EA045916B1 - ANTIBODY CONTAINING GLUTAMINE CONTAINING C-TERMINAL ELONGATION OF LIGHT CHAIN, ITS CONJUGATES, METHODS AND ROUTES OF APPLICATION - Google Patents
ANTIBODY CONTAINING GLUTAMINE CONTAINING C-TERMINAL ELONGATION OF LIGHT CHAIN, ITS CONJUGATES, METHODS AND ROUTES OF APPLICATION Download PDFInfo
- Publication number
- EA045916B1 EA045916B1 EA202191518 EA045916B1 EA 045916 B1 EA045916 B1 EA 045916B1 EA 202191518 EA202191518 EA 202191518 EA 045916 B1 EA045916 B1 EA 045916B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- group
- glutamine
- antibody
- compound
- conjugate
- Prior art date
Links
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims description 43
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 29
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 claims description 47
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 42
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 claims description 42
- 108060008539 Transglutaminase Proteins 0.000 claims description 39
- 102000003601 transglutaminase Human genes 0.000 claims description 39
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 35
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 31
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 30
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 claims description 29
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 29
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 29
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 claims description 26
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims description 21
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 16
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 claims description 15
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims description 14
- -1 glutamine side chain carboxamide Chemical class 0.000 claims description 12
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 11
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 11
- UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N beta-alanine Chemical compound NCCC(O)=O UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 10
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 claims description 10
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 claims description 9
- 229960002449 glycine Drugs 0.000 claims description 9
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 8
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 8
- 102100039390 Toll-like receptor 7 Human genes 0.000 claims description 8
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 claims description 8
- 150000003141 primary amines Chemical class 0.000 claims description 8
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 7
- 239000000556 agonist Substances 0.000 claims description 7
- 229960002885 histidine Drugs 0.000 claims description 7
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 claims description 7
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 6
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 6
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 6
- 101710196623 Stimulator of interferon genes protein Proteins 0.000 claims description 6
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 claims description 6
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 claims description 6
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 229960002433 cysteine Drugs 0.000 claims description 6
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 claims description 6
- OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N (+/-)-DABA Natural products NCCC(N)C(O)=O OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 5
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims description 5
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- SNDPXSYFESPGGJ-BYPYZUCNSA-N L-2-aminopentanoic acid Chemical compound CCC[C@H](N)C(O)=O SNDPXSYFESPGGJ-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 5
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N L-Ornithine Chemical compound NCCC[C@H](N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 5
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 5
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 5
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 claims description 5
- RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N L-citrulline Chemical compound NC(=O)NCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 5
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 5
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 5
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 5
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 5
- SNDPXSYFESPGGJ-UHFFFAOYSA-N L-norVal-OH Natural products CCCC(N)C(O)=O SNDPXSYFESPGGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N L-norleucine Chemical compound CCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 5
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 5
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 claims description 5
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 5
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 5
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N Ndelta-carbamoyl-DL-ornithine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=O RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N Orn-delta-NH2 Natural products NCCCC(N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N Ornithine Natural products OC(=O)C(C)CCCN UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims description 5
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims description 5
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 claims description 5
- 239000012491 analyte Substances 0.000 claims description 5
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 229960003121 arginine Drugs 0.000 claims description 5
- 235000009697 arginine Nutrition 0.000 claims description 5
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 claims description 5
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 claims description 5
- 229940000635 beta-alanine Drugs 0.000 claims description 5
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 235000013477 citrulline Nutrition 0.000 claims description 5
- 229960002173 citrulline Drugs 0.000 claims description 5
- 239000002254 cytotoxic agent Substances 0.000 claims description 5
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 claims description 5
- 229960003692 gamma aminobutyric acid Drugs 0.000 claims description 5
- UHBYWPGGCSDKFX-VKHMYHEASA-N gamma-carboxy-L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(C(O)=O)C(O)=O UHBYWPGGCSDKFX-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 5
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 claims description 5
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 claims description 5
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 claims description 5
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims description 5
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 claims description 5
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 claims description 5
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 claims description 5
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000004474 valine Substances 0.000 claims description 5
- 101000831496 Homo sapiens Toll-like receptor 3 Proteins 0.000 claims description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 claims description 4
- 102100024324 Toll-like receptor 3 Human genes 0.000 claims description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims description 4
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 4
- 108010060818 Toll-Like Receptor 9 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100033117 Toll-like receptor 9 Human genes 0.000 claims description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 3
- 229940044606 RIG-I agonist Drugs 0.000 claims description 2
- 101000669402 Homo sapiens Toll-like receptor 7 Proteins 0.000 claims 2
- 102000000874 Pyrin Domain-Containing 3 Protein NLR Family Human genes 0.000 claims 2
- 108010001946 Pyrin Domain-Containing 3 Protein NLR Family Proteins 0.000 claims 2
- 239000000562 conjugate Substances 0.000 description 24
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 18
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 18
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 18
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 18
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 15
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 14
- 230000008569 process Effects 0.000 description 12
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 9
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 9
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 9
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 9
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 9
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 8
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 7
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 7
- 101000662009 Homo sapiens UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase Proteins 0.000 description 6
- 108010060825 Toll-Like Receptor 7 Proteins 0.000 description 6
- 102100037921 UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase Human genes 0.000 description 6
- 229940049595 antibody-drug conjugate Drugs 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 5
- 239000000611 antibody drug conjugate Substances 0.000 description 5
- 150000002309 glutamines Chemical class 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 5
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 5
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 1-methylethyl 11-methoxy-3,7,11-trimethyl-2,4-dodecadienoate Chemical compound COC(C)(C)CCCC(C)CC=CC(C)=CC(=O)OC(C)C NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102100041003 Glutamate carboxypeptidase 2 Human genes 0.000 description 4
- 101000892862 Homo sapiens Glutamate carboxypeptidase 2 Proteins 0.000 description 4
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 102100035533 Stimulator of interferon genes protein Human genes 0.000 description 4
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 4
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 4
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 4
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 4
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 4
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 4
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 4
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100037435 Antiviral innate immune response receptor RIG-I Human genes 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 3
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 3
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 description 3
- 102100039813 Inactive tyrosine-protein kinase 7 Human genes 0.000 description 3
- 101710099452 Inactive tyrosine-protein kinase 7 Proteins 0.000 description 3
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 3
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 3
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 3
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 230000022811 deglycosylation Effects 0.000 description 3
- 150000002333 glycines Chemical class 0.000 description 3
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 3
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 3
- 230000006320 pegylation Effects 0.000 description 3
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 238000007056 transamidation reaction Methods 0.000 description 3
- AGGWFDNPHKLBBV-YUMQZZPRSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-methylbutanoyl]amino]-5-(carbamoylamino)pentanoic acid Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=O AGGWFDNPHKLBBV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- 102100038080 B-cell receptor CD22 Human genes 0.000 description 2
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 description 2
- 102100032912 CD44 antigen Human genes 0.000 description 2
- 102100025221 CD70 antigen Human genes 0.000 description 2
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 description 2
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 description 2
- 102000010956 Glypican Human genes 0.000 description 2
- 108050001154 Glypican Proteins 0.000 description 2
- 108050007237 Glypican-3 Proteins 0.000 description 2
- 101000952099 Homo sapiens Antiviral innate immune response receptor RIG-I Proteins 0.000 description 2
- 101000884305 Homo sapiens B-cell receptor CD22 Proteins 0.000 description 2
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 description 2
- 101000868273 Homo sapiens CD44 antigen Proteins 0.000 description 2
- 101000934356 Homo sapiens CD70 antigen Proteins 0.000 description 2
- 101000643024 Homo sapiens Stimulator of interferon genes protein Proteins 0.000 description 2
- 101000851376 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Proteins 0.000 description 2
- 101000955999 Homo sapiens V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1 Proteins 0.000 description 2
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 2
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 2
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 description 2
- 239000012515 MabSelect SuRe Substances 0.000 description 2
- 102000003735 Mesothelin Human genes 0.000 description 2
- 108090000015 Mesothelin Proteins 0.000 description 2
- 238000006845 Michael addition reaction Methods 0.000 description 2
- 239000012124 Opti-MEM Substances 0.000 description 2
- 102100038095 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 Human genes 0.000 description 2
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- 102100036857 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Human genes 0.000 description 2
- 102100038929 V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1 Human genes 0.000 description 2
- HSRXSKHRSXRCFC-WDSKDSINSA-N Val-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HSRXSKHRSXRCFC-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 2
- 230000000240 adjuvant effect Effects 0.000 description 2
- 150000003973 alkyl amines Chemical class 0.000 description 2
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001408 amides Chemical group 0.000 description 2
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 125000003310 benzodiazepinyl group Chemical class N1N=C(C=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 2
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 2
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 230000004154 complement system Effects 0.000 description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 2
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 238000001437 electrospray ionisation time-of-flight quadrupole detection Methods 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 125000005439 maleimidyl group Chemical group C1(C=CC(N1*)=O)=O 0.000 description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 229940044616 toll-like receptor 7 agonist Drugs 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 2
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 2
- OBGWIHKWGGEOEV-WJPOXRCESA-N (1S,17S,20Z,24R,26R)-4,24-dihydroxy-26-[(1R)-1-hydroxyethyl]-25-oxa-16-azahexacyclo[15.7.2.01,26.02,15.05,14.07,12]hexacosa-2,4,7,9,11,14,20-heptaen-18,22-diyne-6,13-dione Chemical compound O[C@@H]1C#C\C=C/C#C[C@@H]2NC(C=3C(=O)C4=CC=CC=C4C(=O)C=3C(O)=C3)=C3[C@@]31O[C@]32[C@H](O)C OBGWIHKWGGEOEV-WJPOXRCESA-N 0.000 description 1
- WGJUFIXHTBAMBX-BYPYZUCNSA-N (2s)-2,6,6-triaminohexanoic acid Chemical compound NC(N)CCC[C@H](N)C(O)=O WGJUFIXHTBAMBX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 102100032814 ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1 Human genes 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 206010069754 Acquired gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 101710127675 Antiviral innate immune response receptor RIG-I Proteins 0.000 description 1
- XWKBWZXGNXTDKY-ZKWXMUAHSA-N Asp-Val-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O XWKBWZXGNXTDKY-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 102100031650 C-X-C chemokine receptor type 4 Human genes 0.000 description 1
- ZUHQCDZJPTXVCU-UHFFFAOYSA-N C1#CCCC2=CC=CC=C2C2=CC=CC=C21 Chemical group C1#CCCC2=CC=CC=C2C2=CC=CC=C21 ZUHQCDZJPTXVCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100038078 CD276 antigen Human genes 0.000 description 1
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 1
- 102000004225 Cathepsin B Human genes 0.000 description 1
- 108090000712 Cathepsin B Proteins 0.000 description 1
- 102000005600 Cathepsins Human genes 0.000 description 1
- 108010084457 Cathepsins Proteins 0.000 description 1
- 101710112752 Cytotoxin Proteins 0.000 description 1
- 241001658031 Eris Species 0.000 description 1
- 108010008177 Fd immunoglobulins Proteins 0.000 description 1
- 101000922348 Homo sapiens C-X-C chemokine receptor type 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000884279 Homo sapiens CD276 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000889276 Homo sapiens Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000666171 Homo sapiens Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 Proteins 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VWPJQIHBBOJWDN-DCAQKATOSA-N Lys-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VWPJQIHBBOJWDN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 1
- 102000012064 NLR Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005686 NOD-like receptors Proteins 0.000 description 1
- 101800000795 Proadrenomedullin N-20 terminal peptide Proteins 0.000 description 1
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 description 1
- 108700039882 Protein Glutamine gamma Glutamyltransferase 2 Proteins 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241001495137 Streptomyces mobaraensis Species 0.000 description 1
- 101000837751 Streptomyces mobaraensis Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 108091021474 TMEM173 Proteins 0.000 description 1
- 102000008230 Toll-like receptor 3 Human genes 0.000 description 1
- 108010060885 Toll-like receptor 3 Proteins 0.000 description 1
- XXDVDTMEVBYRPK-XPUUQOCRSA-N Val-Gln Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O XXDVDTMEVBYRPK-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N Valylglycine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NCC(O)=O IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102220591670 WW domain-binding protein 2_Y75F_mutation Human genes 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 1
- 239000002168 alkylating agent Substances 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 238000011394 anticancer treatment Methods 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 description 1
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 1
- 108010044540 auristatin Proteins 0.000 description 1
- IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N azide group Chemical group [N-]=[N+]=[N-] IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 229960000074 biopharmaceutical Drugs 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- HXCHCVDVKSCDHU-LULTVBGHSA-N calicheamicin Chemical compound C1[C@H](OC)[C@@H](NCC)CO[C@H]1O[C@H]1[C@H](O[C@@H]2C\3=C(NC(=O)OC)C(=O)C[C@](C/3=C/CSSSC)(O)C#C\C=C/C#C2)O[C@H](C)[C@@H](NO[C@@H]2O[C@H](C)[C@@H](SC(=O)C=3C(=C(OC)C(O[C@H]4[C@@H]([C@H](OC)[C@@H](O)[C@H](C)O4)O)=C(I)C=3C)OC)[C@@H](O)C2)[C@@H]1O HXCHCVDVKSCDHU-LULTVBGHSA-N 0.000 description 1
- 229930195731 calicheamicin Natural products 0.000 description 1
- 150000003857 carboxamides Chemical group 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 238000006352 cycloaddition reaction Methods 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002619 cytotoxin Substances 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 108010007093 dispase Proteins 0.000 description 1
- VQNATVDKACXKTF-XELLLNAOSA-N duocarmycin Chemical compound COC1=C(OC)C(OC)=C2NC(C(=O)N3C4=CC(=O)C5=C([C@@]64C[C@@H]6C3)C=C(N5)C(=O)OC)=CC2=C1 VQNATVDKACXKTF-XELLLNAOSA-N 0.000 description 1
- 229960005501 duocarmycin Drugs 0.000 description 1
- 229930184221 duocarmycin Natural products 0.000 description 1
- 229930013356 epothilone Natural products 0.000 description 1
- HESCAJZNRMSMJG-KKQRBIROSA-N epothilone A Chemical class C/C([C@@H]1C[C@@H]2O[C@@H]2CCC[C@@H]([C@@H]([C@@H](C)C(=O)C(C)(C)[C@@H](O)CC(=O)O1)O)C)=C\C1=CSC(C)=N1 HESCAJZNRMSMJG-KKQRBIROSA-N 0.000 description 1
- 239000006167 equilibration buffer Substances 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- ZZUFCTLCJUWOSV-UHFFFAOYSA-N furosemide Chemical compound C1=C(Cl)C(S(=O)(=O)N)=CC(C(O)=O)=C1NCC1=CC=CO1 ZZUFCTLCJUWOSV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 229940045207 immuno-oncology agent Drugs 0.000 description 1
- 230000002998 immunogenetic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002584 immunological anticancer agent Substances 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 229960005386 ipilimumab Drugs 0.000 description 1
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- 229960003301 nivolumab Drugs 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 1
- 238000011275 oncology therapy Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 150000002923 oximes Chemical class 0.000 description 1
- PIRWNASAJNPKHT-SHZATDIYSA-N pamp Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](C)N)C(C)C)C1=CC=CC=C1 PIRWNASAJNPKHT-SHZATDIYSA-N 0.000 description 1
- 229960002621 pembrolizumab Drugs 0.000 description 1
- NMHMNPHRMNGLLB-UHFFFAOYSA-N phloretic acid Chemical compound OC(=O)CCC1=CC=C(O)C=C1 NMHMNPHRMNGLLB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- UOWVMDUEMSNCAV-WYENRQIDSA-N rachelmycin Chemical class C1([C@]23C[C@@H]2CN1C(=O)C=1NC=2C(OC)=C(O)C4=C(C=2C=1)CCN4C(=O)C1=CC=2C=4CCN(C=4C(O)=C(C=2N1)OC)C(N)=O)=CC(=O)C1=C3C(C)=CN1 UOWVMDUEMSNCAV-WYENRQIDSA-N 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 102220076790 rs570768038 Human genes 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 230000037439 somatic mutation Effects 0.000 description 1
- 150000003557 thiazoles Chemical class 0.000 description 1
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 1
- OBGWIHKWGGEOEV-UHFFFAOYSA-N uncialamycin Natural products OC1C#CC=CC#CC2NC(C=3C(=O)C4=CC=CC=C4C(=O)C=3C(O)=C3)=C3C31OC32C(O)C OBGWIHKWGGEOEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Description
Перекрестная ссылка на родственные заявкиCross reference to related applications
Согласно настоящей заявке испрашивается приоритет в соответствии с §119 (е) раздела 35 USC по предварительной заявке США с серийным № 62/773708, поданной 30 ноября 2018 г.; раскрытие которой включено в настоящий документ посредством ссылки.This application claims priority under 35 USC §119(e) to US Provisional Application Serial No. 62/773708, filed November 30, 2018; the disclosure of which is incorporated herein by reference.
