EA041301B1 - ANTIBODIES TO TIGIT - Google Patents
ANTIBODIES TO TIGIT Download PDFInfo
- Publication number
- EA041301B1 EA041301B1 EA201891989 EA041301B1 EA 041301 B1 EA041301 B1 EA 041301B1 EA 201891989 EA201891989 EA 201891989 EA 041301 B1 EA041301 B1 EA 041301B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- antibody
- seq
- tigit
- amino acid
- acid sequence
- Prior art date
Links
Description
Перекрестная ссылка на родственные заявкиCross-reference to related applications
По настоящей заявке испрашивается приоритет временной патентной заявки США № 62/304045, поданной 4 марта 2016 г., и временной патентной заявки США № 62/413025, поданной 26 октября 2016 г., описание которых включено в настоящую заявку посредством ссылки во всей их полноте.This application claims priority to U.S. Provisional Application No. 62/304045, filed March 4, 2016, and U.S. Provisional Application No. 62/413025, filed October 26, 2016, the disclosures of which are hereby incorporated by reference in their entirety. .
Область техники, к которой относится изобретениеThe field of technology to which the invention belongs
В настоящей заявке представлены, inter alia, моноклональные антитела, которые специфически связываются с молекулами иммунных контрольных точек, таким образом, приводя к существенной активации иммунных клеток, а также применение таких антител для лечения злокачественного новообразования и инфекционного заболевания, среди прочего.The present application provides, inter alia, monoclonal antibodies that specifically bind to immune checkpoint molecules, thus leading to significant activation of immune cells, as well as the use of such antibodies for the treatment of cancer and infectious disease, among others.
Уровень техникиState of the art
Антигенспецифический иммунный ответ представляет собой сложный биологический процесс, который контролируется несколькими уровнями положительных и отрицательных регуляторов. T-клетки изначально стимулируются через T-клеточный рецептор (TCR) путем распознавания их когнатного пептидного антигена, презентированного молекулами главного комплекса гистосовместимости (MHC) на антиген-презентирующих клетках. Для оптимальной T-клеточной активации требуется второй сигнал, обеспечиваемый костимуляторными молекулами, такими как CD28. Иммунный ответ затем положительно регулируется костимуляторными молекулами, такими как OX40, GITR и 4-1BB, которые относятся к суперсемейству рецепторов TNF, и отрицательно регулируется молекулами контрольных точек, такими как PD-1 и CTLA-4. Функция молекул контрольных точек заключается в предотвращении нежелательной чрезмерной реакции иммунной системы в организме; однако, они также ограничивают способность иммунной системы эффективно бороться со злокачественными новообразованиями и инфекционным заболеванием. Сообщалось о том, что блокирование функции PD-1 или CTLA-4 антагонистическим моноклональным IgG антителом эффективно для иммунотерапии злокачественных новоообразований у людей (см. обзор Pardoll, Nat. Rev. Cancer, 12:252-264, 2012; Mahoney et al., Nat. Rev. Drug Discov. 14:561-584, 2015; Shin et al., Curr. Opin. Immunol. 33:23-35, 2015; Marquez-Rodas et al. Ann. Transl. Med. 3:267, 2015).The antigen-specific immune response is a complex biological process that is controlled by several levels of positive and negative regulators. T cells are initially stimulated through the T cell receptor (TCR) by recognition of their cognate peptide antigen presented by major histocompatibility complex (MHC) molecules on antigen presenting cells. Optimal T cell activation requires a second signal provided by co-stimulatory molecules such as CD28. The immune response is then upregulated by costimulatory molecules such as OX40, GITR and 4-1BB, which belong to the TNF receptor superfamily, and downregulated by checkpoint molecules such as PD-1 and CTLA-4. The function of checkpoint molecules is to prevent unwanted overreaction of the immune system in the body; however, they also limit the ability of the immune system to effectively fight cancer and infection. Blocking PD-1 or CTLA-4 function with an antagonistic monoclonal IgG antibody has been reported to be effective for human cancer immunotherapy (reviewed by Pardoll, Nat. Rev. Cancer, 12:252-264, 2012; Mahoney et al., Nat. Rev. Drug Discov. 14:561-584, 2015; Shin et al., Curr. Opin. Immunol. 33:23-35, 2015; Marquez-Rodas et al. Ann. Transl. Med. 3:267, 2015).
Сообщалось о других молекулах контрольных точек, таких как TIM-3, LAG-3, TIGIT, BTLA и VISTA (Mercier et al., Front. Immunol. 6:418, 2015). TIGIT (T-клеточный иммунорецептор с Ig и ITIM доменами), член суперсемейства иммуноглобулинов с иммунорецепторным ингибиторным мотивом на основе тирозина (ITIM) в цитоплазматическом концевом сегменте, экспрессируется на подгруппах активированных T-клеток и природных киллерных (NK) клеток (Yu et al., Nat. Immunol. 10:48-57, 2009). Известно, что TIGIT взаимодействует с CD155 (также называемым PVR и necl-5), CD112 (также называемым PVRL2 и нектин-2) и возможно CD113 (также называемым PVRL3 и нектин-3) (Mercier et al., supra; Martinet et al., Nat. Rev. Immunol. 15:243-254, 2015). Сообщалсь, что связывание TIGIT с высокоаффинными лигандами CD155, которые экспрессируются на антигенпрезентирующих клетках, подавляет функцию T-клеток и NK клеток (Mercier et al., supra; Joller et al., J. Immunol. 186: 1338-1342, 2011; Stanietsky et al., Eur. J. Immunol. 43:2138-2150, 2013; Li et al., J. Biol. Chem. 289:17647-17657, 2014; Zhang et al. Cancer Immunol. Immunother. Epub on Feb. 3, 2016). Также сообщалось, что TIGIT ингибирует T-клетки опосредованно путем модуляции продукции цитокинов дендритными клетками (Yu et al., supra).Other checkpoint molecules such as TIM-3, LAG-3, TIGIT, BTLA and VISTA have been reported (Mercier et al., Front. Immunol. 6:418, 2015). TIGIT (T-cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains), a member of the immunoglobulin superfamily with a tyrosine-based immunoreceptor inhibitory motif (ITIM) in the cytoplasmic terminal segment, is expressed on subgroups of activated T cells and natural killer (NK) cells (Yu et al. , Nat Immunol 10:48-57, 2009). TIGIT is known to interact with CD155 (also called PVR and necl-5), CD112 (also called PVRL2 and nectin-2), and possibly CD113 (also called PVRL3 and nectin-3) (Mercier et al., supra; Martinet et al. ., Nat Rev Immunol 15:243-254, 2015). Binding of TIGIT to high-affinity CD155 ligands, which are expressed on antigen-presenting cells, has been reported to suppress T cell and NK cell function (Mercier et al., supra; Joller et al., J. Immunol. 186: 1338-1342, 2011; Stanietsky et al., Eur. J. Immunol. 43:2138-2150, 2013; Li et al., J. Biol. Chem. 289:17647-17657, 2014; Zhang et al. Cancer Immunol. Immunother. Epub on Feb. 3, 2016). TIGIT has also been reported to inhibit T cells indirectly by modulating dendritic cell cytokine production (Yu et al., supra).
Опухоли создают высокосупрессивное микроокружение, где инфильтрирующие T-клетки истощаются и NK клетки подавляются молекулами контрольных точек, такими как PD-1 и TIGIT, для уклонения от иммунных ответов (Johnston et al., Cancer Cell. 26:926-937, 2014; Chauvin et al., J. Clin. Invest. 125:20462058, 2015; Inozume et al., J. Invest. Dermatol. Epub on Oct 12, 2015). Как сообщалось, высокий уровень экспрессии TIGIT на CD8 + T-клетках коррелирует с плохим клиническим результатом у пациентов с AML (Kong et al., Clin. Cancer Res. Epub on Jan. 13, 2016). Функциональные дефекты истощенных TIGIT+ CD8+ T-клеток у пациентов с AML, как сообщалось, обратимы при миРНК-опосредованном нокдауне экспрессии TIGIT (Kong et al., supra). Также сообщалось, что эффекторные CD8+ T-клетки при инфекции ВИЧ в крови и инфекции ВСГ (вирус свиного гриппа) в лимфоидной ткани демонстрируют более высокие уровни TIGIT (Chew et al., PLOS Pathogens, 12:e1005349, 2016). Кроме того, сообщалось, что ex vivo блокирование TIGIT антителом восстанавливает вирус-специфические CD8+ T-клеточные эффекторные ответы.Tumors create a highly suppressive microenvironment where infiltrating T cells are depleted and NK cells are downregulated by checkpoint molecules such as PD-1 and TIGIT to evade immune responses (Johnston et al., Cancer Cell. 26:926-937, 2014; Chauvin et al., J. Clin. Invest. 125:20462058, 2015; Inozume et al., J. Invest. Dermatol. Epub on Oct 12, 2015). High levels of TIGIT expression on CD8+ T cells have been reported to correlate with poor clinical outcome in AML patients (Kong et al., Clin. Cancer Res. Epub on Jan. 13, 2016). Functional defects in TIGIT+ depleted CD8+ T cells in AML patients have been reported to be reversible by miRNA-mediated knockdown of TIGIT expression (Kong et al., supra). It has also been reported that effector CD8+ T cells in HIV infection in the blood and HCV (swine influenza virus) infection in lymphoid tissue show higher levels of TIGIT (Chew et al., PLOS Pathogens, 12:e1005349, 2016). In addition, ex vivo blocking of TIGIT with an antibody has been reported to restore virus-specific CD8+ T cell effector responses.
Раскрытие сущности изобретенияDisclosure of the essence of the invention
Изобретение относится к inter alia антителу, которое конкурирует с любым из TIG1, TIG2 или TIG3 за связывание с TIGIT человека. Антитело TIG1 характеризуется зрелой вариабельной областью легкой цепи SEQ ID NO: 14 и зрелой вариабельной областью тяжелой цепи SEQ ID NO: 10, антитело TIG2 характеризуется зрелой вариабельной областью легкой цепи SEQ ID NO: 22 и зрелой вариабельной областью тяжелой цепи SEQ ID NO: 18, и антитело TIG3 характеризуется зрелой вариабельной областью легкой цепи SEQ ID NO: 30 и зрелой вариабельной областью тяжелой цепи SEQ ID NO: 26, для специфического связывания с TIGIT. Некоторые антитела связываются с тем же самым эпитопом на TIGIT человека, что и TIG1, TIG2 или TIG3. Некоторые антитела ингибируют связывание TIGIT человека с CD155. Некоторые антитела включают три CDR легкой цепи и три CDR тяжелой цепи, по существу из соответствующих трех CDR легкой цепи и трех CDR тяжелой цепи из TIG1. Некоторые антитела включают три CDR легкой цепи и три CDR тяжелой цепи TIG1, TIG2 или TIG3. Некоторые антитела включают триThe invention relates, inter alia, to an antibody that competes with any of TIG1, TIG2 or TIG3 for binding to human TIGIT. The TIG1 antibody is characterized by the mature light chain variable region of SEQ ID NO: 14 and the mature heavy chain variable region of SEQ ID NO: 10, the TIG2 antibody is characterized by the mature light chain variable region of SEQ ID NO: 22 and the mature heavy chain variable region of SEQ ID NO: 18, and the TIG3 antibody is characterized by the mature light chain variable region of SEQ ID NO: 30 and the mature heavy chain variable region of SEQ ID NO: 26, for specific binding to TIGIT. Some antibodies bind to the same epitope on human TIGIT as TIG1, TIG2, or TIG3. Some antibodies inhibit the binding of human TIGIT to CD155. Some antibodies include three light chain CDRs and three heavy chain CDRs, essentially from the corresponding three light chain CDRs and three heavy chain CDRs from TIG1. Some antibodies include three light chain CDRs and three heavy chain CDRs TIG1, TIG2, or TIG3. Some antibodies include three
- 1 041301- 1 041301
CDR тяжелой цепи, определенные по номенклатуре Кэбота, и три CDR легкой цепи, определенные по номенклатуре Кэбота, любого из TIG1 (SEQ ID NO: 15-17 легкой цепи и 11-13 тяжелой цепи), TIG2 (SEQ ID NO: 23-25 легкой цепи, 19-21 тяжелой цепи) или TIG3 (SEQ ID NO: 31-33 легкой цепи и 27-29 тяжелой цепи).Heavy chain CDRs defined by Cabot nomenclature and three light chain CDRs defined by Cabot nomenclature, any of TIG1 (SEQ ID NO: 15-17 light chain and 11-13 heavy chain), TIG2 (SEQ ID NO: 23-25 light chain, 19-21 heavy chain) or TIG3 (SEQ ID NOs: 31-33 light chain and 27-29 heavy chain).
Некоторые моноклональные антитела связываются с эпитопом TIGIT человека, содержащим остатки 35 и 37 SEQ NO: 1 и/или остатки 49 и 51 SEQ ID NO: 1. Некоторые моноклональные антитела связываются с эпитопом TIGIT человека, содержащим остатки 35, 37, 49 и 51 SEQ ID NO: 1. Некоторые моноклональные антитела связываются с пептидом, состоящим из остатков 35-51 SEQ ID NO: 1 и не более чем пяти фланкирующих аминокислот из SEQ ID NO: 1 с обеих сторон. Некоторые моноклональные антитела связываются с пептидом, состоящим из остатков 35-51 SEQ ID NO: 1. Некоторые такие моноклональные антитела связываются с эпитопом, состоящим из 3-20 смежных остатков SEQ ID NO: 1.Some monoclonal antibodies bind to the human TIGIT epitope containing residues 35 and 37 of SEQ NO: 1 and/or residues 49 and 51 of SEQ ID NO: 1. Some monoclonal antibodies bind to the human TIGIT epitope containing residues 35, 37, 49 and 51 of SEQ ID NO: 1. Some monoclonal antibodies bind to a peptide consisting of residues 35-51 of SEQ ID NO: 1 and no more than five flanking amino acids from SEQ ID NO: 1 on both sides. Some monoclonal antibodies bind to a peptide consisting of residues 35-51 of SEQ ID NO: 1. Some such monoclonal antibodies bind to an epitope consisting of 3-20 contiguous residues of SEQ ID NO: 1.
Некоторые антитела являются химерными, гуманизированными, венированными или человеческими. Некоторые антитела имеют IgG1 каппа изотип человека. Некоторые антитела имеют IgG4 каппа изотип человека. Антитело может представлять собой интактное антитело или одноцепочечное антитело, Fab или F(ab')2 фрагмент.Some antibodies are chimeric, humanized, veneered, or human. Some antibodies have the human IgG1 kappa isotype. Some antibodies have the human IgG4 kappa isotype. The antibody may be an intact antibody or a single chain antibody, Fab or F(ab')2 fragment.
Изобретение также относится к фармацевтической композиции, содержащей любое из указанных выше антител и фармацевтически приемлемый носитель.The invention also relates to a pharmaceutical composition containing any of the above antibodies and a pharmaceutically acceptable carrier.
Изобретение также относится к способам лечения или осуществления профилактики злокачественного новообразования у пациента, включающим введение пациенту, страдающему злокачественным новообразованием или имеющему повышенный риск развития злокачественного новообразования, любого из указанных выше антител в эффективном режиме. В некоторых способах пациент страдает острым миелоидным лейкозом или T-клеточным лейкозом взрослых.The invention also relates to methods for treating or preventing cancer in a patient, comprising administering to a patient suffering from cancer or having an increased risk of developing cancer, any of the above antibodies in an effective manner. In some methods, the patient is suffering from acute myeloid leukemia or adult T-cell leukemia.
