EA045931B1 - ANTI-CTLA-4 ANTIBODY AND ITS APPLICATION - Google Patents

ANTI-CTLA-4 ANTIBODY AND ITS APPLICATION Download PDF

Info

Publication number
EA045931B1
EA045931B1 EA202291976 EA045931B1 EA 045931 B1 EA045931 B1 EA 045931B1 EA 202291976 EA202291976 EA 202291976 EA 045931 B1 EA045931 B1 EA 045931B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
seq
amino acid
hvr
acid sequence
antibody
Prior art date
Application number
EA202291976
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Хитоси КАТАДА
Канако ТАЦУМИ
Ютака Мацуда
Сюн СИМИДЗУ
Масаки Камимура
Ясунори Комори
Юдзи ХОРИ
Томоюки ИГАВА
Хироки Каваути
Хироаки Сусуму
Original Assignee
Чугаи Сейяку Кабусики Кайся
Filing date
Publication date
Application filed by Чугаи Сейяку Кабусики Кайся filed Critical Чугаи Сейяку Кабусики Кайся
Publication of EA045931B1 publication Critical patent/EA045931B1/en

Links

Description

Область техникиTechnical field

Настоящее изобретение относится к анти-СТЬА-4 антителам и способам применение этих антител Предшествующий уровень техникиThe present invention relates to anti-CTA-4 antibodies and methods of using these antibodies. Background of the Invention

Клетки, несущие генные мутации и подобные нарушения в живых организмах, отслеживаются и уничтожаются системой иммунного надзора. Однако постоянство чрезмерных иммунных реакций может нанести вред и самому организму, например, повреждение нормальных тканей в результате аутоиммунной реакции. Таким образом, иммунная система снабжена механизмом отрицательной обратной связи (иммунные контрольные точки) для подавления иммунных ответов после активации (см., например NPL 1). Считается, что иммунные контрольные точки играют важную роль в поддержании гомеостаза в иммунной системе. С другой стороны, выясняется, что некоторые опухоли используют иммунные контрольные точки для иммунологического ускользания. В настоящее время активно проводятся обширные исследования иммуносупрессорной функции через молекулы основных иммунных контрольных точек, цитотоксический Т-лимфоцит-ассоциированный антиген 4 (CTLA-4), запрограммированную гибель клеток 1 (PD-1) и лиганд-запрограммированную гибель клеток 1 (PD-L1).Cells carrying gene mutations and similar disorders in living organisms are tracked and destroyed by the immune surveillance system. However, the persistence of excessive immune reactions can cause harm to the body itself, such as damage to normal tissues as a result of an autoimmune reaction. Thus, the immune system is equipped with a negative feedback mechanism (immune checkpoints) to suppress immune responses once activated (see, for example, NPL 1). Immune checkpoints are thought to play an important role in maintaining homeostasis in the immune system. On the other hand, it appears that some tumors use immune checkpoints for immunological escape. Extensive research is currently underway into immunosuppressive function through the essential immune checkpoint molecules, cytotoxic T-lymphocyte-associated antigen 4 (CTLA-4), programmed cell death 1 (PD-1), and programmed cell death ligand 1 (PD-L1). ).

CTLA-4 представляет собой гликопротеин, принадлежащий к надсемейству иммуноглобулинов, ген которого был клонирован из библиотеки клонов кДНК Т-клеток-киллеров, полученных от мышей в 1987 г. (см., например, NPL2). Известно, что иммунный ответ Т-клеток подавляется посредством CTLA-4. В 1996 году сообщалось, что эффект регрессии опухоли наблюдался при введении антитела против CTLA4 мышам-носителям рака, что соответствует представлению о том, что стимулирование активации Тклеток путем подавления функции CTLA-4 приводит к регрессии рака (см., например, NPL 3). Оценка эффективности анти-CTLA-4 антител у человека проводится с 2000 года, а моноклональное анти-CTLA-4 антитело человека (ипилимумаб) было одобрено Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) в качестве первого в мире иммуностимулирующего терапевтического антитела в 2011 г. Было также произведено много моноклональных анти-CTLA-4 антител, отличных от ипилимумаба (см., например, PTL 1, 2, 3 и 4), и их разработка в качестве лекарственных средств в настоящее время проводится. Такие лекарственные препараты, которые ингибируют иммунные контрольные точки, чтобы нейтрализовать иммуносупрессивный механизм, тем самым повышая иммунореактивность, называются ингибиторами иммунных контрольных точек.CTLA-4 is a glycoprotein belonging to the immunoglobulin superfamily, the gene of which was cloned from a library of killer T cell cDNA clones obtained from mice in 1987 (see, for example, NPL2). The T cell immune response is known to be suppressed by CTLA-4. In 1996, it was reported that a tumor regression effect was observed when anti-CTLA4 antibody was administered to cancer-bearing mice, consistent with the notion that promoting T cell activation by inhibiting CTLA-4 function leads to cancer regression (see, e.g., NPL 3). The effectiveness of anti-CTLA-4 antibodies in humans has been evaluated since 2000, and the human monoclonal anti-CTLA-4 antibody (ipilimumab) was approved by the US Food and Drug Administration (FDA) as the world's first immunostimulatory therapeutic. antibodies in 2011. Many anti-CTLA-4 monoclonal antibodies other than ipilimumab have also been produced (see, for example, PTL 1, 2, 3 and 4), and their development as drugs is currently underway. Such drugs that inhibit immune checkpoints to neutralize the immunosuppressive mechanism, thereby increasing immunoreactivity, are called immune checkpoint inhibitors.

С другой стороны, ранее было известно, что среди Т-клеток есть клетки, обладающие иммуносупрессорной функцией, и они были идентифицированы как CD25- и CD4-πоложuтельные Т-клетки в 1995 г. и названы регуляторными Т-клетками (см., например, NPL 4). В 2003 году был идентифицирован ген Foxp3, который является основным геном и специфически экспрессируется в регуляторных Т-клетках, где регулирует их развитие и функцию. Foxp3 регулирует экспрессию различных генов, связанных с иммунным ответом, в качестве фактора транскрипции. В частности, Foxp3 участвует в конститутивной экспрессии CTLA-4 в регуляторных Т-клетках, и предполагают, что он играет важную роль в иммуносупрессорной функции регуляторных Т-клеток (см., например, NPL 5).On the other hand, it was previously known that among T cells there are cells that have an immunosuppressive function, and they were identified as CD25- and CD4-positive T cells in 1995 and called regulatory T cells (see, for example, NPL 4). In 2003, the Foxp3 gene was identified as a major gene specifically expressed in regulatory T cells, where it regulates their development and function. Foxp3 regulates the expression of various immune response-related genes as a transcription factor. In particular, Foxp3 is involved in the constitutive expression of CTLA-4 in regulatory T cells and has been suggested to play an important role in the immunosuppressive function of regulatory T cells (see, for example, NPL 5).

Предполагают, что инфильтрация регуляторных Т-клеток в опухолевые ткани приводит к ослаблению или ингибированию механизма иммунного контроля за опухолью. Действительно, было обнаружено, что во многих карциномах человека наблюдается увеличение количества регуляторных Т-клеток (см., например, NPL 6), и сообщалось, что локальная инфильтрация регуляторных Т-клеток в опухоль может стать плохим прогностическим фактором рака у пациента. И наоборот, если регуляторные Т-клетки могут быть удалены из опухолевых тканей или уменьшены в них, ожидается, что это приведет к усилению противоопухолевого иммунитета. В настоящее время активно развивается иммунотерапия рака, нацеленная на регуляторные Т-клетки.It is assumed that the infiltration of regulatory T cells into tumor tissues leads to weakening or inhibition of the immune control mechanism of the tumor. Indeed, it has been found that many human carcinomas exhibit an increase in the number of regulatory T cells (see, for example, NPL 6), and it has been reported that local infiltration of regulatory T cells into the tumor may be a poor prognostic factor for the patient's cancer. Conversely, if regulatory T cells can be removed from or reduced in tumor tissues, this would be expected to result in enhanced antitumor immunity. Cancer immunotherapy targeting regulatory T cells is currently being actively developed.

Введение анти-CTLA-4 антитела, ипилимумаба, усиливает противоопухолевый иммунитет, но сообщалось, что оно вызывает аутоиммунные заболевания, поскольку системно повышает иммунореактивность. В одном клиническом исследовании нежелательные явления наблюдались у 60% пациентов, которым вводили ипилимумаб, причем у многих из них были аутоиммунные заболевания, связанные с кожей или желудочно-кишечным трактом. В другом клиническом исследовании также сообщалось, что примерно у половины пациентов, которым вводили ипилимумаб, развились аналогичные аутоиммунные заболевания. Для подавления таких побочных эффектов в некоторых случаях пациенту, которому вводили ипилимумаб, вводят иммунодепрессант. Желательна разработка нового лекарственного средства, которое может поддерживать противоопухолевый иммунный ответ, одновременно подавляя такие побочные эффекты ингибиторов иммунных контрольных точек.Administration of the anti-CTLA-4 antibody, ipilimumab, enhances antitumor immunity, but has been reported to cause autoimmune diseases because it systemically increases immunoreactivity. In one clinical trial, adverse events occurred in 60% of patients treated with ipilimumab, many of whom had autoimmune diseases related to the skin or gastrointestinal tract. Another clinical study also reported that approximately half of the patients treated with ipilimumab developed similar autoimmune diseases. To suppress such side effects, in some cases, an immunosuppressant drug is administered to the patient receiving ipilimumab. Development of a new drug that can support the antitumor immune response while suppressing such side effects of immune checkpoint inhibitors is desirable.

Цитотоксические эффекторные функции антител IgG, активность антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC - antibody-dependent cellular cytotoxicity), комплементзависимой цитотоксичности (CDC - complement-dependent cytotoxicity) и антителозависимого клеточного фагоцитоза (ADCP antibody-dependent cellular phagocytosis) привлекают внимание как многообещающие средства для достижения противоопухолевых эффектов с помощью антител (см., например, NPL 7 и 8). Эти эффекторные функции индуцируются связыванием Fc-области антител IgG с рецепторами антител (FcyR), присутствующими на поверхности эффекторных клеток, таких как природные клетки-киллеры и макрофаги, или с различными компонентами комплемента. К настоящему времени было проведено множество исследоваThe cytotoxic effector functions of IgG antibodies, the activity of antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC), complement-dependent cytotoxicity (CDC) and antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP antibody-dependent cellular phagocytosis) have attracted attention as promising means for achieving antitumor effects. effects using antibodies (see, for example, NPL 7 and 8). These effector functions are induced by binding of the Fc region of IgG antibodies to antibody receptors (FcyRs) present on the surface of effector cells, such as natural killer cells and macrophages, or to various complement components. To date, many studies have been carried out

- 1 045931 ний вариантов Fc-области, и были получены варианты, обладающие различными свойствами, такими как FcYR-связывающая активность, которая выше чем у дикого типа (см., например, PTL 5 и 6 и NPL 9 и 10). Кроме того, сообщалось, что Fc-область антител связывается с FcyR в соотношении 1:1 и асимметрично распознает FcyR в нижних шарнирных областях и областях СН2 (см., например, NPL 11). На этом основании также сообщалось о способах оптимизации взаимодействия с FcyR путем внесения различных изменений в две полипептидные цепи, составляющие Fc-область антитела, и получения асимметричных вариантов Fc-области (см., например, PTL 7, 8, 9 и 10).- 1 045931 variants of the Fc region have been produced, and variants have been obtained having different properties, such as FcYR binding activity, which is higher than that of the wild type (see, for example, PTL 5 and 6 and NPL 9 and 10). In addition, the Fc region of antibodies has been reported to bind to FcyR in a 1:1 ratio and to asymmetrically recognize FcyR in the lower hinge and CH2 regions (see, for example, NPL 11). On this basis, methods have also been reported for optimizing the interaction with FcyR by making various changes to the two polypeptide chains constituting the Fc region of an antibody and producing asymmetric variants of the Fc region (see, for example, PTL 7, 8, 9 and 10).

Желательно, чтобы при введении терапевтического антитела в живой организм его антиген-мишень специфически экспрессировался только в местах поражения. Однако во многих случаях один и тот же антиген экспрессируется также в участках, не имеющих поражений, в нормальных тканях и может вызывать побочные эффекты, нежелательные с точки зрения терапии. Например, хотя антитело против опухолевого антигена может проявлять цитотоксическую активность в отношении опухолевых клеток посредством ADCC и т.п., если тот же антиген также экспрессируется в нормальных тканях, антитело может также повреждать нормальные клетки. Для решения вышеуказанной проблемы была разработана технология, которая фокусируется на том явлении, что большое количество того или иного соединения присутствует в ткани-мишени (например, ткани опухоли) и создает антигенсвязывающую молекулу, у которой изменяется антигенсвязывающая активность в зависимости от концентрации соединения (см., например, PTL 11).It is desirable that when a therapeutic antibody is introduced into a living organism, its target antigen is specifically expressed only at the affected sites. However, in many cases the same antigen is also expressed in unlesioned areas of normal tissue and can cause side effects that are undesirable from a therapeutic point of view. For example, although an antibody against a tumor antigen may exhibit cytotoxic activity against tumor cells through ADCC and the like, if the same antigen is also expressed in normal tissues, the antibody may also damage normal cells. To solve the above problem, a technology has been developed that focuses on the phenomenon that a large amount of a compound is present in a target tissue (for example, tumor tissue) and creates an antigen-binding molecule that changes antigen-binding activity depending on the concentration of the compound (see eg PTL 11).

Цитируемая патентная литература:Patent Literature Cited:

[PTL 1] WO 2000/037504[PTL 1] WO 2000/037504

[PTL2] WO 2001/014424[PTL2] WO 2001/014424

[PTL3] WO 2012/120125[PTL3] WO 2012/120125

[PTL4] WO 2016/196237[PTL4] WO 2016/196237

[PTL 5] WO 2000/042072[PTL 5] WO 2000/042072

[PTL6] WO 2006/019447[PTL6] WO 2006/019447

[PTL7] WO 2012/058768[PTL7] WO 2012/058768

[PTL8] WO 2012/125850[PTL8] WO 2012/125850

[PTL9] WO 2013/002362[PTL9] WO 2013/002362

[PTL10] WO 2014/104165[PTL10] WO 2014/104165

[PTL 11] WO 2013/180200[PTL 11] WO 2013/180200

Цитируемые научные публикации.Cited scientific publications.

[NPL 1] Pardoll, Nat Rev Cancer (2012) 12: 252-264[NPL 1] Pardoll, Nat Rev Cancer (2012) 12:252-264

[NPL 2] Brunet с соавт., Nature (1987) 328: 267-270[NPL 2] Brunet et al., Nature (1987) 328: 267-270

[NPL 3] Leach с соавт., Science (1996) 271: 1734-1736[NPL 3] Leach et al., Science (1996) 271: 1734-1736

[NPL 4] Sakaguchi с соавт., J Immunol (1995) 155: 1151-1164[NPL 4] Sakaguchi et al., J Immunol (1995) 155: 1151-1164

[NPL 5] Takahashi с соавт., J Exp Med (2000) 192: 303-310[NPL 5] Takahashi et al., J Exp Med (2000) 192: 303-310

[NPL 6] Nishikawa, Sakaguchi, Int J Cancer (2010) 127: 759-767[NPL 6] Nishikawa, Sakaguchi, Int J Cancer (2010) 127:759-767

[NPL 7] Clynes с соавт., Proc Natl Acad Sci USA (1998) 95: 652-656[NPL 7] Clynes et al., Proc Natl Acad Sci USA (1998) 95: 652-656

[NPL 8] Clynes с соавт., Nat Med (2000) 6: 443-446[NPL 8] Clynes et al., Nat Med (2000) 6: 443-446

[NPL 9] Lazar с соавт., Proc Natl Acad Sci USA (2006) 103: 4005-4010[NPL 9] Lazar et al., Proc Natl Acad Sci USA (2006) 103: 4005-4010

[NPL 10] Chu с соавт., Mol Immunol (2008) 45: 3926-3933[NPL 10] Chu et al., Mol Immunol (2008) 45: 3926-3933

[NPL 11] Radaev с соавт., J Biol Chern (2001) 276: 16469-16477[NPL 11] Radaev et al., J Biol Chern (2001) 276: 16469-16477

Краткое описание изобретенияBrief description of the invention

Техническая проблема.Technical problem.

Настоящее изобретение предусматривает анти-CTLA-4 антитела и способы применения этих антител. Настоящее изобретение также предусматривает полипептиды, включающие вариант Fc-области, и способы получения полипептидов.The present invention provides anti-CTLA-4 antibodies and methods of using these antibodies. The present invention also provides polypeptides comprising a variant Fc region and methods for producing the polypeptides.

Решение проблемы.Solution to the problem.

Точнее, настоящее изобретение предусматривает приведенные ниже пункты [1]-[47]:More precisely, the present invention provides the following paragraphs [1] to [47]:

[1] Ahtu-CTLA-4 антитело, обладающее активностью по связыванию CTLA-4, которая зависит от[1] Ahtu-CTLA-4 antibody, which has CTLA-4 binding activity that is dependent on

- 2 045931 концентрации аденозин-содержащего соединения, причем указанное антитело имеет по меньшей мере один признак, выбранный из приведенных ниже (а)-(и):- 2 045931 concentration of an adenosine-containing compound, wherein said antibody has at least one feature selected from the following (a)-(i):

(а) связывающая активность в присутствии 100 мкМ аденозин-содержащего соединения больше в два раза или более чем в отсутствие аденозин-содержащего соединения;(a) binding activity in the presence of 100 μM adenosine-containing compound is twofold or greater than in the absence of adenosine-containing compound;

(б) значение KD в присутствии 100 мкМ аденозин-содержащего соединения составляет 5х10-7 М или меньше;(b) the KD value in the presence of 100 μM adenosine-containing compound is 5x10 -7 M or less;

(в) значение KD в отсутствие аденозин-содержащего соединения составляет 1х 10-6 М или более;(c) the KD value in the absence of the adenosine-containing compound is 1x 10 -6 M or more;

(г) образование тройного комплекса с аденозин-содержащим соединением и CTLA-4;(d) formation of a ternary complex with an adenosine-containing compound and CTLA-4;

(д) связывание с областью от аминокислоты в положении 97 до аминокислоты в положении 106 CTLA-4 человека (внеклеточный домен, SEQ ID NO: 28);(e) binding to the region from amino acid position 97 to amino acid position 106 of human CTLA-4 (extracellular domain, SEQ ID NO: 28);

(е) конкурирование с АВАМ004 (VH, SEQ ID NO: 10; и VL, SEQ ID NO: 11) за связывание с CTLA4;(f) competition with ABAM004 (VH, SEQ ID NO: 10; and VL, SEQ ID NO: 11) for binding to CTLA4;

(ж) связывание с тем же эпитопом, что и АВАМ004 (VH, SEQ ID NO: 10; и VL, SEQ ID NO: 11);(g) binding to the same epitope as ABAM004 (VH, SEQ ID NO: 10; and VL, SEQ ID NO: 11);

(з) проявление цитотоксической активности против CTLA-4-экспрессирующих клеток; и (и) связывание с CTLA-4 человека или мыши.(h) manifestation of cytotoxic activity against CTLA-4-expressing cells; and/or binding to human or mouse CTLA-4.

[2] Антитело по пункту [1], где антитело является моноклональным антителом.[2] The antibody of claim [1], wherein the antibody is a monoclonal antibody.

[3] Антитело по пункту [1] или [2], где антитело является антителом человека, гуманизированным антителом или химерным антителом.[3] The antibody of claim [1] or [2], wherein the antibody is a human antibody, a humanized antibody, or a chimeric antibody.

[4] Антитело по любому из пунктов [1]-[3], где антитело является фрагментом антитела, который связывается с CTLA-4.[4] The antibody of any one of [1] to [3], wherein the antibody is an antibody fragment that binds to CTLA-4.

[5] Антитело по любому из пунктов [1]-[4], где антитело включает: (a) HVR-H1 (SEQ ID NO: 223), содержащую аминокислотную последовательность SX1TMN, где X1 означает Н, A, R или K; (б) HVR-H2 (SEQ ID NO: 224), содержащую аминокислотную последовательность SISX1X2SX3YIYYAX4SVX5Q где X1 означает S или Т, Х2 означает R или Q, X3 означает G или Н, Х4 означает D, Е или R и Х5 означает K или R; и (в) HVR-H3 (SEQ ID NO: 225), содержащую аминокислотную последовательность YGX1REDMLWVFDY, где X1 означает K или А.[5] The antibody of any one of [1] to [4], wherein the antibody comprises: (a) HVR-H1 (SEQ ID NO: 223) containing the amino acid sequence SX 1 TMN, where X1 is H, A, R, or K; (b) HVR-H2 (SEQ ID NO: 224) containing the amino acid sequence SISX 1 X 2 SX 3 YIYYAX 4 SVX 5 Q where X1 is S or T, X 2 is R or Q, X 3 is G or H, X 4 means D, E or R and X 5 means K or R; and (c) HVR-H3 (SEQ ID NO: 225) containing the amino acid sequence YGX1REDMLWVFDY, where X1 is K or A.

[6] Антитело по пункту [5], которое дополнительно включает: (a) HVR-L1 (SEQ ID NO: 226), содержащую аминокислотную последовательность X1GX2STX3VGDYX4X5VX6, где X1 означает Т, D, Q или Е, Х2 означает Т или Р, Х3 означает D или Q Х4 означает N или Т, X5 означает Y или W, и Х6 означает S или Н; (б) HVR-L2 (SEQ ID NO: 227), содержащую аминокислотную последовательность Х1ТХ2Х3КРХ4, где X1 означает Е, F или Y, Х2 означает S или I, Х3 означает K или S, и Х4 означает S, Е или K; и (в) HVRL3 (SEQ ID NO: 228), содержащую аминокислотную последовательность X1TYAAPLGPX2, где X1 означает S или Q и Х2 означает М или Т.[6] The antibody of item [5], which further includes: (a) HVR-L1 (SEQ ID NO: 226) containing the amino acid sequence X1GX 2 STX 3 VGDYX 4 X 5 VX 6 , where X1 means T, D, Q or E, X 2 is T or P, X 3 is D or Q, X 4 is N or T, X 5 is Y or W, and X 6 is S or H; (b) HVR-L2 (SEQ ID NO: 227) containing the amino acid sequence X 1 TX 2 X 3 KRX 4 where X1 is E, F or Y, X 2 is S or I, X 3 is K or S, and X 4 means S, E or K; and (c) HVRL3 (SEQ ID NO: 228) containing the amino acid sequence X1TYAAPLGPX2, where X1 is S or Q and X2 is M or T.

[7] Антитело по пункту [5], которое дополнительно включает: вариабельный домен тяжелой цепи FR1, содержащий любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 229-232; FR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 233; FR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 234; и FR4, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 235.[7] The antibody of item [5], which further includes: a heavy chain variable domain FR1 containing any amino acid sequence from SEQ ID NO: 229-232; FR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 233; FR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 234; and FR4 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 235.

[8] Антитело по пункту [6], которое дополнительно включает: вариабельный домен легкой цепи FR1, содержащий любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 236-238; FR2, содержащий любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 240 и 241; FR3, содержащий любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 242-244; и FR4, содержащий любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 245 и 246.[8] The antibody of paragraph [6], which further includes: a light chain variable domain FR1 containing any amino acid sequence from SEQ ID NO: 236-238; FR2 containing any amino acid sequence from SEQ ID NO: 240 and 241; FR3 containing any amino acid sequence from SEQ ID NO: 242-244; and FR4 containing any amino acid sequence from SEQ ID NOs: 245 and 246.

[9] Антитело по любому из пунктов [1]-[4], которое включает: (a) VH, которая по меньшей мере на 95% идентична любой аминокислотной последовательности из SEQ ID NO: 83-86, 98 и 135-141; (б) VL, которая по меньшей мере на 95% идентична любой аминокислотной последовательности из SEQ ID NO: 88-95, 97, 99, 134 и 144-149; или (в) VH, имеющую любую из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 83-86, 98 и 135-141, и VL, имеющую любую из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 88-95, 97, 99, 134 и 144-149.[9] An antibody according to any one of [1]-[4], which includes: (a) a VH that is at least 95% identical to any amino acid sequence of SEQ ID NOs: 83-86, 98 and 135-141; (b) VL that is at least 95% identical to any amino acid sequence of SEQ ID NO: 88-95, 97, 99, 134 and 144-149; or (c) VH having any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 83-86, 98 and 135-141, and VL having any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 88-95, 97, 99, 134 and 144-149 .

[10] Антитело по любому из пунктов [1]-[3] и [5]-[9], которое является антителом IgG1 полной длины.[10] An antibody according to any one of [1]-[3] and [5]-[9], which is a full-length IgG1 antibody.

[11] Антитело по пункту [10], в котором Fc-область является вариантом Fc-области, содержащей изменение (изменения) аминокислоты, и где вариант Fc-области обладает повышенной связывающей активностью по меньшей мере с одним рецептором Fcy, выбранным из группы, состоящей из FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb и FcYRIIIa, по сравнению с нативной Fc-областью.[11] The antibody of claim [10], wherein the Fc region is a variant Fc region containing amino acid change(s), and wherein the variant Fc region has increased binding activity to at least one Fcy receptor selected from the group, consisting of FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb and FcYRIIIa, compared to the native Fc region.

[12] Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело по любому из пунктов [1]-[11].[12] An isolated nucleic acid encoding an antibody according to any one of [1]-[11].

[13] Клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по пункту [12].[13] A host cell containing the nucleic acid of [12].

[14] Способ получения антитела, включающий культивирование клеток-хозяев по пункту [13] таким образом, чтобы продуцировалось антитело.[14] A method for producing an antibody, comprising culturing host cells as in [13] so that the antibody is produced.

[15] Фармацевтический состав, включающий антитело по любому из пунктов [1]-[11], и фармацевтически приемлемый носитель.[15] A pharmaceutical composition comprising an antibody according to any one of [1] to [11] and a pharmaceutically acceptable carrier.

[16] Фармацевтический состав по пункту [15], в котором антитело является иммуноконъюгатом.[16] The pharmaceutical composition according to paragraph [15], in which the antibody is an immunoconjugate.

- 3 045931- 3 045931

[17] Фармацевтический состав по пункту [15] или [16], где фармацевтический состав используют в комбинации по крайней мере с одним агентом из группы, состоящей из ингибиторов иммунных контрольных точек, ингибиторов EGFR, ингибиторов HER2 и химиотерапевтических агентов.[17] The pharmaceutical composition of claim [15] or [16], wherein the pharmaceutical composition is used in combination with at least one agent from the group consisting of immune checkpoint inhibitors, EGFR inhibitors, HER2 inhibitors and chemotherapeutic agents.

[18] Фармацевтический состав по любому из пунктов [15]-[17], причем фармацевтический состав применяют для лечения опухоли.[18] The pharmaceutical composition according to any one of paragraphs [15]-[17], wherein the pharmaceutical composition is used for treating a tumor.

[19] Фармацевтический состав по пункту [18], причем опухоль представляет собой солидную опухоль, в которую инфильтрированы регуляторные Т-клетки (Treg).[19] The pharmaceutical composition according to [18], wherein the tumor is a solid tumor into which regulatory T cells (Treg) are infiltrated.

[20] Фармацевтический состав по любому из пунктов [15]-[17], причем фармацевтический состав предназначен для повреждения клеток.[20] The pharmaceutical composition according to any one of paragraphs [15]-[17], wherein the pharmaceutical composition is intended to damage cells.

[21] Фармацевтический состав по любому из пунктов [15]-[17], причем фармацевтический состав предназначен для повреждения клеток Treg.[21] The pharmaceutical composition according to any one of paragraphs [15]-[17], wherein the pharmaceutical composition is intended to damage Treg cells.

[22] Фармацевтический состав по пункту [20], причем повреждение клеток обусловлено активностью ADCC, активностью CDC или активностью ADCP.[22] The pharmaceutical composition according to [20], wherein the cell damage is caused by ADCC activity, CDC activity or ADCP activity.

[23] Фармацевтический состав по пункту [20] или [21], причем иммунитет активируется повреждением клеток Treg.[23] The pharmaceutical composition according to paragraph [20] or [21], wherein immunity is activated by damage to Treg cells.

[24] Фармацевтический состав по любому из пунктов [15]-[17], причем фармацевтический состав предназначен для применения при активации иммунитета.[24] The pharmaceutical composition according to any one of paragraphs [15]-[17], wherein the pharmaceutical composition is intended for use in activating the immune system.

[25] Фармацевтический состав по пункту [24], где активация иммунитета представляет собой активацию Т-клеток.[25] The pharmaceutical composition according to paragraph [24], where the activation of immunity is the activation of T cells.

[26] Фармацевтический состав по пункту [24] или [25], причем иммунитет в опухолевой ткани активируется.[26] The pharmaceutical composition according to paragraph [24] or [25], and the immunity in the tumor tissue is activated.

[27] Фармацевтический состав по любому из пунктов [24]-[26], причем уровень активации иммунитета в неопухолевых тканях ниже, чем уровень активации иммунитета под действием фармацевтической композиции, содержащей контрольное анти-CTLA-4 антитело.[27] The pharmaceutical composition according to any one of paragraphs [24]-[26], wherein the level of immune activation in non-tumor tissues is lower than the level of immune activation under the influence of a pharmaceutical composition containing a control anti-CTLA-4 antibody.

[28] Фармацевтический состав по любому из пунктов [24]-[27], причем уровень побочного эффекта ниже по сравнению с уровнем побочного эффекта под действием фармацевтической композиции, содержащей контрольное анти-CTLA-4 антитело.[28] The pharmaceutical composition according to any one of [24]-[27], wherein the level of side effect is lower compared to the level of side effect under the influence of a pharmaceutical composition containing a control anti-CTLA-4 antibody.

[29] Фармацевтический состав по любому из пунктов [24]-[28], причем контрольное анти-С.'ТЬЛ-4 антитело представляет собой анти-СТЬЛ-4 антитело, которое не обладает связывающей активностью в отношении CTLA-4, которая зависит от концентрации аденозин-содержащего соединения.[29] The pharmaceutical composition as claimed in any one of [24]-[28], wherein the control anti-CTLA-4 antibody is an anti-CTLA-4 antibody that does not have binding activity for CTLA-4, which is dependent on the concentration of adenosine-containing compound.

[30] Фармацевтический состав по пункту [29], причем побочным эффектом является аутоиммунное заболевание.[30] The pharmaceutical composition according to item [29], and the side effect is an autoimmune disease.

[31] Фармацевтический состав по любому из пунктов [18], [19] и [26]-[30], причем опухоль является раком груди или раком печени.[31] The pharmaceutical composition according to any one of paragraphs [18], [19] and [26]-[30], wherein the tumor is breast cancer or liver cancer.

[32] Полипептид, который содержит вариант Fc-области, содержащий изменения аминокислот в исходной Fc-области, причем исходная Fc-область состоит из двух полипептидных цепей, и этот вариант Fc-области содержит аминокислотные изменения в следующих положениях:[32] A polypeptide that contains a variant Fc region containing amino acid changes in the original Fc region, wherein the original Fc region consists of two polypeptide chains, and the variant Fc region contains amino acid changes at the following positions:

(i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307 и 326 согласно нумерации EU в первом полипептиде исходной Fc-области; а также (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326 и 334 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.(i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307 and 326 according to EU numbering in the first polypeptide of the parent Fc region; and (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326 and 334 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

[33] Полипептид по пункту [32], причем вариант Fc-области дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 332 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fcобласти.[33] The polypeptide of [32], wherein the Fc region variant further comprises an amino acid change at position 332 consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region.

[34] Полипептид по пункту [32] или [33], причем вариант Fc-области дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 332 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.[34] The polypeptide of [32] or [33], wherein the Fc region variant further comprises an amino acid change at position 332 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

[35] Полипептид по любому из пунктов [32]-[34], причем вариант Fc-области дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 330 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.[35] The polypeptide of any one of [32]-[34], wherein the Fc region variant further comprises an amino acid change at position 330 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

[36] Полипептид по любому из пунктов [32]-[35], причем вариант Fc-области дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 356 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.[36] The polypeptide of any one of [32]-[35], wherein the Fc region variant further comprises an amino acid change at position 356 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

[37] Полипептид по любому из пунктов [32]-[36], причем вариант Fc-области дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области.[37] The polypeptide of any one of [32]-[36], wherein the Fc region variant further comprises an amino acid change at position 366 consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region.

[38] Полипептид по любому из пунктов [32]-[37], причем вариант Fc-области дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 439 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.[38] The polypeptide of any one of [32]-[37], wherein the Fc region variant further comprises an amino acid change at position 439 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

[39] Полипептид по любому из пунктов [32]-[38], причем вариант Fc-области дополнительно содержит изменение аминокислоты в положениях 366, 368 и 407 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.[39] The polypeptide of any one of [32]-[38], wherein the Fc region variant further comprises an amino acid change at positions 366, 368 and 407 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

- 4 045931- 4 045931

[40] Полипептид по любому из пунктов [32]-[39], включающий по меньшей мере одно изменение аминокислоты, выбранное из следующих изменений аминокислот:[40] A polypeptide according to any one of paragraphs [32]-[39], comprising at least one amino acid change selected from the following amino acid changes:

(i) Tyr или Phe в положении 234, Gln в положении 235, Trp в положении 236, Met в положении 239, Val в положении 250, Asp в положении 268, Glu в положении 270, Ala в положении 298, Pro в положении 307, Asp в положении 326, Glu в положении 332, Cys в положении 349, Lys в положении 356 и Trp в положении 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области; а также (ii) Ala в положении 236, Val в положении 250, Glu в положении 270, Ala в положении 298, Pro в положении 307, Asp в положении 326, Met или Lys в положении 330, Asp или Glu в положении 332, Glu в положении 334, Cys в положении 356, Ser в положении 366, Ala в положении 368, Val в положении 407 и Glu в положении 439 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.(i) Tyr or Phe at position 234, Gln at position 235, Trp at position 236, Met at position 239, Val at position 250, Asp at position 268, Glu at position 270, Ala at position 298, Pro at position 307, Asp at position 326, Glu at position 332, Cys at position 349, Lys at position 356, and Trp at position 366 according to EU numbering in the first polypeptide of the parent Fc region; and (ii) Ala at position 236, Val at position 250, Glu at position 270, Ala at position 298, Pro at position 307, Asp at position 326, Met or Lys at position 330, Asp or Glu at position 332, Glu at position 334, Cys at position 356, Ser at position 366, Ala at position 368, Val at position 407, and Glu at position 439 according to the EU numbering in the second polypeptide of the parent Fc region.

[41] Полипептид по любому из пунктов [32]-[40], причем вариант Fc-области дополнительно содержит любое из аминокислотных изменений от (а) до (г), приведенных ниже, в первом полипептиде и/или втором полипептиде исходной Fc-области:[41] The polypeptide of any one of [32]-[40], wherein the variant Fc region further comprises any of the amino acid changes from (a) to (d) below in the first polypeptide and/or second polypeptide of the original Fc- areas:

(а) Ala в положении 434 согласно нумерации EU;(a) Ala at position 434 according to EU numbering;

(б) Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно нумерации EU;(b) Ala at position 434, Thr at position 436, Arg at position 438 and Glu at position 440 according to EU numbering;

(в) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно нумерации EU; а также (г) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно нумерации EU.(c) Leu at position 428, Ala at position 434, Thr at position 436, Arg at position 438 and Glu at position 440 according to EU numbering; and (d) Leu at position 428, Ala at position 434, Arg at position 438, and Glu at position 440 according to EU numbering.

[42] Полипептид по любому из пунктов [32]-[41], причем связывающая активность по меньшей мере с одним рецептором Fcy, выбранным из группы, состоящей из FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb и FcYRIIIa, повышена у варианта Fc-области по сравнению с таковой в исходной Fc-области.[42] A polypeptide according to any one of [32]-[41], wherein the binding activity to at least one Fcy receptor selected from the group consisting of FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb and FcYRIIIa is increased in the Fc region variant compared to that in the original Fc region.

[43] Полипептид по пункту [42], причем связывающая активность с FcYRIIa и FcYRIIIa повышена в варианте Fc-области по сравнению с таковой в исходной Fc-области.[43] The polypeptide according to paragraph [42], wherein the binding activity to FcYRIIa and FcYRIIIa is increased in the Fc region variant compared to that in the original Fc region.

[44] Полипептид по любому из пунктов [32]-[43], причем селективность между активирующим рецептором Fcy и ингибирующим рецептором Fcy улучшается в варианте Fc-области по сравнению с исходной Fc-областью.[44] A polypeptide according to any one of [32]-[43], wherein the selectivity between the activating Fcy receptor and the inhibitory Fcy receptor is improved in the Fc region variant compared to the original Fc region.

[45] Полипептид по пункту [44], причем активирующий рецептор Fcy представляет собой по меньшей мере один рецептор Fcy, выбранный из группы, состоящей из FcYRIa, FcYRIIa и FcYRIIIa, где ингибирующий рецептор Fcy представляет собой FcYRIIb.[45] The polypeptide of claim [44], wherein the activating Fcy receptor is at least one Fcy receptor selected from the group consisting of FcYRIa, FcYRIIa and FcYRIIIa, wherein the inhibitory Fcy receptor is FcYRIIb.

[46] Полипептид по любому из пунктов [32]-[45], где полипептиды, включающие вариант Fcобласти, являются антителом.[46] The polypeptide of any one of [32]-[45], wherein the polypeptides comprising the F region variant are an antibody.

[47] Способ получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, включающий введение аминокислотных изменений в исходную Fc-область, причем исходная Fc-область состоит из двух полипептидных цепей, и аминокислотные изменения вводят в исходную Fc-область в следующие положения:[47] A method of producing a polypeptide containing a variant Fc region, comprising introducing amino acid changes into the original Fc region, wherein the original Fc region consists of two polypeptide chains, and the amino acid changes are introduced into the original Fc region at the following positions:

(i) положения 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307 и 326 согласно нумерации EU в первом полипептиде исходной Fc-области; а также (ii) положения 236, 250, 270, 298, 307, 326 и 334 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.(i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307 and 326 according to EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region; and (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326 and 334 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

Краткое описание фигурBrief description of the figures

Фиг. 1. Связывающая активность анти-CTLA-4 антител АВАМ004 CTLA-4, причем активность связывания зависит от концентрации АТФ, АДФ или АМФ, как описано в примерах 1-9.Fig. 1. Binding activity of anti-CTLA-4 antibodies ABAM004 CTLA-4, and the binding activity depends on the concentration of ATP, ADP or AMP, as described in examples 1-9.

Фиг. 2. Связывающая активность анти-CTLA-4 антитела АВАМ004 с клетками, экспрессирующими CTLA-4, причем связывающая активность зависит от концентрации АМФ, как описано в примерах 1-10.Fig. 2. Binding activity of the anti-CTLA-4 antibody ABAM004 with cells expressing CTLA-4, and the binding activity depends on the concentration of AMP, as described in examples 1-10.

Фиг. 3. Активность ADCC анти-CTLA-4-антитела АВАМ004 в отношении клеток, экспрессирующих CTLA-4, в присутствии и в отсутствие АМФ, как описано в примерах 1-11.Fig. 3. ADCC activity of the anti-CTLA-4 antibody ABAM004 against cells expressing CTLA-4 in the presence and absence of AMP, as described in Examples 1-11.

Фиг. 4. Способ связывания Fab-фрагмента АВАМ004 и AMP, как описано в примерах 2-13. На фигуре тяжелая цепь антитела обозначена черным цветом, легкая цепь - серым, а АМФ - в шаростержневой модели. Аминокислотные остатки, образующие взаимодействие с АМФ, указаны в стержневой модели. Пунктирные линии и их значения показывают расстояние (А) между каждым аминокислотным остатком и АМФ.Fig. 4. Method of binding the ABAM004 Fab fragment and AMP, as described in examples 2-13. In the figure, the antibody heavy chain is shown in black, the light chain in gray, and AMP in a ball-and-stick model. Amino acid residues forming an interaction with AMP are indicated in the rod model. The dotted lines and their values indicate the distance (A) between each amino acid residue and AMP.

Фиг. 5. Характер связывания Fab-фрагмента АВАМ004, АМФ и CTLA4 человека (hCTLA4), как описано в примерах 2-14. На фигуре тяжелая цепь антитела обозначена черным цветом, легкая цепь серым цветом, hCTLA4 - белым цветом, а АМФ в шаростержневой модели. Аминокислотные остатки hCTLA4, содержащие один или несколько атомов, не являющихся атомами водорода, расположенными на расстоянии 4,2 А от любой части антитела или АМФ, взяты в качестве эпитопа и указаны в стержневой модели.Fig. 5. The binding pattern of the ABAM004 Fab fragment, AMP and human CTLA4 (hCTLA4), as described in examples 2-14. In the figure, the antibody heavy chain is shown in black, the light chain in gray, hCTLA4 in white, and AMP in a ball-and-stick model. Amino acid residues of hCTLA4 containing one or more non-hydrogen atoms located at a distance of 4.2 A from any part of the antibody or AMP are taken as the epitope and are indicated in the rod model.

Фиг. 6. Картирование эпитопа Fab-фрагмента АВАМ004 в аминокислотной последовательности hCTLA4, как описано в примерах 2-14. На фигуре черным цветом обозначены аминокислотные остатки hCTLA4, которые содержат один или несколько атомов, не являющихся атомами водорода, расположенFig. 6. Epitope mapping of the ABAM004 Fab fragment to the amino acid sequence of hCTLA4, as described in examples 2-14. In the figure, black indicates amino acid residues of hCTLA4 that contain one or more atoms that are not hydrogen atoms, located

- 5 045931 ных на расстоянии 4,2 А от любой части АВАМ004 или АМФ в кристаллической структуре. Аминокислотные остатки, выделенные серым цветом, показывают остатки, модель которых не была построена изза неупорядоченности их кристаллической структуры.- 5 045931 at a distance of 4.2 A from any part of ABAM004 or AMP in the crystal structure. Amino acid residues highlighted in gray indicate residues that were not modeled due to the disorder of their crystal structure.

Фиг. 7. Наложенный рисунок структур антитела и АМФ, извлеченных из кристаллических структур только Fab-фрагмента АВАМ004, комплекса Fab-фрагмента АВАМ004 и АМФ и тройного комплекса Fab-фрагмента АВАМ004, АМФ и CTLA4, как описано в примере 2-15. На рисунке тяжелая цепь антитела обозначена черным цветом, легкая цепь - серым, а АМР - в виде шаростержневой модели. Структура Fab-фрагмента АВАМ004 показана тонкой линией, структура бинарного комплекса с АМР -средней по толщине линией, а структура тройного комплекса - толстой линией.Fig. 7. Overlay drawing of the antibody and AMP structures extracted from the crystal structures of ABAM004 Fab alone, the ABAM004 Fab-AMP complex, and the ternary complex of ABAM004 Fab, AMP, and CTLA4, as described in Example 2-15. In the figure, the heavy chain of the antibody is shown in black, the light chain is shown in gray, and AMP is shown as a ball-and-stick model. The structure of the ABAM004 Fab fragment is shown by a thin line, the structure of the binary complex with AMP by a medium-thick line, and the structure of the ternary complex by a thick line.

Фиг. 8. Связывающая активность анти-CTLA-4 антитела АВАМ004 и его варианта 04H0150/04L0072 с CTLA-4, причем активность связывания зависит от концентрации АТФ, АДФ или АМФ, как описано в примере 3-2. В обозначениях на рисунке WT и H150L072 обозначают АВАМ004 и 04H0150/04L0072, соответственно.Fig. 8. Binding activity of the anti-CTLA-4 antibody ABAM004 and its variant 04H0150/04L0072 with CTLA-4, and the binding activity depends on the concentration of ATP, ADP or AMP, as described in Example 3-2. In the notation in the figure, WT and H150L072 are designated ABAM004 and 04H0150/04L0072, respectively.

Фиг. 9. Нейтрализующая активность анти-CTLA-4-антитела SW1077 в отношении CTLA-4, причем нейтрализующая активность зависит от концентрации АТФ, как описано в примерах 3-6.Fig. 9. Neutralizing activity of the anti-CTLA-4 antibody SW1077 against CTLA-4, and the neutralizing activity depends on the ATP concentration, as described in examples 3-6.

Фиг. 10. Противоопухолевый эффект анти-CTLA-4-антитела mNS-mFa55 (контрольное антитело) на мышиной модели, трансплантированной клеточной линией FM3A, как описано в примере 3-7-4. Антитело вводят в дозах 0,01, 0,1, 0,25, 1, 10, 30 и 100 мг/кг через хвостовую вену. Каждая точка представляет собой средний объем опухоли в группе, n=4.Fig. 10. Antitumor effect of anti-CTLA-4 antibody mNS-mFa55 (control antibody) in a mouse model transplanted with the FM3A cell line as described in Example 3-7-4. The antibody is administered at doses of 0.01, 0.1, 0.25, 1, 10, 30 and 100 mg/kg via the tail vein. Each dot represents the mean tumor volume per group, n=4.

Фиг. 11. Противоопухолевый эффект анти-CTLA-4-антитела SW1208-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией FM3A, как описано в примере 3-7-4. Антитело вводят в дозах 0,1, 1, 10, 100 и 500 мг/кг через хвостовую вену. Каждая точка представляет собой средний объем опухоли в группе, n=4.Fig. 11. Antitumor effect of anti-CTLA-4 antibody SW1208-mFa55 (switching antibody) in a mouse model transplanted with the FM3A cell line as described in Example 3-7-4. The antibody is administered in doses of 0.1, 1, 10, 100 and 500 mg/kg via the tail vein. Each dot represents the mean tumor volume per group, n=4.

Фиг. 12. Изменения в соотношении эффекторных клеток Treg в опухоли при введении анти-CTLA4-антитела mNS-mFa55 (контрольное антитело) или SW1208-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией FM3A, как описано в примере 3-7-7. Антитело mNS-mFa55 вводят в дозах 0,1, 1, 10 и 100 мг/кг через хвостовую вену, а антитело SW1208-mFa55 вводят в дозах 0,1, 1, 10, 100 и 500 мг/кг через хвостовую вену. Опухоль исследуют через шесть дней после введения и оценивают увеличение или уменьшение эффекторных Treg с помощью анализа FACS. Продольная ось представляет отношение эффекторных клеток Treg (CD4+ FoxP3+ KLRG1') к клеткам CD45+. Показано среднее значение n=3.Fig. 12. Changes in the proportion of effector Treg cells in the tumor upon administration of the anti-CTLA4 antibody mNS-mFa55 (control antibody) or SW1208-mFa55 (switch antibody) in a mouse model engrafted with the FM3A cell line as described in Example 3-7-7 . The mNS-mFa55 antibody was administered at doses of 0.1, 1, 10, and 100 mg/kg via the tail vein, and the SW1208-mFa55 antibody was administered at doses of 0.1, 1, 10, 100, and 500 mg/kg via the tail vein. The tumor is examined six days after injection and the increase or decrease of effector Tregs is assessed using FACS analysis. The longitudinal axis represents the ratio of Treg effector cells (CD4 + FoxP3 + KLRG1') to CD45+ cells. Mean n=3 shown.

Фиг. 13. Изменения в соотношении активированных хелперных Т-клеток в селезенке при введении анти-CTLA-4-антитела mNS-mFa55 (контрольное антитело) или SW1208-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией FM3A, как описано в примере 3-7-8. Антитело mNS-mFa55 вводят в дозах 0,1, 1, 10 и 100 мг/кг через хвостовую вену, а антитело SW1208mFa55 вводят в дозах 0,1, 1, 10, 100 и 500 мг/кг через хвостовую вену. Селезенку извлекают через шесть дней после введения и оценивают увеличение или уменьшение количества активированных хелперных Т-клеток с помощью анализа FACS. Продольная ось представляет собой отношение активированных хелперных Т-клеток (CD4+ Foxp3- ICOS+) к CD45+ клеткам. Показано среднее значение, n=3.Fig. 13. Changes in the proportion of activated helper T cells in the spleen upon administration of the anti-CTLA-4 antibody mNS-mFa55 (control antibody) or SW1208-mFa55 (switch antibody) in a mouse model engrafted with the FM3A cell line as described in Example 3 -7-8. The mNS-mFa55 antibody was administered at doses of 0.1, 1, 10, and 100 mg/kg via the tail vein, and the SW1208mFa55 antibody was administered at doses of 0.1, 1, 10, 100, and 500 mg/kg via the tail vein. The spleen is removed six days after injection and the increase or decrease in the number of activated helper T cells is assessed using FACS analysis. The longitudinal axis represents the ratio of activated helper T cells (CD4 + Foxp3 - ICOS+) to CD45+ cells. Means shown, n=3.

Фиг. 14. Противоопухолевый эффект анти-CTLA-4-антитела SW1389-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 4-3-5. Антитело вводят в дозах 0,1, 1, 10 и 100 мг/кг через хвостовую вену. Каждая точка представляет собой средний объем опухоли в группе, n=4.Fig. 14. Antitumor effect of anti-CTLA-4 antibody SW1389-mFa55 (switching antibody) in a mouse model transplanted with the Hepa1-6/hGPC3 cell line as described in Example 4-3-5. The antibody is administered in doses of 0.1, 1, 10 and 100 mg/kg via the tail vein. Each dot represents the mean tumor volume per group, n=4.

Фиг. 15. Противоопухолевый эффект анти-CTLA-4-антитела hNS-mFa55 (контрольное антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 4-3-5. Антитело вводят в дозах 0,1, 1, 10 и 30 мг/кг через хвостовую вену. Каждая точка представляет собой средний объем опухоли в группе, n=4.Fig. 15. Antitumor effect of anti-CTLA-4 antibody hNS-mFa55 (control antibody) in a mouse model transplanted with the Hepa1-6/hGPC3 cell line as described in Example 4-3-5. The antibody is administered in doses of 0.1, 1, 10 and 30 mg/kg via the tail vein. Each dot represents the mean tumor volume per group, n=4.

Фиг. 16. Изменение соотношения эффекторных клеток Treg в опухоли при введении анти-CTLA-4антитела hNS-mFa55 (контрольное антитело) или SW1389-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клетками линии Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 4-3-8. Антитело hNS-mFa55 вводят в дозах 0,1, 1, 10 и 30 мг/кг, a SW1389-mFa55 вводят в дозах 0,1, 1, 10, 100 и 500 мг/кг через хвостовую вену. Опухоль исследуют через шесть дней после введения и оценивают увеличение или уменьшение эффекторных клеток Treg с помощью анализа FACS. Продольная ось представляет собой отношение эффекторных Treg (CD4+ FoxP3+ CCR7low KLRG1+) к клеткам CD45+. Показано среднее значение, n=3.Fig. 16. Change in the ratio of effector Treg cells in the tumor upon administration of the anti-CTLA-4 antibody hNS-mFa55 (control antibody) or SW1389-mFa55 (switching antibody) in a mouse model transplanted with Hepa1-6/hGPC3 cells, as described in example 4- 3-8. The hNS-mFa55 antibody was administered at doses of 0.1, 1, 10 and 30 mg/kg, and SW1389-mFa55 was administered at doses of 0.1, 1, 10, 100 and 500 mg/kg via the tail vein. The tumor is examined six days after injection and the increase or decrease of effector Treg cells is assessed using FACS analysis. The longitudinal axis represents the ratio of effector Tregs (CD4 + FoxP3 + CCR7 low KLRG1+) to CD45+ cells. Means shown, n=3.

Фиг. 17. Изменение соотношения активированных хелперных Т-клеток в селезенке при введении анти-CTLA-4-антитела hNS-mFa55 (контрольное антитело) или SW1389-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 4-3-9. Антитело hNS-mFa55 вводят в дозах 0,1, 1, 10 и 30 мг/кг, а антитело SW1389-mFa55 вводят в дозах 0,1, 1, 10, 100 и 500 мг/кг через хвостовую вену. Селезенку извлекают через шесть дней после введения и оценивают увеличение или уменьшение количества активированных хелперных Т-клеток с помощью анализа FACS. Продольная ось представляет собой отношение активированных хелперных Т-клетокFig. 17. Change in the ratio of activated helper T cells in the spleen by administration of the anti-CTLA-4 antibody hNS-mFa55 (control antibody) or SW1389-mFa55 (switch antibody) in a mouse model engrafted with the Hepa1-6/hGPC3 cell line as described. in example 4-3-9. The hNS-mFa55 antibody was administered at doses of 0.1, 1, 10, and 30 mg/kg, and the SW1389-mFa55 antibody was administered at doses of 0.1, 1, 10, 100, and 500 mg/kg via the tail vein. The spleen is removed six days after injection and the increase or decrease in the number of activated helper T cells is assessed using FACS analysis. Longitudinal axis represents the ratio of activated helper T cells

- 6 045931 (CD4+ Foxp3-ICOS+) к CD45+ клеткам. Показано среднее значение, n=3.- 6 045931 (CD4 + Foxp3-ICOS + ) to CD45 + cells. Means shown, n=3.

Фиг. 18. Противоопухолевый эффект анти-СТк-ЛН-антитела SW1610-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 5-4-5. Антитело вводят в дозах 0,3, 1 и 3 мг/кг через хвостовую вену. Каждая точка представляет собой средний объем опухоли в группе, n=5.Fig. 18. Antitumor effect of anti-CTk-LN antibody SW1610 - mFa55 (switching antibody) in a mouse model transplanted with the Hepa1-6/hGPC3 cell line, as described in Example 5-4-5. The antibody is administered in doses of 0.3, 1 and 3 mg/kg through the tail vein. Each dot represents the mean tumor volume per group, n=5.

Фиг. 19. Противоопухолевый эффект анти-СТкЛ-4-антитела SW1612-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 5-4-5. Антитело вводят в дозах 0,3, 1 и 3 мг/кг через хвостовую вену. Каждая точка представляет собой средний объем опухоли в группе, n=5.Fig. 19. Antitumor effect of anti-CTCL-4 antibody SW1612-mFa55 (switching antibody) in a mouse model transplanted with the Hepa1-6/hGPC3 cell line as described in Example 5-4-5. The antibody is administered in doses of 0.3, 1 and 3 mg/kg through the tail vein. Each dot represents the mean tumor volume per group, n=5.

Фиг. 20. Противоопухолевый эффект анти-СТкЛ-4-антитела SW1615-mFa55 (переключающее антитело) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 5-4-5. Антитело вводят в дозах 0,3, 1 и 3 мг/кг через хвостовую вену. Каждая точка представляет собой средний объем опухоли в группе, n=5.Fig. 20. Antitumor effect of anti-CTCL-4 antibody SW1615-mFa55 (switching antibody) in a mouse model transplanted with the Hepa1-6/hGPC3 cell line as described in Example 5-4-5. The antibody is administered in doses of 0.3, 1 and 3 mg/kg through the tail vein. Each dot represents the mean tumor volume per group, n=5.

Фиг. 21. Изменения соотношения эффекторных клеток Treg в опухоли при введении анти-СТкЛ-4антитела SW1610-mFa55, SW1612-mFa55 или SW1615-mFa55 (все они являются переключающими антителами) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 5-4-8. Антитело SW1610-mFa55 вводят в дозах 50, 100 и 200 мг/кг, SW1612-mFa55 вводят в дозах 50, 100 и 200 мг/кг, SW1615-mFa55 вводят в дозах 50, 100, 200 и 400 мг/кг и отрицательное контрольное антитело KLH-mFa55 вводят в дозе 400 мг/кг через хвостовую вену. Опухоль исследуют через шесть дней после введения и оценивают увеличение или уменьшение эффекторных клеток Treg с помощью анализа FACS. Продольная ось представляет собой отношение эффекторных клеток Treg (CD4+ FoxP3+ CCR7low KLRG1') к клеткам CD45+. Показано среднее значение, n=3.Fig. 21. Changes in the ratio of effector Treg cells in the tumor when administered anti-CTCL-4 antibodies SW1610 - mFa55, SW1612-mFa55 or SW1615-mFa55 (all of which are switching antibodies) in a mouse model transplanted with the Hepa1-6/hGPC3 cell line, as described in example 5-4-8. Antibody SW1610 - mFa55 is administered at doses of 50, 100 and 200 mg/kg, SW1612-mFa55 is administered at doses of 50, 100 and 200 mg/kg, SW1615-mFa55 is administered at doses of 50, 100, 200 and 400 mg/kg and negative control the KLH-mFa55 antibody is administered at a dose of 400 mg/kg through the tail vein. The tumor is examined six days after injection and the increase or decrease of effector Treg cells is assessed using FACS analysis. The longitudinal axis represents the ratio of Treg effector cells (CD4 + FoxP3 + CCR7 low KLRG1') to CD45+ cells. Means shown, n=3.

Фиг. 22. Изменения в соотношении активированных хелперных Т-клеток в селезенке при введении анти-СТкЛ-4-антитела SW1610-mFa55, SW1612-mFa55 или SW1615-mFa55 (все они являются переключающими антителами) в мышиной модели, трансплантированной клеточной линией Hepa1-6/hGPC3, как описано в примере 5-4-9. Антитело SW1610-mFa55 вводят в дозах 50, 100 и 200 мг/кг, SW1612-mFa55 вводят в дозах 50, 100 и 200 мг/кг, SW1615-mFa55 вводят в дозах 50, 100, 200 и 400 мг/кг, и отрицательное контрольное антитело KLH-mFa55 вводят в дозе 400 мг/кг через хвостовую вену. Селезенку исследуют через шесть дней после введения и оценивают увеличение или уменьшение количества активированных хелперных Т-клеток с помощью анализа FACS. Продольная ось представляет собой отношение активированных хелперных Т-клеток (CD4+ Foxp3- ICOS+) к CD45+ клеткам. Показано среднее значение, n=3.Fig. 22. Changes in the proportion of activated helper T cells in the spleen upon administration of the anti-CTCL-4 antibody SW1610 - mFa55, SW1612-mFa55 or SW1615-mFa55 (all of which are switch antibodies) in a mouse model transplanted with the Hepa1-6 cell line/ hGPC3 as described in Example 5-4-9. Antibody SW1610 - mFa55 is administered at doses of 50, 100 and 200 mg/kg, SW1612-mFa55 is administered at doses of 50, 100 and 200 mg/kg, SW1615-mFa55 is administered at doses of 50, 100, 200 and 400 mg/kg, and negative control antibody KLH-mFa55 is administered at a dose of 400 mg/kg via the tail vein. The spleen is examined six days after administration and the increase or decrease in the number of activated helper T cells is assessed using FACS analysis. The longitudinal axis represents the ratio of activated helper T cells (CD4 + Foxp3 - ICOS+) to CD45+ cells. Means shown, n=3.

Фиг. 23. Сравнение активности ADCC in vitro антител, имеющих различные измененные константные области с повышенным связыванием с FcyR, как описано в примере 6-2. Как показано на фигуре, IgG1 представляет собой MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT, GASDALIE представляет собой MDX10D1H-GASDALIE/MDX10D1L-k0MT, ART6 представляет собой MDX10D1H-Kn462/MDX10D1HH1445/MDX10D1L-k0MT, ART8 представляет собой MDX10D1H-Kn461/MDX10D1HH1443/MDX10D1L-k0MT. В данном случае IgG1 представляет собой антитело, имеющее контрольную константную область, GASDALIE представляет собой антитело, имеющее константную область, описанную ранее, ART6 и ART8 представляют собой антитела, имеющие измененную константную область, полученную в примере 6-1.Fig. 23. Comparison of in vitro ADCC activity of antibodies having various altered constant regions with increased binding to FcyR, as described in Example 6-2. As shown in the figure, IgG1 is MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT, GASDALIE is MDX10D1H-GASDALIE/MDX10D1L-k0MT, ART6 is MDX10D1H-Kn462/MDX10D1HH1445/MDX10D1L-k0MT, ART8 is MDX10D1H-K n461/MDX10D1HH1443/MDX10D1L -k0MT. Here, IgG1 is an antibody having a control constant region, GASDALIE is an antibody having a constant region described previously, ART6 and ART8 are antibodies having a modified constant region obtained in Example 6-1.

Фиг. 24. Сравнение in vitro активности ADCP антител, имеющих различные измененные константные области с повышенным связыванием с FcyR, как описано в примере 6-3. На рисунке IgG1 представляет собой MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT, GASDIE представляет собой MDX10D1HGASDIE/MDX10D1L-k0MT, ART6 представляет собой MDX10D1H-Kn462/MDX10D1HH1445/MDX10D1L-k0MT и ART8 представляет собой MDX10D1H-Kn461/MDX10D1HH1443/MDX10D1L-k0MT. В данном случае IgG1 представляет собой антитело, имеющее контрольную константную область, GASDIE представляет собой антитело, имеющее ранее описанную константную область, и ART6 и ART8 представляют собой антитела, имеющие измененную константную область, полученную в примере 6-1.Fig. 24. Comparison of in vitro activity of ADCP antibodies having various altered constant regions with increased binding to FcyR, as described in Example 6-3. In the figure, IgG1 is MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT, GASDIE is MDX10D1HGASDIE/MDX10D1L-k0MT, ART6 is MDX10D1H-Kn462/MDX10D1HH1445/MDX10D1L-k0MT and ART8 is MDX10D1H-Kn461/MDX 10D1HH1443/MDX10D1L-k0MT. Here, IgG1 is an antibody having a control constant region, GASDIE is an antibody having a previously described constant region, and ART6 and ART8 are antibodies having a modified constant region obtained in Example 6-1.

Фиг. 25. Активность in vitro ADCC переключающего анти-CTLA-4-антитела SW1389-ART6, имеющего измененную константную область с повышенным связыванием с FcyR, как описано в примере 6-4.Fig. 25. In vitro ADCC activity of the anti-CTLA-4 switch antibody SW1389-ART6 having an altered constant region with increased binding to FcyR, as described in Example 6-4.

Фиг. 26. Активность in vitro ADCC переключающего анти-CTLA-4-антитела SW1610-ART6, имеющего измененную константную область с повышенным связыванием с FcyR, как описано в примере 6-4.Fig. 26. In vitro ADCC activity of the anti-CTLA-4 switch antibody SW1610-ART6 having an altered constant region with increased binding to FcyR, as described in Example 6-4.

Фиг. 27. Активность in vitro ADCC переключающего анти-CTLA-4-антитела SW1612-ART6, имеющего измененную константную область с повышенным связыванием с FcyR, как описано в примере 6-4.Fig. 27. In vitro ADCC activity of the anti-CTLA-4 switch antibody SW1612-ART6 having an altered constant region with increased binding to FcyR, as described in Example 6-4.

Фиг. 28. Нейтрализующая активность переключающего анти-CTLA4 антитела SW1389 (активность по отмене сигнала CTLA4, который действует ингибирующим образом против активации эффекторных клеток), как описано в примере 6-5.Fig. 28. Neutralizing activity of the anti-CTLA4 switch antibody SW1389 (activity to cancel the CTLA4 signal that acts in an inhibitory manner against effector cell activation) as described in Example 6-5.

Фиг. 29. Нейтрализующая активность переключающего анти-CTLA4 антитела SW1610 (активность по отмене сигнала CTLA4, который действует ингибирующим образом против активации эффекторныхFig. 29. Neutralizing activity of the anti-CTLA4 switching antibody SW1610 (activity to cancel the CTLA4 signal, which acts in an inhibitory manner against the activation of effectors

- 7 045931 клеток), как описано в примере 6-5.- 7 045931 cells), as described in example 6-5.

Фиг. 30. Нейтрализующая активность переключающего анти-СТЕ-А4 антитела SW1612 (активность по отмене сигнала CTLA4, который действует ингибирующим образом против активации эффекторных клеток), как описано в примере 6-5.Fig. 30. Neutralizing activity of the anti-CTE-A4 switching antibody SW1612 (activity to cancel the CTLA4 signal, which acts in an inhibitory manner against effector cell activation), as described in Example 6-5.

Фиг. 31. Нейтрализующая активность переключающего анти-CTLA4 антитела SW1615 (активность по отмене сигнала CTLA4, который действует ингибирующим образом против активации эффекторных клеток), как описано в примере 6-5.Fig. 31. Neutralizing activity of the anti-CTLA4 switching antibody SW1615 (activity to cancel the CTLA4 signal that acts in an inhibitory manner against effector cell activation) as described in Example 6-5.

Фиг. 32. Цитотоксическая активность in vitro переключающего анти-CTLA4 антитела SW1389ART5+ACT1 против CTLA4-положuтельных регуляторных Т-клеток, как описано в примере 6-6.Fig. 32. In vitro cytotoxic activity of anti-CTLA4 switching antibody SW1389ART5+ACT1 against CTLA4-positive regulatory T cells as described in Example 6-6.

Фиг. 33. Цитотоксическая активность in vitro переключающего анти-CTLA4 антитела SW1389ART5+ACT1 против CTLA4-положuтельных регуляторных Т-клеток, как описано в примере 6-6.Fig. 33. In vitro cytotoxic activity of anti-CTLA4 switching antibody SW1389ART5+ACT1 against CTLA4-positive regulatory T cells as described in Example 6-6.

Фиг. 34. Цитотоксическая активность in vitro переключающего анти-CTLA4 антитела SW1610 ART5+ACT1 против CTLA4-положuтельных регуляторных Т-клеток, как описано в примере 6-6.Fig. 34. In vitro cytotoxic activity of anti-CTLA4 switching antibody SW1610 ART5+ACT1 against CTLA4-positive regulatory T cells as described in Example 6-6.

Фиг. 35. Цитотоксическая активность in vitro переключающего анти-CTLA4 антитела SW1610 ART5+ACT1 против CTLA4-положuтельных регуляторных Т-клеток, как описано в примере 6-6.Fig. 35. In vitro cytotoxic activity of anti-CTLA4 switching antibody SW1610 ART5+ACT1 against CTLA4-positive regulatory T cells as described in Example 6-6.

Описание вариантов осуществления настоящего изобретения Методы и процедуры, описанные или упомянутые в настоящем документе, как правило, понятны и обычно используются специалистами в данной области, например, широко используемые методологии, описанные в кн.:Description of Embodiments of the Present Invention The methods and procedures described or referred to herein are generally understood and commonly used by those skilled in the art, for example, the commonly used methodologies described in the book:

Sambrook с соавт., «Molecular Cloning: A Laboratory Manual», Зе изд., 2001, изд-во Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, Нью-Йорк; кн.: «Current Protocols in Molecular Biology», под ред. F.M. Ausubel с соавт., ред., 2003; серии «Methods in Enzymology», изд-во Academic Press, Inc: PCR 2: A Practical Approach, под ред. M.J. MacPherson, B.D. Hames, G.R.Sambrook et al., “Molecular Cloning: A Laboratory Manual,” Ze ed., 2001, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York; book: “Current Protocols in Molecular Biology”, ed. F.M. Ausubel et al., eds., 2003; series "Methods in Enzymology", published by Academic Press, Inc: PCR 2: A Practical Approach, ed. M.J. MacPherson, B.D. Hames, G.R.

I Taylor, 1995, под ред. Harlow и Lane, 1988, «Antibodies, A Laboratory Manual, and Animal Cell Culture», под ред. R.I. Freshney, 1987; «Introduction to Cell and Tissue Culture», под ред. J. P. Mather, P.E. Roberts, 1998, изд-во Plenum Press; «Cell and Tissue Culture: Laboratory Procedures», под ред. A. Doyle, J.B. Griffiths, D.G. Newell, 1993-8, изд-во J. Wiley and Sons; «Handbook of Experimental Immunology», под ред. D.M. Weir и C.C. Blackwell; «Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells», под ред. J.M. Miller и M.P. Calos, 1987; «PCR: The Polymerase Chain Reaction», под ред. Mullis с соавт., 1994; «Current Protocols in Immunology», под ред. J.E. Coligan с соавт., 1991; «Short Protocols in Molecular Biology», изд-во Wiley and Sons, 1999; «Immunobiology», под ред. С. A. Janeway иР. Travers, 1997; «Antibodies», под ред. P. Finch, 1997; «Antibodies: A Practical Approach», под ред. D. Catty., изд-во IRL Press, 1988-1989; «Monoclonal Antibodies: A Practical Approach», под ред. P. Shepherd и C. Dean, изд-во Oxford University Press, 2000; «Using Antibodies: A Laboratory Manual», под ред. E. Harlow и D. Lane, изд-во Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999); «The Antibodies», под ред. M. Zanetti и J. D. Capra, изд-во Harwood Academic Publishers, 1995; «Cancer: Principles and Practice of Oncology», под ред. V.T. DeVita с соавт., изд-во J.B. Lippincott Company, 1993.I Taylor, 1995, ed. Harlow and Lane, 1988, Antibodies, A Laboratory Manual, and Animal Cell Culture, ed. R.I. Freshney, 1987; "Introduction to Cell and Tissue Culture", ed. J.P. Mather, P.E. Roberts, 1998, Plenum Press; "Cell and Tissue Culture: Laboratory Procedures", ed. A. Doyle, J.B. Griffiths, D. G. Newell, 1993-8, J. Wiley and Sons; "Handbook of Experimental Immunology", ed. D.M. Weir and C.C. Blackwell; "Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells", ed. J.M. Miller and M.P. Calos, 1987; "PCR: The Polymerase Chain Reaction", ed. Mullis et al., 1994; "Current Protocols in Immunology", ed. J.E. Coligan et al., 1991; Short Protocols in Molecular Biology, Wiley and Sons, 1999; "Immunobiology", ed. S. A. Janeway and R. Travers, 1997; "Antibodies", ed. P. Finch, 1997; Antibodies: A Practical Approach, ed. D. Catty., IRL Press, 1988-1989; "Monoclonal Antibodies: A Practical Approach", ed. P. Shepherd and C. Dean, Oxford University Press, 2000; "Using Antibodies: A Laboratory Manual", ed. E. Harlow and D. Lane, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999); "The Antibodies", ed. M. Zanetti and J. D. Capra, Harwood Academic Publishers, 1995; "Cancer: Principles and Practice of Oncology", ed. V.T. DeVita et al., J.B. Lippincott Company, 1993.

I. Определения.I. Definitions.

Если не указано иное, используемые в настоящем описании технические и научные термины имеют то же значение, которое обычно понимают специалисты в области, к которой относится настоящее изобретение. Singleton с соавт., Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2-е изд., изд-во J. Wiley & Sons, Нью-Йорк, 1994; March, Advanced Organic Chemistry Reactions, Mechanisms and Structure, 4-е изд., изд-во John Wiley & Sons, Нью-Йорк, 1992), предоставляют специалистам в данной области общие сведения по многим терминам, используемым в настоящем изобретении. Все цитируемые в настоящем описании ссылки, включая заявки на патенты и публикации, полностью включены в настоящий документ посредством ссылок.Unless otherwise specified, technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by those skilled in the art to which the present invention relates. Singleton et al., Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2nd ed., J. Wiley & Sons, New York, 1994; March, Advanced Organic Chemistry Reactions, Mechanisms and Structure, 4th ed., John Wiley & Sons, New York, 1992), provide those skilled in the art with a general understanding of many of the terms used in the present invention. All references cited herein, including patent applications and publications, are incorporated herein by reference in their entirety.

Для целей интерпретации настоящего описания применяют следующие определения, и, при необходимости, термины, используемые в единственном числе, также могут означать множественное число и наоборот. Следует учитывать, что используемая в настоящем описании терминология предназначенаFor purposes of interpretation of this specification, the following definitions apply and, where appropriate, terms used in the singular may also refer to the plural and vice versa. It should be noted that the terminology used in this description is intended

- 8 045931 только для целей описания конкретных вариантов осуществления настоящего изобретения и не предназначена для ограничения настоящего изобретения. Если какое-либо определение, изложенное ниже, противоречит любому документу, включенному в настоящий документ посредством ссылки, определение, изложенное ниже, имеет преимущественную силу.- 8 045931 is for the purpose of describing specific embodiments of the present invention only and is not intended to limit the present invention. If any definition set forth below is inconsistent with any document incorporated herein by reference, the definition set forth below shall control.

Акцепторный каркас человека для целей настоящего документа представляет собой каркас, содержащий аминокислотную последовательность каркаса вариабельного домена легкой цепи (VL) или каркаса вариабельного домена тяжелой цепи (VH), полученного из каркаса иммуноглобулина человека или консенсусного каркаса человека, как определено ниже. Акцепторный каркас человека, происходящий из каркаса иммуноглобулина человека или консенсусного каркаса человека, может содержать ту же аминокислотную последовательность, что и он, или он может содержать изменения в аминокислотной последовательности. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения количество аминокислотных замен составляет 10 или менее, 9 или менее, 8 или менее, 7 или менее, 6 или менее, 5 или менее, 4 или менее, 3 или менее или 2 или менее. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения акцепторный каркас VL человека идентичен по последовательности каркасной последовательности иммуноглобулина VL человека или консенсусной каркасной последовательности человека.A human acceptor framework, for the purposes of this document, is a framework comprising the amino acid sequence of a light chain variable domain (VL) framework or a heavy chain variable domain (VH) framework derived from a human immunoglobulin framework or a human consensus framework, as defined below. A human acceptor framework derived from a human immunoglobulin framework or a human consensus framework may contain the same amino acid sequence as it, or it may contain changes in the amino acid sequence. In some embodiments of the present invention, the number of amino acid substitutions is 10 or less, 9 or less, 8 or less, 7 or less, 6 or less, 5 or less, 4 or less, 3 or less, or 2 or less. In some embodiments of the present invention, the human VL acceptor framework is identical in sequence to the human VL immunoglobulin framework sequence or the human consensus framework sequence.

Антителозависимая клеточноопосредованная цитотоксичность или ADCC -Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity относится к форме цитотоксичности, при которой секретируемый иммуноглобулин, связанный с Fc рецепторами (FcR), присутствующими на определенных цитотоксических клетках (например, клетках NK, нейтрофилах и макрофагах), активирует эти цитотоксические эффекторные клетки специфически связываться с клеткой-мишенью, несущей антиген, и впоследствии убивают клетку-мишень цитотоксинами. Первичные клетки для опосредования ADCC, клетки NK, экспрессируют только FcyRIII, тогда как моноциты экспрессируют FcyRI, FcyRII и FcyRIII. Экспрессия FcR на кроветворных клетках представлена в табл. 3 на стр. 464 в публикации Ravetch и Kinet, Annu. Rev. Immunol 1991, 9:457-492. Для оценки активности ADCC исследуемой молекулы можно провести анализ ADCC in vitro, например, согласно описанию в US 5500362, US 5821337 или в US 6737056 (Presta). Полезные эффекторные клетки для таких анализов включают клетки МКПК и NK. Альтернативно или дополнительно активность ADCC исследуемой молекулы может быть оценена in vivo, например, на животной модели, такой как модель, описанная в статье Clynes с соавт., PNAS (USA), 1998, 95:652-656.Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity or ADCC - Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity refers to a form of cytotoxicity in which secreted immunoglobulin bound to Fc receptors (FcR) present on certain cytotoxic cells (eg, NK cells, neutrophils and macrophages) activates these cytotoxic effector cells specifically bind to the target cell bearing the antigen and subsequently kill the target cell with cytotoxins. The primary cells for mediating ADCC, NK cells, express only FcyRIII, whereas monocytes express FcyRI, FcyRII, and FcyRIII. FcR expression on hematopoietic cells is presented in Table. 3 at page 464 in Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 1991, 9:457-492. To evaluate the ADCC activity of a test molecule, an in vitro ADCC assay can be performed, for example, as described in US 5500362, US 5821337 or US 6737056 (Presta). Useful effector cells for such assays include PBMC and NK cells. Alternatively or additionally, the ADCC activity of the test molecule can be assessed in vivo, for example, in an animal model, such as the model described in Clynes et al., PNAS (USA), 1998, 95:652-656.

Цитотоксическая активность включает, например, антителозависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC), как указано выше, комплементзависимую цитотоксичность (CDC), как указано ниже, и Т-клеточно-опосредованную цитотоксическую активность. Активность CDC означает цитотоксическую активность системы комплемента. С другой стороны, активность ADCC означает активность, при которой антитело связывается с антигеном, присутствующим на клеточной поверхности клетки-мишени, а эффекторная клетка дополнительно связывается с антителом, и тем самым эффекторная клетка повреждает клетку-мишень. Обладает ли интересующее антитело активностью ADCC и имеет ли интересующее антитело активность CDC, можно измерить известными способами (см., например, Current Protocols in Immunology, глава 7, Immunologic Studies in people, издано Coligan с соавт. 1993).Cytotoxic activity includes, for example, antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) as defined above, complement-dependent cytotoxicity (CDC) as defined below, and T cell-mediated cytotoxic activity. CDC activity refers to the cytotoxic activity of the complement system. On the other hand, ADCC activity means an activity in which an antibody binds to an antigen present on the cell surface of a target cell, and the effector cell further binds to the antibody, and thereby the effector cell damages the target cell. Whether an antibody of interest has ADCC activity and whether an antibody of interest has CDC activity can be measured by known methods (see, for example, Current Protocols in Immunology, Chapter 7, Immunologic Studies in people, published by Coligan et al. 1993).

Понятие нейтрализующая активность относится к активности антитела по ингибированию некоторой биологической активности путем связывания с молекулой, участвующей в биологической активности. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения биологическая активность обеспечивается связыванием между лигандом и рецептором. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело ингибирует связывание между лигандом и рецептором путем связывания с лигандом или рецептором. Антитела, обладающие такой нейтрализующей активностью, называются нейтрализующими антителами. Нейтрализующую активность определенного испытуемого вещества можно измерить, сравнивая биологическую активность в присутствии лиганда между условиями в присутствии и в отсутствие испытуемого вещества.The term neutralizing activity refers to the activity of an antibody to inhibit some biological activity by binding to a molecule involved in the biological activity. In some embodiments of the present invention, the biological activity is provided by binding between the ligand and the receptor. In some embodiments of the present invention, the antibody inhibits binding between a ligand and a receptor by binding to the ligand or receptor. Antibodies that have this neutralizing activity are called neutralizing antibodies. The neutralizing activity of a particular test substance can be measured by comparing the biological activity in the presence of the ligand between conditions in the presence and absence of the test substance.

Термин антителозависимый клеточный фагоцитоз или ADCP - antibody-dependent cellular phagocytosis означает процесс, при котором либо вся клетка, либо ее часть, покрытая антителом, поглощается фагоцитирующими иммунными клетками (например, макрофагами, нейтрофилами и дендритными клетками), которые связываются с участком Fc иммуноглобулина.The term antibody-dependent cellular phagocytosis or ADCP refers to the process in which either the entire cell or a portion of it coated with an antibody is engulfed by phagocytic immune cells (for example, macrophages, neutrophils and dendritic cells) that bind to the Fc region of an immunoglobulin.

Термин связывающая активность относится к общей силе всех нековалентных взаимодействий между одним или более сайтами связывания молекулы (например, антитела) и ее партнером по связыванию (например, антигеном). В настоящем изобретении связывающая активность строго не ограничивается взаимодействием 1:1 между членами связывающей пары (например, антителом и антигеном). Например, когда члены связывающейся пары отражают моновалентное взаимодействие 1:1, активность связывания относится к внутренней аффинности связывания (аффинности). Когда член связывающейся пары способен как к моновалентному, так и к поливалентному связыванию, активность связывания представляет собой сумму сил каждого связывания. Связывающая активность молекулы X с ее партнером Y обычно может быть представлена константой диссоциации (KD) или количеством связывания исследуемого соединения на единицу количества лиганда. Связывающая активность может быть измерена обычными способами, известными в данной области, включая описанные в настоящем изобретении. Конкретные примеры в виде иллюстрации вариантов осуществления измерения связывающей активноThe term binding activity refers to the overall strength of all non-covalent interactions between one or more binding sites of a molecule (eg, antibody) and its binding partner (eg, antigen). In the present invention, binding activity is not strictly limited to a 1:1 interaction between members of a binding pair (eg, antibody and antigen). For example, when members of a binding pair reflect a 1:1 monovalent interaction, binding activity refers to the intrinsic binding affinity (affinity). When a member of a binding pair is capable of both monovalent and polyvalent binding, the binding activity is the sum of the strengths of each binding. The binding activity of molecule X to its partner Y can usually be represented by the dissociation constant (KD) or the amount of binding of the compound of interest per unit amount of ligand. Binding activity can be measured by conventional methods known in the art, including those described in the present invention. Specific examples to illustrate embodiments of active binding measurement

- 9 045931 сти описаны ниже.- 9 045931 details are described below.

Антитело с созревшей аффинностью относится к антителу с одним или более изменениями в одной или более гипервариабельных областях (HVR - hypervariable region) по сравнению с исходным антителом, которое не имеет таких изменений, причем такие изменения приводят к улучшению аффинности антитела к антигену.An affinity matured antibody refers to an antibody with one or more changes in one or more hypervariable regions (HVR) compared to a parent antibody that does not have such changes, such changes resulting in an improvement in the affinity of the antibody for the antigen.

Термины анти-CTLA-4-антитело и антитело, которое связывается с CTLA-4 относятся к антителу, которое способно связывать CTLA-4 с достаточной аффинностью, так что это антитело можно использовать в качестве диагностического и/или терапевтического средства для нацеливания на CTLA-4. В одном варианте осуществления настоящего изобретения степень связывания анти-CTLA-4-антитела с неродственным белком, не относящимся к CTLA-4, составляет менее примерно 10% от связывания антитела с CTLA-4, что измерено, например, с помощью радиоиммуноанализа (РИА). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело, которое связывается с CTLA-4, имеет константу диссоциации (KD) 1 мкМ или менее, 100 нМ или менее, 10 нМ или менее, 1 нМ или менее, 0,1 нМ или менее, 0,01 нМ или менее, или 0,001 нМ или менее (например, 10-8 М или менее, например, от 10-8 М до 1013 М, например, от 10-9 М до 10-13 М). В некоторых вариантах осуществления анти-CTLA-4-антитело связывается с эпитопом CTLA-4, который является консервативным среди CTLA-4 разных видов.The terms anti-CTLA-4 antibody and antibody that binds CTLA-4 refer to an antibody that is capable of binding CTLA-4 with sufficient affinity such that the antibody can be used as a diagnostic and/or therapeutic agent for targeting CTLA-4. 4. In one embodiment of the present invention, the extent of binding of an anti-CTLA-4 antibody to an unrelated non-CTLA-4 protein is less than about 10% of the binding of the antibody to CTLA-4, as measured, for example, by a radioimmunoassay (RIA). . In some embodiments of the present invention, an antibody that binds to CTLA-4 has a dissociation constant (KD) of 1 μM or less, 100 nM or less, 10 nM or less, 1 nM or less, 0.1 nM or less, 0. 01 nM or less, or 0.001 nM or less (for example, 10 -8 M or less, for example, from 10 -8 M to 10 -13 M, for example, from 10 -9 M to 10 -13 M). In some embodiments, the anti-CTLA-4 antibody binds to a CTLA-4 epitope that is conserved among CTLA-4 species.

Термин антитело используют в настоящем изобретении в самом широком смысле, и он охватывает различные структуры антител, включая, помимо прочего, моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела (например, биспецифические антитела) и фрагменты антител, при условии, что они проявляют желаемую антигенсвязывающую активность.The term antibody is used in the broadest sense in the present invention, and it covers various antibody structures, including, but not limited to, monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, multispecific antibodies (for example, bispecific antibodies) and antibody fragments, provided that they exhibit the desired antigen-binding activity .

Термин фрагмент антитела относится к молекуле, отличной от интактного антитела, которая содержит часть интактного антитела, которая связывает антиген, с которым связывается интактное антитело. Примеры фрагментов антител включают, но ими перечень не ограничивается, Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; диатела; линейные антитела; молекулы одноцепочечных антител (например, scFv); и мультиспецифические антитела, образованные из фрагментов антител.The term antibody fragment refers to a molecule, other than the intact antibody, that contains a portion of the intact antibody that binds the antigen to which the intact antibody binds. Examples of antibody fragments include, but are not limited to, Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; diabodies; linear antibodies; single chain antibody molecules (eg scFv); and multispecific antibodies formed from antibody fragments.

Понятие антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и контрольное антитело, относится к антителу, которое блокирует связывание контрольного антитела с его антигеном в конкурентном анализе, например, на 50% или более, и/или контрольное антитело блокирует связывание антитела с его антигену в конкурентном анализе, например, на 50% или более. Пример конкурентного анализа представлен в настоящем документе.An antibody that binds to the same epitope as a control antibody refers to an antibody that blocks the control antibody from binding to its antigen in a competition assay, e.g., by 50% or more, and/or the control antibody blocks the antibody from binding to its antigen in competitive analysis, for example, by 50% or more. An example of a competitive analysis is presented in this document.

Аутоиммунное заболевание относится к незлокачественному заболеванию или расстройству, возникающему из собственных тканей человека и направленному против них. Аутоиммунные заболевания в настоящем изобретении специально исключают злокачественные или раковые заболевания или состояния, особенно В-клеточную лимфому, острый лимфобластный лейкоз (ALL - acute lymphoblastic leukemia), хронический лимфолейкоз (CLL - chronic lymphocytic leukemia), волосатоклеточный лейкоз и хронический миелобластный лейкоз. Примеры аутоиммунных заболеваний или нарушений включают, но ими перечень не ограничивается, воспалительные реакции, такие как воспалительные заболевания кожи, включая псориаз и дерматит (например, атопический дерматит); системную склеродермию и склероз; ответы, связанные с воспалительным заболеванием кишечника (такие как болезнь Крона и язвенный колит); респираторный дистресс-синдром (включая респираторный дистресс-синдром взрослых; ОРДС adult respiratory distress syndrome); дерматит; менингит; энцефалит; увеит; колит; гломерулонефрит; аллергические состояния, такие как экзема и астма, и другие состояния, включающие инфильтрацию Тклеток и хронические воспалительные реакции; атеросклероз; дефицит адгезии лейкоцитов; ревматоидный артрит; системную красную волчанку (SLE - systemic lupus erythematosus) (включая, но не ограничиваясь ими, волчаночный нефрит, кожную волчанку); сахарный диабет (например, сахарный диабет I типа или инсулинозависимый сахарный диабет); рассеянный склероз; синдром Рейно; аутоиммунный тиреоидит; тиреоидит Хашимото; аллергический энцефаломиелит; Синдром Шегрена; юношеский диабет; и иммунные реакции, связанные с острой и замедленной гиперчувствительностью, опосредованной цитокинами и Т-лимфоцитами, обычно обнаруживаемой при туберкулезе, саркоидозе, полимиозите, гранулематозе и васкулите; пернициозную анемию (болезнь Аддисона); заболевания, сопровождающиеся лейкоцитарным диапедезом; воспалительное заболевание центральной нервной системы (ЦНС); синдром полиорганного поражения; гемолитическая анемия (включая, но ими не ограничиваясь, криоглобулинемию или анемию с положительной реакцией Кумбса); тяжелую миастению; заболевания, опосредованные комплексом антиген-антитело; заболевание базальной мембраны клубочков; антифосфолипидный синдром; аллергический неврит; Болезнь Грейвса; миастенический синдром Ламберта-Итона; буллезный пемфигоид; пузырчатку; аутоиммунные полиэндокринопатии; болезнь Рейтера; синдром мышечной скованности; болезнь Бехчета; гигантоклеточный артериит; иммунокомплексный нефрит; IgA-нефропатия; полинейропатии IgM; иммунную тромбоцитопеническую пурпуру (ITP - immune thrombocytopenic purpura) или аутоиммунную тромбоцитопению.Autoimmune disease refers to a non-cancerous disease or disorder that arises from and is directed against a person's own tissues. Autoimmune diseases in the present invention specifically exclude malignant or cancerous diseases or conditions, especially B-cell lymphoma, acute lymphoblastic leukemia (ALL), chronic lymphocytic leukemia (CLL), hairy cell leukemia and chronic myeloblastic leukemia. Examples of autoimmune diseases or disorders include, but are not limited to, inflammatory reactions such as inflammatory skin diseases, including psoriasis and dermatitis (eg, atopic dermatitis); systemic scleroderma and sclerosis; responses associated with inflammatory bowel disease (such as Crohn's disease and ulcerative colitis); respiratory distress syndrome (including adult respiratory distress syndrome; ARDS adult respiratory distress syndrome); dermatitis; meningitis; encephalitis; uveitis; colitis; glomerulonephritis; allergic conditions such as eczema and asthma, and other conditions involving T cell infiltration and chronic inflammatory reactions; atherosclerosis; leukocyte adhesion deficiency; rheumatoid arthritis; systemic lupus erythematosus (SLE - systemic lupus erythematosus) (including, but not limited to, lupus nephritis, cutaneous lupus); diabetes mellitus (for example, type I diabetes mellitus or insulin-dependent diabetes mellitus); multiple sclerosis; Raynaud's syndrome; autoimmune thyroiditis; Hashimoto's thyroiditis; allergic encephalomyelitis; Sjögren's syndrome; juvenile diabetes; and immune responses associated with acute and delayed hypersensitivity mediated by cytokines and T lymphocytes, commonly found in tuberculosis, sarcoidosis, polymyositis, granulomatosis and vasculitis; pernicious anemia (Addison's disease); diseases accompanied by leukocyte diapedesis; inflammatory disease of the central nervous system (CNS); multiple organ damage syndrome; hemolytic anemia (including, but not limited to, cryoglobulinemia or anemia with a positive Coombs test); myasthenia gravis; diseases mediated by the antigen-antibody complex; glomerular basement membrane disease; antiphospholipid syndrome; allergic neuritis; Graves' disease; Lambert-Eaton myasthenic syndrome; bullous pemphigoid; pemphigus; autoimmune polyendocrinopathies; Reiter's disease; muscle stiffness syndrome; Behçet's disease; giant cell arteritis; immune complex nephritis; IgA nephropathy; IgM polyneuropathy; immune thrombocytopenic purpura (ITP - immune thrombocytopenic purpura) or autoimmune thrombocytopenia.

Термины рак и злокачественный относятся или описывают физиологическое состояние у млекопитающих, которое обычно характеризуется нерегулируемым ростом/пролиферацией клеток. Примеры рака включают рак молочной железы и рак печени.The terms cancer and malignant refer to or describe a physiological condition in mammals that is typically characterized by unregulated cell growth/proliferation. Examples of cancer include breast cancer and liver cancer.

- 10 045931- 10 045931

Термин комплемент-зависимая цитотоксичность или CDC - complement-dependent cytotoxicity означает механизм индукции гибели клеток, при котором эффекторный домен Fc антитела, связанного с мишенью, активирует ряд ферментативных реакций, приводящих к образованию отверстий в мембране клетки-мишени. Как правило, комплекс антиген-антитело, образующийся на клетке-мишени, связывается с компонентом комплемента C1q и активирует его, что, в свою очередь, активирует каскад комплемента и приводит к гибели клетки-мишени. Более того, активация комплемента также может приводить к отложению компонентов комплемента на поверхности клетки-мишени, что приводит к связыванию с рецепторами комплемента (например, CR3) на лейкоцитах и тем самым способствует ADCC.The term complement-dependent cytotoxicity or CDC - complement-dependent cytotoxicity refers to a mechanism of cell death induction in which the effector Fc domain of an antibody bound to a target activates a series of enzymatic reactions leading to the formation of holes in the membrane of the target cell. Typically, the antigen-antibody complex formed on the target cell binds to and activates the complement component C1q, which in turn activates the complement cascade and leads to the death of the target cell. Moreover, complement activation can also lead to the deposition of complement components on the surface of the target cell, leading to binding to complement receptors (eg, CR3) on leukocytes and thereby promoting ADCC.

Термин химиотерапевтическое средство относится к химическому соединению, которое может применяться для лечения рака. Примеры химиотерапевтических агентов включают алкилирующие агенты, такие как тиотепа и циклофосфамид (CYTOXAN (зарегистрированный товарный знак)); алкилсульфонаты, такие как бусульфан, импросульфан и пипосульфан; азиридины, такие как бензодопа, карбокон, метуредопа и уредопа; этиленимины и метилолмеламины, включая альтретамин, триэтиленмеламин, триэтиленфосфорамид, триэтилентиофосфорамид и триметиломеламин; ацетогенины (особенно буллатацин и буллатацинон); дельта-9-тетрагидроканнабинол (дронабинол, МАРИНОЛ (зарегистрированный товарный знак)); бета-лапахон; лапахол; колхицины; бетулиновая кислота; камптотецин (включая синтетический аналог топотекана (HYCAMTIN (зарегистрированный товарный знак)),The term chemotherapy agent refers to a chemical compound that can be used to treat cancer. Examples of chemotherapeutic agents include alkylating agents such as thiotepa and cyclophosphamide (CYTOXAN (registered trademark)); alkylsulfonates such as busulfan, improsulfan and piposulfan; aziridines such as benzodopa, carbocone, meturedopa and uredopa; ethylene imines and methylol melamines, including altretamine, triethylene melamine, triethylene phosphoramide, triethylene thiophosphoramide and trimethyl melamine; acetogenins (especially bullatacin and bullatacinone); delta-9-tetrahydrocannabinol (dronabinol, MARINOL (registered trademark)); beta-lapachone; lapachol; colchicines; betulinic acid; camptothecin (including synthetic analogue of topotecan (HYCAMTIN (registered trademark)),

СРТ-11 (иринотекан, CAMPTOSAR (зарегистрированный товарный знак)), ацетилкамптотецин, скополектин и 9-аминокамптотецин); бриостатин; каллистатин; СС-1065 (включая его синтетические аналоги адозелезин, карзелезин и бизелезин); подофиллотоксин; подофиллиновая кислота; тенипозид; криптофицины (в частности, криптофицин 1 и криптофицин 8); доластатин; дуокармицин (включая синтетические аналоги KW-2189 и СВ1-ТМ1); элеутеробин; панкратистатин; саркодиктин; спонгистатин; азотистые иприты, такие как хлорамбуцил, хлорнафазин, хлорфосфамид, эстрамустин, ифосфамид, мехлорэтамин, гидрохлорид мехлорэтамина оксида, мелфалан, новембихин, фенестерин, преднимустин, трофосфамид, урациловый иприт; нитрозомочевины, такие как кармустин, хлорзотоцин, фотемустин, ломустин, нимустин и ранимустин; антибиотики, такие как ендииновые антибиотики (например, калихеамицин, особенно калихеамицин гаммаП и калихеамицин омегаП (см., например, публикацию Nicolaou с соавт., Angew. Chem Intl. Ed. Engl., 1994, 33: 183-186); CDP323, пероральный ингибитор интегрина альфа-4; динемицин, включая динемицин А; эсперамицин; а также неокарзиностатиновый хромофор и родственные хромопротеиновые эндииновые антибиотические хромофоры), аклациномицины, актиномицин, антрамицин, азасерин, блеомицины, кактиномицин, карубицин, карминомицин, карцинофиллин, хромомицины, дактиномицин, даунорубицин, деторубицин, 6-диазо-5-оксо-Р-оксо-Р. доксорубицин (в том числе ADRIAMYCIN (зарегистрированный товарный знак)), морфолино-доксорубицин, цианоморфолино-доксорубицин, 2-пирролино-доксорубицин, липосомальная инъекция доксорубицина HCl (DOXIL (зарегистрированный товарный знак)), липосомальный доксорубицин TLC D-99 (MYOCET (зарегистрированный товарный знак)), пегилированный липосомальный доксорубицин (CAELYX (зарегистрированный товарный знак) и дезоксидоксорубицин), эпирубицин, эзорубицин, идарубицин, марцелломицин, митомицины, такие как митомицин С, микофеноловая кислота, ногаламицин, оливомицины, пепломицин, порфиромицин, пуромицин, келамицин, родорубицин, стрепторубицин, стрептозорубицин, туберцидин, убенимекс, зиностатин, зорубицин; антиметаболиты, такие как метотрексат, гемцитабин (GEMZAR (зарегистрированный товарный знак)), тегафур (UFTORAL (зарегистрированный товарный знак)), капецитабин (XELODA (зарегистрированный товарный знак)), эпотилон и 5-фторурацил (5-ФУ); аналоги фолиевой кислоты, такие как деноптерин, метотрексат, птероптерин, триметрексат; аналоги пуринов, такие как флударабин, 6-меркаптопурин, тиамиприн, тиогуанин; аналоги пиримидина, такие как анцитабин, азацитидин, 6-азауридин, кармофур, цитарабин, дидезоксиуридин, доксифлуридин, эноцитабин, флоксуридин; андрогены, такие как калустерон, дромостанолона пропионат, эпитиостанол, мепитиостан, тестолактон; средства лечения надпочечников, такие как аминоглютетимид, митотан, трилостан; восполнитель фолиевой кислоты, такой как фолиновая кислота; ацеглатон; альдофосфамидный гликозид; аминолевулиновая кислота; энилурацил; амсакрин; бесстрабуцил; бисантрен; эдатрексат; дефамин; демеколцин; диазиквон; эльфорнитин; ацетат эллиптиния; эпотилон; этоглюцид; нитрат галлия; гидроксимочевина; лентинан; лонидамин; майтанзиноиды, такие как майтанзин и ансамитоцины; митогуазон; митоксантрон; мопидамол; нитраэрин; пентостатин; фенамет; пирарубицин; лосоксантрон; 2этилгидразид; прокарбазин; полисахаридный комплекс PSK (зарегистрированная торговая марка) (фирма JHS Natural Products, Юджин, штат Орегон); разоксан; ризоксин; сизофиран; спирогерманий; тенуазоновая кислота; триазиквон; 2,2',2'-трихлортриэтиламин; трихотецены (особенно токсин Т-2, верракурин А, роридин А и ангидин); уретан; виндезин (ELDISINE (зарегистрированная торговая марка), FILDESIN (зарегистрированная торговая марка)); дакарбазин; манномустин; митобронитол; митолактол; пипоброман; гацитозин; арабинозид (Ara-С); тиотепа; таксоиды, например, паклитаксел (TAXOL (зарегистрированная торговая марка)), состав наночастиц паклитаксела, созданный с помощью альбумина (ABRAXANETM), и доцетаксел (TAXOTERE (зарегистрированная торговая марка)); хлорамбуцил; 6тиогуанин; меркаптопурин; метотрексат; агенты платины, такие как цисплатин, оксалиплатин (например, ELOXATIN (зарегистрированный товарный знак)) и карбоплатин; алкалоиды барвинка, которые препятCPT-11 (irinotecan, CAMPTOSAR (registered trademark)), acetylcamptothecin, scopolectin and 9-aminocamptothecin); bryostatin; kallistatin; CC-1065 (including its synthetic analogues adozelesin, carzelesin and bizelesin); podophyllotoxin; podophyllic acid; teniposide; cryptophycins (particularly cryptophycin 1 and cryptophycin 8); dolastatin; duocarmycin (including synthetic analogues KW-2189 and CB1-TM1); eleutherobin; pancratistatin; sarcodictin; spongistatin; nitrogen mustards such as chlorambucil, chlornaphasine, chlorphosphamide, estramustine, ifosfamide, mechlorethamine, mechlorethamine oxide hydrochloride, melphalan, novembiquine, phenesterine, prednimustine, trofosfamide, uracil mustard; nitrosoureas such as carmustine, chlorzotocin, fotemustine, lomustine, nimustine and ranimustine; antibiotics such as enediyne antibiotics (eg, calicheamicin, especially calicheamicin gammaP and calicheamicin omegaP (see, for example, Nicolaou et al., Angew. Chem Intl. Ed. Engl., 1994, 33: 183-186); CDP323, oral alpha-4 integrin inhibitor; dinemycin, including dinemycin A; esperamycin; and neocarzinostatin chromophore and related chromoprotein enediine antibiotic chromophores), aclacinomycins, actinomycin, anthramycin, azaserine, bleomycins, cactinomycin, carubicin, carminomycin, carcinophylline, chromomycins, dactinomycin , daunorubicin , detorubicin, 6-diazo-5-oxo-R-oxo-R. doxorubicin (including ADRIAMYCIN (registered trademark)), morpholino-doxorubicin, cyanomorpholino-doxorubicin, 2-pyrrolino-doxorubicin, liposomal injection of doxorubicin HCl (DOXIL (registered trademark)), liposomal doxorubicin TLC D-99 (MYOCET (registered trademark) trademark)), pegylated liposomal doxorubicin (CAELYX (registered trademark) and deoxydoxorubicin), epirubicin, ezorubicin, idarubicin, marcellomycin, mitomycins such as mitomycin C, mycophenolic acid, nogalamycin, olivomycins, peplomycin, porphyromycin, puromycin, kelamicin, rhodorubi qing , streptorubicin, streptozorubicin, tubercidin, ubenimex, zinostatin, zorubicin; antimetabolites such as methotrexate, gemcitabine (GEMZAR (registered trademark)), tegafur (UFTORAL (registered trademark)), capecitabine (XELODA (registered trademark)), epothilone and 5-fluorouracil (5-FU); folic acid analogs such as denopterin, methotrexate, pteropterin, trimetrexate; purine analogs such as fludarabine, 6-mercaptopurine, thiamiprin, thioguanine; pyrimidine analogues such as ancytabine, azacitidine, 6-azauridine, carmofur, cytarabine, dideoxyuridine, doxifluridine, enocytabine, floxuridine; androgens such as calusterone, dromostanolone propionate, epithiostanol, mepithiostane, testolactone; adrenal medications such as aminoglutethimide, mitotane, trilostane; a folic acid replenisher such as folinic acid; aceglatone; aldophosphamide glycoside; aminolevulinic acid; eniluracil; amsacrine; bestrabucil; bisantrene; edatrexate; defamine; demecolcine; diaziquon; elfornitine; elliptinium acetate; epothilone; ethoglucide; gallium nitrate; hydroxyurea; lentinan; lonidamine; maytansinoids such as maytansine and ansamitocins; mitoguazone; mitoxantrone; mopidamole; nitraerin; pentostatin; phenomet; pirarubicin; Losoxantrone; 2ethylhydrazide; procarbazine; PSK Polysaccharide Complex (registered trademark) (JHS Natural Products, Eugene, OR); razoxane; rhizoxin; sisofiran; spirogermanium; tenuazonic acid; triaziquon; 2,2',2'-trichlorotriethylamine; trichothecenes (especially T-2 toxin, verracurine A, roridin A and anhydrine); urethane; vindesine (ELDISINE (registered trademark), FILDESIN (registered trademark)); dacarbazine; mannomustin; mitobronitol; mitolactol; pipobromance; gacytosine; arabinoside (Ara-C); thiotepa; taxoids, for example, paclitaxel (TAXOL (registered trademark)), albumin-derived paclitaxel nanoparticle formulation (ABRAXANETM), and docetaxel (TAXOTERE (registered trademark)); chlorambucil; 6thioguanine; mercaptopurine; methotrexate; platinum agents such as cisplatin, oxaliplatin (eg, ELOXATIN (registered trademark)) and carboplatin; vinca alkaloids, which prevent

- 11 045931 ствуют полимеризации тубулина с образованием микротрубочек, включая винбластин (VELBAN (зарегистрированный товарный знак)), винкристин (ONCOVIN (зарегистрированный товарный знак)), виндезин (ELDISINE (зарегистрированный товарный знак), FILDESIN (зарегистрированный товарный знак)) и винорелбин (NAVELBINE (зарегистрированный товарный знак)); этопозид (VP-16); ифосфамид; митоксантрон; лейковорин; новантрон; эдатрексат; дауномицин; аминоптерин; ибандронат; ингибитор топоизомеразы RFS 2000; дифторметилорнитин (DMFO); ретиноиды, такие как ретиноевая кислота, включая бексаротен (TARGRETIN (зарегистрированный товарный знак)); бисфосфонаты, такие как клодронат (например, BONEFOS (зарегистрированный товарный знак) или OSTAC (зарегистрированный товарный знак)), этидронат (DIDROCAL (зарегистрированный товарный знак)), NE-58095, золедроновая кислота/золедронат (ZOMETA (зарегистрированный товарный знак)), алендронат (FOSAMAX (зарегистрированный товарный знак)), памидронат (AREDIA (зарегистрированный товарный знак)), тилудронат (SKELID (зарегистрированный товарный знак)) или ризедронат (ACTONEL (зарегистрированный товарный знак)); троксацитабин (аналог 1,3-диоксоланнуклеозида цитозина); антисмысловые олигонуклеотиды, особенно те, которые ингибируют экспрессию генов в сигнальных путях, участвующих в аберрантной клеточной пролиферации, таких как, например, PKC-альфа, Raf, H-Ras и рецептор эпидермального фактора роста (EGF-R); вакцины, такие как вакцина THERATOPE (зарегистрированная торговая марка) и вакцины для генной терапии, например, вакцина ALLOVECTIN (зарегистрированная торговая марка), вакцина LEUVECTIN (зарегистрированная торговая марка) и вакцина VAXID (зарегистрированная торговая марка); ингибитор топоизомеразы 1 (например, LURTOTECAN (зарегистрированный товарный знак)); rmRH (например, ABARELIX (зарегистрированная торговая марка)); BAY439006 (сорафениб; фирма Bayer); SU-11248 (сунитиниб, SUTENT (зарегистрированная торговая марка), фирма Pfizer); перифозин, ингибитор СОХ-2 (например, целекоксиб или эторикоксиб), ингибитор протеосом (например, PS341); бортезомиб (VELCADE (зарегистрированная торговая марка)); CCI-779; типифарниб (R11577); сорафениб, АВТ510; ингибитор Bcl-2, такой как облимерсен натрия (GENASENSE (зарегистрированный товарный знак)); пиксантрон; ингибиторы EGFR (см. определение ниже); ингибиторы тирозинкиназы (см. определение ниже); ингибиторы серин-треонинкиназы, такие как рапамицин (сиролимус, RAPAMUNE (зарегистрированный товарный знак)); ингибиторы фарнезилтрансферазы, такие как лонафарниб (SCH 6636, SARASARTM); и фармацевтически приемлемые соли, кислоты или производные любого из вышеуказанных агентов; а также комбинации двух или более из вышеперечисленных агентов, такие как CHOP, аббревиатура для комбинированной терапии циклофосфамидом, доксорубицином, винкристином и преднизолоном; и FOLFOX, аббревиатура схемы лечения оксалиплатином (ELOXATIN™) в сочетании с 5-ФУ и лейковорином.- 11 045931 polymerization of tubulin to form microtubules, including vinblastine (VELBAN (registered trademark)), vincristine (ONCOVIN (registered trademark)), vindesine (ELDISINE (registered trademark), FILDESIN (registered trademark)) and vinorelbine ( NAVELBINE (registered trademark)); etoposide (VP-16); ifosfamide; mitoxantrone; leucovorin; Novantrone; edatrexate; daunomycin; aminopterin; ibandronate; topoisomerase inhibitor RFS 2000; difluoromethylornithine (DMFO); retinoids such as retinoic acid, including bexarotene (TARGRETIN (registered trademark)); bisphosphonates such as clodronate (eg, BONEFOS (registered trademark) or OSTAC (registered trademark)), etidronate (DIDROCAL (registered trademark)), NE-58095, zoledronic acid/zoledronate (ZOMETA (registered trademark)), alendronate (FOSAMAX (registered trademark)), pamidronate (AREDIA (registered trademark)), tiludronate (SKELID (registered trademark)) or risedronate (ACTONEL (registered trademark)); troxacitabine (analogue of cytosine 1,3-dioxolane nucleoside); antisense oligonucleotides, especially those that inhibit gene expression in signaling pathways involved in aberrant cell proliferation, such as, for example, PKC-alpha, Raf, H-Ras and epidermal growth factor receptor (EGF-R); vaccines such as THERATOPE vaccine (registered trademark) and gene therapy vaccines such as ALLOVECTIN vaccine (registered trademark), LEUVECTIN vaccine (registered trademark) and VAXID vaccine (registered trademark); topoisomerase 1 inhibitor (eg, LURTOTECAN (registered trademark)); rmRH (for example, ABARELIX (registered trademark)); BAY439006 (sorafenib; Bayer); SU-11248 (sunitinib, SUTENT (registered trademark), Pfizer); perifosine, COX-2 inhibitor (eg, celecoxib or etoricoxib), proteasome inhibitor (eg, PS341); bortezomib (VELCADE (registered trademark)); CCI-779; tipifarnib (R11577); sorafenib, ABT510; a Bcl-2 inhibitor such as oblimersen sodium (GENASENSE (registered trademark)); pixantron; EGFR inhibitors (see definition below); tyrosine kinase inhibitors (see definition below); serine-threonine kinase inhibitors such as rapamycin (sirolimus, RAPAMUNE (registered trademark)); farnesyltransferase inhibitors such as lonafarnib (SCH 6636, SARASARTM); and pharmaceutically acceptable salts, acids or derivatives of any of the foregoing agents; as well as combinations of two or more of the above agents, such as CHOP, an acronym for combination therapy of cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine and prednisolone; and FOLFOX, an acronym for the treatment regimen of oxaliplatin (ELOXATIN™) in combination with 5-FU and leucovorin.

