EA042216B1 - Фармацевтические комбинации, содержащие антитело к ly75 - Google Patents

Фармацевтические комбинации, содержащие антитело к ly75 Download PDF

Info

Publication number
EA042216B1
EA042216B1 EA201991845 EA042216B1 EA 042216 B1 EA042216 B1 EA 042216B1 EA 201991845 EA201991845 EA 201991845 EA 042216 B1 EA042216 B1 EA 042216B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
antibody
antibodies
cells
seq
drug
Prior art date
Application number
EA201991845
Other languages
English (en)
Inventor
Моника Бинаски
Марио Биджони
Джузеппе Мерлино
Чечилия Симонелли
Франческо БЕРТОНИ
Андреа Пеллакани
Original Assignee
Берлин-Хеми Аг
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Берлин-Хеми Аг filed Critical Берлин-Хеми Аг
Publication of EA042216B1 publication Critical patent/EA042216B1/ru

Links

Description

Введение
Изобретение в целом относится к областям иммунологии и молекулярной биологии. Более конкретно, в данном документе представлены фармацевтическая комбинация, содержащая (A) антитела или их антигенсвязывающие части, направленные против LY75, и (B) второе противораковое средство; применение фармацевтической комбинации; и способ лечения диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (DLBCL).
Предпосылки изобретения
Виды лейкоза и лимфомы принадлежат к обширной группе опухолей, которые поражают кровь, костный мозг и лимфоидную систему; они известны как опухоли кроветворной и лимфоидной тканей.
Лимфома представляет собой группу опухолей из клеток крови, которые развиваются из лимфоцитов. Признаки и симптомы могут включать увеличенные лимфатические узлы, жар, потение, непреднамеренную потерю массы тела, зуд и постоянное ощущение усталости. Существует ряд подтипов лимфомы: двумя основными группами лимфом являются лимфомы Ходжкина (HL) и неходжкинские лимфомы (NHL). Всемирная организация здравоохранения (WHO) включает две другие группы в качестве типов лимфомы: множественную миелому и иммунопролиферативные заболевания. Приблизительно 90% видов лимфомы являются неходжкинскими лимфомами.
Лейкоз представляет собой группу форм рака, которые обычно появляются в костном мозгу и приводят к большому количеству аномальных белых кровяных телец. Симптомы могут включать проблемы кровотечения и кровоподтеков, ощущение усталости, жар и увеличенный риск инфекций. Такие симптомы проявляются из-за нехватки нормальных клеток крови. Диагностику, как правило, осуществляют посредством анализов крови или биопсии костного мозга. Существует четыре основных типа лейкоза: острый лимфобластный лейкоз (ALL), острый миелоидный лейкоз (AML), хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL) и хронический миелоидный лейкоз (CML), а также ряд менее распространенных типов.
Лечение видов лейкоза и лимфомы может включать одно или более из химиотерапии, лучевой терапии, направленной терапии и хирургии (и трансплантацию костного мозга в случае видов лейкоза). Успех лечения лейкоза зависит от типа лейкоза и возраста пациента. Результат лечения лимфомы зависит от подтипа, при этом некоторые являются излечимыми, и в большинстве случаев лечение увеличивает выживаемость.
Ранее для лечения видов лейкоза применяли ряд химиотерапевтических средств, включая преднизон, винкристин, антрациклины, L-аспарагиназу, циклофосфамид, метотрексат, 6-меркаптопурин, флударабин, пентостатин и кладрибин. Химиотерапевтические средства для лечения видов лимфомы включают циклофосфамид, гидроксидаунорубицин (также известный как доксорубицин или адриамицин), онковин (винкристин), преднизон, преднизолон, блеомицин, дакарбазин, этопозид и прокарбазин.
Комбинированная химиотерапия предусматривает лечение пациента с помощью двух или более различных лекарственных средств одновременно. Лекарственные средства могут различаться их механизмом действия и побочными эффектами. Наибольшее преимущество такого подхода состоит в сокращении до минимума шансов развития устойчивости к какому-либо одному средству. Кроме того, лекарственные средства часто можно применять в меньших дозах, снижая токсичность. Виды комбинированной терапии для лечения болезни Ходжкина включают MOPP (мустарген, винкристин, прокарбазин, преднизолон) и ABVD (доксорубицин, блеомицин, винбластин, дакарбазин). Виды комбинированной терапии для лечения неходжкинской лимфомы включают CHOP (циклофосфамид, доксорубицин, винкристин, преднизолон). С учетом количества лекарственных средств, которые известны вследствие применения для лечения видов лейкоза и лимфомы, количество перестановок и комбинаций возможных видов лечения лекарственными средствами определенно является большим. Кроме того, вышеуказанные виды комбинированной терапии не предусматривают антител.
Остается, однако, потребность в новых видах лечения видов лейкоза и лимфомы и, в частности, в эффективных видах комбинированной терапии.
Лимфоцитарный антиген 75 действует в качестве эндоцитирующего рецептора, направляющего захваченные антигены из внеклеточного пространства в специализированный антиген-процессирующий компартмент, и, как полагают, вызывает снижение пролиферации B-лимфоцитов. Экспрессия лимфоцитарного антигена 75 наблюдалась при раке поджелудочной железы, яичника, молочной железы, ободочной и прямой кишки, пищевода, кожи, щитовидной железы и легкого (немелкоклеточном), а также при множественной миеломе и многих различных подтипах лимфомы и лейкоза. В WO 2009/061996 раскрыты выделенные моноклональные антитела, связывающиеся с DEC-205 (LY75) человека, и соответствующие композиции и молекулы на основе антител. Также раскрыты фармацевтические композиции, содержащие антитела, а также терапевтические и диагностические способы применения антител. В WO 2008/104806 раскрыты аффинные реагенты, способные к связыванию с LY75, для применения при лечении или профилактике рака. В WO 2015/052537 раскрыты конкретные выделенные антитела, способные к связыванию с LY75, и их применение при лечении различных форм рака.
Ритуксимаб представляет собой моноклональное антитело к белку CD20, который широко экспрессируется на B-клетках (Oncogene (2003 Oct 20), Smith MR, Rituximab (monoclonal anti-CD20 antibody): mechanisms of action and resistance, 22(47):7359-68). Ритуксимаб разрушает как нормальные, так и злока
- 1 042216 чественные B-клетки, которые имеют CD20 на их поверхности, и, следовательно, применяется для лечения заболеваний, которые характеризуются наличием слишком большого количества B-клеток, сверхактивных B-клеток или дисфункциональных B-клеток. Ритуксимаб ранее применялся для лечения ряда аутоиммунных заболеваний и некоторых типов рака, включая ревматоидный артрит, идиопатическую тромбоцитопеническую пурпуру, обыкновенную пузырчатку, рассеянный склероз, системную красную волчанку, неходжкинскую лимфому, хроническую воспалительную демиелинизирующую полинейропатию, хронический лимфоцитарный лейкоз и виды аутоиммунной анемии.
Ибрутиниб (Imbravica) представляет собой низкомолекулярное лекарственное средство, которое перманентно связывается с тирозинкиназой Брутона (BTK), которая играет важную роль в B-клетках. Ибрутиниб ранее применялся для лечения B-клеточных форм рака, таких как мантийноклеточная лимфома, хронический лимфоцитарный лейкоз и макроглобулинемия Вальденстрема.
В настоящее время было обнаружено, что комбинации (i) определенных антител к LY75 с ритуксимабом и (ii) определенных антител к LY75 с ибрутинибом демонстрируют синергические результаты в лечении видов лимфомы.
Краткое описание изобретения
В одном аспекте настоящее изобретение предусматривает фармацевтическую комбинацию, содержащую (A) (i) антитело к LY75 или его антигенсвязывающую часть, при этом указанное антитело или часть содержит
a) вариабельную область тяжелой цепи, содержащую
i) первую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 5;
ii) вторую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 6; и iii) третью vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 7; и
b) вариабельную область легкой цепи, содержащую
i) первую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 8;
ii) вторую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 9; и iii) третью vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 10; или (ii ) антитело к LY75 или его антигенсвязывающую часть, при этом указанное антитело или часть содержит
a) вариабельную область тяжелой цепи, содержащую
i) первую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 5;
ii) вторую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 6; и iii) третью vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 7; и
b) вариабельную область легкой цепи, содержащую
i) первую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 8;
ii) вторую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 9; и iii) третью vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 10, где любые одна или более из вышеуказанных SEQ ID NO независимо содержат одну или две аминокислотные замены, где антитело к LY75 или его антигенсвязывающая часть ковалентно присоединены к лекарственному средству, где указанное лекарственное средство представляет собой майтанзиноидное лекартвенное средство 1 (DM1) или майтанзиноидное лекарственное средство 4 (DM4); и (B) ритуксимаб, где фармацевтическая комбинация находится в форме комбинированного препарата, подходящего для одновременного, раздельного или последовательного применения для лечения диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (DLBCL).
В одном варианте осуществления антитело к LY75 или его антигенсвязывающая часть содержат вариабельную область тяжелой цепи, содержащую 1, 2 или 3 CDR, выбранные из группы, состоящей из CDR, содержащих SEQ ID NO: 5, 6 и 7, и/или вариабельную область легкой цепи, содержащую 1, 2 или 3 CDR, выбранные из группы, состоящей из CDR, содержащих SEQ ID NO: 8, 9 и 10.
В некоторых вариантах осуществления антитела к LY75 связываются с LY75 (SEQ ID NO: 15) и способны к интернализации клеткой, экспрессирующей LY75.
В другом варианте осуществления антитело к LY75 содержит области, определяющие комплементарность (CDR), или вариабельные области (VR) тяжелых и/или легких цепей конкретного антитела, описанного в данном документе (например, упоминаемого в данном документе как LY75_A1). Соответственно в одном варианте осуществления антитело к LY75 содержит домены CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной области тяжелой цепи (VH) антитела LY75_A1, имеющей последовательность, показанную под SEQ ID NO: 1, и/или домены CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной области легкой цепи (VL) LY75_A1, имеющей последовательность, показанную под SEQ ID NO: 2.
В другом варианте осуществления антитела к LY75 связываются с LY75 человека и содержат вариабельную область тяжелой цепи, содержащую SEQ ID NO: 1, и/или ее консервативные модификации последовательности. Антитело может дополнительно содержать вариабельную область легкой цепи, со- 2 042216 держащую SEQ ID NO: 2 и/или ее консервативные модификации последовательности.
В дополнительном варианте осуществления антитела к LY75 связываются с LY75 человека и содержат вариабельную область тяжелой цепи и вариабельную область легкой цепи, содержащие аминокислотные последовательности, приведенные под SEQ ID NO: 1 и/или 2 соответственно, и их консервативные модификации последовательности.
Антитела, содержащие вариабельные области тяжелых и легких цепей, характеризующиеся по меньшей мере 80%, или по меньшей мере 85%, или по меньшей мере 90%, или по меньшей мере 91%, или по меньшей мере 92%, или по меньшей мере 93%, или по меньшей мере 94%, или по меньшей мере 95%, или по меньшей мере 96%, или по меньшей мере 97%, или по меньшей мере 98%, или по меньшей мере 99%, или большей идентичностью последовательности с любой из вышеприведенных последовательностей, также включены в настоящее изобретение. Промежуточные диапазоны вышеуказанных значений, например вариабельные области тяжелых и легких цепей, характеризующиеся по меньшей мере 80-85, 85-90, 90-95 или 95-100% идентичностью последовательности с любой из вышеприведенных последовательностей, также подразумеваются как охватываемые настоящим изобретением.
В одном варианте осуществления антитело к LY75 содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую SEQ ID NO: 1 или последовательность, на по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичную SEQ ID NO: 1. В другом варианте осуществления антитело к LY75 содержит вариабельную область легкой цепи, содержащую SEQ ID NO: 2 или последовательность, на по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичную SEQ ID NO: 2. В другом варианте осуществления антитело к LY75 содержит каркасную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, на по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичную каркасной области вариабельной области тяжелой цепи под SEQ ID NO: 1, показанной под SEQ ID NO: 16, 17, 18 и 19. В другом варианте осуществления антитело к LY75 содержит каркасную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, на по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичную каркасной области вариабельной области легкой цепи под SEQ ID NO: 2, показанной под SEQ ID NO: 20, 21, 22 и 23.
В одном варианте осуществления антитело к LY75 конкурирует за связывание с LY75 с антителом, содержащим вариабельные области тяжелых и/или легких цепей, содержащие аминокислотные последовательности, соответственно приведенные под SEQ ID NO: 1 и 2, или аминокислотные последовательности, на по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичные им. В другом варианте осуществления антитело к LY75 конкурирует за связывание с LY75 с антителом, содержащим вариабельные области тяжелых и/или легких цепей, содержащие аминокислотные последовательности, приведенные под SEQ ID NO: 1 и 2 (LY75_A1).
Другие антитела по настоящему изобретению связываются с тем же эпитопом или эпитопом на LY75, распознаваемым антителами, описанными в данном документе. В другом конкретном варианте осуществления антитело связывается с эпитопом на LY75, распознаваемым антителом, содержащим вариабельные области тяжелых и/или легких цепей, содержащие аминокислотные последовательности, соответственно приведенные под SEQ ID NO: 1 и 2, или аминокислотные последовательности, на по меньшей мере 80% идентичные им. В другом варианте осуществления антитело связывается с эпитопом на LY75, распознаваемым антителом, содержащим вариабельные области тяжелых и/или легких цепей, содержащие аминокислотные последовательности, приведенные под SEQ ID NO: 1 и 2 (LY75_A1).
В дополнительном варианте осуществления антитела к LY75 специфично связываются с одним или более, например 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, пептидом(и), выбранным(и) из группы, включающей SEQ ID nO: 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36 или 37, или их фрагментами, где указанные фрагменты содержат по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9 или по меньшей мере 10 смежных аминокислот. В дополнительном варианте осуществления эпитоп, распознаваемый антителами к LY75, содержит один или более пептидов, два или более или три или более пептидов, выбранных из группы, состоящей из SEQ ID NO: 27, 29, 30, 34, 35, 36 или 37, или их фрагментов, где указанные фрагменты содержат по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9 или по меньшей мере 10 смежных аминокислот. В дополнительном варианте осуществления эпитоп, распознаваемый антителами
- 3 042216 к LY75, содержит один или более пептидов, например два или три пептида, выбранных из группы, состоящей из SEQ ID NO: 30, 36 и 37, или их фрагментов, где указанные фрагменты содержат по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9 или по меньшей мере 10 смежных аминокислот.
В дополнительном варианте осуществления антитела к LY75 содержат отличающиеся CDR по сравнению с исходными антителами, описанными в данном документе. Таким образом, в настоящем изобретении представлены варианты антител, содержащие варианты вариабельных областей исходного антитела, где исходное антитело содержит первую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 5, вторую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 6, третью vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 7, первую vlCDR, содержащую SEQ ID nO: 8, вторую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 9 и третью vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 10, и где вариант антитела в совокупности имеет 1, 2, 3, 4, 5 или 6 аминокислотных замен в наборе из первой vhCDR, второй vhCDR, третьей vhCDR, первой vlCDR, второй vlCDR и третьей vlCDR, при этом 1-4, 1-3 или 1-2 замены являются особенно применимыми, и где антитело сохраняет специфичное связывание с LY75.
Все антитела, раскрытые в данном документе, могут быть антителами полной длины, например, любого из следующих изотипов: IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, секреторный компонент IgA, IgD и IgE. В качестве альтернативы антитела могут представлять собой фрагменты, такие как антигенсвязывающая часть или одноцепочечное антитело (например, Fab, F(ab')2, Fv, одноцепочечный Fv-фрагмент, выделенная область, определяющая комплементарность (CDR), или комбинация двух или более выделенных CDR). Антитела могут быть антителами любого типа, в том числе без ограничений человеческими, гуманизированными и химерными антителами.
В других вариантах осуществления антитела к LY75 находятся в форме иммуноконъюгата (т.е. дополнительно содержат ковалентно присоединенный компонент).
В одном варианте осуществления антитело к LY75 содержит вариабельную область тяжелой цепи и вариабельную область легкой цепи, кодируемые последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 3 и 4 соответственно, или последовательностями нуклеиновой кислоты, характеризующимися по меньшей мере 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичностью с вышеупомянутыми последовательностями нуклеиновой кислоты или последовательностями, отличающимися от SEQ ID NO: 3 и 4 по причине вырожденности генетического кода.
В одном варианте осуществления антитело к CD20 представляет собой химерное антитело мыши/человека, гуманизированное антитело или антитело человека. Предпочтительно антитело к CD20 представляет собой ритуксимаб.
В другом аспекте настоящего изобретения представлены наборы векторов экспрессии, содержащие нуклеиновые кислоты, кодирующие вариабельные области тяжелых и/или легких цепей антител, описанных в данном документе, функционально связанные с одним или более регуляторными элементами.
В предпочтительном варианте осуществления клетка-хозяин содержит векторы экспрессии, содержащие нуклеиновые кислоты, кодирующие (i) тяжелую цепь антитела к LY75 или его антигенсвязывающей части;
(ii) легкую цепь антитела к LY75 или его антигенсвязывающей части;
(iii) тяжелую цепь антитела к CD20 или его антигенсвязывающей части; и (iv) легкую цепь антитела к CD20 или его антигенсвязывающей части.
В дополнительном аспекте представлен способ лечения диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (DLBCL) у пациента, включающий одновременное, последовательное или раздельное введение пациенту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективных количеств компонентов (A) и (B) фармацевтической комбинации по настоящему изобретению.
В дополнительном аспекте настоящего изобретения представлена фармацевтическая комбинация по настоящему изобретению для применения при лечении диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (DLBCL).
Также представлено применение компонентов (A) и (B), как определено в данном документе, в изготовлении фармацевтической комбинации для одновременного, раздельного или последовательного применения для лечения диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (DLBCL).
Другие признаки и преимущества настоящего изобретения будут очевидными из следующего подробного описания и формулы изобретения.
Краткое описание графических материалов
На фиг. 1 представлено выравнивание тяжелой цепи LY75_A1 (SEQ ID NO: 1), VH 3-15 человека зародышевого типа (SEQ ID NO: 11) и JH4 человека зародышевого типа (SEQ ID NO: 12). CDR-области тяжелой цепи LY75_A1 подчеркнуты.
На фиг. 2 представлено выравнивание легкой цепи LY75_A1 (SEQ ID NO: 2), VK 012 человека зародышевого типа (SEQ ID NO: 13) и JK4 человека зародышевого типа (SEQ ID NO: 14). CDR-области легкой цепи LY75_A1 подчеркнуты.
На фиг. 3a представлена цитотоксическая активность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1, в отношении HT-29 и показано, что при том, что большинство антител связываются с
- 4 042216
LY75, только некоторые из них проявляют эффективность.
На фиг. 3b представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении HT-29.
На фиг. 3c представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток RAJI.
На фиг. 3d представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток Namalwa.
На фиг. 3e представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток Karpas 299.
На фиг. 3f представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток BxPC3.
На фиг. 3g представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток HupT4.
На фиг. 3h представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток HPAFFII.
На фиг. 3i представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток EHEB.
На фиг. 3j представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток Mec-1.
На фиг. 3k представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток AML-193.
На фиг. 3l представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток HCC 70.
На фиг. 3m представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток HCC 1806.
На фиг. 3n представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток MDA-MB-468.
На фиг. 3o представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток RT4.
На фиг. 3p представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток 5637.
На фиг. 3q представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток SW780.
На фиг. 3r представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток SCC-9.
На фиг. 3s представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток OE 19.
На фиг. 3t представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток OVCAR-3.
На фиг. 3u представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток SK-OV-3.
На фиг. 3v представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток MOLP-8.
На фиг. 3w представлена цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток RPMI8226.
На фиг. 4a представлена эффективность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток Raji лимфомы Беркитта в ксенотрансплантатной модели на мышах с SCID.
На фиг. 4b представлена эффективность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток Namalwa лимфомы Беркитта в ксенотрансплантатной модели на мышах с SCID.
На фиг. 4c представлена эффективность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток HPAFII аденокарциномы поджелудочной железы в ксенотрансплантатной модели на бестимусных голых мышах.
На фиг. 4d представлена эффективность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток SW780 карциномы мочевого пузыря человека в ксенотрансплантатной модели на мышах с SCID.
На фиг. 4e представлена эффективность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток MDA-MB-468 в ксенотрансплантатной модели на бестимусных голых мышах.
На фиг. 4f представлена эффективность антител к LY75, конъюгированных с DM1 либо DM4, в отношении клеток COLO205 аденокарциномы ободочной и прямой кишки в ксенотрансплантатной модели на бестимусных голых мышах.
На фиг. 5a показано конкурентное связывание mAb к LY75 и mAb к LY75, конъюгированного с MCC-DM1.
- 5 042216
На фиг. 5b показано неконкурентное связывание LY75_A1 и mAb к LY75, конъюгированного с
MCC-DM1.
На фиг. 6a-6j показаны графические представления связывания антитела LY75_A1 с пептидами
LY75 в пептидной микроматрице.
На фиг. 7 показано выравнивание аминокислотных последовательностей пептидов, с которыми связывается антитело LY75_A1, как в микроматричном анализе пептидов, так и в анализе пептидов по методу соосаждения. Выделенные пептиды, вероятно, образуют эпитоп, распознаваемый антителом LY75_A1.
На фиг. 8a и 8b показан антипролиферативный эффект различных (нМ) доз LY75_DM4 в качестве однократной обработки или в комбинации с ритуксимабом на двух различных линиях клеток с ABC-DLBCL (TMD8 и HBL1). (О=показатель аддитивности Чоу-Талалая). Фиг. 8a: медианный CI=0,27. Фиг. 8b: медианный CI=0,57.
На фиг. 9 показан антипролиферативный эффект различных (нМ) доз LY75_DM4 в качестве однократной обработки или в комбинации с ибрутинибом на линиях клеток HBL-1 (ABC-DLBCL). (О=показатель аддитивности Чоу-Талалая). Медианный CI=0,24.
Подробное описание изобретения
Настоящее изобретение относится к фармацевтическим комбинациям, содержащим компоненты (A) и (B), как определено в данном документе, где фармацевтическая комбинация находится в форме комбинированного препарата для одновременного, раздельного или последовательного применения. Компонент (A) относится к антителу к LY75, как определено в данном документе. Компонент (B) относится либо к (i) антителу к CD20, как определено в данном документе, либо (ii) к ибрутинибу или его фармацевтически приемлемой соли.
Один пример белка LY75 приведен под SEQ ID NO: 15 в данном документе. Термины антитела к LY75 и антитела LY75 используются взаимозаменяемо в данном документе.
Антитела LY75, раскрытые в данном документе, могут интернализироваться при контакте с клетками, экспрессирующими рецептор LY75. Как обсуждается в данном документе, рецептор LY75 сверхэкспрессируется и/или дифференциально экспрессируется в определенных раковых клетках, в том числе без ограничений при лейкозе, предпочтительно остром миелоидном лейкозе или хроническом лимфоцитарном лейкозе, лимфоме, предпочтительно DLBCL, B-клеточной лимфоме, фолликулярной лимфоме, мантийноклеточной лимфоме, лимфоме из лимфоидной ткани слизистых оболочек (MALT), B-клеточной лимфоме, богатой T-клетками/гистиоцитами, лимфоме Беркитта, лимфоплазмоцитарной лимфоме, мелкоклеточной лимфоцитарной лимфоме, лимфоме из клеток маргинальной зоны, T-клеточной лимфоме, периферической T-клеточной лимфоме, анапластической крупноклеточной лимфоме и ангиоиммунобластной T-клеточной лимфоме.
В связи с этим, если антитела к LY75, раскрытые в данном документе, конъюгированы с лекарственными средствами (иногда называемые в данном документе конъюгатами антитело-лекарственное средство или ADC), то интернализация этих молекул ADC раковыми клетками приводит к гибели клеток и, таким образом, лечению опухоли.
Антитела к LY75 обладают конкретными структурными особенностями, такими как CDR-области с конкретными аминокислотными последовательностями. В данном документе описан набор CDR, которые могут образовывать аффинный реагент, например антитело, который характеризуется связыванием с LY75.
Таким образом, в настоящем изобретении представлены антитела, предпочтительно выделенные антитела (которые, как вкратце изложено ниже, включают большое разнообразие хорошо известных структур, производных, миметиков и конъюгатов антител), нуклеиновые кислоты, кодирующие комбинации антител, клетки-хозяева, применяемые для получения комбинаций антител, способы получения комбинаций антител и фармацевтические комбинации, содержащие антитела и необязательно фармацевтический носитель, способы лечения, включающие применение фармацевтических комбинаций, и применение фармацевтических комбинаций для лечения форм рака.
Лимфоцитарный антиген 75 действует в качестве эндоцитирующего рецептора, направляющего захваченные антигены из внеклеточного пространства в специализированный антиген-процессирующий компартмент, и, как полагают, вызывает снижение пролиферации B-лимфоцитов.
Согласно SWISS-PROT лимфоцитарный антиген 75 экспрессируется в селезенке, тимусе, толстой кишке и лимфоцитах периферической крови. Он был выявлен в линиях миелоидных клеток и лимфоидных B-клеток. Изоформы, обозначенные в данном документе как OGTA076b и OGTA076c, экспрессируются в злокачественных клетках лимфомы Ходжкина, называемых клетками Ходжкина и РидШтернберга (HRS). LY75 действует в качестве эндоцитирующего рецептора, направляющего захваченные антигены из внеклеточного пространства в специализированный антиген-процессирующий компартмент. Он вызывает снижение пролиферации B-лимфоцитов.
Экспрессия LY75 наблюдалась при раке поджелудочной железы, мочевого пузыря, яичника, молочной железы (в том числе трижды негативном), ободочной и прямой кишки, пищевода, кожи, щитовидной железы и легкого (немелкоклеточном), а также при множественной миеломе и многих различных
- 6 042216 подтипах лимфомы (в том числе DLBCL) и лейкоза.
Антитело к LY75 в некоторых случаях может перекрестно реагировать с LY75 от вида, отличного от человека. Например, для облегчения проведения клинического исследования антитела к LY75 могут перекрестно реагировать с молекулами LY75 мышей или приматов. В альтернативном случае в некоторых вариантах осуществления антитела могут обладать полной специфичностью к LY75 человека и могут не характеризоваться видовой перекрестной реактивностью или другими ее типами в отношении молекул, отличных от человеческих.
Настоящее изобретение относится к антителам к LY75 и в некоторых вариантах осуществления антителам к CD20, обычно терапевтическим антителам, как описано в данном документе. Антитела, находящие применение в настоящем изобретении, могут принимать ряд форматов, описанных в данном документе, включающих традиционные антитела, а также производные, фрагменты и миметики антител, описанные ниже. В одном варианте осуществления в настоящем изобретении представлены структуры антител, содержащие набор из 6 CDR, определенных в данном документе (содержащих небольшое количество аминокислотных изменений, описанных ниже).
Антитело, как используется в данном документе, включает большое разнообразие структур, понятных специалистам в данной области, которые в некоторых вариантах осуществления содержат как минимум набор из 6 CDR, определенных в данном документе; включающих без ограничений традиционные антитела (в том числе как моноклональные, так и поликлональные антитела), гуманизированные и/или химерные антитела, фрагменты антител, сконструированные антитела (например, имеющие аминокислотные модификации, вкратце изложенные ниже), полиспецифические антитела (в том числе биспецифические антитела) и другие аналоги, известные из уровня техники.
Структурные единицы традиционных антител обычно включают тетрамер. Каждый тетрамер обычно состоит из двух идентичных пар полипептидных цепей, при этом каждая пара имеет одну легкую (обычно имеющую молекулярную массу приблизительно 25 кДа) и одну тяжелую цепь (обычно имеющую молекулярную массу приблизительно 50-70 кДа). Легкие цепи человека классифицируются как легкие каппа- и лямбда-цепи. Тяжелые цепи классифицируются как мю, дельта, гамма, альфа или эпсилон и соответственно определяют изотип антитела как IgM, IgD, IgG, IgA и IgE. IgG имеет несколько подклассов, включающих без ограничений IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4. IgM имеет подклассы, включающие без ограничений IgM1 и IgM2. Таким образом, изотип, как используется в данном документе, означает любой из подклассов иммуноглобулинов, определяемых химическими и антигенными характеристиками их константных областей. Известными изотипами иммуноглобулинов человека являются IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, IgA2, IgM1, IgM2, IgD и IgE. Следует понимать, что терапевтические антитела также могут включать гибриды из любой комбинации изотипов и/или подклассов.
Во многих вариантах осуществления в настоящем изобретении применяются изотипы IgG, при этом в ряде путей применения особенное применение находит IgG1.
