EA043660B1 - Полипептиды, содержащие домен d, и их применение - Google Patents

Полипептиды, содержащие домен d, и их применение Download PDF

Info

Publication number
EA043660B1
EA043660B1 EA202091198 EA043660B1 EA 043660 B1 EA043660 B1 EA 043660B1 EA 202091198 EA202091198 EA 202091198 EA 043660 B1 EA043660 B1 EA 043660B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
ddpp
domain
seq
cell
amino acid
Prior art date
Application number
EA202091198
Other languages
English (en)
Inventor
Дэвид М. ХИЛБЕРТ
Джеффри С. Суэрс
Original Assignee
Эрселлкс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Эрселлкс, Инк. filed Critical Эрселлкс, Инк.
Publication of EA043660B1 publication Critical patent/EA043660B1/ru

Links

Description

Уровень техники
Реагенты на основе антител ускорили темпы биологических исследований и разработок. Композиции антител представляют собой один из наиболее важных и успешных классов терапевтических и диагностических агентов, используемых в фармацевтической промышленности. Однако стоимость, время и эффективность подталкивали на разработку альтернативных аффинных реагентов.
Для целей в которых традиционно использовались антитела, появилось множество форматов связывания не на основе антител. Хотя сообщалось о многих успехах с неструктурированными линейными пептидами, более надежные результаты были достигнуты путем наложения структурного ограничения на пептидную последовательность - обычно путем введения дисульфидной связи. Это ограничение обеспечивает более высокую аффинность и большую специфичность благодаря более благоприятной термодинамике комплементарности фиксированной формы и поверхностных представлений остатков (например, гидрофобных аминокислот), которые в противном случае могли бы быть скрыты и, следовательно, не обращены к мишени (Ladner, Trends in Biotech). 13(10): 426-430 (1995)). И наоборот, форматы, которые содержат дисульфидные связи, как правило, склонны к неправильному спариванию цистеинов, либо внутридоменных, либо междоменных, что может привести к снижению экспрессии, выхода продукта и качества продукта.
Структура, обнаруженная в белковых поддоменах, является еще одним источником структурных ограничений. Такие структуры, как повторы фибронектина типа III (аднектины), z-белки (аффитела), кноттины, липокалины (антикалины) и анкириновые повторы (DARPin), были разработаны с антителоподобным сродством к множеству различных мишеней. (Hey et al., Trends in Biotech. 23(10): 514-422 (2005)). Эти домены обычно содержат две черты, которые аналогичны каркасам и областям, определяющим комплементарность (CDR), обнаруженным в вариабельных доменах антител: структурный каркас, который придает высокую термодинамическую стабильность, и остатки или петли, которые составляют основу изменчивости библиотеки дисплея.
Сущность изобретения
Остается существенная неудовлетворенная потребность в новых композициях, связывающих мишень, и особенно в таких агентах, содержащих альтернативные каркасы связывания (например, каркасы связывания не из антител). Агенты, представляющие особый интерес, могут характеризоваться, например, существенно сниженными производственными затратами и/или сопоставимыми или превосходными реагентными, диагностическими и/или терапевтическими свойствами по сравнению с антителами. В данном изобретении предложены новые связывающиеся с мишенью полипептиды на основе домена D (DD), которые основаны на структурном каркасе не из антител. В некоторых вариантах осуществления полипептиды домена D (DDpp) характеризуются высокой аффинностью связывания с мишенью и структурным каркасом не из антител. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляют собой специфичные для мишени связывающие полипептиды, которые могут преимущественно использоваться для нацеливания терапевтических средств (например, иммунных клеток) на конкретные клетки (например, больные клетки), тем самым уменьшая или устраняя побочные эффекты. В некоторых вариантах осуществления предложены DDpp, которые применяются в качестве терапевтических средств для связывания клеток или растворимых факторов, вовлеченных в заболевание.
В некоторых вариантах осуществления данное изобретение относится к белку, содержащему домен связывания мишени на основе домена D (DD), причем DD специфически связывает представляющую интерес мишень, выбранную из группы, состоящей из ВСМА (SEQ ID NO: 7), CD123 (SEQ ID NO: 8), CS1 (SEQ ID NO: 965), HER2 (SEQ ID NO: 967), AFP (SEQ ID NO: 9), p26 AFP (SEQ ID NO: 10) или их фрагмента. В некоторых вариантах DDpp являются одновалентными или мультивалентными. В некоторых вариантах DDpp являются моноспецифичными или мультиспецифичными. В дальнейших вариантах осуществления DDpp являются моноспецифичными или мультивалентными. В других вариантах осуществления DDpp являются мультиспецифичными и мультивалентными. Также предложены слитые белки, содержащие один или более DD, а также способы получения и применения слитых белков. Также предложены нуклеиновые кислоты, кодирующие DDpp и векторы, и клетки-хозяева, содержащие нуклеиновые кислоты. Такие применения включают, но не ограничиваются ими, диагностические и терапевтические применения.
В дополнительном варианте осуществления, в данном изобретении предложен белок, содержащий домен связывания мишени на основе домена D (DD) (DDpp), причем DD представляет собой член, выбранный из группы, состоящей из: (a) DD, который специфически связывает ВСМА (SEQ ID NO: 7) и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-305 или 306; (b) DD, который специфически связывает CD123 (SEQ ID NO: 8) и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 307739 или 740; (с) DD, который специфически связывает AFP (SEQ ID NO: 9) или его фрагмент, и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 741-874 или 886-895; (d) DD, который специфически связывает р26 AFP (SEQ ID NO: 10) и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 741874 или 886-895; (е) DD, который специфически связывает CS1 (SEQ ID NO: 965) или его фрагмент, и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 896-909 или 910, и (f) DD, который специфически связывает HER2 или его фрагмент, и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID
- 1 043660
NO: 911-949 или 950. Также предложены белки, содержащие варианты (a)-(f), которые сохраняют способность специфически связывать свои соответствующие мишени. В некоторых вариантах осуществления DDpp слит с гетерологичным полипептидом. В некоторых вариантах осуществления гетерологичный полипептид содержит полноразмерное антитело или фрагмент антитела. В некоторых вариантах осуществления DD слит с: амино концом тяжелой цепи полноразмерного антитела; амино концом легкой цепи полноразмерного антитела; карбоксильным концом тяжелой цепи полноразмерного антитела; или карбоксильным концом легкой цепи полноразмерного антитела. В других вариантах осуществления DD слит с фрагментом антитела, который представляет собой Fc. В дополнительных вариантах осуществления гетерологичный полипептид содержит член, выбранный из группы, состоящей из: (i) трансмембранного домена; (ii) мембраносвязывающего домена; (iii) человеческого сывороточного альбумина или его фрагмента; (iv) AFP или его фрагмента; (v) p26 AFP или его фрагмента; (vi) внеклеточного домена рецептора или его фрагмента; и (vii) внеклеточного домена внутриклеточного рецептора (например, ядерного белка) или его фрагмента. В некоторых вариантах осуществления белок содержит гетерологичный полипептид, который содержит внеклеточный домен, или фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или CD19 (SEQ ID NO: 3) или CS1 (SEQ ID NO: 965). В некоторых вариантах осуществления белок содержит гетерологичный полипептид, который содержит внеклеточный домен, или фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37; TSLPR, IL7R и gp96. В некоторых вариантах осуществления белок содержит гетерологичный полипептид, который содержит антигенную часть сывороточного белка (например, AFP и р26 AFP). В некоторых вариантах осуществления белок содержит гетерологичный полипептид, который содержит антигенную часть внутриклеточного белка (например, ядерного белка). В некоторых вариантах осуществления белок является меченным. В других вариантах осуществления метку выбирают из группы, состоящей из ферментативной метки, флуоресцентной метки, люминесцентной метки, биолюминесцентной метки и биотинового фрагмента. В дополнительных вариантах осуществления белок является конъюгированным с терапевтическим или цитотоксическим агентом. В некоторых вариантах осуществления белок содержит гетерологичный полипептид, который связывается с одним или более главными комплексами гистосовместимости (ГКГС) класса I или класса II.
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает ВСМА. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает белок ВСМА, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 7. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит несколько доменов связывания мишени (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связывают ВСМА. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связываются с различными эпитопами ВСМА. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые связываются с ВСМА или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает ВСМА. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который специфически связывает белок ВСМА, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 7. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или часть (фрагмент) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или
- 2 043660
IgG4). В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В других вариантах осуществления связывающий
ВСМА DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит связывающий ВСМА DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11305 и 306. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP или р26 AFP или их фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP (например, SEQ ID NO: 9) или их фрагмента. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит р26 AFP (SEQ ID NO: 10) или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp представляет собой растворимый белок, содержащий один или более связывающих мишень DDpp и белок р29 (например, имеющий последовательность SEQ ID NO: 10, 968, 969, 970, 971, 972, 973 или 974). Было обнаружено, что такие слитые белки, содержащие последовательности р29, имеют удивительно длинный период полужизни в сыворотке. В некоторых вариантах осуществления растворимый слитый белок DDpp имеет период полужизни в плазме in vivo, равный по меньшей мере 1 ч, по меньшей мере 2 ч, по меньшей мере 4 ч, по меньшей мере 8 ч, по меньшей мере 16 ч, по меньшей мере 32 ч, по меньшей мере 64 ч, или более. В некоторых вариантах осуществления растворимый слитый белок имеет период полужизни в плазме in vivo, равный по меньшей мере 1 ч, по меньшей мере 2 ч, по меньшей мере 4 ч, по меньшей мере 8 ч, по меньшей мере 16 ч, по меньшей мере 32 ч, по меньшей мере 64 ч, или более 65 ч, или 1-10 ч, 2-10 ч, 4-10 ч, 6-10 ч или 6-9 ч у мыши. В некоторых вариантах осуществления растворимый слитый белок DDpp имеет период полужизни в плазме in vivo, равный по меньшей мере 1 час, по меньшей мере 2 ч, по меньшей мере 4 ч, по меньшей мере 8 ч, по меньшей мере 16 ч, по меньшей мере 32 ч, по меньшей мере 64 ч, или более 65 ч, или 110 ч, 2-10 ч, 4-10 ч, 6-10 ч или 6-9 ч у человека.
В некоторых вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен CD123 (SEQ ID NO: 8) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, CS1, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит фрагмент сывороточного белка (например, HSA, AFP и р26 AFP), внеклеточный домен рецептора (например, ВСМА, CD123, CS1 и CD19) или внутриклеточный белок (например, ядерный белок), состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков.
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает CD123. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок CD123, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 8. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит несколько доменов связывания мишени (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связывают CD123. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связываются с различными эпитопами CD123. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123 и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые связываются с ВСМА или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления
- 3 043660
DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает CD123. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает белок CD123, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 8. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или часть (фрагмент) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN8828). В других вариантах осуществления связывающий CD123 DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит связывающий CD123 DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307739 и 740. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP или р26 AFP или их фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP (например, SEQ ID NO: 9) или их фрагмента. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит р26 AFP (SEQ ID NO: 10) или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий CD123 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или их фрагмента. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, Cd22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, CS1, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий CD123 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит фрагмент сывороточного белка (например, HSA, AFP и р26 AFP), внеклеточный домен рецептора (например, ВСМА, CS1, CD123 и CD19) или внутриклеточный белок (например, ядерный белок), состоящий из 5500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков.
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает CS1. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок CS1, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 965. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 DDpp содержит вариант аминокислотной последова
- 4 043660 тельности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит несколько доменов связывания мишени (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связывают CS1. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связываются с различными эпитопами CS1. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1 и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые связываются с ВСМА или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает CS1. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает белок CS1, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 965. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или часть (фрагмент) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN8828). В других вариантах осуществления связывающий CS1 DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит связывающий CS1 DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP или р26 AFP или их фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP (например, SEQ ID NO: 9) или их фрагмента. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит р26 AFP (SEQ ID NO: 10) или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий CS1 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7), CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, CS-1, tSlPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий CS1 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит фрагмент сывороточного белка (например, HSA, AFP и р26 AFP), внеклеточный домен рецептора (например, ВСМА, CS1, CD123 и CD19) или внутриклеточный белок (например, ядерный белок), состоящий из 5- 5 043660
500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков.
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает AFP или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9, или его фрагмент. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит несколько доменов связывания мишени (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связывают AFP, или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связываются с различными эпитопами AFP или его фрагмента. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP или его фрагмент и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые связываются с AFP, фрагментом AFP или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP или его фрагмент, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает AFP или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает белок AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9, или его фрагмент. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий AFP DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит связывающий AFP DD, функционально связанный с полноразмерным антителом или частью (фрагментом) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В некоторых вариантах осуществления связывающий AFP DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP или фрагмент AFP, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий AFP DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP или фрагмент AFP и дополнительно содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий AFP DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который специфи- 6 043660 чески связывает AFP или фрагмент AFP и дополнительно содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886895. В других вариантах осуществления связывающий AFP DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит фрагмент сывороточного белка (например, HSA), внеклеточный домен рецептора (например, ВСМА, CS1, CD123 и CD19) или внутриклеточный белок (например, ядерный белок), состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков.
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает AFP р26, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 10, или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления DD специфически связывает AFP р26, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 10, но специфически не связывает AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит несколько доменов связывания мишени (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связывают р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связываются с различными эпитопами р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые связываются с р26 AFP или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает AFP р26, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp, связывающий р26 AFP, содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DD слитого белка DDpp специфически связывает р26 AFP, но специфически не связывает AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9. В других вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий р26 AFP DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит связывающий р26 AFP DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp, связывающий р26 AFP, содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит связывающий р26 AFP DD и дополнительно содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы,
- 7 043660 состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp, связывающий р26 AFP, содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7), CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит связывающий р26 AFP DD и дополнительно содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp, связывающий р26 AFP, содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp, связывающий р26 AFP, содержит фрагмент сывороточного белка (например, HSA), внеклеточный домен рецептора (например, ВСМА, CS1, CD123 и CD19) или внутриклеточный белок (например, ядерный белок), состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков.
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает HER2. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок HER2, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 967. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит несколько доменов связывания мишени (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связывают HER2. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые связываются с различными эпитопами HER2. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2 и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые связываются с ВСМА или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2, и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает HER2. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает белок HER2, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 967. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или часть (фрагмент) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело. В других вариантах осуществления связывающий HER2 DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит связывающий HER2 DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911949 и 950. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP или р26 AFP или их фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP
- 8 043660 (например, SEQ ID NO: 9) или их фрагмента. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит р26 AFP (SEQ ID NO: 10) или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий HER2 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7), CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, CS-1, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий HER2 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950.
В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит фрагмент сывороточного белка (например, HSA, AFP и р26 AFP), внеклеточный домен рецептора (например, ВСМА, CS1, CD123 и CD19) или внутриклеточный белок (например, ядерный белок), состоящий из 5500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело. В других вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий полноразмерное антитело, которое специфически связывается с раковым антигеном. В других вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий полноразмерное антитело, причем антитело специфически связывается с раковым антигеном, предположительно экспрессируемым раком субъекта, которому вводят слитый белок DDpp.
В некоторых вариантах осуществления раскрытый DDpp (например, слитый белок DDpp) является меченным. Метки, которые можно использовать для мечения DDpp, включают, но не ограничиваются ими, ферментную метку, флуоресцентную метку, люминесцентную метку и биолюминесцентную метку. В некоторых вариантах осуществления метка представляет собой биотиновый фрагмент. В некоторых вариантах осуществления метка представляет собой стрептавидиновый фрагмент. В некоторых вариантах осуществления метка представляет собой метку His или метку FLAG. В некоторых вариантах осуществления метка представляет собой люциферазу, зеленый флуоресцентный белок, красный флуоресцентный белок или другой подобный агент.
В других вариантах осуществления слитый белок DDpp прикреплен к твердой подложке. В некоторых вариантах осуществления твердый носитель выбирают из группы, состоящей из гранулы, предметного стекла, чипа, желатина и агарозы.
В некоторых вариантах осуществления DDpp (например, слитый белок DDpp) связан с липосомой. В некоторых вариантах осуществления DDpp связан с липосомой посредством ковалентного связывания. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок. В других вариантах осуществления DDpp представляет собой CAR. В дополнительных вариантах осуществления DDpp связан с липосомой посредством ионного связывания, но не ковалентного связывания.
В некоторых вариантах осуществления DDpp, связывающийся с мишенью, конъюгируют с терапевтическим или цитотоксическим агентом (например, химиотерапевтическим агентом или радиотерапевтическим агентом).
В дополнительных вариантах осуществления в данном изобретении предложен химерный антигенный рецептор (CAR), который содержит домен связывания мишени, содержащий раскрытый в данном документе DD (например, DD, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950). В некоторых вариантах осуществления DD связывает ВСМА и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления DD связывает CD123 и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления DD связывает AFP и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DD связывает р26 AFP и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит домен связывания мишени, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен CAR содержит трансмембранный домен 41ВВ или CD28. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит внутриклеточный сигнальный домен, который выбирают из группы, состоящей из домена аль- 9 043660 фа-, бета- или дзета- цепи рецептора Т-клеток человека; домена 41ВВ человека; домена CD28 человека и любой их комбинации. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен CAR содержит внутриклеточный домен костимулирующей молекулы, выбранной из группы, состоящей из: CD27, CD28, 41ВВ, ОХ40, CD30, CD40, PD1, антигена, связанного с функцией лимфоцитов-1 (LFA-1), CD2, CD7, LIGHT, NKG2C, В7-Н3, лиганд, который специфически связывается с CD83, и любой их комбинации. В некоторых вариантах осуществления CAR дополнительно содержит второй домен связывания мишени, имеющий ту же или другую мишень, что и домен связывания мишени на основе DD. В некоторых вариантах осуществления CAR экспрессируется в иммунной клетке. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку (CAR Т-клетку) или клетку естественного киллера (NK) (CAR NK-клетку). В некоторых вариантах осуществления CAR связан с липосомой.
В некоторых вариантах осуществления CAR содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD и/или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают представляющую интерес мишень (например, ВСМА или CD123), экспрессируемую на поверхности раковой клетки. В дополнительных вариантах осуществления CAR содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают вторую другую представляющую интерес мишень, экспрессируемую на поверхности раковой клетки. В дополнительных вариантах осуществления вводимый CAR дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают вторую другую представляющую интерес мишень, экспрессируемую второй другой раковой клеткой или сосудистой эндотелиальной клеткой.
Также предложены нуклеиновые кислоты, кодирующие раскрытый DDpp (например, слитые белки DDpp). Дополнительно предложены векторы (например, плазмиды, вирусные векторы и невирусные векторы), содержащие нуклеиновые кислоты, кодирующие DDpp (например, слитые белки DDpp), и клеткихозяева, содержащие нуклеиновые кислоты и векторы. В некоторых вариантах осуществления вектор содержит нуклеотидную последовательность, которая регулирует экспрессию полипептида, кодируемого молекулой нуклеиновой кислоты. В дополнительных вариантах осуществления вектор содержит последовательность индуцибельного промотора. В дополнительных вариантах осуществления вектор содержит один или более дополнительных стандартных компонентов для экспрессии белка, кодируемого нуклеиновой кислотой (например, промоторы, компоненты упаковки и т.д.). В некоторых вариантах осуществления вектор представляет собой лентивирусный вектор.
В данном изобретении также предложены клетки-хозяева, которые содержат молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие связывающийся с мишенью DDpp, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления клетки-хозяева (например, клетки клеточной линии) сконструированы для экспрессии белка, содержащего описанный в данном документе DD, (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950). В некоторых вариантах осуществления экспрессия DDpp клетками-хозяевами позволяет продуцировать и выделять DDpp. В некоторых вариантах осуществления экспрессия приводит к тому, что DDpp экспрессируется на поверхности и/или интегрируется в мембрану клеток-хозяев. В некоторых вариантах осуществления клетка-хозяин представляет собой вирусную частицу или клетку бактерий, дрожжей, грибов или растений. В других вариантах осуществления клетка-хозяин представляет собой клетку млекопитающего. В другом варианте осуществления клетка млекопитающего представляет собой иммунную клетку. В одном варианте осуществления клеткахозяин представляет собой иммунную клетку человека. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка человека представляет собой Т-клетку. В других вариантах осуществления иммунная клетка человека представляет собой клетку естественного киллера (NK). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка человека отображает DDpp на своей клеточной поверхности.
В данном изобретении дополнительно предложена клетка-хозяин, экспрессирующая белок, содержащий DD, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления клетка-хозяин экспрессирует химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий DD, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит домен связывания мишени, который содержит DD, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 11-305 и 306; SEQ ID NO: 307-739 и 740; SEQ ID NO: 741-874 и 886-895; SEQ ID NO: 896-909 и 910 или SEQ ID NO: 911-949, и 950 и трансмембранный домен. В некоторых вариантах осуществления CAR дополнительно содержит внутриклеточный домен (содержащий сигнальный домен). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка CAR представляет собой Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка CAR представляет собой NK-клетку. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка CAR не является Т-клеткой или NK-клеткой. В некоторых вариантах осуществления клетка-хозяин представляет собой иммунную клетку, которая дополнительно содержит второй полипептид CAR, имеющий DD или другой связывающий домен (например, scFv), который специфически связывает ту же или другую мишень (например, другой эпитоп той же мишени), или вторую представляющую интерес мишень), экспрессируемую раковой клеткой) как первая CAR, экспрессируемая иммунной клеткой-хозяином.
Также предложены клетки млекопитающих, которые генерируют связанные с мембраной вирусоподобные частицы (VLP), причем клетка млекопитающего сконструирована так, чтобы экспрессировать слитый белок, содержащий полипептид домена D (DDpp), слитый с химерным антигенным рецептором
- 10 043660 (CAR), причем этот гибридный белок экспрессируется на сгенерированных VLP (например, в виде трансмембранных белков). В зависимости от вариантов осуществления VLP, продуцируемые клетками млекопитающих, пригодны для использования в качестве иммуногенов для создания антител.
Фармацевтические композиции, содержащие белок, содержащий описанный в данном документе DD, нуклеиновые кислоты, кодирующие белки, векторы, содержащие нуклеиновые кислоты, и клеткихозяева, содержащие нуклеиновые кислоты и/или векторы. Как и наборы, содержащие один или более раскрытых DDpp, связывающихся с мишенью (например, слитые белки DDpp, такие как DD-Fc и DDCAR), молекулы нуклеиновой кислоты, векторы и клетки-хозяева (например, терапевтический набор, диагностический набор, комплект для применения и т.д.).
DDpp, предложенные в данном документе, обладает активностями, которые включают, но не ограничиваются ими, способность специфически связывать представляющую интерес мишень (например, терапевтическую мишень и/или диагностическую мишень, такую как ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и р26 AFP, пептидная метка и сывороточный белок, такой как альфа-фетопротеин, человеческий сывороточный альбумин (HSA) или иммуноглобулин) in vitro или in vivo, и способность служить в качестве реактивного сайта для связывания или ассоциации белка, такого как слитый белок DDpp, с одним или более дополнительными фрагментами (например, твердой подложки) и/или других модификаций. DDpp, предложенный в данном документе, также может обладать дополнительными желательными свойствами и/или функциональными возможностями, полезными в производстве, составлении рецептур и биологических, диагностических и терапевтических применениях.
В некоторых вариантах осуществления DDpp используется для связывания, обнаружения и/или количественного определения представляющей интерес мишени (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP) в образце, содержащем мишень. В одном варианте осуществления в данном изобретении предложен способ обнаружения представляющей интерес мишени (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или AFP р26) в образце, включающий: (а) приведение в контакт образца с DDpp, содержащим DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950, которые специфически связывают мишень в условиях, подходящих для специфического связывания DDpp с мишенью, для образования комплекса мишень/DDpp и (b) обнаружение присутствия комплекса и/или захваченной мишени. В некоторых вариантах осуществления DDpp иммобилизован на твердой подложке. В некоторых вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 или 306, a DDpp используется для связывания, обнаружения и/или количественного определения ВСМА или слитого белка, содержащего ВСМА, в образце. В некоторых вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 или 740, а DDpp используется для связывания, обнаружения и/или количественного определения CD123 или слитого белка, содержащего CD123, в образце. В некоторых вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 или 886-895, a DDpp используется для связывания, обнаружения и/или количественного определения р26 AFP или слитого белка, содержащего р26 AFP, в образце. В некоторых вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 или 910, а DDpp используется для связывания, обнаружения и/или количественного определения CS1 или слитого белка, содержащего CS1, в образце. В некоторых вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 или 950, a DDpp используется для связывания, обнаружения и/или количественного определения HER2 или слитого белка, содержащего HER2, в образце.
Также предложен способ количественного определения представляющей интерес мишени (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP) в образце, содержащем мишень, включающий: (а) приведение в контакт образца с DDpp, содержащим DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950, который специфически связывает мишень и который иммобилизован на твердой подложке, в условиях, подходящих для специфического связывания DDpp с мишенью, с образованием комплекса мишень/DDpp и (b) обнаружение присутствия комплекса мишень/DDpp и/или захваченная мишень, причем количественное определение продукта указывает или может быть коррелировано с количеством мишени или слитого белка, содержащего мишень, в образце.
В дополнительных вариантах осуществления предложенные DDpp используют в аналитике белка. В некоторых вариантах осуществления DDpp конъюгированы с обнаруживаемым агентом и/или меткой. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306; SEQ ID NO: 307-739 и 740; SEQ ID NO: 741-874 и 886-895; SEQ ID NO: 896-909 и 910 или SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306; SEQ ID NO: 307-739 и 740 или SEQ ID NO: 741-874 и 886-895; SEQ ID NO: 896-909 и 910 или SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления DDpp конъюгирован с детектируемым агентом.
- 11 043660
В одном варианте осуществления детектируемый агент включает хромоген. В другом варианте осуществления детектируемый агент включает флуоресцентный краситель. В дополнительном варианте осуществления детектируемый агент включает радионуклид. В некоторых вариантах осуществления DDpp конъюгирован с детектируемым агентом посредством ковалентного связывания. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок. В дополнительных вариантах осуществления DDpp является мультимерным. В дополнительных вариантах осуществления DDpp конъюгирован с меткой. В некоторых вариантах осуществления метка является членом, выбранным из группы, состоящей из: полигистидильной метки, myc-метки и FLAG-метки. В других вариантах осуществления DDpp конъюгирован с комбинацией меток (например, полигистидильной меткой и FLAG-меткой). В некоторых вариантах осуществления DDpp конъюгирован с меткой (метками) посредством ковалентного связывания. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок. В некоторых вариантах осуществления DDpp является мультимерным.
В дополнительных вариантах осуществления DDpp конъюгирован с твердой подложкой или меткой. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой хроматографический шарик, смолу, предметное стекло, чип, желатин или агарозу.
Также предложены способы применения DDpp в диагностических и терапевтических применениях. В одном варианте осуществления в данном изобретении предложен способ лечения заболевания или расстройства, включающий введение терапевтически эффективного количества DDpp (например, слитого белка DDpp), который специфически связывает представляющую интерес терапевтическую мишень (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP) нуждающемуся в этом субъекту. В некоторых вариантах осуществления заболевание или расстройство представляет собой рак, В-клеточное злокачественное новообразование, заболевание или расстройство иммунной системы или инфекцию. Также предложены способы лечения заболевания или расстройства, которые включают совместное введение дополнительного терапевтического агента вместе с раскрытым DDpp. В некоторых вариантах осуществления заболевание или расстройство представляет собой множественную миелому. В некоторых вариантах осуществления заболевание или расстройство представляет собой рак молочной железы или рак яичника.
Раскрытые в данном документе DDpp, связывающие мишень, имеют применения, которые включают диагностические и терапевтические применения. В некоторых вариантах осуществления DDpp являются пригодными в терапевтическом контексте, например, для лечения и/или диагностики заболевания, такого как рак (например, солидное или гематологическое злокачественное новообразование).
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предложен способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий: введение субъекту терапевтически эффективного количества белка (т.е. DDpp), содержащего DD, раскрытый в данном документе (например, раскрытый в табл. 1, или имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950); нуклеиновой кислоты, кодирующей белок; вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, или клетку-хозяина, содержащую нуклеиновую кислоту или вектор. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность DD, которая специфически связывает ВСМА. В некоторых вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает ВСМА, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 7. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность DD, которая специфически связывает CD123. В некоторых вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает CD123, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 8. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность DD, которая специфически связывает CS1. В некоторых вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает CS1, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 965. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность DD, которая специфически связывает HER2. В некоторых вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает HER2, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 967. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность DD, которая специфически связывает AFP. В некоторых вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает AFP р26, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 10. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает р26 AFP, но специфически не связывает AFP, имеющий аминокислотную последователь- 12 043660 ность, состоящую из SEQ ID NO: 9. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предложен способ лечения субъекта, имеющего В-клеточное злокачественное новообразование, включающий: введение субъекту эффективного количества белка, содержащего DD, раскрытый в данном документе (например, раскрытый в табл. 1, или имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950); нуклеиновой кислоты, кодирующей белок; вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, или клетку-хозяина, содержащую нуклеиновую кислоту или вектор. В некоторых вариантах осуществления В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из лимфомы (например, лимфомы Ходжкина и неходжкинской лимфомы (НХЛ), лейкоза и миеломы. В некоторых вариантах осуществления В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из: острого лимфоцитарного лейкоза, хронического лимфоцитарного лейкоза, фолликулярной лимфомы, лимфомы из мантийных клеток и диффузной В-крупноклеточной лимфомы, плазмоцитомы и множественной миеломы.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предложен способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий: введение субъекту иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), причем CAR содержит: домен связывания мишени, содержащий DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950, причем полипептид специфически связывает представляющую интерес мишень и трансмембранный домен. В других вариантах осуществления представляющая интерес мишень экспрессируется раковой клеткой. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает ВСМА, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 7. В других вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает CD123, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 8. В других вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает CS1, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 965. В других вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает HER2, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 967. В других вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает AFP р26, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 10. В других вариантах осуществления DD содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит внутриклеточный домен. В других вариантах осуществления внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, в котором при введении субъекту, имеющему рак, домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью, экспрессируемой раковой клеткой (например, ВСМА и CD123), и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует иммунную клетку для генерации цитотоксических сигналов, которые приводят к цитотоксическим эффектам на раковых клетках. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку. В других вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой NK-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, NK-клеток и Т-клеток). В некоторых вариантах осуществления введение иммунной клетки является внутривенным. В некоторых вариантах осуществления комбинацию различных типов иммунных клеток CAR вводят субъекту внутривенно. В некоторых вариантах рак представляет собой множественную миелому. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой рак молочной железы или рак яичника.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предложен способ лечения субъекта, имеющего В-клеточное злокачественное новообразование, включающий: введение субъекту иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), причем CAR содержит: домен связывания мишени, содержащий полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950, причем полипептид специфически связывает представляющую интерес мишень, экспрессируемую раковой клеткой, трансмембранный домен и внутриклеточный домен. В некоторых вариантах осуществления домен связывания мишени специфически связывает ВСМА, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 7. В других вариантах осуществления домен связывания мишени содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления домен связывания мишени специфически связывает CD123, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 8. В других вариантах осуществления домен связывания мишени содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления домен связывания мишени специфически связывает CS1, имеющий
- 13 043660 аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 965. В других вариантах осуществления домен связывания мишени содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит внутриклеточный домен. В других вариантах осуществления внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, в котором при введении субъекту, имеющему рак, домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью, экспрессируемой злокачественной В-клеткой (например, ВСМА, CS1 и CD123), и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует иммунную клетку для генерации цитотоксических сигналов, которые приводят к цитотоксическим эффектам на злокачественных В-клетках рака. В некоторых вариантах осуществления В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из лимфомы (например, лимфомы Ходжкина и неходжкинской лимфомы (НХЛ), лейкоза и миеломы. В некоторых вариантах осуществления В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из: острого лимфоцитарного лейкоза, хронического лимфоцитарного лейкоза, фолликулярной лимфомы, лимфомы из мантийных клеток, диффузной В-крупноклеточной лимфомы, плазмоцитомы и множественной миеломы. В некоторых вариантах В-клеточное злокачественное новообразование представляет собой множественную миелому. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку. В других вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой NK-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, NK-клеток и Тклеток). В некоторых вариантах осуществления введение иммунной клетки является внутривенным. В некоторых вариантах осуществления комбинацию различных типов иммунных клеток CAR вводят субъекту внутривенно.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предложен способ лечения субъекта, имеющего связанное с В-клетками расстройство, включающий: введение субъекту эффективного количества белка, содержащего DD, раскрытый в данном документе (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, раскрытую в табл. 1, или имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950); нуклеиновой кислоты, кодирующей белок; вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, или клетку-хозяина, содержащую нуклеиновую кислоту или вектор.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предложен способ лечения субъекта, имеющего расстройство иммунной системы, включающий: введение субъекту эффективного количества белка, содержащего DD, раскрытый в данном документе (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, раскрытую в табл. 1, или имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950); нуклеиновой кислоты, кодирующей белок; вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, или клетку-хозяина, содержащую нуклеиновую кислоту или вектор. В некоторых вариантах осуществления расстройство иммунной системы представляет собой аутоиммунное заболевание, такое как ревматоидный артрит.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложено применение композиции для лечения рака, причем композиция содержит: белок, содержащий DD, раскрытый в данном документе (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, раскрытую в табл. 1, или имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950); нуклеиновой кислоты, кодирующей белок; вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, или клетку-хозяина, содержащую нуклеиновую кислоту или вектор. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой В-клеточное злокачественное новообразование. В некоторых вариантах осуществления В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из лимфомы (например, лимфомы Ходжкина и неходжкинской лимфомы (НХЛ), лейкоза и миеломы. В некоторых вариантах осуществления В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из: острого лимфоцитарного лейкоза, хронического лимфоцитарного лейкоза, фолликулярной лимфомы, лимфомы из мантийных клеток, диффузной Вкрупноклеточной лимфомы, плазмоцитомы и множественной миеломы. В некоторых вариантах рак представляет собой множественную миелому. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой рак молочной железы или рак яичника.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложено применение композиции для лечения В-клеточного злокачественного новообразования, причем композиция содержит: белок, содержащий DD, раскрытый в данном документе (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, раскрытую в табл. 1, или имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950); нуклеиновой кислоты, кодирующей белок; вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, или клетку-хозяина, содержащую нуклеиновую кислоту или вектор. В некоторых вариантах осуществления В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из лимфомы (например, лимфомы Ходжкина и неходжкинской лимфомы (НХЛ), лейкоза и миеломы. В некоторых вариантах осуществления В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из: острого лимфоцитарного лейкоза, хронического лимфоцитарного лейкоза, фолликулярной лимфомы, лимфомы из мантийных клеток, диффузной В-крупноклеточной лимфомы, плазмоцитомы и множественной миеломы. В некоторых вариантах В-клеточное злокачественное новообразование представляет собой
- 14 043660 множественную миелому.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложено применение композиции для лечения расстройства, связанного с В-клетками, причем композиция содержит: белок, содержащий DD, раскрытый в данном документе (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, раскрытую в табл. 1, или имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950); нуклеиновой кислоты, кодирующей белок; вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, или клеткухозяина, содержащую нуклеиновую кислоту или вектор.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложено применение композиции для лечения расстройства иммунной системы, причем композиция содержит: белок, содержащий DD, раскрытый в данном документе (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, раскрытую в табл. 1, или имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-949 или 950); нуклеиновой кислоты, кодирующей белок; вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, или клетку-хозяина, содержащую нуклеиновую кислоту или вектор. В некоторых вариантах осуществления расстройство иммунной системы представляет собой аутоиммунное заболевание, такое как ревматоидный артрит.
В дополнительных вариантах осуществления в данном изобретении предложено применение иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), для лечения рака, причем CAR содержит: домен связывания мишени, содержащий полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950, при этом полипептид специфически связывает представляющую интерес мишень, экспрессируемую раковой клеткой, трансмембранный домен и внутриклеточный домен, при этом внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, в котором при введении субъекту, имеющему рак, домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью, экспрессируемой раковой клеткой, и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует иммунную клетку для генерации цитотоксических сигналов, которые приводят к цитотоксическим эффектам на раковых клетках. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку или клетку естественного киллера (NK). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой клетку естественного киллера (NK). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, Тклеток и NK-клеток). В некоторых вариантах рак представляет собой множественную миелому. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой рак молочной железы или рак яичника.
В дополнительных вариантах осуществления в данном изобретении предложено применение иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), для лечения В-клеточного злокачественного новообразования, причем CAR содержит: домен связывания мишени, содержащий полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 или 950, при этом полипептид специфически связывает представляющую интерес мишень (например, мишень, экспрессируемую злокачественной В-клеткой, такой как BCMA, CS1 или CD123, при этом домен связывания мишени содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-306, 307-740 и 896-910), трансмембранный домен и внутриклеточный домен, при этом внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, в котором при введении субъекту, имеющему рак, домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью, экспрессируемой В-клеткой злокачественного новообразования, и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует иммунную клетку для генерации цитотоксических сигналов, которые приводят к цитотоксическим эффектам на В-клетках злокачественного новообразования. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку или клетку естественного киллера (NK). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой клетку естественного киллера (NK). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, Т-клеток и NK-клеток). В некоторых вариантах В-клеточное злокачественное новообразование представляет собой множественную миелому.
В дополнительных вариантах осуществления в данном изобретении предложено применение иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), для лечения расстройства иммунной системы, причем CAR содержит: домен связывания мишени, содержащий полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950, при этом полипептид специфически связывает представляющую интерес мишень, экспрессируемую иммунной клеткой, подлежащей лечению, трансмембранный домен и внутриклеточный домен, при этом внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, в котором при введении субъекту, имеющему расстройство иммунной системы, домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью, экспрессируемой иммунной клеткой-мишенью, и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует рекомбинантную иммунную клетку для генерации цитотоксических сигналов, которые приводят к цитотоксическим эффектам на иммунных клетках-мишенях. В некоторых
- 15 043660 вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку или клетку естественного киллера (NK). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка не является Т-клеткой или NKклеткой. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой клетку естественного киллера (NK). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, Т-клеток и NK-клеток).
Способы, кратко изложенные выше и/или изложенные в данном документе, описывают определенные действия, предпринимаемые практикующим врачом; однако следует понимать, что они могут также включать указание этих действий другой стороной. Таким образом, такие действия, как введение Тклетки, содержащей специфически связывающий мишень полипептид-CAR, включают инструкцию по введению Т-клетки, содержащей специфически связывающий мишень полипептид-CAR.
В некоторых вариантах осуществления в данном раскрытии предложено.
Gg
[1. ] Белок, содержащий домен связывания мишени на основе домена D (DD), причем DD представляет собой член, выбранный из группы, состоящей из (a) DD, который специфически связывает ВСМА и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-305 или 306;
(b) DD, который специфически связывает CD123 и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 307-739 или 740;
(c) DD, который специфически связывает AFP и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 741-874 или 886-895;
(d) DD, который специфически связывает р26 AFP и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 741-874 или 886-895;
(e) DD, который специфически связывает CS1 и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 896-909 или 910; и (f) DD, который специфически связывает HER2 и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 911-949 или 950;
[2. ] белок по [1], в котором DD слит с гетерологичным полипептидом;
[3. ] белок по [2], в котором гетерологичный полипептид содержит полноразмерное антитело или фрагмент антитела;
[4. ] белок по [2], в котором гетерологичный полипептид содержит член, выбранный из группы, состоящей из (a) трансмембранного домена;
(b) ассоциированного с мембраной домена;
(c) сывороточного альбумина человека или его фрагмента;
(d) AFP или его фрагмента;
(e) р26 AFP или его фрагмента; и (f) внеклеточного домена рецептора или его фрагмента;
[5.] белок по [3], в котором DD слит с: амино концом тяжелой цепи полноразмерного антитела; амино концом легкой цепи полноразмерного антитела; карбоксильным концом тяжелой цепи полноразмерного антитела; или карбоксильным концом легкой цепи полноразмерного антитела;
[6.] белок по [3], в котором гетерологичный полипептид представляет собой Fc;
[7.] белок по [2], в котором гетерологичный полипептид содержит внеклеточный домен или фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: ВСМА, CD123, CS1 и CD19;
[8.] белок по любому из [1]-[7], который является меченым;
[9.] белок по [8], в котором метку выбирают из группы, состоящей из ферментативной метки, флуоресцентной метки, люминесцентной метки, биолюминесцентной метки и биотинового фрагмента;
[10.] белок по любому из [1]-[10], который конъюгирован с терапевтическим или цитотоксическим агентом;
[11.] химерный антигенный рецептор (CAR), который содержит домен связывания мишени, содержащий белок по любому из [1]-[5];
[12.] CAR по [11], который содержит домен связывания мишени, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен;
[13.] CAR по [11] или [12], в котором трансмембранный домен содержит трансмембранный домен 41ВВ или CD28;
[14.] CAR по любому из [11]-[13], в котором внутриклеточный сигнальный домен выбирают из группы, состоящей из домена альфа-, бета- или дзета- цепи рецептора Т-клеток человека; домена 41ВВ человека; домена CD28 человека и любой их комбинации;
[15.] CAR по [11]-[14], в котором внутриклеточный сигнальный домен содержит внутриклеточный домен костимулирующей молекулы, выбранной из группы, состоящей из CD27, CD28, 41ВВ, ОХ40, CD30, CD40, PD1, антигена, связанного с функцией лимфоцитов-1 (LFA-1), CD2, CD7, LIGHT, NKG2C,
- 16 043660
NKG2D, В7-НЗ, лиганда, который специфически связывается с CD83, и любой их комбинации;
[16.] белок по любому из [1]-[15], который дополнительно содержит второй домен связывания мишени, имеющий ту же или другую мишень, что и домен связывания мишени на основе DD;
[17.] выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая белок по любому из [1]-[16];
[18.] вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по [17];
[19.] вектор по [18], в котором нуклеиновая кислота функционально связана с нуклеотидной последовательностью, которая регулирует экспрессию белка, кодируемого нуклеиновой кислотой;
[20.] вектор по [19], который представляет собой лентивирусный вектор;
[21.] клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по [17] или вектор по любому из [18-21];
[22.] клетка, сконструированная для экспрессии белка по любому из [1]-[16];
[23.] клетка по [21] или [22], в которой клетка представляет собой Т-клетку или естественную клетку-киллера (NK);
[24.] фармацевтическая композиция, содержащая белок по любому из [1]-[16], нуклеиновую кислоту по [17], вектор по [18], [19] или [20], или клетку по любому из [21]-[23];
[25.] набор, содержащий белок по любому из [1]-[16];
[26.] способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий:
введение субъекту эффективного количества белка по любому из [1]-[16], нуклеиновой кислоты по [17], вектора по [18], [19] или [20], клетки по любому из [21]-[23] или фармацевтической композиции по [24];
[27.] способ по [26], в котором рак представляет собой В-клеточное злокачественное новообразование, выбранное из группы, состоящей из лимфомы (например, лимфомы Ходжкина и неходжкинской лимфомы (НХЛ), лейкоза, плазмоцитомы и миеломы;
[28.] способ по [27], в котором В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из: хронического лимфоцитарного лейкоза, фолликулярной лимфомы, лимфомы из мантийных клеток и диффузной В-крупноклеточной лимфомы, плазмоцитомы и множественной миеломы;
[27.] способ по [26], в котором рак представляет собой миелоидное злокачественное новообразование, выбранное из группы, состоящей из: хронического миелоидного лейкоза, острого миелоидного лейкоза, лейкоза, плазмоцитомы и миеломы;
[29.] способ лечения субъекта, имеющего расстройство, связанное с В-клетками (например, моноклональную гаммапатию определенного значения), (MGUS)), включающий: введение субъекту эффективного количества белка по любому из [1]-[16], нуклеиновой кислоты по [17], вектора по [18], [19] или [20], клетки по любому из [21]-[23], или фармацевтической композиции по [24];
[30.] способ лечения субъекта, имеющего расстройство иммунной системы, включающий: введение субъекту эффективного количества белка по любому из [1]-[16], нуклеиновой кислоты по [17], вектора по [18], [19] или [20], клетки по любому из [21]-[23], или фармацевтической композиции по [24];
[31.] способ по [30], в котором расстройство иммунной системы представляет собой аутоиммунное заболевание, такое как ревматоидный артрит;
[32.] способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий введение субъекту иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), причем CAR содержит: домен связывания мишени, содержащий DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950, необязательно, при этом DD специфически связывает представляющую интерес мишень, экспрессируемую раковой клеткой;
трансмембранный домен и внутриклеточный домен; причем внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, и при этом после введения субъекту домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью, экспрессируемой раковой клеткой, и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует иммунную клетку для создания цитотоксических сигналов, которые приводят к цитотоксическим эффектам на раковой клетке;
[33.] способ по [32], в котором иммунная клетка представляет собой Т-клетку;
[34.] способ по [32], в котором иммунная клетка представляет собой NK-клетку;
[35.] способ по [32], в котором введение является внутривенным;
[36.] применение композиции для лечения рака, причем композиция содержит белок по любому из [1]-[16], нуклеиновую кислоту по [17], вектор по [18], [19] или [20], или клетку по любому из [21]-[23];
[37.] применение по [36], в котором рак представляет собой В-клеточное злокачественное новообразование;
[38.] применение по [37], в котором В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из лимфомы (например, лимфомы Ходжкина и неходжкинской лимфомы (НХЛ), лейкоза и миеломы;
[39.] применение по [38], в котором В-клеточное злокачественное новообразование выбирают из группы, состоящей из: хронического лимфоцитарного лейкоза, фолликулярной лимфомы, лимфомы из мантийных клеток и диффузной В-крупноклеточной лимфомы;
[40.] применение композиции для лечения расстройства, связанного с В-клетками, в котором композиция содержит белок по любому из [1]-[16], нуклеиновую кислоту по [17], вектор по [18], [19] или [20], клетку по любому из [21]-[23], или фармацевтическую композицию по [24];
- 17 043660
[41.] применение композиции для лечения расстройства иммунной системы, в котором композиция содержит белок по любому из [1]-[16], нуклеиновую кислоту по [17], вектор по [18], [19] или [20], клетку по любому из [21]-[23], или фармацевтическую композицию по [24];
[42.] применение по [41], в котором расстройство иммунной системы представляет собой аутоиммунное заболевание, такое как ревматоидный артрит;
[43.] применение иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR) для лечения рака, причем CAR содержит: домен связывания мишени, содержащий DD, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 или 950, и, необязательно, при этом домен связывания мишени специфически связывает представляющую интерес мишень, экспрессируемую раковой клеткой, трансмембранный домен и внутриклеточный домен; причем внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, при этом после введения субъекту, имеющему рак, домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью, экспрессируемой раковой клеткой, и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует иммунную клетку для создания цитотоксических сигналов, которые приводят к цитотоксическим эффектам на раковой клетке;
[44.] применение по [43], в котором иммунная клетка представляет собой Т-клетку или естественную клетку-киллера (NK).
Краткое описание графических материалов
На фиг. 1А, В, DDpp придают новые специфичности связывания другой молекуле (например, полноразмерному антителу) как части слитого белка (например, слитого белка антитело-DDpp). Слитые DDpp-антитела были созданы с использованием RSV-специфичного антитела (SYN) и любого пептида без мишени SEQ ID NO: 1 (DD) или CD137-специфичный DDpp (bb10) (SEQ ID NO: 876). DDpp слиты с N-концом (bb10-SYN и DD-SYN) или с С-концом (SYN-bb10 и SYN-DD). Все четыре слитых антитела связываются с RSV (фиг. 1А). Однако bb10 слитый с N-концом (bb10-SYN) или С-концом (SYN-bb10) тяжелой цепи антитела придает новую специфичность связывания CD137 с моноспецифичным антителом (фиг. 1В).
На фиг. 2A-F. Т-клетки CD123-DDpp-CAR продуцируют цитокины в ответ на связывание с мишенью. На фиг. На фиг. 2А и 2В показаны данные, связанные с продукцией гамма-интерферона (IFNy) Тклетками, экспрессирующими CD123-DDpp-CAR, при совместном культивировании с CD123-негативной опухолью K562 и CD123-позитивной опухолью BDCM, соответственно. На фиг. 2С и 2D представлены аналогичные данные, измеряющие продукцию интерлейкина-2 (IL2) Т-клетками CD123-DDpp-CAR при совместном культивировании с K562 и BDCM соответственно. На фиг. 2Е и 2F представлен сходный управляемый мишенью цитокин (IFNy, IL2) Т-клетками PD-L1-DDppCAR при совместном культивировании с опухолевыми клетками, экспрессирующими PDL1 (SUDHL-1).
На фиг. 3А, В. Т-клетки, экспрессирующие DDpp-CAR, не подвергаются чрезмерному истощению в большей степени, чем scFv. На фиг. 3А представленаэкспрессия трех маркеров истощения (LAG3, PD1 и TIM3) на Т-клетках, экспрессирующих различные DDpp-CAR, при сходных уровнях экспрессии этих маркеров на scFv-CAR 32716 (32716 (Du X1, Но М, Pastan I. 2007. Новые иммунотоксины, нацелены на CD123-антиген стволовых клеток на клетках острого миелоидного лейкоза. J Immunother. 30(6): 607-13). На фиг. 3В показаны данные проточной цитометрии, демонстрирующие сходную экспрессию маркера истощения на Т-клетках DDpp-CAR (экспрессирующих CD123, нацеленную на cg06 DDpp) по сравнению с Т-клеткой CAR, экспрессирующей CD123-специфичный scFv (32716).
На фиг. 4А-С. Т-клетки, экспрессирующие DDpp-CAR (CD123-нацеленные), подвергаются дегрануляции при совместном культивировании с экспрессирующими мишень опухолевыми клетками (BDCM). На фиг. 4А-С показаны результаты, полученные при культивировании Т-клеток отдельно (фиг. 4А) или в присутствии клеток K562 (фиг. 4В) или BDCM (фиг. 4С).
На фиг. 5A-D. Т-клетки, экспрессирующие DDpp-CAR, опосредуют специфичную для мишени цитотоксичность опухоли. На фиг. 5А показаны данные, относящиеся к проценту уничтожения CD123DDpp-CAR Т-клеток опухолевых клеток K562, которые являются негативными в отношении CD123. На фиг. 5В показан процент уничтожения, когда нацеленные на CD123 DDpp-CAR Т-клетки, совместно культивируют с CD123-позитивными клетками BDCM. Данные из фиг. 5А и 5В были получены с использованием Т-клеток из первого образца донорской крови. На фиг. 5С и 5D показаны аналогичные данные для Т-клеток, собранных у второго донора.
На фиг. 6А-Е. показаны биспецифичные DDpp-CAR Т-клетки. На фиг. 6А показан процент Тклеток, экспрессирующих нацеленные на CD123 DDpp-CAR (cg06). На фиг. 6В показан процент Тклеток, экспрессирующих нацеленные на PDL1 DDpp-CAR (pb04). На фиг. 6С показан процент Т-клеток, экспрессирующих биспецифичные нацеленные на CD123-PDL1 DDpp-CAR (экспрессируемые с cg06 DDpp, дистальным к мембране Т-клеток, по сравнению с pb04 DDpp). На фиг. 6D показан процент Тклеток, экспрессирующих биспецифичные нацеленные на PDL1-CD123 DDpp-CAR (экспрессируемые с pb04 DDpp, дистальным к мембране Т-клеток, по сравнению с cg06 DDpp). На фиг. 6Е представлены данные, относящиеся к повышенному внутриклеточному сигналингу биспецифичного DDpp.
- 18 043660
На фиг. 7А и В показано, что двойные адаптеры связывающих доменов управляют усилением сигналинга репортерных клеток Jurkat NFAT-люцифераза, экспрессирующих CAR, по сравнению с единичными адаптерами связывающих доменов. На фиг. 7А, 50000 репортерных клеток, ранее трансдуцированных AFP (р26)-связывающим CAR (af03), культивировали в течение 5 ч в присутствии CD123специфического Cg06-адаптера (Cg06-p26) или Cg06-двойного адаптерного белка (Cg06-p26-Cg06) в присутствии 50000 CD123+ MOLM13 или CD123- дефицитных клеток MOLM13, затем оценивали на активность люциферазы. CD123-дефицитные клетки создавали с использованием технологии генной инженерии CRISPR/Cas9. На фиг. 7В, 50000 репортерных клеток, ранее трансдуцированных AFP (домен р26)связывающим CAR (af03), культивировали в течение 5 ч в присутствии ВСМА-специфического Вс40адаптера (Вс40-р26) или двойного Вс40-адаптера (Вс40-р26-Вс40) в присутствии или в отсутствие клеток 50000 ВСМА+ U266, затем оценивали на активность люциферазы.
На фиг. 8 нацеленный на ВСМА DDpp-CAR, содержащий DDpp bc40 (SEQ-ID NO: 164) уничтожает опухоль U226, экспрессирующую ВСМА, в мышиной модели В-клеточного рака.
Подробное описание сущности изобретения
Заголовки разделов, используемые в данном документе, предназначены только для организационных целей и не должны ни в коей мере рассматриваться как ограничивающие заявленный предмет.
Определение терминов
Следует понимать, что в тех случаях, когда варианты осуществления описаны в данном документе с формулировкой содержащий, в противном случае также предложены аналогичные варианты осуществления, описанные в терминах состоящий из и/или состоящий в основном из. Однако при использовании в формуле изобретения в качестве переходных фраз, каждая из них должна интерпретироваться отдельно и в соответствующем юридическом и фактическом контексте (например, содержащий считается более открытой фразой, тогда как состоящий из является более исключительным и состоящим по существу из является переходной формой).
В контексте данного документа, слова в единственном числе означают также и множественное число, если не указано иное.
Термин и/или, используемый в такой фразе, как А и/или В, предназначен для включения как А, так и В; А или В; А (отдельно) и В (отдельно). Аналогично, термин и/или, используемый в фразе, такой как А, В и/или С, предназначен для охвата каждого из следующих вариантов осуществления: А, В, и С; А, В, или С; А или С; А или В; В или С; А и С; А и В; В и С; А (отдельно); В (отдельно); и С (отдельно).
Термины белок и полипептид используются в данном документе взаимозаменяемо для обозначения биологического полимера, содержащего звенья, полученные из аминокислот, связанных через пептидные связи; белок может состоять из двух или более полипептидных цепей.
Термины антитело или иммуноглобулин, используемые в данном документе взаимозаменяемо, включают полноразмерные антитела и фрагменты антител, включая любой функциональный домен антитела, такой как антигенсвязывающий фрагмент или его отдельные цепи, эффекторный домен, эпитоп, эпитоп связывания рецептора реутилизации или его часть. Типичное антитело содержит по меньшей мере две тяжелые (Н) цепи и две легкие (L) цепи, связанные дисульфидными связями. Каждая тяжелая цепь состоит из вариабельной области тяжелой цепи (в данном документе сокращенно называемой VH) и константной области тяжелой цепи. Константная область тяжелой цепи состоит из трех доменов - CH1, CH2 и СН3. Каждая легкая цепь состоит из вариабельной области легкой цепи (в данном документе сокращенно называемой VL) и константной области легкой цепи. Константная область легкой цепи состоит из одного домена - Cl. Области VH и VL могут быть дополнительно поделены на области гипервариабельности, называемые определяющими комплементарность областями (CDR), перемежающиеся более консервативными областями, называемыми каркасными областями (FW). Каждая VH и VL состоит из трех CDR и четырех FW, расположенных от амино-конца к карбоксильному концу в следующем порядке: FW1, CDR1, FW2, CDR2, FW3, CDR3, FW4. Вариабельные области тяжелой и легкой цепей содержат связывающий домен, который взаимодействует с антигеном. Константные области антител Рак опосредовать связывание иммуноглобулина с тканями или факторами организма-хозяина, включая различные клетки иммунной системы (например, эффекторные клетки) и первый компонент (C1q) классической системы комплемента. Примеры антител по данному изобретению включают типичные антитела, scFv и их комбинации, в которых, например, DDpp ковалентно связан (например, через пептидные связи или через химический линкер) с N-концом тяжелой цепи и/или легкой цепи типичного цельного (полноразмерного) антитела, или интеркалирован в Н-цепь и/или L-цепь полноразмерного антитела.
Термин фрагмент антитела относится к части интактного антитела и относится к любому функциональному домену антитела, такому как антигенсвязывающий фрагмент или его отдельные цепи, эффекторный домен или его часть и эпитоп, связывающий рецептор спасения, или его часть. Примеры фрагментов антител включают, но не ограничиваются ими, фрагменты Fab, Fab', F(ab')2 и Fv, линейные антитела, одноцепочечные антитела и мультиспецифичные антитела, образованные из фрагментов антител. Используемый в данном документе термин фрагмент антитела включает антигенсвязывающий сайт или эпитоп-связывающий сайт. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит эффекторный домен или его часть. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит эпитоп,
- 19 043660 связывающий рецептор спасения, или его часть.
