EA043952B1 - Соединения-антагонисты pcsk9 - Google Patents

Соединения-антагонисты pcsk9 Download PDF

Info

Publication number
EA043952B1
EA043952B1 EA202190086 EA043952B1 EA 043952 B1 EA043952 B1 EA 043952B1 EA 202190086 EA202190086 EA 202190086 EA 043952 B1 EA043952 B1 EA 043952B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
formula
mmol
ultra
plus
pharmaceutically acceptable
Prior art date
Application number
EA202190086
Other languages
English (en)
Inventor
Харольд Б. ВУД
Хуберт Б. ДЖОСИЕН
Томас Джозеф ТАКЕР
Анджела Дон Керекес
Лин ТУН
Аббас М. ВАЛДЖИ
Анилкумар Дж. Наир
Фа-Сян ДИН
Элизабетта БЬЯНКИ
Данила БРАНКА
Чэнвэй ВУ
Юйшэн Сюн
Соокхее Николь Ха
Цзянь Лю
Собхана Бабу БОГА
Original Assignee
МЕРК ШАРП И ДОУМ ЭлЭлСи
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by МЕРК ШАРП И ДОУМ ЭлЭлСи filed Critical МЕРК ШАРП И ДОУМ ЭлЭлСи
Publication of EA043952B1 publication Critical patent/EA043952B1/ru

Links

Description

Перекрестная ссылка на родственную заявку
Настоящей заявке испрашивается приоритет по заявке США № 62/687913, поданной 21 июня 2018 года, которая включена в настоящее описание в качестве ссылки в полном объеме.
Уровень техники, к которому относится изобретение
Идентификация соединений и/или средств, которые являются эффективными для лечения сердечнососудистых заболеваний, является в высокой степени желательной. В клинических испытаниях снижение уровней LDL-холестерина прямо связано с частотой коронарных приступов; Law et al., 2003 BMJ 326:1423-1427. Было обнаружено, что умеренное пожизненное уменьшение уровней LDL-холестерина в плазме коррелирует со значительным снижением встречаемости коронарных приступов; Cohen et al., 2006 N. Engl. J. Med. 354:1264-1272. Это справедливо даже в популяциях с высокой частотой не связанных с липидами сердечно-сосудистых факторов риска; выше. Таким образом, был бы в значительной степени полезным управляемый контроль уровней LDL-холестерина.
Пропротеиновая конвертаза субтилизин-кексинового типа 9 (далее обозначаемая как PCSK9), также известная как нейрональная апоптоз-регулируемая конвертаза 1 (NARC-1), представляет собой протеазу К-подобную субтилазу, идентифицированную в качестве 9-го представителя семейства секреторных субтилаз; см. Seidah et al., 2003 PNAS 100:928-933. PCSK9 принадлежит семейству конвертаз пробелков млекопитающих, сериновых протеаз, и содержит N-концевую сигнальную последовательность, продомен, каталитический домен и С-концевой домен; см. Seidah et al., 2012 Nat. Rev. Drug Discov. 11:367-383. Исследование регуляции транскрипции PCSK9 продемонстрировало, что она регулируется белками, связывающими стеринрегулирующие элементы (SREBP), как видно для других генов, вовлеченных в метаболизм холестерина; Maxwell et al., 2003 J. Lipid Res. 44:2109-2119, что является типичным для других генов, вовлеченных в метаболизм липопротеинов; Dubuc et al., 2004 Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol 24:1454-1459. Было показано, что статины повышают экспрессию PCSK9 аналогично эффектам снижения уровня холестерина у лекарственных средств; выше. Более того, было показано, что промоторы PCSK9 обладают двумя консервативными участками, вовлеченными в регуляцию холестерина: стеринрегулирующий элемент и участок Sp1; выше.
Между тем, в эндоплазматичском ретикулуме PCSK9 в качестве его единственной каталитической активности выполняет ауторасщепление между остатками Gln-152 и Ser-153; см. Naureckiene et al., 2003 Arch. Biochem. Biophys. 420:55-67; Seidah et al., 2003 Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 100:928-933. Продомен остается прочно связанным с каталитическим доменом в ходе последующего транспорта через транс-сеть Гольджи. Было продемонстрировано, что созревание посредством ауторасщепления является ключевым для секреции PCSK9 и последующей внеклеточной функции (см. Benjannet et al., 2012 J. Biol. Chem. 287:33745-33755). Таким образом, несколько линий доказательств демонстрируют, что PCSK9, в частности, уменьшает количество белка LDLR в печени и, таким образом, снижает способность печени удалять LDL-холестерин из кровотока.
Опосредуемая аденовирусом сверхэкспрессия PCSK9 в печени мышей приводит к накоплению циркулирующего LDL-C вследствие выраженной потери печеночного белка LDLR без эффекта на уровни мРНК LDLR; Benjannet et al., 2004 J. Biol. Chem. 279:48865-48875; Maxwell & Breslow, 2004 PNAS 101:7100-7105; Park et al., 2004 J. Biol. Chem. 279:50630-50638; и Lalanne et al., 2005 J. Lipid Res. 46:13121319. Эффект сверхэкспрессии PCSK9 на повышение уровней LDL-C в кровотоке мышей полностью зависит от экспрессии LDLR, вновь указывая на то, что регуляция LDL-C посредством PCSK9 опосредуется подавлением белка LDLR. В соответствии с этими данными, мыши, лишенные PCSK9, или у которых мРНК PCSK9 снижена посредством антисмысловых олигонуклеотидных ингибиторов, имеют более высокие уровни белка LDLR в печени и более высокую способность к выведению циркулирующего LDL-C; Rashid et al., 2005 PNAS 102:5374-5379; и Graham et al., 2007 J. Lipid Res. 48(4):763-767. Кроме того, снижение уровней PCSK9 в культивируемых гепатоцитах человека посредством миРНК также приводит к более высоким уровням белка LDLR и повышенной способности поглощать LDL-C; Benjannet et al., 2004 J. Biol. Chem. 279:48865-48875; и Lalanne et al., 2005 J. Lipid Res. 46:1312-1319. Взятые вместе, эти данные указывают на то, что действие PCSK9 приводит к увеличению уровня LDL-C путем снижения уровней белка LDLR.
Ряд мутаций в гене PCSK9 также достоверно ассоциирован с аутосомно-доминантной гиперхолестеринемией (ADH), наследственным нарушением метаболизма, характеризующимся выраженным повышением уровня частиц липопротеинов низкой плотности (LDL) в плазме, что может приводить к преждевременной сердечно-сосудистой недостаточности; см. Abifadel et al., 2003 Nature Genetics 34:154156; Timms et al., 2004 Hum. Genet. 114:349-353; Leren, 2004 Clin. Genet. 65:419-422. Позднее опубликованное исследование мутации S127R Abifadel et al., выше, показало, что пациенты, имеющие такую мутацию, демонстрировали более высокий уровень общего холестерина и apoB100 в плазме, связанный с (1) сверхпродукцией содержащих apoB100 липопротеинов, таких как липопротеин низкой плотности (LDL), липопротеин очень низкой плотности (VLDL) и липопротеин промежуточной плотности (IDL), и (2) ассоциированным снижением клиренса или конвертирования указанных липопротеинов; Ouguerram et al., 2004 Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 24:1448-1453.
Таким образом, не может быть сомнений, что PCSK9 играет роль в регуляции LDL. Экспрессия или
- 1 043952 активация PCSK9 ассоциирована с повышенными уровнями в плазме холестерина LDL, и соответствующее ингибирование или отсутствие экспрессии PCSK9 ассоциировано со сниженными уровнями холестерина LDL в плазме. Было обнаружено, что сниженные уровни холестерина LDL, ассоциированные с варьированием последовательности PCSK9, обеспечивают защиту против коронарной болезни сердца;
Cohen, 2006 N. Engl. J. Med. 354:1264-1272.
Таким образом, идентификация соединений и/или средств, эффективных для лечения сердечнососудистых заболеваний, является в высокой степени желательной, включая антагонизм роли PCSK9 в регуляции LDL, однако, как правило, поскольку PCSK9 циркулирует в крови и имеет умеренную аффинность связывания с рецепторами LDL на клеточной поверхности, предшествующие попытки использовать этот механизм для лечения заболеваний, связанных с высокими уровнями LDL в сыворотке, были сфокусированы на использовании больших биомолекул, например, антител. Таким образом, недостаточно публикаций, отражающих активность в отношении его мишени, с использованием небольших пептидов или низкомолекулярных соединений для ингибирования PCSK9, см. например, Zhang et al., 2014 J. Biol. Chemistry, 289(2): 942-955. Более того, существует мало соединений, которые могут быть составлены в дозированную форму для перорального пути введения таких соединений, который является в высокой степени желательным для обеспечения терапии состояний, при которых регуляция активности PCSK9 может играть роль.
Настоящее изобретение направлено на эти интересы путем предоставления антагонистов PCSK9, которые предположительно можно использовать для ингибирования активности PCSK9 и соответствующей роли, которую PCSK9 играет при различных состояниях, при которых введение антагониста PCSK9 обеспечивает терапию.
Сущность изобретения
В одном аспекте изобретение относится к соединению формулы I
Формула I, где
X представляет собой Н, F, Cl или Br;
R1 выбран из:
(a) -Н; или (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой:
(i) -H;
(ii) -NH2;
(iii) -N%;
(iv) -N+(H3C)3;
(v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B, где R14B представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
(vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B, где y12 и y13 не равны оба 2 и независимо равны от 2 до 4; и
R14B представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N+(CH3)3;
(vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)za-N+(CH3)3, где za равен 3 или 4; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой:
(ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
(aii) -N+(CH3)3; или
- 2 043952
(aiii) часть формулы:
R2 выбран из:
(a) -H; и (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A выбран из: (i) -H;
(ii) -NH2;
(iii) -N+Нз;
(iv) -К+(НзС)з;
(v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B, где R14B представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или К+(СНз)з;
(Vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B, где y12 и у13 не равны оба 2 и независимо равны от 2 до 4; и
R14b представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
(vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)zb-N+(CH3)3, где zb равен 3 или 4; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где, у=1-6 и R14C представляет собой:
(ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
(aii) -N+(CH3)2R14ca, где R14ca представляет собой -СН3 или -(CH2)1-4-OCH3;
о но noz .
(aiii) часть формулы: ’ или ' ^I ICuVD7 ( /уЫСс (aiv) часть формулы: ’ где y14Cb и у14Сс равны от 1 до 4;
или
R1 и R2 могут быть связаны вместе с образованием части формулы: где
G1, RG1a и RG1b определяются следующим образом:
(a) G1 представляет собой линкерную часть формулы:
где nq1 равен от 1 до 6, mq1 равен 0, 1 или 2 и вместе величины nq1 и mq1 выбраны так, чтобы длина линкерной части, которую они определяют, не превышала всего 8 атомов углерода и/или кислорода, составляющих цепь, включающую атом углерода в цепи, который образует карбонильную часть;
RG1a выбран из: (i) -H; и (ii) алкила из вплоть до 4 атомов углерода; и
RG1b выбран из:
(i) части формулы:
и
(ii) части формулы:
- 3 043952 (b) G1 представляет собой линкерную часть формулы:
где nq2 равен 0, 1 или 2, mq2 равен от 1 до 6, и вместе величины nq2 и mq2 выбраны так, чтобы длина линкерной части, которую они определяют, не превышала всего 8 атомов углерода и/или кислорода, составляющих цепь, включающую атом углерода в цепи, который образует карбонильную часть; RG1a выбран из:
(i) части формулы:
и (ii) части формулы:
RG1b выбран из: (i) -H; и (ii) алкила из вплоть до 4 атомов углерода;
R8 представляет собой -CH3 или часть формулы:
где R8a представляет собой -Н или линейный, разветвленный или циклический алкил из вплоть до четырех атомов углерода;
А выбран из:
(а) части формулы:
(b) -СН2-(СН2)у-СН2-, где y равен от 1 до 6;
(c) части формулы:
’ где Ab1 представляет собой:
(i) часть формулы:
СН2 ’ где x равен от 1 до 6; или (ii) часть формулы:
’ где у равен от 1 до 5;
(d) части формулы: -CH2-(CH2)m-O-(CH2)n-, где m=1-5, и n=0 или 1-4;
В представляет собой:
(a) связь;
(b) -(СН2)1.4; или
(c) часть формулы:
D представляет собой:
- 4 043952
О , (а) часть формулы: ’ где Е представляет собой -СН2- или (СН2)2-4-О-, и А и В являются такими, как определено выше;
нейный разветвленный или циклический алкил из вплоть до четырех атомов углерода, и А и В являются такими, как определено выше, или любой его фармацевтически приемлемой соли.
В следующем варианте осуществления изобретение относится к соединению формулы I, где X представляет собой F, или его любой фармацевтически приемлемой соли. В некоторых вариантах осуществления предпочтительно, чтобы D представлял собой часть формулы:
’ где Е представляет собой -СН2- или -(СН2)2-О-, и А и В являются такими, как определено в настоящем описании.
В некоторых вариантах осуществления предпочтительно, чтобы D представлял собой часть формуft ---
О лы: ’ где Е представляет собой -СН2- или -(СН2)2-О-, и А и В являются такими, как определено в настоящем описании.
В некоторых вариантах осуществления предпочтительно, чтобы D представлял собой часть форму-
описании. В некоторых вариантах осуществления предпочтительно, чтобы D представлял собой часть
- 5 043952 формулы: ’ где А и В являются такими, как определено в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления предпочтительно, чтобы D представлял собой
О
О Л
часть формулы: ’ где А и В являются такими, как определено в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления предпочтительно, чтобы D представлял
собой часть формулы: ’ где А и В являются такими, как определено в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления предпочтительно, чтобы D предЛ
ставлял собой часть формулы: ’ где А и В являются такими, как определено в настоящем описании.
В некоторых вариантах осуществления, где R1 и R2 соединены вместе и вместе с пептидным кольцом, к которому они присоединены, образуют циклическую структуру, предпочтительно, чтобы R1 и R2 образовывали часть структуры:
В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к фармацевтическим композициям, содержащим соединение по изобретению, например, соединение формулы I, и по меньшей мере один фармацевтический эксципиент, предпочтительно к композиции, предназначенной для перорального введения.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способу антагонизма PCSK9 для обеспечения терапии болезненных состояний, связанных с активностью PCSK9, например, атеросклероза, гиперхолестеринемии, коронарной болезни сердца, метаболического синдрома, острого коронарного синдрома или родственного сердечно-сосудистого заболевания и кардиометаболических состояний, путем введения индивидууму, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества соединения формулы I, или его соли, предпочтительно в форме фармацевтической композиции.
Подробное описание изобретения
В описании, которое следует, используют общепринятое представление структуры, и оно включает стереохимическое обозначение определенных асимметричных углеродных центров.
Таким образом, структурное представление соединений по изобретению включает общепринятое стереохимическое обозначение для некоторых асимметричных углеродных центров, представленных в иллюстративных соединениях. Таким образом, в таких случаях сплошные черные клинообразные связи обозначают связи, выступающие из плоскости изображения, заштрихованные клинообразные связи обозначают связи, нисходящие в плоскость изображения, и волнистая линия, присоединенная к атому углерода, имеющему двойную связь, указывает на то, что включены возможные как цис-, так и трансориентации. Как является общепринятым, простые сплошные линии обозначают все пространственные конфигурации для изображенной связи. Таким образом, когда отсутствует конкретное стереохимическое обозначение, изображение предусматривает все стерохимические и пространственные ориентации структурных признаков.
Как показано в примерах изобретения и как упоминается выше, конкретные асимметричные углеродные центры структурно изображают с использованием общепринятого сплошного клинообразного и пунктирного клинообразного преставления связей. По большей части абсолютная конфигурация не была определена для иллюстративных соединений, но была присвоена по аналогии с конкретными ил- 6 043952 люстративными соединениями известной стереохимической конфигурации (определенной посредством рентеговской кристаллографии), полученными с использованием тех же или аналогичных условий реакции и исходных реагентов и выделенными с использованием тех же условий хроматографии. Таким образом, конкретное указание конфигураций, структурно представленных в настоящем описании, предназначено для идентификации конкретных полученных соединений, которые имеют избыток одного конкретного стереоизомера и не обязательно приводится в настоящем описании для утверждения об абсолютном определении стереохимической структуры указанного соединения, если нет иных указаний в приведенных данных.
Будет понятно, что, когда получают изомерные смеси, получение индивидуальных стереоизомеров в значительных процентах энантиомерного избытка можно проводить, если желательно, путем разделения смеси с использованием специализированных способов, например, посредством хроматографии или кристаллизации, или с использованием стереохимически однородных исходных материалов для описанного синтеза, или посредством стереоселективного синтеза. Необязательно перед разделением стереоизомеров можно проводить дериватизацию. Разделение смеси стереоизомеров можно проводить на промежуточной стадии в ходе синтеза соединения формулы I, или его можно проводить на конечном рацемическом продукте.
Когда в настоящем описании указано, абсолютная стереохимия определена посредством рентгеновской кристаллографии кристаллических продуктов или кристаллических промежуточных соединений, которые дериватизированы, если необходимо, реагентом, содержащим стереогенный центр известной конфигурации. Если только не указан конкретный изомер, соль, сольват (включая гидраты) или сольватированная соль такого рацемата, энантиомера или диастереомера, настоящее изобретение относится ко всем таким изомерам, а также солям, сольватам (включая гидраты) и сольватированным солям таких рацематов, энантиомеров, диастереомеров и их смесей.
Настоящее изобретение также охватывает изотопно меченые соединения по настоящему изобретению, которые структурно идентичны соединениям, указанным в настоящем описании, за исключением того факта, что статистически значимый процент одного или нескольких атомов в этой форме соединения заменен атомами, имеющими атомную массу или массовое число, отличные от атомной массы или массового числа наиболее распространенного изотопа, обычно встречающегося в природе, таким образом, изменяя природное содержание изотопа в соединении по изобретению. Подразумевается, что настоящее изобретение включает все подходящие изотопные варианты соединений формулы I.
Примеры изотопов, которые предпочтительно могут быть включены в соединения по изобретению, включают изотопы водорода, углерода, азота, кислорода, фосфора, йода, фтора и хлора, например, но не ограничиваясь ими: 2Н, 3Н, nC, 13C, 14C, 13N, 15N, 15О, 17О, 18О, 31Р, 32Р, 35S, 18F, и 36Cl, 123I и 125I. Будет понятно, что также могут быть включены другие изотопы известными способами.
В частности, определенные изотопно меченые соединения по изобретению (например, соединения, обозначаемые как 3Н, 11C и 14С) признаны являющимися особенно пригодными в анализах распределения соединений и/или субстратов в тканях с использованием различных известных способов. Кроме того, соединения по изобретению, охватывающие изотопную замену, включают различные изотопные формы водорода (Н), включая протий (1H) и дейтерий (2Н или D). Протий является преобладающим изотопом водорода в природе. Обогащение дейтерием может обеспечить определенные терапевтические преимущества, такие как повышение времени полужизни in vivo или уменьшение требуемых дозировок, или может обеспечить соединение, пригодное в качестве стандарта для охарактеризации биологических образцов. Изотопно обогащенные соединения формулы I можно получать без излишнего экспериментирования общепринятыми способами, хорошо известными специалистам в данной области или способами, аналогичными способам, описанным в схемах и примерах настоящего описания, с использованием подходящих изотопно обогащенных реагентов и/или промежуточных соединений.
Когда волнистая линия находится на конце общепринятой связи (в противоположность соединению двух атомов в структуре), она указывает на точку присоединения к структуре, например:
СМ указывает на то, что вторичная бутильная часть связана через метиленовую группу через связь, на конце которой находится волнистая линия. Когда буквенное обозначение используют для обозначения части заместителя, тире используют для указания на точку связывания с указанным субстратом, например, -СН2-С(О)-СН2С1 указывает на то, что ацетилхлоридная часть связана через метиленовый фрагмент этой части.
Когда какая-либо переменная (например, n, Ra, Rb и т.д.) встречается более одного раза в какомлибо компоненте или в формуле I, ее определение в каждом случае является независимым от ее определения в каждом другом случае, если нет иных указаний в месте определения. Специалисту в данной области будет понятно, что выбор комбинаций различных заместителей, определяемых в структурном представлении, т.е. R1, RA, осуществляется в соответствии с хорошо известными принципами соединения и стабильности химических структур, и комбинации заместителей и/или переменных допустимы, только
- 7 043952 если такие комбинации приводят к стабильным соединениям.
Стабильное соединение представляет собой соединение, которое может быть получено и выделено, и чья структура и свойства сохранятся и могут оставаться по существу неизменными в течение периода времени, достаточного, чтобы позволить применение соединения для целей, описанных в настоящем описании (например, терапевтическое введение индивидууму). Соединения по настоящему изобретению ограничиваются стабильными соединениями, охватываемыми формулой I.
Когда какая-либо переменная или часть выражена в форме диапазона, например (-CH2-)1_4, включены обе границы указанного диапазона (т.е. 1 и 4 в данном примере), а также все целые числа между ними (т.е. 2 и 3 в примере).
Термин галоген включает фтор, хлор, бром и йод, если конкретно не указано в месте упоминания.
Как используют в настоящем описании, термин индивидуумы (альтернативно пациенты) отно сится к животному, предпочтительно млекопитающему, и, в частности, к человеку или не являющемуся человеком животному, включая сельскохозяйственных животных и домашних животных, включая, но не ограничиваясь ими, крупный рогатый скот, лошадей, овец, свиней, коз, кроликов, кошек, собак и других млекопитающих, нуждающихся в лечении. В некоторых вариантах осуществления индивидуумом предпочтительно является человек. Как используют в рамках изобретения, термин введение и его варианты (например, проведение введения соединения) в отношении соединения формулы I означает предоставление соединения или его фармацевтически приемлемой соли индивидууму, нуждающемуся в лечении.
Как упоминалось выше, в одном аспекте настоящее изобретение относится к предоставлению соединений формулы I или их фармацевтически приемлемых солей, которые имеют свойства антагонистов функции PCSK9.
В одном варианте осуществления соединения формулы I имеют структуру формулы IA:
Формула IA, где
R1 выбран из:
(a) -Н; или (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой:
(i) -H;
(ii) -NH2;
(iii) -N+H3;
(iv) -N+(HaC)3;
(v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B, где R14B представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или N+(CH3)3;
(vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]1_4-(CH2)y13R14B, предпочтительно -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B, где у12 и у13 на равны оба 2 и независимо составляют от 2 до 4; и
R14b представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
(vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)za-N+(CH3)3, где za равно 3 или 4; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой:
(ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
(aii) -N+(CH3)3; или
НО (aiii) часть формулы:
- 8 043952
R2 выбран из:
(a) -Н; и (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A выбран из:
(i) -H;
(ii) -NH2;
(iii) -N+H3;
(iv) -N+(H3C)3;
(v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]1-4-(CH2)2R14B, предпочтительно -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B, где R14B представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
(vi) -NHC(O)-[(CH2)y1,-O-]2-(CH2)y13R14B, где у 12 и у13 на равны оба 2 и независимо составляют от 2 до 4; и
R14b представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
(vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C или 4; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)zb-N+(CH3)3, где zb равно 3 представляет собой:
(ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
(aii) -N+(CH3)2R14ca, где R14ca представляет собой -СН3 или -(СН2)1-4-ОСН3;
(aiv) часть формулы: или (aiii) часть формулы:
’ или
где Y14Cb и Y14Cc равны 1-4;
R1 и R2 могут быть связаны вместе с образованием части формулы: где
G1, RG1a и RG1b определяются следующим образом:
(a) G1 представляет собой линкерную часть формулы:
где nq1 равен от 1 до 6, mq1 равен 0, 1 или 2 и вместе величины nq1 и
mq1 выбраны так, чтобы длина линкерной части, которую они определяют, не превышала всего 8 атомов углерода и/или кислорода, составляющих цепь, включающую атом углерода в цепи, который образует карбонильную часть;
RG1a выбран из: (i) -H; и (ii) алкила из вплоть до 4 атомов углерода; и
RG1b выбран из:
(i) части формулы:
(ii) части формулы:
или (b) G1 представляет собой линкерную часть формулы:
где nq2 равен 0, 1 или 2, mq2 равен от 1 до 6, и вместе величины nq2 и mq2 выбраны так, чтобы длина
- 9 043952 линкерной части, которую они определяют, не превышала всего 8 атомов углерода и/или кислорода, составляющих цепь, включающую атом углерода в цепи, который образует карбонильную часть;
RG1a выбран из:
(i) части формулы:
и (ii) части формулы:
RG1b выбран из: (i) -H; и (ii) алкила из вплоть до 4 атомов углерода; R8 представляет собой -CH3 или
часть формулы:
где R8a представляет собой -Н или линейный, разветвленный или циклический алкил из вплоть до четырех атомов углерода; А выбран из:
(а) части формулы:
(b) -СН2 -(СН2)у-СН2-, где у равен от 1 до 6;
А31 (с) части формулы:
’ где Ab1 представляет собой:
(i) часть формулы:
’ где x равен от 1 до 6; или
(ii) часть формулы:
’ где у равен от 1 до 5;
(d) части формулы: -CH2-(CH2)m-O-(CH2)n-, где m=1-5, и n=0 или 1-4;
В представляет собой:
(a) связь;
(b) -(СН2)1-4; или
(c) часть формулы:
D представляет собой:
В
О (а) часть формулы:
или -(СН2)2-4-О-, и А и В являются такими, как определено выше;
’ где Е представляет собой -СН2- 10 043952
линейный разветвленный или циклический алкил из вплоть до четырех атомов углерода, и А и В являются такими, как определено выше, или любой его фармацевтически приемлемой соли.