Термин химерное антитело относится к антителу, в котором часть тяжелой и/или легкой цепи получена из определенного источника или вида, а остальная часть тяжелой и/или легкой цепи получена из другого источника или вида.The term chimeric antibody refers to an antibody in which a portion of the heavy and/or light chain is derived from a particular source or species and the remainder of the heavy and/or light chain is derived from another source or species.

Класс антитела относится к типу константного домена или константной области, которой обладает его тяжелая цепь. Существует пять основных классов антител: IgA, IgD, IgE, IgG и IgM, и некоторые из них могут быть дополнительно разделены на подклассы (изотипы), например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. Константные домены тяжелой цепи, которые соответствуют различным классам иммуноглобулинов, называются α, δ, ε, γ и μ соответственно.An antibody class refers to the type of constant domain or constant region that its heavy chain possesses. There are five main classes of antibodies: IgA, IgD, IgE, IgG and IgM, and some of them can be further divided into subclasses (isotypes), such as IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 and IgA2. The heavy chain constant domains that correspond to different classes of immunoglobulins are called α, δ, ε, γ and μ, respectively.

В настоящем изобретении термин цитотоксический агент относится к веществу, которое ингибирует или предотвращает клеточную функцию и/или вызывает гибель или разрушение клеток. Цитотоксические агенты включают, но ими перечень не ограничивается, радиоактивные изотопы (например, 211At, 1311,125I,90Y, 186Re, 188Re, 153Sm, 212Bi, 32P, 212Pb и радиоактивные изотопы Lu); химиотерапевтические агенты или лекарства (например, метотрексат, адриамицин, алкалоиды барвинка (винкристин, винбластин, этопозид), доксорубицин, мелфалан, митомицин С, хлорамбуцил, даунорубицин или другие интеркалирующие агенты); ингибирующие рост агенты; ферменты и их фрагменты, такие как нуклеолитические ферменты; антибиотики; токсины, такие как низкомолекулярные токсины или ферментативно активные токсины бактериального, грибкового, растительного или животного происхождения, включая их фрагменты и/или варианты; и различные химиотерапевтические агенты, описанные выше.In the present invention, the term cytotoxic agent refers to a substance that inhibits or prevents cellular function and/or causes cell death or destruction. Cytotoxic agents include, but are not limited to, radioactive isotopes (eg, 211 At, 131 1, 125 I, 90 Y, 186 Re, 188 Re, 153 Sm, 212 Bi, 32 P, 212 Pb and Lu radioactive isotopes); chemotherapeutic agents or drugs (eg, methotrexate, adriamycin, vinca alkaloids (vincristine, vinblastine, etoposide), doxorubicin, melphalan, mitomycin C, chlorambucil, daunorubicin or other intercalating agents); growth inhibitory agents; enzymes and fragments thereof, such as nucleolytic enzymes; antibiotics; toxins, such as low molecular weight toxins or enzymatically active toxins of bacterial, fungal, plant or animal origin, including fragments and/or variants thereof; and the various chemotherapeutic agents described above.

Эффекторные клетки относятся к лейкоцитам, которые экспрессируют один или более FcR и выполняют эффекторные функции. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения клетки экспрессируют по меньшей мере FcyRIII и выполняют эффекторную (эффекторные) функцию (функции) ADCC. Примеры лейкоцитов, которые опосредуют ADCC, включают мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК), естественные клетки-киллеры (NK), моноциты, цитотоксические Т-клетки и нейтрофилы. Эффекторные клетки могут быть выделены из нативного источника, например, из крови. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения эффекторные клетки могут представлять собой эффекторные клетки человека.Effector cells refer to leukocytes that express one or more FcRs and perform effector functions. In some embodiments of the present invention, the cells express at least FcyRIII and perform ADCC effector function(s). Examples of leukocytes that mediate ADCC include peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), natural killer (NK) cells, monocytes, cytotoxic T cells, and neutrophils. Effector cells can be isolated from a native source, such as blood. In some embodiments of the present invention, the effector cells may be human effector cells.

Эффекторные функции относятся к биологической активности, которая приписывается Fcобласти антитела и зависит от изотипа антитела. Примеры эффекторных функций антител включают: связывание C1q и комплементзависимую цитотоксичность (CDC); связывание рецептора Fc; антителозаEffector functions refer to the biological activity that is attributed to the F region of an antibody and is dependent on the antibody isotype. Examples of antibody effector functions include: C1q binding and complement dependent cytotoxicity (CDC); Fc receptor binding; antibodyosis

- 12 045931 висимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC); антителозависимый клеточноопосредованный фагоцитоз (ADCP); понижающую регуляцию рецепторов клеточной поверхности (например, рецептора В-клеток); и активация В-клеток.- 12 045931 dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC); antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP); down-regulation of cell surface receptors (eg, B-cell receptor); and B cell activation.

Термин эпитоп включает любую детерминанту, способную связываться с антителом. Эпитоп представляет собой область антигена, которая связана с антителом, нацеленным на антиген, и включает в себя специфические аминокислоты, которые непосредственно контактируют с антителом. Эпитопные детерминанты могут включать химически активные поверхностные группы молекул, такие как аминокислоты, боковые цепи сахаров, фосфорильные или сульфонильные группы, и могут иметь специфические трехмерные структурные характеристики и/или специфические характеристики заряда. Как правило, антитела, специфичные к конкретному антигену-мишени, предпочтительно распознают эпитоп на антигене-мишени в сложной смеси белков и/или макромолекул.The term epitope includes any determinant capable of binding to an antibody. An epitope is the region of an antigen that is bound to the antibody targeting the antigen and includes specific amino acids that directly contact the antibody. Epitope determinants may include reactive surface groups of molecules, such as amino acids, sugar side chains, phosphoryl or sulfonyl groups, and may have specific three-dimensional structural characteristics and/or specific charge characteristics. In general, antibodies specific for a particular target antigen preferentially recognize an epitope on the target antigen in a complex mixture of proteins and/or macromolecules.

Термин рецептор Fc или FcR относится к рецептору, который связывается с Fc-областью антитела. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения FcR представляет собой природный FcR человека. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения FcR связывает антитело IgG (гамма-рецептор), и включает рецепторы подклассов FcyRI, FcyRII и FcyRIII, в том числе аллельные варианты и формы альтернативного сплайсинга этих рецепторов. Рецепторы FcyRII включают FcyRIIA (активирующий рецептор) и FcyRIIB (ингибирующий рецептор), которые имеют сходные аминокислотные последовательности, отличаются, прежде всего, их цитоплазматическими доменами. Активирующий рецептор FcyRIIA содержит мотив активации иммунорецептора на основе тирозина (ITAM) в своем цитоплазматическом домене. Ингибирующий рецептор FcyRIIB содержит иммунорецепторный мотив ингибирования на основе тирозина (ITIM) в своем цитоплазматическом домене (см., например, Daeron, Annu. Rev. Immunol. 1997, 15: 203-234). FcR рассмотрены, например, в публикациях Ravetch и Kinet, Annu. Rev. Immunol 1991, 9:457-492; Capel с соавт., Immunomethods 1994, 4: 25-34; de Haas с соавт., J. Lab. Clin. Med. 1995, 126: 330-341). Другие FcR, в том числе те, которые будут идентифицированы в будущем, относятся к термину FcR по настоящему изобретению.The term Fc receptor or FcR refers to a receptor that binds to the Fc region of an antibody. In some embodiments of the present invention, the FcR is a naturally occurring human FcR. In some embodiments, the FcR binds an IgG antibody (receptor gamma), and includes receptors of the FcyRI, FcyRII, and FcyRIII subclasses, including allelic variants and alternative splicing forms of these receptors. FcyRII receptors include FcyRIIA (activating receptor) and FcyRIIB (inhibitory receptor), which have similar amino acid sequences, differing primarily in their cytoplasmic domains. The activating receptor FcyRIIA contains an immunoreceptor tyrosine-based activation motif (ITAM) in its cytoplasmic domain. The inhibitory receptor FcyRIIB contains an immunoreceptor tyrosine inhibitory motif (ITIM) in its cytoplasmic domain (see, for example, Daeron, Annu. Rev. Immunol. 1997, 15: 203-234). FcRs are discussed, for example, in the publications of Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 1991, 9:457-492; Capel et al. Immunomethods 1994, 4: 25-34; de Haas et al., J. Lab. Clin. Med. 1995, 126: 330-341). Other FcRs, including those that will be identified in the future, fall within the term FcRs of the present invention.

Термин Fc-рецептор или FcR также включает неонатальный рецептор FcRn, который отвечает за перенос материнских IgG к плоду (Guyer с соавт., J. Immunol. 1976, 117: 587; Kim с соавт., J. Immunol. 1994, 24: 249) и регуляцию гомеостаза иммуноглобулинов. Известны методы измерения связывания с FcRn (см., например, Ghetie и Ward, Immunol. Today 1997, 18(12): 592-598; Ghetie с соавт., NatureThe term Fc receptor or FcR also includes the neonatal FcRn receptor, which is responsible for the transfer of maternal IgG to the fetus (Guyer et al., J. Immunol. 1976, 117:587; Kim et al., J. Immunol. 1994, 24:249 ) and regulation of immunoglobulin homeostasis. Methods for measuring FcRn binding are known (see, for example, Ghetie and Ward, Immunol. Today 1997, 18(12): 592-598; Ghetie et al., Nature

Biotechnology, 1997, 15(7): 637-640; Hinton с соавт., J. Biol. Chem. 2004, 279(8):6213-6216; WO 2004/92219 (Hinton с соавт.)).Biotechnology, 1997, 15(7): 637-640; Hinton et al., J. Biol. Chem. 2004, 279(8):6213-6216; WO 2004/92219 (Hinton et al.)).

Связывание с FcRn человека in vivo и время полужизни в сыворотке высокоаффинно связывающих полипептидов FcRn человека можно анализировать, например, в трансгенных мышах или трансфицированных клеточных линиях человека, экспрессирующих FcRn человека, или на приматах, которым вводят полипептиды с вариантом Fc-области. WO 2000/42072 (Presta) описывает варианты антител с улучшенным или пониженным связыванием с FcR. См. также, например, Shields с соавт., J. Biol. Chem. 2001, 9(2): 6591-6604.The in vivo binding to human FcRn and the serum half-life of high affinity binding human FcRn polypeptides can be assayed, for example, in transgenic mice or transfected human cell lines expressing human FcRn, or in primates administered Fc region variant polypeptides. WO 2000/42072 (Presta) describes antibody variants with improved or reduced FcR binding. See also, for example, Shields et al., J. Biol. Chem. 2001, 9(2): 6591-6604.

Термин Fc-область в настоящем изобретении используют для определения С-концевой области тяжелой цепи иммуноглобулина, которая содержит по меньшей мере часть константной области. Термин включает Fc-области с нативной последовательностью и вариантные Fc-области. В одном варианте осуществления настоящего изобретения Fc-область тяжелой цепи IgG человека простирается от Cys226 или от Pro230 до карбоксильного конца тяжелой цепи. Однако С-концевой лизин (Lys447) или глицин-лизин (Gly446-Lys447) Fc-области может присутствовать или отсутствовать. Если здесь не указано иное, нумерация аминокислотных остатков в Fc-области или константной области соответствует системе нумерации EU, также называемой индексом EU, как описано в работе Kabat с соавт., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5e изд., изд-во Public Health Service, National Institutes of Health, Бетесда, Мэриленд, 1991.The term Fc region is used in the present invention to define the C-terminal region of an immunoglobulin heavy chain that contains at least part of a constant region. The term includes native sequence Fc regions and variant Fc regions. In one embodiment of the present invention, the Fc region of the human IgG heavy chain extends from Cys226 or Pro230 to the carboxyl terminus of the heavy chain. However, the C-terminal lysine (Lys447) or glycine-lysine (Gly446-Lys447) Fc region may or may not be present. Unless otherwise noted herein, the numbering of amino acid residues in the Fc region or constant region follows the EU numbering system, also called the EU index, as described in Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public. Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991.

Термин антитело, содержащее Fc-область относится к антителу, содержащему Fc-область. Сконцевой лизин (остаток 447 в соответствии с системой нумерации EU) или С-концевой глицин-лизин (остатки 446-447) Fc-области можно удалить, например, во время очистки антитела или путем рекомбинантной инженерии нуклеиновой кислоты, кодирующее антитело. Соответственно, композиция, содержащая антитело, имеющее Fc-области по настоящему изобретению, может содержать антитело с G446K447, с G446 и без K447, с удаленными всеми G446-K447, или смесь трех типов антител, описанных выше.The term Fc region-containing antibody refers to an antibody containing an Fc region. The C-terminal lysine (residue 447 according to the EU numbering system) or C-terminal glycine-lysine (residues 446-447) Fc regions can be removed, for example, during antibody purification or by recombinant engineering of the nucleic acid encoding the antibody. Accordingly, a composition containing an antibody having the Fc regions of the present invention may contain an antibody with G446K447, with G446 and without K447, with all G446-K447 removed, or a mixture of the three types of antibodies described above.

Термин вариабельная область или вариабельный домен относится к домену тяжелой или легкой цепи антитела, который участвует в связывании антитела с антигеном. Вариабельные домены тяжелой цепи и легкой цепи (VH и VL, соответственно) нативного антитела обычно имеют сходную структуру, при этом каждый домен включает четыре консервативных каркасных участка (FR) и три гипервариабельных участка (HVR) (см., например, Kindt с соавт., Kuby Immunology, 6e изд., 2007, изд-во WH Freeman and Co., стр. 91). Одного домена VH или VL может быть достаточно для придания антигенсвязывающей специфичности. Кроме того, антитела, которые связывают конкретный антиген, могут быть выThe term variable region or variable domain refers to the heavy or light chain domain of an antibody that is involved in the binding of the antibody to an antigen. The heavy chain and light chain variable domains (VH and VL, respectively) of a native antibody typically have a similar structure, with each domain comprising four conserved framework regions (FR) and three hypervariable regions (HVR) (see, for example, Kindt et al. , Kuby Immunology, 6th ed., 2007, WH Freeman and Co., p. 91). A single VH or VL domain may be sufficient to confer antigen-binding specificity. In addition, antibodies that bind a specific antigen may be

- 13 045931 делены с использованием домена VH или VL из антитела, которое связывает антиген, для скрининга библиотеки комплементарных доменов VL или VH, соответственно. См., например, Portolano с соавт., J. Immunol. 1993, 150: 880-887; Clarkson с соавт., Nature 1991, 352: 624-628.- 13 045931 are separated using the VH or VL domain from an antibody that binds the antigen to screen a library of complementary VL or VH domains, respectively. See, for example, Portolano et al., J. Immunol. 1993, 150: 880-887; Clarkson et al., Nature 1991, 352: 624-628.

Каркас или FR относится к остаткам вариабельного домена, отличным от остатков гипервариабельной области (HVR). FR вариабельного домена обычно состоит из четырех доменов FR: FR1, FR2, FR3 и FR4. Соответственно, последовательности HVR и FR обычно появляются в следующей последовательности в VH (или VL): FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.Framework or FR refers to variable domain residues other than hypervariable region residues (HVR). The FR variable domain typically consists of four FR domains: FR1, FR2, FR3 and FR4. Accordingly, HVR and FR sequences typically appear in the following sequence in VH (or VL): FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.

Термины полноразмерное антитело, интактное антитело и антитело полной длины используют в настоящем изобретении взаимозаменяемо для обозначения антитела, имеющего структуру, по существу аналогичную структуре нативного антитела, или имеющего тяжелые цепи, которые содержат Fcобласть, как определено в настоящем документе.The terms full-length antibody, intact antibody, and full-length antibody are used interchangeably in the present invention to refer to an antibody having a structure substantially similar to that of a native antibody, or having heavy chains that contain an F region, as defined herein.

Функциональная Fc-область обладает эффекторной функцией Fc-области с нативной последовательностью. Примеры эффекторных функций включают связывание C1q; CDC; связывание рецептора Fc; ADCC; фагоцитоз; понижающаяся регуляция рецепторов клеточной поверхности (например, Вклеточного рецептора; BCR) и т.д. Такие эффекторные функции обычно требуют объединения Fcобласти со связывающим доменом (например, вариабельным доменом антитела) и могут быть оценены с использованием различных анализов, как описано, например, в определениях, приведенных в настоящем описании.The functional Fc region has the effector function of the native sequence Fc region. Examples of effector functions include C1q binding; CDC; Fc receptor binding; ADCC; phagocytosis; down-regulation of cell surface receptors (eg, B cell receptor; BCR), etc. Such effector functions typically require association of an F region with a binding domain (eg, an antibody variable domain) and can be assessed using various assays, as described, for example, in the definitions provided herein.

Антитело человека представляет собой антитело, которое обладает аминокислотной последовательностью, соответствующей последовательности антитела, продуцируемого человеком или человеческой клеткой, или полученного из другого источника, в котором используют репертуары человеческих антител или другие последовательности, кодирующие антитела человека. Это определение антитела человека специально исключает гуманизированное антитело, содержащее антигенсвязывающие остатки, не происходящие от человека.A human antibody is an antibody that has an amino acid sequence corresponding to that of an antibody produced by a human or a human cell, or obtained from another source that uses human antibody repertoires or other human antibody coding sequences. This definition of a human antibody specifically excludes a humanized antibody containing non-human antigen-binding moieties.

Консенсусный каркас человека представляет собой каркас, который представляет наиболее часто встречающиеся аминокислотные остатки в ряде последовательностей каркаса VL или VH иммуноглобулина человека. Как правило, выбор последовательностей VL или VH иммуноглобулина человека осуществляют из подгруппы последовательностей вариабельных доменов. Как правило, подгруппа последовательностей является такой подгруппой, как описанная в кн.: Kabat с соавт., Sequences of Proteins of Immunological Interest, т. 1-3, 5e изд., изд-во NIH Publication 91-3242, 1991, Бетесда, Мэриленд. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения для VL подгруппа представляет собой подгруппу kI, как в публикации Kabat с соавт., см. выше. В одном варианте осуществления для VH подгруппа представляет собой подгруппу III, как в публикации Kabat с соавт., см. выше.The human consensus framework is a framework that represents the most frequently occurring amino acid residues in a number of human immunoglobulin VL or VH framework sequences. Typically, the selection of human immunoglobulin VL or VH sequences is made from a subset of variable domain sequences. Typically, the subset of sequences is such a subset as described in: Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, vol. 1-3, 5th ed., NIH Publication 91-3242, 1991, Bethesda, Maryland. In one embodiment of the present invention, the VL subgroup is the kI subgroup, as in Kabat et al., supra. In one embodiment, for VH, the subgroup is subgroup III, as in Kabat et al., supra.

Гуманизированное антитело относится к химерному антителу, содержащему аминокислотные остатки HVR, не происходящие от человека, и аминокислотные остатки FR человека. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения гуманизированное антитело может содержать, по существу все, по меньшей мере один, а обычно два вариабельных домена, в которых все или по существу все HVR (например, CDR) соответствуют таковым у антитела, происходящего не от человека, и все или практически все FR соответствуют FR антитела человека. Гуманизированное антитело необязательно может содержать по меньшей мере часть константной области антитела, происходящую от антитела человека. Гуманизированная форма антитела, например, антитело, происходящее не от человека, относится к антителу, подвергшемуся гуманизации.A humanized antibody refers to a chimeric antibody containing non-human HVR amino acid residues and human FR amino acid residues. In some embodiments of the present invention, a humanized antibody may contain substantially all of at least one, and typically two, variable domains in which all or substantially all of the HVRs (e.g., CDRs) correspond to those of the non-human antibody, and all or virtually all FRs correspond to human antibody FRs. The humanized antibody may optionally contain at least a portion of the antibody constant region derived from a human antibody. A humanized form of an antibody, for example, a non-human antibody, refers to an antibody that has been humanized.

Термин гипервариабельная область или HVR, используемый в настоящем изобретении, относится к каждой из областей вариабельного домена антитела, которые являются гипервариабельными по последовательности (области, определяющие комплементарность или CDR) и/или образуют структурно определенные петли (гипервариабельные петли) и/или содержат остатки, контактирующие с антигеном (антигенные контакты). Как правило, антитела включают шесть HVR: три в VH (H1, Н2, Н3) и три в VL (L1, L2, L3). Примеры HVR в настоящем изобретении включают:The term hypervariable region or HVR, as used in the present invention, refers to each of the regions of an antibody variable domain that are hypervariable in sequence (complementarity determining regions or CDRs) and/or form structurally defined loops (hypervariable loops) and/or contain residues in contact with antigen (antigenic contacts). Typically, antibodies include six HVRs: three in VH (H1, H2, H3) and three in VL (L1, L2, L3). Examples of HVR in the present invention include:

(а) гипервариабельные петли, расположенные на аминокислотных остатках 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (Н2) и 96-101 (Н3) (Chothia и Lesk, J. Mol. Biol. 1987, 196:901-917);(a) hypervariable loops located on amino acid residues 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (H2) and 96-101 (H3 ) (Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 1987, 196:901-917);

(б) CDR, расположенные на аминокислотных остатках 24-34 (L1), 50-56 (L2), 89-97 (L3), 31-35b (H1), 50-65 (Н2) и 95-102 (Н3) (Kabat с соавт., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5e изд., изд-во Public Health Service, 1991, Бетесда, Мэриленд;(b) CDRs located at amino acid residues 24-34 (L1), 50-56 (L2), 89-97 (L3), 31-35b (H1), 50-65 (H2) and 95-102 (H3) (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, 1991, Bethesda, MD;

(в) контакты антигена, происходящие по аминокислотным остаткам 27с-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35b (H1), 47-58 (Н2) и 93-101 (Н3) ( MacCallum с соавт., J. Mol. Biol., 1996, 262: 732-745); а также (г) комбинации (а), (б) и/или (в), включая аминокислотные остатки HVR 46-56 (L2), 47-56 (L2), 4856 (L2), 49-56 (L2), 26-35 (H1), 26-35b (H1), 49-65 (Н2), 93-102 (Н3) и 94-102 (Н3).(c) antigen contacts occurring at amino acid residues 27c-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35b (H1), 47-58 (H2) and 93-101 (H3 ) (MacCallum et al., J. Mol. Biol., 1996, 262: 732-745); and (d) combinations (a), (b) and/or (c), including amino acid residues HVR 46-56 (L2), 47-56 (L2), 4856 (L2), 49-56 (L2), 26-35 (H1), 26-35b (H1), 49-65 (H2), 93-102 (H3) and 94-102 (H3).

Если не указано иное, остатки HVR и другие остатки в вариабельном домене (например, остатки FR) пронумерованы в соответствии с Kabat с соавт., см. выше.Unless otherwise stated, HVR residues and other residues in the variable domain (eg, FR residues) are numbered according to Kabat et al., supra.

Иммуноконъюгат представляет собой антитело, конъюгированное с одной или более гетерологичной молекулой (молекулами), включая цитотоксический агент, но не ограничиваясь им.An immunoconjugate is an antibody conjugated to one or more heterologous molecule(s), including but not limited to a cytotoxic agent.

Изолированное антитело представляет собой антитело, которое было отделено от компонентовAn isolated antibody is an antibody that has been separated from its components

- 14 045931 его естественной среды. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело очищают до чистоты более 95% или 99%, что определяется, например, методом электрофореза (например, SDS-PAGE, изоэлектрическим фокусированием (IEF), капиллярным электрофорезом) или хроматографией (например, ионообменным или обращенно-фазовым ВЭЖХ). Обзор методов оценки чистоты антител см., например, Flatman с соавт., J. Chromatogr. В, 2007, 848: 79-87.- 14 045931 of its natural environment. In some embodiments of the present invention, the antibody is purified to greater than 95% or 99% purity, as determined, for example, by electrophoresis (e.g., SDS-PAGE, isoelectric focusing (IEF), capillary electrophoresis) or chromatography (e.g., ion exchange or reverse phase HPLC). For a review of methods for assessing antibody purity, see, for example, Flatman et al., J. Chromatogr. In, 2007, 848: 79-87.

Изолированная нуклеиновая кислота относится к молекуле нуклеиновой кислоты, которая была отделена от компонентов ее естественного окружения. Выделенная нуклеиновая кислота включает молекулу нуклеиновой кислоты, содержащуюся в клетках, которые обычно содержат молекулы нуклеиновой кислоты, но молекула нуклеиновой кислоты присутствует внехромосомно или в хромосомном расположении, которое отличается от его естественного хромосомного местоположения.Isolated nucleic acid refers to a nucleic acid molecule that has been separated from components of its natural environment. An isolated nucleic acid includes a nucleic acid molecule contained in cells that normally contain nucleic acid molecules, but the nucleic acid molecule is present extrachromosomally or in a chromosomal location that differs from its natural chromosomal location.

Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело относится к одной или более молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим тяжелую и легкую цепи антитела (или их фрагменты), включая такую молекулу (молекулы) нуклеиновой кислоты в одном векторе или отдельных векторах, и такая молекула нуклеиновой кислоты (кислот) присутствует в одном или более местах в клетке-хозяине.An isolated antibody-encoding nucleic acid refers to one or more nucleic acid molecules encoding the heavy and light chains of an antibody (or fragments thereof), including such nucleic acid molecule(s) in a single vector or separate vectors, and such nucleic acid molecule(s) present at one or more locations in the host cell.

Термин вектор, используемый в настоящем изобретении, относится к молекуле нуклеиновой кислоты, способной к увеличению копий другой нуклеиновой кислоты, с которой она связана. Термин включает вектор как самовоспроизводящуюся структуру нуклеиновой кислоты, а также вектор, включенный в геном клетки-хозяина, в которую он был введен. Некоторые векторы способны направлять экспрессию нуклеиновых кислот, с которыми они функционально связаны. Такие векторы называются здесь векторами экспрессии.The term vector as used in the present invention refers to a nucleic acid molecule capable of expanding copies of another nucleic acid to which it is linked. The term includes a vector as a self-replicating nucleic acid structure, as well as a vector incorporated into the genome of the host cell into which it has been introduced. Some vectors are capable of directing the expression of nucleic acids to which they are operably linked. Such vectors are referred to herein as expression vectors.

Термины клетка-хозяин, линия клеток-хозяев и культура клеток-хозяев используют взаимозаменяемо и относят к клеткам, в которые была введена экзогенная нуклеиновая кислота, а также к потомству таких клеток. Клетки-хозяева включают трансформанты и трансформированные клетки, которые включают первично трансформированную клетку и полученное из нее потомство независимо от количества пассажей. Потомство может быть не полностью идентичным по содержанию нуклеиновых кислот родительской клетке, и может содержать мутации. Мутантное потомство, обладающее той же функцией или биологической активностью, что и подвергнутые скринингу или отобранные в исходно трансформированной клетке, включены в настоящее описание.The terms host cell, host cell line, and host cell culture are used interchangeably and refer to cells into which exogenous nucleic acid has been introduced, as well as the progeny of such cells. Host cells include transformants and transformed cells, which include the primary transformed cell and its progeny, regardless of the number of passages. The offspring may not be completely identical in nucleic acid content to the parent cell, and may contain mutations. Progeny mutants having the same function or biological activity as those screened or selected in the initially transformed cell are included herein.

Термин моноклональное антитело, используемый в настоящем изобретении, относится к антителу, полученному из популяции по существу гомогенных антител, т.е. отдельные антитела, составляющие популяцию, идентичны и/или связывают один и тот же эпитоп, за исключением возможных вариантных антител, например, содержащих природные мутации или возникающие во время получения препарата моноклонального антитела, причем такие варианты обычно присутствуют в незначительных количествах. В отличие от препаратов поликлональных антител, которые обычно включают разные антитела, направленные против разных детерминант (эпитопов), каждое моноклональное антитело в препарате моноклональных антител направлено против одной детерминанты антигена. Таким образом, модификатор моноклональный указывает на то, что антитело получено из по существу гомогенной популяции антител, и его не следует толковать как требующее получения антитела каким-либо конкретным способом. Например, моноклональные антитела, используемые в соответствии с настоящим изобретением, могут быть получены различными методами, включая, помимо прочего, гибридомный метод, методы рекомбинантной ДНК, методы фагового дисплея и методы с использованием трансгенных животных, содержащих полностью или частично локусы иммуноглобулинов человека, такие способы и другие иллюстративные способы получения моноклональных антител описаны в настоящем изобретении.The term monoclonal antibody as used in the present invention refers to an antibody obtained from a population of essentially homogeneous antibodies, i.e. The individual antibodies composing the population are identical and/or bind the same epitope, with the exception of possible variant antibodies, for example those containing natural mutations or those arising during preparation of the monoclonal antibody, such variants usually being present in minute quantities. Unlike polyclonal antibody preparations, which typically include different antibodies directed against different determinants (epitopes), each monoclonal antibody in a monoclonal antibody preparation is directed against one antigen determinant. Thus, the modifier monoclonal indicates that the antibody is derived from an essentially homogeneous population of antibodies and should not be interpreted as requiring the antibody to be produced by any particular method. For example, monoclonal antibodies used in accordance with the present invention can be produced by various methods, including, but not limited to, hybridoma method, recombinant DNA methods, phage display methods and methods using transgenic animals containing all or part of human immunoglobulin loci, such methods and other exemplary methods for producing monoclonal antibodies are described in the present invention.

Понятие голое антитело относится к антителу, которое не конъюгировано с гетерологичным фрагментом (например, цитотоксическим фрагментом) или радиоактивной меткой. Голое антитело может присутствовать в фармацевтическом составе.The term naked antibody refers to an antibody that is not conjugated to a heterologous moiety (eg, a cytotoxic moiety) or radiolabel. The naked antibody may be present in the pharmaceutical composition.

Понятие нативные антитела относится к встречающимся в природе молекулам иммуноглобулина с различной структурой. Например, нативные антитела IgG представляют собой гетеротетрамерные гликопротеины массой около 150 000 дальтон, состоящие из двух идентичных легких цепей и двух идентичных тяжелых цепей, связанных дисульфидной связью. От N- до С-конца каждая тяжелая цепь имеет вариабельную область (VH), также называемую вариабельным доменом тяжелой цепи или вариабельным доменом тяжелой цепи, за которой следуют три константных домена (CH1, CH2 и СН3). Аналогично, от N-конца к С-концу каждая легкая цепь имеет вариабельную область (VL), также называемую вариабельным доменом легкой цепи, за которой следует константный домен легкой цепи (CL). Легкая цепь антитела может быть отнесена к одному из двух типов, называемых каппа (к) и лямбда (λ), на основании аминокислотной последовательности их константного домена.The term native antibodies refers to naturally occurring immunoglobulin molecules with different structures. For example, native IgG antibodies are heterotetrameric glycoproteins of approximately 150,000 daltons, consisting of two identical light chains and two identical heavy chains linked by a disulfide bond. From the N- to C-terminus, each heavy chain has a variable region (VH), also called a heavy chain variable domain or heavy chain variable domain, followed by three constant domains (CH1, CH2 and CH3). Likewise, from the N-terminus to the C-terminus, each light chain has a variable region (VL), also called a light chain variable domain, followed by a light chain constant domain (CL). An antibody light chain can be classified into one of two types, called kappa (k) and lambda (λ), based on the amino acid sequence of its constant domain.

Понятие нативная последовательность Fc-области содержит аминокислотную последовательность, идентичную аминокислотной последовательности Fc-области, встречающейся в природе. Fcобласть человека с нативной последовательностью включает Fc-область IgG1 человека с нативной последовательностью (аллотипы не-А и А); Fc-область IgG2 человека с нативной последовательностью; Fcобласть IgG3 человека с нативной последовательностью; и Fc-область IgG4 человека с нативной последовательностью, а также их природные варианты.The term native Fc region sequence contains an amino acid sequence identical to the amino acid sequence of the Fc region found in nature. The native sequence human Fc region includes the native sequence human IgG1 Fc region (non-A and A allotypes); Fc region of human IgG2 with native sequence; Human IgG3 F region with native sequence; and the Fc region of human IgG4 with the native sequence, as well as their natural variants.

- 15 045931- 15 045931

Вариант Fc-области содержит аминокислотную последовательность, которая отличается от последовательности Fc-области с нативной последовательностью в силу по меньшей мере одной аминокислотной модификации (изменения), предпочтительно одной или более аминокислотных замен. Предпочтительно вариант Fc-области имеет по меньшей мере одну аминокислотную замену по сравнению с Fcобластью нативной последовательности или Fc-областью исходного полипептида, например, от примерно одной до примерно десяти аминокислотных замен, предпочтительно от примерно одной до примерно пяти аминокислотных замен в Fc-области нативной последовательности или в Fc-области исходного полипептида. Вариант Fc-области согласно настоящему изобретению предпочтительно обладает по меньшей мере приблизительно 80% гомологией с Fc-областью нативной последовательности и/или сThe Fc region variant contains an amino acid sequence that differs from the native sequence Fc region sequence due to at least one amino acid modification, preferably one or more amino acid substitutions. Preferably, the variant Fc region has at least one amino acid substitution relative to the Fc region of the native sequence or the Fc region of the parent polypeptide, for example, from about one to about ten amino acid substitutions, preferably from about one to about five amino acid substitutions in the native Fc region sequence or in the Fc region of the parent polypeptide. The Fc region variant of the present invention preferably has at least about 80% homology to the native sequence Fc region and/or

Fc-областью исходного полипептида, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 90% гомологией с ними и наиболее предпочтительно по меньшей мере приблизительно 95% гомологией.the Fc region of the parent polypeptide, more preferably at least about 90% homology thereto, and most preferably at least about 95% homology thereto.

Понятие процент (%) идентичности аминокислотной последовательности по отношению к эталонной последовательности полипептида определяют как процентная доля аминокислотных остатков в последовательности-кандидате, которые идентичны аминокислотным остаткам в эталонной полипептидной последовательности, после выравнивания последовательностей и введения пробелов, если это необходимо, для достижения максимальной процентной идентичности последовательности и без учета какихлибо консервативных замен как части идентичности последовательности. Выравнивание с целью определения процентной идентичности аминокислотной последовательности может быть достигнуто различными способами, известными специалистам в данной области, например, с использованием общедоступного компьютерного программного обеспечения, такого как BLAST, BLAST-2, ALIGN, Megalign (DNASTAR) или GENETYX (зарегистрированная торговая марка) (фирма Genetyx Co., Ltd.). Специалисты в данной области техники могут определить подходящие параметры для выравнивания последовательностей, включая любые алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания по всей длине сравниваемых последовательностей.The concept of percent (%) amino acid sequence identity with respect to a reference polypeptide sequence is defined as the percentage of amino acid residues in a candidate sequence that are identical to amino acid residues in the reference polypeptide sequence, after sequence alignment and the introduction of spaces if necessary to achieve maximum percent identity sequence and without considering any conservative substitutions as part of sequence identity. Alignment to determine percent amino acid sequence identity can be achieved in a variety of ways known to those skilled in the art, for example, using publicly available computer software such as BLAST, BLAST-2, ALIGN, Megalign (DNASTAR) or GENETYX (registered trademark) (Genetyx Co., Ltd.). Those skilled in the art can determine appropriate parameters for sequence alignment, including any algorithms necessary to achieve maximum alignment over the entire length of the sequences being compared.

Автором компьютерной программы сравнения последовательностей ALIGN-2 является фирма Genentech, Inc., а исходный код зарегистрирован вместе с документацией пользователей в Бюро регистрации авторских прав США, Вашингтон, округ Колумбия, 20559, где он зарегистрирован под номером авторского права США № TXU510087. Программа ALIGN-2 находится в свободном доступе от фирмы Genentech, Inc., Южный Сан-Франциско, Калифорния, или может быть скомпилирована из исходного кода. Программа ALIGN-2 должна быть скомпилирована для использования в операционной системе UNIX, включая цифровую версию UNIX V4.0D. Все параметры сравнения последовательностей задаются программой ALIGN-2 и не изменяются.The ALIGN-2 sequence comparison computer program was originated by Genentech, Inc., and the source code is registered, along with user documentation, with the United States Copyright Office, Washington, DC 20559, where it is registered under U.S. Copyright No. TXU510087. The ALIGN-2 program is freely available from Genentech, Inc., South San Francisco, California, or can be compiled from source code. The ALIGN-2 program must be compiled for use on the UNIX operating system, including the digital version of UNIX V4.0D. All sequence comparison parameters are set by the ALIGN-2 program and do not change.

В ситуациях, когда ALIGN-2 используют для сравнения аминокислотных последовательностей, процента идентичности аминокислотной последовательности данной аминокислотной последовательности А относительно данной аминокислотной последовательности В (которая может быть альтернативно выражена как данная аминокислотная последовательность А, которая имеет или содержит определенный % идентичности аминокислотной последовательности с данной аминокислотной последовательностью В, или против нее), рассчитывают следующим образом:In situations where ALIGN-2 is used to compare amino acid sequences, the percentage amino acid sequence identity of a given amino acid sequence A relative to a given amino acid sequence B (which may alternatively be expressed as a given amino acid sequence A that has or contains a certain % amino acid sequence identity with a given amino acid sequence B, or against it), is calculated as follows:

100-кратная дробь X/Y, где X означает количество аминокислотных остатков, признанных идентичными с помощью программы выравнивания последовательностей ALIGN-2 при выравнивании А и В этой программой, и где Y - общее количество аминокислотных остатков в В. Следует учитывать, что если длина аминокислотной последовательности А не равна длине аминокислотной последовательности В, то % идентичности аминокислотных последовательностей А и В не будет равен % идентичности аминокислотных последовательностей В и А. Если специально не указано иное, все проценты значений идентичности аминокислотной последовательности, используемые в настоящем изобретении, получают, как описано в предыдущем абзаце, с использованием компьютерной программы ALIGN-2.100-fold fraction X/Y, where X is the number of amino acid residues found identical by the ALIGN-2 sequence alignment program when aligning A and B by that program, and where Y is the total number of amino acid residues in B. It should be noted that if the length amino acid sequence A is not equal in length to amino acid sequence B, then the % identity of amino acid sequences A and B will not equal the % identity of amino acid sequences B and A. Unless specifically stated otherwise, all percent amino acid sequence identity values used in the present invention are obtained as described in the previous paragraph using the ALIGN-2 computer program.

Термин фармацевтический состав относится к препарату, который находится в такой форме, которая обеспечивает эффективную биологическую активность содержащегося в нем активного ингредиента, и который не содержит дополнительных компонентов, являющихся неприемлемо токсичными для субъекта, для которого препарат может быть назначен.The term pharmaceutical composition refers to a preparation that is in a form that provides effective biological activity of the active ingredient it contains, and that does not contain additional components that are unacceptably toxic to the subject for whom the drug may be prescribed.

Понятие индивид или субъект относится к млекопитающим.The concept of individual or subject refers to mammals.

Млекопитающими являются, но ими перечень не ограничивается, домашние животные (например, коровы, овцы, кошки, собаки и лошади), приматы (например, люди и другие приматы, такие как обезьяны), кролики и грызуны (например, мыши и крысы). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения индивидом или субъектом является человек.Mammals include, but are not limited to, domestic animals (for example, cows, sheep, cats, dogs and horses), primates (for example, humans and other primates such as monkeys), rabbits and rodents (for example, mice and rats). In some embodiments of the present invention, the individual or subject is a human.

Понятие фармацевтически приемлемый носитель относится к ингредиенту фармацевтического состава, отличному от активного ингредиента, который нетоксичен для субъекта. Фармацевтически приемлемый носитель включает, но не ограничивается ими, буфер, вспомогательное вещество, стабилизатор или консервант.The term pharmaceutically acceptable carrier refers to an ingredient of the pharmaceutical composition, other than the active ingredient, that is non-toxic to the subject. A pharmaceutically acceptable carrier includes, but is not limited to, a buffer, excipient, stabilizer or preservative.

Понятие эффективное количество агента, например фармацевтического состава, относится к количеству, эффективному в дозах и на протяжении периодов времени, необходимых для достижения жеThe term effective amount of an agent, such as a pharmaceutical composition, refers to an amount effective in doses and over periods of time necessary to achieve the same

- 16 045931 лаемого терапевтического или профилактического результата.- 16 045931 desired therapeutic or preventive result.

Термин вкладыш в упаковку используют для обозначения инструкций, обычно включаемых в коммерческие упаковки терапевтических продуктов, которые содержат информацию о показаниях, применении, дозировке, введении, комбинированной терапии, противопоказаниях и/или предупреждениях относительно использования таких терапевтических продуктов.The term package insert is used to refer to instructions typically included in commercial packaging of therapeutic products that contain information regarding the indications, use, dosage, administration, combination therapy, contraindications and/or warnings regarding the use of such therapeutic products.

Термин CTLA-4, используемый в настоящем изобретении, относится к любому нативному CTLA4 от любого позвоночного животного, включая млекопитающих, таких как приматы (например, люди) и грызуны (например, мыши и крысы), если не указано иное. Термин охватывает полноразмерный непроцессированный CTLA-4, a также любую форму CTLA-4, полученную в результате процессинга в клетке. Термин также охватывает встречающиеся в природе варианты CTLA-4, например, сплайс варианты или аллельные варианты. Аминокислотная последовательность типичного CTLA-4 человека представлена в SEQ ID NO: 214, аминокислотная последовательность CTLA-4 мыши представлена в SEQ ID NO: 247, аминокислотная последовательность CTLA-4 обезьяны представлена в SEQ ID NO: 248, и аминокислотная последовательность внеклеточного домена CTLA-4 человека представлена в SEQ ID NO: 28. В настоящем изобретении CTLA-4 также может быть описан как CTLA4.The term CTLA-4 as used in the present invention refers to any native CTLA4 from any vertebrate animal, including mammals such as primates (eg, humans) and rodents (eg, mice and rats), unless otherwise noted. The term includes full-length, full-length CTLA-4, as well as any form of CTLA-4 resulting from cellular processing. The term also covers naturally occurring variants of CTLA-4, such as splice variants or allelic variants. The amino acid sequence of typical human CTLA-4 is shown in SEQ ID NO: 214, the amino acid sequence of mouse CTLA-4 is shown in SEQ ID NO: 247, the amino acid sequence of monkey CTLA-4 is shown in SEQ ID NO: 248, and the amino acid sequence of the extracellular domain of CTLA-4 4 human is shown in SEQ ID NO: 28. In the present invention, CTLA-4 may also be described as CTLA4.

Термин регуляторные Т-клетки (Treg) относится к субпопуляции Т-клеток, которые регулируют иммунную систему, поддерживают толерантность к аутоантигенам и подавляют аутоиммунные заболевания. Эти клетки обычно подавляют пролиферацию эффекторных Т-клеток. Наиболее изученными клетками Treg являются клетки, экспрессирующие CD4, CD25 и Foxp3 (клетки CD4+ CD25+ клетки Treg). Эти клетки Treg отличаются от хелперных Т-клеток. Для идентификации и мониторинга клеток Treg используют несколько различных методов. При определении по экспрессии CD4 и CD25 (клетки CD4+ CD25+) клетки Treg составляют примерно от 5 до примерно 10% субпопуляции зрелых CD4+ Т-клеток у мышей и людей, в то время как примерно от 1 до примерно 2% Treg можно измерить в цельной крови. Идентификацию и мониторинг можно проводить путем дальнейшего измерения экспрессии Foxp3 (клетки CD4+ CD25+ Foxp3+). Кроме того, в качестве другого маркера можно использовать отсутствие или низкий уровень экспрессии CD127 в сочетании с наличием CD4 и CD25. Клетки Treg также экспрессируют высокие уровни CTLA-4 и GITR. Treg также можно идентифицировать способами, описанными в примерах ниже.The term regulatory T cells (Treg) refers to a subset of T cells that regulate the immune system, maintain tolerance to self-antigens, and suppress autoimmune diseases. These cells typically suppress the proliferation of effector T cells. The most studied Treg cells are those expressing CD4, CD25, and Foxp3 (CD4 + CD25 + Treg cells). These Treg cells are different from helper T cells. Several different methods are used to identify and monitor Treg cells. When measured by expression of CD4 and CD25 (CD4+ CD25+ cells), Treg cells constitute about 5 to about 10% of the mature CD4+ T cell subpopulation in mice and humans, while about 1 to about 2% Tregs can be measured in whole blood . Identification and monitoring can be accomplished by further measuring Foxp3 expression (CD4 + CD25 + Foxp3 + cells). In addition, the absence or low level of CD127 expression in combination with the presence of CD4 and CD25 can be used as another marker. Treg cells also express high levels of CTLA-4 and GITR. Tregs can also be identified using the methods described in the examples below.

Используемый в настоящем изобретении термин практически сходный, практически равный или практически такой же относится к достаточно высокой степени сходства между двумя числовыми значениями (например, одно связано с антителом по настоящему изобретению, а другое связанное с эталонным/сравнительным антителом), так что специалист в данной области может определить разницу между двумя значениями незначительной или не имеющей биологической и/или статистической значимости в контексте биологической характеристики, измеряемой указанными значениями (например, значения KD).As used herein, the term substantially similar, substantially equal, or substantially the same refers to a sufficiently high degree of similarity between two numerical values (e.g., one associated with an antibody of the present invention and the other associated with a reference/comparative antibody) such that one skilled in the art area can determine the difference between two values of negligible or no biological and/or statistical significance in the context of the biological characteristic measured by the specified values (eg, KD value).

Используемый в настоящем изобретении термин лечение (и его грамматическая вариация, такая как лечить) относится к клиническому вмешательству в попытке изменить естественное течение заболевания у индивидуума, проходящего лечение, и может проводиться либо для профилактики, либо во время лечения клинической патологии. Желательные эффекты лечения включают, но не ограничиваются ими, предотвращение возникновения или рецидива заболевания, облегчение симптомов, уменьшение любых прямых или косвенных патологических последствий заболевания, предотвращение метастазирования, снижение скорости прогрессирования заболевания, улучшение или облегчение болезненного состояния, ремиссию или улучшение прогноза. В некоторых вариантах осуществления антитела по настоящему изобретению используют для задержки развития заболевания или для замедления прогрессирования заболевания.As used herein, the term treatment (and its grammatical variation such as treat) refers to a clinical intervention in an attempt to alter the natural history of a disease in an individual undergoing treatment, and may be carried out either prophylactically or during the treatment of a clinical pathology. Desirable effects of treatment include, but are not limited to, preventing the onset or recurrence of a disease, alleviating symptoms, reducing any direct or indirect pathological consequences of the disease, preventing metastasis, reducing the rate of disease progression, improving or alleviating a disease state, remission, or improving prognosis. In some embodiments, the antibodies of the present invention are used to delay the development of a disease or to slow the progression of a disease.

Термин опухоль относится к росту всех неопластическим клеток и к пролиферации, злокачественным или доброкачественным, а также ко всем предраковым и раковым клеткам и тканям. Термины рак, злокачественный, клеточное пролиферативное нарушение, пролиферативное нарушение и опухоль не являются взаимоисключающими в контексте настоящего описания.The term tumor refers to all neoplastic cell growth and proliferation, malignant or benign, as well as all precancerous and cancerous cells and tissues. The terms cancer, malignant, cell proliferative disorder, proliferative disorder and tumor are not mutually exclusive as used herein.

Термин опухолевая ткань означает ткань, содержащую по меньшей мере одну опухолевую клетку. Опухолевая ткань обычно состоит из популяции опухолевых клеток, которые образуют основную часть опухоли (паренхиму), и соединительных тканей и кровеносных сосудов, которые существуют между этими клетками и поддерживают опухоль (строма). Различие между ними в одних случаях очевидно, а в других они смешиваются. Опухолевые ткани могут быть инфильтрированы иммунными клетками и т.п. С другой стороны, неопухолевая ткань означает ткань, отличную от опухолевой (опухолевых) ткани (тканей) в живом организме. Здоровые/нормальные ткани, не находящиеся в болезненном состоянии, являются типичными примерами неопухолевых тканей.The term tumor tissue means tissue containing at least one tumor cell. Tumor tissue typically consists of a population of tumor cells that form the bulk of the tumor (parenchyma), and connective tissues and blood vessels that exist between these cells and support the tumor (stroma). The difference between them is obvious in some cases, but in others they are confused. Tumor tissues may be infiltrated by immune cells and the like. On the other hand, non-tumor tissue means tissue other than the tumor tissue(s) in a living body. Healthy/normal tissues that are not in a disease state are typical examples of non-tumor tissues.

II. Составы и композиции.II. Compositions and compositions.

Один из объектов настоящего изобретения частично основан на ннти-СТЕА^ антителах и их применении. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусмотрены антитела, которые связываются с CTLA-4. Антитела по настоящему изобретению применимы, например, для диагностики или лечения рака.One aspect of the present invention is based in part on anti-CTEA antibodies and their use. In some embodiments, the present invention provides antibodies that bind to CTLA-4. The antibodies of the present invention are useful, for example, in the diagnosis or treatment of cancer.

- 17 045931- 17 045931

А. Примеры aHTu-CTLA-4 антител.A. Examples of aHTu-CTLA-4 antibodies.

В одном из объектов по настоящему изобретению предусматривают выделенные антитела, которые связываются с CTLA-4. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело по настоящему изобретению обладает CTLA-4-связывающей активностью в зависимости от концентрации аденозин-содержащего соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения связывающаяся с CTLA-4 активность выше в присутствии аденозин-содержащего соединения по сравнению с активностью в отсутствие аденозин-содержащего соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения активность связывания с CTLA-4 выше в присутствии высокой концентрации аденозин-содержащего соединения по сравнению с таковой в присутствии низкой концентрации аденозин-содержащего соединения. В других вариантах осуществления настоящего изобретения разница в связывающей активности с CTLA-4 отличается, например, в два раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, в 200 раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, в 1 х 103 раз или более, в 2х 103 раз или более, в 3х 103 раз или более, в 5х 103 раз или более, в 1х 104 раза или более, в 2х 104 раза или более, в 3х 104 раза или более, в 5х 104 раза или более или в 1х 105 раз или более.In one aspect of the present invention, isolated antibodies are provided that bind to CTLA-4. In some embodiments, the anti-CTLA-4 antibody of the present invention has CTLA-4 binding activity depending on the concentration of the adenosine-containing compound. In some embodiments of the present invention, CTLA-4 binding activity is greater in the presence of an adenosine-containing compound compared to activity in the absence of an adenosine-containing compound. In another embodiment of the present invention, CTLA-4 binding activity is higher in the presence of a high concentration of an adenosine-containing compound compared to that in the presence of a low concentration of an adenosine-containing compound. In other embodiments of the present invention, the difference in binding activity to CTLA-4 is different, for example, two-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 20-fold or more, 30 times or more, 50 times or more, 100 times or more, 200 times or more, 300 times or more, 500 times or more, 1 x 10 3 times or more, 2 x 10 3 times or more , 3x 10 3 times or more, 5x 10 3 times or more, 1x 10 4 times or more, 2x 10 4 times or more, 3x 10 4 times or more, 5x 10 4 times or more or 1x 10 5 times or more.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения связывающая активность антиCTLA-4 антитела может быть выражена величиной KD (константа диссоциации). В другом варианте осуществления настоящего изобретения величина KD анти-CTLA-4 антитела в присутствии аденозинсодержащего соединения меньше, чем в отсутствие аденозин-содержащего соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения значение KD анти-CTLA-4 антитела в присутствии высокой концентрации аденозин-содержащего соединения меньше, чем в присутствии низкой концентрации аденозин-содержащего соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения различие значений KD анти-CTLA-4 антитела отличается, например в два раза или более, 3 в раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, в 200 раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, в 1х 103 раз или более, в 2х103 раз или более, в 3х103 раз или более, в 5х103 раз или более, в 1х 104 раз или более, в 2х104 раз или более, в 3х 104 раз или более, в 5х 104 раз или более, или в 1х 105 раз или более. Значения KD анти-CTLA-4 антител в присутствии аденозин-содержащего соединения или в присутствии высокой концентрации аденозинсодержащего соединения могут быть, например, 9х10-7 М или менее, 8х10-7 М или менее, 7х10-7 М или менее, 6х10-7 М или менее, 5х10-7 М или менее, 4х10-7 М или менее, 3х10-7 М или менее, 2х10-7 М или менее, 1 х 10-7 М или менее, 9х10-8 М или менее, 8х10-8 М или менее, 7х10-8 М или менее, 6х10-8 М или менее, 5х10-8 М или менее, 4х10-8 М или менее, 3х10-8 М или менее, 2х10-8 М или менее, 1 х 10-8 М или менее, 9х10-9 М или менее, 8х10-9 М или менее, 7х10-9 М или менее, 6х10-9 М или менее, 5х10-9 М или менее, 4х10-9 М или менее, 3х10-9 М или менее, 2х10-9 М или менее, 1х 10-9 М или менее, 9х10-10 М или менее, 8х10-10 М или менее, 7х10-10 М или менее, 6х10-10 М или менее, 5х10-10 М или менее, 4х10-10 М или менее, 3х 10-10 М или менее, 2х 10-10 М или менее, или 1 х 10-10 М или менее. Значения KD анти-CTLA4 антител в отсутствие аденозин-содержащего соединения или в присутствии низкой концентрации аденозин-содержащего соединения могут быть, например, 1х 10-8 М или более, 2х10-8 М или более, 3х10-8 М или более, 4х 10-8 М или более, 5х 10-8 М или более, 6х 10-8 М или более, 7х 10-8 М или более 8х 10-8 М или более, 9х10-8 М или более, 1 х 10-7 М или более, 2х10-7 М или более, 3х10-7 М или более, 4х10-7 М или более, 5х 10-7 М или более, 6х 10-7 М или более, 7х 10-7 М или более, 8х 10-7 М или более, 9х 10-7 М или более, 1х 10-6 М или более, 2х10-6 М или более 3х10-6 М или более, 4х10-6 М или более, 5х10-6 М или более, 6х 10-6 М или более, 7х 10-6 М или более, 8х 10-6 М или более, или 9х 10-6 М или более.In some embodiments of the present invention, the binding activity of an anti-CTLA-4 antibody can be expressed by a KD (dissociation constant) value. In another embodiment of the present invention, the KD value of the anti-CTLA-4 antibody in the presence of an adenosine-containing compound is less than in the absence of an adenosine-containing compound. In another embodiment of the present invention, the KD value of the anti-CTLA-4 antibody in the presence of a high concentration of an adenosine-containing compound is less than in the presence of a low concentration of an adenosine-containing compound. In another embodiment of the present invention, the difference in KD values of the anti-CTLA-4 antibody is different, for example, two-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 20-fold or more, 30 times or more, 50 times or more, 100 times or more, 200 times or more, 300 times or more, 500 times or more, 1x103 times or more, 2x103 times or more, 3x10 3 times or more, 5x10 3 times or more, 1x 10 4 times or more, 2x10 4 times or more, 3x 10 4 times or more, 5x 10 4 times or more, or 1x 10 5 times or more. The KD values of anti-CTLA-4 antibodies in the presence of an adenosine-containing compound or in the presence of a high concentration of an adenosine-containing compound may be, for example, 9x10 -7 M or less, 8x10 -7 M or less, 7x10 -7 M or less, 6x10 -7 M or less, 5x10 -7 M or less, 4x10 -7 M or less, 3x10 -7 M or less, 2x10 -7 M or less, 1 x 10 -7 M or less, 9x10 -8 M or less, 8x10 - 8 M or less, 7x10 -8 M or less, 6x10 -8 M or less, 5x10 -8 M or less, 4x10 -8 M or less, 3x10 -8 M or less, 2x10 -8 M or less, 1 x 10 -8 M or less, 9x10 -9 M or less, 8x10 -9 M or less, 7x10 -9 M or less, 6x10 -9 M or less, 5x10 -9 M or less, 4x10 -9 M or less, 3x10 - 9 M or less, 2x10 -9 M or less, 1x 10 -9 M or less, 9x10 -10 M or less, 8x10 -10 M or less, 7x10 -10 M or less, 6x10 -10 M or less, 5x10 - 10 M or less, 4 x 10 -10 M or less, 3 x 10 -10 M or less, 2 x 10 -10 M or less, or 1 x 10 -10 M or less. The KD values of anti-CTLA4 antibodies in the absence of an adenosine-containing compound or in the presence of a low concentration of an adenosine-containing compound may be, for example, 1x10 -8 M or more, 2x10 -8 M or more, 3x10 -8 M or more, 4x10 -8 M or more, 5x 10 -8 M or more, 6x 10 -8 M or more, 7x 10 -8 M or more 8x 10 -8 M or more, 9x10 -8 M or more, 1 x 10 -7 M or more, 2x10 -7 M or more, 3x10 -7 M or more, 4x10 -7 M or more, 5x 10 -7 M or more, 6x 10 -7 M or more, 7x 10 -7 M or more, 8x 10 -7 M or more, 9x 10 -7 M or more, 1x 10 -6 M or more, 2x10 -6 M or more 3x10 -6 M or more, 4x10 -6 M or more, 5x10 -6 M or more, 6x 10 -6 M or more, 7x 10 -6 M or more, 8x 10 -6 M or more, or 9x 10 -6 M or more.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность анти-CTLA-4 антитела может быть представлена значением kd (константа скорости диссоциации) вместо значения KD.In another embodiment of the present invention, the binding activity of an anti-CTLA-4 antibody may be represented by a kd (dissociation rate constant) value instead of a KD value.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность анти-CTLA-4 антитела может быть представлена количеством связывания CTLA-4 на единицу количества антитела. Например, в анализе методом поверхностного плазмонного резонанса количество связывания антитела, иммобилизованного на сенсорном чипе, и количество связывания антигена, дополнительно связанного с ним, измеряются как резонансная единица (RU - resonance unit). Значение, полученное путем деления количества связывания антигена на количество связывания антитела, может быть определено как количество связывания антигена на единицу количества антитела. Конкретные способы измерения и расчета таких количеств связывания описаны в примерах ниже. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения количество связывания CTLA-4 в присутствии аденозин-содержащего соединения выше, чем в отсутствие аденозин-содержащего соединения. Альтернативно, в другом варианте осуществления настоящего изобретения количество связывания CTLA-4 в присутствии высокой концентрации аденозин-содержащего соединения выше, чем в присутствии низкой концентрации аденозинсодержащего соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения различие связывающего количества CTLA-4 отличается, например, в два раза или более, 3 в раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, вIn another embodiment of the present invention, the binding activity of an anti-CTLA-4 antibody can be represented by the amount of CTLA-4 binding per unit amount of antibody. For example, in surface plasmon resonance analysis, the amount of binding of an antibody immobilized on a sensor chip and the amount of binding of an antigen further bound thereto are measured as a resonance unit (RU). The value obtained by dividing the amount of antigen binding by the amount of antibody binding can be defined as the amount of antigen binding per unit amount of antibody. Specific methods for measuring and calculating such binding amounts are described in the examples below. In some embodiments of the present invention, the amount of CTLA-4 binding in the presence of an adenosine-containing compound is higher than in the absence of an adenosine-containing compound. Alternatively, in another embodiment of the present invention, the amount of CTLA-4 binding in the presence of a high concentration of adenosine-containing compound is greater than in the presence of a low concentration of adenosine-containing compound. In another embodiment of the present invention, the difference in CTLA-4 binding amount is different, for example, two-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 20-fold or more, 30-fold, or more, 50 times or more, 100 times or more, in

- 18 045931- 18 045931

200 раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, в 1х 103 раз или более, в 2х103 раз или более, в 3х 103 раз или более, в 5х 103 раз или более, в 1х 104 раз или более, в 2х 104 раз или более, в 3х 104 раз или более, в 5х104 раз или более, или в 1х 105 раз или более. Величина количества связываемого CTLA-4 в присутствии аденозин-содержащего соединения или в присутствии высокой концентрации аденозинсодержащего соединения может составлять, например, 0,01 или более, 0,02 или более, 0,03 или более, 0,04 или более, 0,05 или более, 0,06 или более, 0,07 или более, 0,08 или более, 0,09 или более, 0,1 или более, 0,2 или более, 0,3 или более, 0,4 или более, 0,5 или более, 0,6 или более, 0,7 или более, 0,8 или более, 0,9 или более или 1 или более. Величина количества связываемого CTLA-4 в отсутствие аденозинсодержащего соединения или в присутствии низкой концентрации аденозин-содержащего соединения может составлять, например, 0,5 или менее, 0,4 или менее, 0,3 или менее, 0,2 или менее, 0,1 или менее, 0,09 или менее, 0,08 или менее, 0,07 или менее, 0,06 или менее, 0,05 или менее, 0,04 или менее, 0,03 или менее, 0,02 или менее, 0,01 или менее, 0,009 или менее, 0,008 или менее, 0,007 или менее, 0,006 или менее, 0,005 или менее, 0,004 или менее, 0,003 или менее, 0,002 или менее или 0,001 или менее.200 times or more, 300 times or more, 500 times or more, 1x 10 3 times or more, 2x 103 times or more, 3x 103 times or more, 5x 103 times or more, 1x 10 4 times or more, 2x 10 4 times or more, 3x 10 4 times or more, 5x 10 4 times or more, or 1x 10 5 times or more. The amount of CTLA-4 bound in the presence of an adenosine-containing compound or in the presence of a high concentration of an adenosine-containing compound may be, for example, 0.01 or more, 0.02 or more, 0.03 or more, 0.04 or more, 0. 05 or more, 0.06 or more, 0.07 or more, 0.08 or more, 0.09 or more, 0.1 or more, 0.2 or more, 0.3 or more, 0.4 or more more than, 0.5 or more, 0.6 or more, 0.7 or more, 0.8 or more, 0.9 or more or 1 or more. The amount of CTLA-4 bound in the absence of an adenosine-containing compound or in the presence of a low concentration of an adenosine-containing compound may be, for example, 0.5 or less, 0.4 or less, 0.3 or less, 0.2 or less, 0. 1 or less, 0.09 or less, 0.08 or less, 0.07 or less, 0.06 or less, 0.05 or less, 0.04 or less, 0.03 or less, 0.02 or less, 0.01 or less, 0.009 or less, 0.008 or less, 0.007 or less, 0.006 or less, 0.005 or less, 0.004 or less, 0.003 or less, 0.002 or less, or 0.001 or less.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения значения KD, значения kd, значения связываемого количества и т.п., описанные в настоящем изобретении, измеряют или рассчитывают путем проведения анализа поверхностного плазмонного резонанса при 25°С или 37°С (см., например, пример 3 в настоящем описании).In some embodiments of the present invention, the KD values, kd values, binding amount values, and the like described in the present invention are measured or calculated by performing a surface plasmon resonance assay at 25°C or 37°C (see, for example, Example 3 in this specification).

Любая концентрация аденозин-содержащего соединения может быть выбрана при условии, что обнаруживается различие в активности связывания анти-CTLA-4 антитела. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения высокая концентрация может включать, например, 1 нМ или более 1 нМ, 3 нМ или более 3 нМ, 10 нМ или более 10 нМ, 30 нМ или более 30 нМ, 100 нМ или более 100 нМ. нМ, 300 нМ или более 300 нМ, 1 мкМ или более 1 мкМ, 3 мкМ или более 3 мкМ, 10 мкМ или более 10 мкМ, 30 мкМ или более 30 мкМ, 100 мкМ или более 100 мкМ, 300 мкМ или более 300 мкМ, 1 мМ или более 1 мМ, 3 мМ или более 3 мМ, 10 мМ или более 10 мМ, 30 мМ или более 30 мМ, 100 мМ или более 100 мМ, 300 мМ или выше 300 мМ и 1 М или выше 1 М. В другом варианте высокая концентрация в настоящем изобретении может быть достаточным количеством, при котором соответствующее анти-CTLA4 антитело проявляет максимальную связывающую активность. В одном варианте осуществления настоящего изобретения в качестве высокой концентрации могут быть выбраны 1 мкМ, 10 мкМ, 100 мкМ, 1 мМ или достаточное количество, при котором соответствующее анти-CTLA-4-антитело проявляет максимальную связывающую активность. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения низкая концентрация может включать, например, 1 мМ или менее 1 мМ, 300 мкМ или менее 300 мкМ, 100 мкМ или менее 100 мкМ, 30 мкМ или менее 30 мкМ, 10 мкМ или менее 10 мкМ. мкМ, 3 мкМ или менее 3 мкМ, 1 мкМ или менее 1 мкМ, 300 нМ или менее 300 нМ, 100 нМ или менее 100 нМ, 30 нМ или менее 30 нМ, 10 нМ или менее 10 нМ, 3 нМ или ниже 3 нМ, 1 нМ или ниже 1 нМ, 300 пМ или ниже 300 пМ, 100 пМ или ниже 100 пМ, 30 пМ или ниже 30 пМ, 10 пМ или ниже 10 пМ, 3 пМ или ниже 3 пМ и 1 пМ или ниже 1 пМ. В другом варианте низкая концентрация может представлять собой концентрацию, при которой соответствующее анти-CTLA-4 антитело проявляет минимальную связывающую активность. Случай, когда существенная концентрация равна нулю (в отсутствие аденозин-содержащего соединения), также может быть выбран как вариант осуществления низкой концентрации. В одном варианте осуществления в качестве более низкой концентрации здесь может быть выбрана концентрация 1 мМ, 100 мкМ, 10 мкМ, 1 мкМ, при которой соответствующее анти-CTLA-4 антитело проявляет минимальную связывающую активность, или отсутствие соединения аденозина. В другом варианте осуществления настоящего изобретения в качестве отношения высокой концентрации к низкой концентрации могут быть выбраны следующие значения: например, в 3 раза или более, в 10 раз или более, в 30 раз или более, в 100 раз или более, в 300 раз или более, 1х103 раз или более, 3х103 раз или более, 1х 104 раз или более, 3х104 раз или более, 1х 105 раз или более, 3х105 раз или более, 1х 106 раз или более, 3х106 раз или более, 1х 107 раз или более, 3х107 раз или более, 1 108 раз или более, 3х108 раз или более, 1х 109 раз или более, 3х109 раз или более, 1х 1010 раз или более, 3х1010 раз или более, 1х 1011 раз или более, 3х 1011 раз или более или 1х 1012 раз или более.Any concentration of adenosine-containing compound may be selected as long as a difference in the binding activity of the anti-CTLA-4 antibody is detected. In some embodiments of the present invention, a high concentration may include, for example, 1 nM or more than 1 nM, 3 nM or more than 3 nM, 10 nM or more than 10 nM, 30 nM or more than 30 nM, 100 nM or more than 100 nM. nM, 300 nM or more than 300 nM, 1 µM or more than 1 µM, 3 µM or more than 3 µM, 10 µM or more than 10 µM, 30 µM or more than 30 µM, 100 µM or more than 100 µM, 300 µM or more than 300 µM , 1 mM or more than 1 mM, 3 mM or more than 3 mM, 10 mM or more than 10 mM, 30 mM or more than 30 mM, 100 mM or more than 100 mM, 300 mM or more than 300 mM and 1 M or more than 1 M. In another embodiment, the high concentration in the present invention may be a sufficient amount at which the corresponding anti-CTLA4 antibody exhibits maximum binding activity. In one embodiment of the present invention, the high concentration may be 1 μM, 10 μM, 100 μM, 1 mM, or a sufficient amount at which the corresponding anti-CTLA-4 antibody exhibits maximum binding activity. In some embodiments of the present invention, the low concentration may include, for example, 1 mM or less than 1 mM, 300 μM or less than 300 μM, 100 μM or less than 100 μM, 30 μM or less than 30 μM, 10 μM or less than 10 μM. µM, 3 µM or less than 3 µM, 1 µM or less than 1 µM, 300 nM or less than 300 nM, 100 nM or less than 100 nM, 30 nM or less than 30 nM, 10 nM or less than 10 nM, 3 nM or less than 3 nM , 1 nM or below 1 nM, 300 pM or below 300 pM, 100 pM or below 100 pM, 30 pM or below 30 pM, 10 pM or below 10 pM, 3 pM or below 3 pM and 1 pM or below 1 pM. Alternatively, the low concentration may be the concentration at which the corresponding anti-CTLA-4 antibody exhibits minimal binding activity. The case where the significant concentration is zero (in the absence of an adenosine-containing compound) can also be selected as a low concentration embodiment. In one embodiment, the lower concentration here may be 1 mM, 100 μM, 10 μM, 1 μM at which the corresponding anti-CTLA-4 antibody exhibits minimal binding activity, or no adenosine compound. In another embodiment of the present invention, the ratio of high concentration to low concentration may be selected as follows: for example, 3 times or more, 10 times or more, 30 times or more, 100 times or more, 300 times, or more, 1x103 times or more, 3x103 times or more, 1x 10 4 times or more, 3x10 4 times or more, 1x 10 5 times or more, 3x10 5 times or more, 1x 10 6 times or more, 3x10 6 times or more , 1x 10 7 times or more, 3x10 7 times or more, 1 108 times or more, 3x10 8 times or more, 1x 10 9 times or more, 3x10 9 times or more, 1x 10 10 times or more, 3x10 10 times or more than, 1x 10 11 times or more, 3x 10 11 times or more, or 1x 10 12 times or more.

В одном варианте осуществления настоящего изобретения в качестве более низкой концентрации может быть выбрана концентрация 1 мМ, 100 мкМ, 10 мкМ, 1 мкМ, при которой соответствующее антиCTLA-4 антитело проявляет минимальную связывающую активность, или в отсутствие соединения аденозина. В другом варианте осуществления настоящего изобретения в качестве отношения высокой концентрации к низкой концентрации могут быть выбраны следующие значения: например, в 3 раза или более, в 10 раз или более, в 30 раз или более, в 100 раз или более, в 300 раз или более, в 1х103 раз или более, в 3х103 раз или более, в 1х 104 раз или более, в 3х104 раз или более, в 1х 105 раз или более, в 3х105 раз или более, в 1х 106раз или более, в 3х 106 раз или более, в 1х 107 раз или более, в 3х 107 раз или более, в 1 х 108 раз или более, в 3х108 раз или более, в 1х 109 раз или более, в 3х109 раз или более, в 1х 1010раз или более, в 3х1010 раз или более, в 1х 1011 раз или более, в 3х 1011 раз или более или в 1 х 1012 раз или более.In one embodiment of the present invention, the lower concentration may be 1 mM, 100 μM, 10 μM, 1 μM at which the corresponding anti-CTLA-4 antibody exhibits minimal binding activity, or in the absence of an adenosine compound. In another embodiment of the present invention, the ratio of high concentration to low concentration may be selected as follows: for example, 3 times or more, 10 times or more, 30 times or more, 100 times or more, 300 times, or more, 1x103 times or more, 3x103 times or more, 1x 10 4 times or more, 3x10 4 times or more, 1x 10 5 times or more, 3x10 5 times or more, 1x 10 6 times or more, 3x 10 6 times or more, 1x 107 times or more, 3x 107 times or more, 1 x 108 times or more, 3x10 8 times or more, 1x 10 9 times or more, 3x10 9 times or more, 1x 10 10 times or more, 3x 10 10 times or more, 1x 10 11 times or more, 3x 10 11 times or more, or 1 x 10 12 times or more.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению обладают активностью связывания также с аденозин-содержащими соединениями. КоличеIn another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention also have binding activity to adenosine-containing compounds. Quantity

- 19 045931 ство связывания аденозин-содержащего соединения на единицу количества анти-СТЬА-4-антитела можно рассчитать с использованием вышеупомянутого метода и использовать в качестве связывающей активности антитела с аденозин-содержащим соединением. Конкретные способы измерения и расчета таких количеств связывания описаны в примерах ниже. Величина количества связывания аденозинсодержащего соединения на единицу количества анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению может составлять, например, 0,0001 или более, 0,0002 или более, 0,0003 или более, 0,0004 или более, 0,0005 или более, 0,0006 или более, 0,0007 или более, 0,0008 или более, 0,0009 или более, 0,001 или более, 0,002 или более, 0,003 или более, 0,004 или более, 0,005 или более, 0,006 или более, 0,007 или более, 0,008 или более, 0,009 или более или 0,01 или более.- 19 045931 The binding activity of an adenosine-containing compound per unit amount of anti-CTA-4 antibody can be calculated using the above method and used as the binding activity of the antibody to the adenosine-containing compound. Specific methods for measuring and calculating such binding amounts are described in the examples below. The amount of binding amount of adenosine-containing compound per unit amount of anti-CTLA-4 antibody of the present invention may be, for example, 0.0001 or more, 0.0002 or more, 0.0003 or more, 0.0004 or more, 0.0005 or more, 0.0006 or more, 0.0007 or more, 0.0008 or more, 0.0009 or more, 0.001 or more, 0.002 or more, 0.003 or more, 0.004 or more, 0.005 or more, 0.006 or more, 0.007 or more, 0.008 or more, 0.009 or more, or 0.01 or more.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения анmи-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению образуют тройной комплекс с аденозин-содержащим соединением и CTLA-4. В одном варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело связывается с аденозинсодержащим соединением через CDR1, CDR2 и CDR3 тяжелой цепи. В одном варианте осуществления анти-CTLA-4 антитело имеет мотив связывания с аденозин-содержащим соединением. Мотив связывания для аденозин-содержащего соединения может состоять, например, из по меньшей мере одной аминокислоты, присутствующей в положениях 33, 52, 52а, 53, 56, 58, 95, 96, 100а, 100b и 100с в соответствии с нумерацией по Kabat. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело связывается с аденозин-содержащим соединением, например, через по меньшей мере одну аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из положений 33, 52, 52а, 53, 56, 58, 95, 96, 100а, 100b и 100с по нумерации Kabat. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела содержат по меньшей мере одну аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Thr в положении 33, Ser в положении 52, Ser в положении 52а, Arg в положении 53, Tyr в положении 56, Tyr в положении положение 58, Tyr в положении 95, Gly в положении 96, Met в положении 100а, Leu в положении 100b и Trp в положении 100с согласно нумерации Kabat. CTLA-4 может дополнительно связываться с комплексом, образованным связыванием анти-CTLA-4 антитела и аденозин-содержащего соединения. Более того, аденозин-содержащее соединение может присутствовать на поверхности раздела, где взаимодействуют анти-CTLA-4 антитела и CTLA-4, и может связываться с ними обоими. С помощью таких методов, как описанный ниже анализ кристаллической структуры, можно подтвердить, что анти-CTLA-4 антитело образует тройной комплекс с аденозин-содержащим соединением и CTLA-4 (см. примеры).In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention form a ternary complex with an adenosine-containing compound and CTLA-4. In one embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody binds to an adenosine-containing compound via CDR1, CDR2 and CDR3 of the heavy chain. In one embodiment, the anti-CTLA-4 antibody has an adenosine-containing compound binding motif. The binding motif for an adenosine-containing compound may consist, for example, of at least one amino acid present at positions 33, 52, 52a, 53, 56, 58, 95, 96, 100a, 100b and 100c according to Kabat numbering. In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody binds to an adenosine-containing compound, for example, through at least one amino acid selected from the group consisting of positions 33, 52, 52a, 53, 56, 58, 95, 96 , 100a, 100b and 100c according to Kabat numbering. In some embodiments, the anti-CTLA-4 antibodies contain at least one amino acid selected from the group consisting of Thr at position 33, Ser at position 52, Ser at position 52a, Arg at position 53, Tyr at position 56, Tyr at position 58, Tyr at position 95, Gly at position 96, Met at position 100a, Leu at position 100b and Trp at position 100c according to Kabat numbering. CTLA-4 may further bind to a complex formed by the binding of an anti-CTLA-4 antibody and an adenosine-containing compound. Moreover, the adenosine-containing compound may be present at the interface where anti-CTLA-4 antibodies and CTLA-4 interact and may bind to both. Using methods such as crystal structure analysis described below, it can be confirmed that the anti-CTLA-4 antibody forms a ternary complex with an adenosine-containing compound and CTLA-4 (see examples).

В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению связываются по меньшей мере с одной аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из аминокислот в положении 3 (Met), положении 33 (Glu), положении 35 (Arg), положении 53 (Thr), положении 97 (Glu), положении 99 (Met), положении 100 (Tyr), положении 101 (Pro), положении 102 (Pro), положении 103 (Pro), положении 104 (Tyr), положении 105 (Tyr) и положении 106 (Leu) CTLA-4 человека (внеклеточный домен; SEQ ID NO: 28). Эти аминокислоты могут составлять эпитоп анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антиCTLA-4 антитела по настоящему изобретению связываются с областью от аминокислоты в положении 97 (Glu) до аминокислоты в положении 106 (Leu) CTLA-4 человека (внеклеточный домен; SEQ ID №: 28). В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению связываются с областью от аминокислоты в положении 99 (Met) до аминокислоты в положении 106 (Leu) CTLA-4 человека (внеклеточный домен; SEQ ID №: 28).In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention bind to at least one amino acid selected from the group consisting of amino acids at position 3 (Met), position 33 (Glu), position 35 (Arg), position 53 (Thr), position 97 (Glu), position 99 (Met), position 100 (Tyr), position 101 (Pro), position 102 (Pro), position 103 (Pro), position 104 (Tyr), position 105 ( Tyr) and position 106 (Leu) of human CTLA-4 (extracellular domain; SEQ ID NO: 28). These amino acids may constitute the epitope of the anti-CTLA-4 antibody of the present invention. In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention bind to the region from amino acid position 97 (Glu) to amino acid position 106 (Leu) of human CTLA-4 (extracellular domain; SEQ ID No: 28). In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention bind to the region from amino acid position 99 (Met) to amino acid position 106 (Leu) of human CTLA-4 (extracellular domain; SEQ ID No: 28).

В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению конкурируют с АВАМ004 (VH, SEQ ID NO: 10; VL, SEQ ID NO: 11; HVR-H1, SEQ ID NO: 100; HVR-H2, SEQ ID NO: 101; HVR-H3, SEQ ID NO: 102; HVR-L1, SEQ ID NO: 113; HVR-L2, SEQ ID NO: 114; HVR-L3, SEQ ID NO: 115) по связыванию с CTLA-4. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению связываются с тем же эпитопом, что и АВАМ004. При избытке анти-CTLA-4 антител связывание АВАМ004 с CTLA-4 может быть снижено, например, на 10% или более, 15% или более, 20% или более, 25% или более, 30% или более, 35% или более, 40% или более, 45% или более, 50% или более, 55% или более, 60% или более, 65% или более, 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более или 95% или более. В настоящем описании приводятся примеры анализов конкуренции.In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention compete with ABAM004 (VH, SEQ ID NO: 10; VL, SEQ ID NO: 11; HVR-H1, SEQ ID NO: 100; HVR-H2, SEQ ID NO: 101; HVR-H3, SEQ ID NO: 102; HVR-L1, SEQ ID NO: 113; HVR-L2, SEQ ID NO: 114; HVR-L3, SEQ ID NO: 115) by binding to CTLA- 4. In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention bind to the same epitope as ABAM004. When there is an excess of anti-CTLA-4 antibodies, the binding of ABAM004 to CTLA-4 may be reduced, for example, by 10% or more, 15% or more, 20% or more, 25% or more, 30% or more, 35% or more , 40% or more, 45% or more, 50% or more, 55% or more, 60% or more, 65% or more, 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85% or more , 90% or more or 95% or more. This description provides examples of competition analyses.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению проявляют цитотоксическую активность в отношении клеток, экспрессирующих CTLA-4. Когда CTLA-4 экспрессируется на поверхности клетки-мишени и с ней связывается анти-CTLA-4 антитело, клетка может быть повреждена. Повреждение клетки может быть вызвано эффекторными клетками, связанными с антителом, например активностью антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC) и активностью антителозависимого клеточного фагоцитоза (ADCP), или оно может быть вызвано комплементами, связанными с антителом, такими как комплементзависимая цитотоксичность (CDC). В другом варианте повреждение может быть вызвано цитотоксическим агентом (например, радиоизотопным или химиотерапевтическим агентом), конъюгированным с антителом, таким как иммуноконъюгат. Цитотоксичность в настоящем изобретении может включать эффекты индукции гибели клеток, подавления клеточной пролиферации и нарушения клеточных функций. Когда анти-CTLA-4 антитело приIn another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention exhibit cytotoxic activity against cells expressing CTLA-4. When CTLA-4 is expressed on the surface of a target cell and an anti-CTLA-4 antibody binds to it, the cell can be damaged. Cell damage may be caused by effector cells bound to the antibody, such as antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) activity and antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP) activity, or it may be caused by complements bound to the antibody, such as complement-dependent cytotoxicity (CDC). In another embodiment, the damage may be caused by a cytotoxic agent (eg, a radioisotope or chemotherapeutic agent) conjugated to an antibody, such as an immunoconjugate. Cytotoxicity in the present invention may include the effects of inducing cell death, suppressing cell proliferation and impairing cellular functions. When anti-CTLA-4 antibody is

- 20 045931 сутствует в достаточном количестве, оно может вызвать повреждение, например, 10 % или более, 15% или более, 20% или более, 25% или более, 30% или более, 35% или более, 40% или более, 45% более или, 50% или более, 55% или более, 60% или более, 65% или более, 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, или 95% или более клеток, экспрессирующих CTLA-4. Измерение такой цитотоксической активности можно проводить, сравнивая ее с измерением в отсутствие антитела или в присутствии антитела отрицательного контроля. В настоящем описании приводятся примеры анализов цитотоксичности.- 20 045931 is present in sufficient quantity that it can cause damage, for example 10% or more, 15% or more, 20% or more, 25% or more, 30% or more, 35% or more, 40% or more, 45% or more, 50% or more, 55% or more, 60% or more, 65% or more, 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, or 95% or more of cells expressing CTLA-4. Measurement of such cytotoxic activity can be performed by comparison with the measurement in the absence of antibody or in the presence of a negative control antibody. Examples of cytotoxicity assays are provided herein.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению проявляют нейтрализующую активность в отношении CTLA-4. Известно, что CTLA-4 функционирует, взаимодействуя со своим лигандом, CD80 (В7-1) или CD86 (В7-2). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела ингибируют взаимодействие CTLA-4 с CD80 (В7-1) или CD86 (В7-2). Когда анти-CTLA-4 антитело присутствует в достаточном количестве, оно может ингибировать взаимодействие CTLA-4 с CD80 (В7-1) или CD86 (В7-2), например, на 10% или более, 15% или более, 20% или более, 25% или более, 30% или более, 35% или более, 40% или более, 45% или более, 50% или более, 55% или более, 60% или более, 65% или более, 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, или 95% или более. Измерение такой ингибирующей активности можно проводить, сравнивая ее с измерением в отсутствие антитела или в присутствии антитела отрицательного контроля. В настоящем описании представлены конкретные способы измерения нейтрализующей активности.In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention exhibit neutralizing activity against CTLA-4. CTLA-4 is known to function by interacting with its ligand, CD80 (B7-1) or CD86 (B7-2). In some embodiments, anti-CTLA-4 antibodies inhibit the interaction of CTLA-4 with CD80 (B7-1) or CD86 (B7-2). When the anti-CTLA-4 antibody is present in sufficient quantity, it can inhibit the interaction of CTLA-4 with CD80 (B7-1) or CD86 (B7-2), for example, by 10% or more, 15% or more, 20% or more more, 25% or more, 30% or more, 35% or more, 40% or more, 45% or more, 50% or more, 55% or more, 60% or more, 65% or more, 70% or more more, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, or 95% or more. Measurement of such inhibitory activity can be performed by comparison with the measurement in the absence of antibody or in the presence of a negative control antibody. Specific methods for measuring neutralizing activity are provided herein.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению связываются с CTLA-4, происходящим от нескольких видов животных. Примеры видов животных могут включать млекопитающих, например, людей, обезьян, мышей, крыс, хомяков, морских свинок, кроликов, свиней, крупного рогатого скота, коз, лошадей, овец, верблюдов, собак и кошек. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела связываются с CTLA-4, полученными от людей и от других видов (например, обезьян, мышей и крыс). Аминокислотная последовательность CTLA-4 человека представлена в SEQ ID NO: 214, аминокислотная последовательность CTLA-4 обезьян представлена в SEQ ID NO: 247, а аминокислотная последовательность CTLA-4 мыши представлена в SEQ ID NO: 248. Аминокислотные последовательности CTLA-4, полученные от других видов животных, также можно надлежащим образом определить способами, известными специалистам в данной области.In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention bind to CTLA-4 derived from multiple animal species. Examples of animal species may include mammals, such as humans, monkeys, mice, rats, hamsters, guinea pigs, rabbits, pigs, cattle, goats, horses, sheep, camels, dogs and cats. In some embodiments of the present invention, anti-CTLA-4 antibodies bind to CTLA-4 obtained from humans and from other species (eg, monkeys, mice and rats). The amino acid sequence of human CTLA-4 is presented in SEQ ID NO: 214, the amino acid sequence of monkey CTLA-4 is presented in SEQ ID NO: 247, and the amino acid sequence of mouse CTLA-4 is presented in SEQ ID NO: 248. The amino acid sequences of CTLA-4 obtained from other animal species can also be suitably determined by methods known to those skilled in the art.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения аденозин-содержащие соединения по настоящему изобретению могут включать, например, аденозин (АДО), аденозинтрифосфат (АТФ), аденозиндифосфат (АДФ), аденозинмонофосфат (АМФ), циклический аденозинмонофосфат (цАМФ), дезоксиаденозин (дАДО), дезоксиаденозин трифосфат (dATP), дезоксиаденозиндифосфат (dADP), дезоксиаденозинмонофосфат (dAMP) и аденозин (γ-тио) трифосфат (ATPyS).In some embodiments of the present invention, the adenosine-containing compounds of the present invention may include, for example, adenosine (ADO), adenosine triphosphate (ATP), adenosine diphosphate (ADP), adenosine monophosphate (AMP), cyclic adenosine monophosphate (cAMP), deoxyadenosine (dADO), deoxyadenosine triphosphate (dATP), deoxyadenosine diphosphate (dADP), deoxyadenosine monophosphate (dAMP) and adenosine (γ-thio) triphosphate (ATPyS).

В одном объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, содержащее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (а) последовательности HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223; (б) последовательности HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 224; и (в) последовательности HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 225. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 224; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 225.In one aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two, or all three VH HVR sequences selected from (a) an HVR-H1 sequence comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 223; (b) an HVR-H2 sequence containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224; and (c) an HVR-H3 sequence comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 223; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, содержащее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 226; (б) HVR-L2 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 227; и (в) HVR-L3 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 228. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 226; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 227; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 228.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 226; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 227; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 228. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 226; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 227; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 228.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, содержащее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три VH HVR, выбранные из (i) последовательности HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 224, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 225; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 226, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 227, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 228.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VHs selected from (i) an HVR-H1 sequence comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 223, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three sequences of (i) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 226, (ii) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: : 227, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 228.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, содержащее (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223; (б) HVR-H2, содержащую аминоIn another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 223; (b) HVR-H2 containing amino

- 21 045931 кислотную последовательность SEQ ID NO: 224; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 225; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 226; (д) последовательность HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 227; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 228.- 21 045931 acid sequence SEQ ID NO: 224; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 226; (e) an HVR-L2 sequence containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 227; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 228.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, содержащее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (а) последовательности HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; (б) последовательности HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two, or all three VH HVR sequences selected from (a) an HVR-H1 sequence comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 100; (b) an HVR-H2 sequence containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 101; and (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102. In another embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 100; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 101; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, содержащее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 113; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 114; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 115. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 113; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 114; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 115.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 113; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 114; and (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 115. In another embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 113; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 114; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 115.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, по меньшей мере все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, по меньшей мере все три VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 113, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 114, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO:115.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, at least all three VH HVR sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO : 100, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 101, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, at least all three HVR VLs selected from (i) HVR-L1 comprising the amino acid sequence SEQ ID NO: 113, (ii) HVR-L2 , containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 114, and (c) HVR-L3, containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 115.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; (б) домен HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101; (в) домен HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) домен HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 113; (д) домен HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 114; и (е) домен HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 115.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) an HVR-H1 domain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 100; (b) an HVR-H2 domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 101; (c) an HVR-H3 domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) an HVR-L1 domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 113; (e) an HVR-L2 domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 114; and (e) an HVR-L3 domain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 115.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 100; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 104; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 100; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 104; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 116; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 115. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит последовательности: (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 116; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 115.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 116; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 115. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises the sequences of: (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 116; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 115.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, по меньшей мере все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO:100, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, по меньшей мере все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 116, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 115.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, at least all three VH HVR sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO :100, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 104, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, at least all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 116, (ii) HVR- L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 115.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; (б) HVR-H2, содержащую амино- 22 045931 кислотную последовательность SEQ ID NO: 104; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 116; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 115.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 100; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 104; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 116; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 115.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело включает последовательности (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 106; and (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises the sequences of (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 106; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело включает последовательности (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises the sequences of (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105, (ii) HVRH2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence SEQ ID NO: 105 , (ii) HVRH2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 106, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122, (ii) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее последовательности (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising the sequences of (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 106; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 108; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело включает последовательности: (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 108; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 108; and (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises the sequences of: (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 108; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 153. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 153.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 121; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 123; and (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 153. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 121; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 123; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 153.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 108, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 153.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 108, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 121, (ii) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 123, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 153.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее последовательности (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2,In another aspect, the present invention provides an antibody comprising the sequences of (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2,

- 23 045931 содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 108; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 153.- 23 045931 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 108; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 121; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 123; and (f) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 153.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 110; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 110; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR выбраны из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 110, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122, (ii) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее последовательности (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising the sequences of (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 110; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 112; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 112; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain containing at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, ( ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 112, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128, (ii) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее последовательности :(а) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2,In another aspect, the present invention provides an antibody comprising the sequences: (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2,

- 24 045931 содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133.- 24 045931 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 112; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело включает (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 111; and (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 111; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO:133. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит последовательности (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3 содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:133. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises the sequences of (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 111, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128, (ii) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее последовательности (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising the sequences of (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 111; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело включает (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 112; and (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 112; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело включает (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 112, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129, (ii) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминоIn another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing amino

- 25 045931 кислотную последовательность SEQ ID NO: 112; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133.- 25 045931 acid sequence SEQ ID NO: 112; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 111; and (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 111; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR выбраны из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129, (ii) HVR-L2 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-L3 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 111, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129, (ii) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 109; и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело включает (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 109; и (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three VH HVR sequences selected from (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 109; and (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 109; and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело включает (a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130; (б) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (в) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 130; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises (a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 130; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 109, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; и (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, (ii) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 109, and (iii) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; and (b) a VL domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 130, (ii) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 133.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 109; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 109; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 130; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения любая одна или более аминокислот анти-CTLA-4 антитела, как указано выше, заменены в следующих положениях HVR:In some embodiments of the present invention, any one or more amino acids of the anti-CTLA-4 antibody as defined above are replaced at the following HVR positions:

- 26 045931 в HVR-H1 (SEQ ID NO: 223): положение 2, в HVR-H2 (SEQ ID NO: 224): положения 4, 5, 7, 13 и 16, в HVR-H3 (SEQ ID NO: 225): положение 3, в HVR-L1 (SEQ ID NO: 226): положения 1, 3, 6, 11,12 и 14, в HVR-L2 (SEQ ID NO: 227): положения 1, 3, 4 и 7, в HVR-L3 (SEQ ID NO: 228): положения 1 и 10.- 26 045931 in HVR-H1 (SEQ ID NO: 223): position 2, in HVR-H2 (SEQ ID NO: 224): positions 4, 5, 7, 13 and 16, in HVR-H3 (SEQ ID NO: 225): position 3, in HVR-L1 (SEQ ID NO: 226): positions 1, 3, 6, 11,12 and 14, in HVR-L2 (SEQ ID NO: 227): positions 1, 3, 4 and 7, in HVR-L3 (SEQ ID NO: 228): positions 1 and 10.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения замещения являются консервативными, согласно предусмотренному в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения любое одно или несколько замещений может быть выполнено в виде комбинации:In some embodiments of the present invention, the substitutions are conservative, as provided in the present invention. In some embodiments of the present invention, any one or more substitutions may be made as a combination:

в HVR-H1 (SEQ ID NO: 100): Н2А, R или K, в HVR-H2 (SEQ ID NO: 101): S4T; R5Q; G7H; D13E или R; K16R, в HVR-H3 (SEQ ID NO: 102): K3A, в HVR-L1 (SEQ ID NO: 113): T1D, Q или Е; Т3Р; D6G; NUT; Y12W; S14H, в HVR-L2 (SEQ ID NO: 114): E1F или Y; S3I; K4S; S7E или K, в HVR-L3 (SEQ ID NO: 115): S1Q; М10Т.in HVR-H1 (SEQ ID NO: 100): H2A, R or K, in HVR-H2 (SEQ ID NO: 101): S4T; R5Q; G7H; D13E or R; K16R, in HVR-H3 (SEQ ID NO: 102): K3A, in HVR-L1 (SEQ ID NO: 113): T1D, Q or E; T3P; D6G; NUT; Y12W; S14H, in HVR-L2 (SEQ ID NO: 114): E1F or Y; S3I; K4S; S7E or K, in HVR-L3 (SEQ ID NO: 115): S1Q; M10T.

