound described in the published PCT application WO 2008/073687, for the treatment of a disease such as cancer, anaplastic large cell lymphoma (ALCL), non-small cell lung cancer (NSCLC) or neuroblastoma. In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an IGF-1R inhibitor, 3-(4- (4-((5-chloro-4-((5-methyl1H-pyrazol-3-yl)amino)pyrimidin-2-yl)amino)-5-fluoro-2-methylphenyl)piperidin-1-yl)thiethane- 1,1 dioxide (compound A43), 5-chloro-N-(2-fluoro-5-methyl-4-(1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)piperidin-4yl)phenyl)-H 4 -( 5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidin-2,4-diamine (compound C44) or 5-chloro-N2-(4-(1ethylpiperidin-4-yl)-2-fluoro-5-methylphenyl)- H 4 -(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidin-2,4-diamine (compound A45), or with a compound described in published PCT application WO 2010/002655, for the treatment of a disease, e.g. mentioned in the invention. In one embodiment, the IGF-1R inhibitor is 3-(4-(4-((5-chloro-4-((5-methyl-1H-pyrazol-3yl)amino)pyrimidin-2-yl)amino)-5 -fluoro-2-methylphenyl)piperidin-1-yl)thiethane 1,1-dioxide (compound A43), 5-chloro-H 2 -(2-fluoro-5-methyl-4-(1-(tetrahydro-2H- pyran-4-yl)piperidin-4-yl)phenyl)-H 4 -(5methyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidin-2,4-diamine (compound C44) or 5-chloro-N2-(4- (1-ethylpiperidin-4yl)-2-fluoro-5-methylphenyl)-H 4 -(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidin-2,4-diamine (compound A45), or the compound described in published PCT application WO 2010/002655. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with 3-(4-(4-((5-chloro-4-((5-methyl-1H-pyrazol-3yl)amino)pyrimidin-2-yl) amino)-5-fluoro-2-methylphenyl)piperidin-1-yl)thiethane 1,1-dioxide (compound A43), 5-chloro-H 2 -(2-fluoro-5-methyl-4-(1-( tetrahydro-2H-pyran-4-yl)piperidin-4-yl)phenyl)-H 4 -(5methyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidin-2,4-diamine (compound C44) or 5-chloro-N2 -(4-(1-ethylpiperidin4-yl)-2-fluoro-5-methylphenyl)-H 4 -(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidin-2,4-diamine (compound A45) or with a compound described in PCT Published Application No. WO 2010/002655 for the treatment of a disease such as cancer or sarcoma.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором Р-гликопротеина 1, препаратом Валсподар (также известный как Амдрэй/AMDRAY, соединение А46) или с соединением, описанным в патенте ЕР 296122, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором Р-гликопротеина 1 является Валсподар (соединение А46) или соединение, описанное в ЕР 296122. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с Валсподаром (соединением А46) или соединением, раскрытым в ЕР 296122, для лечения заболевания, такого как рак или опухоль с лекарственной резистентностью.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with the P-glycoprotein 1 inhibitor drug Valspodar (also known as AMDRAY, compound A46) or with the compound described in patent EP 296122, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the P-glycoprotein 1 inhibitor is Valspodar (compound A46) or a compound disclosed in EP 296122. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with Valspodar (compound A46) or a compound disclosed in EP 296122. to treat a disease such as cancer or a drug-resistant tumor.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с одним или несколькими ингибиторами VEGFR, препаратом Ваталиниб сукцинат (соединение А47) или с соединением, описанным в патенте ЕР 296122 для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитором VEGFR является Ваталиниб сукцинат (соединение А47) или соединение, описанное в ЕР 296122. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с препаратом Ваталиниб сукцинат (соединение А47) или с соединением, описанным в ЕР 296122, для лечения рака.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with one or more VEGFR inhibitors, the drug Vatalinib succinate ( compound A47) or with a compound described in patent EP 296122 for the treatment of a disease, for example the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the VEGFR inhibitor is Vatalinib succinate (compound A47) or a compound described in EP 296122. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with the drug Vatalinib succinate (compound A47) or a compound described in EP 296122 , for the treatment of cancer.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором изоцитрат дегидрогеназы (IDH) или с соединением, раскрытым в WO 2014/141104, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор ИДГ IDH представляет собой соединение, раскрытое в опубликованной заявке РСТ WO 2014/141104. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением, раскрытым в WO 2014/141104, для лечения заболевания, например, рака.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with an isocitrate dehydrogenase (IDH) inhibitor or a compound disclosed in WO 2014/141104, for the treatment of a disease, for example the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the IDH inhibitor IDH is a compound disclosed in published PCT application WO 2014/141104. In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with a compound disclosed in WO 2014/141104 to treat a disease, such as cancer.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или неIn another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, such as an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more
- 86 045940 сколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором BCL-ABL или с соединением, описанным в опубликованных заявках РСТ WO 2013/171639, WO 2013/171640, WO 2013/171641 или WO 2013/171642, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор BCL-ABL представляет собой соединение, раскрытое в опубликованных заявках РСТ №№ WO 2013/171639, WO 2013/171640, WO 2013/171641 или WO 2013/171642. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением, раскрытым в опубликованных заявках РСТ №№ WO 2013/171639, WO 2013/171640, WO 2013/171641 или WO 2013/171642, для лечения заболевания, такого как рак.- 86 045940 how many other immunomodulators, used in combination with a BCL-ABL inhibitor or with a compound described in published PCT applications WO 2013/171639, WO 2013/171640, WO 2013/171641 or WO 2013/171642, for the treatment of a disease, e.g. disease mentioned in the invention. In one embodiment, the BCL-ABL inhibitor is a compound disclosed in PCT Published Application Nos. WO 2013/171639, WO 2013/171640, WO 2013/171641, or WO 2013/171642. In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with a compound disclosed in PCT Published Application Nos. WO 2013/171639, WO 2013/171640, WO 2013/171641 or WO 2013/171642 to treat a disease such as cancer .
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с ингибитором c-RAF или с соединением, описанным в опубликованной заявке РСТ WO 2014/151616, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления ингибитор c-RAF представляет собой соединение А50 или соединение, описанное в опубликованной заявке РСТ WO 2014/151616. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением, раскрытым в опубликованной заявке РСТ WO 2014/151616, для лечения заболевания, такого как рак.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a c-RAF inhibitor or a compound described in published PCT application WO 2014/151616, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the c-RAF inhibitor is compound A50 or a compound described in published PCT application WO 2014/151616. In one embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with a compound disclosed in published PCT application WO 2014/151616 to treat a disease, such as cancer.
В другом варианте осуществления молекула антитела против PD-1, например, молекула антитела против PD-1 по изобретению, в качестве единственного средства или в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами, применяется в комбинации с конкурентным ингибитором ERK1/2ATP или с соединением, описанным в международной патентной заявке PCT/US 2014/062913, для лечения заболевания, например, заболевания, упомянутого в изобретении. В одном варианте осуществления конкурентный ингибитор ERK1/2ATP представляет собой соединение, раскрытое в международной патентной заявке PCT/US 2014/062913. В одном варианте осуществления молекула антитела против PD-1 применяется в комбинации с соединением А51 или соединением, раскрытым в международной патентной заявке PCT/US 2014/062913, для лечения заболевания, такого как рак.In another embodiment, an anti-PD-1 antibody molecule, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule of the invention, alone or in combination with one or more other immunomodulators, is used in combination with a competitive ERK1/2ATP inhibitor or a compound described in international patent application PCT/US 2014/062913, for the treatment of a disease, for example, the disease mentioned in the invention. In one embodiment, the competitive ERK1/2ATP inhibitor is a compound disclosed in international patent application PCT/US2014/062913. In one embodiment, the anti-PD-1 antibody molecule is used in combination with compound A51 or a compound disclosed in international patent application PCT/US2014/062913 to treat a disease such as cancer.
В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела PD-1 вводят в комбинации с одним или несколькими веществами, выбранными из соединения А8, соединения А17, соединения А23, соединения А24, соединения А27, соединения А29 и соединения А33.In some embodiments, the PD-1 antibody molecule is administered in combination with one or more substances selected from Compound A8, Compound A17, Compound A23, Compound A24, Compound A27, Compound A29, and Compound A33.
В некоторых вариантах осуществления молекулу антитела PD-1 вводят в комбинации с противоопухолевым средством, активность которого установлена в анализе иммунных клеток, например, в одном или нескольких следующих исследованиях: анализ huMLR, анализ Т-клеточной пролиферации, анализ В-клеточной пролиферации. Примеры анализов описаны ниже. Исходя из упомянутых анализов, можно вычислить IC50 для каждого тестируемого вещества. В некоторых вариантах осуществления значение IC50 противоопухолевого средства составляет, например, от 0 до 1 мкМ, от 1 до 4 мкМ, или превышает 4 мкМ, например, составляет от 4 до 10 мкМ или от 4 до 20 мкМ. В некоторых вариантах осуществления второе терапевтическое средство выбрано из одного или нескольких следующих соединений: соединение А9, соединение А16, соединение А17, соединение А21, соединение А22, соединение А25, соединение А28, соединение А48 и соединение 49.In some embodiments, the PD-1 antibody molecule is administered in combination with an antineoplastic agent that has been shown to be active in an immune cell assay, such as one or more of the following assays: huMLR assay, T cell proliferation assay, B cell proliferation assay. Examples of analyzes are described below. From the above analyses, the IC 50 for each test substance can be calculated. In some embodiments, the IC 50 value of the anticancer agent is, for example, 0 to 1 μM, 1 to 4 μM, or greater than 4 μM, such as 4 to 10 μM, or 4 to 20 μM. In some embodiments, the second therapeutic agent is selected from one or more of the following compounds: compound A9, compound A16, compound A17, compound A21, compound A22, compound A25, compound A28, compound A48, and compound 49.
В некоторых вариантах осуществления соединение А28 (или соединение, родственное соединениею А28) вводят в дозе приблизительно от 5 до 10 или от 10 до 30 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А22 (или соединение, родственное соединению А22) вводят в дозе приблизительно 200 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А17 (или соединение, родственное соединению А17) вводят в дозе приблизительно от 400 до 600 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А16 (или соединение, родственное соединению А16) вводят в дозе приблизительно от 400 до 600 мг перорально один раз в день. В некоторых вариантах осуществления соединение А29 (или соединение родственное соединению А29) вводят в дозе приблизительно от 200 до 400 или от 300 до 400 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А24 (или соединение, родственное соединению А24) вводят в дозе приблизительно от 200 до 600 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А23 (церитиниб) (или соединение, родственное церитинибу) вводят в дозе приблизительно 750 мг один раз в день. В некоторых вариантах осуществления соединение А8 (или соединение, родственное соединению А8) вводят в дозе приблизительно от 200 до 400 или от 300 до 400 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А5 (или соединение, родственное соединению А5) вводят в дозе приблизительно от 100 до 125 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А6 (или соединение, родственное соединению А6) вводят в дозе приблизительно 100 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А1 (или соединение, родственное соединению А1) вводят в дозе приблизительно от 200 до 300 или от 200 до 600 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А40 (или соединение, родственное соединению А40) вводят в дозе приблизительно от 150 до 250 мг. В некоторых вариантах осуществления соединение А10 (или соединение, родственное соединению А10) вводят в дозе приблизительно от 400 до 700 мг, например, вводят три раза в неделю в течение 2 недель и с перерывом на одну неделю. В вариантах осуществления ингибитор BCR-ABL вводят в дозе приблизительно от 20 мг два раза в день до 80 мг два раза в день.In some embodiments, Compound A28 (or a compound related to Compound A28) is administered at a dose of about 5 to 10 or 10 to 30 mg. In some embodiments, compound A22 (or a compound related to compound A22) is administered at a dose of approximately 200 mg. In some embodiments, compound A17 (or a compound related to compound A17) is administered at a dose of about 400 to 600 mg. In some embodiments, compound A16 (or a compound related to compound A16) is administered at a dose of about 400 to 600 mg orally once daily. In some embodiments, compound A29 (or a compound related to compound A29) is administered at a dose of about 200 to 400 or 300 to 400 mg. In some embodiments, compound A24 (or a compound related to compound A24) is administered at a dose of about 200 to 600 mg. In some embodiments, Compound A23 (ceritinib) (or a ceritinib-related compound) is administered at a dose of approximately 750 mg once daily. In some embodiments, Compound A8 (or a compound related to Compound A8) is administered at a dose of about 200 to 400 or 300 to 400 mg. In some embodiments, compound A5 (or a compound related to compound A5) is administered at a dose of about 100 to 125 mg. In some embodiments, compound A6 (or a compound related to compound A6) is administered at a dose of approximately 100 mg. In some embodiments, Compound A1 (or a compound related to Compound A1) is administered at a dose of about 200 to 300 or 200 to 600 mg. In some embodiments, compound A40 (or a compound related to compound A40) is administered at a dose of about 150 to 250 mg. In some embodiments, compound A10 (or a compound related to compound A10) is administered at a dose of about 400 to 700 mg, for example, administered three times a week for 2 weeks and one week apart. In embodiments, the BCR-ABL inhibitor is administered at a dose of about 20 mg twice daily to 80 mg twice daily.
- 87 045940- 87 045940
Ниже в качестве примера представлен анализ huMLR и анализ В-клеточной или Т-клеточной пролиферации.The huMLR assay and the B cell or T cell proliferation assay are presented below as an example.
Смешанная лимфоцитарная реакции у человека Смешанная лимфоцитарная реакция (MLR) представляет собой функциональный анализ, с помощью которого измеряют пролиферативный ответ лимфоцитов от одного человека (респондеры) на лимфоциты от другого человека (стимуляторы). Для выполнения аллогенной MLR, клетки-мононуклеары периферической крови (РВМС) от трех доноров были выделены из светлого края кровяного сгустка неизвестного типа HLA (Kantonspital Blutspendezentrum, Берн и Аарау, Швейцария).Mixed Lymphocyte Response in Humans The Mixed Lymphocyte Response (MLR) is a functional assay that measures the proliferative response of lymphocytes from one individual (responders) to lymphocytes from another individual (stimulators). To perform allogeneic MLR, peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from three donors were isolated from the clear edge of a blood clot of unknown HLA type (Kantonspital Blutspendezentrum, Bern and Aarau, Switzerland).
Клетки подготавливали при концентрации 2х105 в 0,2 мл культуральной среды, содержащей среду RPMI 1640 GlutaMAX™ с добавлением 10% фетальной телячьей сыворотки (FCS), 100U пенициллина/100 мкг стрептомицина, 50 мкМ 2-меркаптоэтанола. Двунаправленные реакции этих людей были проведены путем смешивания РВМС от двух разных доноров в соотношении 1:1 и совместного культивирования в трех повторах в плоскодонных 96-луночных культуральных планшетах в течение 6 дней при температуре 37°C, 5% СО2, с использованием 8-точечного диапазона концентраций тестируемых соединений или в их отсутствии. Клетки подвергались импульсной обработке ЗН-тимидином (1 мкКи/0,2 мл) в течение последних 16 часов культивирование, и включение радиоактивной метки использовалось для измерения клеточной пролиферации. Концентрация, при которой происходит 50% ингибирование от максимального ответа huMLR (IC50), рассчитывалась для каждого соединения. В качестве положительного контроля ингибирования huMLR использовался циклоспорин.Cells were prepared at a concentration of 2x10 5 in 0.2 ml of culture medium containing RPMI 1640 GlutaMAX™ medium supplemented with 10% fetal calf serum (FCS), 100U penicillin/100 μg streptomycin, 50 μM 2-mercaptoethanol. Bidirectional reactions of these individuals were carried out by mixing PBMCs from two different donors in a 1:1 ratio and co-culturing in triplicate in flat-bottomed 96-well culture plates for 6 days at 37°C, 5% CO 2 , using 8- point range of concentrations of the tested compounds or in their absence. Cells were pulsed with 3H-thymidine (1 μCi/0.2 ml) for the last 16 hours of culture, and radiolabel incorporation was used to measure cell proliferation. The concentration at which 50% inhibition of the maximum huMLR response (IC 50 ) occurs was calculated for each compound. Cyclosporine was used as a positive control for huMLR inhibition.
Анализ пролиферации человеческих В-клеток.Human B cell proliferation assay.
Использовали РВМС, свежевыделенные по градиенту плотности Ficoll-Paque из крови человека, и подвергали отрицательной В-клеточной изоляции. В-клетки ресуспендировали в культуральной среде (RPMI 1640, HEPES, 10% FCS, 50 мкг/мл гентамицина, 50 мкМ 2-меркаптоэтанола, 1xITS (инсулин, трансферрин и селенит натрия), 1х заменимые аминокислоты) в концентрации 9х104 на лунку в плоскодонных 96-луночных планшетах для культивирования. Стимуляцию В-клеток проводили с помощью молекулы человеческого антитела против IgM (30 мкг/мл) и IL-4 (75 нг/мл) или с помощью лиганда CD40 (3 мкг/мл) и IL-4 (75 нг/мл) с использованием 7-точечного диапазона концентраций тестируемых соединений или в их отсутствии. Через 72 ч культивирования при 37°C, 10% CO2, клетки подвергали импульсному воздействию 3H-тимидина (1 мкКи/лунку) в течение последних 6 ч культивирования. После этого В-клетки собирали и включение тимидина измеряли с помощью сцинтилляционного счетчика. Рассчитывались средние значения из каждого повтора обработок, и полученные данные вносили в программу XLfit 4 для определения соответствующих значений IC50.PBMCs freshly isolated by Ficoll-Paque density gradient from human blood were used and subjected to negative B cell isolation. B cells were resuspended in culture medium (RPMI 1640, HEPES, 10% FCS, 50 µg/ml gentamicin, 50 µM 2-mercaptoethanol, 1xITS (insulin, transferrin and sodium selenite), 1x nonessential amino acids) at a concentration of 9x10 4 per well in flat-bottomed 96-well culture plates. Stimulation of B cells was performed using a human antibody molecule against IgM (30 μg/ml) and IL-4 (75 ng/ml) or using CD40 ligand (3 μg/ml) and IL-4 (75 ng/ml) with using a 7-point concentration range of test compounds or no concentration range thereof. After 72 h of culture at 37°C, 10% CO 2 , cells were pulsed with 3H-thymidine (1 μCi/well) for the last 6 h of culture. B cells were then collected and thymidine incorporation was measured using a scintillation counter. The average values from each replicate treatment were calculated and the data entered into XLfit 4 software to determine the corresponding IC 50 values.