В одном варианте осуществления соединений формулы IA, R1 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой:
(i) -H;
(ii) -NH2;
(iii) -N+H3; или (iv) -К+(НзС)з;
R2 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A выбран из:
(i) -H;
(ii) -NH2;
(iii) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]1—4-(CH2)2R14B, предпочтительно -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B, где R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N+(CH3)3;
(iv) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B, где y12 и у13 на равны оба 2 и независимо составляют от 2 до 4; и
R14B представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
(v) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)zb-N+(CH3)3, где zb равно 3 или 4; и (vi) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой:
(ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
(aii) -N+(CH3)2R14ca, где R14ca представляет собой -СН3 или -(СН2)1-4-ОСН3;
(aiv) часть формулы:
(aiii) часть формулы: ’ или
О
где Y14Cb и Y14Cc равны от 1 до 4;
или
Ρΰρ
О
R8 представляет собой -СН3 или часть формулы: ’ где R8a представляет собой -Н или линейный, разветвленный или циклический алкил из вплоть до четырех атомов углерода; А выбран из:
- 11 043952
(а) части формулы:
(b) -CH2-(CH2)y-CH2-, где у равен от 1 до 6;
(с) часть формулы:
Λ31 (i) часть формулы:
’ где Ab1 представляет собой:
, где x равен от 1 до 6; или (ii) часть формулы:
, где у равен от 1 до 5; и (d) часть формулы: -CH2-(CH2)m-O-(CH2)n-, где m=1-5, и n=0 или 1-4;
В представляет собой:
(a) -(СН2)1-4; или
(b) часть формулы:
D представляет собой:
нейную, разветвленную или циклическую алкильную группу из вплоть до четырех атомов углерода, и А и В являются такими, как определено выше, или фармацевтически приемлемую соль любого из них.
В одном варианте осуществления соединение формулы IA, D представляет собой часть формулы:
где Е представляет собой -CH2- или -(CH2)2-O-, и А и В являются такими, как определено выше в формуле IA.
В одном варианте осуществления соединения формулы IA, А представляет собой:
(a) -(СН2)6;
- 12 043952 (b) часть формулы:
где x равен от 1 до 3; или (с) часть формулы:
В другом варианте осуществления соединения формулы IA, R2 представляет собой:
(a) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой:
(a) -Н;
(b) -СНз;
(c) -NH2;
(d) -N+Нз;
(e) -NWb;
(f) -NH-C(O)-[(CH2)2-4-O-]2-4-(CH2)2-4R14B, где R14B представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N (CH3)3; (g) -NH-C(O)-[(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой:
(ai) -O-(CH2)2-4-N+(CH3)3;
(aii) -N+(CH3)3; или (aiii) часть формулы:
’ или (b) часть формулы
В следующем варианте осуществления соединения формулы IA, R1 выбран из:
(a) -Н;
(b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой:
(i) -H;
(ii) -N+H3; или (iii)-NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2-N+(CH3)3.
В другом варианте осуществления соединения формулы IA, А представляет собой -СН2-(СН2)у-СН2-, где у равен 3-5. В следующем варианте осуществления А представляет собой -(СН2)6.
В другом варианте осуществления соединения формулы IA, В представляет собой часть формулы:
В другом варианте осуществления соединения формулы IA, R1 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой -Н. В другом варианте осуществления соединения формулы IA, R1 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1, и R14A представляет собой -Н.
В другом варианте осуществления соединения формулы IA, R2 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой N+(CH3)2R14ca, где R14ca представляет собой -СН3.
В другом варианте осуществления соединения формулы IA, R8 представляет собой часть формулы:
- 13 043952
R“P
Q ’ где R8a представляет собой -Н или линейный алкил из вплоть до четырех атомов углерода.
R03
Q
В следующем варианте осуществления R8 представляет собой часть формулы: ’ где
R8b представляет собой -Н, -СН3 или -С(СН3)3.
В некоторых вариантах осуществления предпочтительно, чтобы соединения формулы I имели структуру формулы II или формулы IIA, или их формулу фармацевтически приемлемой соли:
Формула ПА, где A, R1 и R2 являются такими, как определено выше в формуле IA, и В1 представляет собой -(СН2)0-2, и D1 выбран из:
- 14 043952
В некоторых вариантах осуществления формулы II или формулы IIA предпочтительно, чтобы D1
представлял собой часть формулы:
В некоторых вариантах осуществления формулы II или формулы IIA, предпочтительно, чтобы D1
представлял собой часть формулы:
В некоторых вариантах осуществления формулы II или формулы IIA предпочтительно, чтобы D1
представлял собой часть формулы:
В некоторых вариантах осуществления формулы II или формулы IIA, предпочтительно, чтобы D1
представлял собой часть формулы:
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы I предпочтительно представляет собой соединение формулы IID:
(а) часть формулы:
, или где D2 представляет собой:
(b) часть формулы:
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы I предпочтительно представляет собой соединение формулы IIE:
- 15 043952
Формула IIE. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы I предпочтительно представляет собой соединение формулы III:
где A, R1 и R2 являются такими, как определено выше в формуле IA, и D2 представляет собой часть
формулы:
В некоторых вариантах осуществления формулы III предпочтительно, чтобы D2 представлял собой
часть формулы:
В некоторых вариантах осуществления формулы III предпочтительно, чтобы D2 представлял собой
часть формулы:
В некоторых вариантах осуществления формулы III предпочтительно, чтобы D2 представлял собой
- 16 043952
часть формулы:
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы I предпочтительно представляет собой соединение формулы IV:
Формула IV, где A, R1 и R2 являются такими, как определено выше в формуле IA. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы I представляет собой соединение формулы V:
где
А, В, R1 и R2 являются такими, как определено выше в формуле IA; и
- 17 043952
В некоторых вариантах осуществления формулы I, формулы IA, формулы II, формулы IIA, формулы III, формулы IV или формулы V, предпочтительно, чтобы А представлял собой часть формулы: -(СН2)уа, где уа равен от 4 до 6. В некоторых вариантах осуществления формулы I, формулы IA, формулы II или формулы IIA, предпочтительно, чтобы А представлял собой часть формулы: -CH2-(CH2)ma-O-(CH2)na-, где ma равен 2 или 3 и na равен 0 или 1. В некоторых вариантах осуществления формулы III, формулы IV или формулы V, предпочтительно, чтобы А представлял собой часть формулы: -СН2-(СН2)ma-О-(СН2)na-, где ma равен 2 или 4 и na равен 0, 1 или 2. В некоторых вариантах осуществления формулы I, формулы IA, формулы II, формулы IIA, формулы III, формулы IV или формулы V, предпочтительно, чтобы А
представлял собой часть формулы:
’ где yb равен от 1 до 3. В некоторых ва- риантах осуществления формулы I, формулы IA, формулы II, формулы IIA, формулы III, формулы IV
или формулы V, предпочтительно, чтобы А представлял собой часть формулы:
Также в рамках настоящего изобретения в качестве соединений формулы I предусматриваются соединения Ех-1, Ех-2, Ех-3, Ех-4, Ех-5, Ех-6, Ех-7, Ех-8, Ех-9, Ех-10, Ех-11, Ех-12, Ех-13, Ех-14, Ех-15, Ех16, Ех-17, Ех-18, Ех-19, Ех-20, Ех-21, Ех-22, Ех-23, Ех-24, Ех-25, Ех-26, Ех-27, Ех-28, Ех-29, Ех-31, Ех-35, Ех-36, Ех-38, Ех-39, Ех-40, Ех-41, Ех-44, Ех-47, Ех-48, Ех-49, Ех-50, Ех-51, Ех-52, Ех-53, Ех-54, Ех-55, Ех56, Ех-57, Ех-58, Ех-59, Ех-60 и Ех-61, или любая их фармацевтически приемлемая соль. Эти соединения, которые описаны в табл. 1, также называют в настоящем описании соединениями по изобретению.
- 18 043952
Таблица 1
- 19 043952
- 20 043952
- 21 043952
- 22 043952
-23 043952
где А- представляет собой фармацевтически приемлемый анион.
Термин соль(и) и его применение в выражении фармацевтически приемлемые соли, используемом в настоящем описании, включает любые из следующих: кислотные соли, образованные с неорганическими и/или органическими кислотами, основные соли, образованные с неорганическими и/или орга- 24 043952 ническими основаниями, цвитерионные и четвертичные комплексы аммония. Соли соединений по изобретению могут быть получены способами, известными средним специалистам в данной области, например, посредством реакции соединения по изобретению с количеством кислоты или основания, таким как эквивалентное количество, в среде, такой как среда, в которой соль выпадает в осадок, или в водной среде с последующей лиофилизацией.
Соединения по изобретению содержат трикоординированные атомы азота, например, первичные, вторичные или третичные аминочасти, где, как известно, одна пара электронов, присутствующая на атоме азота, может быть протонирована соответствующей кислотой или алкилирована соответствующим реагентом, например, алкилбромидом, в соответствующих условиях реакции, с образованием тетракоординированного заряженного азота, стабилизированного анионом, образующимся в процессе, например, ионом галогена или сопряженным основанием. Таким образом, соединения по изобретению можно получать в форме свободного основания или выделять в форме четвертичного комплекса или солевого комплекса. В некоторых случаях, где существует соответствующий кислотный протон, ближний к основному азоту, является возможным образование цвиттерионного комплекса. Как этот термин используют в настоящем описании, соли соединений по изобретению, все из кислотных солей, образованных с неорганическими и/или органическими кислотами, основных солей, образованных с неорганическими и/или органическими основаниями, солей, которые включают цвитерионный элемент, например, где соединение содержит как основную часть, например, но не ограничиваясь ими, атом азота, например, амин, пиридин или имидазол, и кислотную часть, например, но не ограничиваясь ими, карбоновую кислоту, и четвертичные комплексы аммония, включены в объем соединений по изобретению, описанных в настоящем описании.
Таким образом, структурное представление соединений по изобретению либо в форме свободного основания, либо в форме соли, либо в цвиттерионной форме, либо в форме четвертичного аммония, также включают все другие формы таких соединений, рассмотренных выше. Таким образом, один аспект изобретения относится к предоставлению соединений по изобретению в форме фармацевтически приемлемой соли, цвитерионного комплекса или четвертичного комплекса аммония. Специалистам в данной области будут понятны случаи, когда соединения по изобретению могут образовывать такие комплексы, включая случаи, где тетракоординированный азот может быть кватернизированным или протонированным и форма заряженного азота стабилизирована анионом. Термин фармацевтически приемлемая соль относится к соли (включая четвертичный комплекс аммония и внутреннюю соль, такую как цвитерионный комплекс), которая обладает эффективностью, сходной или превышающей эффективность формы свободного основания соединения, и которая не является биологически или иным образом нежелательной (например, не является ни токсичной, ни иным образом вредоносной для ее реципиента).
Образование фармацевтически пригодных солей из основных (или кислотных) фармацевтических соединений описано, например, S. Berge et al., Journal of Pharmaceutical Sciences (1977) 66(1) 1-19; P. Gould, International J. of Pharmaceutics (1986) 33 201-217; Anderson et al., The Practice of Medicinal Chemistry (1996), Academic Press, New York; in The Orange Book (Food & Drug Administration, Washington, D.C. на их веб-сайте); и Р. Heinrich Stahl, Camille G. Wermuth (Eds.), Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use, (2002) Int'l. Union of Pure and Applied Chemistry, pp. 330-331. Эти документы включены в настоящее описание в качестве ссылок.
Настоящее изобретение относится как к формам свободных оснований для соединений по изобретению, так и ко всем доступным солям, включая соли, которые являются общепризнанными в качестве безопасных для применения для получения фармацевтических составов, и соли, которые могут быть получены специалистами в данной области, а затем классифицированы как в целом признанные безопасными для применения для получения фармацевтических составов, называемым в настоящем описании фармацевтически приемлемыми солями. Как будет понятно, соединения в форме свободного основания можно получать посредством контроля условий выделения соединения в ходе синтеза или посредством нейтрализации или ионного обмена из солевых форм соединений по изобретению.
Примеры фармацевтически приемлемых кислотных солей включают, но не ограничиваются ими, ацетаты, включая трифторацетаты, адипаты, альгинаты, аскорбаты, аспартаты, бензоаты, бензолсульфонаты, бисульфаты, бораты, бутираты, цитраты, камфораты, камфорсульфонаты, циклопентанпропионаты, диглюконаты, додецилсульфаты, этансульфонаты, фумараты, глюкогептаноаты, глицерофосфаты, гемисульфаты, гептаноаты, гексаноаты, гидрохлориды, гидробромиды, гидройодиды, 2гидроксиэтансульфонаты, лактаты, малеаты, метансульфонаты, метилсульфаты, 2-нафталинсульфонаты, никотинаты, нитраты, оксалаты, памоаты, пектинаты, персульфаты, 3-фенилпропионаты, фосфаты, пикраты, пивалаты, пропионаты, салицилаты, сукцинаты, сульфаты, сульфонаты (такие как те, что упомянуты в настоящем описании), тартраты, тиоцианаты, толуолсульфонаты (также известные как тозилаты), ундеканоаты и т.п.
Примеры фармацевтически приемлемых основных солей включают, но не ограничиваются ими, соли аммония, соли щелочных металлов, такие как соли натрия, лития и калия, соли щелочноземельных металлов, такие как соли кальция и магния, соли алюминия, соли цинка, соли с органическими основаниями (например, органические амины), такими как бензатины, диэтиламин, дициклогексиламины, гид- 25 043952 рабамины (образованные с N,N-бис(дегидроабиэтил)этилендиамином), N-метил-О-глюкамины, N-метилD-глюкамиды, трет-бутиламины, пиперазин, фенилциклогексиламин, холин, трометамин и соли с аминокислотами, такими как аргинин, лизин и т.п. Основные азотсодержащие группы можно конвертировать в ион аммония или кватернизировать средствами, такими как низшие алкилгалогениды (например, метил, этил, пропил и бутилхлориды, бромиды и йодиды), диалкилсульфаты (например, диметил, диэтил, дибутил и диамилсульфаты), галогениды длинной цепи (например, децил, лаурил, миристил и стеарилхлориды, бромиды и йодиды), аралкилгалогениды (например, бензил и фенэтилбромиды), и другие.
Термин фармацевтически приемлемый анион относится к аниону, пригодному для образования фармацевтически приемлемой соли.
Следующие примеры фармацевтически приемлемых солей, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают, но не ограничиваются ими, фторид, хлорид, бромид и йодид.
Как правило, подразумевается, что соли соединения представляют собой фармацевтически приемлемые соли, входящие в объем изобретения.
Термины очищенный, в очищенной форме или в выделенной и очищенной форме для соединения относятся к физическому состоянию указанного соединения после выделения из процесса синтеза или природного источника, или их комбинации. Таким образом, термины очищенный, в очищенной форме или в выделенной и очищенной форме для соединения относятся к физическому состоянию указанного соединения после получения в процессе очистки или способами, описанными в настоящем описании или хорошо известными квалифицированному специалисту, и в достаточной чистоте для охарактеризации стандартными аналитическими способами, описанными в настоящем описании или хорошо известными квалифицированному специалисту. Соединения по изобретению включают любую форму соединения, в том числе in situ в реакционной смеси, а также в выделенной и очищенной форме, полученной стандартными способами. Также включены полимерные формы соединений по изобретению и их сольваты и пролекарства.
Определенные соединения по изобретению могут существовать в различных таутомерных формах, например, но не ограничиваются ими, кето/енольные таутомерные формы, таутомерные формы иминэнамин, и, например, гетероароматические формы, такие как следующие части:
Аналогичным образом, если нет иных указаний, подразумевают, что предоставление структурного изображения любой таутомерной формы соединения, которая демонстрирует таутомерию, включает все такие таутомерные формы соединения. Таким образом, когда соединения по изобретению, их соли и сольваты, и их пролекарства могут существовать в различных таутомерных формах или в равновесии среди таких форм, все такие формы соединения охватываются и включены в объем изобретения.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к фармацевтическим композициям, содержащим одно или несколько соединений по изобретению. Как используют в рамках изобретения, термин фармацевтическая композиция включает по меньшей мере одно фармацевтически активное соединение и по меньшей мере один эксципиент и подразумевается, что он охватывает как комбинацию конкретных ингредиентов в конкретных количествах, так и любой продукт, который является результатом, прямо или непрямо, комбинирования конкретных ингредиентов в конкретных количествах.
Как будет понятно специалисту в данной области, эксципиенты представляют собой любой компонент, который адаптирует композицию к конкретному пути введения или облегчает переработку композиции в дозированную форму, самостоятельно не демонстрируя активного фармацевтического эффекта. Как правило композиции содержат более одного эксципиента в зависимости от пути введения и характеристик вводимого активного вещества. Примеры эксципиентов, которые сообщают композиции свойства, которые облегчают хранение или переработку, включают, но не ограничиваются ими, смазывающие вещества или добавки для прессования в порошковых лекарственных средствах, предназначенных для таблетирования, и стабилизаторы эмульсии в композициях, в которых активное вещество присутствует в форме эмульсии. Примерами эксципиентов, которые адаптируют композицию к желаемому пути введе ния, являются, например, но не ограничиваясь ими, для перорального введения: усилители всасывания, способствующие всасыванию из желудочно-кишечного тракта, для трансдермального или трансмукозального введения: усилители проникновения, например, усилители проникновения, используемые в адгезивном кожном пластыре или композициях для буккального введения.
Независимо от функции, которую эксципиенты выполняют в композиции, эксципиенты в совокупности называют в настоящем описании носителем. Как правило, составы могут содержать вплоть до приблизительно 95 процентов активного ингредиента, а остальное носитель, хотя можно получать составы с другими соотношениями. Как правило, приемлемые фармацевтические композиции содержат под
- 26 043952 ходящую концентрацию активного вещества, чтобы эффективное количество антагониста PCSK9 могло быть предоставлено в индивидуальной дозированной форме приемлемого объема, исходя из пути введения, так чтобы оно могло обеспечить терапевтический сывороточный уровень активного вещества в течение приемлемого периода времени у индивидуума, которому вводят композицию, и чтобы композиция сохраняла биологическую активность в ходе хранения при температуре в приемлемом диапазоне в течение приемлемого периода времени.
Фармацевтическая композиция, как используют в рамках изобретения, относится как к бестарной композиции, т.е. составленному материалу, который еще не сформирован в индивидуальные дозированные единицы для введения, так и к композиции, содержащейся в индивидуальных дозированных единицах.
В то время как композиции по изобретению можно использовать в бестарной форме, будет понятно, что для большинства применений композиции могут быть включены в дозированную форму, обеспечивающую индивидуальные единицы, пригодные для введения пациенту, причем каждая дозированная форма содержит количество выбранной композиции, которая содержит эффективное количество указанного одного или нескольких соединений формулы I. Примеры подходящих дозированных форм включают, но не ограничиваются ими, (i) дозированные формы, адаптированные для перорального введения, например, жидкость, гель, порошок, твердая или полутвердая фармацевтическая композиция, которая заключена в капсулу или прессована в таблетку и может содержать, кроме того, одно или несколько покрытий, которые модифицируют ее свойства высвобождения, например, покрытия, которые обеспечивают отсроченное высвобождение, или составы, которые имеют свойства пролонгированного высвобождения; (ii) дозированные формы, адаптированные для введения через ткани полости рта, например, быстрорастворимая таблетка, пастилка, раствор, гель, саше или игольную матрицу, пригодную для обеспечения введения внутрь слизистой оболочки; (iii) дозированные формы, адаптированные для введения через слизистую оболочку полости носа или верхнюю дыхательную полость, например, состав раствора, суспензии или эмульсии для распыления в нос или дыхательные пути; (iv) дозированные формы, адаптированные для трансдермального введения, например, пластырь, крем или гель; (v) дозированные формы, адаптированные для внутрикожного введения, например, микроигольная матрица; (vi) дозированные формы, адаптированные для внутривенной (в/в) инфузии, например, на протяжении длительного периода, с использованием насоса для в/в инфузий; (vii) дозированные формы, адаптированные для внутримышечного (в/м) введения, например, инъекционный раствор или суспензию, и которые могут быть адаптированы для формирования депо, имеющего свойства пролонгированного высвобождения; (viii) дозированные формы, адаптированные для капельного внутривенного (в/в) введения, например, раствор или суспензию, например, в качестве в/в раствора или концентрата для введения в пакет для в/в вливания с солевым раствором; (ix) дозированные формы, адаптированные для подкожного введения, в том числе на протяжении пролонгированного периода времени, посредством имплантации стержня или другого устройства, из которых соединение диффундирует в окружающую ткань и тем самым обеспечивает непрерывный сывороточный терапевтический уровень; или (x) дозированные формы, адаптированные для доставки через ректальную или вагинальную слизистую оболочку, например, суппозиторий.
Фармацевтические композиции могут быть твердыми, полутвердыми или жидкими. Препараты в твердой, полутвердой и жидкой форме могут быть адаптированы к различным способам введения, примеры которых включают, но не ограничиваются ими, порошки, диспергируемые гранулы, минитаблетки, драже, которые можно использовать, например, для таблетирования, инкапсулирования или прямого введения. Кроме того, препараты в жидкой форме включают, но не ограничиваются ими, растворы, суспензии и эмульсии, которые, например, но не исключительно, можно использовать для получения составов, предназначенных для приема внутрь, ингаляционного или внутривенного (в/в) введения, например, но не ограничиваясь ими, введение посредством в/в капельницы или инфузионного насоса, внутримышечной (IM) инъекции, например, болюса, который высвобождается в течение пролонгированного периода, прямой в/в инъекции, или адаптировать для подкожных путей введения.
Другие пути введения, которые могут предусматриваться, включают интраназальное введение, или введение на некоторые другие слизистые оболочки. Составы, полученные для введения на различные слизистые оболочки, также могут включать дополнительные компоненты, адаптирующие их для такого введения, например, модификаторы вязкости.
Хотя в некоторых вариантах осуществления композиции, пригодные для применения в твердой дозированной форме, например, таблетка или быстроплавящийся растворяющийся в полости рта состав, являются предпочтительными для введения соединения по изобретению или его соли, композиция по изобретению может быть составлена для введения посредством других путей, упомянутых выше. Примеры включают препараты аэрозолей, например, пригодные для введения посредством ингаляции или через слизистую оболочку носа, и могут включать растворы и твердые вещества в форме порошка, которые могут быть в комбинации с фармацевтически приемлемым пропеллентом, например, инертным сжатым газом, например, азотом. Также включены препараты в твердой форме, которые предназначены для конвертирования, непосредственно перед применением, в суспензию или раствор, например, для перорального или парентерального введения. Примеры таких твердых форм включают, но не ограничиваются ими, лиофилизированные составы и жидкие составы, адсорбированные на твердую адсорбирующую среду.
- 27 043952
Например, соединения по изобретению также могут быть доставлены трансдермальным или трансмукозальным путем, например, из жидкой формы, суппозитория, крема, пены, геля или быстро растворяющейся твердой формы. Будет понятно, что трансдермальные композиции также могут иметь форму кремов, лосьонов, аэрозолей и/или эмульсий и могут быть предоставлены в единичной дозированной форме, которая включает трансдермальный пластырь, известный в данной области, например, пластырь, который включает либо матрикс, содержащий фармацевтически активное соединение, либо резервуар, который содержит твердую или жидкую форму фармацевтически активного соединения.
