EA045813B1 - Анти-cd24 композиции и их применения - Google Patents

Анти-cd24 композиции и их применения Download PDF

Info

Publication number
EA045813B1
EA045813B1 EA202092306 EA045813B1 EA 045813 B1 EA045813 B1 EA 045813B1 EA 202092306 EA202092306 EA 202092306 EA 045813 B1 EA045813 B1 EA 045813B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
antibody
cells
cancer
seq
antibodies
Prior art date
Application number
EA202092306
Other languages
English (en)
Inventor
Ян Лю
Пань Чжэн
Ронда Флорес
Хун-Янь Чоу
Чжихун Сюэ
Пэйин Е
Мартин Девенпорт
Original Assignee
ОнкоСи4, ИНК.
Чилдрен'С Рисерч Инститьют
Чилдрен'С Нешнл Медикал Сентер
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ОнкоСи4, ИНК., Чилдрен'С Рисерч Инститьют, Чилдрен'С Нешнл Медикал Сентер filed Critical ОнкоСи4, ИНК.
Publication of EA045813B1 publication Critical patent/EA045813B1/ru

Links

Description

Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее раскрытие относится к aHTu-CD24 антителам, которые избирательно связывают человеческий CD24, экспрессируемый в раковых клетках, но не человеческий CD24, экспрессируемый в нераковых клетках. Раскрытие также относится к применению таких антител в лечении рака.
Уровень техники
CD24 представляет собой небольшой сильногликозилированный муцин-подобный белок клеточной поверхности, связанный с гликозилфосфатидилинозитолом (GPI). CD24 экспрессируется на более высоких уровнях на гемопоэтических клетках, включая В-клетки, Т-клетки, нейтрофилы, эозинофилы, дендритные клетки и макрофаги, а также негемопоэтических клетках, включая нервные клетки, ганглиозные клетки, клетки эпителия, кератиноциты, мышечные клетки, клетки поджелудочной железы и эпителиальные стволовые клетки. В целом, CD24 имеет тенденцию экспрессироваться на более высоких уровнях в клетках-предшественниках и метаболически активных клетках и в меньшей степени в терминально дифференцированных клетках. Функция CD24 в большинстве типов клеток неясна, но сообщалось о различных иммунологических функциях CD24. Хотя CD24 обнаружен во многих нормальных тканях и типах клеток, CD24 сверхэкспрессируется почти в 70% случаев рака человека. Высокие уровни экспрессии CD24, детектируемые иммуногистохимическим методом, были обнаружены при эпителиальном раке яичников (83%), раке молочной железы (85%), немелкоклеточном раке легкого (45%), раке простаты (48%) и раке поджелудочной железы (72%). CD24 - один из белков, наиболее сильно экспрессируемых в раковых клетках. Экспрессия CD24 повышается во время онкогенеза, что предполагает его роль в прогрессировании опухоли и метастазировании. Сверхэкспрессия CD24 при раке также была идентифицирована как маркер, указывающий на плохой прогноз и более агрессивное течение болезни для больных раком. При раке молочной железы экспрессия CD24 значительно выше при инвазивной карциноме, чем при доброкачественных или предраковых поражениях. При немелкоклеточном раке легкого экспрессия CD24 была идентифицирована как независимый маркер общей выживаемости пациента. Кроме того, при плоскоклеточном раке пищевода сверхэкспрессия CD24 свидетельствует о метастазировании опухоли в лимфатические узлы, высокой степени злокачественности опухоли, а также о сокращении времени выживания. Подобные наблюдения были обнаружены при многих других формах рака, включая рак толстой кишки, гепатоцеллюлярную карциному, глиому, рак яичников и рак простаты. Хотя CD24 широко использовался в качестве маркера прогноза рака, он не использовался в качестве неоантигена, который может быть потенциальной мишенью для лечения рака, из-за его экспрессии на нормальных типах клеток и потенциальной токсичности. Зрелый CD24 представляет собой небольшой высокогликозилированный сиалогликопротеин из 31 аминокислоты с 16 потенциальными сайтами О-гликозилирования и 2 предполагаемыми сайтами N-гликозилирования. Гликозилирование - одна из самых сложных посттрансляционных модификаций белков. Известно, что во многих раковых клетках происходит переключение с нормального пути гликозилирования, что приводит к изменению экспрессии гликанов и приводит к гипергликозилированию или гипогликозилированию многих клеточных белков. Измененные паттерны гликозилирования, обнаруженные в раковых клетках, являются результатом многих способствующих факторов, включая нарушение регуляции на уровне транскрипции, нарушение регуляции белков-шаперонов во время гликозилирования и изменение активности гликозидазы и гликотрансферазы. Связанные с опухолью изменения гликанов включают более длинное или более короткое разветвление N-гликанов, более высокую или более низкую плотность О-гликанов, образование усеченных версий нормальных аналогов (Tn, sTn и Т-антигены) и образование необычных форм концевых структур с сиаловой кислотой и фукозой (эпитопы sLea и sLex).
Соответственно, в данной области техники существует потребность в улучшенных способах выявления и лечения рака, в частности в способах и композициях, способных отличать раковые клетки от незлокачественных.
Краткое описание изобретения
В настоящем документе предложено моноклональное анти-CD24 антитело, связывание которого с CD24 блокируется гликозилированием, присутствующим в нормальных клетках, но не в раковых клетках. Антитело, ввиду этого, может связывать экранируемый гликаном эпитоп, который не экранирован на раковых клетках, но экранирован на незлокачественных клетках. Антитело может связывать пептид, содержащий последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48.
В другом аспекте моноклональное антитело может связывать раковые клетки с минимальной реактивностью или без реактивности с клетками доброкачественной опухоли. В другом аспекте моноклональное антитело может связывать опухолевые клетки с минимальной реактивностью или без реактивности с неопухолевыми клетками.
В другом аспекте моноклональное антитело может связывать циркулирующие раковые клетки с минимальной реактивностью или без реактивности с гемопоэтическими клетками.
В другом аспекте моноклональное антитело не может связывать CD24 на клетках, лишенных специфических для рака паттернов гликозилирования, но может связывать CD24 на клетках с раковыми паттернами гликозилирования.
В другом аспекте композиция, которая может быть фармацевтической композицией, содержит моноклональное антитело или один или несколько его антигенсвязывающих фрагментов.
В другом аспекте композиция используется для уничтожения раковых клеток посредством антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC).
- 1 045813
В другом аспекте композиция используется для уничтожения раковых клеток посредством антителозависимого клеточного фагоцитоза (ADCP).
В другом аспекте композиция используется для уничтожения раковых клеток посредством комбинации ADCC и ADCP.
В другом аспекте композиция содержит Т-клетку с химерным рецептором антигена, которая может быть использована для придания Т-клеткам специфичности к раковым клеткам.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело 3В6.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее последовательности, указанные в SEQ ID NO: 1 и 2.
В другом аспекте композиция содержит моноклональные антитела, полученные в результате созревания аффинности моноклонального антитела 3В6.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, выбранную из любой из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 3-10.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее легкую цепь, выбранную из любой из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 11-16.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело РР6373, полученное в результате созревания аффинности моноклонального антитела 3В6.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее последовательности, указанные в SEQ ID NO: 6 и 16.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, полученное путем гуманизации моноклонального антитела РР6373.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, выбранную из любой из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 29-32.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее легкую цепь, выбранную из любой из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 33-36.
В другом аспекте фармацевтическая композиция содержит моноклональное антитело H2L3, полученное путем гуманизации моноклонального антитела РР6373.
В другом аспекте фармацевтическая композиция содержит моноклональное антитело H3L3, полученное путем гуманизации моноклонального антитела РР6373.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее вариабельную последовательность тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 30, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.
В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 31, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 33.
В другом аспекте композиция содержит одноцепочечное моноклональное антитело, содержащее последовательность, указанную в SEQ ID NO: 17.
В другом аспекте композиция содержит биспецифическое антитело, содержащее первый домен антитела, включающий анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, и второй домен антитела, включающий второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. Биспецифическое антитело можно использовать для образования мостика между раковыми и иммунными эффекторными Тклетками у пациента, нуждающегося в лечении или профилактике рака.
В другом аспекте второй домен антитела обладает специфичностью связывания, отличной от специфичности первого домена антитела.
В другом аспекте второй домен антитела привлекает иммунные эффекторные Т-клетки к раковым клеткам.
В другом аспекте второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывает CD3.
В другом аспекте второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывает α-цепь TCR, β-цепь TCR, γ-цепь TCR или δ-цепь TCR.
В другом аспекте первый домен антитела включает антитело, содержащее последовательность, указанную в SEQ ID NO: 17, а второй домен антитела содержит последовательность, указанную в SEQ ID NO: 18.
В другом аспекте первый домен антитела включает антитело, содержащее любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 23-27 и 37-41.
В другом аспекте композиция, содержащая биспецифическое антитело, может использоваться для лечения раковых клеток за счет антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC).
В другом аспекте композиция содержит биспецифическое антитело с повышенной активностью ADCC.
В другом аспекте композиция, содержащая биспецифическое антитело, используется для лечения раковых клеток за счет антителозависимого клеточного фагоцитоза (ADCP).
В другом аспекте композиция, содержащая биспецифическое антитело, обладает повышенной активностью ADCP.
- 2 045813
В другом аспекте композиция содержит химерный рецептор антигена для использования в иммунотерапии, причем указанный рецептор включает одноцепочечное антитело, содержащее любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 1-36.
В другом аспекте химерный рецептор антигена используется в иммунотерапии, причем указанный рецептор включает одноцепочечное антитело, содержащее последовательность, указанную в SEQ ID NO: 28.
В другом аспекте фармацевтическая композиция используется вместе со вторым противораковым лекарственным средством.
В настоящем документе предложен способ лечения рака у пациента, который в этом нуждается, включающий введение пациенту одного или нескольких из антител, биспецифических антител, химерных рецепторов антигена или композиций, описанных в настоящем документе, причем рак представляет собой рак легкого, рак печени, рак головного мозга, рак шейки матки, рак яичника, рак почки, рак яичка, рак простаты или нейробластому.
Рак может связываться с композицией анти-CD24 антитела, описанной в данном документе.
Кроме того, в настоящем документе предлагается способ диагностики злокачественной ткани или метастатического поражения с использованием композиции анти-CD24 антитела. Композиция антиCD24 антитела может связывать злокачественную ткань или метастатическое поражение на уровне выше пороговой величины, что может указывать на злокачественную ткань или метастатическое поражение.
В настоящем документе также раскрыт способ идентификации циркулирующих раковых клеток с использованием композиции анти-CD24 антитела. Композиция анти-CD24 антитела может связывать циркулирующие раковые клетки на уровне выше пороговой величины, что может указывать на циркулирующие раковые клетки. Кроме того, в настоящем документе предусмотрено применение описанной здесь композиции в изготовлении лекарственного средства для лечения заболевания или состояния, описанного в данном документе.
Описание графических материалов
Фиг. 1 - столбчатая диаграмма результатов ELISA (иммуноферментный анализ), показывающая, что связывание моноклонального анти-CD24 антитела 3В6 затруднено присутствием гликана, тогда как связывание коммерчески доступного моноклонального анти-CD24 антитела ML5 - нет. 3В6 прочно связывает CD24, лишенный модификаций N-гликаном и сиаловой кислотой (N-SA-CD24), и CD24, лишенный модификаций N-гликаном, сиаловой кислотой и О-гликаном (N-SA-O-CD24), но связывает очень слабо как CD24, лишенный модификаций N-гликаном (N-CD24), так и полностью модифицированный (модификации N-гликаном + сиаловой кислотой + О-гликаном) CD24. CD24GST представляет собой отрицательный контроль, слитый белок CD24-GST.
Фиг. 2А, В - анализы связывания показывают, что 3В6 связывает клеточные линии нейробластомы и медуллобластому. Фиг. 2А - нормализованные графики аффинности моноклональных анти-CD24 антител ML5, 3В6 и SN3 и контрольного антитела, тестированных против 6 линий клеток нейробластомы, IMR32, SK-N-SH, SH-SY5Y, SK-N-BE(2), SK-N-AS и SK-N-BE(2)C. Хотя 3В6 имеет некоторую аффинность ко всем линиям клеток нейробластомы, кроме SK-N-AS, аффинность 3В6 была значительно ниже по сравнению с коммерчески доступными анти-CD24 антителами ML5 (BD Bioscience Cat#555426) и SN3 (Thermo Fisher Cat#MA5-11833). Фиг. 2В - флуоресцентное изображение результатов обработки 4 медуллобластом с помощью 3В6. 3В6 связало 3 из 4 опухолей.
