EA042529B1 - ANTIBODY TO CCR7 AND DRUG CONJUGATES - Google Patents
ANTIBODY TO CCR7 AND DRUG CONJUGATES Download PDFInfo
- Publication number
- EA042529B1 EA042529B1 EA201991763 EA042529B1 EA 042529 B1 EA042529 B1 EA 042529B1 EA 201991763 EA201991763 EA 201991763 EA 042529 B1 EA042529 B1 EA 042529B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- antibody
- seq
- antigen
- drug
- ccr7
- Prior art date
Links
Description
Перечень последовательностейSequence listing
Настоящая заявка содержит перечень последовательностей, который был подан в электронном виде в формате ASCII и тем самым включен посредством ссылки во всей своей полноте. Указанная ASCIIкопия, созданная 10 января 2018 г., имеет название PAT057594-WO-PCT_SL.txt и размер 387054 байта.This application contains a sequence listing that has been filed electronically in ASCII format and is hereby incorporated by reference in its entirety. The specified ASCII copy, created on January 10, 2018, is named PAT057594-WO-PCT_SL.txt and is 387054 bytes in size.
Область техники, к которой относится изобретениеThe field of technology to which the invention belongs
Настоящее изобретение относится к антителам к CCR7, фрагментам антител и их иммуноконъюгатам, а также путям их применения для лечения или предупреждения рака.The present invention relates to antibodies to CCR7, antibody fragments and their immunoconjugates, as well as ways of using them for the treatment or prevention of cancer.
Предпосылки изобретенияBackground of the invention
СС-хемокиновый рецептор 7 (CCR7) впервые был идентифицирован в 1993 году в качестве специфического для лимфоцитов рецептора (см., например, Birkenbach et al., J Virol. 1993 Apr; 67(4):2209-20). Его экспрессия ограничена субпопуляциями иммунных клеток, таких как наивные Т-клетки, Т-клетки центральной памяти (Tcm), регуляторные Т-клетки (Treg), наивные В-клетки, NK-клетки и зрелые антигенпрезентирующие дендритные клетки (DC). CCR7 регулирует хоминг иммунных клеток в лимфоидные органы и миграцию в пределах них и, таким образом, играет ключевую роль в балансе иммунитета и переносимости (см., например, Forster et al., Nat Rev Immunol. 2008 May;8(5):362-71).CC chemokine receptor 7 (CCR7) was first identified in 1993 as a lymphocyte-specific receptor (see, for example, Birkenbach et al., J Virol. 1993 Apr; 67(4):2209-20). Its expression is limited to immune cell subpopulations such as naive T cells, central memory T cells (T cm ), regulatory T cells (T reg ), naive B cells, NK cells and mature antigen presenting dendritic cells (DC). CCR7 regulates immune cell homing to and migration within lymphoid organs and thus plays a key role in the balance of immunity and tolerance (see, e.g., Forster et al., Nat Rev Immunol. 2008 May;8(5):362 -71).
CCR7 представляет собой родопсин-подобный рецептор, сопряженный с G-белком (GPCR), класса А с двумя лигандами, CCL21 и CCL19. Структура CCR7 еще не полностью выяснена, однако, были обнаружены некоторые мотивы, необходимые для активности рецептора (см., например, Legler et al., Int J Biochem Cell Biol. 2014 Jul 1).CCR7 is a class A rhodopsin-like G protein coupled receptor (GPCR) with two ligands, CCL21 and CCL19. The structure of CCR7 is not yet fully elucidated, however, several motifs required for receptor activity have been discovered (see, for example, Legler et al., Int J Biochem Cell Biol. 2014 Jul 1).
CCR7 и ракCCR7 and cancer
Также известно, что CCR7 (также называемый EBI1, BLR2, CC-CKR-7, CMKBR7, CD197 и CDw197) сверхэкспрессируется на целом ряде злокачественных опухолей, включая, среди прочего, Вклеточные злокачественные новообразования (например, CLL, MCL, лимфому Беркитта), Т-клеточные злокачественные новообразования (например, ATLL), HNSCC, ESCC, карциному желудка, NSCLC, колоректальную карциному, рак поджелудочной железы, рак щитовидной железы, рак молочной железы и рак шейки матки. Например, сверхэкспрессия CCR7 на клетках колоректальной карциномы, ESCC, рака поджелудочной железы, HNSCC и рака желудка была ассоциирована с поздней стадией опухоли, метастазированием в лимфатические узлы и неблагоприятным прогнозом в отношении выживания (см., например, Malietzis et al., Journal of Surgical Oncology 2015;112:86-92; Irino et al., BMC Cancer 2014, 14:291; Guo et al., Oncology Letters 5: 1572-1578, 2013; Xia et al., Oral Dis. 2015 Jan; 21(1):123-31; Du et al., Gastric Cancer. 2016 Mar 16).CCR7 (also referred to as EBI1, BLR2, CC-CKR-7, CMKBR7, CD197, and CDw197) is also known to be overexpressed on a variety of cancers, including but not limited to Intracellular malignancies (e.g., CLL, MCL, Burkitt's lymphoma), T cell malignancies (eg, ATLL), HNSCC, ESCC, gastric carcinoma, NSCLC, colorectal carcinoma, pancreatic cancer, thyroid cancer, breast cancer, and cervical cancer. For example, overexpression of CCR7 in colorectal carcinoma, ESCC, pancreatic cancer, HNSCC, and gastric cancer cells has been associated with late tumor stage, lymph node metastasis, and poor prognosis for survival (see, e.g., Malietzis et al., Journal of Surgical Oncology 2015;112:86-92; Irino et al., BMC Cancer 2014, 14:291; Guo et al., Oncology Letters 5: 1572-1578, 2013; Xia et al., Oral Dis. 2015 Jan; 21( 1):123-31; Du et al., Gastric Cancer. 2016 Mar 16).
Кроме того, было показано, например, что экспрессия CCR7 на клетках HNSCC играет роль в резистентности к химиотерапии (см., например, Wang et al., JNCI J Natl Cancer Inst (2008) 100 (7): 502-512). При некоторым типах рака, таких как рак поджелудочной железы и носоглоточная карцинома (NPC), как известно, CCR7 стимулирует метастазирование раковых стволовых клеток и образование сфер (см., например, Zhang et al., PLOS ONE 11 (8); Lun et al., PLOS ONE 7(12)). Роль CCR7 в миграции клеток, инвазивности и ЕМТ (эпителиально-мезенхимальном переходе) описана у различных типов рака, таких как рак молочной железы и поджелудочной железы in vitro и in vivo (см., например, Pang et al., Oncogene (2015), 1-13); Sperveslage et al., Int. J. Cancer: 131, E371-E381 (2012)). Ключевые пути, которые были описаны как необходимые для передачи сигнала с помощью CCR7, включают путь передачи сигнала p38/ERK1/2, опосредованный b-аррестином, и путь передачи сигнала Rho (см., например, Noor et al., J Neuroinflammation 2012 Apr. 25; 9:77).In addition, for example, CCR7 expression on HNSCC cells has been shown to play a role in resistance to chemotherapy (see, for example, Wang et al., JNCI J Natl Cancer Inst (2008) 100 (7): 502-512). In some types of cancer, such as pancreatic cancer and nasopharyngeal carcinoma (NPC), CCR7 is known to stimulate cancer stem cell metastasis and sphere formation (see, e.g., Zhang et al., PLOS ONE 11 (8); Lun et al. ., PLOS ONE 7(12)). The role of CCR7 in cell migration, invasiveness, and EMT (epithelial-mesenchymal transition) has been described in various types of cancer such as breast and pancreatic cancer in vitro and in vivo (see, for example, Pang et al., Oncogene (2015), 1-13); Sperveslage et al., Int. J. Cancer: 131, E371-E381 (2012)). Key pathways that have been described as required for CCR7 signaling include the b-arrestin-mediated p38/ERK1/2 signaling pathway and the Rho signaling pathway (see e.g. Noor et al., J Neuroinflammation 2012 Apr 25; 9:77).
Известны многочисленные сопряженные с раком процессы, которые индуцируют экспрессию CCR7. Показано, что при HNSCC экспрессия CCR7 индуцируется факторами транскрипции NF-kB и AP1 за счет прямого связывания с сайтами в промоторе CCR7 (Mburu et al., J. Biol. Chem. 2012, 287:35813590). В частности, экспрессия CCR7 регулируется различными факторами в микроокружении опухоли. В данном контексте, известно, что экспрессия CCR7 индуцируется за счет пути b-дефензин 3/NF-kB в HNSCC (см., например, Mburu et al., Carcinogenesis vol. 32 no. 2 pp.168-174, 2010) и рецептора А эндотелина и индуцируемого гипоксией фактора-1 в клетках опухоли молочной железы (см., например, Wilson et al., Cancer Res 2006; 66:11802-11807).Numerous cancer-associated processes are known to induce CCR7 expression. In HNSCC, CCR7 expression has been shown to be induced by transcription factors NF-kB and AP1 by direct binding to sites in the CCR7 promoter (Mburu et al., J. Biol. Chem. 2012, 287:35813590). In particular, CCR7 expression is regulated by various factors in the tumor microenvironment. In this context, it is known that CCR7 expression is induced by the b-defensin 3/NF-kB pathway in HNSCC (see e.g. Mburu et al., Carcinogenesis vol. 32 no. 2 pp. 168-174, 2010) and endothelin receptor A and hypoxia inducible factor-1 in breast tumor cells (see, for example, Wilson et al., Cancer Res 2006; 66:11802-11807).
Конъюгаты антитела и лекарственного средстваAntibody drug conjugates
Конъюгаты антитела и лекарственного средства (ADC) нашли применение в местной доставке цитотоксических средств при лечении рака (см., например, Lambert, Curr. Opinion In Pharmacology 5:543549, 2005). ADC обеспечивают возможность нацеленной доставки фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, при которой может достигаться максимальная эффективность при минимальной токсичности. ADC включают антитело, выбранное за его способность связываться с клеткой, на которую нацелено терапевтическое вмешательство, соединенное с лекарственным средством, выбранным за егоAntibody drug conjugates (ADCs) have found use in the local delivery of cytotoxic agents in the treatment of cancer (see, for example, Lambert, Curr. Opinion In Pharmacology 5:543549, 2005). ADCs allow targeted delivery of a drug moiety that can achieve maximum efficacy with minimum toxicity. ADCs include an antibody selected for its ability to bind to the cell targeted by the therapeutic intervention, coupled to a drug selected for its
- 1 042529 цитостатическую или цитотоксическую активность. Тем самым, при связывании антитела с целевой клеткой лекарственное средство доставляется в сайт, в котором требуется его терапевтический эффект.- 1 042529 cytostatic or cytotoxic activity. Thus, when the antibody binds to the target cell, the drug is delivered to the site where its therapeutic effect is required.
Для применения в ADC было раскрыто множество антител, которые распознают и селективно связываются с целевыми клетками, например, раковыми клетками. Несмотря на масштабную работу над ADC, связывания антитела с конкретной мишенью, представляющей интерес, недостаточно для предсказания успеха в применениях ADC. Примеры факторов, которые могут воздействовать на терапевтическую эффективность ADC (кроме особенностей, присущих мишени), включают различные аспекты, которые необходимо модифицировать путем тонкой настройки, такие как оптимальная аффинность антитела как баланс между мишень-опосредованным распределением (TMDD) и управляющим эффективностью воздействием, оценка Fc-опосредованных функций (антителозависимая клеточноопосредованная цитотоксичность, ADCC), способ конъюгации (сайт-специфическая или нет), отношение молекул лекарственного средства/полезной нагрузки у такого конъюгата с каждым антителом (DAR или соотношение лекарственного средства и антитела), расщепляемость или стабильность линкера, стабильность ADC и склонность ADC к образованию агрегатов.A variety of antibodies have been disclosed for use in ADCs that recognize and selectively bind to target cells, such as cancer cells. Despite extensive work on ADC, binding of an antibody to a particular target of interest is not sufficient to predict success in ADC applications. Examples of factors that can affect the therapeutic efficacy of an ADC (other than the inherent characteristics of the target) include various aspects that need to be modified by fine tuning, such as optimal antibody affinity as a balance between target-mediated distribution (TMDD) and performance-driven exposure, evaluation Fc-mediated functions (antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity, ADCC), conjugation method (site-specific or not), drug/payload ratio of such a conjugate with each antibody (DAR or drug-antibody ratio), linker cleavage or stability, the stability of the ADC; and the propensity of the ADC to form aggregates.
Остается потребность в антителах, способах прикрепления и цитотоксических полезных нагрузках с улучшенными свойствами для применения в качестве эффективных терапевтических композиций на основе ADC и способов, связанных с ними.There remains a need for antibodies, attachment methods, and improved cytotoxic payloads for use as effective ADC-based therapeutic compositions and methods associated therewith.
Краткое описание настоящего изобретенияBrief description of the present invention
В настоящей заявке раскрыты антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с белком CCR7 человека, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент характеризуются сниженной или незначительной эффекторной функцией по сравнению с антителом дикого типа того же изотипа. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент характеризуются сниженным или незначительным уровнем активности антителозависимой клеточноопосредованной цитотоксичности (ADCC). В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат молчащую область Fc. В некоторых вариантах осуществления антитело содержит в области Fc мутацию, выбранную из: D265A; Р329А; P329G; N297A; D265A и Р329А; D265A и N297A; L234 и L235A; Р329А, L234A и L235A; а также P329G, L234A и L235A. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент характеризуются незначительной активностью цитолиза клеток. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с большей аффинностью с клетками, экспрессирующими более высокие уровни CCR7, чем с клетками, экспрессирующими более низкие уровни CCR7. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с большей аффинностью с раковыми клетками, которые экспрессируют более высокие уровни CCR7, чем с нормальными клетками, которые экспрессируют более низкие уровни CCR7. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в незначительной степени истощают нормальные гемопоэтические клетки, которые экспрессируют CCR7.Disclosed herein is an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to human CCR7 protein, wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof has reduced or negligible effector function compared to a wild-type antibody of the same isotype. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, has a reduced or negligible level of antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) activity. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, comprises a silent Fc region. In some embodiments, the antibody contains in the Fc region a mutation selected from: D265A; R329A; P329G; N297A; D265A and P329A; D265A and N297A; L234 and L235A; P329A, L234A and L235A; as well as P329G, L234A and L235A. In one embodiment, the antibody or antigen-binding fragment has little cell cytolysis activity. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds with greater affinity to cells expressing higher levels of CCR7 than to cells expressing lower levels of CCR7. In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds with greater affinity to cancer cells that express higher levels of CCR7 than to normal cells that express lower levels of CCR7. In some embodiments, the antibody or antigen-binding fragment thereof slightly depletes normal hematopoietic cells that express CCR7.
В одном варианте осуществления настоящей заявки раскрыты антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связывают CCR7, содержащие:In one embodiment of the present application, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds CCR7 is disclosed, comprising:
a) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 (определяющая комплементарность область 1 тяжелой цепи) под SEQ ID NO: 1, HCDR2 (определяющая комплементарность область 2 тяжелой цепи) под SEQ ID NO: 2 и HCDR3 (определяющая комплементарность область 3 тяжелой цепи) под SEQ ID NO: 3; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 (определяющая комплементарность область 1 легкой цепи) под SEQ ID NO: 17, LCDR2 (определяющая комплементарность область 2 легкой цепи) под SEQ ID NO: 18 и LCDR3 (определяющая комплементарность область 3 легкой цепи) под SEQ ID NO: 19;a) a heavy chain variable region that contains HCDR1 (heavy chain complementarity determining region 1) of SEQ ID NO: 1, HCDR2 (heavy chain complementarity determining region 2) of SEQ ID NO: 2, and HCDR3 (heavy chain complementarity determining region 3) under SEQ ID NO: 3; and a light chain variable region which contains LCDR1 (light chain complementarity determining region 1) of SEQ ID NO: 17, LCDR2 (light chain complementarity determining region 2) of SEQ ID NO: 18, and LCDR3 (light chain complementarity determining region 3) of SEQ ID NO: 19;
b) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 4, HCDR2 под SEQ ID NO: 5 и HCDR3 под SEQ ID NO: 6; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 20, LCDR2 под SEQ ID NO: 21 и LCDR3 под SEQ ID NO: 22;b) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 4, HCDR2 of SEQ ID NO: 5, and HCDR3 of SEQ ID NO: 6; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 20, LCDR2 of SEQ ID NO: 21, and LCDR3 of SEQ ID NO: 22;
c) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 7, HCDR2 под SEQ ID NO: 8 и HCDR3 под SEQ ID NO: 9; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 23, LCDR2 под SEQ ID NO: 24 и LCDR3 под SEQ ID NO: 25;c) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 7, HCDR2 of SEQ ID NO: 8, and HCDR3 of SEQ ID NO: 9; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 23, LCDR2 of SEQ ID NO: 24, and LCDR3 of SEQ ID NO: 25;
d) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 10, HCDR2 под SEQ ID NO: 11 и HCDR3 под SEQ ID NO: 12; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 2 6, LCDR2 под SEQ ID NO: 27 и LCDR3 под SEQ ID NO: 28;d) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 10, HCDR2 of SEQ ID NO: 11, and HCDR3 of SEQ ID NO: 12; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 26, LCDR2 of SEQ ID NO: 27, and LCDR3 of SEQ ID NO: 28;
e) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 33, HCDR2 под SEQ ID NO: 34 и HCDR3 под SEQ ID NO: 35; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 49, LCDR2 под SEQ ID NO: 50 и LCDR3 под SEQ ID NO: 51;e) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 33, HCDR2 of SEQ ID NO: 34, and HCDR3 of SEQ ID NO: 35; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 49, LCDR2 of SEQ ID NO: 50, and LCDR3 of SEQ ID NO: 51;
f) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 36, HCDR2 под SEQ ID NO: 37 и HCDR3 под SEQ ID NO: 38; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 52, LCDR2 под SEQ ID NO: 53 и LCDR3 под SEQ ID NO: 54;f) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 36, HCDR2 of SEQ ID NO: 37, and HCDR3 of SEQ ID NO: 38; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 52, LCDR2 of SEQ ID NO: 53, and LCDR3 of SEQ ID NO: 54;
g) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 39, HCDR2 под SEQ ID NO: 40 и HCDR3 под SEQ ID NO: 41; и вариабельную область легкой цепи, которая содержитg) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 39, HCDR2 of SEQ ID NO: 40, and HCDR3 of SEQ ID NO: 41; and a light chain variable region that contains
- 2 042529- 2 042529
LCDR1 под SEQ ID NO: 55, LCDR2 под SEQ ID NO: 56 и LCDR3 под SEQ ID NO: 57;LCDR1 under SEQ ID NO: 55, LCDR2 under SEQ ID NO: 56 and LCDR3 under SEQ ID NO: 57;
h) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 42, HCDR2 подh) a heavy chain variable region that contains HCDR1 under SEQ ID NO: 42, HCDR2 under
SEQ ID NO: 43 и HCDR3 под SEQ ID NO: 44; и вариабельную область легкой цепи, которая содержитSEQ ID NO: 43 and HCDR3 under SEQ ID NO: 44; and a light chain variable region that contains
LCDR1 под SEQ ID NO: 58, LCDR2 под SEQ ID NO: 59 и LCDR3 под SEQ ID NO: 60;LCDR1 under SEQ ID NO: 58, LCDR2 under SEQ ID NO: 59 and LCDR3 under SEQ ID NO: 60;
i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 65, HCDR2 под SEQ ID NO: 66 и HCDR3 под SEQ ID NO: 67; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 81, LCDR2 под SEQ ID NO: 82 и LCDR3 под SEQ ID NO: 83;i) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 65, HCDR2 of SEQ ID NO: 66, and HCDR3 of SEQ ID NO: 67; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 81, LCDR2 of SEQ ID NO: 82, and LCDR3 of SEQ ID NO: 83;
j) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 68, HCDR2 под SEQ ID NO: 69 и HCDR3 под SEQ ID NO: 70; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 84, LCDR2 под SEQ ID NO: 85 и LCDR3 под SEQ ID NO: 86;j) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 68, HCDR2 of SEQ ID NO: 69, and HCDR3 of SEQ ID NO: 70; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 84, LCDR2 of SEQ ID NO: 85, and LCDR3 of SEQ ID NO: 86;
k) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 71, HCDR2 под SEQ ID NO: 72 и HCDR3 под SEQ ID NO: 73; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 87, LCDR2 под SEQ ID NO: 88 и LCDR3 под SEQ ID NO: 89;k) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 71, HCDR2 of SEQ ID NO: 72, and HCDR3 of SEQ ID NO: 73; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 87, LCDR2 of SEQ ID NO: 88, and LCDR3 of SEQ ID NO: 89;
l) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 74, HCDR2 под SEQ ID NO: 75 и HCDR3 под SEQ ID NO: 76; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 90, LCDR2 под SEQ ID NO: 91 и LCDR3 под SEQ ID NO: 92;l) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 74, HCDR2 of SEQ ID NO: 75, and HCDR3 of SEQ ID NO: 76; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 90, LCDR2 of SEQ ID NO: 91, and LCDR3 of SEQ ID NO: 92;
m) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 596, HCDR2 под SEQ ID NO: 597 и HCDR3 под SEQ ID NO: 598; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 612, LCDR2 под SEQ ID NO: 613 и LCDR3 под SEQ ID NO: 614;m) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 596, HCDR2 of SEQ ID NO: 597, and HCDR3 of SEQ ID NO: 598; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 612, LCDR2 of SEQ ID NO: 613, and LCDR3 of SEQ ID NO: 614;
n) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 599, HCDR2 под SEQ ID NO: 600 и HCDR3 под SEQ ID NO: 601; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 615, LCDR2 под SEQ ID NO: 616 и LCDR3 под SEQ ID NO: 617;n) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 599, HCDR2 of SEQ ID NO: 600, and HCDR3 of SEQ ID NO: 601; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 615, LCDR2 of SEQ ID NO: 616, and LCDR3 of SEQ ID NO: 617;
о) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 602, HCDR2 под SEQ ID NO: 603 и HCDR3 под SEQ ID NO: 604; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 618, LCDR2 под SEQ ID NO: 619 и LCDR3 под SEQ ID NO: 620; илиo) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 602, HCDR2 of SEQ ID NO: 603, and HCDR3 of SEQ ID NO: 604; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 618, LCDR2 of SEQ ID NO: 619, and LCDR3 of SEQ ID NO: 620; or
р) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 605, HCDR2 под SEQ ID NO: 606 и HCDR3 под SEQ ID NO: 607; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 621, LCDR2 под SEQ ID NO: 622 и LCDR3 под SEQ ID NO: 623.p) a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 605, HCDR2 of SEQ ID NO: 606, and HCDR3 of SEQ ID NO: 607; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 621, LCDR2 of SEQ ID NO: 622, and LCDR3 of SEQ ID NO: 623.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связывают CCR7 по настоящей заявке, также могут содержать:An antibody or antigen-binding fragment thereof that binds CCR7 of the present application may also contain:
a) вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 13, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 29;a) a heavy chain variable region (VH) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13 and a light chain variable region (VL) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 29;
b) вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 45, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 61;b) a heavy chain variable region (VH) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45 and a light chain variable region (VL) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
c) вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 77, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 93; илиc) a heavy chain variable region (VH) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 77 and a light chain variable region (VL) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 93; or
d) вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 608, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 624.d) a heavy chain variable region (VH) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 608 and a light chain variable region (VL) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 624.
В другом варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связывают CCR7, содержат:In another embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds CCR7 comprises:
a) тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 15, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 31;a) a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 31;
b) тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 47, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 63;b) a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
c) тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 79, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 95; илиc) a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 79 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 95; or
d) тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 610, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 626.d) a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 610 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 626.
Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, описанные в данном документе, могут содержать одну или несколько цистеиновых замен. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат одну или несколько цистеиновых замен, выбранных из S152C, S375C или обеих S152C и S375C, в тяжелой цепи антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, где нумерация положения соответствует системе EU. Антитело, раскрытое в данном документе, может представлять собой моноклональное антитело.An antibody or antigen-binding fragment thereof described herein may contain one or more cysteine substitutions. In one embodiment, the antibody or antigen-binding fragment thereof contains one or more cysteine substitutions selected from S152C, S375C, or both S152C and S375C, in the heavy chain of the antibody or antigen-binding fragment, where the position numbering follows the EU system. An antibody disclosed herein may be a monoclonal antibody.
В настоящей заявке раскрыт конъюгат антитела и лекарственного средства, предусматривающий формулуThe present application discloses an antibody-drug conjugate comprising the formula
Ab-(L-(D)m)n, или ее фармацевтически приемлемую соль;Ab-(L-(D)m)n, or a pharmaceutically acceptable salt thereof;
- 3 042529 где- 3 042529 where
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий антигенсвязывающий фрагмент, раскрытые в данном документе;Ab is an antibody, or an antigen-binding antigen-binding fragment thereof, as disclosed herein;
L представляет собой линкер;L is a linker;
D представляет собой фрагмент, представляющий собой лекарственное средство;D is a drug moiety;
m составляет целое число от 1 до 8 и n составляет целое число от 1 до 12.m is an integer from 1 to 8; and n is an integer from 1 to 12.
В некоторых вариантах осуществления m составляет 1. В одном варианте осуществления n составляет от приблизительно 3 до приблизительно 4. В одном варианте осуществления линкер выбран из группы, состоящей из расщепляемого линкера, нерасщепляемого линкера, гидрофильного линкера, предварительно заряженного линкера и линкера на основе дикарбоновой кислоты.In some embodiments, m is 1. In one embodiment, n is from about 3 to about 4. In one embodiment, the linker is selected from the group consisting of a cleavable linker, a non-cleavable linker, a hydrophilic linker, a precharged linker, and a dicarboxylic acid linker. .
В одном варианте осуществления линкер происходит из сшивающего реагента, выбранного из группы, состоящей изIn one embodiment, the linker is derived from a crosslinking agent selected from the group consisting of
N-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионата (SPDP),N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionate (SPDP),
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)пентаноата (SPP),N-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)pentanoate (SPP),
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутαноαта (SPDB),N-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)butαnoαta (SPDB),
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)-2-сульфобутаноата (сульфо-SPDB),N-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)-2-sulfobutanoate (sulfo-SPDB),
N-сукцинимидилйодацетата (SIA),N-succinimidyliodoacetate (SIA),
N-сукцинимидил(4-йодацетил)аминобензоαта (SIAB), малеимид-PEG-NHS,N-succinimidyl(4-iodoacetyl)aminobenzoαta (SIAB), maleimide-PEG-NHS,
N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилата (SMCC),N-succinimidyl-4-(maleimidomethyl)cyclohexanecarboxylate (SMCC),
N-сульфосукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилата (сульфо-SMCC) иN-sulfosuccinimidyl-4-(maleimidomethyl)cyclohexanecarboxylate (sulfo-SMCC) and
2,5-диоксопирролидин-1 -ил- 17-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1 Н-пиррол-1 -ил)-5,8,11,14-тетраоксо4,7,10,13 -тетраазагептадекан-1 -оата (СХ1-1).2,5-dioxopyrrolidin-1-yl-17-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1 H-pyrrol-1-yl)-5,8,11,14-tetraoxo4,7,10,13 -tetraazaheptadecan-1-oate (CX1-1).
В других вариантах осуществления линкер имеет следующую формулу (IIA):In other embodiments, the implementation of the linker has the following formula (IIA):
где * соединен с тиольной функциональной группой на антителе и ** соединен с тиольной функциональной группой фрагмента, представляющего собой лекарственное средство; и гдеwhere * is connected to the thiol functional group on the antibody and ** is connected to the thiol functional group of the fragment, which is a drug; and where
L1 представляет собой С1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 is C 1-6 alkylene, whereby one of the methylene groups may be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где y составляет от 1 до 11;L 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 -, where y is from 1 to 11;
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол; а алкилен является линейным или разветвленным.X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole; and alkylene is linear or branched.
В другом варианте осуществления линкер имеет следующую формулу:In another embodiment, the linker has the following formula:
где y составляет от 1 до 11;where y is from 1 to 11;
* соединен с тиольной функциональной группой на антителе, и ** соединен с тиольной функциональной группой фрагмента, представляющего собой лекарственное средство.* is linked to a thiol functional group on the antibody, and ** is linked to a thiol functional group on the drug moiety.
- 4 042529- 4 042529
В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, выбран из группы, состоящей из ингибитора V-АТФазы, проапоптического средства, ингибитора Bcl2, ингибитора MCL1, ингибитора HSP90, ингибитора IAP, ингибитора mTor, стабилизатора микротрубочек, дестабилизатора микротрубочек, ауристатина, аманитина, пирролобензодиазепина, ингибитора РНКполимеразы, доластатина, майтанзиноида, MetAP (метионинаминопептидазы), ингибитора ядерного экспорта белков CRM1, ингибитора DPPIV, ингибиторов протеасомы, ингибиторов реакций переноса фосфорила в митохондриях, ингибитора синтеза белка, ингибитора киназ, ингибитора CDK2, ингибитора CDK9, ингибитора кинезина, ингибитора HDAC, ДНК-повреждающего средства, ДНК-алкилирующего средства, ДНК-интеркалятора, средства, связывающего малую бороздку ДНК, и ингибитора DHFR. В некоторых вариантах осуществления цитотоксическое средство представляет собой майтанзиноид, где майтанзиноид представляет собойIn one embodiment, the drug moiety is selected from the group consisting of a V-ATPase inhibitor, a proapoptotic agent, a Bcl2 inhibitor, an MCL1 inhibitor, an HSP90 inhibitor, an IAP inhibitor, an mTor inhibitor, a microtubule stabilizer, a microtubule destabilizer, auristatin, amanitin, Pyrrolobenzodiazepine, RNA polymerase inhibitor, dolastatin, maytansinoid, MetAP, CRM1 nuclear export inhibitor, DPPIV inhibitor, proteasome inhibitors, mitochondrial phosphoryl transfer inhibitors, protein synthesis inhibitor, kinase inhibitor, CDK2 inhibitor, CDK9 inhibitor, kinesin inhibitor, inhibitor HDAC, a DNA damaging agent, a DNA alkylating agent, a DNA intercalator, a DNA minor groove binding agent, and a DHFR inhibitor. In some embodiments, the cytotoxic agent is a maytansinoid, where the maytansinoid is
N(2')-деацетил-N(2')-(3-меркапто-1 -оксопропил)майтанзин (DM 1),N(2')-deacetyl-N(2')-(3-mercapto-1-oxopropyl)maytansine (DM 1),
N(2')-деацетил-N(2')-(4-меркапто-1-оксопентил)майтанзин (DM3) или N(2')-деацетил-N2-(4-меркапто-4-метил-1-оксопентил)майтанзин (DM4).N(2')-deacetyl-N(2')-(4-mercapto-1-oxopentyl)maytansine (DM3) or N(2')-deacetyl-N2-(4-mercapto-4-methyl-1-oxopentyl )maytansine (DM4).
В одном варианте осуществления конъюгаты антитела и лекарственного средства, раскрытые в данном документе, предусматривают следующую формулу (VIII):In one embodiment, the antibody-drug conjugates disclosed herein provide for the following formula (VIII):
ОМе Ab-малеимидный линкер-ОМ4 J η (VIII) где L1 представляет собой С1-6алкилен, при этом одна метиленовая группа может быть заменена на кислород;OME Ab-maleimide linker-OM4 J η (VIII) where L 1 represents C 1-6 alkylene, while one methylene group can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где y составляет от 1 до 11;L 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11;
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол и алкилен является линейным или разветвленным; и где n составляет от приблизительно 3 до приблизительно 4; или ее фармацевтически приемлемую соль.X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole and alkylene is linear or branched; and where n is from about 3 to about 4; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
В одном варианте осуществления конъюгаты антитела и лекарственного средства, раскрытые в данном документе, имеют следующую формулу:In one embodiment, the antibody-drug conjugates disclosed herein have the following formula:
где n составляет от приблизительно 3 до приблизительно 4 и Ab представляет собой антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 47, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 63; или ее фармацевтически приемлемую соль.where n is from about 3 to about 4 and Ab is an antibody containing a heavy chain containing the amino acid sequence under SEQ ID NO: 47, and a light chain containing the amino acid sequence under SEQ ID NO: 63; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
В настоящей заявке также раскрыта фармацевтическая композиция, содержащая антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, раскрытые в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель. В настоящей заявке также раскрыта фармацевтическая композиция, содержащая конъюгаты антитела и лекарственного средства, раскрытые в данном документе.The present application also discloses a pharmaceutical composition containing the antibodies or antigen-binding fragments thereof disclosed herein and a pharmaceutically acceptable carrier. The present application also discloses a pharmaceutical composition containing the antibody-drug conjugates disclosed herein.
В настоящей заявке также раскрыты способы лечения или предупреждения рака у пациента, нуждающегося в этом, предусматривающие введение указанному пациенту конъюгатов антитела и лекарственного средства или фармацевтических композиций, раскрытых в данном документе, где рак экспрессирует CCR7.The present application also discloses methods for treating or preventing cancer in a patient in need thereof, comprising administering to said patient the antibody-drug conjugates or pharmaceutical compositions disclosed herein wherein the cancer expresses CCR7.
В некоторых вариантах осуществления способов лечения или предупреждения рака конъюгат антитела и лекарственного средства или фармацевтическую композицию вводят пациенту в комбинации с одним или несколькими дополнительными терапевтическими соединениями. В одном варианте осуществления одно или несколько дополнительных терапевтических соединений выбраны из стандартного хиIn some embodiments of methods for treating or preventing cancer, the antibody drug conjugate or pharmaceutical composition is administered to a patient in combination with one or more additional therapeutic compounds. In one embodiment, one or more additional therapeutic compounds are selected from standard chi
- 5 042529 миотерапевтического средства, костимулируюшей молекулы или ингибитора контрольных точек. В одном варианте осуществления костимулирующая молекула выбрана из агониста ОХ40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1ВВ (CD137), GITR, CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3, STING или лиганда CD83. В другом варианте осуществления ингибитор контрольных точек выбран из ингибитора PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2В4 и/или TGFR-бета.- 5 042529 myotherapeutic agent, costimulatory molecule or checkpoint inhibitor. In one embodiment, the co-stimulatory molecule is selected from OX40 agonist, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1BB (CD137), GITR, CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3, STING or CD83 ligand. In another embodiment, the checkpoint inhibitor is selected from a PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 and/or TGFR-beta inhibitor.
В настоящей заявке также раскрыты конъюгаты антитела и лекарственного средства или фармацевтические композиции, раскрытые в данном документе, для применения в качестве лекарственного препарата. В одном варианте осуществления конъюгаты антитела и лекарственного средства или фармацевтические композиции, раскрытые в данном документе, предназначены для применения в лечении или предупреждении рака, экспрессирующего CCR7, у пациента, нуждающегося в этом.The present application also discloses antibody-drug conjugates or pharmaceutical compositions disclosed herein for use as a drug. In one embodiment, the antibody drug conjugates or pharmaceutical compositions disclosed herein are for use in the treatment or prevention of CCR7 expressing cancer in a patient in need thereof.
В одном варианте осуществления настоящей заявки раскрыто применение антител или их антигенсвязывающих фрагментов, конъюгатов антитела и лекарственного средства или фармацевтических композиций, раскрытых в данном документе, для лечения или предупреждения рака, экспрессирующего CCR7, у пациента, нуждающегося в этом.In one embodiment, the present application discloses the use of antibodies or antigen-binding fragments thereof, antibody-drug conjugates or pharmaceutical compositions disclosed herein for the treatment or prevention of cancer expressing CCR7 in a patient in need thereof.
В одном варианте осуществления настоящей заявки раскрыто применение антител или их антигенсвязывающих фрагментов, конъюгатов антитела и лекарственного средства или фармацевтических композиций, раскрытых в данном документе, в изготовлении лекарственного препарата.In one embodiment, the present application discloses the use of antibodies or antigen-binding fragments thereof, antibody-drug conjugates or pharmaceutical compositions disclosed herein in the manufacture of a drug product.
В одном варианте осуществления рак выбран из группы, состоящей из хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), периферических Т-клеточных лимфом (PTCL), таких как Т-клеточный лейкоз/лимфома взрослых (ATLL) и анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), неходжкинской лимфомы (NHL), такой как лимфома из клеток мантийной зоны (MCL), лимфома Беркитта и диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLBCL), карциномы желудка, немелкоклеточного рака легкого, мелкоклеточного рака легкого, рака головы и шеи, носоглоточной карциномы (NPC), рака пищевода, колоректальной карциномы, рака поджелудочной железы, рака щитовидной железы, рака молочной железы, почечноклеточного рака и рака шейки матки. В конкретных вариантах осуществления рак выбран из группы, состоящей из хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), периферических Т-клеточных лимфом (PTCL), таких как Т-клеточный лейкоз/лимфома взрослых (ATLL) и анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), неходжкинской лимфомы (NHL), такой как лимфома из клеток мантийной зоны (MCL), лимфома Беркитта и диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLBCL), и немелкоклеточного рака легкого.In one embodiment, the cancer is selected from the group consisting of chronic lymphocytic leukemia (CLL), peripheral T-cell lymphomas (PTCL) such as adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) and anaplastic large cell lymphoma (ALCL), non-Hodgkin's lymphoma ( NHL), such as mantle cell lymphoma (MCL), Burkitt's lymphoma and diffuse large B cell lymphoma (DLBCL), gastric carcinomas, non-small cell lung cancer, small cell lung cancer, head and neck cancer, nasopharyngeal carcinoma (NPC), esophageal cancer , colorectal carcinoma, pancreatic cancer, thyroid cancer, breast cancer, renal cell carcinoma and cervical cancer. In specific embodiments, the cancer is selected from the group consisting of chronic lymphocytic leukemia (CLL), peripheral T-cell lymphomas (PTCL) such as adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) and anaplastic large cell lymphoma (ALCL), non-Hodgkin's lymphoma ( NHL) such as mantle cell lymphoma (MCL), Burkitt's lymphoma and diffuse large B cell lymphoma (DLBCL), and non-small cell lung cancer.
В настоящей заявке также раскрыты нуклеиновые кислоты, которые кодируют антитела или антигенсвязывающие фрагменты, раскрытые в данном документе. В одном варианте осуществления нуклеиновая кислота содержит нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 14, 16, 30, 32, 46, 48, 62, 64, 78, 80, 94, 96, 481, 483, 497 или 499. В данной заявке также раскрыты векторы, содержащие нуклеиновые кислоты, и клетки-хозяева, содержащие векторы или нуклеиновые кислоты. В данной заявке также раскрыт способ получения антител или антигенсвязывающих фрагментов, раскрытых в данном документе, предусматривающий культивирование клетки-хозяина и извлечения антитела из культуры клеток. В одном варианте осуществления способ извлечения антитела из культуры клеток предусматривает стадии:The present application also discloses nucleic acids that encode the antibodies or antigen-binding fragments disclosed herein. In one embodiment, the nucleic acid contains the nucleotide sequence under SEQ ID NO: 14, 16, 30, 32, 46, 48, 62, 64, 78, 80, 94, 96, 481, 483, 497, or 499. This application also disclosed are vectors containing nucleic acids and host cells containing vectors or nucleic acids. This application also discloses a method for producing antibodies or antigen-binding fragments disclosed in this document, involving the cultivation of the host cell and the extraction of antibodies from cell culture. In one embodiment, a method for recovering an antibody from a cell culture comprises the steps of:
a) удаление клеток и фильтрования культуры;a) removing cells and filtering the culture;
b) проведение очистки культуры с помощью аффинной хроматографии;b) carrying out purification of the culture using affinity chromatography;
c) инактивация любых вирусов в культуре путем доведения pH до 3,4-3,6, затем повторное доведение pH до 5,8-6,2 и фильтрование культуры;c) inactivating any viruses in the culture by adjusting the pH to 3.4-3.6, then re-adjusting the pH to 5.8-6.2 and filtering the culture;
d) проведение очистки культуры с помощью катионообменной хроматографии и осуществление восстановления культуры на колонке;d) carrying out the purification of the culture by cation exchange chromatography and carrying out the recovery of the culture on the column;
e) осуществление анионообменной хроматографии в отношении культуры;e) performing anion exchange chromatography on the culture;
f) удаление вирусов с помощью нанофильтрации;f) removal of viruses by nanofiltration;
g) фильтрование культуры, содержащей антитело; иg) filtering the culture containing the antibody; And
h) получение очищенного антитела.h) obtaining a purified antibody.
В еще одном варианте осуществления в данном документе раскрыт способ получения конъюгата антитела к CCR7 и лекарственного средства, предусматривающий:In yet another embodiment, disclosed herein is a method for preparing an anti-CCR7 antibody drug conjugate comprising:
(а) предварительное образование фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, следующей формулы:(a) preformation of a linker-drug moiety of the following formula:
где фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, представляет собой DM1, DM3 или DM4, и фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, прикреплен к линкеру посредством своей тиольной функциональной группы;where the drug moiety is DM1, DM3 or DM4 and the drug moiety is attached to the linker via its thiol functionality;
- 6 042529- 6 042529
L1 представляет собой С1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 represents C 1-6 alkylene, while one of the methylene groups can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)уСН2-СН2-, где у составляет от 1 до 11;L 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) in CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11;
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол; а алкилен является линейным или разветвленным;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole; and alkylene is linear or branched;
(b) конъюгирование указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом, извлеченным из культуры клеток, раскрытой в данном документе, с получением конъюгата антитела и лекарственного средства; и (с) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.(b) conjugating said linker-drug fragment with an antibody derived from a cell culture disclosed herein to form an antibody-drug conjugate; and (c) performing purification of the antibody-drug conjugate.
В одном варианте осуществления способ предусматривает:In one embodiment, the method includes:
(а) предварительное образование фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, следующей формулы:(a) preformation of a linker-drug moiety of the following formula:
Ъме иЪme and
(b) конъюгирование указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом, извлеченным из культуры клеток, раскрытой в данном документе, с получением конъюгата антитела и лекарственного средства; и (с) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.(b) conjugating said linker-drug fragment with an antibody derived from a cell culture disclosed herein to form an antibody-drug conjugate; and (c) performing purification of the antibody-drug conjugate.
В другом варианте осуществления способ получения конъюгата антитела к CCR7 и лекарственного средства предусматривает:In another embodiment, a method for preparing an anti-CCR7 antibody drug conjugate comprises:
(а) предварительное образование фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, следующей формулы:(a) preformation of a linker-drug moiety of the following formula:
где фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, представляет собой DM1, DM3 или DM4, и фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, прикреплен к линкеру посредством своей тиольной функциональной группы;where the drug moiety is DM1, DM3 or DM4 and the drug moiety is attached to the linker via its thiol functionality;
L1 представляет собой С1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 represents C 1-6 alkylene, while one of the methylene groups can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где у составляет от 1 до 11;L 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11;
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол; а алкилен является линейным или разветвленным;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole; and alkylene is linear or branched;
(b) конъюгирование указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом, раскрытым в данном документе, с получением конъюгата антитела и лекарственного средства; и (с) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.(b) conjugating said linker drug moiety with an antibody disclosed herein to form an antibody-drug conjugate; and (c) performing purification of the antibody-drug conjugate.
В другом варианте осуществления способ получения конъюгата антитела к CCR7 и лекарственного средства предусматривает:In another embodiment, a method for preparing an anti-CCR7 antibody drug conjugate comprises:
(а) предварительное образование фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, следующей формулы:(a) preformation of a linker-drug moiety of the following formula:
(b) конъюгирование указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средст-(b) conjugation of the specified fragment, which is a linker-drug
- 7 042529 во, с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, раскрытыми в данном документе, с получением конъюгата антитела и лекарственного средства; и (c) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.- 7 042529 in, with the antibody or its antigennegative fragment, disclosed in this document, to obtain a conjugate of antibodies and drugs; and (c) performing purification of the antibody-drug conjugate.
В другом варианте осуществления стадия предварительного образования указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, предусматривает:In another embodiment, the step of pre-forming said linker-drug moiety comprises:
а) осуществление реакции фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, посредством его тиольной функциональной группы сa) the implementation of the reaction of the fragment, which is a drug, through its thiol functional group with
с образованиемwith education
сWith
с образованием фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство: θχ фрагмент >А'Li Х лекарственное—S ) z|1 средствоQ гдеwith the formation of a fragment representing a linker-drug: θχ fragment >A'Li X drug—S ) z |
L1 представляет собой С1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 represents C 1-6 alkylene, while one of the methylene groups can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где у составляет от 1 до 11 иL 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11 and
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол; где алкилен является линейным или разветвленным; иX is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole; where alkylene is linear or branched; And
RG1 и RG2 представляют собой 2 реакционноспособные группы, образующие группу X.RG1 and RG2 are 2 reactive groups forming the X group.
В другом варианте осуществления стадия предварительного образования указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, предусматривает:In another embodiment, the step of pre-forming said linker-drug moiety comprises:
а) осуществление реакции фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, посредством его тиольной функциональной группы сa) the implementation of the reaction of the fragment, which is a drug, through its thiol functional group with
с образованиемwith education
b) осуществление реакции образованногоb) the implementation of the reaction formed
- 8 042529 с образованием фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство- 8 042529 with the formation of a fragment, which is a linker drug
В некоторых вариантах осуществления конъюгат антитела и лекарственного средства, полученный согласно вышеуказанным способам, характеризуется средним DAR, измеренным с помощью УФспектрофотометра, составляющим от приблизительно 3 до приблизительно 4.In some embodiments, the antibody drug conjugate prepared according to the above methods has an average DAR, as measured by a UV spectrophotometer, of about 3 to about 4.
В другом варианте осуществления данной заявки раскрыт способ получения конъюгата антитела к CCR7 и лекарственного средства, предусматривающий:In another embodiment of this application, a method for producing an anti-CCR7 antibody drug conjugate is disclosed, comprising:
(а) химическое соединение SMCC или МРЕТ с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, DM-1 или DM-4, с образованием линкера-лекарственного средства;(a) chemically linking the SMCC or MPET with the drug moiety, DM-1 or DM-4, to form a drug linker;
(b) конъюгирование указанного линкера-лекарственного средства с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, раскрытыми в данном документе; и (c) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.(b) conjugating said drug linker to an antibody or antigen-binding fragment thereof as disclosed herein; and (c) performing purification of the antibody-drug conjugate.
В одном варианте осуществления конъюгат антитела и лекарственного средства, полученный согласно данному способу, характеризуется средним DAR, измеренным с помощью УФ-спектрофотометра, составляющим от приблизительно 3 до приблизительно 4.In one embodiment, the antibody-drug conjugate prepared according to this method has an average DAR, as measured by a UV spectrophotometer, of about 3 to about 4.
В настоящей заявке также раскрыт диагностический реагент, содержащий антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, раскрытые в данном документе. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент являются меченными с помощью радиоактивной метки, флуорофора, хромофора, средства для визуализации или иона металла.The present application also discloses a diagnostic reagent containing the antibody or antigen-binding fragment disclosed herein. In some embodiments, the antibody or antigen-binding fragment thereof is labeled with a radioactive label, a fluorophore, a chromophore, an imaging agent, or a metal ion.
Краткое описание графических материаловBrief description of graphic materials
На фиг. 1 изображены экспериментальные данные по in vitro активности ADCC негуманизированного и гуманизированного антител к CCR7 антител в формате CysMab с применением суррогатного репортерного анализа ADCC.In FIG. 1 shows experimental data on the in vitro ADCC activity of non-humanized and humanized anti-CCR7 antibodies in CysMab format using a surrogate ADCC reporter assay.
На фиг. 2 изображены экспериментальные данные по in vitro активности ADCC у негуманизированных антител к CCR7, содержащих варианты Fc с мутацией DAPA, с применением суррогатного репортерного анализа ADCC.In FIG. 2 depicts experimental data on in vitro ADCC activity in non-humanized anti-CCR7 antibodies containing DAPA-mutated Fc variants using a surrogate ADCC reporter assay.
На фиг. 3 изображены экспериментальные данные по связыванию с рекомбинантным hCCR7 антител к CCR7 в формате CysMab.DAPA с применением анализа на основе ELISA.In FIG. 3 shows experimental data on binding to recombinant hCCR7 of anti-CCR7 antibodies in CysMab.DAPA format using an ELISA-based assay.
На фиг. 4А-С изображены экспериментальные данные по функциональности исходных антител к CCR7 с применением анализа с β -аррестином в режиме агониста (фиг. 4А) и режиме антагониста (фиг. 4В, 4С).In FIG. 4A-C depict experimental data on the functionality of the original anti-CCR7 antibodies using the β-arrestin assay in agonist mode (FIG. 4A) and antagonist mode (FIGS. 4B, 4C).
На фиг. 5 изображены экспериментальные данные по конкуренции с лигандом CCR7 антител к CCR7 в формате CysMab.DAPA с применением FACS-анализа.In FIG. 5 shows experimental data on competition with the CCR7 ligand of anti-CCR7 antibodies in CysMab.DAPA format using FACS analysis.
На фиг. 6 изображены экспериментальные данные по картированию эпитопов исходных антител к CCR7 с применением мутантных белков CCR7.In FIG. 6 shows experimental epitope mapping data for parental anti-CCR7 antibodies using mutant CCR7 proteins.
На фиг. 7А-В изображены экспериментальные данные по анализам с применением piggyback ADC (pgADC) исходных антител к CCR7 в комплексе с фрагментом, представляющим собой вторичное антитело, конъюгированное с полезной нагрузкой.In FIG. 7A-B depict experimental data from piggyback ADC (pgADC) assays of parental anti-CCR7 antibodies complexed with a payload-conjugated secondary antibody fragment.
На фиг. 8 изображены экспериментальные данные по анализам цитолиза с применением piggyback ADC (pgADC) цитотоксических эффектов исходного Ab 121G12 в комплексе с фрагментом, представляющим собой вторичное антитело, конъюгированное с полезной нагрузкой, с применением клеточных линий, отрицательных по наличию мишени.In FIG. 8 shows experimental data from piggyback ADC (pgADC) cytolysis assays of the cytotoxic effects of parental 121G12 Ab complexed with a payload-conjugated secondary antibody fragment using target-negative cell lines.
На фиг. 9 изображены графики, иллюстрирующие истощение CD4+ и CD8a+ Т-клеток с помощью мышиного исходного Ab 121G12, характеризующегося перекрестной реактивностью к CCR7, в формате CysMab с Fc дикого типа, либо в виде антитела отдельно, либо конъюгированного с цитотоксином ауристатином, при этом от данных эффектов избавляются путем переключения на формат молчащей Fc с мутациями DAPA.In FIG. 9 is a graph illustrating the depletion of CD4+ and CD8a + T cells with mouse parental Ab 121G12 cross-reactive to CCR7 in CysMab format with wild-type Fc, either as an antibody alone or conjugated to the cytotoxin auristatin, with data from effects are eliminated by switching to a silent Fc format with DAPA mutations.
На фиг. 10 изображен график, иллюстрирующий дозозависимую эффективность конъюгатов антитела и лекарственного средства, 121G12.CysMab.DAPA.МРЕТ.DM4 и 121G12.DAPA.sSPDB.DM4, в отношении ксенотрансплантатной модели множественной миеломы KE97.In FIG. 10 is a graph illustrating the dose-dependent efficacy of the antibody drug conjugates, 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 and 121G12.DAPA.sSPDB.DM4, against the KE97 multiple myeloma xenograft model.
На фиг. 11 изображен график, иллюстрирующий активность конъюгатов антитела и лекарственного средства, 121G12.CysMab.DAPA.МРЕТ.DM4 и 121G12.sSPDB.DM4, на модели множественной миеломы KE97 с началом введения дозы при большей первоначальной опухолевой массе, чем на фиг. 10.In FIG. 11 is a graph illustrating the activity of the antibody-drug conjugates, 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 and 121G12.sSPDB.DM4, in the KE97 multiple myeloma model, with dose initiation at a higher initial tumor burden than FIG. 10.
На фиг. 12 изображен график, иллюстрирующий in vivo активность конъюгата 121G12.CysMab.DAPA.МРЕТ.DM4 на модели первичной немелкоклеточной опухоли легкого HLUX1934.In FIG. 12 is a graph illustrating the in vivo activity of the 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 conjugate in the HLUX1934 primary non-small cell lung tumor model.
На фиг. 13 изображен график, иллюстрирующий активность конъюгированного исходного антителаIn FIG. 13 is a graph illustrating the activity of the conjugated parent antibody.
- 9 042529- 9 042529
684E12.SMCC.DM1 на ксенотрансплантатной модели множественной миеломы KE97.684E12.SMCC.DM1 in a xenograft model of multiple myeloma KE97.
На фиг. 14А-В изображены фотографии IHC для выявления фосфо-гистона H3 (фиг. 14А) и количественная оценка сигнала фосфо-гистона H3 (фиг. 14В) для опухолей KE97 через 48 ч после обработки однократной дозой либо 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 при 2, 5 или 10 мг/кг, либо изотипического контроля, IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4, при 10 мг/кг, демонстрирующие индукцию митотического блока (фосфо-гистон H3) после обработки с помощью ADC к CCR7.In FIG. 14A-B are IHC photographs for phospho-histone H3 detection (FIG. 14A) and phospho-histone H3 signal quantification (FIG. 14B) for KE97 tumors 48 hours after single dose treatment with either 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 2, 5, or 10 mg/kg, or isotype control, IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4, at 10 mg/kg, showing induction of mitotic block (phospho-histone H3) after treatment with ADC to CCR7.
На фиг. 15 изображен график, иллюстрирующий дозозависимую эффективностьIn FIG. 15 is a graph illustrating dose-response efficacy
121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели ABC-DLBCL OCI-LY3.121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in relation to the ABC-DLBCL OCI-LY3 xenograft model.
На фиг. 16 изображен график, иллюстрирующий дозозависимую эффективностьIn FIG. 16 is a graph illustrating the dose-response efficacy
121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели GCB-DLBCL Toledo.121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in relation to the GCB-DLBCL Toledo xenograft model.
На фиг. 17 изображен график, иллюстрирующий эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели ALCL DEL.In FIG. 17 is a graph showing the efficacy of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 against the ALCL DEL xenograft model.
На фиг. 18 изображен график, иллюстрирующий дозозависимую эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении модели NSCLC на основе полученного от пациента ксенотрансплантата HLUX1787.In FIG. 18 is a graph illustrating the dose-response efficacy of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 against an NSCLC model based on patient-derived HLUX1787 xenograft.
Подробное описание изобретенияDetailed description of the invention
ОпределенияDefinitions
Если не указано иное, подразумевается, что следующие термины и фразы, используемые в данном документе, имеют следующие значения.Unless otherwise noted, the following terms and phrases used in this document are intended to have the following meanings.
Термин алкил относится к одновалентной насыщенной углеводородной цепи, содержащей указанное число атомов углерода. Например, C1-6 алкил относится к алкильной группе, содержащей от 1 до 6 атомов углерода. Алкильная группа может быть прямой или разветвленной. Типичная разветвленная алкильная группа содержит одну, две или три ветви. Примеры алкильных групп включают без ограничения, метил, этил, пропил (н-пропил и изопропил), бутил (н-бутил, изобутил, втор-бутил и трет-бутил), пентил (н-пентил, изопентил и неопентил) и гексил. Термин алкилен обозначает двухвалентную форму алкила.The term alkyl refers to a monovalent saturated hydrocarbon chain containing the specified number of carbon atoms. For example, C1-6 alkyl refers to an alkyl group containing 1 to 6 carbon atoms. The alkyl group may be straight or branched. A typical branched alkyl group contains one, two or three branches. Examples of alkyl groups include, without limitation, methyl, ethyl, propyl (n-propyl and isopropyl), butyl (n-butyl, isobutyl, sec-butyl and t-butyl), pentyl (n-pentyl, isopentyl and neopentyl) and hexyl. The term alkylene denotes the divalent form of alkyl.
Используемый в данном документе термин антитело относится к полипептиду из семейства иммуноглобулинов, который способен к связыванию соответствующего антигена нековалентным, обратимым и специфическим образом. Например, встречающееся в природе антитело IgG представляет собой тетрамер, содержащий по меньшей мере две тяжелые (Н) цепи и две легкие (L) цепи, соединенные между собой посредством дисульфидных связей. Каждая тяжелая цепь состоит из вариабельной области тяжелой цепи (сокращенно обозначаемой в данном документе как VH) и константной области тяжелой цепи. Константная область тяжелой цепи состоит из трех доменов, CH1, CH2 и CH3. Каждая легкая цепь состоит из вариабельной области легкой цепи (сокращенно обозначаемой в данном документе как VL) и константной области легкой цепи. Константная область легкой цепи состоит из одного домена, CL. Области VH и VL могут быть дополнительно подразделены на области гипервариабельности, называемые определяющими комплементарность областями (CDR), которые чередуются с более консервативными областями, называемыми каркасными областями (FR). Каждая VH и VL состоит из трех CDR и четырех FR, расположенных от амино-конца к карбокси-концу в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 и FR4. Вариабельные области тяжелой и легкой цепей содержат связывающий домен, который взаимодействует с антигеном. Константные области антител могут опосредовать связывание иммуноглобулина с тканями или факторами хозяина, которые включают различные клетки иммунной системы (например, эффекторные клетки) и первый компонент (Clq) классической системы комплемента.As used herein, the term antibody refers to a polypeptide from the immunoglobulin family that is capable of binding a corresponding antigen in a non-covalent, reversible, and specific manner. For example, a naturally occurring IgG antibody is a tetramer containing at least two heavy (H) chains and two light (L) chains linked together by disulfide bonds. Each heavy chain consists of a heavy chain variable region (abbreviated herein as VH) and a heavy chain constant region. The heavy chain constant region consists of three domains, CH1, CH2 and CH3. Each light chain is composed of a light chain variable region (abbreviated herein as VL) and a light chain constant region. The light chain constant region consists of a single domain, CL. The VH and VL regions can be further subdivided into regions of hypervariability called complementarity determining regions (CDRs) that alternate with more conserved regions called framework regions (FRs). Each VH and VL consists of three CDRs and four FRs, arranged from amino to carboxy in the following order: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 and FR4. The variable regions of the heavy and light chains contain a binding domain that interacts with an antigen. Antibody constant regions can mediate immunoglobulin binding to host tissues or factors, which include various cells of the immune system (eg, effector cells) and the first component (Clq) of the classical complement system.
Термин антитело предусматривает без ограничения моноклональные антитела, человеческие антитела, гуманизированные антитела, химерные антитела и антиидиотипические (анти-Id) антитела (включая, например, анти-Id антитела к антителам по настоящему изобретению). Антител могут относиться к любому изотипу/классу (например, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA и IgY) или подклассу (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2).The term antibody includes, without limitation, monoclonal antibodies, human antibodies, humanized antibodies, chimeric antibodies, and anti-idiotypic (anti-Id) antibodies (including, for example, anti-Id antibodies to antibodies of the present invention). Antibodies may be of any isotype/class (eg, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA, and IgY) or subclass (eg, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, and IgA2).
Определяющие комплементарность домены или определяющие комплементарность области (CDR) взаимозаменяемо относятся к гипервариабельным областям VL и VH. В цепях антитела CDR представляют собой сайт связывания белка-мишени, который обуславливает специфичность в отношении такого белка-мишени. В каждой человеческой VL или VH имеется по три CDR (CDR1-3, пронумерованные последовательно от N-конца), составляющие приблизительно 15-20% от вариабельных доменов. CDR являются структурно комплементарными эпитопу белка-мишени и, таким образом, непосредственно ответственны за специфичность связывания. Остальные отрезки VL или VH, так называемые каркасные области, проявляют меньшую изменчивость аминокислотной последовательности (Kuby, Immunology, 4th ed., Chapter 4. W.H. Freeman & Co., New York, 2000).Complementarity-determining domains or complementarity-determining regions (CDRs) refer interchangeably to VL and VH hypervariable regions. In antibody chains, the CDRs are the binding site of a target protein that confer specificity for that target protein. Each human VL or VH has three CDRs (CDR1-3, numbered sequentially from the N-terminus), representing approximately 15-20% of the variable domains. The CDRs are structurally complementary to the epitope of the target protein and are thus directly responsible for binding specificity. The remaining VL or VH stretches, the so-called framework regions, show less amino acid sequence variability (Kuby, Immunology, 4th ed., Chapter 4. WH Freeman & Co., New York, 2000).
Положения CDR и каркасных областей могут быть определены с применением различных определений, широко известных из уровня техники, например, Rabat, Chothia, международной базы данных ImMunoGeneTics (IMGT) (во всемирной сети по адресу www.imgt.org/) и AbM (см., например, Johnson et al., Nucleic Acids Res., 29:205-206 (2001); Chothia and Lesk, J. Mol. Biol., 196:901-917 (1987); Chothia et al., Nature, 342:877-883 (1989); Chothia et al., J. Mol. Biol., 227:799-817 (1992); Al-Lazikani et al., J.Mol.Biol.,The positions of the CDRs and framework regions can be determined using various definitions widely known in the art, such as Rabat, Chothia, ImMunoGeneTics (IMGT) international database (on the web at www.imgt.org/) and AbM (see eg Johnson et al., Nucleic Acids Res., 29:205-206 (2001), Chothia and Lesk, J. Mol. Biol., 196:901-917 (1987), Chothia et al., Nature, 342 :877-883 (1989); Chothia et al., J. Mol. Biol., 227:799-817 (1992); Al-Lazikani et al., J. Mol. Biol.,
- 10 042529- 10 042529
273:927-748 (1997)). Определения антигенсвязывающих активных центров также описаны в следующих источниках: Ruiz et al., Nucleic Acids Res., 28:219-221 (2000); и Lefranc, M.P., Nucleic Acids Res., 29:207209 (2001); MacCallum et al., J. Mol. Biol., 262:732-745 (1996); и Martin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,273:927-748 (1997)). Definitions of antigen-binding active sites are also described in the following references: Ruiz et al., Nucleic Acids Res., 28:219-221 (2000); and Lefranc, M.P., Nucleic Acids Res., 29:207209 (2001); MacCallum et al., J. Mol. Biol., 262:732-745 (1996); and Martin et al., Proc. Natl. Acad. sci. usa,
86:9268-9272 (1989); Martin et al., Methods Enzymol., 203:121-153 (1991) и Rees et al., в Sternberg M.J.E.86:9268-9272 (1989); Martin et al., Methods Enzymol., 203:121-153 (1991) and Rees et al., in Sternberg M.J.E.
(ed.), Protein Structure Prediction, Oxford University Press, Oxford, 141-172 (1996).(ed.), Protein Structure Prediction, Oxford University Press, Oxford, 141-172 (1996).
Как легкая, так и тяжелая цепи подразделяются на области структурной и функциональной гомологии. Термины константный и вариабельный применяются в функциональном смысле. В связи с этим следует понимать, что вариабельные домены из частей как легкой (VL), так и тяжелой (VH) цепей определяют распознавание антигена и специфичность в его отношении. Напротив, константные домены легкой цепи (CL) и тяжелой цепи (CH1, CH2 или CH3) придают важные биологические свойства, такие как секреция, перемещение через плаценту, связывание с рецептором Fc, связывание с комплементом и т.п. Принято, что номера доменов константной области увеличиваются по мере их удаления от антигенсвязывающего сайта или амино-конца антитела. N-конец представляет собой вариабельную область, а на Сконце находится константная область; домены CH3 и CL фактически содержат карбоксиконцевые домены тяжелой и легкой цепи, соответственно.Both light and heavy chains are subdivided into regions of structural and functional homology. The terms constant and variable are used in a functional sense. In this regard, it is to be understood that variable domains from both the light (VL) and heavy (VH) chain portions determine antigen recognition and specificity for it. In contrast, the light chain (CL) and heavy chain (CH1, CH2 or CH3) constant domains confer important biological properties such as secretion, placental movement, Fc receptor binding, complement binding, and the like. It is accepted that the numbers of constant region domains increase as they move away from the antigen-binding site or amino-terminus of an antibody. The N-terminus is the variable region and the C-terminus is the constant region; the CH3 and CL domains actually contain the heavy and light chain carboxy-terminal domains, respectively.
Используемый в данном документе термин антигенсвязывающий фрагмент относится к одной или нескольким частям антитела, которые сохраняют способность специфически взаимодействовать (например, посредством связывания, стерического несоответствия, стабилизации/дестабилизации, пространственного распределения) с эпитопом антигена. Примеры связывающих фрагментов включают без ограничения одноцепочечные Fv (scFv), антитела верблюжьих, соединенные дисульфидными связями Fv (sdFv), Fab-фрагменты, F(ab')-фрагменты, одновалентный фрагмент, состоящий из доменов VL, VH, CL и СН1; F(ab)2-фрагмент, двухвалентный фрагмент, содержащий два Fab-фрагмента, соединенные дисульфидным мостиком в шарнирной области; Fd-фрагмент, состоящий из доменов VH и CH1; Fv-фрагмент, состоящий из доменов VL и VH одного плеча антитела; dAb-фрагмент (Ward et al., Nature 341:544-546, 1989), который состоит из домена VH; а также выделенную определяющую комплементарность область (CDR) или другие эпитопсвязывающие фрагменты антитела.As used herein, the term antigen binding fragment refers to one or more portions of an antibody that retain the ability to specifically interact (eg, through binding, steric mismatch, stabilization/destabilization, spatial distribution) with an antigen epitope. Examples of binding fragments include, but are not limited to, single chain Fv (scFv), camelid disulfide-linked Fv (sdFv), Fab fragments, F(ab') fragments, a monovalent fragment consisting of VL, VH, CL and CH1 domains; F(ab)2 fragment, bivalent fragment containing two Fab fragments connected by a disulfide bridge in the hinge region; Fd fragment consisting of VH and CH1 domains; Fv fragment, consisting of the VL and VH domains of one antibody arm; dAb fragment (Ward et al., Nature 341:544-546, 1989) which consists of a VH domain; as well as an isolated complementarity determining region (CDR) or other epitope-binding antibody fragments.
Кроме того, хотя два домена Fv-фрагмента, VL и VH, кодируются отдельными генами, они могут быть соединены с применением рекомбинантных способов с помощью синтетического линкера, что обеспечивает их получение в виде одной белковой цепи, в которой области VL и VH соединяются в пару с образованием одновалентной молекулы (известной как одноцепочечный Fv (scFv); см., например, Bird et al., Science 242:423-426, 1988 и Huston et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 85:5879-5883, 1988). Предусматривается, что такие одноцепочечные антитела также охватываются термином антигенсвязывающий фрагмент. Такие антигенсвязывающие фрагменты получают с применением традиционных методик, известных специалистам в данной области техники, и фрагменты подвергают скринингу на применимость таким же способом, что и интактные антитела.In addition, although the two domains of the Fv fragment, VL and VH, are encoded by separate genes, they can be connected using recombinant methods using a synthetic linker, which provides them with a single protein chain in which the VL and VH regions are paired. to form a monovalent molecule (known as single chain Fv (scFv); see, for example, Bird et al., Science 242:423-426, 1988 and Huston et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 85:5879-5883 , 1988). It is envisaged that such single chain antibodies are also covered by the term antigen binding fragment. Such antigen binding fragments are prepared using conventional techniques known to those skilled in the art and the fragments are screened for utility in the same manner as intact antibodies.
Антигенсвязывающие фрагменты также могут быть включены в состав однодоменных антител, максител, минител, однодоменных антител, интрател, диател, триател, тетрател, v-NAR и бис-scFv (см., например, Hollinger and Hudson, Nature Biotechnology 23:1126-1136, 2005). Антигенсвязывающие фрагменты можно прививать на остовы на основе полипептидов, таких как фибронектин типа III (Fn3) (см. патент США № 6703199, в котором описаны монотела на основе полипептида фибронектина).Antigen binding fragments can also be incorporated into single domain antibodies, maxitel, minitel, single domain antibodies, intrabodies, diabodies, triabodies, tetrabodies, v-NARs, and bis-scFvs (see, e.g., Hollinger and Hudson, Nature Biotechnology 23:1126-1136 , 2005). Antigen binding fragments can be grafted onto polypeptide backbones such as type III fibronectin (Fn3) (see US Pat. No. 6,703,199, which describes fibronectin polypeptide monobodies).
Антигенсвязывающие фрагменты можно вводить в состав одноцепочечных молекул, содержащих пару тандемных сегментов Fv (VH-CH1-VH-CH1), которые вместе с комплементарными полипептидами легкой цепи образуют пару антигенсвязывающих областей (Zapata et al., Protein Eng. 8:1057-1062, 1995 и патент США № 5641870).Antigen binding fragments can be incorporated into single chain molecules containing a pair of tandem Fv segments (VH-CH1-VH-CH1) which, together with complementary light chain polypeptides, form a pair of antigen binding regions (Zapata et al., Protein Eng. 8:1057-1062, 1995 and US Pat. No. 5,641,870).
Используемый в данном документе термин моноклональное антитело или композиция на основе моноклонального антитела относится к полипептидам, включающим антитела и антигенсвязывающие фрагменты, которые характеризуются практически идентичной аминокислотной последовательностью или происходят из одного генетического источника. Данный термин также охватывает препараты молекул антител одного молекулярного состава. Композиция на основе моноклонального антитела проявляет одну специфичность и аффинность связывания в отношении конкретного эпитопа.As used herein, the term monoclonal antibody or monoclonal antibody composition refers to polypeptides, including antibodies and antigen-binding fragments, that have a substantially identical amino acid sequence or are derived from the same genetic source. The term also covers preparations of antibody molecules of the same molecular composition. A monoclonal antibody composition exhibits a single binding specificity and affinity for a particular epitope.
Используемый в данном документе термин человеческое антитело охватывает антитела, имеющие вариабельные области, в которых как каркасные области, так и CDR получены из последовательностей, происходящих от человека. Кроме того, если антитело содержит константную область, то константная область также происходит из таких человеческих последовательностей, например, последовательностей зародышевой линии человека, или мутантных вариантов последовательностей зародышевой линии человека, или антитела, содержащего консенсусные каркасные последовательности, полученные за счет анализа человеческих каркасных последовательностей, например, как описано в Knappik et al., J. Mol. Biol. 296:57-86, 2000). Также подразумеваются антитела, происходящие из человеческих последовательностей, где одна или несколько CDR были подвергнуты мутированию в процессе созревания аффинности или для целей изготовления/конъюгации с полезной нагрузкой. См. Kilpatrick et al., Rapid development of affinity matured monoclonal antibodies using RIMMS, Hvbridoma. 1997 Aug;16(4): 381-9.As used herein, the term human antibody encompasses antibodies having variable regions in which both the framework regions and the CDRs are derived from human-derived sequences. In addition, if the antibody contains a constant region, then the constant region is also derived from such human sequences, for example, human germline sequences, or mutant variants of human germline sequences, or an antibody containing consensus framework sequences obtained by analyzing human framework sequences, for example, as described in Knappik et al., J. Mol. Biol. 296:57-86, 2000). Also contemplated are antibodies derived from human sequences where one or more CDRs have been mutated during affinity maturation or for manufacturing/payload conjugation purposes. See Kilpatrick et al., Rapid development of affinity matured monoclonal antibodies using RIMMS, Hvbridoma. 1997 Aug;16(4): 381-9.
Человеческие антитела по настоящему изобретению могут включать аминокислотные остатки, ко- 11 042529 торые не закодированы в человеческих последовательностях (например, мутации, введенные посредством случайного или сайт-специфического мутагенеза in vitro или за счет соматических мутаций in vivo, или консервативная замена, которая содействует стабильности или облегчает изготовление).Human antibodies of the present invention may include amino acid residues that are not encoded in human sequences (e.g., mutations introduced by in vitro random or site-directed mutagenesis or by in vivo somatic mutations, or conservative substitution that promotes stability or facilitate production).
Используемый в данном документе термин распознавать относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, которые отыскивают свой эпитоп и взаимодействуют (например, связываются) с ним, независимо от того является ли эпитоп линейным или конформационным. Термин эпитоп относится к сайту на антигене, с которым специфически связываются антитело или антигенсвязывающий фрагмент по настоящему изобретению. Эпитопы могут быть образованы как смежными аминокислотами, так и несмежными аминокислотами, размещаемыми рядом за счет третичной укладки белка. Эпитопы, образуемые из смежных аминокислот, как правило, сохраняются при воздействии денатуририрующих растворителей, в то время как эпитопы, образуемые за счет третичной укладки, как правило, утрачиваются при обработке денатурирующими растворителями. Эпитоп, как правило, содержит по меньшей мере 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 или 15 аминокислот в уникальной пространственной конформации. Способы определения пространственной конформации эпитопов включают методики из уровня техники, например, рентгеноструктурную кристаллографию и 2-мерный ядерный магнитный резонанс (см., например, Epitope Mapping Protocols в Methods in Molecular Biology, vol. 66, G. E. Morris, Ed. (1996)).As used herein, the term recognize refers to an antibody or antigen-binding fragment thereof that seeks out and interacts with (eg, binds to) its epitope, whether the epitope is linear or conformational. The term epitope refers to a site on an antigen to which an antibody or antigen-binding fragment of the present invention specifically binds. Epitopes can be formed by both adjacent amino acids and non-adjacent amino acids placed side by side due to the tertiary folding of the protein. Epitopes derived from contiguous amino acids are generally retained upon exposure to denaturing solvents, while epitopes derived from tertiary folding are generally lost upon exposure to denaturing solvents. An epitope typically contains at least 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15 amino acids in a unique spatial conformation. Methods for determining the spatial conformation of epitopes include prior art techniques such as X-ray diffraction crystallography and 2D nuclear magnetic resonance (see, for example, Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, vol. 66, G. E. Morris, Ed. (1996)) .
Используемый в данном документе термин аффинность относится к силе взаимодействия между антителом и антигеном в отдельных антигенных сайтах. В пределах каждого антигенного сайта вариабельная область плеча антитела взаимодействует с антигеном посредством слабых нековалентных сил в многочисленных сайтах; при этом, чем больше взаимодействий, тем сильнее аффинность.As used herein, the term affinity refers to the strength of the interaction between an antibody and an antigen at individual antigenic sites. Within each antigenic site, the variable arm of an antibody interacts with the antigen through weak non-covalent forces at multiple sites; moreover, the more interactions, the stronger the affinity.
Термин выделенное антитело относится к антителу, которое практически не содержит других антител с отличающейся антигенной специфичностью. Однако выделенное антитело, которое специфически связывается с одним антигеном, может характеризоваться перекрестной реактивностью в отношении других антигенов. Более того, выделенное антитело может практически не содержать другого клеточного материала и/или химических веществ.The term isolated antibody refers to an antibody that is substantially free of other antibodies of differing antigenic specificity. However, an isolated antibody that specifically binds to one antigen may be cross-reactive with other antigens. Moreover, the isolated antibody may be substantially free of other cellular material and/or chemicals.
Термин соответствующая последовательность зародышевой линии человека относится к последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность или подпоследовательность человеческой вариабельной области, которые обладают самой высокой установленной идентичностью аминокислотной последовательности с эталонной аминокислотной последовательностью или подпоследовательностью вариабельной области в сравнении со всеми другими всеми другими известными аминокислотными последовательностями вариабельной области, закодированными в последовательностях вариабельной области иммуноглобулина зародышевой линии человека. Соответствующая последовательность зародышевой линии человека также может относиться к аминокислотной последовательности или подпоследовательности человеческой вариабельной области, характеризующимся самой высокой идентичностью аминокислотной последовательности с эталонной аминокислотной последовательностью или подпоследовательностью вариабельной области в сравнении со всеми другими подвергнутыми оценке аминокислотными последовательностями вариабельной области. Соответствующей последовательностью зародышевой линии человека могут быть только каркасные области, только определяющие комплементарность области, каркасные и определяющие комплементарность области, вариабельный сегмент (как определено выше) или другие комбинации последовательностей или подпоследовательностей, которые составляют вариабельную область. Идентичность последовательности может быть определена с применением способов, описанных в данном документе, например, выравнивания двух последовательностей с применением BLAST, ALIGN или другого алгоритма выравнивания, известного из уровня техники. Соответствующая последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислотная последовательность зародышевой линии человека может характеризоваться по меньшей мере приблизительно 90%, 91, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичностью последовательности с эталонной последовательностью нуклеиновой кислоты или аминокислотной последовательностью вариабельной области. Соответствующие последовательности зародышевой линии человека могут быть определены, например, с помощью международной базы данных ImMunoGeneTics (IMGT), находящейся в открытом доступе (во всемирной сети по адресу www.imgt.org/) и V-base (во всемирной сети по адресу vbase.mrc-cpe.cam.ac.uk).The term corresponding human germline sequence refers to a nucleic acid sequence encoding a human variable region amino acid sequence or subsequence that has the highest established amino acid sequence identity with a reference variable region amino acid sequence or subsequence when compared to all other variable region amino acid sequences known, encoded in human germline immunoglobulin variable region sequences. A corresponding human germline sequence can also refer to a human variable region amino acid sequence or subsequence having the highest amino acid sequence identity with a reference variable region amino acid sequence or subsequence compared to all other variable region amino acid sequences evaluated. The corresponding human germline sequence can be framework regions only, complementarity-determining regions only, framework and complementarity-determining regions, a variable segment (as defined above), or other combinations of sequences or subsequences that constitute a variable region. Sequence identity can be determined using the methods described herein, for example, aligning two sequences using BLAST, ALIGN, or another alignment algorithm known in the art. The corresponding human germline nucleic acid or amino acid sequence may have at least about 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% sequence identity. with a reference nucleic acid sequence or variable region amino acid sequence. Corresponding human germline sequences can be determined, for example, using the international public domain ImMunoGeneTics (IMGT) database (on the web at www.imgt.org/) and V-base (on the web at vbase. mrc-cpe.cam.ac.uk).
Фраза специфически связывает или селективно связывает, когда она применяется в контексте описания взаимодействия между антигеном (например, белком) и антителом, фрагментом антитела или связывающим средством, происходящим из антитела, относится к реакции связывания, которая является определяющей для установления присутствия антигена в неоднородной популяции белков и других биологических веществ, например, в биологическом образце, например, крови, сыворотке, плазме или образце ткани. Таким образом, при некоторых обозначенных условиях проведения иммунологического анализа антитела или связывающие средства, характеризующиеся конкретной специфичностью связывания, связываются с конкретным антигеном в по меньшей мере два раза сильнее, чем фоновый уровень, и практически не связываются в значительном количестве с другими антигенами, присутствующими в образце. В одном варианте осуществления при обозначенных условиях иммунологического анализа антитело или связывающее средство с конкретной специфичностью связывания связывается с конкретнымThe phrase specifically binds or selectively binds, when used in the context of describing an interaction between an antigen (e.g., a protein) and an antibody, an antibody fragment, or a binding agent derived from an antibody, refers to a binding reaction that is determinant for establishing the presence of an antigen in a heterogeneous population of proteins and other biological substances, for example, in a biological sample, such as blood, serum, plasma or tissue sample. Thus, under certain specified immunoassay conditions, antibodies or binding agents with a particular binding specificity bind to a particular antigen at least twice as strongly as background and do not substantially bind to significant amounts with other antigens present in the sample. . In one embodiment, under designated immunoassay conditions, an antibody or binding agent with a particular binding specificity binds to a particular
- 12 042529 антигеном в по меньшей мере десять (10) раз сильнее относительно фонового уровня, и практически не связывается в значительном количестве с другими антигенами, присутствующими в образце. Специфическое связывание с антителом или связывающим средством в таких условиях может предусматривать то, что антитело или средство должно отбираться за его специфичность в отношении конкретного белка. При желании или необходимости данный отбор можно проводить путем отбрасывания антител, которые вступают в перекрестные реакции с молекулами от другого вида (например, мыши или крысы) или других подтипов. В качестве альтернативы в некоторых вариантах осуществления отбирают антитела или фрагменты антител, которые вступают в перекрестные реакции с некоторыми требуемыми молекулами.- 12 042529 antigen is at least ten (10) times stronger than the background level, and practically does not bind in significant amounts to other antigens present in the sample. Specific binding to an antibody or binding agent under such conditions may require that the antibody or agent be selected for its specificity for a particular protein. If desired or necessary, this selection can be made by discarding antibodies that cross-react with molecules from another species (eg mouse or rat) or other subtypes. Alternatively, in some embodiments, antibodies or antibody fragments are selected that cross-react with some of the desired molecules.
Целый ряд форматов иммунологического анализа может применяться для отбора антител, характеризующихся специфической иммунной реактивностью в отношении конкретного белка. Например, твердофазные иммунологические анализы ELISA традиционно применяются для отбора антител, характеризующихся специфической реактивностью в отношении белка (см., например, Harlow & Lane, Using Antibodies, A Laboratory Manual (1998), где описаны форматы и условия иммунологического анализа, которые можно применять для определения специфической иммунной реактивности). Как правило, реакция специфического или селективного связывания будет приводить к сигналу, в по меньшей мере два раза превышающему фоновый уровень, и, более типично, в по меньшей мере 10-100 раз превышающему фоновый уровень.A variety of immunoassay formats can be used to screen for antibodies that have specific immune reactivity for a particular protein. For example, ELISA immunoassays have traditionally been used to screen for antibodies having specific protein reactivity (see, e.g., Harlow & Lane, Using Antibodies, A Laboratory Manual (1998) for descriptions of immunoassay formats and conditions that can be used to determination of specific immune reactivity). Typically, a specific or selective binding reaction will result in a signal at least two times background, and more typically at least 10-100 times background.
Термин равновесная константа диссоциации (KD [М]) относится к константе скорости диссоциации (kd [время-1]), поделенной на константу скорости ассоциации (ka [время-1, М-1]). Равновесные константы диссоциации могут быть измерены с применением любого способа, известного из уровня техники. Обычно антитела по настоящему изобретению будут характеризоваться равновесной константой диссоциации, составляющей менее приблизительно 10-7 или 10-8 М, например, менее приблизительно 10-9 М или 10-10 М, в некоторых вариантах осуществления менее приблизительно 10-11 М, 10-12 М или 10-13 М.The term equilibrium dissociation constant (K D [M]) refers to the dissociation rate constant (k d [time-1]) divided by the association rate constant (k a [time-1, M-1]). Equilibrium dissociation constants can be measured using any method known in the art. Typically, the antibodies of the present invention will have an equilibrium dissociation constant of less than about 10 -7 or 10 -8 M, such as less than about 10 -9 M or 10 -10 M, in some embodiments, less than about 10 -11 M, 10 - 12 M or 10 -13 M.
Термин биодоступность относится к системной доступности (т. е. уровням в крови/плазме) заданного количества лекарственного средства, вводимого пациенту. Биодоступность представляет собой абсолютный термин, обозначающий показатель как времени (скорости), в течение которого лекарственное средство достигает общего кровообращения из введенной лекарственной формы, так и общего количества (величины) лекарственного средства в нем.The term bioavailability refers to the systemic availability (ie, blood/plasma levels) of a given amount of drug administered to a patient. Bioavailability is an absolute term referring to both the time (rate) it takes a drug to reach the general circulation from an administered dosage form and the total amount (amount) of drug in it.
Используемая в данном документе фраза состоящий фактически из относится к родам или видам активных фармацевтических средств, включенных в способ или композицию, а также любым вспомогательным веществам, не проявляющим активность в отношении намеченной цели применения способов или композиций. В некоторых вариантах осуществления фраза состоящий фактически из однозначно исключает включение одного или нескольких дополнительных активных средств, отличных от конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления фраза состоящий фактически из однозначно исключает включение одного или нескольких дополнительных активных средств, отличных от конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению и второго средства, вводимого совместно.As used herein, the phrase consisting in fact of refers to the genera or types of active pharmaceutical agents included in the method or composition, as well as any excipients that are not active in relation to the intended purpose of using the methods or compositions. In some embodiments, the phrase consisting essentially of unambiguously excludes the inclusion of one or more additional active agents other than the antibody-drug conjugate of the present invention. In some embodiments, the phrase consisting essentially of unambiguously excludes the inclusion of one or more additional active agents other than the antibody-drug conjugate of the present invention and the second agent co-administered.
