EA043316B1 - METHODS AND COMPOSITIONS FOR HETEROLOGICAL repRNA IMMUNIZATIONS - Google Patents
METHODS AND COMPOSITIONS FOR HETEROLOGICAL repRNA IMMUNIZATIONS Download PDFInfo
- Publication number
- EA043316B1 EA043316B1 EA202090386 EA043316B1 EA 043316 B1 EA043316 B1 EA 043316B1 EA 202090386 EA202090386 EA 202090386 EA 043316 B1 EA043316 B1 EA 043316B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- composition
- reprna
- ivt
- antigenic
- immune response
- Prior art date
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims description 246
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 95
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 175
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 claims description 172
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 157
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 120
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims description 91
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 78
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 74
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims description 73
- 230000037452 priming Effects 0.000 claims description 71
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 70
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 41
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 41
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 41
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 41
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 37
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 29
- 241000598171 Human adenovirus sp. Species 0.000 claims description 21
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 18
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 18
- 244000052769 pathogen Species 0.000 claims description 17
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 claims description 16
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 16
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 claims description 16
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 15
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 14
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 14
- 241000710959 Venezuelan equine encephalitis virus Species 0.000 claims description 9
- 230000036039 immunity Effects 0.000 claims description 9
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 5
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 claims description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 4
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 58
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 58
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 44
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 44
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 41
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 37
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 28
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 26
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 24
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 23
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 23
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 21
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 19
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 18
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 18
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 description 17
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 16
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 16
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 15
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 14
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 14
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 13
- 206010014611 Encephalitis venezuelan equine Diseases 0.000 description 12
- 208000002687 Venezuelan Equine Encephalomyelitis Diseases 0.000 description 12
- 201000009145 Venezuelan equine encephalitis Diseases 0.000 description 12
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 11
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 10
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 10
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 10
- 238000013401 experimental design Methods 0.000 description 10
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 10
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 10
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 10
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 9
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 9
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 9
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 9
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 8
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 description 8
- 102100034922 T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Human genes 0.000 description 8
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 8
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 8
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 8
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 8
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 8
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 8
- 108010068327 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase Proteins 0.000 description 7
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 7
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 7
- 238000003114 enzyme-linked immunosorbent spot assay Methods 0.000 description 7
- 239000000463 material Substances 0.000 description 7
- 230000004044 response Effects 0.000 description 7
- KWVJHCQQUFDPLU-YEUCEMRASA-N 2,3-bis[[(z)-octadec-9-enoyl]oxy]propyl-trimethylazanium Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(C[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC KWVJHCQQUFDPLU-YEUCEMRASA-N 0.000 description 6
- 241000710929 Alphavirus Species 0.000 description 6
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 6
- 241001135569 Human adenovirus 5 Species 0.000 description 6
- 241000711902 Pneumovirus Species 0.000 description 6
- 241000725643 Respiratory syncytial virus Species 0.000 description 6
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 6
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 6
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 6
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 6
- 229940023143 protein vaccine Drugs 0.000 description 6
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 6
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 6
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 6
- 241000990167 unclassified Simian adenoviruses Species 0.000 description 6
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 5
- 238000011510 Elispot assay Methods 0.000 description 5
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 5
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 5
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 5
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 5
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 5
- 125000000129 anionic group Chemical group 0.000 description 5
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 5
- 238000009566 cancer vaccine Methods 0.000 description 5
- 229940022399 cancer vaccine Drugs 0.000 description 5
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 5
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 5
- UQLDLKMNUJERMK-UHFFFAOYSA-L di(octadecanoyloxy)lead Chemical compound [Pb+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O UQLDLKMNUJERMK-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 5
- 230000008348 humoral response Effects 0.000 description 5
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 5
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 5
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 5
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 4
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 4
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 4
- 101000991410 Homo sapiens Nucleolar and spindle-associated protein 1 Proteins 0.000 description 4
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 4
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 4
- 102100030991 Nucleolar and spindle-associated protein 1 Human genes 0.000 description 4
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 4
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 4
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 4
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 4
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 4
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 4
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 4
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 4
- MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N (3s)-4-[[(2s)-1-[[(2s)-1-[[(1s)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-[[2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N 0.000 description 3
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 3
- CXURGFRDGROIKG-UHFFFAOYSA-N 3,3-bis(chloromethyl)oxetane Chemical compound ClCC1(CCl)COC1 CXURGFRDGROIKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241001217856 Chimpanzee adenovirus Species 0.000 description 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 3
- 241000725619 Dengue virus Species 0.000 description 3
- 101710145505 Fiber protein Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101710094396 Hexon protein Proteins 0.000 description 3
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 3
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 3
- 101710173835 Penton protein Proteins 0.000 description 3
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091027544 Subgenomic mRNA Proteins 0.000 description 3
- 241000907316 Zika virus Species 0.000 description 3
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 3
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 3
- -1 cationic lipid Chemical class 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 3
- 230000034994 death Effects 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 230000002500 effect on skin Effects 0.000 description 3
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 3
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 3
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 3
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 3
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 3
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- NRJAVPSFFCBXDT-HUESYALOSA-N 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC NRJAVPSFFCBXDT-HUESYALOSA-N 0.000 description 2
- OGHAROSJZRTIOK-KQYNXXCUSA-O 7-methylguanosine Chemical compound C1=2N=C(N)NC(=O)C=2[N+](C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OGHAROSJZRTIOK-KQYNXXCUSA-O 0.000 description 2
- 206010002091 Anaesthesia Diseases 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 2
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 101100191768 Caenorhabditis elegans pbs-4 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 2
- 241001502567 Chikungunya virus Species 0.000 description 2
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001115402 Ebolavirus Species 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 241000711950 Filoviridae Species 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 241000282575 Gorilla Species 0.000 description 2
- 102000004269 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 2
- 108010017080 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 2
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 2
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 2
- 108091006905 Human Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 102000008100 Human Serum Albumin Human genes 0.000 description 2
- PIWKPBJCKXDKJR-UHFFFAOYSA-N Isoflurane Chemical compound FC(F)OC(Cl)C(F)(F)F PIWKPBJCKXDKJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 2
- 108010038512 Platelet-Derived Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000010780 Platelet-Derived Growth Factor Human genes 0.000 description 2
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 2
- 201000003176 Severe Acute Respiratory Syndrome Diseases 0.000 description 2
- 241000710886 West Nile virus Species 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 229940027570 adenoviral vector vaccine Drugs 0.000 description 2
- 230000037005 anaesthesia Effects 0.000 description 2
- 230000005809 anti-tumor immunity Effects 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 2
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 2
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 2
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 2
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 2
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 2
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 2
- 229960002725 isoflurane Drugs 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 229940038694 mRNA-based vaccine Drugs 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 2
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 2
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 2
- MWRBNPKJOOWZPW-NYVOMTAGSA-N 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine zwitterion Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OCCN)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC MWRBNPKJOOWZPW-NYVOMTAGSA-N 0.000 description 1
- UTAIYTHAJQNQDW-KQYNXXCUSA-N 1-methylguanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)N(C)C(N)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O UTAIYTHAJQNQDW-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- OVYNGSFVYRPRCG-UHFFFAOYSA-N 2'-O-Methylguanosine Natural products COC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC(N)=NC2=O)=C2N=C1 OVYNGSFVYRPRCG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVYNGSFVYRPRCG-KQYNXXCUSA-N 2'-O-methylguanosine Chemical compound CO[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(N=C(N)NC2=O)=C2N=C1 OVYNGSFVYRPRCG-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- YUCFXTKBZFABID-WOUKDFQISA-N 2-(dimethylamino)-9-[(2r,3r,4r,5r)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-methoxyoxolan-2-yl]-3h-purin-6-one Chemical compound CO[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(NC(=NC2=O)N(C)C)=C2N=C1 YUCFXTKBZFABID-WOUKDFQISA-N 0.000 description 1
- 241000224422 Acanthamoeba Species 0.000 description 1
- 241000701242 Adenoviridae Species 0.000 description 1
- 241001123964 African pouched rat arterivirus Species 0.000 description 1
- 241001292006 Arteriviridae Species 0.000 description 1
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 1
- 241000178568 Aura virus Species 0.000 description 1
- 241000934146 Balamuthia mandrillaris Species 0.000 description 1
- 241000710946 Barmah Forest virus Species 0.000 description 1
- 241000608319 Bebaru virus Species 0.000 description 1
- 206010005003 Bladder cancer Diseases 0.000 description 1
- 241000228405 Blastomyces dermatitidis Species 0.000 description 1
- 241000701106 Bovine adenovirus 3 Species 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000231316 Buggy Creek virus Species 0.000 description 1
- 210000005236 CD8+ effector T cell Anatomy 0.000 description 1
- 241000589875 Campylobacter jejuni Species 0.000 description 1
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 1
- 241000701157 Canine mastadenovirus A Species 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 description 1
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 description 1
- 241000223205 Coccidioides immitis Species 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 241000711573 Coronaviridae Species 0.000 description 1
- 241000709687 Coxsackievirus Species 0.000 description 1
- 229940046168 CpG oligodeoxynucleotide Drugs 0.000 description 1
- 201000007336 Cryptococcosis Diseases 0.000 description 1
- 241000221204 Cryptococcus neoformans Species 0.000 description 1
- 241000223935 Cryptosporidium Species 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 241000710945 Eastern equine encephalitis virus Species 0.000 description 1
- 206010014733 Endometrial cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010014759 Endometrial neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000701832 Enterobacteria phage T3 Species 0.000 description 1
- 241000701867 Enterobacteria phage T7 Species 0.000 description 1
- 241000709661 Enterovirus Species 0.000 description 1
- 241000991587 Enterovirus C Species 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- 206010066919 Epidemic polyarthritis Diseases 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000710803 Equine arteritis virus Species 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000465885 Everglades virus Species 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 241000231322 Fort Morgan virus Species 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 206010069767 H1N1 influenza Diseases 0.000 description 1
- 241000590002 Helicobacter pylori Species 0.000 description 1
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 1
- 241000598436 Human T-cell lymphotropic virus Species 0.000 description 1
- 241000205701 Human adenovirus 26 Species 0.000 description 1
- 241000701085 Human alphaherpesvirus 3 Species 0.000 description 1
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 1
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 description 1
- 102100034349 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 description 1
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 description 1
- 102000003814 Interleukin-10 Human genes 0.000 description 1
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 description 1
- 102000013462 Interleukin-12 Human genes 0.000 description 1
- 108010065805 Interleukin-12 Proteins 0.000 description 1
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 description 1
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 1
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 108090001007 Interleukin-8 Proteins 0.000 description 1
- 102000004890 Interleukin-8 Human genes 0.000 description 1
- 241000567229 Isospora Species 0.000 description 1
- 241000701460 JC polyomavirus Species 0.000 description 1
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102000003855 L-lactate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 108700023483 L-lactate dehydrogenases Proteins 0.000 description 1
- 108091026898 Leader sequence (mRNA) Proteins 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- 241000222722 Leishmania <genus> Species 0.000 description 1
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 241000712899 Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus Species 0.000 description 1
- 108010074338 Lymphokines Proteins 0.000 description 1
- 102000008072 Lymphokines Human genes 0.000 description 1
- 241000701244 Mastadenovirus Species 0.000 description 1
- 241000608292 Mayaro virus Species 0.000 description 1
- 241000712079 Measles morbillivirus Species 0.000 description 1
- 201000009906 Meningitis Diseases 0.000 description 1
- 241000710949 Middelburg virus Species 0.000 description 1
- 241000700560 Molluscum contagiosum virus Species 0.000 description 1
- 241000895316 Monkey arterivirus Species 0.000 description 1
- 241000711386 Mumps virus Species 0.000 description 1
- RSPURTUNRHNVGF-IOSLPCCCSA-N N(2),N(2)-dimethylguanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N(C)C)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O RSPURTUNRHNVGF-IOSLPCCCSA-N 0.000 description 1
- 241000224438 Naegleria fowleri Species 0.000 description 1
- 241000608287 Ndumu virus Species 0.000 description 1
- 241000588653 Neisseria Species 0.000 description 1
- 241000588652 Neisseria gonorrhoeae Species 0.000 description 1
- 208000015914 Non-Hodgkin lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 241001263478 Norovirus Species 0.000 description 1
- 108700001237 Nucleic Acid-Based Vaccines Proteins 0.000 description 1
- 102000011931 Nucleoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010061100 Nucleoproteins Proteins 0.000 description 1
- 241000710944 O'nyong-nyong virus Species 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000282577 Pan troglodytes Species 0.000 description 1
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241001504519 Papio ursinus Species 0.000 description 1
- 241000014771 Pebjah virus Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 241000367425 Piliocolobus badius Species 0.000 description 1
- 241000868134 Pixuna virus Species 0.000 description 1
- 241000224016 Plasmodium Species 0.000 description 1
- 241000233870 Pneumocystis Species 0.000 description 1
- 108091036407 Polyadenylation Proteins 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 108010076039 Polyproteins Proteins 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 241000188845 Porcine adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001135989 Porcine reproductive and respiratory syndrome virus Species 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- 102000029797 Prion Human genes 0.000 description 1
- 108091000054 Prion Proteins 0.000 description 1
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 108010065868 RNA polymerase SP6 Proteins 0.000 description 1
- 101150006932 RTN1 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010037742 Rabies Diseases 0.000 description 1
- 241000711798 Rabies lyssavirus Species 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 208000015634 Rectal Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 description 1
- 241000724205 Rice stripe tenuivirus Species 0.000 description 1
- 239000008156 Ringer's lactate solution Substances 0.000 description 1
- 241000710942 Ross River virus Species 0.000 description 1
- 241000702670 Rotavirus Species 0.000 description 1
- 241000710799 Rubella virus Species 0.000 description 1
- 241000315672 SARS coronavirus Species 0.000 description 1
- 241000608282 Sagiyama virus Species 0.000 description 1
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 1
- 241001468001 Salmonella virus SP6 Species 0.000 description 1
- 241000710961 Semliki Forest virus Species 0.000 description 1
- 241000607768 Shigella Species 0.000 description 1
- 241000710960 Sindbis virus Species 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 101710137500 T7 RNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 108091036066 Three prime untranslated region Proteins 0.000 description 1
- 208000024770 Thyroid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000710924 Togaviridae Species 0.000 description 1
- 241000223997 Toxoplasma gondii Species 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 241000608278 Una virus Species 0.000 description 1
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 108700002693 Viral Replicase Complex Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100038611 Vitamin D-binding protein Human genes 0.000 description 1
- 241000710951 Western equine encephalitis virus Species 0.000 description 1
- IPSYLHZJPVDMHR-LDLOPFEMSA-N [(2r)-3-[ethoxy(hydroxy)phosphoryl]oxy-2-octadecanoyloxypropyl] octadecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC IPSYLHZJPVDMHR-LDLOPFEMSA-N 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000033289 adaptive immune response Effects 0.000 description 1
- 238000007259 addition reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 108700010877 adenoviridae proteins Proteins 0.000 description 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004873 anchoring Methods 0.000 description 1
- 239000010775 animal oil Substances 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 244000309743 astrovirus Species 0.000 description 1
- 108010028263 bacteriophage T3 RNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 1
- BMLSTPRTEKLIPM-UHFFFAOYSA-I calcium;potassium;disodium;hydrogen carbonate;dichloride;dihydroxide;hydrate Chemical compound O.[OH-].[OH-].[Na+].[Na+].[Cl-].[Cl-].[K+].[Ca+2].OC([O-])=O BMLSTPRTEKLIPM-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- ZEWYCNBZMPELPF-UHFFFAOYSA-J calcium;potassium;sodium;2-hydroxypropanoic acid;sodium;tetrachloride Chemical compound [Na].[Na+].[Cl-].[Cl-].[Cl-].[Cl-].[K+].[Ca+2].CC(O)C(O)=O ZEWYCNBZMPELPF-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000007969 cellular immunity Effects 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 239000007979 citrate buffer Substances 0.000 description 1
- 238000011260 co-administration Methods 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000000139 costimulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000011026 diafiltration Methods 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 208000037765 diseases and disorders Diseases 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 238000004945 emulsification Methods 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000001125 extrusion Methods 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 239000012537 formulation buffer Substances 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 150000002334 glycols Chemical class 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 230000003862 health status Effects 0.000 description 1
- 229940037467 helicobacter pylori Drugs 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000004727 humoral immunity Effects 0.000 description 1
- 230000036571 hydration Effects 0.000 description 1
- 238000006703 hydration reaction Methods 0.000 description 1
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000036737 immune function Effects 0.000 description 1
- 239000003547 immunosorbent Substances 0.000 description 1
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000015788 innate immune response Effects 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 1
- 238000010212 intracellular staining Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000008176 lyophilized powder Substances 0.000 description 1
- 108700021021 mRNA Vaccine Proteins 0.000 description 1
- 108010026228 mRNA guanylyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 229940126582 mRNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 239000000693 micelle Substances 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 1
- 235000010446 mineral oil Nutrition 0.000 description 1
- 238000009126 molecular therapy Methods 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 1
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 244000045947 parasite Species 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 1
- 101150088856 pix gene Proteins 0.000 description 1
- 201000000317 pneumocystosis Diseases 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 230000001124 posttranscriptional effect Effects 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 206010038038 rectal cancer Diseases 0.000 description 1
- 201000001275 rectum cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000008354 sodium chloride injection Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 201000010740 swine influenza Diseases 0.000 description 1
- 229940036185 synagis Drugs 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 1
- 239000010409 thin film Substances 0.000 description 1
- 201000002510 thyroid cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 239000003440 toxic substance Substances 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 201000008827 tuberculosis Diseases 0.000 description 1
- 230000037455 tumor specific immune response Effects 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 1
- 210000000689 upper leg Anatomy 0.000 description 1
- 201000005112 urinary bladder cancer Diseases 0.000 description 1
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 description 1
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 108010063191 vitamin D-binding protein-macrophage activating factor Proteins 0.000 description 1
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 1
Description
Ссылка на перечень последовательностей, представленный в электронном видеLink to the list of sequences presented in electronic form
Настоящая заявка содержит перечень последовательностей, который представлен в электронном виде через EFS-Web как ASCII отформатированный перечень последовательностей с именем файла sequence_listing, дата создания 26 июля 2017 года, и который имеет размер около 23045 байт. Перечень последовательностей, представленный одновременно через EFS-Web, является частью описания изобретения и включен в настоящую заявку посредством ссылки во всей полноте.This application contains a sequence listing, which is presented electronically via EFS-Web as an ASCII formatted sequence listing with the file name sequence_listing, creation date July 26, 2017, and which is approximately 23,045 bytes in size. The sequence listing provided concurrently via EFS-Web is part of the specification and is incorporated herein by reference in its entirety.
Область, к которой относится изобретениеField to which the invention relates
Изобретение относится к способам и композициям для индукции иммунного ответа у субъектачеловека. В частности, индуцированный иммунный ответ получают путем введения гетерологичной прайм-буст комбинации in vitro транскрибированной (IVT) самореплицирующейся РНК (репРНК) и аденовирусного вектора. Такие способы и композиции обеспечивают сильную индукцию гуморального и клеточного иммунных ответов против иммуногена у субъекта-человека, что можно использовать для обеспечения эффективного лечения и/или защиты против заболевания, такого как опухоль или инфекционное заболевание, у субъекта-человека.The invention relates to methods and compositions for inducing an immune response in a human subject. Specifically, an induced immune response is generated by administering a heterologous prime-boost combination of in vitro transcribed (IVT) self-replicating RNA (repRNA) and an adenoviral vector. Such methods and compositions provide potent induction of humoral and cellular immune responses against an immunogen in a human subject, which can be used to provide effective treatment and/or protection against a disease, such as a tumor or infectious disease, in a human subject.
Предпосылки создания изобретенияPrerequisites for creating the invention
Вакцины можно использовать для обеспечения иммунной защиты против патогенов, таких как вирусы, бактерии, грибки или простейшие, а также против рака.Vaccines can be used to provide immune protection against pathogens such as viruses, bacteria, fungi or protozoa, as well as against cancer.
Инфекционные заболевания являются второй по значимости причиной смерти во всем мире после сердечно-сосудистых заболеваний, но являются основной причиной смерти у младенцев и детей (Lee and Nguyen, 2015, Immune Network, 15 (2): 51-7). Вакцинация является наиболее эффективным средством профилактики различных инфекционных заболеваний. Целью вакцинации является формирование патоген-специфического иммунного ответа, обеспечивающего длительную защиту от инфекции. Несмотря на значительный успех вакцин, разработка безопасных и сильных вакцин по-прежнему необходима из-за появления новых патогенов, повторного появления старых патогенов и неоптимальной защиты, предоставляемой существующими вакцинами. Имеющие важное значение заболевания, возникающие или вновь возникающие в последнее время, включают следующие: тяжелый острый респираторный синдром (SARS) в 2003 году, пандемия гриппа H1N1 в 2009 году и вирус Эбола в 2014 году. В результате возникает необходимость в разработке новых и эффективных вакцин против возникающих заболеваний.Infectious diseases are the second leading cause of death worldwide after cardiovascular disease, but are the leading cause of death in infants and children (Lee and Nguyen, 2015, Immune Network, 15 (2): 51-7). Vaccination is the most effective means of preventing various infectious diseases. The goal of vaccination is to generate a pathogen-specific immune response that provides long-term protection against infection. Despite significant vaccine success, the development of safe and potent vaccines remains necessary due to the emergence of new pathogens, the re-emergence of old pathogens, and the suboptimal protection provided by existing vaccines. Significant diseases emerging or re-emerging recently include the following: severe acute respiratory syndrome (SARS) in 2003, the H1N1 influenza pandemic in 2009, and Ebola virus in 2014. As a result, there is a need to develop new and effective vaccines against emerging diseases.
Рак является одной из основных причин смерти в западном мире, при этом наиболее распространенными являются рак легких, молочной железы, предстательной железы и колоректальный рак (Butterfield, 2015, BMJ, 350: h988). Существует несколько клинических подходов к лечению рака, включая хирургию, химиотерапию, лучевую терапию и лечение низкомолекулярными ингибиторами сигнальных путей. Было показано, что каждый из этих стандартных подходов модулирует противоопухолевый иммунитет путем увеличения экспрессии опухолевых антигенов в опухоли или вызывая высвобождение антигенов из умирающих опухолевых клеток и путем стимулирования противоопухолевого иммунитета для терапевтического эффекта. Иммунотерапия является перспективной областью, которая предлагает альтернативные методы лечения рака. Противораковые вакцины предназначены для стимулирования опухоль-специфических иммунных ответов, особенно цитотоксических CD8+ T-клеток, специфичных к опухолевым антигенам. Клиническая эффективность должна быть улучшена, чтобы противораковые вакцины стали полноценной альтернативой или дополнением к традиционным методам лечения рака. До настоящего времени предпринимались значительные усилия для лучшего понимания основных требований к клинически эффективным противораковым вакцинам. Последние данные подчеркивают, что важными требованиями, среди прочего, являются (1) использование мультиэпитопных иммуногенов, возможно, происходящих из различных опухолевых антигенов; (2) выбор эффективных адъювантов; (3) связь противораковых вакцин с агентами, способными противодействовать регуляторной среде, присутствующей в микроокружении опухоли; и (4) необходимость выбора окончательной композиции и режима вакцины после точных предварительных испытаний, сравнивающих различные композиции антигенов (Fenoglio et al., 2013, Hum Vaccin Immunother, (12): 2543-7). Для удовлетворения этих требований необходимо новое поколение противораковых вакцин, обладающих как иммунологической, так и клинической эффективностью.Cancer is one of the leading causes of death in the Western world, with lung, breast, prostate and colorectal cancers being the most common (Butterfield, 2015, BMJ, 350: h988). There are several clinical approaches to treating cancer, including surgery, chemotherapy, radiation therapy, and treatment with small molecule signaling pathway inhibitors. Each of these standard approaches has been shown to modulate antitumor immunity by increasing the expression of tumor antigens in the tumor or by causing the release of antigens from dying tumor cells and by stimulating antitumor immunity for therapeutic effect. Immunotherapy is a promising field that offers alternative treatments for cancer. Cancer vaccines are designed to stimulate tumor-specific immune responses, especially cytotoxic CD8+ T cells specific for tumor antigens. Clinical efficacy must be improved for cancer vaccines to become viable alternatives or complements to conventional cancer treatments. To date, significant efforts have been made to better understand the basic requirements for clinically effective cancer vaccines. Recent data highlight that important requirements include, among others, (1) the use of multiepitope immunogens, possibly derived from different tumor antigens; (2) selection of effective adjuvants; (3) association of cancer vaccines with agents capable of counteracting the regulatory milieu present in the tumor microenvironment; and (4) the need to select the final vaccine composition and regimen after rigorous preliminary trials comparing different antigen compositions (Fenoglio et al., 2013, Hum Vaccin Immunother, (12): 2543-7). To meet these demands, a new generation of cancer vaccines with both immunological and clinical efficacy is needed.