Фиг. 3 - график конкурентного ELISA, сравнивающего способность вариантов 3В6 блокировать связывание 3В6 со слитым белком CD24-GST. РР6226 имеет ту же вариабельную область, что и 3В6.
Фиг. 4 - график конкурентного ELISA, сравнивающего варианты 3В6 по их способности блокировать связывание 3В6 со слитым белком CD24-GST. РР6226 имеет ту же вариабельную область, что и 3В6.
Фиг. 5 - график конкурентного ELISA, сравнивающего варианты 3В6 по их способности блокировать связывание 3В6 со слитым белком CD24-GST. РР6226 имеет ту же вариабельную область, что и 3В6.
Фиг. 6 - столбчатая диаграмма результатов ELISA, показывающая относительную аффинность химерных анти-CD24 антител с созревшей аффинностью к CD24, экспрессируемому клетками СНО (яичника китайского хомячка). Двенадцать клонов показали повышенную аффинность и различную специфичность в отношении полностью гликозилированного CD24, N-CD24, SA-CD24 и N-SA-CD24 по сравнению с 3В6 (РР6226).
Фиг. 7 - анализ титрования различных химерных анти-CD24 антител с созревшей аффинностью, тестированных против линии клеток рака легкого NCI-H727 (левая панель) и линии клеток нейробластомы IMR32 (правая панель). Максимальная протестированная концентрация антител составляла 5 мкг/мл с коэффициентом титрования 2х до минимальной концентрации 0,01 мкг/мл. Также показан неокрашенный (0 мкг/мл) отрицательный контроль.
Фиг. 8 - количественное сравнение связывания между различными гликоформами CD24 и антиCD24 антителами: исходный РР6229 против РР6373 с созревшей аффинностью.
CD24 с удаленным Fc (кристаллизующийся фрагмент) наносили на планшет для ELISA и затем об
- 3 045813 рабатывали либо буфером (CD24), либо NanA (SA-), либо NanA+N-гликаназой (SA-N-) перед добавлением заданных доз РР6626 (левая панель) или РР6373 (правая панель).
Максимальная испытанная концентрация составляла 7812,50 нг/мл с коэффициентом титрования 5х до минимальной концентрации 0,02 нг/мл.
Фиг. 9 - картирование сайта связывания 3В6 с помощью анализа ингибирования пептидов. Из пяти протестированных перекрывающихся пептидов CD24 только один (пептид 4) содержит антигенный эпитоп.
Фиг. 10 - картирование сайта связывания РР6373 с помощью анализа ингибирования пептидов. Из пяти протестированных перекрывающихся пептидов CD24 только один (SNSGLAPNT (SEQ ID NO: 46)) содержит антигенный эпитоп.
Фиг. 11 - картирование эпитопа РР6373 с усеченными пептидами из последовательности антигенного эпитопа пептида 4. Данные показывают, что оптимальный эпитоп содержится в последовательности SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48).
Фиг. 12 - график, показывающий, что РР6373 снижает рост опухоли in vivo на мышиной модели. Голые мыши с пальпируемым ксенотрансплантатом рака легкого получали либо контрольный человеческий IgG, либо РР6373 в двух временных точках, указанных стрелками, после чего рост опухолей еженедельно измеряли.
Фиг. 13 - график, показывающий индуцированную РР6373 клеточную цитотоксичность (ADCC) против линии раковых клеток человека Н727. Клетки Н727 совместно инкубировали с эффекторными клетками PBL с РР6373 и человеческим IgG FC при 5 мкг/мл, индуцировавшими ADCC.
Фиг. 14 - график, показывающий, что РР6373 без фукозилирования ядра (d6873) индуцирует более высокую ADCC против линии раковых клеток человека Н727, чем РР6373. Клетки Н727 совместно инкубировали с эффекторными клетками PBL с d6373, PP6373 и человеческим FC IgG при 5 мкг/мл, индуцировавшими ADCC.
Фиг. 15 - графики проточной цитометрии, показывающие, что комбинация РР6373-впадина и ОКТЗ-выступ показывает более высокую биспецифичность, чем РР6373-выступ и OKT3-впадина. Клетки Jurkat окрашивали супернатантами тканевых культур клеток 293Т, трансфицированных РР6373, OKT3, РР6373-выступ и OKT3-впадина или РР6373-впадина и ОКТЗ-выступ, с последующей инкубацией с биотинилированным белком SA-N-CD24. Сигнал РЕ-стрептавидин (фикоэритрин-стрептавидин) измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.
Фиг. 16 - графики проточной цитометрии, показывающие, что РР6373-ОКТЗ индуцирует более высокую биспецифическую активность, чем ОКТЗ-РР6373. Клетки Jurkat окрашивали супернатантами тканевых культур клеток 293Т, трансфицированных пустой плазмидой (отрицательный контроль), РР6373OKT3 или ОКТЗ-РР6373, с последующей инкубацией с биотинилированным белком SA-N-CD24. Сигнал РЕ-стрептавидин измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.
Фиг. 17 - график проточной цитометрии, показывающий, что биспецифическое антитело РР6373OKT3 обладает противоопухолевой активностью. Клетки рака легких Н727 и активированные человеческие Т-клетки инкубировали в соотношении 1:5с супернатантами тканевых культур необработанных клеток 293Т или трансфицировали пустой плазмидой (нетрансфицированные), РР6373, OKT3, РР6373OKT3 в течение 12 ч. Цитокины (IFNr, TNF, IL10, IL6, IL4 и IL2) в средах тканевых культур измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.
Фиг. 18 - график проточной цитометрии, показывающий, что биспецифическое антитело РР6373OKT3 индуцировало цитотоксичность опухолевых клеток Т-клетками. Клетки рака легких Н727 и активированные человеческие Т-клетки инкубировали в соотношении 1:5 с супернатантами тканевых культур необработанных клеток 293Т или трансфицированных пустой плазмидой (нетрансфицированные), РР6373, OKT3, РР6373-ОКТЗ в течение 12 ч. Клетки рака легких и человеческие Т-клетки собирали и окрашивали античеловеческим CD45 и реагентом Aqua Live/Dead. Количество опухолевых клеток было нанесено на график как дважды негативное по анти-CD45 и Aqua. Было проведено три независимых эксперимента.
Фиг. 19 - анализ высокой биспецифической активности, индуцированной FIT-Ig с помощью проточной цитометрии. Клетки Jurkat окрашивали отрицательным контролем (нетрансфицированный супернатант 293Т) или FIT-Ig с последующей инкубацией с биотинилированным белком SA-N-CD24. Сигнал РЕ-стептавидин измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.
Фиг. 20 - анализ с помощью проточной цитометрии показывает, что FIT-Ig имеет более высокую противоопухолевую активность, чем РР6373-ОКТЗ и ОКТЗ-РР6373. Клетки рака легкого Н727 и активированные Т-клетки человека инкубировали в соотношении 1:5с отрицательным контролем (нетрансфицированный супернатант 293Т), РР6373-ОКТЗ, ОКТЗ-РР6373 или FIT-Ig в течение 12 ч. Цитокины (IFNr, TNF, IL10, IL6, IL4 и IL2) в средах тканевых культур измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.
Фиг. 21 - анализ с помощью проточной цитометрии показывает, что FIT-Ig индуцирует цитотоксичность опухолевых клеток Т-клетками. Клетки рака легкого Н727 и активированные Т-клетки человека
- 4 045813 инкубировали в соотношении 1:5с отрицательным контролем (нетрансфицированный супернатант 293Т), РР6373-ОКТ3, ОКТЗ-РР6373 или FIT-Ig в течение 12 ч. Клетки рака легких и человеческие Т-клетки собирали и окрашивали античеловеческим CD45 и реагентом Aqua Live/Dead. Количество опухолевых клеток было нанесено на график как дважды негативное по анти-CD45 и Aqua. Было проведено три независимых эксперимента.
Фиг. 22 - анализ с помощью проточной цитометрии показывает, что FIT-Ig имеет более высокую термическую стабильность, чем РР6373-ОКТЗ и ОКТЗ-РР6373. Все биспецифические антитела РР6373OKT3, ОКТЗ-РР6373 и FIT-Ig инкубировали при указанной температуре в течение 20 мин, а супернатанты после центрифугирования при 14000g в течение 5 мин использовали для окрашивания клеток Jurkat. Затем биотинилированный белок SA-N-CD24 инкубировали с клетками Jurkat, и сигнал РЕ-стептавидин измеряли с помощью проточной цитометрии.
Фиг. 23 - схема конструкции CarT, содержащей анти-CD24-scFv.
Фиг. 24 - график цитотоксичности, индуцированной CD24 CART, для линии клеток рака легкого А549.
Фиг. 25 - график активации CART линией опухолевых клеток, о чем свидетельствует продуцирование IFNy.
Фиг. 26 - столбчатая диаграмма противоопухолевой активности CD24 CART против различных типов опухолей. Соотношение Е/Т для представленных данных равно 5.
Фиг. 27 - ленточная диаграмма трехмерного структурного выравнивания химерного РР6373 (FR: белый, CDR: светло-серый) и huVHv1VLv1 (FR: серый, CDR: темно-серый).
Фиг. 28 - график относительной эффективности различных пар антител по экспрессии и связыванию CD24-GST.
Фиг. 29 - график связывания H2L3 и H3L3 с линиями раковых клеток человека NCI-H727 (вверху) и IMR32 (внизу). Показанные данные представляют собой среднюю интенсивность флуоресценции при использовании широкого диапазона антител.
Фиг. 30 - графики гибели клеток показывают, что при низкой концентрации HL33 более эффективен, чем РР6373, в ADCC. В качестве мишени использовали линию клеток рака легкого А549, а в качестве эффекторов использовали PBL человека. Используемая доза антител составляла 3 мкг/мл (верхняя панель) или 9 мкг/мл (нижняя панель).
Фиг. 31 - графики гибели клеток показывают, что H3L3 придает сильную активность ADCC по отношению к множеству линий опухолевых клеток, включая линии клеток рака легкого А549 и NCI-H727 и линию клеток нейробластомы IMR-32. Человеческие РВМС (мононуклеарные клетки периферической крови) использовали в качестве эффекторных клеток.
Фиг. 32 - графики гибели клеток показывают, что H3L3 придает сильную активность ADCC множеству линий опухолевых клеток, включая линии клеток рака легкого А549 и NCI-H727 и линию клеток нейробластомы IMR-32. NK-клетки (естественные киллеры), очищенные из РВМС человека, используются в качестве эффекторных клеток.
Фиг. 33 - анализ с помощью проточной цитометрии показывает, что антитела, распознающие экранируемый гликаном эпитоп, не распознают В-клетки, эритроциты и плохо взаимодействуют с нейтрофилами.
Подробное описание изобретения
Нацеливание на эпитопы, экспрессируемые раком, является широко применяемым подходом к лечению рака. Однако многие такие эпитопы не являются хорошими мишенями для лекарств, потому что они также экспрессируются в нормальных тканях, что может привести к проблемам токсичности. Идеальный опухолевый специфический антиген (TSA) должен иметь высокую экспрессию в опухоли, но минимальную экспрессию или отсутствие экспрессии в важных органах хозяина. Атрибуты менее идеальных, но в равной степени работоспособных TSA - это те, которые экспрессируются, но по-разному модифицируются в нормальных и раковых тканях, так называемые опухолевые антигены (ТАА). Примерами хорошо охарактеризованных опухолевых антигенов являются MAGE-A3, MUC-1 и NY-ESO 1.
