EA044601B1 - ANTIBODIES AND RESEARCH FOR CD37 DETECTION - Google Patents

ANTIBODIES AND RESEARCH FOR CD37 DETECTION Download PDF

Info

Publication number
EA044601B1
EA044601B1 EA201890347 EA044601B1 EA 044601 B1 EA044601 B1 EA 044601B1 EA 201890347 EA201890347 EA 201890347 EA 044601 B1 EA044601 B1 EA 044601B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
antibody
antigen
binding fragment
seq
binding
Prior art date
Application number
EA201890347
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Ютта Декерт
Даниэль Таварес
Линъюнь Жуй
Свен Лёбрих
Меган Келли
Original Assignee
Дебиофарм Интернэшнл, С.А.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Дебиофарм Интернэшнл, С.А. filed Critical Дебиофарм Интернэшнл, С.А.
Publication of EA044601B1 publication Critical patent/EA044601B1/en

Links

Description

Перекрестная ссылка на родственные заявкиCross reference to related applications

Заявка на данное изобретение испрашивает приоритет на основании предварительной заявки на патент США № 62/211,455, поданной 28 августа 2015 г., и предварительной заявки на патент США № 62/212,183, поданной 31 августа 2015 г., каждая из которых включена в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте.This invention claims priority to U.S. Provisional Patent Application No. 62/211,455, filed Aug. 28, 2015, and U.S. Provisional Patent Application No. 62/212,183, filed Aug. 31, 2015, each of which is incorporated herein. by reference in its entirety.

Область техникиField of technology

Настоящее изобретение в целом относится к диагностическим исследованиям и наборам для нацеленного на CD37 лечения, а также антителам, которые связываются с CD37 человека.The present invention generally relates to diagnostic tests and kits for CD37-targeted treatments, as well as antibodies that bind to human CD37.

Уровень техникиState of the art

Рак является одной из основных причин смерти в развитых странах, только в Соединенных Штатах рак диагностирован более чем у одного миллиона человек и вызывает 500000 смертей в год. В целом, по оценкам, более чем у 1 из 3 человек будет развиваться некоторая форма рака в течение жизни.Cancer is a leading cause of death in developed countries, with more than one million people diagnosed with cancer in the United States alone and causing 500,000 deaths per year. Overall, it is estimated that more than 1 in 3 people will develop some form of cancer during their lifetime.

Антиген лейкоцитов CD37 (CD37), также известный как GP52-40, тетраспанин-26 или TSPAN26, представляет собой трансмембранный белок суперсемейства тетраспанинов (Maecker et al., 1997, FASEB J. 11:428-442). Указанный белок представляет собой сильно гликозилированный белок с четырьмя трансмембранными доменами, который экспрессируется на поверхности В-клеток на стадиях от пре-Вклеток до зрелых периферических В-клеток, но отсутствует на конечной стадии дифференцировки в плазматические клетки (Link et al., 1987, J. Pathol. 152:12-21). Антиген CD37 лишь в незначительной степени экспрессирован на Т-клетках, миелоидных клетках и гранулоцитах (Schwartz-Albiez et al., 1988, J. Immunol., 140(3):905-914). Однако CD37 также экспрессируется на злокачественных В-клетках, таких как В-клетки, обнаруживаемые при неходжкинской лимфоме (НХЛ) и хроническом лимфоцитарном лейкозе (ХЛЛ) (Moore et al., 1986, J. Immunol. 137(9):3013-8). Этот профиль экспрессии позволяет предположить, что CD37 представляет собой перспективную терапевтическую мишень для лечения В-клеточных злокачественных новообразований, экспрессирующих CD37. Однако для того, чтобы эти способы лечения были максимально эффективными, необходимо иметь возможность чувствительного и специфичного определения CD37 в динамическом диапазоне.Leukocyte antigen CD37 (CD37), also known as GP52-40, tetraspanin-26, or TSPAN26, is a transmembrane protein of the tetraspanin superfamily (Maecker et al., 1997, FASEB J. 11:428-442). The protein is a highly glycosylated protein with four transmembrane domains that is expressed on the surface of B cells from pre-B cells to mature peripheral B cells, but is absent during the final stage of differentiation into plasma cells (Link et al., 1987, J Pathol 152:12-21). The CD37 antigen is expressed only to a small extent on T cells, myeloid cells and granulocytes (Schwartz-Albiez et al., 1988, J. Immunol., 140(3):905-914). However, CD37 is also expressed on malignant B cells, such as the B cells found in non-Hodgkin's lymphoma (NHL) and chronic lymphocytic leukemia (CLL) (Moore et al., 1986, J. Immunol. 137(9):3013-8 ). This expression profile suggests that CD37 represents a promising therapeutic target for the treatment of CD37-expressing B-cell malignancies. However, for these treatments to be as effective as possible, it is necessary to be able to sensitively and specifically detect CD37 over a dynamic range.

Краткое описание изобретенияBrief description of the invention

В настоящем описании предложены антитела к CD37 и их антигенсвязывающие фрагменты, а также способы обнаружения CD37, диагностики ассоциированных с CD37 заболеваний и расстройств (таких как рак), контроля эффективности нацеленных на CD37 способов лечения, и разделения пациентов на группы. Антитела к CD37 и их антигенсвязывающие фрагменты являются особенно предпочтительными в силу того, что они обеспечивают возможность более специфичного и выраженного окрашивания, а также окрашивания без ядерного фона. Антитела к CD37 и их антигенсвязывающие фрагменты могут связываться с эпитопом, который содержит одну или более из аминокислот 110-137 CD37. Антитела к CD37 и их антигенсвязывающие фрагменты также могут связываться с полипептидом, содержащим аминокислоты 107-242 CD37 (SEQ ID NO: 20) и/или с полипептидом, содержащим аминокислоты 107-235 CD37 (SEQ ID NO: 19), при этом указанные антитела к CD37 и их антигенсвязывающие фрагменты не связываются с полипептидом, состоящим из аминокислот 138-235 CD37.Provided herein are anti-CD37 antibodies and antigen-binding fragments thereof, as well as methods for detecting CD37, diagnosing CD37-associated diseases and disorders (such as cancer), monitoring the effectiveness of CD37-targeted treatments, and stratifying patients. Antibodies to CD37 and antigen-binding fragments thereof are particularly preferred because they allow more specific and robust staining, as well as staining without a nuclear background. Antibodies to CD37 and antigen binding fragments thereof can bind to an epitope that contains one or more of amino acids 110-137 of CD37. Antibodies to CD37 and antigen-binding fragments thereof can also bind to a polypeptide containing amino acids 107-242 of CD37 (SEQ ID NO: 20) and/or a polypeptide containing amino acids 107-235 of CD37 (SEQ ID NO: 19), wherein said antibodies to CD37 and their antigen-binding fragments do not bind to the polypeptide consisting of amino acids 138-235 of CD37.

В одном из вариантов реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию специфично связывается с тем же эпитопом CD37, что и антитело, содержащее полипептид, представленный SEQ ID NO: 9, и полипептид, представленный SEQ ID NO: 10.In one embodiment, an antibody or antigen binding fragment thereof as described herein specifically binds to the same CD37 epitope as an antibody comprising the polypeptide represented by SEQ ID NO: 9 and the polypeptide represented by SEQ ID NO: 10.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию специфично связывается с CD37 и конкурентно ингибирует связывание с CD37 антитела, содержащего полипептид, представленный SEQ ID NO: 9, и полипептид, представленный SEQ ID NO: 10.In another embodiment, an antibody or antigen binding fragment thereof as described herein specifically binds to CD37 and competitively inhibits the binding to CD37 of an antibody comprising the polypeptide represented by SEQ ID NO: 9 and the polypeptide represented by SEQ ID NO: 10.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию содержит последовательности вариабельной области тяжелой цепи CDR1, CDR2 и CDR3, представленные SEQ ID NO: 3-5 соответственно, и последовательности вариабельной области легкой цепи CDR1, CDR2 и CDR3, представленные SEQ ID NO: 6-8 соответственно.In another embodiment, an antibody or antigen binding fragment thereof as described herein comprises the heavy chain variable region sequences CDR1, CDR2 and CDR3 represented by SEQ ID NO: 3-5, respectively, and the light chain variable region sequences CDR1, CDR2 and CDR3 represented by SEQ ID NO : 6-8 respectively.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию специфично связывается с CD37, и указанное антитело или его фрагмент содержит последовательности вариабельной области тяжелой цепи CDR1, CDR2 и CDR3, представленные SEQ ID NO: 3-5, и последовательности вариабельной области легкой цепи CDR1, CDR2 и CDR3, представленные SEQ ID NO: 6-8 соответственно.In another embodiment, an antibody or antigen binding fragment thereof as described herein specifically binds to CD37, and said antibody or fragment thereof comprises the heavy chain variable region sequences CDR1, CDR2 and CDR3 represented by SEQ ID NO: 3-5 and the light chain variable region sequences CDR1, CDR2 and CDR3 represented by SEQ ID NO: 6-8 respectively.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию содержит полипептидные последовательности, по меньшей мере на 90% идентичные полипептидным последовательностям, представленным SEQ ID NO: 9 и 10. В другом варианте реализации указанные полипептидные последовательности по меньшей мере на 95% идентичны полипептидным последовательностям, представленным SEQ ID NO: 9 и 10. В другом варианте реализации указанные полипептидные последовательности по меньшей мере на 99% идентичны полипептидным последовательностям, представленным SEQ ID NO: 9 и 10. В другом варианте реализации указанные полипептидные последовательности содержат аминокислоты последовательностей SEQ ID NO: 9 и 10.In another embodiment, an antibody or antigen binding fragment thereof as described herein comprises polypeptide sequences that are at least 90% identical to the polypeptide sequences set forth in SEQ ID NOs: 9 and 10. In another embodiment, said polypeptide sequences are at least 95% identical to polypeptide sequences. sequences set forth in SEQ ID NOs: 9 and 10. In another embodiment, said polypeptide sequences are at least 99% identical to the polypeptide sequences set forth in SEQ ID NOs: 9 and 10. In another embodiment, said polypeptide sequences comprise the amino acids of SEQ ID NOs. : 9 and 10.

- 1 044601- 1 044601

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию специфично связывается с CD37, причем указанное антитело или его фрагмент содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую SEQ ID NO: 9.In another embodiment, an antibody or antigen binding fragment thereof as described herein specifically binds to CD37, wherein said antibody or fragment thereof comprises a heavy chain variable region comprising SEQ ID NO: 9.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию специфично связывается с CD37, причем указанное антитело или его фрагмент содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую SEQ ID NO: 10.In another embodiment, an antibody or antigen binding fragment thereof as described herein specifically binds to CD37, wherein said antibody or fragment thereof comprises a heavy chain variable region comprising SEQ ID NO: 10.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию получают рекомбинантным способом. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент является мышиным, отличным от человеческого, гуманизированным, химерным или человеческим. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент имеет измененную поверхность. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой полноразмерное антитело. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой антигенсвязывающий фрагмент. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, Fd, одноцепочечный Fv или scFv, стабилизированный дисульфидной связью Fv, домен V-NAR, IgNar, интраантитело, IgGACH2, мини-антитело, F(ab')3, тетратело, триотело, диатело, однодоменное антитело, DVD-Ig, Fcab, mAb2, (scFv)2 или scFv-Fc. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv или scFv, стабилизированный дисульфидной связью Fv, интраантитело, IgGACH2, мини-антитело, F(ab')3, тетратело, триотело, диатело, DVD-Ig, mAb2, (scFv)2 или scFv-Fc. В другом варианте реализации антитело или антигенсвязывающий фрагмент продуцируется клеткой. В другом варианте реализации указанная клетка выделена. В другом варианте реализации предложен способ получения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, включающий (а) культивирование клетки и (b) выделение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента из культивированной клетки.In another embodiment, an antibody or antigen binding fragment thereof as described herein is produced by a recombinant method. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof is murine, non-human, humanized, chimeric, or human. In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof has an altered surface. In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof is a full-length antibody. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof is an antigen binding fragment. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a Fab, Fab', F(ab')2, Fd, single chain Fv or scFv, disulfide bond stabilized Fv, V-NAR domain, IgNar, intra-antibody, IgGACH2, mini-antibody, F (ab') 3 , tetrabody, tribody, diabody, single domain antibody, DVD-Ig, Fcab, mAb2 , (scFv)2 or scFv-Fc. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv or scFv, disulfide bond stabilized Fv, intra-antibody, IgGACH2, mini-antibody, F(ab') 3 , tetrabody, tribody , diabody, DVD-Ig, mAb 2 , (scFv) 2 or scFv-Fc. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment is produced by a cell. In another embodiment, said cell is highlighted. In another embodiment, a method for producing an antibody or an antigen-binding fragment thereof is provided, comprising (a) culturing a cell and (b) isolating the antibody or an antigen-binding fragment thereof from the cultured cell.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с CD37 человека со значением Kd, составляющим от приблизительно 0,5 до приблизительно 10 нМ. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с CD37 человека со значением Kd, составляющим 1,0 нМ, или лучше.In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to human CD37 with a Kd value of from about 0.5 to about 10 nM. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to human CD37 with a Kd value of 1.0 nM or better.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с полипептидом, содержащим, по существу состоящим из или состоящим из аминокислот 107-242 CD37 (SEQ ID NO: 20). В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с полипептидом, содержащим, по существу состоящим из или состоящим из аминокислот 107-235 CD37 (SEQ ID NO: 19). В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с последовательностью, представленной SEQ ID NO: 15. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с последовательностью, представленной SEQ ID NO: 16. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с последовательностью, представленной SEQ ID NO: 17. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с полипептидом, содержащим аминокислоты 107242 CD37 (SEQ ID NO: 20), но не связывается с полипептидом, состоящим из аминокислот 138-235 CD37. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с полипептидом, содержащим аминокислоты 107-235 CD37 (SEQ ID NO: 19), но не связывается с полипептидом, состоящим из аминокислот 138-235 CD37.In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to a polypeptide comprising, essentially consisting of, or consisting of amino acids 107-242 of CD37 (SEQ ID NO: 20). In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to a polypeptide comprising, essentially consisting of, or consisting of amino acids 107-235 of CD37 (SEQ ID NO: 19). In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof binds to the sequence represented by SEQ ID NO: 15. In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof binds to the sequence represented by SEQ ID NO: 16. In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof binds with the sequence represented by SEQ ID NO: 17. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to the polypeptide comprising CD37 amino acids 107242 (SEQ ID NO: 20) but does not bind to the polypeptide consisting of CD37 amino acids 138-235. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to a polypeptide comprising amino acids 107-235 of CD37 (SEQ ID NO: 19), but does not bind to a polypeptide consisting of amino acids 138-235 of CD37.

В другом варианте реализации антитело или антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему изобретению связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 15, но не связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 18. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 16, но не связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 18. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 17, но не связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 18. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с по меньшей мере одной аминокислотой из аминокислот 110-137 CD37.In another embodiment, an antibody or antigen binding fragment of the present invention binds to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 15, but does not bind to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 18. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 16, but does not bind to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 18. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 17, but does not bind to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 18 In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof binds to at least one amino acid from amino acids 110-137 of CD37.

В другом варианте реализации аффинность связывания антитела или его антигенсвязывающего фрагмента измеряют с помощью проточной цитометрии, Biacore, иммуноферментного анализа (ELISA) или радиоиммуноанализа.In another embodiment, the binding affinity of an antibody or antigen-binding fragment thereof is measured using flow cytometry, Biacore, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), or radioimmunoassay.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент имеет обнаруживаемую метку. В другом варианте реализации метка выбрана из группы, состоящей из иммунофлуоресцентной метки, хемилюминесцентной метки, фосфоресцирующей метки, ферментной метки, радиоактивной метки, авидина/биотина, частицы коллоидного золота, окрашенной частицы и магнитной частицы. В другом варианте реализации предложена композиция, содержащая антитело или его антигенсвязывающий фрагмент и буфер, выбранный из группы, состоящей из буфера для иммуногистохимии (ИГХ), буфера для иммуноферментного анализа (ELISA) и буфера для анализа методом сортировки флуорес- 2 044601 центно-активированных клеток (FACS).In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof has a detectable label. In another embodiment, the label is selected from the group consisting of an immunofluorescent label, a chemiluminescent label, a phosphorescent label, an enzyme label, a radioactive label, avidin/biotin, a colloidal gold particle, a colored particle, and a magnetic particle. In another embodiment, a composition is provided comprising an antibody or an antigen-binding fragment thereof and a buffer selected from the group consisting of an immunohistochemistry (IHC) buffer, an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) buffer, and a fluorescent cell sorting assay buffer. (FACS).

В другом варианте реализации предложен способ обнаружения экспрессии CD37 в образце, включающий приведение указанного образца в контакт с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом или композицией согласно настоящему описанию.In another embodiment, a method for detecting CD37 expression in a sample is provided, comprising contacting said sample with an antibody or antigen binding fragment or composition thereof as described herein.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент имеет обнаруживаемую метку. В другом варианте реализации метка выбрана из группы, состоящей из иммунофлуоресцентной метки, хемилюминесцентной метки, фосфоресцирующей метки, ферментной метки, радиоактивной метки, авидина/биотина, частицы коллоидного золота, окрашенной частицы и магнитной частицы. В другом варианте реализации метка представляет собой ферментную метку.In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof has a detectable label. In another embodiment, the label is selected from the group consisting of an immunofluorescent label, a chemiluminescent label, a phosphorescent label, an enzyme label, a radioactive label, avidin/biotin, a colloidal gold particle, a colored particle, and a magnetic particle. In another embodiment, the label is an enzyme label.

В другом варианте реализации экспрессию CD37 определяют с помощью радиоиммуноанализа, анализа методом вестерн-блоттинга, цитометрии, иммунофлуоресцентного анализа, иммуноферментного анализа, иммунопреципитационного анализа, хемилюминесцентного анализа или иммуногистохимического анализа. В другом варианте реализации экспрессию CD37 определяют с помощью иммуногистохимического анализа.In another embodiment, CD37 expression is determined by radioimmunoassay, Western blot analysis, cytometry, immunofluorescence assay, enzyme-linked immunosorbent assay, immunoprecipitation assay, chemiluminescent assay, or immunohistochemical assay. In another embodiment, CD37 expression is determined using immunohistochemical analysis.

В другом варианте реализации предложен способ повышения эффективности лечения рака с применением терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, включающий введение указанного терапевтически активного агента субъекту, имеющему рак, при котором в образце рака от указанного субъекта с применением антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или композиции согласно настоящему описанию была обнаружена повышенная экспрессия CD37.In another embodiment, a method is provided for increasing the effectiveness of cancer treatment using a therapeutically active agent containing an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof, comprising administering said therapeutically active agent to a subject having cancer, wherein in a cancer sample from said subject using the antibody or antigen-binding fragment thereof fragment or composition according to the present description, increased expression of CD37 was detected.

В другом варианте реализации предложен способ идентификации рака, который, вероятно, может реагировать на терапевтически активный агент, содержащий антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, включающий (а) приведение биологического образца, содержащего клетки указанного рака, в контакт с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом или композицией; (b) обнаружение связывания антитела или его антигенсвязывающего фрагмента с CD37 в биологическом образце (а); (с) присвоение значения связыванию, обнаруженному на стадии (b), где указанное значение присваивают на основании сравнения с одним или более эталонными образцами; и (d) сравнение значения, полученного на стадии (с), со значением для эталонной ткани или клетки, где значение для уровня CD37 указанного рака, превышающее значение для эталонного образца с нормальной или низкой экспрессией CD37, или значение для уровня CD37 указанного рака, равное или превышающее значение для эталонного образца с высокой экспрессией CD37, указывает на рак, который, вероятно, может реагировать на антитело к CD37.In another embodiment, a method is provided for identifying a cancer that is likely to respond to a therapeutically active agent comprising an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof, comprising (a) contacting a biological sample containing cells of said cancer with the antibody or an antigen-binding fragment thereof or composition; (b) detecting binding of an antibody or an antigen binding fragment thereof to CD37 in a biological sample (a); (c) assigning a value to the binding detected in step (b), where the value is assigned based on comparison with one or more reference samples; and (d) comparing the value obtained in step (c) with the value for a reference tissue or cell, where the value for the CD37 level of the specified cancer is greater than the value for the reference sample with normal or low CD37 expression, or the value for the CD37 level of the specified cancer, equal to or greater than the reference sample with high CD37 expression, indicates a cancer that is likely to respond to anti-CD37 antibody.

В другом варианте реализации предложен способ лечения пациента, имеющего рак, включающий (а) определение значения уровня экспрессии CD37 на основании обнаружения экспрессии CD37 в образце рака, полученном от указанного пациента, где указанное обнаружение выполняют с применением антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или композиции; и (b) введение терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, пациенту, если указанное значение показывает, что пациент получит пользу от введения терапевтически активного агента.In another embodiment, a method of treating a patient having cancer is provided, comprising (a) determining a CD37 expression level value based on detection of CD37 expression in a cancer sample obtained from said patient, wherein said detection is performed using an antibody or an antigen binding fragment or composition thereof; and (b) administering a therapeutically active agent comprising an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof to the patient if said value indicates that the patient will benefit from administration of the therapeutically active agent.

В другом варианте реализации способ лечения пациента, имеющего рак, включает (а) определение значения уровня экспрессии CD37 на основании обнаружения экспрессии CD37 в образце рака, полученном от указанного пациента, где указанное обнаружение выполняют с применением антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или композиции; и (b) инструктирование лица, предоставляющего медицинские услуги, по введению терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, пациенту, если указанное значение показывает, что пациент получит пользу от введения терапевтически активного агента.In another embodiment, a method of treating a patient having cancer includes (a) determining a CD37 expression level value based on detection of CD37 expression in a cancer sample obtained from said patient, wherein said detection is performed using an antibody or an antigen binding fragment or composition thereof; and (b) instructing the health care provider to administer a therapeutically active agent comprising an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof to a patient if the indicated value indicates that the patient will benefit from administration of the therapeutically active agent.

В другом варианте реализации способ лечения пациента, имеющего рак, включает (а) предоставление образца рака, полученного от пациента, имеющего рак, для определения значения уровня экспрессии CD37 на основании обнаружения экспрессии CD37 с применением антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или композиции и (b) введение терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, пациенту, если указанное значение показывает, что пациент получит пользу от введения терапевтически активного агента.In another embodiment, a method of treating a patient having cancer includes (a) providing a cancer sample obtained from the patient having cancer to determine a CD37 expression level value based on detection of CD37 expression using an antibody or antigen binding fragment or composition thereof and (b) administering a therapeutically active agent comprising an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof to a patient if the indicated value indicates that the patient will benefit from administration of the therapeutically active agent.

В другом варианте реализации способ лечения пациента, имеющего рак, включает (а) обнаружение экспрессии CD37 в образце рака, полученном от указанного пациента, выполненное с применением антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или композиции; (b) определение значения уровня экспрессии CD37 образца рака и (с) введение терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, пациенту, если указанное значение показывает, что пациент получит пользу от введения терапевтически активного агента.In another embodiment, a method of treating a patient having cancer includes (a) detecting CD37 expression in a cancer sample obtained from the patient using an antibody or antigen binding fragment or composition thereof; (b) determining a CD37 expression level value of the cancer sample; and (c) administering a therapeutically active agent comprising an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof to the patient if the value indicates that the patient will benefit from administration of the therapeutically active agent.

В другом варианте реализации способ идентификации рака как чувствительного к лечению с применением активного агента против CD37 включает (а) определение уровня экспрессии CD37 в раковом образце указанного рака с применением антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или композиции, включающее применение способа, который позволяет обнаружить отличия в интенсивности окрашивания или равномерности окрашивания в экспрессирующем CD37 образце рака по сравнению с ин- 3 044601 тенсивностью окрашивания или равномерностью окрашивания в одном или более эталонных образцов; (b) определение значения интенсивности окрашивания или равномерности окрашивания CD37 для указанного образца рака и (с) сравнение значения интенсивности окрашивания или равномерности окрашивания CD37, определенного на стадии (b), с относительным значением, определенным путем измерения экспрессии белка CD37 в по меньшей мере одном эталонном образце, представляющем собой образец ткани, клетки или осадка клеток, который не является чувствительным к лечению с применением терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, и где значение интенсивности окрашивания CD37 для указанного образца рака, определенное на стадии (b), превышающее указанное относительное значение, идентифицирует указанный рак как чувствительный к лечению с применением указанного терапевтически активного агента.In another embodiment, a method for identifying a cancer as responsive to treatment with an anti-CD37 active agent comprises (a) determining the level of CD37 expression in a cancer sample of said cancer using an antibody or antigen-binding fragment or composition thereof, including using a method that detects differences in intensity the intensity or uniformity of staining in a CD37 expressing cancer sample compared to the intensity or uniformity of staining in one or more reference samples; (b) determining a CD37 staining intensity or uniformity value for said cancer sample; and (c) comparing a CD37 staining intensity or uniformity value determined in step (b) with a relative value determined by measuring CD37 protein expression in at least one a reference sample being a sample of tissue, cell or cell pellet that is not sensitive to treatment with a therapeutically active agent containing an anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof, and wherein the CD37 staining intensity value for said cancer sample is determined at stage (b ), exceeding the specified relative value, identifies the specified cancer as sensitive to treatment using the specified therapeutically active agent.

В другом варианте реализации способ идентификации рака как чувствительного к лечению с применением терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, включает (а) определение уровня экспрессии CD37 в раковом образце указанного рака с применением антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или композиции, включающее применение способа, который позволяет обнаружить отличия в интенсивности окрашивания или равномерности окрашивания в экспрессирующем CD37 образце рака по сравнению с интенсивностью окрашивания или равномерностью окрашивания в одном или более эталонных образцов; (b) определение значения интенсивности окрашивания или равномерности окрашивания CD37 для указанного образца рака и (с) сравнение значения интенсивности окрашивания или равномерности окрашивания CD37, определенного на стадии (b), с относительным значением, определенным путем измерения экспрессии белка CD37 в по меньшей мере одном эталонном образце, представляющем собой образец ткани, клетки или осадка клеток, который является чувствительным к лечению с применением терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, и где значение интенсивности окрашивания CD37 для указанного образца рака, определенное на стадии (b), превышающее или равное указанному относительному значению, идентифицирует указанный рак как чувствительный к лечению с применением указанного терапевтически активного агента. В другом варианте реализации предложен способ, который дополнительно включает введение терапевтически активного агента, содержащего антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент, субъекту, от которого был получен образец рака или биологический образец. В другом варианте реализации уровень CD37 у пациента определяют в образце рака или биологическом образце, полученном от указанного пациента. В другом варианте реализации образец рака или биологический образец представляет собой жидкий экстракт, кровь, плазму, сыворотку, спинномозговую жидкость, лимфатическую жидкость или препарат селезенки. В другом варианте реализации обнаружение осуществляют методом иммуногистохимии (ИГХ). В другом варианте реализации метод ИГХ представляет собой калиброванный метод ИГХ, который позволяет различить различные уровни экспрессии CD37. В другом варианте реализации ИГХ обеспечивает диапазон интенсивности окраски для образцов с низким уровнем экспрессии CD37, средним уровнем экспрессии CD37 или высоким уровнем экспрессии CD37. В другом варианте реализации ИГХ позволяет обнаружить отличия в интенсивности окрашивания или равномерности окрашивания в экспрессирующем CD37 образце рака или биологическом образце по сравнению с эталонным образцом. В другом варианте реализации ИГХ выполняют вручную. В другом варианте реализации ИГХ выполняют с использованием автоматизированной системы. В другом варианте реализации значение CD37 определяют на основании ИГХ. В другом варианте реализации обнаружение осуществляют с помощью иммуноферментного анализа (ELISA). В другом варианте реализации эталонный образец представляет собой положительный эталонный образец или отрицательный эталонный образец. В другом варианте реализации эталонный образец включает клетки, осадок клеток или ткань.In another embodiment, a method for identifying a cancer as being responsive to treatment using a therapeutically active agent comprising an anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises (a) determining the level of CD37 expression in a cancer sample of said cancer using the antibody or antigen-binding fragment or composition thereof, comprising: using a method that detects differences in staining intensity or staining uniformity in a CD37 expressing cancer sample compared to staining intensity or staining uniformity in one or more reference samples; (b) determining a CD37 staining intensity or uniformity value for said cancer sample; and (c) comparing a CD37 staining intensity or uniformity value determined in step (b) with a relative value determined by measuring CD37 protein expression in at least one a reference sample, which is a sample of tissue, cell or cell pellet that is sensitive to treatment with a therapeutically active agent containing an anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof, and wherein the CD37 staining intensity value for said cancer sample is determined in step (b) , greater than or equal to the specified relative value, identifies the specified cancer as sensitive to treatment using the specified therapeutically active agent. In another embodiment, a method is provided that further comprises administering a therapeutically active agent comprising an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof to the subject from which the cancer or biological sample was obtained. In another embodiment, a patient's CD37 level is determined in a cancer sample or biological sample obtained from the patient. In another embodiment, the cancer sample or biological sample is a liquid extract, blood, plasma, serum, cerebrospinal fluid, lymph fluid, or spleen preparation. In another embodiment, detection is performed by immunohistochemistry (IHC). In another embodiment, the IHC method is a calibrated IHC method that can distinguish between different levels of CD37 expression. In another embodiment, IHC provides a range of color intensities for samples with low CD37 expression, intermediate CD37 expression, or high CD37 expression. In another embodiment, IHC detects differences in staining intensity or uniformity of staining in a CD37-expressing cancer sample or biological sample compared to a reference sample. In another embodiment, IHC is performed manually. In another embodiment, IHC is performed using an automated system. In another embodiment, CD37 is determined based on IHC. In another embodiment, detection is performed using an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). In another embodiment, the reference sample is a positive reference sample or a negative reference sample. In another embodiment, the reference sample includes cells, a cell pellet, or tissue.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит реагент для детекции, выбранный из группы, состоящей из иммунофлуоресцентной метки, хемилюминесцентной метки, фосфоресцирующей метки, фермента, радиоактивной метки, авидина/биотина, частицы коллоидного золота, окрашенной частицы и магнитной частицы. В другом варианте реализации реагент для детекции представляет собой фермент.In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof further comprises a detection reagent selected from the group consisting of an immunofluorescent label, a chemiluminescent label, a phosphorescent label, an enzyme, a radioactive label, avidin/biotin, a colloidal gold particle, a colored particle, and a magnetic particle. In another embodiment, the detection reagent is an enzyme.

В другом варианте реализации рак представляет собой CD37-положительный рак. В другом варианте реализации рак представляет собой лейкоз или лимфому. В другом варианте реализации рак выбран из группы, состоящей из В-клеточных лимфом, НХЛ, В-клеточного лимф областного лейкоза/лимфомы из клеток-предшественников и новообразований из зрелых В-клеток, В-клеточного хронического лимфоцитарного лейкоза (ХЛЛ)/лимфомы из малых лимфоцитов (ЛМЛ), В-клеточного пролимфоцитарного лейкоза, лимфоплазмоцитарной лимфомы, мантийноклеточной лимфомы (МКЛ), фолликулярной лимфомы (ФЛ), ФЛ низкой степени, средней степени и высокой степени, кожной лимфомы из клеток фолликулярного центра, В-клеточной лимфомы из клеток маргинальной зоны, MALT-типа В-клеточной лимфомы из клеток маргинальной зоны, узлового типа В-клеточной лимфомы из клеток маргинальной зоны, Вклеточной лимфомы из клеток маргинальной зоны селезенки, волосатоклеточного лейкоза, диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы (ДКВЛ), лимфомы Беркитта, плазмоцитомы, плазмоклеточной миеломы, посттрансплантационного лимфопролиферативного заболевания, макроглобулинемии ВальIn another embodiment, the cancer is a CD37-positive cancer. In another embodiment, the cancer is leukemia or lymphoma. In another embodiment, the cancer is selected from the group consisting of B-cell lymphomas, NHL, B-cell lymphoblastic leukemia/progenitor cell lymphoma and mature B-cell neoplasms, B-cell chronic lymphocytic leukemia (CLL)/lymphoma from small lymphocytes (SML), B-cell prolymphocytic leukemia, lymphoplasmacytic lymphoma, mantle cell lymphoma (MCL), follicular lymphoma (FL), low-grade, moderate-grade and high-grade FL, cutaneous follicular center cell lymphoma, B-cell lymphoma marginal zone, MALT-type marginal zone B-cell lymphoma, nodal type marginal zone B-cell lymphoma, splenic marginal zone B-cell lymphoma, hairy cell leukemia, diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), Burkitt's lymphoma, plasmacytoma, plasma cell myeloma, post-transplant lymphoproliferative disease, Wahl macroglobulinemia

- 4 044601 денстрема и анапластической крупноклеточной лимфомы (АККЛ). В другом варианте реализации CD37положительный рак представляет собой диффузную крупноклеточную В-клеточную лимфому, фолликулярную лимфому или мантийноклеточную лимфому. В другом варианте реализации экспрессию CD37 обнаруживают с применением по меньшей мере одного дополнительного антитела к CD37 или его антигенсвязывающего фрагмента. В другом варианте реализации экспрессию CD37 измеряют с применением двух антител к CD37 или их антигенсвязывающих фрагментов. В другом варианте реализации по меньшей мере одно дополнительное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит агент для детекции. В другом варианте реализации агент для детекции представляет собой хромогенный агент для детекции, флуорогенный агент для детекции, ферментативный агент для детекции или электрохемилюминесцентный агент для детекции. В другом варианте реализации агент для детекции представляет собой пероксидазу хрена (ПХ).- 4 044601 denstrom and anaplastic large cell lymphoma (ALCL). In another embodiment, the CD37-positive cancer is diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, or mantle cell lymphoma. In another embodiment, CD37 expression is detected using at least one additional anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof. In another embodiment, CD37 expression is measured using two anti-CD37 antibodies or antigen-binding fragments thereof. In another embodiment, the at least one additional antibody or antigen binding fragment thereof comprises a detection agent. In another embodiment, the detection agent is a chromogenic detection agent, a fluorogenic detection agent, an enzymatic detection agent, or an electrochemiluminescent detection agent. In another embodiment, the detection agent is horseradish peroxidase (HRP).

В другом варианте реализации по меньшей мере одно дополнительное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связано/связан с твердым носителем. В другом варианте реализации по меньшей мере одно дополнительное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связано/связан с планшетом для микротитрования.In another embodiment, the at least one additional antibody or antigen binding fragment thereof is/is bound to a solid carrier. In another embodiment, the at least one additional antibody or antigen binding fragment thereof is/is bound to a microtiter plate.

В другом варианте реализации ELISA представляет собой двухслойный сэндвич (sandwich) ELISA.In another embodiment, the ELISA is a sandwich ELISA.

В другом варианте реализации терапевтически активный агент содержит антитело к CD37 huCD37-3. В другом варианте реализации терапевтически активный агент представляет собой конъюгат антитело-майтанзиноид, содержащий антитело к CD37 huCD37-3, майтанзиноид DM1 и нерасщепляемый №сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилатный (SMCC) линкер (IMGN529).In another embodiment, the therapeutically active agent comprises an anti-CD37 antibody, huCD37-3. In another embodiment, the therapeutically active agent is an antibody-maytansinoid conjugate comprising the anti-CD37 antibody huCD37-3, the maytansinoid DM1, and a non-cleavable N-succinimidyl-4-(maleimidomethyl)cyclohexanecarboxylate (SMCC) linker (IMGN529).

В другом варианте реализации предложен комбинированный диагностический и фармацевтический набор, который содержит антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или композицию согласно настоящему описанию для применения для диагностики и терапевтически активный агент, содержащий антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент для применения для лечения.In another embodiment, a combination diagnostic and pharmaceutical kit is provided that contains an antibody or antigen binding fragment or composition as described herein for diagnostic use and a therapeutically active agent comprising an anti-CD37 antibody or antigen binding fragment thereof for therapeutic use.

В другом варианте реализации антитело для детекции позволяет обнаруживать экспрессию CD37 с помощью ИГХ. В другом варианте реализации антитело для детекции позволяет обнаруживать экспрессию CD37 с помощью ELISA.In another embodiment, the detection antibody allows CD37 expression to be detected by IHC. In another embodiment, the detection antibody detects CD37 expression using ELISA.

В другом варианте реализации антитело к CD37 в терапевтически активном агенте конъюгировано с цитотоксином.In another embodiment, the anti-CD37 antibody in the therapeutically active agent is conjugated to a cytotoxin.

В другом варианте реализации диагностический набор согласно настоящему описанию содержит антитело, его антигенсвязывающий фрагмент согласно настоящему описанию, реагент для ИГХ и один или более стандартизированных эталонных образцов, включающих клетки, осадок клеток или фиксированные в формалине и залитые парафином образцы ткани, и при этом один или более стандартизированных эталонных образцов получены из не экспрессирующих CD37, в низкой степени экспрессирующих CD37 или в высокой степени экспрессирующих CD37 клеток, осадков клеток или тканей.In another embodiment, a diagnostic kit as described herein comprises an antibody, an antigen binding fragment thereof as described herein, an IHC reagent, and one or more standardized reference samples comprising cells, a cell pellet, or formalin-fixed, paraffin-embedded tissue samples, and one or more more standardized reference samples are derived from non-CD37-expressing, low-CD37-expressing, or high-CD37-expressing cells, cell pellets, or tissues.

Краткое описание чертежей/фигурBrief description of drawings/figures

На фиг. 1А и 1В представлены результаты скрининга методом ELISA для антител, полученных путем иммунизации мышей с применением белка hCD37-LEL (большой внеклеточной петли) (SEQ ID NO: 15), содержащего аминокислоты со 107 по 242 CD37 человека, слитого с гистидиновой меткой (His-tag).In fig. 1A and 1B show the results of an ELISA screen for antibodies obtained by immunizing mice using the hCD37-LEL (large extracellular loop) protein (SEQ ID NO: 15) containing amino acids 107 to 242 of human CD37 fused to a histidine tag (His- tag).

На фиг. 1А показано, что супернатант клона 1B11 гибридомы связывается с различными вариантами антигена CD37, hCD37-LEL, hCD37-Fc-LAGA (LAGA относится к мутациям Fc G236A и Р238А), SEQ ID NO: 17, содержащими аминокислоты со 107 по 235 CD37 человека, слитыми с доменом Fc IgG1 человека) и hCD37-ECD-Fc (внеклеточный домен, SEQ ID NO: 16, содержащий аминокислоты со 107 по 235 CD37 человека, слитый с доменом Fc IgG2a мыши) как в нативных, так и в денатурирующих условиях.In fig. 1A shows that the supernatant of hybridoma clone 1B11 binds to various variants of the CD37 antigen, hCD37-LEL, hCD37-Fc-LAGA (LAGA refers to the Fc mutations G236A and P238A), SEQ ID NO: 17, containing amino acids 107 to 235 of human CD37, fused to the Fc domain of human IgG1) and hCD37-ECD-Fc (extracellular domain, SEQ ID NO: 16, containing amino acids 107 to 235 of human CD37 fused to the Fc domain of mouse IgG2a) under both native and denaturing conditions.

На фиг. 1В показано, что супернатанты двух субклонов гибридомы, 1В11-2 и 1В11-20, связываются с hCD37-Fc-LAGA и hCD37-LEL как в нативных, так и в денатурирующих условиях.In fig. Figure 1B shows that supernatants of two hybridoma subclones, 1B11-2 and 1B11-20, bind to hCD37-Fc-LAGA and hCD37-LEL under both native and denaturing conditions.

На фиг. 2 показано, что антитело 1B11-2 связывается с нативными белками hCD37-Fc-LAGA и hCD37-LEL со значительно улучшенной аффинностью по сравнению с эталонным антителом к CD37, NCL-CD37 (клон СТ1, Leica Biosystems).In fig. 2 shows that antibody 1B11-2 binds to the native proteins hCD37-Fc-LAGA and hCD37-LEL with significantly improved affinity compared to the reference CD37 antibody, NCL-CD37 (clone CT1, Leica Biosystems).

На фиг. 3 показано, что антитело 1В11-2 связывается с денатурированным белком hCD37-LEL со значительно улучшенной аффинностью по сравнению с NCL-CD37.In fig. 3 shows that antibody 1B11-2 binds to the denatured hCD37-LEL protein with significantly improved affinity compared to NCL-CD37.

На фиг. 4 показано, что антитело 1В11-2 не связывается с процессированным белком hCD37-ECDS2-Fc (S2 относится ко второму сегменту большого внеклеточного домена CD37, содержащему аминокислоты со 138 по 176, SEQ ID NO: 18), тогда как NCL-CD37 сохраняет способность к связыванию с этим белком CD37.In fig. 4 shows that antibody 1B11-2 does not bind to the processed protein hCD37-ECDS2-Fc (S2 refers to the second segment of the large extracellular domain of CD37, containing amino acids 138 to 176, SEQ ID NO: 18), while NCL-CD37 retains the ability to binding to this protein CD37.

На фиг. 5 показаны иммуногистохимические изображения нормальной миндалины человека, окрашенной либо моноклональным антителом (МАТ) мыши NCL-CD37 (слева), либо МАТ мыши CD37 1В11-2 (справа). Стрелки указывают на зародышевые центры, мантийные зоны (и те, и другие CD37-положительны) и межфолликулярные области (CD37-отрицательны) соответственно. ЧерныеIn fig. Figure 5 shows immunohistochemical images of a normal human tonsil stained with either the mouse monoclonal antibody (Mab) NCL-CD37 (left) or the mouse mAb CD37 1B11-2 (right). Arrows indicate germinal centers, mantle zones (both CD37 positive), and interfollicular regions (CD37 negative), respectively. Black

- 5 044601 стрелки указывают на зародышевые центры; серые стрелки указывают на мантийные зоны (и те, и другие CD37-положительны), а неокрашенные стрелки указывают на межфолликулярные области (CD37-отрицательны). При применении антитела NCL-CD37 окраска ядер присутствует как в зародышевом центре, так и в мантийной зоне. При применении антитела 1В11-2 окраска ядер отсутствует.- 5 044601 arrows point to germinal centers; gray arrows indicate mantle areas (both CD37 positive) and uncolored arrows indicate interfollicular areas (CD37 negative). When using the NCL-CD37 antibody, nuclear staining is present in both the germinal center and the mantle zone. When using the 1B11-2 antibody, there is no staining of the nuclei.

На фиг. 6 показаны иммуногистохимические изображения нормального тонкого кишечника человека (верхняя панель) и нормальной поджелудочной железы человека (нижняя панель) с применением либо моноклонального антитела (MAT) NCL-CD37 мыши (левая панель), либо MAT 1B11-2 мыши (правая панель). Стрелками на панелях слева обозначено розовое окрашивание цитоплазмы клеток Панета (верхняя панель, обозначено черными стрелками) и островковых клеток (нижняя панель, обозначено неокрашенными стрелками), полученное с применением MAT NCL-CD37 мыши. Стрелки на панелях справа показывают, что при применении антитела 1В11-2 это окрашивание не наблюдается в соответствующих областях.In fig. 6 shows immunohistochemical images of normal human small intestine (top panel) and normal human pancreas (bottom panel) using either the mouse monoclonal antibody (MAT) NCL-CD37 (left panel) or mouse MAT 1B11-2 (right panel). Arrows in the panels on the left indicate pink staining of the cytoplasm of Paneth cells (top panel, indicated by black arrows) and islet cells (lower panel, indicated by unstained arrows) obtained using the mouse MAT NCL-CD37. The arrows in the panels on the right indicate that this staining is not observed in the corresponding areas when the 1B11-2 antibody is used.

На фиг. 7 показаны иммуногистохимические изображения ткани пациента с диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомой (верхняя панель) и ткани пациента с фолликулярной лимфомой (нижняя панель), окрашенные с применением либо MAT NCL-CD37 мыши (левая панель), либо MAT 1B11-2 мыши (правая панель). Более сильное, более четкое окрашивание наблюдается для обоих типов рака при применении МАТ 1В11-2 мыши.In fig. Figure 7 shows immunohistochemical images of tissue from a patient with diffuse large B-cell lymphoma (top panel) and tissue from a patient with follicular lymphoma (bottom panel) stained using either mouse MAT NCL-CD37 (left panel) or mouse MAT 1B11-2 (right panel). panel). Stronger, more distinct staining is observed for both types of cancer when using murine mAb 1B11-2.

На фиг. 8 показаны результаты вестерн-блоттинга после электрофореза в ДНС-ПААГ в денатурирующих условиях продуктов слияния Fc с антигенами внеклеточного домена (ECD) CD37, где приведено сравнение моноклонального антитела 1В11-2 мыши с поставляемым на рынок моноклональным антителом мыши к CD37 (Leica). Маркеры молекулярной массы в килодальтонах (кДа) показаны в исходном виде и в виде схематического изображения справа.In fig. 8 shows the results of Western blotting after denaturing DNS-PAGE of Fc fusion products with CD37 extracellular domain (ECD) antigens, comparing the mouse monoclonal antibody 1B11-2 with a commercially available mouse monoclonal anti-CD37 antibody (Leica). Molecular mass markers in kilodaltons (kDa) are shown in their original form and as a schematic representation on the right.

На фиг. 9 показаны результаты вестерн-блоттинга после электрофореза в ПААГ в нативных условиях продуктов слияния Fc с антигенами внеклеточного домена (ECD) CD37, обнаруживаемые с применением моноклонального антитела 1В11-2 мыши.In fig. 9 shows the results of Western blotting after native PAGE of Fc fusion products with CD37 extracellular domain (ECD) antigens detected using the mouse monoclonal antibody 1B11-2.

Подробное описание изобретенияDetailed Description of the Invention

В настоящем описании предложены способы обнаружения CD37 человека.Provided herein are methods for detecting human CD37.

Эти способы позволяют идентифицировать раковые заболевания, характеризующиеся экспрессией CD37, для улучшения эффективности лечения с применением нацеленных на CD37 терапевтических средств. Способы обнаружения могут быть использованы для разделения пациентов на группы, контроля или определения терапевтической эффективности или определения вероятности того, что рак будет реагировать на нацеленное на CD37 терапевтическое средство. Способы обнаружения позволяют обнаруживать клинически значимый динамический диапазон CD37. Также раскрыты новые связывающиеся с CD37 полипептиды, такие как антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, пригодные для применения в способах обнаружения (например, иммуногистохимическом (ИГХ) анализе для CD37). Связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент), предложенный в настоящем описании, обеспечивает возможность более специфичного и выраженного окрашивания без ядерного фона. Связывающийся с CD37 агент связывается с эпитопом, который содержит одну или более из аминокислот 110-137 CD37. Связывающийся с CD37 агент также связывается с полипептидом, содержащим аминокислоты 107-242 CD37 (SEQ ID NO: 20), или с полипептидом, содержащим аминокислоты 107-235 CD37 (SEQ ID NO: 19), но не связывается с полипептидом, состоящим из аминокислот 138-235 CD37. Также предложены родственные полипептиды и полинуклеотиды, композиции, содержащие связывающиеся с CD37 агенты и способы получения связывающихся с CD37 агентов.These methods allow the identification of cancers characterized by CD37 expression to improve the effectiveness of treatment using CD37-targeted therapeutics. Detection methods can be used to stratify patients, monitor or determine therapeutic efficacy, or determine the likelihood that a cancer will respond to a CD37-targeted therapeutic agent. Detection methods allow detection of clinically relevant dynamic range of CD37. Also disclosed are novel CD37-binding polypeptides, such as antibodies and antigen-binding fragments thereof, suitable for use in detection methods (eg, immunohistochemical (IHC) assays for CD37). A CD37-binding agent (eg, an antibody or an antigen-binding fragment thereof) provided herein allows for more specific and robust staining without nuclear background. The CD37 binding agent binds to an epitope that contains one or more of amino acids 110-137 of CD37. The CD37-binding agent also binds to a polypeptide containing amino acids 107-242 of CD37 (SEQ ID NO: 20) or a polypeptide containing amino acids 107-235 of CD37 (SEQ ID NO: 19), but does not bind to a polypeptide consisting of amino acids 138-235 CD37. Also provided are related polypeptides and polynucleotides, compositions containing CD37 binding agents and methods for producing CD37 binding agents.