Потенциал вакцин на основе нуклеиновых кислот исследуют в течение многих лет (Vogel and Sarver N, 1995, Clin Microbiol Rev., 8(3):406-10). В настоящее время проводятся клинические испытания с использованием вакцин на основе ДНК или вакцин на основе мРНК, в том числе клинические испытания вакцин на основе мРНК против вирусных мишеней, таких как вирус бешенства (см., например, world wide web at clinicaltrials.gov; Alberer et al., The Lancet, published online July 2017, world wide web at dx.doi.org/10.1016/S0140-6736(17)31665-3; DeFrancesco et al., Nature Biotechnology, 35: 193-197).The potential of nucleic acid-based vaccines has been explored for many years (Vogel and Sarver N, 1995, Clin Microbiol Rev., 8(3):406-10). Clinical trials using DNA-based vaccines or mRNA-based vaccines are currently underway, including clinical trials of mRNA-based vaccines against viral targets such as rabies virus (see, for example, world wide web at clinicaltrials.gov; Alberer et al., The Lancet, published online July 2017, world wide web at dx.doi.org/10.1016/S0140-6736(17)31665-3; DeFrancesco et al., Nature Biotechnology, 35: 193-197).
В следующем поколении вакцин на основе мРНК используется самореплицирующаяся РНК (репРНК), которая основана на самореплицирующемся механизме положительно-полярных РНК-вирусов, таких как альфа-вирусы (см., например, Bogers et al., 2015, J Infect Dis., 211 (6):947-55). Такие репРНК индуцируют транзиторную высокую экспрессию антигена в широком диапазоне тканей организма хозяина и способны действовать как в делящихся, так и в неделящихся клетках.The next generation of mRNA vaccines uses self-replicating RNA (repRNA), which is based on the self-replicating mechanism of positive-sense RNA viruses such as alpha viruses (see, for example, Bogers et al., 2015, J Infect Dis., 211 (6):947-55). Such repRNAs induce transient high expression of antigen in a wide range of host tissues and are capable of acting in both dividing and non-dividing cells.
Альфа-вирусы принадлежат к семейству тогавирусов и имеют линейные одноцепочечные РНКAlpha viruses belong to the togavirus family and have linear, single-stranded RNA
- 1 043316 геномы с положительной полярностью, включающие два функциональных сегмента, каждый со своим собственным промотором. Первый сегмент, расположенный на 5'-конце генома, кодирует неструктурные белки, которые составляют самособирающуюся репликазу, которая синтезирует РНК-геном с отрицательной полярностью, РНК-геном с положительной полярностью и субгеномную РНК. Второй сегмент кодирует структурные оболочечные и капсидные белки. Самореплицирующиеся РНК (репРНК), также называемые альфа-вирусными репликонами, представляют собой нуклеиновые кислоты, происходящие из полноразмерного вируса, в котором гены, кодирующие структурные белки, удалены таким образом, что репликон способен реплицироваться в клетке, но не способен размножаться как вирус. В случае систем экспрессии антигенов на основе репРНК, гены, кодирующие антигены, могут быть встроены ниже субгеномного промотора вместо генов, кодирующих структурные белки. РепРНК могут доставляться в клетку в виде молекулы ДНК, из которой запускается репРНК, упакованными в частицу вирусного репликона (VRP) или в виде оголенной модифицированной или немодифицированной молекулы РНК- 1 043316 genomes with positive polarity, including two functional segments, each with its own promoter. The first segment, located at the 5' end of the genome, encodes nonstructural proteins that constitute a self-assembling replicase that synthesizes a negative polarity RNA genome, a positive polarity RNA genome, and subgenomic RNA. The second segment encodes structural envelope and capsid proteins. Self-replicating RNAs (repRNAs), also called alpha viral replicons, are nucleic acids derived from a full-length virus in which the genes encoding structural proteins have been deleted so that the replicon is able to replicate in a cell but is not able to replicate as a virus. In the case of repRNA-based antigen expression systems, genes encoding antigens can be inserted downstream of a subgenomic promoter instead of genes encoding structural proteins. RepRNAs can be delivered into the cell as a DNA molecule from which the repRNA starts, packaged in a viral replicon particle (VRP) or as a naked modified or unmodified RNA molecule
Исследование вакцин на основе репРНК все еще находится на доклинических стадиях, но клинические испытания, как ожидается, начнутся не позднее чем через пару лет. Исследования показали, что объединение репРНК, запускаемой из ДНК или упакованной в вирусные репликоновые частицы (VRP), с аденовирусными векторами при гетерологичной прайм-буст вакцинации стимулирует иммунные ответы (см., например, WO2005046621; Zhao et al., 2009, Vet Immunol Immunopathol., 131: 158-166 и Naslund et al., 2007, J Immunol, 178: 6761-6769). Кроме того, было показано, что гуморальные ответы, индуцированные вакциной на основе репРНК, могут быть усилены вакциной на основе белка (Bogers et al., Id.).Research into repRNA vaccines is still in the preclinical stages, but clinical trials are expected to begin within a couple of years. Studies have shown that combining repRNA, launched from DNA or packaged in viral replicon particles (VRP), with adenoviral vectors in heterologous prime-boost vaccination stimulates immune responses (see, for example, WO2005046621; Zhao et al., 2009, Vet Immunol Immunopathol ., 131: 158-166 and Naslund et al., 2007, J Immunol, 178: 6761-6769). In addition, it has been shown that humoral responses induced by a repRNA vaccine can be enhanced by a protein vaccine (Bogers et al., Id.).
Однако гетерологичная вакцинация с использованием аденовирусного вектора в сочетании с плазмидой ДНК, из которой запускается репРНК, имеет несколько проблем. Например, ДНК плазмиды связаны с проблемами безопасности, такими как загрязнение бактериальной продукцией, риск интеграции ДНК в геном хозяина и отсутствие самоограничивающейся экспрессии антигенов. С другой стороны, гетерологичная вакцинация с использованием аденовирусного вектора в сочетании с репРНК, запускаемой из VRP, требует пакующей клеточной линии для продукции VRP, что является дорогостоящим и длительным процессом со сложными производственными проблемами. Использование вакцины на основе белка в сочетании с репРНК имеет ограничение, заключающееся в том, что вакцины на основе белка требуют дорогостоящей и длительной продукции белка клетками с риском загрязнения. Кроме того, большинство вакцин на основе белка имеют проблемы стабильности и требуют холодовой цепи, и, как правило, вакцины на основе белка ограничиваются стимуляцией гуморальных иммунных ответов.However, heterologous vaccination using an adenoviral vector in combination with a DNA plasmid from which the repRNA is launched has several problems. For example, DNA plasmids are associated with safety concerns such as contamination by bacterial products, risk of DNA integration into the host genome, and lack of self-limiting expression of antigens. On the other hand, heterologous vaccination using an adenoviral vector in combination with VRP-driven repRNA requires a packaging cell line to produce VRP, which is an expensive and time-consuming process with complex manufacturing issues. The use of a protein-based vaccine in combination with repRNA has the limitation that protein-based vaccines require expensive and time-consuming protein production by cells with the risk of contamination. Additionally, most protein-based vaccines have stability issues and require a cold chain, and generally protein-based vaccines are limited to stimulating humoral immune responses.
Соответственно, в данной области существует потребность в улучшенных вакцинах на основе технологии репРНК, которые можно использовать для индукции защитного гуморального и клеточного иммунитета против иммуногенов, особенно когда требуется быстрый ответ в случае вспышки пандемии. Производство таких вакцин должно быть экономически выгодным, и они должны иметь минимальные побочные эффекты. Кроме того, они предпочтительно должны быть эффективны против широкого ряда антигенов.Accordingly, there is a need in the field for improved repRNA technology-based vaccines that can be used to induce protective humoral and cellular immunity against immunogens, especially when a rapid response is required in the event of a pandemic outbreak. Such vaccines must be cost-effective to produce and have minimal side effects. In addition, they should preferably be effective against a wide range of antigens.
Сущность изобретенияThe essence of the invention
Изобретение удовлетворяет эту потребность, обеспечивая схемы гетерологичной прайм-буст иммунизации с использованием двух разных вакцинных платформ: (i) in vitro транскрибированной (IVT) самореплицирующейся мРНК (репРНК) и (ii) вакцины на основе аденовирусного вектора.The invention addresses this need by providing heterologous prime-boost immunization regimens using two different vaccine platforms: (i) in vitro transcribed (IVT) self-replicating mRNA (repRNA) and (ii) an adenoviral vector vaccine.
Было обнаружено, что проблемы, связанные с применением вакцины на основе ДНК, упакованных в VRP вакцин и вакцин на основе белка, некоторые из которых обсуждаются выше, можно обойти с использованием in vitro продукции репРНК, которая представляет собой не содержащий ДНК продукт, который можно получить с использованием быстрого универсального и бесклеточного способа получения (Kallen and Thess, 2014, Ther Adv Vaccines, 2(1) 10-31). Авторы настоящего изобретения неожиданно обнаружили, что объединение IVT репРНК с аденовирусным вектором в схеме гетерологичной прайм-буст иммунизации приводит к индуцированным гуморальным и клеточным иммунным ответам, которые сильнее, чем ответы, получаемые в результате отдельных или гомологичных прайм-буст иммунизации аденовирусным вектором или IVT репРНК. Изобретение поэтому можно использовать для получения высокоэффективных вакцин против широкого ряда мишеней.It has been found that the problems associated with the use of DNA-based vaccines, VRP-packaged vaccines and protein-based vaccines, some of which are discussed above, can be circumvented by the use of in vitro repRNA products, which is a DNA-free product that can be prepared using a rapid, versatile and cell-free production method (Kallen and Thess, 2014, Ther Adv Vaccines, 2(1) 10-31). The present inventors have unexpectedly discovered that combining IVT repRNA with an adenoviral vector in a heterologous prime-boost immunization regimen results in induced humoral and cellular immune responses that are stronger than those obtained from separate or homologous prime-boost immunization with an adenoviral vector or IVT repRNA . The invention can therefore be used to produce highly effective vaccines against a wide range of targets.
В одном общем аспекте, изобретение относится к способу индукции иммунного ответа у субъектачеловека путем введения гетерологичной прайм-буст иммунизации, включающей комбинацию IVT репРНК и аденовирусного вектора.In one general aspect, the invention relates to a method of inducing an immune response in a human subject by administering a heterologous prime-boost immunization comprising a combination of IVT repRNA and an adenoviral vector.
В некоторых вариантах осуществления изобретения гетерологичные прайм-буст комбинации IVT репРНК и аденовирусного вектора генерируют индуцированный иммунный ответ на антигенный белок или его иммуногенный полипептид у субъекта-человека. Антигенный белок или его иммуногенный полипептид может представлять собой любой антигенный белок или его иммуногенный полипептид. Например, антигенный белок или его иммуногенный полипептид может происходить из патогена, например вируса, бактерии, грибка, простейшего, или рака, например опухоли.In some embodiments, heterologous prime-boost combinations of IVT repRNA and adenoviral vector generate an induced immune response to an antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof in a human subject. An antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof may be any antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof. For example, the antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof may be derived from a pathogen, such as a virus, bacterium, fungus, protozoan, or cancer, such as a tumor.
Соответственно, один общий аспект изобретения относится к способу индукции иммунного ответа у субъекта-человека, нуждающегося в этом, включающему:Accordingly, one general aspect of the invention relates to a method of inducing an immune response in a human subject in need thereof, comprising:
a. введение субъекту-человеку первой композиции, включающей иммунологически эффективноеa. administering to a human subject a first composition comprising an immunologically effective
- 2 043316 количество in vitro транскрибированной (IVT) самореплицирующейся РНК (репРНК), включающей первый полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, и- 2 043316 amount of in vitro transcribed (IVT) self-replicating RNA (repRNA), comprising a first polynucleotide encoding a first antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. введение субъекту второй композиции, включающей иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, где одна из композиций является примирующей композицией, а другая композиция является бустерной композицией, для достижения таким образом индуцированного иммунного ответа у субъекта-человека, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере общую антигенную детерминанту.b. administering to a subject a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, wherein one of the compositions is a priming composition and the other composition is a booster composition, thereby achieving induced immune response in a human subject, wherein the first and second antigenic proteins have at least a common antigenic determinant.
Другой общий аспект изобретения относится к комбинации для индукции иммунного ответа у субъекта-человека, включающей:Another general aspect of the invention relates to a combination for inducing an immune response in a human subject, comprising:
a. первую композицию, включающую иммунологически эффективное количество IVT репРНК, включающей первый полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. a first composition comprising an immunologically effective amount of an IVT repRNA comprising a first polynucleotide encoding a first antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. вторую композицию, включающую иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, где одну из композиций вводят субъекту-человеку для примирования иммунного ответа, а другую композицию вводят субъекту-человеку для усиления иммунного ответа, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту.b. a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, wherein one of the compositions is administered to a human subject to prime an immune response and the other composition is administered to a human subject to enhancing an immune response, wherein the first and second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant.
Другой общий аспект изобретения относится к применению комбинации в соответствии с вариантом осуществления изобретения для индукции иммунного ответа у субъекта-человека.Another general aspect of the invention relates to the use of a combination in accordance with an embodiment of the invention to induce an immune response in a human subject.
В предпочтительных вариантах осуществления изобретения композиция, включающая IVT репРНК, является примирующей композицией, а композиция, включающая аденовирусный вектор, является бустерной композицией.In preferred embodiments of the invention, the composition comprising the IVT repRNA is a priming composition and the composition comprising the adenoviral vector is a booster composition.
В предпочтительных вариантах осуществления изобретения индуцированный иммунный ответ включает индуцированный гуморальный, или ответ антител, иммунный ответ против по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков, у субъекта-человека. Такой ответ, например, может характеризоваться большим процентом отвечающих пациентов, например, более чем 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 100% протестированных субъектов, как определено твердофазным иммуноферментным анализом (ELISA).In preferred embodiments of the invention, the induced immune response includes induced humoral, or antibody response, immune response against at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins in a human subject. Such a response, for example, may be characterized by a large percentage of patients responding, eg, greater than 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, or 100% of subjects tested, as determined by an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA).
В предпочтительных вариантах осуществления изобретения индуцированный иммунный ответ включает индуцированный клеточный иммунный ответ против по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков, у субъекта-человека.In preferred embodiments of the invention, the induced immune response includes an induced cellular immune response against at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins in a human subject.
В одном варианте осуществления изобретения усиленный иммунный ответ, генерируемый этим способом, включает усиленный CD8+ T-клеточный ответ против по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков, у субъекта-человека. Такой ответ, например, может характеризоваться большим процентом CD8+ отвечающих пациентов, например более чем 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 100% протестированных субъектов, как определено иммуноферментным спот-анализом (ELISPOT) или методом внутриклеточного окрашивания цитокинов (ICS). В другом варианте осуществления изобретения усиленный CD8+ T-клеточный ответ, генерируемый этим способом, включает увеличение или индукцию полифункциональных CD8+ Т-клеток, специфических в отношении по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков. Такие полифункциональные CD8+ Т-клетки экспрессируют более чем один цитокин, например, два или более из IFN-гамма, IL-2 и TNF-альфа.In one embodiment of the invention, the enhanced immune response generated by this method includes an enhanced CD8+ T cell response against at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins in a human subject. Such a response, for example, may be characterized by a large percentage of CD8+ responding patients, such as greater than 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, or 100% of subjects tested, as determined by an enzyme-linked immunosorbent spot assay (ELISPOT) or intracellular cytokine staining assay. (ICS). In another embodiment, the enhanced CD8+ T cell response generated by this method includes the expansion or induction of polyfunctional CD8+ T cells specific for at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins. Such polyfunctional CD8+ T cells express more than one cytokine, for example two or more of IFN-gamma, IL-2 and TNF-alpha.
В одном варианте осуществления изобретения усиленный иммунный ответ, генерируемый этим способом, включает усиленный CD4+ T-клеточный ответ против по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков, у субъекта-человека. Такой ответ, например, может характеризоваться большим процентом CD4+ отвечающих пациентов, например более чем 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, или 100% протестированных субъектов, как определено методом ELISPOT или методом ICS. В другом варианте осуществления изобретения усиленный CD4+ Tклеточный ответ, генерируемый этим способом, включает увеличение или индукцию полифункциональных CD4+ T-клеток, специфических в отношении по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков. Такие полифункциональные CD4+ Tклетки экспрессируют более чем один цитокин, например два или более из IFN-гамма, IL-2 и TNF-альфа.In one embodiment of the invention, the enhanced immune response generated by this method includes an enhanced CD4+ T cell response against at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins in a human subject. Such a response, for example, may be characterized by a large percentage of CD4+ responding patients, eg, greater than 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, or 100% of subjects tested, as determined by the ELISPOT method or the ICS method. In another embodiment of the invention, the enhanced CD4+ T cell response generated by this method includes the expansion or induction of polyfunctional CD4+ T cells specific for at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins. Such polyfunctional CD4+ T cells express more than one cytokine, for example two or more of IFN-gamma, IL-2 and TNF-alpha.
В предпочтительных вариантах осуществления изобретения индуцированный иммунный ответ включает индуцированный ответ антител, индуцированный CD4+ T-клеточный ответ и индуцированный CD8+ T-клеточный ответ против по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков, у субъекта-человека.In preferred embodiments, the induced immune response includes an induced antibody response, an induced CD4+ T cell response, and an induced CD8+ T cell response against at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins in a human subject.
В предпочтительных вариантах осуществления, IVT репРНК представляет собой репРНК на основеIn preferred embodiments, the IVT repRNA is a repRNA based
- 3 043316 вируса венесуэльского энцефалита лошадей (VEE). В предпочтительных вариантах осуществления каркас IVT репРНК представляет собой один из тех, которые описаны Frolov et al. (1999, J Virol., 73(5):385465). В предпочтительных вариантах осуществления каркас IVT репРНК представляет собой каркасную последовательность SEQ ID NO: 3 без вставки белка pre-F RSV.- 3 043316 Venezuelan equine encephalitis virus (VEE). In preferred embodiments, the IVT repRNA framework is one of those described by Frolov et al. (1999, J Virol., 73(5):385465). In preferred embodiments, the IVT repRNA framework is the framework sequence of SEQ ID NO: 3 without the RSV pre-F protein insert.
В предпочтительных вариантах осуществления аденовирусный вектор представляет собой вектор на основе рекомбинантного человеческого аденовируса серотипа 26 (Ad26) или вектор на основе рекомбинантного человеческого аденовируса серотипа 35 (Ad35).In preferred embodiments, the adenoviral vector is a recombinant human adenovirus serotype 26 (Ad26) vector or a recombinant human adenovirus serotype 35 (Ad35) vector.
В вариантах осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 1-52 недель после введения примирующей композиции. В одном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 2-52 недель после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 4-52 недель после введения примирующей композиции. В одном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 1 неделю после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 2 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 4 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 8 недель после введения примирующей композиции. В других вариантах осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 6, 10, 12, 14, 16, 20, 24 или более недель после введения примирующей композиции.In embodiments of the invention, the booster composition is administered 1-52 weeks after administration of the priming composition. In one embodiment of the invention, the booster composition is administered 2-52 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 4-52 weeks after administration of the priming composition. In one embodiment of the invention, the booster composition is administered 1 week after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 2 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 4 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 8 weeks after administration of the priming composition. In other embodiments, the booster composition is administered 6, 10, 12, 14, 16, 20, 24, or more weeks after administration of the primer composition.
В одном варианте осуществления изобретения первый или второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид происходит из патогена, такого как вирус, бактерия, грибок или простейшее. В предпочтительных вариантах осуществления первый или второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид происходит из вируса. В другом варианте осуществления изобретения антигенный белок происходит из рака. В предпочтительных вариантах осуществления первый или второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид происходит из опухоли.In one embodiment of the invention, the first or second antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof is derived from a pathogen such as a virus, bacterium, fungus or protozoan. In preferred embodiments, the first or second antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof is derived from a virus. In another embodiment of the invention, the antigenic protein is derived from cancer. In preferred embodiments, the first or second antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof is tumor derived.
В одном варианте осуществления изобретения первый полинуклеотид и второй полинуклеотид кодируют один и тот же антигенный белок или его иммуногенный полипептид. В другом варианте осуществления изобретения первый полинуклеотид и второй полинуклеотид кодируют разные иммуногенные полипептиды или эпитопы одного и того же антигенного белка. Еще в одном варианте осуществления изобретения первый полинуклеотид и второй полинуклеотид кодируют разные, но родственные, антигенные белки или их иммуногенный полипептид. Например, родственные антигенные белки могут быть по существу схожими белками, происходящими из одного и того же антигенного белка, или разными антигенныыми белками, происходящими из одного и того же патогена или опухоли.In one embodiment of the invention, the first polynucleotide and the second polynucleotide encode the same antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof. In another embodiment of the invention, the first polynucleotide and the second polynucleotide encode different immunogenic polypeptides or epitopes of the same antigenic protein. In yet another embodiment, the first polynucleotide and the second polynucleotide encode different, but related, antigenic proteins or an immunogenic polypeptide thereof. For example, related antigenic proteins may be substantially similar proteins derived from the same antigenic protein, or different antigenic proteins derived from the same pathogen or tumor.
В предпочтительных вариантах осуществления первый и второй антигенные белки являются идентичными или по существу идентичными.In preferred embodiments, the first and second antigenic proteins are identical or substantially identical.
В одном варианте осуществления изобретения способ по изобретению обеспечивает защитный иммунитет субъекту-человеку против заболевания, связанного с антигенным белком, такого как опухоль или инфекционное заболевание. В одном предпочтительном варианте осуществления прайм-буст комбинация IVT репРНК и аденовирусного вектора индуцирует защитный иммунный ответ против опухоли у субъекта-человека. В другом предпочтительном варианте осуществления прайм-буст комбинация IVT репРНК и аденовирусного вектора индуцирует иммунный ответ против патогена у субъекта-человека.In one embodiment, the method of the invention provides protective immunity to a human subject against a disease associated with an antigenic protein, such as a tumor or infectious disease. In one preferred embodiment, the prime-boost combination of IVT repRNA and adenoviral vector induces a protective immune response against a tumor in a human subject. In another preferred embodiment, the prime-boost combination of IVT repRNA and adenoviral vector induces an immune response against a pathogen in a human subject.
В предпочтительных вариантах осуществления первый или второй антигенный белок происходит из F белка до слияния из респираторно-синцитиального вируса (RSV-preF), и первый и второй антигенные белки являются идентичными или по существу идентичными.In preferred embodiments, the first or second antigenic protein is derived from the prefusion F protein from respiratory syncytial virus (RSV-preF), and the first and second antigenic proteins are identical or substantially identical.
В предпочтительных вариантах осуществления первый и второй антигенные белки каждый независимо включают аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, их иммуногенные полипептиды и их комбинации.In preferred embodiments, the first and second antigenic proteins each independently comprise an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, immunogenic polypeptides thereof, and combinations thereof.