В других вариантах осуществления настоящее изобретение относится к применению антител, описанных в настоящей заявке, в комбинации с ингибиторами иммунных контрольных точек. Было показано, что блокада иммунных контрольных точек, которая приводит к амплификации антигенспецифеских T-клеточных ответов, является перспективным подходом в лечении злокачественного новообразования у человека. Примеры иммунных контрольных точек (лигандов и рецепторов), некоторые из которых селективно активируются при регуляции в различных типах опухолевых клеток, которые являются кандидатами для блокады, включают PD-1 (белок запрограммированной клеточной гибели 1); PD-L1 (лиганд запрограммированной клеточной гибели-1); BTLA (B и T лимфоцитарный аттенюатор); CTLA-4 (антиген 4 цитотоксических T-лимфоцитов); TIM-3 (Т-клеточный мембранный белок 3); LAG-3 (ген активации лимфоцитов 3); V-доменный иммуноглобулиновый супрессор T-клеточной активации (VISTA); CD96; A2aR (аденозиновый A2a рецептор); A2bR (аденозиновый A2b рецептор); CD73 (экто-5'-нуклеотидаза); CD39 (ENTPD1, NTPDasel); Аргиназу; индоламин-пиррол 2,3-диоксигеназу (IDO); триптофан 2,3диоксигеназу (TDO) и ингибирующие рецепторы киллеров. Ингибиторы иммунных контрольных точек и комбинированная терапия с использованием таких ингибиторов обсуждаются подробно в настоящей заявке.In other embodiments, the implementation of the present invention relates to the use of antibodies described in this application, in combination with inhibitors of immune checkpoints. Blockade of immune checkpoints, which leads to the amplification of antigen-specific T-cell responses, has been shown to be a promising approach in the treatment of human cancer. Examples of immune checkpoints (ligands and receptors), some of which are selectively upregulated in various tumor cell types that are candidates for blockade, include PD-1 (programmed cell death protein 1); PD-L1 (programmed cell death ligand-1); BTLA (B and T lymphocyte attenuator); CTLA-4 (antigen 4 cytotoxic T-lymphocytes); TIM-3 (T cell membrane protein 3); LAG-3 (lymphocyte activation gene 3); V-domain immunoglobulin suppressor of T-cell activation (VISTA); CD96; A2aR (adenosine A2a receptor); A2bR (adenosine A2b receptor); CD73 (ecto-5'-nucleotidase); CD39 (ENTPD1, NTPDasel); Arginase; indolamine-pyrrole 2,3-dioxygenase (IDO); tryptophan 2,3 dioxygenase (TDO) and inhibitory killer receptors. Immune checkpoint inhibitors and combination therapy using such inhibitors are discussed in detail in this application.
Изобретение также обеспечивает способы лечения индивида, инфицированного патогеном, включающие введение индивиду любого из указанных выше антител в эффективном режиме. В некоторых способах патоген представляет собой ВИЧ или ВСГ. В других способах патоген представляет собой вирусный, бактериальный, грибковый или простейший патоген.The invention also provides methods for treating an individual infected with a pathogen, comprising administering to the individual any of the above antibodies in an effective manner. In some methods, the pathogen is HIV or HCV. In other methods, the pathogen is a viral, bacterial, fungal, or protozoan pathogen.
В дополнительных аспектах в настоящей заявке представлено анти-TIGIT антитело, которое связывается с полипептидом TIGIT на одном или нескольких аминокислотных остатках, включающих D51, где полипептид TIGIT имеет аминокислотную последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления антитело представляет собой моноклональное антитело. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело является химерным, гуманизированным или венированным. В некоторых вариантах осуществления антитело представляет собой человеческое антитело. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело не связывается с одним или несколькими аминокислотными остатками, включающими L44, 147 или H55. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело включает зрелую вариабельную область легкой цепи SEQ ID NO: 14 и зрелую вариабельную область тяжелой цепи SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело связывается с тем же с эпитопом, что и TIG1, в аминокислотной последовательности, соответствующей SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело включает три CDR легкой цепи, включающие SEQ ID NO: 15-17, и три CDR тяжелой цепи, включающие SEQ ID NO: 11-13. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело содержит зрелую вариабельную область тяжелой цепи, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности SEQ ID NO: 35, и зрелую вариабельную область легкой цепи, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности SEQ ID NO: 37. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи включает аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, и зреIn additional aspects, provided herein is an anti-TIGIT antibody that binds to a TIGIT polypeptide at one or more amino acid residues including D51, wherein the TIGIT polypeptide has an amino acid sequence corresponding to SEQ ID NO: 1. In some embodiments, the antibody is a monoclonal antibody . In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody is chimeric, humanized, or veneered. In some embodiments, the antibody is a human antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed in this application, the antibody does not bind to one or more amino acid residues, including L44, 147 or H55. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody comprises a mature light chain variable region of SEQ ID NO: 14 and a mature heavy chain variable region of SEQ ID NO: 10. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein application, the antibody binds to the same epitope as TIG1 at the amino acid sequence corresponding to SEQ ID NO: 1. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody comprises three light chain CDRs comprising SEQ ID NO: : 15-17, and three heavy chain CDRs comprising SEQ ID NOs: 11-13. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody comprises a mature heavy chain variable region that is at least 90% identical to the sequence of SEQ ID NO: 35 and a mature light chain variable region that is at least 90 % is identical to the sequence of SEQ ID NO: 37. In some embodiments, the mature heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 35, and the mature
- 2 041301 лая вариабельная область легкой цепи включает аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, зрелая вариабельная область тяжелой цепи связана с константной областью тяжелой цепи, включающей SEQ ID NO: 40, при условии, что C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелая вариабельная область легкой цепи связана с константной областью легкой цепи, включающей SEQ ID NO: 41.- 2 041301 the light chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the mature heavy chain variable region is linked to a heavy chain constant region comprising SEQ ID NO: 40, with the proviso that a C-terminal lysine may or may not be present and the mature light chain variable region is linked to a light chain constant region comprising SEQ ID NO: 41.
В следующих аспектах в настоящей заявке представлено моноклональное антитело, которое конкурирует с любым из TIG1, TIG2 или TIG3 за связывание с человеческим TIGIT, где антитело TIG1 характеризуется зрелой вариабельной областью легкой цепи SEQ ID NO: 14 и зрелой вариабельной областью тяжелой цепи SEQ ID NO: 10, антитело TIG2 характеризуется зрелой вариабельной областью легкой цепи SEQ ID NO: 22 и зрелой вариабельной областью тяжелой цепи SEQ ID NO: 18, и антитело TIG3 характеризуется зрелой вариабельной областью легкой цепи SEQ ID NO: 30 и зрелой вариабельной областью тяжелой цепи SEQ ID NO: 26, для специфического связывания с CD155. В некоторых вариантах осуществления антитело связывается с тем же самым с эпитопом на человеческом TIGIT, что и любое из TIG1, TIG2 или TIG3. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело ингибирует связывание CD155 с человеческим TIGIT. В некоторых вариантах осуществления антитело включает три CDR легкой цепи и три CDR тяжелой цепи, соответствующие трем CDR легкой цепи и трем CDR тяжелой цепи любого из TIG1, TIG2 или TIG3. В некоторых вариантах осуществления антитело включает три CDR тяжелой цепи и три CDR легкой цепи любого из TIG1, TIG2 или TIG3. В некоторых вариантах осуществления антитело включает три CDR тяжелой цепи, определенные по номенклатуре Кэбота, и три CDR легкой цепи, определенные по номенклатуре Кэбота, любого из TIG1 (SEQ ID NO: 15-17 легкой цепи и 11-13 тяжелой цепи), TIG2 (SEQ ID NOs. 23-25 легкой цепи, 19-21 тяжелой цепи) или TIG3 (SEQ ID NO: 31-33 легкой цепи и 27-29 тяжелой цепи). В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело является химерным, гуманизированным или венированным. В некоторых вариантах осуществления антитело представляет собой человеческое антитело. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело имеет человеческий IgG1 каппа изотип. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело представляет собой интактное антитело. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело представляет собой одноцепочечное антитело, Fab или F(ab')2 фрагмент. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело содержит зрелую вариабельную область тяжелой цепи, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности SEQ ID NO: 35, и зрелую вариабельную область легкой цепи, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности SEQ ID NO: 37. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи по меньшей мере на 95 или 99% идентична последовательности SEQ ID NO: 35, и зрелая вариабельная область легкой цепи по меньшей мере 95 или 99% идентична последовательности SEQ ID NO: 37. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, и зрелая вариабельная область легкой цепи имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи связана с константной областью тяжелой цепи, включающей SEQ ID NO: 40, при условии, что C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелая вариабельная область легкой цепи связана с константной областью легкой цепи, включающей SEQ ID NO: 41. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи связана с константной областью тяжелой цепи, включающей SEQ ID NO: 60, при условии, что C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелая вариабельная область легкой цепи связана с константной областью легкой цепи, включающей SEQ ID NO: 64. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи связана с константной областью тяжелой цепи, включающей SEQ ID NO: 61, при условии, что C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелая вариабельная область легкой цепи связана с константной областью легкой цепи, включающей SEQ ID NO: 64. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело содержит зрелую вариабельную область тяжелой цепи, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности SEQ ID NO: 43, и зрелую вариабельную область легкой цепи, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности SEQ ID NO: 45. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи по меньшей мере на 95 или 99% идентична последовательности SEQ ID NO: 43, и зрелая вариабельная область легкой цепи по меньшей мере на 95 или 99% идентична последовательности SEQ ID NO: 45. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, и зрелая вариабельная область легкой цепи имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи связана с константной областью тяжелой цепи, включающей SEQ ID NO: 48, при условии, что C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелая вариабельная область легкой цепи связана с константной областью легкой цепи, вклюIn the following aspects, the present application provides a monoclonal antibody that competes with any of TIG1, TIG2, or TIG3 for binding to human TIGIT, wherein the TIG1 antibody is characterized by the mature light chain variable region of SEQ ID NO: 14 and the mature heavy chain variable region of SEQ ID NO: 10, the TIG2 antibody is characterized by the mature light chain variable region of SEQ ID NO: 22 and the mature heavy chain variable region of SEQ ID NO: 18, and the TIG3 antibody is characterized by the mature light chain variable region of SEQ ID NO: 30 and the mature heavy chain variable region of SEQ ID NO: : 26, for specific binding to CD155. In some embodiments, the antibody binds to the same epitope on human TIGIT as any of TIG1, TIG2, or TIG3. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody inhibits the binding of CD155 to human TIGIT. In some embodiments, the antibody comprises three light chain CDRs and three heavy chain CDRs corresponding to three light chain CDRs and three heavy chain CDRs of any one of TIG1, TIG2, or TIG3. In some embodiments, the antibody comprises three heavy chain CDRs and three light chain CDRs of any of TIG1, TIG2, or TIG3. In some embodiments, the antibody comprises three heavy chain CDRs defined by Cabot nomenclature and three light chain CDRs defined by Cabot nomenclature, any of TIG1 (SEQ ID NOS: 15-17 light chain and 11-13 heavy chain), TIG2 ( SEQ ID NOs 23-25 light chain, 19-21 heavy chain) or TIG3 (SEQ ID NOs: 31-33 light chain and 27-29 heavy chain). In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody is chimeric, humanized, or veneered. In some embodiments, the antibody is a human antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody is of the human IgG1 kappa isotype. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody is an intact antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody is a single chain antibody, Fab, or F(ab') 2 fragment. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antibody comprises a mature heavy chain variable region that is at least 90% identical to the sequence of SEQ ID NO: 35 and a mature light chain variable region that is at least 90 % identical to the sequence of SEQ ID NO: 37. In some embodiments, the mature heavy chain variable region is at least 95 or 99% identical to the sequence of SEQ ID NO: 35, and the mature light chain variable region is at least 95 or 99% identical to the sequence of SEQ ID NO: 37. In some embodiments, the mature heavy chain variable region has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 35, and the mature light chain variable region has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37. In some embodiments, the mature heavy chain variable region is linked to a constant heavy chain region comprising SEQ ID NO: 40, with y provided that a C-terminal lysine may or may not be present and the mature light chain variable region is linked to a light chain constant region comprising SEQ ID NO: 41. In some embodiments, the mature heavy chain variable region is linked to a heavy chain constant region comprising SEQ ID NO: 60, with the proviso that a C-terminal lysine may or may not be present and the mature light chain variable region is linked to a light chain constant region comprising SEQ ID NO: 64. In some embodiments, the mature heavy chain variable region is linked with a heavy chain constant region comprising SEQ ID NO: 61, provided that the C-terminal lysine may or may not be present and the mature light chain variable region is linked to the light chain constant region comprising SEQ ID NO: 64. In some embodiments, implementation of any of the embodiments disclosed in this application, the antibody contains a mature variable a heavy chain region that is at least 90% identical to the sequence of SEQ ID NO: 43; and a mature light chain variable region that is at least 90% identical to the sequence of SEQ ID NO: 45. In some embodiments, the mature heavy chain variable region is at least 95% or 99% identical to the sequence of SEQ ID NO: 43, and the mature light chain variable region is at least 95 or 99% identical to the sequence of SEQ ID NO: 45. In some embodiments, the mature heavy chain variable region has the amino acid sequence SEQ ID NO: 43 and the mature light chain variable region has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45. In some embodiments, the mature heavy chain variable region is linked to a heavy chain constant region comprising SEQ ID NO: 48, provided that C- terminal lysine may or may not be present, and the mature light chain variable region is linked to the constant light chain region, including
- 3 041301 чающей SEQ ID NO: 49. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи связана с константной областью тяжелой цепи, включающей SEQ ID NO: 62, при условии, что Cконцевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелая вариабельная область легкой цепи связана с константной областью легкой цепи, включающей SEQ ID NO: 65. В некоторых вариантах осуществления зрелая вариабельная область тяжелой цепи связана с константной областью тяжелой цепи, включающей SEQ ID NO: 63, при условии, что C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелая вариабельная область легкой цепи связана с константной областью легкой цепи, включающей SEQ ID NO: 65. В некоторых других аспектах в настоящей заявке представлено моноклональное антитело, которое связывается с эпитопом, включающим остатки 35 и 37 SEQ NO: 1 и/или остатки 49 и 51 SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления антитело связывается с эпитопом, включающим остатки 35, 37, 49 и 51 SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления антитело связывается с пептидом, состоящим из остатков 35-51 SEQ ID NO: 1 и не более чем пяти фланкирующих аминокислот из SEQ ID NO: 1 с обеих сторон. В некоторых вариантах осуществления антитело связывается с пептидом, состоящим из остатков 35-51 SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления эпитоп состоит из 3-20 смежных остатков SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антитело обладает одним или несколькими из следующих свойств: (a) ингибирует связывание TIGIT с CD155, необязательно с IC50 15-100 нг/мл, (b) повышает естественную T-клеточную активацию в присутствии антигенпрезентирующих клеток, экспрессирующих CD155, как измерено по продукции IL-2, необязательно 1,5-3-кратно, (c) повышает антигенспецифическую T-клеточную активацию, как измерено по продукции IL-12, необязательно 1,5-3кратно, (d) повышает активацию природных киллерных клеток, как измерено по продукции любого из IL-2, IL-6, TNFa или IFNy, необязательно 1,5-3-кратно, (e) повышает продукцию T-клетками по меньшей мере одного провоспалительного цитокина, необязательно 1,5-3-кратно, и (f) уменьшает продукцию Tклетками по меньшей мере одного противовоспалительного цитокина, необязательно 1,5-3-кратно.- 3 041301 SEQ ID NO: 49. In some embodiments, the mature heavy chain variable region is linked to a heavy chain constant region comprising SEQ ID NO: 62, with the proviso that the C-terminal lysine may or may not be present, and the mature light chain variable region chain is linked to a light chain constant region comprising SEQ ID NO: 65. In some embodiments, a mature heavy chain variable region is linked to a heavy chain constant region comprising SEQ ID NO: 63, provided that the C-terminal lysine may or may not be present. present, and the mature light chain variable region is linked to the light chain constant region comprising SEQ ID NO: 65. In some other aspects, the present application provides a monoclonal antibody that binds to an epitope comprising residues 35 and 37 of SEQ NO: 1 and/or residues 49 and 51 of SEQ ID NO: 1. In some embodiments, the antibody binds to an epitope including residues 35, 37, 49 and 5 1 SEQ ID NO: 1. In some embodiments, the antibody binds to a peptide consisting of residues 35-51 of SEQ ID NO: 1 and no more than five flanking amino acids from SEQ ID NO: 1 on either side. In some embodiments, the antibody binds to a peptide consisting of residues 35-51 of SEQ ID NO: 1. In some embodiments, the epitope consists of 3-20 contiguous residues of SEQ ID NO: 1. In some embodiments of any of the embodiments disclosed in of the present application, the antibody has one or more of the following properties: (a) inhibits TIGIT binding to CD155, optionally with an IC50 of 15-100 ng/mL, (b) increases natural T-cell activation in the presence of antigen-presenting cells expressing CD155, as measured in IL-2 production, optionally 1.5-3-fold, (c) increases antigen-specific T cell activation, as measured by IL-12 production, optionally 1.5-3-fold, (d) increases natural killer cell activation, as measured by production of any of IL-2, IL-6, TNFa or IFNy, optionally 1.5-3-fold, (e) increases T-cell production of at least one pro-inflammatory cytokine, optionally 1.5-3-fold, and (f) decrease aet production of at least one anti-inflammatory cytokine by T cells, optionally 1.5-3-fold.