Примеры фармацевтически приемлемых носителей и способов производства различных композиций, упомянутых выше, могут быть найдены в A. Gennaro (ed.), Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 20th Edition, (2000), Lippincott Williams & Wilkins, Baltimore, MD. Дополнительные примеры публикаций, касающихся составления, могут быть найдены в приведенных ниже публикациях. Фармацевтические композиции могут быть составлены посредством любой из ряда стратегий, известных в данной области см., например, McGoff and Scher, 2000 Solution Formulation of Proteins/Peptides: McNally, E.J., ed. Protein Formulation and Delivery. New York, NY: Marcel Dekker; pp. 139-158; Akers & Defilippis, 2000, Peptides and Proteins as Parenteral Solutions. Pharmaceutical Formulation Development of Peptides and Proteins. Philadelphia, PA: Taylor and Francis; pp. 145-177; Akers et al., 2002, Pharm. Biotechnol. 14:47-127.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам использования PCSK9специфических соединений-антагонистов, описанных в настоящем описании, для антагонизма функции PCSK9, которые дополнительно описано ниже. Использование термина антагонизм на протяжении настоящей заявки относится к предоставлению пораженной ткани(ям) вещества, которое оказывает противоположное действие, ингибирует, нейтрализует или сокращает одну или несколько функций PCSK9 в пораженных тканях. Ингибирование или антагонизм одного или нескольких ассоциированных с PCSK9 функциональных свойств могут быть без труда определены с использованием методологий, известных в данной области (см., например, Barak & Webb, 1981 J. Cell Biol. 90:595-604; Stephan & Yurachek, 1993 J. Lipid Res. 34:325330; и McNamara et al., 2006 Clinica Chimica Acta 369:158-167), а также методологий, описанных в настоящем описании. Ингибирование или антагонизм могут обеспечивать снижение активности PCSK9 относительно активности, наблюдаемой в отсутствии антагониста или, например, активности, наблюдаемой, когда присутствует контрольный антагонист с посторонней специфичностью. Предпочтительно, PCSK9-специфический антагонист в соответствии с настоящим изобретением является антагонистом функции PCSK9 так, чтобы происходило снижение по меньшей мере 10% измеряемого параметра, включая, но не ограничиваясь ими, активность, описанную в настоящем описании, и, более предпочтительно, снижение измеряемого параметра по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% и 95%. Такое ингибирование/антагонизм функции PCSK9 является особенно эффективным в случаях, когда функционирование PCSK9 по меньшей мере частично вносит вклад в конкретный фенотип, заболевание, нарушение или состояние, которые негативно влияют на индивидуума.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способу обеспечения антагонизма активности PCSK9, который включает приведение в контакт клетки, популяции клеток или образца ткани, которые способны поддаваться влиянию PCSK9 (т.е. которые экспрессируют и/или содержат рецепторы LDL), с конкретным PCSK9-специфическим антагонистом, описанным в настоящем описании, в условиях, которые позволяют указанному антагонисту связываться с PCSK9, когда он присутствует, и ингибировать ингибирование посредством PCSK9 клеточного поглощения LDL. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение включает такие способы, где клеткой является клетка человека. Дополнительные варианты осуществления настоящего изобретения включают такие способы, где клетка представляет собой клетку мыши.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способу обеспечения антагонизма активности PCSK9 у индивидуума, который включает введение индивидууму терапевтически эффективного количества PCSK9-специфического антагониста по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления способы обеспечения антагонизма функции PCSK9 предназначены для лечения, как определено в настоящем описании, PCSK9-ассоциированного заболевания, нарушения или состояния или, альтернативно, для обеспечения терапии заболевания, нарушения или состоянии, при которых были бы полезными эффекты антагонистов PCSK9.
Настоящее изобретение, таким образом, охватывает применение PCSK9-специфических антагонистов, описанных в настоящем описании, в различных способах лечения, где является желательным антагонизм функции PCSK9. Как используют в рамках изобретения, термин способ лечения относится к порядку действий, приводящему к изменению по меньшей мере одного симптома заболевания, который может быть профилактическим или терапевтическим по своей природе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к способу лечения состояния, ассоциированного и/или приписываемого активности PCSK9, или состояния, где функционирование PCSK9 противопоказано для конкретного индивидуума, причем способ включает введение индивидууму терапевтически эффективного количества соединения формулы I, являющегося антагонистом PCSK9, или его фармацевтически приемлемой соли. В некоторых вариантах осуществления состояние может представлять собой атеросклероз, гиперхолестеринемию, коронарную болезнь сердца, метаболический синдром, острый коронарный син- 28 043952 дром или родственное сердечно-сосудистое заболевание и кардиометаболические состояние, или может представлять собой заболевание или состояние, при котором активность PCSK9 противопоказана.
Способы лечения в соответствии с настоящим изобретением включают введение индивидууму терапевтически (или профилактически) эффективного количества PCSK9-специфического антагониста по настоящему изобретению. Использование терминов терапевтически эффективный или профилактически эффективный в отношении количества относится к количеству, необходимому в предполагаемой дозировке для достижения желаемого терапевтического и/или профилактического эффекта в течение желаемого периода времени. Желаемый эффект может представлять собой, например, облегчение, смягчение, уменьшение или устранение по меньшей мере одного симптома, ассоциированного с подвергаемым лечению состоянием. Эти количества могут варьироваться, как будет понятно специалисту в данной области, в зависимости от различных факторов, включая, но не ограничиваясь ими, болезненное состояние, возраст, пол и масса индивидуума, и способность РС8К9-специфического антагониста индуцировать желаемый эффект у индивидуума. Ответ может быть зарегистрирован посредством анализа in vitro, исследований in vivo на не являющихся человеком животных, и/или дополнительно подтвержден в клинических испытаниях.
В некоторых вариантах осуществления предпочтительно вводить соединение-антагонист PCSK9 по изобретению в форме фармацевтической композиции, как описано в настоящем описании.
Дозирование терапевтических средств-антагонистов входит в пределы способностей специалиста в данной области, см., например, Lederman et al., 1991 Int. J. Cancer 47:659-664; Bagshawe et al., 1991 Antibody, Immunoconjugates and Radiopharmaceuticals 4:915-922, и варьируется, исходя из ряда факторов, например, но не ограничиваясь ими, факторы, упомянутые выше, включая состояние пациента, подвергаемую лечению область, путь введения и желаемое лечение, например, профилактику или неотложное лечение, и т.п. Врач или ветеринар, являющийся средним специалистом в данной области, может без труда определить и назначить эффективное терапевтическое количество антагониста.
Индивидуум, может нуждаться или желать лечения от существующего заболевания или медицинского состояния. Как используют в рамках изобретения, индивидуум, нуждающийся в лечении существующего состояния, охватывает как определение необходимости медицинским специалистом, так и желание индивидуума получить такое лечение. Когда соединение или его соль предоставляются в комбинации с другими активными веществами, под введением и его вариантами в каждом случае подразумевается предоставление соединения или его соли и других веществ совместно или одновременно, или в ходе раздельного введения на протяжении периода времени. Когда средства в комбинации вводят одновременно, их можно вводить вместе в одной композиции или их можно вводить по отдельности. Понятно, что комбинация активных веществ может представлять собой одну композицию, содержащую все активные вещества, или множество композиций, каждая из которых содержит одно или несколько активных веществ. В случае двух активных веществ комбинация может представлять собой либо единую композицию, содержащую оба активных вещества, либо две отдельных композиции, каждая из которых содержит одно из веществ; в случае трех активных веществ, комбинация может представлять собой либо одну композицию, содержащую все три вещества, либо три отдельных композиции, каждая из которых содержит одно из веществ, либо две композиции, одна из которых содержит два вещества, а другая содержит третье вещество и т.д.
Композиции и комбинации по настоящему изобретению в подходящем случае вводят в эффективных количествах. Термин эффективное количество означает количество активного соединения, достаточное для обеспечения антагонизма PCSK9 и, таким образом, для индукции желаемого ответа (т.е. индукция терапевтического ответа при лечении или управлении течением состояний ассоциированных с или находящихся под воздействием функции PCSK9, включая, но не ограничиваясь ими, атеросклероз, гиперхолестеринемию, коронарную болезнь сердца, метаболический синдром, острый коронарный синдром и родственное сердечно-сосудистое заболевание и кардиометаболические состояния у животного или человека).
Фактическая используемая дозировка может варьироваться в зависимости от потребностей пациента и тяжести подвергаемого лечению состояния. Определение надлежащего режима дозирования для конкретного состояния входит в пределы способностей специалиста в данной области, например, как описано в стандартной литературе, например, как описано в Physicians' Desk Reference (PDR), например, издание 1996 года (Medical Economics Company, Montvale, NJ 07645-1742, США), Physician's Desk Reference, 56th Edition, 2002 (опубликованном Medical Economics company, Inc. Montvale, NJ 07645-1742), или Physician's Desk Reference, 57th Edition, 2003 (опубликованном Thompson PDR, Montvale, NJ 076451742); содержание которых включено в настоящее описание в качестве ссылок. Для удобства общая суточная дозировка может быть разделенной и может вводиться частями в течение суток при необходимости, или может доставляться непрерывно.
PCSK9-специфический антагонист можно вводить индивидууму любым путем введения, известным в данной области, включая, но не ограничиваясь ими, пероральное введение, введение посредством инъекции (конкретные варианты осуществления которого включают внутривенную, подкожную, внутрибрюшинную или внутримышечную инъекцию), или введение посредством ингаляционного, интрана- 29 043952 зального или местного введения, либо отдельно, либо в комбинации с другими средствами, предназначенными для способствования лечению индивидуума. PCSK9-специфический антагонист также можно вводить посредством инъекционных устройств, шприцов-ручек, безыгольных устройств и систем доставки в виде подкожных пластырей. Путь введения должен определяться с учетом ряда факторов, известных специалисту в данной области, включая, но не ограничиваясь ими, желаемые физикохимические характеристики лекарственного средства.
В комбинации с соединением формулы I можно вводить одно или несколько дополнительных фармакологически активных веществ. Дополнительное активное вещество (или вещества) означает фармацевтически активное вещество (или вещества), которое является активным в организме, включая пролекарства, которые конвертируются в фармацевтически активную форму после введения, которые отличаются от соединения формулы I, и также включает свободную кислоту, свободное основание и фармацевтически приемлемые соли указанных дополнительных активных веществ. Как правило, любое подходящее дополнительное активное вещество или вещества, включая, но не ограничиваясь ими, антигипертензивные вещества, антиатеросклеротические вещества, такие как модифицирующие липиды соединения, антидиабетические вещества и/или вещества против ожирения, можно использовать в любой комбинации с соединением формулы I в едином дозированном составе (комбинация лекарственных средств с фиксированной дозой), или можно вводить индивидууму в одном или нескольких раздельных дозированных составах, что позволяет одновременное или последовательное введение активных веществ (совместное введение отдельных активных веществ).
Примеры дополнительных активных веществ, которые можно использовать, включают, но не ограничиваются ими, ингибиторы ангиотензинпревращающего фермента (например, алацеприл, беназеприл, каптоприл, церонаприл, цилазаприл, делацеприл, эналаприл, эналаприлат, фосиноприл, имидаприл, лизиноприл, мовелтиприл, периндоприл, квинаприл, рамиприл, спираприл, темокаприл или трандолаприл), антагонисты рецепторов ангиотензина II (например, лозартан, т.е. COZAAR®, валсартан, кандесартан, олмесартан, телмесартан и любые из этих лекарственных средств, используемые в комбинации с гидрохлортиазидом, таким как HYZAAR®); ингибиторы нейтральных эндопептидаз (например, тиорфан и фосфорамидон), антагонисты альдостерона, ингибиторы альдостеронсинтазы, ингибиторы ренина (например, производные мочевины и ди- и три-пептидов (см. патент США № 5116835), аминокислоты и производные (патенты США 5095119 и 5104869), цепи аминокислот, связанные непептидными связями (патент США 5114937), производные ди- и три-пептидов, пептидиламинодиолы и пептидил бетааминоациламинодиолкарбаматы, и низкомолекулярные ингибиторы ренина (включая диолсульфонамиды и сульфинилы), N-морфолино производные, N-гетероциклические спирты и пиролимидазолоны; также производные пепстатина и фтор- и хлор-производные статин-содержащих пептидов, эналкреин, RO 425892, А 65317, СР 80794, ES 1005, ES 8891, SQ 34017, алискирен (2(S),4(S),5(S),7(S)-N-(2-карбамоил-2метилпропил)-5-амино-4-гидрокси-2,7-диизопропил-8-[4-метокси-3-(3-метоксипропокси)фенил]октанамид гемифумарат) SPP600, SPP630 и SPP635), антагонисты рецепторов эндотелина, ингибиторы фосфодиэстеразы-5 (например, силденафил, тадалфил и варденафил), сосудорасширяющие средства, блокаторы кальциевых каналов (например, амлодипин, нифедипин, верапамил, дилтиазем, галлопамил, нилудипин, нимодипины, никардипин), активаторы калиевых каналов (например, никорандил, пинацидил, кромакалим, миноксидил, априлкалим, лопразолам), диуретики (например, гидрохлортиазид), симпатолитики, бета-адренергические блокаторы (например, пропранолол, атенолол, бизопролол, карведилол, метопролол или метопролол тартрат), альфа-адренергические блокаторы (например, доксазозин, празозин или альфа-метилдопа), центральные альфа-адренергические агонисты, периферические сосудорасширяющие средства (например, гидралазин); снижающие уровень липидов средства, например, ингибиторы HMGCoA редуктазы, такие как симвастатин и ловастатин, которые выпускаются в продажу в качестве ZOCOR® и MEVACOR® в пролекарственной форме лактона и функционируют в качестве ингибиторов после введения, и фармацевтически приемлемые соли ингибиторов дигидрокси HMG-CoA редуктазы кислот с открытым кольцом, таких как аторвастатин (в частности, соль кальция, продаваемая как LIPITOR®), розувастатин (в частности, соль кальция, продаваемая как CRESTOR®), правастатин (в частности, соль натрия, продаваемая как PRAVACHOL®), флувастатин (в частности, соль натрия, продаваемая как LESCOL®), кривастатин и питавастатин; ингибитор всасывания холестерина, такой как эзетимиб (ZETIA®) и эзетимиб в комбинации с любыми другими снижающими уровень липидов средствами, такими как ингибиторы HMG-CoA редуктазы, описанные выше, и, в частности, с симвастатином (VYTORIN®) или с аторвастатином кальция; ниацин в формах немедленного высвобождения или контролируемого высвобождения и/или с ингибитором HMG-CoA редуктазы; агонисты рецепторов ниацина, такие как аципимокс и ацифран, а также частичные агонисты рецепторов ниацина; изменяющие метаболизм средства, включающие инсулин и миметики инсулина (например, инсулин деглудек, инсулин гларгин, инсулин лизпро), ингибиторы дипептидилпептидазы IV (DPP-4) (например, ситаглиптин, алоглиптин, омариглиптин, линаглиптин, вилдаглиптин); сенсибилизирующие к инсулину средства, включая (i) агонисты PPARy, такие как глитазоны (например, пиоглитазон, AMG 131, МВХ2044, митоглитазон, лобеглитазон, IDR-105, розиглитазон и балаглитазон), и другие лиганды PPAR, включая (1) двойные агони
- 30 043952 сты PPARa/γ (например, ZYH2, ZYH1, GFT505, чиглитазар, мураглитазар, алеглитазар, соделглитазар и навеглитазар); (2) агонисты PPARa, такие как производные фенофибриновой кислоты (например, гемфиброзил, клофибрат, ципрофибрат, фенофибрат, безафибрат), (3) селективные модуляторы PPARy (SPPARyM), (например, такие как те, что описаны в WO 02/060388, WO 02/08188, WO 2004/019869, WO 2004/020409, WO 2004/020408, и WO 2004/066963); и (4) частичные агонисты PPARy; (ii) бигуаниды, такие как метформин и его фармацевтически приемлемые соли, в частности, метформина гидрохлорид, и его составы с пролонгированным высвобождением, такие как Glumetza™, Fortamet™ и GlucophageXR™; и (iii) ингибиторы протеинтирозинфосфатазы-1В (РТР-1В) (например, ISIS-113715 и ТТР814); инсулин или аналоги инсулина (например, инсулин детемир, инсулин глулизин, инсулин деглудек, инсулин гларгин, инсулин лизпро и ингаляционные составы каждого из них); лептин и производные и агонисты лептинов; амилин и аналоги амилина (например, прамлитинид); сульфонилмочевину средства, усиливающие секрецию инсулина не на основе сульфонилмочевины (например, толбутамид, глибурид, глипизид, глимепирид, митиглинид, меглитиниды, натеглинид и репаглинид); ингибиторы а-глюкозидазы (например, акарбоза, воглибоз и миглитол); антагонисты рецепторов глюкагона (например, МК-3577, МК-0893, LY2409021 и КТ6-971); миметики инкретина, такие как GLP-1, аналоги, производные и миметики GLP-1; и агонисты рецепторов GLP-1 (например, дулаглутид, семаглутид, албиглутид, эксенатид, лираглутид, ликсисенатид, таспоглутид, CJC-1131 и BIM-51077, включая его интраназальные, трансдермальные и вводимые раз в неделю составы); секвестранты желчных кислот (например, колестилаан, колестимид, колесевалама гидрохлорид, колестипол, холестирамин и диалкиламиноалкильные производные сшитого декстрана), ингибиторы ацил СоА:холестерин ацилтрансферазы (например, авасимиб); соединения против ожирения; средства, предназначенные для применения в воспалительных состояниях, такие как аспирин, нестероидные противовоспалительные лекарственные средства или NSAID, глюкокортикоиды и селективные ингибиторы циклооксигеназы-2 или СОХ-2; активаторы глюкокиназы (GKA) (например, AZD6370); ингибиторы 11 β-гидроксистероиддегидрогеназы типа 1 (например, такие как те, которые описаны в патенте США № 6730690, и LY-2523199); ингибиторы СЕТР (например, анацетрапиб, торцетрапиб и эвацетрапиб); ингибиторы фруктозо-1,6-бисфосфатазы (например, такие как те, которые описаны в патентах США № 6054587; 6110903; 6284748; 6399782 и 6489476); ингибиторы ацетил-СоА карбоксилазы-1 или 2 (АСС1 или АСС2); активаторы АМР-активируемой протеинкиназы (АМРК); другие агонисты сопряженных с G-белком рецепторов: (i) GPR-109, (ii) GPR-119 (например, МВХ2982 и PSN821) и (iii) GPR-40 (например, TAK875); антагонисты SSTR3 (например, такие как те, которые описаны в WO 2009/001836); агонисты рецепторов нейромедина U (например, такие как те, которые описаны в WO 2009/042053, включая, но не ограничиваясь ими, нейромедин S (NMS)); модуляторы SCD; антагонисты GPR-105 (например, такие как те, которые описаны в WO 2009/000087); ингибиторы SGLT (например, ASP1941, SGLT-3, эмпаглифлозин, дапаглифлозин, канаглифлозин, BI-10773, эртуглифлозин, ремоглофлозин, TS-071, тофоглифлозин, ипраглифлозин и LX-4211); ингибиторы ацил-кофермент А:диацилглицеринацилтрансферазы 1 и 2 (DGAT-1 и DGAT-2); ингибиторы синтазы жирных кислот; ингибиторы ацил-кофермент А:моноацилглицеринацилтрансферазы 1 и 2 (MGAT-1 и MGAT-2); агонисты рецептора TGR5 (также известные как GPBAR1, BG37, GPCR19, GPR131 и M-BAR); ингибиторы подвздошнокишечного переносчика желчных кислот; РАСАР, миметики РАСАР, и агонисты рецепторов 3 РАСАР; агонисты PPAR; ингибиторы протенитирозинфосфатазы-1В (РТР-1В); антитела против IL-1b (например, ХОМА052 и канакинумаб); и бромкриптина мезилат и его составы быстрого высвобождения; или с другими лекарственными средствами, полезными для лечения вышеупомянутых состояний или нарушений, включая формы свободной кислоты, свободного основания и фармацевтически приемлемых солей указанных выше активных соединений, когда это химически возможно.
Соединения по настоящему изобретению можно без труда получать по следующим схемам и примерам реакций или их модификациям, с использованием легко доступных исходных материалов, реагентов и общепринятых методик синтеза. В этих реакциях также можно использовать известные варианты. Для очистки соединений с использованием обращено-фазовой хроматографии (либо ВЭЖХ, либо MPLC, как указано ниже), использовали колонку С18. Другие способы получения соединений по изобретению будут хорошо понятными специалисту в данной области с учетом приведенных ниже схем реакции и примеров. Сокращенные обозначения, приведенные ниже, могут использоваться в иллюстративных схемах и/или примерах настоящего описания.
ACN представляет собой ацетонитрил.
АсОН представляет собой уксусную кислоту.
AcO-NH4 представляет собой ацетат аммония.
Вос2О представляет собой ди-трет-бутилдикарбонат.
Bn представляет собой бензил.
BnBr представляет собой бензилбромид.
BzCl представляет собой бензоилхлорид.
CBr4 представляет собой пербромметан.
Cbz-Cl представляет собой бензилхлорформиат.
- 31 043952
DBU представляет собой 1,8-диазабицикло[5.4.0]уднец-7-ен.
DCC представляет собой дициклогексилкарбодиимид.
DCE представляет собой 1,2-дихлорэтан.
DCM представляет собой дихлорметан.
DEA представляет собой N,N-диэтиламин.
DIAD представляет собой (Е)-диизопропилдиазен-1,2-дикарбоксилат.
DIEA или DIPEA представляет собой N,N-диизопропилэтиламин.
DMAP представляет собой 4-диметиламинопиридин.
DMF представляет собой N,N-диметилформамид.
DMSO представляет собой диметилсульфоксид.
ЕА или EtOAc представляет собой этилацетат.
EtOH представляет собой этанол.
Et2O представляет собой диэтиловый эфир.
Fmoc представляет собой флуоренилметилоксикарбонильную защитную группу.
Fmoc-Cl представляет собой (9H-фтор-9-ил)метилкарбонохлоридат.
Fmoc-D-Dap(Boc)-OH представляет собой N-альфа-(9-флуоренилметилоксикарбонил)-N-бета-третбутилоксикарбонил-D-2,3-диаминопропионовую кислоту.
Fmoc-Osu представляет собой N-гидроксисукцинимидный сложный эфир Fmoc.
HATU представляет собой гексафторфосфат 3-оксида 1-[бис(диметиламино)метилен]-1Н-1,2,3триазоло[4,5-b]пиридиния.
ВЭЖХ представляет собой высокоэффективную жидкостную хроматографию.
IPA представляет собой изопропиловый спирт.
LiOH представляет собой гидроксид лития.
LC/MS представляет собой жидкостную хроматографию-масс-спектрометрию.
Me3N представляет собой триметиламин.
МеОН представляет собой метанол.
MPLC представляет собой жидкостную хроматографию среднего давления.
MsCl представляет собой метансульфонилхлорид.
NaBH(OAc)3 представляет собой триацетоксиборгидрид натрия.
ЯМР представляет собой ядерный магнитный резонанс.
NsCl представляет собой 4-нитробензол-1-сульфонилхлорид.
РЕ представляет собой петролейный эфир.
Pd2(dba)3(HCCl3) представляет собой аддукт трис(дибензилиденацетон)дипалладий(0)-хлороформ.
PPh3 представляет собой трифенилфосфин.
PdCl2(dppf) или Pd(ii)(dppf)Cl2 представляет собой дихлор[1,1'-бис(дифенилфосфино)ферроцен] палладий(П).
Pd(dppf)Cl2CH2Cl2 представляет собой аддукт дихлор[1,1'-бис(дифенилфосфино)ферроцен]палладий(П)дихлорметан.
Pd(PPh3)4 представляет собой тетракис(трифенилфосфин)палладий.
PPTS представляет собой п-толуолсульфонат пиридиния.
[Rh(OAc)2]2 представляет собой димер ацетата родия(П).
КТ, или к.т., или кт представляет собой комнатную температуру.
tBuOAc представляет собой трет-бутилацетат.
TEA представляет собой триэтиламин.
TFA представляет собой трифторуксусную кислоту.
TFE представляет собой тетрафторэтилен.
THF представляет собой тетрагидрофуран.
Tf2O представляет собой трифторметансульфоновый ангидрид.
Teoc-OSu представляет собой 2,5-диоксопирролидин-1-ил (2-(триметилсилил)этил)карбонат.
TBAF представляет собой фторид тетрабутиламмония.
TMS представляет собой тетраметилсилан.
Катализатор Чжань 1В представляет собой дихлор(1,3-бис(2,4,6-триметилфенил)-2имидазолидинилиден)((5-((диметиламино)сульфонил)-2-(1-метилэтокси-О)фенил)метилен-С)рутений(П) (также описывается как дихлорид 1,3-бис(2,4,6-триметилфенил)-4,5-дигидроимидазол-2-илиден[2(изопропокси)-5-(N,N-диметиламиносульфонил)фенил[метиленрутения (II)).
- 32 043952
Пример 1. Получение Ех-01 и Ех-51.
О
Ех-01 (проиллюстрировано свободное основание).
О
Ех-51 (проиллюстрировано свободное основание).
- 33 043952
Формы солей соединений Ех-01 и Ех-51 получали из промежуточных соединений 76 и 86 (способ получения описан ниже) в соответствии со следующей схемой:
- 34 043952
муравьиная кислота
Стадия А: получение промежуточного соединения 89.