Используемый в данном документе термин область Fc или просто Fc означает карбоксильную концевую часть константной области цепи иммуноглобулина, предпочтительно константную область тяжелой цепи иммуноглобулина или ее часть. Например, область Fc иммуноглобулина может содержать (1) домен СН1, домен СН2 и домен СН3, (2) домен СН1 и домен СН2, (3) домен СН1 и домен СН3, 4) домен СН2 и домен СН3 или (5) комбинацию двух или более доменов и шарнирной области иммуноглобулина. Таким образом, в различных вариантах осуществления Fc относится к двум последним константным областям иммуноглобулиновых доменов IgA, IgD и IgG и к последним трем константным областям иммуноглобулиновых доменов IgE и IgM, а также к гибкому шарнирному N-концу этих доменов. Для IgA и IgM Fc может содержать J-цепь. Для IgG Fc содержит домены иммуноглобулина Су2 и Су3 и шарнир между Cy1 и Су2. В предпочтительном варианте осуществления область Fc иммуноглобулина содержит по меньшей мере шарнирную область иммуноглобулина, домен СН2 и домен СН3, и предпочтительно при этом отсутствует домен СН1. В одном варианте осуществления класс иммуноглобулина, из которого получена константная область тяжелой цепи, представляет собой IgG (Igy) (подклассы 1, 2, 3 или 4 у). Можно использовать другие классы иммуноглобулина IgA (Iga), IgD (Igδ), IgE (Igε) и IgM (Igμ). Хотя границы области Fc могут варьировать, область Fc тяжелой цепи IgG человека обычно определяется как содержащая остатки С226 или р260 до его карбоксильного конца, где нумерация соответствует индексу EU, как указано в Kabat. (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, NIH, Bethesda, Md. (1991)). Fc может относиться к данной области в отдельности или к данной области в контексте полноразмерного антитела, фрагмента антитела или слитого белка Fc. Полиморфизмы наблюдались в ряде различных положений Fc, включая, но не ограничиваясь ими, положения 270, 272, 312, 315, 356 и 358, пронумерованные индексом EU, и, таким образом могут существовать небольшие различия между представленной последовательностью и последовательностями в предшествующем уровне техники. Выбор подходящей константной области тяжелой цепи иммуноглобулина подробно обсуждается в патенте США № 5541087 и 5726044, каждый из которых включен в данный документ посредством ссылки в полном объеме. Считается, что выбор конкретных последовательностей константных областей тяжелой цепи иммуноглобулина из определенных классов и подклассов иммуноглобулина для достижения конкретного результата, находится в пределах квалификации специалиста в данной области. Часть ДНК-конструкции, кодирующей Fc-область иммуноглобулина, предпочтительно содержит по меньшей мере часть шарнирного домена и, предпочтительно по меньшей мере часть СН3домена Fc-гамма или гомологичных доменов в любом из IgA, IgD, IgE или IgM. Кроме того, предполагается, что замена или делеция аминокислот в константных областях тяжелой цепи иммуноглобулина могут быть пригодны при осуществлении способов и композиций, раскрытых в данном документе. Одним из примеров может быть введение аминокислотных замен в верхней области СН2 для создания варианта Fc с пониженной аффинностью к рецепторам Fc (Cole, J. Immunol. 159: 3613 (1997)).
Антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность или АЗКЦ соответствуют опосредованной клетками реакции, в которой неспецифические цитотоксические клетки, которые экспрессируют рецепторы Fc (FcR) (например, естественные клетки-киллеры (NK), нейтрофилы и макрофаги), распознают связанное антитело на целевой клетке и, таким образом, приводят к лизису (или другому цитотоксическому эффекту) клетки-мишени. Для оценки активности АЗКЦ представляющей интерес молекулы может быть проведен любой анализ АЗКЦ in vitro, описанный в патентах США № 5500362 или 5821337. Эффекторные клетки, пригодные для такого анализа, включают, без ограничения, мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК) и естественные клетки-киллеры (NK). В качестве альтернативы или дополнения, АЗКЦ-активность молекулы, представляющей интерес, можно оценить in vivo, например, в животной модели, например, согласно описанию в публикации Clynes et al. PNAS 95: 652656 (1998).
Используемые в данном документе термины одноцепочечный вариабельный фрагмент(ы) или scFv относятся к формам антител (например, фрагментам антител), содержащим вариабельные области только тяжелых и легких цепей, соединенных линкерным пептидом. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит DDpp и scFv.
Термин линкер относится к пептиду или другой химической связи, расположенной между DDpp и другим полипептидом слитого белка DDpp. Подходящие линкеры для связывания двух или более связанных DDpp будут понятны специалистам в данной области техники, а неограничивающие примеры описаны в данном документе.
Термин функционально связанный, используемый в данном документе, указывает, что две молекулы присоединены так, что каждая из них сохраняет по меньшей мере некоторый уровень функциональной активности, который была у каждой молекулы в отдельности (при условии, что каждая молекула имела функциональную активность). В вариантах осуществления, когда одна молекула была лишена функциональной активности, она функционально связана с другой молекулой, если другая молекула сохраняет по меньшей мере некоторый уровень своей функциональной активности. Функционально связанный также может относиться к связыванию двух нефункциональных молекул. Две молекулы могут
- 20 043660 быть функционально связаны независимо от того, присоединены они прямо или косвенно (например, через линкер).
Термины специфически связывает или обладающие селективной аффинностью к, связывает, связывание используются взаимозаменяемо для обозначения того, что связывающий агент, такой как DDpp, реагирует или связывается чаще, быстрее, с большей продолжительностью, с большей аффинностью или с некоторой комбинацией вышеуказанного к эпитопу, белку или молекуле-мишени, чем с альтернативными веществами, включая белки, не связанные с эпитопом, белком или молекулой-мишенью. Из-за идентичности последовательностей между гомологичными белками у разных видов специфическое связывание в некоторых вариантах может включать связывающий агент, который распознает белок или мишень у более чем одного вида. Аналогично, из-за гомологии внутри определенных областей полипептидных последовательностей различных белков специфическое связывание может включать связывающий агент, который распознает более одного белка или мишени. Понятно, что в некоторых вариантах осуществления связывающий агент, который специфически связывает первую мишень, может специфически связывать или не связывать вторую мишень. Как таковое, специфическое связывание не обязательно требует (хотя может включать в себя) исключительное связывание, например, связывание с одной мишенью. Таким образом, связывающий агент может, в определенных вариантах осуществления, специфически связывать более чем одну мишень. В некоторых вариантах осуществления множественные мишени могут быть связаны одним и тем же антигенсвязывающим сайтом на связывающем агенте.
Мишень относится к любой молекуле или комбинации молекул, которые могут быть связаны DDpp, таким как слитый белок DDpp, или другим компонентом слитого белка DDpp, таким как антитело или фрагмент вариабельного домена антитела.
Термины эпитоп и антигенная детерминанта используются в данном документе взаимозаменяемо и относятся к данной части любой молекулы (например, представляющей интерес мишени, такой как ВСМА, CD123, AFP или р26 AFP), способной распознаваться и специфически связываться конкретным связующим агентом (например, DDpp или антителом). Когда распознанная молекула представляет собой полипептид, эпитопы могут быть образованы из смежных аминокислот и несмежных аминокислот и/или других химически активных поверхностных групп молекул (таких как углеводы), расположенных рядом при образовании третичной структуры белка. Эпитопы, образованные из смежных аминокислот, как правило, сохраняются при денатурации белка, тогда как эпитопы, образованные третичной структурой, как правило, теряются при денатурации белка. Эпитоп обычно включает по меньшей мере 3 аминокислот и более, обычно, по меньшей мере 5 или 8-10 аминокислот в уникальной пространственной конформации.
Пептидная метка в контексте данного документа относится к пептидной последовательности, которая является частью или присоединена (например, посредством генной инженерии) к другому белку, чтобы обеспечить функцию результирующего слияния. Пептидные метки обычно относительно короткие по сравнению с белком, с которым они слиты; в качестве примера, пептидные метки, в некоторых вариантах осуществления, имеют длину четыре или более аминокислот, такую как 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 или 25, или более аминокислот. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, который содержит пептидную метку. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает пептидную метку. В данной области техники известны многочисленные пептидные метки, которые используются в соответствии с данным изобретением. Примеры пептидных меток, которые могут быть компонентом слитого белка DDpp или мишени, связанной с DDpp (например, слитого белка DDpp), включают, но не ограничиваются ими, НА (гемагглютинин), с-тус, гликопротеин D вируса простого герпеса (gD), T7, GST, GFP, МВР, Strep-метки, His-метки, Мус-метки, ТАР-метки и метка FLAG® (Eastman Kodak, Рочестер, штат Нью-Йорк) Аналогично, антитела к эпитопу-метке позволяют обнаруживать и локализовать слитый белок с использованием методов, известных в данной области техники, таких как анализы вестерн-блот, ИФА и иммуноокрашивание клеток.
Термин встречающийся в природе, используемый в связи с биологическими материалами, такими как молекулы нуклеиновой кислоты, полипептиды и клетки-хозяева, относится к тем, которые встречаются в природе и не являются модифицированными человеком. И наоборот, термины не встречающийся в природе или синтетический используемые в связи с биологическими материалами, относится к тем материалам, которые не встречаются в природе и были изменены человеком.
Используемые в данном документе модификации в отношении эталонной последовательности включают замены, делеции, вставки и/или добавления последовательности соответствующего аминокислотного положения эталонной последовательности (например, DD, раскрытый в данном документе).
Замена в отношении эталонной последовательности относится к замене конкретного аминокислотного остатка другим аминокислотным остатком в соответствующем аминокислотном положении эталонной последовательности.
Консервативная аминокислотная замена представляет собой консервативную аминокислотную замену, в которой аминокислотный остаток заменен аминокислотным остатком, имеющим сходную боковую цепь. Семейства аминокислотных остатков, имеющих сходные боковые цепи, определены в данной области техники, и включают остатки с основными боковыми цепями (например, лизин (K), аргинин (R), гистидин (Н)), остатки с кислотными боковыми цепями (например, аспарагиновая кислота (D), глу- 21 043660 таминовая кислота (Е)), остатки с незаряженными полярными боковыми цепями (например, глицин (G), аспарагин (N), глутамин (Q), серии (S), треонин (Т), тирозин (Y), цистеин (С)), остатки с неполярными боковыми цепями (например, аланин (А), валин (V), лейцин (L), изолейцин (I), пролин (Р), фенилаланин (F), метионин (М), триптофан (W), остатки с бета-разветвленными боковыми цепями (например, треонин (Т), валин (V), изолейцин (I)) и остатки с ароматическими боковыми цепями (например, тирозин (Y), фенилаланин (F), триптофан (W), гистидин (Н)). Например, замещение фенилаланина на тирозин представляет собой консервативную замену. В конкретных вариантах осуществления консервативные замены в последовательностях DDpp приводят к измененному или неизмененному специфическому связыванию DDpp, содержащего замену, с представляющей интерес мишенью (например, ВСМА, CD123, AFP или р26 AFP), с которой он связывается. В одном варианте осуществления консервативные замены в последовательностях DDpp не отменяют связывание DDpp, содержащего замену, с представляющей интерес мишенью, с которой он связывается. Способы идентификации нуклеотидных и аминокислотных консервативных замен и неконсервативных замен, которые придают, изменяют или поддерживают селективную аффинность связывания, известны в данной области техники (см., например, Brummell, Biochem. 32: 1180-1187 (1993); Kobayashi, Protein Eng. 12(10): 879-884 (1999) и Burks, PNAS 94: 412-417 (1997)).
Неконсервативная аминокислотная замена представляет собой консервативную аминокислотную замену, в которой аминокислотный остаток заменен аминокислотным остатком, имеющим несходную боковую цепь. В одном варианте осуществления неконсервативные замены в последовательностях DDpp приводят к специфическому связыванию DDpp, содержащего замену, с представляющей интерес мишенью (например, ВСМА, CD123, AFP или р26 AFP), с которой он связывается. В одном варианте осуществления неконсервативные замены в последовательностях DDpp не отменяют связывание DDpp, содержащего замену, с представляющей интерес мишенью, с которой он связывается.
Термины не встречающиеся в природе аминокислоты, аналоги аминокислот и нестандартные аминокислотные остатки используются в данном документе взаимозаменяемо. Не встречающиеся в природе аминокислоты, которые могут быть замещены в DDpp, предложенные в данном документе, известны в данной области техники. В одном варианте осуществления не встречающаяся в природе аминокислота представляет собой 4-гидроксипролин, который может заменить пролин; 5-гидроксилизин, который может заменить лизин; 3-метилгистидин, который может заменить гистидин; гомосерин, который может заменить серии; и орнитин, который может заменить лизин.
Дополнительные примеры не встречающихся в природе аминокислот, которые могут быть замещены в DDpp, включают, но не ограничиваются ими, такие молекулы, как: D-изомеры обычных аминокислот, 2,4-диаминомасляная кислота, альфа-аминоизомасляная кислота, А-аминомасляная кислота, Abu, 2амино-масляная кислота, гамма-Abu, эпсилон-Ahx, 6-амино-гексановая кислота, Aib, 2-аминоизомасляная кислота, 3-амино-пропионовая кислота, орнитин, норлейцин, норвалин, гидроксипролин, саркозин, цитруллин, гомоцитруллин, цистеиновая кислота, трет-бутилглицин, трет-бутилаланин, фенилглицин, циклогексилаланин, бета-аланин, лантионин, дегидроаланин, γ-аминомасляная кислота, селеноцистеин и пирролизин, фтораминокислоты, аминокислоты-конструктор, такие как мета-бетааминокислоты С-альфа-метиламинокислоты и N-альфа-метиламинокислоты или комбинации не встречающихся в природе аминокислот. Дополнительные не встречающиеся в природе аминокислоты могут включать, например, 4-амино-масляную кислоту, 4-амино-3-гидрокси-5-фенилпентановую кислоту, 4амино-3-гидрокси-6-метилгептановую кислоту, 2-тиенилаланин и/или D -изомеры аминокислот. Как обсуждено в данном документе, в нескольких вариантах осуществления не встречающиеся в природе аминокислоты или аналоги аминокислот могут включать делецию одной или более аминокислот из последовательности.
Термины полинуклеотид и нуклеиновая кислота, взаимозаменяемо употребляемые в данном документе, относятся к полимерной форме нуклеотидов любой длины, как рибонуклеотидов, так и дезоксирибонуклеотидов. Эти термины включают, но не ограничиваются ими, ДНК, РНК, кДНК (комплементарная ДНК), мРНК (РНК-мессенджер), рРНК (рибосомная РНК), мшРНК (малая шпилечная РНК), мяРНК (малая ядерная РНК), кяРНК (короткая ядрышковая РНК), микроРНК (микроРНК), геномная ДНК, синтетическая ДНК, синтетическая РНК и/или тРНК.
Используемый в данном документе термин оголенная ДНК относится к ДНК (например, ДНК, не содержащей гистонов), кодирующей белок, такой как DDpp (например, CAR), которая клонируется в подходящем векторе экспрессии в правильной ориентации для экспрессии (например, плазмида). Вирусные векторы, которые можно использовать для переноса и/или экспрессии ДНК, кодирующей DDpp, включают, без ограничения, лентивирусные векторы SIN, ретровирусные векторы, векторы пенистых вирусов, векторы аденовирусов, векторы аденоассоциированных вирусов (AAV), гибридные векторы и/или транспозоны плазмид (например, транспозонную систему спящей красавицы) или интегрированные векторные системы. Другие векторы, которые можно использовать в связи с созданием и использованием DDpp, описаны в данном документе или иным образом известны в данной области техники.
Используемые в данном документе термины вектор, вектор клонирования и вектор экспрессии относятся к носителю, с помощью которого последовательность нуклеиновой кислоты (например, последовательность, кодирующая DDpp) может поддерживаться или амплифицироваться в клетке- 22 043660 хозяине (например, клонирующий вектор) или вводится в клетку-хозяина, чтобы трансформировать хозяина и способствовать экспрессии (например, транскрипции и трансляции) введенной последовательности. Векторы включают плазмиды, фаги, вирусы и т.д.
Клетка-хозяин включает отдельную клетку или клеточную культуру, которая может быть или являлась реципиентом нуклеиновых кислот, кодирующих раскрытый DDpp. Клетки-хозяева включают, но не ограничиваются ими, вирусные частицы, фагмиды, клетки бактерий, дрожжей, растений, животных и млекопитающих. Клетки-хозяева включают потомство одной клетки-хозяина, и потомство необязательно может быть полностью идентичным (по морфологии или по комплементарности всей ДНК) исходной родительской клетке из-за естественной, случайной или преднамеренной мутации и/или изменения. Клетка-хозяин включает клетки, трансфицированные или инфицированные in vivo, in vitro или ex vivo с нуклеиновыми кислотами, кодирующими раскрытый DDpp. В некоторых примерах клетка-хозяин способна экспрессировать и презентовать на своей поверхности раскрытый DDpp, такой как, например, в фаговом дисплее или CAR Т-клетке. Экспрессия включает транскрипцию и/или трансляцию.
Используемые в данном документе термины твердая подложка, подложка, матрицы и смолы используются взаимозаменяемо и относятся, без ограничения, к любой колонке (или материалу колонки), грануле, пробирке, чашке для микротитрования, твердой частице (например, агарозе или сефарозе), микрочипу (например, кремниевому, кремний-стеклянному или золотому чипу) или мембране (например, биологической или фильтрующей мембране), к которой может быть присоединен DDpp, антитело или другой белок (например, объединенный, связанный или прикрепленный), прямо или косвенно (например, через промежуточные звенья других партнеров по связыванию, такие как другие антитела или белок А), или в которые может быть встроен DDpp или антитело (например, через рецептор или канал). Реагенты и способы прикрепления полипептидов к твердым подложкам (например, к матрицам, смолам, пластмассам и т.д.) хорошо известны в данной области техники. Подходящие твердые носители включают, но не ограничиваются ими, хроматографическую смолу или матрицу (например, агарозные гранулы SEPHAROSE-4 FF), стенку или дно лунки в пластиковой чашке для микротитрования, биочип на основе диоксида кремния, полиакриламид, агарозу, диоксид кремния, нитроцеллюлозу, бумагу, пластик, нейлон, металл и их комбинации. DDpp и другие композиции могут быть нанесены на материал подложки нековалентной ассоциацией или ковалентной связью с использованием реагентов и методик, известных в данной области техники. В одном варианте осуществления DDpp связан с хроматографическим материалом с использованием линкера.
Используемые в данном документе термины фармацевтически приемлемый или физиологически приемлемый и их грамматические вариации, поскольку они относятся к композициям, носителям, разбавителям и реагентам, используются взаимозаменяемо и означают, что материалы способны вводиться человеку или применяться к человеку без получения терапевтически неприемлемых нежелательных физиологических эффектов, таких как тошнота, головокружение, расстройство желудка и тому подобные.
Модулировать означает изменение или регулировку амплитуды, частоты, степени или активности. В другом связанном аспекте такая модуляция может быть положительно модулированной (например, увеличение частоты, степени или активности) или отрицательно модулированной (например, уменьшение частоты, степени или активности). В некоторых вариантах осуществления модуляция в положительном или отрицательном направлении относится к функции клетки, ткани или органа до введения терапевтического средства. В дополнительных вариантах осуществления модуляция в положительном или отрицательном направлении относится к нормальной, здоровой клетке, ткани или органу.
Эффективное количество DDpp, такого как слитый белок DDpp, как указано в данном документе, представляет собой количество, достаточное для достижения конкретно заявленной цели, такой как обеспечение наблюдаемого изменения уровня одной или более биологических активностей, связанных с мишенью, с которой связывается DDpp (например, слитый белок DDpp). В определенных вариантах осуществления изменение повышает уровень целевой активности. В других вариантах осуществления изменение понижает уровень целевой активности. Эффективное количество может быть определено эмпирически и стандартным способом по отношению к указанной цели. Термин терапевтически эффективное количество относится к количеству DDpp, такого как слитый белок DDpp, или другому терапевтическому агенту, эффективному для лечения (например, уменьшения симптомов) заболевания или расстройства у субъекта (млекопитающего). Термин терапевтически эффективное количество также относится к количеству, эффективному в дозировках и в течение периодов времени, необходимых для достижения желаемого профилактического результата.
Пациент, субъект, животное и млекопитающее используются взаимозаменяемо и относятся к млекопитающим, таким как пациенты-люди и приматы, не являющиеся людьми, а также к экспериментальным животным, таким как кролики, крысы и мыши, и другие животные. Животные включают всех позвоночных, например, млекопитающих и животных, отличных от млекопитающих, таких как цыплята, амфибии и рептилии. Используемый в данном документе термин млекопитающее относится к любому представителю класса млекопитающих, включая, без ограничения, людей и приматов, отличных от людей, таких как шимпанзе и другие виды высших обезьян и низших обезьян; сельскохозяйственных животных, таких как крупный рогатый скот, овец, свиней, коз и лошадей; домашних млекопитающих, таких
- 23 043660 как собаки и кошки; лабораторных животных, включая грызунов, таких как мыши, крысы и морские свинки, и тому подобные. В конкретном варианте осуществления пациент является человеком. Этот термин не указывает на конкретный возраст или пол. Таким образом, взрослые и новорожденные субъекты, а также эмбрионы и плоды, будь то мужчины или женщины, должны быть включены в объем этого термина.
Термины лечить, лечение и процесс лечения, используемые в данном документе, относятся как к терапевтическому лечению, так и к профилактическим или превентивным мерам, в которых целью является предотвращение или замедление (уменьшение или задержка) симптомов, осложнений или биохимического воздействия признаков заболевания, состояния или расстройства, ослабления симптомов или остановки или подавления дальнейшего развития заболевания, состояния или расстройства. Лечение может быть профилактическим (для предотвращения или отсрочки возникновения заболевания или для предотвращения проявления его клинических или субклинических симптомов) или терапевтическим подавлением или ослаблением симптомов после проявления заболевания, состояния или расстройства, направленного на патологическое состояние, предотвращение патологическое состояние, преследовать или получить полезные результаты, или снизить шансы индивидуума на развитие состояния, даже если лечение в конечном итоге безуспешно. К числу тех, кто нуждается в лечении, относятся те, у кого уже есть это заболевание, а также те, кто склонен к заболеванию, или те, у кого это заболевание необходимо предотвратить. Лечение может осуществляться с использованием слитого белка DDpp отдельно или в сочетании с дополнительным терапевтическим агентом.
Рак, опухоль или злокачественная опухоль используются как синонимичные термины и относятся к любому из ряда заболеваний, которые характеризуются неконтролируемой, ненормальной пролиферацией клеток, способностью пораженных клеток распространяться локально или через кровоток и лимфатическую систему для других частей тела (метастазирование), а также любой из ряда характерных структурных и/или молекулярных особенностей. Термин опухоль, используемый в данном документе, относится ко всем видам роста и пролиферации опухолевой клетки, будь то злокачественный или доброкачественный, и всем предраковым и раковым клеткам и тканям. Раковая опухоль или злокачественная клетка понимается как клетка, обладающая специфическими структурными свойствами, лишенная дифференцировки и способная к инвазии и метастазированию. Рак, который можно лечить с использованием слитых белков DDpp, представленных в данном документе, включает гематологические опухоли, такие как лейкозы и лимфомы, или солидные опухоли. В конкретных вариантах осуществления рак, подлежащий лечению, представляет собой лейкоз или лимфому. Типы раковых заболеваний, подлежащих лечению DBDpp, включают, без ограничения, карциному, бластому и саркому, а также некоторые лейкозы или лимфоидные злокачественные новообразования, доброкачественные и злокачественные опухоли и злокачественные новообразования, например, саркомы, карциномы и меланомы. Типы рака и опухолей, которые можно лечить с использованием DDpp, включают, без ограничения, рак молочной железы, легких, мозга, костей, печени, почек, толстой кишки, головы и шеи, яичников, гематопоэтические (например, лейкоз) и рак простаты. В некоторых вариантах осуществления рак и опухоли, которые можно лечить с использованием DDpp, включают рак молочной железы и яичников. Другие типы рака и опухолей, которые можно лечить с использованием DDpp-содержащих антител, описаны в данном документе или иным образом известны в данной области техники.
Термины опухолевый антиген или раковый антиген используются в данном документе взаимозаменяемо. Опухолевые и раковые антигены могут быть как опухолеспецифичный антиген (TSA - англ.: tumor-specific antigen), специфичный антиген рака (CSA - англ.: cancer-specific antigen), опухольассоциированные антигены (ТАА - англ.: tumor-associated antigen) или рако-ассоциированный антиген (САА -англ.: cancer-associated antigen). TSA представляет собой антиген, который уникален для опухолевых клеток и не встречается в других клетках организма. ТАА представляет собой антиген, который обнаруживается как в опухоли, так и в некоторых нормальных клетках. Из-за динамической природы опухолей в некоторых случаях опухолевые клетки могут экспрессировать уникальные антигены на определенных стадиях, а в других также экспрессировать антигены, которые также экспрессируются на неопухолевых клетках. Таким образом, включение определенного маркера в качестве ТАА не исключает его в качестве TSA.
Используемый в данном документе термин клетка-мишень относится к клетке или клеткам, которые вовлечены в заболевание и могут быть мишенями композиций, содержащих DDpp. Другие клеткимишени включают любую клетку у субъекта (например, человека или животного), на которую может быть нацелен раскрытый DDpp. Клетка-мишень может представлять собой клетку, экспрессирующую или сверхэкспрессирующую мишень, специфически связанную слитым белком DDpp.
Используемый в данном документе термин эффекторные клетки представляет собой лейкоциты, которые экспрессируют один или более FcR и осуществляют эффекторные функции. Предпочтительно, такие клетки экспрессируют по меньшей мере Fc(RIII и осуществляют эффекторную функцию АЗКЦ. Примеры лейкоцитов человека, которые опосредуют (АЗКЦ), включают мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК), естественные клетки-киллеры (NK), моноциты, цитотоксические Т-клетки и нейтрофилы; причем (МКПК) и NK-клетки являются предпочтительными в определенных вариантах осуществления. Эффекторные клетки могут быть выделены из нативного источника, например, из крови
- 24 043660 или РВМС, как описано в данном документе, или иным образом известно из уровня техники. В конкретном варианте осуществления эффекторные клетки представляют собой эффекторные клетки человека.
Термин эффекторная функция относится к специализированной иммунной функции дифференцированной клетки. Эффекторная функция Т-клетки, например, может представлять собой цитолитическую активность или хелперную активность, в том числе секрецию цитокинов.
Используемый в данном документе термин иммунная клетка относится к клеткам иммунной системы млекопитающих, включая, без ограничения, антигенпрезентирующие клетки, В-клетки, базофилы, цитотоксические Т-клетки, дендритные клетки, эозинофилы, гранулоциты, хелперные Т-клетки, лейкоциты, лимфоциты, макрофаги, тучные клетки, клетки памяти, моноциты, природные клетки-киллеры, нейтрофилы, фагоциты, клетки плазмы и Т-клетки.
Термины Т-клетка и Т-лимфоцит являются взаимозаменяемыми и используются в данном документе как синонимы. Примеры включают, но не ограничиваются ими, нативные Т-клетки, центральные Т-клетки памяти, эффекторные Т-клетки памяти или их комбинации.
Используемый в данном документе термин иммунный ответ относится к иммунитетам, включая, но не ограничиваясь ими, врожденный иммунитет, гуморальный иммунитет, клеточный иммунитет, иммунитет, воспалительный ответ, приобретенный (адаптивный) иммунитет, аутоиммунитет и/или сверхактивный иммунитет.
Используемый в данном документе термин трансдукция относится к введению чужеродной нуклеиновой кислоты в клетку с использованием вирусного вектора. Используемый в данном документе термин трансфекция относится к введению чужеродной нуклеиновой кислоты в клетку с использованием технологии рекомбинантной ДНК. Термин трансформация означает введение чужеродной (например, внешней, внеклеточной или иным образом неэндогенной) последовательности нуклеиновой кислоты (ДНК или РНК) в клетку-хозяина, так что клетка-хозяин будет экспрессировать введенную нуклеиновую кислоту для получения желаемого вещества, такого как белок или фермент, кодируемый введенной кодирующей последовательностью. Введенная последовательность нуклеиновой кислоты также может называться клонированным или чужеродным геном или последовательностью и может включать регуляторные или контрольные последовательности, такие как стартовый кодон, стоп- кодон, промотор, сигнал-транскрипции, последовательность секреции или другие последовательности, используемые генетическим механизмом клетки. Последовательность нуклеиновой кислоты может включать нефункциональные последовательности или последовательности без известной функции. Клетка-хозяин, которая получает и экспрессирует введенную нуклеиновую кислоту (например, ДНК или РНК), была трансформирована и является трансформантом или клоном. ДНК или РНК, введенные в клеткухозяина, могут происходить из любого источника, включая клетки того же рода или вида, что и клеткахозяин, или клетки другого рода или вида или могут быть не встречающимися в природе.
Рецептор клеточной поверхности относится к молекулам и комплексам молекул, способным принимать сигнал и передавать такой сигнал через плазматическую мембрану клетки. Примером рецептора клеточной поверхности, предложенного в данном документе, является активированный рецептор интегрина, например, активированный рецептор интегрина αΎβ3 на метастатической клетке. Используемый в данном документе термин рецептор клеточной поверхности также включает молекулу, экспрессируемую на поверхности клетки, которая содержит DDpp, способный связывать представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP). Термин рецептор обозначает связанный с клеткой белок, который связывается или иным образом взаимодействует с молекулой (например, лигандом) и опосредует действие лиганда на клетку. В нескольких вариантах осуществления молекула, которая взаимодействует с рецептором, представляет собой биоактивную молекулу. Мембраносвязанные рецепторы клеточной поверхности, как правило, характеризуются многодоменной структурой, включающей внеклеточный лигандсвязывающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный эффекторный домен, который обычно участвует в трансдукции сигнала.
Используемый в данном документе термин CS1 относится к рецептору NK-клеток, регулирующему иммунные функции, который также экспрессируется на В-клетках, Т-клетках, дендритных клетках, NK-T-клетках и моноцитах. CS1 сверхэкспрессируется при множественной миеломе и был успешно направлен на иммунотерапию множественной миеломы. Malaer & Mathew, Am J Cancer Res. 7(8): 16371641 (2017). CS1 также известен как SLAM7, белок 19А, CRACC и CD319. Термин CS1 включает варианты, изоформы, гомологи, ортологи и паралоги. CS1 представляет собой трансмембранный белок с различными дифференциально сплайсированными изоформами. В некоторых вариантах осуществления аминокислотная последовательность CS1 человека, содержащая 22 аминокислотных остатка N-концевой сигнальной последовательности (MAGSPTCLTLIYILWQLTGSAA, SEQ ID NO: 964) и внеклеточный домен, содержащий 226 N-концевых остатков (SEQ ID NO: 965), имеет номер доступа Genbank № NP_067004 (SEQ ID NO: 966). В некоторых вариантах осуществления аминокислотная последовательность CS1 человека имеет номер доступа Genbank: NP_001269517, NP_001269518, NP_001269519, NP_001269520, NP_001269521, NP_001269522, NP_001269523, NP_001269524 или NP_001269525.
Используемый в данном документе термин химерный антигенный рецептор или CAR или несколько CAR относится к сконструированному рецептору, который прививает антиген или специфич- 25 043660 ность мишени к клетке (например, Т-клеткам, таким как наивные Т-клетки, Т-клетки центральной памяти, Т-клетки эффекторной памяти, NK-клетки, NKT-клетки или их комбинации). Как известно, CAR также упоминаются как искусственные рецепторы Т-клеток, химерные рецепторы Т-клеток или химерные иммунорецепторы.
Полипептиды домена D (DDpp)
Если не указано иное, в практике раскрытых композиций и способов используются стандартные методы молекулярной биологии (включая рекомбинантные методы, культуру ткани и трансформацию клеток), микробиологии, клеточной биологии, биохимии и иммунологии, которые известны специалистам в данной области техники. Такие методики обычно выполняются в соответствии со спецификациями производителя или обычно выполняются с использованием или регулярным изменением известных процедур, таких как процедуры, изложенные в Sambrook et al. (Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)); PCR Technology: Principles and Applications for DNA Amplification (ed. H. A. Erlich, Freeman Press, NY, N.Y., 1992); Oligonucleotide Synthesis (Gait, ed., 1984); Animal Cell Culture (Freshney, ed., 1987); Handbook of Experimental Immunology (Weir et al., eds.; Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (Miller, ed., 1987); Current Protocols in Molecular Biology (Ausubel., ed., 1987); PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (Innis, ed., Academic Press, San Diego, Calif., 1990); Mattila, et al., Nucleic Acids Res. 19: 967 (1991); Eckert, et al., PCR Methods and Applications 1: 17 (1991); PCR (McPherson, ed., IRL Press, Oxford); PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis, ed., 1994); Harlow, Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988) и Kontermann, ed., The Antibody Engineering Lab Manual (Springer Verlag, Heidelberg/New York, 2000); Current Protocols in Immunology (Coligan, ed., 1991); The Immunoassay Handbook (Wild, ed., Stockton Press NY, 1994); и Methods of Immunological Analysis (Masseyeff, ed., Weinheim: VCH Verlags gesellschaft mbH, 1993); and Gennaro, et al. 2000, Remington: the Science and Practice of Pharmacy, 20th Ed. Lipincott Williams and Wilkins: Baltimore, Md., или как описано в данном документе. Если не указаны конкретные определения, номенклатура, используемая в связи с этим, а также лабораторные процедуры и техники аналитической, синтетической органической химии, и медицинской и фармацевтической химии, описанные в данном документе, являются известными и применяемыми в данной области техники. Кроме того, стандартные методы могут быть использованы для химического синтеза, химического анализа, рекомбинантного производства, очистки, фармацевтического приготовления, создания препаратов, доставки и лечения пациентов.
В соответствии с различными вариантами осуществления в данном изобретении предложен DDpp, который специфично связывает представляющую интерес мишень, выбранную из группы, состоящей из ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления DD DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит домен D (DD), выбранный из группы, состоящей из: (a) DD, который специфически связывает ВСМА и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11-305 или 306; (b) DD, который специфически связывает CD123 и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 307-739 или 740; и (с) DD, который специфически связывает AFP или его фрагмент, и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 741-874 или 886-895; (d) DD, который специфически связывает р26 AFP и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 741-874 или 886-895; (е) DD, который специфически связывает CS1 (SEQ ID NO: 965) или его фрагмент, и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 896-909 или 910, (f) DD, который специфически связывает HER2 или его фрагмент, и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 911-949 или 950. Также предложены белки, содержащие варианты (a)-(f), которые сохраняют способность специфически связывать свои соответствующие мишени.
В дополнительных вариантах осуществления DD DDpp представляет собой вариант эталонной последовательности DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-949 и 950, который сохраняет способность специфически связывать мишень эталонного DD. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит аминокислотную последовательность варианта, которая имеет по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96% или 98% идентичности последовательности с эталонной последовательностью DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11949 и 950, и вариант DD сохраняет способность специфически связывать мишень эталонной последовательности DD.
В некоторых вариантах осуществления DD DDpp представляет собой вариант эталонной последовательности связывающего BCMA DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306, который сохраняет способность специфически связывать ВСМА. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит аминокислотную последовательность варианта, которая имеет по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96% или 98% идентичности последовательности с эталонной последовательностью DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11305 и 306, и вариант DD сохраняет способность специфически связывать ВСМА.
В некоторых вариантах осуществления DD DDpp представляет собой вариант эталонной последовательности связывающего CD123 DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740,
- 26 043660 который сохраняет способность специфически связывать CD123. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит аминокислотную последовательность варианта, которая имеет по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96% или 98% идентичности последовательности с эталонной последовательностью DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307739 и 740, и вариант DD сохраняет способность специфически связывать CD123.
В некоторых вариантах осуществления DD DDpp представляет собой вариант эталонной последовательности связывающего CS1 DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910, который сохраняет способность специфически связывать CS1. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит аминокислотную последовательность варианта, которая имеет по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96% или 98% идентичности последовательности с эталонной последовательностью DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910, и вариант DD сохраняет способность специфически связывать CS1.
В некоторых вариантах осуществления DD DDpp представляет собой вариант эталонной последовательности связывающего HER2 DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950, который сохраняет способность специфически связывать HER2. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит аминокислотную последовательность варианта, которая имеет по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96% или 98% идентичности последовательности с эталонной последовательностью DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911949 и 950, и вариант DD сохраняет способность специфически связывать HER2.
В некоторых вариантах осуществления DD DDpp представляет собой вариант эталонной последовательности связывающего AFP DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895, который сохраняет способность специфически связывать AFP. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит аминокислотную последовательность варианта, которая имеет по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96% или 98% идентичности последовательности с эталонной последовательностью DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741874 и 886-895, и вариант DD сохраняет способность специфически связывать AFP.
В некоторых вариантах осуществления DD DDpp представляет собой вариант эталонной последовательности связывающего р26 AFP DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 или 886-895, который сохраняет способность специфически связывать р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит аминокислотную последовательность варианта, которая имеет по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96% или 98 % идентичности последовательности с эталонной последовательностью DD, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 или 886-895, и вариант DD сохраняет способность специфически связывать р26 AFP.
В конкретных вариантах осуществления идентичность между вариантом последовательности DD (искомая) и эталонной последовательностью DD, также называемой глобальным выравниванием последовательности, определяется с использованием компьютерной программы FASTDB на основе алгоритма Brutlag et al. Сотр. Арр. Biosci. 6: 237-245 (1990). Предпочтительными параметрами, используемыми для выравнивания аминокислот FASTDB, являются: матрица=РАМ 0, k-кортеж=2, штраф за несоответствие=1, штраф за присоединение=20, длина группы рандомизации=0, граничный балл=1, размер окна=длина последовательности, штраф за гэп=5, размер штрафа за гэп=0,05, размер окна=500 или длина рассматриваемой аминокислотной последовательности, что короче. Согласно данному варианту осуществления, если эталонная последовательность DD короче, чем искомая последовательность варианта DD, из-за удалений N- или С-конца, а не из-за внутренних удалений, выполняется ручное исправление результатов, чтобы принять во внимание тот факт, что программа FASTDB не учитывает усечения N- и Сконцов эталонной последовательности DD при расчете глобальной процентной идентичности. Для получения эталонных последовательностей укороченных на N- и С-концах, по отношению к искомой последовательности, процент идентичность корректируются путем подсчета количества остатков искомой последовательности, которые являются N- и С-концевыми у эталонной последовательности, которые не соответствуют/выровнены с соответствующим искомым остатком, как процент от общего количества оснований искомой последовательности. Определение того, соответствует/выровнен ли остаток, определяется по результатам выравнивания последовательности FASTDB. Этот процент затем вычитается из процента идентичности, рассчитанного вышеуказанной программой FASTDB с использованием указанных параметров, чтобы получить окончательный процент идентичности. Этот окончательный процентный показатель идентичности используется для целей данного варианта осуществления.
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит вариант DD, содержащий аминокислотную последовательность, которая отличается от соответствующего эталонного DD с SEQ ID NO: 11-949 или 950, в двух или более категориях модификаций последовательности (то есть замен, удалений, вставок и дополнений), и вариант DD сохраняет способность связывать мишень соответствующего эталонного DD (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и р26 AFP). Например, последовательность варианта DD может содержать комбинации аминокислотных делеций, вставок и замен по сравнению с последовательностью эталонного DD. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более 10 аминокислотных замен по сравнению с эталонной последова- 27 043660 тельностью DD SEQ ID NO: 11-949 или 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более 10 консервативных аминокислотных замен по сравнению с эталонной последовательностью DD SEQ ID NO: 11-949 или 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более 10 неконсервативных аминокислотных замен по сравнению с эталонной последовательностью DD SEQ ID NO: 11-949 или 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более 10 консервативных и неконсервативных аминокислотных замен по сравнению с эталонной последовательностью DD SEQ ID NO: 11-949 или 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более 10 аминокислотных делеций по сравнению с эталонной последовательностью DD SEQ ID NO: 11-949 или 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более 10 аминокислотных инсерций в эталонной последовательностью DD SEQ ID NO: 11-949 или 950, и вариант DD сохраняет способность связывать мишень эталонного DD. Кроме того, предложен DDpp, содержащий вариант DD, в котором аминокислотные остатки были удалены с амино-конца, карбокси-конца или как амино, так и карбокси-конца соответствующего эталонного DD SEQ ID NO: 866 и 867. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит последовательность с 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 аминокислотными остатками, удаленными с амино- конца эталонной последовательности DD SEQ ID NO: 11-949 или 950, и вариант DD сохраняет способность связывать мишень эталонного DD. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит последовательность с 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 аминокислотными остатками, удаленными с карбокси-конца эталонного DD SEQ ID NO: 11-949 или 950, и вариант DD сохраняет способность связывать мишень эталонного DD. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта DD содержит 1-5, 1-10 или 1-15 аминокислотных остатков, удаленных с амино- конца эталонной последовательности DD SEQ ID NO: 11-949 или 950, вариант последовательности DD имеет 1-5, 1-10 или 1-15, аминокислотных остатков, удаленных с карбокси-конца эталонной последовательности DD, и вариант DD сохраняет способность связывать мишень эталонного DD.
Слитые белки DDpp
Слитый белок, химерный полипептид, химерный белок, химерный антиген и DDpp, который содержит/имеет в составе гетерологичный полипептид, представляет собой полипептид, состоящий по меньшей мере из двух полипептидов и, необязательно, линкера для функционального связывания двух полипептидов в один непрерывный полипептид, полученный, например, рекомбинантными способами. Два полипептида могут быть функционально присоединены прямо или косвенно.
Слитый белок DDpp, предложенный в данном документе, содержит по меньшей мере один раскрытый в данном документе DDpp, который специфически связывает представляющую интерес мишень (например, ВСМА (SEQ ID NO: 7), CD123 (SEQ ID NO: 8), CS1 (SEQ ID NO: 965), HER2 (SEQ ID NO: 967), AFP (SEQ ID NO: 9), p26 AFP (SEQ ID NO: 10) или их фрагмент). В одном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит один DDpp.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp представляет собой растворимый белок, содержащий один или более связывающих мишень DDpp и белок р26 (например, имеющий последовательность SEQ ID NO: 10, 968, 969, 970, 971, 972, 973 или 974). Было обнаружено, что такие слитые белки, содержащие последовательности р26, имеют удивительно длинный период полужизни в сыворотке. В некоторых вариантах осуществления растворимый слитый белок DDpp имеет период полужизни в плазме in vivo, равный по меньшей мере 1 ч, по меньшей мере 2 ч, по меньшей мере 4 ч, по меньшей мере 8 ч, по меньшей мере 16 ч, по меньшей мере 32 ч, по меньшей мере 64 ч, или более. В некоторых вариантах осуществления растворимый слитый белок имеет период полужизни в плазме in vivo, равный по меньшей мере 1 час, по меньшей мере 2 ч, по меньшей мере 4 ч, по меньшей мере 8 ч, по меньшей мере 16 ч, по меньшей мере 32 ч, по меньшей мере 64 ч, или более 65 ч, или 1-10 ч, 2-10 ч, 4-10 ч, 6-10 ч или 6-9 ч у мыши. В некоторых вариантах осуществления растворимый слитый белок DDpp имеет период полужизни в плазме in vivo, равный по меньшей мере 1 час, по меньшей мере 2 ч, по меньшей мере 4 ч, по меньшей мере 8 ч, по меньшей мере 16 ч, по меньшей мере 32 ч, по меньшей мере 64 ч, или более 65 ч, или 110 ч, 2-10 ч, 4-10 ч, 6-10 ч или 6-9 ч у человека. В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен способ модификации периода полужизни in vivo (например, у мыши или человека) растворимого слитого белка, содержащего белок р26 (например, имеющий последовательность SEQ ID NO: 10, 968, 969, 970, 971, 972, 973 или 974). В некоторых вариантах осуществления растворимый слитый белок р26 содержит один или более связывающих мишень DDpp. В некоторых вариантах осуществления период полужизни растворимого слитого белка р26 увеличивается или уменьшается путем замены или удаления одного или более аминокислотных остатков, обычно присутствующих в белке р26 человека, или путем вставки одного или более аминокислотных остатков, которые обычно не обнаруживаются в белке р26 человека. В другом варианте осуществления последовательность растворимого слитого белка р26 модифицируется посредством 1, 2, 3, 5, 5, 10 или 1-20, 1-10, 3-10 или 3-5 аминокислотных замен (консервативных и/или неконсервативных замен), делеций и/или вставок, чтобы увеличить или уменьшить период полужизни растворимого слитого белка in vivo. В конкретном варианте осуществления
- 28 043660 аминокислотный остаток, соответствующий глутамину (Gln, Q) в положении 217 SEQ ID NO: 10 из р26 замещен другими аминокислотными остатками. В дополнительном варианте осуществления замена представляет собой Gln217Pro. В другом варианте осуществления последовательность р26 растворимого слитого белка модифицируется путем делеций 1-150, 1-100, 1-50, 1-25 или 1-10 аминокислотных остатков, так чтобы увеличить или уменьшить период полужизни in vivo растворимого слитого белка. В дополнительных вариантах осуществления последовательность р26 растворимого слитого белка модифицируют посредством 1, 2, 3, 5, 5, 10 или 1-20, 1-10, 3-10 или 3-5 аминокислотных замен (консервативных и/или неконсервативных замен), делеций и/или вставок, чтобы увеличить или уменьшить взаимодействие растворимого слитого белка с FcRn.
Мультимерные слитые белки DDpp
В одном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит более одного DDpp, причем два или более DDpp имеют одинаковую или различную специфичность. В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит тандемный повтор одного и того же или другого DD, который позволяет слитому белку DDpp связывать несколько мишеней и/или повторяющиеся эпитопы или разные эпитопы на одной и той же мишени. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит по меньшей мере 2, 3, 4 или 5 или более 5 DDpp. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит 1-3, 1-4, 1-5 или более 5 различных DDpp. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит по меньшей мере 2, 3, 4 или 5 или более 5 различных DDpp. Таким образом, слитый белок DDpp может представлять собой мономерный DDpp (то есть содержащий один DDpp) или мультимерный DDpp (то есть содержащий более одного DDpp в тандеме, необязательно функционально соединенных линкером). В некоторых вариантах осуществления применение мультимерного DDpp обеспечивает улучшенное (например, синергетическое) связывание с мишенью. В дополнительных вариантах осуществления мультимерный DDpp позволяет нацеливать более чем одну мишень с использованием конструкции с одним DDpp (например, двух-, трех-специфичного и т.д.). Связывание двух или более идентичных DDpp приводит к получению мультивалентной молекулы, которая обеспечивает явные преимущества (например, повышенную авидность связывания, кластеризацию мишени и активацию рецептора) по сравнению с моновалентными композициями. Связывание двух или более различных DDpp приводит к образованию мультивалентной и мультиспецифичной молекулы, которая обладает способностью связывать более одного антигена-мишени, независимо или одновременно.
Мультимерный слитый белок DDpp может быть гомомультимерным DDpp (то есть содержать более одного и того же DDpp в тандеме, необязательно соединенном линкером(ами) (например, гомодимерами, гомотримерами, гомотетрамерами и т.д.) или гетеромультимерным DDpp (т.е., содержащий два или более DDpp, в которых присутствуют по меньшей мере два разных белка DDpp. Количество мономерного DDpp, включенного в мультимерную композицию, может варьировать в зависимости от варианта осуществления и может определяться, по меньшей мере частично, системой экспрессии, в которой продуцируется DDpp. Однако в некоторых вариантах осуществления слитые белки могут содержать мультимеры от около 5 до около 10 субъединиц DDpp, от около 10 до около 15 субъединиц, от около 15 до около 20 субъединиц, от около 20 до около 25 субъединиц или от около 25 до около 30 субъединиц (включая числа между перечисленными и конечными точками). Более того, несколько тандемных компонентов слитого белка DDpp могут содержать один и тот же или разные DDpp. В некоторых слитых DDpp DDpp присутствует в виде мономера или в гомомультимерах или гетеромерах, таких как гомодимеры или гетеродимеры, гомотримеры или гетеротримеры, гомотетрамеры или гетеротетрамеры.
Слитый белок DDpp может быть моноспецифичным или мультиспецифичным. Слитый белок DDpp, который является мультиспецифичным (например, биспецифичным, триспецифичным или обладающим большей мультиспецифичностью), распознает и связывается с двумя или более различными эпитопами, присутствующими в одной или более различных молекулах (например, белки, твердые структуры подложки и т.д.).
В некоторых вариантах осуществления два или более DD объединены вместе в виде мультивалентного DDpp. DD мультивалентного DDpp могут быть одинаковым или различным. Таким образом, в данном изобретении предложен гомодимер DDpp (то есть DDpp, содержащий два идентичных DD), гомомультимер DDpp (то есть DDpp, содержащий три или более идентичных DD), гетеродимер DDpp (то есть DDpp, содержащий два разных DD) и DDpp гетеромультимер (то есть DDpp, содержащий три или более DD, где по меньшей мере два DD являются различными), содержащий любой из DD, описанных в данном документе, необязательно присоединенный одним или более линкерами.
В некоторых вариантах осуществления два или более DD связаны доменом мультимеризации или присоединены посредством химической связи для образования мультивалентного комплекса DD. DD мультивалентного комплекса DD могут быть одинаковым или различным. Таким образом, в данном изобретении предложен DD-гомодимерный комплекс (то есть DD-комплекс, содержащий два идентичных DD), DD-гомомультимерный комплекс (т.е. DD-комплекс, содержащий три или более идентичных DD), гетеродимерный комплекс DD (т.е. комплекс DD, содержащий два разных DD), и гетеромультимерный комплекс DD (т.е. комплекс DD, содержащий три или более DD, где по меньшей мере два из DD являются разными), содержащий любой из описанных в данном документе DD, необязательно присоединенный
- 29 043660 посредством одного или более линкеров.
В одном варианте осуществления мультиспецифичный слитый белок DDpp содержит по меньшей мере два DDpp, которые связываются по меньшей мере с двумя различными эпитопами на одной представляющем интерес мишени (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP). В дополнительном варианте осуществления слитый DDpp является биспецифичным и специфически связывается с двумя разными мишенями, экспрессируемыми на поверхности двух разных типов клеток. В одном варианте осуществления биспецифичный слитый белок DDpp специфически связывается с мишенью на раковой клетке и мишенью на иммунной эффекторной клетке. В одном варианте осуществления биспецифичный слитый белок DDpp специфически связывает мишень, экспрессируемую на раковой клетке (например, ВСМА, CS1, CD123 и CD19), и мишень, экспрессируемую на поверхности Т-лимфоцита (например, CD3). В одном варианте осуществления биспецифичный слитый белок DDpp специфически связывает ВСМА и CS1.
В дополнительных вариантах осуществления мультиспецифичный слитый белок DDpp содержит по меньшей мере один DDpp, который специфически связывает один эпитоп на представляющей интерес мишени, и по меньшей мере один другой домен или обеспечивающую функцию последовательность (например, фрагмент или домен антитела, такой как scFv), который специфически связывается с другим эпитопом на той же самой представляющей интерес мишени. В одном варианте осуществления мультиспецифичный слитый белок DDpp содержит, по меньшей мере, один DDpp, который специфически связывается с эпитопом с представляющей интерес мишенью, и, по меньшей мере, один другой домен или обеспечивающую функцию последовательность (например, фрагмент или домен антитела, например scFv), который специфически связывается с эпитопом на другой представляющей интерес мишени. В одном варианте осуществления мультиспецифичный слитый белок DDpp содержит, по меньшей мере, один DDpp, который специфически связывается с эпитопом на представляющей интерес мишени и по меньшей мере один другой домен или последовательность, которая специфически связывается с эпитопом на другой мишени на той же клетке. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит по меньшей мере один DDpp и по меньшей мере один другой DDpp обеспечивающую функцию последовательность домена, например фрагмент или домен антитела, который специфически связывается с твердой подложкой.
В дополнительном варианте осуществления мультимерный слитый DDpp, содержащий 2 или более DDpp, в свою очередь, сливается с другими гетерологичными белками (или их поддоменами) и при этом придает поливалентные и мультиспецифичные свойства партнеру по слиянию. Примеры партнеров слияния DDpp включают, без ограничения, антитела, субдомены антител (например, домены scFv или Fc), сывороточный альбумин, субдомены сывороточного альбумина, рецепторы клеточной поверхности, альфа-цепь рецептора Т-клеток (TCR), бета-цепь рецептора Т-клеток, субдоменов рецепторов клеточной поверхности, пептидов, пептидных меток (например, FLAG или myc), повторы фибронектина типа III, zдомены, эластиноподобные полипептиды. Количество и расположение DDpp и их соответствующие положения в слитом белке могут варьировать. Например, DDpp могут быть расположены на одном или на всех концах партнера по слиянию и/или перемежаться в гетерологичных субъединицах партнера по слиянию DDpp.
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DDpp и полипептидную последовательность, содержащую дополнительный домен. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DDpp и член, выбранный из: антитела, фрагмента антитела (например, антигенсвязывающего домена или его части (например, scFv), эффекторного домена или его части, домена связывания FcRn, или его части и Fc или его части), сывороточный белок (например, альбумин или его часть), цитокин, фактор роста, гормон, визуализирующий агент, метящий агент и пептидную метку. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит домен Fc иммуноглобулина (например, домен Fc человека) или его часть. В других вариантах осуществления домен Fc представляет собой вариант домена Fc человека.
В некоторых вариантах осуществления DDpp слит с гетерологичным полипептидом. В некоторых вариантах осуществления гетерологичный полипептид содержит полноразмерное антитело или фрагмент антитела. В некоторых вариантах осуществления DD слит с: амино концом тяжелой цепи полноразмерного антитела; амино концом легкой цепи полноразмерного антитела; карбоксильным концом тяжелой цепи полноразмерного антитела; или карбоксильным концом легкой цепи полноразмерного антитела. В других вариантах осуществления DD слит с фрагментом антитела, который представляет собой Fc. В дополнительных вариантах осуществления гетерологичный полипептид содержит член, выбранный из группы, состоящей из: (i) трансмембранного домена; (ii) мембраносвязывающего домена; (iii) человеческого сывороточного альбумина или его фрагмента; (iv) AFP или его фрагмента; (v) p26 AFP или его фрагмента; (vi) внеклеточного домена рецептора или его фрагмента; и (vii) внеклеточного домена внутриклеточного рецептора (например, ядерного белка) или его фрагмента. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит гетерологичный полипептид, содержащий внеклеточный домен или фрагмент внеклеточного домена рецептора клеточной поверхности.
В некоторых вариантах осуществления DDpp слитого белка DDpp включается в более крупный,
- 30 043660 многодоменный молекулярный комплекс (например, мономерный или мультимерный слитый белок DDpp) и при этом придает функциональные атрибуты встроенного DDpp полученному слитому белку. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DDpp и полипептидную последовательность из антитела, фрагмента антитела, белка сыворотки (например, человеческого сывороточного альбумина) или фрагмента белка сыворотки или рецептора клеточной поверхности, альфа-цепи Тклеточного рецептора (TCR), бета-цепи Т-клеточного рецептора, цитокина, фактора роста, гормона или фермента или их фрагмента. Включение DD в мультидоменные и/или мультифункциональные комплексы обычно может быть достигнуто путем рекомбинантного слияния с другим полипептидом, связывания с другим химическим фрагментом и ковалентной химической связи с другим полипептидом (или другим желательным химическим соединением) с использованием методов, известных в данной области техники. Слитые белки DDpp могут дополнительно содержать другие необязательные компоненты, такие как линкеры и другие компоненты, описанные в данном документе.
Слитые белки DDpp в качестве CAR
В дополнение к включению DD в растворимые многодоменные белки в данном изобретении предложено средство для создания связанного с клетками DDpp, состоящего по меньшей мере из одного DDpp, предназначенного для придания специфичности связывания слитому белку, связанному с мембраной. DDpp-рецепторы могут экспрессироваться любым типом клеток.
В одном варианте осуществления слитый белок DDpp-рецептора содержит химерный антигенный рецептор (CAR) или DDpp-CAR, который содержит внеклеточный нацеливающий домен и трансмембранный домен. В другом варианте осуществления DDpp-CAR состоит из внеклеточного нацеливающего домена, трансмембранного домена и цитоплазматического домена, где цитоплазматический домен содержит сигнальный домен. В дополнительном варианте осуществления внеклеточный домен DDpp-CAR содержит один или более DDpp, в которых каждый DDpp представляет собой специфический связывающий домен с одинаковыми или разными специфичностями. В некоторых вариантах осуществления специфичный для мишени домен нацелен на один (или более) из раковых или опухолевых антигенов, раскрытых в данном документе, таких как ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и р26 AFP, в качестве неограничивающих примеров. В одном варианте осуществления внутриклеточный домен (например, цитоплазматический домен) DDpp-CAR содержит внутриклеточный домен дзета-цепи CD3. В другом варианте осуществления внутриклеточный сигнальный домен DDpp состоит из части внутриклеточного домена дзетацепи CD3. В дополнительном варианте осуществления внутриклеточный домен DDpp-CAR содержит внутриклеточный домен дзета-цепи CD3 и костимулирующую сигнальную область. Костимулирующая сигнальная область относится к части DDpp-CAR, содержащей весь внутриклеточный домен костимулирующей молекулы или его часть. Костимулирующие молекулы представляют собой молекулы клеточной поверхности, отличающиеся от рецепторов антигена или их лигандов, которые требуются для эффективного ответа лимфоцитов на антиген. Костимулирующие молекулы и части этих молекул, которые способны придавать костимулирующие свойства AR, известны в данной области техники и могут регулярно включаться в DDpp-CAR. Кроме того, укорочения или мутации в этих внутриклеточных сигнальных и костимулирующих доменах могут быть включены для дополнительного усиления или уменьшения сигналинга рецепторов. В предпочтительных вариантах осуществления Т-клетка является генетически модифицированной для стабильной экспрессии DDpp-CAR. В таких вариантах осуществления цитоплазматический домен DDpp-CAR может быть спроектирован так, чтобы он сам содержал сигнальный домен CD28 и/или 41ВВ или был объединен с любым другим желаемым цитоплазматическим доменом(ами), применимым в контексте раскрытых вариантов осуществления. В одном варианте осуществления цитоплазматический домен DDpp-CAR может быть сконструирован так, чтобы дополнительно содержать сигнальный домен CD3-дзета. В одном варианте осуществления DDpp-CAR содержит внеклеточный нацеливающий домен, линкер внеклеточного белка с трансмембранным доменом, который проходит через клеточную мембрану (например, найденную в Т-клетках или NK-клетках), и цитоплазматический домен, необязательно содержащий несколько сигнальных модулей. В нескольких вариантах осуществления DDpp-CAR также может содержать эпитопную метку. В некоторых вариантах осуществления цитоплазматический домен DDpp-CAR может содержать, без ограничения, сигнальные модули CD3-дзета, 41ВВ и CD28 и их комбинации.
В дополнительных вариантах осуществления в данном изобретении предложен химерный антигенный рецептор (CAR), где CAR содержит нацеливающий домен, содержащий раскрытый в данном документе DDpp, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен. В нескольких вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен выбирают из группы, состоящей из: дзета-домена CD3 человека, домена 41ВВ, домена CD28 и/или любой их комбинации. В зависимости от варианта осуществления костимулирующая сигнальная область может содержать, например, внутриклеточный домен костимулирующей молекулы, выбранной из группы, состоящей из: CD27, CD28, 41ВВ, ОХ40, CD30, CD40, PD1, антигена, связанного с функцией лимфоцитов-1 (LFA 1), CD2, CD7, LIGHT, NKG2C, В7Н3, лиганд, который специфически связывается с CD83, и любой их комбинации. В некоторых вариантах осуществления нацеливающий домен CAR содержит множество связывающих доменов (например, DD или один или более DD и scFv), которые содержат дополнительный полипептид, связывающийся с ми- 31 043660 шенью. Также предложены нуклеиновые кислоты, кодирующие CAR, которые содержат полипептиды, связывающиеся с мишенью, как часть (или вся) области нацеливания.