Термин аминокислота относится к встречающимся в природе, синтетическим и неприродным аминокислотам, а также аналогам аминокислот и миметикам аминокислот, которые функционируют подобно встречающимся в природе аминокислотам. Встречающиеся в природе аминокислоты представляют собой аминокислоты, закодированные в генетическом коде, а также такие аминокислоты, которые были впоследствии модифицированы, например, гидроксипролин, γ-карбоксиглутамат и О-фосфосерин. Аналоги аминокислот относятся к соединениям, которые характеризуются такой же основной химической структурой, что и встречающаяся в природе аминокислота, то есть имеют α-углерод, который связан с водородом, карбоксильной группой, аминогруппой и R-группой, например, к гомосерину, норлейцину, метионинсульфоксиду, метионинметилсульфонию. Такие аналоги имеют модифицированные Rгруппы (например, норлейцин) или модифицированные пептидные остовы, но сохраняют такую же основную химическую структуру, что и встречающаяся в природе аминокислота. Миметики аминокислот относятся к химическим соединениям, которые имеют структуру, отличающуюся от общей химической структуры аминокислоты, но которые функционируют подобно встречающейся в природе аминокислоте.The term amino acid refers to naturally occurring, synthetic and non-natural amino acids, as well as amino acid analogs and amino acid mimetics that function similarly to naturally occurring amino acids. Naturally occurring amino acids are amino acids encoded in the genetic code, as well as those amino acids that have been subsequently modified, such as hydroxyproline, γ-carboxyglutamate and O-phosphoserine. Amino acid analogs refer to compounds that have the same basic chemical structure as a naturally occurring amino acid, i.e. have an α-carbon that is bonded to hydrogen, a carboxyl group, an amino group, and an R group, e.g., homoserine, norleucine, methionine sulfoxide , methionine methylsulfonium. Such analogs have modified R groups (eg, norleucine) or modified peptide backbones, but retain the same basic chemical structure as the naturally occurring amino acid. Amino acid mimetics refer to chemical compounds that have a structure that differs from the general chemical structure of an amino acid, but that function similarly to a naturally occurring amino acid.
Термин консервативно модифицированный вариант применяется в отношении как аминокислотных последовательностей, так и последовательностей нуклеиновой кислоты. Применительно к конкретным последовательностям нуклеиновой кислоты, консервативно модифицированные варианты относятся к тем нуклеиновым кислотам, которые кодируют идентичные или фактически идентичные аминокислотные последовательности, или же, если нуклеиновая кислота не кодирует аминокислотную последовательность, к фактически идентичным последовательностям. Вследствие вырожденности генетического кода любой заданный белок кодируется большим количеством функционально идентичных нуклеиновых кислот. Например, все из кодонов GCA, GCC, GCG и GCU кодируют аминокислоту аланин. Таким образом, в каждом положении, в котором кодоном задан аланин, кодон может быть изменен на любой из соответствующих описанных кодонов без изменения кодируемого полипептида. Такие вариации нуклеиновой кислоты являются молчащими вариациями, которые представляют собой одну разновидность ваThe term conservatively modified variant is used to refer to both amino acid sequences and nucleic acid sequences. With respect to specific nucleic acid sequences, conservatively modified variants refer to those nucleic acids that encode identical or substantially identical amino acid sequences, or, if the nucleic acid does not encode an amino acid sequence, substantially identical sequences. Due to the degeneracy of the genetic code, any given protein is encoded by a large number of functionally identical nucleic acids. For example, all of the codons GCA, GCC, GCG, and GCU code for the amino acid alanine. Thus, at each position at which the codon is given by alanine, the codon can be changed to any of the corresponding codons described without changing the encoded polypeptide. Such nucleic acid variations are silent variations, which are one kind of va
- 13 042529 риаций с консервативными модификациями. В данном документе каждая последовательность нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, также описывает каждую возможную молчащую вариацию нуклеиновой кислоты. Специалист в данной области будет осознавать, что каждый кодон в нуклеиновой кислоте (за исключением AUG, который обычно является единственным кодоном для метионина, и TGG, который обычно является единственным кодоном для триптофана) может быть модифицирован с получением функционально идентичной молекулы. Соответственно, каждая молчащая вариация нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, неявно определена в каждой описанной последовательности.- 13 042529 revisions with conservative modifications. In this document, each nucleic acid sequence that encodes a polypeptide also describes each possible silent variation of the nucleic acid. One skilled in the art will appreciate that every codon in a nucleic acid (with the exception of AUG, which is usually the only codon for methionine, and TGG, which is usually the only codon for tryptophan) can be modified to produce a functionally identical molecule. Accordingly, each silent variation of a nucleic acid that encodes a polypeptide is implicitly defined in each described sequence.
В случае полипептидных последовательностей консервативно модифицированные варианты охватывают отдельные замены, делеции или добавления в полипептидной последовательности, которые приводят к замене аминокислоты на аналогичную по химическим свойствам аминокислоту. Таблицы консервативных замен, обеспечивающие функционально аналогичные аминокислоты, хорошо известны из уровня техники. Такие консервативно модифицированные варианты дополняют, а не исключают, полиморфные варианты, межвидовые гомологи и аллели по настоящему изобретению. Следующие восемь групп содержат аминокислоты, которые являются консервативными заменами друг для друга:In the case of polypeptide sequences, conservatively modified variants encompass individual substitutions, deletions, or additions in the polypeptide sequence that result in the substitution of an amino acid for a chemically similar amino acid. Conservative substitution tables providing functionally similar amino acids are well known in the art. Such conservatively modified variants are in addition to, and not exclusive to, the polymorphic variants, interspecies homologues and alleles of the present invention. The following eight groups contain amino acids that are conservative substitutions for each other:
1) аланин (А), глицин (G);1) alanine (A), glycine (G);
2) аспарагиновая кислота (D), глутаминовая кислота (Е);2) aspartic acid (D), glutamic acid (E);
3) аспарагин (N), глутамин (Q);3) asparagine (N), glutamine (Q);
4) аргинин (R), лизин (K);4) arginine (R), lysine (K);
5) изолейцин (I), лейцин (L), метионин (М), валин (V);5) isoleucine (I), leucine (L), methionine (M), valine (V);
6) фенилаланин (F), тирозин (Y), триптофан (W); 7) серин (S), треонин (Т) и6) phenylalanine (F), tyrosine (Y), tryptophan (W); 7) serine (S), threonine (T) and
8) цистеин (С), метионин (М) (см., например, Creighton, Proteins (1984)).8) cysteine (C), methionine (M) (see, for example, Creighton, Proteins (1984)).
В некоторых вариантах осуществления термин консервативные модификации последовательности используется для обозначения аминокислотных модификаций, которые не оказывают значительного влияния на характеристики связывания у антитела, содержащего аминокислотную последовательность, или не изменяют их.In some embodiments, the term conservative sequence modifications is used to refer to amino acid modifications that do not significantly affect or change the binding characteristics of an antibody containing an amino acid sequence.
Используемый в данном документе термин оптимизированная относится к нуклеотидной последовательности, кодирующей аминокислотную последовательность, которая была изменена с применением кодонов, предпочтительных в продуцирующих клетке или организме, обычно в эукариотической клетке, например, дрожжевой клетке, клетке Pichia, грибной клетке, клетке Trichoderma, клетке яичника китайского хомячка (СНО) или человеческой клетке. Оптимизированную нуклеотидную последовательность конструируют таким образом, чтобы полностью или насколько это возможно сохранить аминокислотную последовательность, изначально закодированную в первоначальной нуклеотидной последовательности, которая также известна как исходная последовательность.As used herein, the term optimized refers to a nucleotide sequence encoding an amino acid sequence that has been altered using codons preferred in a producing cell or organism, typically a eukaryotic cell, e.g., a yeast cell, a Pichia cell, a fungus cell, a Trichoderma cell, an ovarian cell Chinese hamster (CHO) or human cage. The optimized nucleotide sequence is designed in such a way as to fully or as far as possible preserve the amino acid sequence originally encoded in the original nucleotide sequence, which is also known as the original sequence.
Термины процент идентичности или процентная идентичность, в контексте двух или более нуклеиновых кислот или полипептидных последовательностей, относятся к степени, в которой две или более последовательности или подпоследовательности являются одинаковыми. Две последовательности являются идентичными, если они имеют одинаковую последовательность из аминокислот или нуклеотидов на протяжении области, подлежащей сравнению. Две последовательности являются практически идентичными, если две последовательности имеют указанную процентную долю аминокислотных остатков или нуклеотидов, которые являются одинаковыми (т. е. 60% идентичность, необязательно 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичность на протяжении указанной области или, если не указано, на протяжении всей последовательности), при сравнении и выравнивании для обеспечения максимального соответствия на протяжении окна сравнения или обозначенной области, как измерено с применением одного из следующих алгоритмов сравнения последовательности или посредством ручного выравнивания и визуального просмотра. Необязательно идентичность существует на протяжении области, длина которой составляет по меньшей мере приблизительно 30 нуклеотидов (или 10 аминокислот), или более предпочтительно на протяжении области, длина которой составляет 100-500 или 1000 или более нуклеотидов (или 20, 50, 200 или более аминокислот).The terms percent identity or percent identity, in the context of two or more nucleic acids or polypeptide sequences, refers to the degree to which two or more sequences or subsequences are the same. Two sequences are identical if they have the same amino acid or nucleotide sequence over the region to be compared. Two sequences are substantially identical if two sequences have the specified percentage of amino acid residues or nucleotides that are the same (i.e. 60% identity, optionally 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95 % or 99% identity over the specified region or, if not specified, throughout the entire sequence), when compared and aligned to ensure maximum agreement throughout the comparison window or specified region, as measured using one of the following sequence comparison algorithms or by manual alignment and visual inspection. Optionally, identity exists over a region that is at least about 30 nucleotides (or 10 amino acids) long, or more preferably over a region that is 100-500 or 1000 or more nucleotides (or 20, 50, 200 or more amino acids) long. ).
При сравнении последовательностей обычно одна последовательность выступает в качестве эталонной последовательности, с которой сравнивают тестируемые последовательности. При использовании алгоритма сравнения последовательностей тестируемую и эталонную последовательности вводят в компьютер, если необходимо, устанавливают координаты подпоследовательностей и устанавливают программные параметры алгоритма для анализа последовательностей. Могут применяться программные параметры по умолчанию или можно устанавливать альтернативные параметры. На основании программных параметров алгоритм сравнения последовательностей затем рассчитывает значения процента идентичности последовательностей для тестируемых последовательностей относительно эталонной последовательности.When comparing sequences, usually one sequence acts as a reference sequence against which the test sequences are compared. When using the sequence comparison algorithm, the test and reference sequences are entered into the computer, if necessary, the coordinates of the subsequences are set, and the software parameters of the algorithm for sequence analysis are set. Default program settings may be used, or alternative settings may be set. Based on the program parameters, the sequence comparison algorithm then calculates percent sequence identity values for the test sequences relative to the reference sequence.
Используемое в данном документе окно сравнения предусматривает ссылку на сегмент из любого количества смежных положений, выбранных из группы, состоящей из от 20 до 600, обычно от приблизительно 50 до приблизительно 200, чаще от приблизительно 100 до приблизительно 150, в котором последовательность можно сравнивать с эталонной последовательностью с таким же количеством смежных положений, после того как две последовательности подвергли оптимальному выравниванию. СпособыAs used herein, a comparison window refers to a segment of any number of contiguous positions selected from the group consisting of 20 to 600, typically about 50 to about 200, more typically about 100 to about 150, in which the sequence can be compared to a reference sequence with the same number of contiguous positions after the two sequences have been optimally aligned. Ways
- 14 042529 выравнивания последовательностей для проведения сравнения хорошо известны из уровня техники. Оптимальное выравнивание последовательностей для сравнения можно проводить, например, с помощью алгоритма поиска локальной гомологии Смита-Уотермана, Adv. Appl. Math. 2:482c (1970), с помощью алгоритма выравнивания областей гомологии Нидлмана-Вунша, J. Mol. Biol. 48:443 (1970), с помощью способа поиска сходства Пирсона-Липмана, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:2444 (1988), с помощью компьютерных реализаций таких алгоритмов (GAP, BESTFIT, FASTA и TFASTA в составе пакета программного обеспечения Wisconsin Genetics, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Мэдисон, Висконсин) или с помощью ручного выравнивания и визуального просмотра (см., например, Brent et al., Current Protocols in Molecular Biology, 2003).- 14 042529 sequence alignments for comparison are well known in the art. Optimal alignment of sequences for comparison can be performed, for example, using the Smith-Waterman Local Homology Search Algorithm, Adv. Appl. Math. 2:482c (1970), using the Needleman-Wunsch homology region alignment algorithm, J. Mol. Biol. 48:443 (1970), using the Pearson-Lipman similarity search method, Proc. Natl. Acad. sci. USA 85:2444 (1988), using computer implementations of such algorithms (GAP, BESTFIT, FASTA, and TFASTA as part of the Wisconsin Genetics software package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI) or using manual alignment and visual browsing (see, for example, Brent et al., Current Protocols in Molecular Biology, 2003).
Два примера алгоритмов, которые подходят для определения процента идентичности последовательностей и сходства последовательностей, представляют собой алгоритмы BLAST и BLAST 2.0, которые описаны в Altschul et al., Nuc. Acids Res. 25:3389-3402, 1977; и Altschul et al., J. Mol. Biol. 215:403410, 1990, соответственно. Программное обеспечение для осуществления анализов BLAST находится в открытом доступе от Национального центра биотехнологической информации. На первом этапе данный алгоритм предусматривает идентификацию пар последовательностей с высоким показателем сходства (HSP) за счет идентификации коротких слов длиной W в запрашиваемой последовательности, которые либо совпадают, либо удовлетворяют некоторому пороговому баллу Т с положительным значением при выравнивании со словом такой же длины в последовательности из базы данных. Т известен под названием пороговый балл соседних слов (Altschul et al., выше). Эти первоначальные совпадения соседних слов выступают в качестве затравок для начала поисков, предназначенных для нахождения более длинных HSP, содержащие их. Совпадения слов продлеваются в обоих направлениях вдоль каждой последовательности до тех пор, пока может увеличиваться суммарный балл выравнивания. В случае нуклеотидных последовательностей суммарные баллы рассчитывают с применением параметров М (вознаграждающий балл за пару совпадающих остатков; всегда >0) и N (штрафной балл за несовпадающие остатки; всегда <0). В случае аминокислотных последовательностей для подсчета суммарного балла применяют матрицу замен. Продление совпадений слов в каждом направлении останавливается, когда суммарный балл выравнивания уменьшается на величину X относительно своего максимального достигнутого значения; суммарный балл стремится к нулю или ниже вследствие накопления одного или нескольких выравниваний остатков с отрицательными баллами; или достигается конец любой из последовательностей. Параметры W, Т и X алгоритма BLAST определяют чувствительность и скорость выравнивания. В программе BLASTN (для нуклеотидных последовательностей) в качестве параметров по умолчанию применяется длина слова (W), составляющая 11, ожидание (Е), составляющее 10, М=5, N=-4 и сравнение обеих нитей. В случае аминокислотных последовательностей в программе BLASTP в качестве параметров по умолчанию применяется длина слова, составляющая 3, и ожидание (Е), составляющее 10, и матрица замен BLOSUM62 (см. Henikoff and Henikoff (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915), выравнивания (В), составляющие 50, ожидание (Е), составляющее 10, М=5, N=-4 и сравнение обеих нитей.Two examples of algorithms that are suitable for determining percent sequence identity and sequence similarity are the BLAST and BLAST 2.0 algorithms, which are described in Altschul et al., Nuc. Acids Res. 25:3389-3402, 1977; and Altschul et al., J. Mol. Biol. 215:403410, 1990, respectively. BLAST analysis software is available from the National Center for Biotechnology Information. At the first stage, this algorithm involves the identification of pairs of sequences with a high score of similarity (HSP) by identifying short words of length W in the requested sequence that either match or satisfy some threshold score T with a positive value when aligned with a word of the same length in the sequence of Database. T is known as the neighborhood word threshold score (Altschul et al., supra). These initial neighbor word matches act as seeds to start searches designed to find longer HSPs containing them. Word matches are extended in both directions along each sequence for as long as the total alignment score can increase. For nucleotide sequences, total scores are calculated using the parameters M (reward score for a pair of matching residues; always >0) and N (penalty score for mismatched residues; always <0). In the case of amino acid sequences, a substitution matrix is used to calculate the total score. The extension of word matches in each direction stops when the total alignment score decreases by X from its maximum achieved value; the total score tends to zero or lower due to the accumulation of one or more negative-scoring residual alignments; or the end of either sequence is reached. The W, T and X parameters of the BLAST algorithm determine the sensitivity and speed of the alignment. The BLASTN program (for nucleotide sequences) uses word length (W) of 11, expectation (E) of 10, M=5, N=-4, and comparison of both strands as default parameters. For amino acid sequences, the BLASTP program defaults to a word length of 3 and an expectation (E) of 10 and a BLOSUM62 substitution matrix (see Henikoff and Henikoff (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915), alignments (B) of 50, wait (E) of 10, M=5, N=-4, and comparison of both strands.
Алгоритм BLAST также осуществляет статистический анализ сходства между двумя последовательностями (см., например, Karlin and Altschul, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5787, 1993). Одной мерой сходства, предусмотренной в алгоритме BLAST, является наименьшая суммарная вероятность (Р (N)), которая указывает на вероятность, с которой совпадение между двумя нуклеотидными или аминокислотными последовательностями возникло случайно. Например, нуклеиновая кислота считается схожей с эталонной последовательностью, если наименьшая суммарная вероятность при сравнении тестируемой нуклеиновой кислоты с эталонной нуклеиновой кислотой составляет менее приблизительно 0,2, более предпочтительно менее приблизительно 0,01 и наиболее предпочтительно менее приблизительно 0,001.The BLAST algorithm also performs a statistical analysis of the similarity between two sequences (see, for example, Karlin and Altschul, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5787, 1993). One measure of similarity provided in the BLAST algorithm is the smallest sum probability (P(N)), which indicates the probability with which a match between two nucleotide or amino acid sequences occurred by chance. For example, a nucleic acid is considered similar to a reference sequence if the smallest sum probability when comparing the test nucleic acid to the reference nucleic acid is less than about 0.2, more preferably less than about 0.01, and most preferably less than about 0.001.
Процентную идентичность между двумя аминокислотными последовательностями также можно определить с использованием алгоритма из Е. Meyers и W. Miller (Comput. Appl. Biosci. 4:11-17, (1988) который был включен в программу ALIGN (версия 2.0), с применением таблицы весов замен остатков РАМ120, штрафа за продление гэпа, составляющего 12, и штрафа за открытие гэпа, составляющего 4. Кроме того, процентная идентичность между двумя аминокислотными последовательностями может быть определена с применением алгоритма Нидлмана-Вунша, J. Mol. Biol. 48:444-453, (1970), который был включен в программу GAP в составе пакета программного обеспечения GCG (доступного на www.gcg.com), с применением либо матрицы BLOSUM62, либо матрицы РАМ250, и также штрафа за открытие гэпа, составляющего 16, 14, 12, 10, 8, 6 или 4, и штрафа за продление гэпа, составляющего 1, 2, 3, 4, 5 или 6.Percent identity between two amino acid sequences can also be determined using the algorithm from E. Meyers and W. Miller (Comput. Appl. Biosci. 4:11-17, (1988) which was included in the ALIGN program (version 2.0), using the table PAM120 residue substitution weights, a gap extension penalty of 12, and a gap opening penalty of 4. In addition, percent identity between two amino acid sequences can be determined using the Needleman-Wunsch algorithm, J. Mol. Biol.48:444 -453, (1970), which was included in the GAP program as part of the GCG software package (available at www.gcg.com), using either the BLOSUM62 matrix or the PAM250 matrix, and also a gap opening penalty of 16, 14 , 12, 10, 8, 6, or 4, and a gap extension penalty of 1, 2, 3, 4, 5, or 6.
Помимо процента идентичности последовательностей, упомянутого выше, еще одним показателем того, что две последовательности нуклеиновой кислоты или полипептида являются практически идентичными, является то, что полипептид, кодируемый первой нуклеиновой кислотой, является иммунологически перекрестно реактивным с антителами, выработка которых индуцирована полипептидом, кодируемым второй нуклеиновой кислотой, как описано ниже. Таким образом, полипептид, как правило, является практически идентичным второму полипептиду, например, если два пептида отличаются только консервативными заменами. Другим показателем того, что две последовательности нуклеиновой кисло- 15 042529 ты являются практически идентичными, является то, что две молекулы или их комплементарные цепи гибридизируются друг с другом в жестких условиях, как описано ниже. Еще одним показателем того, что две последовательности нуклеиновой кислоты являются практически идентичными, является то, что для амплификации последовательности могут применяться одни и те же праймеры.In addition to the percent sequence identity mentioned above, another indication that two nucleic acid or polypeptide sequences are substantially identical is that the polypeptide encoded by the first nucleic acid is immunologically cross-reactive with antibodies induced by the polypeptide encoded by the second nucleic acid. acid as described below. Thus, the polypeptide is typically substantially identical to the second polypeptide, for example, if the two peptides differ only in conservative substitutions. Another indication that two nucleic acid sequences are substantially identical is that the two molecules, or their complementary strands, hybridize to each other under stringent conditions, as described below. Another indication that two nucleic acid sequences are substantially identical is that the same primers can be used to amplify the sequence.
Термин нуклеиновая кислота используется в данном документе взаимозаменяемо с термином полинуклеотид и относится к дезоксирибонуклеотидам или рибонуклеотидам и полимерам на их основе в одно- или двухнитевой форме. Термин охватывает нуклеиновые кислоты, содержащие известные аналоги нуклеотидов или модифицированные остатки или связи в остове, которые являются синтетическими, встречающимися в природе и не встречающимися в природе, которые характеризуются свойствами связывания, подобными эталонной нуклеиновой кислоте, и которые метаболизируются подобно эталонным нуклеотидам. Примеры таких аналогов включают без ограничения фосфоротиоаты, фосфорамидаты, метилфосфонаты, хиральные метилфосфонаты, 2-O-метилрибонуклеотиды, пептидонуклеиновые кислоты (PNA).The term nucleic acid is used herein interchangeably with the term polynucleotide and refers to deoxyribonucleotides or ribonucleotides and polymers based on them in single or double stranded form. The term encompasses nucleic acids containing known nucleotide analogs or modified backbone residues or bonds that are synthetic, naturally occurring or non-naturally occurring, that have binding properties similar to the reference nucleic acid, and that are metabolized like the reference nucleotides. Examples of such analogues include, without limitation, phosphorothioates, phosphoramidates, methylphosphonates, chiral methylphosphonates, 2-O-methylribonucleotides, peptidonucleic acids (PNAs).
Если не указано иное, конкретная последовательность нуклеиновой кислоты также в неявном виде охватывает ее консервативно модифицированные варианты (например, замены на основе вырожденных кодонов) и комплементарные последовательности, а также последовательность, указанную явным образом. А именно, как подробно описано ниже, замены на основе вырожденных кодонов можно проводить за счет создания последовательностей, в которых третье положение в одном или нескольких выбранных (или всех) кодонах заменено на любой из канонических нуклеозидов и/или остаток дезоксиинозина (Batzer et al., Nucleic Acid Res. 19:5081, 1991; Ohtsuka et al., J. Biol. Chem. 260:2605-2608, 1985; и Rossolini et al., Mol. Cell. Probes 8:91-98, 1994).Unless otherwise indicated, a particular nucleic acid sequence also implicitly encompasses its conservatively modified variants (eg, substitutions based on degenerate codons) and complementary sequences, as well as the sequence specified explicitly. Namely, as detailed below, substitutions based on degenerate codons can be performed by creating sequences in which the third position in one or more selected (or all) codons is replaced by any of the canonical nucleosides and/or a deoxyinosine residue (Batzer et al. , Nucleic Acid Res. 19:5081, 1991; Ohtsuka et al., J. Biol. Chem. 260:2605-2608, 1985; and Rossolini et al., Mol. Cell. Probes 8:91-98, 1994).
В контексте нуклеиновых кислот термин функционально связанный относится к функциональной взаимосвязи двух или более сегментов полинуклеотида (например, ДНК). Как правило, он относится к функциональной взаимосвязи регулирующей транскрипцию последовательности с транскрибируемой последовательностью. Например, промоторная или энхансерная последовательность является функционально связанной с кодирующей последовательностью, если она стимулирует или модулирует транскрипцию кодирующей последовательности в соответствующей клетке-хозяине или другой системе экспрессии. Обычно регулирующие транскрипцию промоторные последовательности, которые являются функционально связанными с транскрибируемой последовательностью, являются физически смежными с транскрибируемой последовательностью, т. е. они функционируют в цис-положении. Однако некоторые регулирующие транскрипцию последовательности, такие как энхансеры, не обязательно должны быть физически смежными или располагаться в непосредственной близости от кодирующих последовательностей, транскрипцию которых они усиливают.In the context of nucleic acids, the term operably linked refers to the functional relationship of two or more segments of a polynucleotide (eg, DNA). Generally, it refers to the functional relationship of a transcriptional regulatory sequence to a transcribed sequence. For example, a promoter or enhancer sequence is operably linked to a coding sequence if it stimulates or modulates the transcription of the coding sequence in an appropriate host cell or other expression system. Typically, transcription-regulating promoter sequences that are operably linked to the transcribed sequence are physically adjacent to the transcribed sequence, ie, they function in the cis position. However, some transcription control sequences, such as enhancers, need not be physically contiguous or in close proximity to the coding sequences whose transcription they enhance.
Термины полипептид и белок используются в данном документе взаимозаменяемо для обозначения полимера из аминокислотных остатков. Термины применимы к полимерам из аминокислот, в которых один или несколько аминокислотных остатков представляют собой искусственный химический миметик соответствующей встречающейся в природе аминокислоты, а также к полимерам из встречающихся в природе аминокислот и полимеру из не встречающихся в природе аминокислот. Если не указано иное, конкретная полипептидная последовательность также в неявном виде охватывает ее консервативно модифицированные варианты.The terms polypeptide and protein are used interchangeably herein to refer to a polymer of amino acid residues. The terms apply to polymers of amino acids in which one or more amino acid residues is an artificial chemical mimetic of the corresponding naturally occurring amino acid, as well as to polymers of naturally occurring amino acids and a polymer of non-naturally occurring amino acids. Unless otherwise indicated, a particular polypeptide sequence also implicitly encompasses conservatively modified variants thereof.
Используемый в данном документе термин конъюгат антитела и лекарственного средства или иммуноконъюгат относится к связи антитела или его антигенсвязывающего фрагмента с другим средством, таким как химиотерапевтическое средство, токсин, иммунотерапевтическое средство, зонд для визуализации и т. п. Связь может представлять собой ковалентные связи или нековалентные взаимодействия, такие как посредством электростатических сил. Для образования конъюгата антитела и лекарственного средства могут использоваться различные линкеры, известные из уровня техники. Кроме того, конъюгат антитела и лекарственного средства может предусматриваться в форме слитого белка, который может экспрессироваться с полинуклеотида, кодирующего иммуноконъюгат. Используемый в данном документе слитый белок относится к белкам, созданным за счет соединения двух или более генов или фрагментов генов, которые изначально кодировали отдельные белки (в том числе пептиды и полипептиды). Трансляция слитого гена приводит к единому белку с функциональными свойствами, происходящими из каждого из исходных белков.As used herein, the term antibody drug conjugate or immunoconjugate refers to the association of an antibody or antigen-binding fragment thereof with another agent, such as a chemotherapeutic agent, toxin, immunotherapeutic agent, imaging probe, and the like. The association may be covalent bonds or non-covalent interactions, such as through electrostatic forces. Various linkers known in the art can be used to form an antibody-drug conjugate. In addition, the antibody-drug conjugate may be provided in the form of a fusion protein that can be expressed from a polynucleotide encoding an immunoconjugate. As used herein, a fusion protein refers to proteins created by combining two or more genes or gene fragments that originally encoded separate proteins (including peptides and polypeptides). Translation of the fused gene results in a single protein with functional properties derived from each of the original proteins.
Термин субъект охватывает человека и отличных от человека животных. Отличные от человека животные охватывают всех позвоночных, например, млекопитающих и отличных от млекопитающих животных, как, например, отличных от человека приматов, овцу, собаку, корову, кур, амфибий и рептилий. За исключением случаев, когда это отмечается, термины пациент или субъект используются в данном документе взаимозаменяемо.The term subject encompasses humans and non-human animals. Non-human animals include all vertebrates, such as mammals and non-mammals, such as non-human primates, sheep, dogs, cows, chickens, amphibians and reptiles. Except where noted, the terms patient or subject are used interchangeably herein.
Используемый в данном документе термин цитотоксин или цитотоксическое средство относится к любому средству, которое является вредным для роста и пролиферации клеток и которое может функционировать с уменьшением, ингибированием или разрушением клетки или злокачественной опухоли.As used herein, the term cytotoxin or cytotoxic agent refers to any agent that is detrimental to cell growth and proliferation and that can function to reduce, inhibit, or destroy a cell or cancer.
Используемый в данном документе термин противораковое средство относится к любому средст- 16 042529 ву, которое может использоваться для лечения или предупреждения нарушения пролиферации клеток, такого как рак, в том числе без ограничения к цитотоксическим средствам, химиотерапевтическим средствам, лучевой терапии и средствам для лучевой терапии, нацеливающим противораковым средствам и иммунотерапевтическим средствам.As used herein, the term anticancer agent refers to any agent that can be used to treat or prevent a cell proliferation disorder such as cancer, including, without limitation, cytotoxic agents, chemotherapeutic agents, radiotherapy, and radiotherapy agents. , targeting anticancer agents and immunotherapeutic agents.
Используемый в данном документе термин фрагмент, представляющий собой лекарственное средство или полезная нагрузка относится к химическому фрагменту, который конъюгирован с антителом или антигенсвязывающим фрагментом по настоящему изобретению, и может охватывать любое терапевтическое или диагностическое средство, например, противораковое, противовоспалительное, противоинфекционное (например, противогрибковое, антибактериальное, антипаразитарное, противовирусное) или анестетическое средство. Например, фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, может представлять собой противораковое средство, такое как цитотоксин. В некоторых вариантах осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, выбран из ингибитора V-АТФазы, ингибитора HSP90, ингибитора IAP, ингибитора mTor, стабилизатора микротрубочек, дестабилизатора микротрубочек, ауристатина, доластатина, майтанзиноида, MetAP (метионинаминопептидазы), ингибитора РНК-полимеразы, пирролобензодиазепина (PBD), аманитина, ингибитора ядерного экспорта белков CRM1, ингибитора DPPIV, ингибитора реакций переноса фосфорила в митохондриях, ингибитора синтеза белка, ингибитора киназ, ингибитора CDK2, ингибитора CDK9, ингибитора протеасомы, ингибитора кинезина, ингибитора HDAC, ДНК-повреждающего средства, ДНК-алкилирующего средства, ДНКинтеркалятора, средства, связывающего малую бороздку ДНК, и ингибитора DHFR. Способы прикрепления каждого из них к линкеру, совместимому с антителами и способом по настоящему изобретению, известны из уровня техники. См., например, Singh et al. (2009) Therapeutic Antibodies: Methods and Protocols, vol. 525, 445-457. Кроме того, полезная нагрузка может представлять собой зонд для биофизического обнаружения, флуорофор, спиновую метку, зонд для инфракрасного обнаружения, зонд для обнаружения аффинности, хелатор, зонд для спектроскопического обнаружения, радиоактивный зонд, липидную молекулу, полиэтиленгликоль, полимер, спиновую метку, ДНК, РНК, белок, пептид, поверхность, антитело, фрагмент антитела, наночастицу, квантовую точку, липосому, частицу PLGA, сахарид или полисахарид.As used herein, the term drug or payload moiety refers to a chemical moiety that is conjugated to an antibody or antigen-binding moiety of the present invention, and may encompass any therapeutic or diagnostic agent, e.g. , antibacterial, antiparasitic, antiviral) or anesthetic. For example, a drug moiety may be an anticancer agent such as a cytotoxin. In some embodiments, the drug moiety is selected from V-ATPase inhibitor, HSP90 inhibitor, IAP inhibitor, mTor inhibitor, microtubule stabilizer, microtubule destabilizer, auristatin, dolastatin, maytansinoid, MetAP (methionine aminopeptidase), RNA polymerase inhibitor, pyrrolobenzodiazepine (PBD), amanitin, CRM1 nuclear export inhibitor, DPPIV inhibitor, mitochondrial phosphoryl transfer inhibitor, protein synthesis inhibitor, kinase inhibitor, CDK2 inhibitor, CDK9 inhibitor, proteasome inhibitor, kinesin inhibitor, HDAC inhibitor, DNA damaging agent, DNA an α-alkylating agent, a DNA intercalator, a DNA minor groove binding agent, and a DHFR inhibitor. Methods for attaching each of these to an antibody-compatible linker and method of the present invention are known in the art. See, for example, Singh et al. (2009) Therapeutic Antibodies: Methods and Protocols, vol. 525, 445-457. In addition, the payload may be a biophysical detection probe, a fluorophore, a spin label, an infrared detection probe, an affinity detection probe, a chelator, a spectroscopic detection probe, a radioactive probe, a lipid molecule, polyethylene glycol, a polymer, a spin label, DNA, RNA, protein, peptide, surface, antibody, antibody fragment, nanoparticle, quantum dot, liposome, PLGA particle, saccharide or polysaccharide.
Термин фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, обозначает часть конъюгата антитела и лекарственного средства, которая имеет структуру майтанзиноидного соединения. Сначала майтанзин был выделен из куста Maytenus serrata, произрастающего в восточной Африке (патент США № 3896111). Впоследствии было установлено, что некоторые микроорганизмы также вырабатывают майтанзиноиды, такие как майтанзинол и сложные эфиры С-3-майтанзинола (патент США № 4151042). Сообщалось о синтетическом майтанзиноле и аналогах майтанзинола. См. патенты США №№ 4137230; 4248870; 4256746; 4260608; 4265814; 4294757; 4307016; 4308268; 4308269; 4309428; 4313946; 4315929; 4317821; 4322348; 4331598; 4361650; 4364866; 4424219; 4450254; 4362663 и 4371533, и Kawai et al. (1984) Chem. Pharm. Bull. 3441-3451), каждый из которых однозначно включен посредством ссылки. Примеры конкретных майтанзиноидов, применимых для конъюгации, включают DM1, DM3 и DM4.The term maytansinoid drug fragment refers to the portion of an antibody-drug conjugate that has the structure of a maytansinoid compound. First, maytansine was isolated from the bush Maytenus serrata, growing in East Africa (US patent No. 3896111). Subsequently, it was found that some microorganisms also produce maytansinoids, such as maytansinol and esters of C-3-maytansinol (US patent No. 4151042). Synthetic maytansinol and maytansinol analogues have been reported. See U.S. Patent Nos. 4,137,230; 4248870; 4256746; 4260608; 4265814; 4294757; 4307016; 4308268; 4308269; 4309428; 4313946; 4315929; 4317821; 4322348; 4331598; 4361650; 4364866; 4424219; 4450254; 4362663 and 4371533, and Kawai et al. (1984) Chem. Pharm. Bull. 3441-3451), each of which is expressly incorporated by reference. Examples of specific maytansinoids useful for conjugation include DM1, DM3 and DM4.
Опухоль относится к росту и пролиферации неопластических клеток, неважно злокачественных или доброкачественных, а также всех предраковых и раковых клеток и тканей.Tumor refers to the growth and proliferation of neoplastic cells, whether malignant or benign, and all precancerous and cancerous cells and tissues.
Термин противоопухолевая активность означает снижение скорости пролиферации, жизнеспособности или метастатической активности опухолевых клеток. Например, противоопухолевая активность может быть показана за счет падения скорости роста аномальных клеток, которое появляется во время терапии, или стабилизации или уменьшения размера опухоли, или более длительного выживания, обусловленного терапией, по сравнению с контролем без терапии. Такую активность можно оценить с применением принятых in vitro или in vivo моделей опухоли, в том числе без ограничения ксенотрансплантатных моделей, моделей с аллогенными трансплантатами, моделей MMTV и других известных моделей, известных из уровня техники для исследования противоопухолевой активности.The term antitumor activity means a reduction in the rate of proliferation, viability or metastatic activity of tumor cells. For example, antitumor activity can be shown by a drop in the growth rate of abnormal cells that occurs during therapy, or stabilization or reduction in tumor size, or longer survival due to therapy compared to a control without therapy. Such activity can be assessed using accepted in vitro or in vivo tumor models, including, but not limited to, xenograft models, allogeneic graft models, MMTV models, and other known models known in the art for testing antitumor activity.
Термин злокачественная опухоль относится к недоброкачественной опухоли или раку. Используемый в данном документе термин рак охватывает злокачественную опухоль, которая характеризуется дерегулированным или неконтролируемым ростом клеток. Иллюстративные типы рака включают карциномы, саркомы, лейкозы и лимфомы.The term malignant tumor refers to a benign tumor or cancer. As used herein, the term cancer encompasses a malignant tumor that is characterized by deregulated or uncontrolled cell growth. Illustrative types of cancer include carcinomas, sarcomas, leukemias, and lymphomas.
Термин рак охватывает первичные злокачественные опухоли (например, опухоли, клетки которых не мигрировали в локализации в организме субъекта, отличные от локализации исходной опухоли) и вторичные злокачественные опухоли (например, опухоли, развившиеся за счет метастазирования, миграции опухолевых клеток во вторичные локализации, которые отличны от локализации исходной опухоли).The term cancer encompasses primary malignant tumors (e.g., tumors whose cells have not migrated to locations in the subject's body that are different from those of the original tumor) and secondary malignancies (e.g., tumors that have developed by metastasis, migration of tumor cells to secondary sites that are different from the location of the original tumor).
Термин CCR7 (также известный как BLR2, CC-CKR-7, CCR-7, CD197, CDw197, CMKBR7, EBI1 или хемокиновый рецептор 7 с С-С мотивом) относится к представителю семейства рецепторов, сопряженных с G белком. Последовательность нуклеиновой кислоты и аминокислотная последовательность CCR7 человек была опубликована в GenBank под следующими №№ доступа: NP_001829, NP_001288643, NP_001288645, NP_00128864 6, NP_001288647 (аминокислотные последовательности) и NM_001838, NM_001301714, NM_001301716, NM_001301717, NM_001301718 (нуклеотидные последовательности).The term CCR7 (also known as BLR2, CC-CKR-7, CCR-7, CD197, CDw197, CMKBR7, EBI1 or C-C chemokine receptor 7) refers to a member of the G protein-coupled receptor family. Последовательность нуклеиновой кислоты и аминокислотная последовательность CCR7 человек была опубликована в GenBank под следующими №№ доступа: NP_001829, NP_001288643, NP_001288645, NP_00128864 6, NP_001288647 (аминокислотные последовательности) и NM_001838, NM_001301714, NM_001301716, NM_001301717, NM_001301718 (нуклеотидные последовательности).
- 17 042529- 17 042529
Используемый в данном документе термин CCR7 применяют для совместного обозначения всех встречающихся в природе изоформ белка CCR7 или его варианта.As used herein, the term CCR7 is used collectively to refer to all naturally occurring isoforms of the CCR7 protein or a variant thereof.
Термин вариант относится к полипептиду, который имеет практически идентичную аминокислотную последовательность с эталонным полипептидом, или кодируется практически идентичной нуклеотидной последовательностью и может характеризоваться одной или несколькими активностями эталонного полипептида. Например, вариант может характеризоваться приблизительно 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99% или более высокой идентичностью последовательности с эталонным полипептидом, при этом он сохраняет одну или несколько активностей эталонного полипептида.The term variant refers to a polypeptide that has a substantially identical amino acid sequence to a reference polypeptide, or is encoded by a substantially identical nucleotide sequence, and may have one or more of the activities of the reference polypeptide. For example, a variant may have approximately 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or greater sequence identity to the reference polypeptide while retaining one or more of the activities of the reference polypeptide.
Используемые в данном документе термины лечить, осуществление лечения или лечение любого заболевания или нарушения в одном варианте осуществления относятся к уменьшению тяжести заболевания или нарушения (т.е. замедлению, или остановке, или снижению развития заболевания или по меньшей мере одного из его клинических симптомов). В другом варианте осуществления лечить, осуществление лечения или лечение относятся к облегчению или уменьшению тяжести по меньшей мере одного физического параметра, в том числе таких, которые могут быть неявными для пациента. В еще одном варианте осуществления лечить, осуществление лечения или лечение означают модулирование заболевания или нарушения либо физически (например, стабилизацию явного симптома), либо физиологически (например, стабилизацию физического параметра), либо с помощью того и другого.As used herein, the terms treat, treat, or treat any disease or disorder, in one embodiment, refer to lessening the severity of the disease or disorder (i.e., slowing, or stopping, or reducing the progression of the disease or at least one of its clinical symptoms) . In another embodiment, to treat, treat, or treat refers to alleviating or reducing the severity of at least one physical parameter, including those that may not be apparent to the patient. In yet another embodiment, to treat, treat, or treat means to modulate a disease or disorder, either physically (eg, stabilizing an overt symptom) or physiologically (eg, stabilizing a physical parameter) or both.
Используемый в данном документе термин предупреждать, осуществление предупреждения или предупреждение любого заболевания или нарушения относится к профилактическому лечению заболевания или нарушения или замедлению начала или прогрессирования заболевания или нарушения.As used herein, the term prevent, prevent, or prevent any disease or disorder refers to the prophylactic treatment of a disease or disorder, or to slow the onset or progression of a disease or disorder.
Термин терапевтически приемлемое количество или терапевтически эффективная доза взаимозаменяемо относится к количеству, достаточному для произведения требуемого результата (т.е. уменьшения размера опухоли, ингибирования роста опухоли, предотвращения метастазирования, ингибирования или предупреждения вирусной, бактериальной, грибковой или паразитарной инфекции). В некоторых вариантах осуществления терапевтически приемлемое количество не индуцирует или не вызывает нежелательные побочные эффекты. В некоторых вариантах осуществления терапевтически приемлемое количество индуцирует или вызывает побочные эффекты, но только такие, которые являются допустимыми с точки зрения медицинских работников, учитывая состояние пациента. Терапевтически приемлемое количество можно определять, вводя вначале низкую дозу, а затем постепенно увеличивать данную дозу до тех пор, пока не будет достигнут требуемый эффект. Профилактически эффективная доза и терапевтически эффективная доза молекул по настоящему изобретению может предупреждать проявление или, соответственно, приводить к уменьшению тяжести симптомов заболевания, в том числе симптомов, ассоциированных с раком.The term therapeutically acceptable amount or therapeutically effective dose interchangeably refers to an amount sufficient to produce the desired result (i.e., reduction in tumor size, inhibition of tumor growth, prevention of metastasis, inhibition or prevention of viral, bacterial, fungal or parasitic infection). In some embodiments, the therapeutically acceptable amount does not induce or cause unwanted side effects. In some embodiments, the therapeutically acceptable amount induces or causes side effects, but only those that are acceptable from the point of view of medical professionals, given the condition of the patient. A therapeutically acceptable amount can be determined by first administering a low dose and then gradually increasing this dose until the desired effect is achieved. A prophylactically effective dose and a therapeutically effective dose of the molecules of the present invention may prevent the onset of or, respectively, lead to a reduction in the severity of symptoms of a disease, including symptoms associated with cancer.
Термин совместное введение относится к присутствию двух активных средств в крови индивидуума. Активные средства, которые вводятся совместно, могут доставляться одновременно или последовательно.The term co-administration refers to the presence of two active agents in the blood of an individual. Active agents that are co-administered may be delivered simultaneously or sequentially.
В настоящем изобретении представлены антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и их конъюгаты с лекарственным средством, т.е. конъюгаты антитела и лекарственного средства или ADC, которые связываются с CCR7. В частности, в настоящем изобретении представлены антитела и фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые связываются с CCR7 и подвергаются интернализации после такого связывания. Антитела и фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) по настоящему изобретению могут применяться для получения конъюгатов антитела и лекарственного средства. Кроме того, в настоящем изобретении представлены конъюгаты антитела и лекарственного средства, которые характеризуются требуемыми фармакокинетическими характеристиками и другими требуемыми свойствами, и, таким образом, они могут применяться для лечения или предупреждения рака, экспрессирующего CCR7. В настоящем изобретении дополнительно предусмотрены фармацевтические композиции, содержащие конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению; а также способы изготовления и применения таких фармацевтических композиций для лечения или предупреждения рака.The present invention provides antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) and their drug conjugates, i.e. antibody drug conjugates or ADCs that bind to CCR7. In particular, the present invention provides antibodies and antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) that bind to CCR7 and are internalized after such binding. The antibodies and antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) of the present invention can be used to prepare antibody-drug conjugates. In addition, the present invention provides antibody-drug conjugates that have the desired pharmacokinetic characteristics and other desired properties, and thus can be used to treat or prevent cancer expressing CCR7. The present invention further provides pharmaceutical compositions containing the antibody-drug conjugates of the present invention; as well as methods of making and using such pharmaceutical compositions for the treatment or prevention of cancer.
Конъюгаты антитела и лекарственного средстваAntibody drug conjugates
В настоящем изобретении предусмотрены конъюгаты антитела и лекарственного средства, также называемые иммуноконъюгатами, где антитело, антигенсвязывающий фрагмент или его функциональный эквивалент, которые специфически связываются с CCR7, соединены с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство. В одном аспекте антитела, антигенсвязывающие фрагменты или их функциональные эквиваленты по настоящему изобретению соединены посредством ковалентной связи за счет линкера с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, которое представляет собой противораковое средство. Конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению могут доставлять эффективную дозу противоракового средства (например, цитотоксического средства) в ткани опухоли, экспрессирующей CCR7, вследствие чего может достигаться большая селективность (и более низкая эффективная доза).The present invention provides antibody-drug conjugates, also referred to as immunoconjugates, wherein an antibody, antigen-binding fragment, or functional equivalent thereof that specifically binds to CCR7 is linked to a drug moiety. In one aspect, the antibodies, antigen-binding fragments, or functional equivalents thereof of the present invention are linked via a covalent bond through a linker to a drug moiety that is an anticancer agent. The antibody drug conjugates of the present invention can deliver an effective dose of an anticancer agent (eg, a cytotoxic agent) to tumor tissue expressing CCR7, whereby greater selectivity (and lower effective dose) can be achieved.
В одном аспекте настоящего изобретения представлен иммуноконъюгат формулы (I) Ab-(L-(D)m)n,In one aspect of the present invention, there is provided an immunoconjugate of formula (I) Ab-(L-(D) m ) n ,
- 18 042529 где Ab представляет собой CCR7-связывающее антитело, описанное в данном документе;- 18 042529 where Ab is a CCR7-binding antibody described in this document;
L представляет собой линкер;L is a linker;
D представляет собой фрагмент, представляющий собой лекарственное средство;D is a drug moiety;
m составляет целое число от 1 до 8 и n составляет целое число от 1 до 20.m is an integer from 1 to 8; and n is an integer from 1 to 20.
В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 2, 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления m составляет 1; в других вариантах осуществления m составляет 2, 3 или 4.In one embodiment, n is an integer from 1 to 10, 2 to 8, or 2 to 5. In a particular embodiment, n is 2, 3, or 4. In some embodiments, m is 1; in other embodiments, m is 2, 3, or 4.
Хотя в конкретной молекуле конъюгата отношение лекарственного средства к антителу имеет точное значение (например, n, умноженное на m в формуле (I)), известно, что зачастую значение будет представлять собой среднее значение, когда его применяют для описания образца, содержащего множество молекул, вследствие некоторой степени гетерогенности, обычно сопряженной со стадией конъюгации. Средняя нагрузка для образца иммуноконъюгата обозначается в данном документе как отношение лекарственного средства к антителу или DAR. В некоторых вариантах осуществления, когда лекарственное средство представляет собой майтанзиноид, его называют MAR. В некоторых вариантах осуществления DAR составляет от приблизительно 2 до приблизительно 6, и обычно составляет приблизительно 3, 3,5, 4, 4,5, 5, 5,5, 6, 6,5, 7,0, 7,5, 8,0. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 50% образца по весу составляет соединение, характеризующееся средним DAR ± 2, и предпочтительно по меньшей мере 50% образца составляет конъюгат, который подразумевает среднее DAR ± 1. Варианты осуществления охватывают иммуноконъюгаты, у которых DAR составляет приблизительно 3,5, 3,6, 3,7, 3,8 или 3,9. В некоторых вариантах осуществления DAR, составляющее 'приблизительно n', означает, что измеренное значение DAR находится в пределах 20% от n.Although the ratio of drug to antibody has an exact value in a particular conjugate molecule (for example, n times m in formula (I)), it is known that often the value will be an average when used to describe a sample containing many molecules, due to some degree of heterogeneity usually associated with the conjugation step. The average loading for an immunoconjugate sample is referred to herein as the ratio of drug to antibody, or DAR. In some embodiments, when the drug is a maytansinoid, it is referred to as a MAR. In some embodiments, the DAR is from about 2 to about 6, and is typically about 3, 3.5, 4, 4.5, 5, 5.5, 6, 6.5, 7.0, 7.5, 8 ,0. In some embodiments, at least 50% of the sample, by weight, is a compound having an average DAR of ± 2, and preferably at least 50% of the sample is a conjugate that implies an average DAR of ± 1. Embodiments encompass immunoconjugates having a DAR of approximately 3 .5, 3.6, 3.7, 3.8 or 3.9. In some embodiments, a DAR of 'about n' means that the measured DAR is within 20% of n.
Настоящее изобретение также направлено на иммуноконъюгаты, содержащие антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и их функциональные эквиваленты, раскрытые в данном документе, соединенные или конъюгированные с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство. В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство D, представляет собой фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, в том числе характеризующиеся структуройThe present invention is also directed to immunoconjugates containing antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) and their functional equivalents disclosed herein, connected or conjugated to a fragment representing a drug. In one embodiment, the D drug moiety is a maytansinoid drug moiety, including those having the structure
где волнистая линия указывает на ковалентную связь атома серы майтанзиноида с линкером конъюгат антитела и лекарственного средства. R в каждом случае независимо представляет собой H или С1С6алкил. Алкиленовая цепь, прикрепляющая амидную группу к атому серы, может представлять собой метанил, этанил или пропил, т.е. r составляет 1, 2 или 3. (патент США № 633410, патент США № 5208020, Chari et al. (1992) Cancer Res. 52;127-131, Lui et al. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. 93:8618-8623).where the wavy line indicates the covalent bond of the sulfur atom of the maytansinoid to the linker of the antibody-drug conjugate. R is at each occurrence independently H or C1C 6 alkyl. The alkylene chain attaching the amide group to the sulfur atom may be methanyl, ethanyl or propyl, i.e. r is 1, 2 or 3. (U.S. Patent No. 633410, U.S. Patent No. 5208020, Chari et al. (1992) Cancer Res. 52;127-131, Lui et al. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. 93:8618-8623).
Все стереоизомеры фрагмента, представляющего собой майтанзиноидное лекарственное средство, предусмотрены для применения в иммуноконъюгатах по настоящему изобретению, т.е. любая комбинация R- и S-конфигураций по хиральным атомам углерода майтанзиноида. В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, характеризуется следующей стереохимией.All stereoisomers of the maytansinoid drug moiety are contemplated for use in the immunoconjugates of the present invention, ie. any combination of R and S configurations at the chiral carbons of the maytansinoid. In one embodiment, the maytansinoid drug moiety has the following stereochemistry.
В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, представляет собой N2'-деацетил-N2'-(3-меркапто-1-оксопропил)майтанзин (также известный как DM1). DM1 представлен следующей структурной формулой.In one embodiment, the maytansinoid drug moiety is N 2' -deacetyl-N 2 '-(3-mercapto-1-oxopropyl)maytansine (also known as DM1). DM1 is represented by the following structural formula.
- 19 042529- 19 042529
DM1DM1
В другом варианте осуществления фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, представляет собой N2’-деацетил-N2’-(4-меркапто-1-оксопентил)майтанзин (также известный как DM3). DM3 представлен следующей структурной формулой.In another embodiment, the maytansinoid drug moiety is N 2' -deacetyl-N 2 '-(4-mercapto-1-oxopentyl)maytansine (also known as DM3). DM3 is represented by the following structural formula.
DM3DM3
В другом варианте осуществления фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, представляет собой N2’-деацетил-N2’-(4-метил-4-меркапто-1-оксопентил)-майтанзин (также известный как DM4). DM4 представлен следующей структурной формулой.In another embodiment, the maytansinoid drug moiety is N 2' -deacetyl-N 2 '-(4-methyl-4-mercapto-1-oxopentyl)-mytansine (also known as DM4). DM4 is represented by the following structural formula.
DM4DM4
Фрагмент, представляющий собой лекарственное средство D, может быть соединен с антителом Ab с помощью линкера L. L представляет собой любой химический фрагмент, способный к соединению фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, с антителом за счет ковалентных связей. Сшивающий реагент представляет собой бифункциональный или мультифункциональный реагент, который может использоваться для соединения фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, и антитела с образованием конъюгатов антитела и лекарственного средства. Конъюгаты антитела и лекарственного средства могут быть получены с применением сшивающего реагента, имеющего реакционноспособные функциональные группы, способные к связывание как с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, так и с антителом. Например, цистеин, тиол или амин, например, на Nконце или боковой цепи аминокислоты, такой как лизин, в антителе могут образовать связь с функциональной группой сшивающего реагента. В качестве альтернативы конъюгаты антитела и лекарственного средства могут быть получены за счет предварительного образования фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство (или фрагмента, представляющего собой лекарственное средстволинкер, оба термина используются взаимозаменяемо), и осуществления реакции фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом. В некоторых случаях фрагмент, представляющий собой линкер, собирается на лекарственном средстве постепенно с помощью нескольких соединяющих фрагментов до тех пор, пока не получится требуемый фрагмент, представляющий собой линкерлекарственное средство.The drug moiety D can be linked to the antibody Ab using a linker L. L is any chemical moiety capable of linking the drug moiety to the antibody through covalent bonds. A crosslinking reagent is a bifunctional or multifunctional reagent that can be used to join a drug moiety and an antibody to form antibody-drug conjugates. Antibody-drug conjugates can be prepared using a cross-linking reagent having reactive functional groups capable of binding to both the drug moiety and the antibody. For example, a cysteine, thiol, or amine, for example, at the N-terminus or side chain of an amino acid such as lysine, in an antibody can form a bond with a functional group of a cross-linking reagent. Alternatively, antibody-drug conjugates can be prepared by first forming a linker-drug moiety (or a drug-linker moiety, both terms are used interchangeably) and reacting the linker-drug moiety, with an antibody. In some cases, the linker moiety is gradually assembled on the drug by several connecting moieties until the desired linker drug moiety is obtained.
В одном варианте осуществления L представляет собой расщепляемый линкер. В другом варианте осуществления L представляет собой нерасщепляемый линкер. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой кислотолабильный линкер, фотолабильный линкер, расщепляемый пептидазами линкер, расщепляемый эстеразами линкер, линкер с расщепляемой дисульфидной связью, гидрофильный линкер, предварительно заряженный линкер, расщепляемый гликозидазами линкер, расщепляемый фосфодиэстеразами линкер, расщепляемый фосфатазами линкер или линкер на основе дикарбоновой кислоты.In one embodiment, L is a cleavable linker. In another embodiment, L is a non-cleavable linker. In some embodiments, L is an acid-labile linker, a photo-labile linker, a peptidase-cleavable linker, an esterase-cleavable linker, a disulfide-cleavable linker, a hydrophilic linker, a pre-charged linker, a glycosidase-cleavable linker, a phosphodiesterase-cleavable linker, a phosphatase-cleavable linker, or a dicarboxylic linker. acids.
Подходящие сшивающие реагенты, которые образуют нерасщепляемый линкер между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например майтанзиноид, и антителом, широко известны из уровня техники, и они могут образовывать нерасщепляемые линкеры, которые содержат атом серыSuitable crosslinking reagents that form a non-cleavable linker between a drug moiety, such as a maytansinoid, and an antibody are well known in the art and can form non-cleavable linkers that contain a sulfur atom.
- 20 042529 (такие как SMCC), или линкеры, которые не содержат атом серы. Предпочтительные сшивающие реагенты, которые образуют нерасщепляемые линкеры между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например майтанзиноид, и антителом, содержат фрагмент на основе малеимида или галогенацетила. В соответствии с настоящим изобретением про такие нерасщепляемые линкеры говорится, что они происходят из фрагментов на основе малеимида или галогенацетила.- 20 042529 (such as SMCC), or linkers that do not contain a sulfur atom. Preferred crosslinking reagents that form non-cleavable linkers between a drug moiety, such as a maytansinoid, and an antibody, contain a maleimide or haloacetyl moiety. In accordance with the present invention, such non-cleavable linkers are said to be derived from maleimide or haloacetyl moieties.
Сшивающие реагенты, содержащие фрагмент на основе малеимида включают без ограничения N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилат (SMCC), сульфосукцинимидил-4-(N-малеимидометил)циклогексан-1 -карбоксилат (сульфо-SMCC), N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексан-1 -карбокси-(6-амидокапроат), который представляет собой длинноцепочечный аналог SMCC (LC-SMCC),Crosslinking reagents containing a maleimide moiety include, but are not limited to, N-succinimidyl-4-(maleimidomethyl)cyclohexanecarboxylate (SMCC), sulfosuccinimidyl-4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate (sulfo-SMCC), N-succinimidyl-4 -(maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxy-(6-amidocaproate), which is a long chain analogue of SMCC (LC-SMCC),
N-сукцинимидильный сложный эфир κ-малеимидоундекановой кислоты (KMUA), N-сукцинимидильный сложный эфир γ-малеимидомасляной кислоты (GMBS), N-сукцинимидильный сложный эфир ε-малеимидокапроновой кислоты (EMCS), m-малеимидобензоил-N-гидроксисукцинимидный сложный эфир (MBS), N-(α-малеимидоацетокси)сукцинимидный сложный эфир (AMSA), сукцинимидил-6-(в-малеимидопропионамидо)гексаноат (SMPH), N-сукцинимидил-4-(p-малеимидофенил)бутират (SMPB),κ-maleimidoundecanoic acid N-succinimidyl ester (KMUA), γ-maleimidobutyric acid N-succinimidyl ester (GMBS), ε-maleimidocaproic acid N-succinimidyl ester (EMCS), m-maleimidobenzoyl-N-hydroxysuccinimide ester (MBS ), N-(α-maleimidoacetoxy)succinimide ester (AMSA), succinimidyl-6-(β-maleimidopropionamido)hexanoate (SMPH), N-succinimidyl-4-(p-maleimidophenyl)butyrate (SMPB),
N-(-р-малеимидофенил)изоцианат (PMIP) и сшивающие реагенты на основе малеимида, содержащие полиэтиленгликольный спейсер, такие как MAL-PEG-NHS.N-(-p-maleimidophenyl)isocyanate (PMIP) and maleimide-based crosslinkers containing a polyethylene glycol spacer such as MAL-PEG-NHS.
Данные сшивающие реагенты образуют нерасщепляемые линкеры, происходящие из фрагментов на основе малеимида.These crosslinkers form non-cleavable linkers derived from maleimide-based moieties.
Типичные структуры сшивающих реагентов на основе малеимида показаны ниже.Representative structures of maleimide-based crosslinkers are shown below.
О ОOh Oh
SMCCSMCC
-SO3Na сульфо-SMCC ft О Z-SO 3 Na sulfo-SMCC ft O Z
О О'O O'
MAL-PEG-NHSMAL-PEG-NHS
В другом варианте осуществления линкер L происходит из N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилата (SMCC), сульфосукцинимидил 4-(N-малеимидометил)циклогексан-1-карбоксилата (сульфо-SMCC) или MAL-PEG-NHS.In another embodiment, linker L is derived from N-succinimidyl-4-(maleimidomethyl)cyclohexanecarboxylate (SMCC), sulfosuccinimidyl 4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate (sulfo-SMCC), or MAL-PEG-NHS.
Сшивающие реагенты, содержащие фрагмент на основе галогенацетила, включают Nсукцинимидилйодацетат (SIA), N-сукцинимидил(4-йодацетил)аминобензоат (SIAB), N-сукцинимидилбромацетат (SBA) и N-сукцинимидил-3-(бромацетамидо)пропионат (SBAP). Данные сшивающие реагенты образуют нерасщепляемый линкер, происходящий из фрагментов на основе галогенацетила. Типичные структуры сшивающих реагентов на основе галогенацетила показаны ниже.Cross-linking reagents containing a haloacetyl moiety include N-succinimidyliodoacetate (SIA), N-succinimidyl(4-iodoacetyl)aminobenzoate (SIAB), N-succinimidyl bromoacetate (SBA), and N-succinimidyl-3-(bromoacetamido)propionate (SBAP). These crosslinkers form a non-cleavable linker derived from haloacetyl-based moieties. Representative structures of haloacetyl crosslinkers are shown below.
В одном варианте осуществления линкер L происходит из N-сукцинимидилйодацетата (SIA) или Nсукцинимидил(4-йодацетил)аминобензоата (SIAB).In one embodiment, linker L is from N-succinimidyliodoacetate (SIA) or Nsuccinimidyl(4-iodoacetyl)aminobenzoate (SIAB).
Подходящие сшивающие реагенты, которые образуют расщепляемый линкер между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например майтанзиноид, и антителом, широко известны из уровня техники. Линкеры, содержащие дисульфид, представляют собой линкеры, расщепляемые посредством дисульфидного обмена, который может происходить при физиологических условиях. В соответствии с настоящим изобретением про такие расщепляемые линкеры говорится, что они происходят из фрагментов на основе дисульфида. Подходящие дисульфидные сшивающие реагенты включаютSuitable crosslinking reagents that form a cleavable linker between a drug moiety, such as a maytansinoid, and an antibody, are well known in the art. Disulfide-containing linkers are linkers cleavable by disulfide exchange, which can occur under physiological conditions. In accordance with the present invention, such cleavable linkers are said to be derived from disulfide-based moieties. Suitable disulfide crosslinkers include
N-сукцинимидил-3-(2-nиридилдитио)пропионат (SPDP),N-succinimidyl-3-(2-niridyldithio)propionate (SPDP),
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)пентаноат (SPP),N-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)pentanoate (SPP),
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутаноат (SPDB) иN-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)butanoate (SPDB) and
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)-2-сульфобутаноат (сульфо-SPDB), структуры которых показаны ниже.N-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)-2-sulfobutanoate (sulfo-SPDB) whose structures are shown below.
Данные дисульфидные сшивающие реагенты образуют расщепляемый линкер, происходящий из фрагментов на основе дисульфида.These disulfide crosslinkers form a cleavable linker derived from disulfide-based moieties.
- 21 042529- 21 042529
N-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионат (SPDP),N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionate (SPDP),
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)пентаноат (SPP),N-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)pentanoate (SPP),
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутаноат (SPDB) иN-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)butanoate (SPDB) and
N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)-2-сульфобутаноат (сульфо-SPDB).N-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)-2-sulfobutanoate (sulfo-SPDB).
В одном варианте осуществления линкер L происходит из N-сукцинимидил-4-(2пиридилдитио)бутаноата (SPDB).In one embodiment, linker L is from N-succinimidyl-4-(2pyridyldithio)butanoate (SPDB).
Подходящие сшивающие реагенты, которые образуют заряженный линкер между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например майтанзиноид, и антителом, известны как предварительно заряженные сшивающие реагенты. В одном варианте осуществления линкер L происходит из предварительно заряженного сшивающего реагента СХ1-1. Структура СХ1-1 приведена ниже.Suitable crosslinkers that form a charged linker between a drug moiety, such as a maytansinoid, and an antibody are known as precharged crosslinkers. In one embodiment, the linker L comes from a pre-charged crosslinker CX1-1. The structure of CX1-1 is shown below.
оO
2,5-диоксопирролидин-1-ил-17-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1Н-пиррол-1-ил)-5,8,11,14-тетраоксо4,7,10,13 -тетраазагептадекан-1 -оат (СХ1-1)2,5-dioxopyrrolidin-1-yl-17-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-5,8,11,14-tetraoxo4,7,10,13 - tetraazaheptadecan-1-oate (SH1-1)
Каждый из сшивающих реагентов, изображенных выше, на одном конце сшивающего реагента содержит NHS-сложный эфир, который реагирует с первичным амином антитела с образованием амидной связи, а на другом конце малеимидную группу или пиридинилдисульфидную группу, которая реагирует с сульфгидрилом фрагмента, представляющего собой майтанзиноидное лекарственное средство, с образованием тиоэфирной или дисульфидной связи.Each of the crosslinkers depicted above has an NHS ester at one end that reacts with the primary amine of the antibody to form an amide bond, and at the other end a maleimide group or a pyridinyl disulfide group that reacts with the sulfhydryl of the maytansinoid drug moiety. agent, with the formation of a thioether or disulfide bond.
В другом варианте осуществления подходящие сшивающие фрагменты, которые образуют расщепляемый линкер между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство (например, майтанзиноид), и антителом представлены следующей формулой (II):In another embodiment, suitable crosslinking moieties that form a cleavable linker between the drug (e.g., maytansinoid) moiety and the antibody are represented by the following formula (II):
ίΗ° , .ίΗ° , .
I n-l1-x-l2-sh 0 (II);I nl 1 -xl 2 -sh 0 (II);
гдеWhere
L1 представляет собой C1-6αлкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 represents C 1-6 αkylene, while one of the methylene groups can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой C1-6aлкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где y составляет от 1 до 11; иL 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 -, where y is from 1 to 11; And
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole;
где алкилен является линейным или разветвленным.where alkylene is linear or branched.
В одном аспекте данного варианта осуществления у составляет 5, 7, 9 или 11. В другом аспекте данного варианта осуществления y составляет меньше 5.In one aspect of this embodiment, y is 5, 7, 9, or 11. In another aspect of this embodiment, y is less than 5.
В еще одном варианте осуществления подходящие сшивающие фрагменты в соответствии с формулой I выбраны из группы, состоящей изIn yet another embodiment, suitable crosslinking moieties according to Formula I are selected from the group consisting of
- 22 042529- 22 042529
где у составляет от 1 до 11.where y is between 1 and 11.
В случае сшивающих фрагментов, изображенных выше (т.е. МВТ, МРЕТ, МЕРЕТ; ММТВТ, МРРТ, МРВТ), малеимидная группа обеспечивает возможность реакции с сульфгидрилом (или тиолом) цистеина в антителе, с образованием, тем самым, тиоэфирной связи; а тиольная функциональная группа сшивающего фрагмента соединяется с тиолом фрагмента, представляющего собой майтанзиноидное лекарственное средство, с образованием расщепляемой дисульфидной связи. В силу перекрестнореакционноспособной природы соединяющего фрагмента формулы (I) (тиол и малеимид могут вступать в перекрестную реакцию), специалист в данной области техники будет осознавать, что соединяющий фрагмент должен собираться постепенно на фрагменте, представляющем собой лекарственное средство, как изображено на схеме 1.In the case of the crosslinking moieties depicted above (i.e., MBT, MPET, MERET; MMTBT, MPPT, MPBT), the maleimide group allows reaction with the cysteine sulfhydryl (or thiol) in the antibody, thereby forming a thioether bond; and the thiol functional group of the crosslinking moiety combines with the thiol of the maytansinoid drug moiety to form a cleavable disulfide bond. Due to the cross-reactive nature of the linking moiety of formula (I) (thiol and maleimide can cross-react), one skilled in the art will appreciate that the linking moiety must be assembled progressively onto the drug moiety as depicted in Scheme 1.
В соответствии с вышеуказанным вариантом осуществления линкеры, полученные из сшивающих фрагментов (т.е. МВТ, МРЕТ, МЕРЕТ), могут быть изображены следующим образом:According to the above embodiment, linkers derived from crosslinking moieties (i.e. MBT, MPET, MERET) can be depicted as follows:
где * соединен с тиольной функциональной группой на антителе и ** соединен с тиольной функциональной группой фрагмента, представляющего собой лекарственное средство (например, фрагмента, представляющего собой майтанзиноидное лекарственное средство, DM1, DM3 или DM4).where * is connected to a thiol functional group on the antibody and ** is connected to the thiol functional group of a drug moiety (eg, a maytansinoid drug moiety, DM1, DM3, or DM4).
В соответствии с вышеуказанным вариантом осуществления линкеры, полученные из сшивающих фрагментов (т.е. МВТ, МРЕТ, МЕРЕТ), могут быть изображены следующим образом:According to the above embodiment, linkers derived from crosslinking moieties (i.e. MBT, MPET, MERET) can be depicted as follows:
где у составляет от 1 до 11;where y is from 1 to 11;
- 23 042529 * соединен с тиольной функциональной группой на антителе и ** соединен с тиольной функциональной группой фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, (например, майтанзиноидное лекарственное средство, DM1, DM3 или DM4).- 23 042529 * linked to a thiol functional group on an antibody and ** linked to a thiol functional group of a drug moiety (eg, maytansinoid drug, DM1, DM3, or DM4).
В предпочтительном варианте осуществления линкер имеет следующую формулу:In a preferred embodiment, the linker has the following formula:
где * соединен с тиольной функциональной группой на антителе, и ** соединен с тиольной функциональной группой майтанзиноидного лекарственного средства (DM1, DM3 или DM4)where * is linked to the thiol functional group on the antibody, and ** is linked to the thiol functional group of the maytansinoid drug (DM1, DM3 or DM4)
В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к фрагменту, представляющему собой линкер-лекарственное средство, с формулой:In one embodiment, the present invention provides a linker drug moiety with the formula:
гдеWhere
L1 представляет собой С1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 is C1-6 alkylene, whereby one of the methylene groups may be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где y составляет от 1 до 11; иL 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11; And
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole;
где алкилен является линейным или разветвленным.where alkylene is linear or branched.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение связано с постепенным образованием вышеуказанного конъюгата линкера и лекарственного средства, раскрытым на схеме 1 в данном документе.In another embodiment, the present invention relates to the gradual formation of the above linker-drug conjugate disclosed in Scheme 1 herein.
В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединениям фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, имеющим одну из следующих формул (III), (IV) и (V):In one embodiment, the present invention provides compounds of the linker drug moiety having one of the following formulas (III), (IV) and (V):
где L1 представляет собой С1-6алкилен, при этом одна метиленовая группа может быть заменена на кислород;where L 1 represents C 1-6 alkylene, while one methylene group can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где у составляет от 1 до 11; иL 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11; And
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole;
- 24 042529 где алкилен является линейным или разветвленным.- 24 042529 where alkylene is linear or branched.
В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединениям фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, которые выбраны из следующих формул:In one embodiment, the present invention provides compounds of the linker drug moiety selected from the following formulae:
В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединениям фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, которые выбраны из следующих формул:In another embodiment, the present invention provides compounds of the linker drug moiety selected from the following formulae:
В другом варианте осуществления линкер-лекарственное средство по настоящему изобретению представлены любой из следующих формул:In another embodiment, the linker drug of the present invention is represented by any of the following formulas:
- 25 042529- 25 042529
где у составляет от 1 до 11, предпочтительно от 1 до 5.where y is from 1 to 11, preferably from 1 to 5.
В одном варианте осуществления линкер-лекарственное средство по настоящему изобретению представлены любой из следующих структурных формул:In one embodiment, the linker drug of the present invention is represented by any of the following structural formulas:
В одном варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих структурных формул:In one embodiment, the conjugate of the present invention is represented by any of the following structural formulas:
- 26 042529- 26 042529
гдеWhere
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связывают CCR7;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds CCR7;
n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D-), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20.n, which indicates the number of linker-drug groups (L-D-) linked to the Ab by forming an amide bond with a primary amine on the Ab, is an integer from 1 to 20.
В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5.In one embodiment, n is an integer from 1 to 10, 2 to 8, or 2 to 5.
В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4.In a specific embodiment, n is 3 or 4.
В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих формул (VI), (VII) и (VIII):In another embodiment, the conjugate of the present invention is any of the following formulas (VI), (VII) and (VIII):
- 27 042529- 27 042529
гдеWhere
L1 представляет собой C1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 represents C 1-6 alkylene, while one of the methylene groups can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где y составляет от 1 до 11;L 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 -, where y is from 1 to 11;
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole;
где алкилен является линейным или разветвленным; иwhere alkylene is linear or branched; And
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof;
n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D-), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20.n, which indicates the number of linker-drug groups (L-D-) linked to the Ab by forming an amide bond with a primary amine on the Ab, is an integer from 1 to 20.
В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In one embodiment, n is an integer from 1 to 10, 2 to 8, or 2 to 5. In a specific embodiment, n is 3 or 4. In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to an antigen that is expressed on tumor cells. cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению имеет формулу (VIA) или (VIB), соответствующую открытым формам сукцинимида конъюгата формулы (VI)In another embodiment, the conjugate of the present invention has formula (VIA) or (VIB) corresponding to open forms of the succinimide conjugate of formula (VI)
гдеWhere
L1 представляет собой C1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 represents C 1-6 alkylene, while one of the methylene groups can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой C1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где у составляет от 1 до 11; иL 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11; And
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole;
где алкилен является линейным или разветвленным; иwhere alkylene is linear or branched; And
- 28 042529- 28 042529
Ab представляет собой антитело или антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen binding fragment;
n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D-), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20.n, which indicates the number of linker-drug groups (L-D-) linked to the Ab by forming an amide bond with a primary amine on the Ab, is an integer from 1 to 20.
В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают Р-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In one embodiment, n is an integer from 1 to 10, 2 to 8, or 2 to 5. In a specific embodiment, n is 3 or 4. In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to an antigen that is expressed on tumor cells. cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению имеет формулу (VIIA) или (VIIB), соответствующую открытым формам сукцинимида конъюгата формулы (VII):In another embodiment, the conjugate of the present invention has formula (VIIA) or (VIIB) corresponding to open forms of the succinimide conjugate of formula (VII):
гдеWhere
L1 представляет собой C1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 is C 1-6 alkylene, whereby one of the methylene groups may be replaced by oxygen;
L2 представляет собой C1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где y составляет от 1 до 11; иL 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11; And
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole;
где алкилен является линейным или разветвленным; иwhere alkylene is linear or branched; And
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof;
n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20.n, which indicates the number of linker-drug groups (L-D) linked to the Ab by forming an amide bond with a primary amine on the Ab, is an integer from 1 to 20.
В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают Р-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In one embodiment, n is an integer from 1 to 10, 2 to 8, or 2 to 5. In a specific embodiment, n is 3 or 4. In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to an antigen that is expressed on tumor cells. cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению имеет формулу (VIIIA), (VIIIB), соответствующую открытым формам сукцинимида конъюгата формулы (VIII)In another embodiment, the conjugate of the present invention has formula (VIIIA), (VIIIB) corresponding to open forms of the succinimide conjugate of formula (VIII)
гдеWhere
L1 представляет собой C1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена наL 1 represents C 1-6 alkylene, while one of the methylene groups can be replaced by
- 29 042529 кислород;- 29 042529 oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где У составляет от 1 до 11; иL 2 is C1-6alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where Y is from 1 to 11; And
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole;
где алкилен является линейным или разветвленным; иwhere alkylene is linear or branched; And
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof;
n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D-), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20.n, which indicates the number of linker-drug groups (L-D-) linked to the Ab by forming an amide bond with a primary amine on the Ab, is an integer from 1 to 20.
В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают Р-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In one embodiment, n is an integer from 1 to 10, 2 to 8, or 2 to 5. In a specific embodiment, n is 3 or 4. In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to an antigen that is expressed on tumor cells. cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В одном варианте осуществления каждый конъюгат антитела и лекарственного средства, раскрытый в данном документе, где фрагмент, представляющий собой линкер-лекарственное средство, присоединен к антителу с помощью сукцинимида, также может существовать в виде открытых форм сукцинимида, как в общем изображено в формулах (VIA), (VIB), (VIIA), (VIIB), (VIIIA) и (VIIIB).In one embodiment, each antibody drug conjugate disclosed herein, wherein the drug linker moiety is attached to the antibody via succinimide, may also exist as open forms of succinimide, as generally depicted in formulas (VIA ), (VIB), (VIIA), (VIIB), (VIIIA), and (VIIIB).
В еще одном варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих структурных формул:In another embodiment, the conjugate of the present invention is represented by any of the following structural formulas:
- 30 042529- 30 042529
- 31 042529- 31 042529
гдеWhere
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof;
n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 12, или от 1 до 8, или предпочтительно от 1 до 4.n, which indicates the number of D-L groups associated with Ab by forming a thioether bond with the sulfhydryl of Ab, is an integer from 1 to 12, or from 1 to 8, or preferably from 1 to 4.
В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4.In a specific embodiment, n is 3 or 4.
В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to an antigen that is expressed on tumor cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих структурных формул:In another embodiment, the conjugate of the present invention is represented by any of the following structural formulas:
- 32 042529- 32 042529
а также соответствующими открытыми формами сукцинимида; гдеas well as the corresponding open forms of succinimide; Where
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof;
n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 12, или от 1 до 8, или предпочтительно от 1 до 4.n, which indicates the number of D-L groups associated with Ab by forming a thioether bond with the sulfhydryl of Ab, is an integer from 1 to 12, or from 1 to 8, or preferably from 1 to 4.
В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4.In a specific embodiment, n is 3 or 4.
В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to an antigen that is expressed on tumor cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих структурных формул:In another embodiment, the conjugate of the present invention is represented by any of the following structural formulas:
а также соответствующими открытыми формами сукцинимида; гдеas well as the corresponding open forms of succinimide; Where
- 33 042529 y составляет от 1 до 11, предпочтительно от 1 до 5;- 33 042529 y is from 1 to 11, preferably from 1 to 5;
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof;
n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 12, или от 1 до 8, или предпочтительно от 1 до 4.n, which indicates the number of D-L groups associated with Ab by forming a thioether bond with the sulfhydryl of Ab, is an integer from 1 to 12, or from 1 to 8, or preferably from 1 to 4.
В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In a specific embodiment, n is 3 or 4. In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to an antigen that is expressed on tumor cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В еще одном варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен следующими формулами:In yet another embodiment, the conjugate of the present invention is represented by the following formulas:
а также соответствующими открытыми формами сукцинимида;as well as the corresponding open forms of succinimide;
гдеWhere
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof;
n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 12, или от 1 до 8, или предпочтительно от 1 до 4.n, which indicates the number of D-L groups associated with Ab by forming a thioether bond with the sulfhydryl of Ab, is an integer from 1 to 12, or from 1 to 8, or preferably from 1 to 4.
В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In a specific embodiment, n is 3 or 4. In some embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to an antigen that is expressed on tumor cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В предпочтительном варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен следующей формулой:In a preferred embodiment, the conjugate of the present invention is represented by the following formula:
гдеWhere
Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;Ab is an antibody or antigen-binding fragment thereof;
n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи сn, which indicates the number of D-L groups associated with Ab through the formation of a thioether bond with
- 34 042529 сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 20.- 34 042529 sulfhydryl Ab, is an integer from 1 to 20.
В некоторых вариантах осуществления n составляет целое число от 1 до 12. В некоторых вариантах осуществления n составляет целое число от 1 до 8. В некоторых вариантах осуществления n составляет целое число от 1 до 4. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В другом варианте осуществления среднее значение n составляет от приблизительно 3 до приблизительно 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.In some embodiments, n is an integer from 1 to 12. In some embodiments, n is an integer from 1 to 8. In some embodiments, n is an integer from 1 to 4. In a specific embodiment, n is 3 or 4. B in another embodiment, the average value of n is from about 3 to about 4. In some embodiments, the antibody or antigen-binding fragment thereof binds to an antigen that is expressed on tumor cells. In one embodiment, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds CCR7. In other embodiments, the antibody, or antigen-binding fragment thereof, specifically binds P-cadherin, cadherin 6, FGFR2, or FGFR4.
В одном варианте осуществления среднее молярное отношение лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) к антителу в конъюгате (т.е. среднее значение n, также известное как отношение майтанзиноида к антителу (MAR)) составляет от приблизительно 1 до приблизительно 10, от приблизительно 2 до приблизительно 8 (например, 1,9, 2,0, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3,0, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7, 3,8, 3,9, 4,0, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5,0, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6,0, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7,0, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8,0, или 8,1), от приблизительно 2,5 до приблизительно 7, от приблизительно 3 до приблизительно 5, от приблизительно 2,5 до приблизительно 4,5 (например, приблизительно 2,5, приблизительно 2,6, приблизительно 2,7, приблизительно 2,8, приблизительно 2,9, приблизительно 3,0, приблизительно 3,1, приблизительно 3,3, приблизительно 3,4, приблизительно 3,5, приблизительно 3,6, приблизительно 3,7, приблизительно 3,8, приблизительно 3,9, приблизительно 4,0, приблизительно 4,1, приблизительно 4,2, приблизительно 4,3, приблизительно 4,4, приблизительно 4,5), от приблизительно 3,0 до приблизительно 4,0, от приблизительно 3,2 до приблизительно 4,2 или от приблизительно 4,5 до 5,5 (например, приблизительно 4,5, приблизительно 4,6, приблизительно 4,7, приблизительно 4,8, приблизительно 4,9, приблизительно 5,0, приблизительно 5,1, приблизительно 5,2, приблизительно 5,3, приблизительно 5,4 или приблизительно 5,5).In one embodiment, the average molar ratio of drug (e.g., DM1, DM3, or DM4) to antibody in the conjugate (i.e., average n, also known as maytansinoid to antibody ratio (MAR)) is from about 1 to about 10, from about 2 to about 8 (e.g., 1.9, 2.0, 2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2.5, 2.6, 2.7, 2.8, 2 .9, 3.0, 3.1, 3.2, 3.3, 3.4, 3.5, 3.6, 3.7, 3.8, 3.9, 4.0, 4.1 , 4.2, 4.3, 4.4, 4.5, 4.6, 4.7, 4.8, 4.9, 5.0, 5.1, 5.2, 5.3, 5 .4, 5.5, 5.6, 5.7, 5.8, 5.9, 6.0, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4, 6.5, 6.6 , 6.7, 6.8, 6.9, 7.0, 7.1, 7.2, 7.3, 7.4, 7.5, 7.6, 7.7, 7.8, 7 .9, 8.0, or 8.1), about 2.5 to about 7, about 3 to about 5, about 2.5 to about 4.5 (e.g., about 2.5, about 2, 6, approximately 2.7, approximately 2.8, approximately 2.9, approximately 3.0, approximately 3.1, approximately 3.3, approximately 3.4, approximately 3.5, approximately 3.6, approximately 3.7, approximately 3.8, approximately 3.9, approximately 4.0, approximately 4.1, approximately 4.2, approximately 4.3, approximately 4.4, approximately 4.5), about 3.0 to about 4.0, about 3.2 to about 4.2, or about 4.5 to 5.5 (e.g., about 4.5, about 4.6, about 4.7, about 4.8, about 4.9, about 5.0, about 5.1, about 5.2, about 5.3, about 5.4, or about 5.5).