К раствору 76 (1,56 г, 1,917 ммоль, получение описано ниже) и 86 (1,506 г, 1,936 ммоль, получение описано ниже) в DMF (40 мл) добавляли HATU (0,802 г, 2,108 ммоль) и DIEA (0,670 мл, 3,83 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 50 мин, затем распределяли между EtOAc (300 мл) и рассолом (100 мл). Органическую фазу промывали рассолом (2x100 мл), сушили над Na2SO4, концен- 35 043952 трировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием MeOH/DCM в качестве элюирующих растворителей с получением 89. LC/MS: (М+1)+: 1573,8.
Стадия В: получение промежуточного соединения 90.
Раствор 89 (0,68 г, 0,432 ммоль) в DCM (500 мл) и уксусной кислоте (40 мл) барботировали N2 в течение 20 мин, а затем добавляли катализатор Чжань-1b (0,222 г, 0,302 ммоль). Полученную смесь далее барботировали N2 в течение 20 мин, а затем нагревали при 55°С в течение 5 ч. После охлаждения до к.т. смесь фильтровали через целит, фильтрат концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием MeOH/DCM в качестве элюирующих растворителей с получением 90 (смесь цис/транс). LC/MS: (М+1)+: 1545,7.
Стадия С: получение промежуточного соединения 91.
К раствору 90 (смесь цис/транс) (65 мг, 0,042 ммоль) в ацетонитриле (2 мл) добавляли пиперидин (0,042 мл, 0,420 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 1 ч, затем концентрировали и остаток растворяли в ацетонитриле (4 мл) и вновь концентрировали. Остаток далее сушили в высоком вакууме 30 мин с получением 91 (смесь цис и транс). LC/MS: (М+1)+: 1324,0.
Стадия D: получение промежуточного соединения 92.
К раствору 91 (смесь цис/транс) (548 мг, 0,414 ммоль) и 88 (227 мг, 0,455 ммоль, получение описано ниже) в DMF (10 мл) при 0°С добавляли HATU (181 мг, 0,476 ммоль) и DIEA (0,166 мл, 0,952 ммоль). Полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 1 ч, и раствор очищали обращено-фазовой MPLC на колонке С18 с использованием ацетонитрила (0,05% TFA)/воды (0,05% TFA) в качестве элюирующих растворителей с получением 92 (смесь цис/транс). LC/MS: (М+1)+: 1803,5.
Стадия Е: получение промежуточного соединения 93.
К раствору 92 (700 мг, 0,388 ммоль) в THF (20 мл), МеОН (6 мл) и воде (6 мл) при 0°С капельно добавляли 1 Н водный раствор LiOH (3,11 мл, 3,11 ммоль), и полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 23 ч. Раствор нейтрализовывали добавлением 1 Н HCl до рН 7-8, летучие вещества выпаривали, водную фазу подкисляли до рН 5, и смесь очищали обращено-фазовой MPLC на колонке С18 с использованием ацетонитрила (0,05% TFA)/воды (0,05% TFA) в качестве элюирующих растворителей с получением 93 в форме соли TFA. К раствору 93 в форме соли TFA (427 мг, 0,257 ммоль)) в воде (70 мл) и ацетонитриле (70 мл) при 0°С капельно добавляли 0,1 Н HCl (13,5 мл, 1,350 ммоль), полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 5 мин, а затем лиофилизировали с получением 93 в виде соли HCl. LC/MS: (М+1)+: 1567,1.
Стадия F: получение промежуточного соединения 94.
К раствору 93 в форме соли HCl (200 мг, 0,125 ммоль) в DMF (30 мл) добавляли HATU (56,9 мг, 0,150 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 30 мин, затем разбавляли DCM (400 мл), а затем добавляли DIEA (0,065 мл, 0,374 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 1 ч, летучие вещества выпаривали на роторном испарителе, и полученный раствор в DMF очищали обращено-фазовой MPLC с использованием ацетонитрила (0,05% TFA)/вода (0,05% TFA) в качестве элюирующих растворителей с получением 94. LC/MS: (М+1)+: 1549,2.
Стадия G: получение промежуточного соединения 95.
К раствору 94 (14 мг, 9,04 мкмоль) в МеОН (20 мл) добавляли 10% Pd/C (1,924 мг, 1,808 мкмоль) и полученную смесь подвергали гидрогенизации при к.т. через балон Н2 в течение 1 ч. Смесь фильтровали через целит и фильтрат концентрировали с получением промежуточного соединения 95. LC/MS: (М+1)+: 1550,9.
Стадия Н: получение Ех-01.
Промежуточное соединение 95, полученное на предшествующей стадии (26 мг, 0,017 ммоль), растворяли в DCM (2 мл). К этому раствору добавляли TFA (6 мл, 78 ммоль) и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 30 мин, затем концентрировали и остаток растворяли в DCM (3 мл) и обрабатывали 4 Н HCl в диоксане (0,042 мл, 0,168 ммоль), и вновь концентрировали с получением Ех-01 в качестве неочищенного продукта. Неочищенный Ех-01 очищали обращено-фазовой ВЭЖХ с использованием ацетонитрила (0,1% муравьиная кислота)/воды (0,1% муравьиная кислота) в качестве элюирующих растворителей с получением формы соли муравьиной кислоты Ех-01. LC/MS: (М+1)+: 1394,4.
Стадия I: получение Ех-51.
К раствору промежуточного соединения 94 (30 мг, 0,019 ммоль) в DCM (2 мл) добавляли TFA (4 мл, 51,9 ммоль), и реакционную смесь перемешивали при температуре окружающей среды в течение 30 мин, а затем концентрировали. Остаток растворяли в DCM (2 мл), обрабатывали HCl (4 Н в диоксане) (0,048 мл, 0,194 ммоль) и концентрировали с получением Ех-51 в форме соли HCl. Соединение очищали обращено-фазовой ВЭЖХ с использованием ацетонитрила (0,1% муравьиная кислота)/воды (0,1% муравьиная кислота) в качестве подвижной фазы с получением формы соли муравьиной кислоты Ех-51. LC/MS: (М+1)+: 1392,0.
Следующие схемы и методики использовали для получения промежуточных соединений 76, 86 и 88, использованных в методиках, описанных выше.
- 36 043952
Получение промежуточного соединения 68, использованное для получения промежуточного соединения 76.
Стадия А: получение промежуточного соединения 65.
К суспензии (2S,3S)-3-гидроксипирролидин-2-карбоновой кислоты (5,32 г, 40,6 ммоль) в диоксане (100 мл) при 0°С добавляли гидроксид натрия (122 мл, 122 ммоль), а затем капельно добавляли бензилхлорформиат (6,50 мл, 44,6 ммоль). Полученную суспензию перемешивали при 0°С в течение 5 ч. После удаления летучих веществ водную фазу подкисляли до рН 3, затем распределяли между 30%IPA/DCM (200 мл) и рассолом (50 мл), а затем водную фазу далее экстрагировали 30% IPA/DCM (2x100 мл). Объединенные органические фазы сушили над Na2SO4 и концентрировали с получением (2S,3S)-1((бензилокси)карбонил)-3-гидроксипирролидин-2-карбоновой кислоты (65). LC/MS: (М+1)+: 266,1.
Стадия В: получение промежуточного соединения 66.
К раствору 65 (7,48 г, 28,2 ммоль) в МеОН (80 мл) капельно добавляли TMS-диазометан (70,5 мл, 141 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 10 мин, а затем гасили капельным добавлением уксусной кислоты (приблизительно 400 мкл). Раствор концентрировали, и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием EtOAc/гексана в качестве элюирующих растворителей с получением 66. LC/MS: (М+1)+: 280,1.
Стадия С: получение промежуточного соединения 67.
Раствор 66 (4,81 г, 17,22 ммоль) в DCM (200 мл) барботировали N2 в течение 30 мин, а затем добавляли димер ацетата родия(п) (0,761 г, 1,722 ммоль). Смесь охлаждали на ледяной бане и капельно добавляли трет-бутилдиазоацетат (3,58 мл, 25,8 ммоль) при 0°С. Полученную смесь перемешивали при 0°С в течение 1,5 ч. Реакцию гасили добавлением воды (100 мл), смесь экстрагировали DCM (3x100 мл), объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали обращенофазовой MPLC с использованием ацетонитрила (0,05% TFA)/воды (0,05% TFA) в качестве элюирующих растворителей. Фракцию, содержавшую продукт, концентрировали и водную фазу экстрагировали DCM (2x100 мл). Объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4 и концентрировали с получением 67. LC/MS: (М+1)+: 394,2.
Стадия D: получение промежуточного соединения 68.
К раствору 67 (3,72 г, 9,46 ммоль) в МеОН (80 мл) добавляли 10% Pd/C (0,805 г, 0,756 ммоль) и полученную смесь подвергали гидрогенизации с использованием баллона с Н2 при температуре окружающей среды в течение 2 ч, а затем фильтровали через целит. Фильтрат концентрировали с получением 68. LC/MS: (М+1)+: 259,9.
- 37 043952
Получение промежуточного соединения 76.
Стадия Е
Стадия А: получение промежуточного соединения 69.
К раствору (S)-2-((((9H-флуорен-9-ил)метокси)карбонuл)амино)-3 -(5-фтор-1 Н-индол-3 -ил)пропионовой кислоты (3 г, 6,75 ммоль) в THF (20 мл), МеОН (10 мл) и воде (20,00 мл) при 0°С добавляли NaOH (20,25 мл, 20,25 ммоль) и полученный раствор перемешивали при температуре окружающей среды в течение 4 ч, а затем летучие вещества выпаривали. К водной смеси добавляли диоксан (50 мл) и воду (20 мл), полученный раствор охлаждали до 0°С и к указанному выше раствору добавляли Boc2O (1,881 мл, 8,10 ммоль). Полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 3 ч, летучие вещества удаляли и водную фазу экстрагировали Et2O (3x40 мл), подкисляли до рН 3, затем экстрагировали DCM
- 38 043952 (3x100 мл), а затем 30% IPA/DCM (2x80 мл). Объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4 и концентрировали с получением 69. LC/MS: (М+1)+: 322,9.
Стадия В: получение промежуточного соединения 70.
К раствору 69 (2,079 г, 6,45 ммоль) в DMF (40 мл) при 0°С добавляли 60% NaH в гексане (0,568 г, 14,19 ммоль) и полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 50 мин, а затем капельно добавляли аллилбромид (1,172 мл, 13,54 ммоль). Полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 1,5 ч, а затем гасили добавлением 1 Н HCl (приблизительно 3,68 мл). Затем раствор распределяли между EtOAc (200 мл) и водой (100 мл), органическую фазу промывали рассолом (2x100 мл), сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием MeOH/DCM в качестве элюирующих растворителей с получением 70. LC/MS: (М+1)+: 363,0.
Стадия С: получение промежуточного соединения 71.
К раствору 70 (2,239 г, 6,18 ммоль) и 68 (1,842 г, 7,11 ммоль) в DMF (30 мл) добавляли HATU (2,82 г, 7,41 ммоль) и DIEA (2,59 мл, 14,83 ммоль), и полученный раствор перемешивали при температуре окружающей среды в течение 1 часа. Смесь распределяли между EtOAc (200 мл) и рассолом (100 мл), органическую фазу промывали рассолом (3x100 мл), сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием EtOAc/гексана в качестве элюирующих растворителей с получением 71. LC/MS: (М+1)+: 604,2.
Стадия D: получение промежуточного соединения 72.
К раствору 71 (2,83 г, 4,69 ммоль) в CH2Cl2 (20 мл) и tBuOAc (30 мл) при 0°С добавляли метансульфоновую кислоту (1,218 мл, 18,75 ммоль), и полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 16,5 ч, а затем при температуре окружающей среды в течение 2,5 ч. Раствор (72) использовали непосредственно на следующей стадии. LC/MS: (М+1)+: 504,2.
Стадия Е: получение промежуточного соединения 73.
К раствору (S)-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-3-(3-(((трет-бутоксикарбонил)амино)метил)фенил)пропионовой кислоты (2,66 г, 5,16 ммоль) в DMF (10 мл) добавляли HATU (1,961 г, 5,16 ммоль) и DIEA (5,32 мл, 30,5 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 30 мин, а затем добавляли к раствору 72, полученного как описано выше, на ледяной бане. Полученный раствор перемешивали при температуре окружающей среды в течение 1 ч. Летучие вещества выпаривали на роторном испарителе, и остаток очищали обращено-фазовой MPLC с использованием ацетонитрила (0,05% TFA)/воды (0,05% TFA) в качестве элюирующих растворителей. Собранные фракции концентрировали на роторном испарителе с получением 73. LC/MS: (М+1)+: 1002,1.
Стадия F: получение промежуточного соединения 74.
К раствору 73 (3,235 г, 3,23 ммоль) в DCM (4 мл) добавляли TFA (7,46 мл, 97 ммоль), и полученный раствор перемешивали при температуре окружающей среды в течение 1 ч, а затем концентрировали. Остаток растворяли в DCM (10 мл), обрабатывали 4 Н HCl в диоксане (3,23 мл, 12,91 ммоль), затем концентрировали и остаток растворяли в ацетонитриле (100 мл)/воде (50 мл) и лиофилизировали с получением 74. LC/MS: (М+1)+: 846,1.
Стадия G: получение промежуточного соединения 75.
К раствору 74 (2,85 г, 3,23 ммоль) в DMF (45 мл) добавляли HATU (1,474 г, 3,88 ммоль), и полученный раствор перемешивали при температуре окружающей среды в течение 30 мин, затем разбавляли DCM (600 мл), а затем капельно добавляли DIEA (1,692 мл, 9,69 ммоль). Полученный раствор перемешивали при температуре окружающей среды в течение 1 ч. Раствор концентрировали и остаток очищали обращено-фазовой MPLC на колонке С18 с использованием ацетонитрила (0,05% TFA)/воды (0,05% TFA) в качестве элюирующих растворителей. Фракции, содержавшие продукт, концентрировали, и водный слой распределяли между DCM (200 мл) и насыщ. NaHCO3 (200 мл). Водную фазу экстрагировали DCM (2x100 мл) и объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4 и концентрировали с получением 75. LC/MS: (М+1)+: 828,1.
Стадия Н: получение промежуточного соединения 76.
К раствору 75 (1,93 г, 2,331 ммоль) в THF (60 мл), МеОН (30 мл) и воде (20 мл) при 0°С капельно добавляли 1 Н водный LiOH (9,9 мл, 9,90 ммоль) и полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 16 ч, а затем гасили добавлением HCl (1 Н, 9,9 мл). Летучие вещества выпаривали на роторном испарителе и к указанному выше раствору при 0°С добавляли ацетон (60 мл), карбонат натрия (0,371 г, 3,50 ммоль) и Fmoc-Osu (0,802 г, 2,378 ммоль). Полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 6 ч, летучие вещества выпаривали на роторном испарителе, водную фазу подкисляли до рН 4, а затем экстрагировали 30% IPA/DCM (3x100 мл). Объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием MeOH/DCM в качестве элюирующих растворителей с получением 76. LC/MS: (М+1)+: 814,2.
Альтернативный способ получения промежуточного соединения 75b и промежуточного соединения 76В из него:
- 39 043952
Следовали в основном общей методике, описанной выше для получения промежуточного соединения 75, за исключением того, что стадию В исключали, а также включали конечную стадию G, заменяющую защитную группу Fmoc защитной группой Boc, таким образом, получая промежуточное соединение 75 а. Методики для 75 а и 76В описаны ниже.
Стадия С: получение промежуточного соединения 71а.
К раствору 69 (5,00 г, 15,5 ммоль) в DMF (40,0 мл) при -50°С добавляли 68, HATU (5,90 г, 15,5 ммоль) и DIEA (4,01 г, 31,0 ммоль), и реакционную смесь перемешивали при -50°С в течение 3 ч. Конечный раствор гасили водой (5 мл), концентрировали при пониженном давлении, и остаток очищали обращенофазовой колоночная хроматографией на С18 (элюирование градиентом ацетонитрил/вода+0,01% бикарбонат аммония) с получением 71а. LCMS (ESI): вычислено для C28H38FN3O8 [M+H]+: 564,3, найдено 564,2.
Стадия D: получение промежуточного соединения 72а.
К раствору 2 Н HCl в диоксане (100 мл) и THF (100 мл) при к.т. добавляли 71а (8,40 г, 14,9 ммоль) и реакционную смесь перемешивали в течение 5 ч. Конечный раствор концентрировали при пониженном давлении с получением 72а. LCMS (ESI): вычислено для C23H31ClFN3O6 [M-HC1+H]+: 464,2, найдено 464,3.
Стадия Е: получение промежуточного соединения 73а.
К раствору 72а (800 мг, 1,60 ммоль) в DMF (10,0 мл) при -50°С добавляли (S)-2-((((9Н-флуорен-9ил)метокси)карбонил)амино)-3-(3-(((трет-бутоксикарбонил)амино)метил)фенил)пропионовую кислоту (827 мг, 1,60 ммоль), HATU (608 мг, 1,60 ммоль) и DIEA (620 мг, 4,80 ммоль) и смесь перемешивали при -50°С в течение 3 ч. Полученный раствор разбавляли водой (50 мл), и водный слой экстрагировали EtOAc (3x100 мл). Объединенный органический слой промывали рассолом, сушили над безводным Na2SO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле (элюирование градиентом 1%-60% EtOAc в РЕ) с получением 73а. LCMS (ESI): вычислено для C53H60FN5O11 [M+H]+: 962,4, найдено 962,6.
Стадия F: получение промежуточного соединения 74а.
К раствору 73 а (3,00 г, 3,12 ммоль) в DCM (15,0 мл) при к.т. добавляли TFA (15,0 мл) и реакционную смесь перемешивали в течение 1 ч при комнатной температуре.
Полученный раствор концентрировали при пониженном давлении, а затем совместно упаривали с толуолом и DCM с получением 74а. LCMS (ESI): вычислено для C46H45F4N5O11 [M - TFA+H]+: 806,3,
- 40 043952 найдено 806,7.
Стадия G: получение промежуточного соединения 75а.
К раствору 74а (4,00 г, 4,35 ммоль) в DMF (150 мл) при к.т. добавляли HATU (1,65 г, 4,35 ммоль) и реакционный раствор перемешивали в течение 0,5 ч. Раствор разбавляли DCM (450 мл) и DIEA (1,69 г, 13,1 ммоль), а затем перемешивали при к.т. в течение 3 ч. Полученный раствор гасили водой (5 мл), концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали обращено-фазовой колоночной хроматографией на С18 (элюирование градиентом ацетонитрил/вода+0,05% TFA) с получением Fmocзащищенного промежуточного соединения. LCMS (ESI): вычислено для CMII.12FN5O8 [M+H]+: 788,3, найдено 788,9.
К раствору Fmoc-защищенного промежуточного соединения, описанного непосредственно выше (200 мг, 0,250 ммоль), в DCM (5,00 мл) при к.т. добавляли пиперидин (1,25 мл) и реакционный раствор перемешивали в течение 1 ч. Конечный раствор концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле (элюирование градиентом 0-5% МеОН в DCM) с получением промежуточного соединения в виде амина. LCMS (ESI): вычислено для C29H32FN5O6 [M+H]+: 566,2, найдено 566,3.
К раствору промежуточного соединения в виде амина, описанного непосредственно выше (2,86 г, 5,06 ммоль) в THF (30,0 мл) и воде (30,0 мл) при к.т. добавляли Вос2О (2,21 г, 10,1 ммоль) и бикарбонат натрия (1,70 г, 20,2 ммоль) и реакционную смесь перемешивали в течение 3 ч. Конечный раствор разбавляли водой (50 мл) и экстрагировали EtOAc (3x100 мл). Объединенный органический слой промывали рассолом (3x100 мл), сушили над безводным Na2SO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле (элюирование градиентом 0%-5% МеОН в DCM) с получением 75а. LCMS (ESI): вычислено для C34H40FN5O8 [M+H]+: 666,3, найдено 666,5; 1Н-ЯМР (300 МГц, CD3OD) δ 7,35-7,08 (м, 6Н), 6,95-6,79 (м, 2Н), 5,01-4,91 (м, 1H), 4,72-4,56 (м, 2Н), 4,45-4,38 (м, 1H), 4,45-4,38 (м, 5Н), 3,69 (с, 3Н), 3,32-2,92 (м, 5Н), 2,14-1,82 (м, 2Н), 1,47 (с, 9Н).
Стадия Н: получение промежуточного соединения 75b.
К раствору 75а (0,665 г, 0,99 ммоль) в DMF (0,5 мл) добавляли Cs2CO3 (1,11 г, 3,40 ммоль) и 3бромпроп-1-ен (0,43 г, 3,55 ммоль) при 0°С. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 16 ч и переливали в 5 мл раствора 50% насыщ. рассол/10% лимонная кислота, а затем экстрагирвоали этилацетатом (2x20 мл). Органический слой промывали рассолом (3x20 мл), сушили над безводным MgSO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении. Остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле, элюируя градиентом 1%-5% МеОН в DCM. Фракции, содержавшие промежуточное соединение 75b, объединяли и концентрировали с получением указанного в заголовке соединения. LCMS (ESI): вычислено для C37H44FN5O8 [M+H]+: 706,3, найдено 706,3.
Стадия I: получение промежуточного соединения 76В.
Гидролиз 75b посредством LiOH соответствовал условиям, сходным с условиями, описанными для получения промежуточного соединения 93, с получением 76В.
Получение промежуточного соединения 77В.
- 41 043952
Стадия А: получение промежуточного соединения 77А.
К раствору (S)-1-(((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-2-метилпирролидин-2-карбоновой кислоты (6,16 г, 17,54 ммоль) и гидрохлорида трет-бутил 4-(2-аминоэтил)бензилкарбамата (5,03 г, 17,54 ммоль) в DMF (140 мл) при 0°С добавляли HATU (8,00 г, 21,05 ммоль) и DIPEA (9,16 мл, 52,6 ммоль), а затем реакционной смеси позволяли нагреться до к.т. и перемешивали в течение 2 ч. Конечную смесь разбавляли водой, экстрагировали EtOAc, промывали рассолом, сушили над MgSO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 060% EtOAc в гексане) с получением 77А. MS (ESI): m/z (M+H)+ 584,5.
Стадия В: получение промежуточного соединения 77В.
К раствору 77А (8,92 г, 15,28 ммоль) в DCM (40 мл) добавляли 4 Н HCl в диоксане (15,28 мл, 61,1 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение ночи. Смесь концентрировали с получением 77В. MS (ESI): m/z (M+H)+ 484,3.
Получение промежуточного соединения 86.
86
Стадия А: получение промежуточного соединения 77.
К раствору гидрохлорида (S)-(9Н-флуорен-9-ил)метил 2-((4-(аминометил)фенэтил)карбамоил)-2- 42 043952 метилпирролидин-1-карбоксилата (77В) (5,87 г, 11,29 ммоль) в DCM (140 мл) при 0°С капельно добавляли DIEA (5,91 мл, 33,9 ммоль) и CBZ-Cl (1,726 мл, 11,85 ммоль), и полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 4 ч.
Реакционный раствор распределяли между водой (200 мл) и DCM (200 мл), водную фазу экстрагировали DCM (100 мл), объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4, и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием EtOAc/гексана в качестве элюирующих растворителей с получением 77. LC/MS: (М+1)+: 618,3.
Стадия В: получение промежуточного соединения 78.
К раствору 77 (5,56 г, 9,00 ммоль) в THF (100 мл), воде (50 мл) и МеОН (30 мл) добавляли 1 Н водный раствор NaOH (45,0 мл, 45,0 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 2 ч. Летучие вещества выпаривали и к водному раствору добавляли диоксан (200 мл) и Вос2О (2,508 мл, 10,80 ммоль) в диоксане (20 мл). Полученную смесь перемешивали при температуре от 0°С до к.т. в течение ночи. Летучие вещества выпаривали на роторном испарителе, и водную фазу экстрагировали DCM (3x150 мл). Объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием смеси EtOAc/гексан в качестве элюирующих растворителей с получением 78. LC/MS: (М+1)+: 496,2.
Стадия С: получение промежуточного соединения 79.
К раствору 78 (4,04 г, 8,15 ммоль) в МеОН (100 мл) добавляли 10% Pd/C (0,867 г, 0,815 ммоль), и полученную смесь подвергали гидрогенизации через баллон с Н2 при к.т. в течение 1,5 ч. Смесь фильтровали через целит и фильтрат концентрировали с получением 79. LC/MS: (М+1)+: 362,2.
Стадия D: получение промежуточного соединения 80.