Анализ пролиферации человеческих Т-клеток.Human T cell proliferation assay.
Использовали РВМС, свежевыделенные по градиенту плотности Ficoll-Paque из крови человека, и подвергали отрицательной Т-клеточной изоляции. Т-клетки подготавливали в культуральной среде (RPMI 1640, HEPES, 10% FCS, 50 мкг/мл гентамицина, 50 мкМ 2-меркаптоэтанола, 1xITS (инсулин, трансферрин и селенит натрия), 1х заменимые аминокислоты) в концентрации 8х104 на лунку в плоскодонных 96-луночных планшетах для культивирования. Стимуляцию Т-клеток проводили с помощью молекулы человеческого антитела против CD3 (10 мкг/мл) или молекулы человеческого антитела против CD3 (5 мкг/мл), и молекулы антитела против CD28 (1 мкг/мл) с использованием 7-точечного диапазона концентраций тестируемых соединений или в их отсутствии. Через 72 ч культивирования при 37°C, 10% CO2, клетки подвергали импульсному воздействию 3H-тимидина (1 мкКи/лунку) в течение последних 6 ч культивирования. Пролиферацию клеток измеряли по включению тимидина, что позволяло определить IC50 для каждого тестируемого соединения.PBMCs freshly isolated by Ficoll-Paque density gradient from human blood were used and subjected to negative T-cell isolation. T cells were prepared in culture medium (RPMI 1640, HEPES, 10% FCS, 50 μg/ml gentamicin, 50 μM 2-mercaptoethanol, 1xITS (insulin, transferrin and sodium selenite), 1x nonessential amino acids) at a concentration of 8x10 4 per well in flat-bottomed 96-well culture plates. T cell stimulation was performed with human anti-CD3 antibody molecule (10 μg/ml) or human anti-CD3 antibody molecule (5 μg/ml), and anti-CD28 antibody molecule (1 μg/ml) using a 7-point test concentration range connections or lack thereof. After 72 h of culture at 37°C, 10% CO 2 , cells were pulsed with 3H-thymidine (1 μCi/well) for the last 6 h of culture. Cell proliferation was measured by thymidine incorporation, allowing the IC 50 to be determined for each compound tested.
Понижающие модуляторы иммунной системы.Down-modulators of the immune system.
В альтернативном варианте осуществления молекулы антитела против PD-1, раскрытые в изобретении, применяются для получения антиидиотипических пептидов или антител (Wallmann, J. et al. (2010) Anti-Ids in Allergy: Timeliness of a Classic Concept, World Allergy Organiz. J. 3(6):195-201; Nardi, M. et al. (2000) Antiidiotype Antibody Against Platelet Anti-Gpiiia Contributes To The Regulation Of Thrombocytopenia In HIV-1-ITP Patients, J. Exp. Med. 191(12):2093-2100) или миметиков (Zang, Y. С et al. (2003) Human Anti-Idiotypic T Cells Induced By TCR Peptides Corresponding To A Common CDR3Sequence Motif In Myelin Basic Protein-Reactive T Cells, Int. Immunol. 15(9):1073-1080; Loiarro, M. et al. (Epub 2010 Apr. 8) Targeting TLR/IL-1R Signalling In Human Diseases, Mediators Inflamm. 2010:674363) В7-Н1 или PD-1. Такие молекулы служат в качестве суррогатов PD-1, и, таким образом, при их введении субъекту происходит понижающая модуляция иммунную систему у этого субъекта, что имитирует связывание В7-Н1 PD-1 или способствует такому связыванию. Эти молекулы являются полезными при лечении реакции трансплантат против хозяина. Аналогичным образом, антитела-агонисты, которые I) усиливают связывание между упомянутыми антителами и упомянутым рецептором/лигандом, или II) запускают сигнальную трансдукцию при непосредственном связывании с В7-Н1 или с PD-1, являются полезными в качестве агонистов сигнального пути В7-Н1 - PD-1 и, таким образом, могут применяться при лечении воспалительных и аутоиммунных заболеваний, путем прямого или опосредованного действия в качестве агониIn an alternative embodiment, the anti-PD-1 antibody molecules disclosed in the invention are used to produce anti-idiotypic peptides or antibodies (Wallmann, J. et al. (2010) Anti-Ids in Allergy: Timeliness of a Classic Concept, World Allergy Organiz. J 3(6):195-201 Nardi, M. et al (2000) Antiidiotype Antibody Against Platelet Anti-Gpiiia Contributes To The Regulation Of Thrombocytopenia In HIV-1-ITP Patients, J. Exp. Med. 191(12 ):2093-2100) or mimetics (Zang, Y. C et al. (2003) Human Anti-Idiotypic T Cells Induced By TCR Peptides Corresponding To A Common CDR3Sequence Motif In Myelin Basic Protein-Reactive T Cells, Int. Immunol. 15 (9):1073-1080; Loiarro, M. et al. (Epub 2010 Apr. 8) Targeting TLR/IL-1R Signaling In Human Diseases, Mediators Inflamm. 2010:674363) B7-H1 or PD-1. Such molecules serve as surrogates for PD-1 and thus, when administered to a subject, down-modulate the immune system in that subject, which mimics or promotes B7-H1 binding to PD-1. These molecules are useful in the treatment of graft-versus-host disease. Likewise, agonist antibodies that i) enhance binding between said antibodies and said receptor/ligand, or ii) trigger signal transduction upon direct binding to B7-H1 or PD-1 are useful as agonists of the B7-H1 signaling pathway - PD-1 and thus can be used in the treatment of inflammatory and autoimmune diseases, through direct or indirect action as an agonist
- 88 045940 ста рецептора.- 88 045940 hundred receptor.
Биспецифичные антитела, проявляющие иммуноспецифичное связывание и с PD-1 и с В7-Н1, способны связываться и с антиген-представляющими клетками (АРС) и с Т-клетками, и, таким образом, способствовать колокализации АРС- и Т-клеток. Такая колокализация облегчает способность таких клеток связываться друг с другом посредством молекул В7-Н1 и молекул PD-1, которые не образуют комплекс с антителом, или посредством коингибирующих молекул. Благодаря такому связыванию происходит понижающая модуляция иммунной системы реципиента.Bispecific antibodies that exhibit immunospecific binding to both PD-1 and B7-H1 are able to bind to both antigen presenting cells (APCs) and T cells, and thus promote the colocalization of APC and T cells. This colocalization facilitates the ability of such cells to communicate with each other through B7-H1 molecules and PD-1 molecules that do not form a complex with the antibody, or through coinhibitory molecules. Thanks to this binding, down-modulation of the recipient's immune system occurs.
Понижающая модуляция иммунной системы является желательной при лечении воспалительных и аутоиммунных заболеваний, и реакция трансплантат против хозяина (GvHD). Примеры аутоиммунных заболеваний, которые можно лечить путем введения антитела по настоящему изобретению, включают без ограничения такие заболевания, как: очаговая алопеция, анкилозирующий спондилит, антифосфолипидный синдром, аутоиммунная болезнь Аддисона, аутоиммунные заболевания надпочечников, аутоиммунная гемолитическая анемия, аутоиммунный гепатит, аутоиммунный оофорит и орхит, аутоиммунная тромбоцитопения, болезнь Бехчета, буллезный пемфигоид, кардиомиопатия, целиакия-спру, дерматит, синдром хронической усталости и иммунной дисфункции (CFIDS), хронические воспалительные демиелинизирующие полинейропатии, синдром Чарга-Стросса, рубцовый пемфигоид, синдром CREST, болезнь холодовых агглютининов, болезнь Крона, дискоидная волчанка, эссенциальная смешанная криоглобулинемия, фибромиалгия-фибромиозит, гломерулонефрит, болезнь Грейвса, синдром Гийена-Барре, тиреоидит Хашимото, идиопатический легочный фиброз, идиопатическая тромбоцитопеническая пурпура (ITP), IgA-нейропатия, ювенильный артрит, плоский лишай, системная красная волчанка, болезнь Меньера, смешанное заболевание соединительной ткани, рассеянный склероз, оптиконевромиелит (NMO), сахарный диабет 1 типа 1 или иммуноопосредованный сахарный диабет, миастения, пузырчатка обыкновенная, пернициозная анемия, узелковый полиартериит, полихондрит, полигландулярные синдромы, ревматическая полимиалгия, полимиозит и дерматомиозит, первичная агаммаглобулинемия, первичный билиарный цирроз, псориаз, псориатический артрит, феномен Рейно, синдром Рейтера, ревматоидный артрит, саркоидоз, склеродермия, синдром Шегрена, синдром мышечной скованности, системная красная волчанка, эритематозная волчанка, артериит Такаясу, темпоральный артериит/артериит гигантских клеток, поперечный миелит, язвенный колит, увеит, васкулиты, такие как васкулит герпетиформный дерматит, витилиго и гранулематоз Вегенера.Down-modulation of the immune system is desirable in the treatment of inflammatory and autoimmune diseases, and graft-versus-host disease (GvHD). Examples of autoimmune diseases that can be treated by administering the antibody of the present invention include, but are not limited to: alopecia areata, ankylosing spondylitis, antiphospholipid syndrome, autoimmune Addison's disease, autoimmune adrenal diseases, autoimmune hemolytic anemia, autoimmune hepatitis, autoimmune oophoritis and orchitis , autoimmune thrombocytopenia, Behçet's disease, bullous pemphigoid, cardiomyopathy, celiac sprue, dermatitis, chronic fatigue and immune dysfunction syndrome (CFIDS), chronic inflammatory demyelinating polyneuropathies, Churg-Strauss syndrome, cicatricial pemphigoid, CREST syndrome, cold agglutinin disease, Crohn's disease , discoid lupus, essential mixed cryoglobulinemia, fibromyalgia-fibromyositis, glomerulonephritis, Graves' disease, Guillain-Barré syndrome, Hashimoto's thyroiditis, idiopathic pulmonary fibrosis, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP), IgA neuropathy, juvenile arthritis, lichen planus, systemic erythematosus chunka, Meniere's disease, mixed connective tissue disease, multiple sclerosis, neuromyelitis optica (NMO), diabetes mellitus type 1 or immune-mediated diabetes mellitus, myasthenia gravis, pemphigus vulgaris, pernicious anemia, polyarteritis nodosa, polychondritis, polyglandular syndromes, polymyalgia rheumatica, polymyositis and dermatomyositis, primary agammaglobulinemia, primary biliary cirrhosis, psoriasis, psoriatic arthritis, Raynaud's phenomenon, Reiter's syndrome, rheumatoid arthritis, sarcoidosis, scleroderma, Sjogren's syndrome, muscle stiffness syndrome, systemic lupus erythematosus, erythematous lupus, Takayasu's arteritis, temporal arteritis/giant cell arteritis, transverse myelitis , ulcerative colitis, uveitis, vasculitis such as vasculitis dermatitis herpetiformis, vitiligo and Wegener's granulomatosis.
Примеры воспалительных заболеваний, которые можно предотвращать, лечить или контролировать в соответствии со способами по изобретению, включают без ограничения астму, энцефалит, воспалительную болезнь кишечника, хроническую обструктивную болезнь легких (ХОБЛ), аллергические заболевания, септический шок, легочный фиброз, недифференцированные спондилоартропатии, недифференцированные артропатии, артрит, воспалительный остеолиз и хроническое воспаление, обусловленное хроническими вирусными или бактериальными инфекциями.Examples of inflammatory diseases that can be prevented, treated or controlled in accordance with the methods of the invention include, but are not limited to, asthma, encephalitis, inflammatory bowel disease, chronic obstructive pulmonary disease (COPD), allergic diseases, septic shock, pulmonary fibrosis, undifferentiated spondyloarthropathies, undifferentiated arthropathy, arthritis, inflammatory osteolysis and chronic inflammation caused by chronic viral or bacterial infections.
Таким образом, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты по настоящему изобретению являются полезными в лечении воспалительных и аутоиммунных заболеваний.Thus, the antibodies and antigen binding fragments thereof of the present invention are useful in the treatment of inflammatory and autoimmune diseases.
Виды диагностического применения.Types of diagnostic applications.
В одном из аспектов настоящее изобретение относится к способу диагностики для обнаружения присутствия белка PD-1 in vitro (например, в биологическом образце, например, в биоптате ткани, например, из раковой ткани) или in vivo (например, визуализация in vivo у субъекта). Способ включает: (I) контактирование образца с молекулой антитела по изобретению, или введение субъекту молекулы антитела; (необязательно) (II) контактирование эталонного образца, например, контрольного образца (например, биологического контрольного образец, например, плазмы, ткани, биоптата) или контрольного субъекта)); и (III) обнаружение образования комплекса между молекулой антитела и образцом или субъектом, или контрольным образцом или субъектом, при этом изменение, например, статистически значимое изменение, в образовании комплекса в образце или в субъекте по сравнению с контрольным образцом или субъектом, свидетельствует о присутствии в образце белка PD-1. Молекула антитела может подвергаться прямому или опосредованному мечению детектируемым веществом для облегчения обнаружения связанного или несвязанного антитела. Подходящие детектируемые вещества включают различные ферменты, простетические группы, флуоресцентные материалы, люминесцентные материалы и радиоактивные материалы, как описано выше и более подробно описано ниже.In one aspect, the present invention provides a diagnostic method for detecting the presence of PD-1 protein in vitro (e.g., in a biological sample, e.g., in a tissue biopsy, e.g., from cancer tissue) or in vivo (e.g., in vivo imaging in a subject) . The method includes: (I) contacting the sample with an antibody molecule of the invention, or administering the antibody molecule to the subject; (optional) (II) contacting a reference sample, e.g., a control sample (e.g., a biological control sample, e.g., plasma, tissue, biopsy) or control subject)); and (III) detecting the formation of a complex between the antibody molecule and the sample or subject, or a control sample or subject, wherein a change, such as a statistically significant change, in complex formation in the sample or subject compared to the control sample or subject, indicates the presence of in the PD-1 protein sample. The antibody molecule may be labeled directly or indirectly with a detectable substance to facilitate detection of bound or unbound antibody. Suitable detectable substances include various enzymes, prosthetic groups, fluorescent materials, luminescent materials and radioactive materials, as described above and described in more detail below.
Термин образец, по отношению к образцам, используемым для обнаружения полипептидов, включает без ограничения клетки, клеточные лизаты, белки или мембранные экстракты клеток, жидкости организма или образцы тканей.The term sample, with respect to samples used for detection of polypeptides, includes, without limitation, cells, cell lysates, proteins or membrane extracts of cells, body fluids or tissue samples.
Образование комплекса между молекулой антитела и PD-1 может быть обнаружено путем измерения или визуализации и связывающей молекулы, присоединенной к PD-1-антигену, или неприсоединенной связывающей молекулы. Могут применяться общепринятые анализы обнаружения, например, фермент-связанный иммуноферментативный анализ (ELISA), радиоиммуноанализ (RIA) или иммуногистохимическое исследование ткани. В качестве альтернативы мечения молекулы антитела, можно исследовать в образце присутствие PD-1 с помощью конкурентного иммуноанализа с использованием стандартов, меченых детектируемым веществом и молекулы немеченого антитела. В этом анализе объединяютFormation of a complex between the antibody molecule and PD-1 can be detected by measuring or imaging both the binding molecule attached to the PD-1 antigen or the unattached binding molecule. Conventional detection assays such as enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), radioimmunoassay (RIA) or tissue immunohistochemistry may be used. As an alternative to labeling the antibody molecule, the presence of PD-1 in a sample can be examined by a competitive immunoassay using analyte-labeled standards and an unlabeled antibody molecule. This analysis combines
- 89 045940 биологический образец, меченые стандарты и молекулу антитела, и проводят количественное определение меченого стандарта, связанного с немеченой связывающей молекулой. Количество PD-1 в образце обратно пропорционально количеству меченого стандарта, связанного с молекулой антитела.- 89 045940 biological sample, labeled standards and antibody molecule, and quantify the labeled standard bound to the unlabeled binding molecule. The amount of PD-1 in a sample is inversely proportional to the amount of labeled standard bound to the antibody molecule.
Нуклеиновые кислоты.Nucleic acids.