В одном аспекте настоящего изобретения конъюгат по настоящему изобретению характеризуется в значительной степени высокой чистотой и имеет один или несколько из следующих признаков:In one aspect of the present invention, the conjugate of the present invention is of substantially high purity and has one or more of the following:
(а) более приблизительно 90% (например, больше или равно приблизительно 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100%), предпочтительно более приблизительно 95% разновидностей конъюгата являются мономерными, (b) уровень неконъюгированного линкера в препарате конъюгата составляет менее приблизительно 10% (например, меньше или равно приблизительно 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1 или 0%) (относительно общего количества линкера), (с) менее 10% разновидностей конъюгата являются сшитыми (например, меньше или равно приблизительно 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1 или 0%), (d) уровень свободного лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) в препарате конъюгата составляет менее приблизительно 2% (например, меньше или равно приблизительно 1,5, 1,4, 1,3, 1,2, 1,1, 1,0, 0,9, 0,8, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,1, или 0%) (моль/моль относительно общего количества цитотоксического средства); и/или (е) не происходит значительное повышение уровня свободного лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) после хранения (например, после приблизительно 1 недели, приблизительно 2 недель, приблизительно 3 недель, приблизительно 1 месяца, приблизительно 2 месяцев, приблизительно 3 месяцев, приблизительно 4 месяцев, приблизительно 5 месяцев, приблизительно 6 месяцев, приблизительно 1 года, приблизительно 2 лет, приблизительно 3 лет, приблизительно 4 лет или приблизительно 5 лет).(a) greater than about 90% (e.g., greater than or equal to about 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, or 100%), preferably greater than about 95% of the conjugate species are monomeric, (b) the level of the unconjugated linker in the conjugate preparation is less than about 10% (e.g., less than or equal to about 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1, or 0%) (relative to the total amount of linker), (c) less than 10 % of conjugate species are cross-linked (e.g., less than or equal to about 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1, or 0%), (d) free drug level (e.g., DM1, DM3, or DM4) in the conjugate preparation is less than about 2% (e.g., less than or equal to about 1.5, 1.4, 1.3, 1.2, 1.1, 1.0, 0.9, 0.8, 0.7 , 0.6, 0.5, 0.4, 0.3, 0.2, 0.1, or 0%) (mol/mol relative to the total amount of cytotoxic agent); and/or (e) there is no significant increase in free drug (e.g., DM1, DM3, or DM4) levels after storage (e.g., after about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, approximately 4 months, approximately 5 months, approximately 6 months, approximately 1 year, approximately 2 years, approximately 3 years, approximately 4 years, or approximately 5 years).
Значительное повышение уровня свободного лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) означает, что после некоторого времени хранения (например, приблизительно 1 недели, приблизительно 2 недель, приблизительно 3 недель, приблизительно 1 месяца, приблизительно 2 месяцев, приблизительно 3 месяцев, приблизительно 4 месяцев, приблизительно 5 месяцев, приблизительно 6 месяцев, приблизительно 1 года, приблизительно 2 лет, приблизительно 3 лет, приблизительно 4 лет или приблизительно 5 лет) повышение уровня свободного лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) составляет менее приблизительно 0,1%, приблизительно 0,2%, приблизительно 0,3%, приблизительно 0,4%, приблизительно 0,5%, приблизительно 0,6%, приблизительно 0,7%, приблизительно 0,8%, приблизительно 0,9%, приблизительно 1,0%, приблизительно 1,1%, приблизительно 1,2%, приблизительно 1,3%, приблизительно 1,4%, приблизительно 1,5%, приблизительно 1,6%, приблизительно 1,7%, приблизительно 1,8%, приблизительно 1,9%, приблизительно 2,0%, приблизительно 2,2%, приблизительно 2,5%, приблизительно 2,7%, приблизительно 3,0%, приблизительно 3,2%, приблизительно 3,5%, приблизительно 3,7% или приблизительно 4,0%.A significant increase in the level of free drug (eg, DM1, DM3, or DM4) means that after some storage time (eg, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 3 years, about 4 years, or about 5 years) free drug (e.g., DM1, DM3, or DM4) elevation is less than about 0. 1%, approximately 0.2%, approximately 0.3%, approximately 0.4%, approximately 0.5%, approximately 0.6%, approximately 0.7%, approximately 0.8%, approximately 0.9% , approximately 1.0%, approximately 1.1%, approximately 1.2%, approximately 1.3%, approximately 1.4%, approximately 1.5%, approximately 1.6%, approximately 1.7%, approximately 1.8%, approx. 1.9%, approx. positively 2.0%, about 2.2%, about 2.5%, about 2.7%, about 3.0%, about 3.2%, about 3.5%, about 3.7%, or about 4 .0%.
Применяемый в данном документе термин ''неконъюгированный линкер относится к антителу, которое ковалентно связано с линкером, происходящим из сшивающего реагента (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1), где антитело не присоединено ковалентной связью к лекарственному средству (например, DM1, DM3 или DM4) за счет линкера (т.е. неконъюгированный линкерAs used herein, the term "unconjugated linker" refers to an antibody that is covalently linked to a linker derived from a crosslinking reagent (e.g., SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1), where the antibody is not covalently attached to drug (e.g., DM1, DM3, or DM4) via a linker (i.e., an unconjugated linker
- 35 042529 может быть представлен как Ab-MCC, Ab-SPDB или АЬ-СХ1-1).- 35 042529 can be represented as Ab-MCC, Ab-SPDB or AL-CX1-1).
1. Фрагмент, представляющий собой лекарственное средство1. Fragment representing a drug
В настоящем изобретении представлены иммуноконъюгаты, которые специфически связываются с CCR7. Конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению содержат антитела к CCR7, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты, которые конъюгированы с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например, противораковым средством, средством лечения аутоиммунных заболеваний, противовоспалительным средством, противогрибковым средством, антибактериальным средством, антипаразитическим средством, противовирусным средством или анестетическим средством. Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению могут быть конъюгированы с несколькими идентичными или различными фрагментами, представляющими собой лекарственное средство, с применением любых способов, известных из уровня техники.The present invention provides immunoconjugates that specifically bind to CCR7. The antibody-drug conjugates of the present invention comprise anti-CCR7 antibodies, antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments), or functional equivalents that are conjugated to a drug moiety, e.g., an anticancer agent, an autoimmune drug, an anti-inflammatory agent, an antifungal agent. , an antibacterial agent, an antiparasitic agent, an antiviral agent, or an anesthetic agent. Antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention may be conjugated to multiple identical or different drug moieties using any of the methods known in the art.
В некоторых вариантах осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, из иммуноконъюгатов по настоящему изобретению, выбран из группы, состоящей из ингибитора VАТФазы, проапоптического средства, ингибитора Bcl2, ингибитора MCL1, ингибитора HSP90, ингибитора IAP, ингибитора mTor, стабилизатора микротрубочек, дестабилизатора микротрубочек, ингибитора РНК-полимеразы, аманитина, пирролобензодиазепина, ауристатина, доластатина, майтанзиноида, MetAP (метионинаминопептидазы), ингибитора ядерного экспорта белков CRM1, ингибитора DPPIV, ингибитора Eg5, ингибиторов протеасомы, ингибитора реакций переноса фосфорила в митохондриях, ингибитора синтеза белка, ингибитора киназ, ингибитора CDK2, ингибитора CDK9, ингибитора кинезина, ингибитора HDAC, ДНК-повреждающего средства, ДНК-алкилирующего средства, ДНК-интеркалятора, средства, связывающего малую бороздку ДНК, и ингибитора DHFR.In some embodiments, the drug moiety of the immunoconjugates of the present invention is selected from the group consisting of a VATPase inhibitor, a proapoptotic agent, a Bcl2 inhibitor, an MCL1 inhibitor, an HSP90 inhibitor, an IAP inhibitor, an mTor inhibitor, a microtubule stabilizer, a microtubule destabilizer, RNA polymerase inhibitor, amanitin, pyrrolobenzodiazepine, auristatin, dolastatin, maytansinoid, MetAP (methionine aminopeptidase), CRM1 nuclear export inhibitor, DPPIV inhibitor, Eg5 inhibitor, proteasome inhibitors, mitochondrial phosphoryl transfer inhibitor, protein synthesis inhibitor, kinase inhibitor, inhibitor CDK2, CDK9 inhibitor, kinesin inhibitor, HDAC inhibitor, DNA damaging agent, DNA alkylating agent, DNA intercalator, DNA minor groove binding agent, and DHFR inhibitor.
В определенном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, из иммуноконъюгатов по настоящему изобретению представляет собой ауристатин, раскрытый в РСТ-публикациях под номерами: WO 2015/095301 и WO 2015/189791, при этом обе заявки тем самым включены посредством ссылки. Неограничивающие примеры конструкций из фрагмента, представляющего собой ауристатиновое лекарственное средство, и линкера представляют собой:In a particular embodiment, the drug moiety of the immunoconjugates of the present invention is auristatin as disclosed in PCT Publications WO 2015/095301 and WO 2015/189791, both applications hereby incorporated by reference. Non-limiting examples of constructs from an auristatin drug moiety and a linker are:
которая представляет собой AURIX2, как раскрыто в настоящей заявке, иwhich is AURIX2 as disclosed in this application, and
которая представляет собой AURIX1, как раскрыто в настоящей заявке.which is AURIX1 as disclosed in this application.
В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, из иммуноконъюгатов по настоящему изобретению представляет собой фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, такое как без ограничения DM1, DM3 или DM4.In one embodiment, the drug moiety of the immunoconjugates of the present invention is a maytansinoid drug moiety, such as, but not limited to, DM1, DM3, or DM4.
Кроме того, антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению могут быть конъюгированы с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, модифицирующее заданный биологический ответ. Фрагменты, представляющие собой лекарственные средства, не следует рассматривать как ограниченные классическими химическими терапевтическими средствами. Например, фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, может представлять собой белок, пептид или полипептид, обладающие требуемой биологической активностью. Такие белки могут включать, например, токсин, такой как абрин, рицин А, экзотоксин Pseudomonas, холерный токсин или дифтерийный токсин; белок, такой как фактор некроза опухоли, α-интерферон, β-интерферон, фактор роста нервов, фактор роста тромбоцитов, тканевой активатор плазминогена, цитокин, апоптическое средство, антиангиогенное средство или модификатор биологического ответа, такой как, например, лимфокин.In addition, antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention may be conjugated to a drug moiety that modifies a desired biological response. Drug moieties should not be construed as being limited to classic chemical therapeutic agents. For example, a drug moiety may be a protein, peptide, or polypeptide having the desired biological activity. Such proteins may include, for example, a toxin such as abrin, ricin A, Pseudomonas exotoxin, cholera toxin, or diphtheria toxin; a protein such as tumor necrosis factor, α-interferon, β-interferon, nerve growth factor, platelet growth factor, tissue plasminogen activator, cytokine, apoptotic agent, anti-angiogenic agent or biological response modifier such as, for example, lymphokine.
В одном варианте осуществления антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению конъюгированы с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, таким как цитотоксин, лекарственное средство (например, иммуносупрессор) или радиотоксин. Примеры цитотоксинов включают без ограничения таксаны (см., например, международные (РСТ) заявки на патент №№ WO 01/38318 и PCT/US03/02675), ДНКIn one embodiment, the antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention are conjugated to a drug moiety, such as a cytotoxin, drug (eg, immunosuppressant), or radiotoxin. Examples of cytotoxins include, without limitation, taxanes (see, for example, International (PCT) Patent Application Nos. WO 01/38318 and PCT/US03/02675), DNA
- 36 042529 алкилирующие средства (например, аналоги СС-1065), антрациклины, аналоги тубулизина, аналоги дуокармицина, ауристатин Е, ауристатин F, майтанзиноиды и цитотоксические средства, содержащие фрагмент, представляющий собой реакционноспособный полиэтиленгликоль (см., например, Sasse et al., J. Antibiot. (Tokyo), 53, 879-85 (2000), Suzawa et al., Bioorg. Med. Chem., 8, 2175-84 (2000), Ichimura et al., J. Antibiot. (Tokyo), 44, 1045-53 (1991), Francisco et al., Blood (2003) (электронная публикация до печатной публикации), патенты США №№ 5475092, 6340701, 6372738 и 6436931, публикацию заявки на патент США № 2001/0036923 А1, находящиеся на рассмотрении заявки на патент США с порядковыми №№ 10/024290 и 10/116053, и международную (РСТ) заявку на патент № WO 01/49698), таксон, цитохалазин В, грамицидин D, этидия бромид, эметин, митомицин, этопозид, тенопозид, винкристин, винбластин, t. колхицин, доксорубицин, даунорубицин, дигидроксиантрациндион, митоксантрон, митрамицин, актиномицин D, 1-дегидротестостерон, глюкокортикоиды, прокаин, тетракаин, лидокаин, пропранолол и пуромицин, а также их аналоги или гомологи. Терапевтические средства также включают, например, антиметаболиты (например, метотрексат, 6-меркаптопурин, 6-тиогуанин, цитарабин, 5-фторурацил, декарбазин), разрушающие средства (например, мехлорэтамин, тиотепу, хлорамбуцил, мелфалан, кармустин (BSNU) и ломустин (CCNU), циклофосфамид, бусульфан, дибромманнит, стрептозотоцин, митомицин С и цис-дихлордиаминплатину (II) (DDP), цисплатин, антрациклины (например, даунорубицин (ранее дауномицин) и доксорубицин), антибиотики (например, дактиномицин (ранее актиномицин), блеомицин, митрамицин и антрамицин (АМС)) и антимитотические средства (например, винкристин и винбластин). (См. например, US20090304721 от Seattle Genetics).alkylating agents (e.g., CC-1065 analogs), anthracyclines, tubulisin analogs, duocarmycin analogs, auristatin E, auristatin F, maytansinoids, and cytotoxic agents containing a reactive polyethylene glycol moiety (see, for example, Sasse et al. , J. Antibiot (Tokyo), 53, 879-85 (2000), Suzawa et al., Bioorg Med. Chem., 8, 2175-84 (2000), Ichimura et al., J. Antibiot (Tokyo ), 44, 1045-53 (1991), Francisco et al., Blood (2003) (electronic publication prior to printed publication), U.S. Patent Nos. 5,475,092, 6,340,701, 6,372,738 and 6,436,931, U.S. Patent Application Publication No. 2001/0036923 A1 , pending U.S. Patent Applications Serial Nos. 10/024290 and 10/116053, and International (PCT) Patent Application No. WO 01/49698), taxon, cytochalasin B, gramicidin D, ethidium bromide, emetine, mitomycin, etoposide, tenoposide, vincristine, vinblastine, t. colchicine, doxorubicin, daunorubicin, dihydroxyanthracindione, mitoxantrone, mithramycin, actinomycin D, 1-dehydrotestosterone, glucocorticoids, procaine, tetracaine, lidocaine, propranolol and puromycin, as well as their analogues or homologues. Therapeutic agents also include, for example, antimetabolites (eg, methotrexate, 6-mercaptopurine, 6-thioguanine, cytarabine, 5-fluorouracil, decarbazine), disruptive agents (eg, mechlorethamine, thiotepa, chlorambucil, melphalan, carmustine (BSNU), and lomustine ( CCNU), cyclophosphamide, busulfan, dibromomannite, streptozotocin, mitomycin C and cis-dichlorodiaminplatinum(II) (DDP), cisplatin, anthracyclines (eg, daunorubicin (formerly daunomycin) and doxorubicin), antibiotics (eg, dactinomycin (formerly actinomycin), bleomycin , mithramycin and anthramycin (AMC)) and antimitotic agents (eg vincristine and vinblastine) (See eg US20090304721 from Seattle Genetics).
Другие примеры цитотоксинов, которые могут быть конъюгированы с антителами, фрагментами антител (антигенсвязывающими фрагментами) или функциональными эквивалентами по настоящему изобретению, включают дуокармицины, калихеамицины, маитанзины и ауристатины, а также их производные.Other examples of cytotoxins that can be conjugated to antibodies, antibody fragments (antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention include duocarmycins, calicheamicins, maititansins, and auristatins, as well as derivatives thereof.
Различные типы цитотоксинов, линкеров и способы конъюгирования терапевтических средств с антителами известны из уровня техники, см., например, Saito et al. (2003) Adv. Drug Deliv. Rev. 55:199-215; Trail et al. (2003) Cancer Immunol. Immunother. 52:328-337; Payne, (2003) Cancer Cell 3:207-212; Allen, (2002) Nat. Rev. Cancer 2:750-763; Pastan and Kreitman, (2002) Curr. Opin. Investig. Drugs 3:1089-1091; Senter and Springer, (2001) Adv. Drug Deliv. Rev. 53:247-264.Various types of cytotoxins, linkers, and methods for conjugating therapeutics to antibodies are known in the art, see, for example, Saito et al. (2003) Adv. drug deliv. Rev. 55:199-215; Trail et al. (2003) Cancer Immunol. Immunother. 52:328-337; Payne, (2003) Cancer Cell 3:207-212; Allen, (2002) Nat. Rev. Cancer 2:750-763; Pastan and Kreitman, (2002) Curr. Opin. Investig. Drugs 3:1089-1091; Senter and Springer, (2001) Adv. drug deliv. Rev. 53:247-264.
Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению также можно конъюгировать с радиоактивным изотопом для создания цитотоксических радиофармацевтических препаратов, называемых радиоиммуноконъюгаты. Примеры радиоактивных изотопов, которые можно конъюгировать с антителами для применения в диагностических или терапевтических целях, включают без ограничения йод-131, индий-111, иттрий-90 и лютеций-177. Способы получения радиоиммуноконъюгатов определены в уровне техники. Примеры радиоиммуноконъюгатов являются доступными коммерчески, в том числе Zevalin™ (DEC Pharmaceuticals) и Bexxar™ (Corixa Pharmaceuticals), а также подобные способы можно использовать для получения радиоиммуноконъюгатов с применением антител по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления макроциклический хелатор представляет собой 1,4,7,10-тетраазациклододеканN,N',N,N'-тетрауксусную кислоту (DOTA), которая может быть прикреплена к антителу через линкерную молекулу. Такие линкерные молекулы широко известны из уровня техники и описаны в Denardo et al. (1998) Clin Cancer Res. 4 (10):2483-90; Peterson et al. (1999) Bioconjug. Chem. 10(4):553-7 и Zimmerman et al. (1999) Nucl. Med. Biol. 26(8):943-50, каждый из которых включен посредством ссылки во всей своей полноте.Antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention can also be conjugated with a radioactive isotope to create cytotoxic radiopharmaceuticals called radioimmunoconjugates. Examples of radioactive isotopes that can be conjugated to antibodies for diagnostic or therapeutic use include, but are not limited to, iodine-131, indium-111, yttrium-90, and lutetium-177. Methods for obtaining radioimmunoconjugates are defined in the prior art. Examples of radioimmunoconjugates are commercially available, including Zevalin™ (DEC Pharmaceuticals) and Bexxar™ (Corixa Pharmaceuticals), and similar methods can be used to prepare radioimmunoconjugates using the antibodies of the present invention. In some embodiments, the macrocyclic chelator is 1,4,7,10-tetraazacyclododecaneN,N',N,N'-tetraacetic acid (DOTA), which can be attached to the antibody via a linker molecule. Such linker molecules are widely known in the art and are described in Denardo et al. (1998) Clin Cancer Res. 4(10):2483-90; Peterson et al. (1999) Bioconjug. Chem. 10(4):553-7 and Zimmerman et al. (1999) Nucl. Med. Biol. 26(8):943-50, each of which is incorporated by reference in its entirety.
Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению также можно конъюгировать с гетерологичным белком или полипептидом (или их фрагментом, предпочтительно с полипептидом из по меньшей мере 10, по меньшей мере 20, по меньшей мере 30, по меньшей мере 40, по меньшей мере 50, по меньшей мере 60, по меньшей мере 70, по меньшей мере 80, по меньшей мере 90 или по меньшей мере 100 аминокислот) для создания слитых белков. В частности, в настоящем изобретении представлены слитые белки, содержащие фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент), описанный в данном документе (например, Fab-фрагмент, Fd-фрагмент, Fv-фрагмент, F(ab)2-фрагмент, домен VH, CDR VH, домен VL или CDR VL), и гетерологичный белок, полипептид или пептид.Antibodies, antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention can also be conjugated to a heterologous protein or polypeptide (or fragment thereof, preferably a polypeptide of at least 10, at least 20, at least 30, at least at least 40, at least 50, at least 60, at least 70, at least 80, at least 90, or at least 100 amino acids) to create fusion proteins. In particular, the present invention provides fusion proteins comprising an antibody fragment (e.g., antigen-binding fragment) described herein (e.g., Fab fragment, Fd fragment, Fv fragment, F(ab)2 fragment, VH domain, VH CDR, VL domain, or VL CDR), and a heterologous protein, polypeptide, or peptide.
Дополнительные слитые белки можно создавать за счет методик шаффлинга генов, шаффлинга мотивов, шаффлинга экзонов и/или шаффлинга кодонов (совокупно называемых шаффлингом ДНК). Шаффлинг ДНК можно использовать для изменения активности антител по настоящему изобретению или их фрагментов (например, получения антител или их фрагментов с более высокими уровнями аффинности и более низкими значениями скорости диссоциации). См., в целом, патенты США №№ 5605793, 5811238, 5830721, 5834252 и 5837458; Patten et al. (1997) Curr. Opinion Biotechnol. 8:724-33; Harayama, (1998) Trends Biotechnol. 16(2):76-82; Hansson et al. (1999) J. Mol. Biol. 287:265-76; и Lorenzo and Blasco, (1998) Biotechniques 24(2):308-313 (каждый из данных патентов и публикаций тем самым включен посредством ссылки во всей своей полноте). Антитела или их фрагменты, или кодируемые ан- 37 042529 титела или их фрагменты можно изменять путем воздействия на них случайного мутагенеза с помощьюAdditional fusion proteins can be generated by gene shuffling, motif shuffling, exon shuffling, and/or codon shuffling (collectively referred to as DNA shuffling) techniques. DNA shuffling can be used to alter the activity of antibodies of the present invention or fragments thereof (eg, producing antibodies or fragments thereof with higher affinity levels and lower dissociation rates). See, in general, US Pat. Nos. 5,605,793; 5,811,238; 5,830,721; Patten et al. (1997) Curr. Opinion Biotechnol. 8:724-33; Harayama, (1998) Trends Biotechnol. 16(2):76-82; Hanson et al. (1999) J. Mol. Biol. 287:265-76; and Lorenzo and Blasco, (1998) Biotechniques 24(2):308-313 (each of these patents and publications is hereby incorporated by reference in its entirety). Antibodies or fragments thereof, or encoded antibodies or fragments thereof, can be altered by subjecting them to random mutagenesis using
ПЦР с внесением ошибок, случайной вставки нуклеотидов или других способов до проведения рекомбинации. Полинуклеотид, кодирующий антитело или его фрагмент, которые специфически связываются с антигеном, может быть подвергнут рекомбинации с одним или несколькими компонентами, мотивами, секциями, частями, доменами, фрагментами и т.д. одной или нескольких гетерологичных молекул.PCR with the introduction of errors, random insertion of nucleotides or other methods before recombination. A polynucleotide encoding an antibody or fragment thereof that specifically binds to an antigen may be recombined with one or more components, motifs, sections, moieties, domains, fragments, and the like. one or more heterologous molecules.
Более того, антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению могут быть конъюгированы с маркерными последовательностями, такими как пептид, для облегчения очистки. В предпочтительных вариантах осуществления маркерная аминокислотная последовательность представляет собой гексагистидиновый пептид (SEQ ID NO: 628), такой как метка, предусмотренная в векторе pQE (QIAGEN, Inc., 9259 Eton Avenue, Чатсворт, Калифорния, 91311), среди прочих, многие из которых являются коммерчески доступными. Как описано в Gentz et al. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:821-824, например, гексагистидин (SEQ ID NO: 628) обеспечивает удобную очистку слитого белка. Другие пептидные метки, применимые для очистки, включают без ограничения гемагглютининовую (НА) метку, которая соответствует эпитопу, происходящему из белка гемагглютинина вируса гриппа (Wilson et al. (1984) Cell 37:767), и метку FLAG (A. Einhauer et al., J. Biochem. Biophys. Methods 49: 455-465, 2001). Согласно настоящему изобретению для повышения эффективности антител или антигенсвязывающих фрагментов их также можно конъюгировать с проникающими в опухоль пептидами.Moreover, antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention may be conjugated to marker sequences, such as a peptide, to facilitate purification. In preferred embodiments, the marker amino acid sequence is a hexahistidine peptide (SEQ ID NO: 628), such as the tag provided in the pQE vector (QIAGEN, Inc., 9259 Eton Avenue, Chatsworth, CA 91311), among others, many of which are commercially available. As described in Gentz et al. (1989) Proc. Natl. Acad. sci. USA 86:821-824, for example, hexahistidine (SEQ ID NO: 628) provides a convenient purification of the fusion protein. Other peptide tags useful for purification include, but are not limited to, a hemagglutinin (HA) tag that corresponds to an epitope derived from influenza virus hemagglutinin protein (Wilson et al. (1984) Cell 37:767) and a FLAG tag (A. Einhauer et al ., J. Biochem. Biophys. Methods 49: 455-465, 2001). In accordance with the present invention, antibodies or antigen-binding fragments can also be conjugated to tumor-penetrating peptides to increase the effectiveness of antibodies or antigen-binding fragments.
В других вариантах осуществления антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению конъюгируют с диагностическим или выявляемым средством. Такие иммуноконъюгаты могут быть применимыми для контроля или прогнозирования проявления, развития, прогрессирования и/или степени тяжести заболевания или нарушения в рамках процедуры клинического тестирования, такой как определение эффективности конкретной терапии. Такая диагностика и обнаружение могут осуществляться путем сопряжения антитела с выявляемыми веществами, в том числе без ограничения с различными ферментами, такими как без ограничения пероксидаза хрена, щелочная фосфатаза, бета-галактозидаза или ацетилхолинэстераза; простетическими группами, такими как без ограничения стрептавидин/биотин и авидин/биотин; флуоресцентными материалами, такими как без ограничения Alexa Fluor 350, Alexa Fluor 405, Alexa Fluor 430, Alexa Fluor 488, Alexa Fluor 500, Alexa Fluor 514, Alexa Fluor 532, Alexa Fluor 546, Alexa Fluor 555, Alexa Fluor 568, Alexa Fluor 594, Alexa Fluor 610, Alexa Fluor 633, Alexa Fluor 647, Alexa Fluor 660, Alexa Fluor 680, Alexa Fluor 700, Alexa Fluor 750, умбеллиферон, флуоресцеин, флуоресцеина изотиоцианат, родамин, дихлортриазиниламинфлуоресцеин, дансилхлорид или фикоэритрин; люминесцентными материалами, такими как без ограничения люминол; биолюминесцентными материалами, такими как без ограничения люцифераза, люциферин и экворин; радиоактивными материалами, такими как без ограничения йод (131I, 125I, 123I и 121I), углерод (14С), сера (35S), тритий (3Н), индий (115In, 113In, 112In и mIn), технеций (99Тс), таллий (201Ti), галлий (68Ga, 67Ga), палладий (103Pd), молибден (99Мо), ксенон (133Хе), фтор (18F), 153Sm, 177Lu, 159Gd, 149Pm, 140La, 175Yb, 166Ho, 90Y, 47Sc, 186Re, 188Re, 142Pr, 105Rh, 97Ru, 68Ge, 57Co, 65Zn, 85Sr, 32P, 153Gd, 169Yb, 51Cr, 54Mn, 75Se, 64Cu, 113Sn и 117Sn; и позитронно-активными металлами с применением различных видов позитронной эмиссионной томографии, и нерадиоактивными ионами парамагнитных металлов.In other embodiments, antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention are conjugated to a diagnostic or detectable agent. Such immunoconjugates may be useful in monitoring or predicting the manifestation, development, progression and/or severity of a disease or disorder in a clinical testing procedure such as determining the efficacy of a particular therapy. Such diagnosis and detection can be accomplished by coupling the antibody to detectable substances, including, but not limited to, various enzymes such as, but not limited to, horseradish peroxidase, alkaline phosphatase, beta-galactosidase, or acetylcholinesterase; prosthetic groups such as, but not limited to, streptavidin/biotin and avidin/biotin; fluorescent materials such as without limitation Alexa Fluor 350, Alexa Fluor 405, Alexa Fluor 430, Alexa Fluor 488, Alexa Fluor 500, Alexa Fluor 514, Alexa Fluor 532, Alexa Fluor 546, Alexa Fluor 555, Alexa Fluor 568, Alexa Fluor 594 , Alexa Fluor 610, Alexa Fluor 633, Alexa Fluor 647, Alexa Fluor 660, Alexa Fluor 680, Alexa Fluor 700, Alexa Fluor 750, umbelliferone, fluorescein, fluorescein isothiocyanate, rhodamine, dichlorotriazinylamine fluorescein, dansyl chloride, or phycoerythrin; luminescent materials such as, but not limited to, luminol; bioluminescent materials such as, but not limited to, luciferase, luciferin, and aequorin; radioactive materials such as, without limitation, iodine ( 131 I, 125 I, 123 I and 121 I), carbon ( 14 C), sulfur ( 35 S), tritium ( 3 H), indium ( 115 In, 113 In, 112 In and m In), technetium ( 99 Tc), thallium ( 201 Ti), gallium ( 68 Ga, 67 Ga), palladium ( 103 Pd), molybdenum ( 99 Mo), xenon ( 133 Xe), fluorine ( 18 F), 153 Sm, 177 Lu, 159 Gd, 149 Pm, 140 La, 175 Yb, 166 Ho, 90 Y, 47 Sc, 186 Re, 188 Re, 142 Pr, 105 Rh, 97 Ru, 68 Ge, 57 Co, 65 Zn , 85 Sr, 32 P, 153 Gd, 169 Yb, 51 Cr, 54 Mn, 75 Se, 64 Cu, 113 Sn and 117 Sn; and positron-active metals using various types of positron emission tomography, and non-radioactive ions of paramagnetic metals.
Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению также могут быть прикреплены к твердым подложкам, которые особенно применимы для иммунологических анализов или очистки целевого антигена. Такие твердые подложки включают без ограничения стекло, целлюлозу, полиакриламид, нейлон, полистирол, поливинилхлорид или полипропилен.Antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or functional equivalents of the present invention may also be attached to solid supports, which are particularly useful for immunoassays or target antigen purification. Such solid substrates include, without limitation, glass, cellulose, polyacrylamide, nylon, polystyrene, polyvinyl chloride, or polypropylene.
2. Линкер2. Linker
Используемый в данном документе линкер представляет собой любой химический фрагмент, который способен соединить антитело, фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональный эквивалент с другим фрагментом, таким как фрагмент, представляющий собой лекарственное средство. Линкеры могут поддаваться расщеплению (расщепляемый линкер), такому как индуцированное кислотами расщепление, фотоиндуцированное расщепление, индуцированное пептидазами расщепление, индуцированное эстеразами расщепление, индуцированное гликозидазами расщепление, индуцированное фосфодиэстеразами расщепление, индуцированное фосфатазами расщепление и расщепление дисульфидной связи, в условиях, при которых соединение или антитело остаются активными. В качестве альтернативы линкеры могут быть в значительной степени устойчивыми к расщеплению (например, стабильный линкер или нерасщепляемый линкер). В некоторых аспектах линкер представляет собой предварительно заряженный линкер, гидрофильный линкер или линкер на основе дикарбоновой кислоты.As used herein, a linker is any chemical moiety that is capable of linking an antibody, antibody fragment (eg, antigen-binding fragments), or a functional equivalent to another moiety, such as a drug fragment. Linkers may be amenable to cleavage (cleavable linker), such as acid-induced cleavage, photoinduced cleavage, peptidase-induced cleavage, esterase-induced cleavage, glycosidase-induced cleavage, phosphodiesterase-induced cleavage, phosphatase-induced cleavage, and disulfide bond cleavage, under conditions in which the compound or antibody remain active. Alternatively, the linkers may be substantially resistant to cleavage (eg, a stable linker or a non-cleavable linker). In some aspects, the linker is a pre-charged linker, a hydrophilic linker, or a dicarboxylic acid linker.
В одном аспекте линкер, применяемый в настоящем изобретении, происходит из сшивающего реагента, такого как N-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионат (SPDP), N-сукцинимидил-4-(2пиридилдитио)пентаноат (SPP), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутаноат (SPDB), Nсукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)-2-сульфобутаноат (сульфо-SPDB), N-сукцинимидилйодацетат (SIA), N-сукцинимидил-(4-йодацетил)аминобензоат (SIAB), малеимид-PEG-NHS, N-сукцинимидил-4- 38 042529 (малеимидометил)циклогексанкарбоксилат (SMCC), N-сульфосуkцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилат (сульфо-SMCC) или 2,5-диоксопирролидин-1-ил-17-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1Нпиррол-1-ил)-5,8,11,14-тетраоксо-4,7,10,13-тетраазагептадекан-1-оат (СХ1-1).In one aspect, the linker used in the present invention is derived from a crosslinking agent such as N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionate (SPDP), N-succinimidyl-4-(2pyridyldithio)pentanoate (SPP), N-succinimidyl -4-(2-pyridyldithio)butanoate (SPDB), N-succinimidyl-4-(2-pyridyldithio)-2-sulfobutanoate (sulfo-SPDB), N-succinimidyliodoacetate (SIA), N-succinimidyl-(4-iodoacetyl)aminobenzoate ( SIAB), maleimide-PEG-NHS, N-succinimidyl-4-38 042529 (maleimidomethyl)cyclohexanecarboxylate (SMCC), N-sulfosuccinimidyl-4-(maleimidomethyl)cyclohexanecarboxylate (sulfo-SMCC) or 2,5-dioxopyrrolidin-1-yl -17-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1Hpyrrol-1-yl)-5,8,11,14-tetraoxo-4,7,10,13-tetraazaheptadecan-1-oate (CX1-1 ).
Нерасщепляемые линкеры представляют собой любой химический фрагмент, который способен соединить лекарственное средство, такое как майтанзиноид, с антителом с помощью устойчивой ковалентной связи и не попадает в категории, перечисленные выше для расщепляемых линкеров. Таким образом, нерасщепляемые линкеры являются в значительной степени устойчивыми к индуцированному кислотами расщеплению, фотоиндуцированному расщеплению, индуцированному пептидазами расщеплению, индуцированному эстеразами расщеплению и расщеплению дисульфидной связи. Кроме того, нерасщепляемый относится к способности химической связи в линкере или прикрепляемой к линкеру противостоять расщеплению, индуцированному кислотой, фотолабильным расщепляющим средством, пептидазой, эстеразой или химическим или физиологическим соединением, которое расщепляет дисульфидную связь, в условиях при которых лекарственное средство, такое как майтанзиноид или антитело, не теряет свою активность.Non-cleavable linkers are any chemical moiety that is capable of linking a drug, such as a maytansinoid, to an antibody via a stable covalent bond and does not fall into the categories listed above for cleavable linkers. Thus, non-cleavable linkers are largely resistant to acid-induced cleavage, photo-induced cleavage, peptidase-induced cleavage, esterase-induced cleavage, and disulfide bond cleavage. In addition, non-cleavable refers to the ability of a chemical bond in or attached to a linker to resist cleavage induced by an acid, a photolabile cleaving agent, a peptidase, an esterase, or a chemical or physiological compound that cleaves a disulfide bond under conditions under which a drug such as a maytansinoid or antibody does not lose its activity.
Кислотолабильные линкеры представляют собой линкеры, расщепляемые при кислотном pH. Например, некоторые внутриклеточные компартменты, такие как эндосомы и лизосомы, имеют кислотный pH (pH 4-5) и обеспечивают условия, подходящие для расщепления кислотолабильных линкеров.Acid labile linkers are linkers that are cleavable at acidic pH. For example, some intracellular compartments, such as endosomes and lysosomes, have an acidic pH (pH 4-5) and provide conditions suitable for cleavage of acid-labile linkers.
Фотолабильные линкеры представляют собой линкеры, которые применимы на поверхности тела и во многих полостях тела, которые доступны для воздействия света. Кроме того, инфракрасный свет может проникать внутрь ткани.Photolabile linkers are linkers that are applicable on the surface of the body and in many body cavities that are exposed to light. In addition, infrared light can penetrate into the tissue.
Некоторые линкеры могут расщепляться под действием пептидаз, т. е. являются расщепляемыми пептидазами линкерами. Только некоторые пептиды легко расщепляются внутри или за пределами клеток, см., например, Trout et al., 79 Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 626-629 (1982) и Umemoto et al., 43 Int. J. Cancer, 677-684 (1989). Кроме того, пептиды состоят из α-аминокислот и пептидных связей, которые химически представляют собой амидные связи между карбоксильной группой одной аминокислоты и аминогруппой второй аминокислоты. Понятно, что другие амидные связи, такие как связь между карбоксильной группой и ε-аминогруппой лизина, не являются пептидными связями и считаются нерасщепляемыми.Some linkers can be cleaved by peptidases, i.e., they are peptidase cleavable linkers. Only some peptides are easily cleaved inside or outside of cells, see, for example, Trout et al., 79 Proc. Natl. Acad. sci. USA, 626-629 (1982) and Umemoto et al., 43 Int. J. Cancer, 677-684 (1989). In addition, peptides are composed of α-amino acids and peptide bonds, which are chemically amide bonds between the carboxyl group of one amino acid and the amino group of a second amino acid. It is understood that other amide bonds, such as the bond between the carboxyl group and the ε-amino group of lysine, are not peptide bonds and are considered non-cleavable.
Некоторые линкеры могут расщепляться под действием эстераз, т. е. являются расщепляемыми эстеразами линкерами. Опять-таки, только некоторые сложные эфиры могут расщепляться под действием эстераз, присутствующих внутри или за пределами клеток. Сложные эфиры образуются путем конденсации карбоновой кислоты и спирта. Простые сложные эфиры представляют собой сложные эфиры, полученные с помощью простых спиртов, таких как алифатические спирты, и небольших циклических и небольших ароматических спиртов.Some linkers can be cleaved by esterases, i.e., they are esterase-cleavable linkers. Again, only some esters can be cleaved by esterases present inside or outside the cells. Esters are formed by the condensation of a carboxylic acid and an alcohol. Ethers are esters made with simple alcohols such as aliphatic alcohols and small cyclic and small aromatic alcohols.
Предварительно заряженные линкеры происходят из заряженных сшивающих реагентов, которые сохраняют свой заряд после введения в конъюгат антитела и лекарственного средства. Примеры предварительно заряженных линкеров можно найти в US 2009/0274713.Pre-charged linkers are derived from charged cross-linking reagents that retain their charge after being introduced into the antibody-drug conjugate. Examples of pre-charged linkers can be found in US 2009/0274713.
3. Конъюгация и получение ADC3. Conjugation and preparation of ADC
Многочисленные способы конъюгирования линкеров-полезных нагрузок с антигенсвязывающим фрагментом известны из уровня техники (обзор приведен, например, в: Antibody-Drug Conjugate, Methods in Molecular Biology, Vol. 1045, Editor L. Ducry, Humana Press (2013)). Традиционно лекарственные средства конъюгируют с нативными лизиновыми или нативными цистеиновыми остатками антитела. Полученные препараты представляют собой сложные смеси. В последнее время для улучшения терапевтического индекса и гомогенности препаратов ADC используются способы сайт-специфической конъюгации (обзор приведен в: Panowski, S.; Bhakta, S.; Raab, H.; Polakis, P.; Junutula, J. R. mAbs 2014, 6, 34). Помимо применения гликоинжиниринга (Zhou, Q. et al., Bioconjugate chemistry 2014, 25, 510; Zhu, Z. et al., mAbs 2014, 6, 1190); некоторые более общеизвестные способы получения сайт-специфических ADC основаны на введении сконструированных цистеинов (Junutula, J. R. et al., Nature biotechnology 2008, 26, 925; Shinmi, D. et al., Bioconjugate chemistry 2016, 27, 1324), неканонических аминокислот (Tian, F. et al., Proceedings National Academy of Sciences USA 2014, 111, 1766; Axup, J. Y. et al., Proceedings National Academy of Sciences USA 2012, 109, 16101) или коротких пептидных последовательностей в остов антитела (Drake, P. M. et al., Bioconjugate chemistry 2014, 25, 1331; Strop, P. et al., Chemistry & biology 2013, 20, 161; Beerli, R. R. et al., PloS one 2015, 10, e0131177; Grunewald, J. et al., Bioconjugate chemistry 2015, 26, 2554). Данные способы обеспечивают контроль за стехиометрией и сайтом прикрепления цитотоксина, что приводит к лучшей фармакокинетике (PK), безопасности и профилям эффективности конъюгатов по сравнению с традиционно полученными ADC.Numerous methods for conjugating payload linkers to an antigen-binding moiety are known in the art (for a review see, for example, Antibody-Drug Conjugate, Methods in Molecular Biology, Vol. 1045, Editor L. Ducry, Humana Press (2013)). Traditionally, drugs are conjugated to native lysine or native cysteine residues of the antibody. The preparations obtained are complex mixtures. Recently, site-specific conjugation techniques have been used to improve the therapeutic index and homogeneity of ADC preparations (reviewed in: Panowski, S.; Bhakta, S.; Raab, H.; Polakis, P.; Junutula, J. R. mAbs 2014, 6, 34). Beyond the application of glycoengineering (Zhou, Q. et al., Bioconjugate chemistry 2014, 25, 510; Zhu, Z. et al., mAbs 2014, 6, 1190); some of the more well-known methods for producing site-specific ADCs are based on the introduction of engineered cysteines (Junutula, J. R. et al., Nature biotechnology 2008, 26, 925; Shinmi, D. et al., Bioconjugate chemistry 2016, 27, 1324), non-canonical amino acids ( Tian, F. et al., Proceedings National Academy of Sciences USA 2014, 111, 1766; Axup, J. Y. et al., Proceedings National Academy of Sciences USA 2012, 109, 16101) or short peptide sequences into an antibody backbone (Drake, P. M. et al., Bioconjugate chemistry 2014, 25, 1331; Strop, P. et al., Chemistry & biology 2013, 20, 161; Beerli, R. R. et al., PloS one 2015, 10, e0131177; Grunewald, J. et al. ., Bioconjugate chemistry 2015, 26, 2554). These methods provide control over cytotoxin stoichiometry and site of attachment, resulting in better pharmacokinetics (PK), safety and potency profiles of conjugates compared to conventionally prepared ADCs.
Конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены с помощью любых способов, известных из уровня техники, таких как описанные в патентах США №№ 7811572, 6411163, 7368565 и 8163888, публикациях заявок на патент США 2011/0003969, 2011/0166319, 2012/0253021 и 2012/0259100, и РСТ-публикациях WO 2014/124316 и WO 2015/138615. Полное изложение идей данных патентов и публикаций заявок на патент включено в данный документ посредством ссылки.The conjugates of the present invention can be prepared using any of the methods known in the art, such as those described in US Pat. 2012/0259100 and PCT Publications WO 2014/124316 and WO 2015/138615. A full summary of the ideas behind these patents and patent application publications is incorporated herein by reference.
- 39 042529- 39 042529
Способ конъюгации с введенными путем конструирования цистеиновыми остатками антителаConjugation method with engineered cysteine residues of an antibody
Конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены с применением цистеиновых остатков, введенных путем конструирования в антитело, например, с помощью сайт-направленного мутагенеза. Такие сайт-специфические конъюгаты являются гомогенными и характеризуются улучшенными свойствами (Junutula JR, Raab H, Clark S, Bhakta S, Leipold DD, Weir S, Chen Y, Simpson M, Tsai SP, Dennis MS, Lu Y, Meng YG, Ng C, Yang J, Lee CC, Duenas E, Gorrell J, Katta V, Kim A, McDorman K, Flagella K, Venook R, Ross S, Spencer SD, Lee Wong W, Lowman HB, Vandlen R, Sliwkowski MX, Scheller RH, Polakis P, Mallet W. (2008) Nature Biotechnology 26:925-932.)The conjugates of the present invention can be obtained using cysteine residues introduced by design into the antibody, for example, using site-directed mutagenesis. These site-specific conjugates are homogeneous and have improved properties (Junutula JR, Raab H, Clark S, Bhakta S, Leipold DD, Weir S, Chen Y, Simpson M, Tsai SP, Dennis MS, Lu Y, Meng YG, Ng C , Yang J, Lee CC, Duenas E, Gorrell J, Katta V, Kim A, McDorman K, Flagella K, Venook R, Ross S, Spencer SD, Lee Wong W, Lowman HB, Vandlen R, Sliwkowski MX, Scheller RH, Polakis P, Mallet W. (2008) Nature Biotechnology 26:925-932.)
Поскольку введенные путем конструирования цистеины в антителах, экспрессируемых в клетках млекопитающих, во время биосинтеза модифицируются за счет аддуктов (дисульфидов), таких как глутатион (GSH) и/или цистеин (Chen et al. 2009), изначально экспрессированные введенные путем конструирования цистеиновые остатки в продукте не реагируют с реагентами, вступающими в реакцию с тиолами, такими как малеимидная или бром- или йод-ацетамидная группы. Для осуществления конъюгации полезной нагрузки с введенным путем конструирования цистеином после экспрессии глутатионовый или цистеиновый аддукты должны быть удалены путем восстановления данных дисульфидных аддуктов, что обычно вызывает также восстановление нативных дисульфидов в экспрессированном белке. Удаление аддуктов у введенных путем конструирования цистеинов можно осуществлять, вначале подвергая антитело воздействию восстановителя, например, дитиотреитола (DTT), ТСЕР, или восстановленного цистеина, с последующим проведением процедуры, которая обеспечивает возможность повторного окисления всех нативных дисульфидных связей антитела для восстановления и/или стабилизации функциональной структуры антитела.Because the engineered cysteines in antibodies expressed in mammalian cells are modified during biosynthesis by adducts (disulfides) such as glutathione (GSH) and/or cysteine (Chen et al. 2009), the engineered cysteine residues initially expressed in the product does not react with reagents that react with thiols, such as maleimide or bromine or iodo-acetamide groups. In order to effect conjugation of the payload to the engineered cysteine after expression, the glutathione or cysteine adducts must be removed by the reduction of these disulfide adducts, which usually also causes the restoration of native disulfides in the expressed protein. Removal of adducts from engineered cysteines can be accomplished by first exposing the antibody to a reducing agent, such as dithiothreitol (DTT), TCEP, or reduced cysteine, followed by a procedure that allows all native disulfide bonds of the antibody to be reoxidized to reduce and/or stabilize functional structure of the antibody.
Можно использовать несколько способов восстановления и повторного окисления антител с введенными путем конструирования Cys-остатками для получения конъюгатов антитела и лекарственного средства. Попытки следовать ранее описанным в литературе протоколам повторного окисления с применением высоких концентраций CuSO4 приводили к осаждению белка (Junutula JR, Raab Н, Clark S, Bhakta S, Leipold DD, Weir S, Chen Y, Simpson M, Tsai SP, Dennis MS, Lu Y, Meng YG, Ng C, Yang J, Lee CC, Duenas E, Gorrell J, Katta V, Kim A, McDorman K, Flagella K, Venook R, Ross S, Spencer SD, Lee Wong W, Lowman HB, Vandlen R, Sliwkowski MX, Scheller RH, Polakis P, Mallet W. (2008) Nature Biotechnology 26:925). Авторы настоящего изобретения успешно подготовили и получили конъюгаты антитела и лекарственного средства с помощью нескольких различных способов восстановления и повторного окисления антитела.Several methods of reducing and re-oxidizing antibodies with engineered Cys residues can be used to produce antibody-drug conjugates. Attempts to follow reoxidation protocols previously described in the literature using high concentrations of CuSO 4 resulted in protein precipitation (Junutula JR, Raab H, Clark S, Bhakta S, Leipold DD, Weir S, Chen Y, Simpson M, Tsai SP, Dennis MS, Lu Y, Meng YG, Ng C, Yang J, Lee CC, Duenas E, Gorrell J, Katta V, Kim A, McDorman K, Flagella K, Venook R, Ross S, Spencer SD, Lee Wong W, Lowman HB, Vandlen R, Sliwkowski MX, Scheller RH, Polakis P, Mallet W. (2008) Nature Biotechnology 26:925). The present inventors have successfully prepared and prepared antibody drug conjugates using several different antibody reduction and reoxidation techniques.
В одном примере свежеполученный DTT добавляют к очищенным антителам с Cys-мутацией до конечной концентрации, составляющей 10 мМ. После инкубации с DTT при комнатной температуре в течение 1 часа смесь диализировали против PBS при 4°С в течение трех дней с ежедневной заменой буфера для удаления DTT и повторного окисления нативных дисульфидных связей антитела. Альтернативный способ заключается в удалении восстанавливающих реагентов путем пропускания через обессоливающую колонку, такую как Sephadex G-25, уравновешенную с помощью PBS. После того как белок полностью восстановился, к обессоленным образцам необязательно добавляют 1 мМ окисленного аскорбата (дигидроаскорбиновая кислота) и инкубации для повторного окисления проводят в течение 20-24 ч.In one example, freshly generated DTT is added to purified Cys mutated antibodies to a final concentration of 10 mM. After incubation with DTT at room temperature for 1 hour, the mixture was dialyzed against PBS at 4°C for three days with daily buffer changes to remove DTT and re-oxidize the native disulfide bonds of the antibody. An alternative method is to remove the reducing reagents by passing through a desalting column such as Sephadex G-25 equilibrated with PBS. After the protein is completely reduced, 1 mM oxidized ascorbate (dihydroascorbic acid) is optionally added to the desalted samples and incubations for re-oxidation are carried out for 20-24 hours.
В другом иллюстративном способе освобождение введенных путем конструирования Cys-остатков осуществляют путем добавления полностью восстановленного цистеина при концентрации 20 мМ к антителам, связанным со смолой на основе сефарозы с белком А. Восстановление аддуктов на Cys достигается путем инкубации в течение примерно 30-60 мин при комнатной температуре, затем восстановитель быстро удаляют путем промывания смолы с помощью 50 объемов слоя PBS. Повторное окисление восстановленного антитела достигается инкубацией промытой взвеси при комнатной температуре с добавлением или без добавления 50-2000 нМ CuCl2 в качестве катализатора. За исключением применения сульфата меди, в примерах из данного документа применялся каждый из протоколов, описанных в данном документе с получением аналогичных результатов. Повторное окисление восстанавливает внутрицепочечные дисульфиды, в то время как диализ, обессоливание или хроматография с белком А удаляет восстановитель, а также цистеины и глутатионы, изначально присоединенные к введенному(-ым) путем конструирования цистеину(-ам) антитела. Для отслеживания процесса повторного окисления обычно применяют HPLC-хроматографию с обращенной фазой: антитела загружают на колонку PLRP-S (4000 А, 50 мм х 2,1 мм, Agilent), нагретую до 80°С и элюируют с применением линейного градиента 30-45% CH3CN в воде, содержащей 0,1% TFA, при 1,5 мл/мин и пике обнаружения при 215, 254 и 280 нм.In another illustrative method, release of engineered Cys residues is accomplished by adding fully reduced cysteine at 20 mM to antibodies bound to Protein A Sepharose resin. temperature, then the reducing agent is rapidly removed by washing the resin with 50 bed volumes of PBS. Re-oxidation of the reduced antibody is achieved by incubating the washed suspension at room temperature with or without the addition of 50-2000 nM CuCl 2 as a catalyst. With the exception of the use of copper sulfate, the examples in this document used each of the protocols described in this document with similar results. Reoxidation restores intrachain disulfides, while dialysis, desalting, or protein A chromatography removes the reducing agent, as well as cysteines and glutathiones, originally attached to the introduced(s) by constructing the cysteine(s) of the antibody. Reverse phase HPLC is commonly used to monitor the reoxidation process: antibodies are loaded onto a PLRP-S column (4000 A, 50 mm x 2.1 mm, Agilent) heated to 80°C and eluted using a linear gradient of 30-45 % CH 3 CN in water containing 0.1% TFA at 1.5 ml/min and detection peak at 215, 254 and 280 nm.
После повторного окисления антитело конъюгируют с предварительно образованным фрагментом, представляющим собой линкер-лекарственное средство. В качестве примера предварительно образованный фрагмент, представляющий собой линкер-лекарственное средство (такой как, например, MMTBTDM4; MPET-DM4; MBT-DM4; MEPET-DM4, MPBT-DM1; и другие фрагменты, представляющие собой линкер-лекарственное средство, описанные в данном документе) добавляют к повторно окисленному антителу с Cys-мутацией из расчета 10 молярных эквивалентов относительно антитела в буфере PBS (pH 7,2). Инкубации проводят в течение 1 ч. Процесс конъюгации отслеживают с помощью HPLC с обращенной фазой, которая может отделить конъюгированные антитела от неконъюгированных. Реакцион- 40 042529 ные смеси в процессе конъюгации анализируют на колонке PRLP-S (4000 А, 50 мм х 2,1 мм, Agilent), нагретой до 80°С, а элюирование колонки проводят с помощью линейного градиента 30-60% ацетонитрила в воде, содержащей 0,1% TFA при расходе 1,5 мл/мин. Элюирование белков из колонки отслеживают при 280, 254 и 215 нм.After reoxidation, the antibody is conjugated to a preformed linker-drug fragment. As an example, a preformed linker drug fragment (such as, for example, MMTBTDM4; MPET-DM4; MBT-DM4; MEPET-DM4, MPBT-DM1; and other linker drug fragments described in herein) is added to the reoxidized Cys mutated antibody at 10 molar equivalents relative to the antibody in PBS buffer (pH 7.2). Incubations are carried out for 1 hour. The conjugation process is monitored by reverse phase HPLC, which can separate conjugated antibodies from non-conjugated ones. The reaction mixtures during conjugation are analyzed on a PRLP-S column (4000 A, 50 mm x 2.1 mm, Agilent) heated to 80°C, and the column is eluted with a linear gradient of 30-60% acetonitrile in water containing 0.1% TFA at a flow rate of 1.5 ml/min. The elution of proteins from the column is monitored at 280, 254 and 215 nm.
В одном варианте осуществления примеры фрагмента, представляющего собой линкерлекарственное средство, для конъюгации по цистеину могут быть получены в соответствии со схемами 1-3:In one embodiment, examples of a linker drug moiety for cysteine conjugation can be prepared according to Schemes 1-3:
Схема 1Scheme 1
где фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, прикреплен к линкеру посредством тиольной функциональной группы;where the fragment representing the drug is attached to the linker through a thiol functional group;
L1 представляет собой C1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;L 1 represents C 1-6 alkylene, while one of the methylene groups can be replaced by oxygen;
L2 представляет собой С1-6алкилен или представляет собой -(СН2СН2О)у-СН2-СН2-, где у составляет от 1 до 11; иL 2 is C 1-6 alkylene or is -(CH 2 CH 2 O) y -CH 2 -CH 2 - where y is from 1 to 11; And
X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;X is -C(O)-NH-, -NHC(O)- or triazole;
где алкилен является линейным или разветвленным; иwhere alkylene is linear or branched; And
RG1 и RG2 представляют собой 2 реакционноспособные группы, образующие группу X.RG1 and RG2 are 2 reactive groups forming the X group.
Осуществление реакции групп, которые образуют амид или триазол, широко известно из уровня техники.The reaction of groups that form an amide or triazole is well known in the art.
Один пример предварительного образования фрагмента, представляющего собой линкерлекарственное средство, представлен на схеме 2, где фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, представляет собой DM4; RG1 представляет собой аминогруппу, a RG2 представляет собой активированную кислоту, которые приводят к образованию амидной связи (X).One example of preformation of a linker drug moiety is shown in Scheme 2, where the drug moiety is DM4; RG1 is an amino group and RG2 is an activated acid, which lead to the formation of an amide bond (X).
Схема 2Scheme 2
образования фрагмента, представляющего собой линкерДругой пример предварительного лекарственное средство, представлен на схеме 3, где фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, представляет собой DM4; RG1 представляет собой азидную группу, a RG2 представляет собой алкиновую группу, которые приводят к образованию тетразола (X).forming a linker moiety Another example of a predrug is shown in Scheme 3, where the drug moiety is DM4; RG1 is an azide group and RG2 is an alkyne group, which lead to the formation of a tetrazole (X).
Схема 3Scheme 3
- 41 042529- 41 042529
Эффективность конъюгации различных фрагментов, представляющих собой лекарственное средство, имеющих присоединенный малеимид, с антителом с Cys-мутацией, варьирует в зависимости от растворимости применяемого фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, однако, многие реакции приводят к более 90% конъюгата. Для оценки состояния агрегации полученные конъюгаты анализируют на колонке для эксклюзионной хроматографии (GE, Superdex200, 3,2/30) при расходе 0,1 мл/мин в PBS. Все конъюгаты являются преимущественно мономерными. Большая часть конъюгатов содержит менее 3% димерного и олигомерного материала, что указывает на то, что конъюгация фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, имеющего присоединенный малеимид, с антителом с Cys-мутацией не вызывает агрегацию.The efficiency of conjugation of various maleimide-attached drug moieties to a Cys-mutated antibody varies depending on the solubility of the drug moiety used, however, many reactions result in over 90% conjugate. To evaluate the state of aggregation, the resulting conjugates are analyzed on a size exclusion chromatography column (GE, Superdex200, 3.2/30) at a flow rate of 0.1 ml/min in PBS. All conjugates are predominantly monomeric. Most of the conjugates contain less than 3% dimeric and oligomeric material, indicating that conjugation of the maleimide-attached drug moiety to the Cys-mutated antibody does not cause aggregation.
Иммуноконъюгаты также характеризуют с точки зрения средней нагрузки фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, на фрагмент, представляющий собой антитело связывания, обычно называемой отношение лекарственного средства-к-антителу (DAR). Значение DAR экстраполируют, например, на основании данных LC-MS для восстановленных и дегликозилированных образцов. LC/MS обеспечивает возможность получения количественной оценки среднего числа молекул полезной нагрузки (фрагмент, представляющий собой лекарственное средство), прикрепленных к антителу в ADC. HPLC разделяет антитело на легкую и тяжелую цепи, а также разделяет тяжелую цепь (НС) и легкую цепь (LC) в соответствии с числом групп линкер-полезная нагрузка на цепь. Данные масс-спектров позволяют идентифицировать разновидности компонентов в смеси, например, LC, LC+1, LC+2, НС, НС+1, НС+2 и т.д. На основании средней нагрузки цепей LC и НС для ADC может быть рассчитано среднее DAR. DAR для данного образца иммуноконъюгата представляет собой среднее число молекул лекарственного средства (полезная нагрузка), прикрепленных к тетрамерному антителу, содержащему две легкие цепи и две тяжелые цепи.Immunoconjugates are also characterized in terms of the average load of drug moiety per antibody binding moiety, commonly referred to as the drug-to-antibody ratio (DAR). The DAR value is extrapolated from, for example, LC-MS data for reconstituted and deglycosylated samples. LC/MS provides the ability to quantify the average number of payload molecules (drug-forming fragment) attached to an antibody in an ADC. HPLC separates the antibody into light and heavy chains, and also separates the heavy chain (HC) and light chain (LC) according to the number of linker-payload groups per chain. The mass spectrum data allows identification of the species of components in the mixture, e.g. LC, LC+1, LC+2, HC, HC+1, HC+2, etc. Based on the average load of the LC and HC circuits for the ADC, an average DAR can be calculated. The DAR for a given immunoconjugate sample is the average number of drug molecules (payload) attached to a tetrameric antibody containing two light chains and two heavy chains.
Способ конъюгации с нативными цистеиновыми остатками антителаMethod for conjugation with native cysteine residues of an antibody
Фрагменты, представляющие собой линкер-лекарственное средство, описанные в данном документе, также можно конъюгировать с нативными цистеиновыми остатками не подвергнутых конструированию антител с применением процедуры, которая предусматривает частичное восстановление антител (Doronina S. O., Toki, B. E., Torgov M. Y., Mendelsohn B. A., Cerveny C. G., Chace D. F., DeBlanc R. L., Gearing R. P., Bovee T. D., Siegall С. В., Francisco J. A., Wahl,A. F., Meyer D. L. and Senter P. D. (2003) Development of potent monoclonal antibody auristatin conjugates for cancer therapy. Nat. Biotechnol. 21, 778784). Следующий протокол является неограничивающим примером того, как такие конъюгаты могут быть получены. Межцепочечные и внутрицепочечные дисульфидные связи антитела (обычно при концентрации 5-10 мг/мл) сначала частично восстанавливают в PBS, содержащем 2 мМ EDTA, путем добавления ТСЕР до конечной концентрации 10 мМ и инкубации смеси при 37°С в течение 1 ч. После обессоливания и добавления 1% вес./об детергента PS-20 частично восстановленные антитела (1-2 мг/мл) подвергают реакции в течение ночи при 4°С с 0,5-1 мг соединения малеимидсодержащего линкера и полезной нагрузки на 10 мг антитела. Полученные конъюгаты очищают хроматографией с белком А посредством стандартных способов и проводят замену буфера на PBS, и их обычно анализируют с помощью масс-спектрометрии (MS), аналитической эксклюзионной хроматографии (AnSEC) и аналитической хроматографии гидрофобных взаимодействий (AnHIC) для определения отношения лекарственного средства-к-антителу, склонности к агрегации и гидрофобности, а также с помощью анализов активности.The linker drug fragments described herein can also be conjugated to native cysteine residues of unengineered antibodies using a procedure that involves partial antibody recovery (Doronina S. O., Toki, B. E., Torgov M. Y., Mendelsohn B. A., Cerveny C. G. , Chace D. F., DeBlanc R. L., Gearing R. P., Bovee T. D., Siegall C. B., Francisco J. A., Wahl, A. F., Meyer D. L. and Senter P. D. (2003) Development of potent monoclonal antibody auristatin conjugates for cancer therapy. Nat. Biotechnol. 21 , 778784). The following protocol is a non-limiting example of how such conjugates can be made. Interchain and intrachain disulfide bonds of the antibody (typically at a concentration of 5-10 mg/ml) are first partially reduced in PBS containing 2 mM EDTA by adding TCEP to a final concentration of 10 mM and incubating the mixture at 37°C for 1 hour. After desalting and adding 1% w/v PS-20 detergent, partially reduced antibodies (1-2 mg/ml) are reacted overnight at 4°C with 0.5-1 mg of maleimide-containing linker compound and payload per 10 mg of antibody. The resulting conjugates are purified by protein A chromatography using standard methods and buffer exchanged with PBS, and are typically analyzed by mass spectrometry (MS), analytical size exclusion chromatography (AnSEC) and analytical hydrophobic interaction chromatography (AnHIC) to determine the ratio of drug- k-antibody, aggregation propensity and hydrophobicity, as well as using activity assays.
Одностадийный способ для сшивания с лизиновыми остатками антителаOne-step method for cross-linking with lysine residues of an antibody
В одном варианте осуществления конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены с помощью одностадийного способа сшивания лекарственного средства с лизиновыми остатками на антителе. Способ предусматривает объединение антитела, лекарственного средства и сшивающего средства в значительной степени водной среде, необязательно содержащей один или несколько сорастворителей, при подходящем pH. В одном варианте осуществления способ предусматривает стадию приведения антитела по настоящему изобретению в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4) с образованием первой смеси, содержащей антитело и лекарственное средство, и затем приведение первой смеси, содержащей антитело и лекарственное средство, в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) в растворе, характеризующемся pH от приблизительно 4 до приблизительно 9, с получением смеси, содержащей:In one embodiment, the conjugates of the present invention can be obtained using a one-step method of cross-linking a drug with lysine residues on an antibody. The method involves combining the antibody, drug, and crosslinker in a substantially aqueous medium, optionally containing one or more co-solvents, at a suitable pH. In one embodiment, the method comprises the step of contacting an antibody of the present invention with a drug (e.g., DM1 or DM4) to form a first mixture containing the antibody and the drug, and then contacting the first mixture containing the antibody and the drug with cross-linking agent (for example, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) in a solution having a pH of about 4 to about 9 to form a mixture containing:
(i) конъюгат (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1), (ii) свободное лекарственное средство (например, DM1 или DM4) и (iii) побочные продукты реакции.(i) a conjugate (eg, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4, or Ab-CX1-1-DM1), (ii) free drug (eg, DM1 or DM4), and (iii) reaction by-products.
В одном варианте осуществления одностадийный способ предусматривает приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) в растворе, характеризующемся pH приблизительно 6 или больше (например, от приблизительно 6 до приблизительно 9, от приблизительно 6 до приблизительно 7, от приблизительно 7 до приблизительно 9, от приблизительно 7 до приблизительно 8,5, от приблизительно 7,5 до приблизительно 8,5, от приблизительно 7,5 до приблизительно 8,0, от приблизительно 8,0 до приблизительно 9,0 или от приблизительно 8,5 до приблизительно 9,0). Например, способ по настоящему изобретению предусматривает приведение связывающего клетку средства в кон- 42 042529 такт с лекарственным средством (DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) в растворе, характеризующемся pH приблизительно 6,0, приблизительно 6,1, приблизительно 6,2, приблизительно 6,3, приблизительно 6,4, приблизительно 6,5, приблизительно 6,6, приблизительно 6,7, приблизительно 6,8, приблизительно 6,9, приблизительно 7,0, приблизительно 7,1, приблизительно 7,2, приблизительно 7,3, приблизительно 7,4, приблизительно 7,5, приблизительно 7,6, приблизительно 7,7, приблизительно 7,8, приблизительно 7,9, приблизительно 8,0, приблизительно 8,1, приблизительно 8,2, приблизительно 8,3, приблизительно 8,4, приблизительно 8,5, приблизительно 8,6, приблизительно 8,7, приблизительно 8,8, приблизительно 8,9, или приблизительноIn one embodiment, the one step method involves contacting the antibody with a drug (e.g., DM1 or DM4) and then with a crosslinker (e.g., SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) in a solution characterized by a pH of about 6 or greater (e.g., about 6 to about 9, about 6 to about 7, about 7 to about 9, about 7 to about 8.5, about 7.5 to about 8.5, from about 7.5 to about 8.0, about 8.0 to about 9.0, or about 8.5 to about 9.0). For example, the method of the present invention involves contacting a cell-binding agent with a drug (DM1 or DM4) and then with a cross-linking agent (e.g., SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) in solution having a pH of about 6.0, about 6.1, about 6.2, about 6.3, about 6.4, about 6.5, about 6.6, about 6.7, about 6.8, about 6.9, about 7.0, about 7.1, about 7.2, about 7.3, about 7.4, about 7.5, about 7.6, about 7.7, about 7.8, about 7.9, about 8.0, about 8.1, about 8.2, about 8.3, about 8.4, about 8.5, about 8.6, about 8.7, about 8.8, approximately 8.9, or approximately
9,0. В конкретном варианте осуществления способ по настоящему изобретению предусматривает приведение связывающего клетку средства в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) в растворе, характеризующемся pH приблизительно 7,8 (например, pH от 7,6 до 8,0 или pH от 7,7 до 7,9).9.0. In a specific embodiment, the method of the present invention involves contacting a cell-binding agent with a drug (e.g., DM1 or DM4) and then with a cross-linking agent (e.g., SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) in a solution having a pH of about 7.8 (eg pH 7.6 to 8.0 or pH 7.7 to 7.9).
Одностадийный способ (т. е. приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфоSPDB или СХ1-1) можно проводить при любой подходящей температуре, известной из уровня техники. Например, одностадийный способ может происходить при приблизительно 20°С или меньше (например, от приблизительно -10°С (при условии, что не допускается замерзание раствора, например, за счет присутствия органического растворителя, применяемого для растворения цитотоксического средства и бифункционального сшивающего реагента) до приблизительно 20°С, от приблизительно 0 до приблизительно 18°С, от приблизительно 4 до приблизительно 16°С), при комнатной температуре (например, от приблизительно 20 до приблизительно 30°С или от приблизительно 20 до приблизительно 25°С) или при повышенной температуре (например, от приблизительно 30°Сдо приблизительно 37°С). В одном варианте осуществления одностадийный способ происходит при температуре от приблизительно 16 до приблизительно 24°С (например, приблизительно 16°С, приблизительно 17°С, приблизительно 18°С, приблизительно 19°С, приблизительно 20°С, приблизительно 21°С, приблизительно 22°С, приблизительно 23°С, приблизительно 24°С или приблизительно 25°С). В другом варианте осуществления одностадийный способ проводят при температуре приблизительно 15°С или меньше (например, от приблизительно -10 до приблизительно 15°С или от приблизительно 0 до приблизительно 15°С). Например, способ предусматривает приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) при температуре приблизительно 15°С, приблизительно 14°С, приблизительно 13°С, приблизительно 12°С, приблизительно 11°С, приблизительно 10°С, приблизительно 9°С, приблизительно 8°С, приблизительно 7°С, приблизительно 6°С, приблизительно 5°С, приблизительно 4°С, приблизительно 3°С, приблизительно 2°С, приблизительно 1°С, приблизительно 0°С, приблизительно -1°С, приблизительно -2°С, приблизительно -3°С, приблизительно -4°С, приблизительно -5°С, приблизительно -6°С, приблизительно -7°С, приблизительно -8°С, приблизительно -9°С или приблизительно -10°С, при условии, что не допускается замерзание раствора, например, за счет присутствия органического(их) растворителя(ей), применяемого(ых) для растворения сшивающего средства (например, SMCC, сульфо-SMCC, сульфо-SPDB, SPDB или СХ1-1). В одном варианте осуществления способ предусматривает приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) при температуре от приблизительно -10 до приблизительно 15°С, от приблизительно 0 до приблизительно 15°С, от приблизительно 0 до приблизительно 10°С, от приблизительно 0 до приблизительно 5°С, от приблизительно 5 до приблизительно 15°С, от приблизительно 10 до приблизительно 15°С или от приблизительно 5 до приблизительно 10°С. В другом варианте осуществления способ предусматривает приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) при температуре приблизительно 10°С (например, температуре от 8 до 12°С или температуре от 9 до 11°С).The one-step method (i.e., contacting the antibody with the drug (eg, DM1 or DM4) and then with the cross-linking agent (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) can be performed at any suitable temperature , known in the art. For example, a one-step process can occur at about 20°C or less (for example, from about -10°C (provided that freezing of the solution is not allowed, for example, due to the presence of an organic solvent used to dissolve the cytotoxic agent and a bifunctional crosslinker) to about 20°C, from about 0 to about 18°C, from about 4 to about 16°C), at room temperature (for example, from about 20 to about 30°C, or from about 20 to about 25°C) or at an elevated temperature (e.g., from about 30°C to about 37°C).In one embodiment, the one-step process occurs at at temperatures from about 16 to about 24°C (e.g., about 16°C, about 17°C, about 18°C, about 19°C, about 20°C, about 21°C, about 22°C, about 23 °C, approximately 24°C or approximately 25°C). In another embodiment, the one-step process is carried out at a temperature of about 15°C or less (eg, from about -10 to about 15°C or from about 0 to about 15°C). For example, the method involves contacting the antibody with a drug (eg, DM1 or DM4) and then with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) at a temperature of approximately 15°C, approximately 14°C, approximately 13°C, approximately 12°C, approximately 11°C, approximately 10°C, approximately 9°C, approximately 8°C, approximately 7°C, approximately 6°C, approximately 5°C, approximately 4°C, approximately 3°C, approximately 2°C, approximately 1°C, approximately 0°C, approximately -1°C, approximately -2°C, approximately -3°C, approximately -4°C, approximately -5°C, approximately -6°C, approximately -7°C, approximately -8°C, approximately -9°C or approximately -10°C, provided that the solution is not allowed to freeze, for example, due to the presence of organic (their) solvent(s) used to dissolve the crosslinker (eg SMCC, sulfo-SMCC, sulfo-SPDB, SPDB or CX1-1). In one embodiment, the method involves contacting the antibody with a drug (eg, DM1 or DM4) and then with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) at a temperature of from about - 10 to about 15°C, about 0 to about 15°C, about 0 to about 10°C, about 0 to about 5°C, about 5 to about 15°C, about 10 to about 15° C or from about 5 to about 10°C. In another embodiment, the method involves contacting the antibody with a drug (eg, DM1 or DM4) and then with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) at a temperature of approximately 10°C. C (for example, a temperature of 8 to 12°C or a temperature of 9 to 11°C).
В одном варианте осуществления описанное выше приведение в контакт осуществляют путем внесения антитела, затем приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4) с образованием первой смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), а затем приведения первой смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4) в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфоSPDB или СХ1-1). Например, в одном варианте осуществления антитело вносится в реакционный сосуд, лекарственное средство (например, DM1 или DM4) добавляют в реакционный сосуд (тем самым приводя в контакт с антителом), а затем сшивающее средство (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфоSPDB или СХ1-1) добавляют в смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4) (тем самым приводя в контакт со смесью, содержащей антитело и лекарственное средство). В одном варианте осуществления антитело вносится в реакционный сосуд, а лекарственное средство (например, DM1 или DM4) добавляют в реакционный сосуд непосредственно после внесения антитела в сосуд. В другом варианте осуществления антитело вносится в реакционный сосуд, а лекарственное средство (например, DM1 или DM4) добавляют в реакционный сосуд через некоторый временной интервалIn one embodiment, the above-described contacting is carried out by introducing the antibody, then contacting the antibody with a drug (e.g., DM1 or DM4) to form a first mixture containing the antibody and drug (e.g., DM1 or DM4), and then bringing a first mixture containing the antibody and drug (eg DM1 or DM4) in contact with a crosslinker (eg SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfoSPDB or CX1-1). For example, in one embodiment, an antibody is added to a reaction vessel, a drug (e.g., DM1 or DM4) is added to the reaction vessel (thereby contacting the antibody), and then a crosslinker (e.g., SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulphoSPDB or CX1-1) is added to the mixture containing the antibody and the drug (eg, DM1 or DM4) (thereby bringing into contact with the mixture containing the antibody and the drug). In one embodiment, the antibody is added to the reaction vessel and the drug (eg, DM1 or DM4) is added to the reaction vessel immediately after the antibody is added to the vessel. In another embodiment, the antibody is added to the reaction vessel and the drug (e.g., DM1 or DM4) is added to the reaction vessel at some time interval.
- 43 042529 после внесения антитела в сосуд (например, через приблизительно 5 мин, приблизительно 10 мин, приблизительно 20 мин, приблизительно 30 мин, приблизительно 40 мин, приблизительно 50 мин, приблизительно 1 ч, приблизительно 1 день или больше после внесения связывающего клетку средства в емкость). Лекарственное средство (например, DM1 или DM4) можно добавлять быстро (т. е. за короткий временной интервал, такой как приблизительно 5 мин, приблизительно 10 мин) или медленно (как, например, с применением насоса).- 43 042529 after the introduction of the antibody into the vessel (for example, about 5 minutes, about 10 minutes, about 20 minutes, about 30 minutes, about 40 minutes, about 50 minutes, about 1 hour, about 1 day or more after the addition of the cell-binding agent into the container). The drug (eg, DM1 or DM4) can be added rapidly (ie, in a short time frame such as about 5 minutes, about 10 minutes) or slowly (such as using a pump).
Смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), затем можно привести в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1), либо непосредственно после приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), либо немного позже (например, от приблизительно 5 мин до приблизительно 8 ч или больше) после приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4).The antibody-drug mixture (eg, DM1 or DM4) can then be contacted with a cross-linking agent (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) or directly after the antibody has been contacted. with the drug (eg, DM1 or DM4), or slightly later (eg, from about 5 minutes to about 8 hours or more) after bringing the antibody into contact with the drug (eg, DM1 or DM4).
Например, в одном варианте осуществления сшивающее средство (например, SMCC, сульфоSMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) добавляют в смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), непосредственно после добавления лекарственного средства (например, DM1 или DM4) в реакционный сосуд, содержащий антитело. В качестве альтернативы смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), можно привести в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) через приблизительно 5 мин, приблизительно 10 мин, приблизительно 20 мин, приблизительно 30 мин, приблизительно 1 ч, приблизительно 2 ч, приблизительно 3 ч, приблизительно 4 ч, приблизительно 5 ч, приблизительно 6 ч, приблизительно 7 ч, приблизительно 8 ч или больше после приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4).For example, in one embodiment, a crosslinker (e.g., SMCC, sulfoSMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) is added to the mixture containing the antibody and drug (e.g., DM1 or DM4) immediately after the addition of the drug (e.g., DM1 or DM4) into the reaction vessel containing the antibody. Alternatively, a mixture containing antibody and drug (eg, DM1 or DM4) may be contacted with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) after about 5 minutes, approximately 10 minutes, approximately 20 minutes, approximately 30 minutes, approximately 1 hour, approximately 2 hours, approximately 3 hours, approximately 4 hours, approximately 5 hours, approximately 6 hours, approximately 7 hours, approximately 8 hours or more after the antibody has been contacted with drug (eg DM1 or DM4).
После того, как смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), приводят в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1), обеспечивают возможность протекания реакции в течение приблизительно 1 ч, приблизительно 2 ч, приблизительно 3 ч, приблизительно 4 ч, приблизительно 5 ч, приблизительно 6 ч, приблизительно 7 ч, приблизительно 8 ч, приблизительно 9 ч, приблизительно 10 ч, приблизительно 11 ч, приблизительно 12 ч, приблизительно 13 ч, приблизительно 14 ч, приблизительно 15 ч, приблизительно 16 ч, приблизительно 17 ч, приблизительно 18 ч, приблизительно 19 ч, приблизительно 20 ч, приблизительно 21 ч, приблизительно 22 ч, приблизительно 23 ч, приблизительно 24 ч или больше (например, приблизительно 30 ч, приблизительно 35 ч, приблизительно 40 ч, приблизительно 45 ч или приблизительно 48 ч).After the mixture containing the antibody and drug (eg, DM1 or DM4) is contacted with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1), the reaction is allowed to proceed in for about 1 hour, about 2 hours, about 3 hours, about 4 hours, about 5 hours, about 6 hours, about 7 hours, about 8 hours, about 9 hours, about 10 hours, about 11 hours, about 12 hours, about 13:00, approximately 14:00, approximately 15:00, approximately 16:00, approximately 17:00, approximately 18:00, approximately 19:00, approximately 20:00, approximately 21:00, approximately 22:00, approximately 23:00, approximately 24 hours or more (for example , about 30 hours, about 35 hours, about 40 hours, about 45 hours, or about 48 hours).
В одном варианте осуществления одностадийный способ дополнительно предусматривает стадию блокирования, чтобы заблокировать любое непрореагировавшее лекарственное средство (например, DM1 или DM4) и/или непрореагировавшее сшивающее средство (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1). Обычно стадию блокирования проводят до очистки конъюгата. В одном варианте осуществления смесь блокируют путем приведения смеси в контакт с блокирующим реагентом. Используемый в данном документе блокирующий реагент относится к реагенту, который реагирует со свободным лекарственным средством (например, DM1 или DM4) и/или сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1). В одном варианте осуществления можно применять малеимидные или галогенацетамидные блокирующие реагенты, такие как 4малеимидомасляная кислота, 3-малеимидопропионовая кислота, N-этилмалеимид, йодацетамид или йодацетамидопропионовая кислота, чтобы гарантировать, что любая непрореагировавшая группа (такая как тиол) в лекарственном средстве (например, DM1 или DM4) заблокирована. Стадия блокирования может способствовать предупреждению димеризации лекарственного средства (например, DM1). Димеризованный DM1 может быть сложно удалить. После блокирования с помощью полярных, заряженных, блокирующих тиол реагентов (таких как 4-малеимидомасляная кислота или 3-малеимидопропионовая кислота) избыточный, непрореагировавший DM1 превращается в полярный, заряженный, водорастворимый аддукт, который можно легко отделить от конъюгата, соединенного ковалентной связью, во время стадии очистки. Также можно применять блокирование с помощью неполярных и нейтральных блокирующих тиол реагентов. В одном варианте осуществления смесь блокируют путем приведения смеси в контакт с блокирующим реагентом, который реагирует с непрореагировавшим сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1). Например, чтобы блокировать любой непрореагировавший SMCC, в смесь можно добавлять нуклеофилы. Предпочтительно нуклеофил представляет собой нуклеофил, содержащий аминогруппу, такой как лизин, таурин и гидроксиламин.In one embodiment, the one step method further includes a blocking step to block any unreacted drug (e.g., DM1 or DM4) and/or unreacted crosslinker (e.g., SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1). Typically, the blocking step is carried out prior to purification of the conjugate. In one embodiment, the mixture is blocked by bringing the mixture into contact with a blocking reagent. As used herein, a blocking reagent refers to a reagent that reacts with a free drug (eg, DM1 or DM4) and/or a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1). In one embodiment, maleimide or haloacetamide blocking reagents, such as 4-maleimidobutyric acid, 3-maleimidopropionic acid, N-ethylmaleimide, iodoacetamide, or iodoacetamidopropionic acid, can be used to ensure that any unreacted group (such as a thiol) in the drug (e.g., DM1 or DM4) is disabled. The blocking step may help prevent dimerization of the drug (eg, DM1). Dimerized DM1 can be difficult to remove. After blocking with polar, charged, thiol-blocking reagents (such as 4-maleimidobutyric acid or 3-maleimidopropionic acid), excess, unreacted DM1 is converted to a polar, charged, water-soluble adduct that can be easily separated from the covalently bonded conjugate during cleaning stages. Blocking with non-polar and neutral thiol blocking reagents can also be used. In one embodiment, the mixture is blocked by contacting the mixture with a blocking reagent that reacts with the unreacted crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1). For example, nucleophiles can be added to the mixture to block any unreacted SMCC. Preferably, the nucleophile is an amino group-containing nucleophile such as lysine, taurine, and hydroxylamine.
В предпочтительном варианте осуществления обеспечивают возможность протекания реакции (т. е. приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1)) до ее завершения перед приведением смеси в контакт с блокирующим реагентом. В связи с этим блокирующий реагент добавляют в смесь через от приблизительно 1 до приблизительно 48 ч (например, через приблизительно 1 ч, приблизительно 2 ч, приблизительно 3 ч, приблизительно 4 ч, приблизительно 5 ч, приблизительно 6 ч, приблизительно 7 ч, приблизительно 8 ч, приблизительно 9 ч, приблизительно 10 ч, приблизительно 11 ч, приблизительно 12 ч, приблизительно 13 ч, приблизительно 14 часов, приблизительно 15In a preferred embodiment, the reaction is allowed to proceed (i.e., the antibody is brought into contact with the drug (eg, DM1 or DM4) and then with the crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1- 1)) to its completion before bringing the mixture into contact with the blocking reagent. Therefore, the blocking agent is added to the mixture after about 1 to about 48 hours (e.g., after about 1 hour, about 2 hours, about 3 hours, about 4 hours, about 5 hours, about 6 hours, about 7 hours, about 8 o'clock, approximately 9 o'clock, approximately 10 o'clock, approximately 11 o'clock, approximately 12 o'clock, approximately 13 o'clock, approximately 14 o'clock, approximately 15
- 44 042529 ч, приблизительно 16 ч, приблизительно 17 ч, приблизительно 18 ч, приблизительно 19 ч, приблизительно 20 ч, приблизительно 21 ч, приблизительно 22 ч, приблизительно 23 ч, приблизительно 24 ч или от приблизительно 25 до приблизительно 48 ч) после приведения смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1).- 44 042529 hours, approximately 16 hours, approximately 17 hours, approximately 18 hours, approximately 19 hours, approximately 20 hours, approximately 21 hours, approximately 22 hours, approximately 23 hours, approximately 24 hours or from approximately 25 to approximately 48 hours) after bringing the mixture containing the antibody and drug (eg, DM1 or DM4) into contact with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1).