К раствору 79 (2,58 г, 7,14 ммоль) в DMF (15 мл) добавляли пент-4-ен-1-ил 4метилбензолсульфонат (0,858 г, 3,57 ммоль) и K2CO3 (1,973 г, 14,27 ммоль), и полученную смесь нагревали при 80°С в течение 6 ч. После охлаждения до к.т. смесь фильтровали и фильтрат очищали обращено-фазовой MPLC с использованием ацетонитрила (0,05% TFA)/воды (0,05% TFA) в качестве элюирующих растворителей с получением продукта в виде соли TFA, который далее распределяли между DCM (100 мл) и 1 Н водным раствором NaOH (50 мл). Водную фазу далее экстрагировали DCM (2x50 мл), объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4, и концентрировали с получением 80. LC/MS: (М+1)+: 430,3.
Стадия Е: получение промежуточного соединения 81.
К раствору 80 (0,95 г, 2,211 ммоль) в DMF (15 мл) добавляли 4-метокси-4-оксобутановую кислоту (0,321 г, 2,433 ммоль), HATU (1,009 г, 2,65 ммоль) и DIEA (0,927 мл, 5,31 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 1 ч. Раствор распределяли между EtOAc (200 мл) и рассолом (100 мл), органическую фазу промывали рассолом (2x100 мл), сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием EtOAc/гексана в качестве элюирующих растворителей с получением 81. LC/MS: (М+1)+: 544,2.
Стадия F: получение промежуточного соединения 82.
К раствору 81 (1,165 г, 2,143 ммоль) в DCM (12 мл) добавляли HCl (4 Н в диоксане) (5,36 мл, 21,43 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 3 ч и смесь концентрировали с получением 82. LC/MS: (М+1)+: 444,2.
Стадия G: получение промежуточного соединения 83.
К раствору 82 (1,003 г, 2,089 ммоль) в DMF (20 мл) добавляли Fmoc-L-Tyr(Me)-OH (0,959 г, 2,298 ммоль), HATU (0,914 г, 2,403 ммоль) и DIEA (1,095 мл, 6,27 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 50 мин. Раствор распределяли между EtOAc (200 мл) и рассолом (100 мл), органическую фазу промывали рассолом (2x100 мл), объединенную органическую фазу сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием EtOAc/гексана в качестве элюирующих растворителей с получением 83. LC/MS: (М+1)+: 843,4.
Стадия Н: получение промежуточного соединения 84.
К раствору 83 (1,63 г, 1,934 ммоль) в ацетонитриле (10 мл) добавляли пиперидин (0,574 мл, 5,80 ммоль) и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 1 ч, а затем концентрировали. Остаток ресуспендировали в ацетонитриле (20 мл) и вновь концентрировали, цикл повторяли один раз, и остаток далее сушили в высоком вакууме с получением 84. LC/MS: (М+1)+: 621,3.
Стадия I: получение промежуточного соединения 85.
К раствору 84 (1,2 г, 1,933 ммоль) в DMF (15 мл) добавляли Fmoc-L-Thr(tBu)-OH (0,922 г, 2,320 ммоль), HATU (0,919 г, 2,416 ммоль) и DIEA (0,844 мл, 4,83 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 1 ч. Раствор распределяли между EtOAc (200 мл) и рассолом (100 мл), органическую фазу промывали рассолом (2x100 мл), сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле с использованием EtOAc/гексана в качестве элюирующих растворителей с получением 85. LC/MS: (М+1)+: 1000,2.
Стадия J: получение промежуточного соединения 86.
К раствору 85, полученному на предыдущей стадии (1,94 г, 1,940 ммоль) в ацетонитриле (20 мл)
- 43 043952 добавляли пиперидин (0,960 мл, 9,70 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 30 мин, а затем концентрировали. Остаток перерастворяли в DCM/ацетонитриле (1:1, 20 мл), затем вновь концентрировали, цикл повторяли один раз, и остаток сушили в высоком вакууме с получением 86.
LC/MS: (М+1)+: 778,3.
Получение промежуточного соединения 88.
Стадия А - синтез промежуточного соединения 87.
К 2-хлор-2-хлортритилсмоле 1-1,5 ммоль/г (7,0 г, 1-1,5 ммоль/г) добавляли сухой DCM (45 мл). Смолу встряхивали в течение 20 мин, а затем добавляли половину 0,17 Н DIPEA в DCM (3,67 мл, 21,00 ммоль), Fmoc-D-Dap(Boc)-OH (3,28 г, 7,70 ммоль), а затем остальную часть 0,17 Н DIPEA в DCM (3,67 мл, 21,00 ммоль). Смолу встряхивали при комнатной температуре в течение ночи, ополаскивали DCM и сушили. Затем смолу гасили 5% DIPEA и 10% МеОН в DCM (80 мл), встряхивали в течение 2 ч, затем фильтровали, ополаскивая DCM (3х), DMF (3х) и DCM (3х), а затем сушили в вакууме с получением смолы 87, которую использовали как есть на следующей стадии.
Стадия В - синтез промежуточного соединения 88.
Из смолы 87 (4,5 г, 2,475 ммоль) вручную удаляли защитную группу с использованием 5% пиперидина в DMF (30 мл) в течение 30 мин, фильтровали, повторно обрабатывали 5% пиперидином в DMF (30 мл) в течение дополнительных 30 мин, фильтровали, а затем ополаскивали DMF и DCM и сушили. Затем к смоле вручную присоединяли Fmoc-Ala-OH (1,541 г, 4,95 ммоль), HATU (1,694 г, 4,46 ммоль) и DIPEA (1,729 мл, 9,90 ммоль) в DMF (30 мл) в течение 2 ч, затем фильтровали, ополаскивая DMF и DCM, а затем сушили. Затем смолу обрабатывали 10% АсОН и TFE в DCM (60 мл) в течение 90 мин, фильтровали и фильтрат концентрировали с получением 88. LC/MS: [2М+Н]+=995,01.
Пример 1А. Альтернативный синтез Ех-01 и получение Ех-25 из него.
Соединение Ех-01, указанное выше, можно получать альтернативным способом, и из Ех-01 можно получать соединение Ех-25, в соответствии со следующей схемой:
- 44 043952
- 45 043952
Int-cdS
- 46 043952
Стадия А - синтез промежуточного соединения Int-cd1.
К раствору Int-3с (синтез из промежуточного соединения 107, описанного ниже) (7,09 г, 10,33 ммоль) в DMF (45 мл) при 0°С добавляли Int-2d (3,63 г, 9,84 ммоль, получение описано ниже) и HATU (3,74 г, 9,84 ммоль)), а затем DIPEA в DMF (6,87 мл, 39,4 ммоль), и смеси позволяли нагреться до комнатной температуры и перемешивали в течение 1 ч. Смесь гасили при 0°С рассолом и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции промывали рассолом, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом от 1% до 80% этилацетата в петролейном эфире) с получением Int-cd1. LC/MS: [M+l]+=1000,5.
Стадия В - синтез промежуточного соединения Int-cd2.
К раствору Int-cd1 (3,48 г, 3,48 ммоль) в ацетонитриле (50 мл) добавляли пиперидин (1,72 мл, 17,40 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 3 ч. Смесь концентрировали, остаток перерастворяли в DCM/ацетонитриле (1:1, 20 мл), вновь концентрировали, и остаток сушили в вакууме с получением Int-cd2 в качестве неочищенного продукта. LC/MS: (М+1)+=778,5.
Стадия С - синтез промежуточного соединения Int-cd3.
К раствору 76 (получение представлено в примере 1, выше) (2,45 г, 3,01 ммоль) и Int-cd2 (2,69 г, 3,46 ммоль) в DMF (70 мл) при 0°С добавляли HATU (1,37 г, 3,61 ммоль), а затем DIEA (1,05 мл, 6,02 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 50 мин, затем распределяли между
- 47 043952
EtOAc (500 мл) и рассолом (200 мл). Органическую фазу промывали рассолом (2x200 мл), сушили над
Na2SO4, концентрировали и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-5% МеОН в DCM) с получением Int-cd3. LC/MS: (M+1)+=1574,7.
Стадия D - синтез промежуточного соединения Int-cd4.
Раствор Int-cd3 (1,91 г, 1,21 ммоль) в DCM (1500 мл) и уксусной кислоте (30 мл) комнатной температуры барботировали с N2 в течение 30 мин, а затем добавляли катализатор Чжань-1В (0,445 г, 0,607 ммоль). Полученную смесь далее барботировали при комнатной температуре N2 в течение 30 мин, а затем нагревали при 55°С в течение 5 ч. После охлаждения до к.т. смесь фильтровали через целит, фильтрат концентрировали, и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1-5% МеОН в DCM) с получением Int-cd4 (в качестве смечи цис- и транс-олефинов). LC/MS: (М+1)+=1546,8.
Стадия Е - синтез промежуточного соединения Int-cd5.
К раствору Int-cd4 (смесь цис- и транс-олефинов) (5,49 г, 3,55 ммоль) в DCM (20 мл) и ацетонитриле (50 мл) добавляли пиперидин (1,76 мл, 17,8 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 2 ч, затем концентрировали и остаток суспендировали в ацетонитриле (20 мл) и вновь концентрировали. Затем остаток сушили в вакууме с получением Int-cd5 (в качестве смеси цис- и транс-олефинов) в виде неочищенной смеси. LC/MS: (М+1)+=1323,8.
Стадия F - синтез промежуточного соединения Int-cd6.
К раствору Int-cd5 (смесь цис- и транс-олефинов) (4,70 г, 3,55 ммоль) и Int-1d (2,21 г, 4,44 ммоль, получение описано ниже) в DMF (70 мл) при 0°С добавляли HATU (1,76 г, 4,62 ммоль) и DIEA (1,55 мл, 8,88 ммоль). Полученный раствор нагревали до комнатной температуры и перемешивали в течение 1 ч, а затем распределяли между EtOAc (300 мл) и рассолом (200 мл). Водную фазу экстрагировали EtOAc (200 мл), фазу EtOAc объединяли и промывали рассолом (3x200 мл), сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-5% МеОН в DCM) с получением Int-cd6 (в качестве смеси цис- и транс-олефинов). LC/MS: (М+1)+=1802,8.
Стадия G - синтез промежуточного соединения Int-cd7.
К раствору Int-cd6 (в качестве смеси цис- и транс-олефинов) (5,41 г, 3,00 ммоль) в THF (100 мл), МеОН (30 мл) и воде (30 мл) при 0°С капельно добавляли 1 Н водный раствор LiOH (24,0 мл, 24,0 ммоль), и полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 3 ч. Смесь нейтрализовывали при 0°С добавлением 1 Н HCl, летучие вещества выпаривали, и водный слой нейтрализовывали до рН 5 посредством 1 Н HCl. Затем смесь замораживали и лиофилизировали, и остаток очищали колоночной хроматографией на С18 (элюируя градиентом ацетонитрил (0,05% TFA)/вода (0,05% TFA)) с получением Int-cd7 (в качестве смеси цис- и транс-олефинов) в форме соли TFA. К полученному таким образом Int-cd7, соль TFA, (в качестве смеси цис- и транс-олефинов) в ацетонитриле (750 мл) и воде (450 мл) капельно добавляли при 0°С 0,1 Н водный раствор HCl (150 мл, 15,00 ммоль), затем полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 5 мин, замораживали и лиофилизировали с получением Int-cd7 в форме соли HCl (в качестве смеси цис- и транс-олефинов). LC/MS: (М+1)+=1566,6.
Стадия Н - синтез промежуточного соединения Int-cd8.
К раствору Int-cd7, соль HCl, полученного на предыдущей стадии, (1,01 г, 0,630 ммоль) в DMF (50 мл) и DCM (1300 мл) добавляли DIEA (0,330 мл, 1,890 ммоль) и HATU (0,287 г, 0,756 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 2 ч, летучие вещества выпаривали, и остаток распределяли между EtOAc (400 мл) и рассолом (200 мл). Водную фазу экстрагировали EtOAc (300 мл), объединенные органические слои промывали рассолом (3x100 мл), сушили над Na2SO4, концентрировали, и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-10% МеОН в DCM) с получением Int-cd8 (в качестве смеси цис- и транс-олефинов). LC/MS: (М+1)+=1548,8.
Стадия I - синтез промежуточного соединения Int-cd9.
К раствору Int-cd8, полученному на предыдущей стадии (1,22 г, 0,788 ммоль) в МеОН (100 мл) добавляли 10% Pd/C (0,645 г, 0,607 ммоль), и полученную смесь гидрогенизировали при температуре окружающей среды с использованием баллона с Н2 в течение 7 ч. Через 7 ч реакционную смесь фильтровали через целит, фильтрат концентрировали, и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-10% МеОН в DCM) с получением Int-cd9. LC/MS: (M+1)+=1550,9.
Стадия J - синтез соединения Ех-01 в форме соли HCl.
К раствору Int-cd9 (1,14 г, 0,735 ммоль) в DCM (6 мл) добавляли TFA (12 мл, 156 ммоль), и полученный раствор перемешивали при температуре окружающей среды в течение 30 мин. Затем смесь концентрировали и остаток растворяли в DCM (20 мл) и толуол (20 мл). Полученную смесь концентрировали, и остаток перерастворяли в DCM (20 мл) и обрабатывали HCl (4 Н в диоксане) (0,919 мл, 3,68 ммоль). Полученную смесь концентрировали с получением продукта в виде твердого вещества. Этот твердый продукт перерастворяли в ацетонитриле (200 мл) и воде (100 мл), и к описанному выше раствору при 0°С капельно добавляли 1 Н водный раствор HCl (3,68 мл, 3,68 ммоль). Полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 2 мин, затем замораживали и лиофилизировали с получением Ех-01 в форме соли HCl. LC/MS: (М+1)+=1394,7.
Стадия K - синтез соединения примера Ех-25 в форме соли TFA.
- 48 043952
К раствору Ех-01, соль HCl (870 мг, 0,608 ммоль) и Int-4b (170 мг, 0,669 ммоль, получение описано ниже) в DMF (1,2 мл) и воде (0,6 мл) добавляли HATU (254 мг, 0,669 ммоль) и DIEA (425 мкл,
2,433 ммоль). Полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 1 ч, а затем гасили добавлением 1,2 мл воды. Смесь фильтровали и фильтрат очищали колоночной хроматографией на С18 (элюируя градиентом ацетонитрил (0,05% TFA)/вода (0,05% TFA)) с получением Ех-25 в форме соли TFA. LC/MS: М+=1550,6.
Стадия L - получение соединения примера Ех-25 в форме соли Cl.
Две колонки наполняли 73,6 г ионообменной смолы AG МР-1 в форме хлорида (каталожный номер # 141-1841 BIO-RAD), всего по 36,8 г смолы в каждой колонке. Каждую колонку промывали водой (2x80 мл), а затем 20% ацетонитрилом в воде (2x100 мл). В две колонки со смолой равномерно загружали раствор Ех-25, соль TFA, полученного на предыдущей стадии (737 мг, 0,443 ммоль) в 20% ацетонитриле в воде (100 мл), затем в каждой колонке проводили элюирование 20% ацетонитрилом в воде (130 мл). Элюенты объединяли, замораживали и лиофилизировали с получением Ех-25 в форме хлорида. LC/MS: M+=1550,6.
Ниже следует описание ряда промежуточных соединений, которые эффективно использовать в синтезе Ех-01 и Ех-25, описанных выше.
Получение промежуточного соединения Int-1d.
Промежуточное соединение Int-1d получали из исходных материалов по следующей схеме:
Стадия А - синтез Int-1da.
К раствору D-Dap(Boc)-OMe, соль HCl (4,10 г, 16,10 ммоль), Fmoc-Ala-OH (5,01 г, 16,10 ммоль) и HATU (6,43 г, 16,90 ммоль) в DMF (40 мл) при 0°С добавляли DIPEA (7,03 мл, 40,2 ммоль), и смесь перемешивали при 0°С в течение 2 ч, а затем держали в холодильнике в течение ночи. Смесь гасили при комнатной температуре водой и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции промывали половинным рассолом, сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом гексан/EtOAc) с получением Int1da. LC/MS: [М+Н]+=512,3.
Стадия В - синтез Int-1d.
К раствору Int-1da (8,03 г, 15,70 ммоль) и 0,8 Н хлорида кальция (19,62 мл, 15,70 ммоль) в воде (40 мл) и 2-пропаноле (120 мл) при комнатной температуре добавляли твердый гидроксид натрия (0,691 г, 17,27 ммоль). Смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Смесь концентрировали, подкисляли 0,5 Н до рН ~2 (~40 мл), экстрагировали три раза EtOAc, промывали рассолом, сушили над Na2SO4 и концентрировали. Остаток очищали колоночной хроматографией на С18 (элюируя градиентом ацетонитрил/вода+0,1% TFA) с получением Int-1d. LC/MS: [M+H]+=498,25.
Получение промежуточного соединения Int-1d описано выше для получения Ех-01 и Ех-25. Эта часть молекулы может быть описана как линкер, который циклизует низшее пептидное кольцо в высшее пептидное кольцо. Вместо Int-1d можно использовать другие сходные линкеры путем варьирования спейсера, использованного для синтеза, включая, но не ограничиваясь ими, использование Dap и D-Ala.
Получение промежуточного соединения Int-2d.
Промежуточное соединение Int-2d, пригодное в качестве линкера для получения соединений по изобретению, получали по следующей схеме:
- 49 043952
Стадия С
Стадия А - синтез Int-2da.
Раствор 4-бромбензальдегида (15,00 г, 81 ммоль), трет-бутил N-[2-(трифторборануидuл)этuл]кαрбамат калия (20,97 г, 84 ммоль), карбонат цезия (52,8 г, 162 ммоль) и комплекс дихлорид 1,1'бис(дифенилфосфино)ферроцен-палладия(П)-дихлорметан (Pd(II)(dppf)Cl2, 1,99 г, 2,43 ммоль) в дегазированном толуоле (250 мл) и воде (85 мл) нагревали до 76°С и перемешивали в течение ночи. Смесь гасили при комнатной температуре полунасыщенным водным хлоридом аммония и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции промывали рассолом, сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом DCM/EtOAc) с получением Int-2da. LC/MS: (М-56+1)+=193,0.
Стадия В - синтез Int-2db.
К раствору Int-2da (12,9 г, 51,7 ммоль) и пент-4-ен-1-амина (6,61 г, 78 ммоль) в DCM (120 мл) и АсОН (3 мл) при комнатной температуре на водяной бане порционно добавляли триацетоксигидроборат натрия (32,9 г, 155 ммоль) и смесь перемешивали в течение 30 мин. Реакционную смесь медленно гасили при 0°С 3 мл воды, переливали в 1 Н NaOH (500 мл), перемешивали в течение 15 мин, а затем экстрагировали DCM, сушили над Na2SO4 и концентрировали. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом DCM/MeOH) с получением Int-2db. LC/MS: (M+1)+=319,2.
Стадия С - синтез Int-2dc.
К раствору Int-2db (8,48 г, 20,77 ммоль) и 4-метокси-4-оксобутановой кислоты (3,02 г, 22,85 ммоль) в DMF (40 мл) добавляли HATU (9,48 г, 24,92 ммоль) и DIPEA (8,71 мл, 49,8 ммоль). Полученный раствор перемешивали при комнатной температуре в течение 1 ч, затем гасили насыщенным водным раствором NaHCO3 (10 мл). Смесь распределяли между EtOAc (500 мл) и насыщенным водным раствором NaHCO3 (200 мл), органическую фазу промывали рассолом (3x200 мл), сушили над Na2SO4, концентрировали и остаток очищали на колонке на силикагеле (элюируя градиентом гексан/EtOAc) с получением Int-2dc. LC/MS: (M+1)+=433,4.
Стадия D - синтез Int-2d.
К раствору Int-2dc (2,9 г, 6,70 ммоль) в DCM (15 мл) добавляли 4 М HCl в диоксане (10 мл) при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 1 ч. Смесь концентрировали при пониженном давлении с получением гидрохлорида метил 4-((4-(2аминоэтил)бензил)(пент-4-ен-1-ил)амино)-4-оксобутаноата (Int-2d). LC/MS [M-HCl+H]+=333,3.
Получение Int-3с из 107, использованного для синтеза Ех-01 и Ех-25, описанных выше.
Промежуточное соединение Int-3с получали по следующей схеме:
- 50 043952
lnt-3c
Стадия А - синтез Int-Зса.
К раствору 107 (получение которого описано в описании синтеза 109 и которое далее использовалось для промежуточного соединения 116, которое использовали в синтезе Ех-53, Ех-54 и Ех-55 в примере 3 ниже) (10,34 г, 21,65 ммоль) в THF (100 мл) при комнатной температуре, добавляли 2 Н моногидрат гидроксида лития (43,3 мл, 87 ммоль) и смесь нагревали до 45°С и перемешивали в течение ночи с получением Int-3са в качестве неочищенного раствора. LC/MS: (М+1)+=464,3. Реакционную смесь охлаждали до 0°С и обрабатывали 1 М HCl (40 мл). Смесь непосредственно использовали для следующей стадии.
Стадия В - синтез Int-3с.
К неочищенному Int-3са, полученному на предыдущей стадии, добавляли NaHCO3 (1,725 г, 20,54 ммоль) и Fmoc-OSu (3,81 г, 11,30 ммоль) при 0°С. Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 2 ч, обрабатывали 1 М HCl (20,5 мл) и экстрагировали этилацетатом (2x200 мл). Объединенные органические слои промывали рассолом (2x100 мл) и сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. Остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле, элюируя градиентом 2%-5% МеОН в DCM, с получением Int-3с. LC/MS: (М+1)+=686,4.
Получение промежуточного соединения Int-4b.
Промежуточное соединение Int-4b получали по следующей схеме:
Стадия А - синтез Int-4ba из трет-бутил-3-(2-гидроксиэтокси)пропаноата.
К раствору трет-бутил 3-(2-гидроксиэтокси)пропаноата (500,0 мг, 2,63 ммоль) в DCM (2 мл) добавляли CBr4 (1395 мг, 4,21 ммоль) и PPh3 (965 мг, 3,68 ммоль) при 0°С. Смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. Полученную смесь концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле, элюируя градиентом 1%-15% этилацетата в петролейном эфире. Фракции, содержавшие желаемый продукт, объединяли и концентрировали с получением трет-бутил 6-бромгексаноата. Полученный таким образом раствор трет-бутил 6бромгексаноата (5 г, 19,91 ммоль) в ацетонитриле (10 мл) обрабатывали триметиламином (13,56 мл, 59,7 ммоль) и полученный раствор нагревали при 50°С в течение ночи. Раствор концентрировали с получением Int-4ba. LC/MS: М+=230,3.
Стадия В - синтез Int-4b.
К раствору Int-4ba (6,8 г, 21,92 ммоль) в DCM (6 мл) добавляли 4 Н HCl в диоксане (27,4 мл, 110 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 3 ч. Затем смесь концентрировали с получением Int-4b. LC/MS: M+=174,3.
Получение промежуточного соединения Int-2d описано выше для получения Ех-01 и Ех-25. Эта часть молекулы может быть описана как линкер, который циклизует низшее пептидное кольцо, имеющее заместители R1, R2 и R8. Вместо Int-2d можно использовать другие сходные линкеры. Ниже приведено описание других линкеров, которые могут быть использованы для получения соединений примеров по изобретению, описанных в настоящем описании.
Получение промежуточного соединения Int-2e.
Промежуточное соединение Int-2e, пригодное в качестве линкера для получения соединений по изобретению, получали по следующей схеме:
- 51 043952
IntZed
Стадия А - синтез промежуточного соединения Int-2ea.
К раствору трет-бутил (2-(3-оксоизоиндолин-5-ил)этил)карбамата (1,60 г, 5,79 ммоль) в DCE (20 мл) добавляли NsCl (1,93 г, 8,69 ммоль), триэтиламин (1,76 г, 17,4 ммоль) и DMAP (0,141 г, 1,16 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 14 ч при 40°С. Реакционную смесь охлаждали до комнатной температуры и концентрировали при пониженном давлении. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя 1%-40% градиентом EtOAc в РЕ) с получением Int-2ea. LC/MS: (M+Na)+:=484,4.
Стадия В - синтез промежуточного соединения Int-2eb.
К раствору Int-2ea (11,3 г, 24,5 ммоль) в THF (100 мл) и воде (100 мл) добавляли LiOH (1,76 г, 73,5 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 5 ч при 25°С, затем полученный раствор доводили до рН 4~5 посредством HCl (1 М). Раствор экстрагировали EtOAc и объединенные органические слои промывали рассолом, сушили над безводным Na2SO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-6% МеОН в DCM) с получением Int-2eb. LC/MS: (M+Na)+:=502,2.
Стадия С - синтез промежуточного соединения Int-2ec.
К раствору Int-2eb (1,70 г, 3,55 ммоль) в THF (8 мл) добавляли боргидрид (0,147 г, 10,6 ммоль) при 0°С. Реакционную смесь перемешивали в течение 14 ч при 25°С, затем полученный раствор концентрировали при пониженном давлении. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-50% EtOAc в РЕ) с получением Int-2ec. LC/MS: (M+NH4]+=483,2.