I. Определения.I. Definitions.

Для облегчения понимания настоящего изобретения ниже определен ряд терминов и фраз.To facilitate understanding of the present invention, a number of terms and phrases are defined below.

Термин CD37 в контексте настоящего описания относится к любому нативному CD37, если не указано иное. CD37 также относится к GP52-40, лейкоцитарному антигену CD37 и тетраспанину-26. Термин CD37 охватывает полноразмерный непроцессированный CD37, а также любую форму CD37, которая образуется в результате процессинга в клетке. Указанный термин также охватывает природные варианты CD37, например, варианты сплайсинга, аллельные варианты и изоформы. Полипептиды CD37, описанные в настоящем описании, могут быть выделены из множества источников, таких как биологические образцы человека, или из другого источника или получены рекомбинантными или синтетическими способами.The term CD37 as used herein refers to any native CD37 unless otherwise noted. CD37 is also related to GP52-40, leukocyte antigen CD37 and tetraspanin-26. The term CD37 covers full-length full-length CD37 as well as any form of CD37 that is produced by cellular processing. The term also covers natural variants of CD37, such as splice variants, allelic variants and isoforms. The CD37 polypeptides described herein can be isolated from a variety of sources, such as human biological samples or other sources, or produced by recombinant or synthetic methods.

Термин повышенная экспрессия или сверхэкспрессия CD37 относится к образцу, который демонстрирует повышенные уровни экспрессии CD37. CD37 может быть повышен или сверхэкспрессирован по сравнению с отрицательным контролем или контролем с низким содержанием CD37 или по сравнению с образцом здоровой или непораженной ткани или клеток того же типа. Такая повышенная экспрессия или сверхэкспрессия может быть вызвана, например, мутацией, амплификацией гена, усиленной транскрипцией, усиленной трансляцией или повышенной стабильностью белка. В одном примере экспрессию CD37 измеряют с помощью иммуногистохимии (ИГХ) и определения значения интенсивности окрашивания или значения равномерности окрашивания путем сравнения с калиброванными контролями, имеющими установленные значения (например, исследуемому образцу присваивают значение интен- 6 044601 сивности, равное 3, если его интенсивность сравнима с калиброванным контролем уровня 3, или исследуемому образцу присваивают значение интенсивности, равное 2, если его интенсивность сравнима с калиброванным контролем уровня 2). Равномерность окрашивания, которая является гетерогенной или гомогенной, также свидетельствует об увеличении экспрессии CD37. Значения интенсивности окрашивания и равномерности окрашивания могут быть применены отдельно или в комбинации (например, 2 гомо, 2 гетеро, 3 гомо, 3 гетеро и т.д.). В другом примере повышение экспрессии CD37 может быть определено посредством обнаружения повышения по меньшей мере в 2 раза, по меньшей мере в 3 раза или по меньшей мере в 5 раз относительно контрольных значений (например, уровень экспрессии в биологическом образце, ткани или клетке от субъекта, не имеющего рака или имеющего рак, не характеризующийся повышенными значениями CD37). В другом примере экспрессии CD37 присваивают Н-значение. Нзначения объединяют значения интенсивности окрашивания со значениями равномерности с использованием расчета, предложенного в настоящем описании. В другом примере экспрессию CD37 измеряют путем определения процентного содержания клеток, которые имеют по меньшей мере конкретный уровень окрашивания (например, по меньшей мере 25% клеток имеют значение, составляющее по меньшей мере 2, или по меньшей мере 75% клеток имеют значение, составляющее по меньшей мере 2).The term CD37 overexpression or overexpression refers to a pattern that exhibits increased levels of CD37 expression. CD37 may be increased or overexpressed compared to a negative or low CD37 control or compared to a sample of healthy or unaffected tissue or cells of the same type. Such increased expression or overexpression may be caused, for example, by mutation, gene amplification, increased transcription, increased translation, or increased protein stability. In one example, CD37 expression is measured using immunohistochemistry (IHC) and determining a staining intensity value or staining uniformity value by comparison with calibrated controls having established values (e.g., a test sample is assigned an intensity value of 3 if its intensity is comparable with a calibrated level 3 control, or the test sample is assigned an intensity value of 2 if its intensity is comparable to the calibrated level 2 control). Uniformity of staining that is heterogeneous or homogeneous also indicates increased CD37 expression. The color intensity and color uniformity values can be applied alone or in combination (eg, 2 homo, 2 hetero, 3 homo, 3 hetero, etc.). In another example, an increase in CD37 expression may be determined by detecting an increase of at least 2-fold, at least 3-fold, or at least 5-fold relative to control values (e.g., the level of expression in a biological sample, tissue, or cell from a subject without cancer or with cancer not characterized by elevated CD37 values). In another example, CD37 expression is assigned an H value. The values combine color intensity values with uniformity values using the calculation proposed herein. In another example, CD37 expression is measured by determining the percentage of cells that have at least a particular level of staining (e.g., at least 25% of cells have a value of at least 2, or at least 75% of cells have a value of at least 2).

Эталонный образец может быть применен для сопоставления и сравнения результатов, полученных способами, предложенными в настоящем описании, с исследуемым образцом. Эталонные образцы могут представлять собой клетки (например, линии клеток, осадки клеток) или ткань. Уровни CD37 в эталонном образце могут представлять собой абсолютное или относительное количество, диапазон количеств, минимальное и/или максимальное количество, среднее количество и/или медианное количество CD37. Диагностические способы, предложенные в настоящем описании, включают сравнение уровней экспрессии CD37 в исследуемом образце с эталонным значением. В некоторых вариантах реализации эталонное значение представляет собой уровень экспрессии CD37 в эталонном образце. Эталонное значение может представлять собой предварительно заданное значение, а также может быть определено с помощью эталонных образцов (например, контрольных биологических образцов или эталонных образцов), исследуемых параллельно с исследуемыми образцами. Эталонное значение может представлять собой индивидуальный порог отсечения, такой как медиана или среднее, или диапазон значений, такой как доверительный интервал. Эталонные значения могут быть предварительно установлены для различных подгрупп лиц, таких как лица, предрасположенные к раку, лица, имеющие рак ранней или поздней стадии, лица мужского и/или женского пола или лица, подвергавшиеся терапии рака. Примеры отрицательных эталонных образцов или значений и положительных эталонных образцов или значений описаны в настоящем описании.The reference sample can be used to compare and contrast the results obtained by the methods proposed herein with the test sample. The reference samples may be cells (eg, cell lines, cell pellets) or tissue. The levels of CD37 in a reference sample may be an absolute or relative amount, a range of amounts, a minimum and/or maximum amount, an average amount, and/or a median amount of CD37. Diagnostic methods proposed herein involve comparing CD37 expression levels in a test sample with a reference value. In some embodiments, the reference value is the level of CD37 expression in the reference sample. The reference value may be a predetermined value and may also be determined using reference samples (eg, control biological samples or reference samples) tested in parallel with the test samples. The reference value may be an individual cutoff such as a median or mean, or a range of values such as a confidence interval. Reference values may be pre-established for various subgroups of individuals, such as individuals predisposed to cancer, individuals with early or late stage cancer, males and/or females, or individuals who have undergone cancer therapy. Examples of negative reference samples or values and positive reference samples or values are described herein.

В некоторых вариантах реализации эталонный образец представляет собой образец из здоровой ткани, в частности соответствующую ткань, не пораженную раком, или соответствующую ткань, не пораженную раком, характеризующимся сверхэкспрессией CD37. Эти типы эталонных образцов называют отрицательными контрольными образцами или эталонными образцами. В других вариантах реализации эталонный образец представляет собой образец из опухоли, которая экспрессирует CD37. Эти типы эталонных образцов упоминаются как положительные контрольные образцы. Положительные контрольные образцы также могут быть использованы в качестве сравнительного индикатора типа (гетеро или гомо), степени (0, 1, 2, 3) интенсивности окрашивания, Н-значения и/или процентного содержания клеток, имеющих по меньшей мере конкретный уровень окрашивания, который коррелирует с уровнем экспрессии CD37. Положительные контрольные сравнительные образцы упоминаются как калиброванные эталонные образцы. Эталонные образцы с низким уровнем или отсутствием CD37 описаны в примерах в настоящем описании и также включают красную пульпу селезенки (например, моноциты и красные клетки крови), Т-клетки и межфолликулярную область миндалин человека. Экспрессирующие CD37 эталонные образцы описаны в примерах в настоящем описании и также включают белую пульпу селезенки (например, В-лимфоциты и маргинальную зону селезенки), зародышевый центр миндалин человека и мантийную зону миндалин человека. Примеры неэкспрессирующих линий клеток включают клетки 30019, а примеры экспрессирующих линий клеток включают В-клетки Дауди (Daudi), Ramos, Намальвы (Namalwa) и неходжкинской лимфомы RL. Другим положительным эталонным образцом с высоким уровнем CD37 является линия клеток, стабильно или временно трансфицированная CD37 (например, 300.19/CD37, как описано в опубликованной заявке США № 2015/0093397 и публикации РСТ WO 2013/149171, каждая из которых включена в настоящее описание посредством ссылки). Соответствующие положительные и отрицательные эталонные уровни CD37 для конкретного рака могут быть определены путем измерения уровней CD37 у одного или более подходящих субъектов, и такие эталонные уровни могут быть адаптированы к конкретным группам субъектов (например, эталонный уровень может быть сопоставлен с возрастом так, что могут быть проведены сравнения между уровнями CD37 в образцах от субъектов определенного возраста и эталонными уровнями для конкретного течения заболевания, фенотипа или их отсутствия в определенной возрастной группе). В контексте настоящего описания иммуногистохимия относится к гистохимическим и иммунологическим способам, используемым для анализа, например, клеток или тканей. Таким образом, термины иммуногистохимия, иммуноцитохимия и иммунохимия используются взаимозаменяемо.In some embodiments, the reference sample is a sample from healthy tissue, particularly corresponding tissue free of cancer or corresponding tissue free of cancer characterized by CD37 overexpression. These types of reference samples are called negative control samples or reference samples. In other embodiments, the reference sample is a sample from a tumor that expresses CD37. These types of reference samples are referred to as positive controls. Positive controls can also be used as a comparative indicator of type (hetero or homo), grade (0, 1, 2, 3) of staining intensity, H-value, and/or percentage of cells having at least a particular staining level that correlates with the level of CD37 expression. Positive control comparative samples are referred to as calibrated reference samples. Reference samples with low or absent CD37 are described in the examples herein and also include splenic red pulp (eg, monocytes and red blood cells), T cells, and the interfollicular region of human tonsils. CD37-expressing reference samples are described in the examples herein and also include splenic white pulp (eg, B cells and splenic marginal zone), human tonsil germinal center, and human tonsil mantle zone. Examples of non-expressing cell lines include 30019 cells, and examples of expressing cell lines include Daudi, Ramos, Namalwa and RL non-Hodgkin's lymphoma B cells. Another high CD37 positive reference sample is a cell line stably or transiently transfected with CD37 (e.g., 300.19/CD37, as described in US Pub. No. 2015/0093397 and PCT Pub. WO 2013/149171, each of which is incorporated herein by links). Appropriate positive and negative CD37 reference levels for a particular cancer can be determined by measuring CD37 levels in one or more suitable subjects, and such reference levels can be tailored to specific groups of subjects (for example, the reference level can be age-matched so that comparisons have been made between CD37 levels in samples from subjects of a certain age and reference levels for a specific disease course, phenotype, or absence thereof in a specific age group). As used herein, immunohistochemistry refers to histochemical and immunological techniques used to analyze, for example, cells or tissues. Thus, the terms immunohistochemistry, immunocytochemistry, and immunochemistry are used interchangeably.

- 7 044601- 7 044601

Образец или биологический образец согласно настоящему изобретению имеет биологическое происхождение, в конкретных вариантах реализации такое, как происхождение от эукариотических организмов. В некоторых вариантах реализации образец представляет собой образец от человека, но образцы от животных также могут быть использованы в практике согласно настоящему изобретению. Неограничивающие источники образца для применения в контексте настоящего изобретения включают, например, солидные ткани, аспираты биопсий, жидкие экстракты, кровь, плазму, сыворотку, спинномозговую жидкость, лимфатическую жидкость, наружные срезы кожи, дыхательных, кишечных и мочеполовых путей, слезы, слюну, молоко, опухоли, органы, культуры клеток и/или компоненты культур клеток. Образец рака (раковый образец) представляет собой образец, который содержит раковую клетку. Способы, предложенные в настоящем описании, могут быть пригодны для применения для образцов солидной ткани, где количество доступного материала мало. Способы, предложенные в настоящем описании, могут быть применены для исследования аспекта экспрессии CD37 или состояния образца, включая, но не ограничиваясь ими, сравнение различных типов клеток или тканей и обнаружение или определение наличия и/или типа заболевания или отклонения от нормы.The sample or biological sample of the present invention is of biological origin, in particular embodiments such as being from eukaryotic organisms. In some embodiments, the sample is a human sample, but animal samples may also be used in the practice of the present invention. Non-limiting sample sources for use in the context of the present invention include, for example, solid tissues, biopsy aspirates, liquid extracts, blood, plasma, serum, cerebrospinal fluid, lymph fluid, external sections of skin, respiratory, intestinal and genitourinary tracts, tears, saliva, milk , tumors, organs, cell cultures and/or components of cell cultures. A cancer sample (cancer sample) is a sample that contains a cancer cell. The methods proposed herein may be suitable for use with solid tissue samples where the amount of material available is low. The methods provided herein can be used to examine an aspect of CD37 expression or the condition of a sample, including, but not limited to, comparing different cell or tissue types and detecting or determining the presence and/or type of disease or abnormality.

Для целей настоящего описания срез образца ткани относится к отдельной части или фрагменту образца ткани, например тонкому слою ткани или клеток, вырезанных из образца ткани. Понятно, что множество срезов образцов ткани может быть взято и подвергнуто анализу в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых случаях выбранная часть или срез ткани содержит гомогенную популяцию клеток. В других случаях выбранная часть содержит область ткани, например просвет, в качестве неограничивающего примера. Выбранная часть может быть небольшой, как одна клетка или две клетки, или может представлять собой, например, многие тысячи клеток. В большинстве случаев сбор клеток важен, и хотя настоящее изобретение было описано для применения при обнаружении клеточных компонентов, способ может также быть применен для обнаружения неклеточных компонентов организма (например, растворимых компонентов в крови в качестве неограничивающего примера).For purposes of this description, a tissue sample section refers to a single portion or fragment of a tissue sample, such as a thin layer of tissue or cells cut from a tissue sample. It will be understood that multiple sections of tissue samples can be taken and analyzed in accordance with the present invention. In some cases, the selected portion or section of tissue contains a homogeneous population of cells. In other cases, the selected portion comprises an area of tissue, such as a lumen, as a non-limiting example. The selected portion may be as small as one cell or two cells, or may be many thousands of cells, for example. In most cases, collection of cells is important, and although the present invention has been described for use in the detection of cellular components, the method can also be applied to the detection of non-cellular components of the body (eg, soluble components in the blood as a non-limiting example).

В контексте настоящего описания термин захватывающий реагент относится к реагенту, способному связывать и захватывать молекулу-мишень в образце таким образом, что при подходящих условиях комплекс захватывающий реагент - молекула-мишень может быть отделен от остальной части образца. В одном из вариантов реализации захватывающий реагент иммобилизован. В одном из вариантов реализации захватывающий реагент в сэндвич-иммуноанализе представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или смесь различных антител или их антигенсвязывающих фрагментов к целевому антигену.As used herein, the term capture reagent refers to a reagent capable of binding and capturing a target molecule in a sample such that, under suitable conditions, the capture reagent-target molecule complex can be separated from the rest of the sample. In one embodiment, the capture reagent is immobilized. In one embodiment, the capture reagent in a sandwich immunoassay is an antibody or an antigen-binding fragment thereof or a mixture of different antibodies or antigen-binding fragments thereof to a target antigen.

В контексте настоящего описания термин обнаруживаемое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, которое/который может быть обнаружено либо непосредственно через метку, усиленную с помощью средства обнаружения, либо опосредованно с помощью, например, другого антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, являющегося меченым. Для прямого мечения антитело или его антигенсвязывающий фрагмент обычно конъюгируют с фрагментом, который может быть обнаружен каким-либо средством. В одном из вариантов реализации обнаруживаемое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой биотинилированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. В контексте настоящего описания термин средство обнаружения относится к фрагменту или методике, используемым для обнаружения присутствия обнаруживаемого антитела или его антигенсвязывающего фрагмента и включает агенты для детекции, которые усиливают иммобилизованную метку, такую как метка, иммобилизованная на планшете для микротитрования. В одном из вариантов реализации средство обнаружения представляет собой флуориметрический агент для детекции, такой как авидин или стрептавидин.As used herein, the term detectable antibody or antigen-binding fragment thereof refers to an antibody or antigen-binding fragment thereof that can be detected either directly through a label enhanced by a detection agent or indirectly through, for example, another antibody or antigen-binding fragment thereof, being labeled. For direct labeling, an antibody or antigen-binding fragment thereof is typically conjugated to a moiety that can be detected by some means. In one embodiment, the detectable antibody or antigen binding fragment thereof is a biotinylated antibody or antigen binding fragment thereof. As used herein, the term detection agent refers to a moiety or technique used to detect the presence of a detectable antibody or antigen binding fragment thereof and includes detection agents that enhance an immobilized label, such as a label immobilized on a microtiter plate. In one embodiment, the detection agent is a fluorimetric detection agent such as avidin or streptavidin.

Обычно сэндвич-ELISA включает следующие стадии: (1) планшет для микротитрования покрывают захватывающим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом; (2) добавляют образец, и любой присутствующий антиген связывается с захватывающим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом; (3) добавляют антитело для детекции или его антигенсвязывающий фрагмент, которое/который связывается с антигеном; (4) добавляют связанное с ферментом вторичное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которое/который связывается с антителом для детекции или его антигенсвязывающим фрагментом; и (5) добавляют субстрат, который конвертируется ферментом в обнаруживаемую форму.Typically, a sandwich ELISA involves the following steps: (1) a microtiter plate is coated with a capture antibody or antigen-binding fragment thereof; (2) a sample is added and any antigen present is bound to the capture antibody or antigen-binding fragment thereof; (3) adding a detection antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to the antigen; (4) adding an enzyme-linked secondary antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the detection antibody or antigen-binding fragment thereof; and (5) add a substrate that is converted by the enzyme to a detectable form.

Термин метка в контексте настоящего описания относится к обнаруживаемому соединению или композиции, непосредственно или опосредованно конъюгированным с антителом с получением меченого антитела. Метка может быть обнаруживаемой сама по себе (например, радиоизотопные метки или флуоресцентные метки) или, в случае ферментной метки, может катализировать химическое изменение субстратного соединения или композиции, которая является обнаруживаемой.The term label as used herein refers to a detectable compound or composition directly or indirectly conjugated to an antibody to produce a labeled antibody. The label may be detectable in itself (eg, radioisotope labels or fluorescent labels) or, in the case of an enzyme label, may catalyze a chemical change in the substrate compound or composition that is detectable.

Под терминами коррелировать или коррелирующей подразумевается сравнение любым способом характеристики и/или результатов первого анализа с характеристикой и/или результатами второго анализа. Например, можно использовать результаты первого анализа при проведении второго анализа и/или можно использовать результаты первого анализа для определения, должен ли выполняться второй анализ, и/или можно сравнивать результаты первого анализа с результатами второго анализа. В одном изThe terms correlate or correlate mean comparison in any way of the characteristics and/or results of the first analysis with the characteristics and/or results of the second analysis. For example, the results of the first analysis may be used in conducting a second analysis, and/or the results of the first analysis may be used to determine whether a second analysis should be performed, and/or the results of the first analysis may be compared with the results of the second analysis. In one of

- 8 044601 вариантов реализации повышенная экспрессия CD37 коррелирует с повышенной вероятностью эффективности нацеленной на CD37 противораковой терапии.- 8 044601 embodiments, increased expression of CD37 correlates with an increased likelihood of effectiveness of CD37-targeted anticancer therapy.

Термин антитело означает молекулу иммуноглобулина, которая распознает и специфично связывается с мишенью, такой как белок, полипептид, пептид, углевод, полинуклеотид, липид или комбинации указанного, посредством по меньшей мере одного сайта распознавания антигена в пределах вариабельной области молекулы иммуноглобулина. В контексте настоящего описания термин антитело охватывает интактные поликлональные антитела, интактные моноклональные антитела, мультиспецифические антитела, такие как биспецифические антитела, полученные по меньшей мере из двух интактных антител, химерные антитела, гуманизированные антитела, антитела человека, химерные белки, содержащие антитело, и любую другую модифицированную молекулу иммуноглобулина при условии, что указанные антитела проявляют желаемую биологическую активность. Антитело может принадлежать к любому из пяти основных классов иммуноглобулинов: IgA, IgD, IgE, IgG и IgM или их подклассов (изотипов) (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2), основанных на идентичности константных доменов их тяжелых цепей, обозначаемых альфа, дельта, эпсилон, гамма и мю соответственно. Различные классы иммуноглобулинов имеют различные и хорошо известные структуры субъединиц и трехмерные конфигурации. Антитела могут быть неконъюгированными или конъюгированными с другими молекулами, такими как токсины, радиоизотопы и т.д.The term antibody means an immunoglobulin molecule that recognizes and specifically binds to a target, such as a protein, polypeptide, peptide, carbohydrate, polynucleotide, lipid, or combination thereof, through at least one antigen recognition site within the variable region of the immunoglobulin molecule. As used herein, the term antibody includes intact polyclonal antibodies, intact monoclonal antibodies, multispecific antibodies such as bispecific antibodies derived from at least two intact antibodies, chimeric antibodies, humanized antibodies, human antibodies, chimeric proteins containing an antibody, and any other a modified immunoglobulin molecule, provided that said antibodies exhibit the desired biological activity. An antibody may belong to any of the five major immunoglobulin classes: IgA, IgD, IgE, IgG, and IgM, or subclasses (isotypes) thereof (e.g., IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, and IgA2), based on the identity of their heavy chain constant domains , denoted alpha, delta, epsilon, gamma and mu, respectively. Different classes of immunoglobulins have different and well-known subunit structures and three-dimensional configurations. Antibodies may be unconjugated or conjugated to other molecules such as toxins, radioisotopes, etc.

Термин фрагмент антитела относится к части интактного антитела.The term antibody fragment refers to a portion of an intact antibody.

Антигенсвязывающий фрагмент относится к части интактного антитела, которая связывается с антигеном. Антигенсвязывающий фрагмент может содержать вариабельные области интактного антитела, соответствующие антигену. Примеры фрагментов антител включают, но не ограничиваются ими, фрагменты Fab, Fab', F(ab')2 и Fv, линейные антитела и одноцепочечные антитела. Примеры фрагментов антител, охватываемых термином антигенсвязывающий фрагмент антитела, включают (без ограничения) (i) фрагмент Fab, моновалентный фрагмент, состоящий из доменов VL, VH, CL и СН1 (например, антитело, расщепляемое папаином с образованием трех фрагментов: двух антигенсвязывающих фрагментов Fab и одного фрагмента Fc, который не связывает антиген); (ii) фрагмент F(ab')2, бивалентный фрагмент, содержащий два фрагмента Fab, соединенных дисульфидным мостиком в шарнирной области (например, антитело, расщепляемое пепсином с образованием двух фрагментов: бивалентного антигенсвязывающего фрагмента F(ab')2 и фрагмента pFc', который не связывает антиген) и родственную ему моновалентную единицу F(ab'); (iii) фрагмент Fd, состоящий из доменов VH и СН1 (т.е. та часть тяжелой цепи, которая включена в Fab); (iv) фрагмент Fv, состоящий из доменов VL и VH одного плеча антитела, и родственный стабилизированный дисульфидной связью Fv и (v) фрагмент dAb (доменное антитело) или sdAb (однодоменное антитело) (Ward et al., Nature 341:544-546, 1989), который состоит из домена VH.An antigen-binding fragment refers to the part of an intact antibody that binds to an antigen. The antigen binding fragment may contain variable regions of the intact antibody corresponding to the antigen. Examples of antibody fragments include, but are not limited to, Fab, Fab', F(ab')2 and Fv fragments, linear antibodies and single chain antibodies. Examples of antibody fragments encompassed by the term antigen-binding antibody fragment include, but are not limited to: (i) a Fab fragment, a monovalent fragment consisting of the VL, VH, CL, and CH1 domains (e.g., an antibody cleaved by papain to produce three fragments: two antigen-binding Fab fragments and one Fc fragment that does not bind antigen); (ii) F(ab')2 fragment, a bivalent fragment containing two Fab fragments linked by a disulfide bridge at the hinge region (e.g., an antibody cleaved by pepsin to produce two fragments: a bivalent antigen-binding fragment F(ab')2 and a pFc' fragment , which does not bind antigen) and its related monovalent unit F(ab'); (iii) an Fd fragment consisting of the VH and CH1 domains (ie, that part of the heavy chain that is included in the Fab); (iv) an Fv fragment consisting of the VL and VH domains of one arm of the antibody and a related disulfide bond-stabilized Fv; and (v) a dAb (domain antibody) or sdAb (single domain antibody) fragment (Ward et al., Nature 341:544-546 , 1989), which consists of the VH domain.

В некоторых вариантах реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой неприродное антитело. В некоторых вариантах реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент получают очисткой из природных компонентов. В некоторых вариантах реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент получают рекомбинантным способом. В некоторых вариантах реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент получают с помощью гибридомы.In some embodiments, the antibody or antigen-binding fragment thereof is a non-naturally occurring antibody. In some embodiments, the antibody or antigen-binding fragment thereof is obtained by purification from natural components. In some embodiments, the antibody or antigen-binding fragment thereof is produced recombinantly. In some embodiments, the antibody or antigen-binding fragment thereof is produced using a hybridoma.

Блокирующее антитело или антитело-антагонист представляет собой антитело, которое ингибирует или снижает биологическую активность связанного с ним антигена, такого как CD37. В конкретном варианте реализации блокирующие антитела или антитела-антагонисты в значительной степени или полностью ингибируют биологическую активность антигена. Предпочтительно, чтобы биологическая активность снижалась на 10, 20, 30, 50, 70, 80, 90, 95 или даже 100%.A blocking antibody or antagonist antibody is an antibody that inhibits or reduces the biological activity of its associated antigen, such as CD37. In a specific embodiment, blocking antibodies or antagonist antibodies significantly or completely inhibit the biological activity of the antigen. Preferably, the biological activity is reduced by 10, 20, 30, 50, 70, 80, 90, 95 or even 100%.

Термин антитело к CD37 или антитело, которое связывается с CD37 относится к антителу, способному связываться с CD37 с достаточной аффинностью, так что указанное антитело пригодно для применения в качестве диагностического и/или терапевтического агента при нацеливании на CD37. Степень связывания антитела к CD37 с посторонним белком, не являющимся CD37, составляет менее приблизительно 10% от степени связывания антитела с CD37, как измерено, например, посредством радиоиммуноанализа (РИА). В некоторых вариантах реализации антитело, которое связывается с CD37, характеризуется константой диссоциации (Kd) <1 мкМ, <100 нМ, <10 нМ, <1 нМ или <0,1 нМ. Примеры антител к CD37 известны в данной области техники и раскрыты, например, в опубликованной заявке США № 2011/0256153, которая включена в настоящее описание посредством ссылки.The term anti-CD37 antibody or antibody that binds to CD37 refers to an antibody capable of binding to CD37 with sufficient affinity such that the antibody is suitable for use as a diagnostic and/or therapeutic agent when targeting CD37. The extent of binding of an anti-CD37 antibody to a non-CD37 foreign protein is less than about 10% of the extent of binding of an anti-CD37 antibody as measured, for example, by radioimmunoassay (RIA). In some embodiments, an antibody that binds to CD37 has a dissociation constant (Kd) of <1 μM, <100 nM, <10 nM, <1 nM, or <0.1 nM. Examples of anti-CD37 antibodies are known in the art and are disclosed, for example, in US Published Application No. 2011/0256153, which is incorporated herein by reference.

Моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент относится к гомогенной популяции антител или антигенсвязывающих фрагментов, вовлеченной в высокоспецифическое распознавание и связывание одной антигенной детерминанты или эпитопа. Это отличает их от поликлональных антител, которые обычно включают различные антитела, направленные против различных антигенных детерминант. Термин моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент охватывает интактные и полноразмерные моноклональные антитела, а также фрагменты антител (такие как Fab, Fab', F(ab')2, Fv), одноцепочечные (scFv) мутанты, химерные белки, содержащие участок антитела, и любую другую модифицированную молекулу иммуноглобулина, содержащую сайт распознавания антигена. Кроме того, моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент относится к таким анти- 9 044601 телам и их антигенсвязывающим фрагментам, полученным любым количеством способов, включая, но не ограничиваясь ими, гибридому, фаговый дисплей, экспрессию рекомбинантных генов и использование трансгенных животных.A monoclonal antibody or antigen-binding fragment thereof refers to a homogeneous population of antibodies or antigen-binding fragments involved in highly specific recognition and binding of a single antigenic determinant or epitope. This distinguishes them from polyclonal antibodies, which typically comprise different antibodies directed against different antigenic determinants. The term monoclonal antibody or antigen-binding fragment thereof covers intact and full-length monoclonal antibodies, as well as antibody fragments (such as Fab, Fab', F(ab') 2 , Fv), single chain (scFv) mutants, chimeric proteins containing the antibody region, and any other modified immunoglobulin molecule containing an antigen recognition site. In addition, a monoclonal antibody or antigen-binding fragment thereof refers to such antibodies and antigen-binding fragments thereof produced by any number of methods, including, but not limited to, hybridoma, phage display, recombinant gene expression, and the use of transgenic animals.

Термин гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент относится к формам антител или антигенсвязывающих фрагментов, не являющихся человеческими (например, мышиных), которые представляют собой специфические цепи иммуноглобулинов, химерные иммуноглобулины или их фрагменты, которые содержат минимальные последовательности, не являющиеся человеческими (например, мышиные). Как правило, гуманизированные антитела или их антигенсвязывающие фрагменты представляют собой иммуноглобулины человека, в которых остатки в участках, определяющих комплементарность (CDR), заменены остатками CDR других видов, отличных от человека, (например, мыши, крысы, кролика, хомяка), обладающими желаемой специфичностью, аффинностью и связывающей способностью (Jones et al., 1986, Nature, 321:522-525, Riechmann et al., 1988, Nature, 332:323-327, Verhoeyen et al., 1988, Science, 239:1534-1536). В некоторых случаях остатки каркасного участка Fv (FR) иммуноглобулина человека заменены соответствующими остатками антитела или фрагмента от других видов, отличных от человека, которые имеют желаемую специфичность, аффинность и связывающую способность. Гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут быть дополнительно модифицированы посредством замещения дополнительных остатков либо в каркасном участке Fv, либо/и остатков из числа замещенных, не являющихся человеческими, для коррекции и оптимизации специфичности, аффинности и/или связывающей способности антитела или его антигенсвязывающего фрагмента. В целом гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент будет содержать по существу все по меньшей мере из одного, а как правило двух или трех вариабельных доменов, содержащих все или по существу все участки CDR, которые соответствуют иммуноглобулину, не являющемуся человеческим, тогда как все или по существу все участки FR представляют собой участки FR консенсусной последовательности иммуноглобулина человека. Гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут также содержать по меньшей мере часть константной области или домена (Fc) иммуноглобулина, как правило иммуноглобулина человека. Примеры способов, используемых для получения гуманизированных антител, описаны в патентах США № 5225539 или 5639641.The term humanized antibody or antigen-binding fragment thereof refers to non-human (e.g., murine) forms of antibodies or antigen-binding fragments that are specific immunoglobulin chains, chimeric immunoglobulins, or fragments thereof that contain minimal non-human (e.g., murine) sequences. . Typically, humanized antibodies or antigen-binding fragments thereof are human immunoglobulins in which residues in the complementarity determining regions (CDRs) are replaced by CDR residues from a non-human species (eg, mouse, rat, rabbit, hamster) having the desired specificity, affinity and binding capacity (Jones et al., 1986, Nature, 321:522-525, Riechmann et al., 1988, Nature, 332:323-327, Verhoeyen et al., 1988, Science, 239:1534- 1536). In some cases, human immunoglobulin Fv framework region (FR) residues are replaced with corresponding antibody or fragment residues from other non-human species that have the desired specificity, affinity and binding ability. The humanized antibody or antigen binding fragment thereof may be further modified by substitution of additional residues in either the Fv framework region and/or substituted non-human residues to adjust and optimize the specificity, affinity and/or binding ability of the antibody or antigen binding fragment thereof. In general, a humanized antibody or antigen binding fragment thereof will comprise substantially all of at least one, and typically two or three, variable domains containing all or substantially all of the CDR regions that correspond to a non-human immunoglobulin, while all or essentially all FR regions are FR regions of the human immunoglobulin consensus sequence. The humanized antibody or antigen binding fragment thereof may also comprise at least a portion of a constant region or domain (Fc) of an immunoglobulin, typically a human immunoglobulin. Examples of methods used to produce humanized antibodies are described in US Pat. No. 5,225,539 or 5,639,641.

Термин первичное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в настоящем описании относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, которое/который специфично связывается с целевым белковым антигеном в образце. Первичное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент как правило является первым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, используемым при выполнении иммуногистохимического анализа. В одном из вариантов реализации первичное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент является единственным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, используемым при выполнении иммуногистохимического анализа.The term primary antibody or antigen-binding fragment thereof as used herein refers to an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to a target protein antigen in a sample. The primary antibody or antigen-binding fragment thereof is typically the first antibody or antigen-binding fragment thereof used in performing an immunohistochemical assay. In one embodiment, the primary antibody or antigen-binding fragment thereof is the only antibody or antigen-binding fragment thereof used in performing the immunohistochemical analysis.

Термин вторичное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в настоящем описании относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, которое/который специфично связывается с первичным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, образуя таким образом мостик между первичным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом и последующим реагентом, если таковой имеется. Вторичное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, как правило, является вторым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, используемым при выполнении иммуногистохимического анализа. Термин третичное антитело в настоящем описании относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, которое/который специфично связывается со вторичным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, образуя таким образом мостик между вторичным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом и последующим реагентом, если таковой имеется.The term secondary antibody or antigen-binding fragment thereof as used herein refers to an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to a primary antibody or antigen-binding fragment thereof, thereby forming a bridge between the primary antibody or antigen-binding fragment thereof and the subsequent reagent, if any. A secondary antibody or antigen-binding fragment thereof is typically a second antibody or antigen-binding fragment thereof used in performing an immunohistochemical assay. The term tertiary antibody as used herein refers to an antibody or antigen binding fragment thereof that specifically binds to a secondary antibody or antigen binding fragment thereof, thereby forming a bridge between the secondary antibody or antigen binding fragment thereof and the downstream reagent, if any.

Вариабельная область антитела или его антигенсвязывающего фрагмента относится к вариабельной области легкой цепи антитела или вариабельной области тяжелой цепи антитела как отдельно, так и в комбинации. Вариабельные области тяжелой и легкой цепи состоят каждая из четырех каркасных участков (FR), соединенных тремя участками, определяющими комплементарность (CDR), также известными как гипервариабельные области. Участки CDR в каждой цепи удерживаются вместе в непосредственной близости от участков FR и вместе с участками CDR другой цепи способствуют образованию антигенсвязывающего сайта антител. Существует по меньшей мере два способа определения участков CDR: (1) подход, основанный на межвидовой изменчивости последовательностей (например, Kabat et al.? Sequences of Proteins of Immunological Interest, (5th ed., 1991, National Institutes of Health, Bethesda Md.)); и (2) подход, основанный на кристаллографических исследованиях комплексов антиген-антитело (Al-lazikani et al. (1997), J. Molec. Biol. 273:927-948)). Помимо этого в данной области техники для определения CDR иногда используют комбинации этих двух подходов.The variable region of an antibody or antigen-binding fragment thereof refers to the variable region of an antibody light chain or the variable region of an antibody heavy chain, either alone or in combination. The heavy and light chain variable regions each consist of four framework regions (FRs) connected by three complementarity determining regions (CDRs), also known as hypervariable regions. The CDR regions of each chain are held together in close proximity to the FR regions and, together with the CDR regions of the other chain, contribute to the formation of the antigen-binding site of antibodies. There are at least two ways to determine CDR regions: (1) an approach based on interspecies sequence variation (e.g., Kabat et al.? Sequences of Proteins of Immunological Interest, ( 5th ed., 1991, National Institutes of Health, Bethesda Md. .)); and (2) an approach based on crystallographic studies of antigen-antibody complexes (Alazikani et al. (1997), J. Molec. Biol. 273:927-948). In addition, combinations of these two approaches are sometimes used in the art to determine CDR.

Систему нумерации Кабата обычно используют при указании остатков в вариабельном домене (остатки приблизительно 1-107 легкой цепи и остатки приблизительно 1-113 тяжелой цепи) (например, Kabat et al., Sequences of Immunological Interest. 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991))). Нумерация положения аминокислоты по Кабату относится к системе нумерации, используемой для вариабельных доменов тяжелой цепи или вариабельных доменов легкой цепи в составе антител, описанной в источнике Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed.The Kabat numbering system is commonly used when indicating residues in the variable domain (residues approximately 1-107 of the light chain and approximately 1-113 of the heavy chain) (e.g., Kabat et al., Sequences of Immunological Interest. 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)). Kabat amino acid position numbering refers to the numbering system used for heavy chain variable domains or light chain variable domains in antibodies, described in Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed.

- 10 044601- 10 044601

Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991). При использовании этой системы нумерации фактическая линейная аминокислотная последовательность может содержать меньшее количество аминокислот или дополнительные аминокислоты в соответствии с укорочением или вставкой в участках FR или CDR вариабельного домена. Например, вариабельный домен тяжелой цепи может включать одну аминокислотную вставку (остаток 52а по Кабату) после остатка 52 в Н2 и вставленные остатки (например, остатки 82а, 82b и 82с и т.д. по Кабату) после остатка 82 FR тяжелой цепи. Нумерация остатков по Кабату для данного антитела может быть определена посредством сравнения в областях гомологии последовательности антитела со стандартной последовательностью, пронумерованной по Кабату. Вместо этого Чотиа указывает на расположение структурных петель (Chothia и Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). Конец петли CDR-H1 по Чотиа при нумерации с использованием нумерации по Кабату варьирует между Н32 и Н34 в зависимости от длины петли (это происходит потому, что схема нумерации по Кабату помещает вставки в положениях Н35А и Н35В; если ни 35А, ни 35В не присутствуют, то цикл заканчивается на положении 32, если присутствует только 35А, цикл заканчивается на положении 33; если присутствуют и 35А, и 35В, то цикл заканчивается на положении 34). Гипервариабельные области согласно AbM представляют собой компромисс между CDR по Кабату и структурными петлями по Чотиа и используются программой моделирования антител Oxford Molecular's AbM.Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991). When using this numbering system, the actual linear amino acid sequence may contain fewer amino acids or additional amino acids in accordance with the truncation or insertion in the FR or CDR regions of the variable domain. For example, a heavy chain variable domain may include one amino acid insertion (Kabat residue 52a) after residue 52 in H2 and inserted residues (eg, Kabat residues 82a, 82b and 82c, etc.) after heavy chain FR residue 82. The Kabat numbering of residues for a given antibody can be determined by comparing regions of homology between the antibody sequence and a standard Kabat numbered sequence. Instead, Chothia refers to the location of the structural loops (Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). The end of the Chotia CDR-H1 loop when numbered using Kabat numbering varies between H32 and H34 depending on the length of the loop (this is because the Kabat numbering scheme places inserts at positions H35A and H35B; if neither 35A nor 35B is present , then the cycle ends at position 32, if only 35A is present, the cycle ends at position 33; if both 35A and 35B are present, then the cycle ends at position 34). AbM hypervariable regions represent a compromise between Kabat's CDRs and Chotia's structural loops and are used by Oxford Molecular's AbM antibody modeling program.

Петля A loop Кабат Kabat АЪМ ABM Чотиа Chotia T.I T.I. I.24-I.34 I.24-I.34 Т.24-1,34 T.24-1.34 1.24-1,34 1.24-1.34 L2 L2 L50-L56 L50-L56 L50-L56 L50-L56 L5O-L56 L5O-L56 L3 L3 L89-L97 L89-L97 L89-L97 L89-L97 L89-L97 L89-L97 Н1 H1 Н31-Н35В Н31-Н35В Н26-Н35В (Нумерация Н26-Н35В (Numbering Н26-Н32..34 по Кабату) N26-N32..34 according to Kabat) ш w ΙΙ31-Π35 ΙΙ31-Π35 II26-II35 ΙΙ26-Π32 (Нумерация по Чотиа) II26-II35 ΙΙ26-Π32 (Numbering according to Chotia) Н2 H2 H50-H65 H50-H65 Н50-Н58 H50-H58 Н52-Н56 H52-H56 НЗ NZ Н95-Н102 N95-N102 Н95-Н102 N95-N102 Н95-Н102 N95-N102

Термин антитело человека (человеческое антитело) или его антигенсвязывающий фрагмент означает антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, продуцируемые человеком, или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, имеющие аминокислотную последовательность, соответствующую антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, продуцируемому человеком, полученные с применением любого способа, известного в данной области техники. Это определение антитела человека или его антигенсвязывающего фрагмента включает интактные или полноразмерные антитела, их фрагменты.The term human antibody (human antibody) or antigen-binding fragment thereof means an antibody or antigen-binding fragment thereof produced by a human, or an antibody or antigen-binding fragment thereof having an amino acid sequence corresponding to an antibody or antigen-binding fragment thereof produced by a human, obtained using any method known in the art. this field of technology. This definition of a human antibody or antigen-binding fragment thereof includes intact or full-length antibodies and fragments thereof.

Термин химерные антитела или их антигенсвязывающие фрагменты относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, в которых аминокислотная последовательность получена от двух или более видов. Как правило, вариабельная область как легкой, так и тяжелой цепей соответствует вариабельной области антител или их антигенсвязывающих фрагментов с желаемой специфичностью, аффинностью и связывающей способностью, полученных от одного вида млекопитающих (например, мыши, крысы, кролика и т.д.), тогда как константные области гомологичны последовательностям в антителах или их антигенсвязывающих фрагментах, полученных от другого вида (обычно человека), чтобы избежать возникновения иммунного ответа у этих видов.The term chimeric antibodies or antigen-binding fragments thereof refers to antibodies or antigen-binding fragments thereof in which the amino acid sequence is derived from two or more species. Typically, the variable region of both the light and heavy chains corresponds to the variable region of antibodies or antigen-binding fragments thereof with the desired specificity, affinity and binding ability obtained from the same mammalian species (eg, mouse, rat, rabbit, etc.), then as constant regions are homologous to sequences in antibodies or antigen-binding fragments thereof derived from another species (usually humans), to avoid eliciting an immune response in those species.

Термины эпитоп или антигенная детерминанта используются в настоящем описании взаимозаменяемо и относятся к той части антигена, которая может быть распознана и специфично связана конкретным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом. В случае, когда антиген является полипептидом, эпитопы могут быть образованы как смежными аминокислотами, так и несмежными аминокислотами, сближающимися при укладке белка в третичную структуру. Эпитопы, образованные из смежных аминокислот, обычно сохраняются при денатурации белка, тогда как эпитопы, образованные при укладке белка в третичную структуру, обычно теряются при денатурации белка. Эпитоп обычно включает по меньшей мере 3, а как правило по меньшей мере 5 или 8-10 аминокислот в уникальной пространственной конформации.The terms epitope or antigenic determinant are used interchangeably herein and refer to that portion of an antigen that can be recognized and specifically bound by a particular antibody or antigen-binding fragment thereof. In the case when the antigen is a polypeptide, epitopes can be formed both by adjacent amino acids and by non-adjacent amino acids that come closer together when the protein is folded into the tertiary structure. Epitopes formed from contiguous amino acids are usually retained when the protein is denatured, whereas epitopes formed when the protein is folded into a tertiary structure are usually lost when the protein denatures. An epitope typically comprises at least 3, and typically at least 5 or 8-10 amino acids, in a unique spatial conformation.

Аффинность связывания в целом относится к прочности суммарного количества нековалентных взаимодействий между отдельно взятым сайтом связывания молекулы (например, антитела) и связывающимся с ней партнером (например, антигеном). Если не указано иное, в контексте настоящего описания аффинность связывания относится к собственной аффинности связывания, которая отражает взаимодействие между членами связывающейся пары (например, антителом и антигеном) в отношении 1:1. Аффинность молекулы X в отношении ее партнера Y обычно может быть охарактеризована константой диссоциации (Kd). Аффинность может быть измерена обычными способами, известными в данной области техники, включая описанные в настоящем описании. Низкоаффинные антитела, как правило, медленно связываются с антигеном и склонны легко диссоциировать, тогда как высокоаффинные антитела, как правило, связываются с антигеном быстрее и склонны дольше оставаться связанными. В данной области техники известны различные способы измерения аффинности связывания, любой из которых мо- 11 044601 жет быть применен для целей настоящего изобретения. Конкретные иллюстративные варианты реализации описаны ниже.Binding affinity generally refers to the strength of the total number of noncovalent interactions between a single binding site of a molecule (eg, an antibody) and its binding partner (eg, an antigen). Unless otherwise specified, as used herein, binding affinity refers to intrinsic binding affinity, which reflects the interaction between members of a binding pair (eg, antibody and antigen) in a 1:1 ratio. The affinity of a molecule X for its partner Y can usually be characterized by a dissociation constant (Kd). Affinity can be measured by conventional methods known in the art, including those described herein. Low-affinity antibodies tend to bind antigen slowly and tend to dissociate easily, whereas high-affinity antibodies tend to bind antigen more quickly and tend to remain bound longer. Various methods for measuring binding affinity are known in the art, any of which can be used for the purposes of the present invention. Specific illustrative embodiments are described below.

Или лучше в контексте настоящего описания в отношении аффинности связывания относится к более сильному связыванию между молекулой и связывающимся с ней партнером. Или лучше в контексте настоящего описания относится к более сильному связыванию, характеризующемуся меньшим численным значением Kd. Например, для антитела, которое имеет аффинность к антигену 0,6 нМ или лучше, аффинность антитела к антигену составляет <0,6 нМ, т.е. 0,59 нМ, 0,58 нМ, 0,57 нМ и т.д. или любое значение менее 0,6 нМ.Or better as used herein, binding affinity refers to a stronger binding between a molecule and its binding partner. Or better in the context of the present description refers to a stronger binding characterized by a lower numerical value of Kd. For example, for an antibody that has an affinity for an antigen of 0.6 nM or better, the affinity of the antibody for the antigen is <0.6 nM, i.e. 0.59 nM, 0.58 nM, 0.57 nM, etc. or any value less than 0.6 nM.