Перечень последовательностейList of sequences
В настоящий документ посредством ссылки в полном объеме включен Перечень последовательностей, озаглавленный 191017_SEQT_13142WOPCT_YC.txt, содержащий SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 40, который включает в себя последовательности нуклеиновых кислот и/или аминокислотные последовательности, раскрытые в настоящем документе. Перечень последовательностей был подан в настоящем документе в текстовом формате ASCII посредством EFS-Web и, таким образом, представлен как в бумажной, так и в машиночитаемой форме. Перечень последовательностей был впервые создан с помощью PatentIn 3.5 26 октября 2018 г. и имеет размер примерно 14 кб.Incorporated herein by reference in its entirety is the Sequence Listing entitled 191017_SEQT_13142WOPCT_YC.txt containing SEQ ID NO: 1 through SEQ ID NO: 40, which includes the nucleic acid sequences and/or amino acid sequences disclosed herein. The sequence listing has been provided herein in ASCII text format via EFS-Web and is thus presented in both paper and machine-readable form. The sequence listing was first generated using PatentIn 3.5 on October 26, 2018 and is approximately 14 kb in size.
Предшествующий уровень техники настоящего изобретенияBACKGROUND OF THE INVENTION
Настоящее раскрытие относится к модифицированным антителам, конъюгируемым ферментом трансглутаминазой, и конъюгатам, полученным из таких антител.The present disclosure relates to modified transglutaminase enzyme-conjugated antibodies and conjugates derived from such antibodies.
В настоящее время большой интерес вызывает тот вид биопрепарата, в котором антитело ковалентно связано с молекулой-партнером (конъюгат или иммуноконъюгат). Таким образом, конъюгат состоит из трех компонентов: (1) антитело, (2) молекула-партнер и (3) линкер, ковалентно соединяющий первые два компонента.Currently, there is great interest in the type of biological product in which the antibody is covalently linked to a partner molecule (conjugate or immunoconjugate). Thus, the conjugate consists of three components: (1) the antibody, (2) the partner molecule, and (3) a linker that covalently connects the first two components.
Молекула-партнер может представлять собой терапевтическое средство, такое как противораковое лекарственное средство, адъювант, другой белок или радиоизотоп. Антитело представляет собой антитело, антиген которого экспрессируется целевой клеткой или тканью. Антитело, связываясь с антигеном, служит для доставки конъюгата к мишени. Оказавшись там, расщепление ковалентной связи или деградация антитела приводит к высвобождению терапевтического средства в целевом расположении. И наоборот, пока конъюгат циркулирует в системе крови, терапевтическое средство остается неактивным вследствие его ковалентной связи с антителом, что снижает риск побочных эффектов. Обзор конъюгатов при противораковом лечении см. в Gerber et al. 2013.The partner molecule may be a therapeutic agent, such as an anticancer drug, an adjuvant, another protein, or a radioisotope. An antibody is an antibody whose antigen is expressed by a target cell or tissue. The antibody, binding to the antigen, serves to deliver the conjugate to the target. Once there, cleavage of the covalent bond or degradation of the antibody releases the therapeutic agent at the target location. Conversely, while the conjugate circulates in the blood system, the therapeutic agent remains inactive due to its covalent bond to the antibody, reducing the risk of side effects. For a review of conjugates in anticancer treatment, see Gerber et al. 2013.
В качестве альтернативы терапевтическому средству молекула-партнер может представлять собой аналитическое средство для диагностики, определения очага заболевания или мониторинга медицинского состояния. В таком случае аналитическое средство может представлять собой, например, биотин, флуоресцентную метку, радиоактивную метку или дейтерированный полимер. Smith et al. 2019 раскрывает конъюгат, содержащий дейтерированный полимер, для визуализации с помощью МРТ. В таком случае отщепление линкера в целевом сайте не обязательно и фактически может быть нежелательным. Для такого применения линкер может быть нерасщепляемого типа.As an alternative to a therapeutic agent, the partner molecule may be an analytical agent for diagnosis, disease detection, or monitoring of a medical condition. In such a case, the analytical agent may be, for example, biotin, a fluorescent label, a radiolabel, or a deuterated polymer. Smith et al. 2019 discloses a conjugate containing a deuterated polymer for MRI imaging. In such a case, cleavage of the linker at the target site is not necessary and may in fact be undesirable. For such applications, the linker may be of a non-cleavable type.
Основной стадий приготовления конъюгата является стадия ковалентного соединения, также называемая стадией конъюгирования. Было раскрыто множество способов осуществления конъюгации. В последнее время значительный интерес вызывает конъюгация, опосредованная ферментом трансглутаминазой (ЕС 2.3.2.13).The main step in the preparation of a conjugate is the covalent coupling step, also called the conjugation step. Many methods for performing conjugation have been disclosed. Recently, conjugation mediated by the enzyme transglutaminase (EC 2.3.2.13) has attracted considerable interest.
Известно множество вариантов трансглутаминаз, которые либо продуцируются различными организмами в естественных условиях, либо создаются в процессе биоинженерии. В пищевой промышленности для текстурирования белков широко используется трансглутаминаза Streptomyces mobaraensis, полученная с помощью ферментации или рекомбинантной экспрессии. В настоящем документе термин трансглутаминаза используется в общем, если не указан конкретный тип или источник.There are many known variants of transglutaminases, which are either produced naturally by various organisms or created through bioengineering. In the food industry, Streptomyces mobaraensis transglutaminase, produced by fermentation or recombinant expression, is widely used to texturize proteins. As used herein, the term transglutaminase is used generically unless a specific type or source is indicated.
Трансглутаминаза образует амидную связь между карбоксамидной боковой цепью глутамина (акцептор амина или реципрокно донор ацила) и ε-аминогруппой лизина (донор амина или реципрокно акцептор ацила). С точки зрения специфичности трансглутаминаза является селективной в отношении остатка глутамина, требуя, чтобы он располагался в гибкой части белковой петли и фланкировался определенными аминокислотами, но является неизбирательной в отношении остатка лизина, например, легко принимает аминогруппу соединения алкиленамино в качестве суррогата лизина ε-амино. См. Fontana et al. 2008.Transglutaminase forms an amide bond between the carboxamide side chain of glutamine (amine acceptor or reciprocal acyl donor) and the ε-amino group of lysine (amine donor or reciprocal acyl acceptor). In terms of specificity, transglutaminase is selective for the glutamine residue, requiring it to be located in the flexible part of the protein loop and flanked by certain amino acids, but is non-selective for the lysine residue, for example, readily accepting the amino group of an alkylenamino compound as a surrogate for the ε-amino lysine. See Fontana et al. 2008.
В типичной опосредованной трансглутаминазой конъюгации остаток глутамина расположен на антителе, в то время как аминогруппа расположена на фрагменте линкерной молекулы-партнера, как показано ниже:In a typical transglutaminase-mediated conjugation, the glutamine residue is located on the antibody while the amino group is located on a moiety of the linker partner molecule, as shown below:
~Т~ 9 Трансглутаминаза~T~ 9 Transglutaminase
Gin—(CH2)2-C-NH2 + Н2Х-[Линкер]-[Молекула-партнер] >.Gin—(CH2) 2 -C-NH 2 + H 2 X-[Linker]-[Partner molecule] >.
Антитело “Т~ОAntibody “T~O
IиIi
Gin—(С Н 2) 2' С - N- [Линкер]- [Молекула-партнер] IнGin—(C H 2) 2' C - N - [Linker] - [Partner molecule] In
КонъюгатConjugate
Расположение остатка глутамина в полипептидной цепи значительно влияет на его доступность вThe location of the glutamine residue in the polypeptide chain significantly affects its availability in
- 1 045916 качестве акцептора амина. Обычно ни один из остатков глутамина в антителе недоступен, и требуется некоторая модификация антитела, чтобы сделать их доступными. Обычно антитело гликозилировано в положении 297 аспарагина (N297) тяжелой цепи (N-связанное гликозилирование). Jeger et al. 2010 обнаружил, что дегликозилирование антитела путем устранения сайта гликозилирования посредством замены N297A или посттрансляционного ферментативного дегликозилирования делает близлежащий глутамин в положении 295 (Q295) доступным для трансамидирования трансглутаминазой S. mobaraensis. Они также показали, что замена N297Q не только устраняет гликозилирование, но также вводит второй остаток глутамина (в положении 297), который также является акцептором амина. Таким образом, простое дегликозилирование генерирует два активных в отношении трансглутаминазой остатка глутамина на одно антитело (по одному на тяжелую цепь, в положении Q295), тогда как антитело с заменой N297Q генерирует четыре таких остатка глутамина (два на тяжелую цепь в положениях Q295 и Q297).- 1 045916 as an amine acceptor. Typically, none of the glutamine residues in an antibody are accessible, and some modification of the antibody is required to make them accessible. Typically, the antibody is glycosylated at position 297 of asparagine (N297) of the heavy chain (N-linked glycosylation). Jeger et al. 2010 found that deglycosylation of an antibody by eliminating the glycosylation site via N297A substitution or post-translational enzymatic deglycosylation makes the nearby glutamine at position 295 (Q295) available for transamidation by S. mobaraensis transglutaminase. They also showed that the N297Q substitution not only eliminates glycosylation, but also introduces a second glutamine residue (at position 297), which is also an amine acceptor. Thus, simple deglycosylation generates two transglutaminase-active glutamine residues per antibody (one per heavy chain, at position Q295), whereas an antibody with the N297Q substitution generates four such glutamine residues (two per heavy chain, at positions Q295 and Q297). .