Изобретение также относится к нуклеиновой кислоте, содержащей нуклеотидные последовательности, которые кодируют вариабельные области тяжелой и легкой цепей, и области CDR или гипервариабельные петли в молекулах антител против PD-1 по изобретению. Например, изобретение относится к первой и второй нуклеиновой кислоте, кодирующей вариабельных областей тяжелой и легкой цепи, соответственно, в молекуле антитела против PD-1, выбранной из одной или нескольких молекул антител, раскрытых в изобретении. Нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, как указано в таблицах настоящего изобретения, или последовательность, по существу идентичную ей (например, последовательность, идентичную указанной последовательности по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или с более высокой степенью идентичности, или которая отличается не более чем на 3, 6, 15, 30, или 45 нуклеотидов от последовательностей, представленных в таблицах настоящего изобретения.The invention also relates to a nucleic acid comprising nucleotide sequences that encode heavy and light chain variable regions and CDR regions or hypervariable loops in the anti-PD-1 antibody molecules of the invention. For example, the invention relates to first and second nucleic acids encoding heavy and light chain variable regions, respectively, in an anti-PD-1 antibody molecule selected from one or more antibody molecules disclosed in the invention. The nucleic acid may contain a nucleotide sequence as specified in the tables of the present invention, or a sequence substantially identical thereto (e.g., a sequence identical to the specified sequence with at least about 85, 90, 95, 99% or a greater degree of identity, or which differs by no more than 3, 6, 15, 30, or 45 nucleotides from the sequences presented in the tables of the present invention.
В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три области CDR или гипервариабельные петли из вариабельной области тяжелой цепи, которая имеет аминокислотную последовательность, указанную в таблицах настоящего изобретения, или последовательность, по существу гомологичную (например, последовательность, идентичную указанной последовательности по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну или несколько замен, например, консервативных замен). В других вариантах осуществления нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три области CDR или гипервариабельные петли из вариабельной области легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность, указанную в таблицах настоящего изобретения, или последовательность, по существу, гомологичную (например, последовательность, идентичную указанной последовательности по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну или несколько замен, например, консервативных замен). Еще в одном варианте осуществления нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть областей CDR или гипервариабельные петли из вариабельных областей тяжелой и легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность, указанную в таблицах настоящего изобретения, или последовательность, по существу гомологичную указанной последовательности (например, последовательность, идентичную ей по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или имеющую одну или несколько замен, например, консервативных замен).In some embodiments, the nucleic acid may comprise a nucleotide sequence encoding at least one, two, or three CDR regions or hypervariable loops from a heavy chain variable region that has an amino acid sequence set forth in the tables of the present invention, or a sequence that is substantially homologous (e.g. , a sequence identical to the specified sequence by at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one or more substitutions, for example, conservative substitutions). In other embodiments, the nucleic acid may comprise a nucleotide sequence encoding at least one, two, or three CDR regions or hypervariable loops from a light chain variable region, comprising an amino acid sequence set forth in the tables of the present invention, or a sequence substantially homologous (e.g. , a sequence identical to the specified sequence by at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one or more substitutions, for example, conservative substitutions). In yet another embodiment, the nucleic acid may comprise a nucleotide sequence encoding at least one, two, three, four, five or six CDR regions or hypervariable loops of heavy and light chain variable regions having the amino acid sequence set forth in the tables of the present invention, or a sequence substantially homologous to the specified sequence (eg, a sequence identical to it at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or having one or more substitutions, for example, conservative substitutions).
В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три области CDR или гипервариабельные петли из вариабельной области тяжелой цепи, имеющей нуклеотидную последовательность, указанную в таблицах настоящего изобретения, последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, идентичную ей по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или способную к гибридизации в условиях требований строгости, описанных в изобретении). В другом варианте осуществления нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три CDR или гипервариабельные петли из вариабельной области легкой цепи, имеющей нуклеотидную последовательность, указанную в таблицах настоящего изобретения, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, идентичную ей по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или больше, и/или способную к гибридизации в условиях требований строгости, описанных в изобретении). Еще в одном варианте осуществления нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере, одну, две, три, четыре, пять, или шесть областей CDR или гипервариабельные петли из вариабельных областей тяжелой и легкой цепи, имеющую нуклеотидную последовательность, указанную в таблицах настоящего изобретения, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, идентичную ей по меньшей мере приблизительно на 85, 90, 95, 99% или с более высокой степенью идентичности, и/или последовательность, способную к гибридизации в условиях требований строгости, описанных в изобретении).In some embodiments, the nucleic acid may comprise a nucleotide sequence encoding at least one, two, or three CDR regions or hypervariable loops from a heavy chain variable region having a nucleotide sequence set forth in the tables of the present invention, a sequence substantially homologous thereto (e.g. sequence identical to it by at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or capable of hybridization under the stringent conditions described in the invention). In another embodiment, the nucleic acid may comprise a nucleotide sequence encoding at least one, two or three CDRs or hypervariable loops from a light chain variable region having a nucleotide sequence set forth in the tables of the present invention or a sequence substantially homologous thereto (e.g. sequence identical to it by at least about 85, 90, 95, 99% or more, and/or capable of hybridization under the stringent conditions described in the invention). In yet another embodiment, the nucleic acid may comprise a nucleotide sequence encoding at least one, two, three, four, five, or six CDR regions or hypervariable loops from heavy and light chain variable regions, having a nucleotide sequence set forth in the tables herein invention, or a sequence substantially homologous thereto (e.g., a sequence identical to it with at least about 85, 90, 95, 99% or a higher degree of identity, and/or a sequence capable of hybridizing under the stringency requirements described in the invention).
В другом аспекте настоящая заявка относится к клеткам-хозяевам и векторам, содержащим нуклеиновые кислоты по изобретению. Нуклеиновые кислоты могут присутствовать в одном векторе или в разных векторах, присутствующих в одной и той же клетке-хозяине или в разных клетках-хозяевах, как описано более подробно ниже.In another aspect, the present application relates to host cells and vectors containing nucleic acids of the invention. The nucleic acids may be present in the same vector or in different vectors present in the same host cell or in different host cells, as described in more detail below.
Векторы.Vectors.
Настоящее изобретение дополнительно относится к векторам, содержащим нуклеотидные последовательности, которые кодируют молекулу антитела по изобретению. В одном варианте осуществления векторы содержат нуклеотиды, кодирующие молекулу антитела по изобретению. В одном варианте осуществления векторы содержат нуклеотидные последовательности, описанные в изобретении. ВекторыThe present invention further relates to vectors containing nucleotide sequences that encode an antibody molecule of the invention. In one embodiment, the vectors contain nucleotides encoding an antibody molecule of the invention. In one embodiment, the vectors contain nucleotide sequences described in the invention. Vectors
- 90 045940 включают без ограничения вирус, плазмиду, космиду, фаг лямбда или искусственную хромосому дрожжей (YAC).- 90 045940 includes, without limitation, a virus, plasmid, cosmid, lambda phage or yeast artificial chromosome (YAC).
Можно использовать многочисленные векторные системы. Например, в векторов одного класса используются элементы ДНК, которые получены из вирусов животных, таких, как, например, вирус бычьей папилломы, вирус полиомы, аденовирус, вирус коровьей оспы, бакуловирус, ретровирусы (вируса саркомы Рауса, MMTV или MOMLV) или вирус SV40. В векторах другого класса используются элементы РНК, полученные из РНК-содержащих вирусов, таких как вирус Semliki Forest, вирус восточного конского энцефалита и флавивирусы.Numerous vector systems can be used. For example, one class of vectors uses DNA elements that are derived from animal viruses, such as, for example, bovine papilloma virus, polyoma virus, adenovirus, vaccinia virus, baculovirus, retroviruses (Rouse sarcoma virus, MMTV or MOMLV) or SV40 virus . Another class of vectors uses RNA elements derived from RNA viruses such as Semliki Forest virus, eastern equine encephalitis virus, and flaviviruses.
Дополнительно, клетки, которые устойчиво интегрируют эту ДНК в свои хромосомы, могут быть выбраны с помощью введения одного или нескольких маркеров, которые позволяют проводить отбор трансфицированных клеток-хозяев. Маркер может придавать, например, прототрофность ауксотрофному хозяину, биоцидную устойчивость (например, к антибиотикам), или устойчивость к тяжелым металлам, таким как медь, или тому подобное. Селектируемый маркерный ген может быть или напрямую связан с последовательностями ДНК, предназначенными для экспрессии, или введен в ту же клетку путем котрансформации. Для оптимального синтеза мРНК также могут быть необходимы дополнительные элементы. В число таких элементов могут входить сигналы сплайсинга, а также транскрипционные промоторы, усилители и сигналы терминации.Additionally, cells that stably integrate this DNA into their chromosomes can be selected by introducing one or more markers that allow selection of transfected host cells. The marker may confer, for example, prototrophy on an auxotrophic host, biocide resistance (eg, to antibiotics), or resistance to heavy metals such as copper, or the like. The selectable marker gene can either be directly linked to the DNA sequences to be expressed or introduced into the same cell by co-transformation. Additional elements may also be required for optimal mRNA synthesis. These elements may include splicing signals, as well as transcriptional promoters, amplifiers, and termination signals.
После подготовки для экспрессии вектора экспрессии или ДНК-последовательности, содержащей эти конструкции, векторы экспрессии могут быть трансфицированы или введены в соответствующую клетку-хозяина. Для решения этой задачи можно применять различные технологии, такие как, например, слияния протопластов, преципитацию фосфатом кальция, электропорацию, ретровирусную трансдукцию, вирусную трансфекцию, методику генной пушки, трансфекцию на основе липидов или другие общепринятые методики. В случае слияния протопластов, клетки выращивают в среде и подвергают скринингу на соответствующую активность.Once an expression vector or DNA sequence containing these constructs has been prepared for expression, the expression vectors can be transfected or introduced into the appropriate host cell. Various technologies can be used to accomplish this task, such as, for example, protoplast fusions, calcium phosphate precipitation, electroporation, retroviral transduction, viral transfection, gene gun techniques, lipid-based transfection, or other conventional techniques. For protoplast fusion, cells are grown in media and screened for appropriate activity.
Способы и условия культивирования полученных трансфицированных клеток и восстановления продуцируемой молекулы антитела известны специалистам в данной области и могут быть изменены или оптимизированы в зависимости от конкретного вектора экспрессии и клетки-хозяина млекопитающего, используемого в настоящем изобретении.Methods and conditions for culturing the resulting transfected cells and recovering the produced antibody molecule are known to those skilled in the art and may be modified or optimized depending on the particular expression vector and mammalian host cell used in the present invention.
Клетки.Cells.
Настоящее изобретение также относится к клеткам-хозяевам, содержащим нуклеиновую кислоту, которая кодирует молекулу антитела по изобретению.The present invention also relates to host cells containing a nucleic acid that encodes an antibody molecule of the invention.
В одном варианте осуществления клетки-хозяева созданы генно-инженерным способом с тем, чтобы они содержали нуклеиновые кислоты, кодирующие эту молекулу антитела.In one embodiment, the host cells are genetically engineered to contain nucleic acids encoding the antibody molecule.
В одном варианте осуществления клетки-хозяева созданы генно-инженерным способом с использованием экспрессионной кассеты. Понятие экспрессионная кассета относится к нуклеотидным последовательностям, которые способны влиять на экспрессию гена в клетках-хозяевах, совместимых с такими последовательностями. Такие кассеты могут включать промотор, открытую рамку считывания с интронами или без интронов, и сигнал терминации. Также можно использовать дополнительные факторы, необходимые или полезные для эффективной экспрессии, такие как, например, индуцируемый промотор.In one embodiment, the host cells are genetically engineered using an expression cassette. The term expression cassette refers to nucleotide sequences that are capable of influencing gene expression in host cells compatible with such sequences. Such cassettes may include a promoter, an open reading frame with or without introns, and a termination signal. Additional factors necessary or beneficial for efficient expression, such as, for example, an inducible promoter, can also be used.
Изобретение также относится к клеткам-хозяевам, содержащим векторы, описанные в настоящем изобретении.The invention also relates to host cells containing the vectors described in the present invention.
Клетка может представлять собой, без ограничения, эукариотическую клетку, бактериальную клетку, клетку насекомого или человеческую клетку. Подходящие эукариотические клетки включают без ограничения клетки Vero, клетки HeLa, клетки COS, клетки СНО, клетки HEK293, клетки BHK и клетки MDCKII. Подходящие клетки насекомых включают без ограничения клетки Sf9.The cell may be, without limitation, a eukaryotic cell, a bacterial cell, an insect cell, or a human cell. Suitable eukaryotic cells include, but are not limited to, Vero cells, HeLa cells, COS cells, CHO cells, HEK293 cells, BHK cells, and MDCKII cells. Suitable insect cells include, but are not limited to, Sf9 cells.
- 91 045940- 91 045940
Таблица 1Table 1
Аминокислотные и нуклеотидные последовательности для молекул мышиных, химерных и гуманизированных антител. Молекулы антител включают мышиные mAb ВАР049, химерные mAb BAP049-chi и BAP049-chi-Y и гуманизированные mAb BAP049-hum01 - BAP049-hum16 и ВАР049-клон-А - ВАР049клон-Е. Показаны аминокислотные и нуклеотидные последовательности тяжелой и легкой цепи, областей CDR, вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, и тяжелой и легкой цепей.Amino acid and nucleotide sequences for mouse, chimeric and humanized antibody molecules. Antibody molecules include mouse mAbs BAP049, chimeric mAbs BAP049-chi and BAP049-chi-Y, and humanized mAbs BAP049-hum01 - BAP049-hum16 and BAP049-clone-A - BAP049clone-E. Amino acid and nucleotide sequences of the heavy and light chain, CDR regions, heavy and light chain variable regions, and heavy and light chains are shown.
- 92 045940- 92 045940
- 93 045940- 93 045940
- 94 045940- 94 045940
- 95 045940- 95 045940
- 96 045940- 96 045940
- 97 045940- 97 045940
- 98 045940- 98 045940
- 99 045940- 99 045940
100 045940100 045940
101 045940101 045940
102 045940102 045940
- 103 045940- 103 045940
104 045940104 045940
105 045940105 045940
- 106 045940- 106 045940
107 045940107 045940
108 045940108 045940
- 109 045940- 109 045940
110 045940110 045940
111 045940111 045940
- 112 045940- 112 045940
113 045940113 045940
114 045940114 045940
- 115 045940- 115 045940
116 045940116 045940
117 045940117 045940
- 118 045940- 118 045940
119 045940119 045940
120 045940120 045940
- 121 045940- 121 045940
122 045940122 045940
- 123 045940- 123 045940
- 124 045940- 124 045940
125 045940125 045940
- 126 045940- 126 045940
- 127 045940- 127 045940
128 045940128 045940
- 129 045940- 129 045940
- 130 045940- 130 045940
131 045940131 045940
- 132 045940- 132 045940
- 133 045940- 133 045940
134 045940134 045940
- 135 045940- 135 045940
- 136 045940- 136 045940
137 045940137 045940
- 138 045940- 138 045940
- 139 045940- 139 045940
140 045940140 045940
- 141 045940- 141 045940
- 142 045940- 142 045940
143 045940143 045940
- 144 045940- 144 045940
- 145 045940- 145 045940
146 045940146 045940
- 147 045940- 147 045940
148 045940148 045940
149 045940149 045940
- 150 045940- 150 045940
151 045940151 045940
152 045940152 045940
- 153 045940- 153 045940
154 045940154 045940
155 045940155 045940
156 045940156 045940
157 045940157 045940
158 045940158 045940
159 045940159 045940
160 045940160 045940
- 161 045940- 161 045940
162 045940162 045940
163 045940163 045940
- 164 045940- 164 045940
165 045940165 045940
166 045940166 045940
- 167 045940- 167 045940
- 168 045940- 168 045940
- 169 045940- 169 045940
- 170 045940- 170 045940
- 171 045940- 171 045940
- 172 045940- 172 045940
- 173 045940- 173 045940
- 174 045940- 174 045940
- 175 045940- 175 045940
- 176 045940- 176 045940
Таблица 2table 2
Аминокислотные и нуклеотидные последовательности каркасных областей тяжелой и легкой цепи для гуманизированных mAb BAP049-hum01 - BAP049-hum16 и ВАР049-клон-А - ВАР049-клон-ЕAmino acid and nucleotide sequences of heavy and light chain framework regions for humanized mAbs BAP049-hum01 - BAP049-hum16 and BAP049-clone-A - BAP049-clone-E
- 177 045940- 177 045940
- 178 045940- 178 045940
- 179 045940- 179 045940
Таблица 3Table 3
Аминокислотные последовательности константной области тяжелых цепей человеческого IgG и человеческой легкой цепи-каппа_______________________Amino acid sequences of the constant region of human IgG heavy chains and human kappa light chain_______________________
- 180 045940- 180 045940
Таблица 4Table 4
Аминокислотные последовательности лидерных последовательностей тяжелой и легкой цепи для гума________низированных mAb ВАР04 9-клон-А - ВАР04 9-клон-Е________Amino acid sequences of heavy and light chain leader sequences for humanized mAbs BAP04 9-clone-A - BAP04 9-clone-E________
Таблица 5. См. раздел примеры.Table 5. See examples section.
Таблица 6. См. раздел примеры.Table 6. See examples section.
Таблица 7Table 7
Выбранные терапевтические веществ, которые могут быть введены в комбинации с молекулами антител против PD-1, например, в качестве единственного вещества, или в комбинации с другими иммуномодуляторами, описанными в изобретении. Каждая публикация, указанная в данной таблице, включена в изобретение в качестве ссылки в полном объеме, включая все приведенные в ней структурные формулы.Selected therapeutic agents that may be administered in combination with anti-PD-1 antibody molecules, for example, as a single agent, or in combination with other immunomodulators described in the invention. Each publication listed in this table is incorporated by reference in its entirety, including all structural formulas provided therein.