Фраза по существу подобный или по существу такой же в контексте настоящего описания означает достаточно высокую степень сходства между двумя числовыми значениями (как правило, одно связано с антителом согласно настоящему изобретению, а другое связано с эталонным антителом/антителом сравнения), так что специалисту в данной области техники было бы понятно, что разница между этими двумя значениями имеет малую биологическую и/или статистическую значимость или вообще не имеет биологической и/или статистической значимости в контексте биологических характеристик, определяемых указанными значениями (например, значения Kd). Разница между указанными двумя значениями составляет менее приблизительно 50%, менее приблизительно 40%, менее приблизительно 30%, менее приблизительно 20% или менее приблизительно 10% в зависимости от значения для эталонного антитела/антитела сравнения.The phrase substantially similar or substantially the same as used herein means a sufficiently high degree of similarity between two numerical values (typically one associated with an antibody of the present invention and the other associated with a reference/comparison antibody) such that one skilled in the art It would be clear in the art that the difference between these two values has little or no biological and/or statistical significance in the context of the biological characteristics defined by the values (eg, Kd values). The difference between the two values is less than about 50%, less than about 40%, less than about 30%, less than about 20%, or less than about 10% depending on the value for the reference/comparison antibody.

Выделенные полипептид, антитело, полинуклеотид, вектор, клетка или композиция представляют собой полипептид, антитело, полинуклеотид, вектор, клетку или композицию, которые находятся в форме, не обнаруженной в природе. Выделенные полипептиды, антитела, полинуклеотиды, векторы, клетка или композиции включают те, которые были очищены до такой степени, что они больше не находятся в форме, в которой они обнаруживаются в природе. В некоторых вариантах реализации выделенные антитело, полинуклеотид, вектор, клетка или композиция являются по существу чистыми.An isolated polypeptide, antibody, polynucleotide, vector, cell or composition is a polypeptide, antibody, polynucleotide, vector, cell or composition that is in a form not found in nature. Isolated polypeptides, antibodies, polynucleotides, vectors, cells or compositions include those that have been purified to the extent that they are no longer in the form in which they are found in nature. In some embodiments, the isolated antibody, polynucleotide, vector, cell, or composition is substantially pure.

В контексте настоящего описания по существу чистый относится к веществу, которое является по меньшей мере на 50% чистым (т.е. свободным от примесей), по меньшей мере на 90% чистым, по меньшей мере на 95% чистым, по меньшей мере на 98% чистым или по меньшей мере на 99% чистым.As used herein, substantially pure refers to a substance that is at least 50% pure (i.e. free from impurities), at least 90% pure, at least 95% pure, at least 98% pure or at least 99% pure.

Термин иммуноконъюгат или конъюгат в контексте настоящего описания относится к соединению или его производному, которое связано со связывающимся с клеткой агентом (т.е. антителом к CD37 или его антигенсвязывающим фрагментом) и определено общей формулой: C-L-A, где С = цитотоксин, L = линкер и А = клеточный связывающий агент, антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент. Иммуноконъюгаты также могут быть определены общей формулой в обратном порядке: A-L-C.The term immunoconjugate or conjugate as used herein refers to a compound or derivative thereof that is associated with a cell-binding agent (i.e., an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof) and is defined by the general formula: C-L-A, where C = cytotoxin, L = linker and A = cell binding agent, anti-CD37 antibody, or antigen-binding fragment thereof. Immunoconjugates can also be defined by the general formula in reverse order: A-L-C.

Линкер представляет собой любой химический фрагмент, способный связывать соединение, обычно лекарственное средство, такое как майтанзиноид, со связывающимся с клеткой агентом, таким как антитело к CD37 или его фрагмент, стабильным, ковалентным образом. Линкеры могут быть подвержены или быть по существу устойчивыми к расщеплению, индуцированному кислотой, светоиндуцированному расщеплению, расщеплению, вызванному пептидазой, расщеплению, вызванному эстеразой и расщеплению дисульфидной связи в условиях, при которых соединение или антитело остается активным. Подходящие линкеры хорошо известны в данной области техники и включают, например, дисульфидные группы, тиоэфирные группы, кислотонеустойчивые группы, фотолабильные группы, неустойчивые к пептидазе группы и неустойчивые к эстеразе группы. Линкеры также включают заряженные линкеры и их гидрофильные формы, как описано в настоящем описании и известно в данной области техники.A linker is any chemical moiety capable of linking a compound, typically a drug such as a maytansinoid, to a cell-binding agent, such as an anti-CD37 antibody or fragment thereof, in a stable, covalent manner. Linkers may be susceptible to or substantially resistant to acid-induced cleavage, light-induced cleavage, peptidase-induced cleavage, esterase-induced cleavage, and disulfide bond cleavage under conditions under which the compound or antibody remains active. Suitable linkers are well known in the art and include, for example, disulfide groups, thioester groups, acid labile groups, photolabile groups, peptidase labile groups and esterase labile groups. Linkers also include charged linkers and hydrophilic forms thereof, as described herein and known in the art.

Термины рак и раковый относятся к физиологическому состоянию у млекопитающих, при котором популяция клеток характеризуется нерегулируемым ростом клеток, или описывают такое состояние. Примеры рака включают, но не ограничиваются ими, карциному, лимфому, бластому, саркому и лейкоз. Более конкретные примеры рака или туморогенных заболеваний включают В-клеточные лимфомы, включая НХЛ, В-клеточный лимфобластный лейкоз/лимфому из клеток-предшественников и новообразования из зрелых В-клеток, такие как В-клеточный хронический лимфоцитарный лейкоз (ХЛЛ)/лимфома из малых лимфоцитов (ЛМЛ), В-клеточный пролимфоцитарный лейкоз, лимфоплазмоцитарная лимфома, мантийноклеточная лимфома (МКЛ), фолликулярная лимфома (ФЛ), включая ФЛ низкой степени, средней степени и высокой степени, кожная лимфома из клеток фолликулярного центра, В-клеточная лимфома из клеток маргинальной зоны (MALT-типа, узлового типа и лимфома селезенки), волосатоклеточный лейкоз, диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома (ДКВЛ), лимфома Беркитта (БЛ), плазмоцитома, плазмоклеточная миелома, посттрансплантационное лимфопролиферативное заболевание и анапластическая крупноклеточная лимфома (АККЛ). В некоторых вариантах реализации указанный рак представляет собой лейкоз или лимфому.The terms cancer and cancerous refer to or describe a physiological condition in mammals in which a population of cells is characterized by unregulated cell growth. Examples of cancer include, but are not limited to, carcinoma, lymphoma, blastoma, sarcoma and leukemia. More specific examples of cancer or tumorigenic diseases include B-cell lymphomas, including NHL, B-cell lymphoblastic leukemia/progenitor cell lymphoma, and mature B-cell neoplasms, such as B-cell chronic lymphocytic leukemia (CLL)/small cell lymphoma. lymphocyte lymphoma (LML), B-cell prolymphocytic leukemia, lymphoplasmacytic lymphoma, mantle cell lymphoma (MCL), follicular lymphoma (FL), including low-grade, moderate-grade and high-grade FL, cutaneous follicular center cell lymphoma, B-cell lymphoma marginal zone (MALT type, nodular type and splenic lymphoma), hairy cell leukemia, diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), Burkitt lymphoma (BL), plasmacytoma, plasma cell myeloma, post-transplant lymphoproliferative disease and anaplastic large cell lymphoma (ALCL). In some embodiments, said cancer is leukemia or lymphoma.

Опухоль и новообразование относятся к любому образованию, которое представляют собой результат избыточного роста или пролиферации клеток, либо доброкачественных (нераковых), либо злокачественных (раковых), включая предраковые поражения.Tumor and neoplasm refer to any formation that is the result of excess growth or proliferation of cells, either benign (noncancerous) or malignant (cancerous), including precancerous lesions.

Термины раковая клетка, клетка опухоли и грамматические эквиваленты относятся к общей по- 12 044601 пуляции клеток, полученных из опухоли или предракового поражения, включая как нетуморогенные клетки, которые составляют основную массу популяции клеток опухоли, так и туморогенные стволовые клетки (раковые стволовые клетки). В контексте настоящего описания к термину клетка опухоли будет добавлен термин нетуморогенная, когда он относится исключительно к тем клеткам опухоли, которые лишены способности к обновлению и дифференцировке, чтобы отличать эти клетки опухоли от раковых стволовых клеток.The terms cancer cell, tumor cell, and grammatical equivalents refer to the general population of cells derived from a tumor or precancerous lesion, including both nontumorigenic cells, which constitute the bulk of the tumor cell population, and tumorigenic stem cells (cancer stem cells). As used herein, the term tumor cell will be appended to the term non-tumorigenic when it refers solely to those tumor cells that lack the ability to renew and differentiate to distinguish these tumor cells from cancer stem cells.

Термин субъект относится к любому животному (например, млекопитающему), включая, но не ограничиваясь ими, людей, приматов, не являющихся человеком, грызунов и т.п., которые должны быть реципиентами конкретного лечения. Как правило, термины субъект и пациент используются взаимозаменяемо в настоящем описании в отношении человека.The term subject refers to any animal (eg, mammal), including, but not limited to, humans, non-human primates, rodents, and the like, that are intended to be recipients of a particular treatment. Generally, the terms subject and patient are used interchangeably herein to refer to a human being.

Химиотерапевтический агент представляет собой химическое соединение, пригодное для применения для лечения рака, независимо от механизма действия. Классы химиотерапевтических агентов включают, но не ограничиваются ими, алкилирующие агенты, антиметаболиты, алкалоиды растений веретенные яды, цитотоксические/противоопухолевые антибиотики, ингибиторы топоизомеразы, антитела, фотосенсибилизаторы и ингибиторы киназы. Химиотерапевтические агенты включают соединения, применяемые в нацеленной терапии и традиционной химиотерапии. Введение в комбинации с одним или более дополнительными терапевтическими агентами включает одновременное (совместное) и последовательное введение в любом порядке.A chemotherapeutic agent is a chemical compound useful for the treatment of cancer, regardless of its mechanism of action. Classes of chemotherapeutic agents include, but are not limited to, alkylating agents, antimetabolites, plant alkaloids, spindle poisons, cytotoxic/antitumor antibiotics, topoisomerase inhibitors, antibodies, photosensitizers, and kinase inhibitors. Chemotherapeutic agents include compounds used in targeted therapy and conventional chemotherapy. Administration in combination with one or more additional therapeutic agents includes simultaneous and sequential administration in any order.

Термин фармацевтический состав относится к препарату, который находится в такой форме, чтобы обеспечить эффективную биологическую активность активного ингредиента, и который не содержит дополнительных компонентов, неприемлемо токсичных для субъекта, которому препарат будет введен. Такой состав может быть стерильным.The term pharmaceutical composition refers to a preparation that is in such a form as to provide effective biological activity of the active ingredient, and which does not contain additional components that are unacceptably toxic to the subject to whom the drug will be administered. Such a composition may be sterile.

Эффективное количество антитела, его антигенсвязывающего фрагмента или иммуноконъюгата, раскрытое в настоящем описании, представляет собой количество, достаточное для достижения конкретно заявленной цели. Эффективное количество может быть определено эмпирически и в обычном порядке применительно к заявленной цели.An effective amount of an antibody, antigen-binding fragment or immunoconjugate thereof disclosed herein is an amount sufficient to achieve the specifically stated purpose. The effective amount can be determined empirically and routinely in relation to the stated purpose.

Термин терапевтически эффективное количество относится к количеству антитела, его антигенсвязывающего фрагмента или другого лекарственного средства, эффективного для лечения заболевания или расстройства у субъекта или млекопитающего. В случае рака терапевтически эффективное количество лекарственного средства может снижать количество раковых клеток; уменьшать размер опухоли; подавлять (т.е. до некоторой степени замедлять и в определенном варианте реализации останавливать) инфильтрацию раковых клеток в периферические органы; подавлять (т.е. до некоторой степени замедлять и в определенном варианте реализации останавливать) метастазирование опухоли; до некоторой степени подавлять рост опухоли; до некоторой степени ослаблять один или более симптомов, связанных с раком; и/или приводить к положительному ответу, такому как повышенная выживаемость без прогрессирования (PFS), безрецидивная выживаемость (DFS) или общая выживаемость (OS), полный ответ (CR), частичный ответ (PR) или в некоторых случаях стабильное заболевание (SD), снижение прогрессирования заболевания (PD), сокращение времени до прогрессирования (ТТР) или любой их комбинации. См. определение лечения в настоящем описании. В зависимости от той степени, в которой лекарственное средство может предотвращать рост и/или уничтожать существующие раковые клетки, оно может быть цитостатическим и/или цитотоксическим. В некоторых вариантах реализации выявление повышенных уровней CD37 позволяет вводить уменьшенные количества нацеленного на CD37 терапевтического средства для достижения того же терапевтического эффекта, что и при более высоких дозах. Профилактически эффективное количество относится к количеству, эффективному в дозах и в течение периодов времени, необходимых для достижения желаемого профилактического результата. Обычно, но необязательно, поскольку профилактическую дозу используют у субъектов до начала заболевания или на ранней стадии заболевания, профилактически эффективное количество будет меньше терапевтически эффективного количества.The term therapeutically effective amount refers to the amount of an antibody, antigen binding fragment thereof, or other drug effective to treat a disease or disorder in a subject or mammal. In the case of cancer, a therapeutically effective amount of a drug can reduce the number of cancer cells; reduce tumor size; suppress (ie, to some extent slow down and in a certain embodiment stop) the infiltration of cancer cells into peripheral organs; suppress (i.e., to some extent slow down and in a certain embodiment stop) tumor metastasis; suppress tumor growth to some extent; relieve to some extent one or more symptoms associated with cancer; and/or result in a positive response such as improved progression-free survival (PFS), disease-free survival (DFS) or overall survival (OS), complete response (CR), partial response (PR) or in some cases stable disease (SD) , reduction in disease progression (PD), reduction in time to progression (TTP), or any combination thereof. See definition of treatment herein. Depending on the extent to which a drug can prevent the growth and/or destroy existing cancer cells, it may be cytostatic and/or cytotoxic. In some embodiments, detection of elevated CD37 levels allows administration of reduced amounts of the CD37-targeting therapeutic agent to achieve the same therapeutic effect as at higher doses. A prophylactically effective amount refers to an amount effective in doses and for periods of time necessary to achieve the desired prophylactic result. Typically, but not necessarily, since the prophylactic dose is used in subjects prior to the onset of the disease or early in the disease, the prophylactically effective amount will be less than the therapeutically effective amount.

Термин положительно отвечать в целом относится к обусловливанию благоприятного состояния у субъекта. В отношении лечения рака этот термин относится к оказанию терапевтического воздействия на субъекта. Положительные терапевтические эффекты при раке могут быть измерены несколькими способами (См. W.A. Weber, J. Nucl. Med. 50:1S-10S (2009)). Например, подавление роста опухоли, экспрессия молекулярного маркера, экспрессия сывороточного маркера и методы молекулярной визуализации могут быть применены для оценки терапевтической эффективности противоракового терапевтического средства. В отношении подавления роста опухоли в соответствии со стандартами NCI Т/С<42% соответствует минимальному уровню противоопухолевой активности. Т/С<10% считается высоким уровнем противоопухолевой активности, где Т/С (%) = средний объем опухоли в случае лечения/средний объем опухоли в контроле х 100. Положительный ответ может быть выражен, например, в повышенной выживаемости без прогрессирования (PFS), безрецидивной выживаемости (DFS) или общей выживаемости (OS), полном ответе (CR), частичном ответе (PR) или в некоторых случаях, стабильном заболевании (SD), снижении прогрессирования заболевания (PD), сокращении времени до прогрессирования (ТТР) или любой ихThe term responding positively generally refers to conditioning a favorable state in a subject. In relation to cancer treatment, the term refers to the delivery of a therapeutic effect to a subject. Beneficial therapeutic effects in cancer can be measured in several ways (See W.A. Weber, J. Nucl. Med. 50:1S-10S (2009)). For example, tumor growth inhibition, molecular marker expression, serum marker expression, and molecular imaging techniques can be used to evaluate the therapeutic efficacy of an anticancer therapeutic agent. In terms of tumor suppression, NCI T/C standards <42% correspond to the minimum level of antitumor activity. T/C <10% is considered a high level of antitumor activity, where T/C (%) = mean tumor volume in the case / mean tumor volume in the control x 100. A positive response can be expressed, for example, in increased progression-free survival (PFS ), disease-free survival (DFS) or overall survival (OS), complete response (CR), partial response (PR) or in some cases, stable disease (SD), reduction in disease progression (PD), reduction in time to progression (TTP) or any of them

- 13 044601 комбинации.- 13 044601 combinations.

PFS, DFS и OS могут быть измерены согласно стандартам, установленным Национальным институтом рака и Управлением по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами США для утверждения новых лекарственных средств. См. Johnson et al., (2003), J. Clin. Oncol. 21(7):1404-1411.PFS, DFS, and OS can be measured according to standards established by the National Cancer Institute and the US Food and Drug Administration for the approval of new drugs. See Johnson et al., (2003), J. Clin. Oncol. 21(7):1404-1411.

Выживаемость без прогрессирования (PFS) относится к периоду времени от регистрации до прогрессирования заболевания или смерти. Для пациентов с НХЛ PFS может быть измерена с использованием стандартов, представленных в пересмотренных критериях оценки результатов лечения злокачественных лимфом Международного проекта по гармонизации (Cheson et al., J. Clin. Oncol. 25:579-86 (2007), включено в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте). Для пациентов с ХЛЛ PFS может быть измерена с использованием стандартов, представленных Международной рабочей группой по критериям ответа ХЛЛ Национального института рака (Hallek et al., Blood, 777:5446-56 (2008), включено в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте). Для пациентов с лимфомой Ходжкина и неходжкинской лимфомой PFS может быть измерена с использованием стандартов классификации Лугано (Cheson et al., J. Clin. Oncol. 32:3059-68 (2014)). В целом выживаемость без прогрессирования относится к ситуации, когда пациент остается живым без усугубления течения рака. Время до прогрессирования опухоли (ТТР) определяют как период времени от регистрации до прогрессирования заболевания. Для пациентов с НХЛ ТТР может быть измерена с использованием стандартов, представленных в пересмотренных критериях оценки результатов лечения злокачественных лимфом Международного проекта по гармонизации (Cheson et al., J. Clin. Oncol. 25:579-86 (2007), включено в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте). Для пациентов с ХЛЛ ТТР может быть измерена с использованием стандартов, представленных Международной рабочей группой по критериям ответа ХЛЛ Национального института рака (Hallek et al., Blood, 111:5446-56 (2008), включено в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте). Для пациентов с лимфомой Ходжкина и неходжкинской лимфомой PFS может быть измерена с использованием стандартов классификации Лугано (Cheson et al., J. Clin. Oncol. 32:3059-68 (2014)).Progression-free survival (PFS) refers to the period of time from registration to disease progression or death. For patients with NHL, PFS can be measured using the standards presented in the revised International Harmonization Project Outcome Criteria for Malignant Lymphomas (Cheson et al., J. Clin. Oncol. 25:579-86 (2007), incorporated herein by reference in its entirety). For patients with CLL, PFS can be measured using the standards presented by the International Working Group on CLL Response Criteria of the National Cancer Institute (Hallek et al., Blood, 777:5446-56 (2008), incorporated herein by reference in its entirety ). For patients with Hodgkin's lymphoma and non-Hodgkin's lymphoma, PFS can be measured using the Lugano classification standards (Cheson et al., J. Clin. Oncol. 32:3059-68 (2014)). In general, progression-free survival refers to the situation in which a patient remains alive without the cancer getting worse. Time to tumor progression (TTP) is defined as the period of time from registration to disease progression. For patients with NHL, TTP can be measured using the standards presented in the revised International Harmonization Project Outcome Criteria for Malignant Lymphomas (Cheson et al., J. Clin. Oncol. 25:579-86 (2007), incorporated herein by reference in its entirety). For patients with CLL, TTP can be measured using the standards presented by the International Working Group on CLL Response Criteria of the National Cancer Institute (Hallek et al., Blood, 111:5446-56 (2008), incorporated herein by reference in its entirety ). For patients with Hodgkin's lymphoma and non-Hodgkin's lymphoma, PFS can be measured using the Lugano classification standards (Cheson et al., J. Clin. Oncol. 32:3059-68 (2014)).

Полный ответ или полная ремиссия или CR указывает на исчезновение всех признаков опухоли или рака в ответ на лечение. Это не всегда означает, что рак был излечен.Complete response or complete remission or CR indicates the disappearance of all signs of the tumor or cancer in response to treatment. This does not always mean that the cancer has been cured.

Частичный ответ или PR относится к уменьшению размера или объема одной или более опухолей или поражений или распространения рака в организме в ответ на лечение.Partial response or PR refers to a decrease in the size or volume of one or more tumors or lesions or the spread of cancer in the body in response to treatment.

Стабильное заболевание относится к заболеванию без прогрессирования или рецидива. При стабильном заболевании не наблюдается достаточного уменьшения размера опухоли, чтобы соответствовать критериям частичного ответа или достаточного увеличения размера опухоли, чтобы соответствовать критериям прогрессирования заболевания.Stable disease refers to disease without progression or relapse. In stable disease, there is not a sufficient decrease in tumor size to meet the criteria for a partial response or a sufficient increase in tumor size to meet the criteria for disease progression.

Прогрессирование заболевания относится к появлению еще одного нового поражения или опухоли и/или однозначному прогрессированию существующих поражений, не являющихся мишенью. Прогрессирование заболевания также может относиться к росту опухоли более чем на 20% с момента начала лечения вследствие либо увеличения массы, либо распространения опухоли.Disease progression refers to the appearance of another new lesion or tumor and/or clear progression of existing non-target lesions. Disease progression can also refer to tumor growth of more than 20% since the start of treatment due to either increased mass or spread of the tumor.

Безрецидивная выживаемость (DFS) относится к периоду времени в процессе и после лечения, в течение которого у пациента не проявляются признаки заболевания.Disease-free survival (DFS) refers to the period of time during and after treatment during which the patient shows no signs of disease.

Общая выживаемость (OS) относится к периоду времени от регистрации пациента до смерти или даты последней явки. OS включает увеличение продолжительности жизни по сравнению с контрольными или не получавшими лечения людьми или пациентами. Общая выживаемость относится к ситуации, когда пациент остается живым в течение определенного периода времени, такого как год, пять лет и т.д., например, со времени постановки диагноза или лечения.Overall survival (OS) refers to the time period from patient enrollment to death or date of last presentation. OS includes an increase in life expectancy compared to control or untreated individuals or patients. Overall survival refers to the situation where a patient remains alive for a certain period of time, such as a year, five years, etc., such as from the time of diagnosis or treatment.

Такие термины как проведение лечения или лечение или лечить или облегчение или облегчать относятся к терапевтическим мерам, которые излечивают, замедляют, ослабляют симптомы и/или останавливают прогрессирование диагностированного патологического состояния или расстройства. Таким образом, те, кто нуждается в лечении, включают тех, у кого уже диагностировано или подозревается расстройство. В некоторых вариантах реализации субъекта успешно излечивают от рака в соответствии со способами согласно настоящему изобретению, если пациент демонстрирует одно или более из следующего: уменьшение количества или полное отсутствие раковых клеток; уменьшение размера опухоли; подавление или отсутствие инфильтрации раковых клеток в периферические органы, включая, например, распространение рака в мягкие ткани и кости; подавление или отсутствие метастазирования опухоли; подавление или отсутствие роста опухоли; облегчение одного или нескольких симптомов, связанных с конкретным раком; снижение заболеваемости и смертности; улучшение качества жизни; уменьшение туморогенности, частоты туморогенных состояний или туморогенной способности опухоли; уменьшение числа или частоты встречаемости раковых стволовых клеток в опухоли; дифференцировка клеток опухоли в нетуморогенное состояние; повышенная выживаемость без прогрессирования (PFS), безрецидивная выживаемость (DFS) или общая выживаемость (ОС), полный ответ (CR), частичный ответ (PR), стабильное заболевание (SD), снижение прогрессирования заболевания (PD), сокращение времени до прогрессирования (ТТР) или любую их комбинацию.Terms such as treating or treating or treating or alleviating or alleviating refer to therapeutic measures that cure, slow, reduce symptoms and/or stop the progression of a diagnosed pathological condition or disorder. Thus, those in need of treatment include those already diagnosed or suspected of having a disorder. In some embodiments, a subject is successfully cured of cancer in accordance with the methods of the present invention if the patient demonstrates one or more of the following: a decrease in the number or complete absence of cancer cells; reduction in tumor size; suppression or absence of infiltration of cancer cells into peripheral organs, including, for example, spread of cancer into soft tissue and bone; suppression or absence of tumor metastasis; suppression or absence of tumor growth; relief of one or more symptoms associated with a specific cancer; reduction in morbidity and mortality; improving quality of life; reducing tumorigenicity, incidence of tumorigenic conditions, or tumorigenic ability of a tumor; reducing the number or frequency of cancer stem cells in the tumor; differentiation of tumor cells into a non-tumorigenic state; improved progression-free survival (PFS), disease-free survival (DFS) or overall survival (OS), complete response (CR), partial response (PR), stable disease (SD), decreased disease progression (PD), decreased time to progression ( TTP) or any combination thereof.

Профилактические или предотвращающие меры относятся к терапевтическим мерам, которые пре- 14 044601 дотвращают и/или замедляют развитие целевого патологического состояния или расстройства. Таким образом, те, кто нуждается в профилактических или предотвращающих мерах, включают тех, кто предрасположен к расстройству, и тех, у кого расстройство подлежит предотвращению.Prophylactic or preventive measures refer to therapeutic measures that prevent and/or slow the development of the target pathological condition or disorder. Thus, those in need of prophylactic or preventive measures include those who are susceptible to the disorder and those who have the disorder that is preventable.

В контексте настоящего описания термин лицо, предоставляющее медицинские услуги относится к отдельным лицам или учреждениям, которые непосредственно взаимодействуют с живыми субъектами, например, пациентами, являющимися людьми, и осуществляют воздействие. Неограничивающие примеры лиц, предоставляющих медицинские услуги, включают врачей, медсестер, лаборантов, терапевтов, фармацевтов, консультантов, практиков альтернативной медицины, медицинские учреждения, кабинеты врачей, больницы, отделения неотложной помощи, клиники, центры неотложной помощи, клиники/учреждения альтернативной медицины и любые другие организации, предоставляющие общее и/или специализированное лечение, наблюдение, поддержку, терапию, средство для лечения и/или рекомендации, касающиеся всех или любой части состояния здоровья пациента, включая, но не ограничиваясь ими, общие медицинские, специализированные медицинские, хирургические и/или любой другой вид лечения, наблюдения, поддержки, терапии, лечения и/или рекомендаций. В некоторых аспектах лицо, предоставляющее медицинские услуги, может осуществлять воздействие или инструктировать другое лицо, предоставляющее медицинские услуги, по осуществлению терапии для лечения рака. Осуществление терапии в контексте настоящего описания включает назначение терапии субъекту, а также доставку, применение или предоставление терапии субъекту. Лицо, предоставляющее медицинские услуги, может обеспечить выполнение или поручить другому лицу, предоставляющему медицинские услуги, или пациенту выполнить следующие действия: получить образец, обработать образец, предоставить образец, получить образец, передать образец, проанализировать или измерить образец, количественно оценить образец, предоставить результаты, полученные после анализа/измерения/количественной оценки образца, получить результаты, полученные после анализа/измерения/количественной оценки образца, сравнить/оценить результаты, полученные после анализа/измерения/количественной оценки одного или более образцов, обеспечить сравнение/оценку одного или более образцов, получить сравнение/оценку одного или более образцов, назначить терапию или терапевтический агент (например, CD37-связывающий агент), начать применение терапии, прекратить применение терапии, продолжить применение терапии, временно прервать применение терапии, увеличить количество вводимого терапевтического агента, уменьшить количество вводимого терапевтического агента, продолжить введение количества вводимого терапевтического агента, повысить частоту введения терапевтического агента, снизить частоту введения терапевтического агента, поддерживать ту же частоту введения терапевтического агента, заменить терапию или терапевтический агент по меньшей мере другой терапией или терапевтическим агентом, объединить терапию или терапевтический агент по меньшей мере с другой терапией или дополнительным терапевтическим агентом. Эти действия могут быть выполнены лицом, предоставляющим медицинские услуги, автоматически с использованием компьютеризированного способа (например, через веб-службу или автономную компьютерную систему).As used herein, the term health care provider refers to individuals or institutions that directly interact with and deliver exposure to living subjects, such as human patients. Non-limiting examples of health care providers include physicians, nurses, laboratory technicians, physicians, pharmacists, counselors, alternative medicine practitioners, medical facilities, doctors' offices, hospitals, emergency departments, clinics, urgent care centers, alternative medicine clinics/facilities, and any other organizations providing general and/or specialized treatment, supervision, support, therapy, remedy and/or advice relating to all or any part of the patient's health condition, including, but not limited to, general medical, specialized medical, surgical and/ or any other type of treatment, supervision, support, therapy, treatment and/or advice. In some aspects, a health care provider may administer or instruct another health care provider to administer therapy to treat cancer. Providing therapy as used herein includes administering therapy to a subject, as well as delivering, administering, or providing therapy to a subject. A health care provider may provide or direct another health care provider or patient to do the following: obtain a sample, process a sample, provide a sample, receive a sample, transmit a sample, analyze or measure a sample, quantify a sample, provide results , obtained after analysis/measurement/quantification of a sample, obtain results obtained after analysis/measurement/quantification of a sample, compare/evaluate results obtained after analysis/measurement/quantification of one or more samples, provide comparison/evaluation of one or more samples , obtain a comparison/evaluation of one or more samples, prescribe therapy or a therapeutic agent (eg, CD37 binding agent), initiate therapy, discontinue therapy, continue therapy, temporarily interrupt therapy, increase the amount of therapeutic agent administered, decrease the amount administered therapeutic agent, continue administration of the amount of therapeutic agent administered, increase the frequency of administration of the therapeutic agent, decrease the frequency of administration of the therapeutic agent, maintain the same frequency of administration of the therapeutic agent, replace the therapy or therapeutic agent with at least another therapy or therapeutic agent, combine the therapy or therapeutic agent by at least with another therapy or additional therapeutic agent. These actions may be performed automatically by the health care provider using a computerized method (eg, through a web service or stand-alone computer system).

Термины полинуклеотид или нуклеиновая кислота, взаимозаменяемо используемые в настоящем описании, относятся к полимерам нуклеотидов любой длины и включают ДНК и РНК. Нуклеотиды могут представлять собой дезоксирибонуклеотиды, рибонуклеотиды, модифицированные нуклеотиды или основания и/или их аналоги или любой субстрат, который может быть включен в полимер ДНК- или РНК-полимеразой. Полинуклеотид может содержать модифицированные нуклеотиды, такие как метилированные нуклеотиды и их аналоги. Модификация, если таковая присутствует, может быть введена в структуру нуклеотида до или после сборки полимера. Последовательность нуклеотидов может быть прервана ненуклеотидными компонентами. Полинуклеотид может быть дополнительно модифицирован после полимеризации, например, путем конъюгации с меченым компонентом. Другие типы модификаций включают, например, кэпы (caps), замещение одного или более природных нуклеотидов аналогами, межнуклеотидные модификации, такие как, например, модификации с незаряженными связями (например, метилфосфонаты, фосфотриэфиры, фосфоамидаты, карбаматы и т.д.) и заряженными связями (например, фосфоротиоаты, фосфородитиоаты и т.д.), содержащие концевые фрагменты, такие как, например, белки (например, нуклеазы, токсины, антитела, сигнальные пептиды, поли-Ь-лизин и т.д.), с интеркаляторами (например, акридин, псорален и т.д.), содержащие хелаторы (например, металлы, радиоактивные металлы, бор, металлы-окислители и т.д.), содержащие алкилирующие агенты, с модифицированными связями (например, альфа-аномерные нуклеиновые кислоты и т.д.), а также немодифицированные формы полинуклеотида (полинуклеотидов). Дополнительно любая из гидроксильных групп, обычно присутствующих в сахарах, может быть замещена, например, фосфонатными группами, фосфатными группами, защищена стандартными защитными группами или активирована для получения дополнительных связей с дополнительными нуклеотидами или может быть конъюгирована с твердыми носителями. 5'- и 3'-конец ОН могут быть фосфорилированы или замещены аминами или фрагментами органических кэпирующих групп, содержащими от 1 до 20 атомов углерода. Другие гидроксилы также могут быть дериватизированы до стандартных защитных групп. Полинуклеотиды также могут содержать аналоги сахаров - производных рибозы или дезоксирибозы, которые обычно известны в данной области техники, включая, например, 2'-О-метил-, 2'-О-аллил, 2'-фтор- или 2'-азидо-рибозу, карбоциклические ана- 15 044601 логи сахаров, альфа-аномерные сахара, эпимерные сахара, такие как арабиноза, ксилозы или ликсозы, пиранозные сахара, фуранозные сахара, седогептулозы, ациклические аналоги и аналоги нуклеозидов, лишенные азотистых оснований, такие как метилрибозид. Одна или более фосфодиэфирных связей могут быть заменены альтернативными связующими группами. Эти альтернативные связующие группы включают, но не ограничиваются ими, варианты реализации, где фосфат заменен на P(O)S (тиоат), P(S)S (дитиоат), (O)NR2 (амидат), P(O)R, P(O)OR', CO или СН2 (формацеталь), в которых каждый R или R' независимо представляет собой Н или замещенный или незамещенный алкил (1-20 С), необязательно содержащий простую эфирную (-О-) связь, арил, алкенил, циклоалкил, циклоалкенил или аральдил. Не все связи в полинуклеотиде должны быть одинаковыми. Предшествующее описание относится ко всем полинуклеотидам, упоминаемым в настоящем описании, включая РНК и ДНК.The terms polynucleotide or nucleic acid, used interchangeably herein, refer to polymers of nucleotides of any length and include DNA and RNA. Nucleotides may be deoxyribonucleotides, ribonucleotides, modified nucleotides or bases and/or analogs thereof, or any substrate that can be incorporated into a polymer by DNA or RNA polymerase. The polynucleotide may contain modified nucleotides, such as methylated nucleotides and analogs thereof. The modification, if present, can be introduced into the nucleotide structure before or after polymer assembly. The nucleotide sequence can be interrupted by non-nucleotide components. The polynucleotide may be further modified after polymerization, for example, by conjugation with a labeled moiety. Other types of modifications include, for example, caps, replacement of one or more natural nucleotides with analogues, internucleotide modifications, such as, for example, modifications with uncharged bonds (for example, methylphosphonates, phosphotriesters, phosphoamidates, carbamates, etc.) and charged bonds (e.g. phosphorothioates, phosphorodithioates, etc.) containing terminal fragments, such as, for example, proteins (e.g. nucleases, toxins, antibodies, signal peptides, poly-L-lysine, etc.), with intercalators (for example, acridine, psoralen, etc.), containing chelators (for example, metals, radioactive metals, boron, oxidizing metals, etc.), containing alkylating agents, with modified bonds (for example, alpha anomeric nucleic acids etc.), as well as unmodified forms of polynucleotide (polynucleotides). Additionally, any of the hydroxyl groups typically present in sugars may be substituted, for example, with phosphonate groups, phosphate groups, protected with standard protecting groups, or activated to provide additional linkages to additional nucleotides, or may be conjugated to solid supports. The 5' and 3' OH can be phosphorylated or replaced with amines or organic capping moieties containing from 1 to 20 carbon atoms. Other hydroxyls can also be derivatized to standard protecting groups. The polynucleotides may also contain sugar analogues derived from ribose or deoxyribose, which are generally known in the art, including, for example, 2'-O-methyl-, 2'-O-allyl, 2'-fluoro- or 2'-azido- ribose, carbocyclic sugar analogues, alpha-anomeric sugars, epimeric sugars such as arabinose, xyloses or lyxoses, pyranose sugars, furanose sugars, sedoheptuloses, acyclic analogues and nucleoside analogues lacking nitrogenous bases such as methyl riboside. One or more phosphodiester linkages may be replaced by alternative linking groups. These alternative linking groups include, but are not limited to, embodiments where the phosphate is replaced by P(O)S (thioate), P(S)S (dithioate), (O)NR2 (amidate), P(O)R, P(O)OR', CO or CH2 (formacetal), in which each R or R' independently represents H or substituted or unsubstituted alkyl (1-20 C), optionally containing an ether (-O-) bond, aryl, alkenyl, cycloalkyl, cycloalkenyl or araldyl. Not all bonds in a polynucleotide need to be the same. The foregoing description applies to all polynucleotides mentioned herein, including RNA and DNA.

Термин вектор означает конструкцию, которая способна доставлять и экспрессировать один/одну или более требуемых генов или последовательностей в клетку хозяина. Примеры векторов включают, но не ограничиваются ими, вирусные векторы, векторы экспрессии депротеинизированной ДНК или РНК, плазмидные, космидные или фаговые векторы, векторы экспрессии ДНК или РНК, связанные с катионными конденсирующими агентами, векторы экспрессии ДНК или РНК в липосомальных лекарственных формах и некоторые эукариотические клетки, такие как клетки-продуценты.The term vector means a construct that is capable of delivering and expressing one or more desired genes or sequences into a host cell. Examples of vectors include, but are not limited to, viral vectors, deproteinized DNA or RNA expression vectors, plasmid, cosmid or phage vectors, DNA or RNA expression vectors coupled to cationic condensing agents, DNA or RNA expression vectors in liposomal dosage forms, and certain eukaryotic cells, such as producer cells.

Термины полипептид, пептид и белок взаимозаменяемо используют в настоящем описании для обозначения полимеров аминокислот любой длины. Полимер может быть линейным или разветвленным, он может содержать модифицированные аминокислоты и его цепь может включать неаминокислоты. Термины также охватывают полимер аминокислот, который был модифицирован естественным путем или посредством вмешательства; например, образования дисульфидных связей, гликозилирования, липидизации, ацетилирования, фосфорилирования или любых других манипуляций или модификаций, таких как конъюгация с компонентом метки. В определение также включены, например, полипептиды, содержащие один или более аналогов аминокислоты (включая, например, не встречающиеся в природе аминокислоты и т.д.), а также другие модификации, известные в данной области техники. Понятно, что, поскольку полипептиды согласно настоящему изобретению основаны на антителах, в некоторых вариантах реализации полипептиды могут встречаться в виде отдельных цепей или связанных цепей. В некоторых вариантах реализации полипептид, пептид или белок является не встречающимся в природе. В некоторых вариантах реализации полипептид, пептид или белок получают очисткой из природных компонентов. В некоторых вариантах реализации полипептид, пептид или белок получают рекомбинантным способом.The terms polypeptide, peptide and protein are used interchangeably herein to refer to polymers of amino acids of any length. The polymer may be linear or branched, it may contain modified amino acids and its chain may include non-amino acids. The terms also cover a polymer of amino acids that has been modified naturally or through intervention; for example, the formation of disulfide bonds, glycosylation, lipidation, acetylation, phosphorylation or any other manipulation or modification, such as conjugation with a tag component. Also included in the definition are, for example, polypeptides containing one or more amino acid analogues (including, for example, non-naturally occurring amino acids, etc.), as well as other modifications known in the art. It is understood that, since the polypeptides of the present invention are antibody based, in some embodiments the polypeptides may occur as single chains or linked chains. In some embodiments, the polypeptide, peptide, or protein is not naturally occurring. In some embodiments, the polypeptide, peptide, or protein is obtained by purification from natural components. In some embodiments, the polypeptide, peptide, or protein is produced recombinantly.

Термины идентичный или процент идентичности в контексте двух или более нуклеиновых кислот или полипептидов относятся к двум или более последовательностям или подпоследовательностям, которые являются одинаковыми или содержат определенный процент нуклеотидов или аминокислотных остатков, которые являются одинаковыми при сравнении и выравнивании (и введении пропусков, если необходимо) для максимального соответствия без учета каких-либо консервативных аминокислотных замен в контексте идентичности последовательности. Процент идентичности может быть определен с использованием программного обеспечения или алгоритмов для сравнения последовательностей или посредством визуального контроля. В данной области техники известны различные алгоритмы и программное обеспечение, которые могут быть использованы для выравнивания аминокислотных или нуклеотидных последовательностей. Одним из таких неограничивающих примеров алгоритма выравнивания последовательностей является алгоритм, описанный в источнике Karlin et al., 1990, Proc. Natl. Acad. Sci., 87:2264-2268, модифицированный в работе Karlin et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci., 90:5873-5877 и включенный в программы NBLAST и XBLAST (Altschul et al., 1991, Nucleic Acids Res., 25:3389-3402). В некоторых вариантах реализации может быть применена программа Gapped BLAST согласно описанию в источнике Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Другими общедоступными программами, которые могут быть применены для выравнивания последовательностей, являются BLAST-2, WU-BLAST-2 (Altschul et al., 1996, Methods in Enzymology, 266:460-480), ALIGN, ALIGN-2 (Genentech, South San Francisco, California) или Megalign (DNASTAR). В некоторых вариантах реализации процент идентичности двух нуклеотидных последовательностей определяют с использованием программы GAP, входящей в программное обеспечение GCG (например, с использованием матрицы NWSgapdna.CMP и значения штрафа за пропуск, равного 40, 50, 60, 70 или 90 и значения штрафа за продление пропуска, равного 1, 2, 3, 4, 5 или 6). В качестве альтернативы в некоторых вариантах реализации программа GAP в составе пакета программ GCG, включающего алгоритм Нидлмана-Вунша (J. Mol. Biol. (48):444-453 (1970)), может быть использована для определения процента идентичности двух аминокислотных последовательностей (например, с использованием матрицы Blossum 62 или матрицы РАМ250 и значения штрафа за пропуск, равного 16, 14, 12, 10, 8, 6 или 4 и значения штрафа за продление пропуска, равного 1, 2, 3, 4, 5). В качестве альтернативы в некоторых вариантах реализации процент идентичности двух нуклеотидных или аминокислотных последовательностей определяют с использованием алгоритма Миллера-Маерса (CABIOS, 4:11-17 (1989)). Например, процент идентичности может быть определен с использованием программы ALIGN (версия 2.0) и с использованием РАМ120 с таблицей остатков, значением штрафа за продление пропуска, равным 12 и значением штрафа за пропуск, равным 4. ПодходящиеThe terms identical or percent identity, in the context of two or more nucleic acids or polypeptides, refer to two or more sequences or subsequences that are the same or contain a certain percentage of nucleotides or amino acid residues that are the same when compared and aligned (and gapping, if necessary) for maximum matching without considering any conservative amino acid substitutions in the context of sequence identity. Percent identity can be determined using sequence comparison software or algorithms or by visual inspection. Various algorithms and software are known in the art that can be used to align amino acid or nucleotide sequences. One such non-limiting example of a sequence alignment algorithm is the algorithm described in Karlin et al., 1990, Proc. Natl. Acad. Sci., 87:2264-2268, modified from Karlin et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci., 90:5873-5877 and included in the NBLAST and XBLAST programs (Altschul et al., 1991, Nucleic Acids Res., 25:3389-3402). In some embodiments, the Gapped BLAST program may be used as described in Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389–3402. Other publicly available programs that can be used for sequence alignment are BLAST-2, WU-BLAST-2 (Altschul et al., 1996, Methods in Enzymology, 266:460-480), ALIGN, ALIGN-2 (Genentech, South San Francisco, California) or Megalign (DNASTAR). In some embodiments, the percent identity of two nucleotide sequences is determined using the GAP program included in the GCG software (e.g., using the matrix NWSgapdna.CMP and a gap penalty value of 40, 50, 60, 70, or 90 and a prolongation penalty value gap equal to 1, 2, 3, 4, 5 or 6). Alternatively, in some embodiments, the GAP program of the GCG software package including the Needleman-Wunsch algorithm (J. Mol. Biol. (48):444-453 (1970)) can be used to determine the percent identity of two amino acid sequences ( for example, using a Blossum 62 matrix or a PAM250 matrix and a skip penalty value of 16, 14, 12, 10, 8, 6 or 4 and a skip penalty value of 1, 2, 3, 4, 5). Alternatively, in some embodiments, the percent identity of two nucleotide or amino acid sequences is determined using the Miller-Myers algorithm (CABIOS, 4:11-17 (1989)). For example, percent identity can be determined using the ALIGN program (version 2.0) and using PAM120 with a residual table, a pass-over penalty value of 12, and a skip-penalty value of 4. Suitable

- 16 044601 параметры для максимального выравнивания посредством конкретного программного обеспечения для выравнивания могут быть определены специалистом в данной области техники. В некоторых вариантах реализации используют параметры по умолчанию программного обеспечения для выравнивания В некоторых вариантах реализации процент идентичности X первой аминокислотной последовательности по отношению ко второй аминокислотной последовательности рассчитывают как 100x(Y/Z), где Y представляет собой число аминокислотных остатков, отмеченных как идентичные соответствия при выравнивании первой и второй последовательностей (в соответствии с визуальным контролем или конкретной программой выравнивания последовательностей), a Z - общее количество остатков во второй последовательности. Если длина первой последовательности превышает длину второй последовательности, процент идентичности первой последовательности по отношению ко второй последовательности будет больше, чем процент идентичности второй последовательности по отношению к первой последовательности. В качестве неограничивающего примера, наличие определенного процента идентичности последовательности конкретного полинуклеотида (например, по меньшей мере на 80% идентичен, по меньшей мере на 85% идентичен, по меньшей мере на 90% идентичен, а в некоторых вариантах реализации по меньшей мере на 95, 96, 97, 98 или 99% идентичен) по отношению к эталонной последовательности в определенных вариантах реализации может быть определено с использованием программы Bestfit (Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, WI 53711). Bestfit использует алгоритм локальной гомологии согласно Smith and Waterman, Advances in Applied Mathematics, 2:482-489 (1981), для поиска лучшего сегмента гомологии между двумя последовательностями. При использовании программы Bestfit или любой другой программы для выравнивания последовательностей для определения того, является ли конкретная последовательность, например, на 95% идентичной эталонной последовательности согласно настоящему изобретению, параметры устанавливают таким образом, что процент идентичности вычисляется по всей длине эталонной нуклеотидной последовательности и разрешены пропуски в гомологии длиной до 5% от общего числа нуклеотидов в эталонной последовательности.- 16 044601 parameters for maximum alignment by means of specific alignment software can be determined by one skilled in the art. In some embodiments, the default parameters of the alignment software are used. In some embodiments, the percent identity X of the first amino acid sequence with respect to the second amino acid sequence is calculated as 100x(Y/Z), where Y is the number of amino acid residues marked as identical matches at alignment of the first and second sequences (according to visual inspection or a specific sequence alignment program), and Z is the total number of residues in the second sequence. If the length of the first sequence is greater than the length of the second sequence, the percentage identity of the first sequence with respect to the second sequence will be greater than the percentage identity of the second sequence with respect to the first sequence. By way of non-limiting example, having a certain percentage of sequence identity to a particular polynucleotide (e.g., at least 80% identical, at least 85% identical, at least 90% identical, and in some embodiments, at least 95, 96, 97, 98, or 99% identical) to the reference sequence in certain embodiments can be determined using the Bestfit program (Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison , WI 53711). Bestfit uses the local homology algorithm according to Smith and Waterman, Advances in Applied Mathematics, 2:482-489 (1981), to find the best segment of homology between two sequences. When using Bestfit or any other sequence alignment program to determine whether a particular sequence is, for example, 95% identical to a reference sequence according to the present invention, the parameters are set such that the percent identity is calculated over the entire length of the reference nucleotide sequence and gaps are allowed in homology up to 5% of the total number of nucleotides in the reference sequence.