В дополнение к заменам N297A и N297Q, раскрытым Jeger et al. 2010, имели место и другие раскрытия касательно модификации антитела или другого белка для того, чтобы сделать его субстратом для трансглутаминазы.In addition to the N297A and N297Q substitutions disclosed by Jeger et al. 2010, there have been other disclosures regarding modification of an antibody or other protein to make it a substrate for transglutaminase.
(a) Strop et al. 2017 and Farias et al. раскрывают Fc-области антитела, сконструированные с помощью глутаминсодержащих меток, таких как LLQGG, LSLSQG, GGGLLQGG, GLLQG и т.д., при этом глутамин в метке может выступать в качестве акцептора амина и располагаться в различных местах тяжелой или легкой цепи антитела, включая их карбоксиконцы.(a) Strop et al. 2017 and Farias et al. reveal the Fc regions of antibodies constructed using glutamine-containing tags, such as LLQGG, LSLSQG, GGGLLQGG, GLLQG, etc., while the glutamine in the tag can act as an amine acceptor and be located at various places in the heavy or light chain of the antibody, including their carboxy ends.
(b) Chen et al. 2005 раскрывает модификацию белка с меткой QSKVX, где X представляет собой L или I, и этот белок затем можно конъюгировать с трансглутаминазой.(b) Chen et al. 2005 discloses a modification of a protein with a QSKVX tag, where X is L or I, and this protein can then be conjugated to a transglutaminase.
(c) Fischer et al. 2015 раскрывает включение во фрагмент антитела, не содержащего Fc-домена, глутамин ((9)-содержащую метку формулы (Q)-NH-(C)-X-L-(V-(Y-(M или Z)z)q)r (d) Rao-Naik et al. 2018 раскрывает добавление к антителу глутаминсодержащих С-концевых удлинений тяжелой цепи, для придания ему способности реагировать на трансглутаминазу.(c) Fischer et al. 2015 discloses the inclusion of glutamine ((9)-containing a label of the formula (Q)-NH-(C)-XL-(V-(Y-(M or Z) z )q) r in an antibody fragment not containing an Fc domain (d) Rao-Naik et al 2018 discloses the addition of glutamine-containing C-terminal heavy chain extensions to an antibody to render it transglutaminase responsive.
В подходе, дополняющем модификацию антитела, чтобы сделать его активным в отношении трансглутаминазы, Rao-Naik et al. 2017 раскрывают модификацию трансглутаминазы таким образом, чтобы сделать ее способной к конъюгированию с антителом дикого типа.In an approach complementary to modifying an antibody to make it active against transglutaminase, Rao-Naik et al. 2017 disclose modification of transglutaminase to make it capable of conjugating to a wild-type antibody.
Также были проведены исследования субстратной специфичности трансглутаминазы с использованием небольших пептид содержащих молекул: Ando et al. 1989, Kamiya et al. 2011, Ohtsuka et al. 2000.Substrate specificity studies of transglutaminase have also been carried out using small peptide-containing molecules: Ando et al. 1989, Kamiya et al. 2011, Ohtsuka et al. 2000.
Другие раскрытия, касающиеся конъюгации антител или других белков с использованием трансглутаминазы: Bregeon 2016, Bregeon et al. 2016, Bregeon et al. 2017, Dennler et al. 2014, Innate Pharma 2013, Lin et al. 2006, Mero et al. 2009, Mindt et al. 2008, Sato 2002, Sato et al. 2001, Schibli et al. 2007, и Sugimura et al. 2007.Other disclosures regarding the conjugation of antibodies or other proteins using transglutaminase: Bregeon 2016, Bregeon et al. 2016, Bregeon et al. 2017, Dennler et al. 2014, Innate Pharma 2013, Lin et al. 2006, Mero et al. 2009, Mindt et al. 2008, Sato 2002, Sato et al. 2001, Schibli et al. 2007, and Sugimura et al. 2007.
Также известно присоединение цистеинсодержащих концевых удлинений к антителу с целью осуществления конъюгации посредством реакции присоединения Михаэля к малеимидной группе. Liu et al. 2014 раскрывают присоединение таких удлинений к С-концу тяжелой цепи. Babcook et al. 2017 раскрывают присоединение таких удлинений к С-концу легкой цепи.It is also known to attach cysteine-containing terminal extensions to an antibody to achieve conjugation via a Michael addition reaction to the maleimide group. Liu et al. 2014 disclose the addition of such extensions to the C-terminus of the heavy chain. Babcook et al. 2017 disclose the addition of such extensions to the C-terminus of the light chain.
Полные ссылки на документы, процитированные в данном документе, с указанием первого автора или изобретателя и года выпуска перечислены в конце настоящего описания.Complete references to the documents cited herein, with first author or inventor and year of issue, are listed at the end of this specification.
Краткое раскрытие настоящего изобретенияBrief Disclosure of the Present Invention
Расположение сайта конъюгации может влиять на стабильность и фармакокинетику конъюгата. Strop et al. 2013. Таким образом, желательно предусмотреть альтернативные сайты конъюгации и структуры конъюгата, чтобы разнообразить варианты, доступные для разработки биопрепаратов.The location of the conjugation site can affect the stability and pharmacokinetics of the conjugate. Strop et al. 2013. Thus, it is desirable to provide alternative conjugation sites and conjugate structures to diversify the options available for biologics development.
В настоящем описании раскрыты антитела, имеющие С-концевые глутаминсодержащие удлинения на легкой цепи для конъюгации с трансглутаминазой. В соответствии с одним вариантом осуществления предусмотрено полноразмерное антитело, имеющее на С-конце (карбоксиконце) своей легкой цепи глутаминсодержащее удлинение, содержащее аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5, NO: 6, NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11, NO: 12, NO: 13, NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO: 26, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33, NO: 34, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 и NO:40.Disclosed herein are antibodies having C-terminal glutamine-containing extensions on the light chain for conjugation with transglutaminase. In accordance with one embodiment, a full-length antibody is provided having at the C-terminus (carboxy-terminus) of its light chain a glutamine-containing extension comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5, NO: 6, NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11, NO: 12, NO: 13, NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO: 26, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33, NO: 34, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 and NO:40.
В соответствии с другим аспектом в настоящем описании предусмотрен конъюгат формулы (IV) 0 ы Ab-C-N-L-D (IV) где Ab представляет собой полноразмерное антитело, имеющее на С-конце (карбоксиконце) своей легкой цепи глутаминсодержащее удлинение, содержащее аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5, NO: 6, NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11, NO: 12, NO: 13, NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO: 26, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33, NO: 34, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 и NO: 40;In another aspect, provided herein is a conjugate of formula (IV) 0 s Ab-CNLD ( IV ) wherein the Ab is a full-length antibody having at the C-terminus (carboxy-terminus) of its light chain a glutamine-containing extension comprising an amino acid sequence selected from the group , consisting of SEQ ID NO: 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5, NO: 6, NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11, NO : 12, NO: 13, NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24 , NO: 25, NO: 26, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33, NO: 34, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO : 39 and NO: 40;
- 2 045916- 2 045916
L представляет собой линкерный фрагмент, связывающий Ab с помощью амидной связиL is a linker moiety that binds Ab via an amide bond
с глутамином в глутаминсодержащем удлинении; иwith glutamine in glutamine-containing extension; And
D выбирают из группы, состоящей из белка, радиоизотопа, аналитического средства и терапевтического средства.D is selected from the group consisting of a protein, a radioisotope, an analytical agent and a therapeutic agent.
В соответствии с другим аспектом в настоящем описании предусмотрен способ получения конъюгата антитела, включающий стадии (а) смешивания полноразмерного антитела, имеющего на С-конце (карбоксиконце) своей легкой цепи глутаминсодержащее удлинение, содержащее аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5, NO: 6, NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11, NO: 12, NO: 13, NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO: 26, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33, NO: 34, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 и NO: 40, с соединением-донором амина, содержащим первичный амин и фрагмент, выбранный из группы, состоящей из белка, радиоизотопа, аналитического средства и терапевтического средства, в присутствии трансглутаминазы; и (b) предоставления трансглутаминазе возможности катализировать образование амидной связи между карбоксамидом боковой цепи глутамина глутаминсодержащего удлинения и первичным амином соединения-донора амина, тем самым приводя к образованию конъюгата антитела.In another aspect, provided herein is a method of producing an antibody conjugate comprising the steps of (a) mixing a full-length antibody having at the C-terminus (carboxy-terminus) of its light chain a glutamine-containing extension comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO : 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5, NO: 6, NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11, NO: 12, NO: 13 , NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO : 26, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33, NO: 34, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 and NO: 40 , with an amine donor compound containing a primary amine and a moiety selected from the group consisting of a protein, a radioisotope, an analyte and a therapeutic agent, in the presence of transglutaminase; and (b) allowing transglutaminase to catalyze the formation of an amide bond between the glutamine side chain carboxamide of the glutamine-containing extension and the primary amine of the amine donor compound, thereby resulting in the formation of an antibody conjugate.
В соответствии с другим аспектом в настоящем описании предусмотрен способ получения конъюгата антитела, включающий стадии (a) смешивания полноразмерного антитела, имеющего на С-конце (карбоксиконце) своей легкой цепи глутаминсодержащее удлинение, содержащее аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5, NO: 6, NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11, NO: 12, NO: 13, NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO: 26, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33, NO: 34, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 и NO: 40, с первым соединением, при этом первое соединение представляет собой соединение-донор амина, имеющее первичный амин и первую реакционноспособную функциональную группу, в присутствии трансглутаминазы;In another aspect, provided herein is a method of producing an antibody conjugate comprising the steps of (a) mixing a full-length antibody having at the C-terminus (carboxy-terminus) of its light chain a glutamine-containing extension comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO : 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5, NO: 6, NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11, NO: 12, NO: 13 , NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO : 26, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33, NO: 34, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 and NO: 40 , with a first compound, wherein the first compound is an amine donor compound having a primary amine and a first reactive functional group, in the presence of transglutaminase;
(b) предоставления трансглутаминазе возможности катализировать образование амидной связи между карбоксамидом боковой цепи глутамина глутаминсодержащего удлинения и первичным амином первого соединения, с образованием аддукта антитела и первого соединения;(b) allowing transglutaminase to catalyze the formation of an amide bond between the glutamine side chain carboxamide of the glutamine-containing extension and the primary amine of the first compound, forming an adduct of the antibody and the first compound;
(c) приведения аддукта в контакт со вторым соединением, имеющим вторую реакционноспособную функциональную группу и фрагмент, выбранный из группы, состоящей из белка, радиоизотопа, аналитического средства и терапевтического средства; при этом вторая реакционноспособная функциональная группа способна реагировать с первой реакционноспособной функциональной группой с образованием ковалентной связи между ними; и (d) предоставления первой и второй реакционноспособным функциональным группам возможности вступать в реакцию и образовывать ковалентную связь между ними, тем самым приводя к образованию конъюгата антитела.(c) contacting the adduct with a second compound having a second reactive functional group and a moiety selected from the group consisting of a protein, a radioisotope, an analyte, and a therapeutic agent; wherein the second reactive functional group is capable of reacting with the first reactive functional group to form a covalent bond therebetween; and (d) allowing the first and second reactive functional groups to react and form a covalent bond between them, thereby resulting in the formation of an antibody conjugate.
Если фрагмент (в первом соединении или втором соединении, в зависимости от обстоятельств) представляет собой белок, полученный конъюгат представляет собой слитый белок. Если фрагмент представляет собой радиоизотоп, полученный конъюгат можно использовать для лучевой терапии или радиовизуализации. Фрагмент может представлять собой аналитическое средство, такое как флуоресцентная метка, дейтерированный полимер или лиганд-подобный биотин, и в этом случае конъюгат можно использовать для диагностики медицинского состояния, мониторинга лечения или аналитических путей применения. Предпочтительно фрагмент представляет собой терапевтическое средство (в этом случае продукт также называют конъюгатом антитело-лекарственное средство или ADC), который можно использовать при различных видах лечения, особенно при лечении рака.If the fragment (in the first connection or second connection, as appropriate) is a protein, the resulting conjugate is a fusion protein. If the fragment is a radioisotope, the resulting conjugate can be used for radiation therapy or radioimaging. The moiety may be an analytical agent such as a fluorescent tag, a deuterated polymer, or a ligand-like biotin, in which case the conjugate may be used for medical condition diagnosis, treatment monitoring, or analytical applications. Preferably, the fragment is a therapeutic agent (in which case the product is also called an antibody-drug conjugate or ADC) that can be used in various treatments, especially in the treatment of cancer.
Краткое описание чертежейBrief description of drawings
На фиг. 1 схематически изображена легкая цепь антитела, имеющая С-концевое удлинение (SEQ ID NO: 1), как раскрыто в настоящем документе.In fig. 1 is a schematic diagram of an antibody light chain having a C-terminal extension (SEQ ID NO: 1) as disclosed herein.
На фиг. 2 представлено сравнение одно- и двухстадийных способов получения конъюгатов с использованием трансглутаминазы (BTG).In fig. 2 presents a comparison of one- and two-step methods for producing conjugates using transglutaminase (BTG).