- 181 045940- 181 045940
- 182 045940- 182 045940
- 183 045940- 183 045940
- 184 045940- 184 045940
- 185 045940- 185 045940
- 186 045940- 186 045940
- 187 045940- 187 045940
- 188 045940- 188 045940
- 189 045940- 189 045940
- 190 045940- 190 045940
- 191 045940- 191 045940
- 192 045940- 192 045940
- 193 045940- 193 045940
ПримерыExamples
Представленные ниже примеры приведены для помощи в понимании настоящего изобретения, но не предназначены, и не должны считаться каким-либо ограничением его объема.The following examples are provided to assist in understanding the present invention, but are not intended to be, and should not be construed as, any limitation on its scope.
Пример 1: гуманизация ВАР049, антитела против PD-1. Мышиное моноклональное антитело против PD-1 BAP049 подвергалось гуманизации. Были получены последовательности и тестовые образцы шестнадцати гуманизированных клонов ВАР049 с уникальными последовательностями вариабельной области. Эти клоны были дополнительно проанализированы на их биологические функции (например, связывание антигена и блокировка лиганда), структурные характеристики и транзиторную экспрессию в клетExample 1: Humanization of BAP049, anti-PD-1 antibodies. The mouse anti-PD-1 monoclonal antibody BAP049 was humanized. Sequences and test samples of sixteen humanized BAP049 clones with unique variable region sequences were obtained. These clones were further analyzed for their biological functions (eg, antigen binding and ligand blocking), structural characteristics, and transient cellular expression
- 194 045940 ках СНО.- 194 045940 kah SNO.
Пример 1.1: технология и способ гуманизации.Example 1.1: technology and method of humanization.
Гуманизацию ВАР049 проводили с использованием комбинаторной библиотеки человеческих зародышевых каркасных областей (FW) вариабельной области. Технология подразумевает перенос мышиных областей CDR в рамке в библиотеку человеческих вариабельных областей (VR), которая была сконструирована путем случайной комбинации последовательностей человеческой зародышевой линии FW1, FW2 и FW3. Использовалась только одна последовательность FW4, представляющая собой WGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 169) для тяжелой цепи (НС) (согласно системе Kabat, человеческая НС подгруппа I, № 21), и последовательность FGQGTKVEIK (SEQ ID NO: 208) для легкой цепи (LC) (согласно системе Kabat, человеческая цепь каппа, подгруппа I, № 5). Библиотека VR последовательностей была слита с человеческими последовательностями константной области (CR), тяжелой цепью (НС) человеческого IgG4 (S228P) и человеческой каппа-цепью CR легкой цепи (LC), и полученную библиотеку полноразмерного IgG эеспрессировали в клетках СНО для скрининга. Скрининг проводили с супернатантами тканевых культур путем измерения связывающей авидности на антиген-экспрессирующих клетках в анализе ELISA в формате цельной клетки или с помощью FACS.Humanization of BAP049 was performed using a combinatorial library of human germline framework (FW) variable regions. The technology involves in-frame transfer of mouse CDR regions into a human variable region (VR) library that was constructed by randomly combining human germline sequences FW1, FW2 and FW3. Only one FW4 sequence was used, which was WGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 169) for the heavy chain (HC) (according to the Kabat system, human HC subgroup I, no. 21), and the sequence FGQGTKVEIK (SEQ ID NO: 208) for the light chain ( LC) (according to the Kabat system, human kappa chain, subgroup I, no. 5). The VR sequence library was fused to the human constant region (CR), heavy chain (HC) of human IgG4 (S228P) and human kappa chain CR light chain (LC) sequences, and the resulting full-length IgG library was expressed in CHO cells for screening. Screening was performed with tissue culture supernatants by measuring binding avidity on antigen-expressing cells in a whole-cell ELISA or FACS.
Гуманизацию проводили поэтапно, начиная с конструирования и экспрессии подходящего химерного mAb (мышиная VR, IgG4 (S228P), человеческая каппа-цепь), которое может служить в качестве компаратора для скрининга гуманизированных клонов. Аминокислотные последовательности константной области человеческой тяжелой цепи IgG4 (S228P) и человеческой легкой каппа-цепи показаны в табл. 3.Humanization was carried out in a stepwise manner, starting with the construction and expression of a suitable chimeric mAb (mouse VR, IgG4 (S228P), human kappa chain), which can serve as a comparator for screening humanized clones. The amino acid sequences of the constant region of the human IgG4 heavy chain (S228P) and the human kappa light chain are shown in table. 3.
Гуманизацию VR из LC и НС выполняли в двух независимых этапах. Библиотеку гуманизированной LC (huLC) спаривали с химерной НС (мышиная VR, IgG4 (S228P)) и полученные полугуманизированные mAb подвергали скринингу на активность связывания с помощью ELISA. Были выбраны клоны huLC с адекватной активностью связывания (> связыванию химерного mAb). Аналогично, библиотеку гуманизированной НС (huHC) спаривали с химерной LC (мышиная VR, человеческая каппа-цепь) и проводили скрининг на активность связывания с помощью ELISA. Были выбраны клоны huHC с подходящей активностью связывания ((> связыванию химерного mAb).Humanization of VR from LC and NS was performed in two independent stages. A humanized LC (huLC) library was paired with a chimeric NS (mouse VR, IgG4 (S228P)) and the resulting semi-humanized mAbs were screened for binding activity by ELISA. huLC clones with adequate binding activity (> chimeric mAb binding) were selected. Similarly, a humanized HC (huHC) library was paired with a chimeric LC (mouse VR, human kappa chain) and screened for binding activity by ELISA. huHC clones with suitable binding activity ((> chimeric mAb binding) were selected.
Вариабельные области выбранных huLC и huHC секвенировали для идентификации huLC и huHC с уникальными последовательностями (некоторые клоны из первоначального этапа отбора могут иметь одинаковые LC или НС). Затем уникальные huLC и huHC были случайным образом скомбинированы для создания небольшой библиотеки гуманизированных моноклональных антител (humAb), которую экспрессировали в клетках СНО, и подвергали скринингу на антиген-экспрессирующие клетки с помощью ELISA и FACS. Клоны со связывающей активностью, которая была такой же или превышала активность связывания химерного mAb - компаратора, являются конечным продуктом гуманизации.The variable regions of the selected huLCs and huHCs were sequenced to identify huLCs and huHCs with unique sequences (some clones from the initial selection round may have the same LC or HC). The unique huLC and huHC were then randomly combined to generate a small library of humanized monoclonal antibodies (humAb) that were expressed in CHO cells and screened for antigen-expressing cells by ELISA and FACS. Clones with binding activity that was the same as or greater than the binding activity of the chimeric comparator mAb are the final humanization products.
Пример 1.2: последовательность мышиного mAb BAP049.Example 1.2: sequence of mouse mAb BAP049.
Были определены последовательности вариабельной области LC и НС мышиного mAb против PD1. Последовательности, полученные в двух независимых анализах, были идентичными, как показано на фиг. 1.The LC and HC variable region sequences of the mouse anti-PD1 mAb were determined. The sequences obtained in two independent analyzes were identical, as shown in Fig. 1.
Был проведен анализ зародышевой линии, и результат частично показан на фиг. 2А, как выравнивание аминокислотной последовательности. Для легкой цепи V-ген на 98,65% идентичен mIGKV819*01F (293/297 nts) и J-ген на 97,30% идентичен mIGKJ2*01F (36/37 nts). Для тяжелой цепи V-ген на 92,83% идентичен mIGHV1S22*01F (259/279 nts), J-ген на 82,98% идентичен mIGHJ3*01F (39/47 nts), и D-ген представляет собой mIGHD2-14*01F. Как показано на фиг. 2В, последовательность LC мышиного mAb содержит неспаренный Cys в положении 102, который находится в CDRL3 и возникает посредством точечной мутации в мышином гене J2 (tac ^ tgc; Y ^ С).Germline analysis was performed and the result is shown in part in FIG. 2A as an amino acid sequence alignment. For the light chain, the V gene is 98.65% identical to mIGKV819*01F (293/297 nts) and the J gene is 97.30% identical to mIGKJ2*01F (36/37 nts). For the heavy chain, the V gene is 92.83% identical to mIGHV1S22*01F (259/279 nts), the J gene is 82.98% identical to mIGHJ3*01F (39/47 nts), and the D gene is mIGHD2-14 *01F. As shown in FIG. 2B, the LC sequence of the mouse mAb contains an unpaired Cys at position 102, which is located in CDRL3 and arises through a point mutation in the mouse J2 gene (tac^tgc; Y^C).
Пример 1.3: конструирование химерного антитела.Example 1.3: Construction of a chimeric antibody.
Были получены три варианта химерного антитела, которые имели остаток Cys, Tyr или Ser в положении 102 последовательности LC. Три химерные антитела, т.е. BAP049-chi (Cys), BAP049-chi (Tyr) и BAP049-chi (Ser) (также известные как BAP049-chi, BAP049-chi-Y и BAP049-chi-S, соответственно), были экспрессированы в клетках СНО и протестированы на их способность конкурировать с меченым мышиным антителом за связывание с PD-1 клеток, экспрессирующих Jurkat. Как показано на фиг. 3A-3B, эти три варианта были неразличимы в эксперименте с конкуренцией. Результаты показывают, что три химерные моноклональные антитела (Cys, Tyr, Ser) одинаково хорошо конкурируют со связыванием с меченым мышиным mAb BAP049. Небольшое различие между кривыми химерного mAb и кривыми мышиного mAb, вероятно обусловлено применением разных способов определения концентрации mAb. Концентрацию мышиного mAb определяли с помощью измерения OD280, тогда как концентрации химерного mAb в супернатантах определяли с помощью ELISA с использованием стандартного IgG4. Для гуманизированных антител был выбран остаток зародышевой линии Tyr.Three variants of the chimeric antibody were produced that had a Cys, Tyr or Ser residue at position 102 of the LC sequence. Three chimeric antibodies, i.e. BAP049-chi (Cys), BAP049-chi (Tyr) and BAP049-chi (Ser) (also known as BAP049-chi, BAP049-chi-Y and BAP049-chi-S, respectively) were expressed in CHO cells and tested on their ability to compete with a labeled mouse antibody for binding to PD-1 in Jurkat-expressing cells. As shown in FIG. 3A-3B, the three variants were indistinguishable in the competition experiment. The results show that the three chimeric monoclonal antibodies (Cys, Tyr, Ser) compete equally well in binding to the labeled murine mAb BAP049. The slight difference between the chimeric mAb curves and the mouse mAb curves is likely due to the use of different methods for determining mAb concentration. The concentration of the mouse mAb was determined by measuring OD280, while the concentrations of the chimeric mAb in the supernatants were determined by ELISA using standard IgG4. For the humanized antibodies, the germline Tyr residue was selected.
Аминокислотные последовательности тяжелой и легкой цепей в химерных mAb BAP049-chi (Cys) показаны в табл. 1. Нуклеотидные последовательности тяжелой и легкой цепей в химерном mAb BAP049-chi (Cys) показаны в табл. 1. В антителах BAP049-chi (Tyr) и BAP049-chi (Ser) непарный CysThe amino acid sequences of the heavy and light chains in the chimeric mAb BAP049-chi (Cys) are shown in Table. 1. The nucleotide sequences of the heavy and light chains in the chimeric mAb BAP049-chi (Cys) are shown in table. 1. In antibodies BAP049-chi (Tyr) and BAP049-chi (Ser) unpaired Cys
- 195 045940 остаток в положении 102 LC был заменен на остаток Tyr или Ser.- 195 045940 the residue at position 102 LC was replaced by a Tyr or Ser residue.
Пример 1.4: клоны гуманизированных антител.Example 1.4: Humanized Antibody Clones.
Как показано на фиг. 4, в результате гуманизации были получены шестнадцать клонов с аффинностью связывания, сравнимой с аффинностью связывания химерного антитела. В дополнение к показателям связывания, для каждого клона были представлены последовательности VR вместе с образцом mAb. Образцы были подготовлены с помощью транзиторной трансфекции клеток СНО и представляли собой супернатанты тканевой культуры. Показатели концентрации антител в растворах определяли с помощью IgG4-специфичного ELISA.As shown in FIG. 4, humanization resulted in sixteen clones with binding affinities comparable to those of the chimeric antibody. In addition to binding scores, VR sequences were provided for each clone along with the mAb sample. Samples were prepared by transient transfection of CHO cells and were tissue culture supernatants. Antibody concentrations in solutions were determined using IgG4-specific ELISA.
Как показано на фиг. 5, шестнадцать уникальных клонов представляют собой комбинации четырех уникальных последовательностей НС и девяти уникальных последовательностей LC. В FW-областях НС, последовательности НС представляют собой комбинации одной из двух разных VHFW1, одной из трех разных VHFW2, и одной из двух разных последовательностей VHFW3. В FW-областях LC последовательности LC представляют собой комбинации одной из пяти разных VLFW1, одной из трех разных VLFW2, и одной из четырех разных последовательностей VLFW3. Аминокислотные последовательности и нуклеотидные вариабельных доменов тяжелой и легкой цепей из гуманизированных клонов ВАР049 показаны в табл. 1. Аминокислотные и нуклеотидные последовательности областей CDR тяжелой и легкой цепи из гуманизированных клонов ВАР049 также показаны в табл. 1.As shown in FIG. 5, the sixteen unique clones are combinations of four unique HC sequences and nine unique LC sequences. In the FW regions of the HC, the HC sequences are combinations of one of two different VHFW1, one of three different VHFW2, and one of two different VHFW3 sequences. In the LC FW regions, the LC sequences are combinations of one of five different VLFW1, one of three different VLFW2, and one of four different VLFW3 sequences. The amino acid sequences and nucleotide sequences of the heavy and light chain variable domains from the humanized BAP049 clones are shown in Table. 1. The amino acid and nucleotide sequences of the heavy and light chain CDR regions from the humanized BAP049 clones are also shown in Table. 1.
На фиг. 5 показано, что образцы различаются по концентрации mAb, в пределах от 7,9 до 61,5 мкг/мл. Эти цифры являются репрезентативными данными нескольких экспериментов с транзиторной экспрессией.In fig. Figure 5 shows that samples vary in mAb concentration, ranging from 7.9 to 61.5 μg/ml. These numbers are representative of several transient expression experiments.
Пример 1.5: анализ гуманизированных клонов.Example 1.5: Analysis of Humanized Clones.
Пример 1.5.1: анализ активности связывания и специфичности связывания.Example 1.5.1: Analysis of binding activity and binding specificity.
Активность и специфичность связывания были измерены в анализе конкурентного связывания с использованием постоянной концентрации меченых Alexa 488 мышиных mAb, серийных разведений тестируемых mAb и PD-1-экспрессирующих клеток 300.19. Инкубацию смесей моноклональных антител, имеющих разные соотношения концентрации тестируемого mAb и меченого mAb, проводили при температуре 4°C в течение 30 мин. Затем проводили количественное определение связанного меченого мышиного mAb, используя устройство FACS. Эксперимент повторяли два раза. Результаты показаны на фиг. 6А-6В.Binding activity and specificity were measured in a competitive binding assay using a constant concentration of Alexa 488-labeled mouse mAbs, serial dilutions of test mAbs, and PD-1-expressing 300.19 cells. Incubation of mixtures of monoclonal antibodies having different concentration ratios of the tested mAb and labeled mAb was carried out at 4°C for 30 min. Bound labeled mouse mAb was then quantified using a FACS device. The experiment was repeated twice. The results are shown in Fig. 6A-6B.
В пределах точности эксперимента, все гуманизированные клоны показывают сходную активность конкуренции за связывание с меченым мышиным mAb. Эта активность также сравнима с активностью родительского мышиного mAb и химерного mAb. MAb были ранжированы по сравнению друг с другом. Например, клон может быть более слабым конкурентом, если в обоих экспериментах кривая определенного клона расположена справа от кривой химерного mAb, или он может быть более сильным конкурентом, если кривая определенного клона расположена слева от кривой химерного mAb. Такая система ранжирования использована в фиг. 7.Within the limits of experimental precision, all humanized clones show similar binding competition activity with the labeled murine mAb. This activity is also comparable to that of the parental murine mAb and the chimeric mAb. The MAbs were ranked in comparison to each other. For example, a clone may be a weaker competitor if in both experiments the curve of a particular clone is located to the right of the chimeric mAb curve, or it may be a stronger competitor if the curve of a particular clone is located to the left of the chimeric mAb curve. Such a ranking system is used in FIG. 7.
Пример 1.5.2: анализ последовательностей.Example 1.5.2: Sequence Analysis.
На основании структурных характеристик шестнадцать гуманизированных моноклональных антител были разделены на четыре группы и ранжированы от А до Е. Результаты показаны на фиг. 7.Based on structural characteristics, sixteen humanized monoclonal antibodies were divided into four groups and ranked from A to E. The results are shown in FIG. 7.
Пример 1.5.3: отбор гуманизированных клонов.Example 1.5.3: selection of humanized clones.
На фиг. 7 приведены данные, которые учитывались при отборе гуманизированных клонов. Данные экспрессии (столбец 2), вариабельность вариабельных областей по их композиции (столбец 3), относительные показатели в анализах связывания (столбцы 4 и 5) и также структурный анализ (столбец 6).In fig. Table 7 shows the data that was taken into account when selecting humanized clones. Expression data (column 2), variability of variable regions in their composition (column 3), relative performance in binding assays (columns 4 and 5) and also structural analysis (column 6).