Стадия D - Синтез промежуточного соединения Int-2ed
К раствору Int-2ec (4,50 г, 9,67 ммоль) в DMF (150 мл) добавляли K2CO3 (2,01 г, 14,5 ммоль) и 3бромпроп-1-ен (1,41 г, 11,6 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 5 ч при комнатной температуре, затем разбавляли водой и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические слои промывали рассолом, сушили над безводным Na2SO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-50% EtOAc в РЕ) с получением Int-2ed. LC/MS: (M+H)+:=506,2.
Стадия Е - синтез промежуточного соединения Int-2e.
К раствору Int-2ed (4,50 г, 8,90 ммоль) в DMF (35 мл) добавляли DBU (1,35 г, 8,90 ммоль) и 2меркаптоэтанол (2,08 г, 26,7 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 14 ч при комнатной температуре, а затем очищали колоночной хроматографией на С18 (колонка: 330 g; подвижная фаза А: вода/0,05% TFA, подвижная фаза В: ACN; скорость потока: 85 мл/мин; градиент: от 10% В до 20% В в течение 15 мин, от 20% В до 45% В в течение 15 мин, детектор: УФ 210 нм; Rt=20 мин) с получением Int2e. LC/MS: (М+Н)+:=321,2. 1Н-ЯМР (300 МГц, CDCl3) δ 7,21-7,13 (м, 2Н), 7,10-7,01 (м, 1H), 5,96-5,79 (м, 1H), 5,30-5,09 (м, 2Н), 4,58 (с, 2Н), 3,84 (с, 2Н), 3,43-3,19 (м, 4Н), 2,76 (т, J=7,1 Гц, 2Н), 1,41 (с, 9Н).
Получение промежуточного соединения Int-2f-1.
Промежуточное соединение Int-2f-1, пригодное в качестве линкер для получения соединений по изобретению, получали в соответствии со следующей схемой:
- 52 043952
lnt-2fb-2
I nt-2f b- рацемиче cttoe
Стадия А - синтез промежуточного соединения Int-2fa.
К раствору 4-бромбензальдегида (20,0 г, 108 ммоль), (S)-2-метилпропан-2-сульфинамида (12,5 г, 103 ммоль), MgSO4 (130 г, 1081 ммоль) в DCM (225 мл) добавляли пиридин 4-метилбензолсульфонат (1,35 г, 5,40 ммоль) под защитой азотом. Эту смесь перемешивали при 25°С в течение 72 ч, затем полученный раствор фильтровали, и фильтрат концентрировали при пониженном давлении. Полученный остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-15% EtOAc в РЕ) с получением Int-2fa. LC/MS: (М+Н)+:=287,9, 289,9.
Стадия В - синтез промежуточного соединения Int-2fb (рацемат) и разделение на энантиомеры Int2/b-1 и Int-2fb-2.
К раствору Int-2fa (20,0 г, 65,9 ммоль) в сухом DCM (200 мл) медленно добавляли бромид бут-3-ен1-илмагния (15,7 г, 99 ммоль) при -48°С под защитой азотом. Смесь перемешивали при -48°С в течение 2 ч, затем гасили насыщенным водным раствором NH4Cl (400 мл) и экстрагировали DCM. Объединенные органические слои промывали рассолом, сушили над безводным Na2SO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении и полученный остаток (содержащий рацемическую смесь Int2fb) очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-35% EtOAc в РЕ) с получением Int-2fb-1 и Int-2fb-2. LC/MS: (M+H)+:=344,0, 346,0.
Стадия С - синтез промежуточного соединения Int-2fc-1.
К раствору HCl (100 мл, 4 Н в 1,4-диоксане) при комнатной температуре добавляли Int-2fb-1 (17,0 г, 46,9 ммоль). Реакционный раствор перемешивали в течение 1 ч, а затем концентрировали при пониженном давлении с получением Int-2fc-1. LC/MS: (M+H-HCl)+:=240,0, 242,0.
Стадия D - синтез промежуточного соединения Int-2fd-1.
К раствору Int-2fc-1 (8,20 г, 28,2 ммоль) и Teoc-OSu (8,03 г, 31,0 ммоль) в 1,4-диоксане (200 мл) добавляли TEA (8,55 г, 84 ммоль) при 25°С. Эту смесь перемешивали в течение 2 ч, затем гасили водой и экстрагировали петролейным эфиром (РЕ). Объединенные органические слои концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-10% EtOAc в РЕ) с получением Int-2fd-1. LC/MS: (M+Na+CH3CN)+:=447,3, 449,3.
- 53 043952
Стадия Е - синтез промежуточного соединения Int-2fe-1.
К раствору Int-2fd-1 (15,1 г, 37,3 ммоль), (2-((трет-бутоксикарбонил)амино)этил)трифторбората калия (18,7 г, 74,6 ммоль), Cs2CO3 (36,5 г, 112 ммоль) в толуоле (285 мл) и воде (95 мл) добавляли PdCl2(dppf) (1,37 г, 1,87 ммоль) под защитой азотом. Смесь перемешивали при 80°С в течение 40 ч. Полученный раствор гасили водой и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические слои сушили над Na2SO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали колоночной хроматографией над силикагелем (элюируя градиентом 1%-40% EtOAc в РЕ) с получением Int2fe-1. LC/MS: (M+Na)+:=471,4.
Стадия F - синтез промежуточного соединения Int-2f-1.
К раствору Int-2fe-1 (10,6 г, 22,4 ммоль) в THF (100 мл) добавляли 1 Н TBAF в THF (44,9 мл, 44,9 ммоль). Эту смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 16 ч, а затем гасили водой и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические слои промывали рассолом, сушили над безводным Na2SO4 и фильтровали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя градиентом 1%-70% EtOAc в РЕ), а затем колоночной хроматографией на С18 (колонка: 330 г; подвижная фаза А: вода (10 мм NH4HCO3), подвижная фаза В: ACN; скорость потока: 80 мл/мин; градиент: от 10% В до 10% В в течение 10 мин, от 20% В до 45% В в течение 10 мин, от 45% В до 70% В в течение 20 мин, детектор:УФ 210 нм; Rt=25 мин) с получением Int2f-1. LC/MS: (М+Н)+:=305,1. 1Н-ЯМР (300 МГц, CD3OD) δ 7,27-7,16 (м, 4Н), 5,85-5,75 (м, 1H), 5,00-4,85 (м, 2Н), 3,79 (т, J=7,0 Гц, 1H), 3,32-3,21 (м, 2Н), 2,75 (т, J=7,4 Гц, 2Н), 2,98-1,72 (м, 4Н), 1,42 (с, 9Н).
Пример 2. Получение Ех-50 и Ех-52.
Соединение Ех-50 получали в соответствии со схемой, приведенной ниже, из соединения Ех-01, получение которого описано в настоящем описании в примере 1, посредством реакции его в соответствующих условиях с промежуточным соединением Int 32, полученным по следующей схеме:
- 54 043952
Стадия А: получение промежуточного соединения Int-32A.
К раствору трет-бутил 3-(2-(2-бромэтокси)этокси)пропаноата (5 г, 16,82 ммоль) в ацетонитриле (10 мл) добавляли триметиламин (33% в этаноле, 11,46 мл, 50,5 ммоль) и полученный раствор нагревали при 50°С в течение ночи. Раствор концентрировали с получением бромида 2-(2-(3-(трет-бутокси)-3оксопропокси)этокси)-N,N,N-триметилэтанаминия (Int 32A). LC/MS: (М)+: 276,5.
Стадия В: получение промежуточного соединения Int-32.
К раствору бромида 2-(2-(3-(трет-бутокси)-3-оксопропокси)этокси)-N,N,N-триметилэтанаминия (Int-32A) (5,99 г, 16,81 ммоль) в DCM (20 мл) добавляли HCl (4 Н в диоксане) (21,01 мл, 84 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение ночи. Раствор концентрировали с получением бромида 2-(2-(2-карбоксиэтокси)этокси)-N,N,N-триметuлэтанаминия (Int-32). LC/MS: (M)+: 220,1.
Получение соединения примера Ех-50.
К раствору Ех-01 (неочищенный) (17,4 мг, 0,012 ммоль) и бромида 2-(2-(2-карбоксиэтокси)этокси)Ν,Ν,Ν-триметилэтанаминия (Int-32) (4,49 мг, 0,015 ммоль) в DMF (2 мл) добавляли HATU (5,69 мг, 0,015 ммоль) и DIEA (6,54 мкл, 0,037 ммоль), и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 50 мин, а затем очищали обращено-фазовой ВЭЖХ с использованием ацетонитрила (0,1% муравьиная кислота)/вода (0,1% муравьиная кислота) в качестве подвижной фазы с получением Ех-50. LC/MS: М+=1596,3.
- 55 043952
Получение соединения примера Ех-52.
Соединение Ех-52 получали аналогично получению соединения Ех-50, но с использованием Ех-51 вместо Ех-01. Ех-52 очищали с использованием обращено-фазовой ВЭЖХ в соответствии со способами, описанными в настоящем описании. LC/MS: M+=1593,8.
Пример 3. Получение Ех-53, Ех-54 и Ех-55.
Соединения Ех-53, Ех-54 и Ех-55 получали аналогично получению соединений, описанных выше, из промежуточного соединения 115 (получение описано ниже), в соответствии со следующими схемами и описанием синтеза:
- 56 043952
HATU/DIEA/DMF
Стадия A - синтез промежуточного соединения 116.
К раствору 115 (66,3 мг, 0,044 ммоль) в DMF (1,5 мл), DCM (10 мл) и воде (0,5 мл) при 0°С добавляли DIPEA (0,030 мл, 0,173 ммоль), а затем HATU (18,50 мг, 0,049 ммоль) и смесь перемешивали в течение 30 мин. Смесь концентрировали в вакууме и непосредственно очищали колоночной хроматографией на С18 (30 г, элюируя ацетонитрилом+0,05% ТРА/вода+0,05% TFA от 90:10 до 40:60) с получением 116 в качестве смеси Е- и Z-изомеров, а также 116 в качестве очищенных фракций Е- или Z-изомеров. LC/ MS (основной изомер) LC/MS: М =1481,19; LC/MS (минорный изомер): LC/MS: М =1480.
Стадия В - синтез соединения Ех-54.
Раствор 116 (25,1 мг, 0,017 ммоль) и Pd-C 10% (3,61 мг, 3,39 мкмоль) в МеОН (10 мл) гидрогенизировали при 1 атм. в течение 1 ч. Реакционную смесь фильтровали через целит и концентрировали. Остаток обрабатывали DCM/TFA 1:1 в течение 30 мин, затем концентрировали, обрабатывали 4 Н НС1 в диоксане (100 мкл), а затем концентрировали с получением Ех-54 в форме соли HCl. LC/MS: М =1383,44.
Стадия С - синтез соединения Ех-55.
Соединение примера Ех-55 получали в форме формиата из Ех-54 способом, идентичным способу, описанному в примере 2 для синтеза соединения Ex-50. LC/MS: М =1583,69.
Стадия D - синтез соединения Ех-53.
Соединение примера Ех-53 получали в форме соли НС1 из промежуточного соединения 116 способом, идентичным способу, описанному в примере 1 для синтеза соединения Ex-51. LC/MS: М =1381,33.
Получение промежуточных соединений, необходимых для предоставления промежуточного соединения 115, из которого в конечном итоге получают соединения Ех-53, Ех-54 и Ех-55, описано на схемах и способах синтеза ниже для получения промежуточного соединения 103.
Стадия А - синтез промежуточного соединения 100.
Раствор 4-бром-2-гидроксибензальдегида (3,00 г, 14,92 ммоль), трет-бутил N-[2трифторбораниудил)этил]карбамата калия (3,82 г, 15,22 ммоль), карбоната цезия (17,02 г, 52,2 ммоль) и комплекса дихлорид 1,Г-бис(дифенилфосфино)ферроценпалладий(П)-дихлорметан (0,611 г, 0,746 ммоль) в дегазированном толуоле (45 мл) и воде (15 мл) нагревали до 75°С и перемешивали в течение ночи. Смесь гасили при комнатной температуре полунасыщенным водным раствором бикарбоната натрия и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции промывали рассолом, сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc от 99:1 до 60:40) с получением 100. LC/MS: (М-55) =210,25.
Стадия В - синтез промежуточного соединения 101.
К раствору 100 (1,70 г, 6,41 ммоль) и аллилбромида (0,832 мл, 9,61 ммоль) в DMF (10 мл) при ком
-57043952 натной температуре добавляли карбонат калия (1,328 г, 9,61 ммоль) и смесь нагревали при 50°С и перемешивали в течение 1 ч. Смесь гасили при комнатной температуре полунасыщенным водным раствором бикарбоната натрия и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции промывали рассолом, сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc от 99:1 до 70:30) с получением 101. LC/MS: (М-55)+=250,29.
Стадия С - синтез промежуточного соединения 102.
К раствору 101, полученного на предыдущей стадии (1,76 г, 5,76 ммоль), молекулярных сит 4А (2 г) и ацетата аммония (4,44 г, 57,6 ммоль) в МеОН (100 мл) при комнатной температуре добавляли цианоборгидрид натрия (0,380 г, 6,05 ммоль) и смесь встряхивали в течение ночи. Смесь концентрировали, гасили при комнатной температуре водой и экстрагировали DCM. Объединенные органические фракции сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя DCM/MeOH от 99:1 до 30:70) с получением 102. LC/MS: (2М+Н)+=613,56.
Стадия D - синтез промежуточного соединения 103.
К раствору 102 (220 мг, 0,718 ммоль) и монометилового эфира янтарной кислоты (114 мг, 0,862 ммоль) в DMF (4 мл) при комнатной температуре добавляли HATU (300 мг, 0,790 ммоль) и DIPEA (0,314 мл, 1,795 ммоль) и смесь перемешивали в течение 30 мин. Смесь гасили при комнатной температуре насыщенным водным раствором бикарбоната натрия и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции промывали рассолом, сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc от 99:1 до 30:70) с получением промежуточного соединения, которое обрабатывали 20% TFA в DCM в течение 1 ч. Реакционную смесь концентрировали, а затем обрабатывали 4 Н HCl (1,5 мл) и концентрировали с получением 103. LC/MS: (М+Н)+=321,29.
Получение промежуточного соединения 109.
Стадия А - синтез промежуточного соединения 104.
К перемешиваемому раствору гидрохлорида метил (S)-2-метилпирролидин-2-карбоксилата (7,00 г, 39 ммоль) и (S)-2-((трет-бутоксикарбонил)амино)-3-(4-метоксифенил)пропионовой кислоты (12,08 г, 40,9 ммоль) в DMF (100 мл) при 0°С добавляли DIPEA (17,01 мл, 97,0 ммоль), а затем HATU (19,26 г, 50,7 ммоль). Полученной смеси позволяли нагреться до комнатной температуры и перемешивали в течение ночи. Реакционную смесь гасили 10% водным раствором LiCl и экстрагировали EtOAc. Органический экстракт промывали 10% водным раствором LiCl и сушили над MgSO4. Растворитель удаляли при пониженном давлении и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc от 80:20 до 40:60) с получением 104.
Стадия В - синтез промежуточного соединения 105.
К раствору 104 (16,4 г, 39,0 ммоль) в EtOAc (100 мл) добавляли 4 Н HCl в диоксане (48,8 мл, 195 ммоль). Полученную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 18 ч и концентрировали при пониженном давлении с получением 105, которое использовали на следующей стадии без
- 58 043952 дальнейшей очистки.
Стадия С - синтез промежуточного соединения 106.
К раствору 105 (13,2 г, 37,0 ммоль) и N-((бензuлокси)карбонил)-О-(трет-бутил)-L-треонина (18,15 г, 37,0 ммоль) в DMF при 0°С добавляли DIPEA (16,15 мл, 92 ммоль), а затем HATU (18,28 г, 48,1 ммоль). Полученной смеси позволяли нагреться до комнатной температуры и перемешивали в течение ночи. Реакционную смесь гасили 10% водным раствором LiCl и экстрагировали EtOAc. Органический экстракт промывали 10% водным раствором LiCl и сушили над MgSO4. Растворитель удаляли при пониженном давлении и остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc от 80:20 до 40:60) с получением 106.
Стадия D - синтез промежуточного соединения 107.
К раствору 106 (16,5 г, 27,0 ммоль) в МеОН добавляли взвесь 10% Pd/C и смесь гидрогенизировали при 20 фунт./кв. дюйм в течение 4 ч. Реакционную смесь фильтровали через целит и концентрировали при пониженном давлении. Затем неочищенный продукт перерастворяли в DCM и раствор фильтровали через 2-мкм фильтр и концентрировали с получением 107.
Стадия Е - синтез промежуточного соединения 108.
К раствору 107 (3,2 г, 6,70 ммоль) в DCM добавляли DIPEA (1,52 мл, 8,71 ммоль), а затем ди-третбутилдикарбонат (1,90 г, 8,71 ммоль). Полученную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч, а затем концентрировали при пониженном давлении. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc от 100:0 до 40:60) с получением 108.
Стадия F - синтез промежуточного соединения 109.
Раствор 108 (1,43 г, 2,475 ммоль) и 1 Н водный раствор LiOH (9,90 мл, 9,90 ммоль) в THF (15 мл) и МеОН (15 мл) нагревали при 45°С и перемешивали в течение 4 ч, а затем при 32°С в течение 48 ч. Реакционную смесь концентрировали, гасили при 0°С 0,5 М водным раствором хлористоводородной кислоты до рН ~2-3 и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc-EtOH от 99:1 до EtOAc-EtOH 3:1) с получением 109. LC/MS: (М+Н)+=564,49.
Получение промежуточных соединений с 110 по 115.
Стадия А - синтез промежуточного соединения 110.
Стадия А
Раствор 109 (217 мг, 0,385 ммоль), HATU (133 мг, 0,350 ммоль) и DIPEA (0,245 мл, 1,400 ммоль) в DMF (2,5 мл) обрабатывали 103 (217 мг, 0,385 ммоль) при 0°С и смеси позволяли нагреться до комнатной температуры и перемешивали в течение 30 мин. Смесь гасили при 0°С насыщенным водным раствором бикарбоната натрия и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции промывали рассолом, сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc-EtOH 3:1 от 99:1 до EtOAc-EtOH 3:1) с получением 110. LC/MS: (М+Н)+=866,21.
- 59 043952
Стадии В и С - синтез промежуточных соединений 111 и 112.
К раствору 110 (249 мг, 0,288 ммоль) в DCM (1 мл) при комнатной температуре добавляли 4 Н HCl в диоксане (0,359 мл, 1,438 ммоль) и смесь перемешивали в течение 6 ч, а затем концентрировали с получением 111. LC/MS: (М+Н)+=710,19.
К раствору 111 (219 мг, 0,293 ммоль) и 76 (232 мг, 0,285 ммоль) в DMF (3 мл) и воде (0,15 мл) при 0°С добавляли DIPEA (0,128 мл, 0,734 ммоль) и HATU (123 мг, 0,323 ммоль), и смесь перемешивали в течение 30 мин. Смесь гасили при 0°С рассолом и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические фракции сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя смесью гексан/EtOAc-EtOH 3-1 от 99:1 до 30:70, а затем DCM/MeOH от 99:1 до 70:30) с получением 112. LC/MS: (М+Н)+=1506,11.
Стадия D - синтез промежуточного соединения 113.
К раствору 112 (173 мг, 0,115 ммоль) в DCM (180 мл) и АсОН (15 мл), дегазированному азотом в течение 30 мин, добавляли катализатор Чжань (59,0 мг, 0,080 ммоль), и смесь нагревали при 50°С и перемешивали в течение 3 ч. Смесь фильтровали через целит, промывали DCM, а затем концентрировали в вакууме. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (элюируя DCM/MeOH от 99:1 до 80:20) с получением 113 в качестве смеси Е- и Z-изомеров. LC/MS (основной изомер): (М)+=1477,80; LC/MS (минорный изомер): (М)+=1478,28.
Стадия Е - синтез промежуточного соединения 114.
- 60 043952
К раствору 113 (141 мг, 0,095 ммоль)) в ацетонитриле (2 мл) добавляли пиперидин (0,066 мл, 0,668 ммоль) и смесь перемешивали в течение 45 мин. Смесь концентрировали в вакууме, совместно упаривали с ацетонитрилом три раза с получением неочищенного материала. К взвеси того неочищенного материала (119 мг, 0,095 ммоль) и промежуточного соединения 88 (52,0 мг, 0,105 ммоль) в DMF (2 мл) и воде (0,1 мл) при 0°С добавляли HATU (39,7 мг, 0,105 ммоль) и DIPEA (0,037 мл, 0,209 ммоль) и смесь перемешивали в течение 30 мин. Смесь очищали колоночной хроматографией на С18 (элюируя ацетонитрилом+0,05% TFA/вода +0,05% TFA от 90:10 до 30:70) с получением 114 в качестве смеси Е- и Zизомеров. Основной изомер LC/MS: (М)+=1735,28; LC/MS (минорный изомер): (М)+=1735,25.
Стадия F - синтез промежуточного соединения 115.
К раствору 114 (134 мг, 0,077 ммоль) в THF (1,5 мл) и МеОН (1,5 мл) при 0°С капельно добавляли 1 Н водный LiOH (0,386 мл, 0,386 ммоль) и смесь перемешивали в течение 2 ч. Реакционную смесь капельно обрабатывали при 0°С 0,5 Н HCl до рН~7, концентрировали из органических растворителей, а затем взвесь растворяли ~1 мл DMF и прямо очищали колоночной хроматографией на С18 (элюируя ацетонитрилом+0,05% ТГА/вода+0,05% TFA от 90:10 до 50:50) с получением 115 в качестве смеси Е- и Zизомеров. Основной изомер LC/MS: (М)+=1498,71; LC/MS (минорный изомер): (М)+=1499,48.
Как описано выше для получения Ех-50 из Ех-01, и Ех-55 из Ех-54 посредством реакции их амида R2 в соответствующих исходных соединениях с кислотным предшественником заместителя, можно ис пользовать следующие промежуточные соединения в аналогичных реакциях с получением пригодных соединений по изобретению.
Синтез предшественников заместителей R1/R2.
Получение хлорида 5-карбокси-N-(3-метоксипропил)-N,N-диметилпентан-1-аминия (промежуточное соединение Z-1a).
Стадия А: получение промежуточного соединения Z-1.
К перемешиваемому раствору трет-бутил 6-(диметиламино)гексаноата (300 мг, 1,393 ммоль) в ацетонитриле (1 мл) добавляли 1-бром-3-метоксипропан (853 мг, 5,57 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Полученную смесь концентрировали при пониженном давлении с получением Z-1. LC/MS: (М-Вг)+=288,4. 1Н-ЯМР (300 МГц, CDCb): δ 3,76-3,47 (м, 6Н), 3,38 (д, J=28,9 Гц, 9Н), 2,25 (т, J=7,2 Гц, 2Н), 2,12-1,95 (м, 2Н), 1,87-1,55 (м, 4Н), 1,45 (с, 11Н).
Стадия В: синтез промежуточного соединения Z-la.
К перемешиваемому раствору Z-1 (460 мг, 1,249 ммоль) в DCM (0,5 мл) добавляли 4 М HCl в диоксане (2 мл) при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 4 ч и концентрировали при пониженном давлении. Остаток перерастворяли в DCM (5 мл) и концентрировали при пониженном давлении с получением промежуточного соединения Z-la. LC/MS: (М-а)+=232,3.
Получение промежуточного соединения Z-2b.
Стадия А: получение промежуточного соединения Z-2.
- 61 043952
К перемешиваемому раствору трет-бутил 6-бромгексаноата (1,0 г, 3,98 ммоль) в THF (10 мл) добавляли диметиламин (2M в THF) (7,96 мл, 15,93 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 16 ч. Полученную смесь концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле, элюируя градиентом 1%-15% МеОН в DCM. Фракции, содержавшие желаемый продукт, объединяли и концентрировали с получением Z-2. LC/MS: (М+Н)+=216,2. 1Н-ЯМР (300 МГц, CDCl3): δ 2,35-2,17 (м, J=8,5, 6,5 Гц, 10Н), 1,67-1,47 (м, 4Н), 1,45 (с, 9Н), 1,42 -1,23 (м, 2Н).
Стадия В: получение промежуточного соединения Z-2a.
К перемешиваемому раствору Z-2 (250 мг, 1,161 ммоль) в ACN (1 мл) добавляли 1-бром-2метоксиэтан (645 мг, 4,64 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Полученную смесь концентрировали при пониженном давлении с получением Z-2a. LC/MS: (M-Br)+=274,3. 1НЯМР (300 МГц, CDOj): δ 4,02-3,80 (м, 4Н), 3,70-3,54 (м, 2Н), 3,42 (д, J=13,0 Гц, 9Н), 2,24 (т, J=7,2 Гц, 2Н), 1,85-1,75 (м, 2Н), 1,72-1,55 (м, 2Н), 1,44 (с, 11Н).