Все возможные комбинации вышеуказанных замен охватываются консенсусными последовательностями SEQ ID NO: 223, 224, 225, 226, 227 и 228 для HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2, и HVR-L3 соответственно.All possible combinations of the above substitutions are covered by the consensus sequences SEQ ID NOs: 223, 224, 225, 226, 227 and 228 for HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2, and HVR-L3, respectively.

В любом из перечисленных выше вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело является гуманизированным. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело содержит области HVR, как в любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения, и дополнительно содержит акцепторный каркас человека, например, каркас иммуноглобулина человека или консенсусный каркас человека. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело содержит HVR, как в любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения, и дополнительно содержит VH или VL, содержащие последовательность FR. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело содержит последовательность (последовательности) FR вариабельного домена тяжелой цепи и/или легкой цепи, как указано ниже: для вариабельного домена тяжелой цепи FR1 содержит любую из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 229-232, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 233, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 234, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 235; и для вариабельного домена легкой цепи FR1 содержит любую из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 236-238, FR2 содержит любую из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 240-241, FR3 содержит любую из аминокислотных последовательностей последовательности SEQ ID NO: 242-244, FR4 содержит любую из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 245-246.In any of the above embodiments of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody is humanized. In one embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody comprises HVR regions as in any of the above embodiments of the present invention, and further comprises a human acceptor framework, such as a human immunoglobulin framework or a human consensus framework. In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody comprises an HVR as in any of the above embodiments of the present invention, and further comprises a VH or VL containing an FR sequence. In another embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody comprises the heavy chain and/or light chain variable domain FR sequence(s) as follows: for the heavy chain variable domain, FR1 comprises any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 229-232 FR2 contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 233, FR3 contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 234, FR4 contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 235; and for a light chain variable domain, FR1 contains any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 236-238, FR2 contains any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 240-241, FR3 contains any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 242-244, FR4 contains any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 245-246.

В другом объекте настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело содержит вариабельный домен тяжелой цепи (VH), которая по меньшей мере на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения последовательность VH по меньшей мере при идентичности 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% содержит замещения (например, консервативные замещения), инсерции или делеции относительно эталонной последовательности, но анти-CTLA-4 антитело, включающее такую последовательность, сохраняет способность связываться с CTLA-4. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения в совокупности от 1 до 10 аминокислот, до 11, до 12, до 13, до 14 или до 15 аминокислот заменены, инсертированы и/или делетированы в SEQ ID NO: 10. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения замещения, инсерции или делеции находятся вне HVR (т.е. в FR). Необязательно анти-CTLA-4 антитело содержит последовательность VH в SEQ ID NO: 10, включая посттрансляционные модификации этой последовательности. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения VH содержит одну, две или три области HVR, выбранные из: (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100, (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101, и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO:102. Посттрансляционные модификации включают, но не ограничиваются ими, модификацию глутамина или глутамата на N-конце тяжелой или легкой цепи в пироглутаминовую кислоту путем пироглутамилирования.In another aspect of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody contains a heavy chain variable domain (VH) that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical in amino acid sequence SEQ ID NO: 10. In some embodiments of the present invention, the VH sequence contains at least 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, or 99% identity, substitutions (e.g., conservative substitutions), insertions, or deletions relative to the reference sequence, but an anti-CTLA-4 antibody incorporating such a sequence retains the ability to bind CTLA-4. In certain embodiments of the present invention, a total of 1 to 10 amino acids, up to 11, up to 12, up to 13, up to 14, or up to 15 amino acids are substituted, inserted, and/or deleted in SEQ ID NO: 10. In certain embodiments of the present invention, the substitutions , insertions or deletions are outside the HVR (i.e., in the FR). Optionally, the anti-CTLA-4 antibody contains the VH sequence of SEQ ID NO: 10, including post-translational modifications of this sequence. In one embodiment of the present invention, the VH contains one, two or three HVR regions selected from: (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 100, (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 101, and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:102. Post-translational modifications include, but are not limited to, modification of glutamine or glutamate at the N-terminus of the heavy or light chain to pyroglutamic acid by pyroglutamylation.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают анти-CTLA-4 антитело, которое содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), последовательность которого по меньшей мере на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 11. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения последовательность VL, которая по меньшей мере на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентична, содержит замены (например, консервативные замещения), инсерции или делеции относительно эталонной последовательности, но антиCTLA-4 антитело, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с CTLA-4. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения в совокупности от 1 до 10 аминокисIn another aspect, the present invention provides an anti-CTLA-4 antibody that contains a light chain variable domain (VL) whose sequence is at least 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, or 100 % identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11. In certain embodiments of the present invention, a VL sequence that is at least 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, or 99% identical contains substitutions (e.g. , conservative substitutions), insertions or deletions relative to the reference sequence, but an anti-CTLA-4 antibody containing this sequence retains the ability to bind CTLA-4. In certain embodiments of the present invention, a total of 1 to 10 amino acids

- 27 045931 лот, до 11, до 12, до 13, до 14 или до 15 аминокислот заменены, инсертированы и/или делетированы в SEQ ID NO: 11. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения замещения, инсерции или делеции находятся вне HVR (т.е. в FR). Необязательно анти-CTLA-4 антитело содержит последовательность VL в SEQ ID NO: 11, включая посттрансляционные модификации этой последовательности. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения VL содержит одну, две или три области HVR, выбранные из: (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100, (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101, и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO:102. Посттрансляционные модификации включают, но не ограничиваются ими, модификацию глутамина или глутамата на N-конце тяжелой или легкой цепи в пироглутаминовую кислоту путем пироглутамилирования.- 27 045931 lot, up to 11, up to 12, up to 13, up to 14 or up to 15 amino acids are substituted, inserted and/or deleted in SEQ ID NO: 11. In certain embodiments of the present invention, the substitutions, insertions or deletions are outside the HVR (i.e. ie in FR). Optionally, the anti-CTLA-4 antibody contains the VL sequence of SEQ ID NO: 11, including post-translational modifications of this sequence. In one embodiment of the present invention, the VL contains one, two or three HVR regions selected from: (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 100, (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 101, and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:102. Post-translational modifications include, but are not limited to, modification of glutamine or glutamate at the N-terminus of the heavy or light chain to pyroglutamic acid by pyroglutamylation.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают анти-CTLA-4 антитело, которое содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), последовательность которого по меньшей мере на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 149. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения VL, которая по меньшей мере на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентична, содержит замены (например, консервативные замещения), инсерции или делеции относительно эталонной последовательности, но анти-CTLA-4 антитело, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с CTLA-4. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения в совокупности от 1 до 10 аминокислот, до 11, до 12, до 13, до 14 или до 15 аминокислот заменены, инсертированы и/или делетированы в SEQ ID NO: 149. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения замещения, инсерции или делеции находятся вне HVR (т.е. в FR). Необязательно αнти-CTLA-4 антитело содержит VL в SEQ ID NO: 149, включая посттрансляционные модификации этой последовательности. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения VL содержит одну, две или три области HVR, выбранные из: (a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130, (б) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117, и (в) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO:133. Посттрансляционные модификации включают, но не ограничиваются ими, модификацию глутамина или глутамата на N-конце тяжелой или легкой цепи в пироглутаминовую кислоту путем пироглутамилирования.In another aspect, the present invention provides an anti-CTLA-4 antibody that contains a light chain variable domain (VL) whose sequence is at least 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, or 100 % identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 149. In some embodiments of the present invention, a VL that is at least 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, or 99% identical contains substitutions (e.g., conservative substitutions), insertions or deletions relative to the reference sequence, but an anti-CTLA-4 antibody containing this sequence retains the ability to bind CTLA-4. In certain embodiments of the present invention, a total of 1 to 10 amino acids, up to 11, up to 12, up to 13, up to 14, or up to 15 amino acids are substituted, inserted, and/or deleted in SEQ ID NO: 149. In certain embodiments of the present invention, the substitutions , insertions or deletions are outside the HVR (i.e., in the FR). Optionally, the αanti-CTLA-4 antibody contains VL in SEQ ID NO: 149, including post-translational modifications of this sequence. In one embodiment of the present invention, the VL contains one, two or three HVR regions selected from: (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 130, (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 117, and (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:133. Post-translational modifications include, but are not limited to, modification of glutamine or glutamate at the N-terminus of the heavy or light chain to pyroglutamic acid by pyroglutamylation.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают анти-CTLA-4 антитело, которое содержит VH, как в любом из вариантов осуществления настоящего изобретения, представленных выше, и VL, как в любом из вариантов осуществления настоящего изобретения, представленных выше. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 10 и SEQ ID NO: 11, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 98 и SEQ ID NO: 99, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 83 и SEQ ID NO: 97, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 86 и SEQ ID NO: 134, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 136 и SEQ ID NO: 95, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 140 и SEQ ID NO: 146, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 141 и SEQ ID NO: 146, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 140 и SEQ ID NO: 147, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 141 и SEQ ID NO: 147, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 136 и SEQ ID NO: 149 соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В еще одном объекте настоящего изобретения предусматривают гетеромерное анти-CTLA-4 антитело, которое антитело содержит по меньшей мере две разные вариабельные области, выбранные из вариабельных областей, содержащих последовательности VH и VL, представленные выше. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 140 и SEQ ID NO: 146, соответственно, и VH и VL в SEQ ID NO: 141 и SEQ ID NO: 146, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело содержит VH и VL в SEQ ID NO: 140 и SEQ ID NO: 147, соответственно, и VH и VL в SEQ ID NO: 141 и SEQ ID NO: 147, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. Посттрансляционные модификации включают, но не ограничиваются ими, модификацию глутамина или глутамата на N-конце тяжелой или легкой цепи в пироглутаминовую кислотуIn another aspect, the present invention provides an anti-CTLA-4 antibody that contains VH, as in any of the embodiments of the present invention presented above, and VL, as in any of the embodiments of the present invention presented above. In one embodiment, the antibody contains VH and VL in SEQ ID NO: 10 and SEQ ID NO: 11, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody contains VH and VL in SEQ ID NO: 98 and SEQ ID NO: 99, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody contains VH and VL in SEQ ID NO: 83 and SEQ ID NO: 97, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody contains VH and VL in SEQ ID NO: 86 and SEQ ID NO: 134, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody comprises VH and VL in SEQ ID NO: 136 and SEQ ID NO: 95, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody comprises VH and VL in SEQ ID NO: 140 and SEQ ID NO: 146, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody comprises VH and VL in SEQ ID NO: 141 and SEQ ID NO: 146, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody comprises VH and VL in SEQ ID NO: 140 and SEQ ID NO: 147, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody comprises VH and VL in SEQ ID NO: 141 and SEQ ID NO: 147, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment, the antibody contains VH and VL in SEQ ID NO: 136 and SEQ ID NO: 149, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In another aspect, the present invention provides a heteromeric anti-CTLA-4 antibody, which antibody contains at least two different variable regions selected from the variable regions containing the VH and VL sequences presented above. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises VH and VL in SEQ ID NO: 140 and SEQ ID NO: 146, respectively, and VH and VL in SEQ ID NO: 141 and SEQ ID NO: 146, respectively, including post-translational modifications of these sequences. In one embodiment of the present invention, the antibody comprises VH and VL in SEQ ID NO: 140 and SEQ ID NO: 147, respectively, and VH and VL in SEQ ID NO: 141 and SEQ ID NO: 147, respectively, including post-translational modifications of these sequences. Post-translational modifications include, but are not limited to, modification of glutamine or glutamate at the N-terminus of the heavy or light chain to pyroglutamic acid

- 28 045931 путем пироглутамилирования.- 28 045931 by pyroglutamylation.

Когда аминокислота на N-конце тяжелой цепи или легкой цепи анти-СТЬА-4 антитела, предусмотренного в настоящем изобретении, представляет собой глутамин, эта аминокислота может быть заменена глутаматом. Когда аминокислота на N-конце тяжелой цепи или легкой цепи анти-CTLA-4 антитела, предусмотренного в настоящем изобретении, является глутаматом, эта аминокислота может быть заменена глутамином.When the amino acid at the N-terminus of the heavy chain or light chain of the anti-CTA-4 antibody provided in the present invention is glutamine, this amino acid can be replaced by glutamate. When the amino acid at the N-terminus of the heavy chain or light chain of the anti-CTLA-4 antibody provided in the present invention is glutamate, this amino acid can be replaced by glutamine.

В другом объекте настоящего изобретения предусматривают антитело, включающее такой же эпитоп, что и у анти-CTLA-4 антитела, предусмотренного в настоящем изобретении. Например, в некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и любое из антител, перечисленных в табл. 4, табл. 9, табл. 14 и табл. 19. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают антитело, которое связывается с эпитопом в пределах фрагмента CTLA-4, содержащего по меньшей мере одну аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из аминокислот в положении 3 (Met), положении 33 (Glu), положении 35 (Arg), положении 53 (Thr), положении 97 (Glu), положении 99 (Met), положении 100 (Tyr), положении 101 (Pro), положении 102 (Pro), положении 103 (Pro), положении 104 (Tyr), положении 105 (Tyr) и положение 106 (Leu) SEQ ID NO: 28. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают антитело, которое связывается с эпитопом в пределах фрагмента CTLA-4, состоящего из аминокислот от положения от 97 (Glu) до положения 106 (Leu) в последовательности SEQ ID NO: 28. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают антитело, которое связывается с эпитопом в пределах фрагмента CTLA-4, состоящего из аминокислот от положения от 99 (Met) до положения 106 (Leu) в последовательности SEQ ID NO: 28.In another aspect, the present invention provides an antibody comprising the same epitope as the anti-CTLA-4 antibody of the present invention. For example, in some embodiments, the present invention provides an antibody that binds to the same epitope as any of the antibodies listed in table. 4, table. 9, table. 14 and table. 19. In some embodiments, the present invention provides an antibody that binds to an epitope within a fragment of CTLA-4 containing at least one amino acid selected from the group consisting of amino acids at position 3 (Met), position 33 (Glu), position 35 (Arg), position 53 (Thr), position 97 (Glu), position 99 (Met), position 100 (Tyr), position 101 (Pro), position 102 (Pro), position 103 (Pro), position 104 ( Tyr), position 105 (Tyr) and position 106 (Leu) SEQ ID NO: 28. In some embodiments, the present invention provides an antibody that binds to an epitope within a fragment of CTLA-4 consisting of amino acids from position 97 (Glu) to position 106 (Leu) in the sequence SEQ ID NO: 28. In some embodiments, the present invention provides an antibody that binds to an epitope within a fragment of CTLA-4 consisting of amino acids from position 99 (Met) to position 106 (Leu) in the sequence SEQ ID NO: 28.

В еще одном объекте настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело в соответствии с любым из приведенных выше вариантов осуществления настоящего изобретения представляет собой моноклональное антитело, включая химерное, гуманизированное или антитело человека. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антитело против CTLA-4 представляет собой фрагмент антитела, например, фрагмент Fv, Fab, Fab', scFv, диатело или фрагмент F(ab')2. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антитело представляет собой антитело полной длины, например, интактное антитело IgG1, интактное антитело IgG4 или антитело другого класса или изотипа по настоящему изобретению.In yet another aspect of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody in accordance with any of the above embodiments of the present invention is a monoclonal antibody, including a chimeric, humanized or human antibody. In one embodiment of the present invention, the anti-CTLA-4 antibody is an antibody fragment, for example, an Fv fragment, Fab, Fab', scFv, diabody or F(ab')2 fragment. In another embodiment of the present invention, the antibody is a full length antibody, for example, an intact IgG1 antibody, an intact IgG4 antibody, or an antibody of another class or isotype of the present invention.

В другом объекте настоящего изобретения ηη^^^ΑΜ антитела по настоящему изобретению содержат константные области. Константные области могут представлять собой константные области тяжелой цепи (включая Fc-области), константные области легкой цепи или и то, и другое. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения Fc-область является нативной. Примеры константных областей тяжелой цепи, полученных из нативных антител, могут включать, например, константные области тяжелой цепи, такие как IgG1 человека (SEQ ID NO: 249), IgG2 человека (SEQ ID NO: 250), IgG3 человека (SEQ ID NO: 251) и IgG4 человека (SEQ ID NO: 252). Кроме того, в других примерах константные области тяжелой цепи могут включать константные области тяжелой цепи SEQ ID NO: 82 и 158. Примеры константных областей легкой цепи, полученных из нативных антител, могут включать, например, константные области легкой цепи, такие как κ-цепь человека (SEQ ID NOs : 33, 63 и 159) и λ-цепи человека (SEQ ID NO: 53 и 87).In another aspect of the present invention, the antibodies of the present invention contain constant regions. The constant regions may be heavy chain constant regions (including Fc regions), light chain constant regions, or both. In some embodiments of the present invention, the Fc region is native. Examples of heavy chain constant regions derived from native antibodies may include, for example, heavy chain constant regions such as human IgG1 (SEQ ID NO: 249), human IgG2 (SEQ ID NO: 250), human IgG3 (SEQ ID NO: 251) and human IgG4 (SEQ ID NO: 252). Additionally, in other examples, heavy chain constant regions may include heavy chain constant regions of SEQ ID NOs: 82 and 158. Examples of light chain constant regions derived from native antibodies may include, for example, light chain constant regions such as the κ chain human (SEQ ID NOs: 33, 63 and 159) and human λ chain (SEQ ID NOs: 53 and 87).

В другом варианте осуществления настоящего изобретения вариант Fc-области представляет собой вариант Fc-области, полученной путем добавления аминокислотных изменений к Fc-области нативной последовательности. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вариант Fc-области имеет повышенную связывающую активность по меньшей мере с одним рецептором Fcy, выбранным из группы, состоящей из FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb и FcYRIIIa, по сравнению с Fc-областью нативной последовательности. В других вариантах осуществления настоящего изобретения вариант Fc-области имеет повышенную связывающую активность с FcYRIIa и FcYRIIIa по сравнению с Fc-областью нативной последовательности. Примеры константных областей тяжелой цепи, содержащих такой вариант Fcобласти, включают, например, константные области тяжелой цепи, перечисленные в табл. 26-30, и константные области тяжелой цепи SEQ ID NO: 31, 32, 41-46, 65, 66, 81, 207, 239, 253-271, 276, 277 и 278.In another embodiment of the present invention, the variant Fc region is a variant Fc region obtained by adding amino acid changes to the Fc region of the native sequence. In some embodiments of the present invention, the variant Fc region has increased binding activity to at least one Fcy receptor selected from the group consisting of FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb and FcYRIIIa, compared to the Fc region of the native sequence. In other embodiments of the present invention, the variant Fc region has increased binding activity to FcYRIIa and FcYRIIIa compared to the native sequence Fc region. Examples of heavy chain constant regions containing such a variant Fc region include, for example, the heavy chain constant regions listed in Table 1. 26-30, and heavy chain constant regions SEQ ID NOs: 31, 32, 41-46, 65, 66, 81, 207, 239, 253-271, 276, 277 and 278.

Fc-область нативной последовательности обычно состоит из гомодимера, состоящего из двух идентичных полипептидных цепей. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вариант Fc-области может быть гомодимером, состоящим из полипептидных цепей с той же последовательностью, или гетеродимером, состоящим из полипептидных цепей, отличающимися друг от друга. Аналогичным образом константные области тяжелой цепи, содержащие Fc-область, могут быть гомодимерными и состоять из полипептидных цепей с одинаковыми последовательностями, или гетеродимерами, состоящими из полипептидных цепей с отличающимися друг от друга последовательностями. Примеры константных областей гетеромерной тяжелой цепи включают, например, константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 31 и 32; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 43 и 44; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 45 и 46; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидныеThe native sequence Fc region typically consists of a homodimer consisting of two identical polypeptide chains. In some embodiments of the present invention, the Fc region variant may be a homodimer consisting of polypeptide chains with the same sequence, or a heterodimer consisting of polypeptide chains different from each other. Likewise, heavy chain constant regions containing the Fc region can be homodimeric, consisting of polypeptide chains with the same sequence, or heterodimeric, consisting of polypeptide chains with different sequences. Examples of heteromeric heavy chain constant regions include, for example, heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 31 and 32; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 43 and 44; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 45 and 46; heavy chain constant regions containing polypeptide

- 29 045931 цепи SEQ ID NO: 254 и 256; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 257 и 258; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 259 и 260; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 261 и 263; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 262 и 264; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 265 и 267; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 266 и 268; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 269 и 270; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 271 и 81; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 65 и 66; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 239 и 207; константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 259 и 276; и константные области тяжелой цепи, содержащие полипептидные цепи SEQ ID NO: 65 и 278.- 29 045931 chains SEQ ID NO: 254 and 256; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 257 and 258; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 259 and 260; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 261 and 263; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 262 and 264; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 265 and 267; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 266 and 268; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 269 and 270; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 271 and 81; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 65 and 66; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 239 and 207; heavy chain constant regions containing polypeptide chains of SEQ ID NOs: 259 and 276; and heavy chain constant regions containing the polypeptide chains of SEQ ID NOs: 65 and 278.

В другом объекте анти-CTLA-4 антитело в соответствии с любым из приведенных выше вариантов осуществления настоящего изобретения может включать любые признаки, по отдельности или в комбинации, как описано в разделах 1-7 ниже.In another aspect, an anti-CTLA-4 antibody in accordance with any of the above embodiments of the present invention may include any of the features, alone or in combination, as described in sections 1-7 below.

1. Связывающая активность антитела.1. Antibody binding activity.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения с, предусмотренная в настоящем изобретении, представлена константой диссоциации (KD), равной 10 мкМ или менее, 1 мкМ или менее, 100 нМ или менее, 10 нМ или менее, 1 нМ или менее, 0,1 нМ или менее, 0,01 нМ или менее или 0,001 нМ или менее (например, 10-8М или менее, например, от 10-8М до 10-13 М, например, от 10-9 до 10-13 М).In some embodiments of the present invention, c as provided in the present invention is represented by a dissociation constant (KD) of 10 μM or less, 1 μM or less, 100 nM or less, 10 nM or less, 1 nM or less, 0.1 nM or less, 0.01 nM or less, or 0.001 nM or less (eg, 10-8M or less, eg, 10-8M to 10-13M , eg, 10-9 to 10-13M ).

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающую активность определяют путем анализа с применением радиоактивно-меченого антигена (RIA - radiolabeled antigen binding assay). В еще одном из вариантов осуществления настоящего изобретения RIA проводят с версией Fab исследуемого антитела и его антигена. Например, аффинность связывания Fab в растворе с антигеном измеряют путем уравновешивания Fab с минимальной концентрацией (|:5[)-меченого антигена в присутствии серии титрования немеченого антигена, а затем захвата связанного антигена с помощью планшета, покрытого анти-Fab антителом (см., например, Chen с соавт., J. Mol. Biol. 1999, 293: 865-881). Чтобы определить условия для анализа, мультилуночные планшеты MICROTITER (зарегистрированная торговая марка) (фирма Thermo Scientific) покрывают в течение ночи 5 мкг/мл захватывающего анти-Fab антитела (фирма Cappel Labs) в 50 мМ карбонате натрия (рН 9,6) и затем блокируют 2% (масса/объем) бычьего сывороточного альбумина (БСА) в фосфатно-солевом буфере (TBS) в течение двух-пяти часов при комнатной температуре (приблизительно 23°С). В планшете без адсорбции (фирма Nunc, номер в каталоге 269620) 100 пМ или 26 пМ [^Ц-антигена смешивают с серийными разведениями исследуемого Fab (например, в соответствии с оценкой анти-VEGF-антитела, Fab-12, в публикации Presta с соавт., Cancer Res. 1997, 57: 4593-4599). Затем исследуемый Fab инкубируют в течение ночи; однако инкубация может продолжаться в течение более длительного периода (например, около 65 ч), чтобы обеспечить достижение равновесия. После этого смеси переносят на планшет для захвата для инкубации при комнатной температуре (например, в течение одного часа). Затем раствор удаляют, и планшет восемь раз промывают 0,1% полисорбатом 20 (TWEEN-20 (зарегистрированная торговая марка)) в TBS. Когда планшеты высохнут, добавляют 150 мкл/лунку сцинтиллятора (MICROSCINT-20TM; фирма Packard) и планшеты подсчитывают на гамма-счетчике TOPCOUNTTM (фирма Packard) в течение десяти минут. Концентрации каждого Fab, дающие меньше или равную 20% от максимального связывания, выбирают для использования в анализах конкурентного связывания.In one embodiment of the present invention, binding activity is determined by a radiolabeled antigen binding assay (RIA). In yet another embodiment of the present invention, the RIA is performed with a Fab version of the test antibody and its antigen. For example, the binding affinity of a Fab in solution to an antigen is measured by equilibrating the Fab with a minimal concentration of ( |: 5[)-labeled antigen in the presence of a titration series of unlabeled antigen, and then capturing the bound antigen using a plate coated with anti-Fab antibody (see, for example, Chen et al., J Mol Biol 1999, 293: 865-881). To determine assay conditions, MICROTITER (registered trademark) multiwell plates (Thermo Scientific) are coated overnight with 5 μg/ml anti-Fab capture antibody (Capel Labs) in 50 mM sodium carbonate (pH 9.6) and then block with 2% (w/v) bovine serum albumin (BSA) in phosphate-buffered saline (TBS) for two to five hours at room temperature (approximately 23°C). In a non-adsorption plate (Nunc, catalog no. 269620), 100 pM or 26 pM [IgC antigen is mixed with serial dilutions of the test Fab (for example, according to the evaluation of the anti-VEGF antibody, Fab-12, in the Presta publication with et al., Cancer Res. 1997, 57: 4593-4599). The Fab of interest is then incubated overnight; however, incubation may be continued for a longer period (eg, about 65 hours) to ensure equilibrium is achieved. The mixtures are then transferred to a capture plate for incubation at room temperature (eg, one hour). The solution is then removed and the plate is washed eight times with 0.1% polysorbate 20 (TWEEN-20 (registered trademark)) in TBS. When the plates are dry, 150 μl/well of scintillator (MICROSCINT-20TM; Packard) is added and the plates are counted on a TOPCOUNTTM gamma counter (Packard) for ten minutes. Concentrations of each Fab producing less than or equal to 20% of maximum binding were selected for use in competitive binding assays.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающую активность антитела измеряют с помощью анализа захвата лиганда с использованием метода поверхностного плазмонного резонанса в качестве принципа измерения, например, с помощью BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200 или BIACORE (зарегистрированная торговая марка) 4000 (фирма GE Healthcare, Уппсала, Швеция). Программное обеспечение BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Control Software используется для работы устройства. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения применяют комплект для соединения аминов (фирма GE Healthcare, Уппсала, Швеция) в соответствии с инструкцией поставщика, а сенсорный чип, покрытый карбоксиметилдекстраном (фирма GE Healthcare, Уппсала, Швеция), иммобилизуют с молекулой для захвата лиганда, например, антителом против метки (анти-tag антителом, антителом против IgG и белком А). Молекулу для захвата лиганда разбавляют 10 мМ раствором ацетата натрия при соответствующем рН и вводят с соответствующими скоростью потока и временем введения. Анализ активности связывания проводят с использованием буфера, содержащего 0,05% полисорбата 20 (другое название - TWEEN (зарегистрированный товарный знак)-20) в качестве буфера для анализа, при скорости потока от 10 до 30 мкл/мин и при температуре анализа предпочтительно 25°С или 37°С. Когда проводят анализ, позволяя молекуле для захвата лиганда захватить антитело в качестве лиганда, серийное разведение антигена или Fc рецептора, приготовленного с буфером для анализа (аналита), вводят после захвата целевого количества антитела путем инъекции антитела. Когда анализ проводят, позволяя молекуле для захвата лиганда захватить антиген или Fc рецептор в качестве лиIn one embodiment of the present invention, the binding activity of an antibody is measured using a ligand capture assay using surface plasmon resonance as the measurement principle, for example, using BIACORE (registered trademark) T200 or BIACORE (registered trademark) 4000 (GE Healthcare , Uppsala, Sweden). BIACORE (registered trademark) Control Software is used to operate the device. In one embodiment of the present invention, an amine coupling kit (GE Healthcare, Uppsala, Sweden) is used according to the supplier's instructions, and a carboxymethyldextran-coated sensor chip (GE Healthcare, Uppsala, Sweden) is immobilized with the ligand capture molecule, for example, anti-tag antibody (anti-tag antibody, anti-IgG antibody and protein A). The ligand capture molecule is diluted with 10 mM sodium acetate solution at the appropriate pH and administered at the appropriate flow rate and injection time. The binding activity assay is carried out using a buffer containing 0.05% polysorbate 20 (also known as TWEEN (registered trademark)-20) as assay buffer, at a flow rate of 10 to 30 µl/min and at an assay temperature of preferably 25 °C or 37°C. When an assay is performed by allowing the ligand capture molecule to capture the antibody as a ligand, a serial dilution of the antigen or Fc receptor prepared with assay buffer (analyte) is administered after the target amount of antibody has been captured by antibody injection. When the assay is performed by allowing the ligand capture molecule to capture the antigen or Fc receptor as a

- 30 045931 ганда, серийное разведение антитела, приготовленного с буфером для анализа (аналита), вводят после захвата целевого количества антигена или рецептора Fc путем инъекции, антиген или рецептор Fc.- 30 045931 ganda, a serial dilution of an antibody prepared with an assay buffer (analyte) is administered after capturing the target amount of antigen or Fc receptor by injection, antigen or Fc receptor.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения результаты анализируют с использованием программного обеспечения для оценки BIACORE (зарегистрированная торговая марка). Параметры кинетики рассчитываются путем одновременной подгонки сенсограмм связывания и диссоциации с использованием модели связывания 1:1, что позволяет рассчитать скорость связывания (kon или ka), скорость диссоциации (koff или kd) и равновесную константу диссоциации (KD). Когда связывающая активность слабая, особенно когда диссоциация быстрая и трудно рассчитать кинетические параметры, равновесную константу диссоциации (KD) можно рассчитать с использованием модели стационарного состояния. В качестве другого параметра связывающей активности можно рассчитать количество связывания аналита на единицу количества лиганда путем деления количества связывания аналита при определенной концентрации (RU) на количество захваченного лиганда (RU).In one embodiment of the present invention, the results are analyzed using evaluation software BIACORE (registered trademark). Kinetic parameters are calculated by simultaneously fitting binding and dissociation sensorgrams using a 1:1 binding model, allowing the calculation of the binding rate (kon or ka), dissociation rate (koff or kd) and the equilibrium dissociation constant (KD). When binding activity is weak, especially when dissociation is fast and kinetic parameters are difficult to calculate, the equilibrium dissociation constant (KD) can be calculated using a steady state model. As another parameter of binding activity, the amount of analyte binding per unit amount of ligand can be calculated by dividing the amount of analyte binding at a particular concentration (RU) by the amount of ligand captured (RU).

2. Фрагменты антитела.2. Antibody fragments.

В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения предусмотренное антитело является фрагментом антитела. К фрагментам антитела относятся, но ими перечень не ограничивается, фрагменты Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, Fv и scFv, а также другие фрагменты, описанные ниже. Обзор определенных фрагментов изложен в публикации Hudson с соавт., Nat. Med. 2003, 9:129-134. Для обзора фрагментов scFv, см., например, Pluckthiin в кн.: The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, под ред. Rosenburg и Moore, (изд-во Springer-Verlag, Нью-Йорк), 1994, т. 113:269-315; см. также WO 93/16185 и US 5571894 и US 5587458. Для обсуждения фрагментов Fab и F(ab')2, содержащих остатки эпитопа, связывающего рецептор спасения, и имеющих повышенный период полужизни in vivo, см. US 5869046.In certain embodiments of the present invention, the provided antibody is an antibody fragment. Antibody fragments include, but are not limited to, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab') 2 , Fv and scFv fragments, as well as other fragments described below. A review of certain passages is provided in Hudson et al., Nat. Med. 2003, 9:129-134. For a review of scFv fragments, see, for example, Pluckthiin in: The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, ed. Rosenburg and Moore, (Springer-Verlag, New York), 1994, vol. 113:269-315; see also WO 93/16185 and US 5571894 and US 5587458. For a discussion of Fab and F(ab') 2 fragments containing salvage receptor binding epitope residues and having an increased half-life in vivo, see US 5869046.

Диатела представляют собой фрагменты антител с двумя сайтами связывания антигена, которые могут быть бивалентными или биспецифичными. См., например, ЕР 404097; WO 1993/01161; Hudson с соавт., Nat. Med. 2003, 9: 129-134; Hollinger с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90: 6444-6448. Тритела и тетратела также описаны в работе Hudson с соавт., Nat. Med. 2003, 9: 129-134.Diabodies are antibody fragments with two antigen binding sites that can be bivalent or bispecific. See, for example, EP 404097; WO 1993/01161; Hudson et al., Nat. Med. 2003, 9: 129-134; Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90: 6444-6448. Tribodies and tetrabodies are also described in Hudson et al., Nat. Med. 2003, 9: 129-134.

Однодоменные антитела представляют собой фрагменты антител, содержащие весь или часть вариабельного домена тяжелой цепи или весь или часть вариабельного домена легкой цепи антитела. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения однодоменное антитело представляет собой однодоменное антитело человека (фирма Domantis, Inc., Уолтем, Массачусетс; см., например, US 6248516 В1).Single domain antibodies are antibody fragments containing all or part of the heavy chain variable domain or all or part of the light chain variable domain of the antibody. In certain embodiments of the present invention, the single domain antibody is a human single domain antibody (Domantis, Inc., Waltham, Mass.; see, for example, US 6,248,516 B1).

Фрагменты антител могут быть получены различными способами, включая, но не ограничиваясь ими, протеолитическое расщепление интактного антитела, а также продуцирование рекомбинантными клетками-хозяевами (например, Е. coli или фагом), как описано в настоящем описании.Antibody fragments can be produced by a variety of methods, including, but not limited to, proteolytic cleavage of the intact antibody, as well as production by recombinant host cells (eg, E. coli or phage), as described herein.

3. Химерные и гуманизированные антитела.3. Chimeric and humanized antibodies.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматриваемое антитело является химерным антителом. Определенные химерные антитела описаны, например, в US 4816567; и Morrison с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1984, 81: 6851-6855. В одном из примеров химерное антитело содержит вариабельную область, отличную от области человека (например, вариабельную область, полученную от мыши, крысы, хомяка, кролика или примата, например, обезьяны) и константную область человека. В другом примере химерное антитело представляет собой антитело переключенного класса, в котором класс или подкласс был изменен по сравнению с классом или подклассом родительского антитела. Химерные антитела включают их антиген-связывающие фрагменты.In some embodiments of the present invention, the antibody provided is a chimeric antibody. Certain chimeric antibodies are described, for example, in US 4816567; and Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1984, 81: 6851-6855. In one example, a chimeric antibody comprises a non-human variable region (eg, a variable region derived from a mouse, rat, hamster, rabbit, or primate, such as a monkey) and a human constant region. In another example, a chimeric antibody is a class switched antibody in which the class or subclass has been changed from the class or subclass of the parent antibody. Chimeric antibodies include their antigen-binding fragments.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения химерное антитело представляет собой гуманизированное антитело. Как правило, антитело, полученное не от человека, гуманизируют для снижения иммуногенности для человека, сохраняя при этом специфичность и аффинность родительского антитела, полученного не от человека. Как правило, гуманизированное антитело содержит один или более вариабельных доменов, в которых HVR, например, CDR (или их части) получены из антитела, полученного не от человека, a FR (или их части) получены из последовательностей антитела человека. Гуманизированное антитело необязательно также будет содержать по меньшей мере часть константной области человека. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения некоторые остатки FR в гуманизированном антителе заменены соответствующими остатками антитела, полученного не от человека, (например, антитела, из которого получены остатки HVR), например, для восстановления или улучшения специфичности или аффинности антитела.In some embodiments of the present invention, the chimeric antibody is a humanized antibody. Typically, a non-human antibody is humanized to reduce immunogenicity in humans while maintaining the specificity and affinity of the parent non-human antibody. Typically, a humanized antibody contains one or more variable domains in which the HVRs, eg, CDRs (or portions thereof) are derived from a non-human antibody, and the FRs (or portions thereof) are derived from human antibody sequences. The humanized antibody will also optionally contain at least a portion of the human constant region. In some embodiments of the present invention, certain FR residues in a humanized antibody are replaced with corresponding residues of a non-human antibody (eg, an antibody from which the HVR residues are derived), for example, to restore or improve the specificity or affinity of the antibody.

Гуманизированные антитела и способы их получения рассматриваются, например, в работах Almagro и Fransson, Front. Biosci. 2008, 13:1619-1633; Riechmann с соавт., Nature 1988, 332: 323-329; Queen с соавт., Proc. NatlAcad. Sci. USA 1989, 86:10029-10033; US 5821337, US 7527791, US 6982321 и US 7087409; Kashmiri с соавт., Methods 2005? 36:25-34 (описание внедрения области, определяющей специфичность (SDR)); Padlan, Mol. Immunol. 1991, 28:489-498 (описание обновления); Dall'Acqua с соавт., Methods, 2005, 36:43-60 (описание перетасовки FR); Osbourn с соавт., Methods, 2005, 36:61-68; Klimka с соавт., Br. J. Cancer, 2000, 83:252-260 (описание подхода направленной селекции для перетасовки FR).Humanized antibodies and methods for their production are discussed, for example, in the works of Almagro and Fransson, Front. Biosci. 2008, 13:1619-1633; Riechmann et al., Nature 1988, 332: 323-329; Queen et al., Proc. NatlAcad. Sci. USA 1989, 86:10029-10033; US 5821337, US 7527791, US 6982321 and US 7087409; Kashmiri et al., Methods 2005? 36:25-34 (describing the implementation of the specificity determining region (SDR)); Padlan, Mol. Immunol. 1991, 28:489-498 (update description); Dall'Acqua et al., Methods, 2005, 36:43-60 (describing FR shuffling); Osbourn et al., Methods, 2005, 36:61-68; Klimka et al., Br. J Cancer 2000, 83:252-260 (describing a directed selection approach for FR shuffling).

Каркасные области человека, которые можно использовать для гуманизации, включают, но не ограничиваются ими: каркасные области, выбранные с использованием метода наилучшего соответствияHuman wireframes that can be used for humanization include, but are not limited to: wireframes selected using the best fit method

- 31 045931 (см., например, Sims с соавт., J. Immunol. 1993, 151:2296); каркасные области, полученные из консенсусной последовательности антител человека конкретной подгруппы вариабельных областей легкой или тяжелой цепи (см., например, Carter с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992, 89:4285; Presta с соавт., J. Immunol, 151: 2623 (1993)); зрелые (соматически мутированные) каркасные области человека или каркасные области зародышевой линии человека (см., например, Almagro и Fransson, Front. Biosci. 2008, 13:1619-1633); каркасные области, полученные в результате скрининга библиотек FR (см., например, Васа с соавт., J. Biol. Chem. 1997, 272:10678-10684; Rosok с соавт., J. Biol. Chem. 1996, 271:22611-22618).- 31 045931 (see, for example, Sims et al., J. Immunol. 1993, 151:2296); framework regions derived from a human antibody consensus sequence of a particular subset of light or heavy chain variable regions (see, for example, Carter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992, 89:4285; Presta et al., J Immunol, 151: 2623 (1993)); mature (somatically mutated) human or germline human frameworks (see, for example, Almagro and Fransson, Front. Biosci. 2008, 13:1619-1633); framework regions obtained from screening FR libraries (see, for example, Vasa et al., J. Biol. Chem. 1997, 272:10678-10684; Rosok et al., J. Biol. Chem. 1996, 271:22611 -22618).

4. Антитела человека.4. Human antibodies.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусмотренное антитело является антителом человека. Антитела человека могут быть получены с использованием различных методов, известных в данной области. Антитела человека в общем описаны в публикациях van Dijk и van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 2001, 5: 368-374; и Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 2008, 20:450-459.In some embodiments of the present invention, the antibody provided is a human antibody. Human antibodies can be obtained using various methods known in the art. Human antibodies are generally described in the publications of van Dijk and van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 2001, 5: 368-374; and Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 2008, 20:450-459.

Антитела человека могут быть получены путем введения иммуногена трансгенному животному, которое было модифицировано для получения интактных антител человека или интактных антител с вариабельными областями человека в ответ на антигенную стимуляцию. Такие животные обычно содержат все или часть локусов иммуноглобулинов человека, которые заменяют эндогенные локусы иммуноглобулинов, или которые присутствуют внехромосомно или случайным образом интегрированы в хромосомы животного. У таких трансгенных мышей локусы эндогенного иммуноглобулина обычно инактивированы. Для обзора методов получения антител человека от трансгенных животных см. Lonberg, Nat. Biotech. 2005, 23: 1117-1125. См. также, например, патенты US 6075181 и US 6150584, в которых описана технология XENOMOUSE™; US 5770429, описывающую технологию HuMab (зарегистрированная торговая марка); US 7041870 описывает технологию K-М MOUSE (зарегистрированная торговая марка) и US 2007/0061900 описывает технологию VelociMouse (зарегистрированная торговая марка). Вариабельные области человека из интактных антител, генерируемых такими животными, могут быть дополнительно модифицированы, например, путем объединения с другой константной областью человека.Human antibodies can be produced by administering an immunogen to a transgenic animal that has been modified to produce intact human antibodies or intact human variable region antibodies in response to antigenic stimulation. Such animals typically contain all or part of human immunoglobulin loci that replace endogenous immunoglobulin loci, or that are present extrachromosomally or randomly integrated into the animal's chromosomes. In such transgenic mice, endogenous immunoglobulin loci are usually inactivated. For a review of methods for producing human antibodies from transgenic animals, see Lonberg, Nat. Biotech. 2005, 23: 1117-1125. See also, for example, US 6,075,181 and US 6,150,584, which describe XENOMOUSE™ technology; US 5,770,429 describing HuMab technology (registered trademark); US 7041870 describes K-M MOUSE technology (registered trademark) and US 2007/0061900 describes VelociMouse technology (registered trademark). Human variable regions from intact antibodies generated by such animals can be further modified, for example, by combining with another human constant region.

Антитела человека также могут быть получены методами на основе гибридом. Описаны клеточные линии миеломы человека и мышино-человеческой гетеромиеломы для выработки моноклональных антител человека (см., например, Kozbor J. Immunol, 1984, 133:3001; Brodeur с соавт., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, 1987, стр. 51-63, изд-во Marcel Dekker, Inc., Нью-Йорк); Boerner с соавт., J. Immunol., 1991, 147: 86). Также описаны антитела человека, полученные с помощью гибридомной технологии В-клеток человека в публикации Li с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2006, 103:35573562. К дополнительным относятся методы, описанные, например, в US 7189826 (выработка моноклональных антител IgM человека из клеточных линий гибридом) и Ni, Xiandai Mianyixue, 2006, 26(4):265268 (описание гибридом между разными клетками человека). Технология гибридомы человека (технология Trioma) также описана в публикациях Vollmers и Brandlein, Histology and Histopathology, 2005, 20(3):927-937; и Vollmers и Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 2005, 27(3): 185-191.Human antibodies can also be produced by hybridoma-based methods. Human myeloma and murine-human heteromyeloma cell lines have been described for the production of human monoclonal antibodies (see, for example, Kozbor J. Immunol, 1984, 133:3001; Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, 1987, pp. 51- 63, Marcel Dekker, Inc., New York); Boerner et al., J. Immunol., 1991, 147: 86). Human antibodies produced using human B cell hybridoma technology are also described in Li et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2006, 103:35573562. Additional methods include those described, for example, in US 7189826 (production of human IgM monoclonal antibodies from hybridoma cell lines) and Ni, Xiandai Mianyixue, 2006, 26(4):265268 (description of hybridomas between different human cells). Human hybridoma technology (Trioma technology) is also described in Vollmers and Brandlein, Histology and Histopathology, 2005, 20(3):927-937; and Vollmers and Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 2005, 27(3): 185-191.

Антитела человека также могут быть получены путем выделения последовательностей вариабельных доменов Fv клона, выбранных из библиотек фагового дисплея человеческого происхождения. Затем такие последовательности вариабельных доменов можно комбинировать с желаемым константным доменом человека. Методы отбора антител человека из библиотек антител описаны ниже.Human antibodies can also be generated by isolating Fv clone variable domain sequences selected from phage display libraries of human origin. Such variable domain sequences can then be combined with the desired human constant domain. Methods for selecting human antibodies from antibody libraries are described below.

5. Антитела, разработанные на основе библиотек.5. Antibodies developed from libraries.

Антитела по настоящему изобретению могут быть выделены путем скрининга комбинаторных библиотек на антитела с требуемой активностью или активностями. Например, в данной области известны различные методы создания библиотек фагового дисплея и скрининга таких библиотек на наличие антител, обладающих желаемыми характеристиками связывания. Такие методы рассматривают, например, в публикациях Hoogenboom с соавт., в кн.: Methods in Molecular Biology 2001, 178:1-37, под ред. O'Brien с соавт., изд-во Human Press, Тотова, Нью-Джерси; а также описанные, например, в работах McCafferty с соавт., Nature 348: 552-554; Clackson с соавт., Nature 1991, 352: 624-628; Marks с соавт., J. Mol. Бю1. 1992, 222: 581-597; Marks и Bradbury, в кн.: Methods in Molecular Biology 2003, 248:161-175, под ред. Lo, издво Human Press, Тотова, Нью-Джерси; Sidhu с соавт., J. Mol. Biol. 2004, 338(2): 299-310; Lee с соавт., J. Mol. Biol. 2004, 340(5): 1073-1093; Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101(34): 12467-12472; Lee с соавт., J. Immunol. Methods 2004, 284(1-2): 119-132.Antibodies of the present invention can be isolated by screening combinatorial libraries for antibodies with the desired activity or activities. For example, various methods are known in the art for constructing phage display libraries and screening such libraries for antibodies having the desired binding characteristics. Such methods are considered, for example, in the publications of Hoogenboom et al., in the book: Methods in Molecular Biology 2001, 178: 1-37, ed. O'Brien et al., Human Press, Totowa, NJ; as well as those described, for example, in the works of McCafferty et al., Nature 348: 552-554; Clackson et al., Nature 1991, 352: 624-628; Marks et al., J. Mol. By1. 1992, 222: 581-597; Marks and Bradbury, in: Methods in Molecular Biology 2003, 248:161-175, ed. Lo, Human Press, Totowa, New Jersey; Sidhu et al., J. Mol. Biol. 2004, 338(2): 299-310; Lee et al., J. Mol. Biol. 2004, 340(5): 1073-1093; Fellowes, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101(34): 12467-12472; Lee et al., J. Immunol. Methods 2004, 284(1-2): 119-132.

В некоторых методах фагового дисплея репертуары генов VH и VL отдельно клонируют с помощью полимеразной цепной реакции (ПНР) и случайным образом рекомбинируют в фаговых библиотеках, которые затем можно подвергать скринингу на наличие антигенсвязывающего фага, как описано в Winter с соавт., Ann. Rev. Immunol, 1994, 12: 433-455. Фаг обычно отображает фрагменты антител либо в виде одноцепочечных фрагментов Fv (scFv), либо в виде фрагментов Fab. Библиотеки из иммунизированных источников обеспечивают высокоаффинные антитела к иммуногену без необходимости конструирования гибридом. В качестве альтернативы наивный репертуар может быть клонирован (например, из человека), чтобы обеспечить единый источник антител к широкому спектру чужеродных, а также собственных антигенов без какой-либо иммунизации, как описано Griffiths с соавт., ЕМВО J, 1993, 12: 725In some phage display methods, the VH and VL gene repertoires are separately cloned by polymerase chain reaction (PCR) and randomly recombined into phage libraries, which can then be screened for the presence of antigen-binding phage, as described in Winter et al., Ann. Rev. Immunol 1994, 12: 433-455. Phage typically displays antibody fragments as either single chain Fv fragments (scFv) or Fab fragments. Libraries from immunized sources provide high-affinity antibodies to an immunogen without the need to construct hybridomas. Alternatively, the naive repertoire can be cloned (eg from humans) to provide a single source of antibodies to a wide range of foreign as well as self antigens without any immunization, as described by Griffiths et al., EMBO J, 1993, 12: 725

- 32 045931- 32 045931

734. В итоге, наивные библиотеки также могут быть получены синтетически путем клонирования нереаранжированных сегментов V-гена из стволовых клеток и использования праймеров ПНР содержащих случайную последовательность, для кодирования высоковариабельных областей CDR3 и выполнения реаранжировки in vitro, как описано Hoogenboom и Winter, J. Mol. Biol., 1992, 227: 381-388. Патентные публикации, описывающие библиотеки фагов антител человека, включают, например: US 5750373, US 2005/0079574, US 2005/0119455, US 2005/0266000, US 2007/0117126, US 2007/0160598, US 2007/0237764, US 2007/0292936, US 2009/0002360.734. Finally, naïve libraries can also be prepared synthetically by cloning unrearranged V gene segments from stem cells and using random sequence PNR primers to encode highly variable CDR3 regions and perform the rearrangement in vitro, as described by Hoogenboom and Winter, J. Mol . Biol., 1992, 227: 381-388. Patent publications describing human antibody phage libraries include, for example: US 5750373, US 2005/0079574, US 2005/0119455, US 2005/0266000, US 2007/0117126, US 2007/0160598, US 2007/0237764, US 2007 /0292936 , US 2009/0002360.

Антитела или фрагменты антител, выделенные из библиотек антител человека, в настоящем изобретении считаются антителами человека или фрагментами антител человека.Antibodies or antibody fragments isolated from human antibody libraries are considered to be human antibodies or human antibody fragments in the present invention.

6. Мультиспецифические антитела.6. Multispecific antibodies.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело, предусмотренное в настоящем изобретении, представляет собой мультиспецифическое антитело, например, биспецифическое антитело. Мультиспецифические антитела представляют собой моноклональные антитела, обладающие специфичностью связывания как минимум для двух разных сайтов. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения одна из специфичностей связывания предназначена для CTLA-4, а другая для любого другого антигена. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения биспецифические антитела могут связываться с двумя разными эпитопами CTLA-4. Биспецифические антитела также можно использовать для локализации цитотоксических агентов в клетках, которые экспрессируют CTLA-4. Биспецифические антитела могут быть получены в виде полноразмерных антител или фрагментов антител.In some embodiments of the present invention, the antibody provided in the present invention is a multispecific antibody, for example, a bispecific antibody. Multispecific antibodies are monoclonal antibodies that have binding specificity for at least two different sites. In some embodiments of the present invention, one of the binding specificities is for CTLA-4 and the other is for any other antigen. In some embodiments of the present invention, bispecific antibodies can bind to two different epitopes of CTLA-4. Bispecific antibodies can also be used to localize cytotoxic agents to cells that express CTLA-4. Bispecific antibodies can be produced as full-length antibodies or antibody fragments.

Методы получения мультиспецифических антител включают, но не ограничиваются ими, рекомбинантную совместную экспрессию двух пар тяжелой и легкой цепей иммуноглобулина, обладающих различной специфичностью (см. Milstein и Cuello, Nature 1983, 305: 537), WO 93/08829, Traunecker с соавт., ЕМВО J. 1991, 10: 3655), и конструирование выступ-во-впадину (см., например, US 5731168). Мультиспецифические антитела также могут быть получены путем разработки эффектов электростатического управления для создания Fc-гетеродимерных молекул антител (WO 2009/089004A1); перекрестное сшивание двух или более антител или их фрагментов (см., например, US 4676980, и Brennan с соавт., Science, 1985, 229:81); использование лейциновых молний для получения биспецифических антител (см., например, Kostelny с соавт., J. Immunol, 1992, 148(5): 1547-1553); использование технологии диатело для получения биспецифических фрагментов антител (см., например, Hollinger с соавт., Proc. Nail. Acad. Sci. USA, 1993, 90: 6444-6448); и с использованием одноцепочечных димеров Fv (scFv) (см., например, Gruber с соавт., J. Immunol, 1994, 152: 5368); и получение триспецифических антител, как описано, например, в Tutt с соавт., J. Immunol. 1991, 147:60.Methods for producing multispecific antibodies include, but are not limited to, recombinant coexpression of two pairs of immunoglobulin heavy and light chains having different specificities (see Milstein and Cuello, Nature 1983, 305: 537), WO 93/08829, Traunecker et al., EMBO J. 1991, 10: 3655), and projection-to-recess design (see, for example, US 5731168). Multispecific antibodies can also be produced by engineering electrostatic control effects to create Fc heterodimeric antibody molecules (WO 2009/089004A1); cross-linking two or more antibodies or fragments thereof (see, for example, US 4676980, and Brennan et al., Science, 1985, 229:81); the use of leucine zippers to produce bispecific antibodies (see, for example, Kostelny et al., J. Immunol, 1992, 148(5): 1547-1553); the use of diabody technology to produce bispecific antibody fragments (see, for example, Hollinger et al., Proc. Nail. Acad. Sci. USA, 1993, 90: 6444-6448); and using single chain Fv dimers (scFv) (see, for example, Gruber et al., J. Immunol, 1994, 152: 5368); and preparing trispecific antibodies as described, for example, in Tutt et al., J. Immunol. 1991, 147:60.

Сюда также включены сконструированные антитела с тремя или более функциональными антигенсвязывающими сайтами, включая антитела-осьминоги (см., например, US 2006/0025576A1).Also included are engineered antibodies with three or more functional antigen binding sites, including octopus antibodies (see, for example, US 2006/0025576A1).

Антитело или его фрагмент в настоящем изобретении также включает Fab двойного действия (DAF - Dual Acting Fab), содержащий антигенсвязывающий сайт, который связывается с CTLA-4, а также с другим отличающимся антигеном (см., US 2008/0069820, например).The antibody or fragment thereof of the present invention also includes a Dual Acting Fab (DAF) containing an antigen binding site that binds to CTLA-4 as well as another different antigen (see US 2008/0069820, for example).

7. Варианты антител.7. Antibody variants.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения рассматривают варианты аминокислотной последовательности антител, предусмотренных в настоящем изобретении. Например, может быть желательным улучшить аффинность связывания и/или другие биологические свойства антитела. Варианты аминокислотной последовательности антитела могут быть получены путем внесения соответствующих модификаций в нуклеотидную последовательность, кодирующую антитело, или путем пептидного синтеза. Такие модификации включают, например, делеции, и/или инсерции, и/или замены остатков в аминокислотных последовательностях антитела. Любая комбинация делеций, инсерций и замещений может быть использована для получения конечной конструкции при условии, что конечная конструкция обладает желаемыми характеристиками, например, связыванием антигена.In some embodiments of the present invention, variants of the amino acid sequence of the antibodies provided in the present invention are contemplated. For example, it may be desirable to improve the binding affinity and/or other biological properties of the antibody. Variants of the amino acid sequence of an antibody can be obtained by introducing appropriate modifications into the nucleotide sequence encoding the antibody or by peptide synthesis. Such modifications include, for example, deletions and/or insertions and/or substitutions of residues in the amino acid sequences of the antibody. Any combination of deletions, insertions and substitutions can be used to produce the final construct, provided that the final construct has the desired characteristics, such as antigen binding.

а. Варианты замещений, инсерций и делеций.A. Variants of substitutions, insertions and deletions.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены варианты антител, имеющие одну или более аминокислотных замен. Сайты, представляющие интерес для заместительного мутагенеза, включают HVR и FR. Консервативные замены показаны в табл. 1 под заголовком предпочтительные замещения. Более существенные изменения представлены в табл. 1 под заголовком примеры замещений и как дополнительно описано ниже в отношении классов боковых цепей аминокислот. Аминокислотные замены могут быть введены в интересующее антитело, а продукты подвергнуты скринингу на желаемую активность, например, на сохранение/улучшение связывания антигена, снижение иммуногенности или улучшение ADCC или CDC.In some embodiments, the present invention provides antibody variants having one or more amino acid substitutions. Sites of interest for replacement mutagenesis include HVR and FR. Conservative substitutions are shown in table. 1 under the heading Preferred Substitutions. More significant changes are presented in table. 1 under the heading Examples of Substitutions and as further described below with respect to classes of amino acid side chains. Amino acid substitutions can be introduced into the antibody of interest, and the products are screened for the desired activity, such as maintaining/improving antigen binding, reducing immunogenicity, or improving ADCC or CDC.

- 33 045931- 33 045931

Таблица 1Table 1

Первоначальные остатки Initial balances Примеры замещений Examples of substitutions Предпочтительные замещения Preferred Substitutions Ala (А) Ala (A) Val; Leu; lie Val; Leu; lie Val Val Arg (R) Arg(R) Lys; Gin; Asn Lys; Gin; Asn Lys Lys Asn (N) Asn(N) Gin; His; Asp, Lys; Arg Gin; His; Asp, Lys; Arg Gin Gin Asp (D) Asp (D) Glu; Asn Glu; Asn Glu Glu Cys(C) Cys(C) Ser; Ala Ser; Ala Ser Ser Gln(Q) Gln(Q) Asn; Glu Asn; Glu Asn Asn Glu (E) Glu (E) Asp; Gin Asp; Gin Asp Asp Gly (G) Gly (G) Ala Ala Ala Ala His (H) His(H) Asn; Gin; Lys; Arg Asn; Gin; Lys; Arg Arg Arg He (I) He(I) Leu; Val; Met; Ala; Phe; Norleucine Leu; Val; Met; Ala; Ph; Norleucine Leu Leu Leu (L) Leu (L) Norleucine; lie; Val; Met; Ala; Phe Norleucine; lie; Val; Met; Ala; Phe lie lie Lys (K) Lys (K) Arg; Gin; Asn Arg; Gin; Asn Arg Arg Met (M) Met(M) Leu; Phe; lie Leu; Ph; lie Leu Leu Phe (F) Phe (F) Trp; Leu; Val; lie; Ala; Tyr Trp; Leu; Val; lie; Ala; Tyr Tyr Tyr Pro (P) Pro (P) Ala Ala Ala Ala Ser(S) Ser(S) Thr Thr Thr Thr Thr (T) Thr (T) Val; Ser Val; Ser Ser Ser Trp (W) Trp(W) Tyr; Phe Tyr; Phe Tyr Tyr Tyr(Y) Tyr(Y) Trp; Phe; Thr; Ser Trp; Ph; Thr; Ser Phe Phe Val (V) Val(V) lie; Leu; Met; Phe; Ala; Norleucine lie; Leu; Met; Ph; Ala; Norleucine Leu Leu

Аминокислоты можно разделить на группы в соответствии с общими свойствами их боковых цепей:Amino acids can be divided into groups according to the general properties of their side chains:

(1) гидрофобные: норлейцин, метионин (Met), аланин (Ala), валин (Val), лейцин (Leu) и изолейцин (Ile);(1) hydrophobic: norleucine, methionine (Met), alanine (Ala), valine (Val), leucine (Leu) and isoleucine (Ile);

(2) нейтральные и гидрофильные: цистеин (Cys), серии (Ser), треонин (Thr), аспарагин (Asn) и глутамин (Gln);(2) neutral and hydrophilic: cysteine (Cys), series (Ser), threonine (Thr), asparagine (Asn) and glutamine (Gln);

(3) кислые: аспартат (Asp) и глутамат (Glu);(3) acidic: aspartate (Asp) and glutamate (Glu);

(4) основные: гистидин (His), лизин (Lys) и аргинин (Arg);(4) basic: histidine (His), lysine (Lys) and arginine (Arg);

(5) остатки, влияющие на ориентацию цепи: глицин (Gly) и пролин (Pro); а также (6) ароматические: триптофан (Trp), тирозин (Tyr) и фенилаланин (Phe). Неконсервативная замена относится к замене члена одного из этих классов членом другого класса.(5) residues that affect chain orientation: glycine (Gly) and proline (Pro); and (6) aromatic: tryptophan (Trp), tyrosine (Tyr) and phenylalanine (Phe). Non-conservative substitution refers to the replacement of a member of one of these classes by a member of another class.

Один тип варианта замены включает замену одного или более остатков гипервариабельной области исходного антитела (например, гуманизированного антитела или антитела человека). Как правило, полученные варианты, выбранные для дальнейшего исследования, имеют модификации (например, улучшения) определенных биологических свойств (например, повышенная аффинность, сниженная иммуногенность) по сравнению с исходным антителом и/или в значительной степени сохраняют определенные биологические свойства исходного антитела. Иллюстративный вариант замены представляет собой антитело с созревшей аффинностью, которое может быть легко получено, например, с использованием методов созревания аффинности на основе фагового дисплея, таких как описанные в настоящем изобретении. Вкратце, один или более остатков HVR мутируют, а вариант антитела экспонируют на фаге и подвергают скринингу на конкретную биологическую активность (например, аффинность связывания).One type of substitution variant involves replacing one or more hypervariable region residues of a parent antibody (eg, a humanized or human antibody). Typically, the resulting variants selected for further study have modifications (eg, improvements) in certain biological properties (eg, increased affinity, reduced immunogenicity) compared to the parent antibody and/or substantially retain certain biological properties of the parent antibody. An exemplary replacement option is an affinity matured antibody that can be readily produced, for example, using phage display-based affinity maturation methods, such as those described in the present invention. Briefly, one or more HVR residues are mutated and the antibody variant is displayed on phage and screened for specific biological activity (eg, binding affinity).

В HVR могут быть внесены изменения (например, замены), например, для улучшения аффинности антител. Такие изменения могут быть сделаны в горячих точках HVR, то есть в остатках, кодируемых кодонами, которые подвергаются мутациям с высокой частотой в процессе соматического созревания (см., например, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 2008, 207: 179-196), и/или остатки, которые контактируют с антигеном, при этом полученный вариант VH или VL тестируют на аффинность связывания. Было описано созревание аффинности путем создания и повторного выбора из вторичных библиотек, описанных, например, Hoogenboom с соавт., Methods in Molecular Biology, 2001, 178:1-37, под ред. O'Brien с соавт., изд-во Human Press, Totova, Нью-Джерси. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения, касающихся созревания аффинности, разнообразие вводится в вариабельные гены, выбранные для созревания, любым из множества методов (например, подверженной ошибкам ПЦР, перестановкой цепей или мутагенезом, направленным на олигонуклеотиды). Затем создается вторичная библиотека. После этого библиотеку подвергают скринингу для выявления любых вариантов антител с желаемой аффинностью. Другой метод введения разнообразия включает подходы, направленные на HVR, в которых несколько остатков HVR (например, 4-6 остатков за раз) рандомизируют. Остатки HVR, участвующие в связывании антигена, могут быть специфически идентифицированы, например, с использованием аланиChanges (eg, substitutions) can be made to the HVR, for example to improve antibody affinity. Such changes can be made at HVR hotspots, that is, at residues encoded by codons that undergo mutations at high rates during somatic maturation (see, for example, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 2008, 207: 179-196), and/or residues that contact the antigen, wherein the resulting VH or VL variant is tested for binding affinity. Affinity maturation by generating and iterating from secondary libraries has been described, as described, for example, by Hoogenboom et al., Methods in Molecular Biology, 2001, 178:1-37, ed. O'Brien et al., Human Press, Totova, New Jersey. In some affinity maturation embodiments of the present invention, diversity is introduced into the variable genes selected for maturation by any of a variety of methods (eg, error-prone PCR, strand shuffling, or oligonucleotide-directed mutagenesis). A secondary library is then created. The library is then screened to identify any antibody variants with the desired affinity. Another method for introducing diversity involves HVR-targeting approaches in which multiple HVR residues (e.g., 4–6 residues at a time) are randomized. HVR residues involved in antigen binding can be specifically identified, e.g. using alani

- 34 045931 нового сканирующего мутагенеза или моделирования. CDR-H3 и CDR-L3, в частности, часто становятся мишенью.- 34 045931 new scanning mutagenesis or modeling. CDR-H3 and CDR-L3 in particular are often targeted.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения замены, инсерции или делеции могут происходить в одной или более HVR, если такие изменения существенно не снижают способность антитела связывать антиген. Например, в HVR могут быть внесены консервативные изменения (например, консервативные замены, как предусмотрено в настоящем изобретении), которые существенно не снижают аффинность связывания. Такие изменения могут, например, быть за пределами остатков, контактирующих с антигеном, в областях HVR. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в вариантах VH и VL, предусмотренных выше, каждая HVR либо не изменена, либо содержит не более одной, двух или трех аминокислотных замен.In some embodiments of the present invention, substitutions, insertions or deletions may occur in one or more HVRs as long as such changes do not significantly reduce the ability of the antibody to bind antigen. For example, conservative changes can be made to the HVR (eg, conservative substitutions as provided in the present invention) that do not significantly reduce binding affinity. Such changes may, for example, be beyond antigen-contacting residues in HVR regions. In some embodiments of the present invention, in the VH and VL variants provided above, each HVR is either unchanged or contains no more than one, two, or three amino acid substitutions.

Полезный метод идентификации остатков или областей антитела, которые могут стать мишенью для мутагенеза, называется мутагенез со сканированием аланина, как описано Cunningham и Wells, Science, 1989, 244: 1081-1085. В этом методе остаток или группу целевых остатков (например, заряженных остатков, таких как arg, asp, his, Lys и glu) идентифицируют и заменяют нейтральной или отрицательно заряженной аминокислотой (например, аланином или полиаланином) для определения, есть ли влияние взаимодействие антитела с антигеном. Дополнительные замены могут быть введены в места расположения аминокислот, демонстрирующих функциональную чувствительность к исходным заменам. Альтернативно или дополнительно можно анализировать кристаллическую структуру комплекса антигенантитело для идентификации точек контакта между антителом и антигеном. Такие контактные остатки и соседние остатки могут быть выбраны или исключены как кандидаты на замену. Варианты могут быть проверены, чтобы определить, содержат ли они желаемые свойства.A useful method for identifying residues or regions of an antibody that may be targeted for mutagenesis is called alanine scanning mutagenesis, as described by Cunningham and Wells, Science, 1989, 244: 1081-1085. In this method, a residue or group of target residues (eg, charged residues such as arg, asp, his, Lys, and glu) are identified and replaced with a neutral or negatively charged amino acid (eg, alanine or polyalanine) to determine whether the interaction of the antibody with antigen. Additional substitutions can be introduced at amino acid locations that exhibit functional sensitivity to the original substitutions. Alternatively or additionally, the crystal structure of the antigen-antibody complex can be analyzed to identify points of contact between the antibody and the antigen. Such contact residues and adjacent residues can be selected or excluded as candidates for replacement. The options can be tested to determine whether they contain the desired properties.

Вставки аминокислотной последовательности включают слияния с амино- и/или карбоксиконцом последовательностей разной длины, от одного остатка до полипептидов, содержащих сто или более остатков, а также инсерции внутри последовательности одного или нескольких аминокислотных остатков. Примеры концевых ирнсерций включают антитело с N-концевым метионильным остатком. Другие инсерционные варианты молекулы антитела включают слияние фермента (например, антителонаправленного фермента ADEPT) или полипептида, который увеличивает время полужизни антитела в плазме, с N- или С-концом антитела.Amino acid sequence insertions include fusions to the amino and/or carboxy terminus of sequences of varying lengths, from one residue to polypeptides containing a hundred or more residues, as well as intrasequence insertions of one or more amino acid residues. Examples of terminal insertions include an antibody with an N-terminal methionyl residue. Other insertional variants of an antibody molecule include fusion of an enzyme (eg, the antibody targeting enzyme ADEPT) or polypeptide that increases the plasma half-life of the antibody to the N- or C-terminus of the antibody.

б. Варианты гликозилирования.b. Glycosylation variants.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело по настоящему изобретению изменено для увеличения или уменьшения степени гликозилирования антитела. Добавление или удаление сайтов гликозилирования в антителе может быть удобно осуществлено путем изменения аминокислотной последовательности таким образом, что создается или удаляется один или более сайтов гликозилирования.In some embodiments, the antibody of the present invention is modified to increase or decrease the degree of glycosylation of the antibody. The addition or removal of glycosylation sites in an antibody can be conveniently accomplished by changing the amino acid sequence such that one or more glycosylation sites are created or removed.

Если антитело содержит Fc-область, связанный с ним углевод может быть изменен. Нативные антитела, продуцируемые клетками млекопитающих, обычно содержат разветвленный, биантенный олигосахарид, который обычно присоединен N-связью к Asn297 домена СН2 Fc-области. См., например, Wright с соавт., TIBTECH 1997, 15: 26-32. Олигосахарид может включать различные углеводы, например, маннозу, N-ацетилглюкозамин (GlcNAc), галактозу и сиаловую кислоту, а также фукозу, присоединенную к GlcNAc в стволе биантеннарной олигосахаридной структуры. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения модификации олигосахарида в антителе по настоящему изобретению могут быть выполнены для создания вариантов антител с некоторыми улучшенными свойствами.If an antibody contains an Fc region, the carbohydrate associated with it may be altered. Native antibodies produced by mammalian cells typically contain a branched, biantennary oligosaccharide that is typically N-linked to Asn297 of the CH2 domain of the Fc region. See, for example, Wright et al., TIBTECH 1997, 15: 26-32. The oligosaccharide may include various carbohydrates, such as mannose, N-acetylglucosamine (GlcNAc), galactose and sialic acid, as well as fucose attached to GlcNAc in the stem of the biantennary oligosaccharide structure. In some embodiments of the present invention, modifications to the oligosaccharide in the antibody of the present invention can be made to create antibody variants with certain improved properties.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают варианты антител, имеющие углеводную структуру, в которой отсутствует фукоза, присоединенная (прямо или косвенно) к Fc-области. Например, количество фукозы в таком антителе может составлять от 1 до 80%, от 1 до 65%, от 5 до 65% или от 20 до 40%. Количество фукозы определяют путем расчета среднего количества фукозы в цепи сахара в Asn297 по отношению к сумме всех гликоструктур, присоединенных к Asn 297 (например, сложных, гибридных структур и структур с высоким содержанием маннозы), по данным массспектрометрии MALDI-TOF, как описано, например в WO 2008/077546. Asn297 относится к остатку аспарагина, расположенному примерно в положении 297 в Fc-области (нумерация остатков Fc-области по EU); однако Asn297 также может быть расположен примерно на +/- 3 аминокислоты выше или ниже по цепи положения 297, то есть между положениями 294 и 300, из-за незначительных вариаций последовательности в антителах. Такие варианты фукозилирования могут иметь улучшенную функцию ADCC. См., например, публикации патентов US 2003/0157108 (Presta, L.); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). Примеры публикаций, относящихся к дефукозилированным или дефицитным по фукозе вариантам антител, включают: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO 2005/053742; WO 2002/031140; Okazaki с соавт., J. Mol. Biol. 2004, 336: 1239-1249; yamane-Ohnuki с соавт., Biotech. Bioeng. 2004, 87: 614. Примеры клеточных линий, способных продуцировать дефукозилированные антитела, включают клетки Lec13 СНО, дефицитные по фукозилированию белков (Ripka с соавт., Arch. Biochem. Biophys. 1986, 249: 533-545; US Pat Appl 2003/0157108 A1, Presta L.; WO 2004/056312 A1, Adams с соавт.,In one embodiment, the present invention provides antibody variants having a carbohydrate structure that lacks fucose attached (directly or indirectly) to the Fc region. For example, the amount of fucose in such an antibody may be from 1 to 80%, from 1 to 65%, from 5 to 65%, or from 20 to 40%. The amount of fucose is determined by calculating the average amount of fucose in the sugar chain of Asn297 relative to the sum of all glycostructures attached to Asn297 (e.g., complex, hybrid, and high-mannose structures) as measured by MALDI-TOF mass spectrometry as described e.g. in WO 2008/077546. Asn297 refers to an asparagine residue located at approximately position 297 in the Fc region (EU numbering of Fc region residues); however, Asn297 may also be located approximately +/- 3 amino acids upstream or downstream of position 297, that is, between positions 294 and 300, due to minor sequence variations in antibodies. Such fucosylation variants may have improved ADCC function. See, for example, patent publications US 2003/0157108 (Presta, L.); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). Examples of publications related to defucosylated or fucose-deficient antibody variants include: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO 2005/053742; WO 2002/031140; Okazaki et al., J. Mol. Biol. 2004, 336: 1239-1249; Yamane-Ohnuki et al., Biotech. Bioeng. 2004, 87: 614. Examples of cell lines capable of producing defucosylated antibodies include Lec13 CHO cells, deficient in protein fucosylation (Ripka et al., Arch. Biochem. Biophys. 1986, 249: 533-545; US Pat Appl 2003/0157108 A1, Presta L.; WO 2004/056312 A1, Adams et al.,

- 35 045931 особенно пример 11), и линии клеток с нокаутом, например, гена альфа-1,6-фукозилтрансферазы, FUT8, клетки СНО с нокаутом (см., например, yamane-Ohnuki с соавт., Biotech. Bioeng. 2004, 87: 614; Kanda Y. с соавт., Biotechnol. Bioeng., 2006, 94(4): 680-688; и WO 2003/085107).- 35 045931 especially example 11), and cell lines with knockout, for example, the alpha-1,6-fucosyltransferase gene, FUT8, CHO cells with knockout (see, for example, Yamane-Ohnuki et al., Biotech. Bioeng. 2004, 87: 614; Kanda Y. et al., Biotechnol. Bioeng., 2006, 94(4): 680-688; and WO 2003/085107).

Кроме того, предусматривают варианты антител с расщепленными пополам олигосахаридами, например, в которых биантенный олигосахарид, присоединенный к области F антитела, расщеплен пополам под действием GlcNAc. Такие варианты антител могут иметь пониженное фукозилирование и/или улучшенную функцию ADCC. Примеры таких вариантов антител описаны, например, в WO 2003/011878 (Jean-Mairet с соавт.); US 6602684 (Umana с соавт.); и US 2005/0123546 (Umana с соавт.). Также предусмотрены варианты антител по меньшей мере с одним остатком галактозы в олигосахариде, присоединенным к Fc-области. Такие варианты антител могут иметь улучшенную функцию CDC; они описаны, например, в WO 1997/30087 (Patel с соавт.); WO 1998/58964 (Raju S); и WO 1999/22764 (Raju S.).In addition, antibody variants with bisected oligosaccharides are contemplated, for example, in which the biantennary oligosaccharide attached to the F region of the antibody is bisected by GlcNAc. Such antibody variants may have reduced fucosylation and/or improved ADCC function. Examples of such antibody variants are described, for example, in WO 2003/011878 (Jean-Mairet et al.); US 6602684 (Umana et al.); and US 2005/0123546 (Umana et al.). Also provided are antibody variants with at least one galactose residue in the oligosaccharide attached to the Fc region. Such antibody variants may have improved CDC function; they are described, for example, in WO 1997/30087 (Patel et al.); WO 1998/58964 (Raju S); and WO 1999/22764 (Raju S.).

в.Варианты Fc-области.c. Variants of the Fc region.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения одна или более аминокислотных модификаций могут быть введены в Fc-область антитела, представленного в настоящем изобретении, получая, таким образом, вариант Fc-области. Вариант Fc-области может содержать последовательность Fc-области человека (например, Fc-область IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4 человека), содержащей аминокислотную модификацию (например, замену) в одном или более аминокислотных положениях.In some embodiments, one or more amino acid modifications may be introduced into the Fc region of an antibody of the present invention, thereby producing a variant Fc region. The Fc region variant may comprise a human Fc region sequence (eg, human IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 Fc region) containing an amino acid modification (eg, substitution) at one or more amino acid positions.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают вариант антитела, который обладает некоторыми, но не всеми эффекторными функциями, что делает его желательным кандидатом для применений, в которых важен период полужизни антитела in vivo, но некоторые эффекторные функции (такие как комплемент и ADCC) не нужны или вредны. Анализы цитотоксичности in vitro и/или in vivo могут быть проведены для подтверждения снижения/исчерпания активности CDC и/или ADCC. Например, можно провести анализ связывания Fc-рецептора (FcR), чтобы убедиться, что антитело не связывается с FcyR (следовательно, вероятно, не имеет активности ADCC), но сохраняет способность связывать FcRn. Первичные клетки для опосредования ADCC, клетки NK, экспрессируют только FcyRIII, тогда как моноциты экспрессируют FcyRI, FcyRII и FcyRIII. Экспрессия FcR на кроветворных клетках суммирована в табл. 3 на странице 464 в публикации Ravetch и Kinet, Annu. Rev. Immunol. 1991, 9: 457-492. Примеры, не являющиеся ограничительными, анализов in vitro для оценки активности ADCC исследуемой молекулы описаны в US 5500362 (см., например, Hellstrom I. с соавт., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 1986, 83:7059-7063) и Hellstrom I. с соавт., Proc. Nat'lAcad. Sci. USA 1985, 82:1499-1502; US 5821337 (см. Bruggemann M. с соавт., J. Exp. Med. 1987, 166: 1351-1361). В качестве альтернативы можно использовать методы нерадиоактивных анализов (см., например, анализ нерадиоактивной цитотоксичности АСТ1™ для проточной цитометрии (фирма CellTechnology, Inc. Маунтин-Вью, Калифорния; и CytoTox 96 (зарегистрированная торговая марка) анализ нерадиоактивной цитотоксичности (фирма Promega, Мэдисон, Висконсин). Полезные эффекторные клетки для таких анализов включают мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК) и природные клетки-киллеры (NK). В другом варианте или дополнительно активность ADCC исследуемой молекулы может быть оценена in vivo, например, в животной модели, например, описанной Clynes с соавт., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 1998, 95:652-656. Анализы связывания C1q также можно проводить для подтверждения того, что антитело не способно связывать C1q и, следовательно, не имеет активности CDC. См., например, связывание ELISA C1q и С3с в WO 2006/029879 и WO 2005/100402. Для оценки активации комплемента можно провести анализ CDC (см., например, Gazzano-Santoro с соавт., J. Immunol. Methods 1996, 202:163; Cragg M.S. с соавт., Blood2003, 101:1045-1052; Cragg M.S., Glennie M.J., Blood 2004, 103: 2738-2743). Связывание FcRn и определение клиренса/периода полувыведения in vivo также можно проводить с использованием методов, известных в данной области (см., например, Petkova S.B. с соавт., Int'l. Immunol. 2006, 18(12): 1759-1769).In some embodiments, the present invention provides a variant antibody that possesses some, but not all, effector functions, making it a desirable candidate for applications in which the in vivo half-life of the antibody is important but certain effector functions (such as complement and ADCC) are not needed. or harmful. In vitro and/or in vivo cytotoxicity assays can be performed to confirm the reduction/exhaustion of CDC and/or ADCC activity. For example, an Fc receptor (FcR) binding assay can be performed to ensure that the antibody does not bind to FcyR (thus likely to have no ADCC activity) but retains the ability to bind FcRn. The primary cells for mediating ADCC, NK cells, express only FcyRIII, whereas monocytes express FcyRI, FcyRII, and FcyRIII. FcR expression on hematopoietic cells is summarized in Table. 3 on page 464 in Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 1991, 9: 457-492. Non-limiting examples of in vitro assays for assessing the ADCC activity of a test molecule are described in US 5500362 (see, for example, Hellstrom I. et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 1986, 83:7059-7063) and Hellstrom I. et al., Proc. Nat'lAcad. Sci. USA 1985, 82:1499-1502; US 5821337 (see Bruggemann M et al., J. Exp. Med. 1987, 166: 1351-1361). Alternatively, non-radioactive assay methods may be used (see, for example, the ACT1™ Non-Radioactive Cytotoxicity Assay for Flow Cytometry (CellTechnology, Inc. Mountain View, Calif.; and the CytoTox 96 (Registered Trademark) Non-Radioactive Cytotoxicity Assay (Promega, Madison) , Wisconsin. Useful effector cells for such assays include peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and natural killer (NK) cells. Alternatively or additionally, the ADCC activity of the test molecule can be assessed in vivo, for example, in an animal model, e.g. described by Clynes et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 1998, 95:652-656. C1q binding assays can also be performed to confirm that the antibody is unable to bind C1q and therefore does not have CDC activity. ., for example, the binding ELISA C1q and C3c in WO 2006/029879 and WO 2005/100402. To assess complement activation, a CDC assay can be performed (see, for example, Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 1996, 202:163; Cragg M.S. et al., Blood2003, 101:1045-1052; Cragg M.S., Glennie M.J., Blood 2004, 103: 2738-2743). FcRn binding and determination of clearance/half-life in vivo can also be performed using methods known in the art (see, for example, Petkova S.B. et al., Int'l. Immunol. 2006, 18(12): 1759-1769) .

Антитела со сниженной эффекторной функцией включают антитела с заменой одного или более остатков 238, 265, 269, 270, 297, 327 и 329 Fc-области (US 6737056). Такие мутанты Fc включают мутанты Fc с заменами в двух или более аминокислотных положениях из числа 265, 269, 270, 297 и 327, включая так называемый мутант Fc DANA с заменой остатков 265 и 297 на аланин (US 7332581).Antibodies with reduced effector function include antibodies with a substitution of one or more residues 238, 265, 269, 270, 297, 327 and 329 of the Fc region (US 6,737,056). Such Fc mutants include Fc mutants with substitutions at two or more amino acid positions from amino acid positions 265, 269, 270, 297 and 327, including the so-called Fc DANA mutant with residues 265 and 297 replaced by alanine (US Pat. No. 7,332,581).

Описаны некоторые варианты антител с повышенным или пониженным связыванием с FcR (см., например, US 6737056; WO 2004/056312, и Shields с соавт., J. Biol. Chem. 2001, 9(2):6591-6604).Several antibody variants with increased or decreased FcR binding have been described (see, for example, US 6,737,056; WO 2004/056312, and Shields et al., J. Biol. Chem. 2001, 9(2):6591-6604).

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вариант антитела содержит Fcобласть с одной или более аминокислотными заменами, которые улучшают ADCC, например, с заменами в положениях 298, 333 и/или 334 Fc-области (нумерация остатков согласно EU).In some embodiments of the present invention, the antibody variant comprises an Fc region with one or more amino acid substitutions that improve ADCC, for example, substitutions at positions 298, 333 and/or 334 of the Fc region (EU residue numbering).

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения изменения происходят в Fcобласти, что приводит к изменению (т. е. увеличению или уменьшению) связывания C1q и/или K комплементзависимой цитотоксичности (CDC), например, как описано в US 6194551, WO 99/51642, Idusogie с соавт., J. Immunol. 2000, 164:4178-4184.In some embodiments of the present invention, changes occur in the F region, resulting in altered (i.e., increased or decreased) binding of C1q and/or K complement dependent cytotoxicity (CDC), for example, as described in US 6194551, WO 99/51642, Idusogie et al., J. Immunol. 2000, 164:4178-4184.

Антитела с увеличенным периодом полужизни и повышенным связыванием с неонатальным Fcрецептором (FcRn), который отвечает за перенос материнских IgG к плоду (Guyer с соавт., J. Immunol., 1976, 117:587; Kim с соавт., J. Immunol., 1994, 24:249), описаны в US 2005/0014934 A1 (Hinton с соавт.).Antibodies with an extended half-life and increased binding to the neonatal Fc receptor (FcRn), which is responsible for the transfer of maternal IgG to the fetus (Guyer et al., J. Immunol., 1976, 117:587; Kim et al., J. Immunol., 1994, 24:249), described in US 2005/0014934 A1 (Hinton et al.).

- 36 045931- 36 045931

Эти антитела содержат Fc-область с одной или более заменами, которые увеличивают связывание Fcобласти с FcRn. Такие варианты Fc включают варианты с заменами в одном или более остатках Fcобласти из числа: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 или 434, например, замена остатка 434 Fc-области (US 7371826).These antibodies contain an Fc region with one or more substitutions that increase the binding of the Fc region to FcRn. Such Fc variants include variants with substitutions in one or more residues of the Fc region from among: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 or 434, for example, replacing residue 434 of the Fc region (US 7371826).

См. также публикации Duncan и Winter, Nature 1988, 322:738-740; US 5648260; US 5624821; WO 94/29351, в которых описаны другие примеры вариантов Fc-области.See also Duncan and Winter, Nature 1988, 322:738-740; US 5648260; US 5624821; WO 94/29351, which describes other examples of Fc region variants.

г. Варианты антител, переработанные с цистеином.d. Antibody variants processed with cysteine.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения может оказаться целесообразным переработка антител с цистеином, например, тиоМАЬ, в которых один или более остатков антитела заменены остатками цистеина. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения замещенные остатки встречаются в доступных участках антитела. Путем замены этих остатков цистеином реакционноспособные тиоловые группы, таким образом, располагаются в доступных участках антитела и могут быть использованы для конъюгации антитела с другими фрагментами, такими как фрагменты лекарственного средства или фрагменты линкер-лекарственное средство, для создания иммуноконъюгата, как описано далее в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения какой-либо один или более из следующих остатков может быть заменен цистеином: V205 (нумерация по Kabat) легкой цепи; А118 (нумерация EU) тяжелой цепи; и S400 (нумерация EU) Fc-области тяжелой цепи. Антитела, переработанные с использованием цистеина, могут быть получены согласно описанию EU 7521541.In some embodiments of the present invention, it may be advisable to process antibodies with cysteine, for example, thioMAB, in which one or more residues of the antibody are replaced by cysteine residues. In certain embodiments of the present invention, the substituted residues occur in accessible regions of the antibody. By replacing these residues with cysteine, the reactive thiol groups are thus located in accessible regions of the antibody and can be used to conjugate the antibody to other moieties, such as drug moieties or linker-drug moieties, to create an immunoconjugate, as described later in the present invention . In some embodiments of the present invention, any one or more of the following residues may be replaced by cysteine: V205 (Kabat numbering) light chain; A118 (EU numbering) heavy chain; and S400 (EU numbering) heavy chain Fc region. Antibodies processed using cysteine can be prepared as described in EU 7521541.

д. Производные антител.d. Antibody derivatives.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, может быть дополнительно модифицировано, чтобы содержать дополнительные небелковые фрагменты, которые известны в данной области и легко доступны. Фрагменты, подходящие для дериватизации антитела, включают водорастворимые полимеры, но не ограничиваются ими. Примерами таких водорастворимых полимеров являются, но не ограничиваются ими, полиэтиленгликоль (ПЭГ), сополимеры этиленгликоля/пропиленгликоля, карбоксиметилцеллюлозы, декстрана, поливинилового спирта, поливинилпирролидона, поли-1,3-диоксолана, поли-1,3,6-триоксана, сополимера этилена/малеинового ангидрида, полиаминокислот (либо гомополимеры, либо статистические сополимеры) и декстран или поли(н-винилпирролидон)полиэтиленгликоль, гомополимеры полипропиленгликоля, сополимеры полипропиленоксид/этиленоксид, полиоксиэтилированные полиолы (например, глицерин), поливиниловый спирт и их смеси. Полиэтиленгликольпропионовый альдегид может иметь преимущество при производстве из-за его стабильности в воде. Полимер может иметь любую молекулярную массу и может быть разветвленным или неразветвленным. Количество полимеров, присоединенных к антителу, можно варьировать, и если присоединено более одного полимера, они могут быть одинаковыми или разными молекулами. Как правило, количество и/или тип полимеров, используемых для дериватизации, можно определить исходя из конкретных свойств или функции антитела, которые необходимо улучшить, а также из того, будет ли производное антитела использоваться в терапии согласно определенные условиям и т.д.In some embodiments, the antibody of the present invention may be further modified to contain additional non-protein moieties that are known in the art and readily available. Fragments suitable for antibody derivatization include, but are not limited to, water-soluble polymers. Examples of such water-soluble polymers include, but are not limited to, polyethylene glycol (PEG), ethylene glycol/propylene glycol copolymers, carboxymethylcellulose, dextran, polyvinyl alcohol, polyvinylpyrrolidone, poly-1,3-dioxolane, poly-1,3,6-trioxane, ethylene copolymer /maleic anhydride, polyamino acids (either homopolymers or random copolymers) and dextran or poly(n-vinylpyrrolidone)polyethylene glycol, polypropylene glycol homopolymers, polypropylene oxide/ethylene oxide copolymers, polyoxyethylated polyols (for example, glycerol), polyvinyl alcohol and mixtures thereof. Polyethylene glycol propionaldehyde may have an advantage in production due to its stability in water. The polymer can have any molecular weight and can be branched or unbranched. The number of polymers attached to the antibody can be varied, and if more than one polymer is attached, they may be the same or different molecules. In general, the amount and/or type of polymers used for derivatization can be determined based on the specific properties or function of the antibody that is to be improved, whether the antibody derivative will be used in therapy under certain conditions, etc.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусмотрены конъюгаты антитела и небелкового фрагмента, которые можно нагревать избирательно под воздействием излучения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения небелковая часть представляет собой углеродную нанотрубку (Kam с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102: 11600-11605). Излучение может иметь любую длину волны и включает, помимо прочего, длины волн, которые не повреждают обычные клетки, но которые нагревают небелковую часть до температуры, при которой погибают клетки, проксимальные к антитело-небелковой части.In another embodiment, the present invention provides antibody-non-protein moiety conjugates that can be selectively heated by radiation. In one embodiment of the present invention, the non-protein portion is a carbon nanotube (Kam et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102: 11600-11605). The radiation can be of any wavelength and includes, but is not limited to, wavelengths that do not damage normal cells, but which heat the non-protein portion to a temperature that kills cells proximal to the antibody-non-protein portion.

Б. Рекомбинантные методы и составы.B. Recombinant methods and compositions.

Антитела могут быть получены методом рекомбинации и с применением композиций, например, описанных в US 4816567. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую анти-CTLA-4 антитело, описанное в настоящем изобретении. Такая нуклеиновая кислота может кодировать аминокислотную последовательность, включающую VL, и/или аминокислотную последовательность, включающую VH антитела (например, легкие и/или тяжелые цепи антитела). В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают один или более векторов (например, векторов экспрессии), содержащих такую нуклеиновую кислоту. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают клетку-хозяина, содержащую указанную нуклеиновую кислоту. В одном из таких вариантов осуществления настоящего изобретения клетка-хозяин содержит (например, была трансформирована): (1) вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, включающую VL антитела, и аминокислотную последовательность, включающую VH антитела, или (2) первый вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, включающую VL антитела, и второй вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, включающую VH антитела. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения клетка-хозяин является эукариотической, например, клетка яичника китайского хомяка (СНО) или лимфоидная клеткаAntibodies can be produced by recombination and using compositions such as those described in US Pat. No. 4,816,567. In one embodiment, the present invention provides an isolated nucleic acid encoding an anti-CTLA-4 antibody described in the present invention. Such a nucleic acid may encode an amino acid sequence comprising VL and/or an amino acid sequence comprising VH of an antibody (eg, antibody light and/or heavy chains). In another embodiment, the present invention provides one or more vectors (eg, expression vectors) containing such a nucleic acid. In another embodiment, the present invention provides a host cell containing said nucleic acid. In one such embodiment of the present invention, the host cell contains (eg, has been transformed): (1) a vector comprising a nucleic acid encoding an amino acid sequence comprising a VL antibody and an amino acid sequence comprising a VH antibody, or (2) a first vector containing a nucleic acid encoding an amino acid sequence including a VL antibody, and a second vector containing a nucleic acid encoding an amino acid sequence including a VH antibody. In one embodiment of the present invention, the host cell is eukaryotic, for example, a Chinese hamster ovary (CHO) cell or a lymphoid cell

- 37 045931 (например, клетки Y0, NSO, Sp2/0). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения описывают способ получения анти-CTLA-4 антитела, который включает культивирование клетки-хозяина, содержащей нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, как указано выше, в условиях, подходящих для экспрессии анти-CTLA-4 антитела, и необязательно выделение антитела из клетки-хозяина (или среды для культивирования клеток-хозяев).- 37 045931 (for example, Y0, NSO, Sp2/0 cells). In one embodiment, the present invention describes a method for producing an anti-CTLA-4 antibody, which includes culturing a host cell containing a nucleic acid encoding the antibody as described above under conditions suitable for expression of the anti-CTLA-4 antibody, and optionally isolating the antibody from the host cell (or host cell culture medium).

Для рекомбинантного получения анти-CTLA-4 антитела нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, например, как описано выше, выделяют и встраивают в один или более векторов для дальнейшего клонирования и/или экспрессии в клетке-хозяине. Такую нуклеиновую кислоту можно легко выделить и секвенировать с использованием обычных процедур (например, с использованием олигонуклеотидных зондов, которые способны специфически связываться с генами, кодирующими тяжелые и легкие цепи антитела).To recombinantly produce an anti-CTLA-4 antibody, the nucleic acid encoding the antibody, for example as described above, is isolated and inserted into one or more vectors for further cloning and/or expression in a host cell. Such nucleic acid can be readily isolated and sequenced using conventional procedures (eg, using oligonucleotide probes that are capable of specifically binding to genes encoding antibody heavy and light chains).

Клетки-хозяева, подходящие для клонирования или экспрессии векторов, кодирующих антитела, включают описанные в настоящем изобретении прокариотические или эукариотические клетки. Например, антитела могут продуцироваться бактериями, в частности, когда гликозилирование и эффекторная функция Fc не нужны. Для экспрессии фрагментов антител и полипептидов в бактериях см., например, US 5648237, US 5789199 и US 5840523 (см. также Charlton, Methods in Molecular Biology, 2003, том 248, стр. 245-254, под ред. Lo В.К.С, изд-во Humana Press, Тотова, Нью-Джерси, где описывается экспрессия фрагментов антител в Е. coli). После экспрессии антитело может быть выделено из биомассы бактериальных клеток в виде растворимой фракции и может быть дополнительно очищено.Host cells suitable for cloning or expression of vectors encoding antibodies include prokaryotic or eukaryotic cells described in the present invention. For example, antibodies can be produced by bacteria, particularly when glycosylation and Fc effector function are not required. For the expression of antibody fragments and polypeptides in bacteria, see, for example, US 5648237, US 5789199 and US 5840523 (see also Charlton, Methods in Molecular Biology, 2003, volume 248, pp. 245-254, edited by Lo V.K. .C, Humana Press, Totowa, NJ, which describes the expression of antibody fragments in E. coli). Once expressed, the antibody can be isolated from the bacterial cell biomass as a soluble fraction and can be further purified.

Помимо прокариот, подходящими хозяевами для клонирования или экспрессии векторов, кодирующих антитела, являются эукариотические микробы, такие как мицелиальные грибы или дрожжи, включая штаммы грибов и дрожжей, пути гликозилирования которых были гуманизированы, что приводит к выработке антитела с паттерном гликозилирования, который частично или полностью соответствует таковому у человека. См. Gerngross, Nat. Biotech. 2004, 22:1409-1414; Li с соавт., Nat. Biotech. 2006, 24:210-215.In addition to prokaryotes, suitable hosts for the cloning or expression of antibody-encoding vectors include eukaryotic microbes such as filamentous fungi or yeast, including fungal and yeast strains whose glycosylation pathways have been humanized, resulting in the production of an antibody with a glycosylation pattern that is partially or completely corresponds to that of humans. See Gerngross, Nat. Biotech. 2004, 22:1409-1414; Li et al., Nat. Biotech. 2006, 24:210-215.

Подходящие клетки-хозяева для экспрессии гликозилированного антитела также получают из многоклеточных организмов (беспозвоночных и позвоночных). Примерами могут быть клетки беспозвоночных, включаю насекомых, и клетки растений. Были идентифицированы многочисленные штаммы бакуловирусов, которые можно использовать в сочетании с клетками насекомых, в частности, для трансфекции клеток Spodoptera frugiperda.Suitable host cells for expression of the glycosylated antibody are also obtained from multicellular organisms (invertebrates and vertebrates). Examples include invertebrate cells, including insects, and plant cells. Numerous strains of baculoviruses have been identified that can be used in combination with insect cells, particularly for transfection of Spodoptera frugiperda cells.

Клетки растений могут быть клетками-хозяевами. См., например, US 5959177, US 6040498, US 6420548, US 7125978 и US 6417429 (описание технологии PLANTIBODIES™ для получения антител в трансгенных растениях).Plant cells can be host cells. See, for example, US 5959177, US 6040498, US 6420548, US 7125978 and US 6417429 (describing PLANTIBODIES™ technology for producing antibodies in transgenic plants).

Клетки позвоночных также могут быть использованы в качестве хозяев. Например, могут быть полезны клеточные линии млекопитающих, адаптированные для роста в виде суспензии. Другими примерами подходящих линий клеток-хозяев млекопитающих являются линия CV1 почки обезьяны, трансформированная вирусом SV40 (COS-7); линия почки эмбриона человека (клетки 293 или клетки 293, описанные, например, в публикации Graham с соавт., J. Gen Virol. 1977, 36: 59); клетки почки детеныша хомячка (ВНК); мышиные клетки Сертоли (клетки ТМ4, как описано, например, в публикации Mather, Biol. Reprod. 1980, 23:243-251); клетки почки обезьяны (CV1); клетки почки африканской зеленой мартышки (VERO-76); клетки карциномы шейки матки человека (HELA); клетки почки собаки (MDCK); клетки печени серой крысы (BRL ЗА); клетки легкого человека (W138); клетки печени человека (Hep G2); опухоль молочной железы мыши (ММТ 060562); клетки TRI, как описано, например, в публикации Mather с соавт., Annals N.Y. Acad. Sci. 1982, 383:44-68; клетки MRC 5; и клетки FS4. Другие пригодные линии клеток-хозяев млекопитающих включают клетки яичника китайского хомячка (СНО), в том числе клетки DHFR-CHO (Urlaub с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1980, 77:4216); и линии клеток миеломы, такие как Y0, NS0 и Sp2/0. Обзор некоторых линий клеток-хозяев млекопитающих, подходящих для выработки антител, см., например, yazaki и Wu, Methods in Molecular Biology, 2003, том 248, стр. 255-268, под ред. Lo В.К.С, изд., Humana Press, Totova, Нью-Джерси.Vertebrate cells can also be used as hosts. For example, mammalian cell lines adapted for suspension growth may be useful. Other examples of suitable mammalian host cell lines include monkey kidney line CV1 transformed with SV40 virus (COS-7); human embryonic kidney line (293 cells or 293 cells described, for example, in Graham et al., J. Gen Virol. 1977, 36: 59); baby hamster kidney cells (BHK); mouse Sertoli cells (TM4 cells, as described, for example, in Mather, Biol. Reprod. 1980, 23:243-251); monkey kidney cells (CV1); African green monkey kidney cells (VERO-76); human cervical carcinoma (HELA) cells; canine kidney cells (MDCK); gray rat liver cells (BRL 3A); human lung cells (W138); human liver cells (Hep G2); mouse mammary tumor (MMT 060562); TRI cells, as described, for example, in the publication of Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 1982, 383:44-68; MRC 5 cells; and FS4 cells. Other useful mammalian host cell lines include Chinese hamster ovary (CHO) cells, including DHFR-CHO cells (Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1980, 77:4216); and myeloma cell lines such as Y0, NS0 and Sp2/0. For a review of some mammalian host cell lines suitable for antibody production, see, for example, Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, 2003, vol. 248, pp. 255-268, ed. Lo V.K.S., ed., Humana Press, Totova, New Jersey.

Поликлональные антитела предпочтительно получают у животных путем множественных подкожных (п/к) или внутрибрюшинных (в/б) инъекций соответствующего антигена и адъюванта. Может конъюгировать соответствующий антиген с белком, который является иммуногенным для иммунизируемых видов, например, гемоцианином лимфы улитки, сывороточным альбумином, бычьим тиреоглобулином или ингибитором трипсина сои, используя бифункциональный или дериватизирующий агент, например, малеимидобензоил сульфосукцинимидный эфир (конъюгация через остатки цистеина), Nгидроксисукцинимид (через остатки лизина), глутаровый альдегид, янтарный ангидрид, SOCl2 или R1N=C=NR, где R и R1 - разные алкильные группы.Polyclonal antibodies are preferably produced in animals by multiple subcutaneous (SC) or intraperitoneal (IP) injections of the appropriate antigen and adjuvant. May conjugate the appropriate antigen to a protein that is immunogenic in the immunized species, e.g., snail limpet hemocyanin, serum albumin, bovine thyroglobulin, or soybean trypsin inhibitor, using a bifunctional or derivatizing agent, e.g., maleimidobenzoyl sulfosuccinimide ester (conjugation via cysteine residues), Nhydroxysuccinimide ( through lysine residues), glutaraldehyde, succinic anhydride, SOCl 2 or R 1 N=C=NR, where R and R 1 are different alkyl groups.