В предпочтительных вариантах осуществления IVT репРНК включает нуклеиновую кислоту, кодирующую антигенный белок, происходящий из RSV-preF белка. Предпочтительно, IVT репРНК включает нуклеиновую кислоту, кодирующую антигенный белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, или его иммуногенный полипептид или антигенную детерминанту. Наиболее предпочтительно, IVT репРНК включает нуклеиновокислотную последовательность SEQ ID NO: 3.In preferred embodiments, the IVT repRNA includes a nucleic acid encoding an antigenic protein derived from the RSV-preF protein. Preferably, the IVT repRNA includes a nucleic acid encoding an antigenic protein having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, or an immunogenic polypeptide or antigenic determinant thereof. Most preferably, the IVT repRNA comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 3.
Краткое описание чертежейBrief description of drawings
Представленное выше краткое описание, а также последующее подробное описание изобретения будет лучше понято при прочтении вместе с прилагаемыми чертежами. Должно быть понятно, что изобретение не ограничивается точными вариантами осуществления, показанными на чертежах.The above brief description, as well as the following detailed description of the invention, will be better understood when read in conjunction with the accompanying drawings. It should be understood that the invention is not limited to the exact embodiments shown in the drawings.
На чертежах:On the drawings:
фиг. 1 представляет схематическое изображение репРНК на основе VEE-вируса, кодирующей RSVpreF белок;fig. 1 is a schematic representation of a VEE virus-based repRNA encoding the RSVpreF protein;
фиг. 2 представляет план эксперимента для исследования гомологичной IVT репРНК иммунизации, в котором анализ осуществляли методом ELISA;fig. 2 shows an experimental design for a homologous IVT repRNA immunization study in which the analysis was performed by ELISA;
фиг. 3 представляет RSV-preF белок-специфические гуморальные иммунные ответы из исследова- 4 043316 ния гомологичной IVT репРНК иммунизации, определенные методом ELISA;fig. 3 represents RSV-preF protein-specific humoral immune responses from a homologous IVT repRNA immunization study determined by ELISA;
фиг. 4 представляет план эксперимента для исследования гомологичной IVT репРНК иммунизации, в котором анализ осуществляли методом ELISPOT;fig. 4 presents an experimental design for a homologous IVT repRNA immunization study in which analysis was performed by the ELISPOT method;
фиг. 5 представляет RSV-preF белок-специфические T-клеточные ответы из исследования гомологичной IVT репРНК иммунизации, определенные при помощи IFN-γ ELISPOT анализа с использованием PBMC и CTL-активирующего пептида KYKNAVTEL из RSV-F;fig. 5 represents RSV-preF protein-specific T cell responses from a homologous IVT repRNA immunization study determined by IFN-γ ELISPOT assay using PBMC and CTL activating peptide KYKNAVTEL from RSV-F;
фиг. 6 представляет план эксперимента для исследования гетерологичной иммунизации с использованием IVT репРНК и аденовирусного вектора, в котором анализ осуществляли методом ELISA и ELISPOT;fig. 6 presents an experimental design for a heterologous immunization study using IVT repRNA and an adenoviral vector, in which the analysis was carried out by ELISA and ELISPOT;
фиг. 7 представляет RSV-preF белок-специфические гуморальные иммунные ответы из исследования гетерологичной иммунизации с использованием IVT репРНК и аденовирусного вектора, определенные методом ELISA; и фиг. 8 представляет RSV-preF белок-специфические T-клеточные ответы из исследования гетерологичной иммунизации с использованием IVT репРНК и аденовирусного вектора, определенные методом IFN-γ ELISPOT с использованием спленоцитов.fig. 7 represents RSV-preF protein-specific humoral immune responses from a heterologous immunization study using IVT repRNA and adenoviral vector determined by ELISA; and fig. 8 presents RSV-preF protein-specific T cell responses from a heterologous immunization study using IVT repRNA and adenoviral vector determined by IFN-γ ELISPOT using splenocytes.
Подробное описание изобретенияDetailed Description of the Invention
Различные публикации, статьи и патенты цитируются или описаны в предшествующем уровне техники и в описании; каждый из этих ссылочных документов полностью включен в настоящую заявку посредством ссылки. Обсуждение документов, актов, материалов, устройств, статей или т.п., которые включены в настоящее описание, представлено в целях обеспечения контекста для изобретения. Такое обсуждение не является признанием того, что какие-либо или все из вышеперечисленных являются частью предшествующего уровня техники в отношении любых изобретений, раскрытых или заявленных.Various publications, articles and patents are cited or described in the prior art and description; each of these referenced documents is incorporated herein by reference in its entirety. The discussion of documents, acts, materials, devices, articles, or the like that are included in this specification is presented for the purpose of providing context for the invention. Such discussion is not an admission that any or all of the foregoing is part of the prior art with respect to any inventions disclosed or claimed.
Если не указано иное, все технические и научные термины, используемые в настоящей заявке, имеют то же значение, которое обычно понимают специалисты в области техники, к которой относится настоящее изобретение. В противном случае, некоторые термины, используемые в настоящей заявке, имеют значения, указанные в описании. Все патенты, опубликованные патентные заявки и публикации, процитированные в настоящей заявке, включены посредством ссылки, как если бы они были изложены полностью в настоящей заявке. Следует отметить, что используемые в настоящей заявке и в прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа включают множественное число, если контекст явно не предписывает иное.Unless otherwise specified, all technical and scientific terms used in this application have the same meaning as commonly understood by those skilled in the art to which the present invention relates. Otherwise, certain terms used in this application have the meanings specified in the specification. All patents, published patent applications and publications cited in this application are incorporated by reference as if set forth in their entirety herein. It should be noted that as used in this application and in the accompanying claims, the singular number includes the plural unless the context clearly dictates otherwise.
Если не указано иное, термин по меньшей мере, предшествующий серии элементов, следует понимать как относящийся к каждому элементу в серии. Специалистам в данной области техники будет понятно, или они смогут установить, с использованием не более чем рутинного экспериментирования, множество эквивалентов конкретных вариантов осуществления изобретения, описанных в настоящей заявке. Такие эквиваленты предназначены для охвата изобретением.Unless otherwise specified, the term at least preceding a series of elements should be understood to refer to each element in the series. Those skilled in the art will recognize, or be able to ascertain, using no more than routine experimentation, many equivalents to the specific embodiments described herein. Such equivalents are intended to be covered by the invention.
В настоящем описании и в формуле изобретения, которая следует далее, если контекст не требует иного, следует понимать, что слово включать и такие варианты, как включает и включающий, подразумевают включение единого целого или стадии или группы единых целых или стадий, но не исключение любого другого единого целого или стадии или группы единых целых или стадий. В контексте настоящей заявки термин включающий может быть заменен термином содержащий или включающий в себя или иногда, когда он используется в настоящей заявке, термином имеющий. В контексте настоящей заявки состоящий из исключает любой элемент, стадию или ингредиент, не указанный в элементе формулы изобретения. В контексте настоящей заявки по существу состоящий из не исключает материалы или стадии, которые не оказывают существенного влияния на основные и новые характеристики формулы изобретения. В каждом случае в настоящей заявке любой из терминов включающий, состоящий по существу из и состоящий из может быть заменен любым из двух других терминов.In the present specification and in the claims that follow, unless the context otherwise requires, it is to be understood that the word include and variations such as includes and including include the inclusion of a whole or step or group of wholes or steps, but not the exclusion of any another single whole or stage or group of single wholes or stages. As used herein, the term including may be replaced by the term containing or including, or sometimes, when used herein, by the term having. In the context of this application, consisting of excludes any element, step or ingredient not specified in the element of the claims. As used herein, substantially consisting of does not exclude materials or steps that do not materially affect the essential and novel features of the claims. In each case in this application, any of the terms including, consisting essentially of, and consisting of may be replaced by either of the other two terms.
В контексте настоящей заявки союз и/или между множеством перечисляемых элементов понимается как охватывающий как индивидуальные, так и комбинированные варианты. Например, когда два элемента соединены и/или, первый вариант относится к применимости первого элемента без второго. Второй вариант относится к применимости второго элемента без первого. Третий вариант относится к применимости первого и второго элементов вместе. Предполагается, что любой из этих вариантов соответствует смыслу и поэтому удовлетворяет требованию термина и/или, как он используется в настоящей заявке. Также должно быть понятно, что одновременная применимость более чем одного из вариантов соответствует смыслу и, следовательно, удовлетворяет требованию термина и/или.In the context of this application, union and/or between multiple enumerated elements is understood to include both individual and combined options. For example, when two elements are connected and/or, the first option refers to the applicability of the first element without the second. The second option refers to the applicability of the second element without the first. The third option concerns the applicability of the first and second elements together. It is assumed that any of these options corresponds to the meaning and therefore satisfies the requirement of the term and/or as used in this application. It should also be clear that the simultaneous applicability of more than one of the options is consistent with the meaning and therefore satisfies the requirement of the term and/or.
В контексте настоящей заявки термин субъект означает любое животное, предпочтительно млекопитающее, наиболее предпочтительно человека, лечение которого будет или было осуществлено способом в соответствии с вариантом осуществления изобретения. В контексте настоящей заявки термин млекопитающее охватывает любое млекопитающее. Примеры млекопитающих включают, но не ограничиваются этим, коров, лошадей, овец, свиней, кошек, собак, мышей, крыс, кроликов, морских свинок, обезьян, людей и т.д., более предпочтительно человека.In the context of this application, the term subject means any animal, preferably a mammal, most preferably a human, which will be or has been treated by a method in accordance with an embodiment of the invention. As used herein, the term mammal includes any mammal. Examples of mammals include, but are not limited to, cows, horses, sheep, pigs, cats, dogs, mice, rats, rabbits, guinea pigs, monkeys, humans, etc., more preferably humans.
Защитный иммунитет зависит как от врожденного, так и от адаптивного иммунного ответа. В кон- 5 043316 тексте настоящей заявки термин иммунный ответ относится к развитию у субъекта гуморального и/или клеточного иммунологического ответа на антиген, который был введен субъекту способами по изобретению. Гуморальные иммунные ответы относятся к продукции антител B-клетками, а клеточный иммунный ответ относится к цитотоксической активности CD8+ эффекторных T-клеток и CD4+ T-клеток, также известных как хелперные T-клетки. CD4+ T-клетки играют ключевую роль как в гуморальном, так и в клеточном иммунном ответе.Protective immunity depends on both innate and adaptive immune responses. As used herein, the term immune response refers to the development in a subject of a humoral and/or cellular immunological response to an antigen that has been administered to the subject by the methods of the invention. Humoral immune responses refer to the production of antibodies by B cells, and cellular immune responses refer to the cytotoxic activity of CD8+ effector T cells and CD4+ T cells, also known as helper T cells. CD4+ T cells play a key role in both humoral and cellular immune responses.
В контексте настоящей заявки термин индуцирующий или стимулирующий и их вариации относятся к любому измеримому увеличению клеточной активности. Индукция иммунного ответа может включать, например, активацию, пролиферацию или созревание популяции иммунных клеток, увеличение продукции цитокинов и/или другой показатель повышения иммунной функции. В некоторых вариантах осуществления индукция иммунного ответа может включать увеличение пролиферации B-клеток, продуцирование антиген-специфических антител, увеличение пролиферации антиген-специфических Tклеток, улучшение презентации антигена дендритными клетками и/или повышение экспрессии определенных цитокинов, хемокинов и костимуляторных маркеров.As used herein, the term inducing or stimulating and variations thereof refer to any measurable increase in cellular activity. Induction of an immune response may include, for example, activation, proliferation, or maturation of a population of immune cells, increased production of cytokines, and/or other indication of increased immune function. In some embodiments, induction of an immune response may include increased B cell proliferation, production of antigen-specific antibodies, increased proliferation of antigen-specific T cells, improved antigen presentation by dendritic cells, and/or increased expression of certain cytokines, chemokines, and costimulatory markers.
В контексте настоящей заявки термин индуцированный ответ антител или индуцированный гуморальный иммунный ответ относится к ответу антител у субъекта-человека, которому вводят праймбуст комбинацию репРНК и аденовирусного вектора по изобретению, который усиливается по меньшей мере в 1,5, 2, 2,5 или более раз в сравнении с соответствующим иммунным ответом, наблюдаемым у человека, которому вводили гомологичную прайм-буст иммунизацию либо только с репРНК, либо только с аденовирусным вектором в сопоставимых дозах с использованием такой же прайм-буст схемы.As used herein, the term induced antibody response or induced humoral immune response refers to an antibody response in a human subject administered a prime boost combination of a repRNA and an adenoviral vector of the invention that is enhanced by at least 1.5, 2, 2.5 or more times compared to the corresponding immune response observed in a person who received a homologous prime-boost immunization with either repRNA alone or an adenoviral vector alone at comparable doses using the same prime-boost schedule.
В контексте настоящей заявки термин индуцированный клеточный иммунный ответ относится к клеточному иммунному ответу у человека, которому вводят прайм-буст комбинацию репРНК и аденовирусного вектора в соответствии с изобретением, который увеличивается по меньшей мере 1,5, 2, 2,5 раз или в сравнении с соответствующим иммунным ответом, наблюдаемым у человека, которому вводили гомологичную прайм-буст иммунизацию либо только с репРНК, либо только с аденовирусным вектором в сопоставимых дозах, с использованием такой же прайм-буст схемы.As used herein, the term induced cellular immune response refers to the cellular immune response in a human being administered a prime-boost combination of repRNA and adenoviral vector in accordance with the invention, which is increased by at least 1.5-, 2-, 2.5-fold or more with the corresponding immune response observed in a person given a homologous prime-boost immunization with either repRNA alone or an adenoviral vector alone at comparable doses using the same prime-boost schedule.
В контексте настоящей заявки термин защитный иммунитет или защитный иммунный ответ означает, что вакцинированный субъект способен контролировать инфекцию или заболевание, связанное с антигенным белком или его иммуногенным полипептидом, против которого была сделана вакцинация. Обычно у субъекта, у которого развился защитный иммунный ответ, развиваются только легкие или умеренные клинические симптомы, или вообще нет никаких симптомов. Обычно субъект, имеющий защитный иммунный ответ или защитный иммунитет против определенного антигенного белка, не умирает в результате инфекции или заболевания, связанного с антигенным белком.As used herein, the term protective immunity or protective immune response means that the vaccinated subject is able to control the infection or disease associated with the antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof against which the vaccination was given. Typically, a subject who has developed a protective immune response will develop only mild or moderate clinical symptoms, or no symptoms at all. Typically, a subject who has a protective immune response or protective immunity against a particular antigenic protein does not die as a result of an infection or disease associated with the antigenic protein.
В контексте настоящей заявки термин иммунологически эффективное количество относится к количеству активного ингредиента или компонента, которое вызывает желаемый биологический или медицинский ответ у субъекта. Иммунологически эффективное количество может быть определено эмпирически и обычным образом в зависимости от заявленной цели. Например, анализы in vitro необязательно могут быть использованы для определения оптимальных диапазонов доз. Выбор конкретной эффективной дозы может осуществить (например, при помощи клинических испытаний) специалист в данной области с учетом некоторых факторов, включая заболевание, которое нужно лечить или предотвратить, симптомы, связанные с заболеванием, массу тела пациента, иммунный статус пациента и другие факторы, известные специалистам в данной области. Точная доза для применения в препарате также будет зависеть от пути введения и тяжести заболевания, и ее следует выбирать в соответствии с мнением практикующего врача и обстоятельствами каждого пациента. Эффективные дозы могут быть экстраполированы из кривых доза-ответ, полученных из тест-систем in vitro или на моделях животных.As used herein, the term immunologically effective amount refers to an amount of an active ingredient or component that produces a desired biological or medical response in a subject. The immunologically effective amount can be determined empirically and routinely depending on the stated purpose. For example, in vitro assays may not necessarily be used to determine optimal dose ranges. The selection of a specific effective dose can be made (for example, through clinical trials) by one skilled in the art, taking into account several factors, including the disease being treated or prevented, symptoms associated with the disease, the body weight of the patient, the immune status of the patient, and other factors known specialists in this field. The exact dosage to be used in the formulation will also depend on the route of administration and the severity of the disease, and should be selected in accordance with the judgment of the practitioner and the circumstances of each patient. Effective doses can be extrapolated from dose-response curves obtained from in vitro test systems or animal models.
В контексте настоящей заявки термин транскрибированный in vitro относится к способу, в котором РНК ферментативно синтезируют in vitro бесклеточным способом, например, с использованием клеточных экстрактов или выделенных ферментов.As used herein, the term in vitro transcribed refers to a method in which RNA is enzymatically synthesized in vitro in a cell-free manner, for example, using cell extracts or isolated enzymes.
В контексте настоящей заявки термин самореплицирующаяся РНК, самореплицирующийся РНКрепликон или репРНК или РНК-репликон относится к молекуле РНК, экспрессирующей гены неструктурного белка альфа-вируса, таким образом, что она может направлять свою собственную амплификацию репликации в клетке, без продуцирования вирусного потомства. Например, репРНК может включать 5' и 3' последовательности распознавания репликации альфа-вируса, кодирующие последовательности для неструктурных белков альфа-вируса, гетерологичный ген, кодирующий антиген и средства для экспрессии антигена, и путь полиаденилирования. РепРНК по изобретению может содержать одну или несколько мутаций, таких как аттенуирующие мутации или мутации, которые улучшают функциональность. РепРНК по изобретению может содержать модифицированные нуклеиновые основания, такие как те, которые описаны в US 2011/0300205, соответствующее содержание которого включено в настоящую заявку посредством ссылки. Например, репРНК по изобретению могут содержать модифицированные нуклеозиды, включая, но не ограничиваясь этим, m1G (1-метилгуанозин), m2G (К2-метилгуанозин), m7G (7-метилгуанозин), Gm (2'-O-метилгуанозин), m22G (N2,N2-диметилгуанозин), m2Gm (N2,2'-Oдиметилгуанозин) и m22Gm (N2,N2,2'-O-триметилгуанозин).As used herein, the term self-replicating RNA, self-replicating RNAreplicon or repRNA or RNA replicon refers to an RNA molecule expressing alpha virus non-structural protein genes such that it can direct its own replication amplification in a cell without producing viral progeny. For example, the repRNA may include 5' and 3' alpha virus replication recognition sequences, coding sequences for alpha virus nonstructural proteins, a heterologous gene encoding an antigen and means for expressing the antigen, and a polyadenylation pathway. The repRNA of the invention may contain one or more mutations, such as attenuating mutations or mutations that improve functionality. The repRNA of the invention may contain modified nucleic acid bases, such as those described in US 2011/0300205, the corresponding contents of which are incorporated herein by reference. For example, repRNAs of the invention may contain modified nucleosides, including, but not limited to, m1G (1-methylguanosine), m2G (K2-methylguanosine), m7G (7-methylguanosine), Gm (2'-O-methylguanosine), m22G ( N2,N2-dimethylguanosine), m2Gm (N2,2'-Odimethylguanosine) and m22Gm (N2,N2,2'-O-trimethylguanosine).
- 6 043316- 6 043316
В контексте настоящей заявки термин антигенный белок относится к белку, который способен стимулировать иммунный ответ у позвоночного. В контексте настоящей заявки термин его иммуногенный полипептид или его иммуногенный фрагмент относится к фрагменту антигенного белка, который сохраняет способность стимулировать иммунный ответ. В контексте настоящей заявки термин антигенная детерминанта или эпитоп относится к области антигенного белка, которая специфически взаимодействует с антителом.As used herein, the term antigenic protein refers to a protein that is capable of stimulating an immune response in a vertebrate. As used herein, the term immunogenic polypeptide or immunogenic fragment thereof refers to a fragment of an antigenic protein that retains the ability to stimulate an immune response. As used herein, the term antigenic determinant or epitope refers to a region of an antigenic protein that specifically interacts with an antibody.
В контексте настоящей заявки термин носитель относится к любому эксципиенту, разбавителю, наполнителю, соли, буферу, стабилизатору, солюбилизатору, маслу, липиду, липид-содержащей везикуле, микросфере, липосомальной инкапсуляции или другому материалу, хорошо известному в данной области техники для использования в фармацевтических композициях. Должно быть понятно, что характеристики носителя, эксципиента или разбавителя будут зависеть от пути введения для конкретного применения. В контексте настоящей заявки термин фармацевтически приемлемый носитель относится к нетоксичному веществу, которое не влияет на эффективность композиции по изобретению или биологическую активность композиции по изобретению. В соответствии с конкретными вариантами осуществления, в свете настоящего раскрытия, любой фармацевтически приемлемый носитель, подходящий для применения в фармацевтической композиции на основе репРНК IVT или на основе аденовирусного вектора, можно использовать в изобретении. Подходящие эксципиенты включают, но не ограничиваются этим, стерильную воду, физиологический раствор, декстрозу, глицерин, этанол или т.п. и их комбинации, а также стабилизаторы, например, человеческий сывороточный альбумин (HSA) или другие подходящие белки и редуцирующие сахара.As used herein, the term carrier refers to any excipient, diluent, excipient, salt, buffer, stabilizer, solubilizer, oil, lipid, lipid-containing vesicle, microsphere, liposomal encapsulation or other material well known in the art for use in pharmaceutical applications. compositions. It should be understood that the characteristics of the carrier, excipient or diluent will depend on the route of administration for a particular application. As used herein, the term pharmaceutically acceptable carrier refers to a non-toxic substance that does not interfere with the effectiveness of the composition of the invention or the biological activity of the composition of the invention. In certain embodiments, in light of the present disclosure, any pharmaceutically acceptable carrier suitable for use in an IVT repRNA-based or adenoviral vector-based pharmaceutical composition can be used in the invention. Suitable excipients include, but are not limited to, sterile water, saline, dextrose, glycerol, ethanol, or the like. and combinations thereof, as well as stabilizers, for example, human serum albumin (HSA) or other suitable proteins and reducing sugars.
В контексте настоящей заявки термин примирующая композиция, примирующая иммунизация или прайм-иммунизация относится к первичной стимуляции антигеном с использованием первой композиции по изобретению. В частности, термин примирование или потенцирование иммунного ответа, как используется в настоящей заявке, относится к первой иммунизации с использованием антигена, которая индуцирует иммунный ответ на желаемый антиген и вызывает более высокий уровень иммунного ответа на желаемый антиген при последующей повторной иммунизации тем же антигеном. В контексте настоящей заявки термин бустерная композиция, бустерная иммунизация или бустер-иммунизация относится к дополнительной иммунизации, вводимой млекопитающему, или эффективной у млекопитающего, после первичной иммунизации. В частности, термин усиление иммунного ответа, как используется в настоящей заявке, относится к введению композиции, доставляющей тот же самый антиген, который кодируется при первичной иммунизации.As used herein, the term priming composition, priming immunization or prime immunization refers to primary stimulation with an antigen using a first composition of the invention. In particular, the term priming or potentiation of an immune response, as used herein, refers to a first immunization with an antigen that induces an immune response to a desired antigen and induces a higher level of immune response to the desired antigen upon subsequent booster immunization with the same antigen. As used herein, the term booster composition, booster immunization, or booster immunization refers to an additional immunization administered to, or effective in a mammal, after a primary immunization. In particular, the term enhancement of the immune response, as used herein, refers to the administration of a composition delivering the same antigen that is encoded in the primary immunization.
В контексте настоящей заявки термин патоген относится к инфекционному агенту, такому как вирус, бактерия, грибок, паразит или прион, который вызывает заболевание у хозяина.As used herein, the term pathogen refers to an infectious agent, such as a virus, bacterium, fungus, parasite or prion, that causes disease in a host.
Термины идентичный или процент идентичности, в контексте двух или более нуклеиновых кислот или полипептидных последовательностей, относятся к двум или более последовательностям или субпоследовательностям, которые являются одинаковыми или имеют определенный процент аминокислотных остатков или нуклеотидов, которые являются одинаковыми, при их сравнении и выравнивании для максимального соответствия, как измеряют, используя алгоритмы сравнения последовательностей, которые являются известными и стандартными для специалистов в данной области техники.The terms identical or percentage identity, in the context of two or more nucleic acid or polypeptide sequences, refer to two or more sequences or subsequences that are the same or have a certain percentage of amino acid residues or nucleotides that are the same when compared and aligned for maximum consistency , as measured using sequence comparison algorithms that are known and standard to those skilled in the art.