В качестве альтернативы смесь блокируют путем снижения pH смеси до приблизительно 5,0 (например, 4,8, 4,9, 5,0, 5,1 или 5,2). В другом варианте осуществления смесь блокируют путем снижения pH до менее 6,0, менее 5,5, менее 5,0, менее 4,8, менее 4,6, менее 4,4, менее 4,2, менее 4,0. В качестве альтернативы pH снижают до значения от приблизительно 4,0 (например, 3,8, 3,9, 4,0, 4,1 или 4,2) до приблизительно 6,0 (например, 5,8, 5,9, 6,0, 6,1 или 6,2), от приблизительно 4,0 до приблизительно 5,0, от приблизительно 4,5 (например, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6 или 4,7) до приблизительно 5,0. В одном варианте осуществления смесь блокируют путем снижения pH смеси до 4,8. В другом варианте осуществления смесь блокируют путем снижения pH смеси до 5,5.Alternatively, the mixture is blocked by lowering the pH of the mixture to about 5.0 (eg, 4.8, 4.9, 5.0, 5.1, or 5.2). In another embodiment, the mixture is blocked by lowering the pH to less than 6.0, less than 5.5, less than 5.0, less than 4.8, less than 4.6, less than 4.4, less than 4.2, less than 4.0. Alternatively, the pH is reduced to between about 4.0 (e.g., 3.8, 3.9, 4.0, 4.1, or 4.2) to about 6.0 (e.g., 5.8, 5.9 , 6.0, 6.1, or 6.2), from about 4.0 to about 5.0, from about 4.5 (for example, 4.3, 4.4, 4.5, 4.6, or 4 .7) to about 5.0. In one embodiment, the mixture is blocked by lowering the pH of the mixture to 4.8. In another embodiment, the mixture is blocked by lowering the pH of the mixture to 5.5.
В одном варианте осуществления одностадийный способ дополнительно предусматривает стадию удерживания для высвобождения нестабильно связавшихся линкеров из антитела. Стадия удерживания предусматривает удерживание смеси до очистки конъюгата (например, после стадии реакции, между стадией реакции и стадией блокирования или после стадии блокирования). Например, способ предусматривает (а) приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1, DM3 или DM4) с образованием смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4); а затем приведение смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4), в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) в растворе, характеризующемся pH от приблизительно 4 до приблизительно 9, с получением смеси, содержащей:In one embodiment, the one step method further includes a retention step to release unstable bound linkers from the antibody. The retention step involves holding the mixture until the conjugate is purified (eg, after the reaction step, between the reaction step and the blocking step, or after the blocking step). For example, the method comprises (a) contacting an antibody with a drug (eg, DM1, DM3, or DM4) to form a mixture containing the antibody and the drug (eg, DM1, DM3, or DM4); and then bringing the mixture containing the antibody and drug (eg, DM1, DM3, or DM4) into contact with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) in a solution having a pH of about 4 to about 9, to obtain a mixture containing:
(i) конъюгат (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1), (ii) свободное лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4) и (iii) побочные продукты реакции, (b) удержание смеси, полученной на стадии (а), до высвобождения нестабильно связавшихся линкеров из связывающего клетку средства и (с) проведение очистки смеси с получением очищенного конъюгата.(i) conjugate (eg, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4, or Ab-CX1-1-DM1), (ii) free drug (eg, DM1, DM3, or DM4), and (iii) reaction by-products , (b) holding the mixture obtained in step (a) until the unstable bound linkers are released from the cell-binding agent, and (c) purifying the mixture to obtain a purified conjugate.
В другом варианте осуществления способ предусматривает (а) приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например DM1, DM3 или DM4) с образованием смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4); и затем приведение смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4), в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) в растворе, характеризующемся pH от приблизительно 4 до приблизительно 9, с получением смеси, содержащей:In another embodiment, the method comprises (a) contacting an antibody with a drug (eg, DM1, DM3, or DM4) to form a mixture containing the antibody and drug (eg, DM1, DM3, or DM4); and then bringing the mixture containing the antibody and drug (eg, DM1, DM3, or DM4) into contact with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) in a solution having a pH of about 4 to about 9, to obtain a mixture containing:
(i) конъюгат, (ii) свободное лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4), и (iii) побочные продукты реакции, (b) блокирование смеси, полученной на стадии (а), для блокирования любого непрореагировавшего лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) и/или непрореагировавшего сшивающего средства (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1), (с) удержание смеси, полученной на стадии (b), до высвобождения нестабильно связавшихся линкеров из связывающего клетку средства и (d) проведение очистки смеси с получением очищенного конъюгата (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1).(i) conjugate, (ii) free drug (e.g. DM1, DM3 or DM4), and (iii) reaction by-products, (b) blocking the mixture obtained in step (a) to block any unreacted drug (e.g. , DM1, DM3 or DM4) and/or unreacted crosslinker (e.g. SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB or CX1-1), (c) holding the mixture obtained in step (b) until the unstable bound linkers from the cell-binding agent; and (d) purifying the mixture to obtain a purified conjugate (eg, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4, or Ab-CX1-1-DM1).
В качестве альтернативы стадию удерживания можно проводить после очистки конъюгата, с последующей дополнительной стадией очистки.Alternatively, the retention step may be carried out after purification of the conjugate, followed by an additional purification step.
В предпочтительном варианте осуществления обеспечивают возможность протекания реакции до завершения перед стадией удерживания. В связи с этим стадию удерживания проводят через от приблизительно 1 ч до приблизительно 48 ч (например, через приблизительно 1 ч, приблизительно 2 ч, приблизительно 3 ч, приблизительно 4 ч, приблизительно 5 ч, приблизительно 6 ч, приблизительно 7 ч, приблизительно 8 ч, приблизительно 9 ч, приблизительно 10 ч, приблизительно 11 ч, приблизительно 12 ч, приблизительно 13 ч, приблизительно 14 ч, приблизительно 15 ч, приблизительно 16 ч, приблизительно 17 ч, приблизительно 18 ч, приблизительно 19 ч, приблизительно 20 ч, приблизительно 21 ч, приблизительно 22 ч, приблизительно 23 ч, приблизительно 24 ч или от приблизительно 24 до приблизительно 48 ч) после приведения смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4), в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1).In a preferred embodiment, the reaction is allowed to proceed to completion before the retention step. Therefore, the retention step is carried out after about 1 hour to about 48 hours (e.g., after about 1 hour, about 2 hours, about 3 hours, about 4 hours, about 5 hours, about 6 hours, about 7 hours, about 8 hours). h, approximately 9 h, approximately 10 h, approximately 11 h, approximately 12 h, approximately 13 h, approximately 14 h, approximately 15 h, approximately 16 h, approximately 17 h, approximately 18 h, approximately 19 h, approximately 20 h, about 21 hours, about 22 hours, about 23 hours, about 24 hours, or about 24 to about 48 hours) after the antibody/drug mixture (e.g., DM1, DM3, or DM4) has been contacted with a crosslinker (e.g., , SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB or CX1-1).
Стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при подходящей температуре (например, от приблизительно 0 до приблизительно 37°С) в течение подходящего периода времени (например, от приблизительно 1 ч до приблизительно 1 недели, от приблизительно 1 до приблизительно 24 ч, от приблизительно 1 до приблизительно 8 ч или от приблизительно 1 до приблизительно 4 ч) для высвобождения нестабильно связавшихся линкеров из антитела, при этом не происходит значительного высво- 45 042529 бождения стабильно связавшихся линкеров из антитела. В одном варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при приблизительно 20°С или меньше (например, от приблизительно 0 до приблизительно 18°С, от приблизительно 4 до приблизительно 16°С), при комнатной температуре (например, от приблизительно 20 до приблизительно 30°С или от приблизительно 20 до приблизительно 25°С) или при повышенной температуре (например, от приблизительно 30 до приблизительно 37°С). В одном варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре от приблизительно 16 до приблизительно 24°С (например, приблизительно 15°С, приблизительно 16°С, приблизительно 17°С, приблизительно 18°С, приблизительно 19°С, приблизительно 20°С, приблизительно 21°С, приблизительно 22°С, приблизительно 23°С, приблизительно 24°С или приблизительно 25°С). В другом варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре от приблизительно 2 до приблизительно 8°С (например, приблизительно 0°С, приблизительно 1°С, приблизительно 2°С, приблизительно 3°С, приблизительно 4°С, приблизительно 5°С, приблизительно 6°С, приблизительно 7°С, приблизительно 8°С, приблизительно 9°С или приблизительно 10°С). В другом варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре приблизительно 37°С (например, приблизительно 34°С, приблизительно 35°С, приблизительно 36°С, приблизительно 37°С, приблизительно 38°С, приблизительно 39 или приблизительно 40°С).The retention step involves maintaining the solution at a suitable temperature (for example, from about 0 to about 37°C) for a suitable period of time (for example, from about 1 hour to about 1 week, from about 1 to about 24 hours, from about 1 to about 8 hours or about 1 to about 4 hours) to release stably bound linkers from the antibody without significantly releasing stably bound linkers from the antibody. In one embodiment, the retention step involves maintaining the solution at or less than about 20°C (for example, from about 0 to about 18°C, from about 4 to about 16°C), at room temperature (for example, from about 20 to about 30 °C or from about 20 to about 25°C) or at an elevated temperature (for example, from about 30 to about 37°C). In one embodiment, the retention step involves maintaining the solution at a temperature of from about 16 to about 24°C (for example, about 15°C, about 16°C, about 17°C, about 18°C, about 19°C, about 20° C, about 21°C, about 22°C, about 23°C, about 24°C or about 25°C). In another embodiment, the retention step involves maintaining the solution at a temperature of from about 2 to about 8°C (for example, about 0°C, about 1°C, about 2°C, about 3°C, about 4°C, about 5° C, about 6°C, about 7°C, about 8°C, about 9°C or about 10°C). In another embodiment, the retention step involves maintaining the solution at a temperature of about 37°C (e.g., about 34°C, about 35°C, about 36°C, about 37°C, about 38°C, about 39 or about 40°C ).
Продолжительность стадии удерживания зависит от температуры и pH, при которых проводят стадию удерживания. Например, продолжительность стадии удерживания может быть значительно уменьшена путем проведения стадии удерживания при повышенной температуре, при этом максимальная температура ограничивается стабильностью конъюгата связывающего клетку средства и цитотоксического средства. Стадия удерживания может предусматривать поддержание раствора в течение от приблизительно 1 ч до приблизительно 1 дня (например, приблизительно 1 ч, приблизительно 2 ч, приблизительно 3 ч, приблизительно 4 ч, приблизительно 5 ч, приблизительно 6 ч, приблизительно 7 ч, приблизительно 8 ч, приблизительно 9 ч, приблизительно 10 ч, приблизительно 12 ч, приблизительно 14 ч, приблизительно 16 ч, приблизительно 18 ч, приблизительно 20 ч, приблизительно 22 или приблизительно 24 ч), от приблизительно 10 до приблизительно 24 ч, от приблизительно 12 до приблизительно 24 ч, от приблизительно 14 до приблизительно 24 ч, от приблизительно 16 до приблизительно 24 ч, от приблизительно 18 до приблизительно 24 ч, от приблизительно 20 до приблизительно 24 ч, от приблизительно 5 ч до приблизительно 1 недели, от приблизительно 20 ч до приблизительно 1 недели, от приблизительно 12 ч до приблизительно 1 недели (например, приблизительно 12 ч, приблизительно 16 ч, приблизительно 20 ч, приблизительно 24 ч, приблизительно 2 дней, приблизительно 3 дней, приблизительно 4 дней, приблизительно 5 дней, приблизительно 6 дней или приблизительно 7 дней) или от приблизительно 1 дня до приблизительно 1 недели.The duration of the retention step depends on the temperature and pH at which the retention step is carried out. For example, the duration of the retention step can be significantly reduced by conducting the retention step at an elevated temperature, the maximum temperature being limited by the stability of the cell-binding agent-cytotoxic agent conjugate. The retention step may include maintaining the solution for from about 1 hour to about 1 day (e.g., about 1 hour, about 2 hours, about 3 hours, about 4 hours, about 5 hours, about 6 hours, about 7 hours, about 8 hours , about 9 hours, about 10 hours, about 12 hours, about 14 hours, about 16 hours, about 18 hours, about 20 hours, about 22 or about 24 hours), about 10 to about 24 hours, from about 12 to about 24 hours, from about 14 to about 24 hours, from about 16 to about 24 hours, from about 18 to about 24 hours, from about 20 to about 24 hours, from about 5 hours to about 1 week, from about 20 hours to about 1 week, from about 12 hours to about 1 week (e.g., about 12 hours, about 16 hours, about 20 hours, about 24 hours, approx. about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, or about 7 days) or from about 1 day to about 1 week.
В одном варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре от приблизительно 2 до приблизительно 8°С в течение периода, составляющего от по меньшей мере приблизительно 12 ч вплоть до недели. В другом варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре от приблизительно 2 до приблизительно 8°С в течение ночи (например, от приблизительно 12 до приблизительно 24 ч, предпочтительно приблизительно 20 ч).In one embodiment, the retention step involves maintaining the solution at a temperature of from about 2 to about 8°C for a period of at least about 12 hours up to a week. In another embodiment, the retention step involves maintaining the solution at a temperature of from about 2 to about 8° C. overnight (eg, from about 12 to about 24 hours, preferably about 20 hours).
Значение pH для стадии удерживания предпочтительно составляет от приблизительно 4 до приблизительно 10. В одном варианте осуществления значение pH для стадии удерживания составляет приблизительно 4 или больше, но менее приблизительно 6 (например, от 4 до 5,9), или приблизительно 5 или больше, но менее приблизительно 6 (например, от 5 до 5,9). В другом варианте осуществления значения pH для стадии удерживания находятся в диапазоне от приблизительно 6 до приблизительно 10 (например, от приблизительно 6,5 до приблизительно 9, от приблизительно 6 до приблизительно 8). Например, значения pH для стадии удерживания могут составлять приблизительно 6, приблизительно 6,5, приблизительно 7, приблизительно 7,5, приблизительно 8, приблизительно 8,5, приблизительно 9, приблизительно 9,5 или приблизительно 10.The pH value for the retention step is preferably from about 4 to about 10. In one embodiment, the pH value for the retention step is about 4 or more, but less than about 6 (for example, from 4 to 5.9), or about 5 or more, but less than about 6 (eg, 5 to 5.9). In another embodiment, the pH values for the retention step are in the range of about 6 to about 10 (eg, about 6.5 to about 9, about 6 to about 8). For example, pH values for the retention step may be about 6, about 6.5, about 7, about 7.5, about 8, about 8.5, about 9, about 9.5, or about 10.
В конкретных вариантах осуществления стадия удерживания может предусматривать инкубирование смеси при 25°С при pH приблизительно 6-7,5 в течение от приблизительно 12 ч до приблизительно 1 недели, инкубирование смеси при 4°С при pH приблизительно 4,5-5,9 в течение от приблизительно 5 ч до приблизительно 5 дней или инкубирование смеси при 25°С при pH приблизительно 4,5-5,9 в течение от приблизительно 5 ч до приблизительно 1 дня.In specific embodiments, the retention step may include incubating the mixture at 25°C at a pH of about 6-7.5 for about 12 hours to about 1 week, incubating the mixture at 4°C at a pH of about 4.5-5.9 for about 5 hours to about 5 days; or incubating the mixture at 25°C at a pH of about 4.5-5.9 for about 5 hours to about 1 day.
Одностадийный способ необязательно может предусматривать добавление сахарозы на стадии реакции для повышения растворимости и извлечения конъюгатов. Желательно сахарозу добавляют при концентрации от приблизительно 0,1 до приблизительно 20 вес./об.% (например, приблизительно 0,1 вес./об.%, 1 вес./об.%, 5 вес./об.%, 10 вес./об.%, 15 вес./об.% или 20 вес./об.%).The one-step method may optionally include the addition of sucrose during the reaction step to increase solubility and recover conjugates. Desirably, sucrose is added at a concentration of from about 0.1% to about 20% w/v (e.g., about 0.1% w/v, 1% w/v, 5% w/v, 10 wt./vol.%, 15 wt./vol.% or 20 wt./vol.%).
Предпочтительно сахарозу добавляют при концентрации от приблизительно 1 до приблизительно 10 вес./об.% (например, приблизительно 0,5 вес./об.%, приблизительно 1 вес./об.%, приблизительно 1,5 вес./об.%, приблизительно 2 вес./об.%, приблизительно 3 вес./об.%, приблизительно 4 вес./об.%, приблизительно 5 вес./об.%, приблизительно 6 вес./об.%, приблизительно 7 вес./об.%, приблизительно 8Preferably, sucrose is added at a concentration of from about 1% to about 10% w/v (e.g., about 0.5% w/v, about 1% w/v, about 1.5% w/v). , approximately 2 wt./vol.%, approximately 3 wt./vol.%, approximately 4 wt./vol.%, approximately 5 wt./vol.%, approximately 6 wt./vol.%, approximately 7 wt. /vol.%, about 8
- 46 042529 вес./об.%, приблизительно 9 вес./об.%, приблизительно 10 или приблизительно 11 вес./об.%). Кроме того, стадия реакции также может предусматривать добавление буферного средства. Можно применять любое подходящее буферное средство, известное из уровня техники. Подходящие буферные средства включают, например, цитратный буфер, ацетатный буфер, сукцинатный буфер и фосфатный буфер. В одном варианте осуществления буферное средство выбрано из группы, состоящей из HEPPSO (N-(2гидроксиэтил)пиперазин-N'-(2-гидроксипропансульфоновая кислота)), POPSO (дегидрат пиперазин-1,4бис-(2-гидроксипропансульфоновой кислоты)), HEPES (4-(2-гидроксиэтил)пиперазин-1-этансульфоновая кислота), HEPPS (EPPS) (4-(2-гидроксиэтил)пиперазин-1-пропансульфоновая кислота), TES (N[трис(гидроксиметил)метил]-2-аминоэтансульфоновая кислота) и их комбинации.- 46 042529 wt./vol.%, about 9 wt./vol.%, about 10 or about 11 wt./vol.%. In addition, the reaction step may also include the addition of a buffering agent. Any suitable buffer means known in the art may be used. Suitable buffering agents include, for example, citrate buffer, acetate buffer, succinate buffer and phosphate buffer. In one embodiment, the buffering agent is selected from the group consisting of HEPPSO (N-(2hydroxyethyl)piperazine-N'-(2-hydroxypropanesulfonic acid)), POPSO (piperazine-1,4bis-(2-hydroxypropanesulfonic acid) dehydrate), HEPES (4-(2-hydroxyethyl)piperazine-1-ethanesulfonic acid), HEPPS (EPPS) (4-(2-hydroxyethyl)piperazine-1-propanesulfonic acid), TES (N[tris(hydroxymethyl)methyl]-2-aminoethanesulfonic acid) and combinations thereof.
В одном варианте осуществления одностадийный способ может дополнительно предусматривать стадию проведения очистки смеси с получением очищенного конъюгата (например, Ab-MCC-DM1, AbSPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1). Любые способы очистки, известные из уровня техники, можно применять для очистки конъюгатов по настоящему изобретению. В одном варианте осуществления конъюгаты по настоящему изобретению очищают с применением тангенциальной поточной фильтрации (TFF), неадсорбционной хроматографии, адсорбционной хроматографии, адсорбционной фильтрации, селективного осаждения или любого другого подходящего способа очистки, а также их комбинации. В другом варианте осуществления перед воздействием на конъюгаты способа очистки, описанного выше, конъюгаты вначале фильтруют через одну или несколько мембран из PVDF. В качестве альтернативы конъюгаты фильтруют через одну или несколько мембран из PVDF после воздействия на конъюгаты способа очистки, описанного выше. Например, в одном варианте осуществления конъюгаты фильтруют через одну или несколько мембран из PVDF, а затем очищают с применением тангенциальной поточной фильтрации. В качестве альтернативы конъюгаты очищают с применением тангенциальной поточной фильтрации, а затем фильтруют через одну или несколько мембран из PVDF.In one embodiment, the one-step method may further comprise the step of purifying the mixture to obtain a purified conjugate (eg, Ab-MCC-DM1, AbSPDB-DM4, or Ab-CX1-1-DM1). Any purification methods known in the art can be used to purify the conjugates of the present invention. In one embodiment, the conjugates of the present invention are purified using tangential flow filtration (TFF), non-adsorption chromatography, adsorption chromatography, adsorption filtration, selective precipitation, or any other suitable purification method, as well as combinations thereof. In another embodiment, prior to subjecting the conjugates to the purification process described above, the conjugates are first filtered through one or more PVDF membranes. Alternatively, the conjugates are filtered through one or more PVDF membranes after subjecting the conjugates to the purification process described above. For example, in one embodiment, the conjugates are filtered through one or more PVDF membranes and then purified using tangential flow filtration. Alternatively, the conjugates are purified using tangential flow filtration and then filtered through one or more PVDF membranes.
Для очистки можно использовать любые подходящие TFF-системы, в том числе систему типа Pellicon (Millipore, Биллерика, Массачусетс), кассетную систему Sartocon (Sartorius AG, Эджвуд, Нью-Йорк) и систему типа Centrasette (Pall Corp., Ист-Хиллс, Нью-Йорк).Any suitable TFF system may be used for cleaning, including the Pellicon type system (Millipore, Billerica, MA), the Sartocon cassette system (Sartorius AG, Edgewood, NY) and the Centrasette type system (Pall Corp., East Hills, NY).
Для очистки можно использовать любую подходящую смолу для адсорбционной хроматографии. Предпочтительные смолы для адсорбционной хроматографии предусматривают хроматографию на гидроксиапатите, гидрофобную хроматографию с индуцированием заряда (HCIC), хроматографию гидрофобных взаимодействий (HIC), ионообменную хроматографию, ионообменную хроматографию с комбинированным режимом работы, аффинную хроматографию на иммобилизованных ионах металла (IMAC), хроматографию с лигандом красителем, аффинную хроматографию, хроматографию с обращенной фазой и их комбинации. Примеры подходящих гидроксиапатитных смол включают керамический гидроксиапатит (СНТ типа I и типа II, Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния), гидроксиапатит НА Ultrogel (Pall Corp., Ист-Хиллс, Нью-Йорк) и керамический фторапатит (CFT типа I и типа II, Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примером подходящей смолы для HCIC является смола МЕР Hypercel (Pall Corp., Ист-Хиллс, Нью-Йорк). Примеры подходящих смол для HIC включают смолы на основе бутилсефарозы, гексил-сефарозы, фенил-сефарозы и октил-сефарозы (все от GE Healthcare, Пискатавей, НьюДжерси), а также метиловую смолу Macro-prep и трет-бутиловую смолу Macro-Prep (Biorad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примеры подходящих ионообменных смол включают смолы на основе SPсефарозы, СМ-сефарозы и Q-сефарозы (все от GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси) и смолу Unosphere S (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примеры подходящих смолы для ионообменной хроматографии с комбинированным режимом работы включают смолу Bakerbond ABx (JT Baker, Филлипсбург, Нью-Джерси). Примеры подходящих смол для IMAC включают смолу Chelating Sepharose (GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси) и смолу Profinity IMAC (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примеры подходящих смол для хроматографии с лигандом красителем включают смолу Blue Sepharose (GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси) и смолу Affi-gel Blue (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примеры подходящих смол для аффинной хроматографии включают смолу на основе сефарозы с белком А (например, MabSelect, GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси) и смолы для аффинной хроматографии с лектинами, например, смолу на основе сефарозы с лектином чечевицы (GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси), где антитело несет подходящие сайты связывания лектина. Примеры подходящих смол для хроматографии с обращенной фазой включают смолы С4, С8 и С18 (Grace Vydac, Хесперия, Калифорния).Any suitable adsorption chromatography resin may be used for purification. Preferred adsorption chromatography resins include hydroxyapatite chromatography, charge induction hydrophobic chromatography (HCIC), hydrophobic interaction chromatography (HIC), ion exchange chromatography, combined mode ion exchange chromatography, immobilized metal ion affinity chromatography (IMAC), dye ligand chromatography , affinity chromatography, reverse phase chromatography, and combinations thereof. Examples of suitable hydroxyapatite resins include ceramic hydroxyapatite (CFT type I and type II, Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA), hydroxyapatite HA Ultrogel (Pall Corp., East Hills, NY) and ceramic fluorapatite (CFT type I and type II, Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA). An example of a suitable HCIC resin is Hypercel MEP resin (Pall Corp., East Hills, NY). Examples of suitable HIC resins include Butyl Sepharose, Hexyl Sepharose, Phenyl Sepharose, and Octyl Sepharose resins (all from GE Healthcare, Piscataway, NJ), as well as Macro-prep methyl resin and Macro-Prep tert-butyl resin (Biorad Laboratories, Hercules, California). Examples of suitable ion exchange resins include SP Sepharose, CM Sepharose and Q Sepharose resins (all from GE Healthcare, Piscataway, NJ) and Unosphere S resin (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA). Examples of suitable resins for combined mode ion exchange chromatography include Bakerbond ABx resin (JT Baker, Phillipsburg, NJ). Examples of suitable IMAC resins include Chelating Sepharose resin (GE Healthcare, Piscataway, NJ) and Profinity IMAC resin (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA). Examples of suitable dye ligand chromatography resins include Blue Sepharose resin (GE Healthcare, Piscataway, NJ) and Affi-gel Blue resin (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA). Examples of suitable affinity chromatography resins include protein A Sepharose resin (e.g., MabSelect, GE Healthcare, Piscataway, NJ) and lectin affinity chromatography resins, e.g., Lentil Lectin Sepharose Resin (GE Healthcare, Piscataway). , NJ) where the antibody carries appropriate lectin binding sites. Examples of suitable reverse phase chromatography resins include C4, C8, and C18 resins (Grace Vydac, Hesperia, Calif.).
Для очистки можно использовать любую подходящую смолу для неадсорбционной хроматографии. Примеры подходящих смол для неадсорбционной хроматографии включают без ограничения смолы SEPHADEX™ G-25, G-50, G-100, SEPHACRYL™ (например, S-200 и S-300), смолы SUPERDEX™ (например, SUPERDEX™ 75 и SUPERDEX™ 200), смолы BIO-GEL® (например, Р-6, Р-10, Р-30, Р-60 и Р-100) и другие, известные рядовым специалистам в данной области техники.Any suitable non-adsorption chromatography resin may be used for purification. Examples of suitable non-adsorption chromatography resins include, but are not limited to, SEPHADEX™ G-25, G-50, G-100, SEPHACRYL™ resins (e.g. S-200 and S-300), SUPERDEX™ resins (e.g. SUPERDEX™ 75 and SUPERDEX™ 200), BIO-GEL® resins (eg, P-6, P-10, P-30, P-60 and P-100), and others known to those of ordinary skill in the art.
Двухстадийный способ и способ в одном реакционном сосуде для сшивания с лизиновыми остатками антителаTwo-step and one-pot method for cross-linking with antibody lysine residues
В одном варианте осуществления конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены,In one embodiment, the conjugates of the present invention can be obtained,
- 47 042529 как описано в патенте США № 7811572 и публикации заявки на патент США № 2006/0182750. Способ предусматривает стадии:- 47 042529 as described in US patent No. 7811572 and US patent application publication No. 2006/0182750. The method includes the steps:
(а) приведение антитела по настоящему изобретению в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1) с присоединением с помощью ковалентной связи линкера (т.е. Ab-SMCC, Ab-SPDB или Ab-CX1-1) к антителу и, тем самым, получения первой смеси, содержащей антитело, имеющее связанный с ним линкер;(a) contacting an antibody of the present invention with a crosslinker (e.g., SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1) with a covalently attached linker (i.e., Ab-SMCC, Ab- SPDB or Ab-CX1-1) to the antibody and thereby obtaining a first mixture containing the antibody having a linker associated with it;
(b) необязательно воздействие на первую смесь способа очистки с получением очищенной первой смеси из антитела, имеющего связанный с ним линкер;(b) optionally subjecting the first mixture to a purification method to obtain a purified first mixture from an antibody having a linker associated therewith;
(с) конъюгирование лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) с антителом, имеющим связанный с ним линкер, в первой смеси путем осуществления реакции антитела, имеющего связанный с ним линкер, с лекарственным средством (например, DM1, DM3 или DM4) в растворе, характеризующемся pH от приблизительно 4 до приблизительно 9, с получением второй смеси, содержащей:(c) conjugating the drug (e.g., DM1, DM3, or DM4) to an antibody having an associated linker in the first mixture by reacting the antibody having an associated linker with the drug (e.g., DM1, DM3, or DM4) in a solution having a pH of about 4 to about 9 to form a second mixture containing:
(i) конъюгат (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1), (ii) свободное лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4);(i) conjugate (eg Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 or Ab-CX1-1-DM1), (ii) free drug (eg DM1, DM3 or DM4);
(iii) промежуточные продукты реакции; и (d) воздействие на вторую смесь способа очистки с очисткой конъюгата от других компонентов второй смеси.(iii) reaction intermediates; and (d) subjecting the second mixture to a purification process to purify the conjugate from the other components of the second mixture.
В качестве альтернативы стадия (b) очистки может не проводиться. На стадиях (b) и (d) могут применяться любые способы очистки, описанные в данном документе. В одном варианте осуществления на обеих стадиях (b) и (d) применяется TFF. В другом варианте осуществления TFF применяется на стадии (b), а адсорбционная хроматография (например, СНТ) применяется на стадии (d).Alternatively, purification step (b) may be omitted. In steps (b) and (d), any of the purification methods described herein can be used. In one embodiment, both steps (b) and (d) use TFF. In another embodiment, TFF is used in step (b) and adsorption chromatography (eg, CHT) is used in step (d).
Реагент для одностадийного способа и in-situ способ для сшивания с лизиновыми остатками антителаReagent for one-step method and in-situ method for cross-linking with lysine residues of an antibody
В одном варианте осуществления конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены путем конъюгирования предварительно образованного соединения линкер-лекарственное средство (например, SMCC-DM1, сульФо-SMCC-DMI, SPDB-DM4 или CXI-1-DMI) с антителом по настоящему изобретению, как описано в патенте США № 6441163 и публикации заявки на патент США №№ 2011/0003969 и 2008/0145374, с последующей стадией очистки. Можно применять любые способы очистки, описанные в данном документе. Соединение линкер-лекарственное средство получают путем осуществления реакции лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или СХ1-1). Соединение линкерлекарственное средство (например, SMCC-DM1, сульФо-SMCC-DMI, SPDB-DM4 или CX1-1-DM1) необязательно подвергают очистке перед конъюгированием с антителом.In one embodiment, the conjugates of the present invention can be prepared by conjugating a preformed linker-drug compound (e.g., SMCC-DM1, sulfo-SMCC-DMI, SPDB-DM4, or CXI-1-DMI) with an antibody of the present invention, as described in US Pat. No. 6,441,163 and US Patent Application Publication Nos. 2011/0003969 and 2008/0145374 followed by a purification step. You can use any of the cleaning methods described in this document. A linker-drug compound is prepared by reacting a drug (eg, DM1, DM3, or DM4) with a crosslinker (eg, SMCC, sulfo-SMCC, SPDB, sulfo-SPDB, or CX1-1). The linker drug compound (eg, SMCC-DM1, sulfo-SMCC-DMI, SPDB-DM4, or CX1-1-DM1) is optionally purified prior to antibody conjugation.
Антитела к CCR7Antibodies to CCR7
В настоящем изобретении представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7. Антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) по настоящему изобретению включают без ограничения человеческие моноклональные антитела или их фрагменты, выделенные, как описано в примерах.The present invention provides antibodies or antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) that specifically bind to CCR7. The antibodies or antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) of the present invention include, without limitation, human monoclonal antibodies or fragments thereof isolated as described in the examples.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связывают CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат домен VH, имеющий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 13, 45, 77 или 608. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения также представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат CDR VH, имеющую аминокислотную последовательность любой из CDR VH, перечисленных в табл. 1 и 4, ниже. В конкретных вариантах осуществления настоящего изобретения представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела содержат (или в качестве альтернативы состоят из) одну, две, три, четыре, пять или больше CDR VH, имеющих аминокислотную последовательность любой из CDR VH, перечисленных в табл. 1 и 4, ниже.In some embodiments, the present invention provides antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) that specifically bind CCR7, wherein said antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) comprise a VH domain having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13, 45, 77, or 608. In some embodiments, the invention also provides antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) that specifically bind to CCR7, wherein said antibody or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) comprise a VH CDR having the amino acid the sequence of any of the VH CDRs listed in Table. 1 and 4 below. In specific embodiments, the present invention provides antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) that specifically bind to CCR7, said antibodies containing (or alternatively consisting of) one, two, three, four, five, or more VH CDRs. having the amino acid sequence of any of the VH CDRs listed in Table. 1 and 4 below.
В настоящем изобретении представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат домен VL, имеющий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 29, 61, 93 или 624. В настоящем изобретении также представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат CDR VL, имеющую аминокислотную последовательность любой из CDR VL, перечисленных в табл. 1 и 4 ниже. В частности, в настоящем изобретении представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат (или в качестве альтернативы состоять из) одну, две, три или большеThe present invention provides antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) that specifically bind to CCR7, wherein said antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) comprise a VL domain having the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 29, 61, 93 or 624. The present invention also provides antibodies or antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) that specifically bind to CCR7, wherein said antibodies or antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) comprise a VL CDR having the amino acid sequence of any one of the VL CDRs. listed in Table. 1 and 4 below. In particular, the present invention provides antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) that specifically bind to CCR7, wherein said antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) comprise (or alternatively consist of) one, two, three or more
- 48 042529- 48 042529
CDR VL, имеющих аминокислотную последовательность любой из CDR VL, перечисленных в табл. 1 иCDR VL having the amino acid sequence of any of the CDR VL listed in table. 1 and
4, ниже.4 below.
Другие антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) по настоящему изобретению включают аминокислоты, которые были подвергнуты мутации, но при этом они характеризуются по меньшей мере 60, 70, 80, 90 или 95 процентной идентичностью в областях CDR с областями CDR, показанными в последовательностях, описанных в табл. 1 и 4. В некоторых вариантах осуществления антитела содержат мутантные аминокислотные последовательности, в которых не более 1, 2, 3, 4 или 5 аминокислот были подвергнуты мутации в областях CDR в сравнении с областями CDR, показанными в последовательности, описанной в табл. 1 и 4.Other antibodies or antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) of the present invention include amino acids that have been mutated but share at least 60%, 70%, 80%, 90%, or 95% identity in the CDR regions with the CDR regions shown in sequences described in table. 1 and 4. In some embodiments, the antibodies comprise mutant amino acid sequences in which no more than 1, 2, 3, 4, or 5 amino acids have been mutated in the CDR regions compared to the CDR regions shown in the sequence described in Table 1. 1 and 4.
В настоящем изобретении также представлены последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют VH, VL, полноразмерную тяжелую цепь и полноразмерную легкую цепь антител, которые специфически связываются с CCR7. Такие последовательности нуклеиновой кислоты могут быть оптимизированы для экспрессии в клетках млекопитающих.The present invention also provides nucleic acid sequences that encode VH, VL, full length heavy chain and full length light chain of antibodies that specifically bind to CCR7. Such nucleic acid sequences can be optimized for expression in mammalian cells.
На протяжении текста настоящей заявки может встречаться несоответствие между текстом описания и перечнем последовательностей, при этом текст описания имеет преимущественную силу.Throughout the text of this application, there may be inconsistencies between the description text and the sequence listing, with the description text taking precedence.
Таблица 1. Примеры антител к CCR7 по настоящему изобретениюTable 1. Examples of anti-CCR7 antibodies of the present invention
- 49 042529- 49 042529
- 50 042529- 50 042529
- 51 042529- 51 042529
- 52 042529- 52 042529
- 53 042529- 53 042529
- 54 042529- 54 042529
- 55 042529- 55 042529
- 56 042529- 56 042529
- 57 042529- 57 042529
- 58 042529- 58 042529
- 59 042529- 59 042529
- 60 042529- 60 042529
- 61 042529- 61 042529
-62042529-62042529
Другие антитела по настоящему изобретению включают антитела, в которых аминокислоты или нуклеиновые кислоты, кодирующие аминокислоты, были подвергнуты мутации, но при этом они характеризуются по меньшей мере 60, 70, 80, 90 или 95 процентной идентичностью с последовательностями, описанными в табл. 1 и 4. В некоторых вариантах осуществления 1, 2, 3, 4 или 5 аминокислот были подвергнуты мутации в вариабельных областях по сравнению с вариабельными областями, показанными в последовательности, описанной в табл. 1 и 4, при этом они сохраняют практически такую же терапевтическую активность, что и антитела, перечисленные в табл. 1 и 4.Other antibodies of the present invention include antibodies in which the amino acids or nucleic acids encoding the amino acids have been mutated but are at least 60%, 70%, 80%, 90%, or 95% identical to the sequences described in Table 1. 1 and 4. In some embodiments, 1, 2, 3, 4, or 5 amino acids have been mutated in the variable regions compared to the variable regions shown in the sequence described in Table 1. 1 and 4, while they retain almost the same therapeutic activity as the antibodies listed in table. 1 and 4.
Поскольку каждое из данных антител может связываться с CCR7 последовательности (аминокислотные последовательности и нуклеотидные последовательности, кодирующие аминокислотные последовательности) VH, VL, полноразмерной легкой цепи и полноразмерной тяжелой цепи можно подвергать смешиванию и подбору для создания других CCR7-связывающих антител по настоящему изобретению. Такие подвергнутые смешиванию и подбору CCR7-связывающие антитела можно тестировать с применением анализов связывания, известных из уровня техники (например, разновидностей ELISA и других анализов, описанных в разделе примеры). Когда такие цепи подвергают смешиванию и подбору, последовательность VH из конкретной пары VH/VL следует заменить структурно подобной последовательностью VH. Аналогичным образом, последовательность полноразмерной тяжелой цепи из конкретной пары полноразмерная тяжелая цепь/полноразмерная легкая цепь следует заменить структурно подобной последовательностью полноразмерной тяжелой цепи. Аналогичным образом, последовательность VL из конкретной пары VH/VL следует заменить структурно подобной последовательностью VL. Аналогичным образом, последовательность полноразмерной легкой цепи из конкретной пары полноразмерная тяжелая цепь/полноразмерная легкая цепь следует заменить структурно подобной последовательностью полноразмерной легкой цепи. Соответственно, в одном аспекте настоящего изобретения представлены выделенные моноклональное антитело или его антигенсвязывающая область, имеющие: вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 13, 45, 77 и 608; и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 29, 61, 93 и 624; где антитело специфически связывается с CCR7.Because each of these antibodies can bind to CCR7 sequences (amino acid sequences and nucleotide sequences encoding amino acid sequences), VH, VL, full-length light chain, and full-length heavy chain can be mixed and matched to create other CCR7-binding antibodies of the present invention. Such mixed and matched CCR7 binding antibodies can be tested using binding assays known in the art (eg, ELISAs and other assays described in the examples section). When such chains are subjected to mixing and matching, the VH sequence from a particular VH/VL pair should be replaced with a structurally similar VH sequence. Similarly, a full length heavy chain sequence from a particular full length heavy chain/full length light chain pair should be replaced with a structurally similar full length heavy chain sequence. Similarly, a VL sequence from a particular VH/VL pair should be replaced with a structurally similar VL sequence. Similarly, a full length light chain sequence from a particular full length heavy chain/full length light chain pair should be replaced with a structurally similar full length light chain sequence. Accordingly, in one aspect of the present invention, there is provided an isolated monoclonal antibody, or antigen-binding region thereof, having: a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 13, 45, 77, and 608; and a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 29, 61, 93 and 624; where the antibody specifically binds to CCR7.
В другом аспекте настоящего изобретения представлены:In another aspect of the present invention are:
(i) выделенное моноклональное антитело, имеющее: полноразмерную тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность, которая была оптимизирована для экспрессии в системе экспрессии, представляющей собой клетку млекопитающего, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 15, 47, 79 и 610; и (ii) полноразмерную легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность, которая была оптимизирована для экспрессии в клетке млекопитающего, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 31, 63, 95 и 626; или(i) an isolated monoclonal antibody having: a full length heavy chain containing an amino acid sequence that has been optimized for expression in a mammalian cell expression system selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 15, 47, 79, and 610; and (ii) a full length light chain containing an amino acid sequence that has been optimized for expression in a mammalian cell selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 31, 63, 95 and 626; or
- 63 042529 (ii) функциональный белок, содержащий его антигенсвязывающую часть.- 63 042529 (ii) a functional protein containing its antigen-binding portion.
В другом аспекте настоящего изобретения представлены CCR7-связывающие антитела, которые содержат CDR1, CDR2 и CDR3 тяжелой цепи и легкой цепи, описанные в табл. 1 и 4, или их комбинации. Аминокислотные последовательности CDR1 VH антител показаны, например, под SEQ ID NO: 1, 4, 7, 10, 33, 36, 39, 42, 65, 68, 71 и 74. Аминокислотные последовательности CDR2 VH антител показаны, например, под SEQ ID NO: 2, 5, 8, 11, 34, 37, 40, 43, 66, 69, 72 и 75. Аминокислотные последовательности CDR3 VH антител показаны, например, под SEQ ID NO: 3, 6, 9, 12, 35, 38, 41, 44, 67, 70, 73 и 76. Аминокислотные последовательности CDR1 VL антител показаны, например, под SEQ ID NO: 17, 20, 23, 26, 49, 52, 55, 58, 81, 84, 87 и 90. Аминокислотные последовательности CDR2 VL антител показаны, например, под SEQ ID NO: 18, 21, 24, 27, 50, 53, 56, 59, 82, 85, 88 и 91. Аминокислотные последовательности CDR3 VL антител показаны, например, под SEQ ID NO: 19, 22, 25, 28, 51, 54, 57, 60, 83, 86, 89 и 92.In another aspect of the present invention provides CCR7-binding antibodies that contain CDR1, CDR2 and CDR3 of the heavy chain and light chain described in table. 1 and 4, or combinations thereof. The amino acid sequences of CDR1 VH antibodies are shown, for example, under SEQ ID NOs: 1, 4, 7, 10, 33, 36, 39, 42, 65, 68, 71, and 74. The amino acid sequences of CDR2 VH antibodies are shown, for example, under SEQ ID NOs: 2, 5, 8, 11, 34, 37, 40, 43, 66, 69, 72, and 75. The amino acid sequences of CDR3 VH antibodies are shown, for example, under SEQ ID NOs: 3, 6, 9, 12, 35, 38, 41, 44, 67, 70, 73 and 76. The amino acid sequences of CDR1 VL antibodies are shown, for example, under SEQ ID NOs: 17, 20, 23, 26, 49, 52, 55, 58, 81, 84, 87 and 90. VL CDR2 amino acid sequences of antibodies are shown, for example, under SEQ ID NOs: 18, 21, 24, 27, 50, 53, 56, 59, 82, 85, 88, and 91. Antibody CDR3 amino acid sequences are shown, for example, under SEQ ID NOs: 19, 22, 25, 28, 51, 54, 57, 60, 83, 86, 89 and 92.
С учетом того, что каждое из данных антител может связываться с CCR7, и что специфичность связывания антигена в первую очередь обеспечивается областями CDR1, 2 и 3, последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 VH и последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 VL могут быть подвергнуты смешиванию и подбору (т.е. CDR из различных антител могут быть подвергнуты смешиванию и подбору. Такие подвергнутые смешиванию и подбору CCR7-связывающие антитела можно тестировать с применением анализов связывания, известных из уровня техники и описанных в примерах (например, разновидностей ELISA). Когда последовательности CDR VH подвергают смешиванию и подбору, последовательность CDR1, CDR2 и/или CDR3 из конкретной последовательности VH следует заменить структурно подобной(ыми) последовательностью(ями) CDR. Аналогичным образом, когда последовательности CDR VL подвергают смешиванию и подбору, последовательность CDR1, CDR2 и/или CDR3 из конкретной последовательности VL следует заменить структурно подобной(ыми) последовательностью(ями) CDR. Рядовому специалисту в данной области техники будет совершенно очевидно, что новые последовательности VH и VL можно создавать путем замены одной или нескольких последовательностей областей CDR VH и/или VL структурно подобными последовательностями из последовательностей CDR, показанных в данном документе для моноклональных антител по настоящему изобретению.Given that each of these antibodies can bind to CCR7, and that antigen binding specificity is primarily provided by CDR1, 2, and 3 regions, the CDR1, CDR2, and CDR3 VH sequences and the CDR1, CDR2, and CDR3 VL sequences can be mixed and matched (i.e., CDRs from different antibodies can be mixed and matched. Such mixed and matched CCR7 binding antibodies can be tested using binding assays known in the art and described in the examples (e.g., ELISA variants). When sequences VH CDR sequences are mixed and matched, the sequence of CDR1, CDR2 and/or CDR3 from a particular VH sequence should be replaced with structurally similar CDR sequence(s). or CDR3 from a particular VL sequence should be replaced by structurally similar sequence(s). CDR property(s). One of ordinary skill in the art will appreciate that new VH and VL sequences can be generated by replacing one or more VH and/or VL CDR region sequences with structurally similar sequences from the CDR sequences shown herein for the monoclonal antibodies of the present invention.
Соответственно, в некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены выделенные моноклональное антитело или его антигенсвязывающая область, содержащие CDR1 тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 4, 7, 10, 33, 36, 39, 42, 65, 68, 71, 74, 596, 599, 602 и 605; CDR2 тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 5, 8, 11, 34, 37, 40, 43, 66, 69, 72, 75, 597, 600, 603 и 606; CDR3 тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 3, 6, 9, 12, 35, 38, 41, 44, 67, 70, 73, 7 6, 598, 601, 604 и 607; CDR1 легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 17, 20, 23, 26, 49, 52, 55, 58, 81, 84, 87, 90, 612, 615, 618 и 621; CDR2 легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 18, 21, 24, 27, 50, 53, 56, 59, 82, 85, 88, 91, 613, 616, 619 и 622; и CDR3 легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 19, 22, 25, 28, 51, 54, 57, 60, 83, 86, 89, 92, 614, 617, 620 и 623; где антитело специфически связывает CCR7.Accordingly, in some embodiments, the present invention provides an isolated monoclonal antibody or antigen-binding region thereof, comprising a heavy chain CDR1 comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 1, 4, 7, 10, 33, 36, 39, 42, 65, 68, 71, 74, 596, 599, 602 and 605; a heavy chain CDR2 comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 2, 5, 8, 11, 34, 37, 40, 43, 66, 69, 72, 75, 597, 600, 603, and 606; A heavy chain CDR3 comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 3, 6, 9, 12, 35, 38, 41, 44, 67, 70, 73, 76, 598, 601, 604 and 607 ; A light chain CDR1 comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 17, 20, 23, 26, 49, 52, 55, 58, 81, 84, 87, 90, 612, 615, 618 and 621; a light chain CDR2 comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 18, 21, 24, 27, 50, 53, 56, 59, 82, 85, 88, 91, 613, 616, 619, and 622; and a light chain CDR3 comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 19, 22, 25, 28, 51, 54, 57, 60, 83, 86, 89, 92, 614, 617, 620 and 623 ; where the antibody specifically binds CCR7.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 1, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 2; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 3; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 17; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 18 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 19.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 1, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 2; heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 3; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 17; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 18 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 19.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 4, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 5; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 6; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 20; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 21 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 22.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 4, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 5; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 6; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 20; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 21 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 22.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 7, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 8; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 9; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 23; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 24 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 25.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 7, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 8; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 9; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 23; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 24 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 25.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 10, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 11; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 12; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 26; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 27 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 28.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 10, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 11; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 12; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 26; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 27 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 28.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 33, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 34; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 35; CDR1In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 33, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 34; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 35; CDR1
- 64 042529 легкой цепи под SEQ ID NO: 49; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 50 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID- 64 042529 light chain according to SEQ ID NO: 49; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 50 and Light chain CDR3 of SEQ ID
NO: 51.NO: 51.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 36, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 37; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 38; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 52; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 53 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 54.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 36, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 37; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 38; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 52; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 53 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 54.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 39, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 40; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 41; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 55; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 56 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 57.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 39, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 40; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 41; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 55; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 56 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 57.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID nO: 42, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 43; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 44; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 58; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 59 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 60.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID nO: 42, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 43; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 44; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 58; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 59 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 60.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 65, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 66; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 67; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 81; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 82 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 83.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 65, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 66; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 67; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 81; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 82 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 83.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 68, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 69; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 70; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 84; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 85 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 86.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 68, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 69; heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 70; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 84; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 85 and light chain CDR3 of SEQ ID NO: 86.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 71, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 72; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 73; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 87; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 88 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 89.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 71, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 72; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 73; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 87; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 88 and Light chain CDR3 of SEQ ID NO: 89.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 74, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 75; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO: 76; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO: 90; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO: 91 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO: 92.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (eg, antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 74, a heavy chain CDR2 of SEQ ID NO: 75; Heavy chain CDR3 under SEQ ID NO: 76; Light chain CDR1 under SEQ ID NO: 90; Light chain CDR2 of SEQ ID NO: 91 and Light chain CDR3 of SEQ ID NO: 92.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 596, HCDR2 под SEQ ID NO: 597 и HCDR3 под SEQ ID NO: 598; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 612, LCDR2 под SEQ ID NO: 613 и LCDR3 под SEQ ID NO: 614.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 596, HCDR2 of SEQ ID NO: 597, and HCDR3 of SEQ ID NO: 597. : 598; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 612, LCDR2 of SEQ ID NO: 613, and LCDR3 of SEQ ID NO: 614.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 599, HCDR2 под SEQ ID NO: 600 и HCDR3 под SEQ ID NO: 601; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 615, LCDR2 под SEQ ID NO: 616 и LCDR3 под SEQ ID NO: 617.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 599, HCDR2 of SEQ ID NO: 600, and HCDR3 of SEQ ID NO: 600. : 601; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 615, LCDR2 of SEQ ID NO: 616, and LCDR3 of SEQ ID NO: 617.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 602, HCDR2 под SEQ ID NO: 603 и HCDR3 под SEQ ID NO: 604; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 618, LCDR2 под SEQ ID NO: 619 и LCDR3 под SEQ ID NO: 620.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 602, HCDR2 of SEQ ID NO: 603, and HCDR3 of SEQ ID NO: 603, and HCDR3 of SEQ ID NO: : 604; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 618, LCDR2 of SEQ ID NO: 619, and LCDR3 of SEQ ID NO: 620.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO: 605, HCDR2 под SEQ ID NO: 606 и HCDR3 под SEQ ID NO: 607; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO: 621, LCDR2 под SEQ ID NO: 622 и LCDR3 под SEQ ID NO: 623.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain variable region that contains HCDR1 of SEQ ID NO: 605, HCDR2 of SEQ ID NO: 606, and HCDR3 of SEQ ID NO: 606. : 607; and a light chain variable region that contains LCDR1 of SEQ ID NO: 621, LCDR2 of SEQ ID NO: 622, and LCDR3 of SEQ ID NO: 623.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 13, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 29.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain variable region (VH) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13 and a light chain variable region (VL) containing amino acid sequence under SEQ ID NO: 29.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязы- 65 042529 вающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 45, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 61.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain variable region (VH) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45 and a light chain variable region ( VL) containing the amino acid sequence under SEQ ID NO: 61.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 77, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 93.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain variable region (VH) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 77 and a light chain variable region (VL) containing amino acid sequence under SEQ ID NO: 93.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 608, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 624.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain variable region (VH) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 608 and a light chain variable region (VL) containing amino acid sequence under SEQ ID NO: 624.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 15, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 31.In a particular embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 31.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 47, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 63.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 79, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 95.In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 79 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 95.
В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 610, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 626In a specific embodiment, the antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) that specifically binds to CCR7 comprises a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 610 and a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 626
В некоторых вариантах осуществления антитело, которое специфически связывается с CCR7, представляет собой антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент), которые описаны в табл. 1 и 4.In some embodiments, an antibody that specifically binds to CCR7 is an antibody or antibody fragment (eg, an antigen-binding fragment) as described in Table 1. 1 and 4.
1. Идентификация эпитопов и антител, которые связываются с одним и тем же эпитопом1. Identification of epitopes and antibodies that bind to the same epitope
В настоящем изобретении также представлены антитела и фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с тем же эпитопом, что и антитела к CCR7, описанные в табл. 1 и 4, или вступает в перекрестную конкуренцию с антителами, описанными в табл. 1 и 4. Следовательно, дополнительные антитела и фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) можно идентифицировать на основе их способности к перекрестной конкуренции (например, к конкурентному ингибированию связывания, статистически значимым образом) с другими антителами по настоящему изобретению в анализах связывания CCR7, например, с помощью BIACORE или анализов, известных специалистам в данной области техники для измерения связывания. Способность тестируемого антитела ингибировать связывание антител и фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) по настоящему изобретению с CCR7 (например, CCR7 человека) демонстрирует, что тестируемое антитело может конкурировать с таким антителом или фрагментом антитела (например, антигенсвязывающими фрагментами) за связывание с CCR7; при этом, согласно неограничивающей теории такое антитело может связываться с тем же или родственным (например, структурно подобным или пространственно близким или перекрывающимся) эпитопом на белке CCR7, что и антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), с которым оно конкурирует. В некоторых вариантах осуществления антитела, которые связываются с тем же эпитопом на CCR7, что и антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), описанные в табл. 1 и 4, представляют собой человеческие или гуманизированные моноклональные антитела. Такие человеческие или гуманизированные моноклональные антитела могут быть получены и выделены, как описано в данном документе.The present invention also provides antibodies and antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) that specifically bind to the same epitope as the anti-CCR7 antibodies described in Table 1. 1 and 4, or enters into cross-competition with the antibodies described in table. 1 and 4. Therefore, additional antibodies and antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) can be identified based on their ability to cross-compete (e.g., competitive binding inhibition, in a statistically significant manner) with other antibodies of the present invention in CCR7 binding assays, e.g. , using BIACORE or assays known to those skilled in the art to measure binding. The ability of a test antibody to inhibit the binding of antibodies and antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments) of the present invention to CCR7 (e.g., human CCR7) demonstrates that the test antibody can compete with such antibody or antibody fragment (e.g., antigen-binding fragments) for binding to CCR7; however, according to a non-limiting theory, such an antibody can bind to the same or related (for example, structurally similar or spatially similar or overlapping) epitope on the CCR7 protein as the antibody or antibody fragment (for example, antigen-binding fragments) with which it competes. In some embodiments, antibodies that bind to the same epitope on CCR7 as the antibodies or antibody fragments (eg, antigen-binding fragments) described in Table 1. 1 and 4 are human or humanized monoclonal antibodies. Such human or humanized monoclonal antibodies may be prepared and isolated as described herein.
2. Дополнительное изменение каркасной области в области Fc2. Additional modification of the framework region in the Fc region
Иммуноконъюгаты по настоящему изобретению могут содержать модифицированные антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, которые дополнительно содержат модификации каркасных остатков в пределах VH и/или VL, например, для улучшения свойств антитела. В некоторых вариантах осуществления модификации каркасной области осуществляют для снижения иммуногенности антитела. Например, один подход заключается в том, что один или несколько каркасных остатков мутируют к первоначальному виду в направлении соответствующей последовательности зародышевой линии. Более конкретно, антитело, которое подверглось соматической мутации, может содержать каркасные остатки, которые отличаются от последовательности зародышевой линии, из которой происходит антитело. Такие остатки могут быть идентифицированы посредством сравнения каркасных последовательностей антитела с последовательностями зародышевой линии, из которых происходит антитело. Чтобы вернуть после- 66 042529 довательности каркасной области в их конфигурацию зародышевой линии, соматические мутации можно вводить для мутирования к первоначальному виду в последовательности зародышевой линии, например, с помощью сайт-направленного мутагенеза. Подразумевается, что такие подвергнутые мутации к первоначальному виду антитела также охватываются настоящим изобретением.The immunoconjugates of the present invention may contain modified antibodies or antigen-binding fragments thereof, which further contain modifications to framework residues within the VH and/or VL, for example, to improve the properties of the antibody. In some embodiments, modifications to the framework region are made to reduce the immunogenicity of the antibody. For example, one approach is that one or more framework residues are mutated to the original species in the direction of the corresponding germline sequence. More specifically, an antibody that has undergone a somatic mutation may contain framework residues that differ from the germline sequence from which the antibody is derived. Such residues can be identified by comparing the framework sequences of the antibody with the germline sequences from which the antibody is derived. To return the framework sequences to their germline configuration, somatic mutations can be introduced to mutate back to the original species in the germline sequence, for example, by site-directed mutagenesis. It is understood that such mutated to the original form of antibodies are also covered by the present invention.
Другой тип модификации каркасной области предусматривает мутацию одного или нескольких остатков в пределах каркасной области или даже в пределах одной или нескольких областей CDR, чтобы удалить Т-клеточные эпитопы, со снижением тем самым потенциальной иммуногенности антитела. Данный подход также называют деиммунизацией, и он более подробно описан в публикации заявки на патент США № 20030153043 от Carr et al.Another type of framework modification involves mutating one or more residues within the framework, or even within one or more CDR regions, to remove T-cell epitopes, thereby reducing the potential immunogenicity of the antibody. This approach is also referred to as deimmunization and is described in more detail in US Patent Application Publication No. 20030153043 by Carr et al.
В качестве дополнения или альтернативы модификациям, осуществляемым в пределах каркасных областей или областей CDR, антитела по настоящему изобретению можно конструировать таким образом, чтобы они включали модификации в пределах области Fc, как правило, для изменения одного или нескольких функциональных свойств антитела, таких как период полужизни в сыворотке крови, фиксация комплемента, связывание с Fc-рецептором и/или антигензависимая клеточная цитотоксичность (ADCC). Кроме того, антитело по настоящему изобретению может быть модифицировано химически (например, к антителу можно присоединять один или несколько химических фрагментов), или оно может быть модифицировано для изменения характера его гликозилирования, чтобы опять-таки изменить одно или несколько функциональных свойств антитела. Каждый из данных вариантов осуществления более подробно описан ниже.As an addition or alternative to modifications made within the framework or CDR regions, the antibodies of the present invention can be designed to include modifications within the Fc region, typically to alter one or more of the functional properties of the antibody, such as half-life in serum, complement fixation, Fc receptor binding and/or antigen-dependent cellular cytotoxicity (ADCC). In addition, an antibody of the present invention may be chemically modified (for example, one or more chemical moieties may be attached to the antibody), or it may be modified to change its glycosylation pattern, again to alter one or more of the functional properties of the antibody. Each of these embodiments is described in more detail below.
В одном варианте осуществления шарнирную область СН1 модифицируют таким образом, что меняется число цистеиновых остатков в шарнирной области, например, увеличивается или уменьшается. Данный подход дополнительно описан в патенте США № 5677425 от Bodmer et al. Число цистеиновых остатков в шарнирной области СН1 изменяют, например, чтобы облегчить сборку легкой и тяжелой цепей, или чтобы увеличить или уменьшить стабильность антитела.In one embodiment, the CH1 hinge region is modified such that the number of cysteine residues in the hinge region changes, such as increasing or decreasing. This approach is further described in US Pat. No. 5,677,425 to Bodmer et al. The number of cysteine residues in the CH1 hinge region is changed, for example, to facilitate assembly of the light and heavy chains, or to increase or decrease the stability of the antibody.
В некоторых вариантах осуществления антитело или фрагмент антитела, раскрытые в данном документе, содержат модифицированные или введенные путем конструирования аминокислотные остатки, например, один или несколько цистеиновых остатков, в качестве сайтов для конъюгации с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство (Junutula JR, et al., Nat Biotechnol 2008, 26:925-932). В одном варианте осуществления настоящего изобретения представлены модифицированные антитело или фрагмент антитела, содержащие замену одной или нескольких аминокислот на цистеин в положениях, описанных в данном документе. Сайты для цистеиновой замены расположены в константных областях антитела или фрагмента антитела и, таким образом, применимы к множеству антител или фрагментов антител, и сайты выбирают для обеспечения стабильных и однородных конъюгатов. Модифицированные антитело или фрагмент могут иметь одну, две или более цистеиновых замен, и такие замены могут применяться в комбинации с другими способами модификации и конъюгации, описанными в данном документе. Способы для вставки цистеина в специфические местоположения антитела известны из уровня техники, см., например, Lyons et al. (1990) Protein Eng., 3:703-708, WO 2011/005481, WO2014/124316, WO 2015/138615. В некоторых вариантах осуществления модифицированное антитело содержит замену одной или нескольких аминокислот на цистеин в своей константной области в положении, выбранном из положений 117, 119, 121, 124, 139, 152, 153, 155, 157, 164, 169, 171, 174, 189, 191, 195, 197, 205, 207, 246, 258, 269, 274, 286, 288, 290, 292, 293, 320, 322, 326, 333, 334, 335, 337, 344, 355, 360, 375, 382, 390, 392, 398, 400 и 422 тяжелой цепи антитела, и где нумерация положений соответствует системе EU. В некоторых вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент антитела содержат замену одной или нескольких аминокислот на цистеин в своей константной области в положении, выбранном из положений 107, 108, 109, 114, 129, 142, 143, 145, 152, 154, 156, 159, 161, 165, 168, 169, 170, 182, 183, 197, 199, и 203 легкой цепи антитела или фрагмента антитела, где нумерация положений соответствует системе EU и где легкая цепь представляет собой человеческую каппа-легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат комбинацию из замен двух или более аминокислот на цистеин в своих константных областях, где комбинации предусматривают замены в положениях 375 тяжелой цепи антитела, положении 152 тяжелой цепи антитела, положении 360 тяжелой цепи антитела или положении 107 легкой цепи антитела, и где нумерация положений соответствует системе EU. В некоторых вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат замену одной аминокислоты на цистеин в своих константных областях, где замена находится в положении 375 тяжелой цепи антитела, положении 152 тяжелой цепи антитела, положении 360 тяжелой цепи антитела, положении 107 легкой цепи антитела, положении 165 легкой цепи антитела или положении 159 легкой цепи антитела, и где нумерация положений соответствует системе EU, и где легкая цепь представляет собой каппа-цепь. В конкретных вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат комбинацию из замен двух аминокислот на цистеин в своих константных областях, где комбинации предусматривают замены в положениях 375 тяжелой цепи антитела и положении 152 тяжелой цепи антитела, где нумерация положений соответствует системе EU. В конкретных вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат замену одной аминокислоты на цистеин в положении 360 тяже- 67 042529 лой цепи антитела, где нумерация положений соответствует системе EU. В других конкретных вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат замену одной аминокислоты на цистеин в положении 107 легкой цепи антитела, и где нумерация положений соответствует системе EU и где легкая цепь представляет собой каппа-цепь.In some embodiments, an antibody or antibody fragment disclosed herein contains modified or engineered amino acid residues, such as one or more cysteine residues, as sites for conjugation to a drug moiety (Junutula JR, et al. , Nat Biotechnol 2008, 26:925-932). In one embodiment, the present invention provides a modified antibody or antibody fragment containing the replacement of one or more amino acids with cysteine at the positions described herein. Cysteine substitution sites are located in the constant regions of an antibody or antibody fragment and are thus applicable to a variety of antibodies or antibody fragments, and the sites are chosen to provide stable and uniform conjugates. The modified antibody or fragment may have one, two or more cysteine substitutions, and such substitutions may be used in combination with other modification and conjugation methods described herein. Methods for inserting cysteine at specific antibody locations are known in the art, see, for example, Lyons et al. (1990) Protein Eng. 3:703-708, WO 2011/005481, WO2014/124316, WO 2015/138615. In some embodiments, the modified antibody comprises a substitution of one or more amino acids for cysteine in its constant region at a position selected from positions 117, 119, 121, 124, 139, 152, 153, 155, 157, 164, 169, 171, 174, 189, 191, 195, 197, 205, 207, 246, 258, 269, 274, 286, 288, 290, 292, 293, 320, 322, 326, 333, 334, 335, 337, 344, 355, 360 375, 382, 390, 392, 398, 400 and 422 of the heavy chain of the antibody, and where the position numbering follows the EU system. In some embodiments, the modified antibody or antibody fragment comprises a substitution of one or more amino acids for cysteine in its constant region at a position selected from positions 107, 108, 109, 114, 129, 142, 143, 145, 152, 154, 156, 159 , 161, 165, 168, 169, 170, 182, 183, 197, 199, and 203 of the light chain of an antibody or antibody fragment, where the position numbering follows the EU system and where the light chain is a human kappa light chain. In some embodiments, the modified antibody or antibody fragment comprises a combination of two or more amino acid substitutions for cysteine in its constant regions, where the combinations include substitutions at positions 375 of the antibody heavy chain, position 152 of the antibody heavy chain, position 360 of the antibody heavy chain, or position 107 the light chain of the antibody, and where the position numbering follows the EU system. In some embodiments, the modified antibody or antibody fragment comprises a single amino acid substitution for cysteine in its constant regions, where the substitution is at position 375 of the antibody heavy chain, position 152 of the antibody heavy chain, position 360 of the antibody heavy chain, position 107 of the antibody light chain, position 165 of the antibody light chain or position 159 of the antibody light chain, and where the position numbering is according to the EU system, and where the light chain is a kappa chain. In specific embodiments, the modified antibody or antibody fragment contains a combination of two amino acid substitutions for cysteine in its constant regions, where the combinations include substitutions at positions 375 of the antibody heavy chain and position 152 of the antibody heavy chain, where the position numbering follows the EU system. In specific embodiments, the modified antibody, or a fragment of such an antibody, comprises a single amino acid substitution for a cysteine at position 360 of the heavy chain of the antibody, where position numbering follows the EU system. In other specific embodiments, the modified antibody or antibody fragment comprises a single amino acid substitution for cysteine at position 107 of the light chain of the antibody, and where the position numbering follows the EU system and where the light chain is a kappa chain.
В дополнительных вариантах осуществления антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающий фрагмент), применимые в иммуноконъюгатах по настоящему изобретению, включают модифицированные или сконструированные антитела, такие как антитело, модифицированное для введения одной или нескольких других реакционноспособных аминокислот (отличных от цистеина), в том числе Pcl, пирролизина, пептидных меток (таких как метки S6, А1 и ybbR) и неприродных аминокислот, вместо по меньшей мере одной аминокислоты из нативной последовательности, тем самым обеспечивая реакционноспособный сайт на антителе или антигенсвязывающем фрагменте для конъюгации с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, или фрагментом, представляющим собой линкерлекарственное средство, с комплементарной реакционной группой. Например, антитела или фрагменты антител могут быть модифицированы для введения Pcl или пирролизина (W. Ou, et al. (2011) PNAS 108 (26), 10437-10442; WO 2014124258) или неприродных аминокислот (J.Y. Axup, et al., Proc Natl Acad Sci USA, 109 (2012), pp. 16101-16106; обзор см. в С.С. Liu and P.G. Schultz (2010) Annu Rev Biochem 79, 413444; C.H. Kim, et al. (2013) Curr Opin Chem Biol. 17, 412-419) в качестве сайтов для конъюгации с лекарственным средством. Аналогичным образом в антитело могут быть введены пептидные метки для способов ферментативной конъюгации (Strop P., et al., Chem Biol. 2013, 20(2):161-7; Rabuka D., Curr Opin Chem Biol. 2010 Dec;14(6):790-6; Rabuka D, et al., Nat Protoc. 2012, 7(6):1052-67). Одним другим примером является применение 4'-фосфопантетеинилтрансфераз (РРТаза) для конъюгации аналогов кофермента A (WO 2013184514) и (Grunewald et al. (2015) Bioconjugate Chem. 26 (12), 2554-62). Способы конъюгации таких модифицированных или сконструированных антител с полезными нагрузками или комбинациями линкер-полезная нагрузка известны из уровня техники.In additional embodiments, antibodies or antibody fragments (e.g., an antigen-binding fragment) useful in the immunoconjugates of the present invention include modified or engineered antibodies, such as an antibody modified to introduce one or more other reactive amino acids (other than cysteine), including Pcl, pyrrolysin, peptide tags (such as S6, A1, and ybbR tags), and non-natural amino acids, in place of at least one amino acid from the native sequence, thereby providing a reactive site on the antibody or antigen-binding fragment for conjugation to the drug moiety, or a linker drug moiety with a complementary reactive group. For example, antibodies or antibody fragments can be modified to introduce Pcl or pyrrolysine (W. Ou, et al. (2011) PNAS 108(26), 10437-10442; WO 2014124258) or unnatural amino acids (J.Y. Axup, et al., Proc Natl Acad Sci USA, 109 (2012), pp. 16101-16106, for a review see C. C. Liu and P. G. Schultz (2010) Annu Rev Biochem 79, 413444; C. H. Kim, et al. (2013) Curr Opin Chem Biol. 17, 412-419) as drug conjugation sites. Similarly, peptide labels for enzymatic conjugation methods can be introduced into an antibody (Strop P., et al., Chem Biol. 2013, 20(2):161-7; Rabuka D., Curr Opin Chem Biol. 2010 Dec;14( 6):790-6; Rabuka D, et al., Nat Protoc. 2012, 7(6):1052-67). One other example is the use of 4'-phosphopantetheinyltransferases (PPTase) for the conjugation of coenzyme A analogs (WO 2013184514) and (Grunewald et al. (2015) Bioconjugate Chem. 26 (12), 2554-62). Methods for conjugating such modified or engineered antibodies to payloads or linker-payload combinations are known in the art.
В другом варианте осуществления для снижения биологического периода полужизни антитела подвергают мутации область Fc-шарнир антитела. Более конкретно, одну или несколько аминокислотных мутаций вводят в пограничную область между доменами СН2-СНЗ фрагмента Fc-шарнир, вследствие чего антитело характеризуется нарушенным связыванием с белком А стафилококка (SpA) по сравнению со связыванием нативного домена Fc-шарнир с SpA. Данный подход более подробно описан в патенте США № 6165745 от Ward et al.In another embodiment, to reduce the biological half-life of the antibody, the Fc-hinge region of the antibody is mutated. More specifically, one or more amino acid mutations are introduced in the border region between the CH2-CH3 domains of the Fc-hinge fragment, whereby the antibody has impaired binding to Staphylococcus A protein (SpA) compared to the binding of the native Fc-hinge domain to SpA. This approach is described in more detail in US patent No. 6165745 from Ward et al.
В других вариантах осуществления область Fc изменяют путем замены по меньшей мере одного аминокислотного остатка на отличный аминокислотный остаток для изменения эффекторных функций антитела. Например, одну или несколько аминокислот можно заменить на отличный аминокислотный остаток, вследствие чего антитело характеризуется измененной аффинностью в отношении эффекторного лиганда, но сохраняет способность к связыванию антигена исходного антитела. Эффекторный лиганд, аффинность в отношении которого изменяют, может представлять собой, например, Fc-рецептор или компонент С1 комплемента. Данный подход описан, например, в патентах США №№ 5624821 и 5648260, оба от Winter et al.In other embodiments, the Fc region is altered by replacing at least one amino acid residue with a different amino acid residue to alter the effector functions of the antibody. For example, one or more amino acids can be replaced with a different amino acid residue such that the antibody has an altered affinity for the effector ligand but retains the ability to bind the parent antibody's antigen. The effector ligand for which the affinity is changed may be, for example, the Fc receptor or the C1 component of complement. This approach is described, for example, in US patent No. 5624821 and 5648260, both from Winter et al.
В другом варианте осуществления одну или несколько аминокислот, выбранных из аминокислотных остатков, можно заменить на отличный аминокислотный остаток, вследствие чего антитело характеризуется измененным связыванием Clq и/или сниженной или устраненной комплементзависимой цитотоксичностью (CDC). Данный подход описан, например, в патенте США № 6194551 от Idusogie et al.In another embodiment, one or more amino acids selected from the amino acid residues can be replaced with a different amino acid residue, whereby the antibody has altered Clq binding and/or reduced or eliminated complement dependent cytotoxicity (CDC). This approach is described, for example, in US patent No. 6194551 from Idusogie et al.
В другом варианте осуществления один или несколько аминокислотных остатков изменяют, чтобы тем самым изменить способность антитела к фиксации комплемента. Данный подход описан, например, в РСТ-публикации WO 94/29351 от Bodmer et al. Аллотипические аминокислотные остатки охватывают без ограничения константную область тяжелой цепи подклассов IgG1, IgG2 и IgG3, a также константную область легкой цепи изотипов каппа-цепи, как описано в Jefferis et al., MAbs. 1:332-338 (2009).In another embodiment, one or more amino acid residues are altered to thereby alter the ability of the antibody to fix complement. This approach is described, for example, in PCT publication WO 94/29351 from Bodmer et al. Allotypic amino acid residues include, without limitation, the heavy chain constant region of the IgG1, IgG2, and IgG3 subclasses, as well as the light chain constant region of the kappa chain isotypes, as described in Jefferis et al., MAbs. 1:332-338 (2009).
Комплексы на основе слитого белка с антителом, содержащим такие мутации, опосредуют сниженные антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC) или комплементзависимую цитотоксичность (CDC) или их отсутствие. В некоторых вариантах осуществления аминокислотные остатки L234 и L235 в константной области IgG1 заменены на А234 и А235. В некоторых вариантах осуществления аминокислотный остаток N267 в константной области IgG1 заменен на А267. В некоторых вариантах осуществления аминокислотные остатки D265 и Р329 в константной области IgG1 заменены на А265 и А329. В некоторых вариантах осуществления тяжелая цепь иммуноглобулина необязательно содержит мутацию или комбинацию мутаций, обусловливающих сниженную эффекторную функцию, выбранные из любой из D265A, Р329А, P329G, N297A, D265A/P329A, D265A/N297A, L234/L235A, P329A/L234A/L235A и P329G/L234A/L235A. В конкретных вариантах осуществления иммуноконъюгат содержит тяжелую цепь иммуноглобулина, содержащую мутацию или комбинацию мутаций, обусловливающих сниженную эффекторную функцию, выбранных из любой из D265A, Р329А, P329G, N297A, D265A/P329A, D265A/N297A, L234/L235A, P329A/L234A/L235A и P329G/L234A/L235AFusion protein-based complexes with an antibody containing such mutations mediate reduced or absent antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) or complement-dependent cytotoxicity (CDC). In some embodiments, amino acid residues L234 and L235 in the IgG1 constant region are replaced by A234 and A235. In some embodiments, the N267 amino acid residue in the IgG1 constant region is replaced by A267. In some embodiments, amino acid residues D265 and P329 in the IgG1 constant region are changed to A265 and A329. In some embodiments, the immunoglobulin heavy chain optionally contains a mutation or combination of mutations conferring reduced effector function selected from any of D265A, P329A, P329G, N297A, D265A/P329A, D265A/N297A, L234/L235A, P329A/L234A/L235A, and P329G /L234A/L235A. In specific embodiments, the immunoconjugate comprises an immunoglobulin heavy chain containing a mutation or combination of mutations conferring reduced effector function selected from any of D265A, P329A, P329G, N297A, D265A/P329A, D265A/N297A, L234/L235A, P329A/L234A/L235A and P329G/L234A/L235A
В другом варианте осуществления один или несколько аминокислотных остатков изменяют, чтобы тем самым изменить способность антитела к фиксации комплемента. Данный подход описан, например,In another embodiment, one or more amino acid residues are altered to thereby alter the ability of the antibody to fix complement. This approach is described, for example,
- 68 042529 в РСТ-публикации WO 94/29351 от Bodmer et al. В конкретном варианте осуществления одна или несколько аминокислот антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по настоящему изобретению заменены на один или несколько аллотипических аминокислотных остатков. Аллотипические аминокислотные остатки также включают без ограничения константную область тяжелой цепи подклассов IgG1, IgG2 и IgG3, a также константную область легкой цепи изотипа каппа-цепи, как описано в Jefferis et al., MAbs. 1:332-338 (2009).- 68 042529 in PCT publication WO 94/29351 from Bodmer et al. In a specific embodiment, one or more amino acids of the antibody or antigen-binding fragment of the present invention are replaced by one or more allotypic amino acid residues. Allotypic amino acid residues also include, without limitation, the heavy chain constant region of the IgG1, IgG2, and IgG3 subclasses, as well as the light chain constant region of the kappa chain isotype, as described in Jefferis et al., MAbs. 1:332-338 (2009).
В еще одном варианте осуществления модифицируют характер гликозилирования антитела. Например, можно получать агликозилированное антитело (т.е. антитело, у которого отсутствует гликозилирование). Характер гликозилирования может быть изменен, например, для повышения аффинности антитела в отношении антигена. Такие модификации углеводов можно осуществлять, например, посредством изменения одного или нескольких сайтов гликозилирования в пределах последовательности антитела. Например, можно произвести одну или несколько аминокислотных замен, которые приводят к устранению одного или нескольких сайтов гликозилирования в каркасной области вариабельной области, тем самым устраняя гликозилирования в этом сайте. Такое агликозилирование может повышать аффинность антитела в отношении антигена. Такой подход описан, например, патентах США №№ 5714350 и 6350861 от Со et al.In yet another embodiment, the glycosylation pattern of the antibody is modified. For example, you can get an aglycosylated antibody (ie, an antibody that lacks glycosylation). The pattern of glycosylation can be changed, for example, to increase the affinity of the antibody for the antigen. Such modifications of carbohydrates can be carried out, for example, by changing one or more glycosylation sites within the sequence of the antibody. For example, one or more amino acid substitutions can be made that result in the elimination of one or more glycosylation sites in the framework region of the variable region, thereby eliminating glycosylations at that site. Such aglycosylation can increase the affinity of the antibody for the antigen. Such an approach is described, for example, in US Pat. Nos. 5,714,350 and 6,350,861 to Co et al.
В другом варианте осуществления антитело модифицируют для увеличения его биологического периода полужизни. Возможны различные подходы. Например, можно вводить одну или несколько из следующих мутаций: T252L, T254S, T256F, как описано в патенте США № 6277375 от Ward. В качестве альтернативы для увеличения биологического периода полужизни антитело можно изменять в пределах области СН1 или CL таким образом, чтобы оно содержало эпитоп для связывания с рецептором реутилизации, взятый из двух петель домена СН2 из области Fc IgG, как описано в патентах США №№ 5869046 и 6121022 от Presta et al.In another embodiment, the antibody is modified to increase its biological half-life. Various approaches are possible. For example, you can enter one or more of the following mutations: T252L, T254S, T256F, as described in US patent No. 6277375 from Ward. Alternatively, to increase the biological half-life, the antibody can be modified within the CH1 or CL region such that it contains an epitope for binding to the salvage receptor taken from two loops of the CH2 domain from the IgG Fc region, as described in US Patent Nos. 5,869,046 and 6121022 from Presta et al.
3. Выработка антител к CCR73. Production of antibodies to CCR7
Антитела к CCR7 и фрагменты таких антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) могут быть получены с помощью любых средств, известных из уровня техники, в том числе без ограничения рекомбинантной экспрессии, химического синтеза и ферментативного расщепления тетрамеров антител, при этом полноразмерные моноклональные антитела можно получать, например, с помощью гибридом или рекомбинантного продуцирования. Рекомбинантная экспрессия может осуществляться в любых подходящих клетках-хозяевах, известных из уровня техники, например, в клетках-хозяевах, представляющих собой клетки млекопитающих, бактериальных клетках-хозяевах, дрожжевых клетках-хозяевах, клетках-хозяевах, представляющих собой клетки насекомых, и т. д.Anti-CCR7 antibodies and fragments of such antibodies (for example, antigen-binding fragments) can be obtained using any means known in the art, including, without limitation, recombinant expression, chemical synthesis, and enzymatic cleavage of antibody tetramers, while full-length monoclonal antibodies can be obtained, for example, using hybridomas or recombinant production. Recombinant expression can be carried out in any suitable host cells known in the art, for example, mammalian host cells, bacterial host cells, yeast host cells, insect host cells, etc. d.
В настоящем изобретении дополнительно представлены полинуклеотиды, кодирующие антитела, описанные в данном документе, например, полинуклеотиды, кодирующие вариабельные области или сегменты тяжелой или легкой цепей, содержащие определяющие комплементарность области, описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид, кодирующий вариабельные области тяжелой цепи, характеризуется по меньшей мере 85, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO: 14, 46, 78 и 609. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид, кодирующий вариабельные области легкой цепи, характеризуется по меньшей мере 85, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO: 30, 62, 94 и 62 5.The present invention further provides polynucleotides encoding the antibodies described herein, for example, polynucleotides encoding variable regions or heavy or light chain segments containing the complementarity-determining regions described herein. In some embodiments, the polynucleotide encoding the heavy chain variable regions has at least 85%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% nucleic acid sequence identity with the selected polynucleotide. from the group consisting of SEQ ID NOs: 14, 46, 78, and 609. In some embodiments, a polynucleotide encoding light chain variable regions is characterized by at least 85, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96 , 97, 98, 99, or 100% nucleic acid sequence identity with a polynucleotide selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 30, 62, 94, and 62-5.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид, кодирующий тяжелую цепь, характеризуется по меньшей мере 85, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с полинуклеотидом под SEQ ID NO: 16, 48, 80 или 611. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид, кодирующий легкую цепь, характеризуется по меньшей мере 85, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с полинуклеотидом под SEQ ID NO: 32, 64, 96 или 627.In some embodiments, the heavy chain-encoding polynucleotide has at least 85%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% nucleic acid sequence identity with the polynucleotide of SEQ ID NO. : 16, 48, 80, or 611. In some embodiments, the light chain encoding polynucleotide is at least 85%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical. nucleic acid sequences with a polynucleotide under SEQ ID NO: 32, 64, 96 or 627.
Полинуклеотиды по настоящему изобретению могут кодировать только последовательность вариабельной области антитела к CCR7. Они также могут кодировать как вариабельную область, так и константную область антитела. Некоторые из полинуклеотидных последовательностей кодируют полипептид, который содержит вариабельные области как тяжелой цепи, так и легкой цепи одного из иллюстративных мышиных антител к CCR7. Некоторые другие полинуклеотиды кодируют два полипептидных сегмента, которые в значительной степени идентичны вариабельным областям тяжелой цепи и легкой цепи, соответственно, одного из мышиных антител.The polynucleotides of the present invention can encode only the sequence of the variable region of an anti-CCR7 antibody. They can also encode both the variable region and the constant region of an antibody. Some of the polynucleotide sequences encode a polypeptide that contains both the heavy chain and light chain variable regions of one of the exemplary mouse anti-CCR7 antibodies. Some other polynucleotides encode two polypeptide segments that are largely identical to the heavy chain and light chain variable regions, respectively, of one of the mouse antibodies.