Выявление новых TSA и ТАА является ограничивающим фактором в разработке новых или более эффективных средств лечения рака, особенно тех видов рака, для которых в настоящее время не существует опухолевых антигенов. CD24 является хорошей мишенью для рака по следующим причинам: он чрезмерно экспрессируется более чем в 70% всех раковых заболеваний человека и дифференциально гликозилирован при раке, он, по-видимому, является онкогеном и связан с плохим прогнозом при различных раковых заболеваниях и значительно более короткой продолжительностью выживаемости пациентов, и он является маркером раковых стволовых клеток, которые могут вызвать рецидив и метастазирование, давая начало новым опухолям. Авторы изобретения обнаружили анти-CD24 антитела, связывание которых с CD24 блокируется гликозилированием, которое происходит в нормальных клетках, но не в раковых. В результате антитела связываются с клетками раковых линий и раковыми тканями, но с минимальной реактивностью по отношению к множеству нормальных тканей и гемопоэтических клеток. В настоящем документе предусмотрены антитела и их антигенсвязывающие фрагменты. Антитело может представлять собой моноклональное антитело, человеческое антитело, химерное антитело или гуманизи
- 5 045813 рованное антитело. Антитело может быть моноспецифическим, биспецифическим, триспецифическим или мультиспецифическим. Антигенсвязывающий фрагмент антитела может иммуноспецифично связывать CD24, и, в частности, человеческий CD24, предпочтительно экспрессируемый на поверхности живой клетки в эндогенной или трансфицированной концентрации. Антигенсвязывающий фрагмент может связывать CD24. Антитело может быть помечено детектируемой меткой или может включать конъюгированный токсин, лекарственное средство, рецептор, фермент или лиганд рецептора.
В дополнение к прямому нацеливанию на опухоль иммунная система обладает способностью распознавать и устранять рак в экспериментальных модельных системах и у пациентов. В результате иммунотерапия рака становится одной из самых многообещающих областей терапии рака. Активная иммунотерапия рака включает агенты, которые усиливают естественные иммунные ответы (включая антитела против PD-1, PD-L1 или CTLA-4); биспецифические молекулы, такие как антитела, которые образуют мостик между раковыми и иммунными эффекторными Т-клетками; или адоптивный перенос клеток (ACT) с использованием ex vivo стимулированных лимфоцитов, инфильтрирующих опухоль (TIL), активированных естественных киллеров (NK) или генно-инженерных Т-клеток (Т-клетки, модифицированные химерными рецепторами антигена (CAR) и Т-клеточными рецепторами (TCR)). Многие из этих технологий требуют наличия компонента нацеливания на опухоль для специфичности и эффективности.
1. Определения.
Используемая здесь терминология предназначена только для описания конкретных вариантов осуществления и не должна интерпретироваться ограничительно. Используемые в описании и прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа также обозначают множественное число, если контекст явно не диктует иное. Слово около (примерно, приблизительно) в сочетании с числовым значением обозначает разумное приближение к этому значению. В некоторых случаях около может быть истолковано как находящееся в пределах 10 % от конкретного значения, с которым оно употреблено. Например, фраза около 100 может охватывать любое значение от 90 до 110. При перечислении числовых диапазонов в данном документе явно полагается рассмотрение каждого промежуточного числа внутри диапазона с одинаковой степенью точности. Например, для диапазона 6-9 числа 7 и 8 полагаются в дополнение к 6 и 9, а для диапазона 6,0-7,0 - явным образом полагаются числа 6,0, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9 и 7,0.
Лечение или лечить применительно к защите животного от болезни означает предотвращение, супрессию, репрессию или полное устранение болезни. Предотвращение заболевания включает введение композиции согласно раскрытию животному до начала заболевания. Супрессия заболевания включает введение композиции согласно раскрытию животному после индукции заболевания, но до его клинического проявления. Репрессия заболевания включает введение композиции по раскрытию животному после клинического проявления заболевания.
Используемый здесь термин антитело предназначен для обозначения молекулы иммуноглобулина, которая обладает сайтом распознавания антигена вариабельной области. Термин вариабельная область предназначен для отличия такого домена иммуноглобулина от доменов, которые широко распространены среди антител (таких как домен Fc антитела). Вариабельная область включает гипервариабельную область, остатки которой отвечают за связывание антигена. Гипервариабельная область содержит аминокислотные остатки области, определяющей комплементарность или CDR (то есть, как правило, остатки приблизительно в позициях 24-34 (L1), 50-56 (L2) и 89-97 (L3) в вариабельной области легкой цепи и остатки приблизительно в позициях 27-35 (H1), 50-65 (Н2) и 95-102 (Н3) в вариабельной области тяжелой цепи) и/или остатках гипервариабельной петли (т.е. остатки 26-32 (L1), 50-52 (L2) и 9196 (L3) в вариабельной области легкой цепи и 26-32 (H1), 53-55 (Н2) и 96-101 (Н3) в вариабельной области тяжелой цепи). Остатки каркасной области или FR представляют собой те остатки вариабельной области, которые отличаются от остатков гипервариабельной области, как определено здесь. Термин антитело включает моноклональные антитела, мультиспецифические антитела, человеческие антитела, гуманизированные антитела, синтетические антитела, химерные антитела, антитела семейства верблюдовых, одноцепочечные антитела, дисульфидно-связанные Fv (sdFv), интратела и антиидиотипические (анти-Id) антитела (включая, например, анти-Id и анти-анти-Id антитела к антителам по изобретению). В частности, такие антитела включают молекулы иммуноглобулинов любого типа (например IgG, IgE, IgM, IgD, IgA и IgY), любого класса (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2) или любого подкласса.
Используемый здесь термин антигенсвязывающий фрагмент антитела относится к одной или нескольким частям антитела, которые содержат CDR антитела и, необязательно, каркасные остатки, которые составляют сайт распознавания антигена вариабельной области антитела и проявляют способность к иммуноспецифическому связыванию антигена. Такие фрагменты включают Fab', F(ab')2, Fv, одноцепочечный фрагмент (ScFv) и их мутанты, встречающиеся в природе варианты и слитые белки, содержащие сайт распознавания антигена вариабельной области антитела и гетерологичный белок (например, токсин, сайт распознавания антигена для другого антигена, фермент, рецептор или лиганд рецептора и т.д.). Используемый здесь термин фрагмент относится к пептиду или полипептиду, содержащему аминокислотную последовательность, состоящую по меньшей мере из 5 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 10 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 15 смежных аминокислотных
- 6 045813 остатков, по меньшей мере 20 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 25 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 40 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 50 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 60 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 70 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 80 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 90 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 100 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 125 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 150 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 175 смежных аминокислотных остатков, по меньше мере 200 смежных аминокислотных остатков или по меньшей мере 250 смежных аминокислотных остатков.
Человеческие, химерные или гуманизированные антитела особенно предпочтительны для использования in vivo у людей, однако мышиные антитела или антитела других видов могут быть успешно использованы для многих применений (например, анализы обнаружения in vitro или in situ, применение в острый период in vivo и т.д.).
Химерное антитело представляет собой молекулу, в которой разные части антитела происходят из разных молекул иммуноглобулина, такую как антитела, имеющие вариабельную область, полученную из нечеловеческого антитела, и константную область иммуноглобулина человека. Химерные антитела, содержащие одну или несколько CDR из нечеловеческих видов и каркасные области из молекулы иммуноглобулина человека, могут быть получены с использованием множества методик, известных в данной области, включая, например, трансплантацию CDR (ЕР 239,400; Международная публикация № WO 91/09967; и патенты США №№ 5,225,539, 5,530,101 и 5,585,089; содержание каждого из этих документов полностью включено в настоящий документ), венирование (veneering) или перекладку вариабельного домена (resurfacing) (ЕР 592,106; ЕР 519,596, содержание каждого из этих документов включено в настоящий документ путем ссылки) и перестановки цепей (chain shuffling) (патент США № 5,565,332, содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки).
Используемый здесь термин гуманизированное антитело относится к иммуноглобулину, содержащему каркасную область человека и одну или несколько CDR из нечеловеческого (обычно мышиного или крысиного) иммуноглобулина. Иммуноглобулин нечеловеческого происхождения, из которого берутся CDR, называется донором, а иммуноглобулин человека, из которого берется каркас, называется акцептором. Постоянные области не обязательно должны присутствовать, но если они есть, они должны быть по существу идентичны константным областям человеческого иммуноглобулина, то есть идентичны по меньшей мере примерно на 85-90%, предпочтительно примерно на 95% или более. Следовательно, все части гуманизированного иммуноглобулина, за исключением, возможно, CDR, по существу идентичны соответствующим частям последовательностей природного иммуноглобулина человека. Гуманизированное антитело - это антитело, включающее иммуноглобулин с гуманизированной легкой цепью и гуманизированной тяжелой цепью. Например, гуманизированное антитело не будет включать типичное химерное антитело, потому что, например, вся вариабельная область химерного антитела является нечеловеческой. Донорское антитело может называться гуманизированным в процессе гуманизации, поскольку ожидается, что полученное гуманизированное антитело будет связываться с тем же антигеном, что и донорское антитело, из которого взяты CDR. По большей части гуманизированные антитела представляют собой человеческие иммуноглобулины (реципиентные антитела), в которых остатки гипервариабельной области реципиента заменены остатками гипервариабельной области из нечеловеческого вида (донорское антитело), такого как мышь, крыса, кролик или примат, не являющийся человеком, имеющими желаемую специфичность, аффинность и связывающую способность. В некоторых случаях остатки каркасной области (FR) иммуноглобулина человека заменяются соответствующими остатками нечеловеческого происхождения. Кроме того, гуманизированные антитела могут содержать остатки, которых нет в реципиентном антителе или в донорском антителе. Эти модификации осуществляются для дальнейшего улучшения характеристик антител. В общем, гуманизированное антитело будет включать по существу всю последовательность по меньшей мере одного, а обычно двух вариабельных доменов, в которых все или практически все гипервариабельные области соответствуют таковым иммуноглобулина нечеловеческого происхождения, и все или практически все FR являются последовательностями человеческого иммуноглобулина. Гуманизированное антитело необязательно также может включать по меньшей мере часть константной области иммуноглобулина (Fc), как правило иммуноглобулина человека, который иммуноспецифически связывается с полипептидом FcyRIIB, который был изменен путем введения замен, делеций или добавлений аминокислотных остатков (т.е. мутаций).
2. Композиции анти-CD24 антител.
В данном документе описывается анти-CD24 антитело, которое может специфически нацеливаться на специфичную для рака гликоформу CD24. Ahtu-CD24 антитело можно использовать для разработки средств лечения рака, включая, но не ограничиваясь ими: конъюгаты антитело-лекарственное средство, терапевтические антитела с усилением ADCC, биспецифические антитела, CAR-T-терапии и TCRтерапии. В частности, анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут связываться с экранируемым гликаном эпитопом, который не экранирован на раковых клетках, но экранирован на незлокачественных клетках. В частности, анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент мо
- 7 045813 гут связываться с пептидом CD24, содержащим аминокислотную последовательность SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48).
Ahtu-CD24 антитело может представлять собой ЗВ6, которое может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 1, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 2. Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может быть версией 3В6 с созревшей аффинностью и может включать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 3-10, и вариабельную область легкой цепи, содержащую любую из последовательности, указанные в SEQ ID NO: 11-16. Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может представлять собой РР6373, которое может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 6, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 16. Для терапевтического применения у людей анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может быть гуманизированной версией РР6373 и может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 29-32, и вариабельную область легкой цепи, содержащую любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 33-36. В частности, гуманизированное анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может представлять собой H2L3, которое может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 30, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35; или может представлять собой H3L3, которое может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 31, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.
3. Композиции конъюгата антитело-лекарственное средство.
Нацеленное на опухоль антитело можно использовать для предотвращения или ограничения роста опухолей, непосредственно влияя на биологию опухоли. Например, гуманизированное моноклональное анти-VEGF антитело (бевацизумаб; Авастин) блокирует рост опухолей, предотвращая VEGF-индуцированную васкуляризацию опухоли. Другие нацеленные на опухоль антитела используются для подавления роста опухолевых клеток или уничтожения раковых клеток посредством модификации самого антитела. Например, нацеленные на опухоль иммуноконъюгаты состоят из антитела и эффекторного фрагмента, связанных вместе ковалентными перекрестными связями или генетическим слиянием. Эффекторный фрагмент может быть цитотоксическим лекарственным средством (конъюгат антитело-лекарственное средство), белковым токсином (иммунотоксин) или радионуклидом (радиоиммуноконъюгат). Примером конъюгата антитело-лекарственное средство является брентуксимаб ведотин (ADCETRIS®, Seattle Genetics), который состоит из химерного моноклонального антитела брентуксимаб (сАС10, которое нацелено на белок клеточной мембраны CD30), связанного с тремя-пятью единицами антимитотического агента монометил ауристатин Е (ММАЕ, что отражено выражением ведотин в названии препарата).
Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может быть включено в конъюгаты антитело-лекарственное средство, иммунотоксины или радиоиммуноконъюгаты. Нацеливающий антиCD24 компонент таких композиций может обеспечивать специфическую доставку конъюгата к раковым клеткам и тканям, ограничивая при этом воздействие на нормальные клетки и ткани и, таким образом, предотвращая нецелевую токсичность.