В контексте настоящей заявки термин по существу идентичный, в отношении полипептидной последовательности антигена, относится к полипептиду антигена, имеющему по меньшей мере 70%, предпочтительно по меньшей мере 80%, более предпочтительно по меньшей мере 90% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 95% идентичности последовательности с эталонной полипептидной последовательностью. Термин по существу идентичный, в отношении последовательности нуклеиновой кислоты, относится к последовательности нуклеотидов, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно по меньшей мере 80%, более предпочтительно по меньшей мере 90% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 95% идентичности последовательности с эталонной нуклеиновокислотной последовательностью.As used herein, the term substantially identical, with respect to an antigen polypeptide sequence, refers to an antigen polypeptide having at least 70%, preferably at least 80%, more preferably at least 90%, and most preferably at least 95% identity sequences with a reference polypeptide sequence. The term substantially identical, with respect to a nucleic acid sequence, refers to a nucleotide sequence having at least 70%, preferably at least 80%, more preferably at least 90%, and most preferably at least 95% sequence identity with a reference nucleic acid sequence.
Еще одним указанием на то, что две последовательности нуклеиновых кислот или полипептиды по существу идентичны, является то, что полипептид, кодируемый первой нуклеиновой кислотой, иммунологически перекрестно реактивен с полипептидом, кодируемым второй нуклеиновой кислотой. Таким образом, полипептид типично по существу идентичен второму полипептиду, например, когда два пептида отличаются только консервативными заменами. Другим указанием, что две последовательности нуклеиновых кислот по существу идентичны, является то, что две молекулы гибридизуются друг с другом в жестких условиях.Another indication that two nucleic acid sequences or polypeptides are substantially identical is that the polypeptide encoded by the first nucleic acid is immunologically cross-reactive with the polypeptide encoded by the second nucleic acid. Thus, the polypeptide is typically substantially identical to the second polypeptide, for example when the two peptides differ only by conservative substitutions. Another indication that two nucleic acid sequences are essentially identical is that the two molecules hybridize to each other under stringent conditions.
В изобретении обнаружено, что гетерологичные прайм-буст комбинации, в частности комбинации репРНК IVT и аденовирусного вектора, неожиданно эффективны для генерирования защитных иммунных ответов у людей.The invention has found that heterologous prime-boost combinations, in particular combinations of IVT repRNA and adenoviral vector, are surprisingly effective in generating protective immune responses in humans.
Антигенные белки.Antigenic proteins.
Любая представляющая интерес ДНК может быть встроена в конструкции репРНК и аденовирусные векторы, описанные в настоящей заявке, для гетерологичной экспрессии из репРНК и векторов. Чужеродные гены для встраивания в геном вируса в экспрессируемой форме могут быть получены с исAny DNA of interest can be inserted into the repRNA constructs and adenoviral vectors described herein for heterologous expression from the repRNAs and vectors. Foreign genes for insertion into the genome of the virus in an expressed form can be obtained using
- 7 043316 пользованием традиционных методов выделения желаемого гена с учетом настоящего раскрытия. Для организмов, которые содержат ДНК-геном, гены, кодирующие представляющий интерес антиген, могут быть выделены из геномной ДНК; для организмов с РНК-геномами желаемый ген может быть выделен из кДНК-копий генома. Антигенный белок также может кодироваться рекомбинантной ДНК, которая модифицирована на основании природной последовательности, например, для оптимизации антигенного ответа, экспрессии генов и т.д.- 7 043316 using traditional methods of isolating the desired gene, subject to the present disclosure. For organisms that contain a DNA genome, genes encoding the antigen of interest can be isolated from the genomic DNA; for organisms with RNA genomes, the desired gene can be isolated from cDNA copies of the genome. The antigenic protein may also be encoded by recombinant DNA that is modified based on the natural sequence, for example, to optimize antigenic response, gene expression, etc.
В некоторых вариантах осуществления изобретения прайм-буст комбинации репРНК и аденовируса генерируют индуцированный иммунный ответ на антигенный белок или его иммуногенный полипептид у субъекта-человека. Антигенный белок может быть любым антигенным белком, связанным с инфекцией или заболеванием.In some embodiments, prime-boost combinations of repRNA and adenovirus generate an induced immune response to an antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof in a human subject. The antigenic protein can be any antigenic protein associated with infection or disease.
В соответствии с вариантами осуществления изобретения, антигенный белок или его иммуногенный полипептид может быть выделен или может происходить из патогена, такого как вирус (например, филовирус, аденовирус, арбовирус, астровирус, коронавирус, коксаки-вирус, цитомегаловирус, вирус денге, Эпштейна-барра вирус, вирус гепатита, герпесвирус, вирус иммунодефицита человека, папиллома-вирус человека, T-лимфотропный вирус человека, вирус гриппа, JC вирус, вирус лимфоцитарного хориоменингита, вирус кори, вирус контагиозного моллюска, вирус эпидемического паротита, норовирус, паровирус, полиовирус, вирус бешенства, респираторно-синцитиальный вирус, риновирус, ротавирус, вирус краснухи, вирус оспы, вирус ветряной оспы, вирус Западного Нила, вирус зика и т.д.), бактерия (например, Campylobacter jejuni, Escherichia coli, Helicobacter pylori, Micobacterium tuberculosis, Neisseria gonorrhoeae, Neisseria meningitides, Salmonella, Shigella, Staphylococcus aureus, Streptococcus и т.д.), грибок (например, Coccidioides immitis, Blastomyces dermatitidis, Cryptococcus neoformans, Candida species, Aspergillus species и т.д.), простейшее (например, Plasmodium, Leishmania, Trypanosome, cryptosporidiums, isospora, Naegleria fowleri, Acanthamoeba, Balamuthia mandrillaris, Toxoplasma gondii, Pneumocystis carinri и т.д.), или рака (например, рака мочевого пузыря, рака толстой кишки и рака прямой кишки, рака эндометрия, рака почки, лейкоза, рака легкого, меланомы, не-ходжкинской лимфомы, рака поджелудочной железы, рака предстательной железы, рака щитовидной железы и т.д.).In accordance with embodiments of the invention, the antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof may be isolated from or may be derived from a pathogen such as a virus (e.g., filovirus, adenovirus, arbovirus, astrovirus, coronavirus, coxsackievirus, cytomegalovirus, dengue virus, Epstein-Barr virus virus, hepatitis virus, herpes virus, human immunodeficiency virus, human papilloma virus, human T-lymphotropic virus, influenza virus, JC virus, lymphocytic choriomeningitis virus, measles virus, molluscum contagiosum virus, mumps virus, norovirus, parovirus, poliovirus, virus rabies, respiratory syncytial virus, rhinovirus, rotavirus, rubella virus, smallpox virus, varicella zoster virus, West Nile virus, zika virus, etc.), bacteria (e.g. Campylobacter jejuni, Escherichia coli, Helicobacter pylori, Micobacterium tuberculosis, Neisseria gonorrhoeae, Neisseria meningitides, Salmonella, Shigella, Staphylococcus aureus, Streptococcus, etc.), fungus (e.g. Coccidioides immitis, Blastomyces dermatitidis, Cryptococcus neoformans, Candida species, Aspergillus species, etc.), protozoa (e.g. Plasmodium, Leishmania, Trypanosome, cryptosporidiums, isospora, Naegleria fowleri, Acanthamoeba, Balamuthia mandrillaris, Toxoplasma gondii, Pneumocystis carinri, etc.), or cancer (for example, bladder cancer, colon and rectal cancer, endometrial cancer, kidney cancer, leukemia, lung cancer, melanoma, non-Hodgkin's lymphoma, pancreatic cancer, prostate cancer, thyroid cancer, etc.).
В соответствии с вариантами осуществления изобретения, антигенный белок или его иммуногенный полипептид может быть выделен из, или происходит из, опухоли, такой как рак.In accordance with embodiments of the invention, an antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof can be isolated from, or derived from, a tumor, such as cancer.
В некоторых вариантах осуществления нуклеиновые кислоты экспрессируют антигенные домены, а не целый антигенный белок. Эти фрагменты могут иметь любую длину, достаточную для того, чтобы быть иммуногенными или антигенными. Фрагменты могут быть длиной не менее четырех аминокислот, предпочтительно 8-20 аминокислот, но могут быть длиннее, например длиной 100, 200, 660, 800, 1000, 1200, 1600, 2000 или более аминокислот, или иметь любую промежуточную длину.In some embodiments, the nucleic acids express antigenic domains rather than the entire antigenic protein. These fragments can be of any length sufficient to be immunogenic or antigenic. The fragments may be at least four amino acids long, preferably 8-20 amino acids, but may be longer, such as 100, 200, 660, 800, 1000, 1200, 1600, 2000 or more amino acids long, or any length in between.
Специалисту в данной области будет понятно, что молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие антигенный белок, могут быть модифицированы, например, молекулы нуклеиновой кислоты, описанные в настоящей заявке, могут быть мутированы, при условии, что модифицированный экспрессируемый белок вызывает иммунный ответ против патогена или заболевания. Таким образом, используемый в настоящей заявке термин антигенный белок относится к белку, который включает по меньшей мере одну антигенную детерминанту патогена или опухоли, описанную выше. Термин антигенные белки также охватывает антигенные белки, которые являются по существу схожими.One skilled in the art will appreciate that nucleic acid molecules encoding an antigenic protein may be modified, for example, the nucleic acid molecules described herein may be mutated, provided that the modified expressed protein elicits an immune response against the pathogen or disease. Thus, as used herein, the term antigenic protein refers to a protein that includes at least one pathogen or tumor antigenic determinant described above. The term antigenic proteins also covers antigenic proteins that are substantially similar.
IVT репРНК.IVT repRNA.
РепРНК, полезные в изобретении, происходят из альфа-вирусов, которые являются одноцепочечными РНК-вирусами с положительной полярностью. В одном варианте осуществления РепРНК, которую можно использовать в изобретении, содержит 7-метилгуанозиновый кэп, 5' нетранслируемую область, РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp) полипротеин P1234 (т.е. неструктурные белки, nsPs), субгеномный промоторный элемент, представляющую интерес вариабельную область, из которой экспрессируют антигенный белок, 3' нетранслируемую область и а поли(А) хвост.RepRNAs useful in the invention are derived from alpha viruses, which are single-stranded RNA viruses with positive polarity. In one embodiment, the RepRNA that can be used in the invention contains a 7-methylguanosine cap, a 5' untranslated region, an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), a P1234 polyprotein (i.e., non-structural proteins, nsPs), a subgenomic promoter element representing of interest is the variable region from which the antigenic protein is expressed, the 3' untranslated region and the poly(A) tail.
РепРНК, полезные в изобретении, могут происходить из любого самореплицирующегося вируса, содержащего плюс-цепь РНК, например, репРНК могут происходить из семейств вирусов Togaviridae или Arteriviridae, таких как аура-вирус, вирус Бабанки, вирус Barmah Forest, вирус Bebaru, вирус Buggy Creek, вирус Чикунгунья, вирус восточного конского энцефалита, вирус Эверглейдс, вирус ФортМорган, вирус Гета, вирус Хайленд J, вирус Кызылагач, вирус Майаро, вирус Мидлбург, вирус Мукамбо, вирус Ндуму, вирус О'Ньонг-Ньонг, вирус Пиксуна, вирус реки Росс, SA AR86, вирус Сагияма, вирус леса Семлики, вирус Синдбис, вирус Уна, вирус венесуэльского лошадиного энцефалита, вирус западного лошадиного энцефалита, вирус Ватароа, артеривирус африканских сумчатых крыс, артеривирус обезьян DeBrazza, вирус артериита лошадей, вирус красного колобуса Кибале, вирус краснохвостых мартышек Кибале, вирус, повышающий лактатдегидрогеназу, вирус бабуинов Mikumi 1, вирус Pebjah, вирус репродуктивного и респираторного синдрома свиней. В предпочтительных вариантах осуществления репРНК по изобретению происходят из вируса венесуэльского энцефалита лошадей (VEE). Примеры предпочтительных репРНК каркасов изобретения включают каркасы, описанные Frolov et al., Id. и каркасную последовательность SEQ ID NO: 3 без вставки белка pre-F RSV.RepRNAs useful in the invention may come from any self-replicating virus containing plus-strand RNA, for example, repRNAs may come from the Togaviridae or Arteriviridae virus families, such as Aura virus, Babanchi virus, Barmah Forest virus, Bebaru virus, Buggy Creek virus , Chikungunya virus, Eastern equine encephalitis virus, Everglades virus, FortMorgan virus, Geta virus, Highland J virus, Kizilagac virus, Mayaro virus, Middleburg virus, Mukambo virus, Ndumu virus, O'Nyong-Nyong virus, Pixuna virus, Ross River virus , SA AR86, Sagiyama virus, Semliki forest virus, Sindbis virus, Una virus, Venezuelan equine encephalitis virus, Western equine encephalitis virus, Wataroa virus, African pouched rat arterivirus, DeBrazza monkey arterivirus, equine arteritis virus, Kibale red colobus virus, red-tailed virus Kibale monkeys, lactate dehydrogenase increasing virus, Mikumi baboon virus 1, Pebjah virus, porcine reproductive and respiratory syndrome virus. In preferred embodiments, the repRNAs of the invention are derived from the Venezuelan equine encephalitis (VEE) virus. Examples of preferred repRNA scaffolds of the invention include those described by Frolov et al., Id. and the framework sequence of SEQ ID NO: 3 without the RSV pre-F protein insert.
Получение in vitro транскрибированной РНК (IVT) хорошо известно в данной области, и стандарт- 8 043316 ные процедуры IVT и очистки могут быть использованы для получения репРНК IVT, полезных в изобретении, с учетом настоящего изобретения.The production of in vitro transcribed (IVT) RNA is well known in the art, and standard IVT and purification procedures can be used to produce IVT repRNA useful in the invention in light of the present invention.
Получение репРНК IVT описано, например, в US 2011/0300205 и US2013/0195968, соответствующее содержание которых включено в настоящую завку посредством ссылки. Например, молекулы репРНК могут быть получены путем IVT молекулы ДНК, которая кодирует самореплицирующуюся молекулу РНК, с использованием подходящей ДНК-зависимой РНК-полимеразы, такой как РНК-полимераза фага T7, РНК-полимераза фага SP6, РНК-полимераза фага T3 и т.д. В методе IVT можно использовать кДНК матрицу, созданную и размноженную в плазмиде из бактерий, или созданную синтетически, например, методами синтеза генов и/или ПНР. При необходимости можно использовать соответствующие реакции кэппирования-присоединения, и поли-A может кодироваться в ДНК матрице или может быть добавлен с использованием поли-A реакции. Подходящие способы синтеза можно использовать по отдельности или в комбинации с одним или несколькими другими способами (например, с использованием технологии рекомбинантной ДНК или РНК) для получения IVT репРНК молекулы по изобретению. Подходящие способы синтеза de novo хорошо известны в данной области и могут быть адаптированы для конкретных применений.The preparation of IVT repRNA is described, for example, in US2011/0300205 and US2013/0195968, the corresponding contents of which are incorporated herein by reference. For example, repRNA molecules can be produced by IVT of a DNA molecule that encodes a self-replicating RNA molecule using a suitable DNA-dependent RNA polymerase such as phage T7 RNA polymerase, phage SP6 RNA polymerase, phage T3 RNA polymerase, etc. d. The IVT method can use a cDNA template created and propagated in a plasmid from bacteria, or created synthetically, for example, by gene synthesis and/or PNR methods. If necessary, appropriate capping-addition reactions can be used, and the poly-A can be encoded into the DNA template or can be added using a poly-A reaction. Suitable synthetic methods can be used alone or in combination with one or more other methods (eg, using recombinant DNA or RNA technology) to produce the IVT repRNA molecule of the invention. Suitable de novo synthesis methods are well known in the art and can be adapted for specific applications.
Как правило, IVT репРНК, полезную в изобретении, получают с использованием молекулы ДНК, из которой может быть транскрибирована репРНК. Таким образом, изобретение также обеспечивает выделенные молекулы нуклеиновых кислот, которые кодируют репРНК по изобретению. Молекулы нуклеиновых кислот по изобретению могут быть в форме РНК или в форме ДНК, полученной путем клонирования или полученной синтетическим путем. ДНК может быть двухцепочечной или одноцепочечной.Typically, IVT repRNA useful in the invention is prepared using a DNA molecule from which the repRNA can be transcribed. Thus, the invention also provides isolated nucleic acid molecules that encode the repRNA of the invention. The nucleic acid molecules of the invention may be in the form of RNA or in the form of DNA, obtained by cloning or synthetically produced. DNA can be double-stranded or single-stranded.
IVT репРНК, полезные в изобретении, могут быть включены в подходящие системы доставки для введения. В предпочтительных вариантах осуществления IVT репРНК, полезные в изобретении, сформулированы в невирионные частицы для введения. Подходящие невирионные частицы описаны, например, в US 2011/0300205 и US2013/0195968, соответствующее содержание которых включено в настоящую заявку посредством ссылки. Например, полезные системы доставки включают липосомы, полимерные частицы, нетоксичные и биоразлагаемые микрочастицы, электропорацию, инъекцию оголенной РНК и катионные субмикронные эмульсии масло-в-воде. В предпочтительных вариантах осуществления IVT репРНК, полезные в изобретении, сформулированы в композиции липидных наночастиц (LNP) (см., например, Semple et al., 2010, Nat Biotechnol. 28 (2): 172-176, соответствующее содержание которого включено в настоящую заявку посредством ссылки).IVT repRNAs useful in the invention can be included in suitable delivery systems for administration. In preferred embodiments, the IVT repRNAs useful in the invention are formulated into non-virion particles for administration. Suitable non-virion particles are described, for example, in US2011/0300205 and US2013/0195968, the respective contents of which are incorporated herein by reference. For example, useful delivery systems include liposomes, polymer particles, non-toxic and biodegradable microparticles, electroporation, naked RNA injection, and cationic submicron oil-in-water emulsions. In preferred embodiments, IVT repRNAs useful in the invention are formulated in a lipid nanoparticle (LNP) composition (see, e.g., Semple et al., 2010, Nat Biotechnol. 28 (2): 172-176, the relevant contents of which are incorporated herein application via link).
В контексте настоящей заявки термин липидная наночастица или LNP относится к любой композиции липидов, которую можно использовать для доставки терапевтического продукта, включая, но не ограничиваясь этим, липосомы или везикулы, где водный объем инкапсулирован амфипатическими липидными бислоями, или где липиды покрывают внутреннюю часть, которая включает терапевтический продукт, или липидные агрегаты или мицеллы, где липид-инкапсулированный терапевтический продукт содержится в относительно неупорядоченной смеси липидов.As used herein, the term lipid nanoparticle or LNP refers to any lipid composition that can be used to deliver a therapeutic product, including, but not limited to, liposomes or vesicles, where the aqueous volume is encapsulated by amphipathic lipid bilayers, or where the lipids coat an interior that includes a therapeutic product, or lipid aggregates or micelles, wherein the lipid-encapsulated therapeutic product is contained in a relatively disordered mixture of lipids.
В конкретных вариантах осуществления LNP включают катионный липид для инкапсулирования и/или повышения доставки IVT репРНК в клетку-мишень. Катионный липид может быть любым видом липида, который несет чистый положительный заряд при выбранном pH, таком как физиологический pH. Липидные наночастицы можно получить путем включения многокомпонентных липидных смесей с различными соотношениями с использованием одного или нескольких катионных липидов, некатионных липидов и ПЭГ-модифицированных липидов. Некоторые катионные липиды описаны в литературе, многие из которых коммерчески доступны. Например, подходящие катионные липиды для использования в композициях и способах по изобретению включают 1,2-диолеоил-3-триметиламмонийпропан (DOTAP).In specific embodiments, the LNPs include a cationic lipid to encapsulate and/or enhance delivery of IVT repRNA to a target cell. A cationic lipid can be any type of lipid that carries a net positive charge at a selected pH, such as physiological pH. Lipid nanoparticles can be prepared by incorporating multicomponent lipid mixtures with different ratios using one or more cationic lipids, non-cationic lipids and PEG-modified lipids. Several cationic lipids are described in the literature, many of which are commercially available. For example, suitable cationic lipids for use in the compositions and methods of the invention include 1,2-dioleoyl-3-trimethylammoniumpropane (DOTAP).
Композиции LNP могут включать анионные липиды. Анионные липиды могут представлять собой любой вид липидов, который несет чистый отрицательный заряд при выбранном pH, таком как физиологический pH. Анионные липиды в сочетании с катионными липидами используются для уменьшения общего поверхностного заряда LNP и для введения pH-зависимого разрушения двухслойной структуры LNP, способствующего высвобождению нуклеотидов. Некоторые анионные липиды описаны в литературе, многие из которых коммерчески доступны. Например, подходящие анионные липиды для использования в композициях и способах по изобретению включают 1,2-диолеоил-sn-глицеро-3фосфоэтаноламин (DOPE).LNP compositions may include anionic lipids. Anionic lipids can be any type of lipid that carries a net negative charge at a selected pH, such as physiological pH. Anionic lipids in combination with cationic lipids are used to reduce the overall surface charge of LNPs and to introduce pH-dependent disruption of the LNP bilayer structure to promote nucleotide release. Several anionic lipids are described in the literature, many of which are commercially available. For example, suitable anionic lipids for use in the compositions and methods of the invention include 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3phosphoethanolamine (DOPE).
LNP можно получить с использованием способов, хорошо известных в данной области техники, с учетом настоящего раскрытия. Например, LNP могут быть получены с использованием инжекции этанола или разбавления этанолом, гидратации тонких пленок, замораживания-оттаивания, пресса Фрэнча или экструзии с использованием мембран, диафильтрации, обработки ультразвуком, диализа с использованием детергентов, эфирной инфузии и обращенно-фазового выпаривания. В предпочтительных вариантах осуществления LNP, используемые в изобретении, получают путем разбавления этанолом.LNP can be prepared using methods well known in the art, subject to the present disclosure. For example, LNPs can be produced using ethanol injection or ethanol dilution, thin film hydration, freeze-thaw, French press or membrane extrusion, diafiltration, sonication, detergent dialysis, ether infusion, and reverse phase evaporation. In preferred embodiments, the LNPs used in the invention are prepared by dilution with ethanol.
Аденовирусы.Adenoviruses.
Аденовирус по изобретению принадлежит к семейству Adenoviridae и предпочтительно относится к роду Mastadenovirus. Это может быть человеческий аденовирус, но также и аденовирус, который заражает другие виды, включая, но не ограничиваясь этим, бычий аденовирус (например, бычий аденовирус 3,The adenovirus of the invention belongs to the family Adenoviridae and preferably belongs to the genus Mastadenovirus. It may be a human adenovirus, but also an adenovirus that infects other species, including, but not limited to, bovine adenovirus (e.g. bovine adenovirus 3,
- 9 043316- 9 043316
BAdV3), аденовирус собак (например, CAdV2), аденовирус свиней (например, PAdV3 или 5) или аденовирус обезьян (который включает аденовирус обезьян и аденовирус приматов, такой как аденовирус шимпанзе или аденовирус горилл). Предпочтительно аденовирус представляет собой человеческий аденовирус (HAdV или AdHu); в изобретении человеческий аденовирус подразумевается, если он относится к Ad без указания вида, например, краткое обозначение Ad5 означает то же самое, что HAdV5, что означает человеческий аденовирус серотипа 5), или аденовирус обезьян, такой как аденовирус шимпанзе или горилл (ChAd, AdCh или SAdV). В настоящем изобретении под человеческим аденовирусом подразумевается Ad без указания вида, например, краткое обозначение Ad26 означает то же самое, что и HadV26, что означает человеческий аденовирус серотипа 26. Также в настоящей заявке обозначение rAd означает рекомбинантный аденовирус, например, rAd26 относится к рекомбинантному человеческому аденовирусу 26.BAdV3), canine adenovirus (eg CAdV2), porcine adenovirus (eg PAdV3 or 5) or simian adenovirus (which includes simian adenovirus and primate adenovirus such as chimpanzee adenovirus or gorilla adenovirus). Preferably the adenovirus is a human adenovirus (HAdV or AdHu); in the invention, a human adenovirus is meant if it refers to Ad without specifying the species, for example, the short designation Ad5 means the same as HAdV5, which means human adenovirus serotype 5), or simian adenovirus such as chimpanzee or gorilla adenovirus (ChAd, AdCh or SAdV). In the present invention, human adenovirus means Ad without specifying the species, for example, the short designation Ad26 means the same as HadV26, which means human adenovirus serotype 26. Also in this application, the designation rAd means recombinant adenovirus, for example, rAd26 refers to recombinant human adenovirus 26.