В данном изобретении также предложены клетки, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR, причем CAR содержит антигенсвязывающий домен, состоящий, по меньшей мере, частично из раскрытого DDpp, который связывает представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и р26 AFP), трансмембранный домен и сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления CAR специфически связывается с опухолевым антигеном (и, таким образом, функционирует для доставки клетки, экспрессирующей CAR, в опухоль. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген связан с гематологическим злокачественным новообразованием. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой ВСМА. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой CD123. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой CS1. В дополнительных вариантах осуществления опухолевый антиген связан с солидной опухолью. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой HER2. В некоторых вариантах осуществления мишенями являются как солидные, так и гематологические новообразования. В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой Т-клетку, клетку естественного киллера (NK) или клетку другого иммунного типа. В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR (будь то Т-клетка, NKклетка или клетка другого типа), проявляет противоопухолевый иммунитет, когда полипептид связывается с соответствующим опухолевым антигеном.
Внеклеточный домен
В зависимости от желаемого антигена, который должен представлять собой мишень, DDpp-CAR может быть сконструирован так, чтобы включать антигенсвязывающий DDpp, который специфичен для желаемого антигена-мишени. Например, если ВСМА является желаемым антигеном, который должен представлять собой мишень, один или более ВСМА-связывающих DDpp могут быть включены в специфический домен связывания мишени DDpp-CAR. Кроме того, DDpp-CAR может содержать более одного DDpp, придавая мультиспецифичность или мультивалентность DDpp-CAR. В некоторых вариантах осуществления DDpp-CAR содержит связывающий ВСМА DDpp. В некоторых вариантах осуществления DDpp-CAR содержит связывающий CS1 DDpp. В некоторых вариантах осуществления DDpp-CAR содержит связывающий ВСМА DDpp и связывающий CS1 DDpp.
Выбор DDpp, включенного во внеклеточный домен рецептора DDpp (например, DDpp-CAR), зависит от идентичности клетки или клеток-мишеней. Например, DDpp-CAR может специфически связываться с белками клеточной поверхности, такими как рецептор, в той же клетке или другой клетке. В других вариантах осуществления DDpp-CAR специфически связывается с растворимой молекулой, такой как иммуноглобулин. В других вариантах осуществления представляющие интерес мишени, связанные с помощью DDpp-CAR, включают мишени, связанные с вирусными, бактериальными и паразитарными инфекциями, заболеваниями и расстройствами иммунной системы (например, аутоиммунным заболеванием).
В других вариантах осуществления DDpp-CAR может быть выбран для распознавания лиганда, который действует как маркер клеточной поверхности на клетках-мишенях, связанных с раком. В некоторых вариантах осуществления DDpp-CAR могут быть нацелены и могут связывать опухолевый или раковый антиген (например, ТАА или другой опухолевый антиген, описанный в данном документе или иным образом известный в данной области техники). Соответственно, в данном документе предложены способы создания DDpp-CAR, их применение при создании химерных клеток, таких как человеческие Т-клетки и природные клетки-киллеры, и использование этих химерных Т-клеток в адоптивной иммунотерапии.
В контексте, представленном в данном документе, опухолевый антиген относится к антигенам, которые являются общими для специфических гиперпролиферативных нарушений, таких как рак. Опухолевые антигены, которые могут специфически связываться с DDpp в DDpp-CAR, раскрыты в данном документе. В одном варианте осуществления DDpp в DDpp-CAR специфически связывает опухолеспецифический антиген (TSA) или ассоциированный с опухолью антиген (ТАА). TSA уникален для опухолевых клеток и не встречается в других клетках организма. ТАА-ассоциированный антиген не является уникальным для опухолевой клетки, и вместо этого также экспрессируется на нормальной клетке в условиях, которые не позволяют индуцировать состояние иммунологической толерантности к антигену. Экспрессия антигена на опухоль может происходит в условиях, дающих возможность иммунной системе отвечать на данный антиген. ТАА могут представлять собой антигены, экспрессирующиеся на нормальных клетках во время эмбрионального развития, когда иммунная система является незрелой и неспособной реагировать, или они могут представлять собой антигены, в нормальном состоянии представленные в чрезвычайно низких уровнях на нормальных клетках, но экспрессирующихся на намного больших уровнях на опухолевых клетках.
В некоторых вариантах осуществления DDpp в части антигенсвязывающего фрагмента DDpp-CAR специфически связывает ВСМА, CS1, HER2 или CD123. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок ВСМА, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 7. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает ВСМА и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В
- 32 043660 некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок CD123, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 8. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает CD123 и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок CS1, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 965. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает CS1 и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает CS1 и ВСМА. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок HER2, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 967. В других вариантах осуществления DDpp специфически связывает HER2 и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В дополнительных вариантах осуществления часть антигенсвязывающего фрагмента DDpp-CAR дополнительно связывает мишень, выбранную из: HVEM, BTLA, DR3, CD19, CD20 и CD22.
В одном варианте осуществления DDpp в DDpp-CAR специфически связывает опухолевый антиген, связанный со злокачественной опухолью. В одном варианте осуществления DDpp в DDpp-CAR связывается с антигеном, выбранным из: В-клеточного лимфома-специфического идиотипа иммуноглобулина; антигена В-клеточной дифференцировки, такого как CD19, CD20 и CD37; TSLPR и IL7R на миелоидных клетках и белка теплового шока gp96 на клетках множественной миеломы.
В некоторых вариантах осуществления DDpp в части антигенсвязывающего фрагмента DDpp-CAR специфически связывает AFP, p26 AFP или их фрагмент. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9, или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления DDpp специфически связывает белок р26 AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 10, или его фрагмент. В других вариантах осуществления DDpp специфически содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления часть антигенсвязывающего фрагмента DDpp-CAR дополнительно связывает опухолевый антиген. В дополнительных вариантах осуществления часть антигенсвязывающего фрагмента DDppCAR дополнительно связывает мишень, выбранную из: ВСМА, CD123, CS1, HER2, HVEM, BTLA, DR3, CD19, CD20 и CD22.
Трансмембранный домен
Трансмембранный домен (TMD) в контексте данного описания относится к области клеточной поверхности, экспрессируемой слитым белком DDpp, таким как DDpp-CAR, которая проникает через плазматическую мембрану. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен DDpp-CAR является трансмембранной областью трансмембранного белка (например, трансмембранного белка типа I), искусственной гидрофобной последовательности или их комбинации. Другие трансмембранные домены будут очевидны для специалистов в данной области техники и могут использоваться в связи с альтернативными вариантами осуществления, предложенными в данном документе.
Рецептор DDpp (например, DDpp-CAR) может быть сконструирован так, чтобы он содержал трансмембранный домен, который слит с внеклеточным доменом рецептора DDpp. Как описано выше, слияние внеклеточных и трансмембранных доменов может осуществляться с линкером или без него. В одном варианте осуществления используется трансмембранный домен, который естественным образом связан с одним из доменов в DDpp-CAR. В конкретном варианте осуществления трансмембранный домен в DDpp-CAR представляет собой трансмембранный домен CD8. В некоторых случаях трансмембранный домен DDpp-CAR содержит шарнирный домен CD8. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен выбирают или модифицируют путем замены аминокислот для стимуляции или ингибирования ассоциации с другими белками поверхностной мембраны.
Трансмембранный домен может быть получен либо из природного, либо из синтетического источника. Если источник является природным, то домен может быть образован из любого связанного с мембраной или трансмембранного белка. Трансмембранные области, которые могут использоваться в данных целях, могут быть получены из (т.е., содержат по меньшей мере трансмембранную область(и)) члена, выбранного из группы: альфа, бета или дзета цепи Т-клеточного рецептора; CD28, CD3 эпсилон, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137 и CD154. В качестве альтернативы, трансмембранный домен может быть синтетическим, и в этом случае трансмембранный домен DDpp-CAR будет содержать преимущественно гидрофобные остатки, такие как лейцин и валин. В дополнительных вариантах осуществления трансмембранный домен содержит триплет фенилаланин, триптофан и валин на каждом конце синтетического трансмембранного домена.
Используемый в данном документе термин внеклеточный спейсерный домен (ESD) относится к гидрофильной области, которая находится между антигенспецифической нацеливающей областью и трансмембранным доменом. В некоторых вариантах осуществления DDpp-CAR содержат внеклеточный спейсерный домен. В других вариантах осуществления DDpp-CAR не содержат внеклеточный спейсерный домен. Внеклеточные спейсерные домены включают, без ограничения, Fc-фрагменты антител или их фрагменты или производные, шарнирные области антител или фрагменты или их производные, СН2
- 33 043660 области антител, СНЗ-области антител, искусственные спейсерные последовательности или их комбинации. Дополнительные примеры внеклеточных спейсерных доменов включают, без ограничения, шарнир CD8a и искусственные спейсеры, сделанные из полипептидов, которые могут быть такими маленькими, как, например, домены Gly3 или СН1 и СН3 IgG (такие как IgG4 человека). В некоторых вариантах осуществления внеклеточный спейсерный домен представляет собой любую одну или более из (i) шарнирной области, СН2 и СН3-областей IgG4, (ii) шарнирной области IgG4, (iii) шарнирной области и области СН2 IgG4, (iv) шарнирной области CD8a, (v) шарнирной области, областей СН2 и СН3 IgG1, (vi) шарнирная область IgG1 или (vi) шарнирной области и области СН2 IgG1. Другие внеклеточные спейсерные домены будут очевидны для специалистов в данной области техники и могут использоваться в связи с альтернативными вариантами осуществления, предложенными в данном документе.
В некоторых вариантах осуществления короткий олиго- или полипептидный линкер, длиной от около 1 до 100 аминокислот, используется для связывания воедино любого из доменов DDpp-CAR. Линкеры могут состоять из гибких остатков, таких как глицин и серии (или любая другая аминокислота), так что смежные белковые домены могут свободно перемещаться относительно друг друга. Состав аминокислотной последовательности линкера может быть выбран для минимизации потенциальной иммуногенности DDpp-CAR или слитого белка DDpp. Более длинные линкеры могут быть использованы, когда желательно гарантировать, что два соседних домена не будут стерически мешать друг другу. В некоторых вариантах осуществления предпочтительно от 2 до 10 аминокислот в длину образуют связь между трансмембранным доменом и цитоплазматическим сигнальным доменом DDpp-CAR. В дополнительных вариантах осуществления линкер имеет длину от 10 до 15 аминокислот, или от 15 до 20, или от 20 до 30, или от 30 до 60, или от 60 до 100 аминокислот (или любой интервал между указанными значениями). В дополнительных вариантах осуществления линкер представляет собой последовательность глицинсериновый дублет. В других вариантах осуществления используется фрагмент шарнирной области, полученный из альфа-цепи гликопротеина CD8 поверхности Т-клеток человека (например, в диапазоне аминокислотных положений 138-182 альфа-цепи CD8; номер доступа Swiss-Prot P01732). В дополнительных вариантах осуществления используется фрагмент шарнирной области CD8, который был дополнительно модифицирован путем замены аминокислот для улучшения функции экспрессии или иммуногенности. В дополнительных вариантах осуществления используется фрагмент внеклеточной области, полученный из CD28 человека. В других вариантах осуществления используется фрагмент внеклеточной области CD28, который был дополнительно модифицирован посредством замены аминокислот для улучшения функции экспрессии или иммуногенности.
Внутриклеточный домен
Используемый в данном документе термин внутриклеточный сигнальный домен (ISD) или цитоплазматический домен относится к части DDpp-CAR, которая передает сигнал эффекторной функции и направляет клетку на выполнение своей специализированной функции. Цитоплазматический домен (т.е. внутриклеточный сигнальный домен) DDpp-CAR отвечает за активацию по меньшей мере одной из нормальных эффекторных функций иммунной клетки, сконструированной для экспрессии DDpp-CAR. Термин эффекторная функция относится к специализированной функции клетки. Эффекторная функция Тклетки, например, может включать цитолитическую активность и хелперную активность, в том числе секрецию цитокинов. Таким образом, термин внутриклеточный сигнальный домен относится к части белка DDpp-CAR, которая передает сигнал эффекторной функции и направляет клетку на выполнение специализированной функции. Хотя обычно можно использовать весь внутриклеточный сигнальный домен, соответствующий природному рецептору, во многих случаях нет необходимости использовать всю цепь. В той мере, в которой используется усеченная часть внутриклеточного сигнального домена, такая усеченная часть может использоваться вместо интактной цепи до тех пор, пока она будет передавать сигнал эффекторной функции. Таким образом, подразумевается, что термин внутриклеточный сигнальный домен включает в себя любую усеченную часть внутриклеточного сигнального домена, достаточную для передачи сигнала эффекторной функции. В одном варианте осуществления внутриклеточный сигнальный домен в DDpp-CAR содержит цитоплазматические последовательности рецептора Т-клеток (TCR), а также последовательность ко-рецепторов, которые действуют совместно, инициируя трансдукцию сигнала после включения антигенного рецептора, или любое производное или вариант этих последовательностей, которые имеют функциональные возможности. Примеры доменов, которые передают сигнал эффекторной функции, включают, без ограничения, ζ-цепь рецепторного комплекса Т-клеток или любой из его гомологов (например, η-цепь, FcsRly и β-цепи, цепь MB 1 (Iga), В29 (Ig) цепь и т.д.), дзетацепь CD3 человека, полипептиды CD3 (Δ, δ и ε), тирозинкиназы семейства syk (Syk, ZAP 70 и т.д.), тирозинкиназы семейства src (Lck, Fyn, Lyn и т.д.) и другие молекулы, участвующие в трансдукции Т-клеток, такие как CD2, CD5 и CD28.
Известно, что создаваемые только TCR сигналы недостаточны для полной активации Т-клетки, и что также требуется вторичный или костимулирующий сигнал. Таким образом, можно сказать, что активация Т-клеток может опосредоваться двумя различными классами цитоплазматических последовательностей сигнализации: теми что инициируют антигензависимую первичную активации посредством TCR
- 34 043660 (последовательности первичной цитоплазматической сигнализации) и теми что действуют независимым от антигенов образом для обеспечения вторичного или костимулирующего сигнала (последовательности вторичной цитоплазматической сигнализации).
Последовательности первичной цитоплазматической сигнализации регулируют первичную активацию комплекса TCR либо стимулирующим путем, либо ингибирующим путем. Последовательности первичной цитоплазматической сигнализации, действующие стимулирующим путем, могут содержать мотивы сигнализации, которые известны как тирозинсодержащие активационные мотивы или ITAM.
Примеры ITAM, содержащих первичные цитоплазматические сигнальные последовательности, которые особенно применимы в предложенных вариантах осуществления, включают последовательности, полученные из TCR дзета, FcR гамма, FcR бета, CD3 гамма, CD3 дельта, CD3 эпсилон, CD22, CD79a, CD79b и CD66d. Особенно предпочтительно, чтобы цитоплазматическая сигнальная молекула в CAR содержала цитоплазматическую сигнальную последовательность, полученную из CD3 дзета.
Термин костимуляторный домен (CSD) в контексте данного описания относится к части CAR или DDpp-CAR, которая усиливает пролиферацию, выживание и/или развитие клеток памяти. DDpp-CAR может содержать один или более костимуляторных доменов. Каждый костимуляторный домен содержит костимуляторный домен любого одного или более, например, члена суперсемейства TNFR, выбранного из CD28, CD137 (4-lBB), CD134 (OX40), Dap10, CD27, CD2, CD5, ICAM-1, LFA-1(CD1 1a/CD18), Lck, TNFR-I, TNFR-II, Fas, CD30 и CD40 или их комбинацию. Другие костимулирующие домены (например, из других белков) будут очевидны для специалистов в данной области техники и могут использоваться в связи с альтернативными вариантами осуществления изобретения, охватываемыми данным описанием.
В предпочтительном варианте осуществления цитоплазматический домен DDpp-CAR содержит CD3-дзета-сигнальный домен сам по себе или в сочетании с любым другим желаемым цитоплазматическим доменом(ами), пригодным в контексте DDpp-CAR. Например, цитоплазматический домен DDppCAR может содержать часть цепи CD3 дзета и костимулирующую сигнализирующую область. Костимулирующая сигнальная область относится к части CAR, содержащей внутриклеточный домен костимулирующей молекулы. Костимулирующая молекула представляет собой молекулу клеточной поверхности, отличающуюся от рецептора антигена или его лигандов, которая требуется для эффективного ответа лимфоцитов на антиген. Примеры таких молекул включают CD27, CD28, 41ВВ (CD 137), ОХ40, CD30, CD40, PD1, ICOS, ассоциированный с функционированием лимфоцитов антиген-1 (LFA1), CD2, CD7, LIGHT, NKG2C, В7Н3, TIM1 и LAG3.
Полипептидные линкеры могут быть расположены между соседними элементами DDpp-CAR. Например, линкеры могут быть расположены между соседними DDpp или между DDpp и трансмембранным доменом или между трансмембранным доменом и цитоплазматическим доменом или между соседними цитоплазматическими доменами. Цитоплазматические сигнальные последовательности в цитоплазматической сигнальной части DDpp-CAR могут быть связаны друг с другом в случайном или заданном порядке. Необязательно, короткий линкер, предпочтительно от 2 до 10 аминокислот в длину, может образовывать связь. Глицин-сериновый дублет обеспечивает особенно подходящий линкер.
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp представляет собой химерный антигенный рецептор (CAR), который содержит домен связывания мишени, содержащий раскрытый в данном документе DD (например, DD, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11949 или 950). В некоторых вариантах осуществления DD связывает ВСМА и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления DD связывает CD123 и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления DD связывает CS1 и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления DD связывает HER2 и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления DD связывает AFP и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DD связывает р26 AFP и содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит домен связывания мишени, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен CAR содержит трансмембранный домен 41ВВ или CD28. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит внутриклеточный сигнальный домен, который выбирают из группы, состоящей из домена альфа-, бета- или дзета- цепи рецептора Т-клеток человека; домена 41ВВ человека; домена CD28 человека и любой их комбинации. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен CAR содержит внутриклеточный домен костимулирующей молекулы, выбранной из группы, состоящей из: CD27, CD28, 41ВВ, ОХ40, CD30, CD40, PD1, антигена, связанного с функцией лимфоцитов-1 (LFA-1), CD2, CD7, LIGHT, NKG2C, В7-Н3, лиганд, который специфически связывается с CD83, и любой их комбинации. В некоторых вариантах осуществления CAR дополнительно содержит второй домен связывания мишени, имеющий ту же или другую мишень, что и домен связывания мишени на основе DD. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит первый
- 35 043660 домен связывания мишени, который связывает CS1, и второй домен связывания мишени, который связывает ВСМА. В некоторых вариантах осуществления CAR экспрессируется в иммунной клетке. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой Т-клетку (CAR Т-клетку) или клетку естественного киллера (NK) (CAR NK-клетку). В некоторых вариантах осуществления CAR связан с липосомой. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD и/или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CS1 или CD123), экспрессируемую на поверхности раковой клетки. В дополнительных вариантах осуществления CAR содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают вторую другую представляющую интерес мишень (например, scFv), экспрессируемую на поверхности раковой клетки. В дополнительных вариантах осуществления вводимый CAR дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают вторую другую представляющую интерес мишень, экспрессируемую второй другой раковой клеткой или сосудистой эндотелиальной клеткой.
Дополнительные слитые белки DDpp
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит гетерологичный полипептид, содержащий фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислот внеклеточного домена рецептора клеточной поверхности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит гетерологичный полипептид, который содержит внеклеточный домен, или фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит гетерологичный полипептид, который содержит внеклеточный домен, или фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит гетерологичный полипептид, который содержит внеклеточный домен, или фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37; TSLPR, IL7R и gp96.
В некоторых вариантах осуществления белок содержит гетерологичный полипептид, который содержит сывороточный белок или антигенный фрагмент сывороточного белка (например, AFP и р26 AFP). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит гетерологичный полипептид, содержащий фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислот сывороточного белка. В некоторых вариантах осуществления белок содержит гетерологичный полипептид, который содержит внутриклеточный белок или антигенную часть внутриклеточного белка (например, ядерного белка). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит гетерологичный полипептид, содержащий фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислот внутриклеточного белка. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит гетерологичный полипептид, имеющий последовательность SEQ ID NO: 10, 968, 969, 970, 971, 972, 972 или 974.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp специфически связывает ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и/или р26 AFP и дополнительно связывает одну или более дополнительных представляющих интерес мишеней. Представляющие интерес мишени, специфически связанные слитым белком DDpp, могут представлять собой любую молекулу, с которой желательно связать DDpp. Например, мишенями, специфически связанными слитым белком DDpp, могут быть ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и/или р26 AFP и, кроме того, любая дополнительная мишень для производственной, рецептурной, терапевтической, диагностической или прогностической значимости или ценности. Ряд иллюстративных дополнительных мишеней предоставлен в качестве примера и предназначен для иллюстрации, а не для ограничения. Дополнительная представляющая интерес мишень, связанная слитым белком DDpp, может быть встречающейся в природе или синтетической. Дополнительная представляющая интерес мишень может представлять собой внеклеточный компонент, внутриклеточный компонент, растворимый фактор (например, фермент, гормон, цитокин и фактор роста, токсин, яд, загрязнитель и т.д.) или трансмембранный белок (например, рецептор клеточной поверхности). В некоторых вариантах осуществления представляющая интерес мишень, связанная слитым белком DDpp, представляет собой белок человека. В одном варианте осуществления DDpp (например, слитый белок DDpp) связывает представляющий интерес белок-мишень человека и его ортолог обезьяны (например, яванского макака), мыши, кролика, хомяка и/или кролика.
В одном варианте осуществления слитый белок DDpp специфически связывает ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и/или р26 AFP и белок сыворотки. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp специфически связывает сывороточный белок, выбранный из: сывороточного альбумина (например, человеческого сывороточного альбумина (ЧСА)), тироксинсвязывающего белка, трансферрина, фибриногена и иммуноглобулина (например, IgG, IgE и IgM). Без ограничения какой-либо теорией, связывание DDpp с белком-носителем, как полагают, придает DDpp (или его слитому белку) улучшенный фармакодинамический профиль, который включает, без ограничения, улучшенное нацеливание на опухоль, проникновение в опухоль, диффузию в опухоли и усиление терапевтической активности по сравнению со слитым белком DDpp, в котором отсутствует последовательность, связывающая белок-носитель (см., на- 36 043660 пример, WO 01/45746, содержание которой полностью включено в данное описание в качестве ссылки).
Слитые белки DDpp на основе антител
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или фрагмент или субдомен антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело, которое специфически связывается с раковым антигеном. В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В других вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок Fc. В других вариантах осуществления белок Fc содержит вариант домена Fc человека.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или фрагмент или субдомен антитела (например, антитело IgG1, антитело IgG3, вариабельную область антитела, CDR3, scFv, Fc, FcRn-связывающий субдомен и другие субдомены антитела). Белки DDpp могут быть функционально связаны друг с другом и/или с одним или более концами антитела, цепи антитела, фрагмента антитела или субдомена антитела с образованием слитого белка DDpp.
Компонент-антитело слитого белка DDpp может представлять собой любой подходящий полноразмерный иммуноглобулин или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий домен и/или эффекторный домен) или их фрагмент. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp-антитело сохраняет структурные и функциональные свойства традиционного моноклонального антитела. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp-антитело сохраняет свойства связывания эпитопа, но преимущественно также содержит посредством слияния DDpp одну или более дополнительных специфичностей связывания с мишенью. Антитела, которые можно использовать при слиянии DDpp, включают, без ограничения, моноклональные, мультиспецифические, человеческие, гуманизированные, приматизированные и химерные антитела. Молекулы иммуноглобулина или антитела, представленные в данном документе, могут быть любого типа (например, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA и IgY), класса (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2) или подкласса молекулы иммуноглобулина. В конкретных вариантах осуществления антитела представляют собой Fc-оптимизированные антитела. Антитела могут быть или получены из любого животного, включая птиц и млекопитающих, или могут быть созданы синтетически. Антитело-компонент слитого белка DDpp-антитело может быть получен естественным путем или в результате рекомбинантной инженерии (например, фаговый дисплей, ксеномышь и синтез). В некоторых вариантах осуществления антитело-компонент слитого белка антитело-DDpp увеличивает период полужизни и увеличивает или уменьшает активность антителозависимой клеточной цитотоксичности (АЗКЦ) и/или комплементзависимой цитотоксичности (КЗЦ). В некоторых вариантах осуществления антитела представляют собой антитела человека, мыши, осла, кролика, козы, морской свинки, верблюда, ламы, лошади или курицы. В конкретных вариантах осуществления антитела являются человеческими.
Обычно считается, что константная область опосредует несколько эффекторных функций. Например, связывание компонента комплемента С1 с антителами активирует систему комплемента. Активация комплемента важна в опсонизации и лизисе клеточных патогенов. Активация комплемента также стимулирует воспалительный ответ и может также участвовать в аутоиммунной гиперчувствительности. Кроме того, антитела связываются с клетками через Fc-область, при этом сайт Fc-рецептора на Fc-области антитела связывается с Fc-рецептором (FcR) на клетке. Существует ряд рецепторов Fc, которые специфичны для различных классов антител, включая IgG (гамма-рецепторы), IgE (эта-рецепторы), IgA (альфа-рецепторы) и IgM (мю-рецепторы). Связывание антитела с Fc-рецепторами на клеточных поверхностях запускает ряд важных и разнообразных биологических реакций, включая поглощение и разрушение покрытых антителом частиц, клиренс иммунных комплексов, лизис покрытых антителом клетокмишеней клетками-киллерами (называемыми антителозависимая клеточная опосредованная цитотоксичность (АЗКЦ), высвобождение медиаторов воспаления, перенос плаценты и контроль продукции иммуноглобулина.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp-Fc имеет измененную эффекторную функцию, которая, в свою очередь, влияет на биологический профиль вводимого слитого белка DDpp-Fc. Например, делеция или инактивация (посредством точечных мутаций или других средств) субдомена константной области может снижать связывание Fc-рецептора циркулирующего модифицированного антитела. В других случаях модификации константной области может обеспечивать умеренное связывание комплемента и, таким образом, уменьшать период полужизни в сыворотке и неспецифическую ассоциацию конъюгированного цитотоксина. Еще другие модификации константной области могут быть использованы для устранения дисульфидных связей или олигосахаридных фрагментов, которые обеспечивают улучшенную локализацию благодаря повышенной специфичности антигена или гибкости антител. Подобным образом, модификации константной области в соответствии с данным изобретением могут быть легко выполнены с использованием биохимических или молекулярных технологий, известных специалистам в данной области техники.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp-Fc не имеет одной или более эффектор- 37 043660 ных функций. Например, в некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp-Fc не обладает активностью антителозависимой клеточной цитотоксичности (АЗКЦ) и/или активностью комплементзависимой цитотоксичности (КЗЦ). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp-Fc не связывается с рецептором Fc и/или факторами комплемента. В определенных вариантах осуществления слитый белок DDpp-Fc не имеет эффекторной функции. Примеры инженерных модификаций последовательности Fc, которые снижают или устраняют активность АЗКЦ и/или КЗЦ и связывание с рецептором Fc и/или фактором комплемента, описаны в данном документе или известны в данной области техники, как и анализы и процедуры для их тестирования.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp-Fc сконструирован для слияния домена СН3 непосредственно с шарнирной областью соответствующего модифицированного антитела. В других конструкциях пептидный спейсер вставлен между шарнирной областью и модифицированными доменами СН2 и/или СН3. Например, могут быть экспрессированы совместимые конструкции, в которых домен СН2 был удален, а оставшийся домен СН3 (модифицированный или немодифицированный) соединен с шарнирной областью с 5-20 аминокислотными спейсерами. Такой спейсер может быть добавлен, например, для обеспечения того, чтобы регуляторные элементы константной области оставались свободными и доступными или чтобы шарнирная область оставалась гибкой. Аминокислотные спейсеры могут в некоторых случаях оказаться иммуногенными и вызывать нежелательный иммунный ответ против конструкции. Соответственно, в определенных вариантах осуществления любой спейсер, добавленный в конструкцию, может быть относительно неиммуногенным или даже вообще отсутствовать, чтобы поддерживать желаемые биохимические качества модифицированного слитого белка DDpp-Fc.
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp-Fc модифицируют частичной делецией или заменой нескольких или даже одной аминокислоты в константной области. Например, мутации одной аминокислоты в выбранных областях домена СН2 может быть достаточно, чтобы существенно уменьшить связывание Fc и тем самым. Аналогично, один или более доменов константной области, которые контролируют эффекторную функцию (например, связывание комплемента C1Q), могут быть полностью или частично удалены. Такие частичные делеции константных областей могут улучшить выбранные характеристики слитого белка DDpp-Fc (например, период полужизни в сыворотке), оставляя при этом нетронутыми другие желательные функции, связанные с соответствующим доменом константной области. В некоторых вариантах осуществления константная область слитого белка DDpp-Fc модифицируется посредством мутации или замены одной или более аминокислот, что усиливает профиль получаемой конструкции. В этом отношении можно нарушать активность, обеспечиваемую консервативным сайтом связывания (например, связывание Fc), в то же время по существу сохраняя конфигурацию и иммуногенный профиль модифицированного слитого белка DDpp-Fc. В данном изобретении также предложен слитый белок DDpp-Fc, который содержит добавление одной или более аминокислот к константной области для усиления желаемых характеристик, таких как уменьшение или увеличение эффекторной функции или предоставление сайтов присоединения для одной или более цитотоксиновых, меточных или углеводных групп. В таких вариантах осуществления может быть желательным вставлять или реплицировать конкретные последовательности, полученные из выбранных доменов константной области.
В некоторых вариантах осуществления DDpp функционально связан с фрагментом или поддоменом антитела (например, scFv, диатело, ЕР 404097; WO 93/111161; WO 14/028776 и Holliger et al., PNAS 90: 6444-6448 (1993), содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме. Фрагмент или поддомен антитела может представлять собой любой фрагмент или домен антитела. См., например, WO04/058820, WO99/42077 и WO05/017148, содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме. Например, слитый белок DDpp может содержать эффекторный домен антитела или производное эффекторного домена антитела, которое наделяет DDpp одной или более эффекторными функциями и/или наделяет слитый белок DDpp способностью связываться с одним или более Fc-рецепторами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp-антитело содержит антигенсвязывающий фрагмент антитела или его фрагмент. В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp-антитело содержит эффекторный домен иммуноглобулина, который содержит один или более доменов СН2 и/или СН3 антитела, обладающего эффекторной функцией, обеспечиваемой доменами СН2 и СН3. Другие последовательности в слитом DDpp, которые обеспечивают эффекторную функцию и охватываются изобретением, будут понятны специалистам в данной области техники и могут быть обычно выбраны и объединены в слитый белок DDpp, охватываемый в данном документе, на основе желаемой эффекторной функции(й).
В одном варианте осуществления слитый DDpp содержит полноразмерное антитело или фрагмент антитела, который является антигенсвязывающим фрагментом. В дополнительном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела связывают связанный с заболеванием антиген. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит антитело или фрагмент антитела, которое специфически связывается с раковым антигеном. В другом варианте осуществления слитый белок DDpp содержит антитело или фрагмент антитела, который специфически связывает определенный патоген (например, бактериальную клетку (например, туберкулез, оспу, сибирскую язву)), вирус (например, ВИЧ), паразит (на
- 38 043660 пример, малярия, лейшманиоз), инфекцию, вызванную грибами, плесень, микоплазма, прионный антиген. В другом варианте осуществления слитый белок DDpp содержит антитело или фрагмент антитела, который специфически связывает определенный патоген (например, бактериальную клетку (например, туберкулез, оспа, сибирская язва)), вирус (например, ВИЧ), паразита (например, малярия, лейшманиоз), инфекцию, вызванную грибами, плесень, микоплазма или прионный антиген. В другом варианте осуществления слитый белок DDpp содержит антитело или фрагмент антитела, который специфически связывает антиген, связанный с заболеванием или расстройством иммунной системы.
В предпочтительных вариантах осуществления слитый белок DDpp, содержащий фрагмент или домен антитела, сохраняет активность родительского антитела. Таким образом, в определенных вариантах осуществления слитый белок DDpp, содержащий фрагмент или домен антитела, способен индуцировать комплемент-зависимую цитотоксичность. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp, содержащий фрагмент или домен антитела, способен индуцировать антителозависимую клеточную цитотоксичность (АЗКЦ).
Соответственно, в некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент антитела, который придает слитому белку DDpp биологическую или биохимическую характеристику иммуноглобулина. В некоторых вариантах осуществления фрагмент антитела придает характеристику, выбранную из: способности нековалентно димеризоваться, способности локализоваться в месте опухоли и увеличенного периода полужизни в сыворотке по сравнению со слитым белком DDpp, в котором один или более DDpp были удалены. В определенных вариантах осуществления слитый белок DDpp является по меньшей мере таким же стабильным, как и соответствующее антитело без присоединенного DDpp. В определенных вариантах осуществления слитый белок DDpp является более стабильным, чем соответствующее антитело без присоединенного DDpp. Стабильность слитого белка DDpp может быть измерена с использованием установленных методов, включая, например, методы ИФА. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp стабилен в цельной крови (in vivo или ex vivo) при 37°С в течение по меньшей мере около 10 ч, по меньшей мере около 15 ч, по меньшей мере около 20 ч, по меньшей мере около 24 ч, по меньшей мере около 25 ч, по меньшей мере около 30 ч, по меньшей мере около 35 ч, по меньшей мере около 40 ч, по меньшей мере около 45 ч, по меньшей мере около 48 ч, по меньшей мере около 50 ч, по меньшей мере около 55 ч, по меньшей мере около 60 ч, по меньшей мере около 65 ч, по меньшей мере около 70 ч, по меньшей мере около 72 ч, по меньшей мере около 75 ч, по меньшей мере около 80 ч, по меньшей мере около 85 ч, по меньшей мере около 90 ч, по меньшей мере около 95 ч или по меньшей мере около 100 ч (включая любое время между перечисленным). В одном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит эффекторный домен иммуноглобулина или домен, влияющий на период полужизни, который соответствует домену или фрагменту иммуноглобулина, в котором по меньшей мере часть одного или более доменов константной области была изменена, чтобы обеспечить желаемые биохимические характеристики такие как сниженные или повышенные эффекторные функции, способность нековалентно димеризоваться, повышенная способность локализоваться в месте опухоли, уменьшенное время полужизни в сыворотке или увеличенное время полужизни в сыворотке по сравнению с фрагментом иммуноглобулина, имеющим соответствующую неизмененную последовательность иммуноглобулина. Эти изменения доменов константной области могут быть аминокислотными заменами, вставками или делециями.
В одном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность эффекторного домена иммуноглобулина или производного эффекторного домена иммуноглобулина, который придает антителозависимую клеточную цитотоксичность (АЗКЦ) слитому белку DDpp. В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для увеличения АЗКЦ (см., например, Bruhns, Blood 113: 3716-3725 (2009); Shields, J. Biol. Chem. 276: 6591-6604 (2001); Lazar, PNAS 103: 40054010 (2006); Stavenhagen, Cancer Res. 67: 8882-8890 (2007); Horton, Cancer Res. 68: 8049-8057 (2008); Zalevsky, Blood 113: 3735-3743 (2009); Bruckheimer, Neoplasia 11: 509-517 (2009); WO06/020114; Strohl, Curr. Op. Biotechnol. 20: 685-691 (2009) и WO 04/074455, содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме). Примеры модификаций инженерных фрагментов иммуноглобулина, содержащихся в аминокислотной последовательности в слитом белке DDpp, который увеличивает АЗКЦ, включают последовательности эффекторного домена иммуноглобулина, имеющие одну или более модификаций, соответствующих: IgG1-S298A, E333A, К334А; IgG1-S239D, I332E; IgG1S239D, A330L, I332E; IgG1-P247I, A339D или Q; IgG1-D280H, K290S с или без S298D или V; IgG1F243L, R292P, Y300L; IgG1-F243L, R292P, Y300L, P396L и IgG1-F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L; где нумерация остатков в области Fc соответствует нумерации индекса EU Kabat et al. (Kabat et al., Sequences of proteins of Immunological Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки).
В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для уменьшения АЗКЦ (см., например, Idusogie et al., J. Immunol. 166: 2571-2575 (2001); Sazinsky et al., PNAS 105: 20167-20172 (2008); Davis et al., J. Rheumatol. 34: 2204-2210 (2007); Bolt et al., Eur. J. Immunol. 23: 403-411 (1993); Alegre et al., Transplanta
- 39 043660 tion 57: 1537-1543 (1994); Xu et al., Cell Immunol. 200: 16-26 (2000); Cole et al., Transplantation 68: 563-571 (1999); Hutchins et al., PNAS 92: 11980-11984 (1995); Reddy et al., J. Immunol. 164: 1925-1933 (2000); WO97/11971; WO07/106585; US 2007/0148167A1; McEarchern et al., Blood 109: 1185-1192 (2007); Strohl, Curr. Op. Biotechnol. 20: 685-691 (2009); and Kumagai et al., J. Clin. Pharmacol. 47: 1489-1497 (2007), содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме. Примеры модификаций последовательностей инженерных фрагментов иммуноглобулина, содержащихся в аминокислотной последовательности в слитом белке DDpp, который уменьшает АЗКЦ, включают последовательности эффекторного домена иммуноглобулина, имеющие одну или более модификаций, соответствующих: IgG1-K326W, E333S; IgG2-E333S; IgG1-N297A; IgG1-L234A, L235A; IgG2-V234A, G237A; IgG4-L235A, G237A, E318A; IgG4-S228P, L236E; IgG2- 118-260; IgG4- 261-447; IgG2-H268Q, V309L, A330S, A331S; IgG1-C220S, C226S, C229S, p268S; IgG1-C226S, C229S, E233P, L234V, L235A или IgG1L234F, L235E, P331S; где нумерация остатков соответствует нумерации индекса EU Kabat (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки).
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность эффекторного домена иммуноглобулина или производного эффекторного домена иммуноглобулина, который придает антителозависимый клеточный фагоцитоз (АЗКФ) слитому белку DDpp. В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для увеличения антителозависимого клеточного фагоцитоза (АЗКФ) (см., например, Shields et al., J. Biol. Chem. 276: 6591-6604 (2001); Lazar et al., PNAS 103: 4005-4010 (2006); Stavenhagen et al., Cancer Res. 67: 8882-8890 (2007); Richards et al., Mol. Cancer Ther. 7: 2517-2527 (2008); Horton et al., Cancer Res. 68: 8049-8057 (2008), Zalevsky et al., Blood 113: 3735-3743 (2009); Bruckheimer et al., Neoplasia 11: 509-517 (2009); WO06/020114; Strohl, Curr. Op. Biotechnol. 20: 685-691 (2009) и WO 04/074455, содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме). Примеры модификаций инженерных фрагментов иммуноглобулина, содержащихся в аминокислотной последовательности в слитом белке DDpp, который увеличивает АЗКФ, включают последовательности эффекторного домена иммуноглобулина, имеющие одну или более модификаций, соответствующих: IgG1-S298A, Е333А, К334А; IgG1-S239D, I332E; IgG1S239D, A330L, I332E; IgG1-P247I, A339D или Q; IgG1-D280H, K290S с или без S298D или V; IgG1F243L, R292P, Y300L; IgG1-F243L, R292P, Y300L, P396L; IgG1-F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L и IgG1-G236A, S239D, I332E; где нумерация остатков в области Fc соответствует нумерации индекса EU Kabat et al. (Kabat et al., Sequences of proteins of Immunological Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки).
В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для уменьшения АЗКФ (см., например, Sazinsky et al., PNAS 105: 20167-20172 (2008); Davis et al., J. Rheumatol. 34: 2204-2210 (2007); Bolt et al., Eur. J. Immunol. 23: 403-411 (1993); Alegre et al., Transplantation 57: 1537-1543 (1994); Xu et al., Cell Immunol. 200: 16-20 (2000); Cole et al., Transplantation 68: 563-571 (1999); Hutchins et al., PnAS 92: 11980-11984 (1995); Reddy et al., J. Immunol. 164: 1925-1933 (2000); WO97/11971; WO07/106585; US 2007/0148167A1; McEarchern et al., Blood 109: 1185-1192 (2007); Strohl, Curr. Op. Biotechnol. 20: 685-691 (2009); and Kumagai et al., J. Clin. Pharmacol. 47: 1489-1497 (2007), содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме. Например, слитые белки DDpp могут содержать фрагмент или домен антитела, который содержит одну или более из следующих модификаций, которые уменьшают АЗКЦ: IgG1-N297A; IgG1-L234A, L235A; IgG2-V234A, G237A; IgG4-L235A, G237A, E318A; IgG4-S228P, L236E; последовательность EU IgG2 118-260; последовательность IgG4-EU 261-447; IgG2H268Q, V309L, A330S, A331S; IgG1-C220S, C226S, C229S, p268S; IgG1-C226S, C229S, E233P, L234V, L235A и IgG1-L234F, L235E, P331S; где нумерация остатков соответствует нумерации индекса EU Kabat et al. (Kabat et al., Sequences of proteins of Immunol ogical Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки).
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность эффекторного домена иммуноглобулина или производного эффекторного домена иммуноглобулина, который придает комплементзависимой цитотоксичности (КЗЦ) слитому белку DDpp. В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для увеличения комплементзависимой цитотоксичности (КЗЦ) (см., например, Idusogie et al., J. Immunol. 166: 2571-2575 (2001); Strohl, Curr. Op. Biotechnol. 20: 685-691 (2009) и Natsume etal., Cancer Res. 68: 3863-3872 (2008), содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме. Например, слитые белки DDpp могут содержать фрагмент или домен антитела, который содержит одну или более из следующих модификаций, которые увеличивают КЗЦ: IgG1-K326A, E333A; IgG1-K326W, E333S, IgG2-E333S; где нумерация остатков соответствует нумерации индекса EU Kabat et al. (Kabat et al., Sequences of proteins of Immunological Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки).
- 40 043660
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность эффекторного домена иммуноглобулина или производного эффекторного домена иммуноглобулина, который обеспечивает слитому белку DDpp способность связывать рецептор FcgammaRIIb. В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для увеличения ингибирующего связывания с рецептором FcgammaRIIb (см., например, Chu et al., Mol. Immunol. 45: 3926-3933 (2008)). Примером модификаций сконструированного фрагмента иммуноглобулина, содержащихся в аминокислотной последовательности в слитом белке DDpp, которые увеличивают связывание с ингибирующим рецептором FcgammaRIIb, является IgG1-S267E, L328F.
В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для уменьшения КЗЦ (см., например, WO 97/11971; WO 07/106585; US 2007/0148167A1; McEarchemetal., Blood 109: 1185-1192 (2007); HaydenLedbetter et al., Clin. Cancer 15: 2739-2746 (2009); Lazar et al., PNAS 103: 4005-4010 (2006); Bruckheimer et al., Neoplasia 11: 509-517 (2009); Strohl, Curr. Op. Biotechnol. 20: 685-691 (2009) и Sazinsky et al., PNAS 105: 20167-20172 (2008), содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме. Например, слитые белки DDpp могут содержать фрагмент или домен антитела, который содержит одну или более из следующих модификаций, которые уменьшают КЗЦ: IgG1-S239D, A330L, I332E; IgG2- 118-260; IgG4-261-447; IgG2-H268Q, V309L, A330S, A331S; IgG1-C226S, C229S, E233P, L234V, L235A; IgG1-L234F, L235E, P331S и IgG1-C226S, p260S; где нумерация остатков соответствует нумерации индекса EU Kabat et al. (Kabat et al., Sequences of proteins of Immunol ogical Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки).
Период полужизни IgG опосредуется его рН-зависимым связыванием с неонатальным рецептором FcRn. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность эффекторного домена иммуноглобулина или производного эффекторного домена иммуноглобулина, который обеспечивает слитому белку DDpp способность связывать неонатальный рецептор FcRn. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность связывающего FcRn домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для усиления связывания с FcRn (см., например, Petkova et al., Int. Immunol. 18: 1759-1769 (2006); Dall'Acqua et al., J. Immunol. 169: 5171-5180 (2002); Oganesyan et al., Mol. Immunol. 46: 1750-1755 (2009); Dall'Acqua et al., J. Biol. Chem. 281: 23514-23524 (2006); Hinton et al., J. Immunol. 176: 346-356 (2006); Datta-Mannan et al., Drug Metab. Dispos. 35: 86-94 (2007); Datta-Mannan et al., J. Biol. Chem. 282: 1709-1717 (2007); WO06/130834; Strohl, Curr. Op. Biotechnol. 20: 685-691 (2009) и Yeung et al., J. Immunol. 182: 7663-7671 (2009), содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме.
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, который был модифицирован, чтобы иметь селективную аффинность с FcRn при рН 6,0, но не рН 7,4. Например, слитые белки DDpp могут содержать фрагмент или домен антитела, который содержит одну или более из следующих модификаций, которые увеличивают период полужизни: IgG1-M252Y, S254T, Т256Е; IgG1-T250Q, M428L; IgG1-H433K, N434Y; IgG1-N434A и IgG1-T307A, E380A, N434A; где нумерация остатков соответствует нумерации индекса EU Kabat et al. (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки).
В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была модифицирована для уменьшения связывания с FcRn (см., например, Petkova et al., Int. Immunol. 18: 1759-1769 (2006); Datta-Mannan et al., Drug Metab. Dispos. 35: 86-94 (2007); Datta-Mannan et al., J. Biol. Chem. 282: 1709-1717 (2007); Strohl, Curr. Op. Biotechnol. 20: 685691 (2009) и Vaccaro et al., Nat. Biotechnol. 23: 1283-1288 (2005), содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме. Например, слитые белки DDpp могут содержать фрагмент или домен антитела, который содержит одну или более из следующих модификаций, которые уменьшает период полужизни: IgG1-M252Y, S254T, Т256Е; Н433К, N434F, 436Н; IgG1-I253A; и IgG1-P257I, N434H и D376V, N434H; где нумерация остатков соответствует нумерации индекса EU Kabat et al. (Kabat et al., Sequences of proteins of Immunol ogical Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки).
Согласно другому варианту осуществления, слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, соответствующую эффекторному домену иммуноглобулина, который был модифицирован, чтобы содержать по меньшей мере одну замену в своей последовательности, соответствующую положению области Fc (например, гамма-FC), выбранной из группы, состоящей из: 238, 239, 246, 248, 249, 252, 254, 255, 256, 258, 265, 267, 268, 269, 270, 272, 276, 278, 280, 283, 285, 286, 289, 290, 292, 293, 294, 295, 296, 298, 301, 303, 305, 307, 309, 312, 315, 320, 322, 324, 326, 327, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 337, 338, 340, 360, 373, 376, 378, 382, 388, 389, 398, 414, 416, 419, 430, 434, 435, 437, 438 и 439, где нумерация остатков в области Fc соответствует системе нумерации EU из Kabat et al. (Kabat et al., Sequences of proteins of Immunological Interest, 1991 Fifth edition, содержание которого полностью включено в данное описание посредством ссылки). В конкретном варианте осуществления слитый белок DDpp содер
- 41 043660 жит последовательность производного эффекторного домена иммуноглобулина, где по меньшей мере один остаток, соответствующий положению 434, представляет собой остаток, выбранный из группы, состоящей из: A, W, Y, F и Н. В соответствии с другим вариантом осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность производного эффекторного фрагмента иммуноглобулина, имеющую следующие соответствующие замены S298A/E333A/K334A. В дополнительном варианте осуществления слитый белок DDpp содержит производное эффекторного домена иммуноглобулина, имеющее замену, соответствующую К322А. В другом варианте осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность производного эффекторного домена иммуноглобулина, имеющую одну или любую комбинацию из следующих замен К246Н, H268D, E283L, S324G, S239D и I332E. Согласно еще одному варианту осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность производного эффекторного домена иммуноглобулина, имеющую замены, соответствующие D265A/N297A.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит последовательность эффекторного домена иммуноглобулина, которая была гликоинженерирована или мутирована для увеличения эффекторной функции с использованием методов, известных в данной области техники. Например, инактивация (посредством точечных мутаций или других средств) последовательности домена константной области, содержащейся в DDpp, может снижать связывание Fc-рецептора циркулирующего слитого белка DDpp, тем самым увеличивая локализацию опухоли. В других случаях может быть так, что модификации константной области, согласующиеся с определенными предложенными вариантами осуществления, обеспечивают умеренное связывание комплемента и, таким образом, уменьшают период полужизни в сыворотке и неспецифическую ассоциацию конъюгированного цитотоксина. Еще другие модификации константной области могут быть использованы для модификации дисульфидных связей или олигосахаридных фрагментов, которые обеспечивают улучшенную локализацию благодаря повышенной специфичности антигена или гибкости антител. Результирующий физиологический профиль, биодоступность и другие биохимические эффекты модификаций, такие как локализация опухоли, биораспределение и период полужизни в сыворотке, могут быть легко измерены и количественно определены с использованием хорошо известных иммунологических методов без ненужных экспериментов.
В некоторых вариантах осуществления иммунная эффекторная клетка содержит рецептор клеточной поверхности для иммуноглобулина или другой пептид-связывающей молекулы, такой как рецептор для константной области иммуноглобулина, и включает класс рецепторов, обычно называемых Fcрецепторами (FcR). Ряд FcR был структурно и/или функционально охарактеризован и известен в данной области техники, включая FcR, обладающий специфическими способностями взаимодействовать с ограниченным подмножеством изотипов тяжелой цепи иммуноглобулина, или которые взаимодействуют с доменами Fc с различной аффинностью, и/или которые может быть экспрессирован на ограниченных подмножествах иммунных эффекторных клеток при определенных условиях (например, KijimotoOchichai et al., Cell Mol. Life. Sci. 59: 648 (2002); Davis et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol. 266: 85 (2002); Pawankar, Curr. Opin. Allerg. Clin. Immunol. 1: 3 (2001); Radaev et al., Mol. Immunol. 38: 1073 (2002); Wurzburg et al., Mol. Immunol. 38: 1063 (2002); Sulica et al., Int. Rev. Immunol. 20: 371 (2001); Underhill et al., Ann. Rev. Immunol. 20: 825 (2002); Coggeshall, Curr. Dir. Autoimm. 5: 1 (2002); Mimura et al., Adv. Exp. Med. Biol. 495: 49 (2001); Baumann et al., Adv. Exp. Med. Biol. 495: 219 (2001); Santoso et al., Ital. Heart J. 2: 811 (2001); Novak et al., Curr. Opin. Immunol. 13: 721 (2001); Fossati et al., Eur. J. Clin. Invest. 31: 821 (2001)); содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме.
Клетки, которые способны опосредовать АЗКЦ, являются примерами иммунных эффекторных клеток. Другие иммунные эффекторные клетки включают естественные клетки-киллеры, инфильтрирующие опухоль Т-лимфоциты (TIL), цитотоксические Т-лимфоциты и гранулоцитарные клетки, такие как клетки, которые содержат механизмы аллергического ответа. Таким образом, иммунные эффекторные клетки включают, без ограничения, клетки гематопоэтического происхождения, включая клетки на различных стадиях дифференцировки в миелоидных и лимфоидных линиях и которые могут (но не обязательно) экспрессировать один или более типов FcR функциональной клеточной поверхности, таких как Т лимфоциты, В-лимфоциты, NK-клетки, моноциты, макрофаги, дендритные клетки, нейтрофилы, базофилы, эозинофилы, тучные клетки, тромбоциты, эритроциты и предшественники, предшественники (например, гематопоэтические стволовые клетки), а также покоящиеся, активированные и зрелые формы таких клеток. Другие иммунные эффекторные клетки могут включать клетки негематопоэтического происхождения, которые способны опосредовать иммунные функции, например, эндотелиальные клетки, кератиноциты, фибробласты, остеокласты, эпителиальные клетки и другие клетки. Иммунные эффекторные клетки могут также включать клетки, которые опосредуют цитотоксические или цитостатические события, или эндоцитические, фагоцитарные или пиноцитотические события, или которые влияют на индукцию апоптоза, или которые влияют на микробный иммунитет или нейтрализацию микробной инфекции, или клетки, которые опосредуют аллергическую, воспалительную, гиперчувствительность и/или аутоиммунные реакции.
Слитые белки DDpp с увеличенным периодом полужизни
Раскрытый DDpp может быть слит или образовывать комплекс со вторым пептидным доменом, увеличивающим время полужизни или стабильность DDpp.
- 42 043660
В одном аспекте DDpp дополнительно содержит одну или более аминокислот, которые облегчают синтез, обработку или использование пептида, включая, без ограничения, один или два лизина на Nконце и/или С-конце для увеличения растворимости полипептида. Подходящие слитые белки включают, без ограничения, белки, содержащие DDpp, связанный с одним или более полипептидами, полипептидными фрагментами или аминокислотами, которые обычно не считаются частью последовательности белка. В одном аспекте слитый пептид содержит полные аминокислотные последовательности двух или более пептидов или, альтернативно, содержит части (фрагменты) двух или более пептидов. В некоторых аспектах пептид (например, белок S-связывающий пептид) функционально связан, например, с одним или более из следующих компонентов: маркерный белок, пептид, который облегчает очистку, пептидная последовательность, которая способствует образованию мультимерных белков, или фрагмент любого из вышеперечисленного. Подходящие партнеры по слиянию включают, без ограничения, His-метку, FLAGметку, strep-метку и myc-метку.
В некоторых вариантах осуществления DDpp слит с одним или более фрагментами, которые увеличивают период полужизни полипептида. Период полужизни может быть увеличен, например, путем увеличения молекулярной массы DDpp, чтобы избежать почечного клиренса и/или включения связывающего домена для FcRn-опосредованного пути рециркуляции. В одном варианте осуществления DDpp слит или химически конъюгирован с полипептидом альбумина или его фрагментом (например, сывороточным альбумином человека (HSA)). В конкретных вариантах осуществления слитый или химически конъюгированный фрагмент альбумина содержит 10%, 2 %, 50% или 75% полноразмерного белка альбумина. В дополнительных или альтернативных вариантах осуществления DDpp сливается или образует комплекс с альбумин-связывающим доменом или жирной кислотой, которая связывает альбумин при введении in vivo. Примером альбумин-связывающего домена является albu-метка, фрагмент, полученный из 4-(пйодфенил)-бутановой кислоты (Dumelin et al., Angew Chem. Int. Ed Engl. 47: 3196-3201 (2008)).
В одном варианте осуществления DDpp слит или химически конъюгирован с полипептидом трансферрина или его фрагментом (например, человеческим трансферрином). В конкретных вариантах осуществления слитый или химически конъюгированный фрагмент трансферрина содержит 10%, 25%, 50% или 75% полноразмерного белка трансферрина. В дополнительных или альтернативных вариантах осуществления DDpp сливается или образует комплекс с доменом, связывающим трансферрин, который связывает трансферрин при введении in vivo.
В некоторых вариантах осуществления DDpp слит или химически конъюгирован с пролин-аланинсериновым мультимером (PASylation; XL-Protein GmbH), неточной повторяющейся пептидной последовательностью (XTENylation, rPEG), гомополимером остатков глицина (HAPylation), эластиноподобные повторяющиеся последовательности (последовательности) (ELPylation; см., например, заявку на патент США Appl. № 61/442,106, содержание которой полностью включено в данное описание посредством ссылки), искусственный GLK (слитый GLK; Huang et al., Eur. J. Pharm. Biopharm. 72: 435-41 (2010)), или пептид СТР из бета-субъединицы CG человека (слитый СТР).
Дополнительные слитые белки DDpp
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp специфически связывает ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и/или р26 AFP и дополнительно связывает связанный с заболеванием антиген. Связанный с заболеванием антиген может быть антигеном, характерным для рака и/или определенного типа клеток (например, гиперпролиферативной клетки) и/или патогена (например, бактериальной клетки (например, туберкулеза, оспы и сибирской язвы), вируса (например, ВИЧ), паразита (например, малярии и лейшманиоза), антигеном грибковой инфекции, микромицета, микоплазмы, прионным антигеном или антигеном, связанным с нарушением иммунной системы. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp конъюгирован с терапевтическим или цитотоксическим агентом.
В дополнительном варианте осуществления слитый белок DDpp связан с одной или более химическими составляющими (например, метками), которые облегчают обнаружение, мультимеризацию, связывание с партнером по взаимодействию или характеристику активности DDpp. Типичным химическим фрагментом является биотин. Другие фрагменты, подходящие для конъюгации с DDpp, включают, но не ограничиваются ими, фотосенсибилизатор, краситель, флуоресцентный краситель, радионуклид, радионуклидсодержащий комплекс, фермент, токсин и цитотоксический агент. Фотосенсибилизаторы включают, например, фотофрин, Visudyne, Levulan, Foscan, Metvix, Hexvix®, Cysview™, Laserphyrin, Antrin, Photochlor, Photosens, Photrex, Lumacan, Cevira, Visonac, BF-200 ALA и Amphinex. В дополнительных вариантах осуществления His-метка, FLAG-метка, strep-метка или myc-метка сопряжены с DDpp.
В другом варианте осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который связывает ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP, p26 AFP или их фрагмент и дополнительно связывает пептидную метку, присутствующую на представляющей интерес мишени. Такие пептидные метки обеспечивают полезное средство для обнаружения и/или прикрепления интересующих мишеней, содержащих пептидные метки. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp специфически связывает пептидную метку, выбранную из группы: гексагистидильная (His6) метка, myc-метка или FLAG-метка. Другие пептидные метки описаны в данном документе или иным образом известны в данной области техники.