Животных (обычно млекопитающим, не являющимся человеком) иммунизируют против антигена, иммуногенных конъюгатов или производных путем объединения, например, 100 мкг или 5 мкг белка или конъюгата (для кроликов или мышей, соответственно) с 3 объемами полного адъюванта Фрейнда, и вводят раствор внутрикожно в несколько мест. Через месяц животным повторно вводят от 1/5 до 1/10 исходного количества пептида или конъюгата в полном адъюванте Фрейнда путем подкожной инъекции вAnimals (usually non-human mammals) are immunized against the antigen, immunogenic conjugates or derivatives by combining, for example, 100 μg or 5 μg of the protein or conjugate (for rabbits or mice, respectively) with 3 volumes of Freund's complete adjuvant, and the solution is administered intradermally into several places. After a month, the animals are re-injected with 1/5 to 1/10 of the original amount of peptide or conjugate in Freund's complete adjuvant by subcutaneous injection into the

- 38 045931 несколько мест. Через 7-14 дней у животных берут кровь и анализируют титр антител в сыворотке. Животным вводят бустерные инъекции до тех пор, пока титр не выйдет на плато. Предпочтительно животное ревакцинируют конъюгатом того же антигена, но конъюгированного с другим белком и/или с помощью другого сшивающего реагента. Конъюгаты также могут быть получены в культуре рекомбинантных клеток в виде белковых слияний. Кроме того, для усиления иммунного ответа применимы агрегирующие агенты, такие как квасцы.- 38 045931 several places. After 7-14 days, blood is taken from the animals and the antibody titer in the serum is analyzed. Animals are given booster injections until the titer reaches a plateau. Preferably, the animal is revaccinated with a conjugate of the same antigen, but conjugated to a different protein and/or using a different cross-linking reagent. Conjugates can also be produced in recombinant cell culture as protein fusions. In addition, aggregating agents such as alum are useful to enhance the immune response.

Моноклональные антитела получают из популяции по существу гомогенных антител, т. е. отдельные антитела, составляющие популяцию, идентичны, за исключением возможных природных мутаций и/или посттрансляционных модификаций (например, в результате изомеризации, амидирования), которые могут присутствовать в незначительных количествах. Таким образом, модификатор моноклональный указывает на то, что антитело не является смесью отдельных антител.Monoclonal antibodies are obtained from a population of essentially homogeneous antibodies, i.e., the individual antibodies making up the population are identical, except for possible natural mutations and/or post-translational modifications (eg, isomerization, amidation), which may be present in minor quantities. Thus, the modifier monoclonal indicates that the antibody is not a mixture of individual antibodies.

Например, моноклональные антитела могут быть получены с использованием гибридомного метода, впервые описанного Kohler с соавт., Nature, 1975, 256(5517):495-497. В методе гибридом мышь или другое подходящее животное-хозяин, например, хомяка, иммунизируют, как описано выше, для выявления лимфоцитов, которые продуцируют или способны продуцировать антитела, которые специфически связываются с белком, используемым для иммунизации. Альтернативно лимфоциты могут быть иммунизированы in vitro.For example, monoclonal antibodies can be produced using the hybridoma method first described by Kohler et al., Nature, 1975, 256(5517):495-497. In the hybridoma method, a mouse or other suitable host animal, such as a hamster, is immunized as described above to identify lymphocytes that produce or are capable of producing antibodies that specifically bind to the protein used for immunization. Alternatively, lymphocytes can be immunized in vitro.

Иммунизирующий агент обычно включает антигенный белок или его слитый вариант. Обычно используются либо лимфоциты периферической крови (PBL -peripheral blood lymphocytes), если предпочтительны клетки человеческого происхождения, либо клетки селезенки или клетки лимфатических узлов, если предпочтительны млекопитающие других видов. Затем лимфоциты сливают с иммортализованной клеточной линией с использованием подходящего связующего агента, такого как полиэтиленгликоль, с образованием гибридомной клетки (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, 1986, стр. 59-103, изд-во Academic Press).The immunizing agent typically comprises an antigenic protein or a fusion thereof. Typically, either peripheral blood lymphocytes (PBL) are used if cells of human origin are preferred, or spleen cells or lymph node cells if other mammalian species are preferred. The lymphocytes are then fused with the immortalized cell line using a suitable coupling agent such as polyethylene glycol to form a hybridoma cell (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, 1986, pp. 59-103, Academic Press).

Иммортализованные клеточные линии обычно представляют собой трансформированные клетки млекопитающих, особенно клетки миеломы грызунов, крупного рогатого скота и человека. Обычно используют клеточные линии крысиной или мышиной миеломы. Полученные таким образом гибридомные клетки высевают и выращивают в подходящей культуральной среде, которая предпочтительно содержит одно или более веществ, ингибирующих рост или выживание неслитых родительских клеток миеломы. Например, если в родительских клетках миеломы отсутствует фермент гипоксантингуанинфосфорибозилтрансфераза (HGPRT или HPRT), культуральная среда для гибридом обычно будет включать гипоксантин, аминоптерин и тимидин (среда HAT), которые представляют собой вещества, предотвращающие рост клеток, дефицитных по HGPRT.Immortalized cell lines are typically transformed mammalian cells, especially rodent, bovine and human myeloma cells. Typically, rat or mouse myeloma cell lines are used. The hybridoma cells thus obtained are seeded and grown in a suitable culture medium, which preferably contains one or more substances that inhibit the growth or survival of unfused parent myeloma cells. For example, if the parent myeloma cells lack the enzyme hypoxanthine guanine phosphoribosyltransferase (HGPRT or HPRT), hybridoma culture medium will typically include hypoxanthine, aminopterin, and thymidine (HAT medium), which are substances that prevent the growth of HGPRT-deficient cells.

Предпочтительными иммортализованными клетками миеломы являются те клетки, которые эффективно сливаются, поддерживают стабильно высокий уровень продукции антител выбранными клетками, продуцирующими антитела, и чувствительны к среде, такой как среда HAT. Среди них предпочтительными являются линии мышиной миеломы, такие как линии, полученные из опухолей мышей МОРС-21 и МРС-11, доступные в Центре распределения клеток Института Солка, Сан-Диего, Калифорния, США, и клетки SP-2 (и их производные, например, X63-Ag8-653), доступные из Американской коллекции типовых культур, Манассас, Вирджиния, США. Клеточные линии миеломы человека и гетеромиеломы мыши-человека также были описаны для получения моноклональных антител человека (Kozbor с соавт., J. Immunol. 1984, 133(6):3001 -3005; Brodeur с соавт., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, 1987, стр. 51-63, изд-во Marcel Dekker, Inc., Нью-Йорк).Preferred immortalized myeloma cells are those that fuse efficiently, maintain a consistently high level of antibody production by the selected antibody-producing cells, and are sensitive to a medium, such as a HAT medium. Among them, preferred are murine myeloma lines, such as those derived from mouse tumors MOPC-21 and MPC-11, available from the Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, California, USA, and SP-2 cells (and their derivatives, e.g. X63-Ag8-653), available from the American Type Culture Collection, Manassas, Virginia, USA. Human myeloma and mouse-human heteromyeloma cell lines have also been described for the production of human monoclonal antibodies (Kozbor et al., J. Immunol. 1984, 133(6):3001-3005; Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, 1987, pp. 51-63, Marcel Dekker, Inc., New York).

Культуральную среду, в которой растут клетки гибридомы, анализируют на продукцию моноклональных антител против антигена. Предпочтительно специфичность связывания моноклональных антител, продуцируемых клетками гибридомы, определяют с помощью иммунопреципитации или анализа связывания in vitro, такого как радиоиммуноанализ (RIA) или твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA). Такие методики и анализы известны в данной области. Например, аффинность связывания можно определить с помощью анализа Скэтчарда (Munson, Anal. Biochem. 1980, 107(1): 220-239.The culture medium in which hybridoma cells grow is analyzed for the production of monoclonal antibodies against the antigen. Preferably, the binding specificity of monoclonal antibodies produced by hybridoma cells is determined using immunoprecipitation or an in vitro binding assay such as a radioimmunoassay (RIA) or an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Such techniques and assays are known in the art. For example, binding affinity can be determined using the Scatchard assay (Munson, Anal. Biochem. 1980, 107(1): 220-239.

После идентификации гибридомных клеток, которые продуцируют антитела с требуемой специфичностью, аффинностью и/или активностью, клоны могут быть субклонированы с помощью процедур лимитирующих разведений, и выращены стандартными способами (публикация Goding, см. выше). Подходящие для этой цели питательные среды включают, например, среду D-MEM или RPMI-1640. Кроме того, клетки гибридомы можно выращивать in vivo в виде опухолей у млекопитающих.Once hybridoma cells are identified that produce antibodies with the desired specificity, affinity and/or activity, clones can be subcloned using limiting dilution procedures and grown by standard methods (Goding publication, supra). Suitable culture media for this purpose include, for example, D-MEM or RPMI-1640 media. In addition, hybridoma cells can be grown in vivo as tumors in mammals.

Моноклональные антитела, секретируемые субклонами, соответствующим образом выделяют из культуральной среды, асцитной жидкости или сыворотки с помощью обычных процедур очистки иммуноглобулина, таких как, например, протеин А-сефароза, хроматография на гидроксиапатите, гельэлектрофорез, диализ или аффинная хроматография.Monoclonal antibodies secreted by the subclones are suitably isolated from culture medium, ascites fluid or serum using conventional immunoglobulin purification procedures such as, for example, protein A-Sepharose, hydroxyapatite chromatography, gel electrophoresis, dialysis or affinity chromatography.

Антитела могут быть получены путем иммунизации соответствующего животного-хозяина против антигена. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антиген представляет собой полипептид, содержащий полноразмерный антиген CTLA-4. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антиген представляет собой полипептид, содержащий растворимый CTLA-4. ВAntibodies can be obtained by immunizing an appropriate host animal against the antigen. In one embodiment of the present invention, the antigen is a polypeptide containing the full-length CTLA-4 antigen. In one embodiment of the present invention, the antigen is a polypeptide containing soluble CTLA-4. IN

- 39 045931 одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антиген представляет собой полипептид, содержащий область, соответствующую аминокислотам в положении от 97 (Glu) до положения 106 (Leu) CTLA-4 человека (внеклеточный домен, SEQ ID NO: 28). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антиген является полипептидом, содержащим область, соответствующую аминокислотам в положении от 99 (Met) до положения 106 (Leu) CTLA-4 человека (внеклеточный домен, SEQ ID NO: 28). Также в настоящее изобретение включены антитела, полученные путем иммунизации животного против антигена. Антитела могут включать любые признаки, по отдельности или в комбинации, как описано выше в разделе Примеры анти-CTLA-4 антител.- 39 045931 In one embodiment of the present invention, the antigen is a polypeptide containing a region corresponding to amino acids at position 97 (Glu) to position 106 (Leu) of human CTLA-4 (extracellular domain, SEQ ID NO: 28). In one embodiment of the present invention, the antigen is a polypeptide containing a region corresponding to amino acids at position 99 (Met) to position 106 (Leu) of human CTLA-4 (extracellular domain, SEQ ID NO: 28). Also included in the present invention are antibodies obtained by immunizing an animal against an antigen. The antibodies may include any of the features, alone or in combination, as described above in the Examples of Anti-CTLA-4 Antibodies section.

В. Исследования.B. Research.

Предусмотренные в настоящем изобретении анти-CTLA-4-антитела могут быть идентифицированы, подвергнуты скринингу или охарактеризованы в отношении их физических/химических свойств и/или биологической активности с помощью различных исследований, известных в данной области.Anti-CTLA-4 antibodies provided herein can be identified, screened or characterized for their physical/chemical properties and/or biological activity using various assays known in the art.

1. Связывание и другие исследования1. Binding and other studies

В другом объекте настоящего изобретения антитело проверяют на антигенсвязывающую активность, например, с помощью известных методов, таких как ELISA, вестерн-блоттинг, метод поверхностного плазмонного резонанса и т.д.In another aspect of the present invention, the antibody is tested for antigen binding activity, for example, using known methods such as ELISA, Western blotting, surface plasmon resonance, etc.

В другом объекте настоящего изобретения конкурентные исследования можно использовать для идентификации антитела, которое конкурирует с анти-CTLA-4 антителами, описанными в настоящем изобретении (например, анти-CTLA-4 антителами, описанными в табл. 4, табл. 9, табл. 14 и табл. 19) за связывание с CTLA-4. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения, если такое конкурирующее антитело присутствует в избытке, связывание эталонного антитела с CTLA-4 предотвращается (например, уменьшается) по меньшей мере на 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75 или выше. В некоторых примерах связывание предотвращено по меньшей мере на 80, 85, 90, 95% или выше. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения такое конкурирующее антитело связывается с тем же эпитопом (например, линейным или конформационным эпитопом), который связывается ант'и-СТЪЛ^ антителами, описанными в настоящем изобретении (например, анmи-CTLA-4 антителами, описанными в табл. 4, табл. 9, табл. 14 и табл. 19). Подробные стандартные методы картирования эпитопа, с которым связывается антитело, представлены в публикации Morris Epitope Mapping Protocols в кн.: Methods in Molecular Biology том 66, изд. Humana Press, Тотова, Нью-Джерси.In another aspect of the present invention, competition assays can be used to identify an antibody that competes with the anti-CTLA-4 antibodies described in the present invention (for example, the anti-CTLA-4 antibodies described in Table 4, Table 9, Table 14 and Table 19) for binding to CTLA-4. In some embodiments of the present invention, if such a competing antibody is present in excess, binding of the reference antibody to CTLA-4 is prevented (e.g., reduced) by at least 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50. 55, 60, 65, 70, 75 or higher. In some examples, binding is prevented by at least 80, 85, 90, 95% or greater. In some embodiments of the present invention, such a competitive antibody binds to the same epitope (for example, a linear or conformational epitope) that is bound by the anti-CTLA-4 antibodies described in the present invention (for example, the anti-CTLA-4 antibodies described in Table 4, table 9, table 14 and table 19). Detailed standard methods for mapping the epitope to which an antibody binds are presented in Morris Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology vol. 66, ed. Humana Press, Totowa, NJ.

В примере конкурентного анализа иммобилизованный CTLA-4 инкубируют в растворе, содержащем первое меченое антитело, которое связывается с CTLA-4, и второе немеченое антитело, которое тестируют на его способность конкурировать с первым антителом за связывание с CTLA-4. Второе антитело может присутствовать в супернатанте гибридомы. В качестве контроля иммобилизованный CTLA-4 инкубируют в растворе, содержащем первое меченое антитело, но не второе немеченое антитело. После инкубации в условиях, допускающих связывание первого антитела с CTLA-4, удаляют избыток несвязавшегося антитела и измеряют количество метки, связанной с иммобилизованным CTLA-4. Если количество метки, связанной с иммобилизованным CTLA-4, существенно снижено в тестируемом образце по сравнению с контрольным образцом, то это указывает на то, что второе антитело конкурирует с первым антителом за связывание с CTLA-4. См. Antibodies: A Laboratory Manual, 1988, глава 14, под ред. Е. Harlow и D. Lane, изд-во Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbour, Нью-Йорк.In an example of a competition assay, immobilized CTLA-4 is incubated in a solution containing a first labeled antibody that binds to CTLA-4 and a second unlabeled antibody that is tested for its ability to compete with the first antibody for binding to CTLA-4. The second antibody may be present in the supernatant of the hybridoma. As a control, immobilized CTLA-4 was incubated in a solution containing the first labeled antibody but not the second unlabeled antibody. After incubation under conditions allowing binding of the first antibody to CTLA-4, excess unbound antibody is removed and the amount of label bound to the immobilized CTLA-4 is measured. If the amount of label bound to immobilized CTLA-4 is significantly reduced in the test sample compared to the control sample, this indicates that the second antibody is competing with the first antibody for binding to CTLA-4. See Antibodies: A Laboratory Manual, 1988, chapter 14, ed. E. Harlow and D. Lane, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York.

2. Исследование активности.2. Activity research.

В одном объекте настоящего изобретения предусматривают анализы для идентификации антиCTLA-4 антител, обладающих биологической активностью. Биологическая активность может включать, например, активность ингибирующую пролиферацию клеток, цитотоксическую активность (например, активность ADCC/CDC и активность ADCP), иммуностимулирующую активность и ингибирующую активность CTLA-4. Также предусматривают антитела, обладающие такой биологической активностью in vivo и/или in vitro.In one aspect of the present invention, assays are provided to identify anti-CTLA-4 antibodies having biological activity. Biological activities may include, for example, cell proliferation inhibitory activity, cytotoxic activity (eg, ADCC/CDC activity and ADCP activity), immunostimulatory activity, and CTLA-4 inhibitory activity. Antibodies having such biological activity in vivo and/or in vitro are also provided.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело по настоящему изобретению тестируют на такую биологическую активность.In some embodiments, the antibody of the present invention is tested for such biological activity.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело по настоящему изобретению тестируют на его способность ингибировать рост или пролиферацию клеток in vitro. Анализы ингибирования роста или пролиферации клеток хорошо известны в данной области. Определенные анализы клеточной пролиферации, например описанные в настоящем изобретении анализы уничтожения клеток, измеряют жизнеспособность клеток. Одним из таких анализов является люминесцентный анализ жизнеспособности клеток CellTiter-GloTM, который коммерчески доступен от фирмы Promega (Мэдисон, Висконсин). Этот анализ определяет количество жизнеспособных клеток в культуре на основе количественного определения присутствующего АТФ, что является признаком метаболически активных клеток. См. Crouch с соавт. J. Immunol. Meth. 1993, 160:81-88, US 6602677. Исследование может быть выполнено в 96- или 384-луночном формате, что делает его пригодным для автоматизированного высокопроизводительного скрининга. См. Cree с соавт. AntiCancer Drugs, 1995, 6:398-404. Процедура анализа включает добавление единственного реагента (реагент CellTiter-Glo (зарегистрированная торговая марка)) непосредственно к культивируемым клеткам. Это приводит к лизису клеток и генерации люминесцентногоIn some embodiments, an antibody of the present invention is tested for its ability to inhibit cell growth or proliferation in vitro. Cell growth or proliferation inhibition assays are well known in the art. Certain cell proliferation assays, such as the cell killing assays described herein, measure cell viability. One such assay is the CellTiter-GloTM Luminescent Cell Viability Assay, which is commercially available from Promega (Madison, WI). This assay determines the number of viable cells in a culture based on the quantification of ATP present, an indication of metabolically active cells. See Crouch et al. J. Immunol. Meth. 1993, 160:81-88, US 6602677. The assay can be performed in 96- or 384-well format, making it suitable for automated high-throughput screening. See Cree et al. AntiCancer Drugs 1995, 6:398-404. The assay procedure involves adding a single reagent (CellTiter-Glo Reagent (registered trademark)) directly to the cultured cells. This leads to cell lysis and generation of luminescent

- 40 045931 сигнала, вызванного люциферазной реакцией. Люминесцентный сигнал пропорционален количеству присутствующей АТФ, которое прямо пропорционально количеству жизнеспособных клеток, присутствующих в культуре. Данные могут быть зарегистрированы с помощью люминометра или устройства формирования изображения камеры CCD. Выход люминесценции выражается в относительных световых единицах (RLU - relative light units).- 40 045931 signal caused by the luciferase reaction. The luminescent signal is proportional to the amount of ATP present, which is directly proportional to the number of viable cells present in the culture. Data can be recorded using a luminometer or a CCD camera imaging device. The luminescence output is expressed in relative light units (RLU - relative light units).

Другим тестом на пролиферацию клеток является анализ МТТ -колориметрический анализ, который измеряет окисление бромида 3-(4,5-диметилтиазол-2-ил)-2,5-дифенилтетразолия до формазана под действием митохондриальной редуктазы. См., например, Mosmann, J. Immunol. Meth., 1983, 65:55-63; Zhang с соавт., Cancer Res. 2005, 65:3877-3882.Another test for cell proliferation is the MTT assay, a colorimetric assay that measures the oxidation of 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide to formazan by mitochondrial reductase. See, for example, Mosmann, J. Immunol. Meth., 1983, 65:55-63; Zhang et al., Cancer Res. 2005, 65:3877-3882.

Клетки для применения в любом из вышеперечисленных анализов in vitro включают клетки или клеточные линии, которые естественным образом экспрессируют CTLA-4 или которые были сконструированы для экспрессии CTLA-4. Такие клетки также включают клеточные линии, которые экспрессируют CTLA-4, и клеточные линии, которые в норме не экспрессируют CTLA-4, но трансфицированы нуклеиновой кислотой, кодирующей CTLA-4.Cells for use in any of the above in vitro assays include cells or cell lines that naturally express CTLA-4 or that have been engineered to express CTLA-4. Such cells also include cell lines that express CTLA-4 and cell lines that do not normally express CTLA-4 but are transfected with a nucleic acid encoding CTLA-4.

В одном объекте настоящего изобретения описанное анти-CTLA-4 антитело тестируют на способность ингибировать рост или пролиферацию клеток in vivo. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело тестируют на способность ингибировать рост опухоли in vivo. В таком тестировании могут быть применены модельные системы in vivo, например модели ксенотрансплантата. В иллюстративной системе ксенотрансплантата опухолевые клетки человека вводят подходящему животному с ослабленным иммунитетом, отличному от человека, например бестимусной голой мыши. Антитело по настоящему изобретению вводят животному. Измеряют способность антитела ингибировать или уменьшать рост опухоли. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения, касающихся выше указанной системы ксенотрансплантата, опухолевые клетки человека представляют собой опухолевые клетки от пациента-человека. Такие модели ксенотрансплантатов коммерчески доступны от фирмы Oncotest GmbH (Фриберг, Германия). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения опухолевые клетки человека вводят животному с подходящим иммунодефицитом, но не человеку, путем подкожной инъекции или путем трансплантации в подходящее место, такое как жировая ткань молочной железы.In one aspect of the present invention, the described anti-CTLA-4 antibody is tested for its ability to inhibit cell growth or proliferation in vivo. In some embodiments, the anti-CTLA-4 antibody is tested for its ability to inhibit tumor growth in vivo. In vivo model systems, such as xenograft models, can be used in such testing. In an exemplary xenograft system, human tumor cells are administered to a suitable immunocompromised non-human animal, such as an athymic nude mouse. The antibody of the present invention is administered to an animal. The ability of an antibody to inhibit or reduce tumor growth is measured. In some embodiments of the present invention relating to the above xenograft system, the human tumor cells are tumor cells from a human patient. Such xenograft models are commercially available from Oncotest GmbH (Friberg, Germany). In some embodiments of the present invention, human tumor cells are administered to a suitably immunocompromised animal, other than a human, by subcutaneous injection or by transplantation into a suitable site, such as mammary adipose tissue.

Очевидно, что любое из вышеперечисленных исследований можно проводить с использованием иммуноконъюгата по настоящему изобретению в место или в дополнение к анти-CTLA-4 антителу.It will be appreciated that any of the above studies can be performed using the immunoconjugate of the present invention in place of or in addition to the anti-CTLA-4 antibody.

Типичный анализ для измерения активности ADCC терапевтического антитела основан на анализе высвобождения 51Cr и включает следующие этапы: мечение клеток-мишеней [51Cr]Na2CrO4; опсонизацию клеток-мишеней, экспрессирующих антиген на клеточной поверхности, антителом; объединение опсонизированных меченных радиоактивным изотопом клеток-мишеней с эффекторными клетками в подходящем соотношении в микротитрационном планшете в присутствии или в отсутствие тестируемого антитела; инкубация смеси клеток предпочтительно в течение от 16 до 18 ч, предпочтительно при 37°С сбор супернатанта; и анализ радиоактивности в образце супернатанта. Затем определяют цитотоксичность тестируемого антитела, например, по следующему уравнению: степень удельной цитотоксичности (%)=(радиоактивность в присутствии антитела - радиоактивность в отсутствие антитела)/(максимальная радиоактивность - радиоактивность в отсутствие антитело)х 100. График можно построить, изменив соотношение клеток-мишеней и эффекторных клеток или концентрацию антител.A typical assay for measuring the ADCC activity of a therapeutic antibody is based on a 51 Cr release assay and includes the following steps: labeling target cells with [ 51 Cr]Na 2 CrO 4 ; opsonization of target cells expressing antigen on the cell surface with an antibody; combining opsonized radiolabeled target cells with effector cells in a suitable ratio in a microtiter plate in the presence or absence of a test antibody; incubating the cell mixture preferably for 16 to 18 hours, preferably at 37°C collecting the supernatant; and analysis of radioactivity in the supernatant sample. The cytotoxicity of the test antibody is then determined, for example, using the following equation: degree of specific cytotoxicity (%) = (radioactivity in the presence of antibody - radioactivity in the absence of antibody) / (maximum radioactivity - radioactivity in the absence of antibody) x 100. The graph can be constructed by changing the ratio of cells -targets and effector cells or antibody concentration.

Для оценки активации комплемента можно провести анализ комплементзависимой цитотоксичности (CDC), как описано, например, в Gazzano-Santoro с соавт., J. Immunol. Methods, 1996, 202:163. Вкратце, различные концентрации варианта полипептида и комплемента человека разводят буфером. Клетки, экспрессирующие антиген, с которым связывается вариант полипептида, разводят до плотности приблизительно 1 х 106 клеток/мл. Смесь варианта полипептида, разбавленного комплемента человека и антигенэкспрессирующих клеток добавляют в плоскодонный 96-луночный планшет для тканевых культур и инкубируют при 37°С и в атмосфере 5% СО2 в течение 2 ч для стимулирования опосредованного комплементом клеточного лизиса. Затем в каждую лунку добавляют по 50 мкл красителя Alamar Blue (фирма Accumed International) и инкубируют при 37°С в течение ночи. Поглощение измеряют с использованием 96-луночного флуориметра с возбуждением при 530 нм и испусканием при 590 нм. Результаты представлены в относительных единицах флуоресценции (RFU - relative fluorescence units). Концентрации образца можно рассчитать по стандартной кривой, и процент активности по сравнению с невариантным полипептидом указывается для представляющего интерес варианта полипептида.To assess complement activation, a complement-dependent cytotoxicity (CDC) assay can be performed, as described, for example, in Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods, 1996, 202:163. Briefly, various concentrations of the polypeptide variant and human complement are diluted in buffer. Cells expressing the antigen to which the variant polypeptide binds are diluted to a density of approximately 1 x 106 cells/ml. A mixture of variant polypeptide, dilute human complement, and antigen-expressing cells is added to a flat-bottomed 96-well tissue culture plate and incubated at 37° C. and 5% CO 2 for 2 hours to stimulate complement-mediated cell lysis. 50 μl of Alamar Blue dye (Accumed International) was then added to each well and incubated at 37°C overnight. Absorbance is measured using a 96-well fluorimeter with excitation at 530 nm and emission at 590 nm. The results are presented in relative fluorescence units (RFU). Sample concentrations can be calculated from a standard curve, and the percentage of activity relative to the non-variant polypeptide is reported for the variant polypeptide of interest.

Один из способов анализа активности ADCP может включать следующее: покрытие биочастицмишений, таких как Е. coli, меченных FITC (фирма Molecular Probes), или Staphylococcus aureus-FITC, тестируемым антителом; формирование опсонизированных частиц; добавление вышеуказанных опсонизированных частиц к эффекторным клеткам ТНР-1 (моноцитарная клеточная линия, доступная в АТСС) в соотношении 1:1, 10:1, 30:1, 60:1, 75:1 или 100:1 для индукции FcYR-опосредованного фагоцитозу; предпочтительно инкубировать клетки и Е. coli-FITC/антитело при 37° в течение 1,5 ч; после инкубации добавление к клеткам красителя трипанового синего (желательно при комнатной температуре в течениеOne method for assaying ADCP activity may include: coating bioparticles such as FITC-labeled E. coli (Molecular Probes) or Staphylococcus aureus-FITC with a test antibody; formation of opsonized particles; adding the above opsonized particles to THP-1 effector cells (a monocytic cell line available from ATCC) at a ratio of 1:1, 10:1, 30:1, 60:1, 75:1 or 100:1 to induce FcYR-mediated phagocytosis ; it is preferable to incubate cells and E. coli-FITC/antibody at 37°C for 1.5 hours; after incubation, adding trypan blue dye to the cells (preferably at room temperature for

- 41 045931 двух-трех минут) для гашения флуоресценции бактерий, не внедрившихся в клетки и прикрепившихся к внешней поверхности клеток; перенос клеток в буфер FACS (например, 0,1% БСА и 0,1% азида натрия в PBS) для анализа флуоресценции клеток ТНР-1 с использованием FACS (например, BD FACS Calibur). Чтобы оценить степень ADCP, гейт предпочтительно устанавливают на клетках THP-1 и измеряют среднюю интенсивность флуоресценции. В наиболее предпочтительных вариантах осуществления настоящего изобретения анализ ADCP проводят с использованием Е. coli-FITC в среде (контроль); клетки Е. coliFITC и THP-1 (используют как FcYR-независимую активность ADCP); и Е. coli-FITC, клетки THP-1 и тестируемое антитело (используемое как FcYR-зависимая активность ADCP).- 41 045931 two to three minutes) to quench the fluorescence of bacteria that have not penetrated the cells and are attached to the outer surface of the cells; transfer cells into FACS buffer (eg, 0.1% BSA and 0.1% sodium azide in PBS) for fluorescence analysis of THP-1 cells using FACS (eg, BD FACS Calibur). To assess the extent of ADCP, a gate is preferably installed on THP-1 cells and the average fluorescence intensity is measured. In the most preferred embodiments of the present invention, the ADCP assay is performed using E. coli-FITC in media (control); E. coliFITC and THP-1 cells (used as FcYR-independent ADCP activity); and E. coli-FITC, THP-1 cells and test antibody (used as FcYR-dependent ADCP activity).

Цитотоксическая активность антитела обычно включает связывание антитела с клеточной поверхностью. Экспрессия антигена на поверхности клетки-мишени может быть надлежащим образом подтверждена способами, известными специалистам в данной области, такими как FACS.The cytotoxic activity of an antibody typically involves binding of the antibody to the cell surface. Expression of the antigen on the surface of the target cell can be suitably confirmed by methods known to those skilled in the art, such as FACS.

Активацию иммунитета можно обнаружить, используя в качестве индикаторов клеточный или гуморальный иммунный ответ. Активация иммунитета включает, в частности, повышение уровня экспрессии цитокинов (например, IL-6, G-CSF, IL-12, TNFa и ZFNy) или их рецепторов, стимулирование пролиферации иммунных клеток (например, В-клеток, Т-клеток, клеток NK, макрофагов и моноцитов), повышенное состояние активации, повышенные функции и повышенная цитотоксическая активность. В частности, активацию Т-клеток можно обнаружить путем измерения повышенной экспрессии маркеров активации, таких как CD25, CD69 и ICOS. Например, известно, что у пациентов, которым вводят анти-CTLA4 антитело, ипилимумаб, после введения наблюдают повышение ICOS+ CD4+ Т-клеток в периферической крови, и это рассматривают в качестве эффекта активации системного иммунного статуса введением анtu-CTLA-4 антитела (Cancer Immunol. Res., 2013, 1(4): 229-234).Immune activation can be detected using cellular or humoral immune responses as indicators. Immune activation includes, but is not limited to, increasing the expression of cytokines (e.g., IL-6, G-CSF, IL-12, TNFa and ZFNy) or their receptors, stimulating the proliferation of immune cells (e.g., B cells, T cells, NK, macrophages and monocytes), increased activation state, increased functions and increased cytotoxic activity. In particular, T cell activation can be detected by measuring increased expression of activation markers such as CD25, CD69 and ICOS. For example, patients receiving the anti-CTLA4 antibody, ipilimumab, are known to experience an increase in ICOS+ CD4+ T cells in the peripheral blood after administration, and this is considered to be an effect of activation of the systemic immune status by the administration of the anti-CTLA-4 antibody (Cancer Immunol Res., 2013, 1(4): 229-234).

Для активации Т-клеток требуется не только стимуляция через антигенный рецептор (TCR), но и вспомогательная стимуляция через CD28. Когда CD28 на поверхности Т-клетки связывается с В7-1 (CD80) или В7-2 (CD86) на поверхности антигенпрезентирующей клетки, вспомогательный сигнал передается на Т-клетку, и затем Т-клетка активируется. С другой стороны, CTLA-4 экспрессируется на поверхности активированных Т-клеток. Поскольку CTLA-4 связывается с CD80 и CD86 с большей аффинностью, чем с CD28, он взаимодействует с CD80 и CD86 в большей степени, чем с CD28, что приводит к подавлению активации Т-клеток.Activation of T cells requires not only stimulation through the antigen receptor (TCR), but also ancillary stimulation through CD28. When CD28 on the surface of a T cell binds to B7-1 (CD80) or B7-2 (CD86) on the surface of an antigen-presenting cell, an auxiliary signal is transmitted to the T cell, and the T cell is then activated. On the other hand, CTLA-4 is expressed on the surface of activated T cells. Because CTLA-4 binds to CD80 and CD86 with greater affinity than CD28, it interacts with CD80 and CD86 more than CD28, resulting in suppression of T cell activation.

Основываясь на таком механизме действия, ингибирующую активность в отношении CTLA-4 можно измерить как активность ингибирования связывания CTLA-4 с CD80 или CD86. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анализ измерения ингибирующей активности в отношении CTLA-4 включает следующие этапы: обеспечение возможности связывания очищенного белка CTLA-4 с подложкой, такой как планшет для микротитрования или магнитные гранулы; добавление тестируемого антитела и меченого растворимого CD80 или CD86; вымывание несвязавшихся компонентов; и количественное определение связанного меченого CD80 или CD86. Реагирует ли тестируемое антитело перекрестно с CD28 или нет, можно подтвердить, выполнив аналогичный анализ, в котором вместо CTLA-4 используется CD28. Более того, в другом варианте осуществления настоящего изобретения функциональный анализ, который выявляет активацию Т-клеток, как описано выше, также можно использовать для измерения ингибирующей активности в отношении CTLA-4. Например, когда тестируемое антитело, обладающее ингибирующей активностью в отношении CTLA-4, добавляется в систему, в которой активация Т-клеток измеряется путем стимуляции популяции Т-клеток клетками, экспрессирующими CD80 или CD86, активация Т-клеток дополнительно усиливается.Based on this mechanism of action, CTLA-4 inhibitory activity can be measured as the activity of inhibiting the binding of CTLA-4 to CD80 or CD86. In one embodiment of the present invention, the assay for measuring CTLA-4 inhibitory activity includes the following steps: allowing the purified CTLA-4 protein to bind to a support, such as a microtiter plate or magnetic beads; adding test antibody and labeled soluble CD80 or CD86; washing out unbound components; and quantification of bound labeled CD80 or CD86. Whether the test antibody cross-reacts with CD28 or not can be confirmed by performing a similar assay in which CD28 is used instead of CTLA-4. Moreover, in another embodiment of the present invention, a functional assay that detects T cell activation as described above can also be used to measure CTLA-4 inhibitory activity. For example, when a test antibody having CTLA-4 inhibitory activity is added to a system in which T cell activation is measured by stimulating a population of T cells with cells expressing CD80 or CD86, T cell activation is further enhanced.

Г. Иммуноконъюгаты.D. Immunoconjugates.

В настоящем изобретении также предлагаются иммуноконъюгаты, включающие анти-CTLA-4 антитело, конъюгированное в настоящем документе с одним или более цитотоксическими агентами, такими как химиотерапевтические агенты или лекарственные средства, ингибирующие рост агенты, токсины (например, белковые токсины, ферментативно активные токсины бактерий, грибов, растений, или животного происхождения, или их фрагменты) или радиоактивные изотопы.The present invention also provides immunoconjugates comprising an anti-CTLA-4 antibody conjugated herein to one or more cytotoxic agents, such as chemotherapeutic agents or drugs, growth inhibitory agents, toxins (e.g., protein toxins, enzymatically active bacterial toxins, fungi, plants, or animals, or their fragments) or radioactive isotopes.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения иммуноконъюгат представляет собой конъюгат антитело-лекарственное средство (ADC - antibody-drug conjugate), в котором антитело конъюгировано с одним или несколькими лекарственными средствами, включая, помимо прочего, майтансиноид (см. патенты US 5208020, US5416064 и европейский патент ЕР 0425235 В1); ауристатин, такой как молекулы монометилауристатина DE и DF (ММАЕ и MMAF) (см. US 5635483, US 5780588 и US 7498298); доластатин; калихеамицин или его производное (см. патенты US 5712374, US 5714586, US 5739116, US 5767285, US 5770701, US 5770710, US 5773001 и US 5877296; Hinman с соавт., Cancer Res. 1993, 53: 3336-3342; Lode с соавт., Cancer Res. 1998, 58: 2925-2928); антрациклин, такой как дауномицин или доксорубицин (см. Kratz с соавт., Current Med. Chem. 2006, 13: 477-523; Jeffrey с соавт., Bioorganic & Med. Chem. Letters 2006, 16: 358-362; Torgov с соавт., Bioconj. Chem. 2005, 16: 717-721; Nagy с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97: 829-834; Dubowchik с соавт., Bioorg. &Med. Chem. Letters 2002, 12: 1529-1532; King с соавт., J. Med. Chem. 2002, 45:4336-4343; US 6630579); метотрексат; виндезин; таксан, такой как доцетаксел, паклитаксел, ларотаксел, тезетаксел и ортатаксел; трихотецен; и СС1065.In one embodiment of the present invention, the immunoconjugate is an antibody-drug conjugate (ADC) in which the antibody is conjugated to one or more drugs, including, but not limited to, a maytansinoid (see US Pat. Nos. 5,208,020, US 5,416,064, and European patent EP 0425235 B1); auristatin, such as monomethyl auristatin molecules DE and DF (MMAE and MMAF) (see US 5635483, US 5780588 and US 7498298); dolastatin; calicheamicin or a derivative thereof (see US 5712374, US 5714586, US 5739116, US 5767285, US 5770701, US 5770710, US 5773001 and US 5877296; Hinman et al., Cancer Res. 1993, 53: 3336-33 42; Lode s et al., Cancer Res. 1998, 58: 2925-2928); an anthracycline such as daunomycin or doxorubicin (see Kratz et al., Current Med. Chem. 2006, 13: 477-523; Jeffrey et al., Bioorganic & Med. Chem. Letters 2006, 16: 358-362; Torgov et al. et al., Bioconj. Chem. 2005, 16: 717-721; Nagy et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97: 829-834; Dubowchik et al., Bioorg. & Med. Chem. Letters 2002 , 12: 1529-1532; King et al., J Med Chem 2002, 45:4336-4343; US 6630579); methotrexate; vindesine; a taxane such as docetaxel, paclitaxel, larotaxel, tesetaxel and ortataxel; trichothecene; and CC1065.

- 42 045931- 42 045931

В другом варианте осуществления настоящего изобретения иммуноконъюгат содержит антитело, как описано в настоящем изобретении, конъюгированное с ферментативно активным токсином или его фрагментом, включая, помимо прочего, цепь А дифтерийного токсина, несвязывающиеся активные фрагменты дифтерийного токсина, цепь А экзотоксина (из Pseudomonas aeruginosa), цепь А рицина, цепь А абрина, цепь А модеццина, альфа-сарцин, белки Aleuritesfordii, белки диантина, белки Phytolacca americana (PAPI, PAPII и PAP-S), ингибитор Momordica charantia, куриц, каротин, ингибитор Saponaria officinalis, Г аланин, митогеллин, рестриктоцин, феномицин, эномицин и трихотецены.In another embodiment of the present invention, the immunoconjugate comprises an antibody as described herein conjugated to an enzymatically active toxin or fragment thereof, including, but not limited to, diphtheria toxin A chain, non-binding active diphtheria toxin fragments, exotoxin A chain (from Pseudomonas aeruginosa), ricin A chain, abrin A chain, modezzan A chain, alpha-sarcin, Aleuritesfordii proteins, diantine proteins, Phytolacca americana proteins (PAPI, PAPII and PAP-S), Momordica charantia inhibitor, chicken, carotene, Saponaria officinalis inhibitor, G alanine, mitogellin, restrictocin, fenomycin, enomycin and trichothecenes.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения иммуноконъюгат содержит описанное в настоящем изобретении антитело, конъюгированное с радиоактивным атомом с образованием радиоконъюгата. Для производства радиоконъюгатов доступны различные радиоактивные изотопы. Примеры включают 211At, 131I, 125I,90Y, 186Re, 188Re, 153Sm, 212Bi, 32P, 212Pb и радиоактивные изотопы Lu. Когда радиоконъюгат используют для обнаружения, он может содержать радиоактивный атом для сцинтиграфических исследований, например, Тс-99ш или 123I, или спиновую метку для визуализации методом ядерного магнитного резонанса (ЯМР) (также известным как магнитно-резонансная томография, МРТ), такой как йод-123, йод-131, индий-111, фтор-19, углерод-13, азот-15, кислород-17, гадолиний, марганец или железо.In another embodiment of the present invention, the immunoconjugate contains an antibody described in the present invention, conjugated to a radioactive atom to form a radioconjugate. Various radioactive isotopes are available for the production of radioconjugates. Examples include 211 At, 131 I, 125 I, 90 Y, 186 Re, 188 Re, 153 Sm, 212 Bi, 32 P, 212 Pb and radioactive isotopes of Lu. When the radioconjugate is used for detection, it may contain a radioactive atom for scintigraphic studies, such as Tc-99sh or 123 I, or a spin label for nuclear magnetic resonance (NMR) imaging (also known as magnetic resonance imaging, MRI), such as iodine-123, iodine-131, indium-111, fluorine-19, carbon-13, nitrogen-15, oxygen-17, gadolinium, manganese or iron.

Конъюгаты антитела и цитотоксического агента могут быть получены с использованием различных бифункциональных связывающих белков агентов, таких как №сукцинимидил-3-(2пиридилдитио)пропионат (SPDP), сукцинимидил-4-(№малеимидометил)циклогексан-1-карбоксилат (SMCC), иминотиолан (IT), бифункциональные производные имидоэфиров (такие как диметиладипимидат HCl), активные сложные эфиры (такие как дисукцинимидилсуберат), альдегиды (такие как глутаровый альдегид), бис-азидосоединения (такие как бис(п-азидобензоил) гександиамин), производные бисдиазония (такие как бис-(п-диазонийбензоил)-этилендиамин), диизоцианаты (такие как толуол 2,6диизоцианат) и биактивные соединения фтора (такие как 1,5-дифтор-2, 4-динитробензол). Например, рициновый иммунотоксин можно получить, как описано в Vitetta с соавт., Science 1987, 238:1098. Меченая углеродом-141-изотиоцианатобензил-3-метилдиэтилентриаминпентауксусная кислота (MX-DTPA) является типичным хелатирующим агентом для конъюгации радионуклида с антителом. См. WO 94/11026. Линкер может быть расщепляемым линкером, облегчающим высвобождение цитотоксического лекарственного средства в клетке. Например, можно использовать кислотолабильный линкер, пептидазочувствительный линкер, фотолабильный линкер, диметиллинкер или дисульфид-содержащий линкер (Chari с соавт., Cancer Res. 1992, 52: 127-131; US 5208020).Antibody-cytotoxic agent conjugates can be prepared using various bifunctional protein coupling agents such as N-succinimidyl-3-(2pyridyldithio)propionate (SPDP), succinimidyl-4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate (SMCC), iminothiolane ( IT), bifunctional imidoester derivatives (such as dimethyladipimidate HCl), active esters (such as disuccinimidyl suberate), aldehydes (such as glutaraldehyde), bis-azido compounds (such as bis(p-azidobenzoyl)hexanediamine), bisdiazonium derivatives (such as bis(p-diazoniumbenzoyl)ethylenediamine), diisocyanates (such as toluene 2,6diisocyanate) and biactive fluorine compounds (such as 1,5-difluoro-2,4-dinitrobenzene). For example, ricin immunotoxin can be prepared as described in Vitetta et al., Science 1987, 238:1098. Carbon-141-isothiocyanatobenzyl-3-methyldiethylenetriaminepentaacetic acid (MX-DTPA) is a typical chelating agent for radionuclide-antibody conjugation. See WO 94/11026. The linker may be a cleavable linker that facilitates release of the cytotoxic drug into the cell. For example, an acid-labile linker, a peptidase-sensitive linker, a photolabile linker, a dimethyl linker, or a disulfide-containing linker can be used (Chari et al., Cancer Res. 1992, 52: 127-131; US 5,208,020).

Иммуноконъюгаты или ADC в настоящем изобретении предусматривают, но не ограничиваются ими, такие конъюгаты, полученные с использованием сшивающих реагентов, включая, наряду с другими, BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, МРВН, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, сульфо-EMCS, сульфо-GMBS, сульфо-KMUS, сульфо-MBS, сульфо-SIAB, сульфо-SMCC и сульфоSMPB, а также SVSB (сукцинимидил-(4-винилсульфон)бензоат), которые являются коммерчески доступными (например, от фирмы Pierce Biotechnology, Inc., Рокфорд, Иллинойс, США).Immunoconjugates or ADCs in the present invention include, but are not limited to, those made using cross-linking reagents, including, but not limited to, BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, sulfo-EMCS, sulfo-GMBS, sulfo-KMUS, sulfo-MBS, sulfo-SIAB, sulfo-SMCC and sulfoSMPB, as well as SVSB (succinimidyl (4-vinyl sulfone) benzoate), which are commercially available (eg, from Pierce Biotechnology, Inc., Rockford, IL, USA).

Д. Способы и композиции для диагностики и изыскания.D. Methods and compositions for diagnostics and research.

В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения любое из представленных в настоящем изобретении анти-CTLA-4 антител применимо для обнаружения присутствия CTLA-4 в биологическом образце. Используемый в настоящем изобретении термин изыскание включает количественное или качественное обнаружение. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения биологический образец включает клетку или ткань, такую как сыворотка, цельная кровь, плазма, образец биопсии, образец ткани, клеточная суспензия, слюна, мокрота, ротовая жидкость, мозговая жидкость, амниотическая жидкость, асцитическая жидкость, молоко, молозиво, секрет молочной железы, лимфа жидкость, моча, пот, слезная жидкость, желудочный сок, синовиальная жидкость, асцитическая жидкость, глазная жидкость и слизь.In certain embodiments of the present invention, any of the anti-CTLA-4 antibodies provided herein are useful for detecting the presence of CTLA-4 in a biological sample. As used herein, the term prospecting includes quantitative or qualitative discovery. In certain embodiments of the present invention, the biological sample includes a cell or tissue, such as serum, whole blood, plasma, biopsy sample, tissue sample, cell suspension, saliva, sputum, oral fluid, brain fluid, amniotic fluid, ascitic fluid, milk, colostrum , breast secretion, lymph fluid, urine, sweat, tear fluid, gastric juice, synovial fluid, ascitic fluid, ocular fluid and mucus.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CTLA-4 антитело для использования в методе диагностики или изыскания. В еще одном объекте настоящего изобретения предложен способ обнаружения присутствия CTLA-4 в биологическом образце. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения способ включает приведение биологического образца в контакт с анти-CTLA-4 антителом как описано в настоящем документе, в условиях, допускающих связывание анти-CTLA-4 антитела с CTLA-4, и определение того, образуется ли комплекс между анти-CTLA-4 антителом и CTLA-4. Такой способ может выполняться in vitro или in vivo. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитело используют для отбора субъектов, подходящих для терапии анти-CTLA-4 антителом, например, где CTLA-4 является биомаркером для отбора пациентов.In one embodiment, the present invention provides an anti-CTLA-4 antibody for use in a diagnostic or research method. In yet another aspect, the present invention provides a method for detecting the presence of CTLA-4 in a biological sample. In certain embodiments of the present invention, the method includes contacting a biological sample with an anti-CTLA-4 antibody as described herein, under conditions allowing the anti-CTLA-4 antibody to bind to CTLA-4, and determining whether a complex is formed between anti-CTLA-4 antibody and CTLA-4. This method can be performed in vitro or in vivo. In one embodiment of the present invention, an anti-CTLA-4 antibody is used to select subjects suitable for anti-CTLA-4 antibody therapy, for example, where CTLA-4 is a biomarker for patient selection.

Антитело по настоящему изобретению можно использовать, например, для проверки состояния иммунного ответа и диагностики дисфункции иммунной системы.The antibody of the present invention can be used, for example, to test the state of the immune response and diagnose immune system dysfunction.

В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают меченые анtu-CTLA-4 антитела. Метки включают, но не ограничиваются ими, метки или фрагменты, которые обнаруживаются непосредственно (например, флуоресцентные, хромофорные, электронно-плотные, хемилюIn certain embodiments, the present invention provides anti-CTLA-4 labeled antibodies. Labels include, but are not limited to, tags or moieties that are directly detectable (e.g., fluorescent, chromophore, electron dense, hemil

- 43 045931 минесцентные и радиоактивные метки), а также фрагменты, такие как ферменты или лиганды, которые обнаруживаются косвенно, например, посредством ферментативной реакции или молекулярного взаимодействия. Примеры меток включают, но не ограничиваются ими, радиоизотопы 32Р, 14С, 125I, 3H и 131I, флуорофоры, такие как хелаты редкоземельных элементов или флуоресцеин и его производные, родамин и его производные, дансил, умбеллиферон, люцериферазы, например, люцифераза светлячка и бактериальная люцифераза (US 4737456), люциферин, 2,3-дигидрофталазиндионы, пероксидаза хрена (HRP), щелочная фосфатаза, бета-галактозидаза, глюкоамилаза, лизоцим, сахаридоксидазы, например, глюкозооксидаза, галактозооксидаза и глюкозо-6-фосфат дегидрогеназа, гетероциклические оксидазы, такие как уриказа и ксантиноксидаза, соединенные с ферментом, который использует перекись водорода для окисления предшественника красителя, такого как HRP, лактопероксидаза или микропероксидаза, биотин/авидин, спиновые метки, бактериофаговые метки, стабильные свободные радикалы и другие.- 43 045931 minescent and radioactive tags), as well as fragments such as enzymes or ligands that are detected indirectly, for example through an enzymatic reaction or molecular interaction. Examples of labels include, but are not limited to, radioisotopes 32 P, 14 C, 125 I, 3 H and 131 I, fluorophores such as rare earth chelates or fluorescein and its derivatives, rhodamine and its derivatives, dansyl, umbelliferone, luceriferases, for example , firefly luciferase and bacterial luciferase (US 4737456), luciferin, 2,3-dihydrophthalazinediones, horseradish peroxidase (HRP), alkaline phosphatase, beta-galactosidase, glucoamylase, lysozyme, saccharide oxidases, e.g. glucose oxidase, galactose oxidase and glucose-6-phosphate dehydrogen aza , heterocyclic oxidases such as uricase and xanthine oxidase coupled to an enzyme that uses hydrogen peroxide to oxidize a dye precursor such as HRP, lactoperoxidase or microperoxidase, biotin/avidin, spin tags, bacteriophage tags, stable free radicals and others.

Е. Фармацевтические составы.E. Pharmaceutical compounds.

Фармацевтические составы анти-CTLA-4 антитела, как описано в настоящем изобретении, готовят путем смешивания такого антитела, имеющего желаемую степень чистоты, с одним или более необязательными фармацевтически приемлемыми носителями (Remington's Pharmaceutical Sciences, 1980, 16-е издание, под ред. Osol А.) в виде лиофилизированных составов или водных растворов. Фармацевтически приемлемые носители обычно нетоксичны для реципиентов в используемых дозировках и концентрациях и включают, но не ограничиваются ими: буферы, такие как фосфатный, цитратный и других органических кислот; антиоксиданты, включая аскорбиновую кислоту и метионин; консерванты (такие как хлорид октадецилдиметилбензиламмония, хлорид гексаметония, хлорид бензалкония, хлорид бензетония, фенол, бутиловый или бензиловый спирт, алкилпарабены, такие как метил-или пропилпарабен, катехол, резорцин, циклогексанол, 3-пентанол и м-крезол); низкомолекулярные (менее примерно 10 остатков) полипептиды; белки, такие как сывороточный альбумин, желатин или иммуноглобулины; гидрофильные полимеры, такие как поливинилпирролидон; аминокислоты, такие как глицин, глутамин, аспарагин, гистидин, аргинин или лизин; моносахариды, дисахариды и другие углеводы, включая глюкозу, маннозу или декстрины; хелатирующие агенты, такие как ЭДТА; сахара, такие как сахароза, маннит, трегалоза или сорбит; солеобразующие противоионы, такие как натрий; комплексы металлов (например, Znбелковые комплексы); и/или неионогенные поверхностно-активные вещества, такие как полиэтиленгликоль (ПЭГ). Примеры фармацевтически приемлемых носителей в настоящем изобретении дополнительно включают интерстициальные агенты для диспергирования лекарственных средств, такие как растворимые нейтрально-активные гликопротеины гиалуронидазы (sHASEGP), например, растворимые гликопротеины гиалуронидазы РН-20 человека, такие как rHuPH20 (HYLENEX (зарегистрированная торговая марка), Baxter International, Inc.). Некоторые показательные sHASEGP и способы применения, включая rHuPH20, описаны в патентных публикациях US 2005/0260186 и US 2006/0104968. В одном из объектов настоящего изобретения sHASEGP сочетается с одной или несколькими гликозаминогликаназами, такими как хондроитиназы.Pharmaceutical compositions of anti-CTLA-4 antibodies, as described in the present invention, are prepared by mixing such antibody, having the desired degree of purity, with one or more optional pharmaceutically acceptable carriers (Remington's Pharmaceutical Sciences, 1980, 16th edition, edited by Osol A.) in the form of lyophilized formulations or aqueous solutions. Pharmaceutically acceptable carriers are generally non-toxic to recipients at the dosages and concentrations used and include, but are not limited to: buffers such as phosphate, citrate and other organic acids; antioxidants including ascorbic acid and methionine; preservatives (such as octadecyldimethylbenzylammonium chloride, hexamethonium chloride, benzalkonium chloride, benzethonium chloride, phenol, butyl or benzyl alcohol, alkylparabens such as methyl or propylparaben, catechol, resorcinol, cyclohexanol, 3-pentanol and m-cresol); low molecular weight (less than about 10 residues) polypeptides; proteins such as serum albumin, gelatin or immunoglobulins; hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone; amino acids such as glycine, glutamine, asparagine, histidine, arginine or lysine; monosaccharides, disaccharides and other carbohydrates, including glucose, mannose or dextrins; chelating agents such as EDTA; sugars such as sucrose, mannitol, trehalose or sorbitol; salt-forming counterions such as sodium; metal complexes (for example, Zn-protein complexes); and/or nonionic surfactants such as polyethylene glycol (PEG). Examples of pharmaceutically acceptable carriers in the present invention further include interstitial drug dispersing agents such as soluble neutral active hyaluronidase glycoproteins (sHASEGP), for example, soluble human hyaluronidase glycoprotein PH-20 such as rHuPH20 (HYLENEX (registered trademark), Baxter International, Inc.). Some representative sHASEGPs and methods of use, including rHuPH20, are described in patent publications US 2005/0260186 and US 2006/0104968. In one aspect of the present invention, sHASEGP is combined with one or more glycosaminoglycanases, such as chondroitinases.

Примеры лиофилизированных составов антител описаны в патенте US 6267958. Водные составы антител включают составы, описанные в патенте US 6171586 и WO 2006/044908, последние составы включают гистидин-ацетатный буфер.Examples of lyophilized antibody formulations are described in US Pat. No. 6,267,958. Aqueous antibody formulations include those described in US Pat. No. 6,171,586 and WO 2006/044908, the latter formulations including histidine acetate buffer.

Состав по настоящему изобретению может также содержать более одного активного ингредиента, если это необходимо для конкретного показания, подлежащего лечению, предпочтительно с дополнительными активностями, которые не оказывают неблагоприятного воздействия друг на друга. Такие активные ингредиенты подходящим образом присутствуют в комбинации в количествах, которые эффективны для намеченной цели.The composition of the present invention may also contain more than one active ingredient if necessary for the particular indication being treated, preferably with additional activities that do not adversely affect each other. Such active ingredients are suitably present in combination in amounts that are effective for the intended purpose.

Активные ингредиенты могут быть заключены в микрокапсулы, приготовленные, например, методами коацервации или межфазной полимеризации, например, микрокапсулы из гидроксиметилцеллюлозы, желатина или поли(метилметакрилата), соответственно, для систем доставки коллоидных лекарственных средств (например, липосомы, альбуминовые микросферы, микроэмульсии, наночастицы и нанокапсулы) или макроэмульсий. Такие методы описаны в кн.: Remington's Pharmaceutical Sciences, 1980, 16е изд., под ред Osol A.The active ingredients can be encapsulated in microcapsules prepared, for example, by coacervation or interfacial polymerization methods, e.g. microcapsules of hydroxymethylcellulose, gelatin or poly(methyl methacrylate), respectively, for colloidal drug delivery systems (e.g. liposomes, albumin microspheres, microemulsions, nanoparticles and nanocapsules) or macroemulsions. Such methods are described in the book: Remington's Pharmaceutical Sciences, 1980, 16th ed., edited by Osol A.

Могут быть приготовлены препараты с замедленным высвобождением. Подходящие примеры препаратов с замедленным высвобождением включают полупроницаемые матрицы из твердых гидрофобных полимеров, содержащие антитело, причем матрицы представлены в виде формованных изделий, например, пленок или микрокапсул.Sustained release formulations can be prepared. Suitable examples of sustained release formulations include semi-permeable matrices of solid hydrophobic polymers containing the antibody, the matrices being in the form of molded articles such as films or microcapsules.

Составы, используемые для введения in vivo, обычно стерильны. Стерильность может быть легко достигнута, например, путем фильтрации через стерильные фильтрующие мембраны.Formulations used for in vivo administration are generally sterile. Sterility can be easily achieved, for example, by filtration through sterile filter membranes.

Ж. Терапевтические способы и композиции.G. Therapeutic methods and compositions.

Любое из анти-CTLA-4 антител, предусмотренных в настоящем изобретении, может применяться в терапевтических способах.Any of the anti-CTLA-4 antibodies provided in the present invention can be used in therapeutic methods.

В одном из объектов настоящего изобретения предусматривают анти-CTLA-4 антител для применения в качестве лекарственного средства. В других объектах предусматривают анти-CTLA-4 антитело для применения в лечении опухолей. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретенияIn one aspect of the present invention, anti-CTLA-4 antibodies are provided for use as a medicine. In other aspects, an anti-CTLA-4 antibody is provided for use in the treatment of tumors. In certain embodiments of the present invention

- 44 045931 предусматривают анти-СТЬА-4 антитело для применения в способе лечения опухолей. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CTLA-4 антитело для применения в способе лечения индивида с опухолью, включающем введение индивиду эффективного количества ηη™-Ο^Α-4 антитела. В одном подобном варианте осуществления настоящего изобретения способ дополнительно включает введение индивиду эффективного количества, по меньшей мере, одного дополнительного терапевтического агента, например, согласно описанному выше. В других вариантах осуществления настоящее изобретение относится к ннти-СТЕАМ антителу, применяемому для повреждения клеток. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают антиCTLA-4 антитело для применения в способе повреждения клеток у индивидуума, включающем введение индивидууму эффективного количества анти-CTLA-4 антитела для повреждения клеток. В других вариантах осуществления предусматривают анти-CTLA-4 антитело, применяемое для активизации иммунитета. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CTLA-4 антитело, применяемое в способе активизации иммунитета у индивида, включающий введение индивиду эффективного количества анти-CTLA-4 антитела для активизации иммунитета. Индивидом в любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения преимущественно является человек.- 44 045931 provide an anti-STA-4 antibody for use in a method of treating tumors. In certain embodiments, the present invention provides an anti-CTLA-4 antibody for use in a method of treating an individual with a tumor, comprising administering to the individual an effective amount of a ηη™-Ο^Α-4 antibody. In one such embodiment of the present invention, the method further includes administering to the individual an effective amount of at least one additional therapeutic agent, for example, as described above. In other embodiments, the present invention relates to a nnti-STEAM antibody used to damage cells. In certain embodiments, the present invention provides an anti-CTLA-4 antibody for use in a method of damaging cells in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of an anti-CTLA-4 antibody to damage cells. In other embodiments, an anti-CTLA-4 antibody is provided for immune activation. In certain embodiments, the present invention provides an anti-CTLA-4 antibody used in a method of activating the immune system in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of an anti-CTLA-4 antibody to activate the immune system. The individual in any of the above embodiments of the present invention is preferably a human.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения опухолью является солидная опухоль. В солидной опухоли опухолевые клетки обычно пролиферируют, образуя популяцию, и опухолевая ткань образована в основном этими клетками. Кроме того, опухолевые ткани живых организмов часто инфильтрированы иммунными клетками, такими как лимфоциты, которые также составляют часть опухолевых тканей. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения опухолевые ткани инфильтруются иммунными клетками, особенно регуляторными Т-клетками (Treg). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения повреждение клеток вызывается активностью ADCC, активностью CDC или активностью ADCP. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения клетки, экспрессирующие CTLA-4 на своей клеточной поверхности, повреждаются. В другом варианте осуществления настоящего изобретения клетки, подлежащие повреждению, представляют собой клетки Treg. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения клетки Treg, проникшие в ткани опухоли, повреждаются. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения иммунитет активируется повреждением клеток Treg (отменяется иммуносупрессия клетками Treg). В других вариантах осуществления настоящего изобретения активируется иммунитет (в частности, противоопухолевый иммунитет) в опухолевых тканях. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения активация иммунитета является активацией Т-клеток.In some embodiments of the present invention, the tumor is a solid tumor. In a solid tumor, tumor cells typically proliferate to form a population, and the tumor tissue is composed primarily of these cells. In addition, tumor tissues of living organisms are often infiltrated by immune cells, such as lymphocytes, which also form part of the tumor tissues. In some embodiments of the present invention, tumor tissues are infiltrated by immune cells, especially regulatory T cells (Treg). In one embodiment of the present invention, cell damage is caused by ADCC activity, CDC activity, or ADCP activity. In one embodiment of the present invention, cells expressing CTLA-4 on their cell surface are damaged. In another embodiment of the present invention, the cells to be damaged are Treg cells. In certain embodiments of the present invention, Treg cells that have infiltrated tumor tissue are damaged. In one embodiment of the present invention, immunity is activated by damage to Treg cells (immunosuppression by Treg cells is reversed). In other embodiments, the present invention activates immunity (in particular, antitumor immunity) in tumor tissues. In some embodiments of the present invention, the immune activation is T cell activation.

В других объектах осуществления настоящего изобретения степень воздействия лекарственного средства, производимого анти-CTLA-4 антителом по настоящему изобретению, варьирует в зависимости от ткани человека. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения степень лекарственного воздействия изменяется в зависимости от концентрации аденозин-содержащего соединения в ткани. В других вариантах осуществления настоящего изобретения эффект усиливается в ткани с высокой концентрацией аденозин-содержащего соединения по сравнению с тканью с низкой концентрацией аденозин-содержащего соединения. К тканям с высокой концентрацией аденозин-содержащего соединения относятся, например, опухолевые ткани. Ткани с низкой концентрацией аденозин-содержащего соединения включают, например, неопухолевые ткани, такие как здоровые ткани. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения иммунитет сильнее активируется в опухолевой ткани, чем в неопухолевой. Такие различия в ответе необязательно должны наблюдаться для всех доз анти-CTLA-4 антител, а должны наблюдаться только для определенного диапазона доз. В другом варианте осуществления настоящего изобретения иммунитет активируется при более низкой дозе в опухолевой ткани, чем в неопухолевой ткани. Более того, в другом варианте осуществления настоящего изобретения терапевтический эффект наблюдается при более низкой дозе, чем та, при которой наблюдается побочный эффект. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения терапевтический эффект заключается в проявлении противоопухолевого эффекта (например, регрессия опухоли и индукция клеточной гибели или торможение роста опухолевых клеток), а побочный эффект заключается в развитии аутоиммунного заболевания (включая повреждение здоровых тканей вследствие избыточных иммунных ответов).In other aspects of the present invention, the degree of drug exposure produced by the anti-CTLA-4 antibody of the present invention varies depending on the human tissue. In some embodiments of the present invention, the degree of drug effect varies depending on the concentration of the adenosine-containing compound in the tissue. In other embodiments of the present invention, the effect is enhanced in tissue with a high concentration of the adenosine-containing compound compared to tissue with a low concentration of the adenosine-containing compound. Tissues with a high concentration of adenosine-containing compounds include, for example, tumor tissues. Tissues with low concentrations of adenosine-containing compounds include, for example, non-tumor tissues such as healthy tissues. In some embodiments of the present invention, immunity is more strongly activated in tumor tissue than in non-tumor tissue. Such differences in response need not be observed for all doses of anti-CTLA-4 antibodies, but should only be observed for a certain range of doses. In another embodiment of the present invention, immunity is activated at a lower dose in tumor tissue than in non-tumor tissue. Moreover, in another embodiment of the present invention, the therapeutic effect is observed at a lower dose than that at which the side effect is observed. In certain embodiments of the present invention, the therapeutic effect is to produce an antitumor effect (eg, tumor regression and induction of cell death or inhibition of tumor cell growth) and the side effect is the development of an autoimmune disease (including damage to healthy tissue due to excessive immune responses).

В другом объекте осуществления настоящего изобретения степень лекарственного эффекта, вырабатываемого анти-CTLA-4 антителом по настоящему изобретению, варьирует в зависимости от того, обладает ли оно активностью по связыванию с CTLA-4, которая зависит от аденозин-содержащего соединения (т.е. изменяется ли в соответствии с концентрации аденозин-содержащего соединения). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению представляют собой антитела, связывающая активность с CTLA-4 у которых увеличивается по мере увеличения концентрации аденозин-содержащего соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения контрольным анти-CTLA-4 антителом является антитело, которое не обладает активностью по связыванию CTLA-4, зависящей от концентрации аденозин-содержащего соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело, которое не обладает CTLA-4-связывающей активностью, зависящей от концентрации аденозинсодержащего соединения, означает антитело, в котором разница в CTLA-4-связывающей активности в присутствии и в отсутствиеIn another aspect of the present invention, the degree of drug effect produced by the anti-CTLA-4 antibody of the present invention varies depending on whether it has CTLA-4 binding activity that is dependent on an adenosine-containing compound (i.e. changes according to the concentration of the adenosine-containing compound). In some embodiments, the anti-CTLA-4 antibodies of the present invention are antibodies whose CTLA-4 binding activity increases as the concentration of the adenosine-containing compound increases. In some embodiments of the present invention, a control anti-CTLA-4 antibody is an antibody that does not have concentration-dependent CTLA-4 binding activity of the adenosine-containing compound. In some embodiments of the present invention, an antibody that does not have CTLA-4 binding activity dependent on the concentration of an adenosine-containing compound is an antibody in which the difference in CTLA-4 binding activity in the presence and absence of

- 45 045931 соединение отличается, например, менее чем в два раза, менее чем в 1,8 раза, менее чем в 1,5 раза, менее чем в 1,3 раза, менее чем в 1,2 раза или менее чем в 1,1 раза. Желательно, чтобы анти-СТк-Л-4 антитело по настоящему изобретению и контрольное анти-СТкЛ-4 антитело имели CTLA-4-связывающую активность, по существу, равную, в присутствии достаточного количества аденозин-содержащего соединения.- 45 045931 compound differs, for example, by less than two times, less than 1.8 times, less than 1.5 times, less than 1.3 times, less than 1.2 times or less than 1 ,1 time. It is desirable that the anti-CTCL-4 antibody of the present invention and the control anti-CTCL-4 antibody have substantially equal CTLA-4 binding activity in the presence of a sufficient amount of adenosine-containing compound.

В некоторых объектах настоящего изобретения анти-СТкЛ-4 антитело по настоящему изобретению и контрольное анти-СТкЛ-4 антитело как лекарственные средства различаются по оказываемому действию. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения они отличаются по действию как лекарственные средства в ткани с низкой концентрацией аденозин-содержащего соединения. Ткани с низкой концентрацией аденозин-содержащего соединения включают, например, неопухолевые ткани, то есть нормальные ткани. Анти-СТкЛ-4 антитела также могут быть предусмотрены в виде фармацевтического состава, содержащего антитело. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с низкой концентрацией аденозин-содержащего соединения анти-СТкЛ-4 антитело по настоящему изобретению проявляет низкий уровень активации иммунитета по сравнению с контрольным антиCTLA-4 антителом. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с низкой концентрацией аденозин-содержащего соединения дозы анти-СТкЛ-4 антитела по настоящему изобретению, необходимые для активации иммунитета, являются высокими по сравнению с дозами контрольного анти-СТкЛ-4 антитела. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с низкой концентрацией аденозин-содержащего соединения анти-СТкЛ-4 антитело по настоящему изобретению проявляет на низком уровне побочные эффекты по сравнению с контрольным антителом. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с низкой концентрацией аденозинсодержащего соединения дозы анти-СТкЛ-4 антитела по настоящему изобретению, при которых наблюдается побочный эффект, являются высокими по сравнению с дозами контрольного анти-СТкЛ-4 антитела. Такие различия в реакции не обязательно должны наблюдаться во всех тканях (например, во всех тканях с низкой концентрацией аденозин-содержащего соединения), но должны наблюдаться только в некоторых тканях. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения побочным эффектом является аутоиммунное заболевание (включая повреждение нормальных тканей из-за чрезмерного иммунного ответа).In some aspects of the present invention, the anti-STCL-4 antibody of the present invention and the control anti-CTCL-4 antibody as drugs differ in their effects. In certain embodiments of the present invention, they differ in their action as drugs in tissue with a low concentration of the adenosine-containing compound. Tissues with low concentrations of adenosine-containing compounds include, for example, non-tumor tissues, ie normal tissues. Anti-STCL-4 antibodies may also be provided in the form of a pharmaceutical composition containing the antibody. In some embodiments of the present invention, in tissue with a low concentration of an adenosine-containing compound, the anti-CTLA-4 antibody of the present invention exhibits a low level of immune activation compared to a control anti-CTLA-4 antibody. In some embodiments of the present invention, in tissue with a low concentration of adenosine-containing compound, the doses of the anti-STCL-4 antibody of the present invention required to activate the immune system are high compared to the doses of the control anti-CTCL-4 antibody. In some embodiments of the present invention, in tissue with a low concentration of an adenosine-containing compound, the anti-CTCL-4 antibody of the present invention exhibits low levels of side effects compared to a control antibody. In some embodiments of the present invention, in tissue with a low concentration of an adenosine-containing compound, the doses of the anti-STCL-4 antibody of the present invention at which the side effect is observed are high compared to the doses of the control anti-CTCL-4 antibody. Such differences in response need not be observed in all tissues (eg, in all tissues with low concentrations of the adenosine-containing compound), but should be observed only in some tissues. In some embodiments of the present invention, the side effect is an autoimmune disease (including damage to normal tissues due to an excessive immune response).

В некоторых объектах настоящего изобретения анти-СТкЛ-4 антитело по настоящему изобретению и контрольное анти-СТкЛ-4 антитело как лекарственные средства по существу оказывают равное действие. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения они проявляют по существу равное действие как лекарственные средства в ткани с высокой концентрацией аденозин-содержащего соединения. К тканям с высокой концентрацией аденозин-содержащего соединения относятся, например, опухолевые ткани. Анти-СТкЛ-4 антитела также могут быть предусмотрены в виде фармацевтических составов, содержащих антитело. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с высокой концентрацией аденозин-содержащего соединения анти-СТкЛ-4 антитело по настоящему изобретению и контрольное анти-СТкЛ-4 антитело проявляют по существу равный уровень активации иммунитета. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с высокой концентрацией аденозин-содержащего соединения анти-СТкЛ-4 антитело по настоящему изобретению и контрольное анти-СТкЛ-4 антитело проявляют равный уровень активации иммунитета по существу в одинаковой дозе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с высокой концентрацией аденозин-содержащего соединения анти-СТкЛ-4 антитело по настоящему изобретению и контрольное анти-СТкЛ-4 антитело по существу проявляют одинаковый уровень терапевтического эффекта. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с высокой концентрацией аденозин-содержащего соединения анти-СТкЛ-4 антитело по настоящему изобретению и контрольное антиCTLA-4 антитело проявляют одинаковый уровень терапевтического эффекта по существу в одинаковой дозе. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения терапевтический эффект представляет проявление противоопухолевого эффекта (например, регрессию опухоли и индукцию гибели клеток или ингибирование роста опухолевых клеток).In some aspects of the present invention, the anti-STCL-4 antibody of the present invention and the control anti-CTCL-4 antibody as drugs have substantially equal effects. In certain embodiments of the present invention, they exhibit substantially equal activity as drugs in tissue with a high concentration of the adenosine-containing compound. Tissues with a high concentration of adenosine-containing compounds include, for example, tumor tissues. Anti-CTCL-4 antibodies may also be provided in the form of pharmaceutical compositions containing the antibody. In some embodiments of the present invention, in tissue with a high concentration of an adenosine-containing compound, the anti-STCL-4 antibody of the present invention and the control anti-CTCL-4 antibody exhibit substantially equal levels of immune activation. In some embodiments of the present invention, in tissue with a high concentration of an adenosine-containing compound, the anti-STCL-4 antibody of the present invention and the control anti-CTCL-4 antibody exhibit equal levels of immune activation at substantially the same dose. In some embodiments, in tissue with a high concentration of an adenosine-containing compound, the anti-STCL-4 antibody of the present invention and the control anti-CTCL-4 antibody exhibit substantially the same level of therapeutic effect. In some embodiments, in tissue with a high concentration of an adenosine-containing compound, the anti-CTLA-4 antibody of the present invention and the control anti-CTLA-4 antibody exhibit the same level of therapeutic effect at substantially the same dose. In certain embodiments of the present invention, the therapeutic effect is the manifestation of an antitumor effect (eg, tumor regression and induction of cell death or inhibition of tumor cell growth).

В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения опухоль выбирают из группы, состоящей из рака молочной железы и рака печени.In certain embodiments of the present invention, the tumor is selected from the group consisting of breast cancer and liver cancer.

В еще одном объекте настоящего изобретения предусматривают применение анти-СТкЛ-4 антитело в производстве или приготовлении лекарственного средства. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения лекарственное средство предназначено для лечения опухолей. В другом варианте осуществления настоящего изобретения лекарственное средство предназначено для применения в способе лечения опухоли, включающем введение индивидууму, имеющему опухоль, эффективного количества лекарственного средства. В одном из подобных вариантов осуществления настоящего изобретения способ дополнительно включает введение индивидууму эффективного количества по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства, например, описанного ниже. В другом варианте осуществления настоящего изобретения лекарственное средство предназначено для разрушения клеток. В другом варианте осуществления настоящего изобретения лекарственное средство предназначено для применения в способе разрушения клеток у индивиду, включающий введение индивиду эффективного количества лекарственного средства для разрушения клеток. В другом варианте осуществления наIn yet another aspect, the present invention provides for the use of an anti-CTCL-4 antibody in the manufacture or preparation of a medicinal product. In one embodiment of the present invention, the medicament is for the treatment of tumors. In another embodiment of the present invention, the drug is for use in a method of treating a tumor, comprising administering to an individual having a tumor an effective amount of the drug. In one such embodiment of the present invention, the method further includes administering to the individual an effective amount of at least one additional therapeutic agent, such as those described below. In another embodiment of the present invention, the drug is intended to destroy cells. In another embodiment of the present invention, the drug is for use in a method of destroying cells in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of the drug to destroy cells. In another embodiment, on

- 46 045931 стоящего изобретения лекарственное средство предназначено для активирования иммунитета. В другом варианте осуществления настоящего изобретения лекарственное средство предназначено для применения в способе активирования иммунитета у индивида, включающем введение индивиду эффективного количества лекарственного средства для активирования иммунитета. Индивидом в любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения может быть человек.- 46 045931 of the invention, the drug is intended to activate the immune system. In another embodiment of the present invention, the drug is for use in a method of activating the immune system in a subject, comprising administering to the subject an effective amount of the drug to activate the immune system. The individual in any of the above embodiments of the present invention may be a human.

В еще одном объекте настоящего изобретения предусматривают способ лечения рака. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ включает введение индивиду с такой опухолью эффективного количества ηη™^ΤΕΑ-4 антитела. В одном из подобных вариантов осуществления настоящего изобретения способ дополнительно включает введение индивиду эффективного количества по меньшей мере одного дополнительного терапевтического агента, как описано ниже. Индивидом в соответствии с любым из вышеприведенных вариантов осуществления может быть человек.In yet another aspect, the present invention provides a method for treating cancer. In one embodiment of the present invention, the method includes administering to an individual with such a tumor an effective amount of a ηη™^ΤΕΑ-4 antibody. In one such embodiment of the present invention, the method further comprises administering to the individual an effective amount of at least one additional therapeutic agent, as described below. The individual in accordance with any of the above embodiments may be a human.

В еще одном объекте настоящее изобретение предусматривает способ повреждения клеток у индивида. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ включает введение индивидууму эффективного количества анти-CTLA-4 антитела для повреждения клеток. В другом объекте настоящего изобретения предусматривают способ активации иммунитета у индивида. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ включает введение индивиду эффективного количества анти-CTLA-4 антитела для активации иммунитета. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения понятие индивид означает человека.In yet another aspect, the present invention provides a method for damaging cells in an individual. In one embodiment of the present invention, the method includes administering to an individual an effective amount of an anti-CTLA-4 antibody to damage cells. In another aspect, the present invention provides a method for activating the immune system in an individual. In one embodiment of the present invention, the method includes administering to a subject an effective amount of an anti-CTLA-4 antibody to activate the immune system. In one embodiment of the present invention, the term individual means a person.

В еще одном объекте настоящее изобретение предусматривает фармацевтические составы, включающие любое из предусмотренных в настоящем изобретении анти-CTLA-4 антител, например, для использования в любом из вышеперечисленных терапевтических способов. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения фармацевтический состав включает любое из предусмотренных в настоящем изобретении анти-CTLA-4 антител и фармацевтически приемлемый носитель. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают фармацевтический состав для применения в лечении опухолей. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают фармацевтический состав для применения в разрушении клеток. В одном из вариантов осуществления настоящее изобретение предусматривает фармацевтический состав для применения при стимулировании иммунитета. В другом варианте осуществления настоящего изобретения фармацевтический состав содержит любое из предусмотренных в настоящем изобретении анти-CTLA-4 антител и по меньшей мере одно дополнительное терапевтическое средство, например, как описано ниже.In yet another aspect, the present invention provides pharmaceutical compositions comprising any of the anti-CTLA-4 antibodies provided herein, for example, for use in any of the above therapeutic methods. In one embodiment of the present invention, the pharmaceutical composition includes any of the anti-CTLA-4 antibodies provided herein and a pharmaceutically acceptable carrier. In one embodiment, the present invention provides a pharmaceutical composition for use in the treatment of tumors. In one embodiment, the present invention provides a pharmaceutical composition for use in cell destruction. In one embodiment, the present invention provides a pharmaceutical composition for use in stimulating the immune system. In another embodiment of the present invention, the pharmaceutical composition contains any of the anti-CTLA-4 antibodies provided in the present invention and at least one additional therapeutic agent, for example, as described below.

В другом объекте настоящее изобретение предусматривает способы получения лекарственного средства или фармацевтического состава (например, для использования в любом из вышеупомянутых терапевтических способов), включающие перемешивание любого из анти-CTLA-4 антител, предусмотренных в настоящем изобретении, с фармацевтически приемлемом носителем. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ получения лекарственного средства или фармацевтического состава дополнительно включает добавление по меньшей мере одного дополнительного терапевтического агента к лекарственному средству или фармацевтическому составу.In another aspect, the present invention provides methods for preparing a drug or pharmaceutical composition (eg, for use in any of the above therapeutic methods) comprising admixing any of the anti-CTLA-4 antibodies provided herein with a pharmaceutically acceptable carrier. In one embodiment of the present invention, the method of producing a drug or pharmaceutical composition further includes adding at least one additional therapeutic agent to the drug or pharmaceutical composition.

Антитела по настоящему изобретению можно использовать в терапии либо отдельно, либо в комбинации с другими агентами. Например, антитело по настоящему изобретению можно вводить совместно по меньшей мере с одним дополнительным терапевтическим агентом. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения дополнительным терапевтическим агентом является ингибитор контрольной точки иммунного ответа, ингибитор EGFR, ингибитор HER2 или химиотерапевтический агент. Ингибитором иммунной контрольной точки может быть, например, ингибитор анти-CTLA-4, ингибитор анти-PD-i, ингибитор анти-PD-L!, ингибитор aнти-PD-L2, ингибитор анти-ТГМ-3, ингибитор анти-LAG-3, анти-TIGIT ингибитор, анти-BTLA ингибитор и анти-VISTA ингибитор. Ингибитор антиCTLA-4 может включать, например, ипилимумаб и тремелимумаб. Ингибитором анти-PD-1 могут быть, например, ниволумаб и пембролизумаб. Ингибитором анти-PD-L! могут быть, например, атезолизумаб, дурвалумаб и авелумаб. анти-PD-12 ингибитором может быть, например, анти-PD-L2 ингибирующее антитело. Ингибитором анти-ТГМ-3 может быть, например, анти-ТГМ-3 ингибирующее антитело. антиLAG-3 ингибитором может быть, например, анти-LAG-3 ингибирующее антитело. Ингибитором антиTIGIT может быть, например, анти-TIGIT ингибирующее антитело. Анти-BTLA ингибитором может быть, например, ингибирующее антитело анти-BTLA. Анти-VISTA ингибитором может быть, например, ингибирующее анти-VISTA антитело. К ингибиторам EGFR могут относиться, например, цетуксимаб, панитумумаб, нимотузумаб, нецитумумаб и залутумумаб. К ингибиторам HER2 могут относиться, например, трастузумаб, трастузумаб эмтансин и пертузумаб.The antibodies of the present invention can be used in therapy either alone or in combination with other agents. For example, an antibody of the present invention can be co-administered with at least one additional therapeutic agent. In certain embodiments of the present invention, the additional therapeutic agent is an immune checkpoint inhibitor, an EGFR inhibitor, a HER2 inhibitor, or a chemotherapeutic agent. The immune checkpoint inhibitor may be, for example, an anti-CTLA-4 inhibitor, an anti-PD-i inhibitor, an anti-PD-L! inhibitor, an anti-PD-L2 inhibitor, an anti-TGM-3 inhibitor, an anti-LAG- 3, anti-TIGIT inhibitor, anti-BTLA inhibitor and anti-VISTA inhibitor. The anti-CTLA-4 inhibitor may include, for example, ipilimumab and tremelimumab. Anti-PD-1 inhibitors include, for example, nivolumab and pembrolizumab. Anti-PD-L inhibitor! may be, for example, atezolizumab, durvalumab and avelumab. The anti-PD-12 inhibitor may be, for example, an anti-PD-L2 inhibitory antibody. The anti-TGM-3 inhibitor may be, for example, an anti-TGM-3 inhibitory antibody. The anti-LAG-3 inhibitor may be, for example, an anti-LAG-3 inhibitory antibody. The anti-TIGIT inhibitor may be, for example, an anti-TIGIT inhibitory antibody. The anti-BTLA inhibitor may be, for example, an anti-BTLA inhibitory antibody. The anti-VISTA inhibitor may be, for example, an anti-VISTA inhibitory antibody. EGFR inhibitors may include, for example, cetuximab, panitumumab, nimotuzumab, necitumumab and zalutumumab. HER2 inhibitors may include, for example, trastuzumab, trastuzumab emtansine and pertuzumab.

Такие комбинированные терапии, упомянутые выше, охватывают комбинированные введения (где два или более терапевтических агента включены в один и тот же или в отдельные составы) и раздельное введение, при котором введение антитела по настоящему изобретению могут быть введены до, одновременно и/или после введения дополнительного терапевтического агента или агентов. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения введение анmи-CTLA-4 антитела и введение дополнительного терапевтического агента происходят в течение примерно одного месяца, или в течение примерно одной, двух или трех недель, или в течение каждых примерно одного, двух, трех, четырех, пяти или шестиSuch combination therapies mentioned above include combination administrations (where two or more therapeutic agents are included in the same or separate formulations) and separate administrations, wherein the antibodies of the present invention may be administered before, simultaneously and/or after administration additional therapeutic agent or agents. In one embodiment of the present invention, administration of the anti-CTLA-4 antibody and administration of the additional therapeutic agent occur over a period of about one month, or for about one, two, or three weeks, or for every about one, two, three, four, five or six

- 47 045931 дней. Антитела по настоящему изобретению можно также использовать в сочетании с лучевой терапией.- 47 045931 days. The antibodies of the present invention can also be used in combination with radiation therapy.

Антитело по настоящему изобретению (и любой дополнительный терапевтический агент) могут вводиться любым подходящим способом, включая парентеральное, внутрилегочное и интраназальное введение, и, при необходимости для местного лечения, внутриочаговое введение. Парентеральные инфузии включают внутримышечное, внутривенное, внутриартериальное, внутрибрюшинное или подкожное введение. Дозирование может осуществляться любым подходящим путем, например, инъекциями, такими как внутривенные или подкожные инъекции, частично в зависимости от того, является ли введение кратковременным или постоянным. В настоящем изобретении рассматриваются различные схемы дозирования, включая, но не ограничиваясь ими, однократное или многократное введение в различные моменты времени, болюсное введение и импульсные инфузии.The antibody of the present invention (and any additional therapeutic agent) can be administered by any suitable route, including parenteral, intrapulmonary and intranasal administration, and, if necessary for local treatment, intralesional administration. Parenteral infusions include intramuscular, intravenous, intraarterial, intraperitoneal, or subcutaneous administration. Dosing may be accomplished by any suitable route, for example, by injection, such as intravenous or subcutaneous injection, depending in part on whether the administration is short-term or chronic. The present invention contemplates various dosing regimens, including, but not limited to, single or multiple administrations at different times, bolus administration and pulse infusions.

Антитела по настоящему изобретению должны быть составлены, дозированы и введены в соответствии с надлежащей медицинской практикой. Факторы, которые следует учитывать в этом контексте, включают конкретное подвергаемое лечению заболевание, конкретное подвергаемое лечению млекопитающее, клиническое состояние конкретного пациента, причину расстройства, место доставки агента, способ введения, график введения и другие факторы, известные практикующим врачам. Антитело необязательно должно быть включено в состав одного или более агентов, используемых в настоящее время для профилактики или лечения рассматриваемого расстройства. Эффективное количество таких других агентов зависит от количества антител, присутствующих в составе, типа нарушения или лечения и других факторов, рассмотренных выше. Они обычно используются в тех же дозировках и теми же путями введения, которые описаны в настоящем описании, или примерно от 1 до 99% доз, описанных в настоящем описании, или в любой дозировке и любым путем, которые эмпирически/клинически определены как подходящие.The antibodies of the present invention must be formulated, dosed and administered in accordance with good medical practice. Factors to be considered in this context include the particular disease being treated, the particular mammal being treated, the clinical condition of the particular patient, the cause of the disorder, the site of delivery of the agent, the route of administration, the schedule of administration and other factors known to the practitioner. The antibody need not be included in one or more agents currently used for the prevention or treatment of the disorder in question. The effective amount of such other agents depends on the amount of antibodies present in the formulation, the type of disorder or treatment, and other factors discussed above. They are typically used at the same dosages and routes of administration as described herein, or from about 1 to 99% of the dosages described herein, or at any dosage and route of administration that are empirically/clinically determined to be appropriate.

Для профилактики или лечения заболевания подходящая доза антитела по настоящему изобретению (при использовании отдельно или в сочетании с одним или несколькими или другими дополнительными терапевтическими агентами) будет зависеть от типа заболевания, подлежащего лечению, типа антитела, тяжести и течения заболевания, от того, вводится ли антитело в профилактических или терапевтических целях, предшествующая терапия, история болезни пациента и реакция на антитело, а также с учетом мнения и принятым решением лечащего врача. Антитело подходящим образом вводят пациенту за один раз или в течение серии обработок. В зависимости от типа и тяжести заболевания примерно от 1 мкг/кг до 15 мг/кг (например, от 0,1 мг/кг до 10 мг/кг) антитела могут быть первоначальной рекомендуемой дозой для введения пациенту, будь то, например, одно или более отдельных введений или непрерывная инфузия. Одна типичная суточная доза может варьировать от 1 мкг/кг до 100 мг/кг или более, в зависимости от упомянутых выше факторов. При повторных введениях в течение нескольких дней или дольше, в зависимости от состояния, лечение обычно продолжают до тех пор, пока не произойдет желаемое подавление симптомов заболевания. Одна типичная доза антитела может находиться в диапазоне от примерно 0,05 до примерно 10 мг/кг. Таким образом, пациенту можно вводить одну или более доз примерно 0,5, 2,0, 4,0 или 10 мг/кг (или любую их комбинацию). Такие дозы можно вводить с перерывами, например, каждую неделю или каждые три недели (например, таким образом, что пациент получает примерно от двух до примерно двадцати или, например, примерно шести доз антитела). Можно вводить первоначальную более высокую нагрузочную дозу, а затем одну или более пониженных доз. Ход этой терапии легко контролировать с помощью обычных методов и анализов.For the prevention or treatment of a disease, the appropriate dosage of an antibody of the present invention (when used alone or in combination with one or more or other additional therapeutic agents) will depend on the type of disease being treated, the type of antibody, the severity and course of the disease, whether antibody for prophylactic or therapeutic purposes, previous therapy, the patient's medical history and response to the antibody, as well as the opinion and decision of the attending physician. The antibody is suitably administered to the patient at one time or over a series of treatments. Depending on the type and severity of the disease, approximately 1 mcg/kg to 15 mg/kg (e.g., 0.1 mg/kg to 10 mg/kg) of antibody may be the initial recommended dose to administer to the patient, whether e.g. or more separate administrations or continuous infusion. One typical daily dose may vary from 1 mcg/kg to 100 mg/kg or more, depending on the factors mentioned above. With repeated administrations over several days or longer, depending on the condition, treatment is usually continued until the desired suppression of disease symptoms occurs. One typical dose of antibody may range from about 0.05 to about 10 mg/kg. Thus, the patient can be administered one or more doses of about 0.5, 2.0, 4.0 or 10 mg/kg (or any combination thereof). Such doses may be administered intermittently, for example, every week or every three weeks (for example, such that the patient receives from about two to about twenty or, for example, about six doses of the antibody). An initial higher loading dose may be administered followed by one or more lower doses. The progress of this therapy can be easily monitored using conventional methods and tests.

Очевидно, что любой из вышеуказанных составов или терапевтических способов можно осуществлять с использованием иммуноконъюгата по настоящему изобретению вместо или в дополнение к антиCTLA-4 антителу.It will be appreciated that any of the above formulations or therapeutic methods can be carried out using the immunoconjugate of the present invention instead of or in addition to the anti-CTLA-4 antibody.

3. Продукция.3. Products.

В другом объекте настоящего изобретения предлагают изделие, содержащее материалы, полезные для лечения, профилактики и/или диагностики описанных выше нарушений. Промышленное изделие включает контейнер и этикетку или вкладыш в упаковку, связанный с контейнером. Подходящие контейнеры включают, например, бутылки, флаконы, шприцы, пакеты для внутривенных растворов и т.д. Контейнеры могут быть изготовлены из различных материалов, таких как стекло или пластик. Контейнер содержит композицию, которая сама по себе или в сочетании с другой композицией эффективна для лечения, профилактики и/или диагностики состояния, и может иметь стерильный порт доступа (например, контейнер может представлять собой пакет для внутривенного раствора или флакон с пробкой, которую можно проколоть игла для подкожных инъекций). По меньшей мере один активный ингредиент в композиции представляет собой антитело по настоящему изобретению. На этикетке или листке-вкладыше указано, что композиция используется для лечения определенного состояния. Кроме того, промышленное изделие может включать (а) первый контейнер с содержащейся в нем композицией, которая содержит антитело по настоящему изобретению; и (б) второй контейнер с содержащейся в нем композицией, содержащей дополнительный цитотоксический или иной терапевтический агент. Промышленное изделие в этом варианте осуществления настоящего изобретения может дополнительно содержать вкладыш в упаковку, указывающий, что композиции могут быть использованы для лечения конкретного состояния. Альтернативно или дополнительно изделие может дополнительно содержать второй (или третий) конIn another aspect, the present invention provides an article containing materials useful for the treatment, prevention and/or diagnosis of the disorders described above. The manufactured article includes a container and a label or package insert associated with the container. Suitable containers include, for example, bottles, vials, syringes, IV bags, etc. Containers can be made from various materials such as glass or plastic. The container contains a composition that, alone or in combination with another composition, is effective for the treatment, prevention and/or diagnosis of a condition, and may have a sterile access port (for example, the container may be an intravenous solution bag or a vial with a pierceable stopper hypodermic needle). At least one active ingredient in the composition is an antibody of the present invention. The label or package insert states that the composition is used to treat a specific condition. In addition, the article of manufacture may include (a) a first container containing a composition that contains an antibody of the present invention; and (b) a second container containing a composition containing an additional cytotoxic or other therapeutic agent. The article of manufacture in this embodiment of the present invention may further include a package insert indicating that the compositions can be used to treat a particular condition. Alternatively or additionally, the article may further comprise a second (or third) cone

- 48 045931 тейнер, содержащий фармацевтически приемлемый буфер, такой как бактериостатическая вода для инъекций (BWFI), фосфатно-солевой буфер, раствор Рингера и раствор декстрозы. Кроме того, он может включать другие материалы, желательные с коммерческой точки зрения и с точки зрения пользователя, включая другие буферы, разбавители, фильтры, иглы и шприцы.- 48 045931 container containing a pharmaceutically acceptable buffer such as bacteriostatic water for injection (BWFI), phosphate buffered saline, Ringer's solution and dextrose solution. In addition, it may include other materials desirable from a commercial and user point of view, including other buffers, diluents, filters, needles and syringes.

Понятно, что любое из вышеуказанных промышленных изделий может включать иммуноконъюгат по настоящему изобретению вместо или в дополнение к анти-CTLA-4 антителу.It is understood that any of the above industrial products may include an immunoconjugate of the present invention instead of or in addition to an anti-CTLA-4 antibody.

Полипептиды, содержащие вариант Fc-области.Polypeptides containing a variant Fc region.

В одном объекте настоящего изобретения описаны выделенные полипептиды, содержащие вариант Fc-области. В некоторых объектах полипептиды представляют собой антитела. В некоторых объектах полипептиды представляют собой слитые белки Fc. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-области содержат по меньшей мере одно изменение аминокислотного остатка (например, замену) по сравнению с соответствующей последовательностью в Fc-области нативной последовательности или сопоставляемого варианта последовательности (в настоящем изобретении все они могут называться исходной Fc-областью). Fc-область нативной последовательности обычно состоит из гомодимера, состоящего из двух идентичных полипептидных цепей. Аминокислотные изменения в вариантах Fc-области по настоящему изобретению могут быть введены либо в одну из двух полипептидных цепей исходного участка Fc, либо в обе полипептидные цепи.In one aspect of the present invention, isolated polypeptides containing a variant Fc region are described. In some entities, the polypeptides are antibodies. In some cases, the polypeptides are Fc fusion proteins. In certain embodiments of the present invention, the Fc region variants contain at least one amino acid residue change (e.g., substitution) compared to the corresponding sequence in the Fc region of the native sequence or a comparable sequence variant (all of which may be referred to as the original Fc region in the present invention ). The native sequence Fc region typically consists of a homodimer consisting of two identical polypeptide chains. The amino acid changes in the Fc region variants of the present invention can be introduced into either one of the two polypeptide chains of the original Fc region or into both polypeptide chains.

В некоторых объектах настоящего изобретения предусматривают варианты Fc-области, функция которых изменена по сравнению с исходной Fc-областью. В некоторых объектах варианты Fc-области по настоящему изобретению обладают повышенной активностью связывания с рецептором Fcy по сравнению с исходной Fc-областью. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению обладают повышенной активностью связывания по меньшей мере с одним рецептором Fcy, выбранным из группы, состоящей из FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb и FcYRIIIa, по сравнению с исходной Fc-областью. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению обладают повышенной активностью связывания с FcYRIIa. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению обладают повышенной активностью связывания с FcYRIIIa. В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению обладают повышенной активностью связывания с FcYRIIa и FcYRIIIa.In some aspects of the present invention, Fc region variants are provided whose function is altered from that of the original Fc region. In some aspects, the Fc region variants of the present invention have increased Fcy receptor binding activity compared to the parent Fc region. In certain embodiments of the present invention, variants of the Fc regions of the present invention have increased binding activity to at least one Fcy receptor selected from the group consisting of FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb and FcYRIIIa, compared to the parent Fc region. In some embodiments of the present invention, the Fc region variants of the present invention have increased FcYRIIa binding activity. In some embodiments of the present invention, the Fc region variants of the present invention have increased FcYRIIIa binding activity. In other embodiments of the present invention, the Fc region variants of the present invention have increased binding activity to FcYRIIa and FcYRIIIa.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению содержат по меньшей мере одно изменения аминокислоты по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 234, 235, 236, 298, 330, 332 и 334 по нумерации EU. В другом варианте аминокислотные изменения такие, как описано в WO 2013/002362 и WO 2014/104165, могут быть сходным образом использованы в настоящем изобретении.In some embodiments of the present invention, the Fc region variants of the present invention comprise at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of EU numbering positions 234, 235, 236, 298, 330, 332 and 334 . Alternatively, amino acid changes such as those described in WO 2013/002362 and WO 2014/104165 can be similarly used in the present invention.

В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения связывающая активность исходной Fc-области и вариантов Fc-областей может быть представлена значением KD (константы диссоциации). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения величина отношения [значение KD исходной Fc-области для FcγRIIa]/[значение KD варианта Fc-области для FcYRIIa] составляет, например, 1,5 или более, 2 или более, 3 или более, 4 или более, 5 или более, 6 или более, 7 или более, 8 или более, 9 или более, 10 или более, 15 или более, 20 или более, 25 или более, 30 или более, 40 или более, или 50 или более. В других вариантах осуществления настоящего изобретения FcYRIIa может быть FcYRIIa R или FcYRIIa H, или обоими рецепторами. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения величина отношение [связывающая активность исходной Fc-области с FcγRIIIa]/[связывающая активность варианта Fc-области с FcYRIIIa] равно, например, 2 или более, 3 или более, 5 или более, 10 или более, 20 или более, 30 или более, 50 или более, 100 или более, 200 или более, 300 или более, 500 или более, 1 х 103 или более, 2х103 или более, 3х103 или более, или 5х103 или более. В других вариантах осуществления настоящего изобретения FcYRIIIa может быть FcYRIIIa F или FcYRIIIa V, или и тем, и другим.In certain embodiments of the present invention, the binding activity of the original Fc region and variant Fc regions can be represented by a KD (dissociation constant) value. In one embodiment of the present invention, the ratio [KD value of the original Fc region for FcγRIIa]/[KD value of the variant Fc region for FcYRIIa] is, for example, 1.5 or more, 2 or more, 3 or more, 4 or more than, 5 or more, 6 or more, 7 or more, 8 or more, 9 or more, 10 or more, 15 or more, 20 or more, 25 or more, 30 or more, 40 or more, or 50 or more . In other embodiments of the present invention, FcYRIIa may be FcYRIIa R or FcYRIIa H, or both receptors. In one embodiment of the present invention, the ratio [binding activity of the original Fc region to FcγRIIIa]/[binding activity of the variant Fc region to FcYRIIIa] is equal to, for example, 2 or more, 3 or more, 5 or more, 10 or more, 20 or more, 30 or more, 50 or more, 100 or more, 200 or more, 300 or more, 500 or more, 1 x 10 3 or more, 2 x 10 3 or more, 3 x 10 3 or more, or 5 x 10 3 or more . In other embodiments of the present invention, FcYRIIIa may be FcYRIIIa F or FcYRIIIa V, or both.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения значения KD вариантов Fc-областей для FcYRIIa составляют, например, 1,0х10-6 М или менее, 5,0х10-7 М или менее, 3,0х10-7 М или менее, 2,0х10-7 М или менее, 1,0х10-7 М или менее, 5,0х10-8 М или менее, 3,0х10-8 М или менее, 2,0х10-8 М или менее, 1,0х10-8 М или менее, 5,0х10-9 М или менее, 3,0х10-9 М или менее, 2,0х10-9 М или менее, или 1,0х10-9 М или менее. В других вариантах осуществления настоящего изобретения FcYRIIa может быть FcYRIIa R или FcYRIIa H, или и тем, и другим. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения значения KD вариантов Fc-областей для FcYRIIa составляют, например, 1,0х10-6 М или менее, 5,0х10-7 М или менее, 3,0х10-7 М или менее, 2,0х10-7 М или менее, 1,0х10-7 М или менее, 5,0х10-8 М или менее, 3,0х10-8 М или менее, 2,0х10-8 М или менее, 1,0х10-8 М или менее, 5,0х10-9 М или менее, 3,0х10-9 М или менее, 2,0х10-9 М или менее, 1,0х10-9 М или менее, 5,0х10-10 М или менее, 3,0х10-10 М или менее, 2,0х10-10 М или менее, или 1,0х10-10 М или менее. В других вариантах осуществления настоящего изобретения FcYRIIIa может быть FcYRIIIa F или FcYRIIIa V, или и тем, и другим.In one embodiment of the present invention, the KD values of Fc region variants for FcYRIIa are, for example, 1.0 x 10 -6 M or less, 5.0 x 10 -7 M or less, 3.0 x 10 -7 M or less, 2.0 x 10 - 7 M or less, 1.0x10 -7 M or less, 5.0x10 -8 M or less, 3.0x10 -8 M or less, 2.0x10 -8 M or less, 1.0x10 -8 M or less, 5.0x10 -9 M or less, 3.0x10 -9 M or less, 2.0x10 -9 M or less, or 1.0x10 -9 M or less. In other embodiments of the present invention, FcYRIIa may be FcYRIIa R or FcYRIIa H, or both. In one embodiment of the present invention, the KD values of Fc region variants for FcYRIIa are, for example, 1.0 x 10 -6 M or less, 5.0 x 10 -7 M or less, 3.0 x 10 -7 M or less, 2.0 x 10 - 7 M or less, 1.0x10 -7 M or less, 5.0x10 -8 M or less, 3.0x10 -8 M or less, 2.0x10 -8 M or less, 1.0x10 -8 M or less, 5.0x10 -9 M or less, 3.0x10 -9 M or less, 2.0x10 -9 M or less, 1.0x10 -9 M or less, 5.0x10 -10 M or less, 3.0x10 -10 M or less, 2.0x10 -10 M or less, or 1.0x10 -10 M or less. In other embodiments of the present invention, FcYRIIIa may be FcYRIIIa F or FcYRIIIa V, or both.