Наиболее продвинутые исследования осуществляли с использованием человеческих аденовирусов, и человеческие аденовирусы являются предпочтительными в соответствии с некоторыми аспектами изобретения. В некоторых предпочтительных вариантах осуществления рекомбинантный аденовирус по изобретению основан на человеческом аденовирусе. В предпочтительных вариантах осуществления рекомбинантный аденовирус основан на человеческом аденовирусе серотипа 5, 11, 26, 34, 35, 48, 49 или 50. В соответствии с особенно предпочтительным вариантом осуществления изобретения, аденовирус представляет собой человеческий аденовирус одного из серотипов 26 или 35.Most advanced research has been carried out using human adenoviruses, and human adenoviruses are preferred in accordance with some aspects of the invention. In some preferred embodiments, the recombinant adenovirus of the invention is based on a human adenovirus. In preferred embodiments, the recombinant adenovirus is based on a human adenovirus of serotype 5, 11, 26, 34, 35, 48, 49, or 50. In a particularly preferred embodiment of the invention, the adenovirus is a human adenovirus of one of serotypes 26 or 35.
Преимуществами этих серотипов являются низкая серопревалентность и/или низкие титры предсуществующих нейтрализующих антител в человеческой популяции и опыт применения на людях в клинических испытаниях.These serotypes have the advantage of low seroprevalence and/or low titers of pre-existing neutralizing antibodies in the human population and experience with human use in clinical trials.
Аденовирусы обезьян обычно также имеют низкую серопревалентность и/или низкие титры предсуществующих нейтрализующих антител в человеческой популяции, и было сообщение о значительном объеме работ с использованием векторов на основе аденовирусов шимпанзе (например, US 6083716; WO 2005/071093; WO 2010/086189; WO 2010085984; Farina et al., 2001, J Virol 75: 11603-13; Cohen et al., 2002, J Gen Virol 83: 151-55; Kobinger et al., 2006, Virology 346: 394-401; Tatsis et al., 2007, Molecular Therapy 15: 608-17; см. также обзор Bangari and Mittal, 2006, Vaccine 24: 849-62; обзор Lasaro and Ertl, 2009, Mol Ther 17: 1333-39). Следовательно, в других предпочтительных вариантах осуществления рекомбинантный аденовирус в соответстви с изобретением основан на аденовирусе обезьян, например, аденовирусе шимпанзе. В некоторых вариантах осуществления рекомбинантный аденовирус основан на аденовирусе обезьян типа 1, 7, 8, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27.1, 28.1, 29, 30, 31.1, 32, 33, 34, 35.1, 36, 37.2, 39, 40.1, 41.1, 42.1, 43, 44, 45, 46, 48, 49, 50 или SA7P.Simian adenoviruses also generally have low seroprevalence and/or low titers of pre-existing neutralizing antibodies in the human population, and a significant amount of work has been reported using chimpanzee adenovirus vectors (e.g. US 6083716; WO 2005/071093; WO 2010/086189; WO 2010085984; Farina et al., 2001, J Virol 75: 11603-13; Cohen et al., 2002, J Gen Virol 83: 151-55; Kobinger et al., 2006, Virology 346: 394-401; Tatsis et al. ., 2007, Molecular Therapy 15: 608-17; see also review by Bangari and Mittal, 2006, Vaccine 24: 849-62; review by Lasaro and Ertl, 2009, Mol Ther 17: 1333-39). Therefore, in other preferred embodiments, the recombinant adenovirus according to the invention is based on a simian adenovirus, for example a chimpanzee adenovirus. In some embodiments, the recombinant adenovirus is based on simian adenovirus type 1, 7, 8, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27.1, 28.1, 29, 30, 31.1, 32, 33, 34, 35.1, 36, 37.2 , 39, 40.1, 41.1, 42.1, 43, 44, 45, 46, 48, 49, 50 or SA7P.
Аденовирусные векторы rAd26 и rAd35.Adenoviral vectors rAd26 and rAd35.
В предпочтительном варианте осуществления в соответствии с изобретением аденовирусные векторы включают капсидные белки из двух редких серотипов: Ad26 и Ad35. В типичных вариантах осуществления вектор представляет собой rAd26 или rAd35 вирус.In a preferred embodiment of the invention, the adenoviral vectors include capsid proteins from two rare serotypes: Ad26 and Ad35. In typical embodiments, the vector is a rAd26 or rAd35 virus.
Таким образом, векторы, которые можно использовать в изобретении, включают капсидный белок Ad26 или Ad35 (например, волокнистый, пентоновый или гексоновый белок). Специалистам должно быть понятно, что в векторах по изобретению необязательно нужно использовать целый Ad26 или Ad35 капсидный белок. Таким образом, в векторах по изобретению можно использовать химерные капсидные белки, которые включают по меньшей мере часть капсидного белка Ad26 или Ad35. Векторы по изобретению также могут включать капсидные белки, где волокнистые, пентоновые и гексоновые белки происходят каждый из разных серотипов, при условии, что по меньшей мере один капсидный белок происходит из Ad26 или Ad35. В предпочтительных вариантах осуществления волокнистые, пентоновые и гексоновые белки происходят каждый из Ad26 или каждый из Ad35.Thus, vectors that can be used in the invention include capsid protein Ad26 or Ad35 (eg, fiber, penton or hexon protein). Those skilled in the art will appreciate that the vectors of the invention do not necessarily need to use the entire Ad26 or Ad35 capsid protein. Thus, chimeric capsid proteins that include at least a portion of the Ad26 or Ad35 capsid protein can be used in the vectors of the invention. The vectors of the invention may also include capsid proteins, wherein the fiber, penton and hexon proteins are each derived from a different serotype, provided that at least one capsid protein is derived from Ad26 or Ad35. In preferred embodiments, the fiber, penton, and hexon proteins are each derived from Ad26 or each from Ad35.
Специалистам в данной области должно быть понятно, что элементы, происходящие из множества серотипов, могут быть объединены в один рекомбинантный аденовирусный вектор. Таким образом, может быть получен химерный аденовирус, который сочетает в себе желательные свойства из разных серотипов. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления химерный аденовирус по изобретению может сочетать отсутствие пред-существующего иммунитета серотипов Ad26 и Ad35 с такими характеристиками, как температурная стабильность, сборка, заякоривание, выход продукции, перенаправленное или улучшенное заражение, стабильность ДНК в клетке-мишени и т.п.Those skilled in the art will appreciate that elements originating from multiple serotypes can be combined into a single recombinant adenoviral vector. In this way, a chimeric adenovirus can be produced that combines desirable properties from different serotypes. Thus, in some embodiments, a chimeric adenovirus of the invention may combine the absence of pre-existing immunity of serotypes Ad26 and Ad35 with characteristics such as temperature stability, assembly, anchoring, yield, redirected or enhanced infection, DNA stability in the target cell, etc. .P.
В некоторых вариантах осуществления рекомбинантный аденовирусный вектор, полезный в изобретении, происходит в основном или полностью из Ad35 или из Ad26 (т.е. вектор представляет собой rAd35 или rAd26). В некоторых вариантах осуществления аденовирус является дефицитным по репликации, например, потому что он содержит делецию в E1 области генома. Для аденовирусов по изобретению, происходящих из Ad26 или Ad35, типичным является обмен E4-orf6 кодирующей последовательности аденовируса с E4-orf6 аденовируса человеческой подгруппы C, такой как Ad5. Это делает возможным размножение таких аденовирусов в хорошо известных дополняющих клеточных линиях, которые экспрессируют E1 гены Ad5, таких как, например, клетки 293, клетки PER.C6 и т.п. (см., например, Havenga et al, 2006, J Gen Virol 87: 2135-43; WO 03/104467). В некоторых вариантах осуществления аденовирус представляет собой человеческий аденовирус серотипа 35 с делецией в E1 области, в которую быIn some embodiments, the recombinant adenoviral vector useful in the invention is derived primarily or entirely from Ad35 or Ad26 (ie, the vector is rAd35 or rAd26). In some embodiments, the adenovirus is replication deficient, for example, because it contains a deletion in the E1 region of the genome. For adenoviruses of the invention derived from Ad26 or Ad35, it is typical to exchange the E4-orf6 coding sequence of the adenovirus with the E4-orf6 of a human subgroup C adenovirus such as Ad5. This makes it possible for such adenoviruses to propagate in well-known complementary cell lines that express Ad5 E1 genes, such as, for example, 293 cells, PER.C6 cells, and the like. (see eg Havenga et al, 2006, J Gen Virol 87: 2135-43; WO 03/104467). In some embodiments, the adenovirus is a human adenovirus serotype 35 with a deletion in the E1 region in which
- 10 043316 ла клонирована нуклеиновая кислота, кодирующая антиген, и с E4-orf6 областью Ad5. В некоторых вариантах осуществления аденовирус представляет собой человеческий аденовирус серотипа 26 с делецией в E1 области, в которую была клонирована нуклеиновая кислота, кодирующая антиген, и с E4-orf6 областью Ad5. Что касается аденовируса Ad35, обычно сохраняется 3'-конец открытой рамки считывания E1B 55K в аденовирусе, например, 166 п.н. непосредственно перед открытой рамкой считывания pIX, или включающий это фрагмент, такой как фрагмент размером 243 п.н. непосредственно перед старткодоном pIX, отмеченный на 5'-конце рестрикционным сайтом Bsu36I, т.к. это увеличивает стабильность аденовируса, поскольку промотор гена pIX частично находится в этой области (см., например, Havenga et al, 2006, выше; WO 2004/001032).- 10 043316 la cloned nucleic acid encoding the antigen, and with the E4-orf6 region of Ad5. In some embodiments, the adenovirus is a human adenovirus serotype 26 with a deletion in the E1 region into which the antigen-encoding nucleic acid was cloned and with the E4-orf6 region of Ad5. Regarding adenovirus Ad35, the 3′ end of the E1B 55K open reading frame in the adenovirus is usually retained, e.g., 166 bp. immediately upstream of the pIX open reading frame, or a fragment including it, such as a 243 bp fragment. immediately before the start codon pIX, marked at the 5' end with the restriction site Bsu36I, because this increases the stability of the adenovirus since the promoter of the pIX gene is partially located in this region (see, for example, Havenga et al, 2006, supra; WO 2004/001032).
Получение рекомбинантных аденовирусных векторов хорошо известно в данной области техники.The production of recombinant adenoviral vectors is well known in the art.
Получение rAd26 векторов описано, например, в WO 2007/104792 и в Abbink et al., (2007) Virol 81(9): 4654-63. Иллюстративные геномные последовательности Ad26 можно найти в GenBank Accession EF 153474 и в SEQ ID NO: 1 WO 2007/104792. Получение rAd35 векторов описано, например, в патенте США № 7270811 и в Vogels et al., (2003) J Virol 77(15): 8263-71. Иллюстративную геномную последовательность Ad35 можно найти в GenBank Accession AC_000019.The preparation of rAd26 vectors is described, for example, in WO 2007/104792 and Abbink et al., (2007) Virol 81(9): 4654-63. Exemplary Ad26 genomic sequences can be found in GenBank Accession EF 153474 and SEQ ID NO: 1 WO 2007/104792. The preparation of rAd35 vectors is described, for example, in US Pat. No. 7,270,811 and Vogels et al., (2003) J Virol 77(15): 8263-71. An exemplary genomic sequence of Ad35 can be found in GenBank Accession AC_000019.
В одном варианте осуществления изобретения векторы, полезные для изобретения, включают векторы, описанные в WO2012/082918, раскрытие которой включено в настоящую заявку посредством ссылки во всей полноте.In one embodiment, vectors useful for the invention include those described in WO2012/082918, the disclosure of which is incorporated herein by reference in its entirety.
Типично, аденовирусный вектор, полезный в изобретении, получают с использованием нуклеиновой кислоты, включающей полный рекомбинантный аденовирусный геном (например, плазмидный, космидный или бакуловирусный вектор). Таким образом, изобретение также обеспечивает выделенные молекулы нуклеиновых кислот, которые кодируют аденовирусные векторы по изобретению. Молекулы нуклеиновых кислот по изобретению можно получить путем клонирования или синтетическим путем. ДНК может быть двухцепочечной или одноцепочечной.Typically, an adenoviral vector useful in the invention is prepared using a nucleic acid comprising a complete recombinant adenoviral genome (eg, a plasmid, cosmid or baculovirus vector). Thus, the invention also provides isolated nucleic acid molecules that encode the adenoviral vectors of the invention. The nucleic acid molecules of the invention can be obtained by cloning or synthetically. DNA can be double-stranded or single-stranded.
Аденовирусные векторы, используемые в изобретении, обычно дефектны по репликации. В этих вариантах осуществления вирус становится дефектным по репликации путем делеции или инактивации областей, критических для репликации вируса, таких как E1 область. Области могут быть по существу делетированы или инактивированы, например, путем вставки представляющего интерес гена (обычно связанного с промотором). В некоторых вариантах осуществления векторы по изобретению могут содержать делеции в других областях, таких как E2, E3 или E4 области, или вставки гетерологичных генов, связанных с промотором. Для E2- и/или E4-мутированных аденовирусов обычно используют E2- и/или E4-дополняющие клеточные линии для получения рекомбинантных аденовирусов. Мутации в E3 области аденовируса не должны дополняться клеточной линией, поскольку E3 не требуется для репликации.Adenoviral vectors used in the invention are typically replication defective. In these embodiments, the virus is made replication defective by deletion or inactivation of regions critical for viral replication, such as the E1 region. Regions can be substantially deleted or inactivated, for example, by insertion of a gene of interest (usually associated with a promoter). In some embodiments, the vectors of the invention may contain deletions in other regions, such as E2, E3 or E4 regions, or insertions of heterologous promoter-associated genes. For E2 and/or E4 mutated adenoviruses, E2 and/or E4 complementary cell lines are typically used to produce recombinant adenoviruses. Mutations in the E3 region of an adenovirus should not be introduced into the cell line because E3 is not required for replication.
Пакующую клеточную линию обычно используют для получения достаточного количества аденовирусных векторов по изобретению. Пакующая клетка представляет собой клетку, которая включает те гены, которые были делетированы или инактивированы в дефектном по репликации векторе, что позволяет вирусу реплицироваться в клетке. Подходящие клеточные линии включают, например, PER.C6, 911, 293 и E1 A549.A packaging cell line is typically used to produce sufficient quantities of the adenoviral vectors of the invention. A packaging cell is a cell that includes those genes that have been deleted or inactivated in the replication-defective vector, allowing the virus to replicate within the cell. Suitable cell lines include, for example, PER.C6, 911, 293 and E1 A549.
В некоторых вариантах осуществления аденовирусный вектор может экспрессировать гены или части генов, которые кодируют антигенные пептиды. Эти чужеродные гетерологичные или экзогенные пептиды или полипептиды могут включать последовательности, которые являются иммуногенными, такие как, например, опухоль-специфические антигены (TSA), бактериальные, вирусные, грибковые и протозойные антигены.In some embodiments, the adenoviral vector may express genes or portions of genes that encode antigenic peptides. These foreign heterologous or exogenous peptides or polypeptides may include sequences that are immunogenic, such as, for example, tumor-specific antigens (TSA), bacterial, viral, fungal and protozoal antigens.
Гетерологичный ген, кодирующий антигенный пептид, может находиться под контролем промотора (т.е. функционально связанный с промотором), происходящего из аденовируса (например, главный поздний промотор), или может находиться под контролем гетерологичного промотора. Примеры подходящих гетерологичных промоторов включают CMV промотор и RSV промотор. Предпочтительно, промотор расположен перед представляющим интерес гетерологичным геном внутри экспрессионной кассеты.The heterologous gene encoding the antigenic peptide may be under the control of a promoter (ie, operably linked to a promoter) derived from an adenovirus (eg, a major late promoter), or may be under the control of a heterologous promoter. Examples of suitable heterologous promoters include the CMV promoter and the RSV promoter. Preferably, the promoter is located upstream of the heterologous gene of interest within the expression cassette.
Иммуногенные композиции.Immunogenic compositions.
Иммуногенные композиции представляют собой композиции, содержащие иммунологически эффективное количество репРНК или аденовирусных векторов для применения в изобретении. Композиции могут быть сформулированы в виде вакцин (также называемые иммуногенными композициями) в соответствии со способами, хорошо известными в данной области. Такие композиции могут включать адъюванты для усиления иммунных ответов. Оптимальные количества каждого компонента в композиции можно определить методами, хорошо известными специалистам в данной области техники, с учетом настоящего раскрытия.Immunogenic compositions are compositions containing an immunologically effective amount of repRNA or adenoviral vectors for use in the invention. The compositions can be formulated as vaccines (also called immunogenic compositions) according to methods well known in the art. Such compositions may include adjuvants to enhance immune responses. Optimal amounts of each component in the composition can be determined by methods well known to those skilled in the art in light of the present disclosure.
Получение и использование иммуногенных композиций хорошо известны специалистам в данной области. Жидкие фармацевтические композиции обычно включают жидкий носитель, такой как вода, нефтяные, животные или растительные масла, минеральное масло или синтетическое масло. Могут быть включены физиологический солевой раствор, раствор декстрозы или раствор другого сахарида, или гликоли, такие как этиленгликоль, пропиленгликоль или полиэтиленгликоль.The preparation and use of immunogenic compositions are well known to those skilled in the art. Liquid pharmaceutical compositions typically include a liquid carrier such as water, petroleum, animal or vegetable oils, mineral oil or synthetic oil. Physiological saline, dextrose or other saccharide solution, or glycols such as ethylene glycol, propylene glycol or polyethylene glycol may be included.
Композиции по изобретению могут содержать репРНК или аденовирусные векторы, экспрессиThe compositions of the invention may contain repRNA or adenoviral vectors that express
- 11 043316 рующие один или несколько антигенных белков или их иммуногенных полипептидов. Эти антигенные пептиды или полипептиды могут включать любые последовательности, которые являются иммуногенными, включая, но не ограничиваясь этим, опухоль-специфические антигены (TSA), бактериальные, вирусные, грибковые и протозойные антигены. Например, антигенный белок или его иммуногенный полипептид может происходить из патогена, например вируса, бактерии, грибка, простейшего, или он также может происходить из опухоли. В одном или нескольких предпочтительных аспектах композиции по изобретению включают репРНК или аденовирусные векторы, экспрессирующие один или несколько антигенных белков из вируса, такого как респираторно-синцитиальный вирус (RSV, вирус гриппа, ВИЧ, вирус эбола, HPV, HSV, CMV, RSV, вирус гепатита, вирус зика, вирус SARS, вирус Чикунгунья, вирус денге или вирус Западного Нила.- 11 043316 containing one or more antigenic proteins or their immunogenic polypeptides. These antigenic peptides or polypeptides may include any sequences that are immunogenic, including, but not limited to, tumor-specific antigens (TSA), bacterial, viral, fungal and protozoal antigens. For example, the antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof may be derived from a pathogen, such as a virus, bacterium, fungus, protozoan, or it may also be derived from a tumor. In one or more preferred aspects, the compositions of the invention include repRNA or adenoviral vectors expressing one or more antigenic proteins from a virus, such as respiratory syncytial virus (RSV, influenza virus, HIV, Ebola virus, HPV, HSV, CMV, RSV, hepatitis, Zika virus, SARS virus, Chikungunya virus, dengue virus or West Nile virus.
Антигенные белки могут представлять собой любой белок из любого пневмовируса, содержащий антигенную детерминанту. В предпочтительном варианте осуществления антигенные белки представляют собой F-белок до слияния из респираторно-синцитиального вируса (RSV-preF).Antigenic proteins can be any protein from any pneumovirus containing an antigenic determinant. In a preferred embodiment, the antigenic proteins are prefusion F protein from respiratory syncytial virus (RSV-preF).
В предпочтительном варианте осуществления антигенные белки, кодируемые IVT репРНК или аденовирусными векторами, имеют аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, их иммуногенные полипептиды и их комбинации.In a preferred embodiment, the antigenic proteins encoded by IVT repRNA or adenoviral vectors have the amino acid sequences of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, immunogenic polypeptides thereof, and combinations thereof.
Иммуногенные композиции, используемые в изобретении, могут включать адъюванты.Immunogenic compositions used in the invention may include adjuvants.
Адъюванты, подходящие для совместного введения в соответствии с изобретением, должны быть потенциально безопасными, хорошо переносимыми и эффективными для людей, включая QS-21, DetoxPC, MPL-SE, MoGM-CSF, TiterMax-G, CRL - 1005, GERBU, TERамид, PSC97B, Adjumer, PG-026, GSK-I, GcMAF, B-алетин, MPC-026, Adjuvax, CpG ODN, бетафектин, квасцы и MF59.Adjuvants suitable for co-administration in accordance with the invention must be potentially safe, well tolerated and effective in humans, including QS-21, DetoxPC, MPL-SE, MoGM-CSF, TiterMax-G, CRL - 1005, GERBU, TERamide, PSC97B, Adjumer, PG-026, GSK-I, GcMAF, B-alethine, MPC-026, Adjuvax, CpG ODN, Betafectin, Alum and MF59.
Другие адъюванты, которые можно вводить, включают лектины, факторы роста, цитокины и лимфокины, такие как альфа-интерферон, гамма-интерферон, тромбоцитарный фактор роста (PDGF), гранулоцитарный колониестимулирующий фактор (gCSF), гранулоцитарный-макрофагальный колониестимулирующий фактор (gMCSF), фактор некроза опухоли (TNF), эпидермальный фактор роста (EGF), IL-I, IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10 и IL-12 или кодирующие нуклеиновые кислоты.Other adjuvants that can be administered include lectins, growth factors, cytokines and lymphokines such as interferon alpha, interferon gamma, platelet-derived growth factor (PDGF), granulocyte colony-stimulating factor (gCSF), granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (gMCSF), tumor necrosis factor (TNF), epidermal growth factor (EGF), IL-I, IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10 and IL-12 or encoding nucleic acids.
Композиции по изобретению могут включать фармацевтически приемлемый эксципиент, носитель, буфер, стабилизатор или другие вещества, хорошо известные специалистам в данной области. Такие вещества должны быть нетоксичными и не должны мешать эффективности активного ингредиента. Точная природа носителя или другого вещества может зависеть от пути введения, например, внутримышечного, подкожного, перорального, внутривенного, кожного, интрамукозального (например, кишечного), интраназального или интраперитонеального путей.The compositions of the invention may include a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, buffer, stabilizer, or other substances well known to those skilled in the art. Such substances must be non-toxic and must not interfere with the effectiveness of the active ingredient. The exact nature of the carrier or other substance may depend on the route of administration, for example, intramuscular, subcutaneous, oral, intravenous, dermal, intramucosal (eg, intestinal), intranasal, or intraperitoneal routes.
Способ усиления иммунного ответа.A way to enhance the immune response.
Изобретение обеспечивает улучшенный способ примирования и усиления иммунного ответа на любой антигенный белок или его иммуногенный полипептид у субъекта-человека с использованием IVT репРНК в комбинации с аденовирусным вектором.The invention provides an improved method of priming and enhancing the immune response to any antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof in a human subject using IVT repRNA in combination with an adenoviral vector.