- 43 043660
Слитые белки DDpp с эпитопной меткой
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит пептидную эпитопную метку. В некоторых вариантах осуществления пептидную метку выбирают из группы, состоящей из гексагистидильной (His6) метки, myc-метки и FLAG-метки. В дополнительных вариантах осуществления пептидные метки включают, без ограничения, ави-метку (обеспечивает биотинилирование метки и выделение стрептавидином), кальмодулин, Е-метку, гемагглютинин (НА), S-метку, SBP-метку, sof-метку 1, стрептавидин тетра или полицистеин, V5, VSV и Xpress-метку. Кроме того, могут быть использованы полигистидильные метки (отличные от 6 остатков). В дополнительных вариантах осуществления могут быть использованы ковалентные пептидные метки, белковые метки и тому подобное. Ковалентные пептидные метки включают, без ограничения, isopep-метка (ковалентно связывается с белком pilinC), Spy-метка (ковалентно связывается с белком SpyCatcher) и Snoop-метка (ковалентно связывается с белком SnoopCatcher). В дополнительных вариантах осуществления необязательно могут быть использованы белковые метки, включая, без ограничения, биотин-карбоксильный белок-носитель (ВССР), глутатион-sтрансферазу, зеленый флуоресцентный белок (или другой флуорофор), Halo-метку, Nus-метку, тиоредоксин и Fc-метки. В дополнительных вариантах осуществления могут использоваться несколько типов меток. В дополнительных вариантах осуществления метки не используются. В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит удаляемую метку. Может быть использована любая комбинация внеклеточных, трансмембранных и внутриклеточных доменов, раскрытых в данном документе, в зависимости от варианта осуществления.
Линкеры DDpp
Термины линкер и спейсер используются в данном документе взаимозаменяемо для обозначения пептидной или другой химической связи, которая функционирует для связывания в противном случае независимых функциональных доменов. В одном варианте осуществления линкер в DDpp расположен между DDpp и другим полипептидным компонентом, содержащим независимый в остальном функциональный домен. Подходящие линкеры для связывания двух или более связанных DDpp будут понятны специалистам в данной области техники и обычно могут быть любым линкером, используемым в данной области техники для связывания пептидов, белков или других органических молекул. В конкретных вариантах осуществления такой линкер подходит для конструирования белков или полипептидов, которые предназначены для фармацевтического применения.
Подходящие линкеры для функционального связывания DDpp и дополнительного компонента слитого белка DDpp в одноцепочечной аминокислотной последовательности включают, без ограничения, полипептидные линкеры, такие как глициновые линкеры, сериновые линкеры, смешанные глицин/сериновые линкеры, богатые глицином и серином линкеры или линкеры, состоящие в основном из полярных полипептидных фрагментов.
В одном варианте осуществления линкер состоит из большинства аминокислот, выбранных из глицина, аланина, пролина, аспарагина, глутамина и лизина. В одном варианте осуществления линкер состоит из большинства аминокислот, выбранных из глицина, аланина, пролина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, треонина, глутамина и лизина. В одном варианте осуществления линкер слитого белка DDpp состоит из одной или более аминокислот, выбранных из глицина, аланина, пролина, аспарагина, глутамина и лизина. В одном варианте осуществления линкер слитого белка DDpp состоит из одной или более аминокислот, выбранных из глицина, аланина, пролина, аспарагина, аспартата, треонина, глутамина и лизина. В другом варианте осуществления линкер слитого белка DDpp состоит из большинства аминокислот, которые являются стерически незатрудненными. В другом варианте осуществления раскрыт линкер, в котором большинство аминокислот представляют собой глицин, серин и/или аланин. В некоторых вариантах осуществления пептидный линкер выбирают из полиглицинов (таких как (Gly)5 (SEQ ID NO: 975) и (Gly)8 (SEQ ID NO: 976), поли(Oly-Ala), и полиаланины. В некоторых вариантах осуществления пептидный линкер содержит последовательность Gl·y-Gl·y-Gl·y-Gl·y-Thr-Gl·y-Gl·y-Gl·y-Gl·y-Ser (SEQ ID NO: 4). В некоторых вариантах осуществления пептидный линкер содержит последовательность GlyGly-Gly-Gly-Asp-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (SEQ ID NO: 5).
В одном варианте осуществления слитый DDpp содержит DDpp, непосредственно присоединенный (т.е. без линкера) к другому компоненту слитого белка DDpp. В одном варианте осуществления слитый DDpp содержит по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, DDpp, непосредственно присоединенный к другому компоненту слитого DDpp.
В другом варианте осуществления DDpp может быть функционально связан с другим компонентом слитого белка DDpp через линкер. Слитые белки DDpp могут содержать один линкер, несколько линкеров или не содержат линкеров. В одном варианте осуществления слитый DDpp содержит DDpp, функционально связанный с другим компонентом слитого белка DDpp через линкерный пептид. В одном варианте осуществления слитый DDpp содержит по меньшей мере 2, 3, 4 или 5 DD функционально связанных с другим компонентом слитого белка DDpp через линкерный пептид.
Линкеры могут быть любого размера или состава, если они способны оперативно связывать DDpp таким образом, который позволяет DDpp связывать представляющую интерес мишень, такую как ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления линкеры составляют от
- 44 043660 около 1 до около 100 аминокислот, от около 1 до 50 аминокислот, от около 1 до 20 аминокислот, от около 1 до 15 аминокислот, от около 1 до 10 аминокислот, от около 1 до 5 аминокислот кислоты, около от 2 до 20 аминокислот, около от 2 до 15 аминокислот, около от 2 до 10 аминокислот или около от 2 до 5 аминокислот. Должно быть понятно, что длина, степень гибкости и/или другие свойства линкера(ов) могут иметь некоторое влияние на свойства предложенных белков, содержащих DD, включая, без ограничения, аффинность, специфичность или авидность для представляющей интерес мишени или одного или более других белков-мишеней, представляющих интерес. Когда два или более линкера используются в слитых белках DDpp, эти линкеры могут быть одинаковыми или разными. В контексте и раскрытии, предложенном в данном документе, специалист в данной области техники сможет регулярно определять оптимальную композицию и длину линкера с целью функционального связывания DDpp и других компонентов слитого белка DDpp.
Линкер также может представлять собой непептидный линкер, такой как алкильный линкер или ПЭГ-линкер. Например, могут быть использованы алкильные линкеры, такие как -NH-(CH2)s-C(0)-, где s=2-20. Эти алкильные линкеры могут быть дополнительно замещены любой не стерически затрудненной группой, такой как низший алкил, например, С1-С6) низший ацил, галоген (например, Cl, Br), CN, NH2, фенил, и т.д. Иллюстративный непептидный линкер представляет собой ПЭГ-линкер. В некоторых вариантах осуществления ПЭГ-линкер имеет молекулярную массу от около 100 до 5000 кДа или от около 100 до 500 кДа.
Подходящие линкеры для связывания компонентов слитого белка DDpp путем химического сшивания включают, без ограничения, гомобифункциональные химические сшивающие соединения, такие как глутаровый альдегид, имидоэфиры, такие как диметиладипимидат (DMA), диметилсуберимидат (DMS) и диметилпимелимидат (DMP) или N-гидроксисукцинимид (NHS), такие как дитиобис (сукцинимидилпропионат) (DSP) и дитиобис (сульфосукцини-мидилпропионат) (DTSSP). Примеры подходящих линкеров для связывания компонентов слитого белка DDpp гетеро-бифункциональных реагентов для перекрестного сшивания включают, без ограничения, сшивающие линкеры с одним аминореактивным концом и сульфгидрильно-реактивным фрагментом на другом конце или с эфиром NHS на одном конце и SHреактивной группой (например, малеимид или пиридил).
В дополнительных вариантах осуществления один или более линкеров в слитом белке DDpp являются расщепляемыми. Примеры расщепляемых линкеров включают, без ограничения, последовательность пептида, распознаваемую протеазами (in vitro или in vivo) различного типа, такими как Tev, тромбин, фактор Ха, плазмин (протеазы крови), металлопротеазы, катепсины (например, GFLG, и т.д.), и протеазы, найденные в других компартментах тела.
В одном варианте осуществления линкер представляет собой расщепляемый линкер, который облегчает высвобождение DDpp или цитотоксического агента в клетке. Например, кислотолабильный линкер (например, гидразон), протеазочувствительный (например, чувствительный к пептидазе) линкер, фотолабильный линкер, диметиловый линкер или дисульфидсодержащий линкер (Chari, Can. Res. 52: 127131 (1992); патент США № 5208020, публ. заявки США публикации № 20090110753; содержимое каждого из которых включено в данное описание в качестве ссылки в полном объеме) может использоваться, когда желательно, чтобы ковалентное присоединение между DDpp или цитотоксическим агентом и партнером по слиянию внутриклеточно расщеплялось, когда композиция интернализуется в клетку. Термины внутриклеточно расщепляемый и внутриклеточное расщепление относятся к метаболическому процессу или реакции внутри клетки на конъюгат лекарственное средство-DDpp, в результате чего ковалентное прикрепление, то есть связывание через линкер между DDpp и цитотоксическим агентом, DDpp и партнером по слиянию, или между двумя DDpp приводит к высвобождению DDpp, и/или цитотоксического агента, диссоциированных внутри клетки.
Оптимизация линкера может быть оценена с использованием методик, описанных в данном документе и/или иным образом известных в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления линкеры не нарушают способность DDpp связывать молекулу-мишень и/или другой компонент слитого белка DDpp, такой как домен или фрагмент антитела, связывать антиген.
DDpp как химические конъюгаты
Слитые белки DDpp, которые способствуют специфическому связыванию с представляющими интерес мишенями, могут быть химически конъюгированы с различными соединениями, такими как флуоресцентные красители, радиоизотопы, хроматографические композиции (например, шарики, смолы, гели и т.д.) и химиотерапевтические агенты. Конъюгаты DDpp имеют применение, которое включает, без ограничения, диагностические, аналитические, производственные и терапевтические применения.
Присущий недостаток цистеинов в последовательности DD обеспечивает возможность введения уникальных цистеинов для целей сайт-специфической конъюгации.
В некоторых вариантах осуществления DDpp (например, слитый белок DDpp) содержит по меньшей мере один реактивный остаток. Реактивные остатки применимы, например, в качестве сайтов для присоединения конъюгатов, таких как химиотерапевтические препараты. Реакционноспособным остатком может быть, например, цистеин, лизин или другой реакционноспособный остаток. Таким образом, цистеин может быть добавлен к DDpp на N- или С-конце или в последовательности DDpp. Цистеин мо
- 45 043660 жет быть заменен другой аминокислотой в последовательности DDpp. Кроме того, лизин может быть добавлен к DDpp на любом конце или в последовательности DDpp, и/или лизин может быть заменен другой аминокислотой в последовательности DDpp. В одном варианте осуществления реакционноспособный остаток (например, цистеин, лизин и т.д.) расположен в последовательности петли DD (например, аминокислотные остатки 22-24 и 46-49 SEQ ID NOS: 11-949 и 950). В одном варианте осуществления реактивный остаток расположен между компонентами слитого белка DDpp, например, в линкере, расположенном между DDpp и другим компонентом слитого белка DDpp. Реактивный остаток (например, цистеин, лизин и т.д.) также может быть расположен в последовательности DDpp или другого компонента слитого белка DDpp. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp или DDpp содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два, по меньшей мере три реакционноспособных остатка. В одном варианте осуществления DDpp такой, как слитый белок DDpp содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или по меньшей мере три остатка цистеина.
DDpp, связывающий ВСМА
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает ВСМА. В других вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает ВСМА, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 7. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306.
В некоторых вариантах осуществления связывающий ВСМА DDpp содержит множество доменов связывания мишени, которые связывают одну мишень (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связывают ВСМА и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связываются с различными эпитопами ВСМА и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые специфически связываются с ВСМА или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает ВСМА (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит вариант раскрытого в данном документе связывающего ВСМА DD (эталонный DD), который сохраняет способность специфически связывать ВСМА. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим ВСМА DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен по сравнению с эталонным связывающим ВСМА DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим
- 46 043660
ВСМА DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ
ID NO: 11-305 и 306.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего ВСМА DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного BCMA-DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего ВСМА DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного связывающего ВСМА DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего ВСМА DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий ВСМА DDpp, который полностью или частично (например, перекрывается с эпитопом) блокирует связывание эталонного DD с ВСМА, причем эталонный DD имеет аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий ВСМА DDpp, который связывается с тем же эпитопом ВСМА, что и эталонный DD, состоящий из аминокислотной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 11-305 и 306.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает ВСМА. В некоторых вариантах осуществления DD специфически связывает белок ВСМА, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 7. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp, связывающий ВСМА, содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или часть (фрагмент) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело, которое специфически связывается с раковым антигеном. В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В других вариантах осуществления связывающий ВСМА DDpp представляет собой слитый белок Fc. В других вариантах осуществления белок Fc содержит вариант домена Fc человека.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит связывающий ВСМА DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11305 и 306. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP или р26 AFP или их фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP (например, SEQ ID NO: 9) или их фрагмента. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит р26 AFP (SEQ ID NO: 10) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полипептид, имеющий последовательность SEQ ID NO: 10, 968, 969, 970, 971, 972,
- 47 043660
973 или 974. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент белка сыворотки или антигенный фрагмент белка сыворотки (например, AFP и р26 AFP). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100,
5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-10о или 10-50 аминокислот сывороточного белка.
В некоторых вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен CD123 (SEQ ID NO: 8) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 1050 аминокислот внеклеточного домена рецептора клеточной поверхности. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7), CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37; TSLPR, IL7R и gp96.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В других вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306. В некоторых вариантах осуществления связывающий ВСМА слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков внутриклеточного белка (например, ядерного белка).
DDpp, связывающий CD123
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает CD123. В других вариантах осуществления DD специфически связывает CD123, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 8. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: SEQ ID NO: 307-739 и 740.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 DDpp содержит множество доменов связывания мишени, которые связывают одну мишень (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связывают CD123 и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связываются с различными эпитопами CD123 и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123 и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые специфически связываются с CD123 или другим антигеноммишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307- 48 043660
739 и 740) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307739 и 740) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CD123 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит вариант раскрытого в данном документе связывающего CD123 DD (эталонный DD), который сохраняет способность специфически связывать CD123. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим CD123 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен по сравнению с эталонным связывающим CD123 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим CD123 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего CD123 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 4307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 122, 29-46 и 52-72 эталонного CD123-DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего CD123 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного связывающего CD123 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CD123 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий CD123 DDpp, который полностью или частично (например, перекрывается с эпитопом) блокирует связывание эталонного DD с CD123, причем эталонный DD имеет аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий CD123 DDpp, который связывается с тем же эпитопом CD123, что и эталонный DD, состоящий из аминокислотной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 307-739 и 740.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает CD123. В некоторых вариантах осуществления DD слитого белка DDpp специфически связывает CD123, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 8. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полно
- 49 043660 размерное антитело или часть (фрагмент) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело, которое специфически связывается с раковым антигеном. В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В других вариантах осуществления связывающий CD123 DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий связывающий CD123 DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий CD123 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит весь или часть человеческого сывороточного альбумина. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP (SEQ ID NO: 9) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит р26 AFP (SEQ ID NO: 10) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит полипептид, имеющий последовательность SEQ ID NO: 10, 968, 969, 970, 971, 972, 973 или 974. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент белка сыворотки или антигенный фрагмент белка сыворотки (например, AFP и р26 AFP). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-10о или 10-50 аминокислот сывороточного белка.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен CD123 (SEQ ID NO: 8) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 1050 аминокислот внеклеточного домена рецептора клеточной поверхности. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена CD123 (SEQ ID NO: 8). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена CS1 (SEQ ID NO: 965). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37; TSLPR, IL7R и gp96.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В других вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740. В некоторых вариантах осуществления связывающий CD123 слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков внутриклеточного белка (например, ядерного белка).
DDpp, связывающий CS1
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает CS1. В других вариантах осуществления DD специфически связывает CS1, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 965. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 DDpp содержит множество доменов связывания мишени, которые связывают одну мишень (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связывают CS1 и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD,
- 50 043660 которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связываются с различными эпитопами CS1 и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1 и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые специфически связываются с CS1 или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности Вклетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает CS1 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит вариант раскрытого в данном документе связывающего CS1 DD (эталонный DD), который сохраняет способность специфически связывать CS1. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим CS1 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен по сравнению с эталонным связывающим CS1 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 15 или 1-10 неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим CS1 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего CS1 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 110 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 5272 эталонного CS1-DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего CS1 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного связывающего CS1 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариан- 51 043660 тах осуществления последовательность варианта связывающего CS1 DD содержит в общей сложности 1,
2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59,
61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий CS1 DDpp, который полностью или частично (например, перекрывается с эпитопом) блокирует связывание эталонного DD с CS1, причем эталонный DD имеет аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий CS1 DDpp, который связывается с тем же эпитопом CS1, что и эталонный DD, состоящий из аминокислотной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 896-909 и 910.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает CS1. В некоторых вариантах осуществления DD слитого белка DDpp специфически связывает CS1, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 965. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или часть (фрагмент) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело, которое специфически связывается с раковым антигеном. В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В других вариантах осуществления связывающий CS1 DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий связывающий CS1 DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий CS1 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит весь или часть человеческого сывороточного альбумина. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP (SEQ ID NO: 9) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит р26 AFP (SEQ ID NO: 10) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит полипептид, имеющий последовательность SEQ ID NO: 10, 968, 969, 970, 971, 972, 973 или 974. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент белка сыворотки или антигенный фрагмент белка сыворотки (например, AFP и р26 AFP). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислот сывороточного белка.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен CS1 (SEQ ID NO: 965) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD 19, CD20, Cd22, HvEm, BTLA, DR3, CD37, TsLpR, Il7r и gp96, или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислот внеклеточного домена рецептора клеточной поверхности. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена CD123 (SEQ ID NO: 8). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена CS1 (SEQ ID NO: 965). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37; TSLPR, IL7R и gp96.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, вы- 52 043660 бранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В других вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910. В некоторых вариантах осуществления связывающий CS1 слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков внутриклеточного белка (например, ядерного белка).
DDpp, связывающий HER2
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает HER2. В других вариантах осуществления DD специфически связывает HER2, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 967. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950.
В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 DDpp содержит множество доменов связывания мишени, которые связывают одну мишень (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связывают HER2 и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связываются с различными эпитопами HER2 и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2 и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые специфически связываются с HER2 или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911949 и 950) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает HER2 (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит вариант раскрытого в данном документе связывающего HER2 DD (эталонный DD), который сохраняет способность специфически связывать HER2. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим HER2 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен по сравнению с эталонным связывающим HER2 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим HER2 DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего HER2 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из груп
- 53 043660 пы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного HER2-DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего HER2 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного связывающего HER2 DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего HER2 DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий HER2 DDpp, который полностью или частично (например, перекрывается с эпитопом) блокирует связывание эталонного DD с HER2, причем эталонный DD имеет аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий HER2 DDpp, который связывается с тем же эпитопом HER2, что и эталонный DD, состоящий из аминокислотной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 911-949 и 950.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает HER2. В некоторых вариантах осуществления DD слитого белка DDpp специфически связывает HER2, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 967. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело или часть (фрагмент) антитела. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело, которое специфически связывается с раковым антигеном. В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В других вариантах осуществления связывающий HER2 DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий связывающий HER2 DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывающий HER2 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит весь или часть человеческого сывороточного альбумина. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит AFP (SEQ ID NO: 9) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит р26 AFP (SEQ ID NO: 10) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит полипептид, имеющий последовательность SEQ ID NO: 10, 968, 969, 970, 971, 972, 973 или 974. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент белка сыворотки или антигенный фрагмент белка сыворотки (например, AFP и р26 AFP). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-10о или 10-50 аминокислот сывороточного белка.
В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоя
- 54 043660 щей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен HER2 (SEQ ID NO: 967) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 1050 аминокислот внеклеточного домена рецептора клеточной поверхности. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена CD123 (SEQ ID NO: 8). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена CS1 (SEQ ID NO: 965). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37; TSLPR, IL7R и gp96.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В других вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950. В некоторых вариантах осуществления связывающий HER2 слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков внутриклеточного белка (например, ядерного белка).
DDpp, связывающий AFP
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает AFP или его фрагмент. В других вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9, или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В дополнительных вариантах осуществления связывающий AFP DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления связывающий AFP DDpp содержит множество доменов связывания мишени, которые связывают одну мишень (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связывают AFP и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связываются с различными эпитопами AFP и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые специфически связываются с AFP или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp со- 55 043660 держит DD, который специфически связывает AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит вариант раскрытого в данном документе связывающего AFP DD (эталонный DD), который сохраняет способность специфически связывать AFP. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим AFP DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен по сравнению с эталонным связывающим AFP DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим AFP DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего AFP DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 4741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного AFP-DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 2946 и 52-72 эталонного связывающего AFP DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного связывающего AFP DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий AFP DDpp, который полностью или частично (например, перекрывается с эпитопом) блокирует связывание эталонного DD с AFP, причем эталонный DD имеет аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 741 873 и 874. В других вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий AFP DDpp, который связывается с тем же эпитопом AFP, что и эталонный DD, состоящий из аминокислотной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 741 873 и 874.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает AFP. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий связывающий AFP DD, который является вариантом DD, содержащим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает AFP, функционально связанный с полноразмерным антителом или частью (фрагментом) антитела. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый
- 56 043660 белок Fc. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело, которое специфически связывается с раковым антигеном. В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В других вариантах осуществления связывающий AFP DDpp представляет собой слитый белок Fc.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий связывающий AFP DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент белка сыворотки или антигенный фрагмент белка сыворотки. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислот сывороточного белка.
В некоторых вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или их фрагмента. В других вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7), CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислот внеклеточного домена рецептора клеточной поверхности. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD 19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37; TSLPR, IL7R и gp96.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления связывающий AFP слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков внутриклеточного белка (например, ядерного белка).
DDpp, связывающий р26 AFP
В некоторых вариантах осуществления DD в DDpp специфически связывает р26 AFP. В других вариантах осуществления DD DDpp специфически связывает р26 AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886895. В дополнительных вариантах осуществления связывающий р26 AFP DDpp содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления связывающий р26 AFP DDpp содержит множество доменов связывания мишени, которые связывают одну мишень (например, димеры, тримеры и т.д.). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связывают р26 AFP и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые имеют одинаковые последовательности. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 DD, которые специфически связываются с различными эпитопами р26 AFP и которые имеют аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специ
- 57 043660 фически связывает р26 AFP и дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5 дополнительных различных DD или доменов связывания мишени (например, scFv), которые специфически связываются с р26 AFP или другим антигеном-мишенью. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более антигенов, экспрессируемых на поверхности В-клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895), и дополнительно содержит один или более дополнительных DD или других доменов связывания мишени, связывающих один или более раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных мишеней. В других вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 различных раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит DD, который специфически связывает р26 AFP (например, DD, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895) и специфически связывает 2, 3, 4, 5 или более 5 раковых антигенов, экспрессируемых на поверхности различных раковых клеток.
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит вариант раскрытого в данном документе связывающего р26 AFP DD (эталонный DD), который сохраняет способность специфически связывать р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим р26 AFP DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 13, 1-5 или 1-10 консервативных замен по сравнению с эталонным связывающим р26 AFP DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен по сравнению с эталонным связывающим р26 AFP DD, имеющим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего р26 AFP DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 4741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего р26 AFP DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам с 1-22, 29-46 и 52-72 эталонного связывающего р26 AFP DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных или неконсервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного связывающего р26 AFP DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 консервативных замен в положениях, соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41, 43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления последовательность варианта связывающего р26 AFP DD содержит в общей сложности 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, 1-3, 1-5 или 1-10 неконсервативных замен в положениях,
- 58 043660 соответствующих аминокислотным остаткам: 2-6, 8-10, 12, 13, 15-17, 19, 20, 29, 30, 32-34, 36, 37, 39-41,
43, 44, 52-55, 57-59, 61, 62, 64-66 и 68-70, эталонного DD, имеющего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий р26 AFP DDpp, который полностью или частично (например, перекрывается с эпитопом) блокирует связывание эталонного DD с р26 AFP, причем эталонный DD имеет аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 741 873 и 874. В других вариантах осуществления в данном изобретении предложен связывающий р26 AFP DDpp, который связывается с тем же эпитопом р26 AFP, что и эталонный DD, состоящий из аминокислотной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 741 873 и 874.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает р26 AFP. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает р26 AFP, имеющий аминокислотную последовательность, состоящую из SEQ ID NO: 9. В других вариантах осуществления DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий связывающий р26 AFP DD, который является вариантом DD, содержащим аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий DD, который специфически связывает р26 AFP, функционально связанный с полноразмерным антителом или частью (фрагментом) антитела. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок Fc. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело IgG (например, IgG1, IgG2, IgG2 или IgG4). В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит полноразмерное антитело, которое специфически связывается с раковым антигеном. В других вариантах осуществления DDpp содержит коммерчески одобренное терапевтическое антитело (например, ритуксимаб, офатумумаб, окрелизумаб, вельтузумаб, MEDI-551, эпратузумаб, белимумаб, табалумаб, AMG-557, MEDI-570 и NN882). В других вариантах осуществления связывающий р26 AFP DDpp представляет собой слитый белок Fc. В других вариантах осуществления слитый белок Fc содержит вариант домена Fc человека.
В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой слитый белок, содержащий связывающий р26 AFP DD, функционально связанный с сывороточным белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp, связывающий р26 AFP, содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит человеческий сывороточный альбумин или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент белка сыворотки или антигенный фрагмент белка сыворотки. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислот сывороточного белка.
В некоторых вариантах осуществления связывающий р26 AFP слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp, связывающий р26 AFP, содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления связывающий р26 AFP слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или их фрагмента. В других вариантах осуществления связывающий р26 AFP слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965) или их фрагмента. В некоторых вариантах осуществления связывающий р26 AFP слитый белок DDpp содержит внеклеточный домен рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37, TSLPR, IL7R и gp96, или их фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления связывающий р26 AFP слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5-200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 1050 аминокислот внеклеточного домена рецептора клеточной поверхности. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8). В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена ВСМА (SEQ ID NO: 7) или CD123 (SEQ ID NO: 8) или CS1 (SEQ ID NO: 965). В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, HVEM, BTLA, DR3, CD37; TSLPR, IL7R и gp96.
В дополнительных вариантах осуществления связывающий р26 AFP слитый белок DDpp содержит внутриклеточный белок (например, ядерный белок) или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp содержит DD, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В других вариантах осуществления
- 59 043660 слитый белок DDpp, связывающий р26 AFP, содержит вариант аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 741-874 и 886-895. В некоторых вариантах осуществления связывающий р26 AFP слитый белок DDpp содержит фрагмент, состоящий из 5-500, 5-400, 5-300, 5200, 5-100, 5-50, 10-500, 10-400, 10-300, 10-200, 10-100 или 10-50 аминокислотных остатков внутриклеточного белка (например, ядерного белка).
Также предложены нуклеиновые кислоты, кодирующие DDpp и векторы, содержащие нуклеиновые кислоты. Также предложены клетки-хозяева (включая вирусные частицы), содержащие нуклеиновые кислоты и векторы. В некоторых вариантах осуществления клетка-хозяин представляет собой прокариотическую или эукариотическую клетку, которая презентирует вариант DD на своей поверхности. В некоторых вариантах осуществления клетка-хозяин презентирует вариант DD на своей поверхности. В дополнительном варианте осуществления клетка-хозяин представляет собой фаг, который презентирует вариант DD на своей поверхности. В дополнительном варианте осуществления клетка-хозяин представляет собой иммунную клетку человека, которая экспрессирует вариантный слитый белок DD на своей поверхности.
Агонист DDpp относится к DDpp, который каким-то образом увеличивает или усиливает биологическую активность мишени DDpp или обладает биологической активностью, сравнимой с известным агонистом мишени DDpp. В другом варианте осуществления DDpp является антагонистом мишени, которую он связывает. Антагонист DDpp относится к DDpp, который полностью или частично блокирует или каким-либо образом препятствует биологической активности белка-мишени DDpp или обладает биологической активностью, сравнимой с известным антагонистом или ингибитором белка-мишени DDpp.
Выражения, такие как аффинность связывания с мишенью, связывание с мишенью и тому подобные, относятся к свойству полипептида, которое может быть непосредственно измерено посредством определения констант аффинности, например, количества DDpp, которое ассоциирует и диссоциирует при определенной концентрации антигена. Для характеристики молекулярного взаимодействия могут быть использованы различные методы, включая анализ конкуренции, анализ равновесия и микрокалориметрический анализ, а также анализ взаимодействия в реальном времени на основе поверхностноплазмонного резонансного взаимодействия (например, с использованием прибора Biacore®). Эти способы известны специалисту в данной области техники и описаны, например, в Neri et al., Tibtech 14: 465470 (1996) и Jansson et al., J Biol Chem 272: 8189-8197 (1997).
Требования к аффинности для данного события связывания DDpp зависят от множества факторов, включая, без ограничения: состав и сложность матрицы связывания, валентность и плотность как DDpp, так и молекул-мишеней, а также функциональное применение DDpp. В одном варианте осуществления DDpp связывает представляющую интерес мишень (например, BCMA, CD123, AFP или р26 AFP) с константой диссоциации (KD), меньшей или равной 5x10’3 М, 10’3 М, 5х10’4 М, 10-4 М, 5x10’5 М или 10’5 М. В дополнительном варианте осуществления DDpp связывает представляющую интерес мишень с KD, меньшей или равной 5x10’6 М, 10’6 М, 5x10’7 М, 10’7 М, 5x10’8 М или 10’8М. В дополнительном варианте осуществления DDpp связывает представляющую интерес мишень с KD, меньшей или равной 5x10’9 М, 10’9 М, 5x10’10 М, 10’10 М, 5x10’11 М, 10’11 М, 5x10’12 М, 10’12 М, 5x10’13 М, 10’13 М, 5x10’14 М, 10’14 М, 5x10’15 М или 10’15 М. В нескольких вариантах осуществления предложенный DDpp имеет константу диссоциации, выбранную из группы: от 10’4 М до 10’5 М, от 10’5 М до 10’6 М, от 10’6 М до 10’7 М, от 10’7 М до 10’8 М, от 10’8 М до 10’9 М, от 10’9 М до 10’10 М, от 10’10 М до 10’11 М и от 10’11 М до 10’12 М.
В некоторых вариантах осуществления DDpp связывает представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, AFP или р26 AFP) в активной форме. В одном варианте осуществления DDpp обратимо связывает представляющую интерес мишень в активной форме, а также освобождает связанную мишень в активной форме. В некоторых вариантах осуществления DDpp связывает представляющую интерес мишень в нативной форме. В конкретных вариантах осуществления DDpp связывает представляющую интерес мишень со скоростью диссоциации или Koff, большей или равной 10’10 сек’1, 5χ10’9сек’1, 10’9 сек’1, 5x10’8 сек’1, 10’8 сек’1, 5x10’7 сек’1, 10’7 сек’1, 5x10’6 сек’1, 10’6 сек’1, 5x10’5 сек’1, 10’5 сек’1, 5x10’4 сек’1, 10’4 сек’1, 5x10’3 сек’1, 10’3 сек’1, 5x10’2 сек’1, 10’2 сек’1, 5x10’1 сек’1 или 10’1 сек’1.
Эксперименты по связыванию для определения KD и скорости диссоциации могут быть выполнены в ряде условий, включая, без ограничения, [рН 6,0, 0,01% Tween 2], [рН 6,0, 0,1% желатин], [рН 5,0, 0,01% Tween 2], [рН 9,0, 0,1 % Tween 2], [рН 6,0, 15% этиленгликоль, 0,01% Tween 2], [рН 5,0, 15% этиленгликоль, 0,01% Tween 2] и [рН 9,0, 15% этиленгликоль, 0,01% Tween 2]. Буферы, в которых можно приготовить эти растворы, могут быть легко определены специалистом в данной области техники и в значительной степени зависят от желаемого рН конечного раствора. Растворы с низким рН (<рН 5,5) могут быть приготовлены, например, в цитратном буфере, буфере глицин-HCl или в буфере янтарной кислоты. Растворы с высоким рН можно приготовить, например, в трис-HCl, фосфатных буферах или бикарбонатных буферах натрия. Специалист в данной области техники обычно может использовать ряд условий для определения KD и скоростей диссоциации с целью определения, например, оптимальных значений рН и/или концентрации соли.
- 60 043660
В одном варианте осуществления DDpp специфически связывает представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, AFP или р26 AFP) с KOff в диапазоне от 0,1 до 10-7 сек-1, от 10-2 до 10-7 сек-1 или от 0,5х10-2 до 10-7 сек-1. В конкретном варианте осуществления DDpp (например, слитый белок DDpp) связывает представляющую интерес мишень со скоростью диссоциации (KOff) менее чем 5х10-2 сек-1, 10-2 сек-1, 5х10-3 сек-1 или 10-3 сек-1. В дополнительном варианте осуществления DDpp связывает представляющую интерес мишень со скоростью диссоциации (KOf) менее, чем 5 х10-4 сек-1, 10-4 сек-1, 5х10-5 сек-1 или 10-5 сек-1, 5х10-6 сек-1, 10-6 сек-1, 5х10-7 сек-1 или 10-7 сек-1.
В одном варианте осуществления DDpp специфически связывает представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, AFP или р26 AFP) с KOn в диапазоне от 103 до 107 М-1 сек-1, от 103 до 1о6 М-1 сек-1, или от 103 до 105 М-1 сек-1. В конкретном варианте осуществления DDpp (например, слитый белок DDpp) связывает представляющую интерес мишень со скоростью ассоциации (KOn) более чем 103 М-1 сек-1, 5х103 М-1 сек-1, 104 М-1 сек-1 или 5х104 М-1 сек-1. В дополнительном варианте осуществления DDpp связывает представляющую интерес мишень с KOn более, чем 105 М-1 сек-1, 5х105 М-1 сек-1, 106 М-1 сек-1 или 5х106 М-1 сек-1 или 107 М-1 сек-1.
Молекулы нуклеиновых кислот, кодирующие раскрытый DDpp, включены в данный документ, как и векторы, содержащие эти нуклеиновые кислоты, клетки-хозяева, содержащие эти векторы нуклеиновых кислот, и способы получения слитых белков DDpp-альбумин и применение этих нуклеиновых кислот, векторов и/или клеток-хозяев. Изобретение также охватывает фармацевтические составы, содержащие слитый белок DDpp-альбумин и фармацевтически приемлемый разбавитель или носитель. Такие составы могут быть использованы в способах лечения, профилактики, улучшения или диагностики заболевания или симптома заболевания у пациента, предпочтительно млекопитающего, наиболее предпочтительно человека, включающих этап введения фармацевтического состава пациенту.
Получение DDpp
Раскрытый DDpp может быть обычно получен с использованием коммерчески доступных реагентов и методик, известных в данной области техники. В одном варианте осуществления DDpp синтезируют способами твердофазного синтеза, известными в данной области техники, такими как, Merrifield, J. Am. Chem. Soc. 85: 2149 (1963); Davis et al., Biochem. Intl. 10: 394-414 (1985); Larsen et al., J. Am. Chem. Soc. 115: 6247 (1993); Smith et al., J. Peptide Protein Res. 44: 183 (1994); O'Donnell et al., J. Am. Chem. Soc. 118: 6070 (1996); Stewart and Young, Solid Phase Peptide Synthesis, Freeman (1969); Finn et al., The Proteins, 3.sup.rd ed., 2: 105-253 (1976) и Erickson et al., The Proteins, 3.sup.rd ed., 2: 257-527 (1976). В данном изобретении рассматриваются синтетические пептиды. В качестве альтернативы, пептид экспрессируется рекомбинантно путем введения нуклеиновой кислоты, кодирующей раскрытый DDpp, в клетки-хозяева, которые культивируют для экспрессии пептида. Такие пептиды очищают от культуральной среды или клеточного дебриса.
Получение DDpp, пригодного для практического применения предложенных способов, может быть осуществлено с использованием различных стандартных методов химического синтеза, полусинтетических методов и методик рекомбинантных ДНК, известных в данной области техники. Также предложен способ получения DDpp, индивидуально или как часть многодоменного слитого белка, в качестве растворимых агентов и белков, ассоциированных с клетками.
Необязательно, эталонная последовательность и/или модифицированные полипептиды (например, DDpp) могут быть де-иммунизированы. Например, остатки или мотивы, которые являются потенциально иммуногенными, могут быть идентифицированы и модифицированы для уменьшения или элиминирования потенциальных иммунных ответов на DDpp. Дополнительные подробности, относящиеся к различным вариантам изготовления, выбора и выделения DDpp, представлены более подробно ниже.
Рекомбинантная экспрессия DDpp
В некоторых вариантах осуществления DDpp, такой как слитый белок DDpp, рекомбинантно продуцируется, (т.е., продуцируется с использованием технологии рекомбинантных ДНК). Иллюстративные рекомбинантные способы, доступные для синтеза слитых белков DDpp, включают, без ограничения, синтез на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР), конкатемеризацию, бесшовное клонирование и лигирование в обратном направлении. (RDL) (см., например, Meyer et al., Biomacromolecules 3: 357-367 (2002); Kurihara et al., Biotechnol. Lett. 27: 665-670 (2005); Haider et al., Mol. Pharm. 2: 139-150 (2005) и McMillan et al., 32: 3643-3646 (1999), содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме.
Также предложены нуклеиновые кислоты, содержащие полинуклеотидную последовательность, кодирующую DDpp. Такие полинуклеотиды необязательно дополнительно содержат один или более элементов контроля экспрессии. Например, полинуклеотид может содержать один или более промоторов или энхансеров транскрипции, сайты связывания рибосом, сигналы терминации транскрипции и сигналы полиаденилирования в качестве элементов контроля экспрессии. Полинуклеотид может быть вставлен в любой подходящий вектор, который может содержаться в любой подходящей клетке-хозяине для экспрессии.
Экспрессия нуклеиновых кислот, кодирующих DDpp, обычно достигается путем функционального
- 61 043660 связывания нуклеиновой кислоты, кодирующей DDpp, с промотором в векторе экспрессии. Типичные векторы экспрессии содержат терминаторы транскрипции и трансляции, последовательности инициации и промоторы, пригодные для регуляции экспрессии желаемой последовательности нуклеиновой кислоты. Способы, известные в данной области техники, могут быть использованы для обычного конструирования векторов экспрессии, содержащих последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую DDpp, вместе с соответствующими сигналами контроля транскрипции/трансляции. Эти методы включают, без ограничения, методы рекомбинантной ДНК in vitro, методы синтеза и рекомбинацию in vivo/генетическую рекомбинацию. Экспрессия полинуклеотида может быть осуществлена в любом подходящем хозяине экспрессии, известном в данной области техники, включая, без ограничения, бактериальные клетки, клетки дрожжей, клетки насекомых, клетки растений или клетки млекопитающих. В одном варианте осуществления последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая DDpp, функционально связана с подходящей последовательностью промотора, так что последовательность нуклеиновой кислоты транскрибируется и/или транслируется в DDpp у хозяина. Промоторы, пригодные для экспрессии в E.coli, включают, без ограничения, промотор Т7.
В одном варианте осуществления вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую DDpp, вводят в клетку-хозяина (например, фагмиду) для экспрессии DDpp. Вектор может оставаться эписомальным или становиться хромосомно интегрированным до тех пор, пока вставка, кодирующая терапевтический агент, может быть транскрибирована. Векторы могут быть сконструированы с помощью стандартной технологии рекомбинантных ДНК. Векторами могут быть плазмиды, фаги, космиды, фагмиды, вирусы или любые другие типы, известные в данной области техники, которые используются для репликации и экспрессии в прокариотических или эукариотических клетках. Специалисту в данной области техники будет понятно, что в такие векторы может быть включено широкое разнообразие компонентов, известных в данной области техники (таких как элементы управления экспрессией), включая широкий спектр сигналов транскрипции, таких как промоторы и другие последовательности, которые регулируют связывание РНК-полимеразы с промотором. Любой промотор, известный или продемонстрированный как эффективный в клетках, в которых будет экспрессироваться вектор, может быть использован для инициации экспрессии DDpp. Подходящие промоторы могут быть индуцибельными (например, регулируемыми) или конститутивными. Неограничивающие примеры подходящих промоторов включают область раннего промотора SV40, промотор, содержащийся в 3'-длинном концевом повторе вируса саркомы Рауса, промотор тимидинкиназы HSV-1 (вирус простого герпеса-1), регуляторные последовательности гена металлотионеина и т.д., а также следующие области контроля транскрипции животных, которые проявляют тканевую специфичность и были использованы у трансгенных животных: область контроля гена эластазы I, которая активна в ацинарных клетках поджелудочной железы; область контроля гена инсулина, которая активна в бета-клетках поджелудочной железы, область контроля вируса опухоли молочной железы мыши, которая активна в клетках яичка, молочной железы, лимфоидных клеток и тучных клеток, область контроля гена альбумина, которая активна в печени, область контроля гена альфафетопротеина, которая активна в печени, область контроля гена альфа-1-антитрипсина, которая активна в печени, область контроля гена бета-глобина, которая активна в эритроидных клетках, область контроля гена основного белка миелина, которая активна в клетках олигодендроцитов в мозге, область контроля гена легких цепей миозина 2, которая активна в скелетных мышцах, и область контроля генов гонадотропин-высвобождающего-гормона, которая активна в гипоталамусе. В конкретном варианте осуществления промотор представляет собой область контроля гена иммуноглобулина, которая активна в лимфоидных клетках.
В одном варианте осуществления одна или более нуклеиновых кислот, кодирующих DDpp, экспрессируются под контролем конститутивного промотора или, альтернативно, регулируемой системы экспрессии. Подходящие системы регулируемой экспрессии включают, без ограничения, систему экспрессии, регулируемую тетрациклином, систему экспрессии, индуцируемую экдизоном, систему экспрессии с лактозным переключателем, систему экспрессии, индуцируемую глюкокортикоидами, систему индуцируемых температурой промоторов и металлотионеиновую металл -индуцируемую систему экспрессии. Если в системе клеток-хозяев содержится несколько различных нуклеиновых кислот, кодирующих DDpp, некоторые из нуклеиновых кислот могут экспрессироваться под контролем конститутивного промотора, тогда как другие могут экспрессироваться под контролем регулируемого промотора. Уровни экспрессии могут быть определены способами, известными в данной области техники, включая вестерн-блот анализ и нозерн-блот анализ.
Для экспрессии нуклеиновой кислоты, кодирующей DDpp, можно использовать множество векторных систем экспрессии хозяина. Векторы, содержащие нуклеиновые кислоты, кодирующие DDpp (например, самостоятельные субъединицы DD или слитые DDpp) или их части или фрагменты, включают плазмидные векторы, одноцепочечные и двухцепочечные фаговые векторы, а также одноцепочечные и двухцепочечные вирусные векторы РНК или ДНК. Фаговые и вирусные векторы также могут быть введены в клетки-хозяева в форме упакованного или инкапсулированного вируса с использованием известных методов заражения и трансдукции. Кроме того, вирусные векторы могут быть компетентными в отношении репликации или, альтернативно, дефектными в отношении репликации. Альтернативно, бес- 62 043660 клеточные трансляционные системы также могут быть использованы для получения белка с использованием РНК, полученных из экспрессирующих конструкций ДНК (см., например, WO86/05807 и
WO89/01036, и патент США № 5122464, каждая из которых включена в данный документ в полном объеме посредством ссылки).
Как правило, любой тип клеток или культивируемой клеточной линии может быть использован для экспрессии DDpp, предложенного в данном документе. В некоторых вариантах осуществления фоновая клеточная линия, используемая для создания сконструированных клеток-хозяев, представляет собой фаг, бактериальную клетку, дрожжевую клетку или клетку млекопитающего. Для экспрессии кодирующей последовательности слитого белка DDpp может использоваться множество векторных систем экспрессии хозяина. Клетки млекопитающих можно использовать в качестве систем клеток-хозяев, трансфицированных рекомбинантными плазмидными ДНК или векторами экспрессии космидной ДНК, содержащими кодирующую последовательность представляющей интерес мишени и кодирующей последовательности слитого полипептида.
Клетки могут быть первичными изолятами организмов (включая человека), культурами или клеточными линиями трансформированной или трансгенной природы. В некоторых вариантах осуществления клетка-хозяин представляет собой клетку человека. В некоторых вариантах осуществления клеткахозяин представляет собой Т- клетку человека В некоторых вариантах осуществления клетка-хозяин получена от пациента-человека.
Пригодные клетки-хозяева включают, без ограничения, микроорганизмы, такие как бактерии (например, Е. coli и В. subtilis), трансформированные рекомбинантной ДНК бактериофага, векторы экспрессии плазмидной ДНК или космидной ДНК, содержащие последовательности, кодирующие DDpp; дрожжи (например, Saccharomyces, Pichia), трансформированные рекомбинантными дрожжевыми векторами экспрессии, содержащими последовательности, кодирующие DDpp; системы клеток насекомых, инфицированные рекомбинантными векторами экспрессии вирусов (например, Baculovirus), содержащие кодирующие последовательности DDpp; системы растительных клеток, инфицированные рекомбинантными векторами экспрессии вирусов (например, вирус мозаики цветной капусты, CaMV; вирус табачной мозаики, TMV) или трансформированные рекомбинантными плазмидными векторами экспрессии (например, Ti-плазмида), содержащими кодирующие последовательности DDpp. В конкретных вариантах осуществления системы клеток млекопитающих используются для получения DDpp. В клеточных системах млекопитающих обычно используются рекомбинантные экспрессионные конструкции, содержащие промоторы, полученные из генома клеток млекопитающих (например, металлотионеиновый промотор) или из вирусов млекопитающих (например, поздний промотор аденовируса; промотор вируса коровьей оспы 7,5K).
Прокариоты, пригодные в качестве клеток-хозяев при получении DDpp, такого как слитый белок DDpp, включают грамотрицательные или грамположительные организмы, такие как, Е. coli и В. subtilis. Векторы экспрессии для использования в прокариотических клетках-хозяевах обычно содержат один или более фенотипически селектируемых маркерных генов (например, гены, кодирующие белки, обеспечивающие устойчивость к антибиотикам или обеспечивающие автотрофную потребность). Примеры пригодных прокариотических экспрессирующих векторов-хозяев включают серии векторов pKK223-3 (Pharmacia, Uppsala, Sweden), pGEMl (Promega, Wis., USA), pET (Novagen, Wis., USA) и pRSET (Invitrogen, Calif., USA) (см., например, Studier, J. Mol. Biol. 219: 37 (1991) и Schoepfer, Gene 124: 83 (1993)). Типичные последовательности промотора, часто используемые в векторах экспрессии прокариотических клеток-хозяев, включают Т7, (Rosenberg et al., Gene 56: 125-135 (1987)), промотор бета-лактамазы (пенициллиназы), промоторную систему лактозы (Chang et al., Nature 275: 615 (1978)) и Goeddel et al., Nature 281: 544 (1979)), триптофановую (trp) промоторную систему (Goeddel et al., Nucl. Acids Res. 8: 4057 (1980)) и промотор tac (Sambrook et al., 1990, Molecular Cloning, ALaboratory Manual, 2d Ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.).
В одном варианте осуществления используют системы эукариотических клеток-хозяев, включая дрожжевые клетки, трансформированные рекомбинантными дрожжевыми векторами экспрессии, содержащими кодирующую последовательность DDpp, такими как системы экспрессии, описанные в заявке США. № 60/344169 и WO 03/056914 (способы получения человекоподобного гликопротеина в эукариотической клетке-хозяине, отличной от клетки человека) (содержание каждого из которых включено в качестве ссылки в полном объеме). Иллюстративные дрожжи, которые можно использовать для получения предложенных композиций, таких как DD, включают дрожжи из родов Saccharomyces, Pichia, Actinomycetes и Kluyveromyces. Дрожжевые векторы обычно содержат точку начала репликации последовательности из 2mu дрожжевой плазмиды, автономно реплицирующуюся последовательность (ARS), область промотора, последовательности для полиаденилирования, последовательности для терминации транскрипции и селектируемый маркерный ген. Примеры последовательностей промотоов в дрожжевых экспрессирующих конструкциях включают промоторы из металлотионеина, 3-фосфоглицераткиназы (Hitzeman, J. Biol. Chem. 255: 2073 (1980)) и других гликолитических ферментов, таких как енолаза, глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа, гексокиназа, пируватдекарбоксилаза, фосфофруктокиназа, глюкозо-6-фосфат-изомераза, 3-фосфоглицерат мутаза, пируваткиназа, триозофосфазо-фосфозо-изомераза,
- 63 043660 фосфоизофосфоизомераза. Дополнительные подходящие векторы и промоторы для использования в экспрессии дрожжей, а также протоколы трансформации дрожжей известны в данной области техники. См., например, Fleer, Gene 107: 285-195 (1991) и Hinnen, PNAS 75: 1929 (1978).
Системы культивирования на основе клеток насекомых и растений также пригодны для получения композиций по изобретению. Такие системы клеток-хозяев включают, например, системы клеток насекомых, инфицированные векторами экспрессии рекомбинантных вирусов (например, бакуловируса), содержащие кодирующую последовательность DD; системы растительных клеток, инфицированные векторами экспрессии рекомбинантного вируса (например, вирусом мозаики цветной капусты, CaMV; вирусом табачной мозаики, TMV) или трансформированные векторами экспрессии рекомбинантной плазмиды (например, Ti-плазмидой), содержащей кодирующую последовательность DD, включая, без ограничения, системы экспрессии, раскрытые в пат. США № 6815184, публ. заявки США № 60/365769 и 60/368047, и WO 04/057002, WO 04/024927, и WO 03/078614, содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме.
В дополнительном варианте осуществления могут использоваться системы клеток-хозяев, включая системы клеток животных, инфицированные векторами экспрессии рекомбинантных вирусов (например, аденовирусы, ретровирусы, аденоассоциированные вирусы, вирусы герпеса, лентивирусы), включая клеточные линии, сконструированные так, чтобы они содержали несколько копий ДНК, кодирующей DDpp, либо стабильно амплифицируемой (CHO/dhfr), либо нестабильно амплифицируемой в двухминутных хромосомах (например, мышиные клеточные линии). В одном варианте осуществления вектор, содержащий полинуклеотид(ы), кодирующий DDpp, является полицистронным. Иллюстративные клетки млекопитающих, пригодные для получения этих композиций, включают клетки 293 (например, 293Т и 293F), клетки СНО, клетки ВНК, клетки NS0, клетки SP2/0, клетки миеломы YO, клетки миеломы мыши Р3Х63, клетки PER, клетки PER.C6 (Crucell, Нидерланды) VERY, клетки Hela, клетки COS, клетки MDCK, клетки ЗТЗ, клетки W138, клетки ВТ483, клетки Hs578T, клетки НТВ2, клетки ВТ20, клетки T47D, клетки CRL7O30, клетки HsS78Bst, клетки гибридомы и другие клетки млекопитающих. Дополнительные иллюстративные клетки-хозяева млекопитающих, которые применимы при практическом применении предложенных вариантов осуществления, включают, без ограничения, Т-клетки. Некоторые примеры систем экспрессии и методов выбора описаны в следующих ссылках и ссылках, приведенных в них: Borth et al., Biotechnol. Bioen. 71(4): 266-73 (2000) в Werner et al., Arzneimittel-forschung/Drug Res. 48(8): 870-80 (1998), Andersen et al., Curr. Op. Biotechnol. 13: 117-123 (2002), Chadd et al., Curr. Op. Biotechnol. 12: 188-194 (2001) и Giddings, Curr. Op. Biotechnol. 12: 450-454 (2001). Дополнительные примеры систем экспрессии и методов отбора описаны в Logan et al., PNAS 81: 355-359 (1984), Birtner et al., Methods Enzymol. 153: 51-544 (1987)). Последовательности контроля транскрипции и трансляции для векторов экспрессии клеток-хозяев млекопитающих часто происходят из вирусных геномов. Обычно используемые промоторные последовательности и энхансерные последовательности в векторах экспрессии млекопитающих включают последовательности, полученные из вируса полиомы, аденовируса 2, вируса симана 40 (SV40) и цитомегаловируса человека (CMV). Иллюстративные коммерчески доступные векторы экспрессии для использования в клетках-хозяевах млекопитающих включают рСЕР4 (Invitrogen) и pcDNA3 (Invitrogen).
Физические способы введения нуклеиновой кислоты в клетку-хозяина (например, клетку-хозяина млекопитающего) включают осаждение фосфатом кальция, липофекцию, бомбардировку частицами, микроинъекцию, электропорацию и тому подобное. Способы получения клеток содержащих векторы и/или экзогенные нуклеиновые кислоты хорошо известны в данной области техники. См., например, Sambrook et al. (2001, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York).
К биологическим способам введения представляющего интерес полинуклеотида в клетку-хозяин относится использование векторов ДНК и РНК. Вирусные векторы и особенно ретровирусные векторы стали наиболее широко используемым способом внедрения генов в клетки млекопитающих (например, клетки человека). Другие вирусные векторы могут быть получены из лентивируса, поксвируса, вируса простого герпеса I типа, аденовирусов и аденоассоциированных вирусов и т.п. См., например, патенты США № 5350674 и 5585362, содержание каждого из которых включено в данный документе в качестве ссылки в полном объеме.
Способы введения представляющих интерес полинуклеотидов ДНК и РНК в клетку-хозяина включают электропорацию клеток, при которой к клеткам применяют электрическое поле, чтобы увеличить проницаемость клеточной мембраны, позволяя химическим веществам, лекарственным средствам или полинуклеотидам вводиться в клетку. Конструкции ДНК или РНК, содержащие DDpp, могут быть введены в клетки млекопитающих или прокариотические клетки с помощью электропорации.
В предпочтительном варианте электропорация клеток приводит к экспрессии DDpp-CAR на поверхности Т-клеток, NK-клеток, NKT-клеток. Такая экспрессия может быть временной или стабильной в течение жизни клетки. Электропорацию можно проводить способами, известными в данной области техники, включая системы трансфекции MaxCyte GT® и STX® (MaxCyte, Гейтерсберг, штат Мэриленд, США).
К химическим способам введения полинуклеотида в клетку-хозяина относятся системы коллоидной дисперсии, такие как макромолекулярные комплексы, нанокапсулы, микросферы, гранулы, и системы на
- 64 043660 основе липидов, включая эмульсии масло-в-воде, мицеллы, смешанные мицеллы и липосомы. Примером коллоидной системы, используемой в качестве средства доставки in vitro и in vivo, является липосома (например, искусственная мембранная везикула). В случае использования невирусной системы доставки примером средства доставки является липосома. Предусмотрено использование липидных составов для введения нуклеиновых кислот в клетку-хозяина (in vitro, ex vivo или in vivo). В другом аспекте нуклеиновая кислота может быть связана с липидом. Нуклеиновая кислота, связанная с липидом, может быть инкапсулирована в водном внутреннем пространстве липосомы, рассеяна по липидному бислою липосомы, присоединена к липосоме посредством линкерной молекулы, которая связана как с липосомой, так и с олигонуклеотидом, заключена в липосоме, связана в комплекс с липосомой, диспергирована в растворе, содержащем липид, смешана с липидом, объединена с липидом, может содержаться в виде суспензии в липиде, содержатся или быть связана в комплекс с мицеллой или любым другим образом связана с липидом. Композиции, связанные с липидом, липидом/ДНК или липидом/вектором экспрессии, не ограничиваются какой-либо конкретной структурой в растворе. Например, они могут присутствовать в бислойной структуре, такой как мицеллы, или иметь разрушенную структуру. Также они могут быть просто рассеяны в растворе, предположительно образуя агрегаты, не имеющие одинаковых размера или формы. Липиды представляют собой жиры, которые могут быть природными или синтетическими липидами. Например, липиды включают в себя жировые капли, которые встречаются естественным образом в цитоплазме, и также класс соединений, которые содержат длинноцепочечные алифатические углеводороды и их производные, такие как жирные кислоты, спирты, амины, аминоспирты и альдегиды.
Подходящие для использования липиды можно получить из коммерческих источников. Например, димиристоилфосфатидилхолин (DMPC) можно получить от компании Sigma, Сент-Луис, штат Миссури; дицетилфосфат (DCP) можно получить от компании K & K Laboratories (Плейнвью, штат НьюЙорк); холестерин (Choi) можно получить от компании Calbiochem-Behring; димиристоилфосфатидилглицерин (DMPG) и другие липиды можно получить от компании Avanti Polar Lipids, Inc. (Бирмингем, штат Алабама). Исходные растворы липидов в хлороформе или хлороформе/метаноле можно хранить приблизительно при температуре -20°С. Хлороформ может быть использован в качестве единственного растворителя, поскольку он легче испаряется, чем метанол. Липосома представляет собой общий термин, охватывающий различные однослойные и многослойные липидные носители, получаемые посредством образования заключенных липидных бислоев или агрегатов. Липосомы можно охарактеризовать, как содержащие везикулярные структуры с фосфолипидной бислойной мембраной и внутренней водной средой. Многослойные липосомы содержат много липидных слоев, разделенных водной средой. Они образуются спонтанно, когда фосфолипиды суспендируют в избытке водного раствора. Липидные компоненты подвергаются самоперестройке до образования замкнутых структур и захватывают воду и растворенные вещества между липидными бислоями (Ghosh et al., Glycobiology 5: 505-510 (1991)). Однако также охватываются композиции, которые имеют структуры в растворе, отличные от нормальной везикулярной структуры. Например, липиды могут принимать мицеллярную структуру или существовать только в виде неоднородных агрегатов липидных молекул. Также предусмотрены комплексы липофектамин-нуклеиновая кислота.
Независимо от способа, используемого для введения экзогенных нуклеиновых кислот в клеткухозяина, или наличия рекомбинантной последовательности нуклеиновой кислоты в клетке-хозяине обычно можно подтвердить с помощью различных анализов, известных в данной области техники. Такие анализы включают в себя, например, молекулярно-биологические анализы, хорошо известные в данной области техники, такие как саузерн- и нозерн-блоттинг, ОТ-ПЦР и ПЦР; биохимические анализы, такие как выявление наличия или отсутствия конкретного пептида, например, иммунологическими способами (ИФА и вестерн-блоттинги) или путем анализов, описываемых в настоящем документе, для идентификации веществ, входящих в объем предложенных вариантов осуществления.