- 49 045931- 49 045931

В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность исходной и вариантной Fc-областей может быть представлена значением kd (константа скорости диссоциации) вместо значения KD.In another embodiment of the present invention, the binding activity of the original and variant Fc regions can be represented by a kd (dissociation rate constant) value instead of a KD value.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность исходной и вариантной Fc-областей может быть представлена количеством связывания с рецептором Fcy на единицу количества Fc-области. Например, в анализе методом поверхностного плазмонного резонанса связанное количество Fc-области, иммобилизованной на сенсорном чипе, и связанное количество рецептора Fcy, дополнительно связанного с ним, измеряют как резонансную единицу (RU). Значение, полученное путем деления количества связывания рецептора Fcy на количество связывания Fc-области, можно определить как количество связывания с рецептором Fcy на единицу количества Fc-области. Конкретные способы измерения и расчета таких количеств связывания описаны в примерах ниже. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения значение отношения [количество связанного варианта Fcобласти с FcγRIIa]/[количество связанной исходной Fc-области с FcYRIIa] составляет, например, 1,5 или более, 2 или более, 3 или более, 4 или более, 5 или более, 6 или более, 7 или более, 8 или более, 9 или более, 10 или более, 15 или более, 20 или более, 25 или более, 30 или более, или 40 или более, или 50 или более. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения значение отношения [количество связанного варианта Fc-области с FcγRШa]/[количество связанной исходной Fc-области с FcYRIIIa] составляет, например, 2 или более, 3 или более, 5 или более, 10 или более, 20 или более, 30 или более, 50 или более, 100 или более, 200 или более, 300 или более, 500 или более, 1х 103 или более, 2х103 или более, 3х 103 или более, 5х 103 или более.In another embodiment of the present invention, the binding activity of the original and variant Fc regions can be represented by the amount of Fcy receptor binding per unit amount of Fc region. For example, in surface plasmon resonance analysis, the bound amount of Fc region immobilized on a sensor chip and the bound amount of Fcy receptor further bound thereto are measured as a resonance unit (RU). The value obtained by dividing the amount of Fcy receptor binding by the amount of Fc region binding can be determined as the amount of Fcy receptor binding per unit amount of Fc region. Specific methods for measuring and calculating such binding amounts are described in the examples below. In some embodiments of the present invention, the ratio [amount of variant Fc region bound to FcγRIIa]/[amount of parent Fc region bound to FcYRIIa] is, for example, 1.5 or more, 2 or more, 3 or more, 4 or more, 5 or more, 6 or more, 7 or more, 8 or more, 9 or more, 10 or more, 15 or more, 20 or more, 25 or more, 30 or more, or 40 or more, or 50 or more. In some embodiments of the present invention, the ratio [amount of variant Fc region bound to FcγRIIIa]/[amount of parent Fc region bound to FcYRIIIa] is, for example, 2 or more, 3 or more, 5 or more, 10 or more, 20 or more, 30 or more, 50 or more, 100 or more, 200 or more, 300 or more, 500 or more, 1x 10 3 or more, 2x 10 3 or more, 3x 10 3 or more, 5x 10 3 or more.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения значения KD, значения kd, значения количества связывания и другие, описанные в настоящем изобретении, измеряют или рассчитывают путем проведения анализа методом поверхностного плазмонного резонанса при 25°С или 37°С (см., например, пример 6 в настоящем описании).In some embodiments of the present invention, KD values, kd values, binding amount values, and others described in the present invention are measured or calculated by performing surface plasmon resonance analysis at 25° C. or 37° C. (see, for example, Example 6 in this description).

В некоторых объектах настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению обладает улучшенной селективностью в отношении активирующих и ингибирующих рецепторов Fcy по сравнению с исходной Fc-областью. Другими словами, активность связывания варианта Fc-области по настоящему изобретению с активирующим рецептором Fcy значительно выше, чем активность связывания с ингибирующим рецептором Fcy, по сравнению с исходной Fc-областью. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения активирующий рецептор Fcy представляет собой по меньшей мере один рецептор Fcy, выбранный из группы, состоящей из FcYRIa, FcYRIIa R, FcYRIIa H, FcYRIIIa F и FcYRIIIa V, а ингибирующим рецептором Fcy является FcYRIIb. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-области в настоящем изобретении имеют улучшенную селективность среди FcYRIIa и FcYRIIb. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вариант Fc-области в настоящем изобретении имеет улучшенную селективность среди FcYRIIIa и FcYRIIb. В других вариантах осуществления настоящего изобретения вариант Fc-области в настоящем изобретении имеет улучшенную селективность среди FcYRIIa и FcYRIIb, а также среди FcYRIIIa и FcYRIIb.In some aspects of the present invention, the variant Fc region of the present invention has improved selectivity for activating and inhibitory Fcy receptors compared to the parent Fc region. In other words, the binding activity of the Fc region variant of the present invention to the activating Fcy receptor is significantly higher than the binding activity to the inhibitory Fcy receptor compared to the parent Fc region. In certain embodiments of the present invention, the activating Fcy receptor is at least one Fcy receptor selected from the group consisting of FcYRIa, FcYRIIa R, FcYRIIa H, FcYRIIIa F, and FcYRIIIa V, and the inhibitory Fcy receptor is FcYRIIb. In some embodiments of the present invention, the Fc region variants of the present invention have improved selectivity among FcYRIIa and FcYRIIb. In some embodiments of the present invention, the Fc region variant of the present invention has improved selectivity among FcYRIIIa and FcYRIIb. In other embodiments of the present invention, the variant Fc region of the present invention has improved selectivity among FcYRIIa and FcYRIIb, as well as among FcYRIIIa and FcYRIIb.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению содержат по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 236, 239, 268, 270 и 326 в соответствии с нумерацией EU. В другом варианте аминокислотные изменения, описанные в WO 2013/002362 и WO 2014/104165, могут быть аналогичным образом использованы в настоящем изобретении.In some embodiments of the present invention, the variants of the Fc regions of the present invention contain at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of positions 236, 239, 268, 270 and 326 according to EU numbering. Alternatively, the amino acid changes described in WO 2013/002362 and WO 2014/104165 can be similarly used in the present invention.

В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения связывающая активность исходной Fc-области и ее вариантов может быть представлена значением KD (константа диссоциации). Варианты осуществления настоящего изобретения, касающиеся связывающей активности с FcYRIIa и FcYRIIIa, описаны выше. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения значение отношения [величина KD исходной Fc-области для FcγRIIb]/[величина KD варианта Fc-области для FcYRIIb] составляет, например, 10 или менее, 5 или менее, 3 или менее, 2 или менее, 1 или менее, 0,5 или менее, 0,3 или менее, 0,2 или менее или 0,1 или менее. В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность исходной и вариантной Fc-областей может быть представлена значением kd (константа скорости диссоциации) вместо значения KD.In certain embodiments of the present invention, the binding activity of the parent Fc region and variants thereof can be represented by a KD (dissociation constant) value. Embodiments of the present invention regarding binding activity to FcYRIIa and FcYRIIIa are described above. In one embodiment of the present invention, the ratio [KD value of the original Fc region for FcγRIIb]/[KD value of the variant Fc region for FcYRIIb] is, for example, 10 or less, 5 or less, 3 or less, 2 or less, 1 or less, 0.5 or less, 0.3 or less, 0.2 or less, or 0.1 or less. In another embodiment of the present invention, the binding activity of the original and variant Fc regions can be represented by a kd (dissociation rate constant) value instead of a KD value.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность исходной Fcобласти и ее вариантов может быть представлена указанным выше количеством связывания с рецептором Fcy на единицу количества Fc-области. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения величина отношения [количество связанного варианта Fc-области с FcγRIIb]/[количество связанной исходной Fc-области с FcYRIIb] составляет, например, 10 или менее, 5 или менее, 3 или менее, 2 или менее, 1 или менее, 0,5 или менее, 0,3 или менее, 0,2 или менее или 0,1 или менее. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения количество связывания варианта Fc-области с FcYRIIb составляет, например, 0,5 или менее, 0,3 или менее, 0,2 или менее, 0,1 или менее, 0,05 или менее, 0,03 или менее, 0,02 или менее, 0,01 или менее, 0,005 или менее, 0,003 или менее, 0,002 или менее или 0,001 илиIn another embodiment of the present invention, the binding activity of the parent Fc region and its variants may be represented by the above amount of Fcy receptor binding per unit amount of Fc region. In some embodiments of the present invention, the ratio [amount of variant Fc region bound to FcγRIIb]/[amount of parent Fc region bound to FcYRIIb] is, for example, 10 or less, 5 or less, 3 or less, 2 or less, 1 or less, 0.5 or less, 0.3 or less, 0.2 or less, or 0.1 or less. In some embodiments of the present invention, the amount of Fc region variant binding to FcYRIIb is, for example, 0.5 or less, 0.3 or less, 0.2 or less, 0.1 or less, 0.05 or less, 0. 03 or less, 0.02 or less, 0.01 or less, 0.005 or less, 0.003 or less, 0.002 or less, or 0.001 or

- 50 045931 менее.- 50 045931 less.

В некоторых объектах настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению обладает улучшенной стабильностью по сравнению с исходной Fc-областью. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения стабильность является термодинамической стабильностью. О термодинамической стабильности полипептида можно судить, например, используя значение Tm в качестве показателя. Значения Tm можно измерить с использованием способов, известных специалистам в данной области, таких как круговой дихроизм (CD - circular dichroism), дифференциальный сканирующий калориметр (DSC - differential scanning calorimeter) и дифференциальная сканирующая флуориметрия (DSF -differential scanning fluorimetry). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в варианте Fc-области по настоящему изобретению значение Tm области СН2 увеличивается на 0,1 градуса или более, 0,2 градуса или более, 0,3 градуса или более, 0,4 градуса или более, 0,5 градуса или более, 1 градуса или более, 2 градуса или более, 3 градуса или более, 4 градуса или более, 5 градусов или более или 10 градусов или более по сравнению с исходной Fc-областью.In some aspects of the present invention, the variant Fc region of the present invention has improved stability compared to the original Fc region. In certain embodiments of the present invention, the stability is thermodynamic stability. The thermodynamic stability of a polypeptide can be judged, for example, by using the Tm value as an indicator. Tm values can be measured using methods known to those skilled in the art, such as circular dichroism (CD), differential scanning calorimeter (DSC), and differential scanning fluorimetry (DSF). In one embodiment of the present invention, in an embodiment of the Fc region of the present invention, the Tm value of the CH2 region is increased by 0.1 degrees or more, 0.2 degrees or more, 0.3 degrees or more, 0.4 degrees or more, 0 .5 degrees or more, 1 degree or more, 2 degrees or more, 3 degrees or more, 4 degrees or more, 5 degrees or more, or 10 degrees or more compared to the original Fc region.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению содержат по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 250 и 307 в соответствии с нумерацией EU. В другом варианте изменения аминокислот, описанные в WO 2013/118858, могут быть аналогичным образом использованы в настоящем изобретении.In some embodiments of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of positions 250 and 307 according to EU numbering. Alternatively, the amino acid changes described in WO 2013/118858 can be similarly used in the present invention.

В некоторых объектах настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению состоит из двух полипептидных цепей с отличающимися друг от друга последовательностями. В дополнительном объекте настоящего изобретения в варианте Fc-области по настоящему изобретению простимулирована гетеродимеризация между первым полипептидом и вторым полипептидом. Когда гетеродимерный белок получают методом рекомбинации, предпочтительно, чтобы пептидные цепи, отличающиеся друг от друга, предпочтительно связывались с образованием гетеродимера, а неидентичные полипептидные цепи связывались с образованием гомодимера. Полезна ли гетеродимеризация в варианте Fc-области или нет, можно судить, например, путем отделения гомодимеров и гетеродимеров от полученных вариантов Fc-областей с помощью такого метода, как хроматография, и путем определения доли каждого компонента.In some aspects of the present invention, the variant Fc region of the present invention consists of two polypeptide chains with different sequences from each other. In a further aspect of the present invention, a variant of the Fc region of the present invention promotes heterodimerization between the first polypeptide and the second polypeptide. When a heterodimeric protein is produced by recombination, it is preferred that peptide chains that are different from each other are preferably associated to form a heterodimer, and non-identical polypeptide chains are preferentially associated to form a homodimer. Whether heterodimerization in an Fc region variant is beneficial or not can be judged, for example, by separating homodimers and heterodimers from the resulting Fc region variants using a method such as chromatography and by determining the proportion of each component.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению содержат по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 349, 356, 366, 368, 407 и 439 в соответствии с нумерацией EU. В другом варианте аминокислотные изменения, описанные в WO 2006/106905 и WO 1996/027011, могут быть аналогичным образом использованы в настоящем изобретении.In some embodiments of the present invention, the variants of the Fc regions of the present invention contain at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of positions 349, 356, 366, 368, 407 and 439 in accordance with EU numbering . Alternatively, the amino acid changes described in WO 2006/106905 and WO 1996/027011 can be similarly used in the present invention.

В некоторых объектах настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению обладает повышенной активностью связывания с FcRn при кислом рН. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения кислый рН означает величину рН от 4,0 до 6,5. В других вариантах осуществления настоящего изобретения кислый рН представляет собой по меньшей мере одну величину, выбранную из группы, состоящей из рН 4,0, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5,0, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6,0, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4 и 6,5. В вариантах осуществления настоящего изобретения кислый рН составляет величину рН 5,8.In some aspects of the present invention, the Fc region variant of the present invention has increased FcRn binding activity at acidic pH. In some embodiments of the present invention, an acidic pH means a pH value between 4.0 and 6.5. In other embodiments of the present invention, the acidic pH is at least one value selected from the group consisting of pH 4.0, 4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 4.5, 4.6 , 4.7, 4.8, 4.9, 5.0, 5.1, 5.2, 5.3, 5.4, 5.5, 5.6, 5.7, 5.8, 5 ,9, 6.0, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4 and 6.5. In embodiments of the present invention, the acidic pH is pH 5.8.

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению содержат по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 428, 434, 436, 438 и 440 в соответствии с нумерацией EU. В другом варианте аминокислотные изменения, описанные в WO 2016/125495, могут быть аналогичным образом использованы в настоящем изобретении.In some embodiments of the present invention, the variants of the Fc regions of the present invention contain at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of positions 428, 434, 436, 438 and 440 according to EU numbering. Alternatively, the amino acid changes described in WO 2016/125495 can be similarly used in the present invention.

В одном из объектов настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению содержит по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 349, 356, 366, 368, 407, 428, 434, 436, 438, 439 и 440 согласно нумерации EU.In one aspect of the present invention, a variant Fc region of the present invention contains at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 349, 356, 366, 368, 407, 428, 434, 436, 438, 439 and 440 according to EU numbering.

В некоторых объектах настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению содержит изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326 и 334 согласно нумерации EU. В еще одном аспекте вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307 и 326 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области, и в (ii) положения 236, 250, 270, 298, 307, 326 и 334 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In some aspects of the present invention, the variant Fc region of the present invention contains amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326 and 334 according to EU numbering. In yet another aspect, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, and 326, consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region, and (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326 and 334 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 332 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменение аминокислоты в положении 332 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области.In another aspect of the present invention, the Fc region variant of the present invention further comprises an amino acid change at position 332 in accordance with the EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises an amino acid change at position 332 consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 356 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменение аминокислоты в полоIn another aspect of the present invention, the Fc region variant of the present invention further comprises an amino acid change at position 356 in accordance with the EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the Fc region variant comprises an amino acid change in polo

- 51 045931 жении 356 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области.- 51 045931 gene 356 in accordance with the EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 366 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменение аминокислоты в положении 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области.In another aspect of the present invention, the Fc region variant of the present invention further comprises an amino acid change at position 366 in accordance with the EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises an amino acid change at position 366 corresponding to EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 349 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменение аминокислоты в положении 349 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области.In another aspect of the present invention, the Fc region variant of the present invention further comprises an amino acid change at position 349 in accordance with the EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises an amino acid change at position 349 consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 332 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменение аминокислоты в положении 332 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In another aspect of the present invention, the Fc region variant of the present invention further comprises an amino acid change at position 332 in accordance with the EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises an amino acid change at position 332 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 330 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменение аминокислоты в положении 330 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной области-Fc.In another aspect of the present invention, the Fc region variant of the present invention further comprises an amino acid change at position 330 in accordance with the EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises an amino acid change at position 330 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 439 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменение аминокислоты в положении 439 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In another aspect of the present invention, the Fc region variant of the present invention further comprises an amino acid change at position 439 in accordance with the EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises an amino acid change at position 439 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменения аминокислот в положениях 366, 368 и 407 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в положениях 366, 368 и 407 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fcобласти.In another aspect of the present invention, the variant Fc region of the present invention further comprises amino acid changes at positions 366, 368 and 407 in accordance with EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at positions 366, 368 and 407 in accordance with the EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В другом объекте настоящего изобретения вариант Fc-области по настоящему изобретению дополнительно содержит изменение аминокислоты в положении 356 в соответствии с нумерацией EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменение аминокислоты в положении 356 в соответствии с нумерацией EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In another aspect of the present invention, the Fc region variant of the present invention further comprises an amino acid change at position 356 in accordance with the EU numbering. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises an amino acid change at position 356 consistent with EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 334, 349, 356, 366, 368 и 407 по нумерации EU. В еще одном объекте настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 349 и 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положения 236, 250, 270, 298, 307, 326, 334, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 334, 349, 356, 366, 368, and 407 by numbering EU. In yet another aspect of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 349 and 366 in accordance with the EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region and at (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 334, 356, 366, 368 and 407 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 334, 349, 356 и 439 по нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326 и 356 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 334 и 439 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention comprise amino acid changes at EU numbering positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 334, 349, 356, and 439. In other aspects of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326 and 356, consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region and at (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 334 and 439 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 349, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 349 и 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 349, 356, 366, 368 and 407 according to EU numbering. In other aspects of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 349 and 366 in accordance with the EU numbering in the first polypeptide of the original Fc -region and at (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 356, 366, 368 and 407 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 356 и 439 согласно нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326 и 356 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334 и 439 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fcобласти.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 356 and 439 according to EU numbering. In other aspects of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326 and 356, consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region and at (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334 and 439 according to EU numbering in the second polypeptide of the original F region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 349, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fcобласти содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 349 и 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii)In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 349, 356, 366, 368, and 407 according to EU numbering. In other aspects of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 349 and 366, consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc -areas and in (ii)

- 52 045931 положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.- 52 045931 positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 356, 366, 368 and 407 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 356 и 439 согласно нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332 и 356 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 332, 334 и 439 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fcобласти.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 356 and 439 according to EU numbering. In other aspects of the present invention, the variant Fc region contains amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332 and 356 in accordance with the EU numbering in the first polypeptide of the original Fc -region and at (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 332, 334 and 439 according to EU numbering in the second polypeptide of the original F region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fcобласти содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326 и 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 366, 368 and 407 according to numbering EU. In other aspects of the present invention, the Fc region variant comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, and 366 in accordance with the EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region and in (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 366, 368 and 407 according to EU numbering in the second polypeptide of the parent Fc region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332 и 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 366, 368 and 407 according to EU numbering. In other aspects of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332 and 366, consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc -region and at (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 366, 368 and 407 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 349, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fc-области содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 349 и 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 349, 356, 366, 368 and 407 according to EU numbering. In other aspects of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 349 and 366 in accordance with the EU numbering in the first polypeptide of the original Fc -region and at (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 330, 332, 334, 356, 366, 368 and 407 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В некоторых объектах настоящего изобретения варианты Fc-области по настоящему изобретению содержат изменения аминокислот в положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 349, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU. В других объектах настоящего изобретения вариант Fcобласти содержит изменения аминокислот в (i) положениях 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 349 и 366 в соответствии с нумерацией EU в первом полипептиде исходной Fc-области и в (ii) положениях 236, 250, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 356, 366, 368 и 407 согласно нумерации EU во втором полипептиде исходной Fc-области.In some aspects of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain amino acid changes at positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 349, 356, 366, 368, and 407 according to EU numbering. In other aspects of the present invention, the variant Fc region comprises amino acid changes at (i) positions 234, 235, 236, 239, 250, 268, 270, 298, 307, 326, 332, 349 and 366, consistent with EU numbering in the first polypeptide of the original Fc -region and at (ii) positions 236, 250, 270, 298, 307, 326, 332, 334, 356, 366, 368 and 407 according to EU numbering in the second polypeptide of the original Fc region.

В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты Fc-областей по настоящему изобретению содержат по меньшей мере одно аминокислотное изменение, выбранное из группы, состоящей из: (i) Tyr или Phe в положении 234, Gln в положении 235, Trp в положении 236, Met в положении 239, Val в положении 250, Asp в положении 268, Glu в положении 270, Ala в положении 298, Pro в положении 307, Asp в положении 326, Glu в положении 332, Cys в положении 349, Lys в положении 356 и Trp в положении 366, согласно нумерация EU в первом полипептиде исходной Fc-области; и (ii) Ala в положении 236, Val в положении 250, Glu в положении 270, Ala в положении 298, Pro в положении 307, Asp в положении 326, Met или Lys в положении 330, Asp или Glu в положении 332, Glu в положении положение 334, Cys в положении 356, Ser в положении 366, Ala в положении 368, Val в положении 407 и Glu в положении 439, согласно нумерации EU, во втором полипептиде исходной Fc-области.In other embodiments of the present invention, the Fc region variants of the present invention contain at least one amino acid change selected from the group consisting of: (i) Tyr or Phe at position 234, Gln at position 235, Trp at position 236, Met at position 239, Val at position 250, Asp at position 268, Glu at position 270, Ala at position 298, Pro at position 307, Asp at position 326, Glu at position 332, Cys at position 349, Lys at position 356 and Trp at position 366, according to the EU numbering in the first polypeptide of the original Fc region; and (ii) Ala at position 236, Val at position 250, Glu at position 270, Ala at position 298, Pro at position 307, Asp at position 326, Met or Lys at position 330, Asp or Glu at position 332, Glu at position position 334, Cys at position 356, Ser at position 366, Ala at position 368, Val at position 407 and Glu at position 439, according to EU numbering, in the second polypeptide of the original Fc region.

В других объектах варианты Fc-областей по настоящему изобретению дополнительно содержат любое из аминокислотных изменений (а)-(г), приведенных ниже:In other aspects, variants of the Fc regions of the present invention further comprise any of the amino acid changes (a)-(d) below:

(а) Ala в положении 434 согласно нумерации EU;(a) Ala at position 434 according to EU numbering;

(б) Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно нумерации EU;(b) Ala at position 434, Thr at position 436, Arg at position 438 and Glu at position 440 according to EU numbering;

(в) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно нумерации EU; а также (г) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно нумерации EU.(c) Leu at position 428, Ala at position 434, Thr at position 436, Arg at position 438 and Glu at position 440 according to EU numbering; and (d) Leu at position 428, Ala at position 434, Arg at position 438, and Glu at position 440 according to EU numbering.

В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают полипептиды, содержащие аминокислотную последовательность любой из последовательностей SEQ ID NO: 43- 46, 65, 66, 81, 207, 239, 253-271, 276, 277 и 278.In other embodiments, the present invention provides polypeptides comprising the amino acid sequence of any of SEQ ID NOs: 43-46, 65, 66, 81, 207, 239, 253-271, 276, 277, and 278.

Обозначение рецепторы Fcy (в настоящем описании называемые рецепторами Fcy, FcyR или FcgR) относится к рецепторам, которые могут связываться с Fc-областью моноклональных антител IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, и практически означают любого представителя семейства белков, кодируемых генамиThe designation Fcy receptors (herein referred to as Fcy, FcyR, or FcgR receptors) refers to receptors that can bind to the Fc region of monoclonal antibodies IgG1, IgG2, IgG3, and IgG4, and virtually any member of the family of proteins encoded by the genes

- 53 045931 рецептора Fcy. У человека это семейство включает FcyRI (CD64), в том числе изоформы FcYRIa, FcYRIb и FcyRIc; FcyRII (CD32), включая изоформы FcYRIIa (включая аллотипы Н131 (тип Н) и R131 (тип R)), FcYRIIb (включая FcYRIIb-1 и FcYRIIb-2) и FcyRIIc; и FcyRIII (CD16), включая изоформы FcYRIIIa (включая аллотипы V158 и F158) и FcYRIIIb (включая аллотипы FcYRIIIb-NA1 и FcYRIIIb-NA2), и любые рецепторы FcyR человека, изоформы или аллотипы FcyR, которые еще предстоит обнаружить, но не ограничиваются ими. Сообщалось, что FcYRIIb1 и FcYRIIb2 являются вариантами сплайсинга FcYRIIb человека. Кроме того, сообщалось о варианте сплайсинга, названном FcYRIIb3 (J Exp Med, 1989, 170:1369-1385). В дополнение к этим вариантам сплайсинга FcYRIIb человека включает все варианты сплайсинга, зарегистрированные в NCBI, а именно NP_001002273.1,NP_001002274.1,NP_001002275.1,NP_001177757.1 и NP_003992.3. Кроме того, FcYRIIb человека включает в себя все описанные ранее генетические полиморфизмы, а также FcYRIIb (Arthritis Rheum. 2003, 48:3242-3252); Kono с соавт., Hum. Mol. Genet. 2005, 14:2881-2892; и Kyogoju с соавт., Arthritis Rheum. 2002, 46:1242-1254), и каждый генетический полиморфизм, о котором будет известно в будущем.- 53 045931 Fcy receptor. In humans, this family includes FcyRI (CD64), including the FcYRIa, FcYRIb, and FcyRIc isoforms; FcyRII (CD32), including isoforms FcYRIIa (including allotypes H131 (type H) and R131 (type R)), FcYRIIb (including FcYRIIb-1 and FcYRIIb-2) and FcyRIIc; and FcyRIII (CD16), including but not limited to the FcYRIIIa (including allotypes V158 and F158) and FcYRIIIb isoforms (including the FcYRIIIb-NA1 and FcYRIIIb-NA2 allotypes), and any human FcyR receptors, FcyR isoforms or allotypes yet to be discovered . FcYRIIb1 and FcYRIIb2 have been reported to be splice variants of human FcYRIIb. In addition, a splice variant called FcYRIIb3 has been reported (J Exp Med 1989, 170:1369-1385). In addition to these splice variants, human FcYRIIb includes all splice variants reported in NCBI, namely NP_001002273.1, NP_001002274.1, NP_001002275.1, NP_001177757.1 and NP_003992.3. In addition, human FcYRIIb includes all previously described genetic polymorphisms, as well as FcYRIIb (Arthritis Rheum. 2003, 48:3242-3252); Kono et al., Hum. Mol. Genet. 2005, 14:2881-2892; and Kyogoju et al., Arthritis Rheum. 2002, 46:1242-1254), and every genetic polymorphism that will be known in the future.

У FcYRIIa существует два аллотипа: в одном аминокислота в положении 131 FcYRIIa представляет собой гистидин (тип Н), а в другом аминокислота в положении 131 заменена аргинином (тип R) (Warrmerdam, J. Exp. Med. 1990, 172: 19-25).There are two allotypes of FcYRIIa: one in which the amino acid at position 131 of FcYRIIa is a histidine (type H), and the other in which the amino acid at position 131 is replaced by arginine (type R) (Warrmerdam, J. Exp. Med. 1990, 172: 19-25 ).

FcyR подразумевает рецепторы FcyR, производные от человека, мыши, крысы, кролика и обезьяны, но не ограничивается ими, и может быть получен из любого организма. К FcyR мыши относятся FcyRI (CD64), FcyRII (CD32), FcyRIII (CD16) и FcyRIII-2 (CD16-2) и любые FcyR мыши или изоформы FcyR, но ими возможный перечень не ограничивается.FcyR includes, but is not limited to, human, mouse, rat, rabbit and monkey-derived FcyR receptors and can be derived from any organism. Mouse FcyRs include, but are not limited to, FcyRI (CD64), FcyRII (CD32), FcyRIII (CD16), and FcyRIII-2 (CD16-2) and any mouse FcyRs or FcyR isoforms.

Аминокислотная последовательность FcyRI человека представлена в SEQ ID NO: 131 (NP_000557.1); аминокислотная последовательность FcYRIIa человека представлена в SEQ ID NO: 132 (ААН20823.1), SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 143 или SEQ ID NO: 150; аминокислотная последовательность FcYRIIb человека представлена в SEQ ID NO: 151 (AAI46679.1), SEQ ID NO: 169 или SEQ ID NO: 172; аминокислотная последовательность FcYRIIIa человека представлена в SEQ ID NO: 174 (ААН33678.1), SEQ ID NO: 175, SEQ ID NO: 176 или SEQ ID NO: 177; и аминокислотная последовательность FcYRIIIb человека представлена в SEQ ID NO: 178 (AAI28563.1).The amino acid sequence of human FcyRI is shown in SEQ ID NO: 131 (NP_000557.1); the amino acid sequence of human FcYRIIa is provided in SEQ ID NO: 132 (AAH20823.1), SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 143 or SEQ ID NO: 150; the amino acid sequence of human FcYRIIb is provided in SEQ ID NO: 151 (AAI46679.1), SEQ ID NO: 169 or SEQ ID NO: 172; the amino acid sequence of human FcYRIIIa is provided in SEQ ID NO: 174 (AAH33678.1), SEQ ID NO: 175, SEQ ID NO: 176 or SEQ ID NO: 177; and the amino acid sequence of human FcYRIIIb is shown in SEQ ID NO: 178 (AAI28563.1).

В отличие от рецептора Fcy, принадлежащего к надсемейству иммуноглобулинов, FcRn человека структурно сходен с полипептидами главного комплекса гистосовместимости (МНС - major histocompatibility complex) класса I, демонстрируя 22-29% идентичности последовательности с молекулами МНС класса I (Ghetie с соавт., Immunol. Today, 1997, 18 (12):592-598). FcRn экспрессируется в виде гетеродимера, состоящего из растворимой β-цепи или легкой цепи (в2-микроглобулина), образующей комплекс с трансмембранной α-цепью или тяжелой цепью. Как и МНС, α-цепь FcRn содержит три внеклеточных домена (α1, α2 и α3), и его короткий цитоплазматический домен закрепляет белок на поверхности клетки. Домены α1 и α2 взаимодействуют с FcRn-связывающим доменом Fc-области антитела (Raghavan с соавт., Immunity, 1994, 1: 303-315). Аминокислотная последовательность FcRn человека представлена в SEQ ID NO: 179 (NP_004098.1), а аминокислотная последовательность в2-микроглобулина представлена в SEQ ID NO: 180.Unlike the Fcy receptor, which belongs to the immunoglobulin superfamily, human FcRn is structurally similar to major histocompatibility complex class I polypeptides, demonstrating 22-29% sequence identity with MHC class I molecules (Ghetie et al., Immunol. Today, 1997, 18 (12):592-598). FcRn is expressed as a heterodimer consisting of a soluble β chain or light chain (β2-microglobulin) complexed with a transmembrane α chain or heavy chain. Like MHC, the FcRn α chain contains three extracellular domains (α1, α2, and α3), and its short cytoplasmic domain anchors the protein to the cell surface. The α1 and α2 domains interact with the FcRn binding domain of the antibody Fc region (Raghavan et al., Immunity, 1994, 1: 303-315). The amino acid sequence of human FcRn is presented in SEQ ID NO: 179 (NP_004098.1), and the amino acid sequence of β2-microglobulin is presented in SEQ ID NO: 180.

Обозначение исходная Fc-область в настоящем изобретении относится к Fc-области до интродукции изменения (изменений) аминокислот, описанных в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения исходная Fc-область означает Fc-область нативной последовательности (или Fc-область нативного антитела). Антитело включает, например, IgA (IgA1, IgA2), IgD, IgE, IgG (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4) и IgM. Антитело может быть получено от человека или обезьяны (например, яванского макака, макаки-резуса, мартышки, шимпанзе или бабуина). Нативное антитело может включать встречающиеся в природе мутации. Множество аллотипических последовательностей IgG, обусловленных генетическим полиморфизмом, описано в Sequences of proteins of immunological interest, публикация NIH № 91-3242, и любая из них может быть использована в настоящем изобретении. В частности, для IgG1 человека аминокислотная последовательность в положениях с 356 по 358 (нумерация EU) может быть либо DEL, либо ЕЕМ. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения исходная Fc-область представляет собой Fc-область, полученную из константной области тяжелой цепи IgG1 человека (SEQ ID NO: 249), IgG2 человека (SEQ ID NO: 250), IgG3 человека (SEQ ID NO: 251) или IgG4 человека (SEQ ID NO: 252). В другом варианте осуществления настоящего изобретения исходная Fc-область представляет собой Fc-область, полученную из константной области тяжелой цепи SEQ ID NO: 82 или SEQ ID NO: 158. В других вариантах осуществления настоящего изобретения исходная Fc-область может представлять собой Fc-областью, полученную путем добавления аминокислотного изменения (изменений), отличных от аминокислотного изменения (изменений), описанных в настоящем изобретении, к Fc-области нативной последовательности (Fc-области эталонного варианта последовательности). Fc-область нативной последовательности обычно представляет собой гомодимер, состоящий из двух идентичных полипептидных цепей.The designation "original Fc region" in the present invention refers to the Fc region prior to the introduction of the amino acid change(s) described in the present invention. In some embodiments of the present invention, the original Fc region means the Fc region of the native sequence (or the Fc region of the native antibody). The antibody includes, for example, IgA (IgA1, IgA2), IgD, IgE, IgG (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4) and IgM. The antibody may be obtained from a human or a monkey (eg, cynomolgus, rhesus, monkey, chimpanzee, or baboon). The native antibody may include naturally occurring mutations. A variety of allotypic IgG sequences due to genetic polymorphisms are described in Sequences of proteins of immunological interest, NIH publication No. 91-3242, and any of them can be used in the present invention. In particular, for human IgG1, the amino acid sequence at positions 356 to 358 (EU numbering) can be either DEL or EEM. In certain embodiments of the present invention, the parent Fc region is an Fc region derived from the heavy chain constant region of human IgG1 (SEQ ID NO: 249), human IgG2 (SEQ ID NO: 250), human IgG3 (SEQ ID NO: 251 ) or human IgG4 (SEQ ID NO: 252). In another embodiment of the present invention, the parent Fc region is an Fc region derived from the heavy chain constant region of SEQ ID NO: 82 or SEQ ID NO: 158. In other embodiments of the present invention, the parent Fc region may be an Fc region , obtained by adding amino acid change(s) other than the amino acid change(s) described in the present invention to the Fc region of the native sequence (Fc region of the reference sequence variant). The Fc region of the native sequence is usually a homodimer consisting of two identical polypeptide chains.

Кроме того, аминокислотные изменения, выполненные для других целей, могут быть объединены сAdditionally, amino acid changes made for other purposes can be combined with

- 54 045931 описанным в настоящем изобретении вариантом Fc-области. Например, могут быть добавлены замещения, которые улучшают активность по связыванию FcRn (Hinton с соавт., J. Immunol. 2006, 176(1):346356; Dall'Acqua с соавт., J. Biol. Chem. 2006, 281(33): 23514-23524; Petkova с соавт., Intl. Immunol. 2006, 18(12): 1759-1769; Zalevsky с соавт., Nat. Biotechnol. 2010, 28(2): 157-159; WO 2006/019447; WO 2006/053301; WO 2009/086320), и замещения аминокислот для улучшения гетерогенности или стабильности антител (WO 2009/041613). В другом варианте полипептиды, способные стимулировать клиренс антигена, которые описаны в WO 2011/122011, WO 2012/132067, WO 2013/046704 или WO 2013/180201, полипептиды со свойством специфического связывания с тканью-мишенью, которые описаны в WO 2013/180200, полипептиды со свойством многократного связывания с множеством молекул антигена, которые описаны в WO 2009/125825, WO 2012/073992 или WO 2013/047752, можно комбинировать с вариантом Fc-области, описанным в настоящем изобретении. В другом варианте с целью придания связывающей способности другим антигенам аминокислотные изменения, описанные в ЕР 1752471 и ЕР 1772465, могут быть объединены в СН3 варианта Fc-области, описанного в настоящем изобретении. В другом варианте с целью увеличения удерживания в плазме, аминокислотные изменения, которые снижают pI константной области (WO 2012/016227), могут быть объединены с вариантом Fc-области, описанным в настоящем изобретении. В другом варианте с целью стимуляции поглощения клетками аминокислотные изменения, повышающие pI константной области (WO 2014/145159), могут быть объединены с описанным в настоящем изобретении вариантом Fc-области. В другом варианте с целью стимуляции элиминации молекулы-мишени из плазмы аминокислотные изменения, повышающие pI константной области (WO 2016/125495), могут быть объединены в вариант Fc-области, описанный в настоящем изобретении. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения такое изменение может включать, например, замену по меньшей мере по одному положению, выбранному из группы, состоящей из положений 311, 343, 384, 399, 400 и 413 согласно нумерации EU. В другом варианте осуществления настоящего изобретения такая замена может представлять собой замену аминокислоты на Lys или Arg в каждом положении.- 54 045931 a variant of the Fc region described in the present invention. For example, substitutions may be added that improve FcRn binding activity (Hinton et al., J. Immunol. 2006, 176(1):346356; Dall'Acqua et al., J. Biol. Chem. 2006, 281(33) ): 23514-23524; Petkova et al., Intl. Immunol. 2006, 18(12): 1759-1769; Zalevsky et al., Nat. Biotechnol. 2010, 28(2): 157-159; WO 2006/019447 ; WO 2006/053301; WO 2009/086320), and amino acid substitutions to improve heterogeneity or stability of antibodies (WO 2009/041613). In another embodiment, polypeptides capable of promoting antigen clearance, which are described in WO 2011/122011, WO 2012/132067, WO 2013/046704 or WO 2013/180201, polypeptides with the property of specific binding to a target tissue, which are described in WO 2013/180200 , polypeptides with the property of multiple binding to multiple antigen molecules, which are described in WO 2009/125825, WO 2012/073992 or WO 2013/047752, can be combined with the Fc region variant described in the present invention. In another embodiment, in order to impart binding ability to other antigens, the amino acid changes described in EP 1752471 and EP 1772465 can be combined into the CH3 variant Fc region described in the present invention. In another embodiment, in order to increase plasma retention, amino acid changes that reduce the pI of the constant region (WO 2012/016227) can be combined with the Fc region variant described in the present invention. Alternatively, amino acid changes that increase the pI constant region (WO 2014/145159) can be combined with the Fc region variant described herein to promote cellular uptake. Alternatively, in order to promote elimination of a target molecule from plasma, amino acid changes that increase the pI of the constant region (WO 2016/125495) can be combined into a variant Fc region described in the present invention. In one embodiment of the present invention, such a change may include, for example, replacing at least one provision selected from the group consisting of provisions 311, 343, 384, 399, 400 and 413 according to the EU numbering. In another embodiment of the present invention, such a substitution may be an amino acid substitution of Lys or Arg at each position.

Кроме того, также могут быть использованы методы получения гетеродимеризованных антител, в которых используют ассоциацию СН1 и CL антитела и ассоциацию VH и VL, которые описаны в WO 2011/028952.In addition, methods for producing heterodimerized antibodies that use the association of CH1 and CL antibodies and the association of VH and VL, which are described in WO 2011/028952, can also be used.

Как и в случае со способом, описанным в WO 2008/119353 и WO 2011/131746, также можно использовать метод получения гетеродимеризованных антител путем предварительного получения двух типов гомодимеризованных антител, инкубации антител в восстанавливающих условиях для их диссоциации и последующей заново осуществляемой ассоциации.As with the method described in WO 2008/119353 and WO 2011/131746, it is also possible to use a method for producing heterodimerized antibodies by first preparing two types of homodimerized antibodies, incubating the antibodies under reducing conditions to dissociate them, and then re-associating them.

Кроме того, как и в случае со способом, описанным в WO 2012/058768, также можно использовать метод получения гетеродимеризованных антител путем добавления изменений в домены СН2 и СН3.In addition, as with the method described in WO 2012/058768, a method for producing heterodimerized antibodies by adding changes to the CH2 and CH3 domains can also be used.

При одновременной экспрессии двух полипептидов, содержащих вариант Fc-области, которые имеют разные аминокислотные последовательности, для получения полипептидов, содержащих гетерологичные варианты Fc-областей, полипептиды, содержащие гомологичные варианты Fc-областей, также обычно получают в виде примесей. В таких случаях полипептиды, содержащие гетерологичные варианты Fc-областей, могут быть эффективно получены путем их отделения и очистки от полипептидов, содержащих гомологичные варианты Fc-областей, с использованием известных технологий. Сообщалось о способе эффективного отделения и очистки гетеродимеризованных антител от гомодимеризованных антител с использованием ионообменной хроматографии путем внесения аминокислотных изменений в вариабельные области двух типов тяжелых цепей антител для создания различий в изоэлектрических точках между гомодимеризованными антителами и гетеродимеризованными антителами (WO 2007/114325). Сообщалось о другом методе очистки гетеродимеризованных антител с использованием хроматографии с белком А путем конструирования гетеродимеризованного антитела, содержащего два типа тяжелых цепей, полученных из IgG2a мыши, который связывается с белком А, и IgG2b крысы, который не связывается с белком А.When two Fc region variant-containing polypeptides that have different amino acid sequences are co-expressed to produce polypeptides containing heterologous Fc region variants, polypeptides containing homologous Fc region variants are also typically produced as impurities. In such cases, polypeptides containing heterologous Fc region variants can be efficiently obtained by separating and purifying them from polypeptides containing homologous Fc region variants using known techniques. A method for efficiently separating and purifying heterodimerized antibodies from homodimerized antibodies using ion exchange chromatography by introducing amino acid changes into the variable regions of two types of antibody heavy chains to create differences in isoelectric points between homodimerized antibodies and heterodimerized antibodies has been reported (WO 2007/114325). Another method for purifying heterodimerized antibodies using Protein A chromatography has been reported by constructing a heterodimerized antibody containing two types of heavy chains derived from mouse IgG2a, which binds to Protein A, and rat IgG2b, which does not bind to Protein A.

Сообщалось о другом методе очистки гетеродимеризованных антител с использованием хроматографии с белком А путем конструирования гетеродимеризованного антитела, содержащего два типа тяжелых цепей, полученных из IgG2a мыши, который связывается с белком А, и IgG2b крысы, который не связывается с белком A (WO 1998/050431 и WO 1995/033844).Another method for purifying heterodimerized antibodies using Protein A chromatography has been reported by constructing a heterodimerized antibody containing two types of heavy chains derived from mouse IgG2a, which binds to Protein A, and rat IgG2b, which does not bind to Protein A (WO 1998/050431 and WO 1995/033844).

Кроме того, гетеродимеризованное антитело можно эффективно очистить с помощью хроматографии с белком А путем замены аминокислотных остатков в положениях 435 и 436 (нумерация EU), которые расположены в сайте связывания белка А тяжелой цепи антитела, аминокислотами, такими как Tyr или His, чтобы получить различную аффинность связывания с белком А.In addition, a heterodimerized antibody can be efficiently purified by Protein A chromatography by replacing amino acid residues at positions 435 and 436 (EU numbering), which are located in the Protein A binding site of the antibody heavy chain, with amino acids such as Tyr or His to produce a different binding affinity for protein A.

В настоящем изобретении изменение аминокислоты означает любую замену, делецию, добавление, инсерцию и модификацию или их комбинацию. В настоящем изобретении изменение аминокислоты может быть перефразировано как мутация аминокислоты.In the present invention, an amino acid change means any substitution, deletion, addition, insertion and modification, or a combination thereof. In the present invention, an amino acid change can be rephrased as an amino acid mutation.

Число аминокислотных изменений, интродуцированных в Fc-область, не ограничиваются. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения их может быть 1, 2 или менее, 3 или менее, 4 или менее, 5 или менее, 6 или менее, 8 или менее, 10 или менее, 12 или менее, 14 или менее, 16 или меThe number of amino acid changes introduced into the Fc region is not limited. In certain embodiments of the present invention, there may be 1, 2 or less, 3 or less, 4 or less, 5 or less, 6 or less, 8 or less, 10 or less, 12 or less, 14 or less, 16 or more

- 55 045931 нее, 18 или менее или 20 или менее.- 55 045931 her, 18 or less or 20 or less.

В одном объекте настоящее изобретение относится к способам получения полипептида, содержащего вариант Fc-области. В дополнительных объектах настоящее изобретение относится к способам получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, функция которого была изменена. В некоторых объектах полипептиды представляют собой антитела. В некоторых объектах полипептиды представляют собой слитые Fc белки. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения эти способы включают введение по меньшей мере одной замены аминокислоты в исходную Fc-область. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения эти способы включают: (i) получение полипептида (полипептидов), включающих исходную Fc-область; и (ii) введение по меньшей мере одного изменения аминокислоты в исходной Fc-области. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения эти способы могут дополнительно включать (iii) измерение функции полипептида (полипептидов), содержащих вариант Fc-области. Нативная Fc-область обычно состоит из двух идентичных полипептидных цепей. Аминокислотные изменения в исходной Fc-области могут быть введены либо в одну из двух полипептидных цепей исходной Fc-области, либо в обе из двух полипептидных цепей.In one aspect, the present invention relates to methods for producing a polypeptide containing a variant Fc region. In further aspects, the present invention provides methods for producing a polypeptide containing a variant Fc region whose function has been altered. In some entities, the polypeptides are antibodies. In some cases, the polypeptides are Fc fusion proteins. In certain embodiments of the present invention, these methods include introducing at least one amino acid substitution into the original Fc region. In certain embodiments of the present invention, these methods include: (i) producing polypeptide(s) comprising the original Fc region; and (ii) introducing at least one amino acid change in the original Fc region. In certain embodiments of the present invention, these methods may further include (iii) measuring the function of the polypeptide(s) containing the Fc region variant. The native Fc region usually consists of two identical polypeptide chains. Amino acid changes in the original Fc region can be introduced into either one of the two polypeptide chains of the original Fc region, or into both of the two polypeptide chains.

В другом варианте осуществления настоящего изобретения способ получения полипептида (полипептидов), содержащих вариант Fc-области, включает: (i) получение одной или более нуклеиновых кислот, кодирующих полипептиды, содержащие исходную Fc-область; (ii) введение по меньшей мере одной мутации в область (области), кодирующие исходную Fc-область в нуклеиновых кислотах; (iii) введение нуклеиновых кислот, полученных в (ii), в клетку-хозяина; и (iv) культивирование клетки, описанной в (iii), таким образом, что экспрессируется полипептид (полипептиды), содержащий вариант Fc-области. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения вышеуказанные способы могут дополнительно включать (v) выделение полипептида (полипептидов), содержащих вариант Fc-области, из культуры клеток-хозяев, описанной в (iv).In another embodiment of the present invention, a method for producing polypeptide(s) containing a variant Fc region comprises: (i) producing one or more nucleic acids encoding polypeptides containing the original Fc region; (ii) introducing at least one mutation into the region(s) encoding the original Fc region in the nucleic acids; (iii) introducing the nucleic acids obtained in (ii) into a host cell; and (iv) culturing the cell described in (iii) such that the polypeptide(s) containing the Fc region variant are expressed. In certain embodiments of the present invention, the above methods may further comprise (v) isolating the polypeptide(s) containing the Fc region variant from the host cell culture described in (iv).

В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения нуклеиновые кислоты, полученные в (ii), могут быть включены в один или более векторов (например, в векторы экспрессии).In certain embodiments of the present invention, the nucleic acids obtained in (ii) may be included in one or more vectors (eg, expression vectors).

В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения аминокислотные изменения, используемые в способах получения по настоящему изобретению, выбирают из любых одиночных изменений, выбранных из аминокислотных изменений, которые могут содержаться в вышеупомянутых вариантах Fc-областей, комбинаций отдельных изменений или комбинированных изменений, перечисленные в табл. 26-30.In some embodiments of the present invention, the amino acid changes used in the production methods of the present invention are selected from any of the single amino acid changes that may be contained in the above-mentioned Fc region variants, combinations of single changes, or combined changes listed in Table. 26-30.

Fc-область может быть получена повторным элюированием фракции, адсорбированной на колонке с белком А, после частичного расщепления моноклональных антител IgG1, IgG2, IgG3, IgG4 или подобных им антител с использованием протеазы, такой как пепсин. Протеаза определенным образом не ограничена, если она может расщеплять полноразмерное антитело таким образом, что Fab и F(ab')2 продуцируются ограниченно путем соответствующего установления условий ферментативной реакции, таких как рН, примерами являются пепсин и папаин.The Fc region can be obtained by re-eluting the fraction adsorbed on the Protein A column after partial digestion of monoclonal antibodies IgG1, IgG2, IgG3, IgG4 or the like using a protease such as pepsin. A protease is not particularly limited if it can cleave a full-length antibody such that Fab and F(ab')2 are produced in a limited manner by appropriately setting enzymatic reaction conditions such as pH, examples being pepsin and papain.

Полипептиды, содержащие вариант Fc-области по настоящему изобретению, могут быть получены другими способами, известными в данной области, в дополнение к вышеупомянутым способам получения. Полипептиды, включающие вариант Fc-области, полученные описанными в настоящем изобретении способами получения, также включены в настоящее изобретение.Polypeptides containing the Fc region variant of the present invention can be produced by other methods known in the art, in addition to the above production methods. Polypeptides comprising a variant Fc region produced by the production methods described herein are also included in the present invention.

Способы анализа, описанные в настоящем изобретении, или различные способы измерения, известные в данной области, могут быть использованы для идентификации или скрининга вариантов Fcобластей, представленных в настоящем изобретении, или для выяснения их физических или химических свойств или биологической активности.The assay methods described in the present invention, or various measurement methods known in the art, can be used to identify or screen F region variants provided in the present invention, or to elucidate their physical or chemical properties or biological activity.

Анализы для определения связывающей активности полипептида, содержащего вариант Fcобласти, в отношении одного или более рецепторов семейства FcR описаны в настоящем изобретении или иным образом известны в данной области. Такие анализы связывания включают, но им не ограничиваются, анализ поверхностного плазмонного резонанса, скрининг методом Amplified Luminescent Proximity Homogeneous Assay (ALPHA), ELISA и сортировку клеток, активированных флуоресценцией (FACS) (Lazar с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2006, 103(11): 4005-4010).Assays for determining the binding activity of a polypeptide containing an Fc region variant to one or more FcR family receptors are described in the present invention or otherwise known in the art. Such binding assays include, but are not limited to, surface plasmon resonance analysis, Amplified Luminescent Proximity Homogeneous Assay (ALPHA) screening, ELISA, and fluorescence activated cell sorting (FACS) (Lazar et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2006, 103(11): 4005-4010).

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения активность связывания полипептида, содержащего вариант Fc-области, с членами семейства FcR можно измерить с помощью анализа методом поверхностного плазмонного резонанса. Например, различные FcR в качестве исследуемых соединений подвергают взаимодействию с полипептидом, содержащим вариант Fc-области, иммобилизованный или захваченный на сенсорном чипе, с использованием известных методов и реагентов (например, белка А, белка L, белка A/G, белка G, антитела с анти-А, цепью, антитела с анти-к цепью, антигенные пептиды и антигенные белки). В другом варианте FcR могут быть иммобилизованы или захвачены на сенсорном чипе, а полипептид, содержащий вариант Fc-области, может быть использован в качестве анализируемого вещества. В результате таких взаимодействий получают сенсограммы связывания и, анализируя их, можно рассчитать значения констант диссоциации (KD) таких связываний. Более того, разница в значении резонансной единицы (RU) на сенсограммах до и после взаимодействия с FcR (т.е. количество связывания FcR) может быть использована в качестве индикатора связывающей активности полипептида,In one embodiment of the present invention, the binding activity of a polypeptide containing an Fc region variant to members of the FcR family can be measured using a surface plasmon resonance assay. For example, various FcRs as test compounds are reacted with a polypeptide containing a variant Fc region immobilized or captured on a sensor chip using known methods and reagents (eg, protein A, protein L, protein A/G, protein G, antibody with anti-A chain, antibodies with anti-chain, antigenic peptides and antigenic proteins). In another embodiment, FcRs can be immobilized or captured on a sensor chip, and a polypeptide containing a variant Fc region can be used as an analyte. As a result of such interactions, binding sensorgrams are obtained and, by analyzing them, the values of the dissociation constants (KD) of such bindings can be calculated. Moreover, the difference in the resonance unit (RU) value in the sensorgrams before and after interaction with FcR (i.e., the amount of FcR binding) can be used as an indicator of the binding activity of the polypeptide,

- 56 045931 включающего вариант Fc-области к FcR. Кроме того, скорректированное значение, полученное путем деления указанного выше количества связывания FcR на разницу значений RU на сенсограммах до и после иммобилизации или захвата полипептида, содержащего вариант Fc-области, на сенсорном чипе (т.е. количество полипептида, содержащего вариант Fc-области) (то есть поправочное значение представляет собой количество связывания FcR на единицу количества полипептида, содержащего вариант Fcобласти), можно использовать в качестве индикатора активности связывания.- 56 045931 including a variant of the Fc region to FcR. In addition, the adjusted value obtained by dividing the above amount of FcR binding by the difference in RU values in the sensorgrams before and after immobilization or capture of the Fc region variant-containing polypeptide on the sensor chip (i.e., the amount of Fc region variant-containing polypeptide ) (that is, the correction value is the amount of FcR binding per unit amount of polypeptide containing the Fc region variant) can be used as an indicator of binding activity.

В другом объекте настоящее изобретение предусматривает фармацевтические составы, содержащие полипептид, включающий вариант Fc-области, согласно описанному в настоящем изобретении. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения указанные выше фармацевтические составы дополнительно содержат фармацевтически приемлемые носители.In another aspect, the present invention provides pharmaceutical compositions containing a polypeptide comprising a variant Fc region as described herein. In one embodiment of the present invention, the above pharmaceutical compositions further contain pharmaceutically acceptable carriers.

Примеры.Examples.

Ниже показаны примеры способов и композиций по настоящему изобретению. Следует учитывать, что различные другие варианты осуществления могут быть реализованы с учетом упомянутого выше общего описания.Shown below are examples of methods and compositions of the present invention. It should be appreciated that various other embodiments may be implemented in light of the general description mentioned above.

Пример 0. Концепция переключающего антитела, которое проявляет антитело-зависимую цитотоксическую активность в отношении маркеров клеточной поверхности регуляторных Т-клеток только в микроокружении рака.Example 0: A switch antibody concept that exhibits antibody-dependent cytotoxic activity against cell surface markers of regulatory T cells only in the cancer microenvironment.

Считалось, что ипилимумаб оказывает противоопухолевое действие путем ингибирования подавления активации эффекторных Т-клеток с помощью CTLA4, экспрессируемого на поверхности эффекторных Т-клеток; однако недавно сообщалось, что антителозависимая цитотоксическая активность (активность ADCC) в отношении Т-клеток, экспрессирующих CTLA4, важна, и было обнаружено, что удаление регуляторных Т-клеток в опухолях и активность ADCC являются важными механизмами действия противоопухолевого эффекта анти-CTLA4 антител.Ipilimumab was thought to exert its antitumor effects by inhibiting the suppression of effector T cell activation by CTLA4 expressed on the surface of effector T cells; however, antibody-dependent cytotoxic activity (ADCC activity) on CTLA4-expressing T cells has recently been reported to be important, and clearance of regulatory T cells in tumors and ADCC activity have been found to be important mechanisms of action for the antitumor effect of anti-CTLA4 antibodies.

Кроме того, известно, что активность ADCC антител IgG1 является результатом индукции цитотоксической активности за счет связывания константной области антитела с FcyR клеток NK и макрофагов, а антитела с константной областью, модифицированной для усиления такого связывания, индуцируют более сильное цитотоксическое действие, проявляемое как противоопухолевое действие.In addition, it is known that the ADCC activity of IgG1 antibodies results from the induction of cytotoxic activity due to the binding of the antibody constant region to the FcyR of NK cells and macrophages, and antibodies with a constant region modified to enhance such binding induce a stronger cytotoxic effect, manifested as an antitumor effect .

С другой стороны, сообщалось, что удаление регуляторных Т-клеток из всего организма вызывает системную реакцию, подобную аутоиммунному заболеванию, и считается, что регуляция баланса между цитотоксической активностью для оказания противоопухолевого эффекта и системным ответом является очень важной задачей.On the other hand, the removal of regulatory T cells from the entire body has been reported to induce a systemic response similar to an autoimmune disease, and regulating the balance between cytotoxic activity to produce an antitumor effect and the systemic response is considered to be a very important task.

Более конкретно, ожидается, что антитело будет проявлять более мощную цитотоксическую активность и будет способно подавлять системные ответы при условии, что антитело может прочно связываться с регуляторными Т-клетками или истощенными Т-клетками в микроокружении рака, оказывать сильное противоопухолевое действие путем удаления регуляторных Т-клеток или истощенных Т-клеток по цитотоксической активности, и ограничивают ответ только на микроокружение рака. Об антителах с таким механизмом действия пока не сообщается. Поэтому в настоящем описании фактически созданы и проверены антитела (антитела переключения CTLA4), которые действуют против CTLA4 только локально в опухоли и содержат константную область с усиленным связыванием с FcyR, экспрессируемыми на клетках NK и макрофагах.More specifically, the antibody is expected to exhibit more potent cytotoxic activity and be able to suppress systemic responses, provided that the antibody can tightly bind to regulatory T cells or exhausted T cells in the cancer microenvironment, exert a potent antitumor effect by removing regulatory T cells. cells or exhausted T cells for cytotoxic activity, and limit the response only to the cancer microenvironment. Antibodies with this mechanism of action have not yet been reported. Therefore, herein, we actually created and tested antibodies (CTLA4 switch antibodies) that act against CTLA4 only locally in the tumor and contain a constant region with enhanced binding to FcyRs expressed on NK cells and macrophages.

Пример 1. Получение антител, которые связываются с антигенами в присутствии АТФ или его метаболита, из наивной библиотеки и библиотеки антител рационального дизайна с использованием техники фагового дисплея.Example 1: Generation of antibodies that bind to antigens in the presence of ATP or its metabolite from a naive library and a rationally designed antibody library using phage display techniques.

Пример 1-1. Подготовка антигенов для получения антител, которые связываются с антигеном в присутствии малой молекулы.Example 1-1. Preparing antigens to produce antibodies that bind to the antigen in the presence of a small molecule.

В качестве антигенов получают биотинилированную внеклеточную область CTLA4 мыши (mCTLA4), внеклеточную область CTLA4 человека (hCTLA4) и белок абатацепт. В частности, что касается внеклеточной области hCTLA4, был синтезирован ген hCTLA4-His-BAP (SEQ ID NO: 1), в котором His-метка и ВАР-метка слиты с С-концом внеклеточной области hCTLA4, которые встраивают в экспрессионную плазмиду животного. Белок-антиген экспрессируют и очищают, используя следующий метод. Подготовленную плазмиду вводят методом липофекции в линию клеток FreeStyle 293-F, полученную из клеток эмбриональной почки человека (фирма Invitrogen), и клетки высевают в колбу после суспендирования в экспрессионной среде FreeStyle 293 (фирма Invitrogen) при плотности клеток 1.33/106 клеток/мл. Через три часа после введения плазмиды добавляют биотин до конечной концентрации 100 мкМ, культивируют в инкубаторе в атмосфере СО2 (37°С, 8% СО2, 125 об/мин) в течение 4 суток и очищают антиген из культурального супернатанта по методике, известной специалистам в данной области. Поглощение очищенного раствора антигена при 280 нм измеряют с помощью спектрофотометра. Концентрацию очищенного антигена рассчитывают из полученного значения с использованием коэффициента экстинкции, рассчитанного методом РАСЕ (Protein Science, 1995, 4: 2411-2423). С другой стороны, mCTLA4-His (фирма Sino Biologies Inc. 50503-M08H, номер в каталоге NP_033973.2), в котором Hisметка слита с внеклеточной областью mCTLA4, и абатацепт (фирма Alfresa Corporation), в котором конThe biotinylated extracellular region of mouse CTLA4 (mCTLA4), the extracellular region of human CTLA4 (hCTLA4) and abatacept protein are obtained as antigens. Specifically, regarding the extracellular region of hCTLA4, the hCTLA4-His-BAP gene (SEQ ID NO: 1) was synthesized in which a His tag and a BAP tag are fused to the C-terminus of the extracellular region of hCTLA4, which are inserted into an animal expression plasmid. The antigen protein is expressed and purified using the following method. The prepared plasmid is introduced by lipofection into the FreeStyle 293-F cell line obtained from human embryonic kidney cells (Invitrogen), and the cells are seeded in a flask after suspension in FreeStyle 293 expression medium (Invitrogen) at a cell density of 1.33/106 cells/ml. Three hours after the introduction of the plasmid, biotin is added to a final concentration of 100 μM, cultivated in an incubator in a CO 2 atmosphere (37 ° C, 8% CO 2 , 125 rpm) for 4 days, and the antigen is purified from the culture supernatant according to a well-known method specialists in this field. The absorbance of the purified antigen solution at 280 nm is measured using a spectrophotometer. The concentration of the purified antigen is calculated from the obtained value using the extinction coefficient calculated by the PACE method (Protein Science, 1995, 4: 2411-2423). On the other hand, mCTLA4-His (Sino Biologies Inc. 50503-M08H, catalog number NP_033973.2), in which the His tag is fused to the extracellular region of mCTLA4, and abatacept (Alfresa Corporation), in which

- 57 045931 стантная область IgG1 человека слита с hCTLA4, биотинилируют методом сочетания с амином (фирма PIERCE, номер в каталоге 21329).- 57 045931 human IgG1 stant region fused to hCTLA4, biotinylated by amine coupling (PIERCE, catalog number 21329).

Пример 1-2. Получение антител, которые связываются с CTLA4 мыши в присутствии малых молекул из библиотеки наивных антител человека, путем пэннинга с применением гранул.Example 1-2. Generation of antibodies that bind to mouse CTLA4 in the presence of small molecules from a naïve human antibody library by bead panning.

Библиотека фагового дисплея человеческих антител, состоящая из множества фагов, которые представляют домены Fab последовательностей антител человека, отличающиеся друг от друга, сконструирована в соответствии со способом, известным специалистам в данной области, с использованием в качестве матрицы поли-А РНК, полученные из человеческих МКПК, коммерчески доступные поли-А РНК человека и т.п.A human antibody phage display library consisting of a plurality of phages that represent different Fab domains of human antibody sequences is constructed in accordance with a method known to those skilled in the art using poly-A RNAs derived from human PBMCs as templates. , commercially available human poly-A RNA, etc.

Из сконструированной библиотеки фагового дисплея наивных антител человека отбирают антитела, связывающая активность которых с внеклеточной областью CTLA4 мыши (mCTLA4) изменяется в присутствии и в отсутствие малой молекулы. Точнее, собирают фаги, презентирующие антитела, которые проявляют активность по связыванию с mCTLA4 и захватываются на гранулах в присутствии малой молекулы. Фаги выделяли из фагового элюата, элюированного с гранул в отсутствие малой молекулы. В этом методе получения в качестве антигена использовали меченый биотином mCTLA4 (mCTLA4-HisBiotin).From a constructed naïve human antibody phage display library, antibodies were selected whose binding activity to the extracellular region of mouse CTLA4 (mCTLA4) was altered in the presence and absence of the small molecule. More specifically, phages are collected that present antibodies that exhibit mCTLA4 binding activity and are captured on beads in the presence of a small molecule. Phages were isolated from phage eluate eluted from beads in the absence of the small molecule. In this production method, biotin-tagged mCTLA4 (mCTLA4-HisBiotin) was used as the antigen.

Фаги, полученные из клеток Е. coli, несущих сконструированную фагмиду для фагового дисплея, очищают по общей методике. Затем получают раствор фаговой библиотеки, диализованный против TBS. Пэннинг проводят с использованием антигена, иммобилизованного на магнитных гранулах. В качестве магнитных гранул используют гранулы, покрытые NeutrAvidin (гранулы Sera-Mag SpeedBeads, покрытые NeutrAvidin) или гранулы, покрытые стрептавидином (Dynabeads M-280 Streptavidin).Phages obtained from E. coli cells carrying an engineered phagemid for phage display are purified using a general procedure. A phage library solution dialyzed against TBS is then obtained. Panning is carried out using antigen immobilized on magnetic beads. The magnetic beads used are NeutrAvidin-coated beads (Sera-Mag SpeedBeads, NeutrAvidin-coated beads) or streptavidin-coated beads (Dynabeads M-280 Streptavidin).

Для эффективного получения зависимого от малых молекул антитела-переключателя малых молекул, которое может действовать как переключатель в раковых тканях, проводили пэннинг, ссылаясь на метод, описанный в предшествующей патентной литературе WO 2013/180200. Этот метод пэннинга обогащает антитела, которые связываются с антигеном в присутствии аденозин-5'-трифосфата (АТФ) и метаболитов АТФ, но не связываются с антигеном в отсутствие АТФ.To efficiently produce a small molecule-dependent small molecule switch antibody that can act as a switch in cancerous tissues, panning was performed by referring to the method described in prior patent literature WO 2013/180200. This panning method enriches antibodies that bind to antigen in the presence of adenosine 5'-triphosphate (ATP) and ATP metabolites, but do not bind to antigen in the absence of ATP.

Пример 1-3. Оценка активности связывания в присутствии и в отсутствие малой молекулы с помощью фагового ИФА (ELISA).Example 1-3. Assessment of binding activity in the presence and absence of a small molecule using phage ELISA.

Из одиночных колоний Е. coli, полученных в примере 1-2 получают культуральный супернатант, содержащий фаг, в соответствии с общепринятым методом (Methods Mol. Biol. 2002, 178:133-145). Супернатанты культур, полученные с помощью NucleoFast 96 (фирма MACHERY-NAGEL), подвергают ультрафильтрации. По 100 мкл супернатанта каждой культуры вносят в каждую лунку NucleoFast 96 и центрифугируют в режиме 4500 g в течение 45 мин для удаления протока. Добавляют по 100 мкл Н2О и снова промывают центрифугированием при 4500 g в течение 30 мин. Затем добавляют по 100 мкл TBS и смесь оставляют при комнатной температуре в течение 5 мин, после чего растворы фагов, содержащиеся в супернатантах, извлекают.From single colonies of E. coli obtained in example 1-2, a culture supernatant containing phage is obtained in accordance with the generally accepted method (Methods Mol. Biol. 2002, 178:133-145). Culture supernatants obtained using NucleoFast 96 (MACHERY-NAGEL) are subjected to ultrafiltration. 100 μl of the supernatant of each culture is added to each well of NucleoFast 96 and centrifuged at 4500 g for 45 min to remove the duct. Add 100 µl of H 2 O and wash again by centrifugation at 4500 g for 30 minutes. Then 100 μl of TBS is added and the mixture is left at room temperature for 5 min, after which the phage solutions contained in the supernatants are removed.

Очищенные фаги, к которым добавляют TBS, анализируют ELISA по следующей методике. Планшет для микротитрования StreptaWell 96 (фирма Roche) на ночь покрывают 100 мкл TBS, содержащего mCTLA4-His-биотин. После промывания каждой лунки TBST для удаления mCTLA4-His-биотинa, не связанного с планшетом, лунки блокируют 250 мкл 2% обезжиренного молока-TBS на 1 ч или дольше. После удаления 2% обезжиренного молока-TBS в каждую лунку добавляют подготовленные очищенные фаги и планшет оставляют стоять при комнатной температуре в течение 1 ч, что позволяет фагам, презентирующим антитела, связываться с mCTLA4-His-биотином, присутствующим в каждой лунке в отсутствие или в присутствии АТФ. После промывания каждой лунки TBST или ATP/TBST туда добавляют HRP-конъюгированное анти-М13 антитело (фирма Amersham Pharmacia Biotech), разведенное TBS или ATP/TBS, и планшет инкубируют в течение 1 ч. После промывки TBST или ATP/TBST реакцию развития окраски раствора в каждой лунке, в которую добавляли один раствор ТМВ (ZyMED), останавливают добавлением серной кислоты, а затем измеряют изменение окраски по поглощению при 450 нм. В результате были подтверждены множественные антитела, которые связывались с mCTLA4 только в присутствии АТФ. Результаты фагового ELISA показаны в табл. 2. В данном случае клоны, имеющие коэффициент поглощения выше 0,2 в присутствии АТФ, определены как положительные, а клоны, имеющие коэффициент поглощения выше 2 в присутствии/отсутствии АТФ, определены как положительные клоны, обладающие АТФ-зависимой антигенсвязывающей способностью (переключающие клоны). В этом примере SM может использоваться как аббревиатура для малой молекулы (small molecule)/низкомолекулярной молекулы, такой как АТФ.Purified phages to which TBS was added were analyzed by ELISA using the following procedure. A StreptaWell 96 microtiter plate (Roche) is coated with 100 μl of TBS containing mCTLA4-His-biotin overnight. After washing each well with TBST to remove mCTLA4-His-biotin not bound to the plate, the wells are blocked with 250 μl of 2% skim milk-TBS for 1 h or longer. After removing the 2% skim milk-TBS, prepared purified phages are added to each well and the plate is allowed to stand at room temperature for 1 hour, allowing the antibody-presenting phages to bind to the mCTLA4-His-biotin present in each well with or without presence of ATP. After washing each well with TBST or ATP/TBST, HRP-conjugated anti-M13 antibody (Amersham Pharmacia Biotech) diluted in TBS or ATP/TBS is added and the plate is incubated for 1 hour. After washing with TBST or ATP/TBST, color development reaction occurs. solution in each well to which one TMB solution (ZyMED) was added is stopped by adding sulfuric acid, and then the color change is measured by absorbance at 450 nm. The results confirmed multiple antibodies that bound mCTLA4 only in the presence of ATP. The phage ELISA results are shown in Table. 2. In this case, clones having an absorption coefficient higher than 0.2 in the presence of ATP are defined as positive, and clones having an absorption coefficient higher than 2 in the presence/absence of ATP are defined as positive clones possessing ATP-dependent antigen-binding ability (switching clones ). In this example, SM can be used as an acronym for small molecule such as ATP.

Таблица 2table 2

Общее количество Total Количество ELISA-обработанных клонов Number of ELISA-treated clones 192 192 Количество положительных клонов (абсорбция >0,2) Number of positive clones (absorbance >0.2) 103 103 Количество переключающих клонов (SM± соотношение>2) Number of switching clones (SM± ratio>2) 28 28

Пример 1-4. Получение антител, которые связываются с антигеном в присутствии малой молекулыExample 1-4. Producing antibodies that bind to an antigen in the presence of a small molecule

- 58 045931 из библиотеки рационального дизайна с использованием АТФ или его метаболита.- 58 045931 from the library of rational design using ATP or its metabolite.

Из библиотеки фагового дисплея с рациональным дизайном антител, созданной в предшествующей практике (WO 2015/083764), антитела, проявляющие антигенсвязывающую активность в условиях присутствия АТФ или метаболита АТФ (например, АДФ, АМФ, аденозина (АДО) и т.д.) были получены. Для получения антител собирают фаги, презентирующие антитела, демонстрирующие способность связывания с антигеном, захваченным на гранулах, в присутствии АТФ или метаболита АТФ, после чего фаги выделяют из элюата, элюированного с шариков, в условиях отсутствия АТФ или метаболита АТФ.From a phage display library with rational antibody design generated in prior practice (WO 2015/083764), antibodies exhibiting antigen binding activity in the presence of ATP or an ATP metabolite (e.g. ADP, AMP, adenosine (ADO), etc.) were received. To obtain antibodies, phages presenting antibodies that demonstrate the ability to bind to antigen captured on beads in the presence of ATP or an ATP metabolite are collected, and the phages are then isolated from the bead elute in the absence of ATP or an ATP metabolite.

Фаги получают обычным способом из Е. coli, несущей сконструированную фагмиду для фагового дисплея. Раствор фаговой библиотеки получают разбавлением TBS популяции фагов, осажденных путем добавления 2,5 М NaCl/10% ПЭГ к культуральному раствору Е. coli, в котором были получены фаги. Затем к раствору фаговой библиотеки добавляют БСА до конечной концентрации 4%. Пэннинг проводят с использованием антигена, иммобилизованного на магнитных гранулах. В качестве магнитных гранул используют гранулы, покрытые NeutrAvidin (гранулы Sera-Mag SpeedBeads, покрытые NeutrAvidin), или гранулы, покрытые стрептавидином (Dynabeads M-280 Streptavidin). В качестве антигена используют биотинилированный абатацепт (Abatacept-Biotin).Phages are produced in the usual manner from E. coli carrying an engineered phagemid for phage display. A phage library solution is prepared by diluting the phage population with TBS, precipitated by adding 2.5 M NaCl/10% PEG to the E. coli culture solution in which the phages were obtained. BSA is then added to the phage library solution to a final concentration of 4%. Panning is carried out using antigen immobilized on magnetic beads. The magnetic beads used are NeutrAvidin-coated beads (Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated beads) or streptavidin-coated beads (Dynabeads M-280 Streptavidin). Biotinylated abatacept (Abatacept-Biotin) is used as an antigen.

Чтобы эффективно получить зависимое от малых молекул низкомолекулярное антителопереключатель, которое может действовать как переключатель в раковой ткани, пэннинг для обогащения антител, которые связываются с антигеном в присутствии аденозин-5'-трифосфата (АТФ) или метаболита АТФ, и не связываться с антигеном в отсутствие АТФ или метаболита АТФ, проводят со ссылкой на метод, показанный в предшествующей патентной литературе (WO 2015/083674).To efficiently produce a small molecule-dependent small molecule antibody switch that can act as a switch in cancer tissue, panning to enrich antibodies that bind antigen in the presence of adenosine 5'-triphosphate (ATP) or an ATP metabolite, and do not bind antigen in the absence ATP or ATP metabolite is carried out with reference to the method shown in previous patent literature (WO 2015/083674).

Пример 1-5. Оценка активности связывания в присутствии и в отсутствие АТФ или его метаболита с помощью фагового ИФА (ELISA).Example 1-5. Evaluation of binding activity in the presence and absence of ATP or its metabolite using phage ELISA.

Из одиночных колоний Е. coli, полученных вышеописанным способом, получают культуральный супернатант, содержащий фаг, в соответствии с общепринятым методом (Methods Mol. Biol. 2002, 178:133-145). Восстановленный культуральный супернатант подвергают ультрафильтрации с использованием NucleoFast 96 (MACHEREY-NAGEL). Проток удаляют центрифугированием (4500 g, 45 минут) NucleoFast 96 с добавлением 100 мкл культурального супернатанта в каждую лунку. NucleoFast 96 с добавлением 100 мкл Н2О в каждую лунку снова промывают центрифугированием (4500 g, 30 мин). В итоге добавляют по 100 мкл TBS и получают раствор фага, содержащийся в супернатанте каждой лунки NucleoFast 96, который оставляют при комнатной температуре на 5 мин.From single colonies of E. coli obtained as described above, a culture supernatant containing phage is obtained in accordance with the conventional method (Methods Mol. Biol. 2002, 178:133-145). The recovered culture supernatant was ultrafiltrated using NucleoFast 96 (MACHEREY-NAGEL). The duct is removed by centrifugation (4500 g, 45 minutes) NucleoFast 96 with the addition of 100 μl of culture supernatant to each well. NucleoFast 96 with the addition of 100 μl of H 2 O to each well is washed again by centrifugation (4500 g, 30 min). Finally, 100 μl of TBS is added to obtain a phage solution contained in the supernatant of each NucleoFast 96 well, which is left at room temperature for 5 minutes.

TBS или TBS, содержащий АТФ или его метаболит (SM/TBS), добавляют к очищенным фагам, и фаги подвергают анализу ELISA по следующей процедуре. Планшет для микротитрования StreptaWell 96 (фирма Roche) покрывают в течение ночи 100 мкл TBS, содержащего меченый биотином антиген (абатацепт-биотин), полученный в примере 1-1. После того как свободный абатацепт-биотин удаляют путем промывания каждой лунки планшета TBST, лунки блокируют 250 мкл 2% обезжиренного молока-ТВS на 1 ч или дольше. После удаления 2% обезжиренного молока-TBS в каждую лунку добавляют подготовленные очищенные фаги и планшет оставляют при 37°С в течение 1 ч, что позволяет фагам, презентирующим антитела, связываться с абатацептом-биотином, присутствующим в каждой лунке в отсутствие или присутствие АТФ или его метаболита. После того как каждую лунку планшета промывают TBST или TBST, содержащим АТФ или его метаболит (SM/TBST), туда добавляют HRP-конъюгированное анти-М13-антитело (фирма Amersham Pharmacia Biotech), разведенное TBS или SM/TBS, и этот планшет инкубируют 1 ч.TBS or TBS containing ATP or its metabolite (SM/TBS) is added to the purified phages, and the phages are subjected to ELISA analysis using the following procedure. A StreptaWell 96 microtiter plate (Roche) is coated overnight with 100 μl of TBS containing the biotin-labeled antigen (abatacept-biotin) prepared in Example 1-1. After free abatacept-biotin is removed by washing each well of the plate with TBST, the wells are blocked with 250 μl of 2% skim milk-TBS for 1 hour or longer. After removing the 2% skim milk-TBS, prepared purified phages are added to each well and the plate is left at 37°C for 1 hour, allowing the antibody-presenting phages to bind to the abatacept-biotin present in each well in the absence or presence of ATP or its metabolite. After each well of the plate is washed with TBST or TBST containing ATP or its metabolite (SM/TBST), HRP-conjugated anti-M13 antibody (Amersham Pharmacia Biotech) diluted with TBS or SM/TBS is added and the plate is incubated. 1 hour

После промывки TBST или ATP/TBST реакцию развития окраски раствора в каждой лунке, в которую добавляли один раствор ТМВ (ZyMED), останавливают добавлением серной кислоты, а затем измеряют изменение окраски по поглощению при 450 нм. В результате были подтверждены множественные антитела, которые связывались с mCTLA4 только в присутствии АТФ. Результаты фагового ELISA показаны в табл. 3. В данном случае клоны, имеющие коэффициент поглощения выше 2 в присутствии АТФ, определены как положительные, а клоны, имеющие коэффициент поглощения выше 2 в присутствии/отсутствии АТФ или его метаболита, определены как клоны, обладающие антигенсвязывающей способностью, которая зависит от АТФ или его метаболита (переключение клонов).After washing with TBST or ATP/TBST, the color development reaction of the solution in each well to which one TMB solution (ZyMED) was added was stopped by adding sulfuric acid, and then the color change was measured by absorbance at 450 nm. The results confirmed multiple antibodies that bound mCTLA4 only in the presence of ATP. The results of the phage ELISA are shown in Table. 3. In this case, clones having an absorption coefficient above 2 in the presence of ATP are defined as positive, and clones having an absorption coefficient above 2 in the presence/absence of ATP or its metabolite are defined as clones having antigen-binding ability, which depends on ATP or its metabolite (clone switching).

Таблица 3Table 3

4й тест 4th test 5й тест 5th test Общее количество Total Количество ELISA-обработанных клонов Number of ELISA-treated clones 288 288 288 288 576 576 Количество положительных клонов (S/N >2) Number of positive clones (S/N >2) 157 157 159 159 316 316 4й тест 4th test 5й тест 5th test Общее количество Total Количество переключающих клонов (SM± соотношение>2) Number of switching clones (SM± ratio>2) 6 6 16 16 22 22

- 59 045931- 59 045931

Пример 1-6. Анализ последовательности переключающих антител, антигенсвязывающая активность которых изменяется в зависимости от наличия или отсутствия АТФ и ее метаболитов.Example 1-6. Analysis of the sequence of switching antibodies, the antigen-binding activity of which changes depending on the presence or absence of ATP and its metabolites.

Нуклеотидные последовательности генов, амплифицированных с использованием специфических праймеров lacPF (SEQ ID NO: 2) и GlseqR (SEQ ID NO: 3) из клонов, обладающих антигенсвязывающей активностью, при условии наличия АТФ и ее метаболитов в результате анализа методом фагового ИФА (ELISA). В результате анализа были получены клоны ABADh11-4_020, ABADh11-4086, ABADh124_014, ABADh12-5_001, ABADh12-5_046 и ABADh5-5_041, которые, как было установлено, обладают активностью связывания с меченым биотином абатацептом в присутствии АТФ и его метаболитов. Имена клонов были переименованы и стали обозначаться как АВАМ001, АВАМ002, АВАМ003, АВАМ004, АВАМ005 и АВАМ006, соответственно (табл. 4).Nucleotide sequences of genes amplified using specific primers lacPF (SEQ ID NO: 2) and GlseqR (SEQ ID NO: 3) from clones with antigen binding activity, subject to the presence of ATP and its metabolites as a result of phage ELISA analysis. As a result of the analysis, clones ABADh11-4_020, ABADh11-4086, ABADh124_014, ABADh12-5_001, ABADh12-5_046 and ABADh5-5_041 were obtained, which were found to have binding activity with biotin-labeled abatacept in the presence of ATP and its metabolites. The clone names were renamed and became ABAM001, ABAM002, ABAM003, ABAM004, ABAM005 and ABAM006, respectively (Table 4).

Таблица 4Table 4

Клоны Clones Антитела Antibodies VH SEQ ID NO VH SEQ ID NO VL SEQ ID NO VL SEQ ID NO ABADhll-4 020 ABADhll-4 020 ABAM001 ABAM001 4 4 5 5 ABADhll-4 086 ABADhll-4 086 ABAM002 ABAM002 6 6 7 7 ABADhl2-4 014 ABADhl2-4 014 ABAM003 ABAM003 8 8 9 9 ABADhl2-5 001 ABADhl2-5 001 ABAM004 ABAM004 10 10 11 eleven ABADhl2-5 046 ABADhl2-5 046 ABAM005 ABAM005 12 12 13 13 ABADh5-5 041 ABADh5-5 041 ABAM006 ABAM006 14 14 15 15

Пример 1-7. Экспрессия и очистка переключающих антител, у которых антигенсвязывающая активность изменяется в зависимости от присутствия и отсутствия АТФ и ее метаболитов.Example 1-7. Expression and purification of switch antibodies whose antigen-binding activity varies depending on the presence and absence of ATP and its metabolites.

Гены, кодирующие вариабельные области АВАМ001, АВАМ002, АВАМ003, АВАМ004, АВАМ005 и АВАМ006, полученные из библиотеки фагов рационального дизайна человека, встраивают в экспрессионную плазмиду животных IgG1/Lambda человека. Антитела экспрессируют с использованием следующего метода. Полученную плазмиду вводят методом липофекции в линию клеток FreeStyle 293-F, полученную из клеток эмбриональной почки человека (фирма Invitrogen), которая была суспендирована в экспрессионной среде FreeStyle 293 (фирма Invitrogen) при плотности клеток 1,33 х 106 клеток/мл, и высевают по 3 мл/лунку в каждую лунку 6-луночных планшетов. Антитела очищают из культур ального супернатанта, культивируемого в СО2-инкубаторе (37°С, 8% СО2, 90 об/мин) в течение 4 дней с использованием среды rProtein A Sepharose™ Fast Flow (фирма Amersham Biosciences) методом, известным специалистам в данной области. Поглощение растворов очищенных антител при 280 нм измеряют с использованием спектрофотометра. По полученным измеренным значениям рассчитывают концентрацию очищенных антител с использованием коэффициента экстинкции, рассчитанного методом РАСЕ (Protein Science, 1995, 4: 2411-2423).The genes encoding the variable regions ABAM001, ABAM002, ABAM003, ABAM004, ABAM005 and ABAM006, obtained from a rationally designed human phage library, are inserted into a human IgG1/Lambda animal expression plasmid. Antibodies are expressed using the following method. The resulting plasmid is introduced by lipofection into the FreeStyle 293-F cell line, obtained from human embryonic kidney cells (Invitrogen), which was suspended in the FreeStyle 293 expression medium (Invitrogen) at a cell density of 1.33 x 106 cells/ml, and seeded 3 ml/well in each well of 6-well plates. Antibodies are purified from culture supernatant cultured in a CO 2 incubator (37°C, 8% CO 2 , 90 rpm) for 4 days using rProtein A Sepharose™ Fast Flow medium (Amersham Biosciences) by a method known in the art. in this area. The absorbance of purified antibody solutions at 280 nm is measured using a spectrophotometer. From the obtained measured values, the concentration of purified antibodies is calculated using the extinction coefficient calculated by the PACE method (Protein Science, 1995, 4: 2411-2423).

Пример 1-8. Оценка связывающей активности полученных антител против hCTLA4 в присутствии и в отсутствие АМП методом IgG ELISA.Example 1-8. Evaluation of the binding activity of the obtained antibodies against hCTLA4 in the presence and absence of AMPs using IgG ELISA.

Полученные шесть антител АВАМ001, АВАМ002, АВАМ003, АВАМ004, АВАМ005 и АВАМ006 анализируют методом IgG ELISA. Буферы, показанные в табл. 5, приготавливают надлежащим образом. В качестве антигена используют меченный биотином CTLA4 человека (hCTLA4-His-Biotin).The resulting six antibodies ABAM001, ABAM002, ABAM003, ABAM004, ABAM005 and ABAM006 were analyzed by IgG ELISA. The buffers shown in table. 5, Prepare properly. Biotin-labeled human CTLA4 (hCTLA4-His-Biotin) is used as the antigen.

Таблица 5Table 5

Буфер Buffer Состав Compound Буфер для промывки Wash buffer TSB, 0,1% Tween20 TSB, 0.1% Tween20 Блокирующий буфер Blocking buffer TSB, 2% БСА TSB, 2% BSA Буфер для образцов Sample Buffer TSB, 1 мМ АМФ TSB, 1 mM AMP

Сначала планшет для микротитрования StreptaWell 96 (фирма Roche) покрывают 100 мкл TBS, содержащего hCTLA4-His-биотин, при комнатной температуре на 1 ч или дольше. После того как каждую лунку планшета промывают буфером для промывки для удаления hCTLA4-His-биотина, не связанного с планшетом, лунки блокируют 250 мкл блокирующего буфера на 1 ч или дольше. В каждую лунку, из которой удаляли блокирующий буфер, добавляют по 100 мкл каждого очищенного IgG в итоговой концентрации 2,5 мкг/мл в буфере для образцов, содержащем АМФ, в конечной концентрации 1 мМ, и планшет оставляют при комнатной температуре в течение 1 ч, что позволяет каждому IgG связываться с hCTLA4-His-биотином, присутствующим в каждой лунке. После промывки промывочным буфером, содержащим AMP в конечной концентрации 1 мМ, планшет, в каждую лунку которого было добавлено HRP-конъюгированное анти-IgG антитело человека (фирма BIOSOURCE), разведенное буфером для образцов, инкубируют в течение 1 ч. После промывки промывочным буфером, содержащим малую молекулу, реакцию изменения окраски раствора в каждой лунке, в которую добавляли раствор ТМВ (фирма ZyMED), останавливают добавлением серной кислоты, а затем измеряют развитие окраски по поглощению при 450 нм. В качестве буферов использовали буферы, содержащие композиции, показанные в табл. 5.First, a StreptaWell 96 microtiter plate (Roche) is coated with 100 μl of TBS containing hCTLA4-His-biotin at room temperature for 1 hour or longer. After each well of the plate is washed with wash buffer to remove hCTLA4-His-biotin not bound to the plate, the wells are blocked with 250 μl of blocking buffer for 1 hour or longer. To each well from which blocking buffer has been removed, add 100 μl of each purified IgG at a final concentration of 2.5 μg/ml in sample buffer containing AMP at a final concentration of 1 mM, and the plate is left at room temperature for 1 h. , allowing each IgG to bind to the hCTLA4-His-biotin present in each well. After washing with wash buffer containing AMP at a final concentration of 1 mM, the plate containing HRP-conjugated anti-human IgG antibody (BIOSOURCE) diluted in sample buffer was added to each well for 1 hour. After washing with wash buffer, containing a small molecule, the color change reaction of the solution in each well to which the TMB solution (ZyMED) was added was stopped by adding sulfuric acid, and then the color development was measured by absorbance at 450 nm. Buffers containing the compositions shown in table were used as buffers. 5.

Результаты измерений представлены в табл. 6. Переполненным лункам присваивают оценку 5,00. Результаты показывают, что у всех клонов АВАМ001, АВАМ002, АВАМ003, АВАМ004, АВАМ005 и АВАМ006 поглощение в отсутствие АМФ было значительно ниже, чем в присутствии АМФ. Этот реThe measurement results are presented in table. 6. Crowded holes are given a score of 5.00. The results show that for all clones ABAM001, ABAM002, ABAM003, ABAM004, ABAM005, and ABAM006, the uptake in the absence of AMP was significantly lower than in the presence of AMP. This re

- 60 045931 зультат подтверждает, что все клоны АВАМ001, АВАМ002, АВАМ003, АВАМ004, АВАМ005 и АВАМ006 обладают свойством изменять связывание с антигеном в зависимости от присутствия или отсутствия малых молекул.- 60 045931 The result confirms that all clones ABAM001, ABAM002, ABAM003, ABAM004, ABAM005 and ABAM006 have the property of altering antigen binding depending on the presence or absence of small molecules.

Таблица 6Table 6

Антитела Antibodies Поглощение при 450 нм Absorbance at 450 nm Наличие малой молекулы Presence of a small molecule Отсутствие малой молекулы Lack of small molecule S/N S/N АВАМ001 ABAM001 5,000 5,000 3,455 3.455 1,45 1.45 АВАМ002 ABAM002 5,000 5,000 0,139 0.139 35,97 35.97 АВАМ003 ABAM003 5,000 5,000 3,180 3,180 1,57 1.57 АВАМ004 ABAM004 5,000 5,000 0,643 0.643 7,78 7.78 АВАМ005 ABAM005 0,303 0.303 0,069 0.069 4,46 4.46 АВАМ006 ABAM006 2,995 2,995 0,776 0.776 3,86 3.86

Примет 1-9. Оценка воздействия АТФ и его метаболитов на связывание с CTLA4 человека методом поверхностного плазмонного резонанса.Will accept 1-9. Evaluation of the effect of ATP and its metabolites on binding to human CTLA4 by surface plasmon resonance.

АВАМ004 дополнительно оценивают как антитело-переключатель CTLA4.ABAM004 is further evaluated as a CTLA4 switch antibody.

Взаимодействие реакции антиген-антитело между АВАМ004 и hCTLA4-His-BAP анализируют с использованием Biacore T200 (фирма GE Healthcare). После захвата АВАМ004 сенсорным чипом СМ5 (фирма GE Healthcare), на котором иммобилизован белок A/G (фирма Pierce) в соответствующем количестве методом сочетания с амином, допускают взаимодействие с антигеном hCTLA4-His-BAP, полученным в примере 1-1. TBS используют в качестве подвижного буфера, а 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) используют в качестве раствора для регенерации.Antigen-antibody interaction between ABAM004 and hCTLA4-His-BAP was analyzed using Biacore T200 (GE Healthcare). After ABAM004 is captured by the CM5 sensor chip (GE Healthcare), on which protein A/G (Pierce) is immobilized in an appropriate amount by amine coupling, it is allowed to interact with the hCTLA4-His-BAP antigen obtained in Example 1-1. TBS is used as the running buffer, and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) is used as the regeneration solution.

После захвата 1 мкг/мл АВАМ004, суспендированного в TBS, раствор, содержащий 500 нМ hCTLA4-His-BAP и 10 концентраций АТФ, АДФ или АМФ, разбавленных до концентрации от 4 из 4000 мкМ, и 2 мМ MgCl2 вводят в каждую проточную кювету со скоростью потока 10 мкл/мин в течение 3 мин. Эти 3 мин используют в качестве фазы связывания hCTLA4-His-BAP. После завершения фазы связывания инъекцией вводят уже рабочий буфер в течение 2 мин, которые используют в качестве фазы диссоциации hCTLA4-His-BAP. После завершения фазы диссоциации вводят регенерирующий раствор со скоростью потока 30 мкл/мин в течение 30 с. Указанное выше определяют как цикл измерения связывающей активности АВАМ004. Количество связывания hCTLA-4-His-BAP, которое взаимодействует с АВАМ004 в фазе связывания, корректируют в отношении количества захваченного антитела. Для анализа и построения графика по полученным результатам используют программное обеспечение Biacore T200 Evaluation Software Version: 2.0 и Microsoft Excel 2013 (фирма Microsoft).After capturing 1 µg/ml ABAM004 suspended in TBS, a solution containing 500 nM hCTLA4-His-BAP and 10 concentrations of ATP, ADP or AMP diluted to a concentration of 4 of 4000 µM, and 2 mM MgCl 2 injected into each flow cell at a flow rate of 10 µl/min for 3 min. This 3 min is used as the hCTLA4-His-BAP binding phase. After completion of the binding phase, the working buffer is injected for 2 min, which is used as the dissociation phase of hCTLA4-His-BAP. After completion of the dissociation phase, the regenerating solution is introduced at a flow rate of 30 μl/min for 30 s. The above is defined as the ABAM004 binding activity measurement cycle. The amount of hCTLA-4-His-BAP binding that interacts with ABAM004 in the binding phase is adjusted for the amount of antibody captured. To analyze and plot the results obtained, Biacore T200 Evaluation Software Version: 2.0 and Microsoft Excel 2013 (Microsoft) are used.

Фиг. 1 представляет количество связывания АВАМ004 и hCTLA4-His-BAP в присутствии АТФ и его метаболитов, полученное с помощью описанного измерения.Fig. 1 represents the amount of binding of ABAM004 and hCTLA4-His-BAP in the presence of ATP and its metabolites, obtained using the described measurement.

На фиг. 1 подтверждается подтверждено, что АВАМ004 обладает свойством связываться с hCTLA4, используя в качестве переключателя не только АТФ, но и метаболиты АТФ. Кроме того, показано, что это антитело обладает наиболее сильной связывающей активностью, особенно в присутствии AMP.In fig. 1 confirms that ABAM004 has the property of binding to hCTLA4, using not only ATP, but also ATP metabolites as a switch. In addition, this antibody has been shown to have the strongest binding activity, especially in the presence of AMP.

Пример 1-10. Оценка связывания антител с клетками, экспрессирующими CTLA4 человека.Example 1-10. Assessment of antibody binding to human CTLA4-expressing cells.

Проточный цитометр используют для оценки изменений взаимодействия антиген-антитело между АВАМ004 и CTLA4 человека в присутствии и в отсутствие AMP. Клетки СНО, которые стабильно экспрессируют CTLA4 человека (клетки hCTLA4-СНО), получают в соответствующей концентрации. Одновременно для суспензии используют PBS, содержащий 0,1% БСА (буфер FACS). К 100 мкл клеточного раствора добавляют антитело до конечной концентрации 10 мг/мл, затем добавляют АМФ до конечной концентрации 0, 0,4, 4, 40, 200 и 1000 мкМ и оставляют при 4°С в течение 30 мин. После этого клеточную линию промывают промывочным буфером, который представляет собой буфер FACS, содержащий АМФ в конечной концентрации 0, 0,4, 4, 40, 200 и 1000 мкМ, а затем вторичное антитело, меченное FITC ((Goat F(ab'2) Anti-Human IgG Mouse ads-FITC, фирма Beckman, номер в каталоге 732598), и снова оставляют при 4°С в течение 30 мин в темноте. После повторной промывке измеряют и анализируют с использованием проточного цитометра (FACS CyAnTM ADP). Результаты представлены на фиг. 2.A flow cytometer is used to evaluate changes in antigen-antibody interaction between ABAM004 and human CTLA4 in the presence and absence of AMP. CHO cells that stably express human CTLA4 (hCTLA4-CHO cells) are prepared at the appropriate concentration. At the same time, PBS containing 0.1% BSA (FACS buffer) is used for suspension. Antibody is added to 100 μl of cell solution to a final concentration of 10 mg/ml, then AMP is added to final concentrations of 0, 0.4, 4, 40, 200 and 1000 μM and left at 4°C for 30 min. The cell line is then washed with a wash buffer, which is a FACS buffer containing AMP at final concentrations of 0, 0.4, 4, 40, 200 and 1000 µM, followed by a FITC-labeled secondary antibody ((Goat F(ab'2) Anti-Human IgG Mouse ads-FITC, Beckman, catalog number 732598), and again left at 4°C for 30 minutes in the dark. After repeated washing, measurements were made and analyzed using a flow cytometer (FACS CyAnTM ADP). Results are shown. in Fig. 2.

Приведенные выше результаты показывают, что АВАМ004 проявляет связывающую активность, зависящую от концентрации АМФ, с клетками, экспрессирующими hCTLA4, и зависит от концентрации АМФ активность связывания не только с растворимыми антигенами, но также и с антигенами мембранного типа.The above results indicate that ABAM004 exhibits AMP concentration-dependent binding activity to hCTLA4-expressing cells and AMP concentration-dependent binding activity not only to soluble antigens but also to membrane-type antigens.

Пример 1-11. Активность ADCC исследуемого антитела с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека (МКПК) в качестве эффекторных клеток.Example 1-11. ADCC activity of a test antibody using human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) as effector cells.

Активность ADCC исследуемого антитела, которое связывается с антигеном АТФ-зависимым образом, измеряют в соответствии со следующим методом. Активность ADCC исследуемого антитела одновременно измеряют следующим образом с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека (далее называемых МКПК человека) в качестве эффекторных клеток.The ADCC activity of the test antibody, which binds to antigen in an ATP-dependent manner, is measured according to the following method. The ADCC activity of the test antibody is simultaneously measured as follows using human peripheral blood mononuclear cells (hereinafter referred to as human PBMCs) as effector cells.

Сначала готовят раствор МКПК человека. У здоровых добровольцев (взрослых мужчин) отбираютFirst, a human PBMC solution is prepared. Healthy volunteers (adult men) are taken

- 61 045931 по 50 мл периферической крови с помощью шприца, уже содержащего 200 мкл раствора гепарина 1000 ЕД/мл (Ново-гепарин для инъекций 5000 ЕД, фирма Novo Nordisk). Периферическую кровь, разведенную в 2 раза PBS(-), делят на 4 аликвоты и добавляют в пробирки для разделения лимфоцитов Leucosep (фирма Greiner Bio-One), которые центрифугируют после предварительной инъекции 15 мл Ficoll-Paque PLUS. Пробирки для разделения, в которые вносили аликвоты периферической крови, центрифугируют в режиме 2150 об/мин в течение 10 мин при комнатной температуре, а затем разделяют фракции мононуклеарных клеток. После однократной промывки содержащихся во фракциях клеток однократно препаратом RPMI-1640 (фирма Nacalai Tesque), содержащим 10 % FBS (далее - 10 % FBS/RPMI), клетки суспендируют в 10 % FBS/RPMI до плотности клеток 1х107 клеток/мл. Суспензию клеток используют в качестве раствора МКПК человека для последующих экспериментов.- 61 045931 50 ml of peripheral blood using a syringe already containing 200 μl of heparin solution 1000 IU/ml (Novo-heparin for injection 5000 IU, Novo Nordisk). Peripheral blood, diluted 2-fold with PBS(-), is divided into 4 aliquots and added to Leucosep lymphocyte separation tubes (Greiner Bio-One), which are centrifuged after a preliminary injection of 15 ml Ficoll-Paque PLUS. Separation tubes into which aliquots of peripheral blood were added are centrifuged at 2150 rpm for 10 minutes at room temperature, and then mononuclear cell fractions are separated. After washing the cells contained in the fractions once with RPMI-1640 (Nacalai Tesque) containing 10% FBS (hereinafter referred to as 10% FBS/RPMI), the cells are suspended in 10% FBS/RPMI to a cell density of 1x10 7 cells/ml. The cell suspension is used as a human PBMC solution for subsequent experiments.