В соответствии с одним общим аспектом изобретения, способ индукции иммунного ответа у субъекта-человека, нуждающегося в этом, включает:In accordance with one general aspect of the invention, a method of inducing an immune response in a human subject in need thereof comprises:
a. введение субъекту-человеку первой композиции, включающей иммунологически эффективное количество in vitro транскрибированной (IVT) самореплицирующейся РНК (репРНК), включающей первый полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. administering to a human subject a first composition comprising an immunologically effective amount of in vitro transcribed (IVT) self-replicating RNA (repRNA) comprising a first polynucleotide encoding a first antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. введение субъекту второй композиции, включающей иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, для достижения таким образом индуцированного иммунного ответа у субъекта-человека, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту, и одна из композиций является примирующей композицией, а другая композиция является бустерной композицией.b. administering to a subject a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, to thereby elicit an immune response in a human subject, wherein the first and second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant, and one of the compositions is a priming composition and the other composition is a booster composition.
В соответствии с вариантами осуществления изобретения, индуцированный иммунный ответ включает индуцированный ответ антител против антигенного белка у субъекта-человека.In accordance with embodiments of the invention, the induced immune response includes induced antibody response against an antigenic protein in a human subject.
Предпочтительно, усиленный иммунный ответ также включает усиленный CD4+ ответ или усиленный CD8+ T-клеточный ответ против антигенного белка у субъекта-человека. Усиленный CD4+ Tклеточный ответ, вызываемый способом в соответствии с вариантом осуществления изобретения, может представлять собой, например, повышение или индукцию доминирующего CD4+ T-клеточного ответа против антигенного белка и/или увеличение или индукцию полифункциональных CD4+ T-клеток, специфических в отношении антигенного белка, у субъекта-человека. Полифункциональные CD4+ T-клетки экспрессируют более чем один цитокин, например, два или более из IFN-гамма, IL-2 и TNF-альфа. Усиленный CD8+ T-клеточный ответ, вызываемый способом в соответствии с вариантом осуществления изобретения, может представлять собой, например, увеличение или индукцию полифункциональных CD8+ T-клеток, специфических в отношении антигенного белка, у субъекта-человека.Preferably, the enhanced immune response also includes an enhanced CD4+ response or an enhanced CD8+ T cell response against the antigenic protein in the human subject. The enhanced CD4+ T cell response produced by the method in accordance with an embodiment of the invention may be, for example, an increase or induction of a dominant CD4+ T cell response against an antigen protein and/or an increase or induction of multifunctional CD4+ T cells specific for an antigen protein, in a human subject. Polyfunctional CD4+ T cells express more than one cytokine, for example two or more of IFN-gamma, IL-2 and TNF-alpha. The enhanced CD8+ T cell response produced by the method in accordance with an embodiment of the invention may be, for example, an increase or induction of polyfunctional CD8+ T cells specific for an antigen protein in a human subject.
Более предпочтительно, усиленный иммунный ответ, вызываемый способом в соответствии с вари- 12 043316 антом осуществления изобретения, включает усиленный CD4+ T-клеточный ответ, усиленный ответ антител и усиленный CD8+ T-клеточный ответ против антигенного белка у субъекта-человека.More preferably, the enhanced immune response induced by the method according to an embodiment of the invention includes an enhanced CD4+ T cell response, an enhanced antibody response, and an enhanced CD8+ T cell response against an antigenic protein in a human subject.
Анализы, которые можно использовать для определения иммунных ответов, хорошо известны в данной области техники. Некоторые из таких анализов включают, например, ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ), ELISPOT (иммуноферментный спот-анализ) и ICS (метод внутриклеточного окрашивания цитокинов). Анализы ELISA определяют, например, уровни секретируемых антител или цитокинов. Когда ELISA анализы используют для определения уровней антител, которые связываются с определенным антигеном, индикатором гуморального иммунного ответа, они также могут отражать активность CD4+ T-клеток, поскольку продукция высокоаффинных антител B-клетками зависит от активности CD4+ хелперных T-клеток. ELISPOT и ICS представляют собой одноклеточные анализы, которые анализируют, например, ответы T-клеток на определенный антиген. Анализы ELISPOT измеряют секреторную активность отдельных клеток, а анализы ICS анализируют уровни внутриклеточных цитокинов. CD4+ специфические и CD8+ специфические T-клеточные ответы можно определить с использованием ICS анализов.Assays that can be used to determine immune responses are well known in the art. Some of these tests include, for example, ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), ELISPOT (enzyme-linked immunosorbent spot assay), and ICS (cytokine intracellular staining method). ELISA tests measure, for example, the levels of secreted antibodies or cytokines. When ELISA assays are used to determine the levels of antibodies that bind to a particular antigen, an indicator of the humoral immune response, they can also reflect the activity of CD4+ T cells, since the production of high-affinity antibodies by B cells depends on the activity of CD4+ helper T cells. ELISPOT and ICS are single-cell assays that analyze, for example, T cell responses to a specific antigen. ELISPOT assays measure the secretory activity of individual cells, and ICS assays analyze intracellular cytokine levels. CD4+ specific and CD8+ specific T cell responses can be determined using ICS assays.
В одном или нескольких вариантах осуществления изобретения IVT репРНК используют для примирования иммунного ответа, а вектор Ad26 или Ad35 используют для усиления иммунного ответа, в соответствии с вариантом осуществления изобретения. В других вариантах осуществления изобретения вектор Ad26 или Ad35 используют для примирования иммунного ответа, a IVT репРНК используют для усиления иммунного ответа, в соответствии с вариантом осуществления изобретения.In one or more embodiments of the invention, the IVT repRNA is used to prime the immune response, and the Ad26 or Ad35 vector is used to enhance the immune response, in accordance with an embodiment of the invention. In other embodiments, the Ad26 or Ad35 vector is used to prime an immune response, and the IVT repRNA is used to enhance the immune response, in accordance with an embodiment of the invention.
Антигены в примирующих и бустерных композициях необязательно должны быть идентичными, но должны иметь общие антигенные детерминанты или быть по существу схожими друг с другом.The antigens in the priming and booster compositions need not be identical, but must have common antigenic determinants or be substantially similar to each other.
Введение иммуногенных композиций обычно осуществляют внутримышечным, подкожным или внутрикожным путем. Однако можно использовать и другие способы введения, такие как внутривенный, кожный или интраназальный. Внутримышечное введение иммуногенных композиций можно осуществить при помощи иглы для инъекции композиции в виде суспензии. Альтернативой является использование безыгольного инъекционного устройства для введения композиции (с использованием, например, Biojector(TM) или лиофилизированного порошка, содержащего композицию.Administration of immunogenic compositions is usually carried out by the intramuscular, subcutaneous or intradermal route. However, other routes of administration can be used, such as intravenous, dermal or intranasal. Intramuscular administration of immunogenic compositions can be accomplished using a needle to inject the composition in the form of a suspension. An alternative is to use a needleless injection device to administer the composition (using, for example, a Biojector(TM) or lyophilized powder containing the composition.
Для внутривенной, кожной или подкожной инъекции или инъекции в место поражения композиция должна быть в форме парентерально приемлемого водного раствора, который не содержит пирогенов и имеет подходящий pH, изотоничность и стабильность. Специалисты в данной области техники могут легко получить подходящие растворы, используя, например, изотонические носители, такие как раствор хлорида натрия для инъекций, раствор Рингера для инъекций, лактированный раствор Рингера для инъекций. IVT репРНК по изобретению можно сформулировать в липидных наночастицах для введения. В композиции можно включить консерванты, стабилизаторы, буферы, антиоксиданты и/или другие добавки, по мере необходимости. Также можно использовать лекарственные формы с замедленным высвобождением.For intravenous, dermal, subcutaneous or intralesional injection, the composition must be in the form of a parenterally acceptable aqueous solution that is pyrogen-free and has suitable pH, isotonicity and stability. Those skilled in the art can readily prepare suitable solutions using, for example, isotonic vehicles such as sodium chloride injection, Ringer's injection, lactated Ringer's injection. The IVT repRNA of the invention can be formulated into lipid nanoparticles for administration. Preservatives, stabilizers, buffers, antioxidants and/or other additives may be included in the compositions, as needed. Slow-release dosage forms may also be used.
Как правило, введение будет иметь профилактическую цель для генерирования иммунного ответа против антигена до заражения или развития симптомов. Заболевания и расстройства, которые можно лечить или предотвращать в соответствии с изобретением, включают такие, в которых иммунный ответ может играть защитную или терапевтическую роль. В других вариантах осуществления IVT репРНК и аденовирусный вектор можно вводить для профилактики после контактирования с возбудителем инфекции.Typically, administration will be for the prophylactic purpose of generating an immune response against the antigen prior to infection or development of symptoms. Diseases and disorders that may be treated or prevented in accordance with the invention include those in which the immune response may play a protective or therapeutic role. In other embodiments, the IVT repRNA and adenoviral vector can be administered for prophylaxis following exposure to an infectious agent.
Иммуногенные композиции, содержащие IVT репРНК и аденовирусный вектор, вводят субъекту, вызывая иммунный ответ у субъекта. Количество композиции, достаточное для индукции определяемого иммунного ответа, определяется как иммунологически эффективная доза. Как показано ниже, иммуногенные композиции по изобретению индуцируют гуморальный, а также клеточный иммунный ответ. В предпочтительном варианте осуществления иммунный ответ представляет собой защитный иммунный ответ.Immunogenic compositions containing IVT repRNA and an adenoviral vector are administered to a subject, causing an immune response in the subject. An amount of the composition sufficient to induce a detectable immune response is defined as the immunologically effective dose. As shown below, the immunogenic compositions of the invention induce a humoral as well as a cellular immune response. In a preferred embodiment, the immune response is a protective immune response.
Фактическое количество вводимых композиций, а также скорость и время введения будут зависеть от природы и тяжести заболевания, расстройства или состояния, которое лечат. Назначение лечения, например, принятие решения о дозировке и т.д., входит в сферу ответственности врачей общей практики и других врачей и, как правило, учитывает заболевание, расстройство или состояние, подлежащее лечению, состояние конкретного пациента, место доставки, способ применения и другие факторы, известные практикующим врачам. Примеры методов и протоколов, указанных выше, можно найти в Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th edition, Osol, A. ed., 1980.The actual amount of compositions administered, as well as the rate and timing of administration, will depend on the nature and severity of the disease, disorder or condition being treated. Prescribing treatment, e.g. deciding on dosage, etc., is the responsibility of general practitioners and other physicians and usually takes into account the disease, disorder or condition being treated, the condition of the individual patient, the site of delivery, the route of administration and other factors known to medical practitioners. Examples of the methods and protocols listed above can be found in Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th edition, Osol, A. ed., 1980.
После получения IVT репРНК и аденовирусных векторов и необязательного формулирования таких частиц в композиции композицию можно вводить индивидууму, в частности человеку.Once the IVT repRNA and adenoviral vectors are prepared and such particles are optionally formulated into a composition, the composition can be administered to an individual, particularly a human.
Терапевтически эффективное количество или дозировка могут варьироваться в зависимости от различных факторов, таких как способ введения, участок-мишень, физиологическое состояние субъекта (включая, например, возраст, массу тела, состояние здоровья), независимо от того, является ли субъект человеком или животным, другие вводимые лекарственные средства, и является ли лечение профилактическим или терапевтическим. Дозы лечения оптимально титруют для оптимизации безопасности и эф- 13 043316 фективности.The therapeutically effective amount or dosage may vary depending on various factors, such as the route of administration, the target site, the physiological condition of the subject (including, for example, age, body weight, health status), whether the subject is human or animal, other drugs administered, and whether the treatment is prophylactic or therapeutic. Treatment doses are optimally titrated to optimize safety and effectiveness.
В одной иллюстративной схеме IVT репРНК вводят (например, внутримышечно) в объеме от около 100 мкл до около 10 мл, содержащем дозу <200 мкг, <100 мкг, <50 мкг, или <10 мкг IVT репРНК, но экспрессию можно наблюдать при значительно более низких уровнях, например <1 мкг, <100 нг, <10 нг или <1 нг IVT репРНК на дозу. Предпочтительно, IVT репРНК вводят в объеме от 0,25 мл до 1,0 мл. Более предпочтительно, IVT репРНК вводят в объеме 0,5 мл.In one exemplary regimen, IVT repRNA is administered (eg, intramuscularly) in a volume of about 100 μl to about 10 ml containing a dose of <200 μg, <100 μg, <50 μg, or <10 μg IVT repRNA, but expression can be observed at significantly lower levels, such as <1 μg, <100 ng, <10 ng, or <1 ng IVT repRNA per dose. Preferably, IVT repRNA is administered in a volume of 0.25 ml to 1.0 ml. More preferably, IVT repRNA is administered in a volume of 0.5 ml.
Типично, IVT репРНК вводят в количестве около 10-100 мкг на дозу. В предпочтительном варианте осуществления IVT репРНК вводят в количестве около 10 мкг на дозу. В другом предпочтительном варианте осуществления IVT репРНК вводят в количестве около 25 мкг на дозу. В другом предпочтительном варианте осуществления IVT репРНК вводят в количестве около 50 мкг на дозу. В другом предпочтительном варианте осуществления IVT репРНК вводят в количестве около 75 мкг на дозу. В другом предпочтительном варианте осуществления IVT репРНК вводят в количестве около 100 мкг на дозу.Typically, IVT repRNA is administered in an amount of about 10-100 μg per dose. In a preferred embodiment, IVT repRNA is administered in an amount of about 10 μg per dose. In another preferred embodiment, IVT repRNA is administered in an amount of about 25 μg per dose. In another preferred embodiment, IVT repRNA is administered in an amount of about 50 μg per dose. In another preferred embodiment, IVT repRNA is administered in an amount of about 75 μg per dose. In another preferred embodiment, IVT repRNA is administered in an amount of about 100 μg per dose.
В одной иллюстративной схеме аденовирусный вектор вводят (например, внутримышечно) в объеме от около 100 мкл до около 10 мл, содержащем концентрации около 104-1012 вирусных частиц/мл. Предпочтительно, аденовирусный вектор вводят в объеме от 0,25 мл до 1,0 мл. Более предпочтительно, аденовирусный вектор вводят в объеме 0,5 мл.In one exemplary scheme, the adenoviral vector is administered (eg, intramuscularly) in a volume of about 100 μl to about 10 ml, containing concentrations of about 10 4 -10 12 viral particles/ml. Preferably, the adenoviral vector is administered in a volume of 0.25 ml to 1.0 ml. More preferably, the adenoviral vector is administered in a volume of 0.5 ml.
Типично, аденовирус вводят в количестве от около 109 до около 1012 вирусных частиц (vp) субъекту-человеку за одно введение, более типично в количестве от около 1010 до около 1012 vp. В предпочтительном варианте осуществления аденовирусный вектор вводят в количестве около 5х1010 vp. В другом предпочтительном варианте осуществления, аденовирусный вектор вводят в количестве около 0,8х1010 vp. В другом предпочтительном варианте осуществления аденовирусный вектор вводят в количестве около 2х1010 vp. В другом предпочтительном варианте осуществления аденовирусный вектор вводят в количестве около 4х1010 vp.Typically, the adenovirus is administered in an amount of from about 10 9 to about 10 12 viral particles (vp) to a human subject per administration, more typically in an amount from about 10 10 to about 10 12 vp. In a preferred embodiment, the adenoviral vector is administered in an amount of about 5 x 10 10 vp. In another preferred embodiment, the adenoviral vector is administered in an amount of about 0.8 x 10 10 vp. In another preferred embodiment, the adenoviral vector is administered in an amount of about 2x10 10 vp. In another preferred embodiment, the adenoviral vector is administered in an amount of about 4 x 10 10 vp.
Композиции по изобретению можно вводить отдельно или в комбинации другими лечениями, либо одновременно, либо последовательно, в зависимости от состояния, подлежащего лечению.The compositions of the invention may be administered alone or in combination with other treatments, either simultaneously or sequentially, depending on the condition being treated.
Бустерные композиции вводят через несколько недель или месяцев после введения примирующей композиции, например, примерно через 1 неделю, 2 недели, 3 недели, 4 недели, 5 недель, 6 недель, 7 недель, 8 недель, 9 недель, 10 недель, 11 недель, 12 недель, 13 недель, 14 недель, 15 недель, 16 недель, 17 недель, 18 недель, 19 недель, 20 недель, 21 неделю, 22 недели, 23 недели, 24 недели, 25 недель, 26 недель, 27 недель, 28 недель, 29 недель, 30 недель, 31 неделю, 32 недели, 33 недели, 34 недели, 35 недель, 36 недель, 37 недель, 38 недель, 39 недель, 40 недель, 41 неделю, 42 недели, 43 недели, 44 недели, 45 недель, 46 недель, 47 недель, 48 недель, 49 недель, 50 недель, 51 неделю или один-два года после введения примирующей композиции.Booster compositions are administered several weeks or months after administration of the priming composition, for example, about 1 week, 2 weeks, 3 weeks, 4 weeks, 5 weeks, 6 weeks, 7 weeks, 8 weeks, 9 weeks, 10 weeks, 11 weeks, 12 weeks, 13 weeks, 14 weeks, 15 weeks, 16 weeks, 17 weeks, 18 weeks, 19 weeks, 20 weeks, 21 weeks, 22 weeks, 23 weeks, 24 weeks, 25 weeks, 26 weeks, 27 weeks, 28 weeks , 29 weeks, 30 weeks, 31 weeks, 32 weeks, 33 weeks, 34 weeks, 35 weeks, 36 weeks, 37 weeks, 38 weeks, 39 weeks, 40 weeks, 41 weeks, 42 weeks, 43 weeks, 44 weeks, 45 weeks, 46 weeks, 47 weeks, 48 weeks, 49 weeks, 50 weeks, 51 weeks or one to two years after administration of the priming composition.
Предпочтительно, бустерную композицию вводят через 1-52 недели после введения примирующей композиции. В предпочтительном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 2-52 недели после введения примирующей композиции. В другом предпочтительном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 4-52 недели после введения примирующей композиции. В другом предпочтительном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 1 неделю после введения примирующей композиции. В другом предпочтительном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 2 недели после введения примирующей композиции. В другом предпочтительном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 4 недели после введения примирующей композиции. В другом предпочтительном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 8 недель после введения примирующей композиции.Preferably, the booster composition is administered 1-52 weeks after administration of the priming composition. In a preferred embodiment of the invention, the booster composition is administered 2-52 weeks after administration of the priming composition. In another preferred embodiment of the invention, the booster composition is administered 4-52 weeks after administration of the priming composition. In another preferred embodiment of the invention, the booster composition is administered 1 week after administration of the priming composition. In another preferred embodiment of the invention, the booster composition is administered 2 weeks after administration of the priming composition. In another preferred embodiment of the invention, the booster composition is administered 4 weeks after administration of the priming composition. In another preferred embodiment of the invention, the booster composition is administered 8 weeks after administration of the priming composition.
Примирующая и бустерная композиции по изобретению может каждая включать одну, две, три или множество доз.The priming and booster compositions of the invention may each comprise one, two, three or multiple doses.
В одном варианте осуществления изобретение относится к способу индукции иммунного ответа против опухоли у субъекта-человека.In one embodiment, the invention relates to a method of inducing an immune response against a tumor in a human subject.
Способ включает:The method includes:
a. введение субъекту-человеку первой композиции, включающей иммунологически эффективное количество IVT репРНК, включающей первый полинуклеотид, кодирующий антигенный белок, продуцируемый клеткой опухоли, по существу аналогичный антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. administering to a human subject a first composition comprising an immunologically effective amount of an IVT repRNA comprising a first polynucleotide encoding an antigenic protein produced by a tumor cell, a substantially similar antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. введение субъекту второй композиции, включающей иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий антигенный белк, по существу аналогичный антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, для достижения таким образом индуцированного иммунного ответа против опухоли у субъектачеловека, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту, и одна из композиций является примирующей композицией, а другая композиция является бустерной композицией.b. administering to a subject a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding an antigenic protein, a substantially similar antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, to thereby induce an immune response against a tumor in the human subject, wherein the first and the second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant, and one of the compositions is a priming composition and the other composition is a booster composition.
- 14 043316- 14 043316
Предпочтительно, индуцированный иммунный ответ обеспечивает защитный иммунитет против опухоли у субъекта-человека.Preferably, the induced immune response provides protective immunity against the tumor in the human subject.
В предпочтительном варианте осуществления композиция, включающая IVT репРНК, представляет собой примирующую композицию, а композиция, включающая аденовирусный вектор, представляет собой бустерную композицию.In a preferred embodiment, the composition comprising the IVT repRNA is a priming composition and the composition comprising the adenoviral vector is a booster composition.
В соответствии с вариантами осуществления изобретения, бустерную композицию вводят через 152 недели после введения примирующей композиции. Бустерную композицию также можно вводить позже, чем через 52 недель после введения примирующей композиции.In accordance with embodiments of the invention, the booster composition is administered 152 weeks after administration of the priming composition. The booster composition can also be administered later than 52 weeks after administration of the priming composition.
В одном варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 2-52 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 4-52 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 1 неделю после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 2 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 4 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 8 недель после введения примирующей композиции.In one embodiment of the invention, the booster composition is administered 2-52 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 4-52 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 1 week after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 2 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 4 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 8 weeks after administration of the priming composition.
В дополнительных вариантах осуществления бустерную композицию вводят по меньшей мере через 2 недели или по меньшей мере через 4 недели после введения примирующей композиции. Еще в некоторых вариантах осуществления бустерную композицию вводят через 4-12 недель или через 4-8 недель после введения примирующей композиции.In additional embodiments, the booster composition is administered at least 2 weeks or at least 4 weeks after administration of the priming composition. In still some embodiments, the booster composition is administered 4-12 weeks or 4-8 weeks after administration of the priming composition.
В предпочтительном варианте осуществления IVT репРНК представляет собой репРНК на основе VEE-вируса.In a preferred embodiment, the IVT repRNA is a VEE virus-based repRNA.
В предпочтительном варианте осуществления аденовирусный вектор представляет собой Ad26 или Ad35 вектор.In a preferred embodiment, the adenoviral vector is an Ad26 or Ad35 vector.
Антигенный белок, продуцируемый клеткой опухоли, может представлять собой любой опухолевый антиген. В предпочтительном варианте осуществления опухолевый антиген представляет собой опухоль-специфический антиген, который присутствует только на опухолевых клетках. Опухолевый антиген также может представлять собой опухоль-ассоциированный антиген, который присутствует на некоторых опухолевых клетках, а также некоторых нормальных клетках.The antigenic protein produced by the tumor cell may be any tumor antigen. In a preferred embodiment, the tumor antigen is a tumor-specific antigen that is present only on tumor cells. A tumor antigen may also be a tumor-associated antigen that is present on some tumor cells as well as some normal cells.
В соответствии с еще одним вариантом осуществления, изобретение относится к способу индукции иммунного ответа против вируса у субъекта-человека. Способ включает:According to yet another embodiment, the invention relates to a method for inducing an immune response against a virus in a human subject. The method includes:
a. введение субъекту-человеку первой композиции, включающей иммунологически эффективное количество IVT репРНК, включающей первый полинуклеотид, кодирующий антигенный белок вируса, по существу аналогичный антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. administering to a human subject a first composition comprising an immunologically effective amount of an IVT repRNA comprising a first polynucleotide encoding an antigenic protein of a virus, a substantially similar antigenic protein, or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. введение субъекту второй композиции, включающей иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий антигенный белок, по существу аналогичный антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, для достижения таким образом индуцированного иммунного ответа против вируса у субъектачеловека, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту, и одна из композиций является примирующей композицией, а другая композиция является бустерной композицией.b. administering to a subject a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding an antigenic protein, a substantially similar antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, to thereby elicit an immune response against the virus in the human subject, wherein the first and the second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant, and one of the compositions is a priming composition and the other composition is a booster composition.
Предпочтительно, усиленный иммунный ответ обеспечивает защитный иммунитет против вируса у субъекта-человека.Preferably, the enhanced immune response provides protective immunity against the virus in the human subject.
В предпочтительном варианте осуществления композиция, включающая IVT репРНК, представляет собой примирующую композицию, а композиция, включающая аденовирусный вектор, представляет собой бустерную композицию.In a preferred embodiment, the composition comprising the IVT repRNA is a priming composition and the composition comprising the adenoviral vector is a booster composition.