4. Композиции ADCC-антител.
Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, или композиция антитела, содержащая одно из вышеперечисленных, могут быть использованы для стимуляции гибели раковых клеток посредством по меньшей мере одного из следующих механизмов: антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC) и антителозависимого клеточного фагоцитоза (ADCP). ADCC - это механизм иммунной защиты, посредством которого определенный набор иммунных клеток (эффекторных клеток) организма активно взаимодействует с клеткой-мишенью (например, патогеном) и лизирует ее. ADCC был идентифицирован как важный клеточно-опосредованный врожденный иммунный ответ, функционирует как первая линия защиты организма от патогенов и действует для ограничения и сдерживания инфекций. Процесс ADCC рассчитан на уничтожение покрытой антителом клетки-мишени посредством нефагоцитарного процесса и характеризуется либо направленным высвобождением цитотоксических вакуолей, либо экспрессией молекул, индуцирующих гибель клеток. ADCC обычно инициируется, когда специфические антитела (в основном классы IgG) хозяина распознают и связывают антигены мембранной поверхности клеток-мишеней и одновременно взаимодействуют с рецепторами Fc (FcR) на поверхности эффекторных клеток. Наиболее распространенными эффекторными клетками, которые опосредуют ADCC, являются естественные клетки-киллеры (NK), хотя моноциты, макрофаги, нейтрофилы, эозинофилы и дендритные клетки также способны опосредовать ответ ADCC. Хотя ADCC является довольно быстрым ответом, эффективность варьируется в зависимости от нескольких параметров, таких как плотность антигена на поверхности клеток-мишеней и аффинность взаимодействия антиген-антитело, а также характеристики фрагментов Fc, которые определяют взаимодействия антител с различными членами семейства рецепторов Fc.
- 8 045813
Связывание антитела со специфическими рецепторами клеточной поверхности на клетках-мишенях - процесс, называемый опсонизацией, - является ключевым событием процесса ADCC. Процесс опсонизации привлекает фагоциты к клетке-мишени и может инициировать фагоцитоз. Связывание Fc-области антитела с FcR на фагоцитах также способствует образованию С3Ь, продукта расщепления компонента 3 комплемента, который является важным белком, который инициирует поглощение опсонизированной антителом клетки-мишени. Фагоцитоз, опосредованный антителами, также часто называют антителозависимым клеточноопосредованным фагоцитозом (ADCP). Однако в случае ADCC для уничтожения патогена не требуется, чтобы он был фагоцитирован. Как отмечалось выше, FcR на поверхности цитотоксических эффекторных клеток является ключом к индукции ADCC. У людей наиболее важными классами FcR, способными вызывать ADCC, являются FcyRI (CD64), FcyRIIa и FcyRIIc (CD32), а также FcyRIIIa (CD16). Впрочем, рецептор FcyRIIb подавляет ответ ADCC. Таким образом, баланс между активирующим и ингибирующим сигналами от FcyRs является важным фактором, определяющим величину ответа ADCC. После распознавания мишени специализированные внутриклеточные вакуоли (также называемые секреторными лизосомами) высвобождаются цитотоксическими эффекторными клетками в кальций-зависимом поляризованном экзоцитотическом процессе. Перфорин, цитолизин и гранзим В являются ключевыми компонентами, которые высвобождаются из вакуолей. Перфорин проникает и формирует поры в мембране клеткимишени. Для этого процесса требуется кальций. Гранзим В вызывает фрагментацию ДНК целевой клетки. Примером терапевтического антитела, которое работает с помощью ADCC, является трастузумаб (Герцептин, Genentech). Трастузумаб нацелен на HER2, который экспрессируется на аномально высоких уровнях при большом количестве видов рака молочной железы, часто называемых HER2положительным раком молочной железы, и подавляет рост HER2-положительного рака молочной железы, индуцируя ADCC у хозяина. Антитела, используемые для индукции ADCC, обычно требуют некоторой модификации, чтобы усилить их активность ADCC. Для этого существует ряд технологий, которые обычно включают конструирование антитела так, чтобы олигосахариды в Fc-области антитела не содержали фукозных сахарных единиц, что улучшает связывание с рецептором FcyIIIa. Афукозилированные антитела проявляют повышенную антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC). Например, технология Potelligent® компании Biowa использует линию клеток СНО, нокаутированную по гену FUT8, для производства 100 % афукозилированных антител. FUT8 - единственный ген, кодирующий α1,6-фукозилтрансферазу, который катализирует перенос фукозы от ГДФ-фукозы к GlcNAc через связь α1,6 олигосахарида сложного типа. Probiogen разработал линию СНО, которая предназначена для получения более низких уровней фукозилированных гликанов на MAb, хотя и не за счет нокаута FUT. Система Probiogen вводит бактериальный фермент, который перенаправляет путь синтеза фукозы de-novo к сахару-нуклеотиду, который не может быть метаболизирован клеткой. В качестве альтернативного подхода у Seattle Genetics есть проприетарная система подпитки, которая производит более низкие уровни фукозилированных гликанов на MAb, продуцируемых в клеточных линиях СНО (и, возможно, других). Компания Xencor разработала технологию XmAb Fc домена, предназначенную для улучшения устранения иммунной системой опухолевых и других патологических клеток. Этот домен Fc имеет две замены аминокислот, что приводит к увеличению аффинности к FcyRIIIa в 40 раз. Он также увеличивает аффинность к FcyRIIa с возможностью привлечения других эффекторных клеток, таких как макрофаги, которые играют роль в иммунитете, поглощая и переваривая чужеродный материал. Анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут быть включены в состав антител, уничтожающих рак посредством ADCC. Анти-CD24 нацеливающий компонент таких композиций может обеспечивать специфическую нацеленную доставку к раковым клеткам для ADCC-опосредованного разрушения при сохранении нормальных клеток и тканей. Активность ADCC анти-CD24 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента может быть усилена одной или несколькими модификациями, описанными в данном документе.
5. Композиции биспецифических антител.
В настоящем документе дополнительно предложено биспецифическое антитело, которое содержит первый домен антитела, содержащий первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, связанный со вторым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом. Первый домен антитела может содержать описанное здесь анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, а второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связываться с другими иммуностимулирующими молекулами. В конкретном варианте осуществления второй домен антитела включает анти-CD3 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. В этом случае биспецифическое антитело может специфически нацеливаться на опухолевые клетки, экспрессирующие ракоспецифичную гликоформу CD24, одновременно связывая CD3 на цитотоксических Т-клетках, тем самым привлекая Т-клетки к месту опухоли, посредством чего Т-клетки будут проникать в опухоль и вызывать цитотоксичность в опухоли. Другие примеры антител-партнеров для использования в биспецифическом антителе с целью привлечения цитотоксических Т-клеток или других эффекторных клеток к месту опухоли известны в данной области.
Второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может нацеливаться на комплементарный противоопухолевый путь или механизм. Второй домен антитела может включать антитело для иммунотерапии рака или его антигенсвязывающий фрагмент, который усиливает естественные иммунные отве
- 9 045813 ты. Примеры таких антител для иммунотерапии рака включают анти-PD-l, анти-В7-Н1, анти-В7-Н3, анти-В7-Н4, анти-LIGHT, анти-LAG3, анти-TIM3, анти-TIM4, анти-CD40, анти-ОХ40, анти-GITR, антиBTLA, анти-CD27, анти-ICOS или анти-4-1ВВ антитела. Такие антитела можно использовать для лечения рака. Второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связывать α-цепь TCR, β-цепь TCR, γ-цепь TCR или 5-цепь TCR.
Биспецифическое антитело может содержать последовательности, указанные в SEQ ID NO: 17 и 18, или любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 23-27 и 37-41. В данной области известно много различных технологий биспецифических антител. Для большинства из них требуется, чтобы антитела двух компонентов были в одноцепочечном формате, чтобы две части могли экспрессироваться в единой конструкции. Предпочтительный метод заключается в экспрессии антител в виде одноцепочечного вариабельного фрагмента (scFv). Неограничивающие примеры технологий биспецифических антител включают BiTE (что означает Bi-specific T-cell Engager, биспецифическое средство привлечения Т-клеток), DART (что означает Dual-Affinity Re-Targeting, перенацеливание с двойной аффинностью), иммуноглобулин с тандемом Fab (FIT-Ig) и типа выступы-во-впадины. Такие биспецифические антитела, содержащие анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в особенности рассматриваются в данном документе.
6. CAR-T терапевтические композиции.
Терапия на основе Т-клеток с химерным рецептором антигена (CAR), или CAR-T-терапия, представляет собой тип клеточного лечения, при котором Т-клетки больного раком генетически модифицированы ex vivo с возможностью экспрессии белка CAR, чтобы они могли атаковать раковые клетки. В частности, Т-клетки получают из крови пациента, которая, в частности, может быть собственной кровью пациента (аутологичной), и трансфицируют генной конструкцией, которая экспрессирует рекомбинантный CAR-рецептор. Затем в лаборатории выращивают большое количество CAR-T-клеток и вводят обратно пациенту, где они могут нацеливаться и уничтожать раковые клетки пациента. Т-клетки также могут быть аллогенными от подходящего донора или от универсальной или готовой линии Т-клеток, в которой один или несколько из локусов гена TCR и локусов HLA класса I аллогенных Т-клеток нарушены и полученные Т-клетки не способны распознавать аллогенные антигены.
Белковые конструкции CAR имеют модульные структуры, обычно содержащие следующие основные компоненты: полученный из антитела внеклеточный одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv), присоединенный к шарнирному/спейсерному пептиду и трансмембранному домену, который дополнительно связан с внутриклеточными доменами передачи Т-клеточных сигналов Т-клеточного рецептора. ScFv является нацеливающим элементом и экспрессируется на поверхности CAR-T-клетки для придания антигенной специфичности. Спейсер соединяет внеклеточный нацеливающий элемент с трансмембранным доменом и влияет на функцию CAR и гибкость scFv. Трансмембранный домен пересекает клеточную мембрану, заякоривает CAR на поверхности клетки и соединяет внеклеточный домен с внутриклеточным сигнальным доменом, тем самым воздействуя на экспрессию CAR на клеточной поверхности. Костимулирующий домен происходит из внутриклеточных сигнальных доменов костимулирующих белков, таких как CD28 и 4-1ВВ, которые усиливают продукцию цитокинов. Дзета-домен CD3 происходит из внутриклеточной сигнальной части Т-клеточного рецептора, которая опосредует нисходящую передачу сигналов во время активации Т-клеток. Примеры CAR-T-терапевтических средств включают такие, которые нацелены на поверхностные антигены В-клеток CD19 (такие как JCAR017 и JCAR014 [Juno Therapeutics]), CTL019 (тисагенлеклеуцел-Т (Kymriah™) [Novartis]) и КТЕ-С19 (аксикабтаген цилолейцел (Yescarta®) [Kite Pharma]) и CD22 (JCAR014 [Juno Therapeutics]). Другие примеры CAR-T-терапевтических средств включают такие, которые нацелены на Ll-CAM (JCAR023 [Juno Therapeutics]), ROR-1 (JCAR024 [Juno Therapeutics]) и MUC16 (JCAR020 [Juno Therapeutics]). ScFv-часть CAR является критическим компонентом, который обеспечивает специфичность для раковых клеток, предотвращая при этом активность против нормальных клеток, которая связана с нецелевой токсичностью. Следовательно, scFv-часть обычно происходит из части антитела, которая распознает целевой белок, специфически экспрессируемый на раковых клетках, но гораздо реже или, в идеале, совсем не экспрессируется на других клетках и тканях. Соответственно, scFv-фрагмент, полученный из любого из описанных здесь анти-CD24 антител, может быть использован в качестве нацеливающего на рак компонента рекомбинантного белка CAR. В частности, белок scFv может содержать последовательность, указанную в SEQ ID NO: 28.