Отобранные клоны были дополнительно протестированы на их способность блокировать связывание PD-L1 и PD-L2 с PD-1 и повышать активность Т-клеток in vitro в анализах с человеческими РВМС.Selected clones were further tested for their ability to block PD-L1 and PD-L2 binding to PD-1 and enhance T cell activity in vitro in human PBMC assays.
Пример 1.5.4: блокирование связывания лиганда.Example 1.5.4: blocking ligand binding.
Мышиное моноклональное антитело против PD-1 блокирует связывание природных лигандов PDL1 и PD-L2 с белком PD-1, который экспрессируется на клетках в низких концентрациях. Проводили сравнительные эксперименты с мышиными и химерными антителами, чтобы определить, сохраняют ли гуманизированные клоны способность блокировать родительское мышиное mAb.A mouse monoclonal antibody against PD-1 blocks the binding of the natural ligands PDL1 and PD-L2 to the PD-1 protein, which is expressed in low concentrations on cells. Comparative experiments were performed with mouse and chimeric antibodies to determine whether the humanized clones retained the ability to block the parental mouse mAb.
Блокирующую способность mAb оценивали в анализе конкурентного связывания при постоянной концентрации слитого Fc-белка PD-L1 - huIgG1 или слитого Fc-белка PD-L2 - huIgG1, используя серийные разведения тестируемых моноклональных антител и PD-1-экспрессирующие клетки 300.19. Инкубирование проводили при температуре 4°C в течение 30 мин. Обнаружение связанных с лигандом слитых белков проводили с РЕ-конъюгированным F(ab')2 фрагментом козьего антитела против человеческого IgG, которое не распознает mAb IgG4 (Southern Biotech 2043-09), и с помощью проточной цитометрии. Результаты показаны на фиг. 8А-8В.The blocking ability of the mAb was assessed in a competitive binding assay at a constant concentration of PD-L1 - huIgG1 Fc fusion protein or PD-L2 - huIgG1 Fc fusion protein, using serial dilutions of the test monoclonal antibodies and PD-1-expressing 300.19 cells. Incubation was carried out at 4°C for 30 min. Detection of ligand-bound fusion proteins was performed with a PE-conjugated F(ab') 2 fragment of a goat anti-human IgG antibody that does not recognize IgG4 mAb (Southern Biotech 2043-09) and by flow cytometry. The results are shown in Fig. 8A-8B.
В пределах точности эксперимента гуманизированные клоны, химерные антитела и мышиное родительское mAb проявляют сравнимую блокирующую активность в отношении обоих лигандов PD-L1 и PD-L2.Within experimental limits, the humanized clones, chimeric antibodies, and mouse parental mAb exhibited comparable blocking activity against both PD-L1 and PD-L2 ligands.
Пример 1.5.5: анализ Т-клеточных эпитопов.Example 1.5.5: T cell epitope analysis.
Гуманизированные моноклональные антитела анализировали на Т-клеточные эпитопы с использоHumanized monoclonal antibodies were analyzed for T cell epitopes using
- 196 045940 ванием алгоритма Epibase™. Этот алгоритм анализирует каждый возможный пептид (каждый 10-мер по длине белка с продвижением на одну аминокислоту) на связывание с HLA класса II. Epibase™ оценивает свободную энергию связывания (bind) для каждого пептида и вычисляет предполагаемую KD (AGbind=RT nKD). Затем пептиды получают обозначения S, М, или N, как имеющие сильное (S), среднее (М), слабое связывание или как несвязывающие (N) вещества. Пороговые значения, используемые для этой классификации, различаются для каждого аллотипа.- 196 045940 using the Epibase™ algorithm. This algorithm analyzes every possible peptide (every 10-mer along the length of the protein, moving forward by one amino acid) for binding to HLA class II. Epibase™ estimates the free energy of binding (bind) for each peptide and calculates the estimated KD ( AG bind= RT nKD). Peptides are then designated S, M, or N as strong (S), moderate (M), weak, or nonbinding (N). The thresholds used for this classification vary for each allotype.
Данные были стандартизированы по шкале риска. Общая оценка риска является совокупностью всех потенциальных эпитопов для всех протестированных аллелей, взвешенных по аффинности соответствующих пептидов, с отбрасыванием всех потенциальные эпитопов в последовательностях зародышевой линии (таким образом, более низкое значение становится лучше).Data were standardized to risk scores. The overall risk score is the sum of all potential epitopes for all alleles tested, weighted by the affinity of the corresponding peptides, discarding all potential epitopes in germline sequences (thus, lower is better).
Существуют приблизительно три категории mAb, полученные из большой группы моноклональных антител с различными составами, как описано ниже.There are approximately three categories of mAbs derived from a large group of monoclonal antibodies with different compositions, as described below.
Оценка риска приблизительно 500: полностью человеческие моноклональные антитела, полученные от людей, гуманизированных мышей, и из фаговых библиотек (значения ниже 500 в действительности являются хорошими даже для полностью гуманизированных антител). Гуманизированные mAb специально сконструированы (даже области CDR) с низкой оценкой, и обычно находятся в категории риска 500-700.Risk score approximately 500: fully human monoclonal antibodies derived from humans, humanized mice, and phage libraries (values below 500 are actually good even for fully humanized antibodies). Humanized mAbs are specifically designed (even the CDR regions) to have a low score, and are typically in the 500-700 risk category.
Оценка риска приблизительно 900: типичные CDR-трансплантированные антитела, которые имеют полностью мышиные области CDR с изменениями или без изменений в FW - области; к этой категории в основном относятся подтвержденные CDR-трансплантированные mAb.Risk score approximately 900: typical CDR-grafted antibodies that have fully murine CDR regions with or without changes in the FW region; this category mainly includes confirmed CDR-transplanted mAbs.
Оценка риска приблизительно 1500: химерные моноклональные антитела.Risk score approximately 1500: chimeric monoclonal antibodies.
Результаты выбранных гуманизированных mAb BAP049:Results of selected humanized mAb BAP049:
Выбранные гуманизированные клоны имеют низкие оценки. Обычно значения ниже 500 указывают на низкий риск иммуногенности даже для полностью человеческих антител. Например, человеческое mAb адалимумаб (Хумира/Humira®), имеет оценку 654, который является относительно высокой для человеческого mAb (на верхнем конце кривой Гаусса), но более низкой по сравнению с типичным CDRтрансплантированным mAb.The selected humanized clones have low scores. Typically, values below 500 indicate a low risk of immunogenicity, even for fully human antibodies. For example, the human mAb adalimumab (Humira®), has a score of 654, which is relatively high for a human mAb (at the upper end of the Gaussian curve) but lower than a typical CDR transplant mAb.
Заключение и выводы.Conclusion and conclusions.
Мышиное моноклональное антитело против PD-1, BAP049, подвергается гуманизации. Эта технология подразумевает клонирование мышиных областей CDR в рамке считывания в упорядоченную библиотеку человеческой зародышевой линии каркасных областей вариабельной области, экспрессию в клетках СНО библиотеки клонированных вариабельных областей в виде интактных mAb, гуманизированных IgG4 (S228P), и отбор клонов, которые связываются с мишенью с сопоставимой или с более высокой аффинностью, чем родительское mAb. Таким образом, мышиные области CDR тестировали для отбора подходящих человеческих каркасных последовательностей зародышевой линии, которые сохраняют свою конформацию и, соответственно, аффинность и специфичность связывания родительского мышиного mAb. Были получены последовательности и тестовые образцы шестнадцати гуманизированных моноклональных антител с уникальными последовательностями вариабельной области, которые прошли тест связывания с PD-1-трансфицированными клетками СНО. Эти клоны были дополнительно проанализированы на их биологические функции (например, связывания антигена и блокировка лиганда), структурные характеристики и транзиторную экспрессию в клетках СНО.A mouse monoclonal antibody against PD-1, BAP049, is humanized. This technology involves cloning in-frame murine CDR regions into a sequenced library of human germline variable region frameworks, expressing the cloned variable region library in CHO cells as intact mAbs humanized IgG4 (S228P), and selecting clones that bind to a target with comparable or with higher affinity than the parent mAb. Thus, mouse CDR regions were tested to select suitable human germline framework sequences that retain their conformation and thus the binding affinity and specificity of the parental mouse mAb. Sixteen humanized monoclonal antibodies with unique variable region sequences were sequenced and tested and tested for binding to PD-1-transfected CHO cells. These clones were further analyzed for their biological functions (eg, antigen binding and ligand blocking), structural characteristics, and transient expression in CHO cells.
Пример 2: экспрессия ВАР049, гуманизированного антитела против PD-1.Example 2: Expression of BAP049, a humanized anti-PD-1 antibody.
Пять гуманизированных клонов, описанных в примере 1, были выбраны для оценки экспрессии в клетках яичника китайского хомячка (СНО).Five humanized clones described in Example 1 were selected to evaluate expression in Chinese hamster ovary (CHO) cells.
Были сконструированы векторы с единственным геном (SGV) с использованием векторов GS Xceed Lonza (IgG4pro м' для тяжелой цепи и каппа для легкой цепи). SGV подвергались амплификации и транзиторно котрансфицировались в клетки CHOK1SV GS-KO для экспрессии в объеме 2,8 л.Single gene vectors (SGVs) were constructed using Xceed Lonza GS vectors (IgG4pro m ' for the heavy chain and kappa for the light chain). SGVs were amplified and transiently cotransfected into CHOK1SV GS-KO cells for expression in a 2.8-L volume.
Экспрессионные культуры собирали на 6-й день после трансфекции и осветляли путем центрифугирования и стерильной фильтрации. Осветленный супернатант клеточной культуры очищали с помощью одноэтапной одноступенчатую хроматографии с белком А. Анализы качества продукта с помощью эксклюзионной высокоэффективной жидкостной хроматографии (SE-ВЭЖХ), электрофореза в полиакExpression cultures were harvested on day 6 posttransfection and clarified by centrifugation and sterile filtration. The clarified cell culture supernatant was purified by one-step protein A chromatography. Product quality analyzes by size exclusion high-performance liquid chromatography (SE-HPLC), polyac electrophoresis
- 197 045940 риламидном геле в присутствии додецилсульфата натрия (SDS-PAGE), ИЭФ и методики LAL проводили с использованием очищенного материала в концентрации 1 мг/мл, включающей антитела в качестве контрольного образца.- 197 045940 sodium dodecyl sulfate rilamide gel (SDS-PAGE), IEF and LAL procedures were performed using purified material at a concentration of 1 mg/ml, including antibodies as a control sample.
Пример 2.1: конструирование вектора.Example 2.1: vector construction.
Последовательности кодирующих участков вариабельного домена легкой и тяжелой цепи были синтезированы с помощью GeneArt AG. Кодирующие участки вариабельного домена легкой цепи субклонировали в рХС-каппа, и кодирующие участки вариабельного домена тяжелой цепи субклонировали в векторы pXC-IgG4pro ΔΚ, соответственно, с помощью N-концевого сайта рестрикции Hind III и Сконцевых сайтов рестрикции BsiWI (легкая цепь) и ApaI (тяжелая цепь). Положительные клоны подвергали скринингу путем ПЦР-амплификации (праймеры 1053: GCTGACAGACTAACAGACTGTTCC (SEQ ID NO: 226) и 1072: CAAATGTGGTATGGCTGA (SEQ ID NO: 227)), и верифицировали с помощью рестрикционного расщепления (с использованием двойного расщепления EcoRI-HF и Hind III-HF) и нуклеотидного секвенирования представляющего интерес гена.The sequences of the coding regions of the light and heavy chain variable domains were synthesized using GeneArt AG. The light chain variable domain coding regions were subcloned into pXC-kappa, and the heavy chain variable domain coding regions were subcloned into pXC-IgG4proΔΚ vectors, respectively, using the N-terminal HindIII restriction site and the C-terminal BsiWI (light chain) and ApaI restriction sites ( heavy chain). Positive clones were screened by PCR amplification (primers 1053: GCTGACAGACTAACAGACTGTTCC (SEQ ID NO: 226) and 1072: CAAATGTGGTATGGCTGA (SEQ ID NO: 227)), and verified by restriction digestion (using EcoRI-HF and HindIII double digestion -HF) and nucleotide sequencing of the gene of interest.
Пример 2.2: амплификация ДНК.Example 2.2: DNA amplification.
Одиночную бактериальную колонию пикировали в 15 мл среды Лурии Бертани (LB) (LB бульон, Sigma-Aldrich, L7275), содержащей 50 мкг/мл ампициллина, и инкубировали при 37°C в течение ночи с взбалтыванием при 220 оборотах в минуту. Полученную стартерную культуру использовали для инокуляции 1 л среды Лурии Бертани (LB), содержащей 50 мкг/мл ампициллина, и инкубировали при 37°C в течение ночи с взбалтыванием при 220 оборотах в минуту. Вектор ДНК выделяли с помощью системы QIAGEN Plasmid Plus Gigaprep (Qiagen, 12991). Во всех случаях концентрацию ДНК измеряли с помощью спектрофотометра NanoDrop 1000 (Thermo-Scientific) и до 1 мг/мл доводили ЕВ-буфером (10 мМ Трис-Cl, рН 8,5). Качество ДНК для векторов с единственным геном оценивали путем измерения отношения оптической плотности А260/А280. Было установлено значение в диапазоне от 1,88 до 1,90.A single bacterial colony was picked into 15 ml of Luria Bertani (LB) medium (LB broth, Sigma-Aldrich, L7275) containing 50 μg/ml ampicillin and incubated at 37°C overnight with shaking at 220 rpm. The resulting starter culture was used to inoculate 1 L of Luria Bertani (LB) medium containing 50 μg/ml ampicillin and incubated at 37°C overnight with shaking at 220 rpm. Vector DNA was isolated using the QIAGEN Plasmid Plus Gigaprep system (Qiagen, 12991). In all cases, DNA concentration was measured using a NanoDrop 1000 spectrophotometer (Thermo-Scientific) and adjusted to 1 mg/ml with EB buffer (10 mM Tris-Cl, pH 8.5). DNA quality for single gene vectors was assessed by measuring the absorbance ratio A260/A280. The value was found to range from 1.88 to 1.90.
Пример 2.3: культивирование клеток CHOK1SV GS-KO.Example 2.3: Culture of CHOK1SV GS-KO cells.
Клетки CHOK1SV GS-KO культивировали в среде CD-CHO (Invitrogen, 10743-029), дополненной 6 мМ глутамина (Invitrogen, 25030-123). Клетки инкубировали в инкубаторе с встряхиванием при температуре 36,5°C, 5% CO2, 85% влажности, 140 об/мин. Клетки рутинным способом субкультивировали каждые 3-4 дня, высевая их в концентрации 2х105 клеток/мл и размножали, чтобы иметь достаточное количество клеток, доступных для трансфекции. Клетки отбраковывались после 20 пересевания.CHOK1SV GS-KO cells were cultured in CD-CHO medium (Invitrogen, 10743-029) supplemented with 6 mM glutamine (Invitrogen, 25030-123). Cells were incubated in a shaking incubator at 36.5°C, 5% CO 2 , 85% humidity, 140 rpm. Cells were routinely subcultured every 3-4 days at a concentration of 2 x 10 5 cells/ml and expanded to ensure sufficient numbers of cells were available for transfection. Cells were discarded after 20 subcultures.
Пример 2.4: транзиторные трансфекции клеток CHOK1SV GS-KO.Example 2.4: transient transfections of CHOK1SV GS-KO cells.
Транзиторные трансфекции проводили с использованием клеток CHOK1SV GS-KO, которые культивировали в течение минимум две недели. Клетки были субкультивирована за 24 ч до трансфекции, жизнеспособности клеток во время трансфекции составляла 99%.Transient transfections were performed using CHOK1SV GS-KO cells, which were cultured for a minimum of two weeks. Cells were subcultured 24 h before transfection, and cell viability during transfection was 99%.
Все трансфекции проводили путем электропорации с использованием планшетной системы для электропорации Gene Pulse MXCell (Bio-Rad). Для каждой трансфекции жизнеспособные клетки ресуспендировали в предварительно нагретой среде до концентрации 2,86х107 клеток/мл. В каждую кювету/лунку добавляли аликвотное количество 80 мкг ДНК (1:1 соотношение тяжелых и легких цепей SGV) и 700 мкл клеточной суспензии. Клетки проходили электропорацию при 300 В, 1300 мкФ. Трансфицированные клетки переносили в предварительно нагретой среде в колбах Эрленмейера и кювету/лунки промывали дважды предварительно нагретой средой, которую также переносили в колбы. Трансфицированные клеточные культуры инкубировали в инкубаторе с взбалтыванием при 36,5°C, 5% CO2, 85% влажности, 140 об/мин в течение 6 дней. Жизнеспособность клеток и концентрации жизнеспособных клеток измеряли в момент сбора с помощью автоматизированного счетчика клеток Cedex HiRes (Roche).All transfections were performed by electroporation using the Gene Pulse MXCell Electroporation Plate System (Bio-Rad). For each transfection, viable cells were resuspended in prewarmed medium to a concentration of 2.86 x 10 7 cells/ml. An aliquot of 80 μg of DNA (1:1 ratio of SGV heavy to light chains) and 700 μl of cell suspension was added to each cuvette/well. Cells were electroporated at 300 V, 1300 μF. Transfected cells were transferred in prewarmed medium in Erlenmeyer flasks and the cuvette/wells were washed twice with prewarmed medium, which was also transferred to the flasks. Transfected cell cultures were incubated in a shaking incubator at 36.5°C, 5% CO2, 85% humidity, 140 rpm for 6 days. Cell viability and viable cell concentrations were measured at the time of collection using a Cedex HiRes automated cell counter (Roche).