В одном варианте осуществления бустерную композицию вводят через 1-52 недели после введения примирующей композиции. Бустерную композицию также можно вводить позже, чем через 52 недели после введения примирующей композиции.In one embodiment, the booster composition is administered 1-52 weeks after administration of the priming composition. The booster composition can also be administered later than 52 weeks after administration of the priming composition.
В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 2-52 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 4-52 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 1 неделю после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 2 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 4 недели после введения примирующей композиции. В другом варианте осуществления изобретения бустерную композицию вводят через 8 недель после введения примирующей композиции.In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 2-52 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 4-52 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 1 week after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 2 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 4 weeks after administration of the priming composition. In another embodiment of the invention, the booster composition is administered 8 weeks after administration of the priming composition.
В дополнительных вариантах осуществления бустерную композицию вводят по меньшей мере че- 15 043316 рез 2 недели или по меньшей мере через 4 недель после введения примирующей композиции. Еще в некоторых вариантах осуществления бустерную композицию вводят через 4-12 недель или через 4-8 недель после введения примирующей композиции.In additional embodiments, the booster composition is administered at least 2 weeks or at least 4 weeks after administration of the priming composition. In still some embodiments, the booster composition is administered 4-12 weeks or 4-8 weeks after administration of the priming composition.
В предпочтительном варианте осуществления IVT репРНК представляет собой репРНК на основеIn a preferred embodiment, the IVT repRNA is a repRNA based
VEE-вируса.VEE virus.
В предпочтительном варианте осуществления аденовирусный вектор представляет собой Ad26 или Ad35 вектор.In a preferred embodiment, the adenoviral vector is an Ad26 or Ad35 vector.
Антигенный белок может представлять собой любой антигенный белок вируса. В предпочтительном варианте осуществления антигенный белок представляет собой гликопротеин или нуклеопротеин вируса.The antigenic protein can be any antigenic protein of a virus. In a preferred embodiment, the antigenic protein is a glycoprotein or nucleoprotein of a virus.
Варианты осуществленияEmbodiments
Изобретение обеспечивает также следующие неограничивающие варианты осуществления.The invention also provides the following non-limiting embodiments.
Вариант осуществления 1 представляет собой способ индукции иммунного ответа у субъектачеловека, нуждающегося в этом, включающий:Embodiment 1 is a method of inducing an immune response in a human subject in need thereof, comprising:
a. введение субъекту-человеку первой композиции, включающей иммунологически эффективное количество in vitro транскрибированной (IVT) самореплицирующейся РНК (репРНК), включающей первый полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. administering to a human subject a first composition comprising an immunologically effective amount of in vitro transcribed (IVT) self-replicating RNA (repRNA) comprising a first polynucleotide encoding a first antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. введение субъекту второй композиции, включающей иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, для достижения таким образом индуцированного иммунного ответа у субъекта-человека, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту, и одна из композиций является примирующей композицией, а другая композиция является бустерной композицией.b. administering to a subject a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, to thereby elicit an immune response in a human subject, wherein the first and second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant, and one of the compositions is a priming composition and the other composition is a booster composition.
Вариант осуществления 2 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 1, где композиция, включающая IVT репРНК, представляет собой примирующую композицию, а композиция, включающая аденовирусный вектор, представляет собой бустерную композицию.Embodiment 2 is the method according to Embodiment 1, wherein the composition comprising the IVT repRNA is a priming composition and the composition comprising the adenoviral vector is a booster composition.
Вариант осуществления 3 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 1, где композиция, включающая аденовирусный вектор, представляет собой примирующую композицию, а композиция, включающая IVT репРНК, представляет собой бустерную композицию.Embodiment 3 is the method according to Embodiment 1, wherein the composition comprising the adenoviral vector is a priming composition and the composition comprising IVT repRNA is a booster composition.
Вариант осуществления 4 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-3, где индуцированный иммунный ответ включает индуцированный иммунный ответ антител против по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков, у субъекта-человека.Embodiment 4 is the method according to any of Embodiments 1-3, wherein the induced immune response comprises induced antibody immune response against at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins in a human subject.
Вариант осуществления 5 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 4, где индуцированный иммунный ответ антител определяют методом ELISA.Embodiment 5 is the method according to Embodiment 4, where the induced antibody immune response is determined by ELISA.
Вариант осуществления 6 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-3, где индуцированный иммунный ответ включает индуцированный клеточный иммунный ответ против по меньшей мере одной антигенной детерминанты, являющейся общей для первого и второго антигенных белков, у субъекта-человека.Embodiment 6 is the method according to any of Embodiments 1-3, wherein the induced immune response comprises an induced cellular immune response against at least one antigenic determinant common to the first and second antigenic proteins in a human subject.
Вариант осуществления 7 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 6, где индуцированный клеточный иммунный ответ определяют методом ICS или методом ELISPOT.Embodiment 7 is the method according to Embodiment 6, where the induced cellular immune response is determined by the ICS method or the ELISPOT method.
Вариант осуществления 8 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-7, где индуцированный иммунный ответ обеспечивает защитный иммунитет субъектучеловеку против заболевания, связанного с по меньшей мере одним из первого и второго антигенных белков.Embodiment 8 is a method according to any of Embodiments 1-7, wherein the induced immune response provides protective immunity to a human subject against a disease associated with at least one of the first and second antigenic proteins.
Вариант осуществления 9 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-8, где IVT репРНК представляет собой репРНК на основе вируса венесуэльского энцефалита лошадей (VEE).Embodiment 9 is a method according to any of Embodiments 1-8, wherein the IVT repRNA is a Venezuelan equine encephalitis (VEE) virus-based repRNA.
Вариант осуществления 10 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-9, где аденовирусный вектор представляет собой вектор на основе рекомбинантного человеческого аденовируса серотипа 26 (Ad26) или вектор на основе рекомбинантного человеческого аденовируса серотипа 35 (Ad35).Embodiment 10 is the method according to any of Embodiments 1 to 9, wherein the adenoviral vector is a recombinant human adenovirus serotype 26 (Ad26) vector or a recombinant human adenovirus serotype 35 (Ad35) vector.
Вариант осуществления 11 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-10, где бустерную композицию вводят через 1-52 недели после введения примирующей композиции.Embodiment 11 is the method according to any of Embodiments 1-10, wherein the booster composition is administered 1-52 weeks after administration of the primer composition.
Вариант осуществления 12 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-11, где бустерную композицию вводят по меньшей мере через 1 неделю после введения примирующей композиции.Embodiment 12 is the method according to any of Embodiments 1-11, wherein the booster composition is administered at least 1 week after administration of the priming composition.
Вариант осуществления 13 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-12, где первый или второй антигенный белок происходит из патогена или опухоли.Embodiment 13 is a method according to any of Embodiments 1-12, wherein the first or second antigenic protein is derived from a pathogen or tumor.
- 16 043316- 16 043316
Вариант осуществления 14 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-12, где первый или второй антигенный белок происходит из вируса.Embodiment 14 is a method according to any of Embodiments 1-12, wherein the first or second antigenic protein is derived from a virus.
Вариант осуществления 15 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществленияEmbodiment 15 is a method according to Embodiment
14, где первый или второй антигенный белок происходит из пневмовируса, филовируса, ВИЧ, вируса денге, вируса зика, вируса гриппа или вируса гепатит B.14, wherein the first or second antigenic protein is derived from a pneumovirus, filovirus, HIV, dengue virus, zika virus, influenza virus, or hepatitis B virus.
Вариант осуществления 16 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-15, где первый и второй антигенные белки являются идентичными или по существу идентичными.Embodiment 16 is a method according to any of Embodiments 1-15, wherein the first and second antigenic proteins are identical or substantially identical.
Вариант осуществления 17 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-16, где первый или второй антигенный белок происходит из F белка до слияния из респираторно-синцитиального вируса (RSV-preF), и где первый и второй антигенные белки являются идентичными или по существу идентичными.Embodiment 17 is a method according to any of Embodiments 1-16, wherein the first or second antigenic protein is derived from a prefusion F protein from respiratory syncytial virus (RSV-preF), and wherein the first and second antigenic proteins are identical or essentially identical.
Вариант осуществления 18 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 17, где первый и второй антигенные белки, каждый независимо, включают аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, их иммуногенные полипептиды и их комбинации.Embodiment 18 is the method of Embodiment 17, wherein the first and second antigenic proteins each independently comprise an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, immunogenic polypeptides thereof, and combinations.
Вариант осуществления 19 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 18, где IVT репРНК включает полинуклеотид, кодирующий по меньшей мере один антигенный белок, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, и его иммуногенные полипептиды.Embodiment 19 is the method of Embodiment 18, wherein the IVT repRNA comprises a polynucleotide encoding at least one antigenic protein having an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, and its immunogenic polypeptides.
Вариант осуществления 20 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 21, где IVT репРНК включает полинуклеотид, имеющий последовательность SEQ ID NO: 3.Embodiment 20 is the method of Embodiment 21, wherein the IVT repRNA comprises a polynucleotide having the sequence of SEQ ID NO: 3.
Вариант осуществления 21 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 20, где аденовирусный вектор включает полинуклеотид, кодирующий по меньшей мере один антигенный белок, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, и его иммуногенные полипептиды.Embodiment 21 is the method of Embodiment 20, wherein the adenoviral vector includes a polynucleotide encoding at least one antigenic protein having an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, and its immunogenic polypeptides.
Вариант осуществления 22 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-21, где IVT репРНК вводят в виде композиции липидных наночастиц в количестве 0,1-1000 мкг IVT репРНК на дозу.Embodiment 22 is a method according to any of Embodiments 1-21, wherein the IVT repRNA is administered as a lipid nanoparticle composition in an amount of 0.1-1000 μg of IVT repRNA per dose.
Вариант осуществления 23 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 1-22, где аденовирусный вектор вводят в количестве 109-1012 вирусных частиц на дозу.Embodiment 23 is a method according to any of Embodiments 1-22, wherein the adenoviral vector is administered in an amount of 109-1012 viral particles per dose.
Вариант осуществления 24 представляет собой способ индукции иммунного ответа против по меньшей мере одного субтипа пневмовируса у субъекта-человека, включающий:Embodiment 24 is a method of inducing an immune response against at least one subtype of pneumovirus in a human subject, comprising:
a. введение субъекту-человеку первой композиции, включающей иммунологически эффективное количество IVT репРНК, включающей первый полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок по меньшей мере одного субтипа пневмовируса или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. administering to a human subject a first composition comprising an immunologically effective amount of an IVT repRNA comprising a first polynucleotide encoding a first antigenic protein of at least one pneumovirus subtype or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. введение субъекту второй композиции, включающей иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок по меньшей мере одного субтипа пневмовируса или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, для достижения таким образом индуцированного иммунного ответа против по меньшей мере одного субтипа пневмовируса у субъекта-человека, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту, и одна из композиций является примирующей композицией, а другая композиция является бустерной композицией.b. administering to a subject a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein of at least one pneumovirus subtype or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, to thereby achieve an immune response against at least one subtype pneumovirus in a human subject, wherein the first and second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant, and one of the compositions is a priming composition and the other composition is a booster composition.
Вариант осуществления 25 представляет собой комбинацию для индукции иммунного ответа у субъекта-человека, включающую:Embodiment 25 is a combination for inducing an immune response in a human subject, comprising:
a. первую композицию, включающую иммунологически эффективное количество IVT репРНК, включающей первый полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. a first composition comprising an immunologically effective amount of an IVT repRNA comprising a first polynucleotide encoding a first antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. вторую композицию, включающую иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, где одну из композиций вводят субъекту-человеку для примирования иммунного ответа, а другую композицию вводят субъекту-человеку для усиления иммунного ответа, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту.b. a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, wherein one of the compositions is administered to a human subject to prime an immune response and the other composition is administered to a human subject to enhancing an immune response, wherein the first and second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant.
Вариант осуществления 26 представляет собой применение комбинации для получения лекарственного средства для индукции иммунного ответа у субъекта-человека, включающего:Embodiment 26 is the use of a combination to produce a medicament for inducing an immune response in a human subject, comprising:
a. первую композицию, включающую иммунологически эффективное количество IVT репРНК, включающей первый полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. a first composition comprising an immunologically effective amount of an IVT repRNA comprising a first polynucleotide encoding a first antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
- 17 043316- 17 043316
b. вторую композицию, включающую иммунологически эффективное количество аденовирусного вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, где одну из композиций вводят субъекту-человеку для примирования иммунного ответа, а другую композицию вводят субъекту-человеку для усиления иммунного ответа, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту.b. a second composition comprising an immunologically effective amount of an adenoviral vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, wherein one of the compositions is administered to a human subject to prime an immune response and the other composition is administered to a human subject to enhancing an immune response, wherein the first and second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant.
Вариант осуществления 27 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где композиция, включающая IVT репРНК, представляет собой примирующую композицию, а композиция, включающая аденовирусный вектор, представляет собой бустерную композицию.Embodiment 27 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the composition comprising IVT repRNA is a priming composition and the composition comprising an adenoviral vector is booster composition.
Вариант осуществления 28 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где композиция, включающая аденовирусный вектор, представляет собой примирующую композицию, а композиция, включающая IVT репРНК, представляет собой бустерную композицию.Embodiment 28 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the composition comprising the adenoviral vector is a priming composition and the composition comprising IVT repRNA is booster composition.
Вариант осуществления 29 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где первый или второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид происходит из патогена или опухоли.Embodiment 29 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the first or second antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof is derived from a pathogen or tumor.
Вариант осуществления 30 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где первый или второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид происходит из вируса.Embodiment 30 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the first or second antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof is derived from a virus.
Вариант осуществления 31 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где первый или второй антигенный белок происходит из RSV-preF белка, и где первый и второй антигенные белки являются идентичными или по существу идентичными.Embodiment 31 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the first or second antigenic protein is derived from RSV-preF protein, and wherein the first and second antigenic proteins are identical or substantially identical.
Вариант осуществления 32 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где первый и второй антигенные белки, каждый независимо, включают аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, их иммуногенные полипептиды и их комбинации.Embodiment 32 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the first and second antigenic proteins each independently comprise an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, immunogenic polypeptides thereof and combinations thereof.
Вариант осуществления 33 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где IVT репРНК включает полинуклеотид, кодирующий по меньшей мере один антигенный белок, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, и его иммуногенные полипептиды.Embodiment 33 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the IVT repRNA includes a polynucleotide encoding at least one antigenic protein having an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, and immunogenic polypeptides thereof.
Вариант осуществления 34 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где аденовирусный вектор включает полинуклеотид, кодирующий по меньшей мере один антигенный белок, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, и его иммуногенные полипептиды.Embodiment 34 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the adenoviral vector includes a polynucleotide encoding at least one antigenic protein having an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, and immunogenic polypeptides thereof.
Вариант осуществления 35 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где IVT репРНК представляет собой репРНК на основе вируса венесуэльского энцефалита лошадей (VEE).Embodiment 35 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the IVT repRNA is a Venezuelan equine encephalitis (VEE) virus-based repRNA.
Вариант осуществления 36 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 24, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 25 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 26, где аденовирусный вектор представляет собой Ad26 вектор или Ad35 вектор.Embodiment 36 is the method of Embodiment 24, the combination of Embodiment 25, or the use of Embodiment 26, wherein the adenoviral vector is an Ad26 vector or an Ad35 vector.
Вариант осуществления 37 представляет собой способ индукции иммунного ответа у субъектачеловека, нуждающегося в этом, включающий:Embodiment 37 is a method of inducing an immune response in a human subject in need thereof, comprising:
a. введение субъекту-человеку первой композиции, включающей иммунологически эффективное количество in vitro транскрибированной (IVT) самореплицирующейся РНК (репРНК), включающей полинуклеотид, кодирующий неструктурные белки вируса венесуэльского энцефалита лошадей (VEE), и другой полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. administering to a human subject a first composition comprising an immunologically effective amount of in vitro transcribed (IVT) self-replicating RNA (repRNA) comprising a polynucleotide encoding non-structural proteins of the Venezuelan equine encephalitis (VEE) virus and another polynucleotide encoding a first antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. введение субъекту второй композиции, включающей иммунологически эффективное количество Ad26 вектора или Ad35 вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, для достижения таким образом индуцированного иммунного ответа у субъекта-человека, где пер- 18 043316 вый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту, и первая композиция является примирующей композицией, а вторая композиция является бустерной композицией.b. administering to a subject a second composition comprising an immunologically effective amount of an Ad26 vector or an Ad35 vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, to thereby achieve an immune response in a human subject, wherein 043316 The first and second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant, and the first composition is a priming composition and the second composition is a booster composition.
Вариант осуществления 38 представляет собой комбинацию для индукции иммунного ответа у субъекта-человека, включающую:Embodiment 38 is a combination for inducing an immune response in a human subject, comprising:
a. первую композицию, включающую иммунологически эффективное количество in vitro транскрибированной (IVT) самореплицирующейся РНК (репРНК), включающей полинуклеотид, кодирующий неструктурные белки вируса венесуэльского энцефалита лошадей (VEE), и другой полинуклеотид, кодирующий первый антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, иa. a first composition comprising an immunologically effective amount of in vitro transcribed (IVT) self-replicating RNA (repRNA), comprising a polynucleotide encoding non-structural proteins of the Venezuelan equine encephalitis virus (VEE), and another polynucleotide encoding a first antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, and
b. вторую композицию, включающую иммунологически эффективное количество Ad26 вектора или Ad35 вектора, включающего второй полинуклеотид, кодирующий второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид, вместе с фармацевтически приемлемым носителем, где первый и второй антигенные белки имеют по меньшей мере одну общую антигенную детерминанту, и первая композиция является примирующей композицией, а вторая композиция является бустерной композицией.b. a second composition comprising an immunologically effective amount of an Ad26 vector or an Ad35 vector comprising a second polynucleotide encoding a second antigenic protein or an immunogenic polypeptide thereof, together with a pharmaceutically acceptable carrier, wherein the first and second antigenic proteins have at least one common antigenic determinant, and the first composition is a priming composition, and the second composition is a booster composition.
Вариант осуществления 39 представляет собой применение комбинации в соответствии с Вариантом осуществления 38 для получения лекарственного средства для индукции иммунного ответа у субъекта-человека.Embodiment 39 is the use of the combination in accordance with Embodiment 38 to produce a medicament for inducing an immune response in a human subject.
Вариант осуществления 40 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 37, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 38 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 39, где первый или второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид происходит из патогена или опухоли.Embodiment 40 is the method of Embodiment 37, the combination of Embodiment 38, or the use of Embodiment 39, wherein the first or second antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof is derived from a pathogen or tumor.
Вариант осуществления 41 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 38, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 39 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 40, где первый или второй антигенный белок или его иммуногенный полипептид происходит из вируса.Embodiment 41 is the method of Embodiment 38, the combination of Embodiment 39, or the use of Embodiment 40, wherein the first or second antigenic protein or immunogenic polypeptide thereof is derived from a virus.
Вариант осуществления 42 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 37, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 38 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 39, где первый или второй антигенный белок происходит из RSV-preF белка, и где первый и второй антигенные белки являются идентичными или по существу идентичными.Embodiment 42 is the method of Embodiment 37, the combination of Embodiment 38, or the use of Embodiment 39, wherein the first or second antigenic protein is derived from RSV-preF protein, and wherein the first and second antigenic proteins are identical or substantially identical.
Вариант осуществления 43 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 37, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 38 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 39, где первый и второй антигенные белки, каждый независимо, включают аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, их иммуногенные полипептиды и их комбинации.Embodiment 43 is the method of Embodiment 37, the combination of Embodiment 38, or the use of Embodiment 39, wherein the first and second antigenic proteins each independently comprise an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, immunogenic polypeptides thereof and combinations thereof.
Вариант осуществления 44 представляет собой способ в соответствии с Вариантом осуществления 37, комбинацию в соответствии с Вариантом осуществления 38 или применение в соответствии с Вариантом осуществления 39, где первая композиция включает иммунологически эффективное количество IVT репРНК, имеющей последовательность SEQ ID NO: 3, а вторая композиция включает иммунологически эффективное количество Ad26 вектора, включающего полинуклеотид, кодирующий антигенный белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1.Embodiment 44 is the method of Embodiment 37, the combination of Embodiment 38, or the use of Embodiment 39, wherein the first composition comprises an immunologically effective amount of an IVT repRNA having the sequence SEQ ID NO: 3, and the second composition comprises an immunologically effective amount of an Ad26 vector comprising a polynucleotide encoding an antigenic protein having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
Вариант осуществления 45 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 37-44, комбинацию в соответствии с любым из Вариантов осуществления 38-44 или применение в соответствии с любым из Вариантов осуществления 39-44, где вторую композицию вводят субъекту-человеку через 2-12 недель, предпочтительно через 4-8 недель, после введения первой композиции.Embodiment 45 is a method in accordance with any of Embodiments 37-44, a combination in accordance with any of Embodiments 38-44, or a use in accordance with any of Embodiments 39-44, wherein the second composition is administered to a human subject after 2 -12 weeks, preferably 4-8 weeks, after administration of the first composition.
Вариант осуществления 46 представляет собой способ в соответствии с любым из Вариантов осуществления 38 или 41-45, комбинацию в соответствии с любым из Вариантов осуществления 39 или 4145 или применение в соответствии с любым из Вариантов осуществления 40-45, где первую композицию формулируют в виде композиции липо-наночастиц.Embodiment 46 is a method according to any of Embodiments 38 or 41-45, a combination according to any of Embodiments 39 or 4145, or a use according to any of Embodiments 40-45, wherein the first composition is formulated as a composition lipo-nanoparticles.
ПримерыExamples
Следующие примеры представлены для иллюстрации, а не для ограничения заявленного изобретения.The following examples are presented for illustration and not as limitation of the claimed invention.
Пример 1.Example 1.
Исследование на животных осуществляли с целью изучения потенциала гомологичных прайм-буст иммунизации вакцинами на основе репРНК, кодирующими модельный антиген. Модельный антиген, который использовали, представлял собой F-белок до слияния из респираторно-синцитиального вируса (RSV-preF). В исследовании испытывали диапазон доз гомологичных вакцинаций с интервалом между иммунизациями 4 недели.An animal study was carried out to investigate the potential of homologous prime-boost immunization with repRNA-based vaccines encoding a model antigen. The model antigen used was the prefusion F protein from respiratory syncytial virus (RSV-preF). The study tested a range of doses of homologous vaccinations with an interval of 4 weeks between immunizations.
Манипуляции с животными.Manipulations with animals.
Исследования соответствовали всем применимым разделам окончательных положений Закона о благополучии животных (9 CFR, части 1, 2 и 3) и Руководства по уходу и использованию лабораторныхThe studies complied with all applicable sections of the final regulations of the Animal Welfare Act (9 CFR parts 1, 2, and 3) and the Guide for the Care and Use of Laboratory Laboratory Equipment.
- 19 043316 животных - National Academy Press, Washington D.C. Восьмое издание (Руководство).- 19 043316 animals - National Academy Press, Washington D.C. Eighth Edition (Manual).
Закупали в общей сложности 30 (6-недельных) самок Balb/c мышей у Jackson laboratories.A total of 30 (6-week-old) female Balb/c mice were purchased from Jackson laboratories.
Материалы для вакцин.Materials for vaccines.