Стадия С: получение промежуточного соединения Z-2b.
К перемешиваемому раствору Z-2a (450 мг, 1,270 ммоль) в DCM (0,5 мл) добавляли 4 М HCl в диоксане (2 мл) при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 4 ч и концентрировали при пониженном давлении. Остаток перерастворяли в DCM (5 мл) и концентрировали при пониженном давлении с получением Z-2b. LC/MS: ^-0)+=218,3.
Получение промежуточного соединения Z-3b.
Стадия А: получение промежуточного соединения Z-3.
К раствору трет-бутил 3-(2-гидроксиэтокси)пропаноата (500,0 мг, 2,63 ммоль) в DCM (2 мл) добавляли CBr4 (1395 мг, 4,21 ммоль) и PPh3 (965 мг, 3,68 ммоль) при 0°С. Смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. Полученную смесь концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле, элюируя градиентом 1%-15% ЕА в РЕ. Фракции, содержавшие желаемый продукт, объединяли и концентрировали с получением Z-3. 1Н-ЯМР (400 МГц, CDOj): δ 3,78 (дт, J=11,1, 6,3 Гц, 4Н), 3,47 (т, J=6,3 Гц, 2Н), 2,53 (т, J=6,4 Гц, 2Н), 1,48 (с, 9Н).
Стадия В: синтез промежуточного соединения Z-3a.
К перемешиваемому раствору трет-бутил 3-(2-бромэтокси)пропаноата Z-3 (450 мг, 1,778 ммоль) в ACN (2 мл) добавляли триметиламин (955 мг, 5,33 ммоль) (33%Wt, в EtOH). Реакционную смесь перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Полученную смесь концентрировали при пониженном давлении с получением Z-3a. LC/MS: (M-Br)+=232,3. 1Н-ЯМР (400 МГц, CDCl3): δ 5,32 (с, 1H), 4,04-3,94 (м, 4Н), 3,73 (т, J=5,7 Гц, 2Н), 3,50 (с, 10Н), 2,50 (т, J=5,7 Гц, 2Н), 1,44 (с, 9Н).
Стадия С: синтез промежуточного соединения Z-3b.
К раствору Z-3a (550 мг, 1,761 ммоль) в DCM (0,6 мл) добавляли 4 М HCl в диоксане (2,5 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 4 ч. Полученную смесь концентрировали при пониженном давлении и остаток перерастворяли в DCM (3 мл) и толуоле (3 мл). Затем смесь концентрировали при пониженном давлении с получением Z-3b. LC/MS: (M-C1)+=176,2.
Получение промежуточного соединения Z-4b.
- 62 043952
Стадия А: получение промежуточного соединения Z-4.
К раствору DIAD (1,755 мл, 9,03 ммоль) в THF (30 мл) добавляли Ph3P (2,368 г, 9,03 ммоль). Смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 10 мин, затем к раствору добавляли метил 2-(3гидроксифенил)ацетат (1,0 г, 6,02 ммоль) и 3-(диметиламино)пропан-1-ол (0,931 г, 9,03 ммоль). Смесь перемешивали при 50°С в течение 1 ч. Полученный раствор концентрировали при пониженном давлении и остаток очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле, элюируя градиентом 1%-10% МеОН в DCM. Ф ракции, содержавшие желаемый продукт, объединяли и концентрировали с получением Z-4. LC/MS: (М+Н)+=252,2. 1H-NMR (300 МГц, CDC13): δ 7,23-7,18 (м, 1H), 6,82 (тд, J=8,7, 4,1 Гц, 3Н), 4,01 (т, J=6,4 Гц, 2Н), 3,69 (с, 3Н), 3,59 (с, 2Н), 2,46 (т, J=7,3 Гц, 2Н), 2,27 (с, 6Н), 1,97 (дт, J=7,9, 6,5 Гц, 2Н).
Стадия В: получение промежуточного соединения Z-4a.
К раствору Z-4 (600 мг, 2,268 ммоль) в ACN (12 мл) добавляли MeI (1,288 г, 9,07 ммоль). Смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 1 ч. Полученный раствор концентрировали при пониженном давлении с получением -Z-4a. LC/MS: (M-I)+=266,2.
Стадия С: получение промежуточного соединения Z-4b.
К раствору Z-4a (800 мг, 1,729 ммоль) в THF (12 мл) добавляли 2 М LiOH (1,729 мл, 3,46 ммоль). Эту смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. Величину рН раствора доводили до 4 посредством HCl (1 М) и раствор концентрировали при пониженном давлении. Неочищенный продукт очищали обращено-фазовой хроматографией на С18 (подвижная фаза А: вода, подвижная фаза В: ACN; скорость потока: 60 мл/мин; градиент: от 1% В до 25% В в течение 25 мин; от 25% В до 95% В в течение 15 мин; от 95% В до 95% В в течение 10 мин) с получением Z-4b. LC/MS: (M-C1)+=252,2. 1Н-ЯМР (300 МГц, CD3OD): δ 7,21 (т, J=7,9 Гц, 1H), 6,95-6,75 (м, 3Н), 4,12 (т, J=5,7 Гц, 2Н), 3,63-3,50 (м, 4Н), 3,18 (с, 9Н), 2,35-2,20 (м, 2Н).
- 63 043952
Пример 4. Получение Ех-23.
Стадия А: получение промежуточного соединения S-1b.
(2S,3R,4S,5S,6R)-6-(ацетоксиметил)тетрагидро-2Н-пиран-2,3,4,5-тетраилтетраацетат S-1a (5 г, 12,81 ммоль) добавляли к растворителю 48% HBr (7,25 мл, 64,0 ммоль) в АсОН и DCM (40 мл) при 0°С и смесь перемешивали при 0°С в течение 1 ч. Реакционную смесь переливали в насыщенный водный раствор гидрокарбоната натрия, охлажденный на льду, и смесь экстрагировали DCM (3x60 мл). Органический слой промывали рассолом, сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали, а затем неочищенный продукт очищали флэш-хроматографией на силикагеле (элюируя 0~30% EtOAc/РЕ) с получением S-1b.
Стадия В: получение промежуточного соединения S-1c.
К раствору S-1b (4,5 г, 10,94 ммоль) в сухом DMF (45 мл) добавляли азид натрия (0,854 г, 13,13 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 18°С в течение 30 мин. Реакционную смесь разбавляли водой (30 мл) и экстрагировали EtOAc (3x80 мл). Органический слой сушили над Na2SO4 и упаривали до сухого состояния. Неочищенный продукт очищали флэш-хроматографией на силикагеле (элюируя 0~30% EtOAc/РЕ) с получением S-1c. К раствору S-1b (4,5 г, 10,94 ммоль) в сухом DMF (45 мл) добавляли азид натрия (0,854 г, 13,13 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 18°С в течение 30 мин. Реакционную смесь разбавляли водой (30 мл) и экстрагировали EtOAc (3x80 мл). Органический слой сушили над Na2SO4 и упаривали до сухого состояния. Неочищенный продукт очищали флэш-хроматографией на силикагеле (элюируя 0~30% EtOAc/РЕ) с получением S-1c.
Стадия С: получение промежуточного соединения S-1d.
К раствору S-1c (3,15 г, 8,44 ммоль) в EtOH (60 мл) добавляли 10% Pd-C (0,898 г, 0,844 ммоль). Реакционную емкость продували воздухом и заполняли Н2 при 50 фунт/кв. дюйм (345 кПа). Реакционную смесь перемешивали при 18°С в течение 5 ч. Реакционную смесь разбавляли EtOAc, фильтровали через целит и концентрировали с получением S-1d, которое использовали для следующей стадии.
Стадия D: получение промежуточного соединения S-1e.
К раствору S-1d (2,34 г, 6,74 ммоль) в безводном THF (20 мл) добавляли дигидрофуран-2,5-дион (0,742 г, 7,41 ммоль) и Et3N (0,939 мл, 6,74 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 3 ч до полного израсходования исходного материала, а затем упаривали. Полученный неочищенный продукт очищали флэш-хроматографией на силикагеле (элюируя 0~10% DCM/MeOH) с получением S-1e. MS
- 64 043952 (ESI): m/z (M+H)+ 448,1. Ш-ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ: 6,48 (д, J=9,04 Гц, 1H), 5,43 (с, 1H), 5,24 (т, J=8,93
Гц, 1H), 5,07-5,17 (м, 2Н), 4,08-4,18 (м, 2Н), 4,04 (кв, J=6,69 Гц, 1H), 2,72-2,84 (м, 1H), 2,58-2,69 (м, 2Н),
2,43-2,53 (м, 2Н), 2,15 (с, 3Н), 2,06 (с, 3Н), 2,04 (с, 4Н), 2,00 (с, 3Н).
Стадия Е: получение Ех-23.
К раствору Ех-01 (300 мг, 0,215 ммоль) и S-1e (115 мг, 0,258 ммоль) в DMF (8 мл) и воде (0,4 мл) добавляли DIEA (0,150 мл, 0,860 ммоль) и HATU (98 мг, 0,258 ммоль) и полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 1 ч. Реакционную смесь капельно гасили 1 Н LiOH (2,58 мл, 2,58 ммоль), полученный раствор перемешивали при к.т. в течение 2 ч, а затем фильтровали и фильтрат очищали на колонке С18 обращено-фазовой ВЭЖХ с использованием градиента 29-34% ацетонитрила (0,05% TFA) в воде (0,05% TFA) с получением Ех-23. LC/MS: [М+1]+=1657,1.
Пример 5. Получение Ех-14.
Ех-14
Соединение Ех-14 получали способом, аналогичным способам, описанным в примере 1, но с использованием различных линкеров и альтернативных стадий синтеза. Синтез этих линкеров, альтернативные стадии и основная сборка описаны ниже.
Получение промежуточного соединения Int-2g.
Промежуточное соединение Int-2g, пригодное в качестве линкера для получения соединений по изобретению, получали по следующей схеме:
- 65 043952
Стадия А - синтез Int-2gb.
К раствору Int-2da (0,5 г, 2 ммоль) и 2-азидоэтанамина, HCl (0,246 г, 2 ммоль) в THF (16 мл) при комнатной температуре на водяной бане порционно добавляли триацетоксигидроборат натрия (1,06 г, 5 ммоль) и смесь перемешивали в течение 2 ч. Реакционную смесь медленно гасили насыщенным водным раствором NaHCO3, а затем экстрагировали DCM и промывали рассолом. Объединенные органические слои сушили над MgSO4 и концентрировали с получением Int-2gb. LC/MS: (М+1)+=320,3.
Стадия В - синтез Int-2gc.
К раствору Int-2gb (0,64 г, 2 ммоль) и монометилсукцината (0,3 г, 2,3 ммоль) в DMF (4 мл) и DCM (8 мл) добавляли HATU (0,914 г, 2,4 ммоль) и DIPEA (0,7 мл, 4,01 ммоль) при -15°С. Полученный раствор перемешивали при -15°С в течение 2 ч, затем гасили водой и концентрировали. Остаток очищали обращено-фазовой хроматографией на С18 (элюируя смесью ацетонитрил/вода+0,1% TFA) с получением Int-2gc. LC/MS: (M+1)+=434,3.
Стадия С - синтез Int-2g.
К раствору Int-2gc (0,52 г, 1,2 ммоль) в DCM (9 мл) добавляли TFA (3 мл, 38,9 ммоль) при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. Смесь концентрировали при пониженном давлении с получением Int-2g. LC/MS: (M+1)+=334,3.
Получение промежуточных соединений 70В и 76С.
Стадия А - синтез промежуточного соединения 70В.
К раствору 69В (1,5 г, 4,46 ммоль) в DMF (17,8 мл) при 0°С добавляли 95% NaH (0,141 г, 5,56 ммоль), и полученный раствор перемешивали при 0°С в течение 20 мин, а затем капельно добавляли 3-бромпроп1-ин (80% в толуоле) (0,596 мл, 5,35 ммоль). К полученному раствору капельно добавляли водный раствор гидроксида лития (2 М) (3345 мкл, 6,69 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч, фильтровали и очищали обращено-фазовой ВЭЖХ (элюируя смесью ацетонитрил/вода+0,1% TFA) с получением 70В. LC/MS: (М+1)+: 361,0, (M+Na)+: 383,0.
Стадия В - синтез промежуточного соединения 76С.
Конвертирование 70В в промежуточное соединение 76С проводили по методикам, аналогичным методикам, описанным для получения промежуточного соединения 76, стадии С-Н. LC/MS: [М+1]+=812,16.
- 66 043952
Сборка в соединение примера Ех-14:
- 67 043952
Стадия А - синтез промежуточного соединения 117.
Промежуточное соединение 117 получали из промежуточных соединений Int-2g и 76С в соответствии с методиками, аналогичными методикам, описанным в примере 1 и 1А. Более конкретно, Int-2g функционализировали посредством тех же реагентов и методик, что и для получения промежуточного соединения 77В, стадии А-В, далее разрабатывали следующие методики для получения промежуточного соединения 86, стадии G-J, а затем в конце проводили связывание с промежуточным соединением 76С в соответствии с методиками получения соединения примера 1А, стадии В-С, с получением 117. LC/MS: (М+1)+: 1573,36.
Стадия В - синтез промежуточного соединения 118.
Гексафторфосфат тетракис(ацетонитрил)меди(I) (51,6 мг, 0,138 ммоль), трис[(1-бензил-1H-1,2,3триазол-4-ил)метил]амин (73,4 мг, 0,138 ммоль) и аскорбат натрия (137 мг, 0,692 ммоль) в смеси BuOH (185,00 мл)/вода (93 мл) барботировали азотом, а затем нагревали до 50°С. В реакционную смесь добавляли промежуточное соединение 117 (435,3 мг, 0,277 ммоль) в качестве твердого вещества. Через 1 ч реакционную смесь обрабатывали водным буфером при рН 4 и экстрагировали EtOAc. Объединенные органические слои упаривали и остаток очищали обращено-фазовой хроматографией (элюируя градиентом из ацетонитрила/воды +0,1% муравьиная кислота) с получением промежуточного соединения 118. LC/MS: (М+1)+: 1573,2.
Стадия С - синтез Ех-14.
Синтез соединения примера Ех-14 проводили из промежуточного соединения 118 в соответствии с методиками, аналогичными методикам, описанным в примере 1, включая использование альтернативных спейсеров для сборки. LC/MS: [M+1]+=1621,01.
С использованием схем синтеза, описанных выше, и как будет понятно, в некоторых случаях с со- 68 043952 ответствующим замещением определенных промежуточных соединений, включая использование альтернативных спейсеров, известных специалистам в данной области, получение которых может быть описано выше, получали следующие соединения по изобретению, приведенные в табл. 2 ниже. Кроме того, также в настоящей заявке могут быть описаны альтернативные солевые формы соединений по настоящему изобретению.
Таблица 2
- 69 043952
- 70 043952
- 71 043952
- 72 043952
- 73 043952
- 74 043952
- 75 043952
- 76 043952
- 77 043952
- 78 043952
- 79 043952
- 80 043952
- 81 043952
- 82 043952
- 83 043952
- 84 043952
- 85 043952
Ех-58, соль С1 . о ^nLCI V-7n f h-£>n AQ ., До 0 ϊ - D ° ДА A 1594,93
Ех-59, соль С1 о =( A ΖΞ О T / ' ° /=\ 1 А V V - - о X 1593,7
Ех-60, соль С1 , о A aJJ Ч V oVV NH η γγΊ ^'V0 оАн η Ан^аА_ ДО. , ϊ До 0 ДД) ” нмуА^А A о Чаа 1 LAJ 1607,4
Ех-61, соль С1 | Cl 0 C cnA 1 i»VNA 1 Ί А·,·^0 J CA.NH c5n [ Г h V A FA AA 1 Η Ί A ^'· NH %/ > 1 .,- 0 А о 411 n 0 НДД A о Ч-A IIN^0 tlj 1592,4
Определение активности.
Отдельные соединения по изобретению подвергали одной или нескольким методикам для анализа
- 86 043952 их активности в отношении антагонизма активности PCSK9.
Ниже приводится описание способов анализа, используемых для определения активности соединений по изобретению и любых описанных сравниваемых соединений, в отношении антагонизма PCSK9. Биотинилированный PCSK9 получали из коммерческого источника.
TR-FRET для LDLR.
Анализ TR-FRET для PCSK9 измеряет взаимодействие между PCSK9 и LDLR. Раствор, содержащий 40 нМ биотинилированный PCSK9+10 нМ Lance ULight Streptavidin приготавливают в 50 мМ HEPES, рН 7,4, с 0,15 М NaCl, 5 мМ CaCl2, 0,01% BSA, и 0,01% поверхностно-активным веществом Р20. Отдельный раствор, содержащий 40 нМ rhLDLR-6xHis+10 нМ Eu-W1024 анти-6xHis приготавливают в той же буферной системе. Echo используют для переноса 0,750 мл соединения в планшет для анализа с последующим добавлением 15 мкл PCSK9+Ulight и 15 мкл LDLR+Eu. Конечный объем анализа составляет 30,750 мкл, содержащие 20 нМ PCSK9, 5 нМ Ulight, 20 нМ LDLR и 5 нМ Eu. Реакционную смесь инкубируют при комнатной температуре в течение по меньшей мере двух часов, а затем проводят измерение флуоресценции с использованием Envision Multilabel Reader. Величины КД, определяют путем аппроксимации данных к сигмовидной кривой доза-ответ с использованием нелинейной регрессии. Количество импульсов (количество импульсов В) меченного европием LDLR определяют для определения того, влияют ли соединения неблагоприятным образом на LDLR. Снижение количества импульсов В, вероятно, указывает на ложноположительное ингибирование.
TR-FRET со стандартом Alexa FRET.
Стандартный анализ Alexa FRET для PCSK9 измеряет взаимодействие между PCSK9 и меченным AlexaFluor647 (AF) циклическим пептидом, реагентом A (KD=83 нМ).
Раствор, содержащий 1 нМ биотинилированный PCSK9+2,5 нМ Lance Streptavidin Europium (StrepEu) приготавливают в 50 мМ HEPES pH 7,4, с 0,15 М NaCl, 5 мМ CaCl2, 0,01% BSA и 0,01% поверхностно-активным веществом Р20. Отдельный раствор, содержащий 40 нМ меченного AlexaFluor циклического пептида, приготавливают в той же буферной системе. Echo используют для переноса 0,750 мл соединения в планшет для анализа с последующим добавлением 15 мкл PCSK9+Stept-Eu и 15 мкл пептида AF. Конечный объем анализа составляет 30,750 мкл, содержащие 0,5 нМ PCSK9, 1,25 нМ Strep-Eu и 20 нМ циклический пептид AF. Реакционную смесь инкубируют при комнатной температуре в течение по меньшей мере двух часов, а затем проводят измерение флуоресценции с использованием Envision Multilabel Reader. Величины IC50 определяют путем аппроксимации данных к сигмовидной кривой доза-ответ с использованием нелинейной регрессии. Затем вычисляют Ki из IC50 и KD циклическогоо пептида AF. Количество импульсов (количество импульсов В) меченного европием PCSK9 определяют для определения того, влияют ли соединения неблагоприятным образом на PCSK9. Снижение количества импульсов В, вероятно, указывает на ложноположительное ингибирование. Данные этой процедуры описываются как А=числовая величина (наномолярная)
Реагент А получали в соответствии со следующим способом.
- 87 043952
Стадия А - синтез промежуточного соединения Int-A.
Пептид синтезировали в масштабе 0,250 ммоль на микроволновом устройстве для синтеза СЕМ Liberty Blue с использованием химии Fmoc/tBu на амидной смоле PS Ринка МВНА, 0,32 ммоль г’1. Сборка проводили с использованием однократных присоединений с использованием 4 экв. 0,2 М Fmocзащищенной аминокислоты в DMF, 4 экв. 0,5 М HATU в DMF, 4 экв. 2 М DIPEA (двойное присоединение для Tyr). Циклы удаления защитной группы Fmoc проводили с использованием 20% об./об. пиперидина в DMF.
Последовательность использованных Fmoc-защищенных аминокислот и структурных элементов представляет собой следующее.
1. N-(((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-S-тритил-L-цистеин.
2. (S)-1((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-2-метuлпирролидин-2-карбоновая кислота.
3. (((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-L-тирозин.
4. N-(((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-N-тритил-L-гистидин.
5. (S)-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-4-(трет-бутокси)-4-оксобутановая кислота.
6. (S)-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-3-(5-фтор-1Н-индол-3-ил)пропионовая кислота.
7. (S)-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-3-(5-фтор-1Н-индол-3-ил)пропионовая кислота.
8. (((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)глицин.
9. ^-(((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-М-(трет-бутоксикарбонил)Ъ-лизин.
10. 3-(тритилтио)пропионовая кислота.
В конце сборки смолу промывали DMF, MeOH, DCM, Et2O. Пептид отщепляли от твердой подложки с использованием 50 мл раствора TFA (об./об.) (91% TFA, 5% Н2О, 4% TIPS) в течение приблизительно 1,5 ч при комнатной температуре. Смолу фильтровали, промывали TFA и раствором, концентрировали до сухого состояния и лиофилизировали. Лиофилизация обеспечивала промежуточное соединение Int. A (399 мг), которое использовали в качестве неочищенного материала на следующей стадии. LCMS, аналитически вычислено для C61H75F2N15O13S2: 1328,48, найдено: 1328,2 (М+1)+.
Стадия В - синтез промежуточного соединения Int-B: как описано для реагента В.
Очистку проводили посредством ОФ-ВЭЖХ (Waters Deltapak C4, двойная кассета, 40x100 мм, 15 мкм, 300А; от 15% до 35% ACN/вода+модификатор 0,1% TFA в течение 20 мин). Собранные фракции лиофилизировали с получением 35 мг промежуточного соединения Int-B. LCMS аналитически вычислено для C69H81F2N15O13S2: 1430,62; найдено: 1430,9 (М+1)+.
Стадия С - синтез соединения реагента А: как описано для реагента В.
LCMS аналитически вычислено для C105H122F2N17O26S63·: 2268,58; 1135,8 (М+2)2+.
Alexa FRET Plus TR-FRET.
Анализ Alexa FRET Plus для PCSK9 определяет взаимодействие между PCSK9 и меченным AlexaFluor647 (AF) циклическим пептидом, реагентом В (KD=35 нМ). Раствор, содержащий 1 нМ биотинилированный PCSK9+2,5 нМ Lance Streptavidin Europium (Strep-Eu) приготавливают в 50 мМ HEPES pH 7,4, с 0,15 М NaCl, 5 мМ CaCl2, 0,01% BSA и 0,01% поверхностно-активным веществом Р20. Отдельный раствор, содержащий 1920 нМ меченный AlexaFluor циклический пептид, приготавливают в той же буферной системе. Echo используют для переноса 0,075 мкл соединения плюс 0,675 мкл DMSO в каждую лунку планшета для анализа с последующим добавлением 15 мкл PCSK9+Stept-Eu и 15 мкл пептида AF. Конечный объем анализа составляет 30,750 мкл, содержащие 0,5 нМ PCSK9, 1,25 нМ Strep-Eu и 960 нМ циклический пептид AF. Реакционную смесь инкубируют при комнатной температуре в течение по меньшей мере двух часов, а затем проводят измерение флуоресценции с использованием Envision Multilabel Reader. Величины IC50 определяют путем аппроксимации данных к сигмовидной кривой доза-ответ
- 88 043952 с использованием нелинейной регрессии. Величины IC50 определяют путем аппроксимации данных к сигмовидной кривой доза-ответ с использованием нелинейной регрессии. Затем вычисляют Ki из IC50 и KD циклическогоо пептида AF. Количество импульсов (количество импульсов В) меченного европием PCSK9 определяют для определения того, влияют ли соединения неблагоприятным образом на PCSK9. Снижение количества импульсов В, вероятно, указывает на ложноположительное ингибирование. Данные этой процедуры описываются как Р=числовая величина (наномолярная)
Реагент В получали по следующей методике.
Реагент В
Стадия А - синтез промежуточного соединения Int-A.
Пептид синтезировали в масштабе 0,250 ммоль на микроволновом устройстве для синтеза СЕМ Liberty Blue с использованием химии Fmoc/tBu на амидной смоле PS Ринка МВНА, 0,32 ммоль г’1. Сборку проводили с использованием единичного присоединения с использованием 4 экв. 0,2 М Fmocзащищенной аминокислоты в DMF, 4 экв. 1 М оксима в DMF, 4 экв. 0,5 Ν,Ν-диизопропилкарбодиимида (DIC) (двойное присоединение для Y01). Циклы удаления защитной группы Fmoc проводили с использованием 20% об./об. пиперидина в DMF.