Аминоконцевая часть каждой цепи содержит вариабельную область из приблизительно 100-110 или больше аминокислот, несущих основную ответственность за распознавание антигена. В вариабельной области в каждом из V-доменов тяжелой цепи и легкой цепи три петли собраны вместе с образованием антигенсвязывающего участка. Каждая из петель называется областью, определяющей комплементарность (далее в данном документе упоминаемой как CDR), в которой изменчивость аминокислотной последовательности является наиболее значительной. Вариабельный относится к тому факту, что определенные сегменты вариабельной области существенно различаются по последовательности среди антител. Вариабельность в пределах вариабельной области распределена неравномерно. На самом деле V-области состоят из относительно инвариантных участков, называемых каркасными областями (FR), из 15-30 аминокислот, разделенных более короткими областями чрезвычайной вариабельности, называемыми гипервариабельными областями, каждая из которых имеет длину 9-15 аминокислот или больше.
Каждая VH и VL состоит из трех гипервариабельных областей (областей, определяющих комплементарность, CDR) и четырех FR, расположенных от аминоконца к карбоксильному концу в следующем порядке: FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4.
Гипервариабельная область обычно охватывает аминокислотные остатки из аминокислотных остатков приблизительно 24-34 (LCDR1; L означает легкую цепь), 50-56 (LCDR2) и 89-97 (LCDR3) в вариабельной области легкой цепи и около приблизительно 31-35В (HCDR1; H означает тяжелую цепь), 5065 (HCDR2) и 95-102 (HCDR3) в вариабельной области тяжелой цепи; Kabat et al., SEQUENCES OF PROTEINS OF IMMUNOLOGICAL INTEREST, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991), и/или остатки, образующие гипервариабельную петлю (например, остатки 26-32 (LCDR1), 50-52 (LCDR2) и 91-96 (LCDR3) в вариабельной области легкой цепи и 26-32 (HCDR1), 53-55 (HCDR2) и 96-101 (HCDR3) в вариабельной области тяжелой цепи; Chothia and Lesk (1987), J. Mol. Biol., 196:901-917). Конкретные CDR по настоящему изобретению описаны ниже.
Во всем настоящем описании при ссылке на остаток в вариабельном домене (примерно остатки 1-107 вариабельной области легкой цепи и остатки 1-113 вариабельной области тяжелой цепи) обычно применяется система нумерации по Kabat (например, Kabat et al., выше (1991)).
CDR вносят вклад в образование антигенсвязывающего или, более конкретно эпитопсвязывающего
- 7 042216 участка антител. Термин эпитоп или антигенная детерминанта относится к участку на антигене, с которым специфично связывается иммуноглобулин или антитело. Эпитопы могут быть образованы как смежными аминокислотами, так и несмежными аминокислотами, расположенными рядом благодаря сворачиванию белка в третичную структуру. Эпитопы, образованные смежными аминокислотами, обычно сохраняются при воздействии денатурирующих растворителей, тогда как эпитопы, образованные благодаря сворачиванию в третичную структуру, обычно утрачиваются при обработке денатурирующими растворителями. Эпитоп обычно содержит по меньшей мере 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 или 15 аминокислот в уникальной пространственной конформации. Описанные в данном документе способы определения того, с какими эпитопами связывается указанное антитело (т.е. картирования эпитопов), хорошо известны из уровня техники и включают, например, анализы по методам иммуноблоттинга и иммунопреципитации, где перекрывающиеся или смежные пептиды LY75 исследуют в отношении реактивности с указанным антителом к LY75. Способы определения пространственной конформации эпитопов включают методики, известные из уровня техники, и методики, описанные в данном документе, например, рентгеновскую кристаллографию и 2-мерную спектроскопию ядерного магнитного резонанса (см., например, Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, vol. 66, G.E. Morris, ed. (1996)). Термин картирование эпитопов относится к способу идентификации молекулярных детерминант распознавания антигена антителом.
Карбоксиконцевая часть каждой цепи определяет константные области, несущие основную ответственность за эффекторную функцию. Kabat и соавт. собрали данные о множестве первичных последовательностей вариабельных областей тяжелых цепей и легких цепей. На основании степени консервативности последовательностей они отнесли отдельные первичные последовательности к CDR и каркасным участкам и составили их перечень (см. SEQUENCES OF IMMUNOLOGICAL INTEREST, 5th edition, NIH publication, № 91-3242, E.A. Kabat et al.).
В подклассе иммуноглобулинов IgG в тяжелой цепи находится несколько доменов иммуноглобулинов. Под доменом иммуноглобулина (Ig) в данном документе подразумевается область иммуноглобулина, имеющая четко выраженную третичную структуру. В настоящем изобретении интерес представляют домены тяжелых цепей, включающие константные домены (CH) и шарнирные домены тяжелых цепей.
Применительно к антителам IgG каждый из изотипов IgG имеет три CH-области. Соответственно CH-домены применительно к IgG являются следующими: CH1 относится к положениям 118-220 согласно EU-индексу по Kabat. CH2 относится к положениям 237-340 согласно EU-индексу по Kabat, a CH3 относится к положениям 341-447 согласно EU-индексу по Kabat.
Другим типом домена тяжелой цепи Ig является шарнирная область. Под шарнирным участком, или шарнирной областью, или шарнирной областью антитела, или шарнирной областью иммуноглобулина в данном документе подразумевается гибкий полипептид, содержащий аминокислоты между первым и вторым константными доменами антитела. В структурном плане CH1-домен IgG заканчивается положением 220 согласно EU, а CH2-домен IgG начинается с положения остатка 237 согласно EU. Таким образом, для антитела IgG шарнирный участок в данном документе определяется как включающий положения с 221 (D221 в IgG1) по 236 (G236 в IgG1), где нумерация соответствует EU-индексу по Kabat. В некоторых вариантах осуществления, например, применительно к Fc-области, включен нижний шарнирный участок, при этом нижний шарнирный участок обычно относится к положениям 226 или 230.
Особенный интерес в настоящем изобретении представляют Fc-области. Под Fc, или Fc-областью, или Fc-доменом, как используется в данном документе, подразумевается полипептид, содержащий константную область антитела за исключением первого домена константной области иммуноглобулина и в некоторых случаях части шарнирного участка. Таким образом, Fc относится к последним двум доменам константной области иммуноглобулинов IgA, IgD и IgG, последним трем доменам константной области иммуноглобулинов IgE и IgM и гибкому шарнирному участку, расположенному в направлении N-конца от этих доменов. В случае IgA и IgM Fc может содержать J-цепь. В случае IgG Fc-домен содержит домены иммуноглобулинов Cy2 и Cy3 (Cy2 и Cy3) и нижнюю шарнирную область между Cy1 (Cy1) и Cy2 (Cy2). Хотя границы Fc-области могут варьировать, Fc-область тяжелой цепи IgG человека обычно определяется как включающая остатки от C226 или P230 до ее карбоксильного конца, где нумерация соответствует EU-индексу по Kabat. В некоторых вариантах осуществления, как более полно описано ниже, аминокислотные модификации производят в Fc-области, например, с изменением связывания с одним или более FcyR-рецепторами или с FcRn-рецептором.
В некоторых вариантах осуществления антитела являются антителами полной длины. Под антителом полной длины в данном документе подразумевается структура, являющаяся естественной биологической формой антитела, содержащая вариабельные и константные области, содержащие одну или более модификаций, вкратце изложенных в данном документе.
В альтернативном случае антитела могут представлять собой ряд структур, включающих без ограничений фрагменты антител, моноклональные антитела, биспецифические антитела, миниантитела, доменные антитела, синтетические антитела (иногда называемые в данном документе миметиками анти- 8 042216 тел), химерные антитела, гуманизированные антитела, продукты слияния антител (иногда называемые в данном документе конъюгатами антител) и соответственно фрагменты каждого из них. Структуры, в основе которых лежит применение набора CDR, включены в определение антитела.
В одном варианте осуществления антитело представляет собой фрагмент антитела. Конкретные фрагменты антител включают без ограничений (i) Fab-фрагмент, состоящий из VL-, VH-, CL- и CH1-доменов;
(ii) Fd-фрагмент, состоящий из VH- и CH1-доменов;
(iii) Fv-фрагмент, состоящий из VL- и VH-доменов отдельного антитела;
(iv) dAb-фрагмент (Ward et al., 1989, Nature, 341:544-546, включенный посредством ссылки во всей своей полноте), состоящий из отдельной вариабельной области;
(v) выделенные CDR-области;
(vi) F(ab')2-фрагменты, бивалентные фрагменты, содержащие два связанных Fab-фрагмента;
(vii) одноцепочечные молекулы Fv (scFv), где VH-домен и VL-домен связаны пептидным линкером, обеспечивающим объединение двух доменов с образованием антигенсвязывающего участка (Bird et al., 1988, Science 242:423-426; Huston et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 85:5879-5883, включенный посредством ссылки во всей своей полноте);
(viii) биспецифические одноцепочечные Fv (WO 03/11161, включенная посредством ссылки во всей своей полноте); и (ix) диатела или триатела, поливалентные или полиспецифические фрагменты, конструируемые путем слияния генов (Tomlinson et. al., 2000, Methods Enzymol., 326:461-479; WO 94/13804; Holliger et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 90:6444-6448, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте).
В некоторых вариантах осуществления антитело может представлять собой комбинацию от различных видов, например, химерное антитело и/или гуманизированное антитело. Иными словами, в настоящем изобретении наборы CDR можно применять с каркасными и константными областями, отличными от конкретно описанных в данном документе по последовательности.
В целом как химерные антитела, так и гуманизированные антитела относятся к антителам, в которых объединены области от более чем одного вида. Например, химерные антитела традиционно содержат вариабельную(ые) область(и) от мыши (или в некоторых случаях крысы) и константную(ые) область(и) от человека. Гуманизированные антитела обычно относятся к антителам, отличным от человеческих, у которых каркасные области вариабельных доменов были заменены последовательностями, обнаруживаемыми в антителах человека. Как правило, в гуманизированном антителе все антитело за исключением CDR кодируется полинуклеотидом человеческого происхождения или за исключением своих CDR идентично такому антителу. CDR, некоторые или все из которых кодируются нуклеиновыми кислотами, происходящими от организма, отличного от человека, трансплантируют в каркасный участок со структурой бета-листа в вариабельной области антитела человека с получением антитела, специфичность которого определяется трансплантированными CDR. Получение таких антител описано, например, в WO 92/11018, Jones, 1986, Nature, 321:522-525; Verhoeyen et al., 1988, Science, 239:1534-1536, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте. Обратная мутация по типу замены выбранных остатков акцепторных каркасных участков на соответствующие донорные остатки часто необходима для восстановления аффинности, утрачиваемой конструкцией после первоначальной трансплантации (US 5530101; US 5585089; US 5693761; US 5693762; US 6180370; US 5859205; US 5821337; US 6054297; US 6407213, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте). Гуманизированное антитело в оптимальном случае также содержит по меньшей мере часть константной области иммуноглобулина, обычно иммуноглобулина человека и, соответственно, обычно содержит Fc-область человека. Гуманизированные антитела также можно получать с применением мышей с иммунной системой, подвергнутой генной инженерии. Roque et al., 2004, Biotechnol. Prog., 20:639-654, включенный посредством ссылки во всей своей полноте. Из уровня техники хорошо известен ряд методик и способов гуманизации и реконструирования антител, отличных от человеческих (см. Tsurushita & Vasquez, 2004, Humanization of Monoclonal Antibodies, Molecular Biology of B Cells, 533-545, Elsevier Science (USA), и литературные источники, упоминаемые там, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте). Способы гуманизации включают без ограничений способы, описанные в Jones et al., 1986, Nature, 321:522525; Riechmann et al., 1988, Nature, 332:323-329; Verhoeyen et al., 1988, Science, 239:1534-1536; Queen et al., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 86:10029-33; He et al., 1998, J. Immunol., 160:1029-1035; Carter et al., 1992, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 89:4285-9, Presta et al., 1997, Cancer Res., 57(20):4593-9; Gorman et al., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 88:4181-4185; O'Connor et al., 1998, Protein Eng., 11:321-8, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте. Гуманизация или другие способы снижения иммуногенности вариабельных областей антител, отличных от человеческих, может включать способы изменения поверхности, описанные, например, в Roguska et al., 1994, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 91:969973, включенном посредством ссылки во всей своей полноте. В одном варианте осуществления исходное антитело было подвергнуто созреванию аффинности, известному из уровня техники. Для гуманизации и созревания аффинности можно использовать структурные способы, например, описанные в USSN
- 9 042216
11/004590. Для гуманизации и/или созревания аффинности вариабельных областей антител можно использовать способы на основе отбора, в том числе без ограничений способы, описанные в Wu et al., 1999, J. Mol. Biol., 294:151-162; Baca et al., 1997, J. Biol. Chem., 272(16):10678-10684; Rosok et al., 1996, J. Biol. Chem., 271(37):22611-22618; Rader et al., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 95:8910-8915; Krauss et al., 2003, Protein Engineering, 16(10):753-759, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте. Другие способы гуманизации могут включать трансплантацию лишь частей CDR, в том числе без ограничений способы, описанные в USSN 09/810510; Tan et al., 2002, J. Immunol., 169:1119-1125; De Pascalis et al., 2002, J. Immunol., 169:3076-3084, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте.
Антитела, раскрытые в данном документе, могут быть выделенными или рекомбинантными. Выделенный, используемый для описания различных полипептидов, раскрытых в данном документе, означает полипептид, который был идентифицирован и отделен от и/или извлечен из клетки или культуры клеток, в которой он экспрессировался. Таким образом, выделенное антитело предназначено для обозначения антитела, практически свободного от других антител с другой специфичностью к антигенам (например, выделенное антитело, которое специфично связывается с LY75, практически свободно от антител, специфично связывающихся с антигенами, отличными от LY75). Таким образом, выделенное антитело находится в форме, обычно не обнаруживаемой в природе (например, не встречающейся в природе). Выделенное антитело, определенное в данном документе, может в одном варианте осуществления содержать по меньшей мере одну аминокислоту, не встречающуюся во встречающемся в природе антителе. Эта аминокислота может быть введена посредством добавления или замены. Будет понятно, что вводимая аминокислота может быть встречающейся в природе или не встречающейся в природе аминокислотой. В некоторых вариантах осуществления антитела по настоящему изобретению представляют собой рекомбинантные белки, выделенные белки или практически чистые белки. Выделенный белок не сопровождается по меньшей мере некоторой частью материала, с которым он обычно связан в своем естественном состоянии, например, составляя по меньшей мере приблизительно 5% или по меньшей мере приблизительно 50% по весу от общего белка в указанном образце. Понятно, что выделенный белок может составлять от 5 до 99,9% по весу от содержания общего белка в зависимости от обстоятельств. Например, белок может быть получен в значительно более высокой концентрации путем применения индуцируемого промотора или промотора, обеспечивающего высокую экспрессию, благодаря чему белок получают при повышенных уровнях концентрации. В случае рекомбинантных белков определение включает получение антитела в большом разнообразии организмов и/или клеток-хозяев, известных в данной области техники, в которых оно не образуется в естественных условиях. Обычно выделенный полипептид получают с помощью по меньшей мере одного этапа очистки. Выделенное антитело относится к антителу, практически свободному от других антител с другой специфичностью к антигенам. Например, выделенное антитело, которое специфично связывается с LY75, практически свободно от антител, специфично связывающихся с антигенами, отличными от LY75, за исключением антител, которые связываются с CD20.
Выделенные моноклональные антитела с разной специфичностью можно объединить в четко определенную композицию. Таким образом, например, антитело по настоящему изобретению можно необязательно и по отдельности включать или не включать в состав, как дополнительно обсуждается ниже.
Антитела к LY75 по настоящему изобретению специфично связываются с LY75 (например, SEQ ID NO: 15). Антитела к CD20 по настоящему изобретению специфично связываются с CD20. Специфичное связывание, или специфично связывается с, или специфичный к в отношении конкретного антигена или эпитопа означает связывание, измеримо отличающееся от неспецифического взаимодействия. Специфичное связывание можно измерить, например, путем определения связывания молекулы в сравнении со связыванием контрольной молекулы, которая обычно представляет собой молекулу сходной структуры, не обладающей активностью связывания. Например, специфичное связывание можно определить по конкуренции с контрольной молекулой, сходной с целевой.
Специфичное связывание с конкретным антигеном или эпитопом может проявляться, например, антителом, имеющим KD для антигена или эпитопа, составляющую по меньшей мере приблизительно 10-4 М, по меньшей мере приблизительно 10-5 М, по меньшей мере приблизительно 10-6 М, по меньшей мере приблизительно 10-7 М, по меньшей мере приблизительно 10-8 М, по меньшей мере приблизительно 10-9 М, в альтернативном случае по меньшей мере приблизительно 10-10 М, по меньшей мере приблизительно 10-11 М, по меньшей мере приблизительно 10-12 М или больше, где KD относится к константе скорости диссоциации при конкретном взаимодействии антитела и антигена. Антитело, которое специфично связывается с антигеном, обычно будет иметь KD, в 20, 50, 100, 500, 1000, 5000, 10000 или больше раз большую для контрольной молекулы по сравнению с антигеном или эпитопом. Однако в настоящем изобретении при введении ADC на основе антител к LY75 по настоящему изобретению важно, чтобы KD была достаточной для обеспечения интернализации и, следовательно, гибели клеток без значительных побочных эффектов.
Специфичное связывание с конкретным антигеном или эпитопом также может проявляться, например, антителом, имеющим KA или Ka для антигена или эпитопа, по меньшей мере в 20, 50, 100, 500,
- 10 042216
1000, 5000, 10000 или больше раз большую для эпитопа по сравнению с контролем, где KA или Ka относится к константе скорости ассоциации при конкретном взаимодействии антитела и антигена.
Стандартные анализы для оценки способности антител к связыванию с LY75 или CD20 могут выполняться на уровне белков или клеток и известны из уровня техники, в том числе, например, разновидности ELISA, вестерн-блоттинга, RIA, анализы на BIAcore® и анализ по методу проточной цитометрии. Подходящие анализы подробно описаны в разделе Примеры. Кинетику связывания (например, аффинность связывания) антител также можно оценить с помощью стандартных анализов, известных из уровня техники, как, например, с помощью анализа на системе Biacore®. Для оценки связывания с клетками Raji или Daudi B-клеточной опухоли клетки Raji (номер депонирования в ATCC CCL-86) или Daudi (номер депонирования в ATCC CCL-213) можно получить из общедоступных источников, таких как Американская коллекция типовых культур, и применять в стандартных анализах, таких как анализы по методу проточной цитометрии.
Антитела к LY75, которые связываются с LY75 (SEQ ID NO: 15), могут интернализироваться при контакте с клетками, на клеточной поверхности которых экспрессируется LY75. Эти антитела упоминаются в данном документе как антитела, связывающиеся с LY75 либо, для простоты описания, антитела к LY75. Оба термина используются взаимозаменяемо в данном документе.
Антитела к LY75 интернализируются при контакте с клетками, в частности опухолевыми клетками, на поверхности которых экспрессируется LY75. Иными словами, антитела к LY75, определенные в данном документе, которые также содержат конъюгированные лекарственные средства, интернализируются опухолевыми клетками, что приводит к высвобождению лекарственного средства и последующей гибели клеток, обеспечивая лечение форм рака, характеризующихся экспрессией LY75. Интернализацию в данном случае можно измерить несколькими способами. В одном варианте осуществления антитела к LY75 приводят в контакт с клетками, такими как линия клеток, вкратце описанная в данном документе, с помощью стандартных анализов, как, например, с использованием MAbZap. Для специалиста в данной области будет очевидно, что анализ с использованием MabZap иллюстрирует ожидаемый эффект, который можно наблюдать для конъюгата антитело-лекарственное средство (ADC). В последнем случае ADC будет интернализироваться, привнося таким образом лекарственное средство в клетку. Токсичное лекарственное средство будет иметь способность к уничтожению клетки, т.е. к уничтожению раковой клеткимишени. Данные анализов MabZap легко принимаются специалистами в данной области как иллюстративные для анализов ADC (Kohls, M and Lappi, D. (2000), Biotechniques, vol. 28, № 1, 162-165).
В этих вариантах осуществления анализов in vitro антитела к LY75 добавляют вместе с антителом к антителам к LY75, содержащим токсин; например, антитело к LY75 может быть мышиным или гуманизированным, а антитело к антителам к LY75, может быть антителом к мышиным антителам или антителом к гуманизированным антителам и содержать токсин, такой как сапорин. После образования комплекса [антитело к LY75]-[конъюгат антитело к антителу к LY75-лекарственное средство] комплекс интернализируется, и лекарственное средство (например, сапорин) высвобождается, приводя к гибели клеток. Лекарственное средство высвобождается только после интернализации, и поэтому клетки в отсутствие интернализации остаются жизнеспособными. Как вкратце изложено ниже без ограничения какойлибо теорией, в терапевтических путях применения антитело к антителу к LY75 содержит токсин и после интернализации связь между антителом и токсином расщепляется с высвобождением токсина и уничтожением клетки.
В одном варианте осуществления антитело к LY75 содержит области, определяющие комплементарность (CDR), или вариабельные области (VR) тяжелых и легких цепей конкретного антитела, описанного в данном документе (например, упоминаемого в данном документе как LY75_A1). Соответственно в одном варианте осуществления антитело содержит домены CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной области тяжелой цепи (VH) антитела LY75_A1, имеющей последовательность, показанную под SEQ ID NO:1, и домены CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной области легкой цепи (VL) антитела LY75_A1, имеющей последовательность, показанную под SEQ ID NO: 2.
В другом варианте осуществления антитело к LY75 содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую первую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 5; вторую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 6; и третью vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 7; и вариабельную область легкой цепи, содержащую первую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 8; вторую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 9; и третью vlCDR, содержащую SEQ ID nO: 10.
В другом варианте осуществления антитела к LY75 связываются с LY75 человека и содержат вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, содержащую SEQ ID NO: 1, и ее консервативные модификации последовательности. Антитело может дополнительно содержать вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, содержащую SEQ ID NO: 2, и ее консервативные модификации последовательности.
В дополнительном варианте осуществления антитела к LY75 связываются с LY75 человека и содержат вариабельную область тяжелой цепи и вариабельную область легкой цепи, содержащие аминокислотные последовательности, приведенные под SEQ ID NO: 1 и/или 2 соответственно, и их консерва- 11 042216 тивные модификации последовательности. Как используется в данном документе, термин консервативная модификация последовательности относится, например, к замене аминокислоты аминокислотой, имеющей аналогичные характеристики. Для специалиста в данной области обычно общеизвестно, какие из этих замен могут считаться консервативными. Другие модификации, которые могут считаться консервативными модификациями последовательности, включают, например, гликозилирование.
Необязательно одна или более из SEQ ID NO: 5-10 независимо содержат одну, две, три, четыре или пять консервативных аминокислотных замен; необязательно одна или более из SEQ ID NO: 5-10 независимо содержат одну или две консервативные аминокислотные замены.
Предпочтительно термин консервативные модификации последовательности подразумевается как включающий аминокислотные модификации, которые не влияют на характеристики связывания антитела, содержащего аминокислотную последовательность или не изменяют их в значительной степени. Такие консервативные модификации включают аминокислотные замены, добавления или делеции. Модификации могут быть введены в антитело по настоящему изобретению посредством стандартных методик, известных из уровня техники, таких как сайт-направленный мутагенез и ПЦР-опосредованный мутагенез. Консервативные аминокислотные замены являются такими, при которых аминокислотный остаток заменяют аминокислотным остатком, имеющим сходную боковую цепь. Семейства аминокислотных остатков, имеющих сходные боковые цепи, были определены в уровне техники. Такие семейства включают аминокислоты с основными боковыми цепями (например, лизин, аргинин, гистидин), кислыми боковыми цепями (например, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота), незаряженными полярными боковыми цепями (например, глицин, аспарагин, глутамин, серин, треонин, тирозин, цистеин, триптофан), неполярными боковыми цепями (например, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин), бета-разветвленными боковыми цепями (например, треонин, валин, изолейцин) и ароматическими боковыми цепями (например, тирозин, фенилаланин, триптофан, гистидин). Таким образом, один или более аминокислотных остатков в CDR-областях антитела по настоящему изобретению могут быть заменены другими аминокислотными остатками из того же семейства боковых цепей, и измененное антитело можно исследовать в отношении сохранения функции с применением функциональных анализов, описанных в данном документе.
Выделенные антитела, содержащие вариабельные области тяжелых и легких цепей, характеризующиеся по меньшей мере 80%, или по меньшей мере 85%, или по меньшей мере 90%, или по меньшей мере 91%, или по меньшей мере 92%, или по меньшей мере 93%, или по меньшей мере 94%, или по меньшей мере 95%, или по меньшей мере 96%, или по меньшей мере 97%, или по меньшей мере 98%, или по меньшей мере 99%, или большей идентичностью последовательности с любой из вышеприведенных последовательностей, также включены в настоящее изобретение. Промежуточные диапазоны вышеуказанных значений, например вариабельные области тяжелых и легких цепей, характеризующиеся по меньшей мере 80-85, 85-90, 90-95 или 95-100% идентичностью последовательности с любой из вышеприведенных последовательностей, также подразумеваются как охватываемые настоящим изобретением. В одном варианте осуществления антитело к LY75 содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую SEQ ID NO: 1 или последовательность, на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичную SEQ ID NO: 1. В другом варианте осуществления антитело к LY75 содержит вариабельную область легкой цепи, содержащую SEQ ID NO: 2 или последовательность, на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичную SEQ ID NO: 2. В другом варианте осуществления антитело к LY75 содержит каркасную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичную каркасной области вариабельной области тяжелой цепи под SEQ ID NO: I, содержащей SEQ ID NO: 16, 17 и 18. В другом варианте осуществления антитело к LY75 содержит каркасную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, по меньшей мере 99% идентичную каркасной области вариабельной области легкой цепи под SEQ ID NO: 2, содержащей SEQ ID NO: 19, 20 и 21.
В одном варианте осуществления антитело к LY75, называемое в данном документе антителом LY75_A1, содержит следующие CDR, а также их варианты, содержащие небольшое количество аминокислотных вариантов.
- 12 042216
А1 SEQ ГО NO
CDR1 вариабельной области тяжелой цепи 5
CDR2 вариабельной области тяжелой цепи 6
CDR3 вариабельной области тяжелой цепи 7
CDR1 вариабельной области легкой цепи 8
CDR2 вариабельной области легкой цепи 9
CDR3 вариабельной области легкой цепи 10
В данном документе также раскрыты вариабельные области тяжелых и легких цепей, которые содержат наборы CDR по настоящему изобретению, а также тяжелые и легкие цепи полной длины (например, также содержащие константные области). Как будет понятно специалистам в данной области, наборы CDR антитела к LY75 можно внедрить в мышиные, гуманизированные или человеческие константные области (в том числе каркасные области). Соответственно в настоящем изобретении представлены вариабельные области тяжелых и легких цепей, на по меньшей мере приблизительно 90-99% идентичные SEQ ID, раскрытым в данном документе, при этом все из 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 и 99% находят применение в настоящем изобретении.
В некоторых вариантах осуществления антитело к LY75 представляет собой антитело, которое конкурирует за связывание с LY75 человека с антителом, содержащим вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, приведенную под SEQ ID NO: 1, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, приведенную под SEQ ID NO: 2. Антитела, конкурирующие за связывание, можно идентифицировать с применением стандартных методик. Такие методики включают, например, иммунологический анализ, демонстрирующий способность одного антитела к блокированию связывания другого антитела с антигеном-мишенью, т.е. анализ конкурентного связывания. Конкурентное связывание определяют в анализе, в котором исследуемый иммуноглобулин ингибирует специфичное связывание эталонного антитела с общим антигеном, таким как LY75. Известно множество типов анализов конкурентного связывания, например твердофазный прямой или непрямой радиоиммунологический анализ (RIA), твердофазный прямой или непрямой иммуноферментный анализ (EIA), конкурентный сэндвич-анализ (см. Stahli et al., Methods in Enzymology, 9:242 (1983)); твердофазный прямой EIA с использованием комплекса биотин-авидин (см. Kirkland et al., J. Immunol., 137:3614 (1986)); твердофазный прямой анализ с мечением, твердофазный прямой сэндвичанализ с мечением (см. Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press (1988)); твердофазный прямой RIA с мечением с использованием метки I-125 (см. Morel et al., Mol. Immunol., 25(1):7 (1988)); твердофазный прямой EIA с использованием комплекса биотин-авидин (Cheung et al., Virology, 176:546 (1990)) и прямой RIA с мечением (Moldenhauer et al., Scand. J. Immunol., 32:77 (1990)). Обычно такой анализ включает применение очищенного антигена, связанного с твердой поверхностью или клетками, несущими любой из них, немеченого исследуемого иммуноглобулина и меченого эталонного иммуноглобулина. Конкурентное ингибирование измеряют путем определения количества метки, связанной с твердой поверхностью или с клетками, в присутствии исследуемого иммуноглобулина. Исследуемый иммуноглобулин обычно присутствует в избытке. Если конкурирующее антитело присутствует в избытке, оно обычно будет ингибировать специфичное связывание эталонного антитела с общим антигеном на по меньшей мере 50-55, 55-60, 60-65, 65-70, 70-75, 75-80, 80-85, 85-90, 90-95, 95-99% или больше.