В некоторых вариантах реализации две нуклеиновые кислоты или два полипептида согласно настоящему изобретению по существу идентичны, то есть имеют идентичность нуклеотидов или аминокислотных остатков по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, а в некоторых вариантах реализации по меньшей мере 9, 96, 97, 98, 99% при сравнении и выравнивании для максимального соответствия, определенную с использованием алгоритма сравнения последовательностей или визуального контроля. В некоторых вариантах реализации идентичность имеет место в области последовательностей, которая имеет длину по меньшей мере приблизительно 10, приблизительно 20, приблизительно 40-60 остатков или любое целое значение между ними или в области с длиной, превышающей 60-80 остатков, по меньшей мере приблизительно 90-100 остатков, или последовательности по существу идентичны по всей длине сравниваемых последовательностей, таких как, например, кодирующая область нуклеотидной последовательности.In some embodiments, two nucleic acids or two polypeptides of the present invention are substantially identical, that is, have at least 70%, at least 75%, at least 80%, at least 85% identity in nucleotides or amino acid residues. at least 90%, and in some embodiments, at least 9, 96, 97, 98, 99% when compared and aligned for best fit, determined using a sequence comparison algorithm or visual inspection. In some embodiments, the identity occurs in a sequence region that is at least about 10, about 20, about 40-60 residues in length, or any integer value therebetween, or in a region that is greater than 60-80 residues in length by at least about 90-100 residues, or sequences, are substantially identical throughout the entire length of the compared sequences, such as, for example, the coding region of a nucleotide sequence.

Консервативная аминокислотная замена представляет собой аминокислотную замену, при которой один аминокислотный остаток заменен другим аминокислотным остатком, имеющим сходную боковую цепь. Семьи аминокислотных остатков, имеющих сходные боковые цепи, были определены в данной области техники, включая основные боковые цепи (например, лизин, аргинин, гистидин), кислотные боковые цепи (например, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота), незаряженные полярные боковые цепи (например, аспарагин, глутамин, серин, треонин, тирозин, цистеин), неполярные боковые цепи (например, глицин, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин, триптофан), бета-разветвленные боковые цепи (например, треонин, валин, изолейцин) и ароматические боковые цепи (например, тирозин, фенилаланин, триптофан, гистидин). Например, замена фенилаланина на тирозин является консервативной заменой. В некоторых вариантах реализации консервативные замены в последовательностях полипептидов и антител согласно настоящему изобретению не отменяют связывания полипептида или антитела, содержащего аминокислотную последовательность, с антигеном (антигенами), то есть с CD37, с которым связывается полипептид или антитело. Способы идентификации нуклеотидных и аминокислотных консервативных замен, которые не препятствуют связыванию антигена, хорошо известны в данной области техники (см., например, Brummell et al., Biochem. 32:1180-1187 (1993); Kobayashi et al. Protein Eng. 12(10):879-884 (1999) и Burks et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94:412-417 (1997)).A conservative amino acid substitution is an amino acid substitution in which one amino acid residue is replaced by another amino acid residue having a similar side chain. Families of amino acid residues having similar side chains have been defined in the art, including basic side chains (e.g., lysine, arginine, histidine), acidic side chains (e.g., aspartic acid, glutamic acid), uncharged polar side chains (e.g., asparagine, glutamine, serine, threonine, tyrosine, cysteine), non-polar side chains (e.g. glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, proline, phenylalanine, methionine, tryptophan), beta-branched side chains (e.g. threonine, valine, isoleucine) and aromatic side chains (eg, tyrosine, phenylalanine, tryptophan, histidine). For example, replacing phenylalanine with tyrosine is a conservative substitution. In some embodiments, conservative substitutions in the polypeptide and antibody sequences of the present invention do not abolish the binding of the polypeptide or antibody comprising the amino acid sequence to the antigen(s), i.e., CD37, to which the polypeptide or antibody binds. Methods for identifying nucleotide and amino acid conservative substitutions that do not interfere with antigen binding are well known in the art (see, for example, Brummell et al., Biochem. 32:1180-1187 (1993); Kobayashi et al. Protein Eng. 12 (10):879-884 (1999) and Burks et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94:412-417 (1997)).

В контексте настоящего описания и формулы изобретения неопределенные и определенные формы единственного числа включают формы множественного числа, если контекстом явным образом не продиктовано иное.As used herein and in the claims, the indefinite and definite singular forms include the plural forms unless the context clearly dictates otherwise.

Понятно, что во всех случаях, когда варианты реализации описаны в настоящем описании с использованием формулировки включающий/содержащий, также предложены иные аналогичные варианты реализации, описанные в терминах состоящий из и/или по существу состоящий из.It is understood that whenever embodiments are described herein using the language including/comprising, other similar embodiments described in terms of consisting of and/or essentially consisting of are also provided.

Термин и/или в настоящем описании, используемый в такой фразе, как А и/или В, предназначен для включения А и В, А или В, А и В. Аналогично термин и/или, используемый в такой фразе как А, В и/или С, предназначен для охвата каждого из следующих вариантов реализации: А, В и С; А,The term and/or as used herein in a phrase such as A and/or B is intended to include A and B, A or B, A and B. Similarly, the term and/or used in a phrase such as A, B and /or C is intended to cover each of the following implementations: A, B and C; A,

- 17 044601- 17 044601

В или С; А или С; А или В; В или С; А и С; А и В; В и С; А (отдельно); В (отдельно) и С (отдельно).B or C; A or C; A or B; B or C; A and C; A and B; B and C; A (separately); B (separately) and C (separately).

II. Связывающиеся с CD37 агенты.II. CD37 binding agents.

В настоящем описании предложены агенты, которые специфично связываются с CD37 человека. Эти агенты упомянуты в настоящем описании как связывающиеся с CD37 агенты. В некоторых вариантах реализации связывающиеся с CD37 агенты представляют собой антитела, их антигенсвязывающие фрагменты, иммуноконъюгаты или полипептиды. Полноразмерные аминокислотные последовательности для CD37 человека известны в данной области техники и также приведены в настоящем описании, как представлено SEQ ID NO: 1, соответственно. CD37 человека:Provided herein are agents that specifically bind to human CD37. These agents are referred to herein as CD37 binding agents. In some embodiments, the CD37 binding agents are antibodies, antigen binding fragments thereof, immunoconjugates, or polypeptides. Full-length amino acid sequences for human CD37 are known in the art and are also set forth herein as set forth in SEQ ID NO: 1, respectively. Human CD37:

MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKVLAI SGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLRDVVE KTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCSCY NLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHNNL ISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR (SEQ ID NO:1)MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKVLAI SGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLRDVVE KTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCSCY NL SATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHNNL ISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR (SEQ ID NO:1)

Последовательность нуклеиновой кислоты CD37 человека:Human CD37 nucleic acid sequence:

atgtcagcccaggagagctgcctcagcctcatcaagtacttcctcttcgttttcaacctcttcttcttcgtcctcggcagcctgatcttctgcttcg gcatctggatcctcattgacaagaccagcttcgtgtcctttgtgggcttggccttcgtgcctctgcagatctggtccaaagtcctggccatctca ggaatcttcaccatgggcatcgccctcctgggttgtgtgggggccctcaaggagctccgctgcctcctgggcctgtattttgggatgctgctg ctcctgtttgccacacagatcaccctgggaatcctcatctccactcagcgggcccagctggagcgaagcttgcgggacgtcgtagagaaaa ccatccaaaagtacggcaccaaccccgaggagaccgcggccgaggagagctgggactatgtgcagttccagctgcgctgctgcggctg gcactacccgcaggactggttccaagtcctcatcctgagaggtaacgggtcggaggcgcaccgcgtgccctgctcctgctacaacttgtcg gcgaccaacgactccacaatcctagataaggtgatcttgccccagctcagcaggcttggacacctggcgcggtccagacacagtgcagac atctgcgctgtccctgcagagagccacatctaccgcgagggctgcgcgcagggcctccagaag1ggc1gcacaacaaccttatttccatag tgggcatttgcctgggcgtcggcctactcgagctcgggttcatgacgctctcgatattcctgtgcagaaacctggaccacgtctacaaccggc tcgctcgataccgt (SEQ ID NO:2)atgtcagcccaggagagctgcctcagcctcatcaagtacttcctcttcgttttcaacctcttcttcttcgtcctcggcagcctgatcttctgcttcg gcatctggatcctcattgacaagaccagcttcgtgtcctttgtgggcttggccttcgtgcctctgcagatctggtccaaagtcctggccat ctca ggaatcttcaccatgggcatcgccctcctgggttgtgtgggggccctcaaggagctccgctgcctcctgggcctgtattttgggatgctgctg ctcctgtttgccacacagatcaccctgggaatcctcatctccactcagcgggcccagctggagcgaagcttgcgggacgtcgtagagaaaa ccatccaaa agtacggcaccaaccccgaggagaccgcggccgaggagagctgggactatgtgcagttccagctgcgctgctgcggctg gcactaccccgcaggactggttccaagtcctcatcctgagaggtaacgggtcggaggcgcaccgcgtgccctgctcctgctacaacttgtcg gcgaccaacgactccacaatcctagataaggtgatctt gccccagctcagcaggcttggacacctggcgcggtccagacacagtgcagac atctgcgctgtccctgcagagagccacatctaccgcgagggctgcgcgcagggcctccagaag1ggc1gcacaacaaccttatttccatag tgggcatttgcctgggcgtcggcctactcgagctcgggttcatgacgctctcgatatt cctgtgcagaaacctggaccacgtctacaaccggc tcgctcgataccgt (SEQ ID NO:2)

Таким образом, в некоторых вариантах реализации связывающиеся с CD37 агенты могут специфично связываться с эпитопом, представленным SEQ ID NO: 1, или с эпитопом полипептида, кодируемого SEQ ID NO: 2.Thus, in some embodiments, CD37 binding agents may specifically bind to the epitope represented by SEQ ID NO: 1 or to the epitope of the polypeptide encoded by SEQ ID NO: 2.

Связывающиеся с CD37 агенты также включают связывающиеся с CD37 агенты с последовательностями антитела 1В11-2, приведенными ниже.CD37 binding agents also include CD37 binding agents with the 1B11-2 antibody sequences set forth below.

muCD37-lBl 1-2 VH-CDR1muCD37-lBl 1-2 VH-CDR1

GYFMN (SEQ ID NO:3) muCD37-lBl 1-2 VH-CDR2 (Кабат)GYFMN (SEQ ID NO:3) muCD37-lBl 1-2 VH-CDR2 (Kabat)

RINPYNGDTFYNQKFKr (SEQ ID NO :4) muCD37-lBll-2 VH-CDR2 (AbM)RINPYNGDTFYNQKFKr (SEQ ID NO:4) muCD37-lBll-2 VH-CDR2 (AbM)

RINPYNGDTF (SEQ ID NO:34) muCD37-lBl 1-2 VH -CDR3RINPYNGDTF (SEQ ID NO:34) muCD37-lBl 1-2 VH -CDR3

RGIVASSRFFDV (SEQ ID NO:5)RGIVASSRFFDV (SEQ ID NO:5)

- 18 044601 muCD37-lBl 1-2 VL-CDR1- 18 044601 muCD37-lBl 1-2 VL-CDR1

KASQGVSNDVD (SEQ ID NO:6) muCD37-lBl 1-2 VL-CDR2KASQGVSNDVD (SEQ ID NO:6) muCD37-lBl 1-2 VL-CDR2

YASNRYT (SEQ ID NO:7) muCD37-lBl 1-2 VL-CDR3YASNRYT (SEQ ID NO:7) muCD37-lBl 1-2 VL-CDR3

CHQDYTSPT (SEQ ID NO:8) muCD37-lBl 1-2 вариабельная область тяжелой цепи (VH)CHQDYTSPT (SEQ ID NO:8) muCD37-lBl 1-2 heavy chain variable region (VH)

EVQLLQSGPELVKPGASVKISCKASGYSFTGYFMNWVIQSHGKFLEWIGRINPYNGDTFY NQKFKrKATLTVDKSSTTAHMELLSLTSEDSAVYYCGSRGIVASSRFFDVWGAGTSVIVS S(SEQIDNO:9) muCD37-lBl 1-2 вариабельная область легкой цепи (VL)EVQLLQSGPELVKPGASVKISCKASGYSFTGYFMNWVIQSHGKFLEWIGRINPYNGDTFY NQKFKrKATLTVDKSSTTAHMELLSLTSEDSAVYYCGSRGIVASSRFFDVWGAGTSVIVS S(SEQIDNO:9) muCD37-lBl 1-2 light chain variable region (VL)

SIVMFQTPKFLLVSAGDRVTITCKASQGVSNDVDWYQQKPGQSPKLLIYYASNRYTGVP DRFTGSGYGTDFTFS1STVQAEDLAVYFCHQDYTSPTFGGGTKLE1KR (SEQ ID NO: 10) muCD37- lBl 1-2 полноразмерная тяжелая цепь (НС)SIVMFQTPKFLLVSAGDRVTITCKASQGVSNDVDWYQQKPGQSPKLLIYYASNRYTGVP DRFTGSGYGTDFTFS1STVQAEDLAVYFCHQDYTSPTFGGGTKLE1KR (SEQ ID NO: 10) muCD37- lBl 1-2 full-length heavy chain (HC)

EVQLLQSGPELVKPGASVKISCKASGYSFTGYFMNWVIQSHGKFLEW1GRINPYNGDTFY NQKFKFKATLTVDKSSTTAHMELLSLTSEDSAVYYCGSRGIVASSRFFDVWGAGTSVIVS SAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKTYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLES DLYTLSSSVTVPSSPRPSETVTCNVAHPASSFKVDKKIVPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFP PKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSE LP1MHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKFRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSL TCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMNTNGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTF TCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK (SEQ ID NO:11) muCD37-lBl 1-2 полноразмерная легкая цепьEVQLLQSGPELVKPGASVKISCKASGYSFTGYFMNWVIQSHGKFLEW1GRINPYNGDTFY NQKFKFKATLTVDKSSTTAHMELLSLTSEDSAVYYCGSRGIVASSRFFDVWGAGTSVIVS SAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKTYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLES DLYTLSSSVTVPSSPRPSETVTCN VAHPASSFKVDKKIVPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFP PKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSE LP1MHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKFRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSL TCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAEN YKNTQPIMNTNGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTF TCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK (SEQ ID NO:11) muCD37-lBl 1-2 full length light chain

SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITCKASQGVSNDVDWYQQKPGQSPKLLIYYASNRYTGVP DRFTGSGYGTDFTFSISTVQAEDLAVYFCHQDYTSPTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPS SEQLTSGGASWCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLT LTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSP1VKSFNRNEC (SEQ ID NO: 12)SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITCKASQGVSNDVDWYQQKPGQSPKLLIYYASNRYTGVP DRFTGSGYGTDFTFSISTVQAEDLAVYFCHQDYTSPTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPS SEQLTSGGASWCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLT LTKDEYERH NSYTCEATHKTSTSP1VKSFNRNEC (SEQ ID NO: 12)

Связывающиеся с CD37 агенты включают связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты), которые содержат шесть последовательностей CDR антитела 1В11-2, представленных SEQ ID NO: 3-8. Связывающиеся с CD37 молекулы могут представлять собой связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты), которые содержат участки CDR антитела 1В11-2 (т.е. SEQ ID NO: 3-8), содержащие до четырех (т.е. 0, 1, 2, 3 или 4) консервативных аминокислотных замен на CDR. Связывающиеся с CD37 молекулы могут представлять собой связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты), которые содержат участки CDR антитела 1В11-2 (т.е. SEQ ID NO: 3-8), содержащие до четырех (т.е. 0, 1, 2, 3 или 4) консервативных аминокислотных замен. Связывающиеся с CD37 молекулы могут представлять собой связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты), которые содержат (i) участки CDR, представленные SEQ ID NO: 3, 4, 6 и 7, содержащие до четырех (т.е. 0, 1, 2, 3 или 4) консервативных аминокислотных замен на CDR и (ii) участки CDR, представленные SEQ ID NO: 5 и 8. Связывающиеся с CD37 молекулы могут представлять собой связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты), которые содержат (i) участки CDR, представленные SEQ ID NO: 3, 4, 6 и 7, содержащие до четырех (т.е. 0, 1, 2, 3 или 4) консервативных аминокислотных замен и (ii) участки CDR, представленные SEQ ID NO: 5 и 8. Связывающиеся с CD37 молекулы могут представлять собой связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты), которые содержат (i) участки CDR, представленные SEQ ID NO: 3, 4 и 6-8, содержащие до четырех (т.е. 0, 1, 2, 3 или 4) консервативных аминокислотных замен на CDR и (ii) участок CDR, представленную SEQ ID NO: 5. Связывающиеся с CD37 молекулы могут представлять собой связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты), которые содержат (i) участки CDR, представленные SEQ ID NO: 3, 4 и 6-8, содержащие до четырех (т.е. 0, 1, 2, 3 или 4) консервативных аминокислотных замен и (ii) участок CDR, представленную SEQ ID NO: 5.CD37 binding agents include CD37 binding agents (eg, antibodies and antigen binding fragments thereof) that contain the six CDR sequences of the 1B11-2 antibody represented by SEQ ID NOs: 3-8. CD37-binding molecules may be CD37-binding agents (eg, antibodies and antigen-binding fragments thereof) that contain antibody 1B11-2 CDR regions (i.e., SEQ ID NO: 3-8) containing up to four (i.e. 0, 1, 2, 3 or 4) conservative amino acid substitutions per CDR. CD37-binding molecules may be CD37-binding agents (eg, antibodies and antigen-binding fragments thereof) that contain antibody 1B11-2 CDR regions (i.e., SEQ ID NO: 3-8) containing up to four (i.e. 0, 1, 2, 3 or 4) conservative amino acid substitutions. CD37-binding molecules may be CD37-binding agents (e.g., antibodies and antigen-binding fragments thereof) that contain (i) CDR regions represented by SEQ ID NOs: 3, 4, 6 and 7, containing up to four (i.e. 0, 1, 2, 3 or 4) conservative amino acid substitutions on the CDRs and (ii) the CDR regions represented by SEQ ID NOs: 5 and 8. The CD37-binding molecules may be CD37-binding agents (e.g., antibodies and antigen-binding fragments thereof ), which contain (i) CDR regions represented by SEQ ID NOs: 3, 4, 6 and 7, containing up to four (i.e. 0, 1, 2, 3 or 4) conservative amino acid substitutions and (ii) CDR regions represented by SEQ ID NOs: 5 and 8. The CD37-binding molecules may be CD37-binding agents (eg, antibodies and antigen-binding fragments thereof) that contain (i) the CDR regions represented by SEQ ID NOs: 3, 4, and 6- 8, containing up to four (i.e., 0, 1, 2, 3 or 4) conservative amino acid substitutions per CDR and (ii) the CDR region represented by SEQ ID NO: 5. CD37-binding molecules may be CD37-binding agents (e.g., antibodies and antigen-binding fragments thereof) that contain (i) CDR regions represented by SEQ ID NOs: 3, 4 and 6-8, containing up to four (i.e. 0, 1, 2, 3 or 4) conservative amino acid substitutions and (ii) the CDR region represented by SEQ ID NO: 5.

Полипептиды, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты могут содержать вариабельную область легкой цепи, вариабельную область тяжелой цепи или вариабельные области и легкой, и тяжелой цепей антитела 1В11-2. Также предложены полипептиды, которые содержат (а) полипептид, имеющий последовательность, по меньшей мере на 90% идентичную SEQ ID NO: 9 и/или (b) полипептид, имеющий последовательность, по меньшей мере на 90% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой антитело и/или полипептид, который специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой мышиное, химерное илиThe polypeptides, antibodies, and antigen binding fragments thereof may comprise a light chain variable region, a heavy chain variable region, or both light and heavy chain variable regions of the 1B11-2 antibody. Also provided are polypeptides that comprise (a) a polypeptide having a sequence at least 90% identical to SEQ ID NO: 9 and/or (b) a polypeptide having a sequence at least 90% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide is an antibody and/or polypeptide that specifically binds to CD37. In some embodiments, the polypeptide is murine, chimeric, or

- 19 044601 гуманизированное антитело, которое специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательностям SEQ ID NO: 9 или 10, отличается от SEQ ID NO: 9 или 10 только наличием консервативных аминокислотных замен.- 19 044601 humanized antibody that specifically binds to CD37. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage identity to SEQ ID NO: 9 or 10 differs from SEQ ID NO: 9 or 10 only by the presence of conservative amino acid substitutions.

В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 95% идентичную SEQ ID NO: 9. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 96% идентичную SEQ ID NO: 9. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 97% идентичную SEQ ID NO: 9. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 98% идентичную SEQ ID NO: 9. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 99% идентичную SEQ ID NO: 9. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой антитело и/или полипептид, который специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой мышиное, химерное или гуманизированное антитело, которое специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 9, отличается от SEQ ID NO: 9 только наличием консервативных аминокислотных замен. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 9, отличается от SEQ ID NO: 9 только аминокислотами вне участков CDR. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 9, отличается от SEQ ID NO: 9 только консервативными аминокислотными заменами вне участков CDR.In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence at least 95% identical to SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain, comprising a sequence at least 96% identical to SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence at least 97% identical to SEQ ID NO: 9. B In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence at least 98% identical to SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence that is at least 99% identical to SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the polypeptide is an antibody and/or polypeptide that specifically binds to CD37. In some embodiments, the polypeptide is a murine, chimeric, or humanized antibody that specifically binds to CD37. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 9 differs from SEQ ID NO: 9 only by the presence of conservative amino acid substitutions. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 9 differs from SEQ ID NO: 9 only in amino acids outside the CDR regions. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 9 differs from SEQ ID NO: 9 only by conservative amino acid substitutions outside the CDR regions.

В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 95% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 96% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 97% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 98% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 99% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой антитело и/или полипептид, который специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой мышиное, химерное или гуманизированное антитело, которое специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 10, отличается от SEQ ID NO: 10 только наличием консервативных аминокислотных замен. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 10, отличается от SEQ ID NO: 10 только аминокислотами вне участков CDR. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 10, отличается от SEQ ID NO: 10 только консервативными аминокислотными заменами вне участков CDR.In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen-binding fragment thereof comprises a light chain variable domain comprising a sequence at least 95% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen-binding fragment thereof comprises a light chain variable domain, comprising a sequence at least 96% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen binding fragment thereof comprises a light chain variable domain comprising a sequence at least 97% identical to SEQ ID NO: 10. B In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen-binding fragment thereof comprises a light chain variable domain comprising a sequence at least 98% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen-binding fragment thereof comprises a light chain variable domain comprising a sequence that is at least 99% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide is an antibody and/or polypeptide that specifically binds to CD37. In some embodiments, the polypeptide is a murine, chimeric, or humanized antibody that specifically binds to CD37. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 10 differs from SEQ ID NO: 10 only by the presence of conservative amino acid substitutions. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 10 differs from SEQ ID NO: 10 only in amino acids outside the CDR regions. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 10 differs from SEQ ID NO: 10 only by conservative amino acid substitutions outside the CDR regions.

В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 95% идентичную SEQ ID NO: 9, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 95% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 96% идентичную SEQ ID NO: 9, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 96% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 97% идентичную SEQ ID NO: 9, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 97% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 98% идентичную SEQ ID NO: 9, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 98% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 99% идентичную SEQ ID NO: 9, и вариабель- 20 044601 ный домен легкой цепи, содержащий последовательность, по меньшей мере на 99% идентичную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой антитело и/или полипептид, которое/который специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой мышиное, химерное или гуманизированное антитело, которое специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 9 и/или 10, отличается от SEQ ID NO: 9 и/или 10 только наличием консервативных аминокислотных замен. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 9 и/или 10, отличается от SEQ ID NO: 9 и/или 10 только аминокислотами вне участков CDR. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 9 и/или 10, отличается от SEQ ID NO: 9 и/или 10 только консервативными аминокислотными заменами вне участков CDR.In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence at least 95% identical to SEQ ID NO: 9 and a light chain variable domain comprising a sequence at least 95% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence at least 96% identical to SEQ ID NO: 9 and a light chain variable domain comprising a sequence of at least 96% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence at least 97% identical to SEQ ID NO: 9, and a light chain variable domain comprising a sequence at least 97% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence at least 98% identical to SEQ ID NO: 9, and a variable a light chain domain comprising a sequence at least 98% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising a sequence at least 99% identical to SEQ ID NO: : 9, and a light chain variable domain comprising a sequence at least 99% identical to SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the polypeptide is an antibody and/or a polypeptide that specifically binds to CD37. In some embodiments, the polypeptide is a murine, chimeric, or humanized antibody that specifically binds to CD37. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 9 and/or 10 differs from SEQ ID NO: 9 and/or 10 only by the presence of conservative amino acid substitutions. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 9 and/or 10 differs from SEQ ID NO: 9 and/or 10 only by amino acids outside the CDR regions. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 9 and/or 10 differs from SEQ ID NO: 9 and/or 10 only by conservative amino acid substitutions outside the CDR regions.

В некоторых вариантах реализации полипептид, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность, представленную SEQ ID NO: 9, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий последовательность, представленную SEQ ID NO: 10.In some embodiments, the polypeptide, antibody, or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable domain comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 9 and a light chain variable domain comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 10.

Полипептиды могут содержать одну из отдельных легких цепей или тяжелых цепей, описанных в настоящем описании. Антитела и полипептиды также могут содержать и легкую цепь, и тяжелую цепь. Последовательности легкой цепи и тяжелой цепи антитела 1В11-2 представлены SEQ ID NO: 11 и 12.Polypeptides may contain one of the individual light chains or heavy chains described herein. Antibodies and polypeptides may also contain both a light chain and a heavy chain. The light chain and heavy chain sequences of antibody 1B11-2 are shown in SEQ ID NOs: 11 and 12.

Также предложены полипептиды, которые содержат (а) полипептид, имеющий по меньшей мере приблизительно 90% идентичности последовательности SEQ ID NO: 11, и/или (b) полипептид, имеющий по меньшей мере приблизительно 90% идентичности последовательности SEQ ID NO: 12. В некоторых вариантах реализации полипептид содержит полипептид, имеющий по меньшей мере приблизительно 95%, по меньшей мере приблизительно 96%, по меньшей мере приблизительно 97%, по меньшей мере приблизительно 98% или по меньшей мере приблизительно 99% идентичности последовательности SEQ ID NO: 11 или 12. Таким образом, в некоторых вариантах реализации полипептид содержит (а) полипептид, имеющий по меньшей мере приблизительно 95% идентичности последовательности SEQ ID NO: 11, и/или (b) полипептид, имеющий по меньшей мере приблизительно 95% идентичности последовательности SEQ ID NO: 12. В некоторых вариантах реализации полипептид содержит (а) полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, представленную SEQ ID NO: 11; и/или (b) полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, представленную SEQ ID NO: 12. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой антитело и/или полипептид, который специфично связывается CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид представляет собой мышиное, химерное или гуманизированное антитело, которое специфично связывается с CD37. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 11 и/или 12, отличается от SEQ ID NO: 11 и/или 12 только наличием консервативных аминокислотных замен. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 11 и/или 12, отличается от SEQ ID NO: 11 и/или 12 только аминокислотами вне участков CDR. В некоторых вариантах реализации полипептид, имеющий определенный процент идентичности последовательности SEQ ID NO: 11 и/или 12, отличается от SEQ ID NO: 11 и/или 12 только консервативными аминокислотными заменами вне участков CDR.Also provided are polypeptides that comprise (a) a polypeptide having at least about 90% sequence identity to SEQ ID NO: 11, and/or (b) a polypeptide having at least about 90% sequence identity to SEQ ID NO: 12. B In some embodiments, the polypeptide comprises a polypeptide having at least about 95%, at least about 96%, at least about 97%, at least about 98%, or at least about 99% sequence identity to SEQ ID NO: 11, or 12. Thus, in some embodiments, the polypeptide comprises (a) a polypeptide having at least about 95% sequence identity to SEQ ID NO: 11, and/or (b) a polypeptide having at least about 95% sequence identity to SEQ ID NO: 11 NO: 12. In some embodiments, the polypeptide comprises (a) a polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 11; and/or (b) a polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 12. In some embodiments, the polypeptide is an antibody and/or a polypeptide that specifically binds CD37. In some embodiments, the polypeptide is a murine, chimeric, or humanized antibody that specifically binds to CD37. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 11 and/or 12 differs from SEQ ID NO: 11 and/or 12 only by the presence of conservative amino acid substitutions. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 11 and/or 12 differs from SEQ ID NO: 11 and/or 12 only by amino acids outside the CDR regions. In some embodiments, a polypeptide having a certain percentage sequence identity to SEQ ID NO: 11 and/or 12 differs from SEQ ID NO: 11 and/or 12 only by conservative amino acid substitutions outside the CDR regions.

В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с тем же эпитопом, что и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, представленную SEQ ID NO: 9, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, представленную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) конкурентно ингибирует связывание антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, содержащего вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, представленную SEQ ID NO: 9, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, представленную SEQ ID NO: 10, с CD37. В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) конкурентно ингибирует связывание антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, содержащего вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, представленную SEQ ID NO: 9, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, представленную SEQ ID NO: 10, с CD37, и связывается с эпитопом, который перекрывается с эпитопом, с которым связывается антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, представленную SEQ ID NO: 9, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, представленную SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с и/или не связывается с антигенными последовательностями CD37, приведенными ниже в настоящем описании.In some embodiments, the CD37 binding agent (e.g., an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to the same epitope as the antibody or antigen binding fragment thereof comprising a heavy chain variable region comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 9 and a variable region light chain comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 10. In some embodiments, a CD37 binding agent (e.g., an antibody or an antigen binding fragment thereof) competitively inhibits the binding of an antibody or antigen binding fragment thereof comprising a heavy chain variable region comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 9, and a light chain variable region containing the sequence represented by SEQ ID NO: 10 with CD37. In some embodiments, a CD37 binding agent (e.g., an antibody or an antigen binding fragment thereof) competitively inhibits the binding of an antibody or an antigen binding fragment thereof comprising a heavy chain variable region comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 9 and a light chain variable region comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 10, with CD37, and binds to an epitope that overlaps with an epitope to which an antibody or antigen binding fragment thereof binds, containing a heavy chain variable region containing the sequence represented by SEQ ID NO: 9, and a light chain variable region chain comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the CD37 binding agent (eg, an antibody or antigen binding fragment thereof) binds and/or does not bind to the CD37 antigenic sequences set forth herein below.

- 21 044601- 21 044601

Антигенные последовательности CD37:CD37 antigenic sequences:

hCD37-LEL (подчеркнуты АК 107-242 CD37)hCD37-LEL (AK 107-242 CD37 is underlined)

TMELLISTQRAQLERSLRDVVEKT1OKYGTNPEETAAEESWDYVQFOLRCCGWHYPQD WFOVLILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVP AESHIYREGCAOGLOKWLHNNLSFLEOKLISEEDLNSAVDHHHHHHfSEO ГО NO: 15) hCD37-ECD-Fc (подчеркнуты АК 107-235 hCD37)TMELLISTQRAQLERSLRDVVEKT1OKYGTNPEETAAEESWDYVQFOLRCCGWHYPQD WFOVLILRNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVP AESHIYREGCAOGLOKWLHNNLSFLEOKLISEEDLNSAVDHHHHHHfSEO GO NO: 15) hCD37-ECD- Fc (underlined AK 107-235 hCD37)

GPEFL1STORAOLERSLRDVVEKTIOKYGTNPEETAAEESWDYVOFOLRCCGWHYPQD WFQVLILRGNGSEAHRVPCSCYNl·SATNDSTILDKVILPOLSRLGHLARSRHSADICAVP AESHIYREGCAOGLOGSEPRGPTIKPCPPCKCPAPNLLGGPSVF1FPPKIKDVLMISLSPIVT CVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKE FKCKVNNKDLPAPIERTISKPKFSVRAPQVYVLPPPEEEMTKKQVTLTCMVTDFMPEDIY VEWTWGKTELNYKNTEPVLDSDGSYFMYSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNH HTTKSFSRTPGK (SEQ ГО NO: 16) hCD37-Fc-LAGA (подчеркнуты AK 107-235 hCD37)GPEFL1STORAOLERSLRDVVEKTIOKYGTNPEETAAEESWDYVOFOLRCCGWHYPQD WFQVLILRGNGSEAHRVPCSCYNl·SATNDSTILDKVILPOLSRLGHLARSRHSADICAVP AESHIYREGCAOGLOGSEPRGPTIKPCPPCKCPAPNLLGGPSVF1FPPKIKDVLMISLSPIVT CVVVDVSEDDPDVQI SWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKE FKCKVNNKDLPAPIERTISKPKFSVRAPQVYVLPPPEEEMTKKQVTLTLTCMVTDFMPEDIY VEWTWGKTELNYKNTEPVLDSDGSYFMYSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNH HTTKSFSRTPGK (SEQ GO NO: 1 6) hCD37-Fc-LAGA (underlined AK 107-235 hCD37)

GPEFLISTORAOLERSLRDVVEKTIOKYGTNPEETAAEESWDYVOFOLRCCGWHYPOD WFOVLILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDST1L·DKVIL·POLSRLGHLARSRHSADICAVP AESHIYREGCAQGLQGSDKTHTCPPCPAPELAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVV VDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEY KCKVSNKALPAPIEKTISKAKFQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKrFYPSDTAVE WESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQ KSLSLSPG (SEQ ID NO:17) hCD37-ECD-S2-Fc (дважды подчеркнуты АК 107-109 hCD37 и подчеркнуты АК 138-235)GPEFLISTORAOLERSLRDVVEKTIOKYGTNPEETAAEESWDYVOFOLRCCGWHYPOD WFOVLILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDST1L·DKVIL·POLSRLGHLARSRHSADICAVP AESHIYREGCAQGLQGSDKTHTCPPCPAPELAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVV VDVSHEDPEVKFNWYVD GVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEY KCKVSNKALPAPIEKTISKAKFQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKrFYPSDTAVE WESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQ KSLSLSPG (SEQ ID NO:17) hCD 37-ECD-S2-Fc (AK 107-109 hCD37 is underlined twice and AK 138-235 is underlined)

GPEFLISAAEESWDYVOFOLRCCGWHYPODWFOVLILRGNGSEAHRVPCSCYNl·SATN DSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQGSEPRGPTIKPCPPC KCPAPNLLGGPSVFIFPPKIKDVLMISLSPIVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQ TQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKEFKCKVNNKDLPAPIERTISKPKrSVRAPQ VYVLPPPEEEMTKKQVTLTCMVTDFMPEDTYVEWTNNGKTELNYKNTEPVLDSDGSYF MYSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNHHTTKSFSRTPGK (SEQ ID NO: 18) hCD37 (AK 107-235)GPEFLISAAEESWDYVOFOLRCCGWHYPODWFOVLILRGNGSEAHRVPCSCYNl·SATN DSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQGSEPRGPTIKPCPPC KCPAPNLLGGPSVFIFPPKIKDVLMISLSPIVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQ TQTHREDYNSTLRV VSALPIQHQDWMSGKEFKCKVNNKDLPAPIERTISKPKrSVRAPQ VYVLPPPEEEMTKKQVTLTCMVTDFMPEDTYVEWTNNGKTELNYKNTEPVLDSDGSYF MYSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNHHTTKSFSRTPGK (SEQ ID NO: 18) hCD37 (AK 107-235)

LISTQRAQLERSLRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQV LILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHI YREGCAQGLQ (SEQ ID NO: 19) hCD37 (AK 107-242)LISTQRAQLERSLRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQV LILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHI YREGCAQGLQ (SEQ ID NO: 19) hCD37 (AK 107-242)

LISTQRAQLERSLRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQV LILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHI YREGCAQGLQKWLHNNL (SEQ ID NO :20) hCD37 (AK 107-109 и 138-235)ListqraqlerslrdvvekkkygtnpeetnpeeswhyvqfqlrclrclrgwhypcdwfQv LilrGngseahrvpskvilsrSrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhsrhlhpaeshi (SEQ ID NO: 20) HCD37 (AK 107-109 and 138-235)

LISAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTIL DKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQ (SEQ ID NO :21)LISAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTIL DKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQ (SEQ ID NO :21)

В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с аминокислотами 107-242 CD37 (SEQ ID NO: 20). В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с аминокислотами 107-235 CD37 (SEQ ID NO: 19).In some embodiments, the CD37 binding agent (eg, an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to amino acids 107-242 of CD37 (SEQ ID NO: 20). In some embodiments, the CD37 binding agent (eg, an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to amino acids 107-235 of CD37 (SEQ ID NO: 19).

В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с последовательностью, представленной SEQ ID NO: 15. В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с последовательностью, представленной SEQ ID NO: 16. В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с последовательностью, представленной SEQ ID NO: 17.In some embodiments, a CD37 binding agent (e.g., an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to the sequence represented by SEQ ID NO: 15. In some embodiments, a CD37 binding agent (e.g., an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to the sequence represented by SEQ ID NO: 16. In some embodiments, the CD37 binding agent (e.g., an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to the sequence represented by SEQ ID NO: 17.

В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с аминокислотами 107-242 CD37 (SEQ ID NO: 20), но не связывается с аминокислотами 138-235 CD37. В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с аминокислотами 107235 CD37 (SEQ ID NO: 19), но не связывается с аминокислотами 138-235 CD37.In some embodiments, the CD37 binding agent (eg, an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to amino acids 107-242 of CD37 (SEQ ID NO: 20) but does not bind to amino acids 138-235 of CD37. In some embodiments, the CD37 binding agent (eg, an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to amino acids 107235 of CD37 (SEQ ID NO: 19) but does not bind to amino acids 138-235 of CD37.

В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 15, но не связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 16, но не связывается с полипептидом, представленнымIn some embodiments, the CD37-binding agent (e.g., an antibody or antigen-binding fragment thereof) binds to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 15, but does not bind to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 18. In some embodiments, the CD37-binding agent ( e.g., an antibody or antigen-binding fragment thereof) binds to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 16, but does not bind to the polypeptide represented by

- 22 044601- 22 044601

SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 17, но не связывается с полипептидом, представленным SEQ ID NO: 18.SEQ ID NO: 18. In some embodiments, the CD37 binding agent (e.g., an antibody or antigen binding fragment thereof) binds to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 17, but does not bind to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 18.

В некоторых вариантах реализации связывающийся с CD37 агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) связывается с эпитопом, который содержит по меньшей мере одну аминокислоту из 110-137 SEQ ID NO: 1. Аминокислоты 110-137 представляют собой первый сегмент (S1) большого внеклеточного домена CD37.In some embodiments, a CD37-binding agent (e.g., an antibody or an antigen-binding fragment thereof) binds to an epitope that contains at least one amino acid from SEQ ID NO: 110-137. Amino acids 110-137 represent the first segment (S1) of the large extracellular domain of CD37.

Аффинность или авидность антитела к антигену может быть определена экспериментально с применением любого подходящего способа, хорошо известного в данной области техники, например, проточной цитометрии, иммуноферментного анализа (ELISA) или радиоиммуноанализа (РИА) или кинетики (например, анализ BIACORE™). Могут быть легко использованы форматы анализа непосредственного связывания, а также анализа конкурентного связывания. (См., например, Berzofsky, et al., Berzofsky, et al., Antibody-Antigen Interactions, In Fundamental Immunology, Paul, W.E., Ed., Raven Press: New York, N.Y. (1984); Kuby, Janis Immunology, W.H. Freeman and Company: New York, N.Y. (1992) и способы, описанные в настоящем документе. Измеренная аффинность взаимодействия антитело-антиген может варьировать при измерении при различных условиях (например, концентрация соли, рН, температура). Таким образом, измерения аффинности и других параметров связывания антигена (например, KD или Kd, Kon, Koff) выполняют со стандартизованными растворами антител и антигена и стандартизованным буфером, такими как известные в данной области техники и таким как буфер, описанный в настоящем описании.The affinity or avidity of an antibody for an antigen can be determined experimentally using any suitable method well known in the art, for example, flow cytometry, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) or radioimmunoassay (RIA) or kinetics (eg, BIACORE™ assay). Direct binding assay formats as well as competitive binding assay formats can be easily used. (See, for example, Berzofsky, et al., Berzofsky, et al., Antibody-Antigen Interactions, In Fundamental Immunology, Paul, W.E., Ed., Raven Press: New York, NY (1984); Kuby, Janis Immunology, WH Freeman and Company: New York, NY (1992) and the methods described herein.The measured affinity of an antibody-antigen interaction may vary when measured under different conditions (eg, salt concentration, pH, temperature).Thus, affinity measurements and other antigen binding parameters (eg, K D or K d , K on , K off ) are performed with standardized antibody and antigen solutions and a standardized buffer, such as those known in the art and such as the buffer described herein.

В одном аспекте анализ связывания может быть выполнен методом проточной цитометрии на клетках, экспрессирующих антиген CD37 на поверхности. Например, CD37-положительные клетки, такие как клетки 300-19, могут быть инкубированы с различными концентрациями антител к CD37 с использованием 1x105 клеток на образец в 100 мкл буфера для FACS (среда RPMI-1640 с добавлением 2% нормальной сыворотки козла).In one aspect, the binding assay can be performed by flow cytometry on cells expressing the CD37 antigen on the surface. For example, CD37-positive cells, such as 300-19 cells, can be incubated with various concentrations of anti-CD37 antibodies using 1x105 cells per sample in 100 μl FACS buffer (RPMI-1640 medium supplemented with 2% normal goat serum).

Затем клетки могут быть осаждены, промыты и инкубированы в течение 1 ч со 100 мкл конъюгированного с флуоресцеинизотиоцианатом (FITC) антитела козла к IgG мыши или антитела козла к IgG человека (такого как, например, получаемое от Jackson Laboratory, 6 мкг/мл в буфере для FACS). Затем клетки снова осаждают, промывают буфером для FACS и ресуспендируют в 200 мкл фосфатно-солевого буфера (ФСБ), содержащего 1% формальдегида. Образцы могут быть получены, например, с использованием проточного цитометра FACS Calibur с многолуночным пробоотборником HTS и проанализированы с использованием CellQuest Pro (все инструменты BD Biosciences, Сан-Диего, США). Для каждого образца средняя интенсивность флуоресценции FL1 (MFI) может быть экспортирована и нанесена на график зависимости от концентрации антитела в полулогарифмическом масштабе для получения кривой связывания. Для кривых связывания строят сигмоидальную кривую зависимости от дозы, а значения ЕС50 вычисляют с использованием таких программ, как GraphPad Prism v4 с параметрами по умолчанию (программное обеспечение GraphPad, Сан-Диего, Калифорния). Значения ЕС50 могут быть использованы в качестве меры для кажущейся константы диссоциации Kd или KD для каждого антитела.Cells can then be pelleted, washed, and incubated for 1 hour with 100 μl of fluorescein isothiocyanate (FITC)-conjugated goat anti-mouse IgG or goat anti-human IgG (such as those available from Jackson Laboratory, 6 μg/ml in buffer for FACS). Cells are then pelleted again, washed with FACS buffer, and resuspended in 200 μl of phosphate-buffered saline (PBS) containing 1% formaldehyde. Samples can be obtained, for example, using a FACS Calibur flow cytometer with an HTS multiwell sampler and analyzed using CellQuest Pro (all BD Biosciences instruments, San Diego, USA). For each sample, the mean FL1 fluorescence intensity (MFI) can be exported and plotted against antibody concentration on a semi-log scale to obtain a binding curve. Binding curves are plotted with a sigmoidal dose-response curve and EC50 values are calculated using programs such as GraphPad Prism v4 with default parameters (GraphPad Software, San Diego, CA). EC 50 values can be used as a measure of the apparent dissociation constant Kd or KD for each antibody.

Моноклональные антитела могут быть получены с использованием гибридомных методов, таких как методы, описанные Kohler и Mil stein (1975), Nature, 256:495. При использовании гибридомного метода мышь, хомяка или другое подходящее животное-хозяина иммунизируют, чтобы вызвать выработку лимфоцитами антител, которые будут специфично связываться с иммунизирующим антигеном. Лимфоциты также могут быть иммунизированы in vitro. После иммунизации лимфоциты выделяют и сливают с подходящей линией клеток миеломы с применением, например, полиэтиленгликоля, с образованием клеток гибридомы, которые затем могут быть отделены от неслитых лимфоцитов и клеток миеломы. Гибридомы, продуцирующие моноклональные антитела, специфично направленные против выбранного антигена, как определяют, например, путем иммунопреципитации, иммуноблоттинга или анализа связывания in vitro (например, радиоиммуноанализа (РИА); иммуноферментного анализа (ELISA)), затем могут быть размножены в либо в культуре in vitro с использованием стандартных методов (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, Academic Press, 1986), либо in vivo в виде асцитных опухолей у животного. Затем моноклональные антитела могут быть очищены из культуральной среды или асцитной жидкости. В качестве альтернативы моноклональные антитела также могут быть получены способами с использованием рекомбинантной ДНК, как описано в патенте США 4816567. Полинуклеотиды, кодирующие моноклональное антитело, выделяют из зрелых В-клеток или клеток гибридомы, например, с помощью RT-PCR с использованием олигонуклеотидных праймеров, которые специфично амплифицируют гены, кодирующие тяжелые и легкие цепи антитела, а их последовательность определяют с использованием общепринятых методов. Выделенные полинуклеотиды, кодирующие тяжелые и легкие цепи, затем клонируют в подходящие векторы экспрессии, которые трансфицируют в клетки-хозяева, такие как клетки Е. coli, клетки COS обезьяны, клетки яичника китайского хомячка (СНО) или клетки миеломы, которые в иных случаях не продуцируют иммуноглобулиновый белок, и моноклональные антитела вырабатываются клетками-хозяевами. Также рекомбинантные моноклональные антитела или их фрагменты желаемых видов могут быть выделены из библиотек фагового дисплея, экспрессирующих участки CDRMonoclonal antibodies can be produced using hybridoma methods, such as those described by Kohler and Milstein (1975), Nature, 256:495. In the hybridoma method, a mouse, hamster, or other suitable host animal is immunized to induce the lymphocytes to produce antibodies that will specifically bind to the immunizing antigen. Lymphocytes can also be immunized in vitro. Following immunization, the lymphocytes are isolated and fused with a suitable myeloma cell line using, for example, polyethylene glycol, to form hybridoma cells, which can then be separated from the unfused lymphocytes and myeloma cells. Hybridomas that produce monoclonal antibodies specifically directed against a selected antigen, as determined, for example, by immunoprecipitation, immunoblotting or in vitro binding assays (eg, radioimmunoassay (RIA); enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)), can then be propagated in or in culture in vitro using standard methods (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, Academic Press, 1986), or in vivo in the form of ascites tumors in an animal. The monoclonal antibodies can then be purified from the culture medium or ascites fluid. Alternatively, monoclonal antibodies can also be produced by methods using recombinant DNA, as described in US Pat. No. 4,816,567. Polynucleotides encoding a monoclonal antibody are isolated from mature B cells or hybridoma cells, for example, by RT-PCR using oligonucleotide primers, which specifically amplify the genes encoding the heavy and light chains of an antibody, and their sequence is determined using conventional methods. The isolated polynucleotides encoding the heavy and light chains are then cloned into suitable expression vectors, which are transfected into host cells, such as E. coli cells, monkey COS cells, Chinese hamster ovary (CHO) cells, or myeloma cells that are not otherwise produce immunoglobulin protein, and monoclonal antibodies are produced by host cells. Also, recombinant monoclonal antibodies or fragments thereof of the desired species can be isolated from phage display libraries expressing CDR regions

- 23 044601 желаемых видов, как описано (McCafferty et al., 1990, Nature, 348:552-554; Clackson et al., 1991, Nature, 352:624-628 и Marks et al., 1991, J. Mol. Biol., 222:581-597). Полинуклеотид (полинуклеотиды), кодирующий моноклональное антитело, может быть дополнительно модифицирован различными способами с использованием технологии рекомбинантной ДНК для получения альтернативных антител. В некоторых вариантах реализации константные домены тяжелых и легких цепей, например, моноклонального антитела мыши, могут быть заменены 1) на те же области, например, антитела человека для получения химерного антитела или 2) полипептид неиммуноглобулиновой природы для получения слитого антитела. В некоторых вариантах реализации константные области усекают или удаляют для получения желаемого фрагмента моноклонального антитела. Для оптимизации специфичности, аффинности и т.д. моноклонального антитела могут быть применены сайт-направленный или высокоплотный мутагенез вариабельной области.- 23 044601 desired species as described (McCafferty et al., 1990, Nature, 348:552-554; Clackson et al., 1991, Nature, 352:624-628 and Marks et al., 1991, J. Mol. Biol., 222:581-597). The polynucleotide(s) encoding a monoclonal antibody can be further modified in various ways using recombinant DNA technology to produce alternative antibodies. In some embodiments, the heavy and light chain constant domains of, for example, a mouse monoclonal antibody can be replaced with 1) the same regions, for example, a human antibody to produce a chimeric antibody or 2) a non-immunoglobulin polypeptide to produce a fusion antibody. In some embodiments, constant regions are truncated or removed to produce the desired monoclonal antibody fragment. To optimize specificity, affinity, etc. of a monoclonal antibody, site-directed or high-density mutagenesis of the variable region can be used.