Последовательность использованных Fmoc-защищенных аминокислоты и структурных элементов представляет собой следующее.
1. N-(((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-S-тритил-L-цистеин.
2. (S)-1((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-2-метилпирролидин-2-карбоновая кислота.
3. (S)-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-3-(4-метоксифенил)пропионовая кислота.
4. N-(((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-N-тритил-L-гистидин.
5. (S)-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-4-(трет-бутокси)-4-оксобутановая кислота
6. (S)-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-3 -(5-фтор-1 Н-индол-3 -ил)пропионовая кислота.
7. (S)-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-3 -(5-фтор-1 Н-индол-3 -ил)пропионовая кислота.
8. (((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-D-аланин.
9. N-(((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)-N6-(трет-бутоксикарбонил)-L-лизин.
10. 3-(тритилтио)пропионовая кислота.
В конце сборки смолу промывали DMF, MeOH, DCM, Et2O. Пептид отщепляли от твердой подложки с использованием 50 мл раствора TFA (об./об.) (91% TFA, 5% Н2О, 4% TIPS) в течение приблизитель- 89 043952 но 1,5 ч при комнатной температуре. Смолу фильтровали, промывали TFA и раствором, концентрировали до сухого состояния и лиофилизировали. Лиофилизация обеспечивала промежуточное соединение Int.
A (300 мг), которое использовали в качестве неочищенного материала на следующей стадии. LCMS, аналитически вычислено для C63H79F2N15O13S2: 1356,53, найдено: 1356,9 (М+1)+.
Стадия В - синтез промежуточного соединения Int-B.
Неочищенное соединение Int-A (0,22 ммоль) перерастворяли в 24 мл DMF. Добавляли 6 мл 1 М водный раствор бикарбоната натрия для повышения pH до 7. Затем капельно добавляли 0,26 ммоль 1,3бис(бромметил)бензола (0,1 М в DMF). Реакционную смесь оставляли при перемешивании при комнатной температуре в течение 20 мин, гасили TFA (pH до 3-4), а затем концентрировали в вакууме с получением неочищенного Int-B, которое очищали посредством ОФ-ВЭЖХ (Waters XBridge, С18, 50x150 мм, 5 мкм, 130А; от 25% до 40% ACN/вода+модификатор 0,1% TFA в течение 20 мин). Собранные фракции лиофилизировали с получением 35 мг промежуточного соединения Int-B. LCMS аналитически вычислено для C71H85F2N15O13S2: 1458,67; найдено: 1458,8 (М+1)+
Стадия С - синтез соединения реагента В.
Промежуточное соединение Int-B (15 мг) растворяли в 0,2 мл сухого DMSO. Затем добавляли 15 мг ALEXAFLUOR 647NHS Ester (A37566, Life technology), растворенного в 1,5 мл сухого DMSO. Добавляли 20 мкл сухого DIPEA. Реакционную смесь оставляли при перемешивании при комнатной температуре в течение 12ч в атмосфере азота в темноте. Ее гасили TFA (pH до 3-4) и очищали посредством ОФВЭЖХ (Dr Maish, Reprosil Gold C18, 250x20 мм, 120A, 10 мкм; от 20% до 35% 0,1% TFA в ACN/0,1% TFA в Н2О, в течение 20 мин, затем от 35% до 40% в течение 5 мин при скорости потока 20 мл/мин). Собранные фракции лиофилизировали с получением 16,1 мг соединения реагента В. LCMS аналитически вычислено для C107H126F2N17O26S63-:2296,64; найдено: 1150,6 (М+2)2+.
Данные активности, полученные посредством одной или обеих из описанных выше методик, описаны для отдельных иллюстративных соединений по изобретению в следующем формате.
Пример №: А (стандарт TR Fret)=числовая величина; Р (Alexa Fret плюс стандарт TR Fret)=числовая величина/следует отметить, что все указанные величины являются наномолярными.
Alexa FRET Ultra TR-FRET.
Анализ Alexa FRET Ultra для PCSK9 измеряет взаимодействие между PCSK9 и меченным AlexaFluor647 (AF) циклическим пептидом, реагентом В (KD=0,99 нМ). Раствор, содержащий 1 нМ биотинилированный PCSK9+2,5 нМ Lance Streptavidin Europium (Strep-Eu) приготавливают в 50 мМ HEPES pH 7,4, с 0,15 М NaCl, 5 мМ CaCl2, 0,01% BSA и 0,01% поверхностно-активным веществом Р20. Отдельный раствор, содержащий 1920 нМ меченный AlexaFluor циклический пептид, приготавливают в той же буферной системе. Echo используют для переноса 0,015 мкл соединения плюс 0,735 мкл DMSO в каждую лунку планшета для анализа с последующим добавлением 15 мкл PCSK9+Stept-Eu и 15 мкл пептида AF. Конечный объем анализа составляет 30,750 мкл, содержащие 0,5 нМ PCSK9, 1,25 нМ Strep-Eu и 960 нМ циклический пептид AF. Реакционную смесь инкубируют при комнатной температуре в течение по меньшей мере двух часов, а затем проводят измерение флуоресценции с использованием Envision Multilabel Reader. Величины IC50 определяют путем аппроксимации данных к сигмовидной кривой доза-ответ с использованием нелинейной регрессии. Затем вычисляют Ki из IC50 и KD циклического пептида AF. Количество импульсов (количество импульсов В) меченного европием PCSK9 определяют для определения того, влияют ли соединения неблагоприятным образом на PCSK9. Снижение количества импульсов В, вероятно, указывает на ложноположительное ингибирование. Данные этой процедуры описываются как Ki Ultra=числовая величина (представленные данные являются наномолярными).
Следующие соединения оценивали, как показано в табл. 2, с использованием протокола, описанного выше, с представленными результатами:
Ex-01 Ki Plus = < 0,00558, Ki Ultra=0,0046/Ex-02 Ki Plus=0,00558, Ki
Ultra=0,005933/ Ex-03 Ki Plus=0,02535, Ki Ultra=0,06803/ Ex-04 Ki Plus < 0,00558, Ki
Ultra=0,004711/ Ex-05 Ki Plus=0,009621, Ki Ultra=0,03296/ Ex-06 Ki Plus=0,00568, Ki
Ultra=0,003424/ Ex-07 Ki Plus=0,05914, Ki Ultra=0,06753/ Ex-08 Ki Plus=0,01574, Ki
Ultra=0,06832/ Ex-09 Ki Plus=0,09189, Ki Ultra=0,247/ Ex-10 Ki Plus=0,005743,Ki
Ultra=0,02489/ Ex-11 Ki Plus=0,04334, Ki Ultra=0,2067/ Ex-12 Ki Plus=0,01448,Ki
Ultra=0,02247/ Ex-13 Ki Plus=0,1454, Ki Ultra=0,4772/ Ex-14 Ki Plus=0,01605,Ki
Ultra=0,02099/ Ex-15 Ki Plus=0,1027, Ki Ultra=0,2601/ Ex-16 Ki Plus=0,01423,Ki
Ultra=0,05141/ Ex-17 Ki Plus < 0,00558, Ki Ultra=0,0028/ Ex-18 Ki Plus=0,03356, Ki
Ultra=0,1183/ Ex-19 Ki Plus=0,01662, Ki Ultra=0,01204/ Ex-20 Ki Plus=0,01303, Ki Ultra=0,01711/ Ex-21 Ki Plus=0,005692, Ki Ultra=0,001264/ Ex-22 Ki Plus=0,00926, Ki
-

Claims (35)

  1. Ultra-0,01519/ Ex-23 Ki Plus=0,00938, Ki Ultra=0,00239/ Ex-24 Ki Plus=0,00812, Ki
    Ultra-0,00767/ Ex-25 Ki Plus=0,01127, Ki Ultra-0,00463/ Ex-26 Ki Plus < 0,00558, Ki
    Ultra-0,002754/ Ex-27 Ki Plus < 0,00558, Ki Ultra-0,00301/ Ex-28 Ki Plus < 0,00558, Ki
    Ultra-0,00078/ Ex-29 Ki Plus-0,00981, Ki Ultra-0,00614/ Ex-31 Ki Plus < 0,00558, Ki
    Ultra-0,00074/ Ex-35 Ki Plus-0,04652, Ki Ultra=0,08434/ Ex-36 Ki Plus=0,00762,Ki
    Ultra-0,00507/ Ex-38 Ki Plus-0,00904, Ki Ultra=0,01416/ Ex-39 Ki Plus=0,00716,Ki
    Ultra=0,00414/ Ex-40 Ki Plus=0,30800, Ki Ultra-0,86010/ Ex-41 Ki Plus=0,00697,Ki
    Ultra=0,00628/ Ex-44 Ki Plus=0,01445, Ki Ultra-0,02194/ Ex-47 Ki Plus=0,01474,Ki
    Ultra=0,01193/ Ex-48 Ki Plus-0,01169, Ki Ultra-0,01545/ Ex-49 Ki Plus=0,00716,Ki
    Ultra-0,00414/ Ex-50 Ki Standard <1,26, Ki Plus=0,01052, Ki Ultra-0,00443/ Ex-51 Ki
    Standard <1,26, Ki Plus < 0,00558, Ki Ultra-0,00597/ Ex-52 Ki Standard <1,26, Ki Plus <
    0,00558, Ki Ultra-O,00359/ Ex-53 Ki Standard <1,26, Ki Plus-0,09629, Ki Ultra-0,21500/ Ex54 Ki Standard <1,26, Ki Plus=0,36720, Ki Ultra-0,48390/ Ex-55 Ki Standard <1,26, Ki Plus=0,07240, Ki Ultra-O,23 800/ Ex-56 Ki Standard <1,257, Ki Plus=O,02237, Ki
    Ultra=O,00481/ Ex-57 Ki Standard <1,257, Ki Plus < 0,00558, Ki Ultra-0,00162/ Ex-58 Ki Standard <1,257, Ki Plus-0,00773, Ki Ultra=0,00196/ Ex-59 Ki Plus=O,00788, Ki
    Ultra-O,004959/ Ex-60 Ki Plus-0,006515, Ki Ultra-0,005312/Ex-61 Ki Plus-0,00747, Ki Ultra-O,006543.
    ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Соединение формулы I
    Формула I, где
    X представляет собой Н, F, Cl или Br;
    R1 выбран из (a) -Н; или (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6 и R14A представляет собой (i) -H;
    (ii) -NH2;
    (iii) —N+Нз;
    (iv) -N+(H3C)3;
    (v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14b, где R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 -N+(CH3)3;
    (vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)yl3R14B, где у12 и у13 не равны оба 2 и независимо равны от 2 до 4; и
    R14b представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
    (vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)3.4-N+(CH3)3; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой (ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
    (aii) -N+(CH3)3; или или
    - 91 043952
    (aiii) часть формулы R2 выбран из (a) -Н; и (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6 и R14A выбран из (i) -Н;
    (ii) -NH2; (iii) -N+Ha;
    (iv) -К+(НзС)з;
    (v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B, где R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -К+(СНз)з;
    (vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B, где у12 и у13 не равны оба 2 и независимо равны от 2 до 4; и
    R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
    (vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)3.4-N+(CH3)3; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой (ai) -О-(СН2)2-К+(СНз)з;
    (aii) -N+(CH3)2R14ca, где R14ca представляет собой -СН3 или -(CH2)1-4-OCH3;
    (aiii) часть формулы ’ или
    (aiv) часть формулы где y14Cb и у14Сс равны от 1 до 4; или
    R1 и R2 могут быть связаны вместе с образованием части формулы
    где
    G1, RG1a и RG1b определяются следующим образом:
    (a) G1 представляет собой линкерную часть формулы:
    где nq1 равен от 1 до 6, mq1 равен 0, 1 или 2 и вместе величины nq1 и mq1 выбраны так, чтобы длина линкерной части, которую они определяют, не превышала всего 8 атомов углерода и/или кислорода, составляющих цепь, включающую атом углерода в цепи, который образует карбонильную часть;
    RG1a выбран из (i) -H; и (ii) алкила из вплоть до 4 атомов углерода; и
    RG1b выбран из (i) части формулы
    и
    - 92 043952 (ii) части формулы
    (b) G1 представляет собой линкерную часть формулы равен 0, 1 или 2, mq2 равен от 1 до 6, и вместе величины nq2
    где nq2 и mq2 выбраны так, чтобы длина линкерной части, которую они определяют, не превышала всего 8 атомов углерода и/или кислорода, составляющих цепь, включающую атом углерода в цепи, который образует карбонильную часть;
    RG1a выбран из (i) части формулы
    и (ii) части формулы:
    RG1b выбран из (i) -H; и (ii) алкила из вплоть до 4 атомов углерода;
    R8 представляет собой -CH3 или часть формулы где R8a представляет собой -Н или линейный, разветвленный или циклический алкил из вплоть до четырех атомов углерода;
    А выбран из
    (а) части формулы (b) -СН2-(СН2)у-СН2-, где у равен от 1 до 6;
    (c) части формулы где Ab1 представляет собой
    (i) часть формулы где x равен от 1 до 6; или (ii) часть формулы где у равен от 1 до 5;
    - 93 043952 (d) части формулы: -CH2-(CH2)m-O-(CH2)n-, где m=1-5 и n=0 или 1-4; В представляет собой (a) связь;
    (b) -(CH2)1-4; или (c) часть формулы D представляет собой (а) часть формулы
    или -(СН2)2-4-О-, и А и В являются такими, как определено выше;
    где Е представляет собой -СН2-
    (b) часть формулы ’ где А и В являются такими, как опре- делено выше;
    (с) часть формулы ’ где na равен 1, 2 или 3, ma равен 2, 3 или
    4, и na+ma равно >3, и где А и В являются такими, как определено выше;
    (d) часть формулы ’ где R34b представляет собой -Н или ли- нейный разветвленный или циклический алкил из вплоть до четырех атомов углерода, и А и В являются такими, как определено выше, или его фармацевтически приемлемая соль.
  2. 2. Соединение по п.1, где X представляет собой F, или его фармацевтически приемлемая соль.
  3. 3. Соединение по п.2, где D представляет собой часть формулы
    где Е представляет собой -СН2- или -(СН2)2-О-, или его фармацевтически приемлемая соль.
  4. 4. Соединение по п.2 где D представляет собой часть формулы
    где Е представляет собой -СН2- или -(СН2)2-О-, или его фармацевтически приемлемая соль.
  5. 5. Соединение по п.2, где D представляет собой часть формулы
    - 94 043952
    или его фармацевтически приемлемая соль.
  6. 6. Соединение по п.2, где D представляет собой часть формулы
    или его фармацевтически приемлемая соль.
  7. 7. Соединение по п.2, где D представляет собой часть формулы
    или его фармацевтически приемлемая соль.
  8. 8. Соединение по п.2, где D представляет собой часть формулы
    или его фармацевтически приемлемая соль.
  9. 9. Соединение по п.2, где D представляет собой часть формулы
    или его фармацевтически приемлемая соль.
  10. 10. Соединение по п.2, где D представляет собой часть формулы
    или его фармацевтически приемлемая соль.
  11. 11. Соединение по п.2, где R1 и R2 соединены вместе частью формулы
    так что вместе с циклопептидом, с которым связаны R1 и R2, они образуют циклическую структуру, или его фармацевтически приемлемую соль.
  12. 12. Соединение по п.2, имеющее структуру формулы IIB, или его фармацевтически приемлемая соль
    - 95 043952
    его фармацевтически приемлемая где
    D2 представляет собой (а) часть формулы
  13. 13. Соединение по п.2, имеющее структуру формулы IIC, или соль
    - 96 043952 соль соль соль
    (b) часть формулы
  14. 14. Соединение по п.2, имеющее структуру формулы IID, или его фармацевтически приемлемая
    или где D2 представляет собой
    его фармацевтически приемлемая
  15. 16. Соединение по п.2, имеющее структуру формулы IIF, или его фармацевтически приемлемая
    - 97 043952
    О
    Формула IIF.
  16. 17. Соединение по любому из пп.1-16 или его фармацевтически приемлемая соль, где А представляет собой (a) -(СН2)6;
    (b) часть формулы
    сн?
    ’ где x равен от 1 до 3; или (с) часть формулы
  17. 18. Соединение по любому из пп.1-10 и 12-17 или его фармацевтически приемлемая соль, где R2 представляет собой (a) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой (a) -Н;
    (b) -NH2;
    (c) -N+H3;
    (d) -N+(H3C)3;
    (e) -NH-C(O)-[(CH2)2-4-O-]2-(CH2)2-4R14B, где R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2 или -N+(CH3)3;
    (f) -NH-C(O)-[(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой (ai) -O-(CH2)2-4-N+(CH3)3;
    (aii) -N+(CH3)3; или
    (aiii) часть формулы
  18. 19. Соединение по любому из пп.1-10 и 12-18 или его фармацевтически приемлемая соль, где R1 выбран из (a) -Н;
    (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой (i) -H;
    (ii) -N+H3; или (iii)-NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2-N+(CH3)3.
  19. 20. Соединение по любому из пп.1-11 и 17-19 или его фармацевтически приемлемая соль, где R8
    - 98 043952 представляет собой часть формулы
    где R8b представляет собой -Н, -СН3 или -С(СН3)3.
  20. 21. Соединение по п.1, которое выбрано из группы, состоящей из
    - 99 043952
    - 100 043952
    - 101 043952
    - 102 043952
    - 103 043952
    - 104 043952
    - 105 043952
    - 106 043952
    - 107 043952
    - 108 043952
    - 109 043952
    - 110 043952
    - 111 043952
    - 112 043952
    - 113 043952
    - 114 043952
    - 115 043952
    - 116 043952
    - 117 043952
    или любая другая их фармацевтически приемлемая соль.
  21. 22. Фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере одно соединение по любому из пп.1-21, или форму его фармацевтически приемлемой соли, или свободного основания, и по меньшей мере один фармацевтически прие,млемый эксципиент.
  22. 23. Способ лечения гиперхолестеринемии, включающий введение пациенту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества композиции по п.22.
  23. 24. Способ лечения гиперхолестеринемии, включающий введение пациенту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества соединения по любому из пп.1-21.
  24. 25. Соединение по п.15, имеющее структуру формулы IIE, или его фармацевтически приемлемая соль
    Формула НЕ где
    R1 выбирают из
    - 118 043952 (a) -Н; или (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6 и R14A представляет собой (i) -H;
    (ii)-NH2;
    (iii) -N+H3;
    (iv) -N+(H3C)3;
    (v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14b, где R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N (CH3)3; (Vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B, где у12 и у13 оба не представляют собой 2 и независимо представляют собой 2-4; и
    R14b представляет собой: -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N+(CH3)3;
    (vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где, у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)3_4-N+(CH3)3; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой (ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
    (aii) -N+(CH3)3;
    R2 выбирают из (a) -Н; и (b) -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A выбирают из (i) -H;
    (ii) -NH2;
    (iii) -N+H3;
    (iv) -N+(H3C)3;
    (v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14b, где R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N+(CH3)3;
    (vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B, где у12 и у13 оба не представляют собой 2 и независимо представляют собой от 2 до 4; и
    R14b представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N+(CH3)3;
    (vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)3_4-N+(CH3)3; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой (ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
    (aii) -N+(CH3)2R14ca, где R14ca представляет собой -СН3 или -(СН2)1_4-ОСН3;
    А выбирают из (a) -СН2-(СН2)у-СН2-, где у представляет собой 1-6;
    (b) часть формулы ’ где Ab1 представляет собой (i) часть формулы
    СН2
    (ii) часть формулы
    , где x представляет собой 1-6; или , где у представляет собой 1-5; и (с) часть формулы -CH2-(CH2)m-O-(CH2)n-, где m=1-5 и n=0 или 1-4.
  25. 26. Соединение по п.25, или его фармацевтически приемлемая соль, где
    R1 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой (i) -H;
    (ii) -NH2;
    (iii) -N+H3;
    (iv) -N+(H3C)3;
    (v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B, где R14B представляет собой -NH2; -N+Щ -N(CH3)2; -N+(CH3)3;
    (vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B, где у12 и у13 оба не представляют собой 2 и независимо представляют собой 2-4; и
    R14b представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N+(CH3)3;
    (vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)3_4-N+(CH3)3; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой (ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
    (aii) -N+(CH3)3;
    R2 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A выбирают из или
    - 119 043952 (i) -H;
    (ii) -NH2;
    (iii) -N+H3;
    (iv) -NWf;
    (v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B где R14B представляет собой -NH2; -N%; -N(CH3b; или -N'(CI th;
    (vi) -NH-C(O)-[(CH2)yi2-O-]2—(CH2)yi3R14B где у12 и у13 оба не представляют собой 2 и независимо представляют собой от 2 до 4; и
    R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N+(CH3)3;
    (vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)3-4-N+(CH3)3; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой (ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
    (aii) -N+(CH3)2R14ca, где R14ca представляет собой -СН3 или -(СН2)1-4-ОСН3;
    А представляет собой -СН2-(СН2)у-СН2-, где у представляет собой 1-6.
  26. 27. Соединение по п.26, или его фармацевтически приемлемая соль, где
    R1 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A представляет собой (i) -H;
    R2 представляет собой -(CH2)z-R14A, где z равен 1-6, и R14A выбирают из (i) -H;
    (ii) -NH2;
    (iii) -\H;;
    (iv) -N+(H3C)3;
    (v) -NH-C(O)-[(CH2)2-O-]2-(CH2)2R14B, где R14B представляет собой -NH2; -N%; -N(CH3h; или -N+(CH3)3;
    (vi) -NH-C(O)-[(CH2)y12-O-]2-(CH2)y13R14B где у12 и у13 оба не представляют собой 2 и независимо представляют собой от 2 до 4; и
    R14B представляет собой -NH2; -N+H3; -N(CH3)2; или -N+(CH3)3;
    (vii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой -O-(CH2)3-4-N+(CH3)3; и (viii) -NH-C(O)-(CH2)yR14C, где у=1-6 и R14C представляет собой (ai) -O-(CH2)2-N+(CH3)3;
    (aii) -N+(CH3)2R14ca, где R14ca представляет собой -СН3 или -(СН2)1-4-ОСН3;
    А представляет собой -СН2-(СН2)у-СН2-, где у представляет собой 1-6.
  27. 28. Соединение, выбранное из группы, состоящей из
    - 120 043952
    - 121 043952
    - 122 043952
    - 123 043952
    - 124 043952
    - 125 043952
    - 126 043952
    - 127 043952
    - 128 043952
    где А- представляет собой фармацевтически приемлемый анион.
  28. 29. Соединение, имеющее структуру
    где А- представляет собой фармацевтически приемлемый анион.
  29. 30. Фармацевтическая композиция, содержащая соединение по п.29 и по меньшей мере один фармацевтически приемлемый экципиент.
  30. 31. Способ лечения гиперхолестеринемии, включающий введение пациенту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества композиции по п.30.
  31. 32. Соединение по п.29, где соединение представляет собой
    - 129 043952
  32. 33. Фармацевтическая композиция, содержащая соединение по п.32 и по меньшей мере один фар мацевтически приемлемый эксципиент.
  33. 34. Способ лечения гиперхолестеринемии, включающий введение пациенту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества композиции по п.ЗЗ.
  34. 35. Соединение по п.13, где D2 представляет собой
  35. 36. Соединение по п.14, где D2 представляет собой (Ь) часть формулы (а) часть формулы
    Евразийская патентная организация, ЕАПВ
    Россия, 109012, Москва, Малый Черкасский пер., 2
    - 130-
EA202190086 2018-06-21 2019-06-20 Соединения-антагонисты pcsk9 EA043952B1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US62/687,913 2018-06-21

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA043952B1 true EA043952B1 (ru) 2023-07-10

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2019290163B2 (en) PCSK9 antagonist compounds
US11306125B2 (en) PCSK9 antagonists bicyclo-compounds
US11484565B2 (en) PCSK9 antagonist compounds
US9877957B2 (en) Tetrahydroisoquinoline derivatives useful as inhibitors of diacylglyceride O-acyltransferase 2
US20230144324A1 (en) Pcsk9 antagonist compounds
EP3188732B1 (en) Tetrahydroisoquinoline derivatives useful as inhibitors of diacylglyceride o-acyltransferase 2
US20100160305A1 (en) 3, 4, 5 - Substituted Piperidine Compounds
RU2728823C1 (ru) Фенильные производные в качестве агонистов каннабиноидного рецептора 2
AU2017360941A1 (en) Indole derivatives useful as inhibitors of diacylglyceride O-acyltransferase 2
EA043952B1 (ru) Соединения-антагонисты pcsk9
TWI840376B (zh) Pcsk9拮抗劑化合物
EP3515891B1 (en) Substituted 1-methyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline molecules as pcsk9 allosteric binders
CA3228604A1 (en) Compounds for treating conditions related to pcsk9 activity