IVT репРНК вакцинный вектор, который использовали, схематически представлен на фиг. 1. IVT репРНК вектор состоял из двух открытых рамок считывания (ORF), где первая кодировала неструктурные белки (NSPs) вируса венесуэльского энцефалита лошадей (VEE), а вторая кодировала RSV-preF белок. IVT репРНК вектор получали с использованием способами in vitro транскрипции (IVT) и очистки. Вкратце, линейную матричную ДНК для in vitro транскрипции T7 получали путем расщепления репликон-несущей ДНК плазмиды 5' промотора T7 и 3' поли-A хвоста. Расщепленный продукт очищали с использованием набора Zymo DNA Clean & Concentrator®-25. IVT репРНК получали с использованием набора для транскрипции T7 Ambion MEGAscript™ (Thermo) с последующей стадией очистки методом ВЭЖХ с использованием колонки GE CaptoCore 700 Hi Screen для удаления компонентов буфера, свободных NTP и белков. После очистки IVT репРНК кэппировали с использованием посттранскрипционной ферментативной реакции кэппирования, используя набор для кэппирования от Cellscript, после этого РНК концентрировали в концентраторе-центрифуге и осуществляли буферный обмен до конечной концентрации 1-5 мкг/мкл. Композицию репРНК в липидных наночастицах (LNP) получали способом разведения в этаноле. Холестерин получали от Sigma-Aldrich, a 1,2-диолеоил-3-триметиламмоний-пропан (DOTAP), 1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолин (DSPC) и 1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфоэтанол амин-N-[метокси(πолиэтиленгликоль)-2000] (DSPE-PEG) получали от Avanti Polar Lipids. Липидные компоненты (в этаноле) при 48:40:10:2 молярных процентов холестерин:DOTAP:DSPC:DSPE-PEG смешивали с репРНК в 10 мМ цитратного буфера с использованием 8:1 молярного соотношения N:P (азот на DOTAP к фосфату на РНК). После эмульгирования в течение 1 часа частицы диализовали против PBS. Перед in vivo инъекциями частицы дополнительно разбавляли до требуемой концентрации РНК в PBS.The IVT repRNA vaccine vector that was used is shown schematically in FIG. 1. The IVT repRNA vector consisted of two open reading frames (ORFs), where the first encoded the nonstructural proteins (NSPs) of the Venezuelan equine encephalitis virus (VEE) and the second encoded the RSV-preF protein. The IVT repRNA vector was prepared using in vitro transcription (IVT) and purification methods. Briefly, linear template DNA for in vitro transcription of T7 was prepared by digestion of the replicon-carrying plasmid DNA of the 5′ T7 promoter and 3′ poly-A tail. The digested product was purified using the Zymo DNA Clean & Concentrator®-25 kit. IVT repRNA was prepared using the T7 Ambion MEGAscript™ Transcription Kit (Thermo) followed by an HPLC purification step using a GE CaptoCore 700 Hi Screen column to remove buffer components, free NTPs, and proteins. Following IVT purification, repRNA was capped using a post-transcriptional enzymatic capping reaction using a capping kit from Cellscript, and the RNA was concentrated in a centrifuge concentrator and buffer exchanged to a final concentration of 1-5 μg/μl. The composition of repRNA in lipid nanoparticles (LNP) was prepared by dilution in ethanol. Cholesterol was obtained from Sigma-Aldrich, a 1,2-dioleoyl-3-trimethylammonium-propane (DOTAP), 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DSPC) and 1,2-distearoyl-sn-glycero- 3-phosphoethanol amine-N-[methoxy(πpolyethylene glycol)-2000] (DSPE-PEG) was obtained from Avanti Polar Lipids. Lipid components (in ethanol) at 48:40:10:2 molar percent cholesterol:DOTAP:DSPC:DSPE-PEG were mixed with repRNA in 10 mM citrate buffer using an 8:1 molar N:P ratio (nitrogen on DOTAP to phosphate on RNA). After emulsification for 1 hour, the particles were dialyzed against PBS. Before in vivo injections, the particles were further diluted to the required RNA concentration in PBS.
IVT репРНК экспрессировала VEE вирусные репликазы и антигенный RSV-preF белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2. Последовательность матричной ДНК, используемая для получения IVT репРНК, имела нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 3.The IVT repRNA expressed VEE viral replicases and the antigenic RSV-preF protein having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. The template DNA sequence used to produce the IVT repRNA had the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3.
Вакцинация и план эксперимента.Vaccination and experimental design.
Balb/c мышей вакцинировали в соответствии со схемой гомологичной прайм-буст иммунизации с использованием репРНК (разделение на группы и план эксперимента см. в табл. 1 и на фиг. 2). Перед иммунизацией каждую мышь анестезировали 1-4% изофлураном в кислороде с использованием наркозного аппарата для грызунов, и животные получали внутримышечные (в/м) инъекции сформулированной в липидных наночастицах(LNP) репРНК (50 мкл). Примирующие и бустерные дозы вводили с 4недельным интервалом (фиг. 2).Balb/c mice were vaccinated according to a homologous prime-boost immunization schedule using repRNA (for division into groups and experimental design, see Table 1 and Fig. 2). Before immunization, each mouse was anesthetized with 1–4% isoflurane in oxygen using a rodent anesthesia machine, and the animals received intramuscular (IM) injections of lipid nanoparticle (LNP)-formulated repRNA (50 μL). Priming and booster doses were administered at 4-week intervals (Fig. 2).
Цельную кровь без антикоагулянта обрабатывали для получения сыворотки.Whole blood without anticoagulant was processed to obtain serum.
Каждую сыворотку анализировали в RSV preF-специфическом ELISA.Each serum was analyzed in an RSV preF-specific ELISA.
Таблица 1Table 1
Разделение животных на группы в эксперименте гомологичной репРНК иммунизации для исследования гуморальных ответовSeparation of animals into groups in a homologous repRNA immunization experiment to study humoral responses
ELISA анализ анти-RSV-F IgG.Anti-RSV-F IgG ELISA assay.
RSV-F-специфические гуморальные ответы определяли через 28 и 42 дней после иммунизации с использованием модифицированного твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA), как описано ранее в Krarup et al. (A highly stable prefusion RSV F vaccine derived from structural analysis of the fusion mechanism. Nat. Commun. 6:8143).RSV-F-specific humoral responses were determined 28 and 42 days after immunization using a modified enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) as previously described by Krarup et al. (A highly stable prefusion RSV F vaccine derived from structural analysis of the fusion mechanism. Nat. Commun. 6:8143).
Вкратце, MaxiSorp полистирольные 96-луночные планшеты (NUNC) покрывали человеческим антиRSV F моноклональным антителом (Synagis) в течение ночи при 4°C при концентрации 1 мкг/мл в PBS. На следующий день планшеты промывали промывочным буфером PBST (PBS, 0,05% Tween) и блокировали в PBS раствором 1% бычьего сывороточного альбумина с последующей инкубацией со стабилизированным F-белком до слияния (0,25 мкг/мл в PBST), который захватывался иммобилизованными антиRSV F антителами.Briefly, MaxiSorp polystyrene 96-well plates (NUNC) were coated with human anti-RSV F monoclonal antibody (Synagis) overnight at 4°C at a concentration of 1 μg/ml in PBS. The next day, plates were washed with PBST wash buffer (PBS, 0.05% Tween) and blocked in PBS with 1% bovine serum albumin, followed by incubation with stabilized prefusion F protein (0.25 μg/ml in PBST), which was captured immobilized anti-RSV F antibodies.
Образцы сыворотки разбавляли в PBST раствором 1% бычьего сывороточного альбумина и инкубировали с конъюгатом козлиное-антимышиное-IgG-HRP от Bio-Rad (1/5000 разведение в PBST) и образцы затем инкубировали в лунках для обеспечения возможности детекции RSV-F специфического мышиного IgG. OPD субстрат использовали для детекции. Все инкубации осуществляли при комнатнойSerum samples were diluted in PBST with 1% bovine serum albumin and incubated with goat anti-mouse IgG-HRP conjugate from Bio-Rad (1/5000 dilution in PBST) and samples were then incubated in wells to allow detection of RSV-F specific mouse IgG . OPD substrate was used for detection. All incubations were carried out at room temperature
- 20 043316 температуре в течение 1 часа. После каждой стадии планшеты промывали три раза PBST. Результаты анализа ELISA показаны на фиг. 3. Примирующие иммунизации с дозами 0,4 мкг или выше приводили к гуморальным иммунным ответам, имеющим определяемые титры IgG, а гомологичная бустериммунизация приводила только к очень незначительному повышению титров IgG (перекрестная доза).- 20 043316 temperature for 1 hour. After each step, the plates were washed three times with PBST. The results of the ELISA assay are shown in FIG. 3. Priming immunizations with doses of 0.4 μg or higher resulted in humoral immune responses having detectable IgG titers, and homologous boosting immunizations resulted in only a very slight increase in IgG titers (cross-dose).
Пример 2.Example 2.
Для исследования клеточных ответов после гомологичной репРНК бустер-иммунизации осуществляли испытание на животных, в котором спленоциты анализировали методом ELISPOT с использованием RSV-F специфического пептида.To examine cellular responses following homologous repRNA boost immunization, an animal test was performed in which splenocytes were analyzed by ELISPOT using an RSV-F specific peptide.
Манипуляции с животными.Manipulations with animals.
Исследования соответствовали всем применимым разделам окончательных положений Закона о благополучии животных (9 CFR, части 1, 2 и 3) и Руководства по уходу и использованию лабораторных животных - National Academy Press, Washington D.C. Восьмое издание (Руководство).The studies complied with all applicable sections of the final regulations of the Animal Welfare Act (9 CFR parts 1, 2, and 3) and the Guide for the Care and Use of Laboratory Animals - National Academy Press, Washington D.C. Eighth Edition (Manual).
Самок Balb/c мышей (6-недельных) закупали у Jackson laboratories.Female Balb/c mice (6 weeks old) were purchased from Jackson laboratories.
Материалы для вакцин.Materials for vaccines.
IVT репРНК получали и формулировали, как описано в Примере 1.IVT repRNA was prepared and formulated as described in Example 1.
Вакцинация и план эксперимента.Vaccination and experimental design.
Balb/c мышей вакцинировали в соответствии со схемой гомологичной прайм-буст иммунизации с использованием репРНК (разделение на группы и план эксперимента см. в табл. 2 и на фиг. 4). Перед иммунизацией каждую мышь анестезировали 1-4% изофлураном в кислороде с использованием наркозного аппарата для грызунов, и животные получали внутримышечные (в/м) инъекции сформулированной в липидных наночастицах(LNP) репРНК (50 мкл). Примирующие и бустерные дозы вводили с 4недельным интервалом (фиг. 4).Balb/c mice were vaccinated according to a homologous prime-boost immunization schedule using repRNA (for division into groups and experimental design, see Table 2 and Fig. 4). Before immunization, each mouse was anesthetized with 1–4% isoflurane in oxygen using a rodent anesthesia machine, and the animals received intramuscular (IM) injections of lipid nanoparticle (LNP)-formulated repRNA (50 μl). Priming and booster doses were administered at 4-week intervals (Fig. 4).
Через 6 недель всех мышей умерщвляли для получения спленоцитов для исследования в IFN-g ELISPOT анализе с использованием анализа RSV-F специфического CTL пептида KYKNAVTEL.After 6 weeks, all mice were sacrificed to obtain splenocytes for testing in the IFN-γ ELISPOT assay using the RSV-F specific CTL peptide KYKNAVTEL assay.
Таблица 2table 2
Разделение животных на группы для гомологичной репРНК иммунизации (в/м) для исследования клеточных ответовDividing animals into groups for homologous repRNA immunization (i.m.) to study cellular responses
ELISPOT Анализ IFN-g.ELISPOT IFN-g Assay.
RSV-F-специфические клеточные иммунные ответы с использованием спленоцитов определяли в точке времени, показанной на фиг. 4, интерферон-гамма иммуноферментным спот-анализом (ELISPOT) с использованием IFNy ELISPOT набора для мышиных клеток от BD. Вкратце, 500000 спленоцитов на лунку стимулировали в течение ночи CTL-активирующим RSV-F пептидом (KYKNAVTEL) при конечной концентрации 1 мкг/мл. Затем пятна проявляли, следуя инструкциям изготовителя, прилагаемым к набору. Результаты ELISPOT анализа показаны на фиг. 5, и они показывают, что клеточные ответы только незначительно усиливались (без статистической значимости) после бустер-иммунизации.RSV-F-specific cellular immune responses using splenocytes were determined at the time point shown in FIG. 4, interferon-gamma enzyme-linked immunosorbent spot (ELISPOT) assay using the IFNy ELISPOT kit for mouse cells from BD. Briefly, 500,000 splenocytes per well were stimulated overnight with CTL-activating RSV-F peptide (KYKNAVTEL) at a final concentration of 1 μg/ml. The stains were then developed following the manufacturer's instructions included with the kit. The results of the ELISPOT analysis are shown in FIG. 5 and they show that cellular responses were only slightly enhanced (without statistical significance) after boost immunization.
Пример 3.Example 3.
Из-за отсутствия бустерного потенциала IVT репРНК вакцины в гомологичном прайм-буст режиме испытание на животных осуществляли с целью исследования потенциала гетерологичных прайм-буст иммунизации с вакцинами на основе репРНК в комбинации с вакцинами на аденовирусной основе, которые обе кодируют модельный антиген. В частности, в исследовании испытывали две гетерологичные вакцинации, включающие репРНК и Ad26-RSV-F с интервалом между иммунизациями 4 недели, для определения, может ли гетерологичная прайм-буст вакцинация улучшать гуморальный или клеточный иммунные ответы по сравнению с гомологичной репРНК вакцинацией Примеров 1 и 2.Due to the lack of boosting potential of IVT repRNA vaccines in a homologous prime-boost mode, animal testing was performed to investigate the potential of heterologous prime-boost immunizations with repRNA-based vaccines in combination with adenoviral-based vaccines, which both encode a model antigen. Specifically, the study tested two heterologous vaccinations comprising repRNA and Ad26-RSV-F with an interval of 4 weeks between immunizations to determine whether the heterologous prime-boost vaccination could improve humoral or cellular immune responses compared to the homologous repRNA vaccination of Examples 1 and 2.
Манипуляции с животными.Manipulations with animals.
Исследования соответствовали всем применимым разделам окончательных положений Закона о благополучии животных (9 CFR, части 1, 2 и 3) и Руководства по уходу и использованию лабораторных животных - National Academy Press, Washington D.C. Восьмое издание (Руководство).The studies complied with all applicable sections of the final regulations of the Animal Welfare Act (9 CFR parts 1, 2, and 3) and the Guide for the Care and Use of Laboratory Animals - National Academy Press, Washington D.C. Eighth Edition (Manual).
В общей сложности 36 самок Balb/c мышей (6-недельных) закупали у Jackson laboratories.A total of 36 female Balb/c mice (6 weeks old) were purchased from Jackson laboratories.
Материалы для вакцин.Materials for vaccines.
IVT репРНК получали и формулировали, как описано в Примере 1.IVT repRNA was prepared and formulated as described in Example 1.
Рекомбинантный аденовирусный вектор, который представлял собой вакцинный вектор на основе очищенного E1/E3-делетированного дефицитного по репликации рекомбинантного аденовируса типа 26 (Ad26), содержащий RSV-F ген, встроенный в положении E1, был изготовлен Janssen R&D. Вектор сохраняли в PER.C6™ клетках, очищали от бляшек, масштабировали и затем очищали с использованиемThe recombinant adenoviral vector, which was a vaccine vector based on purified E1/E3-deleted replication-deficient recombinant adenovirus type 26 (Ad26), containing the RSV-F gene inserted at the E1 position, was manufactured by Janssen R&D. The vector was maintained in PER.C6™ cells, plaque purified, scaled up and then purified using
- 21 043316 двухстадийной процедуры CsCl-связывания, а затем формулировали в рецептурном буфере на основе- 21 043316 two-step CsCl-coupling procedure and then formulated in a formulation buffer based on
TRIS и хранили при температуре ниже -65°C.TRIS and stored below -65°C.
Рекомбинантный аденовирусный вектор экспрессировал RSV-F, происходящий из штамма RSV-A2.The recombinant adenoviral vector expressed RSV-F derived from the RSV-A2 strain.
Экспрессированный RSV-F белок имел аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1.The expressed RSV-F protein had the amino acid sequence SEQ ID NO: 1.
Материалы для вакцин хранили при -80°C в морозильнике с контролируемой температурой.Vaccine materials were stored at -80°C in a temperature-controlled freezer.
Вакцинация и план эксперимента.Vaccination and experimental design.
Balb/c мышей вакцинировали, используя схему гетерологичной прайм-буст иммунизации, с использованием репРНК и Адено-вектора (разделение на группы и план эксперимента см. в табл. 3 и на фиг. 6). Перед иммунизацией каждую мышь анестезировали, и животные получали внутримышечные (в/м) инъекции Адено-вектора или сформулированной в липидных наночастицах (LNP) репРНК (как описано в Примере 1) в верхнюю часть бедра. Примирующие и бустерные дозы вводили с 4-недельным интервалом (Фиг. 6).Balb/c mice were vaccinated using a heterologous prime-boost immunization scheme using repRNA and Adeno-vector (for division into groups and experimental design, see Table 3 and Fig. 6). Before immunization, each mouse was anesthetized and the animals received intramuscular (IM) injections of Adeno-vector or lipid nanoparticle (LNP) repRNA (as described in Example 1) into the upper thigh. Primer and booster doses were administered at 4-week intervals (Figure 6).
Исследование на животных осуществляли для определения, может ли гетерологичная прайм-буст вакцинация с использованием репРНК и Ad26-RSV-F улучшать гуморальный или клеточный иммунные ответы (разделение мышей на группы см. в табл. 3, а план эксперимента см. на фиг. 6) в отличие от гомологичной репРНК вакцинации, как продемонстрировано Примерами 1 и 2. Все иммунизации осуществляли внутримышечно. Три контрольные группы мышей получали только примирующие иммунизации (в/м) с использованием либо PBS, LNP-сформулированной репРНК (1 мкг), либо Ad26-RSV-F (1 х 109 vp). Потенциал гетерологичных прайм-буст иммунизации испытывали в двух дополнительных группах мышей. Одной группе из 8 мышей вводили LNP-сформулированную репРНК (1 мкг) в качестве примирующей иммунизации и через 4 недели вводили бустер-иммунизацию Ad26-RSV-F (1х109 vp). Другой группе из 8 мышей вводили Ad26-RSV-F (1х109 VP) в качестве примирующей иммунизации с последующией бустер-иммунизацией через 4 недели с LNP-сформулированной репРНК (1 мкг).An animal study was performed to determine whether heterologous prime-boost vaccination using repRNA and Ad26-RSV-F could improve humoral or cellular immune responses (see Table 3 for mice grouping and Fig. 6 for experimental design). ) in contrast to homologous repRNA vaccination, as demonstrated by Examples 1 and 2. All immunizations were performed intramuscularly. Three control groups of mice received only priming immunizations (IM) with either PBS, LNP-formulated repRNA (1 μg), or Ad26-RSV-F (1 x 10 9 vp). The potential of heterologous prime-boost immunizations was tested in two additional groups of mice. One group of 8 mice received LNP-formulated repRNA (1 μg) as a priming immunization and 4 weeks later received a boost immunization with Ad26-RSV-F (1x10 9 vp). Another group of 8 mice received Ad26-RSV-F (1x10 9 VP) as a primer, followed by a boost 4 weeks later with LNP-formulated repRNA (1 μg).
Таблица 3Table 3
Разделение животных на группы в эксперименте для исследования гетерологичной иммунизацииDividing animals into groups in an experiment to study heterologous immunization
ELISA анализ анти-RSV-F IgG.Anti-RSV-F IgG ELISA assay.
RSV-F-специфические гуморальные ответы определяли через 42 дня после иммунизации методом ELISA для определения анти-RSV-F IgG, как описано в Примере 1. Результаты анализа ELISA показаны на фиг. 7. Гетерологичные прайм-буст иммунизации с использованием репРНК и аденовирусного вектора приводили к гуморальным иммунным ответам, имеющим повышенные титры IgG, по сравнению с гомологичными иммунизациями с использованием репРНК или аденовирусного вектора.RSV-F-specific humoral responses were determined 42 days after immunization by an anti-RSV-F IgG ELISA as described in Example 1. The results of the ELISA assay are shown in FIG. 7. Heterologous prime-boost immunizations using repRNA and an adenoviral vector resulted in humoral immune responses having increased IgG titers compared with homologous immunizations using repRNA or an adenoviral vector.
ELISPOT Анализ IFN-γ.ELISPOT IFN-γ Assay.
RSV-F-специфические клеточные (спленоциты) иммунные ответы определяли через 42 дня после иммунизации при помощи интерферон-гамма ELISPOT анализа, как описано в Примере 2. Результаты ELISPOT анализа показаны на фиг. 8. Гетерологичные прайм-буст иммунизации с использованием репРНК и аденовирусного вектора приводили к повышенным клеточным иммунным ответам по сравнению с только примирующими иммунизациями с использованием репРНК или аденовирусного вектора.RSV-F-specific cellular (splenocyte) immune responses were determined 42 days after immunization using an interferon-gamma ELISPOT assay as described in Example 2. The results of the ELISPOT assay are shown in FIG. 8. Heterologous prime-boost immunizations using repRNA and adenoviral vector resulted in enhanced cellular immune responses compared with prime-boost immunizations using repRNA or adenoviral vector alone.
Таким образом, исследование продемонстрировало, что усиление гуморального и клеточного иммунного ответа было индуцировано иммунизацией гетерологичными вакцинами на основе репРНК и аденовирусных векторов по сравнению с гомологичными иммунизациями с использованием только репРНК или только аденовирусного вектора.In summary, the study demonstrated that enhanced humoral and cellular immune responses were induced by immunization with heterologous repRNA and adenoviral vector vaccines compared with homologous immunizations with repRNA alone or adenoviral vector alone.
Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что возможны изменения описанных выше вариантов осуществления без отступления от их широкого изобретательского замысла. Поэтому должно быть понятно, что настоящее изобретение не ограничивается конкретными раскрытыми вариантами осуществления, но предполагается, что оно охватывает модификации в пределах сущности и объема настоящего изобретения, как определено в прилагаемой формуле изобретения.It will be appreciated by those skilled in the art that modifications to the embodiments described above are possible without departing from their broad inventive spirit. Therefore, it should be understood that the present invention is not limited to the specific embodiments disclosed, but is intended to cover modifications within the spirit and scope of the present invention as defined in the appended claims.
--
Claims (14)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62/538,070 | 2017-07-28 | ||
US62/546,259 | 2017-08-16 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA043316B1 true EA043316B1 (en) | 2023-05-12 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11964007B2 (en) | Methods and compositions for heterologous repRNA immunizations | |
Pushparajah et al. | Advances in gene-based vaccine platforms to address the COVID-19 pandemic | |
Mendonça et al. | Adenoviral vector vaccine platforms in the SARS-CoV-2 pandemic | |
Park et al. | Non-viral COVID-19 vaccine delivery systems | |
Zhao et al. | COVID-19: coronavirus vaccine development updates | |
AU2003297039B2 (en) | Multi-antigenic alphavirus replicon particles and methods | |
Liu | DNA vaccines: an historical perspective and view to the future | |
AU2007296489B2 (en) | Alphavirus replicon particles matched to protein antigens as immunological adjuvants | |
Wang et al. | Viral vectored vaccines: design, development, preventive and therapeutic applications in human diseases | |
EP2066346B1 (en) | Alphavirus replicon particles encoding il-12 as immunological adjuvants | |
US11229692B2 (en) | Methods and compositions for inducing protective immunity against RSV infection | |
Chang et al. | Polyplex nanomicelle delivery of self-amplifying RNA vaccine | |
Khare et al. | SARS-CoV-2 vaccines: types, working principle, and its impact on thrombosis and gastrointestinal disorders | |
EA043316B1 (en) | METHODS AND COMPOSITIONS FOR HETEROLOGICAL repRNA IMMUNIZATIONS | |
WO2022266511A9 (en) | Temperature-controllable, self-replicating rna vaccines for viral diseases | |
WO2024092346A1 (en) | Binary self-amplifying nucleic acid platform and uses thereof | |
WO2018210871A1 (en) | Methods and compositions for inducing protective immunity against rsv infection | |
Matthews et al. | 210. A Comparative Study of Non-Integrating and Integrating Lentiviral Vectors in Eliciting an Effective Immune Response Against Hepatitis B Surface Antigen in Mice | |
Zajakina et al. | 20 Alphaviruses: Multiplicity of Vectors and Their Promising Application as Vaccines and Cancer Therapy Agents | |
Choi | Modeling pre-existing immunity to adenovirus as a method to identify novel formulations for a protective Ebola vaccine |