Подробное раскрытие настоящего изобретения ОпределенияDetailed Disclosure of the Present Invention Definitions
Термин антитело означает целые антитела и любой антигенсвязывающий фрагмент (т.е., антигенсвязывающую часть) или их одноцепочечные варианты. Полное антитело представляет собой белок, содержащий по меньшей мере две тяжелые (Н) цепи и две легкие (L) цепи, соединенные между собой дисульфидными связями. Каждая тяжелая цепь содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH) и константную область тяжелой цепи, содержащую три домена, CH1, CH2 и CH3. Каждая легкая цепь содерThe term antibody means whole antibodies and any antigen-binding fragment (ie, antigen-binding portion) or single-chain variants thereof. A complete antibody is a protein containing at least two heavy (H) chains and two light (L) chains linked by disulfide bonds. Each heavy chain contains a heavy chain variable region (VH) and a heavy chain constant region containing three domains, CH1 , CH2 and CH3 . Each light chain contains
- 3 045916 жит вариабельную область легкой цепи (VL или Vk) и константную область легкой цепи, содержащую один единственный домен, CL. Области VH и VL могут быть дополнительно подразделены на области гипервариабельности, называемые областями, определяющими комплементарность (CDR), с вставками более консервативных каркасных областей (FR). Каждая VH и VL содержит три CDR и четыре FR, расположенные от амино- до карбоксиконца в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 и FR4. Вариабельные области содержат связывающий домен, который взаимодействует с антигеном. Константные области могут опосредовать связывание антитела с тканями или факторами хозяина, в том числе различными клетками иммунной системы (например, эффекторными клетками) и первым компонентом (Clq) классической системы комплемента. Считается, что антитело специфически связывается с антигеном X, если антитело связывается с антигеном X с KD 5x10-8 М или менее, более предпочтительно 1х 10-8 M или менее, более предпочтительно 6x10-9 М или менее, более предпочтительно 3x10-9 М или менее, еще более предпочтительно 2х10-9 М или менее. Антитело может быть химерным, гуманизированным или предпочтительно человеческим. Константная область тяжелой цепи может быть сконструирована таким образом, чтобы воздействовать на тип или степень гликозилирования, увеличивать периода полужизни антитела, усиливать или уменьшать взаимодействия с эффекторными клетками или системой комплемента или модулировать некоторые другие свойства. Конструирование может быть выполнено с помощью замены, добавления или удаления одной или нескольких аминокислот или замены домена доменом из другого типа иммуноглобулина или комбинацией вышеперечисленного.- 3 045916 has a light chain variable region (V L or V k ) and a light chain constant region containing one single domain, C L . The VH and VL regions can be further subdivided into regions of hypervariability called complementarity determining regions (CDRs), with insertions of more conserved framework regions (FRs). Each VH and VL contains three CDRs and four FRs, located from the amino to carboxy terminus in the following order: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 and FR4. Variable regions contain a binding domain that interacts with the antigen. Constant regions can mediate binding of the antibody to host tissues or factors, including various cells of the immune system (eg, effector cells) and the first component (Clq) of the classical complement system. An antibody is said to specifically bind to antigen X if the antibody binds to antigen X with a KD of 5 x 10 -8 M or less, more preferably 1 x 10 -8 M or less, more preferably 6 x 10 -9 M or less, more preferably 3 x 10 -9 M or less, even more preferably 2x10 -9 M or less. The antibody may be chimeric, humanized, or preferably human. The heavy chain constant region can be designed to affect the type or extent of glycosylation, increase the half-life of the antibody, increase or decrease interactions with effector cells or the complement system, or modulate certain other properties. Design can be accomplished by replacing, adding or deleting one or more amino acids, or replacing a domain with a domain from another type of immunoglobulin or a combination of the above.
Антигенсвязывающий фрагмент и антигенсвязывающая часть антитела (или просто часть антитела или фрагмент антитела) означают один или несколько фрагментов антитела, которые сохраняют способность специфически связываться с антигеном. Было показано, что антигенсвязывающая функция антитела может выполняться фрагментами полноразмерного антитела, такими как (i) фрагмент Fab, моновалентный фрагмент, состоящий из доменов VL, VH, CL и CH1; (ii) фрагмент F(ab')2, бивалентный фрагмент, содержащий два фрагмента Fab, связанных дисульфидным мостиком в шарнирной области; (iii) фрагмент Fab', который по сути представляет собой Fab с частью шарнирной области (см., например, Abbas et al., Cellular and Molecular Immunology, 6th Ed., Saunders Elsevier 2007); (iv) фрагмент Fd, состоящий из доменов VH и CH1; (v) фрагмент Fv, состоящий из доменов VL и VH одного плеча антитела, (vi) фрагмент dAb (Ward et al., (1989) Nature 341:544-546), который состоит из домена VH; (vii) выделенная область, определяющая комплементарность (CDR); и (viii) нанотело, вариабельная область тяжелой цепи, содержащая один вариабельный домен и два константных домена. Предпочтительными антигенсвязывающими фрагментами являются фрагменты Fab, F(ab')2, Fab', Fv и Fd. Кроме того, хотя два домена фрагмента Fv, VL и VH, кодируются отдельными генами, они могут быть соединены с использованием рекомбинантных способов с помощью синтетического линкера, который позволяет им находиться в виде одной белковой цепи, в которой области VL и VH попарно соединяются с образованием моновалентных молекул (известных как одноцепочечные Fv или scFv); см., например, Bird et al. (1988) Science 242:423426; и Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883/ Такие одноцепочечные антитела также охвачены термином антигенсвязывающая часть антитела.Antigen-binding fragment and antigen-binding portion of an antibody (or simply antibody portion or antibody fragment) mean one or more antibody fragments that retain the ability to specifically bind an antigen. It has been shown that the antigen-binding function of an antibody can be performed by fragments of a full-length antibody, such as (i) the Fab fragment, a monovalent fragment consisting of the VL , VH, CL and CH1 domains; (ii) fragment F(ab') 2 , a bivalent fragment containing two Fab fragments linked by a disulfide bridge in the hinge region; (iii) a Fab' fragment, which is essentially a Fab with part of the hinge region (see, for example, Abbas et al., Cellular and Molecular Immunology, 6th Ed., Saunders Elsevier 2007); (iv) Fd fragment consisting of VH and CH1 domains; (v) an Fv fragment consisting of the VL and VH domains of one arm of the antibody, (vi) a dAb fragment (Ward et al., (1989) Nature 341:544-546) which consists of a VH domain; (vii) dedicated complementarity determining region (CDR); and (viii) a nanobody, a heavy chain variable region containing one variable domain and two constant domains. Preferred antigen binding fragments are Fab, F(ab') 2 , Fab', Fv and Fd fragments. In addition, although the two domains of the Fv fragment, V L and V H , are encoded by separate genes, they can be joined using recombinant methods using a synthetic linker that allows them to exist as a single protein chain, in which the V L and V H regions combine in pairs to form monovalent molecules (known as single-chain Fv or scFv); see, for example, Bird et al. (1988) Science 242:423426; and Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883/ Such single chain antibodies are also encompassed by the term antigen binding portion of an antibody.
Если не указано иное, например, посредством ссылки на линейную нумерацию в перечне SEQ ID NO:, ссылки на нумерацию аминокислотных положений в вариабельной области тяжелой или легкой цепи антитела (VH или VL) соответствуют системе Kabat (Kabat et al., Sequences of proteins of immunological interest, 5th ed., Pub. No. 91-3242, U.S. Dept. Health & Human Services, NIH, Bethesda, Md., 1991, hereinafter Kabat) и ссылки на нумерацию аминокислотных положений в константной области тяжелой или легкой цепи антитела (CH1, CH2, CH3 или CL) соответствуют EU-индексу, как изложено в соответствии с Kabat. См. Lazar et al., US 2008/0248028 A1, раскрытие которого включено в настоящий документ посредством ссылки. Кроме того, информационная система ImMunoGeneTics (IMGT) предоставляет на своем веб-сайте таблицу под названием IMGT Scientific Chart: Correspondence between C Numberings, которая показывает соответствие между его системой нумерации, нумерацией согласно EU и нумерацией согласно Kabat для константной области тяжелой цепи.Unless otherwise indicated, for example by reference to linear numbering in SEQ ID NO:, references to the numbering of amino acid positions in the variable region of the heavy or light chain of an antibody (VH or VL) correspond to the Kabat system (Kabat et al., Sequences of proteins immunological interest, 5th ed., Pub. No. 91-3242, US Dept. Health & Human Services, NIH, Bethesda, Md., 1991, hereinafter Kabat) and references to the numbering of amino acid positions in the constant region of the heavy or light chain of the antibody ( C H1 , C H2 , C H3 or C L ) correspond to the EU index as set out according to Kabat. See Lazar et al., US 2008/0248028 A1, the disclosure of which is incorporated herein by reference. In addition, the ImMunoGeneTics Information System (IMGT) provides a table on its website called IMGT Scientific Chart: Correspondence between C Numberings, which shows the correspondence between its numbering system, EU numbering, and Kabat numbering for the heavy chain constant region.
Термин выделенное антитело означает антитело, которое по сути не содержит других антител, обладающих другой антигенной специфичностью (например, выделенное антитело, которое специфически связывает антиген X, по сути не содержит антител, которые специфически связывают антигены, отличные от антигена X). Однако выделенное антитело, которое специфически связывает антиген X, может обладать перекрестной реактивностью с другими антигенами, такими как молекулы антигена X от других видов. В соответствии с определенными вариантами осуществления выделенное антитело специфически связывается с антигеном X человека и не вступает в перекрестную реакцию с другими антигенами антигена X (отличными от человеческих). Более того, выделенное антитело может по сути не содержать другой клеточный материал и/или химические вещества.The term isolated antibody means an antibody that is substantially free of other antibodies having a different antigen specificity (eg, an isolated antibody that specifically binds antigen X is substantially free of antibodies that specifically bind antigens other than antigen X). However, an isolated antibody that specifically binds antigen X may be cross-reactive with other antigens, such as antigen X molecules from other species. In certain embodiments, the isolated antibody specifically binds to human X antigen and does not cross-react with other (non-human) X antigens. Moreover, the isolated antibody may essentially be free of other cellular material and/or chemicals.
Моноклональное антитело или композиция моноклонального антитела означает препарат молекул антитела с одним молекулярным составом, который демонстрирует одну специфичность связывания и аффинность в отношении конкретного эпитопа.Monoclonal antibody or monoclonal antibody composition means a preparation of antibody molecules with a single molecular composition that exhibits a single binding specificity and affinity for a particular epitope.
Человеческое антитело означает антитело, имеющее вариабельные области, в которых как карHuman antibody means an antibody having variable regions in which both
- 4 045916 касная область, так и области CDR (и константная область, при наличии) происходят из последовательностей иммуноглобулина зародышевой линии человека. Человеческие антитела могут включать более поздние модификации, включая естественные или синтетические модификации. Человеческие антитела могут включать аминокислотные остатки, не кодируемые последовательностями иммуноглобулина зародышевой линии человека (например, мутации, введенные случайным или с помощью сайтспецифического мутагенеза in vitro или с помощью соматической мутации in vivo). Однако термин человеческое антитело не включает антитела, в которых последовательности CDR, полученные из зародышевой линии другого вида млекопитающего, такого как мышь, привиты на последовательности каркасных областей человека.- 4 045916 the casing region and CDR regions (and constant region, if present) are derived from human germline immunoglobulin sequences. Human antibodies may include later modifications, including natural or synthetic modifications. Human antibodies may include amino acid residues not encoded by human germline immunoglobulin sequences (eg, mutations introduced randomly or by site-directed mutagenesis in vitro or by somatic mutation in vivo). However, the term human antibody does not include antibodies in which CDR sequences derived from the germ line of another mammalian species, such as a mouse, are grafted onto human framework sequences.
Человеческое моноклональное антитело означает антитело, проявляющее одну специфичность связывания, которое имеет вариабельные области, в которых как каркасная область, так и области CDR происходят из последовательностей иммуноглобулина зародышевой линии человека. В соответствии с одним вариантом осуществления человеческие моноклональные антитела продуцируются гибридомой, которая содержит В-клетку, полученную от трансгенного животного, отличного от человека, например, трансгенной мыши, геном которой содержит трансген тяжелой цепи человека и трансген легкой цепи, слитый с иммортализованной клеткой.Human monoclonal antibody means an antibody exhibiting a single binding specificity that has variable regions in which both the framework region and the CDR regions are derived from human germline immunoglobulin sequences. In one embodiment, human monoclonal antibodies are produced by a hybridoma that contains a B cell derived from a transgenic non-human animal, for example, a transgenic mouse, the genome of which contains a human heavy chain transgene and a light chain transgene fused to an immortalized cell.