Репортерные гены используются для идентификации потенциально трансфицированных клеток и для оценки функциональности регуляторных последовательностей. В целом, репортерный ген представляет собой ген, который не присутствует или не экспрессируется в реципиентном организме, ткани или клетке, и который кодирует полипептид, экспрессия которого проявляется каким-либо легко определяемым свойством, например, ферментной активностью. Экспрессию репортерного гена анализируют в подходящее время после введения ДНК в реципиентные клетки. Неограничивающий перечень подходящих репортерных генов может включать гены, кодирующие люциферазу, бета-галактозидазу, хлорамфеникол-ацетилтрансферазу, секретируемую щелочную фосфатазу или ген зеленого флуоресцентного белка (например, Ui-Tei et al., FEBS Lett. 479: 79-82 (2000)). Подходящие системы экспрессии известны в данной области техники и могут быть получены, используя известные методики, или приобретены на коммерческой основе. В целом, конструкция с минимальным 5' фланкирующим участком, демонстрирующая самый высокий уровень экспрессии репортерного гена, идентифицируется как промотор. Такие промоторные участки могут обычно быть связаны с репортерным геном и использоваться для оценки способности веществ модулировать активированную промотором транскрипцию.
Ряд систем селекции можно использовать в системах экспрессии вектора-хозяина млекопитающего, включая, без ограничения, тимидинкиназу вируса простого герпеса, генов гипоксантин- 65 043660 гуанинфосфорибозилтрансферазы и аденинфосфорибозилтрансферазы (Lowy et al., Cell 22: 817 (1980)), которые могут быть использованы в клетках tk-, hgprt- или aprt-, соответственно. Кроме того, устойчивость к антиметаболитам может быть использована в качестве основы для отбора систем например, dhfr, gpt, neo, hygro, trpB, hisD, ODC (орнитин декарбоксилаза) и глутамин-синтаза.
Экспрессия ассоциированного с клетками DDpp
В другом варианте продуцирование DDpp приводит к композициям ассоциированного с клетками DDpp. Например, экспрессия рекомбинантных векторов, которые кодируют DDpp, функционально связанный с якорным или трансмембранным доменом клеточной мембраны, потенциально может оставаться ассоциированной с клеткой. Химерные антигенные рецепторы, содержащие DDpp, намеренно связаны с клеткой и используются в контексте клетки, в которой они экспрессируются. Один конкретный вариант осуществления относится к стратегии переноса адоптивных клеток Т-клеток, которые были трансдуцированы для экспрессии DDpp химерного антигенного рецептора (CAR). Предпочтительно, клетка может быть генетически модифицирована, чтобы стабильно экспрессировать DDpp на своей поверхности, придавая новую специфичность к мишени, которая не зависит от ГКГС.
Множество векторов, полученных из вируса, можно использовать в тех случаях, когда вирусы используются для трансфекции и интеграции в геном клетки млекопитающего. Вирусы, используемые в качестве векторов, включают, но не ограничиваются этим, ретровирусы, аденовирусы, аденоассоциированные вирусы, вирусы герпеса и лентивирусы. Лентивирусные векторы особенно подходят для достижения долгосрочного переноса гена (например, адоптивной Т-клеточной иммунной терапии), поскольку они обеспечивают долговременную стабильную интеграцию трансгена и его размножение в дочерних клетках. Лентивирусные векторы обладают дополнительным преимуществом перед векторами, полученными из онкоретровирусов, таких как вирусы лейкоза мышей, в том отношении, что они могут трансдуцировать неразмножающиеся клетки, такие как гепатоциты. Они также обладают дополнительным преимуществом низкой иммуногенности. В основном, подходящий вектор содержит сайт начала репликации, функциональный по меньшей мере в одном организме, промоторную последовательность, подходящие участки узнавания рестрикционных эндонуклеаз и один или более селектируемых маркеров (например, WO 01/96584 и WO 01/29058, и патент США № 6326193). Несколько векторных промоторных последовательностей доступны для экспрессии трансгенов. Одним примером подходящего промотора является последовательность немедленно раннего промотора цитомегаловируса (ЦМВ). Эта последовательность промотора является последовательностью сильного конститутивного промотора, способной стимулировать высокие уровни экспрессии любой полинуклеотидной последовательности, функционально с ней связанной. Другим примером подходящего промотора является EF1a. Однако могут также использоваться и другие последовательности конститутивного промотора, включая, помимо прочего, ранний промотор вируса обезьян 40 (SV40), промотор вируса опухоли молочной железы мышей (MMTV), промотор длинных концевых повторов (ДКП) вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), промотор MoMuLV, промотор вируса лейкоза птиц, немедленно ранний промотор вируса Эпштейна- Барр, промотор вируса саркомы Рауса, а также промоторы человеческого гена, такие как, помимо прочего, промотор актина, промотор миозина, промотор гемоглобина и промотор креатинкиназы. Индуцируемые промоторы включают, без ограничения, металлотионеиновый промотор, глюкокортикоидный промотор, прогестероновый промотор и тетрациклиновый промотор.
Чтобы оценить экспрессию полипептида DDpp-CAR или его частей, вектор экспрессии, вводимый в клетку, может также содержать выбираемый маркерный ген, репортерный ген или и тот, и другой, чтобы способствовать идентификации и выбору экспрессирующих клеток из популяции клеток, которые необходимо подвергнуть трансфекции или инфицировать вирусными векторами, в других аспектах селектируемый маркер может быть нанесен на отдельный фрагмент ДНК и использован в процедуре котрансфекции. Как селективные маркеры, так и репортерные гены могут быть фланкированы соответствующими регуляторными последовательностями, чтобы обеспечить экспрессию в клетке-хозяине. К пригодным для использования селективным маркерам относятся, например, устойчивые к антибиотикам гены, такие как пео и т.п.
До размножения и генетической модификации Т-клеток источник Т-клеток получают от субъекта. Т-клетки могут быть получены из ряда источников, включая мононуклеарные клетки периферической крови, костный мозг, ткань лимфатических узлов, пуповинную кровь, ткань вилочковой железы, ткань области инфекции, асциты, плевральный выпот, ткань селезенки и опухоли. В различных вариантах осуществления может использоваться любое количество линий Т-клеток, доступных в данной области техники.
Полное обсуждение способов выделения, культивирования, активации и размножения Т-клеток можно найти в WO/12079000, содержание которой полностью включено в данное описание посредством ссылки.
Дополнительно предложенаклетка-хозяин, содержащая нуклеиновые кислоты, кодирующие DDpp, описанные в данном документе. Также предложены композиции, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую DDpp.
Используемый в данном документе термин коэкспрессируется относится к одновременной экс- 66 043660 прессии двух или более кодирующих белок последовательностей. Кодирующими последовательностями могут быть нуклеиновые кислоты, кодирующие, например, один белок или химерный белок в виде одной полипептидной цепи.
Химический синтез DDpp
В дополнение к рекомбинантным способам, изготовление DDpp также может быть осуществлено с использованием органического химического синтеза желаемого полипептида с использованием различных жидких и твердофазных химических процессов, известных в данной области техники. Различные автоматические синтезаторы являются коммерчески доступными и могут использоваться в соответствии с известными протоколами. См., например, Tam et al., J. Am. Chem. Soc. 105: 6442 (1983); Merrifield, Science 232: 341-347 (1986); Barany and Merrifield, The Peptides, Gross and Meienhofer, eds, Academic Press, New York, 1- 284; Barany et al., Int. J. Pep. Protein Res. 30: 705-739 (1987); Kelley et al. in Genetic Engineering Principles and Methods, Setlow, J. K., ed. Plenum Press, NY. 1990, vol. 12, pp. 1-19; Stewart et al., SolidPhase Peptide Synthesis, W.H. Freeman Co., San Francisco, 1989. Одним из преимуществ данных методологий является то, что они допускают включение не встречающихся в природе аминокислотных остатков в последовательность DDpp.
DDpp, которые используются в описанных в данном документе способах, могут быть модифицированы во время или после синтеза или трансляции, например, путем гликозилирования, ацетилирования, бензилирования, фосфорилирования, амидирования, пегилирования, формилирования, дериватизации известными защитными/блокирующими группами, протеолитического расщепления, связи с молекулой антитела, гидроксилирования, йодирования, метилирования, миристоилирования, окисления, пегилирования, протеолитической обработки, фосфорилирования, пренилирования, рацемизации, селеноилирования, сульфатирования, убиквитинирования и т.д. (см., например, Creighton, Proteins: Structures and Molecular Properties, 2d Ed. (W.H. Freeman and Co., N.Y., 1992); Postranslational Covalent Modification of Proteins, Johnson, ed. (Academic Press, New York, 1983), pp. 1-12; Seifter, Meth. Enzymol. 182: 626-646 (1990); Rattan, Ann. NY Acad. Sci. 663: 48-62 (1992).) В конкретных вариантах осуществления пептиды являются ацетилированными на N-конце и/или амидированными на С-конце.
В данном изобретении также предложены производные DDpp и включают полипептиды, которые были химически модифицированы каким-либо образом, отличным от добавления, делеции или замены аминокислот. В этом отношении DDpp химически связан с полимерами, липидами, другими органическими фрагментами и/или неорганическими фрагментами. Иллюстративные модификации полипептидов приведены в Hermanson, Bioconjugate Techniques, Academic Press, (1996). DDpp необязательно содержит функциональную группу, которая облегчает конъюгирование с другим фрагментом (например, пептидным фрагментом). Иллюстративные функциональные группы включают, без ограничения, производные изотиоцианата, изоцианата, ацилазида, сложного эфира NHS, сульфонилхлорида, альдегида, эпоксида, оксирана, карбоната, арилирующий агент, имидоэфира, карбодиимида, ангидрида, производные алкилгалогенидов (например, производные галоацетила), малеимид, азиридин, акрилоильные производные, арилирующие агенты, тиолдисульфидные обменные реагенты (например, пиридилдисульфиды или тиол TNB), диазоалкан, карбоксилдимайдазол, N, N-дисукцинилкарбонат, N-гидроксисукцинимидилхлорформиат и гидразы. Малеимид полезен, например, для создания DDpp, который связывает альбумин in vivo.
В некоторых вариантах осуществления DDpp ковалентно модифицируется для включения одного или более водорастворимых полимерных соединений. Водорастворимый полимер (или другой химический фрагмент) присоединен к любому аминокислотному остатку, хотя присоединение к N- или С-концу является предпочтительным в некоторых вариантах осуществления. Пригодные полимеры включают, без ограничения, ПЭГ (например, ПЭГ размером приблизительно 40 кДа, 30 кДа, 20 кДа, размером 10 кДа, 5 кДа или 1 кДа), полиоксиэтиленгликоль, полипропиленгликоль, монометокси-полиэтиленгликоль, декстран гидроксиэтилкрахмал, целлюлоза, поли-Щ-винилпирролидон) -полиэтиленгликоль, гомополимеры пропиленгликоля, сополимер полипропиленоксида/этиленоксида, полисиаловая кислота (PSA), полиоксиэтилированные полиолы (например, глицерин) и поливиниловый спирт, как а также смеси любого из вышеперечисленного. В одном варианте осуществления DDpp является пэгилированным. Фрагменты PEG доступны в различных формах, например, линейные или разветвленные. Для дальнейшего обсуждения растворимых в воде полимерных присадок см. патент США № 4640835, 4496689, 4301144, 4670417, 4791192 и 4179337. Другие фрагменты, пригодные для улучшения периода полужизни или стабильности пептида, описаны в данном документе и включают, например, альбумин (необязательно модифицированный для обеспечения конъюгации с DDpp), цепи жирных кислот (например, жирные кислоты С1218, такие как жирные кислоты С14) или дикарбоновые кислоты, такие как октадекан дикарбоновая кислота (oddc)), антитело или его фрагмент (например, Fc-часть антитела) и пролин-аланин-сериновые мультимеры.
В некоторых вариантах осуществления DDpp конъюгирован с фрагментом полиэтиленгликоля (ПЭГ), сывороточным альбумином человека (ЧСА), антителом или фрагментом антитела, гидроксиэтилкрахмалом, мультимером пролин-аланин-серин (PASylation), жирной кислотой С1218 или полисиаловой кислотой.
В некоторых вариантах осуществления DDpp ацилируют по N-концевой аминокислоте пептида. В другом аспекте DDpp амидируются по С-концевой аминокислоте полипептида. В еще одном дополни- 67 043660 тельном аспекте пептиды ацилированы по N-концевой аминокислоте пептида и амидированы по Сконцевой аминокислоте пептида.
В некоторых вариантах осуществления DDpp содержит одну или более модифицированных или непротеиногенных аминокислот или модифицированную линкерную группу (см., например, Grant, Synthetic Peptides: A User's Guide, Oxford University Press (1992)). Модифицированные аминокислоты включают, например, аминокислоты, в которых амино и/или карбоксильная группа заменена другой группой. Неограничивающие примеры включают модифицированные аминокислоты, включающие тиоамиды, мочевины, тиомочевины, ацилгидразиды, сложные эфиры, олефины, сульфонамиды, амиды фосфорной кислоты, кетоны, спирты, амиды бороновой кислоты, бензодиазепины и другие ароматические или неароматические гетероциклы (см., Estiarte et al., Burgers Medicinal Chemistry, 6.sup.th edition, Volume 1, Part 4, John Wiley & Sons, New York (2002)). Непротеиногенные аминокислоты включают, без ограничения, бета-аланин (Bal), норвалин (Nva), норлейцин (Me), 4-аминомасляную кислоту (гамма-Abu), 2аминоизомасляную кислоту (Aib), 6-аминогексановую кислоту (эпсилон-Ahx), орнитин (Orn), гидроксипролин (Hyp), таурин, саркозин, цитруллин (Cit), цистеиновую кислоту (Coh), циклогексилаланин (Cha), метионинсульфоксид (Мео), метионинсульфон (Моо), гомосерин-метиловый эфир (Hsm), пропаргилглицин (Eag), 5-фтортриптофан (5Fw), 6-фтортриптофан (6Fw), 3',4'-диметоксифенил-аланин (Ear), 3',4'дифторфенилаланин (Dff), 4'-фторфенил-аланин (Pff), 1-нафтил-аланин (1Ni), 2-нафтилаланин (2Ni), 1метилтриптофан (1Mw), пеницилламин (Pen), гомосерин (Hse), t-бутилглицин, t-бутилаланин, фенилглицин (Phg), бензотиенилаланин (Bta), L-гомо-цистеин (Hcy), N-метил-фенилаланин (Nmf), 2-тиенилаланин (Thi), 3,3-дифенилаланин (Ebw), L-альфа-t-бутилглицин (Tle), Bpa, гомофенилаланин (Hfe) и S-бензил-Lцистеин (Есе). Эти и другие непротеиногенные аминокислоты могут существовать в виде D- или Lизомеров. Примеры модифицированных линкеров включают, без ограничения, гибкий линкер 4,7,10триокса-1,13-тридеканедиамин (Ttds), глицин, 6-аминогексановая кислота, бета-аланин (Bal), пентиновая кислота (Pyn) и комбинации Ttds, глицина, 6-аминогексановой кислоты и Bal.
Любая из многочисленных химических модификаций может быть осуществлена известными способами, включая, без ограничения, ацетилирование, формилирование и т.д. Кроме того, производное может содержать одну или более неклассических аминокислот.
Таблица 1
Иллюстративные мишень-специфические связывающие DD
SEQID NO: Последовательность домена D Мишень ИФАсред
И MGS W YEF S WRLQ AIHQRLNALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRAYAAGIRG ALQAYRHN ВСМА 9,48683
12 MGSWHEFTWRLIAIQQRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRAYAAGIRH HLQAYRHN ВСМА 17,125
13 MGSWREFAWRLVAINSRLKALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRHYAASIRD GLQAYRHN ВСМА 9,66
14 MGSWHEFAWRLQAINQRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRHYAAHIRN GLQAYRHN ВСМА 13,14
- 68 043660
15 MGSWNEFAWRLTAIEQRLMALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRHYAAGIRD NLQAYRHN BCMA 18,28
16 MGSWTEFAWRLQAIHQRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRVYAAKIRI SLQAYRHN BCMA 18,71
17 MGSWIEFAWRLQAIHQRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLREYAANIRD SLQAYRHN BCMA 18,97
18 MGSWHEFTWRLVAIQQRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRKFAAKIRY ELQAYRHN BCMA 19,51
19 MGSWHEFTWRLIAIRERLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELREYAASIRNM LQAYRHN BCMA 12,99
20 MGS WIEF S WRLE AIRQRLQ ALGGSEAEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRSYAARIRQE LQAYRHN BCMA 9,92
21 MGSW VEF S WRLE AIRQRLQ ALGGSEAEL A A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRSYAARIRQ ELQAYRHN BCMA 19,14
22 MGS WVEF SWRLEAIRQRLT ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRKYAARIRG ELQAYRHN BCMA 21,3
23 MGSWVEFAWRLTAIDQRLSALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRFYAAKIRS HLQAYRHN BCMA 8,43
24 MGSWVEFAWRLEAIKQRLTALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRLYAAKIRR VLQAYRHN BCMA 8,9
25 MGSWVEFAWRLTAIHTRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRKYAAKIRK BCMA 6,08
- 69 043660
QLQAYRHN
26 MGSWTEFAWRLEAINQRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGKPEVEALRAYAAKIRT RLQAYRHN BCMA 15,1475
27 MGSWSEFAWRLEAIHQRLSALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRLFAAQIRE NLQAYRHN BCMA 18,04
28 MGSWNEFAWRLIAINQRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRHFAANIRN DLQAYRHN BCMA 11,53
29 MGSWTEFAWRLIAIDQRLMALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEILRELAAEIRFH LQAYRHN BCMA 8,55
30 MGSWSEFMNRLDAITYRLVALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRHYAAQIRD SLQAYRHN BCMA 12,9
31 MGSWTEFMERLDAISYRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRDYAAIIRN SLQAYRHN BCMA 9,87
32 MGSWAEFMDRLDAITYRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRGYAAIIRS ELQAYRHN BCMA 10,83
33 MGSWIEFQERLDAIFYRLHALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRDAAATIRRQ LQAYRHN BCMA 18,58
34 MGSWIEFQQRLDAIFYRLYALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRDMAAIIRKQ LQAYRHN BCMA 20,02
35 MGSWYEFQSRLDAIFYRLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREAAASIRTQ LQAYRHN BCMA 14,08
36 MGSWSEFIDRLDAITYRLFALGGSEAELAAFEK BCMA 10,18
- 70 043660
EIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRWYAGVIRE QLQAYRHN
37 MGSWSEFYDRLYAINQRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRWYAAFIR AQLQAYRHN BCMA 5,98
38 MGSWYEFYDRLDAIVHRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRWY AAMIR VRLQAYRHN BCMA 14,68
39 MGSWVEFQDRLEAITDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAAMIRV ILQAYRHN BCMA 8,87825
40 MGSWVEFQERLMAISDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRWQAAMIR YTLQAYRHN BCMA 6,7
41 MGSWFEFQHRLEAISMRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRWQAAYIR VVLQAYRHN BCMA 4,05
42 MGS WVEFQ SRLE AIATRLRALGGSE AEL A A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRWQAAWIR MMLQAYRHN BCMA 18,0075
43 MGSWEEFQYRLGAIAARLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRWQAAMIR FMLQAYRHN BCMA 3,H
44 MGSWYEFQVRLQAISWRLKALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNHEVEELRIQAALIRV MLQAYRHN BCMA 14,23
45 MGSWVEFRSRLEAISNRLRALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRTTAALIRVY LQAYRHN BCMA 3,04
46 MGSWVEFKARLEAISSRLTALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAALIRVY LQAYRHN BCMA 8,70714
- 71 043660
47 MGSWSEFYTRLEAINNRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYTAALIRIY LQAYRHN BCMA 3,66
48 MGSW AEF YHRLD AIS SRLR ALGGSE AELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYTAALIRIY LQAYRHN BCMA 4,31
49 MGSWTEFASRLVAIRQRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAAIIRV MLQAYRHN BCMA 7,99
50 MGSWSEFDQRLAAIYQRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAALIRV MLQAYRHN BCMA 7,72
51 MGSWVEFHNRLSAISDRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAALIRV MLQAYRHN BCMA 7,36
52 MGSWNEFEDRLSAISARLSALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAALIRVM LQAYRHN BCMA 4,09
53 MGSWVEFEYRLVAIFDRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYQAALIRV MLQAYRHN BCMA 7,63
54 MGSWVEFQGRLGAIHERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAALIRV FLQAYRHN BCMA 3,83429
55 MGSWYEFSMRLSAIWERLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYQAALIRF YLQAYRHN BCMA 7,12
56 MGSWTEF SQRLGAISERL Y ALGGSE AEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAALIRFM LQAYRHN BCMA 4,15
57 MGSWTEFHDRLEAITHRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAALLRV BCMA 5,79
- 72 043660
FLQAYRHN
58 MGSWTEFEHRLEAIAGRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAALIRF WLQAYRHN BCMA 6,34
59 MGSWTEFANRLEAINARLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFSAALIRV YLQAYRHN BCMA 6,42
60 MGSWEEFDRRLYAIARRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYQAALIRV WLQAYRHN BCMA 8,85
61 MGSWIEFHQRLEAIVTRLEALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYQAALIRVF LQAYRHN BCMA 8
62 MGSWSEFYDRLKAIADRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRTEAAIIRVY LQAYRHN BCMA 8,215
63 MGSWWEFEDRLSAIMERLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYRAAIIRV YLQAYRHN BCMA 10,39
64 MGSWVEFEERLAAIATRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRWRAAIIRV YLQAYRHN BCMA 16,29
65 MGSWSEFRGRLQAIHSRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYSAAIIRIY LQAYRHN BCMA 7,585
66 MGSWTEFRDRLGAIYHRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYQAAIIRV YLQAYRHN BCMA 6,7
67 MGSWVEFYHRLEAIRYRLSALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYVAAVIRY RLQAYRHN BCMA 7,8
68 MGSWVEFYDRLEAIRYRLSALGGSEAELAAFE BCMA 5,636
- 73 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYIAAVIRY RLQAYRHN
69 MGSWVEFYDRLAAIRKRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFRAALIRI WLQAYRHN BCMA 9,76
70 MGSWEEF SERLEAISIRLRALGGSEAEL AAFEKE IAAFESELQAYKGKGNPEVEELRVSAAIIRVWL QAYRHN BCMA 11,26
71 MGSWSEFSDRLHAISDRLQALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRIQAAIIRVWL QAYRHN BCMA 6,3725
72 MGSWIEFSHRLEAIVDRLGALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRNTAAIIRVYL QAYRHN BCMA 18,67
73 MGSWEEF SDRLE AILRRLD ALGGSE AEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRFAAAIIRVQ LQAYRHN BCMA 9,08
74 MGSWMEFSHRLDAIHERLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRFAAAIIRV QLQAYRHN BCMA 6,3
75 MGSWSEFQQRLHAIRTRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFEAAIIRV MLQAYRHN BCMA 11,615
76 MGSWYEFQNRLGAINRRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFEAAIIRV MLQAYRHN BCMA 4,68
77 MGS WQEFTGRLHAIRHRLE ALGGSE AEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFEAAYIRV WLQAYRHN BCMA 3,315
78 MGSWTEFDHRLGAIWERLVALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFHAAIIRIF LQAYRHN BCMA 9,54
- 74 043660
79 MGSWTEFHVRLSAIWDRLVALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFHAAIIRIV LQAYRHN BCMA 23,62
80 MGSWNEFDNRLQAIWDRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFHAAMIRI TLQAYRHN BCMA 9,87
81 MGSWTEFHERLQAIWFRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFRAAIIRLY LQAYRHN BCMA 12,0656
82 MGSWNEF SGRLT AIKDRLAALGGSEAEL A AFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRFRAAVIRL WLQAYRHN BCMA 3,39
83 MGSWVEFDERLVAIWFRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRARAAYIRI WLQAYRHN BCMA 8,96
84 MGSWSEFGQRLSAIWERLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRADAAFIRI WLQAYRHN BCMA 14,01
85 MGSWYEFEDRLVAIWIRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYNAAFIRG ALQAYRHN BCMA 4,93
86 MGSWYEFGDRLSAIWERLAALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRTHAAEIRTI LQAYRHN BCMA 8,895
87 MGSWHEFYYRLEAIEQRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRFDAALIRIY LQAYRHN BCMA 3,73
88 MGSWSEFEERLAAIGSRLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRFDAALIRIYL QAYRHN BCMA 4,85
89 MGSWLEFHYRLHAIQFRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRHIAALIRN BCMA 12,7486
- 75 043660
QLQAYRHN
90 MGSWQEFYNRLEAIHMRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEGLRSDAAPIRD VLQAYRHN BCMA 6,47
91 MGSWNEFHHRLWAIFDRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRKMAAGIR GGLQAYRHN BCMA 3,88
92 MGSWYEFHYRLKAINDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRYSAAMIRH KLQAYRHN BCMA 6,04
93 MGSWTEFHQRLGAIHARLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRFSAAFIRL KLQAYRHN BCMA 8,87
94 MGSWFEFQYRLEAIFYRLLALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGKPEVEELRVRAALIRHL LQAYRHN BCMA 17,31
95 MGSWVEFHARLDAIYTRLGALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRVLAAHIRI SLQAYRHN BCMA 3,8
96 MGSWVEFGTRLSAIYNRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRFEAAIIRIM LQAYRHN BCMA 15,425
97 MGSWVEFTHRLDAIYIRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRHEAAVIRE ELQAYRHN BCMA 13,9167
98 MGSWVEFHGRLAAIYVRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRYHAAMIRR NLQAYRHN BCMA 4
99 MGSWVEFDRRLVAIYIRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEALRDDAALIRL LLQAYRHN BCMA 8,93
100 MGSWVEFDRRLVAIYIRLWALGGSEAELAAFE BCMA 8
- 76 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYDAATIRE TLQAYRHN
101 MGSWLEFDRRLTAIYLRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRED AAMIR DMLQAYRHN BCMA 9,82
102 MGSWIEFDRRLLAIHVRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEVLRADAAI<IR MELQAYRHN BCMA 13,72
103 MGSWIEFDRRLIAIWIRLWALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRSDAADIRQK LQAYRHN BCMA 9,45
104 MGSWVEFDRRLIAIWVRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRSDAAMIRE HLQAYRHN BCMA 5,77
105 MGSWYEFHTRLIAIYVRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRGDAAKIR GYLQAYRHN BCMA 4,06
106 MGSWSEFSTRLSAIYVRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRNKAASIRK TLQAYRHN BCMA 5,35
107 MGSWVEFRYRLGAIYHRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEVLRDRAATIRR LLQAYRHN BCMA 10,81
108 MGS WNEF RNRLG A ID SRLW ALGGSEAEL A A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRAHAAIIRS VLQAYRHN BCMA 4,69667
109 MGS WHEF RNRLG A ID SRLW ALGGSEAEL A A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRARAAMIRS VLQAYRHN BCMA 3,49359
110 MGSWTEFYQRLEAINFRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEVLRDI<AALIRL MLQAYRHN BCMA 6,955
- 77 043660
111 MGSWNEFYNRLHAINLRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLREHAAIIRQ ALQAYRHN BCMA 3,00395
112 MGSWEEFYGRLSAIQDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRMHAAVIR RALQAYRHN BCMA 3,28
113 MGSWGEFNLRLVAIHVRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRSQAANIRA QLQAYRHN BCMA 12,81
114 MGSWGEFSDRLEAINERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRWQAAFIRA NLQAYRHN BCMA 4,26
115 MGSWMEFQGRLPAILARLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRDKAAYIR WMLQAYRHN BCMA 8,32
116 MGSWMEFEGRLPAILARLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRDKAAYIR WMLQAYRHN BCMA 3,93
117 MGSWFEFQNRLQAILFRLRALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRDKAAYIRL MLQAYRHN BCMA 5,39333
118 MGSWVEFDMRLQAILERLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRDSAAYIRL MLQAYRHN BCMA 23,525
119 MGSWVEFNARLDAILFRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRDQAAYIRL MLQAYRHN BCMA 13,52
120 MGSWMEFNVRLRAILDRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRDKAAYIRF MLQAYRHN BCMA 15,59
121 MGSWIEFDTRLAAIVHRLRALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRDKAAYIRY BCMA 13,9475
- 78 043660
MLQAYRHN
122 MGSWIEFDYRLKAILHRLRALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEGLRDKAAYIRFL LQAYRHN BCMA 11,8767
123 MGSWYEFEDRLLAIKVRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRDQAAYIRF MLQAYRHN BCMA 17,6133
124 MGSWYEFQDRLSAITTRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRDKAAYIRF MLQAYRHN BCMA 10,085
125 MGSWEEFDDRLNAIVYRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLRDQAAYIR LMLQAYRHN BCMA 18,64
126 MGSWVEFEQRLHAIVVRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGGGNPEVENLRDQAAYIRF MLQAYRHN BCMA 17,7467
127 MGSWVEFEWRLEAIVVRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRDKAAYIRY MLQAYRHN BCMA 14,95
128 MGSWYEFEHRLKAIVSRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRDKAAYIRY MLQAYRHN BCMA 4,55
129 MGSWMEFKHRLAAITFRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRDKAAYIRL LLQAYRHN BCMA 6,06
130 MGSWMEFEGRLHAIKRRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRDQAAYIRL LLQAYRHN BCMA 7,335
131 MGSWSEFVFRLDTIKSRLRALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRDQAAYIRLM LQAYRHN BCMA 19,86
132 MGSWYEFDERLSAIKLRLRALGGSEAELAAFE BCMA 16,94
- 79 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRAQAAYIRA ILQAYRHN
133 MGSWMEFDERLWAIKKRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRHQAAYIRM LLQAYRHN BCMA 9,526
134 MGSWHEFDGRLSAIKRRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRDQAAYIRY MLQAYRHN BCMA 5,4
135 MGSWYEFDGRLQAIIARLRALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEHLRFRAAYIRW ILQAYRHN BCMA 3,29
136 MGSWFEFDKRLYAIIHRLRALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYKAAIIRLY LQAYRHN BCMA 11,82
137 MGSWVEFDNRLYAIVDRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRQKAAYIRL ILQAYRHN BCMA 11,7167
138 MGSWIEFHQRLNAIFNRLRALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRHHAAYIRE MLQAYRHN BCMA 7,34167
139 MGSWNEFRLRLWAITERLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVECLRAEAAWIRT MLQAYRHN BCMA 3,87179
140 MGSWYEFWLRLSAISYRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRKEAAEIRS WLQAYRHN BCMA 14,4653
141 MGSWYEFQLRLWAIHWRLIALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRMRAAEIR NELQAYRHN BCMA 20,59
142 MGSWYEFAHRLEAIEWRLIALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRQYAAAIRN YLQAYRHN BCMA 9,48
- 80 043660
143 MGSWYEFDTRLGAIRNRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRFQAAYIRF LLQAYRHN BCMA 13,934
144 MGSWYEFWVRLTAIRWRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREQAASIR WVLQAYRHN BCMA 5,72
145 MGSWFEFDRRLKAIDRRLMALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRMQAAIIRN YLQAYRHN BCMA 6,1625
146 MGSWVEFWERLDAIDNRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRWHAAYIR GYLQAYRHN BCMA 11,42
147 MGSWAEFWDRLDAIDSRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLREWAAYIR GYLQAYRHN BCMA 18,22
148 MGSWAEFDLRLRAIAKRLVALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLRLDAAYIR GVLQAYRHN BCMA 4,09
149 MGSWSEFWDRLYAIRIRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRSVAARIRN WLQAYRHN BCMA 12,52
150 MGSWSEFWFRLGAIRNRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRDVAAHIRH WLQAYRHN BCMA 14,93
151 MGSWSEFNDRLDAIRWRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQVAATIR YRLQAYRHN BCMA 13,59
152 MGSWVEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAAAIRH YLQAYRHN BCMA 5,22
153 MGSWAEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAAAIRH BCMA
- 81 043660
YLQAYRHN
154 MGSWTEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAAAIRH YLQAYRHN BCMA
155 MGSWVEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLKYTAAAIRH YLQAYRHN BCMA
156 MGSWVEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLQYTAAAIRH YLQAYRHN BCMA
157 MGSWVEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAAAIKH YLQAYRHN BCMA
158 MGSWAEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLQYTAAAIKH YLQAYRHN BCMA
159 MGSWTEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLQYTAAAIKH YLQAYRHN BCMA
160 MGSWVEFWDRLGAIRERLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYVAAVIRH RLQAYRHN BCMA 4,18
161 MGSWVEFWDRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRASAAAIRI ALQAYRHN BCMA 3,07
162 MGSWVEFWDRLGAIRDRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRNTAAYIRT FLQAYRHN BCMA 16,034
163 MGSWSEFWVRLGAIRDRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRVTAAQIRH YLQAYRHN BCMA 23,5
164 MGSWSEFWVRLGAIRERLDALGGSEAELAAFE BCMA 7,55667
- 82 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAATIRR FLQAYRHN
165 MGSWSEFWARLGAIRERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAATIRR FLQAYRHN BCMA
166 MGSWSEFWVRLGAIRERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAGTIRR FLQAYRHN BCMA
167 MGSWSEFWVRLGAIRERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAATIKR FLQAYRHN BCMA
168 MGSWSEFWARLGAIRERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAGTIKR FLQAYRHN BCMA
169 MGSW SEFWDRLT AIR VRLDALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRYTAAHIRK FLQAYRHN BCMA 16,14
170 MGSWTEFWTRLNAIYERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRFTAASIRM YLQAYRHN BCMA 8,43
171 MGSWFEFWDRLAAIRDRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRYVAAKIRV RLQAYRHN BCMA 12,78
172 MGSWTEFWVRLNAIRDRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRHTAAIIRN YLQAYRHN BCMA 12,53
173 MGSWVEFWHRLGAIYDRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRRTAALIRQ TLQAYRHN BCMA 19,904
174 MGSWVEFWNRLGAIYDRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRHTAAVIRL YLQAYRHN BCMA 14,55
- 83 043660
175 MGSWSEFWERLEAIYDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRRTAATIRSF LQAYRHN BCMA 18,78
176 MGSWEEFDNRLEAIFDRLEALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELREFAATIRITL QAYRHN BCMA 3,93
177 MGSWMEFWDRLYAIEFRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRRVAATIRN ELQAYRHN BCMA 11,6925
178 MGS WTEF WERL YAIEYRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRSVAATIRY ELQAYRHN BCMA 12,7
179 MGS WNEF WERL YAIELRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRMTAAYIR NELQAYRHN BCMA 9,945
180 MGS WYEFWKRL YAIEYRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRKVAAKIRE QLQAYRHN BCMA 14,785
181 MGS WTEF WARLYAIEMRLFALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEHLRRVAAL1RE QLQAYRHN BCMA 12,46
182 MGSWHEFWDRLYAIEFRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRQVAAKIR WHLQAYRHN BCMA 7,3
183 MGSWDEFEFRLGALRWRLIALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRFGAAHIRH ILQAYRHN BCMA 9,2
184 MGSWTEFYHRLYAIRERLSALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRFGAAHIRH LLQAYRHN BCMA 9,6275
185 MGSWVEFETRLDAIRMRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRFGAAHIRA BCMA 14,0717
- 84 043660
LLQAYRHN
186 MGSWGEFDVRLFAIRERLSALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRGYAAQIRSF LQAYRHN BCMA 7,35333
187 MGSWVEFDERLSAIRERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRLYAAQIRV FLQAYRHN BCMA 5,61
188 MGSWSEFDGRLGAIWDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRDRAAQIRE FLQAYRHN BCMA 10,0305
189 MGSWGEFEGRLHAIRSRLSALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRGYAAWIRA LLQAYRHN BCMA 6,17
190 MGSWGEFNGRLGAIRERLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRAYAASIRA VLQAYRHN BCMA 4,95333
191 MGSWWEFTFRLAAIEFRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRAIAAEIRK SLQAYRHN BCMA 5,75
192 MGSWDEFQFRLAAIGFRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRRQAARIRH LLQAYRHN BCMA 6,155
193 MGSWYEFVTRLHAIDHRLKALGGSEADLAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRFYAAGIR MNLQAYRHN BCMA 4,12
194 MGSWSIEFWRLEAIKFRLIALGGSEAEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRVEAAAIRRV LQAYRHN BCMA 8,43
195 MGS WGEFEHRLDPSTCVWL ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRRGAAVIRH WLQAYRHN BCMA 4,05
196 MGSWIEFAMRLEAIENRLTALGGSEAELAIFES BCMA 10,73
- 85 043660
MIAHFEELLQNYI<GI<GNPEVEALIHEAFAIHI<E LWAYRHN
197 MGSWNEFYQRLEAIENRLQALGGSEAELAMFE VRIALFEDMLQGYKGKGNPEVEALKQEAIAILR ELIAYRHN BCMA 6,01
198 MGSWNEFYDRLRAIKKRLYALGGSEAELADFE EDIAQFEVDLQDYKGKGNPEVEALHREAHAIT HELWAYRHN BCMA 12,36
199 MGSWGEFKHRLALIKWYLEALGGSEAELAHFE DWIAVFEVQLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 17,09
200 MGSWYEFKHRLAIIKWYLEALGGSEAELAKFE AWIAEFEMILQRYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 5,505
201 MGSWYEFKHRLAIIKWYLEALGGSEAELAHFE QYIADFEGTLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 14,8333
202 MGSWYNFKHRLAIIKWYLEALGGSEAELARFE NFIANFETQLQLYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 6,7615
203 MGSWFQFKHRLAIIKWQLEALGGSEAELAWFE QWIADFEHQLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 10,39
204 MGSWYNFKHRLAIIKWFLEALGGSEAELAVFE VWIADFEHQLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 16,38
205 MGSWDAFKHRLALIKWYLEALGGSEAELAHFE EYIAEFESNLQ SYI<GI<GNPEVEALRI<E AAA IRD ELQAYRHN BCMA 12,98
206 MGSWDGFKHRLALIKWYLEALGGSEAELANFE NWIAEFEQRLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 23,62
- 86 043660
207 MGSWNGFKHRLAIIKWYLEALGGSEAELASFE SYIAEFESGLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 16,53
208 MGSWNSFKHRLALIKWYLEALGGSEAELATFE WYIASFESELQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 10,34
209 MGSWSDFKYRLAVIKFYLEALGGSEAELASFES FIAHFEDDLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN BCMA 13,04
210 MGSWSGFKYRLAVIKFYLEALGGSEAELASFEL FIAKFEIDLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN BCMA 13,066
211 MGSWYGFKYRLAVIKWYLEALGGSEAELASFE KYIAHFEHDLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 9,05
212 MGSWYGFKYRLAVIKWYLEALGGSEAELASFE KYIAQFEHDLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 7,63333
213 MGSWYGFKYRLALIKWYLEALGGSEAELASFE TYIADFEDLLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 13,03
214 MGSWSTFKYHLAVIKWYLEALGGSEAELASFE DYIAQFETDLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 11,65
215 MGSWHEFKYRLALIKWYLEALGGSEAELATFE HHIAQFEWDLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 16,19
216 MGSWNMFKYRLAHIKWYLEALGGSEAELATF EAYIADFEVDLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN BCMA 16,33
217 MGSWHGFKYRLAIIKWWLEALGGSEAELAFFE EWIASFERDLQIYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD BCMA 6,025
- 87 043660
ELQAYRHN
218 MGSWHGFKYRLAVIKWYLEALGGSEAELAMF EGWIAQFEITLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 5,99
219 MGSWQGFKYRLAVIKWMLEALGGSEAELAFF ENWIAEFETKLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN BCMA 7,75
220 MGSWSGFKYRLAVIKWYLEALGGSEAELATFE EWIAEFETELQFYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 13,975
221 MGSWGYFKYRLAMIKWYLEALGGSEAELASF ESWIAEFEGSLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 13,018
222 MGSWHAFKYKLAMIKWYLEALGGSEAELAHF EEWIAEFEALLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 11,63
223 MGSWQHFKYRLAIIKWYLEALGGSEAELAFFE SFIAKFEHDLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 8,91
224 MGSWNDFKYRLAIIKYYLEALGGSEAELAHFES YIASFEHDLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN BCMA 15,1233
225 MGSWGAFKYRLAIIKFYLEALGGSEAELARFEE FIANFEHDLQNYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRDE LQAYRHN BCMA 12,88
226 MGSWYNFKYRLAIIKFYLEALGGSEAELAQFEI WIAEFEHDLQGYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 19,91
227 MGSWEQFKYRLAIIKYMLEALGGSEAELAWFE SWIANFESDLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 11,01
228 MGSWQQFKYRLAIIKYYLEALGGSEAELAGFE BCMA 15,12
- 88 043660
TYIAKFEEVLQSYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN
229 MGSWAGFKYRLAVIKYYLEALGGSEAELAHFE QWIAHFEGMLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 12,68
230 MGSWTAFKYRLAIIKFYLEALGGSEAELAHFES YIAHFEDMLQHYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 7,43
231 MGSWAHFKYRLAIIKFWLEALGGSEAELANFE EYIAEFESTLQVYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 13,12
232 MGSWANFKYRLALIKWHLEALGGSEAELASFE IWIADFEESLQWYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 14,2878
233 MGSWATFKYRLALIKWHLEALGGSEAELADFE EYIAGFEEGLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 15,07
234 MGSWTHFKYRLALIKWWLEALGGSEAELAGF EVHIADFEAQLQMYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN BCMA 7,36692
235 MGSWNTFKYHLAVIKFMLEALGGSEAELAFFE QWIAEFEVTLQSYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 10,6006
236 MGSWTQFKYHLAVIKWYLEALGGSEAELAGFE QWIAEFEKTLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 21,1178
237 MGSWNQFKYRLAVIKFYLEALGGSEAELAHFE TWIAAFEEQLQFYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 12,85
238 MGSWNEFKYHLAVIKFYLEALGGSEAELAHFE TWIAEFEYELQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 13,68
- 89 043660
239 MGSWVQFKYHLAVIKFYLEALGGSEAELAHFE TWIAEFEVALQGYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 12,6957
240 MGSWVDFKYHLAVIKFWLEALGGSEAELANFE TWIANFEQELQMYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 13,22
241 MGSWVDFKYHLAVIKWYLEALGGSEAELADF ENWIAHFESILQQYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 10,43
242 MGSWVEFKYHLAVIKFTLEALGGSEAELADFE EEIARFEMILQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 6,92
243 MGSWSHFKYHLALIKWYLEALGGSEAELAKFE FWIAEFEHNLQMYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 7,93
244 MGSWYHFKYHLALIKWYLEALGGSEAELAHFE HWIAEFEWTLQQYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 8,85
245 MGSWQGFKYHLALIKFYLEALGGSEAELAHFE HWLAEFEHDLQTYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 21,2
246 MGSWLSFKHHLALIKWYLEALGGSEAELASFE AWIALFEHQLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 6,305
247 MGSWSEFKYKLALIKWYLEALGGSEAELAHFE GWIANFETTLQI<YI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 11,2875
248 MGSWIEFKYKLAIIKFYLEALGGSEAELAHFEH WIADFEFVLQQYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 14,88
249 MGSWQNFKYHLAMIKWYLEALGGSEAELANF EEFIAQFEINLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR BCMA 9,55
- 90 043660
DELQAYRHN
250 MGSWYNFKYHLAIIKWWLEALGGSEAELADFE HYIADFERNLQEYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 8,62636
251 MGSWYQFKYHLAIIKWYLEALGGSEAELAGFE NYIATFEQELQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 18,41
252 MGSWSHFKYHLAIIKFYLEALGGSEAELAGFEI WIAI<FEDELQMYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 9,34
253 MGSWVGFKAHLAIIKWYLEALGGSEAELAGFE IFIADFEALLQMYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 9,71
254 MGSWVNFKYKLAIIKYMLEALGGSEAELAFFE DWIAEFERTLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 7,38951
255 MGSWSNFKYRLAVIKYMLEALGGSEAELAFFE DWIADFELHLQVYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 9,34
256 MGSWTNFKYKLAVIKFMLEALGGSEAELAFFE DWIAGFEIDLQNYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 11,4075
257 MGSWTGFKYRLAIIKFMLEALGGSEAELAFFEQ WIADFENELQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 13,89
258 MGSWHNFKYRLAIIKFMLEALGGSEAELAWFE NWIADFEDSLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 13,59
259 MGSWFAFKHRLAVIKYMLEALGGSEAELAFFE HWIAQFEHDLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 11,985
260 MGSWYEFKHRLAVIKYMLEALGGSEAELAFFE BCMA 3,71
- 91 043660
NWIAQFEHELQTYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN
261 MGSWYKFKHKLAVIKYMLEALGGSEAELAWF EEWIAEFEVTLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN BCMA 4,54
262 MGSWFYFKQKLAFIKWYLEALGGSEAELANFE IYIAEFEVMLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 7,23
263 MGS WF SFKHHL AVIKWNLEALGGSEAEL ASFE EQIAEFESVLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 6,45
264 MGSWGNFKYRLAIIKFHLEALGSSEAELATFEA WIANFESMLQNYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 22,7
265 MGSWSYFKYGLAIIKIRLEALGGSEAELADFER WIAAFEHDLQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 13,33
266 MGSWSYFKFGLAHIKLRLEALGGSEAELADFE QWIASFEEQLQTYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 18,354
267 MGSWSYFKWGLAHIKLRLEALGGSEAELADFE FWIAEFEGLLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 17,64
268 MGSWIYFKYGLAHIKTRLEALGGSEAELADFE QWIAEFEI<MLQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 21,12
269 MGSWGYFKYGLATIKHRLEALGGSEAELADFE LWIAI<FEEQLQVYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 14,01
270 MGSWEYFKYGLATIKMHLEALGGSEAELADFE HWIAHFEHQLQMYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 18,4033
- 92 043660
271 MGSWSYFKYGLATIKEKLEALGGSEAELADFE TWIAMFEKQLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 18,15
272 MGSWHYFKNGLAIIKEKLEALGGSEAELADFEI WIAMFEMELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 19,85
273 MGSWQYFKYGLAIIKIKLEALGGSEAELADFEA WIATFEKQLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 10,28
274 MGSWVYFKHGLAVIKMRLEALGGSEAELADFE TWIAQFEMTLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 21,45
275 MGSWVYFKYGLAVIKEKLEALGGSEAELADFE TWIAEFEFGLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 17,58
276 MGSWYYFKYGLAVIKGKLEALGGSEAELADFE TWIAKFENHLQSYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 3,84
277 MGSWTYFKYGLALIKYRLEALGGSEAELADFE EWIAQFEVSLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 15,21
278 MGSWDYFKYGLALIKIKLEALGGSEAELADFE VWIAQFEMALQVYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 15,76
279 MGSWTYFKFGLAHIKDSLEALGGSEAELADFE QWIAMFEQDLQVYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 17,01
280 MGSWGYFKHGLAHIKS SLEALGGSEAELADFE VWIAAFENELQEYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 18,505
281 MGSWGYFKTGLAIIKAQLEALGGSEAELADFEL WIAQFEETLQFYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE BCMA 12,75
- 93 043660
LQAYRHN
282 MGSWAYFKYGLAVIKLHLEALGGSEAELADFE RYIAEFEYELQAYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 13,44
283 MGSWLDFKEGLADIKRSLEALGGSEAELADFE GVIALFEWI<LQTYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 3,03
284 MGSWEVFKHELAVIKDYLEALGGSEAELAHFE WGIAWFEGFLQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 9,33
285 MGSWIVFKQSLAWIKEHLEALGGSEAELAEFEF YIANFEHTLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 10,57
286 MGSWIYFKDSLAYIKKYLEALGGSEAELATFEY YIANFEHELQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 3,2
287 MGSWDHFKYNLAWIKKYLEALGGSEAELATFE WYIANFEKRLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 9,81
288 MGSWFTFKQNLAWIKLHLEALGGSEAELARFE YYIADFENKLQLYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 14,204
289 MGSWREFKYGLAHIKRVLEALGGSEAELAVFE YYIAKFEQELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 14,7
290 MGSWIQFKYGLAHIKRTLEALGGSEAELAVFE WYIADFEQQLQGYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 8,35667
291 MGSWVEFKHNLAWIKVTLEALGGSEAELAVFE YYIAQFEEQLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 15,83
292 MGSWISFKDNLAMIKEFLEALGGSEAELAVFE BCMA 7,16
- 94 043660
WYIATFEVELQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN
293 MGSWHIFKDNLATIKAFLEALGGSEAELAVFE WYIAI<FEEELQGYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 3,47
294 MGSWTSFKHGLAGIKRVLEALGGSEAELATFE WYIAQFERHLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 9,765
295 MGSWQSFKHALADIKINLEALGGSEAELAQFE YAIAVFEYRLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 13,7188
296 MGSWHTFKEALAQIKGELEALGGSEAELASFE YAIAVFEYRLQMYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 6,76
297 MGSWTDFKTSLADIKAELEALGGSEAELAKFE YYIAIFEYRLQEYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN BCMA 18,76
298 MGSWTNFKEGLAEIKRDLEALGGSEAELARFE YVIAVFEFRLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 12,3267
299 MGSWHTFKDGLAEIKSELEALGGSEAELAMFE YVIAIFEYRLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 10,65
300 MGSWQFFKEHLASIKFWLEALGGSEAELAFFE DAIADFEYHLQNYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN BCMA 10,58
301 MGSWTYFKEHLASIKFWLEALGGSEAELAFFE DAIAEFEKDLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 6,59507
302 MGSWIIFKGYLAHIKHHLEALGGSEAELADFEF YIAIFEMELQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN BCMA 5,18
- 95 043660
303 MGSWYLFQSHLAHIKHHLEALGGSEAELAWFE FTIAGFEQELQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN BCMA 7,69
304 MGSWYSFKWTLARIKLELEALGGSEAELAYFE NVIAHFEMELQSYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 4,05
305 MGSWTTLKWRLAHIKQHLEALGGSEAELALFE YDIAHFEELLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 17,82
306 MGSWYGFKWYLATIKKHLEALGGSEAELALFE TEIATFELWLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN BCMA 10,65
307 MGSWIEFNMRVLAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRYEACLDP WSSAAYRHN CD 123 3,2
308 MGSWIEFHERLWAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREMAASIRH GLQAYRHN CD 123 3,4
309 MGSWFEFYERLWAIDDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREEAASIRS SLQAYRHN CD 123 6
310 MGSWFEFWDRLEAIDDRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRYNAAEIRK ELQAYRHN CD 123 4,9
311 MGSWHEFWSRLDAIDDRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRGAAADIRA ELQAYRHN CD 123 3,8
312 MGSWYEFWIRLEAIDDRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVDILRDFAADIRT ELQAYRHN CD 123 10,4
313 MGSWHEFWDRLEAIDDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLREEAAYIRE CD 123 10,6
- 96 043660
LLQAYRHN
314 MGS WEEFWDRLFAIDDRLW ALGGSE AEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRNEAAEIRM ALQAYRHN CD 123 3,1
315 MGSWWEFDDRLF AID TRLMALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREWAATIRM ELQAYRHN CD 123 3,5
316 MGSWTEFHDRLEAIDDRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLREEAAQIRW ELQAYRHN CD 123 5,8
317 MGSWAEFEDRLWAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLREEAAAIRF ELQAYRHN CD 123 6,2
318 MGS WVEF WF RLE AID SRLW ALGGSE AEL A A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREEAAAIRE DLQAYRHN CD 123 3,2
319 MGSWVEFWQRLEAIESRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEFLREEAAEIRW ELQAYRHN CD 123 7,7
320 MGSWSEFWQRLEAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRENAAMIR DELQAYRHN CD 123 4,7
321 MGSWSEFITRLEAIDDRLWALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEILREEAAEIRQHL QAYRHN CD 123 3,3
322 MGSWYEFETRLEAIYDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRVEAAEIRE DLQAYRHN CD 123 3,2
323 MGSWTEFYYRLEAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRVEAANIRD MLQAYRHN CD 123 7,5
324 MGSWYEFVIRLEAIEDRLWALGGSEAELAAFE CD 123 6,4
- 97 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRWYAADIR HELQAYRHN
325 MGS WTEF SIRLE AIYDRL VALGGSEAEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRTYAANIRHE LQAYRHN CD 123 H,9
326 MGS WTEF SIRLE AI YDRL VALGGSEAEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRTYAAFIRHE LQAYRHN CD 123 10,2
327 MGSWTEFVWRLEAIWDRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLREDAAVIRH FLQAYRHN CD 123 3,6
328 MGSWVEFHERLEAIEDRLMALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLREDAAFIRQ LLQAYRHN CD 123 3,7
329 MGSWVEFHDRLEAIEDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREDAAYIRS ILQAYRHN CD 123 4,6
330 MGSWIEFYDRLEAIYDRLDALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREDAAFIRSW LQAYRHN CD 123 7,5
331 MGSWVEFDQRLEAIYDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREDAAQIR KWLQAYRHN CD 123 5,1
332 MGSWVEFHDRLEAIEDRLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLREYAAGIR WFLQAYRHN CD 123 3,3
333 MGSWEEFAQRLYAIEWRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRYVAAQIRY HLQAYRHN CD 123 16,9
334 MGSWDEFAWRLDVIFARLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRKNAAQIRD GLQAYRHN CD 123 4,6
- 98 043660
335 MGSWDEFYYRLEAIEMRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRHYAAQIRH MLQAYRHN CD 123 7,2
336 MGSWEEFYDRLEAIYNRLGALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEVLREYAADIRE MLQAYRHN CD 123 18,6
337 MGSWDEFGRRLYAIEWQLYALGGEEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRKEAAVIRE NLQAYRHN CD 123
338 MGSWDEFGRRLYAIEWQLYALGGTEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRKEAAVIRE NLQAYRHN CD 123
339 MGSWDEFGRRLYAIETQLYALGGEEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
340 MGSWDEFGRRLYAIEWQLYALGGEEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
341 MGSWDEFGRRLYAIKWQLYALGGEEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
342 MGSWDEFGRRLYAIEWQLYALGGEEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRKIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
343 MGSWDEFGRRLYAIEWQLYALGGGEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
344 MGSWDEFGRRLYAIEWQLYALGGTEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
345 MGSWDEFGRRLYAIEWQLYALGGGEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRS CD 123
- 99 043660
NLQAYRHN
346 MGS WDEFGRRLYAIEWQLYALGGTEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRS NLQAYRHN CD 123
347 MGS WDEFGRRLYAIEWQLYALGGEEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRS NLQAYRHN CD 123
348 MGSWDEFGRRLAAIEWQLYALGGEEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
349 MGS WDEFGRRLYAIEWQLYALGGEEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
350 MGS WDEFGRRLYAIEWQLYALGGEEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREEAAVIRE NLQAYRHN CD 123
351 MGS WDEFGRRLYAIEWRLYALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGSPEVEKLREIAAVIRSN LQAYRHN CD 123
352 MGS WDEFGRRLYAIEWRLYALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRS NLQAYRHN CD 123 5,8
353 MGS WDEFGRRLYAIEWRLYALGGEEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRS NLQAYRHN CD 123
354 MGSWDEFGRRLYAIEWQLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRS NLQAYRHN CD 123
355 MGSWDEF S RRLY AIE WRLY A LGG SE A ELA A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRS NLQAYRHN CD 123
356 MGS WDEFGRRLYAIEWRLYALGGSEAEL AAFE CD 123
- 100 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN
357 MGSWDEFGRRLAAIKTQLAALGGEEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
358 MGSWDEFGRRLAAIKTQLAALGGTEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRE NLQAYRHN CD 123
359 MGSWDEFGRRLAAIKTQLAALGGEEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRKEAAVIRE NLQAYRHN CD 123
360 MGSWDEFGRRLAAIKTQLAALGGTEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRKEAAVIRE NLQAYRHN CD 123
361 MGSWDEFEQRLIAIEERLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREEAAVIRKY LQAYRHN CD 123 5,9
362 MGSWVEFDQRLGAIWDRLVALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRQGAAVIRD DLQAYRHN CD 123 5,3
363 MGSWVEFDMRLSAIWERLIALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREDAAEIRE FLQAYRHN CD 123 3,3
364 MGSWVEFDQRLDAIYERLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRDEAAEIRE HLQAYRHN CD 123 10,5
365 MGSWHEFDQRLWAIEERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRLYAALIRH DLQAYRHN CD 123 3,3
366 MGSWVEFWDRLDAIEGRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRWLAAEIR ADLQAYRHN CD 123 3,5
- 101 043660
367 MGSWVEFYSRLDAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRIAAASIRE DLQAYRHN CD 123 9,4