В другом аспекте в настоящей заявке представлены фармацевтические композиции, включающие любое из антител, описанных в настоящей заявке, и фармацевтически приемлемый носитель.In another aspect, this application provides pharmaceutical compositions comprising any of the antibodies described in this application, and a pharmaceutically acceptable carrier.
В других аспектах в настоящей заявке представлены способы для лечения или осуществления профилактики злокачественного новообразования, включающие введение индивиду, имеющему рак или повышенный риск развития злокачественного новообразования эффективного режима или терапевтически эффективного количества любого из антител, раскрытых в настоящей заявке. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой острый миелоидный лейкоз или T-клеточный лейкоз взрослых. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду вводят опухоль-инфильтрирующие Т-клетки, которые активируются антителом. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду вводят вакцину, индуцирующую иммунный ответ против злокачественного новообразования, который усиливается антителом. В некоторых вариантах осуществления вакцина включает антиген или его фрагмент, экспрессируемый на поверхности раковых клеток. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду вводят природные киллерные клетки, цитотоксичность которых против злокачественного новообразования усиливается антителом. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят второе антитело против антигена, экспрессированного на поверхности клеток злокачественного новообразования, при этом эффектор-опосредованная цитотоксичность второго антитела против злокачественного новообразования усиливается антителом. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят второе антитело против антигена, экспрессированного на поверхности иммунной клетки. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой T-клетку или природную киллерную клетку. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антиген представляет собой CTLA-4, PD-1 или PD-L1. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят одно или несколько лечений, выбранных из группы, состоящей из химиотерапии, облучения, клеточной терапии и хирургической операции. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят ингибитор одного или нескольких рецепторов или лигандов иммунных контрольных точек. В некоторых вариантах осуществления ингибитор выбран из группы, состоящей из ипилимумаба, ниволумаба, пембролизумаба (ламбролизумаб) и атезолизумаба.In other aspects, provided herein are methods for treating or preventing cancer comprising administering to an individual having cancer or an increased risk of developing cancer an effective regimen or a therapeutically effective amount of any of the antibodies disclosed herein. In some embodiments, the cancer is acute myeloid leukemia or adult T-cell leukemia. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is administered tumor-infiltrating T cells that are activated by an antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, an individual is administered a vaccine that induces an immune response against cancer that is enhanced by an antibody. In some embodiments, the implementation of the vaccine includes an antigen or fragment thereof, expressed on the surface of cancer cells. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is administered natural killer cells whose cytotoxicity against cancer is enhanced by an antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is also administered a second antibody against an antigen expressed on the surface of cancer cells, wherein the effector-mediated cytotoxicity of the second anti-cancer antibody is enhanced by the antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is also administered a second antibody against an antigen expressed on the surface of an immune cell. In some embodiments, the immune cell is a T cell or natural killer cell. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antigen is CTLA-4, PD-1, or PD-L1. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is also administered one or more treatments selected from the group consisting of chemotherapy, radiation, cell therapy, and surgery. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, an inhibitor of one or more immune checkpoint receptors or ligands is also administered to the individual. In some embodiments, the inhibitor is selected from the group consisting of ipilimumab, nivolumab, pembrolizumab (lambrolizumab), and atezolizumab.
В дополнительных аспектах в настоящей заявке представлены способы для лечения индивида, инфицированного патогеном, включающие введение индивиду эффективного режима или терапевтически эффективного количества любого из антител, раскрытых в настоящей заявке. В некоторых вариантах осуществления патоген представляет собой вирусный, бактериальный, грибковый или простейший патоген. В некоторых вариантах осуществления патоген представляет собой ВИЧ, ВСГ, вирус гепатита, вирус герпеса, аденовирус, вирус гриппа, флавивирус, эховирус, риновирус, вирус Коксаки, коронавирус, респираторный синцитиальный вирус, вирус эпидемического паротита, ротавирус, вирус кори, вирусIn additional aspects, the present application provides methods for treating an individual infected with a pathogen, comprising administering to the individual an effective regimen or a therapeutically effective amount of any of the antibodies disclosed in this application. In some embodiments, the implementation of the pathogen is a viral, bacterial, fungal or protozoan pathogen. In some embodiments, the pathogen is HIV, HCV, hepatitis virus, herpes virus, adenovirus, influenza virus, flavivirus, echovirus, rhinovirus, coxsackievirus, coronavirus, respiratory syncytial virus, mumps virus, rotavirus, measles virus, virus
- 4 041301 краснухи, парвовирус, вирус коровьей оспы, HTLV вирус (T лимфотропный вирус человека), вирус денге, папилломавирус, вирус моллюска, полиовирус, вирус бешенства, JC вирус, вирус арбовирусного энцефалита, хламидии, бактерии риккетсии, микобактерии, стафилококки, стрептококки, пневмококки, менингококки, гонококки, клебсиеллу, протеус, серрацию, псевдомонас, легионеллу, дифтерийную палочку, палочку сальмонеллы, бактерии, вызывающие холеру, столбняк, ботулизм, сибирскую язву, чуму, лептоспироз и болезнь Лайма. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивида лечат вакциной, индуцирующей иммунный ответ против патогена, который усиливается антителом. В некоторых вариантах осуществления вакцина включает белок патогена или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят второе антитело против патогена, где эффектор-опосредованная цитотоксичность второго антитела против патогена усиливается антителом. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят одно или несколько из противовирусного средства, антипаразитарного средства, антибактериального средства или противогрибкового средства.- 4 041301 rubella virus, parvovirus, vaccinia virus, HTLV virus (human T lymphotropic virus), dengue virus, papillomavirus, mollusk virus, poliovirus, rabies virus, JC virus, arbovirus encephalitis virus, chlamydia, rickettsia bacteria, mycobacteria, staphylococci, streptococci , pneumococci, meningococci, gonococci, klebsiella, proteus, serration, pseudomonas, legionella, diphtheria bacillus, salmonella bacillus, bacteria that cause cholera, tetanus, botulism, anthrax, plague, leptospirosis and Lyme disease. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is treated with a vaccine that induces an immune response against a pathogen that is enhanced by an antibody. In some embodiments, the implementation of the vaccine includes a protein of the pathogen or a fragment thereof. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is also administered a second antibody against the pathogen, wherein the effector-mediated cytotoxicity of the second antibody against the pathogen is enhanced by the antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is also administered one or more of an antiviral agent, an antiparasitic agent, an antibacterial agent, or an antifungal agent.
В другом аспекте в настоящей заявке представлены способы, способствующие лечению злокачественного новообразования, включающие введение индивиду, имеющему рак, терапевтически эффективного количества любого из антител, раскрытых в настоящей заявке. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой острый миелоидный лейкоз или T-клеточный лейкоз взрослых. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду вводят опухоль-инфильтрирующие T-клетки, которые активируются антителом. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду вводят вакцину, индуцирующую иммунный ответ против злокачественного новообразования, который усиливается антителом. В некоторых вариантах осуществления вакцина включает антиген, экспрессированный на поверхности раковых клеток, или его фрагмент. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду вводят природные киллерные клетки, цитотоксичность которых против злокачественного новообразования усиливается антителом. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду вводят второе антитело против антигена, экспрессированного на поверхности клеток злокачественного новообразования, при этом эффектор-опосредованная цитотоксичность второго антитела против злокачественного новообразования усиливается антителом. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят второе антитело против антигена, экспрессированного на поверхности иммунной клетки. В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка представляет собой T-клетку или природную киллерную клетку. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, антиген представляет собой CTLA-4, PD-1 или PD-L1. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят одно или несколько лечений, выбранных из группы, состоящей из химиотерапии, облучения, клеточной терапии и хирургической операции. В некоторых вариантах осуществления любого из вариантов осуществления, раскрытых в настоящей заявке, индивиду также вводят ингибитор одного или нескольких рецепторов или лигандов иммунных контрольных точек. В некоторых вариантах осуществления один или несколько рецепторов или лигандов иммунных контрольных точек выбраны из группы, состоящей из CTLA-4, PD-1 и PD-L1. В некоторых вариантах осуществления ингибитор выбран из группы, состоящей из ипилимумаба, ниволумаба, пембролизумаба (ламбролизумаб) и атезолизумаба.In another aspect, provided herein are methods to aid in the treatment of cancer comprising administering to an individual having cancer a therapeutically effective amount of any of the antibodies disclosed herein. In some embodiments, the cancer is acute myeloid leukemia or adult T-cell leukemia. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is administered tumor-infiltrating T cells that are activated by an antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, an individual is administered a vaccine that induces an immune response against cancer that is enhanced by an antibody. In some embodiments, the implementation of the vaccine includes an antigen expressed on the surface of cancer cells, or a fragment thereof. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is administered natural killer cells whose cytotoxicity against cancer is enhanced by an antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, a second antibody against an antigen expressed on the surface of cancer cells is administered to the individual, wherein the effector-mediated cytotoxicity of the second anti-cancer antibody is enhanced by the antibody. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is also administered a second antibody against an antigen expressed on the surface of an immune cell. In some embodiments, the immune cell is a T cell or natural killer cell. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the antigen is CTLA-4, PD-1, or PD-L1. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, the individual is also administered one or more treatments selected from the group consisting of chemotherapy, radiation, cell therapy, and surgery. In some embodiments of any of the embodiments disclosed herein, an inhibitor of one or more immune checkpoint receptors or ligands is also administered to the individual. In some embodiments, one or more immune checkpoint receptors or ligands are selected from the group consisting of CTLA-4, PD-1, and PD-L1. In some embodiments, the inhibitor is selected from the group consisting of ipilimumab, nivolumab, pembrolizumab (lambrolizumab), and atezolizumab.
Каждый из аспектов и вариантов осуществления, описанных в настоящей заявке, можно использовать вместе, если только он явно или определенно не исключен из контекста варианта осуществления или аспекта.Each of the aspects and embodiments described herein may be used together unless it is expressly or specifically excluded from the context of the embodiment or aspect.
Краткое описание чертежейBrief description of the drawings
Фиг. 1 схематически представляет структуру векторов экспрессии для рекомбинантных TIGIT и CD155 белков.Fig. 1 is a schematic representation of the structure of expression vectors for recombinant TIGIT and CD155 proteins.
Фиг. 2 представляет ингибирование взаимодействия TIGIT-CD155 анти-TIGIT антителами.Fig. 2 represents inhibition of TIGIT-CD155 interaction by anti-TIGIT antibodies.
Фиг. 3 представляет аминокислотную последовательность TIG1 VH.Fig. 3 represents the amino acid sequence of TIG1 VH.
Фиг. 4 представляет аминокислотную последовательность TIG1 VL.Fig. 4 represents the amino acid sequence of TIG1 VL.
Фиг. 5 представляет аминокислотную последовательность TIG2 VH.Fig. 5 represents the amino acid sequence of TIG2 VH.
Фиг. 6 представляет аминокислотную последовательность TIG2 VL.Fig. 6 represents the amino acid sequence of TIG2 VL.
Фиг. 7 представляет аминокислотную последовательность TIG3 VH.Fig. 7 represents the amino acid sequence of TIG3 VH.
Фиг. 8 представляет аминокислотную последовательность TIG3 VL.Fig. 8 represents the amino acid sequence of TIG3 VL.
Фиг. 9A представляет нуклеотидную последовательность HuTIG1 VH гена и кодируемую аминокислотную последовательность, тогда как фиг. 9B представляет нуклеотидную последовательность HuTIG1 VL гена и кодируемую аминокислотную последовательность.Fig. 9A shows the nucleotide sequence of the HuTIG1 VH gene and the encoded amino acid sequence, while FIG. 9B shows the nucleotide sequence of the HuTIG1 VL gene and the encoded amino acid sequence.
Фиг. 10 схематически представляет структуру вектора экспрессии pHuTIG1.AA.Fig. 10 is a schematic representation of the structure of the pHuTIG1.AA expression vector.
Фиг. 11 показывает результаты ELISA анализа связывания HuTIG1-IgG1.AA с человеческим TIGIT.Fig. 11 shows the results of an ELISA analysis of the binding of HuTIG1-IgG1.AA to human TIGIT.
Фиг. 12 - FACS анализ связывания HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA с человеческим TIGIT.Fig. 12 - FACS analysis of the binding of HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA to human TIGIT.
- 5 041301- 5 041301
Фиг. 13 представляет график, показывающий блокирование взаимодействия между человеческим TIGIT и человеческим CD155 при помощи HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA.Fig. 13 is a graph showing the blocking of interaction between human TIGIT and human CD155 by HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA.
Фиг. 14A представляет нуклеотидную последовательность HuTIG3 VH гена и кодируемую аминокислотную последовательность, тогда как фиг. 14B представляет нуклеотидную последовательность HuTIG3 VL гена и кодируемую аминокислотную последовательность.Fig. 14A shows the nucleotide sequence of the HuTIG3 VH gene and the encoded amino acid sequence, while FIG. 14B shows the nucleotide sequence of the HuTIG3 VL gene and the encoded amino acid sequence.