Варианты осуществленияEmbodiments
Обычно опосредованное трансглутаминазой получение конъюгата антитела может быть одностадийным или двухстадийным, как схематично показано на фиг. 2. В одностадийном процессе трансглутаминаза связывает глутаминкарбоксамид в удлинении, действуя как акцептор амина, и соединение-донор амина H2N-LD, где L представляет собой линкерный фрагмент, а молекула-партнер D представляет собой белок, радиоизотоп, аналитическое средство или терапевтическое средство, с непосредственным образованием конъюгата. В двухстадийном процессе трансглутаминаза катализирует образование начального аддукта трансамидирования между карбоксамидом глутамина в удлинении, действующим как рецептор амина, и первым соединением (H2N-L'-R'), которое представляет собой соединение-донор амина, где L' представляет собой первый линкерный фрагмент, a R' представляет собой первую реакционноспособную функциональную группу. Затем аддукт вступает в реакцию со вторым соединением (R-L-D), где R представляет собой вторую реакционноспособную функциональную группу, способную вступать в реакцию с R, L представляет собой второй линкерный фрагмент, a D имеет значение, определенное выше. Иногда одностадийный процесс называют ферментативным, а двухстадийный процесс химиоферментативным процессом, поскольку он включает в себя как химическую, так и ферментативную стадию. Каждый из L, L' и L может представлять собой алкильную цепь -(СН2)Ш-, где m представляет равняется целому числу от 2 до 10 включительно, или может представлять собой, особенно в случае L и L, более сложную структуру, как описано ниже.Typically, transglutaminase-mediated preparation of an antibody conjugate can be one-step or two-step, as schematically shown in FIG. 2. In a one-step process, transglutaminase binds an extended glutamine carboxamide, acting as an amine acceptor, and an amine donor compound H 2 N-LD, where L is a linker moiety and the partner molecule D is a protein, radioisotope, analyte, or therapeutic agent , with direct formation of the conjugate. In a two-step process, transglutaminase catalyzes the formation of an initial transamidation adduct between the glutamine carboxamide in the extension, which acts as an amine receptor, and the first compound (H 2 N-L'-R'), which is the amine donor compound, where L' represents the first linker moiety and R' represents the first reactive functional group. The adduct is then reacted with a second compound (RLD), wherein R is a second reactive functional group capable of reacting with R, L is a second linker moiety, and D is as defined above. Sometimes a one-step process is called an enzymatic process and a two-step process a chemoenzymatic process because it includes both a chemical and an enzymatic step. Each of L, L' and L may represent an alkyl chain -(CH 2 ) Ш -, where m represents equals an integer from 2 to 10 inclusive, or may represent, especially in the case of L and L, a more complex structure such as described below.
Донор амина, H2N-L-D или H2N-L'-R', часто используется в большом избытке для подавления нежелательного переамидирования между карбоксамидом глутамина и ε-аминогруппой лизина антитела. Если фрагмент D является дорогостоящим или труднодоступным для получения, использование большого избытка может оказаться нецелесообразным. В таких случаях двухстадийный процесс может быть предпочтительным, даже если он требует дополнительной стадии.The amine donor, H2N-LD or H 2 N-L'-R', is often used in large excess to suppress unwanted transamidation between the glutamine carboxamide and the ε-amino group of the antibody lysine. If fragment D is expensive or difficult to obtain, using a large excess may not be practical. In such cases, a two-step process may be preferred, even if it requires an additional step.
В качестве демонстрации конъюгировали антитело к мезотелину, имеющее такие же CDR тяжелой и легкой цепей, что и антитело 6А4 из Terrett et al, US 8268970 B2 (2012). Его последовательности тяжелой и легкой цепи представлены как SEQ ID NO: 27 и SEQ ID NO: 28 соответственно. Были присоединены С-концевые удлинения легкой цепи, имеющие последовательности, описанные ниже, и модифицированные таким образом антитела затем конъюгированы либо с соединением (А), либо с соединением (В) в качестве донора амина с использованием одностадийного процесса.As a demonstration, an anti-mesothelin antibody having the same heavy and light chain CDRs as antibody 6A4 from Terrett et al, US 8268970 B2 (2012) was conjugated. Its heavy and light chain sequences are shown as SEQ ID NO: 27 and SEQ ID NO: 28, respectively. C-terminal light chain extensions having the sequences described below were attached, and the thus modified antibodies were then conjugated to either compound (A) or compound (B) as an amine donor using a one-step process.
[Агонист ТЬК7]-[Саморасщепляющаяся группа] — N[THK7 agonist]-[Self-cleaving group] - N
Ме*^ СО2НMe*^CO 2 H
Me MeMe Me
В соединении (А) терапевтическое средство представляет собой агонист Toll-подобного рецептора 7 (TLR7), который можно использовать в качестве адъюванта для вакцин и иммунотерапевтических средств при лечении различных состояний. Примеры агонистов TLR7 раскрыты в заявках США с серийIn compound (A), the therapeutic agent is a Toll-like receptor 7 (TLR7) agonist, which can be used as an adjuvant for vaccines and immunotherapies in the treatment of various conditions. Examples of TLR7 agonists are disclosed in US series applications
- 5 045916 ными №№ 16/103210, 16/103511, 16/103581, 16/013601 и 16/103619; каждая из которых подана 14 августа 2018 г.; раскрытия которых включены в настоящий документ посредством ссылки. В соединении (В) терапевтическое средство представляет собой аналог тубулизина, цитотоксин, который можно использовать при лечении рака. Получение соединения (В) описано в предварительной заявке США с серийным № 62/688737, поданной 22 июня 2018 г.; раскрытие которой включено в настоящий документ посредством ссылки.- 5 045916 No. 16/103210, 16/103511, 16/103581, 16/013601 and 16/103619; each filed August 14, 2018; the disclosures of which are incorporated herein by reference. In compound (B), the therapeutic agent is a tubulisin analogue, a cytotoxin that can be used in the treatment of cancer. The preparation of compound (B) is described in US provisional application Serial No. 62/688737, filed June 22, 2018; the disclosure of which is incorporated herein by reference.
В соответствии с одним вариантом осуществления раскрытые в настоящем документе С-концевые удлинения легкой цепи содержат один глутамин. Примеры перечислены в табл. А ниже вместе с соотношением лекарственное средство-антитело (DAR) конъюгатов, полученных из них. Поскольку на одно антитело приходится две легкие цепи, каждая из которых имеет удлинение, теоретический максимум DAR составляет 2,0. На фиг. 1 схематически изображена легкая цепь антитела, имеющая С-концевое удлинение под SEQ ID NO: 1.In accordance with one embodiment, the C-terminal light chain extensions disclosed herein comprise one glutamine. Examples are listed in table. And below along with the drug-antibody ratio (DAR) of the conjugates obtained from them. Since there are two light chains per antibody, each of which is extended, the theoretical maximum DAR is 2.0. In fig. 1 is a schematic representation of an antibody light chain having a C-terminal extension of SEQ ID NO: 1.
В соответствии с другим вариантом осуществления С-концевое удлинение легкой цепи содержит два глутамина. Примеры перечислены в табл. В ниже вместе с соотношением лекарственное средствоантитело (DAR) конъюгатов, полученных из них.In another embodiment, the C-terminal light chain extension contains two glutamines. Examples are listed in table. Below along with the drug-antibody ratio (DAR) of the conjugates derived from them.
Поскольку на одно антитело приходится две легкие цепи, каждая из которых имеет удлинение с двумя глутаминами, теоретический максимум DAR составляет 4,0.Since there are two light chains per antibody, each extended with two glutamines, the theoretical maximum DAR is 4.0.
- 6 045916- 6 045916
Возможно, что в С-концевых удлинениях, содержащих два глутамина, полезно отделить глутамины друг от друга дополнительно, чем так, как они представлены в табл. В, вставив между ними от двух до четырех аминокислот.It is possible that in C-terminal extensions containing two glutamines, it is useful to separate the glutamines from each other further than as they are presented in Table 1. B, inserting between two and four amino acids.
Поскольку С-конец легкой цепи в некоторой степени скрыт, желательно предусмотреть спейсеры так, чтобы глутамин в удлинении был более выступающим и был доступен для трансглутаминазы. Такого эффекта можно достичь, используя несколько глицинов (от двух до четырех) на N-конце удлинения. Ссылаясь на табл. А, можно заметить, что удлинение без глицинов (SEQ ID NO: 13) приводит к более низкому DAR, чем те, которые имеют два или четыре глицина.Since the C-terminus of the light chain is somewhat hidden, it is desirable to provide spacers so that the glutamine in the extension is more protruding and accessible to transglutaminase. This effect can be achieved by using multiple glycines (two to four) at the N-terminus of the extension. Referring to the table. And, it can be seen that extensions without glycines (SEQ ID NO: 13) result in a lower DAR than those with two or four glycines.
В соответствии с одним вариантом осуществления антитело имеет С-концевое удлинение легкой цепи, содержащее два спейсерных глицина и один глутамин. Примеры таких удлинений представлены под SEQ ID NO: 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5 и NO: 6.In accordance with one embodiment, the antibody has a C-terminal light chain extension containing two glycine spacers and one glutamine. Examples of such extensions are provided under SEQ ID NO: 1, NO: 2, NO: 3, NO: 4, NO: 5 and NO: 6.
В соответствии с другим вариантом осуществления антитело имеет С-концевое удлинение легкой цепи, содержащее четыре спейсерных глицина и один глутамин. Примеры таких удлинений представлены под SEQ ID NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11 и NO: 12.In another embodiment, the antibody has a C-terminal light chain extension containing four glycine spacers and one glutamine. Examples of such extensions are provided under SEQ ID NO: 7, NO: 8, NO: 9, NO: 10, NO: 11 and NO: 12.
В соответствии с другим вариантом осуществления антитело имеет С-концевое удлинение легкой цепи, содержащее два спейсерных глицина и два глутамина. Примеры таких удлинений представлены под SEQ ID NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33 и NO: 34.In another embodiment, the antibody has a C-terminal light chain extension containing two glycine and two glutamine spacers. Examples of such extensions are provided under SEQ ID NO: 14, NO: 15, NO: 16, NO: 17, NO: 18, NO: 19, NO: 29, NO: 30, NO: 31, NO: 32, NO: 33 and NO: 34.
В соответствии с другим вариантом осуществления антитело имеет С-концевое удлинение легкой цепи, содержащее четыре спейсерных глицина и два глутамина. Примеры таких удлинений представлены под SEQ ID NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 и NO: 40.In another embodiment, the antibody has a C-terminal light chain extension containing four glycine and two glutamine spacers. Examples of such extensions are provided under SEQ ID NO: 20, NO: 21, NO: 22, NO: 23, NO: 24, NO: 25, NO: 35, NO: 36, NO: 37, NO: 38, NO: 39 and NO: 40.
Предпочтительно С-концевые удлинения легкой цепи содержат дипептид валин-лейцин (VL) на Nконцевой стороне глутамина.Preferably, the C-terminal light chain extensions contain a valine-leucine (VL) dipeptide on the N-terminal side of glutamine.