Пример 2.5: аффинная хроматография белка А.Example 2.5: Protein A affinity chromatography.
Супернатанты клеточных культур собирали и осветляли центрифугированием при 2000 об/мин в течение 10 мин, затем фильтровали через мембранный фильтр PES с размером пор 0,22 мкм. Осветленный супернатант очищали с помощью предварительно загруженной 5 мл колонки HiTrap MabSelect Sure (GE Healthcare, 11-0034-94) на очистителе АКТА (10 мл/мин). Колонку уравновешивали с помощью 50 мМ фосфат натрия, 125 мМ хлорида натрия, рН 7,0 (уравновешивающий буфер) на 5 объемов колонки (CV). После загрузки образца колонку промывали уравновешивающим буфером в объеме 2 колонок с последующим промыванием 3-колоночным объемом 50 мМ фосфата натрия, 1М хлорида натрия, рН 7,0, и повторяли процедуру с уравновешивающим буфером в 2 объемах колонки. Продукт затем элюировали 10 мМ формиата натрия, рН 3,5 в объеме 5 колонок. Содержащие белок элюированные фракции сразу доводили до уровня рН 7,2 и фильтровали через фильтр с размером пор 0,2 мкм.Cell culture supernatants were collected and clarified by centrifugation at 2000 rpm for 10 min and then filtered through a 0.22 μm PES membrane filter. The clarified supernatant was purified using a preloaded 5 mL HiTrap MabSelect Sure column (GE Healthcare, 11-0034-94) on an ACT purifier (10 mL/min). The column was equilibrated with 50 mM sodium phosphate, 125 mM sodium chloride, pH 7.0 (equilibration buffer) for 5 column volumes (CV). After loading the sample, the column was washed with 2 column volumes of equilibration buffer, followed by a 3-column wash with 50 mM sodium phosphate, 1 M sodium chloride, pH 7.0, and repeated the procedure with 2 column volumes of equilibration buffer. The product was then eluted with 10 mM sodium formate, pH 3.5 in a volume of 5 columns. Protein-containing eluted fractions were immediately adjusted to pH 7.2 and filtered through a 0.2-μm filter.
Наблюдали единственный белок-содержащий пик во время фазы элюирования. С помощью анализа SE-ВЭЖХ и SDS-PAGE было установлено, что этот пик содержит mAb. Выход восстановленного белка показан в табл. 5. Транзиторная экспрессия клонов была в диапазоне от 32,4 до 43,0 мг/л.A single protein-containing peak was observed during the elution phase. This peak was determined to contain mAb by SE-HPLC and SDS-PAGE analysis. The yield of the reduced protein is shown in table. 5. Transient expression of the clones ranged from 32.4 to 43.0 mg/L.
- 198 045940- 198 045940
Таблица 5Table 5
Выход белка, титр, содержание мономера и уровни эндотоксинаProtein yield, titer, monomer content and endotoxin levels
Пример 2.6: анализ SE-ВЭЖХ.Example 2.6: SE-HPLC analysis.
Образцы белка А - очищенных антител были проанализированы в двух анализах SE-ВЭЖХ на системе ВЭЖХ серии Agilent 1200, с использованием колонки Zorbax GF-250 4 мкм 9,4 мм IDx250 мм (Agilent). Перед введением аликвотные количества образца в концентрации 1 мг/мл фильтровали через фильтр 0,2 мкм. Соответственно, вводили 80 мкл аликвоты и запускали на 15 мин со скоростью 1 мл/мин. Уровень растворимых агрегатов анализировали с помощью программного обеспечения Chemstation (Agilent).Protein A-purified antibody samples were analyzed in two SE-HPLC assays on an Agilent 1200 series HPLC system using a Zorbax GF-250 4 μm 9.4 mm IDx250 mm column (Agilent). Before injection, aliquots of 1 mg/mL sample were filtered through a 0.2 μm filter. Accordingly, 80 μl aliquots were injected and run for 15 min at a rate of 1 ml/min. The level of soluble aggregates was analyzed using Chemstation software (Agilent).
Были получены хроматографические профили с временем удержания, показывающие процент от общей площади обнаруженных пиков для тестируемых антител и контрольных антител IgG4. Эти продукты показывают единственный белковых пик приблизительно от 8,65 до 8,72 мин, что сравнимо с контрольным человеческим антителом IgG4 (приблизительно 8,64 мин) и соответствует мономерному антителу. Было обнаружено небольшое количество (приблизительно до 4-5%) примесей с более высокой молекулярной массой, что соответствует растворимым агрегатам, со временем удерживания приблизительно от 7,43 до 8,08 мин.Retention time chromatographic profiles were obtained showing the percentage of total peak area detected for test antibodies and control IgG4 antibodies. These products show a single protein peak at approximately 8.65 to 8.72 min, which is comparable to the control human IgG4 antibody (approximately 8.64 min) and consistent with the monomeric antibody. Small amounts (up to approximately 4-5%) of higher molecular weight impurities, consistent with soluble aggregates, were detected, with retention times ranging from approximately 7.43 to 8.08 min.
Пример 2.1: анализ SDS-PAGE.Example 2.1: SDS-PAGE analysis.
Были подготовлены восстановленные пробы для анализа путем смешивания с буфером для образцов NuPAGE 4xLDS (Invitrogen, NP0007) и с восстанавливающим веществом для образцов NuPAGEx10 (Invitrogen, NP0000), которые инкубировали при 70°C в течение 10 мин. Для невосстановленных образцов, восстановитель и термоинкубацию пропускали. Образцы подвергали электрофорезу на 1,5 мм NuPAGE 4-12% с готовыми гелями Bis-Tris Novex (Invitrogen, NP0335PK2), с проточным буфером NuPAGE MES-SDS в денатурирующих условиях. В гель вводили 10 мкл аликвоты предварительно окрашенного SeeBlue Plus 2 антитела со стандартной молекулярной массой (Invitrogen, LC5925) и контрольное IgG4 антитело в концентрации 1 мг/мл. 1 мкл каждого образца в количестве 1 мг/мл наносили на гель. После электрофореза гели окрашивали InstantBlue (TripleRed, ISB01L) в течение 30 мин при комнатной температуре. Образы окрашенных гелей анализировали на системе визуализации Biospectrum (UVP).Reduced samples were prepared for analysis by mixing with NuPAGE 4xLDS Sample Buffer (Invitrogen, NP0007) and NuPAGEx10 Sample Reducing Agent (Invitrogen, NP0000), which were incubated at 70°C for 10 min. For unreduced samples, reducing agent and heat incubation were skipped. Samples were electrophoresed on 1.5 mm NuPAGE 4-12% Bis-Tris Novex precast gels (Invitrogen, NP0335PK2), with NuPAGE MES-SDS running buffer under denaturing conditions. A 10 μl aliquot of prestained SeeBlue Plus 2 standard molecular weight antibody (Invitrogen, LC5925) and a control IgG4 antibody at a concentration of 1 mg/ml were injected into the gel. 1 μl of each sample at 1 mg/ml was applied to the gel. After electrophoresis, the gels were stained with InstantBlue (TripleRed, ISB01L) for 30 min at room temperature. Stained gel images were analyzed on a Biospectrum imaging system (UVP).
Анализ подтвердил наличие продуктов антител и хороший уровень чистоты. В невосстанавливающих условиях наблюдалось преобладающая полоса белка, близкого к 98 кДа, что сравнимо с контрольным антителом IgG4. Контрольное IgG4-антитело и один протестированный клон дополнительно проявляет более слабую полосу, соответствующую тяжелой плюс легкой цепи полуантитела приблизительно в 70 кДа при невосстанавливающих условиях. Это является ожидаемым для контрольного антитела. Две полосы наблюдались при восстанавливающих условиях, что соответствует размеру тяжелых цепей (близких к положению 49 кДа маркера) и легких цепей (близких к положению 28 кДа маркера) и сравнимо с полосами, обнаруженными для контрольного IgG4 антитела.The analysis confirmed the presence of antibody products and a good level of purity. Under non-reducing conditions, a predominant protein band close to 98 kDa was observed, comparable to the control IgG4 antibody. The control IgG4 antibody and one clone tested additionally exhibited a weaker band corresponding to the approximately 70 kDa heavy plus light chain half-antibody under non-reducing conditions. This is as expected for the control antibody. Two bands were observed under reducing conditions, consistent with the size of the heavy chains (close to the 49 kDa position of the marker) and light chains (close to the 28 kDa position of the marker) and comparable to the bands detected for the control IgG4 antibody.
Пример 2.8: анализ изоэлектрического фокусирования (ИЭФ).Example 2.8: Isoelectric focusing (IEF) analysis.
Невосстанавливающие образцы белка А - очищенного антитела подвергают электрофорезу, как описано ниже.Non-reducing samples of protein A-purified antibody are subjected to electrophoresis as described below.
мкг белка А - очищенных образцов подвергали электрофорезу в геле с градиентом рН 3-10, 1,0 мм Novex (Invitrogen, EC66552BOX) с использованием рекомендованных производителями условий проведения анализов. В гель были введены аликвотные количества 10 мкл маркеров ИЭФ, рН 3-10 (Invitrogen, 39212-01). После электрофореза гели фиксировали 10%-ным раствором трихлоруксусной кислотой в течение 30 мин, а затем окрашивали красителем InstantBlue (TripleRed, ISB01L) в течение ночи при комнатной температуре. Образы окрашенных гелей анализировали на системе визуализации Biospectrum (UVP).μg of protein A - purified samples were subjected to electrophoresis on a 1.0 mM Novex pH 3-10 gradient gel (Invitrogen, EC66552BOX) using the manufacturers' recommended assay conditions. The gel was aliquoted with 10 μl of IEF markers, pH 3–10 (Invitrogen, 39212-01). After electrophoresis, the gels were fixed with 10% trichloroacetic acid for 30 min and then stained with InstantBlue dye (TripleRed, ISB01L) overnight at room temperature. Stained gel images were analyzed on a Biospectrum imaging system (UVP).
Как показано в табл. 6, тестируемые клоны показывают заряженные изоформы при уровне рН маркеров от 7,4 до 8,0. Обнаруженные заряженные изоформы имели немного более основную реакцию, чем теоретически вычисленный уровень pI для этих антител, который прогнозировался в диапазоне от 6,99 до 7,56. Общий сдвиг в сторону изоформ с более основным зарядом предполагает наличие посттрансляционных модификаций, таких как гликозилирование на молекулах. Клон С и клон Е показывают сопоставимые заряды изоформ, что также согласуется с теоретически рассчитанным pI, одинаковым для обоих клонов (6,99). Контрольное антитело IgG4 имеет ожидаемые характеристики.As shown in table. 6, the tested clones show charged isoforms at marker pH levels between 7.4 and 8.0. The detected charged isoforms had a slightly more basic response than the theoretically calculated pI level for these antibodies, which was predicted to range from 6.99 to 7.56. The general shift towards isoforms with more basic charge suggests the presence of post-translational modifications such as glycosylation on the molecules. Clone C and clone E show comparable isoform charges, which is also consistent with the theoretically calculated pI being the same for both clones (6.99). The IgG4 control antibody has the expected characteristics.
- 199 045940- 199 045940
Таблица 6Table 6
Заряженные изоформы, выявленные с помощью анализа ИЭФ NovexCharged isoforms identified by Novex IEF assay
Пример 2.9: анализ эндотоксина.Example 2.9: Endotoxin assay.
Уровни эндотоксина очищенных белков измерялись в конечных концентрациях (до 3,44 мг/мл) с использованием прибора Endosafe-PTS, с картриджем, способа на основе анализа LAL (Charles River).Endotoxin levels of purified proteins were measured at final concentrations (up to 3.44 mg/ml) using the Endosafe-PTS, cartridge-based LAL assay method (Charles River).
Как показано в табл. 5, было установлено содержание эндотоксина в диапазоне от 0,04 до 0,63 EU/мг.As shown in table. 5, the endotoxin content was found to range from 0.04 to 0.63 EU/mg.
Вывод.Conclusion.
Были сконструированы экспрессионные векторы GS с единственным геном для выбранных гуманизированных моноклональных антител против PD-1 и использованы для транзиторной трансфекции клеток CHOK1SV GS-KO. Экспрессионную культуру в объеме от 2,6 до 2,8 л инкубировали в стандартных условиях в течение 6 дней, и полученный в результате супернатант клеточной культуры очищали с использованием хроматографии с белком А. Титры после очистки указаны в табл. 5, с выявленным диапазоном от 32,38 до 43,0 мг/л. Выход в восстанавливающих условиях был в диапазоне от 90,7 до 120,4 мг.Single gene GS expression vectors for selected humanized anti-PD-1 monoclonal antibodies were constructed and used for transient transfection of CHOK1SV GS-KO cells. A 2.6 to 2.8 L expression culture was incubated under standard conditions for 6 days, and the resulting cell culture supernatant was purified using protein A chromatography. Purification titers are shown in Table 1. 5, with a detected range from 32.38 to 43.0 mg/l. The yield under reducing conditions ranged from 90.7 to 120.4 mg.
Анализы SDS-PAGE и SE-ВЭЖХ показали наличие небольшого количества (до 6,06%) растворимых агрегатов в продуктах, что в основном соответствует димерному антителу для mAb. В моноклональных антителах также выявлены примеси с более высокой молекулярной массой при времени удержания, которое соответствует тримерным антителам.SDS-PAGE and SE-HPLC analyzes indicated the presence of small amounts (up to 6.06%) of soluble aggregates in the products, largely consistent with dimeric antibody for the mAb. Monoclonal antibodies also exhibit higher molecular weight impurities with retention times consistent with trimeric antibodies.
С помощью изоэлектрического фокусирования обнаружено несколько заряженных изоформ для всех mAb. Среди моноклональных антител были выявлены изоформы, в целом с более основной реакцией, чем теоретически вычисленный уровень pI для этих молекул, что предполагает наличие посттрансляционных модификаций. Было обнаружено, что mAb имеют значения pI, сравнимые с их теоретически рассчитанными значениями pI.Using isoelectric focusing, multiple charged isoforms were detected for all mAbs. Among the monoclonal antibodies, isoforms have been identified that are generally more basic in response than the theoretically calculated pI level for these molecules, suggesting the presence of post-translational modifications. The mAbs were found to have pI values comparable to their theoretically calculated pI values.
Уровни эндотоксина для всех образцов измеряли перед введением образцов, и они оказались ниже 0,63 EU/мг.Endotoxin levels for all samples were measured before sample administration and were found to be below 0.63 EU/mg.
Пример 3: определение свойств мышиных и гуманизированных антител против PD-1.Example 3: Determination of properties of murine and humanized anti-PD-1 antibodies.
Пример 3.1: определение свойств мьшиных антител против PD-1.Example 3.1: determination of the properties of mouse antibodies against PD-1.
Анализировали аффинность связывания с PD-1 мышиного антитела против PD-1, BAP049. Мышиное антитело против PD-1 связывается со слитым белком человеческий PD-1-Ig с KD, которая составляет 0,04 нмоль согласно измерению с помощью ELISA. Как показано в анализе FACS, мышиное антитело против PD-1 связывается с клетками Jurkat, трансфицированными PD-1 человека, с KD 0,06 нмоль, с Тклетками обезьян циномолгус (например, CD4 Т-клетками, активированными CD3/CD28) с KD 0,4 нмоль, и с клетками, трансфицированными PD-1 обезьян циномолгус, с KD 0,6 нмоль.The PD-1 binding affinity of the mouse anti-PD-1 antibody, BAP049, was analyzed. The mouse anti-PD-1 antibody binds to the human PD-1-Ig fusion protein with a KD of 0.04 nmol as measured by ELISA. As shown in FACS analysis, mouse anti-PD-1 antibody binds to Jurkat cells transfected with human PD-1 with a KD of 0.06 nmol, to Cynomolgus monkey cells (eg, CD4 T cells activated by CD3/CD28) with a KD of 0 .4 nmol, and with cells transfected with cynomolgus monkey PD-1 with a KD of 0.6 nmol.
Блокирующая активность мышиного антитела против PD-1 ВАР049 была проанализирована с помощью конкурентного связывания. Мышиное антитело против PD-1 блокировали связывание PD-L1 с клетками 300.19, экспрессирующими человеческий PD-1, при IC50 0,3 нмоль. Это антитело блокировало связывание PD-L2 с клетками 300.19, экспрессирующими человеческий PD-1, с IC50 0,9 нмоль.The blocking activity of the mouse anti-PD-1 antibody BAP049 was analyzed by competitive binding. Mouse anti-PD-1 antibody blocked PD-L1 binding to 300.19 cells expressing human PD-1 with an IC 50 of 0.3 nmol. This antibody blocked PD-L2 binding to 300.19 cells expressing human PD-1 with an IC 50 of 0.9 nmol.
Был проанализирован эффект мышиного антитела против PD-1 ВАР049 на экспрессию гаммаинтерферона (IFN-γ). Мышиное антитело против PD-1 вызывает 2,3±1,1 - кратное увеличение экспрессии IFN-γ на клетках, стимулированных анти-CD3 (0,1 мкг/мл), 2,5±2,0 - кратное увеличение экспрессии IFNγ на клетках, стимулированных стафилококковым энтеротоксином В (SEB) (3 пг/мл), и 2,8±0,8 - кратное увеличение экспрессии IFN-γ по сравнению с клетками, которые стимулируются пептидами CMV.The effect of the mouse anti-PD-1 antibody BAP049 on interferon-gamma (IFN-γ) expression was analyzed. Mouse anti-PD-1 antibody causes a 2.3±1.1-fold increase in IFN-γ expression on cells stimulated with anti-CD3 (0.1 μg/ml), a 2.5±2.0-fold increase in IFNγ expression on cells stimulated with staphylococcal enterotoxin B (SEB) (3 pg/ml), and a 2.8 ± 0.8 fold increase in IFN-γ expression compared to cells stimulated with CMV peptides.