Фиг. 15 представляет ELISA анализ связывания HuTIG3-IgG1.AA с человеческим TIGIT.Fig. 15 is an ELISA assay of the binding of HuTIG3-IgG1.AA to human TIGIT.
Фиг. 16 показывает повышенную продукцию IL-2, вызываемую TIG1, при стимуляции антигенспецифеского иммунного ответа.Fig. 16 shows increased production of IL-2 induced by TIG1 upon stimulation of an antigen-specific immune response.
Фиг. 17 представляет повышенную CD4+ и CD8+ T-клеточную пролиферацию, вызываемую TIG1, при стимуляции антигенспецифического иммунного ответа.Fig. 17 represents increased CD4+ and CD8+ T-cell proliferation caused by TIG1 upon stimulation of an antigen-specific immune response.
Фиг. 18 представляет экспрессию CD155 на K562 клетках (вверху) и TIGIT на NK клетках (внизу).Fig. 18 shows CD155 expression on K562 cells (top) and TIGIT on NK cells (bottom).
Фиг. 19 представляет повышенную NK-клеточно-опосредованную цитотоксичность, вызываемую TIG1 на K562 клетках-мишенях.Fig. 19 represents the increased NK cell mediated cytotoxicity induced by TIG1 on K562 target cells.
Фиг. 20 показывает, что HuTIG1-IgG1.AA потенцирует эффекторные ответы цитокинов.Fig. 20 shows that HuTIG1-IgG1.AA potentiates cytokine effector responses.
Фиг. 21 представляет экспрессию человеческого TIGIT клеточной линией Jurkat-TIGIT на поверхности клеток.Fig. 21 shows the expression of human TIGIT by the Jurkat-TIGIT cell line on the cell surface.
Фиг. 22 показывает, что HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA не вызывают активность CDC.Fig. 22 shows that HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA do not induce CDC activity.
Фиг. 23 показывает, что HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA повышали естественную Tклеточную активацию в in vitro анализе T-клеточной антагонистической активности для античеловеческого антитела к TIGIT.Fig. 23 shows that HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA increased natural T cell activation in an in vitro T cell antagonist activity assay for anti-human TIGIT antibody.
Фиг. 24 представляет CD112, CD155 и PD-L1, экспрессированные GM-CSF/IL-4 дифференцированными дендритными клетками моноцитарного происхождения (moDCs).Fig. 24 shows CD112, CD155 and PD-L1 expressed by GM-CSF/IL-4 monocyte-derived differentiated dendritic cells (moDCs).
Фиг. 25 представляет повышенную секрецию IFNy при добавлении HuTIG1-IgG1.AA, анти-PD-L1 антитела и HuTIG1-IgG1.AA в комбинации с анти-PD-L1 антителом.Fig. 25 represents increased secretion of IFNy when added with HuTIG1-IgG1.AA, anti-PD-L1 antibody and HuTIG1-IgG1.AA in combination with anti-PD-L1 antibody.
Фиг. 26A представляет экспрессию TIGIT и CD96 на человеческих лимфоидных и миелоидных клетках.Fig. 26A shows the expression of TIGIT and CD96 on human lymphoid and myeloid cells.
Фиг. 26B представляет репрезентативные гистограммы анти-TIGIT окрашивания при различных уровнях экспрессии.Fig. 26B is representative histograms of anti-TIGIT staining at different expression levels.
Фиг. 27 представляет картирование эпитопов HuTIG1-IgG1.AA методом проточной цитометрии.Fig. 27 shows HuTIG1-IgG1.AA epitope mapping by flow cytometry.
Фиг. 28 представляет ленточное представление внеклеточного IgV домена человеческого TIGIT с пронумерованными боковыми цепями аминокислотных остатков эпитопа в виде трехмерной фигуры.Fig. 28 is a three-dimensional ribbon representation of the extracellular IgV domain of human TIGIT with side chain numbered epitope amino acid residues.
Фиг. 29A и 29B показывают результаты анализа CD4+ Т-клеточной субпопуляции для определения экспрессии TIGIT.Fig. 29A and 29B show the results of analysis of the CD4+ T cell subset to determine TIGIT expression.
Фиг. 30A и 30B показывают результаты анализа CD8+ T-клеточной субпопуляции для определения экспрессии TIGIT.Fig. 30A and 30B show the results of an analysis of the CD8+ T cell subset to determine TIGIT expression.
Фиг. 31 представляет повышенную NK клеточно-опосредованную цитотоксичность, вызываемую HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA, на K562 клетках-мишенях.Fig. 31 shows increased NK cell-mediated cytotoxicity induced by HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA on K562 target cells.
Фиг. 32A представляет экспрессию TIGIT на опухоль-инфильтрирующих лимфоцитах из диссоциированных образцов опухолей.Fig. 32A shows TIGIT expression on tumor-infiltrating lymphocytes from dissociated tumor samples.
Фиг. 32B представляет репрезентативные гистограммы анти-TIGIT окрашивания при различных уровнях экспрессии.Fig. 32B is representative histograms of anti-TIGIT staining at different expression levels.
Подробное описаниеDetailed description
Изобретение обеспечивает, inter alia, моноклональные антитела, которые специфически связываются с внеклеточным доменом TIGIT, который является членом суперсемейства иммуноглобулинов с иммунорецепторный тирозиовым ингибиторным мотивом (ITIM) в цитоплазматическом концевом сегменте. Моноклональные антитела ингибируют связывание TIGIT с CD155 и, таким образом, могут активировать T-клетки и/или NK клетки. Моноклональные антитела можно использовать для лечения злокачественного новообразования и инфекционного заболевания, среди прочих применений.The invention provides, inter alia, monoclonal antibodies that specifically bind to the extracellular domain of TIGIT, which is a member of the immunoglobulin superfamily with an immunoreceptor tyrosine inhibitory motif (ITIM) in the cytoplasmic terminal segment. Monoclonal antibodies inhibit TIGIT binding to CD155 and thus can activate T cells and/or NK cells. Monoclonal antibodies can be used to treat cancer and infectious disease, among other uses.
I. ОпределенияI. Definitions
Моноклональные антитела или другие биологические соединения, такие как фрагмент TIGIT, типично обеспечиваются в выделенной форме. Это значит, что антитело или другое биологическое соединение типично является по меньшей мере на 50% мас./мас. очищенным от мешающих белков и других примесей, возникающих при его получении или очистке, но не исключена возможность того, что моноклональное антитело объединено с избыточным количеством фармацевтически приемлемого носителя(носителей) или другого наполнителя, предназначенного для облегчения его использования. Иногда моноклональные антитела по меньшей мере на 60, 70, 80, 90, 95 или 99% мас./мас. очищены от мешающих белков и примесей от процесса получения или очистки. Часто выделенное моноклональное антитело или другое биологическое соединение является преобладающей макромолекулярной частицей, оставшейся после очистки.Monoclonal antibodies or other biological compounds, such as a TIGIT fragment, are typically provided in isolated form. This means that the antibody or other biological compound is typically at least 50% wt./wt. free from interfering proteins and other impurities arising from its preparation or purification, but it is possible that the monoclonal antibody is combined with an excess amount of pharmaceutically acceptable carrier(s) or other excipient intended to facilitate its use. Sometimes monoclonal antibodies at least 60, 70, 80, 90, 95 or 99% wt./wt. free of interfering proteins and impurities from the manufacturing or purification process. Often, the isolated monoclonal antibody or other biological compound is the predominant macromolecular particle remaining after purification.
Специфическое связывание моноклонального антитела с его целевым антигеном означает аффинность (константу ассоциации или Ka) по меньшей мере 106, 107, 108, 109 или 1010 М'1, определенную, например, в анализе примера 15. Специфическое связывание заметно выше по величине и отлично от неSpecific binding of a monoclonal antibody to its target antigen means an affinity (association constant or Ka) of at least 106, 10 7 , 10 8 , 109 or 10 10 M' 1 as determined, for example, in the assay of Example 15. Specific binding is markedly higher in magnitude and different from
- 6 041301 специфического связывания, происходящего с по меньшей мере одной неродственной мишенью. Специфическое связывание может быть результатом образования связей между конкретными функциональными группами или конкретной пространственной соответствующей структурой (например, по типу замка и ключа), тогда как неспецифическое связывание обычно является результатом ван-дер-ваальсовых сил. Специфическое связывание, однако, необязательно предполагает, что моноклональное антитело связывается с одной и только с одной мишенью.- 6 041301 specific binding occurring with at least one unrelated target. Specific binding may result from the formation of bonds between specific functional groups or a specific spatially relevant structure (eg, like a lock and key), while non-specific binding is usually the result of van der Waals forces. Specific binding, however, does not necessarily imply that the monoclonal antibody binds to one and only one target.
Основной структурной единицей антитела является тетрамер субъединиц. Каждый тетрамер включает две идентичные пары полипептидных цепей, при этом каждая пара имеет одну легкую (около 25 кДа) и одну тяжелую цепь (около 50-70 кДа). Аминоконцевая часть каждой цепи включает вариабельную область из около 100-110 или больше аминокислот, преимущественно ответственную за распознавание антигена. Эта вариабельная область изначально экспрессируется связанной с отщепляемым сигнальным пептидом. Вариабельную область без сигнального пептида иногда называют зрелой вариабельной областью. Таким образом, например, зрелая вариабельная область легкой цепи означает вариабельную область легкой цепи без сигнального пептида легкой цепи. Карбоксиконцевая часть каждой цепи определяет константную область, преимущественно ответственную за эффекторную функцию.The basic structural unit of an antibody is the tetramer of subunits. Each tetramer includes two identical pairs of polypeptide chains, with each pair having one light (about 25 kDa) and one heavy chain (about 50-70 kDa). The amino terminal portion of each chain includes a variable region of about 100-110 or more amino acids primarily responsible for antigen recognition. This variable region is initially expressed associated with a cleaved signal peptide. The variable region without the signal peptide is sometimes referred to as the mature variable region. Thus, for example, a mature light chain variable region means a light chain variable region without a light chain signal peptide. The carboxy-terminal portion of each chain defines a constant region predominantly responsible for effector function.
Легкие цепи классифицируются как каппа- или лямбда-цепи. Тяжелые цепи классифицируются как гамма-, мю-, альфа-, дельта- или эпсилон-цепи и определяют изотип антитела, такой как IgG, IgM, IgA, IgD и IgE соответственно. В пределах легких и тяжелых цепей вариабельные и константные области связаны J-областью, состоящей из около 12 или более аминокислот, при этом тяжелая цепь также включает D''-область, состоящую из около 10 или более аминокислот. (См., общее описание в Fundamental Immunology (Paul W., ed., 2nd ed. Raven Press, N.Y., 1989, Ch. 7, полное содержание которого включено посредством ссылки во всей полноте для всех целей).Light chains are classified as either kappa or lambda chains. Heavy chains are classified as gamma, mu, alpha, delta, or epsilon chains and define the isotype of the antibody, such as IgG, IgM, IgA, IgD, and IgE, respectively. Within the light and heavy chains, the variable and constant regions are linked by a J region of about 12 or more amino acids, while the heavy chain also includes a D'' region of about 10 or more amino acids. (See, for a general description, Fundamental Immunology (Paul W., ed., 2nd ed. Raven Press, N.Y., 1989, Ch. 7, the entire contents of which are incorporated by reference in their entirety for all purposes).
Зрелые вариабельные области каждой пары легкой/тяжелой цепи образуют связывающий сайт антитела. Таким образом, интактное антитело имеет два связывающих сайта. За исключением бифункциональных или биспецифических антител, эти два сайта связывания являются одинаковыми. Все цепи демонстрируют одинаковую общую структуру из относительно консервативных каркасных областей (FR), соединенных тремя гипервариабельными областями, также называемыми определяющими комплементарность областями, или CDR. CDR из двух цепей каждой пары соединяются посредством каркасных областей, обеспечивая связывание со специфическим эпитопом. От N-конца до C-конца легкая и тяжелая цепи включают домены FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 и FR4. Присвоение аминокислот каждому домену осуществляется в соответствии с определением по Кэботу, Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1987 and 1991) или Chothia & Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987); Chothia et al., Nature 342:878-883 (1989). Кроме того, Кэбат обеспечивает широко используемую систему нумерации (нумерация по Кэботу), в которой соответствующим остаткам между различными тяжелыми цепями или между различными легкими цепями присвоены одинаковые номера.The mature variable regions of each light/heavy chain pair form the antibody binding site. Thus, an intact antibody has two binding sites. With the exception of bifunctional or bispecific antibodies, these two binding sites are the same. All chains show the same overall structure of relatively conserved framework regions (FRs) connected by three hypervariable regions, also called complementarity determining regions, or CDRs. The CDRs from the two strands of each pair are linked via framework regions, allowing binding to a specific epitope. From the N-terminus to the C-terminus, the light and heavy chains include the FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 and FR4 domains. The assignment of amino acids to each domain is as defined by Cabot, Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1987 and 1991) or Chothia & Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987); Chothia et al., Nature 342:878-883 (1989). In addition, Cabat provides a widely used numbering system (Cabot numbering) in which the corresponding residues between different heavy chains or between different light chains are assigned the same number.
Термин антитело включает интактные антитела и их связывающие фрагменты. Таким образом, любую ссылку на антитело следует понимать как ссылку на антитело в интактной форме или связывающийся фрагмент, если только из контекста не следует иное. Как правило, фрагменты конкурируют с интактным антителом, из которого они происходят, за специфическое связывание с мишенью, включая отдельные тяжелые цепи, легкие цепи Fab, Fab', F(ab')2, F(ab)c, Dabs, нанотела и scFv, диатела, scFv-Fc, мини-тела, IgNARs, V-NAR, hcIgG, bis-scFv, триатела и тетратела. Фрагменты могут быть получены методами рекомбинантных ДНК или путем ферментативного или химического расщепления интактных иммуноглобулинов. Термин антитело также относится к биспецифическому антителу. Биспецифическое или бифункциональное антитело представляет собой искусственное гибридное антитело, обладающее двумя различными парами тяжелой/легкой цепи и двумя разными сайтами связывания (см., например, Songsivilai and Lachmann, Clin. Exp.Immunol., 79:315-321 (1990); Kostelny et al., J. Immunol. 148: 1547-53 (1992)).The term antibody includes intact antibodies and their binding fragments. Thus, any reference to an antibody should be understood as referring to the antibody in intact form or binding fragment, unless the context dictates otherwise. Typically, fragments compete with the intact antibody from which they are derived for specific target binding, including individual heavy chains, light chains Fab, Fab', F(ab')2, F(ab)c, Dabs, nanobodies, and scFv. , diabody, scFv-Fc, minibody, IgNARs, V-NAR, hcIgG, bis-scFv, triabody, and tetrabody. Fragments can be obtained by recombinant DNA methods or by enzymatic or chemical cleavage of intact immunoglobulins. The term antibody also refers to a bispecific antibody. A bispecific or bifunctional antibody is an artificial hybrid antibody having two different heavy/light chain pairs and two different binding sites (see, for example, Songsivilai and Lachmann, Clin. Exp. Immunol., 79:315-321 (1990); Kostelny et al., J. Immunol 148: 1547-53 (1992)).