Полинуклеотидные последовательности можно получать с помощью твердофазного синтеза ДНК de novo или с помощью ПЦР-мутагенеза существующей последовательности (например, последовательностей, которые описаны в примерах ниже), кодирующей антитело к CCR7 или его связывающий фрагмент. Прямой химический синтез нуклеиновых кислот можно осуществлять с помощью способов, известных из уровня техники, таких как фосфотриэфирный способ из Narang et al., Meth. Enzymol. 68:90, 1979; фосфодиэфирный способ из Brown et al., Meth. Enzymol. 68:109, 1979; диэтилфосфорамидитный способ из Beaucage et al., Tetra Lett., 22:1859, 1981; и способ с использованием твердой подложки из па- 69 042529 тента США № 4458066. Введение мутаций в полинуклеотидную последовательность с помощью ПЦР можно осуществлять, как описано, например, в PCR Technology: Principles and Applications for DNA Amplification, H.A. Erlich (Ed.), Freeman Press, Ny, NY, 1992; PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis et al. (Ed.), Academic Press, San Diego, CA, 1990; Mattila et al., Nucleic Acids Res. 19:967, 1991; иPolynucleotide sequences can be generated by de novo solid phase DNA synthesis or by PCR mutagenesis of an existing sequence (eg, those described in the examples below) encoding an anti-CCR7 antibody or binding fragment thereof. Direct chemical synthesis of nucleic acids can be carried out using methods known in the art, such as the phosphotriester method from Narang et al., Meth. Enzymol. 68:90, 1979; the phosphodiester method from Brown et al., Meth. Enzymol. 68:109, 1979; diethylphosphoramidite method from Beaucage et al., Tetra Lett., 22:1859, 1981; and the solid support method of US Pat. No. 4,458,066. Mutations in a polynucleotide sequence by PCR can be performed as described, for example, in PCR Technology: Principles and Applications for DNA Amplification, H.A. Erlich (Ed.), Freeman Press, Ny, NY, 1992; PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis et al. (Ed.), Academic Press, San Diego, CA, 1990; Mattila et al., Nucleic Acids Res. 19:967, 1991; And
Eckert et al., PCR Methods and Applications 1:17, 1991.Eckert et al., PCR Methods and Applications 1:17, 1991.
Также в настоящем изобретении представлены векторы экспрессии и клетки-хозяева для продуцирования антитела к CCR7, описанных выше. Различные векторы экспрессии можно использовать для экспрессии полинуклеотидов, кодирующих цепи или связывающие фрагменты антитела к CCR7. Как вирусные, так и невирусные векторы экспрессии можно применять для продуцирования антител в клетке-хозяине, представляющей собой клетку млекопитающего. Невирусные векторы и системы включают плазмиды, эписомные векторы, как правило, с кассетой экспрессии для экспрессии белка или РНК, а также искусственные человеческие хромосомы (см., например, Harrington et al., Nat Genet. 15:345, 1997). Например, невирусные векторы, применимые для экспрессии полинуклеотидов и полипептидов, связывающих CCR7, в клетках млекопитающих (например, человеческих), включают pThioHis А, В и С, pcDNA™3.1/His, pEBVHis А, В и С (Invitrogen, Сан-Диего, Калифорния), векторы MPSV и многочисленные другие векторы, известные из уровня техники для экспрессии других белков. Применимые вирусные векторы включают векторы на основе ретровирусов, аденовирусов, аденоассоциированных вирусов, вирусов герпеса, векторы на основе SV40, папилломавируса, вируса Эпштейна-Барр НВР, векторы на основе вируса коровьей оспы и вируса леса Семлики (SFV). См. Brent et al., выше; Smith, Annu. Rev. Microbiol. 49:807, 1995; и Rosenfeld et al., Cell 68:143, 1992.Also provided in the present invention are expression vectors and host cells for producing an anti-CCR7 antibody as described above. Various expression vectors can be used to express polynucleotides encoding chains or binding fragments of an anti-CCR7 antibody. Both viral and non-viral expression vectors can be used to produce antibodies in a mammalian host cell. Non-viral vectors and systems include plasmids, episomal vectors, typically with an expression cassette for protein or RNA expression, and artificial human chromosomes (see, for example, Harrington et al., Nat Genet. 15:345, 1997). For example, non-viral vectors useful for expressing CCR7-binding polynucleotides and polypeptides in mammalian (e.g., human) cells include pThioHis A, B, and C, pcDNA™3.1/His, pEBVHis A, B, and C (Invitrogen, San Diego , Calif.), MPSV vectors, and numerous other vectors known in the art for expressing other proteins. Useful viral vectors include retrovirus, adenovirus, adeno-associated virus, herpesvirus, SV40, papillomavirus, Epstein-Barr HBP, vaccinia virus, and Semliki Forest Virus (SFV) vectors. See Brent et al., supra; Smith, Anna. Rev. microbiol. 49:807, 1995; and Rosenfeld et al., Cell 68:143, 1992.
Выбор вектора экспрессии зависит от предполагаемых клеток-хозяев, в которых следует экспрессировать вектор. Как правило, векторы экспрессии содержать промотор и другие регуляторные последовательности (например, энхансеры), которые функционально связаны с полинуклеотидами, кодирующими цепь или фрагмент антитела к CCR7. В некоторых вариантах осуществления индуцируемый промотор используют для предотвращения экспрессии встроенных последовательностей в условиях, отличающихся от индуцирующих. Индуцируемые промоторы включают, например, арабинозный, lacZ, металлотионеиновый промотор или промотор белка теплового шока. Культуры трансформированных организмов можно размножать в неиндуцирующих условиях без смещения популяции в направлении кодирующих последовательностей, продукты экспрессии которых лучше переносятся клетками-хозяевами. Для эффективной экспрессии цепи или фрагмента антитела к CCR7 кроме промоторов также могут быть необходимы или требоваться другие регуляторные элементы. Такие элементы, как правило, включают кодон инициации трансляции ATG и смежный сайт связывания рибосомы или другие последовательности. Кроме того, эффективность экспрессии можно повысить за счет включения энхансеров, соответствующих применяемой клеточной системе (см., например, Scharf et al., Results Probl. Cell Differ. 20:125, 1994; и Bittner et al., Meth. Enzymol., 153:516, 1987). Например, для повышения экспрессии в клетках-хозяевах, представляющих собой клетки млекопитающих, можно применять энхансер SV40 или энхансер CMV.The choice of expression vector depends on the intended host cells in which the vector is to be expressed. Typically, expression vectors contain a promoter and other regulatory sequences (eg, enhancers) that are operably linked to polynucleotides encoding an anti-CCR7 antibody chain or fragment. In some embodiments, an inducible promoter is used to prevent expression of the inserted sequences under conditions other than inducing. Inducible promoters include, for example, the arabinose, lacZ, metallothionein or heat shock protein promoter. Cultures of transformed organisms can be propagated under non-inducing conditions without shifting the population towards coding sequences whose expression products are better tolerated by host cells. In order to efficiently express an anti-CCR7 antibody chain or fragment, other regulatory elements may also be needed or required in addition to promoters. Such elements typically include the translation initiation codon ATG and an adjacent ribosome binding site or other sequences. In addition, expression efficiency can be increased by including enhancers appropriate to the cell system used (see, for example, Scharf et al., Results Probl. Cell Differ. 20:125, 1994; and Bittner et al., Meth. Enzymol., 153:516, 1987). For example, an SV40 enhancer or a CMV enhancer can be used to increase expression in mammalian host cells.
В векторах экспрессии также может быть предусмотрено положение сигнальной последовательности секреции для образования слитого белка с полипептидами, кодируемыми вставленными последовательностями антитела к CCR7. Чаще вставляемые последовательности антитела к CCR7 соединяют с сигнальными последовательностями до включения в вектор. Векторы, подлежащие применению для получения последовательностей, кодирующих вариабельные домены легкой и тяжелой цепей антитела к CCR7, иногда также кодируют константные области или их части. Такие векторы обеспечивают возможность экспрессии вариабельных областей в виде слитых белков с константными областями, приводя тем самым к получению интактных антител или их фрагментов. Как правило, такие константные области являются человеческими.Expression vectors can also be provided with a secretion signal sequence to form a fusion protein with polypeptides encoded by the inserted anti-CCR7 antibody sequences. More commonly, the inserted anti-CCR7 antibody sequences are fused to signal sequences prior to inclusion in the vector. The vectors to be used to obtain sequences encoding the light and heavy chain variable domains of an anti-CCR7 antibody sometimes also encode constant regions or portions thereof. Such vectors allow the expression of variable regions as fusion proteins with constant regions, thereby leading to the production of intact antibodies or fragments thereof. Typically, such constant regions are human.
Клетки-хозяева, несущие и экспрессирующие цепи антитела к CCR7, могут быть или прокариотическими, или эукариотическими. Е. coli является одним прокариотическим хозяином, применимым для клонирования и экспрессии полинуклеотидов по настоящему изобретению. Другие подходящие для применения микробные хозяева включают бацилл, таких как Bacillus subtilis, и других энтеробактерий, таких как Salmonella, Serratia и различные виды Pseudomonas. Для этих прокариотических хозяев также можно создать векторы экспрессии, которые, как правило, содержат последовательности для управления экспрессией, совместимые с клеткой-хозяином (например, точку начала репликации). Кроме того, будет присутствовать любое число разнообразных хорошо известных промоторов, как, например, лактозная промоторная система, триптофановая (trp) промоторная система, бета-лактамазная промоторная система или промоторная система из фага лямбда. Как правило, промоторы управляют экспрессией, необязательно с помощью операторной последовательности, и имеют последовательности сайта связывания рибосомы и т.п. для инициации и завершения транскрипции и трансляции. Для экспрессии полипептидов, связывающих CCR7, по настоящему изобретению также можно использовать других микроорганизмов, таких как дрожжи. Также можно применять клетки насекомых в сочетании с бакуловирусными векторами.Host cells carrying and expressing anti-CCR7 antibody chains can be either prokaryotic or eukaryotic. E. coli is one prokaryotic host useful for cloning and expression of the polynucleotides of the present invention. Other suitable microbial hosts include bacilli such as Bacillus subtilis and other enterobacteria such as Salmonella, Serratia and various Pseudomonas species. For these prokaryotic hosts, expression vectors can also be created, which typically contain expression control sequences that are compatible with the host cell (eg, origin of replication). In addition, any number of various well known promoters will be present, such as the lactose promoter system, the tryptophan (trp) promoter system, the beta-lactamase promoter system, or the lambda phage promoter system. Typically, promoters drive expression, optionally with an operator sequence, and have ribosome binding site sequences and the like. for the initiation and completion of transcription and translation. Other microorganisms such as yeast can also be used to express the CCR7 binding polypeptides of the present invention. Insect cells can also be used in combination with baculovirus vectors.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления для экспрессии и продуцирования полипептидов, связывающих CCR7, по настоящему изобретению применяют клетки-хозяева, представляющие собой клетки млекопитающих. Например, они могут представлять собой либо линию клеток гибри- 70 042529 домы, экспрессирующих эндогенные гены иммуноглобулинов (например, клоны гибридомы из клеток миеломы, как описано в примерах), либо линию клеток млекопитающих, несущих экзогенный вектор экспрессии (например, клетки миеломы SP2/0, приведенные в качестве примера ниже). Они охватывают любые нормальные мортальные или нормальные или аномальные иммортальные клетки животных или человека. Например, был разработан ряд подходящих линий клеток-хозяев, способных секретировать интактные иммуноглобулины, в том числе линии клеток СНО, различные линии клеток Cos, клетки HeLa, линии клеток миеломы, трансформированные В-клетки и гибридомы. Применение тканевой культуры клеток млекопитающих для экспрессии полипептидов в общих чертах обсуждается, например, в Winnacker, From Genes to Clones, VCH Publishers, N.Y., N.Y., 1987. Векторы экспрессии для клетокхозяев, представляющих собой клетки млекопитающих, могут включать последовательности для управления экспрессией, такие как точка начала репликации, промотор и энхансер (см., например, Queen et al., Immunol. Rev. 89:49-68, 1986), и необходимые сайты, несущие информацию для процессинга, такие как сайты связывания рибосом, сайты сплайсинга РНК, сайты полиаденилирования и последовательности терминатора транскрипции. Такие векторы экспрессии обычно содержат промоторы, происходящие из генов млекопитающих или из вирусов млекопитающих. Подходящие промоторы могут быть конститутивными, специфическими в отношении типа клеток, специфическими в отношении стадии развития и/или модулируемыми или регулируемыми. Применимые промоторы включают без ограничения металлотионеиновый промотор, конститутивный большой поздний промотор аденовируса, индуцируемый дексаметазоном промотор MMTV, промотор SV40, промотор polIII MRP, конститутивный промотор MPSV, индуцируемый тетрациклином промотор CMV (такой как немедленно-ранний промотор CMV человека), конститутивный промотор CMV и комбинации промотор-энхансер, известные из уровня техники.In some preferred embodiments, mammalian host cells are used to express and produce the CCR7 binding polypeptides of the present invention. For example, they can be either a hybridoma cell line expressing endogenous immunoglobulin genes (eg hybridoma clones from myeloma cells as described in the examples) or a mammalian cell line carrying an exogenous expression vector (eg SP2/ myeloma cells). 0 as an example below). They cover any normal mortal or normal or abnormal immortal animal or human cells. For example, a number of suitable host cell lines capable of secreting intact immunoglobulins have been developed, including CHO cell lines, various Cos cell lines, HeLa cells, myeloma cell lines, transformed B cells, and hybridomas. The use of tissue culture of mammalian cells for the expression of polypeptides is discussed in general terms in, for example, Winnacker, From Genes to Clones, VCH Publishers, N.Y., N.Y., 1987. Expression vectors for mammalian host cells may include expression control sequences such as as an origin of replication, a promoter and an enhancer (see e.g. Queen et al., Immunol. Rev. 89:49-68, 1986), and necessary processing information sites such as ribosome binding sites, RNA splicing sites , polyadenylation sites, and transcription terminator sequences. Such expression vectors typically contain promoters derived from mammalian genes or from mammalian viruses. Suitable promoters can be constitutive, cell type specific, developmental stage specific, and/or modulated or regulated. Useful promoters include, but are not limited to, the metallothionein promoter, adenovirus constitutive large late promoter, dexamethasone-inducible MMTV promoter, SV40 promoter, MRP polIII promoter, constitutive MPSV promoter, tetracycline-inducible CMV promoter (such as the human CMV immediate-early promoter), constitutive CMV promoter, and combinations promoter-enhancer, known from the prior art.
Способы введения векторов экспрессии, содержащих представляющие интерес полинуклеотидные последовательности, варьируют в зависимости от типа клетки-хозяина. Например, трансфекцию с использованием хлорида кальция обычно используют для прокариотических клеток, тогда как обработку фосфатом кальция или электропорацию можно применять для других клеток-хозяев (см. в общих чертах Sambrook et al., выше). A Laboratory Manual, 4th ed.). Другие способы включают, например, электропорацию, обработку фосфатом кальция, трансформацию, опосредованную липосомами, инъекцию и микроинъекцию, баллистические способы, виросомы, иммунолипосомы, конъюгаты поликатион:нуклеиновая кислота, депротеинизированную ДНК, искусственные вирионы, слияние со структурным белком VP22 вируса герпеса (Elliot and O'Hare, Cell 88:223, 1997), усиленное средством поглощение ДНК и трансдукцию ex vivo. Чтобы обеспечить длительное получение рекомбинантных белков с высоким выходом, зачастую будет требоваться стабильная экспрессия. Например, линии клеток, которые стабильно экспрессируют цепи или связывающие фрагменты антитела к CCR7, можно получить с применением векторов экспрессии по настоящему изобретению, которые содержат вирусные точки начала репликации или эндогенные экспрессионные элементы и ген селектируемого маркера. После введения вектора клетки можно оставить расти в течение 1-2 дней в обогащенной среде перед их переносом на селективную среду. Задачей селектируемого маркера является придание устойчивости к факторам отбора, и его присутствие обеспечивает возможность роста клеток, которые успешно экспрессируют введенные последовательности, в селективных средах. Пролиферацию устойчивых стабильно трансфицированных клеток можно обеспечивать с применением методик тканевой культуры, соответствующих типу клеток.Methods for introducing expression vectors containing polynucleotide sequences of interest vary depending on the type of host cell. For example, calcium chloride transfection is typically used on prokaryotic cells, while calcium phosphate treatment or electroporation can be used on other host cells (see outlined by Sambrook et al., supra). A Laboratory Manual, 4th ed.). Other methods include, for example, electroporation, calcium phosphate treatment, liposome-mediated transformation, injection and microinjection, ballistic methods, virosomes, immunoliposomes, polycation:nucleic acid conjugates, deproteinized DNA, artificial virions, fusion with the structural protein VP22 of the herpes virus (Elliot and O'Hare, Cell 88:223, 1997), agent-enhanced DNA uptake and ex vivo transduction. To ensure long-term production of recombinant proteins in high yield, stable expression will often be required. For example, cell lines that stably express anti-CCR7 antibody chains or binding fragments can be generated using expression vectors of the present invention that contain viral origins or endogenous expression elements and a selectable marker gene. After the introduction of the vector, cells can be left to grow for 1-2 days in enriched medium before they are transferred to selective medium. The purpose of the selectable marker is to confer resistance to selection factors and its presence allows cells that successfully express the introduced sequences to grow in selective media. Proliferation of resistant stably transfected cells can be achieved using tissue culture techniques appropriate to the cell type.
Пути терапевтического примененияTherapeutic routes
Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению применимы в виде разнообразных применений, в том числе без ограничения лечения или предупреждения рака, такого как типы солидного рака или гемобластозы. В некоторых вариантах осуществления антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению применимы для ингибирования роста опухоли, индуцирования дифференцировки, уменьшения объема опухоли и/или снижения туморогенности опухоли. Способы применения могут представлять собой in vitro, ex vivo или in vivo способы.The antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), and antibody-drug conjugates of the present invention are useful in a variety of applications, including, without limitation, the treatment or prevention of cancer, such as types of solid cancer or hematological malignancies. In some embodiments, the antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), and antibody-drug conjugates of the present invention are useful for inhibiting tumor growth, inducing differentiation, reducing tumor volume, and/or reducing tumor tumorigenicity. The methods of application may be in vitro, ex vivo or in vivo methods.
В одном аспекте антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению применимы для выявления присутствия CCR7 в биологическом образце. Используемый в данном документе термин осуществление обнаружения охватывает количественное или качественное обнаружение. В некоторых вариантах осуществления биологический образец содержит клетку или ткань. В некоторых вариантах осуществления такие ткани включают нормальные и/или раковые ткани, которые экспрессируют CCR7 на более высоких уровнях по сравнению с другими тканями.In one aspect, antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), and antibody-drug conjugates of the present invention are useful for detecting the presence of CCR7 in a biological sample. As used herein, the term performing detection encompasses quantitative or qualitative detection. In some embodiments, the biological sample contains a cell or tissue. In some embodiments, such tissues include normal and/or cancerous tissues that express CCR7 at higher levels than other tissues.
В одном аспекте настоящего изобретения представлен способ обнаружения присутствия CCR7 в биологическом образце. В некоторых вариантах осуществления способ предусматривает приведение биологического образца в контакт с антителом к CCR7 в условиях, допускающих связывание антитела с антигеном, и выявление того, формируется ли комплекс между антителом и антигеном.In one aspect of the present invention, a method is provided for detecting the presence of CCR7 in a biological sample. In some embodiments, the method involves contacting a biological sample with an anti-CCR7 antibody under conditions that allow binding of the antibody to the antigen and determining whether a complex is formed between the antibody and the antigen.
В одном аспекте настоящего изобретения представлен способ диагностики нарушения, ассоцииро- 71 042529 ванного с повышенной экспрессией CCR7. В некоторых вариантах осуществления способ предусматривает приведение тестируемой клетки в контакт с антителом к CCR7; определение уровня экспрессии (или количественно, или качественно) CCR7 на тестируемой клетке путем обнаружения связывания антитела к CCR7 с антигеном CCR7 и сравнение уровня экспрессии CCR7 в тестируемой клетке с уровнем экспрессии CCR7 на контрольной клетке (например, нормальной клетке, происходящей из той же ткани, что и тестируемая клетка, или клетке, которая экспрессирует CCR7 на уровнях, сравнимых с таковыми у нормальной клетки), где более высокий уровень экспрессии CCR7 на тестируемой клетке по сравнению с контрольной клеткой указывает на присутствие нарушения, ассоциированного с повышенной экспрессией CCR7. В некоторых вариантах осуществления тестируемую клетку получают от индивидуума с подозрением на наличие нарушения, ассоциированного с повышенной экспрессией CCR7. В некоторых вариантах осуществления нарушение представляет собой нарушение пролиферации клеток, такое как рак или опухоль. В некоторых вариантах осуществления способ предусматривает измерение числа копий гена CCR7 в тестируемой клетке.In one aspect, the present invention provides a method for diagnosing a disorder associated with overexpression of CCR7. In some embodiments, the method comprises contacting a test cell with an anti-CCR7 antibody; determining the expression level (either quantitatively or qualitatively) of CCR7 on a test cell by detecting the binding of an anti-CCR7 antibody to the CCR7 antigen, and comparing the expression level of CCR7 in the test cell with the level of CCR7 expression on a control cell (e.g., a normal cell originating from the same tissue, as a test cell, or a cell that expresses CCR7 at levels comparable to those of a normal cell), where a higher level of CCR7 expression on the test cell compared to the control cell indicates the presence of a disorder associated with increased expression of CCR7. In some embodiments, the test cell is obtained from an individual suspected of having a disorder associated with overexpression of CCR7. In some embodiments, the implementation of the violation is a violation of cell proliferation, such as cancer or tumor. In some embodiments, the method includes measuring the copy number of the CCR7 gene in the test cell.
В некоторых вариантах осуществления способ диагностики или обнаружения, такой как описываемые выше, предусматривает обнаружение связывания антитела к CCR7 с CCR7, экспрессируемым на поверхности клетки или в препарате мембраны, полученном из клетки, экспрессирующей CCR7 на своей поверхности. Иллюстративным анализом для обнаружения связывания антитела к CCR7 с CCR7, экспрессируемым на поверхности клетки, является FACS-анализ.In some embodiments, a diagnostic or detection method, such as those described above, comprises detecting binding of an anti-CCR7 antibody to CCR7 expressed on a cell surface or in a membrane preparation derived from a cell expressing CCR7 on its surface. An exemplary assay for detecting binding of an anti-CCR7 antibody to CCR7 expressed on a cell surface is a FACS assay.
Для обнаружения связывания антитела к CCR7 с CCR7 могут применяться некоторые другие способы. Такие способы включают без ограничения анализы связывания антигена, которые широко известны из уровня техники, такие как вестерн-блоттинг, радиоиммунологические анализы, ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ), иммунологические сэндвич-анализы, анализы иммунопреципитации, флуоресцентные иммунологические анализы, иммунологические анализы с белком А и иммуногистохимическое исследование (IHC).Several other methods can be used to detect binding of an anti-CCR7 antibody to CCR7. Such methods include, without limitation, antigen binding assays that are well known in the art, such as Western blotting, radioimmunoassays, ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), sandwich immunoassays, immunoprecipitation assays, fluorescence immunoassays, protein A immunoassays, and immunohistochemical study (IHC).
В некоторых вариантах осуществления антитела к CCR7 являются меченными. Метки включают без ограничения метки или фрагменты, которые обнаруживают непосредственно (такие как флуоресцентные, хромофорные, электронноплотные, хемилюминесцентные и радиоактивные метки), а также фрагменты, такие как ферменты или лиганды, которые обнаруживают опосредованно, например, за счет ферментативной реакции или молекулярного взаимодействия.In some embodiments, the anti-CCR7 antibodies are labeled. Labels include, without limitation, labels or moieties that are detected directly (such as fluorescent, chromophoric, electron dense, chemiluminescent, and radioactive labels) as well as moieties, such as enzymes or ligands, that are detected indirectly, such as through an enzymatic reaction or molecular interaction.
В некоторых вариантах осуществления антитела к CCR7 являются иммобилизированными на нерастворимой матрице. Иммобилизация приводит к отделению антитела к CCR7 от любого белка CCR7, который остается свободным в растворе. Традиционно это осуществляют либо посредством перевода антитела к CCR7 в нерастворимую форму перед процедурой анализа в результате адсорбции на нерастворимой в воде матрице или поверхности (Bennich et al., патент США № 3720760) или соединения ковалентной связью (например, с применением сшивания глутаральдегидом), либо посредством перевода антитела к CCR7 в нерастворимую форму после образования комплекса между антителом к CCR7 и белком CCR7, например, посредством иммунного осаждения.In some embodiments, the anti-CCR7 antibodies are immobilized on an insoluble matrix. Immobilization results in separation of the anti-CCR7 antibody from any CCR7 protein that remains free in solution. Traditionally, this is done either by rendering the anti-CCR7 antibody in an insoluble form prior to the assay procedure by adsorption to a water-insoluble matrix or surface (Bennich et al., US Pat. No. 3,720,760) or covalent bonding (e.g., using glutaraldehyde crosslinking), or by converting the anti-CCR7 antibody into an insoluble form after the formation of a complex between the anti-CCR7 antibody and the CCR7 protein, for example, by immunoprecipitation.
Любой из вышеизложенных вариантов осуществления диагностики или обнаружения может проводиться с применением иммуноконъюгата по настоящему изобретению вместо или в дополнение к антителу к CCR7.Any of the above diagnostic or detection embodiments can be performed using an immunoconjugate of the present invention instead of or in addition to an anti-CCR7 antibody.
В одном варианте осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения заболевания, предусматривающий введение пациенту антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В настоящем изобретении также представлено применение антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению для лечения или предупреждения заболевания у пациента. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению для применения в лечении или предупреждении заболевания у пациента. В дополнительных вариантах осуществления настоящего изобретения представлено применение антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению при изготовлении лекарственного препарата для лечения или предупреждения заболевания у пациента.In one embodiment, the present invention provides a method of treating or preventing a disease, comprising administering to a patient antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or antibody-drug conjugates of the present invention. The present invention also provides the use of antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or antibody-drug conjugates of the present invention to treat or prevent a disease in a patient. In some embodiments, the present invention provides antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or antibody-drug conjugates of the present invention for use in the treatment or prevention of a disease in a patient. In further embodiments, the present invention provides the use of antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or antibody-drug conjugates of the present invention in the manufacture of a medicament for the treatment or prevention of a disease in a patient.
В некоторых вариантах осуществления заболевание, которое лечат с помощью антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) и конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению, представляет собой рак. В некоторых вариантах осуществления рак характеризуется наличием клеток, экспрессирующих CCR7, с которыми связываются антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления рак характеризуется повышением экспрессии CCR7 по сравнению с уровнем экспрессии у здорового пациента. В некоторых вариантах осуществления экспрессия CCR7 может быть измерена по повышению РНК CCR7. В других вариантах осуществления рак характеризуется повышением числа копий ДНК CCR7. Специалистам в данной обIn some embodiments, the disease being treated with antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), and antibody-drug conjugates of the present invention is cancer. In some embodiments, the cancer is characterized by the presence of CCR7-expressing cells to which antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), and antibody-drug conjugates of the present invention bind. In some embodiments, the implementation of the cancer is characterized by an increase in the expression of CCR7 compared to the level of expression in a healthy patient. In some embodiments, CCR7 expression can be measured by an increase in CCR7 RNA. In other embodiments, the cancer is characterized by an increase in the copy number of CCR7 DNA. Specialists in this field
- 72 042529 ласти техники известны другие способы измерения или определения уровней экспрессии CCR7. Примеры заболеваний, которые можно лечить и/или предупреждать, включают без ограничения, хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL), периферические Т-клеточные лимфомы (PTCL), такие как Т-клеточный лейкоз/лимфома взрослых (ATLL) и анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), неходжкинскую лимфому (NHL), такую как лимфома из клеток мантийной зоны (MCL), лимфома Беркитта и диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLBCL), карциному желудка, немелкоклеточный рак легкого, мелкоклеточный рак легкого, рак головы и шеи, носоглоточную карциному (NPC), рак пищевода, колоректальную карциному, рак поджелудочной железы, рак щитовидной железы, рак молочной железы, почечноклеточный рак и рак шейки матки.- 72 042529 other methods are known in the art for measuring or determining levels of CCR7 expression. Examples of diseases that can be treated and/or prevented include, without limitation, chronic lymphocytic leukemia (CLL), peripheral T-cell lymphomas (PTCLs) such as adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL), and anaplastic large cell lymphoma (ALCL) , non-Hodgkin's lymphoma (NHL) such as mantle cell lymphoma (MCL), Burkitt's lymphoma and diffuse large B cell lymphoma (DLBCL), gastric carcinoma, non-small cell lung cancer, small cell lung cancer, head and neck cancer, nasopharyngeal carcinoma (NPC ), esophageal cancer, colorectal carcinoma, pancreatic cancer, thyroid cancer, breast cancer, renal cell carcinoma, and cervical cancer.
В настоящем изобретении представлены способы лечения или предупреждения рака, предусматривающие введение терапевтически эффективного количества антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой солидный рак. В некоторых вариантах осуществления субъектом является человек. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой устойчивый рак и/или рецидивирующий рак. В определенных аспектах, например, устойчивый рак является устойчивым к ингибиторам тирозинкиназы, ингибиторам EGFR, ингибиторам Her2, ингибиторам Her3, ингибиторам IGFR и ингибиторам Met.The present invention provides methods for treating or preventing cancer comprising administering a therapeutically effective amount of antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or antibody-drug conjugates of the present invention. In some embodiments, the cancer is a solid cancer. In some embodiments, the subject is a human. In some embodiments, the cancer is resistant cancer and/or recurrent cancer. In certain aspects, for example, resistant cancer is resistant to tyrosine kinase inhibitors, EGFR inhibitors, Her2 inhibitors, Her3 inhibitors, IGFR inhibitors, and Met inhibitors.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены способы ингибирования роста опухоли, предусматривающие введение субъекту терапевтически эффективного количества антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления субъектом является человек. В некоторых вариантах осуществления субъект имеет опухоль или у него была удалена опухоль. В некоторых вариантах осуществления опухоль является устойчивой к другим ингибиторам тирозинкиназы, в том числе без ограничения к ингибиторам EGFR, ингибиторам Her2, ингибиторам Her3, ингибиторам IGFR и ингибиторам Met.In some embodiments, the present invention provides methods for inhibiting tumor growth, comprising administering to a subject a therapeutically effective amount of antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragments), or antibody-drug conjugates of the present invention. In some embodiments, the subject is a human. In some embodiments, the subject has a tumor or has had a tumor removed. In some embodiments, the tumor is resistant to other tyrosine kinase inhibitors, including, but not limited to, EGFR inhibitors, Her2 inhibitors, Her3 inhibitors, IGFR inhibitors, and Met inhibitors.
В некоторых вариантах осуществления опухоль экспрессирует CCR7, с которым связываются антитела к CCR7. В некоторых вариантах осуществления опухоль сверхэкспрессирует CCR7 человека. В некоторых вариантах осуществления опухоль характеризуется повышенным числом копий гена CCR7.In some embodiments, the tumor expresses CCR7, to which anti-CCR7 antibodies bind. In some embodiments, the tumor overexpresses human CCR7. In some embodiments, the tumor is characterized by an increased copy number of the CCR7 gene.
В настоящем изобретении также представлены способы отбора пациентов для лечения антителами, фрагментами антител (например, антигенсвязывающими фрагментами) или конъюгатами антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению, предусматривающие введение терапевтически эффективного количества указанных антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства. В определенных аспектах способ предусматривает отбор пациентов с раком, устойчивым к ингибиторам тирозинкиназы. В определенных аспектах предполагается, что рак, устойчивый к ингибиторам тирозинкиназы, является устойчивым к ингибиторам EGFR, ингибиторам Her2, ингибиторам Her3, ингибиторам IGFR и/или ингибиторам Met. В определенных аспектах предполагается, что устойчивый рак представляет собой рак, устойчивый к Her2. В определенных аспектах предполагается, что рак представляет собой de novo устойчивый рак, а в еще аспектах предполагается, что рак представляет собой рецидивирующий рак. В определенных аспектах настоящего изобретения способы предусматривают отбор пациента с de novo устойчивым или рецидивирующим раком и измерение экспрессии CCR7. Предполагается, что в определенных аспектах рецидивирующий рак или опухоль изначально не были раком или опухолью, экспрессирующими CCR7, но становятся CCR7 положительным раком, который представляет собой устойчивые к тирозинкиназе или рецидивирующие рак или опухоль, после лечения ингибиторами тирозинкиназы.The present invention also provides methods for selecting patients for treatment with antibodies, antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments), or antibody-drug conjugates of the present invention, comprising administering a therapeutically effective amount of said antibodies, antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments), or antibody conjugates, and medicinal product. In certain aspects, the method involves the selection of patients with cancer resistant to tyrosine kinase inhibitors. In certain aspects, tyrosine kinase inhibitor-resistant cancers are expected to be resistant to EGFR inhibitors, Her2 inhibitors, Her3 inhibitors, IGFR inhibitors, and/or Met inhibitors. In certain aspects, it is contemplated that resistant cancer is Her2 resistant cancer. In certain aspects, the cancer is assumed to be de novo resistant cancer, and in still other aspects, the cancer is assumed to be recurrent cancer. In certain aspects of the present invention, the methods involve selecting a patient with de novo resistant or recurrent cancer and measuring CCR7 expression. It is contemplated that, in certain aspects, the recurrent cancer or tumor was not originally a CCR7 expressing cancer or tumor, but becomes a CCR7 positive cancer, which is a tyrosine kinase resistant or recurrent cancer or tumor, following treatment with tyrosine kinase inhibitors.
В случае лечения или предупреждения заболеваний подходящая доза антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению зависит от различных факторов, таких как тип заболевания, подлежащего лечению, тяжесть и течение заболевания, ответная реакция заболевания, предыдущая терапия, клинический анамнез пациента и т.д. Антитело или средство могут вводиться один раз или на протяжении курса лечения, длящегося от нескольких дней до нескольких месяцев, или до осуществления излечения, или до достижения ослабления болезненного состояния (например, уменьшения размера опухоли). Оптимальные схемы приема можно рассчитать на основании измерений накопления лекарственного средства в организме пациента, и они будут варьироваться в зависимости от относительной активности индивидуальных антитела, фрагментов антитела (например, антигенсвязывающего фрагмента) или конъюгатов антитела и лекарственного средства. Лечащий врач может оценить частоту повторения введения дозы на основании измеренного времени удержания и концентраций лекарственного средства в физиологических жидкостях или тканях.In the case of treating or preventing diseases, the appropriate dose of antibodies, antibody fragments (e.g., antigen-binding fragments), or antibody-drug conjugates of the present invention depends on various factors such as the type of disease being treated, the severity and course of the disease, disease response, previous therapy, patient's clinical history, etc. The antibody or agent may be administered once, or over a course of treatment lasting from several days to several months, or until a cure is achieved, or until an amelioration of the disease state (eg, reduction in tumor size) is achieved. Optimal dosing regimens can be calculated based on measurements of drug accumulation in the patient's body and will vary depending on the relative activity of individual antibodies, antibody fragments (eg, antigen-binding fragment), or antibody-drug conjugates. The attending physician can estimate the frequency of repetition of the dose based on the measured retention time and concentrations of the drug in body fluids or tissues.
Комбинированная терапияCombination Therapy
В определенных случаях антитело, фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент) или конъюгат антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению объединяют с другими терапевтическими средствами, такими как другие противораковые средства, противоаллергические средства, средства против тошноты (или противорвотные средства), обезболивающие средства, цитопротекIn certain instances, the antibody, antibody fragment (e.g., antigen-binding fragment), or antibody-drug conjugate of the present invention is combined with other therapeutic agents, such as other anti-cancer agents, anti-allergic agents, anti-nausea (or anti-emetics), analgesics, a cytoprotector.
- 73 042529 торные средства и их комбинации.- 73 042529 Torque agents and their combinations.
В одном варианте осуществления антитело, фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент) или конъюгат антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению объединяют в фармацевтическом комбинированном составе со вторым соединением, характеризующимся противораковыми свойствами, или схема введения доз предусматривает комбинированную терапию с ним. Второе соединение фармацевтического комбинированного состава или схемы введения доз может характеризоваться видами активности, которые взаимно дополняют антитело или иммуноконъюгат из комбинации, вследствие чего они не оказывают неблагоприятного эффекта друг на друга. Например, антитело, фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент) или конъюгат антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению могут вводиться в комбинации без ограничения с химиотерапевтическим средством, ингибитором тирозинкиназы, ингибитором пути передачи нисходящего сигнала с участием CCR7, ингибиторами IAP, ингибиторами Bcl2, ингибиторами Mcl1 и другими ингибиторами CCR7.In one embodiment, an antibody, antibody fragment (e.g., antigen-binding fragment), or antibody-drug conjugate of the present invention is combined in a pharmaceutical combination formulation with a second compound having anti-cancer properties, or a dosing schedule provides for combination therapy with it. The second compound of a pharmaceutical combination formulation or dosing regimen may have activities that complement the antibody or immunoconjugate of the combination such that they do not adversely affect each other. For example, an antibody, antibody fragment (e.g., antigen-binding fragment), or antibody-drug conjugate of the present invention may be administered in combination with, without limitation, a chemotherapeutic agent, a tyrosine kinase inhibitor, an inhibitor of the CCR7 downstream signaling pathway, IAP inhibitors, Bcl2 inhibitors, Mcl1 and other CCR7 inhibitors.
Используемый в данном документе термин фармацевтическая комбинация относится либо к фиксированной комбинации в форме единицы дозирования, либо к нефиксированной комбинации или набору из частей для комбинированного введения, где два или более терапевтических средств могут вводиться независимо в одно и то же время или по отдельности в пределах временных интервалов, в частности, когда такие временные интервалы обеспечивают возможность демонстрации кооперативного, например синергетического, эффекта партнеров по комбинации.As used herein, the term pharmaceutical combination refers to either a fixed combination in the form of a dosage unit, or a non-fixed combination or set of parts for combined administration, where two or more therapeutic agents can be administered independently at the same time or separately within time limits. intervals, in particular when such time intervals allow the demonstration of a cooperative, for example synergistic, effect of the partners in the combination.
Термин комбинированная терапия относится к введению двух или более терапевтических средств для лечения или предупреждения терапевтического состояния или нарушения, описанного в настоящем изобретении. Такое введение охватывает совместное введение этих терапевтических средств практически одновременно, например, в одной капсуле, имеющей фиксированное отношение активных ингредиентов. В качестве альтернативы такое введение охватывает совместное введение в виде нескольких или отдельных контейнеров (например, капсулы, порошки и жидкости) для каждого активного ингредиента. Порошки и/или жидкости могут быть восстановлены или разбавлены до требуемой дозы перед введением. Кроме того, такое введение также охватывает применение каждого типа терапевтического средства последовательным образом, либо приблизительно в одно и то же время, либо в разное время. В любом случае схема лечения будет обеспечивать приносящие пользу эффекты комбинации лекарственных средств при лечении или предупреждении состояний или нарушений, описанных в данном документе.The term combination therapy refers to the administration of two or more therapeutic agents for the treatment or prevention of a therapeutic condition or disorder described in the present invention. Such administration encompasses the co-administration of these therapeutic agents substantially simultaneously, for example in a single capsule having a fixed ratio of active ingredients. Alternatively, such administration encompasses co-administration in multiple or separate containers (eg capsules, powders and liquids) for each active ingredient. Powders and/or liquids may be reconstituted or diluted to the desired dose prior to administration. In addition, such administration also encompasses the use of each type of therapeutic agent in a sequential manner, either at approximately the same time or at different times. In any event, the treatment regimen will provide the beneficial effects of the combination of drugs in the treatment or prevention of the conditions or disorders described herein.
Комбинированная терапия может обеспечивать синергию и оказаться синергетической, т.е. эффект, достигаемый, когда активные ингредиенты применяются вместе, превышает сумму эффектов, которые являются результатом применения соединений по отдельности. Синергетический эффект может быть достигнут, когда активные ингредиенты:Combination therapy can provide synergy and be synergistic, ie. the effect achieved when the active ingredients are applied together is greater than the sum of the effects that result from the use of the compounds alone. A synergistic effect can be achieved when the active ingredients:
(1) составлены вместе и вводятся или доставляются одновременно в виде комбинированного состава с однократной дозой;(1) formulated together and administered or delivered simultaneously as a combined single dose formulation;
(2) доставляются по очереди или параллельно как отдельные составы или (3) применяется какая-либо другая схема. При доставке в виде терапии с чередованием синергетический эффект может достигаться, когда соединения вводят или доставляют одно за другим, например, посредством различных инъекций в отдельных шприцах.(2) are delivered sequentially or in parallel as separate trains, or (3) some other scheme is used. When delivered as interleaved therapy, a synergistic effect can be achieved when the compounds are administered or delivered one after the other, for example by different injections in separate syringes.
В целом, во время терапии с чередованием эффективную дозу каждого активного ингредиента вводят одну за другой, т.е. сериями, в то время как при комбинированной терапии эффективную дозу двух или более активных ингредиентов вводят вместе.In general, during interleaved therapy, an effective dose of each active ingredient is administered one after the other, i. series, while in combination therapy, an effective dose of two or more active ingredients is administered together.
Распространенные химиотерапевтические средства, рассматриваемые для применения в видах комбинированной терапии, включают анастрозол (Arimidex®), бикалутамид (Casodex®), блеомицина сульфат (Blenoxane®), бусульфан (Myleran®), бусульфан в виде инъекции (Busulfex®), капецитабин (Xeloda®), N4-пентоксикарбонил-5-дезокси-5-фторцитидин, карбоплатин (Paraplatin®), кармустин (BiCNU®), хлорамбуцил (Leukeran®), цисплатин (Platinol®), кладрибин (Leustatin®), циклофосфамид (Cytoxan® или Neosar®), цитарабин, цитозина арабинозид (Cytosar-U®), цитарабин в виде липосомной инъекции (DepoCyt®), дакарбазин (DTIC-Dome®), дактиномицин (актиномицин D, Cosmegan), даунорубицина гидрохлорид (Cerubidine®), даунорубицина цитрат в виде липосомной инъекции (DaunoXome®), дексаметазон, доцетаксел (Taxotere®), доксорубицина гидрохлорид (Adriamycin®, Rubex®), этопозид (Vepesid®), флударабина фосфат (Fludara®), 5-фторурацил (Adrucil®, Efudex®), флутамид (Eulexin®), тезацитибин, гемцитабин (дифтордезоксицитидин), гидроксимочевину (Hydrea®), идарубицин (Idamycin®), ифосфамид (IFEX®), иринотекан (Camptosar®), L-аспарагиназу (ELSPAR®), лейковорин кальция, мелфалан (Alkeran®), 6-меркаптопурин (Purinethol®), метотрексат (Folex®), митоксантрон (Novantrone®), милотарг, паклитаксел (Taxol®), феникс (иттрий 90/MX-DTPA), пентостатин, полифероспан 20 с имплантатом кармустина (Gliadel®), тамоксифена цитрат (Nolvadex®), тенипозид (Vumon®), 6-тиогуанин, тиотепу, тирапазамин (Tirazone®), топотекана гидрохлорид для инъекции (Hycamptin®), винбластин (Velban®), винкристин (Oncovin®) и винорелбин (Navelbine®), a также пеметрексед.Common chemotherapy agents being considered for use in combination therapies include anastrozole (Arimidex®), bicalutamide (Casodex®), bleomycin sulfate (Blenoxane®), busulfan (Myleran®), busulfan injection (Busulfex®), capecitabine (Xeloda ®), N4-pentoxycarbonyl-5-deoxy-5-fluorocytidine, carboplatin (Paraplatin®), carmustine (BiCNU®), chlorambucil (Leukeran®), cisplatin (Platinol®), cladribine (Leustatin®), cyclophosphamide (Cytoxan® or Neosar®), Cytarabine, Cytosine Arabinoside (Cytosar-U®), Cytarabine Liposomal Injection (DepoCyt®), Dacarbazine (DTIC-Dome®), Dactinomycin (Actinomycin D, Cosmegan), Daunorubicin Hydrochloride (Cerubidine®), Daunorubicin Citrate liposomal injection (DaunoXome®), dexamethasone, docetaxel (Taxotere®), doxorubicin hydrochloride (Adriamycin®, Rubex®), etoposide (Vepesid®), fludarabine phosphate (Fludara®), 5-fluorouracil (Adrucil®, Efudex®) , flutamide (Eulexin®), tezacitibine, gemcitabine (difluorodeoxycytidine), hydroxy urea (Hydrea®), idarubicin (Idamycin®), ifosfamide (IFEX®), irinotecan (Camptosar®), L-asparaginase (ELSPAR®), calcium leucovorin, melphalan (Alkeran®), 6-mercaptopurine (Purinethol®), methotrexate (Folex®), mitoxantrone (Novantrone®), mylotarg, paclitaxel (Taxol®), phoenix (yttrium 90/MX-DTPA), pentostatin, polyferospan 20 with carmustine implant (Gliadel®), tamoxifen citrate (Nolvadex®), teniposide ( Vumon®), 6-thioguanine, thiotepa, tirapazamine (Tirazone®), topotecan hydrochloride injection (Hycamptin®), vinblastine (Velban®), vincristine (Oncovin®), and vinorelbine (Navelbine®), and pemetrexed.
В одном аспекте настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения ракаIn one aspect of the present invention, a method for treating or preventing cancer is provided.
- 74 042529 путем введения субъекту, нуждающемуся в этом, конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению в комбинации с одним или несколькими ингибиторами тирозинкиназы, в том числе без ограничения ингибиторами ВТК, ингибиторами EGFR, ингибиторами Her2, ингибиторами- 74 042529 by administering to a subject in need thereof an antibody-drug conjugate of the present invention in combination with one or more tyrosine kinase inhibitors, including but not limited to BTK inhibitors, EGFR inhibitors, Her2 inhibitors,
Her3, ингибиторами IGFR и ингибиторами Met.Her3, IGFR inhibitors and Met inhibitors.
Например, ингибиторы тирозинкиназы включают без ограничения ибрутиниб (PCI-32765); эрлотиниба гидрохлорид (Tarceva®); линифаниб Щ-[4-(3-амино-1Н-индазол-4-ил)фенил]-№-(2-фтор-5метилфенил)мочевина, также известный как АВТ 869, доступный от Genentech); сунитиниба малат (Sutent®); босутиниб (4-[(2,4-дихлор-5-метоксифенил)амино]-6-метокси-7-[3-(4-метилпиперазин-1ил)пропокси]хинолин-3-карбонитрил, также известный как SKI-606 и описанный в патенте США № 6780996); дазатиниб (Sprycel®); пазопаниб (Votrient®); сорафениб (Nexavar®); зактима (ZD6474) и иматиниб или иматиниба мезилат (Gilvec® и Gleevec®).For example, tyrosine kinase inhibitors include, without limitation, ibrutinib (PCI-32765); erlotinib hydrochloride (Tarceva®); linifanib N-[4-(3-amino-1H-indazol-4-yl)phenyl]-N-(2-fluoro-5methylphenyl)urea, also known as ABT 869, available from Genentech); sunitinib malate (Sutent®); bosutinib (4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile, also known as SKI-606 and described in US patent No. 6780996); dasatinib (Sprycel®); pazopanib (Votrient®); sorafenib (Nexavar®); zactima (ZD6474); and imatinib or imatinib mesylate (Gilvec® and Gleevec®).
Ингибиторы рецептора эпидермального фактора роста рецептор (EGFR) ингибиторы включают без ограничения, эрлотиниба гидрохлорид (Tarceva®), гефитиниб (Iressa®); Ν-[4-[(3-χλορ-4фторфенил)амино]-7-[[(3S)-тетрагидро-3-фуранил]окси]-6-хиназолинил]-4-(диметиламино)-2-бутенамид, Tovok®); вандетаниб (Caprelsa®); лапатиниб (Tykerb®); (3R,4R)-4-амино-1-((4-((3метоксифенил)амино)пирроло[2,1-1][1,2,4]триазин-5-ил)метил)пиперидин-3-ол (BMS690514); канертиниба дигидрохлорид (CI-1033); 6-[4-[(4-этил-1 -пиперазинил)метил]фенил] -N-[(1R)-1 -фенилэтил]-7Нпирроло[2,3-d]пиримидин-4-амин (АЕЕ788, CAS 497839-62-0); мубритиниб (ТАК165); пелитиниб (ЕКВ569); афатиниб (BIBW2992); нератиниб (HKI-272); N-[4-[[1-[(3-фторфенил)метил]-1н-индазол-5ил]амино]-5-метилпирроло[2,1-f][1,2,4]триазин-6-ил]карбаминовую кислоту, (3 S)-3-морфолинилметиловый сложный эфир (BMS599626); N-(3,4-дихлор-2-фторфенил)-6-метокси-7-[[(3аα,5β,6аα)октагидро-2-метилциклопента[с]пиррол-5-ил]метокси]-4-хиназолинамин (XL647, CAS 781613-23-8) и 4[4-[[(1R)-1-фенилэтил]амино]-7Н-пирроло[2,3-d]пиримидин-6-ил]фенол (PKI166, CAS 187724-61-4).Epidermal growth factor receptor receptor (EGFR) inhibitors include, without limitation, erlotinib hydrochloride (Tarceva®), gefitinib (Iressa®); Ν-[4-[(3-χλορ-4fluorophenyl)amino]-7-[[(3S)-tetrahydro-3-furanyl]oxy]-6-quinazolinyl]-4-(dimethylamino)-2-butenamide, Tovok® ); vandetanib (Caprelsa®); lapatinib (Tykerb®); (3R,4R)-4-amino-1-((4-((3methoxyphenyl)amino)pyrrolo[2,1-1][1,2,4]triazin-5-yl)methyl)piperidin-3-ol (BMS690514); canertinib dihydrochloride (CI-1033); 6-[4-[(4-Ethyl-1-piperazinyl)methyl]phenyl]-N-[(1R)-1-phenylethyl]-7Hpyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine (AEE788, CAS 497839 -62-0); mubritinib (TAK165); pelitinib (EKV569); afatinib (BIBW2992); neratinib (HKI-272); N-[4-[[1-[(3-fluorophenyl)methyl]-1n-indazol-5yl]amino]-5-methylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-6-yl] carbamic acid, (3S)-3-morpholinylmethyl ester (BMS599626); N-(3,4-dichloro-2-fluorophenyl)-6-methoxy-7-[[(3aα,5β,6aα)octahydro-2-methylcyclopenta[c]pyrrol-5-yl]methoxy]-4-quinazolinamine ( XL647, CAS 781613-23-8) and 4[4-[[(1R)-1-phenylethyl]amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl]phenol (PKI166, CAS 187724- 61-4).
Антитела, связывающие EGFR, включают без ограничения, цетуксимаб (Erbitux®); панитумумаб (Vectibix®); матузумаб (EMD-72000); нимотузумаб (hR3); залутумумаб; TheraCIM h-R3; MDX0447 (CAS 339151-96-1) и ch806 (mAb-806, CAS 946414-09-1).Antibodies that bind EGFR include, without limitation, cetuximab (Erbitux®); panitumumab (Vectibix®); matuzumab (EMD-72000); nimotuzumab (hR3); zalutumumab; TheraCIM h-R3; MDX0447 (CAS 339151-96-1) and ch806 (mAb-806, CAS 946414-09-1).
Ингибиторы рецептора эпидермального фактора роста 2 (рецептора Her2) человека (также известного как Neu, ErbB-2, CD340 или р185) включают без ограничения трастузумаб (Herceptin®); пертузумаб (Omnitarg®); трастузумаб эмтанзин (Kadcyla®); нератиниб (HKI-272, (2E)-N-[4-[[3-хлор-4-[(пиридин-2ил)метокси]фенил]амино]-3-циано-7-этоксихинолин-6-ил]-4-(диметиламино)бут-2-енамид и описанный в РСТ-публикации № WO 05/028443); лапатиниб или лапатиниба дитозилат (Tykerb®); (3R,4R)-4-амино-1((4-((3-метоксифенил)амино)пирроло[2,1-1][1,2,4]триазин-5-ил)метил)пиперидин-3-ол (BMS690514); (2E)-N-[4-[(3-хлор-4-фторфенил)амино]-7-[[(3S)-тетрагидро-3-фуранил]окси]-6-хиназолинил]-4-(диметиламино)-2-бутенамид (BIBW-2992, CAS 850140-72-6); N-[4-[[1-[(3-фторфенил)метил]-1Н-индазол-5ил]амино]-5-метилпирроло[2,1-f][1,2,4]триазин-6-ил]карбаминовую кислоту, (3 S)-3-морфолинилметиловый сложный эфир (BMS 599626, CAS 714971-09-2); канертиниба дигидрохлорид (PD183805 или CI-1033) и N-(3,4-дихлор-2-фторфенил)-6-метокси-7-[[(3аα,5β,6аα)октагидро-2-метилциклопента[с]пиррол-5-ил]метокси]-4-хиназолинамин (XL647, CAS 781613-23-8).Human epidermal growth factor 2 receptor (Her2 receptor) inhibitors (also known as Neu, ErbB-2, CD340, or p185) include, but are not limited to, trastuzumab (Herceptin®); pertuzumab (Omnitarg®); trastuzumab emtansine (Kadcyla®); neratinib (HKI-272, (2E)-N-[4-[[3-chloro-4-[(pyridin-2yl)methoxy]phenyl]amino]-3-cyano-7-ethoxyquinolin-6-yl]-4 -(dimethylamino)but-2-enamide and described in PCT Publication No. WO 05/028443); lapatinib or lapatinib ditosylate (Tykerb®); (3R,4R)-4-amino-1((4-((3-methoxyphenyl)amino)pyrrolo[2,1-1][1,2,4]triazin-5-yl)methyl)piperidin-3- ol (BMS690514); (2E)-N-[4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-[[(3S)-tetrahydro-3-furanyl]oxy]-6-quinazolinyl]-4-(dimethylamino)- 2-butenamide (BIBW-2992, CAS 850140-72-6); N-[4-[[1-[(3-fluorophenyl)methyl]-1H-indazol-5yl]amino]-5-methylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-6-yl] carbamic acid, (3S)-3-morpholinylmethyl ester (BMS 599626, CAS 714971-09-2); canertinib dihydrochloride (PD183805 or CI-1033) and N-(3,4-dichloro-2-fluorophenyl)-6-methoxy-7-[[(3aα,5β,6aα)octahydro-2-methylcyclopenta[c]pyrrole-5 -yl]methoxy]-4-quinazolinamine (XL647, CAS 781613-23-8).
Ингибиторы Her3 включают без ограничения LJM716, ММ-121, AMG-888, RG7116, REGN-1400, AV-203, MP-RM-1, ММ-111 и MEHD-7945A.Her3 inhibitors include, without limitation, LJM716, MM-121, AMG-888, RG7116, REGN-1400, AV-203, MP-RM-1, MM-111, and MEHD-7945A.
Ингибиторы Met включают без ограничения кабозатиниб (XL184, CAS 849217-68-1); форетиниб (GSK1363089, ранее XL880, CAS 849217-64-7); тивантиниб (ARQ197, CAS 1000873-98-2); 1-(2-гидрокси2-метилпропил)-N-(5-(7-метоксихинолин-4-илокси)пиридин-2-ил)-5-метил-3-оксо-2-фенил-2,3-дигидро1Н-пиразол-4-карбоксамид (AMG 458); кризотиниб (Xalkori®, PF-02341066); (3Z)-5-(2,3-дигидро-1Ниндол-1 -илсульфонил)-3-({3,5-диметил-4-[(4-метилпиперазин-1 -ил)карбонил] - 1Н-пиррол-2-ил} метилен)1,3-дигидро-2Н-индол-2-он (SU11271); (3Z)-N-(3-хлорфенил)-3-({3,5-диметил-4-[(4-метилпиперазин-1ил)карбонил]-1Н-пиррол-2-ил}метилен)-N-метил-2-оксоиндолин-5-сульфонамид (SU11274); (3Z)-N-(3хлорфенил)-3-{[3,5-диметил-4-(3-морфолин-4-илпропил)-1Н-пиррол-2-ил]метилен}-N-метил-2-оксоиндолин-5-сульфонамид (SU11606); 6-[дифтор[6-(1-метил-1Н-пиразол-4-ил)-1,2,4-триазоло[4,3-b]пиридазин-3-ил]метил]хинолин (JNJ38877605, CAS 943540-75-8); 2-[4-[1-(хинолин-6-илметил)-1Н-Met inhibitors include, but are not limited to, cabozatinib (XL184, CAS 849217-68-1); foretinib (GSK1363089, formerly XL880, CAS 849217-64-7); tivantinib (ARQ197, CAS 1000873-98-2); 1-(2-hydroxy2-methylpropyl)-N-(5-(7-methoxyquinolin-4-yloxy)pyridin-2-yl)-5-methyl-3-oxo-2-phenyl-2,3-dihydro1H-pyrazole -4-carboxamide (AMG 458); crizotinib (Xalkori®, PF-02341066); (3Z)-5-(2,3-dihydro-1Nindol-1-ylsulfonyl)-3-({3,5-dimethyl-4-[(4-methylpiperazin-1 -yl)carbonyl] - 1H-pyrrole-2 -yl}methylene)1,3-dihydro-2H-indol-2-one (SU11271); (3Z)-N-(3-chlorophenyl)-3-({3,5-dimethyl-4-[(4-methylpiperazin-1yl)carbonyl]-1H-pyrrol-2-yl}methylene)-N-methyl- 2-oxoindoline-5-sulfonamide (SU11274); (3Z)-N-(3chlorophenyl)-3-{[3,5-dimethyl-4-(3-morpholin-4-ylpropyl)-1H-pyrrol-2-yl]methylene}-N-methyl-2-oxoindoline -5-sulfonamide (SU11606); 6-[difluoro[6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1,2,4-triazolo[4,3-b]pyridazin-3-yl]methyl]quinoline (JNJ38877605, CAS 943540- 75-8); 2-[4-[1-(quinolin-6-ylmethyl)-1H-
[1,2,3]триазоло[4,5-b]пиразин-6-ил]-1Н-пиразол-1-ил]этанол (PF04217903, CaS 956905-27-4); N-((2R)1,4-диоксан-2-илметил)-N-метил-N'-[3-(1-метил-1Н-пиразол-4-ил)-5-оксо-5Н-бензо[4,5]циклогепта[1,2b]пиридин-7-ил]сульфамид (МК2461, CAS 917879-39-1); 6-[[6-(1-метил-1Н-пиразол-4-ил)-1,2,4- триазоло[4,3-b]пиридазин-3-ил]тио]хинолин (SGX523, CAS 1022150-57-7) и (3Z)-5-[[(2,6-дихлорфенил)метил]сульфонил]-3-[[3,5-диметил-4-[[(2R)-2-(1-пирролидинилметил)-1-пирролидинил]карбонил]1Н-пиррол-2-ил]метилен]-1,3-дигидро-2Н-индол-2-он (РНА665752, CAS 477575-56-7).[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyrazin-6-yl]-1H-pyrazol-1-yl]ethanol (PF04217903, CaS 956905-27-4); N-((2R)1,4-dioxan-2-ylmethyl)-N-methyl-N'-[3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-5-oxo-5H-benzo[4 ,5]cyclohepta[1,2b]pyridin-7-yl]sulfamide (MK2461, CAS 917879-39-1); 6-[[6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1,2,4-triazolo[4,3-b]pyridazin-3-yl]thio]quinoline (SGX523, CAS 1022150-57 -7) and (3Z)-5-[[(2,6-dichlorophenyl)methyl]sulfonyl]-3-[[3,5-dimethyl-4-[[(2R)-2-(1-pyrrolidinylmethyl)- 1-pyrrolidinyl]carbonyl]1H-pyrrol-2-yl]methylene]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one (PHA665752, CAS 477575-56-7).
Ингибиторы IGF1R включают без ограничения, BMS-754807, XL-228, OSI-906, GSK0904529A, А928605, AXL1717, KW-2450, MK0646, AMG479, IMCA12, MEDI-573 и BI836845. Обзор см., например, в Yee, JNCI, 104; 975 (2012).IGF1R inhibitors include, without limitation, BMS-754807, XL-228, OSI-906, GSK0904529A, A928605, AXL1717, KW-2450, MK0646, AMG479, IMCA12, MEDI-573 and BI836845. For a review, see, for example, Yee, JNCI, 104; 975 (2012).
В другом аспекте настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения рака путем введения субъекту, нуждающемуся в этом, конъюгата антитела и лекарственного средства по на- 75 042529 стоящему изобретению в комбинации с одним или несколькими ингибиторами пути передачи нисходящего сигнала с участием CCR7, в том числе без ограничения ингибиторами β-аррестина, ингибиторамиIn another aspect, the present invention provides a method of treating or preventing cancer by administering to a subject in need thereof an antibody drug conjugate of the present invention in combination with one or more CCR7 downstream signaling pathway inhibitors, including without restrictions to β-arrestin inhibitors, inhibitors
GRK, ингибиторами МАРК, ингибиторами PI3K, ингибиторами JAK и т.д.GRK, MAPK inhibitors, PI3K inhibitors, JAK inhibitors, etc.
Например, ингибиторы фосфоинозитид 3-киназы (PI3K) включают без ограничения иделалисиб (Zydelig, GS-1101, Cal-101), 4-[2-(1Н-индазол-4-ил)-6-[[4-(метилсульфонил)пиперазин-1-ил]метил]тиено[3,2-d]пиримидин-4-ил]морфолин (также известный как GDC 0941 и описанный в РСТ-публикациях №№ WO 09/036082 и WO 09/055730); 2-метил-2-[4-[3-метил-2-оксо-8-(хинолин-3-ил)-2,3-дигидроимидазо[4,5-с]хинолин-1-ил]фенил]пропионитрил (также известный как BEZ 235 или NVP-BEZ 235 и описанный в РСТ-публикации № WO 06/122806); 4-(трифторметил)-5-(2,6-диморфолинопиримидин-4ил)пиридин-2-амин (также известный как ВКМ120 или NVP-BKM120 и описанный в РСТ-публикации № WO2007/084786); тозасертиб (VX680 или МК-0457, CAS 639089-54-6); (5Z)-5-[[4-(4-пиридинил)-6хинолинил]метилен]-2,4-тиазолидиндион (GSK1059615, CAS 958852-01-2); (1E,4S,4aR,5R,6aS,9aR)-5(ацетилокси)-1-[(ди-2-пропениламино)метилен]-4,4а,5,6,6а,8,9,9а-октагидро-11-гидрокси-4-(метоксиметил)-4а,6а-диметилциклопента[5,6]нафто[1,2-c]пиран-2,7,10(1Н)-трион (РХ866, CAS 502632-66-8) и 8фенил-2-(морфолин-4-ил)-хромен-4-он (LY294002, CAS 154447-36-6).For example, phosphoinositide 3-kinase (PI3K) inhibitors include, but are not limited to, idelalisib (Zydelig, GS-1101, Cal-101), 4-[2-(1H-indazol-4-yl)-6-[[4-(methylsulfonyl) piperazin-1-yl]methyl]thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl]morpholine (also known as GDC 0941 and described in PCT Publication Nos. WO 09/036082 and WO 09/055730); 2-methyl-2-[4-[3-methyl-2-oxo-8-(quinolin-3-yl)-2,3-dihydroimidazo[4,5-c]quinolin-1-yl]phenyl]propionitrile ( also known as BEZ 235 or NVP-BEZ 235 and described in PCT Publication No. WO 06/122806); 4-(trifluoromethyl)-5-(2,6-dimorpholinopyrimidin-4yl)pyridine-2-amine (also known as VKM120 or NVP-BKM120 and described in PCT Publication No. WO2007/084786); tosacertib (VX680 or MK-0457, CAS 639089-54-6); (5Z)-5-[[4-(4-pyridinyl)-6quinolinyl]methylene]-2,4-thiazolidinedione (GSK1059615, CAS 958852-01-2); (1E,4S,4aR,5R,6aS,9aR)-5(acetyloxy)-1-[(di-2-propenylamino)methylene]-4,4a,5,6,6a,8,9,9a-octahydro- 11-hydroxy-4-(methoxymethyl)-4a,6a-dimethylcyclopenta[5,6]naphtho[1,2-c]pyran-2,7,10(1H)-trione (РХ866, CAS 502632-66-8) and 8-phenyl-2-(morpholin-4-yl)-chromen-4-one (LY294002, CAS 154447-36-6).
В еще одном аспекте настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения рака путем введения субъекту, нуждающемуся в этом, конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению в комбинации с одним или несколькими проапоптотическими средствами, в том числе без ограничения ингибиторами IAP, ингибиторами Bcl2, ингибиторами MCl1, средствами Trail, ингибиторами Chk.In another aspect, the present invention provides a method of treating or preventing cancer by administering to a subject in need thereof an antibody drug conjugate of the present invention in combination with one or more pro-apoptotic agents, including but not limited to IAP inhibitors, Bcl2 inhibitors, MCl1 inhibitors. , Trail means, Chk inhibitors.
Например, ингибиторы IAP включают без ограничения LCL161, GDC-0917, AEG-35156, AT406 и TL32711. Другие примеры ингибиторов IAP включают без ограничения раскрытые в WO 04/005284, WO 04/007529, WO 05/097791, WO 05/069894, WO 05/069888, WO 05/094818, US2006/0014700, US2006/0025347, WO 06/069063, WO 06/010118, WO 06/017295 и WO08/134679, все из которых включены в данный документ посредством ссылки.For example, IAP inhibitors include, without limitation, LCL161, GDC-0917, AEG-35156, AT406, and TL32711. Other examples of IAP inhibitors include, without limitation, those disclosed in WO 04/005284, WO 04/007529, WO 05/097791, WO 05/069894, WO 05/069888, WO 05/094818, US2006/0014700, US2006/0025347, WO 06/ 069063, WO 06/010118, WO 06/017295 and WO08/134679, all of which are incorporated herein by reference.
Ингибиторы BCL-2 включают без ограничения венетоклакс (также известный как GDC-0199, ABT199, RG7601); 4-[4-[[2-(4-хлорфенил)-5,5-диметил-1-циклогексен-1-ил]метил]-1-пиперазинил]-N-[[4[[(1R)-3-(4-морфолинил)-1-[(фенилтио)метил]пропил]амино]-3-[(трифторметил)сульфонил]фенил]сульфонил]бензамид (также известный как АВТ-263 и описанный в РСТ-публикации № WO 09/155386); тетрокарцин А; антимицин; госсипол ((-)BL-193); обатоклакс; этил-2-амино-6-циклопентил-4-(1-циано-2этокси-2-оксоэтил)-4Н-хромон-3-карбоксилат (НА14-1); облимерсен (G3139, Genasense®); пептид Bak BH3; (-)-госсипол-уксусную кислоту (АТ-101); 4-[4-[(4'-хлор[1,1'-бифенил]-2-ил)метил]-1-пиперазинил]N-[[4-[[(1R)-3-(диметиламино)-1-[(фенилтио)метил]пропил]амино]-3-нитрофенил]сульфонил]бензамид (АВТ-737, CAS 852808-04-9) и навитоклакс (АВТ-263, CAS 923564-51-6).BCL-2 inhibitors include, without limitation, venetoclax (also known as GDC-0199, ABT199, RG7601); 4-[4-[[2-(4-chlorophenyl)-5,5-dimethyl-1-cyclohexen-1-yl]methyl]-1-piperazinyl]-N-[[4[[(1R)-3- (4-morpholinyl)-1-[(phenylthio)methyl]propyl]amino]-3-[(trifluoromethyl)sulfonyl]phenyl]sulfonyl]benzamide (also known as ABT-263 and described in PCT Publication No. WO 09/155386 ); tetracarcin A; antimycin; gossypol ((-)BL-193); obatoclax; ethyl 2-amino-6-cyclopentyl-4-(1-cyano-2ethoxy-2-oxoethyl)-4H-chromone-3-carboxylate (HA14-1); oblimersen (G3139, Genasense®); Bak BH3 peptide; (-)-gossypol-acetic acid (AT-101); 4-[4-[(4'-Chloro[1,1'-biphenyl]-2-yl)methyl]-1-piperazinyl]N-[[4-[[(1R)-3-(dimethylamino)-1 -[(phenylthio)methyl]propyl]amino]-3-nitrophenyl]sulfonyl]benzamide (ABT-737, CAS 852808-04-9) and navitoclax (ABT-263, CAS 923564-51-6).
Агонисты проапоптических рецепторов (PARA), в том числе DR4 (TRAILR1) и DR5 (TRAILR2), включают без ограничения дуланермин (AMG-951, RhApo2L/TRAIL); мапатумумаб (HRS-ETR1, CAS 658052-09-6); лексатумумаб (HGS-ETR2, CAS 845816-02-6); апомаб (Apomab®); конатумумаб (AMG655, CAS 896731-82-1) и тигатузумаб (CS1008, CAS 946415-34-5, доступен от Daiichi Sankyo).Pro-apoptotic receptor (PARA) agonists, including DR4 (TRAILR1) and DR5 (TRAILR2), include, but are not limited to, dulanermin (AMG-951, RhApo2L/TRAIL); mapatumumab (HRS-ETR1, CAS 658052-09-6); lexatumumab (HGS-ETR2, CAS 845816-02-6); apomab (Apomab®); conatumumab (AMG655, CAS 896731-82-1) and tigatuzumab (CS1008, CAS 946415-34-5, available from Daiichi Sankyo).
Ингибиторы киназы контрольных точек (СНК) включают без ограничения 7-гидроксистауроспорин (UCN-01); 6-бром-3-(1-метил-1Н-пиразол-4-ил)-5-(3R)-3-пиперидинил-пиразоло[1,5-а]пиримидин-7-амин (SCH900776, CAS 891494-63-6); 5-(3-фторфенил)-3-уреидотиофен-2-карбоновой кислоты N-[(S)пиперидин-3-ил]амид (AZD7762, CAS 8 60352-01-8); 4-[((3S)-1-азабицикло[2.2.2]окт-3-ил)амино]-3-(1Нбензимидазол-2-ил)-6-хлорхинолин-2(1Н)-он (CHIR 124, CAS 405168-58-3); 7-аминодактиномицин (7AAD), изогранулатимид, дебромгимениалдизин; N-[5-бром-4-метил-2-[(2S)-2-морфолинилметокси]фенил]-№-(5-метил-2-пиразинил)мочевину (LY2603618, CaS 911222-45-2); сульфорафан (CAS 4478-937,4-метилсульфинилбутилизотиоцианат); 9,10,11,12-тетрагидро-9,12-эпокси-1 Н-дииндоло[1,2,3-fg:3',2',1 'kl]пирроло[3,4-i][1,6]бензодиазоцин-1,3(2Н)дион (SB-218078, CAS 135897-06-2) и TAT-S216A (YGRKKRRQRRRLYRSPAMPENL (SEQ ID NO: 629)), а также СВР501 ((d-Bpa)sws(d-Phe-F5)(d-Cha)rrrqrr).Checkpoint kinase (CNK) inhibitors include, without limitation, 7-hydroxystaurosporine (UCN-01); 6-bromo-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-5-(3R)-3-piperidinyl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-7-amine (SCH900776, CAS 891494-63 -6); 5-(3-fluorophenyl)-3-ureidothiophene-2-carboxylic acid N-[(S)piperidin-3-yl]amide (AZD7762, CAS 8 60352-01-8); 4-[((3S)-1-azabicyclo[2.2.2]oct-3-yl)amino]-3-(1Hbenzimidazol-2-yl)-6-chloroquinolin-2(1H)-one (CHIR 124, CAS 405168-58-3); 7-aminodactinomycin (7AAD), isogranululathymide, debromohymenialdizin; N-[5-bromo-4-methyl-2-[(2S)-2-morpholinylmethoxy]phenyl]-N-(5-methyl-2-pyrazinyl)urea (LY2603618, CaS 911222-45-2); sulforaphane (CAS 4478-937,4-methylsulfinyl butyl isothiocyanate); 9,10,11,12-tetrahydro-9,12-epoxy-1 H-diindolo[1,2,3-fg:3',2',1 'kl]pyrrolo[3,4-i][1, 6]benzodiazocin-1,3(2H)dione (SB-218078, CAS 135897-06-2) and TAT-S216A (YGRKKRRQRRRLYRSPAMPENL (SEQ ID NO: 629)), as well as CBP501 ((d-Bpa)sws(d -Phe-F5)(d-Cha)rrrqrr).
В дополнительном варианте осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения рака путем введения субъекту, нуждающемуся в этом, конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению в комбинации с одним или несколькими иммуномодуляторами (например, одним или несколькими из активатора костимулирующей молекулы или ингибитора молекулы иммунных контрольных точек).In a further embodiment, the present invention provides a method of treating or preventing cancer by administering to a subject in need thereof an antibody drug conjugate of the present invention in combination with one or more immunomodulators (e.g., one or more of a costimulatory molecule activator or an immune control molecule inhibitor). points).
В некоторых вариантах осуществления иммуномодулятор представляет собой активатор костимулирующей молекулы. В одном варианте осуществления агонист костимулирующей молекулы выбран из агониста (например, агонистического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, или растворимого слитого белка) ОХ40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1ВВ (CD137), GITR, CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3, STING или лиганда CD83.In some embodiments, the immunomodulator is a costimulatory molecule activator. In one embodiment, the costimulatory molecule agonist is selected from an agonist (e.g., agonist antibody or antigen-binding fragment thereof, or soluble fusion protein) OX40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278) , 4-1BB (CD137), GITR, CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3, STING or CD83 ligand.
В некоторых вариантах осуществления иммуномодулятор представляет собой ингибитор молекулы иммунных контрольных точек. В одном варианте осуществления иммуномодулятор представляет собойIn some embodiments, the immunomodulator is an inhibitor of an immune checkpoint molecule. In one embodiment, the immunomodulator is
- 76 042529 ингибитор PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2В4 и/или TGFR-бета. В одном варианте осуществления ингибитор молекулы иммунных контрольных точек ингибирует PD-1, PD-L1, LAG-3, TIM-3 или CTLA4 или любую их комбинацию. Термин ингибирование или ингибитор подразумевает снижение определенного параметра, например, активности данной молекулы, например, ингибитора контрольных точек. Например, данный термин подразумевает ингибирование активности, например, активности PD-1 или PD-L1, на по меньшей мере 5, 10, 20, 30, 40, 50% или больше. Таким образом, ингибирование не обязательно должно составлять 100%.- 76 042529 inhibitor of PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 and/or TGFR-beta. In one embodiment, the immune checkpoint molecule inhibitor inhibits PD-1, PD-L1, LAG-3, TIM-3, or CTLA4, or any combination thereof. The term "inhibition" or "inhibitor" refers to the reduction of a particular parameter, such as the activity of a given molecule, such as a checkpoint inhibitor. For example, the term refers to inhibition of an activity, eg, PD-1 or PD-L1 activity, by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% or more. Thus, inhibition need not be 100%.
Ингибирование ингибирующей молекулы может происходить на уровне ДНК, РНК или белка. В некоторых вариантах осуществления для подавления экспрессии ингибирующей молекулы может применяться ингибирующая нуклеиновая кислота (например, dsRNA, siRNA или shRNA). В других вариантах осуществления ингибитор ингибирующего сигнала представляет собой полипептид, например, растворимый лиганд (например, Ig, связывающий PD-1, или Ig, связывающий CTLA-4) или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ингибирующей молекулой; например, антитело или его фрагмент (также обозначаемые в данном документе как молекула антитела), которые связываются с PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2В4 и/или TGFR-бета или их комбинацией.Inhibition of an inhibitory molecule can occur at the DNA, RNA or protein level. In some embodiments, an inhibitory nucleic acid (eg, dsRNA, siRNA, or shRNA) may be used to suppress the expression of an inhibitory molecule. In other embodiments, the inhibitor of the inhibitory signal is a polypeptide, such as a soluble ligand (eg, an Ig that binds PD-1 or an Ig that binds CTLA-4) or an antibody or antigen-binding fragment thereof, that binds to an inhibitory molecule; for example, an antibody or fragment thereof (also referred to herein as an antibody molecule) that binds to PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, and /or TGFR-beta or a combination thereof.
В одном варианте осуществления молекула антитела представляет собой полное антитело или его фрагмент (например, Fab, F(ab')2, Fv или одноцепочечный Fv-фрагмент (scFv)). В других вариантах осуществления молекула антитела имеет константную область тяжелой цепи (Fc), выбранную, например, из константных областей тяжелой цепи IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD и IgE; в частности, выбранную, например, из константных областей тяжелой цепи IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, более конкретно, константной области тяжелой цепи IgG1 или IgG4 (например, IgG1 или IgG4 человека). В одном варианте осуществления константной область тяжелой цепи получена из IgG1 человека или IgG4 человека. В одном варианте осуществления константная область изменена, например, подвергнута мутации для модификации свойств молекулы антитела (например, повышения или снижения одного или нескольких из связывания с рецептором Fc, гликозилирования антител, числа цистеиновых остатков, функции эффекторных клеток или функции комплемента).In one embodiment, the antibody molecule is a complete antibody or fragment thereof (eg, Fab, F(ab') 2 , Fv, or single chain Fv fragment (scFv)). In other embodiments, the antibody molecule has a heavy chain constant region (Fc) selected from, for example, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD, and IgE heavy chain constant regions; in particular selected, for example, from IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4 heavy chain constant regions, more specifically IgG1 or IgG4 heavy chain constant region (eg human IgG1 or IgG4). In one embodiment, the heavy chain constant region is derived from human IgG1 or human IgG4. In one embodiment, the constant region is altered, such as mutated to modify properties of the antibody molecule (eg, increase or decrease one or more of Fc receptor binding, antibody glycosylation, cysteine residue number, effector cell function, or complement function).
В некоторых вариантах осуществления молекула антитела находится в форме биспецифической или полиспецифической молекулы антитела. В одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела характеризуется первой специфичностью связывания с PD-1 или PD-L1 и второй специфичностью связывания, например, второй специфичностью связывания с TIM-3, LAG-3 или PD-L2. В одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с PD-1 или PD-L1 и TIM-3. В другом варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с PD-1 или PD-L1 и LAG-3. В другом варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с PD-1 и PD-L1. В еще одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с PD-1 и PD-L2. В другом варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с TIM-3 и LAG-3. Любая комбинация вышеуказанных молекул может быть составлена в молекулу полиспецифического антитела, например, триспецифическое антитело, которое предусматривает первую специфичность связывания с PD-1 или PD-1, а также вторую и третью специфичности связывания с двумя или более из TIM-3, LAG-3 или PD-L2.In some embodiments, the antibody molecule is in the form of a bispecific or polyspecific antibody molecule. In one embodiment, the bispecific antibody molecule is characterized by a first binding specificity for PD-1 or PD-L1 and a second binding specificity, for example, a second binding specificity for TIM-3, LAG-3 or PD-L2. In one embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 or PD-L1 and TIM-3. In another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 or PD-L1 and LAG-3. In another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and PD-L1. In yet another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to PD-1 and PD-L2. In another embodiment, the bispecific antibody molecule binds to TIM-3 and LAG-3. Any combination of the above molecules can be formulated into a polyspecific antibody molecule, e.g., a trispecific antibody that provides a first binding specificity for PD-1 or PD-1, as well as a second and third binding specificity for two or more of TIM-3, LAG-3 or PD-L2.
В некоторых вариантах осуществления иммуномодулятор представляет собой ингибитор PD-1, например PD-1 человека. В другом варианте осуществления иммуномодулятор представляет собой ингибитор PD-L1, например PD-L1 человека. В одном варианте осуществления ингибитор PD-1 или PD-L1 представляет собой молекулу антитела к PD-1 или PD-L1. Ингибитор PD-1 или PD-L1 может вводиться отдельно или в комбинации с другими иммуномодуляторами, например, в комбинации с ингибитором LAG-3, TIM-3 или CTLA4. В иллюстративном варианте осуществления ингибитор PD-1 или PD-L1, например, молекулу антитела к PD-1 или PD-L1, вводят в комбинации с ингибитором LAG-3, например, молекулой антитела к LAG-3. В другом варианте осуществления ингибитор PD-1 или PD-L1, например, молекулу антитела к PD-1 или PD-L1, вводят в комбинации ингибитором TIM-3, например, молекулой антитела к TIM-3. В других вариантах осуществления ингибитор PD-1 или PD-L1, например, молекулу антитела к PD-1, вводят в комбинации с ингибитором LAG-3, например молекулой антитела к LAG-3, и ингибитором TIM-3, например, молекулой антитела к TIM-3. Другие комбинации иммуномодуляторов с ингибитором PD-1 (например, с одним или несколькими из PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2В4 и/или TGFR) также предусмотрены в пределах настоящего изобретения. Любая из молекул антитела, известная из уровня техники или раскрытая в данном документе, может использоваться в вышеуказанной комбинации ингибиторов молекулы контрольных точек.In some embodiments, the immunomodulator is a PD-1 inhibitor, such as human PD-1. In another embodiment, the immunomodulator is a PD-L1 inhibitor, such as human PD-L1. In one embodiment, the PD-1 or PD-L1 inhibitor is an anti-PD-1 or PD-L1 antibody molecule. The PD-1 or PD-L1 inhibitor may be administered alone or in combination with other immunomodulators, for example in combination with a LAG-3, TIM-3 or CTLA4 inhibitor. In an exemplary embodiment, a PD-1 or PD-L1 inhibitor, eg, an anti-PD-1 or PD-L1 antibody molecule, is administered in combination with a LAG-3 inhibitor, eg, an anti-LAG-3 antibody molecule. In another embodiment, a PD-1 or PD-L1 inhibitor, eg, an anti-PD-1 or PD-L1 antibody molecule, is administered in combination with a TIM-3 inhibitor, eg, an anti-TIM-3 antibody molecule. In other embodiments, a PD-1 or PD-L1 inhibitor, e.g., an anti-PD-1 antibody molecule, is administered in combination with a LAG-3 inhibitor, e.g., an anti-LAG-3 antibody molecule, and a TIM-3 inhibitor, e.g., an anti-LAG-3 antibody molecule. TIM-3. Other combinations of immunomodulators with a PD-1 inhibitor (eg, one or more of PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, and/or TGFR) are also contemplated within the scope of the present invention. Any of the antibody molecules known in the art or disclosed herein can be used in the above combination of checkpoint molecule inhibitors.
В одном варианте осуществления ингибитор PD-1 представляет собой антитело к PD-1, выбранное из ниволумаба, пембролизумаба или пидилизумаба. В некоторых вариантах осуществления антитело к PD-1 представляет собой ниволумаб. К альтернативным названиям ниволумаба относятся MDX-1106, MDX-1106-04, ONO-4538 или BMS-936558. В некоторых вариантах осуществления антитело к PD-1 представляет собой ниволумаб (регистрационный номер CAS: 946414-94-4). Ниволумаб представляет собой полностью человеческое моноклональное антитело IgG4, которое специфически блокирует PD1.In one embodiment, the PD-1 inhibitor is an anti-PD-1 antibody selected from nivolumab, pembrolizumab, or pidilizumab. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody is nivolumab. Alternative names for nivolumab include MDX-1106, MDX-1106-04, ONO-4538, or BMS-936558. In some embodiments, the anti-PD-1 antibody is nivolumab (CAS accession number: 946414-94-4). Nivolumab is a fully human IgG4 monoclonal antibody that specifically blocks PD1.
- 77 042529- 77 042529
Ниволумаб (клон 5С4) и другие человеческие моноклональные антитела, которые специфически связываются с PD1, раскрыты в патенте США № 8008449 и РСТ-публикации № WO 2006/121168.Nivolumab (clone 5C4) and other human monoclonal antibodies that specifically bind to PD1 are disclosed in US Pat. No. 8,008,449 and PCT Publication No. WO 2006/121168.