Моноклональные антитела можно охарактеризовать по связыванию с LY75 или CD20 с помощью ряда известных методик. Как правило, антитела вначале характеризуют с помощью ELISA. Вкратце титрационные микропланшеты можно покрыть очищенным LY75 или CD20 в PBS, а затем блокировать нерелевантными белками, такими как бычий сывороточный альбумин (BSA), разведенный в PBS. В каждую лунку добавляют разведения плазмы крови мышей, иммунизированных с помощью LY75 или CD20,
- 13 042216 и инкубируют в течение 1-2 ч при 37°C. Планшеты промывают с помощью PBS/Tween 20 и затем инкубируют с реагентом, представляющим собой поликлональное антитело козы к IgG человека, специфичное к Fc, конъюгированное с щелочной фосфатазой, в течение 1 ч при 37°C. После промывания планшеты проявляют с помощью субстрата ABTS и анализируют при OD 405. Предпочтительно для процедур слияния будут использовать мышей, у которых проявляются наиболее высокие титры.
Анализ ELISA, описанный выше, можно применять для скрининга с выявлением антител и, следовательно, гибридом, образующих антитела, которые демонстрируют положительную реактивность в отношении иммуногена LY75/CD20. Гибридомы, которые связываются, предпочтительно с высокой аффинностью, с LY75/CD20, можно затем субклонировать и дополнительно охарактеризовать. Один клон из каждой гибридомы, сохраняющий реактивность исходных клеток (по ELISA), можно затем выбрать для получения клеточного банка и для очистки антител.
Для очистки антител к LY75 или антител к CD20 выбранные гибридомы можно выращивать во вращающихся флаконах, двухлитровых вращающихся колбах или других системах культивирования. Образцы надосадочной жидкости можно фильтровать и концентрировать перед аффинной хроматографией с белком А на сефарозе (Pharmacia, Пискатауэй, Нью-Джерси) для очистки белка. После замены буфера на PBS концентрацию можно определить по OD280 с применением коэффициента экстинкции 1,43 или предпочтительно с помощью нефелометрического анализа. IgG можно проверить с помощью гель-электрофореза и с помощью антиген-специфического способа.
Для определения того, связываются ли выбранные моноклональные антитела к LY75 или антитела к CD20 с уникальными эпитопами, каждое антитело можно биотинилировать с помощью коммерчески доступных реагентов (Pierce, Рокфорд, Иллинойс). Связывание биотинилированных mAb можно выявить с помощью зонда, меченного стрептавидином. Для определения изотипа очищенных антител можно проводить изотипирующий ELISA с применением методик, принятых в данной области техники. Например, лунки титрационных микропланшетов можно покрыть 10 мкг/мл антитела к Ig на ночь при 4°C. После блокирования с помощью 5% BSA в планшетах проводят реакцию с 10 мкг/мл моноклональных антител или очищенных изотипических контролей при температуре окружающей среды в течение 2 ч. В лунках затем можно провести реакцию с конъюгированными зондами, специфичными к IgG1 или другим изотипам. Планшеты проявляют и анализируют, как описано выше.
Для исследования связывания моноклональных антител с живыми клетками, экспрессирующими LY75 или CD20, можно применять проточную цитометрию. Вкратце линии клеток и/или PBMC человека, экспрессирующие мембраносвязанный LY75 или CD20 (выращиваемые в стандартных условиях роста), смешивают с моноклональными антителами в различных концентрациях в PBS, содержащем 0,1% BSA, при 4°C в течение 1 ч. После промывания проводят реакцию клеток с антителом к IgG, меченным флуоресцеином, в тех же условиях, что и при окрашивании первичным антителом. Образцы можно анализировать с помощью прибора FACScan с использованием свойств светорассеяния и бокового рассеяния для введения логического ограничения по отдельным клеткам и определения связывания меченых антител. Можно применять альтернативный анализ с применением флуоресцентной микроскопии в дополнение к анализу по методу проточной цитометрии или вместо него. Клетки можно окрашивать в точности так, как описано выше, и изучать с помощью флуоресцентной микроскопии. Данный способ обеспечивает визуализацию отдельных клеток, но может характеризоваться сниженной чувствительностью в зависимости от плотности антигена.
Можно дополнительно исследовать реактивность антител IgG к LY75 в отношении антигена LY75 с помощью вестерн-блоттинга; то же самое можно осуществить с антителами к CD20. Вкратце можно получить клеточные экстракты из клеток, экспрессирующих LY75/CD20, и подвергнуть электрофорезу в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата натрия. После электрофореза отделенные антигены переносят на нитроцеллюлозные мембраны, блокируют 20% мышиной сывороткой крови и зондируют моноклональными антителами, подлежащими исследованию. Связывание IgG можно выявить с помощью антитела к IgG, конъюгированного с щелочной фосфатазой, и проявить с помощью таблеток субстрата BCIP/NBT (Sigma Chem. Co., Сент-Луис, Миссури).
Способы анализа аффинности связывания, перекрестной реактивности и кинетики связывания различных антител к LY75 включают стандартные анализы, известные в данной области техники, например анализ поверхностного плазмонного резонанса (SPR) Biacore™ с применением прибора для SPR Biacore™ 2000 (Biacore AB, Уппсала, Швеция).
В одном варианте осуществления антитело специфично связывается с LY75 человека, содержащим SEQ ID NO: 15. Предпочтительно антитело к LY75 связывается с LY75 человека с высокой аффинностью.
Предпочтительно антитело к LY75 связывается с белком LY75 с KD 5x10’8 М или меньше, связывается с белком LY75 с KD 2x10’8 М или меньше, связывается с белком LY75 с KD 5x10’9 М или меньше, связывается с белком LY75 с KD 4x10’9 М или меньше, связывается с белком LY75 с KD 3x10’9 М или меньше, связывается с белком LY75 с KD 2x10’9 М или меньше, связывается с белком LY75 с KD 1x10’9 М или меньше, связывается с белком LY75 с KD 5x10’10 М или меньше или связывается с белком LY75 с KD
- 14 042216
1х10-10 М или меньше.
В одном варианте осуществления антитела к LY75 конкурируют (например, перекрестно конкурируют) за связывание с LY75 с конкретными антителами к LY75, описанными в данном документе (например, LY75_A1). Такие конкурирующие антитела можно идентифицировать на основании их способности к конкурентному ингибированию связывания одного или более mAb с LY75 в стандартных анализах связывания с LY75. Например, можно применять стандартные анализы ELISA, в которых рекомбинантный белок LY75 человека иммобилизован на планшете, одно из антител является флуоресцентно меченным, и оценивается способность немеченых антител к выведению меченого антитела из конкуренции за связывание. Дополнительно или в альтернативном случае можно применять анализ BIAcore для оценки способности антител к перекрестной конкуренции. Способность исследуемого антитела к ингибированию связывания антитела к LY75 по настоящему изобретению с LY75 человека демонстрирует, что исследуемое антитело может конкурировать с антителом за связывание с LY75 человека.
В одном варианте осуществления конкурирующее антитело представляет собой антитело, которое связывается с тем же эпитопом на LY75 человека, что и конкретные моноклональные антитела к LY75, описанные в данном документе (например, LY75_A1). Стандартные методики картирования эпитопов, такие как рентгеновская кристаллография и 2-мерная спектроскопия ядерного магнитного резонанса, можно применять для определения того, связывается ли антитело с тем же эпитопом, что и эталонное антитело (см., например, Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, vol. 66, G.E. Morris, ed. (1996)).
В одном варианте осуществления антитело, которое конкурирует за связывание с LY75 и/или связывается с тем же эпитопом на LY75 человека, представляет собой антитело человека.
После выделения одного исходного mAb к LY75, имеющего желаемые свойства, описанные в данном документе, могут быть получены другие mAb с аналогичными свойствами, например, имеющие тот же эпитоп. Например, можно иммунизировать мышей с помощью LY75, как описано в данном документе, получать гибридомы и подвергать полученные mAb скринингу с выявлением способности к конкуренции с исходным mAb за связывание с LY75. Мышей также можно иммунизировать меньшим фрагментом LY75, содержащим эпитоп, с которым связывается исходное mAb. Локализацию эпитопа можно определить путем, например, скрининга с выявлением связывания с рядом перекрывающихся пептидов, охватывающих LY75. В альтернативном случае можно применять способ из Jespers et al., Biotechnology, 12:899, 1994, для управления отбором mAb, имеющих тот же эпитоп и, следовательно, аналогичные свойства по сравнению с исходным mAb. С помощью фагового дисплея вначале тяжелую цепь исходного антитела спаривают с совокупностью (предпочтительно человеческих) легких цепей для отбора mAb, связывающихся с LY75, а затем новую легкую цепь спаривают с совокупностью (предпочтительно человеческих) тяжелых цепей для отбора (предпочтительно человеческих) mAb, связывающихся с LY75, имеющих тот же эпитоп, что и исходное mAb. В альтернативном случае варианты исходного mAb можно получить путем мутагенеза кДНК, кодирующей тяжелые и легкие цепи антитела.
Для оценки уровня конкуренции между двумя антителами можно применять, например, радиоиммунологические анализы или анализы с использованием других меток для антител. Например, антиген LY75 можно инкубировать с насыщающим количеством первого антитела к LY75 или его антигенсвязывающего фрагмента, конъюгированных с соединением-меткой (например, 3H, 125I, биотином или рубидием), в присутствии такого же количества второго немеченого антитела к LY75. Затем оценивают количество меченого антитела, связывающегося с антигеном в присутствии немеченого блокирующего антитела, и сравнивают со связыванием в отсутствие немеченого блокирующего антитела. Конкуренцию определяют по процентному изменению сигналов связывания в присутствии немеченого блокирующего антитела по сравнению с отсутствием блокирующего антитела. Таким образом, если имеет место 50% ингибирование связывания меченого антитела в присутствии блокирующего антитела по сравнению со связыванием в отсутствие блокирующего антитела, то имеет место конкуренция между двумя антителами, составляющая 50%. Таким образом, ссылка на конкуренцию между первым и вторым антителами, составляющую 50% или больше, 60% или больше, 70% или больше, как, например, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или больше, означает, что первое антитело ингибирует связывание второго антитела (или наоборот) с антигеном на 50, 60, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или больше (по сравнению со связыванием с антигеном второго антитела в отсутствие первого антитела). Таким образом, ингибирование связывания первого антитела с антигеном вторым антителом, составляющее 50, 60, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или больше, означает, что два антитела связываются с одним и тем же эпитопом.
В некоторых вариантах осуществления компонент (B) фармацевтической комбинации представляет собой антитело к CD20, определенное в данном документе.
В-лимфоцитарный антиген CD20 или CD20 представляет собой активируемый гликозилированием фосфопротеин, экспрессируемый на поверхности всех B-клеток, начиная с фазы про-B (CD45R+, CD117+), концентрация которого постепенно увеличивается до достижения зрелости (Hardy, Richard (2008). Chapter 7: B Lymphocyte Development and Biology, B Paul, William, Fundamental Immunology (Book) (6th ed.), Philadelphia: Lippincott Williams & Wilkins, p. 237-269, ISBN 0-7817-6519-6).
- 15 042216
CD20 экспрессируется на всех стадиях развития B-клеток за исключением первой и последней; он присутствует, начиная со стадии поздних про-B-клеток до стадии клеток памяти, но отсутствует на ранних про-З-клетках или плазмобластах и плазматических клетках. Он обнаруживается на раковых стволовых клетках при B-клеточной лимфоме, волосатоклеточном лейкозе, B-клеточном хроническом лимфоцитарном лейкозе и меланоме. Экспрессия CD20 регулируется посредством передачи сигнала хемокинами через ось CXCR4/SDF1.
Иммуногистохимическое исследование может применяться для определения присутствия CD20 на клетках в гистологических срезах тканей.
У людей CD20 кодируется геном MS4A1. Этот ген кодирует члена семейства генов трансмембранных белков 4A.
В одном варианте осуществления компонент (B) фармацевтической комбинации содержит антитело к CD20 или его антигенсвязывающую часть, при этом указанное антитело содержит
а) вариабельную область тяжелой цепи, содержащую
i) первую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 40;
ii) вторую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 41; и iii) третью vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 42; и
b) вариабельную область легкой цепи, содержащую
i) первую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 43;
ii) вторую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 44; и iii) третью vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 45, где необязательно любые одна или более из вышеуказанных SEQ ID NO независимо содержат одну, две, три, четыре или пять аминокислотных замен, добавлений или делеций.
Необязательно одна или более из вышеуказанных SEQ ID NO: 40-45 независимо содержат одну, две, три, четыре или пять консервативных аминокислотных замен; более предпочтительно, любые одна или более из вышеуказанных SEQ ID NO независимо содержат одну или две консервативные аминокислотные замены.
Антитело к CD-20 предпочтительно представляет собой моноклональное антитело, более предпочтительно человеческое моноклональное антитело и еще более предпочтительно полностью человеческое моноклональное антитело IgG1.
В особенно предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения антитело к CD20 представляет собой ритуксимаб. Ритуксимаб представляет собой моноклональное антитело к белку CD20, который широко экспрессируется на B-клетках (Oncogene (2003 Oct 20), Smith M.R., Rituximab (monoclonal anti-CD20 antibody): mechanisms of action and resistance, 22(47):7359-68). Ритуксимаб разрушает как нормальные, так и злокачественные B-клетки, которые имеют CD20 на их поверхности, и, следовательно, применяется для лечения заболеваний, которые характеризуются наличием слишком большого количества B-клеток, сверхактивных B-клеток или дисфункциональных B-клеток. Ритуксимаб ранее применялся для лечения ряда аутоиммунных заболеваний и некоторых типов рака, включая ревматоидный артрит, идиопатическую тромбоцитопеническую пурпуру, обыкновенную пузырчатку, рассеянный склероз, системную красную волчанку, неходжкинскую лимфому, хроническую воспалительную демиелинизирующую полинейропатию, хронический лимфоцитарный лейкоз и виды аутоиммунной анемии. Ритуксимаб продается под торговым наименованием Rituxan® компанией Roche.
Предпочтительно тяжелая и/или легкая цепь антитела ритуксимаба содержит аминокислотную последовательность, приведенную под SEQ ID NO: 38 и 39 соответственно, или состоит из нее.
Настоящим изобретением охватываются варианты антител, иногда также называемые производными антител или аналогами антител. Иными словами, существует ряд модификаций, которые можно производить в отношении антител, раскрытых в данном документе, включающих без ограничений аминокислотные модификации CDR (созревание аффинности), аминокислотные модификации каркасных областей, аминокислотные модификации Fc-области, варианты гликозилирования, ковалентные модификации других типов (например, для присоединения конъюгированных лекарственных средств и т.п.).
Под вариантом в данном документе подразумевается полипептидная последовательность, отличающаяся от таковой у исходного полипептида за счет по меньшей мере одной аминокислотной модификации. В этом случае исходный полипептид представляет собой вариабельную область тяжелой либо легкой цепи полной длины, например, приведенную под SEQ ID NO: 1 или 2 соответственно, или CDR-области или каркасные области тяжелых и легких цепей, приведенные под SEQ ID NO 5-10 и 16-21 для LY75. Аминокислотные модификации могут включать замены, вставки и делеции, при этом первые во многих случаях являются предпочтительными. Будет понятно, что аминокислотная замена может представлять собой консервативную или неконсервативную замену, при этом консервативные замены являются предпочтительными. Дополнительно указанная замена может представлять собой замену встречающейся в природе либо не встречающейся в природе аминокислотой.
В целом варианты могут содержать любое количество модификаций при условии что функция антитела будет по-прежнему присутствовать, как описано в данном документе. Иными словами, в случае LY75_A1, например, антитело должно по-прежнему специфично связываться с LY75 человека. Анало- 16 042216 гично антитела к CD20 должны по-прежнему специфично связываться с CD20 человека. Если аминокислотные варианты получают с Fc-областью, например, то варианты антител должны сохранять функции связывания с рецепторами, необходимые для конкретного применения антитела или показания к нему.
Варианты в этом случае можно получить в приведенных последовательностях CDR, каркасных либо Fc-областях антитела.
Однако в целом обычно используют 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 аминокислотных замен, поскольку часто целью является изменение функции с минимальным количеством модификаций. В некоторых случаях имеют место от 1 до 5 модификаций (например, отдельных аминокислотных замен, вставок или делеций), при этом 1-2, 1-3 и 1-4 также находят применение во многих вариантах осуществления. Количество модификаций может зависеть от размера модифицируемой области; например, как правило, в CDR-областях желательным является меньшее количество модификаций. Специалисту в данной области будет понятно, что даже в CDR-областях местоположение модификации может значительно изменять эффект. В одном варианте осуществления модификации можно производить в любой из CDR1, CDR2 или CDR3 тяжелых и/или легких цепей. В дополнительном варианте осуществления модификации производят в любой из CDR1 или CDR2 тяжелых и/или легких цепей. В еще одном дополнительном варианте осуществления модификации расположены в CDR1 тяжелых и/или легких цепей.
Следует отметить, что ряд аминокислотных модификаций может находиться в функциональных доменах: например, может быть необходимо наличие 1-5 модификаций в Fc-области белков дикого типа или сконструированных белков, а также от 1 до 5 модификаций в Fv-области, например. Вариант полипептидной последовательности предпочтительно будет обладать по меньшей мере приблизительно 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичностью с исходными последовательностями (например, вариабельными областями, константными областями и/или последовательностями тяжелых и легких цепей и/или CDR LY75_A1 или ритуксимаба). Следует отметить, что в зависимости от размера последовательности процентная идентичность будет зависеть от количества аминокислот.
Под аминокислотной заменой или заменой в данном документе подразумевается замещение аминокислоты в конкретном положении исходной полипептидной последовательности другой аминокислотой, которая может быть природной или не встречающейся в природе аминокислотой. Например, замена S100A относится к варианту полипептида, в котором серин в положении 100 замещен аланином. Под аминокислотной вставкой или вставкой, используемой в данном документе, подразумевается добавление аминокислоты в конкретное положение исходной полипептидной последовательности. Под аминокислотной делецией или делецией, используемой в данном документе, подразумевается удаление аминокислоты в конкретном положении исходной полипептидной последовательности.
Под исходным полипептидом, исходным белком, полипептидом-предшественником или белком-предшественником, используемым в данном документе, подразумевается немодифицированный полипептид, который впоследствии модифицируют с получением варианта. Как правило, исходные полипептиды в данном документе представляют собой LY75_A1 и ритуксимаб. Соответственно под исходным антителом, используемым в данном документе, подразумевается антитело, которое модифицируют с получением варианта антитела.
Под диким типом, или WT, или нативным в данном документе подразумевается аминокислотная последовательность или нуклеотидная последовательность, обнаруживаемая в природе, в том числе аллельные варианты. Белок, полипептид, антитело, иммуноглобулин, IgG и т.п. WT имеют аминокислотную последовательность или нуклеотидную последовательность, которая не была преднамеренно модифицирована.
Под вариантом Fc-области в данном документе подразумевается последовательность Fc, отличающаяся от последовательности Fc дикого типа за счет по меньшей мере одной аминокислотной модификации. Вариант Fc может относиться к полипептиду Fc как таковому, к композициям, содержащим вариант полипептида Fc, или к аминокислотной последовательности.
В некоторых вариантах осуществления в одной или более CDR LY75_A1 или ритуксимаба производят одну или более аминокислотных модификаций. Как правило, в любой отдельной CDR заменяют только 1, или 2, или 3 аминокислоты, и в наборе из 6 CDR обычно производят не более 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 изменений. Однако следует понимать, что любую комбинацию из отсутствия замен, 1, 2 или 3 замен в любой CDR можно независимо и необязательно сочетать с любой другой заменой. Будет очевидно, что замены можно производить в любой из 6 CDR. В одном варианте осуществления замены производят в CDR1 тяжелых и/или легких цепей.
В некоторых случаях аминокислотные модификации в CDR называют созреванием аффинности. Антитело, подвергнутое созреванию аффинности, имеет одно или более изменений в одной или более CDR, которые приводят к улучшению аффинности антитела к антигену по сравнению с исходным антителом, не имеющим этого(этих) изменения(ий). В некоторых случаях, хоть и редких, может быть желательным снижение аффинности антитела к его антигену, но это обычно не является предпочтительным.
Созревание аффинности можно выполнять для повышения аффинности связывания антитела с антигеном на по меньшей мере приблизительно 10%, приблизительно 20%, приблизительно 30%, приблизительно 40%, приблизительно 50%, приблизительно 60%, приблизительно 70%, приблизительно 80%,
- 17 042216 приблизительно 90%, приблизительно 100%, приблизительно 110%, приблизительно 120%, приблизительно 130%, приблизительно 140%, приблизительно 150% или больше или в от 1, 2, 3, 4 до 5 раз по сравнению с исходным антителом. Предпочтительные антитела, подвергнутые созреванию аффинности, будут характеризоваться наномолярными или даже пикомолярными значениями аффинности к антигену-мишени. Антитела, подвергнутые созреванию аффинности, получают с помощью известных процедур. См., например, Marks et al., 1992, Biotechnology, 10:779-783, в котором описано созревание аффинности путем перетасовки доменов вариабельной области тяжелой цепи (VH) и вариабельной области легкой цепи (VL). Случайный мутагенез остатков CDR и/или каркасных участков описан в Barbas et al., 1994, Proc. Nat. Acad. Sci, USA, 91:3809-3813; Shier et al., 1995, Gene, 169:147-155; Yelton et al., 1995, J. Immunol., 155:1994-2004; Jackson et al., 1995, J. Immunol., 154(7):3310-9; и Hawkins et al., 1992, J. Mol. Biol., 226:889-896, например.
В альтернативном случае в одной или более CDR антител по настоящему изобретению можно производить аминокислотные модификации, которые являются молчащими, например которые незначительно изменяют аффинность антитела к антигену. Их можно производить по ряду причин, включающих оптимизацию экспрессии (которую можно выполнять для нуклеиновых кислот, кодирующих антитела по настоящему изобретению).
Таким образом, в определение CDR и антител, раскрытых в данном документе, включены варианты CDR и антител; иными словами, антитела могут содержать аминокислотные модификации в одной или более CDR LY75_A1 или ритуксимаба. В дополнение, как вкратце изложено ниже, аминокислотные модификации можно также независимо и необязательно производить в любой области за пределами CDR, в том числе в каркасных и константных областях, описанных в данном документе.
В некоторых вариантах осуществления антитела к LY75 и/или антитела к CD20, раскрытые в данном документе, состоят из варианта Fc-домена. Как известно в данной области техники, Fc-область антитела взаимодействует с рядом Fc-рецепторов и лигандов, придавая целый ряд важных функциональных способностей, называемых эффекторными функциями. Эти Fc-рецепторы включают без ограничений (у людей) FcyRI (CD64), в том числе изоформы FcyRIa, FcyRIb и FcyRIc; FcyRII (CD32), в том числе изоформы FcyRIIa (в том числе аллотипы H131 и R131), FcyRIIb (в том числе FcyRIIb-1 и FcyRIIb-2) и FcyRIIc; и FcyRIII (CD16), в том числе изоформы FcyRIIIa (в том числе аллотипы V158 и F158, связанные с антителозависимой клеточной цитотоксичностью (ADCC)) и FcyRIIIb (в том числе аллотипы FcyRIIIb-NA1 и FcyRIIIb-NA2), FcRn (неонатальный рецептор), C1q (белок системы комплемента, участвующий в комплементзависимой цитотоксичности (CDC)) и FcRn (неонатальный рецептор, участвующий в регуляции периода полувыведения из сыворотки крови). Подходящие модификации можно производить в одном или более положениях, как в целом изложено, например, в заявке на патент США 11/841654 и литературных источниках, упоминаемых там, US 2004/013210, US 2005/0054832, US 2006/0024298, US 2006/0121032, US 2006/0235208, US 2007/0148170, USSN 12/341769, патенте США № 6737056, патенте США № 7670600, патенте США № 6086875, все из которых явным образом включены посредством ссылки во всей своей полноте, в частности, что касается конкретных аминокислотных замен, усиливающих связывание с Fc-рецепторами.
В дополнение к модификациям, изложенным выше, можно производить другие модификации. Например, молекулы можно стабилизировать путем включения в их состав дисульфидных мостиков, связывающих VH- и VL-домены (Reiter et al., 1996, Nature Biotech., 14:1239-1245, включенный посредством ссылки во всей своей полноте).
В дополнение модификации цистеиновых остатков являются особенно применимыми в путях применения конъюгатов антитело-лекарственное средство (ADC), дополнительно описанных ниже. В некоторых вариантах осуществления константная область антитела может быть сконструирована содержащей один или более особенно тиол-реактивных цистеиновых остатков в целях обеспечения более специфичного и регулируемого размещения компонента-лекарственного средства. См., например, патент США № 7521541, включенный в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.
В дополнение существует ряд ковалентных модификаций антител, которые можно производить, как вкратце изложено ниже.
Ковалентные модификации антител включены в объем настоящего изобретения и обычно, но не всегда выполняются посттрансляционно. Например, некоторые типы ковалентных модификаций антитела внедряют в молекулу посредством реакции конкретных аминокислотных остатков антитела с органическим дериватизирующим средством, способным к реакции с определенными боковыми цепями или Nили С-концевыми остатками.
Цистеинильные остатки чаще всего подвергают реакции с α-галогенацетатами (и соответствующими аминами), такими как хлоруксусная кислота или хлорацетамид, с получением карбоксиметильных или карбоксиамидометильных производных. Цистеинильные остатки также можно дериватизировать посредством реакции с бромтрифторацетоном, а-бром-в-(5-имидазолил)пропионовой кислотой, хлорацетилфосфатом, N-алкилмалеимидами, 3-нитро-2-пиридилдисульфидом, метил-2-пиридилдисульфидом, п-хлормеркуробензоатом, 2-хлормеркуро-4-нитрофенолом или хлор-7-нитробензо-2-окса-1,3-диазолом
- 18 042216 и т.п.
Гистидильные остатки дериватизируют посредством реакции с диэтилпирокарбонатом при pH 5,5-7,0, поскольку данное средство является относительно специфичным к боковой цепи гистидила. Также применимым является пара-бромфенацилбромид; реакцию предпочтительно проводят в 0,1 М какодилате натрия при pH 6,0.
Лизинильные и аминоконцевые остатки подвергают реакции с ангидридами янтарной или других карбоновых кислот. Дериватизация с помощью этих средств обладает эффектом изменения заряда лизинильных остатков на противоположный. Другие подходящие реагенты для дериватизации остатков, содержащих альфа-аминогруппы, включают имидоэфиры, такие как метилпиколинимидат; пиридоксальфосфат; пиридоксаль; хлорборогидрид; тринитробензолсульфоновую кислоту; O-метилизомочевину; 2,4-пентандион и глиоксилат в реакции, катализируемой трансаминазой.
Аргинильные остатки модифицируют посредством реакции с одним или более традиционными реагентами, среди которых фенилглиоксаль, 2,3-бутандион, 1,2-циклогександион и нингидрин. Дериватизация аргининовых остатков требует, чтобы реакцию проводили в щелочных условиях, в связи с высокой pKa гуанидиновой функциональной группы. Кроме того, эти реагенты могут реагировать с группами лизина, а также с эпсилон-аминогруппой аргинина.
Можно производить конкретные модификации тирозильных остатков, при этом особенный интерес представляет введение спектральных меток в тирозильные остатки посредством реакции с ароматическими соединениями диазония или тетранитрометаном. Для образования О-ацетилтирозильных молекул и 3-нитропроизводных чаще всего соответственно применяют N-ацетилимидазол и тетранитрометан. Тирозильные остатки йодируют с помощью 125I или 131I с получением меченых белков для применения в радиоиммунологическом анализе, при этом способ с применением хлорамина T, описанный выше, является предпочтительным.
Карбоксильные боковые группы (аспартил или глутамил) избирательно модифицируют посредством реакции с карбодиимидами (R'-N=C=N--R'), где R и R' необязательно представляют собой различные алкильные группы, такие как 1-циклогексил-3-(2-морфолинил-4-этил)карбодиимид или 1-этил-3-(4азоний-4,4-диметилпентил)карбодиимид. Кроме того, аспартильные и глутамильные остатки превращают в аспарагинильные и глутаминильные остатки посредством реакции с ионами аммония.