Термин эпитоп относится к участку антигена, с которым связывается антитело. Эпитоп может быть сформирован из смежных или несмежными аминокислот, которые накладываются друг на друга при укладке в третичную структуру одного или нескольких белков. Эпитопы, образованные из смежных аминокислот (также известные как линейные эпитопы), обычно сохраняются при воздействии денатурирующих растворителей, в то время как эпитопы, образованные при формировании третичной структуры (также известные как конформационные эпитопы), обычно теряются при обработке денатурирующими растворителями. Эпитоп типично включает по меньшей мере 3 или более, обычно по меньшей мере 5 или 8-10 аминокислот в уникальной пространственной конформации. Методы определения пространственной конформации эпитопов включают, например, рентгеновскую кристаллографию и двумерный ядерный магнитный резонанс. См., например, Протоколы картирования эпитопов в Methods in Molecular Biology, Vol. 66, Glenn E. Morris, Ed. (1996).The term epitope refers to the site of an antigen to which an antibody binds. An epitope can be formed from contiguous or non-contiguous amino acids that are superimposed on each other when stacked in the tertiary structure of one or more proteins. Epitopes derived from contiguous amino acids (also known as linear epitopes) are typically retained upon exposure to denaturing solvents, while epitopes derived from tertiary structure formation (also known as conformational epitopes) are typically lost upon exposure to denaturing solvents. An epitope typically includes at least 3 or more, usually at least 5 or 8-10 amino acids in a unique spatial conformation. Methods for determining the spatial conformation of epitopes include, for example, x-ray crystallography and two-dimensional nuclear magnetic resonance. See, for example, Protocols for Epitope Mapping in Methods in Molecular Biology, Vol. 66, Glenn E. Morris, Ed. (1996).
Антитела, которые распознают одинаковые или перекрывающиеся эпитопы, могут быть идентифицированы с помощью обычного иммунного анализа, выявляющего способность одного антитела конкурировать за связывание с антигеном-мишенью с другим антителом. Эпитоп антитела может быть также определен при помощи рентгеновской кристаллографии антитела, связанного с его антигеном, для иденAntibodies that recognize the same or overlapping epitopes can be identified using a conventional immunoassay that detects the ability of one antibody to compete for binding to a target antigen with another antibody. The epitope of an antibody can also be determined by X-ray crystallography of an antibody bound to its antigen for identification.
- 7 041301 тификации контактных остатков. Альтернативно, два антитела имеют один и тот же эпитоп, если все аминокислотные мутации в антигене, которые уменьшают или элиминируют связывание одного антитела, уменьшают или элиминируют связывание другого антитела. Два антитела имеют перекрывающиеся эпитопы, если некоторые аминокислотные мутации, которые уменьшают или элиминируют связывание одного антитела, уменьшают или элиминируют связывание другого антитела.- 7 041301 tification of contact residues. Alternatively, two antibodies share the same epitope if all amino acid mutations in the antigen that reduce or eliminate the binding of one antibody reduce or eliminate the binding of the other antibody. Two antibodies have overlapping epitopes if some amino acid mutation that reduces or eliminates the binding of one antibody reduces or eliminates the binding of another antibody.
Конкуренцию между антителами определяют при помощи анализа, в котором антитело в условиях испытания ингибирует специфическое связывание контрольного антитела с общим антигеном (см., например, Junghans et al., Cancer Res. 50: 1495, 1990). Испытываемое антитело конкурирует с контрольным антителом, если избыток испытываемого антитела (например, по меньшей мере 2x, 3x, 4x, 5x, 6x, 7x, 8x, 9x, 10x, 15x, 20x, 25x, 30x, 35x, 40x, 45x, 50x, 60x, 70x, 80x, 90x, 100х или больше, включая значения между указанными значениями) ингибирует связывание контрольного антитела по меньшей мере на 50%, но предпочтительно на 75%, 90% или 99%. В других вариантах осуществления испытываемое антитело конкурирует с контрольным антителом, если избыток испытываемого антитела ингибирует связывание контрольного антитела на любую величину из по меньшей мере около 55, 60, 65, 70% или предпочтительно по меньшей мере около 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81%, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100%, как измерено в анализе конкурентного связывания. Антитела, идентифицированные с помощью методов конкурентного связывания (конкурирующие антитела), включают антитела, связывающиеся с тем же эпитопом, что и контрольное антитело, и антитела, связывающиеся со смежным эпитопом, расположенным проксимально по отношению к эпитопу, с которым связывается контрольное антитело, для образования пространственного затруднения. Предпочтительно конкуренцию оценивают, как описано в примере 14.Antibody competition is determined by an assay in which the antibody, under test conditions, inhibits the specific binding of a control antibody to a common antigen (see, for example, Junghans et al., Cancer Res. 50: 1495, 1990). A test antibody competes with a control antibody if an excess of test antibody (e.g., at least 2x, 3x, 4x, 5x, 6x, 7x, 8x, 9x, 10x, 15x, 20x, 25x, 30x, 35x, 40x, 45x, 50x , 60x, 70x, 80x, 90x, 100x or more, including values between the indicated values) inhibits control antibody binding by at least 50%, but preferably by 75%, 90% or 99%. In other embodiments, a test antibody competes with a control antibody if an excess of test antibody inhibits binding of the control antibody by any amount of at least about 55%, 60%, 65%, 70%, or preferably at least about 75%, 76%, 77%, 78%, 79%. , 80, 81%, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% as measured in competitive analysis binding. Antibodies identified by competitive binding methods (competing antibodies) include antibodies that bind to the same epitope as the control antibody and antibodies that bind to an adjacent epitope proximal to the epitope to which the control antibody binds to form spatial difficulty. Preferably, competition is evaluated as described in Example 14.
Термин индивид включает человека и других индивидов-млекопитающих. В некоторых случаях способы по изобретению можно использовать для экспериментальных животных, в ветеринарии и в разработке животных моделей для заболевания, включая, но не ограничиваясь этим, грызунов, включая мышей, крыс, хомяков, а также приматов, таких как обезьяны. В некоторых вариантах осуществления индивиды принимают, или являются кандидатами для приема, либо профилактическое, либо терапевтическое лечение.The term individual includes humans and other mammalian individuals. In some cases, the methods of the invention can be used in experimental animals, in veterinary medicine, and in developing animal models for disease, including, but not limited to, rodents, including mice, rats, hamsters, as well as primates such as monkeys. In some embodiments, individuals are receiving, or are candidates for, either prophylactic or therapeutic treatment.
В контексте настоящей заявки аминокислотный остаток из представляющей интерес аминокислотной последовательности, который соответствует или является соответствующим или в соответствии с аминокислотным остатком эталонной аминокислотной последовательности, показывает, что аминокислотный остаток из представляющей интерес последовательности находится в положении, гомологичном или эквивалентном указанному остатку в эталонной аминокислотной последовательности. Специалист в данной области сможет определить, соответствует ли положение конкретного аминокислотного остатка в полипептиде, таком как полипептид TIGIT, положению такого остатка в гомологичной эталонной последовательности. Например, последовательность полипептида TIGIT может быть выровнена с эталонной последовательностью с использованием известных методов (например, средства поиска основного локального выравнивания (BLAST), ClustalW2, программы выравнивания последовательностей на основе структуры (STRAP) и т.п.). Кроме того, координаты кристаллической структуры эталонной последовательности могут быть использованы в качестве помощи при определении трехмерной структуры гомологичного полипептидного остатка (Stengel et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 109: 5399-5404, 2012. В другом аспекте эквивалентные остатки могут быть идентифицированы путем определения гомологии на уровне третичной структуры. Используя такие способы, аминокислотные остатки полипептидного варианта TIGIT могут быть пронумерованы в соответствии с нумерацией положений аминокислотных остатков эталонной последовательности. Например, аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 можно использовать для определения нумерации положений аминокислотных остатков для каждого аминокислотного остатка TIGIT варианта, представляющего интерес, или эпитопа. В некоторых вариантах осуществления одна аминокислотная последовательность соответствует другой аминокислотной последовательности, если они имеют идентичность последовательностей по меньшей мере около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100%.In the context of the present application, an amino acid residue from an amino acid sequence of interest that corresponds to or is corresponding to or in accordance with an amino acid residue of a reference amino acid sequence indicates that the amino acid residue from the sequence of interest is in a position homologous or equivalent to the specified residue in the reference amino acid sequence. One skilled in the art will be able to determine if the position of a particular amino acid residue in a polypeptide, such as the TIGIT polypeptide, corresponds to the position of that residue in a homologous reference sequence. For example, the TIGIT polypeptide sequence can be aligned to a reference sequence using known methods (eg, basic local alignment finder (BLAST), ClustalW2, structure-based sequence alignment programs (STRAP), etc.). In addition, the crystal structure coordinates of a reference sequence can be used as an aid in determining the three-dimensional structure of a homologous polypeptide residue (Stengel et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 109: 5399-5404, 2012. In another aspect, equivalent residues can be identified by determining homology at the tertiary structure level.Using such methods, the amino acid residues of a TIGIT polypeptide variant can be numbered according to the amino acid position numbering of a reference sequence.For example, the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 can be used to determine the amino acid position numbering residues for each amino acid residue of the TIGIT variant or epitope of interest.In some embodiments, one amino acid sequence corresponds to another amino acid sequence if they share at least 3 sequence identities. here about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 or 100%.
Для целей классификации аминокислотных замен как консервативных или неконсервативных, аминокислоты сгруппированы следующим образом: Группа I (гидрофобные боковые цепи): Met, Ala, Val, Leu, Ile; Группа II (нейтральные гидрофильные боковые цепи): Cys, Ser, Thr; Группа III (кислотные боковые цепи): Asp, Glu; Группа IV (основные боковые цепи): Asn, Gln, His, Lys, Arg; Группа V (остатки, влияющие на ориентацию цепей): Gly, Pro; и Группа VI (ароматические боковые цепи): Trp, Tyr, Phe. Консервативные замены включают замены между аминокислотами того же класса. Неконсервативные замены включают обмен члена одного из этих классов на член другого класса.For the purposes of classifying amino acid substitutions as conservative or non-conservative, the amino acids are grouped as follows: Group I (hydrophobic side chains): Met, Ala, Val, Leu, Ile; Group II (neutral hydrophilic side chains): Cys, Ser, Thr; Group III (acidic side chains): Asp, Glu; Group IV (major side chains): Asn, Gln, His, Lys, Arg; Group V (residues affecting chain orientation): Gly, Pro; and Group VI (aromatic side chains): Trp, Tyr, Phe. Conservative substitutions include substitutions between amino acids of the same class. Non-conservative substitutions involve exchanging a member of one of these classes for a member of another class.
Процент идентичности последовательностей определяют путем максимального выравнивания последовательностей антител с использованием системы нумерации Кэбота. После выравнивания, если представляющую интерес область антитела (например, весь зрелый вариабельный участок тяжелой или легкой цепи) сравнивают с такой же областью эталонного антитела, то процент идентичности последовательностей между областями сравниваемого и эталонного антитела представляет собой количество положений, занятых той же аминокислотой как в области сравниваемого, так и эталонного антитела, деPercent sequence identity is determined by maximal alignment of antibody sequences using the Cabot numbering system. After alignment, if an antibody region of interest (e.g., the entire mature heavy or light chain variable region) is compared to the same region of a reference antibody, then the percent sequence identity between the regions of the comparison and the reference antibody is the number of positions occupied by the same amino acid as in the region compared and reference antibodies, de
- 8 041301 ленное на общее количество выровненных положений двух областей, причем пропуски не учитываются, умноженное на 100 для преобразования в проценты.- 8 041301 divided by the total number of aligned positions of the two areas, with gaps not taken into account, multiplied by 100 to convert to a percentage.
Композиции или способы включающие один или несколько перечисляемых элементов, могут включать другие элементы, конкретно не указанные. Например, композиция, которая включает антитело, может содержать только антитело или антитело в комбинации с другими ингредиентами.Compositions or methods comprising one or more of the enumerated elements may include other elements not specifically listed. For example, a composition that includes an antibody may contain the antibody alone, or the antibody in combination with other ingredients.
Если явно не следует из контекста, ссылка на диапазон включает все целые числа в рамках этого диапазона и все поддиапазоны, определяемые такими целыми числами.Unless otherwise evident from the context, a range reference includes all integers within that range and all subranges defined by such integers.
II. Молекулы-мишениII. target molecules
Если не указано иное, TIGIT означает человеческий TIGIT. Иллюстративной человеческой последовательности присвоен Swiss-Prot номер доступа Q495A1. Полная последовательность человеческого TIGIT содержит 244 аминокислот, из которых аминокислоты 1-21 представляют собой сигнальный пептид, а аминокислоты 22-244 образуют зрелый белок (SEQ ID NO: 1). Приблизительно остатки 22-141 образуют внеклеточный домен (SEQ ID NO: 3). Приблизительно остатки 142-162 образуют трансмембранный домен, и приблизительно остатки 163-244 образуют цитоплазматический домен.Unless otherwise noted, TIGIT means human TIGIT. An exemplary human sequence has been assigned Swiss-Prot accession number Q495A1. The complete human TIGIT sequence contains 244 amino acids, of which amino acids 1-21 are the signal peptide and amino acids 22-244 form the mature protein (SEQ ID NO: 1). Approximately residues 22-141 form the extracellular domain (SEQ ID NO: 3). Approximately residues 142-162 form the transmembrane domain, and approximately residues 163-244 form the cytoplasmic domain.
Если не указано иное, CD155 относится к человеческой форме этого белка. Иллюстративная человеческая последовательность для человеческого CD155 обозначена как Swiss-Prot P15151, которая представляет собой белок из 417 аминокислот, из которых приблизительно остатки 1-20 представляют собой сигнальный пептид, 21-343 представляют собой внеклеточный домен (SEQ ID NO: 6), 344-367 представляют собой трансмембранный домен и 368-417 представляют собой цитоплазматический домен.Unless otherwise noted, CD155 refers to the human form of this protein. An exemplary human sequence for human CD155 is designated Swiss-Prot P15151, which is a 417 amino acid protein, of which approximately residues 1-20 are the signal peptide, 21-343 are the extracellular domain (SEQ ID NO: 6), 344- 367 are the transmembrane domain and 368-417 are the cytoplasmic domain.
Если явно не следует из контекста, ссылка на один из указанных выше белков означает по меньшей мере внеклеточный домен белка, и обычно полный белок за исключением отщепляемого сигнального пептида.Unless clearly apparent from the context, reference to one of the above proteins means at least the extracellular domain of the protein, and usually the complete protein with the exception of the cleaved signal peptide.
III. Антитела по изобретениюIII. Antibodies of the invention
A. Специфичность связывания и функциональные свойстваA. Binding specificity and functional properties
Изобретение обеспечивает моноклональные антитела, связывающиеся с эпитопами во внеклеточном домене TIGIT белка. Антитела, обозначенные как TIG1, TIG2 и TIG3, являются тремя такими иллюстративными мышиными антителами. Последовательности зрелых вариабельных областей тяжелых и легких цепей этих антител обозначены как SEQ ID NO: 10 и 14, 18 и 22, и 26 и 30 соответственно. TIG1, TIG2 и TIG3 специфически связываются с внеклеточным доменом человеческого TIGIT.The invention provides monoclonal antibodies that bind to epitopes in the extracellular domain of the TIGIT protein. The antibodies designated TIG1, TIG2, and TIG3 are three such exemplary murine antibodies. The sequences of the mature heavy and light chain variable regions of these antibodies are designated as SEQ ID NOs: 10 and 14, 18 and 22, and 26 and 30, respectively. TIG1, TIG2 and TIG3 specifically bind to the extracellular domain of human TIGIT.