368 MGSWYEFYERLDAIEERLW ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRDWAAWIR EDLQAYRHN CD 123 8,4
369 MGS WFEFDDRLWAIENRLW ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRDNAAWIR EILQAYRHN CD 123 4,2
370 MGSWYEFWDRLDALEDRLWALGGSEAELAAF EI<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRDSAAFIR EELQAYRHN CD 123 9,7
371 MGSWMEFVDRLDAIESRLW ALGGSEAEL AAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEWLRIEAAFIRE ELQAYRHN CD 123 5,8
372 MGSWDEFVDRLWAIEERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRIQAAIIREA LQAYRHN CD 123 6
373 MGSWFEFNYRLGAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLRQIAAEIRE FLQAYRHN CD 123 6,9
374 MGSWEEFFTRLDAINERLEALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLRYEAAEIRH MLQAYRHN CD 123 3,9
375 MGS W YEF SNRLD AIGERLW ALGGSEAEL AAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEILRHQAAEIRW FLQAYRHN CD 123 3,9
376 MGSWYEFWGRLDAIEERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGRGNPEVEMLREDAAEIRG QLQAYRHN CD 123 5,4
377 MGSWVEFWDRLW AID YRLF ALGGSEAEL AAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRDEAAWIR CD 123 3,6
- 102 043660
EELQAYRHN
378 MGSWVEFVDRLWAIDERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRTWAAWIR EDLQAYRHN CD 123 3,2
379 MGSWFEFWDRLEAIWERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRREAAIIRED LQAYRHN CD 123 10,3
380 MGSWFEFEDRLEAIYQRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRDEAAWIR SDLQAYRHN CD 123 5,5
381 MGSWFEFHDRLWAIDERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEILREEAADIRLD LQAYRHN CD 123 3,5
382 MGSWYEFEDRLWAIDNRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRVHAADIR DDLQAYRHN CD 123 4,9
383 MGSWFEFQDRLWAIDNRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRDHAAMIR WELQAYRHN CD 123 3,2
384 MGSWDEFEERLFAIDERLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEALRYLAADIRE ELQAYRHN CD 123 5
385 MGSWEEFWERLDAIDTRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRNDAADIRE PLQAYRHN CD 123 6,8
386 MGSWMEFWERLEAIDMRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRDDAAVIR DDLQAYRHN CD 123 4,2
387 MGSWLEFMWRLDAIDERLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLREMAAAIR DDLQAYRHN CD 123 5,1
388 MGSWTEFYNRLDAIDQRLWALGGSEAELAAFE CD 123 3,3
- 103 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLREYAADIRT DLQAYRHN
389 MGSWWEFIWRLEAIEQRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRSRAADIRT DLQAYRHN CD 123 4
390 MGSWSEFYDRLWAIEERLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRYYAAEIRE ELQAYRHN CD 123 17
391 MGSWSEFEDRLWAIDQRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRAYAADIR WELQAYRHN CD 123 4,2
392 MGSWTEFWERLNAIDERLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRLYAAEIRS ELQAYRHN CD 123 4
393 MGSWWEFEERLWAIDYRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLRSWAAEIR ALLQAYRHN CD 123 4,1
394 MGSWWEFENRLWAIEERLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLRNYAAEIR WELQAYRHN CD 123 5,6
395 MGSWVEFEERLWAIDERLGALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEWLRDWAADIR WWLQAYRHN CD 123 4,1
396 MGSWVEFEERLEAIEERLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRDDAANIRH WLQAYRHN CD 123 3,8
397 MGSWMEFEERLWAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRSEAAWIR MELQAYRHN CD 123 3,2
398 MGSWSEFEHRLEAIESRLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRSEAAWIREQ LQAYRHN CD 123 7,6
- 104 043660
399 MGSWFEFWERLDAIEWRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRSTAADIR RYLQAYRHN CD 123 3,4
400 MGSWFEFWGRLEAIESRLKALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELREHAAWIRA YLQAYRHN CD 123 4,9
401 MGSWQEFTMRLDAIYNRLETLGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQSAANIRS ELQAYRHN CD 123 13,7
402 MGSWSEFNMRLDAIYERLTALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRHSAARIRL ELQAYRHN CD 123 13,7
403 MGSWSEFNMRLDAIYERLTALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEWLRHSAALIRL ELQAYRHN CD 123 H,4
404 MGSWIEFNMRLDAIYERLVALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRKVAANIR LELQAYRHN CD 123 H,4
405 MGSWYEFHHRLDAIYERLLALGGSEAELAAFE KEI AAFESELQ AYKGKGNPEVEWLRS S AANIRK ELQAYRHN CD 123 H,9
406 MGSWYEFAKRLDAIYERLVALGGSEAELAAFE KEI AAFESELQ AYKGKGNPEVEWLRS S AANIRE ELQAYRHN CD 123 15,3
407 MGSWTEFYVRLDAIYERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRMVAANIR TELQAYRHN CD 123 16
408 MGSWVEFYTRLDAIYGRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQVAANIR MELQAYRHN CD 123 14,4
409 MGSWVEFHMRLDAIYERLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRTAAANIR CD 123 9,1
- 105 043660
VELQAYRHN
410 MGSWYEFAIRLDAIYERLHALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRVWAANIRTE LQAYRHN CD 123 25,5
411 MGSWNEFVIRLDAIYERLLALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRMAAANIRM ELQAYRHN CD 123 16,6
412 MGSWSEFYVRVDAIYARLSALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRVWAANIR HELQAYRHN CD 123 14,7
413 MGSWSEFHVRLDAIYARLDALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVERLREWAANIRR ELQAYRHN CD 123 14,4
414 MGSWVEFHLRLDAIYGRLMALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRVWAANIR NELQAYRHN CD 123 17,5
415 MGSWVEFEMRLDAIVGRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRRWAANIRS ELQAYRHN CD 123 25,3
416 MGSWVEFNIRLDAIYERLYALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRHWAASIRRE LQAYRHN CD 123 13,4
417 MGSWHEFGVRLDAIYDRLMALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRQAAANIRS ELQAYRHN CD 123 15,6
418 MGSWTEFNLRLDAIYDRLMALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRASAAAIR VELQAYRHN CD 123 14,4
419 MGSWTEFNLRLDAIYGRLSALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRAAAANIRV ELQAYRHN CD 123 19,3
420 MGSWVEFNWRLDAIYDRLVALGGSEAELAAFE CD 123 9,3
- 106 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRVSAAKIR GELQAYRHN
421 MGSWNEFAWRLDAIYSRLAALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRVAAANIR YELQAYRHN CD 123 17,7
422 MGSWTEFAWRLDAIYDRLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRHVAANIR RELQAYRHN CD 123 16,1
423 MGS W VEF SIRLD AI YTRL VALGGSE AEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLRKGAANIRK ELQAYRHN CD 123 15,1
424 MGSWVEFYIRLDAIYVRLMALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRSYAANIRQ ELQAYRHN CD 123 16,1
425 MGS W YEF SMRLD AI YDRLM ALGGSE AEL A A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEQLRGYAANIRN ELQAYRHN CD 123 13
426 MGSWVEFIYRLDAIYDRLEALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRRYAANIRNE LQAYRHN CD 123 17
427 MGSWIEFEVRLDAIYNRLAALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVERLRRYAANIRHE LQAYRHN CD 123 20,8
428 MGSWFEFYDRLDAIYMRLIALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRRYAANIRA ELQAYRHN CD 123 13,6
429 MGSWFEFYMRLDAIYDRLTALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVERLRTFAANIRK ELQAYRHN CD 123 13,1
430 MGSWYEFDYRLDAIYDRLAALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVERLRKWAANIR EELQAYRHN CD 123 24,9
- 107 043660
431 MGSWSEFYLRLDAIYDRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRKTAANIRE ELQAYRHN CD 123 15,7
432 MGSWFEFYERLDAINWRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRGEAAAIRE DLQAYRHN CD 123 3
433 MGSWNEFEDRLDAIWWRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRVEAAFIRT MLQAYRHN CD 123 5,1
434 MGSWFYFKDDLADINYMLEALGGSEAELAMF EDDIAGFELTLLKYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,7
435 MGSWHFFKDDLAWIKNELEALGGSEAELAMFE DDIAMFETMLQSYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,2
436 MGSWHWFKTDLADIKEELEALGGSEAELAMFE DDIAEFEEFLQMYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,5
437 MGSWWLFKDDLAEIKYWLEALGGSEAELAFFE DDIAEFERGLQIYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,3
438 MGSWYEFKDDLAEIKEWLEALGGSEAELAFFE LDIADFEWLLQLYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,8
439 MGSWQWFKDDLAYIKETLEALGGSEAELALFE DMIADFEFELQWYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 6,3
440 MGSWILFKDDLAWIKETLEALGGSEAELAFFED NIADFEEQLQGYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 6
441 MGSWIVFKDDLADIKRWLEALGGSEAELAMFE DEIADFEWQLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR CD 123 3,9
- 108 043660
DELQAYRHN
442 MGSWGHFKQDLAWIKDTLEALGGSEAELAFFE DDIAMFEMELQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,9
443 MGSWGYFKDDLAWIKGELEALGGSEAELAEFE WFIAVFEEDLQVYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,5
444 MGSWYWFKDDLAEIKGLLEALGGSEAELAEFE DEIAVFEQELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 10,4
445 MGSWMFFKEDLADIKWALEALGGSEAELAFFE EEIALFEQHLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,2
446 MGSWTFFKEDLAGIKWELEALGGSEAELAWFE DEIALFEEELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 7
447 MGSWVFFKDDLADIKDELEALGGSEAELAFFEI AIALFEWELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 8,8
448 MGSWTFFKNDLAEIKDWLEALGGSEAELADFE WDIAEFEYSLQEYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,9
449 MGSWTYFKDDLADIKQWLEALGGSEAELAFFE lEIAEFEEELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN CD 123 4,6
450 MGSWTVFKYDLADIKWWLEALGGSEAELADF EEEIAEFEEELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,9
451 MGSWYWFKQDLAHIKSMLEALGGSEAELAWF EEDIADFESELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,3
452 MGSWTFFKWDLADIKANLEALGGSEAELAWF CD 123 4,8
- 109 043660
EEDLAGFEAELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN
453 MGSWSFFKEELANIQVYLEALGGSEAELAWFE EDIADFEEDLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,8
454 MGSWEFFKYELADIKDELEALGGSEAELAWFE EDIATFEEWLQGYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,4
455 MGSWQTFKDELAHIKWELEALGGSEAELAWFE WDIANFEEELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,5
456 MGSWYWFKEELAFIKWELEALGGSEAELALFE EDIAYFEEMLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 9,4
457 MGSWNSFKDELAEIKAELEALGGSEAELAFFEE DIAWFEEHLQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,3
458 MGSWDLFKWELAEIKLGLEALGGSEAELAEFE YDIAWFEEDLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,4
459 MGSWIFFKQDLAEIKLNLEALGGSEAELAWFE DDIAWFESHLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,8
460 MGSWHLFKWTLAEIKYELEALGGSEAELAWFE DDIATFEEELQWYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 4
461 MGSWVTFKDELADIKDFLEALGGSEAELAFFE VDIAEFEAELQFYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 7,6
462 MGSWVYFKDELADIKDFLEALGGSEAELAEFE EDIATFEYDLQWYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,6
- 110 043660
463 MGSWETFKYELAEIKDYLEALGGSEAELAWFE DDIAEFEFELQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 4,4
464 MGSWNTFKYELAEIKHFLEALGGSEAELAMFE DDIAMFEWELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 5
465 MGSWYVFKDELAEIKQFLEALGGSEAELAWFE DDIAEFETQLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 9,9
466 MGSWIFFKEQLAIIKWELEALGGSEAELAWFED DIAAFEDDLQFYKGQGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN CD 123 15
467 MGSWEFFKEVLAEIKYDLEALGGSEAELAWFE TDIAGFEIDLQVYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 8,2
468 MGSWVFFKEDLATIKNDLEALGGSEAELAWFE MMIADFEADLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,1
469 MGSWEEFKEDLAEIKVWLEALGGSEAELAWFE MGIADFEDGLQFYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,3
470 MGSWHWFKEDLANIKDWLEALGGSEAELAWF EDNIADFEGDLQVYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 3,3
471 MGSWFWFKEDLAFIKEDLEALGGSEAELAWFE DGIAFFEWDLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 13,7
472 MGSWQWFKEDLAEIKHDLEALGGSEAELAWF EDFIAQFEFDLQWYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 3,8
473 MGSWHWFKEDLAIIKQDLEALGGSEAELATFE QWIAEFEWDLQEYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR CD 123 5,5
- 111 043660
DELQAYRHN
474 MGSWNWFKEDLAIIKMDLEALGGSEAELAWFE HNIAGFEFELQGYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,1
475 MGSWSWFKEDLAEIKMELEALGGSEAELAYFE WYIAEFEFQLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,8
476 MGSWSWFKQDLADIKIQLEALGGSEAELAWFE WDIAEFEFELQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 4
477 MGSWSWFKEDLADIKFELEALGGSEAELAWFE LDIADFEQALQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 6,8
478 MGSWSWFKEDLASIKAVLEALGGSEAELAFFE SDIAEFEQELQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 6,9
479 MGSWWEFKEDLAEIKWFLEALGGSEAELAWF EHDIAKFEFELQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,1
480 MGSWEWFKSDLASIKWELEALGGSEAELAWFE HDIAEFEEDLQWYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,7
481 MGSWNEFKDDLAMIKMTLEALGGSEAELAWF EHDIAEFEDDLQWYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 3,5
482 MGSWTFFKDDLAEIKWMLEALGGSEAELAWF ESDIAYFEDELQWYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 3,3
483 MGSWSDFKDDLAEIKMILEALGGSEAELAYFE NDIAWFEDDLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,7
484 MGSWSMFKDDLAEIKASLEALGGSEAELAWFE CD 123 5,2
- 112 043660
DDIAWFEDDLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN
485 MGSWQYFKDDLAEIKMVLEALGGSEAELAWF EADIAMFEDDLQIYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,6
486 MGSWSFFKDDLAEIKYFLEALGGSEAELAMFE QTIAEFEYDLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 10,1
487 MGSWMEFKEELAEIKYILEALGGSEAELAWFE QSIADFEYDLQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 5
488 MGSWAWFKEDLAEIKVFLEALGGSEAELAEFE VSIADFEYELQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,5
489 MGSWYEFKFDLAEIKEQLEALGGSEAELALFED DIAFFEYDLQNYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRDE LQAYRHN CD 123 4,6
490 MGSWYDFKYDLAEIKMDLEALGGSEAELAQFE FDIAFFEEELQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,2
491 MGSWYIFKEDLAEIKEELEALGGSEAELAYFEE EIALFEMELQWYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN CD 123 11,1
492 MGSWVLFKEELAYIKFELEALGGSEAELALFEN VIAIFESNLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN CD 123 3,5
493 MGSWQDFKEDLAWIKYELEALGGSEAELAFFE YDIAIFENNLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,2
494 MGSWDHFKNDLAWIKKHLEALGGSEAELAEFE AVIAYFELYLQGYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,3
- 113 043660
495 MGSWYDFKEDLADIKWMLEALGGSEAELAEF ENVIAYFENDLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 8
496 MGSWYMFKEELADIKWYLEALGGSEAELAWF EDDIAGFEWDLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 7
497 MGSWYYFKDELADIKWDLEALGGSEAELAWF EMLIAQFELDLQWYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 4
498 MGSWMYFKDTLADIKWYLEALGGSEAELAFFE DWIAEFEDDLQVYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,1
499 MGSWYQFKHDLADIKYGLEALGGSEAELAWF EDDIADFELDLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 4,7
500 MGSWYVFKDDLADIKYMLEALGGSEAELAWF EWEIANFEFDLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 3,8
501 MGSWNFFKYDLADIMAYLEALGGSEAELAFFE DEIANFEHDLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,4
502 MGSWHWFKIVLADIKDGLEALGGSEAELAYFE TTIADFEMDLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,3
503 MGSWHWFKIVLADIKDGLEALGGSEAELAYFE TTIADFEMDLHHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,5
504 MGSWFMFKEELADIKDWLEALGGSEAELASFE SYIAWFEQDLQWYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,7
505 MGSWFMFKQELAWIKEDLEALGGSEAELADFE WDIAEFEWDLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR CD 123 7,2
- 114 043660
DELQAYRHN
506 MGSWQIFKGELAYIKQYLEALGGSEAELAFFEF DIAEFEEDLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN CD 123 4,7
507 MGSWDFFKEELAEIKHYLEALGGSEAELAFFEF WIADFEQDLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,7
508 MGSWFNFKEELAVIKFQLEALGGSEAELAFFE WVIADFEDDLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 6,1
509 MGSWYQFKTELAWIKDDLEALGGSEAELAWF EWVIADFEDDLQFYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 6,6
510 MGSWFEFKDYLADIKWDLEALGGSEAELAIFE HDIAYFEHNLQQYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,8
511 MGSWVRFKDFLADIKMDLEALGGSEAELADFE YHIAEFEHNLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,8
512 MGSWWLFKEQLALIKYNLEALGGSEAELADFE SWIAEFEHQLQEYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,1
513 MGSWHVFKTELADIKFYLEALGGSEAELAMFE LWIAEFEHELQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,4
514 MGSWIWFKDWLADIKDLLEALGGSEAELAEFE YDIALFEDQLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 7,3
515 MGSWGWFKHELAFIKADLEALGGSEAELAWF EEEIAEFEYELQFYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,3
516 MGSWTWFKDNLAWIKEDLEALGGSEAELAWF CD 123 6,9
- 115 043660
ELEIASFETALQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN
517 MGSWTYFKNDLAGIKEDLEALGGSEAELAQFE FEIAEFEWLLQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,6
518 MGSWTWFKWDLADIKGDLEALGGSEAELAFF EEEIAEFEWRLQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,9
519 MGSWLYFKEYLADIKSDLEALGGSEAELAWFE YEIADFEEQLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,7
520 MGSWHWFKEELAEIKEDLVALGGSEAELAWFE YDIAMFELSLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,1
521 MGSWNDFKEELAWIKFDLEALGGSEAELAWFE EDIAMFEQQLQAYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 3,8
522 MGSWWDFKDWLAEIKHDLEALGGSEAELALF ESEIADFEFGLQWYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,2
523 MGSWDEFKEDLAHIKTDLEALGGSEAELALFE DEIADFEMYLQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 6,3
524 MGSWDFFKYDLANINEWLEALGGSEAELADFE YGIADFELWLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,5
525 MGSWYQFKDDLAHIKHLLEALGGSEAELAVFE YIIADFESFLQIYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN CD 123 4
526 MGSWAEFKHDLADIKRELEALGGSEAELAWFE LSIAFFEDELQHYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,3
- 116 043660
527 MGSWVVFKQDLADINHQLEALGGSEAELAWF EWEIADFEWELQHYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN CD 123 3,6
528 MGSWFQFKEFLAMITHNLEALGGSEAELAEFE HDIALFESELQQYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 3,1
529 MGSWHWFKEDLAMITDVLEALGGSEAELAAF ESEIAVFEADLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 5,2
530 MGSWSWFQWDLAGIKDHLEALGGSEAELAEF ESEIAYFEDELQWYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CD 123 12,9
531 MGSWTEFKGELAEIKWILEALGGSEAELAFFED EIAAFEWDLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD 123 8,2
532 MGSWFEFKWTLALIKQELEALGGSEAELADFE QEIAEFEWWLQTYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CD 123 4,9
533 MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFM DEIMAFEWELWAYKGKGNPEVEALMNEAFAI DVELYAYRHN CD 123 3,4
534 MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFE WEIVAFFSELFAYKGKGNPEVEALRDEAIAIETE LVAYRHN CD 123 3,6
535 MGSWWEFDHRLTAIDTRLQALGGSEAELAEFE S SIAEFEWWLQD YKGKGNPEVE ALF AEAE AI Y VELDAYRHN CD 123 4,3
536 MGSWWEFQFRLYAIDQRLLALGGSEAELAEFE QDIADFEWMLQDYKGKGNPEVEALMLEADAIE AELKAYRHN CD 123 3,1
537 MGSWYEFDHRLDAIYQRLWALGGSEAELAEFE YGIAEFEEYLQDYKGKGNPEVEALISEAWAIEW CD 123 4,6
- 117 043660
ELSAYRHN
538 MGSWYEFDMRLDAIWERLTALGGSEAELADFE QYIAEFERQLQDYKGKGNPEVEALFDEAWAIE DELYAYRHN CD 123 13,7
539 MGSWSEFD SRLD AIAYRLF ALGGSEAELAQFE WIIADFEEDLQMYKGKGNPEVEALF SE AYAIEI ELNAYRHN CD 123 4,3
540 MGSWYEFDDRLDAIAYRLNALGGSEAELAWFE WEIAEFELDLQWYKGKGNPEVEALVWEADAIE WELEAYRHN CD 123 4,6
541 MGSWFEFDERLDAIGSRLTALGGSEAELASFEF YIADFEEWLQQYKGKGNPEVEALEWEAFAIDE ELGAYRHN CD 123 3,8
542 MGSWEEFDQRLDAIDVRLYALGGSEAELAEFE FDIAAFEEWLQLYKGKGNPEVEALNMEAFAIT DELCAYRHN CD 123 3,6
543 MGSWEEFDVRLDAIFNRLWALGGSEAELAEFE FDIAWFEMDLQEYKGKGNPEVEALFDEAEAIT NELVAYRHN CD 123 4,7
544 MGSWEEFDKRLDAITRRLMALGGSEAELAEFE STIAWFEWDLQEYKGKGNPEVEALDWEAYAID YELGAYRHN CD 123 4,5
545 MGSWYEFDHRLEAIYDRLWALGGSEAELAFFE FDIADFEWDLQSYKGKGNPEVEALFDEAAAIG HELLA YRHN CD 123 4,5
546 MGSWNEFDDRLLAIWGRLDALGGSEAELAFFE EQIAGFEDELQWYKGKGNPEVEALDQEAEAIE KELWAYRHN CD 123 4,1
547 MGSWVEFDDRLDAIWERLDALGGSEAELAWF EEQIAVFEHQLQDYKGKGNPEVEALNQEAEAI DLELKAYRHN CD 123 5
548 MGSWTEFDDRLFAIYWRLDALGGSEAELAWFE CD 123 6,4
- 118 043660
EVIAEFENDLQVYKGKGNPEVEALDDEAHAISI ELEAYRHN
549 MGSWSEFDQRLEAIWNRLDALGGSEAELADFE REIAYFENQLQWYKGKGNPEVEALNNEAFAIV DELGAYRHN CD 123 3,4
550 MGSWYEFDERLWAIWERLDALGGSEAELAHFE WVIADFENDLQWYKGKGNPEVEALEFEAEAIV TELHAYRHN CD 123 3,6
551 MGSWMEFDYRLEAIWMRLIALGGSEAELADFE S SIADF EHHLQ S YI< GKGNPE VE A LE WE A F A IG V ELDAYRHN CD 123 3,1
552 MGSWYEFESRLEAIWWRLEALGGSEAELAQFE QYIADFEQHLQWYKGKGNPEVEALDWEADAI WLELQAYRHN CD 123 4,4
553 MGSWEEFYMRLVAIHMRLRALGGSEAELAVFE NYIAEFEEYLQYYKGKGNPEVEALTIEADAIGT ELGAYRHN CD 123 4,4
554 MGSWDEFYYRLVAITHRLHALGGSEAELAWFE DDIAGFEWDLQTYKGKGNPEVEALYKEAGAIG MELTAYRHN CD 123 5,4
555 MGSWEEFDTRLLAIFGRLGALGGSEAELALFE MLIAKFEDDLQNYKGKGNPEVEALSEEAFAIDH ELGAYRHN CD 123 6,7
556 MGSWREFDQRLWAIDWRLEALGGSEAELAMF EWMIATFEDDLQWYKGKGNPEVEALYREAFAI DWELDAYRHN CD 123 3,4
557 MGSWEEFHERLDAIDERLEALGGSEAELAFFED DIASFEDWLQWYKGKGNPEVEALSREADAINF ELEAYRHN CD 123 4,3
558 MGSWNEFYERLEAIDRRLFALGGSEAELALFE WMIADFEDDLQMYKGKGNPEVEALINEAGAIG FELEAYRHN CD 123 5,2
- 119 043660
559 MGSWTEFTQRLEAIVDRLFALGGSEAELAEFEN SIADFEWDLQWYKGKGNPEVEALNREAVAIDN ELWAYRHN CD 123 3,9
560 MGSWVEFIMRLDAIYERLDALGGSEAELAEFE WHIADFEDHLQWYKGKGNPEVEALFEEADAI WEELWAYRHN CD 123 6,4
561 MGSWNEFLLRLDAIEHRLFALGGSEAELAEFE WEIADFEDDLQWYKGKGNPEVEALVEEAEAID VELVAYRHN CD 123 3,2
562 MGSWYEFNMRLGAIDDRLQALGGSEAELAWF EDMIAIFEDDLQIYKGKGNPEVEALEQEAAAIH QELWAYRHN CD 123 3,8
563 MGSWEEFHWRLGAIDARLEALGGSEAELAWFE DGIADFEAILQDYKGKGNPEVEALDSEAVAIHH ELWAYRHN CD 123 3,3
564 MGSWYEFYERLWAIDDRLWALGGSEAELAEFE DSIATFEPSLQMYKGKGNPEVEALVAEAWAIFD ELAAYRHN CD 123 3,6
565 MGSWFEFDQRLDAITFRLWALGGSEAELAEFE DVIALFEYHLQDYKGKGNPEVEALEVEAWAIF HELGAYRHN CD 123 3,2
566 MGSWSEFWFRLDAIEDRLWALGGSEAELAEFE DNIALFEYSLQHYKGKGNPEVEALVKEANAID DELGAYRHN CD 123 4,5
567 MGSWYEFWDRLTAIEHRLWALGGSEAELAYFE DSIAHFEGSLQVYKGKGNPEVEALYKEAEAIE WELEAYRHN CD 123 4,4
568 MGSWYEFDDRLWAIFDRLFALGGSEAELAFFE DSIAEFEEELQHYKGKGNPEVEALYLEAWAIEN ELGAYRHN CD 123 4,7
569 MGSWNEFVERLSAIDHRLWALGGSEAELADFE QQIAEFEIHLQEYKGKGNPEVEALDFEADAIFD CD 123 3,2
- 120 043660
ELLAYRHN
570 MGSWSEFVDRLDAIFDRLWALGGSEAELAWFE DTIAHFEWNLQEYKGKGNPEVEALNGEADAIT DELHAYRHN CD 123 5,3
571 MGSWAEFDSRLDAIAQRLFALGGSEAELAHFE DFIAQFEYSLQEYKGKGNPEVEALSNEADAIFN ELKAYRHN CD 123 3,6
572 MGSWAEFDSRLIAIFDRLWALGGSEAELAWFE DDIAQFEQHLQAYKGKGNPEVEALRQEADAIT FELKAYRHN CD 123 3,6
573 MGSWTEFEERLEAIWDRLYALGGSEAELAAFE WDIAYFEDGLQEYKGKGNPEVEALFMEAEAIIR ELKAYRHN CD 123 5,9
574 MGSWYEFEDRLAAIWDRLNALGGSEAELAIFE WDIAWFEEGLQEYKGKGNPEVEALKHEASAIQ TELFAYRHN CD 123 6,4
575 MGSWLEFESRLWAIWDRLDALGGSEAELAHFE QDIADFEMSLQEYKGKGNPEVEALIREAEAIET ELYAYRHN CD 123 3,4
576 MGSWMEFEDRLIAIWARLDALGGSEAELAWFE ADIADFEESLQEYKGKGNPEVEALIFEAIAINKE LMAYRHN CD 123 3,7
577 MGSWFEFTIRLEAIQDRLDALGGSEAELAWFE WDIAEFEEGLQFYKGKGNPEVEALHTEADAIM NELVAYRHN CD 123 3,5
578 MGSWYEFVSRLDAIEYRLWALGGSEAELAWFE WDIADFEQGLQFYKGKGNPEVEALAQEANAIG SELTAYRHN CD 123 3,2
579 MGSWEEFDYRLYAIQDRLYALGGSEAELAFFE WEIADFEHMLQMYKGKGNPEVEALFQEADAro AELHAYRHN CD 123 4,4
580 MGSWIEFFHRLDAIQDRLDALGGSEAELAYFE CD 123 3,5
- 121 043660
WAIADFEHMLQLYKGKGNPEVEALQFEAFAIE GELYAYRHN
581 MGSW YEF S S RLN AIDD RLW A LGG SE A ELA YF E TDIADFESLLQWYKGKGNPEVEALLNEADAID YELYAYRHN CD 123 3,8
582 MGSWFEFEYRLDAIIDRLFALGGSEAELAEFES MIANFEYSLQEYKGKGNPEVEALYFEADAIVDE LTAYRHN CD 123 4
583 MGSWLEFEYRLDAIYDRLFALGGSEAELAAFE QDIADFEI<YLQYYI<GI<GNPEVEALWEEADAIM WELFAYRHN CD 123 3,1
584 MGSWHEFEERLMAIEDRLWALGGSEAELAEFE QWIALFEYDLQEYKGKGNPEVEALGMEAFAIN NELSAYRHN CD 123 5,8
585 MGSWYEFEERLDAIEDRLIALGGSEAELAIFEDI IAFFEQDLQYYKGKGNPEVEALEMEAEAISIEL DAYRHN CD 123 4,1
586 MGSWHEFEKRLYAIEDRLIALGGSEAELAWFE DSIAWFEWDLQMYKGKGNPEVEALNEEADAIY QELDAYRHN CD 123 3,6
587 MGSWIEFEDRLDAITDRLWALGGSEAELAEFEH QIAFFEEDLQWYKGKGNPEVEALHMEAEAIME ELGAYRHN CD 123 9,5
588 MGSWMEFEDRLMAIVDRLWALGGSEAELADF EWNIAMFEEELQWYKGKGNPEVEALGDEAEAI EWELYAYRHN CD 123 6,8
589 MGSWEEFEDRLFAIDSRLWALGGSEAELAEFE NIIASFEEVLQEYKGKGNPEVEALSVEAFAIDRE LGAYRHN CD 123 3,7
590 MGSWEEFLFRLEAIQDRLWALGGSEAELAWFE YEIASFEDVLQSYI<GI<GNPEVEALSTEAI<AIDY ELFAYRHN CD 123 8,2
- 122 043660
591 MGS WVEFDNRLFAIDERLW ALGGSEAEL AWFE EEIASFEDNLQKYKGKGNPEVEALQLEAFAIME ELDAYRHN CD 123 3,3
592 MGSWFEFDDRLEAIFDRLWALGGSEAELAMFE FAIAEFEDALQEYKGKGNPEVEALYEEAVAIDE ELYAYRHN CD 123 4,1
593 MGSWFEFDARLMAINDRLWALGGSEAELAAFE YHIALFEDQLQMYKGKGNPEVEALTLEAVAIN EELWAYRHN CD 123 4
594 MGSWVEFDSRLAAIDYRLEALGGSEAELAWFE YTIANFEHTLQMYKGKGNPEVEALVYEAHAIA TELQAYRHN CD 123 3,4
595 MGSWTEFDERLDAIDWRLEALGGSEAELAWFE GDIALFEQYLQVYKGKGNPEVEALMEEADAIK AELDAYRHN CD 123 4,5
596 MGSWIEFDERLDAIDFRLWALGGSEAELAWFE GWIAEFESDLQLYKGKGNPEVEALNEEANAIFH ELSAYRHN CD 123 7
597 MGSWWEFDSRLDAIDFRLWALGGSEAELAWF EVEIADFEDWLQLYKGKGNPEVEALWHEADAI VTELYAYRHN CD 123 3,2
598 MGSWYEFDERLDAIFDRLWALGGSEAELAYFE QVIATFEKTLQRYKGKGNPEVEALDTE AKAIS WELDAYRHN CD 123 3
599 MGS WYEFQERLD AID SRLW ALGGSEAEL AWFE YTIAEFEKELQMYKGKGNPEVEALGTEAVAISE ELMAYRHN CD 123 5,5
600 MGSWEEFEDRLWAIDGRLYALGGSEAELAWFE QWIATFEEDLQDYKGKGNPEVEALEYEASAIFE ELEAYRHN CD 123 9,4
601 MGSWFEFGDRLEAIDERLYALGGSEAELAQFE WWIAEFEHHLQDYKGKGNPEVEALEYEADAI CD 123 4,5
- 123 043660
WGELHAYRHN
602 MGSWFEFNDRLDAISERLSALGGSEAELAYFE WQIAVFEKTLQNYKGKGNPEVEALTLEANAIFE ELEAYRHN CD 123 3,9
603 MGSWVEFMDRLEAIEERLSALGGSEAELAFFE WEIAEFEEHLQVYKGKGNPEVE ALEWEAL AIT EELAAYRHN CD 123 4
604 MGSWIEFMDRLWAIDQRLWALGGSEAELAWF EEEIAWFEEELQVYKGKGNPEVEALEWEATAIS EELWAYRHN CD 123 6,5
605 MGSWEEFNWRLRAIDERLFALGGSEAELAWFE YDIAEFEEQLQVYKGKGNPEVEALRVEAAAIAE ELYAYRHN CD 123 5,4
606 MGSWWEFEIRLDAIDERLWALGGSEAELAWFE QSIAFFENDLQVYKGKGNPEVEALRWEANAIIE ELFAYRHN CD 123 3,2
607 MGSWYEFEWRLDAIDRRLWALGGSEAELADF EEEIADFEWMLQNYKGKGNPEVEALVDEASAI QTELWAYRHN CD 123 10
608 MGSWYEFVYRLRAIDERLDALGGSEAELAMFE FEIAFFEDQLQRYKGKGNPEVEALVDEAQAIDF ELFAYRHN CD 123 4,5
609 MGSWWEFEDRLYAIDDRLWALGGSEAELAQF EREIAQFEIWLQEYKGKGNPEVEALDDEATAIN SELFAYRHN CD 123 5,5
610 MGSWDEFEFRLEAIDSRLWALGGSEAELAVFE YEIAQFEFMLQEYKGKGNPEVEALGMEAWAIE NELFAYRHN CD 123 3,6
611 MGSWEEFEWRLDAIDERLWALGGSEAELATFE YEIAIFENELQQYKGKGNPEVEALDSEAYAIER ELGAYRHN CD 123 4,3
612 MGSWYEFFDRLDAIDERLWALGGSEAELAWFE CD 123 3,7
- 124 043660
AEIAEFEMELQGYKGKGNPEVEALDVEAHAIE MELFAYRHN
613 MGSWYEFMGRLEAIDERLQALGGSEAELAWFE HEIAEFEWSLQWYKGKGNPEVEALRFEAGAIP WELWAYRHN CD 123 3,5
614 MGS WVEF S NRLD AIW ERLQ A LGGS E A ELA YFE W EI A EF E WELQ S YKGKGN PE VE A LN A E A D AIE WELEAYRHN CD 123 5,1
615 MGSWEEFHMRLIAIDERLWALGGSEAELAGFE ESIAYFESQLQDYKGKGNPEVEALDYEAHAIW RELYAYRHN CD 123 3,9
616 MGSWWEFKYRLDAICFRLAALGGSEAELASFE DEIAYFEEDLQGYKGKGNPEVEALDYEALAIW DELAAYRHN CD 123 3,1
617 MGSWDEFAMRLEAIQARLFALGGSEAELAIFED EIAFFETMLQDYKGKGNPEVEALEYEAAAIEAE LGAYRHN CD 123 3,7
618 MGSWWEFNARLDAIEDRLMALGGSEAELAYF EDIIASFENILQQYKGKGNPEVEALWYEAYAIE KELNAYRHN CD 123 3,4
619 MGSWIEFWNRLEAIEERLYALGGSEAELAYFED EIAEFEIYLQQYI<GI<GNPEVEALI<HEAEAINI<E LMAYRHN CD 123 5,2
620 MGSWNEFVIRLFAIDDRLYALGGSEAELAWFE DEIATFEYELQRYKGKGNPEVEALEYEAEAIVS ELFAYRHN CD 123 3,5
621 MGSWYEFLARLYAIDERLWALGGSEAELATFE HWIADFEEQLQSYKGKGNPEVEALTDEAVAIG EELSAYRHN CD 123 4,5
622 MGSWLEFETRLHAIDERLWALGGSEAELAEFE EHIAWFEEDLQFYKGKGNPEVEALDFEADAIG WELWAYRHN CD 123 4,6
- 125 043660
623 MGSWFEFETRLEAIDLRLWALGGSEAELATFED VIAFFEDWLQFYKGKGNPEVEALKMEAWAIGE ELHAYRHN CD 123 6,6
624 MGSWHEFWQRLEAIEGRLWALGGSEAELADFE SLIADFEEQLQEYKGKGNPEVEALMAEAEAIDN ELRAYRHN CD 123 7
625 MGSWYEFEQRLEAIEWRLGALGGSEAELATFE EDIADFEEWLQEYKGKGNPEVEALQYEAYAIA EELHAYRHN CD 123 4,4
626 MGSWYEFENRLFAIEERLWALGGSEAELAWFE YEIANFEWGLQSYKGKGNPEVEALDNEAEAIDI ELAAYRHN CD 123 3,3
627 MGSWYEFEQRLGAIEERLWALGGSEAELAAFE DIIAYFEYQLQSYKGKGNPEVEALDEEAWAIDD ELWAYRHN CD 123 10,6
628 MGSWWEFEQRLDAIETRLWALGGSEAELAYFE HIIADFEDELQIYKGKGNPEVEALGWEAFAIDG ELTAYRHN CD 123 4,7
629 MGSWFEFPYRLEAIEERLYALGGSEAELAQFEQ FIAWFEMDLQDYKGKGNPEVEALWFEANAIVE ELDAYRHN CD 123 3,1
630 MGSWVEFYDRLEAIEIRLWALGGSEAELADFES FIAHFEDDLQAYKGKGNPEVE ALMDEAN AIVF ELDAYRHN CD 123 4
631 MGSWVEFWDRLDAIEERLWALGGSEAELAEFE FMIAMFEQHLQEYKGKGNPEVEALIPEAGAIDK ELTAYRHN CD 123 10
632 MGSWDEFDARLWAIEERLWALGGSEAELAEFE FMIAAFEDVLQEYKGKGNPEVEALMGEANAIV MELDAYRHN CD 123 4,3
633 MGSWYEFWRRLDAIEERLWALGGSEAELAMF ETDIAGFEWMLQLYKGKGNPEVEALEHEAWAI CD 123 3,6
- 126 043660
NSELDAYRHN
634 MGSWHEFIWRLDAIEERLWALGGSEAELAWFE TEIATFEAQLQDYKGKGNPEVEALEWEAIAIAW ELDAYRHN CD 123 3,3
635 MGSWYEFYWRLEAIEERLWALGGSEAELAEFE К AIATFEDQLQTYKGKGNPEVE ALETEAL AIHA ELEAYRHN CD 123 3,7
636 MGS WFEFQWRLEAIEDRLW ALGGSE AEL AEFE TIIAGFEEQLQVYKGKGNPEVEALEEEAMAIQT ELHAYRHN CD 123 3,4
637 MGSWWEFEDRLWAIEQRLDALGGSEAELAVFE NSIAKFEDMLQVYKGKGNPEVEALHEEADAII WELYAYRHN CD 123 4,4
638 MGSWWEFEDRLWAIDRRLMALGGSEAELAVF EQMIAHFEQILQVYKGKGNPEVEALHFEAHAIG MELAAYRHN CD 123 4,6
639 MGSWWEFLDRLEAIEYRLQALGGSEAELAVFE WEIAMFEDHLQGYKGKGNPEVEALHSEAHAIIS ELSAYRHN CD 123 3,1
640 MGSWAEFEDRLAAIERRLEALGGSEAELADFES SI AWFEPDLQ YYKGKGNPEVE ALMYE AEAIF SE LYAYRHN CD 123 4,2
641 MGSWWEFYDRLTAIEARLWALGGSEAELADFE EGIADFEYDLQDYKGKGNPEVEALFWEAWAIQ SELTAYRHN CD 123 3,2
642 MGSWYEFEDRLAAIEARLWALGGSEAELADFE EEIAYFEHGLQWYKGKGNPEVE ALESEAM AIID ELHAYRHN CD 123 3,8
643 MGS WWEF S WRLEAIETRLD A LGGS E A EL AFFE MDIAWFEQDLQLYKGKGNPEVEALEEEAYAIY EELEAYRHN CD 123 3,3
644 MGSWEEFFFRLEAIDDRLYALGGSEAELALFEE CD 123 3,2
- 127 043660
VIAYFEQDLQWYKGKGNPEVEALYVEAYAIQE ELYAYRHN
645 MGSWFEFEERLNAISWRLHALGGSEAELAYFE EDIAWFEDDLQFYKGKGNPEVEALENEAYAIW EELDAYRHN CD 123 13
646 MGSWFEFEERLEAIIYRLWALGGSEAELAMFEE SIAWFESDLQQYKGKGNPEVEALEYEAMAISK ELKAYRHN CD 123 3,7
647 MGSWAEFDDRLEAIEYRLHALGGSEAELAWFE EGIAGFEHALQSYKGKGNPEVEALETEAGAINE ELWAYRHN CD 123 5,8
648 MGSWDEFEERLQAIEYRLWALGGSEAELAWFE EVIAQFEYDLQKYKGKGNPEVEALSTEAQAIQD ELWAYRHN CD 123 3,8
649 MGSWWEFTDRLDAIFDRLWALGGSEAELAAFE ESIAIFEQDLQYYKGKGNPEVEALEYEANAIQY ELEAYRHN CD 123 7,5
650 MGSWWEFTDRLEAIEDRLWALGGSEAELAHFE DSIAQFEQELQWYKGKGNPEVEALADEADAIE SELHAYRHN CD 123 16,6
651 MGSWVEFFWRLDAIEDRLWALGGSEAELANFE FEIADFEAWLQKYKGKGNPEVEALHSEADAIQ LELRAYRHN CD 123 4
652 MGSWVEFYNRLDAIENRLWALGGSEAELAFFE ELIAQFEFALQDYKGKGNPEVE ALEDEAD AIWE ELMAYRHN CD 123 6,9
653 MGSWEEFYYRLHAIDNRLWALGGSEAELAYFE WHIADFELELQDYKGKGNPEVEALSEEATAIFE ELWAYRHN CD 123 3
654 MGSWREFHDRLFAIDGRLWALGGSEAELANFE WDIADFEFELQDYKGKGNPEVEALSWEADAIM QELGAYRHN CD 123 5,6
- 128 043660
655 MGSWEEFDERLWAISDRLWALGGSEAELAYFE GEIAYFEQNLQTYKGKGNPEVEALQTEALAIDT ELWAYRHN CD 123 6,5
656 MGSWEEFEQRLWAIDDRLWALGGSEAELAFFE YEIAEFEMDLQWYKGKGNPEVEALFYEAHAIN EELWAYRHN CD 123 5,7
657 MGSWDEFHQRLAAIGDRLWALGGSEAELAYFE WEIATFEWDLQVYKGKGNPEVEALYFEATAID EELMAYRHN CD 123 3,7
658 MGSWVEFEYRLDAISDRLWALGGSEAELAFFE NEIASFESDLQFYKGKGNPEVEALMFEAEAIDD ELHAYRHN CD 123 6,5
659 MGSWDEFDTRLDAIFSRLYALGGSEAELAMFE GEIAEFEGSLQHYKGKGNPEVEALDFEAHAIDE ELWAYRHN CD 123 4
660 MGSWHEFDDRLDAIMSRLDALGGSEAELATFE AEIATFEFVLQLYKGKGNPEVEALLAEAYAIDW ELEAYRHN CD 123 7,7
661 MGSWYEFFDRLDAIYDRLYALGGSEAELASFE AQIAEFEVELQ S YKGKGNPEVEALEWE AW AID EELYAYRHN CD 123 4,7
662 MGSWFEFLYRLDAIEDRLWALGGSEAELAEFE QEIAKFESELQ S YKGKGNPEVEALEWE AH AID MELEAYRHN CD 123 6,6
663 MGSWLEFEDRLVAIDHRLFALGGSEAELAEFEE EIALFESYLQDYKGKGNPEVEALNWEADAIHA ELYAYRHN CD 123 3,9
664 MGSWYEFESRLDAIVDRLWALGGSEAELAEFE YEIAI<FEWELQDYI<GI<GNPEVEALNWEAGAIE FELYAYRHN CD 123 5,1
665 MGSWYEFEDRLDAILYRLLALGGSEAELAWFE RDIAFFESELQWYKGKGNPEVEALEWEAMAID CD 123 4,3
- 129 043660
DELFAYRHN
666 MGSWGEFMDRLEAIDYRLWALGGSEAELAWF ESDIAEFEQELQMYKGKGNPEVEALWDEAMAI RDELFAYRHN CD 123 4,6
667 MGSWEEFDDRLDAIEHRLWALGGSEAELADFE GSIAAFESWLQVYKGKGNPEVEALEAEAEAIA DELWAYRHN CD 123 4
668 MGS WYEFADRLDAIMDRL VALGGSEAEL A YFE WEIAAFEEFLQMYKGKGNPEVEALDEEAEAIK DELMAYRHN CD 123 3,3
669 MGSWNEFWERLDAIEWRLFALGGSEAELAFFE LDIAWFEEELQWYKGKGNPEVEALIFEAHAITL ELDAYRHN CD 123 3
670 MGSWYEFDARLDAIEERLYALGGSEAELAAFE FEIAGFEEALQWYKGKGNPEVE ALLKE AEAITD ELYAYRHN CD 123 8,9
671 MGS WDEF SERLD AIWGRLEALGGSEAEL ATFE FHIAEFEHELQYYKGKGNPEVEALQGEAAAIIN ELYAYRHN CD 123 3,2
672 MGSWDEFWDRLDAIEDRLFALGGSEAELADFE RVIAWFENDLQEYKGKGNPEVEALDNEADAIRI ELHAYRHN CD 123 3,9
673 MGSWDEFDDRLEAIVDRLFALGGSEAELAMFE FEIAQFEHQLQYYKGKGNPEVEALRDEADAIWI ELDAYRHN CD 123 5,6
674 MGSWEEFTIRLGAIYWRLFALGGSEAELANFE WFIAEFEYELQPYKGKGNPEVEALVIEANAIDG ELQAYRHN CD 123 3,3
675 MGSWFEFEWRLDAIENRLNALGGSEAELAWFE YHIAAFEDSLQHYKGKGNPEVEALEWEAHAIQ SELQAYRHN CD 123 3,3
676 MGSWYEFDDRLEAIWDRLGALGGSEAELAAFE CD 123 3,3
- 130 043660
I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEWLRETAADIRA ELQAYRHN
677 MGSWGEFWARLEAIWIRLDALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEWLREEAADIRR SLQAYRHN CD 123 15
678 MGSWIEFEVRLDAIWDRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRDEAADIRQ SLQAYRHN CD 123 4,2
679 MGSWTEFDRRLDAIWDRLFALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEWLREEAADIRD YLQAYRHN CD 123 9,2
680 MGSWTEFDMRLDAIWDRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELREEAATIRG VLQAYRHN CD 123 3,1
681 MGSWEEFHDRLMAIETRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRYEAADIR DYLQAYRHN CD 123 4,3
682 MGSWVEFRDRLDAIETRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRYEAAEIR MVLQAYRHN CD 123 4,2
683 MGSWMEFIDRLDAIEHRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLREEAAEIRM YLQAYRHN CD 123 4,3
684 MGSWTEFVWRLDAIEWRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLREEAAEIRD WLQAYRHN CD 123 4,2
685 MGSWVEFYDRLYAIEVRLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRQEAAEIRD WLQAYRHN CD 123 5,8
686 MGSWYEFYDRLDAIEWRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRDEAAQIR DFLQAYRHN CD 123 6,2
- 131 043660
687 MGSWVEFYDRLDAIEHRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRDEAAFIRD MLQAYRHN CD 123 3,4
688 MGSWFEFVDRLTAIQVRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLREEAALIRY SLQAYRHN CD 123 5,1
689 MGSWFEFLDRLDAIEERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREEAAVIRD SLQAYRHN CD 123 12,2
690 MGSWYEFMVRLDAIEERLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLREEAASIRY HLQAYRHN CD 123 4,1
691 MGSWYEFEDRLDAIQWRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRESAANIR QHLQAYRHN CD 123 6,3
692 MGSWSEFEYRLFAIENRLDALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLREEAAMIRQL LQAYRHN CD 123 3,2
693 MGSWVEFEYRLDAITERLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEILREEAAFIRQ WLQAYRHN CD 123 3,9
694 MGSWWEFLDRLDAIEMRLFALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLREEAALIRN MLQAYRHN CD 123 9
695 MGSWWEFEDRLDAIEYRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLREEAAFIRIF LQAYRHN CD 123 4,9
696 MGSWWEFESRLDAIFMRLTALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLREDAAFIRE FLQAYRHN CD 123 3,7
697 MGSWVEFWHRLDAIKARLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRWYAADFR CD 123 3,5
- 132 043660
LILQAYRHN
698 MGSWYEFYNRLSAIYARLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRWYAADIR YMLQAYRHN CD 123 10,6
699 MGSWYEFYDRLSAIYARLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRWYAADIR YMLQAYRHN CD 123 5,3
700 MGSWNEFYDRLSAIYFRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRWYAADIR MILQAYRHN CD 123 10,6
701 MGSWNEFYDRLSAIYFRLQALGGFEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRWYAADIR MILQAYRHN CD 123 9
702 MGSWEEFYDRLGAIFARLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRWYAADIR MILQAYRHN CD 123 3,9
703 MGSWVEFYDRLHAIYFRLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRWYAADIR LVLQAYRHN CD 123 4,8
704 MGSWKEFDNRLYAIEDRLRALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRWYAADIR MILQAYRHN CD 123 3,9
705 MGSWVEFWDRLWAIEDRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRHYAADIR VWLQAYRHN CD 123 4,5
706 MGSWYEFADRLWAIEDRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRYYAADIR WVLQAYRHN CD 123 4
707 MGSWYEFEERLYAIEDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRQEAADIRL MLQAYRHN CD 123 H,5
708 MGSWTEFEWRLYAIEDRLMALGGSEAELAAFE CD 123 4,2
- 133 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRDEAADIRQ YLQAYRHN
709 MGSWIEFESRLWAIEDRLLALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRLEAADIRED LQAYRHN CD 123 8,7
710 MGSWFEFEDRLDAIWDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRMD AAMIR YILQAYRHN CD 123 5,1
711 MGSWEEFEDRLWAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEILRYDAAYIREI LQAYRHN CD 123 4,1
712 MGSWIEFEDRLYAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRYEAAEIRY WLQAYRHN CD 123 4
713 MGSWYEFWDRLEAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRYSAAEIRY QLQAYRHN CD 123 4,2
714 MGSWVEFESRLAAIEHRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELREYAAEIRD WLQAYRHN CD 123 3,7
715 MGSWWEFEHRLFAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRDYAAEIRD YLQAYRHN CD 123 7,6
716 MGS WYEFD SRLM AIEDRLWALGGSEAEL A A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRQEAAEIRM ILQAYRHN CD 123 3,2
717 MGSWYEFEWRLMAIEDRLWALGGSEAELAAF EI<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRHEAAEIR DVLQAYRHN CD 123 3,4
718 MGSWYEFYNRLDAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRQEAADIRG QLQAYRHN CD 123 H,3
- 134 043660
719 MGSWWEFHDRLEAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRIEAADIRR QLQAYRHN CD 123 6,4
720 MGSWYEFWDRLEAIEERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRLEAADIRR ILQAYRHN CD 123 4,6
721 MGSWYEFEERLWAIEERLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRYEAAWIR DFLQAYRHN CD 123 5,4
722 MGSWYEFENRLEAIEERLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEMLREEAAFIRD WLQAYRHN CD 123 6,1
723 MGSWYEFEYRLEAIEDRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLREEAAWIRV WLQAYRHN CD 123 6,2
724 MGSWYEFENRLGAIGDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRDEAAYIR AVLQAYRHN CD 123 4,8
725 MGSWYEFEHRLDAIYDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREEAAWIR L WLQAYRHN CD 123 6,3
726 MGSWYEFEWRLDAIYDRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREDAAEIRA LLQAYRHN CD 123 6
727 MGSWVEFENRLEAIENRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREDAAQIR MMLQAYRHN CD 123 6,2
728 MGSWYEFEERLEAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREQAAFIRT MLQAYRHN CD 123 6
729 MGSWFEFEWRLEAIFDRLYALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEVLRAEAAEIRL CD 123 6,9
- 135 043660
RLQAYRHN
730 MGSWWEFEDRLMAIYDRLYALGGSEAELAAF EI<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRAEAALIR ETLQAYRHN CD 123 15,3
731 MGSWFEFEDRLYAIEDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRWGAATIR DELQAYRHN CD 123 4,7
732 MGSWIEFWDRLEAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRDEAAWIRD SLQAYRHN CD 123 4,5
733 MGSWFEFWDRLDAIEDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRDEAAWIRG TLQAYRHN CD 123 4,9
734 MGSWEEFTDRLWAIEDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRDEAAFIRK SLQAYRHN CD 123 8,9
735 MGSWVEFVDRLEAIEDRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRDQAAYIRF MLQAYRHN CD 123 4,9
736 MGSWFEFVDRLEAIEMRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRWRAAMIR YDLQAYRHN CD 123 7,1
737 MGSWWEFEMRLEAIEDRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRWEAAFIRD ILQAYRHN CD 123 4
738 MGSWFEFEIRLEAIEDRLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLRDEAAEIRQV LQAYRHN CD 123 3
739 MGSWYEFYQRLEAIEDRLFALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEWLRDEAAEIRV VLQAYRHN CD 123 3
740 MGSWIEFEDRLEAIEDRLFALGGSEAELAAFEK CD 123 21,8
- 136 043660
EIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQEAAEIRL MLQAYRHN
741 MGSWHEFYDRLDAIYFRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRLLAAEIRK ELQAYRHN p26 9,6
742 MGSWHEFITRLEAIDQRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRFWAAEIRF ILQAYRHN p26 16,91
743 MGSWMEFFDRLVAIDERLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRMWAAEIR FLLQAYRHN p26 18,62
744 MGS WVEF SGRLIAIDNRLW A EGGS E A ELA A F E I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRMWAAEIR YILQAYRHN p26 5,28
745 MGSWVEFHHRLFAIDERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRMVAAEIR YILQAYRHN p26 21,39
746 MGSWHEFMERLIAIDGRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRFVAAFIRD VLQAYRHN p26 17,85
747 MGSWKEFIQRLDAIHYRLWALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRFVAAFIRF ELQAYRHN p26 18,41
748 MGSWSEFIFRLDAIHSRLQALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEYLRFIAAEIRL1<L QAYRHN p26 28,3
749 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRVHAAAIRE WLQAYRHN p26 5,92
750 MGSWLEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRVHAAAIRE WLQAYRHN p26
- 137 043660
751 MGSWFEFYHRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRVHAAAIRE WLQAYRHN p26
752 MGSWFEFYDRLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRVHAAAIRE WLQAYRHN p26
753 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRVHAAAIRE WLQAYRHN p26
754 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRDHAAAIRE WLQAYRHN p26
755 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLREHAAAIRE WLQAYRHN p26
756 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRVHAAHIRE WLQAYRHN p26
757 MGSWLEFYHRLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRVHAAAIRE WLQAYRHN p26
758 MGSWLEFYHRLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRDHAAHIRE WLQAYRHN p26 19,23
759 MGSWFEFYHRLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRDHAAHIRE WLQAYRHN p26
760 MGSWLEFYDRLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRDHAAHIRE WLQAYRHN p26
761 MGSWLEFYHRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRDHAAHIRE p26
- 138 043660
WLQAYRHN
762 MGSWLEFYHRLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRDHAAHIRE WLQAYRHN p26
763 MGSWLEFYHRLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRVHAAHIRE WLQAYRHN p26
764 MGSWLEFYHRLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRDHAAAIRE WLQAYRHN p26
765 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRDHAAHIRE WLQAYRHN p26
766 MGSWFEFYERLNAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRAHAASIRT WLQAYRHN p26 27,1
767 MGSWIEFYWRLEAIDQRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRVHAAAIR WWLQAYRHN p26 9,4
768 MGSWSEFVKRLDAIDQRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRVHAAAIRA WLQAYRHN p26 27
769 MGSWEEFYYRLEAIDARLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRVHAAHIRD WLQAYRHN p26 30,3
770 MGSWVEFHYRLQAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRVHAAHIRK WLQAYRHN p26 14,8
771 MGSWVEFVGRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRHHAAEIRN WLQAYRHN p26 26
772 MGSWNEFMDRLNAIDNRLWALGGSEAELAAF p26 10
- 139 043660
EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRKQAASIR LWLQAYRHN
773 MGSWNEFFQRLNAIDERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRQHAANIR WWLQAYRHN p26 28,7
774 MGSWYEFVVRLFAIDERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREHAAHIRS WLQAYRHN p26 18,25
775 MGSWYEFYLRLDAIDHRLW ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLREHAAHIR К WLQAYRHN p26 16
776 MGSWYEFRARLLAIDERLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLREHAAHIRN FLQAYRHN p26 20,9
777 MGSWTEFWHRLEAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREHAAHIRV WLQAYRHN p26 13,19
778 MGSWTEFQNRLNAIDHRLW ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREHAAKIRV WLQAYRHN p26 30,5
779 MGS WSEFFKRLEAIDRRLW ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELREHAAHIRV WLQAYRHN p26 30,2
780 MGSWYEFQQRLEAIDTRLW ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELREHAAHIRH WLQAYRHN p26 27,3
781 MGSWTEFEKRLHAIDYRLW ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLREHAAAIRH WLQAYRHN p26 17,1
782 MGSWTEFHQRLDAIDERLW ALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEFLREHAAKIRM WLQAYRHN p26 24,4
- 140 043660
783 MGSWLEFSQRLTAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLREHAAKIRN WLQAYRHN p26 30,4
784 MGSWTEFVNRLYAIDSRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEGLRTHAAKIRH WLQAYRHN p26 16,7
785 MGS WMEF VDRL SAIDRRLW ALGGSE AELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLREHAANIRQ WLQAYRHN p26 32,1
786 MGSWVEFVSRLYAIDFRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALREHAAQIRD WLQAYRHN p26 29
787 MGSWSEFHTRLDAIDTRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRRHAAAIRF WLQAYRHN p26 23,5
788 MGSWLEFHSRLDAIDTRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLREHAAAIRH YLQAYRHN p26 30,8
789 MGSWTEFYQRLDAIDTRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEGLRQQAAQIRA WLQAYRHN p26 29,7
790 MGS W AEF SDRLNAIDQRLW ALGGSE AEL A A F E KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEILREHAAEIRKF LQAYRHN p26 25,3
791 MGSWMEFNHRLQAIDGRLWALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLREHAAAIR AFLQAYRHN p26 33,4
792 MGSWYEFYKRLEAIDNRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLREHAAAIRH WLQAYRHN p26 30,8
793 MGSWYEFYYRLEAIDNRLIALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEVLREHAAI<IREW p26 29,6
- 141 043660
LQAYRHN
794 MGSWYEFVSRLEAIDDRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEMLRQHAAAIR HWLQAYRHN p26 33,1
795 MGSW YEF SHRLEAIEDRLF ALGGSE AEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEPLREHAAYIRHW LQAYRHN p26 26
796 MGSWFEFFERLAAIEDRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRVHAAAIRA FLQAYRHN p26 20,3
797 MGSWIEFKYRLDAIEWRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRIHAAAIRT WLQAYRHN p26 18,3
798 MGSWYEFMYRLDAIEYRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRIHAAMIRE WLQAYRHN p26 19,4
799 MGSWVEFVTRLEAIEDRLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRAHAAHIRH WLQAYRHN p26 11,7
800 MGSWYEFVIRLDAIEDRLFALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRVHAAHIRV WLQAYRHN p26 30,1
801 MGSWVEFVERLDAIEFRLFALGGSEAEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRNHAAHIRS WLQAYRHN p26 23,8
802 MGSWSEFVHRLDAIEVRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRYHAAKIRS WLQAYRHN p26 16,9
803 MGSWSEFYYRLAAIESRLF AL GGSEAEL AAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVERLREHAAHIRRW LQAYRHN p26 30,8
804 MGSWYEFYLRLSAIEDRLFALGGSEAEL AAFEK p26 27,4
- 142 043660
EIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRVQAAHIRTW LQAYRHN
805 MGSWYEFYDRLDAIEDRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRDQAAYIRT WLQAYRHN p26 31,9
806 MGSWHEFWVRLEAIESRLFALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRVQAAHIRS WLQAYRHN p26 26,9
807 MGSWVEFYHRLEAIEQRLMALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREQAAAIRS WLQAYRHN p26 28,5
808 MGSWVEFYERLNAIEYRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREHAAYIRQ WLQAYRHN p26 28,7
809 MGSWVEFYHRLDAIFDRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRANAAGIRS WLQAYRHN p26 20
810 MGSWSEFTDRLFAIEDRLLALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRMHAASIRL WLQAYRHN p26 25,4
811 MGSWHEFYDRLYAIWDRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEGLRNAAAVIRI FLQAYRHN p26 22,91
812 MGSWFEF SNRLYAIWHRLT ALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRTQAAFIRIL LQAYRHN p26 15,25
813 MGSWFEF SDRLYAIWERLD ALGGSE AELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRFQAAFIRY QLQAYRHN p26 18,99
814 MGSWFEFEDRLFAIWTRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRQSAASIRW LLQAYRHN p26 10,89
- 143 043660
815 MGSWHEFSERLFAIWTRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRQSAAFIRV MLQAYRHN p26 8,21
816 MGSWGEFTVRLYAIDRRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRRFAAIIRAF LQAYRHN p26 8,54
817 MGSWYEFDHRLMAISFRL VALGGSEAEL AAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRRRAANIRH LLQAYRHN p26 20,1
818 MGSWSIFKYHLADIKLLLEALGGSEAELAYFEF LIADFEFTLQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN p26 20,21
819 MGSWHHFKYFLADIKSILEALGGSEAELAIFEV QIAYFEDLLQSYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN p26 8
820 MGSWLYFKYNLAVIKHWLEALGGSEAELAIFE MSIADFEYELQWYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 13,3
821 MGSWFYFKYELAWIKHWLEALGGSEAELASFE THIAFFEHQLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 13,7
822 MGSWADFKWTLAYIKHRLEALGGSEAELAFFE MEIAYFEQSLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 31,5
823 MGSWAYFKGQLAYIKSGLEALGGSEAELAYFE LRIAYFEHWLQNYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 H,4
824 MGSWENFKDTLAWIKEYLEALGGSEAELAGFE HRIAIFEHYLQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN p26 19,2
825 MGSWVLFKDYLADIKHYLEALGGSEAELANFE HLIANFEGDLQTYKGKGNPEVEALRKEAAAIR p26 13,8
- 144 043660
DELQAYRHN
826 MGSWSLFKHRLANIKVYLEALGGSEAELADFE TFIAYFEKDLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 19,6
827 MGSWEHFKVELAGIKAYLEALGGSEAELALFE WAIADFESILQDYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 18,1
828 MGSWIYFKDELAGIKKYLEALGGSEAELAMFE VAIADFEAILQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 15,9
829 MGSWVLFKQELAWIKWLLEALGGSEAELAAFE EQIARFEHDLQI<YI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 29,5
830 MGSWVLFKQELAWIKWYLEALGGSEAELAAF EWEIAAFEQRLQIYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 22,5
831 MGSWFLFKSELAWIKWRLEALGGSEAELAYFE YQIAEFEF WLQ SYKGKGNPEVEALRKE AAAIR DELQAYRHN p26 25,8
832 MGSWLLFKSELAWIKWYLEALGGSEAELAEFE WNIAEFEI<NLQI<YI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 25,7
833 MGSWLLFKSDLAWIKWRLEALGGSEAELAEFE ESIAMFEHWLQEYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 33,3
834 MGSWLYFKSDLAWIKWRLEALGGSEAELADFE EAIAEFEQALQIYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 21,2
835 MGSWKLFKYELAWIKWRLEALGGSEAELADF EASIAQFEKYLQTYKGKGNPEVEALRKE AAAIR DELQAYRHN p26 23,4
836 MGSWYLFKNELAWIKWRLEALGGSEAELADF p26 31,1
- 145 043660
EMVIAMFEDHLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN
837 MGSWVYFKAHLAFIKWELEALGGSEAELANFE STIAEFEKYLQVYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 20,8
838 MGSWMYFKSHLAWIKWELEALGGSEAELAFF EDNIAQFEYWLQLYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN p26 19,8
839 MGSWTLFKWDLAFIKWQLEALGGSEAELAWF EYEIAAFEDSLQNYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 12,1
840 MGSWILFKEDLAFIKWQLEALGGSEAELAWFE TTIANFESDLQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 23,3
841 MGSWYFFKSRLAYIKVYLEALGGSEAELAGFE WEIAHFEEWLQRYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 30,1
842 MGSWYIFKSELAWIKWYLEALGGSEAELANFE VEIATFETWLQGYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 29,6
843 MGSWYIFKQELASIKLSLEALGGSEAELAHFEA EIAWFEWWLQWYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 19,4
844 MGSWVRFKTELAYIKESLEALGGSEAELAMFE SEIAIFEHSLQTYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN p26 20,5
845 MGSWYLFKTELAAIKYRLEALGGSEAELASFE YEIAWFEHILQFYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN p26 20,1
846 MGSWYWFKYELAEIKWHLEALGGSEAELAHF EHSIA VFESQLQQYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 21,5
- 146 043660
847 MGSWWVFKKTLAEIKWTLEALGGSEAELAYFE AEIAFFEFILQQYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN p26 18,6
848 MGSWVYFKDHLAEIKSQLEALGGSEAELALFE YDIAWFEFILQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 22,1
849 MGSWVYFKHRLAEIKDQLEALGGSEAELAEFE TDIAWFEWMLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN p26 11,1
850 MGSWIIFKTDLARIKNYLEALGGSEAELATFER DIAWFEFMLQIYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRDE LQAYRHN p26 16,7
851 MGSWMHFKQDLAEIKGYLEALGGSEAELAIFE MDIAWFEYMLQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAI RDELQAYRHN p26 18,9
852 MGSWQIFKQDLAAIKDYLEALGGSEAELAIFEF DIAWFEHMLQWYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 17,4
853 MGSWLAFKEDLAHIKSILEALGGSEAELAEFEH DIAWFEYMLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 18,6
854 MGSWFVFKEDLAGIKF ILEAL GGSEAELAMFET DIAWFEYMLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 14,2
855 MGSWTHFKEDLAHIKDRLEALGGSEAELAAFE LDIAWFEFMLQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 30,4
856 MGSWYYFKERLAAIKDRLEALGGSEAELAIFEA DIAWFEFMLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 31,5
857 MGSWYTFKGSLAEIKNRLEALGGSEAELAMFE SDIAWFEFMLQFYKGKGNPEVEALRKEAAAIR p26 32,3
- 147 043660
DELQAYRHN
858 MGSWFTFKDDLAQIKNRLEALGGSEAELANFE MSIAWFEFMLQYYKGKGNPEVEALRKE AAAIR DELQAYRHN p26 30,8
859 MGSWVLFKQDLAMIKQRLEALGGSEAELAMF EYDIAWFEHMLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAI RDELQAYRHN p26 29,7
860 MGSWVEFKRDLANIKQRLEALGGSEAELAQFE MQIAWFEHTLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 30,4
861 MGSWSYFKEDLANIKSSLEALGGSEAELAWFE S SI AWFEHTLQ YYKGKGNPE VEALRKE AAAIR DELQAYRHN p26 H,6
862 MGSWSIFKQDLADIKDSLEALGGSEAELAMFE MDIAWFEHTLQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 16,6
863 MGSWEIFKDDLASIKKVLEALGGSEAELALFES DIAWFELMLQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRD ELQAYRHN p26 27,9
864 MGSWSIFKDDLAVIKERLEALGGSEAELAHFEQ DIAWFEHLLQYYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 25,6
865 MGSWSVFKDDLAQIKDRLEALGGSEAELAQFE LDIAWFEYVLQFYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 30,3
866 MGSWAVFKDSLAHIKDVLEALGGSEAELALFE MDIAWFEYVLQDYKGKGNPEVEALRKE AAAIR DELQAYRHN p26 24,1
867 MGSWIAFKDHLAIIKQRLEALGGSEAELARFEF EIAWFEWMLQYYI<GI<GNPEVEALRI<E AAAIR DELQAYRHN p26 29,9
868 MGSWIHFKNDLAVIKDELEALGGSEAELARFEI p26 17,9
- 148 043660
MIAWFEDALQWYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN
869 MGSWMVFKQDLAEIKANLEALGGSEAELADFE FAIAWFEYELQWYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN p26 17,8
870 MGSWKNFKLELALIKSKLEALGGSEAELAQFE ADIAFFEWSLQWYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN p26 20,6
871 MGSWHSFKQDLAYIKYLLEALGGSEAELAQFE ELIAFFEYYLQTYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN p26 25,6
872 MGSWVVFKSSLAQIKILLEALGGSEAELAIFEV KIAHFEQELQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN p26 8,6
873 MGSWDQFKNSLASIKRVLEALGGSEAELAIFEV I<IAHFEHFLQQYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRDE LQAYRHN p26 15,6
874 MGSWNNFKS SL ASIKQVLEALGGSEAEL AVFEL QIAHFERELQYYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRDE LQAYRHN p26 24,1
875 MGSWVEFGHRLWAIDQRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRQRAAFIRF RLQAYRHN CD137
876 MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFL GEIWAFEMELAAYKGKGNPEVEALGREAAAIR MELQAYRHN CD137 (BB10)
877 MGSWYEFDLRLHAIYDRLVALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEILRDNAAYIRQ MLQAYRHN CD47
878 MGSWHEFHDRLQAIHERLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRIAAAHIRQ VLQAYRHN CTLA4
- 149 043660
879 MGSWNYFKDHLAWIKNSLEALGGSEAELAHFE TAIASFERQLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN DR5
880 MGSWLWFKIFLAEIKYFLEALGGSEAELAAFDF EIHAFHVELFAYKGKGNPEVEVLREVAAEIRW DLQAYRHN KIR
881 MGSWTEFQSRLDAIHSRLRALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVELLRDDAAFIRHF LQAYRHN PDL1
882 MGSWVVFKVDLATIKYILEALGGSEAELAEFEG EIAGFEYSLQFYKGKGNPEVEALRKEAAAIRDE LQAYRHN TIM3
883 MGSWTIFKEWLAFIKTDLEALGGSEAELAFFEG WIASFEMELQKYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN PD1