В других вариантах осуществления антитело к PD-1 представляет собой пембролизумаб. Пембролизумаб (торговое наименование KEYTRUDA, ранее ламбролизумаб, также известный как Merck 3745, МК-3475 или SCH-900475) представляет собой гуманизированное моноклональное антитело IgG4, которое связывается с PD1. Пембролизумаб раскрыт, например, в Hamid, О. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44, РСТ-публикации № WO 2009/114335 и патенте США № 8354509.In other embodiments, the anti-PD-1 antibody is pembrolizumab. Pembrolizumab (trade name KEYTRUDA, formerly lambrolizumab, also known as Merck 3745, MK-3475, or SCH-900475) is a humanized IgG4 monoclonal antibody that binds to PD1. Pembrolizumab is disclosed, for example, in Hamid, O. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44, PCT Publication No. WO 2009/114335 and US Patent No. 8354509.
В некоторых вариантах осуществления антитело к PD-1 представляет собой пидилизумаб. Пидилизумаб (СТ-011; Cure Tech) представляет собой гуманизированное моноклональное антитело IgG1k, которое связывается с PD1. Пидилизумаб и другие гуманизированные моноклональные антитела к PD-1 раскрыты в РСТ-публикации № WO 2009/101611. Другие антитела к PD1 раскрыты в патенте США № 8609089, публикации заявки на патент США № 2010028330 и/или публикации заявки на патент США № 20120114649.In some embodiments, the anti-PD-1 antibody is pidilizumab. Pidilizumab (CT-011; Cure Tech) is a humanized IgG1k monoclonal antibody that binds to PD1. Pidilizumab and other humanized anti-PD-1 monoclonal antibodies are disclosed in PCT Publication No. WO 2009/101611. Other anti-PD1 antibodies are disclosed in US Patent Publication No. 8609089, US Patent Application Publication No. 2010028330 and/or US Patent Application Publication No. 20120114649.
Другие антитела к PD1 включают AMP 514 (Amplimmune).Other anti-PD1 antibodies include AMP 514 (Amplimmune).
В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-1 представляет собой PDR001 или любое другое антитело к PD-1, раскрытое в WO 2015/112900.In some embodiments, the PD-1 inhibitor is PDR001 or any other anti-PD-1 antibody disclosed in WO 2015/112900.
В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-1 представляет собой иммуноадгезин (например, иммуноадгезин, содержащий внеклеточную или PD-1-связывающую часть PD-L1 или PD-L2, слитую с константной областью (например, областью Fc последовательности иммуноглобулина). В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-1 представляет собой АМР-224.In some embodiments, the PD-1 inhibitor is an immunoadhesin (e.g., an immunoadhesin comprising an extracellular or PD-1 binding portion of PD-L1 or PD-L2 fused to a constant region (e.g., the Fc region of an immunoglobulin sequence). In some embodiments, implementation the PD-1 inhibitor is AMP-224.
В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-L1 представляет собой антитело к PD-L1. В некоторых вариантах осуществления ингибитор на основе антитела к PD-L1 выбран из YW243.55.S70, MPDL3280A, MEDI-4736 или MDX-1105MSB-0010718C (также называемого А09-246-2), раскрытого, например, WO 2013/0179174, и имеет последовательность, раскрытую в данном документе (или последовательность практически идентичную или сходную с ней, например, последовательность, которая характеризуется по меньшей мере 85, 90, 95% или более высокой идентичностью с указанной последовательностью).In some embodiments, the PD-L1 inhibitor is an anti-PD-L1 antibody. In some embodiments, the anti-PD-L1 antibody inhibitor is selected from YW243.55.S70, MPDL3280A, MEDI-4736, or MDX-1105MSB-0010718C (also referred to as A09-246-2) disclosed in e.g. WO 2013/0179174, and has a sequence disclosed herein (or a sequence substantially identical or similar to it, for example, a sequence that has at least 85%, 90%, 95% or greater identity with the specified sequence).
В одном варианте осуществления ингибитор PD-L1 представляет собой MDX-1105. MDX-1105, также известный как BMS-936559, представляет собой антитело к PD-L1, описанное в РСТ-публикации № WO 2007/005874.In one embodiment, the PD-L1 inhibitor is MDX-1105. MDX-1105, also known as BMS-936559, is an anti-PD-L1 antibody described in PCT Publication No. WO 2007/005874.
В одном варианте осуществления ингибитор PD-L1 представляет собой YW243.55.S70. Антитело YW243.55.S70 представляет собой антитело к PD-L1, описанное в РСТ-публикации № WO 2010/077634 (последовательности вариабельных областей тяжелой и легкой цепей показаны под SEQ ID NO: 20 и 21, соответственно).In one embodiment, the PD-L1 inhibitor is YW243.55.S70. The YW243.55.S70 antibody is an anti-PD-L1 antibody described in PCT Publication No. WO 2010/077634 (the heavy and light chain variable region sequences are shown under SEQ ID NOs: 20 and 21, respectively).
В одном варианте осуществления ингибитор PD-L1 представляет собой MDPL3280A (Genentech/Roche). MDPL3280A представляет собой человеческое моноклональное антитело IgG1 с оптимизированной Fc, которое связывается с PD-L1. MDPL3280A и другие человеческие моноклональные антитела к PD-L1 раскрыты в патенте США № 7943743 и публикации заявки на патент США № 20120039906.In one embodiment, the PD-L1 inhibitor is MDPL3280A (Genentech/Roche). MDPL3280A is an Fc-optimized human IgG1 monoclonal antibody that binds to PD-L1. MDPL3280A and other human anti-PD-L1 monoclonal antibodies are disclosed in US Patent No. 7,943,743 and US Patent Application Publication No. 20120039906.
В других вариантах осуществления ингибитор PD-L2 представляет собой АМР-224. АМР-224 представляет собой растворимый рецептор на основе слитого белка PD-L2 и Fc, который блокирует взаимодействие между PD1 и В7-Н1 (B7-DCIg; Amplimmune; например, раскрытый в РСТ-публикациях №№ WO 2010/027827 и WO 2011/066342).In other embodiments, the PD-L2 inhibitor is AMP-224. AMP-224 is a soluble PD-L2-Fc fusion protein receptor that blocks the interaction between PD1 and B7-H1 (B7-DCIg; Amplimmune; e.g. disclosed in PCT Publication Nos. WO 2010/027827 and WO 2011/ 066342).
В одном варианте осуществления ингибитор LAG-3 представляет собой молекулу антитела к LAG3. В одном варианте осуществления ингибитор LAG-3 представляет собой BMS-986016.In one embodiment, the LAG-3 inhibitor is an anti-LAG3 antibody molecule. In one embodiment, the LAG-3 inhibitor is BMS-986016.
Фармацевтические композицииPharmaceutical compositions
Для получения фармацевтических или стерильных композиций, содержащих иммуноконъюгаты, иммуноконъюгаты по настоящему изобретению смешивают с фармацевтически приемлемым носителем или вспомогательным веществом. Композиции могут дополнительно содержать один или несколько других терапевтических средств, которые подходят для лечения или предупреждения рака, экспрессирующего CCR7 (в том числе без ограничения хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), периферических Т-клеточных лимфом (PTCL), таких как Т-клеточный лейкоз/лимфома взрослых (ATLL) и анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), неходжкинской лимфомы (NHL), такой как лимфома из клеток мантийной зоны (MCL), лимфома Беркитта и диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLBCL), карциномы желудка, немелкоклеточного рака легкого, мелкоклеточного рака легкого, рака головы и шеи, носоглоточной карциномы (NPC), рака пищевода, колоректальной карциномы, рака поджелудочной железы, рака щитовидной железы, рака молочной железы, почечноклеточного рака и рака шейки матки).To obtain pharmaceutical or sterile compositions containing immunoconjugates, the immunoconjugates of the present invention are mixed with a pharmaceutically acceptable carrier or excipient. The compositions may additionally contain one or more other therapeutic agents that are suitable for the treatment or prevention of cancer expressing CCR7 (including, without limitation, chronic lymphocytic leukemia (CLL), peripheral T-cell lymphomas (PTCL), such as T-cell leukemia/ adult lymphoma (ATLL) and anaplastic large cell lymphoma (ALCL), non-Hodgkin's lymphoma (NHL) such as mantle cell lymphoma (MCL), Burkitt's lymphoma and diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), gastric carcinomas, non-small cell lung cancer, small cell lung cancer, head and neck cancer, nasopharyngeal carcinoma (NPC), esophageal cancer, colorectal carcinoma, pancreatic cancer, thyroid cancer, breast cancer, renal cell carcinoma, and cervical cancer).
Составы терапевтических и диагностических средств могут быть получены путем смешивания с физиологически приемлемыми носителями, вспомогательными веществами или стабилизаторами в форме, например, лиофилизированных порошков, взвесей, водных растворов, лосьонов или суспензий (см., например, Hardman et al., Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, McGraw-Hill, New York, N.Y., 2001; Gennaro, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott, Williams, and Wilkins, New York, N.Y., 2000; Avis, et al. (eds.), Pharmaceutical Dosage Forms: Parenteral Medications, Mar- 78 042529 cel Dekker, NY, 1993; Lieberman, et al. (eds.), Pharmaceutical Dosage Forms: tablets, Marcel Dekker, NY,Therapeutic and diagnostic formulations can be prepared by mixing with physiologically acceptable carriers, excipients or stabilizers in the form of, for example, lyophilized powders, slurries, aqueous solutions, lotions or suspensions (see, for example, Hardman et al., Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, McGraw-Hill, New York, N.Y., 2001; Gennaro, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott, Williams, and Wilkins, New York, N.Y., 2000; Avis, et al. (eds.) , Pharmaceutical Dosage Forms: Parenteral Medications, Mar- 78 042529 cel Dekker, NY, 1993; Lieberman, et al.
1990; Lieberman, et al. (eds.) Pharmaceutical Dosage Forms: Disperse Systems, Marcel Dekker, NY, 1990;1990; Lieberman, et al. (eds.) Pharmaceutical Dosage Forms: Disperse Systems, Marcel Dekker, NY, 1990;
Weiner and Kotkoskie, Excipient Toxicity and Safety, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., 2000).Weiner and Kotkoskie, Excipient Toxicity and Safety, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., 2000).
Выбор схемы введения для терапевтического средства зависит от нескольких факторов, в том числе интенсивности метаболизма сыворотки или ткани для объекта, уровня симптомов, иммуногенности объекта и доступности клеток-мишеней в биологической матрице. В некоторых вариантах осуществления схема введения максимизирует количество терапевтического средства, доставляемого пациенту, в соответствии с приемлемым уровнем побочных эффектов. Соответственно, количество доставляемого биологического средства частично зависит от конкретного объекта и тяжести состояния, подлежащего лечению. Руководства по подбору подходящих доз антител, цитокинов и малых молекул являются доступными (см., например, Wawrzynczak, Antibody Therapy, Bios Scientific Pub. Ltd, Oxfordshire, UK, 1996; Kresina (ed.), Monoclonal Antibodies, Cytokines and Arthritis, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1991; Bach (ed.), Monoclonal Antibodies and Peptide Therapy in Autoimmune Diseases, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1993; Baert et al., New Engl. J. Med. 348:601-608, 2003; Milgrom et al., New Engl. J. Med. 341:1966-1973, 1999; Slamon et al., New Engl. J. Med. 344:783-792, 2001; Beniaminovitz et al., New Engl. J. Med. 342:613619, 2000; Ghosh et al., New Engl. J. Med. 348:24-32, 2003; Lipsky et al., New Engl. J. Med. 343:1594-1602, 2000).The choice of administration schedule for a therapeutic agent depends on several factors, including the rate of serum or tissue metabolism for the subject, the level of symptoms, the immunogenicity of the subject, and the availability of target cells in the biological matrix. In some embodiments, the administration schedule maximizes the amount of therapeutic agent delivered to the patient in accordance with an acceptable level of side effects. Accordingly, the amount of biological agent delivered depends in part on the particular subject and the severity of the condition being treated. Guidelines for selecting appropriate doses of antibodies, cytokines and small molecules are available (see e.g. Wawrzynczak, Antibody Therapy, Bios Scientific Pub. Ltd, Oxfordshire, UK, 1996; Kresina (ed.), Monoclonal Antibodies, Cytokines and Arthritis, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1991; Bach (ed.), Monoclonal Antibodies and Peptide Therapy in Autoimmune Diseases, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1993; Baert et al., New Engl. J. Med. 348:601- 608, 2003; Milgrom et al., New Engl. J. Med. 341:1966-1973, 1999; Slamon et al., New Engl. J. Med. 344:783-792, 2001; Beniaminovitz et al., New Engl. J. Med. 342:613619, 2000; Ghosh et al., New Engl. J. Med. 348:24-32, 2003; Lipsky et al., New Engl. J. Med. 343:1594-1602, 2000).
Определение подходящей дозы выполняет лечащий врач, например, с применением параметров или факторов, которые, как известно или ожидаемо из уровня техники, воздействуют на лечение или предупреждение или, как прогнозируют, воздействуют на лечение или предупреждение. Обычно начинают дозирование с количества, несколько меньшего, чем оптимальная доза, и после этого ее повышают небольшими шагами до тех пор, пока не достигается требуемый или оптимальный эффект по сравнению с любыми отрицательными побочными эффектами. Важные диагностические показатели включают, например, показатели, являющиеся симптомами воспаления, или уровень продуцируемых воспалительных цитокинов.Determination of an appropriate dose is performed by the attending physician, for example, using parameters or factors that are known or expected in the art to affect treatment or prevention or are predicted to affect treatment or prevention. Typically, dosing is started at a slightly less than optimal dose and thereafter increased in small increments until the desired or optimal effect is achieved in comparison to any negative side effects. Important diagnostic indicators include, for example, indicators that are symptoms of inflammation, or the level of inflammatory cytokines produced.
Фактические уровни дозы активных ингредиентов в фармацевтических композициях по настоящему изобретению могут варьироваться для того, чтобы получить количество активного ингредиента, которое является эффективным для достижения требуемого терапевтического ответа у конкретного пациента, эффективным в отношении композиции и способа введения, при этом не токсично для пациента. Выбранный уровень дозы будет зависеть от ряда фармакокинетических факторов, в том числе активности конкретных используемых композиций по настоящему изобретению или их сложного эфира, соли или амида, пути введения, времени введения, скорости выведения конкретного используемого соединения, длительности лечения, других лекарственных средств, соединений и/или материалов, применяемых в комбинации с конкретными используемыми композициями, возраста, пола, массы тела, состояния, общего состояния здоровья и анамнеза пациента, подлежащего лечению, и аналогичных факторов, известных в области техники медицины.Actual dosage levels of active ingredients in the pharmaceutical compositions of the present invention may vary in order to obtain an amount of the active ingredient that is effective to achieve the desired therapeutic response in a particular patient, effective with respect to the composition and route of administration, while not toxic to the patient. The selected dose level will depend on a number of pharmacokinetic factors, including the potency of the particular compositions of the present invention or ester, salt or amide thereof used, route of administration, time of administration, rate of elimination of the particular compound used, duration of treatment, other drugs, compounds and /or materials used in combination with the specific compositions used, age, sex, body weight, condition, general health and history of the patient to be treated, and similar factors known in the field of medical technology.
Композиции, содержащие антитела или их фрагменты по настоящему изобретению, могут вводиться в помощью непрерывной инфузии или с помощью доз с интервалами, составляющими, например, один день, одну неделю, или вводиться 1-7 раз в неделю, раз в две недели, раз в три недели, раз в четыре недели, раз в пять недель, раз в шесть недель, раз в семь недель или раз в восемь недель. Дозы могут вводиться внутривенно, подкожно, местно, перорально, назально, ректально, внутримышечно, внутрь мозга или посредством ингаляции. Специфический протокол введения доз является таким, который предусматривает максимальную дозу или частоту введения доз, позволяющие избежать значительных нежелательных побочных эффектов.Compositions containing antibodies or fragments of the present invention may be administered by continuous infusion or by doses at intervals of, for example, one day, one week, or administered 1-7 times a week, every two weeks, every three weeks, once every four weeks, once every five weeks, once every six weeks, once every seven weeks, or once every eight weeks. Doses may be administered intravenously, subcutaneously, topically, orally, nasally, rectally, intramuscularly, intracerebral, or by inhalation. A specific dosing protocol is one that provides for the maximum dose or frequency of dosing to avoid significant unwanted side effects.
Для иммуноконъюгатов по настоящему изобретению доза, вводимая пациенту, может составлять от 0,0001 до 100 мг/кг массы тела пациента. Доза может быть составлять от 0,0001 до 30 мг/кг, от 0,0001 до 20 мг/кг, от 0,0001 мг/кг и 10 мг/кг, от 0,0001 до 5 мг/кг, от 0,0001 до 2 мг/кг, от 0,0001 до 1 мг/кг, от 0,0001 до 0,75 мг/кг, от 0,0001 до 0,5 мг/кг, от 0,0001 до 0,25 мг/кг, от 0,0001 до 0,15 мг/кг, от 0,0001 до 0,10 мг/кг, от 0,001 до 0,5 мг/кг, от 0,01 до 0,25 мг/кг или от 0,01 до 0,10 мг/кг массы тела пациента. Доза антител или их фрагментов по настоящему изобретению может быть рассчитана с применением массы пациента в килограммах (кг), умноженной на подлежащую введению дозу в мг/кг.For the immunoconjugates of the present invention, the dose administered to a patient may be from 0.0001 to 100 mg/kg of the patient's body weight. The dose can be from 0.0001 to 30 mg/kg, from 0.0001 to 20 mg/kg, from 0.0001 mg/kg and 10 mg/kg, from 0.0001 to 5 mg/kg, from 0, 0001 to 2 mg/kg, 0.0001 to 1 mg/kg, 0.0001 to 0.75 mg/kg, 0.0001 to 0.5 mg/kg, 0.0001 to 0.25 mg /kg, 0.0001 to 0.15 mg/kg, 0.0001 to 0.10 mg/kg, 0.001 to 0.5 mg/kg, 0.01 to 0.25 mg/kg, or 0.01 to 0.10 mg/kg of the patient's body weight. The dose of antibodies or fragments thereof of the present invention can be calculated using the patient's weight in kilograms (kg) multiplied by the dose to be administered in mg/kg.
Дозы иммуноконъюгатов по настоящему изобретению могут быть повторными, а введения могут быть разделены менее чем 1 днем, по меньшей мере 1 днем, 2 днями, 3 днями, 5 днями, 10 днями, 15 днями, 30 днями, 45 днями, 2 месяцами, 75 днями, 3 месяцами, 4 месяцами, 5 месяцами или по меньшей мере 6 месяцами. В некоторых вариантах осуществления иммуноконъюгаты по настоящему изобретению можно давать два раза в неделю, раз в неделю, раз в две недели, раз в три недели, раз в четыре недели или менее часто. В конкретном варианте осуществления дозы иммуноконъюгатов по настоящему изобретению вводятся повторно через каждые 2 недели.Doses of the immunoconjugates of the present invention may be repeated and administrations may be separated by less than 1 day, at least 1 day, 2 days, 3 days, 5 days, 10 days, 15 days, 30 days, 45 days, 2 months, 75 days, 3 months, 4 months, 5 months, or at least 6 months. In some embodiments, the immunoconjugates of the present invention can be given twice a week, once a week, once every two weeks, once every three weeks, once every four weeks, or less frequently. In a specific embodiment, doses of the immunoconjugates of the present invention are administered again every 2 weeks.
Эффективное количество для конкретного пациента может варьироваться в зависимости от таких факторов, как подлежащее лечению состояние, общее состояние здоровья пациента, способ, путь и доза введения и тяжесть побочных эффектов (см., например, Maynard et al., A Handbook of SOPs for Good Clinical Practice, Interpharm Press, Boca Raton, Fla., 1996; Dent, Good Laboratory and Good Clinical Practice,The effective amount for a particular patient may vary depending on such factors as the condition being treated, the general health of the patient, the route, route and dose of administration, and the severity of side effects (see, for example, Maynard et al., A Handbook of SOPs for Good Clinical Practice, Interpharm Press, Boca Raton, Fla., 1996 Dent, Good Laboratory and Good Clinical Practice,
- 79 042529- 79 042529
Urch Publ., London, UK, 2001).Urch Publ., London, UK, 2001).
Путем введения может быть, например, местное нанесение или нанесение на кожу, инъекция или инфузия посредством подкожного, внутривенного, внутрибрюшинного, внутримозгового, внутримышечного, внутриглазного, внутриартериального, внутриспинномозгового, внутриочагового введения, или системы замедленного высвобождения или имплантат (см., например, Sidman et al., Biopolymers 22:547556, 1983; Langer et al., J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277, 1981; Langer, Chem. Tech. 12:98-105, 1982; Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:3688-3692, 1985; Hwang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:40304034, 1980; патенты США №№ 6350466 и 6316024). При необходимости композиция может также содержать солюбилизирующее средство и местный анестетик, такой как лидокаин, для облегчения боли в месте инъекции, или их оба. Кроме того, также можно использовать ингаляционное введение, например, за счет применения ингалятора или распылителя и состава со средством в виде аэрозоля. См., например, патенты США №№ 6019968, 5985320, 5985309, 5934272, 5874064, 5855913, 5290540 и 4880078; и публикации согласно РСТ №№ WO 92/19244, WO 97/32572, WO 97/44013, WO 98/31346 и WO 99/66903, каждый из которых включен в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.The route of administration may be, for example, topical or skin application, injection or infusion via subcutaneous, intravenous, intraperitoneal, intracerebral, intramuscular, intraocular, intraarterial, intraspinal, intralesional administration, or a sustained release system or implant (see e.g. Sidman et al., Biopolymers 22:547556, 1983; Langer et al., J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277, 1981; Langer, Chem. Tech. 12:98-105, 1982; Epstein et al. , Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:3688-3692, 1985; Hwang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:40304034, 1980; U.S. Patent Nos. 6,350,466 and 6,316,024). If necessary, the composition may also contain a solubilizing agent and a local anesthetic such as lidocaine to relieve pain at the injection site, or both. In addition, inhalation administration may also be used, for example by using an inhaler or nebulizer and formulation with an aerosol agent. See, for example, US Pat. Nos. 6,019,968; 5,985,320; 5,985,309; 5,934,272; and PCT Publication Nos. WO 92/19244, WO 97/32572, WO 97/44013, WO 98/31346 and WO 99/66903, each of which is incorporated herein by reference in its entirety.
Композицию по настоящему изобретению также вводят с помощью одного или нескольких путей введения с применением одного или нескольких из целого ряда способов, известных из уровня техники. Как будет понятно специалисту в данной области техники, путь и/или способ введения будут варьироваться в зависимости от необходимых результатов. Выбранные пути введения иммуноконъюгатов по настоящему изобретению включают внутривенный, внутримышечный, внутрикожный, внутрибрюшинный, подкожный пути введения, введение в спинной мозг или другие парентеральные пути введения, например, с помощью инъекции или инфузии. Парентеральное введение может представлять способы введения, отличные от энтерального и местного введения, обычно производимые с помощью инъекции, и оно охватывает без ограничения внутривенные, внутримышечные, внутриартериальные, интратекальные, внутрикапсульные, интраорбитальные, внутрисердечные, внутрикожные, внутрибрюшинные, транстрахеальные, подкожные, субкутикулярные, внутрисуставные, подкапсулярные, субарахноидальные, интраспинальные, эпидуральные и интрастернальные инъекцию и инфузию. В качестве альтернативы композицию по настоящему изобретению можно вводить посредством отличного от парентерального пути, такого как местный, эпидермальный пути введения или введение через слизистые оболочки, например, интраназально, перорально, вагинально, ректально, сублингвально или местно. В одном варианте осуществления иммуноконъюгаты по настоящему изобретению вводят с помощью инфузии. В другом варианте осуществления иммуноконъюгаты по настоящему изобретению вводят подкожно.The composition of the present invention is also administered via one or more routes of administration using one or more of a variety of methods known in the art. As will be appreciated by one of skill in the art, the route and/or mode of administration will vary depending on the desired results. Selected routes of administration of the immunoconjugates of the present invention include intravenous, intramuscular, intradermal, intraperitoneal, subcutaneous routes of administration, injection into the spinal cord or other parenteral routes of administration, for example, by injection or infusion. Parenteral administration may be modes of administration other than enteral and topical administration, generally by injection, and includes, without limitation, intravenous, intramuscular, intraarterial, intrathecal, intracapsular, intraorbital, intracardiac, intradermal, intraperitoneal, transtracheal, subcutaneous, subcuticular, intraarticular , subcapsular, subarachnoid, intraspinal, epidural and intrasternal injection and infusion. Alternatively, the composition of the present invention may be administered via a route other than the parenteral route, such as topical, epidermal, or transmucosal routes, eg, intranasally, orally, vaginally, rectally, sublingually, or topically. In one embodiment, the immunoconjugates of the present invention are administered by infusion. In another embodiment, the immunoconjugates of the present invention are administered subcutaneously.
Если иммуноконъюгаты по настоящему изобретению вводятся в системе контролируемого высвобождения или замедленного высвобождения, для осуществления контролируемого или замедленного высвобождения может применяться насос (см. Langer, выше; Sefton, CRC Crit. Ref Biomed. Eng. 14:20, 1987; Buchwald et al., Surgery 88:507, 1980; Saudek et al., N. Engl. J. Med. 321:574, 1989). Для осуществления контролируемого или замедленного высвобождения видов терапии по настоящему изобретению могут применяться полимерные материалы (см., например, Medical Applications of Controlled Release, Langer and Wise (eds.), CRC Pres., Boca Raton, Fla., 1974; Controlled Drug Bioavailability, Drug Product Design and Performance, Smolen and Ball (eds.), Wiley, New York, 1984; Ranger and Peppas, J. Macromol. Sci. Rev. Macromol. Chem. 23:61, 1983; см. также Levy et al., Science 228:190, 1985; During et al., Ann. Neurol. 25:351, 1989; Howard et al., J. Neurosurg. 71:105, 1989; патент США № 5679377; патент США № 5916597; патент США № 5912015; патент США № 5989463; патент США № 5128326; РСТ-публикацию № WO 99/15154 и РСТ-публикацию № WO 99/20253. Примеры полимеров, используемых в составах с замедленным высвобождением, включают без ограничения поли(2-гидроксиэтилметакрилат), поли(метилметакрилат), поли(акриловую кислоту), сополимер(этилена и винилацетата), поли(метакриловую кислоту), полигликолиды (PLG), полиангидриды, поли(N-винилпирролидон), поли(виниловый спирт), полиакриламид, поли(этиленгликоль), полилактиды (PLA), сополимеры(лактида и гликолидов) (PLGA) и сложные полиортоэфиры. В одном варианте осуществления полимер, используемый в составе с замедленным высвобождением, является инертным, не содержит выщелачиваемых примесей, стабильный при хранении, стерильный и биологически разлагаемый. Систему контролируемого или замедленного высвобождения можно поместить вблизи профилактической или терапевтической мишени, при этом требуется только часть системной дозы (см., например, Goodson, в Medical Applications of Controlled Release, выше, vol. 2, pp. 115-138, 1984).If the immunoconjugates of the present invention are administered in a controlled release or sustained release system, a pump may be used to effect the controlled or sustained release (see Langer, supra; Sefton, CRC Crit. Ref Biomed. Eng. 14:20, 1987; Buchwald et al. , Surgery 88:507, 1980; Saudek et al., N. Engl. J. Med. 321:574, 1989). Polymeric materials can be used to effect controlled or sustained release therapies of the present invention (see, for example, Medical Applications of Controlled Release, Langer and Wise (eds.), CRC Pres., Boca Raton, Fla., 1974; Controlled Drug Bioavailability , Drug Product Design and Performance, Smolen and Ball (eds.), Wiley, New York, 1984; Ranger and Peppas, J. Macromol. Sci. Rev. Macromol. Chem. 23:61, 1983; see also Levy et al. ., Science 228:190, 1985; During et al., Ann. Neurol. 25:351, 1989; Howard et al., J. Neurosurg. 71:105, 1989; U.S. Patent No. 5,679,377; U.S. Patent No. 5,916,597; U.S. Patent No. 5912015, U.S. Patent No. 5989463, U.S. Patent No. 5128326, PCT Publication No. WO 99/15154 and PCT Publication No. WO 99/20253 Examples of polymers used in sustained release formulations include, without limitation, poly(2-hydroxyethyl methacrylate ), poly(methyl methacrylate), poly(acrylic acid), copolymer(ethylene-vinyl acetate), poly(methacrylic acid), polygl icolides (PLG), polyanhydrides, poly(N-vinylpyrrolidone), poly(vinyl alcohol), polyacrylamide, poly(ethylene glycol), polylactides (PLA), copolymers (lactide and glycolides) (PLGA) and polyorthoesters. In one embodiment, the polymer used in the sustained release formulation is inert, free of leachable impurities, storage stable, sterile, and biodegradable. The controlled or sustained release system can be placed near the prophylactic or therapeutic target, requiring only a fraction of the systemic dose (see, for example, Goodson, in Medical Applications of Controlled Release, supra, vol. 2, pp. 115-138, 1984).
Системы контролируемого высвобождения рассмотрены в обзоре Langer, Science 249:1527-1533, 1990). Любую методику, известную специалисту в данной области техники, можно применять для получения составов с замедленным высвобождением, содержащих один или несколько иммуноконъюгатов по настоящему изобретению. См., например, патент США № 4526938, РСТ-публикацию WO 91/05548, РСТпубликацию WO 96/20698, Ning et al., Radiotherapy & Oncology 39: 179-189, 1996; Song et al., PDA Journal of Pharmaceutical Science & Technology 50:372-397, 1995; Cleek et al., Pro. Int'l. Symp. Control. Rel. Bioact. Mater. 24:853-854, 1997; и Lam et al., Proc. Int'l. Symp. Control Rel. Bioact. Mater. 24:759-760, 1997, каждый из которых включен в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Controlled release systems are reviewed in Langer, Science 249:1527-1533, 1990). Any technique known to one of skill in the art can be used to prepare sustained release formulations containing one or more of the immunoconjugates of the present invention. See, for example, US Pat. No. 4,526,938, PCT Publication WO 91/05548, PCT Publication WO 96/20698, Ning et al., Radiotherapy & Oncology 39: 179-189, 1996; Song et al., PDA Journal of Pharmaceutical Science & Technology 50:372-397, 1995; Cleek et al., Pro. Int'l. Symp. control. Rel. Bioact. mater. 24:853-854, 1997; and Lam et al., Proc. Int'l. Symp. Control Rel. Bioact. mater. 24:759-760, 1997, each of which is incorporated herein by reference in its entirety.
Если иммуноконъюгаты по настоящему изобретению вводятся местно, они могут быть составленыIf the immunoconjugates of the present invention are administered topically, they can be formulated
- 80 042529 в форме мази, крема, трансдермального пластыря, лосьона, геля, спрея, аэрозоля, раствора, эмульсии или другой формы, широко известной специалисту в данной области техники. См., например, Remington's Pharmaceutical Sciences and Introduction to Pharmaceutical Dosage Forms, 19th ed., Mack Pub. Co., Easton, Pa. (1995). В случае нераспыляемых местных лекарственных форм обычно используются вязкиеполутвердые или твердые формы, содержащие носитель или одно или несколько вспомогательных веществ, совместимые с местным нанесением и, в некоторых случаях, характеризующиеся динамической вязкостью больше, чем у воды. Подходящие составы включают без ограничения растворы, суспензии, эмульсии, кремы, мази, порошки, линименты, бальзамы и т.п., которые при необходимости стерилизуют или смешивают со вспомогательными средствами (например, консервантами, стабилизаторами, смачивающими средствами, буферами или солями) для воздействия на различные свойства, такие как, например, осмотическое давление. Другие подходящие местные лекарственные формы охватывают распыляемые аэрозольные препараты, где активный ингредиент, в некоторых случаях в комбинации с твердым или жидким инертным носителем, упакован в смеси с летучим веществом под давлением (например, газообразным пропеллентом, таким как фреон) или в бутылке-пульверизаторе. При необходимости в фармацевтические композиции и лекарственные формы также можно добавлять увлажнители или увлажняющие средства. Примеры таких дополнительных ингредиентов широко известны из уровня техники.- 80 042529 in the form of an ointment, cream, transdermal patch, lotion, gel, spray, aerosol, solution, emulsion, or other form well known to the person skilled in the art. See, for example, Remington's Pharmaceutical Sciences and Introduction to Pharmaceutical Dosage Forms, 19th ed., Mack Pub. Co., Easton, Pa. (1995). In the case of non-sprayable topical dosage forms, viscous semi-solid or solid forms are usually used, containing a carrier or one or more excipients, compatible with topical application and, in some cases, characterized by a dynamic viscosity greater than that of water. Suitable formulations include, without limitation, solutions, suspensions, emulsions, creams, ointments, powders, liniments, balms, and the like, which are sterilized as necessary or mixed with adjuvants (e.g., preservatives, stabilizers, wetting agents, buffers, or salts) to influence on various properties, such as, for example, osmotic pressure. Other suitable topical dosage forms include aerosol spray formulations wherein the active ingredient, in some cases in combination with a solid or liquid inert carrier, is packaged in admixture with a pressurized volatile substance (e.g. a gaseous propellant such as Freon) or in a spray bottle. Humectants or humectants may also be added to pharmaceutical compositions and dosage forms, if desired. Examples of such additional ingredients are well known in the art.
Если композиции, содержащие иммуноконъюгаты вводят интраназально, они могут быть составлены в форме аэрозоля, спрея, тумана или в форме капель. В частности, в целях удобства профилактические или терапевтические средства для применения согласно настоящему изобретению можно доставлять в форме спрея-аэрозоля из пакетов под давлением или с помощью небулайзера с применением подходящего пропеллента (например, дихлордифторметана, трихлорфторметана, дихлортетрафторэтана, диоксида углерода или другого подходящего газа). В случае аэрозоля под давлением единица дозирования может определяться за счет обеспечения клапана для доставки отмеренного количества. Капсулы и картриджи (например, состоящие из желатина) для применения в ингаляторе или инсуффляторе можно составлять содержащими порошковую смесь соединения и подходящей порошковой основы, такой как лактоза или крахмал.When compositions containing immunoconjugates are administered intranasally, they may be formulated as an aerosol, spray, mist or droplet. In particular, for convenience, prophylactic or therapeutic agents for use according to the present invention can be delivered in the form of an aerosol spray from pressurized bags or by nebulizer using a suitable propellant (for example, dichlorodifluoromethane, trichlorofluoromethane, dichlorotetrafluoroethane, carbon dioxide or other suitable gas) . In the case of a pressurized aerosol, the dosage unit may be determined by providing a valve to deliver a metered amount. Capsules and cartridges (eg consisting of gelatin) for use in an inhaler or insufflator may be formulated containing a powder mixture of the compound and a suitable powder base such as lactose or starch.
Способы совместного введения или лечения с применением второго терапевтического средства, например, цитокина, стероида, химиотерапевтического средства, антибиотика, или облучения, известны из уровня техники (см., например, Hardman et al. (eds.) (2001) Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, 10th ed., McGraw-Hill, New York, N.Y.; Poole and Peterson (eds.) (2001) Pharmacotherapeutics for Advanced Practice:A Practical Approach, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.; Chabner and Longo (eds.) (2001) Cancer Chemotherapy and Biotherapy, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.)Эффективное количество терапевтического средства может снижать симптомы на по меньшей мере 10%; по меньшей мере 20%; по меньшей мере приблизительно 30%; по меньшей мере 40% или по меньшей мере 50%.Methods for co-administration or treatment with a second therapeutic agent, such as a cytokine, steroid, chemotherapeutic agent, antibiotic, or radiation, are known in the art (see, for example, Hardman et al. (eds.) (2001) Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, 10th ed., McGraw-Hill, New York, NY Poole and Peterson (eds.) (2001) Pharmacotherapeutics for Advanced Practice:A Practical Approach, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.; Chabner and Longo (eds.) (2001) Cancer Chemotherapy and Biotherapy, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.) An effective amount of a therapeutic agent can reduce symptoms by at least 10%; at least 20%; at least about 30%; at least 40% or at least 50%.
Дополнительные виды терапии (например, профилактические или терапевтические средства), которые можно применять в комбинации с иммуноконъюгатами по настоящему изобретению, можно применять с интервалом менее 5 мин, с интервалом менее 30 мин, с интервалом 1 ч, с интервалом приблизительно 1 ч, с интервалом от приблизительно 1 до приблизительно 2 ч, с интервалом от приблизительно 2 до приблизительно 3 ч, с интервалом от приблизительно 3 до приблизительно 4 ч, с интервалом от приблизительно 4 до приблизительно 5 ч, с интервалом от приблизительно 5 до приблизительно 6 ч, с интервалом от приблизительно 6 до приблизительно 7 ч, с интервалом от приблизительно 7 до приблизительно 8 ч, с интервалом от приблизительно 8 до приблизительно 9 ч, с интервалом от приблизительно 9 до приблизительно 10 ч, с интервалом от приблизительно 10 до приблизительно 11 ч, с интервалом от приблизительно 11 до приблизительно 12 ч, с интервалом от приблизительно 12 до 18 ч, с интервалом от 18 до 24 ч, с интервалом от 24 до 36 ч, с интервалом от 36 до 48 ч, с интервалом от 48 до 52 ч, с интервалом от 52 до 60 ч, с интервалом от 60 до 72 ч, с интервалом от 72 до 84 ч, с интервалом от 84 до 96 ч или с интервалом от 96 до 120 ч от введения иммуноконъюгатов по настоящему изобретению. Два или более видов терапии могут применяться во время одного и того же визита пациента.Additional therapies (e.g., prophylactic or therapeutic agents) that can be used in combination with the immunoconjugates of the present invention can be used at intervals of less than 5 minutes, at intervals of less than 30 minutes, at intervals of 1 hour, at intervals of approximately 1 hour, at intervals of from about 1 to about 2 hours, from about 2 to about 3 hours, from about 3 to about 4 hours, from about 4 to about 5 hours, from about 5 to about 6 hours, from from about 6 to about 7 hours, from about 7 to about 8 hours, from about 8 to about 9 hours, from about 9 to about 10 hours, from about 10 to about 11 hours, from from about 11 to about 12 hours, with an interval of about 12 to 18 hours, with an interval of 18 to 24 hours, with an interval of 2 4 to 36 hours, every 36 to 48 hours, every 48 to 52 hours, every 52 to 60 hours, every 60 to 72 hours, every 72 to 84 hours, every 84 to 96 hours or at intervals of 96 to 120 hours from administration of the immunoconjugates of the present invention. Two or more therapies may be used during the same patient visit.
В некоторых вариантах осуществления иммуноконъюгаты по настоящему изобретению могут составляться, чтобы гарантировать точное распределение in vivo. Например, гематоэнцефалический барьер (ВВВ) не пропускает множество высокогидрофильных соединений. Чтобы гарантировать то, что терапевтические соединения по настоящему изобретению пересекают ВВВ (при необходимости), их можно составлять, например, в липосомах. Способы изготовления липосомы, см., например, в патентах США №№ 4522811; 5374548 и 5399331. Липосомы могут содержать один или несколько фрагментов, которые селективно транспортируются в специфические клетки или органы, с улучшением тем самым нацеленной доставки лекарственного средства (см., например, Ranade, (1989) J. Clin. Pharmacol. 29:685). Иллюстративные нацеливающие фрагменты включают фолат или биотин (см., например, патент США № 5416016 от Low et al.); маннозиды (Umezawa et al. (1988) Biochem. Biophys. Res. Commun. 153:1038); антитела (Bloeman et al. (1995) FEBS Lett. 357:140; Owais et al. (1995) Antimicrob. Agents Chemother. 39:180); рецептор поверхностно-активного белка A (Briscoe et al. (1995) Am. J. Physiol. 1233:134); p 120 (Schreier et al. (1994) J. Biol. Chem. 269:9090); см. также K. Keinanen; M. L. Laukkanen (1994) FEBS Lett. 346:123; J.In some embodiments, the immunoconjugates of the present invention may be formulated to ensure accurate distribution in vivo. For example, the blood-brain barrier (BBB) keeps many highly hydrophilic compounds out. To ensure that the therapeutic compounds of the present invention cross the BBB (if necessary), they can be formulated, for example, in liposomes. For methods of making a liposome, see, for example, US Pat. Nos. 4,522,811; 5374548 and 5399331. Liposomes may contain one or more fragments that are selectively transported to specific cells or organs, thereby improving targeted drug delivery (see, for example, Ranade, (1989) J. Clin. Pharmacol. 29:685) . Illustrative targeting fragments include folate or biotin (see, for example, US patent No. 5416016 from Low et al.); mannosides (Umezawa et al. (1988) Biochem. Biophys. Res. Commun. 153:1038); antibodies (Bloeman et al. (1995) FEBS Lett. 357:140; Owais et al. (1995) Antimicrob. Agents Chemother. 39:180); surfactant protein A receptor (Briscoe et al. (1995) Am. J. Physiol. 1233:134); p 120 (Schreier et al. (1994) J. Biol. Chem. 269:9090); see also K. Keinanen; M. L. Laukkanen (1994) FEBS Lett. 346:123; J.
- 81 042529- 81 042529
J. Killion; I. J. Fidler (1994) Immunomethods 4:273.J. Killion; I. J. Fidler (1994) Immunomethods 4:273.
В настоящем изобретении предусмотрены протоколы для введения субъекту, нуждающемуся в этом, фармацевтической композиции, содержащей иммуноконъюгаты по настоящему изобретению, отдельно или в комбинации с другими видами терапии. Виды терапии (например, профилактические или терапевтические средства) из видов комбинированной терапии по настоящему изобретению могут применяться в отношении субъекта одновременно или последовательно. Терапия (например, профилактические или терапевтические средства) из видов комбинированной терапии по настоящему изобретению также можно вводить циклически. Циклическая терапия предусматривает введение первого средства терапии (например, первого профилактического или терапевтического средства) в течение некоторого периода времени, а затем введение второго средства терапии (например, второго профилактического или терапевтического средства) в течение некоторого периода времени и повторение такого последовательного введения, т.е. цикла, с целью снижения развития устойчивости к одному из видов терапии (например, средствам), для недопущения или снижения побочных эффектов одного из видов терапии (например, средств) и/или для улучшения эффективности видов терапии.The present invention provides protocols for administering to a subject in need thereof a pharmaceutical composition containing the immunoconjugates of the present invention, alone or in combination with other therapies. Therapies (eg, prophylactic or therapeutic agents) of the combination therapies of the present invention may be applied to a subject simultaneously or sequentially. Therapies (eg, prophylactic or therapeutic agents) of the combination therapies of the present invention can also be administered cyclically. Cyclic therapy involves administering a first therapy (e.g., a first prophylactic or therapeutic agent) over a period of time, followed by administering a second therapy (e.g., a second prophylactic or therapeutic agent) over a period of time, and repeating such sequential administration, i.e. e. cycle, in order to reduce the development of resistance to one of the therapies (for example, agents), to avoid or reduce the side effects of one of the therapies (for example, agents) and / or to improve the effectiveness of the therapies.
Виды терапии (например, профилактические или терапевтические средства) из видов комбинированной терапии по настоящему изобретению могут применяться в отношении субъекта одновременно.Therapies (eg, prophylactic or therapeutic agents) of the combination therapies of the present invention may be applied to a subject at the same time.
Термин одновременно не ограничивается применением видов терапии (например, профилактических или терапевтических средств) точно в одно и то же время, а скорее означает, что фармацевтическую композицию, содержащую антитела или их фрагменты по настоящему изобретению, вводят субъекту последовательно и в течение временного интервала таким образом, чтобы конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению могли действовать вместе с другим(-и) видом(-ами) терапии для обеспечения большей пользы, чем если бы их вводили иным способом. Например, каждый вид терапии может применяться в отношении субъекта в одно и то же время или последовательно в любом порядке в различные моменты времени; однако, если их не применяют в одно и то же время, их следует применять достаточно близко по времени, чтобы обеспечить требуемый терапевтический или профилактический эффект. Каждый вид терапии можно применять в отношении субъекта по отдельности, в любой подходящей форме и с помощью любого подходящего пути. В различных вариантах осуществления виды терапии (например, профилактические или терапевтические средства) применяют в отношении субъекта с интервалом менее 5 мин, с интервалом менее 15 мин, с интервалом менее 30 мин, с интервалом менее 1 ч, с интервалом приблизительно 1 ч, с интервалом от приблизительно 1 до приблизительно 2 ч, с интервалом от приблизительно 2 до приблизительно 3 ч, с интервалом от приблизительно 3 до приблизительно 4 ч, с интервалом от приблизительно 4 до приблизительно 5 ч, с интервалом от приблизительно 5 до приблизительно 6 ч, с интервалом от приблизительно 6 до приблизительно 7 ч, с интервалом от приблизительно 7 до приблизительно 8 ч, с интервалом от приблизительно 8 до приблизительно 9 ч, с интервалом от приблизительно 9 до приблизительно 10 ч, с интервалом от приблизительно 10 до приблизительно 11 ч, с интервалом от приблизительно 11 до приблизительно 12 ч, с интервалом 24 ч, с интервалом 48 ч, с интервалом 72 ч или с интервалом 1 неделя. В других вариантах осуществления два или более видов терапии (например, профилактические или терапевтические средства) применяются во время одного и того же визита пациента.The term simultaneously is not limited to the use of therapies (e.g., prophylactic or therapeutic agents) at exactly the same time, but rather means that a pharmaceutical composition containing antibodies or fragments thereof of the present invention is administered to a subject sequentially and over a time interval in this way so that the antibody-drug conjugates of the present invention can act in conjunction with other therapy(s) to provide greater benefit than if administered otherwise. For example, each therapy may be applied to a subject at the same time or sequentially in any order at different points in time; however, if they are not used at the same time, they should be used close enough in time to provide the desired therapeutic or prophylactic effect. Each therapy may be administered to a subject individually, in any suitable form, and by any suitable route. In various embodiments, therapies (e.g., prophylactic or therapeutic agents) are administered to the subject at intervals of less than 5 minutes, at intervals of less than 15 minutes, at intervals of less than 30 minutes, at intervals of less than 1 hour, at intervals of approximately 1 hour, at intervals of from about 1 to about 2 hours, from about 2 to about 3 hours, from about 3 to about 4 hours, from about 4 to about 5 hours, from about 5 to about 6 hours, from from about 6 to about 7 hours, from about 7 to about 8 hours, from about 8 to about 9 hours, from about 9 to about 10 hours, from about 10 to about 11 hours, from from about 11 to about 12 hours, at 24 hour intervals, at 48 hour intervals, at 72 hour intervals, or at 1 week intervals. In other embodiments, two or more therapies (eg, prophylactic or therapeutic agents) are administered during the same patient visit.
Профилактические или терапевтические средства из видов комбинированной терапии могут вводиться субъекту в одной и той же фармацевтической композиции. В качестве альтернативы профилактические или терапевтические средства из видов комбинированной терапии могут вводиться субъекту одновременно в отдельных фармацевтических композициях. Профилактические или терапевтические средства могут вводиться субъекту с помощью одного и того же или различных путей введения. Профилактические или терапевтические средства из видов комбинированной терапии могут вводиться субъекту в одной и той же фармацевтической композиции. В качестве альтернативы профилактические или терапевтические средства из видов комбинированной терапии могут вводиться субъекту одновременно в отдельных фармацевтических композициях. Профилактические или терапевтические средства могут вводиться субъекту с помощью одного и того же или различных путей введения.The prophylactic or therapeutic agents of the combination therapies may be administered to a subject in the same pharmaceutical composition. Alternatively, the prophylactic or therapeutic agents of the combination therapies may be administered to the subject simultaneously in separate pharmaceutical compositions. Prophylactic or therapeutic agents may be administered to a subject via the same or different routes of administration. The prophylactic or therapeutic agents of the combination therapies may be administered to a subject in the same pharmaceutical composition. Alternatively, the prophylactic or therapeutic agents of the combination therapies may be administered to the subject simultaneously in separate pharmaceutical compositions. Prophylactic or therapeutic agents may be administered to a subject via the same or different routes of administration.
ПримерыExamples
Пример 1. Получение антител к CCR7Example 1 Obtaining antibodies to CCR7
Получение конструкций для экспрессии CCR7 человека, крысы, мыши и яванского макакаGeneration of Constructs for the Expression of Human, Rat, Mouse, and Cynomolgus CCR7
Полноразмерные гены CCR7 человека, яванского макака и мыши синтезировали на основе аминокислотных последовательностей из баз данных GenBank или Uniprot (SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 101). кДНК-матрицу CCR7 крысы получали посредством генного синтеза на основе сведений об аминокислотной последовательности, полученной с применением мРНК, выделенной из различных тканей крысы (SEQ ID NO: 103). Все синтезированные фрагменты ДНК клонировали в подходящие векторы экспрессии.Full-length human, cynomolgus and mouse CCR7 genes were synthesized based on amino acid sequences from the GenBank or Uniprot databases (SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 101). Rat CCR7 cDNA template was obtained by gene synthesis based on amino acid sequence information obtained using mRNA isolated from various rat tissues (SEQ ID NO: 103). All synthesized DNA fragments were cloned into appropriate expression vectors.
- 82 042529- 82 042529
Таблица 2. Сведения об аминокислотной и нуклеотидной последовательности CCR7Table 2. Information about the amino acid and nucleotide sequence of CCR7
- 83 042529- 83 042529
- 84 042529- 84 042529
- 85 042529- 85 042529
Получение линии клеток, стабильно экспрессирующих CCR/ Линии клеток, стабильно экспрессирующих CCR7, получали с применением ретровирусной трансдукции. Клетки 293Т подвергали совместной трансфекции ретровирусным вектором экспрессии CCR7 и упаковывающим вектором pCL-Eco или pCL-10A1 (Novus, США, № по кат. NBP2-29540 или NBP2-2952) с применением реагента трансфекции Fugene 6 (Promega, США, № по кат. Е2692), следуя рекомендациям производителя. Клетки инкубировали при 37°С в увлажненном CO2-инкубаторе и вирусный супернатант собирали через 48 ч после трансфекции. Клетки NIH/3T3 и 300.19 выращивали до практически конфлюэнтного монослоя. У клеток удаляли ростовую среду и добавляли вирусный супернатант в присутствии 8 мкг полибрена/мл (конечная концентрация) (EMD Millipore, № по кат. TR-1003-G). После инкубации в течение 3-6 ч при 37°С добавляли свежую среду. Затем клетки культивировали в условиях, подходящих для отбора, с получением линий клеток, стабильно экспрессирующих CCR7.Preparation of cell lines stably expressing CCR/ Cell lines stably expressing CCR7 were obtained using retroviral transduction. 293T cells were co-transfected with the CCR7 retroviral expression vector and packaging vector pCL-Eco or pCL-10A1 (Novus, USA, cat. no. NBP2-29540 or NBP2-2952) using Fugene 6 transfection reagent (Promega, USA, cat. no. . E2692), following the manufacturer's recommendations. Cells were incubated at 37° C. in a humidified CO 2 incubator and viral supernatant was collected 48 hours after transfection. NIH/3T3 and 300.19 cells were grown to a nearly confluent monolayer. Growth medium was removed from cells and viral supernatant was added in the presence of 8 μg polybrene/ml (final concentration) (EMD Millipore, Cat # TR-1003-G). After incubation for 3-6 h at 37°C, fresh medium was added. The cells were then cultured under conditions suitable for selection to obtain cell lines stably expressing CCR7.
Получение, экспрессия и очистка вирусоподобных частиц (VLP) Клетки НЕК293Т или NIH/3T3 поддерживали в DMEM с 10% FBS. Для получения VLP клеткам меняли среду на DMEM с 4% FBS, затем подвергали совместной трансфекции плазмидой экспрессии CCR7 и ретровирусной плазмидой экспрессии Gag при соотношении 3:2 в мкг. Через 48 ч после трансфекции клеточный супернатант собирали и просветляли центрифугированием при 2500xg в течение 5 мин в настольной центрифуге и держали на льду. VLP очищали ультрацентрифугированием при 100000xg через 20% сахарозную подушку в 38-мл центрифужных пробирках Beckman Ultra-Clear (№ по каталогу 344058) на Ti-роторе Beckman Coulter SW 32 на ультрацентрифуге Sorvall RC 6+. Полученные осадки ресуспендировали в 300 мкл холодного стерильный PBS и подвергали количественной оценке с применением ВСА-анализа (Pierce, № по каталогу 23225).Virus-Like Particle (VLP) Preparation, Expression and Purification HEK293T or NIH/3T3 cells were maintained in DMEM with 10% FBS. To obtain VLPs, cells were medium changed to DMEM with 4% FBS, then co-transfected with CCR7 expression plasmid and Gag retroviral expression plasmid at a ratio of 3:2 in μg. 48 hours after transfection, the cell supernatant was collected and cleared by centrifugation at 2500xg for 5 min in a benchtop centrifuge and kept on ice. VLPs were purified by ultracentrifugation at 100,000xg through a 20% sucrose pad in 38 ml Beckman Ultra-Clear centrifuge tubes (p/n 344058) on a Beckman Coulter SW 32 Ti-rotor on a Sorvall RC 6+ ultracentrifuge. The pellets obtained were resuspended in 300 μl of cold sterile PBS and quantified using the BCA assay (Pierce, catalog # 23225).
Создание иммуногенного остова CCR7 на основании структуры Члены семейства рецепторов, сопряженных с G-белком, представляют собой мембранные белки, которые содержат семь трансмембранных спиральных областей (ТМ1-ТМ7), каждая из которых соединена связывающими последовательностями варьирующей длины. Аминоконец белка расположен на внешней стороне клеточной поверхности, это означает, что 4 области белка потенциально находятся на поверхности клетки, аминоконец (N-конец) и 3 области внеклеточных петель (ЕС1, ЕС2 и ЕС3). Таким образом, такие области доступны в качестве антигенов для антител.Construction of the CCR7 Immunogenic Backbone Based on the Structure Members of the G-protein coupled receptor family are membrane proteins that contain seven transmembrane helical regions (TM1-TM7) each linked by binding sequences of varying length. The amino terminus of the protein is located on the outer side of the cell surface, which means that 4 regions of the protein are potentially located on the cell surface, the amino terminus (N-terminus) and 3 regions of extracellular loops (EC1, EC2 and EC3). Thus, such regions are available as antigens for antibodies.
Предполагалось, что комбинацию из одного или нескольких таких 4 элементов, можно будет вставить в остов растворимого белка, чтобы он структурно приблизился к области CCR7, находящейся заIt was assumed that a combination of one or more of these 4 elements could be inserted into the backbone of a soluble protein so that it would structurally approach the region of CCR7 located behind
- 86 042529 пределами клетки.- 86 042529 outside the cell.
Для определения оптимальных внеклеточных областей CCR7 строили модель с применением кристаллической структуры близкого гомолога CXCR4 (Wu et al., Structures of the CXCR4 chemokine GPCR with small-molecule и cyclic peptide antagonists. (2010) Science 330: 1066-1071), применяя комбинирование структуры CXCR4 записями в базе данных структуры белков (3ODU, 3ОЕ0, 3ОЕ6, 3ОЕ8, 3ОЕ9) и программное обеспечение для моделирования. На основании модели сделали вывод, что аминокислоты, которые расположены между связывающими трансмембранными спиральными областями, находятся на поверхности белка. Данные области идентифицированы в табл. 3 ниже.To determine the optimal extracellular regions of CCR7, a model was built using the crystal structure of a close homologue of CXCR4 (Wu et al., Structures of the CXCR4 chemokine GPCR with small-molecule and cyclic peptide antagonists. (2010) Science 330: 1066-1071) using structure combination CXCR4 records in protein structure database (3ODU, 3OE0, 3OE6, 3OE8, 3OE9) and modeling software. Based on the model, it was concluded that the amino acids that are located between the binding transmembrane helical regions are located on the surface of the protein. These areas are identified in Table. 3 below.
Таблица 3. Сведения об аминокислотной и нуклеотидной последовательности иммуногенного остова CCR7Table 3. Information on the amino acid and nucleotide sequence of the CCR7 immunogenic backbone
- 87 042529- 87 042529
- 88 042529- 88 042529
- 89 042529- 89 042529
Малый размер петель ЕС1 и ЕС3 и пространственное отделение ЕС3 от остальных трех областей делает приоритетным применение N-конца и петли ЕС2 в качестве эпитопов-кандидатов.The small size of the EC1 and EC3 loops and the spatial separation of EC3 from the other three regions prioritizes the use of the N-terminus and the EC2 loop as candidate epitopes.
Моделирование слияния последовательности N-конца с кристаллической структурой мышиного Fab с последовательностью ЕС2, вставленной в различные области петель Fab, как, например, в каркасную область 1, CDR-H3 или CDR3-H1, показало, что если степень гибкости для данных двух последовательностей является допустимой, то они могут представлять собой обоснованные приближения для структуры данных областей в CCR7.N-terminal sequence fusion modeling with a mouse Fab crystal structure with an EC2 sequence inserted into different Fab loop regions, such as framework 1, CDR-H3, or CDR3-H1, showed that if the degree of flexibility for these two sequences is admissible, they may be reasonable approximations for the structure of these regions in CCR7.
Создание иммуногенного остова для иммунизации мышейCreation of an immunogenic scaffold for immunization of mice
Привитые конструкции для иммунизации мышей создавали путем слияния N-концевой последовательности из табл. 3 с N-концом тяжелой цепи остова мышиного Fab (обозначенного как MGFTX1) и прививания модифицированного варианта последовательности ЕС2 с мутацией цистеинового остатка в положении 24 на серии (табл. 3 и подчеркнутые+обозначенные жирным шрифтом последовательности в SEQ ID NO: 113) в CDR3 из остова MGFTX1, затем продуцировали обе тяжелую и легкую цепи из цепей иммуноглобулин для создания конечных белковых конструкций. Таким образом, конструкции, обозначенные как FabCCR7M1, содержали мышиную каркасную область, которая должна характеризоваться иммунной толерантностью при объединении с человеческой последовательностью, на которую был направлен иммунный ответ мыши.Grafted constructs for immunization of mice were created by fusion of the N-terminal sequence from table. 3 with the N-terminus of the heavy chain of the mouse Fab backbone (designated as MGFTX1) and grafting a modified EC2 sequence variant with a cysteine residue mutation at position 24 on the run (Table 3 and underlined+bold sequences in SEQ ID NO: 113) into CDR3 from the MGFTX1 backbone, then both the heavy and light chains were produced from the immunoglobulin chains to create the final protein constructs. Thus, the constructs, designated FabCCR7M1, contained a murine framework region that should be immune tolerant when combined with a human sequence to which the mouse immune response was directed.
Последовательность N-конца напрямую сливали с тяжелой цепью остова MGFTX1. Точки для вставки ЕС2 выбирали так, чтобы она находилась посередине петли CDR, исходя из доступных данных для структурной или гомологичной модели. Белки с привитым Fab получали с применением стандартных методик молекулярной биологии путем использования рекомбинантной ДНК, кодирующей соответствующие последовательности.The N-terminal sequence was directly fused to the heavy chain backbone of MGFTX1. The insertion points for EC2 were chosen to be in the middle of the CDR loop based on the available data for the structural or homologous model. Fab-grafted proteins were generated using standard molecular biology techniques using recombinant DNA encoding the appropriate sequences.
Например, синтезировали вариабельную область каждого антитела, содержащего ЕС2, вставленную в CDR3 тяжелой цепи. ДНК, кодирующую вариабельную область, амплифицировали с помощью ПЦР и полученный фрагмент субклонировали в вектор, содержащий или константную область легкой цепи, или константную область и область Fc тяжелой цепи. Таким способом получали белки FabCCR7M1 с соответствующим слиянием N-конца и вставкой ЕС2 в Н3. Полученные конструкции показаны в табл. 3. Трансфекции с применением подходящих комбинаций векторов, содержащих тяжелую и легкую цепь, приводят к экспрессии рекомбинантного Fab, содержащего одну молекулу N-конца и одну молекулу ЕС2.For example, the variable region of each antibody containing EC2 inserted into the heavy chain CDR3 was synthesized. The DNA encoding the variable region was amplified by PCR, and the resulting fragment was subcloned into a vector containing either the light chain constant region or the heavy chain constant region and Fc region. In this manner, FabCCR7M1 proteins were obtained with the appropriate N-terminus fusion and EC2 insertion into H3. The resulting designs are shown in table. 3. Transfections using suitable combinations of heavy and light chain vectors result in the expression of a recombinant Fab containing one N-terminal molecule and one EC2 molecule.
- 90 042529- 90 042529
Выбор того, какую CDR отбирают для прививания, определяется, исходя из параметров наружного расположения петли и близости к N-концу. В настоящее время программное обеспечение для моделирования только частично применимо для предсказания того, какая CDR и какое местоположение в пределах CDR будут обеспечивать требуемые параметры, что связано с гибкостью петель после проведения слияния и прививания. Структура остова MGFTX1 в комбинации с ЕС2 C24S (табл. 3, SEQ ID NO: 110) показала, что последовательность находится снаружи и является гибкой, о чем свидетельствует отсутствие электронной плотности у большей части последовательности.The choice of which CDR is selected for grafting is determined based on the parameters of the external location of the loop and proximity to the N-terminus. At present, simulation software is only partially applicable to predict which CDR and which location within the CDR will provide the required parameters due to the flexibility of loops after merging and grafting. The structure of the backbone of MGFTX1 in combination with EC2 C24S (Table 3, SEQ ID NO: 110) showed that the sequence is external and flexible, as evidenced by the lack of electron density in most of the sequence.
Подводя итог, точку вставки в CDR выбирали на основе структуры, исходя из предположения, что прививание в CDR будет обеспечивать некоторый уровень структурного подобия с нативным антигеном.In summary, the insertion point in the CDR was chosen based on structure, with the assumption that grafting into the CDR would provide some level of structural similarity to the native antigen.
Создание гибридомыCreating a hybridoma
Трансгенных мышей Bcl-2 (линия C57BL/6-Tgn (bcl-2) 22 WEHI) иммунизировали антигеном с применением процедуры, которая называется Повторная иммунизация в несколько сайтов (RIMMS) (McIntyre GD. Hybridoma 1997). Вкратце, мышам инъецировали по 1-3 мкг иммуногена CCR7 в 8 специфических сайтов, близких к периферическим лимфатическим узлам (PLN). Данную процедуру повторяли 8 раз в течение 12-дневного периода. В день 12 собирали образцы крови и титр сывороточных антител анализировали с помощью FACS. В некоторых случаях мышей BALB/c и/или С57В1/6 иммунизировали с помощью клеток NIH3T3 или 300.19, стабильно свехэкспрессирующих CCR7 человека (SEQ ID NO: 97). Животным инъецировали подкожно 5x106 клеток в PBS один раз в месяц в течение 3 месяцев с последующей внутривенной бустер-инъекцией 25 мкг VLP, экспрессирующих CCR7 человека. Через два дня после бустер-инъекции собирали образцы крови и титр сывороточных антител анализировали с помощью FACS. Селезенки и объединенные PLN извлекали у мышей с высокими титрами. Для сбора лимфоцитов селезенки и PLN промывали дважды с помощью DMEM, а затем разделяли на клетки за счет пропускания через сито с размером ячеек 70 микрон (Falcon, № 352350). Полученные лимфоциты промывали еще 2 раза перед проведением слияния в среде Cytofusion (среда для электропорации BTXpress Cytofusion®, № по кат. 47001).Bcl-2 transgenic mice (line C57BL/6-Tgn (bcl-2) 22 WEHI) were immunized with antigen using a procedure called Multiple Site Booster Immunization (RIMMS) (McIntyre GD. Hybridoma 1997). Briefly, mice were injected with 1-3 μg of CCR7 immunogen at 8 specific sites close to the peripheral lymph nodes (PLN). This procedure was repeated 8 times over a 12 day period. On day 12, blood samples were collected and serum antibody titer was analyzed by FACS. In some cases, BALB/c and/or C57B1/6 mice were immunized with NIH3T3 or 300.19 cells stably overexpressing human CCR7 (SEQ ID NO: 97). Animals were injected subcutaneously with 5x106 cells in PBS once a month for 3 months, followed by an intravenous boost injection of 25 μg VLPs expressing human CCR7. Two days after the booster injection, blood samples were collected and serum antibody titer was analyzed by FACS. Spleens and pooled PLNs were recovered from mice with high titers. To collect lymphocytes, spleens and PLNs were washed twice with DMEM and then separated into cells by passage through a 70 micron sieve (Falcon, no. 352350). The obtained lymphocytes were washed 2 more times before confluence in Cytofusion medium (BTXpress Cytofusion® electroporation medium, Cat # 47001).
Для проведения слияния клетки миеломы F0 смешивали с лимфоцитами при соотношении 1:4. Смесь клеток центрифугировали, суспендировали в среде Cytofusion и затем вносили в камеру для электрослияния (коаксиальная камера 9ML от Harvard Apparatus, изделие № 470020). Электрослияние проводили с соответствии с инструкциями производителя с применением системы для получения гибридом Hybrimune модели CEEF-50B (Cyto Pulse Sciences, Inc). Слитые клетки оставляли для восстановления в течение 5 мин в камере, разбавляли 1/10 в среде для слияния без HAT (DMEM+20% FBS, 1% пенициллина/стрептомицина/глутамина, 1x NEAA, 0,5x HFCS) и помещали при 37°С на 1 ч. Добавляли 4х среду HAT (DMEM+20% FBS, 1% пенициллина/стрептомицина/глутамина, 1x NEAA, 4x HAT, 0,5x HFCS) с получением 1x раствора и плотность доводили до 1,67x104 клеток/мл. Клетки высевали в 384-луночные планшеты из расчета 60 мкл/лунка.For fusion, F0 myeloma cells were mixed with lymphocytes at a ratio of 1:4. The cell mixture was centrifuged, suspended in Cytofusion medium and then introduced into an electrofusion chamber (9ML coaxial chamber from Harvard Apparatus, item # 470020). Electrofusion was performed according to the manufacturer's instructions using a Hybrimune hybridoma system model CEEF-50B (Cyto Pulse Sciences, Inc.). The fused cells were left to recover for 5 min in the chamber, diluted 1/10 in HAT-free fusion medium (DMEM+20% FBS, 1% penicillin/streptomycin/glutamine, 1x NEAA, 0.5x HFCS) and placed at 37° C for 1 hour. 4x HAT medium (DMEM+20% FBS, 1% penicillin/streptomycin/glutamine, 1x NEAA, 4x HAT, 0.5x HFCS) was added to make a 1x solution and the density was adjusted to 1.67x104 cells/ml. Cells were seeded in 384-well plates at the rate of 60 μl/well.
Скрининг с помощью FACSScreening with FACS
Через десять дней после слияния планшеты с гибридомами подвергали скринингу на присутствие CCR7-специфических антител с применением проточной цитометрии для подтверждения специфического связывания антител-кандидатов с линиями клеток, стабильно сверхэкспрессирующими или экспрессирующими эндогенный CCR7. Клетки тщательно ополаскивали PBS и обрабатывали аккутазой (Millipore, № SCR005) для отделения от ростовых планшетов и ресуспендировали в холодном PBS. Клетки метили биотином с флуоресцентным красителем согласно инструкциям производителя (набор для биотинилирования клеточной поверхности FluoReporter, Thermo Fisher Scientific, № по кат. F-20650; стрептавидин РЕ-Су7, ThermoFisher Scientific, № по кат. SA1012). Клетки ресуспендировали из расчета примерно 1x106 клеток/мл в буфере FACS (1x DPBS, 3% FBS, 5 мМ EDTA, 0,1% азида натрия). В 384луночный планшет предварительно вносили по 20 мкл супернатанта гибридом и добавляли 20 мкл клеточной суспензии. Клетки инкубировали в течение 1 ч при 4°С, промывали дважды с помощью холодного буфера FACS и ресуспендировали в 20 мкл вторичного антитела, разведенного 1:400 в буфере FACS (конъюгированный с аллофикоцианином F(ab')2 козы к IgG человека, Fcγ-специфический; Jackson Immunoresearch, № по кат. 109-136-098). После дополнительной инкубации в течение 45 мин при 4°С, клетки промывали дважды с помощью буфера FACS и ресуспендировали в 20 мкл буфера FACS+2 мкг/мл пропидия йодида (Sigma Aldrich, № по кат. P4864-10ML). Геометрическое среднее интенсивности флуоресценции рассчитывали на живых одиночных клетках с применением программного обеспечения FlowJo™.Ten days after fusion, hybridoma plates were screened for the presence of CCR7-specific antibodies using flow cytometry to confirm specific binding of candidate antibodies to cell lines stably overexpressing or expressing endogenous CCR7. Cells were rinsed thoroughly with PBS and treated with Accutase (Millipore, #SCR005) to separate from growth plates and resuspended in cold PBS. Cells were labeled with biotin and fluorescent dye according to the manufacturer's instructions (FluoReporter cell surface biotinylation kit, Thermo Fisher Scientific, cat. no. F-20650; streptavidin PE-Cy7, ThermoFisher Scientific, cat. no. SA1012). Cells were resuspended at approximately 1x106 cells/ml in FACS buffer (1x DPBS, 3% FBS, 5 mM EDTA, 0.1% sodium azide). In a 384-well plate, 20 μl of the hybridoma supernatant was preliminarily added, and 20 μl of the cell suspension was added. Cells were incubated for 1 h at 4°C, washed twice with cold FACS buffer and resuspended in 20 μl of secondary antibody diluted 1:400 in FACS buffer (conjugated with goat allophycocyanin F(ab') 2 to human IgG, Fcγ- specific; Jackson Immunoresearch, Cat # 109-136-098). After an additional 45 min incubation at 4° C., cells were washed twice with FACS buffer and resuspended in 20 μl of FACS buffer + 2 μg/ml propidium iodide (Sigma Aldrich, Cat # P4864-10ML). The geometric mean of fluorescence intensity was calculated on live single cells using FlowJo™ software.
Очистка антителPurification of antibodies
Получали химерные антитела, содержащие мышиные вариабельные области и человеческие константные области. Кроме того, разрабатывали химерные варианты, содержащие цистеиновые мутации (например, цистеины в положении К36°С или в положениях Е152С и S375C тяжелой цепи) для конъюгации с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, и получения ADC, описанных более подробно в данном документе. В случае каждой из отобранных гибридом, mAb121G12, mAb506Е15, mAb674J13 и mAb684Е12, получали ДНК-последовательности вариабельных областей (VH и VL) антител, производимых гибридомами, для создания оптимизированных последовательностей (например, гуReceived chimeric antibodies containing mouse variable regions and human constant regions. In addition, chimeric variants containing cysteine mutations (eg, cysteines at position K36°C or positions E152C and S375C of the heavy chain) have been developed for conjugation to a drug moiety to produce the ADCs described in more detail herein. For each of the selected hybridomas, mAb121G12, mAb506E15, mAb674J13, and mAb684E12, the DNA sequences of the variable regions (VH and VL) of antibodies produced by the hybridomas were obtained to generate optimized sequences (e.g., gu
- 91 042529 манизации, придания предпочтительных характеристик). ДНК вариабельной области из мышиных моноклональных антител амплифицировали с помощью RACE на основе РНК, полученной из каждой отобранной линии клеток гибридомы, с применением стандартных способов. Полипептидные последовательности каждой из мышиных вариабельных областей тяжелой/легкой цепей показаны под SEQ ID NO: 128/SEQ ID NO: 144, SEQ ID NO: 160/SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 192/SEQ ID NO: 208 и SEQ ID NO: 224/SEQ ID NO: 240, соответственно, для каждой из гибридом 674J13, 121G12, 506Е15 и 684Е12. Соответствующие производные нуклеотидные последовательности вариабельных областей тяжелой/легкой цепей для каждой из гибридом показаны под SEQ ID NO: 129/SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 161/SEQ ID NO: 177, SEQ ID NO: 193/SEQ ID NO: 209 и SEQ ID NO: 225/SEQ ID NO: 241. Для получения химерных антител ДНК-последовательности, кодирующие домен VL и VH антитела из гибридомы субклонировали в векторы экспрессии, содержащие соответствующие последовательности человеческой тяжелой цепи дикого типа, или тяжелой цепи с введенным путем конструирования Cys, или тяжелой цепи с мутацией D265A/P329A (DAPA) и последовательность константной области человеческой легкой цепи (IgG1, каппа-цепь).- 91 042529 manization, giving preferred characteristics). Variable region DNA from mouse monoclonal antibodies was amplified by RACE based on RNA obtained from each selected hybridoma cell line using standard methods. The polypeptide sequences of each of the mouse heavy/light chain variable regions are shown under SEQ ID NO: 128/SEQ ID NO: 144, SEQ ID NO: 160/SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 192/SEQ ID NO: 208 and SEQ ID NO: 224/SEQ ID NO: 240, respectively, for each of hybridomas 674J13, 121G12, 506E15 and 684E12. The respective derived heavy/light chain variable region nucleotide sequences for each of the hybridomas are shown under SEQ ID NO: 129/SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 161/SEQ ID NO: 177, SEQ ID NO: 193/SEQ ID NO: 209 and SEQ ID NO: 225/SEQ ID NO: 241. To obtain chimeric antibodies, DNA sequences encoding the VL and VH domain of antibodies from hybridoma were subcloned into expression vectors containing the corresponding sequences of the human wild-type heavy chain or the heavy chain with the introduced pathway constructing a Cys or D265A/P329A (DAPA) mutated heavy chain and human light chain constant region sequence (IgG1, kappa chain).
Гуманизация антителHumanization of antibodies
Конструкции вариабельных областей подвергали разработке для гуманизации и оптимизации последовательностей (например, удаления посттрансляционных модификаций, нежелательных сайтов и т. д.), для включения цистеиновых мутаций (например, цистеинов в положении К36°С или в положениях Е152С и S375C тяжелой цепи), предназначенных для конъюгации фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, и получения ADC, описанных более подробно в данном документе; а также для модификации с помощью мутаций эффекторной области Fc (например, мутаций D265A/P329A в области Fc), чтобы обеспечить конструкции, характеризующиеся сниженной эффекторной функцией Fc, и обеспечения их комбинаций.Variable region constructs have been designed to humanize and optimize sequences (e.g., remove post-translational modifications, unwanted sites, etc.) to include cysteine mutations (e.g., cysteines at position K36°C or at positions E152C and S375C of the heavy chain) intended for conjugation of a fragment representing a drug, and obtaining ADC, described in more detail in this document; and to modify with Fc effector region mutations (eg, D265A/P329A mutations in the Fc region) to provide constructs having reduced Fc effector function and to provide combinations thereof.
ДНК-последовательности, кодирующие гуманизированные домены VL и VH, заказывали в GeneArt (Life Technologies Inc., Регенсбург, Германия), включая оптимизацию кодонов для Cricetulus griseus. Последовательности, кодирующие домены VL и VH, субклонировали из векторов, взятых из GeneArt, в векторы экспрессии, подходящие для продуцирования белка в клетках млекопитающих. Тяжелые и легкие цепи клонировали в отдельные векторы экспрессии для обеспечения возможности совместной трансфекции.DNA sequences encoding the humanized VL and VH domains were ordered from GeneArt (Life Technologies Inc., Regensburg, Germany), including codon optimization for Cricetulus griseus. The sequences encoding the VL and VH domains were subcloned from vectors taken from GeneArt into expression vectors suitable for protein production in mammalian cells. The heavy and light chains were cloned into separate expression vectors to allow co-transfection.
Рекомбинантные антитела (IgG1, каппа-цепь) получали за счет совместной трансфекции векторов в экспрессирующие клетки Freestyle™ 293 (Invitrogen, США) с применением PEI (полиэтиленимин, MW 25000, линейный, Polysciences, США, № по кат. 23966) в качестве реагента для трансфекции. Исходный раствор PEI готовили растворением 1 r PEI в 900 мл воды, подходящей для культивирования клеток, при комнатной температуре (RT). Для облегчения растворения PEI раствор подкисляли добавлением HCl до pH 3-5 с последующей нейтрализацией с помощью NaOH с получением конечного pH, составляющего 7,05. Наконец, объем доводили до 1 л и раствор стерилизовали фильтрацией через фильтр с размером пор 0,22 мкм, разделяли на аликвоты и замораживали при -80°С до дальнейшего применения.Recombinant antibodies (IgG1, kappa chain) were generated by co-transfection of the vectors into Freestyle™ 293 expressing cells (Invitrogen, USA) using PEI (polyethyleneimine, MW 25000, linear, Polysciences, USA, Cat # 23966) as a reagent for transfection. The PEI stock solution was prepared by dissolving 1 r PEI in 900 ml water suitable for cell culture at room temperature (RT). To facilitate dissolution of the PEI, the solution was acidified by adding HCl to pH 3-5 followed by neutralization with NaOH to give a final pH of 7.05. Finally, the volume was adjusted to 1 L and the solution was sterilized by filtration through a 0.22 µm filter, aliquoted and frozen at -80° C. until further use.
Клетки Freestyle™ 293 (Gibco™, ThermoFisher scientific, USA, № по кат. R79007) культивировали в среде Freestyle™ 293 (Gibco™, ThermoFisher scientific, США, № по кат. 12338018) во встряхиваемых колбах (Corning, Тьюксбери, Массачусетс) на орбитальном шейкере (100-120 об/мин) при 37°С в увлажненном инкубаторе при 5% СО2. В случае временных трансфекции клетки выращивали до плотности примерно 3x106 клеток/мл, а затем 1 мкг стерилизованной фильтрацией ДНК/мл культуры (0,5 мкг тяжелой цепи+0,5 мкг легкой цепи) добавляли в раствор 2 мкг PEI/1 мкг ДНК в OptiMem (ThermoFisher Scientific, США, #11058021) и инкубировали при RT в течение 8 мин. Смесь добавляли к клеткам Freestyle™ 293 по каплям с аккуратным перемешиванием круговыми движениями. После трансфекции клетки культивировали в течение одной-двух недель до проведения очистки антитела от супернатанта. Чтобы создать стабильные линии клеток для продуцирования антител, векторы трансфицировали совместно с помощью нуклеофекции (Nucleofector™ 96-well shuttle™; Lonza) в клетки СНО с применением рекомендаций производителя и их культивировали в условиях отбора в течение не более четырех недель во встряхиваемых колбах. Клетки собирали центрифугированием, а супернатант извлекали для очистки антитела. Антитело очищали с применением колонок с белком А, белком G или MabSelect SuRe (GE Healthcare Life Sciences). Перед загрузкой супернатанта смолу уравновешивали с помощью PBS. После связывания образца колонку промывали с помощью PBS и антитело элюировали с помощью буфера для элюирования IgG Thermo (Pierce), pH 2,8 (№ по кат. 21004). Элюированные фракции нейтрализовали с помощью буфера на основе дегидрата трехосновного цитрата натрия, pH 8,5 (Sigma Aldrich, № по кат. S4641-1Kg), и затем диализировали в течение ночи в PBS, pH 7,2.Freestyle™ 293 cells (Gibco™, ThermoFisher scientific, USA, cat. no. R79007) were cultured in Freestyle™ 293 medium (Gibco™, ThermoFisher scientific, USA, cat. no. 12338018) in shake flasks (Corning, Tewkesbury, MA) on an orbital shaker (100-120 rpm) at 37°C in a humidified incubator at 5% CO 2 . In the case of transient transfections, cells were grown to a density of approximately 3x106 cells/mL, and then 1 μg filter-sterilized DNA/mL culture (0.5 μg heavy chain+0.5 μg light chain) was added to a solution of 2 μg PEI/1 μg DNA in OptiMem (ThermoFisher Scientific, USA, #11058021) and incubated at RT for 8 min. The mixture was added dropwise to Freestyle™ 293 cells with gentle mixing in a circular motion. After transfection, cells were cultured for one to two weeks before the antibody was purified from the supernatant. To establish stable cell lines for antibody production, the vectors were co-transfected by nucleofection (Nucleofector™ 96-well shuttle™; Lonza) into CHO cells using the manufacturer's recommendations and cultured under selective conditions for up to four weeks in shake flasks. Cells were harvested by centrifugation and the supernatant was recovered for antibody purification. The antibody was purified using Protein A, Protein G or MabSelect SuRe columns (GE Healthcare Life Sciences). The resin was equilibrated with PBS before loading the supernatant. After sample binding, the column was washed with PBS and the antibody was eluted with IgG Thermo Elution Buffer (Pierce), pH 2.8 (Cat. No. 21004). The eluted fractions were neutralized with tribasic sodium citrate dehydrate buffer, pH 8.5 (Sigma Aldrich, Cat # S4641-1Kg), and then dialyzed overnight in PBS, pH 7.2.
Краткое описание антителBrief description of antibodies
В табл. 4 изложены соответствующие сведения о последовательности исходных и гуманизированных антител к CCR7, происходящих из мышиных гибридомных антител. На всем протяжении данной заявки при описании антител термины гибридомное и исходное используются взаимозаменяемо и относятся к Ab, которые происходят из гибридомы.In table. 4 provides relevant sequence information for the original and humanized anti-CCR7 antibodies derived from mouse hybridoma antibodies. Throughout this application, when describing antibodies, the terms hybridoma and parent are used interchangeably and refer to Abs that are derived from a hybridoma.