Некоторые антитела по изобретению связываются с тем же или перекрывающемся эпитопом, что и антитело, обозначенное как TIG1, TIG2 или TIG3. Другие антитела, обладающие такой специфичностью связывания, можно получить иммунизацией мышей при помощи TIGIT или его части, включая целевой эпитоп, и скрининга полученных антител на связывание с внеклеточным доменом TIGIT, необязательно в конкуренции с TIG1, TIG2 или TIG3. Антитела также можно скринировать против мутагенезированных форм TIGIT антигена для идентификации антитела, показывающего такой же или подобный профиль связывания с коллекцией мутационных изменений, как TIG1, TIG2 или TIG3. Мутации могут представлять собой системную замену аланином (или серином, если аланин уже присутствует) одного остатка за раз, или с более широкими промежутками, по всему внеклеточному домену TIGIT антитела или его части, в которой, как известно, находится эпитоп.Some antibodies of the invention bind to the same or overlapping epitope as an antibody designated TIG1, TIG2, or TIG3. Other antibodies with such binding specificity can be obtained by immunizing mice with TIGIT or a portion thereof, including the target epitope, and screening the resulting antibodies for binding to the extracellular domain of TIGIT, optionally in competition with TIG1, TIG2 or TIG3. Antibodies can also be screened against mutagenic forms of the TIGIT antigen to identify an antibody showing the same or similar binding profile to a collection of mutations as TIG1, TIG2, or TIG3. Mutations can be a systemic substitution of alanine (or serine if alanine is already present) for one residue at a time, or at wider intervals, throughout the extracellular domain of the TIGIT antibody, or the portion of it known to contain the epitope.
В примере 16 картированы остатки 35, 37, 49 и 51 SEQ ID NO: 1 как представляющие собой остатки, образующие эпитоп TIG1 антитела. Замена аланином на любом из этих остатков по существу устраняет связывание антитела. Изобретение, таким образом, включает другие антитела, связывающиеся с эпитопом человеческого TIGIT, включающим остатки 35 и 37 SEQ NO: 1 и/или остатки 49 и 51 SEQ ID NO: 1, и предпочтительно эпитопом, включающим все из этих остатков. Эпитоп может быть линейным (например, 3-20, 3-17 или 5-10 смежных остатков) или конформационным. Некоторые такие антитела связываются с пептидом, состоящим из остатков 35-51 SEQ ID NO: 1 и не более чем 1, 2, 3, 4 или 5 фланкирующих аминокислот из SEQ ID NO: 1 с обеих сторон. Некоторые такие антитела связываются с пептидом, состоящим из остатков 35-51 SEQ ID NO: 1. Некоторые такие антитела могут быть генерированы путем иммунизации такими пептидами. Пример 19 также показывает, что остаток 90 SEQ ID NO: 1 является критическим для связывания гуманизированного (Hu)TIG1 антитела с TIGIT, в дополнение к остаткам 35, 37, 49 и 51 SEQ ID NO: 1. В других вариантах осуществления антитело (такое как HuTIG1 антитело) связывается с эпитопом, включающим один или несколько из остатков, соответствующих аминокислотным положениям 35, 37, 49, 51 и/или 90 SEQ ID NO: 1. В других вариантах осуществления антитело (такое как HuTIG1 антитело) не связывается с одним или несколькими остатками, соответствующими аминокислотным положениям 34, 39, 44, 47, 52, 55, 86, 88, 92 и/или 96 SEQ ID NO: 1.Example 16 maps residues 35, 37, 49, and 51 of SEQ ID NO: 1 as being residues that form the epitope of a TIG1 antibody. Substitution of alanine at any of these residues essentially eliminates antibody binding. The invention thus includes other antibodies that bind to a human TIGIT epitope comprising residues 35 and 37 of SEQ NO: 1 and/or residues 49 and 51 of SEQ ID NO: 1, and preferably an epitope comprising all of these residues. An epitope may be linear (eg, 3-20, 3-17, or 5-10 contiguous residues) or conformational. Some such antibodies bind to a peptide consisting of residues 35-51 of SEQ ID NO: 1 and no more than 1, 2, 3, 4, or 5 flanking amino acids from SEQ ID NO: 1 on either side. Some of these antibodies bind to a peptide consisting of residues 35-51 of SEQ ID NO: 1. Some of these antibodies can be generated by immunization with such peptides. Example 19 also shows that residue 90 of SEQ ID NO: 1 is critical for the binding of a humanized (Hu)TIG1 antibody to TIGIT, in addition to residues 35, 37, 49, and 51 of SEQ ID NO: 1. In other embodiments, the antibody (such as a HuTIG1 antibody) binds to an epitope comprising one or more of the residues corresponding to amino acid positions 35, 37, 49, 51, and/or 90 of SEQ ID NO: 1. In other embodiments, an antibody (such as a HuTIG1 antibody) does not bind to one or several residues corresponding to amino acid positions 34, 39, 44, 47, 52, 55, 86, 88, 92 and/or 96 of SEQ ID NO: 1.
Антитела, обладающие специфичностью связывания выбранного мышиного антитела (например, TIG1, TIG2 или TIG3), также можно получить с использованием варианта метода фагового дисплея. См. Winter, WO 92/20791. Этот метод является особенно подходящим для получения человеческих антител. В этом методе вариабельную область либо тяжелой, либо легкой цепи выбранного мышиного антитела используют в качестве исходного материала. Если, например, вариабельная область легкой цепи выбрана в качестве исходного материала, конструируют библиотеку фагов, в которой члены демонстрируют одинаковую вариабельную область легкой цепи (т.е. мышиного исходного материала) и разные вариабельAntibodies having the binding specificity of the selected mouse antibody (eg, TIG1, TIG2, or TIG3) can also be generated using a variation of the phage display method. See Winter, WO 92/20791. This method is particularly suitable for the production of human antibodies. In this method, either the heavy or light chain variable region of a selected mouse antibody is used as starting material. If, for example, a light chain variable region is chosen as the starting material, a phage library is constructed in which members exhibit the same light chain variable region (i.e., mouse starting material) and different
- 9 041301 ные области тяжелой цепи. Вариабельные области тяжелой цепи, например, можно получить из библиотеки перегруппированных человеческих вариабельных областей тяжелой цепи. Выбирают фаг, показывающий сильное специфическое связывание для TIGIT (например, по меньшей мере 108, и предпочтительно по меньшей мере 109 М-1). Вариабельная область тяжелой цепи из этого фага затем служит в качестве исходного материала для конструирования дополнительной библиотеки фагов. В этой библиотеке каждый из фагов демонстрирует одинаковую вариабельную область тяжелой цепи (т.е. область, идентифицированную из первой библиотеки фагового дисплея) и разные вариабельные области легкой цепи. Вариабельные области легкой цепи можно получить, например, из библиотеки перегруппированных человеческих вариабельных областей легкой цепи. Снова выбирают фаг, показывающий сильное специфическое связывание для TIGIT. Полученные антитела обычно имеют такую же или подобную специфичность в отношении эпитопа, как у исходного материала из мыши.- 9 041301 heavy chain regions. Heavy chain variable regions, for example, can be obtained from a library of rearranged human heavy chain variable regions. Choose phage showing strong specific binding for TIGIT (for example, at least 10 8 and preferably at least 10 9 M -1 ). The heavy chain variable region from this phage then serves as starting material for the construction of an additional phage library. In this library, each of the phages displays the same heavy chain variable region (ie, the region identified from the first phage display library) and different light chain variable regions. Light chain variable regions can be obtained, for example, from a library of rearranged human light chain variable regions. Again, a phage showing strong specific binding for TIGIT is selected. The resulting antibodies typically have the same or similar epitope specificity as the mouse starting material.
Некоторые антитела имеют зрелую вариабельную область тяжелой цепи, включающую CDR H1, H2 и H3, и зрелую область легкой цепи, включающую CDR L1, L2 и L3, полностью или по существу из TIG1. Некоторые антитела имеют зрелую вариабельную область тяжелой цепи, включающую CDR H1, H2 и H3, и зрелую вариабельную область легкой цепи, включающую CDR L1, L2 и L3, полностью или по существу из TIG2. Некоторые антитела имеют зрелую вариабельную область тяжелой цепи, включающую CDR H1, H2 и H3, и зрелую вариабельную область легкой цепи, включающую CDR L1, L2 и L3, полностью или по существу из TIG3. CDR могут быть определены в соответствии с любым принятым определением, включая определение по Кэботу, по Чотиа, по Кэботу и Чотиа, по AbM или определение по контакту, как показано в таблице ниже: _______________________________Some antibodies have a mature heavy chain variable region, including CDRs H1, H2, and H3, and a mature light chain region, including CDRs L1, L2, and L3, wholly or substantially from TIG1. Some antibodies have a mature heavy chain variable region, including CDRs H1, H2, and H3, and a mature light chain variable region, including CDRs L1, L2, and L3, wholly or substantially from TIG2. Some antibodies have a mature heavy chain variable region, including CDRs H1, H2, and H3, and a mature light chain variable region, including CDRs L1, L2, and L3, wholly or substantially from TIG3. CDRs can be defined according to any accepted definition, including Cabot, Chothia, Cabot and Chothia, AbM, or Contact as shown in the table below: _______________________________
Другие антитела можно получить путем мутагенеза кДНК, кодирующей тяжелую и легкую цепи иллюстративного антитела, такого как TIG1, TIG2 или TIG3. Моноклональные антитела, которые по меньшей мере на около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичны TIG1, TIG2 или TIG3 в аминокислотной последовательности зрелых вариабельных областей тяжелой и/или легкой цепи и сохраняют их функциональные свойства, и/или которые отличаются от соответствующего антитела небольшим количеством функционально несущественных аминокислотных замен (например, консервативных замен), делеций или инсерций, также включены в изобретение. Аминокислоты в каркасах вариабельных областей, возможно являющиеся важными для связывания, можно идентифицировать, как описано в разделах, относящихся к гуманизации, ниже. Моноклональные антитела, содержащие по меньшей мере одну и предпочтительно все шесть CDR(s), определенных по номенклатуре Кэбота, которые на любое из следующих значений около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичны соответствующим CDR TIG1, TIG2 или TIG3, также включены.Other antibodies can be generated by mutagenesis of cDNA encoding the heavy and light chains of an exemplary antibody, such as TIG1, TIG2, or TIG3. Monoclonal antibodies that are at least about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, or 100 % are identical to TIG1, TIG2 or TIG3 in the amino acid sequence of mature heavy and/or light chain variable regions and retain their functional properties, and/or which differ from the corresponding antibody by a small number of functionally non-essential amino acid substitutions (for example, conservative substitutions), deletions or insertions, also included in the invention. Amino acids in the variable region frameworks that may be important for binding can be identified as described in the humanization sections below. Monoclonal antibodies containing at least one and preferably all six CDR(s) defined by Cabot's nomenclature, which are any of the following values about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90 , 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% identical to the corresponding TIG1, TIG2, or TIG3 CDRs are also included.
Антитела предпочтительно имеют одну или несколько из следующих характеристик (i) ингибирование связывания человеческого TIGIT с человеческим CD155, (ii) ингибирование связывания TIGIT с другими лигандами, такими как CD112 и CD113, (iii) усиление антигенспецифических T-клеточных ответов, (iv) активация природных киллерных клеток, (v) стимуляция естественных T-клеточных активаций, и (vi) стимуляция продукции одного или нескольких иммуностимуляторных цитокинов и/или снижение продукции одного или нескольких иммуносупрессорных цитокинов T-клетками и другими клетками иммунной системы. Иллюстративные анализы для измерения этих свойств представлены в примерах.Antibodies preferably have one or more of the following characteristics (i) inhibition of binding of human TIGIT to human CD155, (ii) inhibition of binding of TIGIT to other ligands such as CD112 and CD113, (iii) enhancement of antigen-specific T cell responses, (iv) activation natural killer cells, (v) stimulation of natural T cell activations, and (vi) stimulation of production of one or more immunostimulatory cytokines and/or reduction of production of one or more immunosuppressive cytokines by T cells and other cells of the immune system. Illustrative assays for measuring these properties are provided in the examples.
Предпочтительные антитела полностью или частично ингибируют связывание TIGIT с CD155. Некоторые антитела могут ингибировать такое взаимодействие с любым из следующих значений IC50 около 25-300 нг/мл, 25-75 нг/мл, 25-50 нг/мл, 40-75 нг/мл, 50-75 нг/мл, 50-90 нг/мл, 50-100 нг/мл, 75-100 нг/мл, 50-150, 75-175 нг/мл, 100-200 нг/мл, 125-225 нг/мл, 100-250 нг/мл, 150-300 нг/мл, 175-250 нг/мл, 200-300 нг/мл, 25-275 нг/мл, 250-300 нг/мл, 49 +/-10% нг/мл, 65 +/-10% нг/мл или 76 +/-10% нг/мл, измеренных, как описано в примерах. В других вариантах осуществления, антитела могут полностью или частично ингибировать связывание TIGIT с CD155 с любым из следующих значений IC50 около 25, 50, 75, 100, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275 или 300 нг/мл или больше, включая концентрации, находящиеся между этими значениями. Некоторые антитела могут усиливать антигенспецифеские T-клеточные отвеPreferred antibodies completely or partially inhibit the binding of TIGIT to CD155. Some antibodies can inhibit this interaction with any of the following IC values of about 25-300 ng/mL, 25-75 ng/mL, 25-50 ng/mL, 40-75 ng/mL, 50-75 ng/mL, 50- 90 ng/ml, 50-100 ng/ml, 75-100 ng/ml, 50-150, 75-175 ng/ml, 100-200 ng/ml, 125-225 ng/ml, 100-250 ng/ml , 150-300 ng/ml, 175-250 ng/ml, 200-300 ng/ml, 25-275 ng/ml, 250-300 ng/ml, 49+/-10% ng/ml, 65+/- 10% ng/ml or 76+/-10% ng/ml measured as described in the examples. In other embodiments, the antibodies can completely or partially inhibit the binding of TIGIT to CD155 with any of the following IC 50 values of about 25, 50, 75, 100, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, or 300 ng/mL, or more, including concentrations between these values. Some antibodies can enhance antigen-specific T-cell responses
- 10 041301 ты 1,5-3-кратно, например, с любым из следующих значений усиления ответа примерно 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9 или 3-кратно или больше, как измерено в примерах. Некоторые антитела могут повышать продукцию 1, 2, 3 или всех из IL-2, IL-6, TNFa и IFNy NK-клетками 1,5-3кратно, например, с любым из следующих значений повышения продукции примерно 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9 или 3 -кратно или больше, как измерено в примерах. Некоторые антитела могут повышать естественную T-клеточную активацию 1,5-3-кратно, например, с любым из следующих значений повышения активации примерно 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9 или 3 -кратно или больше, как измерено в примерах. Некоторые антитела могут ингибировать рак или инфекционное заболевание, как показано в животной модели или клинических испытаниях. Животные модели злокачественного новообразования, в которых раковые клетки человека инъецируют иммунодефицитному лабораторному животному, такому как мышь или крыса, являются широко доступными.- 10 041301 you 1.5-3 times, for example, with any of the following response gain values of about 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 2, 2.1, 2, 2, 2.3, 2.4, 2.5, 2.6, 2.7, 2.8, 2.9 or 3 times or more as measured in the examples. Some antibodies can increase production of 1, 2, 3, or all of IL-2, IL-6, TNFa, and IFNy by NK cells 1.5-3-fold, for example, with any of the following increase values of about 1.5, 1.6 , 1.7, 1.8, 1.9, 2, 2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2.5, 2.6, 2.7, 2.8, 2.9 or 3 times or more as measured in the examples. Some antibodies can increase natural T cell activation 1.5-3-fold, for example, with any of the following activation increase values of about 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 2, 2 .1, 2.2, 2.3, 2.4, 2.5, 2.6, 2.7, 2.8, 2.9, or 3 times or more as measured in the examples. Some antibodies can inhibit cancer or infectious disease as shown in animal models or clinical trials. Animal models of cancer in which human cancer cells are injected into an immunodeficient laboratory animal such as a mouse or rat are widely available.