В некоторых вариантах реализации моноклональное антитело к CD37 человека представляет собой гуманизированное антитело. В некоторых вариантах реализации указанное гуманизированное антитело представляет собой антитело с измененной поверхностью.In some embodiments, the anti-human CD37 monoclonal antibody is a humanized antibody. In some embodiments, the humanized antibody is a surface-edited antibody.

Антитела человека могут быть получены непосредственно с использованием различных методов, известных в данной области техники. Могут быть получены иммортализованные В-лимфоциты человека, которые продуцируют антитело, направленное против целевого антигена, иммунизированные in vitro или выделенные от иммунизированного лица, (см., например, Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985); Boemer et al., 1991, J. Immunol., 147(1):86-95 и патент США 5750373). Также антитело человека может быть выбрано из фаговой библиотеки, в случае если указанная фаговая библиотека экспрессирует антитела человека, как описано, например, в источниках Vaughan et al., 1996, Nat. Biotech., 14:309-314, Sheets et al., 1998, Proc. Nat'l. Acad. Sci., 95:6157-6162, Hoogenboom and Winter, 1991, J. Mol. Biol., 227:381, и Marks et al., 1991, J. Mol. Biol., 222:581). Методики получения и использования фаговых библиотек антител также описаны в патентах США № 5969108, 6172197, 5885793, 6521404; 6544731; 6555313; 6582915; 6593081; 6300064; 6653068; 6706484 и 7264963 и источнике Rothe et al., 2007, J. Mol. Bio., doi:10.1016/j.jmb.2007.12.018 (каждый из которых включен посредством ссылки во всей своей полноте). Стратегии созревания аффинности и стратегии перестановки цепей (Marks et al., 1992, Bio/Technology 10:779-783, включен посредством ссылки во всей своей полноте) известны в данной области техники и могут быть применены для получения высокоаффинных антител человека.Human antibodies can be obtained directly using various methods known in the art. Immortalized human B lymphocytes that produce antibody directed against a target antigen can be prepared, immunized in vitro, or isolated from an immunized individual (see, for example, Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985); Boemer et al., 1991, J. Immunol., 147(1):86-95 and US patent 5750373). Also, the human antibody may be selected from a phage library if said phage library expresses human antibodies, as described, for example, in Vaughan et al., 1996, Nat. Biotech., 14:309-314, Sheets et al., 1998, Proc. Nat'l. Acad. Sci., 95:6157-6162, Hoogenboom and Winter, 1991, J. Mol. Biol., 227:381, and Marks et al., 1991, J. Mol. Biol., 222:581). Methods for obtaining and using phage antibody libraries are also described in US patents No. 5969108, 6172197, 5885793, 6521404; 6544731; 6555313; 6582915; 6593081; 6300064; 6653068; 6706484 and 7264963 and Rothe et al., 2007, J. Mol. Bio., doi:10.1016/j.jmb.2007.12.018 (each of which is incorporated by reference in its entirety). Affinity maturation strategies and chain shuffling strategies (Marks et al., 1992, Bio/Technology 10:779-783, incorporated by reference in their entirety) are known in the art and can be used to produce high-affinity human antibodies.

Гуманизированные антитела также могут быть получены в трансгенных мышах, несущих локусы иммуноглобулина человека, способных после иммунизации продуцировать полный спектр антител человека в отсутствие выработки эндогенного иммуноглобулина. Этот подход описан в патентах США № 5545807;5545806;5569825;5625126;5633425 и 5661016.Humanized antibodies can also be produced in transgenic mice carrying human immunoglobulin loci, capable of producing the full range of human antibodies after immunization in the absence of endogenous immunoglobulin production. This approach is described in US patents No. 5545807;5545806;5569825;5625126;5633425 and 5661016.

В некоторых вариантах реализации предложен фрагмент антитела для, например, повышения проникновения в опухоль. Известны различные способы для получения фрагментов антител. Традиционно эти фрагменты получают путем протеолитического расщепления интактных антител (например, Morimoto et al., 1993, Journal of Biochemical and Biophysical Methods, 24:107-117; Brennan et al., 1985, Science, 229:81). В некоторых вариантах реализации фрагменты антител получают рекомбинантным способом. Fab, Fv и scFv фрагменты антител могут экспрессироваться и секретироваться Е. coli или другими клетками-хозяевами, обеспечивая таким образом возможность получения больших количеств этих фрагментов. Такие фрагменты антител также могут быть выделены из фаговых библиотек антител, обсуждаемых выше. Фрагмент антитела также может представлять собой линейные антитела, как описано, например, в патенте США № 5641870, и может быть моноспецифическим или биспецифическим. Другие способы получения фрагментов антител будут очевидны специалисту в данной области техники.In some embodiments, an antibody fragment is provided to, for example, enhance tumor penetration. Various methods are known for producing antibody fragments. Traditionally, these fragments are obtained by proteolytic cleavage of intact antibodies (eg, Morimoto et al., 1993, Journal of Biochemical and Biophysical Methods, 24:107-117; Brennan et al., 1985, Science, 229:81). In some embodiments, the antibody fragments are produced recombinantly. Fab, Fv and scFv antibody fragments can be expressed and secreted by E. coli or other host cells, thereby allowing the production of large quantities of these fragments. Such antibody fragments can also be isolated from the phage antibody libraries discussed above. The antibody fragment may also be a linear antibody, as described, for example, in US Pat. No. 5,641,870, and may be monospecific or bispecific. Other methods for producing antibody fragments will be apparent to one skilled in the art.

В соответствии с настоящим изобретением, способы могут быть адаптированы для получения одноцепочечных антител, специфичных к CD37 (см. патент США № 4946778). Помимо этого, способы могут быть адаптированы для построения библиотек экспрессии Fab (Huse, et al., Science, 246:1275-1281 (1989)) для обеспечения быстрой и эффективной идентификации моноклональных фрагментов Fab с желаемой специфичностью к CD37 или их производных, фрагментов, аналогов или гомологов. Фрагменты антител могут быть получены способами в данной области техники, включая, но не ограничиваясь ими: (а) фрагмент F(ab')2, полученный расщеплением молекулы антитела пепсином; (b) фрагмент Fab, полученный путем восстановления дисульфидных мостиков фрагмента F(ab')2; (с) фрагмент Fab, полученный обработкой молекулы антитела папаином и восстанавливающим агентом, и (d) фрагменты Fv.In accordance with the present invention, the methods can be adapted to produce single chain antibodies specific for CD37 (see US patent No. 4946778). In addition, the methods can be adapted to construct Fab expression libraries (Huse, et al., Science, 246:1275-1281 (1989)) to provide rapid and efficient identification of monoclonal Fab fragments with the desired CD37 specificity or derivative fragments thereof, analogues or homologues. Antibody fragments can be produced by methods in the art, including, but not limited to: (a) an F(ab') 2 fragment obtained by digestion of an antibody molecule with pepsin; (b) a Fab fragment obtained by reducing the disulfide bridges of the F(ab') 2 fragment; (c) a Fab fragment obtained by treating the antibody molecule with papain and a reducing agent; and (d) Fv fragments.

Для целей настоящего описания следует понимать, что модифицированные антитела могут содержать вариабельную область любого типа, которая обеспечивает связывание антитела с полипептидами CD37 человека. В этом отношении вариабельная область может содержать область любого типа млекопитающих или быть получена из любого типа млекопитающих. Таким образом, вариабельная область модифицированных антител может иметь происхождение от, например, человека, мыши, приматов, не являющихся человеком (например, яванских макак (cynomolgus monkeys), макак и т.д.), или волков. В некоторых вариантах реализации как вариабельная, так и константная области модифицированных иммуноглобулинов являются человеческими. В других вариантах реализации вариабельные области совместимых антител (обычно полученные из источника, отличного от человека) могут быть сконструироFor the purposes of this description, it should be understood that the modified antibodies may contain any type of variable region that allows the antibody to bind to human CD37 polypeptides. In this regard, the variable region may comprise a region of any type of mammal or be derived from any type of mammal. Thus, the variable region of the modified antibodies may be derived from, for example, humans, mice, non-human primates (eg, cynomolgus monkeys, macaques, etc.), or wolves. In some embodiments, both the variable and constant regions of the modified immunoglobulins are human. In other embodiments, the variable regions of compatible antibodies (usually derived from a non-human source) can be engineered

- 24 044601 ваны или специально адаптированы для улучшения связывающих свойств молекулы. В связи с этим вариабельные области, пригодные для применения в настоящем изобретении, могут быть гуманизированы или иным образом изменены путем включения других (imported) аминокислотных последовательностей. В некоторых вариантах реализации вариабельные области модифицированных антител могут быть отличными от человеческих (например, мышиными), а константные области модифицированных антител могут быть человеческими.- 24 044601 baths or specially adapted to improve the binding properties of the molecule. Accordingly, variable regions useful in the present invention may be humanized or otherwise modified to include other (imported) amino acid sequences. In some embodiments, the variable regions of the modified antibodies may be non-human (eg, murine), and the constant regions of the modified antibodies may be human.

В некоторых вариантах реализации вариабельные домены как в тяжелых, так и в легких цепях изменены путем по меньшей мере частичной замены одного или более участков CDR и, если необходимо, частичной замены каркасной области и изменения последовательности. Хотя участки CDR могут быть получены из антитела того же класса или даже подкласса, что и антитело, из которого получены каркасные области, предполагают, что участки CDR будут получены из антитела другого класса и, возможно, из антитела других видов. Не всегда необходимо заменять все участки CDR на полные участки CDR из вариабельной области донора, чтобы перенести антигенсвязывающую способность одного вариабельного домена в другой. Скорее, в некоторых случаях необходимо перенести только те остатки, которые необходимы для поддержания активности сайта связывания антигена.In some embodiments, the variable domains in both the heavy and light chains are altered by at least partially replacing one or more CDR regions and, if necessary, partially replacing the framework region and changing the sequence. Although the CDR regions may be derived from an antibody of the same class or even subclass as the antibody from which the framework regions are derived, it is contemplated that the CDR regions will be derived from an antibody of a different class and possibly from a different species of antibody. It is not always necessary to replace all CDR regions with complete CDR regions from the donor variable region in order to transfer the antigen binding capacity of one variable domain to another. Rather, in some cases it is necessary to transfer only those residues that are necessary to maintain the activity of the antigen binding site.

Несмотря на изменения в вариабельной области, специалистам в данной области техники будет понятно, что модифицированные антитела согласно настоящему изобретению будут содержать антитела (например, полноразмерные антитела или их иммунореактивные фрагменты), в которых по меньшей мере часть одного или более доменов константной области была удалена или иным образом изменена, чтобы обеспечить желаемые биохимические характеристики. В некоторых вариантах реализации константная область модифицированных антител будет содержать константную область человека. Модификации константной области могут включать вставки, делеции или замены одной или более аминокислот в одном или более доменах. Таким образом, модифицированные антитела, раскрытые в настоящем описании, могут содержать изменения или модификации в одном или более из трех константных доменов тяжелой цепи (CH1, CH2 или СН3) и/или константном домене легкой цепи (CL). В некоторых вариантах реализации предполагаются модифицированные константные области, где один или более доменов частично или полностью удалены. В некоторых вариантах реализации модифицированные антитела будут содержать конструкции с удаленным доменом или варианты, где весь домен СН2 был удален (конструкции АСН2). В некоторых вариантах реализации отсутствующий домен константной области будет заменен коротким аминокислотным спейсером (например, 10 остатков) который обеспечивает некоторую молекулярную гибкость, обычно обеспечиваемую отсутствующей константной областью. В некоторых вариантах реализации модификации константной области могут быть применены для удаления дисульфидных связей или олигосахаридных фрагментов, что обеспечивает улучшенное позиционирование вследствие повышения специфичности к антигену или гибкости антитела. Модификации константной области могут быть легко осуществлены с использованием общеизвестных биохимических способов или способов молекулярной инженерии в пределах компетенции специалиста в данной области техники.Notwithstanding the changes in the variable region, those skilled in the art will appreciate that the modified antibodies of the present invention will comprise antibodies (e.g., full-length antibodies or immunoreactive fragments thereof) in which at least a portion of one or more constant region domains have been deleted or otherwise modified to provide the desired biochemical characteristics. In some embodiments, the constant region of the modified antibodies will comprise a human constant region. Modifications to the constant region may include insertions, deletions, or substitutions of one or more amino acids in one or more domains. Thus, the modified antibodies disclosed herein may contain changes or modifications in one or more of the three heavy chain constant domains (CH1, CH2 or CH3) and/or the light chain constant domain (CL). In some embodiments, modified constant regions are contemplated where one or more domains are partially or completely removed. In some embodiments, the modified antibodies will contain domain deleted constructs or variants where the entire CH2 domain has been deleted (ACH2 constructs). In some embodiments, the missing constant region domain will be replaced by a short amino acid spacer (eg, 10 residues) that provides some of the molecular flexibility typically provided by the missing constant region. In some embodiments, modifications to the constant region may be used to remove disulfide bonds or oligosaccharide moieties, allowing for improved positioning due to increased antigen specificity or flexibility of the antibody. Modifications to the constant region can be readily accomplished using well-known biochemical or molecular engineering techniques within the skill of one skilled in the art.

Следует отметить, что в некоторых вариантах реализации модифицированные антитела могут быть сконструированы для слияния домена СН3 непосредственно с шарнирной областью соответствующих модифицированных антител. В других конструкциях может быть желательно обеспечить наличие пептидного спейсера между шарнирной областью и модифицированными доменами СН2 и/или СН3. Например, могут быть экспрессированы совместимые конструкции, где указанный домен СН2 был удален, а оставшийся домен СН3 (модифицированный или немодифицированный) присоединен к шарнирной области посредством спейсера из 5-20 аминокислот. Такой спейсер может быть добавлен, например, чтобы гарантировать, что регуляторные элементы константного домена остаются свободными и доступными или что шарнирная область остается гибкой.It should be noted that, in some embodiments, the modified antibodies can be designed to fuse the CH3 domain directly to the hinge region of the corresponding modified antibodies. In other designs, it may be desirable to provide a peptide spacer between the hinge region and the modified CH2 and/or CH3 domains. For example, compatible constructs can be expressed where the CH2 domain has been removed and the remaining CH3 domain (modified or unmodified) is attached to the hinge region via a 5-20 amino acid spacer. Such a spacer may be added, for example, to ensure that the constant domain regulatory elements remain free and accessible or that the hinge region remains flexible.

Настоящее описание дополнительно охватывает варианты и эквиваленты, которые по существу гомологичны мышиным, химерным, гуманизированным и человеческим антителам или их фрагментам, предложенным в настоящем описании. Они могут включать, например, мутации - консервативные замены, т.е. замену одной или более аминокислот подобными аминокислотами. Например, консервативная замена относится к замене одной аминокислоты другой в пределах того же общего класса, такой как, например, одной кислой аминокислоты другой кислой аминокислотой, одной основной аминокислоты другой основной аминокислотой или одной нейтральной аминокислоты другой нейтральной аминокислотой. В данной области техники хорошо известно, что подразумевается под консервативной аминокислотной заменой.The present description further covers variants and equivalents that are substantially homologous to the murine, chimeric, humanized and human antibodies or fragments thereof provided herein. They may include, for example, mutations - conservative substitutions, i.e. replacing one or more amino acids with similar amino acids. For example, a conservative substitution refers to the replacement of one amino acid with another within the same general class, such as, for example, one acidic amino acid with another acidic amino acid, one basic amino acid with another basic amino acid, or one neutral amino acid with another neutral amino acid. It is well known in the art what is meant by a conservative amino acid substitution.

Полипептиды согласно настоящему описанию могут представлять собой рекомбинантные полипептиды, природные полипептиды или синтетические полипептиды, содержащие антитело к CD37 человека или его фрагмент. В данной области техники будет понятно, что некоторые аминокислотные последовательности согласно настоящему изобретению могут быть изменены без значительного влияния на структуру или функцию белка. Таким образом, настоящее изобретение дополнительно включает вариации полипептидов, которые проявляют существенную активность или которые содержат области антитела к белку CD37 или его фрагмента. Такие мутанты включают делеции, вставки, инверсии, повторы и замены типов.The polypeptides herein may be recombinant polypeptides, naturally occurring polypeptides, or synthetic polypeptides comprising an anti-human CD37 antibody or fragment thereof. Those skilled in the art will appreciate that certain amino acid sequences of the present invention may be altered without significantly affecting the structure or function of the protein. Thus, the present invention further includes variations of polypeptides that exhibit significant activity or that contain regions of an antibody to the CD37 protein or a fragment thereof. Such mutants include deletions, insertions, inversions, repeats, and type substitutions.

- 25 044601- 25 044601

Выделенные полипептиды, описанные в настоящем описании, могут быть получены любым подходящим способом, известным в данной области техники. Такие способы варьируют от прямых способов синтеза белка до конструирования последовательности ДНК, кодирующей выделенные полипептидные последовательности, и экспрессии этих последовательностей в подходящем трансформированном хозяине. В некоторых вариантах реализации последовательность ДНК сконструирована с использованием рекомбинантной технологии путем выделения или синтеза последовательности ДНК, кодирующей представляющий интерес белок дикого типа. Указанная последовательность может быть необязательно, подвергнута мутагенезу с помощью сайт-направленного мутагенеза для получения ее функциональных аналогов. См., например, Zoeller et al., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA, 81:5662-5066 (1984) и патент США № 4588585.The isolated polypeptides described herein can be prepared by any suitable method known in the art. Such methods range from direct methods of protein synthesis to the design of DNA sequences encoding isolated polypeptide sequences and expression of these sequences in a suitable transformed host. In some embodiments, the DNA sequence is constructed using recombinant technology by isolating or synthesizing a DNA sequence encoding a wild-type protein of interest. The specified sequence may optionally be subjected to mutagenesis using site-directed mutagenesis to obtain functional analogues thereof. See, for example, Zoeller et al., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA, 81:5662-5066 (1984) and US Patent No. 4588585.

В некоторых вариантах реализации последовательность ДНК, кодирующая представляющий интерес полипептид, может быть сконструирована путем химического синтеза с использованием олигонуклеотидного синтезатора. Такие олигонуклеотиды могут быть сконструированы на основе аминокислотной последовательности желаемого полипептида и выбора тех кодонов, которые предпочтительны для клетки-хозяина, в которой будет продуцироваться представляющий интерес рекомбинантный полипептид.In some embodiments, the DNA sequence encoding the polypeptide of interest can be constructed by chemical synthesis using an oligonucleotide synthesizer. Such oligonucleotides can be designed based on the amino acid sequence of the desired polypeptide and the selection of those codons that are preferred by the host cell in which the recombinant polypeptide of interest will be produced.

Для синтеза выделенной полинуклеотидной последовательности, кодирующей выделенный представляющий интерес полипептид, могут быть применены стандартные способы. Например, полная аминокислотная последовательность может быть использована для конструирования гена с последовательностью, восстановленной по полипептиду. Дополнительно может быть синтезирован олигомер ДНК, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую конкретный выделенный полипептид. Например, несколько небольших олигонуклеотидов, кодирующих части желаемого полипептида, могут быть синтезированы и затем лигированы. Отдельные олигонуклеотиды обычно содержат выступающие 5'- или 3'-концы для комплементарной сборки.Standard methods can be used to synthesize an isolated polynucleotide sequence encoding an isolated polypeptide of interest. For example, the complete amino acid sequence can be used to construct a gene with the sequence reconstructed from the polypeptide. Additionally, a DNA oligomer may be synthesized containing a nucleotide sequence encoding the specific isolated polypeptide. For example, several small oligonucleotides encoding parts of the desired polypeptide can be synthesized and then ligated. Individual oligonucleotides typically contain 5' or 3' overhangs for complementary assembly.

После сборки (путем синтеза, сайт-направленного мутагенеза или другим способом) полинуклеотидные последовательности, кодирующие конкретный выделенный представляющий интерес полипептид, будут встроены в вектор экспрессии и функционально связаны с последовательностью контроля экспрессии, подходящей для экспрессии белка в желаемом хозяине. Правильная сборка может быть подтверждена секвенированием нуклеиновой кислоты, рестрикционным картированием и экспрессией биологически активного полипептида в подходящем хозяине. Как хорошо известно в данной области техники, для получения высоких уровней экспрессии трансфицированного гена в хозяине ген должен быть функционально связан с последовательностями транскрипционного и трансляционного контроля экспрессии, которые являются функционально активными в выбранном хозяине экспрессии.Once assembled (by synthesis, site-directed mutagenesis, or other means), polynucleotide sequences encoding the particular isolated polypeptide of interest will be inserted into an expression vector and operably linked to an expression control sequence suitable for expression of the protein in the desired host. Correct assembly can be confirmed by nucleic acid sequencing, restriction mapping and expression of the biologically active polypeptide in a suitable host. As is well known in the art, to obtain high levels of expression of a transfected gene in a host, the gene must be operably linked to transcriptional and translational expression control sequences that are functionally active in the chosen expression host.

В некоторых вариантах реализации рекомбинантные векторы экспрессии используют для амплификации и экспрессии ДНК, кодирующей антитела к CD37 человека или их фрагменты. Рекомбинантные векторы экспрессии представляют собой реплицируемые ДНК-конструкции, которые содержат синтетические или полученные из кДНК фрагменты ДНК, кодирующие полипептидную цепь антитела к CD37 или его фрагмента, функционально связанные с подходящими транскрипционными или трансляционными регуляторными элементами, полученными из генов млекопитающих, микроорганизмов, вирусов или насекомых. Единица транскрипции обычно содержит совокупность (1) генетического элемента или элементов, имеющих регуляторное значение в экспрессии генов, например, транскрипционных промоторов или энхансеров, (2) структурную или кодирующую последовательность, которая транскрибируется в мРНК и транслируется в белок, и (3) подходящие последовательности инициации и терминации транскрипции и трансляции, как подробно описано ниже. Такие регуляторные элементы могут включать операторную последовательность для контроля транскрипции. Дополнительно могут быть введены способность к репликации в хозяине, обычно обеспечиваемая точкой начала репликации, и ген отбора для облегчения распознавания трансформантов. Области ДНК являются функционально связанными, когда они функционально соотносятся друг с другом. Например, ДНК для сигнального пептида (секреторная лидерная последовательность) функционально связана с ДНК для полипептида, если она экспрессируется в качестве предшественника, который участвует в секреции полипептида; промотор функционально связан с кодирующей последовательностью, если он контролирует транскрипцию последовательности, или сайт связывания рибосом функционально связан с кодирующей последовательностью, если он расположен так, чтобы допускать трансляцию. Структурные элементы, предназначенные для использования в дрожжевых системах экспрессии, содержат лидерную последовательность, обеспечивающую внеклеточную секрецию транслированного белка клеткой-хозяином. В качестве альтернативы, когда рекомбинантный белок экспрессируется без лидерной или транспортной последовательности, он может содержать Nконцевой остаток метионина. Этот остаток впоследствии может быть необязательно отщеплен от экспрессированного рекомбинантного белка с получением конечного продукта.In some embodiments, recombinant expression vectors are used to amplify and express DNA encoding anti-human CD37 antibodies or fragments thereof. Recombinant expression vectors are replicable DNA constructs that contain synthetic or cDNA-derived DNA fragments encoding a polypeptide chain of an anti-CD37 antibody or fragment thereof, operably linked to suitable transcriptional or translational regulatory elements derived from mammalian, microbial, viral or insect genes. . A transcription unit typically contains a collection of (1) a genetic element or elements having regulatory significance in gene expression, such as transcriptional promoters or enhancers, (2) a structural or coding sequence that is transcribed into mRNA and translated into protein, and (3) suitable sequences initiation and termination of transcription and translation, as detailed below. Such regulatory elements may include an operator sequence to control transcription. Additionally, the ability to replicate in the host, usually provided by the origin of replication, and a selection gene may be introduced to facilitate recognition of transformants. Regions of DNA are functionally related when they are functionally related to each other. For example, DNA for a signal peptide (secretory leader sequence) is operably linked to DNA for a polypeptide if it is expressed as a precursor that participates in the secretion of the polypeptide; a promoter is operably linked to a coding sequence if it controls transcription of the sequence, or a ribosome binding site is operably linked to a coding sequence if it is positioned to allow translation. Structural elements intended for use in yeast expression systems contain a leader sequence that ensures extracellular secretion of the translated protein by the host cell. Alternatively, when the recombinant protein is expressed without a leader or transport sequence, it may contain an N-terminal methionine residue. This residue may subsequently be optionally cleaved from the expressed recombinant protein to obtain the final product.

Выбор последовательности контроля экспрессии и вектора экспрессии будет зависеть от выбора хозяина. Может быть использован широкий спектр комбинаций хозяина/вектора экспрессии. Пригодные для применения векторы экспрессии для эукариотических хозяев включают, например, векторы, содержащие последовательности контроля экспрессии из SV40, вируса папилломы крупного рогатого скота,The choice of expression control sequence and expression vector will depend on the choice of host. A wide range of host/expression vector combinations can be used. Suitable expression vectors for eukaryotic hosts include, for example, vectors containing expression control sequences from SV40, bovine papillomavirus,

- 26 044601 аденовируса и цитомегаловируса. Пригодные для применения векторы экспрессии для бактериальных хозяев включают известные бактериальные плазмиды, такие как плазмиды из Esherichia coli, включая pCR 1, pBR322, pMB9 и их производные, плазмиды более широкого диапазона хозяев, таких как M13 и нитевидные фаги, содержащие одноцепочечную ДНК. Подходящие клетки-хозяева для экспрессии связывающегося с CD37 полипептида или антитела (или белка CD37 для применения в качестве антигена) включают клетки прокариот, дрожжей, насекомых или высшие эукариотические клетки под контролем подходящих промоторов. Прокариоты включают грамотрицательные или грамположительные организмы, например, Е. coli или палочковидные бактерии. Высшие эукариотические клетки включают устойчивые линии клеток млекопитающих, как описано ниже. Также могут быть использованы бесклеточные системы трансляции. Подходящие векторы клонирования и экспрессии для применения с клеткамихозяевами бактерий, грибов, дрожжей и млекопитающих описаны в источнике Pouwels et al. (Cloning Vectors: A Laboratory Manual, Elsevier, N.Y., 1985), соответствующее описание из которого включено в настоящее описание посредством ссылки. Дополнительная информация о способах получения белка, включая получение антитела, приведена, например, в патентной публикации США № 2008/0187954, патентах США № 6413746 и 6660501 и международной патентной публикации № WO 04009823, и каждый из указанных источников настоящим включен в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте.- 26 044601 adenovirus and cytomegalovirus. Suitable expression vectors for bacterial hosts include known bacterial plasmids, such as those from Escherichia coli, including pCR 1, pBR322, pMB9 and derivatives thereof, wider host range plasmids such as M13 and filamentous phages containing single-stranded DNA. Suitable host cells for expressing a CD37-binding polypeptide or antibody (or CD37 protein for use as an antigen) include prokaryotic, yeast, insect, or higher eukaryotic cells under the control of suitable promoters. Prokaryotes include gram-negative or gram-positive organisms, such as E. coli or rod-shaped bacteria. Higher eukaryotic cells include stable mammalian cell lines, as described below. Cell-free translation systems can also be used. Suitable cloning and expression vectors for use with bacterial, fungal, yeast and mammalian host cells are described in Pouwels et al. (Cloning Vectors: A Laboratory Manual, Elsevier, N.Y., 1985), the relevant description of which is incorporated herein by reference. Additional information regarding methods for producing protein, including antibody production, is provided, for example, in US Patent Publication No. 2008/0187954, US Patent Nos. 6,413,746 and 6,660,501, and International Patent Publication No. WO 04009823, each of which is hereby incorporated herein by reference. in its entirety.

Различные системы культур клеток млекопитающих или насекомых также эффективно применяют для экспрессии рекомбинантного белка. Экспрессия рекомбинантных белков в клетках млекопитающих может быть осуществлена, поскольку такие белки обычно правильно складываются, соответствующим образом модифицируются и полностью функциональны. Примеры подходящих линий клеток-хозяев млекопитающих включают линии клеток почки обезьяны COS-7, описанные Gluzman (Cell 23:175, 1981), и другие линии клеток, способные экспрессировать подходящий вектор, включая, например, L-клетки, С127, 3Т3, клетки яичника китайского хомячка (СНО), линии клеток HeLa и BHK. Векторы экспрессии млекопитающих могут содержать нетранскрибируемые элементы, такие как точка начала репликации, подходящие промотор и энхансер, связанные с экспрессируемым геном, и другие 5'- или 3'-фланкирующие нетранскрибируемые последовательности и 5'- или 3'-нетранслируемые последовательности, такие как необходимые сайты связывания рибосомы, сайт полиаденилирования, донорные и акцепторные сайты сплайсинга и последовательности терминации транскрипции. Бакуловирусные системы для получения гетерологичных белков в клетках насекомых рассмотрены Luckow and Summers, Bio/Technology, 6:47 (1988).Various mammalian or insect cell culture systems are also effectively used for recombinant protein expression. Expression of recombinant proteins in mammalian cells can be accomplished because such proteins are usually correctly folded, appropriately modified, and fully functional. Examples of suitable mammalian host cell lines include the COS-7 monkey kidney cell lines described by Gluzman (Cell 23:175, 1981), and other cell lines capable of expressing a suitable vector, including, for example, L cells, C127, 3T3 cells Chinese hamster ovary (CHO), HeLa and BHK cell lines. Mammalian expression vectors may contain non-transcribed elements, such as an origin of replication, a suitable promoter and enhancer associated with the gene to be expressed, and other 5' or 3' flanking non-transcribed sequences and 5' or 3' non-translated sequences, such as necessary ribosome binding sites, polyadenylation site, splice donor and acceptor sites, and transcription termination sequences. Baculovirus systems for producing heterologous proteins in insect cells are reviewed by Luckow and Summers, Bio/Technology, 6:47 (1988).

Белки, продуцируемые трансформированным хозяином, могут быть очищены в соответствии с любым подходящим способом. Такие стандартные способы включают хроматографию (например, ионообменную, аффинную и колоночную хроматографию с распределением по размерам), центрифугирование, способы, основанные на различной растворимости, или любой другой стандартный способ очистки белка. Для обеспечения легкой очистки путем пропускания через подходящую аффинную колонку к белку могут быть присоединены аффинные метки, такие как гексагистидин, мальтоза-связывающий домен, последовательность белка оболочки вируса гриппа и глутатион-S-трансфераза. Выделенные белки также могут быть физически охарактеризованы с использованием таких методов, как протеолиз, ядерный магнитный резонанс и рентгеноструктурная кристаллография.Proteins produced by the transformed host can be purified according to any suitable method. Such standard methods include chromatography (eg, ion exchange, affinity and size distribution column chromatography), centrifugation, differential solubility methods, or any other standard protein purification method. Affinity tags such as hexahistidine, maltose binding domain, influenza virus envelope protein sequence, and glutathione S-transferase can be attached to the protein to allow easy purification through a suitable affinity column. Isolated proteins can also be physically characterized using techniques such as proteolysis, nuclear magnetic resonance, and X-ray crystallography.

Например, супернатанты из систем, которые секретируют рекомбинантный белок в культуральную среду, могут быть сначала сконцентрированы с использованием поставляемого на рынок фильтра для концентрирования белка, например, ультрафильтрационной установки Amicon или Millipore Pellicon. После стадии концентрирования концентрат может быть нанесен на подходящую матрицу для очистки. В качестве альтернативы может быть использована анионообменная смола, например, матрица или субстрат, имеющие боковые диэтиламиноэтильные (DEAE) группы. Матрицы могут представлять собой акриламид, агарозу, декстран, целлюлозу или другие типы, обычно используемые для очистки белка. В качестве альтернативы может быть использована стадия катионного обмена. Подходящие катионообменники включают различные нерастворимые матрицы, содержащие сульфопропильные или карбоксиметильные группы. Наконец, для дополнительной очистки связывающегося с CD37 агента могут быть использованы одна или более стадий обращенно-фазовой высокоэффективной жидкостной хроматографии (ОФ-ВЭЖХ) с использованием гидрофобной среды для ОФ-ВЭЖХ, например, силикагеля, имеющего боковые метальные или другие алифатические группы. Некоторые или все вышеуказанные стадии очистки в различных сочетаниях также могут быть использованы для получения гомогенного рекомбинантного белка.For example, supernatants from systems that secrete recombinant protein into the culture medium may first be concentrated using a commercially available protein concentration filter, such as an Amicon or Millipore Pellicon ultrafiltration unit. After the concentration step, the concentrate can be applied to a suitable matrix for purification. Alternatively, an anion exchange resin may be used, such as a matrix or substrate having pendant diethylaminoethyl (DEAE) groups. The matrices may be acrylamide, agarose, dextran, cellulose, or other types commonly used for protein purification. Alternatively, a cation exchange step may be used. Suitable cation exchangers include various insoluble matrices containing sulfopropyl or carboxymethyl groups. Finally, one or more reverse-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC) steps using a hydrophobic RP-HPLC medium, such as silica gel having pendant methyl or other aliphatic groups, can be used to further purify the CD37 binding agent. Some or all of the above purification steps in various combinations can also be used to obtain a homogeneous recombinant protein.

Рекомбинантный белок, получаемый в бактериальной культуре, можно выделить, например, путем первоначальной экстракции из осадков клеток с последующим проведением одной или более стадий концентрирования, высаливания, водной ионообменной или эксклюзионной хроматографии. Высокоэффективная жидкостная хроматография (ВЭЖХ) может быть использована на конечных стадиях очистки.The recombinant protein produced in bacterial culture can be isolated, for example, by initial extraction from cell pellets followed by one or more steps of concentration, salting out, aqueous ion exchange or size exclusion chromatography. High performance liquid chromatography (HPLC) can be used in the final stages of purification.

Микробные клетки, используемые для экспрессии рекомбинантного белка, могут быть разрушены любым удобным способом, включая циклы замораживания и оттаивания, обработку ультразвуком, механическое разрушение или использование агентов, лизирующих клетки.The microbial cells used to express the recombinant protein may be disrupted by any convenient means, including freeze-thaw cycles, sonication, mechanical disruption, or the use of cell lysing agents.

- 27 044601- 27 044601

Способы, известные в данной области техники для очистки антител и других белков, также включают, например, описанные в патентных публикациях США № 2008/0312425, 2008/0177048 иMethods known in the art for purifying antibodies and other proteins also include, for example, those described in US Patent Publications No. 2008/0312425, 2008/0177048 and

2009/0187005, каждая из которых настоящим включена в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте.2009/0187005, each of which is hereby incorporated by reference in its entirety.

III. Полинуклеотиды.III. Polynucleotides.

В некоторых вариантах реализации настоящее изобретение охватывает полинуклеотиды, содержащие полинуклеотиды, кодирующие специфично связывающийся с CD37 полипептид или фрагмент такого полипептида. Например, в настоящем изобретении предложен полинуклеотид, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующей антитело к CD37 человека или кодирующей фрагмент такого антитела. Полинуклеотиды согласно настоящему изобретению могут быть в форме РНК или в форме ДНК. ДНК включает кДНК, геномную ДНК и синтетическую ДНК и может быть двунитевой или однонитевой и в случае однонитевой может представлять собой кодирующую нить или некодирующую (антисмысловую) нить. В некоторых вариантах реализации полинуклеотид представляет собой кДНК или ДНК, лишенную одного или более эндогенных интронов.In some embodiments, the present invention includes polynucleotides comprising polynucleotides encoding a CD37-specific binding polypeptide or a fragment of such a polypeptide. For example, the present invention provides a polynucleotide comprising a nucleic acid sequence encoding an anti-human CD37 antibody or encoding a fragment of such an antibody. The polynucleotides of the present invention may be in the form of RNA or in the form of DNA. DNA includes cDNA, genomic DNA and synthetic DNA and can be double-stranded or single-stranded and, in the case of single-stranded, can be a coding strand or a non-coding (antisense) strand. In some embodiments, the polynucleotide is cDNA or DNA lacking one or more endogenous introns.

В некоторых вариантах реализации полинуклеотиды, предложенные в настоящем описании, являются не встречающимися в природе. В некоторых вариантах реализации полинуклеотиды, предложенные в настоящем описании, получены рекомбинантным способом. В некоторых вариантах реализации полинуклеотиды выделены. В некоторых вариантах реализации полинуклеотиды являются по существу чистыми.In some embodiments, the polynucleotides provided herein are not naturally occurring. In some embodiments, the polynucleotides provided herein are produced by a recombinant process. In some embodiments, the polynucleotides are isolated. In some embodiments, the polynucleotides are substantially pure.

В настоящем описании предложен полинуклеотид, кодирующий полипептид, содержащий последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 3-11.Provided herein is a polynucleotide encoding a polypeptide containing a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 3-11.

В некоторых вариантах реализации полинуклеотид содержит последовательности, кодирующие полипептиды, представленные SEQ ID NO: 3-5. В некоторых вариантах реализации полинуклеотид содержит последовательности, кодирующие полипептиды, представленные SEQ ID NO: 6-8. В некоторых вариантах реализации полинуклеотид содержит последовательности, кодирующие полипептиды, представленные SEQ ID NO: 3-5 и SEQ ID NO: 6-8. В некоторых вариантах реализации вектор содержит полинуклеотиды, кодирующие полипептиды, представленные SEQ ID NO: 3-8. В некоторых вариантах реализации композиция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептиды, представленные SEQ ID NO: 3-5, и полинуклеотид, кодирующий полипептиды, представленные SEQ ID NO: 6-8. В некоторых вариантах реализации композиция содержит вектор, содержащий полинуклеотиды, кодирующие полипептиды, представленные SEQ ID NO: 3-5, и вектор, содержащий полинуклеотиды, кодирующие полипептиды, представленные SEQ ID NO: 6-8.In some embodiments, the polynucleotide comprises sequences encoding the polypeptides represented by SEQ ID NOs: 3-5. In some embodiments, the polynucleotide comprises sequences encoding the polypeptides represented by SEQ ID NOs: 6-8. In some embodiments, the polynucleotide comprises sequences encoding the polypeptides represented by SEQ ID NOs: 3-5 and SEQ ID NOs: 6-8. In some embodiments, the vector contains polynucleotides encoding the polypeptides represented by SEQ ID NOs: 3-8. In some embodiments, the composition comprises a polynucleotide encoding the polypeptides represented by SEQ ID NOs: 3-5 and a polynucleotide encoding the polypeptides represented by SEQ ID NOs: 6-8. In some embodiments, the composition comprises a vector containing polynucleotides encoding the polypeptides represented by SEQ ID NOs: 3-5, and a vector containing polynucleotides encoding the polypeptides represented by SEQ ID NOs: 6-8.

В некоторых вариантах реализации композиция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид, представленный SEQ ID NO: 9, и полинуклеотид, кодирующий полипептид, представленный SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации композиция содержит вектор, содержащий полинуклеотид, кодирующий полипептид, представленный SEQ ID NO: 9, и вектор, содержащий полинуклеотид, кодирующий полипептид, представленный SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах реализации вектор содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид, представленный SEQ ID NO: 9, и полинуклеотид, кодирующий полипептид, представленный SEQ ID NO: 10. В настоящем описании дополнительно предложен полинуклеотид, содержащий последовательность, выбранную из последовательностей, представленных SEQ ID NO: 13 и 14.In some embodiments, the composition comprises a polynucleotide encoding the polypeptide represented by SEQ ID NO: 9 and a polynucleotide encoding the polypeptide represented by SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the composition contains a vector containing a polynucleotide encoding the polypeptide represented by SEQ ID NO: 9, and a vector comprising a polynucleotide encoding the polypeptide represented by SEQ ID NO: 10. In some embodiments, the vector contains a polynucleotide encoding the polypeptide represented by SEQ ID NO: 9 and a polynucleotide encoding the polypeptide represented by SEQ ID NO: 10. B The present description further provides a polynucleotide containing a sequence selected from the sequences represented by SEQ ID NOs: 13 and 14.

Последовательность нуклеиновой кислоты VH muCD37-lBl 1-2 gaggttcaactgctgcagtctggacctgagctggtgaagcctggggcttcagtgaagatatcctgcaaggcttctggttactcatttactggct actttatgaactgggtgatacagagccatggaaagggccttgagtggattggacgtattaatccttacaatggtgataccttctacaaccagaa gttcaagggcaaggccacattgactgtagacaaatcctctaccacagcccacatggagctcctgagcctgacatctgaggactctgccgtct attattgtggatcccgggggatagtggcttcctctaggttcttcgatgtctggggcgcagggacctcggtcatcgtctcctcagccaaaacga cac (SEQ ID NO: 13)Nucleic acid sequence VH muCD37-lBl 1-2 gaggttcaactgctgcagtctggacctgagctggtgaagcctggggcttcagtgaagatatcctgcaaggcttctggttactcatttactggct actttatgaactgggtgatacagagccatggaaagggccttgagtggattggacgtattaatccttacaatggtgat accttctacaaccagaa gttcaagggcaaggccacattgactgtagacaaatcctctaccacagcccacatggagctcctgagcctgacatctgaggactctgccgtct attattgtggatcccgggggatagtggcttcctctaggttcttcgatgtctggggcgcagggacctcggtcatcgtctcctcagccaaaacga cac (SEQ ID NO: 13)

Последовательность нуклеиновой кислоты VL muCD37-lBl 1-2 agtattgtgatgacccagactcccaaattcctgcttgtatcagcaggagacagggttaccataacctgcaaggccagtcagggtgtgagtaat gatgtagattggtaccaacagaagccagggcagtctcctaaactgctgatatactatgcatccaatcgctacactggagtccctgatcgcttca ctggcagtggatatgggacggatttcactttcagcatcagcactgtgcaggctgaagacctggcagtttatttctgtcaccaggattatacctct ccgacgttcggtggaggcaccaagctggaaatcaaacgggctgat (SEQ ID NO: 14)Nucleic acid sequence VL muCD37-lBl 1-2 agtattgtgatgacccagactcccaaattcctgcttgtatcagcaggagacagggttaccataacctgcaaggccagtcagggtgtgagtaat gatgtagattggtaccaacagaagccagggcagtctcctaaactgctgatatactatgcatccaatcgctacactggagtccctgat cgcttca ctggcagtggatatgggacggatttcactttcagcatcagcactgtgcaggctgaagacctggcagtttatttctgtcaccaggattatacctct ccgacgttcggtggaggcaccaagctggaaatcaaacgggctgat (SEQ ID NO: 14)

Также предложен полинуклеотид, имеющий последовательность, по меньшей мере приблизительно на 95%, по меньшей мере приблизительно на 96%, по меньшей мере приблизительно на 97%, по меньшей мере приблизительно на 98% или по меньшей мере приблизительно на 99% идентичную одной из SEQ ID NO: 13 и 14. Также предложена композиция, содержащая полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид,Also provided is a polynucleotide having a sequence that is at least about 95%, at least about 96%, at least about 97%, at least about 98%, or at least about 99% identical to one of SEQ ID NOs: 13 and 14. Also provided is a composition comprising a polynucleotide that is at least approximately 90% identical to SEQ ID NO: 13, and a polynucleotide

- 28 044601 по меньшей мере приблизительно на 90% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 95% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 95% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 96% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 96% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 97% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 97% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 98% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 98% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 99% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 99% идентичный SEQ ID NO: 14.- 28 044601 at least about 90% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition comprising a polynucleotide at least about 95% identical to SEQ ID NO: 13 and a polynucleotide at least about 95% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition containing a polynucleotide at least about 96% identical to SEQ ID NO: 13 and a polynucleotide at least about 96% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition containing a polynucleotide at least about 97% identical to SEQ ID NO: 13, and a polynucleotide at least about 97% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition comprising a polynucleotide at least about 98% identical to SEQ ID NO: 14. 13, and a polynucleotide that is at least about 98% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition comprising a polynucleotide that is at least about 99% identical to SEQ ID NO: 13, and a polynucleotide that is at least about 99% identical identical to SEQ ID NO: 14.

Также предложена композиция, содержащая вектор или векторы, содержащие полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая вектор или векторы, содержащие полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 95% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 95% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая вектор или векторы, содержащие полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 96% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 96% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая вектор или векторы, содержащие полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 97% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 97% идентичный SEQ ID NO: 14.Also provided is a composition containing a vector or vectors containing a polynucleotide at least about 90% identical to SEQ ID NO: 13 and a polynucleotide at least about 90% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition containing a vector or vectors containing a polynucleotide at least about 95% identical to SEQ ID NO: 13, and a polynucleotide at least about 95% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition containing a vector or vectors containing a polynucleotide at least at least about 96% identical to SEQ ID NO: 13, and a polynucleotide at least about 96% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition containing a vector or vectors containing a polynucleotide at least about 97% identical to SEQ ID NO: 13, and a polynucleotide at least about 97% identical to SEQ ID NO: 14.