CAR Т-клетки продемонстрировали впечатляющие эффекты против гематологических опухолей, таких как острый лимфобластный лейкоз (ALL), В-клеточный острый лимфобластный лейкоз, миелоидный лейкоз взрослых (AML), диффузная большая В-клеточная лимфома (DLBCL), неходжкинская лимфома (NHL), хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL), первичная средостенная В-клеточная лимфома (PMBCL), лимфома клеток мантийной зоны (MCL) и множественная миелома (ММ). Однако на сегодняшний день CAR-Т-терапия продемонстрировала лишь ограниченный эффект против солидных опухолей. Из-за характерного паттерна экспрессии CD24 в опухолях и нормальных тканях данные, полученные с использованием CD24 CAR-T, продемонстрировали, что типы рака, на которые можно воздейство
- 10 045813 вать, включают, не ограничиваясь указанным, опухоли головного мозга, рак головы и шеи, саркому, рак легких, рак желудочно-кишечного тракта, рак молочной железы, рак яичка, рак простаты, рак поджелудочной железы, рак шейки матки, рак яичника, рак печени или гематологические злокачественные новообразования.
7. TCR-терапевтические композиции.
Подобно CAR-T-терапии, терапия с использованием генетически модифицированных Т-клеточных рецепторов (TCR) представляет собой тип клеточного лечения, при котором Т-клетки больного раком генетически модифицированы ex vivo для экспрессии модифицированного TCR с целью улучшения способности Т-клеточных рецепторов распознавать и атаковать специфические антигенные клеточные антигены, когда клетки снова вводят пациенту. Однако, в отличие от CAR Т-клеток, которые распознают белки, экспрессируемые на поверхности, Т-клеточная иммунотерапия с использованием генномодифицированных TCR была нацелена в большей степени на солидные опухоли. TCR могут распознавать опухолеспецифические белки внутри клеток. Когда опухолеспецифические белки разбиваются на фрагменты, они презентируются на поверхности клетки с другим белком, называемым главным комплексом гистосовместимости, или МНС. TCR рассчитаны на распознавание комбинации опухолеспецифического белкового фрагмента/МНС. Примеры мишеней для Т-клеток, модифицированных TCR, включают мишени, нацеленные на Mage-Аз, такие как KITE-718 (Kite Pharma), опухолевый антиген Вильмса 1 (WT-1), такой как JTCR016 (Juno Therapeutics) и NY-ESO 1.
TCR представляет собой гетеродимер, состоящий из двух субъединиц, TCRa и TCRe. Каждая субъединица содержит константную область, которая находится рядом с Т-клеточной мембраной и заякоривает рецептор в клеточной мембране, а также гипервариабельную область, которая участвует в распознавании антигена. Соответственно, scFv-фрагмент, полученный из любого из анти-CD24 антител, описанных в данном документе, может быть использован в качестве нацеливающего на рак компонента рекомбинантного белка TCR. В частности, белок scFv может содержать последовательность, указанную в SEQ ID NO: 28.
8. Пептидные композиции.
Описанное в данном документе анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связывать экранируемый гликаном эпитоп, который не экранирован на раковых клетках, но экранирован на незлокачественных клетках. В частности, анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связывать пептид CD24, содержащий аминокислотную последовательность SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48). Соответственно, пептиды, содержащие последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48, могут быть использованы для нейтрализации анти-CD24 антител, которые связываются с эпитопами, содержащими ядро последовательности, указанной в SEQ ID NO: 48. Это может быть использовано в анализах на основе антител к лекарствам для обнаружения нейтрализующих антител. Пептиды, содержащие последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48, можно использовать для ингибирования потенциальных неблагоприятных эффектов, связанных с антителами, которые связываются с эпитопами, составляющими ядро последовательности, указанной в SEQ ID NO: 48. Пептид может быть модифицирован для повышения стабильности для использования in vivo с помощью методов, известных в данной области, включая, но не ограничиваясь указанным, использование D-аминокислот, замену О на S в одной или нескольких пептидных связях, добавление последовательности слияния для улучшения растворимости или периода полужизни (например, слияние с альбумином). В еще одном варианте осуществления молекула, содержащая последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48, может быть использована в качестве вакцины для лечения и профилактики рака.
9. Способы лечения.
Композиции анти-CD24 антител или клеточные терапевтические средства, включающие такие композиции антител, описанные в данном документе, могут использоваться для лечения или предотвращения рака или другого аномального пролиферативного заболевания. В настоящем документе предлагается способ такого применения у пациента, нуждающегося в этом, который может включать введение пациенту анти-CD24 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или фармацевтической композиции, содержащей вышеуказанное. Такие молекулы и фармацевтические композиции также можно использовать в изготовлении лекарственного средства для лечения или профилактики рака или другого аномального пролиферативного заболевания. Используемый здесь термин рак относится к новообразованию или опухоли, возникающим в результате аномального неконтролируемого роста клеток. Используемый здесь термин рак явно включает лейкоз и лимфомы. Термин относится к заболеванию с участием клеток, которые могут метастазировать в отдаленные участки. Пациент может быть человеком. Раком или другим аномальным пролиферативным заболеванием может быть (но не ограничиваясь указанным) одно или несколько из следующих: карцинома, включая карциному мочевого пузыря, молочной железы, толстой кишки, почки, печени, легких, яичников, поджелудочной железы, желудка, шейки матки, щитовидной железы и кожи; включая плоскоклеточный рак; гемопоэтические опухоли лимфоидной линии, включая лейкоз, острый лимфолейкоз, острый лимфобластный лейкоз, В-клеточную лимфому, Т-клеточную лимфому, лимфому Беркетта; гемопоэтические опухоли миелоидного происхождения, включая острые и хронические миелогенные лейкозы и промиелоцитарный лейкоз; опухоли мезенхимального происхожде
- 11 045813 ния, включая фибросаркому и рабдомиосаркому; другие опухоли, включая меланому, семиному, тетратокарциному, нейробластому и глиому; опухоли центральной и периферической нервной системы, включая астроцитому, нейробластому, глиому и шванномы; опухоли мезенхимального происхождения, включая фибросаркому, рабдомиосаркому и остеосаркому; и другие опухоли, включая меланому, пигментную ксенодерму, кератоактантому, семиному, фолликулярный рак щитовидной железы и тератокарциному. Также предполагается, что раковые заболевания, вызванные аберрациями апоптоза, также можно лечить способами и композициями по настоящему изобретению. Такие виды рака могут включать, но не ограничиваясь указанным, фолликулярные лимфомы, карциномы с мутациями р53, гормонозависимые опухоли молочной железы, простаты и яичников, а также предраковые поражения, такие как семейный аденоматозный полипоз и миелодиспластические синдромы. В конкретных вариантах реализации злокачественные или диспролиферативные изменения (такие как метаплазии и дисплазии) или гиперпролиферативные расстройства лечат или предотвращают способами и композициями по настоящему изобретению в яичниках, мочевом пузыре, молочной железе, толстой кишке, легких, коже, поджелудочной железе или матке. Раком также может быть саркома, меланома или лейкемия.
Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно использовать в комбинации с одним или несколькими другими видами противоопухолевой терапии, включая, но не ограничиваясь, современные стандартные и экспериментальные химиотерапии, гормональные терапии, биологические методы лечения, иммунотерапии, лучевые терапии или хирургическое вмешательство. В некоторых вариантах реализации анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно вводить в сочетании с терапевтически или профилактически эффективным количеством одного или нескольких агентов, терапевтических антител или других агентов, известных специалистам в данной области для лечения и/или профилактика рака, аутоиммунного заболевания, инфекционного заболевания или интоксикации. Такие агенты включают, например, любые из обсуждаемых выше модификаторов биологического ответа, цитотоксины, антиметаболиты, алкилирующие агенты, антибиотики или антимитотические агенты, а также иммунотерапевтические средства.
Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно использовать в комбинации с одним или несколькими противоопухолевыми иммунотерапевтическими средствами. Противоопухолевые иммунотерапевтические средства могут включать молекулы, которые нарушают или усиливают альтернативные иммуномодулирующие пути (такие как TIM3, TIM4, ОХ40, CD40, GITR, 4-1-ВВ, В7-Н1, PD-1, B7-H3, В7-Н4, LIGHT, BTLA, ICOS, CD27 или LAG3) или модулируют активность эффекторных молекул, таких как цитокины (например, IL-4, IL-7, IL-10, IL-12, IL-15, IL-17, GF-beta, IFNg, Flt3, BLys) и хемокины (например, CCL21), с целью усиления иммуномодулирующих эффектов. Конкретные варианты реализации включают биспецифическое антитело, содержащее анти-CD24 антитело или его связывающий фрагмент и анти-PD-1 (пембролизумаб (Keytruda®) или ниволумаб (Opdivo®)), анти-В7-Н1 (атезолизумаб (Tecentriq®) или дурвалумаб), анти-В7-Н3, анти-В7-Н4, анти-LIGHT, анти-LAG3, антиTIM3, анти-TIM4, анти-CD40, анти-ОХ40, анти-GITR, анти-BTLA, анти-CD27, анти-ICOS или анти-41ВВ. В еще одном варианте осуществления анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно вводить в комбинации с молекулами, которые активируют различные стадии или аспекты иммунного ответа, чтобы достичь более широкого иммунного ответа. В более предпочтительном варианте осуществления анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно комбинировать с анти-PD-1 или анти-4-1ВВ антителами без усиления аутоиммунных побочных эффектов.
10. Получение.
Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно получить с использованием эукариотической системы экспрессии. Система экспрессии может включать экспрессию с вектора в клетках млекопитающих, таких как клетки яичника китайского хомячка (СНО). Система также может представлять собой вирусный вектор, такой как дефектный по репликации ретровирусный вектор, который можно использовать для инфицирования эукариотических клеток. Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент также можно продуцировать в стабильной клеточной линии, которая экспрессирует антитело с вектора или части вектора, интегрированной в клеточный геном. Стабильная клеточная линия может экспрессировать антитело с интегрированного ретровирусного вектора, дефектного по репликации. Система экспрессии может представлять собой GPExTM.
Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно очистить, используя, например, хроматографические методы, такие как аффинная хроматография, ионообменная хроматография, хроматография гидрофобного взаимодействия, DEAE-ионообмен, гель-фильтрация и хроматография на гидроксиапатите. В некоторых вариантах реализации слитые белки могут быть сконструированы так, чтобы они содержали дополнительный домен, содержащий аминокислотную последовательность, которая позволяет полипептидам захватываться аффинной матрицей. Например, описанные в данном документе антитела, содержащие Fc-область иммуноглобулинового домена, могут быть выделены из супернатанта клеточной культуры или цитоплазматического экстракта с использованием колонки с протеином А. Кроме того, для облегчения очистки полипептида можно использовать метку, такую как c-myc, гемагглютинин, полигистидин или Flag™ (Kodak). Такие метки могут быть вставлены в любом месте по
- 12 045813 липептида, включая карбоксильный или аминный конец. Другие слияния, которые могут быть полезны, включают ферменты, которые помогают в обнаружении полипептида, такие как щелочная фосфатаза. Иммуноаффинная хроматография также может использоваться для очистки полипептидов. Вакцины
В настоящем документе предложен способ лечения рака или обеспечения профилактики рака, описанного в настоящем документе, у пациента. С помощью этого метода можно вакцинировать пациента от рака. Способ может включать введение композиции, содержащей последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48, пациенту, нуждающемуся в этом. Композицию также можно вводить пациенту, нуждающемуся в лечении побочных эффектов, связанных с терапией, включающем использование анти-CD24 антитела или клеток, экспрессирующих рецепторы, связывающие CD24. Композиция также может быть использована при производстве лекарственного средства для лечения рака или обеспечения профилактики рака.
11. Фармацевтические композиции.
В настоящем документе предложена фармацевтическая композиция, содержащая терапевтически эффективное количество любого из описанных выше анти-CD24 антител, клеточных терапевтических средств или пептидных композиций и физиологически приемлемый носитель или вспомогательное вещество. Фармацевтическая композиция может содержать профилактически или терапевтически эффективное количество анти-CD24 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента и фармацевтически приемлемый носитель. В конкретном варианте осуществления термин фармацевтически приемлемый означает одобренный регулирующим органом федерального правительства или правительства штата или перечисленный в Фармакопее США или другой общепризнанной фармакопее для применения у животных и, более конкретно, у людей. Термин носитель относится к разбавителю, адъюванту (например, адъюванту Фрейнда (полный и неполный), вспомогательному веществу или несущей среде, с которыми вводится терапевтическое средство. Такие фармацевтические носители могут быть стерильными жидкостями, такими как вода и масла, в том числе нефтяного, животного, растительного или синтетического происхождения, такие как арахисовое масло, соевое масло, минеральное масло, кунжутное масло и т.д. Вода является предпочтительным носителем, когда фармацевтическая композиция вводится внутривенно. Солевые растворы и водные растворы декстрозы и глицерина также могут быть использованы в качестве жидких носителей, особенно для инъекционных растворов. Подходящие фармацевтические вспомогательные вещества включают крахмал, глюкозу, лактозу, сахарозу, желатин, солод, рис, муку, мел, силикагель, стеарат натрия, моностеарат глицерина, тальк, хлорид натрия, сухое обезжиренное молоко, глицерин, пропилен, гликоль, вода, этанол и т.д. Фармацевтическая композиция, если желательно, может также содержать незначительные количества смачивающих или эмульгирующих агентов или рНбуферов. Эти композиции могут принимать форму растворов, суспензий, эмульсии, таблеток, пилюль, капсул, порошков, составов с замедленным высвобождением и т.п.