Антитела, которые можно модифицировать и конъюгировать способами, описанными в настоящем раскрытии, включают антитела, распознающие следующие антигены: мезотелин, специфический мембранный антиген простаты (PSMA), CD19, CD22, CD30, CD70, В7Н3, В7Н4 (также известный как О8Е), белок тирозинкиназу 7 (PTK7), глипикан-3, RG1, фукозид-GMi, CTLA4 и CD44. Антитело может быть животным (например, мышиным), химерным, гуманизированным или предпочтительно человеческим. Антитело предпочтительно является моноклональным, особенно моноклональным человеческим антитеAntibodies that can be modified and conjugated by the methods described in this disclosure include antibodies that recognize the following antigens: mesothelin, prostate specific membrane antigen (PSMA), CD19, CD22, CD30, CD70, B7H3, B7H4 (also known as O8E), protein tyrosine kinase 7 (PTK7), glypican-3, RG1, fucoside-GMi, CTLA4 and CD44. The antibody may be animal (eg, murine), chimeric, humanized, or preferably human. The antibody is preferably a monoclonal antibody, especially a human monoclonal antibody
- 7 045916 лом. Получение человеческих моноклональных антител к некоторым из вышеупомянутых антигенов раскрыто в Korman et al., US 8609816 В2 (2013; В7Н4, также известное как 08Е; в частности, антитела 2А7, 1G11 и 2F9); Rao-Naik et al, 8097703 B2 (2012; CD19; в частности, антитела 5G7, 13F1, 46Е8, 21D4, 21D4a, 47G4, 27F3 и 3С10); King et al., US 8481683 В2 (2013; CD22; в частности, антитела 12С5, 19А3, 16F7 и 23С6); Keler et al., US 7387776 B2 (2008; CD30; в частности, антитела 5F11, 2Н9 и 17G1); Terrett et al., US 8124738 В2 (2012; CD70; в частности, антитела 2Н5, 10В4, 8В5, 18Е7 и 69А7); Korman et al., US 6984720 B1 (2006; CTLA-4; в частности, антитела 10D1, 4B6 и 1Е2); Vistica et al., US 8,383,118 B2 (2013, fucosyl-GM1, в частности, антитела 5B1, 5B1a, 7D4, 7Е4, 13В8 и 18D5) Korman et al., US 8008449 B2 (2011; PD-1; в частности, антитела 17D8, 2D3, 4Н1, 5С4, 4А11, 7D3 и 5F4); Huang et al., US 2009/0297438 A1 (2009; PSMA, в частности, антитела 1C3, 2A10, 2F5, 2C6); Cardarelli et al., US 7875278 B2 (2011; PSMA; в частности, антитела 4A3, 7F12, 8C12, 8A11, 16F9, 2A10, 2C6, 2F5 и 1С3); Terrett et al., US 8,222,375 B2 (2012; PTK7; в частности, антитела 3G8, 4D5, 12C6, 12C6a и 7С8); Terrett et al., US 8680247 B2 (2014; глипикан-3; в частности, антитела 4А6, 11Е7 и 16D10); Harkins et al., US 7335748 B2 (2008; RG1; в частности, антитела А, В, С и D); Terrett et al., US 8268970 B2 (2012; мезотелин; в частности, антитела 3С10, 6А4 и 7В1); Xu et al., US 2010/0092484 A1 (2010; CD44; в частности, антитела 14G9.B8.B4, 2D1.A3.D12 и 1А9.А6.В9); Deshpande et al., US 8258266 В2 (2012; IP10; в частности, антитела 1D4, 1Е1, 2G1, 3С4, 6А5, 6А8, 7С10, 8F6, 10А12, 10A12S и 13С4); Kuhne et al., US 8450464 В2 (2013; CXCR4; в частности, антитела F7, F9, D1 и Е2); и Korman et al., US 7943743 B2 (2011; PD-L1; в частности, антитела 3G10, 12А4, 10А5, 5F8, 10Н10, 1В12, 7Н1, 11Е6, 12В7 и 13G4); раскрытия которых включены в данный документ посредством ссылки.- 7 045916 scrap. The production of human monoclonal antibodies to some of the above antigens is disclosed in Korman et al., US 8609816 B2 (2013; B7H4, also known as 08E; in particular, antibodies 2A7, 1G11 and 2F9); Rao-Naik et al, 8097703 B2 (2012; CD19; specifically antibodies 5G7, 13F1, 46E8, 21D4, 21D4a, 47G4, 27F3 and 3C10); King et al., US 8481683 B2 (2013; CD22; in particular antibodies 12C5, 19A3, 16F7 and 23C6); Keler et al., US 7387776 B2 (2008; CD30; in particular antibodies 5F11, 2H9 and 17G1); Terrett et al., US 8124738 B2 (2012; CD70; in particular antibodies 2H5, 10B4, 8B5, 18E7 and 69A7); Korman et al., US 6984720 B1 (2006; CTLA-4; specifically antibodies 10D1, 4B6 and 1E2); Vistica et al., US 8,383,118 B2 (2013, fucosyl-GM1, in particular antibodies 5B1, 5B1a, 7D4, 7E4, 13B8 and 18D5) Korman et al., US 8008449 B2 (2011; PD-1; in particular antibodies 17D8, 2D3, 4Н1, 5С4, 4А11, 7D3 and 5F4); Huang et al., US 2009/0297438 A1 (2009; PSMA, in particular antibodies 1C3, 2A10, 2F5, 2C6); Cardarelli et al., US 7875278 B2 (2011; PSMA; in particular antibodies 4A3, 7F12, 8C12, 8A11, 16F9, 2A10, 2C6, 2F5 and 1C3); Terrett et al., US 8,222,375 B2 (2012; PTK7; specifically antibodies 3G8, 4D5, 12C6, 12C6a and 7C8); Terrett et al., US 8680247 B2 (2014; glypican-3; specifically antibodies 4A6, 11E7 and 16D10); Harkins et al., US 7335748 B2 (2008; RG1; specifically antibodies A, B, C and D); Terrett et al., US 8268970 B2 (2012; mesothelin; in particular antibodies 3C10, 6A4 and 7B1); Xu et al., US 2010/0092484 A1 (2010; CD44; in particular antibodies 14G9.B8.B4, 2D1.A3.D12 and 1A9.A6.B9); Deshpande et al., US 8258266 B2 (2012; IP10; in particular, antibodies 1D4, 1E1, 2G1, 3C4, 6A5, 6A8, 7C10, 8F6, 10A12, 10A12S and 13C4); Kuhne et al., US 8450464 B2 (2013; CXCR4; in particular antibodies F7, F9, D1 and E2); and Korman et al., US 7,943,743 B2 (2011; PD-L1; specifically, antibodies 3G10, 12A4, 10A5, 5F8, 10H10, 1B12, 7H1, 11E6, 12B7 and 13G4); the disclosures of which are incorporated herein by reference.
В отношении конъюгатов формулы (IV) 0 и Ab-C-N-L-D (IV) (a) D предпочтительно представляет собой, в соответствии с одним вариантом осуществления, ци тотоксическое лекарственное средство.With respect to conjugates of formula (IV) 0 and Ab-CNLD ( IV ) (a) D is preferably, in accordance with one embodiment, a cytotoxic drug.
(b) В соответствии с другим предпочтительным вариантом осуществления D представляет собой агонист TLR7, STING, NRLP3 или RIG-1.(b) In another preferred embodiment, D is a TLR7, STING, NRLP3 or RIG-1 agonist.
(c) В соответствии с предпочтительным вариантом осуществления L представляет со6ой-(СН2)2-6.(c) In a preferred embodiment, L is co6oy-( CH2 ) 2-6 .
(d) В соответствии с другим предпочтительным вариантом осуществления L представляет собой о <|а'>(d) According to another preferred embodiment, L is o < |a '>
где Т представляет собой саморасщепляющуюся группу;where T represents a self-cleaving group;
t равняется 0 или 1;t is 0 or 1;
ААа и каждое AAb независимо выбирают из группы, состоящей из аланина, β-аланина, γаминомасляной кислоты, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, γ-карбоксиглутаминовой кислоты, цитруллина, цистеина, глутаминовой кислоты, глутамина, глицина, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, норлейцина, норвалина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина и валина;AA a and each AA b are independently selected from the group consisting of alanine, β-alanine, γ-aminobutyric acid, arginine, asparagine, aspartic acid, γ-carboxyglutamic acid, citrulline, cysteine, glutamic acid, glutamine, glycine, histidine, isoleucine, leucine , lysine, methionine, norleucine, norvaline, ornithine, phenylalanine, proline, serine, threonine, tryptophan, tyrosine and valine;
р представляет собой 1, 2, 3 или 4;p is 1, 2, 3 or 4;
q равняется 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10; и r равняется 1, 2, 3, 4 или 5.q equals 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 or 10; and r equals 1, 2, 3, 4 or 5.
Одно- и двухстадийные процессы конъюгации далее обсуждаются более подробно.One- and two-step conjugation processes are discussed in more detail below.
В соответствии с предпочтительным вариантом осуществления соединение-донор амина в одностадийном процессе представлено формулой (I):According to a preferred embodiment, the amine donor compound in the one-step process is represented by formula (I):
H2N-(CH2)2.6D (I) где D представляет собой белок, радиоизотоп, аналитическое средство или терапевтическое средство.H 2 N-(CH 2 ) 2 . 6 D (I) where D represents a protein, radioisotope, analytical agent or therapeutic agent.
В соответствии с другим предпочтительным вариантом осуществления соединение-донор амина для одностадийного процесса имеет структуру, представленную формулой (Ia):According to another preferred embodiment, the amine donor compound for the one-step process has the structure represented by formula (Ia):
о <|а>o < |a >
где D представляет собой белок, радиоизотоп, аналитическое средство или терапевтическое средство;where D is a protein, radioisotope, analytical agent or therapeutic agent;
Т представляет собой саморасщепляющуюся группу;T represents a self-cleaving group;
t равняется 0 или 1;t is 0 or 1;
ААа и каждое AAb независимо выбирают из группы, состоящей из аланина, β-аланина, γаминомасляной кислоты, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, γ-карбоксиглутаминовой кислоты, цитруллина, цистеина, глутаминовой кислоты, глутамина, глицина, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, норлейцина, норвалина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, трипAA a and each AA b are independently selected from the group consisting of alanine, β-alanine, γ-aminobutyric acid, arginine, asparagine, aspartic acid, γ-carboxyglutamic acid, citrulline, cysteine, glutamic acid, glutamine, glycine, histidine, isoleucine, leucine , lysine, methionine, norleucine, norvaline, ornithine, phenylalanine, proline, serine, threonine, trip
- 8 045916 тофана, тирозина и валина;- 8 045916 tophan, tyrosine and valine;
р представляет собой 1, 2, 3 или 4;p is 1, 2, 3 or 4;
q равняется 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10; и r равняется 1, 2, 3, 4 или 5.q equals 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 or 10; and r equals 1, 2, 3, 4 or 5.
В формулах (Ia), (Ia') и (III) (ниже) -ААа-[ААь]р- представляет собой полипептид, длина которого определяется значением р (дипептид, если р равен 1, тетрапептид, если р равен 3 и т.д.). ААа находится на карбоксильном конце полипептида, и его карбоксильная группа образует пептидную (амидную) связь с азотом амина D (или Т, при наличии). В отличие от этого, последний AAb находится на аминоконце полипептида, и его α-аминогруппа образует пептидную связь сIn formulas (Ia), (Ia') and (III) (below), -AA a -[AA b ] p - is a polypeptide whose length is determined by the value of p (dipeptide if p is 1, tetrapeptide if p is 3 etc.). AA a is at the carboxyl terminus of the polypeptide, and its carboxyl group forms a peptide (amide) bond with the amine nitrogen D (or T, if present). In contrast, the last AA b is at the amino terminus of the polypeptide, and its α-amino group forms a peptide bond with
Предпочтительными полипептидами -ААа-[ЛЛь]р- являются ValCit, Val-Lys, Lys-Val-Ala, Asp-ValAla, Val-Ala, Lys-Val-Cit, Ala-Val-Cit, ValGly, ValGln и Asp-Val-Cit, записанные в обычном направлении N-to-C, как в H2NValCitCO2H. Более предпочтительно полипептид представляет собой Val-Cit, Val-Lys или Val-Ala. Предпочтительно полипептид ААа[ААь]р расщепляется ферментом, обнаруженным внутри целевой клетки, например, катепсином и особенно катепсином В, или ферментом в окружении целевого органа или ткани.Preferred -AA a -[LL b ]p- polypeptides are ValCit, Val-Lys, Lys-Val-Ala, Asp-ValAla, Val-Ala, Lys-Val-Cit, Ala-Val-Cit, ValGly, ValGln and Asp -Val-Cit, written in the normal N-to-C direction, as in H2NValCitCO2H. More preferably, the polypeptide is Val-Cit, Val-Lys or Val-Ala. Preferably, the AA polypeptide a [AA b ]p is cleaved by an enzyme found within the target cell, for example cathepsin and especially cathepsin B, or by an enzyme in the environment of the target organ or tissue.
Если индекс q отличается от 0, соединение (Ia) содержит группу поли(этиленгликоля) (PEG), которая может преимущественно улучшать растворимость соединения (Ia), облегчая конъюгацию с антителом - стадию, которая осуществляется в водной среде. Кроме того, группа PEG может служить в качестве спейсера между антителом и пептидом -ААа-[ААь]р- таким образом, что основная масса антитела не препятствует стерически действию фермента, расщепляющего пептид.If the q index is different from 0, compound (Ia) contains a poly(ethylene glycol) (PEG) group, which can advantageously improve the solubility of compound (Ia) by facilitating conjugation with the antibody, a step that is carried out in an aqueous environment. In addition, the PEG group can serve as a spacer between the antibody and the peptide -AA a -[AA b ] p - such that the bulk of the antibody does not sterically interfere with the action of the enzyme that cleaves the peptide.
Как указано нижним индексом, если t равняется 0 или 1, саморасщепляющаяся группа Т необязательно присутствует. Саморасщепляющаяся группа представляет собой группу, отщепление которой от ААа или AAb, в зависимости от обстоятельств, инициирует последовательность реакций, в результате чего саморасщепляющаяся группа отделяется от D и освобождает последнюю для выполнения своей терапевтической функции. При наличии саморасщепляющаяся группа Т, предпочтительно это паминобензилоксикарбонильная (РАВС) группа, структура которой показана ниже звездочкой (*), обозначающей конец РАВС, связанный с аминным азотом лекарственного средства D, и волнистой линией обозначающей конец, связанный с полипептидом -ААа-[ААь]р-. Группа РАВС может быть замещена, как раскрыто в предварительной заявке США с серийным № 62/677307, поданной 29 мая 2018 г.As indicated by the subscript, if t is 0 or 1, the self-cleaving group T is not necessarily present. A self-cleaving group is a group whose cleavage from AA a or AA b , as the case may be, initiates a sequence of reactions whereby the self-cleaving group separates from D and frees the latter to perform its therapeutic function. If present, a self-cleaving T group is preferably a paminobenzyloxycarbonyl (PABC) group, the structure of which is shown below with an asterisk (*) indicating the end of PABC bound to the amine nitrogen of drug D and a wavy line indicating the end bound to the polypeptide -AA a -[AA b ] p -. The RABC group may be substituted as disclosed in US Provisional Application Serial No. 62/677307, filed May 29, 2018.
Другой саморасщепляющейся группой, которая может быть использована, является замещенный тиазол, как описано в Feng, US 7375078 В2 (2008).Another self-cleaving group that can be used is a substituted thiazole, as described in Feng, US 7375078 B2 (2008).
Соединения (А) и (В) иллюстрируют конструкцию соединений-доноров амина в соответствии с формулой (Ia) с расположением их различных элементов, как показано. Соединение (А), но не соединение (В), содержит саморасщепляющуся группу.Compounds (A) and (B) illustrate the construction of amine donor compounds according to formula (Ia) with the arrangement of their various elements as shown. Compound (A), but not compound (B), contains a self-cleaving group.