Затем в качестве клеток-мишеней клетки hCTLA4-CHO, полученные путем принудительной экспрессии внеклеточной области CTLA4 человека в клетках СНО, суспендируют и получают в 10% FBS/RPMI, чтобы получить 2х105 клеток/мл. Кроме того, АМФ (фирма Sigma), разбавленный до 4 мМ с помощью RPMI, используют в качестве раствора АМФ для последующих анализов.Then, as target cells, hCTLA4-CHO cells, obtained by forced expression of the extracellular region of human CTLA4 in CHO cells, were suspended and prepared in 10% FBS/RPMI to obtain 2x10 5 cells/ml. In addition, AMP (Sigma) diluted to 4 mM with RPMI was used as the AMP solution for subsequent assays.

Активность ADCC оценивают по высвобождению ЛДГ (лактатдегидрогеназы). Сначала в каждую лунку 96-луночного планшета с U-образным дном добавляют по 50 мкл раствора антител, приготовленного в каждой из концентраций (0, 0,04, 0,4, 4 и 40 мкг/мл), и в лунки высевали по 50 мкл из клетокмишеней (1 х 104 клеток/лунку). Кроме того, в каждую лунку добавляют по 50 мкл раствора АМФ и смесь оставляют при комнатной температуре на 15 мин. В каждую лунку добавляют по 50 мкл (5х10 клеток/лунку) раствора МКПК человека, центрифугируют планшет и затем оставляют на 4 ч при 37°С в инкубаторе с 5% углекислым газом. После завершения реакции 100 мкл культурального супернатанта собирают и переносят в 96-луночный планшет для измерения, а затем катализатор (С) и раствор красителя (D), присоединенные к набору для обнаружения ЛДГ (TaKaRa), смешивают 1:45, и добавляют 100 мкл этой смеси. После реакции при комнатной температуре в течение 15 мин добавляют 50 мкл 1H НС1 для остановки реакции. Измеряют поглощение при 492 нм и активность ADCC оценивают по высвобождению ЛДГ. Активность ADCC определяют на основе следующей формулы:ADCC activity is assessed by the release of LDH (lactate dehydrogenase). First, 50 μl of an antibody solution prepared at each concentration (0, 0.04, 0.4, 4 and 40 μg/ml) was added to each well of a 96-well plate with a U-shaped bottom, and 50 μl were seeded into the wells. µl of target cells (1 x 10 4 cells/well). In addition, 50 μl of AMP solution was added to each well and the mixture was left at room temperature for 15 min. Add 50 μl (5x10 cells/well) of human PBMC solution to each well, centrifuge the plate and then leave for 4 hours at 37°C in an incubator with 5% carbon dioxide. After completion of the reaction, 100 μl of the culture supernatant is collected and transferred into a 96-well plate for measurement, and then the catalyst (C) and dye solution (D) attached to the LDH detection kit (TaKaRa) are mixed 1:45, and 100 μl is added this mixture. After reacting at room temperature for 15 min, add 50 μl of 1H HCl to stop the reaction. Absorbance at 492 nm is measured and ADCC activity is assessed by LDH release. ADCC activity is determined based on the following formula:

Активность ADCC (%) = {(А-D) - (C-D)} х 100/{(B-D)-(C-D)}ADCC activity (%) = {(A-D) - (C-D)} x 100/{(B-D)-(C-D)}

В приведенной выше формуле А означает среднее значение активности ЛДГ (ОП при 492 нм) в лунках, в которые добавляют каждое тестируемое антитело. В означает среднее значение активности ЛДГ (ОП при 492 нм) в лунках, в которые после реакции добавляют 10 мкл 20% водного раствора TritonX. С означает среднее значение активности ЛДГ (ОП при 492 нм) в лунках, в которые к клеткаммишеням добавляют 150 мкл 10% FBS/RPMI или 100 мкл 10% FBS/RPMI и 50 мкл раствора АМФ. D означает среднее значение активности ЛДГ (ОП при 492 нм) в лунках, содержащих только 10% FBS/RPMI. Тест проводят в двух повторностях и рассчитывают среднее значение активности ADCC (%) в тесте, отражающее активность ADCC исследуемого антитела. Результаты представлены на фиг. 3.In the above formula, A denotes the average LDH activity (OD at 492 nm) in the wells to which each test antibody is added. B represents the average value of LDH activity (OD at 492 nm) in the wells to which 10 μl of 20% aqueous TritonX solution was added after the reaction. C means the average value of LDH activity (OD at 492 nm) in wells to which 150 μl of 10% FBS/RPMI or 100 μl of 10% FBS/RPMI and 50 μl of AMP solution were added to the target cells. D is the average LDH activity (OD at 492 nm) in wells containing only 10% FBS/RPMI. The test is carried out in duplicate and the average ADCC activity value (%) in the test is calculated, reflecting the ADCC activity of the test antibody. The results are presented in Fig. 3.

Из приведенных выше результатов следует, что антитело АВАМ004 обладает антигенсвязывающей активностью в присутствии АМФ и обладает способностью убивать клетки-мишени, проявляя активность ADCC.From the above results, it follows that the ABAM004 antibody has antigen-binding activity in the presence of AMP and has the ability to kill target cells by exhibiting ADCC activity.

Пример 2. Анализ кристаллической структуры анти-CTLA4 антитела, обладающего АТФзависимыми связывающими свойствамиExample 2 Analysis of the crystal structure of an anti-CTLA4 antibody having ATP-dependent binding properties

Пример 2-1. Рентгеноструктурный анализ анти-CTLA4-связывающего антитела АВАМ004, в котором AMP используется в качестве переключателя.Example 2-1. X-ray crystallographic analysis of the anti-CTLA4-binding antibody ABAM004, which uses AMP as a switch.

Для hCTLA4-связывающего антитела АВАМ004, которое использует АМФ в качестве переключателя и получено из библиотеки в примере 1, анализируют кристаллические структуры отдельно фрагмента Fab ABAM004, комплекса фрагмента Fab ABAM004 и АМФ и комплекса фрагмента Fab ABAM004, АМФ и внеклеточного домена hCTLA4.For the hCTLA4-binding antibody ABAM004, which uses AMP as a switch and is derived from the library in Example 1, the crystal structures of the ABAM004 Fab fragment, the complex of the ABAM004 Fab fragment and AMP, and the complex of the ABAM004 Fab fragment, AMP, and the hCTLA4 extracellular domain were analyzed separately.

Пример 2-2. Приготовление антитела АВАМ004 полной длины для кристаллизации.Example 2-2. Preparation of full length ABAM004 antibody for crystallization.

Получение и очистку антитела АВАМ004 полной длины для кристаллизации осуществляют методом, известным специалистам в данной области.The preparation and purification of full length ABAM004 antibody for crystallization is accomplished by a method known to those skilled in the art.

Пример 2-3. Приготовление фрагмента Fab для анализа кристаллической структуры фрагмента Fab ABAM004.Example 2-3. Preparation of Fab fragment for crystal structure analysis of ABAM004 Fab fragment.

Фрагмент Fab антитела АВАМ004 получают обычным методом рестрикционного расщепления протеазой rLys-C (фирма Promega, номер в каталоге V1671) с последующей загрузкой в колонку с белком A (MabSelect SuRe, фирма GE Healthcare), катионообменную колонку (HiTrap SP HP, фирма GE Healthcare) и колонку для гель-фильтрации (Superdex200 16/60, фирма GE Healthcare) для удаления фрагментов Fc. Фракции, содержащие фрагменты Fab, объединяют и хранят при -80°С.The Fab fragment of the ABAM004 antibody is obtained by the usual method of restriction digestion with rLys-C protease (Promega, catalog number V1671) followed by loading into a protein A column (MabSelect SuRe, GE Healthcare), cation exchange column (HiTrap SP HP, GE Healthcare) and a gel filtration column (Superdex200 16/60, GE Healthcare) to remove Fc fragments. Fractions containing Fab fragments are pooled and stored at -80°C.

Пример 2-4. Получение кристаллов фрагмента Fab ABAM004.Example 2-4. Preparation of ABAM004 Fab fragment crystals.

Фрагмент Fab антитела АВАМ004 для кристаллизации, очищенный методом из примера 2-3, концентрируют примерно до 13 мг/мл и кристаллизуют при 20°С методом диффузии паров в сидячей капле. Резервуарный раствор состоит из 0,1 М MES, рН 6,5, 25 % мас./об. полиэтиленгликоля 4000. Полученные кристаллы погружают в раствор 0,08 М MES, рН 6,5, 20 % мас./об. полиэтиленгликоля 4000 и 20 % этиThe ABAM004 antibody Fab fragment for crystallization, purified by the method of Example 2-3, is concentrated to approximately 13 mg/ml and crystallized at 20°C by sessile drop vapor diffusion. The reservoir solution consists of 0.1 M MES, pH 6.5, 25% w/v. polyethylene glycol 4000. The resulting crystals are immersed in a solution of 0.08 M MES, pH 6.5, 20% w/v. polyethylene glycol 4000 and 20% eti

- 62 045931 ленгликоля.- 62 045931 lenglycol.

Пример 2-5. Сбор данных рентгеноструктурного анализа по кристаллам фрагмента Fab АВАМ004 и определение структуры.Example 2-5. Collection of X-ray diffraction analysis data on crystals of the Fab ABAM004 fragment and determination of the structure.

Данные рентгеновской дифракции измеряют с помощью BL-17A радиационной установки Photon Factory Исследовательской организации ускорителей высоких энергий (High Energy Accelerator Research Organization). Во время измерения кристаллы постоянно выдерживают в замороженном состоянии в токе азота при температуре -178°С, в общей сложности было получено 360 рентгеновских дифракционных изображений с помощью CCD-детектора Quantum 270 (ADSC), подключенного к каналу луча, при вращении кристаллы за раз поворачиваются на 0,5°. Определение параметров ячейки, индексирование дифракционных пятен и обработку дифракционных данных по дифракционным изображениям проводят с помощью программы Xia2 (J. Appl. Cryst. 2010, 43:186-190), пакета XDS (Acta. Cryst. 2010, D66:125-132. Scala (Acta. Cryst. 2006, D62:72-82), и в результате получают данные интенсивности дифракции с разрешением до 1,70 А. Статистика кристаллографических данных представлена в табл. 7.X-ray diffraction data is measured using the BL-17A radiation facility of the Photon Factory of the High Energy Accelerator Research Organization. During the measurement, the crystals were kept frozen continuously in a nitrogen stream at -178°C, a total of 360 x-ray diffraction images were obtained using a Quantum 270 CCD detector (ADSC) connected to the beam channel, rotating the crystals at a time by 0.5°. Determination of cell parameters, indexing of diffraction spots and processing of diffraction data from diffraction images is carried out using the Xia2 program (J. Appl. Cryst. 2010, 43:186-190), the XDS package (Acta. Cryst. 2010, D66:125-132. Scala (Acta. Cryst. 2006, D62:72-82) and results in diffraction intensity data with a resolution of up to 1.70 A. Crystallographic data statistics are presented in Table 7.

Структуру определяют методом молекулярного замещения с использованием программы Phaser (J. Appl. Cryst. 2007, 40, 658-674). Модель поиска фрагментов Fab получена из опубликованной кристаллической структуры Fab (код PDB: 4NKI). Модель была построена с помощью программы Coot (Acta Cryst. 2010, D66: 486-501) и уточнена с помощью программы Refmac5 (Acta Cryst. 2011, D67: 355-467). Фактор кристаллографической достоверности (R) данных интенсивности дифракции от 52,92 до 1,70 А составил 16,92%, а значение свободного R составило 21,22%. Статистика структурного уточнения представлена в табл. 7.The structure is determined by molecular replacement using the Phaser program (J. Appl. Cryst. 2007, 40, 658-674). The Fab fragment search model is derived from the published crystal structure of Fab (PDB code: 4NKI). The model was built using the Coot program (Acta Cryst. 2010, D66: 486-501) and refined using the Refmac5 program (Acta Cryst. 2011, D67: 355-467). The crystallographic confidence factor (R) for diffraction intensity data from 52.92 to 1.70 A was 16.92%, and the free R value was 21.22%. Structural refinement statistics are presented in Table. 7.

Таблица 7Table 7

Сводка данных рентгеноструктурного анализа и статистические уточненияSummary of X-ray diffraction data and statistical refinements

Собранные данные Data collected ABAM004fab ABAM004fab ABAM004fab -АМФ ABAM004fab -AMP ABAM004fab -АМФ-СТКА4 ABAM004fab -AMF-STKA4 Пространственная группа Space group Р42Л R42L Ρ4^2 Ρ4^2 Габариты одной ячейки Dimensions of one cell а,Ь,с (А) a, b, c (A) 64,27, 70,86, 79,59 64.27, 70.86, 79.59 135,75, 135,75, 66,04 135.75, 135.75, 66.04 72,29, 72,29,309,31 72.29, 72.29,309.31 α,β,γ (°) α,β,γ (°) 90,00, 90,00, 90,00, 90.00, 90.00, 90.00, 90,00, 90,00, 90,00, 90.00, 90.00, 90.00, 90,00, 90,00, 90,00, 90.00, 90.00, 90.00, Разрешение (А) Resolution (A) 52,92-1,70 52.92-1.70 47,33-2,89 47.33-2.89 52,81-3,09 52.81-3.09 Число общих отражений Number of total reflections 296585 296585 181799 181799 157732 157732 Число уникальных отражений Number of unique reflections 40500 40500 14366 14366 16037 16037 Комплектность (крайняя оболочка) Completeness (outer shell) 99,6 (98,8) 99.6 (98.8) 100,0 (100,0) 100.0 (100.0) 99,9 (99,9) 99.9 (99.9) ЯтегееЧкрайняя оболочка)(%) YategeeCh extreme shell)(%) 5,8 (67,6) 5.8 (67.6) 17,3 (88,7) 17.3 (88.7) 14,1 (63,2) 14.1 (63.2) Обработка Treatment Разрешение (А) Resolution (A) 52,92-1,70 52.92-1.70 47,33-2,89 47.33-2.89 52,81-3,09 52.81-3.09 Число отражений Number of reflections 38523 38523 13658 13658 15145 15145 Ифакторы0 (RfreeB) (%) Ifactors 0 (Rfree B ) (%) 16,92 (21,22) 16.92 (21.22) 19,97 (25,62) 19.97 (25.62) 23,49 (63,2) 23.49 (63.2) rms отклонение от идеального значения rms deviation from ideal value длина связей (А) bond length (A) 0,0128 0.0128 0,0037 0.0037 0,0038 0.0038 углы связей (°) bond angles (°) 1,7102 1.7102 0,9275 0.9275 0,8442 0.8442

Пример 2-6. Получение фрагмента Fab ABAM004 из антитела полной длины для анализа кристаллической структуры комплекса фрагмента Fab антитела АВАМ004 с АМФ, и комплекса фрагмента Fab антитела АВАМ004, АМФР и hCTLA4.Example 2-6. Preparation of the ABAM004 Fab fragment from the full-length antibody to analyze the crystal structure of the complex of the ABAM004 Fab fragment with AMP, and the complex of the ABAM004 Fab fragment, AMP and hCTLA4.

Фрагмент Fab ABAM004 получают обычным методом рестрикционного расщепления папаином (фирма Roche Diagnostics, номер в каталоге 1047825) с последующей загрузкой в колонку с белком A (MabSelect SuRe, фирма GE Healthcare), катионообменную колонку (HiTrap SP HP, фирма GE Healthcare) и колонку для гель-фильтрации (Superdex200 16/60, фирма GE Healthcare) для удаления фрагментов Fc. Фракции, содержащие фрагменты Fab, объединяют и хранят при -80°С.The Fab ABAM004 fragment was prepared by conventional papain restriction digestion (Roche Diagnostics, catalog no. 1047825) followed by loading onto a protein A column (MabSelect SuRe, GE Healthcare), a cation exchange column (HiTrap SP HP, GE Healthcare) and a gel filtration (Superdex200 16/60, GE Healthcare) to remove Fc fragments. Fractions containing Fab fragments are pooled and stored at -80°C.

Пример 2-7. Получение кристаллов комплекса фрагмента Fab ABAM004 и АМФ.Example 2-7. Preparation of crystals of the complex of ABAM004 Fab fragment and AMP.

Фрагмент Fab ABAM004 для кристаллизации, очищенный по способу примера 2-6, концентрируют примерно до 13 мг/мл, к которому добавляют АМФ, чтобы получить конечную концентрацию 2 мМ, и кристаллизацию проводят при 20° С с помощью метода диффузии паров в сидячей капле. Резервуарный раствор состоит из 0,1 М буфера Morpheus 2, рН 7,5, 37,5% мас./об. MPD_P1K_P3350, 10% карбоновых кислот Morpheus (Morpheus, фирма Molecular Dimensions).The ABAM004 Fab fragment for crystallization, purified by the method of Example 2-6, was concentrated to approximately 13 mg/ml, to which AMP was added to give a final concentration of 2 mM, and crystallization was carried out at 20° C. using the sessile drop vapor diffusion method. The reservoir solution consists of 0.1 M Morpheus 2 buffer, pH 7.5, 37.5% w/v. MPD_P1K_P3350, 10% Morpheus carboxylic acids (Morpheus, Molecular Dimensions).

Пример 2-8. Сбор данных рентгеноструктурного анализа кристаллов комплекса фрагмента Fab ABAM004 с АМФ и определение структуры.Example 2-8. Collection of X-ray diffraction data on crystals of the complex of the ABAM004 Fab fragment with AMP and determination of the structure.

Данные рентгеновской дифракции были измерены с помощью BL-1A радиационной установки Photon Factory в Исследовательской организации ускорителей высоких энергий (High Energy Accelerator ReX-ray diffraction data were measured using the BL-1A radiation facility of the Photon Factory at the High Energy Accelerator Re

- 63 045931 search Organization). Во время измерения кристаллы постоянно выдерживают в замороженном состоянии в токе азота при температуре -178°С, было получено 720 рентгеновских дифракционных изображений с помощью детектора Pilatus 2M (фирма DECTRIS), подключенного к пучку, при повороте кристаллов на 0,25° за один раз. Определение параметров ячейки, индексирование дифракционных пятен и обработку данных по дифракционным изображениям проводят с помощью программы Xia2 (J. Appl. Cryst. 2010, 43:186-190), пакета XDS (Acta. Cryst. 2010, D66:125-132) и Scala (Acta. Cryst. 2006, D62:72-82), и в результате получены данные интенсивности дифракции до разрешения 1,70 А. Статистика кристаллографических данных представлена в табл. 7.- 63 045931 search Organization). During the measurement, the crystals were kept frozen continuously in a nitrogen stream at -178°C, and 720 x-ray diffraction images were obtained using a Pilatus 2M detector (DECTRIS) connected to the beam, rotating the crystals 0.25° at a time . Determination of cell parameters, indexing of diffraction spots and processing of data from diffraction images is carried out using the Xia2 program (J. Appl. Cryst. 2010, 43:186-190), the XDS package (Acta. Cryst. 2010, D66:125-132) and Scala (Acta. Cryst. 2006, D62:72-82), and as a result diffraction intensity data were obtained up to a resolution of 1.70 A. The statistics of the crystallographic data are presented in Table. 7.

Структуру определяют методом молекулярного замещения с использованием программы Phaser (J. Appl. Cryst. 2007, 40, 658-674). Модель поиска фрагментов Fab получена из опубликованной кристаллической структуры Fab (код PDB: 4NKI). Модель построена с помощью программы Coot (Acta Cryst. 2010, D66: 486-501) и уточнена с помощью программы Refmac5 (Acta Cryst. 2011, D67: 355-367). Фактор кристаллографической достоверности (R) данных интенсивности дифракции от 47,33-2,89 А составляет 19,97%, значение свободного R составляет 25,62%. Статистика структурного уточнения представлена в табл. 7.The structure is determined by molecular replacement using the Phaser program (J. Appl. Cryst. 2007, 40, 658-674). The Fab fragment search model is derived from the published crystal structure of Fab (PDB code: 4NKI). The model was built using the Coot program (Acta Cryst. 2010, D66: 486-501) and refined using the Refmac5 program (Acta Cryst. 2011, D67: 355-367). The crystallographic confidence factor (R) of diffraction intensity data from 47.33-2.89 A is 19.97%, the free R value is 25.62%. Structural refinement statistics are presented in Table. 7.

Пример 2-9. Получение внеклеточного домена hCTLA4.Example 2-9. Preparation of the extracellular domain of hCTLA4.

Внеклеточный домен hCTLA4 получают обычным методом рестрикционного расщепления абатацепта эндопротеиназой Lys-C (фирма Roche, номер в каталоге 11047825001) с последующей загрузкой в колонку с белком A (MabSelect SuRe, фирма GE Healthcare) и колонку для гель-фильтрации ( Superdex200 10/300, фирма GE Healthcare) для удаления фрагментов Fc. Фракции, содержащие внеклеточный домен hCTLA4, объединяют и хранят при -80°С.The extracellular domain of hCTLA4 is obtained by the usual method of restriction digestion of abatacept with endoproteinase Lys-C (Roche, catalog number 11047825001) followed by loading on a protein A column (MabSelect SuRe, GE Healthcare) and a gel filtration column (Superdex200 10/300, GE Healthcare) to remove Fc fragments. Fractions containing the extracellular domain of hCTLA4 were pooled and stored at -80°C.

Пример 2-10. Получение комплекса фрагмента Fab ABAM004, АМФ и внеклеточного домена hCTLA4.Example 2-10. Preparation of a complex of ABAM004 Fab fragment, AMP and the extracellular domain of hCTLA4.

Внеклеточный домен hCTLA4, очищенный по способу из примера 2-9, смешивают с фрагментом Fab ABAM004, очищенным по способу из примера 2-6, в молярном соотношении 1,5:1, и к нему добавляют АМФ, чтобы получить конечную концентрацию 2 мМ. Комплекс очищают гель-фильтрационной хроматографией (Superdex200 10/300, фирма GE Healthcare) с использованием колонки, уравновешенной 25 мМ HEPES, рН 7,5, 100 мМ NaCl, 2 мМ АМФ.The extracellular domain of hCTLA4, purified by the method of Example 2-9, is mixed with the Fab fragment ABAM004, purified by the method of Example 2-6, in a molar ratio of 1.5:1, and AMP is added to it to obtain a final concentration of 2 mM. The complex is purified by gel filtration chromatography (Superdex200 10/300, GE Healthcare) using a column equilibrated with 25 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM NaCl, 2 mM AMP.

Пример 2-11. Получение кристаллов комплекса фрагмента Fab АВАМ004, АМФ и внеклеточного домена hCTLA4.Example 2-11. Preparation of crystals of the complex of the ABAM004 Fab fragment, AMP and the extracellular domain of hCTLA4.

Очищенный комплекс концентрируют примерно до 8 мг/мл и кристаллизуют при 20°С с помощью метода диффузии паров в сидячей капле в сочетании с методом затравки. Резервуарный раствор состоял из 0,1 М буфера Morpheus 1, рН 6,5, 37,5% мас./об. М1К3350, 10% галогенов (Morpheus, фирма Molecular Dimensions).The purified complex is concentrated to approximately 8 mg/ml and crystallized at 20°C using the sessile drop vapor diffusion method combined with the seeding method. The reservoir solution consisted of 0.1 M Morpheus 1 buffer, pH 6.5, 37.5% w/v. M1K3350, 10% halogen (Morpheus, Molecular Dimensions).

Пример 2-12. Сбор данных рентгеноструктурного анализа кристаллов комплекса фрагмента Fab АВАМ004, АМФ и hCTLA4 и определение структуры.Example 2-12. Collection of X-ray diffraction data on crystals of the complex of ABAM004 Fab fragment, AMP and hCTLA4 and determination of the structure.

Данные рентгеновской дифракции измеряют с помощью BL32XU SPring-8. Во время измерения кристаллы постоянно выдерживают в замороженном состоянии в потоке азота при температуре -178°С, и в общей сложности было получено 180 рентгеновских дифракционных изображений с помощью детектора CCD MX-225HS (фирма RAYONIX), подключенного к пучку, при повороте кристаллы на 1,0° за один раз. Определение параметров ячейки, индексирование дифракционных пятен и обработку данных по дифракционным изображениям проводят с помощью программы Xia2 (J. Appl. Cryst. 2010, 43:186190), пакета XDS (Acta. Cryst. 2010, D66:125-132) и Scala (Acta. Cryst. 2006, D62:72-82), и в результате получены данные интенсивности дифракции до разрешения 1,70 А. Статистика кристаллографических данных представлена в табл. 7.X-ray diffraction data is measured using a BL32XU SPring-8. During the measurement, the crystals were kept frozen continuously in a nitrogen stream at -178°C, and a total of 180 x-ray diffraction images were obtained using a CCD MX-225HS detector (RAYONIX) connected to the beam, turning the crystals by 1 ,0° at a time. Determination of cell parameters, indexing of diffraction spots and processing of data from diffraction images is carried out using the Xia2 program (J. Appl. Cryst. 2010, 43:186190), the XDS package (Acta. Cryst. 2010, D66:125-132) and Scala ( Acta. Cryst. 2006, D62:72-82), and as a result, diffraction intensity data were obtained up to a resolution of 1.70 A. The statistics of crystallographic data are presented in table. 7.

Структуру определяют методом молекулярного замещения с использованием программы Phaser (J. Appl. Cryst. 2007, 40, 658-674). Модель поиска фрагментов Fab получена из опубликованной кристаллической структуры Fab (код PDB: 4NKI), а модель поиска внеклеточного домена hCTLA4 получена из опубликованной кристаллической структуры CTLA4 человека (код PDB: 3OSK, J. Biol. Chem. 2011, 286: 6685-6696). Модель была построена с помощью программы Coot (Acta Cryst. 2010, D66: 486-501) и уточнена с помощью программы Refmac5 (Acta Cryst. 2011, D67: 355-367). Фактор кристаллографической достоверности (R) данных интенсивности дифракции от 52,81-3,09 А составил 23,49%, а значение свободного R составило 31,02%. Статистика структурного уточнения представлена в табл. 7.The structure is determined by molecular replacement using the Phaser program (J. Appl. Cryst. 2007, 40, 658-674). The search model for Fab fragments is derived from the published crystal structure of Fab (PDB code: 4NKI), and the search model for the extracellular domain of hCTLA4 is derived from the published crystal structure of human CTLA4 (PDB code: 3OSK, J. Biol. Chem. 2011, 286: 6685-6696) . The model was built using the Coot program (Acta Cryst. 2010, D66: 486-501) and refined using the Refmac5 program (Acta Cryst. 2011, D67: 355-367). The crystallographic confidence factor (R) of diffraction intensity data from 52.81-3.09 A was 23.49%, and the free R value was 31.02%. Structural refinement statistics are presented in Table. 7.

Пример 2-13. Определение сайта взаимодействия между АВАМ004 и АМФ.Example 2-13. Determination of the site of interaction between ABAM004 and AMP.

Кристаллическая структура показала, что АМФ в основном распознается тяжелой цепью антитела.The crystal structure showed that AMP is mainly recognized by the antibody heavy chain.

Часть аденинового кольца АМФ распознается CDR1 и CDR3 тяжелой цепи, а часть рибозы и часть фосфатной группы распознаются CDR1 и CDR2.The adenine ring portion of AMP is recognized by heavy chain CDR1 and CDR3, and the ribose portion and phosphate group portion are recognized by CDR1 and CDR2.

В частности, как показано на фиг. 4, фрагмент аденинового кольца АМФ распознается боковыми цепями Т33, принадлежащими CDR1 тяжелой цепи, и Y95, L100B и W100C, принадлежащими CDR3, и основными цепями G96 и M100А антитела. В частности установлено, что карбонильные атомы кислорода в основных цепях G96 и M100А образуют водородные связи с N в положении 6 АМФ, группа NHIn particular, as shown in FIG. 4, the adenine ring fragment of AMP is recognized by the side chains T33 belonging to CDR1 of the heavy chain and Y95, L100B and W100C belonging to CDR3, and the main chains G96 and M100A of the antibody. In particular, it was found that carbonyl oxygen atoms in the main chains of G96 and M100A form hydrogen bonds with N in position 6 of AMP, NH group

- 64 045931 амида основной цепи W100C образует водородную связь с N в положении 1, а боковые цепи Y95, L100B и W100C взаимодействуют с использованием пи-электронов фрагмента аденинового кольца, так что антитело строго распознает фрагмент аденинового кольца. Фрагмент рибозы распознается каждой из боковых цепей Т33, принадлежащих CDR1 тяжелой цепи, и Y56 и Y58, принадлежащих CDR2, посредством сил Ван-дер-Ваальса и посредством взаимодействия пи-электронов Y56. Кроме того, фрагмент фосфатной группы распознается каждой из боковых цепей Т33, принадлежащих тяжелой цепи CDR1, и S52, S52A и R53, принадлежащих CDR2, и основной цепи S52A. В частности, считается, что водородные связи, образованные боковой цепью Т33 и амидной группой NH основной цепи S52A с фрагментом фосфатной группы, и ван-дер-ваальсовы взаимодействия S52 и R53 играют важную роль в распознавании части фосфатной группы. Нумерация аминокислотных остатков Fab основана на схеме нумерации Kabat.- 64 045931 the main chain amide W100C forms a hydrogen bond with the N at position 1, and the side chains Y95, L100B and W100C interact using the pi electrons of the adenine ring moiety, so that the antibody strictly recognizes the adenine ring moiety. The ribose moiety is recognized by each of the side chains of T33, belonging to heavy chain CDR1, and Y56 and Y58, belonging to CDR2, through van der Waals forces and through Y56 pi-electron interactions. In addition, the phosphate group moiety is recognized by each of the side chains T33 belonging to the heavy chain of CDR1, and S52, S52A and R53 belonging to CDR2, and the main chain of S52A. In particular, hydrogen bonds formed by the side chain of T33 and the NH amide group of the main chain of S52A with the phosphate group moiety, and van der Waals interactions of S52 and R53 are thought to play an important role in recognizing the phosphate group moiety. Fab amino acid residue numbering is based on the Kabat numbering scheme.

Пример 2-14. Идентификация эпитопов АВАМ004.Example 2-14. Identification of ABAM004 epitopes.

На фиг. 5 и 6 эпитопы контактной области Fab ABAM004 картированы в кристаллической структуре hCTLA4 и в аминокислотной последовательности, соответственно. Эпитопы содержат аминокислотные остатки hCTLA4, содержащие один или более атомов, отличных от водорода, расположенных в пределах 4,2 А от любой части Fab ABAM004 или АМФ в кристаллической структуре.In fig. 5 and 6 epitopes of the ABAM004 Fab contact region are mapped to the hCTLA4 crystal structure and amino acid sequence, respectively. The epitopes contain hCTLA4 amino acid residues containing one or more non-hydrogen atoms located within 4.2 A of any portion of the ABAM004 Fab or AMP in the crystal structure.

Из кристаллической структуры становится ясно, что по крайней мере М3, Е33, R35, Т53, Е97, М99, Y100, Р101, Р102, Р103, Y104, Y105 и L106 антигена распознаются CDR2 и CDR3 тяжелой цепи, CDR1 и CDR3 легких цепей антитела и AMP. В частности, петля, состоящая из фрагмента M99-Y104 антигена, отчетливо распознается антителом, так как она скрыта в петле CDR антитела, и считается, что эта петля играет основную роль в распознавании антигена антителом.From the crystal structure it is clear that at least M3, E33, R35, T53, E97, M99, Y100, P101, P102, P103, Y104, Y105 and L106 of the antigen are recognized by CDR2 and CDR3 of the heavy chain, CDR1 and CDR3 of the light chains of the antibody and AMP. In particular, the loop consisting of the M99-Y104 fragment of the antigen is clearly recognized by the antibody because it is buried in the CDR loop of the antibody, and this loop is believed to play a major role in the recognition of the antigen by the antibody.

Пример 2-15. АМФ-зависимый механизм связывания антигена.Example 2-15. AMP-dependent mechanism of antigen binding.

Вариабельную область антитела экстрагируют из кристаллической структуры только АВАМ004 Fab, кристаллической структуры комплекса АВАМ004 Fab и АМФ и кристаллической структуры тройного комплекса, состоящего из АВАМ004 Fab, АМФ и CTLA4; фиг. 7 представляет собой наложенный рисунок выделенных вариабельных областей, сосредоточенных вокруг тяжелой цепи. Для АМФзависимого связывания антигена важным считают не только прямое взаимодействие между АМФ и CTLA4, показанным в примере 2-14, но и структурное изменение антитела, связанное со связыванием АМФ.The antibody variable region is extracted from the crystal structure of ABAM004 Fab alone, the crystal structure of the complex of ABAM004 Fab and AMP, and the crystal structure of the ternary complex consisting of ABAM004 Fab, AMP and CTLA4; fig. 7 is an overlay of highlighted variable regions centered around the heavy chain. For AMP-dependent antigen binding, not only the direct interaction between AMP and CTLA4, shown in example 2-14, but also the structural change in the antibody associated with AMP binding is considered important.

Как показано на фиг. 7, путем сравнения кристаллической структуры одного антитела с кристаллической структурой антитела, с которым связывается АМФ, установлено, что петлевые структуры CDR3 тяжелой цепи и CDR3 легкой цепи, а также угол кручения между тяжелой цепью и легкой цепью в вариабельной области антитела также изменялся. Кроме того, сравнивая кристаллическую структуру антитела, с которым связывается АМФ, и кристаллическую структуру тройного комплекса, состоящего из антитела, АМФ и CTLA4, также признано, что структуры CDR3 тяжелой цепи и CDR1 легкой цепи дополнительно изменены путем антигенсвязывающих, проявляющих антигенную зависимость структурных изменений. С другой стороны, поскольку структура петли CDR3 легкой цепи и угол закручивания между тяжелой цепью и легкой цепью не изменились, полагают, что связывание АМФ может изменить структуру антитела до состояния, близкого к структуре во время связывания антигена. Таким образом, полагают, что структурные изменения, связанные со связыванием АМФ, необходимы для формирования подходящей структуры для связывания антигена и играют важную роль в зависимом от АМФ связывании антигена.As shown in FIG. 7, by comparing the crystal structure of one antibody with the crystal structure of the antibody to which AMP binds, it was found that the loop structures of the heavy chain CDR3 and the light chain CDR3, as well as the torsion angle between the heavy chain and the light chain in the antibody variable region, also changed. In addition, by comparing the crystal structure of the antibody to which AMP binds and the crystal structure of the ternary complex consisting of antibody, AMP and CTLA4, it is also recognized that the structures of the heavy chain CDR3 and light chain CDR1 are further modified by antigen-binding, antigen-dependent structural changes. On the other hand, since the structure of the light chain CDR3 loop and the twist angle between the heavy chain and the light chain have not changed, it is believed that AMP binding may change the structure of the antibody to a state similar to the structure at the time of antigen binding. Thus, it is believed that the structural changes associated with AMP binding are necessary for the formation of a suitable structure for antigen binding and play an important role in AMP-dependent antigen binding.

Пример 3. Получение CTLA4-измененных антител и оценка их активности.Example 3. Preparation of CTLA4-modified antibodies and assessment of their activity.

Пример 3-1. Получение CTLA4-связывающих с повышенной активностью вариантов антитела АВАМ004.Example 3-1. Preparation of CTLA4-binding variants of the ABAM004 antibody with increased activity.

Аминокислотная последовательность АВАМ004 (VH SEQ ID NO: 10, VL SEQ ID NO: 11), полученная из фаговой библиотеки рационального дизайна человека, описанной в примере 1, изменена для снижения CTLA4-связывающей активности указанной последовательности в отсутствие аналогов АТФ и для повышения активности связывания CTLA4 человека в присутствии аналогов АТФ и для усиления связывания с АТФ и аналогами АТФ. Чтобы достичь этого, были созданы варианты с точечными мутациями в остатках, которые, как ожидается, будут участвовать в связывании, на основе ко-кристаллической структуры АВАМ004 и АМФ и ко-кристаллической структуры АВАМ004, АМФ и CTLA4 человека, полученных описанным методом в примере 2. Кроме того, также созданы варианты, в которых каждая аминокислота, содержащаяся в CDR, заменена на Ala или Pro. Варианты точечных мутаций измеряют с помощью Biacore T200 или Biacore 4000 (фирма GE Healthcare) для активности связывания CTLA4 человека (абатацепт и hCTLA4-His-BAP) в отсутствие АТФ и в присутствии АТФ, АДФ или АМФ для скрининга мутаций, которые усиливают связывающую активность. Варианты получают путем объединения мутаций, которые усиливают связывающую активность, и значение KD рассчитывали с помощью программного обеспечения Biacore. В результате установлено, что введение замен Н32А и S52aT в тяжелую цепь АВАМ004 и T24D, Т26Р и E50F в легкую цепь (согласно нумерации Kabat) усиливает способность связывания АВАМ004. Вариант обозначен как 04H0150/04L0072 (VH SEQ ID NO: 47, VL SEQ ID NO: 48).The amino acid sequence ABAM004 (VH SEQ ID NO: 10, VL SEQ ID NO: 11), derived from the human rational design phage library described in Example 1, is modified to reduce the CTLA4 binding activity of the sequence in the absence of ATP analogues and to increase binding activity Human CTLA4 in the presence of ATP analogues and to enhance binding to ATP and ATP analogues. To achieve this, variants were created with point mutations at residues expected to be involved in binding, based on the co-crystal structure of ABAM004 and AMP and the co-crystal structure of ABAM004, AMP and human CTLA4 obtained by the method described in Example 2 In addition, variants have also been created in which each amino acid contained in the CDR is replaced by Ala or Pro. Point mutation variants are measured using Biacore T200 or Biacore 4000 (GE Healthcare) for human CTLA4 binding activity (abatacept and hCTLA4-His-BAP) in the absence of ATP and in the presence of ATP, ADP or AMP to screen for mutations that enhance binding activity. Variants were generated by combining mutations that enhance binding activity, and the KD value was calculated using Biacore software. As a result, it was found that the introduction of substitutions H32A and S52aT into the heavy chain of ABAM004 and T24D, T26P and E50F into the light chain (according to Kabat numbering) enhances the binding ability of ABAM004. The variant is designated 04H0150/04L0072 (VH SEQ ID NO: 47, VL SEQ ID NO: 48).

Пример 3-2. Измерение методом поверхностного плазмонного резонанса влияния АТФ и его метаболитов на активность по связыванию CTLA4 человека с АВАМ004 и 04H0150/04L0072.Example 3-2. Measurement by surface plasmon resonance of the effect of ATP and its metabolites on the binding activity of human CTLA4 with ABAM004 and 04H0150/04L0072.

- 65 045931- 65 045931

Сначала был создан чип для измерения Biacore T200. Температура Biacore T200 установлена на 25°С, а скорость потока установлена на 10 мкл/мин. HBS-EP+ используют в качестве подвижного буфера. Смесь равных объемов NHS (N-гидроксисукцинимида) и EDC (К-этил-К'(диметиламинопропил)карбодиимида) добавляют к сенсорному чипу СМ5 (фирма GE Healthcare) со скоростью потока 10 мкл/мин в течение 10 минут для активирования проточных кювет. Затем добавляют 25 мкг/мл белка A/G (фирма Pierce), суспендированного в 10 мМ ацетата натрия, рН 4,0, и оставляют для связывания при 10 мкл/мин в течение 30 мин. Затем избыточные активные группы на проточных кюветах блокируют добавлением 1 М раствора этаноламина-HCl со скоростью 10 мкл/мин в течение 10 мин.First, the Biacore T200 measurement chip was created. The Biacore T200 temperature is set to 25°C and the flow rate is set to 10 μL/min. HBS-EP+ is used as a running buffer. A mixture of equal volumes of NHS (N-hydroxysuccinimide) and EDC (N-ethyl-K'(dimethylaminopropyl)carbodiimide) was added to the CM5 sensor chip (GE Healthcare) at a flow rate of 10 μl/min for 10 minutes to activate the flow cells. 25 μg/ml protein A/G (Pierce) suspended in 10 mM sodium acetate, pH 4.0 was then added and allowed to bind at 10 μl/min for 30 minutes. Excess active groups on the flow cells are then blocked by adding 1 M ethanolamine-HCl at 10 μL/min for 10 min.

Затем измеряют влияние АТФ и его метаболитов на связывание целевого антитела с CTLA4 человека. Заданная температура составляет 25°С, а в качестве подвижного буфера используют TBS. 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) используют в качестве раствора для регенерации. После того как антитело, суспендированное в TBS, можно было захватить, в каждую проточную кювету вводят раствор TBS, содержащий 500 нМ hCTLA4-His-BAP, 10 концентраций АТФ, АДФ или АМФ, разбавленных в обычном соотношении 4 из 4000 мкМ и 2 мМ MgCl2 при скорости потока 10 мкл/мин в течение 3 мин. Эти 3 мин используют в качестве фазы связывания hCTLA4-His-BAP. После завершения фазы связывания инъекцию переключают на подвижный буфер на 2 минуты, которые используют в качестве фазы диссоциации. После завершения фазы диссоциации вводят регенерирующий раствор со скоростью потока 30 мкл/мин в течение 30 с; описанное выше рассматривают как цикл измерения активности связывания. Количество связывания hCTLA4-His-BAP, которое взаимодействовало с АВАМ004 или 04H0150/04L0072 в фазе связывания, корректируют по количеству захваченного антитела. Результаты показаны на фиг. 8. Кроме того, при измерении связывания АВАМ004 и 04H0150/04L0072 концентрацию малых молекул в фазе связывания поддерживают на уровне 62,5 мкМ или 1 мМ, а 8 концентраций hCTLA4-His-BAP разбавляют в обычном соотношении 2 из 2000 нМ и используют в фазе связывания. Значения KD, полученные в результате анализа количества связывания hCTLA4-His-BAP, показаны в табл. 8. Для анализа и построения графика данных используют программное обеспечение Biacore T200 версия: 2.0 и Microsoft Excel 2013 (фирма Microsoft). Для расчета значения KD используют устойчивую модель аффинности.The effect of ATP and its metabolites on the binding of the target antibody to human CTLA4 is then measured. The set temperature is 25°C and TBS is used as the running buffer. 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) is used as the regeneration solution. Once the antibody suspended in TBS can be captured, each flow cell is injected with a TBS solution containing 500 nM hCTLA4-His-BAP, 10 concentrations of ATP, ADP, or AMP diluted in the usual ratio of 4 to 4000 μM and 2 mM MgCl 2 at a flow rate of 10 µl/min for 3 min. This 3 min is used as the hCTLA4-His-BAP binding phase. After completion of the binding phase, the injection is switched to the running buffer for 2 minutes, which is used as the dissociation phase. After completion of the dissociation phase, the regenerating solution is introduced at a flow rate of 30 μl/min for 30 s; the above is considered to be a binding activity measurement cycle. The amount of hCTLA4-His-BAP binding that interacted with ABAM004 or 04H0150/04L0072 in the binding phase was adjusted to the amount of antibody captured. The results are shown in Fig. 8. In addition, when measuring the binding of ABAM004 and 04H0150/04L0072, the concentration of small molecules in the binding phase is maintained at 62.5 μM or 1 mM, and 8 concentrations of hCTLA4-His-BAP are diluted at the usual ratio of 2 of 2000 nM and used in the phase binding. The KD values obtained from hCTLA4-His-BAP binding amount analysis are shown in Table. 8. To analyze and plot data, use Biacore T200 software version: 2.0 and Microsoft Excel 2013 (Microsoft). A robust affinity model is used to calculate the KD value.

Таблица 8Table 8

Лиганд Ligand Образец Sample KD (М) KD (M) SM (62,5 мкМ)* SM (62.5 µM)* SM(ImM) SM(ImM) 04H0150/04L0072 04H0150/04L0072 hCTLA4 АМФ hCTLA4 AMP 6,9Е-07 6.9E-07 2,ЗЕ-07 2,ZE-07 hCTLA4 АДФ hCTLA4 ADP 4,2Е-07 4.2E-07 3,2Е-07 3.2E-07 hCTLA4 АТФ hCTLA4 ATP 8ДЕ-07 8DE-07 3,2Е-07 3.2E-07 АВАМ004 ABAM004 hCTLA4 АМФ hCTLA4 AMP 4,ЗЕ-06 4,ZE-06 1,4Е-06 1.4E-06 hCTLA4 АДФ hCTLA4 ADP 2,5Е-06 2.5E-06 1,5Е-06 1.5E-06 hCTLA4 АТФ hCTLA4 ATP 5,5Е-06 5.5E-06 2,ЗЕ-06 2,ZE-06

*SM означает малые молекулы (АТФ, АДФ или АМФ), используемые в данном анализе.*SM refers to small molecules (ATP, ADP or AMP) used in this assay.

Пример 3-3. Повышение связывающей способности за счет внесения различных измененийExample 3-3. Increasing binding capacity by making various changes

Для создания улучшенных анти-CTLA4 антител аминокислотные изменения были специально введены в 04H0150/04L0072, которые представляют собой вариабельные области антитела против CTLA4 человека, полученного в примере 3-1. Варианты, в которых аминокислотная замена каждой из 18 аминокислот, кроме цистеина, проводилась во всех CDR 04H0150 и 04L0072, были созданы способами, известными специалистам в данной области, такими как ПЦР. Измерения около 1200 вариантов, созданных для связывания с CTLA4 человека, были выполнены с использованием программного обеспечения Biacore 4000. Белок A/G (фирма Thermo Fisher Scientific) иммобилизован на сенсорном чипе Series S CM5 (фирма GE Healthcare), и антитела захватываются чипом путем взаимодействия с культуральным супернатантом, содержащим вариант антитела. Затем раствор CTLA4 человека, к которому добавлена малая молекула (АТФ, АДФ или АМФ), или раствор CTLA4 человека, к которому не добавлялась малая молекула, приводят во взаимодействие с антителом для оценки связывающей способности антитела к CTLA4 человека в присутствии или в отсутствие малой молекулы. Анализ проводят при 25°С с использованием трисбуферного солевого раствора, 0,02% PS20 в качестве подвижного буфера.To create improved anti-CTLA4 antibodies, amino acid changes were specifically introduced into 04H0150/04L0072, which are the variable regions of the anti-human CTLA4 antibody produced in Example 3-1. Variants in which amino acid changes were made to each of the 18 amino acids except cysteine in all CDRs 04H0150 and 04L0072 were generated by methods known to those skilled in the art, such as PCR. Measurements of approximately 1200 variants designed to bind to human CTLA4 were performed using Biacore 4000 software. The A/G protein (Thermo Fisher Scientific) is immobilized on a Series S CM5 sensor chip (GE Healthcare) and antibodies are captured by the chip by interaction with a culture supernatant containing the antibody variant. A solution of human CTLA4 to which a small molecule (ATP, ADP, or AMP) has been added, or a solution of human CTLA4 to which no small molecule has been added, is then reacted with the antibody to evaluate the binding ability of the antibody to human CTLA4 in the presence or absence of the small molecule . The assay is performed at 25°C using Tris-buffered saline, 0.02% PS20 as running buffer.

Изменения, усиливающие связывание с CTLA4 человека в присутствии малой молекулы, и изменения, снижающие связывание с CTLA4 человека в отсутствие малой молекулы, были выявлены с помощью описанного выше метода, и объединены для получения антител против CTLA4 человека, показывающих лучшие профили. К гену тяжелой цепи антитела 04H0150-G1m (SEQ ID NO: 209), который имеет 04Н0150 в качестве вариабельной области тяжелой цепи и Glm (SEQ ID NO: 82), в котором удалены С-концевые Gly и Lys IgG1 человека в качестве константной области тяжелой цепи, изменения, обнаруженные введением всесторонних изменений и изменений в каркас, объединяют для получения генов тяжелой цепи антитела. Для легкой цепи антитела 04L0072-lam1 (SEQ ID NO: 208), имеющей 04L0072 в качестве вариабельной области легкой цепи и λ-цепи lam1 (SEQ ID NO: 87) в качестве константной области легкой цепи человека, обнаруженные изменения объединяют для получения генов легкой цепи антитела. Кроме того, также создают вариант, в котором каркас вариабельной области и константнойChanges that increase binding to human CTLA4 in the presence of the small molecule and changes that decrease binding to human CTLA4 in the absence of the small molecule were identified using the method described above and combined to obtain anti-human CTLA4 antibodies showing better profiles. To the heavy chain gene, antibodies 04H0150-G1m (SEQ ID NO: 209), which has 04H0150 as the heavy chain variable region and Glm (SEQ ID NO: 82), in which the C-terminal Gly and Lys of human IgG1 are removed as the constant region heavy chain, changes detected by introducing comprehensive changes and changes in the framework are combined to obtain antibody heavy chain genes. For the antibody light chain 04L0072-lam1 (SEQ ID NO: 208) having 04L0072 as the light chain variable region and lam1 λ chain (SEQ ID NO: 87) as the human light chain constant region, the detected changes are combined to obtain the light chain genes antibody chains. In addition, a variant is also created in which the framework of the variable region and the constant region

- 66 045931 области легкой цепи заменены последовательностью κ-цепи человека. Для сравнения, получают ген тяжелой цепи антитела MDX10D1H-G1m (SEQ ID NO: 210), содержащий вариабельную область тяжелой цепи MDX10D1H (SEQ ID NO: 154), и ген легкой цепи антитела MDX10D1L-k0MT (SEQ ID NO: 211), имеющие вариабельную область легкой цепи MDX10D1L (SEQ ID NO: 155) существующего антитела против CTLA4 человека, описанного в WO 0114424. Антитела экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области, путем объединения этих генов для получения представляющих интерес антител против CTLA4. В табл. 9 перечислены SEQ ID NO вариабельных областей тяжелой цепи, вариабельных областей легкой цепи, константных областей тяжелой цепи, константных областей легкой цепи и гипервариабельных областей полученных антител.- 66 045931 light chain regions are replaced by human κ chain sequence. For comparison, the MDX10D1H-G1m antibody heavy chain gene (SEQ ID NO: 210) containing the MDX10D1H heavy chain variable region (SEQ ID NO: 154) and the MDX10D1L-k0MT antibody light chain gene (SEQ ID NO: 211) having light chain variable region MDX10D1L (SEQ ID NO: 155) of the existing anti-human CTLA4 antibody described in WO 0114424. The antibodies are expressed and purified in a manner known to those skilled in the art by combining these genes to produce the anti-CTLA4 antibodies of interest. In table 9 lists the SEQ ID NOs of the heavy chain variable regions, light chain variable regions, heavy chain constant regions, light chain constant regions and hypervariable regions of the resulting antibodies.

В настоящем описании антитела названы в соответствии со следующим правилом: (вариабельная область тяжелой цепи) - (константная область тяжелой цепи)/(вариабельная область легкой цепи) - (константная область легкой цепи). Например, это означает, что если название антитела 04H0150G1m/04L0072-lam1, вариабельная область тяжелой цепи этого антитела - 04Н0150, константная область тяжелой цепи - G1m, вариабельная область легкой цепи - 04L0072, а константная область легкой цепи lam1.In the present specification, antibodies are named according to the following rule: (heavy chain variable region) - (heavy chain constant region)/(light chain variable region) - (light chain constant region). For example, this means that if the name of an antibody is 04H0150G1m/04L0072-lam1, the heavy chain variable region of that antibody is 04H0150, the heavy chain constant region is G1m, the light chain variable region is 04L0072, and the light chain constant region is lam1.

Таблица 9 Аминокислотные последовательности тяжелых цепей, легких цепей ____и их гипервариабельных областей (обозначены как SEQ ID NO_)_____Table 9 Amino acid sequences of heavy chains, light chains ____and their hypervariable regions (designated as SEQ ID NO_)_____

Антитело Antibody Вариабельная область Variable region Константная область Constant region Гипервариабельная область (HVR) Hypervariable region (HVR) Тяжелая цепь Heavy chain Легкая цепь Light chain Тяжелая цепь Heavy chain Легкая цепь Light chain Н1 H1 Н2 H2 НЗ NZ L1 L1 L2 L2 L3 L3 04Н0150-G1 m/04L0072-lsm1 04Н0150-G1 m/04L0072-lsm1 98 98 99 99 82 82 87 87 103 103 104 104 102 102 116 116 117 117 115 115 04H1077-G1m/04L104Ham1 04H1077-G1m/04L104Ham1 83 83 88 88 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 118 118 117 117 115 115 04H1077-G1 m/04L1063~lam1 04H1077-G1 m/04L1063~lam1 83 83 89 89 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 116 116 117 117 133 133 04H1077-G1m/04L1027-lain1 04H1077-G1m/04L1027-lain1 83 83 90 90 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 119 119 117 117 115 115 04H1077-G1m/04L1034-lam1 04H1077-G1m/04L1034-lam1 83 83 91 91 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 120 120 117 117 115 115 04H1077-G1 m/04L1066-laml 04H1077-G1 m/04L1066-laml 83 83 92 92 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 121 121 117 117 115 115 04H1077-G1 m/04L1067-laml 04H1077-G1 m/04L1067-laml 83 83 93 93 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 122 122 117 117 115 115 Q4H1077-G1 m/04L1068-laml Q4H1077-G1 m/04L1068-laml 83 83 94 94 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 118 118 117 117 133 133 04H1077-G1 m/04L1086-laml 04H1077-G1 m/04L1086-laml 83 83 97 97 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 122 122 117 117 133 133 04H107 7-G1 m/04L1305-kOMT 04H107 7-G1 m/04L1305-kOMT 83 83 95 95 82 82 96 96 105 105 106 106 102 102 122 122 117 117 133 133 04H1206-G1 m/04L1086-lam1 04H1206-G1 m/04L1086-lam1 84 84 97 97 82 82 87 87 105 105 106 106 102 102 122 122 117 117 133 133 04H1207-G1 m/04L1086-laml 04H1207-G1 m/04L1086-laml 85 85 97 97 82 82 87 87 107 107 106 106 102 102 122 122 117 117 133 133 04H1208-GW04L1086-lam! 04H1208-GW04L1086-lam! 86 86 97 97 82 82 87 87 107 107 108 108 102 102 122 122 117 117 133 133 04H1208-G1 m/04L1407-kOMT 04H1208-G1 m/04L1407-kOMT 86 86 134 134 82 82 96 96 107 107 108 108 102 102 121 121 123 123 153 153

Biacore T200 используют для измерения связывания полученных антител с CTLA4 человека. В качестве рабочего буфера используют 20 мМ ACES (pH 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2, 0,05% Tween 20 с добавлением АТФ до нужной концентрации, анализ проводят при 37°С. Во-первых, белок G (фирма CALBIOCHEM) иммобилизуют на сенсорном чипе серии S СМ3 (фирма GE Healthcare), и антитела захватывают путем взаимодействия с чипом раствора антител, приготовленного в подвижном буфере, не содержащем АТФ. Далее, при взаимодействии с раствором CTLA4 человека, приготовленным в подвижном буфере, содержащем АТФ до желаемой концентрации, или с раствором CTLA4 человека, приготовленным в подвижном буфере, не содержащем АТФ, оценивают связывающую способность антитела к CTLA4 человека в присутствии или в отсутствие АТФ. Чипы регенерируют с помощью 25 мМ NaOH и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) и проводят анализ путем повторного захвата антител. Константу диссоциации каждого антитела относительно CTLA4 рассчитывают с использованием программного обеспечения Biacore T200 Evaluation Software 2.0. В частности, константу скорости связывания ka (л/моль/с) и константу скорости диссоциации kd (1/с) рассчитывают путем глобальной подгонки сенсорограмм, полученных в результате измерения, с использованием модели связывания Ленгмюра 1:1. По этим значениям рассчитывают константу диссоциации KD (моль/л). В качестве альтернативы константу диссоциации KD (моль/л) рассчитывают по модели стационарного состояния. Кроме того, количество связывания CTLA4 на единицу количества антитела рассчитывают путем корректировки количества связанного CTLA4, рассчитанного по сенсограмме, полученной в результате анализа, с количеством антител, захваченных на поверхности чипа. В табл. 10 показаны результаты этих анализов.Biacore T200 is used to measure the binding of the resulting antibodies to human CTLA4. The working buffer is 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 , 0.05% Tween 20 with the addition of ATP to the desired concentration, the analysis is carried out at 37°C. First, protein G (CALBIOCHEM) is immobilized on a CM3 S series sensor chip (GE Healthcare) and antibodies are captured by contacting the chip with an antibody solution prepared in an ATP-free running buffer. Next, by reacting with a solution of human CTLA4 prepared in a running buffer containing ATP to the desired concentration, or with a solution of human CTLA4 prepared in a running buffer not containing ATP, the binding ability of the anti-human CTLA4 antibody in the presence or absence of ATP is assessed. The chips were regenerated with 25 mM NaOH and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) and assayed by antibody recapture. The dissociation constant of each antibody relative to CTLA4 was calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0. Specifically, the binding rate constant ka (L/mol/s) and the dissociation rate constant kd (1/s) are calculated by globally fitting the measured sensorograms using a 1:1 Langmuir binding model. From these values the dissociation constant KD (mol/l) is calculated. Alternatively, the dissociation constant KD (mol/L) is calculated from the steady state model. In addition, the amount of CTLA4 binding per unit amount of antibody is calculated by adjusting the amount of CTLA4 bound calculated from the sensogram obtained from the assay with the amount of antibody captured on the chip surface. In table Figure 10 shows the results of these analyses.

- 67 045931- 67 045931

Таблица 10Table 10

Анализ связывания измененного антитела с CTLA4 человека.Analysis of altered antibody binding to human CTLA4.

Антитело Antibody Связывание c CTLA4 человека Binding to human CTLA4 Kd для CTLA4 человека (М) Kd for human CTLA4 (M) Без АТФ Without ATP АТФ 1 мкМ ATP 1 µM АТФ 1Г)мк\-1 ATP 1G)mk\-1 АТФ 100 мкМ ATP 100 µM Без АТФ Without ATP АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM MDX1001HG1 m/MDX10D1 LkOMT MDX1001HG1 m/MDX10D1 LkOMT 0.189 0.189 0.189 0.189 0.181 0.181 0.170 0.170 4. ЗЕ-08 4. ZE-08 4.9Е-08 4.9E-08 4.5Е-08 4.5E-08 04Н0150-G1 m/04L0072-lam1 04Н0150-G1 m/04L0072-lam1 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.010 0.056 0.056 N.A. N.A. N.A. N.A. 1.9Е-06 1.9E-06 04H1077-G1 m/04L1041 -Iam1 04H1077-G1 m/04L1041 -Iam1 0.006 0.006 0.023 0.023 0.094 0.094 0.172 0.172 N.A. N.A. 7.3Е-О7 7.3E-O7 1.4Е-07 1.4E-07 04H1077-G1 m/04L1063-lam1 04H1077-G1 m/04L1063-lam1 0.001 0.001 0.003 0.003 0.029 0.029 0.105 0.105 N.A. N.A. N.A. N.A. 5.8Е-07 5.8E-07 04H1077-G1 m/04L1027-lam1 04H1077-G1 m/04L1027-lam1 0.000 0.000 0.001 0.001 0.024 0.024 0.099 0.099 N.A. N.A. N.A. N.A. 6.7Е-07 6.7E-07 04H1077-G1 m/04L1034-lam1 04H1077-G1 m/04L1034-lam1 0.004 0.004 0.007 0.007 0.041 0.041 0.114 0.114 N.A. N.A. N.A. N.A. 3.2Е-07 3.2E-07 04H1077-G1 m/04L1066-lam1 04H1077-G1 m/04L1066-lam1 0.020 0.020 0.057 0.057 0.142 0.142 0.185 0.185 *6.9Е-О6 *6.9E-O6 2.8Е-07 2.8E-07 4.8Е-08 4.8E-08 04H1077-G1 m/04L1067-lam1 04H1077-G1 m/04L1067-lam1 0.012 0.012 0.041 0.041 0.131 0.131 0.192 0.192 N.A. N.A. 4.0Е-07 4.0E-07 7.6Е-08 7.6E-08 04H1077 G1 m/04L1068lam1 04H1077 G1 m/04L1068lam1 0.005 0.005 0.018 0.018 0.080 0.080 0.165 0.165 N.A. N.A. 8.8Е-07 8.8E-07 1.5Е-07 1.5E-07 04H1077-G1 m/04LI 086-lam 1 04H1077-G1 m/04LI 086-lam 1 0.0 ΙΟ 0.0ΙΟ 0.031 0.031 0.106 0.106 0.181 0.181 N.A. N.A. 6.9Е-07 6.9E-07 I.IE-07 I.IE-07 04H 1077-G1 m/04L1305-kCMT 04H 1077-G1 m/04L1305-kCMT 0.018 0.018 0.046 0.046 0.128 0.128 0.185 0.185 +6.5Е-06 + 6.5E-06 3.6Е-07 3.6E-07 5.6Е-08 5.6E-08 04H1206-G1 m/04L1086-lam1 04H1206-G1 m/04L1086-lam1 0.010 0.010 0.029 0.029 0.103 0.103 0.179 0.179 N.A. N.A. 6.8Е-07 6.8E-07 1.2Е-07 1.2E-07 04H1207-G1 m/04L1086-lam1 04H1207-G1 m/04L1086-lam1 0.013 0.013 0.047 0.047 0.137 0.137 0.196 0.196 N.A. N.A. З.ЗЕ-07 Z.ZE-07 5.9Е-08 5.9E-08 04H1208-G1 m/04L1086-lam1 04H1208-G1 m/04L1086-lam1 0.005 0.005 0.030 0.030 0.108 0.108 0.170 0.170 N.A. N.A. 4.5Е-07 4.5E-07 7.4Е-08 7.4E-08 04H1208-G1 m/04L1407-kOMT 04H1208-G1 m/04L1407-kOMT 0.138 0.138 0.175 0.175 0.200 0.200 0.214 0.214 *4.3Е-07 *4.3E-07 2.3Е-08 2.3E-08 6.2Е-09 6.2E-09

N.A. Результаты чрезвычайно низкие и не позволяют определить величину KD.N.A. The results are extremely low and do not allow us to determine the KD value.

* Константу диссоциации KD (моль/л) рассчитывают по модели стационарного состояния.* Dissociation constant KD (mol/l) is calculated using the steady state model.

Значение связывание с CTLA4 человека в таблице указывает количество связываемого антигена CTLA4 человека на единицу количества антитела, когда применяют 1000 нМ CTLA4 человека при каждой из перечисленных концентраций АТФ, и KD для CTLA4 человека (М) означает константу диссоциации для CTLA4 человека при каждой концентрации АТФ. Значения KD, отмеченные в табл. 12 знаком *, рассчитаны с использованием стационарной модели. Установлено, что все варианты, полученные с использованием 04H0150-G1m/04L0072-lam1 в качестве исходного антитела, обладают повышенным связыванием в присутствии АТФ по сравнению с 04H0150-G1m/04L0072-lam1. Кроме того, как 04H0150-G1m/04L0072-lam1, так и эти варианты проявляют повышенное связывание при концентрации АТФ 10 мкМ по сравнению с концентрацией 1 мкМ; связываемое количество при 100 мкМ еще выше, таким образом, показана зависимость связывания с CTLA4 человека в от концентрации АТФ. С другой стороны, сравнение с MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT не показало такого зависимого от концентрации АТФ связывания с CTLA4 человека. Хотя 04H1077-G1m/04L1305-k0MT, в котором каркас легкой цепи 04Н1077-G1m/04L1086-lam1 и константная область заменены κ-цепью человека, обладают повышенным связыванием с CTLA4 человека в отсутствие АТФ в отличие от 04Н1077-G1m/04L1086-lam1, зависящее от концентрации АТФ связывание также усиливалось. Эти результаты показали, что свойство связываться с CTLA4 человека АТФ-зависимым образом сохраняется, даже когда последовательность заменена последовательностью κ-цепи человека. Среди разработанных в настоящем изобретении антител 04Η1077-01μΌ^1066-^1, 04H1077-G1m/04L1305-k0MT и 04H1207-G1m/04L1086-lam1 показывают почти такую же связывающую активность, что и существующее анти-CTLA4 антитело человека MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT в условиях, когда АТФ присутствует в количестве 100 мкМ, и 04H1208-G1m/04L1407-k0MT проявляет более сильную связывающую активность, чем MDX10D1HG1m/MDX10D1L-k0MT в условиях, когда АТФ присутствует в количестве 10 мкМ или более.The human CTLA4 binding value in the table indicates the amount of human CTLA4 antigen bound per unit amount of antibody when 1000 nM human CTLA4 is used at each of the listed ATP concentrations, and the KD for human CTLA4 (M) means the dissociation constant for human CTLA4 at each ATP concentration. The KD values noted in the table. 12 *, calculated using a stationary model. All variants obtained using 04H0150-G1m/04L0072-lam1 as the starting antibody were found to have increased binding in the presence of ATP compared to 04H0150-G1m/04L0072-lam1. In addition, both 04H0150-G1m/04L0072-lam1 and these variants exhibit increased binding at 10 μM ATP concentration compared to 1 μM concentration; the amount bound at 100 μM is even higher, thus demonstrating the dependence of binding to human CTLA4 on ATP concentration. On the other hand, comparison with MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT did not show such ATP concentration-dependent binding to human CTLA4. Although 04H1077-G1m/04L1305-k0MT, in which the 04H1077-G1m/04L1086-lam1 light chain backbone and constant region are replaced by the human κ chain, has increased binding to human CTLA4 in the absence of ATP, in contrast to 04H1077-G1m/04L1086-lam1, ATP concentration-dependent binding was also enhanced. These results showed that the property of binding to human CTLA4 in an ATP-dependent manner is retained even when the sequence is replaced by a human κ chain sequence. Among the antibodies developed in the present invention, 04Η1077-01μΌ^1066-^1, 04H1077-G1m/04L1305-k0MT and 04H1207-G1m/04L1086-lam1 show almost the same binding activity as the existing anti-CTLA4 human antibody MDX10D1H-G1m/MDX10D1L -k0MT under conditions where ATP is present at 100 μM, and 04H1208-G1m/04L1407-k0MT exhibits stronger binding activity than MDX10D1HG1m/MDX10D1L-k0MT under conditions where ATP is present at 10 μM or more.

Затем среди антител, представленных в табл. 10, оценивают связывание 04Н1077- G1m/04L1086lam1 и 04H1208-G1m/04L1407-k0MT с CTLA4 мыши. Для сравнения получают ген тяжелой цепи антитела hUH02-G1d (SEQ ID NO: 212), содержащий вариабельную область тяжелой цепи hUH02 (SEQ ID NO: 156) антитела против CTLA4 мыши, и ген легкой цепи антитела hUL01- k0 (SEQ ID NO: 213), содержащие вариабельную область hUL0l легкой цепи (SEQ ID NO: 157), антитело экспрессируют, очищают и используют. Анализ проводят с использованием Biacore T200 в тех же условиях, что и измерение связывания с CTLA4 человека, за исключением использования CTLA4 мыши в качестве образца (табл. 11). CTLA4 мыши получают следующим образом.Then, among the antibodies presented in table. 10, assess the binding of 04H1077-G1m/04L1086lam1 and 04H1208-G1m/04L1407-k0MT to mouse CTLA4. For comparison, the antibody heavy chain gene hUH02-G1d (SEQ ID NO: 212), containing the heavy chain variable region hUH02 (SEQ ID NO: 156) of the mouse anti-CTLA4 antibody, and the antibody light chain gene hUL01-k0 (SEQ ID NO: 213) were obtained ) containing the hUL0l light chain variable region (SEQ ID NO: 157), the antibody is expressed, purified and used. The assay was performed using a Biacore T200 under the same conditions as the human CTLA4 binding measurement, except using mouse CTLA4 as a sample (Table 11). Mouse CTLA4 was prepared as follows.

Ген внеклеточной области CTLA4 мыши, связанный с His-меткой (mCTLA4-His) (SEQ ID NO: 49), синтезирован и инсертирован в экспрессирующую плазмиду животного. Подготовленную плазмиду вводят методом липофекции в линию FreeStyle 293-F, полученную из клеток эмбриональной почки человека (фирма Invitrogen), которую высевают в колбу после суспендирования в экспрессионной среде FreeStyle 293 (фирма Invitrogen) при плотности клеток 1,33x106 клеток/мл. Поглощение очищенного раствора антигена при 280 нм измеряют с помощью спектрофотометра. Из полученных значений измерений рассчитывают концентрацию очищенного антигена с использованием коэффициента экстинкции, рассчитанного методом РАСЕ (Protein Science, 1995,4,2411-2423).The mouse CTLA4 His-tagged extracellular region gene (mCTLA4-His) (SEQ ID NO: 49) was synthesized and inserted into an animal expression plasmid. The prepared plasmid is introduced by lipofection into the FreeStyle 293-F line obtained from human embryonic kidney cells (Invitrogen), which is seeded into a flask after suspension in the FreeStyle 293 expression medium (Invitrogen) at a cell density of 1.33x106 cells/ml. The absorbance of the purified antigen solution at 280 nm is measured using a spectrophotometer. From the obtained measurement values, the concentration of the purified antigen is calculated using the extinction coefficient calculated by the PACE method (Protein Science, 1995,4,2411-2423).

- 68 045931- 68 045931

Таблица 11Table 11

Анализ связывания измененных антител с CTLA4 мышиAnalysis of the binding of altered antibodies to mouse CTLA4

Антитело Antibody Связывание c CTLA4 мыши Binding to mouse CTLA4 KD для CTLA4 мыши K D for CTLA4 mouse Без АТФ Without ATP АТФ 1 мкМ ATP 1 µM АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM hUH02-Gld/hUL01-k0 hUH02-Gld/hUL01-k0 0,155 0.155 0,160 0.160 0,159 0.159 0,157 0.157 1,1Е-07 1.1E-07 Ι,ΙΕ-07 Ι,ΙΕ-07 04H1077-Glm/04L1086- 1am 1 04H1077-Glm/04L1086- 1am 1 ND. N.D. 0,001 0.001 0,024 0.024 0,093 0.093 4ДЕ-06 4DE-06 5,9Е-07 5.9E-07 04H1208-Glm/04L1407kOMT 04H1208-Glm/04L1407kOMT 0,023 0.023 0,099 0.099 0,153 0.153 0,175 0.175 8,4Е-08 8.4E-08 1,6Е-08 1.6E-08

N.D. - слишком слабые показатели для определения связывания.N.D. - indicators are too weak to determine binding.

Значение связывание с CTLA4 мыши в таблице означает количество связывания CTLA4 мыши на единицу количества антитела, когда CTLA4 мыши взаимодействует при концентрации 1000 нМ с каждой из концентраций АТФ, и KD для CTLA4 мыши (М) означает константу диссоциации для CTLA4 мыши при каждой концентрации АТФ. Установлено, что hUH02-Gld/hUL01-k0 связывается с CTLA4 мыши в равной степени независимо от концентрации АТФ, тогда как 04H1077-G1m-04L1086-lam1 и 04H1208G1m/04L1407-k0MT связываются с CTLA4 мыши в зависимости от концентрации АТФ. По сравнению со связыванием с CTLA4 человека, показанной в табл. 10, способность связывания 4H1077-G1m-04L1086lam1 с CTLA4 мыши примерно в 5 раз слабее по сравнению со способностью связываться с CTLA4 человека, а способность 04H1208-G1m/ 04L1407-k0MT связываться с CTLA4 мыши примерно в два раза слабее по сравнению со способностью связываться с CTLA4 человека в присутствии 100 мкМ АТФ.The mouse CTLA4 binding value in the table means the amount of mouse CTLA4 binding per unit amount of antibody when mouse CTLA4 reacts at 1000 nM with each of the ATP concentrations, and the mouse CTLA4 KD (M) means the dissociation constant for mouse CTLA4 at each ATP concentration. It was found that hUH02-Gld/hUL01-k0 binds to mouse CTLA4 equally regardless of ATP concentration, while 04H1077-G1m-04L1086-lam1 and 04H1208G1m/04L1407-k0MT bind to mouse CTLA4 depending on ATP concentration. Compared to binding to human CTLA4 shown in Table. 10, the binding ability of 4H1077-G1m-04L1086lam1 to mouse CTLA4 is approximately 5 times weaker compared to the ability to bind to human CTLA4, and the ability of 04H1208-G1m/ 04L1407-k0MT to bind to mouse CTLA4 is approximately two times weaker compared to the ability to bind to human CTLA4. Human CTLA4 in the presence of 100 μM ATP.

Пример 3-4. Создание контрольного анти-mCTLA4 антитела и переключающих анти-mCTLA4 антител.Example 3-4. Generation of control anti-mCTLA4 antibody and switching anti-mCTLA4 antibody.

Создают контрольное анти-mCTLA4 антитело (hUH02-mFa55/hUL01-mk1, аббревиатура: mNSmFa55) и анти-CTLA4 переключатели (04H1077-mFa55/04L1086-m10r, аббревиатура: SW1077-mFa55; и 04H1208-mFa55/04L1407s-mk1, аббревиатура: SW1208-mFa55). В антителе mNS-mFa55 используют вариабельную область тяжелой цепи hUH02 (SEQ ID NO: 16) и вариабельную область легкой цепи hUL01 (SEQ ID NO: 17), а в качестве константных областей используют константную область тяжелой цепи мыши mFa55 (SEQ ID NO: 18) и константную область mk1 легкой цепи мыши дикого типа (SEQ ID NO: 19). Также используют константную область тяжелой цепи мыши, к которой добавлены изменения для усиления связывания с рецептором Fcy. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.Create a control anti-mCTLA4 antibody (hUH02-mFa55/hUL01-mk1, abbreviation: mNSmFa55) and anti-CTLA4 switches (04H1077-mFa55/04L1086-m10r, abbreviation: SW1077-mFa55; and 04H1208-mFa55/04L 1407s-mk1, abbreviation: SW1208-mFa55). The mNS-mFa55 antibody uses the hUH02 heavy chain variable region (SEQ ID NO: 16) and the hUL01 light chain variable region (SEQ ID NO: 17), and the mFa55 mouse heavy chain constant region (SEQ ID NO: 18) is used as the constant regions ) and wild-type mouse light chain mk1 constant region (SEQ ID NO: 19). A mouse heavy chain constant region is also used, to which modifications have been added to enhance binding to the Fcy receptor. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе SW1077-mFa55 используют вариабельную область тяжелой цепи 04Н1077 (SEQ ID NO: 20) и вариабельную область легкой цепи 04L1086 (SEQ ID NO: 21), а в качестве константных областей используют константную область тяжелой цепи мыши mFa55 (SEQ ID NO: 18) и константную область легкой цепи мыши дикого типа m10r (SEQ ID NO: 22). Также используют константную область тяжелой цепи мыши, к которой добавлены изменения для усиления связывания с рецептором Fcy. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.The SW1077-mFa55 antibody uses the heavy chain variable region 04H1077 (SEQ ID NO: 20) and the light chain variable region 04L1086 (SEQ ID NO: 21), and the mouse heavy chain constant region mFa55 (SEQ ID NO: 18) is used as the constant regions ) and the wild-type mouse light chain constant region m10r (SEQ ID NO: 22). A mouse heavy chain constant region is also used, to which modifications have been added to enhance binding to the Fcy receptor. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе SW1208-mFa55 используют вариабельную область тяжелой цепи 04Н1208 (SEQ ID NO: 23) и вариабельную область легкой цепи 04L1407s (SEQ ID NO: 21), а в качестве константных областей используют константную область тяжелой цепи мыши mFa55 (SEQ ID NO: 18) и константную область легкой цепи мыши дикого типа mk1 (SEQ ID NO: 19). Также используют константную область тяжелой цепи мыши, к которой добавлены изменения для усиления связывания с рецептором Fcy. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.The SW1208-mFa55 antibody uses the heavy chain variable region 04H1208 (SEQ ID NO: 23) and the light chain variable region 04L1407s (SEQ ID NO: 21), and the mouse heavy chain constant region mFa55 (SEQ ID NO: 18) is used as the constant regions ) and wild-type mouse light chain constant region mk1 (SEQ ID NO: 19). A mouse heavy chain constant region is also used, to which modifications have been added to enhance binding to the Fcy receptor. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Пример 3-6. Оценка нейтрализующей активности переключающего антитела CTLA4.Example 3-6. Evaluation of neutralizing activity of CTLA4 switch antibody.

Нейтрализующую активность переключающего анти-CTLA4 антитела (SW1077-mFa55), полученного в примере 3-4, оценивают методом конкурентного иммуноферментного анализа (ELISA). В mCTLA4-Fc (SEQ ID NO: 25), в котором константная область человека связана с mCTLA4, разбавляют до концентрации 5 мкг/мл (55 нМ) 0,1 M NaHCO3, 0,05% NaN3 для приготовления раствора mCTLA4-Fc. По 100 мкл каждого приготовленного раствора mCTLA4-Fc добавляют в 96-луночный планшет, и планшет оставляют при 4°С в течение ночи для иммобилизации mCTLA4-Fc на поверхности планшета. После 3-кратной промывки TBS, 0,1% Tween 20, в каждую лунку добавляют по 250 мкл раствора БСА, разбавленного до 2% TBS, для блокирования поверхности планшета. Затем планшет промывают 3 раза. mCD86-Fc-His (Sino Biologies Inc. 50068-M03H, номер доступа NP_062261.3), в котором константная область человека и His-метка слиты с мышиным CD86, разведенным TBS до конечной концентрации 55 нМ, раствор антитела SW1077-mFa55, разбавленный до конечной концентрации 6,25, 1,56, 0,390, 0,0977, 0,0061 и 0 мкг/мл, и раствор АТФ, разведенный до конечной концентрации 0, 1, 10 и 100 мкМ, каждый смешивают таким образом, чтобы получить в сумме 100 мкл, смесь добавляют в каждую лунку и планшет оставляют при 37°С на 1 ч. Каждую лунку затем промывают 3 раза TBS, 0,1% Tween 20, приготовThe neutralizing activity of the anti-CTLA4 switching antibody (SW1077-mFa55) obtained in Example 3-4 was assessed by a competitive enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). mCTLA4-Fc (SEQ ID NO: 25), in which the human constant region is linked to mCTLA4, is diluted to a concentration of 5 μg/ml (55 nM) with 0.1 M NaHCO 3 , 0.05% NaN 3 to prepare a solution of mCTLA4- Fc. 100 μl of each prepared mCTLA4-Fc solution was added to a 96-well plate, and the plate was left at 4°C overnight to immobilize mCTLA4-Fc on the surface of the plate. After washing 3 times with TBS, 0.1% Tween 20, 250 μl of BSA solution diluted to 2% TBS was added to each well to block the plate surface. The plate is then washed 3 times. mCD86-Fc-His (Sino Biologies Inc. 50068-M03H, accession number NP_062261.3), in which the human constant region and His tag are fused to mouse CD86, diluted with TBS to a final concentration of 55 nM, SW1077-mFa55 antibody solution, diluted to final concentrations of 6.25, 1.56, 0.390, 0.0977, 0.0061 and 0 µg/ml, and ATP solution diluted to final concentrations of 0, 1, 10 and 100 µM, each mixed so as to obtain a total of 100 µl, the mixture is added to each well and the plate is left at 37°C for 1 hour. Each well is then washed 3 times with TBS, 0.1% Tween 20, prepared

- 69 045931 ленным так, чтобы он содержал ту же концентрацию АТФ, что и раствор, добавленный в каждую лунку. Затем в каждую лунку добавляют 100 мкл анти-His-tag mAb-HRP-Direct (фирма MBL Life Sciences), разбавленного в 10000 раз блокирующим буфером таким образом, чтобы концентрация АТФ была такой же, как и в растворе, добавленном в каждую лунку, и планшет оставляют при 37°С на 1 ч. Каждую лунку затем промывают 3 раза TBS, 0,1% Tween 20, приготовленным так, чтобы он содержал ту же концентрацию АТФ, что и раствор, добавленный в каждую лунку. В каждую лунку добавляют по 100 мкл раствора ТМБ и оставляют планшет при 37°С на 1 ч. В каждую лунку добавляют 50 мкл 1 М H2SO.4. чтобы остановить реакцию, и определяют оптическую плотность при 450 нм с помощью считывающего устройства для микропланшетов (фирма Wako Sunrise).- 69 045931 adjusted so that it contains the same concentration of ATP as the solution added to each well. Then, 100 μl of anti-His-tag mAb-HRP-Direct (MBL Life Sciences) diluted 10,000 times with blocking buffer is added to each well so that the ATP concentration is the same as the solution added to each well. and the plate is left at 37°C for 1 hour. Each well is then washed 3 times with TBS, 0.1% Tween 20, prepared to contain the same concentration of ATP as the solution added to each well. Add 100 µl of TMB solution to each well and leave the plate at 37°C for 1 hour. Add 50 µl of 1 M H2SO to each well.4. to stop the reaction, and determine the absorbance at 450 nm using a microplate reader (Wako Sunrise).

Величина поглощения в лунках без антител при равной концентрации АТФ принимают за степень связывания mCTLA4-mCD86, равную 100%, и оценивают, насколько скорость связывания снижается при добавлении антител. Результаты представлены на фиг. 9.The absorbance value in wells without antibodies at the same ATP concentration is taken as the degree of mCTLA4-mCD86 binding equal to 100%, and the extent to which the binding rate decreases with the addition of antibodies is assessed. The results are presented in Fig. 9.

Из полученных результатов следует, что нейтрализующая активность антитела SW1077 в отношении взаимодействия mCTLA4-mCD86 становится сильнее по мере увеличения концентрации АТФ в анализе. Эти результаты подтвердили, что антитело SW1077 обладает АТФ-зависимой нейтрализующей активностью.The results indicate that the neutralizing activity of the SW1077 antibody against the mCTLA4-mCD86 interaction becomes stronger as the ATP concentration in the assay increases. These results confirmed that antibody SW1077 has ATP-dependent neutralizing activity.

Пример 3-7. Эффективность переключающего анти-СТЕА4 антитела в мышиной модели с трансплантированными сингенными опухолевыми клетками, увеличение/уменьшение регуляторных Т-клеток (Treg) в опухоли и изменение маркера системного ответа в селезенке.Example 3-7. Efficacy of an anti-STEA4 antibody switch in a murine model of syngeneic tumor cell transplantation, increase/decrease of regulatory T cells (Treg) in the tumor, and alteration of a systemic response marker in the spleen.

Пример 3-7-1. Получение клеточной линии и мышиной модели с трансплантированной сингенной опухолевой линией.Example 3-7-1. Generation of cell line and mouse model with transplanted syngeneic tumor line.

Используемые клетки являются клетками линии рака молочной железы мыши FM3A, приобретенными в фирме RIKEN. Клетки FM3A поддерживают и пассируют в среде RPMI 1640 (фирма Sigma), содержащей 10% бычьей сыворотки (фирма Thermo Fisher Scientific). Используют мышей СЗН/HeN (7недельный возраст, самки), приобретенных в фирме Charles River Laboratories, Япония. Клетки FM3A трансплантируют в живот мышам под кожу, и подтверждают, что модель приживается, когда объем трансплантированной опухоли достигает размера примерно от 150 до примерно 300 мм3.The cells used are mouse mammary cancer cell line FM3A, purchased from RIKEN. FM3A cells are maintained and passaged in RPMI 1640 medium (Sigma) containing 10% bovine serum (Thermo Fisher Scientific). SZN/HeN mice (7 weeks old, females) purchased from Charles River Laboratories, Japan, were used. FM3A cells are transplanted into the abdomen of mice under the skin, and the model is confirmed to be established when the volume of the transplanted tumor reaches a size of about 150 to about 300 mm 3 .

Объем трансплантированной опухоли рассчитывают по следующей формуле:The volume of the transplanted tumor is calculated using the following formula:

Объем опухоли=больший диаметрхменьший диаметрхменьший диаметр/2.Tumor volume=larger diameterxsmaller diameterxsmaller diameter/2.

Пример 3-7-2. Получение лекарственных средств для введения.Example 3-7-2. Obtaining medications for administration.

Лекарственными средствами, которые вводят модели с трансплантированными клетками FM3A, являются контрольное антитело против мышиного CTLA4 (mNS-mFa55) и переключающее анти-С^А4 антитело (SW1208-mFa55), полученные в примере 3-4. С использованием His-буфера (20 мМ His-HCl, 150 мМ NaCl, pH 6,0) готовят растворы mNS-mFa55 в концентрациях 0,0005 мг/мл, 0,005 мг/мл, 0,0125 мг/мл, 0,05 мг/мл, 0,5 мг/мл, 1,5 мг/мл и 5 мг/мл, а раствор SW1208-mFa55 готовят в концентрациях 0,005 мг/мл, 0,05 мг/мл, 0,5 мг/мл, 5 мг/мл и 25 мг/мл, соответственно.The drugs administered to the FM3A cell transplant models are the anti-mouse CTLA4 control antibody (mNS-mFa55) and the anti-C^A4 switch antibody (SW1208-mFa55) prepared in Example 3-4. Using His buffer (20 mM His-HCl, 150 mM NaCl, pH 6.0), solutions of mNS-mFa55 are prepared at concentrations of 0.0005 mg/ml, 0.005 mg/ml, 0.0125 mg/ml, 0.05 mg/ml, 0.5 mg/ml, 1.5 mg/ml and 5 mg/ml, and SW1208-mFa55 solution is prepared in concentrations of 0.005 mg/ml, 0.05 mg/ml, 0.5 mg/ml, 5 mg/ml and 25 mg/ml, respectively.

Пример 3-7-3. Введение лекарственных средств для измерения противоопухолевого эффекта.Example 3-7-3. Administration of drugs to measure antitumor effect.

На 9-й день после трансплантации мышам вводят mNS-mFa55 в дозах 0,01 мг/кг, 0,1 мг/кг, 0,25 мг/кг, 1 мг/кг, 10 мг/кг, 30 мг/кг и 100 мг/кг, a SW1208-mFa55 вводят в дозах 0,1 мг/кг, 1 мг/кг, 10 мг/кг, 100 мг/кг и 500 мг/кг, соответственно. Приготовленные растворы для введения вводят в дозе 20 мл/кг через хвостовую вену.On the 9th day after transplantation, mice were administered mNS-mFa55 at doses of 0.01 mg/kg, 0.1 mg/kg, 0.25 mg/kg, 1 mg/kg, 10 mg/kg, 30 mg/kg and 100 mg/kg, and SW1208-mFa55 is administered at doses of 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, 10 mg/kg, 100 mg/kg and 500 mg/kg, respectively. Prepared solutions for administration are administered at a dose of 20 ml/kg through the tail vein.

В табл. 12 подробно изложено лечение лекарственным средством при измерении противоопухолевого эффекта.In table 12 details the drug treatment when measuring the antitumor effect.

- 70 045931- 70 045931

Таблица 12Table 12

Измерение противоопухолевого эффекта в модели трансплантированных клеток FM3AMeasuring the antitumor effect in the FM3A cell transplant model

Группа Group Животных Animals Лекарство Medicine Доза Dose Введение Introduction Дата введения Date of introduction 1 1 4 4 His-буфер His buffer - - В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 2 2 4 4 mNS-mFa55 mNS-mFa55 0,01 мг/кг 0.01 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 3 3 4 4 mNS-mFa55 mNS-mFa55 ОД мг/кг OD mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 4 4 4 4 mNS-mFa55 mNS-mFa55 0,25 мг/кг 0.25 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 5 5 4 4 mNS-mFa55 mNS-mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 6 6 4 4 mNS-mFa55 mNS-mFa55 10 мг/кг 10 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 7 7 4 4 mNS-mFa55 mNS-mFa55 30 мг/кг 30 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 8 8 4 4 mNS-mFa55 mNS-mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 9 9 4 4 SW1208mFa55 SW1208mFa55 0,1 мг/кг 0.1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 10 10 4 4 SW1208mFa55 SW1208mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation И AND 4 4 SW1208mFa55 SW1208mFa55 10 мг/кг 10 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 12 12 4 4 SW1208mFa55 SW1208mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation 13 13 4 4 SW1208mFa55 SW1208mFa55 500 мг/кг 500 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 9й день после трансплантации 9th day after transplantation

Пример 3-7-4. Оценка противоопухолевого эффекта.Example 3-7-4. Evaluation of antitumor effect.

Противоопухолевый эффект оценивают по объему опухоли, рассчитанному по формуле, описанной в примере 3-7-1.The antitumor effect is assessed by tumor volume, calculated using the formula described in example 3-7-1.

Значение скорости ингибирования роста опухоли (TGI - Tumor Growth Inhibition) рассчитывают по следующей формуле:The tumor growth inhibition rate (TGI - Tumor Growth Inhibition) is calculated using the following formula:

TGI (%) = (1 - (Средний объем опухоли в исследуемой группе на момент измерения - Средний объем опухоли в исследуемой группе на момент первоначального введения) / (Средний объем опухоли в контрольной группе на момент измерения средний объем опухоли в контрольной группе на момент первоначального введения)) х 100TGI (%) = (1 - (Mean tumor volume in the study group at the time of measurement - Average tumor volume in the study group at the time of initial administration) / (Average tumor volume in the control group at the time of measurement average tumor volume in the control group at the time of initial administration introduction)) x 100

В результате эффективность препарата TGI=60% и более на 13-й день после введения, что было установлено для mNS-mFa55 в дозах 0,1 мг/кг и более и для SW1208-mFa55 в дозах 1 мг/кг и более (фиг. 10 и 11).As a result, the effectiveness of the drug TGI = 60% or more on the 13th day after administration, which was established for mNS-mFa55 in doses of 0.1 mg/kg or more and for SW1208-mFa55 in doses of 1 mg/kg or more (Fig. 10 and 11).

Пример 3-7-5. Введение лекарственного средства для оценки клеток Treg в опухоли и подтверждения системных эффектов в селезенке.Example 3-7-5. Drug administration to evaluate Treg cells in the tumor and confirm systemic effects in the spleen.

На 7-й день после трансплантации через хвостовую вену вводят контрольное антитело против мышиного CTLA4 (mNS-mFa55) в дозах 0,1 мг/кг, 1 мг/кг, 10 мг/кг и 100 мг/кг, а переключающее антиCTLA4 антитело (SW1208-mFa55) вводят через хвостовую вену в дозах 0,1 мг/кг, 1 мг/кг, 10 мг/кг, 100 мг/кг и 500 мг/кг. В табл. 13 показаны подробности медикаментозного лечения для оценки клеток Treg в опухоли и подтверждения системных эффектов в селезенке.On day 7 after transplantation, a control anti-mouse CTLA4 antibody (mNS-mFa55) is administered via the tail vein at doses of 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, 10 mg/kg and 100 mg/kg, and a switching anti-CTLA4 antibody ( SW1208-mFa55) is administered via the tail vein at doses of 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, 10 mg/kg, 100 mg/kg and 500 mg/kg. In table Figure 13 shows details of drug treatment to evaluate Treg cells in the tumor and confirm systemic effects in the spleen.

- 71 045931- 71 045931

Таблица 13Table 13

Проверка внутриопухолевых и системных эффектов в модели трансплантированных клеток FM3A (mNS-mFa55 и SW1208-mFa55)Testing intratumoral and systemic effects in the FM3A cell transplant model (mNS-mFa55 and SW1208-mFa55)

Группа Group Животных Animals Лекарство Medicine Доза Dose Введение Introduction Дата введения Date of introduction 1 1 3 3 His-буфер His buffer - - В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 2 2 3 3 mNS-mFa55 mNS-mFa55 0,1 мг/кг 0.1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 3 3 3 3 mNS-mFa55 mNS-mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 4 4 3 3 mNS-mFa55 mNS-mFa55 10 мг/кг 10 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 5 5 3 3 mNS-mFa55 mNS-mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 6 6 3 3 SW1208mFa55 SW1208mFa55 ОД мг/кг OD mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 7 7 3 3 SW1208mFa55 SW1208mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 8 8 3 3 SW1208mFa55 SW1208mFa55 10 мг/кг 10 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 9 9 3 3 SW1208mFa55 SW1208mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 10 10 3 3 SW1208mFa55 SW1208mFa55 500 мг/кг 500 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation

Пример 3-7-6. Резекция опухоли и селезенки у модельных мышей с трансплантированными клетками FM3A.Example 3-7-6. Tumor and spleen resection in FM3A cell-transplanted mouse model.

На 6-й день после введения антител мышей подвергают эвтаназии под наркозом и проводят резекцию опухоли и селезенки. Из резецированной селезенки готовят клеточную суспензию с использованием среды RPMI-1640 (SIGMA), содержащей 10%.On day 6 after antibody injection, mice were euthanized under anesthesia and the tumor and spleen were resected. A cell suspension is prepared from the resected spleen using RPMI-1640 medium (SIGMA) containing 10%.

FBS (фирма SIGMA), и затем подвергают гемолизу с использованием набора для лизирования эритроцитов мыши (фирма R&D) для получения клеток селезенки. Резецированные опухоли измельчают с помощью набора Tumor Dissociation Kt, mouse (фирма Miltenyi). Как клетки селезенки, так и раздробленные опухоли реагируют со следующими антителами, и фракции присутствующих иммунных клеток анализируют с помощью FACS-анализа: анти-CD45 антитело (фирма BD, клон: 30-F11), анти-CD3 антитело (фирма BD, клон: 145-2С11), анти-CD4 антитело (фирма BD, клон: RM4-5), анти-PDхР3 антитело (фирма eBioscience, клон: FJK-16s)), анти-ICOS антитело (фирма eBioscience, клон: 7E17G9), анти-KLRG1 антитело (фирма Biolegend, клон: 2F1/KLRG1). Анализ FACS выполняют с помощью проточного цитофлуориметра BD LSR Fortessa X-20 (фирма BD).FBS (SIGMA), and then hemolyzed using a mouse erythrocyte lysis kit (R&D) to obtain spleen cells. Resected tumors are crushed using a Tumor Dissociation Kt, mouse kit (Miltenyi). Both spleen cells and crushed tumors react with the following antibodies, and the fractions of immune cells present are analyzed by FACS analysis: anti-CD45 antibody (BD, clone: 30-F11), anti-CD3 antibody (BD, clone: 145-2C11), anti-CD4 antibody (BD, clone: RM4-5), anti-PDxP3 antibody (eBioscience, clone: FJK-16s)), anti-ICOS antibody (eBioscience, clone: 7E17G9), anti -KLRG1 antibody (Biolegend, clone: 2F1/KLRG1). FACS analysis is performed using a BD LSR Fortessa X-20 flow cytometer (BD).

Пример 3-7-7. Оценка опухоли Treg в модели трансплантированных клеток FM3A.Example 3-7-7. Evaluation of Treg tumor in the FM3A cell transplant model.

Оценивают изменения эффекторных клеток Treg (CD4+ FoxP3+ KLRG1') в опухоли после введения контрольного антитела против мышиного CTLA4 (mNS-mFa55) или переключающего антитела против CTLA4 (SW1208-mFa55). В результате как mNS-mFa55, так и SW1208-mFa55 снижают долю эффекторных клеток Treg до менее чем 0,2% CD45-позитивных клеток в дозах 1 мг/кг и более (фиг. 12). Пример 37-8. Оценка системных воздействий на селезенку в модели трансплантированных клеток FM3A.Changes in Treg effector cells (CD4+ FoxP3 + KLRG1') in the tumor after administration of a control anti-mouse CTLA4 antibody (mNS-mFa55) or a switch anti-CTLA4 antibody (SW1208-mFa55) were assessed. As a result, both mNS-mFa55 and SW1208-mFa55 reduced the proportion of effector Treg cells to less than 0.2% CD45-positive cells at doses of 1 mg/kg or more (Fig. 12). Example 37-8. Evaluation of systemic effects on the spleen in the FM3A cell transplant model.

Изменения активированных хелперных Т-клеток (CD4+ Foxp3- ICOS+) в селезенке после введения mNS-mFa55 или SW1208-mFa55 оценивают с помощью анализа FACS. В результате соотношение активированных хелперных Т-клеток к CD45-положительным клеткам в селезенке значительно увеличивается при введении mNS-mFa55, но не было значительного увеличения соотношения активированных хелперных Т-клеток к CD45-положuтельным клеткам в селезенке даже при увеличении дозы введения SW1208-mFa55 (фиг. 13). Было подтверждено, что хотя антитело-переключатель показывает такую же эффективность, как и контрольное антитело, оно не вызывает ответа в тканях, отличных от опухоли, и концепция проявления активности только локально в опухоли доказана in vivo в опытах на мышах.Changes in activated helper T cells (CD4 + Foxp3 - ICOS + ) in the spleen after administration of mNS-mFa55 or SW1208-mFa55 were assessed using FACS analysis. As a result, the ratio of activated helper T cells to CD45-positive cells in the spleen increased significantly with mNS-mFa55 administration, but there was no significant increase in the ratio of activated helper T cells to CD45-positive cells in the spleen even with increasing doses of SW1208-mFa55 ( Fig. 13). It was confirmed that although the switch antibody showed the same potency as the control antibody, it did not induce a response in tissues other than the tumor, and the concept of activity only locally in the tumor was proven in vivo in mice.

Пример 4. Получение измененных антител CTLA4 и оценка их активности.Example 4. Production of modified CTLA4 antibodies and evaluation of their activity.

Проводят дальнейшее изменение и оценку анти-CTLA4 переключающих антител, полученных в примере 3.The anti-CTLA4 switching antibodies obtained in Example 3 were further modified and evaluated.

Пример 4-1. Усиление способности связывания с CTLA4 путем изменения усиления связывания с АТФ.Example 4-1. Enhancing CTLA4 binding ability by altering ATP binding enhancement.

По результатам структурного анализа, выполненного в примере 2-1, показано, что CDR2 тяжелой цепи антитела взаимодействует с фосфатной группой АМФ. Полагают, что когда маленькой молекулой является АТФ, γ-фосфатная группа может вызывать стерические затруднения для CDR2 тяжелой цепи. Затем аминокислоты в этой области заменяют для изучения повышения способности связывания с АТФ.Based on the results of the structural analysis performed in Example 2-1, it was shown that CDR2 of the antibody heavy chain interacts with the phosphate group of AMP. It is believed that when the small molecule is ATP, the γ-phosphate group may cause steric hindrance to the heavy chain CDR2. The amino acids in this region are then replaced to study the increase in ATP binding capacity.

- 72 045931- 72 045931

В частности, 04H1389-G1m/04L1086-lam1 и 04H1382-G1m/04L1086-lam1 были получены путем введения изменений R53Q и G55H в вариабельные области тяжелой цепи 04Н1207- G1m/04L1086-lam1 и 04H1208G1m/04L1086-lam1, полученные в примере 3. Кроме того, 04H1389-G1m/04L1305-k0MT получен путем замены легкой цепи 04Н1389- G1m/04L1086-lam1 последовательностью κ-цепи человека. В табл. 14 перечислены SEQ ID NO вариабельных областей тяжелой цепи, вариабельных областей легкой цепи, константных областей тяжелой цепи, константных областей легкой цепи и гипервариабельных областей этих антител.Specifically, 04H1389-G1m/04L1086-lam1 and 04H1382-G1m/04L1086-lam1 were obtained by introducing R53Q and G55H changes into the heavy chain variable regions of 04H1207-G1m/04L1086-lam1 and 04H1208G1m/04L1086-lam1 obtained in Example 3. In addition, 04H1389-G1m/04L1305-k0MT was obtained by replacing the light chain of 04H1389-G1m/04L1086-lam1 with the human κ chain sequence. In table 14 lists the SEQ ID NOs of the heavy chain variable regions, light chain variable regions, heavy chain constant regions, light chain constant regions and hypervariable regions of these antibodies.