884 MGSWEEFELRLNAIEERLYALGGSEAELAYFEY VIADFEGNLQRYKGKGNPEVEALYFEADAIFEE LVAYRHN CD19
885 MGSWVVFKQRLAYIKDLLEALGGSEAELAYFE MSIAFFEEDLQVYKGKGNPEVEALRKEAAAIRD ELQAYRHN CD22
886 MGSWVEFYERLDAIDRRLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRVHAASIRA WLQAYRHN p26
887 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRAHAAAIRE WLQAYRHN p26
888 MGSWSEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRVHAAAIRE WLQAYRHN p26
889 MGSWSEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRAHAAAIRE p26
- 150 043660
WLQAYRHN
890 MGSWSEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLKAHAAAIRE WLQAYRHN p26
891 MGSWSEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLQAHAAAIRE WLQAYRHN p26
892 MGSWSEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRAHAAGIRE WLQAYRHN p26
893 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREHAAHIRE WLQAYRHN p26
894 MGSWFEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREHAAAIRE WLQAYRHN p26
895 MGSWSEFYDRLNAIDARLWALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLREHAAAIRE WLQAYRHN p26
896 MGSWVEFEARLSAIYERLEALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRRHAAGIRSN LQAYRHN CS1
897 MGSWVEFFVRLDAIWERLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRFHAAGIRQ KLQAYRHN CS1
898 MGSWTEFNLRLDAIYERLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRWHAAGIR QQLQAYRHN CS1
899 MGSWMEFYDRLDAIWVRLEALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRFHAAGIR EQLQAYRHN CS1
900 MGSWHEFNGRLWAIYARLDALGGSEAELAAFE CS1
- 151 043660
KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRRHAAGIRG ILQAYRHN
901 MGSWYEFVQRLHAINDRLSALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRRHAAGIRY TLQAYRHN CS1
902 MGSWAEFYQRLNAIWNRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEVLRRHAAGIRG QLQAYRHN CS1
903 MGSWVEFNERLHAIYLRLDALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRRHAAGIR WQLQAYRHN CS1
904 MGSWNEFKLELAFIKDWLEALGGSEAELANFE EAIAEFEAGLQGYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN CS1
905 MGSWMEFEARLEAIWDRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVESLRFHAAGIRQ HLQAYRHN CS1
906 MGSWVEFEDRLNAIWWRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRRHAAGIRT QLQAYRHN CS1
907 MGSWHHFKMHLAGIKLQLEALGGSEAELAEFE EWIADFEGALQDYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN CS1
908 MGSWAEFFARLDAIWERLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRFHAAGIRQ KLQAYRHN CS1
909 MGSWAEFFARLDAIWDRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRFHAAGIRQ KLQAYRHN CS1
910 MGSWAEFFARLDAIWERLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLKFHAAGIRQ KLQAYRHN CS1
- 152 043660
911 MGSWHEFRWRLFAIWQRLHALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEWLRLDAALIRV MLQAYRHN HER2 10,02
912 MGSWAEFRWRLHAIWLKLGELGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREDAEQIK YILQAYRHN HER2
913 MGSWAEFRWALHAIWLKLGELGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLREDAEQIK YILQAYRHN HER2
914 MGSWAEFRWRLHAIWLKLGALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQDAAQI К YILQAYRHN HER2
915 MGSWAEFRWRLHAIWLQLGALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQDAAQI К YILQAYRHN HER2
916 MGSWAEFRWRLHAIWLRLGALGGTEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQDAAQI К YILQAYRHN HER2
917 MGSWAEFRWRLHAIWLRLGALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQDAAQI К YILQAYRHN HER2
918 MGSWAEFRWKLEAIWLRLGALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQDAAQIK YILQAYRHN HER2
919 MGSWAEFRWKLGAIWLRLGALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQDAAQI К YILQAYRHN HER2
920 MGSWYEFRWRLHAIWLRLGALGGSEAELAAF EKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEWLRQDAAQI RYILQAYRHN HER2 7,18
921 MGSWHEFLRRLLAIEMRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEHLRVRAASIRQ HER2 8,15
- 153 043660
MLQAYRHN
922 MGSWWGFKVNLAWIKWKLEALGGSEAELAYF ELWIANFEHSLQEYKGKGNPEVEALRKEAAAIR DELQAYRHN HER2 8,69
923 MGSWVNFKTHLARIKVHLEALGGSEAELALFE HDIANFEQVLQQYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN HER2 7,91
924 MGSWLVFKDELAGIKNYLEALGGSEAELATFE QDIAWFEQWLQNYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIR DELQAYRHN HER2 3,28
925 MGSWKTFKIELAGIKLELEALGGSEAELAGFEN AI AQFES SLQ YYKGKGNPEVEALRKE AAAIRDE LQAYRHN HER2 4,95
926 MGSWWEFKVRLSAIQYRLYALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEALREQAALIRTI LQAYRHN HER2 5,17
927 MGSWWEFHIRLHAINYRLAALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRELAAKIRG DLQAYRHN HER2 11,90
928 MGSWWEFQVRLRAIQYRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRGLAAQIRF DLQAYRHN HER2 14,39
929 MGS WWEFKIRLYAIEYRLN ALGGSE AELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRAKAAQIRY NLQAYRHN HER2 4,49
930 MGSWFEFNIRLHAIEYRLKALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRNYAASIRKL LQAYRHN HER2 7,86
931 MGSWFEFEIRLRAIEYRLSALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRELAAEIRYA LQAYRHN HER2 7,75
932 MGSWFEFKIRLYAIQYRLSALGGSEAELAAFEK HER2 13,08
- 154 043660
EIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRNLAAEIRHS LQAYRHN
933 MGSWWEFKVRLRAIEYRLSALGGSEAELAAFE I<EIAAFESELQAYI<GI<GNPEVEELRVLAASIRIH LQAYRHN HER2 10,09
934 MGSWSEFWFRLHAILYRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVETLRDAAAEIRV ALQAYRHN HER2 14,79
935 MGSWIEFWVRLNAILYRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEALRDSAAEIRR WLQAYRHN HER2 3,91
936 MGSWVEFWIRLNAIKYRLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEKLRQDAADIRE LLQAYRHN HER2 10,62
937 MGSWTEFWWRLSAIVYRLNALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRDMAADIRS LLQAYRHN HER2 5,76
938 MGSWWEFYLRLRAISYRLQALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEGLRQDAAEIRK LLQAYRHN HER2 5,10
939 MGSWWEFHVRLRAIEYRLEALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEQLRLIAANIRH LLQAYRHN HER2 5,48
940 MGSWWEFHVRLKAIEYRLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRYIAANIRQ LLQAYRHN HER2 4,56
941 MGSWWEFKVRLKAIEYRLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRYIAANIRQ LLQAYRHN HER2
942 MGSWWEFQVRLAAIEYRLKALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVENLRQLAAHIRS VLQAYRHN HER2 6,33
- 155 043660
943 MGSWWEFQVRLSAIEYRLTALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEELRQKAARIRS LLQAYRHN HER2 9,61
944 MGSWWEFNIRLHAIDYRLKALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVELLREKAAQIRA QLQAYRHN HER2 9,75
945 MGSWWEFRVRLEAIDYRLKALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRMKAATIR AILQAYRHN HER2 6,82
946 MGSWYEFDIRLEAIKYRLSALGGSEAELAAFEK EIAAFESELQAYKGKGNPEVEYLRKKAAVIRSM LQAYRHN HER2 5,35
947 MGSWWEFRIRLEAIWYRLHALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRIFAANIRSK LQAYRHN HER2 8,04
948 MGSWWEFNVRLQAIKYRLSALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRKTAAHIR WQLQAYRHN HER2 5,23
949 MGSWWEFNVRLSAIRYRLLALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEDLRASAAQIRA MLQAYRHN HER2 6,73
950 MGSWWEFNMRLSAIKYRLYALGGSEAELAAFE KEIAAFESELQAYKGKGNPEVEILRRLAADIRER LQAYRHN HER2 3,08
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложены композиции, содержащие одну или более последовательностей DD, раскрытых в табл. 1. В других вариантах осуществления в данном изобретении преложены композиции, содержащие один или более DD, содержащих последовательность с гомологией 60-70%, 70-75%, 75-80%, 80-85%, 85-90%, 95-99% (и перекрывающиеся диапазоны) с последовательностью, раскрытой в табл. 1. В некоторых вариантах осуществления DD, имеющие такую гомологию, являются функционально подобными или идентичными по сравнению с соответствующей эталонной последовательностью в табл. 1. В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении преложен полипептид, который содержит один или более DD, которые конкурируют (полностью или частично) с одной или более последовательностями DD, раскрытыми в табл. 1 (эталонная последовательность), за его соответствующую мишень. Способность одного полипептида конкурировать с эталонным полипептидом за связывание с соответствующей мишенью обычно может быть определена с использованием стандартного конкурентного анализа, известного в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления конкуренция не требует, чтобы полипептид конкурировал за тот же эпитоп, что и полипептид (DD) из табл. 1, скорее, полипептид может конкурировать, связывая стерически ингибирующий эпитоп, перекрывающийся эпитоп и т.д.
Созревание аффинности и деиммунизация DD и DDpp
Стратегии созревания аффинности можно использовать для создания DD и DDpp с высокой аффинностью, которые можно использовать в описанных в данном документе слитых белках DDpp. Улучшенные DD и DDpp, которые специфически связывают представляющую интерес мишень (например, ВСАМ, CD123, CS1, HER2, AFP и р26 AFP), также могут быть созданы на основе известной эталонной последовательности DDpp. Например, по меньшей мере одна, две, три, четыре, пять или более аминокислотных мутаций (например, консервативные или неконсервативные замены), делеции или вставки могут быть введены в последовательность DD, раскрытую в табл. 1 (то есть эталонную последователь- 156 043660 ность) и полученный DDpp может быть подвергнут скринингу на связывание с соответствующей мишенью и биологическую активность, такую как способность антагонизировать биологическую активность соответствующей мишени или агонизировать биологическую активность соответствующей мишени.
Диссоциированный DDpp, особенно введенный субъекту, предпочтительно не является антигенным по отношению к субъекту (например, человеку). В некоторых вариантах осуществления последовательность DDpp не содержит человеческого HLA-DR-связывающего мотива или сайтов расщепления для протеасом и иммунных протеасом. В конкретных вариантах осуществления последовательность DDpp не содержит антигенной последовательности, как определено версией модели компьютерного прогнозирования, существующей на дату подачи данного изобретения. В конкретных вариантах осуществления последовательность DDpp не содержит последовательность сайтов связывания ГКГС (класс I или класс II), как предсказано алгоритмом, выбранным из ProPred (см., например, Singh, Bioinformatics 17(12): 12361237 (2001)), ProPred1 (Singh, Bioinformatics 19(8): 1009-14 (2003)), SYFPEITHI (см., например, Schuler, Immunoinf. Meth. in Mol. Biol. 409(1): 75-93 (2007)), SMM-align (см., например, Nielsen, BMC Bioinformatics 8: 238 (2007)), RANKPEP (см., например, Reche, Hum Immunol 63: 701-709. (2004)) или TEPITOPE (см., Sturniolo, Nat Biotechnol 17: 555-561 (1999)), где версия алгоритма и применяемая база данных существуют на дату подачи данной заявки. В некоторых вариантах осуществления DDpp не содержит последовательности, которая обладает характеристиками с высокой аффинностью (порог связывания менее 6%) Т-клеточного эпитопа. (Singh, Bioinformatics 17: 1236-1237 (2001)). В некоторых вариантах осуществления DDpp не содержит последовательности, которая имеет общие характеристики с универсальным (присутствующим в более чем 50% соответствующих аллелей) эпитопом Т-клеток (Singh, Bioinformatics 17: 1236-1237 (2001)). В некоторых вариантах осуществления DDpp не содержит последовательности, которая обладает характеристиками с высокой аффинностью или универсальный Т-клеточный эпитоп. В конкретных вариантах DDpp не содержит последовательность LAAIKTRLQ (SEQ ID NO: 2). В данной области техники известны способы создания, скрининга и идентификации вариантов DDpp со зрелой аффинностью и вариантов связывания DDpp с мишенью, содержащих изменение последовательности, которое удаляет предсказанную последовательность сайта связывания ГКГС (класс I или класс II).
Промышленные изделия
В данном документе предложены промышленные изделия, в том числе комплекты. Изделие может содержать контейнер и размещенную с контейнером или находящуюся на нем этикетку или вкладыш в упаковку. Подходящие контейнеры включают, например, бутылки, флаконы или шприцы. Контейнеры могут быть изготовлены из различных материалов, таких как стекло или пластик. Контейнер содержит один или более DDpp, нуклеиновых кислот, кодирующих DDpp и/или векторов или клеток-хозяев по данному изобретению. Этикетка или вкладыш в упаковку могут включать содержать указания для выполнения скрининга и/или обнаружения на основе аффинности
Также предложены наборы, содержащие DDpp. Такие наборы имеют применение, включая, без ограничения, обнаружение представляющей интерес мишени, с которой специфически связывается DDpp (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP). Такой набор для анализа может быть пригоден для скрининга на присутствие представляющей интерес мишени и/или количественного определения концентраций представляющей интерес мишени в жидкости, такой как биологическая жидкость (например, кровь, сыворотка или синовиальная жидкость).
В одном варианте осуществления рассматривается набор для анализа DDpp, который содержит один или более контейнеров DDpp, которые специфически связывают представляющей интерес мишень, и, необязательно, средство обнаружения для определения наличия или отсутствия взаимодействия мишени/DDpp или его отсутствия. Кроме того, набор необязательно содержит представляющий интерес белок (например, BCMA, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP), который можно использовать, например, в качестве контроля или стандарта. DDpp может быть свободным или экспрессироваться на поверхности клетки-хозяина или на поверхности бактериофага. В конкретном варианте осуществления DDpp или представляющая интерес мишень, представленная в наборе, может быть мечен. Можно использовать любую метку, известную в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления метку выбирают из группы, состоящей из биотина, фторогена, фермента, эпитопа, хромогена или радионуклида. В некоторых вариантах осуществления DDpp иммобилизован на твердой подложке. Средства обнаружения, используемые для обнаружения метки, будут зависеть от природы метки и могут быть любыми известными в данной области техники, например пленка для обнаружения радионуклида; субстрат фермента, который вызывает или усиливает обнаруживаемый сигнал для обнаружения присутствия представляющей интерес мишени.
Предпочтительно набор дополнительно содержит твердую подложку для DDpp, которая может быть предоставлена в виде отдельного элемента или на которой иммобилизован DDpp, которой специфически связывает представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP). Следовательно, DDpp, который специфически связывает представляющую интерес мишень в наборе, может быть иммобилизован на твердой подложке, или они могут быть иммобилизованы на такой подложке, которая входит в комплект или поставляется отдельно от комплекта. Предпочтительно DDpp наносят на микротитровальный планшет. В некоторых вариантах осуществления обнаружение включает
- 157 043660 применение молекулы, усиливающей сигнал. Когда молекула, усиливающая сигнал, представляет собой фермент, набор необязательно дополнительно содержит субстраты и кофакторы, необходимые для фермента, и при этом молекула-амплификатор представляет собой флуорофор. Набор необязательно дополнительно содержит предшественник красителя, который обеспечивает обнаруживаемый хромофор.
Набор также может содержать инструкции по проведению анализа, а также другие добавки, такие как стабилизаторы, промывочные и инкубационные буферы и тому подобное. Компоненты набора будут предложены в заранее определенных соотношениях, причем относительные количества различных реагентов соответственно варьируют для обеспечения концентраций в растворе реагентов, которые по существу максимизируют чувствительность анализа. В частности, реагенты могут быть предоставлены в виде сухих порошков, обычно лиофилизированных, включая наполнители, которые при растворении обеспечат раствор реагента, имеющий подходящую концентрацию, для объединения с исследуемым образцом.
Различные форматы и методы анализа связывания, которые можно использовать, известны в данной области техники и включают, без ограничения, иммобилизацию на фильтрах, таких как нейлон или нитроцеллюлоза; двумерные массивы, иммуноферментный анализ (ИФА), радиоиммуноанализ (РИА), анализы конкурентного связывания, прямой и непрямой сэндвич-анализ, иммунопреципитационные анализы, флуориметрический анализ микрообъемов (FMATTM), анализы системы LuminexTM, перенос энергии флуоресцентного резонанса (FRET), биолюминесцентный резонансный перенос энергии (BRET), электроиммуноанализы, AlphaScreenTM, методы, основанные на наночастицах, и поверхностный плазмонный резонанс (ППР).
Анализы связывания могут быть гомогенными или полугомогенными. Гомогенный анализ представляет собой анализ, в котором все компоненты смешиваются, инкубируются и затем анализируются. Полугомогенный анализ - это тот, в котором большая часть реакции происходит в виде сложной смеси, но перед добавлением конечного реагента и анализа требуется стадия промывки, в отличие от типичного многослойного анализа с поэтапной сборкой, где каждый компонент добавлен, затем смывается до добавления следующего компонента. В некоторых вариантах осуществления анализ представляет собой иммуноанализ. В определенных вариантах осуществления анализ представляет собой полугомогенный иммуноферментный анализ (EIA).
Применение
DDpp, отдельно, в виде слитых белков, в качестве химических конъюгатов или в качестве других вариантов осуществления, описанных в данном документе, имеет множество применений. В некоторых вариантах осуществления DDpp применяется в качестве реагентов для обнаружения, диагностических реагентов или аналитических реагентов. Некоторые варианты осуществления имеют применения in vivo, in vitro и/или ex vivo. Способы, в которых DDpp применяются in vitro, могут быть выполнены в различных форматах, таких как микропланшеты, белковые матрицы, поверхности биосенсоров, срезы тканей и дополнительные форматы, которые очевидны для специалиста в данной области техники. Аналогично, способы, в которых DDpp применяются in vivo, могут использоваться в различных форматах, которые включают, без ограничения, слитые белки DDpp-Fc, клетки CAR и мультиспецифические антитела DDpp. В конкретных вариантах осуществления DDpp, такой как слитые белки DDpp, применяют в качестве терапевтического агента.
Аналитические и диагностические применения
DDpp, отдельно, в виде слитых белков, в качестве химических конъюгатов или в качестве других вариантов осуществления, описанных в данном документе, имеет множество применений. В некоторых вариантах осуществления DDpp применяют в качестве реагентов для обнаружения представляющих интерес объектов во множестве различных типов образцов.
В одном варианте осуществления DDpp используются для обнаружения представляющих интерес мишеней в растворах, участвующих в производственных процессах, таких как экспрессия белка. Образцы могут включать, без ограничения, воду, буферы, образцы для очистки в процессе, объемное лекарственное вещество и конечный лекарственный продукт. В дополнительных вариантах осуществления DDpp можно применять для обнаружения загрязнений из образца, такого как источник подачи воды или воды (или другой жидкости), используемой в производстве.
В другом варианте осуществления DDpp применяют для обнаружения представляющих интерес мишеней в диагностических образцах. Образцы могут включать, без ограничения, гомогенаты тканей, клеточные экстракты, образцы биопсии, сыворотку, плазму, лимфу, кровь, фракции крови, мочу, синовиальную жидкость, спинномозговую жидкость, слюну, слизистую, мокроту, плевральную жидкость, аспирационный биоптат сосков, жидкость дыхательных путей, кишечника и мочеполового тракта, слезную жидкость, грудное молоко, жидкость из лимфатической системы, сперму, спинномозговую жидкость, жидкость из внутренних органов, асцитическую жидкость, жидкость из опухолевых кист, аминотическую жидкость и среда или лизат из культивируемых клеток.
В одном варианте осуществления DDpp полезны для обнаружения присутствия фактора или множества факторов (например, антигенов или организмов) в биологическом образце. В контексте данного документа термин выявление включает количественное или качественное выявление. В определенных вариантах осуществления биологический образец содержит клетку, ткань или жидкость. В определенных
- 158 043660 вариантах осуществления такие ткани включают нормальные и/или раковые ткани.
Различные форматы и методики обнаружения известны в данной области техники и включают, без ограничения, вестерн-блот-анализ, иммуногистохимию, ИФА, анализ FACS, ферментные анализы, авторадиографию и любые из анализов связывания, упомянутых в данном документе.
В одном варианте осуществления предложен способ для обнаружения представляющей интерес мишени (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP) в растворе, содержащем мишень, включающий: (а) приведение в контакт раствора с DDpp, который специфически связывает представляющую интерес мишень в условиях, подходящих для специфического связывания DDpp с мишенью, и (b) обнаружение связывания DDpp и мишени. DDpp может быть свободным или иммобилизованным. Обеспечивают достаточное время для связывания между представляющей интерес мишенью и DDpp, и несвязывающие компоненты в растворе или смеси удаляют или вымывают. Образование связывающего комплекса между DDpp и представляющей интерес мишенью затем можно обнаружить, например, путем обнаружения сигнала от метки на DDpp, которая является одним из компонентов связывающего комплекса. Метка может быть любой меткой, которая создает сигнал, который может быть обнаружен стандартными методами, такими как флуоресцентная метка, радиоактивное соединение или фермент, который реагирует с субстратом, чтобы создать обнаруживаемый сигнал. Примеры подходящих меток для таких целей описаны в данном документе и/или иным образом известны в данной области техники.
DDpp, который связывается с представляющей интерес мишенью, такой как BCMA, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP, можно детектируемо пометить с помощью радиоизотопов, аффинных меток (таких как биотин, авидин и т.д.), ферментативных меток (таких как в качестве пероксидазы хрена, щелочной фосфатазы и т.д.) с использованием способов, известных в данной области техники, таких как описанные в WO 00/70023 и (Harlow and Lane (1989) Antibodies, Cold Spring Harbor Laboratory, pp. 1-726).
Обнаруживаемый маркер или метка может быть любым, который способен прямо или косвенно создавать измеримый сигнал, такой как радиоактивный, хромогенный, люминесцентный или флуоресцентный сигнал, который можно использовать для количественного определения количества связанной обнаруживаемой части или метки в образце. Обнаруживаемые метки, известные в данной области, включают радиоизотопы, такие как 3Н, 14С, 32Р, 35S или 125I, электрохемилюминесцентные метки (такие как катализатор на основе рутения (Ru) в сочетании с субстратами и т.д.), люминесцентные или биолюминесцентные метки (например, европий, ванадий), флуоресцентные или хемилюминесцентные соединения, такие как изотиоцианат флуоресцеина, родамин или люциферин, ферменты (например, фермент, такой как щелочная фосфатаза, бета-галактозидаза или пероксидаза хрена), колориметрические метки, такие как коллоидное золото, цветные стеклянные или пластиковые шарики (например, полистирол, полипропилен, латекс и т.д.), парамагнитные атомы или магнитные агенты, электронно-плотные реагенты, нано- или микрошарики, содержащие флуоресцентный краситель, нанокристаллы, квантовую точку, квантовый шарик, нанометку, дендримеры с флуоресцентной меткой, микротранспондер, донор электронов, молекулу или молекулярную структуру, или светоотражающую частицу, микрочастицы могут быть нанокристаллами или квантовыми точками. Нанокристаллы представляют собой вещества, которые поглощают фотоны света, а затем переизлучают фотоны с другой длиной волны (флуорофоры). Кроме того, дополнительные флуоресцентные метки или вторичные антитела могут быть конъюгированы с нанокристаллами. Нанокристаллы коммерчески доступны из таких источников, как Invitrogen и Evident Technologies (Troy, N.Y.). Другие метки включают Е)-5-[2-(метоксикарбонил) этенил]цитидин, который представляет собой нефлуоресцентную молекулу, которая при воздействии ультрафиолетового (УФ) излучения дает продукт 3-бета-D-рибофуранозил-2,7-диоксопиридо[2,3-d]пиримидин, который показывает сильный сигнал флуоресценции.
Конкурентное ингибирование может быть определено любым способом, известным в данной области техники, например, конкурентным ИФА. Говорят, что DDpp, такой как слитый белок DDpp (например, DDpp-Fc, DDpp-CAR, DDpp-scFv) или другая молекула, конкурентно ингибирует связывание эталонной молекулы с данным эпитопом, если он связывается с этим эпитопом в той степени, в которой он до некоторой степени блокирует связывание эталонной молекулы с эпитопом. В контексте данного описания можно сказать, что DDpp (например, слитый белок DDpp) или другая молекула конкурентно ингибируют связывание эталонной молекулы с данным эпитопом, например, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 30% или по меньшей мере на 20%. Термины конкурировать, способность конкурировать и конкурировать с являются относительными терминами, используемыми для описания DDpp, такого как слитый белок DDpp, который обеспечивает по меньшей мере 20%, по меньшей мере 30%, по меньшей мере 40%, или по меньшей мере 50% ингибирования связывания эталонной молекулы с мишенью посредством DDpp, такого как слитый белок DDpp (например, DDpp-Fc, DDpp CAR, DDpp-scFv и антитело, содержащее DDpp), как определено стандартным конкурентным анализом, как описано в данном документе или иным образом известный в данной области техники, включая, без ограничения, системы конкурентного анализа с использованием таких методов, как радиоиммуноанализ (РИА), иммуноферментный анализ (EIA), предпочтительно иммуноферментный анализ (ИФА) сэндвич-иммуноанализы, иммунорадиометрические анализы, флуоресцентные имму- 159 043660 ноанализы, люминесцентные, электрохимические люминесцентные и иммуноэлектрофорезные анализы.
Способы определения связывания и аффинности молекул-кандидатов на связывание известны в данной области техники и включают, без ограничения, аффинную хроматографию, эксклюзионную хроматографию по размеру, равновесный диализ, смещение флуоресцентного зонда и плазменный резонанс.
Терапевтические средства
Описанные в данном документе DD могут быть использованы во множестве применений, включая, без ограничения, способы терапевтического лечения, которые могут быть способами in vitro, ex vivo или in vivo.
Применение в качестве терапевтического средства является атрибутом специфичности связывания мишени DDpp. Включение DDpp в различные молекулярные композиции (например, слитые белки DDантитело, конъюгаты DD-лекарственное средство и DD-химерный рецептор) позволяет применять различные терапевтические средства и способы, которые включают, без ограничения, растворимые и клеточно-ассоциированные композиции.
В одном варианте осуществления DDpp представляет собой растворимый слитый белок, состоящий из необязательной эпитопной метки 10 и нацеливающего домена, который связывается с мишенью, которая связана с заболеванием или нарушением метаболической, сердечно-сосудистой, скелетно-мышечной, неврологической или скелетной системы. В других вариантах осуществления DDpp представляет собой растворимый слитый белок, который связывается с мишенью, которая связана с инфекцией или заболеванием, вызванными дрожжами, грибами, вирусами или бактериями. В некоторых вариантах осуществления DDpp представляет собой растворимый слитый белок, который связывается с мишенью, которая связана с заболеванием или расстройством иммунной системы.
Также предложены терапевтические композиции, пригодные для осуществления терапевтических способов, описанных в данном документе. В одном варианте осуществления терапевтические композиции, предложенные в данном документе, содержат физиологически переносимый носитель вместе с по меньшей мере одним видом слитого DDpp, как описано в данном документе, растворенным или диспергированным в нем в качестве активного ингредиента. В другом варианте осуществления терапевтические композиции, предложенные в данном документе, содержат физиологически переносимый носитель вместе с по меньшей мере одним видом DDpp, как описано в данном документе, растворенным или диспергированным в нем в качестве активного ингредиента. В предпочтительном варианте осуществления терапевтическая композиция не является иммуногенной при введении пациенту-человеку для терапевтических целей.
Приготовление фармакологической композиции, содержащей растворенные или диспергированные в ней активные ингредиенты, хорошо известно в данной области техники. Обычно такие композиции готовят в виде стерильных инъекционных растворов в виде жидких растворов или суспензий, водных или неводных. Однако твердые формы, подходящие для раствора или суспензии, в жидкости перед использованием также могут быть приготовлены. Препарат также может быть эмульгирован. Таким образом, содержащая DDpp композиция может иметь форму растворов, суспензий, таблеток, капсул, составов с замедленным высвобождением или порошков или других композиционных форм. В некоторых вариантах осуществления композиции DDpp (например, слитые белки DDpp) составлены для обеспечения или оптимизации распределения in vivo. Например, гематоэнцефалический барьер (ГЭБ) исключает многие высокогидрофильные соединения, и, если это желательно, композиции готовят так, чтобы увеличить перенос через ГЭБ, например, путем заключения в липосомах. Относительно способов получения липосом см., например, патенты США. № 4522811, 5374548 и 5399331. Липосомы могут содержать один или более компонентов, которые избирательным образом переносятся в конкретные клетки или органы, улучшая, таким образом, целевую доставку лекарства (см., например, Ranade, Clin. Pharmacol. 29: 685 (1989)).
DDpp (например, слитый гормон DDpp) может быть смешан с другими активными ингредиентами и/или эксципиентами, которые являются фармацевтически приемлемыми и совместимыми с активным ингредиентом и в количествах, подходящих для использования в терапевтических способах, описанных в данном документе. Подходящими эксципиентами являются, например, вода, физиологический раствор, декстроза, глицерин, этанол или тому подобное и их комбинации. Кроме того, если желательно, композиция может содержать незначительные количества вспомогательных веществ, таких как смачивающие или эмульгирующие агенты, рН-буферные агенты и подобные, известные в данной области техники, которые повышают эффективность активного ингредиента.
Терапевтический DDpp могут включать фармацевтически приемлемые соли содержащихся в них компонентов. Фармацевтически приемлемые соли включают соли, полученные посредством добавления кислоты (образованные с помощью свободных аминогрупп полипептида), которые образуются с неорганическими кислотами, такими как, например, соляная или фосфорная кислоты, или такими органическими кислотами, как уксусная, винная, миндальная и тому подобные. Соли, образованные со свободными карбоксильными группами, также могут быть получены из неорганических оснований, таких как, например, гидроксиды натрия, калия, аммония, кальция или железа, и таких органических оснований, как изопропиламин, триметиларнин, 2-этиламиноэтанол, гистидин, прокаин и тому подобные.
Физиологически переносимые носители известны в данной области техники.
- 160 043660
Примерами жидких носителей являются стерильные водные растворы, которые не содержат материалов в дополнение к активным ингредиентам и воде или содержат буфер, такой как фосфат натрия при физиологическом значении рН, физиологический раствор или оба, такие как забуференный фосфатом физиологический раствор. Кроме того, водные носители могут содержать более одной буферной соли, а также соли, такие как хлориды натрия и калия, декстрозу, пропиленгликоль, полиэтиленгликоль и другие растворенные вещества.
Жидкие композиции могут также содержать жидкие фазы в дополнение к воде и за исключением воды. Примерами таких дополнительных жидких фаз являются глицерин, растительные масла, такие как хлопковое масло, органические сложные эфиры, такие как этилолеат, и водно-масляные эмульсии.
В одном варианте осуществления терапевтическая композиция содержит слитый белок DDpp, обычно в количестве, по меньшей мере, 0,1 мас.% слитого белка DDpp на массу общей терапевтической композиции. Массовый процент представляет собой отношение массы слитого DDpp к общей композиции. Так, например, 0,1 мас. процента составляет 0,1 г DDpp на 100 г общей композиции.
Терапевтическая композиция, содержащая слитый белок DDpp, обычно содержат от около 10 микрограмм (мкг) на миллилитр (мл) до около 100 микрограмм (мг) на мл слитого белка DDpp в качестве активного ингредиента на объем композиции и более предпочтительно содержат от около 1 мг/мл до около 10 мг/мл (т.е. приблизительно от 0,1 до 1 мас.%).
Диапазоны доз для введения DDpp (например, слитого белка DDpp) достаточно велики для достижения желаемого эффекта, при котором симптомы заболевания, опосредуемые молекулой-мишенью, уменьшаются. Дозировка не должна быть настолько большой, чтобы вызывать побочные эффекты, такие как синдромы повышенной вязкости, отек легких, застойная сердечная недостаточность и тому подобное. Как правило, дозировка будет варьировать в зависимости от возраста, состояния, пола и степени заболевания у пациента и может быть определена специалистом в данной области техники. Дозировка может корректироваться лечащим врачом в случае наличия каких-либо осложнений.
DDpp (например, слитый белок DDpp) можно вводить парентерально путем инъекции или постепенной инфузии с течением времени. Хотя к молекуле-мишени обычно можно получить доступ в организме путем системного введения и, следовательно, чаще всего ее лечат путем внутривенного введения терапевтических композиций, другие ткани и средства доставки рассматриваются там, где существует вероятность того, что ткань-мишень содержит молекулу-мишень. Таким образом, DDpp можно вводить внутривенно, внутрибрюшинно, внутримышечно, подкожно, внутриполостно, трансдермально и может доставляться перистальтическими средствами. Слитые белки DDpp также могут быть доставлены аэрозолем в дыхательные пути и легкие.
Терапевтические композиции, содержащие DDpp, могут обычно вводиться внутривенно, например, путем инъекции разовой дозы. Термин разовая доза при использовании в отношении терапевтической композиции, предложенной в данном документе, относится к физически дискретным единицам, подходящим в качестве единичной дозы для субъекта, причем каждая единица содержит заранее определенное количество активного материала, рассчитанное для получения желаемого терапевтического эффекта в сочетании с требуемым разбавителем, например, носителем или несущей средой. В некоторых вариантах осуществления терапевтические композиции, содержащие DDpp, вводят подкожно.
DDpp (например, слитый белок DDpp) вводят способом, совместимым с лекарственной формой, и в терапевтически эффективном количестве. Количество, которое следует вводить, зависит от подлежащего лечению субъекта, способности системы субъекта использовать активный ингредиент вводимой композиции и желаемой степени терапевтического эффекта. Точные количества активного ингредиента, необходимые для введения, зависят от суждения практикующего врача и являются индивидуальными для каждого человека. Однако подходящие диапазоны доз для системного применения раскрыты в данном документе и зависят от пути введения. Подходящие режимы для введения также являются переменными, но они типичны для начального введения с последующими повторными дозами с интервалом в один или более часов с последующей инъекцией или другим введением. Альтернативно предполагается непрерывная внутривенная инфузия, достаточная для поддержания концентраций в крови в диапазонах, указанных для терапии in vivo.
Композиции DDpp составляются, дозируются и вводятся способом, соответствующим хорошей медицинской практике. Факторы, подлежащие рассмотрению в этом контексте, включают конкретное расстройство, которое лечат, конкретное млекопитающее, которое лечат, клиническое состояние отдельного пациента, причину расстройства, место доставки агента, способ введения, график введения и другие факторы, известные врачам. Диапазоны доз для введения DDpp достаточно велики для достижения желаемого эффекта, при котором симптомы заболевания, опосредуемые молекулой-мишенью, уменьшаются. Дозировка не должна быть настолько большой, чтобы вызывать побочные эффекты, такие как синдромы повышенной вязкости, отек легких, застойная сердечная недостаточность и тому подобное. Как правило, дозировка будет варьировать в зависимости от возраста, состояния, пола и степени заболевания у пациента и может быть определена специалистом в данной области техники. Дозировка может корректироваться лечащим врачом в случае наличия каких-либо осложнений.
Схема дозировки и количества, эффективные для терапевтического и профилактического примене
- 161 043660 ния, т.е. режим дозирования, будут зависеть от множества факторов, включая причину, стадию и тяжесть заболевания или расстройства, здоровье, физическое состояние, возраст млекопитающего, подвергаемого лечению, а также место и способ доставки DD. Терапевтическая эффективность и токсичность комплекса и образования может быть определена с помощью стандартных фармацевтических, фармакологических и токсикологических процедур на клеточных культурах или экспериментальных животных. Данные, полученные в результате этих процедур, также могут быть использованы при составлении диапазона дозировок для применения человеком. Кроме того, терапевтический индекс (т.е., доза, терапевтически эффективная для 50 процентов населения, деленная на смертельную дозу для 50 процентов населения (ED50/LD50)), может быть легко определена с использованием известных процедур. Дозировка предпочтительно находится в пределах диапазона концентраций, который включает ED50 с незначительной токсичностью или без токсичности, и может варьировать в пределах этого диапазона в зависимости от используемой лекарственной формы, чувствительности пациента и пути введения.
Режим дозирования также принимает во внимание параметры фармакокинетики, известные в данной области техники, такие как скорость всасывания лекарственного средства, биодоступность, метаболизм и клиренс (см., например, Hidalgo-Aragones, J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 58: 611-617 (1996); Groning et al., Pharmazie 51: 337-341 (1996); Fotherby, Contraception 54: 59-69 (1996) и Johnson et al., J. Pharm. Sci. 84: 1144-1146 (1995)). В настоящее время клиницист в соответствии с состоянием и уровнем квалификации вполне может определить режим дозирования для каждого субъекта, которого лечат. Кроме того, разовое или многократное введение композиций DDpp можно вводить в зависимости от дозировки и частоты, которые требуются и переносятся субъектом. Продолжительность профилактического и терапевтического лечения будет варьировать в зависимости от конкретного заболевания или состояния, подлежащего лечению. Некоторые заболевания поддаются острому лечению, тогда как другие требуют длительной хронической терапии. DDpp можно вводить последовательно или одновременно с дополнительным терапевтическим средством.
В некоторых вариантах осуществления DDpp вводят в количестве от около 1 мг/кг до около 50 мг/кг, от около 1 мг/кг до около 25 мг/кг, от около 1 мг/кг до около 20 мг/кг, от около 1 мг/кг до около 15 мг/кг, от около 1 мг/кг до около 10 мг/кг или от около 1 до около 5 мг/кг.
В другом варианте осуществления DDpp вводят в сочетании с одним или более дополнительными терапевтическими средствами.
Терапевтически эффективное количество DDpp (например, слитого белка DDpp) может быть таким, чтобы при введении в физиологически переносимой композиции было достаточно для достижения концентрации в плазме от около 0,1 микрограмма (мкг) на миллилитр (мл) до около 100 мкг/мл, предпочтительно от около 1 мкг/мл до около 5 мкг/мл и обычно около 5 мкг/мл. Иными словами, дозировка может варьировать от около 0,1 мг/кг до около 300 мг/кг, предпочтительно от около 0,2 до около 200 мг/кг, наиболее предпочтительно от около 0,5 мг/кг до около 20 мг/кг. один или более приемов дозы ежедневно, в течение одного или нескольких дней.
В некоторых вариантах осуществления описанный в данном документе DDpp пригоден для лечения заболевания или расстройства иммунной системы, такого как воспаление или аутоиммунное заболевание.
В некоторых вариантах осуществления описанный в данном документе DDpp пригоден для лечения рака. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен способ лечения рака, который включает введение терапевтически эффективного количества DDpp (например, слитого DDpp) пациенту.
В дополнительных вариантах осуществления в данном изобретении предложен химерный антигенный рецептор (CAR), где CAR содержит нацеливающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления домен нацеливания состоит по меньшей мере частично из связывающего с мишенью DDpp, раскрытого в данном документе.
В данном изобретении также предложены клетки, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR, причем CAR содержит антигенсвязывающий домен, состоящий, по меньшей мере, частично из раскрытого полипептида, который связывает представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP и р26 AFP), трансмембранный домен и сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления CAR специфически связывается с опухолевым антигеном (и, таким образом, функционирует для доставки клетки, экспрессирующей CAR, в опухоль). В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген связан с гематологическим злокачественным новообразованием. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой ВСМА. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой CD123. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой CS1. В дополнительных вариантах осуществления опухолевый антиген связан с солидной опухолью. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой HER2. В некоторых вариантах осуществления мишенями являются как солидные, так и гематологические новообразования. В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой Т-клетку, клетку естественного киллера (NK) или клетку другого иммунного типа. В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR (будь то Тклетка, NK-клетка или клетка другого типа), проявляет противоопухолевый иммунитет, когда полипеп
- 162 043660 тид связывается с соответствующим опухолевым антигеном.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества иммунной клетки CAR, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), причем CAR содержит домен связывания мишени, который содержит DD, который специфически связывает ВСМА (например, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306), трансмембранный домен и внутриклеточный домен (содержащий сигнальный домен). В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR представляет собой Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR представляет собой NK-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, NK-клеток и Т-клеток).
В некоторых вариантах осуществления домен связывания мишени введенной иммунной клетки CAR специфически связывает ВСМА, экспрессируемый раковой клеткой субъекта, и индуцирует иммунную клетку CAR для создания цитотоксического сигнала, который приводит к цитотоксическим эффектам в отношении раковой клетки, таким образом обеспечивая лечение рака.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества иммунной клетки CAR, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), причем CAR содержит домен связывания мишени, который содержит DD, который специфически связывает CD123 (например, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 307-739 и 740), трансмембранный домен и внутриклеточный домен (содержащий сигнальный домен). В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR представляет собой Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR представляет собой NK-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, NK-клеток и Т-клеток). В некоторых вариантах осуществления домен связывания мишени введенной иммунной клетки CAR специфически связывает CD123, экспрессируемый раковой клеткой субъекта, и индуцирует иммунную клетку CAR для создания цитотоксического сигнала, который приводит к цитотоксическим эффектам в отношении раковой клетки, таким образом обеспечивая лечение рака.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества иммунной клетки CAR, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), причем CAR содержит домен связывания мишени, который содержит DD, который специфически связывает CS1 (например, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 896-909 и 910), трансмембранный домен и внутриклеточный домен (содержащий сигнальный домен). В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR представляет собой Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR представляет собой NK-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, NK-клеток и Т-клеток). В некоторых вариантах осуществления домен связывания мишени введенной иммунной клетки CAR специфически связывает CS1, экспрессируемый раковой клеткой субъекта, и индуцирует иммунную клетку CAR для создания цитотоксического сигнала, который приводит к цитотоксическим эффектам в отношении раковой клетки, таким образом обеспечивая лечение рака.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложен способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества иммунной клетки CAR, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), причем CAR содержит домен связывания мишени, который содержит DD, который специфически связывает HER2 (например, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 911-949 и 950), трансмембранный домен и внутриклеточный домен (содержащий сигнальный домен). В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR представляет собой Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR представляет собой NK-клетку. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка CAR не является Т-клеткой или NK-клеткой. В других вариантах осуществления субъекту вводят комбинацию различных типов иммунных клеток CAR (например, NK-клеток и Т-клеток). В некоторых вариантах осуществления домен связывания мишени введенной иммунной клетки CAR специфически связывает HER2, экспрессируемый раковой клеткой субъекта, и индуцирует иммунную клетку CAR для создания цитотоксического сигнала, который приводит к цитотоксическим эффектам в отношении раковой клетки, таким образом обеспечивая лечение рака.
Дополнительно предложены способы лечения или профилактики рака, включающие введение DDppCAR Т-лимфоцита пациенту, предрасположенному к или имеющему рак, который экспрессирует опухолевый антиген на поверхности клеток-мишеней, и при этом DDpp специфически связывает антиген.
В некоторых вариантах осуществления, в которых Т-клетки CAR вводят субъекту, имеющему рак,
- 163 043660 связывание представляющей интерес мишени (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP) стимулирует Т-клетки CAR для инициирования внутриклеточного сигналинга. В других вариантах осуществления связывание Т-клетки CAR с представляющей интерес мишенью стимулирует Т-клетку для инициирования внутриклеточного сигналинга и продуцирования цитокинов. В других вариантах осуществления связывание Т-клетки CAR с представляющей интерес мишенью стимулирует Т-клетку инициировать внутриклеточный сигналинг, продуцировать цитокины и дегранулировать, что приводит к цитотоксическому эффекту в отношении раковой клетки. В некоторых вариантах осуществления CAR Тклетки пролиферируют в ответ на связывание представляющей интерес мишени. Преимущественно, в некоторых вариантах осуществления активность CAR Т-клеток не приводит к тому, что Т-клетки демонстрируют фенотип, связанный с истощением Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен Т-клетки CAR содержит 41ВВ или CD28, а цитоплазматический домен содержит альфа-, бета- или дзета-цепь рецептора Т-клетки.
В некоторых вариантах осуществления введенный CAR дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD и/или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP), экспрессируемую раковой клеткой. В дополнительных вариантах осуществления вводимый CAR дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают другую представляющую интерес мишень, экспрессируемую раковой клеткой. В дополнительных вариантах осуществления вводимый CAR дополнительно содержит 2, 3, 4, 5 или более 5, DD или других связывающих доменов (например, scFv), которые специфически связывают другую представляющую интерес мишень, экспрессируемую другой раковой клеткой или сосудистой эндотелиальной клеткой.
В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка дополнительно содержит второй полипептид CAR, имеющий DD или другой связывающий домен (например, scFv), который специфически связывает вторую представляющую интерес мишень, экспрессируемую раковой клеткой. В некоторых вариантах осуществления введенная иммунная клетка дополнительно содержит второй полипептид CAR, имеющий DD или другой связывающий домен (например, scFv), который специфически связывает вторую представляющую интерес мишень, экспрессируемую другой раковой клеткой или сосудистой эндотелиальной клеткой.
В некоторых вариантах осуществления введение иммунных клеток с помощью CAR является внутривенным. В других вариантах осуществления иммунные клетки с CAR вводят внутриартериальным, внутримышечным, местным или другим приемлемым путем для данного сценария лечения.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе также предложены способы лечения субъекта, имеющего рак, включающие: введение субъекту иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), причем CAR содержит: домен связывания мишени, причем домен связывания мишени содержит полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306; SEQ ID NO: 307-739 и 740; SEQ ID NO: 741-874 и 886-895; SEQ ID NO: 896-909 и 910 или SEQ ID NO: 911-949 и 950; причем полипептид специфически связывает представляющую интерес мишень (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP), экспрессируемую раковой клеткой.
В дополнительных вариантах осуществления в данном документе предложен способ лечения субъекта, имеющего рак, включающий: внутривенное введение субъекту иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), экспрессируемой на Т-клетке, причем CAR содержит: домен связывания мишени, содержащий полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306; SEQ ID NO: 307-739 и 740; SEQ ID NO: 741-874 и 886-895; SEQ ID NO: 896-909 и 910 или SEQ ID NO: 911-949 и 950; трансмембранный домен, выбранный из 41BB и CD28, и внутриклеточный домен, причем внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, выбранный из альфа-, бета- или дзета-цепи рецептора Т-клеток, при этом при введении субъекту, имеющему рак, домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP), экспрессируемой раковой клеткой, и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует CAR Т-клетку для создания цитотоксических сигналов, что приводит к цитотоксическому воздействию на раковые клетки. В некоторых вариантах осуществления цитотоксические эффекты являются результатом дегрануляции CAR Т-клеток. Преимущественно, в некоторых вариантах осуществления активация и цитотоксическая активность CAR Т-клеток не связана с CAR Т-клетками, проявляющими фенотип, связанный с истощением Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления CAR необязательно дополнительно содержит второй домен связывания мишени, содержащий второй полипептид, имеющий мишень, отличную от домена связывания мишени. В других вариантах осуществления дополнительные нацеливающий домены могут быть необязательно включены для усиления способности связывания с маркером или для придания специфичности связывания другим маркерам.
В некоторых вариантах осуществления в данном изобретении предложено применение иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), для лечения рака, причем CAR содержит:
- 164 043660 домен связывания мишени, содержащий полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-305 и 306; SEQ ID NO: 307-739 и 740; SEQ ID NO: 741-874 и 886-895; SEQ ID NO: 896-909 и 910 или SEQ ID NO: 911-949 и 950; трансмембранный домен, выбранный из 41BB и CD28, и внутриклеточный домен, причем внутриклеточный домен содержит сигнальный домен, выбранный из альфа-, бета- или дзета-цепи рецептора Т-клеток, при этом при введении субъекту, имеющему рак, домен связывания мишени специфически связывается с представляющей интерес мишенью (например, ВСМА, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP), экспрессируемой раковой клеткой, и при этом связывание представляющей интерес мишени индуцирует иммунную клетку для создания цитотоксических сигналов, что приводит к цитотоксическому воздействию на раковые клетки. В других вариантах осуществления иммунная клетка может представлять собой Т-клетку или клетку естественного киллера (NK).
Рак, который можно лечить, включает опухоли, которые не являются васкуляризованными или еще по существу не васкуляризированными, а также васкуляризированные опухоли. Рак может включать несолидные опухоли (такие как гематологические опухоли, например, лейкозы и лимфомы) или может включать солидные опухоли. Типы раковых заболеваний, подлежащих лечению DDpp, включают, без ограничения, карциному, бластому и саркому, а также некоторые лейкозы или лимфоидные злокачественные новообразования, доброкачественные и злокачественные опухоли и злокачественные новообразования, например, саркомы, карциномы и меланомы. Также включены взрослые опухоли/раковые заболевания и детские опухоли/раковые заболевания.