[Агонист ТЬК7]-[Саморасщепляющаяся группа] —N ν н °оА[THK7 agonist]-[Self-cleaving group] -N ν n °oA
Ме^Me^
Н • N^NH2 H • N^NH 2
ОABOUT
Н г (A) nh2 ‘MeN g (A) nh 2 'Me
HH
Терапевтическое Саморасщепляюсредство щаяся группаTherapeutic Self-cleaving agent group
Расщепляемый Донор пептид алкиламинаCleavable Alkylamine Donor Peptide
nh2 nh 2
Терапевтическое средствоTherapeutic agent
Me MeMe Me
Расщепляемый Донор пептид алкиламина (B)Cleavable Alkylamine Donor Peptide (B)
При двухстадийной конъюгации можно использовать множество комбинаций групп R' и R. Подходящие комбинации R' и R (или, наоборот, R и R') включают:In two-step conjugation, many combinations of R' and R groups can be used. Suitable combinations of R' and R (or, alternatively, R and R') include:
- 9 045916 (а) малеимидную группу и сульфгидрильную группу с образованием аддукта присоединения Михаэля, как в- 9 045916 (a) a maleimide group and a sulfhydryl group to form a Michael addition adduct, as in
(b) дибензоциклооктиновую группу и азидную группу с образованием продукта циклоприсоединения посредством клик--химии, как в(b) a dibenzocyclooctyne group and an azide group to form a cycloaddition product via click chemistry as in
(с) сложный эфир N-гидроксисукцинимида и амин с образованием амида, как в(c) N-hydroxysuccinimide ester and amine to form an amide as in
(d) альдегид или кетон (где алкил предпочтительно представляет собой Оьзалкил) и гидроксиламин с образованием оксима, как в(d) an aldehyde or ketone (where alkyl is preferably Ozalkyl) and hydroxylamine to form an oxime, as in
Таким образом, R' может быть выбран из в то время как реципрокно R может быть выбран изThus, R' can be selected from while reciprocally R can be selected from
Подходящее первое соединение-донор амина для двухстадийного процесса изображено в формуле (II)A suitable first amine donor compound for the two-step process is depicted in formula (II)
H2N-(CH2)2-8-R' (II) где R' определен выше и предпочтительно представляет собойH 2 N-(CH2) 2 -8-R' (II) where R' is defined above and is preferably
Соответствующее подходящее соединение R-L-D показано в формуле (III) о R'-(CH2)r4o^L[AAb]p“AAa“(T)rD (111) где R' определен выше и предпочтительно представляет собойA corresponding suitable RLD compound is shown in formula (III) o R ' - (CH2)r 4o^ L[AAb]p “ AAa “ (T)rD (111) where R' is defined above and is preferably
и r, q, AAb, р, ААа, Т, t и D определены выше в соответствии с формулой (Ia).and r, q, AA b , p, AA a , T, t and D are defined above in accordance with formula (Ia).
В случае, когда конъюгат предназначен для использования при лечении рака, терапевтическоеIn the case where the conjugate is intended for use in the treatment of cancer, the therapeutic
- 10 045916 средство может представлять собой цитотоксическое лекарственное средство, которое вызывает гибель целевой раковой клетки. Цитотоксические лекарственные средства, которые можно использовать в конъюгатах, включают следующие типы соединений, их аналоги и производные:- 10 045916 the agent may be a cytotoxic drug that causes the death of the target cancer cell. Cytotoxic drugs that can be used in conjugates include the following types of compounds, their analogs and derivatives:
(a) ендиины, такие как калихеамицин (см., например, Lee et al, J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 3464 и(a) enediynes such as calicheamicin (see, for example, Lee et al, J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 3464 and
3466) и унциаламицин (см., например, Davies et al., WO 2007/038868 A2 (2007); Chowdari et al., US 8709431 B2 (2012); и Nicolaou et al., WO 2015/023879 A1 (2015));3466) and uncialamycin (see, for example, Davies et al., WO 2007/038868 A2 (2007); Chowdari et al., US 8709431 B2 (2012); and Nicolaou et al., WO 2015/023879 A1 (2015) );
(b) тубулизины (см., например, Domling et al., US 7778814 B2 (2010); Cheng et al., US 8394922 B2 (2013); и Cong et al., US 8980824 B2 (2015));(b) tubulisins (see, for example, Domling et al., US 7778814 B2 (2010); Cheng et al., US 8394922 B2 (2013); and Cong et al., US 8980824 B2 (2015));
(c) ДНК-алкиляторы, такие как аналоги СС-1065 и дуокармицин (см., например, Yang et al., US 2018/0051031 A1 (2018); Boger, US 65458530 B1 (2003); Sufi et al., US 8461117 B2 (2013); и Zhang et al., US 8852599 B2 (2014));(c) DNA alkylators such as CC-1065 analogues and duocarmycin (see, for example, Yang et al., US 2018/0051031 A1 (2018); Boger, US 65458530 B1 (2003); Sufi et al., US 8461117 B2 (2013); and Zhang et al., US 8852599 B2 (2014));
(d) эпотилоны (см., например, Vite et al., US 2007/0275904 Al (2007) и US RE42930 E (2011));(d) epothilones (see, for example, Vite et al., US 2007/0275904 Al (2007) and US RE42930 E (2011));
(e) ауристатины (см., например, Senter et al., US 6844869 B2 (2005), и Doronina et al., US 7498298 B2 (2009));(e) auristatins (see, for example, Senter et al., US 6844869 B2 (2005), and Doronina et al., US 7498298 B2 (2009));
(f) бензодиазепиновые димеры (см., например, Zhang et al, US 9527871 B2 (2016); Zhang et al., US 9688694 B2 (2017); McDonald et al, US 9526801 B2 (2016); Howard et al., US 2013/0059800 A1 (2013); US 2013/0028919 A1 (2013); и WO 2013/041606 A1 (2013)); и (g) майтансиноиды, такие как DM1 и DM4 (см., например, Chari et al., US 5208020 (1993), и Amphlett et al., US 7374762 B2 (2008)).(f) benzodiazepine dimers (see, for example, Zhang et al., US 9527871 B2 (2016); Zhang et al., US 9688694 B2 (2017); McDonald et al., US 9526801 B2 (2016); Howard et al., US 2013/0059800 A1 (2013); US 2013/0028919 A1 (2013); and WO 2013/041606 A1 (2013)); and (g) maytansinoids such as DM1 and DM4 (see, for example, Chari et al., US 5208020 (1993), and Amphlett et al., US 7374762 B2 (2008)).
В соответствии с одним вариантом осуществления цитотоксическое лекарственное средство представляет собой ДНК-алкилятор, тубулизин, ауристатин, бензодиазепиновый димер, ендиин или майтансиноид. Конкретные примеры приведены в качестве иллюстрации, а не ограничения.In one embodiment, the cytotoxic drug is a DNA alkylator, tubulisin, auristatin, benzodiazepine dimer, enediyne, or maytansinoid. Specific examples are provided by way of illustration and not limitation.
В иммунной системе имеются рецепторы, естественными лигандами которых являются патогенассоциированные молекулярные структуры (РАМР). Связывание РАМР с его когнатным рецепторомThe immune system has receptors whose natural ligands are pathogen-associated molecular patterns (PAMs). Binding of PAMP to its cognate receptor
- 11 045916 активирует иммунную систему для защиты от инфекции, вызванной ассоциированным патогеном. Кроме того, эти рецепторы также могут быть активированы синтетическими агонистами, которые оказывают адъювантное действие на действие вакцин и иммунотерапевтических средств при лечении множества состояний, отличных от фактической патогенной инфекции. Иммуноонкологические средства, такие как ипилимумаб, ниволумаб и пембролизумаб, в частности, могут извлекать пользу от этого адъювантного эффекта. Рецепторы, которые могут быть активированы синтетическими агонистами, включают TLR3, TLR7, TLR9 (Toll-подобный рецептор-3, -7 и -9 соответственно), STING (стимулятор генов; также известный как MPYS, ТМЕМ173, MITA или ERIS), NLRP3 (NOD-подобный рецепторный белок 3) и RIG-I (ген I, индуцируемый ретиноевой кислотой). Таким образом, в соответствии с альтернативным вариантом осуществления терапевтическое средство представляет собой агонист TLR3, TLR7, TLR9, STING, NLRP3 или RIG-I. В частности, терапевтическое средство может представлять собой агонист TLR7, как раскрывается в Poudel et al., US 2019/0055243 A1 (2019); Young et al., US 2019/0055244 A1 (2019); Poudel et al., US 2019/0055245 A1 (2019); He et al., US 2019/0055246 A1 (2019); He et al., US 2019/0055247 A1 (2019); и Purandare et al., заявке PCT PCT/US2019/028697, поданных 23 апреля 2019 г.- 11 045916 activates the immune system to protect against infection caused by an associated pathogen. In addition, these receptors can also be activated by synthetic agonists, which have an adjuvant effect on the action of vaccines and immunotherapies in the treatment of a variety of conditions other than the actual pathogenic infection. Immuno-oncology agents such as ipilimumab, nivolumab and pembrolizumab in particular may benefit from this adjuvant effect. Receptors that can be activated by synthetic agonists include TLR3, TLR7, TLR9 (Toll-like receptor-3, -7, and -9, respectively), STING (gene stimulator; also known as MPYS, TMEM173, MITA, or ERIS), NLRP3 ( NOD-like receptor protein 3) and RIG-I (retinoic acid-inducible gene I). Thus, according to an alternative embodiment, the therapeutic agent is a TLR3, TLR7, TLR9, STING, NLRP3, or RIG-I agonist. In particular, the therapeutic agent may be a TLR7 agonist, as disclosed in Poudel et al., US 2019/0055243 A1 (2019); Young et al., US 2019/0055244 A1 (2019); Poudel et al., US 2019/0055245 A1 (2019); He et al., US 2019/0055246 A1 (2019); He et al., US 2019/0055247 A1 (2019); and Purandare et al., PCT application PCT/US2019/028697, filed April 23, 2019.
Вышеупомянутые терапевтические средства можно использовать в конъюгатах, полученных либо с помощью одностадийного, либо двухстадийного способа.The above-mentioned therapeutic agents can be used in conjugates obtained using either a one-step or two-step method.
ПримерыExamples
Практическое применение настоящего изобретения можно дополнительно понять, обратившись к следующим примерам, которые предоставлены в качестве иллюстрации, а не ограничения.The practical application of the present invention can be further understood by reference to the following examples, which are provided by way of illustration and not limitation.
Пример 1 - Получение модифицированных антителExample 1 - Preparation of modified antibodies
Клетки ExpiCHO использовали для экспрессии антител. Клетки ExpiCHO выращивали в среде ExpiCHO при 37°С, атмосфере 8% CO2 в пластмассовых колбах. Вектор экспрессии тяжелой цепи и легкой цепи смешивали в OptiMEM, добавляли раствор PEI в OptiMEM и полученный комплекс PEI/ДНК инкубировали при комнатной температуре в течение 30 минут перед добавлением к клеткам. Через 24 часа после трансфекции к клеткам добавляли Feed В и VPA и клетки хранили при 37°С при перемешивании. Через 7 дней супернатант культуры собирали с помощью центрифугирования и фильтрации. Супернатант очищали смолой MabSelect SuRe LX. Вкратце, клеточный супернатант инкубировали со смолой в течение ночи при 4°С, промывали 10 CV PBS с последующим элюированием 4 CV 0,1 М цитрата рН 3,5, немедленно нейтрализовали 1/10 объема 1 М Tris рН 8.ExpiCHO cells were used for antibody expression. ExpiCHO cells were grown in ExpiCHO medium at 37°C, 8% CO2 atmosphere in plastic flasks. The heavy chain and light chain expression vector were mixed in OptiMEM, the PEI solution in OptiMEM was added, and the resulting PEI/DNA complex was incubated at room temperature for 30 minutes before adding to the cells. 24 hours after transfection, Feed B and VPA were added to the cells and the cells were stored at 37°C with agitation. After 7 days, the culture supernatant was collected by centrifugation and filtration. The supernatant was purified with MabSelect SuRe LX resin. Briefly, cell supernatant was incubated with the resin overnight at 4°C, washed with 10 CV PBS followed by elution with 4 CV 0.1 M citrate pH 3.5, immediately neutralized with 1/10 volume of 1 M Tris pH 8.
Пример 2 - Конъюгация модифицированных антителExample 2 - Conjugation of Modified Antibodies
Конъюгацию антитела, модифицированного, как описано в настоящем документе, с донором амина с использованием трансглутаминазы проводили по протоколу, указанному ниже. Использовали диспазу, активирующую BTGase с точечными мутациями V65I и Y75F. Ее диализовали в 50 мМ ацетата натрия рН 5,5 из состава (буфер 20 мМ ацетат, 10% глицерин рН 4) перед использованием.Conjugation of an antibody modified as described herein to an amine donor using transglutaminase was carried out according to the protocol specified below. We used a BTGase-activating dispase with point mutations V65I and Y75F. It was dialyzed in 50 mM sodium acetate pH 5.5 from the formulation (buffer 20 mM acetate, 10% glycerol pH 4) before use.