Таблица 14Table 14

Аминокислотные последовательности тяжелых цепей, легких цепей и их гипервариабельных областей (обозначены SEQ ID NO:)Amino acid sequences of heavy chains, light chains and their hypervariable regions (designated SEQ ID NO:)

Антитело Antibody Вариабельная область Variable region Константная область Constant region Гипервариабельная область (HVR) (М) Hypervariable region (HVR) (M) Тяжелая цепь Heavy chain Легкая цепь Light chain Тяжелая цепь Heavy chain Легкая цепь Light chain Н1 H1 Н2 H2 НЗ NZ L1 L1 L2 L2 L3 L3 04H1389-G1m/04L1086-lam1 04H1389-G1m/04L1086-lam1 136 136 97 97 82 82 87 87 107 107 110 110 102 102 122 122 117 117 133 133 04Н1382-G1 m/04L1086-I am 1 04Н1382-G1 m/04L1086-I am 1 135 135 97 97 82 82 87 87 107 107 109 109 102 102 122 122 117 117 133 133 04 Η1389-G1 m/04L13O5-kOMT 04 Η1389-G1 m/04L13O5-kOMT 136 136 95 95 82 82 96 96 107 107 110 110 102 102 122 122 117 117 133 133

Biacore T200 используют для оценки связывания полученных вариантов с АТФ и с CTLA4 человека. Анализ связывания с АТФ проводят при 37°С с использованием 20 мМ ACES (pH 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2, 0,05% Tween20 в качестве подвижного буфера. Во-первых, Sure Protein А (фирма GE Healthcare) иммобилизуют на сенсорном чипе СМЗ серии S (фирма GE Healthcare), и антитела захватываются чипом путем взаимодействия с раствором антител, приготовленным в подвижном буфере. Далее способность связывания с антителом оценивают путем взаимодействия с раствором АТФ, приготовленным в подвижном буфере. Чипы регенерируют с помощью 25 мМ NaOH и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) и проводят анализ путем повторного захвата антител. Для связывания количества каждого антитела с АТФ рассчитывают связываемое количество АТФ на единицу количества антитела путем корректировки количества связывания, когда АТФ вводят в концентрации 100 нМ с количеством антитела, захваченного на поверхности чипа. Связывание с CTLA4 человека измеряют с использованием Biacore T200 по методу, описанному в примере 3-3. В табл. 15 показаны результаты этих измерений.Biacore T200 is used to assess the binding of the resulting variants to ATP and to human CTLA4. The ATP binding assay was performed at 37°C using 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 , 0.05% Tween20 as running buffer. First, Sure Protein A (GE Healthcare) is immobilized on a SMZ S Series sensor chip (GE Healthcare), and the antibodies are captured on the chip by reacting with an antibody solution prepared in running buffer. Next, the ability to bind to the antibody is assessed by interaction with an ATP solution prepared in a running buffer. The chips were regenerated with 25 mM NaOH and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) and assayed by antibody recapture. To bind the amount of each antibody to ATP, the amount of ATP bound per unit amount of antibody is calculated by adjusting the amount of binding when ATP is injected at a concentration of 100 nM with the amount of antibody captured on the chip surface. Binding to human CTLA4 was measured using Biacore T200 according to the method described in Example 3-3. In table Figure 15 shows the results of these measurements.

Таблица 15 Анализ связывания с АТФ и CTLA4 человекаTable 15 Human ATP and CTLA4 binding assay

Антитело Antibody Связывание с АТФ ATP binding Связывание c CTLA4 человека Binding to human CTLA4 Kd для CTL А4 человека (М) Kd for human CTL A4 (M) Без АТФ Without ATP АТФ 1 мкМ ATP 1 µM АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM Без АТФ Without ATP АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM 04H1207-G1m/04L10864am 1 04H1207-G1m/04L10864am 1 0.00013 0.00013 0.010 0.010 0.037 0.037 0.111 0.111 0.166 0.166 N.A. N.A. 4.0Е-07 4.0E-07 7.6Е-08 7.6E-08 04H1208-G1m/04L1086-lam1 04H1208-G1m/04L1086-lam1 0.00018 0.00018 0.003 0.003 0.022 0.022 0.084 0.084 0.139 0.139 N.A. N.A. 5.1Е-07 5.1E-07 9.1Е-08 9.1E-08 04H1389-G1m/04L1086-lam1 04H1389-G1m/04L1086-lam1 0.00243 0.00243 0.022 0.022 0.138 0.138 0.189 0.189 0.193 0.193 *5.1Е-06 *5.1E-06 4.3Е-08 4.3E-08 2.1Е-О8 2.1E-O8 04H1382 G1m/04L1086lam1 04H1382 G1m/04L1086lam1 0.00204 0.00204 0.008 0.008 0.090 0.090 0,152 0.152 0.159 0.159 N.A. N.A. 4.6Е-08 4.6E-08 1.4Е-08 1.4E-08 04H1389-G1 m/04L1305-kOMT 04H1389-G1 m/04L1305-kOMT 0.00190 0.00190 0.030 0.030 0.120 0.120 0.154 0.154 0.151 0.151 *3.2Е-06 *3.2E-06 1.9Е-08 1.9E-08 5.4Е-09 5.4E-09

N.A. - чрезвычайно малая величина для определения KD.NA is an extremely small value for determining KD .

*Величину KD определяют по стационарной модели.*The value of K D is determined using a stationary model.

Антитела 04H1389-G1m/04L1086-lam1 и 04H1382-G1m/04L1086-lam1 обладают повышенной связывающей способностью с АТФ по сравнению с родительскими антителами 04H1207-G1m/04L1086-lam1 и 04H1208-G1m/04L1086-lam1, для которых не интродуцировали R53Q/G55H. Связывающая способность 04H1389-G1m/04L1086-lam1 и 04H1382-G1m/04L1086-lam1 с CTLA4 человека повышается примерно в 10 раз в присутствии 10 мкМ АТФ по сравнению с исходными антителами 04Н1207- G1m/04L1086-lam1 и 04Н1208- G1m/04L1086-lam1, для которых R53Q/G55H не был интродуцирован. Сравнение связываемого количества показывает, что способность связываться с CTLA4 человека при более низких концентрациях АТФ повышалась. Также было показано, что 04H1389-G1m/04L1305-k0MT, в котором легкая цепь 04H1389-G1m/04L1086-lam1 заменена последовательностью κ-цепи человека, обладает эквивалентной АТФ-связывающей способностью и АТФ-зависимой способностью связывать CTLA4 человека как и 04H13 89-G1 m/04L 1086-lam1.Antibodies 04H1389-G1m/04L1086-lam1 and 04H1382-G1m/04L1086-lam1 have increased binding ability to ATP compared to parental antibodies 04H1207-G1m/04L1086-lam1 and 04H1208-G1m/04L1086-lam1, for which R was not introduced 53Q/G55H . The binding ability of 04H1389-G1m/04L1086-lam1 and 04H1382-G1m/04L1086-lam1 to human CTLA4 increases approximately 10-fold in the presence of 10 μM ATP compared to the parent antibodies 04H1207-G1m/ 04L1086 -lam1 and 04H1208-G1m/04 L1086-lam1 , for which R53Q/G55H has not been introduced. Comparison of the amount bound shows that the ability to bind to human CTLA4 was increased at lower ATP concentrations. It has also been shown that 04H1389-G1m/04L1305-k0MT, in which the 04H1389-G1m/04L1086-lam1 light chain is replaced by a human κ chain sequence, has equivalent ATP-binding capacity and ATP-dependent ability to bind human CTLA4 as 04H13 89- G1 m/04L 1086-lam1.

Пример 4-2. Получение контрольного антитела против CTLA4 человека и анти-CTLA4 переключающего антитела, а также оценка их связывающей способности.Example 4-2. Preparation of control anti-human CTLA4 antibody and anti-CTLA4 switch antibody and evaluation of their binding capacity.

Были созданы контрольное антитело против CTLA4 человека (MDX10D1H-mFa55/MDX10D1Lmk1, аббревиатура: hNS-mFa55) и антитело-переключатель против CTLA4 (04H1389-mFa55/04L1305mk1, аббревиатура: SW1389-mFa55). В антителе hNS-mFa55 используют вариабельную область тяжелой цепи MDX10D1H (SEQ ID NO: 26) и вариабельную область легкой цепи MDX10D1L (SEQ ID NO: 27), а в качестве константных областей используют константную область тяжелой цепи мыши mFa55 (SEQ IDA control antibody against human CTLA4 (MDX10D1H-mFa55/MDX10D1Lmk1, abbreviation: hNS-mFa55) and a switch antibody against CTLA4 (04H1389-mFa55/04L1305mk1, abbreviation: SW1389-mFa55) were generated. The hNS-mFa55 antibody uses the MDX10D1H heavy chain variable region (SEQ ID NO: 26) and the MDX10D1L light chain variable region (SEQ ID NO: 27), and the mFa55 mouse heavy chain constant region (SEQ ID

- 73 045931- 73 045931

NO: 18) и константную область mk1 легкой цепи мыши дикого типа (SEQ ID NO: 19). Также используют константную область тяжелой цепи мыши, к которой добавлены изменения для усиления связывания с рецептором Fcy. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.NO: 18) and wild-type mouse light chain mk1 constant region (SEQ ID NO: 19). A mouse heavy chain constant region is also used, to which modifications have been added to enhance binding to the Fcy receptor. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе SW1389-mFa55 используют вариабельную область тяжелой цепи 04Н1389 (SEQ ID NO: 29) и вариабельную область легкой цепи 04L1305 (SEQ ID NO: 30), а в качестве константных областей используют константную область тяжелой цепи мыши mFa55 (SEQ ID NO: 18) и константную область mkl легкой цепи мыши дикого типа (SEQ ID NO: 19). Также используют константную область тяжелой цепи мыши, к которой добавлены изменения для усиления связывания с рецептором Fcy. Антитело экспрессировали и очищали способом, известным специалистам в данной области.The SW1389-mFa55 antibody uses the heavy chain variable region 04H1389 (SEQ ID NO: 29) and the light chain variable region 04L1305 (SEQ ID NO: 30), and the mouse heavy chain constant region mFa55 (SEQ ID NO: 18) is used as the constant regions ) and wild-type mouse light chain mkl constant region (SEQ ID NO: 19). A mouse heavy chain constant region is also used, to which modifications have been added to enhance binding to the Fcy receptor. The antibody was expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Оценивали связывание разработанных hNS-mFa55 и SW1389-mFa55 с CTLA4 человека. В качестве подвижного буфера используют 20 мМ ACES (pH 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2, 0,05% Tween 20 с добавлением АТФ до требуемых концентраций, анализ проводят при 37°С. Сначала кроличьи антимышиные IgG (фирма Thermo Fisher Scientific) иммобилизуют на сенсорных чипах серии S CM5 (фирма GE Healthcare), и антитело захватывается чипом путем взаимодействия с раствором антител’ приготовленным в подвижном буфере, не содержащим АТФ. Затем связывающую способность антитела к CTLA4 человека в присутствии или в отсутствие АТФ оценивают путем взаимодействия с раствором CTLA4 человека, приготовленным в подвижном буфере с добавлением АТФ до нужной концентрации, или раствором CTLA4 человека, приготовленным в подвижном буфере, не содержащим АТФ. Чипы регенерируют с помощью 25 мМ NaOH и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) и проводят анализ путем повторного захвата антител. Константу диссоциации каждого антитела к CTLA4 рассчитывают с использованием программного обеспечения Biacore T200 Evaluation Software 2.0. В частности, константу скорости связывания ka (л/моль/с) и константу скорости диссоциации kd (1/с) рассчитывают путем глобальной подгонки сенсорограмм, полученных при измерении с использованием модели связывания Ленгмюра 1:1, а константу диссоциации KD (моль/л) рассчитывают по этим значениям. В табл. 16 показаны результаты этих анализов.The binding of the designed hNS-mFa55 and SW1389-mFa55 to human CTLA4 was assessed. The running buffer is 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 , 0.05% Tween 20 with the addition of ATP to the required concentrations, the analysis is carried out at 37°C. First, rabbit anti-mouse IgG (Thermo Fisher Scientific) is immobilized on S-Series CM5 sensor chips (GE Healthcare), and the antibody is captured on the chip by reacting with an antibody solution prepared in an ATP-free running buffer. The binding ability of the anti-human CTLA4 antibody in the presence or absence of ATP is then assessed by reacting with a solution of human CTLA4 prepared in running buffer with ATP added to the desired concentration, or a solution of human CTLA4 prepared in running buffer without ATP. The chips were regenerated with 25 mM NaOH and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) and assayed by antibody recapture. The dissociation constant of each anti-CTLA4 antibody was calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0. Specifically, the binding rate constant ka (l/mol/s) and the dissociation rate constant kd (1/s) are calculated by globally fitting the sensorograms obtained from measurements using the 1:1 Langmuir binding model, and the dissociation constant KD (mol/l ) are calculated from these values. In table Figure 16 shows the results of these analyses.

Таблица 16Table 16

Анализ связывания вариантов с константными областями мыши с CTLA4 человекаAnalysis of binding of mouse constant region variants to human CTLA4

Антитело Antibody KD для CTLA4 человека (М) K D for human CTLA4 (M) АТФ 1 мкМ ATP 1 µM АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM MDX10DlH-mFa55/MDxl0DlL-mkl MDX10DlH-mFa55/MDxl0DlL-mkl 3,2Е-08 3.2E-08 3,8Е-08 3.8E-08 3,6Е-08 3.6E-08 04H1389-mFa55/04L1305-mkl 04H1389-mFa55/04L1305-mkl 5ДЕ-08 5DE-08 1,8Е-08 1.8E-08 8,9Е-09 8.9E-09

Было подтверждено, что оба антитела, полученные с использованием константных областей мыши, связываются с CTLA4 человека. Также было показано, что SW1389-mFa55 связывается с CTLA4 человека АТФ-зависимым образом, аналогично 04H1389-G1m/04L1305-k0MT, полученному с использованием той же вариабельной области и константной области человека, показанных в табл. 15.Both antibodies generated using mouse constant regions were confirmed to bind to human CTLA4. SW1389-mFa55 was also shown to bind to human CTLA4 in an ATP-dependent manner, similar to 04H1389-G1m/04L1305-k0MT prepared using the same human variable region and constant region shown in Table. 15.

Пример 4-3. Эффективность каждого анти-CTLA4 переключающего антитела и анти-CTLA4 непереключающего антитела в сингенной модели с трансплантацией опухолевых клеток с использованием нокаута CTLA4 человека, трансгенной мыши CD3 человека, увеличения/уменьшения клеток Treg в опухоли и изменения в маркере системного ответа в селезенке.Example 4-3. Efficacy of each anti-CTLA4 switch antibody and anti-CTLA4 nonswitch antibody in a syngeneic tumor cell transplantation model using a human CTLA4 knockout, human CD3 transgenic mouse, increase/decrease of Treg cells in the tumor, and changes in a marker of systemic response in the spleen.

Пример 4-3-1. Клеточная линия.Example 4-3-1. Cell line.

Используют клетки Hepa1-6/hGPC3. Эту клеточную линию получают путем приобретения линии клеток рака печени мыши Hepa1-6 в коллекции АТСС, которые конститутивно экспрессируют ген Glypican 3 человека (hGPC3, SEQ ID NO: 181) путем трансфекции и осуществления клонирования. Клетки Hepa1-6/hGPC3 поддерживают и пассируют в среде D-MEM (с высоким содержанием глюкозы) (фирма SIGMA), содержащей 10% FBS (фирма SIGMA) и 600 мкг/мл GENETICIN (фирма Gibco).Hepa1-6/hGPC3 cells were used. This cell line is obtained by purchasing the Hepa1-6 mouse liver cancer cell line from the ATCC collection, which constitutively expresses the human Glypican 3 gene (hGPC3, SEQ ID NO: 181) by transfection and cloning. Hepa1-6/hGPC3 cells are maintained and passaged in D-MEM (high glucose) medium (SIGMA) containing 10% FBS (SIGMA) and 600 μg/ml GENETICIN (Gibco).

Пример 4-3-2. Подготовка модели мыши с трансплантированной сингенной опухолевой линией.Example 4-3-2. Preparation of a mouse model with a transplanted syngeneic tumor line.

Применяют CTLA4 KI человека, CD3 человека EDG-замещенную мышь (hCTLA4 KI hCD3 EDGзамещенная мышь), которая является гибридом мыши с нокаутом CTLA4 человека (Blood, 2005, 106(9): 3127-3133), и мыши, полученной авторами настоящего изобретения, с заменой CD3 EDG человека (Sci Rep, 2017, 7: 45839). Клетки Hepa1-6/hGPC3 трансплантируют подкожно мышам с заменой hCTLA4 KI hCD3 EDG, и было определено, что модель приживается, когда средний объем трансплантированных опухолей достигает приблизительно от 200 мм3 до приблизительно 400 мм3.A human CTLA4 KI, a human CD3 EDG-replaced mouse (hCTLA4 KI hCD3 EDG-replaced mouse), which is a hybrid of a human CTLA4 knockout mouse (Blood, 2005, 106(9): 3127-3133), and a mouse obtained by the authors of the present invention, are used. with human CD3 EDG replacement (Sci Rep 2017, 7: 45839). Hepa1-6/hGPC3 cells were transplanted subcutaneously into hCTLA4 KI hCD3 EDG replacement mice, and the model was determined to engraft when the average volume of transplanted tumors reached approximately 200 mm 3 to approximately 400 mm 3 .

Объем трансплантированной опухоли рассчитывают по формуле:The volume of the transplanted tumor is calculated using the formula:

Объем опухоли=больший диаметрхменьший диаметрхменьший диаметр/2.Tumor volume=larger diameterxsmaller diameterxsmaller diameter/2.

Пример 4-3-3. Получение лекарственных средств для введения.Example 4-3-3. Obtaining medications for administration.

В качестве лекарственных средств для введения модели с трансплантированными клетками Hepa16/hGPC3 получают анти-CTLA4 переключающее антитело (SW1389-mFa55) и контрольное антитело против CTLA4 человека (hNS-mFa55), полученные в примере 4-2, в концентрациях 0,01, 0,1, 1, 5, 10 и 20 мг/мл и 0,01, 0,1, 1 и 3 мг/мл, соответственно, с использованием His-буфера (150 мМ NaCl/20 мМ HisHCl-буфера, рН 6.0).Anti-CTLA4 switching antibody (SW1389-mFa55) and control anti-human CTLA4 antibody (hNS-mFa55) obtained in Example 4-2 were prepared as drugs for administration to the Hepa16/hGPC3 cell transplantation model at concentrations of 0.01, 0 ,1, 1, 5, 10 and 20 mg/ml and 0.01, 0.1, 1 and 3 mg/ml, respectively, using His buffer (150 mM NaCl/20 mM HisHCl buffer, pH 6.0) .

- 74 045931- 74 045931

Пример 4-3-4. Введение лекарственного средства для измерения противоопухолевого эффекта.Example 4-3-4. Administration of a drug to measure the antitumor effect.

На 7-й день после трансплантации мышам вводят SW1389-mFa55 в дозах 0,1, 1, 10 и 100 мг/кг, и hNS-mFa55 вводят в дозах 0,1 мг/кг, 1 мг /кг, 10 мг/кг и 30 мг/кг через хвостовую вену. В табл. 17 показаны подробности лечения лекарственным средством при измерении противоопухолевого эффекта.On day 7 after transplantation, mice were administered SW1389-mFa55 at doses of 0.1, 1, 10, and 100 mg/kg, and hNS-mFa55 was administered at doses of 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, 10 mg/kg and 30 mg/kg via the tail vein. In table 17 shows details of drug treatment when measuring the antitumor effect.

Таблица17Table17

Измерение противоопухолевого эффекта в модели трансплантированных клеток Hepa1-6/hGPC3Measuring the antitumor effect in the Hepa1-6/hGPC3 cell transplant model

Группа Group Животных Animals Лекарство Medicine Доза Dose Введение Introduction Дата введения Date of introduction 1 1 4 4 His-буфер His buffer - - В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 2 2 4 4 hNS-mFa55 hNS-mFa55 0,1 мг/кг 0.1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 3 3 4 4 hNS-mFa55 hNS-mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 4 4 4 4 hNS-mFa55 hNS-mFa55 10 мг/кг 10 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 5 5 4 4 hNS-mFa55 hNS-mFa55 30 мг/кг 30 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 6 6 4 4 SW1389mFa55 SW1389mFa55 ОД мг/кг OD mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 7 7 4 4 SW1389mFa55 SW1389mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 8 8 4 4 SW1389mFa55 SW1389mFa55 10 мг/кг 10 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 9 9 4 4 SW1389mFa55 SW1389mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation

Пример 4-3-5. Оценка противоопухолевого эффекта.Example 4-3-5. Evaluation of antitumor effect.

Противоопухолевый эффект оценивают по объему опухоли, рассчитанному по формуле, описанной в примере 4-3-2. JMP 11.2.1 (фирма SAS Institute Inc.) используют для статистического анализа.The antitumor effect is assessed by tumor volume, calculated using the formula described in example 4-3-2. JMP 11.2.1 (SAS Institute Inc.) was used for statistical analysis.

Ингибирование роста опухоли (TGI - tumor growth inhibition) рассчитывают по формуле:Tumor growth inhibition (TGI - tumor growth inhibition) is calculated using the formula:

TGI (%) = (1 - (Средний объем опухоли в исследуемой группе на момент измерения - Средний объем опухоли в исследуемой группе перед введением антитела) / (Средний объем опухоли в контрольной группе на момент измерения - средний объем опухоли в контрольной группе перед введением антитела)) х 100TGI (%) = (1 - (Average tumor volume in the study group at the time of measurement - Average tumor volume in the study group before antibody administration) / (Average tumor volume in the control group at the time of measurement - average tumor volume in the control group before antibody administration )) x 100

В результате как hNS-mFa55, так и SW1389-mFa55 показали эффективность препарата TGI=60% и более на 18-й день после введения в дозах 1 мг/кг или более (фиг. 14 и 15).As a result, both hNS-mFa55 and SW1389-mFa55 showed drug efficacy TGI=60% or more on day 18 post-administration at doses of 1 mg/kg or more (FIGS. 14 and 15).

Пример 4-3-6. Введение лекарственного средства для оценки клеток Treg в опухоли и подтверждения системных эффектов в селезенке.Example 4-3-6. Drug administration to evaluate Treg cells in the tumor and confirm systemic effects in the spleen.

На 7-й день после трансплантации SW1389-mFa55 вводят мышам в дозах 0,1 мг/кг, 1 мг/кг, 10 мг/кг, 100 мг/кг и 500 мг/кг через хвостовую вену, a hNS-mFa55 вводят в дозах 0,1 мг/кг, 1 мг/кг, 10 мг/кг и 30 мг/кг через хвостовую вену. В табл. 18 показаны подробности применения лекарственных средств для оценки клеток Treg в опухоли и подтверждения системных эффектов в селезенке.On the 7th day after transplantation, SW1389-mFa55 was administered to mice at doses of 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, 10 mg/kg, 100 mg/kg and 500 mg/kg via the tail vein, and hNS-mFa55 was administered i.d. doses of 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, 10 mg/kg and 30 mg/kg via the tail vein. In table Figure 18 shows details of drug use to evaluate Treg cells in the tumor and confirm systemic effects in the spleen.

- 75 045931- 75 045931

Таблица 18Table 18

Проверка внутриопухолевых и системных эффектов в модели трансплантированных клеток Hepal______________________6/hGPC3 (hNS-mFa55 и SW1389-mFa55)_____________________Validation of intratumoral and systemic effects in the Hepal______________________6/hGPC3 (hNS-mFa55 and SW1389-mFa55) transplanted cell model_____________________

Группа Group Животных Animals Лекарство Medicine Доза Dose Введение Introduction Дата введения Date of introduction 1 1 3 3 His-буфер His buffer - - В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 2 2 3 3 hNS-mFa55 hNS-mFa55 0,1 мг/кг 0.1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 3 3 3 3 hNS-mFa55 hNS-mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 4 4 3 3 hNS-mFa55 hNS-mFa55 10 мг/кг 10 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 5 5 3 3 hNS-mFa55 hNS-mFa55 30 мг/кг 30 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 6 6 3 3 SW1389mFa55 SW1389mFa55 ОД мг/кг OD mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 7 7 3 3 SW1389mFa55 SW1389mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 8 8 3 3 SW1389mFa55 SW1389mFa55 10 мг/кг 10 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 9 9 3 3 SW1389mFa55 SW1389mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation 10 10 3 3 SW1389mFa55 SW1389mFa55 500 мг/кг 500 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 7й день после трансплантации 7th day after transplantation

Пример 4-3-7. Резекция опухоли и селезенки у модельных мышей с трансплантированными клетками Hepa1-6/hGPC3.Example 4-3-7. Tumor and spleen resection in Hepa1-6/hGPC3 cell-transplanted mouse models.

На 6-й день после введения антител мышей подвергают эвтаназии под наркозом, и проводят резекцию опухоли и селезенки. Из полученных селезенок готовят клеточную суспензию с использованием среды RPMI-1640 (фирма SIGMA), содержащей 10% FBS (фирма SIGMA), и затем подвергают гемолизу с использованием набора для лизирования эритроцитов мыши (фирма R&D) для получения клеток селезенки. Полученные опухоли измельчают с помощью набора Tumor Dissociation Kt, mouse (фирма Miltenyi). Как клетки селезенки, так и раздробленные опухоли реагируют со следующими антителами, и фракции присутствующих иммунных клеток анализируют с помощью FACS-анализа: анти-CD45 антитело (фирма BD, клон: 30-F11), анти-CD3 антитело (фирма BD, клон: UCHT1), анти-CD4 антитело (фирма BD, клон: RM4-5), анти-PDxР3 антитело (фирма eBioscience, клон: FJK-16s), анти-ICOS антитело (фирма eBioscience, клон: 7E17G9), анти- CCR7 антитело (фирма Biolegend, клон: 4В12). Анализ FACS выполняют с помощью проточного цитофлуориметра BD LSR Fortessa X-20 (фирма BD).On day 6 after antibody administration, mice were euthanized under anesthesia, and the tumor and spleen were resected. From the obtained spleens, a cell suspension is prepared using RPMI-1640 medium (SIGMA) containing 10% FBS (SIGMA), and then hemolyzed using a mouse erythrocyte lysis kit (R&D) to obtain spleen cells. The resulting tumors are crushed using the Tumor Dissociation Kt, mouse kit (Miltenyi). Both spleen cells and crushed tumors react with the following antibodies, and the fractions of immune cells present are analyzed by FACS analysis: anti-CD45 antibody (BD, clone: 30-F11), anti-CD3 antibody (BD, clone: UCHT1), anti-CD4 antibody (BD, clone: RM4-5), anti-PDxP3 antibody (eBioscience, clone: FJK-16s), anti-ICOS antibody (eBioscience, clone: 7E17G9), anti-CCR7 antibody (Biolegend, clone: 4B12). FACS analysis is performed using a BD LSR Fortessa X-20 flow cytometer (BD).

Пример 4-3-8. Оценка опухоли Treg в модели трансплантированных клеток Hepa1-6/hGPC3.Example 4-3-8. Evaluation of tumor Treg in a Hepa1-6/hGPC3 cell transplant model.

Оценивают изменения эффекторных клеток Treg (CD4+ FoxP3+ CCR7low KLRG1') в опухоли после введения SW1389-mFa55 или hNS-mFa55. В результате как hNS-mFa55, так и SW1389-mFa55 снижают долю эффекторных клеток Treg до менее чем 0,2% CD45-позитивных клеток в дозах 1 мг/кг и более (фиг. 16).Changes in Treg effector cells (CD4+ FoxP3 + CCR7 low KLRG1') in the tumor after administration of SW1389-mFa55 or hNS-mFa55 were assessed. As a result, both hNS-mFa55 and SW1389-mFa55 reduced the proportion of effector Treg cells to less than 0.2% CD45-positive cells at doses of 1 mg/kg or more (Fig. 16).

Пример 4-3-9. Оценка системного эффекта в селезенке в модели трансплантированных клеток Hepa1-6/hGPC3.Example 4-3-9. Evaluation of the systemic effect in the spleen in the Hepa1-6/hGPC3 cell transplantation model.

Изменения активированных хелперных Т-клеток (CD4 Foxp3- ICOS+) в селезенке после введения hNS-mFa55 или SW1389-mFa55 оценивают методом FACS. В результате соотношение активированных хелперных Т-клеток к CD45-положительным клеткам в селезенке значительно увеличивается при введении hNS-mFa55, но не наблюдалось значительного увеличения активированных хелперных Т-клеток в селезенке при введении SW1389-mFa55, даже при увеличении дозы введения (фиг. 17). Это подтверждает, что переключающее антитело проявляет такую же эффективность, как и контрольное антитело, но не вызывает ответа в тканях, отличных от опухолевых. Таким образом, концепция проявления активности только локально в опухоли доказана in vivo на мышах с CTLA4 KI человека.Changes in activated helper T cells (CD4 Foxp3 - ICOS + ) in the spleen after administration of hNS-mFa55 or SW1389-mFa55 were assessed by FACS. As a result, the ratio of activated helper T cells to CD45 positive cells in the spleen increased significantly with hNS-mFa55 administration, but no significant increase in activated helper T cells in the spleen was observed with SW1389-mFa55 administration, even with increasing administration dose (Fig. 17 ). This confirms that the switching antibody is as effective as the control antibody but does not induce a response in non-tumor tissues. Thus, the concept of exerting activity only locally in the tumor was proven in vivo in mice with human CTLA4 KI.

Пример 4-4. Получение контрольного анти-CTLA4 антитела и переключающего анти-CTLA4 антитела для теста на токсичность у яванских макак.Example 4-4. Preparation of control anti-CTLA4 antibody and switch anti-CTLA4 antibody for toxicity testing in cynomolgus monkeys.

Получают контрольное анти-CTLA4 антитело (MDX10D1H-Kn125/MDX10D1Lk0MT//MDX10D1H-H1076/MDX10D1L-k0MT, аббревиатура: NS-ART1) и переключающее анти-CTLA4 антитело (04H1389-Kn125/04L1305-k0MT//04H1389-H1076)/04L1305-k0MT, аббревиатура: SW1389ART1). В антителе NS-ART1 используют вариабельную область тяжелой цепи MDX10D1H (SEQ ID NO: 26) и вариабельную область легкой цепи MDX10D1L (SEQ ID NO: 27), а в качестве константных областей используют константную область тяжелой цепи человека Kn125 (SEQ ID NO: 31) и константную область тяжелой цепи человека H1076 (SEQ ID NO: 32), описанную в предшествующей патентной литера- 76 045931 туре WO 2013/002362, и константную область легкой цепи человека k0MT (SEQ ID NO: 33). Также используют константную область тяжелой цепи человека, к которой добавлены изменения для усиления связывания с рецептором Fcy. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.Prepare control anti-CTLA4 antibody (MDX10D1H-Kn125/MDX10D1Lk0MT//MDX10D1H-H1076/MDX10D1L-k0MT, abbreviation: NS-ART1) and switch anti-CTLA4 antibody (04H1389-Kn125/04L1305-k0MT//04H1389- H1076)/04L1305 -k0MT, abbreviation: SW1389ART1). The NS-ART1 antibody uses the heavy chain variable region MDX10D1H (SEQ ID NO: 26) and the light chain variable region MDX10D1L (SEQ ID NO: 27), and the human heavy chain constant region Kn125 (SEQ ID NO: 31) is used as the constant regions ) and the human heavy chain constant region H1076 (SEQ ID NO: 32), described in the prior patent literature WO 2013/002362, and the human light chain constant region k0MT (SEQ ID NO: 33). A human heavy chain constant region is also used, to which modifications have been added to enhance binding to the Fcy receptor. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе SW1389-ART1 используют вариабельную область тяжелой цепи 04Н1389 (SEQ ID NO: 29) и вариабельную область легкой цепи 04L1305 (SEQ ID NO: 30), а в качестве константных областей используют константную область тяжелой цепи человека Kn125 (SEQ ID NO: 31), константную область тяжелой цепи человека Н1076 (SEQ ID NO: 32) и константную область легкой цепи человека k0MT (SEQ ID NO: 33). Также используют константную область тяжелой цепи человека, к которой добавлены изменения для усиления связывания с рецептором Fcy. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.The SW1389-ART1 antibody uses the heavy chain variable region 04H1389 (SEQ ID NO: 29) and the light chain variable region 04L1305 (SEQ ID NO: 30), and the human heavy chain constant region Kn125 (SEQ ID NO: 31) is used as the constant regions ), human heavy chain constant region H1076 (SEQ ID NO: 32) and human light chain constant region k0MT (SEQ ID NO: 33). A human heavy chain constant region is also used, to which modifications have been added to enhance binding to the Fcy receptor. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Гетеродимеризованные антитела (антитела, содержащие два разных полипептида тяжелой цепи и/или два разных полипептида легкой цепи) в настоящем изобретении обозначают последующему правилу: (первая вариабельная область тяжелой цепи)-(первая константная область тяжелой цепи)/(первая вариабельная область легкой цепи)-(первая константная область легкой цепи)//(вторая вариабельная область тяжелой цепи)-(вторая константная область тяжелой цепи)/(вторая вариабельная область легкой цепи)-(вторая константная область легкой цепи). Например, если название антитела 04H1389Kn125/04L1305-k0MT//04H1389-H1076/04L1305-k0MT, это означает, что в этом антителе первая вариабельная область тяжелой цепи - 04Н1389, первая константная область тяжелой цепи - Kn125, первая вариабельная область легкой цепи представляет собой 04L1305, первая константная область легкой цепи представляет собой k0MT, вторая вариабельная область тяжелой цепи представляет собой 04Н1389, вторая константная область тяжелой цепи представляет собой H1076, вторая вариабельная область легкой цепи представляет собой 04L1305, а вторая константная область легкой цепи представляет собой область k0MT.Heterodimerized antibodies (antibodies containing two different heavy chain polypeptides and/or two different light chain polypeptides) in the present invention are denoted by the following rule: (first heavy chain variable region)-(first heavy chain constant region)/(first light chain variable region) -(first light chain constant region)//(second heavy chain variable region)-(second heavy chain constant region)/(second light chain variable region)-(second light chain constant region). For example, if the name of an antibody is 04H1389Kn125/04L1305-k0MT//04H1389-H1076/04L1305-k0MT, this means that in this antibody the first variable region of the heavy chain is 04H1389, the first constant region of the heavy chain is Kn125, the first variable region of the light chain is 04L1305, the first light chain constant region is k0MT, the second heavy chain variable region is 04H1389, the second heavy chain constant region is H1076, the second light chain variable region is 04L1305, and the second light chain constant region is k0MT.

Пример 4-5. Проведение теста на токсичность у яванского макака.Example 4-5. Conducting a toxicity test in a cynomolgus monkey.

Для оценки и сравнения токсичности, включая системный ответ, антитело NS-ART1 или антитело SW1389-ART1, приготовленные в примере 4-4, вводят самцам яванских макаков (по 3 особи) в дозе 60 мг/кг один раз в неделю в общей сложности 5 раз. Введение осуществляют медленно внутривенно с помощью шприцевого насоса, и проводят наблюдение за общим состоянием, измеряют массу тела, проводят биохимический анализ крови/крови, исследуют костный мозг, проводят патологическое исследование и измеряют концентрации лекарственного средства в плазме.To evaluate and compare toxicity, including systemic response, NS-ART1 antibody or SW1389-ART1 antibody prepared in Example 4-4 was administered to male cynomolgus monkeys (3 each) at a dose of 60 mg/kg once a week for a total of 5 once. Administration is carried out slowly intravenously using a syringe pump, and general condition is monitored, body weight is measured, blood/blood chemistry is performed, bone marrow is examined, pathological examination is performed, and plasma drug concentrations are measured.

Появление антител к лекарственному средству наблюдают в течение периода введения обоих антител, но экспозицию сохраняют до конца периода введения. Введение антитела NS-ART1 приводит к изменениям, подобным системным аутоиммунным заболеваниям, таким как появление аутоантител, воспалительные изменения (васкулит, воспалительная клеточная инфильтрация), анемические изменения и активация Т-клеток, в то время как вышеуказанные изменения не наблюдались при введении антитела SW1389-ART1. Эти результаты показывают, что антитело SW1389-ART1 обладает пониженной токсичностью in vivo.The appearance of antibodies to the drug is observed during the period of administration of both antibodies, but exposure is maintained until the end of the administration period. Administration of the NS-ART1 antibody results in changes similar to systemic autoimmune diseases, such as the appearance of autoantibodies, inflammatory changes (vasculitis, inflammatory cell infiltration), anemic changes and T-cell activation, while the above changes were not observed with the administration of the SW1389-antibody. ART1. These results indicate that the SW1389-ART1 antibody has reduced toxicity in vivo.

Пример 5. Получение измененных антител CTLA4 и оценка их активности.Example 5. Production of modified CTLA4 antibodies and evaluation of their activity.

Осуществляют дальнейшее изменение и оценку переключающих антител против CTLA4, полученных в примере 4.The anti-CTLA4 switching antibodies obtained in Example 4 were further modified and evaluated.

Пример 5-1. Оптимизация антител путем внесения комплексных изменений и замены каркасов.Example 5-1. Antibody optimization through complex modifications and scaffold replacements.

Изменения аминокислот целенаправленно вводят в CDR 04H1389-G1m/04L1086-lam1 и исследуют изменения с улучшенными профилями. Целенаправленное введение и оценку аминокислотных изменений проводят с использованием метода, описанного в примере 3-3. Созданы варианты, в которые введена комбинация обнаруженных в настоящем изобретении изменений и заменены каркасы. В табл. 19 перечислены SEQ ID NO вариабельных областей тяжелой цепи, вариабельных областей легкой цепи, константных областей тяжелой цепи, константных областей легкой цепи и гипервариабельных областей этих антител. Легкие цепи 04L1594-lam1, 04L1581-lam1, 04L1610-lam1, 04L1612-lam1 и 04L1610-lam1 в табл. 19 интродуцированы с изменениями в CDR и каркасах по сравнению с легкой цепью родительского антитела 04L1086-lam1, и имеют каркасы и константную область последовательностей зародышевой линии λ-цепи человека. Кроме того, 04L1615-k0MT, 04L1616-k0MT и 04L1617-k0MT имеют изменения, интродуцированные в CDR 04L1086-lam1, и имеют каркас и константную область последовательностей зародышевой линии κ-цепи человека. Вариабельная область тяжелой цепи 04H1389v373 интродуцирована с изменениями в CDR вариабельной области тяжелой цепи 04Н1389 исходного антитела. Вариабельные области тяжелой цепи 04Н1637, 04Н1643, 04Н1654, 04Н1656, 04Н1642 и 04Н1735 имеют изменения, интродуцированные в CDR 04H1389, а также замены каркасных последовательностей на последовательности другой зародышевой линии.Amino acid changes are specifically introduced into CDR 04H1389-G1m/04L1086-lam1 and the changes are examined with improved profiles. Targeted administration and assessment of amino acid changes are carried out using the method described in Example 3-3. Variations have been created that incorporate a combination of the changes found in the present invention and replace the frameworks. In table 19 lists the SEQ ID NOs of the heavy chain variable regions, light chain variable regions, heavy chain constant regions, light chain constant regions and hypervariable regions of these antibodies. Light chains 04L1594-lam1, 04L1581-lam1, 04L1610 - lam1, 04L1612-lam1 and 04L1610 - lam1 in table. 19 are introduced with changes in CDRs and frameworks compared to the light chain of the parent antibody 04L1086-lam1, and have frameworks and constant region germline human λ chain sequences. In addition, 04L1615-k0MT, 04L1616-k0MT, and 04L1617-k0MT have changes introduced in the 04L1086-lam1 CDR and have the framework and constant region of human κ chain germline sequences. The heavy chain variable region 04H1389v373 was introduced with changes in the CDR of the heavy chain variable region 04H1389 of the parent antibody. Heavy chain variable regions 04H1637, 04H1643, 04H1654, 04H1656, 04H1642 and 04H1735 have changes introduced in CDR 04H1389, as well as substitutions of framework sequences with other germline sequences.

- 77 045931- 77 045931

Таблица 19Table 19

Аминокислотные последовательности тяжелых цепей, легких цепей и их гипервариабельных областей _________________________(обозначены SEQ ID NO:)__________________________Amino acid sequences of heavy chains, light chains and their hypervariable regions _________________________(indicated by SEQ ID NO:)__________________________

Антитело Antibody Вариабельная область Variable region Константная область Constant region Гнперварнабельная область (HVR) (М) Hnpervarnatable region (HVR) (M) Тяжелая цепь Heavy chain Легкая цепь Light chain Тяжелая цепь Heavy chain Легкая цепь Light chain Н1 H1 Н2 H2 нз nz L1 L1 L2 L2 L3 L3 04Н 1 389v373-G 1 m/04L1086-lam 1 04Н 1 389v373-G 1 m/04L1086-lam 1 137 137 97 97 82 82 87 87 107 107 111 111 102 102 122 122 117 117 133 133 04Н1637-G1m/O4L1086-lam1 04Н1637-G1m/O4L1086-lam1 138 138 97 97 82 82 87 87 107 107 111 111 102 102 122 122 117 117 133 133 04H1637-G1m/04L1594-ram1 04H1637-G1m/04L1 581 -laml 04H1637-G1m/04L1594-ram1 04H1637-G1m/04L1 581 -laml 138 138 138 138 144 145 144 145 82 82 82 82 87 87 87 87 107 107 107 107 111 111 111 111 102 102 102 102 124 126 124 126 125 127 125 127 133 133 133 133 04H1637-G1 m/04L 16104am i 04H1637-G1 m/04L 16104am i 138 138 146 146 82 82 87 87 107 107 111 111 102 102 128 128 117 117 133 133 04H1643-G1m/04L1610-lam1 04H1643-G1m/04L1610-lam1 139 139 146 146 82 82 87 87 107 107 111 111 102 102 128 128 117 117 133 133 04H1654-Glm/04L1610-tam1 04H1654-Glm/04L1610-tam1 140 140 146 146 82 82 87 87 107 107 112 112 102 102 128 128 117 117 133 133 04H1656-Gtm/04Lt610-laml 04H1656-Gtm/04Lt610-laml 141 141 146 146 82 82 87 87 107 107 111 111 152 152 128 128 117 117 133 133 04H1654-G1m/04L1612-lam1 04H1654-G1m/04L1612-lam1 140 140 147 147 82 82 87 87 107 107 112 112 102 102 129 129 117 117 133 133 04H1656-Gtm/04L1612-lam 1 04H1656-Gtm/04L1612-lam 1 141 141 147 147 82 82 87 87 107 107 111 111 152 152 129 129 117 117 133 133 04H1654-G1m/04Ll 606-lam 1 04H1654-G1m/04Ll 606-lam 1 140 140 148 148 82 82 87 87 107 107 112 112 102 102 124 124 117 117 133 133 04H1656-G1m/04LI 606Ham1 04H1656-G1m/04LI 606Ham1 141 141 148 148 82 82 87 87 107 107 111 111 152 152 124 124 117 117 133 133 04H1389-G1 m/04Ll 615-kOMT 04H1389-G1 m/04Ll 615-kOMT 136 136 149 149 82 82 96 96 107 107 110 110 102 102 130 130 117 117 133 133

Активность связывания созданных вариантов с CTLA4 человека оценивают методом, описанным в примере 3-3 (табл. 20).The binding activity of the created variants to human CTLA4 is assessed by the method described in example 3-3 (Table 20).

Таблица 20Table 20

Анализ связывания с CTLA4 человекаHuman CTLA4 binding assay

Антитело Antibody Kd для CTLA4 человека (Μ) Kd for human CTLA4 (Μ) Без АТФ Without ATP АТФ 1 мкМ ATP 1 µM АТФ 10 мкМ ATP 10 µM MDX10D1H-G1 m/MDX WD1 L-kOMT MDX10D1H-G1 m/MDX WD1 L-kOMT 4.8Е-08 4.8E-08 5.0Е-08 5.0E-08 4.9Е-08 4.9E-08 04Н1389-G1 m/04L1086-lam 1 04Н1389-G1 m/04L1086-lam 1 *5.7Е“06 *5.7E“06 1.8Е-07 1.8E-07 3.7Е-08 3.7E-08 04H1389v373-Glm/04L1086-lam1 04H1389v373-Glm/04L1086-lam1 * 5.3Е-06 * 5.3E-06 1.4Е-07 1.4E-07 2.8Е-08 2.8E-08 04H1637-G1 m/04L1086-lam 1 04H1637-G1 m/04L1086-lam 1 *5.3Е-06 *5.3E-06 1.6Е-07 1.6E-07 3.0Е-08 3.0E-08 04H1637-G 1 m/04L1594-lam 1 04H1637-G 1 m/04L1594-lam 1 *4.3Е-06 *4.3E-06 1.4Е-07 1.4E-07 2.8Е-08 2.8E-08 04H1637-G 1 m/04L1581 -lam 1 04H1637-G 1 m/04L1581 -lam 1 *3.2Е-06 *3.2E-06 8.9Е-08 8.9E-08 1.7Е-08 1.7E-08 04H1637-G 1 m/04L1610-lam 1 04H1637-G 1 m/04L1610-lam 1 *З.ЗЕ-06 *Z.ZE-06 1.0Е-07 1.0E-07 1.8Е-08 1.8E-08 04H1643-G1 m/04L1610-lam 1 04H1643-G1 m/04L1610-lam 1 *2.8Е-06 *2.8E-06 8.9Е-08 8.9E-08 1.4Е-08 1.4E-08 04H1654-G1 m/04L1610-lam 1 04H1654-G1 m/04L1610-lam 1 * 5.3Е-06 * 5.3E-06 1.2Е-07 1.2E-07 1 .ЭЕ-08 1.EE-08 04H1656-G 1 m/04L1610-lam 1 04H1656-G 1 m/04L1610-lam 1 *2.2Е-06 *2.2E-06 9.8Е-08 9.8E-08 1.ЭЕ-08 1.EE-08 04H1654-G 1 m/04L1612-lam 1 04H1654-G 1 m/04L1612-lam 1 *4.8Е-06 *4.8E-06 2.0Е-07 2.0E-07 З.ЗЕ-08 Z.ZE-08 04H1656-G 1 m/04L1612-lam 1 04H1656-G 1 m/04L1612-lam 1 *7.6Е-06 *7.6E-06 1.6Е-07 1.6E-07 3.2Е-08 3.2E-08 04H1654-G 1 m/04Ll 606-lam 1 04H1654-G 1 m/04Ll 606-lam 1 *6.8Е-06 *6.8E-06 1.4Е-07 1.4E-07 2.5Е-08 2.5E-08 04H1656-G 1 m/04L1606-lam 1 04H1656-G 1 m/04L1606-lam 1 *2.3Е-О6 *2.3E-O6 9.5Е-08 9.5E-08 ТЭЕ-08 TEE-08 04H138 9-G1 m/04L 1305-kOMT 04H138 9-G1 m/04L 1305-kOMT *2.4Е-06 *2.4E-06 8.2Е-08 8.2E-08 1.5Е-08 1.5E-08 04H138 9-G 1 m/04L 1615-k0MT 04H138 9-G 1 m/04L 1615-k0MT *2.0Е-06 *2.0E-06 7.2Е-08 7.2E-08 1.5Е-08 1.5E-08

* Величину KD определяют по стационарной модели.* The value of K D is determined using a stationary model.

Значения KD в таблице, отмеченные *, рассчитаны с использованием стационарной модели. Показано, что все варианты, полученные с использованием 04H1389-G1m/04L1086-lam1 в качестве исходного антитела, связываются с CTLA4 человека АТФ-зависимым образом и обладают более сильной связывающей способностью, чем исходное антитело с KD 3,7х10-8 М в условиях, когда АТФ присутствует в количестве 10 мкМ. Показано, что все эти антитела обладают более сильной связывающей способностью, чем существующее антитело против CTLA4 человека MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT в усло- 78 045931 виях, когда АТФ присутствует в количестве 10 мкМ.KD values in the table marked * are calculated using a steady-state model. All variants obtained using 04H1389-G1m/04L1086-lam1 as the parent antibody were shown to bind to human CTLA4 in an ATP-dependent manner and have a stronger binding capacity than the parent antibody with a KD of 3.7x10 -8 M under conditions when ATP is present in an amount of 10 µM. All of these antibodies were shown to have stronger binding capacity than the existing anti-human CTLA4 antibody MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT when ATP was present at 10 μM.

Способность связывать полученных вариантов с CTLA4 человека в присутствии АДФ или АМФ оценивают с помощью Biacore T200 и сравнивают со способностью связываться в присутствии АТФ. Способность к связыванию с CTLA4 человека в присутствии АДФ или АМФ измеряют с использованием метода, описанного в примере 3-3, как и при оценке связывающей способности в присутствии АТФ, но с использованием АДФ или АМФ вместо АТФ (табл. 21).The ability of the resulting variants to bind to human CTLA4 in the presence of ADP or AMP was assessed using Biacore T200 and compared with the ability to bind in the presence of ATP. The binding ability to human CTLA4 in the presence of ADP or AMP is measured using the method described in Example 3-3, as for the binding ability in the presence of ATP, but using ADP or AMP instead of ATP (Table 21).

Таблица 21Table 21

Оценка зависимости от АТФ, АДФ и АМФAssessment of dependence on ATP, ADP and AMP

Антитело Antibody Кинетические параметры для CTLA4 человека. Kinetic parameters for human CTLA4. АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АДФ 10 мкМ ADP 10 µM АМФ 10 мкМ AMP 10 µM КофСсек *) KofSsec *) ЛгЯсек-1) LgYasek -1 ) Й<М) Y<M) Ысек-1) Ysek -1 ) £г(М) £r(M) к'й(М_1сек_1) k'y(M _1 sec _1 ) foices1) foices 1 ) Й<М) Y<M) MDX10D1H-G1 m/MDX10D1 L-kOMT MDX10D1H-G1 m/MDX10D1 L-kOMT 2.9Е+05 2.9E+05 1 .ЗЕ-02 1.ZE-02 4.6Е-08 4.6E-08 3.6Е+05 3.6E+05 1 .ЗЕ-02 1.ZE-02 3.6Е-08 3.6E-08 3.4Е+05 3.4E+05 1.ЗЕ-02 1.ZE-02 3.9E-0S 3.9E-0S 04H1389-G1 m/04L1086-laml 04H1389-G1 m/04L1086-laml 1.0Е+05 1.0E+05 3.2Е-03 3.2E-03 3.2Е-08 3.2E-08 1.4Е+05 1.4E+05 6.1Е-03 6.1E-03 4.4Е-08 4.4E-08 1.4Е-Ю5 1.4E-U5 1.8Е-02 1.8E-02 1 .ЗЕ-07 1.ZE-07 04H1637-G1 m/04L161 Q-laml 04H1637-G1 m/04L161 Q-laml 1.2Е+05 1.2E+05 1.9Е-03 1.9E-03 1.5Е-08 1.5E-08 1.6Е+05 1.6E+05 3.5Е-03 3.5E-03 2.2Е-08 2.2E-08 1.5Е+05 1.5E+05 1.0Е-02 1.0E-02 7ΌΕ-08 7ΌΕ-08 04H1654-G1 m/04L1610-laml 04H1654-G1 m/04L1610-laml 7.1Е+04 7.1E+04 1.4Е-03 1.4E-03 1.9Е-08 1.9E-08 8.8Е+04 8.8E+04 2.8Е-03 2.8E-03 3.2Е-08 3.2E-08 8.9Е+04 8.9E+04 8.9Е-03 8.9E-03 1ΌΕ-07 1ΌΕ-07 04H1656-G1 m/04Ll 610-laml 04H1656-G1 m/04Ll 610-laml 1.3Е+05 1.3E+05 1.9Е-03 1.9E-03 1.5Е-08 1.5E-08 1.7Е+05 1.7E+05 4.3Е-03 4.3E-03 2.5Е-08 2.5E-08 1.7Е+05 1.7E+05 1.4Е-02 1.4E-02 8.2Е-08 8.2E-08 04H1654-G1 m/04L1612-laml 04H1654-G1 m/04L1612-laml 7.4Е+04 7.4E+04 2.7Е-03 2.7E-03 3.6Е-08 3.6E-08 8.9Е+04 8.9E+04 5.0Е-03 5.0E-03 5.6Е-08 5.6E-08 9.4 Е+04 9.4 E+04 1.6Е-02 1.6E-02 1.7Е-07 1.7E-07 04H1656-G1m/04L1612-lam1 04H1656-G1m/04L1612-lam1 1.1Е+05 1.1E+05 2.9Е-03 2.9E-03 2.6Е-08 2.6E-08 1.5Е+05 1.5E+05 6.4Е-03 6.4E-03 4.2Е-08 4.2E-08 1.5Е+05 1.5E+05 2.0Е-02 2.0E-02 1 .ЗЕ-07 1.ZE-07 04H1654-G1 m/04L1606-laml 04H1654-G1 m/04L1606-laml 6.5Е+04 6.5E+04 1 .ЗЕ-ОЗ 1.ZE-OZ 2.1Е-08 2.1E-08 8.0Е+04 8.0E+04 2.8Е-03 2.8E-03 3.5Е-08 3.5E-08 8.1Е1-04 8.1E1-04 9.0Е-03 9.0E-03 1.1Е-07 1.1E-07 04H1656-G1 m/04L1606-laml 04H1656-G1 m/04L1606-laml 1.2Е+05 1.2E+05 2.2Е-03 2.2E-03 1.9Е-08 1.9E-08 Т6Е+05 T6E+05 4.8Е-03 4.8E-03 3.0Е-08 3.0E-08 1.6Е+05 1.6E+05 1.6Е-02 1.6E-02 1.0Е-07 1.0E-07 04H1389-G1 m/04L1305-kOMT 04H1389-G1 m/04L1305-kOMT 1.1Е+05 1.1E+05 1.9Е-03 1.9E-03 1.7Е-08 1.7E-08 1.6Е+05 1.6E+05 3.8Е-03 3.8E-03 2.5Е-08 2.5E-08 1.5Е+05 1.5E+05 1.2Е-02 1.2E-02 7.9Е-08 7.9E-08 04H1389-G1 m/04L1615-kOMT 04H1389-G1 m/04L1615-kOMT 1.3Е+05 1.3E+05 1.5Е-03 1.5E-03 1.1Е-08 1.1E-08 1.8Е+05 1.8E+05 З.ОЕ-ОЗ Z.OE-OZ 1.7Е-08 1.7E-08 1.7Е+О5 1.7E+O5 9.7Е-03 9.7E-03 5.5Е-08 5.5E-08

Существующее антитело к CTLA4 человека MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT показывает сходные кинетические параметры независимо от типа и присутствия малых молекул, тогда как все АТФзависимые антитела к CTLA4 связываются с CTLA4 человека не только в присутствии АТФ, но и в присутствии АДФ или АМФ, и связывающая способность в присутствии этих малых молекул была выше, чем связывающая способность в отсутствие малых молекул, показанная в табл. 20. Таким образом, было показано, что эти антитела представляют собой антитела, которые связываются с CTLA4 АТФ-, АДФ- и АМФ-зависимым образом. Эти антитела имеют самую высокую связывающую способность в присутствии АТФ, за которой следует самая высокая связывающая способность в присутствии АДФ и самая низкая связывающая способность в присутствии АМФ. Во всех случаях связывающая способность в присутствии АДФ была примерно в 3 раза сильнее, чем связывающая способность в присутствии АМФ, а связывающая способность в присутствии АТФ была примерно в 5 раз сильнее, чем связывающая способность в присутствии АМФ. Величина ka одинакова в присутствии любой из малых молекул, но есть разница в величине kd. Поскольку диссоциация в присутствии АДФ происходит быстрее, чем в присутствии АТФ, а дальнейшая диссоциация в присутствии АМФ происходит быстрее, чем в присутствии АДФ, показано, что разница в величине KD в зависимости от типа малой молекулы связана с разницей в скорости диссоциации.The existing anti-human CTLA4 antibody MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT shows similar kinetic parameters regardless of the type and presence of small molecules, whereas all ATP-dependent anti-CTLA4 antibodies bind to human CTLA4 not only in the presence of ATP, but also in the presence of ADP or AMP, and the binding capacity in the presence of these small molecules was higher than the binding capacity in the absence of small molecules shown in Table. 20. Thus, these antibodies have been shown to be antibodies that bind to CTLA4 in an ATP-, ADP-, and AMP-dependent manner. These antibodies have the highest binding capacity in the presence of ATP, followed by the highest binding capacity in the presence of ADP and the lowest binding capacity in the presence of AMP. In all cases, the binding capacity in the presence of ADP was approximately 3 times stronger than the binding capacity in the presence of AMP, and the binding capacity in the presence of ATP was approximately 5 times stronger than the binding capacity in the presence of AMP. The value of ka is the same in the presence of either small molecule, but there is a difference in the value of kd. Since dissociation in the presence of ADP occurs faster than in the presence of ATP, and further dissociation in the presence of AMP occurs faster than in the presence of ADP, the difference in KD value depending on the type of small molecule is shown to be due to the difference in the rate of dissociation.

Затем оценивают связывающую способность некоторых вариантов с CTLA4 мыши и CTLA4 яванского макака. Активность связывания с CTLA4 человека, CTLA4 мыши и CTLA4 яванского макака оценивают с использованием Biacore T200 по методу, описанному в примере 3-3 (табл. 22). CTLA4 яванского макака получали следующим способом.The binding ability of some variants to mouse CTLA4 and cynomolgus CTLA4 is then assessed. Binding activity to human CTLA4, mouse CTLA4 and cynomolgus CTLA4 was assessed using Biacore T200 according to the method described in Example 3-3 (Table 22). Cynomolgus CTLA4 was obtained by the following method.

Ген CyCTLA4-His-BAP (SEQ ID NO: 50), представляющий собой слияние His-метки и ВАР-метки на С-конце внеклеточной области CTLA4 яванского макака, был синтезирован и инсертирован в плазмиду экспрессии животных. Полученную плазмиду вводят методом липофекции в линию клеток FreeStyle 293-F, полученную из клеток эмбриональной почки человека (фирма Invitrogen), эти клетки высевают в колбу после суспендирования в среду для экспрессии FreeStyle 293 (фирма Invitrogen) при плотности клеток 1,33.x 106 клеток/мл. Через три часа после трансфекции плазмиды добавляют биотин до конечной концентрации 100 мкМ, клетки культивируют в СО2-инкубаторе (37°С, 8% СО2, 125 об/мин) в течение 4 сут и антиген очищают методом, известным специалистам в данной области, из культурального супернатанта каждого образца. Поглощение растворов очищенного антигена при 280 нм измеряют с помощью спектрофотометра. Из полученных измеренных значений рассчитывают концентрацию очищенного антигена с использованием коэффициента экстинкции, рассчитанного методом РАСЕ (Protein Science, 1995, 4, 2411-2423).The CyCTLA4-His-BAP gene (SEQ ID NO: 50), which is a fusion of a His tag and a BAP tag at the C-terminus of the extracellular region of cynomolgus macaque CTLA4, was synthesized and inserted into an animal expression plasmid. The resulting plasmid is introduced by lipofection into the FreeStyle 293-F cell line, obtained from human embryonic kidney cells (Invitrogen), these cells are seeded in a flask after suspension in the FreeStyle 293 expression medium (Invitrogen) at a cell density of 1.33.x 10 6 cells/ml. Three hours after transfection of the plasmid, biotin is added to a final concentration of 100 μM, the cells are cultured in a CO 2 incubator (37 ° C, 8% CO 2 , 125 rpm) for 4 days and the antigen is purified by a method known to specialists in the field , from the culture supernatant of each sample. The absorbance of purified antigen solutions at 280 nm is measured using a spectrophotometer. From the measured values obtained, the concentration of the purified antigen is calculated using the extinction coefficient calculated by the PACE method (Protein Science, 1995, 4, 2411-2423).

- 79 045931- 79 045931

Таблица 22Table 22

Анализ связывания с CTLA4 человека, мыши, макаки крабоедаHuman, mouse, cynomolgus macaque CTLA4 binding assay

Kd для CTLA4 человека (Μ) Kd for human CTLA4 (Μ) Kd для CTLA4 мыши (М) Kd for mouse CTLA4 (M) Kd для CTLA4 обезьяны (М) Kd for CTLA4 monkey (M) Антитело Antibody АТФ 1 мкМ ATP 1 µM АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM АТФ 1 мкМ ATP 1 µM АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM АТФ 1 мкМ ATP 1 µM АТФ 10 мкМ ATP 10 µM АТФ 100 мкМ ATP 100 µM MDX10D1H-G1 m/MDX10D1 L-kOMT MDX10D1H-G1 m/MDX10D1 L-kOMT 4.7Е-08 4.7E-08 5.3Е-08 5.3E-08 5.4Е-08 5.4E-08 N.T. N.T. N.T. N.T. N.T. 1 1.6Е-О7 N.T. 1 1.6E-O7 1 1.2Е-О7 1 1.2E-O7 1 1.2Е-О7 1 1.2E-O7 04H1389~G1m/04L1305-kOMT 04H1389~G1m/04L1305-kOMT 7.2Е-08 7.2E-08 1.4Е-08 1.4E-08 4.6Е-09 4.6E-09 2.1 Е-07 2.1 E-07 3.2Е-08 3.2E-08 1.2Е-08 I 1.4Е-07 1.2E-08 I 1.4E-07 1 2.6Е-08 1 2.6E-08 1 1.2Е-08 1 1.2E-08 04H1654-G1m/04L1610-lam1 04H1654-G1m/04L1610-lam1 1.1Е-07 1.1E-07 1.5Е-08 1.5E-08 4.4Е-09 4.4E-09 1.8Е-07 1.8E-07 2.7Е-08 2.7E-08 1.0Е-08 I 1.8Е-О7 1.0E-08 I 1.8E-O7 1 2.8Е-08 1 2.8E-08 1 8.1Е-09 1 8.1E-09 04H1656-G1m/04L1610-lam1 04H1656-G1m/04L1610-lam1 7.9Е-08 7.9E-08 1.6Е-08 1.6E-08 6.2Е-09 6.2E-09 2.3Е-07 2.3E-07 3.7Е-08 3.7E-08 1.4Е-08 I 1.2Е-О7 1 2.6Е-08 1.4E-08 I 1.2E-O7 1 2.6E-08 1 1.0Е-08 1 1.0E-08 04Ш 654-G1 m/04L1612-lam 1 04Ш 654-G1 m/04L1612-lam 1 1.7Е-07 1.7E-07 З.ОЕ-О8 Z.OE-O8 1.1Е-08 1.1E-08 3.9Е-07 3.9E-07 4.8Е-08 4.8E-08 1.8Е-08 I 3.1Е-07 1 5.4Е-08 1.8E-08 I 3.1E-07 1 5.4E-08 1 2.1Е-08 1 2.1E-08 04H1656-G1m/04L1612-laml 04H1656-G1m/04L1612-laml 9.5Е-08 9.5E-08 2.5Е-08 2.5E-08 7.8Е-09 7.8E-09 3.2Е-07 3.2E-07 5.4Е-08 5.4E-08 2.1Е-08 1 1.6Е-О7 1 4.1Е-08 2.1E-08 1 1.6E-O7 1 4.1E-08 1 1.6Е-08 1 1.6E-08 O4H1389-G1m/Q4L1615-k0MT O4H1389-G1m/Q4L1615-k0MT 5.8Е-08 5.8E-08 1.2Е-08 1.2E-08 5.0Е-09 5.0E-09 1.6Е-07 1.6E-07 2.6Е-08 2.6E-08 1.0Е-О8 I 1.1Е-07 1 2.1Е-08 1 9.3Е-09 1.0E-O8 I 1.1E-07 1 2.1E-08 1 9.3E-09

N.T. - He исследовали.N.T. - They didn’t investigate.

Установлено, что все шесть изученных зависимых от малых молекул антител CTLA4 связываются не только с CTLA4 человека, но также с CTLA4 мыши и с CTLA4 яванского макака АТФ-зависимым образом.All six small molecule-dependent CTLA4 antibodies studied were found to bind not only to human CTLA4, but also to mouse CTLA4 and cynomolgus CTLA4 in an ATP-dependent manner.

Пример 5-2. Получение измененных анти-CTLA4 переключающих антител и антитела отрицательного контроля.Example 5-2. Preparation of modified anti-CTLA4 switch antibodies and negative control antibodies.

Получают измененные анти-CTLA4 переключающие антитела (04Н1654-mFa55m2P1/04L1610 ml0r//04H1656-mFa55m2N1/04L1610-ml0r, аббревиатура: SW1610-mFa55;04H1654-mFa55m2P1/04L1612ml0r//04H1656-mFa55m2N1/04L1612-m10r, аббревиатура: SW1612-mFa55; and 04H1389-mFa55/04L1615mk1, аббревиатура: SW1615-mFa55) и антитело отрицательного контроля (IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1, аббревиатура: KLH-mFa55).Generate modified anti-CTLA4 switching antibodies (04H1654-mFa55m2P1/04L1610 ml0r//04H1656-mFa55m2N1/04L1610-ml0r, abbreviation: SW1610-mFa55;04H1654-mFa55m2P1/04L1612ml0r//04H1656-mFa55m2N1/04L1612-m10r, abbreviation: SW1612-mFa55; and 04H1389-mFa55/04L1615mk1, abbreviation: SW1615-mFa55) and negative control antibody (IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1, abbreviation: KLH-mFa55).

В антителе SW1615-mFa55 используют вариабельную область тяжелой цепи 04Н1389 (SEQ ID NO: 29) и вариабельную область легкой цепи 04L1615 (SEQ ID NO: 34), а в качестве константных областей используют константную область тяжелой цепи mFa55 мыши (SEQ ID NO: 18) и константную область mk1 легкой цепи мыши дикого типа (SEQ ID NO: 19). Также используют константную область тяжелой цепи мыши, к которой были добавлены изменения для усиления связывания с рецептором Fcy. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.The SW1615-mFa55 antibody uses the heavy chain variable region 04H1389 (SEQ ID NO: 29) and the light chain variable region 04L1615 (SEQ ID NO: 34), and the mouse mFa55 heavy chain constant region (SEQ ID NO: 18) is used as the constant regions ) and wild-type mouse light chain mk1 constant region (SEQ ID NO: 19). A mouse heavy chain constant region to which modifications have been added to enhance binding to the Fcy receptor is also used. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе SW1610-mFa55 в качестве константных областей одна вариабельную область тяжелой цепи 04Н1654 (SEQ ID NO: 35) связана с константной областью тяжелой цепи мыши mFa55m2P1 (SEQ ID NO: 36), другая вариабельную область тяжелой цепи 04Н1656 (SEQ ID NO: 37) связана с константной областью тяжелой цепи мыши mFa55m2N1 (SEQ ID NO: 38), а для вариабельной области легкой цепи 04L1610 (SEQ ID NO: 39) - с константной областью легкой цепи мыши дикого типа mFa55m2N1 (SEQ ID NO: 39). (SEQ ID NO: 22). Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.In the antibody SW1610 - mFa55, as constant regions, one heavy chain variable region 04H1654 (SEQ ID NO: 35) is linked to the mouse heavy chain constant region mFa55m2P1 (SEQ ID NO: 36), the other heavy chain variable region 04H1656 (SEQ ID NO: 37 ) is linked to the mouse heavy chain constant region mFa55m2N1 (SEQ ID NO: 38), and for the light chain variable region 04L1610 (SEQ ID NO: 39) to the wild-type mouse light chain constant region mFa55m2N1 (SEQ ID NO: 39). (SEQ ID NO: 22). The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе SW1612-mFa55 в качестве константных областей одна вариабельная область тяжелой цепи 04Н1654 (SEQ ID NO: 35) связана с константной областью тяжелой цепи мыши mFa55m2Pl (SEQ ID NO: 36), другая вариабельная область тяжелой цепи 04Н1656 (SEQ ID NO: 37) связана с константной областью тяжелой цепи мыши mFa55m2N1 (SEQ ID NO: 38), а для вариабельной области легкой цепи 04L1612 (SEQ ID NO: 40) - с константной областью легкой цепи мыши дикого типа mFa55m2N1 (SEQ ID NO: 22). Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.In the antibody SW1612-mFa55, as constant regions, one heavy chain variable region 04H1654 (SEQ ID NO: 35) is linked to the mouse heavy chain constant region mFa55m2Pl (SEQ ID NO: 36), another heavy chain variable region 04H1656 (SEQ ID NO: 37 ) is linked to the mouse heavy chain constant region mFa55m2N1 (SEQ ID NO: 38), and for the light chain variable region 04L1612 (SEQ ID NO: 40) to the wild-type mouse light chain constant region mFa55m2N1 (SEQ ID NO: 22). The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе отрицательного контроля в качестве константных областей вариабельная область тяжелой цепи IC17Hdk (SEQ ID NO: 51) связана с константной областью мыши тяжелой цепи mFa55 (SEQ ID NO: 18), а для вариабельной области легкой цепи IC17L (SEQ ID NO: 52) используют константную область mk1 легкой цепи мыши дикого типа (SEQ ID NO: 19). Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.In the negative control antibody, as constant regions, the heavy chain variable region IC17Hdk (SEQ ID NO: 51) is linked to the mouse heavy chain constant region mFa55 (SEQ ID NO: 18), and for the light chain variable region IC17L (SEQ ID NO: 52) using the wild-type mouse light chain mk1 constant region (SEQ ID NO: 19). The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Пример 5-3. Оценка связывающей способности антител, имеющих константную область мыши, с CTLA4 человека.Example 5-3. Evaluation of the binding ability of antibodies having a mouse constant region to human CTLA4.

Способность анти-CTLA4-антител, имеющих константную область мыши, связываться с антигеном оценивают методом, описанным в примере 4-2 (табл. 23). Установлено, что все эти антитела, имеющие константную область мыши, обладают такой же АТФ-зависимой способностью связываться с CTLA4 человека, что и антитела, показанные в табл. 22, имеющие такую же вариабельную область, но с константной областью человека.The ability of anti-CTLA4 antibodies having a mouse constant region to bind to antigen was assessed by the method described in Example 4-2 (Table 23). All of these mouse constant region antibodies were found to have the same ATP-dependent ability to bind to human CTLA4 as the antibodies shown in Table 1. 22, having the same variable region, but with a human constant region.

- 80 045931- 80 045931

Таблица 23Table 23

Анализ связывания вариантов с константными областями мыши с CTLA4 человекаAnalysis of binding of mouse constant region variants to human CTLA4

Kd для CTLA4 человека (Μ) Kd for human CTLA4 (Μ) Антитело Antibody ΑΤΦ 1 мкМ ΑΤΦ 1 µM ΑΤΦ 10 мкМ ΑΤΦ 10 µM ΑΤΦ 100 мкМ ΑΤΦ 100 µM MDX10D1 H-mFa55/MDX10D1 L-mk1 MDX10D1 H-mFa55/MDX10D1 L-mk1 3.2Ε-08 3.2Ε-08 3.8Ε-08 3.8Ε-08 3.6Е-08 3.6E-08 04Н1654-mFa55m2P1 /04L1610-ml0r 04Н1654-mFa55m2P1 /04L1610-ml0r 5.8Ε-08 5.8Ε-08 1.7Ε-08 1.7Ε-08 8.5Е-09 8.5E-09 04H1656-mFa55m2N1/04L1610-ml0r 04H1656-mFa55m2N1/04L1610-ml0r 4.7Ε-08 4.7Ε-08 1.ЗЕ-08 1.ZE-08 7.4Е-09 7.4E-09 04H1654-mFa55m2P1 /04L1612-ml0r 04H1654-mFa55m2P1 /04L1612-ml0r 9.4Ε-08 9.4Ε-08 2.9Е-08 2.9E-08 1.2Е-08 1.2E-08 04H1656-mFa55m2N1/04L1612-rrlOr 04H1656-mFa55m2N1/04L1612-rrlOr 6.7Ε-08 6.7Ε-08 2.0Е-08 2.0E-08 1.0Е-08 1.0E-08 04H1389-rriFa55/04L1615-mk1 04H1389-rriFa55/04L1615-mk1 4.5Ε-08 4.5Ε-08 1.5Е-08 1.5E-08 8.7Е-09 8.7E-09

Пример 5-4. Эффективность переключающих анти-CTLA4 антител в модели трансплантированных сингенных опухолевых клеток с использованием нокина CTLA4 человека, трансгенной мыши с CD3 человека, с увеличением/уменьшением клеток Treg в опухоли и изменением маркера системного ответа в селезенке.Example 5-4. Efficacy of anti-CTLA4 switching antibodies in a syngeneic tumor cell transplant model using human CTLA4 knockin, human CD3 transgenic mouse, with increased/decreased Treg cells in the tumor and altered systemic response marker in the spleen.

Пример 5-4-1. Клеточная линия.Example 5-4-1. Cell line.

Используют клетки Hepa1-6/hGPC3. Эта клеток линии рака печени мыши Нера1-6 приобретена в коллекции АТСС, она обладает конститутивной экспрессией гена Glypican 3 человека (hGPC3) в результате трансфекции и клонирования. Клетки Hepa1-6/hGPC3 поддерживают и пассируют в среде D-MEM (с высоким содержанием глюкозы) (фирма SIGMA), содержащей 10% FBS (фирма Sigma) и 0,6 мг/мл G418 (фирма Nacalai Tesque).Hepa1-6/hGPC3 cells were used. This mouse liver cancer cell line Hepa1-6 was acquired from the ATCC collection and has constitutive expression of the human Glypican 3 (hGPC3) gene as a result of transfection and cloning. Hepa1-6/hGPC3 cells are maintained and passaged in D-MEM (high glucose) medium (SIGMA) containing 10% FBS (Sigma) and 0.6 mg/ml G418 (Nacalai Tesque).

Пример 5-4-2. Получение модели мыши с трансплантированной сингенной опухолью.Example 5-4-2. Generation of a mouse model with a transplanted syngeneic tumor.

Используют мышей с заменой CTLA4 KI человека, CD3 EDG человека (мыши с заменой hCTLA4 KI hCD3 EDG), которые представляют собой гибрид мыши с нокаутом CTLA4 человека (Blood, 2005, 106 (9):3127-3133) и мыши, полученной авторами настоящего изобретения, с заменой на CD3 EDG человека (Sci Rep, 2017, 7: 45839). Клетки Hepa1-6/hGPC3 трансплантируют подкожно мышам с заменой hCTLA4 KI hCD3 EDG, и определяют, что модель приживается, когда средний объем трансплантированных опухолей достигает приблизительно от 200 мм до приблизительно 400 мм3.Human CTLA4 KI, human CD3 EDG knockout mice (hCTLA4 KI hCD3 EDG mice) are used, which are a hybrid of a human CTLA4 knockout mouse (Blood, 2005, 106(9):3127-3133) and a mouse produced by the present authors invention, with replacement by human CD3 EDG (Sci Rep, 2017, 7: 45839). Hepa1-6/hGPC3 cells are transplanted subcutaneously into hCTLA4 KI hCD3 EDG replacement mice, and the model is determined to be established when the average volume of transplanted tumors reaches from about 200 mm to about 400 mm 3 .

Объем трансплантированной опухоли рассчитывают по следующей формуле:The volume of the transplanted tumor is calculated using the following formula:

Объем опухоли=больший диаметрхменьший диаметрхменьший диаметр/2.Tumor volume=larger diameterxsmaller diameterxsmaller diameter/2.

Пример 5-4-3. Получение лекарственного средства для введения.Example 5-4-3. Obtaining the drug for administration.

Лекарственные средства, которые вводят модели с трансплантированными клетками Hepa16/hGPC3, представляют переключающие анти-CTLA4 антитела (SW1610-mFa55, SW1612-mFa55, SW1615-mFa55), полученные в примере 5-2. Лекарственные средства для введения готовят с использованием His-буфера (20 мМ His-HCl, 150 мМ NaCl, pH 6,0) таким образом, чтобы они были в концентрации 0,03, 0,1 и 0,3 мг/мл.The drugs administered to Hepa16/hGPC3 cell transplant models are the anti-CTLA4 switch antibodies (SW1610 - mFa55, SW1612-mFa55, SW1615-mFa55) prepared in Example 5-2. Drugs for administration are prepared using His buffer (20 mM His-HCl, 150 mM NaCl, pH 6.0) so that they are at concentrations of 0.03, 0.1 and 0.3 mg/ml.

Пример 5-4-4. Введение лекарственного средства для измерения противоопухолевого эффекта.Example 5-4-4. Administration of a drug to measure the antitumor effect.

На 8-й день после трансплантации мышам через хвостовую вену вводят три образца переключающих анти-CTLA4 антител в дозах 0,3, 1 и 3 мг/кг, соответственно. В табл. 24 показаны подробности лечения лекарственным средством при измерении противоопухолевого эффекта.On day 8 after transplantation, mice were injected via the tail vein with three samples of anti-CTLA4 switching antibodies at doses of 0.3, 1, and 3 mg/kg, respectively. In table 24 shows details of drug treatment when measuring the antitumor effect.

- 81 045931- 81 045931

Таблица 24Table 24

Измерение противоопухолевого эффекта в модели с трансплантированными клетками Hepa1-6/hGPC3 _____________________(анти-CTLA4 переключающие антитела)_____________________Measuring the antitumor effect in a Hepa1-6/hGPC3 cell transplant model _____________________(anti-CTLA4 switching antibodies)_____________________

Группа Group Животных Animals Лекарство Medicine Доза Dose Введение Introduction Дата введения Date of introduction 1 1 5 5 His-буфер His buffer - - В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 2 2 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 0,3 мг/кг 0.3 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 3 3 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 4 4 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 3 мг/кг 3 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 5 5 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 о,з мг/кг o.z mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 6 6 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 7 7 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 3 мг/кг 3 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 8 8 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 0,3 мг/кг 0.3 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 9 9 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 1 мг/кг 1 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation 10 10 5 5 SW1615mFa55 SW1615mFa55 3 мг/кг 3 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 8й день после трансплантации 8th day after transplantation

Пример 5-4-5. Оценка противоопухолевого эффекта.Example 5-4-5. Evaluation of antitumor effect.

Противоопухолевый эффект оценивают по объему опухоли, рассчитанному по формуле, описанной в примере 5-4-2.The antitumor effect is assessed by tumor volume, calculated using the formula described in example 5-4-2.

Скорость ингибирования роста опухоли (TGI - Tumor Growth Inhibition) рассчитывают по следующей формуле:The rate of tumor growth inhibition (TGI - Tumor Growth Inhibition) is calculated using the following formula:

TGI (%) = (1 - (Средний объем опухоли в исследуемой группе на момент измерения - Средний объем опухоли в исследуемой группе на момент первоначального введения) / (Средний объем опухоли в контрольной группе на момент измерения средний объем опухоли в контрольной группе на момент первоначального введения)) х 100TGI (%) = (1 - (Mean tumor volume in the study group at the time of measurement - Average tumor volume in the study group at the time of initial administration) / (Average tumor volume in the control group at the time of measurement average tumor volume in the control group at the time of initial administration introduction)) x 100

В результате эффективность лекарственного средства SW1610-mFa55 и SW1612-mFa55 по критерию TGI составляет 60% и более на 16-й день после введения в дозах 1 мг/кг или более, a SW1615-mFa55 в дозах 3 мг/кг или более (фиг. 18-20).As a result, the effectiveness of the drug SW1610 - mFa55 and SW1612-mFa55 according to the TGI criterion is 60% or more on the 16th day after administration at doses of 1 mg/kg or more, and SW1615-mFa55 at doses of 3 mg/kg or more (Fig. 18-20).

Пример 5-4-6. Введение лекарственного средства для оценки клеток Treg в опухоли и подтверждения системного эффекта в селезенке.Example 5-4-6. Drug administration to evaluate Treg cells in the tumor and confirm systemic effect in the spleen.

На 10-й день после трансплантации мышам вводят через хвостовую вену SW1610-mFa55 в дозах 50 мг/кг, 100 мг/кг и 200 мг/кг, SW1612-mFa55 вводят в дозах 50 мг/кг, 100 мг/кг и 200 мг/кг, и SW1615mFa55 вводят в дозах 50 мг/кг, 100 мг/кг, 200 мг/кг и 400 мг/кг. Кроме того, в контрольной группе через хвостовую вену вводят антитело отрицательного контроля IC17Hdk-mFa55/IC17L-mkl (сокращенное обозначение: KLH-mFa55) в дозе 400 мг/кг. В табл. 25 показаны подробности медикаментозного лечения для оценки клеток Treg в опухоли и подтверждения системных эффектов в селезенке.On the 10th day after transplantation, mice are administered through the tail vein SW1610 - mFa55 in doses of 50 mg/kg, 100 mg/kg and 200 mg/kg, SW1612-mFa55 is administered in doses of 50 mg/kg, 100 mg/kg and 200 mg /kg, and SW1615mFa55 was administered at doses of 50 mg/kg, 100 mg/kg, 200 mg/kg and 400 mg/kg. In addition, in the control group, the negative control antibody IC17Hdk-mFa55/IC17L-mkl (abbreviation: KLH-mFa55) was administered via the tail vein at a dose of 400 mg/kg. In table Figure 25 shows details of drug treatment to evaluate Treg cells in the tumor and confirm systemic effects in the spleen.

- 82 045931- 82 045931

Таблица 25Table 25

Оценка внутриопухолевых и системных эффектов у модельных мышей с трансплантированными клетками Hepa1-6/hGPC3 (переключающие анти-CTLA4 антитела)Evaluation of intratumoral and systemic effects in mouse models transplanted with Hepa1-6/hGPC3 cells (switching anti-CTLA4 antibodies)

Группа Group Животных Animals Лекарство Medicine Доза Dose Введение Introduction Дата введения Date of introduction 1 1 3 3 KLH-mFa55 KLH-mFa55 400 мг/кг 400 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 2 2 3 3 SW1610mFa55 SW1610mFa55 50 мг/кг 50 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 3 3 3 3 SW1610mFa55 SW1610mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 4 4 3 3 SW1610mFa55 SW1610mFa55 200 мг/кг 200 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 5 5 3 3 SW1612mFa55 SW1612mFa55 50 мг/кг 50 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 6 6 3 3 SW1612mFa55 SW1612mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 7 7 3 3 SW1612mFa55 SW1612mFa55 200 мг/кг 200 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 8 8 3 3 SW1615mFa55 SW1615mFa55 50 мг/кг 50 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 9 9 3 3 SW1615mFa55 SW1615mFa55 100 мг/кг 100 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation 10 10 3 3 SW1615mFa55 SW1615mFa55 200 мг/кг 200 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation И AND 3 3 SW1615mFa55 SW1615mFa55 400 мг/кг 400 mg/kg В хвостовую вену To the tail vein 10й день после трансплантации 10th day after transplantation

Пример 5-4-7. Резекция опухолей и селезенки у модельных мышей с трансплантированными клетками Hepa1-6/hGPC3.Example 5-4-7. Resection of tumors and spleens in model mice transplanted with Hepa1-6/hGPC3 cells.

На 6-й день после введения антител мышей подвергают эвтаназии под наркозом и отделяли опухоли и селезенки. Из полученных селезенок готовят клеточную суспензию с использованием среды RPMI1640 (SIGMA), содержащей 10% FBS (фирма SIGMA), и затем подвергают гемолизу с использованием набора для лизирования эритроцитов мыши (фирма R&D) для получения клеток селезенки. Полученные опухоли измельчают с использованием набора для диссоциации опухолей мышей (фирма Miltenyi). Как клетки селезенки, так и раздробленные опухоли реагируют с приведенными ниже антителами и фракции присутствующих иммунных клеток анализируют с помощью метода FACS: антитело к CD45 (фирма BD, клон: 30-F11), антитело к CD3 (фирма BD, клон: UCHT1), анти-CD4 антитело (фирма BD, клон: RM4-5), анти-FoxP3 антитело (фирма eBioscience, клон: FJK-16s), антитело к ICOS (фирма eBioscience, клон: 7E17G9), антитело к CCR7 (фирма Biolegend, клон : 4В12), антитело против KLRG1 (фирма Biolegend, клон: 2F1/KLRG1). Анализ FACS выполняют с помощью BD LSR Fortessa X-20 (BD).On day 6 after antibody administration, mice were euthanized under anesthesia, and tumors and spleens were separated. From the obtained spleens, a cell suspension was prepared using RPMI1640 medium (SIGMA) containing 10% FBS (SIGMA), and then hemolyzed using a mouse erythrocyte lysis kit (R&D) to obtain spleen cells. The resulting tumors are crushed using a mouse tumor dissociation kit (Miltenyi). Both spleen cells and crushed tumors react with the following antibodies and the fractions of immune cells present are analyzed by FACS: anti-CD45 (BD, clone: 30-F11), anti-CD3 (BD, clone: UCHT1), anti-CD4 antibody (BD, clone: RM4-5), anti-FoxP3 antibody (eBioscience, clone: FJK-16s), anti-ICOS antibody (eBioscience, clone: 7E17G9), anti-CCR7 antibody (Biolegend, clone : 4B12), antibody against KLRG1 (Biolegend, clone: 2F1/KLRG1). FACS analysis is performed using a BD LSR Fortessa X-20 (BD).

Пример 5-4-8. Оценка Treg в опухоли в модели с трансплантированными клетками Hepa1-6/hGPC3.Example 5-4-8. Assessment of tumor Tregs in a Hepa1-6/hGPC3 cell transplantation model.

Оценивают изменения эффекторных клеток Treg (CD4+ FoxP3+ CCR7low KLRG1') в опухолях после введения анти-CTLA4 переключающих антител. В результате SW1610-mFa55, SW1612-mFa55 и SW1615mFa55 снижают долю эффекторных клеток Treg до уровня менее 0,2% CD45-положительных клеток во всех вводимых дозах (фиг. 21).Assess changes in Treg effector cells (CD4+ FoxP3 + CCR7 low KLRG1') in tumors after administration of anti-CTLA4 switching antibodies. As a result, SW1610 - mFa55, SW1612-mFa55 and SW1615mFa55 reduced the proportion of effector Treg cells to less than 0.2% CD45-positive cells at all administered doses (Fig. 21).

Пример 5-4-9. Оценка системного эффекта в селезенке в модели с трансплантированными клетками Hepa1-6/hGPC3.Example 5-4-9. Evaluation of the systemic effect in the spleen in a model with transplanted Hepa1-6/hGPC3 cells.

Изменения активированных хелперных Т-клеток (CD4+ Foxp3- ICOS+) в селезенке после введения анти-CTLA4-переключающих антител оценивают с помощью метода FACS. В результате соотношение активированных хелперных Т-клеток к CD45-положительным клеткам в селезенке существенно не увеличивается при концентрации оцениваемых доз 50 мг/кг для SW1610-mFa55 и SW1612-mFa55 и при 200 мг/кг или менее оцениваемых доз для SW1615-mFa55. Тест Даннета осуществляют в группе, получавшей KLH-mFa55, с использованием JMP 11.2.1 (фирма SAS Institute Inc.) для определения теста значимости (фиг. 22). Подтверждено, что хотя все переключающие антитела проявляют эффективность, они не вызывают ответа в тканях, отличных от опухоли, и что они обладают способностью проявлять активность только локально в опухоли.Changes in activated helper T cells (CD4 + Foxp3 - ICOS + ) in the spleen after administration of anti-CTLA4-switching antibodies are assessed using the FACS method. As a result, the ratio of activated helper T cells to CD45-positive cells in the spleen does not increase significantly at the 50 mg/kg evaluated doses for SW1610 - mFa55 and SW1612-mFa55 and at 200 mg/kg or less evaluated doses for SW1615-mFa55. Dunnett's test was performed on the KLH-mFa55 treated group using JMP 11.2.1 (SAS Institute Inc.) to determine the significance test (FIG. 22). It has been confirmed that although all switching antibodies are effective, they do not induce a response in tissues other than the tumor and that they only have the ability to be active locally in the tumor.

Пример 6. Создание варианта Fc-области, способного усиливать активность ADCC/ADCP.Example 6: Creation of an Fc region variant capable of enhancing ADCC/ADCP activity.

Для получения антител с усиленной активностью ADCC и ADCP, которые являются цитотоксическими эффекторными функциями, исследуют получение вариантов Fc-области с повышенной способностью связываться с активирующими FcYR-рецепторами FcYRIIIa и FcYRIIa.To obtain antibodies with enhanced ADCC and ADCP activity, which are cytotoxic effector functions, the production of Fc region variants with increased ability to bind to the activating FcYR receptors FcYRIIIa and FcYRIIa is being explored.

Пример 6-1. Получение и оценка вариантов с повышенным связыванием с FcyR.Example 6-1. Generation and evaluation of variants with increased binding to FcyR.

- 83 045931- 83 045931

Получают гетеродимеризованное антитело 04H1637-Kn125/04L1610-lam1//04H1637-H1076/04L1610 laml, имеющее константные области тяжелой цепи Kn125 и H1076 с повышенной способностью связывания с FcyR, описанное в WO 2013/002362, и имеющее 04Н1637 в качестве вариабельной области тяжелой цепи и 04L1610-lam1 в качестве легкой цепи. В частности, создан ген тяжелой цепи антитела 04H1637-Kn125 (SEQ ID NO: 162), который содержит 04Н1637 (SEQ ID NO: 138) в качестве одной вариабельной области тяжелой цепи и имеет L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A, интродуцированный в G1d (SEQ ID NO: 158) с удаленными Gly и Lys на С-конце константной области тяжелой цепи IgG1 человека, а также имеет изменения Y349C/T366W в области СН3, которые способствуют гетеродимеризации. Аналогичным образом создан ген тяжелой цепи антитела 04Н1637-Н1076 (SEQ ID NO: 163), который содержит 04Н1637 (SEQ ID NO: 138) в качестве другой вариабельной области тяжелой цепи и имеет D27OE/K326D/A33OM/K334E, интродуцированный в константную область G1d тяжелой цепи IgG1 человека (SEQ ID NO: 158), а также имеет изменения D356C/T366S/L368A/Y407V в области СН3, которые способствуют гетеродимеризации. Используя 04L1610-lam1 (SEQ ID NO: 161) в качестве легкой цепи антитела, получают гетеродимер 04Н1637-Kn125/04L1610-lam1//04Н1637-Н1076/04L1610 lam1 способом, известным специалистам в данной области. Гены тяжелых цепей антител 04Н1637-Кп462 (SEQ ID NO: 164), 04Н1637-Н1441 (SEQ ID NO: 165), 04Н1637-Н1445 (SEQ ID NO: 166), 04H1637-Kn461 (SEQ ID NO: 167) и 04Н1637-Н1443 (SEQ ID NO: 168), которые, в дополнение к L235Q, G236W, S239M, H268D, D270E, S298A, K326D и К334Е, имеют изменения, внесенные в область СН2 L234F и АЗЗОК, описанные в WO 2013/002362 как изменения, которые меняют связывание с FcyR; G236A, I332E и I332D, о которых сообщается в Mol. Cancer Ther., 2008, 7, 2517-2527 и WO 2004/029207; а также T250V и Т307Р, указанные в WO 2013/118858, как изменения для улучшения стабильности, в комбинации. Кроме того, получен ген тяжелой цепи антитела О4Н1654-КТ462 (SEQ ID NO: 182), в котором удалены Gly и Lys на С-конце IgG1 человека (IGHG1*03), и он имеет те же изменения, что и Kn462 в области СН2, изменение Е356К, которое способствует гетеродимеризации, как описано в WO 2006/106905 в области СН3, а также содержит 04Н1654 (SEQ ID NO: 140) в качестве вариабельной области тяжелой цепи. Сходным образом создан ген тяжелой цепи антитела 04Н1656-НТ441 (SEQ ID NO: 170), в котором удалены Gly и Lys на Сконце IgG1 человека (IGHG1*03), и он имеет те же изменения, что и Н1441 в области СН2, изменение К439Е, которое способствует гетеродимеризации, как описано в WO 2006/106905 в области СН3, а также содержит 04Н1656 (SEQ ID NO:141) в качестве вариабельной области тяжелой цепи. Аналогичным образом созданы гены 04Н1656-НТ445 (SEQ ID NO: 171), 04Н1654-КТ461 (SEQ ID NO: 183) и 04Н1656НТ443 (SEQ ID NO: 173). Кроме того, исследовали комбинацию изменений для улучшения в крови кинетики антител, описанных в Mabs, 2017, 9, 844-853. В частности, создан ген 04Н1654-КТ473 (SEQ ID NO: 184), в котором N434A/Y436T/Q438R/S440E введен в область СН3 04Н1654-КТ462 (SEQ ID NO: 182), что представляет собой комбинацию изменений, которые усиливают связывание с FcRn человека в кислых условиях, и изменения, снижающие связывание с ревматоидным фактором. Аналогичным образом создан ген для 04Н1656-НТ482 (SEQ ID NO: 185), который имеет N434A/Y436T/Q438R/S440E, интродуцированный в 04Н1656-НТ445 (SEQ ID NO: 171). Аналогично, тяжелая цепь антитела 04Н1654-КТ481 (SEQ ID NO: 186) и тяжелая цепь антитела 04Н1656-НТ498 (SEQ ID NO: 187) получены путем введения таких же изменений в 04Н1654-КТ461 и 04Н1656-НТ443, соответственно. Путем объединения этих тяжелых цепей и использования 04L1610-lam1 или 04L1612-lam1 (SEQ ID NO: 188) в качестве легкой цепи получены желаемые гетеродимеризованные антитела.Get heterodimerized antibody 04H1637-Kn125/04L1610-lam1//04H1637-H1076/04L1610 laml having the heavy chain constant regions Kn125 and H1076 with increased FcyR binding ability described in WO 2013/002362 and having 04H1637 as the heavy chain variable region and 04L1610-lam1 as a light chain. In particular, the antibody heavy chain gene 04H1637-Kn125 (SEQ ID NO: 162) was created, which contains 04H1637 (SEQ ID NO: 138) as one heavy chain variable region and has L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/ S298A introduced into G1d (SEQ ID NO: 158) with Gly and Lys removed at the C-terminus of the human IgG1 heavy chain constant region, and also has Y349C/T366W changes in the CH3 region that promote heterodimerization. Similarly, the antibody heavy chain gene 04H1637-H1076 (SEQ ID NO: 163) was generated, which contains 04H1637 (SEQ ID NO: 138) as another heavy chain variable region and has D27OE/K326D/A33OM/K334E introduced into the G1d constant region human IgG1 heavy chain (SEQ ID NO: 158), and also has changes D356C/T366S/L368A/Y407V in the CH3 region, which promote heterodimerization. Using 04L1610-lam1 (SEQ ID NO: 161) as the light chain of the antibody, obtaining the heterodimer 04H1637-Kn125/04L1610-lam1//04Н1637-Н1076/04L1610 lam1 in a manner known to those skilled in the art. Antibody heavy chain genes 04H1637-Kp462 (SEQ ID NO: 164), 04H1637-H1441 (SEQ ID NO: 165), 04H1637-H1445 (SEQ ID NO: 166), 04H1637-Kn461 (SEQ ID NO: 167) and 04H1637- H1443 (SEQ ID NO: 168), which, in addition to L235Q, G236W, S239M, H268D, D270E, S298A, K326D and K334E, have changes made to the CH2 region of L234F and ADZOC described in WO 2013/002362 as changes, which alter binding to FcyR; G236A, I332E and I332D, reported in Mol. Cancer Ther., 2008, 7, 2517-2527 and WO 2004/029207; and T250V and T307P, specified in WO 2013/118858, as changes to improve stability, in combination. In addition, the antibody heavy chain gene O4H1654-KT462 (SEQ ID NO: 182) was obtained, in which Gly and Lys at the C-terminus of human IgG1 were removed (IGHG1*03), and it has the same changes as Kn462 in the CH2 region , an E356K change that promotes heterodimerization as described in WO 2006/106905 in the CH3 region and also contains 04H1654 (SEQ ID NO: 140) as the heavy chain variable region. In a similar way, the antibody heavy chain gene 04H1656-HT441 (SEQ ID NO: 170) was created, in which Gly and Lys at the C-terminus of human IgG1 (IGHG1*03) are removed, and it has the same changes as H1441 in the CH2 region, change K439E , which promotes heterodimerization as described in WO 2006/106905 in the CH3 region, and also contains 04H1656 (SEQ ID NO:141) as the heavy chain variable region. The genes 04H1656-HT445 (SEQ ID NO: 171), 04H1654-KT461 (SEQ ID NO: 183) and 04H1656HT443 (SEQ ID NO: 173) were created in a similar way. In addition, a combination of changes to improve the blood kinetics of antibodies described in Mabs, 2017, 9, 844-853 was investigated. In particular, the gene 04H1654-KT473 (SEQ ID NO: 184) was created, in which N434A/Y436T/Q438R/S440E was introduced into the CH3 region of 04H1654-KT462 (SEQ ID NO: 182), which is a combination of changes that enhance binding to Human FcRn under acidic conditions and changes that reduce binding to rheumatoid factor. Similarly, a gene was created for 04H1656-HT482 (SEQ ID NO: 185), which has N434A/Y436T/Q438R/S440E introduced in 04H1656-HT445 (SEQ ID NO: 171). Similarly, the antibody heavy chain 04H1654-KT481 (SEQ ID NO: 186) and the antibody heavy chain 04H1656-HT498 (SEQ ID NO: 187) were obtained by introducing the same changes into 04H1654-KT461 and 04H1656-HT443, respectively. By combining these heavy chains and using 04L1610-lam1 or 04L1612-lam1 (SEQ ID NO: 188) as the light chain, the desired heterodimerized antibodies were obtained.

Внеклеточные домены FcyR получают следующим способом. Во-первых, гены внеклеточных доменов FcyR синтезированы способом, известным специалистам в данной области. Также последовательности каждого FcyR получают на основе информации, зарегистрированной в NCBI. В частности, FcyRI получен на основе последовательности NCBI с номером доступа NM_000566.3, FcYRIIa получен на основе последовательности NCBI с номером доступа NM_001136219.1, FcYRIIb получен на основе последовательности NCBI с номером доступа NM_004001.3, FcYRIIIa получен на основе последовательности NCBI с номером доступа NM_004001.3. получен на основе последовательности с номером доступа NCBINM_001127593.1, и к С-концу добавлена His-метка. Полиморфный сайт FcYRIIa получен со ссылкой на J. Exp. Med., 1990, 172, 19-25, а полиморфный сайт FcYRIIIa подготовлен со ссылкой на J. Clin. Invest., 1997, 100, 1059-1070. Векторы экспрессии получают путем инсерции полученных фрагментов генов в векторы экспрессии в клетках животных. Полученные векторы экспрессии временно вводят в клетки FreeStyle293, производные от клеток эмбрионального рака почки человека (фирма Invitrogen), для экспрессии белков, представляющих интерес. После получения культуральных супернатантов их пропускают через фильтр с порами 0,22 мкм и очищают, в принципе, на протяжении следующих четырех этапов. Первым этапом является катионообменная колоночная хроматография (SP Sepharose FF), вторым этапом является аффинная колоночная хроматография для His-tag (HisTrap HP), третьим этапом является колоночная хроматография с гель-фильтрацией (Superdex200), а четвертым этапом является асептическая фильтрация. Однако для FcyRI на первой стадии выполняли колоночную хроматографию на анионообменной колонке с использованием Q-сефарозы FF. Концентрацию очищенного белка рассчитывают путем измерения поглощения при 280 нм с использованием спектрофотометра и с использованием коэфThe extracellular domains of FcyR are obtained by the following method. First, the FcyR extracellular domain genes are synthesized in a manner known to those skilled in the art. Also, the sequences of each FcyR are obtained based on information registered in NCBI. In particular, FcyRI was obtained based on the NCBI sequence with accession number NM_000566.3, FcYRIIa was obtained based on the NCBI sequence with accession number NM_001136219.1, FcYRIIb was obtained based on the NCBI sequence with accession number NM_004001.3, FcYRIIIa was obtained based on the NCBI sequence with accession number access NM_004001.3. derived from the sequence accession number NCBINM_001127593.1, and a His tag was added to the C-terminus. The polymorphic site of FcYRIIa was obtained with reference to J. Exp. Med., 1990, 172, 19-25, and the FcYRIIIa polymorphic site was prepared with reference to J. Clin. Invest., 1997, 100, 1059-1070. Expression vectors are produced by inserting the resulting gene fragments into expression vectors in animal cells. The resulting expression vectors were transiently introduced into FreeStyle293 cells, derived from human embryonic kidney cancer cells (Invitrogen), to express proteins of interest. Once the culture supernatants are obtained, they are passed through a 0.22 μm pore filter and purified in principle through the following four steps. The first step is cation exchange column chromatography (SP Sepharose FF), the second step is His-tag affinity column chromatography (HisTrap HP), the third step is gel filtration column chromatography (Superdex200), and the fourth step is aseptic filtration. However, for FcyRI, the first step was anion exchange column chromatography using Q-Sepharose FF. The purified protein concentration is calculated by measuring the absorbance at 280 nm using a spectrophotometer and using the coefficient

- 84 045931 фициента экстинкции, рассчитанного из полученного значения с помощью такого метода, как РАСЕ (Protein Science, 1995, 4, 2411-2423). FcRn человека получают способом, описанным в WO 2010/107110.- 84 045931 extinction factor calculated from the obtained value using a method such as PACE (Protein Science, 1995, 4, 2411-2423). Human FcRn is obtained by the method described in WO 2010/107110.