Дериватизация с помощью бифункциональных средств применима для сшивания антител с нерастворимой в воде матрицей-подложкой или поверхностью для применения в ряде способов в дополнение к способам, описанным ниже. Широко используемые сшивающие средства включают, например, 1,1-бис(диазоацетил)-2-фенилэтан, глутаровый альдегид, N-гидроксисукцинимидные сложные эфиры, например, сложные эфиры 4-азидосалициловой кислоты, гомобифункциональные имидоэфиры, в том числе дисукцинимидиловые сложные эфиры, такие как 3,3'-дитиобис(сукцинимидилпропионат), и бифункциональные малеимиды, такие как бис-М-малеимидо-1,8-октан. Дериватизирующие средства, такие как метил-3-[(п-азидофенил)дитио]пропиоимидат, обеспечивают получение фотоактивируемых промежуточных соединений, способных образовывать поперечные связи в присутствии света. В альтернативном случае для иммобилизации белков используют реакционноспособные нерастворимые в воде матрицы, такие как активированные бромистым цианогеном углеводы и реакционноспособные субстраты, описанные в патентах США № 3969287; 3691016; 4195128; 4247642; 4229537 и 4330440, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте.
Глутаминильные и аспарагинильные остатки часто дезамидируют с получением соответствующих глутамильных и аспартильных остатков соответственно. В альтернативном случае эти остатки дезамидируют в слабокислых условиях. Любая форма этих остатков находится в пределах объема настоящего изобретения.
Другие модификации включают гидроксилирование пролина и лизина, фосфорилирование гидроксильных групп серильных или треонильных остатков, метилирование α-аминогрупп боковых цепей лизина, аргинина и гистидина (T.E. Creighton, Proteins: Structure and Molecular Properties, W.H. Freeman & Co., San Francisco, p. 79-86 [1983], включенный посредством ссылки во всей своей полноте), ацетилирование N-концевой аминогруппы и амидирование любой C-концевой карбоксильной группы.
В дополнение, как будет понятно специалистам в данной области, к антителам (а также к другим композициям по настоящему изобретению) можно добавлять любые метки (в том числе флуоресцентные, ферментные, магнитные, радиоактивные и т.п.).
Другим типом ковалентной модификации являются изменения гликозилирования. В некоторых вариантах осуществления антитела, раскрытые в данном документе, могут быть полностью или частично агликозилированными, например афукозилированными.
Другой тип ковалентной модификации антитела включает связывание антитела с различными небелковыми полимерами, в том числе без ограничений с различными полиолами, такими как полиэтиленгликоль, полипропиленгликоль или полиоксиалкилены, согласно изложенному, например, в каталоге PEG 2005-2006 от Nektar Therapeutics (доступном на веб-сайте Nektar), патентах США 4640835; 4496689; 4301144; 4670417; 4791192 или 4179337, все из которых включены посредством ссылки во всей своей полноте. В дополнение, как известно из уровня техники, аминокислотные замены можно производить в
- 19 042216 различных положениях в антителе для облегчения добавления полимеров, таких как PEG. См., например, публикацию заявки на патент США № 2005/0114037 A1, включенную посредством ссылки во всей своей полноте.
В дополнительных вариантах осуществления антитела могут содержать метку. Под меченым в данном документе подразумевается, что соединение имеет по меньшей мере один элемент, изотоп или химическое соединение, присоединенные для обеспечения выявления соединения. Как правило, метки подразделяются на три класса:
a) изотопные метки, которые могут представлять собой радиоактивные или тяжелые изотопы;
b) магнитные, электрические, температурные метки; и
c) цветные или люминесцентные красители, хотя метки также включают ферменты и частицы, такие как магнитные частицы. Предпочтительные метки включают без ограничений флуоресцентные комплексы лантаноидов (в том числе европия и тербия) и флуоресцентные метки, включающие без ограничений квантовые точки, флуоресцеин, родамин, тетраметилродамин, эозин, эритрозин, кумарин, метилкумарины, пирен, малахитовый зеленый, стильбен, люциферовый желтый, Cascade синий, техасский красный, красители Alexa, циановые красители и другие, описанные в 6-м издании Molecular Probes Handbook под редакцией Richard P. Haugland, явным образом включенном в данный документ посредством ссылки.
Конъюгаты антитело-лекарственное средство.
В некоторых вариантах осуществления антитела к LY75, раскрытые в данном документе, конъюгируют с лекарственными средствами с образованием конъюгатов антитело-лекарственное средство (ADC). Как правило, ADC применяют в путях применения в онкологии, где применение конъюгатов антителолекарственное средство для локальной доставки цитотоксических или цитостатических средств обеспечивает целенаправленную доставку функциональной части, представляющей собой лекарственное средство, в опухоли, что может обеспечить более высокую эффективность, более низкую токсичность и т.п. Обзор данной технологии приведен в Ducry et al., Bioconjugate Chem., 21:5-13 (2010), Carter et al., Cancer J. 14(3):154 (2008); и Senter, Current Opin. Chem. Biol., 13:235-244 (2009), все из которых включены в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.
Таким образом, в настоящем изобретении представлены фармацевтические комбинации, содержащие, помимо прочего, антитела к LY75, конъюгированные с лекарственными средствами. Как правило, конъюгирование выполняется путем ковалентного присоединения к антителу, как подробно описано ниже, и обычно основано на применении линкера, часто пептидной связи (которая, как описана ниже, может быть предусмотрена чувствительной или нечувствительной к расщеплению протеазами в целевом участке). В дополнение, как описано выше, связывание структурной единицы линкер-лекарственное средство (LU-D) можно выполнить путем присоединения к цистеиновым остаткам в антителе. Как будет понятно специалистам в данной области, количество функциональных частей, представляющих собой лекарственные средства, на антитело может изменяться в зависимости от условий реакции, и соотношение лекарственное средство:антитело может варьироваться от 1:1 до 10:1. Как будет понятно специалистам в данной области, фактическое количество является средним значением.
Таким образом, антитела к LY75 могут быть конъюгированными с лекарственными средствами. Как описано ниже, лекарственное средство ADC может представлять собой любое количество средств, включающих без ограничений представленные цитотоксические средства, такие как химиотерапевтические средства, ингибиторы роста, токсины (например, ферментативно активные токсины бактериального, грибного, растительного или животного происхождения или их фрагменты), или радиоактивные изотопы (иными словами, в радиоконъюгате). В других вариантах осуществления в настоящем изобретении дополнительно представлены способы применения ADC.
Лекарственные средства для применения в настоящем изобретении включают цитотоксические лекарственные средства, в частности, применяемые для терапии рака. Такие лекарственные средства включают, как правило, средства, повреждающие ДНК, антиметаболиты, натуральные продукты и их аналоги. Иллюстративные классы цитотоксических средств включают ингибиторы ферментов, такие как ингибиторы дигидрофолатредуктазы и ингибиторы тимидилатсинтазы, ДНК-интеркаляторы, средства, расщепляющие ДНК, ингибиторы топоизомеразы, лекарственные средства семейства антрациклинов, лекарственные средства из барвинка, митомицины, блеомицины, цитотоксические нуклеозиды, лекарственные средства семейства птеридинов, диинены, подофиллотоксины, доластатины, майтанзиноиды, индукторы дифференцировки и таксолы.
Представители этих классов включают, например, таксол, метотрексат, метоптерин, дихлорметотрексат, 5-фторурацил, 6-меркаптопурин, арабинозид цитозина, мелфалан, лейрозин, лейросидеин, актиномицин, даунорубицин, доксорубицин, митомицин C, митомицин A, карминомицин, аминоптерин, таллизомицин, подофиллотоксин и производные подофиллотоксина, такие как этопозид или фосфат этопозида, винбластин, винкристин, виндезин, таксаны, в том числе таксол, таксотер, ретиноевую кислоту, масляную кислоту, К8-ацетилспермидин, камптотецин, калихеамицин, эсперамицин, ендиины, дуокармицин A, дуокармицин SA, калихеамицин, камптотецин, гемиастерлины, майтанзиноиды (в том числе DM1), монометилауристатин E (MMAE), монометилауристатин F (MMAF) и майтанзиноиды (DM4) и их
- 20 042216 аналоги.
Токсины могут применяться в составе конъюгатов антитело-токсин и включают бактериальные токсины, такие как дифтерийный токсин, растительные токсины, такие как рицин, низкомолекулярные токсины, такие как гелданамицин (Mandler et al. (2000), J. Nat. Cancer Inst., 92(19):1573-1581; Mandler et al. (2000), Bioorganic & Med. Chem. Letters, 10:1025-1028; Mandler et al. (2002), Bioconjugate Chem., 13:786-791), майтанзиноиды (EP 1391213; Liu et al. (1996), Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 93:8618-8623) и калихеамицин (Lode et al. (1998), Cancer Res., 58:2928; Hinman et al. (1993), Cancer Res., 53:3336-3342), гемиастерлины (WO 2004/026293; Zask et al. (2004), J. Med. Chem., 47:4774-4786). Токсины могут оказывать свои цитотоксические и цитостатические эффекты с помощью механизмов, включающих связывание тубулина, связывание ДНК или ингибирование топоизомеразы.
Также можно применять конъюгаты антитела к LY75 и одного или более низкомолекулярных токсинов, таких как майтанзиноиды, доластатины, ауристатины, трихотецин, калихеамицин, дуокармицины, пирролбензодиазепины и СС1065, и производные этих токсинов, обладающие активностью токсинов.
Антитело к LY75 предпочтительно конъюгировано с DM1 или DM4, наиболее предпочтительно с DM4. Соединения майтанзина, подходящие для применения в качестве майтанзиноидных функциональных частей, представляющих собой лекарственное средство, хорошо известны в данной области техники и могут быть выделены из естественных источников в соответствии с известными способами, быть получены с помощью методик генной инженерии (см. Yu et al. (2002), PNAS 99:7968-7973) или представлять собой майтанзинол и аналоги майтанзинола, получаемые синтетически в соответствии с известными способами. Как описано ниже, лекарственные средства можно модифицировать путем включения в их состав функционально активной группы, такой как тиольная группа или аминогруппа, для конъюгирования с антителом.
Иллюстративные майтанзиноидные функциональные части, представляющие собой лекарственные средства, включают компоненты, которые имеют модифицированное ароматическое кольцо, такие как C-19-дехлорпроизводные (патент США № 4256746) (получаемые посредством восстановления ансамитоцина P2 алюмогидридом лития); C-20-гидрокси- (или C-20-деметил-) +/-C-19-дехлорпроизводные (патенты США № 4361650 и 4307016) (получаемые путем деметилирования с помощью Streptomyces или Actinomyces или дехлорирования с помощью LAH) и C-20-деметокси, C-20-ацилокси (--OCOR), +/-дехлорпроизводные (патент США № 4294757) (получаемые путем ацилирования с помощью хлорангидридов), а также компоненты, которые имеют модификации в других положениях.
Иллюстративные майтанзиноидные функциональные части, представляющие собой лекарственные средства, также включают компоненты, которые имеют такие модификации, как C-9-SH (патент США № 4424219) (получаемые посредством реакции майтанзинола с H2S или P2S5); C-14-алкоксиметил(деметокси/CH2OR) (патент США № 4331598); C-14-гидроксиметил или ацилоксиметил (CH2OH или CH2OAc) (патент США № 4450254) (получаемые из Nocardia); C-15-гидрокси/ацилокси (патент США № 4364866) (получаемые путем превращения майтанзинола под действием Streptomyces); C-15-метокси (патенты США №№ 4313946 и 4315929) (выделяемые из Trewia nudlflora); C-18-N-деметил (патенты США №№ 4362663 и 4322348) (получаемые путем деметилирования майтанзинола под действием Streptomyces) и 4,5-дезокси (патент США № 4371533) (получаемые путем восстановления майтанзинола трихлоридом титана/LAH).
Особенную применимость имеют DM1 (раскрытый в патенте США № 5208020, включенном посредством ссылки) и DM4 (раскрытый в патенте США № 7276497, включенном посредством ссылки).
См. также ряд дополнительных майтанзиноидных производных и способов в 5416064, WO 01/24763, 7303749, 7601354, USSN 12/631508, WO 02/098883, 6441163, 7368565, WO 02/16368 и WO 04/1033272, все из которых явным образом включены посредством ссылки во всей своей полноте.
ADC, содержащие майтанзиноиды, способы их получения и их терапевтическое применение раскрыты, например, в патентах США № 5208020; 5416064; 6441163 и европейском патенте EP 0425235 B1, раскрытия которых явным образом включены в данный документ посредством ссылки. B Liu et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 93:8618-8623 (1996), описаны ADC, содержащие майтанзиноид, обозначенный как DM1, связанный с моноклональным антителом C242, направленным против рака ободочной и прямой кишки человека. Было обнаружено, что конъюгат является весьма цитотоксическим в отношении культивируемых раковых клеток толстой кишки и демонстрирует противоопухолевую активность в анализе роста опухоли in vivo.
В Chari et al., Cancer Research, 52:127-131 (1992) описаны ADC, в которых майтанзиноид был конъюгирован с помощью дисульфидного линкера с антителом мыши A7, связывающимся с антигеном в линиях раковых клеток толстой кишки человека, или с другим моноклональным антителом мыши TA.1, которое связывается с онкогеном HER-2/neu. Цитотоксичность конъюгата TA.1-майтанзиноид исследовали in vitro в линии раковых клеток молочной железы человека SK-BR-3, в которой экспрессируется 3x105 поверхностных антигенов HER-2 на клетку. Конъюгированное лекарственное средство достигало степени цитотоксичности, сходной с таковой у свободного майтанзиноидного лекарственного средства, которую можно повысить путем увеличения количества молекул майтанзиноидов на молекулу антитела. Конъюгат A7-майтанзиноид демонстрировал низкую системную цитотоксичность у мышей.
- 21 042216
Для композиций, содержащих множество антител, нагрузка лекарственным средством представлена в виде p, среднего количества молекул лекарственного средства на антитело. Нагрузка лекарственным средством может варьироваться в диапазоне от 1 до 20 молекул лекарственного средства (D) на антитело. Среднее количество молекул лекарственного средства на антитело в препарате, полученном посредством реакций конъюгирования, можно охарактеризовать с помощью традиционных способов, таких как массспектроскопия, анализ ELISA и HPLC. Также можно определить количественное распределение конъюгатов антитело-лекарственное средство по p.
В некоторых случаях отделение, очистку однородных конъюгатов антитело-лекарственное средство, где p представляет собой определенное значение, от конъюгатов антитело-лекарственное средство с другой нагрузкой лекарственным средством и установление их характеристик можно осуществлять с помощью таких способов, как обращенно-фазовая HPLC или электрофорез. В иллюстративных вариантах осуществления p равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 или является их дробью.
Получение соединений-конъюгатов антитело-лекарственное средство можно осуществлять согласно любой методике, известной специалисту в данной области. Вкратце соединения-конъюгаты антителолекарственное средство могут содержать антитело к LY75 в качестве структурной единицы-антитела, лекарственное средство и необязательно линкер, который соединяет лекарственное средство и связывающее средство.
Множество различных реакций доступно для ковалентного присоединения лекарственных средств и/или линкеров к связывающим средствам. Это можно осуществить посредством реакции с аминокислотными остатками связывающего средства, например молекулы антитела, включающими аминогруппы лизина, свободные группы карбоновой кислоты глутаминовой и аспарагиновой кислот, сульфгидрильные группы цистеина и различные функциональные части ароматических аминокислот. Широко применяемым неспецифическим способом ковалентного присоединения является карбодиимидная реакция связывания карбоксильной (или амино-) группы соединения с амино- (или карбоксильными) группами антитела. Дополнительно бифункциональные средства, такие как диальдегиды или имидоэфиры, применялись для связывания аминогруппы соединения с аминогруппами молекулы антитела.
Также для присоединения лекарственных средств к связывающим средствам доступна реакция образования основания Шиффа. Данный способ включает окисление периодатом лекарственного средства, содержащего гликолевые группы или гидроксигруппы, с образованием, таким образом, альдегида, который затем подвергают реакции со связывающим средством. Присоединение происходит посредством образования основания Шиффа с аминогруппами связывающего средства. Изотиоцианаты также можно применять в качестве средств сочетания для ковалентного присоединения лекарственных средств к связывающим средствам. Другие методики известны специалисту в данной области и находятся в пределах объема настоящего изобретения.
В некоторых вариантах осуществления промежуточное соединение, представляющее собой предшественник линкера, подвергают реакции с лекарственным средством в соответствующих условиях. В других вариантах осуществления применяют реакционноспособные группы в лекарственном средстве и/или промежуточном соединении. Продукт реакции между лекарственным средством и промежуточным соединением, или дериватизированное лекарственное средство, затем подвергают реакции с антителом к LY75 по настоящему изобретению в соответствующих условиях.
Будет понятно, что в желаемом соединении также можно производить химические модификации, чтобы сделать реакции этого соединения более пригодными для целей получения конъюгатов по настоящему изобретению. Например, функциональную группу, например, аминогруппу, гидроксильную или сульфгидрильную группу, можно присоединить к лекарственному средству в положении, оказывающем минимальный или допустимый эффект на активность или другие свойства лекарственного средства.
Как правило, соединения-конъюгаты антитело-лекарственное средство содержат линкерную структурную единицу между структурной единицей-лекарственным средством и структурной единицейантителом. В некоторых вариантах осуществления линкер расщепляется во внутриклеточных или внеклеточных условиях, так что при расщеплении линкера из антитела высвобождается структурная единица-лекарственное средство в соответствующую среду. Например, солидные опухоли, секретирующие определенные протеазы, могут служить в качестве целевых для расщепляемого линкера; в других вариантах осуществления используются именно внутриклеточные протеазы. В еще нескольких других вариантах осуществления линкерная структурная единица не является расщепляемой и лекарственное средство высвобождается, например, посредством разрушения антител в лизосомах.
В некоторых вариантах осуществления линкер расщепляется с помощью расщепляющего средства, присутствующего во внутриклеточной среде (например, в лизосоме или эндосоме или в кавеоле). Линкер может представлять собой, например, пептидильный линкер, расщепляемый под действием внутриклеточного фермента пептидазы или протеазы, в том числе без ограничений лизосомальной или эндосомальной протеазы. В некоторых вариантах осуществления пептидильный линкер имеет длину по меньшей мере две аминокислоты или имеет длину по меньшей мере три аминокислоты или больше.
Расщепляющие средства могут включать без ограничений катепсины B и D и плазмин, обо всех из
- 22 042216 которых известно, что они гидролизуют дипептидные производные лекарственных средств, что приводит к высвобождению активного лекарственного средства внутрь клеток-мишеней (см., например, Dubowchik and Walker, 1999, Pharm. Therapeutics, 83:67-123). Пептидильные линкеры расщепляются ферментами, присутствующими в клетках, экспрессирующих LY75. Например, можно применять пептидильный линкер, расщепляемый тиол-зависимой протеазой катепсином B, характеризующейся высоким уровнем экспрессии в раковой ткани (например, линкер Phe-Leu или Gly-Phe-Leu-Gly (SEQ ID NO: 52)). Другие примеры таких линкеров описаны, например, в патенте США № 6214345, включенном в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте и во всех отношениях.
В некоторых вариантах осуществления пептидильный линкер, расщепляемый внутриклеточной протеазой, представляет собой линкер Val-Cit или линкер Phe-Lys (см., например, патент США № 6214345, в котором описан синтез доксорубицина с помощью линкера Val-Cit).
В других вариантах осуществления расщепляемый линкер является pH-чувствительным, иными словами, чувствительным к гидролизу при определенных значениях pH. Как правило, pH-чувствительный линкер гидролизуется в кислых условиях. Например, можно применять кислотонеустойчивый линкер, гидролизуемый в лизосоме (например, гидразон, семикарбазон, тиосемикарбазон, амид цис-аконитовой кислоты, ортоэфир, ацеталь, кеталь и т.п.). (См., например, патенты США № 5122368; 5824805; 5622929; Dubowchik and Walker, 1999, Pharm. Therapeutics, 83:67-123; Neville et al., 1989, Biol. Chem., 264:1465314661.) Такие линкеры являются относительно стабильными в условиях нейтрального pH, как, например, в крови, но являются нестабильными при pH ниже 5,5 или 5,0, приблизительном pH в лизосоме. В определенных вариантах осуществления гидролизуемый линкер представляет собой тиоэфирный линкер (такой как, например, тиоэфир, присоединенный к терапевтическому средству с помощью ацилгидразоновой связи (см., например, патент США № 5622929).
В еще нескольких других вариантах осуществления линкер расщепляется в восстанавливающих условиях (например, дисульфидный линкер). Из уровня техники известен ряд дисульфидных линкеров, в том числе, например, те, которые могут образовываться с применением SATA (N-сукцинимидил-5ацетилтиоацетата), SPDP (N-сущинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионата), SPDB Щ-сукцинимидил-3(2-пиридилдитио)бутирата) и SMPT (N-сукцинимидилоксикарбонил-альфа-метил-альфа-(2пиридилдитио)толуола)-, SPDB и SMPT (см., например, Thorpe et al., 1987, Cancer Res., 47:5924-5931; Wawrzynczak et al., в Immunoconjugates: Antibody Conjugates in Radioimagery and Therapy of Cancer (C.W. Vogel ed., Oxford U. Press, 1987). См. также патент США № 4880935).
В других вариантах осуществления линкер представляет собой малонатный линкер (Johnson et al., 1995, Anticancer Res., 15:1387-93), малеимидобензоильный линкер (Lau et al., 1995, Bioorg-Med-Chem. 3(10):1299-1304) или 3'-N-αмuдный аналог (Lau et al., 1995, Bioorg-Med-Chem., 3(10):1305-12).
В еще нескольких других вариантах осуществления линкерная структурная единица не является расщепляемой и лекарственное средство высвобождается посредством разрушения антител (См. публикацию заявки на патент США № 2005/0238649, включенную в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте и во всех отношениях).
Во многих вариантах осуществления линкер является саморасщепляющимся. Используемый в данном документе термин саморасщепляющийся спейсер относится к бифункциональной химической функциональной части, способной к ковалентному соединению двух разнесенных химических функциональных частей в стабильную молекулу из трех частей. Она будет самопроизвольно отделяться от второй химической функциональной части при расщеплении его связи с первым компонентом. См., например, WO 2007/059404A2, WO 06/110476A2, WO 05/112919A2, WO 2010/062171, WO 09/017394, WO 07/089149, WO 07/018431, WO 04/043493 и WO 02/083180, которые относятся к конъюгатам лекарственное средство-расщепляемый субстрат, где лекарственное средство и расщепляемый субстрат необязательно связаны с помощью саморасщепляющегося линкера, и все из которых явным образом включены посредством ссылки.
Линкер часто является практически нечувствительным к действию внеклеточной среды. Как используется в данном документе, практически нечувствительный к действию внеклеточной среды применительно к линкеру означает, что в образце соединения-конъюгата антитело-лекарственное средство расщепляется не более чем приблизительно 20, 15, 10, 5, 3% или не более чем приблизительно 1% линкеров, если соединение-конъюгат антитело-лекарственное средство присутствует во внеклеточной среде (например, в плазме крови).
То, является ли линкер практически нечувствительным к действию внеклеточной среды, можно определить, например, путем инкубирования соединения-конъюгата антитело-лекарственное средство с плазмой крови в течение предварительно определенного периода времени (например, 2, 4, 8, 16 или 24 ч) и последующей количественной оценки количества свободного лекарственного средства, присутствующего в плазме крови.
В других невзаимоисключающих вариантах осуществления линкер способствует клеточной интернализации. В определенных вариантах осуществления линкер способствует клеточной интернализации, будучи конъюгированным с терапевтическим средством (иными словами, в среде функциональной части линкер-терапевтическое средство соединения-конъюгата антитело-лекарственное средство, описанного в
- 23 042216 данном документе). В еще нескольких вариантах осуществления линкер способствует клеточной интернализации, будучи конъюгированным как с ауристатиновым соединением, так и с антителами к LY75 по настоящему изобретению.
Ряд иллюстративных линкеров, которые можно применять в композициях и способах по настоящему изобретению, описан в WO 2004/010957, публикации заявки на патент США № 2006/0074008, публикации заявки на патент США № 20050238649 и публикации заявки на патент США № 2006/0024317 (каждая из которых включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте и во всех отношениях). Предпочтительно линкер представляет собой SPDB (К-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)бутират).
Нагрузка лекарственным средством представлена в виде p и является средним количеством функциональных частей, представляющих собой лекарственные средства, на антитело в молекуле. Нагрузка лекарственным средством (p) может составлять 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или больше функциональных частей (D) на антитело, хотя часто среднее количество является дробным числом или десятичной дробью. Обычно нагрузка лекарственным средством от 1 до 4 является часто применяемой и от 1 до 2 также является применяемой. ADC по настоящему изобретению включают группы антител, конъюгированных с рядом компонентов-лекарственных средств в количестве от 1 до 20, например 1-15, 1-10, 2-9, 3-8, 4-7, 5-6. Среднее количество функциональных частей, представляющих собой лекарственные средства, на антитело в препаратах ADC, полученных в результате реакций конъюгирования, можно охарактеризовать с помощью традиционных способов, таких как масс-спектроскопия и анализ ELISA.
Также можно определить количественное распределение ADC по p. В некоторых случаях отделение, очистка однородных ADC, где p представляет собой определенное значение, от ADC с другой нагрузкой лекарственным средством и установление их характеристик можно осуществлять с помощью таких способов, как электрофорез.
Для некоторых конъюгатов антитело-лекарственное средство p может быть ограничено количеством участков присоединения в антителе. Например, если присоединение происходит по тиольной группе цистеина, как в вышеописанных иллюстративных вариантах осуществления, антитело может иметь только одну или несколько тиольных групп цистеина или может иметь только одну или несколько достаточно реакционноспособных тиольных групп, посредством которых может быть присоединен линкер. В определенных вариантах осуществления более высокая нагрузка лекарственным средством, например p>5, может вызывать агрегацию, нерастворимость, токсичность определенных конъюгатов антителолекарственное средство или утрату клеточной проницаемости для них. В определенных вариантах осуществления нагрузка лекарственным средством для ADC по настоящему изобретению варьируется в диапазоне от 1 до приблизительно 8; от приблизительно 2 до приблизительно 6; от приблизительно 3 до приблизительно 5; от приблизительно 3 до приблизительно 4; от приблизительно 3,1 до приблизительно 3,9; от приблизительно 3,2 до приблизительно 3,8; от приблизительно 3,2 до приблизительно 3,7; от приблизительно 3,2 до приблизительно 3,6; от приблизительно 3,3 до приблизительно 3,8 или от приблизительно 3,3 до приблизительно 3,7. В действительности было показано, что для определенных ADC оптимальный показатель количества функциональных частей, представляющих собой лекарственные средства, на антитело может составлять менее 8 и может составлять от приблизительно 2 до приблизительно 5. См. US 2005/0238649 A1 (включенный в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте).
В определенных вариантах осуществления в ходе реакции конъюгирования с антителом конъюгируют функциональные части, представляющие собой лекарственные средства, в количестве, меньшем, чем теоретический максимум. Антитело может содержать, например, лизиновые остатки, не реагирующие с промежуточным соединением лекарственное средство-линкер или линкерным реагентом, как обсуждается ниже. Антитела обычно содержат немного свободных и реакционноспособных тиольных групп цистеина, которые могут быть связаны с компонентом-лекарственным средством; в действительности большинство тиольных групп цистеиновых остатков в антителах существуют в качестве дисульфидных мостиков. В определенных вариантах осуществления антитело можно восстановить с помощью восстановителя, такого как дитиотреитол (DTT) или трикарбонилэтилфосфин (ТСЕР), в условиях частичного или полного восстановления с образованием реакционноспособных тиольных групп цистеина. В определенных вариантах осуществления антитело подвергают воздействию денатурирующих условий с выявлением реакционноспособных нуклеофильных групп, таких как в лизине или цистеине.
Нагрузку (соотношение лекарственное средство/антитело) в ADC можно регулировать различными способами, например, путем (i) ограничения молярного избытка промежуточного соединения лекарственное средство-линкер или линкерного реагента по сравнению с антителом;
(ii) ограничения продолжительности или температуры реакции конъюгирования;
(iii) применения условий частичного или ограниченного восстановления для модификации тиольных групп цистеина;
(iv) конструирования с помощью рекомбинантных методик аминокислотной последовательности антитела таким образом, чтобы модифицировать количество и положение цистеиновых остатков для регулирования количества и/или положения присоединяемых компонентов линкер-лекарственное средство
- 24 042216 (как, например, в случае тио-Mab или тио-Fab, получаемых согласно раскрытому в данном документе и в
WO 2006/034488 (включенной в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте)).