Было также обнаружено, что мышиное антитело против PD-1 ВАР049 увеличивает пролиферацию CD8+ T- клеток, стимулированных пептидами CMV, это показывает процент CD8+ клеток, которые прошли по меньшей мере через некоторое число (n) клеточных делений (например, n=2, 4, 6).The mouse anti-PD-1 antibody BAP049 was also found to increase the proliferation of CD8+ T cells stimulated with CMV peptides, as measured by the percentage of CD8+ cells that have undergone at least a certain number (n) of cell divisions (eg, n=2, 4 , 6).
Пример 3.2: определение свойств гуманизированного антитела против PD-1.Example 3.2: Determination of properties of a humanized anti-PD-1 antibody.
Аффинность и специфичность связывания.Binding affinity and specificity.
Связывание иллюстративного гуманизированного антитела против PD-1 с человеческим белком PD-1 измеряется способом Biacore. Результаты: Ka=2,78x105M-1s-1; Kd=2,13x104 s-1; KD=0,0827±0,005505The binding of an exemplary humanized anti-PD-1 antibody to human PD-1 protein is measured by the Biacore method. Results: Ka=2.78x10 5 M -1 s -1 ; Kd=2.13x10 4 s -1 ; KD=0.0827±0.005505
- 200 045940 нмоль.- 200 045940 nmol.
Связывание того же самого гуманизированного антитела против PD-1 с клетками 300.19, экспрессирующими человеческий PD-1, измеряли с помощью анализа FACS. Результат показывает, что антитело против PD-1 (IgG4 человека) связывается с высокой аффинностью с человеческим PD-1 по сравнению с контрольным изотипом человеческого IgG4.Binding of the same humanized anti-PD-1 antibody to 300.19 cells expressing human PD-1 was measured by FACS analysis. The result shows that anti-PD-1 antibody (human IgG4) binds with high affinity to human PD-1 compared to the human IgG4 isotype control.
Было обнаружено, что иллюстративное гуманизированное антитело против PD-1 обладает высокой аффинностью к белку PD-1 обезьян циномолгус и к клеткам 300.19, экспрессирующим PD-1 обезьян циномолгус. Согласно анализу Biacore, антитело против PD-1 связывается с PD-1 обезьян циномолгус с KD от 0,093±0,015 нмоль. Аффинность связывания с PD-1 обезьян циномолгус сравнима с аффинность связывания указанного антитела с человеческим PD-1.An exemplary humanized anti-PD-1 antibody was found to have high affinity for the cynomolgus monkey PD-1 protein and for 300.19 cells expressing cynomolgus monkey PD-1. According to the Biacore assay, anti-PD-1 antibody binds to cynomolgus monkey PD-1 with a KD of 0.093 ± 0.015 nmol. The binding affinity for cynomolgus monkey PD-1 is comparable to the binding affinity of the antibody for human PD-1.
Дополнительные анализы связывания показывают, что иллюстративное гуманизированное антитело против PD-1 не имеет перекрестной реактивности с мышиным PD-1 или перекрестной реактивности с родительской клеточной линией.Additional binding assays show that the exemplary humanized anti-PD-1 antibody does not have cross-reactivity with murine PD-1 or cross-reactivity with the parent cell line.
Блокирование взаимодействий между PD-1 и его лигандами.Blocking interactions between PD-1 and its ligands.
Была изучена способность иллюстративного гуманизированного антитела против PD-1 блокировать взаимодействие между PD-1 и его обоими известными лигандами, PD-L1 и PD-L2. Результаты показывают, что антитело против PD-1 блокирует связывание PD-L1 и PD-L2 с клетками 300.19, экспрессирующими человеческий PD-1, по сравнению с контрольным изотипом человеческого IgG4 и контролем без антитела. Антитело против PD-1 блокирует связывание PD-L1 на клетках 300.19 при IC50 0,94±0,15 нмоль. То же самое антитело блокируети связывание PD-L2 на клетках 300.19 при IC50 1,3±0,25 нмоль.The ability of an exemplary humanized anti-PD-1 antibody to block the interaction between PD-1 and both of its known ligands, PD-L1 and PD-L2, was studied. Results show that anti-PD-1 antibody blocks PD-L1 and PD-L2 binding to 300.19 cells expressing human PD-1 compared to human IgG4 isotype control and no antibody control. Anti-PD-1 antibody blocks PD-L1 binding on 300.19 cells with an IC 50 of 0.94 ± 0.15 nmol. The same antibody blocks PD-L2 binding on 300.19 cells with an IC 50 of 1.3 ± 0.25 nmol.
Клеточная активность.Cellular activity.
Способность иллюстративного гуманизированного антитела против PD-1 к повышению экспрессии IL-2, стимулированной стафилококковым энтеротоксином В (SEB), была исследована в анализе цельной крови человека ex vivo. Разведенную цельную кровь человека инкубировали с антителом против PD-1 в присутствии или в отсутствии SEB при 37°C в течение 48 ч перед измерением IL-2. Результат показывает, что антитело против PD-1 увеличивает SEB-стимулированную экспрессию IL-2 в 2,28±0,32 раза по сравнению с контрольным изотипом IgG4 человека (SEB 25 мкг/мл; n=5 доноров).The ability of an exemplary humanized anti-PD-1 antibody to increase staphylococcal enterotoxin B (SEB)-stimulated IL-2 expression was examined in an ex vivo human whole blood assay. Diluted human whole blood was incubated with anti-PD-1 antibody in the presence or absence of SEB at 37°C for 48 h before IL-2 measurement. The result shows that anti-PD-1 antibody increases SEB-stimulated IL-2 expression by 2.28 ± 0.32-fold compared to human IgG4 isotype control (SEB 25 μg/ml; n = 5 donors).
Пример 4: отбор пациентов на основании статуса PD-L1/CD8/IFN-Y.Example 4: Patient selection based on PD-L1/CD8/IFN-Y status.
Образцы от нескольких пациентов для каждого из нескольких типов рака были протестированы на статус PD-L1/CD8/IFN-Y. Каждый образец по классификации был отнесен к следующим группам: тройной отрицательный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-Y, одинарной или двойной положительный фенотип по указанным маркерам, или тройной положительный фенотип по указанным маркерам. На фиг. 11 показано, что в популяции пациентов в этом эксперименте, при следующих видах рака часто выявляют тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-Y: рак легкого (плоскоклеточный), рак легкого (аденокарцинома), рак головы и шеи, рак шейки матки (плоскоклеточный), рак желудка, рак щитовидной железы, меланома и рак носоглотки. Пациенты с этими видами рака являются хорошими кандидатами для лечения антителами против PD-1 и комбинированными терапевтическими средствами, как описано в настоящем изобретении. Вероятность успешного лечения может дополнительно возрастать при определении пациентов с тройным положительным фенотипом на PD-L1/CD8/IFN-y, и лечении пациентов с тройным положительным фенотипом антителами против PD-1 и комбинированными терапевтическими средствами, согласно изобретению.Samples from multiple patients for each of several cancer types were tested for PD-L1/CD8/IFN-Y status. Each sample was classified into the following groups: triple negative phenotype for PD-L1/CD8/IFN-Y, single or double positive phenotype for the specified markers, or triple positive phenotype for the specified markers. In fig. Figure 11 shows that in the patient population in this experiment, the following types of cancer often exhibit a triple positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-Y: lung cancer (squamous cell), lung cancer (adenocarcinoma), head and neck cancer, cervical cancer uterine (squamous cell), stomach cancer, thyroid cancer, melanoma and nasopharyngeal cancer. Patients with these cancers are good candidates for treatment with anti-PD-1 antibodies and combination therapeutic agents as described in the present invention. The likelihood of successful treatment may be further increased by identifying patients with a triple positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-y, and treating patients with a triple positive phenotype with anti-PD-1 antibodies and combination therapeutics according to the invention.
На фиг. 12 показано, что в популяции пациентов при следующих видах рака редко выявляют тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-y: ER+ рак молочной железы и рак поджелудочной железы. Примечательно, что даже при раковых заболеваниях, которые обычно не являются положительными на PD-L1/CD8/IFN-Y, можно повысить вероятность успешного лечения, если определить группу пациентов с тройным положительным фенотипом на PD-L1/CD8/IFN-Y, и лечить пациентов с тройным положительным фенотипом антителом против PD-1 и комбинированными терапевтическими средствами, согласно изобретению.In fig. 12 shows that in the patient population, the following types of cancer rarely exhibit a triple positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-y: ER+ breast cancer and pancreatic cancer. Notably, even in cancers that are not typically PD-L1/CD8/IFN-Y positive, the likelihood of successful treatment can be increased by identifying a subset of patients with a PD-L1/CD8/IFN-Y triple positive phenotype, and treat patients with a triple positive phenotype with anti-PD-1 antibody and combination therapeutic agents according to the invention.
На фиг. 13 показана доля больных раком молочной железы, которые имеют тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-Y. Рассматривая рак молочной железы в целом, можно отметить достаточно низкое число тройных положительных фенотипов. Тем не менее, если сосредоточится только на раке молочной железы IM-TN, можно отметить, что намного больший процент пациентов имеет тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-Y. Рак молочной железы IM-TN особенно трудно поддается лечению с помощью общепринятых терапевтических средств. Открытие факта, что IM-TN рак молочной железы часто является тройным положительным по PD-L1/CD8/IFN-y, открывает новые возможности лечения этого вида рака с помощью антитела против PD-1 и комбинированных терапевтических средств, согласно изобретению.In fig. Figure 13 shows the proportion of breast cancer patients who have a triple positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-Y. Considering breast cancer as a whole, one can note a fairly low number of triple positive phenotypes. However, when focusing only on IM-TN breast cancer, a much larger percentage of patients have a triple positive PD-L1/CD8/IFN-Y phenotype. IM-TN breast cancer is particularly difficult to treat with conventional therapeutic agents. The discovery that IM-TN breast cancer is often triple positive for PD-L1/CD8/IFN-y opens up new possibilities for treating this cancer with anti-PD-1 antibody and combination therapeutics according to the invention.
На фиг. 14 показана доля больных раком толстой кишки, которые имеют тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-Y. Отмечено, что в целом при раке толстой кишки достаточно низкий процент тройного положительного фенотипа. Тем не менее, если сфокусироваться только на раке молочной железы с высокой MSI (с высокой микросателлитной нестабильностью), можно увидеть, что намногоIn fig. Figure 14 shows the proportion of colon cancer patients who have a triple positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-Y. It has been noted that, in general, colon cancer has a fairly low percentage of the triple positive phenotype. However, if we focus only on high MSI (high microsatellite instability) breast cancers, we see that much
- 201 045940 больший процент пациентов имеет тройной положительный фенотип по PD-L1/CD8/IFN-Y. Уровни MSI можно проанализировать с помощью например, коммерчески доступных способов на основе ПЦР.- 201 045940 a higher percentage of patients have a triple positive phenotype for PD-L1/CD8/IFN-Y. MSI levels can be analyzed using, for example, commercially available PCR-based methods.
Образцы рака желудка тестировали на уровни PD-L1/CD8/IFN-Y (данные не показаны). Было установлено, что при раке желудка с высокой MSI или EBV+ раке желудка приблизительно 49% образцов являются положительными по PD-L1, и высокая доля PD-L1-положительных клеток имели тройной положительный фенотип по PD-Ll/CD8/IFN-Y. Было также установлено, что доля PD-L1-положительных клеток и PD-L1/CD8/IFN-Y положительных клеток также являются положительными по PIK3CA. Эти данные свидетельствуют о том, что указанные виды рака можно лечить антителом против PD-1, необязательно в комбинации с лечением PIK3.Gastric cancer samples were tested for PD-L1/CD8/IFN-Y levels (data not shown). In high MSI or EBV+ gastric cancers, approximately 49% of samples were found to be PD-L1 positive, and a high proportion of PD-L1 positive cells had a triple positive PD-Ll/CD8/IFN-Y phenotype. It was also found that a proportion of PD-L1-positive cells and PD-L1/CD8/IFN-Y positive cells are also PIK3CA positive. These data suggest that these cancers can be treated with anti-PD-1 antibody, not necessarily in combination with PIK3 treatment.
Образцы колоректального рака (CRC) с высокой MSI тестировали на комбинации маркеров (данные не показаны). Было установлено, что в образцах CRC с высокой MSI большая доля образцов PDL1/CD8/IFN-Y также является положительной по LAG-3, PD-1 (также называемый PDCD1), RNF43 и BRAF. Полученные данные свидетельствуют о том, что эти виды рака можно лечить антителом против PD-1, необязательно в комбинации с терапевтическим средством, мишенью которого является один или несколько из LAG-3, PDCD1, RNF43 и BRAF.Colorectal cancer (CRC) samples with high MSI were tested for a combination of markers (data not shown). In CRC samples with high MSI, a higher proportion of PDL1/CD8/IFN-Y samples were found to also be positive for LAG-3, PD-1 (also called PDCD1), RNF43, and BRAF. The findings suggest that these cancers can be treated with an anti-PD-1 antibody, optionally in combination with a therapeutic agent that targets one or more of LAG-3, PDCD1, RNF43 and BRAF.
Образца от плоскоклеточного рака легкого тестировали на комбинации маркеров (данные не показаны). Было установлено, что в образцах плоскоклеточного рака легкого большая доля образцов PDL1/CD8/IFN-Y также является положительной по LAG-3. Полученные данные свидетельствуют о том, что указанные виды рака можно лечить антителом против PD-1, необязательно в комбинации с терапевтическим средством, нацеленным на LAG-3, например, антителом против LAG-3.Samples from squamous cell lung cancer were tested for a combination of markers (data not shown). In squamous cell lung cancer specimens, a large proportion of PDL1/CD8/IFN-Y specimens were found to also be LAG-3 positive. The findings suggest that these cancers can be treated with an anti-PD-1 antibody, optionally in combination with a therapeutic agent targeting LAG-3, such as an anti-LAG-3 antibody.
Образцы папиллярного рака щитовидной железы тестировали на комбинации маркеров, включающих мутации BRAF V600E (данные не показаны). Было установлено, что высокая доля образцов рака щитовидной железы, которые являются положительными по PD-L1, также положительны по BRAF V600E. Полученные данные свидетельствуют о том, что указанные виды рака можно лечить антителом против PD-1, необязательно в комбинации с терапевтическим средством, нацеленным на BRAF.Papillary thyroid cancer samples were tested for a combination of markers including BRAF V600E mutations (data not shown). It was found that a high proportion of thyroid cancer samples that are positive for PD-L1 are also positive for BRAF V600E. The findings suggest that these cancers can be treated with an anti-PD-1 antibody, not necessarily in combination with a BRAF-targeting therapeutic.
Пример 5: Отбор пациентов основан на PD-L1 статуса.Example 5: Patient selection based on PD-L1 status.
Чтобы обеспечить широкое изучение показаний к лечению рака терапевтическими средствами на основе PD-1/PD-L1, авторы провели оценку экспрессии PD-L1 на уровне белка и уровне мРНК в злокачественных опухолях человека, включающих опухоли легкого и печени.To enable broad examination of cancer treatment indications with PD-1/PD-L1-based therapeutics, we assessed PD-L1 expression at the protein level and mRNA level in human malignancies including lung and liver tumors.
Экспрессию белка PD-L1 оценивали в иммуногистохимическом анализе (IHC) набора зафиксированных в формалине и залитых парафином образцов таких опухолей, как немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) - аденокарцинома (АСА), NSCLC плоскоклеточная карцинома (SCC) и гепатоцеллюлярнаяй карцинома (НСС). Экспрессию PD-L1 оценивали полуколичественно с помощью методики ручного гистологического подсчета (H-score), основанной на интенсивности окрашивания и процент положительных опухолевых клеток. В анализе IHC по изобретению PD-L1 - позитивность (PD-L1+) была определена как гистологическая оценка 20. Параллельно с этим были изучены данные экспрессии мРНК в PD-L1 в Геномном атласе рака (The Cancer Genome Atlas, TCGA) при этих же показаниях (503 NSCLC АСА, 489 NSCLC SCC и 191 НСС) и проанализированы путем сравнения экспрессии в родственных нормальных тканях из Атласа TCGA.PD-L1 protein expression was assessed in immunohistochemistry (IHC) analysis of a set of formalin-fixed, paraffin-embedded tumor specimens from non-small cell lung cancer (NSCLC)-adenocarcinoma (ACA), NSCLC squamous cell carcinoma (SCC), and hepatocellular carcinoma (HCC). PD-L1 expression was assessed semiquantitatively using a manual histological scoring technique (H-score) based on staining intensity and the percentage of positive tumor cells. In the IHC analysis of the invention, PD-L1 positivity (PD-L1+) was defined as a histological score of 20. In parallel, PD-L1 mRNA expression data were examined in The Cancer Genome Atlas (TCGA) for the same indications (503 NSCLC ACA, 489 NSCLC SCC and 191 NCC) and analyzed by comparing expression in related normal tissues from the TCGA Atlas.