Также предложена композиция, содержащая вектор или векторы, содержащие полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 98% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 98% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая вектор или векторы, содержащие полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 99% идентичный SEQ ID NO: 13, и полинуклеотид, по меньшей мере приблизительно на 99% идентичный SEQ ID NO: 14. Также предложена композиция, содержащая вектор или векторы, содержащие полинуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 13, и полинуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 14. В некоторых вариантах реализации полинуклеотиды содержат кодирующую последовательность для зрелого полипептида, слитую в той же рамке считывания с полинуклеотидом, который способствует, например, экспрессии и секреции полипептида из клетки-хозяина (например, лидерная последовательность, которая действует как секреторная последовательность для регуляции транспорта полипептида из клетки). Полипептид, имеющий лидерную последовательность, является белкомпредшественником, и лидерная последовательность может быть расщеплена клеткой-хозяином с образованием зрелой формы полипептида. Полинуклеотиды также могут кодировать пробелок, который представляет собой зрелый белок плюс дополнительные 5'-аминокислотные остатки. Зрелый белок, имеющий пропоследовательность, является пробелком и представляет собой неактивную форму белка. При расщеплении пропоследовательности остается активный зрелый белок.Also provided is a composition containing a vector or vectors containing a polynucleotide at least about 98% identical to SEQ ID NO: 13 and a polynucleotide at least about 98% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition containing a vector or vectors containing a polynucleotide at least about 99% identical to SEQ ID NO: 13, and a polynucleotide at least about 99% identical to SEQ ID NO: 14. Also provided is a composition containing a vector or vectors containing the polynucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 13, and the polynucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 14. In some embodiments, the polynucleotides comprise a coding sequence for a mature polypeptide fused in frame to a polynucleotide that promotes, for example, expression and secretion of the polypeptide from a cell. host (eg, a leader sequence that acts as a secretory sequence to regulate transport of the polypeptide out of the cell). A polypeptide having a leader sequence is a precursor protein, and the leader sequence can be cleaved by a host cell to produce the mature form of the polypeptide. Polynucleotides can also encode a proprotein, which is the mature protein plus additional 5' amino acid residues. The mature protein, which has a prosequence, is a proprotein and is an inactive form of the protein. When the prosequence is cleaved, the active mature protein remains.

В некоторых вариантах реализации полинуклеотиды содержат кодирующую последовательность для зрелого полипептида, слитую в той же рамке считывания с маркерной последовательностью, которая обеспечивает возможность для, например, очистки кодирующего полипептида. Например, маркерная последовательность может представлять собой гексагистидиновую метку, обеспечиваемую вектором pQE-9, чтобы обеспечить очистку зрелого полипептида, слитого с маркером, в случае бактериального хозяина, или маркерная последовательность может представлять собой гемагглютининовую (НА) метку, полученную из белка гемагглютинина вируса гриппа, в случае использования клеток-хозяев млекопитающих (например, клеток COS-7). Настоящее описание также относится к вариантам описанных выше полинуклеотидов, кодирующим, например, фрагменты, аналоги и производные.In some embodiments, the polynucleotides comprise a coding sequence for a mature polypeptide fused in frame to a marker sequence that allows, for example, purification of the coding polypeptide. For example, the marker sequence may be a hexahistidine tag provided by the pQE-9 vector to allow purification of the mature polypeptide fused to the marker in the case of a bacterial host, or the marker sequence may be a hemagglutinin (HA) tag derived from the influenza virus hemagglutinin protein. in the case of using mammalian host cells (eg COS-7 cells). The present description also relates to variants of the polynucleotides described above, encoding, for example, fragments, analogs and derivatives.

Варианты полинуклеотидов могут содержать изменения в кодирующих областях, некодирующих областях или и в тех, и в других. В некоторых вариантах реализации варианты полинуклеотидов содержат изменения, которые приводят к молчащим заменам, вставкам или делециям, но не изменяют свойств или активностей кодируемого полипептида. В некоторых вариантах реализации варианты полинуклеотидов возникают вследствие молчащих замен из-за вырожденности генетического кода. Варианты полинуклеотидов могут быть получены по ряду причин, например, для оптимизации экспрессии кодонов для конкретного хозяина (изменение кодонов в мРНК человека до тех, которые предпочтительны для бактериального хозяина, такого как Е. coli).Polynucleotide variants may contain changes in coding regions, non-coding regions, or both. In some embodiments, the polynucleotide variants contain changes that result in silent substitutions, insertions, or deletions, but do not change the properties or activities of the encoded polypeptide. In some embodiments, polynucleotide variants arise from silent substitutions due to degeneracy of the genetic code. Polynucleotide variants can be generated for a number of reasons, for example to optimize codon expression for a particular host (changing codons in human mRNA to those preferred by a bacterial host such as E. coli).

Также предложены векторы и клетки, содержащие полинуклеотиды, описанные в настоящем описании.Vectors and cells containing the polynucleotides described herein are also provided.

IV. Биологические образцы.IV. Biological samples.

Биологические образцы часто фиксируют с помощью фиксатора. Обычно используют альдегидные фиксаторы, такие как формалин (формальдегид) и глутаровый альдегид. Образцы тканей, фиксированные с использованием других методов фиксации, таких как спиртовая иммерсия (Battifora and Kopinski, J.Biological samples are often fixed using a fixative. Aldehyde fixatives such as formalin (formaldehyde) and glutaraldehyde are commonly used. Tissue specimens fixed using other fixation methods such as alcohol immersion (Battifora and Kopinski, J.

- 29 044601- 29 044601

Histochem. Cytochem. (1986) 34:1095), также являются подходящими. Используемые образцы также могут быть залиты парафином. В одном из вариантов реализации образцы фиксируют в формалине и заливают парафином (FFPE). В другом варианте реализации блок FFPE окрашивают гематоксилином и эозином перед выбором одной или более частей для анализа, чтобы выбрать определенную область (области) для образца из центральной части блока FFPE. Способы получения тканевых блоков из этих образцов, состоящих из частиц, были использованы в предыдущих исследованиях различных прогностических факторов методом ИГХ и/или хорошо известны специалистам в данной области техники (см., например, Abbondanzo et al., Am. J. Clin. Pathol. 1990 May; 93(5):698-702; Allred et al., Arch. Surg. 1990 Jan; 125(1):107-13).Histochem. Cytochem. (1986) 34:1095) are also suitable. The samples used can also be embedded in paraffin. In one embodiment, the samples are formalin fixed and paraffin embedded (FFPE). In another embodiment, the FFPE block is stained with hematoxylin and eosin before selecting one or more portions for analysis to select a specific sample area(s) from the central portion of the FFPE block. Methods for obtaining tissue blocks from these particulate samples have been used in previous IHC studies of various prognostic factors and/or are well known to those skilled in the art (see, e.g., Abbondanzo et al., Am. J. Clin. Pathol 1990 May;93(5):698-702;Allred et al., Arch Surg 1990 Jan;125(1):107-13).

Вкратце, любой интактный орган или ткань могут быть разрезаны на довольно мелкие части и инкубированы в различных фиксаторах (например, формалине, спирте и т.д.) в течение различных периодов времени до тех пор, пока ткань не будет фиксирована. Образцы могут представлять собой практически любую интактную ткань, хирургически удаленную из организма. Образцы могут быть разрезаны на достаточно мелкие части, подходящие для оборудования, обычно используемого в лабораториях гистопатологии. Размер отрезанных частей обычно составляет от нескольких миллиметров до нескольких сантиметров. Биологический образец также может представлять собой жидкие экстракты, кровь, плазму, сыворотку, спинномозговую жидкость, лимфатическую жидкость и/или препарат селезенки.Briefly, any intact organ or tissue can be cut into fairly small pieces and incubated in various fixatives (eg formaldehyde, alcohol, etc.) for varying periods of time until the tissue is fixed. The samples can be virtually any intact tissue that has been surgically removed from the body. Specimens can be cut into pieces small enough to accommodate equipment commonly used in histopathology laboratories. The size of the cut pieces usually ranges from a few millimeters to several centimeters. The biological sample may also be liquid extracts, blood, plasma, serum, cerebrospinal fluid, lymph fluid, and/or a spleen preparation.

V. Корреляция экспрессии CD37 и терапевтической эффективности.V. Correlation of CD37 expression and therapeutic efficacy.

Иммуноконъюгаты к CD37 предложены в опубликованной заявке США № 2011/0256153, которая включена в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте. В некоторых вариантах реализации иммуноконъюгат к CD37 представляет собой IMGN529. IMGN529 содержит антитело huCD37-3 (содержащее участки CDR, представленные SEQ ID NO: 22-27, VH, представленный SEQ ID NO: 28, и VL, представленный SEQ ID NO: 29), линкер SMCC и майтанзиноид DM1. Последовательности антитела huCD37-3 приведены ниже.CD37 immunoconjugates are disclosed in US Published Application No. 2011/0256153, which is incorporated herein by reference in its entirety. In some embodiments, the CD37 immunoconjugate is IMGN529. IMGN529 contains the antibody huCD37-3 (containing the CDR regions represented by SEQ ID NO: 22-27, VH represented by SEQ ID NO: 28, and VL represented by SEQ ID NO: 29), the SMCC linker and the maytansinoid DM1. The sequences of the huCD37-3 antibody are given below.

huCD37-3 VH-CDR1: TSGVS (SEQ ID NO:22) huCD37-3 VH-CDR2: V1WGDGSTN (SEQ ID NO:23) huCD37-3 VH-CDR3: GGYSLAH (SEQ ID NO:24) huCD37-3 VL-CDR1; RASENIRSNLA (SEQ ID NO:25) huCD37-3 VL-CDR2: VATNLAD (SEQ ID NO 26) huCD37-3 VL-CDR3: QHYWGTTWT (SEQ JD NO:27) huCD37-3 VHv. 1.0:huCD37-3 VH-CDR1: TSGVS (SEQ ID NO:22) huCD37-3 VH-CDR2: V1WGDGSTN (SEQ ID NO:23) huCD37-3 VH-CDR3: GGYSLAH (SEQ ID NO:24) huCD37-3 VL- CDR1; RASENIRSNLA (SEQ ID NO:25) huCD37-3 VL-CDR2: VATNLAD (SEQ ID NO 26) huCD37-3 VL-CDR3: QHYWGTTWT (SEQ JD NO:27) huCD37-3 VHv. 1.0:

QVQVQESGPGLVAPSQTLSITCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKrLEWLGVIWGDGSTNYHPSLKSQVQVQESGPGLVAPSQTLSITCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKrLEWLGVIWGDGSTNYHPSLKS

RLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKrGYSLAHWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO 28) huCD37-3 VHv. 1.1:RLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKrGYSLAHWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO 28) huCD37-3 VHv. 1.1:

QVQVQESGPGLVAPSQTLSITCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKrLEWLGVIWGDGSTNYHSSLKSQVQVQESGPGLVAPSQTLSITCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKrLEWLGVIWGDGSTNYHSSLKS

RLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKFGYSLAHWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:32) huCD37-3 VL:RLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKFGYSLAHWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:32) huCD37-3 VL:

DIQMTQSPSSLSVSVGERVTITCRASENIRSNLAWYQQKPGKSPKLLVNVATNLADGVPSRFSGSDIQMTQSPSSLSVSVGERVTITCRASENIRSNLAWYQQKPGKSPKLLVNVATNLADGVPSRFSGS

GSGTDYSLK1NSLQPEDFGTYYCQHYWGTTWTFGQGTKLEIKR (SEQ ID NO 29)GSGTDYSLK1NSLQPEDFGTYYCQHYWGTTWTFGQGTKLEIKR (SEQ ID NO 29)

Тяжелая цепь (НС) huCD37-3 v. 1.0:Heavy chain (HC) huCD37-3 v. 1.0:

QVQVQESGPGLVAPSQTLS1TCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKFLEWLGVIWGDGSTNYHPSLKS RLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKFGYSLAHWGQGTLVTVSSASTKrPSVFPLAPSS KSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTQVQVQESGPGLVAPSQTLS1TCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKFLEWLGVIWGDGSTNYHPSLKS RLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKFGYSLAHWGQGTLVTVSSASTKrPSVFPLAPSS KSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSL GTQT

- 30 044601- 30 044601

YICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVV

VDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSN

KALPAPIEKTISKAKFQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKFFYPSD1AVEWESNGQPENNYKALPAPIEKTISKAKFQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKFFYPSD1AVEWESNGQPENNY

KTTPPVLDSDr.SFFLYSKITX'DKSRWQQC.NVFSCSVMHEAEHA'H>'TOKSLSISPG (SEQ IDKTTPPVLDSDr.SFFLYSKITX'DKSRWQQC.NVFSCSVMHEAEHA'H>'TOKSLSISPG (SEQ ID

NO:30)NO:30)

Тяжелая цепь (НС) huCD37-3 v. I, I:Heavy chain (HC) huCD37-3 v. I, I:

QVQVQESGPGLVAPSQTLS1TCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKFLEWLGV1WGDGSTNYHSSLK.SQVQVQESGPGLVAPSQTLS1TCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKFLEWLGV1WGDGSTNYHSSLK.S

RL·S1KKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKΓGYSLAHWGQGTLVTVSSASTKΓPSVFPLAPSS KSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQT YICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVV VDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSN KALPAPIEKTISKAKFQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKFFYPSD1AVEWESNGQPENNY KTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (SEQ IDRL·S1KKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKΓGYSLAHWGQGTLVTVSSASTKΓPSVFPLAPSS KSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQT YICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDT LMISRTPEVTCVV VDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSN KALPAPIEKTISKAKFQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKFFYPSD1AVEWESNGQPENNY KTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALH NHYTQKSLSLSPG (SEQ ID

NO:33)NO:33)

Легкая цепь (LC) huCD37-3:Light chain (LC) of huCD37-3:

DIQMTQSPSSLSVSVGERVTITCRASENIRSNLAWYQQKPGKSPKLLVNVATNLADGVPSRFSGSDIQMTQSPSSLSVSVGERVTITCRASENIRSNLAWYQQKPGKSPKLLVNVATNLADGVPSRFSGS

GSGTDYSLKINSLQPEDFGTYYCQHYWGTTWTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASGSGTDYSLKINSLQPEDFGTYYCQHYWGTTWTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTAS

VVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYAC

EVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:31)EVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:31)

В некоторых вариантах реализации иммуноконъюгат может содержать антитело к CD37, полученное из гибридомы с обозначением депонирования в АТСС РТА-10664, депонированной в Американской коллекции типовых культур (АТСС) по адресу 10801 University Boulevard, Manassas, Virginia 20110 18 февраля 2010 г., или его антигенсвязывающий фрагмент. В некоторых вариантах реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит области VH-CDR и VL-CDR антитела, полученного из гибридомы РТА-10664.In some embodiments, the immunoconjugate may comprise an anti-CD37 antibody obtained from a hybridoma with ATCC deposit designation PTA-10664 deposited with the American Type Culture Collection (ATCC) at 10801 University Boulevard, Manassas, Virginia 20110 on February 18, 2010, or its antigen binding fragment. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the VH-CDR and VL-CDR regions of an antibody derived from hybridoma PTA-10664.

IMGN529 в настоящее время проходит клинические исследования в отношении лечения лейкозов и лимфом. Способы введения IMGN529 предложены в заявке США № 14/710354 (публикация № 2015/0343077) и источнике Stathis, et al., Preliminary Findings from a phase I, multi-center, open-label study of the anti-CD37 antibody-drug conjugate (ADC), IMGN529, in adult patients with relapsed or refractory non-Hodgkin Lymphoma (NHL), Abstract Number 8526, ASCO Annual Meeting (2014)), каждый из которых включен в настоящее описание посредством ссылки.IMGN529 is currently in clinical trials for the treatment of leukemia and lymphoma. Methods of administration of IMGN529 are suggested in US Application No. 14/710354 (Publication No. 2015/0343077) and Stathis, et al., Preliminary Findings from a phase I, multi-center, open-label study of the anti-CD37 antibody-drug conjugate (ADC), IMGN529, in adult patients with relapsed or refractory non-Hodgkin Lymphoma (NHL), Abstract Number 8526, ASCO Annual Meeting (2014)), each of which is incorporated herein by reference.

В некоторых вариантах реализации в настоящем описании предложен способ идентификации субъектов, которые могут положительно реагировать на нацеленную на CD37 терапию вследствие повышенных уровней экспрессии CD37 у субъекта, в частности, с применением антител и их антигенсвязывающих фрагментов, предложенных в настоящем описании, с помощью которых можно обнаруживать динамический диапазон уровней экспрессии CD37, например, методом ИГХ. Оценка образцов пациентов и корреляция с эффективностью in vivo с использованием моделей ксенотрансплантатов демонстрирует возможности анализа экспрессии для отбора субъектов, которые более склонны реагировать на лечение. С помощью ИГХ получают значение экспрессии CD37 в опухолевых клетках: от 0 (экспрессия отсутствует) до 3 (очень высокие уровни экспрессии). Образцы со значениями экспрессии CD37, составляющими 1, 2 или 3 (или 2 или 3), характеризуются повышенной вероятностью реакции на нацеленную на CD37 противораковую терапию при клинически значимых дозах иммуноконъюгатов к CD37 (см., например, WO 2013/149171, который включен в настоящее описание посредством ссылки). Таким образом, идентификация лиц, имеющих повышенное значение CD37, поможет выявить лиц, которые могут реагировать на клинически значимую дозу. Более того, экспрессия более однородных уровней CD37 обеспечивает лучшую корреляцию с терапевтической пользой. Таким образом, гомогенная равномерность окрашивания или сочетание большей интенсивности окрашивания с гетерогенной равномерностью окрашивания могут указывать на увеличение экспрессии CD37. Например, значения, превышающие 2 гетеро, могут быть применены в качестве критерия отбора пациента для лечения с применением нацеленного на CD37 терапевтического агента. Помимо этого, критерии отбора пациента могут быть основаны на процентном содержании в образце клеток, экспрессирующих мембранный CD37 на определенном уровне, который отражает как интенсивность окрашивания (например, 1, 2 или 3), так и равномерность (например, гетерогенное или гомогенное (см. табл. 3)). Например, образец может быть охарактеризован как содержащий, например, по меньшей мере 25% клеток, положительно окрашиваемых на CD37 со значением по меньшей мере 2 или более, или по меньшей мере 75% клеток, положительно окрашиваемых на CD37 со значением по меньшей мере 2 или более. В другом примере образец может быть охарактеризован как содержащий, например, по меньшей мере 25% клеток, положительно окрашиваемых на CD37 соIn some embodiments, the present disclosure provides a method for identifying subjects who may respond favorably to CD37-targeted therapy due to increased levels of CD37 expression in the subject, particularly using antibodies and antigen-binding fragments thereof provided herein that can detect dynamic range of CD37 expression levels, for example by IHC. Evaluation of patient samples and correlation with in vivo efficacy using xenograft models demonstrates the power of expression analysis to select subjects who are more likely to respond to treatment. Using IHC, the CD37 expression value in tumor cells is obtained: from 0 (no expression) to 3 (very high levels of expression). Samples with CD37 expression scores of 1, 2 or 3 (or 2 or 3) are characterized by an increased likelihood of responding to CD37-targeted anticancer therapy at clinically relevant doses of CD37 immunoconjugates (see, for example, WO 2013/149171, which is included in this description by reference). Thus, identifying individuals who have elevated CD37 values will help identify individuals who may respond to a clinically relevant dose. Moreover, expression of more uniform levels of CD37 provides a better correlation with therapeutic benefit. Thus, homogeneous staining uniformity or a combination of higher staining intensity with heterogeneous staining uniformity may indicate increased CD37 expression. For example, values greater than 2 hetero may be used as a criterion for selecting a patient for treatment with a CD37-targeted therapeutic agent. In addition, patient selection criteria may be based on the percentage of cells in the sample expressing membranous CD37 at a particular level, which reflects both staining intensity (eg, 1, 2, or 3) and uniformity (eg, heterogeneous or homogeneous (see Table 1). Table 3)). For example, a sample may be characterized as containing, for example, at least 25% of cells staining positive for CD37 with a score of at least 2 or more, or at least 75% of cells staining positive for CD37 with a score of at least 2 or more. In another example, the sample may be characterized as containing, for example, at least 25% of cells that stain positive for CD37 with

- 31 044601 значением по меньшей мере 3, или по меньшей мере 75% клеток, положительно окрашиваемых на CD37 со значением 3. В другом примере экспрессии CD37 присваивают Н-значение. Помимо этого, иммунологическое обнаружение (с помощью иммуногистохимии) CD37 может быть оценено с использованием Н-значений. Н-значения объединяют значения интенсивности окрашивания со значениями равномерности с использованием расчета, предложенного в настоящем описании. Как более подробно описано ниже, Н-значения могут варьировать от 1 до 300.- 31 044601 with a value of at least 3, or at least 75% of cells stain positive for CD37 with a value of 3. In another example, CD37 expression is assigned an H value. In addition, immunological detection (using immunohistochemistry) of CD37 can be assessed using H-scores. H-values combine color intensity values with uniformity values using the calculation proposed herein. As described in more detail below, H-values can range from 1 to 300.

Анализ экспрессии CD37 также может быть использован для идентификации пациентов, у которых сниженные уровни нацеленной на CD37 противораковой терапии (низкодозовая терапия) могут быть эффективны для обеспечения противоопухолевых реакций. Как должно быть понятно в данной области техники, соединения обычно вводят в наименьшей дозе, которая вызывает желаемый терапевтический ответ. Это особенно важно для терапевтических средств, которые вызывают клинические и часто нежелательные побочные эффекты. Возможность распознавания таких субъектов с повышенными уровнями экспрессии CD37 позволяет потенциально минимизировать дозу нацеленного на CD37 терапевтического средства, тем самым уменьшая возможные побочные эффекты, сохраняя при этом терапевтическую эффективность.CD37 expression analysis can also be used to identify patients in whom reduced levels of CD37-targeted anticancer therapy (low-dose therapy) may be effective in producing antitumor responses. As will be understood in the art, compounds are typically administered at the lowest dose that produces the desired therapeutic response. This is especially important for therapeutic agents that cause clinical and often unwanted side effects. The ability to recognize such subjects with elevated levels of CD37 expression allows one to potentially minimize the dose of a CD37-targeted therapeutic, thereby reducing potential side effects while maintaining therapeutic efficacy.

VI. Способы иммунодетекции.VI. Immunodetection methods.

В некоторых вариантах реализации связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты) могут быть применены в способах иммунодетекции для идентификации образцов и/или субъектов с повышенной экспрессией или сверхэкспрессией CD37. Способы иммунодетекции включают, например, иммуногистохимию (ИГХ), иммуноферментный анализ (ELISA), вестернблоттинг, проточную цитометрию и сортировку флуоресцентно-активированных клеток (FACS), если упоминать лишь несколько из них.In some embodiments, CD37-binding agents (eg, antibodies and antigen-binding fragments thereof) can be used in immunodetection methods to identify samples and/or subjects with elevated or overexpressed CD37. Immunodetection methods include, for example, immunohistochemistry (IHC), enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), Western blotting, flow cytometry, and fluorescence-activated cell sorting (FACS), to mention just a few.

Как правило, способы иммунодетекции включают получение образца, предположительно содержащего CD37, и приведение указанного образца в контакт с первым связывающимся с CD37 агентом (например, антителом к CD37 или его антигенсвязывающим фрагментом) в условиях, подходящих для обеспечения образования иммунокомплексов.Typically, immunodetection methods involve obtaining a sample suspected of containing CD37 and contacting said sample with a first CD37-binding agent (eg, an anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof) under conditions suitable to promote the formation of immunocomplexes.

Относительно обнаружения антигена, анализируемый биологический образец может представлять собой любой образец, в котором требуется обнаружить CD37, такой как жидкий экстракт, кровь, плазма, сыворотка, спинномозговая жидкость, лимфатическая жидкость, срез или участок ткани, гомогенизированный экстракт ткани, аспираты биопсий, клетка, отделенные и/или очищенные формы содержащих CD37 композиций или любая биологическая жидкость. В некоторых вариантах реализации используют образцы крови, плазмы или лимфы или экстракты.With respect to antigen detection, the biological sample analyzed may be any sample in which CD37 is desired to be detected, such as liquid extract, blood, plasma, serum, cerebrospinal fluid, lymph fluid, tissue section or section, homogenized tissue extract, biopsy aspirates, cell, separated and/or purified forms of CD37-containing compositions or any biological fluid. In some embodiments, blood, plasma or lymph samples or extracts are used.

Приведение выбранного биологического образца в контакт со связывающимся с CD37 агентом (например, антителом к CD37 или его антигенсвязывающим фрагментом) в подходящих условиях и в течение периода времени, достаточного для обеспечения образования иммунных комплексов (первичных иммунных комплексов), обычно заключается в добавлении связывающегося с CD37 агента (например, антитела к CD37 или его антигенсвязывающего фрагмента) к образцу и инкубирование смеси в течение периода времени, достаточного для того, чтобы связывающийся с CD37 агент (например, антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент) образовал комплексы, т.е. связался с любым присутствующим CD37. По истечении этого времени образец, такой как срез ткани или жидкий экстракт, планшет для ELISA или вестерн-блот, обычно промывают для удаления любого неспецифически связанного связывающегося с CD37 агента (например, антитела к CD37 или его антигенсвязывающего фрагмента), обеспечивая обнаружение только тех связывающихся с CD37 агентов (например, антител к CD37 или их антигенсвязывающих фрагментов), которые специфично связаны в первичных иммунных комплексах.Contacting a selected biological sample with a CD37-binding agent (e.g., an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof) under suitable conditions and for a period of time sufficient to allow formation of immune complexes (primary immune complexes) typically involves the addition of a CD37-binding agent. agent (eg, an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof) to the sample and incubating the mixture for a period of time sufficient to allow the CD37-binding agent (eg, an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof) to form complexes, i.e. contacted any CD37 present. After this time, the sample, such as a tissue section or liquid extract, ELISA plate, or Western blot, is typically washed to remove any nonspecifically bound CD37 binding agent (e.g., anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof), ensuring that only those binding to CD37 are detected. with CD37 agents (eg, anti-CD37 antibodies or antigen-binding fragments thereof) that are specifically bound in primary immune complexes.

Как правило, обнаружение образования иммунокомплексов хорошо известно в данной области техники и может быть достигнуто путем применения многочисленных подходов. Связывающийся с CD37 агент (например, антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент), используемый для обнаружения, сам может быть связан с обнаруживаемой меткой, так чтобы можно было просто обнаружить эту метку, определив таким образом количество первичных иммунных комплексов в композиции, подлежащей анализу. В качестве альтернативы первый связывающийся с CD37 агент (например, антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент), который связывается в первичных иммунных комплексах, может быть обнаружен с помощью второго связывающего агента (например, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента), который обладает связывающей способностью по отношению к первому связывающемуся с CD37 агенту (например, антителу к CD37 или его антигенсвязывающему фрагменту). В этих случаях второй связывающий агент может быть связан с обнаруживаемой меткой. Когда второй связывающий агент сам по себе является антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, он может быть назван вторичным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом. Первичные иммунные комплексы приводят в контакт с меченым вторичным связывающим агентом в подходящих условиях и в течение периода времени, достаточного для обеспечения образования вторичных иммунных комплексов. Вторичные иммунные комплексы затем обычно промывают для удаления любых неспецифически связанных меченых вторичных связывающих агентов, а затем обнаруживают оставшуюся метку во вторичных иммунных комплексах. Дополнительно способы включают обнаружение первичных иммунных комIn general, detection of immunocomplex formation is well known in the art and can be achieved using numerous approaches. The CD37-binding agent (eg, an anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof) used for detection may itself be associated with a detectable label such that the label can be easily detected, thereby determining the amount of primary immune complexes in the composition to be analyzed. Alternatively, a first CD37 binding agent (e.g., an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof) that binds in primary immune complexes can be detected by a second binding agent (e.g., an antibody or an antigen-binding fragment thereof) that has binding ability relative to the first CD37-binding agent (eg, an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof). In these cases, the second binding agent may be associated with the detectable label. When the second binding agent is itself an antibody or an antigen-binding fragment thereof, it may be referred to as a secondary antibody or an antigen-binding fragment thereof. The primary immune complexes are brought into contact with a labeled secondary binding agent under suitable conditions and for a period of time sufficient to allow formation of secondary immune complexes. The secondary immune complexes are then typically washed to remove any nonspecifically bound labeled secondary binders, and the remaining label in the secondary immune complexes is then detected. Additionally, methods include detection of primary immune cells

- 32 044601 плексов с помощью двухстадийного подхода. Второй связывающий агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент), который обладает связывающей способностью по отношению к первому связывающемуся с CD37 агенту (например, антителу к CD37 или его антигенсвязывающему фрагменту), используют для образования вторичных иммунных комплексов, как описано в настоящем описании. После промывки вторичные иммунные комплексы приводят в контакт с третьим связывающим агентом, который обладает связывающей способностью по отношению ко второму связывающему агенту (например, антителу или его антигенсвязывающему фрагменту), также в подходящих условиях и в течение периода времени, достаточного для обеспечения образования иммунных комплексов (третичных иммунных комплексов). Третий связывающий агент связан с обнаруживаемой меткой, что позволяет обнаружить образовавшиеся третичные иммунные комплексы. Эта система может обеспечить усиление сигнала, если это желательно.- 32,044601 plex using a two-stage approach. A second binding agent (eg, an antibody or an antigen-binding fragment thereof) that has binding activity to a first CD37-binding agent (eg, an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof) is used to form secondary immune complexes as described herein. After washing, the secondary immune complexes are brought into contact with a third binding agent that has binding activity to the second binding agent (e.g., an antibody or an antigen-binding fragment thereof), also under suitable conditions and for a period of time sufficient to allow formation of immune complexes ( tertiary immune complexes). The third binding agent is bound to a detectable label, allowing the detection of tertiary immune complexes formed. This system can provide signal amplification if desired.

В другом варианте реализации биотинилированный связывающийся с CD37 агент (например, антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент) используют для обнаружения CD37, а второй связывающий агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) затем используют для обнаружения биотина. В этом способе тестируемый образец сначала инкубируют в растворе, содержащем биотинилированный связывающийся с CD37 агент (например, антитело к CD37 или его антигенсвязывающий фрагмент). Если CD37 присутствует, часть связывающего агента связывается с CD37 с образованием комплекса биотинилированный связывающийся с CD37 агент - CD37. Затем указанный комплекс амплифицируют путем последовательного инкубирования в растворах стрептавидина (или авидина), биотинилированной ДНК и/или комплементарной биотинилированной ДНК, на каждой стадии добавляя дополнительные сайты биотина к комплексу антитело/антиген. Стадии амплификации повторяют до достижения подходящего уровня амплификации, после чего образец инкубируют в растворе, содержащем второй связывающий агент (например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент), который связывается с биотином. Этот второй связывающий агент метят, например, ферментом, который может быть использован для обнаружения присутствия комплекса антитело/антиген с помощью гистоэнзимологии с использованием хромогенного субстрата. При подходящей амплификации может быть получен конъюгат, который является макроскопически видимым.In another embodiment, a biotinylated CD37 binding agent (eg, an anti-CD37 antibody or an antigen-binding fragment thereof) is used to detect CD37, and a second binding agent (eg, an antibody or an antigen-binding fragment thereof) is then used to detect biotin. In this method, the test sample is first incubated in a solution containing a biotinylated CD37 binding agent (eg, an anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof). If CD37 is present, the binding agent moiety binds to CD37 to form a biotinylated CD37 binding agent-CD37 complex. The complex is then amplified by sequential incubation in solutions of streptavidin (or avidin), biotinylated DNA and/or complementary biotinylated DNA, adding additional biotin sites to the antibody/antigen complex at each step. The amplification steps are repeated until a suitable level of amplification is achieved, after which the sample is incubated in a solution containing a second binding agent (eg, an antibody or an antigen-binding fragment thereof) that binds to biotin. This second binding agent is labeled, for example, with an enzyme that can be used to detect the presence of an antibody/antigen complex by histoenzymology using a chromogenic substrate. With suitable amplification, a conjugate can be obtained that is macroscopically visible.

В одном из вариантов реализации для иммунологического обнаружения используют иммуногистохимию (ИГХ). При использовании ИГХ обнаружение CD37 в образце может быть достигнуто с помощью нацеливания на образец зонда, например, антитела к CD37 или его антигенсвязывающего фрагмента. Указанный зонд может быть либо непосредственно, либо опосредованно связан с обнаруживаемой меткой или может быть обнаружен с помощью другого зонда, который либо непосредственно, либо опосредованно связан с обнаруживаемой меткой.In one embodiment, immunohistochemistry (IHC) is used for immunological detection. When using IHC, detection of CD37 in a sample can be achieved by targeting the sample with a probe, such as an anti-CD37 antibody or antigen-binding fragment thereof. The probe may be either directly or indirectly associated with the detectable label or may be detected by another probe that is either directly or indirectly associated with the detectable label.

В некоторых вариантах реализации с помощью ИГХ можно обнаруживать различия между различными уровнями экспрессии белка, например, в калиброванном методе ИГХ. В некоторых вариантах реализации с помощью ИГХ можно различать интенсивности окрашивания для образцов, характеризующихся низкой, промежуточной или высокой экспрессией CD37.In some embodiments, IHC can detect differences between different levels of protein expression, such as in a calibrated IHC method. In some embodiments, IHC can distinguish staining intensities for samples characterized by low, intermediate, or high expression of CD37.

В одном из вариантов реализации иммунологическое обнаружение (с помощью иммуногистохимии) CD37 оценивают как по интенсивности, так и по равномерности (процент окрашенных клеток только мембран). Сравнительные шкалы для интенсивности экспрессии CD37 соотносятся как 0 - отрицательная, 0-1 - очень слабая, 1 - слабая, 1-2 - от слабой до умеренной, 2 - умеренная, 2-3 - от умеренной до сильной, 3 - от сильной до очень сильной. Количественно значение 0 означает, что окрашивания не наблюдается или окрашивание мембраны наблюдается менее чем в 10% опухолевых клеток. Значение 1 или 1+ показывает, что слабое/едва заметное окрашивание мембраны обнаруживается более чем в 10% опухолевых клеток. Клетки окрашиваются только в части их мембран. Значения 1 и 1+ используются взаимозаменяемо. При значении 2 полное окрашивание мембран от слабого до умеренного наблюдается более чем в 10% опухолевых клеток. Наконец, значение 3 показывает, что полное окрашивание мембран от умеренного до сильного наблюдается более чем в 10% опухолевых клеток. Образцы со значением 0 или 1 для экспрессии CD37 могут быть охарактеризованы как не имеющие повышенной экспрессии CD37, в то время как образцы со значениями 2 или 3 могут быть охарактеризованы как имеющие сверхэкспрессию или повышенный уровень CD37. В другом варианте реализации с использованием антител, их антигенсвязывающих фрагментов или полипептидов, предложенных в настоящем описании, образцы со значением 0 для экспрессии CD37 могут быть охарактеризованы как не имеющие повышенной экспрессии CD37, образцы со значением 1 могут быть охарактеризованы как имеющие повышенную экспрессию CD37, а образцы со значениями 2 или 3 могут быть охарактеризованы как имеющие сверхэкспрессию или повышенный уровень CD37. В некоторых вариантах реализации значение, составляющее по меньшей мере 2 в образце, полученном от субъекта, идентифицирует субъекта как претендента на лечение с применением схемы лечения, нацеленного на CD37 (например, IMGN529). В некоторых вариантах реализации значение, составляющее по меньшей мере 3 в образце, полученном от субъекта, идентифицирует субъекта как претендента на лечение с применением схемы лечения, нацеленного на CD37 (например, IMGN529). Образцы, характеризующиеся сверхэкспрессией CD37, также могут быть оценены по иммуногистохимическим показателям, соответствующим количеству копий экспрессируемых молекулIn one embodiment, immunological detection (using immunohistochemistry) of CD37 is assessed for both intensity and uniformity (percentage of membrane-only cells stained). Comparative scales for the intensity of CD37 expression are related as 0 - negative, 0-1 - very weak, 1 - weak, 1-2 - weak to moderate, 2 - moderate, 2-3 - moderate to strong, 3 - strong to very strong. Quantitatively, a value of 0 means that no staining is observed or membrane staining is observed in less than 10% of tumor cells. A value of 1 or 1+ indicates that weak/barely noticeable membrane staining is detected in more than 10% of tumor cells. Cells are stained only in part of their membranes. The values 1 and 1+ are used interchangeably. At a value of 2, weak to moderate complete membrane staining is observed in more than 10% of tumor cells. Finally, a value of 3 indicates that moderate to strong complete membrane staining is observed in more than 10% of tumor cells. Samples with a score of 0 or 1 for CD37 expression may be characterized as having no overexpression of CD37, while samples with scores of 2 or 3 may be characterized as having overexpression or increased levels of CD37. In another embodiment, using antibodies, antigen binding fragments thereof, or polypeptides provided herein, samples with a CD37 expression score of 0 may be characterized as having no CD37 overexpression, samples with a score of 1 may be characterized as having CD37 overexpression, and samples with scores of 2 or 3 can be characterized as having overexpression or increased levels of CD37. In some embodiments, a value of at least 2 in a sample obtained from a subject identifies the subject as a candidate for treatment with a CD37-targeted treatment regimen (eg, IMGN529). In some embodiments, a value of at least 3 in a sample obtained from a subject identifies the subject as a candidate for treatment with a CD37-targeted treatment regimen (eg, IMGN529). Specimens overexpressing CD37 can also be assessed by immunohistochemistry, corresponding to the copy number of the molecules expressed

- 33 044601- 33 044601

CD37 на клетку или связанных антител на клетку (ABC), и могут быть биохимически определены.CD37 per cell or antibody-associated per cell (ABC), and can be biochemically determined.

Сравнительные шкалы для равномерности CD37 (процент окрашивания мембран клеток) следующие: отрицательное = 0%; фокальное = <25%; гетерогенное (гетеро) = 25-75% и гомогенное (гомо) = >75%.Comparative scales for CD37 uniformity (percentage of cell membrane staining) are as follows: negative = 0%; focal = <25%; heterogeneous (hetero) = 25-75% and homogeneous (homo) = >75%.

В некоторых вариантах реализации значение, составляющее по меньшей мере 2 гетеро в образце, полученном от субъекта, идентифицирует субъекта как претендента на лечение с применением схемы лечения, нацеленного на CD37 (например, IMGN529). В некоторых вариантах реализации значение, составляющее по меньшей мере 2 гомо в образце, полученном от субъекта, идентифицирует субъекта как претендента на лечение с применением схемы лечения, нацеленного на CD37 (например, IMGN529). В некоторых вариантах реализации значение, составляющее по меньшей мере 3 гетеро в образце, полученном от субъекта, идентифицирует субъекта как претендента на лечение с применением схемы лечения, нацеленного на CD37 (например, IMGN529). В некоторых вариантах реализации значение, составляющее по меньшей мере 3 гомо в образце, полученном от субъекта, идентифицирует субъекта как претендента на лечение с применением схемы лечения, нацеленного на CD37 (например, IMGN529). В одном из вариантов реализации иммунологическое обнаружение (с помощью иммуногистохимии) CD37 оценивают с использованием Н-значений. Н-значения объединяют значения интенсивности окрашивания (например, значения от 0 до 3, где 0 означает отсутствие окрашивания, а 3 означает сильное окрашивание) с процентным содержанием клеток, которые являются положительными по окрашиванию мембран (т.е. равномерности). Н-значение может быть рассчитано следующим образом: Н-значение = [0*(процентное содержание клеток, окрашенных с интенсивностью 0)] + [1*(процентное содержание клеток, окрашенных с интенсивностью 1)] + [2*(процентное содержание клеток, окрашенных с интенсивностью 2)] + [3*(процентное содержание клеток, окрашенных с интенсивностью 3)]. Соответственно, Н-значение может варьировать от 0 (отсутствие окрашивания мембран клеток) до 300 (все мембраны клеток окрашены с интенсивностью 3).In some embodiments, a value of at least 2 hetero in a sample obtained from a subject identifies the subject as a candidate for treatment with a CD37-targeted treatment regimen (eg, IMGN529). In some embodiments, a value of at least 2 homo in a sample obtained from a subject identifies the subject as a candidate for treatment with a CD37-targeted treatment regimen (eg, IMGN529). In some embodiments, a value of at least 3 hetero in a sample obtained from a subject identifies the subject as a candidate for treatment with a CD37-targeted treatment regimen (eg, IMGN529). In some embodiments, a value of at least 3 homo in a sample obtained from a subject identifies the subject as a candidate for treatment with a CD37-targeted treatment regimen (eg, IMGN529). In one embodiment, immunological detection (using immunohistochemistry) of CD37 is assessed using H-scores. H-scores combine staining intensity values (eg, values from 0 to 3, where 0 means no staining and 3 means strong staining) with the percentage of cells that are positive for membrane staining (i.e., uniformity). The H-value can be calculated as follows: H-value = [0*(percentage of cells stained with intensity 0)] + [1*(percentage of cells stained with intensity 1)] + [2*(percentage of cells , stained with intensity 2)] + [3*(percentage of cells stained with intensity 3)]. Accordingly, the H-value can vary from 0 (no staining of cell membranes) to 300 (all cell membranes are stained with intensity 3).

В качестве примера Н-значение у субъекта, имеющего рак, может быть следующим:As an example, the H-value in a subject having cancer may be as follows:

Н-значение = (75% с интенсивностью 0) + (0% с интенсивностью 1) + (0% с интенсивностью 2) + (25% с интенсивностью 3) = 75 илиH-value = (75% with intensity 0) + (0% with intensity 1) + (0% with intensity 2) + (25% with intensity 3) = 75 or

Н-значение = (0% с интенсивностью 0) + (75% с интенсивностью 1) + (0% с интенсивностью 2) + (25% с интенсивностью 3) = 150.H-value = (0% with intensity 0) + (75% with intensity 1) + (0% with intensity 2) + (25% with intensity 3) = 150.

В другом примере Н-значение у субъекта, имеющего рак, может быть следующим:In another example, the H-value in a subject having cancer may be:

Н-значение = (75% с интенсивностью 0) + (0% с интенсивностью 1) + (25% с интенсивностью 2) + (0% с интенсивностью 3) = 50 илиH-value = (75% with intensity 0) + (0% with intensity 1) + (25% with intensity 2) + (0% with intensity 3) = 50 or

Н-значение = (0% с интенсивностью 0) + (75% с интенсивностью 1) + (25% с интенсивностью 2) + (0% с интенсивностью 3) = 125.H-value = (0% with intensity 0) + (75% with intensity 1) + (25% with intensity 2) + (0% with intensity 3) = 125.

В одном из вариантов реализации иммунологическое обнаружение (с помощью иммуногистохимии) CD37 оценивают с использованием процента положительного результата окрашивания и интенсивности по образцу. В этом варианте реализации отбор для лечения с применением схемы лечения, нацеленного на CD37, основан на процентном содержании в образце клеток, экспрессирующих мембранный CD37 на определенном уровне, который отражает как интенсивность окрашивания (например, 1, 2 или 3), так и равномерность (например, гетерогенное или гомогенное (см. табл. 3)). Например, образец, содержащий по меньшей мере 25% (т.е. 25-75% или >75%) клеток, положительно окрашиваемых на CD37 со значением 3, может быть охарактеризован как 3 гетеро и 3 гомо или, совместно, как по меньшей мере 25% положительны со значением 3.In one embodiment, immunological detection (using immunohistochemistry) of CD37 is assessed using percent positive staining and intensity per sample. In this embodiment, selection for treatment using a CD37-targeted treatment regimen is based on the percentage of cells in the sample expressing membranous CD37 at a particular level, which reflects both the intensity of staining (e.g., 1, 2, or 3) and the uniformity ( for example, heterogeneous or homogeneous (see Table 3)). For example, a sample containing at least 25% (i.e., 25-75% or >75%) of cells staining positive for CD37 with a score of 3 may be characterized as 3 hetero and 3 homo or, together, as at least At least 25% are positive with a value of 3.

ИГХ может быть выполнена вручную или с использованием автоматизированной системы (например, с использованием автоматизированного фильтра). ИГХ может быть выполнена на клетках, осадках клеток, тканях, препаратах из крови, плазме, сыворотке или лимфатической жидкости и т.д. В некоторых вариантах реализации образцы представляют собой фиксированные образцы. В некоторых вариантах реализации образцы представляют собой залитые парафином образцы. В некоторых вариантах реализации образцы представляют собой фиксированные формалином и залитые парафином образцы.IHC can be performed manually or using an automated system (eg, using an automated filter). IHC can be performed on cells, cell pellets, tissues, blood preparations, plasma, serum or lymph fluid, etc. In some embodiments, the samples are fixed patterns. In some embodiments, the samples are paraffin-embedded samples. In some embodiments, the samples are formalin-fixed, paraffin-embedded samples.

В одном из вариантов реализации для иммунологического обнаружения используют иммуноферментный анализ (ELISA). Методология, лежащая в основе ELISA, хорошо известна в данной области техники. См., например, источник Lequin R, Enzyme immunoassay (EIA)/enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), Clin. Chem. 57:2415-2418 (2005), включенный в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте. В одном иллюстративном ELISA связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела или их антигенсвязывающие фрагменты) иммобилизуют на выбранной поверхности, проявляющей сродство к белку, такой как лунка в полистирольном планшете для микротитрования. Затем в лунки добавляют исследуемый образец, такой как клинический образец, содержащий или предполагаемо содержащий CD37. После связывания и промывки для удаления неспецифически связанных иммунокомплексов может быть обнаружен связавшийся CD37. Обнаружения обычно достигают добавлением второго антитела, специфичного для CD37, или его антигенсвязывающего фрагмента, который связан с обнаруживаемой меткой. Этот тип ELISA представляет собой сэндвич-ELISA. Обнаружение также может быть достигнуто добавлением второго антитела или его антигенсвязывающего фрагмента с последую- 34 044601 щим добавлением третьего антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, который обладает связывающей способностью по отношению ко второму антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, причем третье антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связан с обнаруживаемой меткой. Появление окраски можно регистрировать спектрофотометрически и соотносить с концентрацией CD37 с помощью калибровки с использованием калибровочной кривой. В одном иллюстративном ELISA исследуемые образцы иммобилизуют на поверхности лунки и затем приводят в контакт со связывающимися с CD37 агентами (например, антителами или их антигенсвязывающими фрагментами). После связывания и промывки для удаления неспецифически связанных иммунокомплексов обнаруживают связавшийся CD37. В случае, если исходные связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела или их антигенсвязывающие фрагменты) связаны с обнаруживаемой меткой, иммунокомплексы могут быть обнаружены непосредственно. Опять же, иммунокомплексы могут быть обнаружены с использованием второго связывающего агента, который обладает связывающей способностью по отношению к первому связывающему агенту, причем второй связывающий агент связан с обнаруживаемой меткой. Другой ELISA, в котором исследуемые образцы иммобилизованы, включает использование конкуренции при обнаружении. В этом ELISA меченые связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела или их антигенсвязывающие фрагменты) добавляют в лунки, позволяют связаться с CD37 и обнаруживают с помощью их метки. Количество CD37 в образце затем определяют путем смешивания указанного образца с мечеными связывающимися с CD37 агентами (например, антителами или их антигенсвязывающими фрагментами) до или во время инкубирования в лунках с покрытием. Присутствие CD37 в образце способствует уменьшению количества связывающихся с CD37 агентов (например, антител или их антигенсвязывающих фрагментов), доступных для связывания с лункой, и таким образом уменьшает конечный сигнал.In one embodiment, an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) is used for immunological detection. The methodology underlying ELISA is well known in the art. See, for example, Lequin R, Enzyme immunoassay (EIA)/enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), Clin. Chem. 57:2415-2418 (2005), incorporated herein by reference in its entirety. In one exemplary ELISA, CD37-binding agents (eg, antibodies or antigen-binding fragments thereof) are immobilized on a selected surface exhibiting affinity for the protein, such as a well in a polystyrene microtiter plate. A test sample, such as a clinical sample containing or suspected to contain CD37, is then added to the wells. After binding and washing to remove nonspecifically bound immunocomplexes, bound CD37 can be detected. Detection is usually achieved by adding a second antibody specific for CD37, or an antigen-binding fragment thereof, that is linked to the detectable label. This type of ELISA is a sandwich ELISA. Detection may also be achieved by adding a second antibody or antigen-binding fragment thereof, followed by the addition of a third antibody or antigen-binding fragment thereof that has binding activity to the second antibody or antigen-binding fragment thereof, wherein the third antibody or antigen-binding fragment thereof is associated with the detectable tag. The appearance of color can be detected spectrophotometrically and correlated with CD37 concentration by calibration using a calibration curve. In one exemplary ELISA, test samples are immobilized on the surface of a well and then brought into contact with CD37-binding agents (eg, antibodies or antigen-binding fragments thereof). After binding and washing to remove nonspecifically bound immunocomplexes, bound CD37 is detected. If the original CD37-binding agents (eg, antibodies or antigen-binding fragments thereof) are associated with a detectable label, the immunocomplexes can be detected directly. Again, immunocomplexes can be detected using a second binding agent that has binding properties to the first binding agent, the second binding agent being bound to a detectable label. Another ELISA in which the test samples are immobilized involves the use of competition in detection. In this ELISA, labeled CD37-binding agents (eg, antibodies or antigen-binding fragments thereof) are added to wells, allowed to bind to CD37, and detected by their label. The amount of CD37 in a sample is then determined by mixing said sample with labeled CD37-binding agents (eg, antibodies or antigen-binding fragments thereof) before or during incubation in coated wells. The presence of CD37 in a sample reduces the amount of CD37-binding agents (eg, antibodies or antigen-binding fragments thereof) available to bind to the well and thus reduces the final signal.