Следует понимать, что в случае если более чем одна нуклеофильная группа реагирует с промежуточным соединением лекарственное средство-линкер или линкерным реагентом, а затем с реагентом функциональной частью, представляющей собой лекарственное средство, то получаемый продукт представляет собой смесь соединений ADC с распределением одной или более функциональных частей, представляющих собой лекарственные средства, присоединенных к антителу. В смеси можно рассчитать среднее количество лекарственных средств на антитело с помощью двойного анализа антител ELISA, специфичного для антитела и специфичного для лекарственного средства. Отдельные молекулы ADC можно идентифицировать в смеси с помощью масс-спектроскопии и разделить с помощью HPLC, например хроматографии гидрофобных взаимодействий.
В некоторых вариантах осуществления однородный ADC с единственным значением нагрузки можно выделить из смеси конъюгатов с помощью электрофореза или хроматографии.
Способы определения цитотоксического эффекта ADC.
Известны способы определения того, вызывает ли лекарственное средство или конъюгат антителолекарственное средство цитостатический и/или цитотоксический эффект в отношении клетки. Как правило, цитотоксическую или цитостатическую активность конъюгата антитело-лекарственное средство можно измерить путем воздействия на клетки млекопитающих, экспрессирующих белок-мишень, конъюгата антитело-лекарственное средство в среде для культуры клеток; культивирования клеток в течение периода от приблизительно 6 ч до приблизительно 5 дней и измерения жизнеспособности клеток. Клеточные анализы in vitro можно применять для измерения жизнеспособности (пролиферации), цитотоксичности и индукции апоптоза (активации каспаз) конъюгатом антитело-лекарственное средство.
Для определения того, вызывает ли конъюгат антитело-лекарственное средство цитостатический эффект, можно применять анализ включения тимидина. Например, раковые клетки, экспрессирующие антиген-мишень при плотности 5000 клеток/лунка в 96-луночных планшетах, можно культивировать в течение периода 72 ч и подвергать воздействию 0,5 мкКи 3H-тимидина в течение последних 8 ч 72-часового периода. Включение 3H-тимидина в клетки культуры измеряют в присутствии и в отсутствие конъюгата антитело-лекарственное средство.
Для определения цитотоксичности можно измерять некроз или апоптоз (запрограммированную гибель клеток). Некроз обычно сопровождается повышением проницаемости плазматической мембраны; отеком клетки и разрывом плазматической мембраны. Апоптоз обычно характеризуется пузырением мембраны, конденсацией цитоплазмы и активацией эндогенных эндонуклеаз. Определение любого из этих эффектов в отношении раковых клеток указывает на то, что конъюгат антитело-лекарственное средство является применимым в лечении форм рака.
Жизнеспособность клеток можно измерить путем определения в клетке поглощения красителя, такого как нейтральный красный, трипановый синий или ALAMAR™ синий (см., например, Page et al., 1993, Intl. J. Oncology, 3:473-476). В таком анализе клетки инкубируют в среде, содержащей краситель, клетки промывают, и оставшийся краситель, отражающий поглощение клетками красителя, измеряют спектрофотометрически. Связывающийся с белками краситель сульфородамин B (SRB) также можно применять для измерения цитотоксичности (Skehan et al., 1990, J. Natl. Cancer Inst., 82:1107-12).
В альтернативном случае соль тетразолия, такую как MTT, применяют в количественном колориметрическом анализе выживания и пролиферации клеток млекопитающих путем определения живых, но не мертвых клеток (см., например, Mosmann, 1983, J. Immunol. Methods, 65:55-63).
Апоптоз можно оценить количественно путем измерения, например, фрагментации ДНК. Доступны коммерческие фотометрические способы количественного определения фрагментации ДНК in vitro. Примеры таких анализов, в том числе TUNEL (в котором выявляют включение меченых нуклеотидов во фрагментированную ДНК) и анализы на основе ELISA, описаны в Biochemica, 1999, № 2, p. 34-37 (Roche Molecular Biochemicals).
Апоптоз также можно определить путем измерения морфологических изменений в клетке. Например, как и в случае некроза, утрату целостности плазматической мембраны можно определить путем измерения поглощения определенных красителей (например, флуоресцентного красителя, такого как, например, акридиновый оранжевый или бромид этидия). Способ измерения количества апоптозных клеток был описан в Duke and Cohen, Current Protocols in Immunology (Coligan et al., eds., 1992, p. 3.17.1-3.17.16). Также можно метить клетки красителем для ДНК (например, акридиновым оранжевым, бромидом этидия или йодидом пропидия) и наблюдать в клетках конденсацию хроматина и его краевое расположение вдоль внутренней ядерной мембраны. Другие морфологические изменения, которые можно измерить для определения апоптоза, включают, например, конденсацию цитоплазмы, повышенное пузырение мембраны и сжатие клетки.
Наличие апоптозных клеток можно измерить как в закрепленном, так и в плавающем компартментах культур. Например, оба компартмента можно собрать путем удаления надосадочной жидкости, трипсинизации закрепленных клеток, объединения препаратов после этапа промывки путем центрифугирования (например, в течение 10 мин при 2000 об/мин) и выявления апоптоза (например, путем измере- 25 042216 ния фрагментации ДНК) (см., например, Piazza et al., 1995, Cancer Research, 55:3110-16).
Эффект терапевтической композиции антитела к LY75 по настоящему изобретению in vivo можно оценить в подходящей животной модели. Например, можно применять ксеногенные модели рака, где эксплантаты раковых опухолей или пассированные ксенотрансплантатные ткани вводят животным с ослабленным иммунитетом, таким как голые или имеющие SCID мыши (Klein et al., 1997, Nature Medicine, 3:402-408). Эффективность можно измерять с помощью анализов, в которых измеряют ингибирование образования опухоли, регрессии опухоли или метастазирования и т.п.
Терапевтические композиции, применяемые в практическом осуществлении вышеописанных способов, можно составлять в фармацевтические композиции, содержащие носитель, подходящий для желаемого способа доставки. Подходящие носители включают любой материал, который при объединении с терапевтической композицией сохраняет противоопухолевую функцию терапевтической композиции и на который обычно не реагирует иммунная система пациента. Примеры включают без ограничений любой из множества стандартных фармацевтических носителей, таких как стерильные фосфатно-солевые буферные растворы, бактериостатическая вода и т.п. (см. в общем плане Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, A. Osal., ed., 1980).
Способы получения антител.
Антитела, раскрытые в данном документе, могут быть получены с помощью любого подходящего способа. Такие способы включают культивирование клетки-хозяина, содержащей выделенную(ые) нуклеиновую(ые) кислоту(ы), кодирующие антитела. Как будет понятно специалистам в данной области, это можно выполнять рядом способов в зависимости от природы антитела. В случае когда антитела представляют собой традиционные антитела полной длины, например, вариабельная область тяжелой цепи и вариабельная область легкой цепи находятся в таких условиях, что антитело образуется и может быть выделено.
Вариабельные области тяжелых и легких цепей LY75_A1 раскрыты в данном документе (последовательности как белка, так и нуклеиновой кислоты); как будет понятно в данной области, их можно легко увеличить с получением тяжелых и легких цепей полной длины. Иными словами, при наличии фрагментов ДНК, кодирующих VH- и VK-сегменты, вкратце описанные в данном документе, эти фрагменты ДНК можно подвергнуть дополнительным манипуляциям с помощью стандартных методик рекомбинантных ДНК, например, для превращения генов вариабельных областей в гены цепей антител полной длины, в гены Fab-фрагментов или в ген scFv. В ходе этих манипуляций образуют функциональную связь фрагмента ДНК, кодирующего VK или VH, с другим фрагментом ДНК, кодирующим другой белок, такой как константная область антитела или гибкий линкер. Термин функционально связанный, применяемый в данном контексте, подразумевается как означающий, что два фрагменты ДНК соединены таким образом, что аминокислотные последовательности, кодируемые двумя фрагментами ДНК, остаются внутри рамки считывания.
Выделенную ДНК, кодирующую VH-область, можно превратить в ген тяжелой цепи полной длины путем образования функциональной связи ДНК, кодирующей VH, с другой молекулой ДНК, кодирующей константные области тяжелой цепи (CH1, CH2 и CH3). Последовательности генов мышиных константных областей тяжелых цепей известны из уровня техники [см., например, Kabat, E.A. et al. (1991), Sequences of Proteins of Immunological Interest, fifth edition, US Department of Health and Human Services, NIH Publication, № 91-3242], и фрагменты ДНК, охватывающие эти области, можно получить путем стандартной ППР-амплификации. Константная область тяжелой цепи может представлять собой константную область IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA, IgE, IgM или IgD, но наиболее предпочтительно представляет собой константную область IgG1 или IgG4. В случае гена тяжелой цепи Fab-фрагмента можно образовать функциональную связь ДНК, кодирующей VH, с другой молекулой ДНК, кодирующей только константную область CH1 тяжелой цепи.
Выделенную ДНК, кодирующую VL/VK-область, можно превратить в ген легкой цепи полной длины (а также ген легкой цепи Fab) путем образования функциональной связи ДНК, кодирующей VL, с другой молекулой ДНК, кодирующей константную область легкой цепи CL. Последовательности генов мышиных константных областей легких цепей известны из уровня техники [см., например, Kabat, E.A. et al. (1991), Sequences of Proteins of Immunological Interest, fifth edition, US Department of Health and Human Services, NIH Publication, № 91-3242], и фрагменты ДНК, охватывающие эти области, можно получить путем стандартной ППР-амплификации. В предпочтительных вариантах осуществления константная область легкой цепи может представлять собой константную область каппа- или лямбда-цепи.
Для получения гена scFv образуют функциональную связь фрагментов ДНК, кодирующих VH- и VL/VK, с другим фрагментом, кодирующим гибкий линкер, например кодирующим аминокислотную последовательность (Gly4-Ser)3, так что последовательности VH и VL/VK могут экспрессироваться в виде непрерывного одноцепочечного белка, при этом VL/VK и VH-области соединены гибким линкером [см., например, Bird et al. (1988), Science, 242:423-426; Huston et al. (1988), Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 85:5879-5883; McCafferty et al. (1990), Nature, 348:552-554].
Представлены нуклеиновые кислоты, кодирующие антитела, раскрытые в данном документе. Такие полинуклеотиды кодируют как вариабельные, так и константные области каждой из тяжелой и легкой
- 26 042216 цепей, хотя другие комбинации также предусмотрены в соответствии с композициями, описанными в данном документе.
Полинуклеотиды могут находиться в форме РНК или ДНК. Полинуклеотиды в форме ДНК, кДНК, геномной ДНК, аналогов нуклеиновых кислот и синтетических ДНК также являются применимыми. ДНК может быть двухнитевой или однонитевой, и в случае однонитевой может представлять собой кодирующую (смысловую) нить или некодирующую (антисмысловую) нить. Кодирующая последовательность, которая кодирует полипептид, может быть идентична кодирующей последовательности, представленной в данном документе, или может быть другой кодирующей последовательностью, при этом данная последовательность вследствие избыточности или вырожденности генетического кода кодирует те же полипептиды, что и ДНК, представленная в данном документе.
В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая(ые) кислота(ы), кодирующие антитела, раскрытые в данном документе, включены в состав векторов экспрессии, которые могут быть внехромосомными или предназначенными для интеграции в геном клетки-хозяина, в которую их вводят. Векторы экспрессии могут содержать любое количество соответствующих регуляторных последовательностей (в том числе без ограничений последовательности для контроля транскрипции и трансляции, промоторы, сайты связывания рибосомы, энхансеры, точки начала репликации и т.п.) или другие компоненты (селектируемые гены и т.п.), все из которых функционально связаны, как хорошо известно из уровня техники. В некоторых случаях применяют две нуклеиновые кислоты и каждую помещают в отдельный вектор экспрессии (например, тяжелую цепь в первый вектор экспрессии, легкую цепь во второй вектор экспрессии), или в альтернативном случае их можно поместить в один и тот же вектор экспрессии. Специалистам в данной области будет понятно, что конструкция вектора(ов) экспрессии, в том числе выбор регуляторных последовательностей, может зависеть от таких факторов, как выбор клетки-хозяина, желаемый уровень экспрессии белка и т.п.
Нуклеиновые кислоты и/или системы экспрессии обычно можно вводить в подходящую клеткухозяина с получением рекомбинантной клетки-хозяина с помощью любого способа, подходящего для выбранной клетки-хозяина (например, трансформации, трансфекции, электропорации, инфицирования), таким образом, что молекула(молекулы) нуклеиновой кислоты функционально связаны с одним или более элементами контроля экспрессии (например, в векторе, в конструкции, полученной с помощью процессов в клетке, интегрированной в геном клетки-хозяина). Полученную в результате рекомбинантную клетку-хозяина можно выдерживать в условиях, подходящих для экспрессии (например, в присутствии индуктора, в подходящем отличном от человека животном, в подходящей культуральной среде, дополненной надлежащими солями, факторами роста, антибиотиками, пищевыми добавками и т.п.), в результате чего образуются кодируемый(ые) полипептид(ы). В некоторых случаях тяжелые цепи образуются в одной клетке, а легкие цепи в другой.
Линии клеток млекопитающих, доступных в качестве хозяев для экспрессии, известны из уровня техники и включают большое количество иммортализованных линий клеток, доступных из Американской коллекции типовых культур (ATCC), Манассас, Виргиния, в том числе без ограничений клетки яичника китайского хомячка (CHO), клетки HEK 293, клетки NSO, клетки HeLa, клетки почки новорожденного хомяка (BHK), клетки почки обезьяны (COS), клетки гепатоцеллюлярной карциномы человека (например, Hep G2) и множество других линий клеток. Клетки, отличные от клеток млекопитающих, в том числе без ограничений клетки бактерий, дрожжей, насекомых и растений, также можно применять для экспрессии рекомбинантных антител. В некоторых вариантах осуществления антитела можно получать в трансгенных животных, таких как коровы или куры.
Общие способы молекулярной биологии, экспрессии, очистки и скрининга антител хорошо известны, см., например, патенты США № 4816567, 4816397, 6331415 и 7923221, а также Antibody Engineering под редакцией Kontermann & Dubel, Springer, Heidelberg, 2001 и 2010 Hayhurst & Georgiou, 2001, Curr. Opin. Chem. Biol., 5:683-689; Maynard & Georgiou, 2000, Annu. Rev. Biomed. Eng., 2:339-76; и Morrison, S. (1985), Science, 229:1202.
В дополнительном варианте осуществления настоящего изобретения компонент (B) фармацевтической комбинации представляет собой ибрутиниб или его фармацевтически приемлемую соль. Ибрутиниб (Imbravica®) представляет собой низкомолекулярное лекарственное средство, которое перманентно связывается с тирозинкиназой Брутона (BTK). Он ранее применялся для лечения B-клеточных форм рака, таких как мантийноклеточная лимфома, хронический лимфоцитарный лейкоз и макроглобулинемия Вальденстрема (форма неходжкинской лимфомы). Структурная и химическая формулы ибрутиниба представлены ниже:
(R)-1 -(3-(4-амино-3-(4-феноксифенил)-1 H-пиразоло[3,4-d]пиримидин-1 -ил)пиперидин-1 -ил)проп-2ен-1-он.
- 27 042216
Ибрутиниб продается под торговым наименованием Imbravica®. Он доступен от Pharmacyclics, Inc. (США).
Фармацевтические композиции.
Фармацевтическая комбинация по настоящему изобретению находится в форме комбинированного препарата для одновременного, раздельного или последовательного применения. Аналогично в рамках способов по настоящему изобретению компоненты (A) и (B) фармацевтической комбинации можно вводить пациенту одновременно, раздельно или последовательно.
Термин комбинированный препарат включает как фиксированные комбинации, так и нефиксированные комбинации.
Термин фиксированная комбинация означает, что активные ингредиенты (например, компоненты (A) и (B)) находятся в форме единого средства или дозы. Другими словами, активные ингредиенты присутствуют в единой композиции или составе.
Термин нефиксированная комбинация означает, что активные ингредиенты (например, компоненты (A) и (B)), присутствуют в разных средствах или дозах (например, в виде отдельных композиций или составов), например, в виде набора из частей. Независимые компоненты (A) и (B) (в их желаемых композициях или составах) можно затем вводить раздельно или последовательно в один и тот же момент времени или в различные моменты времени.
В случае когда введение осуществляют последовательно, задержка введения второго компонента не должна быть такой, при которой теряется благоприятный эффект, получаемый вследствие применения комбинации. Следовательно, в одном варианте осуществления последовательное лечение включает введение каждого компонента комбинации в течение периода 11 дней. В другом варианте осуществления данный период составляет 10 дней. В другом варианте осуществления данный период составляет 9 дней. В другом варианте осуществления данный период составляет 8 дней. В другом варианте осуществления данный период составляет 7 дней. В другом варианте осуществления данный период составляет 6 дней. В другом варианте осуществления данный период составляет 5 дней. В другом варианте осуществления данный период составляет 4 дня. В другом варианте осуществления данный период составляет 3 дня. В другом варианте осуществления данный период составляет 2 дня. В другом варианте осуществления данный период составляет 24 ч. В другом варианте осуществления данный период составляет 12 ч.
Компоненты (A) и (B) можно вводить в любом порядке, например вначале компонент (A), а затем компонент (B); или вначале компонент (B), а затем компонент (A).
Соотношение общих количеств компонента (A) и компонента (B), подлежащих введению в комбинированном препарате, может варьироваться, например, с целью удовлетворения потребностей субпопуляции пациентов, подлежащих лечению, или потребностей одного пациента, при этом различные потребности пациентов могут быть обусловлены их возрастом, полом, массой тела и т.д.
Компоненты (A) и (B), присутствующие в одной композиции или в отдельных композициях, могут быть независимо составлены с одним или более фармацевтически приемлемыми носителями. Фармацевтические комбинации по настоящему изобретению также могут содержать по меньшей мере одно другое противоопухолевое средство или противовоспалительное или иммунодепрессивное средство. Примеры терапевтических средств, которые можно применять в комбинированной терапии, более подробно описаны ниже в разделе, посвященном путям применения антител, раскрытых в данном документе.
Как используется в данном документе, фармацевтически приемлемый носитель включает любые возможные растворители, дисперсионные среды, покрытия, антибактериальные и противогрибковые средства, изотонические и замедляющие всасывание средства и т.п., которые являются физиологически совместимыми. Носитель предпочтительно подходит для внутривенного, внутримышечного, подкожного, парентерального, спинального или эпидермального введения (например, путем инъекции или инфузии). В зависимости от пути введения активное соединение, т.е. антитело, иммуноконъюгат или биспецифическая молекула, могут быть покрыты материалом для защиты соединения от действия кислот и других естественных условий, которые могут инактивировать соединение.
Компоненты (A) и/или (B) могут быть в форме одной или более фармацевтически приемлемых солей. Фармацевтически приемлемая соль относится к соли, которая сохраняет необходимую биологическую активность исходного соединения и не вызывает никаких нежелательных токсических эффектов [см., например, Berge, S.M. et al. (1977), J. Pharm. Sci., 66:1-19]. Примеры таких солей включают соли присоединения кислоты и соли присоединения основания. Соли присоединения кислоты включают соли, полученные из нетоксичных неорганических кислот, таких как хлористоводородная, азотная, фосфорная,
- 28 042216 серная, бромистоводородная, йодистоводородная, фосфористая и т.п., а также из нетоксичных органических кислот, таких как алифатические моно- и дикарбоновые кислоты, фенилзамещенные алкановые кислоты, гидроксиалкановые кислоты, ароматические кислоты, алифатические и ароматические сульфоновые кислоты и т.п. Соли присоединения основания включают соли, полученные из щелочноземельных металлов, таких как натрий, калий, магний, кальций и т.п., а также из нетоксичных органических аминов, таких как N,N'-дибензилэтилендиамин, N-метилглюкамин, хлорпрокаин, холин, диэтаноламин, этилендиамин, прокаин и т.п.
Фармацевтическая комбинация по настоящему изобретению или ее часть также могут содержать фармацевтически приемлемый антиоксидант. Примеры фармацевтически приемлемых антиоксидантов включают (1) водорастворимые антиоксиданты, такие как аскорбиновая кислота, гидрохлорид цистеина, бисульфат натрия, метабисульфит натрия, сульфит натрия и т.п.;
(2) жирорастворимые антиоксиданты, такие как аскорбилпальмитат, бутилированный гидроксианизол (BHA), бутилированный гидрокситолуол (BHT), лецитин, пропилгаллат, альфа-токоферол и т.п.; и (3) средства, хелатирующие металлы, такие как лимонная кислота, этилендиаминтетрауксусная кислота (EDTA), сорбит, винная кислота, фосфорная кислота и т.п.
Примеры подходящих водных и неводных носителей, которые можно использовать в фармацевтических комбинациях по настоящему изобретению, включают воду, этанол, полиолы (такие как глицерин, пропиленгликоль, полиэтиленгликоль и т.п.) и их подходящие смеси, растительные масла, такие как оливковое масло, и инъекционные органические сложные эфиры, такие как этилолеат. Надлежащую текучесть можно поддерживать, например, путем применения материалов покрытия, таких как лецитин, путем поддержания требуемого размера частиц в случае дисперсий и путем применения поверхностноактивных веществ.
Эти комбинации или их части могут также содержать вспомогательные средства, такие как консерванты, смачивающие средства, эмульгаторы и диспергаторы. Недопущение наличия микроорганизмов можно обеспечивать как с помощью процедур стерилизации, описанных выше, так и путем включения различных антибактериальных и противогрибковых средств, например парабена, хлорбутанола, фенола, сорбиновой кислоты и т.п. Также может быть желательным включение в композиции изотонических средств, таких как сахара, хлорид натрия и т.п. В дополнение пролонгированного всасывания инъекционной фармацевтической формы можно добиться путем включения средств, замедляющих всасывание, таких как моностеарат алюминия и желатин.
Фармацевтически приемлемые носители включают стерильные водные растворы или дисперсии и стерильные порошки для получения стерильных инъекционных растворов или дисперсий для немедленного приема. Применение таких сред и средств для фармацевтически активных веществ известно из уровня техники. За исключением случаев, когда какие-либо традиционные среда или средство несовместимы с активным соединением, предусматривается их применение в фармацевтических композициях по настоящему изобретению. В состав композиций также могут быть включены дополнительные активные соединения.
Терапевтические композиции, как правило, должны быть стерильными и стабильными в условиях производства и хранения. Композицию можно составлять в виде раствора, микроэмульсии, липосомы или другой упорядоченной структуры, подходящей для высокой концентрации лекарственного средства. Носитель может представлять собой растворитель или дисперсионную среду, содержащую, например, воду, этанол, полиол (например, глицерин, пропиленгликоль и жидкий полиэтиленгликоль и т.п.) и их подходящие смеси. Надлежащую текучесть можно поддерживать, например, путем применения покрытия, такого как лецитин, путем поддержания требуемого размера частиц в случае дисперсии и путем применения поверхностно-активных веществ. Во многих случаях будет предпочтительным включение в композицию изотонических средств, например сахаров, многоатомных спиртов, таких как маннит, сорбит, или хлорида натрия. Пролонгированного всасывания инъекционных композиций можно добиться путем включения в композицию средства, замедляющего всасывание, например, моностеаратных солей и желатина.
Стерильные инъекционные растворы можно получить путем включения активного соединения в необходимом количестве в соответствующем растворителе с одним или комбинацией из ингредиентов, перечисленных выше, при необходимости с последующей стерилизующей микрофильтрацией. Дисперсии, как правило, получают путем включения активного соединения в стерильный наполнитель, который содержит основную дисперсионную среду и другие необходимые ингредиенты из перечисленных выше. В случае стерильных порошков для получения стерильных инъекционных растворов предпочтительными способами получения являются вакуумная сушка и сублимационная сушка (лиофилизация), с помощью которых получают порошковую форму активного ингредиента, а также любого дополнительного желаемого ингредиента из их раствора, ранее подвергнутого стерилизующей фильтрации.
Количество активного ингредиента, которое можно объединить с материалом носителя с получением единичной лекарственной формы, будет варьироваться в зависимости от субъекта, подвергаемого лечению, и конкретного способа введения. Количество активного ингредиента, которое можно объеди
- 29 042216 нить с материалом носителя с получением единичной лекарственной формы, как правило, будет представлять собой такое количество композиции, которое вызывает терапевтический эффект. Из 100% это количество обычно будет варьироваться в диапазоне от приблизительно 0,01% до приблизительно 99% активного ингредиента, предпочтительно от приблизительно 0,1% до приблизительно 70%, наиболее предпочтительно от приблизительно 1% до приблизительно 30% активного ингредиента в комбинации с фармацевтически приемлемым носителем.
Режимы дозирования корректируют для получения оптимального желаемого ответа (например, синергическая комбинация, терапевтический ответ). Например, можно вводить однократную болюсную дозу, можно вводить несколько разделенных доз в течение некоторого времени или дозу можно пропорционально понизить или повысить, на что указывают потребности терапевтической ситуации. Особенно преимущественным является составление парентеральных композиций в стандартной лекарственной форме для простоты введения и равномерности дозирования. Стандартная лекарственная форма, как используется в данном документе, относится к физически дискретным единицам, подходящим в качестве одноразовых доз для субъектов, подлежащих лечению; каждая единица содержит предварительно определенное количество активного соединения, рассчитанное для получения желаемого терапевтического эффекта, совместно с необходимым фармацевтическим носителем. Технические требования к стандартным лекарственным формам по настоящему изобретению обусловлены (a) уникальными характеристиками активного соединения и конкретным терапевтическим эффектом, которого следует достичь, и (b) присущими ограничениями в области приготовления такого активного соединения в отношении лечения индивидуумов с чувствительностью, и непосредственно зависят от них.
Для введения антитела к LY75 или антитела к CD20 доза варьируется в диапазоне от приблизительно 0,0001 до 100 мг/кг, например от 0,001 до 50 мг/кг, от 0,005 до 20 мг/кг, от 0,01 до 10 мг/кг и чаще от 0,01 до 5 мг/кг массы тела получающего ее пациента. Например, дозы могут составлять 0,05 мг/кг массы тела, 0,1 мг/кг массы тела, 0,3 мг/кг массы тела, 0,3 мг/кг массы тела, 0,5 мг/кг массы тела, 1 мг/кг массы тела, 2 мг/кг массы тела, 3 мг/кг массы тела, 4 мг/кг массы тела, 5 мг/кг массы тела, 6 мг/кг массы тела, 7 мг/кг массы тела, 8 мг/кг массы тела, 9 мг/кг массы тела, 10 мг/кг массы тела, 12 мг/кг массы тела, 15 мг/кг массы тела, 20 мг/кг массы тела, 25 мг/кг массы тела, 30 мг/кг массы тела или находиться в диапазоне 0,1-20, 0,5-15, 1-10, 2-8, 3-7, 4-6 мг/кг. Иллюстративный режим лечения включает введение один раз в день, один раз в два дня, один раз в неделю, один раз в две недели, один раз в три недели, один раз в четыре недели, один раз в месяц, один раз в шесть недель, один раз в три месяца или один раз в тришесть месяцев. Предпочтительные режимы дозирования антитела к LY75 по настоящему изобретению включают 1 мг/кг массы тела или 3 мг/кг массы тела посредством внутривенного введения, при этом антитело принимают с использованием одной из следующих схем дозирования:
(i) каждые четыре недели в количестве шести доз, затем каждые три месяца;
(ii) каждые три недели;
(iii) 3 мг/кг массы тела однократно, а затем 1 мг/кг массы тела каждые три недели.
В некоторых вариантах осуществления дозу антитела к LY75 (например, LY75-DM4) корректируют для достижения концентрации антитела в плазме крови, составляющей от 0,01 до 1,5 нМ или от 0,018 до 1,2 нМ (например, приблизительно 0,018, 0,037, 0,075, 0,15, 0,3, 0,6 или 1,2 нМ). Предпочтительно дозу антитела к LY75 корректируют для достижения концентрации антитела в плазме крови, составляющей от 0,03 до 0,30 нМ.
В некоторых вариантах осуществления антитело к CD20 составляют в растворе с концентрацией 10 мг/мл. В некоторых вариантах осуществления антитело к CD20 вводят внутривенно в дозе, составляющей 350-400 мг/м2, предпочтительно один раз в неделю. В некоторых вариантах осуществления дозу антитела к CD20 (например, ритуксимаба) корректируют для достижения концентрации антитела в плазме крови, составляющей от приблизительно 2,34 до 150 нМ (например, приблизительно 2,34, 4,68, 9,37, 18,75, 37,5, 75 или 150 нМ). Антитело к CD20 (например, ритуксимаб) можно вводить подкожно в дозе, составляющей приблизительно 1400 мг/23400 единиц. В некоторых вариантах осуществления доза составляет 200, 400, 600, 800, 1000 или 1200 мг. Антитело к CD20 (например, ритуксимаб) можно вводить с одним или более из циклофосфамида, гидроксидаунорубицина, онковина и преднизона или преднизолона (т.е. в рамках терапии CHOP).