Как правило, ингредиенты фармацевтической композиции могут поставляться либо отдельно, либо в смеси в единичной дозированной лекарственной форме, например в виде сухого лиофилизированного порошка или безводного концентрата в герметично закрытом контейнере, таком как ампула или саше, с указанием количества активного агента. Если фармацевтическую композицию следует вводить путем инфузии, ее можно отпускать с бутылкой для инфузии, содержащей стерильную воду или физиологический раствор фармацевтического качества. Когда фармацевтическая композиция вводится путем инъекции, может быть предоставлена ампула стерильной воды для инъекций или физиологического раствора, чтобы ингредиенты можно было смешать перед введением. Фармацевтическая композиция может быть получена в нейтральной или солевой формах. Фармацевтически приемлемые соли включают, но не ограничиваясь указанным, соли, образованные с такими анионами, как происходящие из соляной, фосфорной, уксусной, щавелевой, винной кислот и т.д., и соли, образованные с такими катионами, как происходящие из гидроксидов натрия, калия, аммония, кальция, железа, изопропиламина, триэтиламина, 2этиламиноэтанола, гистидина, прокаина и т.д.
12. Способы введения.
Способы введения составов и их фармацевтических композиций включают, но не ограничиваясь указанным, парентеральное введение (например, внутрикожное, внутримышечное, внутрибрюшинное, внутривенное и подкожное), эпидуральное и мукозальное (например, интраназальный и пероральный пути). В конкретном варианте осуществления композиция вводится внутримышечно, внутривенно или подкожно. Композицию можно вводить любым удобным путем, например инфузией или болюсной инъекцией, путем абсорбции через эпителиальные или кожно-слизистые оболочки (например, слизистую оболочку полости рта, слизистую оболочку прямой и кишки и т.д.) и можно вводить совместно с одним или несколькими другими биологически активными веществами. Введение может быть системным или местным.
Примеры
Раскрытие изобретения имеет множество аспектов, проиллюстрированных следующими неограничивающими примерами.
Пример 1. Синтез моноклональных антител к гипогликозилированному CD24.
Сверхэкспрессия NEU1 и CD24 в опухолях предполагает нарушение регуляции гликозидазы. На
- 13 045813 рушение регуляции гликозидазы предполагает, что CD24, подобно MUC1, может быть гипогликозилирован в опухолях. Связывание антитела, 3В6, с CD24 затрудняется гликанами сиаловой кислоты (фиг. 1). По сравнению с коммерчески доступным анти-CD24 антителом, ML5 (BD bioscience), 3B6 прочно связывает N-SA-CD24 и N-SA-O-CD24, но всего лишь слабо N-CD24 или полностью гликозилированный CD24, как обнаружено с помощью ELISA. Это свидетельствовало о том, что эпитопы, которые связывает 3В6, действительно являются белковым остовом, и что связыванию 3В6 препятствует гликозилирование эпитопа. Результаты сортировки клеток с активированной флуоресценцией (FACS) и иммунофлуоресцентного (IFA) окрашивания показывают, что 3В6 связывает множество линий раковых клеток, включая нейробластому и медуллобластому (фиг. 2А-В). 3В6 связывает клеточные линии нейробластомы IMR32, SK-N-SH, SH-SY5Y, SK-N-BE(2) и SK-N-BE(2)C, но не SK-N-AS (фиг. 2А). 3В6 также связывает 3 из 4 опухолей медуллобластомы, полученных от пациентов, по оценке IFA окрашивания (фиг. 2В). Эти данные указывают на то, что 3В6 способен связывать линии раковых клеток и опухолей.
Пример 2. Созревание аффинности.
Аффинность связывания 3В6 с CD24 была значительно ниже по сравнению с коммерческими антителами ML5 (BD Bioscience) и SN3 (Thermo Fisher). Для увеличения аффинности и специфичности связывания 3В6 с его антигеном проводили созревание аффинности 3В6. Сначала клонировали тяжелую (IgH) и легкую (IgL) цепи антитела 3В6 и идентифицировали последовательность вариабельной области Ig следующим образом: 3В6 IgH (SEQ ID NO: 1, CDR выделены подчеркнутым и полужирным шрифтом) EVKFEESGGGLVQPGGSIKLS CAASGVTFSEAWMDWVRO SPEKGLEWVAEI
RDKTKNYVTYYAESVKGRFTISRDDSKSRVYLOMNNLRTEDTGIYYCTGA
MDYWGOGTSVTVSS
3В6 IgL (SEQ ID NO: 2, CDR выделены подчеркнутым и полужирным шрифтом) DIVMTOTPLSLSVTIGOPASISCKSSOSLLYSNGKTYLNWLOORPGOSPKRLI
YQVSKLDPGIPDRFSGSGSETDFTLKISRVEAEDLGIYYCLQGTSYPWTFGG
GTKLEIK
Фрагменты VH и VL исходного антитела 3В6 были преобразованы в формат scFv и клонированы в вектор фагового дисплея. ScFv моновалентно отображался на фаге, что позволяло отобрать клоны фага с более высокой аффинностью. Чтобы проверить уровень отображения scFv, scFv был слит с тегом обнаружения Flag-6xHis. ELISA на фаге выполняли для проверки связывания родительского антитела с антигеном в формате фагового дисплея. Сигнал связывания от фагового супернатанта был значительным, и проект перешел к созданию библиотеки.
Было проведено три раунда отбора и скрининга. Снижение концентраций антигена CD24-GST и биотинилированного CD24-GST использовали при скрининге для отбора клонов с более высоким связыванием. Отобрали 48 клонов из каждой библиотеки мутагенеза CDR, культивировали, проанализировали на связывание и секвенировали. После подтверждения последовательностей клонов scFv с созревшей аффинностью, scFv клонов с созревшей аффинностью переформатировали в полноразмерные гены антител и временно экспрессировали в клетках млекопитающих. Все антитела с созревшей аффинностью получали в мелких сериях 0,01 л. Исходное антитело также было наработано для прямого сравнения. Плазмиды для указанных тяжелых и легких цепей (табл. 1) трансфицировали в суспензионные клетки HEK293 с использованием сред с химически определенным составом в отсутствие сыворотки для получения антител. Через пять дней после трансфекции кондиционированные среды собирали и осветляли. Целые антитела в кондиционированной среде очищали с использованием среды MabSelect SuRe Protein A (GE Healthcare).
- 14 045813
Таблица 1
Антитела, продуцируемые в клетках HEK293 посредством временной трансфекции и очищенные с помощью IgG1
Родительское С созревшей аффинностью, панель 1 С созревшей аффинностью, панель 2
РР6226 - H4040+L4040 анти- CD24 РР6228 - H4041+L4040 Р3050.Н1.А4 РР6368 - H4069+L4069 P3050.ComFl.All
РР6230- H4042+L4040 Р3050.Н2.А7 РР6369 - H4070+L4069 P3050.ComFl.H4
РР6231 - H4043+L4040 Р3050.Н2.В11 РР6370 - H4071+L4069 P3050.ComFl.2F4
РР6232- H4040+L4041 P3050.L3.B9 Р6371 - H4072+L4070 P3050.ComFl.2F5
РР6233- H4040+L4042 P3050.L3.C7 РР6372 - H4073+L4071 P3050.ComFl.C9
РР6234- H4040+L4043 P3050.L3.D8 РР6373 - H4069+L4071 P3050.ComFl.2Hl
РР6235- H4041+L4042 P3050.H1.A4.L3.C7 РР6387 - H4071+L4071 P3050.ComF2.Bl
РР6236- H4043+L4042 P3050.H2.B11.L3.C7 РР6388- H4072+L4069 P3050.ComF2.A5
Таблица: Список временной трансфекции и очистки, проведенной для получения IgG. Н40хх означает конструкцию тяжелой цепи, a L40xx - конструкцию легкой цепи. Р3050.хх обозначает исходный клон, полученный в результате пэннинга фага. Все IgG хорошо экспрессировались. Номера РР представляют собой серийные коды, используемые для различения продуцируемых белков.
Очищенные антитела с созревшей аффинностью и исходное антитело оценивали на их аффинность к антигену с помощью конкурентного ELISA. Антитело РР6226 (родительские вариабельные области 3В6) наносили на планшеты в концентрации 2 мкг/мл. Антитела с созревшей аффинностью сначала инкубировали с CD24-GST, затем инкубировали на планшете с последующей инкубацией антител для вторичной детекции. Как показано на фиг. 3-5, получено 16 антител с различной способностью конкурировать со своими родительскими клонами. Аминокислотные последовательности тяжелой и легкой цепей этих антител представляют собой SEQ ID NO: 3-10 (тяжелые цепи) и SEQ ID NO: 11-16 (легкие цепи). Чтобы определить, имеют ли клоны с созревшей аффинностью более сильное связывание с CD24, и регулируются ли взаимодействия гликаном, была произведена обработка CD24 либо N-гликаназой (NCD24), либо сиалидазой NanA (SA-CD24), либо обоими ферментами (N-SA-CD24). 16 клонов, описанных на фиг. 3-5, были протестированы с помощью ELISA. Как показано на фиг. 6, несмотря на значительную аффинность к CD24-GST, PP6231 и РР6230 не могут связываться с CD24, экспрессируемым клетками млекопитающих, независимо от гликозилирования. С другой стороны, большинство других клонов сохраняли преимущественное связывание с CD24, которые обрабатывались сиалидазой и/N-гликаназой. Тем не менее, поскольку относительное влияние сиалидазы и N-гликаназы на связывание антител значительно различается для разных клонов, каждый клон необходимо тестировать индивидуально, чтобы определить их чувствительность к гликановому экранированию.
Было выбрано 6 клонов с сильным связыванием SA-N-CD24, но которые проявляют минимальное связывание с CD24, и они были протестированы на связывание с двумя линиями раковых клеток, линией клеток рака легкого Н727 и линией клеток нейробластомы IMR32. Как показано на фиг. 7, несмотря на сходство их связывания с SA-N-CD24, 6 клонов показали значительно различающееся связывание с раковыми клетками. Важно отметить, что РР6373 демонстрирует значительно более сильное связывание с обеими протестированными линиями раковых клеток. Поэтому этот клон выбран для дальнейшего изучения. Последовательность тяжелой цепи РР6373 указана в SEQ ID NO: 6, а последовательность легкой цепи указана в SEQ ID NO: 16. По сравнению с исходной последовательностью тяжелая цепь имеет три мутации в CDR2, тогда как легкая цепь имеет одну мутацию в CDR3 легкой цепи. Как показано на фиг. 8, эти мутации не только увеличивают связывание с SA-N-CD24 почти в 100 раз, но также делают взаимодействие более строго регулируемым посредством десиалилирования. Также следует отметить, что РР6373 приобрел способность связываться с CD24 даже без дегликозилирования на уровне 1/1000 от уровня SA-N-CD24. Однако, поскольку известно, что клетки СНО имеют неполное гликозилирование, вполне вероятно, что связывание отражает более высокую чувствительность антитела к обнаружению минорной гликоформы в рекомбинантном CD24, полученном из клеток СНО.
Пример 3. Антигенный эпитоп, распознаваемый 3В6 и РР6373.
Чтобы определить антигенный эпитоп, распознаваемый 3В6, и клон РР6373 с созревшей аффинно
- 15 045813 стью, были синтезированы перекрывающиеся пептиды, покрывающие зрелую аминокислотную последовательность CD24 (SEQ ID NO: 42), и предварительно инкубировали их с антителом 3В6 перед добавлением 3В6 на планшеты, предварительно покрытые белком NO' CD24 (CD24Fc, предварительно обработанный последовательно N-гликозидазой, NanA и О-гликозидазой). Как показано на фиг. 9, из 5 протестированных пептидов (SEQ ID NO: 43-47) только пептид 4 (SEQ ID NO: 46) демонстрирует значительное блокирование взаимодействия 3B6-CD24, что позволяет предположить, что эпитоп, связывающий CD24, заключен в этой последовательности. Чтобы подтвердить, что РР6373 распознает один и тот же эпитоп, титровали пять пептидов в большом диапазоне доз. Как показано на фиг. 10, только пептид 4 показал дозозависимое ингибирование связывания РР6373 с SA-N-CD24.