В одном из вариантов реализации для иммунологического обнаружения используют вестернблоттинг. Для вестерн-блоттинга белки экстрагируют из образца клетки и подвергают электрофорезу (например, в ДНС-ПААГ) и получают отпечаток на мембране (например, нитроцеллюлозе или поливинилиденфториде (ПВДФ)). Затем мембрану приводят в контакт со связывающимся с CD37 агентом (например, антителом или его антигенсвязывающим фрагментом), который может быть либо непосредственно помечен, либо в дальнейшем подвергнут действию меченого вторичного связывающего агента. Обнаружение может быть осуществлено, например, с помощью авторадиографии, колориметрической реакции или хемилюминесценции. Этот способ обеспечивает как возможность количественной оценки содержания субстрата, так и определение его идентичности по относительному положению на мембране, которое указывает на длину пробега в акриламидном геле во время электрофореза.In one embodiment, Western blotting is used for immunological detection. For Western blotting, proteins are extracted from a cell sample and subjected to electrophoresis (eg, DNS-PAGE) and imprinted on a membrane (eg, nitrocellulose or polyvinylidene fluoride (PVDF)). The membrane is then contacted with a CD37-binding agent (eg, an antibody or an antigen-binding fragment thereof), which can either be directly labeled or subsequently exposed to a labeled secondary binding agent. Detection can be carried out, for example, using autoradiography, colorimetric reaction or chemiluminescence. This method provides both the ability to quantify substrate content and determine its identity by relative position on the membrane, which indicates the path length in the acrylamide gel during electrophoresis.

В одном из вариантов реализации для иммунологического обнаружения используют проточную цитометрию. Так, например, количество связанных антител на клетку (ABC) может быть оценено с использованием проточной цитометрии. Большое количество связанных антител к CD37 на клетку может указывать на высокие уровни экспрессии CD37 и высокую вероятность чувствительности к лечению с применением антитела к CD37 или его иммуноконъюгата.In one embodiment, flow cytometry is used for immunological detection. For example, the amount of antibody bound per cell (ABC) can be assessed using flow cytometry. A high number of bound anti-CD37 antibodies per cell may indicate high levels of CD37 expression and a high likelihood of sensitivity to treatment with an anti-CD37 antibody or its immunoconjugate.

В одном из вариантов реализации для иммунологического обнаружения используют FACS. Анализ методом FACS позволяет обнаружить CD37 на мембранах клеток. Вкратце, связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела или их антигенсвязывающие фрагменты) связаны с флуорофорами, и обнаружение осуществляют с помощью аппарата для сортировки клеток, который считывает длину волны света, излучаемого каждой клеткой, когда она проходит через световой пучок. В этом способе может быть использовано два или более антитела одновременно.In one embodiment, FACS is used for immunological detection. FACS analysis detects CD37 on cell membranes. Briefly, CD37-binding agents (eg, antibodies or antigen-binding fragments thereof) are coupled to fluorophores, and detection is accomplished using a cell sorter that reads the wavelength of light emitted by each cell as it passes through a beam of light. In this method, two or more antibodies can be used simultaneously.

VII. Агенты для детекции.VII. Detection agents.

Связывающиеся с CD37 агенты, предложенные в настоящем описании, могут быть связаны с по меньшей мере одним агентом с образованием конъюгата для детекции. Помимо этого, связывающиеся с CD37 агенты, предложенные в настоящем описании, могут быть обнаружены с помощью агента для детекции, который связан по меньшей мере с одним агентом с образованием конъюгата для детекции. Молекулы и фрагменты для детекции хорошо известны в данной области техники. Для повышения эффективности молекул антител в качестве диагностических принято присоединять или ковалентно связывать или получать комплекс по меньшей мере с одной желаемой молекулой или фрагментом. Такая молекула или фрагмент может представлять собой по меньшей мере одну репортерную молекулу, но не ограничиваясь ею. Репортерная молекула определена как любой фрагмент, который может быть обнаружен с использованием анализа. Неограничивающие примеры репортерных молекул, которые были конъюгированы с антителами, включают ферменты, радиоактивные метки, гаптены, флуоресцентные метки, фосфоресцирующие молекулы, хемилюминесцентные молекулы, хромофоры, люминесцентные молекулы, фотоаффинные молекулы, окрашенные частицы и/или лиганды, такие как биотин.The CD37 binding agents provided herein may be coupled to at least one agent to form a detection conjugate. In addition, the CD37 binding agents provided herein can be detected using a detection agent that is coupled to at least one agent to form a detection conjugate. Molecules and moieties for detection are well known in the art. To increase the effectiveness of antibody molecules as diagnostic molecules, it is common to attach, covalently link, or complex with at least one desired molecule or fragment. Such a molecule or fragment may be at least one reporter molecule, but is not limited to it. A reporter molecule is defined as any fragment that can be detected using an assay. Non-limiting examples of reporter molecules that have been conjugated to antibodies include enzymes, radiolabels, haptens, fluorescent tags, phosphorescent molecules, chemiluminescent molecules, chromophores, luminescent molecules, photoaffinity molecules, colored particles and/or ligands such as biotin.

Конъюгаты антитела или антигенсвязывающего фрагмента для детекции, предусмотренные в настоящем изобретении, включают конъюгаты для детекции для применения in vitro, где антитело или фрагмент связано/связан с вторичным связывающим лигандом и/или ферментом (ферментной меткой), который будет образовывать окрашенный продукт при контакте с хромогенным субстратом. Антитела к CD37 и их антигенсвязывающие фрагменты, предложенные в настоящем описании, в частности пригодны для применения в способах с применением конъюгатов, поскольку, например, они позволяют обнаAntibody or antigen binding moiety detection conjugates provided by the present invention include detection conjugates for in vitro use wherein the antibody or moiety is bound to a secondary binding ligand and/or enzyme (enzyme tag) that will form a colored product upon contact with chromogenic substrate. The anti-CD37 antibodies and antigen-binding fragments thereof provided herein are particularly suitable for use in conjugate methods because, for example, they allow detection

- 35 044601 руживать динамический диапазон CD37. Примеры подходящих ферментов включают уреазу, щелочную фосфатазу, пероксидазу (хрена) и/или глюкозооксидазу. В некоторых вариантах реализации вторичные связывающие лиганды представляют собой соединения биотина и/или авидина и стрептавидина. В случае ферментов интенсивность развившегося и измеренного окрашивания будет представлять собой непосредственное измерение количества присутствующего CD37. Если ПХ является меткой, окрашивание может быть обнаружено с использованием субстрата 3,3',5,5'-тетраметилбензидина (ТМВ), например, по поглощению при длине волны 450 нм. В качестве альтернативы могут быть использованы другие хромогенные субстраты для ПХ, такие как 3,3'-диаминобензидин (DAB) или 2,2'-азино-бис-(3этилбензтиазолин-6-сульфоновая кислота) (ABTS). Субстраты, такие как ТМВ, DAB и ABTS, могут быть применены, например, в способах иммунодетекции с использованием ELISA.- 35 044601 enhance the dynamic range of CD37. Examples of suitable enzymes include urease, alkaline phosphatase, horseradish peroxidase and/or glucose oxidase. In some embodiments, the secondary binding ligands are biotin and/or avidin and streptavidin compounds. In the case of enzymes, the intensity of staining developed and measured will represent a direct measurement of the amount of CD37 present. If HRP is a label, coloring can be detected using the substrate 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine (TMB), for example by absorbance at 450 nm. Alternatively, other chromogenic HRP substrates such as 3,3'-diaminobenzidine (DAB) or 2,2'-azino-bis(3ethylbenzthiazoline-6-sulfonic acid) (ABTS) can be used. Substrates such as TMB, DAB and ABTS can be used, for example, in immunodetection methods using ELISA.

3,3'-Диаминобензидин (DAB) является субстратом для ферментов, таких как ПХ, образующим коричневый конечный продукт, который очень малорастворим в спирте и других органических растворителях. Окисление DAB также вызывает полимеризацию, приводящую к способности взаимодействовать с тетраоксидом осмия и, таким образом, увеличению интенсивности его окрашивания и электронной плотности. Из нескольких металлов и способов, используемых для усиления оптической плотности полимеризованного DAB, хлорид золота в сочетании с сульфидом серебра представляется наиболее эффективным.3,3'-Diaminobenzidine (DAB) is a substrate for enzymes such as HRP, producing a brown end product that is very slightly soluble in alcohol and other organic solvents. Oxidation of DAB also causes polymerization, resulting in the ability to react with osmium tetroxide and thus increase its color intensity and electron density. Of the several metals and methods used to enhance the optical density of polymerized DAB, gold chloride in combination with silver sulfide appears to be the most effective.

3-Амино-9-этилкарбазол (АЕС) является субстратом для ферментов, таких как ПХ, и при окислении образует розово-красный конечный продукт, который растворим в спирте. Поэтому образцы, обработанные АЕС, не следует погружать в спирт или спиртовые растворы (например, гематоксилин Гарриса (Harris)). Вместо этого следует использовать водную среду для контрастного окрашивания и заключения.3-Amino-9-ethylcarbazole (AEC) is a substrate for enzymes such as HRP and upon oxidation produces a pink-red end product that is soluble in alcohol. Therefore, AEC-treated specimens should not be immersed in alcohol or alcohol solutions (eg Harris hematoxylin). Instead, an aqueous medium should be used for counterstaining and mounting.

4-Хлор-1-нафтол (CN) является субстратом для ферментов, таких как ПХ, который выпадает в осадок в виде синего конечного продукта. Поскольку CN растворим в спирте и других органических растворителях, образец нельзя обезвоживать, подвергать действию спиртовых контрастных красителей или заключать под покровное стекло с применением сред для заключения, содержащих органические растворители. В отличие от DAB, CN имеет свойство диффундировать от места осаждения.4-Chloro-1-naphthol (CN) is a substrate for enzymes such as HRP, which precipitates as a blue end product. Because CN is soluble in alcohol and other organic solvents, the sample should not be dehydrated, exposed to alcohol counterstains, or mounted under a coverslip using mounting media containing organic solvents. Unlike DAB, CN tends to diffuse away from the site of deposition.

п-Фенилендиамина дигидрохлорид/пирокатехин (реактив Ханкера-Яте (Hanker-Yates)) является субстратом для ферментов, таких как ПХ, который образует сине-черный продукт реакции, нерастворимый в спирте и других органических растворителях. Подобно полимеризованному DAB, этот продукт реакции может быть обработан осмиевой кислотой. Были получены различные результаты с применением реактива Ханкера-Яте в иммунопероксидазном методе.p-Phenylenediamine dihydrochloride/pyrocatechol (Hanker-Yates reagent) is a substrate for enzymes such as HRP, which produces a blue-black reaction product that is insoluble in alcohol and other organic solvents. Like polymerized DAB, this reaction product can be treated with osmic acid. Various results have been obtained using the Hanker-Yate reagent in the immunoperoxidase method.

Могут быть применены хемилюминесцентные субстраты, такие как ECL. Субстраты, такие как ECL, могут быть применены, например, в способах иммунодетекции с использованием вестернблоттинга.Chemiluminescent substrates such as ECL can be used. Substrates such as ECL can be used, for example, in immunodetection methods using Western blotting.

Иллюстративные флуоресцентные метки, предназначенные для применения в конъюгатах связывающего агента (например, антитела), включают, например, Alexa 350, Alexa 430, Alexa 488, АМСА, BODIPY 630/650, BODIPY 650/665, BODIPY-FL, BODIPY-R6G, BODIPY-TMR, BODIPY-TRX, Cascade Blue, Cy3, Cy5,6-FAM, Dylight 488, флуоресцеина изотиоцианат (FITC), зеленый флуоресцентный белок (GFP), HEX, 6-JOE, Oregon Green 488, Oregon Green 500, Oregon Green 514, Pacific Blue, Phycoerythrin, REG, родамин зеленый, родамин красный, тетраметилродамин (TMR) ренографин, ROX, TAMRA, ТЕТ, тетраметилродамин, техасский красный и производные этих меток (т.е. галогенированные аналоги, модифицированные изотиоцианатом или другими линкерами для конъюгирования т.д.). Примером радиоактивной метки является тритий.Exemplary fluorescent tags for use in binding agent (e.g., antibody) conjugates include, for example, Alexa 350, Alexa 430, Alexa 488, AMCA, BODIPY 630/650, BODIPY 650/665, BODIPY-FL, BODIPY-R6G, BODIPY-TMR, BODIPY-TRX, Cascade Blue, Cy3, Cy5,6-FAM, Dylight 488, fluorescein isothiocyanate (FITC), green fluorescent protein (GFP), HEX, 6-JOE, Oregon Green 488, Oregon Green 500, Oregon Green 514, Pacific Blue, Phycoerythrin, REG, rhodamine green, rhodamine red, tetramethylrhodamine (TMR) renographine, ROX, TAMRA, TET, tetramethylrhodamine, Texas red and derivatives of these labels (i.e., halogenated analogues modified with isothiocyanate or other linkers to conjugation, etc.). An example of a radioactive tracer is tritium.

Молекулы, содержащие азидогруппы, также могут быть использованы для образования ковалентных связей с белками через реакционноспособные нитреновые промежуточные соединения, которые образуются под действием ультрафиолетового излучения низкой интенсивности (Potter & Haley, 1983). В частности, 2- и 8-азидо аналоги пуриновых нуклеотидов были использованы в качестве сайтнаправленных фотозондов для идентификации нуклеотид-связывающих белков в неочищенных экстрактах клеток (Owens & Haley, 1987; Atherton et al., 1985). 2- и 8-азидонуклеотиды также были использованы для картирования нуклеотид-связывающих доменов очищенных белков (Khatoon et al., 1989; King et al., 1989 и Dholakia et al., 1989) и могут быть использованы в качестве антителосвязывающих агентов.Molecules containing azido groups can also be used to form covalent bonds with proteins through reactive nitrene intermediates, which are formed by exposure to low-intensity ultraviolet radiation (Potter & Haley, 1983). In particular, 2- and 8-azido analogs of purine nucleotides have been used as site-directed photoprobes to identify nucleotide-binding proteins in crude cell extracts (Owens & Haley, 1987; Atherton et al., 1985). 2- and 8-azidonucleotides have also been used to map the nucleotide-binding domains of purified proteins (Khatoon et al., 1989; King et al., 1989 and Dholakia et al., 1989) and can be used as antibody binding agents.

В других вариантах реализации настоящего изобретения связывающиеся с CD37 агенты (например, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты) или вторичные связывающие агенты являются радиоактивно мечеными нуклидами, такими как тритий. В дополнительных вариантах реализации применяют наночастицы золота (такие как размером от приблизительно 0,5 до 40 нм) и/или квантовые точки (Quantum Dots) (Хейвард, Калифорния).In other embodiments of the present invention, the CD37 binding agents (eg, antibodies and antigen binding fragments thereof) or secondary binding agents are radiolabeled nuclides, such as tritium. Additional embodiments employ gold nanoparticles (such as those ranging in size from about 0.5 to 40 nm) and/or quantum dots (Hayward, Calif.).

В некоторых вариантах реализации CD37 обнаруживают с использованием реагента Optiview DAB IHC Detection reagent (каталог Ventana # 760-700).In some embodiments, CD37 is detected using the Optiview DAB IHC Detection reagent (Ventana catalog #760-700).

В некоторых вариантах реализации CD37 обнаруживают с использованием системы окрашивания BenchMark Ultra.In some embodiments, CD37 is detected using the BenchMark Ultra staining system.

В некоторых вариантах реализации CD37 обнаруживают с использованием системы окрашивания BenchMark Ultra с применением реагента Optiview DAB IHC Detection reagent (каталог VentanaIn some embodiments, CD37 is detected using the BenchMark Ultra staining system using the Optiview DAB IHC Detection reagent (Ventana catalog

- 36 044601 # 760-700).- 36 044601 # 760-700).

VIII. Композиции и наборы.VIII. Compositions and sets.

Также в настоящем описании предложены композиции и наборы для применения в практическом осуществлении способов, раскрытых в настоящем описании. Такие наборы могут содержать емкости, каждая из которых содержит один или более различных реагентов (обычно в концентрированной форме), используемых в указанных способах, включая, например, один или более связывающихся с CD37 агентов (например, антител или их антигенсвязывающих фрагментов), буферы и/или реагенты и оборудование для обнаружения CD37 для обеспечения практического применения настоящего изобретения. Набор может дополнительно содержать второй связывающий агент, который связывается со связывающимся с CD37 агентом, и необязательно третий связывающий агент, который связывается со вторым связывающим агентом. Связывающийся с CD37 агент, второй связывающий агент или третий связывающий агент могут быть связаны с реагентом для детекции или набор может содержать реагенты для присоединения реагента для детекции к связывающемуся с CD37 агенту, второму связывающему агенту или третьему связывающему агенту. Описание метки или индикатора или набор инструкций по применению компонентов набора в способе обнаружения лиганда согласно настоящему изобретению обычно также будут включены, причем инструкции могут содержаться в листке-вкладыше и/или на упаковке набора или его компонентов.Also provided herein are compositions and kits for use in the practice of the methods disclosed herein. Such kits may contain containers, each of which contains one or more different reagents (usually in concentrated form) used in these methods, including, for example, one or more CD37 binding agents (for example, antibodies or antigen-binding fragments thereof), buffers and /or CD37 detection reagents and equipment to enable the practical application of the present invention. The kit may further comprise a second binding agent that binds to the CD37 binding agent, and optionally a third binding agent that binds to the second binding agent. The CD37 binding agent, the second binding agent, or the third binding agent may be coupled to the detection reagent, or the kit may contain reagents for coupling the detection reagent to the CD37 binding agent, the second binding agent, or the third binding agent. A description of the label or indicator or a set of instructions for use of the kit components in the ligand detection method of the present invention will also typically be included, which instructions may be contained in the package insert and/or on the packaging of the kit or its components.

В некоторых вариантах реализации набор содержит первое антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который связывается с CD37, второе антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который связывается с первым антителом или антигенсвязывающим фрагментом, третье антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который связывается со вторым антителом или антигенсвязывающим фрагментом, где указанное третье антитело или антигенсвязывающий фрагмент связано/связан с реагентом для детекции (например, ферментной меткой), необязательно субстрат для реагента для детекции (например, ТМВ, DAB или ABTS) и необязательно белок CD37 или образец клеток, содержащий CD37 (например, залитый парафином образец). Наборы могут дополнительно содержать терапевтический агент для лечения рака, такой как иммуноконъюгат к CD37.In some embodiments, the kit comprises a first antibody or antigen binding fragment that binds to CD37, a second antibody or antigen binding fragment that binds to the first antibody or antigen binding fragment, a third antibody or antigen binding fragment that binds to the second antibody or antigen binding fragment, wherein said third an antibody or antigen binding fragment is/is bound to a detection reagent (e.g., an enzyme tag), optionally a substrate for a detection reagent (e.g., TMB, DAB, or ABTS), and optionally a CD37 protein or a cell sample containing CD37 (e.g., a paraffin-embedded sample) . The kits may further contain a therapeutic agent for the treatment of cancer, such as an anti-CD37 immunoconjugate.

В одном из вариантов реализации связывающийся с CD37 агент представляет собой 1В11-2 или его антигенсвязывающий фрагмент. В одном из вариантов реализации связывающийся с CD37 агент представляет собой антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который связывается с тем же эпитопом CD37, что и 1В11-2. В одном из вариантов реализации связывающийся с CD37 агент представляет собой антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который содержит шесть участков CDR 1B11-2.In one embodiment, the CD37 binding agent is 1B11-2 or an antigen binding fragment thereof. In one embodiment, the CD37 binding agent is an antibody or antigen binding fragment that binds to the same CD37 epitope as 1B11-2. In one embodiment, the CD37 binding agent is an antibody or antigen binding fragment that contains six CDR 1B11-2 regions.

В одном из вариантов реализации связывающийся с CD37 агент представляет собой антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который содержит VH и VL 1В11-2.In one embodiment, the CD37 binding agent is an antibody or antigen binding fragment that contains VH and VL 1B11-2.

В одном из вариантов реализации специфичное к CD37 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрации от приблизительно 0,1 до приблизительно 20 мкг/мл, от приблизительно 0,1 до приблизительно 15 мкг/мл, от приблизительно 0,1 до приблизительно 10 мкг/мл, от приблизительно 0,5 до приблизительно 20 мкг/мл, от приблизительно 0,5 до приблизительно 15 мкг/мл, от приблизительно 0,5 до приблизительно 10 мкг/мл, от приблизительно 1 до приблизительно 20 мкг/мл, от приблизительно 1 до приблизительно 15 мкг/мл, от приблизительно 1 до приблизительно 10 мкг/мл, от приблизительно 2 до приблизительно 20 мкг/мл, от приблизительно 2 до приблизительно 15 мкг/мл или от приблизительно 2 до приблизительно 10 мкг/мл.In one embodiment, the CD37-specific antibody or antigen-binding fragment thereof is included at a concentration of about 0.1 to about 20 μg/ml, about 0.1 to about 15 μg/ml, about 0.1 to about 10 μg/ml ml, from about 0.5 to about 20 μg/ml, from about 0.5 to about 15 μg/ml, from about 0.5 to about 10 μg/ml, from about 1 to about 20 μg/ml, from about 1 to about 15 μg/ml, about 1 to about 10 μg/ml, about 2 to about 20 μg/ml, about 2 to about 15 μg/ml, or about 2 to about 10 μg/ml.

В другом варианте реализации специфичное к CD37 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрации приблизительно 1,5 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, приблизительно 6 мкг/мл, приблизительно 7 мкг/мл, приблизительно 8 мкг/мл, приблизительно 9 мкг/мл или приблизительно 10 мкг/мл. В другом варианте реализации специфичное к CD37 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрации приблизительно 2 мкг/мл. В другом варианте реализации специфичное к CD37 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрации приблизительно 10 мкг/мл.In another embodiment, the CD37-specific antibody or antigen binding fragment thereof is included at a concentration of about 1.5 μg/ml, about 2 μg/ml, about 3 μg/ml, about 4 μg/ml, about 5 μg/ml, about 6 μg /ml, approximately 7 μg/ml, approximately 8 μg/ml, approximately 9 μg/ml, or approximately 10 μg/ml. In another embodiment, the CD37-specific antibody or antigen binding fragment thereof is included at a concentration of approximately 2 μg/ml. In another embodiment, the CD37-specific antibody or antigen binding fragment thereof is included at a concentration of approximately 10 μg/ml.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрированный раствор с инструкциями по разведению для достижения конечной концентрации от приблизительно 1 до приблизительно 20 мкг/мл, от приблизительно 1 до приблизительно 15 мкг/мл, от приблизительно 1 до приблизительно 10 мкг/мл, от приблизительно 2 до приблизительно 20 мкг/мл, от приблизительно 2 до приблизительно 15 мкг/мл или от приблизительно 2 до приблизительно 10 мкг/мл.In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof is included in a concentrated solution with dilution instructions to achieve a final concentration of about 1 to about 20 μg/ml, about 1 to about 15 μg/ml, about 1 to about 10 μg/ml , from about 2 to about 20 μg/ml, from about 2 to about 15 μg/ml, or from about 2 to about 10 μg/ml.

В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрированный раствор с инструкциями по разведению для достижения конечной концентрации приблизительно 1,5 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, приблизительно 6 мкг/мл, приблизительно 7 мкг/мл, приблизительно 8 мкг/мл, приблизительно 9 мкг/мл или приблизительно 10 мкг/мл. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрированный раствор с инструкциями по разведению для достижения конечной концентрации приблизительно 2 мкг/мл. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрированный раствор с инструкIn another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof is included in a concentrated solution with dilution instructions to achieve a final concentration of about 1.5 μg/ml, about 2 μg/ml, about 3 μg/ml, about 4 μg/ml, about 5 μg /ml, approximately 6 μg/ml, approximately 7 μg/ml, approximately 8 μg/ml, approximately 9 μg/ml, or approximately 10 μg/ml. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof is included in a concentrated solution with dilution instructions to achieve a final concentration of approximately 2 μg/ml. In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof is included in a concentrated solution with instructions

- 37 044601 циями по разведению для достижения конечной концентрации приблизительно 2,1 мкг/мл. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрированный раствор с инструкциями по разведению для достижения конечной концентрации приблизительно 4,2 мкг/мл. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрированный раствор с инструкциями по разведению для достижения конечной концентрации приблизительно 8,4 мкг/мл. В другом варианте реализации антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включены в концентрированный раствор с инструкциями по разведению для достижения конечной концентрации приблизительно 10 мкг/мл. Набор может также содержать инструкции по обнаружению и оценке экспрессии CD37. Набор может также содержать контрольные или эталонные образцы. Неограничивающие примеры контрольных или эталонных образцов включают осадки клеток или линии клеток культуры тканей, полученные из нормальных (нормальный контроль) или опухолевых (положительный контроль) образцов. Иллюстративные линии клеток включают линии клеток, стабильно или временно трансфицированные вектором экспрессии, который экспрессирует CD37. Дополнительные примеры включают осадки клеток и образцы тканей, описанные в примерах. Положительные линии клеток включают клетки Дауди (высокая экспрессия), клетки Ramos (умеренная экспрессия) и клетки Намальвы (от умеренной до низкой экспрессии). Миндалина человека служит как положительной, так и отрицательной контрольной тканью, поскольку зародышевые центры и мантийные зоны демонстрируют высокую экспрессию, а межфолликулярная область демонстрирует отсутствие экспрессии. В некоторых вариантах реализации контрольные или эталонные образцы представляют собой залитые парафином образцы.- 37 044601 dilutions to achieve a final concentration of approximately 2.1 µg/ml. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof is included in a concentrated solution with dilution instructions to achieve a final concentration of approximately 4.2 μg/ml. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof is included in a concentrated solution with dilution instructions to achieve a final concentration of approximately 8.4 μg/ml. In another embodiment, the antibody or antigen binding fragment thereof is included in a concentrated solution with dilution instructions to achieve a final concentration of approximately 10 μg/ml. The kit may also contain instructions for detecting and assessing CD37 expression. The kit may also contain control or reference samples. Non-limiting examples of control or reference samples include cell pellets or tissue culture cell lines derived from normal (normal control) or tumor (positive control) samples. Exemplary cell lines include cell lines stably or transiently transfected with an expression vector that expresses CD37. Additional examples include cell pellets and tissue samples described in the examples. Positive cell lines include Daudi cells (high expression), Ramos cells (moderate expression), and Namalwa cells (moderate to low expression). The human amygdala serves as both a positive and negative control tissue, with germinal centers and pallial zones showing high expression and the interfollicular region showing no expression. In some embodiments, the control or reference samples are paraffin-embedded samples.

В некоторых вариантах реализации набор представляет собой упакованную комбинацию, включающую основные элементы: (а) захватывающие реагенты, состоящие из моноклональных антител против CD37 человека; и (b) реагенты, которые также могут содержать моноклональные антитела к CD37, но могут также содержать обнаруживаемые (меченые или немеченые) антитела, которые связываются с CD37. Эти основные элементы определены в настоящем описании.In some embodiments, the kit is a packaged combination comprising the core elements of: (a) capture reagents consisting of anti-human CD37 monoclonal antibodies; and (b) reagents, which may also contain monoclonal antibodies to CD37, but may also contain detectable (labeled or unlabeled) antibodies that bind to CD37. These basic elements are defined herein.

В одном из вариантов реализации набор дополнительно содержит твердый носитель для захватывающих реагентов, который может быть представлен в виде отдельного элемента или на котором захватывающие реагенты уже иммобилизованы. Следовательно, захватывающие антитела в наборе могут быть иммобилизованы на твердом носителе или они могут быть иммобилизованы на таком носителе, который включен в набор или предоставляется отдельно от набора.In one embodiment, the kit further comprises a solid carrier for the capture reagents, which may be provided as a separate element or on which the capture reagents are already immobilized. Therefore, the capture antibodies in the kit may be immobilized on a solid support, or they may be immobilized on such a support that is included in the kit or provided separately from the kit.

В одном из вариантов реализации захватывающий реагент наносят на планшет для микротитрования. Реагент для детекции может представлять собой меченые антитела, обнаруживаемые непосредственно, или немеченые антитела, которые обнаруживают с помощью меченых антител, направленных против немеченых антител, полученных от других видов. В случае, когда метка представляет собой фермент, набор будет обычно содержать субстраты и кофакторы, необходимые для фермента, а в случае, когда метка представляет собой флуорофор - предшественник красителя, который обеспечивает обнаруживаемый хромофор. В случае, когда реагент для детекции является немеченым, набор может дополнительно содержать средство для обнаружения обнаруживаемых антител, такое как меченые антитела, направленные на немеченые антитела, например, во флуориметрически обнаруживаемой форме. В случае, когда метка представляет собой фермент, набор будет обычно содержать субстраты и кофакторы, необходимые для фермента, когда метка представляет собой флуорофор предшественник красителя, который обеспечивает обнаруживаемый хромофор, а когда метка представляет собой биотин - авидин, такой как авидин, стрептавидин или стрептавидин, конъюгированный с ПХ или α-галактозидазой совместно с 4метилумбеллиферил-бета-О-глюкуронидом (MUG).In one embodiment, the capture reagent is applied to a microtiter plate. The detection reagent may be labeled antibodies that are detected directly, or unlabeled antibodies that are detected using labeled antibodies directed against unlabeled antibodies obtained from other species. In the case where the label is an enzyme, the kit will typically contain the substrates and cofactors required for the enzyme, and in the case where the label is a fluorophore, a precursor dye that provides the detectable chromophore. In the case where the detection reagent is unlabeled, the kit may further contain an agent for detecting detectable antibodies, such as labeled antibodies directed to unlabeled antibodies, for example, in a fluorimetrically detectable form. In the case where the tag is an enzyme, the kit will typically contain the substrates and cofactors required for the enzyme, when the tag is a dye precursor fluorophore that provides a detectable chromophore, and when the tag is a biotin-avidin such as avidin, streptavidin or streptavidin , conjugated to HRP or α-galactosidase together with 4methylumbelliferyl-beta-O-glucuronide (MUG).

В одном из вариантов реализации захватывающий реагент представляет собой антитело 1В11-2 к CD37 или антитело, содержащее последовательности антитела 1В11-2. В одном из вариантов реализации реагент для детекции представляет собой антитело 1В11-2 к CD37 или антитело, содержащее последовательности антитела 1В11-2. В другом варианте реализации реагент для детекции 1В11-2 антитело к CD37 или антитело, содержащее последовательности антитела 1В11-2, является биотинилированным.In one embodiment, the capture reagent is an anti-CD37 antibody 1B11-2 or an antibody comprising sequences from the 1B11-2 antibody. In one embodiment, the detection reagent is an anti-CD37 antibody 1B11-2 or an antibody comprising sequences from the 1B11-2 antibody. In another embodiment, the 1B11-2 anti-CD37 detection reagent or an antibody comprising 1B11-2 antibody sequences is biotinylated.

В другом варианте реализации набор дополнительно содержит реагент для детекции, выбранный из группы, состоящей из фермента, флуорофора, радиоактивной метки и люминофора. В другом варианте реализации реагент для детекции выбран из группы, состоящей из биотина, дигоксигенина, флуоресцеина, трития и родамина. Набор может также содержать инструкции по проведению анализа и/или белок CD37 или его фрагменты (например, внеклеточный домен CD37 или внеклеточный домен CD37 с полным доменом связывания GPI или его частью) в качестве стандарта антигена, а также другие добавки, такие как стабилизаторы, буферы для промывки и инкубирования и т.п. В одном из вариантов реализации стандарт антигена CD37 представляет собой белок CD37, описанный в примерах в настоящем документе. Набор может также содержать инструкции по обнаружению и оценке экспрессии CD37. Компоненты набора могут быть представлены в заранее определенных соотношениях, при этом соответствующие количества различных реагентов подходящим образом варьируют для обеспечения концентраций реагентов в растворе, которые существенно усиливают чувствительность анализа. В частности, реагенты могут быть представлены в виде сухих порошков, обычно лиофилизированных, включая вспомогательные вещества, которые при растворении будут обеспечивать раствор реагента, имеющий подходящуюIn another embodiment, the kit further comprises a detection reagent selected from the group consisting of an enzyme, a fluorophore, a radiolabel, and a phosphor. In another embodiment, the detection reagent is selected from the group consisting of biotin, digoxigenin, fluorescein, tritium and rhodamine. The kit may also contain assay instructions and/or CD37 protein or fragments thereof (e.g., CD37 extracellular domain or CD37 extracellular domain with all or part of the GPI binding domain) as the antigen standard, as well as other additives such as stabilizers, buffers for washing and incubation, etc. In one embodiment, the CD37 antigen standard is the CD37 protein described in the examples herein. The kit may also contain instructions for detecting and assessing CD37 expression. The components of the kit can be presented in predetermined ratios, with the respective amounts of the various reagents suitably varied to provide concentrations of reagents in solution that significantly enhance the sensitivity of the assay. In particular, the reagents may be provided in the form of dry powders, usually lyophilized, including excipients which, when dissolved, will provide a reagent solution having a suitable

- 38 044601 концентрацию для соединения с исследуемым образцом. Также предложены композиции, содержащие антитела или антигенсвязывающие фрагменты, описанные в настоящем описании. В одном из вариантов реализации композиция содержит антитело к CD37 или антигенсвязывающий фрагмент, описанные в настоящем описании, и буфер, например буфер, который может быть применен в анализе на обнаружение, таком как ИГХ, ELISA или FACS. Такие буферы известны средним специалистам в данной области техники и включают разбавители. В качестве примера, буферы для ИГХ могут содержать, например, казеин, сыворотку или альбумин (такие как телячья сыворотка, сыворотка козла или БСА), Tween или тритон, ФСБ и/или азид натрия или любое их сочетание. Буферы для ИГХ также предложены в настоящем описании и известны средним специалистам в данной области техники. Буферы для ELISA также предложены в настоящем описании и известны средним специалистам в данной области техники. Буферы для ELISA могут содержать, например, сыворотку или альбумин (такие как телячья сыворотка, сыворотка козла или БСА), обезжиренное сухое молоко, казеин и/или желатин или любое их сочетание. Некоторые буферы для FACS предложены в настоящем описании, например, в рабочих примерах. Буферы для FACS также могут содержать, например, сыворотку или альбумин (такие как телячья сыворотка, сыворотка козла или БСА) и/или азид натрия. Буферы для FACS также могут содержать ФСБ, ЭДТА и/или ДНКазу или любое их сочетание.- 38 044601 concentration for connection with the test sample. Also provided are compositions containing antibodies or antigen-binding fragments described herein. In one embodiment, the composition comprises an anti-CD37 antibody or antigen binding fragment as described herein and a buffer, for example a buffer that can be used in a detection assay such as IHC, ELISA or FACS. Such buffers are known to those of ordinary skill in the art and include diluents. By way of example, IHC buffers may contain, for example, casein, whey or albumin (such as bovine serum, goat serum or BSA), Tween or Triton, PBS and/or sodium azide, or any combination thereof. Buffers for IHC are also provided herein and are known to those of ordinary skill in the art. ELISA buffers are also provided herein and are known to those of ordinary skill in the art. ELISA buffers may contain, for example, whey or albumin (such as bovine serum, goat serum or BSA), nonfat dry milk, casein and/or gelatin, or any combination thereof. Some buffers for FACS are proposed herein, for example in the working examples. FACS buffers may also contain, for example, serum or albumin (such as bovine serum, goat serum or BSA) and/or sodium azide. FACS buffers may also contain PBS, EDTA and/or DNase or any combination thereof.

Варианты реализации согласно настоящему описанию могут быть дополнительно определены посредством ссылки на следующие неограничивающие примеры, которые подробно описывают получение некоторых антител согласно настоящему описанию и способов применения антител согласно настоящему описанию. Специалистам в данной области техники будет очевидно, что многие модификации как материалов, так и способов могут быть осуществлены на практике без отклонения от объема настоящего описания.Embodiments according to the present description can be further defined by reference to the following non-limiting examples, which describe in detail the preparation of certain antibodies according to the present description and methods of using the antibodies according to the present description. It will be apparent to those skilled in the art that many modifications to both the materials and methods may be practiced without departing from the scope of the present disclosure.

IX. Примеры.IX. Examples.

Понятно, что примеры и варианты реализации, описанные в настоящем документе, предназначены только для иллюстративных целей и что специалистам в данной области техники будут предложены различные модификации или изменения в свете этого, и такие модификации или изменения должны быть включены в сущность и объем настоящей заявки.It is understood that the examples and embodiments described herein are for illustrative purposes only and that various modifications or changes will be suggested to those skilled in the art in light thereof, and such modifications or changes are intended to be included within the spirit and scope of this application.

Пример 1. Получение гибридом CD37.Example 1. Preparation of CD37 hybridoma.

Гибридомы, продуцирующие моноклональные антитела к CD37 человека, которые подходят для иммуногистохимического (ИГХ) окрашивания (антитела согласно настоящему описанию), были выбраны приблизительно из 4800 гибридом. Гибридомы получали иммунизацией мышей Balb/c дикого типа рекомбинантным антигеном CD37 hCD37-LEL, полученным в Е. coli. Этот антиген содержит аминокислоты со 107 по 242 CD37 с 6χHis-меткой, добавленной к 3'-концу для облегчения очистки (SEQ ID NO: 15). Иммунизацию рекомбинантным белком CD37 проводили посредством подкожной инъекции белка, эмульгированного в полном адъюванте Фрейнда (CFA) или неполном адъюванте Фрейнда для стимуляции (Sigma) или адъюванте для мышей Magic mouse adjuvant (Creative Diagnostics). Как правило, мышей иммунизировали пять раз с интервалом в две недели до получения окончательной стимуляции посредством внутрибрюшинной инъекции иммунизирующего вещества за три дня до слияния. Всего было проведено 5 независимых слияний с использованием клеток селезенки, которые были получены от иммунизированных мышей Balb/c дикого типа и клеток мышиной миеломы P3X63Ag8.653 (клетки Р3). Слияние клеток проводили с использованием инструмента для электрослияния ЕСМ200 (ВТХ Harvard Apparatus) в соответствии со стандартными протоколами. Каждое слияние приводило к образованию более 1000 гибридом.Hybridomas producing monoclonal antibodies to human CD37 that are suitable for immunohistochemical (IHC) staining (antibodies as described herein) were selected from approximately 4800 hybridomas. Hybridomas were generated by immunizing wild-type Balb/c mice with the recombinant CD37 antigen hCD37-LEL derived from E. coli. This antigen contains amino acids 107 to 242 of CD37 with a 6χHis tag added to the 3' end to facilitate purification (SEQ ID NO: 15). Immunization with recombinant CD37 protein was performed by subcutaneous injection of the protein emulsified in complete Freund's adjuvant (CFA) or incomplete Freund's adjuvant for stimulation (Sigma) or Magic mouse adjuvant (Creative Diagnostics). Typically, mice were immunized five times at two-week intervals before receiving a final challenge by intraperitoneal injection of the immunizing agent three days before fusion. A total of 5 independent fusions were performed using spleen cells that were obtained from immunized wild-type Balb/c mice and P3X63Ag8.653 murine myeloma cells (P3 cells). Cell fusion was performed using the ECM200 electrofusion instrument (BTX Harvard Apparatus) according to standard protocols. Each fusion resulted in the formation of more than 1000 hybridomas.

Антитела, продуцируемые этими гибридомами, подвергали скринингу и подтверждали с помощью ELISA с использованием различных рекомбинантных версий антигена CD37. hCD37-LEL содержит аминокислоты со 107 по 242 CD37 человека с 6xHis-меткой, добавленной к 3'-концу для облегчения очистки (SEQ ID NO: 15), и было получено в Е. coli. hCD37-Fc-LAGA содержит аминокислоты со 107 по 235 CD37 человека с Fc-доменом IgG1 человека, добавленным к 3'-концу для облегчения очистки (SEQ ID NO: 17), и было получено в клетках HEK-293T. hCD37-ECD-Fc содержит аминокислоты со 107 по 235 CD37 человека с Fc-доменом IgG2a мыши, добавленным к 3'-концу для облегчения очистки (SEQ ID NO: 16), и было получено в клетках HEK-293T.Antibodies produced by these hybridomas were screened and confirmed by ELISA using different recombinant versions of the CD37 antigen. hCD37-LEL contains amino acids 107 to 242 of human CD37 with a 6xHis tag added to the 3' end to facilitate purification (SEQ ID NO: 15) and was produced in E. coli. hCD37-Fc-LAGA contains amino acids 107 to 235 of human CD37 with the human IgG1 Fc domain added to the 3' end to facilitate purification (SEQ ID NO: 17) and was produced in HEK-293T cells. hCD37-ECD-Fc contains amino acids 107 to 235 of human CD37 with the mouse IgG2a Fc domain added to the 3' end to facilitate purification (SEQ ID NO: 16) and was produced in HEK-293T cells.

Для создания нативных условий рекомбинантные белки разводили непосредственно в 50 мМ натрий-бикарбонатном буфере для сорбции (Sigma-Aldrich). Для создания денатурирующих условий рекомбинантные белки инкубировали в 1% додецилсульфате натрия (ДСН) с 50 мМ дитиотреитолом (ДТТ) в течение 30 мин при 65°С с последующим инкубированием со 100 мМ иодацетамидом в течение 30 минут при комнатной температуре и затем разводили в 50 мМ натрий-бикарбонатном буфере для сорбции. Каждый рекомбинантный белок иммобилизовали в концентрации приблизительно 25-100 нг/лунку в планшетах для микротитрования путем инкубирования в течение ночи при 4°С.To create native conditions, recombinant proteins were diluted directly in 50 mM sodium bicarbonate sorption buffer (Sigma-Aldrich). To create denaturing conditions, recombinant proteins were incubated in 1% sodium dodecyl sulfate (SDS) with 50 mM dithiothreitol (DTT) for 30 min at 65°C, followed by incubation with 100 mM iodoacetamide for 30 min at room temperature and then diluted in 50 mM sodium bicarbonate buffer for sorption. Each recombinant protein was immobilized at a concentration of approximately 25-100 ng/well in microtiter plates by incubating overnight at 4°C.

Планшеты промывали один раз ФСБ с добавлением 0,05% Tween-20 и блокировали ФСБ с добавлением 1% бычьего сывороточного альбумина (БСА). Планшеты промывали три раза ФСБ с добавлением 0,05% Tween-20 и добавляли в планшеты супернатанты гибридом. Планшеты инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре, промывали три раза, как описано выше, и инкубировали с меченым ПХThe plates were washed once with PBS supplemented with 0.05% Tween-20 and blocked with PBS supplemented with 1% bovine serum albumin (BSA). The plates were washed three times with PBS supplemented with 0.05% Tween-20, and hybridoma supernatants were added to the plates. The plates were incubated for 1 hour at room temperature, washed three times as described above, and incubated with labeled HRP

- 39 044601 вторичным антителом козла к IgG мыши (Jackson ImmunoResearch, разведение 1:5000) в течение 1 ч при комнатной температуре. Планшеты промывали три раза, как описано выше, и обнаруживали связавшееся конъюгированное с ПХ антитело посредством добавления субстрата ПХ ТМВ (Bio-FX). Планшеты инкубировали в течение приблизительно 10 мин и затем развитие окрашивания останавливали добавлением останавливающего раствора (Bio-FX). Для каждого планшета измеряли поглощение при длине волны 450 нм с помощью микропланшетного спектрофотометра. Супернатант гибридомы от 1В11 обусловливал сильный положительный сигнал ELISA как в нативных, так и в денатурирующих условиях (см. фиг. 1А) и был выбран для субклонирования. Из клона 1B11 были получены два субклона: 1В11-2 и 1В11-20. Супернатант гибридомы от обоих субклонов обусловливал сильный положительный сигнал ELISA как в нативных, так и в денатурирующих условиях (см. фиг. 1В), и клон 1В11-2 был выбран для дополнительного анализа.- 39 044601 goat anti-mouse IgG secondary antibody (Jackson ImmunoResearch, dilution 1:5000) for 1 hour at room temperature. The plates were washed three times as described above, and bound HRP-conjugated antibody was detected by adding the HRP substrate TMB (Bio-FX). The plates were incubated for approximately 10 minutes and then color development was stopped by adding stopping solution (Bio-FX). For each plate, absorbance was measured at 450 nm using a microplate spectrophotometer. The hybridoma supernatant from 1B11 produced a strong positive ELISA signal under both native and denaturing conditions (see Fig. 1A) and was selected for subcloning. From clone 1B11, two subclones were obtained: 1B11-2 and 1B11-20. Hybridoma supernatant from both subclones produced a strong positive ELISA signal under both native and denaturing conditions (see Fig. 1B), and clone 1B11-2 was selected for additional analysis.

Пример 2. Определение характеристик антител к CD37 посредством ELISA.Example 2 Characterization of anti-CD37 antibodies by ELISA.