Гуманизация или химеризация антител повышает период полужизни in vivo по сравнению с исходными мышиными антителами. Получаемый в результате период полужизни может составлять 10-50 дней, например, у человека. Период полужизни можно измерить путем фармакокинетических исследований, таких, которые описаны Kim et al, Eur J of Immunol 24:542 (1994).Humanization or chimerization of antibodies increases the in vivo half-life compared to the original mouse antibodies. The resulting half-life can be 10-50 days, for example in humans. Half-life can be measured by pharmacokinetic studies such as those described by Kim et al, Eur J of Immunol 24:542 (1994).
B. Нечеловеческие антителаB. Non-human antibodies
Получение других нечеловеческих моноклональных антител, например, мышиных, морских свинок, приматов, кроличьих, куриных или крысиных, против TIGIT можно осуществить, например, путем иммунизации животного при помощи TIGIT или его фрагмента или клеток, несущих TIGIT. См. Harlow & Lane, Antobodies, A Laboratory Manual (CSHP NY, 1988) (включенный посредством ссылки для всех целей). Такой иммуноген можно получить из природного источника, путем пептидного синтеза или рекомбинантной экспрессии. Необязательно, иммуноген можно вводить слитым или иным образом, образующим комплекс с белком-носителем. Необязательно иммуноген можно вводить с адъювантом. Можно использовать несколько типов адъювантов, как описано ниже. Для иммунизации лабораторных животных предпочтительным является полный адъювант Фрейнда, затем неполный адъювант. Кроликов или морских свинок обычно используют для получения поликлональных антител. Мышей обычно используют для получения моноклональных антител. Антитела скринируют на специфическое связывание с TIGIT. Необязательно, антитела дополнительно скринируют на связывание с определенной областью TIGIT. Такой скрининг можно осуществить путем определения связывания антитела с коллекцией делеционных мутантов TIGIT и определения того, какие делеционные мутанты связываются с антителом. Связывание можно оценить, например, методом вестерн-блоттинга, FACS или ELISA.Obtaining other non-human monoclonal antibodies, for example, murine, guinea pigs, primates, rabbits, chickens or rats, against TIGIT can be done, for example, by immunizing the animal with TIGIT or its fragment or cells bearing TIGIT. See Harlow & Lane, Antobodies, A Laboratory Manual (CSHP NY, 1988) (incorporated by reference for all purposes). Such an immunogen can be obtained from a natural source, by peptide synthesis or by recombinant expression. Optionally, the immunogen can be administered in a fusion or otherwise complexed with a carrier protein. Optionally, the immunogen may be administered with an adjuvant. Several types of adjuvants can be used, as described below. For immunization of laboratory animals Freund's complete adjuvant is preferred followed by incomplete adjuvant. Rabbits or guinea pigs are usually used to obtain polyclonal antibodies. Mice are commonly used to obtain monoclonal antibodies. Antibodies are screened for specific binding to TIGIT. Optionally, the antibodies are further screened for binding to a specific TIGIT region. Such screening can be done by determining the binding of the antibody to a collection of TIGIT deletion mutants and determining which deletion mutants bind to the antibody. Binding can be assessed, for example, by Western blotting, FACS or ELISA.
C. Гуманизированные антителаC. Humanized antibodies
Уменьшение или устранение ответа HAMA (человеческого антимышиного (также применимо к человеческому антикрысиному или человеческому антикроличьему или человеческому антихомячьему и т.д.) антителу) является важным аспектом клинической разработки подходящих терапевтических средств. См., например, Khaxzaeli et al., J. Natl. Cancer Inst. (1988), 80:937; Jaffers et al., Transplantation (1986), 41:572; Shawler et al., J. Immunol. (1985), 135:1530; Sears et al., J. Biol. Response Mod. (1984), 3:138; Miller et al., Blood (1983), 62:988; Hakimi et al., J. Immunol. (1991), 147:1352; Reichmann et al., Nature (1988), 332:323; Junghans et al., Cancer Res. (1990), 50:1495. Как описанно в настоящей заявке, изобретение обеспечивает антитела, которые являются гуманизированными, чтобы ответ HAMA уменьшался или устранялся. Варианты этих антител можно затем получить с использованием рутинных способов, известных из уровня техники, некоторые из которых описаны ниже.Reducing or eliminating the response of HAMA (human anti-mouse (also applicable to human anti-rat or human anti-rabbit or human anti-hamster, etc.) antibody) is an important aspect of the clinical development of suitable therapeutic agents. See, for example, Khaxzaeli et al., J. Natl. Cancer Inst. (1988), 80:937; Jaffers et al., Transplantation (1986), 41:572; Shawler et al., J. Immunol. (1985), 135:1530; Sears et al., J. Biol. response mod. (1984), 3:138; Miller et al., Blood (1983), 62:988; Hakimi et al., J. Immunol. (1991), 147:1352; Reichmann et al., Nature (1988), 332:323; Junghans et al., Cancer Res. (1990), 50:1495. As described in this application, the invention provides antibodies that are humanized so that the HAMA response is reduced or eliminated. Variants of these antibodies can then be obtained using routine methods known in the art, some of which are described below.
Гуманизированное антитело представляет собой генетически сконструированное антитело, в котором CDR из нечеловеческого донорного антитела пересажены в последовательности человеческого акцепторного антитела (см., например, Queen, US 5530101 и 5585089; Winter, US 5225539, Carter, US 6407213, Adair, US 5859205, 6881557, Foote, US 6881557). Последовательности акцепторного антитела могут представлять собой, например, зрелую последовательность человеческого антитела, смесь таких последовательностей, консенсусную последовательность из последовательностей человеческого антитела или последовательность области зародышевой линии. Таким образом, гуманизированное антитело представляет собой антитело, содержащее некоторые или все CDR полностью или по существу из донорного антитела и каркасные последовательности вариабельных областей и константные области, если присутствуют, полностью или по существу из последовательностей человеческого антитела. Подобным образом гуманизированная тяжелая цепь содержит по меньшей мере одну, две и обычно все три CDR полностью или по существу из тяжелой цепи донорного антитела, и каркасную последовательность вариабельной области тяжелой цепи и константную область тяжелой цепи, если присутствуют, по существу из человеческих последовательностей каркасного участка вариабельной области тяжелой цепи и константной области. Подобным образом, гуманизированная легкая цепь содержит по меньшей мере одну, две и обычно все три CDR полностью или по существу из легкой цепи донорного антитела и каркасную последовательность вариабельной области легкой цепи и константную область легкой цепи, если присутствуют, по существу из человеческих последовательностей каркасного участка вариабельной области легкой цепи и константной области. В отличие от нанотел и dAbs гуманизированное антитело включаетA humanized antibody is a genetically engineered antibody in which CDRs from a non-human donor antibody are grafted into human acceptor antibody sequences (see, for example, Queen, US 5530101 and 5585089; Winter, US 5225539; Carter, US 6407213; , Foote, US 6881557). Acceptor antibody sequences can be, for example, a mature human antibody sequence, a mixture of such sequences, a consensus sequence from human antibody sequences, or a germline region sequence. Thus, a humanized antibody is an antibody containing some or all of the CDRs wholly or substantially from the donor antibody, and variable region framework sequences and constant regions, if present, wholly or substantially from human antibody sequences. Similarly, a humanized heavy chain contains at least one, two, and usually all three CDRs wholly or substantially from the donor antibody's heavy chain, and a heavy chain variable region framework sequence and a heavy chain constant region, if present, substantially from human framework sequences. the variable region of the heavy chain; and the constant region. Similarly, a humanized light chain contains at least one, two, and usually all three CDRs wholly or substantially from the light chain of the donor antibody and a light chain variable region framework sequence and a light chain constant region, if present, substantially from human framework sequences. the variable region of the light chain; and the constant region. Unlike nanobodies and dAbs, a humanized antibody includes
- 11 041301 гуманизированную тяжелую цепь и гуманизированную легкую цепь. Здесь и далее в настоящей заявке CDR в рассматриваемом антителе по существу из соответствующей CDR в эталонном антителе, когда по меньшей мере около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% соответствующих остатков (определенных по Кэботу) идентичны между соответствующими CDR; однако, CDR H2, как определено по номенклатуре Кэбота, в рассматриваемом антителе происходит по существу из соответствующей CDR в эталонном антителе, когда по меньшей мере около 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% соответствующих остатков (определенных по Кэботу) идентичны между соответствующими CDR. Каркасные последовательности вариабельной области цепи антитела или константная область цепи антитела происходят по существу из человеческой каркасной последовательности вариабельной области или человеческой константой области, соответственно, когда по меньшей мере около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% соответствующих остатков, определенных по Кэботу, являются идентичными.- 11 041301 humanized heavy chain and humanized light chain. Here and throughout this application, the CDR in the subject antibody is essentially from the corresponding CDR in the reference antibody when at least about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% of the respective residues (as determined by Cabot) are identical between the respective CDRs; however, the H2 CDR, as defined by Cabot's nomenclature, in the antibody in question is derived substantially from the corresponding CDR in the reference antibody when at least about 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75 , 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 or 100 The % of the respective residues (as determined by Cabot) are identical between the respective CDRs. An antibody variable region framework or an antibody chain constant region is derived substantially from a human variable region framework or human constant region, respectively, when at least about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% of the corresponding Cabot residues are identical.
Хотя гуманизированные антитела часто включают все шесть CDR (предпочтительно, определенных по номенклатуре Кэбота) из нечеловеческого (например, мышиного) антитела, они также могут быть получены с меньшим числом CDR (например, по меньшей мере 3, 4 или 5) CDR из нечеловеческого антитела (например, Pascalis et al., J. Immunol. 169:3076, 2002; Vajdos et al., Journal of Molecular Biology, 320: 415-428, 2002; Iwahashi et al., Mol. Immunol. 36:1079-1091, 1999; Tamura et al, Journal of Immunology, 164:1432-1441, 2000).While humanized antibodies often include all six CDRs (preferably defined by Cabot nomenclature) from a non-human (e.g., murine) antibody, they can also be made with fewer CDRs (e.g., at least 3, 4, or 5) CDRs from a non-human antibody. (e.g., Pascalis et al., J. Immunol. 169:3076, 2002; Vajdos et al., Journal of Molecular Biology, 320: 415-428, 2002; Iwahashi et al., Mol. Immunol. 36:1079-1091 , 1999; Tamura et al, Journal of Immunology, 164:1432-1441, 2000).
В некоторых антителах только часть CDR, а именно ряд CDR остатков, необходимых для связывания, называемых SDR, требуются для сохранения связывания в гуманизированном антителе. CDR остатки, не контактирующие с антигеном и не находящиеся в SDR, могут быть идентифицированы на основании предыдущего исследования (например, остатки H60-H65 в CDR H2 часто не требуются) из областей CDR по системе Кэбота, расположенных вне гипервариабельных петель Чотиа (Chothia, J. Mol. Biol. 196:901, 1987), методом молекулярного моделирования и/или эмпирически или как описанно в Gonzales et al., Mol. Immunol. 41: 863, 2004. В таких гуманизированных антителах в положениях, в которых один или несколько из донорных CDR остатков отсутствует или в которых отсутствует вся донорная CDR, аминокислота, занимающая такое положение, может представлять собой аминокислоту, занимающую соответствующее положение (в соответствии с нумерацией Кэбота) в последовательности акцепторного антитела. Количество таких замен для включения акцепторных аминокислот вместо донорных в CDR отражает баланс соображений, касающихся конкуренции. Такие замены потенциально выгодны для уменьшения количества мышиных аминокислот в гуманизированном антителе и, как следствие, уменьшения потенциальной иммуногенности. Однако замены также могут вызывать изменения аффинности, и предпочтительно избегать значительного снижения аффинности. Положения для замещения внутри CDR и аминокислоты для замены также могут быть выбраны эмпирически.In some antibodies, only a portion of the CDR, namely the set of CDR residues required for binding, called SDRs, are required to maintain binding in a humanized antibody. CDR residues not in contact with antigen and not in SDR can be identified on the basis of previous research (for example, H60-H65 residues in CDR H2 are often not required) from Cabot CDR regions located outside Chothia's hypervariable loops (Chothia, J Mol. Biol. 196:901, 1987), by molecular modeling and/or empirically or as described in Gonzales et al., Mol. Immunol. 41: 863, 2004. In such humanized antibodies, at positions where one or more of the donor CDR residues is missing, or where the entire donor CDR is missing, the amino acid occupying that position may be the amino acid occupying the corresponding position (as numbered Cabot) in the sequence of the acceptor antibody. The number of such substitutions to include acceptor amino acids instead of donor amino acids in CDRs reflects a balance of competitive considerations. Such substitutions are potentially beneficial in reducing the number of murine amino acids in a humanized antibody and, as a result, reducing potential immunogenicity. However, substitutions can also cause changes in affinity, and it is preferable to avoid a significant decrease in affinity. Positions for substitution within the CDR and amino acids for substitution can also be chosen empirically.
Хотя акцептор может быть идентичным по последовательности выбранной человеческой каркасной последовательности независимо от того, происходит ли она из человеческого иммуноглобулина или человеческой консенсусной каркасной последовательности, настоящее изобретение предполагает, что акцепторная последовательность может включать ранее существовавшие аминокислотные замены относительно последовательности человеческого иммуноглобулина или человеческой консенсусной каркасной последовательности. Эти ранее существовавшие замены предпочтительно минимальны; обычно разница только в четырех, трех, двух или одной аминокислоте по отношению к человеческой последовательности иммуноглобулина или консенсусной каркасной последовательности.Although the acceptor may be sequence identical to the selected human framework sequence, whether derived from human immunoglobulin or human consensus framework sequence, the present invention contemplates that the acceptor sequence may include pre-existing amino acid substitutions relative to the human immunoglobulin sequence or human consensus framework sequence. These pre-existing substitutions are preferably minimal; typically only four, three, two, or one amino acid difference relative to the human immunoglobulin sequence or consensus framework sequence.