Чтобы определить минимальный сайт связывания РР6373, проводили усекание пептида 4 по одной аминокислоте за раз и сравнивали его ингибирование связывания РР6373 с SA-N-CD24. Как показано на фиг. 11, в то время как делеция 3 аминокислот с С-конца устраняет ингибирование, делеция одной или двух аминокислот значительно улучшает ингибирование (левая панель). Кроме того, удаление любой аминокислоты с N-конца пептида 4 также устраняет ингибирование (правая панель). Эти данные идентифицируют SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48) как оптимальный эпитоп, распознаваемый РР6373. Произведенная идентификация антигенного эпитопа позволяет генерировать дополнительные антитела с аналогичными свойствами. В одном варианте осуществления можно генерировать новые антитела, используя синтетический пептид, содержащий последовательность SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48). Пептид может быть связан с другим иммуногенным белком-носителем или использоваться вместе с адъювантами. В другом варианте осуществления пептид можно использовать для идентификации других анти-CD24 mAb, которые распознают тот же эпитоп, для генерации ракоспецифичных антител для диагностики и лечения рака. В еще одном варианте осуществления антигенный пептид можно использовать для нейтрализации или ингибирования потенциальных неблагоприятных эффектов, связанных с антителами, которые связываются с эпитопами, содержащими коровую последовательность SEQ ID NO: 48. Пептид может быть модифицирован для лучшей стабильности при применении in vivo с использованием способов известных в данной области, включая, но не ограничиваясь этим, использование D-аминокислот, замену О на S в одной или нескольких пептидных связях, добавление последовательности слияния для улучшения растворимости или периода полужизни (например, слияния альбумина). В еще одном варианте осуществления молекула, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48, может быть использована в качестве вакцины для лечения и профилактики рака.
Пример 4. Экспрессия антигенного эпитопа в нормальных тканях по сравнению со злокачественными.
Чтобы определить, представлен ли эпитоп, распознаваемый РР6373, преимущественно в раковых тканях по сравнению с нормальными тканями, было проанализировано связывание тканей с помощью иммунофлуоресценции с использованием биотинилированного РР6373. Данные о нормальных тканях обобщены в табл. 2, а данные о раковых тканях - в табл. 3. Кроме того, было оценено связывание антитела с нормальным доброкачественным и злокачественным раком головного мозга. Данные представлены в табл. 4.
Таблица 2 Иммунофлуоресцентное окрашивание РР6373 показало минимальное связывание с нормальными тканями
Орган +/- Паттерн окрашивания
Нормальный желудок -
Нормальная двенадцатиперстная кишка -
Нормальный тонкий кишечник -
Нормальная толстая кишка -
Нормальная околоушная слюнная железа -
Нормальная щитовидная железа -
Нормальная поджелудочная железа + Слабо - клеточная поверхность, внутриклеточное?
Нормальная простата -
Нормальная аорта -
Нормальное яичко -
Нормальный большой сальник -
- 16 045813
Нормальная молочная железа -
Нормальный лимфатический узел -
Нормальная кожа -
Нормальный продолговатый мозг
Нормальная селезенка - Мало положительных, клеточная поверхность?
Нормальная матка -
Нормальное влагалище -
Нормальный мочевой пузырь -
Нормальный нерв -
Таблица 3
Реактивность РР6373 к злокачественным тканям
Орган Процент положительных Паттерн окрашивания
Злокачественная толстая кишка 0/1
Злокачественный пищевод 0/1
Злокачественный желудок 0/2
Злокачественный яичник 16/25 поверхность клетки
Злокачественные мягкие ткани 0/1
Злокачественная почка 1/1 поверхность слабо
Злокачественная печень 14/19 поверхность клетки
Злокачественная молочная железа 12/20 поверхность клетки
Злокачественная кожа 1/1 поверхность клетки
Злокачественное яичко 1/1 внутриклеточное/клеточная поверхность
Злокачественное легкое 11/39 поверхность клетки
Таблица 4
Связывание РР6373 с нормальными доброкачественными и злокачественными опухолями головного мозга
Патология поверхность клетки внутри клетки отрицательно
Астроцитома 2/24 (8%) 17/24 (71%) 5/24 (21%)
Глиобластома 3/8 (38%) 2/8 (25%) 5/8 (37%)
Олигодендроглиома 4/8 (50%) 3/8 (38%) 1/8 (12%)
Эпендимома 5/8 (63%) 0/8 (0%) 3/8 (37%)
Медуллобластома 7/10 (70%) 0/10(0%) 3/10(30%)
Доброкачественная менингиома 0/22 (0%) 15/22 (68%) 7/22 (32%)
Нормальная ткань ЦНС 0/16(0%) 0/16(0%) 16/16(100%)
Как показано в табл. 2, за исключением поджелудочной железы и, возможно, селезенки, РР6373 не окрашивал нормальные ткани. Следует отметить, что большая часть окрашивания поджелудочной железы является внутриклеточной. В селезенке окрашивание клеток было редким. Напротив, как показано в табл. 3, большинство протестированных видов рака демонстрируют сильное связывание с РР6373. Как показано в табл. 4, в то время как нормальные ткани ЦНС лишены CD24, доброкачественная менингиома проявляет внутриклеточное окрашивание, но не проявляет окрашивание поверхности клетки. Важно отметить, что злокачественные опухоли головного мозга, включая астроцитому, глиобластому и олигодендроглиому, демонстрируют окрашивание клеточной поверхности в количестве 8-70%, кроме того, некоторые раковые ткани обнаруживают внутриклеточное окрашивание.
В одном из вариантов реализации РР6373 можно использовать для различения злокачественной опухоли мозга от нормальной или доброкачественной ткани мозга. В другом варианте реализации РР6367 можно использовать для идентификации раковых тканей в плотных органах, таких как печень, легкие, молочные железы и яичники.
Пример 5. РР6373 замедляет рост рака легких in vivo.
Чтобы проверить, может ли РР6373 замедлять рост опухоли in vivo, голых мышей заражали клеточной линией рака легких человека Н727 подкожно. После того, как опухоль стала пальпироваться, мышам, несущим опухоль, сделали две инъекции РР6373 в дозе 5 мг/кг (14 и 21 день после инокуляции Н727). Как показано на фиг. 12, по сравнению с контролем IgG, опухоль, обработанная РР6373, росла значительно медленнее. Эти данные демонстрируют, что немодифицированный РР6373 способен проявлять противоопухолевую активность in vivo.
В соответствии с задержкой развития опухоли in vivo, исследования in vitro демонстрируют, что
- 17 045813
РР6367 опосредует сильную антителозависимую клеточную цитотоксичность, как показано на фиг. 13.
Поскольку на ADCC влияет гликозилирование, особенно фукозилирование, был использован инжиниринг антител для получения РР6373 без фукозилирования ядра FC (d6373). Как показано на фиг. 14, фукозилирование увеличивает ADCC-активность РР6373. Представленные данные показывают, что РР6373 можно использовать для лечения рака. В одном варианте осуществления РР6373 WT IgG1 можно использовать в качестве терапевтических антител против рака для введения больным раком. В другом варианте осуществления антитело может быть получено гликоинженерией либо химически, либо продуцировано в клеточной линии, лишенной фукозилтрансферазы.
Пример 6. Биспецифические антитела на основе последовательности РР6373 и OKT3.
Для применения анти-CD24 антитела были получены биспецифические антитела, которые связывают как CD24, так и CD3. В одном варианте осуществления анти-CD24 и анти-CD3 (OKT3) антитела превращают в одноцепочечные антитела с реактивностью к CD24 и CD3, соответственно, и связывают гибкой линкерной последовательностью GGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 49). Последовательность одноцепочечного антитела РР6373 указана в SEQ ID NO: 17, а одноцепочечная последовательность OKT3 указана как SEQ ID NO: 18.
В одном варианте осуществления биспецифическое антитело создают с помощью технологии выступа и впадины, в которых два партнера биспецифической молекулы имеют комплементарные мутации в области Fc для создания выступа и впадин для облегчения образования биспецифических гетеродимеров. Последовательности вариантов выступов и впадин РР6373 и OKT3 перечислены в SEQ ID NO: 1922. Чтобы оценить биспецифичность различных конфигураций выступов и впадин, был разработан анализ, состоящий из окрашивания клеток Jurkat продуктом котрансфекции различных продуктов, полученных с технологией выступа-впадины. Вкратце, клетки CD3+ Jurkat сначала окрашивали супернатантами тканевых культур из трансфицированных клеток 293Т. После смывания несвязавшихся антител клетки инкубировали с биотинилированным SA-N-CD24. Количество SA-N-CD24 на клетках Jurkat определяли с помощью РЕ-стрептавидина. Как показано на фиг. 15, комбинация РР6373-впадина и ОКТЗ-выступ дает наивысшее связывание CD24 с клетками Jurkat, что указывает на то, что пара РР6373-впадина и ОКТЗ-выступ является наиболее подходящей для стратегии выступ-впадина.
В другом варианте осуществления биспецифическое антитело создают посредством тандемного повтора двух одноцепочечных связывающих мотивов. И в этот раз тоже сравнили активность двух конфигураций с разными связывающими мотивами в противоположных порядках, РР6373-ОКТ3 и OKT3РР6373, как указано в SEQ ID NO: 23 и 24, соответственно. Как показано на фиг. 16, конструкция с одной цепью РР6373 на N-конце (РР6З7З-ОКТЗ; SEQ ID NO: 23) показывает более высокую биспецифическую активность. Чтобы определить, обладает ли биспецифическое антитело противоопухолевой активностью, совместно инкубировали линию клеток рака легкого Н727 с Т-клетками, которые были активированы с помощью анти-CD3 и анти-CD28 в течение 2 дней. Сначала проверили, может ли раковая клетка специфично запускать выработку цитокинов. Как показано на фиг. 17, значимые цитокины индуцируются биспецифическим антителом, но не OKT3-Fc PP6373-Fc. Что важнее, биспецифическое антитело не индуцирует продукцию цитокинов, если и Т-клетки, и опухолевые клетки не присутствуют вместе. Эти данные демонстрируют, что биспецифические антитела запускают активацию Т-клеток, задействуя как Т-клетки, так и опухолевые клетки.
Одновременно с анализом высвобождения цитокинов также оценили цитотоксичность опухолевых клеток с помощью основанного на микрочастицах подсчета количества живых опухолевых клеток, меченных красителем, методом проточной цитометрии. Как показано на фиг. 18, биспецифические антитела вызывают потерю опухолевых клеток, если и только если присутствуют Т-клетки.
В еще одном варианте биспецифическое антитело может быть получено с помощью технологии FIT-Ig. Вкратце, биспецифическое антитело образуется совместной экспрессией трех конструкций, кодирующих VL6373-CL-VHokt3-CH1-FC (SEQ ID NO: 25), VH6373-CH1 (SEQ ID NO: 26) и VLokt3-CL (SEQ ID NO: 27), соответственно. Как показано на фиг. 19, FIT-Ig-антитело показало хорошие активности биспецифического связывания как для OKT3, так и для SA-N-CD24. В дополнение к связыванию также было обнаружено, что это биспецифическое антитело вызывает значительный цитокиновый ответ (фиг. 20) и цитотоксичность по отношению к опухолевым клеткам (фиг. 21). Кроме того, это биспецифическое антитело (FIT-Ig) показало более высокую термостабильность по сравнению с предыдущими биспецифическими антителами РР6373-ОКТ3 и ОКТ3-РР6373 (фиг. 22).
Пример 7. Применение РР6373 в Т-клетках, модифицированных химерным рецептором антигена (CAR) (CAR-Т), для лечения рака.
Ahtu-CD24 антитела реагируют с широким спектром раковых клеток и могут быть использованы для получения химерного рецептора антигена, который придает противораковую активность Т-клеткам. В одном варианте осуществления одноцепочечная последовательность Fv PP6373 (SEQ ID NO: 28) или другое одноцепочечное анти-CD24 mAb (alphaCD24SC) вставляют в вектор CAR-Т, известный в данной области, как показано на фиг. 23. Конструкцию затем вставляют в генные векторы, известные в данной области, включая векторы, полученные из ретровируса, лентивируса, аденоассоциированного вируса или аденовирусных векторов.