Антитело в концентрации ~ 2 мг/мл в 50 мМ Tris-HCl, рН 8,0, или 20 мМ гистидина, 50 мМ имидизаола, 10% сахарозы, рН ~ 7,8 вступало в реакцию с 10-кратным молярным избытком на сайт донора амина в присутствии 0,2 молярного избытка трансглутаминазы на антитело. Реакция протекала в течение ночи при 37°С при непрерывном осторожном перемешивании.Antibody at a concentration of ~2 mg/ml in 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, or 20 mM histidine, 50 mM imidizaol, 10% sucrose, pH ~ 7.8 reacted with a 10-fold molar excess at the donor site amine in the presence of a 0.2 molar excess of transglutaminase per antibody. The reaction proceeded overnight at 37°C with continuous gentle stirring.
Конъюгат антитело-лекарственное средство фильтровали через 0,2 мкм μи очищали с использованием колонки mAb Select SuRe™ (GE Healthcare). Конъюгат загружали в колонку, предварительно уравновешенную 50 мМ Tris-HCl, рН 8,0, и промывали 10 CV (объемы колонки) уравновешивающего буфера, а затем 10 CV 50 мМ Tris-HCl, 17% ацетонитрила, рН 8,0, с удалением непрореагировавшего донора амина. Колонку повторно уравновешивали 50 мМ Tris-HCl, рН 8,0, перед элюированием 0,1 М цитратом, рН 3,5, фракциями по 1 мл и нейтрализовали 1/10 объема элюирования 1 М Tris, рН 8,0. Необходимые фракции диализовали в буфере для приготовления 20 мМ гистидина, 10% сахарозы, рН 6,0 и анализировали с помощью LC-MS (ESI-QTOF), RP-HPLC и SDS-PAGE для определения чистоты и соотношения лекарственное средство-антитело (DAR).The antibody-drug conjugate was filtered through 0.2 μm and purified using a mAb Select SuRe™ column (GE Healthcare). The conjugate was loaded onto a column pre-equilibrated with 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, and washed with 10 CV (column volume) of equilibration buffer, followed by 10 CV of 50 mM Tris-HCl, 17% acetonitrile, pH 8.0, to remove unreacted amine donor. The column was re-equilibrated with 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, before eluting with 0.1 M citrate, pH 3.5, in 1 ml fractions and neutralized with 1/10 of the elution volume with 1 M Tris, pH 8.0. The desired fractions were dialyzed into 20 mM histidine, 10% sucrose, pH 6.0 preparation buffer and analyzed by LC-MS (ESI-QTOF), RP-HPLC and SDS-PAGE to determine purity and drug-antibody ratio (DAR) ).
Пример 3 - Анализ конъюгированных модифицированных антителExample 3 - Conjugated Modified Antibody Assay
Антитело в концентрации 5 мг/мл в 50 мМ имидазоле, 10% сахарозе, рН 8, вступало в реакцию с 10кратным молярным количеством на сайт донора амина в присутствии 0,2 молярного избытка рекомбинантной бактериальной трансглутаминазы на антитело. После инкубации в течение ночи при 37°С при непрерывном осторожном перемешивании реакционную смесь анализировали с помощью LC-MS (ESIQTOF) для оценки DAR.Antibody at a concentration of 5 mg/ml in 50 mM imidazole, 10% sucrose, pH 8, reacted with a 10-fold molar amount at the amine donor site in the presence of a 0.2 molar excess of recombinant bacterial transglutaminase per antibody. After overnight incubation at 37°C with continuous gentle stirring, the reaction mixture was analyzed by LC-MS (ESIQTOF) to evaluate DAR.
Приведенное выше подробное описание настоящего изобретения включает фрагменты, которые главным образом или исключительно связаны с конкретными частями или аспектами настоящего изобретения. Следует понимать, что это делается для ясности и удобства, что конкретный признак может иметь отношение не только к фрагменту, в котором он раскрыт, и что настоящее раскрытие в настоящем документе включает в себя все соответствующие комбинации информации, найденной в различных фрагментах. Точно так же, хотя различные фигуры и описания в настоящем документе относятся к конкретным вариантам осуществления настоящего изобретения, следует понимать, что там, где конкретный признак раскрывается в контексте конкретного чертежа или варианта осуществления, такой признакThe foregoing detailed description of the present invention includes portions that primarily or exclusively relate to specific parts or aspects of the present invention. It should be understood that this is for clarity and convenience, that a particular feature may relate to more than just the portion in which it is disclosed, and that the present disclosure herein includes all relevant combinations of information found in the various portions. Likewise, while the various figures and descriptions herein refer to specific embodiments of the present invention, it is to be understood that where a particular feature is disclosed in the context of a particular drawing or embodiment, such feature
- 12 045916 также может использоваться в соответствующей степени в контексте другого чертежа или варианта осуществления в сочетании с другим признаком или в настоящем изобретении в целом.- 12 045916 may also be used to an appropriate extent in the context of another drawing or embodiment in combination with another feature or in the present invention as a whole.
Кроме того, хотя настоящее изобретение было конкретно описано с точки зрения определенных предпочтительных вариантов осуществления, настоящее изобретение не ограничивается такими предпочтительными вариантами осуществления. Предпочтительно объем настоящего изобретения определяется прилагаемой формулой изобретения.Moreover, although the present invention has been specifically described in terms of certain preferred embodiments, the present invention is not limited to such preferred embodiments. Preferably, the scope of the present invention is defined by the appended claims.
Литературные источникиLiterary sources
Полные ссылки на следующие ссылки, процитированные в сокращенном виде первым автором (или изобретателем) и датированные ранее в этом описании, приведены ниже. Каждая из этих ссылок включена в настоящий документ в качестве ссылки для всех целей.The complete references to the following references, cited in abbreviated form by the first author (or inventor) and dated earlier in this specification, are provided below. Each of these references is incorporated herein by reference for all purposes.
Ando et al., Agri. Biol. Chem. 1989, 53, 2613, Purification and Characteristics of a Novel Transglutaminase Derived from Microorganisms.Ando et al., Agri. Biol. Chem. 1989, 53, 2613, Purification and Characteristics of a Novel Transglutaminase Derived from Microorganisms.
Babcook et al., US 2017/0008970 (2017).Babcook et al., US 2017/0008970 (2017).
Bregeon, US 2016/0114056 A1 (2016).Bregeon, US 2016/0114056 A1 (2016).
Bregeon et al., US 9,427,478 B2 (2016).Bregeon et al., US 9,427,478 B2 (2016).
Bregeon etal, US 9,717,803 B2 (2017).Bregeon et al, US 9,717,803 B2 (2017).
Chen et al., US 2005/0136491 A1 (2005).Chen et al., US 2005/0136491 A1 (2005).
Dennler et al., Bioconjug. Chem. 2014,25, 569, Transglutaminase-Based Chemo-Enzymatic Conjugation Approach Yields Homogeneous Antibody-Drug Conjugates.Dennler et al., Bioconjug. Chem. 2014,25, 569, Transglutaminase-Based Chemo-Enzymatic Conjugation Approach Yields Homogeneous Antibody-Drug Conjugates.
Farias et al., US 2016/0193356 A1 (2016).Farias et al., US 2016/0193356 A1 (2016).
Fischer et al., US 2015/0284713 A1 (2015).Fischer et al., US 2015/0284713 A1 (2015).
Fontana et al., Adv. Drug Deliv. Rev. 2008, 60, 13, Site-Specific modification and PEGylation of pharmaceutical proteins mediated by transglutaminase.Fontana et al., Adv. Drug Deliv. Rev. 2008, 60, 13, Site-Specific modification and PEGylation of pharmaceutical proteins mediated by transglutaminase.
Gerber et al., Nat. Prod. Rep. 2013, 30, 625, The antibody-drug conjugate: an enabling modality for natural product-based cancer therapies.Gerber et al., Nat. Prod. Rep. 2013, 30, 625, The antibody-drug conjugate: an enabling modality for natural product-based cancer therapies.
Innate Pharma, A New Site Specific Antibody Conjugation Using Bacterial Transglutaminase, presentation at ADC Summit, San Francisco, California, Oct. 15, 2013.Innate Pharma, A New Site Specific Antibody Conjugation Using Bacterial Transglutaminase, presentation at ADC Summit, San Francisco, California, Oct. 15, 2013.
Jeger et al., Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 9995, Site-Specific and Stoichiometric Modification of Antibodies by Bacterial Transglutaminase.Jeger et al., Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 9995, Site-Specific and Stoichiometric Modification of Antibodies by Bacterial Transglutaminase.
Kamiya et al., US 2011/0184147 A1 (2011).Kamiya et al., US 2011/0184147 A1 (2011).
Lin et al., J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4542, Transglutaminase-Catalyzed Site-Specific Conjugation of Small-Molecule Probes to Proteins in Vitro and on the Surface of Living Cells.Lin et al., J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4542, Transglutaminase-Catalyzed Site-Specific Conjugation of Small-Molecule Probes to Proteins in Vitro and on the Surface of Living Cells.
Liu et al., US 8,865,875 B2 (2014).Liu et al., US 8,865,875 B2 (2014).
Mero et al., Bioconjug. Chem. 2009, 20, 384, Transglutaminase-Mediated PEGylation of Proteins: Direct Identification of the Sites of Protein Modification by Mass Spectrometry Using a Novel Monodisperse PEG.Mero et al., Bioconjug. Chem. 2009, 20, 384, Transglutaminase-Mediated PEGylation of Proteins: Direct Identification of the Sites of Protein Modification by Mass Spectrometry Using a Novel Monodisperse PEG.
Mindt et al, Bioconjug. Chem. 2008, 19, 271, Modification of Different IgG1 Antibodies via Glutamine and Lysine using Bacterial and Human Tissue Transglutaminase.Mindt et al, Bioconjug. Chem. 2008, 19, 271, Modification of Different IgG1 Antibodies via Glutamine and Lysine using Bacterial and Human Tissue Transglutaminase.
Ohtsuka et al., Biosci. Biotechnol Biochem. 2000, 64, 2608, Comparison of Substrate Specificities of Transglutaminases Using Synthetic Peptides as Acyl Donors.Ohtsuka et al., Biosci. Biotechnol Biochem. 2000, 64, 2608, Comparison of Substrate Specificities of Transglutaminases Using Synthetic Peptides as Acyl Donors.
Rao-Naik et al., WO 2017/059158 A1 (2017).Rao-Naik et al., WO 2017/059158 A1 (2017).
Rao-Naik et al., US 2018/0037921 A1 (2018).Rao-Naik et al., US 2018/0037921 A1 (2018).
Sato, Adv. Drug Deliv. Rev. 2002, 54, 487, Enzymatic procedure for site-specific pegylation of proteins.Sato, Adv. Drug Deliv. Rev. 2002, 54, 487, Enzymatic procedure for site-specific pegylation of proteins.
Sato et al., US 6,322,996 В1 (2001).Sato et al., US 6,322,996 B1 (2001).
Schibli et al., US 2007/0184537 A1 (2007).Schibli et al., US 2007/0184537 A1 (2007).
Smith et al., US 2019/0099505 A1 (2019).Smith et al., US 2019/0099505 A1 (2019).
Strop et al., Chemistry & Biology 2013, 20, 161, Location Matters: Site of Conjugation Modulates Stability and Pharmacokinetics of Antibody Drug Conjugates.Strop et al., Chemistry & Biology 2013, 20, 161, Location Matters: Site of Conjugation Modulates Stability and Pharmacokinetics of Antibody Drug Conjugates.
Strop et al., US 9,676,871 B2 (2017).Strop et al., US 9,676,871 B2 (2017).
Sugimura et al., J. Biotechnol. 2007, 131, 121, Novel site-specific immobilization of a functional protein using a preferred substrate sequence for transglutaminase 2.Sugimura et al., J. Biotechnol. 2007, 131, 121, Novel site-specific immobilization of a functional protein using a preferred substrate sequence for transglutaminase 2.
--
Claims (23)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62/773,708 | 2018-11-30 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA045916B1 true EA045916B1 (en) | 2024-01-18 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7194170B2 (en) | TOLL-LIKE RECEPTOR 7 (TLR7) AGONISTS HAVING A TRICYCLIC GROUP, CONJUGATES THEREOF, AND METHODS AND USES THEREOF | |
US20220031860A1 (en) | Antibodies modified for transglutaminase conjugation, conjugates thereof, and methods and uses | |
WO2019036023A1 (en) | 6-amino-7,9-dihydro-8h-purin-8-one derivatives as immunostimulant toll-like receptor 7 (tlr7) agonists | |
CN108602878B (en) | C-terminal lysine conjugated immunoglobulins | |
US11753669B2 (en) | Lysine conjugated immunoglobulins | |
ES2943474T3 (en) | Antibody comprising a carboxy-terminal extension of a glutamine-containing light chain, conjugates thereof, and methods and uses | |
JP2019505575A (en) | Mutant antibodies for site-specific binding | |
EA045916B1 (en) | ANTIBODY CONTAINING GLUTAMINE CONTAINING C-TERMINAL ELONGATION OF LIGHT CHAIN, ITS CONJUGATES, METHODS AND ROUTES OF APPLICATION | |
US11020490B2 (en) | Antibody-drug conjugate with a tubulysin analog warhead having a stabilized acetate group in the TUV subunit |