Взаимодействие между полученными антителами и FcyR человека анализируют методом с использованием Biacore T200. В качестве подвижного буфера используют 50 мМ Na-фосфата, 150 мМ NaCl, 0,05% Tween20 (pH 7,4), анализ проводят при 25°С. В качестве сенсорных чипов используют чипы Series S SA (фирма GE Healthcare), на которых иммобилизован биотиновый конъюгат CaptureSelect Human Fablambda Kinetics (фирма Thermo Fisher Scientific). Исследуемые антитела захватываются этими чипами, и каждому FcyR, разведенному в рабочем буфере, созданы условия для взаимодействия с ними. Чипы регенерируют с помощью 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) и 25 мМ NaOH, и анализ проводят путем повторного захвата антител. Константы диссоциации KD (моль/л) для FcyR и каждого антитела рассчитывают с использованием программного обеспечения Biacore T200 Evaluation Software 2.0, используя модель связывания Ленгмюра 1:1 для FcYRIa и FcYRIIIa и модель аффинности стационарного состояния для FcYRIIa. Для FcYRIIb количество связывания FcYRIIb на единицу количества антитела рассчитывают путем корректировки количества связывания FcYRIIb, полученного из сенсограммы, построенной путем измерения с количеством антитела, захваченного поверхностью чипа.The interaction between the resulting antibodies and human FcyR was analyzed using a Biacore T200 method. 50 mM Na-phosphate, 150 mM NaCl, 0.05% Tween20 (pH 7.4) are used as a running buffer; the analysis is carried out at 25°C. Series S SA chips (GE Healthcare) are used as sensor chips, on which the CaptureSelect Human Fablambda Kinetics biotin conjugate (Thermo Fisher Scientific) is immobilized. The antibodies under study are captured by these chips, and conditions are created for each FcyR, diluted in the working buffer, to interact with them. The chips were regenerated with 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) and 25 mM NaOH, and the assay was performed by antibody recapture. Dissociation constants KD (mol/L) for FcyR and each antibody were calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0 using the 1:1 Langmuir binding model for FcYRIa and FcYRIIIa and the steady state affinity model for FcYRIIa. For FcYRIIb, the amount of FcYRIIb binding per unit amount of antibody is calculated by adjusting the amount of FcYRIIb binding obtained from the sensogram constructed by measuring with the amount of antibody captured on the chip surface.

Взаимодействие между полученными антителами и FcRn человека анализируют методом с использованием Biacore T200. В качестве подвижного буфера используют 50 мМ Na-фосфата, 150 мМ NaCl, 0,05% Tween20 (pH 7,4), анализ проводят при 25°С. В качестве сенсорных чипов используют чипы Series S SA (фирма GE Healthcare), на которых иммобилизован биотиновый конъюгат CaptureSelect Human Fablambda Kinetics (фирма Thermo Fisher Scientific). Исследуемые антитела захватываются этими чипами, и FcRn, разведенному в подвижном буфере, созданы условия для взаимодействия с ними. Чипы регенерируют с помощью 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) и 25 мМ NaOH, и анализ проводят путем повторного захвата антител. Константу диссоциации для FcRn и каждого антитела рассчитывают с использованием модели стационарного состояния с использованием программного обеспечения для оценки Biacore T200 2.0. Табл. 26 показывает результаты измерений.The interaction between the resulting antibodies and human FcRn was analyzed using a Biacore T200 method. 50 mM Na-phosphate, 150 mM NaCl, 0.05% Tween20 (pH 7.4) are used as a running buffer; the analysis is carried out at 25°C. Series S SA chips (GE Healthcare) are used as sensor chips, on which the CaptureSelect Human Fablambda Kinetics biotin conjugate (Thermo Fisher Scientific) is immobilized. The antibodies under study are captured by these chips, and conditions are created for FcRn, diluted in a running buffer, to interact with them. The chips were regenerated with 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) and 25 mM NaOH, and the assay was performed by antibody recapture. The dissociation constant for FcRn and each antibody was calculated using a steady state model using Biacore T200 2.0 evaluation software. Table 26 shows the measurement results.

Таблица 26Table 26

Анализ связывания вариантов Fc-области с рецепторами FcyRs и FcRn человекаAnalysis of binding of Fc region variants to human FcyRs and FcRn receptors

Антитело Antibody Заман иш в домке СН2_в константной области тяжелой цепи Кп или КТ Zaman ish in the house CH2_in the constant region of the heavy chain Kp or KT Замещения в домене CH2 в константной области тяжелой цепи Н1 или НТ Substitutions in the CH2 domain in the constant region of the heavy chain H1 or HT Ко для hFcRn <М) Co for hFcRn <M) Относительная в еличин а между Glm и hFcRn Relative in magnitude between Glm and hFcRn IQ, для hFcyR (M) IQ, for hFcyR (M) Связывающее количество Binding quantity Относительная величина KD между Glm и hFcyR Relative KD value between Glm and hFcyR Относительное связывающее количество Relative binding amount hFcyR hFcyR hFcyR Ite R hFcyR Ite R hFcyR Ite H hFcyR Ite H hFcyR tlte F hFcyR tlte F hFcyR Illa V hFcyR Illa V hFcyR lib hFcyR lib hFo-jrR la hFo-jrr la hFoyR Ite R hFoyR Ite R hFcyR Га H hFcyR Ga H HFcyR Illa F HFcyR Illa F hFcyR Ute V hFcyR Ute V hFcyR lib hFcyR lib 04Н163?-G1m/04L1610-lani1 04Н163?-G1m/04L1610-lani1 1.ЗЕ-06 1.ZE-06 1.0 1.0 4.9E-1I 4.9E-1I 2.0E-06 2.0E-06 1.5ЕНЭ6 1.5ENE6 1.4E-06 1.4E-06 246-07 246-07 0.008 0.008 10 10 10 10 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 10 10 Q4H1 637-Kn 125/04(.1 $1 0-1»т1 // 04Н1 637—HI076/04L1610-larr1 Q4H1 637-Kn 125/04(.1 $1 0-1 "t1 // 04Н1 637—HI076/04L1610-larr1 Зо !gS Sg «ля СМ *·> «ч и « « Zo !gS Sg «la SM *·> «ch and « « ог?ое/кз2ес»/Аззом /К334Е og?oe/kz2es»/Azzom/K334E N.T N.T. NT NT 4.CE-1I 4.CE-1I 1-2E-08 1-2E-08 4.ιε-07 4.ιε-07 3.4E-09 3.4E-09 1 96-09 1 96-09 0007 0007 1.2 1.2 1.6 1.6 3.6 3.6 406.3 406.3 125.6 125.6 0.9 0.9 04Н1 637-Kh462/04L1 61 0-Ι«ί>1// 04H1637-HI44l/04L1610-lam1 04Н1 637-Kh462/04L1 61 0-Ι«ί>1// 04H1637-HI44l/04L1610-lam1 1-2 MF/L235O/G23eWZ S23SM/T25OV/H2S8DZ D2706/S298A/T307P/ K326D 1-2 MF/L235O/G23eWZ S23SM/T25OV/H2S8DZ D2706/S298A/T307P/ K326D G236AZT25OV/D27OEZ S29SA/T3O7P/K325DZ К3346 G236AZT25OV/D27OEZ S29SA/T3O7P/K325DZ K3346 N.T N.T. NT NT 1.5E-10 1.5E-10 2.2E-07 2.2E-07 7.0E-08 7.0E-08 1.7E-09 1.7E-09 5.2E-C9 5.2E-C9 0.013 0.013 03 03 9.2 9.2 20.9 20.9 79.5 79.5 45.8 45.8 1.6 1.6 04H1 637-Kn462/04L1 61 0-laml // 04H1637-Н1445/04ив10-1лт1 04H1 637-Kn462/04L1 61 0-laml // 04H1637-N1445/04iv10-1lt1 L234F/L235Q/G236WZ S239M/T25OV/H268D/ D27O6/S298A/T307P7 K326D L234F/L235Q/G236WZ S239M/T25OV/H268D/ D27O6/S298A/T307P7 K326D > ζβ ¢3 W г» м « и « йёй 2 * с tn g с > ζβ ¢3 W g" m " and " yoi 2 * with tn g with N.T N.T. NT NT 7.66-11 7.66-11 1.16-07 1.16-07 3.9E-08 3.9E-08 3.86-09 3.86-09 1.8E-09 1.8E-09 0030 0030 0.6 0.6 187 187 3 7.5 3 7.5 382.2 382.2 130 7 130 7 3.7 3.7 04H1 63?-Kn461 /041.1 51 o-l9ri1 // 04H1 637-HI443/04L1610-lam1 04H1 63?-Kn461 /041.1 51 ol 9 ri1 // 04H1 637-HI443/04L1610-lam1 L2 34F/L235Q/G236WZ $ШМ/Т25Ф7/НШС>/ D 270E/S2S8A7T307P/ K32FD/1332E L2 34F/L235Q/G236WZ $ШМ/Т25Ф7/НШС>/ D 270E/S2S8A7T307P/ K32FD/1332E G236A/T250V/D270E/ S298A/T3O7P/K326OZ 1Э32Е/К3346 G236A/T250V/D270E/ S298A/T3O7P/K326OZ 1E32E/K3346 N.T N.T. NT NT 4.26-11 4.26-11 1.9E-C7 1.9E-C7 1.36-07 1.36-07 2.26-09 2.26-09 1.16-09 1.16-09 0025 0025 12 12 10.7 10.7 11.1 11.1 616 5 616 5 225 7 225 7 3 1 3 1 04H1854-KT462/O4L1610-lam1// 04H1 658-HT445/04Ll610-lam1 04H1854-KT462/O4L1610-lam1// 04H1 658-HT445/04Ll610-lam1 L2 34F/L235Q/G238WZ S239M/T250V/H258D/ ΒΪ7Ο£Ζ$298Α/Τ3ΰ7Ρ/ K326D L2 34F/L235Q/G238WZ S239M/T250V/H258D/ ΒΪ7Ο£Ζ$298Α/Τ3ΰ7Ρ/ K326D о ~ О 5s! «W® О О! fO « « 0 ω < o~o 5s! “W® O O! fO « « 0 ω < 1.5Е-О6 1.5E-O6 0.9 0.9 ЗОЕ-11 ZOE-11 1.6E-07 1.6E-07 1 IE-07 1 IE-07 33E-O9 33E-O9 2.2E-09 2.2E-09 0025 0025 1.6 1.6 13.0 13.0 13.9 13.9 414.7 414.7 109.6 109.6 3 1 3 1 04H1 654- KT461/04L1610-laml// 04H1S58 -HT448/04LI6l0-teml 04H1 654- KT461/04L1610-laml // 04H1S58 -HT448/04LI6l0-teml L234F/L235Q/G236W/ S2 39M/T2 5OV/H2 88D/ D27M/S2S8A/T307P/ K326D/J332E L234F/L235Q/G236W/ S2 39M/T2 5OV/H2 88D/ D27M/S2S8A/T307P/ K326D/J332E G236A/T250V/D270EZ S298A/T3O7P/K326OZ Ι332Ε/Κ3346 G236A/T250V/D270EZ S298A/T3O7P/K326OZ Ι332Ε/Κ3346 1.5Е-О6 1.5E-O6 0.9 0.9 3 26-И 3 26-I 2.4E-07 2.4E-07 2.OE-O7 2.OE-O7 26E-09 26E-09 1.56-09 1.56-09 0025 0025 1.5 1.5 8 4 8 4 7.3 7.3 525.5 525.5 156 1 156 1 3.1 3.1 04H1 854-KT473/04L1610-larn1// 04H1 65i-HT482/04LI610-lam1 04H1 854-KT473/04L1610-larn1// 04H1 65i-HT482/04LI610-lam1 L234F/L235Q/G236WZ S239M/T25OV/H28SD/ D270E/S298A/T307PZ КЯ26Г. L234F/L235Q/G236WZ S239M/T25OV/H28SD/ D270E/S298A/T307PZ KYA26G. SSuj он й 3 § & о Н 1- 2 4 < ϋ « « е « о СЧ -Ы « SSuj he y 3 §&o N 1- 2 4 < ϋ « « e « o SCH-Y " 5.8Е-07 5.8E-07 2 3 2 3 4 6E-1I 4 6E-1I 1.5E-07 1.5E-07 8.16-08 8.16-08 3.8E-09 3.8E-09 2.IE-09 2.IE-09 0026 0026 1.1 1.1 13.9 13.9 18.0 18.0 3634 3634 1146 1146 32 32 04H1654-KT481/04L1610-lam1// 04H1 85U—HT498/04L1610-tem1 04H1654-KT481/04L1610-lam1// 04H1 85U—HT498/04L1610-tem1 L234F/L235O/G236WZ S239M/T25OV/H268D/ D 2706/8298А/Т307Р/ K326D/1332E L234F/L235O/G236WZ S239M/T25OV/H268D/ D 2706/8298А/Т307Р/ K326D/1332E G236A/T2S0V/D2706Z S298A/T3O7PZK326DZ 1Э32Е/К.3346 G236A/T2S0V/D2706Z S298A/T3O7PZK326DZ 1E32E/K.3346 57Е-О7 57E-O7 2.3 2.3 3.3 E-11 3.3 E-11 2.6E-C7 2.6E-C7 2.3E-O7 2.3E-O7 28E-O9 28E-O9 1.6E-09 1.6E-09 0022 0022 1.$ 1.$ 77 77 6.5 6.5 49S.2 49S.2 152.0 152.0 2.7 2.7 04H1654-KT462/O4Ll612-lam1/Z 04H1S5C-HT445/04L1612-lam1 04H1654-KT462/O4Ll612-lam1/Z 04H1S5C-HT445/04L1612-lam1 Li 34F/L235Q/G236W/ S239M/T25OV/H268O/ D270E/5293A/T307PZ K378D Li 34F/L235Q/G236W/ S239M/T25OV/H268O/ D270E/5293A/T307PZ K378D G236A/T250V/D270EZ 8298A/T3O7P/K326OZ A33OK/I332D/K334E G236A/T250V/D270EZ 8298A/T3O7P/K326OZ A33OK/I332D/K334E 1 66-OS 1 66-OS 0 3 0 3 4.16-11 4.16-11 1.46-0? 1.46-0? 9.16-08 9.16-08 3.46-09 3.46-09 2.36-09 2.36-09 0.028 0.028 1.2 1.2 14.2 14.2 16.1 16.1 408.0 408.0 105.7 105.7 3.4 3.4 04Hl854-KT46l/O4Ll612-teml// D4H1658-HT443/04L1612-lam1 04Hl854-KT46l/O4Ll612-teml// D4H1658-HT443/04L1612-lam1 L2 S4F/L235O/G236WZ S23SM/T25OV/H268D/ D270E/S298A/T307P/ K3?fin/13.19F L2 S4F/L235O/G236WZ S23SM/T25OV/H268D/ D270E/S298A/T307P/ K3?fin/13.19F G236AZT250V/D270EZ S298A/T3O7P/K.326DZ I332E/K334E G236AZT250V/D270EZ S298A/T3O7P/K.326DZ I332E/K334E 1 6Е-О6 1 6E-O6 0 8 0 8 3.9E-11 3.9E-11 2.5E-07 2.5E-07 2.IE-07 2.IE-07 2.6E-O9 2.6E-O9 1.БЕ-09 1.BE-09 0.025 0.025 1.3 1.3 8 2 8 2 7.1 7.1 536 8 536 8 1588 1588 3.1 3.1 Q4H1654-KT473/04L1612-lani1// 04H1 656-HT482ZO4L101 2-larril Q4H1654-KT473/04L1612-lani1// 04H1 656-HT482ZO4L101 2-larril L234F/L235O/G236WZ S239M/T25OV/H268D/ D270E/S298AZT307P/ K326D L234F/L235O/G236WZ S239M/T25OV/H268D/ D270E/S298AZT307P/ K326D G236A/T250V/D270EZ S298A/T3O7P/K326DZ A330K/I332D/K334E G236A/T250V/D270EZ S298A/T3O7P/K326DZ A330K/I332D/K334E 6 2Е-О7 6 2E-O7 2.1 2.1 4.BE-11 4.BE-11 1.5E-07 1.5E-07 9.1E-O8 9.1E-O8 39E-O9 39E-O9 2.2E-09 2.2E-09 0026 0026 1.0 1.0 138 138 1S2 1S2 354.6 354.6 1100 1100 32 32 04H1654-KT4ei/O4Liei2-lam1// 04H165t-HT49e/O4L1612-lam1 04H1654-KT4ei/O4Liei2-lam1// 04H165t-HT49e/O4L1612-lam1 L2 34F/L235Q/G236WZ S239M/T250V/H268D/ D270E/S29BA/T307PZ K326D/J332E L2 34F/L235Q/G236WZ S239M/T250V/H268D/ D270E/S29BA/T307PZ K326D/J332E G236A/T250V/D270EZ S298A/T3O7P/K326DZ I332E/K334E G236A/T250V/D270EZ S298A/T3O7P/K326DZ I332E/K334E 6.ОЕ-О7 6.OE-O7 2 2 2 2 4.3E-11 4.3E-11 2.7E-C7 2.7E-C7 2.3E-07 2.3E-07 296-09 296-09 1.76-09 1.76-09 0022 0022 11 eleven 7 6 7 6 6.4 6.4 479 2 479 2 145.2 145.2 5 6 5 6

N.T.: Не исследовали.N.T.: Not explored.

Значения KD для hFcRn (M) и KD для рецепторов hFcYR (M) в таблице указывают на константы диссоциации для hFcRn и каждого FcyR, соответственно, а количество связывания показывает количество связываемого FcYRIIb на единицу количества антитела, когда для FcYRIIb создавали возможность для взаимодействия при 1000 нМ. Понятия относительное значение для KD между G1m и hFcRn и относительное значение для KD между G1m и рецепторами hFcYR представляют собой значения, полученные путем деления значения KD для 04H1637-G1m/04L1610’lam1 для hFcRn и для каждого FcyR на значение KD для каждого варианта, соответственно. Понятие относительное количество связывания означает величину, полученную путем деления количества связывания каждого варианта с FcYRIIb наThe KD values for hFcRn (M) and KD for hFcYR receptors (M) in the table indicate the dissociation constants for hFcRn and each FcyR, respectively, and the amount of binding indicates the amount of FcYRIIb bound per unit amount of antibody when FcYRIIb was allowed to interact at 1000 nM. The terms relative value for KD between G1m and hFcRn and relative value for KD between G1m and hFcYR receptors are values obtained by dividing the KD value for 04H1637-G1m/04L1610'lam1 for hFcRn and for each FcyR by the KD value for each variant, respectively . The term relative binding amount means the value obtained by dividing the amount of binding of each variant to FcYRIIb by

- 85 045931 количество связывания 04H1637-G1m/04L1610-lam1. Аминокислотные последовательности тяжелой цепи антитела 04H1637-G1m и легкой цепи антитела 04L1610-lam1 показаны в SEQID NO: 160 и 161, соответственно. Показано, что все полученные гетеродимеризованные антитела обладают повышенным связыванием с FcYRIIa и FcYRIIIa по сравнению с 04H1637-G1m/04L1610-lam1, имеющим константную область нативного IgG1 человека. Кроме того, было показано, что 04H1637-Kn462/04L1610-lam1//04H1637H1441/04L1610-lam1, 04H1637-Kn462/04L1610-lam1//04H1637-H1445/04L1610-lam1 и 04H1637Kn461/04L1610-laml//04H1637-H1443/04L1610-lam1 обладают повышенным связыванием с FcYRIIa по сравнению с 04H1637-Kn125/04L1610-lam1//04H1637-H1076/04L1610-lam1, которое имеет вариант Fcобласти, описанный в WO 2013/002362. Показано, что связывающая способность 04H1637Kn462/04L1610-lam1//04H1637-H1445/04L1610-lam1 с FcYRIIIa равна таковой у 04H1637-Kn125/04L1610 lam1//04H1637-H1076/04L1610-lam1, a связывающая способность 04H1637-Kn461/04L1610 lam1//04H1637-H1443/04L1610-lam1 с FcYRIIIa выше по сравнению с 04H1637-Kn125/04L1610 lam1//04H1637-H1076/04L1610-lam1. Показано, что аналогичным образом 04H1654-KT462/04L1610 laml//04H1656-HT445/04L1610-lam1 и 04H1654-KT462/04L1612-lam1//04H1656-HT445/04L1610-lam1, имеющие разные изменения для гетеродимеризации константной области и области СН3 в IGHG1*03, имеют сопоставимые профили связывания FcyR с 04H1637-Kn462/04L1610-lam1//04H1637H1445/04L1610-lam1, а также показано, что 04H1654-KT461/04L1610-lam1//04H1656-HT443/04L1610-lam1 и 04Н1654-KT461/04L1612-lam1//04H1656-HT443/04L1610-lam1 имеют сопоставимые профили связывания FcyR с FcyR с 04H1637-Kn461/04L1610-lam1//04H1637-H1443/04L1610-lam1. Кроме того, 04H1654KT473/04L1610-lam1//04H1656-HT482/04L1610-lam1, 04H1654-KT481/04L1610-lam1//04H1656HT498/04L1610-lam1, 04H1654-KT473/04L1612-lam1//04H1656-HT482/04L1612-lam1 и 04H1654KT481/04L1612-laml//04H1656-HT498/04L1612-lam1 с внесенными изменениями для улучшения кинетики крови обладают улучшенной способностью связывания с FcRn человека и сравнимой способностью связывания с FcyR по сравнению с антителами до внесения изменений для улучшения кинетики крови.- 85 045931 binding quantity 04H1637-G1m/04L1610-lam1. Amino acid sequences of the heavy chain of antibody 04H1637-G1m and the light chain of antibody 04L1610-lam1 are shown in SEQID NO: 160 and 161, respectively. It was shown that all the obtained heterodimerized antibodies have increased binding to FcYRIIa and FcYRIIIa compared to 04H1637-G1m/04L1610-lam1, which has the constant region of native human IgG1. In addition, it was shown that 04H1637-Kn462/04L1610-lam1//04H1637H1441/04L1610-lam1, 04H1637-Kn462/04L1610-lam1//04H1637-H1445/04L1610-lam1 and 04H1637Kn461/04L1610-laml//04H1637-H1443/04L1610-lam1 have increased binding to FcYRIIa compared to 04H1637-Kn125/04L1610-lam1//04H1637-H1076/04L1610-lam1, which has a variant of the Fc region described in WO 2013/002362. It has been shown that the binding capacity of 04H1637Kn462/04L1610-lam1//04H1637-H1445/04L1610-lam1 with FcYRIIIa is equal to that of 04H1637-Kn125/04L1610 lam1//04H1637-H1076/04L1610-lam1, a binding capacity 04H1637-Kn461/04L1610 lam1//04H1637-H1443/04L1610-lam1 with FcYRIIIa is higher compared to 04H1637-Kn125/04L1610 lam1//04H1637-H1076/04L1610-lam1. It is shown that in a similar way 04H1654-KT462/04L1610 laml//04H1656-HT445/04L1610-lam1 and 04H1654-KT462/04L1612-lam1//04H1656-HT445/04L1610-lam1, having different changes for heterodimerization of the constant region and the CH3 region in IGHG1*03, have comparable FcyR binding profiles to 04H1637-Kn462/04L1610-lam1//04H1637H1445/04L1610-lam1, and also shown that 04H1654-KT461/04L1610-lam1//04H1656-HT443/04L1610-lam1 and 04Н1654-KT461/04L1612-lam1//04H1656-HT443/04L1610-lam1 have comparable FcyR to FcyR binding profiles to 04H1637-Kn461/04L1610-lam1//04H1637-H1443/04L1610-lam1. In addition, 04H1654KT473/04L1610-lam1//04H1656-HT482/04L1610-lam1, 04H1654-KT481/04L1610-lam1//04H1656HT498/04L1610-lam1, 04H1654-KT473/04L1612-lam1//04H1656-HT482/04L1612-lam1 and 04H1654KT481/04L1612-laml//04H1656-HT498/04L1612-lam1 with modifications to improve blood kinetics have improved FcRn binding ability human and comparable ability binding to FcyR compared to antibodies before changes were made to improve blood kinetics.

Также создан ген 04Н1656-НТ451 (SEQ ID NO: 272), в котором N434A/Y436T/Q438R/S440E введен в последовательность 04Н1656-НТ441, которая представляет собой комбинацию изменений, которые усиливают связывание с FcRn человека в кислых условиях, и изменений, снижающих связывание с ревматоидным фактором. Аминокислотная последовательность тяжелой цепи антитела НТ451 показана в SEQ ID NO: 276. Гетеродимеризованное антитело получено путем объединения O4H1654-KT473 и 04Н1656-НТ451 и использования 04L1610-lam1 в качестве легкой цепи антитела. В табл. 27 показаны результаты анализа взаимодействия полученных антител с FcRn человека и с FcyR человека.The 04H1656-HT451 gene (SEQ ID NO: 272) was also created, in which N434A/Y436T/Q438R/S440E is introduced into the 04H1656-HT441 sequence, which is a combination of changes that increase binding to human FcRn under acidic conditions, and changes that reduce binding to rheumatoid factor. The amino acid sequence of the heavy chain of antibody HT451 is shown in SEQ ID NO: 276. The heterodimerized antibody is prepared by combining O4H1654-KT473 and 04H1656-HT451 and using 04L1610 - lam1 as the antibody light chain. In table 27 shows the results of an analysis of the interaction of the resulting antibodies with human FcRn and with human FcyR.

Таблица 27Table 27

Анализ связывания вариантов Fc-области с FcyR и FcRnAnalysis of binding of Fc region variants to FcyR and FcRn

Антитело $ flj pq s яAntibody $ flj pq s i

Кр для hFcyR (М)Kp for hFcyR (M)

I*I*

Относительная величина KD между Gkn и hFcyRRelative KD value between Gkn and hFcyR

SilSil

04Н1656-G1 m/04L1610-lam 104Н1656-G1 m/04L1610-lam 1

04H1654-KT462/04L1610-I am 1 // 04H1656-HT441/04L1610-lam104H1654-KT462/04L1610-I am 1 // 04H1656-HT441/04L1610-lam1

04H1654-KT473/04L1610-lam 1 //04H1654-KT473/04L1610-lam 1 //

04H1656-HT451 /04L1610-lam 104H1656-HT451 /04L1610-lam 1

Н: оBut

HFcyR la hFcyR Па R hFcyR Па Η hFcyR Ша FHFcyR la hFcyR Pa R hFcyR Pa Η hFcyR Pa F

HFcyR Ша VHFcyR Sha V

HFcyR Kb hFcyR laHFcyR Kb hFcyR la

HFcyR Ila R hFcyR Па H hFcyR Illa F hFcyR Ша V hFcyR пьHFcyR Ila R hFcyR Pa H hFcyR Illa F hFcyR Sha V hFcyR p

1.7Е-О61.7E-O6

9.2Е-119.2E-11

1.6Е-061.6E-06

1.ЗЕ-061.ZE-06

1.0Е-061.0E-06

9.7Е-079.7E-07

0.0030.003

1.01.0

1.01.0

1.01.0

1.01.0

1.01.0

1.01.0

2ΌΕ-Ο62ΌΕ-Ο6

1.SE-071.SE-07

9.9Е-089.9E-08

1.7Е-081.7E-08

4.4Е-094.4E-09

0.0140.014

0.80.8

9.09.0

13.513.5

58.158.1

218.3218.3

5.4Е-075.4E-07

3.23.2

1.8Е-071.8E-07

9.2Е-089.2E-08

2.0Е-082.0E-08

5.1Е-095.1E-09

0.0120.012

0.60.6

8.98.9

14.514.5

50.850.8

190.3190.3

1.5 * Величину KD определяют по стационарной модели.1.5 * The value of K D is determined using a stationary model.

Установлено, что полученные гетеродимеризованные антитела O4H1654-KT462/O4L161O lam1//04H1656-HT441/04L1610-lam1 и 04H1654-KT473/04L1610-laml//04H1656-HT451/04L1610-lam1 обладают усиленным связыванием с активирующими FcyR, а именно FcYRIIIa и FcYRIIIa, по сравнению с 04Н1656- G1m/04L1610-lam1, которое имеет константную область нативного IgG1 человека. Кроме того, связывание с FcYRIIb, который является ингибирующим FcyR, поддерживалось на том же уровне, что и 04H1656-G1m/04L1610-lam1 в обоих этих антителах. Показано, что 04H1654-KT473/04L1610 lam1//04H1656-HT451/04L1610-lam1, в котором фрагмент N434A/Y436T/Q438R/S440E интродуцирован в 04Н1654-KT462/04L1610-lam1//04H1656-HT441/04L1610-lam1, проявляет повышенную способность связываться с FcRn человека по сравнению с таковой до внесения изменений.It was established that the resulting heterodimerized antibodies O4H1654-KT462/O4L161O lam1//04H1656-HT441/04L1610-lam1 and 04H1654-KT473/04L1610-laml//04H1656-HT451/04L1610-lam1 have enhanced binding to activating FcyRs, namely FcYRIIIa and FcYRIIIa, compared to 04H1656-G1m/04L1610-lam1, which has the constant region of native human IgG1. In addition, binding to FcYRIIb, which is FcyR inhibitory, was maintained at the same level as 04H1656-G1m/04L1610-lam1 in both of these antibodies. Shown to be 04H1654-KT473/04L1610 lam1//04H1656-HT451/04L1610-lam1, in which the N434A/Y436T/Q438R/S440E fragment was introduced into 04H1654-KT462/04L1610-lam1//04H1656-HT441/04L1610-lam1 exhibits increased ability to bind to human FcRn compared to before the modification.

Затем были получены варианты с усиленным связыванием FcyR с использованием различных изменений для гетеродимеризации, описанных в Nat. Biotechnol., 1998, 16, 677-681, оценена их активность связывания с FcRn и FcyR человека. Получают гены тяжелых цепей антител 04H1389-Ks462 (SEQ ID NO: 191) и 04H1389-Km462 (SEQ ID NO: 199), которые содержат 04Н1389 (SEQ ID NO: 136) в качестве вариабельной области тяжелой цепи и константную область тяжелой цепи, которая имеет те же изменения, что и KT462, введенные в область СН2 константной области с удаленными Gly и Lys на С-конце IgG1 человека (IGHG1*03), и, кроме того, содержит в области СН3 T366W, введенный, как изменение с цельюEnhanced FcyR binding variants were then generated using various heterodimerization changes described in Nat. Biotechnol., 1998, 16, 677-681, their binding activity to human FcRn and FcyR was assessed. Antibody heavy chain genes 04H1389-Ks462 (SEQ ID NO: 191) and 04H1389-Km462 (SEQ ID NO: 199) are obtained, which contain 04H1389 (SEQ ID NO: 136) as the heavy chain variable region and the heavy chain constant region, which has the same changes as KT462, introduced into the CH2 region of the constant region with Gly and Lys removed at the C-terminus of human IgG1 (IGHG1*03), and, in addition, contains T366W in the CH3 region, introduced as a change to

- 86 045931 гетеродимеризации для 04H1389-Ks462, и y349C/T366W, введенный как изменение с целью гетеродимеризации для 04Н1389-Km462. Кроме того, получены гены тяжелых цепей антител 04H1389-Hs445 (SEQ ID NO: 192) и 04H1389-Hm445 (SEQ ID NO: 200), которые имеют те же изменения, что и НТ445, введенные в область СН2, и, кроме того, имеют в области СН3 T366S/L368A/Y407V, введенные в качестве изменений для гетеродимеризации 04H1389-Hs445. Аналогично, получают 04H1389-Ks461 (SEQ ID NO: 193), 04ffi389-Km461 (SEQ ID NO: 201), 04H1389-Hs443 (SEQ ID NO: 194) и 04H1389-Hm443 (SEQ ID NO: 202), которые имеют те же изменения, что и у KT461 и НТ443 в области СН2. Кроме того, получают гены тяжелых цепей антител 04H1389-Ks473 (SEQ ID NO: 195), 04H1389-Hs482 (SEQ ID NO: 196), 04H1389-Ks481 (SEQ ID NO: 197), 04H1389-Hs498 (SEQ ID NO: 198), 04H1389-Km473 (SEQ ID NO: 203), 04H1389-Hm482 (SEQ ID NO: 204), 04H1389-Km481 (SEQ ID NO: 205) и 04H1389-Hm498 (SEQ ID NO: 206), которые имеют изменения N434A/Y436T/Q438R/S440E, которые улучшают кинетику крови, введенные в вышеуказанные константные области тяжелой цепи Ks462, Hs445, Ks461, Hs443, Km462, Hm445, Km461 и Hm443, и содержат 04Н389 в качестве вариабельной области. 04L1615-k0MT (SEQ ID NO: 190) используют в качестве легкой цепи и получают представляющие интерес гетеро димеры. Для сравнения получен гомодимер 04H1389-G1m/04L16150k0MT, содержащий 04H1389-G1m (SEQ ID NO: 189). Взаимодействие между разработанными антителами и рецепторами FcyR человека анализируют с использованием Biacore T200. В качестве подвижного буфера используют 50 мМ Na-фосфата, 150 мМ NaCl, 0,05% Tween20 (pH 7,4), анализ проводят при 25°С. Для сенсорного чипа используют чипы Series S SA (фирма GE Healthcare), на которые был иммобилизован биотиновый конъюгат CaptureSelect Human Fab-kappa Kinetics (фирма Thermo Fisher Scientific). Исследуемые антитела захвачены этими чипами, и каждому FcyR, разведенному в подвижном буфере, дают возможность взаимодействовать с ними. Чипы регенерируют с помощью 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) и 25 мМ NaOH и проводят анализ путем повторного захвата антител. Константы диссоциации KD (моль/л) для FcyR каждого антитела рассчитывают с использованием программного обеспечения Biacore T200 Evaluation Software 2.0 и модели связывания Ленгмюра 1:1 для FcYRIa и FcYRIIIa, а также модели стационарной аффинности для FcYRIIa. Для FcYRIIb количество связывания FcYRIIb на единицу количества антитела рассчитывают путем корректировки количества связывания FcYRIIb, полученного из сенсограммы, построенной на основании измерения, с количеством антител, захваченных на поверхности чипа. Для измерения связывания с FcRn в качестве подвижного буфера используют 50 мМ Na-фосфата, 150 мМ NaCl, 0,05% Tween20 (pH 6,0), а константу диссоциации KD (моль/л) рассчитывают по модели стационарного состояния (табл. 28). Что касается констант диссоциации для FcYRIIIa в табл. 28, значения, отмеченные знаком *, представляют собой значения, рассчитанные с помощью стационарной модели аффинности.- 86 045931 heterodimerization for 04H1389-Ks462, and y349C/T366W introduced as a heterodimerization change for 04H1389-Km462. In addition, the heavy chain genes of the antibodies 04H1389-Hs445 (SEQ ID NO: 192) and 04H1389-Hm445 (SEQ ID NO: 200) were obtained, which have the same changes as HT445 introduced into the CH2 region, and, in addition, have in the CH3 region T366S/L368A/Y407V, introduced as changes for heterodimerization of 04H1389-Hs445. Similarly, 04H1389-Ks461 (SEQ ID NO: 193), 04ffi389-Km461 (SEQ ID NO: 201), 04H1389-Hs443 (SEQ ID NO: 194) and 04H1389-Hm443 (SEQ ID NO: 202) are obtained, which have those the same changes as KT461 and HT443 in the CH2 region. In addition, antibody heavy chain genes 04H1389-Ks473 (SEQ ID NO: 195), 04H1389-Hs482 (SEQ ID NO: 196), 04H1389-Ks481 (SEQ ID NO: 197), 04H1389-Hs498 (SEQ ID NO: 198) are obtained ), 04H1389-Km473 (SEQ ID NO: 203), 04H1389-Hm482 (SEQ ID NO: 204), 04H1389-Km481 (SEQ ID NO: 205) and 04H1389-Hm498 (SEQ ID NO: 206), which have N434A changes /Y436T/Q438R/S440E, which improve blood kinetics, introduced into the above heavy chain constant regions Ks462, Hs445, Ks461, Hs443, Km462, Hm445, Km461 and Hm443, and contain 04H389 as a variable region. 04L1615-k0MT (SEQ ID NO: 190) is used as the light chain and the hetero dimers of interest are obtained. For comparison, a homodimer 04H1389-G1m/04L16150k0MT containing 04H1389-G1m (SEQ ID NO: 189) was obtained. The interaction between the designed antibodies and human FcyR receptors was analyzed using Biacore T200. 50 mM Na-phosphate, 150 mM NaCl, 0.05% Tween20 (pH 7.4) are used as a running buffer; the analysis is carried out at 25°C. For the sensor chip, Series S SA chips (GE Healthcare) were used, onto which the CaptureSelect Human Fab-kappa Kinetics biotin conjugate (Thermo Fisher Scientific) was immobilized. The antibodies of interest are captured on these chips, and each FcyR, diluted in running buffer, is allowed to interact with them. The chips were regenerated with 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) and 25 mM NaOH and assayed by antibody recapture. Dissociation constants KD (mol/L) for the FcyR of each antibody were calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0 and a 1:1 Langmuir binding model for FcYRIa and FcYRIIIa, and a steady-state affinity model for FcYRIIa. For FcYRIIb, the amount of FcYRIIb binding per unit amount of antibody is calculated by adjusting the amount of FcYRIIb binding obtained from the sensogram generated from the measurement with the amount of antibody captured on the chip surface. To measure binding to FcRn, 50 mM Na-phosphate, 150 mM NaCl, 0.05% Tween20 (pH 6.0) are used as a running buffer, and the dissociation constant KD (mol/l) is calculated using the steady state model (Table 28 ). As for the dissociation constants for FcYRIIIa in Table. 28, the values marked with * are the values calculated using the stationary affinity model.

Таблица 28Table 28

Анализ связывания вариантов Fc-области с рецепторами FcyR и FcRn человекаAnalysis of binding of Fc region variants to human FcyR and FcRn receptors

Антитело Antibody Кодая hFcRn CM) Code hFcRn CM) Относительная величина KD между Glm и hFcRn Relative KD value between Glm and hFcRn Kd дая hFcyR (M) Kd giving hFcyR (M) Связывающее количество Binding quantity Относительная величина KD между Glm и hFcyR Relative KD value between Glm and hFcyR Относительное связывающее количество Relative binding amount hFcy Ria hFcy Ria hFcyR Ila R hFcyR Ila R hFcyR Па H hFcyR Pa H hFcyR Ша F hFcyR Sha F hFcyR Ша V hFcyR Sha V hFcyR lib hFcyR lib hFcyR la hFcyRla hFcyR Ila R hFcyR Ila R hFcyR Па H hFcyR Pa H hFcyR Ша V hFcyR Sha V hFcyR пь hFcyR pn 04Н1 389-G1m/04L1615-kOMT 04Н1 389-G1m/04L1615-kOMT 1.3E-06 1.3E-06 1.0 1.0 4.5E-11 4.5E-11 1.5E-06 1.5E-06 1. IE-06 1.IE-06 NT. N.T. 9.1E-07 9.1E-07 0.011 0.011 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 O4H1389-Ks462/O4l_1615-kOMT// 04H1389-Hs445/04L1615-kOMT O4H1389-Ks462/O4l_1615-kOMT// 04H1389-Hs445/04L1615-kOMT 1.6E-06 1.6E-06 0.8 0.8 4.7E-11 4.7E-11 1.6E-07 1.6E-07 6.7E-08 6.7E-08 2. IE-09 2.IE-09 1.1E-09 1.1E-09 0.030 0.030 1.0 1.0 9.1 9.1 15.8 15.8 829.9 829.9 2.6 2.6 04H1389-Ks461 Z04L1615-kOMT// 04H1389-Hs443/04L1615-kOMT 04H1389-Ks461 Z04L1615-kOMT// 04H1389-Hs443/04L1615-kOMT 1.7E-06 1.7E-06 0.8 0.8 3.0E-11 3.0E-11 2.5E-07 2.5E-07 1.6E-07 1.6E-07 1.2E-09 1.2E-09 5.6E-10 5.6E-10 0.024 0.024 1.5 1.5 5.9 5.9 6.7 6.7 1627.2 1627.2 2.1 2.1 04H1389-Ks473/04L1615-kOMT// 04H1389-Hs482/O4L161 5-kOMT 04H1389-Ks473/04L1615-kOMT// 04H1389-Hs482/O4L161 5-kOMT 4.5E-O7 4.5E-O7 2.9 2.9 5.1E-11 5.1E-11 1.6E-07 1.6E-07 7.5E-08 7.5E-08 2.3E-09 2.3E-09 1.2E-09 1.2E-09 0.026 0.026 0.9 0.9 9.0 9.0 14.1 14.1 760.2 760.2 2.3 2.3 04H1389-Ks481 /04L161 5-kOMT// 04H1389-Hs498/04L 1615-kOMT 04H1389-Ks481 /04L161 5-kOMT// 04H1389-Hs498/04L 1615-kOMT 4.6E-07 4.6E-07 2.8 2.8 2.8E-11 2.8E-11 2.6E-O7 2.6E-O7 1.9E-07 1.9E-07 1.3E-09 1.3E-09 6ΌΕ-10 6ΌΕ-10 0.023 0.023 1.6 1.6 5.6 5.6 5.6 5.6 1500.7 1500.7 2.0 2.0 04H1389-Km462/04L1615-kOMT// 04H1389-Hm445/04L1615-kOMT 04H1389-Km462/04L1615-kOMT// 04H1389-Hm445/04L1615-kOMT 1.7E-06 1.7E-06 0.8 0.8 4.8E-11 4.8E-11 1.6E-07 1.6E-07 7.4E-08 7.4E-08 2.2E-09 2.2E-09 1.1E-09 1.1E-09 0.029 0.029 0.9 0.9 9.5 9.5 14.4 14.4 810.6 810.6 2.6 2.6 04H1389-Km461 /04L1615-kOMT// 04H1389-Hm443/04L1615-kOMT 04H1389-Km461 /04L1615-kOMT// 04H1389-Hm443/04L1615-kOMT 1.7E-06 1.7E-06 0.7 0.7 2.5E-11 2.5E-11 2.6E-07 2.6E-07 1.9E-07 1.9E-07 1.2E-09 1.2E-09 5.6E-10 5.6E-10 0.024 0.024 1.8 1.8 5.8 5.8 5.7 5.7 1620.3 1620.3 2.1 2.1 04H1389-Km473/04L1615-kOMT// 04H1389-Hm482/04L1615-kOMT 04H1389-Km473/04L1615-kOMT// 04H1389-Hm482/04L1615-kOMT 4.6E-Q7 4.6E-Q7 2.8 2.8 6.2E-11 6.2E-11 1.8E-O7 1.8E-O7 8.7E-08 8.7E-08 2.6E-09 2.6E-09 1.3E-09 1.3E-09 0.024 0.024 0.7 0.7 8.2 8.2 12.3 12.3 705.1 705.1 2.1 2.1 04H1389-Km481 /04L1615-kOMT// 04H1389-Hm498/04L1615-kOMT 04H1389-Km481 /04L1615-kOMT// 04H1389-Hm498/04L1615-kOMT 4.7E-07 4.7E-07 2.8 2.8 4.2E-11 4.2E-11 2.9E-07 2.9E-07 2.1E-07 2.1E-07 1.4E-09 1.4E-09 6.2E-10 6.2E-10 0.021 0.021 1.1 1.1 5.1 5.1 5.0 5.0 1469.1 1469.1 1.9 1.9

* Величину KD определяют по стационарной модели.* The value of K D is determined using a stationary model.

N.T. - Не исследовали.N.T. - They didn’t investigate.

Все полученные в настоящем изобретении гетеродимеризованные антитела обладают повышенной активностью связывания с FcYRIIa и FcYRIIIa по сравнению с 04H1389-G1m/04L1615-k0MT. Hm482/04L1615-k0MT и 04H1389-Km481/04L1615-k0MT//04H1389-Hm498/04L1615-k0MT, в которые были внесены изменения для улучшения кинетики антител в крови, обладают повышенной активностью связывания с FcRn человека по сравнению с исходным антителом до внесения изменений и в отношенииAll heterodimerized antibodies produced in the present invention have increased binding activity to FcYRIIa and FcYRIIIa compared to 04H1389-G1m/04L1615-k0MT. Hm482/04L1615-k0MT and 04H1389-Km481/04L1615-k0MT//04H1389-Hm498/04L1615-k0MT, which were modified to improve the kinetics of antibodies in the blood, have increased binding activity to human FcRn compared to the original antibody before the modification and regarding

- 87 045931 активности связывания FcyR они имели такой же профиль связывания, как и исходное антитело.- 87 045931 FcyR binding activity they had the same binding profile as the parent antibody.

Кроме того, ген 04H1389-Hm441 (SEQ ID NO: 273), который содержит 04Н1389 (SEQ ID NO: 136) в качестве вариабельной области тяжелой цепи, имеет те же изменения, что и НТ441, введенный в область СН2 тяжелой цепи, и содержит Y349C. /366W, использованный для изменений с целью гетеродимеризации в области СН3. Напротив, получен 04H1389-Hm451 (SEQ ID NO: 274) с введенным N434A/Y436T/Q438R/S440E, который представляет собой комбинацию изменений, усиливающих связывание с FcRn человека в кислых условиях, и изменений, снижающих связывание с ревматоидным фактором. Аминокислотные последовательности тяжелых цепей Hm441 и Hm451 антитела показаны в SEQ ID NO: 277 и 278 соответственно. Гетеродимеризованные антитела получены с использованием 04Н1389Km473, 04Н1389-Hm451 или 04Н1389-Hm482 в качестве тяжелой цепи антитела и 04L1305-k0MT в качестве легкой цепи антитела. В табл. 29 показаны результаты анализа взаимодействия полученных антител с FcRn человека и с рецепторами FcyR человека.In addition, the gene 04H1389-Hm441 (SEQ ID NO: 273), which contains 04H1389 (SEQ ID NO: 136) as a heavy chain variable region, has the same changes as HT441 introduced into the CH2 region of the heavy chain, and contains Y349C. /366W used for changes to heterodimerize in the CH3 region. In contrast, 04H1389-Hm451 (SEQ ID NO: 274) was produced with N434A/Y436T/Q438R/S440E introduced, which is a combination of changes that increase binding to human FcRn under acidic conditions and changes that decrease binding to rheumatoid factor. The amino acid sequences of the antibody heavy chains Hm441 and Hm451 are shown in SEQ ID NO: 277 and 278, respectively. Heterodimerized antibodies were prepared using 04H1389Km473, 04H1389-Hm451 or 04H1389-Hm482 as the antibody heavy chain and 04L1305-k0MT as the antibody light chain. In table Figure 29 shows the results of an analysis of the interaction of the obtained antibodies with human FcRn and with human FcyR receptors.

Таблица 29Table 29

Анализ связывания вариантов Fc-области с FcRn человека и с рецепторами FcyR человекаAnalysis of binding of Fc region variants to human FcRn and human FcyR receptors

Антитело Antibody КоДДЯ hFcRn (M) Code hFcRn (M) Относительная величина KD между Glm и hFcRn Relative KD value between Glm and hFcRn KD для hFcyR (M) K D for hFcyR (M) Связывающее количество Binding quantity Относительная величина KD между Glm и hFcyR Relative KD value between Glm and hFcyR Otho сительно e связывающее количество Otho strongly e binding amount hFcyR la hFcyR la hFcyR Па R hFcyR Pa R hFcyR Ila H hFcyR Ila H hFcyR Illa F hFcyR Illa F hFcyR Ша V hFcyR Sha V hFcyR lib hFcyR lib hFcyR la hFcyRla hFcyR Ila R hFcyR Ila R hFcyR Ila H hFcyR Ila H hFcyR Illa F hFcyR Illa F hFcyR Ша V hFcyR Sha V hFcyR lib hFcyR lib 04Н1389-G1 m/04L1305-kOMT 04Н1389-G1 m/04L1305-kOMT 1.0E-06 1.0E-06 1.0 1.0 6.9E-11 6.9E-11 1.6E-06 1.6E-06 1.1E-06 1.1E-06 6.9E-07 6.9E-07 *8.8E-07 *8.8E-07 0.011 0.011 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 04Н1389-Km473/04L1305-kOMT// 04H1389-Hm451 /04L13O5-kOMT 04Н1389-Km473/04L1305-kOMT// 04H1389-Hm451 /04L13O5-kOMT 3.3E-07 3.3E-07 3.0 3.0 1.5E-10 1.5E-10 1.6E-07 1.6E-07 5.3E-08 5.3E-08 1.7E-08 1.7E-08 3.9E-09 3.9E-09 0.015 0.015 0.5 0.5 9.7 9.7 20.0 20.0 41.3 41.3 224.7 224.7 1.3 1.3 04H1389-Km473/04L1305-kOMT// 04H1389-Hm482/04L1305-kOMT 04H1389-Km473/04L1305-kOMT // 04H1389-Hm482/04L1305-kOMT 3.7E-07 3.7E-07 2.7 2.7 6.1E-11 6.1E-11 8.6E-08 8.6E-08 3.5E-08 3.5E-08 2.7E-09 2.7E-09 9.5E-10 9.5E-10 0.034 0.034 1.1 1.1 18.5 18.5 30.8 30.8 258.1 258.1 930.5 930.5 3.0 3.0

* Величину KD определяют по стационарной модели.* The KD value is determined using a stationary model.

Показано, что полученные гетеродимеризованные антитела 04R1389-Km473/04L1305k0МТ//04Н1389-Hm451/04L1305-k0МТ и Ο4Η1389-Κ^473/Ο4Ε13Ο5-ΜΜΤ//Ο4Η1389-^482/Ο4Ε13Ο5k0MT обладают повышенным связыванием с активирующими рецепторами FcyR, а именно FcYRIIa and FcYRIIIa, по сравнению с 04H1389-G1m/04L1305-k0MT, имеющими константную область нативного IgG1 человека. Было также показано, что оба этих антитела обладают повышенной способностью связываться с FcRn человека по сравнению с 04H1389-G1m/04L1305-k0MT.It was shown that the resulting heterodimerized antibodies 04R1389-Km473/04L1305k0MT//04H1389-Hm451/04L1305-k0MT and Ο4Η1389-Κ^473/Ο4Ε13Ο5-ΜΜΤ//Ο4Η1389-^482/Ο4Ε1 3Ο5k0MT have increased binding to activating receptors FcyR, namely FcYRIIa and FcYRIIIa, compared to 04H1389-G1m/04L1305-k0MT, which have the constant region of native human IgG1. Both of these antibodies were also shown to have increased ability to bind to human FcRn compared to 04H1389-G1m/04L1305-k0MT.

Затем варианты константной области с усиленным связыванием с FcyR, обнаруженные в настоящем изобретении, сравнивают с существующими вариантами с усиленным связыванием FcyR. Создают гены тяжелых цепей антител MDX10D1H-Kn125 (SEQ ID NO: 217), MDX10D1H-H1076 (SEQ ID NO: 218), MDX10D1H-Kn462 (SEQ ID NO: 219), MDX10D1H-H1445 (SEQ ID NO: 220), MDX10D1H-Kn461 (SEQ ID NO: 221) и MDX10D1H-H1443 (SEQ ID NO: 222), которые содержат MDX10D1H (SEQ ID NO: 154) в качестве вариабельной области тяжелой цепи, и константные области тяжелой цепи, перечисленные в табл. 26. и ген MDX10D1H-G1m (SEQ ID NO: 210), содержащий область СН2 нативного IgG1 человека. Создан ген тяжелой цепи антитела MDX10D1H-GASDIE (SEQ ID NO: 215), который имеет изменения G236A/S239D/I332E в области СН2, как описано в Mol. Cancer Ther., 2008, 7, 2517-2527, как вариант с усиленным связыванием с FcYRIIa. Кроме того, был создан ген тяжелой цепи антитела MDX10D1HGASDALIE (SEQ ID NO: 216), который имеет G236A/S239D/A330L/I332E в области СН2, как описано в J. Struct. Biol., 2016, 194, 78-89 в качестве варианта с усиленным связыванием с FcYRIIIa. Для получения представляющих интерес антител используют в качестве легкой цепи антитела MDX10D1L-k0MT (SEQ ID NO: 211). Активность связывания этих антител с FcYR человека измеряют описанным выше способом с использованием биотинового конъюгата CaptureSelect Human Fab-kappa Kinetics (табл. 30).The FcyR-enhanced binding constant region variants found in the present invention are then compared to existing FcyR-binding enhanced variants. Generate antibody heavy chain genes MDX10D1H-Kn125 (SEQ ID NO: 217), MDX10D1H-H1076 (SEQ ID NO: 218), MDX10D1H-Kn462 (SEQ ID NO: 219), MDX10D1H-H1445 (SEQ ID NO: 220), MDX10D1H -Kn461 (SEQ ID NO: 221) and MDX10D1H-H1443 (SEQ ID NO: 222), which contain MDX10D1H (SEQ ID NO: 154) as the heavy chain variable region, and the heavy chain constant regions listed in table. 26. and the MDX10D1H-G1m gene (SEQ ID NO: 210), containing the CH2 region of native human IgG1. The antibody heavy chain gene MDX10D1H-GASDIE (SEQ ID NO: 215) was created, which has the changes G236A/S239D/I332E in the CH2 region, as described in Mol. Cancer Ther., 2008, 7, 2517-2527, as a variant with enhanced binding to FcYRIIa. In addition, the antibody heavy chain gene MDX10D1HGASDALIE (SEQ ID NO: 216) was generated, which has G236A/S239D/A330L/I332E in the CH2 region, as described in J. Struct. Biol., 2016, 194, 78-89 as a variant with enhanced binding to FcYRIIIa. To obtain antibodies of interest, the MDX10D1L-k0MT antibody (SEQ ID NO: 211) is used as the light chain. The binding activity of these antibodies to human FcYR is measured as described above using CaptureSelect Human Fab-kappa Kinetics biotin conjugate (Table 30).

Таблица 30Table 30

Анализ связывания вариантов Fc-области с рецепторами FcyR человекаAnalysis of binding of Fc region variants to human FcyR receptors

Антитело Antibody KD для hFcyR (M) K D for hFcyR (M) Связывающее количество Binding amount Относительная величина KD между Glm и hFcyR Relative KD value between Glm and hFcyR Относительное связывающее количество Relative binding amount hFcyR Ila R hFcyR Ila R hFcyR Ila H hFcyR Ila H hFcyR Ша F hFcyR Sha F hFcyR Ша V hFcyR Sha V hFcyR lib hFcyR lib hFcyR Па R hFcyR Pa R hFcyR Па H hFcyR Pa H hFcyR Ша V hFcyR Sha V hFcyR lib hFcyR lib MDX10D1H-G1 m/MDX 10D1 L-kOMT MDX10D1H-G1 m/MDX 10D1 L-kOMT 1.5E-O6 1.5E-O6 1.0E-06 1.0E-06 N.T. N.T. *9.5E-07 *9.5E-07 0.012 0.012 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 MDX10D1H-GASD1E/MDX1OD1 L-kOMT MDX10D1H-GASD1E/MDX1OD1 L-kOMT S.1E-08 S.1E-08 5.5E-08 5.5E-08 2.3E-08 2.3E-08 1.4E-08 1.4E-08 0.072 0.072 24.2 24.2 18.9 18.9 68.2 68.2 5.8 5.8 MDX10D1H-GASDAUE/MDX10D1 L-kOMT MDX10D1H-GASDAUE/MDX10D1 L-kOMT 7.9E-O7 7.9E-O7 9.7E-07 9.7E-07 1.2E-08 1.2E-08 6.9E-09 6.9E-09 0.044 0.044 1.9 1 1.9 1 I 1.1 1 I 1.1 1 I 138.1 I I 138.1 I I 3.6 I 3.6 MDX10D1H-Kn125/MDX10D1H-HI076/MDX1OD1L-k0M1 MDX10D1H-Kn125/MDX10D1H-HI076/MDX1OD1L-k0M1 9.6E-07 9.6E-07 2.7E-07 2.7E-07 1.9E-09 1.9E-09 1.IE-09 1.IE-09 0.009 0.009 1.5 1.5 3.8 3.8 898.8 898.8 0.7 0.7 MDX10D1H-Kn462/MDX10D1H-HI445/MDX10D1L-k0Ml MDX10D1H-Kn462/MDX10D1H-HI445/MDX10D1L-k0Ml 1ΌΕ-Ο7 1ΌΕ-Ο7 2.8E-08 2.8E-08 2.7E-O9 2.7E-O9 1.2E-09 1.2E-09 0.037 0.037 14.9 14.9 37.3 37.3 807.1 807.1 3.0 3.0 MDX10D1H-Kn461/MDX10D1H-HI443/MDX10D1L-k0Ml MDX10D1H-Kn461/MDX10D1H-HI443/MDX10D1L-k0Ml 1.7E-O7 1.7E-O7 8.8E-08 8.8E-08 1.4E-09 1.4E-09 5.7E-10 5.7E-10 0.031 0.031 9.0 I 9.0I 1 11.8 1 1 11.8 1 I 1076.4 I I 1076.4 I I 2.5 I 2.5

* Величину KD определяют по стационарной модели. N.T. - Не исследовали.* The value of K D is determined using a stationary model. NT - Not explored.

- 88 045931- 88 045931

Значение KD для hFcYR (M) в таблице означает константу диссоциации для каждого из перечисленных FcyR, а количество связывания означает количество связывания FcYRIIb на единицу количества антитела, когда у FcYRIIb есть возможность взаимодействовать при 1000 нМ. Относительное значение KD между G1m и рецепторами hFc','R означает величину, полученную путем деления значения KD MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT для каждого FcyR на значение KD каждого варианта, а относительное количество связывания означает величину, полученную путем деления количества связывания каждого варианта с FcYRIIb на количество связывания MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT.The KD value for hFcYR (M) in the table means the dissociation constant for each of the listed FcyRs, and the binding amount means the amount of FcYRIIb binding per unit amount of antibody when FcYRIIb has the opportunity to interact at 1000 nM. The relative KD value between G1m and hFc','R receptors means the value obtained by dividing the KD value of MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT for each FcyR by the KD value of each variant, and the relative binding amount means the value obtained by dividing the binding amount of each variant with FcYRIIb on the amount of MDX10D1H-G1m/MDX10D1L-k0MT binding.

Полученные гетеродимеры MDX10D1H-Kn125/MDX10D1H-H1076/MDX10D1L-k0MT, MDX10D1H-Kn462/MDX10D1H-H1445/MDX10D1L-k0MT и MDX10D1H-Kn461/MDX10D1HH1443/MDX10D1L-k0MT все обладают повышенным связыванием с FcYRIIIa по сравнению с существующими антителами MDX10D1H-GASDIE/MDX10D1L-k0MT и MDX10D1H-GASDALIE/MDX10D1Lk0MT с усиленным связыванием FcyR. Также было показано, что связывание MDX10D1HKn462/MDX10D1H-H1445/MDX10D1L-k0MT с FcYRIIaH примерно в 2 раза выше по сравнению с существующим антителом MDX10D1H-GASDIE/MDX10D1L-k0MT, усиленным FcYRIIa.The resulting heterodimers MDX10D1H-Kn125/MDX10D1H-H1076/MDX10D1L-k0MT, MDX10D1H-Kn462/MDX10D1H-H1445/MDX10D1L-k0MT and MDX10D1H-Kn461/MDX10D1HH1443/MDX10D1L-k0 MT all have increased binding to FcYRIIIa compared to existing antibodies MDX10D1H-GASDIE/ MDX10D1L-k0MT and MDX10D1H-GASDALIE/MDX10D1Lk0MT with enhanced FcyR binding. MDX10D1HKn462/MDX10D1H-H1445/MDX10D1L-k0MT binding to FcYRIIaH was also shown to be approximately 2-fold higher compared to the existing FcYRIIa-enhanced MDX10D1H-GASDIE/MDX10D1L-k0MT antibody.

Пример 6-2. Оценка in vitro активности ADCC различных антител с измененными константными областями.Example 6-2. In vitro assessment of ADCC activity of various antibodies with altered constant regions.

Для анализа активности ADCC in vitro используют набор hFcYRIIIaV ADCC Reporter Bioassay, Core Kit (фирма Promega). В каждую лунку 96-луночного планшета в качестве клеток-мишеней вносят 25 мкл суспензии клеток hCTLA4-CHO в качестве клеток-мишеней в концентрации до 2х106/мл с использованием среды, в качестве которой используют буфер для анализа (90% RPMI1640, 10% FBS). Затем добавляют по 25 мкл каждого раствора антител, разбавленного буфером для анализа, таким образом, чтобы конечная концентрация составляла 0, 0,001, 0,01, 0,1 и 1 мкг/мл. Затем в качестве суспензии эффекторных клеток добавляют 25 мкл клеток Jurkat, экспрессирующих hFcYRIIIaV (входят в набор), приготовленных до концентрации 6х106/мл со средой, таким образом, чтобы растворы были смешаны до общего объема 75 мкл. Планшет оставляют стоять при 37°С в течение ночи в инкубаторе с 5% СО2. Затем планшет оставляют при комнатной температуре на 15 мин и в каждую лунку добавляют по 75 мкл реагента Bio-Glo. В качестве реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-glo (буфер и субстрат). Люминесценцию каждой лунки затем измеряют с помощью планшет-ридера. Значение, полученное путем деления значения люминесценции каждой лунки на значение люминесценции лунок без антител, определяют как индукцию кратности, которую используют в качестве показателя для оценки ADCC каждого антитела. Полученные результаты представлены на фиг. 23. На фигеру индукция кратности представлена в относительных единицах люминесценции (RLU).To analyze ADCC activity in vitro, the hFcYRIIIaV ADCC Reporter Bioassay, Core Kit (Promega) is used. Add 25 μl of hCTLA4-CHO cell suspension as target cells to each well of a 96-well plate at a concentration of up to 2x10 6 /ml using a medium containing assay buffer (90% RPMI1640, 10% FBS). Then add 25 µl of each antibody solution diluted in assay buffer so that the final concentration is 0, 0.001, 0.01, 0.1 and 1 µg/ml. 25 µl of Jurkat cells expressing hFcYRIIIaV (included in the kit), prepared to a concentration of 6x10 6 /ml with the medium, are then added as an effector cell suspension, so that the solutions are mixed to a total volume of 75 µl. The plate is left to stand at 37°C overnight in a 5% CO 2 incubator. The plate is then left at room temperature for 15 minutes and 75 µl of Bio-Glo reagent is added to each well. The Bio-Glo reagent uses the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). The luminescence of each well is then measured using a plate reader. The value obtained by dividing the luminescence value of each well by the luminescence value of the wells without antibodies is determined as the fold induction, which is used as an indicator to evaluate the ADCC of each antibody. The results obtained are presented in Fig. 23. In the figure, the fold induction is presented in relative luminescence units (RLU).

Эти результаты показывают, что активность ADCC антител, содержащих измененный Fc, против клеток hCTLA4-CHO выше, чем активность константной области IgG1 человека дикого типа.These results indicate that the ADCC activity of Fc-altered antibodies against hCTLA4-CHO cells is higher than that of wild-type human IgG1 constant region.

Пример 6-3. Оценка активности ADCP in vitro различных антител с измененными константными областями.Example 6-3. In vitro assessment of ADCP activity of various antibodies with altered constant regions.

Основной набор hFcYRIIaH ADCP Reporter Bioassay (Promega) используют для анализа активности ADCC in vitro. В каждую лунку 96-луночного планшета в качестве клеток-мишеней добавляют по 25 мкл клеток hCTLA4-CHO в качестве клеток-мишеней в концентрации 1х106/мл, приготовленной с использованием среды на основе буфера для анализа (с 4% среды RPMI1640, в которой содержится небольшое количество сыворотки IgG). Затем добавляют по 25 мкл каждого раствора антитела, разбавленного буфером для анализа, таким образом, чтобы конечная концентрация составляла О, 0,001, 0,01, 0,1 и 1 мкг/мл. В итоге, 25 мкл клеток Jurkat, экспрессирующих hFcYRIIaH, включенных в набор, добавляют в качестве суспензии эффекторных клеток, таким образом, чтобы растворы смешивались до общего объема 75 мкл. Планшет оставляют при 37°С в течение ночи в инкубаторе с 5% СО2. Плотность клеточного раствора клеток Jurkat, экспрессирующих hFcYRIIaH, составляет 8,25х105/мл. Затем планшет оставляют при комнатной температуре на 15 мин и в каждую лунку добавляют по 75 мкл реагента Bio-Glo. В качестве реагента Bio-Glo используют реактив с люциферазой Bio-Glo Luciferase Assay System (Buffer and Substrate). Люминесценцию в каждой лунке затем измеряют с помощью планшет-ридера. Значение, полученное путем деления значения люминесценции каждой лунки на значение люминесценции лунок без антител, определяют как индукцию кратности, которую используют в качестве индекса для оценки ADCP каждого антитела. Полученные результаты представлены на фиг. 24. На фигуре индукция кратности представлена в относительных единицах люминесценции (RLU).The hFcYRIIaH ADCP Reporter Bioassay Core Kit (Promega) is used to assay ADCC activity in vitro. Add 25 μl of hCTLA4-CHO cells as target cells to each well of a 96-well plate at a concentration of 1x10 6 /ml prepared using assay buffer-based medium (with 4% RPMI1640 medium in which contains a small amount of IgG serum). Then add 25 µl of each antibody solution diluted in assay buffer so that the final concentration is 0.001, 0.01, 0.1 and 1 µg/ml. Finally, 25 μl of hFcYRIIaH-expressing Jurkat cells included in the kit are added as an effector cell suspension such that the solutions are mixed to a total volume of 75 μl. The plate is left at 37°C overnight in a 5% CO 2 incubator. The density of the cell solution of Jurkat cells expressing hFcYRIIaH is 8.25x10 5 /ml. The plate is then left at room temperature for 15 minutes and 75 µl of Bio-Glo reagent is added to each well. The Bio-Glo reagent used is the Bio-Glo Luciferase Assay System (Buffer and Substrate). The luminescence in each well is then measured using a plate reader. The value obtained by dividing the luminescence value of each well by the luminescence value of the wells without antibodies is determined as the fold induction, which is used as an index to evaluate the ADCP of each antibody. The results obtained are presented in Fig. 24. In the figure, fold induction is represented in relative luminescence units (RLU).

Результаты показывают, что активность ADCP антител, содержащих измененный фрагмент Fc, против клеток hCTLA4-CHO выше, чем такой же показатель в случае константной области IgG1 дикого типа человека.The results show that the ADCP activity of antibodies containing an altered Fc fragment against hCTLA4-CHO cells is higher than that of human wild-type IgG1 constant region.

Пример 6-4. Оценка активности ADCC in vitro анти-CTLA4 переключающего антитела с измененным фрагментом Fc.Example 6-4. In vitro assessment of ADCC activity of an anti-CTLA4 switch antibody with an altered Fc fragment.

Получают анти-CTLA4 переключающие антитела с измененным Fc (04H1654-Kn462/04L1610 lam1//04H1656-H1445/04L1610-lam1, аббревиатура: SW1610-ART6; 04H1654-Kn462/04L1612Generate anti-CTLA4 switch antibodies with altered Fc (04H1654-Kn462/04L1610 lam1//04H1656-H1445/04L1610-lam1, abbreviation: SW1610-ART6; 04H1654-Kn462/04L1612

- 89 045931 lam1//04H1656-H1445/04L1612-lam1, аббревиатура: SW1612-ART6;and 04H1389-Kn462/04L1305k0MT//04H1389-H1445/04L1305-k0MT, аббревиатура: SW1389-ART6).- 89 045931 lam1//04H1656-H1445/04L1612-lam1, abbreviation: SW1612-ART6;and 04H1389-Kn462/04L1305k0MT//04H1389-H1445/04L1305-k0MT, abbreviation: SW138 9-ART6).

В антителе SW1610-ART6 одна вариабельная область тяжелой цепи 04Н1654 (SEQ ID NO: 35) связана с константной областью тяжелой цепи человека Kn462 (SEQ ID NO: 43), другая вариабельная область тяжелой цепи 04Н1656 (SEQ ID NO: 37) связана с константной областью тяжелой цепи человека H1445 (SEQ ID NO: 44) в качестве константной области, а для вариабельной области легкой цепи 04L1610 (SEQ ID NO: 39) - с константной областью легкой цепи человека дикого типа lam1 (SEQ ID NO: 39). ID NO: 53). Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.In the SW1610-ART6 antibody, one heavy chain variable region 04H1654 (SEQ ID NO: 35) is linked to the human heavy chain constant region Kn462 (SEQ ID NO: 43), another heavy chain variable region 04H1656 (SEQ ID NO: 37) is linked to the human constant heavy chain the human heavy chain region H1445 (SEQ ID NO: 44) as the constant region, and for the light chain variable region 04L1610 (SEQ ID NO: 39) with the wild type human light chain constant region lam1 (SEQ ID NO: 39). ID NO: 53). The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе SW1612-ART6 одна вариабельная область тяжелой цепи 04Н1654 (SEQ ID NO: 35) связана с константной областью тяжелой цепи человека Kn462 (SEQ ID NO: 43), другая вариабельная область тяжелой цепи 04Н1656 (SEQ ID NO: 37) связана с константной областью тяжелой цепи человека Н1445 (SEQ ID NO: 44) в качестве константной области, а для вариабельной области легкой цепи 04L1612 (SEQ ID NO: 40) - с константной областью легкой цепи человека дикого типа laml (SEQ ID NO: 53). Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.In the SW1612-ART6 antibody, one heavy chain variable region 04H1654 (SEQ ID NO: 35) is linked to the human heavy chain constant region Kn462 (SEQ ID NO: 43), another heavy chain variable region 04H1656 (SEQ ID NO: 37) is linked to the human constant heavy chain the human heavy chain region H1445 (SEQ ID NO: 44) as the constant region, and for the light chain variable region 04L1612 (SEQ ID NO: 40) with the human wild type laml light chain constant region (SEQ ID NO: 53). The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

В антителе SW1389-ART6 две вариабельные области тяжелой цепи 04Н1389 (SEQ ID NO: 29) связаны, соответственно, с константной областью тяжелой цепи человека Kn462 (SEQ ID NO: 43) и константной областью тяжелой цепи человека Н1445 (SEQ ID NO: 44) в качестве константной области, а также для вариабельной области легкой цепи 04L1305 (SEQ ID NO: 30) используют константную область легкой цепи человека 1<0МТ дикого типа (SEQ ID NO: 33). Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.In antibody SW1389-ART6, two heavy chain variable regions 04H1389 (SEQ ID NO: 29) are linked, respectively, to the human heavy chain constant region Kn462 (SEQ ID NO: 43) and the human heavy chain constant region H1445 (SEQ ID NO: 44) As a constant region, as well as for the light chain variable region 04L1305 (SEQ ID NO: 30), the wild-type human 1<0MT light chain constant region (SEQ ID NO: 33) is used. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Основной набор hFcYRIIIaV ADCP Reporter Bioassay (Promega) используют для анализа активности ADCC in vitro. В каждую лунку 96-луночного планшета в качестве клеток-мишеней добавляют по 12,5 мкл клеток hCTLA4-CHO в качестве клеток-мишеней в концентрации 2х106/мл, приготовленной с использованием среды на основе буфера для анализа (с 4% среды RPMI1640, в которой содержится небольшое количество сыворотки IgG). Затем последовательно добавляют растворы АТФ, разведенные буфером для анализа, таким образом, чтобы конечная концентрация составляла 0 и 100 мкМ, и растворы антител SW1389-ART6, SW1610-ART6 и SW1612-ART6, разведенные буфером для анализа до конечной концентрации 0, 0,001, 0,01, 0,1 и 1 мкг/мл. В итоге, 25 мкл клеток Jurkat, экспрессирующих hFcYRIIIaV (включенных в набор), разводят средой до концентрации 3х106 /мл и добавляют в качестве суспензии эффекторных клеток таким образом, что в смеси общий объем составляет 75 мкл. Планшет оставляют при 37°С на 6 ч в инкубаторе с 5% СО2. Затем планшет оставляют при комнатной температуре на 15 мин и в каждую лунку добавляют по 75 мкл реагента Bio-Glo. В качестве реагента Bio-Glo используют реактив с люциферазой Bio-Glo Luciferase Assay System (Buffer and Substrate). Люминесценцию в каждой лунке затем измеряют с помощью планшет-ридера. Значение, полученное путем деления значения люминесценции каждой лунки на значение люминесценции лунок без антител, определяют как индукцию кратности, которую используют в качестве индекса для оценки ADCP каждого антитела. Полученные результаты представлены на фиг. 25 (SW1389-ART6), фиг. 26 (SW1610-ART6) и фиг. 27 (SW1612-ART6). На фигурах индукция кратности представлена в относительных единицах люминесценции (RLU).The hFcYRIIIaV ADCP Reporter Bioassay Core Kit (Promega) is used to assay ADCC activity in vitro. Add 12.5 μl of hCTLA4-CHO cells as target cells to each well of a 96-well plate at a concentration of 2x10 6 /ml prepared using assay buffer-based medium (with 4% RPMI1640 medium, which contains a small amount of IgG serum). Then sequentially add ATP solutions diluted with assay buffer, so that the final concentration is 0 and 100 μM, and solutions of antibodies SW1389-ART6, SW1610-ART6 and SW1612-ART6, diluted with assay buffer to a final concentration of 0, 0.001, 0 .01, 0.1 and 1 µg/ml. Finally, 25 µl of Jurkat cells expressing hFcYRIIIaV (included in the kit) are diluted with medium to a concentration of 3x10 6 /ml and added as an effector cell suspension such that the total volume in the mixture is 75 µl. The plate is left at 37°C for 6 hours in an incubator with 5% CO 2 . The plate is then left at room temperature for 15 minutes and 75 µl of Bio-Glo reagent is added to each well. The Bio-Glo reagent used is the Bio-Glo Luciferase Assay System (Buffer and Substrate). The luminescence in each well is then measured using a plate reader. The value obtained by dividing the luminescence value of each well by the luminescence value of the wells without antibodies is determined as the fold induction, which is used as an index to evaluate the ADCP of each antibody. The results obtained are presented in Fig. 25 (SW1389-ART6), fig. 26 (SW1610-ART6) and fig. 27 (SW1612-ART6). In the figures, fold induction is presented in relative luminescence units (RLU).

Из полученных результатов было подтверждено, что ADCC активность переключающих антиCTLA4 антител, обладающих измененным фрагментом против клеток hCTLA4-CHO, различается в присутствии и в отсутствие АТФ, и что присутствует АТФ-зависимая цитотоксичность против клеток hCTLA4-CHO.From the results obtained, it was confirmed that the ADCC activity of anti-CTLA4 switching antibodies possessing the altered fragment against hCTLA4-CHO cells differs in the presence and absence of ATP, and that ATP-dependent cytotoxicity against hCTLA4-CHO cells is present.

Пример 6-5. Оценка in vitro нейтрализующей активности анти-CTLA4 переключающих антител.Example 6-5. In vitro assessment of the neutralizing activity of anti-CTLA4 switch antibodies.

Получают измененные анти-CTLA4 переключающие антитела, антитела человека с вариабельными областями SW1389, SW1610, SW1612 и SW1615.Generated modified anti-CTLA4 switch antibodies, human antibodies with variable regions SW1389, SW1610, SW1612 and SW1615.

Для антитела SW1389 применяют 04Н1389 (SEQ ID NO: 29) в качестве вариабельной области тяжелой цепи и 04L1305 (SEQ ID NO: 30) в качестве вариабельной области легкой цепи. После связывания вариабельных областей с константными областями человека антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.For antibody SW1389, 04H1389 (SEQ ID NO: 29) is used as the heavy chain variable region and 04L1305 (SEQ ID NO: 30) is used as the light chain variable region. After binding of the variable regions to the human constant regions, the antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Для антитела SW1610 применяют 04Н1654 (SEQ ID NO: 35) и 04Н1656 (SEQ ID NO: 37) в качестве вариабельной области тяжелой цепи и 04L1610 (SEQ ID NO: 39) в качестве вариабельной области легкой цепи. После связывания вариабельных областей с константными областями человека антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.For antibody SW1610, 04H1654 (SEQ ID NO: 35) and 04H1656 (SEQ ID NO: 37) are used as the heavy chain variable region and 04L1610 (SEQ ID NO: 39) as the light chain variable region. After binding of the variable regions to the human constant regions, the antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Для антитела SW1612 применяют 04Н1654 (SEQ ID NO: 35) и 04Н1656 (SEQ ID NO: 37) в качестве вариабельной области тяжелой цепи и 04L1612 (SEQ ID NO: 40) в качестве вариабельной области легкой цепи. После связывания вариабельных областей с константными областями человека антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.For antibody SW1612, 04H1654 (SEQ ID NO: 35) and 04H1656 (SEQ ID NO: 37) are used as the heavy chain variable region and 04L1612 (SEQ ID NO: 40) as the light chain variable region. After binding of the variable regions to the human constant regions, the antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Для антитела SW1615 применяют 04Н1389 (SEQ ID NO: 29) в качестве вариабельной области тяжелой цепи и 04L1615 (SEQ ID NO: 34) в качестве вариабельной области легкой цепи. После связывания вариабельных областей с константными областями человека антитело экспрессируют и очищают спосоFor antibody SW1615, 04H1389 (SEQ ID NO: 29) is used as the heavy chain variable region and 04L1615 (SEQ ID NO: 34) is used as the light chain variable region. After binding the variable regions to the human constant regions, the antibody is expressed and purified by

- 90 045931 бом, известным специалистам в данной области.- 90 045931 bom, known to experts in the field.

Для измерения in vitro нейтрализующей активности применяют CTLA-4 Blockade Bioassay (фирма Promega). В каждую лунку 96-луночного планшета в качестве клеток-мишеней добавляют по 25 мкл клеток aAPC-Raji, прикрепленных к набору, приготовленных в концентрации 1х106/мл в среде, причем в качестве среды используют буфер для анализа (10% FBS в RPMI1640). Затем растворы АТФ разбавляют буфером для анализа до конечной концентрации 0 и 100 мкМ, после чего растворы антител, имеющие вариабельные области SW1389, SW1610, SW1612 и SW1615, последовательно разбавляют буфером для анализа до конечной концентрации 0, 0,001, 0,01, 0,1, 1 и 10 мкг/мл. В итоге по 25 мкл клеток IL2-luc2CTLA4-Jurkat (включенных в набор), приготовленных до концентрации 2х106/мл добавлением среды, вносят в качестве суспензии эффекторных клеток таким образом, что раствор смешивают до общего объема 75 мкл. Планшет оставляют при 37°С в течение 6 ч в инкубаторе с 5% СО2. Затем планшет оставляют при комнатной температуре на 15 мин и в каждую лунку добавляют по 75 мкл реагента Bio-Glo. В качестве реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-Glo (буфер и субстрат). Люминесценцию каждой лунки затем измеряют с помощью планшет-ридера. Значение, полученное путем деления значения люминесценции каждой лунки на значение люминесценции лунок без антител, определяют как индукцию кратности, которую используют в качестве показателя для оценки нейтрализующей активности каждого антитела. Полученные результаты показаны на фиг. 28 (SW1389), фиг. 29 (SW1610), фиг. 30 (SW1612) и фиг. 31 (SW1615). На фигурах индукция кратности представлена в относительных единицах люминесценции (RLU).To measure in vitro neutralizing activity, CTLA-4 Blockade Bioassay (Promega) is used. To each well of a 96-well plate, 25 µl of aAPC-Raji cells attached to the kit are added as target cells, prepared at a concentration of 1x10 6 / ml in the medium, and the assay buffer (10% FBS in RPMI1640) is used as the medium. . ATP solutions are then diluted with assay buffer to final concentrations of 0 and 100 μM, after which antibody solutions having variable regions SW1389, SW1610, SW1612, and SW1615 are serially diluted with assay buffer to final concentrations of 0, 0.001, 0.01, 0.1 , 1 and 10 µg/ml. Finally, 25 μl of IL2-luc2CTLA4-Jurkat cells (included in the kit), prepared to a concentration of 2x10 6 /ml by adding medium, are added as a suspension of effector cells so that the solution is mixed to a total volume of 75 μl. The plate is left at 37°C for 6 hours in a 5% CO 2 incubator. The plate is then left at room temperature for 15 minutes and 75 µl of Bio-Glo reagent is added to each well. The Bio-Glo reagent uses the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). The luminescence of each well is then measured using a plate reader. The value obtained by dividing the luminescence value of each well by the luminescence value of the wells without antibodies is determined as the fold induction, which is used as an indicator to evaluate the neutralizing activity of each antibody. The results obtained are shown in Fig. 28 (SW1389), fig. 29 (SW1610), fig. 30 (SW1612) and fig. 31 (SW1615). In the figures, fold induction is presented in relative luminescence units (RLU).

Из полученных результатов было подтверждено, что нейтрализующая активность переключающих анти-CTLA4 антител против клеток, экспрессирующих hCTLA4, различается в присутствии и в отсутствие АТФ, и что нейтрализующая активность АТФ-зависима.From the results obtained, it was confirmed that the neutralizing activity of anti-CTLA4 switch antibodies against hCTLA4-expressing cells differs in the presence and absence of ATP, and that the neutralizing activity is ATP-dependent.

Пример 6-6. Оценка in vitro цитотоксической активности анти-CTLA4 переключающего антитела против CTLA4-положительных регуляторных Т-клеток.Example 6-6. In vitro evaluation of the cytotoxic activity of an anti-CTLA4 switch antibody against CTLA4-positive regulatory T cells.

Получают анти-CTLA4 переключающие антитела с измененным фрагментом Fc (04H1654KT473/04L1610-lam1//04H1656-HT451/04L1610-lam1, аббревиатура: SW1610-ART5+ACT1;04H1654KT473/04L1610-lam1//04H1656-HT482/04L1610-lam1, аббревиатура: SW1610-ART6+ACT1; 04H1389Km473/04L1305-k0MT//04H1389-Hm451/04L1305-k0MT, аббревиатура: SW1389-ART5+ACT1; 04H1389Km473/04L1305-k0MT//04H1389-Hm482/04L1305-k0MT, аббревиатура: SW1389-ART6+ACT1).Anti-CTLA4 switching antibodies with an altered Fc fragment are obtained (04H1654KT473/04L1610 - lam1//04H1656-HT451/04L1610 - lam1, abbreviation: SW1610 - ART5+ACT1;04H1654KT473/04L1610 - lam1//04H165 6-HT482/04L1610 - lam1, abbreviation : SW1610-ART6+ACT1; 04H1389Km473/04L1305-k0MT//04H1389-Hm451/04L1305-k0MT, abbreviation: SW1389-ART5+ACT1; 04H1389Km473/04L1305-k0MT//04H1389-H m482/04L1305-k0MT, abbreviation: SW1389-ART6 +ACT1).

Для антитела SW1610-ART5+ACT1 применяют O4H1654-KT473 (SEQ ID NO: 184) в качестве одной тяжелой цепи, 04Н1656-НТ451 (SEQ ID NO: 272) применяют в качестве другой тяжелой цепи и 04L1610 lam1 (SEQ ID NO: 161) применяют в качестве легкой цепи. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.For the SW1610-ART5+ACT1 antibody, O4H1654-KT473 (SEQ ID NO: 184) is used as one heavy chain, 04H1656-HT451 (SEQ ID NO: 272) is used as the other heavy chain, and 04L1610 lam1 (SEQ ID NO: 161) is used as the light chain. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Для антитела SW1610-ART6+ACT1 применяют 04Н1654-КТ473 (SEQ ID NO: 184) в качестве одной тяжелой цепи, 04Н1656-НТ482 (SEQ ID NO: 185) применяют в качестве другой тяжелой цепи и 04L1610 lam1 (SEQ ID NO: 161) применяют в качестве легкой цепи. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.For the SW1610-ART6+ACT1 antibody, 04H1654-KT473 (SEQ ID NO: 184) is used as one heavy chain, 04H1656-HT482 (SEQ ID NO: 185) is used as the other heavy chain, and 04L1610 lam1 (SEQ ID NO: 161) is used as the light chain. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Для антитела SW1389-ART5+ACT1 применяют 04H1389-Km473 (SEQ ID NO: 203) в качестве одной тяжелой цепи, 04H1389-Hm451 (SEQ ID NO: 274) применяют в качестве другой тяжелой цепи и 04L1305k0MT( SEQ ID NO: 275) применяют в качестве легкой цепи. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.For the SW1389-ART5+ACT1 antibody, 04H1389-Km473 (SEQ ID NO: 203) is used as one heavy chain, 04H1389-Hm451 (SEQ ID NO: 274) is used as the other heavy chain, and 04L1305k0MT (SEQ ID NO: 275) is used as a light chain. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Для антитела SW1389-ART6+ACT1 применяют 04H1389-Km473 (SEQ ID NO: 203) в качестве одной тяжелой цепи, 04H1389-Hm482 (SEQ ID NO: 204) применяют в качестве другой тяжелой цепи и 04L1305k0MT (SEQ ID NO: 275) применяют в качестве легкой цепи. Антитело экспрессируют и очищают способом, известным специалистам в данной области.For the SW1389-ART6+ACT1 antibody, 04H1389-Km473 (SEQ ID NO: 203) is used as one heavy chain, 04H1389-Hm482 (SEQ ID NO: 204) is used as the other heavy chain, and 04L1305k0MT (SEQ ID NO: 275) is used as a light chain. The antibody is expressed and purified in a manner known to those skilled in the art.

Оценивают in vitro цитотоксическую активность полученных анти-CTLA4 антител с измененным фрагментом Fc в отношении CTLA4-положительных регуляторных Т-клеток (CD3+ CD4+ CD25+ CD45RA- CTLA4+). Сначала МКПК человека (CTL Cryopreserved Human MKPC, CTL) подвергают замораживанию-оттаиванию и суспендируют в 50 ЕД/мл интерлейкина 2 (HJI-2)/RPMI/10% FBS, таким образом, что плотность клеток составляет 2х106 клеток/мл, и культивируют при 37° С в течение 4 дней в инкубаторе с 5% СО2. Через 4 дня клетки собирают и дважды промывают смесью RPMI/10% FBS, а затем высевают по 100 мкл в каждую лунку 96-луночного планшета с U-образным дном (8х105 клеток/лунку или 5х105 клеток/лунку) и в каждую лунку добавляют по 25 мкл раствора KLH-G1m, доведенного с помощью RPMI/10% FBS до концентрации 8 мг/мл. Затем добавляют по 25 мкл каждого раствора антител, приготовленного для каждой концентрации (0, 2,4, 8, 24 и 80 мкг/мл или 0, 0,8, 8, 80 и 800 мкг/мл) в RPMI/10% FBS в каждую лунку 96-луночного планшета с U-образным дном. Кроме того, добавляют 50 мкл раствора АТФ, доведенного до 0 или 400 мкМ в RPMI/10% FBS, смесь тщательно суспендируют, а затем оставляют при 37°С в течение 6 ч в СО2-инкубаторе (5 мкл раствора АТФ, доведенного до 0 или 4000 мкМ, добавляют каждые 2 ч (в общей сложности дважды)). Через 6 ч МКПК собирают, дважды промывают раствором для промывки auto MACS Rinsing Solution (фирма Miltenyi), проводят реакцию со следующими антителами и анализируют присутствующие фракции иммунных клеток методом FACS:The in vitro cytotoxic activity of the obtained anti-CTLA4 antibodies with an altered Fc fragment against CTLA4-positive regulatory T cells (CD3+ CD4+ CD25+ CD45RA - CTLA4+) is assessed. First, human PBMC (CTL Cryopreserved Human MKPC, CTL) are freeze-thawed and suspended in 50 U/ml interleukin 2 (HJI-2)/RPMI/10% FBS such that the cell density is 2x10 6 cells/ml, and cultured at 37°C for 4 days in an incubator with 5% CO2. After 4 days, cells are collected and washed twice with RPMI/10% FBS and then seeded at 100 µl into each well of a 96-well U-bottom plate (8 x 105 cells/well or 5 x 105 cells/well) and into each well. add 25 μl of KLH-G1m solution adjusted with RPMI/10% FBS to a concentration of 8 mg/ml. Then add 25 µl of each antibody solution prepared for each concentration (0, 2.4, 8, 24 and 80 µg/ml or 0, 0.8, 8, 80 and 800 µg/ml) in RPMI/10% FBS into each well of a 96-well U-bottom plate. In addition, add 50 μl of ATP solution adjusted to 0 or 400 μM in RPMI/10% FBS, the mixture is thoroughly suspended and then left at 37°C for 6 hours in a CO2 incubator (5 μl of ATP solution adjusted to 0 or 4000 µM, added every 2 hours (a total of twice)). After 6 hours, PBMCs are collected, washed twice with auto MACS Rinsing Solution (Miltenyi), reacted with the following antibodies, and the immune cell fractions present are analyzed by FACS:

--

Claims (8)

реагент для определения жизнеспособности (фирма Biolegend, Zombie Aqua), антитело к CD3 (фирма BD, клон: UCHT1), антитело к CD4 (фирма BD, клон: RPA-T4), антитело к CD8 (фирма BD, клон: SK1), антитело к CD45RA (фирма Biolegend, клон: HI100), антитело к CD25 (фирма BD, клон: 2А3), антитело к CD16 (фирма Biolegend, клон: 3G8), антитело к CD56 (фирма Biolegend, клон: HCD56), антитело к CTLA4 (фирма Биолегенда, клон: BNI3). Анализ FACS проводили на проточном цитофлуориметре BD LSR Fortessa X-20 (фирма BD). Долю CTLA4-положuтельных регуляторных Т-клеток среди жизнеспособных клеток рассчитывают при каждой концентрации антитела, а относительную величину, при которой значение при концентрации антитела 0 принимают за 100%, определяют как выживаемость (%) CTLA4- положительных регуляторных Т-клеток, что используют в качестве показателя при оценке цитотоксической активности каждого антитела. Полученные результаты представлены на фиг. 32 (SW1389ART5+ACT1), фиг. 33 (SW1389-ART6+ACT1), фиг. 34 (SW1610-ART5+ACT1) и фиг. 35 (SW1610ART6+ACT1). Эти результаты подтверждают, что цитотоксическая активность переключающих анти-CTLA4 антител с измененным Fc против CTLA4-положительных регуляторных Т-клеток различается в присутствии и в отсутствие АТФ, кроме того, существует АТФ-зависимая цитотоксическая активность против CTLA4- положительных регуляторных Т-клеток. Хотя вышеупомянутые изобретения подробно описаны со ссылками на иллюстрации и примеры с целью содействия ясному пониманию, приведенное описание настоящего изобретения и примеры не следует рассматривать как ограничивающие объем настоящего изобретения. Описание всех патентных и научных публикаций, цитируемых в настоящем описании, прямо включены в настоящий документ посредством ссылки. Промышленная применимость. Ahtu-CTLA-4 антитела по настоящему изобретению и способы их применения могут быть использованы при разработке, производстве, обеспечении, применении и т.п. фармацевтических препаратов с небольшими побочными эффектами, поскольку антитела по настоящему изобретению обладают активностью, активирующей иммунные клетки, цитотоксической активностью и/или противоопухолевой активностью, оказывают слабое влияние на неопухолевые ткани, такие как нормальные ткани. Кроме того, полипептиды, содержащие вариант Fc-области по настоящему изобретению, и способы их получения и применения могут быть использованы при разработке, производстве, обеспечении, применении и т.п. таких фармацевтических препаратов. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯviability reagent (Biolegend, Zombie Aqua), anti-CD3 antibody (BD, clone: UCHT1), anti-CD4 antibody (BD, clone: RPA-T4), anti-CD8 antibody (BD, clone: SK1), antibody to CD45RA (Biolegend, clone: HI100), antibody to CD25 (BD, clone: 2A3), antibody to CD16 (Biolegend, clone: 3G8), antibody to CD56 (Biolegend, clone: HCD56), antibody to CTLA4 (Biolegend company, clone: BNI3). FACS analysis was performed on a BD LSR Fortessa X-20 flow cytometer (BD). The proportion of CTLA4-positive regulatory T cells among viable cells is calculated at each antibody concentration, and the relative value at which the value at antibody concentration 0 is taken as 100% is determined as the survival (%) of CTLA4-positive regulatory T cells, which is used in as an indicator when assessing the cytotoxic activity of each antibody. The results obtained are presented in Fig. 32 (SW1389ART5+ACT1), fig. 33 (SW1389-ART6+ACT1), fig. 34 (SW1610-ART5+ACT1) and fig. 35 (SW1610ART6+ACT1). These results confirm that the cytotoxic activity of Fc-altered anti-CTLA4 switching antibodies against CTLA4-positive regulatory T cells differs in the presence and absence of ATP, and that there is also an ATP-dependent cytotoxic activity against CTLA4-positive regulatory T cells. Although the above inventions have been described in detail with reference to illustrations and examples to promote a clear understanding, the above description of the present invention and examples should not be construed as limiting the scope of the present invention. The description of all patent and scientific publications cited herein is expressly incorporated herein by reference. Industrial applicability. The Ahtu-CTLA-4 antibodies of the present invention and methods of using them can be used in the development, production, provision, use, and the like. pharmaceuticals with little side effects, since the antibodies of the present invention have immune cell activating activity, cytotoxic activity and/or antitumor activity, have little effect on non-tumor tissues such as normal tissues. In addition, the Fc region variant-containing polypeptides of the present invention and methods for preparing and using them can be used in the development, production, provision, use, and the like. such pharmaceuticals. CLAIM (1) последовательность VH, приведенную в SEQ ID NO: 98, и последовательность VL, приведенную в SEQ ID NO: 99;(1) the VH sequence shown in SEQ ID NO: 98 and the VL sequence shown in SEQ ID NO: 99; (1) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 113; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 114; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 115;(1) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 100; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 101; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 113; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 114; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 115; 1. Антитело к цитотоксическому Т-лимфоцитассоциированному белку 4 (CTLA-4), обладающее активностью связывания CTLA-4, которая зависит от концентрации аденозинсодержащего соединения, причем антитело содержит: (a) HVR-H1 (SEQ ID NO: 223), содержащую аминокислотную последовательность SX|TMN. где X1 представляет собой Н, A, R или K; (б) HVR-H2 (SEQ ID NO: 224), содержащую аминокислотную последовательность SISXX2SX3YIYYAX4SVX5G, где X1 представляет собой S или Т, Х2 представляет собой R или Q, Х3 представляет собой G или Н, Х4 представляет собой D, Е или R, и Х5 представляет собой K или R; (в) HVR-H3 (SEQ ID NO: 225), содержащую аминокислотную последовательность YGX1REDMLWVFDY, где X1 представляет собой K или А; (г) HVR-L1 (SEQ ID NO: 226), содержащую аминокислотную последовательность X1GX2STX3VGDYX4X5VX6, где X1 представляет собой Т, D, Q или Е, Х2 представляет собой Т или Р, Х3 представляет собой D или G, Х4 представляет собой N или Т, X5 представляет собой Y или W, а Х6 представляет собой S или Н; (д) HVR-L2 (SEQ ID NO: 227), содержащую аминокислотную последовательность X1T Х2Х3КРХ4, где X1 представляет собой Е, F или Y, Х2 представляет собой S или I, Х3 представляет собой K или S, а Х4 представляет собой S, Е или K; и (е) HVR-L3 (SEQ ID NO: 228), содержащую аминокислотную последовательность X1TYAAPLGP X2, где X1 представляет собой S или Q, а Х2 представляет собой М или Т.1. An anti-cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4 (CTLA-4) antibody having CTLA-4 binding activity that is dependent on the concentration of an adenosine-containing compound, the antibody comprising: (a) HVR-H1 (SEQ ID NO: 223) containing an amino acid sequence SX|TMN. where X 1 represents H, A, R or K; (b) HVR-H2 (SEQ ID NO: 224) containing the amino acid sequence SISXX2SX3YIYYAX4SVX5G, where X1 is S or T, X 2 is R or Q, X 3 is G or H, X 4 is D, E or R, and X 5 represents K or R; (c) HVR-H3 (SEQ ID NO: 225) containing the amino acid sequence YGX1REDMLWVFDY, where X1 represents K or A; (d) HVR-L1 (SEQ ID NO: 226) containing the amino acid sequence X1GX2STX3VGDYX4X5VX6, where X1 is T, D, Q or E, X 2 is T or P, X 3 is D or G, X 4 is is N or T, X5 is Y or W, and X6 is S or H; (e) HVR-L2 (SEQ ID NO: 227) containing the amino acid sequence X1T X 2 X 3 KRX 4 where X1 is E, F or Y, X 2 is S or I, X 3 is K or S and X 4 represents S, E or K; and (e) HVR-L3 (SEQ ID NO: 228) containing the amino acid sequence X1TYAAPLGP X 2 where X 1 is S or Q and X 2 is M or T. (2) последовательность VH, приведенную в SEQ ID NO: 83, и последовательность VL, приведенную в SEQ ID NO: 97;(2) the VH sequence shown in SEQ ID NO: 83 and the VL sequence shown in SEQ ID NO: 97; (2) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 116; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 115;(2) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 100; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 104; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 116; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 115; 2. Антитело по п.1, которое содержит:2. Antibody according to claim 1, which contains: (3) последовательность VH, приведенную в SEQ ID NO: 86, и последовательность VL, приведенную в SEQ ID NO: 134;(3) the VH sequence shown in SEQ ID NO: 86 and the VL sequence shown in SEQ ID NO: 134; 3. Антитело по п.1, которое содержит: (a) VH, которая по меньшей мере на 95% идентична любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 83-86, 98 и 135-141; (б) VL, которая по меньшей мере на 95% идентична любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 88-95, 97, 99, 134 и 144-149; или (в) VH, имеющую любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 83-86, 98 и 135-141, и VL, имеющую любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 88-95, 97, 99, 134 и 144-149.3. The antibody of claim 1, which contains: (a) a VH that is at least 95% identical to any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 83-86, 98 and 135-141; (b) VL that is at least 95% identical to any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 88-95, 97, 99, 134 and 144-149; or (c) VH having any amino acid sequence from SEQ ID NOs: 83-86, 98 and 135-141, and VL having any amino acid sequence from SEQ ID NOs: 88-95, 97, 99, 134 and 144-149 . (3) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последова-(3) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 106; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence - 92 045931 тельность SEQ ID NO: 122; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133;- 92 045931 activity SEQ ID NO: 122; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133; (4) последовательность VH, приведенную в SEQ ID NO: 136, и последовательность VL, приведенную в SEQ ID NO: 95;(4) the VH sequence shown in SEQ ID NO: 136 and the VL sequence shown in SEQ ID NO: 95; 4. Антитело к цитотоксическому Т-лимфоцитассоциированному белку 4 (CTLA-4), которое содержит:4. Antibody to cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4 (CTLA-4), which contains: (4) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 108; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 153;(4) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 108; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 121; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 123; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 153; (5) последовательность VH, приведенную в SEQ ID NO: 140, и последовательность VL, приведенную в SEQ ID NO: 146;(5) the VH sequence shown in SEQ ID NO: 140 and the VL sequence shown in SEQ ID NO: 146; (5) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133;(5) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 110; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 122; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133; (6) последовательность VH, приведенную в SEQ ID NO: 141, и последовательность VL, приведенную в SEQ ID NO: 146;(6) the VH sequence shown in SEQ ID NO: 141 and the VL sequence shown in SEQ ID NO: 146; (6) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133;(6) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 112; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133; (7) последовательность VH, приведенную в SEQ ID NO: 140, и последовательность VL, приведенную в SEQ ID NO: 147;(7) the VH sequence shown in SEQ ID NO: 140 and the VL sequence shown in SEQ ID NO: 147; (7) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133;(7) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 111; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 128; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133; (8) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 112; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133;(8) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 112; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133; (9) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111; (в) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 152; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133; или (10) (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 107; (б) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 109; (в) HVR-НЗ, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; (г) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130; (д) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 117; и (е) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 133.(9) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 111; (c) HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 152; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 129; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133; or (10) (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; (b) HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 109; (c) HVR-NZ containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 102; (d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 130; (e) HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 117; and (e) HVR-L3 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 133. (8) последовательность VH, приведенную в SEQ ID NO: 141, и последовательность VL, приведенную в SEQ ID NO: 147;(8) the VH sequence shown in SEQ ID NO: 141 and the VL sequence shown in SEQ ID NO: 147; --
EA202291976 2019-12-27 ANTI-CTLA-4 ANTIBODY AND ITS APPLICATION EA045931B1 (en)

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA045931B1 true EA045931B1 (en) 2024-01-19

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11192950B2 (en) Humanized and affinity matured antibodies to FcRH5 and methods of use
US20240059774A1 (en) Anti-ctla-4 antibody and use thereof
JP2024010057A (en) Anti-ctla-4 antibodies and use thereof
JP2024095774A (en) Anti-ctla-4 antibodies
JP2024099585A (en) Use of anti-ctla-4 antibody
CN117616123B (en) Anti-CTLA-4 antibodies
EA045931B1 (en) ANTI-CTLA-4 ANTIBODY AND ITS APPLICATION
BR112022011723B1 (en) ANTI-CTLA-4 ANTIBODY AND PHARMACEUTICAL FORMULATION
TW202216764A (en) Anti-CTLA-4 antibody and use thereof having CTLA-4 binding activity depending on the concentration of an adenosine-containing compound