В некоторых вариантах осуществления дозу ибрутиниба корректируют для достижения концентрации в плазме крови, составляющей от приблизительно 15,6 до 1000 нМ (например, приблизительно 15,6, 31,2, 62,5, 125, 250, 500 или 1000 нМ). В других вариантах осуществления дозу ибрутиниба корректируют для достижения концентрации в плазме крови, составляющей от приблизительно 1,56 до 100 нМ (например, приблизительно 1,5, 3,1, 6,2, 12,5, 25, 50 или 100 нМ). Доза ибрутиниба может составлять приблизительно 560 мг (например, четыре капсулы по 140 мг). Ее можно вводить перорально. В некоторых вариантах осуществления доза ибрутиниба составляет приблизительно 100, 200, 300, 400 или 500 мг.
Предпочтительно комбинация компонентов (A) и (B) представляет собой синергическую комбинацию. Специалисту в данной области будет понятно, что синергическая комбинация представляет собой комбинацию, в которой эффект комбинации является большим, чем сумма эффектов ее отдельных компонентов. Синергический эффект может быть определен количественно с применением показателя адди
- 30 042216 тивности Чоу-Талалая (CI) (см. Evaluation of combination chemotherapy: integration of nonlinear regression, curve shift, isobologram, and combination index analyses, Zhao L. et al., Clin Cancer Res. (2004), Dec 1; 10(23):7994-8004; и Computerized quantitation of synergism and antagonism of taxol, topotecan, and cisplatin against human teratocarcinoma cell growth: a rational approach to clinical protocol design, Chou T.C., Motzer R.J., Tong Y., Bosl G.J., J. Natl. Cancer Inst. (1994), Oct 19, 86(20):1517-24). Этот способ с применением показателя аддитивности (CI) основан на уравнении множественного эффекта лекарственного средства, выведенном на основании принципа медианного эффекта закона действующих масс. Он обеспечивает количественное определение сильного синергического эффекта (CI<0,3), синергического эффекта (CI=0,3-0,9), аддитивного эффекта (CI=0,9-1,1) или антагонизма/отсутствия благоприятного эффекта (CI>1,1), и это предоставляет алгоритм для компьютерного программного обеспечения для автоматизированного моделирования комбинаций лекарственных средств. Учитываются как эффективность (значение D(m)), так и форма кривой доза-эффект (значение m) каждого лекарственного средства в отдельности и их комбинации. Показатель аддитивности Чоу-Талалая (CI) можно оценить с применением пакета Synergy R (см. Preclinical versus Clinical Drugs Combination Studies, Chou T.C., Leuk. Lymphoma. (2008), 49(11):2059-2080, и источники в нем, все из которых конкретно включены в данный документ посредством ссылки). CI комбинации может быть исследован в подходящей линии клеток, например в линии клеток ABC-DLBLC (такой как TMD8 или HBL1), например в условиях, используемых в примере 26.
Предпочтительно фармацевтическая комбинация по настоящему изобретению представляет собой синергическую комбинацию, в которой показатель аддитивности Чоу-Талалая (CI) составляет меньше 0,9, 0,8, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3 или 0,2. Предпочтительно CI составляет 0,1-0,5, 0,1-0,3 или 0,1-0,2.
В частности, представлен способ лечения рака у пациента, включающий одновременное, последовательное или раздельное введение пациенту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективных синергических количеств компонентов (A) и (B) фармацевтической комбинации по настоящему изобретению. Также представлена фармацевтическая комбинация по настоящему изобретению для применения при лечении рака, где синергические количества компонентов (A) и (B) вводят пациенту одновременно, раздельно или последовательно для лечения рака. Предпочтительно количества компонентов (A) и (B) вводят пациенту с целью обеспечить концентрации в плазме крови, раскрытые выше.
Также представлено применение синергических количеств компонентов (A) и (B) фармацевтической комбинации по настоящему изобретению в изготовлении фармацевтической комбинации для одновременного, раздельного или последовательного применения для лечения рака. Также представлена синергическая фармацевтическая комбинация по настоящему изобретению для применения в терапии или для применения в качестве лекарственного препарата.
В некоторых способах одновременно вводят два или более моноклональных антитела с различными специфичностями связывания, и в этом случае доза каждого вводимого антитела входит в указанные диапазоны. Антитело обычно вводят несколько раз. Интервалы между приемами отдельных доз могут соответствовать, например, введению один раз в день, два раза в неделю, один раз в неделю, один раз в месяц, каждые три месяца, каждые шесть месяцев или один раз в год. Интервалы также могут быть нерегулярными, на что указывает измерение уровней антитела к антигену-мишени в крови пациента. В некоторых способах дозу корректируют для достижения концентрации антитела в плазме крови, составляющей приблизительно 1-1000, 5-750, 10-600, 15-500, 20-400 мкг/мл и в некоторых способах приблизительно 25-300 мкг/мл.
В качестве альтернативы антитела к LY75 и или антитела к CD20 можно вводить в качестве составов с замедленным высвобождением и в этом случае требуется менее частое введение. Доза и частота варьируются в зависимости от периода полувыведения антитела из организма пациента. Как правило, наиболее длительный период полувыведения демонстрируют антитела человека, за которыми следуют гуманизированные антитела, химерные антитела и антитела, отличные от человеческих. Доза и частота введения может варьироваться в зависимости от того, является ли лечение профилактическим или терапевтическим. В профилактических путях применения относительно низкую дозу вводят с относительно редкими интервалами в течение длительного периода времени. Некоторые пациенты продолжают получать лечение до конца своей жизни. В терапевтических путях применения иногда требуется введение относительно высоких доз с относительно короткими интервалами до уменьшения или прекращения прогрессирования заболевания и предпочтительно до тех пор, пока пациент не продемонстрирует частичного или полного уменьшения интенсивности проявления симптомов заболевания. После этого в отношении пациента можно применять профилактический режим.
Фактические уровни доз активных ингредиентов в фармацевтических комбинациях по настоящему изобретению можно варьировать для того, чтобы получить количество активного ингредиента, эффективное для достижения необходимого терапевтического ответа для конкретных пациента, композиции и способа введения без токсичности для пациента. Выбранный уровень дозы будет зависеть от ряда фармакокинетических факторов, в том числе активности конкретных используемых композиций по настоящему изобретению или их сложного эфира, соли или амида, пути введения, времени введения, скорости экскреции конкретного используемого соединения, продолжительности лечения, других лекарственных
- 31 042216 средств, соединений и/или материалов, применяемых в комбинации с конкретными используемыми композициями, возраста, пола, массы тела, состояния, общего состояния здоровья и анамнеза пациента, подвергаемого лечению, и подобных факторов, хорошо известных в области медицины.
Терапевтически эффективная доза антитела к LY75 или антитела к CD20 предпочтительно приводит к уменьшению тяжести симптомов заболевания, увеличению частоты и продолжительности бессимптомных периодов заболевания или предупреждению ухудшения состояния или потери трудоспособности в связи с поражением заболеванием. Например, для лечения опухолей, опосредованных LY75 или CD20, терапевтически эффективная доза предпочтительно ингибирует рост клеток или рост опухоли на по меньшей мере приблизительно 20%, на по меньшей мере приблизительно 30%, более предпочтительно на по меньшей мере приблизительно 40%, на по меньшей мере приблизительно 50%, еще более предпочтительно на по меньшей мере приблизительно 60%, на по меньшей мере приблизительно 70% и даже еще более предпочтительно на по меньшей мере приблизительно 80% или на по меньшей мере приблизительно 90% по сравнению с субъектами, не получающими лечение. Способность соединения к ингибированию роста опухоли можно оценить в животной модельной системе, предсказывающей эффективность в отношении опухолей человека. В альтернативном случае данное свойство композиции можно оценить путем изучения способности соединения к ингибированию роста клеток, при этом такое ингибирование можно измерить in vitro с помощью анализов, известных практикующему специалисту. Терапевтически эффективное количество терапевтического соединения может обеспечивать уменьшение размера опухоли или иным образом уменьшать интенсивность проявления симптомов у субъекта. Средний специалист в данной области будет способен определить такие количества на основании таких факторов, как габариты субъекта, тяжесть симптомов субъекта и конкретная композиция или выбранный путь введения.
Фармацевтическую комбинацию по настоящему изобретению можно вводить посредством одного или более путей введения с помощью одного или более из ряда способов, известных из уровня техники. Компоненты (A) и (B) можно вводить посредством одного того же пути или посредством различных путей. Как будет понятно специалисту в данной области, путь и/или способ введения будут варьироваться в зависимости от желаемых результатов. Предпочтительные пути введения антител по настоящему изобретению включают внутривенный, внутримышечный, внутрикожный, внутрибрюшинный, подкожный, спинальный или другие парентеральные пути введения, например, посредством инъекции или инфузии. Фраза парентеральное введение, используемая в данном документе, означает способы введения, отличные от энтерального и местного введения, обычно посредством инъекции и включает без ограничений внутривенную, внутримышечную, внутриартериальную, интратекальную, внутрикапсулярную, внутриглазничную, внутрисердечную, внутрикожную, внутрибрюшинную, транстрахеальную, подкожную, субкутикулярную, внутрисуставную, субкапсулярную, субарахноидальную, интраспинальную, эпидуральную и внутригрудинную инъекцию и инфузию.
В качестве альтернативы антитело к LY75 или антитело к CD20 можно вводить посредством непарентерального пути, такого как местный, эпидермальный или чресслизистый путь введения, например интраназально, перорально, вагинально, ректально, сублингвально или местно.
Активные соединения можно получать с носителями, которые будут защищать соединение от быстрого высвобождения, как, например, в составе с контролируемым высвобождением, в том числе имплантатах, трансдермальных пластырях и микроинкапсулированных системах доставки. Можно применять биоразлагаемые биосовместимые полимеры, такие как сополимер этилена и винилацетата, полиангидриды, полигликолевая кислота, коллаген, полиортоэфиры и полимолочная кислота. Многие способы получения таких составов запатентованы или общеизвестны специалистам в данной области [см., например, Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems (1978), J.R. Robinson, ed., Marcel Dekker, Inc., N.Y].
Терапевтические композиции можно вводить с помощью медицинских устройств, известных из уровня техники. Например, в предпочтительном варианте осуществления компонент (A) и/или (B) можно вводить с помощью безыгольного устройства для подкожных инъекций, такого как устройства, раскрытые в патентах США № 5399163; 5383851; 5312335; 5064413; 4941880; 4790824 или 4596556. Примеры хорошо известных имплантатов и модулей, применимых в настоящем изобретении, включают имплантируемую микроинфузионную помпу для дозирования лекарства с контролируемой скоростью, раскрытую в патенте США № 4487603; терапевтическое устройство для введения лекарственных препаратов через кожу, раскрытое в патенте США № 4486194; помпу для инфузии лекарства для доставки лекарства с точной скоростью инфузии, раскрытую в патенте США № 4447233; имплантируемый инфузионный прибор с переменным объемом подачи для непрерывной доставки лекарственного средства, раскрытый в патенте США № 4447224; осмотическую систему доставки лекарственных средств, имеющую многокамерные отделения, раскрытую в патенте США № 4439196; и осмотическую систему доставки лекарственных средств, раскрытую в патенте США № 4475196. Эти патенты включены в данный документ посредством ссылки. Специалистам в данной области известны многие другие такие имплантаты, системы доставки и модули.
В некоторых вариантах осуществления антитела к LY75 и/или антитела к CD20 можно составлять
- 32 042216 для обеспечения надлежащего распределения in vivo. Например, гематоэнцефалический барьер (BBB) не пропускает многие высокогидрофильные соединения. Для обеспечения пересечения BBB терапевтическими соединениями (при необходимости) их можно составлять, например, в липосомах. В отношении способов получения липосом см., например, патенты США 4522811; 5374548 и 5399331. Липосомы могут содержать одну или более функциональных частей, избирательно транспортируемых в конкретные клетки или органы, что, таким образом, повышает качество целенаправленной доставки лекарственных средств [см., например, V.V. Ranade (1989), J. Clin. Pharmacol., 29:685]. Иллюстративные нацеливающие функциональные части включают фолат или биотин (см., например, патент США 5416016.); маннозиды [Umezawa et al. (1988), Biochem. Biophys. Res. Commun., 153:1038]; антитела [P.G. Bloeman et al. (1995), FEBS Lett. 357:140; M. Owais et al. (1995), Antimicrob. Agents Chemother., 39:180]; рецептор поверхностно-активного белка A [Briscoe et al. (1995), Am. J. Physiol., 1233:134]; p120 [Schreier et al. (1994), J. Biol. Chem., 269:9090]; см. также K. Keinanen; M.L. Laukkanen (1994), FEBS Lett. 346:123; J.J. Killion; I.J. Fidler (1994), Immunomethods, 4:273.
Пути применения и способы.
Используемый в данном документе термин субъект подразумевается как включающий человека и отличных от человека животных. Отличные от человека животные включают всех позвоночных животных, например млекопитающих и не являющихся млекопитающими, таких как отличные от человека приматы, овцы, собаки, кошки, коровы, лошади, куры, земноводные и пресмыкающиеся. Предпочтительные субъекты включают пациентов-людей, имеющих нарушения, опосредованные активностью LY75 и/или активностью CD20.
Способы особенно подходят для лечения пациентов-людей, имеющих нарушение, ассоциированное с аномальной экспрессией LY75 и/или экспрессией CD20. С учетом экспрессии LY75 на опухолевых клетках, комбинации и способы по настоящему изобретению можно применять для лечения субъекта с онкогенным нарушением, например нарушением, характеризующимся наличием опухолевых клеток, экспрессирующих LY75, или при изготовлении лекарственного препарата для лечения такого нарушения, включающего, например, лейкоз, в том числе хронический лимфоцитарный лейкоз и острый миелоидный лейкоз, неходжкинскую лимфому, в том числе DLBCL, B-клеточную лимфому, фолликулярную лимфому, мантийноклеточную лимфому, лимфому из лимфоидной ткани слизистых оболочек (MALT), B-клеточную лимфому, богатую T-клетками/гистиоцитами, лимфому Беркитта, лимфоплазмоцитарную лимфому, мелкоклеточную лимфоцитарную лимфому, лимфому из клеток маргинальной зоны, T-клеточную лимфому, периферическую T-клеточную лимфому, анапластическую крупноклеточную лимфому и ангиоиммунобластную T-клеточную лимфому. Было продемонстрировано, что LY75 интернализируется при связывании с антителом, как проиллюстрировано в примерах 5 и 7 ниже, что, таким образом, обеспечивает применение антител к LY75 в любом механизме действия с нагрузкой, например, в подходе с ADC, в радиоиммуноконъюгате или в подходе ADEPT.
Антитела к LY75, обычно вводимые в виде ADC, можно применять для ингибирования или блокирования функции LY75, для которого, в свою очередь, может быть установлена связь с предупреждением или уменьшением интенсивности определенных симптомов заболевания, что, таким образом, подразумевает LY75 в качестве медиатора заболевания. Этого можно достичь путем приведения образца и контрольного образца в контакт с антителом к LY75 в условиях, обеспечивающих образование комплекса между антителом и LY75. В образце и контрольном образце выявляют и сравнивают любые комплексы, образующиеся между антителом и LY75.
Подходящие пути введения композиций антител (например, моноклональных антител и иммуноконъюгатов) in vivo и in vitro хорошо известны из уровня техники и могут быть выбраны средними специалистами в данной области. Например, композиции антител можно вводить посредством инъекции (например, внутривенной или подкожной). Подходящие дозы применяемых молекул будут зависеть от возраста и массы тела субъекта, а также концентрации и/или состава композиции антитела.
Как было описано ранее, антитела к LY75 и/или антитела к CD20 можно вводить совместно с одним или более другими терапевтическими средствами, например цитотоксическим средством, радиотоксичным средством или иммунодепрессивным средством. Антитело может быть связано со средством (в виде иммунного комплекса) или может вводиться отдельно от средства. В последнем случае (раздельное введение) антитело можно вводить до, после введения средства или одновременно с ним или можно вводить совместно с применением других известных видов терапии, например противораковой терапии, например, лучевой терапии. Такие терапевтические средства включают среди прочих противоопухолевые средства, такие как доксорубицин (адриамицин), цисплатин, сульфат блеомицина, кармустин, хлорамбуцил, а также циклофосфамид и гидроксимочевина, которые сами по себе являются эффективными только на уровнях, которые являются токсичными или субтоксичными для пациента. Цисплатин вводят внутривенно в виде дозы 100 мг/кг один раз в четыре недели, а адриамицин вводят внутривенно в виде дозы 60-75 мг/мл один раз в 21 день. Другие средства, подходящие для совместного введения с антителами по настоящему изобретению, включают другие средства, применяемые для лечения форм рака, например рака желудка, рака ободочной и прямой кишки, рака предстательной железы, рака молочной железы, рака яичника или рака легкого, такие как Avastin®, 5FU и гемцитабин. Совместное введение антител к
- 33 042216
LY75 или их антигенсвязывающих фрагментов по настоящему изобретению с химиотерапевтическими средствами обеспечивает два противораковых средства, действующих посредством различных механизмов, которые обеспечивают достижение цитотоксического эффекта в отношении опухолевых клеток человека. Такое совместное введение может решать проблемы, обусловленные развитием устойчивости к лекарственным средствам или изменением антигенности опухолевых клеток, которое может сделать их не реагирующими с антителом.
Фармацевтические комбинации по настоящему изобретению также можно вводить вместе с сывороткой крови и/или системой комплемента. Эти композиции могут быть преимущественными, если система комплемента находится в непосредственной близости к антителам. В качестве альтернативы антитела и систему комплемента или сыворотку крови можно вводить раздельно.
Также в пределах объема настоящего изобретения находятся наборы, содержащие компоненты (A) и (B) вместе с инструкциями по применению. Набор может дополнительно содержать один или более дополнительных реагентов, таких как иммунодепрессивный реагент, цитотоксическое средство или радиотоксичное средство, или одно или более дополнительных антител (например, антитело, обладающее дополняющей активностью, которое связывается с эпитопом на антигене LY75, отличным от такового для первого антитела).
Соответственно пациентам, получающим лечение с помощью фармацевтических комбинаций по настоящему изобретению, можно дополнительно вводить (до введения антитела, раскрытого в данном документе, одновременно с ним или после него) другое терапевтическое средство, такое как цитотоксическое или радиотоксичное средство, которое усиливает или увеличивает терапевтический эффект антител.
В других вариантах осуществления субъект может получать дополнительное лечение с помощью средства, которое модулирует, например усиливает или ингибирует, экспрессию или активность Fcy или Fcy-рецепторов, посредством, например, лечения субъекта цитокином. Предпочтительные цитокины для введения в ходе лечения полиспецифической молекулой включают гранулоцитарный колониестимулирующий фактор (G-CSF), гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF), интерферон-γ (IFN-γ) и фактор некроза опухоли (TNF).
Все литературные источники, упоминаемые в настоящем описании, в том числе без ограничений все документы, публикации, патенты, заявки на патенты, презентации, тексты, отчеты, рукописи, брошюры, книги, интернет-публикации, журнальные статьи, периодические издания, информационные бюллетени о продуктах и т.п., настоящим включены в настоящее описание посредством ссылки во всей своей полноте. Обсуждение литературных источников в данном документе предназначено лишь для обобщения утверждений, сделанных их авторами, и не делается признание того факта, что любой литературный источник составляет часть предшествующего уровня техники, а заявители сохраняют за собой право оспаривать достоверность и значимость упоминаемых литературных источников.
Хотя вышеупомянутое изобретение было довольно подробно описано посредством иллюстрации и примера в целях ясности понимания, средним специалистам в данной области в свете идей настоящего изобретения будет без труда понятно, что в его отношении можно производить определенные изменения и модификации без отступления от сущности или объема зависимых пунктов формулы изобретения.
Настоящее изобретение дополнительно проиллюстрировано с помощью следующих примеров, которые не следует толковать как дополнительно ограничивающие.
Пример 1. Получение человеческих моноклональных антител против антигена LY75.
В соответствии со стандартными процедурами мышей (XenoMouse IgG1) иммунизировали клетками CHO, трансфицированными LY75 полной длины.
Специфичность антител, выработанных против LY75, исследовали при помощи проточной цитометрии с использованием клеток HEK293, трансфицированных LY75, и впоследствии с использованием клеток HT29, экспрессирующих LY75. Для того чтобы исследовать способность антител связываться с белком LY75 на клеточной поверхности, антитела инкубировали с клетками, экспрессирующими LY75. Клетки промывали буфером для FACS (DPBS, 2% FBS), центрифугировали и ресуспендировали в 100 мкл разведенного первичного антитела к LY75 (также разведенного в буфере для FACS). Комплекс антитело-линия клеток инкубировали на льду в течение 60 мин и затем дважды промывали буфером для FACS, описанным выше. Осадок клетка-антитело ресуспендировали в 100 мкл разведенного вторичного антитела (также разведенного в буфере для FACS) и инкубировали на льду в течение 60 мин на льду. Осадок промывали, как описано выше, и ресуспендировали в 200 мкл буфера для FACS. Образцы загружали в проточный питометр BD FACScanto II, при этом данные анализировали при помощи программного обеспечения BD FACSdiva (результаты не показаны).
Пример 2. Установление структурных характеристик моноклональных антител к LY75.
Последовательности кДНК, кодирующие вариабельные области тяжелых и легких цепей моноклонального антитела LY75_A1, получали при помощи стандартных методик ПЦР и секвенировали при помощи стандартных методик секвенирования ДНК.
Последовательности антитела можно подвергнуть мутагенезу для возвращения к остаткам зароды- 34 042216 шевого типа в положении одного или более остатков.
Нуклеотидная и аминокислотная последовательности вариабельной области тяжелой цепи
LY75_A1 показаны под SEQ ID NO: 3 и 1 соответственно.
Нуклеотидная и аминокислотная последовательности вариабельной области легкой цепи LY75_A1 показаны под SEQ ID NO: 4 и 2 соответственно.
Сравнение последовательности тяжелой цепи иммуноглобулина LY75_A1 с известными последовательностями зародышевого типа тяжелой цепи иммуноглобулина человека продемонстрировало, что в тяжелой цепи LY75_A1 используется VH-сегмент из VH 3-15 человека зародышевого типа и JH-сегмент из JH JH4 человека зародышевого типа. Дальнейший анализ последовательности VH LY75_A1 при помощи системы Kabat для определения CDR-области привел к выявлению областей CDR1, CDR2 и CDR3 тяжелой цепи, показанных под SEQ ID NO: 5, 6 и 7 соответственно. Выравнивания последовательностей CDR1, CDR2 и CDR3 VH LY75_A1 с последовательностью VH 3-15 зародышевого типа и JH JH4 зародышевого типа показаны на фиг. 1.
Сравнение последовательности легкой цепи иммуноглобулина LY75_A1 с известными последовательностями зародышевого типа легкой цепи иммуноглобулина человека продемонстрировало, что в легкой цепи LY75_A1 используется VK-сегмент из VK 012 человека зародышевого типа и JK-сегмент из JK JK4 человека зародышевого типа. Дальнейший анализ последовательности VK LY75_A1 при помощи системы Kabat для определения CDR-области привел к выявлению областей CDR1, CDR2 и CDR3 легкой цепи, показанных под SEQ ID NO: 8, 9 и 10 соответственно. Выравнивания последовательностей CDR1, CDR2 и CDR3 VK LY75_A1 с последовательностями VK O12 зародышевого типа и JH JK4 зародышевого типа показаны на фиг. 2.
Пример 3. Иммуногистохимическое исследование при помощи моноклонального антитела к LY75.
При помощи человеческих моноклональных антител, специфичных в отношении LY75, осуществляли иммуногистохимическое исследование с использованием клеточных осадков FFPE HT-29 и A549, матриц с образцами FFPE неходжкинской лимфомы и раковой опухоли поджелудочной железы и свежезамороженных опухолевых образцов лимфомы/лейкоза, срезов раковой опухоли яичника, раковой опухоли поджелудочной железы и раковой опухоли молочной железы и матрицы с нормальными тканями.
Материалы и способы.
Материалы.
Ксилолы (X5P-1gal) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
100% этанол HistoPrep (HC-800-1GAL) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
10х цитратный буфер для термического демаскирования эпитопов (AP9003125) от Thermo Scientific, Массачусетс, США.
Ингибитор пероксидазы Thermo Scientific* Pierce* (35000) от Thermo Scientific, Массачусетс, США. Бессывороточный белковый блокирующий раствор (X0909) от Dako, Калифорния, США.
Вторичное антитело: Fab-специфичное антитело козы к IgG человека, конъюгированное с FITC (109-097-003), от Jackson ImmunoResearch, Пенсильвания, США.
IgG человека ChromPure, целая молекула (09-000-003), от Jackson ImmunoResearch, Пенсильвания, США.
Третичное антитело: антитело мыши к FITC (ab10257) от Abcam, Массачусетс, США.
Очищенный IgG человека для изотипического контроля (1-001A) от R&D Systems, Миннесота, США.
Tween-20 (BP337-100) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Ацетон (BP2403-4) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
HRP-конъюгированный полимер Dual Link EnVision+ для антител мыши и кролика (K4063) от Dako, Калифорния, США.
Набор DAB с 2 растворами (882014) от Invitrogen, Нью-Йорк, США.
Гематоксилин Гарриса (23-245-677) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Заливочная среда Faramount (S302580) от Dako, Калифорния, США.
Тканевые срезы и матрицы приобретали от US Biomax Inc., Мэриленд, США или Origene, Мэриленд, США.
Получение микропрепаратов FFPE - удаление парафина и регидратация.
Осуществляли удаление парафина из микропрепаратов FFPE в ксилоле (2x3 мин), а затем осуществляли регидратацию с использованием смеси 1:1 ксилола и 100% этанола (1x3 мин), 100% этанола (2x3 мин), 95% этанола (1x3 мин), 70% этанола (1x3 мин), 50% этанола (1x3 мин), а также водопроводной воды (1x3 мин).
Получение микропрепаратов FFPE - демаскирование антигена (микроволновое излучение).
Антиген LY75 демаскировали с использованием нагревания микроволновым излучением с высокой мощностью до кипения, затем с низкой мощностью в течение 10 мин в 50 мл 1x цитратного буфера в сосуде Коплина. Микропрепараты затем оставляли охлаждаться до комнатной температуры в течение дополнительных 15 мин, затем промывали водопроводной водой 3 мин. Каждый тканевой срез/TMA об- 35 042216 водили окружностью при помощи карандаша для создания гидрофобного барьера, и затем микропрепараты 3 раза промывали в PBS в течение 3 мин для каждой промывки.
Получение микропрепаратов FF.
Микропрепараты извлекали из хранилища при -80°C и обеспечивали их сушку при комнатной температуре в вытяжном шкафу в течение 20-30 мин. Микропрепараты фиксировали в течение 10 мин в ледяном ацетоне при -20°C, затем обеспечивали их сушку в течение 20 мин в вытяжном шкафу при комнатной температуре. Микропрепараты промывали и осуществляли их регидратацию в PBS с 3 промывками, каждая в течение 3 мин. Срезы обводили по контуру при помощи карандаша для создания гидрофобного барьера.
Получение комплексов антител.
Первичное антитело к LY75 разводили в бессывороточном белковом блокирующем растворе (SFPB) с получением раствора с концентрацией, в 20 раз превышающей необходимую конечную концентрацию (20 мкг/мл для конечной концентрации 1 мкг/мл). Вторичное антитело козы к антигенсвязывающему фрагменту (Fab) иммуноглобулина G человека (IgG) получали аналогичным образом в SFPB для создания раствора с равной концентрацией.
Равные объемы первичного и вторичного антитела объединяли в пробирке с этикеткой, осторожно перемешивали и инкубировали в течение 3 мин при комнатной температуре, в результате чего получали концентрацию первичного антитела, в 10 раз превышающую необходимую конечную концентрацию (10 мкг/мл для конечной концентрации 1 мкг/мл). Эту смесь разводили 1:5 при помощи SFPB, осторожно перемешивали и инкубировали в течение 30 мин при комнатной температуре, в результате чего получали концентрацию первичного антитела, в два раза превышающую необходимую конечную концентрацию (2 мкг/мл для конечной концентрации 1 мкг/мл).
Для получения конечных окрашивающих комплексов 1% (10 мкг/мкл) раствор IgG человека получали в SFPB, при этом равный объем добавляли к смеси первичного/вторичного антитела. Эту комбинацию осторожно перемешивали и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин с разведением смеси первичного/вторичного антитела до половины концентрации первичного антитела, и в результате получали необходимую конечную концентрацию первичного антитела (1 мкг/мл).
Иммуноокрашивание.