С помощью анализа секвенирования РНК рассчитывали данные как log2 (RPKM+0,1) после стандартизации RSEM, используя информацию по секвенированию РНК OmicSoft RNASeq из Атласа TCGA относительно свойств опухолей. Экспрессия PD-L1 повышается при NSCLC АСА и SCC, по отношению к экспрессии при НСС. Путем наложения распределений и сравнение уровней экспрессии по всем свойствам из TCGA авторы оценивали профили сверхэкспрессии для PD-L1 и обнаружили, что в когорте НСС из TCGA значительно снижены уровни мРНК из PD-L1, с медианой -0,8 по сравнению с медианой 1,3 при АСА и 1,5 при SCC, что представляет собой более чем 2-кратное изменение медианного уровня экспрессии. По анализу секвенирования РНК авторы определили, что в 50% случаев NSCLC аденокарциномы, 54% NSCLC плоскоклеточной карциномы и в 6% случаев гепатоцеллюларной карциномы имеется высокая экспрессия PD-L1.RNA sequencing analysis calculated data as log2 (RPKM+0.1) after RSEM standardization using OmicSoft RNASeq RNA sequencing information from the TCGA Atlas of tumor properties. PD-L1 expression is increased in NSCLC ACA and SCC, relative to expression in NCC. By overlaying distributions and comparing expression levels across all properties from TCGA, the authors assessed overexpression profiles for PD-L1 and found that the HCC cohort from TCGA had significantly reduced mRNA levels from PD-L1, with a median of -0.8 compared to a median of 1. 3 in ACA and 1.5 in SCC, representing more than a 2-fold change in median expression level. From RNA sequencing analysis, the authors determined that 50% of NSCLC adenocarcinomas, 54% of NSCLC squamous cell carcinomas, and 6% of hepatocellular carcinomas had high expression of PD-L1.
Экспрессию белка PD-L1 опухолевыми клетками измеряли в 45 образцах аденокарциномы легкого (АСА), 47 образцах плоскоклеточной карциномы легкого (SCC) и в 36 образцах гепатоцеллюлярной карциномы (НСС). Положительными по PD-L1 являлись 16/45 (35,6%) АСА легкого, 21/47 (44,7%) SCC легкого. В отличие от этого, PD-L1 положительность была выявлена только в 2/36 (5,6%) образцах НСС.PD-L1 protein expression by tumor cells was measured in 45 lung adenocarcinoma (ACA), 47 lung squamous cell carcinoma (SCC) samples, and 36 hepatocellular carcinoma (HCC) samples. 16/45 (35.6%) lung ACAs, 21/47 (44.7%) lung SCCs were positive for PD-L1. In contrast, PD-L1 positivity was detected in only 2/36 (5.6%) NCC samples.
Таким образом, с помощью иммуногистохимического анализа (IHC) и секвенирования РНК в больших и независимых комплектах человеческих образцов немелкоклеточного рака легкого и НСС, авторы обнаружили, что экспрессия PD-L1 более обильная при NSCLC, чем при НСС. При NSCLC выявлены сопоставимые результаты между аденокарциномой и плоскоклеточными карциномами. Важно отметить, что среди большого числа образцов (128 в IHC-анализе и 1183 в анализе секвенирования РНК) в 3-х случаях наблюдается очень хорошее соответствие между анализом на уровне белка и анализом на уровне мРНК. Таким образом, полученные выводы могут стать основой крупномасштабного интеллектуального анализа мРНК в TCGA в отношении показаний и групп пациентов, у которых возможно усилитьIn summary, using immunohistochemistry (IHC) and RNA sequencing in large and independent sets of human NSCLC and NCC samples, the authors found that PD-L1 expression is more abundant in NSCLC than in HCC. NSCLC showed comparable results between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas. It is important to note that among the large number of samples (128 in the IHC analysis and 1183 in the RNA-seq analysis), in 3 cases there was very good agreement between the analysis at the protein level and the analysis at the mRNA level. Thus, the findings may form the basis for large-scale mRNA mining in TCGA regarding indications and patient groups in which it is possible to enhance
- 202 045940 реакции на иммунные терапевтические средства на основе PD-1/PD-L1.- 202 045940 reactions to PD-1/PD-L1 based immune therapeutics.
Пример 6: эффект препаратов направленного действия на модуляцию PD-L1.Example 6: Effect of targeted drugs on PD-L1 modulation.
В этом примере оценивали эффекты выбранных терапевтических средств (таких как ингибитор сМЕТ, ингибитор MEK, ингибитор bRAF и ингибитор ALK) на модуляцию PD-L1 (CD274). Соединение А17 может быть получено, как описано в примере 21 патента США № 8420645. Следующие соединения: соединение А18 (руксолитиниб фосфат), соединение А23 (церитиниб), соединение А34 (Биниметиниб) и соединение А29 (Энкорафениб) были получены от компании Novartis AG, Базель, Швейцария. Выбранные терапевтические средства были проанализированы с помощью ПЦР в реальном времени и проточной цитометрии на уровне PD-L1. Наблюдалось значительное ингибирование PD-L1 посредством соединения А17, соединения А18, соединения А34, соединение А29 и соединения А23 на опухолевых клетках.In this example, the effects of selected therapeutics (such as cMET inhibitor, MEK inhibitor, bRAF inhibitor and ALK inhibitor) on PD-L1 (CD274) modulation were assessed. Compound A17 can be prepared as described in Example 21 of US Pat. No. 8,420,645. The following compounds: Compound A18 (ruxolitinib phosphate), Compound A23 (ceritinib), Compound A34 (Binimetinib) and Compound A29 (Encorafenib) were obtained from Novartis AG. Basel, Switzerland. Selected therapeutics were analyzed by real-time PCR and flow cytometry at the PD-L1 level. Significant inhibition of PD-L1 by compound A17, compound A18, compound A34, compound A29 and compound A23 on tumor cells was observed.
Понижающая регуляция белка PD-L1 соединением A17 в клетках немелкоклеточного рака легкого.Down-regulation of PD-L1 protein by compound A17 in non-small cell lung cancer cells.
Экспрессию PD-L1 (CD274) анализировали в линиях раковых клеток, на которые воздействовали соединением А17. Клетки были получены из АТСС и культивированы in vitro в соответствии с инструкциями АТСС. Свойства используемых клеточных линий были описаны ранее, см. Cancer Cell Line Encyclopedia Project (http://www.broadinstitute.org/ccle/home).The expression of PD-L1 (CD274) was analyzed in cancer cell lines treated with compound A17. Cells were obtained from ATCC and cultured in vitro according to ATCC instructions. The properties of the cell lines used have been described previously, see Cancer Cell Line Encyclopedia Project (http://www.broadinstitute.org/ccle/home).
Клетки высевали в шести-луночные культуральные планшеты и обрабатывали соединением А17 в различных концентрациях (10 нмоль, 100 нмоль и 1000 нмоль) в течение 24, 48 и 72 ч. Равное количество носителя (диметилсульфоксид, ДМСО) использовали в качестве контроля. Клетки промывали фосфатнобуферным раствором и затем собирали с помощью клеточного скребка.Cells were seeded in six-well culture plates and treated with compound A17 at various concentrations (10 nmol, 100 nmol and 1000 nmol) for 24, 48 and 72 h. An equal amount of vehicle (dimethyl sulfoxide, DMSO) was used as a control. The cells were washed with phosphate-buffered saline and then collected using a cell scraper.
Для каждой реакции клетки в количестве 0,5-1 х 106 окрашивали 20 мкл моноклональным РЕ антителом против человеческого PD-L1, клон М1Н1 (BD) в течение 30-60 мин при температуре 4°C. Клетки промывали дважды. Данные были получены с помощью Canto II с программным обеспечением FACSDiva (BD Bioscience). Анализ данных проводили с использованием программного обеспечения FlowJo (Tree Star). Среднюю интенсивность флуоресценции (MFI) определяли путем стробирования на отдельные клетки. Неокрашенные клетки использованы в качестве контроля стробирования.For each reaction, 0.5-1 x 10 6 cells were stained with 20 μl of monoclonal PE antibody against human PD-L1, clone M1H1 (BD) for 30-60 min at 4°C. Cells were washed twice. Data were acquired using Canto II with FACSDiva software (BD Bioscience). Data analysis was performed using FlowJo software (Tree Star). Mean fluorescence intensity (MFI) was determined by gating on individual cells. Unstained cells were used as gating controls.
Обработка in vitro клеток ЕВС-1 (клеток немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) с амплификацией сМЕТ) соединением А17 приводило к выраженной понижающей регуляции поверхностной экспрессии PD-L1, что обнаружено с помощью проточной цитометрии (фиг. 15). По представленным в изобретении результатам предполагается, что соединение А17 действует в качестве ингибитора PD-L1/PD-1.In vitro treatment of EBC-1 cells (non-small cell lung cancer (NSCLC) cells with cMET amplification) with compound A17 resulted in a significant down-regulation of PD-L1 surface expression as detected by flow cytometry (FIG. 15). According to the results presented in the invention, it is assumed that compound A17 acts as an inhibitor of PD-L1/PD-1.
Соединение А17, соединение А34, соединение А18, соединение А29 и соединение А23 подавляют мРНК PD-L1.Compound A17, compound A34, compound A18, compound A29 and compound A23 suppress PD-L1 mRNA.
Были разработаны анализы TaqMan-ПЦР для обнаружения изменений уровня экспрессии PD-L1 (CD274) в клеточных линиях и опухолевых ксенотрансплантатах. мРНК выделяли из замороженных клеточных шариков или фрагментов опухоли с использованием набора Qiagen RNeasy Mini Kit. Выделенную РНК замораживали при температуре -80°C. После проверки качества РНК проводили количественную оценку РНК с помощью биоанализатора 2100 Agilent Bioanalyzer в соответствии с протоколом Agilent RNA 6000 Nano Kit. кДНК получали с использованием высокомощного набора РНК-кДНК (High Capacity RNA-to cDNA Kit (Applied Biosystems Kit)).TaqMan-PCR assays were developed to detect changes in PD-L1 (CD274) expression levels in cell lines and tumor xenografts. mRNA was isolated from frozen cell beads or tumor fragments using the Qiagen RNeasy Mini Kit. The isolated RNA was frozen at -80°C. After checking the RNA quality, RNA was quantified using the 2100 Agilent Bioanalyzer according to the Agilent RNA 6000 Nano Kit protocol. cDNA was prepared using the High Capacity RNA-to cDNA Kit (Applied Biosystems Kit).
Реакции ПЦР в реальном времени проводили в 20 мкл общего объема, включающего 10 мкл универсальной смеси для ПЦР Universal PCR master mix (Applied Biosystems), 1 мкл набора зондов/праймеров человеческого PD-L1 (CD274) (Applied Biosystems) и 8 мкл кДНК. Каждый образец проходил реакцию трижды. Количество кДНК, полученное из 25-50 нг РНК в реакции обратной транскрипции, было использовано в каждой реакции ПЦР. Из-за разницы в уровнях мРНК между PD-L1 и GAPDH, в отдельных пробирках проводили две реакции ПЦР в реальном времени, используя такое же количество кДНК. Реакции ПЦР в режиме реального времени проводили на устройстве С1000 Thermal Cycle (BioRad)) со следующей программой термоцикла: 10 мин инкубации при 95°C, с последующими 40 циклами при 95°C в течение 15 с и при 60°C в течение 1 мин. После завершения реакции среднее значение Ct PD-L1 было стандартизировано по отношению к каждому значению Ct из эталонной реакции GAPDH. Каждое стандартизированное логарифмическое значение затем преобразуется в линейную величину.Real-time PCR reactions were performed in a 20-μl total volume containing 10 μl Universal PCR master mix (Applied Biosystems), 1 μl human PD-L1 (CD274) probe/primer set (Applied Biosystems), and 8 μl cDNA. Each sample was reacted three times. The amount of cDNA obtained from 25–50 ng of RNA in the reverse transcription reaction was used in each PCR reaction. Due to the difference in mRNA levels between PD-L1 and GAPDH, two real-time PCR reactions were performed in separate tubes using the same amount of cDNA. Real-time PCR reactions were performed on a C1000 Thermal Cycle (BioRad) with the following thermal cycle program: 10 min incubation at 95°C, followed by 40 cycles at 95°C for 15 s and 60°C for 1 min . After reaction completion, the mean PD-L1 Ct value was standardized to each Ct value from the GAPDH reference reaction. Each standardized logarithmic value is then converted to a linear value.
Подавление экспрессии PD-L1 (мРНК) посредством соединения А17 наблюдалось в ксенотрансплантате опухолевой клетки Hs.746.T (клетки рака желудка с амплификацией и мутации с-МЕТ) (фиг. 16). Ингибирование PD-L1 мРНК посредством соединением А23 наблюдалась in vitro в Н3122 (немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) с транслокацией ALK) (фиг. 17). Ингибирование PD-L1 мРНК посредством соединения А29 и соединения А34 наблюдалось в моделях ксенотрансплантатов опухолей, несущих опухоли LOXIMV1 (меланома с мутанцией BRAF, фиг. 18), и HEYA8 (рак яичников с мутацией KRAF, фиг. 19), соответственно. Ингибирование PD-L1 мРНК посредством соединения А18 наблюдалось в моделях ксенотрансплантатов опухолей, несущих UKE-1 (линия миелопролиферативного новообразования (MPN) с мутацией JAK2V617F, фиг. 20).Suppression of PD-L1 (mRNA) expression by compound A17 was observed in a tumor cell xenograft Hs.746.T (gastric cancer cells with amplification and c-MET mutations) (Fig. 16). Inhibition of PD-L1 mRNA by compound A23 was observed in vitro in H3122 (non-small cell lung cancer (NSCLC) with ALK translocation) (Fig. 17). Inhibition of PD-L1 mRNA by compound A29 and compound A34 was observed in tumor xenograft models bearing LOXIMV1 (BRAF-mutant melanoma, Fig. 18) and HEYA8 (KRAF-mutant ovarian cancer, Fig. 19) tumors, respectively. Inhibition of PD-L1 mRNA by compound A18 was observed in tumor xenograft models harboring UKE-1 (myeloproliferative neoplasm (MPN) cell line with JAK2V617F mutation, Fig. 20).
Результаты, представленные в изобретении, демонстрируют роль соединения А17, соединения А34, соединения А18, соединения А29 и соединения А23 в регуляции молекул точки иммунного контроля при раке. Наблюдаемое ингибирование экспрессии PD-L1 посредством указанных соединений позволяет предположить, что эти вещества направленного действия могут обладать иммунномодулирующими эфThe results presented in the invention demonstrate the role of compound A17, compound A34, compound A18, compound A29 and compound A23 in the regulation of immune checkpoint molecules in cancer. The observed inhibition of PD-L1 expression by these compounds suggests that these targeted agents may have immunomodulatory effects.
- 203 045940 фектами, в дополнение к их влиянию на сигнальный путь рака. Таким образом, представленные в изобретении результаты показывают, что путем введения веществ направленного действия с ингибиторами ингибиторов точки иммунного контроля, таких как PD-1, PD-L1, LAG-3 и/или TIM-3, будет достигаться более мощное обратное развитие иммунносупрессии, опосредуемой точкой иммунного контроля.- 203 045940 fects, in addition to their effects on the cancer signaling pathway. Thus, the results presented in the invention show that by administering targeted substances with inhibitors of immune checkpoint inhibitors such as PD-1, PD-L1, LAG-3 and/or TIM-3, a more potent reversal of immunosuppression will be achieved, mediated point of immune control.
Включение путем ссылкиIncorporation by reference
Все публикации, патенты и номера доступа, упомянутые в изобретении, включены в качестве ссылки в полном объеме, как если бы каждая отдельная публикация или патент были конкретно и отдельно указаны как включенные в качестве ссылки.All publications, patents and accession numbers mentioned in the invention are incorporated by reference in their entirety as if each individual publication or patent were specifically and separately identified as being incorporated by reference.
ЭквивалентыEquivalents
Были рассмотрены конкретные варианты осуществления настоящего изобретения, но, вместе с тем, вышеприведенное описание имеет иллюстративное предназначение и не является ограничивающим. Многие варианты осуществления изобретения станут очевидными для специалистов в данной области при рассмотрении данного описания и нижеприведенной формулы изобретения. Полный объем изобретения должен определяться пунктами формулы изобретения, вместе с полным объемом их эквивалентов, и описанием, наряду с такими вариантами.Specific embodiments of the present invention have been discussed, but the above description is intended to be illustrative and not limiting. Many embodiments of the invention will become apparent to those skilled in the art upon consideration of this specification and the following claims. The full scope of the invention is to be determined by the claims, together with the full scope of their equivalents, and the description, along with such variations.
Claims (56)
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US61/931,512 | 2014-01-24 | ||
US62/059,676 | 2014-10-03 | ||
US62/094,834 | 2014-12-19 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA045940B1 true EA045940B1 (en) | 2024-01-19 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11827704B2 (en) | Antibody molecules to PD-1 and uses thereof | |
US20210009687A1 (en) | Antibody molecules to lag-3 and uses thereof | |
US20240343808A1 (en) | Antibody molecules to pg-l1 and methods of treating cancer and infectious diseases | |
TWI852057B (en) | Antibody molecules to lag-3 and uses thereof | |
EA045940B1 (en) | ANTI-PD-1 ANTIBODY MOLECULES AND THEIR APPLICATIONS | |
EA040295B1 (en) | ANTIBODY MOLECULES AGAINST LAG-3 AND THEIR APPLICATIONS |