- 18 045813
Чтобы проверить активность CAR, РВМС от здорового донора были обогащены Т-клетками с использованием набора для выделения пан-Т-клеток человека (Miltenyl Biotec) (сутки 0). Пан-Т-клетки человека стимулировали с помощью анти-CD3 и анти-CD28 в течение 24 ч и культивировали с IL-2 в течение 2 суток. Активированные Т-клетки подвергали ложной обработке (контроль Т) или инфицировали лентивирусом, несущим CD24-CAR (сутки 2). Для тестирования противоопухолевой активности CAR-T контрольные Т-клетки или CD24 CAR-T-клетки культивировали совместно с опухолевыми клетками, меченными CellTrace Violet (Thermo Fisher), в течение ночи. Лизис опухолевых клеток измеряли окрашиванием Fixable Viability Dye eFluor™ 660 (eBioscience) и рассчитывали по формуле:
Лизис% = (мертвые% - автолиз%)/(1-автолиз%).
Как показано на фиг. 24, в широком диапазоне соотношения эффектор/мишень (Е/Т) CD24 CAR-T проявляет сильную цитотоксичность по сравнению с линией клеток рака легкого А549.
Чтобы проверить, активируется ли CAR-T раковыми клетками, инкубировали 4х104 CAR-T или контрольные Т-клетки с опухолевыми клетками А549 в течение ночи и измерили IFNy в супернатантах. Как показано на фиг. 25, CAR-T, но не контрольные Т-клетки, продуцировали IFNy в ответ на стимуляцию опухолевыми клетками А549.
Поскольку CD24 широко экспрессируется среди множества типов рака. Как показано на фиг. 26, CD24 CAR-T проявляет широкую цитотоксичность в отношении многих типов рака, включая рак легкого, рак молочной железы, рак простаты, рак шейки матки, нейробластому и глиому.
В совокупности, представленные данные демонстрируют, что CD24 CAR-T на основе раскрытого в данном документе антитела имеет большой потенциал в лечении рака. Типы рака, на которые можно воздействовать, включают, помимо прочего, опухоли головного мозга, рак головы и шеи, саркому, рак легкого, рак желудочно-кишечного тракта, рак молочной железы, рак яичка, рак простаты, рак поджелудочной железы, рак печени или гематологические злокачественные новообразования.
Пример 8. Гуманизация РР6373 для лечения рака.
Модель гомологии Fv PP6373 была построена с использованием структуры pdb 4PB0 в качестве модельной структуры. И VH, и VL имеют более 90 % гомологии с таковыми у 4РВ0. При запросе базы данных человеческого Ig, последовательность V-области человеческой зародышевой линии IGHV3-73*01 и последовательность J-области IGHJ4*01 были идентифицированы как подходящие структуры и использовались как человеческая акцепторная каркасная область для CDR-областей тяжелой цепи (Onc-1 VH). V-область человеческой зародышевой линии IGKV2-29*02 и последовательность J-области IGKJ4*01 применяли в качестве человеческого акцепторного каркаса для CDR-областей легкой цепи (Onc-1 VL). Были сконструированы четыре последовательности VH и четыре последовательности VL (SEQ ID NO: 29-36). Новые продукты улучшают показатели гуманизации с 73 % до более 83 % в VH и с 80 % до более 83 % в VL. Структурное выравнивание мышиного Fv PP6373 и Fv гуманизированной версии РР6373 (huVHv1VLv1; SEQ ID NO: 29 и 33) продемонстрировало высокую степень сходства (фиг. 27). Чтобы выбрать лучшую рабочую комбинацию HuVH и HuVL для связывания CD24, различные комбинации подвергали совместной трансфекции в клетки 293 в течение 72 ч. Затем проводили два ELISA с экспрессионной средой. ELISA 1: 96-луночный планшет покрывали очищенным козьим античеловеческим поликлональным IgG (GAH) и после блокирования добавляли экспрессионную среду или очищенные контрольные IgG, и использовали козье античеловеческое антитело IgG-HRP в качестве детектирующего антитела. ELISA 2: 96-луночный планшет покрывали белком CD24-GST и после блокирования добавляли экспрессионную среду или очищенные контрольные IgG, и в качестве детектирующего антитела использовали козий античеловеческий IgG-HRP. Если рассматривать связывание химерного антитела РР6373 как 100% в обоих ELISA, различные комбинации VH и VL, проявляющие разную степень связывания, будут сравниваться с таковыми химерного антитела и ранжироваться по относительному связыванию (кандидаты, выбранные после предварительного скрининга, будут сравниваться еще раз после очистки). Данные первого раунда предварительного скрининга суммированы на фиг. 28, и данные этого эксперимента свидетельствуют о том, что: a) L3 показал высокую связывающую способность на единицу белка, что сделало L3 кандидатом; и b) H1L3 (SEQ ID NO: 29 и 35), H2L3 (SEQ ID NO: 30 и 35), H3L3 (SEQ ID NO: 31 и 35) и H4L3 (SEQ ID nO: 32 и 35) -четыре кандидата гуманизации для РР6373.
Чтобы проверить, сохраняют ли антитела-кандидаты H2L3 и H3L3 свою способность связывать опухолевые клетки, биотинилировали гуманизированные антитела наряду с РР6373. Как показано на фиг. 29, хотя РР6373 имел лучшее связывание с двумя протестированными раковыми клетками человека, как H2L3, так и H3L3 демонстрируют сильное связывание в наномолярном диапазоне IC50.
Проводили анализы ADCC с использованием либо PBL (фиг. 30, 31) или очищенных NK-клеток (фиг. 32) из PBL в качестве эффекторов и клеток А549 в качестве клеток-мишеней. Удивительно, что хотя H2L3 и H3L3 хуже связываются с опухолевыми клетками (фиг. 29), они являются более мощными эффекторами в ADCC при использовании низкой концентрации антител (фиг. 30). Как и ожидалось, дефукозилированный РР6373 (d6373) более активен в ADCC (фиг. 31, 32).
В совокупности, представленные здесь данные продемонстрировали, что гуманизированные клоны РР6373 проявляют значительное связывание с раковыми клетками человека и неожиданно высокую ак
-

Claims (13)

  1. тивность ADCC. В одном варианте осуществления антитела можно использовать для лечения рака. В другом варианте гуманизированное антитело можно использовать в качестве ключевого компонента биспецифического антитела. Чтобы исследовать эту активность, создали две конструкции, содержащие Н3 и L3, для получения биспецифических антител на основе технологии FIT-Ig. Последовательности гуманизированных FIT-Ig-антител перечислены в SEQ ID NO: 37 и 38 и используются вместе с SEQ ID NO: 27. Кроме того, также внесли некоторые мутации для оптимизации гуманизированных последовательностей FIT-Ig, и они были перечислены в SEQ ID NO: 39-41. В частности: все три последовательности содержат сигнальную последовательность на N-конце для очистки и синтеза белка; в SEQ ID NO: 39: мутация (замена D на А) была введена в область Fc для предотвращения ADCC; в SEQ ID NO: 27 есть один дополнительный остаток R между VLOKT3 и CL, появление которого было вызвано сайтом для рестриктазы во время конструирования, а в SEQ ID NO: 41 лишний остаток R был удален.
    В еще одном варианте осуществления гуманизированные антитела можно использовать в качестве ключевого компонента CAR-T для терапии рака с применением способов, известных в данной области.
    Пример 9. Ahtu-CD24 антитела, связывающие экранируемые гликаном эпитопы, не связываются с нормальными клетками с высокой экспрессией CD24.
    Ключевым требованием иммунотерапии на основе антител является минимальная реактивность в нормальных тканях. Поскольку CD24 обильно экспрессируется на гемопоэтических клетках, особенно гранулоцитах, В-клетках, части эритроцитов и части моноцитов, сравнили РР6373 и два его гуманизированных клона, H2L3 и H3L3, с обычными анти-CD24 mAb, ML5. Как показано на фиг. 33, в то время как ML5 демонстрирует сильное связывание с клетками, которые обычно экспрессируют высокие уровни CD24, H2L3 и H3L3 не связываются с В-клетками и эритроцитами и плохо связываются с гранулоцитами. Этот результат демонстрирует минимальное связывание с другими типами клеток, такими как макрофаги, и с фракцией не-В-лимфоцитов.
    ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Ahtu-CD24 антитело для лечения рака, содержащее: (а) вариабельную область тяжелой цепи из последовательности, указанной в SEQ ID NO: 6, и вариабельную область легкой цепи из последовательности, указанной в SEQ ID NO: 16, или (б) вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 31 или 30, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.
  2. 2. Ahtu-CD24 антитело по п.1, где антитело является одноцепочечным.
  3. 3. Ahtu-CD24 антитело по п.1 или 2, содержащее вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 30, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.
  4. 4. Ahtu-CD24 антитело по п.1 или 2, содержащее вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 31, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.
  5. 5. Ahtu-CD24 антитело по любому из пп.1-4, дополнительно включающее константную область (Fc) иммуноглобулина человека.
  6. 6. Биспецифическое антитело для лечения рака, содержащее первый домен антитела, содержащий анти-CD24 антитело по любому из пп.1-5, и второй домен антитела, содержащий второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
  7. 7. Биспецифическое антитело по п.6, где второй домен антитела привлекает иммунные эффекторные Т-клетки к раковым клеткам для иммунотерапии рака и/или связывает CD3, α-цепь TCR (Т-клеточный рецептор), β-цепь TCR, γ-цепь TCR или δ-цепь TCR.
  8. 8. Биспецифическое антитело по п.7, где второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывает CD3.
  9. 9. Биспецифическое антитело по п.8, содержащее второй домен антитела, содержащий последовательность, указанную в SEQ ID NO: 18.
  10. 10. Химерный рецептор антигена, содержащий одноцепочечное антитело по любому из пп.1-5.
  11. 11. Конъюгат антитело-лекарственное средство (ADC), содержащий анти-CD24 антитело по любому из пп.1-5, связанное с эффекторным фрагментом, выбранным из группы, состоящей из цитотоксического лекарственного средства, белкового токсина и радионуклида.
  12. 12. Композиция для лечения рака, содержащая анти-CD24 антитело, как определено в любом из пп.1-5, биспецифическое антитело по любому из пп.6-9, химерный рецептор антигена по п.10 или конъюгат антитело-лекарственное средство по п.11 и второе противораковое средство.
  13. 13. Композиция по п.12, где второе противораковое средство включает анти-PD-1 антитело, антиCTLA-4 антитело или LAG3.
    -
EA202092306 2018-05-14 2019-05-13 Анти-cd24 композиции и их применения EA045813B1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US62/671,193 2018-05-14

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA045813B1 true EA045813B1 (ru) 2023-12-28

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7294758B2 (ja) 抗cd24組成物及びその使用
JP7153626B2 (ja) 抗ヒト4-1bb抗体およびその使用
CN113645996B (zh) 抗claudin 18抗体及其使用方法
TWI645858B (zh) 反應b7-h3之抗體、其免疫活性片段及使用
WO2020098734A1 (zh) 抗tigit抗体及其用途
JP7225135B2 (ja) 腫瘍特異的細胞枯渇のための化合物及び方法
US20240076391A1 (en) Human ccr8 binders
US20240052044A1 (en) Non-blocking human ccr8 binders
TWI844684B (zh) 一種抗ceacam5的單殖株抗體及其製備方法和用途
CA2997809A1 (en) Il-7r-alpha specific antibodies for treating acute lymphoblastic leukemia
EP4286410A1 (en) Single-domain antibody against cd16a and use thereof
JP7490923B2 (ja) 免疫療法効果が向上し副作用が軽減した変異抗ctla-4抗体
US20240052045A1 (en) Murine cross-reactive human ccr8 binders
CN114096559A (zh) 工程化iga抗体及其使用方法
WO2022116079A1 (zh) 一种抗ceacam5的人源化抗体及其制备方法和用途
EA045813B1 (ru) Анти-cd24 композиции и их применения
US11932693B2 (en) Monoclonal antibodies directed against programmed death-1 protein and their use in medicine
TW202305005A (zh) 抗siglec組合物及其用途
KR20170132793A (ko) Afp 펩티드/mhc 복합체를 표적화하는 구축물 및 그의 용도