Тем временем активность эндогенной тканевой пероксидазы блокировали посредством инкубирования тканей с ингибитором пероксидазы в течение 5-10 мин при комнатной температуре в увлажнительной камере. Затем микропрепараты промывали в PBS 3 раза в течение 3 мин для каждой промывки. Ткани инкубировали в SFPB в течение 30 мин при комнатной температуре в увлажнительной камере. Конечные окрашивающие комплексы наносили на каждый тканевой срез и/или микроматрицу, при этом микропрепараты инкубировали в течение 30 мин при комнатной температуре в увлажнительной камере. Затем микропрепараты промывали один раз в PBS и один раз в PBST (PBS+0,125% Tween-20) в течение 3 мин для каждой промывки. Третичное антитело мыши к FITC наносили при концентрации 2 мкг/мл на 30 мин при комнатной температуре в увлажнительной камере. Затем срезы промывали один раз в PBS и один раз в PBST в течение 3 мин для каждой промывки. Затем на ткани наносили HRP-конъюгированный полимер Dual Link EnVision+ для антител мыши и кролика и микропрепараты инкубировали в течение 30 мин при комнатной температуре в увлажнительной камере. Затем микропрепараты промывали один раз в PBS, один раз в PBST в течение 3 мин для каждой промывки. Ткани инкубировали в растворе DAB, полученном в соответствии с инструкциями производителя, при комнатной температуре в течение 10 мин. Затем микропрепараты один раз промывали проточной водопроводной водой в течение 2 мин и один раз в PBS в течение 3 мин. Осуществляли контрастное окрашивание микропрепаратов при помощи гематоксилина в течение 30 с при комнатной температуре и промывали проточной водопроводной водой. Микропрепараты сушили при комнатной температуре в течение 30 мин и затем микропрепараты заключали под покровные стекла с использованием заливочной среды Faramount.
Результаты.
LY75_A1 характеризовалось положительным результатом при использовании образцов FFPE трижды негативной раковой опухоли молочной железы, причем 77% срезов характеризовались положительным окрашиванием и 55% демонстрировали интенсивное (+++) окрашивание.
Окрашивание в отношении LY75 нормальных тканей FF, как правило, было в диапазоне от отсутствующего до низкого уровня. Эпителий протоков молочной железы, слюнной железы и поджелудочной железы демонстрировал уровень окрашивания от выраженного низкого до умеренного, при этом наблюдался низкий уровень положительного окрашивания селезенки. Таким образом, антитела, направленные на LY75, можно использовать в качестве терапевтических средств и диагностических средств при некоторых из исследуемых форм рака и, возможно, других типах рака, характеризующихся экспрессией LY75.
Пример 4. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1, в отношении клеток HT-29.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher
- 36 042216
Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
Результаты представлены на фиг. 3a, на которой показана субпопуляция антител, которые, как известно, связываются с LY75, что может индуцировать уничтожение клеток HT-29. Это позволяет предположить, что, при том что эти антитела могут связываться с LY75, только некоторые из них проявляют эффективность, будучи конъюгированными с DM1. Затем из субпопуляции выбирали антитела для дальнейшего анализа цитотоксической активности.
Пример 5. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении раковых клеток ободочной и прямой кишки.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3b показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток HT-29. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител, по сравнению с другими антителами к LY75, конъюгированными с токсином (выбранными из примера 1).
- 37 042216
Пример 6. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий клеток лимфомы.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher
Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3c показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток RAJI. На фиг. 3d показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток Namalwa. На фиг. 3e показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток Karpas 299. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител, по сравнению с другими антителами к LY75, конъюгированными с DM1 и DM4 (выбранными из примера 1).
Пример 7. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий раковых клеток поджелудочной железы.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3f показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток BxPC3. На фиг. 3g показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюги- 38 042216 рованных с DM1 и DM4, в отношении клеток HupT4. На фиг. 3h показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток HPAFFII. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител, по сравнению с другими антителами к LY75, конъюгированными с DM1 и DM4 (выбранными из примера 1).
Пример 8. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий клеток, являющихся субстратом хронического лимфоцитарного лейкоза.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3i показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток EHEB. На фиг. 3j показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток Mec-1. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител, по сравнению с другими антителами к LY75, конъюгированными с DM1 и DM4 (выбранными из примера 1).
Пример 9. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий клеток, являющихся субстратом острого моноцитарного лейкоза.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный
- 39 042216 лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3k показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток AML-193. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител, по сравнению с другими антителами к LY75, конъюгированными с DM1 и DM4 (выбранными из примера 1).
Пример 10. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий раковых клеток молочной железы.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3l показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток HCC 70 (ER-отрицательных, PR-отрицательных и Her2-отрицательных). На фиг. 3m показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток HCC 1806 (ER-отрицательных, PR-отрицательных и Her2-отрицательных). На фиг. 3n показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток MDA-MB-468. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител.
Пример 11. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий раковых клеток мочевого пузыря.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаж- 40 042216 дения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3o показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток RT4. На фиг. 3p показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток 5637. На фиг. 3q показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток SW780. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител.
Пример 12. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий раковых клеток головы и шеи.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3r показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток SCC-9. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител.
Пример 13. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий раковых клеток пищевода.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаж- 41 042216 дения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3s показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток OE 19. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител.
Пример 14. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий раковых клеток яичника.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США. Среда RPMI 1640 (MT-10041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США. CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение 15 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3t показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток OVCAR-3. На фиг. 3u показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток SK-OV-3. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител.
Пример 15. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении линий клеток множественной миеломы.
Материалы.
CellStripper (неферментативное средство для диссоциации клеток) (MT-25-056CI) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
PBS, pH 7,4 (1X) (SH30028LS) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
Среда RPMI 1640 (MT-10-041-CM) от Fisher Scientific, Пенсильвания, США.
CellTiter Glo (G7572) от Promega, Висконсин, США.
Способ.
Осуществляли диссоциацию клеток при помощи CellStripper и подсчет их количества. 5e3 клеток/лунка центрифугировали с получением осадка (в случае клеток в суспензии можно использовать большее количество в зависимости от времени удвоения количества клеток, как, например, 10e3 клеток/лунка). Осадок ресуспендировали в культуральной среде с получением концентрации 1e5 клеток/мл.
мкл/лунка суспензии клеток добавляли в лунки 96-луночного планшета с белыми стенками и прозрачным дном. Антитела разводили и титровали в 8 точках (титрования с 3-кратными разведениями), соответствующих концентрациям 0-20 нМ (в два раза превышающим исследуемые концентрации). Разведенные антитела или среду (для необработанных образцов) (50 мкл/лунка) добавляли в соответствующие лунки. Избыток среды (200 мкл/лунка) добавляли во внешние ряды и колонки планшета для предотвращения испарения. Планшет инкубировали в течение 72 ч при 37°C.
Планшет извлекали из инкубатора и инкубировали при комнатной температуре в течение 30 мин. Тем временем размораживали раствор CellTiter Glo. Планшет встряхивали и промывали 1 раз с использованием 100 мкл/лунка PBS (в случае клеток в суспензии планшет сначала центрифугировали для осаждения клеток). В каждую лунку добавляли 100 мкл/лунка PBS и 100 мкл CellTiter Glo и тщательно перемешивали с получением смеси. Планшет инкубировали в темноте при комнатной температуре в течение
- 42 042216 мин и наблюдали посредством микроскопии, чтобы убедиться в том, что произошел эффективный лизис клеток. Затем планшет прочитывали на люминометре Glomax.
Результаты.
На фиг. 3v показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток MOLP-8. На фиг. 3w показана цитотоксическая активность антител к LY75, конъюгированных с DM1 и DM4, в отношении клеток RPMI8226. Эти результаты демонстрируют увеличение цитотоксической активности, пропорциональное концентрации антител.
Пример 16. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в ксенотрансплантатных моделях Raji.
Эффективность LY75_DM1 и LY75_DM4 исследовали в ксенотрансплантатной модели с подкожным введением мышам с SCID клеток Raji лимфомы Беркитта.
Иммунодефицитным мышам с SCID подкожно инокулировали опухолевые клетки Raji (лимфомы Беркитта человека). Опухолям давали возможность сформироваться и мышей распределяли в пять групп обработки по 3-6 мышей на группу. Когда среднее значение объема опухоли достигало среднего показателя 129-132 мм3 на группу, каждую группу обрабатывали одним из следующих соединений, вводимых внутривенно при указанных дозах: группа 1 (наполнитель; фосфатно-солевой буферный раствор (PBS)), группа 2 (LY75_DM1; 10 мг/кг), группа 3 (изотипический контроль-DMI; 10 мг/кг), группа 4 (LY75_DM4; 5 мг/кг), группа 5 (изотипический контроль-SPBDDM4; 5 мг/кг). Вторую дозу вводили спустя одну неделю. Отслеживали значения массы тела (BW), мышей часто осматривали для определения состояния здоровья и нежелательных побочных эффектов и опухоли измеряли два раза в неделю. Мышей подвергали эвтаназии, когда их опухоли достигали конечной точки объема опухоли 2000 мм3 или через 60 дней, в зависимости от того, что происходило первым. Эффективность определяли исходя из задержки роста опухоли (TGD), увеличения медианного значения времени до достижения конечной точки (TTE) и исходя из анализа при помощи логарифмического рангового критерия различий по кривым выживаемости Каплана-Мейера для мышей, обработанных ADC, по сравнению с мышами, обработанными PBS. У первых пяти контрольных мышей, обработанных наполнителем, у которых была достигнута конечная точка, отбирали образцы опухолей, которые обрабатывали путем фиксации в формалине и заливки парафином.
Результаты.
На фиг. 4a показано, что каждый из LY75_DM1 и LY75_DM4 продемонстрировал значительную противоопухолевую активность и значительно пролонгированное выживание в ксенотрансплантатной модели лимфомы Беркитта из клеток Raji на мышах с SCID по сравнению с контролями; тем не менее дозы 5 мг/кг LY75_DM4 были значительно более эффективными, чем дозы 10 мг/кг LY75_DM1, в результате чего у 5 из 6 мышей наблюдалась полная, но временная регрессия опухоли. Все обработки были хорошо переносимыми, и не наблюдались клинические признаки токсичности. Эти данные позволяют предположить, что ADC, направленные на LY75, например LY75_DM1 и LY75_DM4, могут обеспечивать клинически благоприятный эффект при лечении раковых пациентов-людей с неходжкинской лимфомой.
Пример 17. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в ксенотрансплантатных моделях Namalwa.
Эффективность LY75_DM1 и LY75_DM4 исследовали в ксенотрансплантатной модели с подкожным введением мышам с SCID клеток Namalwa лимфомы Беркитта.
Иммунодефицитным мышам с SCID подкожно инокулировали опухолевые клетки Namalwa (лимфомы Беркитта человека). Опухолям давали возможность сформироваться, и мышей распределяли в пять групп обработки по шесть мышей на группу. Когда среднее значение объема опухоли достигало среднего показателя 114 мм3 на группу, каждую группу обрабатывали одним из следующих соединений, вводимых внутривенно при указанных дозах: группа 1 (наполнитель; фосфатно-солевой буферный раствор (PBS)); группа 2 (LY75_DM1; 10 мг/кг), группа 3 (изотипический контроль-DMI; 10 мг/кг), группа 4 (LY75_DM4; 5 мг/кг), группа 5 (изотипический контроль-SPBDDM4; 5 мг/кг). Отслеживали значения массы тела (BW), мышей часто осматривали для определения состояния здоровья и нежелательных побочных эффектов, и опухоли измеряли два раза в неделю. Мышей подвергали эвтаназии, когда их опухоли достигали конечной точки объема опухоли 2000 мм3 или через 60 дней в зависимости от того, что происходило первым. Эффективность определяли исходя из задержки роста опухоли (TGD), увеличения медианного значения времени до достижения конечной точки (TTE) и исходя из анализа при помощи логарифмического рангового критерия различий по кривым выживаемости Каплана-Мейера для мышей, обработанных ADC, по сравнению с мышами, обработанными PBS. У первых пяти контрольных мышей, обработанных наполнителем, у которых была достигнута конечная точка, отбирали образцы опухолей, которые обрабатывали путем фиксации в формалине и заливки парафином.
Результаты.
На фиг. 4b показано, что каждый из LY75_DM1 и LY75_DM4 продемонстрировал значительную противоопухолевую активность и пролонгирование выживания в ксенотрансплантатной модели лимфомы Беркитта из клеток Namalwa на мышах с SCID по сравнению с контролями; тем не менее доза 5 мг/кг
- 43 042216
LY75_DM4 была значительно более эффективной, чем доза 10 мг/кг LY75_DM1, вызывая кратковременное уменьшение объема опухоли. Все обработки были хорошо переносимыми и не наблюдались клинические признаки токсичности. Эти данные позволяют предположить, что ADC, направленные на LY75, например LY75_DM1 и LY75_DM4, могут обеспечивать клинически благоприятный эффект при лечении раковых пациентов-людей с неходжкинской лимфомой.
Пример 18. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в ксенотрансплантатных моделях рака поджелудочной железы.
Эффективность LY75_DM1 и LY75_DM4 исследовали в ксенотрансплантатной модели с подкожным введением бестимусным голым мышам клеток HPAFII аденокарциномы поджелудочной железы.
Иммунодефицитным бестимусным голым мышам подкожно инокулировали опухолевые клетки HPAFII (аденокарциномы поджелудочной железы человека). Опухолям давали возможность сформироваться, и мышей распределяли в пять групп обработки по 6 мышей на группу. Когда среднее значение объема опухоли достигало среднего показателя - 114 мм3 на группу, каждую группу обрабатывали одним из следующих соединений, вводимых внутривенно при указанных дозах: группа 1 (наполнитель; фосфатно-солевой буферный раствор (PBS)), группа 2 (LY75_DM1; 10 мг/кг), группа 3 (изотипический контроль-DMI; 10 мг/кг), группа 4 (LY75_DM4; 5 мг/кг), группа 5 (изотипический контроль-SPBDDM4; 5 мг/кг). Отслеживали значения массы тела (BW), мышей часто осматривали для определения состояния здоровья и нежелательных побочных эффектов и опухоли измеряли три раза в неделю. Мышей подвергали эвтаназии, когда их опухоли достигали конечной точки объема опухоли 2000 мм3 или через 90 дней, в зависимости от того, что происходило первым. Эффективность определяли исходя из эффекта обработки в отношении объема опухоли и исходя из анализа при помощи логарифмического рангового критерия различий по кривым выживаемости Каплана-Мейера для мышей, обработанных ADC, по сравнению с мышами, обработанными PBS. Отбирали образцы опухолей у контрольных мышей, обработанных наполнителем, и обрабатывали путем фиксации в формалине и заливки парафином.
Результаты.
На фиг. 4с показано, что LY75_DM1 и LY75_DM4 проявляли значительную и сходную по силе противоопухолевую активность, при этом наблюдалось пролонгирование выживания в ксенотрансплантатной модели HPAFII на голых мышах по сравнению с контролями. Все обработки были хорошо переносимыми, и не наблюдались клинические признаки токсичности. Эти данные позволяют предположить, что ADC, направленные на LY75, например LY75_DM1 и LY75_DM4, могут обеспечивать клинически благоприятный эффект при лечении пациентов-людей с раком поджелудочной железы.
Пример 19. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в ксенотрансплантатных моделях рака мочевого пузыря.
Эффективность LY75_DM1 и LY75_DM4 исследовали в ксенотрансплантатной модели с подкожным введением мышам с SCID клеток SW780 карциномы мочевого пузыря человека.
Иммунодефицитным бестимусным голым мышам подкожно инокулировали опухолевые клетки HPAFII (аденокарциномы поджелудочной железы человека). Опухолям давали возможность сформироваться, и мышей распределяли в пять групп обработки по шесть мышей на группу. Когда среднее значение объема опухоли достигало среднего показателя - 114 мм3 на группу, каждую группу обрабатывали одним из следующих соединений, вводимых внутривенно при указанных дозах: группа 1 (наполнитель; фосфатно-солевой буферный раствор (PBS)), группа 2 (LY75_DM1; 1 мг/кг), группа 3 (LY75_DM1; 2,5 мг/кг), группа 4 (LY75_DM1; 5 мг/кг), группа 5 (LY75_DM4; 1 мг/кг)), группа 6 (LY75_DM4; 2,5 мг/кг)), группа 7 (LY75_DM4; 5 мг/кг)), группа 8 (изотипический контроль-SPBDDM4; 5 мг/кг). Отслеживали значения массы тела (BW), мышей часто осматривали для определения состояния здоровья и нежелательных побочных эффектов и опухоли измеряли три раза в неделю. Мышей подвергали эвтаназии, когда их опухоли достигали конечной точки объема опухоли 2000 мм3 или через 90 дней, в зависимости от того, что происходило первым. Эффективность определяли, исходя из эффекта обработки в отношении объема опухоли и исходя из анализа при помощи логарифмического рангового критерия различий по кривым выживаемости Каплана-Мейера для мышей, обработанных ADC, по сравнению с мышами, обработанными PBS. Отбирали образцы опухолей у контрольных мышей, обработанных наполнителем, и обрабатывали путем фиксации в формалине и заливки парафином.
Результаты.
На фиг. 4d показано, что LY75_DM1 и LY75_DM4 проявляли значительную и сходную по силе противоопухолевую активность, при этом наблюдалось пролонгирование выживания в ксенотрансплантатной модели SW780 на голых мышах по сравнению с контролями. Все обработки были хорошо переносимыми, и не наблюдались клинические признаки токсичности. Эти данные позволяют предположить, что ADC, направленные на LY75, например LY75_DM1 и LY75_DM4, могут обеспечивать клинически благоприятный эффект при лечении пациентов-людей с раком мочевого пузыря.
Пример 20. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в ксенотрансплантатных моделях рака молочной железы.
Эффективность LY75_DM1 и LY75_DM4 исследовали в ксенотрансплантатной модели с подкожным введением бестимусным голым мышам клеток MDA-MB-468.
- 44 042216
Иммунодефицитным бестимусным голым мышам подкожно инокулировали опухолевые клетки MDA-MB-468 (трижды негативной аденокарциномы молочной железы человека). Опухолям давали возможность сформироваться, и мышей распределяли в семь групп обработки по 10 мышей на группу. Когда среднее значение объема опухоли достигало среднего показателя 167 мм3 на группу, каждую группу обрабатывали одним из следующих соединений, вводимых внутривенно при указанных дозах: группа 1 (наполнитель; 20 мМ сукцинат натрия, pH 5,0, 6% трегалоза, 0,04% полисорбат); группа 2 (LY75_DM1; 5 мг/кг), группа 3 (LY75_DM1; 10 мг/кг), группа 4 (LY75_DM4; 5 мг/кг), группа 5 (LY75_DM4; 2,5 мг/кг), группа 6 (LY75_DM4; 1 мг/кг), группа 7 (изотипический контроль-ОМ4; 5 мг/кг). Отслеживали значения массы тела (BW), мышей часто осматривали для определения состояния здоровья и нежелательных побочных эффектов и опухоли измеряли два раза в неделю. Мышей подвергали эвтаназии через 82 дня после инокуляции опухоли. Эффективность определяли исходя из противоопухолевой активности (среднее значение размера опухоли в группе обработки/среднее значение размера опухоли в контрольной группех100) и увеличения среднего значения времени до достижения конечной точки (TTE) у мышей, обработанных ADC, по сравнению с мышами, обработанными PBS. Отбирали образцы пяти самых больших опухолей от контрольных мышей, обработанных наполнителем, в день 71 после инокуляции и обрабатывали путем фиксации в формалине и заливки парафином.
Результаты.
На фиг. 4е показано, что каждый из LY75_DM1 и LY75_DM4 демонстрировал существенную противоопухолевую активность в ксенотрансплантатной модели MDA-MB-468 на голых мышах по сравнению с контролями. При использовании LY75_DM4 наблюдали зависимую от дозы активность, при этом 2,5 и 5 мг/кг характеризовались намного более сильным эффектом чем 1 мг/кг. При 5 мг/кг LY75_DM1 и LY75_DM4 характеризовались сходной эффективностью. Длительные регрессии среднего объема опухоли наблюдали в случае LY75_DM1 при 10 и 5 мг/кг и LY75_DM4 при 5 и 2,5 мг/кг. Все обработки были хорошо переносимыми и не наблюдались клинические признаки токсичности. Эти данные позволяют предположить, что ADC, направленные на LY75, например LY75_DM1 и LY75_DM4, могут обеспечивать клиническую пользу при лечении пациентов-людей с трижды негативным раком молочной железы.
Пример 21. Эффективность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в ксенотрансплантатных моделях рака ободочной и прямой кишки.
Эффективность LY75_DM1 и LY75_DM4 исследовали в ксенотрансплантатной модели с подкожным введением бестимусным голым мышам клеток COLO205 аденокарциномы ободочной и прямой кишки.
Иммунодефицитным бестимусным голым мышам подкожно инокулировали опухолевые клетки COLO205 (аденокарциномы ободочной и прямой кишки человека). Опухолям давали возможность сформироваться, и мышей распределяли в пять групп обработки по шесть мышей на группу. Когда среднее значение объема опухоли достигало среднего показателя 117 мм3 на группу, каждую группу обрабатывали одним из следующих соединений, вводимых внутривенно при указанных дозах: группа 1 (наполнитель; фосфатно-солевой буферный раствор (PBS)), группа 2 (LY75_DM1; 10 мг/кг), группа 3 (изотипический контроль-DMI; 10 мг/кг), группа 4 (LY75_DM4; 5 мг/кг), группа 5 (изотипический контроль-DM4; 5 мг/кг). Вторую дозу вводили через 12 дней после первой. Отслеживали значения массы тела (BW), мышей часто осматривали для определения состояния здоровья и нежелательных побочных эффектов и опухоли измеряли два раза в неделю. Мышей подвергали эвтаназии, когда их опухоли достигали конечной точки объема опухоли 1000 мм3 или через 60 дней, в зависимости от того, что происходило первым. Эффективность определяли, исходя из задержки роста опухоли (TGD), увеличения медианного значения времени до достижения конечной точки (TTE) и исходя из анализа при помощи логарифмического рангового критерия различий по кривым выживаемости Каплана-Мейера для мышей, обработанных ADC, по сравнению с мышами, обработанными PBS. У первых пяти контрольных мышей, обработанных наполнителем, у которых была достигнута конечная точка, отбирали образцы опухолей, которые обрабатывали путем фиксации в формалине и заливки парафином.
Результаты.
На фиг. 4f показано, что LY75_DM1 и LY75_DM4 демонстрировали сходную умеренную противоопухолевую активность и пролонгирование выживания в ксенотрансплантатной модели аденокарциномы ободочной и прямой кишки из клеток COLO205 на голых мышах по сравнению с контролями. Все обработки были хорошо переносимыми, и не наблюдались клинические признаки токсичности. Эти данные позволяют предположить, что ADC, направленные на LY75, например LY75_DM1 и LY75_DM4, могут обеспечивать клиническую пользу при лечении пациентов-людей с раком ободочной и прямой кишки.
Пример 22. Токсичность моноклональных антител к LY75, конъюгированных с DM1 и конъюгированных с DM4, в отношении макак-крабоедов.
Шесть самцов обезьян распределяли в исследовании по 2 обезьяны/группа. Наполнитель (PBS), LY75_DM4 (расщепляемый) или LY75_DM1 (нерасщепляемый) вводили два раза (в день 1 и 29) посредством внутривенной инфузии продолжительностью 15 мин при 0 мг/кг/доза (PBS, наполнитель), 5 мг/кг/доза (LY75_DM4, расщепляемый) или 10 мг/кг/доза (LY75_DM1, нерасщепляемый). Отбирали образцы крови для токсикокинетических исследований перед началом введения доз (день 1) и через 1, 2,
- 45 042216
3, 7, 14, 21 и 28 дней после каждой дозы. Отбирали образцы крови для клинико-патологических анализов перед началом введения доз (день 1) и через 1, 3, 7, 14, 21 и 28 дней после каждой дозы (момент времени 28 дней после 1-й дозы также использовали в качестве момента времени перед введением дозы для 2-й дозы). Всех исследуемых животных подвергали эвтаназии и проводили вскрытие после последнего забора крови в день 57. Выделяли плазму крови, отделенную из каждого образца крови, замораживали и транспортировали в Oxford BioTherapeutics, Inc. для анализа в отношении концентрации ADC при помощи ELISA.
Наблюдаемые клинико-патологические проявления, связанные с обработкой, включали слабовыраженную регенеративную анемию и временные уменьшения количества клеток лейкоцитарного профиля крови, наиболее существенные для количества нейтрофилов. Анемию наблюдали как у животных, обработанных 5 мг/кг LY75_DM4, так и у одного из двух животных, обработанных 10 мг/кг LY75_DM1. Тяжелую нейтропению с максимальным снижением количества нейтрофилов через одну неделю после введения дозы и быстрое восстановление их количества наблюдали у всех животных; при этом максимальное снижение абсолютного количества нейтрофилов было меньшим у животных, обработанных LY75_DM4. Не наблюдали эффектов в отношении параметров коагуляции APTT и PT, связанных с исследуемым препаратом. Изменения химического состава сыворотки крови включали временное повышение уровня AST, CK, LDH (у 1 из 2 животных в каждой группе обработки) и глобулина после введения 5 мг/кг LY75_DM4 и 10 мг/кг LY75_DM1. Кроме того, наблюдали временное повышение уровня фермента ALT, специфичного для печени, только у животных, обработанных LY75_DM4. Небольшая продолжительность и/или величина повышений параметров химического состава сыворотки крови позволяли предположить, что они не относились к нежелательным явлениям. При анализе мочи отсутствовали наблюдаемые проявления, связанные с исследуемым препаратом. В ходе обследования при вскрытии после 4-недельного периода восстановления отсутствовали наблюдаемые макропатологические проявления, связанные с обработкой, или изменения абсолютных и относительных значений массы органов. Наблюдаемые гистопатологические проявления только для щитовидной железы (изменение морфологических характеристик коллоидного содержимого в фолликулах) и почки (расширенные канальцы во внешнем слое коркового вещества) классифицировали как характеризующиеся минимальной тяжестью; не связанные с изменениями других исследуемых параметров; а также не относящиеся к нежелательным явлениям и имеющие минимальную токсикологическую значимость.
Заключение.
Обработка повторными дозами при двух дозах - 5 мг/кг LY75_DM4 или 10 мг/кг LY75_DM1 хорошо переносилась макаками-крабоедами. Все наблюдаемые проявления токсичности, связанной с обработкой, были обратимыми после 4-недельного периода восстановления.
Пример 23. Установление характеристик эпитопа для LY75 A1 при помощи анализа конкурентного связывания с использованием сортировки клеток с активированной флуоресценцией (FACS).
Способ.
Клетки COLO205 (ATCC, № в каталоге CCL-222) отделяли от матрасов для тканевых культур при помощи CellStripper (Cellgro, № в каталоге MT-25-056CI). Клетки промывали и ресуспендировали в буфере для FACS (PBS+2% FBS), нейтрализовали питательной средой и подсчитывали. Клетки высевали при 50000 клеток на лунку в 96-луночный планшет с V-образным дном лунок. Клетки промывали один раз буфером для FACS (PBS (Fisher, № в каталоге SH30028-03)+2% FBS). Добавляли mAb к LY75 (выбранное из примера 1) или LY75_A1 в лунки при исходной концентрации 250 нМ, осуществляли 3-кратные серийные разведения и вносили в соответствующие лунки в течение 45 мин на льду. Исследуемое содержимое лунок, для которого требовались один или несколько этапов окрашивания, при необходимости выдерживали в буфере для FACS для обеспечения одновременного завершения заключительного окрашивания для всех исследуемых условий. Содержимое двух лунок с буфером для FACS оставляли неокрашенным в качестве контролей.
После инкубирования с блокирующим антителом клетки два раза промывали буфером для FACS. Клетки ресуспендировали в буфере для FACS, содержащем mAb к LY75, конъюгированное с MCC-DM1 (1 нМ), и инкубировали на льду в течение 45 мин. Клетки промывали, как описано выше, и ресуспендировали в буфере для FACS с добавлением 1 мкг/мл антитела мыши к майтанзину и инкубировали на льду в течение 45 мин. Клетки промывали, как описано выше, и ресуспендировали в буфере для FACS, содержащем 2 мкг/мл антитела козы к каппа-цепи Ig мыши, конъюгированного с RPE. Клетки инкубировали на льду в течение 45 мин, затем промывали, как описано выше. Клетки ресуспендировали в буфере для FACS при 200 мкл на лунку. Среднее значение интенсивности флуоресценции для каждого образца определяли при помощи проточного питометра Guava EasyCyte Plus HT (форматы 96-луночного планшета) и необработанные данные анализировали при помощи Guava Cytosoft.
Результаты.