В некоторых вариантах осуществления описанный в данном документе DDpp пригоден для лечения пациента с гематологическим раком. Примеры гематологических (или гематогенных) раковых заболеваний включают лейкозы, включая острые лейкозы (такие как острый лимфоцитарный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, острый миелогенный лейкоз и миелобласты, промиейоцитарный, миеломоноцитарный, моноцитарный и эритролейкоз), хронические лейкозы (такие как хронический миелоцитарный (гранулоцитарный) лейкоз, хронический миелогенный лейкоз и хронический лимфоцитарный лейкоз), истинную полицитемию, лимфому, болезнь Ходжкина, неходжкинскую лимфому (индолентные формы и формы высокой степени злокачественности), множественную миелому, макроглобулинемию Вальденстрема, болезнь тяжелой цепи, миелодиспластический синдром, волосатоклеточный лейкоз и миелодисплазию. В некоторых вариантах гематологическая злокачественная опухоль представляет собой множественную миелому.
Примеры солидных опухолей, таких как саркомы и карциномы, включают фибросаркому, миксосаркому, липосаркому, хондросаркому, остеосаркому и другие саркомы, синовиому, мезотелиому, опухоль Юинга, лейомиосаркому, рабдомиосаркому, рак толстой кишки, лимфоидную злокачественную опухоль, рак поджелудочной железы, рак молочной железы, рак легкого, рак яичников, рак предстательной железы, гепатоцеллюлярную карциному, плоскоклеточный рак, базально-клеточный рак, аденокарциному, карциному потовых желез, медуллярную карциному щитовидной железы, папиллярную карциному щитовидной железы, феохромоцитомальную карциному сальных желез, папиллярную карциному, папиллярные аденокарциномы, медуллярную карциному, бронхогенную карциному, почечно-клеточную карциному, гепатому, рак желчных протоков, хориокарциному, опухоль Вильмса, рак шейки матки, опухоль яичка, семиному, рак мочевого пузыря, меланому и опухоли ЦНС (такие как глиома (например, глиома ствола головного мозга и смешанные глиомы), глиобластома (также известная как мультиформная глиобластома) астроцитома, лимфома ЦНС, герминома, медуллобластома, краниофариогома Шваннома, эпендимома, пинеалома, гемангиобластома, акустическая неврома, олигодендроглиома, менангиома, нейробластома, ретинобластома и метастазы в головной мозг). В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой рак молочной железы или рак яичника.
В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp связывает (1) мишень на представляющей интерес клетке или ткани (например, опухолевый антиген на опухолевой клетке) и (2) мишень на эффекторной клетке, такой как молекулу рецептора Т-клетки. В соответствии с одним вариантом осуществления связывание одной или более мишеней слитым белком DDpp используется для направления иммунного ответа на инфекционный агент, клетку, ткань или другое представляющее интерес место у пациента. Например, в некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp специфически связывает мишень на поверхности эффекторной клетки. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp специфически связывает мишень на поверхности Т-клетки. В конкретных вариантах осуществления слитый белок DDpp специфически связывает CD3. В других вариантах осуществления слитый белок DDpp специфически связывает CD2. В дополнительном варианте осуществления слитый белок DDpp специфически связывает рецептор Т-клеток (TCR). Согласно дополнительным вариантам осуществления слитый белок DDpp специфически связывает мишень на поверхности естественной клетки-киллера. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp специфически связывается с рецептором NKG2D (Natural Killer Group 2D). В дополнительных вариантах осуществления слитый белок DDpp специфически связывает CD16 (то есть Fc гамма RIII), CD64 (то есть Fc гамма RI) или CD32 (то есть Fc гамма RII).
В одном варианте слитый белок DDpp связывает мишень на лейкоците и опухолевый антиген на
- 165 043660 опухолевой клетке. В некоторых вариантах осуществления слитый белок DDpp связывает NKG2D. В дополнительном варианте осуществления слитый белок DDpp связывает NKG2D и мишень, выбранную из ErbB2, EGFR, iGf1R, CD19, CD20, CD80 и ЕРСАМ. В одном варианте осуществления слитый белок
DDpp связывает CD3. В конкретных вариантах осуществления DDpp специфически связывает CD3 эпсилон. В одном варианте осуществления слитый белок DDpp связывает CD4.
Конъюгаты DDpp-лекарственное средство
В дополнительном варианте осуществления слитый белок DDpp может быть связан с другими органическими или неорганическими молекулами или субстратами путем использования химического конъюгирования. В одном варианте осуществления конъюгаты DDpp-лекарственное средство предназначены для облегчения локальной доставки цитотоксических агентов посредством направленной специфичности DDpp. Эта комбинация специфичности в отношении нацеливания и цитотоксического агента позволяет осуществлять целевую доставку лекарственного средства в опухоли и внутриклеточное накопление в них, когда системное введение этих неконъюгированных лекарственных средств может привести к неприемлемым уровням токсичности для нормальных клеток, а также для опухолевых клеток, которые должны быть элиминированы (Baldwin et al., Lancet pages 603-605 (1986); Thorpe, Antibody Carriers Of Cytotoxic agents In Cancer Therapy: A Review, в Monoclonal Antibodies '84: Biological And Clinical Applications, A. Pinchera et al., (ed.s), pp. 475-506 (1985)).
Цитотоксические агенты включают химиотерапевтические агенты, агенты, ингибирующие рост, токсины (например, ферментативно активный токсин бактериального, грибного, растительного или животного происхождения или их фрагменты), радиоактивные изотопы (т.е. радиоконъюгаты) и т.д. Химиотерапевтические агенты, пригодные в создании таких иммуноконъюгатов включает, например, метотрексат, адриамицин, доксорубицин, мелфалан, митомицин С, хлорамбуцил, даунорубицин или другие интеркалирующие агенты. Химиотерапевтические агенты, применимые для получения таких иммуноконъюгатов, также включают антитубулиновые лекарственные средства, такие как ауристатины, включая монометилауристатин Е (ММАЕ) и монометилауристатин F (MMAF). Ферментативно активные токсины и их фрагменты, которые можно применять согласно раскрытым способам, включают цепь А дифтерии, несвязывающие активные фрагменты дифтерийного токсина, цепь А экзотоксина, цепь А рицина, цепь А абрина, цепь А модекцина, альфа-сарцин, белки Aleurites fordii, белки диантина, белки Phytolaca americana (PAPI, PAPII и PAP-S), ингибитор Momordica charantia, курцин, кротин, ингибитор Sapaonaria officinalis, гелонин, митогеллин, рестриктоцин, феномицин, эномицин и трихотецены.
В одном варианте осуществления DDpp (например, слитый белок DDpp) конъюгирован с радиоизотопом. В дополнительном варианте осуществления DDpp конъюгирован с изотопом, выбранным из 90Y, 125I, 131I, 123I, n1In, 105Rh, 153Sm, 67Cu, 67Ga, 166Ho, 177Lu, 186Re и 188Re с использованием кого-либо из ряда известных хелаторов или путем прямого мечения. В других вариантах осуществления DDpp связан с лекарственными средствами, пролекарствами или лимфокинами, такими как интерферон. Конъюгаты DDpp и цитотоксина обычно могут быть получены с использованием различных бифункциональных белковых связывающих агентов, таких как N-сукцинимидил-З- (2-пиридиидитиол) пропионат (SPDP), иминотиолан (IT), бифункциональные производные имидоэфиров (такие как диметил), адипимидат HCL), активные сложные эфиры (такие как дисукцинимидилсуберат), альдегиды (такие как глутаральдегид), бис-азидосоединения (такие как бис (п-азидобензоил) гександиамин), производные бис-диазония (такие как бис-(п-диазо-диазо) ниумбензоил) этилендиамин), диизоцианаты (такие как 2,6-диизоцианат толуола) и бис-активные соединения фтора (такие как 1,5-дифтор-2,4-динитробензол). В конкретном варианте осуществления токсин конъюгирован со слитым белком DDpp через расщепляемую ферментом линкерную систему (например, такую, которая присутствует в SGN-35). Также могут быть использованы конъюгаты DDpp и одного или более низкомолекулярных токсинов, таких как калихеамицин, майтансиноиды, трихотен и СС1065, и производные этих токсинов, которые обладают токсической активностью.
В некоторых вариантах осуществления цитотоксический агент ковалентно присоединен к DDpp с помощью линкера. В некоторых вариантах осуществления линкер, присоединяющий DDpp и цитотоксический агент, расщепляется протеазой.
Терапевтическое применение в качестве клеточно-ассоциированного рецептора
В одном варианте осуществления раскрытые DDpp-CARs применяются для перенаправления трансдуцированных Т-клеток на опухолевую мишень, определяемую специфичностью связывания DDppCAR. В одном варианте осуществления первичные Т-клетки трансдуцируются лентивирусным вектором, кодирующим CAR, который комбинирует домен связывания мишени DD с трансмембранным доменом и внутриклеточным доменом CD3-дзета, CD28, 41ВВ. Таким образом, полученная популяция трансдуцированных Т-клеток может вызывать опосредованный DDpp-CAR ответ Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления Т-клетки генетически модифицированы для экспрессии DDpp-CAR, и Т-клетка DDppCAR вводят нуждающемуся в этом реципиенту. В других вариантах осуществления вводимая клетка способна уничтожать опухолевые клетки у реципиента. Особенно выгодные свойства DDpp-CAR включают одно, несколько или все из следующих преимуществ: (i) специфичность связывания с мишенью, (ii) повышенная терапевтическая эффективность, (iii) снижение побочных эффектов, не являющихся мишенями, (iv) возможность настройки маркеров для конкретного пациента или популяции пациентов, (v)
- 166 043660 повышенная стабильность во время производства и обработки и (vi) способность нацеливаться на одну, две или более специфичных мишеней для усиления направленной на мишень терапии.
Генетически модифицированные клетки, перенаправленные клетки, генно-инженерные клетки или модифицированные клетки, используемые в данном документе, относятся к клеткам, которые экспрессируют DDpp, предложенный в данном документе. В конкретном варианте осуществления генетически модифицированные клетки экспрессируют слитый белок DDpp, такой как DDpp-CAR. В дополнительном варианте осуществления генетически модифицированные клетки экспрессируют и презентируют DDpp-CAR на клеточной поверхности.
Термин заболевание, на которое нацелены генетически модифицированные клетки, в контексте данного документе, охватывает нацеливание на любую клетку, вовлеченную любым образом в любое заболевание, генетически модифицированными клетками, независимо от того, нацелены ли генетически модифицированные клетки на пораженные клетки или здоровые клетки для достижения терапевтически полезного результата. Генетически модифицированные клетки включают, без ограничения, генетически модифицированные Т-клетки, NK-клетки, гемопоэтические стволовые клетки, плюрипотентные эмбриональные стволовые клетки или эмбриональные стволовые клетки. Генетически модифицированные клетки экспрессируют DDpp-CAR, который может нацеливаться на любой из антигенов, экспрессируемых на поверхности клеток-мишеней.
В одном варианте осуществления часть DDpp в DDpp-CAR предназначена для лечения конкретного рака. Рак, который можно лечить, включает опухоли, которые не являются васкуляризованными или еще по существу не васкуляризированными, а также васкуляризованные опухоли. Рак может включать несолидные опухоли (такие как гематологические опухоли, например, лейкозы и лимфомы) или может содержать солидные опухоли. Типы раковых заболеваний, подлежащих лечению с помощью DDpp-CAR, включают, без ограничения, карциному, бластому и саркому, а также некоторые лейкозные или лимфоидные злокачественные новообразования, доброкачественные и злокачественные опухоли и злокачественные новообразования, например саркомы, карциномы и меланомы. Также включены опухоли/раковые заболевания взрослых и опухоли/раковые заболевания детей.
Примеры гематологических (или гематогенных) раковых заболеваний включают лейкозы, включая острые лейкозы (такие как острый лимфоцитарный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, острый миелогенный лейкоз и миелобласты, промиейоцитарный, миеломоноцитарный, моноцитарный и эритролейкоз), хронические лейкозы (такие как хронический миелоцитарный (гранулоцитарный) лейкоз, хронический миелогенный лейкоз и хронический лимфоцитарный лейкоз), истинную полицитемию, лимфому, болезнь Ходжкина, неходжкинскую лимфому (индолентные формы и формы высокой степени злокачественности), множественную миелому, макроглобулинемию Вальденстрема, болезнь тяжелой цепи, миелодиспластический синдром, волосатоклеточный лейкоз и миелодисплазию.
Примеры солидных опухолей, таких как саркомы и карциномы, включают фибросаркому, миксосаркому, липосаркому, хондросаркому, остеосаркому и другие саркомы, синовиому, мезотелиому, опухоль Юинга, лейомиосаркому, рабдомиосаркому, рак толстой кишки, лимфоидную злокачественную опухоль, рак поджелудочной железы, рак молочной железы, рак легкого, рак яичников, рак предстательной железы, гепатоцеллюлярную карциному, плоскоклеточный рак, базально-клеточный рак, аденокарциному, карциному потовых желез, медуллярную карциному щитовидной железы, папиллярную карциному щитовидной железы, феохромоцитомальную карциному сальных желез, папиллярную карциному, папиллярные аденокарциномы, медуллярную карциному, бронхогенную карциному, почечно-клеточную карциному, гепатому, рак желчных протоков, хориокарциному, опухоль Вильмса, рак шейки матки, опухоль яичка, семиному, рак мочевого пузыря, меланому и опухоли ЦНС (такие как глиома (например, глиома ствола головного мозга и смешанные глиомы), глиобластома (также известная как мультиформная глиобластома) астроцитома, лимфома ЦНС, герминома, медуллобластома, краниофариогома Шваннома, эпендимома, пинеалома, гемангиобластома, акустическая неврома, олигодендроглиома, менангиома, нейробластома, ретинобластома и метастазы в головной мозг).
В одном варианте осуществления раковые заболевания и расстройства можно лечить с использованием клеток, экспрессирующих DDpp-CAR, которые нацелены на BCMA, CD123, CS1, HER2, AFP или р26 AFP. В одном конкретном варианте осуществления DD-CAR может быть предназначен для нацеливания на CD22 для лечения В-клеточной лимфомы. В другом варианте осуществления клетка, экспрессирующая DDpp-CAR, содержит DDpp, предназначенный для нацеливания на CD19, может использоваться для лечения раковых заболеваний и расстройств, включая, без ограничения, пре-В ОЛЛ (педиатрическое показание), ОЛЛ у взрослых, лимфому из мантийных клеток, диффузную крупную В-крупноклеточную лимфому, терапию спасения после аллогенной трансплантации костного мозга и тому подобное. В другом варианте осуществления клетка, экспрессирующая DDpp-CAR, содержит DDpp, предназначенный для нацеливания на CS1, и может использоваться для лечения множественной миеломы. В другом варианте осуществления клетка, экспрессирующая DDpp-CAR, содержит DDpp, предназначенный для нацеливания на ВСМА, и может использоваться для лечения множественной миеломы. В другом варианте осуществления клетка, экспрессирующая DDpp-CAR, содержит DDpp, предназначенный для нацеливания на CS1 и предназначенный для нацеливания на ВСМА, и может использоваться для лечения множе- 167 043660 ственной миеломы. В другом варианте осуществления клетка, экспрессирующая DDpp-CAR, содержит
DDpp, предназначенный для нацеливания на HER2, и может использоваться для лечения рака молочной железы или рака яичника.
Связанные с В-клетками заболевания в контексте данного описания включают иммунодефициты В-клеток, аутоиммунные заболевания и/или чрезмерную/неконтролируемую пролиферацию клеток, связанную с В-клетками (включая лимфомы и/или лейкозы). Примеры таких заболеваний, в которых DDppCAR могут использоваться для терапевтических подходов, включают, без ограничения: системная красная волчанка (СКВ), диабет, ревматоидный артрит (РА), реактивный артрит, рассеянный склероз (PC), пузырчатку обыкновенную, целиакию, болезнь Крона, воспалительное заболевание кишечника, язвенный колит, аутоиммунное заболевание щитовидной железы, Х-сцепленную агаммаглобулинемию, пре-В острый лимфобластный лейкоз, системную красную волчанку, общий вариабельный иммунодефицит, хронический лимфолейкоз, заболевания, связанные с селективным дефицитом IgA и/или дефицит подкласса IgG, лимфомы линии В (лимфома Ходжкина и/или неходжкинская лимфома), иммунодефицит с тимомой, преходящая гипогаммаглобулинемия и/или синдром гипер-IgM, а также вирусноопосредованные В-клеточные заболевания, такие как лимфопролиферативное заболевание, опосредованное EBV, и хронические инфекции, в которых В-клетки участвуют в патофизиологии.
В предпочтительном варианте осуществления DDpp-CAR экспрессируется в Т-клетке и обеспечивает способ лечения или профилактики рака, включающий введение клеток-хозяев, экспрессирующих DDpp-CAR, пациентам с раком, у которых раковая клетка экспрессирует опухолевый антиген на своей поверхности, и где DDpp специфически связывает антиген-мишень. Иллюстративные антигены-мишени, которые связывают DDpp и DDpp-CAR, включают, без ограничения, ВСМА, CS1, HER2 и CD123.
Модифицированные DDpp-CAR-T-клетки также могут служить типом вакцины для иммунизации ex vivo и/или терапии in vivo у млекопитающего. Предпочтительно млекопитающее представляет собой человека.
Клетки, экспрессирующие модифицированные DDpp-CAR-T-клетки, предложенные в данном документе, можно вводить либо отдельно, либо в виде фармацевтической композиции в комбинации с разбавителями и/или с другими компонентами, такими как химиотерапевтические средства, антитела, цитокины или популяции клеток. Композиции, предложенные в данном документе, предпочтительно составлены для внутривенного введения, которое можно вводить один или более раз.
Используемые в данном документе варианты избежания потери антигена относятся к клеткам, которые демонстрируют снижение или потерю экспрессии антигена-мишени, антигены которых представляют собой мишени для CAR, предложенных в данном документе.
Различные варианты осуществления изобретения далее будут проиллюстрированы посредством описания экспериментов, приведенных в соответствии с ним. Следующие примеры приведены для облегчения повторения раскрытых вариантов осуществления и не должны рассматриваться как ограничивающие каким-либо образом остальную часть описания. В примерах ссылка делается на приложенные фигуры.
Примеры
Пример 1. Выделение и характеристика DDpp, которые связывают иллюстративные представляющие интерес мишени.
Библиотеку DDpp, полученную как описано в Intl. Appl. Publ. № WO2016164305 и WO 2016164369, скринировали на фаг связывание ВСМА, CD123, AFP и AFP р26 посредством нескольких раундов отбора. Содержание каждой из Intl. Appl. Publ. № WO2016164305 и WO 2016164369, полностью включено в данное описание посредством ссылки).
Отдельные колонии, содержащие фагмиду из результатов пэннинга ВСМА, отбирали и фаг извлекали в 96-луночном формате с использованием вспомогательного фага VCSM13 в соответствии со стандартными протоколами. Для анализа связывания мишени с помощью ИФА 96-луночные планшеты покрывали 1,3 мкг/мл козьего антитела против человеческого IgG1-Fc с последующей инкубацией с 5 нМ рекомбинантной мишени человека (BCMA-Fc, CD123-Fc, AFP или AFP123) или IgG1-Fc. Затем в каждую лунку добавляли 50 мкл спасенного фага, разведенного в 5 раз в блокирующем буфере для ИФА. Связывание обнаруживали с использованием конъюгированного с HRP антитела против М13, и отношение ИФА для каждой последовательности определяли как поглощение при 450 нм для мишени (то есть BCMA-Fc, CD123-Fc, AFP или AFP123), деленное на коэффициент поглощения для IgG1-Fc усредненное по всем проверенным лункам, содержащим этот клон.
Пример 2. Слитый белок DDpps.
Чтобы оценить модульную природу DDpp в качестве связывающего элемента, связывающее вещество CD137 DDpp - bb10 (SEQ ID NO: 876), было переформатировано как слитое либо с N-, либо с Сконцом тяжелой цепи антитела, полученного из последовательности RSV-специфического моноклонального антитела паливизумаб (SYNAGIS®). Биспецифические антитела, SYN-bb10 и bb10-SYN, проявляют связывание как с CD137, так и с RSV (Фиг. 1А-1В; заштрихованные квадраты - bb10-SYN, заштрихованные кружки - SYN-bb10)), демонстрируя, что новая последовательность связывания была передана родительской последовательности D-домена, и функциональность DDpp сохраняется как при слиянии на N-,
- 168 043660 так и на С-конце. Напротив, слияния между альфа-спиральным белковым каркасом без мишени (SEQ ID
NO: 1) и SYN (DD-SYN для N-концевого слияния - незакрашенные кружки; SYN-DD для С-концевого слияния (незакрашенные квадраты) показал связывание только с RSV, но не связывание CCD137.
Связывание DDpp, bb10 с CD137, непосредственно связанным с пластиком, было продемонстрировано с помощью ИФА (Фиг. 1А-1В). Связывание DDpp bb10 с CD137 в качестве части клеточной мембраны также наблюдалось in situ с использованием FACS (данные не показаны).
Пример 3. DDpp-CAR, экспрессируемые в Т-клетках человека, продуцируют цитокины при связывании с мишенью.
Способность мишени: взаимодействие DD-CAR-экспрессирующих Т-клеток с мишенью индукции секреции цитокинов оценивали при помощи 293Т-клеток, которые временно трансфицировали 293Тклетки с помощью лентивирусных упаковочных векторов 3-го поколения (pRSV-REV, pMDLg/pRRE, and pMD2.G) с кодированием векторов PELNS DDpp-CAR с помощью LIPOFECTAMINE® 3000. Через 6 ч после трансфекции среду меняли, затем собирали среду, содержащую лентивирус, через 30 и 54 ч после трансфекции, объединяли, затем центрифугировали для удаления клеточного дебриса. Затем лентивирус аликвотировали и хранили при -80°С до использования для вирусной трансдукции. Трансдукцию Тклеток человека лентивирусом CAR осуществляли с использованием полных РВМС человека, активированных гранулами активации CD3/CD28 Т-клеток в культуральной среде, дополненной 40 ед/мл IL2. Через 24 ч 2x106 РВМС высевали на лунку в 6-луночный планшет для тканевых культур с 1 мл культуральной среды и 3 мл среды, содержащей лентивирус, с добавлением 40 ед/мл IL2 и протамин сульфата. Затем планшеты центрифугировали в течение 2 ч при 1000xg при 32°С, а затем инкубировали в течение ночи при 37°С. На следующие сутки процедуру лентивирусной трансдукции повторяли со свежими культуральными средами и содержащими лентивирус. Через 72 ч после начальной активации клеток шарики активации Т-клеток удаляли, затем Т-клетки культивировали для размножения при ~ 0,25-0,5x106 Т-клеток/мл в свежей среде, дополненной 100 ед/мл IL2. Каждые 2-3 суток Т-клетки подпитывали дополнительными средами Т-клеток и IL2 до тех пор, пока их не использовали для анализов цитокинов (описанных ниже) через 7-10 суток после начальной активации.
Продукцию цитокинов в ответ на экспрессию антигена-мишени (CD123) оценивали путем культивирования 25000 трансдуцированных Т-клеток (7 суток после активации) с 25000 без мишеней (K562, CD123-) или с мишенью (BDCM, CD123+) опухолевых клеток на лунку в 96 луночные планшеты Через 24 ч культуральные супернатанты собирали и продукцию цитокинов оценивали с помощью ИФА. Культуральные супернатанты разбавляли 1: 5 до ИФА. Таким же образом, продукцию цитокинов в ответ на экспрессию антигена-мишени PDL1 оценивали путем культивирования 25000 трансдуцированных Т-клеток (7 суток после активации) с 25000 без мишеней (K562, PDL1-) или с мишенью (SUDHL1, PDL1+) опухолевых клеток на лунку в 96 луночные планшеты Через 24 ч культуральные супернатанты собирали и продукцию цитокинов оценивали с помощью ИФА. Культуральные супернатанты разбавляли 1:5 до ИФА.
На фиг. 2А и фиг. 2В показано, что Т-клетки, экспрессирующие CD123’связывающие DDpp-CAR, продуцируют гамма-интерферон (IFNy) после стимуляции клетками CD123+ BDCM, но не клеточной линией CD123- K562. На фиг. 2С и фиг. 2D показано, что Т-клетки, экспрессирующие CD123связывающие DDpp-CAR, продуцируют интерлейкин 2 (IL2) после стимуляции клетками CD123+ BDCM, но не клеточной линией CD123- K562. Аналогично, на фиг. 2Е и 2F показано, что Т-клетки, экспрессирующие PDL1-связывающие DDpp-CAR, продуцируют гамма-интерферон (IFNy) и IL2, соответственно, после стимуляции клетками PDL1+ SUDHL1, но не клеточной линией PDL1- K562.
Пример 4. Т-клетки, трансдуцированные DDpp-CAR, не проявляют фенотипов, связанных с истощением Т-клеток.
Для оценки потенциального антиген-независимого истощения в Т-клетках, экспрессирующих DDpp-CAR, трансдуцированные Т-клетки (10-е сутки после активации) окрашивали антителами против CD3 и маркерами истощения Т-клеток (LAG3, PD1 и TIM3). На фиг. 3А обобщены данные отдельных экспериментов с несколькими донорами Т-клеток. Данные демонстрируют, что экспрессия маркеров истощения не была повышена в CD123-связывающих Т-клетках DDpp-CAR по сравнению с тем, что наблюдалась с анти-CD123 CAR, содержащим scFv (32176). На фиг. 3В показаны репрезентативные данные проточной цитометрии экспрессии LAG3, PD1 и TIM3 в Т-клетках, трансдуцированных либо scFvсодержащим CAR (верхний ряд), либо DDpp-CAR (в этом конкретном эксперименте CD123, нацеленный на cg06) через 10 суток после первоначальной активации Т-клетки. Сходство этих данных снова демонстрирует, что Т-клетки DDpp-CAR не регулируют экспрессию маркеров истощения, что дополнительно подтверждает их эффективность при иммунотерапии рака.
Пример 5. Экспрессирующие DDpp-CAR Т-клетки демонстрируют мишень-специфичную дегрануляцию и цитотоксичность опухоли.
Для оценки дегрануляции Т-клеток, экспрессирующих DDpp-CAR, 1x105 трансдуцированных Тклеток (9 сутки после активации) культивировали в Т-клеточной среде в течение 4 ч в присутствии монензина и РЕ-конъюгированного CD107a/LAMP1. Т-клетки культивировали отдельно (фиг. 4А) или в присутствии 2x105 опухолевых клеток без мишени (K562, которые представляют собой CD123-, фиг. 4В
- 169 043660 или экспрессирующих мишень опухолевых клеток (BDCM, CD123+, фиг. 4С), затем промывали и окрашивали в отношении экспрессии CD3. Дегрануляцию Т-клеток затем оценивали при помощи проточной цитометрии, сначала вводя клетки CD3 + SSC-low (неопухолевые), затем клетки CD3 + CD107а +. Символы представляют образцы из отдельных экспериментов с использованием нескольких доноров.
Продукция CD107а (маркер дегрануляции Т-клеток DDpp-CAR) была эквивалентна отрицательному контролю, когда нацеленные на CD123 Т-клетки DDpp-CAR культивировали отдельно. Ограниченная экспрессия CD107а при совместном культивировании Т-клеток DDpp-CAR с CD123-негативными опухолевыми клетками K562 и значительная экспрессия CD107а наблюдалась, когда Т-клетки DDpp-CAR, нацеленные на CD123, совместно культивировались с CD123-положительными клетками BDCM (данные не представлены). Эти данные показывают, что Т-клетки активируются, подвергаются передаче сигналов, подвергаются дегрануляции и приводят к эрадикации опухоли. Эти данные также обеспечивают дополнительную поддержку для мишень-зависимой активации экспрессирующих DDpp-CAR Т-клеток.
Цитолитическую активность DDpp-CAR Т-клеток оценивали с использованием Т-клеток, полученных от двух независимых доноров. Донор № 1 (Фиг. 5А-5В) DDpp-CAR Т-клетки эффективно уничтожают опухоль, экспрессирующую CD123, BDCM, но проявляют очень небольшую цитолитическую активность в отношении CD123-отрицательной опухоли, K562. Аналогичные результаты наблюдались у донора № 2 (Фиг. 5С и 5D).
Пример 6. Биспецифичный DDpp.
Как обсуждалось выше, DDpp может быть одновалентным или многовалентным и/или мультиспецифичным. Чтобы оценить способность мультиспецифичных Т-клеток DDppCAR вызывать иммунный ответ, на клетках Jurkat экспрессировали биспецифичные DDpp-CAR и измеряли внутриклеточную передачу сигналов в ответ на опухолевые клетки, экспрессирующие одну или обе мишени. Были сконструированы две биспецифичные DDppCAR, которые различались по порядку слияния доменов связывания. CG06-pb04 имеет домен pb04, слитый с трансмембранной областью CD8a, в то время как pb04-cg06 имеет домен cgo6, слитый с трансмембранной областью CD8a. Обе конструкции использовали GS-линкер между доменами, связывания мишени.
На фиг. 6А показано, что DDpp-CAR, содержащие только cg06, только pb04 (фиг. 6B),cg06-pb04, (фиг. 5С) и pb04-cg06 (фиг. 5D) могут быть трансдуцированы и экспрессированы в репортерной клеточной линии Jurkat NFAT, что оценивается по связыванию mAb против FLAG с CAR. Способность моноспецифных и биспецифичных CAR активировать путь NFAT оценивали путем совместного культивирования различных CAR с опухолевыми клетками с различным уровнем экспрессии CD123 и/или PDL1. Клетки совместно культивировали с клетками-мишенями в течение 6 ч. Опосредованную NFAT передачу сигналов измеряли путем добавления к клеткам реагента для анализа люциферазы (Promega) и количественного определения относительных единиц люминесценции (RLU) в качестве меры индуцированной внутриклеточной передачи сигналов.
На фиг. 6Е изображены результаты этого эксперимента. Крайняя левая группа столбцов и гистограмма показывают относительный эффект уничтожения DDG cg06 против различных типов клеток. Сигнальный ответ после совместного культивирования с высоким количеством CD123 + BDCM был самым большим с этим DDpp-CAR. Следующая группа справа показывает данные, показывающие внутриклеточную передачу сигналов после совместного культивирования DDb pb04 против тех же типов клеток. Передача сигнала была самой высокой в BDCM, за которой следуют SUHDL1 и Н460 (это линии клеток с самой высокой экспрессией для CD123 и PDL1 (данные не показаны)). Следующая группа справа изображает данные, показывающие внутриклеточную передачу сигналов би-специфического cd06pb04 DDpp (cg06 более дистальный по отношению к мембране Т-клеток по сравнению с pb04). Наконец, самая правая группа показывает внутриклеточную передачу сигналов от второго биспецифичного DBPpp (pb04-cg06 DDpp, где pb04 является более дистальным по отношению к мембране Т-клеток по сравнению с cg06). Эти две группы указывают на то, что биспецифичные DDpp-CAR действительно способствуют внутриклеточной передаче сигналов. В соответствии с вариантами осуществления, двухспецифичные DDpp-CAR проявляют повышенную активность (величина внутриклеточной передачи сигналов в группе pb04-cg06 с клетками BDCM больше, чем может быть объяснено только одним DDpp pb04). Таким образом, в некоторых вариантах осуществления DDpp-CAR, содержащие два DDpp, могут взаимодействовать для улучшения функции Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления существует синергизм между различными DDpp, используемыми в биспецифичном (или другом мультимерном) DDpp-CAR.
Пример 7. Применение двойных адаптеров связывающих доменов для улучшения передачи сигнала CAR 50000 репортерных клеток, ранее трансдуцированных связывающим AFP (домен р26).
CAR (af03) (SEQ ID NO: 961) культивировали в течение 5 ч в присутствии CD123-специфичного Cg06-адаптера (Cg06-p26, SEQ ID NO: 953) или Cg06-двойного адаптерного белка (Cg06-p26-Cg06, SEQ ID NO: 956) в присутствии 50000 CD123+ MOLM13 или CD123-дефицитных клеток MOLM13, затем оценивали на активность люциферазы. CD123-дефицитные клетки создавали с использованием технологии генной инженерии CRISPR/Cas9 (Фиг. 7А). Аналогичным образом, 50000 репортерных клеток, ранее трансдуцированных связывающим AFP (домен р26) CAR (af03) (SEQ ID NO: 961) культивировали в течение 5 ч в присутствии ВСМА-специфичного Вс40-адаптера (Вс40-р26, SEQ ID NO: 954) или Вс40- 170 043660 двойного адаптерного белка (Вс40-р26-Вс40, SEQ ID NO: 957) в присутствии или отсутствии 50000
ВСМА+ U266 клеток, затем оценивали на активность люциферазы (фиг. 7В).
На фиг. 7А и 7В показано, что белки адаптеров с двумя доменами связывания (бивалентные) управляют усилением сигналинга клетками Jurkat, экспрессирующих CAR, по сравнению с единичными адаптерами связывающих доменов.
Пример 8. DDpp-опосредованная опухолевая иммунотерапия in vivo.
Для оценки противоопухолевой активности in vivo DDpp CAR Т-клетки трансдуцировали с помощью bc40 DDpp CAR (CAR, нацеленный на ВСМА). Вс40 представляет собой SEQ ID NO: 164. Трансдуцированные клетки (5Х10Е6) вводили мышам NSG внутривенно через 34 суток после того, как мыши получали 10Е7 клеток, экспрессирующих ВСМА, меченных люциферазой/gfp опухолевых клеток U226. Как показано на фиг. 8, четыре мыши получили опухоль U226 на 0 сутки, которая прогрессивно росла в течение 32 суток. На 34 сутки мыши № 1, № 2 и № 4 получали Т-клетки CAR bc40-DDpp. Мышь № 3 не получила Т-клеток. На 45 сутки опухоль U226 была очищена у мышей, получавших Т-клетки CAR, в то время как мышь, которая не получала Т-клетки, умерла от опухолевой нагрузки.
Все цитируемые публикации, патенты, заявки на патенты, интернет-сайты и номера доступа/последовательности баз данных (включая как полинуклеотидные, так и полипептидные последовательности) включены в данное описание в качестве ссылки в полном объеме для всех целей в той же степени, как если бы каждая отдельная публикация, патент, заявка на патент, интернет-сайт или номер доступа/последовательность базы данных были специально и индивидуально указаны для включения в качестве ссылки.
Предполагается, что различные комбинации или подкомбинации конкретных признаков и аспектов, раскрытых выше, могут быть выполнены и все еще подпадают под варианты осуществления, охватываемые описанием. Кроме того, раскрытие любого конкретного признака, аспекта, способа, свойства, характеристики, качества, атрибута, элемента или тому подобного в связи с вариантом осуществления может использоваться во всех других вариантах осуществления, изложенных в данном документе. Соответственно, следует понимать, что различные признаки и аспекты раскрытых вариантов осуществления могут сочетаться или заменять друг друга для формирования изменяющихся режимов раскрытых вариантов осуществления. Таким образом, предполагается, что объем вариантов осуществления, охватываемых данным описанием, не должен быть ограничен конкретными раскрытыми вариантами осуществления, описанными в данном документе. Кроме того, хотя охватываемые варианты осуществления восприимчивы к различным модификациям и альтернативным формам, их конкретные примеры были показаны на фигурах и подробно описаны в данном документе. Однако следует понимать, что объем изобретения не должен быть ограничен конкретными раскрытыми формами или способами, а наоборот, изобретение должно охватывать все модификации, эквиваленты и альтернативы, попадающие в сущность и объем различных описанных вариантов осуществления и прилагаемой формулы изобретения. Любые раскрытые в данном документе способы не обязательно должны выполняться в указанном порядке. Раскрытые в данном документе способы включают определенные действия, предпринимаемые практикующим врачом, тем не менее, они могут также включать любые сторонние инструкции этих действий, прямо или косвенно. Например, такие действия, как введение Т-клетки, содержащей DDpp-CAR, включают инструктаж по введению Т-клетки, содержащей DDpp-CAR. Кроме того, если признаки или аспекты изобретения описаны в терминах групп Маркуша, специалисты в данной области техники поймут, что изобретение также таким образом описано в терминах любого отдельного члена или подгруппы членов группы Маркуша.
Раскрытые в данном документе диапазоны также охватывают любые и все перекрытия, поддиапазоны и их комбинации. Термины, такие как до, по меньшей мере, больше чем, менее чем, между и т.п., включают указанное число. Числа, которым предшествует такой термин как около или приблизительно, включают перечисленные числа. Например, около 10 нм включает 10 нм.
Таблица 2
Дополнительное раскрытие последовательности
SEQ ID: Мишень Последовательность
1 Домен D (без мишени) MGSWAEFKQRLAAIKTRLQALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQA YI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRDELQAYRHN
2 Эпитоп гкгс LAAIKTRLQ
3 CD19 LEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQKLGE
- 171 043660
YYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSED KLLACGEGAADIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCF SSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQAQGVALQTMKQEFLINL VKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQKLIS KTRAALGV
4 GlySer GGGGTGGGGS
5 GlySer GGGGDGGGGS
6 a3D (Q19E) Без мишени MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQA YI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRDELQAYRHN
7 ECD BCMA MLQMAGQCSQNEYFDSLLHACIPCQLRCSSNTPPLTCQRYCNAS VTNSVKGTNA
8 ECD CD 123 TKEDPNPPITNLRMKAKAQQLTWDLNRNVTDIECVKDADYSMP AVNNSYCQFGAISLCEVTNYTVRVANPPFSTWILFPENSGKPWA GAENLTCWIHDVDFLSCSWAVGPGAPADVQYDLYLNVANRRQ QYECLHYKTDAQGTRIGCRFDDISRLSSGSQSSHILVRGRSAAFG IPCTDKFVVFSQIEILTPPNMTAKCNKTHSFMHWKMRSHFNRKF RYELQIQKRMQPVITEQVRDRTSFQLLNPGTYTVQIRARERVYE FLSAWSTPQRFECDQEEGANTRAWR
9 AFP RTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEATYKEVS KMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLPAFLEELCHEKEILEKY GHSDCCSQSEEGRHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEE DRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTILLWAARYDKIIPSCCKAENA VECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAITVT KLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKI MSYICSQQDTLSNKITECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNL NRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEYSRRHPQLAVSVILRVAK GYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCGLF QKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCC QLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYAN RRPCF S SL VVDET YVPP AF SDDKFIFHKDLCQ AQGVALQTMKQE FLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEG QKLISKTRAALGV
10 AFP p26 LEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQKLGE YYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSED
- 172 043660
KLLACGEGAADIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCF SSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQAQGVALQTMKQEFLINL VKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQKLIS KTRAALGV
968 P26Q217P LEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQKLGE YYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSED KLLACGEGAADIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCF SSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQAQGVALQTMKQEFLINL VKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGPKLIS KTRAALGV
969 P26 (Q26- V229) QESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELM AITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIRHEMTPV NPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDL CQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEK CCQGQEQEVCFAEEGQKLISKTRAALGV
970 P26(Q26- V229) Q217P QESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELM AITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIRHEMTPV NPGVGQCCT S S YANRRPCF S SL VVDET YVPP AF SDDKFIFHKDL CQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEK CCQGQEQEVCFAEEGPKLISKTRAALGV
971 p26 (K23V229) KYIQESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSE LMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIRHEM TP VNPGVGQCCTS S YANRRPCF SSL VVDETYVPPAF SDDKFIFHK DLCQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLL EKCCQGQEQEVCFAEEGQKLISKTRAALGV
972 p26(K23- V229) Q217P KYIQESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSE LMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIRHEM TP VNPGVGQCCTS S YANRRPCF SSL VVDETYVPPAF SDDKFIFHK DLCQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLL EKCCQGQEQEVCFAEEGPKLISKTRAALGV
973 p26 (G17- V229) GEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKA PQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHL CIRHEMTP VNPGVGQCCT S S YANRRPCF S SL VVDET YVPP AF SD DKFIFHKDLCQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVI ADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQKLISKTRAALGV
- 173 043660
974 p26(G17- V229) Q217P GEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKA PQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHL CIRHEMTP VNPGVGQCCT S S YANRRPCF S SL VVDET YVPP AF SD DKFIFHKDLCQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVI ADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGPKLISKTRAALGV
963 Зрелый ECD CD22 DSSKWVFEHPETLYAWEGACVWIPCTYRALDGDLESFILFHNPE YNKNTSKFDGTRLYESTKDGKVPSEQKRVQFLGDKNKNCTLSI HPVHLNDSGQLGLRMESKTEKWMERIHLNVSERPFPPHIQLPPEI QESQEVTLTCLLNFSCYGYPIQLQWLLEGVPMRQAAVTSTSLTI KSVFTRSELKFSPQWSHHGKIVTCQLQDADGKFLSNDTVQLNV KHTPKLEIK VTP SD AIVREGD S VTMTCE VS S SNPE YTT VS WLKD GTSLKKQNTFTLNLREVTKDQSGKYCCQVSNDVGPGRSEEVFL QVQYAPEPSTVQILHSPAVEGSQVEFLCMSLANPLPTNYTWYHN GKEMQGRTEEKVHIPKILPWHAGTYSCVAENILGTGQRGPGAEL DVQYPPKKVTTVIQNPMPIREGDTVTLSCNYNSSNPSVTRYEWK PHGAWEEPSLGVLKIQNVGWDNTTIACAACNSWCSWASPVAL NVQYAPRDVRVRKIKPLSEIHSGNSVSLQCDFSSSHPKEVQFFWE KNGRLLGKESQLNFDSISPEDAGSYSCWVNNSIGQTASKAWTLE VLYAPRRLRVSMSPGDQVMEGKSATLTCESDANPPVSHYTWFD WNNQSLPYHSQKLRLEPVKVQHSGAYWCQGTNSVGKGRSPLS TLTVYYSPETIGRR
965 Зрелый ECDCS1 SGPVKELVGSVGGAVTFPLKSKVKQVDSIVWTFNTTPLVTIQPE GGTIIVTQNRNRERVDFPDGGYSLKLSKLKKNDSGIYYVGIYSSS LQQPSTQEYVLHVYEHLSKPKVTMGLQSNKNGTCVTNLTCCME HGEEDVIYTWKALGQAANESHNGSILPISWRWGESDMTFICVAR NP VSRNF S SPIL ARKLCEGAADDPD S SM
967 Зрелый ECD HER2 TQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYL PTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFED NYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVL IQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPM CKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCA AGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNP EGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGT QRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIF GSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWP
DSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLREL GSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDEC VGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRV LQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAH YKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHS CVDLDDKGCPAEQRASPLT
- 174 043660
Таблица 3
Иллюстративные адаптеры
SEQ ID NO: Дизайн адаптера Последовательность адаптера
951 CD123 ----1 ВСМА |_ HIS- (cg06) 1------------1 tag DEMGSWDEFGRRLYAIEWRLYALGGSE AELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEV EKLREIAAVIRSNLQAYRHNGGGGSGGG GSGGGGSGMLQMAGQCSQNEYFDSLLH ACIPCQLRCSSNTPPLTCQRYCNASVTNS VKGTNAGGGGSGGGGSGGGGSHHHHH HHHHH
952 none _____1 1____ HIS- , 1 BCMA --- (a3D) 1_______1 tag DEGGGGSMGSWAEFKQRLAAIKTRLQA LGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGK GNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHNGG GGSGGGGSGGGGSGMLQMAGQCSQNE YFDSLLHACIPCQLRCSSNTPPLTCQRYC NASVTNSVKGTNAGGGGSGGGGSGGGG SHHHHHHHHHH
953 I HIS-tag I---- CD123 ----1 26 1 1------LI (Cg06) 1— -----1 DEHHHHHHHHHHKLENLYFQGGGGGS MGSWDEFGRRLYAIEWRLYALGGSEAE LAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEK LREIAAVIRSNLQAYRHNGGGGSGGGGS GGGGSLEKCFQTENPLECQDKGEEELQK YIQESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAF LVAYTKKAPQLTS SELMAITRKMAATA ATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIR HEMTPVNPGVGQCCTS S YANRRPCF SSL VVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQAQGV
- 175 043660
ALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVI ADF SGLLEKCCQGQEQEVCF AEEGQKLI SKTRAALGV
954 1 HIS-tag |— _ BCMA {bc40) - —1 p26 1 DEHHHHHHHHHHKLENLYFQGGGGGS MGSWSEFWVRLGAIRERLDALGGSEAE LAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEK LRYTAATIRRFLQAYRHNGGGGSGGGGS GGGGSLEKCFQTENPLECQDKGEEELQK YIQESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAF LVAYTKKAPQLTS SELMAITRKMAATA ATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIR HEMTPVNPGVGQCCTS S YANRRPCF SSL VVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQAQGV ALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVI ADF SGLLEKCCQGQEQEVCF AEEGQKLI SKTRAALGV
955 I HIS-tag |— none (a3D-Q19E) —1 p26 1 DEHHHHHHHHHHKLENLYFQGGGGGS MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAEL AAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEAL RKEAAAIRDELQAYRHNGGGGSGGGGS GGGGSLEKCFQTENPLECQDKGEEELQK YIQESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAF LVAYTKKAPQLTS SELMAITRKMAATA ATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIR HEMTPVNPGVGQCCTS S YANRRPCF SSL VVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQAQGV ALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVI ADF SGLLEKCCQGQEQEVCF AEEGQKLI SKTRAALGV
956 CD123 {cg06-210) —1 p26 1— CD123 (cg06-210) -------1 HIS-tag | DEGGGGSMGSWDEFGRRLYAIEWQLYA LGGTEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGK GNPEVEKLREIAAVIRENLQAYRHNGGG GSGGGGSGGGGSGLEKCFQTENPLECQD KGEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQKLG EYYLQNAFLVAYTKKAPQLTS SELMAIT
- 176 043660
RKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAAD IIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYAN RRPCF S SL VVDET YVPP A F SDDKFIFHKD LCQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQIT EEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCF AEEGQKLISKTRAALGVGGGGSGGGGS GGGGSMGSWDEFGRRLYAIEWQLYALG GTEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGN PEVEKLREIAAVIRENLQAYRHNGGGGS GGGGSGGGGSHHHHHHHHHH
957 ВСМА ______I I_____ ВСМА ____I t I (Ьс40) 1 PZ6 1 (bc40) DEGGGGSMGSW SEF WVRLGAIRERLD A LGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGK GNPEVEKLRYTAATIRRFLQAYRHNGGG GSGGGGSGGGGSGLEKCFQTENPLECQD KGEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQKLG EYYLQNAFLVAYTKKAPQLTS SELMAIT RKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAAD IIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYAN RRPCF S SL VVDET YVPP A F SDDKFIFHKD LCQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQIT EEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCF AEEGQKLISKTRAALGVGGGGSGGGGS GGGGSMGSWSEFWVRLGAIRERLDALG GSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGN PEVEKLRYTAATIRRFLQAYRHNGGGGS GGGGSGGGGSHHHHHHHHHH
Таблица 4
Иллюстративные последовательности ADBD CAR
SEQ ID NO: Дизайн CAR Последовательность CAR
958 CTsp-Flag- GSanHKep-a3D(Q19E)GSлинκep-CD8H-TM-41BB-CDЗζ MAFLWLLSCWALLGTTFGDYKDDDD KGGGGSGGGGSMGSWAEFKQRLAAI KTRLEALGGSEAELAAFEKEIAAFESE
- 177 043660
LQAYI<GI<GNPEVEALRI<EAAAIRDEL QAYRHNGQAGSGTTTPAPRPPTPAPTI ASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLD FACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEED GCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAP AYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLD KRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNEL QKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHD GLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
959 CTsp-Flag- GSлинκep-cgO6-GSлинκep- ΕΏ8Η-ΤΜ-41ΒΒ-ΕΏ3ζ MAFLWLLSCWALLGTTFGDYKDDDD KGGGGSGGGGSMGSWDEFGRRLYAIE WRLYALGGSEAELAAFEKEIAAFESEL QAYKGKGNPEVEKLREIAAVIRSNLQA YRHNGGGGSGGGGSGTTTPAPRPPTP APTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTR GLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVI TLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQ EEDGC SCRFPEEEEGGCELRVKF SRS A DAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYD VLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLY NELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGK GHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQAL PPR
960 CTsp-Flag- С8линкер-Ьс40-С8линкер- Εϋ8Η-ΤΜ-41ΒΒ-Εϋ3ζ MAFLWLLSCWALLGTTFGDYKDDDD KGGGGSGGGGSMGSWSEFWVRLGAI RERLDALGGSEAELAAFEKEIAAFESE LQAYKGKGNPEVEKLRYTAATIRRFL QAYRHNGGGGSGGGGSGTTTPAPRPP TPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVH TRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSL VITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQT TQEEDGC SCRFPEEEEGGCELRVKF SR SADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEY DVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGL
- 178 043660
YNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRG KGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQA LPPR
961 CTsp-Flag- О8линкер-а£03-О8линкер- Εϋ8Η-ΤΜ-41ΒΒ-Εϋ3ζ MAFLWLLSCWALLGTTFGDYKDDDD KGGGGSGGGGSMGSWFEFYDRLNAID ARLWALGGSEAELAAFEKEIAAFESEL QAYKGKGNPEVENLRVHAAAIREWL QAYRHNGGGGSGGGGSGTTTPAPRPP TPAPTIASMGSWAEFKQRLAAIKTRLE ALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYK GKGNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRH NQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDF ACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEED GCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAP AYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLD KRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNEL QKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHD GLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
962 CTsp-Flag- О8линкер-а£05-О8линкер- CD8H-TM-41BB-CDЗζ MAFLWLLSCWALLGTTFGDYKDDDD KGGGGSGGGGSMGSWLEFYHRLNAID SRLWALGGSEAELAAFEKEIAAFESEL QAYKGKGNPEVESLRDHAAHIREWLQ AYRHNGGGGSGGGGSGTTTPAPRPPT PAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHT RGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLV ITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTT QEEDGC SCRFPEEEEGGCELRVKF SRS ADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEY DVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGL YNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRG KGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQA LPPR

Claims (45)

1. Белок, содержащий основанный на домене D (DD) мишень-связывающий домен, где DD мишеньсвязывающий домен специфически связывается с ВСМА и содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 85% идентична SEQ ID NO: 186.
2. Белок по п.1, где DD мишень-связывающий домен содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168, содержащий 0, 1, 2, 3, 4 или 5 замен.
3. Белок по п.1, где DD мишень-связывающий домен содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 149, 152-160 или 164-169.
4. Белок по п.1, где DD мишень-связывающий домен содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168.
- 179 043660
5. Белок по любому из пп.1-4, также содержащий второй полипептид, где второй полипептид напрямую или косвенно слит с DD мишень-связывающим доменом.
6. Белок по п.5, в котором второй полипептид содержит полноразмерное антитело или фрагмент антитела.
7. Белок по п.5, в котором второй полипептид содержит член, выбранный из группы, состоящей из (a) трансмембранного домена;
(b) ассоциированного с мембраной домена;
(c) сывороточного альбумина человека или его фрагмента;
(d) AFP или его фрагмента;
(e) р26 AFP или его фрагмента;
(f) внеклеточного домена рецептора или его фрагмента;
8. Белок по п.6, в котором DD мишень-связывающий домен слит с амино концом тяжелой цепи полноразмерного антитела;
амино концом легкой цепи полноразмерного антитела; карбоксильным концом тяжелой цепи полноразмерного антитела; или карбоксильным концом легкой цепи полноразмерного антитела.
9. Белок по п.6, в котором второй полипептид представляет собой Fc-домен.
10. Белок по п.5, в котором второй полипептид содержит внеклеточный домен или фрагмент внеклеточного домена рецептора, выбранного из группы, состоящей из ВСМА, CD123, CS1 и CD19.
11. Белок по любому из пп.1-10, который является меченым.
12. Белок по п.11, в котором метка выбрана из группы, состоящей из ферментативной метки, флуоресцентной метки, люминесцентной метки, биолюминесцентной метки и биотинового фрагмента.
13. Белок по любому из пп.1-11, который конъюгирован с терапевтическим или цитотоксическим агентом.
14. Химерный антигенный рецептор (CAR), который содержит мишень-связывающий домен, содержащий белок по любому из пп.1-4.
15. CAR по п.14, который содержит мишень-связывающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен.
16. CAR по п.15, в котором трансмембранный домен содержит трансмембранный домен CD8, 41ВВ или CD28.
17. CAR по п.15 или 16, в котором внутриклеточный сигнальный домен выбран из группы, состоящей из домена альфа-, бета- или дзета- цепи рецептора Т-клеток человека; домена 41ВВ человека; домена CD28 человека и любой их комбинации.
18. CAR по любому из пп.15-17, в котором внутриклеточный сигнальный домен содержит внутриклеточный домен костимулирующей молекулы, выбранной из группы, состоящей из CD27, CD28, 41ВВ, ОХ40, CD30, CD40, PD1, антигена, связанного с функцией лимфоцитов-1 (LFA-1), CD2, CD7, LIGHT, NKG2C, NKG2D, В7-Н3, лиганда, который специфически связывается с CD83, и любой их комбинации.
19. Белок по любому из пп.1-13, который также содержит второй мишень-связывающий домен, имеющий ту же или другую мишень, что и DD мишень-связывающий домен.
20. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая белок по любому из пп.1-10 или 19 или CAR по любому из пп.14-18.
21. Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по п.20.
22. Вектор по п.21, в котором нуклеиновая кислота функционально связана с нуклеотидной последовательностью, которая регулирует экспрессию белка, кодируемого нуклеиновой кислотой.
23. Вектор по п.22, который представляет собой лентивирусный вектор, где вектор содержит нуклеиновую кислоту, кодирующую CAR.
24. Клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по п.20 или вектор по любому из пп.21-23.
25. Клетка, сконструированная для экспрессии белка по любому из пп.1-10 или 19.
26. Клетка, сконструированная для экспрессии CAR по любому из пп.14-18, в которой клетка представляет собой Т-клетку или естественную клетку-киллера (NK).
27. Фармацевтическая композиция, содержащая белок по любому из пп.1-13 или 19, нуклеиновую кислоту по п.20, вектор по любому из пп. 21-23 или клетку по п.26.
28. Способ лечения пациента, страдающего В-клеточным новообразованием, где способ включает введение пациенту эффективного количества белка по любому из пп.1-13 или 19, нуклеиновой кислоты по п.20, вектора по любому из пп.21-23, клетки по п.26 или фармацевтической композиции по п.27.
29. Способ по п.28, в котором В-клеточное злокачественное новообразование представляет собой множественную миелому.
30. Способ лечения пациента с нарушением, связанным с В-клетками, где способ включает введение пациенту эффективного количества белка по любому из пп. 1-13 или 19, нуклеиновой кислоты по п.20, вектора по пп.21-23, клетки по п.26 или фармацевтической композиции по п.27.
31. Способ лечения пациента с расстройством иммунной системы, где способ включает введение пациенту эффективного количества белка по любому из пп.1-13 или 19, нуклеиновой кислоты по п.20,
- 180 043660 вектора по любому из пп.21-23, клетки по п.26 или фармацевтической композиции по п.27.
32. Способ по п.31, в котором расстройство иммунной системы представляет собой аутоиммунное заболевание.
33. Способ лечения пациента, страдающего В-клеточным злокачественным новообразованием, где способ включает введение пациенту иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR), где CAR содержит мишень-связывающий домен, содержащий
a) DD мишень-связывающий домен, который специфически связывается с ВСМА и содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 85% идентична последовательности SEQ ID NO: 186,
b) DD мишень-связывающий домен, который специфически связывается с ВСМА и содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168, содержащую 0, 1, 2, 3, 4 или 5 замен, или
c) DD мишень-связывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 149, 152-160 или 164-169, трансмембранный домен и внутриклеточный домен, где внутриклеточный домен содержит сигнальный домен.
34. Способ по п.33, в котором иммунная клетка представляет собой Т-клетку.
35. Способ по п.33, в котором иммунная клетка представляет собой NK-клетку.
36. Способ по п.33, в котором введение является внутривенным.
37. Способ по любому из пп.31-36, где мишень-связывающий домен содержит DD мишеньсвязывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168.
38. Способ по любому из пп.31-37, где В-клеточное злокачественное новообразование представляет собой множественную миелому.
39. Способ лечения пациента, страдающего В-клеточным злокачественным новообразованием, включающий введение пациенту эффективного количества композиции, содержащей белок по любому из пп.1-13 или 19.
40. Способ по п.39, в котором В-клеточное злокачественное новообразование представляет собой множественную миелому.
41. Способ лечения В-клеточного расстройства, у пациента, включающий введение пациенту эффективного количества композиции, содержащей белок по любому из пп.1-13 или 19.
42. Способ лечения расстройства иммунной системы у пациента, включающий введение пациенту эффективного количества композиции, содержащей белок по любому из пп.1-13 или 19.
43. Способ по п.42, в котором расстройство иммунной системы представляет собой аутоиммунное заболевание.
44. Применение иммунной клетки, содержащей химерный антигенный рецептор (CAR) для лечения множественной миеломы, где CAR содержит мишень-связывающий домен, содержащий DD, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186, трансмембранный домен и внутриклеточный домен; причем внутриклеточный домен содержит сигнальный домен.
45. Применение по п.44, в котором иммунная клетка представляет собой Т-клетку или естественную клетку-киллера (NK).
EA202091198 2017-11-14 2018-11-14 Полипептиды, содержащие домен d, и их применение EA043660B1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US62/585,780 2017-11-14

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA043660B1 true EA043660B1 (ru) 2023-06-08

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7470840B2 (ja) Dドメイン含有ポリペプチドおよびその使用
US20210002381A1 (en) De novo binding domain containing polypeptides and uses thereof
US20240156866A1 (en) Multifunctional immune cell therapies
JP2021502826A5 (ru)
US11464803B2 (en) D-domain containing polypeptides and uses thereof
KR20230162957A (ko) 다중기능적 면역 세포 요법
US20240124605A1 (en) D-domain containing polypeptides and uses thereof
EA043660B1 (ru) Полипептиды, содержащие домен d, и их применение
WO2024118651A2 (en) D-domain containing polypeptides and uses thereof
KR20240105452A (ko) D-도메인 함유 폴리펩티드 및 그의 용도
EA043883B1 (ru) Полипептиды, содержащие de novo связывающий домен, и их применение