- 92 042529- 92 042529
Таблица 4. Сведения об аминокислотной и нуклеотидной последовательности для гибридомных _______________ и гуманизированных антител к CCR7____________Table 4. Amino acid and nucleotide sequence information for hybridoma _______________ and humanized antibodies to CCR7____________
- 93 042529- 93 042529
- 94 042529- 94 042529
- 95 042529- 95 042529
- 96 042529- 96 042529
-97042529-97042529
- 98 042529- 98 042529
- 99 042529- 99 042529
- 100 042529- 100 042529
- 101 042529- 101 042529
- 102042529- 102042529
- 103 042529- 103 042529
- 104 042529- 104 042529
- 105 042529- 105 042529
- 106 042529- 106 042529
- 107042529- 107042529
- 108 042529- 108 042529
- 109 042529- 109 042529
- 110 042529- 110 042529
- 111 042529- 111 042529
- 112 042529- 112 042529
- 113 042529- 113 042529
- 114 042529- 114 042529
- 115 042529- 115 042529
- 116 042529- 116 042529
- 117 042529- 117 042529
- 118 042529- 118 042529
- 119 042529- 119 042529
- 120 042529- 120 042529
- 121 042529- 121 042529
- 122 042529- 122 042529
- 123 042529- 123 042529
- 124 042529- 124 042529
- 125 042529- 125 042529
- 126 042529- 126 042529
- 127 042529- 127 042529
- 128 042529- 128 042529
- 129 042529- 129 042529
- 130 042529- 130 042529
- 131 042529- 131 042529
- 132 042529- 132 042529
- 133 042529- 133 042529
- 134 042529- 134 042529
- 135 042529- 135 042529
- 136 042529- 136 042529
- 137 042529- 137 042529
- 138 042529- 138 042529
- 139 042529- 139 042529
- 140 042529- 140 042529
- 141 042529- 141 042529
- 142 042529- 142 042529
- 143 042529- 143 042529
- 144 042529- 144 042529
- 145042529- 145042529
- 146042529- 146042529
- 147 042529- 147 042529
- 148 042529- 148 042529
- 149 042529- 149 042529
- 150042529- 150042529
- 151 042529- 151 042529
- 152 042529- 152 042529
- 153 042529- 153 042529
- 154 042529- 154 042529
-155042529-155042529
- 156 042529- 156 042529
- 157 042529- 157 042529
- 158042529- 158042529
- 159 042529- 159 042529
- 160042529- 160042529
- 161 042529- 161 042529
- 162 042529- 162 042529
- 163 042529- 163 042529
- 164 042529- 164 042529
- 165 042529- 165 042529
Пример 2. In vitro оценка активности ADCC, индуцированной антителомExample 2 In Vitro Evaluation of Antibody Induced ADCC Activity
Способность антител-кандидатов опосредовать ADCC оценивали с применением суррогатного репортерного анализа ADCC. В качестве клеток-мишеней использовали клетки JVM2, экспрессирующие CCR7 и CD20. Клетки JVM2 промывали и ресуспендировали из расчета 8x104 клеток/мл клеток/мл. Эффекторными клетками в данном анализе была линия клеток Jurkat, стабильно экспрессирующих CD16V158 и NFAT-зависимый люциферазный репортер (Jurkat-V158); экспрессия люциферазы является заменителем канонической передачи сигнала ADCC через CD16. Вкратце, клетки Jurkat-V158, выращенные в суспензионной культуре, центрифугировали для удаления истощенной среды, осадок ресуспендировали в среде для анализа и доводили до 1,6x106 клеток/мл клеток/мл. Смешивали равные объемы эффекторных клеток и клеток-мишеней с получением основной смеси клеток, в которой отношение клетокмишеней к эффекторным клеткам составляет 1:5 или 1:20. Титр антитела разбавляли в среде для анализа при конечной наибольшей концентрации, составляющей 50 мкг/мл в лунке для анализа. 12,5 мкл раствора Ab добавляли в 384-луночный круглодонный планшет и затем добавляли 12,5 мкл основной смеси клеток. Антитело и клетки тщательно смешивали за счет пипетирования и инкубировали в течение 4 ч при 37°С в 5% СО2. После инкубации в каждую лунку добавляли по 15 мкл субстрата Bright Glo (Promega № G7572) и встряхивали в течение 5 мин при RT при 1050 об/мин. Люминесцентный сигнал считывали на планшет-ридере Envision (Perkin Elmer).The ability of candidate antibodies to mediate ADCC was assessed using a surrogate ADCC reporter assay. JVM2 cells expressing CCR7 and CD20 were used as target cells. JVM2 cells were washed and resuspended at 8x104 cells/ml cells/ml. The effector cells in this assay were the Jurkat cell line stably expressing CD16V158 and the NFAT-dependent luciferase reporter (Jurkat-V158); luciferase expression is a substitute for canonical ADCC signaling via CD16. Briefly, Jurkat-V158 cells grown in suspension culture were centrifuged to remove depleted medium, the pellet was resuspended in assay medium and adjusted to 1.6x106 cells/ml cells/ml. Mixed equal volumes of effector cells and target cells to obtain the main mixture of cells in which the ratio of target cells to effector cells is 1:5 or 1:20. The antibody titer was diluted in assay medium at a final highest concentration of 50 μg/ml per assay well. 12.5 µl of the Ab solution was added to a 384-well round bottom plate and then 12.5 µl of the basic cell mixture was added. The antibody and cells were thoroughly mixed by pipetting and incubated for 4 h at 37°C in 5% CO 2 . After incubation, 15 µl of Bright Glo substrate (Promega #G7572) was added to each well and shaken for 5 min at RT at 1050 rpm. The luminescent signal was read on an Envision plate reader (Perkin Elmer).
В качестве контроля включали антитело, нацеливающееся на CD20, и оно показывало значительную передачу сигнала с помощью NFAT, измеренную по активности люциферазы. Аналогично, антитела-кандидаты к CCR7 индуцировали значительную активность ADCC (фиг. 1).An antibody targeting CD20 was included as a control and showed significant NFAT signaling as measured by luciferase activity. Similarly, candidate CCR7 antibodies induced significant ADCC activity (FIG. 1).
В таблице ниже обобщены типичные результаты для антител различных форматов, включенных в анализ ADCC с применением клеток JVM2 и Jurkat-V158.The table below summarizes typical results for the various antibody formats included in the ADCC assay using JVM2 and Jurkat-V158 cells.
Таблица 5. Активность ADCC у негуманизированных и гуманизированных антител к CCR7Table 5. ADCC activity in non-humanized and humanized anti-CCR7 antibodies
- 166 042529- 166 042529
Анализ ADCC проводили с негуманизированным антителом 506Е15 в качестве типичного антитела к CCR7, способного опосредовать ADCC, на различных линиях клеток с разным числом CCR7рецепторов для определения минимальной плотности рецепторов, необходимой для активности ADCC, и наличие надлежащей границы безопасности по сравнению с нормальными CCR7+ Т-клетками. В таблице ниже обобщены некоторые из данных.An ADCC assay was performed with the non-humanized 506E15 antibody as a representative anti-CCR7 antibody capable of mediating ADCC on various cell lines with different numbers of CCR7 receptors to determine the minimum receptor density required for ADCC activity and the presence of an appropriate margin of safety compared to normal CCR7+ T cells. . The table below summarizes some of the data.
Таблица 6. Активность ADCC у негуманизированного антитела 506Е15Table 6 ADCC activity of non-humanized 506E15 antibody
Данные показывают, что даже очень низких уровней CCR7-рецепторов, сравнимых с уровнями CCR7-рецепторов на нормальных Т клетках, было достаточно для обеспечения значительной активности ADCC. ADCC также оценивали с применением анализа жизнеспособности при совместном культивировании NK-клеток с CCR7+ раковыми клетками и получали аналогичные результаты (не обсуждаются в данном документе).The data show that even very low levels of CCR7 receptors, comparable to levels of CCR7 receptors on normal T cells, were sufficient to provide significant ADCC activity. ADCC was also evaluated using a viability assay when NK cells were co-cultured with CCR7+ cancer cells and similar results were obtained (not discussed here).
Это согласуется с описанным ниже наблюдением, согласно которому отмечали истощение Т-клеток in vivo и обнаружили, что оно основано на механизме ADCC. Эти результаты демонстрируют, что механизм ADCC делает CCR7 неприменимым с точки зрения безопасности. В связи с этим всех кандидатов переключали в формат с молчащей Fc (DAPA) для улучшения общей безопасности с точки зрения ми шени.This is consistent with the observation described below, where T cell depletion was observed in vivo and found to be based on an ADCC mechanism. These results demonstrate that the ADCC mechanism renders CCR7 inapplicable from a security point of view. Therefore, all candidates were switched to the silent Fc (DAPA) format to improve overall target safety.
Репортерный in vitro анализ ADCC повторяли, и он подтвердил отсутствие активности ADCC у негуманизированных антител к CCR7, содержащих варианты Fc с мутацией DAPA (фиг. 2).The in vitro reporter ADCC assay was repeated and confirmed the absence of ADCC activity in non-humanized anti-CCR7 antibodies containing DAPA mutated Fc variants (FIG. 2).
Пример 3. Определение биохимических характеристик антителExample 3 Biochemical Characterization of Antibodies
Аффинность антител к CCR7 в отношении CCR7Affinity of Antibodies to CCR7 for CCR7
Аффинность различных антител и ADC в отношении CCR7 и его видовых ортологов определяли с применением FACS. Очищенные IgG титровали, чтобы определить значения ЕС50 для связывания с CCR7, экспрессированным на поверхности клеток.The affinity of various antibodies and ADCs for CCR7 and its species orthologues was determined using FACS. Purified IgGs were titrated to determine EC 50 values for binding to CCR7 expressed on the cell surface.
Для этого CCR7-положительные клетки собирали (адгезивные клетки отделяли с помощью аккутазы), промывали дважды с помощью буфера FACS (PBS/3% FCS/0,02% азида натрия) и разбавляли до примерно 2x106 клеток/мл в буфере FACS. Все последующие стадии проводили на льду, чтобы предотвратить интернализацию рецептора. По 100 мкл клеточной суспензии/лунка переносили в 9б-луночные планшеты с U-образным дном (Falcon). 2x105 клеток/лунка инкубировали с последовательным разведением представляющего интерес антитела к CCR7, при этом концентрация антитела варьировала в диапазоне нескольких порядков, начиная от самой высокой 100 нМ, в течение 60 мин при 4°С с аккуратным встряхиванием. После инкубации клетки центрифугировали (1200 об/мин, 2 мин, 4°С) и трижды промывали буфером FACS. Антитело обнаружения, конъюгированное с флуорофором АРС антитело к hFcгамма (Jackson Immunoresearch), добавляли из расчета 1:400 и образцы инкубировали в течение 1 ч на льду в темноте с аккуратным встряхиванием. После финальной промывки клетки ресуспендировали в 100 мкл буфера FACS, содержащего 0,2 мкг/мл DAPI, с последующим считыванием на устройстве для проточной цитометрии (анализатор клеток BD LSRFortessa; № по кат. 647177). Среднюю интенсивность флуоресценции (MFI) живых одиночных клеток рассчитывали в Fgowjo 10.0.8 и результаты экспортировали в Graphpad Prism6 для определения ЕС50.For this, CCR7-positive cells were harvested (adherent cells were separated with accutase), washed twice with FACS buffer (PBS/3% FCS/0.02% sodium azide) and diluted to about 2x106 cells/ml in FACS buffer. All subsequent steps were performed on ice to prevent internalization of the receptor. 100 μl of cell suspension/well was transferred to 9b-well U-bottom plates (Falcon). 2x105 cells/well were incubated with a serial dilution of the anti-CCR7 antibody of interest, with the antibody concentration varied over several orders of magnitude, from the highest 100 nM, for 60 min at 4°C with gentle shaking. After incubation, cells were centrifuged (1200 rpm, 2 min, 4°C) and washed three times with FACS buffer. A detection antibody, APC fluorophore-conjugated anti-hFcgamma antibody (Jackson Immunoresearch), was added at a rate of 1:400 and samples were incubated for 1 hour on ice in the dark with gentle shaking. After a final wash, the cells were resuspended in 100 µl of FACS buffer containing 0.2 µg/ml DAPI, followed by a flow cytometry device (BD LSRFortessa Cell Analyzer; Cat # 647177). Mean fluorescence intensity (MFI) of live single cells was calculated in Fgowjo 10.0.8 and the results exported to Graphpad Prism6 for EC 50 determination.
Селективность оценивали путем измерения наблюдаемых аффинностей связывания с изогенной парой клеток, сконструированных для сверхэкспрессии CCR7, а также с линиями клеток, экспрессирующих паралоги CCR7, например, CCR9, CCR6, CXCR4 и CCR8. Все антитела к CCR7 связывались специфически образом только с клетками, экспрессирующими CCR7, как показано в табл. 7 ниже.Selectivity was assessed by measuring observed binding affinities to an isogenic pair of cells engineered to overexpress CCR7 as well as to cell lines expressing CCR7 paralogs, eg CCR9, CCR6, CXCR4 and CCR8. All anti-CCR7 antibodies bound in a specific manner only to cells expressing CCR7, as shown in Table 1. 7 below.
- 167 042529- 167 042529
Таблица 7. Связывание различных антител к CCR7 с клетками, экспрессирующими CCR7Table 7. Binding of various anti-CCR7 antibodies to cells expressing CCR7
В аналогичном эксперименте антитела тестировали на перекрестную реактивность с применением наборов сконструированных изогенно-совпадающих линий клеток (серия NIH3T3) и CD4 Т клеток, ко торые очищали из нескольких партий РВМС от здоровых доноров, а также яванских макаков, крыс Вистар и мышей CD-1. Обнаружили, что все антитела специфически связывают CCR7 человека и яванского макака при аналогичных наблюдаемых аффинностях, как показано в табл. 8 и 9 ниже. Только негуманизированное антитело 121G12 характеризуется перекрестной реактивностью в отношении молекулы гры зунов.In a similar experiment, antibodies were tested for cross-reactivity using sets of engineered isogenically matched cell lines (NIH3T3 series) and CD4 T cells, which were purified from several batches of PBMCs from healthy donors, as well as cynomolgus macaques, Wistar rats, and CD-1 mice. All antibodies were found to specifically bind human and cynomolgus monkey CCR7 with similar observed affinities as shown in Table 1. 8 and 9 below. Only the non-humanized 121G12 antibody is cross-reactive with the rodent molecule.
Чтобы определить влияние плотности рецепторов на наблюдаемую аффинность, и, следовательно, вклада авидности в связывание антитела с клеткой, проводили титриметрические эксперименты FACS на линиях раковых клеток, экспрессирующих CCR7 человека на различных уровнях экспрессии, и нормаль- 168042529 ных CCR7-положительных Т клетках, происходящих из РВМС. Количественное определение рецепторов проводили с помощью FACS с применением микросфер от Bangs Laboratories в качестве стандартов подсчета импульсов и следовали инструкциям производителя. Иллюстративные результаты показаны в табл.To determine the effect of receptor density on observed affinity, and hence the contribution of avidity to antibody-cell binding, FACS titrimetric experiments were performed on cancer cell lines expressing human CCR7 at various expression levels and normal CCR7-positive T cells derived from from RVMS. Receptor quantitation was performed by FACS using microspheres from Bangs Laboratories as counting standards and following the manufacturer's instructions. Illustrative results are shown in table.
ниже.below.
Для всех антител к CCR7 показан значительный вклад авидности в наблюдаемую аффинность, и сила связывания снижалась в зависимости от плотности рецепторов. В частности, для 121G12 показано значительно более слабое связывание на клетках с низким уровнем экспрессии CCR7, представленных нормальными CD4+ Т клетками, по сравнению с раковыми клетками DEL, являющимися представителями клеток, для которых показано его применение.All antibodies to CCR7 showed a significant contribution of avidity to the observed affinity, and the binding strength decreased depending on the density of the receptors. In particular, 121G12 shows significantly weaker binding on low CCR7 cells, represented by normal CD4 + T cells, compared to DEL cancer cells, representative of the cells for which it is indicated.
Относительно низкая аффинность конкретного 121G12, которое продемонстрировало самый сильный эффект авидности среди всех антител к CCR7, является оптимальной для использования отличия в плотности рецепторов между нормальными и раковыми клетками в качестве метода для смещения связывания антитела в направлении раковых клеток.The relatively low affinity of particular 121G12, which showed the strongest avidity effect of any anti-CCR7 antibody, is optimal for using the difference in receptor density between normal and cancer cells as a method to shift antibody binding towards cancer cells.
Связывание с рекомбинантным hCCR7 в ELISABinding to recombinant hCCR7 in ELISA
Связывание и аффинность также оценивали в анализе на основе ELISA с применением рекомбинантного CCR7 (Origene, № ТР306614). 384-луночные планшеты Maxisorp™ (Thermo Nunc) покрывали с помощью 3,5 мкг/мл рекомбинантного CCR7, разведенного в PBS. После блокирования с помощью 3% BSA (бычий сывороточный альбумин) в PBS в течение 1 ч при комнатной температуре, промывки планшетов Зх с помощью PBS-Т (0,01% Tween 20 в PBS), добавляли последовательные разведения первичных антител и инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре. Планшеты промывали вновь и связавшиеся антитела обнаруживали посредством инкубации с 1:5000 антителом к hFc-гамма, конъюгированным с пероксидазой хрена (HRP; Jackson Immunoresearch, № по кат. 115-035-098), в течение 1 ч при комнатной температуре с последующей промывкой помощью PBS-Т и последующего добавления субстрата для пероксидазы SureBlue (KPL, № 52-00-03). Спустя 15 мин регистрировали поглощение при 650 нм и анализировали в GraphPad Prism6.Binding and affinity were also evaluated in an ELISA-based assay using recombinant CCR7 (Origene, No. TP306614). Maxisorp™ 384-well plates (Thermo Nunc) were coated with 3.5 μg/ml recombinant CCR7 diluted in PBS. After blocking with 3% BSA (bovine serum albumin) in PBS for 1 hour at room temperature, washing the 3x plates with PBS-T (0.01% Tween 20 in PBS), serial dilutions of primary antibodies were added and incubated for 1 h at room temperature. Plates were washed again and bound antibodies were detected by incubation with 1:5000 horseradish peroxidase conjugated anti-hFc-gamma antibody (HRP; Jackson Immunoresearch, Cat # 115-035-098) for 1 hour at room temperature followed by washing using PBS-T followed by the addition of SureBlue peroxidase substrate (KPL, no. 52-00-03). After 15 min, absorbance was recorded at 650 nm and analyzed in GraphPad Prism6.
Все протестированные антитела к CCR7 способны к связыванию рекомбинантного hCCR7 (табл. 11; фиг. 3).All anti-CCR7 antibodies tested were capable of binding recombinant hCCR7 (Table 11; Fig. 3).
Таблица 11. Аффинность связывания гуманизированных антител к CCR7 с рекомбинантным hCCR7Table 11 Binding affinity of humanized anti-CCR7 antibodies to recombinant hCCR7
Связывание с двойными FabGraftBinding with double FabGraft
FabGraft ELISA проводили для оценки связывания с эпитопом минимальной протяженности, который содержит N-конец и ЕС2 из CCR7. Вкратце, 384-луночные планшеты Maxisorp™ (Thermo Nunc) покрывали с помощью 5 мкг/мл FabGraft. Во всем остальном следовали общей инструкции для протокола ELISA, как описано выше. Все антитела к CCR7 способны к связыванию с двойными FabGraft, как показано в табл. 12 ниже.FabGraft ELISA was performed to assess binding to the minimum length epitope that contains the N-terminus and EC2 from CCR7. Briefly, Maxisorp™ 384-well plates (Thermo Nunc) were coated with 5 μg/ml FabGraft. In all other respects, the general instructions for the ELISA protocol were followed as described above. All anti-CCR7 antibodies are capable of binding to FabGraft doubles as shown in Table 1. 12 below.
Таблица 12. Аффинность связывания гуманизированных антител к CCR7 с FabGraftTable 12. Binding affinity of humanized anti-CCR7 antibodies to FabGraft
Оценка pH-зависимости в ELISA с применением VLPpH-dependency assessment in ELISA using VLP
Известно, что CCL19, связавшийся с CCR7, подвергается интернализации как комплекс рецептор- 169042529 лиганд. Однако, в то время как CCR7 рециклируется обратно на поверхность клетки, CCL19 сортируется в лизосому для разложения, что показывает противоположную судьбу CCR7 и его лиганда, подвергнутых эндоцитозу (Otero et al., J Immunol 2006; 177:2314-2323). Для приводящего к нужному эффекту ADC к CCR7 предпочтительно, чтобы антитело вело себя аналогично лиганду, например, подвергалось быстрой интернализации, но не рециклировалось обратно вместе с CCR7. Чтобы достичь этого, авторы настоящего изобретения обеспечивали отбор pH-зависимых антител, которые будут проявлять более слабое связывание с CCR7 в условиях низкого pH.CCL19 bound to CCR7 is known to be internalized as a receptor-169042529 ligand complex. However, while CCR7 is recycled back to the cell surface, CCL19 is sorted into the lysosome for degradation, showing the opposite fate of endocytotic CCR7 and its ligand (Otero et al., J Immunol 2006; 177:2314-2323). For an anti-CCR7 ADC to have the desired effect, it is preferred that the antibody behave similarly to the ligand, eg, be rapidly internalized but not recycled back along with CCR7. To achieve this, the authors of the present invention ensured the selection of pH-dependent antibodies that will exhibit weaker binding to CCR7 under low pH conditions.
Для оценки pH-зависимости антител к CCR7 проводили ELISA с применением вирусоподобных частиц (VLP), экспрессирующих CCR7. Вкратце, 384-луночные планшеты Maxisorp™ (Thermo Nunc) покрывали с помощью 25 мкг/мл VLP. Первичные антитела инкубировали либо в буфере с pH 5,8 (1:1; dH2O:0,l M цитратный буфер, 150 мМ NaCl) или буфере с pH 7,4. Во всем остальном следовали общей инструкции для протокола ELISA, как описано выше.To assess the pH-dependence of antibodies to CCR7, ELISA was performed using virus-like particles (VLP) expressing CCR7. Briefly, Maxisorp™ 384-well plates (Thermo Nunc) were coated with 25 μg/ml VLP. Primary antibodies were incubated either in pH 5.8 buffer (1:1; dH 2 O:0.1 M citrate buffer, 150 mM NaCl) or pH 7.4 buffer. In all other respects, the general instructions for the ELISA protocol were followed as described above.
При использовании целого ряда гуманизированных вариантов для каждого кандидата сравнение связывания антител при нейтральном (7,4) и кислом (5,8) pH показало, что все антитела-кандидаты к CCR7 характеризуются улучшенной аффинностью при pH 7,4 (табл. 13). Нижеприведенные объекты были выбраны на основании их самой большой pH-зависимости, в числе других признаков.Using a range of humanized variants for each candidate, a comparison of antibody binding at neutral (7.4) and acidic (5.8) pH showed that all CCR7 candidate antibodies had improved affinity at pH 7.4 (Table 13). The objects below were selected based on their highest pH dependence, among other features.
Таблица 13. pH-зависимость связывания гуманизированных антител к CCR7 с VLP, _____________________экспрессирующими CCR7_________________Table 13. pH-dependence of the binding of humanized anti-CCR7 antibodies to VLPs _____________________expressing CCR7_________________
Анализ с b-аррестиномb-arrestin assay
Чтобы определить функциональность антител к CCR7 проводили анализ с β-аррестином с применением набора для обнаружения импульса PathHunter от DiscoverX (№ 93-0247) либо в режиме агониста для оценки агонистической функции, либо в режиме антагониста для оценки антагонистической функ ции.To determine the functionality of anti-CCR7 antibodies, a β-arrestin assay was performed using DiscoverX's PathHunter Pulse Detection Kit (No. 93-0247) in either agonist mode to assess agonist function or antagonist mode to assess antagonist function.
В случае режима агониста CHO-flpin-hCCR7 (разработанная DiscoverX линия клеток, экспрессирующих hCCR7 с меткой ProLink, β-аррестин-ЕА) высевали из расчета 8х104 клеток/лунка в 20 мкл/лунка ростовой среды (среда F-12 Хэма/Glutamax; Invitrogen+10% FBS+0,5 мг/мл G418+0,2 мг/мл гигромицина В; Invitrogen+5 мкг/мл бластицидина; Gibco) с 100 нг/мл Dox в 384-луночные планшеты, покрытые металлическими крышками, инкубировали при 37°С, 5% CO2 в течение ночи. На следующий день последовательное разведение 5х рабочего раствора в 1х буфере для анализа (20 мМ HEPES/0,1% BSA/1x HBSS, pH 7,4) выполняли для тестируемых антител или положительного контроля с применением лиганда hCCL19 (R&D, 361/MI-025/CF). В каждую лунку добавляли по 5 мкл 5х рабочего раствора антител или лиганда, проводили быстрое центрифугирование и инкубировали при 37°С/5% CO2 в течение 2 ч. После инкубации в каждую лунку добавляли по 25 мкл реагента для обнаружения, инкубировали при комнатной температуре в темноте при встряхивании в течение 20 мин. Затем измеряли сигнал люминесценции на приборе Envision, чтобы определить активность фермента. Наконец, активность фермента анализировали с применением Excel.In the case of the CHO-flpin-hCCR7 agonist regimen (a cell line developed by DiscoverX expressing hCCR7 labeled with ProLink, β-arrestin-EA) was plated at 8x10 4 cells/well in 20 µl/well of growth medium (Ham's F-12/Glutamax medium ; Invitrogen+10% FBS+0.5 mg/mL G418+0.2 mg/mL hygromycin B; Invitrogen+5 µg/mL blasticidin; Gibco) with 100 ng/mL Dox in 384-well plates covered with metal caps, incubated at 37°C, 5% CO 2 overnight. The following day, serial dilutions of 5x working solution in 1x assay buffer (20 mM HEPES/0.1% BSA/1x HBSS, pH 7.4) were performed on test antibodies or a positive control using hCCL19 ligand (R&D, 361/MI- 025/CF). 5 µl of 5x working solution of antibodies or ligand was added to each well, fast centrifuged and incubated at 37°C/5% CO2 for 2 h. After incubation, 25 µl of detection reagent was added to each well, incubated at room temperature in dark with shaking for 20 min. The luminescence signal was then measured on an Envision instrument to determine enzyme activity. Finally, enzyme activity was analyzed using Excel.
В режиме антагониста клетки CHO-flpin-hCCR7 высевали, как описано выше. На следующий день 6х рабочий раствор (0,5 мкМх6=3,0 мкМ) в 1х буфере для анализа получали для каждого тестируемого антитела или МАВ197 положительного контроля (эталонное антитело; лиганд-антагонист от R&D) или hlgG отрицательного контроля. В каждую лунку добавляли по 5 мкл 6х рабочего раствора антител или контролей, проводили быстрое центрифугирование и инкубировали при 37°С/5% СО2 в течение 30 мин. Во время инкубации выполняли последовательные разведения 6х рабочего раствора hCCL19 в 1х буфере для анализа. После инкубации в каждую лунку добавляли по 5 мкл 6х рабочего раствора hCCL19, проводили быстрое центрифугирование и инкубировали при 37°С/5% СО2 в течение 90 мин. После инкубации в каждую лунку добавляли по 25 мкл реагента для обнаружения, инкубировали при комнатной температуре в темноте при встряхивании в течение 20 мин. Затем измеряли сигнал люминесценции на приборе Envision, чтобы определить активность фермента, и анализировали с помощью Excel.In antagonist mode, CHO-flpin-hCCR7 cells were seeded as described above. The following day, a 6x working solution (0.5 μM x 6 = 3.0 μM) in 1x assay buffer was prepared for each test antibody, either a MAB197 positive control (reference antibody; antagonist ligand from R&D) or a hlgG negative control. 5 μl of 6x working solution of antibodies or controls was added to each well, fast centrifugation was performed and incubated at 37°C/5% CO 2 for 30 min. During incubation, serial dilutions of 6x hCCL19 working solution were performed in 1x assay buffer. After incubation, 5 µl of 6x hCCL19 working solution was added to each well, fast centrifugation was performed and incubated at 37°C/5% CO 2 for 90 min. After incubation, 25 μl of detection reagent was added to each well, incubated at room temperature in the dark with shaking for 20 min. The luminescence signal was then measured on an Envision instrument to determine enzyme activity and analyzed using Excel.
Ни одно из исходных антител к CCR7 не продемонстрировало активность в модели агониста (фиг. 4А). Однако при анализе в формате антагониста 506Е15 и 121G12 идентифицировали как сильных антагонистов, например, антител, блокирующих связывание с лигандом (фиг. 4В, 4С). 674J12 представляет собой нейтральное антитело, не блокирующее связывание с лигандом. 684Е12 представляет собой слабого антагониста.None of the original anti-CCR7 antibodies showed activity in the agonist model (FIG. 4A). However, when analyzed in antagonist format, 506E15 and 121G12 were identified as strong antagonists, eg, antibodies blocking ligand binding (FIGS. 4B, 4C). 674J12 is a neutral antibody that does not block ligand binding. 684E12 is a weak antagonist.
- 170 042529- 170 042529
Анализ конкурентного связывания в FACS с применением лигандаCompetition binding analysis in FACS using a ligand
Чтобы подтвердить то, что антитело конкурирует с лигандом CCR7, проводили FACS-анализ в присутствии избыточной концентрации лиганда. FACS-анализ проводили, как описано выше. В протокол вносили некоторые изменения, например, CCL19 поддерживали при постоянной концентрации 1 мкМ, в то время как концентрация первичного антитела, которое одновременно применяли к клеткам DEL, варьировала в диапазоне нескольких порядков, начиная с самой высокой концентрации 100 нМ. После 30минутного периода инкубации в ледяном буфере FACS клетки промывали, в течение 15 мин применяли вторичное антитело к hFc, конъюгированное с РЕ, и MFI определяли, как описано выше.To confirm that the antibody competes with the CCR7 ligand, a FACS analysis was performed in the presence of an excess concentration of the ligand. FACS analysis was performed as described above. Some changes were made to the protocol, for example, CCL19 was maintained at a constant concentration of 1 μM, while the concentration of the primary antibody, which was simultaneously applied to DEL cells, varied in the range of several orders of magnitude, starting with the highest concentration of 100 nM. After a 30 minute incubation period in ice-cold FACS buffer, cells were washed, a PE-conjugated secondary anti-hFc antibody was applied for 15 minutes, and MFI was determined as described above.
На фиг. 5 показано, что на гуманизированное CysMab.DAPA 674J13 не влияло присутствие избытка CCL19, что подтверждает его нейтральную функциональность. На аффинность связывания гуманизированных CysMab.DAPA 121G12 и 506Е15 действительно сильно влияло присутствие избытка лиганда.In FIG. 5 shows that humanized CysMab.DAPA 674J13 was not affected by the presence of excess CCL19, confirming its neutral functionality. The binding affinity of the humanized CysMab.DAPA 121G12 and 506E15 was indeed strongly affected by the presence of excess ligand.
Способность к интернализации в различных линиях клеток, характеризующихся диапазоном плотности рецепторовThe ability to internalize in various cell lines characterized by a range of receptor densities
Другим аспектом приводящего к нужному эффекту ADC к CCR7 является гарантия оптимального использования дифференциального распределение экспрессии CCR7. В качестве представителя нормальных клеток, экспрессирующих CCR7, CD4+ Т-клетки выделяли из РВМС здоровых доноров. Кроме того, отобрали целый ряд CCR7-положительных линий раковых клеток, проявляющих диапазон плотностей рецепторов. Авторы настоящего изобретения специально выбрали антитела с более слабой наблюдаемой аффинностью связывания при FACS с CCR7+ Т-клетками относительно CCR7+ раковых клеток. Кроме того, в данном документе описан анализ pHrodo, в котором флуорофорная метка, активируемая низким pH, на антителах к CCR7 используется для оценки того, как измеренный по флуоресценции захват антитела клетками коррелирует с плотностью рецепторов. Предпочтительно свести к минимуму захват антитела нормальными клетками, чтобы получить максимальное терапевтическое окно.Another aspect of effecting ADC to CCR7 is to ensure that the differential distribution of CCR7 expression is optimally utilized. As a representative of normal cells expressing CCR7, CD4+ T cells were isolated from PBMCs of healthy donors. In addition, a variety of CCR7-positive cancer cell lines exhibiting a range of receptor densities were selected. The authors of the present invention specifically chose antibodies with a weaker observable binding affinity in FACS with CCR7+ T cells relative to CCR7+ cancer cells. In addition, this document describes the pHrodo assay, in which a low pH-activated fluorophore label on anti-CCR7 antibodies is used to evaluate how fluorescence-measured antibody uptake by cells correlates with receptor density. It is preferable to minimize antibody uptake by normal cells in order to maximize the therapeutic window.
Вкратце, мечение антитела к CCR7 в формате CysMab с помощью малеимида-pHrodo (ThermoFisher) проводили следуя инструкциям производителя с получением объектов с DAR=4 (отношение лекарственного средства, например, флуорофора, к антителу). FACS-анализ проводили, как описано выше. В протокол вносили некоторые изменения, например, чтобы обеспечить возможность интернализации, первичное антитело инкубировали из расчета 5 мкг/мл с клетками при 37°С в среде для культивирования в течение 6 ч, затем промывали с помощью ледяного буфера FACS, содержащего азид натрия, для прекращения реакции.Briefly, labeling of an anti-CCR7 antibody in CysMab format with maleimide-pHrodo (ThermoFisher) was performed following the manufacturer's instructions to obtain objects with DAR=4 (ratio of drug, eg, fluorophore, to antibody). FACS analysis was performed as described above. Some changes were made to the protocol, for example, to allow for internalization, the primary antibody was incubated at 5 μg/ml with cells at 37°C in culture medium for 6 h, then washed with ice-cold FACS buffer containing sodium azide to termination of the reaction.
В табл. 14 ниже обобщена способность к интернализации у трех антител с применением целого ряда из линий клеток. В качестве контроля применяли ненацеленное антитело, меченное с помощью pHrodo, и было установлено, что сигнал фонового шума составляет до 400 MFI, например, опосредованный нецелевым взаимодействием захват конъюгата антитела. Данные показывают, что для всех трех антител к CCR7 требуются уровни рецептора CCR7 в диапазоне, который является типичным для большинства CCR7+ линий раковых клеток, например более 20000 рецепторов, чтобы эффективно подвергаться интернализации и накапливать конъюгированное вещества, в то же время не попадать в нормальные CD4+ Т-клетки.In table. 14 below summarizes the internalization capacity of three antibodies using a range of cell lines. An untargeted pHrodo-labeled antibody was used as a control and the background noise signal was found to be up to 400 MFI, eg, off-target-mediated capture of the antibody conjugate. The data show that all three anti-CCR7 antibodies require CCR7 receptor levels in the range that is typical of most CCR7+ cancer cell lines, e.g. over 20,000 receptors, to be efficiently internalized and accumulate the conjugate, while avoiding normal CD4s. + T cells.
Таблица 14. Способность к интернализации у различных антител к CCR7Table 14. Internalization capacity of various anti-CCR7 antibodies
Эпитоп-специфическая сортировка с применением системы Octet Red96Epitope-specific sorting using the Octet Red96 system
Эпитоп-специфическую сортировку исходных антител к hCCR7 проводили с применением системы Octet Red96 (ForteBio, США), которая проводит биослойную интерферометрию (BLI). ИммуногенныйEpitope-specific sorting of initial antibodies to hCCR7 was performed using the Octet Red96 system (ForteBio, USA), which performs biolayer interferometry (BLI). Immunogenic
- 171 042529 остов CCR7 биотинилировали с помощью AviTag™ с использованием биотинлигазы BirA в соответствии с рекомендациями производителя (Avidity, LLC, США № по кат. BirA500). Биотинилированный иммуногенный остов загружали из расчета 1,5 мкг/мл на предварительно уравновешенные стрептавидиновые сенсоры (ForteBio, США). Затем сенсоры переносили в раствор, содержащий 100 нМ антитела А в 1х буфере для кинетического анализа (ForteBio, США). Сенсоры быстро промывали в 1х буфере для кинетического анализа и переносили во второй раствор, содержащий 100 нМ антитела-конкурента. Кинетику связывания определяли на основании необработанных данных с применением программного обеспечения для анализа системы Octet Red96 (версия 6.3, ForteBio, США). Антитела тестировали во всех попарных комбинациях в качестве как антитела А, так и антитела-конкурента.- 171 042529 the CCR7 backbone was biotinylated with AviTag™ using BirA biotin ligase according to the manufacturer's recommendations (Avidity, LLC, US cat. no. BirA500). The biotinylated immunogenic backbone was loaded at a rate of 1.5 µg/ml onto pre-balanced streptavidin sensors (ForteBio, USA). Then the sensors were transferred into a solution containing 100 nM antibody A in 1x buffer for kinetic analysis (ForteBio, USA). The sensors were washed briefly in 1x kinetic assay buffer and transferred to a second solution containing 100 nM competitor antibody. Binding kinetics were determined from raw data using Octet Red96 system analysis software (version 6.3, ForteBio, USA). Antibodies were tested in all pairwise combinations as both antibody A and antibody competitor.
Таблица 15. Результаты сортировки антителTable 15 Antibody Sorting Results
Картирование эпитопов с применением мутаций CCR7 Дополнительное картирование эпитопов проводили с использованием линий клеток с мутантным CCR7. Создавали линии клеток NIH/3T3, экспрессирующих варианты CCR7 человека с мутациями. Мутации вводили в специфические положения для замены остатка CCR7 человека на соответствующий остаток CCR7 мыши. Введенные мутации охватывали D35E, F44Y, L47V, S49F, D198G, R201K, S202N, S204G, Q206D, А207Т, M208L, I213V, T214S, Е215А и H216Q. Конструкции плазмид с мутантным CCR7 создавали посредством сайт-направленного мутагенеза и вводили в клетки NIH/3T3 с получением линий клеток со стабильной экспрессией. Специфическое связывание антител-кандидатов с каждой линией клеток с мутантным CCR7 оценивали посредством проточной цитометрии. Клетки тщательно ополаскивали PBS и обрабатывали аккутазой (Millipore, № SCR005) для отделения от ростовых планшетов и ресуспендировали из расчета примерно 1 х 105 клеток/90 мкл в 1х буфере FACS (2% FBS + 0,1% NaN3 в PBS). 10 мкл 10х раствора антитела в буфере FACS предварительно вносили в 96-луночный планшет с U-образным дном и добавляли 90 мкл клеточной суспензии. Клетки инкубировали в течение 30 мин при 4°С, промывали 1х с помощью холодного PBS и ресуспендировали в 100 мкл вторичного антитела, разведенного 1:500 в 1х буфере FACS (конъюгированный с аллофикоцианином F(ab')2 козы к IgG человека, Fcγ-сnецифический; Jackson Immunoresearch, № по кат. 109-136-098). После дополнительной инкубации в течение 15 мин при 4°С, клетки промывали дважды с помощью PBS и ресуспендировали в 100 мкл 1х буфера FACS+4 мкг/мл пропидия йодида (Life Technologies, № по кат. Р3566). Геометрическое среднее интенсивности флуоресценции рассчитывали на живых одиночных клетках с применением FlowJo и наносили на график как % от геометрического среднего интенсивности флуоресценции при CCR7 WT.Epitope Mapping Using CCR7 Mutations Additional epitope mapping was performed using cell lines with mutant CCR7. NIH/3T3 cell lines expressing mutated human CCR7 variants were created. Mutations were introduced at specific positions to replace the human CCR7 residue with the corresponding mouse CCR7 residue. The introduced mutations covered D35E, F44Y, L47V, S49F, D198G, R201K, S202N, S204G, Q206D, A207T, M208L, I213V, T214S, E215A and H216Q. Mutant CCR7 plasmid constructs were generated by site-directed mutagenesis and introduced into NIH/3T3 cells to obtain cell lines with stable expression. The specific binding of candidate antibodies to each mutant CCR7 cell line was assessed by flow cytometry. Cells were thoroughly rinsed with PBS and treated with accutase (Millipore, # SCR005) to separate from growth plates and resuspended at approximately 1 x 10 5 cells/90 μl in 1 x FACS buffer (2% FBS + 0.1% NaN3 in PBS). 10 µl of a 10x antibody solution in FACS buffer was preliminarily added to a 96-well U-bottomed plate and 90 µl of the cell suspension was added. Cells were incubated for 30 min at 4°C, washed 1x with cold PBS and resuspended in 100 µl of secondary antibody diluted 1:500 in 1x FACS buffer (conjugated with goat allophycocyanin F(ab') 2 to human IgG, Fcγ- specific; Jackson Immunoresearch, p/n 109-136-098). After an additional 15 min incubation at 4° C., the cells were washed twice with PBS and resuspended in 100 μl of 1x FACS buffer+4 μg/ml propidium iodide (Life Technologies, Cat # P3566). Geometric mean fluorescence intensity was calculated on live single cells using FlowJo and plotted as % of geometric mean fluorescence intensity at CCR7 WT.
Измеренные на основе ЕС50 показатели аффинности в отношении CCR7 с точковыми мутациями показали, что все протестированные антитела характеризуются различными профилями связывания, что свидетельствует о различном использовании конформационного эпитопа (фиг. 6). Из всех показанных антител 506Е15 характеризуется характером связывания, наиболее сходным с таковым МАВ197, например, для обоих показано значимое резкое снижение аффинности связывания, когда остатки F44 или L47 на N-конце CCR7 мутированы, и отсутствие снижения, когда мутированы М208 или I213 в петле ЕС2. По-видимому, 121G12 и 674J13 используют различный набор критических точек контакта в пределах пространства конформационного эпитопа, поскольку они отличаются от МАВ197 по меньшей мере 4 из 8 протестированных точковых мутаций.Measured on the basis of EC 50 affinities for CCR7 with point mutations showed that all tested antibodies have different binding profiles, indicating a different use of the conformational epitope (Fig. 6). Of all the antibodies shown, 506E15 has a binding pattern most similar to that of MAB197, e.g., both show a significant dramatic decrease in binding affinity when the F44 or L47 residues at the N-terminus of CCR7 are mutated, and no decrease when M208 or I213 are mutated in the EC2 loop . It appears that 121G12 and 674J13 use a different set of critical contact points within the conformational epitope space as they differ from MAB197 in at least 4 of the 8 point mutations tested.
Пример 4. Создание и определение характеристик конгьюгатов антитела к CCR7 и лекарственного средстваExample 4 Creation and Characterization of Anti-CCR7 Antibody Drug Conjugates
В нижеприведенном разделе, мкл используется для обозначения микролитра. Аналогичным образом мкМ используется для микромоль/л; а мкм используется для обозначения микрометра.In the section below, µl is used to refer to the microliter. Similarly, µM is used for micromoles/l; and µm is used to refer to a micrometer.
- 172 042529- 172 042529
Пример 4А. Получение конгьюгата антитела и лекарственного средстваExample 4A. Obtaining an antibody-drug conjugate
121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4
HEPES 25 мМ, рН=7,60 сорастворитель DM Ас (прибл. 10%)HEPES 25 mM, pH=7.60 co-solvent DM Ac (approx. 10%)
20С20C
Конъюгация очищенных 121G12.CysMab.DAPA и MPET.DM4 Исходным материалом служило антитело 121G12.CysMab.DAPA при 127 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в буфере на основе 10 мМ гидрохлорида гистидина. К 7,9 мл антитела (1003 мг) добавляли 16 мл 0,5 М фосфата натрия, pH 8 (Teknova S1280), проверяли, чтобы pH составлял >7, затем антитело абсорбировали на 100,3 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I) в течение 25 мин с аккуратным перемешиванием круговыми движениями при комнатной температуре. Смолу, загруженную из расчета 10 мг Ab/мл слоя, промывали с помощью 15 объемов слоя 1х буфера PBS (Hyclone SH30256.02) посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм (Nalgene 567-0020), помещаемое на горлышко бутылки, затем ресуспендировали в 100,3 мл 1х PBS с получением 50% взвеси.Conjugation of purified 121G12.CysMab.DAPA and MPET.DM4 The starting material was the 121G12.CysMab.DAPA antibody at 127 mg/ml (for a 10 mg/ml IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7) in a buffer based on 10 mM hydrochloride histidine. To 7.9 ml of antibody (1003 mg) was added 16 ml of 0.5 M sodium phosphate, pH 8 (Teknova S1280), checked that the pH was >7, then the antibody was absorbed onto 100.3 ml of RMP Resin with Protein A (GE Healthcare 1-223BPO/I) for 25 minutes with gentle swirling at room temperature. Resin loaded at 10 mg Ab/mL layer was washed with 15 layer volumes of 1x PBS buffer (Hyclone SH30256.02) by vacuum filtration through a 0.2 µm filter device (Nalgene 567-0020) placed on neck of the bottle, then resuspended in 100.3 ml of 1x PBS to obtain a 50% slurry.
К взвеси добавляли 4329 мкл 0,5 М цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 М фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar A16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 30 мин, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1х PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 10 0,3 мл 1х PBS (50% взвесь) и добавляли 1003 мкл 100 мкМ CuCl2 (Aldrich 751944) (суммарно 500 нМ Cu2 +) для инициирования повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора эталонного малеимида (пример 3, стр. 110 в WO 2015/095301), который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 мин, центрифугирования при 7000xg в течение 10 с, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000xg в течение 10 с, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°С) колонку 4,6x50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000А), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH3CN/b воде (Milllipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH3CN/b воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 мин и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.To the slurry was added 4329 μl of 0.5 M cysteine (Sigma G121-03) formulated in 0.5 M phosphate, pH 8, to which NaOH (Alfa Aesar A16037) was added at a ratio of 13.6 g/l. The slurry was stirred occasionally by rotating the vessel at room temperature for 30 minutes, then washed by vacuum filtration through a 0.2 µm filter device placed on the neck of the bottle with 50 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration cycles. and additions. The washed resin was resuspended in 100.3 ml of 1x PBS (50% slurry) and 1003 μl of 100 μM CuCl 2 (Aldrich 751944) (total 500 nM Cu 2 + ) was added to initiate re-oxidation. Reoxidation of the antibody was tested by removing a 30 µl aliquot of the suspension, adding 1 µl of a 20 mM reference maleimide stock solution (Example 3, page 110 in WO 2015/095301), which is known to shift the antibody peak in RPLC, mixing for 1 min, centrifuge at 7000xg for 10s, remove supernatant, add 60µl IgG Thermo elution buffer (Thermo Scientific 21009), centrifuge at 14000xg for 10s, sample supernatant and analyze products by RPLC as follows: 2-µl the sample was injected into a heated (80°C) 4.6x50 mm Agilent PLRP-S column (particles 5 μm, pore size 4000A) equilibrated with 0.1% trifluoroacetic acid in 29.5% CH 3 CN/b water (Milllipore TX1280P- 1, Burdick and Jackson 407-4) at a flow rate of 1.5 ml/min. The column was eluted with a 5 minute gradient to 44.5% CH 3 CN/b water, maintained at this concentration for 1.9 minutes and the peaks were determined at 280 nm. The optimal time for conjugation is defined as the time at which the peak of the main product reaches its maximum value, the peaks with later elution are minimized, and the peaks with earlier elution no longer increase.
Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 60 мин), добавляли 3010 мкл 20 мМ исходного раствора MPET.DM4 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 30 мин. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.When RPLC analysis showed that reoxidation was optimal (in this case 60 min), 3010 µl of a 20 mM stock solution of MPET.DM4 in DMSO was added and the slurry was gently mixed occasionally by swirling the vessel at room temperature for 30 min. The slurry was then washed with 20 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration and addition cycles.
Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (201 мл) нейтрализовали с помощью 20,1 мл 0,5 М фосфата натрия, pH 8, затем концентрировали до 60 мл с применением центрифужных концентраторов (Amicon UFC905024) при 3000xg. Затем концентрат наносили на буферообменные колонки 24 х PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1х PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя.The slurry was then transferred to a porous glass filter column (Pierce 7375021), preliminarily eluted with 0.5 bed volumes of IgG Thermo elution buffer (discarded), then eluted with 2 bed volumes of the same buffer. The entire eluate (201 ml) was neutralized with 20.1 ml of 0.5 M sodium phosphate, pH 8, then concentrated to 60 ml using centrifuge concentrators (Amicon UFC905024) at 3000xg. The concentrate was then applied to 24 x PD-10 buffer exchange columns (GE Healthcare 17-0851-01) equilibrated with 1 x PBS, loading 2.5 ml concentrate and eluting with 3.5 ml 1 x PBS as recommended by the manufacturer.
Для исследований стабильности материал объединяли с партией, полученной идентичным образом, для обеспечения 2 г исходного материала. Объединенный материал интенсивно диализировали (колбаFor stability studies, the material was combined with a batch prepared in an identical manner to provide 2 g of starting material. The pooled material was extensively dialyzed (flask
- 173 042529- 173 042529
Slidealyzer, Thermo Scientific 87762) против буфера на основе 10 мМ хлорида гистидина, pH 5 (гистидин от JTBaker 2080-05), концентрировали до -30 мг/мл, затем добавляли сахарозу (Millipore 1.00892.1003) и Tween 20 (JTBaker 4116-04) до 240 мМ и 0,02 об./об.% соответственно. Для избытка материала, который не требовался для исследований стабильности, проводили обратную замену буфера на 1х PBS. Образцы разделяли на аликвоты, подвергали быстрому замораживанию с помощью жидкого азота и хранили при 80°С. Конечные концентрации составляли 23,9 мг/мл для материала, составленного для тестирования стабильности, и 18,9 мг/мл для материала, составленного в 1х PBS.Slidealyzer, Thermo Scientific 87762) against 10 mM histidine chloride buffer, pH 5 (histidine from JTBaker 2080-05), concentrated to -30 mg/ml, then sucrose (Millipore 1.00892.1003) and Tween 20 (JTBaker 4116- 04) up to 240 mM and 0.02% v/v, respectively. For excess material that was not required for stability studies, buffer back exchange was carried out with 1x PBS. The samples were divided into aliquots, subjected to rapid freezing with liquid nitrogen and stored at 80°C. Final concentrations were 23.9 mg/ml for material formulated for stability testing and 18.9 mg/ml for material formulated in 1x PBS.
Анализ полученных образцов выглядит следующим образом.The analysis of the obtained samples is as follows.
Методы анализаAnalysis Methods
Концентрацию определяли на основании того, что для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7 Пироген определяли с применением анализа Kinetic QCL (Lonza Walkersville 50-650H) со считыванием на планшет-ридере TECAN Safire. Процент агрегатов определяли с помощью аналитической эксклюзионной хроматографии на предколонке Shodex KW-G (Thomson Instrument Company, № по кат. 6960955) и колонке KW-803 (TIC, № по кат. 6960940), уравновешенных подвижной фазой [20 мМ Tris, -pH 7,65 (приготовленный с помощью 10 мМ Tris, pH 7,4, 10 мМ Tris, pH 8), 200 мМ NaCl, 0,02% азида натрия], с получением данных при 280 нм. Для определения DAR готовили аликвоту образца, которую получали разбавлением образца до 2 мг/мл в 1х PBS, дегликозилированием образца с помощью PNGазы F (получена в лаборатории) в течение 10 мин при 50°С, удалением PNGазы F за счет связывание с белком А, промывкой с помощью 1х PBS и элюированием с помощью 1% муравьиной кислоты. Затем образец вводили в колонку 2,1 х50 мм PLRP-S (частицы 8 мкм, размер пор 1000 А), уравновешенную 0,1% муравьиной кислотой в 20% CH3CN/b воде (Invitrogen) при расходе 0,5 мл/мин. Колонку промывали с помощью 20% CH3CN/b воде в течение 3 мин, затем элюировали с помощью 0,1минутного градиента до 0,1% муравьиной кислоты в 90% CH3CN/b воде, при этом данную концентрацию поддерживали в течение 1,9 мин. Данные масс-спектров получали на устройстве Agilent 1260, и деконволюцию проводили с помощью программного обеспечения для качественного анализа MassHunter версии В.05.00 в диапазоне 110-180 кДа. Площади пиков, соответствующих различным рассчитанным состояниям DAR, взвешивали в соответствии с DAR каждого пика, затем суммировали и взвешенную площадь пика DAR4 делили на сумму всех взвешенных пиков с получением значения DAR.The concentration was determined based on the fact that for a 10 mg/ml IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7 Pyrogen was determined using a Kinetic QCL assay (Lonza Walkersville 50-650H) with a TECAN Safire plate reader. The percentage of aggregates was determined by analytical size exclusion chromatography on a Shodex KW-G guard column (Thomson Instrument Company, cat. no. 6960955) and a KW-803 column (TIC, cat. no. 6960940), equilibrated with a mobile phase [20 mM Tris, -pH 7.65 (prepared with 10 mM Tris, pH 7.4, 10 mM Tris, pH 8), 200 mM NaCl, 0.02% sodium azide], obtaining data at 280 nm. To determine DAR, an aliquot of the sample was prepared, which was obtained by diluting the sample to 2 mg/ml in 1x PBS, deglycosylating the sample with PNGase F (obtained in the laboratory) for 10 min at 50°C, removing PNGase F by binding to protein A, washing with 1x PBS and eluting with 1% formic acid. The sample was then injected into a 2.1 x 50 mm PLRP-S column (particles 8 μm, pore size 1000 A) equilibrated with 0.1% formic acid in 20% CH 3 CN/b water (Invitrogen) at a flow rate of 0.5 ml/ min. The column was washed with 20% CH 3 CN/b water for 3 min, then eluted with a 0.1 minute gradient to 0.1% formic acid in 90% CH 3 CN/b water, maintaining this concentration for 1 .9 min. Mass spectral data were obtained on an Agilent 1260 instrument and deconvolution was performed using MassHunter Qualitative Software version B.05.00 over the 110-180 kDa range. Peak areas corresponding to different calculated DAR states were weighted according to the DAR of each peak, then summed and the weighted DAR4 peak area was divided by the sum of all weighted peaks to give the DAR value.
Получение линкера-полезной нагрузки MPET.DM4Obtaining MPET.DM4 payload linker
Аналитические способыAnalytical methods
Если не указано иное, в Получении промежуточных соединений и примерах применяли следующие способы HPLC и HPLC/MS.Unless otherwise indicated, the following HPLC and HPLC/MS methods were used in the Preparation of Intermediates and Examples.
Анализ LC/MS осуществляли на системе Agilent 1200sl/6140. Колонка: Waters Acquity HSS Т3 С18, 50х2,0, 1,8 мкм Подвижная фаза: А) Н2О+0,05% TFA; В: ацетонитрил+0,035% TFALC/MS analysis was performed on an Agilent 1200sl/6140 system. Column: Waters Acquity HSS T3 C18, 50 x 2.0, 1.8 µm Mobile phase: A) H 2 O + 0.05% TFA; B: acetonitrile + 0.035% TFA
Параметры работы насоса:Pump operation parameters:
Обнаружение: Диодно-матричный УФ-детектор при 190-400 нмDetection: Diode array UV detector at 190-400 nm
Сканирование при MS: 200-1350 amu ELSD: 60°CScanning at MS: 200-1350 amu ELSD: 60°C
- 174 042529- 174 042529
Параметры MS:MS options:
(14S,16S,32S,33S,2R,4S,10Е,12E,14R)-86-хлор-14-гидрокси-85,14-диметокси-33,2,7,10-тетраметил12,6-диоксо-7-аза-1 (6,4)оксазинана-3(2,3)оксирана-8(1,3)бензолациклотетрадекафан-10,12-диен-4-ил N(4-((2-(3-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-Ш-пиррол-1-ил)пропанамидо)этил)дисульфанил)-4-метилпентаноил)N-метил-L-аланинат(14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12E,14R)-86-chloro-14-hydroxy-85,14-dimethoxy-33,2,7,10-tetramethyl12,6-dioxo-7- aza-1(6,4)oxazinan-3(2,3)oxirana-8(1,3)benzenecyclotetradecafan-10,12-dien-4-yl N(4-((2-(3-(2.5 -dioxo-2,5-dihydro-III-pyrrol-1-yl)propanamido)ethyl)disulfanyl)-4-methylpentanoyl)N-methyl-L-alaninate
Стадия 1. Получение (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10Е,12Е,14R)-86-хлор-14-гидрокси-85,14-диметокси33,2,7,10-тетраметил-12,6-диоксо-7-аза-1(6,4)оксазинана-3(2,3)оксирана-8(1,3)-бензолациклотетрадекафан-10,12-диен-4-ил N-(4-((2-аминоэтил)дисульфанил)-4-метилпентаноил)-N-метил-L-аланинатаStage 1. Obtaining (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12E,14R)-86-chloro-14-hydroxy-85,14-dimethoxy33,2,7,10-tetramethyl-12,6- dioxo-7-aza-1(6,4)oxazinana-3(2,3)oxirana-8(1,3)-benzenecyclotetradecaphan-10,12-dien-4-yl N-(4-((2-aminoethyl )disulfanyl)-4-methylpentanoyl)-N-methyl-L-alaninate
К DM4 (480 мг, 0,62 ммоль), растворенному в буфере PBS (10,5 мл) и безводном THF (21 мл), добавляли 2-(пиридин-2-илдисульфанил)этан-1-амин (151 мг, 0,68 ммоль) и DIEA (0,27 мл, 1,54 ммоль) при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 30 мин и концентрировали под вакуумом. Водный остаток разбавляли с помощью CH3CN (1 мл) и H2O (2 мл) и очищали посредством ISCO с обращенной фазой, элюировали с помощью 10-60% ацетонитрила в H2O, содержащей 0,05% TFA. Фракции, содержащие требуемый продукт, лиофилизировали с получением требуемого продукта (555 мг, выход 93%).To DM4 (480 mg, 0.62 mmol) dissolved in PBS buffer (10.5 ml) and anhydrous THF (21 ml) was added 2-(pyridin-2-yldisulfanyl)ethan-1-amine (151 mg, 0 .68 mmol) and DIEA (0.27 ml, 1.54 mmol) at room temperature. The reaction mixture was stirred at room temperature for 30 min and concentrated in vacuo. The aqueous residue was diluted with CH3CN (1 ml) and H 2 O (2 ml) and purified by reverse phase ISCO, eluted with 10-60% acetonitrile in H 2 O containing 0.05% TFA. Fractions containing the desired product were lyophilized to give the desired product (555 mg, 93% yield).
1H ЯМР (400 МГц, MeOD-d4) δ ppm 0,83 (s, 3Н) 1,21 (d, J=5,0 Гц, 3H) 1,25 (s, 3H) 1,28 (s, 3H) 1,30 (d, J=5,0 Гц, 3H) 1,45-1,55 (m, 3H) 1,67 (s, 3H) 1,84-1,88 (m, 1Н) 1,95-2,01 (m, 1Н) 2,14 (dd, J=5,0 и 15,0 Гц, 1Н) 2,37-2,43 (m, 1H) 2,53-2,59 (m, 1Н) 2,64 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1Н) 2,82-2,89 (m, 5Н) 2,91 (d, J=10,0 Гц, 1Н) 3,16 (dd, J=5,0 и 10,0 Гц, 2Н) 3,20 (s, 3H) 3,23 (d, J=10,0 Гц, 1Н) 3,35 (s, 3H) 3,55 (d, J=5,0 Гц, 1Н) 3,58 (d, J=10,0 Гц, 1Н) 4,15-4,20 (m, 1Н) 4,64 (dd, J=5,0 и 10,0 Гц, 1Н) 5,43 (q, J=5,0 Гц, 2Н) 5,66 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1Н)) 6,58 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1Н) 6,65 (d, J=10,0 Гц, 1Н) 6,66 (s, 1H) 7,11 (bs, 1H) 7,28 (bs, 1H); MS масса/заряд 855,3 (М+Н), Время удерживания 0,988 мин.1H NMR (400 MHz, MeOD-d 4 ) δ ppm 0.83 (s, 3H) 1.21 (d, J=5.0 Hz, 3H) 1.25 (s, 3H) 1.28 (s, 3H) 1.30 (d, J=5.0 Hz, 3H) 1.45-1.55 (m, 3H) 1.67 (s, 3H) 1.84-1.88 (m, 1H) 1 .95-2.01 (m, 1H) 2.14 (dd, J=5.0 and 15.0 Hz, 1H) 2.37-2.43 (m, 1H) 2.53-2.59 ( m, 1H) 2.64 (dd, J=10.0 and 15.0 Hz, 1H) 2.82-2.89 (m, 5H) 2.91 (d, J=10.0 Hz, 1H) 3.16 (dd, J=5.0 and 10.0 Hz, 2H) 3.20 (s, 3H) 3.23 (d, J=10.0 Hz, 1H) 3.35 (s, 3H) 3.55 (d, J=5.0 Hz, 1H) 3.58 (d, J=10.0 Hz, 1H) 4.15-4.20 (m, 1H) 4.64 (dd, J= 5.0 and 10.0 Hz, 1H) 5.43 (q, J=5.0 Hz, 2H) 5.66 (dd, J=10.0 and 15.0 Hz, 1H)) 6.58 ( dd, J=10.0 and 15.0 Hz, 1H) 6.65 (d, J=10.0 Hz, 1H) 6.66 (s, 1H) 7.11 (bs, 1H) 7.28 ( bs, 1H); MS mass/charge 855.3 (M+H), retention time 0.988 min.
Стадия 2. Получение (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10Е,12Е,14R)-86-хлор-14-гидрокси-85,14-диметокси33,2,7,10-тетраметил-12,6-диоксо-7-аза-1(6,4)оксазинана-3(2,3)оксирана-8(1,3)бензолациклотетрадекафан-10,12-диен-4-ил N-(4-((2-(3-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1Н-пиррол-1-ил)пропанамидо)этил)дисульфанил)-4-метилпентаноил)-N-метил-L-αланинатаStage 2. Obtaining (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12E,14R)-86-chloro-14-hydroxy-85,14-dimethoxy33,2,7,10-tetramethyl-12,6- dioxo-7-aza-1(6,4)oxazinane-3(2,3)oxirana-8(1,3)benzenecyclotetradecaphan-10,12-dien-4-yl N-(4-((2-(3 -(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)propanamido)ethyl)disulfanyl)-4-methylpentanoyl)-N-methyl-L-αlaninate
К (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12Е,14R)-86-хлор-14-гидрокси-85,14-диметокси-33,2,7,10-тетраметил-12,6-диоксо-7-аза-1(6,4)оксазинана-3(2,3)оксирана-8(1,3)бензолациклотетрадекафан-10,12-диен-4-илN-(4-((2-аминоэтил)дисульфанил)-4-метилпентаноил)-N-метил-L-аланинату (555 мг, 0,57 ммоль), растворенному в безводном DMSO (7 мл), добавляли 2,5-диоксопирролидин-1-ил-3-(2,5-диоксо-2,5дигидро-1Н-пиррол-1-ил)пропаноат (171 мг, 0,63 ммоль) и DIEA (249 мл, 1,43 ммоль) при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 15 мин и нейтрализовали с применением TFA. Смесь охлаждали до 0°С с помощью бани со льдом, с последующим добавлением CH3CN (2 мл) и Н2О (7 мл), а затем очищали посредством ISCO с обращенной фазой, при этом элюировали с помощью 10-70% ацетонитрила в Н2О, содержащей 0,05% TFA. Фракции, содержащие требуемый продукт, лиофилизировали с получением требуемого продукта (430 мг, выход 66%)).K (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12E,14R)-86-chloro-14-hydroxy-85,14-dimethoxy-33,2,7,10-tetramethyl-12,6-dioxo -7-aza-1(6,4)oxazinane-3(2,3)oxirana-8(1,3)benzenecyclotetradecaphan-10,12-dien-4-ylN-(4-((2-aminoethyl)disulfanyl) -4-methylpentanoyl)-N-methyl-L-alaninate (555 mg, 0.57 mmol) dissolved in anhydrous DMSO (7 ml) was added 2,5-dioxopyrrolidin-1-yl-3-(2,5- dioxo-2,5dihydro-1H-pyrrol-1-yl)propanoate (171 mg, 0.63 mmol) and DIEA (249 ml, 1.43 mmol) at room temperature. The reaction mixture was stirred at room temperature for 15 minutes and neutralized with TFA. The mixture was cooled to 0°C with an ice bath, followed by the addition of CH3CN (2 ml) and H 2 O (7 ml), and then purified by reverse phase ISCO, while eluting with 10-70% acetonitrile in H 2 O containing 0.05% TFA. Fractions containing the desired product were lyophilized to give the desired product (430 mg, 66% yield).
1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ ppm 0,81 (s, 3H) 1,23 (s, 3H) 1,24 (s, 3H) 1,25 (s, 1Н) 1,28 (d, J=5,0 Гц, 3H) 1,31 (d, J=5,0 Гц, 3H) 1,43-1,49 (m, 1Н) 1,61 (d, J=15,0 Гц, 1H) 1,64 (s, 3H) 1,81-1,87 (m, 1Н) 1,94-2,01 (m, 1Н) 2,19 (dd, J=5,0 и 15,0 Гц, 1Н) 2,30-2,36 (m, 1Н) 2,54 (t, J=5,0 Гц, 2Н) 2,61 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1Н) 2,70 (t, J=5,0 Гц, 2Н) 2,88 (s, 3H) 3,00 (d, J=10,0 Гц, 1Н) 3,13 (d, J=10,0 Гц, 1Н) 3,21 (s, 3H) 3,55 (s, 3H) 3,45 (q, J=5,0 Гц, 2Н) 3,49 (d, J=5,0 Гц, 1Н) 3,62 (d, J=10,0 Гц, 1Н) 3,83 (t, J=5,0 Гц, 1Н) 3,98 (s, 3H) 4,32 (m, 1Н) 4,80 (dd, J=5,0 и 10,0 Гц, 1Н) 5,28 (d, J=5,0 Гц, 1Н) 5,66 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1Н)) 6,22 (bs, 1Н) 6,42 (dd,1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 0.81 (s, 3H) 1.23 (s, 3H) 1.24 (s, 3H) 1.25 (s, 1H) 1.28 (d, J= 5.0Hz, 3H) 1.31 (d, J=5.0Hz, 3H) 1.43-1.49 (m, 1H) 1.61 (d, J=15.0Hz, 1H) 1 .64 (s, 3H) 1.81-1.87 (m, 1H) 1.94-2.01 (m, 1H) 2.19 (dd, J=5.0 and 15.0 Hz, 1H) 2.30-2.36 (m, 1H) 2.54 (t, J=5.0 Hz, 2H) 2.61 (dd, J=10.0 and 15.0 Hz, 1H) 2.70 ( t, J=5.0 Hz, 2H) 2.88 (s, 3H) 3.00 (d, J=10.0 Hz, 1H) 3.13 (d, J=10.0 Hz, 1H) 3 .21 (s, 3H) 3.55 (s, 3H) 3.45 (q, J=5.0 Hz, 2H) 3.49 (d, J=5.0 Hz, 1H) 3.62 (d , J=10.0 Hz, 1H) 3.83 (t, J=5.0 Hz, 1H) 3.98 (s, 3H) 4.32 (m, 1H) 4.80 (dd, J=5 .0 and 10.0 Hz, 1H) 5.28 (d, J=5.0 Hz, 1H) 5.66 (dd, J=10.0 and 15.0 Hz, 1H)) 6.22 (bs , 1H) 6.42 (dd,
- 175 042529- 175 042529
J=10,0 и 15,0 Гц, 1Н) 6,50 (s, 1Н) 6,63 (s, 1Н) 6,66 (d, J=10,0 Гц, 1Н) 6,70 (s, 2H) 6,83(s, 1H); MS масса/заряд 988,3 (М+Н-Н2О), Время удерживания 1,145 мин.J=10.0 and 15.0 Hz, 1H) 6.50 (s, 1H) 6.63 (s, 1H) 6.66 (d, J=10.0 Hz, 1H) 6.70 (s, 2H) 6.83(s, 1H); MS mass/charge 988.3 (M+H-H2O), retention time 1.145 min.
Пример 4В. Получение конгьюгата антитела и лекарственного средства 121G12.DAPA.sSPDB.DM4Example 4B. Obtaining the conjugate of the antibody and drug 121G12.DAPA.sSPDB.DM4
121G12.DAPA.(sSPDB. DM4)n 121G12.DAPA.(sSPDB.DM4) n
К перемешиваемому раствору 25 мМ буфера HEPES, pH 7,6 (3 мл; стерильный) и диметилацетамида (DMAc; 0,12 мл) при 22°С добавляли раствор (1,695 мл) 121G12.DAPA; MW -145546 г/моль; 62 мг (0,426 мкмоль)) в буфере на основе фосфата калия (10 мМ, pH6; стерильный). Добавляли майтанзиноид DM4 (2,42 мг (3,101 мкмоль), растворенный в 0,242 мл DMAc. Добавляли линкер сульфо-SPDB (0,970 мг (2,386 мкмоль, скорректирован для анализа), растворенный в 0,970 мл DMAc. Спустя 18 ч реакционную смесь анализировали на завершенность реакции с помощью SEC-UV и HPLC.To a stirred solution of 25 mM HEPES buffer, pH 7.6 (3 ml; sterile) and dimethylacetamide (DMAc; 0.12 ml) at 22°C was added a solution (1.695 ml) of 121G12.DAPA; MW -145546 g/mol; 62 mg (0.426 µmol)) in potassium phosphate buffer (10 mM, pH 6; sterile). Maytansinoid DM4 (2.42 mg (3.101 µmol) dissolved in 0.242 ml DMAc) was added. Sulfo-SPDB linker (0.970 mg (2.386 µmol, corrected for analysis)) dissolved in 0.970 ml DMAc was added. After 18 h the reaction mixture was analyzed for completeness reactions using SEC-UV and HPLC.
Реакционную смесь очищали от низкомолекулярных побочных продуктов и проводили замену буфера путем фильтрации через мембранные ячейки Amicon; отсекаемая молекулярная масса 30 кДа, с применением 10 мМ буфера PBS, pH 7,4 (стерильный) для промывки. Полученные после применения Amicon ультраконцентраты объединяли и разбавляли до 10 мг/мл (УФ) с получением 2,9 мл раствора конъюгата антитела и лекарственного средства, 121G12.DAPA.sSPDB-DM4, в 10 мМ буфере PBS, pH 7,4 (извлечение белка 49%).The reaction mixture was purified from low molecular weight by-products and buffer exchange was carried out by filtration through Amicon membrane cells; cut-off molecular weight 30 kDa, using 10 mM PBS buffer, pH 7.4 (sterile) for washing. The ultraconcentrates obtained after application of Amicon were pooled and diluted to 10 mg/ml (UV) to obtain a 2.9 ml solution of the antibody-drug conjugate, 121G12.DAPA.sSPDB-DM4, in 10 mM PBS buffer, pH 7.4 (protein recovery 49%).
С помощью SEC-UV определили, что соотношение лекарственного средства и антитела составляет n=3,6, а мономерная чистота составляет 98,7%. Уровень эндотоксинов составлял 0,14 ЕЭ/мг (тест BET Endosafe).The drug to antibody ratio was determined by SEC-UV to be n=3.6 and the monomer purity was 98.7%. Endotoxin levels were 0.14 EU/mg (BET Endosafe test).
Пример 4С. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 684E12.SMCC.DM1Example 4C. Obtaining an antibody-drug conjugate 684E12.SMCC.DM1
К раствору антитела (исходное 684Е12) (7,1 мг/мл, 3,4 мл, приблизительно 47 мкМ, PBS, pH 7,4) добавляли 100 мкл 2 мМ DM1 (0,17 мг) в DMA и 50 мкл 4 мМ сульфо-SMCC (0,15 мг) в DMA и смесь инкубировали и аккуратно перемешивали при 4°С в течение ночи. После инкубации реакционную смесь очищали путем обессоливания на обессоливающей колонке HiPrep 26/10 (GE Healthcare) с применением PBS, pH 7,4, в качестве подвижного буфера, и стерилизовали фильтрацией. Очищенный конъюгат анали- 176 042529 зировали с помощью MALDI-MS, и, согласно оценкам, DAR составило 2,6. Аналитическая SEC показала, что в образце присутствует 3,7% агрегация (или 96,3% мономеров), а тестирование LAL (PTS, CharlesTo an antibody solution (stock 684E12) (7.1 mg/ml, 3.4 ml, approx. 47 μM, PBS, pH 7.4) was added 100 μl 2 mM DM1 (0.17 mg) in DMA and sulfo-SMCC (0.15 mg) in DMA and the mixture was incubated and gently stirred at 4° C. overnight. After incubation, the reaction mixture was purified by desalting on a HiPrep 26/10 desalting column (GE Healthcare) using PBS, pH 7.4 as running buffer and sterilized by filtration. The purified conjugate was analyzed by MALDI-MS and the estimated DAR was 2.6. Analytical SEC showed 3.7% aggregation (or 96.3% monomers) in the sample, and LAL testing (PTS, Charles
River Laboratories) определило, что показатель эндотоксинов составляет 0,36 ЕЭ/мг.River Laboratories determined an endotoxin value of 0.36 EU/mg.
Пример 4D. Получение конгьюгата антитела и лекарственного средства 5O6E15.AURIX14D example. Obtaining a conjugate of an antibody and a drug 5O6E15.AURIX1
Исходным материалом служило антитело 506Е15.CysMab (Fc WT) при 18,8 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1х забуференном фосфатом солевом растворе (1x PBS). 1,76 мл антитела абсорбировали на 3 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1223BPO/I) и к полученной взвеси добавляли 240 мкл 0,5 М цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 М фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar А16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 30 мин, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1х PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1х PBS (50% взвесь) и добавляли 60 мкл 100 мкМ CuCl2 (Aldrich 751944) (суммарно 100 нМ Cu2 +) для инициирования повторного окисления. Спустя 420 мин добавляли дополнительные 90 мкл 100 мкМ CuCl2 для дополнительного ускорения повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора эталонного малеимида (пример 3, стр. 110 в WO 2015/095301), который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 мин, центрифугирования при 7000xg в течение 10 с, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000х g в течение 10 с, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°С) колонку 4,6x50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000А), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH3CN/b воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH3CN/b воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 мин и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.The starting material was 506E15.CysMab (Fc WT) at 18.8 mg/mL (for a 10 mg/mL IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7) in 1x phosphate buffered saline (1x PBS). 1.76 ml of antibody was absorbed onto 3 ml of protein A RMP resin (GE Healthcare 1223BPO/I) and 240 μl of 0.5 M cysteine (Sigma G121-03) formulated in 0.5 M phosphate, pH 8 was added to the resulting slurry. , to which NaOH (Alfa Aesar A16037) was added at a ratio of 13.6 g/l. The slurry was stirred occasionally by rotating the vessel at room temperature for 30 minutes, then washed by vacuum filtration through a 0.2 µm filter device placed on the neck of the bottle with 50 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration cycles. and additions. The washed resin was resuspended in 2 ml 1x PBS (50% slurry) and 60 μl 100 μM CuCl 2 (Aldrich 751944) (total 100 nM Cu 2 + ) was added to initiate re-oxidation. After 420 min was added an additional 90 μl of 100 μm CuCl 2 to further accelerate the re-oxidation. Reoxidation of the antibody was tested by removing a 30 μl aliquot of the suspension, adding 1 μl of a 20 mM reference maleimide stock solution (example 3, page 110 in WO 2015/095301), which is known to shift the antibody peak in RPLC, mixing for 1 min, centrifuge at 7000xg for 10s, remove the supernatant, add 60µl IgG Thermo elution buffer (Thermo Scientific 21009), centrifuge at 14000xg for 10s, sample the supernatant and analyze the products by RPLC as follows: 2- µl of the sample was injected into a heated (80°C) 4.6x50 mm Agilent PLRP-S column (particles 5 µm, pore size 4000A) equilibrated with 0.1% trifluoroacetic acid in 29.5% CH 3 CN/b water (Millipore TX1280P -1, Burdick and Jackson 407-4) at 1.5 ml/min. The column was eluted with a 5 minute gradient to 44.5% CH 3 CN/b water, maintained at this concentration for 1.9 minutes and peaks were detected at 280 nm. The optimal time for conjugation is defined as the time at which the peak of the main product reaches its maximum value, the peaks with later elution are minimized, and the peaks with earlier elution no longer increase.
Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 565 мин), добавляли 220 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 70 мин. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.When RPLC analysis indicated that reoxidation was optimal (565 min in this case), 220 µl of a 20 mM AURIX1 stock solution in DMSO was added and the slurry was gently mixed occasionally by swirling the vessel at room temperature for 70 min. The slurry was then washed with 20 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration and addition cycles.
Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (6 мл) нейтрализовали с помощью 0,6 мл 0,5 М фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 2,5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000xg, наносили на буферообменную колонку PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенную 1x PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 22 мг (66%).The slurry was then transferred to a porous glass filter column (Pierce 7375021), preliminarily eluted with 0.5 bed volumes of IgG Thermo elution buffer (discarded), then eluted with 2 bed volumes of the same buffer. The entire eluate (6 ml) was neutralized with 0.6 ml 0.5 M sodium phosphate, pH 8, concentrated to 2.5 ml using a centrifuge concentrator (Amicon UFC905024) at 3000xg, applied to a PD-10 buffer exchange column (GE Healthcare 17-0851-01) equilibrated with 1x PBS, loading 2.5 ml concentrate and eluting with 3.5 ml 1x PBS as recommended by the manufacturer. The yield was 22 mg (66%).
Пример 4Е. Получение конгьюгата антитела и лекарственного средства 506E15.CysMab.DAPA.AURIX2Example 4E. Obtaining an antibody-drug conjugate 506E15.CysMab.DAPA.AURIX2
Исходным материалом служило антитело 506E15.CysMab.DAPA при 10 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1х забуференном фосфатом солевом растворе (1x PBS). 2,0 мл антитела абсорбировали на 2 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1223BPO/I) и к полученной взвеси добавляли 160 мкл 0,5 М цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 М фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar А16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 30 мин, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1x PBS (50% взвесь) и добавляли 10 мкл 100 мкМ CuCl2 (Aldrich 751944) (суммарно 250 нМ Cu2 +) для инициирования повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора эталонного малеимида (пример 3, стр. 110 в WO 2015/095301), который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 мин, центрифугирования при 7000xg в течение 10 с, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000x g в течение 10 с, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°С) колонку 4,6x50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000А), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH3CN/b воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH3CN/b воде, поддержи- 177 042529 вали данную концентрацию в течение 1,9 мин и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.The starting material was the 506E15.CysMab.DAPA antibody at 10 mg/ml (for a 10 mg/ml IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7) in 1x phosphate buffered saline (1x PBS). 2.0 ml of antibody was absorbed onto 2 ml of protein A RMP resin (GE Healthcare 1223BPO/I) and 160 μl of 0.5 M cysteine (Sigma G121-03) formulated in 0.5 M phosphate, pH 8 was added to the resulting slurry. , to which NaOH (Alfa Aesar A16037) was added at a ratio of 13.6 g/l. The slurry was stirred occasionally by rotating the vessel at room temperature for 30 min, then washed by vacuum filtration through a 0.2 µm filter device placed on the neck of the bottle with 50 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration cycles. and additions. The washed resin was resuspended in 2 ml 1x PBS (50% slurry) and 10 μl 100 μM CuCl 2 (Aldrich 751944) (total 250 nM Cu 2 + ) was added to initiate re-oxidation. Reoxidation of the antibody was tested by removing a 30 μl aliquot of the suspension, adding 1 μl of a 20 mM reference maleimide stock solution (example 3, page 110 in WO 2015/095301), which is known to shift the antibody peak in RPLC, mixing for 1 min, centrifuge at 7000xg for 10s, remove the supernatant, add 60µl IgG Thermo elution buffer (Thermo Scientific 21009), centrifuge at 14000xg for 10s, sample the supernatant and analyze the products by RPLC as follows: 2- µl of the sample was injected into a heated (80°C) 4.6x50 mm Agilent PLRP-S column (particles 5 µm, pore size 4000A) equilibrated with 0.1% trifluoroacetic acid in 29.5% CH 3 CN/b water (Millipore TX1280P -1, Burdick and Jackson 407-4) at 1.5 ml/min. The column was eluted with a 5 minute gradient to 44.5% CH 3 CN/b water, maintained at this concentration for 1.9 minutes and peaks were detected at 280 nm. The optimal time for conjugation is defined as the time at which the peak of the main product reaches its maximum value, the peaks with later elution are minimized, and the peaks with earlier elution no longer increase.
Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 295 мин), добавляли 80 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX2 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 85 мин. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1х PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.When RPLC analysis indicated that reoxidation was optimal (in this case 295 min), 80 µl of a 20 mM AURIX2 stock solution in DMSO was added and the slurry was gently mixed occasionally by swirling the vessel at room temperature for 85 min. The slurry was then washed with 20 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration and addition cycles.
Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (4 мл) нейтрализовали с помощью 0,4 мл 0,5 М фосфата натрия, pH 8, наносили на 2 буферообменные колонки PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1х PBS, при загрузке 2,5 мл элюата и элюировании с помощью 3,5 мл 1х PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 13,3 мг (67%).The slurry was then transferred to a porous glass filter column (Pierce 7375021), preliminarily eluted with 0.5 bed volumes of IgG Thermo elution buffer (discarded), then eluted with 2 bed volumes of the same buffer. The entire eluate (4 ml) was neutralized with 0.4 ml of 0.5 M sodium phosphate, pH 8, applied to 2 PD-10 buffer exchange columns (GE Healthcare 17-0851-01) equilibrated with 1x PBS, loading 2.5 ml of eluate and eluting with 3.5 ml of 1x PBS as recommended by the manufacturer. The yield was 13.3 mg (67%).
Пример 4F. Получение конгьюгата антитела и лекарственного средства 674J13.CysMab.AURIX1Example 4F. Obtaining the conjugate of the antibody and drug 674J13.CysMab.AURIX1
Исходным материалом служило антитело 674J13.CysMab (Fc WT) при 9 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1х забуференном фосфатом солевом растворе (1 х PBS). К 57,6 мл антитела добавляли DTT до 200 мМ (Invitrogen 15508-013) и раствор инкубировали в течение 75 мин для сильного восстановления Ab. Затем восстановленные Ab наносили на буферообменные колонки PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1х PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1х PBS согласно рекомендациям изготовителя. Элюаты из колонок PD10 объединяли, затем вновь наносили на свежие колонки PD10 для более полного удаления DTT. Обратите внимание, что в отдельных экспериментах колонки PD10 являются более эффективными в удалении DTT, чем можно было бы наблюдать при использовании только механизма эксклюзионной хроматографии, при условии, что колонки используют только один раз.The starting material was 674J13.CysMab (Fc WT) at 9 mg/mL (for a 10 mg/mL IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7) in 1x phosphate buffered saline (1x PBS). DTT up to 200 mM (Invitrogen 15508-013) was added to 57.6 ml of antibody and the solution was incubated for 75 min for strong Ab recovery. The recovered Abs were then applied to PD-10 buffer exchange columns (GE Healthcare 17-0851-01) equilibrated with 1x PBS, loading 2.5 ml concentrate and eluting with 3.5 ml 1x PBS as recommended by the manufacturer. The eluates from the PD10 columns were pooled, then reapplied to fresh PD10 columns for more complete removal of DTT. Note that in separate experiments, PD10 columns are more efficient in removing DTT than would be observed using the size exclusion chromatography mechanism alone, provided that the columns are used only once.
Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1, который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 мин, центрифугирования при 7000χg в течение 10 с, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000χg в течение 10 с, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°С) колонку 4,6х50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 А), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH3CN/b воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5минутного градиента до 44,5% CH3CN/b воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 мин и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.Antibody reoxidation was tested by removing a 30 µl aliquot of the suspension, adding 1 µl of 20 mM stock solution of AURIX1, which is known to shift the antibody peak in RPLC, mixing for 1 min, centrifuging at 7000xg for 10 s, removing the supernatant, adding 60 µl of Thermo IgG elution buffer (Thermo Scientific 21009), centrifugation at 14000χg for 10 s, supernatant sampling and analysis of products by RPLC as follows: 2 µl sample was injected into a heated (80°C) 4.6 x 50 mm column Agilent PLRP-S (particles 5 µm, pore size 4000 A) equilibrated with 0.1% trifluoroacetic acid in 29.5% CH 3 CN/b water (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) at a rate of 1, 5 ml/min. The column was eluted with a 5 minute gradient to 44.5% CH 3 CN/b water, maintained at this concentration for 1.9 minutes and the peaks were determined at 280 nm. The optimal time for conjugation is defined as the time at which the peak of the main product reaches its maximum value, the peaks with later elution are minimized, and the peaks with earlier elution no longer increase.
Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 180 мин), добавляли 290 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1 в DMSO вместе с 6 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I). Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 40 мин. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1х PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.When RPLC analysis indicated that reoxidation was optimal (in this case 180 min), 290 μl of a 20 mM AURIX1 stock solution in DMSO was added along with 6 ml of protein A RMP resin (GE Healthcare 1-223BPO/I). The slurry was stirred occasionally by rotating the vessel at room temperature for 40 minutes. The slurry was then washed with 20 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration and addition cycles.
Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (11,5 мл) нейтрализовали с помощью 1,2 мл 0,5 М фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 2,5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000χg, наносили на буферообменную колонку PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенную 1х PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1х PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 26 мг (41%).The slurry was then transferred to a porous glass filter column (Pierce 7375021), preliminarily eluted with 0.5 bed volumes of IgG Thermo elution buffer (discarded), then eluted with 2 bed volumes of the same buffer. The entire eluate (11.5 ml) was neutralized with 1.2 ml of 0.5 M sodium phosphate, pH 8, concentrated to 2.5 ml using a centrifuge concentrator (Amicon UFC905024) at 3000 χg, applied to a PD-10 buffer exchange column ( GE Healthcare 17-0851-01) equilibrated with 1x PBS, loading 2.5 ml concentrate and eluting with 3.5 ml 1x PBS as recommended by the manufacturer. The yield was 26 mg (41%).