На фиг. 5a показано, что блокирование с использованием mAb к LY75, конъюгированного с MCC-DM1, приводило к снижению связывания mAb к LY75. Анализ связывания LY75_A1 с клетками COLO205 продемонстрировал, что LY75_A1 неспособно блокировать связывание mAb к LY75, конъюгированного с MCC-DM1 (см. фиг. 5b). Таким образом, можно определить, что mAb к LY75 и LY75_A1
- 46 042216 не являются конкурирующими антителами, при этом LY75_A1 распознает отличный и уникальный эпитоп LY75 по сравнению с другими антителами к LY75.
Пример 24. Установление характеристик эпитопа для LY75 A1 при помощи микроматричного анализа пептидов.
Способ.
Микроматричный анализ пептидов осуществляли в LC Sciences, Хьюстон, Техас, при этом вкратце способ включал следующие этапы: синтезировали смежные 8-мерные пептиды белка LY75, перекрывающиеся по одной аминокислоте, охватывающие остатки 216-1666 белка LY75 полной длины, и иммобилизовали на микроматричном чипе. Чип содержал три панели, так что эксперимент проводили в трех повторностях. Микроматрицу исследовали с использованием LY75_A1 для идентификации пептидов, с которыми связывалось антитело. Анализ связывания проводили при следующих условиях.
Микроматрицу, содержащую смежные пептиды в трех повторностях, промывали 1 мл буфера для связывания при 4°C в течение 20 мин. Затем ее инкубировали с 1 мкг/мл LY75_A1 в буфере для связывания (pH 7,0) при 4°C в течение 2 ч. Матрицу еще раз промывали 0,5 мл промывочного буфера при 4°C в течение 30 мин, затем инкубировали с 25 нг/мл конъюгата антитела к IgG человека с Alexa 647 в буфере для связывания (pH 7,0) при 4°C в течение 1 ч. Матрицу еще раз промывали 0,5 мл промывочного буфера при 4°C в течение 30 мин.
Затем матрицу сканировали при 635 нм и PMT 500 и регистрировали интенсивность сигнала. Пептид классифицировали как выявляемый, если он присутствовал по меньшей мере в 2/3 допустимых дублирующих проб. Среднюю интенсивность сигнала для повторностей представляли как конечную интенсивность сигнала.
Результаты.
Как показано на фиг. 6, антитело LY75_A1 характеризовалось специфичным связыванием с рядом пептидов, расположенных на матрице. Максимальный уровень сигнала, наблюдаемый для связывания с LY75_A1, составлял 25000 (шкала 1-65535), при этом средний уровень сигнала для всех пятен на матрице составлял приблизительно 885. Интенсивность сигнала, равную 3000, устанавливали в качестве точки отсечения фона, обусловленного неспецифичным связыванием. Исходя из наблюдаемого уровня интенсивности сигнала связывания с антителом идентифицировали потенциальные последовательности, образующие эпитоп для LY75_A1. Эти области показаны на фиг. 6a-6j и под SEQ ID NO: 22-31.
Пример 25. Анализ пептидов по методу соосаждения с использованием LY75 A1.
Способ.
1.1. Анализ по методу соосаждения.
Рекомбинантный белок LY75 расщепляли путем триптического протеолиза белка, связанного с гранулами (Promega, США). Полученные в результате расщепления пептиды извлекали при помощи колонки для захвата C18 (Thermo Fisher Scientific). Затем очищенные пептиды инкубировали с 200 мкл гранул с белком A, сшитым с антителом LY75_A1, в течение ночи при 4°C. На следующий день отбирали несвязанные пептиды, при этом гранулы два раза промывали 1 мл PBS. Пептиды, связанные с антителом, элюировали из гранул путем их нагревания при 90°C в 100 мкл PBS в течение 5 мин. Повторяли этот этап элюирования.
1.2. Масс-спектрометрия.
Образцы анализировали при помощи жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией с использованием системы Waters nanoACQUITY UPLC, оснащенной колонкой nanoACQUITY UPLC BEH 130 C18, 75 мкмх250 мм (186003545) и LTQ Orbitrap Velos (Thermo Fisher Scientific). Пептиды элюировали с использованием градиента с увеличением количества ацетонитрила от 3 до 35% при скорости 300 нл/мин в течение 120 мин. Получали масс-спектры в режиме полного сканирования при разрешающей способности 60000 в диапазоне массы 400-2000 масса/заряд с использованием Orbitrap. В каждом цикле отбирали двадцать пептидов, характеризующихся наибольшей интенсивностью, для сканирований посредством CID MS/MS в линейной ионной ловушке с нанораспылительным источником ионов, установленным на приборе.
1.3. Анализ аминокислотной последовательности пептида.
Необработанные данные, полученные с использованием LTQ Orbitrap Velos, обрабатывали при помощи программного обеспечения Mascot (Matrix Science), в котором используется алгоритм Mowse (Curr. Biol., 1993 Jun 1, 3(6):327-3) для выведения последовательностей аминокислот исходя из набора пиков, путем поиска по базе данных последовательностей, состоящей из Ensembl (http://www.ensembl.org/index.html), IPI (www.ebi.ac.uk/IPI/IPIhuman.html) и SwissProt (http://www.uniprot.org) вместе с последовательностями белков-контаминантов. Критерии идентификации пептидов включали расщепление трипсином до 2 отсутствующих сайтов расщепления и различные биологические и химические модификации (окисленный метионин, модификация цистеина с помощью MMTS или йодацетамида и фосфорилирование серина, треонина и тирозина). Пептиды, которым присваивали ранг 1 при ожидаемом значении 0,05% или меньше, степени совпадения спектров 28 или больше, загружали в базу данных OGAP.
1.4. Распознавание пептидов, ассоциированных с LY75.
В способе идентификации LY75 использовали пептидные последовательности, полученные экспе- 47 042216 риментальным путем при помощи масс-спектрометрии, как описано выше, встречающихся в природе белков человека для идентификации и упорядочивания кодирующих экзонов в опубликованной геномной последовательности человека. Эти экспериментально определенные последовательности сравнивали с базой данных OGAP®, которая была скомпилирована путем обработки и интеграции масс пептидов, сигнатур пептидов, EST и общедоступных данных геномных последовательностей, как описано в международной патентной заявке WO 2009/087462.
Результаты.
Результаты анализа пептидов по методу соосаждения с использованием антитела LY75_A1 показаны в табл. 1 ниже и на фиг. 7. Пептиды, которые были идентифицированы при обоих элюированиях пептидов 1a и 1b в анализе по методу соосаждения и в микроматричном анализе, считались наиболее вероятными кандидатами для образования эпитопа.
Таблица 1
Сравнение экспериментов с микроматричным анализом пептидов и соосаждением пептидов
SEQ ГО NO: Пептид, идентифицированный при помощи микроматричного анализа Пептид, идентифицированный при помощи анализа по методу соосаждения
Область 1 (аминокислоты 609-618) -
Область 2 (аминокислоты 651-662) -
46 Область 3 (аминокислоты 761-780) GWHFYDDR (765-772)
47 Область 4 (аминокислоты 883-901) ISEWPIDDHFTYSR(877-890)
48 FPVTFGEECLYMSAK(896-910)
49 Область 5 (аминокислоты 1029-1040) ELTYSNFHPLLVSGR (1030-1044)
50 Область 6 (аминокислоты 1077-1093) HFVSLCQK (1084-1091)
51 Область 7 (аминокислоты 1107-1118) QTLQNASETVK (1099-1109)
Область 8 (аминокислоты 1368-1378) -
Область 9 (аминокислоты 1518-1528) -
Область 10 (аминокислоты 1535-1554) -
В табл. 1 показано, что ряд перекрывающихся областей пептидов LY75 был идентифицирован как в микроматричном анализе пептидов, так и при обоих элюированиях 1a и 1b в анализе пептидов по методу соосаждения. Считалось, что эти области с наибольшей долей вероятности содержат эпитоп, распознаваемый антителом LY75_A1, поскольку они связываются с LY75_A1 при исследовании с помощью обеих используемых методик.
Пример 26.
Определенное количество активированных B-клеток из линий клеток диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (ABC-DLBCL) (т.е. линий клеток TMD8 и HBL1) подвергали воздействию возрастающих доз LY75_DM4 (т.е. 0,018 - 0,037 - 0,075 - 0,15 - 0,3 - 0,6 - 1,2 нМ) либо отдельно, либо в комбинации с увеличивающимися дозами ритуксимаба (2,34 - 4,68 - 9,37 - 18,75 - 37,5 - 75 - 150 нМ) или ибрутиниба (15,6 - 31,2 - 62,5 - 125 - 250 - 500 - 1000 нМ) в течение 72 ч. За этим следовал анализ с использованием MTT [3-(4,5-диметилтиазолил-2)-2,5-дифенилтетразолбромида].
Показатель аддитивности Чоу-Талалая (CI) оценивали с применением пакета Synergy R (Preclinical versus Clinical Drugs Combination Studies, Chou T.C., Leuk., Lymphoma., 2008;49(11):2059-2080). Он обеспечивает количественное определение сильного синергического эффекта (<0,3), синергического эффекта (0,3-0,9), аддитивного эффекта (0,9-1,1) или антагонизма/отсутствия благоприятного эффекта (>1,1).
На фиг. 8a, 8b показаны синергические эффекты, наблюдаемые между LY75_DM4 и ритуксимабом. На фиг. 9 показаны синергические эффекты, наблюдаемые между LY75_DM4 и ибрутинибом. Дополнительные данные показаны в табл. 2, 3 и 4 ниже.
- 48 042216
Таблица 2 Показатель аддитивности Чоу-Талалая (CI) для различных доз LY75_DM4 в комбинации с ритуксимабом в отношении трех линий клеток TMD8 ABC-DLBCL
Ритуксимаб (нМ) LY75_DM4 (нМ) CI
1 2,3438 0,01875 17,124
2 2,3438 0,075 0,225
3 2,3438 0,15 0,346
4 2,3438 0,3 0,583
5 2,3438 0,6 1,165
6 2,3438 1,2 2,514
7 2,3438 0,0375 0,145
8 4,6875 0,01875 1,499
9 4,6875 0,0375 0,147
10 4,6875 0,075 0,216
11 4,6875 0,15 0,346
12 4,6875 0,3 0,628
13 4,6875 0,6 1,165
14 4,6875 1,2 2,514
15 9,375 0,01875 2,918
16 9,375 0,0375 0,144
17 9,375 0,075 0,219
18 9,375 0,15 0,332
19 9,375 0,3 0,583
20 9,375 0,6 1,025
21 9,375 1,2 2,514
22 18,75 0,01875 0,8
- 49 042216
23 18,75 0,0375 0,145
24 18,75 0,075 0,213
25 18,75 0,15 0,346
26 18,75 0,3 0,628
27 18,75 0,6 1,165
28 18,75 1,2 2,514
29 37,5 0,01875 11,427
30 37,5 0,075 0,216
31 37,5 0,15 0,332
32 37,5 0,3 0,583
33 37,5 0,6 1,165
34 37,5 1,2 2,655
35 37,5 0,0375 0,151
36 75 0,01875 0,216
37 75 0,0375 0,147
38 75 0,075 0,209
39 75 0,15 0,332
40 75 0,3 0,628
41 75 0,6 1,165
42 75 1,2 2,514
43 150 0,01875 45,466
44 150 0,0375 0,152
45 150 0,075 0,209
46 150 0,15 0,332
47 150 0,3 0,628
48 150 0,6 1,257
49 150 1,2 2,770
- 50 042216
Таблица 3 Показатель аддитивности Чоу-Талалая (С1)для различных доз LY75_DM4 в комбинации с ритуксимабом в отношении трех линий клеток HBL-1 ABC-DLBCL
Ритуксимаб (нМ) LY75 DM4 (нМ) CI
1 2,3438 0,0188 0,534
2 2,3438 0,0750 0,958
3 2,3438 0,1500 0,603
4 2,3438 0,3000 0,509
5 2,3438 0,6000 0,454
6 2,3438 1,2000 0,817
7 2,3438 0,0375 0,413
8 4,6875 0,0188 0,568
9 4,6875 0,0375 0,837
10 4,6875 0,0750 0,919
11 4,6875 0,1500 0,635
12 4,6875 0,3000 0,580
13 4,6875 0,6000 0,501
14 4,6875 1,2000 0,908
15 9,375 0,0188 0,249
16 9,375 0,0375 1,576
17 9,375 0,0750 0,717
18 9,375 0,1500 0,439
19 9,375 0,3000 0,618
20 9,375 0,6000 0,501
21 9,375 1,2000 0,908
22 18,75 0,0188 0,787
23 18,75 0,0375 0,497
- 51 042216
24 18,75 0,0750 0,562
25 18,75 0,1500 0,545
26 18,75 0,3000 0,510
27 18,75 0,6000 0,366
28 18,75 1,2000 0,817
29 37,50 0,0375 0,734
30 37,50 0,0750 0,548
31 37,50 0,0188 0,543
32 37,50 0,1500 0,465
33 37,50 0,3000 0,476
34 37,50 0,6000 0,324
35 37,50 1,2000 0,648
36 75 0,0188 0,442
37 75 0,0375 1,578
38 75 0,0750 0,432
39 75 0,1500 0,493
40 75 0,3000 0,383
41 75 0,6000 0,409
42 75 1,2000 0,908
43 150 0,0188 0,680
44 150 0,0375 0,640
45 150 0,0750 0,911
46 150 0,1500 0,498
47 150 0,3000 0,355
48 150 0,6000 0,366
49 150 1,2000 0,817
- 52 042216
Таблица 4 Показатель аддитивности Чоу-Талалая (CI) для различных доз LY75 DM4 в комбинации с ибрутинибом в отношении _______трех линий клеток HBL-1 ABC-DLBCL_______
Ибрутиниб (нМ) LY75_DM4 (нМ) CI
1 1,5625 0,01875 0,481
2 1,5625 0,0375 0,627
3 1,5625 0,075 0,862
4 1,5625 0,15 0,360
5 1,5625 0,3 0,287
6 1,5625 0,6 0,270
7 1,5625 1,2 0,343
8 3,125 0,01875 0,411
9 3,125 0,0375 0,358
10 3,125 0,075 0,461
11 3,125 0,15 0,287
12 3,125 0,3 0,251
13 3,125 0,6 0,246
14 3,125 1,2 0,394
15 6,25 0,01875 0,204
16 6,25 0,0375 0,219
17 6,25 0,075 0,275
18 6,25 0,15 0,226
19 6,25 0,3 0,216
20 6,25 0,6 0,222
21 6,25 1,2 0,343
22 12,5 0,01875 0,205
23 12,5 0,0375 0,152
24 12,5 0,075 0,287
- 53 042216
25 12,5 0,15 0,217
26 12,5 0,3 0,228
27 12,5 0,6 0,222
28 12,5 1,2 0,343
29 25 0,01875 0,152
30 25 0,0375 0,183
31 25 0,075 0,202
32 25 0,15 0,199
33 25 0,3 0,193
34 25 0,6 0,222
35 25 1,2 0,343
36 50 0,01875 0,374
37 50 0,0375 0,473
38 50 0,075 0,287
39 50 0,15 0,192
40 50 0,3 0,194
41 50 0,6 0,246
42 50 1,2 0,394
43 100 0,01875 0,715
44 100 0,0375 0,748
45 100 0,075 0,457
46 100 0,15 0,187
47 100 0,3 0,195
48 100 0,6 0,222
49 100 1,2 0,394
- 54 042216
Последовательности
SEQ ID NO Описание Последовательность
1 А. к. A1VH EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTYSNAWMSWVRQAPGKTLE WVGRIKSKTDGGTTDYAAPVQGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDT AVYYCTIFGWSFDYWGQGTLVTVSS
2 А. к. A1VL DVQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISDYLSWYQQRPGKAPNLLI YAASNLKTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISTLQPEDFATYYCQQSYRSPW TFGQGTKVEIKR
3 Нуклеотиды A1VH gaggtgcagctggtggagtctgggggaggcttggtaaagccgggggggtcccttagactctcctgtgcagcc tctggcttcacttacagtaacgcctggatgagctgggtccgccaggctccagggaaggggctggagtgggttg gccgtattaaaagcaaaactgatggtgggacaacagactacgctgcacccgtgcaaggcagattcaccatctc aagagatgattcaaaaaacacgctgtatctgcaaatgaacagcctgaaaaccgaggacacagccgtgtattac tgtacgatttttggagtggttagctttgactactggggccagggaaccctggtcaccgtctcctca
4 Нуклеотиды A1VL gacgtccagatgacccagtctccatcctccctgtctgcatctgttggagacagagtcaccatcacttgccgggc aagtcagagcattagcgactatttaagttggtatcagcagagaccagggaaagcccctaacctcctgatctatg ctgcatccaatttaaagactggggtcccatcaaggttcagtggcagtggatctgggacagatttcactctcacca tcagcactctgcaacctgaagattttgcaacgtactactgtcaacagagttacaggtccccgtggacgttcggcc aagggaccaaggtggaaatcaaacga
5 А. к. A1VHCDR1 NAWMS
6 А. к. A1VHCDR2 RIKSKTDGGTTDYAAPVQG
7 А. к. A1VHCDR3 FGWSFDY
8 А. к. A1VLCDR1 RASQSISDYLS
9 А. к. A1VLCDR2 AASNLKT
10 А. к. QQSYRSPWT
- 55 042216
A1VLCDR3
11 VH3|315/D4|411 EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSNAWMSWVRQAPGKGLE WVGRIKSKTDGGTTDYAAPVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDT AVYYCTTTTVT
12 JH4 YFDYWGQGTLVTVSS
13 012 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIY AASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYS
14 JK1 WTFGQGTKVEIKR
15 LY75 (DEC205) MRTGWATPRRPAGLLMLLFWFFDLAEPSGRAANDPFTIVHGNTGKCI KPVYGWIVADDCDETEDKLWKWVSQHRLFHLHSQKCLGLDITKSVN ELRMFSCDSSAMLWWKCEHHSLYGAARYRLALKDGHGTAISNASDV WKKGGSEESLCDQPYHEIYTRDGNSYGRPCEFPFLIDGTWHHDCILDE DHSGPWCATTLNYEYDRKWGICLKPENGCEDNWEKNEQFGSCYQFN TQTALSWKEAYVSCQNQGADLLSINSAAELTYLKEKEGIAKIFWIGLN QLYSARGWEWSDHKPLNFLNWDPDRPSAPTIGGSSCARMDAESGLW QSFSCEAQLPYVCRKPLNNTVELTDVWTYSDTRCDAGWLPNNGFCY LLVNESNSWDKAHAKCKAFSSDLISIHSLADVEVWTKLHNEDIKEEV WIGLKNINIPTLFQWSDGTEVTLTYWDENEPNVPYNKTPNCVSYLGE LGQWKVQSCEEKLKYVCKRKGEKLNDASSDKMCPPDEGWKRHGET CYKIYEDEVPFGTNCNLTITSRFEQEYLNDLMKKYDKSLRKYFWTGL RDVDSCGEYNWATVGGRRRAVTFSNWNFLEPASPGGCVAMSTGKSV GKWEVKDCRSFKALSICKKMSGPLGPEEASPKPDDPCPEGWQSFPAS LSCYKVFHAERIVRKRNWEEAERFCQALGAHLSSFSHVDEIKEFLHFL TDQFSGQHWLWIGLNKRSPDLQGSWQWSDRTPVSTIIMPNEFQQDYD IRDCAAVKVFHRPWRRGWHFYDDREFIYLRPFACDTKLEWVCQIPKG RTPKTPDWYNPDRAGIHGPPLIIEGSEYWFVADLHLNYEEAVLYCASN HSFLATITSFVGLKAIKNKIANISGDGQKWWIRISEWPIDDHFTYSRYP WHRFPVTFGEECLYMSAKTWLIDLGKPTDCSTKLPFICEKYNVSSLEK YSPDSAAKVQCSEQWIPFQNKCFLKIKPVSLTFSQASDTCHSYGGTLP SVLSQIEQDFITSLLPDMEATLWIGLRWTAYEKINKWTDNRELTYSNF HPLLVSGRLRIPENFFEEESRYHCALILNLQKSPFTGTWNFTSCSERHF VSLCQKYSEVKSRQTLQNASETVKYLNNLYKIIPKTLTWHSAKRECL KSNMQLVSITDPYQQAFLSVQALLHNSSLWIGLFSQDDELNFGWSDG KRLHFSRWAETNGQLEDCWLDTDGFWKTVDCNDNQPGAICYYSGN ETEKEVKPVDSVKCPSPVLNTPWIPFQNCCYNFIITKNRHMATTQDEV HTKCQKLNPKSHILSIRDEKENNFVLEQLLYFNYMASWVMLGITYRN
- 56 042216
KSLMWFDKTPLSYTHWRAGRPTIKNEKFLAGLSTDGFWDIQTFKVIE EAVYFHQHSILACKIEMVDYKEEYNTTLPQFMPYEDGIYSVIQKKVT WYEALNMCSQSGGHLASVHNQNGQLFLEDIVKRDGFPLWVGLSSHD GSESSFEWSDGSTFDYIPWKGQTSPGNCVLLDPKGTWKHEKCNSVKD GAICYKPTKSKKLSRLIYSSRCPAAKENGSRWIQYKGHCYKSDQALH SFSEAKKLCSKHDHSATIVSIKDEDENKFVSRLMRENNNITMRVWLG LSQHSVDQSWSWLDGSEVTFVKWENKSKSGVGRCSMLIASNETWKK VECEHGFGRWCKVPLGPDYTAIAIIVATLSILVLMGGLIWFLFQRHRL HLAGFSSVRYAQGVNEDEIMLPSFHD
16 A1VHFR1 EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTYS
17 A1VHFR2 WVRQAPGKGLEWVG
18 A1VHFR3 RFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCTI
19 A1VHFR4 WGQGTLVTVSS
20 A1VLFR1 DVQMTQSPSSLSASVGDRVTITC
21 A1VLFR2 WYQQRPGKAPNLLIY
22 A1VLFR3 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISTLQPEDFATYYC
23 A1VLFR4 FGQGTKVEIKR
24 LY75, 609-618 WEVKDCRSFK
25 LY75, 651-662 PASLSCYKVFHA
26 LY75, 761-780 PWRRGWHFYDDREFIYLRPF
27 LY75, 883-901 DDHFTYSRYPWHRFPVTFG
28 LY75, 1029- 1040 RELTYSNFHPLL
29 LY75, 1077- 1093 FTSCSERHFVSLCQKYS
30 LY75, HOT- HIS TVKYLNNLYKII
31 LY75, 1368- EAVYFHQHSIL
- 57 042216
1378
32 LY75, 1518- 1528 KKLSRLTYSSC
33 LY75, 1535- 1554 NGSRWIQYKGHCYKSDQALH
34 LY75, 877-901 ISEWPIDDHFTYSRYPWHRFPVTFG
35 LY75, 1099- 1118 QTLQNASETVKYLNNLYKII
36 LY75, 883-892 DDHFTYSRYP
37 LY75, 1077- 1091 FTSCSERHFVSLCQK
38 VH ритуксимаба QVQLQQPGAELVKPGASVKMSCKASGYTFTSYNMHWVKQTPGRGL EWIGAIYPGNGDTSYNQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSA VYYCARSTYYGGDWYFNVWGAGTTVTVSAASTKGPSVFPLAPSSKS TSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQS SGLYSLSSWTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKAEPKSCDKTH TCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEV KFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKE YKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRD ELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSF FLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
39 VL ритуксимаба QIVLSQSPAILSASPGEKVTMTCRASSSVSYIHWFQQKPGSSPKPWIYA TSNLASGVPVRFSGSGSGTSYSLTISRVEAEDAATYYCQQWTSNPPTF GGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASWCLLNNFYPREAKV QWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVY ACEVTHQGLS SPVTKSFNRGEC
40 Ритуксимаб, VHCDR1 SYNMH
41 Ритуксимаб, AIYPGNGDTSYNQKFKG
- 58 042216
VH_CDR2
42 Ритуксимаб, VH_CDR3 STYYGGDWYFNV
43 Ритуксимаб, VLCDR1 RASSSVSYIH
44 Ритуксимаб, VL_CDR2 ATSNLAS
45 Ритуксимаб, VLCDR3 QQWTSNPPTF
46 (765-772) GWHFYDDR
47 (877-890) ISEWPIDDHFTYSR
48 (896-910) FPVTFGEECLYMSAK
49 (1030-1044) ELTYSNFHPLLVSGR
50 (1084-1091) HFVSLCQK
51 (1099-1109) QTLQNASETVK
52 Линкер Gly-Phe-Leu-Gly
Перечень последовательностей в произвольном формате текста.
SEQ Ю NO: 38 <223> последовательность VH ритуксимаба
SEQ ID NO: 39 <223> последовательность VL ритуксимаба
SEQ ID NO: 40 <223> VH CDR1 ритуксимаба
SEQ ID NO: 41 <223> VH CDR2 ритуксимаба
SEQ ID NO: 42 <223> VH CDR3 ритуксимаба
SEQ ID NO: 43 <223> VL CDR1 ритуксимаба
SEQ ID NO: 44 <223> VL CDR2 ритуксимаба
SEQ ID NO: 45 <223> VL CDR3 ритуксимаба
SEQ ID NO: 52 <223> Линкер
SEQ ID NO: 53-163 <223> Пептид
SEQ ID NO: 165-207 <223> Пептид

Claims (9)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Фармацевтическая комбинация, содержащая (A) (i) антитело к LY75 или его антигенсвязывающую часть, при этом указанное антитело или часть содержит
    a) вариабельную область тяжелой цепи, содержащую
    i) первую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 5;
    ii) вторую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 6; и iii) третью vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 7; и
    b) вариабельную область легкой цепи, содержащую
    i) первую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 8;
    ii) вторую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 9; и iii) третью vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 10; или (ii ) антитело к LY75 или его антигенсвязывающую часть, при этом указанное антитело или часть содержит
    a) вариабельную область тяжелой цепи, содержащую
    i) первую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 5;
    ii) вторую vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 6; и iii) третью vhCDR, содержащую SEQ ID NO: 7; и
    b) вариабельную область легкой цепи, содержащую
    i) первую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 8;
    ii) вторую vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 9; и iii) третью vlCDR, содержащую SEQ ID NO: 10, где любые одна или более из вышеуказанных SEQ ID NO независимо содержат одну или две аминокислотные замены, где антитело к LY75 или его антигенсвязывающая часть ковалентно присоединены к лекарственному средству, где указанное лекарственное средство представляет собой майтанзиноидное лекартвенное средство 1 (DM1) или майтанзиноидное лекарственное средство 4 (DM4); и (B ) ритуксимаб, где фармацевтическая комбинация находится в форме комбинированного препарата, подходящего для одновременного, раздельного или последовательного применения для лечения диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (DLBCL).
  2. 2. Фармацевтическая комбинация по п.1, где любые одна или более из SEQ ID NO: 5-10 независимо содержат одну или две консервативные аминокислотные замены.
  3. 3. Фармацевтическая комбинация по п.1 или 2, где антитело или его антигенсвязывающая часть способны к интернализации.
  4. 4. Фармацевтическая комбинация по любому из пп.1-3, где антитело к LY75 или его антигенсвязывающая часть содержат вариабельную область тяжелой цепи, характеризующуюся по меньшей мере 80, 85, 90, 95, 99 или 100% идентичностью с аминокислотной последовательностью под SEQ ID NO: 1, и вариабельную область легкой цепи, характеризующуюся по меньшей мере 80, 85, 90, 95, 99 или 100% идентичностью с аминокислотной последовательностью под SEQ ID NO: 2.
  5. 5. Фармацевтическая комбинация по любому из пп.1-4, где антитело к LY75 представляет собой моноклональное антитело IgG1 человека.
  6. 6. Фармацевтическая комбинация по любому из пп.1-5, где (A) и/или (B) дополнительно содержат один или более фармацевтически приемлемых разбавителей, вспомогательных веществ или носителей.
  7. 7. Способ лечения диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (DLBCL) у пациента, включающий одновременное, последовательное или раздельное введение пациенту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективных количеств компонентов (A) и (B) фармацевтической комбинации по любому из пп.1-6.
  8. 8. Способ по п.7, где антитело к LY75 или его антигенсвязывающая часть интернализируются клеткой, экспрессирующей LY75.
  9. 9. Применение фармацевтической комбинации по любому из пп.1-6 в терапии или в качестве лекарственного препарата.
EA201991845 2017-03-10 2018-03-09 Фармацевтические комбинации, содержащие антитело к ly75 EA042216B1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1703876.1 2017-03-10

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA042216B1 true EA042216B1 (ru) 2023-01-25

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20210371541A1 (en) Conjugated antiboides against ly75 for the treatment of cancer
US20220289851A1 (en) Pharmaceutical combinations comprising an anti-ly75 antibody
JP7489924B2 (ja) 医薬組合せ
EA042216B1 (ru) Фармацевтические комбинации, содержащие антитело к ly75
EA046736B1 (ru) Фармацевтические комбинации
NZ718617B2 (en) Conjugated antibodies against ly75 for the treatment of cancer