Антитело из 1В11-2 очищали с использованием стандартной хроматографии на белке А. Для сравнения использовали антитело к CD37, реализуемое Leica Biosystems (код продукта NCL-CD37). Связывание антител к CD37 исследовали с помощью ELISA с рекомбинантными белками CD37 в качестве антигена. Каждый рекомбинантный белок иммобилизовали в концентрации приблизительно 25-100 нг/лунку в планшетах для микротитрования в натрий-бикарбонатном буфере для сорбции (SigmaAldrich) с использованием либо нативных, либо денатурирующих условий, как описано выше. Планшеты промывали один раз ФСБ с добавлением 0,05% Tween-20 и блокировали ФСБ с добавлением 1% бычьего сывороточного альбумина (БСА). Планшеты промывали три раза ФСБ с добавлением 0,05% Tween-20 и добавляли в планшеты очищенные антитела. Планшеты инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре, промывали три раза, как описано выше, и инкубировали с меченым ПХ вторичным антителом козла к IgG мыши (Jackson ImmunoResearch, разведение 1:5000) в течение 1 ч при комнатной температуре. Планшеты промывали три раза, как описано выше, и обнаруживали связавшееся конъюгированное с ПХ антитело посредством добавления субстрата ПХ (Bio-FX). Планшеты инкубировали в течение приблизительно 10 минут и затем развитие окрашивания останавливали добавлением останавливающего раствора (Bio-FX). Для каждого планшета измеряли поглощение при длине волны 450 нм с помощью микропланшетного спектрофотометра. Характерные результаты связывания с нативными hCD37-Fc-LAGA и hCD37-LEL приведены на фиг. 2. Антитело 1В11-2 связывается с обоими нативными белками CD37 со значительно улучшенной аффинностью по сравнению с NCL-CD37. Результаты связывания с денатурированным белком hCD37-LEL приведены на фиг. 3. Антитело 1В11-2 связывается с денатурированным белком hCD37-LEL со значительно улучшенной аффинностью по сравнению с NCL-CD37.Antibody from 1B11-2 was purified using standard Protein A chromatography. An anti-CD37 antibody available from Leica Biosystems (product code NCL-CD37) was used for comparison. The binding of anti-CD37 antibodies was examined by ELISA with recombinant CD37 proteins as the antigen. Each recombinant protein was immobilized at a concentration of approximately 25-100 ng/well in microtiter plates in sodium bicarbonate adsorption buffer (SigmaAldrich) using either native or denaturing conditions as described above. The plates were washed once with PBS supplemented with 0.05% Tween-20 and blocked with PBS supplemented with 1% bovine serum albumin (BSA). The plates were washed three times with PBS supplemented with 0.05% Tween-20, and purified antibodies were added to the plates. The plates were incubated for 1 h at room temperature, washed three times as described above, and incubated with HRP-labeled goat anti-mouse IgG secondary antibody (Jackson ImmunoResearch, dilution 1:5000) for 1 h at room temperature. The plates were washed three times as described above, and bound HRP-conjugated antibody was detected by adding HRP substrate (Bio-FX). The plates were incubated for approximately 10 minutes and then color development was stopped by adding stopping solution (Bio-FX). For each plate, absorbance was measured at 450 nm using a microplate spectrophotometer. Representative binding results with native hCD37-Fc-LAGA and hCD37-LEL are shown in FIG. 2. Antibody 1B11-2 binds to both native CD37 proteins with significantly improved affinity compared to NCL-CD37. The binding results with denatured hCD37-LEL protein are shown in FIG. 3. Antibody 1B11-2 binds to the denatured hCD37-LEL protein with significantly improved affinity compared to NCL-CD37.

Пример 3. Определение характеристик эпитопа антигена.Example 3 Determination of antigen epitope characteristics.

Связывание антител к CD37 дополнительно исследовали с помощью ELISA с рекомбинантным белком CD37 hCD37-ECD-S2-Fc, используемым в качестве антигена в нативных условиях, как описано выше. (S2 относится ко второму сегменту большого внеклеточного домена CD37, содержащего аминокислоты со 138 по 176). Характерные результаты приведены на фиг. 4. hCD37-ECD-S2-Fc содержит аминокислоты со 107 по 109 и со 138 по 235 CD37 человека с Fc-доменом IgG2a мыши, добавленным к 3'-концу для облегчения очистки (SEQ ID NO: 18), и был получен в клетках HEK-293T. Антитело 1В11-2 не связывается с hCD37-ECD-S2-Fc, в то время как NCL-CD37 сохраняет способность к связыванию с этим фрагментом белка CD37. Похожие результаты наблюдали при анализе методом вестерн-блоттинга.The binding of anti-CD37 antibodies was further examined by ELISA with the recombinant CD37 protein hCD37-ECD-S2-Fc used as the antigen under native conditions as described above. (S2 refers to the second segment of the large extracellular domain of CD37, containing amino acids 138 to 176). Typical results are shown in Fig. 4. hCD37-ECD-S2-Fc contains amino acids 107 to 109 and 138 to 235 of human CD37 with the mouse IgG2a Fc domain added to the 3' end to facilitate purification (SEQ ID NO: 18) and was prepared in HEK-293T cells. Antibody 1B11-2 does not bind to hCD37-ECD-S2-Fc, while NCL-CD37 retains the ability to bind to this fragment of the CD37 protein. Similar results were observed when analyzed by Western blotting.

Пример 4. Иммуногистохимическая оценка антител к CD37 FFPE CD37 ИГХ.Example 4. Immunohistochemical evaluation of antibodies to CD37 FFPE CD37 IHC.

Очищенное антитело из клона 1В11-2 анализировали и сравнивали с моноклональным антителом мыши NCL-CD37 (Leica) с помощью ИГХ. Анализ проводили с использованием автоматизированного приспособления для окрашивания Leica Bond RX и реагентов и условий, перечисленных в табл. 1.Purified antibody from clone 1B11-2 was analyzed and compared with the mouse monoclonal antibody NCL-CD37 (Leica) by IHC. The analysis was performed using a Leica Bond RX automated stainer and the reagents and conditions listed in Table. 1.

Таблица 1Table 1

Реагенты для ИГХ и условия анализаIHC reagents and assay conditions

Стадия Stage Действие/Реагент (Vendor) Action/Reagent (Vendor) Время Time Сушка Drying Температура: 6О°С Temperature: 6°C 30 минут 30 minutes Депарафинизация Dewaxing раствор Bond Dewax Solution (Leica), 100% этанол чистый для анализа (Arantik) Bond Dewax Solution (Leica), 100% pure ethanol for analysis (Arantik) Установленное Installed Демаскировка антигена Antigen unmasking раствор Bond Epitope Retrieval 1 (цитратный буфер на основе раствора с pH 6,0) Bond Epitope Retrieval 1 solution (citrate buffer based solution with pH 6.0) 20 минут 20 minutes Блокирование эндогенной пероксидазы Blocking endogenous peroxidase Пероксид (Leica) Peroxide (Leica) 5 минут 5 minutes Исследуемый образец Test sample полученные ImmunoGen, Inc. антитела в различных концентрациях, полученные разведением в растворе для разведения антител Leica Antibody Diluent obtained by ImmunoGen, Inc. Antibodies in various concentrations obtained by dilution in Leica Antibody Diluent 15 минут 15 minutes

- 40 044601- 40 044601

Обнаружение Detection реагент Post Primary Regent (Leica) Post Primary Regent (Leica) 8 минут 8 minutes Полимер (Leica) Polymer (Leica) 8 минут 8 minutes Смешанный DAB (Leica) Mixed DAB (Leica) 10 минут 10 minutes Контрастное окрашивание Contrast staining Гематоксилин (Leica) Hematoxylin (Leica) 5 минут 5 minutes

Препараты, содержащие фиксированные в формалине и залитые парафином (FFPE) образцы клеток, нормальные ткани, биоптаты опухолей от пациентов с диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомой, биоптаты опухолей от пациентов с фолликулярной лимфомой и биоптаты опухолей от пациентов с хроническим лимфоцитарным лейкозом/лимфомой из малых лимфоцитов высушивали при 60°С и депарафинизировали с использованием раствора Bond Dewax Solution и 100% этанола. Проводили высокотемпературную демаскировку эпитопа с использованием раствора Bond Epitope Retrieval 1 (цитратный буфер на основе раствора с рН 6,0) в течение 20 мин и блокировали эндогенную пероксидазу пероксидом в течение 5 минут. Препараты инкубировали с полученным ImmunoGen, Inc. антителом 1В11-2, антителом NCL-CD37 (клон СТ1) (Leica/Novocastra) или контрольным антителом muIgG1 (Leica/Novocastra) в различных концентрациях в течение 15 мин. Связанные антитела обнаруживали путем инкубирования с системой обнаружения Leica Bond Refine. После нанесения антител препараты инкубировали с реагентом Post Primary Reagent (IgG кролика к IgG мыши) в течение 8 мин, полимером (полимер козла к IgG кролика) в течение 8 мин и DAB (3,3-диаминобензидина тетрагидрохлорид) в течение 10 мин. Это обеспечивало сигнал коричневого цвета. Проводили контрастное окрашивание препаратов гематоксилином в течение 5 мин.Slides containing formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) cell samples, normal tissues, tumor biopsies from patients with diffuse large B-cell lymphoma, tumor biopsies from patients with follicular lymphoma, and tumor biopsies from patients with chronic lymphocytic leukemia/small lymphoma lymphocytes were dried at 60°C and dewaxed using Bond Dewax Solution and 100% ethanol. High-temperature unmasking of the epitope was carried out using Bond Epitope Retrieval 1 solution (citrate buffer based on a solution with pH 6.0) for 20 minutes and endogenous peroxidase was blocked with peroxide for 5 minutes. The preparations were incubated with the resulting ImmunoGen, Inc. antibody 1B11-2, antibody NCL-CD37 (clone CT1) (Leica/Novocastra) or control antibody muIgG1 (Leica/Novocastra) at various concentrations for 15 min. Bound antibodies were detected by incubation with a Leica Bond Refine detection system. After application of antibodies, the slides were incubated with Post Primary Reagent (rabbit IgG to mouse IgG) for 8 min, polymer (goat polymer to rabbit IgG) for 8 min, and DAB (3,3-diaminobenzidine tetrahydrochloride) for 10 min. This provided a brown signal. The preparations were counterstained with hematoxylin for 5 minutes.

FFPE образцы нормальной ткани селезенки и миндалины получали из блоков тканей человека, полученных от Mercy Health Systems и Ardais Corporation, как указано ниже. FFPE образцы клеток получали из линий клеток Дауди и Ramos, поставляемых DSMZ (Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур), а линия клеток Намальвы была предоставлена Американской коллекцией тканевых культур. Препараты, содержащие срезы образцов, получали из FFPE блоков с использованием микротома, установленного на 5 мкм, и заключали под положительно заряженные предметные стекла. Эти препараты оставляли для сушки на воздухе в течение ночи перед окрашиванием. Микропанели нормальных тканей человека были приобретены у Pantomics, а микропанели тканей неходжкинской лимфомы были приобретены у TriStar Technology Group LLC.FFPE samples of normal spleen and tonsil tissue were obtained from human tissue blocks obtained from Mercy Health Systems and Ardais Corporation as follows. FFPE cell samples were obtained from the Daudi and Ramos cell lines supplied by the DSMZ (German Collection of Microorganisms and Cell Cultures), and the Namalwa cell line was provided by the American Tissue Culture Collection. Slides containing sample sections were prepared from FFPE blocks using a microtome set at 5 μm and mounted under positively charged glass slides. These slides were left to air dry overnight before staining. Human normal tissue micropanels were purchased from Pantomics, and non-Hodgkin's lymphoma tissue micropanels were purchased from TriStar Technology Group LLC.

Таблица 2table 2

FFPE исследуемые образцыFFPE test samples

Тип ткани человека Human tissue type Коммерческий источник Commercial source Нормальная селезенка (2) Normal spleen (2) Mercy Health Systems Mercy Health Systems Нормальная миндалина (3) Normal tonsil (3) Mercy Health Systems (2) and Ardais Corporation (1) Mercy Health Systems (2) and Ardais Corporation (1) Микропанель нормальных тканей Micropanel of normal tissues Pantomics Pantomics Микропанель тканей неходжкинской лимфомы Micropanel of non-Hodgkin's lymphoma tissues Tri Star Technology Group LLC Tri Star Technology Group LLC

Интенсивность окрашивания CD37 и структуру распределения оценивали по сравнению с контрольным окрашиванием IgG (неспецифического), а окрашивание 1В11-2 сравнивали с окрашиванием, наблюдаемым для моноклонального антитела мыши NCL-CD37 (Leica). Интенсивность оценивали по шкале от 0 до 3, где 0 = отсутствие окрашивания, 1 = слабое окрашивание, 2 = умеренное окрашивание и 3 = сильное окрашивание. Равномерность окрашивания оценивали как отрицательную (отсутствие положительно окрашенных клеток), фокальную (<25% окрашенных клеток), гетерогенную (25-75% окрашенных клеток) и гомогенную (>75% окрашенных клеток). Интенсивность окрашивания и шкалы оценки описаны ниже. Все окрашивания были оценены патологом, прошедшим профессиональную сертификацию.CD37 staining intensity and distribution pattern were assessed in comparison with control IgG staining (nonspecific), and 1B11-2 staining was compared with staining observed for the mouse monoclonal antibody NCL-CD37 (Leica). Intensity was graded on a scale from 0 to 3, where 0 = no staining, 1 = weak staining, 2 = moderate staining, and 3 = strong staining. Staining uniformity was graded as negative (no positively stained cells), focal (<25% stained cells), heterogeneous (25–75% stained cells), and homogeneous (>75% stained cells). Staining intensity and grading scales are described below. All stains were evaluated by a board-certified pathologist.

Таблица 3Table 3

Интенсивность и равномерность окрашиванияColor intensity and uniformity

Интенсивность (количество окрашивания мембран) Intensity (amount of membrane staining) 0 0 Отрицательная Negative 1 1 Слабая Weak 2 2 Умеренная Moderate 3 3 Сильная Strong

Равномерность (процент положительных клеток) Uniformity (percentage of positive cells) 0 0 Отрицательная Negative Фокальная Focal <25% <25% Гетерогенная (гетеро) Heterogeneous (hetero) 25-75% 25-75% Г омогенная (гомо) Homogeneous (homo) >75% >75%

Валидация очищенного антитела 1В11-2 для FFPE CD37 ИГХ.Validation of purified antibody 1B11-2 for FFPE CD37 IHC.

Очищенное антитело из клона 1В11-2, разбавленное до концентрации 8,4, 4,2 и 2,1 мкг/мл в раствоPurified antibody from clone 1B11-2, diluted to concentrations of 8.4, 4.2 and 2.1 μg/ml per solution

- 41 044601 ре для разведения антител Leica Antibody Diluent (забуференный трисом солевой раствор, поверхностноактивное вещество и стабилизатор белка с 0,35% ProClin™ 950) использовали для окрашивания CD37положительных контрольных образцов (нормальной миндалины человека, клеток Дауди, клеток Ramos и клеток Намальвы). Антитело оценивали по специфичности к CD37, определяемой приемлемым окрашиванием мембраны и специфичностью в CD37-положительных образцах. Этот клон также сравнивали с МАТ мыши NCL-CD37 (клон СТ1), разбавленным до 4,2 мкг/мл в растворе для разведения антител Leica Antibody Diluent с использованием тех же CD37-положительных ткани и клеток человека. Антитело NCL-CD37 (Leica) обеспечивало приемлемое окрашивание мембран в каждом из CD37-положительных осадков клеток и приемлемое окрашивание мембран в зародышевых центрах и мантийных зонах ткани миндалин (и те, и другие положительны по CD37) наряду в некоторой степени с низким ядерным фоном и отсутствием окрашивания в межфолликулярной области миндалины (отрицательна по CD37). 1В11-2 демонстрировало приемлемое окрашивание мембран в CD37-положительных образцах и хорошую специфичность с дополнительным преимуществом в виде полного отсутствия окрашивания ядерного фона (см. фиг. 5 для сравнения изображений для 1В11-2 и МАТ мыши NCL-CD37 (Leica)). 1B11-2 обеспечивало окрашивание мембран со структурой, аналогичной той, которую наблюдали при применении моноклонального антитела мыши NCL-CD37 (Leica); однако это окрашивание мембран было более специфичным и более четким, чем получаемое при применении антитела NCL-CD37 (Leica). Также важно отметить, что 1В11-2 не приводило к окрашиванию в межфолликулярной области миндалины (отрицательна по экспрессии CD37), что демонстрирует повышенную специфичность. Для 1В11-2 была экспериментально определена подходящая для окрашивания концентрация, составляющая 4,2 мкг/мл.- 41 044601 Leica Antibody Diluent (Tris-buffered saline, surfactant and protein stabilizer with 0.35% ProClin™ 950) was used to stain CD37 positive control samples (normal human tonsil, Daudi cells, Ramos cells and Namalwa cells) . The antibody was assessed for CD37 specificity, as determined by acceptable membrane staining and specificity in CD37-positive samples. This clone was also compared to the mouse mAb NCL-CD37 (clone CT1) diluted to 4.2 μg/ml in Leica Antibody Diluent using the same CD37-positive human tissue and cells. Antibody NCL-CD37 (Leica) provided acceptable membrane staining in each of the CD37-positive cell pellets and acceptable membrane staining in germinal centers and mantle zones of tonsil tissue (both CD37 positive) along with some low nuclear background and lack of staining in the interfollicular region of the tonsil (negative for CD37). 1B11-2 showed acceptable membrane staining in CD37-positive samples and good specificity with the added benefit of complete absence of nuclear background staining (see Fig. 5 for comparison of images for 1B11-2 and mouse mAb NCL-CD37 (Leica)). 1B11-2 provided membrane staining with a structure similar to that observed with the mouse monoclonal antibody NCL-CD37 (Leica); however, this membrane staining was more specific and clearer than that obtained with the NCL-CD37 antibody (Leica). It is also important to note that 1B11-2 did not stain in the interfollicular region of the tonsil (negative for CD37 expression), demonstrating increased specificity. For 1B11-2, the concentration suitable for staining was experimentally determined to be 4.2 μg/ml.

1В11-2, разбавленное до концентрации 4,2 мкг/мл в растворе для разведения антител Leica Antibody Diluent, также использовали для окрашивания микропанели нормальных тканей человека (приобретенной у Pantomics) и тканей миндалины и селезенки человека для оценки специфичности. 1В11-2 снова сравнивали с моноклональным антителом мыши NCL-CD37 (Leica), разбавленным до концентрации 4,2 мкг/мл в растворе для разведения антител Leica Antibody Diluent, на тех же нормальных тканях миндалины и селезенки, а также микропанели нормальных тканей человека. В большинстве нормальных тканей (за исключением миндалины и селезенки) моноклональное антитело мыши NCL-CD37 (Leica) демонстрировало окрашивание только в рассеянных лимфоцитарных клетках, оставляя остальную часть тканей отрицательной. Наблюдали некоторое фоновое розовое окрашивание в цитоплазме клеток Панета тонкого кишечника и в островковых клетках поджелудочной железы (см. фиг. 6). Антитело NCL-CD37 (Leica) обеспечивало приемлемое окрашивание мембран в зародышевых центрах и мантийных зонах нормальной миндалины человека и в краевой зоне в нормальных тканях селезенки человека, хотя и с некоторым низкоуровневым ядерным фоном. Отсутствовало окрашивание в межфолликулярной области миндалины или красной пульпе селезенки при применении антитела NCL-CD37 (Leica). 1B11-2 демонстрировало приемлемое окрашивание мембран в зародышевых центрах и мантийных зонах нормальной миндалины человека и в краевой зоне в нормальных тканях селезенки человека и окрашивание только в рассеянных лимфоцитах в оставшихся нормальных тканях без какого-либо фонового окрашивания (см. фиг. 6). Отсутствовало окрашивание в межфолликулярной области миндалины или красной пульпе селезенки. Эти результаты показывают, что 1В11-2 является предпочтительным с точки зрения чувствительности окрашивания, специфичности и пониженного фона, все из которых имеют решающее значение для высококачественного выполнения и анализа исследований методом ИГХ.1B11-2, diluted to 4.2 μg/mL in Leica Antibody Diluent, was also used to stain a micropanel of normal human tissue (purchased from Pantomics) and human tonsil and spleen tissue to assess specificity. 1B11-2 was again compared with the mouse monoclonal antibody NCL-CD37 (Leica), diluted to a concentration of 4.2 μg/ml in Leica Antibody Diluent, on the same normal tonsil and spleen tissues, as well as a micropanel of normal human tissues. In most normal tissues (except tonsil and spleen), the mouse monoclonal antibody NCL-CD37 (Leica) showed staining only in scattered lymphocytic cells, leaving the rest of the tissue negative. Some background pink staining was observed in the cytoplasm of the Paneth cells of the small intestine and in the islet cells of the pancreas (see Fig. 6). Antibody NCL-CD37 (Leica) provided acceptable membrane staining in the germinal centers and pallial zones of normal human amygdala and in the marginal zone in normal human splenic tissues, although with some low-level nuclear background. There was no staining in the interfollicular region of the tonsil or the red pulp of the spleen using the NCL-CD37 antibody (Leica). 1B11-2 showed acceptable membrane staining in the germinal centers and mantle zones of normal human tonsil and in the marginal zone in normal human spleen tissues and staining only in scattered lymphocytes in the remaining normal tissues without any background staining (see Fig. 6). There was no staining in the interfollicular region of the tonsil or the red pulp of the spleen. These results indicate that 1B11-2 is superior in terms of staining sensitivity, specificity, and reduced background, all of which are critical for high-quality performance and analysis of IHC studies.

Пример 5. Оценка антитела 1В11-2 к CD37 с помощью ИГХ с использованием образцов опухолей человека.Example 5: Evaluation of anti-CD37 antibody 1B11-2 by IHC using human tumor samples.

Образцы опухолей человека, типичные для диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы (n=52), фолликулярной лимфомы (n=20) и хронического лимфоцитарного лейкоза/лимфомы из малых лимфоцитов (n=8) (все включены в микропанель тканей неходжкинской лимфомы, приобретенную у TriStar Technology Group LLC), оценивали в отношении экспрессии CD37 с помощью ИГХ с использованием антитела 1В11-2. Интенсивность окрашивания CD37 и распределение значений суммированы в табл. 4 ниже. На фиг. 7 показан пример окрашивания тканей диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы и фолликулярной лимфомы с применением антитела 1B11-2. Эти результаты демонстрируют преимущества 1В11-2 в качестве более специфичного и чувствительного антитела для применения в исследованиях с помощью ИГХ для оценки экспрессии CD37 в тканях пациентов с неходжкинской лимфомой.Human tumor specimens representative of diffuse large B-cell lymphoma (n=52), follicular lymphoma (n=20), and chronic lymphocytic leukemia/small lymphocyte lymphoma (n=8) (all included in the non-Hodgkin's lymphoma tissue micropanel purchased from TriStar Technology Group LLC) was assessed for CD37 expression by IHC using the 1B11-2 antibody. The intensity of CD37 staining and the distribution of values are summarized in Table 1. 4 below. In fig. Figure 7 shows an example of tissue staining for diffuse large B-cell lymphoma and follicular lymphoma using the 1B11-2 antibody. These results demonstrate the advantages of 1B11-2 as a more specific and sensitive antibody for use in IHC studies to evaluate CD37 expression in tissues from patients with non-Hodgkin's lymphoma.

- 42 044601- 42 044601

Таблица 4Table 4

Распределение значений (% положительных результатов)Distribution of values (% positive results)

ТИП ОПУХОЛИ: TUMOR TYPE: ДИФФУЗНАЯ КРУПНОКЛЕТОЧ НАЯ ВКЛЕТОЧНАЯ ЛИМФОМА ц-52 DIFFUSE LARGE CELL LYMPHOMA c-52 ФОЛЛИКУЛ ЯРНАЯ ЛИМФОМА п=20 FOLLICULAR LYMPHOMA n=20 ХРОНИЧЕСКИЙ ЛИМФОЦИТАРНЫЙ ЛЕЙКОЗ/ЛИМФОМА ИЗ МАЛЫХ ЛИМФОЦИТОВ п=8 CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIA/SMALL LYMPHOCYTE LYMPHOMA n=8 Положительная (любая интенсивность): Positive (any intensity): 96% 96% 95% 95% 100% 100% >уровня 2 интенсивность при окрашивании по меньшей мере 25% опухолевых клеток: >level 2 intensity when staining at least 25% of tumor cells: 58% 58% 35% 35% 50% 50% >уровня 3 интенсивность при окрашивании по меньшей мере 25% опухолевых клеток: >level 3 intensity when staining at least 25% of tumor cells: 60% 60% 100% 100% 100% 100%

Антитело 1В11-2 и моноклональное антитело мыши NCL-CD37 (Leica) сравнивали с использованием микропанели тканей неходжкинской лимфомы (ТМА) (приобретенной у TriStar Technology Group LLC). При применении антитела NCL-CD37 в ИГХ анализе (анализ CD37) 27% образцов диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы (14 из 52), 85% образцов фолликулярной лимфомы (17 из 20) и 37% образцов хронического лимфоцитарного лейкоза/лимфомы из малых лимфоцитов (3 из 8) были отнесены к высшей категории (уровень 3 интенсивности окрашивания на по меньшей мере 25% опухолевых клеток, табл. 5). Напротив, антитело 1В11-2 в анализе ИГХ, описанном выше, с использованием набора Leica Bond Refine Detection Kit на автоматизированном приспособлении для окрашивания препаратов Leica Bond Rx обеспечивало окрашивание с повышенной чувствительностью и специфичностью 59% образцов диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы (31 из 52), 95% образцов фолликулярной лимфомы (19 из 20) и 100% образцов хронического лимфоцитарного лейкоза/лимфомы из малых лимфоцитов (8 из 8), обеспечивая окрашивание, которое было отнесено к высшей категории (уровень 3 интенсивности окрашивания на по меньшей мере 25% опухолевых клеток, табл. 5). Антитело 1В11-2 также позволяло обнаруживать экспрессию CD37 на низком уровне в трех образцах диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы, тогда как антитело NCL-CD37 (Leica) не позволяло обнаружить этот низкий уровень экспрессии. Эти результаты показывают, что 1В11-2 является предпочтительным с точки зрения чувствительности и специфичности окрашивания и обеспечивает больший динамический диапазон окрашивания CD37.Antibody 1B11-2 and mouse monoclonal antibody NCL-CD37 (Leica) were compared using a non-Hodgkin's lymphoma (TMA) tissue micropanel (purchased from TriStar Technology Group LLC). When using the NCL-CD37 antibody in an IHC assay (CD37 assay), 27% of diffuse large B-cell lymphoma samples (14 of 52), 85% of follicular lymphoma samples (17 of 20), and 37% of chronic lymphocytic leukemia/small lymphocyte lymphoma samples (3 of 8) were classified as the highest category (level 3 staining intensity on at least 25% of tumor cells, Table 5). In contrast, antibody 1B11-2 in the IHC assay described above using the Leica Bond Refine Detection Kit on the Leica Bond Rx automated slide stainer provided staining with increased sensitivity and specificity in 59% of diffuse large B-cell lymphoma samples (31 of 52 ), 95% of follicular lymphoma samples (19 of 20) and 100% of chronic lymphocytic leukemia/small lymphocyte lymphoma samples (8 of 8), providing staining that was classified as the highest category (level 3 staining intensity of at least 25% tumor cells, Table 5). Antibody 1B11-2 also detected low-level CD37 expression in three samples of diffuse large B-cell lymphoma, whereas antibody NCL-CD37 (Leica) did not detect this low level of expression. These results indicate that 1B11-2 is superior in terms of staining sensitivity and specificity and provides a greater dynamic range of CD37 staining.

Таблица 5Table 5

Сравнение распространенности CD37 в ТМА неходжкинской лимфомыComparison of CD37 prevalence in TMA of non-Hodgkin's lymphoma

Диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома (п=52) Diffuse large B-cell lymphoma (n=52) Фолликулярная лимфома (п=20) Follicular lymphoma (n=20) Хронический лимфоцитарный лейкоз/лимфома из малых лимфоцитов (п-8) Chronic lymphocytic leukemia/small lymphocyte lymphoma (n-8) Значения Values NCL- CD37 NCL- CD37 1В11-2 1V11-2 NCLCD37 NCLCD37 1В11-2 1V11-2 NCL- CD37 NCL- CD37 1В11-2 1V11-2 Пол ож иге л ьн ое (любая интенсивность) Polar burn (any intensity) 47 (90%) 47 (90%) 50 (96%) 50 (96%) 19(95%) 19(95%) 19 (95%) 19 (95%) 8 (100%) 8 (100%) 8(100%) 8(100%) > уровня 1 интенсивность при окрашивании по меньшей мере 25% опухолевых клеток: > level 1 intensity when staining at least 25% of tumor cells: 26 (50%) 26 (50%) 11 (21%) 11 (21%) 0 0 0 0 0 0 0 0 >уровня 2 интенсивность при окрашивании по меньшей мере 25% опухолевых клеток: >level 2 intensity when staining at least 25% of tumor cells: 33 (63%) 33 (63%) 30 (58%) 30 (58%) 12 (60%) 12 (60%) 7 (35%) 7 (35%) 7 (88%) 7 (88%) 4 (50%) 4 (50%) >уровня 3 интенсивность при окрашивании по меньшей мере 25% опухолевых клеток: >level 3 intensity when staining at least 25% of tumor cells: 14 (27%) 14 (27%) 31 (60%) 31 (60%) 17 (85%) 17 (85%) 19 (95%) 19 (95%) 3 (38%) 3 (38%) 8 (100%) 8 (100%)

- 43 044601- 43 044601

Пример 6. Картирование домена.Example 6: Domain mapping.

Картирование домена с помощью денатурирующего электрофореза в ДСН-ПААГ и вестернблоттинга.Domain mapping using denaturing SDS-PAGE and Western blotting.

Способность распознавать различные препараты слитых с Fc CD37-ECD исследовали в денатурирующем электрофорезе в ДСН-ПААГ с последующим вестерн-блоттингом для 1В11-2 (левая панель) при прямом сравнении с поставляемым на рынок антителом к CD37 (Leica; правая панель). Препараты слитых с Fc CD37-ECD денатурировали путем инкубирования в буфере Лэммли (Laemmli), содержащем 70 мМ β-меркаптоэтанол, при 100°С в течение 10 мин и разделяли электрофорезом в полиакриламидном геле, содержащем ДСН, с последующим электрофоретическим переносом на мембраны из ПВДФ. Мембраны блокировали 5% обезжиренным молоком в забуференном трисом солевом растворе с 0,1% Tween-20 (TBST) в течение 1 ч при комнатной температуре. Первичные антитела применяли в течение ночи с последующим обнаружением с помощью вторичного F(ab)2 к IgG мыши, конъюгированного с пероксидазой хрена, в течение 1 ч при комнатной температуре. Блоты проявляли с использованием усиленного обнаружения хемилюминесценции после применения стандартных техник. Результаты показаны на фиг. 8. В то время как антитело Leica распознает все три препарата Fc-CD37 ECD, антитело 1В11-2 согласно настоящему изобретению распознает только hCD37-ECD-Fc и hCD37-Fc-LAGA, но не hCD37-ECD-S2-Fc. Конструкция hCD37-ECD-S2-Fc не содержит сегмента S1 (аминокислоты 110-137) CD37 ECD. Таким образом, область аминокислот 110-137 имеет критическое значение для распознавания эпитопа с применением 1В11-2, но не антитела Leica. Картирование домена с помощью нативного электрофореза в ПААГ и вестерн-блоттингаThe ability to recognize various Fc-fusion CD37-ECD preparations was examined by denaturing SDS-PAGE followed by Western blotting for 1B11-2 (left panel) in direct comparison with a commercially available anti-CD37 antibody (Leica; right panel). Fc-fusion CD37-ECD preparations were denatured by incubation in Laemmli buffer containing 70 mM β-mercaptoethanol at 100°C for 10 min and separated by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, followed by electrophoretic transfer to PVDF membranes. . Membranes were blocked with 5% nonfat milk in Tris-buffered saline with 0.1% Tween-20 (TBST) for 1 h at room temperature. Primary antibodies were applied overnight followed by detection with horseradish peroxidase-conjugated anti-mouse F(ab) 2 secondary antibody for 1 h at room temperature. Blots were developed using enhanced chemiluminescence detection following standard techniques. The results are shown in Fig. 8. While the Leica antibody recognizes all three Fc-CD37 ECD preparations, the 1B11-2 antibody of the present invention recognizes only hCD37-ECD-Fc and hCD37-Fc-LAGA, but not hCD37-ECD-S2-Fc. The hCD37-ECD-S2-Fc construct does not contain the S1 segment (amino acids 110-137) of the CD37 ECD. Thus, the region of amino acids 110-137 is critical for epitope recognition using 1B11-2, but not the Leica antibody. Domain mapping using native PAGE and Western blotting

Способность распознавать различные препараты слитых с Fc CD37-ECD исследовали в нативном электрофорезе в ПААГ с последующим вестерн-блоттингом для 1В11-2. Препараты слитых с Fc CD37-ECD загружали в буфер для образцов для нативного электрофореза и разделяли электрофорезом SDS в полиакриламидном геле с последующим электрофоретическим переносом на мембраны из ПВДФ или окрашиванием геля Кумасси бриллиантовым синим. Мембраны из ПВДФ блокировали 5% обезжиренным молоком в забуференном трисом солевом растворе с 0,1% Tween-20 (TBST) в течение 1 ч при комнатной температуре. Первичное антитело применяли в течение ночи с последующим обнаружением с помощью вторичного F(ab)2 к IgG мыши, конъюгированного с пероксидазой хрена, в течение 1 ч при комнатной температуре. Блот проявляли с использованием усиленного обнаружения хемилюминесценции после применения стандартных техник. Результаты показаны на фиг. 9. В соответствии с данными денатурирующего электрофореза в ДСН-ПААГ (фиг. 8) и экспериментов ELISA (см. фиг. 4) антитело 1В11-2 согласно настоящему изобретению распознает только hCD37-ECD-Fc и hCD37-Fc-LAGA, но не hCD37-ECD-S2-Fc. Эти данные показывают, что сегмент S1 (аминокислоты 110-137) CD37 ECD или его часть имеет критическое значение для распознавания эпитопа 1В11-2 (левая панель фиг. 9). Окрашивание геля Кумасси бриллиантовым синим (правая панель фиг. 9) показывает, что белок hCD37-ECD-S2-Fc присутствовал в достаточных для обнаружения с применением 1В11-2 количествах.The ability to recognize various Fc-fusion CD37-ECD preparations was examined by native PAGE followed by Western blotting for 1B11-2. Fc-fusion CD37-ECD preparations were loaded into native electrophoresis sample buffer and separated by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, followed by electrophoretic transfer to PVDF membranes or staining of the gel with Coomassie brilliant blue. PVDF membranes were blocked with 5% skim milk in Tris-buffered saline with 0.1% Tween-20 (TBST) for 1 h at room temperature. The primary antibody was applied overnight followed by detection with horseradish peroxidase-conjugated anti-mouse F(ab) 2 secondary antibody for 1 h at room temperature. The blot was developed using enhanced chemiluminescence detection following standard techniques. The results are shown in Fig. 9. According to denaturing SDS-PAGE data (Fig. 8) and ELISA experiments (see Fig. 4), the 1B11-2 antibody of the present invention recognizes only hCD37-ECD-Fc and hCD37-Fc-LAGA, but not hCD37-ECD-S2-Fc. These data indicate that the S1 segment (amino acids 110-137) of the CD37 ECD or a portion thereof is critical for recognition of the 1B11-2 epitope (left panel of Fig. 9). Coomassie brilliant blue staining of the gel (right panel of Fig. 9) shows that hCD37-ECD-S2-Fc protein was present in sufficient quantities to be detected using 1B11-2.

Пример 7. Клонирование и секвенирование областей VL и VH антитела к CD37 человека.Example 7: Cloning and sequencing of the VL and VH regions of anti-human CD37 antibodies.

Общее количество клеточной РНК получали из 5x106 клеток гибридомы против CD37 человека 1В11-2, описанной выше, с использованием набора RNeasy kit (QIAgen) в соответствии с протоколом производителя. Затем синтезировали кДНК с первой цепи общей РНК с использованием набора для синтеза кДНК Superscript III (Invitrogen).Total cellular RNA was prepared from 5x106 anti-human CD37 hybridoma 1B11-2 cells described above using the RNeasy kit (QIAgen) according to the manufacturer's protocol. cDNA was then synthesized from the first strand of total RNA using the Superscript III cDNA Synthesis Kit (Invitrogen).

Процедуры ПЦР для амплификации кДНК вариабельной области антитела, полученной из клеток гибридомы, были основаны на способах, описанных Wang et al. ((2000), J. Immunol. Methods. 233:167-77) и Co et al. ((1992), J. Immunol. 148:1149-54). Последовательности вариабельной области легкой цепи (VL) и вариабельной области тяжелой цепи (VH) амплифицировали с помощью вырожденных праймеров на 5'-конце и специфичных к константной области мышиного каппа или IgG1 праймеров на 3'-конце. Реакционные смеси после ПЦР затем подвергали электрофорезу в геле из 1% легкоплавкой агарозы, затем вырезали зоны ампликона от 300 до 400 п.о., которые затем очищали с использованием мини-колонок Zymo DNA. Очищенные ампликоны отправляли в Beckman Coulter Genomics для секвенирования с использованием тех же 5'- и 3'-праймеров реакций ПЦР для получения последовательности кДНК вариабельной области в обоих направлениях.PCR procedures for amplification of antibody variable region cDNA obtained from hybridoma cells were based on methods described by Wang et al. ((2000), J. Immunol. Methods. 233:167-77) and Co et al. ((1992), J. Immunol. 148:1149-54). Variable light chain (VL) and variable heavy chain (VH) sequences were amplified using degenerate primers at the 5' end and mouse kappa constant region or IgG1 specific primers at the 3' end. The PCR reaction mixtures were then electrophoresed on a 1% low melting point agarose gel and 300 to 400 bp amplicon regions were excised and purified using Zymo DNA mini columns. Purified amplicons were submitted to Beckman Coulter Genomics for sequencing using the same 5′ and 3′ PCR reaction primers to obtain the variable region cDNA sequence in both directions.

Вырожденные праймеры, используемые для клонирования последовательностей кДНК VL и VH, изменяют 5'-конец, поэтому были необходимы дополнительные действия по секвенированию для проверки полных последовательностей кДНК вариабельной области. Предварительные последовательности были введены в поисковый запрос сайта NCBI IgBlast (www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/) для идентификации последовательностей мышиных зародышевых линий, из которых были получены последовательности антител. Праймеры для ПЦР затем были сконструированы таким образом, чтобы отжиг происходил на связанной с зародышевой линией лидерной последовательности мышиного антитела, чтобы эта новая реакция ПЦР приводила к полной последовательности кДНК вариабельной области, не измененной праймерами для ПЦР. Реакции ПЦР, очистку зон и секвенирование выполняли, как описано выше. Последовательности кДНК вариабельных областей, полученные для антитела к CD37 человека, объединялиThe degenerate primers used to clone the VL and VH cDNA sequences alter the 5′ end, so additional sequencing steps were necessary to verify the complete variable region cDNA sequences. Preliminary sequences were entered into a search query on the NCBI IgBlast website (www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/) to identify the mouse germline sequences from which the antibody sequences were derived. The PCR primers were then designed to anneal to the germline-associated mouse antibody leader sequence so that this new PCR reaction would result in the complete variable region cDNA sequence unaltered by the PCR primers. PCR reactions, zone purification, and sequencing were performed as described above. Variable region cDNA sequences obtained for the anti-human CD37 antibody were combined

--

Claims (12)

с последовательностями константных областей зародышевой линии, чтобы получить последовательности кДНК полноразмерного антитела. Молекулярные массы тяжелой и легкой цепей затем вычисляли с помощью трансляций последовательностей кДНК и сравнивали с молекулярными массами, поученными анализом методом LC/MS очищенного мышиного антитела к CD37 человека. Наблюдаемые молекулярные массы для легкой и тяжелой цепей мышиного 1В11-2 соответствовали ожидаемым значениям, подтверждая правильность последовательностей кДНК.with germline constant region sequences to obtain full-length antibody cDNA sequences. The molecular weights of the heavy and light chains were then calculated using translations of the cDNA sequences and compared with the molecular weights obtained by LC/MS analysis of purified mouse anti-human CD37 antibody. The observed molecular weights for the light and heavy chains of murine 1B11-2 were consistent with the expected values, confirming the correctness of the cDNA sequences. Последовательности CDR VH и VL приведены в табл. 1 и 2 соответственно. Последовательности VH и VL приведены в табл. 3 и 4 соответственно. Полноразмерные последовательности тяжелой цепи и легкой цепи приведены в табл. 5 и 6 соответственно. Полинуклеотидные последовательности VH и VL приведены в табл. 8.The CDR sequences of VH and VL are given in table. 1 and 2 respectively. The sequences of VH and VL are given in table. 3 and 4 respectively. The full-length sequences of the heavy chain and light chain are given in table. 5 and 6 respectively. Polynucleotide sequences of VH and VL are given in table. 8. Все публикации, патенты, заявки на патенты, интернет-сайты и номера доступа/последовательности баз данных (включая как полинуклеотидные, так и полипептидные последовательности), цитируемые в настоящем описании, настоящим включены посредством ссылки во всей их полноте во всех отношениях в той же степени, как если бы каждая отдельная публикация, патент, заявка на патент, интернет-сайт или номер доступа/последовательность баз данных была конкретно и индивидуально обозначена как включенная посредством ссылки.All publications, patents, patent applications, Internet sites and accession numbers/database sequences (including both polynucleotide and polypeptide sequences) cited herein are hereby incorporated by reference in their entirety and in all respects to the same extent , as if each individual publication, patent, patent application, Internet site, or accession number/database sequence were specifically and individually designated as being incorporated by reference. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯCLAIM 1. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент указанного антитела, которые специфично связываются с CD37, где указанные антитело или его фрагмент содержат последовательности VH CDR1, CDR2 и CDR3 согласно SEQ ID NO: 3-5 и последовательности VL CDR1, CDR2 и CDR3 согласно SEQ ID NO: 6-8 соответственно.1. An antibody or antigen-binding fragment of said antibody that specifically binds to CD37, wherein said antibody or fragment thereof contains VH CDR1, CDR2 and CDR3 sequences according to SEQ ID NO: 3-5 and VL CDR1, CDR2 and CDR3 sequences according to SEQ ID NO: 6-8 respectively. 2. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент указанного антитела по п.1, где указанное антитело или его фрагмент содержат полипептидные последовательности, содержащие аминокислоты последовательностей SEQ ID NO: 9 и/или 10.2. An antibody or antigen-binding fragment of said antibody according to claim 1, wherein said antibody or fragment thereof comprises polypeptide sequences containing amino acids of the sequences SEQ ID NO: 9 and/or 10. 3. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент указанного антитела по любому из пп.1 или 2, где указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляют собой антитело мыши или его антигенсвязывающий фрагмент, гуманизированное, химерное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, антитело человека или его антигенсвязывающий фрагмент.3. The antibody or antigen binding fragment of said antibody according to any one of claims 1 or 2, wherein said antibody or antigen binding fragment thereof is a mouse antibody or antigen binding fragment thereof, a humanized, chimeric antibody or antigen binding fragment thereof, a human antibody or antigen binding fragment thereof. 4. Антитело по любому из пп.1-3, которое представляет собой полноразмерное антитело.4. Antibody according to any one of claims 1-3, which is a full-length antibody. 5. Антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.1-3, который выбран из группы, содержащей Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv или scFv, стабилизированный дисульфидной связью Fv, интраантитело, IgGACH2, мини-антитело, F(ab')3, тетратело, триатело, диатело, DVD-Ig, mAb2, (scFv)2 и scFv-Fc.5. An antigen-binding fragment according to any one of claims 1 to 3, which is selected from the group consisting of Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv or scFv, disulfide bond stabilized Fv, intraantibody, IgGACH 2 , mini-antibody, F(ab') 3 , tetrabody, tribody, diabody, DVD-Ig, mAb 2 , (scFv)2 and scFv-Fc. 6. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент указанного антитела по любому из пп.1-5, где указанные антитело или его антигенсвязывающий фрагмент помечены меткой с возможностью обнаружения.6. An antibody or antigen-binding fragment of said antibody according to any one of claims 1 to 5, wherein said antibody or antigen-binding fragment thereof is detectably labeled. 7. Способ обнаружения экспрессии CD37 в образце in vitro, включающий приведение указанного образца в контакт с антителом или антигенсвязывающим фрагментом указанного антитела по любому из пп.1-6, и определение уровня экспрессии CD37 в указанном образце.7. A method for detecting CD37 expression in a sample in vitro, comprising contacting said sample with an antibody or antigen-binding fragment of said antibody according to any one of claims 1 to 6, and determining the level of CD37 expression in said sample. 8. Способ по п.7, где экспрессию CD37 определяют с помощью иммуногистохимического (ИГХ) анализа, радиоиммуноанализа, вестерн-блоттинга, цитометрии, иммунофлуоресцентного анализа, иммуноферментного анализа, иммунопреципитационного анализа или хемилюминесцентного анализа.8. The method of claim 7, wherein CD37 expression is determined by immunohistochemical (IHC) analysis, radioimmunoassay, Western blotting, cytometry, immunofluorescence assay, enzyme-linked immunosorbent assay, immunoprecipitation assay, or chemiluminescent assay. 9. Применение антитела или антигенсвязывающего фрагмента указанного антитела по любому из пп.1-6 в способе лечения пациента, имеющего рак, путем введения терапевтически активного агента, представляющего собой конъюгат антитело-майтанзиноид, включающий антитело к CD37, которое содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую SEQ ID NO: 28, и вариабельную область легкой цепи, содержащую SEQ ID NO: 29, причем указанное применение включает обнаружение повышенной экспрессии CD37 в образце рака от указанного пациента.9. The use of an antibody or antigen-binding fragment of said antibody according to any one of claims 1 to 6 in a method of treating a patient having cancer by administering a therapeutically active agent that is an antibody-maytansinoid conjugate including an anti-CD37 antibody that contains a heavy chain variable region, comprising SEQ ID NO: 28, and a light chain variable region comprising SEQ ID NO: 29, wherein said use includes detecting increased expression of CD37 in a cancer sample from said patient. 10. Применение по п.9, где указанное обнаружение осуществляют методом иммуногистохимии (ИГХ).10. Use according to claim 9, where said detection is carried out by immunohistochemistry (IHC). 11. Применение по любому из пп.9 или 10, где указанный рак представляет собой лейкоз или лимфому.11. Use according to any one of claims 9 or 10, wherein said cancer is leukemia or lymphoma. 12. Применение по любому из пп.9 или 10, где указанный рак выбран из группы, состоящей из В-клеточных лимфом, неходжкинской лимфомы (НХЛ), В-клеточного лимфобластного лейкоза/лимфомы из клеток-предшественников и новообразований из зрелых В-клеток, В-клеточного хронического лимфоцитарного лейкоза (ХЛЛ)/лимфомы из малых лимфоцитов (ЛМЛ), В-клеточного пролимфоцитарного лейкоза, лимфоплазмоцитарной лимфомы, мантийноклеточной лимфомы (МКЛ), фолликулярной лимфомы (ФЛ), ФЛ низкой степени злокачественности, средней степени злокачественности и высокой степени злокачественности, кожной лимфомы из клеток фолликулярного центра, В-клеточной лимфомы из клеток маргинальной зоны, MALT-типа В-клеточной лимфомы из клеток маргинальной зоны, узлового типа В-клеточной лимфомы из клеток маргинальной зоны, В-клеточной лим-12. Use according to any one of claims 9 or 10, wherein said cancer is selected from the group consisting of B-cell lymphomas, non-Hodgkin's lymphoma (NHL), B-cell lymphoblastic leukemia/progenitor cell lymphoma and neoplasms of mature B cells , B-cell chronic lymphocytic leukemia (CLL)/small lymphocyte lymphoma (SLL), B-cell prolymphocytic leukemia, lymphoplasmacytic lymphoma, mantle cell lymphoma (MCL), follicular lymphoma (FL), low-grade, intermediate-grade and high-grade FL degree of malignancy, cutaneous lymphoma from follicular center cells, B-cell lymphoma from marginal zone cells, MALT-type B-cell lymphoma from marginal zone cells, nodal type B-cell lymphoma from marginal zone cells, B-cell lymphoma --
EA201890347 2015-08-28 2016-08-26 ANTIBODIES AND RESEARCH FOR CD37 DETECTION EA044601B1 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US62/211,455 2015-08-28
US62/212,183 2015-08-31

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA044601B1 true EA044601B1 (en) 2023-09-13

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11932701B2 (en) Method for increasing the efficacy of cancer therapy by administering an anti-FOLR1 immunoconjugate
US11104740B2 (en) Antibodies and assays for detection of CD37
EA044601B1 (en) ANTIBODIES AND RESEARCH FOR CD37 DETECTION