Пример 4G. Получение конгьюгата антитела и лекарственного средства 674J13.CysMab.DAPA.AURIX24G example. Obtaining the conjugate of the antibody and drug 674J13.CysMab.DAPA.AURIX2
Исходным материалом служило антитело 674J13.CysMab.DAR4.DAPA при 31,7 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1х забуференном фосфатом солевом растворе (1х PBS). 9,5 мл антитела абсорбировали на 30,1 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1223BPO/I) и к полученной взвеси добавляли 1800 мг DTT (Invitrogen 15508-013) для сильного восстановления Ab (суммарно 200 мМ DTT). Взвесь перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 20 мин, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1х PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1х PBS и перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре, при этом не добавляли медь (она ускоряла повторное окисление слишком сильно). Повторное окисление антитела тестировали путемThe starting material was the 674J13.CysMab.DAR4.DAPA antibody at 31.7 mg/mL (for a 10 mg/mL IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7) in 1x phosphate buffered saline (1x PBS). 9.5 ml of antibody was absorbed into 30.1 ml of protein A RMP resin (GE Healthcare 1223BPO/I) and 1800 mg of DTT (Invitrogen 15508-013) was added to the resulting slurry for strong Ab recovery (200 mM DTT in total). The slurry was stirred by rotating the vessel at room temperature for 20 minutes, then washed by vacuum filtration through a 0.2 µm filter device placed on the neck of the bottle with 50 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration cycles and additions. The washed resin was resuspended in 2 ml of 1x PBS and mixed by rotating the vessel at room temperature, with no addition of copper (it accelerated the re-oxidation too much). Reoxidation of the antibody was tested by
- 178 042529 изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора эталонного малеимида (пример 3, страница 110 в WO 2015/095301), который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 мин, центрифугирования при 7000 xg в течение 10 с, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000xg в течение 10 с, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°С) колонку 4,6x50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 А), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH3CN/b воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH3CN/b воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 мин и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.- 178 042529 removing a 30 µl aliquot of the suspension, adding 1 µl of 20 mM reference maleimide stock solution (example 3, page 110 in WO 2015/095301), which is known to shift the antibody peak in RPLC, mixing for 1 min, centrifugation at 7000 xg for 10 s, remove the supernatant, add 60 µl of Thermo IgG elution buffer (Thermo Scientific 21009), centrifuge at 14000 xg for 10 s, sample the supernatant and analyze the products by RPLC as follows: 2 µl sample was injected into a heated (80°C) 4.6x50 mm Agilent PLRP-S column (particles 5 µm, pore size 4000 A) equilibrated with 0.1% trifluoroacetic acid in 29.5% CH 3 CN/b water (Millipore TX1280P-1 , Burdick and Jackson 407-4) at a flow rate of 1.5 ml/min. The column was eluted with a 5 minute gradient to 44.5% CH 3 CN/b water, maintained at this concentration for 1.9 minutes and peaks were detected at 280 nm. The optimal time for conjugation is defined as the time at which the peak of the main product reaches its maximum value, the peaks with later elution are minimized, and the peaks with earlier elution no longer increase.
Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 80 мин), добавляли 903 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX2 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 50 мин. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.When RPLC analysis indicated that reoxidation was optimal (in this case 80 min), 903 µl of a 20 mM stock solution of AURIX2 in DMSO was added and the slurry was gently mixed occasionally by swirling the vessel at room temperature for 50 min. The slurry was then washed with 20 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration and addition cycles.
Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (60,2 мл) нейтрализовали с помощью 6,0 мл 0,5 М фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 17,5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000xg, наносили на 7 буферообменных колонок PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенных 1x PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 243 мг (81%)The slurry was then transferred to a porous glass filter column (Pierce 7375021), preliminarily eluted with 0.5 bed volumes of IgG Thermo elution buffer (discarded), then eluted with 2 bed volumes of the same buffer. The entire eluate (60.2 ml) was neutralized with 6.0 ml of 0.5 M sodium phosphate, pH 8, concentrated to 17.5 ml using a centrifuge concentrator (Amicon UFC905024) at 3000xg, applied to 7 PD-10 buffer exchange columns (GE Healthcare 17-0851-01) equilibrated with 1x PBS, loaded with 2.5 ml concentrate and eluted with 3.5 ml 1x PBS as recommended by the manufacturer. The yield was 243 mg (81%)
Пример 4Н. Получение конгьюгата антитела и лекарственного средства 121G12.CysMab.DAPA.AURIX1Example 4H. Obtaining the conjugate of the antibody and drug 121G12.CysMab.DAPA.AURIX1
Исходным материалом служило антитело 121G12.CysMab.DAPA при 16,7 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1х забуференном фосфатом солевом растворе (1x PBS). 3,6 мл антитела абсорбировали на 6 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1223BPO/I) и полученную взвесь перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 125 мин, затем добавляли 544 мкл 0,5 М цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 М фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar A16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 60 мин, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1x PBS (50% взвесь) и добавляли 16 мкл 100 мкМ CuCl2 (Aldrich 751944) (суммарно 250 нМ Cu2 +) для инициирования повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1, который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 мин, центрифугирования при 7000xg в течение 10 с, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000xg в течение 10 с, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2мкл образец вводили в нагретую (80°С) колонку 4,6x50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000А), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH3CN/b воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH3CN/b воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 мин и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.The starting material was the 121G12.CysMab.DAPA antibody at 16.7 mg/ml (for a 10 mg/ml IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7) in 1x phosphate buffered saline (1x PBS). 3.6 ml of antibody was absorbed onto 6 ml of protein A RMP resin (GE Healthcare 1223BPO/I) and the resulting slurry was stirred by rotating the vessel at room temperature for 125 min, then 544 μl of 0.5 M cysteine (Sigma G121-03) was added. ) formulated in 0.5 M phosphate, pH 8, to which NaOH (Alfa Aesar A16037) was added at a ratio of 13.6 g/L. The slurry was stirred occasionally by rotating the vessel at room temperature for 60 min, then washed by vacuum filtration through a 0.2 µm filter device placed on the neck of the bottle with 50 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration cycles. and additions. The washed resin was resuspended in 2 ml 1x PBS (50% slurry) and 16 μl 100 μM CuCl 2 (Aldrich 751944) (total 250 nM Cu 2 + ) was added to initiate re-oxidation. Antibody reoxidation was tested by removing a 30 µl aliquot of the suspension, adding 1 µl of 20 mM stock solution of AURIX1, which is known to shift the antibody peak in RPLC, mixing for 1 min, centrifuging at 7000xg for 10 s, removing the supernatant, adding 60 µl of Thermo IgG elution buffer (Thermo Scientific 21009), centrifugation at 14000xg for 10 s, supernatant sampling and analysis of products by RPLC as follows: 2 µl of sample was injected into a heated (80°C) 4.6x50 mm Agilent PLRP column -S (particles 5 μm, pore size 4000A) equilibrated with 0.1% trifluoroacetic acid in 29.5% CH 3 CN/b water (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) at a flow rate of 1.5 ml/ min. The column was eluted with a 5 minute gradient to 44.5% CH 3 CN/b water, maintained at this concentration for 1.9 minutes and peaks were detected at 280 nm. The optimal time for conjugation is defined as the time at which the peak of the main product reaches its maximum value, the peaks with later elution are minimized, and the peaks with earlier elution no longer increase.
Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 170 мин), добавляли 67 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 120 мин. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.When RPLC analysis indicated that re-oxidation was optimal (170 min in this case), 67 µl of a 20 mM AURIX1 stock solution in DMSO was added and the slurry was gently mixed occasionally by swirling the vessel at room temperature for 120 min. The slurry was then washed with 20 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration and addition cycles.
Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (15 мл) нейтрализовали с помощью 1,5 мл 0,5 М фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000xg, наносили на 2 буферообменные колонки PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1x PBS, при загрузке 2,5 мл элюата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 54 мг (92%).The slurry was then transferred to a porous glass filter column (Pierce 7375021), preliminarily eluted with 0.5 bed volumes of IgG Thermo elution buffer (discarded), then eluted with 2 bed volumes of the same buffer. The entire eluate (15 ml) was neutralized with 1.5 ml of 0.5 M sodium phosphate, pH 8, concentrated to 5 ml using a centrifuge concentrator (Amicon UFC905024) at 3000xg, applied to 2 PD-10 buffer exchange columns (GE Healthcare 17 -0851-01) equilibrated with 1x PBS, loading 2.5 ml of eluate and eluting with 3.5 ml of 1x PBS as recommended by the manufacturer. The yield was 54 mg (92%).
- 179 042529- 179 042529
Пример 41. Получение конгьюгата антитела и лекарственного средства 121G12.CysMab.AURIX1Example 41 Preparation of 121G12.CysMab.AURIX1 Antibody-Drug Conjugate
Исходным материалом служило антитело 121G12.CysMab (Fc WT) при 12,5 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1х забуференном фосфатом солевом растворе (1х PBS). 4,8 мл антитела абсорбировали на 6 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1223BPO/I) и полученную взвесь перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 125 мин, затем добавляли 592 мкл 0,5 М цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 М фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar A16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 60 мин, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1х PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1х PBS (50% взвесь) и добавляли 16 мкл 100 мкМ CuCl2 (Aldrich 751944) (суммарно 250 нМ Cu2 +) для инициирования повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1, который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 мин, центрифугирования при 7000xg в течение 10 с, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000xg в течение 10 с, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2мкл образец вводили в нагретую (80°С) колонку 4,6x50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000А), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH3CN/b воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH3CN/b воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 мин и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.The starting material was 121G12.CysMab (Fc WT) at 12.5 mg/ml (for a 10 mg/ml IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7) in 1x phosphate buffered saline (1x PBS). 4.8 ml of antibody was absorbed onto 6 ml of protein A RMP resin (GE Healthcare 1223BPO/I) and the resulting slurry was stirred by rotating the vessel at room temperature for 125 min, then 592 μl of 0.5 M cysteine (Sigma G121-03) was added. ) formulated in 0.5 M phosphate, pH 8, to which NaOH (Alfa Aesar A16037) was added at a ratio of 13.6 g/l. The slurry was stirred occasionally by rotating the vessel at room temperature for 60 minutes, then washed by vacuum filtration through a 0.2 µm filter device placed on the neck of the bottle with 50 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration cycles. and additions. The washed resin was resuspended in 2 ml 1x PBS (50% slurry) and 16 μl 100 μM CuCl 2 (Aldrich 751944) (total 250 nM Cu 2 + ) was added to initiate re-oxidation. Antibody reoxidation was tested by removing a 30 µl aliquot of the suspension, adding 1 µl of 20 mM stock solution of AURIX1, which is known to shift the antibody peak in RPLC, mixing for 1 min, centrifuging at 7000xg for 10 s, removing the supernatant, adding 60 µl of Thermo IgG elution buffer (Thermo Scientific 21009), centrifugation at 14000xg for 10 s, supernatant sampling and analysis of products by RPLC as follows: 2 µl of sample was injected into a heated (80°C) 4.6x50 mm Agilent PLRP column -S (particles 5 μm, pore size 4000A) equilibrated with 0.1% trifluoroacetic acid in 29.5% CH 3 CN/b water (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) at a flow rate of 1.5 ml/ min. The column was eluted with a 5 minute gradient to 44.5% CH 3 CN/b water, maintained at this concentration for 1.9 minutes and peaks were detected at 280 nm. The optimal time for conjugation is defined as the time at which the peak of the main product reaches its maximum value, the peaks with later elution are minimized, and the peaks with earlier elution no longer increase.
Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 160 мин), добавляли 67 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 120 мин. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.When RPLC analysis indicated that reoxidation was optimal (in this case 160 min), 67 µl of a 20 mM stock solution of AURIX1 in DMSO was added and the slurry was gently mixed occasionally by swirling the vessel at room temperature for 120 min. The slurry was then washed with 20 bed volumes of 1x PBS over at least 10 filtration and addition cycles.
Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (15 мл) нейтрализовали с помощью 1,5 мл 0,5 М фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000xg, наносили на 2 буферообменные колонки PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1х PBS, при загрузке 2,5 мл элюата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 52 мг (89%).The slurry was then transferred to a porous glass filter column (Pierce 7375021), preliminarily eluted with 0.5 bed volumes of IgG Thermo elution buffer (discarded), then eluted with 2 bed volumes of the same buffer. The entire eluate (15 ml) was neutralized with 1.5 ml of 0.5 M sodium phosphate, pH 8, concentrated to 5 ml using a centrifuge concentrator (Amicon UFC905024) at 3000xg, applied to 2 PD-10 buffer exchange columns (GE Healthcare 17 -0851-01) equilibrated with 1x PBS, loading 2.5 ml of eluate and eluting with 3.5 ml of 1x PBS as recommended by the manufacturer. The yield was 52 mg (89%).
Методы анализаAnalysis Methods
Концентрацию определяли на основании того, что для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7 Пироген определяли с применением анализа Kinetic QCL (Lonza Walkersville 50-650H) со считыванием на планшет-ридере TECAN Safire. Процент агрегатов определяли с помощью аналитической эксклюзионной хроматографии на предколонке Shodex KW-G (Thomson Instrument Company, № по кат. 6960955) и колонке KW-803 (TIC, № по кат. 6960940), уравновешенных подвижной фазой [20 мМ Tris, ~pH 7,65 (приготовленный с помощью 10 мМ Tris, pH 7,4, 10 мМ Tris, pH 8), 200 мМ NaCl, 0,02% азида натрия], с получением данных при 280 нм. Для определения DAR получали аликвоту образца посредством разбавления образца до 2 мг/мл в 1х PBS, дегликозилирования образца с помощью PNGазы F (получена в лаборатории) в течение 10 мин при 50°С, удаления PNGазы F за счет связывания с белком А, промывки с помощью 1х PBS и элюирования с помощью 1% муравьиной кислоты. Образец восстанавливали добавлением 1/4 объема 5 М ацетата аммония, pH 5,0, содержащего 0,5 М ТСЕР, и инкубирования при комнатной температуре в течение 30 мин. Затем образец вводили в колонку 2,1х50 мм PLRP-S (частицы 8 мкм, размер пор 1000А), уравновешенную 0,1% муравьиной кислотой в 20% CH3CN/b воде (Invitrogen) при расходе 0,5 мл/мин. Колонку промывали с помощью 20% CH3CN/b воде в течение 3 мин, затем элюировали с помощью 0,1-минутного градиента до 0,1% муравьиной кислоты в 90% CH3CN/b воде, при этом данную концентрацию поддерживали в течение 1,9 мин. Данные массспектров получали на устройстве Agilent 1260 и деконволюцию проводили с помощью программного обеспечения для качественного анализа MassHunter версии В.05.00 в диапазоне 15-60 кДа. Площади пиков, соответствующих различным рассчитанным состояниям DAR, взвешивали в соответствии с DAR каждого пика, затем суммировали и взвешенную площадь пика DAR4 делили на сумму всех взвешенных пиков с получением значения DAR. Анализ полученного образца выглядит следующим образом.The concentration was determined based on the fact that for a 10 mg/ml IgG solution, the extinction coefficient at OD 280 is 13.7 Pyrogen was determined using a Kinetic QCL assay (Lonza Walkersville 50-650H) with a TECAN Safire plate reader. The percentage of aggregates was determined by analytical size exclusion chromatography on a Shodex KW-G guard column (Thomson Instrument Company, cat. no. 6960955) and a KW-803 column (TIC, cat. no. 6960940), equilibrated with a mobile phase [20 mM Tris, ~pH 7.65 (prepared with 10 mM Tris, pH 7.4, 10 mM Tris, pH 8), 200 mM NaCl, 0.02% sodium azide], obtaining data at 280 nm. To determine DAR, an aliquot of the sample was prepared by diluting the sample to 2 mg/ml in 1x PBS, deglycosylating the sample with PNGase F (obtained in the laboratory) for 10 min at 50°C, removing PNGase F by protein A binding, washing with using 1x PBS and eluting with 1% formic acid. The sample was reconstituted by adding 1/4 volume of 5 M ammonium acetate, pH 5.0 containing 0.5 M TCEP, and incubating at room temperature for 30 minutes. The sample was then injected into a 2.1x50 mm PLRP-S column (8 µm particles, pore size 1000A) equilibrated with 0.1% formic acid in 20% CH 3 CN/b water (Invitrogen) at a flow rate of 0.5 ml/min. The column was washed with 20% CH 3 CN/b water for 3 min, then eluted with a 0.1 minute gradient to 0.1% formic acid in 90% CH 3 CN/b water, while this concentration was maintained at within 1.9 min. Mass spectra data were obtained on an Agilent 1260 device and deconvolution was performed using MassHunter Qualitative Analysis software version B.05.00 in the range of 15-60 kDa. Peak areas corresponding to different calculated DAR states were weighted according to the DAR of each peak, then summed and the weighted DAR4 peak area was divided by the sum of all weighted peaks to give the DAR value. The analysis of the obtained sample is as follows.
- 180 042529- 180 042529
Пример 4J. Получение дополнительных конгьюгатов с применением других антител CysMabExample 4J. Obtaining additional conjugates using other CysMab antibodies
Способы, описанные в примере 4А, также применяли для получения конъюгатов MPET.DM4 с другими антителами с цистеинами, введенными путем конструирования.The methods described in Example 4A were also used to prepare MPET.DM4 conjugates with other engineered cysteine antibodies.
Способы применяют для получения конъюгатов Ab.CysMab.МРЕТ.DM4, связывающих P-кадгерин, с применением антител NOV169N31Q(E152C-S375C), NEG0012(E152C-S375C), NEGOO13(E152C-S375C), NEG0016(E152C-S375C), NEG0064(E152C-S375C), NEG0067(E152C-S375C), NOV169N31Q(K36OC(HC)K107C(LC)), NEGOO12(K36OC(HC)-K1O7C(LC)), NEGOO13(K36OC(HC)-K1O7C(LC)), NEGOO16(K36OC(HC)K107C(LC)), NEGOO64(K36OC(HC)-K1O7C(LC)) и NEGOO67(K36OC(HC)-K1O7C(LC)), раскрытых в PCTпубликации № WO 2016/203432.Methods are used to obtain P-cadherin-binding Ab.CysMab.MRET.DM4 conjugates using antibodies NOV169N31Q(E152C-S375C), NEG0012(E152C-S375C), NEGOO13(E152C-S375C), NEG0016(E152C-S375C), NEG0064 (E152C-S375C), NEG0067(E152C-S375C), NOV169N31Q(K36OC(HC)K107C(LC)), NEGOO12(K36OC(HC)-K1O7C(LC)), NEGOO13(K36OC(HC)-K1O7C(LC)) , NEGOO16(K36OC(HC)K107C(LC)), NEGOO64(K36OC(HC)-K1O7C(LC)) and NEGOO67(K36OC(HC)-K1O7C(LC)), disclosed in PCT Publication No. WO 2016/203432.
Пример 5. In vitro определение характеристик ADCExample 5 In Vitro Characterization of ADCs
Характеристики конъюгатов антитела и лекарственного средства (ADC) определяли с помощью различных функциональных и аналитических методов. По результатам оценки с помощью FACS ADC сохраняли связывание с белком-мишенью CCR7 на клетках. В случае всех ADC геометрическое среднее интенсивности флуоресценции в анализе связывания FACS находилось в пределах 20% от значения для неконъюгированного антитела. По результатам аналитической SEC было показано, что >95% материала ADC характеризовались требуемой молекулярной массой; в случаях, где это не наблюдалось для исходных продуктов реакции, применение препаративной SEC позволяло достичь необходимой спецификации. Соотношение лекарственного средства и антитела (DAR) оценивали с помощью LCMS образца дегликозилированного восстановленного антитела, при суммировании встречаемости различных разновидностей DAR и уравновешивания числа молекул лекарственного средства на каждой разновидности DAR (например, один ион с DAR2 считался как 2, один ион с DAR1 считался как 1). Конъюгаты, содержащие константные области, содержащие две цистеиновые мутации, характеризовались по меньшей мере DAR 3,4 или выше и наиболее обычно DAR 3,8 или выше. Для всех зарегистрированных конъюгатов данные были согласованы.The antibody drug conjugates (ADC) were characterized by various functional and analytical methods. As assessed by FACS, ADCs retained binding to the CCR7 target protein on cells. For all ADCs, the geometric mean of the fluorescence intensity in the FACS binding assay was within 20% of the value for the unconjugated antibody. Analytical SEC showed that >95% of the ADC material had the desired molecular weight; in cases where this was not observed for the initial reaction products, the use of preparative SEC made it possible to achieve the required specification. The drug-to-antibody ratio (DAR) was assessed by LCMS of a deglycosylated reconstituted antibody sample, summing the occurrence of different DAR varieties and balancing the number of drug molecules on each DAR variety (e.g. one DAR2 ion counted as 2, one DAR1 ion counted as 1). Conjugates containing constant regions containing two cysteine mutations were characterized by at least a DAR of 3.4 or greater and most typically a DAR of 3.8 or greater. For all registered conjugates, the data were consistent.
Пример 6. Ингибирование пролиферации клеток/анализ жизнеспособности клетокExample 6 Cell Proliferation Inhibition/Cell Viability Assay
Выше авторы настоящего изобретения показали, что конъюгированные с флуорофором варианты всех трех антител к CCR7 могли приводить к интернализации CCR7 и эффективному накоплению конъюгированного флуорофора в компартментах клеток с низким pH для целого набора линий клеток. В данном примере авторы настоящего изобретения показывают способность антитела к интернализации и накоплению конъюгированного вещества внутри клетки в режиме, при котором конъюгированное вещество представляет собой токсичную полезную нагрузку.We have shown above that fluorophore-conjugated variants of all three anti-CCR7 antibodies could lead to internalization of CCR7 and efficient accumulation of the conjugated fluorophore in low pH cell compartments for a range of cell lines. In this example, the present inventors demonstrate the ability of an antibody to internalize and accumulate a conjugate within a cell in a mode where the conjugate is a toxic payload.
В режиме piggyback ADC (pgADC) цитотоксические эффекты антител к CCR7 в комплексе с фрагментом вторичного антитела, конъюгированного с полезной нагрузкой, изучали путем оценки жизнеспособности клеток после четырех дней обработки. Получали трехкратные разбавления CCR7специфических IgG и смешивали их с постоянным количеством Fab-фрагмента, сопряженного с полезной нагрузкой. Конечная концентрация Fab-фрагмента, сопряженного с полезной нагрузкой, составляла 0,5 мкг/мл. Реагент Fab представляет собой направленный на Fc мыши Fab, конъюгированный или с MMAF, или с сапорином (Advanced Targeting Systems, Fab-Zap). После предварительной инкубации в течение 30 мин при комнатной температуре по 10 мкл/лунка комплекса антитело-полезная нагрузка добавляли в 384-луночные планшеты с белым дном в трех повторностях. Соответствующие CCR7(+) клетки высевали таким образом, чтобы их плотность составляла менее 1х106/мл в случае клеток из суспензионных культур и достигалась 80% конфлюэнтность в случае адгезивных клеток. Клетки собирали (адгезивные клетки отделяли с помощью аккутазы) и ресуспендировали до примерно 2х104 клеток/мл. Клетки добавляли в 384-луночные планшеты поверх комплекса антитело-полезная нагрузка (20 мкл/лунка). Планшет инкубировали в течение четырех дней при 37°С и 5% СО2. Затем готовили раствор CellTiter-Glo (CellTiter-Glo® люминесцентный анализ жизнеспособности клеток; Promega, № G7571) и добавляли к клеткам из расчета 20 мкл/лунка. Только жизнеспособные клетки продуцируют АТФ, необходимый для люциферазной реакции (предоставленной CellTiter-Glo), которая приводит к люминесценции. В соответствии с этим, жизнеспособность клеток определяли по сигналу люминесценции, который измеряли после 10 мин инкубации при 22°С и 400 об/мин с помощью ридера для нескольких меток Envision 2104. Значения IC50 рассчитывали с применением программного обеспечения Graphpad Prism.In piggyback ADC (pgADC) mode, the cytotoxic effects of anti-CCR7 antibodies in combination with a payload-conjugated secondary antibody fragment were studied by assessing cell viability after four days of treatment. Triple dilutions of CCR7-specific IgGs were prepared and mixed with a constant amount of Fab fragment associated with the payload. The final concentration of the Fab fragment associated with the payload was 0.5 μg/ml. The Fab reagent is a mouse Fc-targeted Fab conjugated to either MMAF or saporin (Advanced Targeting Systems, Fab-Zap). After a 30 min pre-incubation at room temperature, 10 μl/well of the antibody-payload complex was added to 384-well white bottom plates in triplicate. The corresponding CCR7(+) cells were seeded so that their density was less than 1x10 6 /ml in the case of cells from suspension cultures and 80% confluence was achieved in the case of adherent cells. Cells were harvested (adherent cells were separated with accutase) and resuspended to about 2x10 4 cells/ml. Cells were added to 384-well plates on top of the antibody-payload complex (20 μl/well). The tablet was incubated for four days at 37°C and 5% CO 2 . A CellTiter-Glo solution (CellTiter-Glo® luminescence cell viability assay; Promega, #G7571) was then prepared and added to the cells at 20 μl/well. Only viable cells produce the ATP required for the luciferase reaction (provided by CellTiter-Glo) that results in luminescence. Accordingly, cell viability was determined from the luminescence signal, which was measured after 10 min incubation at 22° C. and 400 rpm using an Envision 2104 multi-label reader. IC 50 values were calculated using Graphpad Prism software.
На фиг. 7А и фиг. 7В показано, что все четыре антитела к CCR7 способны к зависимому от концен- 181 042529 трации цитолизу клеток при использовании CCR7+ KE97 клеток в анализе формата piggyback с применением MMAF-конъюгированного реагента. В таблице ниже обобщены результаты экспериментов с применением MMAF или сапорина в качестве инструмента-полезной нагрузки при формате piggy-back.In FIG. 7A and FIG. 7B shows that all four anti-CCR7 antibodies are capable of concentration-dependent cell cytolysis using CCR7+ KE97 cells in a piggyback assay using an MMAF-conjugated reagent. The table below summarizes the results of experiments using MMAF or saporin as the piggy-back instrument payload.
Таблица 16. IC50 и АМАХ антител к CCR7 в цитотоксическом анализе с применением pgADCTable 16. IC 50 and AMAX of anti-CCR7 antibodies in a cytotoxic assay using pgADC
Специфичность цитолиза под действием pgADC оценивали с применением линий клеток, отрицательный по мишени. На фиг. 8 показан пример с использованием реагента FabZap. Специфическое CCR7-зависимое повышение активности 121G12 pgADC наблюдали в случае клеток KE97 и NIH3T3.hCCR7 в отличие от CCR7-отрицательных исходных клеток NIH3T3 или контрольного антитела mIgG.The specificity of cytolysis by pgADC was assessed using target-negative cell lines. In FIG. 8 shows an example using the FabZap reagent. A specific CCR7-dependent increase in 121G12 pgADC activity was observed in KE97 and NIH3T3.hCCR7 cells, in contrast to CCR7-negative original NIH3T3 cells or control mIgG antibody.
Пример 7. Воздействие перекрестно реактивных для мыши неконгьюгированных или конгьюгированных с AURIX1 антител к CCR7 на нормальные гемопоэтические клетки мыши In vivoExample 7 Effects of Anti-CCR7 Anti-CCR7 Anti-Cross-Reactive to Mouse Unconjugated or AURIX1-Conjugated Antibodies on Normal Mouse Hematopoietic Cells In vivo
Экспрессия в нормальных тканях в пределах вида ограничена клетками гемопоэтического происхождения, включая CD4+ и CD8+ Т клетки в крови и лимфоидных органах, что делает ADC, нацеливающийся на CCR7, потенциально небезопасным, особенно в формате Fc дикого типа, который мог бы приводить к ADCC и истощению лимфоидных клеток.Expression in normal tissues within the species is limited to cells of hematopoietic origin, including CD4+ and CD8+ T cells in the blood and lymphoid organs, making ADC targeting CCR7 potentially unsafe, especially in wild-type Fc format, which could lead to ADCC and depletion. lymphoid cells.
Чтобы определить воздействие нацеливания ADC на CCR7, находящийся на нормальных гемопоэтических клетках in vivo, на здоровых самках мышей CD-1 возраста 6-8 недель оценивали перекрестно реактивное для мыши исходное Ab 121G12 как в неконъюгированном состоянии, так и конъюгированное с AURIX1, при этом формат Fc был дикого типа или молчащий (DAPA). Мышей обрабатывали путем введения однократной IV инъекции, содержащей исходное 121G12.Cys-Mab.Fc дикого типа-hIgG1 (121G12.wt.Fc), исходное 121G12.Cys-Mab.DAPA.hIgG1 (121G12.DAPA.Fc), исходное 121G12.CysMab.Fc дикого типа.hIgG1.AURIX1 (121G12.wt.Fc.AURIX1) или исходное 121G12.CysMab.DAPA.hIgG1.AURIX1 (121G12.DAPA.Fc.AURIX1) при конечной дозе, составляющей 10 мг/кг. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.To determine the effect of targeting ADC to CCR7, found on normal hematopoietic cells in vivo, in healthy female CD-1 mice aged 6-8 weeks, the mouse cross-reactive parent Ab 121G12, both unconjugated and AURIX1, was evaluated, with the format Fc was wild-type or silent (DAPA). Mice were treated with a single IV injection containing wild-type 121G12.Cys-Mab.Fc-hIgG1 (121G12.wt.Fc), original 121G12.Cys-Mab.DAPA.hIgG1 (121G12.DAPA.Fc), original 121G12. Wild type CysMab.Fc.hIgG1.AURIX1 (121G12.wt.Fc.AURIX1) or parent 121G12.CysMab.DAPA.hIgG1.AURIX1 (121G12.DAPA.Fc.AURIX1) at a final dose of 10 mg/kg. All doses were adjusted according to the individual body weight of the mice.
В день 25 после обработки селезенки извлекали и разделяли на суспензию из отдельных клеток с применением gentleMACS Dissociator (Miltenyi Biotec Inc, Сан-Диего, Калифорния). Затем 1 млн клеток в каждом образце окрашивали с помощью смеси Ab, которая содержала крысиное антитело к CD8a мыши BUV737, клон 53-6.7 (1:100) (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния, № по кат. 564297), и крысиное антитело к CD4 мыши BV510, клон RM4-5 (1:200) (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния, № по кат. 563106), чтобы определить воздействие отдельных обработок на CD4+ и CD8a+ Т-клетки. Образцы инкубировали при 4°С в течение 30 мин, промывали в ледяном забуференном фосфатом солевом растворе HyClone (Hyclone Laboratories, Логан, Юта) и оценивали на клеточном анализаторе BD LSRFortessaTM (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния). Подсчет общего количества спленоцитов использовали для определения истощения CD4+ или CD8a+ Т-клеток. Т-критерий использовали для определения значимости различий между группами.On day 25 post-treatment, spleens were removed and separated into single cell suspension using gentleMACS Dissociator (Miltenyi Biotec Inc, San Diego, CA). Then, 1 million cells in each sample were stained with an Ab mixture that contained rat anti-mouse CD8a BUV737, clone 53-6.7 (1:100) (BD Biosciences, San Jose, CA, Cat # 564297) and rat anti-mouse CD4 antibody BV510, clone RM4-5 (1:200) (BD Biosciences, San Jose, CA, Cat # 563106) to determine the effect of individual treatments on CD4+ and CD8a + T cells. Samples were incubated at 4° C. for 30 min, washed in ice-cold phosphate buffered saline HyClone (Hyclone Laboratories, Logan, UT) and evaluated on a BD LSRFortessa™ cell analyzer (BD Biosciences, San Jose, CA). Total splenocyte counts were used to determine CD4+ or CD8a + T cell depletion. T-test was used to determine the significance of differences between groups.
Как показано в табл. 17 и на фиг. 9, сильное сокращение числа CD4+ (FC 0,5-0,6) и CD8a+ Т-клеток (FC 0,3-0,5) в селезенке наблюдали на день 3 обработки с помощью Ab 121G12.wt.FC или 121G12.wt.Fc.AURIX1 при 10 мг/кг, это позволяет предположить, что воздействие в виде истощения Тклеток не зависело от присутствия полезной нагрузки AURIX1. От таких эффектов избавляются путем получения молчащей Fc за счет введения мутаций DAPA. Как 121G12.DAPA.Fc, так и 121G12.DAPA.Fc.AURIX1 не оказывали воздействия на популяции Т-клеток в сравнении с группой без обработки. Эти данные указывают на то, что ADC к CCR7 могут быть небезопасными с точки зрения истощения Т-клеток, что можно предотвратить путем получения молчащей Fc за счет мутаций DAPA.As shown in Table. 17 and in FIG. 9, a strong reduction in the number of CD4 + (FC 0.5-0.6) and CD8a + T cells (FC 0.3-0.5) in the spleen was observed on day 3 of treatment with Ab 121G12.wt.FC or 121G12 .wt.Fc.AURIX1 at 10 mg/kg, suggesting that the T cell depletion effect was independent of the presence of the AURIX1 payload. Such effects are avoided by obtaining a silent Fc by introducing DAPA mutations. Both 121G12.DAPA.Fc and 121G12.DAPA.Fc.AURIX1 had no effect on T cell populations compared to the untreated group. These data indicate that anti-CCR7 ADCs may be unsafe in terms of T cell depletion, which can be prevented by generating silent Fc through DAPA mutations.
- 182 042529- 182 042529
Таблица 17. Воздействие антитела 121G12 на популяции CD4+ и CD8a+ Т-клеток у мышей CD-1Table 17 Effect of 121G12 Antibody on CD4+ and CD8a + T Cell Populations in CD-1 Mice
Эксперимент оценивали в день 25 после обработки. Кратное изменение (FC)=среднее количество спленоцитов в день 25 для указанной группы обработки/среднее количество спленоцитов для контрольной группы без обработки в день 3. Т-критерий использовали для определения значимости в сравнении с группой без обработки (*р<0,05, ***р<0,001; NS=He значимо).The experiment was evaluated on day 25 after treatment. fold change (FC)=mean splenocyte count on day 25 for the indicated treatment group/mean splenocyte count for the no-treatment group on day 3. T-test was used to determine significance compared to the no-treatment group (*p<0.05, ***p<0.001; NS=He significant).
Пример 8. Активность ADC к CCR7 в формате прямых конгьюгатовExample 8 ADC activity to CCR7 in direct conjugate format
Цитотоксические эффекты после связывания антител (ADC), напрямую конъюгированных с различными полезными нагрузками, и их интернализацию в CCR7(+) клетки исследовали путем оценки жизнеспособности клеток после четырех дней обработки. Трехкратные разбавления ADC вносили в 384луночные планшеты с белым дном в трех повторностях (10 мкл/мл). Соответствующие CCR7(+) клетки высевали таким образом, чтобы их плотность составляла менее 1x106/мл в случае клеток из суспензионных культур и достигалась 80% конфлюэнтность в случае адгезивных клеток. Клетки собирали (адгезивные клетки отделяли с помощью аккутазы) и ресуспендировали до примерно 2x104 клеток/мл. Клетки добавляли в 384-луночные планшеты поверх антитела (20 мкл/лунка). Планшеты инкубировали в течение четырех дней при 37°С и 5% СО2. Затем готовили раствор CellTiter-Glo (CellTiter-Glo® люминесцентный анализ жизнеспособности клеток; Promega, № G7571) и добавляли к клеткам из расчета 20 мкл/лунка. Жизнеспособность клеток определяли по сигналу люминесценции, который измеряли после 10 мин инкубации при 22°С и 400 об/мин, с помощью ридера Envision. Значения IC50 рассчитывали с применением программного обеспечения Graphpad Prism.The post-binding cytotoxic effects of antibodies (ADC) directly conjugated to various payloads and their internalization into CCR7(+) cells were examined by assessing cell viability after four days of treatment. Three-fold dilutions of ADC were added to 384-well white bottom plates in triplicate (10 μl/ml). The corresponding CCR7(+) cells were seeded so that their density was less than 1x10 6 /ml in the case of cells from suspension cultures and 80% confluence was achieved in the case of adherent cells. Cells were harvested (adherent cells removed with accutase) and resuspended to about 2x104 cells/ml. Cells were added to 384-well plates on top of the antibody (20 μl/well). The plates were incubated for four days at 37°C and 5% CO 2 . A CellTiter-Glo solution (CellTiter-Glo® luminescent cell viability assay; Promega, #G7571) was then prepared and added to the cells at 20 μl/well. Cell viability was determined by the luminescence signal, which was measured after 10 min incubation at 22°C and 400 rpm using an Envision reader. IC 50 values were calculated using Graphpad Prism software.
В таблице ниже показаны примеры эффектов в отношении жизнеспособности клеток, измеренных для антител CysMab к CCR7 в формате Fc дикого типа или молчащей (DAPA) Fc, конъюгированных с AURIX1 или AURIX2.The table below shows examples of cell viability effects measured with CysMab anti-CCR7 Fc wild-type or silent (DAPA) Fc format conjugated to AURIX1 or AURIX2.
Таблица 18. IC50 для ADC к CCR7 в цитотоксическом анализеTable 18. IC 50 for ADC to CCR7 in a cytotoxic assay
Чтобы оценить ADC на специфичность в отношении мишени и зависимость от уровня рецепторов, активность ADC тестировали на линиях клеток с различными уровнями CCR7-рецепторов. В таблице ниже показан пример гуманизированного антитела 674J13 в формате CysMab.DAPA и конъюгированного с AURIX2. Линии клеток отбирали на основании сходной чувствительности к полезной нагрузке.To evaluate ADC for target specificity and receptor level dependence, ADC activity was tested on cell lines with different levels of CCR7 receptors. The table below shows an example of a humanized 674J13 antibody in CysMab.DAPA format and conjugated to AURIX2. Cell lines were selected based on similar payload sensitivity.
- 183 042529- 183 042529
Таблица 19. IC50 гуманизированного антитела 674J13 в формате DAPA и ______________конъюгированного с AURIX2__________Table 19. IC 50 of humanized 674J13 antibody in DAPA format and ______________ conjugated to AURIX2__________
Как видно из эксперимента pHrodo, для активности ADC требуется более высокая степень числа рецепторов, чем для механизма ADCC. Точное граничное значение числа рецепторов зависит от различных параметров (например, авидности антитела, активности полезной нагрузки), а данные, показанные в данном примере, описывают общие принципы. Применение зависимого от авидности антитела к CCR7 в формате DAPA сдвигает активность ADC в направлении раковых клеток, а не нормальных CCR7+ РВМС, которые в данном примере представлены линиями раковых клеток с менее 2000 CCR7 рецепторов.As seen from the pHrodo experiment, ADC activity requires a higher degree of receptor number than the ADCC mechanism. The exact cut-off for the number of receptors depends on various parameters (eg, antibody avidity, payload activity), and the data shown in this example describes general principles. The use of an avidity-dependent antibody to CCR7 in DAPA format shifts ADC activity towards cancer cells rather than normal CCR7+ PBMCs, which in this example are cancer cell lines with less than 2000 CCR7 receptors.
Пример 9. Сайт-специфическое введение MPET.DM4 в ADCExample 9 Site Specific Introduction of MPET.DM4 into ADC
ADC, конъюгированные с DM4, являются общепринятыми в области техники ADC. В данном примере авторы настоящего изобретения описывают создание и применение сайт-специфически конъюгированного MPET.DM4 с использованием варианта CysMab антител, что обеспечивает преимущество получения воспроизводимо однородной партии ADC с контролируемым DAR, в которой DAR (отношение лекарственного средства к антителу) составляет приблизительно 4. Было описано, что конъюгаты, полученные без использования сайт-специфической конъюгации, зачастую содержат значительные популяции с высоким DAR, которые связывали с нежелательными биофизическими особенностями, в том числе повышенной гидрофобностью и, следовательно, более быстрым клиренсом, неудовлетворительным РКпрофилем и повышенной токсичностью. Ниже авторы настоящего изобретения показывают различные in vitro и in vivo оценки ADC к CCR7 на основе MPET.DM4 в сравнении с его аналогом на основе sSPDB.DM4.DM4 conjugated ADCs are common in the ADC art. In this example, the present inventors describe the construction and use of site-specifically conjugated MPET.DM4 using a CysMab variant antibody, which provides the advantage of obtaining a reproducibly homogeneous lot of ADC with controlled DAR, in which the DAR (drug to antibody ratio) is approximately 4. It was described that conjugates prepared without the use of site-specific conjugation often contain significant high DAR populations that have been associated with undesirable biophysical features, including increased hydrophobicity and hence faster clearance, poor PK profile, and increased toxicity. Below, the authors of the present invention show different in vitro and in vivo estimates of ADC to CCR7 based on MPET.DM4 in comparison with its counterpart based on sSPDB.DM4.
Пример 10. Аффинность связывания ADC с MPET.DM4 в сравнении с ADC с sSPDB.DM4 в анализе FACSExample 10 Binding Affinity of ADC to MPET.DM4 Versus ADC to sSPDB.DM4 in a FACS Analysis
Другим потенциальным благоприятным эффектом сайт-специфической конъюгации в сравнении с отсутствием сайт-специфической конъюгации могла быть потенциальная интерференция сайтов конъюгации с лизином, которые структурно расположены вблизи важных CSD-остатков. Можно ожидать, что конъюгация полезной нагрузки с такими лизиновыми сайтами будет воздействовать на аффинность связывания ADC. Чтобы протестировать аффинности связывания ADC с применением описанных в данном примере CysMab, конъюгированных с MPET.DM4, в сравнении с антителами, конъюгированными с sSPDB.DM4 через эндогенный лизин, аффинность связывания определяли с помощью FACS, как описано выше. В таблице ниже обобщены некоторые типичные данные аффинности, которые показывают умеренное снижение аффинности связывания sSPDB.DM4 ADC в сравнении с MPET.DM4 ADC.Another potential beneficial effect of site-specific conjugation versus no site-specific conjugation could be the potential interference of lysine conjugation sites that are structurally located near important CSD residues. Payload conjugation to such lysine sites would be expected to affect ADC binding affinity. To test the binding affinities of ADCs using MPET.DM4-conjugated CysMabs described in this example versus antibodies conjugated to sSPDB.DM4 via endogenous lysine, binding affinities were determined using FACS as described above. The table below summarizes some exemplary affinity data that shows a modest reduction in binding affinity for sSPDB.DM4 ADC compared to MPET.DM4 ADC.
Таблица 20. Аффинность связывания ADC к CCR7Table 20 ADC binding affinity for CCR7
Пример 11. In vitro активность ADC с MPET.DM4 в сравнении с ADC с sSPDB.DM4Example 11 In vitro activity of ADC with MPET.DM4 versus ADC with sSPDB.DM4
Цитотоксические эффекты ADC 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 и 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR3,9) оценивали в in vitro анализе жизнеспособности, как описано выше. В таблице ниже показана аналогичная, слегка улучшенная активность конъюгата с MPET.DM4 по сравнению с конъюгатом с sSPDB.DM4. Это может быть следствием лучше сохраненной аффинности или других факторов.The cytotoxic effects of ADC 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 and 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR3,9) were assessed in an in vitro viability assay as described above. The table below shows a similar, slightly improved activity of the MPET.DM4 conjugate compared to the sSPDB.DM4 conjugate. This may be due to better preserved affinity or other factors.
- 184 042529- 184 042529
Таблица 21. In vitro цитотоксическая активность ADC к CCR7Table 21. In vitro cytotoxic activity of ADC to CCR7
ADC 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 дополнительно тестировали на ряде линий раковых клеток, охватывающих различные показания, где он достигал значительного цитолиза клеток, который коррелировал с плотностью рецепторов.ADC 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 was further tested on a range of cancer cell lines covering various indications where it achieved significant cell cytolysis that correlated with receptor density.
Пример 12. Дозозависимая In vivo эффективностьExample 12 Dose Dependent In Vivo Efficacy
121G12.CvsMab.DAPA.MPET.DM4 и 121G12.PAPA.sSPDB.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели множественной миеломы KE97 у мышей SCID-Beiqe121G12.CvsMab.DAPA.MPET.DM4 and 121G12.PAPA.sSPDB.DM4 against the xenograft model of multiple myeloma KE97 in SCID-Beiqe mice
Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 и 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 in vivo, ксенотрансплантатную модель KE97 приживляли самкам мышей SCID-beige посредством подкожной инъекции 3х106 клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 135 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=8 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.МРЕТ.DM4 (DAR4) при конечной дозе, составляющей 0,5, 2 или 5 мг/кг, 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR 3,9) из расчета 0,5, 2 или 5 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг. Все дозы корректировали в соответ ствии с индивидуальной массой тела мышей.To demonstrate the targeted antitumor activity of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 and 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 in vivo, a KE97 xenograft model was engrafted to female SCID-beige mice by subcutaneous injection of 3x10 6 cells into the right flank of each mouse. After tumors reached approximately 135 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume into treatment groups (n=8 per group). Mice were treated with IV administration of one of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) at a final dose of 0.5, 2 or 5 mg/kg, 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR 3.9) based 0.5, 2 or 5 mg/kg or non-specific isotype control IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 5 mg/kg. All doses were adjusted according to individual body weight of mice.
Все тестируемые средства хорошо переносились на протяжении исследования, и выраженных клинических симптомов токсичности или потери массы тела не наблюдали ни в одной из групп обработки (табл. 23).All tested agents were well tolerated throughout the study and no significant clinical signs of toxicity or weight loss were observed in any of the treatment groups (Table 23).
Таблица 23. Дозозависимая эффективность ADC к CCR7 в отношении ксенотрансплантатной модели KE97Table 23. Dose-dependent efficacy of anti-CCR7 ADC in relation to the KE97 xenograft model
- 185 042529- 185 042529
Эксперимент оценивали в день 9 после обработки (день 23 после имплантации), *р<0,001 в сравнении с контрольной группой без обработки (однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений).The experiment was evaluated at day 9 post-treatment (day 23 post-implantation), *p<0.001 compared to no-treatment control group (one-way ANOVA/Tukey's multiple comparison test).
% ΔТ/ΔС=100ΔT/ΔС, где ΔT=средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в D23 исследования - средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в начальный день при введении дозы;% ΔT/ΔC=100ΔT/ΔC, where ΔT=mean tumor volume in the drug-treated group in study D23 - the mean tumor volume in the drug-treated group on the starting day of dosing;
ΔС=средний объем опухоли в контрольной группе в D23 исследования - средний объем опухоли в контрольной группе в начальный день введения дозы D14.ΔC=mean tumor volume in the control group in the D23 study - the average tumor volume in the control group on the initial day of dosing D14.
% регрессии=(1-Т конечный/Т начальный) х 100, где Т конечный представляет собой средний объем опухоли в D23, а Т начальный определяется как объем опухоль в D14 после имплантации.% regression=(1-T final/T initial) x 100, where T final is the mean tumor volume in D23 and T initial is defined as the volume of the tumor in D14 after implantation.
Δ массы тела (%)=(средняя масса тела в D23-средняя масса тела в D14)х100/средняя масса тела в D14 обработки.Δ body weight (%)=(average body weight in D23-average body weight in D14)x100/average body weight in D14 treatments.
Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к дозозависимой противоопухолевой эффективности со значением ΔT/ΔС, составляющим 78,62% (0,5 мг/кг), в то же время дозы 2 и 5 мг/кг приводили к средней регрессии на 33 и 54% соответственно, ко D9 после введения первой дозы (D23 после имплантации). Обработка 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 также продемонстрировала дозозависимую противоопухолевую эффективность со значениями ΔТ/ΔС, составляющими 85,38% (0,5 мг/кг) и 13,77% (2 мг/кг), в то же время доза 5 мг/кг приводила к средней регрессии, составляющей 33%, ко D9 после введения первой дозы (D23 после имплантации). Ко D23-D25 после имплантации мышей контрольных групп и групп обработки дозой 0,5 мг/кг умерщвляли, а оставшиеся группы обрабатывали второй дозой в D28 после имплантации одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 или 5 мг/кг или 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 из расчета 2 или 5 мг/кг. Устойчивую регрессию опухоли наблюдали в случае введенияA slight antitumor efficacy was observed after treatment with non-specific isotype control IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at a rate of 5 mg/kg. Treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 resulted in dose-dependent antitumor efficacy with a ΔT/ΔC value of 78.62% (0.5 mg/kg), while doses of 2 and 5 mg/kg resulted in moderate regression by 33 and 54%, respectively, to D9 after the first dose (D23 after implantation). Treatment with 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 also demonstrated dose-dependent antitumor efficacy with ΔT/ΔC values of 85.38% (0.5mg/kg) and 13.77% (2mg/kg), while the dose was 5 mg/kg resulted in a mean regression of 33% to D9 after the first dose (D23 after implantation). Ko D23-D25 after implantation, mice in the control and 0.5 mg/kg treatment groups were sacrificed, and the remaining groups were treated with a second dose in D28 after implantation of one of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 2 or 5 mg/kg or 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 at the rate of 2 or 5 mg/kg. Stable regression of the tumor was observed in the case of administration
121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 и 5 мг/кг, а также в случае 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 из расчета 5 мг/кг вплоть до конца исследования в D42 после имплантации. В случае121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 2 and 5 mg/kg, and in the case of 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 at 5 mg/kg until the end of the study at D42 after implantation. When
121G12.DAPA.sSPDB.DM4 из расчета 2 мг/кг реакция была более гетерогенной, причем у примерно 25% мышей проявлялась устойчивая регрессия опухоли, в то же время у остальной группы показаны или стабилизация заболевания, или прогрессирование опухоли (фиг. 10, табл. 23).121G12.DAPA.sSPDB.DM4 at the rate of 2 mg/kg, the response was more heterogeneous, with approximately 25% of mice showing stable tumor regression, while the rest of the group showed either disease stabilization or tumor progression (Fig. 10, Table .23).
Пример 13. Оценка эффективности 121G12.CysMab.DAPA.МРЕТ.DM4 в сравнении с 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 в отношении модели множественной миеломы KE97 при больших начальных объемах опухолиExample 13 Efficacy Evaluation of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 Versus 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 in the KE97 Multiple Myeloma Model at Large Initial Tumor Volumes
In vivo модель с более высокими требованиями обеспечивали с применением линии клеток множественной миеломы KE97, чтобы провести дополнительное различие в противоопухолевой эффективности, обусловленной разными расщепляемыми линкерами, путем сравнения эффективности 121G12.CysMab.DAPA.МРЕТ.DM4 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR3,9) в отношении опухолей с большими начальными объемами опухоли при введении первой дозы. Ксенотрансплантатную модель KE97 приживляли самкам мышей SCID-beige посредством подкожной инъекции 3х106 клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 450 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в две группы обработки (n=8). Мышей обрабатывали путем IV введения 2 мг/кг одного из 121G12.CysMab.DAPA.МРЕТ.DM4 или 121G12.DAPA.sSPDB.DM4.A more demanding in vivo model was provided using the KE97 multiple myeloma cell line to further differentiate antitumor efficacy due to different cleavable linkers by comparing the potency of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 to 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR3 ,9) for tumors with large initial tumor volumes at the first dose. The KE97 xenograft model was engrafted to female SCID-beige mice by subcutaneous injection of 3x10 6 cells into the right flank of each mouse. After tumors reached approximately 450 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume into two treatment groups (n=8). Mice were treated with IV administration of 2 mg/kg of either 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 or 121G12.DAPA.sSPDB.DM4.
Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 из расчета 2 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к частичной регрессии/продолжительной остановке роста у 75% (6 из 8) мышей с обработкой однократной дозой (фиг. 11). 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 сильно превосходило 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 в данной модели (в D25 средний объем опухоли составлял 524,83± 143,20 в сравнении с 1337,13±35,13,A slight antitumor efficacy was observed after treatment with 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 at a rate of 2 mg/kg. Treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 resulted in partial regression/permanent stunting in 75% (6 out of 8) single dose treated mice (FIG. 11). 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 was highly superior to 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 in this model (in D25, the mean tumor volume was 524.83±143.20 vs. 1337.13±35.13,
- 186 042529 соответственно, р<0,001; непарный Т-критерий).- 186 042529, respectively, p<0.001; unpaired T-test).
Пример 14. In vivo эффективностьExample 14 In vivo efficacy
121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении модели опухоли на основе полученного от пациента первичного немелкоклеточного рака легкого HLUX1934 Противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 оценивали на ксенотрансплантатной модели первичного немелкоклеточного рака легкого HLUX1934, экспрессирующего CCR7. Самкам бестимусных голых мышей имплантировали подкожно фрагменты опухоли в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 100 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=8). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) из расчета 10 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 10 мг/кг. Вторую дозу каждого антитела вводили спустя 2 недели. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 against a tumor model based on patient-derived primary non-small cell lung cancer HLUX1934 The antitumor activity of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 was evaluated in a xenograft model of primary non-small cell lung cancer HLUX1934 expressing CCR7. Female athymic nude mice were implanted subcutaneously with tumor fragments in the right flank of each mouse. After tumors reached approximately 100 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume into treatment groups (n=8). Mice were treated with IV administration of one of the 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) at 10 mg/kg or the non-specific isotype control IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 10 mg/kg. A second dose of each antibody was administered 2 weeks later. All doses were adjusted according to the individual body weight of the mice.
Неспецифическое изотипическое контрольное IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 10 мг/кг, по-видимому, приводило к небольшой задержке роста опухоли по сравнению с группой без обработки (значение ΔT/ΔС составляло 53,07%), потенциально вследствие неспецифического связывания антитела с нецелевой мишенью в модели HLUX1934. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к более выраженной эффективности, которая была устойчивой при введении второй дозы.The non-specific isotype control IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 10 mg/kg appeared to result in a slight delay in tumor growth compared to the no-treatment group (ΔT/ΔC value was 53.07%), potentially due to non-specific antibody binding to a non-target in the HLUX1934 model. Treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 resulted in a more pronounced efficacy, which was sustained at the second dose.
Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 при дозе 10 мг/кг хорошо переносилась, при этом отсутствовала явная потеря массы тела, а значение ΔT/ΔС составляло 18,83% в D34 после имплантации (фиг. 12, табл. 24).Treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 10mg/kg was well tolerated with no apparent weight loss and a ΔT/ΔC value of 18.83% in D34 after implantation (Fig. 12, Table 24) .
Таблица 24. Эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении модели полученного от пациента NSCLC HLUX1934.Table 24 Efficacy of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 against patient-derived NSCLC model HLUX1934.
Эксперимент оценивали в день 34 после имплантации (D23 после обработки).The experiment was evaluated at day 34 post-implantation (D23 post-treatment).
*р<0,001 в сравнении с контрольной группой без обработки (однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений).*p<0.001 compared to untreated controls (one-way ANOVA/Tukey's multiple comparison test).
% ΔT/ΔС=100ΔT/ΔС, где ΔT=средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в D34 исследования -средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в начальный день при введении дозы;% ΔT/ΔC=100ΔT/ΔC, where ΔT=mean tumor volume in the drug-treated group in study D34 -mean tumor volume in the drug-treated group on the starting day of dosing;
ΔC=средний объем опухоли в контрольной группе в D34 исследования - средний объем опухоли в контрольной группе в начальный день введения дозы.ΔC=mean tumor volume in the control group in the D34 study - the average tumor volume in the control group on the initial day of dosing.
Δ массы тела (%)=(средняя масса тела в D34-средняя масса тела в D11)х100/средняя масса тела в D11 обработки.Δ body weight (%)=(average body weight in D34-average body weight in D11)x100/average body weight in D11 treatment.
** В группе без обработки мышей умерщвляли из-за избыточной опухолевой массы в D25-D27 после обработки.** In the no-treatment group, mice were sacrificed due to excess tumor mass in D25-D27 after treatment.
Пример 15. In vivo эффективность 684E12.SMCC.DM1 в отношении ксенотрансплантатной модели множественной миеломы KE97 у мышей SCID-BeigeExample 15 In vivo Efficacy of 684E12.SMCC.DM1 against the KE97 Xenograft Model of Multiple Myeloma in SCID-Beige Mice
Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 684E12.SMCC.DM1 in vivo, ксенотрансплантатную модель KE97 приживляли самкам мышей SCID-beige посредством подкожной инъекции 3х106 клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 200 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=8 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из исходного 684E12.SMCC.DM1 (DAR2,6) при конечной дозе 2 или 6 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного IgG1.SMCC.DM1 из расчета 6 мг/кг. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.To demonstrate the targeted antitumor activity of 684E12.SMCC.DM1 in vivo, the KE97 xenograft model was engrafted to female SCID-beige mice by subcutaneous injection of 3x10 6 cells into the right flank of each mouse. After tumors reached approximately 200 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume into treatment groups (n=8 per group). Mice were treated with IV administration of one of the parent 684E12.SMCC.DM1 (DAR2,6) at a final dose of 2 or 6 mg/kg or the non-specific isotype control IgG1.SMCC.DM1 at 6 mg/kg. All doses were adjusted according to the individual body weight of the mice.
Все тестируемые средства хорошо переносились на протяжении исследования, и выраженных клинических симптомов токсичности или потери массы тела не наблюдали ни в одной из групп обработки. Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным IgG1.SMCC.DM1 или исходным 684E12.SMCC.DM1 из расчета 2 мг/кг. Обработка исходным 684E12.SMCC.DM1 из расчета 6 мг/кг приводила к значению ΔT/ΔС, составляющему 6,72% в D11 после введения дозы (р<0,0001, однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множествен- 187 042529 ных сравнений) (фиг. 13).All tested agents were well tolerated throughout the study and no significant clinical signs of toxicity or weight loss were observed in any of the treatment groups. Negligible antitumor efficacy was observed after treatment with non-specific isotype control IgG1.SMCC.DM1 or parent 684E12.SMCC.DM1 at 2 mg/kg. Treatment with stock 684E12.SMCC.DM1 at 6 mg/kg resulted in a post-dose ΔT/ΔC of 6.72% in D11 (p<0.0001, one-way ANOVA/Tukey test for multiple comparisons) (Fig. 13).
Пример 16. In vivo целевая модуляция фармакодинамических маркеров под действиемExample 16 In vivo target modulation of pharmacodynamic markers by
121G12.CysMab.PAPA.MPE T.DM4 в модели опухоли KE97121G12.CysMab.PAPA.MPE T.DM4 in KE97 tumor model
Накопление опухолевых клеток, положительных по маркеру фосфо-гистон НЗ, после обработки 121G12.CysMab.DAPA.MPEТ.DM4 применяли для оценки способности ADC к CCR7 индуцировать остановку на стадии G2/M in vivo.The accumulation of tumor cells positive for the phospho-histone H3 marker after treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 was used to assess the ability of ADC to CCR7 to induce arrest at the G2/M stage in vivo.
Проводили исследование, при котором ксенотрансплантатную модель KE97 приживляли самкам мышей SCID-beige посредством подкожной инъекции 3x106 клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 140 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=3 на группу). Мышей обрабатывали путем однократного IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPEТ.DM4 при конечной дозе 2, 5 или 10 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного IgG1.CysMab.DAPA.MPEТ.DM4 из расчета 10 мг/кг. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей. Через 48 ч после обработки опухоли собирали для оценки уровней фосфогистона H3 с помощью иммунного гистохимического окрашивания, описанного ниже.A study was conducted in which a KE97 xenograft model was engrafted to female SCID-beige mice by subcutaneous injection of 3x106 cells into the right flank of each mouse. After the tumors reached approximately 140 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume into treatment groups (n=3 per group). Mice were treated with a single IV injection of one of the 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at a final dose of 2, 5, or 10 mg/kg or the non-specific isotype control IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 10 mg/kg. All doses were adjusted according to the individual body weight of the mice. Tumors were harvested 48 hours after treatment for phosphohistone H3 levels by immunohistochemical staining, described below.
Чтобы измерить накопление ядер, положительных по фосфогистону H3, с помощью иммуногистохимического исследования, поликлональное антитело кролика, нацеливающееся на остатки, окружающие фосфорилированный серин 10 гистона H3 человека, получали от Ventana Medical Systems (Тусон, Аризона, № по кат. 760-4591). Протокол IHC предусматривал нагревание и умеренное воздействие (32 мин) реагента для демаскирования антигена Ventana Discovery Cell Conditioner 1. Образцы инкубировали в течение 60 мин при комнатной температуре с первичным антителом (предварительно разведенным согласно рекомендациям производителя). Последующую инкубацию в течение 12 мин проводили с конъюгированным HRP вторичным Ab к кролику OmniMap (Ventana, Тусон, Аризона, № по кат. 760-4311) (предварительно разведенным согласно рекомендациям производителя).To measure the accumulation of phosphohistone H3 positive nuclei by immunohistochemistry, a rabbit polyclonal antibody targeting residues surrounding human histone H3 phosphorylated serine 10 was obtained from Ventana Medical Systems (Tucson, AZ, Cat # 760-4591). The IHC protocol involved heating and moderate exposure (32 min) to Ventana Discovery Cell Conditioner 1 antigen unmasking reagent. Samples were incubated for 60 min at room temperature with primary antibody (pre-diluted according to manufacturer's recommendations). A subsequent 12 min incubation was performed with HRP-conjugated OmniMap rabbit secondary Ab (Ventana, Tucson, AZ, Cat # 760-4311) (pre-diluted according to manufacturer's recommendations).
Хотя на фиг. 14А на препаратах, полученных у представителей группы без обработки и группы изотипического контрольного IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4, показаны редкие опухолевые клетки, положительные по фосфогистону H3, устойчивое дозозависимое повышение иммунного окрашивания фосфогистона H3 обнаружено через 48 ч после введения 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4. Количественное определение сигнала выполняли с применением MatLab (MathWorks, Натик, Массачусетс), где общую площадь сигнала фосфогистона H3 (мкм2) нормализовали по общей площади ядер (мкм2), что давало значения относительного показателя фосфогистона H3 (%), показанные ниже для каждой из групп обработки. Данные на фиг. 14В указывают на то, что 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 способен вызывать сильно выраженную остановку на стадии G2/M на ксенотрансплантатах опухоли, что соответствует ожидаемому механизму действия полезной нагрузки.Although in FIG. 14A, preparations obtained from members of the untreated group and the isotype control IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 group show rare tumor cells positive for phosphohistone H3, a sustained dose-dependent increase in phosphohistone H3 immune staining was detected 48 h after 121G12.CysMab administration. .DAPA.MPET.DM4. Signal quantification was performed using MatLab (MathWorks, Natick, Massachusetts) where total phosphohistone H3 signal area (µm 2 ) was normalized to total nuclear area (µm 2 ) to give relative phosphohistone H3 values (%) shown below for each from processing groups. The data in FIG. 14B indicate that 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 is able to induce a pronounced arrest at the G2/M stage on tumor xenografts, consistent with the expected payload mechanism.
Пример 17. Способ получения антитела 121G12.CysMab.DAPAExample 17. Method for obtaining antibodies 121G12.CysMab.DAPA
В данном примере описан способ получения антитела к CCR7, 121G12.CysMab.DAPA, с помощью культуры клеток, где Ab экспрессируется с вектора, который кодирует Ab. После того как Ab экспрессировался в культуре клеток, Ab очищали из культуры клеток следующим образом.This example describes a method for obtaining an antibody to CCR7, 121G12.CysMab.DAPA, using cell culture, where Ab is expressed from a vector that encodes Ab. After Ab was expressed in cell culture, Ab was purified from cell culture as follows.
Первая стадия способа очистки промежуточного вещества лекарственной субстанции антитела 121G12.CysMab.DAPA заключалась в удалении клеток с помощью поточной глубокой фильтрации, с последующей фильтрацией через фильтр с размером пор 0,2 мкм.The first step of the method for purifying the drug substance intermediate of the 121G12.CysMab.DAPA antibody was to remove the cells by in-line deep filtration, followed by filtration through a filter with a pore size of 0.2 μm.
Вторая стадия заключается в стадии аффинной жидкостной хроматографии с белком А. В зависимости от общего количества нерасфасованного продукта данную стадию проводят за несколько циклов. Каждый цикл допускает максимальную загрузку, составляющую примерно 20 г/л объема колонки. Элюирование проводят с помощью 50 мМ уксусной кислоты с примерным pH 3,0.The second step is a protein A affinity liquid chromatography step. Depending on the total amount of bulk product, this step is carried out in several cycles. Each cycle allows for a maximum loading of approximately 20 g/L column volume. Elution was carried out with 50 mM acetic acid, approximately pH 3.0.
Рабочая температура составляет 18-28°С. Все элюаты объединяют и хранят при 2-8°С до проведения стадии инактивации вируса.The operating temperature is 18-28°C. All eluates are pooled and stored at 2-8° C. until the virus inactivation step is carried out.
Третья стадия представляет собой инактивацию вируса с помощью обработки при низком pH. Температуру раствора промежуточного вещества из стадии 2 доводят до 18-28°С и корректируют pH до 3,5 (диапазон 3,4-3,6). Затем раствор промежуточного вещества продукта выдерживают для инактивации вируса в течение 70 мин (диапазон 60-90 мин). После завершения времени выдерживания раствор доводят до pH 6,0 (диапазон 5,8-6,2). В конце стадии раствор подвергают глубокой поточной фильтрации с помощью фильтра с размером пор 0,2 мкм и хранят при 2-8°С.The third step is virus inactivation by low pH treatment. The temperature of the intermediate solution from step 2 is brought to 18-28° C. and the pH is adjusted to 3.5 (range 3.4-3.6). The product intermediate solution is then allowed to inactivate the virus for 70 minutes (range 60-90 minutes). After the end of the aging time, the solution is adjusted to pH 6.0 (range 5.8-6.2). At the end of the stage, the solution is subjected to deep flow filtration using a filter with a pore size of 0.2 μm and stored at 2-8°C.
Четвертая стадия представляет собой катионообменную хроматографию в режиме связывание/элюирование, которая предусматривает интегрированное восстановление на колонке. В зависимости от титра данную стадию проводят за несколько циклов. Каждый цикл допускает загрузку, составляющую примерно 30 г/л объема колонки. Колонку уравновешивают с помощью буфера А, содержащего 20 мМ сукцинат натрия, pH 6,0. Восстановление на колонке проводят с применением 20 мМ фосфата натрия, 1 мМ EDTA, 7 мМ L-цистеина, pH 7,1, в качестве буфера для восстановления.The fourth stage is a cation exchange chromatography in the mode of binding/elution, which provides for an integrated reduction on the column. Depending on the titer, this step is carried out in several cycles. Each cycle allows for a loading of approximately 30 g/L column volume. The column is equilibrated with buffer A containing 20 mM sodium succinate, pH 6.0. Recovery on the column is carried out using 20 mm sodium phosphate, 1 mm EDTA, 7 mm L-cysteine, pH 7.1, as a recovery buffer.
Буфер для восстановления удаляют с помощью буфера А и элюирование проводят с линейным градиентом от 10 до 90% с помощью буфера А и буфера В, содержащего 10 мМ сукцината натрия, 300 мМ хлорида натрия, pH 6,0. Элюаты и объединенные элюаты можно хранить при 2-8°С до стадии анионооб- 188 042529 менной хроматографии на мультимодальных разделительных матрицах.The recovery buffer is removed with buffer A and the elution is carried out with a linear gradient from 10 to 90% with buffer A and buffer B containing 10 mm sodium succinate, 300 mm sodium chloride, pH 6.0. The eluates and pooled eluates can be stored at 2-8° C. until the anion exchange chromatography step on multimodal separation matrices.
Пятая стадия способа представляет собой анионообменную хроматографию в режиме с непрерывным потоком. В зависимости от титра данную стадию проводят за несколько циклов. Каждый цикл допускает максимальную загрузку, составляющую примерно 350 г/л объема колонки. Рабочая температура составляет 18-28°С. Уравновешивание проводят с помощью 20 мМ сукцината натрия, 119 мМ хлорида натрия, pH 6,0. Конечный продукт фильтрации хранят при 2-8°С перед стадией удаления вируса.The fifth step of the process is anion exchange chromatography in continuous flow mode. Depending on the titer, this step is carried out in several cycles. Each cycle allows for a maximum load of approximately 350 g/L column volume. The operating temperature is 18-28°C. Equilibration is carried out with 20 mM sodium succinate, 119 mM sodium chloride, pH 6.0. The final filtration product is stored at 2-8° C. prior to the virus removal step.
Вирусная фильтрация, шестая стадия, состоит из префильтрации с помощью фильтра с размером пор 0,1 мкм, с последующей вирусной фильтрацией с помощью нанофильтра Planova 20N. Температуру раствора промежуточного вещества из стадия 5 доводят до 18-28°С перед вирусной фильтрацией. Рабочая температура составляет 18-28°С. После нанофильтрации промежуточное вещество хранят при 2-8°С или 18-28°С.Virus filtration, the sixth stage, consists of prefiltration with a filter with a pore size of 0.1 µm, followed by virus filtration with a Planova 20N nanofilter. The temperature of the intermediate solution from step 5 is adjusted to 18-28° C. before viral filtration. The operating temperature is 18-28°C. After nanofiltration, the intermediate is stored at 2-8°C or 18-28°C.
Седьмая стадия, ультрафильтрация/диафильтрация, состоит из стадии концентрирования до примерно 70 г/л с последующей стадией 1ой диафильтрации с помощью 10 мМ фосфата калия, pH 6,0. При диафильтрации планируется получить коэффициент обмена, составляющий по меньшей мере 7, с последующим разбавлением до примерно 50 г/л. Конечное промежуточное вещество лекарственной субстанции пропускают через фильтр с размером пор 0,2 мкм и хранят при 2-8°С.The seventh step, ultrafiltration/diafiltration, consists of a concentration step to about 70 g/l followed by a 1st diafiltration step with 10 mM potassium phosphate, pH 6.0. With diafiltration, it is planned to obtain an exchange ratio of at least 7, followed by dilution to about 50 g/l. The final drug substance intermediate is passed through a 0.2 µm filter and stored at 2-8°C.
На восьмой и последней стадии конечным нерасфасованным промежуточным соединением лекарственной субстанции заполняют в виде аликвот подходящие контейнеры и хранят при температуре ниже -60°С после замораживания.In the eighth and final step, the final bulk drug substance intermediate is aliquoted into suitable containers and stored below -60° C. after freezing.
Таблица 25. Блок-схема способа очистки и восстановленияTable 25. Flowchart of the cleaning and recovery method
Стадия ОперацияStage Operation
Стадия 1 Сбор, удаление клеток и фильтрацияStage 1 Collection, removal of cells and filtration
Аффинная хроматографияAffinity chromatography
Стадия 2 (MabSelect SuRE)Stage 2 (MabSelect SuRE)
Стадия 3 Инактивация вируса при pH 3,5Step 3 Virus inactivation at pH 3.5
Катионообменная хроматография и Стадия 4 восстановление на колонке (Fractogel EMD SO3 (М))Cation exchange chromatography and Step 4 column recovery (Fractogel EMD SO3 (M))
Анионообменная хроматография на мультимодальныхAnion exchange chromatography on multimodal
Стадия 5 разделительных матрицах (Capto adhere)Stage 5 separator matrices (Capto adhere)
Удаление вируса с помощью нанофильтрации Стадия 6 (Planova 20N)Virus removal by nanofiltration Stage 6 (Planova 20N)
Ультрафильтрация/диафильтрация и конечная Стадия 7 фильтрацияUltrafiltration/diafiltration and final Stage 7 filtration
Стадия 8 Заполнение и глубокое замораживаниеStage 8 Filling and Deep Freezing
Пример 18. Дозозависимая in vivo эффективностьExample 18 Dose-Dependent In Vivo Efficacy
121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели ABC-DLBCL OCILY3 у мышей NSG.121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 against the ABC-DLBCL OCILY3 xenograft model in NSG mice.
Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in vivo на модели ABC-DLBCL, ксенотрансплантатную модель OCILY3 приживляли самкам мышей NSG посредством подкожной инъекции 10х106 клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 140 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=6 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) при конечной дозе 0,5, 1 или 2 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг в день 1 и день 15 исследования. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей. Все тестируемые средства хорошо переносились на протяжении исследования, и выраженных клинических симптомов токсичности или потери массы тела не наблюдали ни в одной из групп обработки (табл. 26).To demonstrate the in vivo targeted antitumor activity of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in the ABC-DLBCL model, an OCILY3 xenograft model was engrafted to female NSG mice by subcutaneous injection of 10 x 10 6 cells into the right flank of each mouse. After tumors reached approximately 140 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume into treatment groups (n=6 per group). Mice were treated with IV administration of one of the 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) at a final dose of 0.5, 1, or 2 mg/kg or the non-specific isotype control hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 2 mg/kg. kg on day 1 and day 15 of the study. All doses were adjusted according to the individual body weight of the mice. All tested agents were well tolerated throughout the study and no significant clinical signs of toxicity or weight loss were observed in any of the treatment groups (Table 26).
Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к дозозависимой противоопухолевой эффективности со значением ΔT/ΔС, составляющим 74,6% (0,5 мг/кг) и 10,7% (1 мг/кг), в то же время доза 2 мг/кг приводи- 189 042529 ла к средней регрессии, составляющей 65,9%, ко дню 28 исследования. У 3 из 6 мышей в группеA slight antitumor efficacy was observed after treatment with non-specific isotype control hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at a rate of 2 mg/kg. Treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 resulted in dose-dependent antitumor efficacy with ΔT/ΔC values of 74.6% (0.5 mg/kg) and 10.7% (1 mg/kg), while the 2 mg/kg dose resulted in a mean regression of 65.9% by day 28 of the study. 3 out of 6 mice in the group
121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг проявлялась полная регрессия (фиг. 15).121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at the rate of 2 mg/kg showed complete regression (Fig. 15).
Таблица 26. Дозозависимая эффективность ADC к CCR7 в отношении ксенотрансплантатной _____________модели OCI-LY3 в . день 28 обработки_____________Table 26. Dose-dependent efficacy of anti-CCR7 ADCs against the xenograft ____________ OCI-LY3 c model. day 28 processing_____________
Эксперимент оценивали в день 28 после обработки, **р<0,005 в сравнении с контрольной группой без обработки (однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений).The experiment was evaluated on day 28 post-treatment, **p<0.005 compared to no-treatment control (one-way ANOVA/Tukey's multiple comparison test).
% ΔТ/ΔС=100ΔT/ΔС, где ΔT=средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в D28 исследования - средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в начальный день при введении дозы;% ΔT/ΔC=100ΔT/ΔC, where ΔT=mean tumor volume in the drug-treated group in study D28 - the mean tumor volume in the drug-treated group on the initial day of dosing;
ΔC=средний объем опухоли в контрольной группе в D28 исследования - средний объем опухоли в контрольной группе в начальный день введения дозы D1.ΔC=mean tumor volume in the control group in the D28 study - the average tumor volume in the control group on the initial day of dosing D1.
% регрессии=(1-Т конечный/Т начальный) х 100 рассчитывали, если ΔΤ<Ο, где Т конечный представляет собой средний объем опухоли в D28, а Т начальный определяется как объем опухоли в D1 обработки.% regression=(1-T final/T initial) x 100 was calculated if ΔΤ<Ο, where T final is the mean tumor volume in D28 and T initial is defined as the tumor volume in D1 treatment.
Δ массы тела (%)=(средняя масса тела в D28-средняя масса тела в D1)х100/средняя масса тела в D1 обработки.Δ body weight (%)=(average body weight in D28-average body weight in D1)x100/average body weight in D1 treatments.
Пример 19. Дозозависимая in vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели GCB-DLBCL Toledo у мышей SCID-bg.Example 19 Dose-dependent in vivo efficacy of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 against the GCB-DLBCL Toledo xenograft model in SCID-bg mice.
Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in vivo на модели GCB-DLBCL, ксенотрансплантатную модель Toledo приживляли самкам мышей Scid-bg посредством подкожной инъекции 3х106 клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 100 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=4 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) при конечной дозе 2 или 5 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг в день 1 и день 15 исследования. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей. Все тестируемые средства хорошо переносились на протяжении исследования, и выраженных клинических симптомов токсичности или потери массы тела не наблюдали ни в одной из групп обработки (табл. 27).To demonstrate the in vivo targeted antitumor activity of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in the GCB-DLBCL model, the Toledo xenograft model was engrafted to female Scid-bg mice by subcutaneous injection of 3x10 6 cells into the right flank of each mouse. After tumors reached approximately 100 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume to treatment groups (n=4 per group). Mice were treated with IV administration of one of the 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) at a final dose of 2 or 5 mg/kg or the non-specific isotype control hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 5 mg/kg on day 1 and day 15 of the study. All doses were adjusted according to the individual body weight of the mice. All tested agents were well tolerated throughout the study, and no significant clinical signs of toxicity or weight loss were observed in any of the treatment groups (Table 27).
Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к дозозависимой противоопухолевой эффективности со значением ΔT/ΔС, составляющим 52,7% (2 мг/кг) и 20,6% (5 мг/кг) (фиг. 16, табл. 27).A slight antitumor efficacy was observed after treatment with non-specific isotype control hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at a rate of 5 mg/kg. Treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 resulted in dose-dependent antitumor efficacy with ΔT/ΔC values of 52.7% (2 mg/kg) and 20.6% (5 mg/kg) (FIG. 16, Table 1). 27).
- 190 042529- 190 042529
Таблица 27. Дозозависимая эффективность ADC к CCR7 в отношении ксенотрансплантатной _______________модели Toledo в день . 20 обработки__________Table 27. Dose-dependent efficacy of anti-CCR7 ADC in xenograft _______________ Toledo model per day. 20 treatments __________
Эксперимент оценивали в день 20 после обработки, *р<0,05, **р<0,005 в сравнении с контрольной группой без обработки (однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений).The experiment was evaluated at day 20 post-treatment, *p<0.05, **p<0.005 compared to no-treatment control group (one-way ANOVA/Tukey's multiple comparison test).
% ЛТ/АС=1ООЛТ/ЛС, где ΔT=средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в D20 исследования - средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в начальный день при введении дозы;% LT/AS=1OOLT/LS where ΔT=mean tumor volume in the drug-treated group in study D20 - the mean tumor volume in the drug-treated group on the initial day of dosing;
ΔC=средний объем опухоли в контрольной группе в D20 исследования - средний объем опухоли в контрольной группе в начальный день введения дозы D1.ΔC=mean tumor volume in the control group in the D20 study - the average tumor volume in the control group on the initial day of dosing D1.
Δ массы тела (%)=(средняя масса тела в D20-средняя масса тела в D1)x100/средняя масса тела в D1 обработки.Δ body weight (%)=(average body weight in D20-average body weight in D1)x100/average body weight in D1 treatment.
Пример 20. In vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 на ксенотрансплантатной модели DEL ALCL у мышей SCID-bg.Example 20 In vivo efficacy of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in a DEL ALCL xenograft model in SCID-bg mice.
Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET. DM4 in vivo на модели CCR7-положительной ALCL, ксенотрансплантатную модель DEL приживляли самкам мышей Scid-bg посредством подкожной инъекции 3х106 клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 100 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=4 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) при конечной дозе 2 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного изотип.МРЕТ.DM4 из расчета 2 мг/кг в день 1 и день 15 исследования. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.To demonstrate the targeted antitumor activity of 121G12.CysMab.DAPA.MPET. DM4 in vivo model of CCR7 positive ALCL, DEL xenograft model was engrafted to female Scid-bg mice by subcutaneous injection of 3x10 6 cells into the right flank of each mouse. After tumors reached approximately 100 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume to treatment groups (n=4 per group). Mice were treated with IV administration of one of the 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) at a final dose of 2 mg/kg or the non-specific isotype control isotype.MPET.DM4 at 2 mg/kg on day 1 and day 15 of the study. All doses were adjusted according to the individual body weight of the mice.
Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг приводила к средней регрессии, составляющей 40,2%, ко дню 14 исследования после введения однократной дозы (р<0,01). Мышам вводили вторую дозу в день 15 и за ними наблюдали в течение еще трех недель. Одно животное-исключение не проявило реакцию на обработку второй дозой, и его пришлось подвергнуть умерщвлению в день 28 из-за опухолевой массы. Еще одно животное продемонстрировало медленное прогрессирование заболевания и его также исключили в день 28 из последующего наблюдения за экспрессией мишени. У двух из четырех мышей продолжали наблюдать устойчивое воздействие на рост опухоли (фиг. 17). Все обработки хорошо переносились с отсутствием явной потери массы тела.A slight antitumor efficacy was observed after treatment with non-specific isotype control hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at a rate of 2 mg/kg. Treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at 2 mg/kg resulted in a mean regression of 40.2% by day 14 of the study after a single dose (p<0.01). Mice received a second dose on day 15 and were observed for an additional three weeks. One exception animal did not respond to the second dose treatment and had to be sacrificed on day 28 due to tumor mass. Another animal showed slow disease progression and was also excluded on day 28 from follow-up for target expression. Two of the four mice continued to see a sustained effect on tumor growth (FIG. 17). All treatments were well tolerated with no apparent weight loss.
Пример 21. In vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении модели опухоли на основе полученного от пациента первичного немелкоклеточного рака легкого HLUX1787Example 21 In Vivo Efficacy of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in a Tumor Model Based on Patient-Derived Primary Non-Small Cell Lung Cancer HLUX1787
Противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 оценивали на ксенотрансплантатной модели первичного немелкоклеточного рака легкого HLUX1787, экспрессирующего CCR7. Самкам NSG мышей имплантировали подкожно фрагменты опухоли в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 150 мм3, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=6 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.МРЕТ.DM4 (DAR4) при 0,5, 2 или 5 мг/кг в день 1, а вторую дозу вводили спустяThe antitumor activity of 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 was evaluated in a xenograft model of primary non-small cell lung cancer HLUX1787 expressing CCR7. Female NSG mice were implanted subcutaneously with tumor fragments in the right flank of each mouse. After tumors reached approximately 150 mm 3 , mice were randomized according to tumor volume to treatment groups (n=6 per group). Mice were treated with IV administration of one of 121G12.CysMab.DAPA.MRET.DM4 (DAR4) at 0.5, 2, or 5 mg/kg on day 1, with a second dose given later
- 191 042529 недели в день 15. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.- 191 042529 weeks on day 15. All doses were adjusted according to the individual body weight of the mice.
Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали в случае низких доз конъюгированного Ab, однако частичную регрессию или стабилизацию заболевания наблюдали в случае обработки 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг. Устойчивую эффективность воздействия на опухоли наблюдали через две недели после введения второй дозы, что привело к значению AT/АС, составляющему 1,3% в D30 обработки (р<0,001; однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений) (фиг. 18). Все обработки хорошо переносились с отсутствием явной потери массы тела.Insignificant antitumor efficacy was observed in the case of low doses of conjugated Ab, however, partial regression or stabilization of the disease was observed in the case of treatment with 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 at a rate of 5 mg/kg. Sustained tumor efficacy was observed two weeks after the second dose, resulting in an AT/AC value of 1.3% in treatment D30 (p<0.001; 1-way ANOVA/Tukey's multiple comparison test) (FIG. 18). All treatments were well tolerated with no apparent weight loss.
Claims (33)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62/454,476 | 2017-02-03 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA042529B1 true EA042529B1 (en) | 2023-02-22 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11833215B2 (en) | CKIT antibody drug conjugates | |
US20240092918A1 (en) | Anti-ccr7 antibody drug conjugates | |
US10117953B2 (en) | Antibody drug conjugates | |
US10626172B2 (en) | Antibody drug conjugates | |
US10238748B2 (en) | Anti-CDH6 antibody drug conjugates | |
JP2024088757A (en) | Antibodies to PMEL17 and conjugates thereof | |
US20230181756A1 (en) | Ccr7 antibody drug conjugates for treating cancer | |
RU2777662C2 (en) | Conjugates of antibody to ccr7 and drug | |
EA042529B1 (en) | ANTIBODY TO CCR7 AND DRUG CONJUGATES | |
NZ790996A (en) | Anti-ccr7 antibody drug conjugates |