Последовательности человеческого акцепторного антитела необязательно могут быть выбраны из множества известных последовательностей человеческих антител для обеспечения высокой степени идентичности последовательностей (например, 65-85% идентичности) между каркасами вариабельной области человеческой акцепторной последовательности и соответствующими каркасами вариабельной области цепи донорного антитела.The human acceptor antibody sequences may optionally be selected from a variety of known human antibody sequences to provide a high degree of sequence identity (e.g., 65-85% identity) between the human acceptor sequence variable region frameworks and the corresponding donor antibody chain variable region frameworks.
Некоторые аминокислоты из каркасных остатков человеческой вариабельной области могут быть выбраны для замены на основании их возможного влияния на CDR конформацию и/или связывание с антигеном. Для исследования таких возможных влияний используют моделирование, исследование характеристик аминокислот в конкретных положениях или эмпирическое наблюдение эффектов замен или мутагенеза конкретных аминокислот.Some amino acids from the framework residues of the human variable region may be selected for substitution based on their possible effect on CDR conformation and/or antigen binding. Modeling, characterization of amino acids at specific positions, or empirical observation of the effects of substitutions or mutagenesis of specific amino acids is used to explore such possible influences.
Например, в случае отличий аминокислоты между каркасным остатком нечеловеческой вариабельной области и выбранным каркасным остатком человеческой вариабельной области, человеческая аминокислота каркасного участка может быть заменена эквивалентной аминокислотой каркасного участка из нечеловеческого антитела, когда есть основания ожидать, что аминокислота:For example, in the event of amino acid differences between a non-human variable region framework residue and a selected human variable region framework residue, the human framework amino acid may be substituted with an equivalent framework amino acid from a non-human antibody when the amino acid is expected to:
(1) нековалентно связывается с антигеном непосредственно, (2) является смежной с CDR областью, (3) как-либо иначе взаимодействует с CDR областью (например, находится в пределах около 6 А от CDR области).(1) non-covalently binds to the antigen directly, (2) is adjacent to the CDR region, (3) otherwise interacts with the CDR region (eg, is within about 6 A of the CDR region).
Другими кандидатами для замены являются аминокислоты акцепторной человеческой каркаснойOther candidates for substitution are amino acids of the acceptor human scaffold
- 12 041301 области, которые являются необычными для иммуноглобулина человека в этом положении. Эти аминокислоты могут быть заменены аминокислотами из эквивалентного положения нечеловеческого донорного антитела или из эквивалентных положений более типичных человеческих иммуноглобулинов. Другими кандидатами для замены являются аминокислоты акцепторной человеческой каркасной области, которые являются необычными для иммуноглобулина человека в этом положении.- 12 041301 areas that are unusual for human immunoglobulin at this position. These amino acids can be replaced with amino acids from the equivalent position of the non-human donor antibody or from the equivalent positions of more typical human immunoglobulins. Other candidates for substitution are human acceptor framework amino acids, which are unusual for human immunoglobulin at this position.
Предпочтительное гуманизированное антитело содержит зрелую вариабельную область тяжелой цепи по меньшей мере на около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или меньше чем 100% идентичную SEQ ID NO: 35 и зрелую вариабельную область легкой цепи по меньшей мере на около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или меньше чем 100% идентичную SEQ ID NO: 37. Предпочтительно любое изменение может иметь место по каркасным остаткам вариабельной области за исключением тех, которые определены как возможно важные для связывания (см. абзац [0073]). Предпочтительно любое изменение представляет собой консервативную аминокислотную замену. Предпочтительное антитело включает зрелую вариабельную область тяжелой цепи с последовательностью SEQ ID NO: 35 и зрелую вариабельную область легкой цепи с последовательностью SEQ ID NO: 37. Для экспрессии полноразмерного антитела зрелую вариабельную область тяжелой цепи предпочтительно связывают с константной областью тяжелой цепи, состоящей из, или включающей, SEQ ID NO: 40, при условии, что C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелую вариабельную область легкой цепи предпочтительно связывают с константной областью легкой цепи, состоящей из или, включающей, SEQ ID NO: 41.A preferred humanized antibody contains a mature heavy chain variable region of at least about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 or less than 100% identical to SEQ ID NO: 35 and a mature light chain variable region of at least about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92 , 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 or less than 100% identical to SEQ ID NO: 37. Preferably, any change can take place at variable region framework residues except those identified as possibly important for binding (see paragraph [0073]). Preferably, any change is a conservative amino acid substitution. A preferred antibody comprises a mature heavy chain variable region of SEQ ID NO: 35 and a mature light chain variable region of SEQ ID NO: 37. For full-length antibody expression, a mature heavy chain variable region is preferably linked to a heavy chain constant region consisting of, or comprising SEQ ID NO: 40, with the proviso that a C-terminal lysine may or may not be present, and the mature light chain variable region is preferably linked to a light chain constant region consisting of or including SEQ ID NO: 41.
Другое предпочтительное гуманизированное антитело содержит зрелую вариабельную область тяжелой цепи по меньшей мере на около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или меньше чем 100% идентичную SEQ ID NO: 43 и зрелую вариабельную область легкой цепи по меньшей мере на около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 9θ, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или меньше чем 100% идентичную SEQ ID NO: 45. Предпочтительно, любое изменение имеет место по каркасным остаткам вариабельной области, за исключением тех, которые определены как возможно важные для связывания (см. абзац [0073] и примеры). Предпочтительно, любое изменение представляет собой консервативную аминокислотную замену. Предпочтительное антитело включает зрелую вариабельную область тяжелой цепи, имеющую последовательность SEQ ID NO: 43, и зрелую вариабельную область легкой цепи, имеющую последовательность SEQ ID NO: 45. Для экспрессии полноразмерного антитела зрелую вариабельную область тяжелой цепи предпочтительно связывают с константной областью тяжелой цепи, состоящей из, или включающей SEQ ID NO: 48, при условии, что C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать, и зрелую вариабельную область легкой цепи предпочтительно связывают с константной областью легкой цепи, состоящей из, или включающей, SEQ ID NO: 49.Another preferred humanized antibody contains a mature heavy chain variable region of at least about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97 , 98, 99, or less than 100% identical to SEQ ID NO: 43 and a mature light chain variable region of at least about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 9θ, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, or less than 100% identical to SEQ ID NO: 45. Preferably, any change occurs in the variable region framework residues, except for those identified as possibly important for binding (See paragraph [0073] and examples). Preferably, any change is a conservative amino acid substitution. A preferred antibody comprises a mature heavy chain variable region having the sequence of SEQ ID NO: 43 and a mature light chain variable region having the sequence of SEQ ID NO: 45. For full-length antibody expression, the mature heavy chain variable region is preferably linked to a heavy chain constant region consisting of of or including SEQ ID NO: 48, with the proviso that a C-terminal lysine may or may not be present, and the mature light chain variable region is preferably linked to a light chain constant region consisting of, or including, SEQ ID NO: 49.
D. Химерные и венированные антителаD. Chimeric and veneered antibodies
Изобретение также обеспечивает химерные и венированные формы нечеловеческих антител, в частности, TIG1, TIG2, и TIG3 антител примеров.The invention also provides chimeric and veneered forms of non-human antibodies, in particular the TIG1, TIG2, and TIG3 antibodies of the examples.
Химерное антитело представляет собой антитело, в котором зрелые вариабельные области легкой и тяжелой цепей нечеловеческого антитела (например, мышиного) присутствуют в комбинации с человеческими константными областями легкой и тяжелой цепей. Такие антитела по существу или полностью сохраняют специфичность связывания нечеловеческого антитела и являются примерно на две трети человеческой последовательностью.A chimeric antibody is an antibody in which the mature light and heavy chain variable regions of a non-human (eg, murine) antibody are present in combination with human light and heavy chain constant regions. Such antibodies essentially or completely retain the binding specificity of the non-human antibody and are about two-thirds human sequence.
Венированное антитело представляет собой тип гуманизированного антитела, которое сохраняет некоторые и обычно все из CDR и некоторые из каркасных остатков нечеловеческой вариабельной области нечеловеческого антитела, но с заменой других каркасных остатков вариабельной области, которые могут способствовать взаимодействию с B- или T-клеточными эпитопами, например, экспонированных остатков (Padlan, Mol. Immunol. 28:489, 1991) остатками из соответствующих положений последовательности человеческого антитела. Результатом является антитело, в котором CDR полностью или по существу из нечеловеческого антитела, а каркасы вариабельных областей нечеловеческого антитела стали более подобны человеческим путем замен. Венированные формы TIG1, TIG2 или TIG3 антитела включены в изобретение.A veneered antibody is a type of humanized antibody that retains some, and usually all, of the CDRs and some of the non-human variable region framework residues of the non-human antibody, but with the replacement of other variable region framework residues that may facilitate interaction with B- or T-cell epitopes, e.g. , exposed residues (Padlan, Mol. Immunol. 28:489, 1991) with residues from the corresponding positions in the human antibody sequence. The result is an antibody in which the CDRs are wholly or essentially from the non-human antibody, and the non-human antibody variable region frameworks are made more human-like by substitutions. Veneered forms of TIG1, TIG2 or TIG3 antibodies are included in the invention.
E. Человеческие антителаE. Human antibodies
Человеческие антитела против TIGIT обеспечиваются с использованием различных способов, описанных ниже. Некоторые человеческие антитела выбирают путем осуществления экспериментов конкурентного связывания, методом фагового дисплея Winter, описанного выше, либо как имеющие такую же эпитоп-специфичность, как у конкретного мышиного антитела, такого как одно из мышиных моноклональных антител, описанных в примерах. Человеческие антитела также можно скринировать на специфичность в отношении конкретного эпитопа с использованием только фрагмента TIGIT в качестве антигена-мишени и/или путем скрининга антитела против коллекции делеционных мутантов TIGIT.Human anti-TIGIT antibodies are provided using the various methods described below. Some human antibodies are selected by performing competitive binding experiments, by the Winter phage display method described above, or by having the same epitope specificity as a particular mouse antibody, such as one of the mouse monoclonal antibodies described in the examples. Human antibodies can also be screened for specificity for a particular epitope using only the TIGIT fragment as the target antigen and/or by screening the antibody against a collection of TIGIT deletion mutants.
Способы получения человеческих антител включают триомный метод Oestberg et al., Hybridoma 2:361-367 (1983); Oestberg, Патент США № 4634664; и Engleman et al., Патент США № 4634666, использование трансгенных мышей, включающих гены человеческого иммуноглобулина (см., например, Lonberg et al., WO93/12227 (1993); US 5877397, US 5874299, US 5814318, US 5789650, US 5770429, USMethods for making human antibodies include the trioma method of Oestberg et al., Hybridoma 2:361-367 (1983); Oestberg, US Patent No. 4634664; and Engleman et al., US Pat. No. 4,634,666, the use of transgenic mice comprising human immunoglobulin genes (see, for example, Lonberg et al., WO93/12227 (1993); US 5877397, US 5874299, US 5814318, US 5789650, US US 5770429
- 13 041301- 13 041301
5661016, US 5633425, US 5625126, US 5569825, US 5545806, Nature 148, 1547-1553 (1994), Nature Biotechnology 14, 826 (1996), Kucherlapati, WO 91/10741 (1991) и методы фагового дисплея (см., например, Dower et al., WO 91/17271 и McCafferty et al., WO 92/01047, US 5877218, US 5871907, US 5858657, US 5837242, US 5733743 и US 5565332).5661016, US 5633425, US 5625126, US 5569825, US 5545806, Nature 148, 1547-1553 (1994), Nature Biotechnology 14, 826 (1996), Kucherlapati, WO 91/10741 (1991) and phage display methods (see for example, Dower et al., WO 91/17271 and McCafferty et al., WO 92/01047, US 5877218, US 5871907, US 5858657, US 5837242, US 5733743 and US 5565332).
F. Выбор константной областиF. Constant Region Selection
Вариабельные области тяжелой и легкой цепей химерных, гуманизированных (включая венированные) или человеческих антител могут быть связаны с по меньшей мере частью человеческой константной области. Выбор константной области зависит частью от того, желательны ли антитело-зависимый комплемент и/или клеточно-опосредованная цитотоксичность. Например, человеческие изотипы IgG1 и IgG3 обладают комплемент-опосредованной цитотоксичностью, а человеческие изотипы IgG2 и IgG4 ей не обладают. Константные области легкой цепи могут быть лямбда или каппа. Для иммунотерапии против злокачественного новообразования или патогена, не экспрессирующего TIGIT, часто предпочтительны человеческие IgG2 или IgG4 или аттенуированная форма человеческого IgG1 со сниженной эффекторной функцией. Для человеческого IgG4 часто предпочтительно включение S228P (Eu нумерация) генно-инженерной мутации на тяжелой цепи для предотвращения обмена Fab-фрагментами. Однако для элиминации раковых клеток, экспрессирующих TIGIT (например, из T-клеточных или NK-клеточных опухолей) или для иммуносупрессии часто предпочтительны человеческие IgG1 или IgG3.The heavy and light chain variable regions of chimeric, humanized (including veneered), or human antibodies can be linked to at least a portion of a human constant region. The choice of constant region depends in part on whether antibody-dependent complement and/or cell-mediated cytotoxicity is desired. For example, the human IgG1 and IgG3 isotypes have complement-mediated cytotoxicity, while the human IgG2 and IgG4 isotypes do not. Light chain constant regions can be lambda or kappa. For immunotherapy against cancer or a non-TIGIT-expressing pathogen, human IgG2 or IgG4 or an attenuated form of human IgG1 with reduced effector function is often preferred. For human IgG4, it is often preferable to include an S228P (Eu numbering) genetically engineered mutation on the heavy chain to prevent the exchange of Fab fragments. However, for elimination of TIGIT-expressing cancer cells (eg, from T-cell or NK-cell tumors) or for immunosuppression, human IgG1 or IgG3 is often preferred.
Человеческие константные области демонстрируют аллотипические вариации и изоаллотипические вариации у разных индивидуумов, то есть константные области могут отличаться у разных индивидуумов по одному или нескольким полиморфным положениям. Изоаллотипы отличаются от аллотипов тем, что белки сыворотки, распознающие изоаллотип, связываются с не-полиморфной областью одного или нескольких других изотипов. Ссылка на человеческую константную область включает константную область с любым природным аллотипом или любой пермутацией остатков, занимающих полиморфные положения в природных аллотипах.Human constant regions show allotypic variation and isoallotype variation between individuals, ie constant regions may differ from individual to individual at one or more polymorphic positions. Isoallotypes differ from allotypes in that the isoallotype-recognizing serum proteins bind to a non-polymorphic region of one or more other isotypes. Reference to a human constant region includes a constant region with any natural allotype or any permutation of residues occupying polymorphic positions in natural allotypes.
Одна или несколько аминокислот на амино или карбокси конце легкой и/или тяжелой цепи, такие как C-концевой лизин тяжелой цепи, может отсутствовать или может быть преобразована в части или во всех из этих молекул. Замены могут быть в константных областях для снижения или повышения эффекторной функции, такой как комплемент-опосредованная цитотоксичность или ADCC [см., например, Winter et al., Патент США № 5624821; Tso et al., Патент США № 5834597 и Lazar et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103:4005, 2006) или для продления периода полужизни в организме человека (см., например, Hinton et al., J. Biol. Chem. 279:6213, 2004). Иллюстративные замены включают Gln в положении 250 и/или Leu в положении 428 (Eu нумерация) для увеличения периода полужизни антитела.One or more amino acids at the amino or carboxy terminus of the light and/or heavy chain, such as the C-terminal lysine of the heavy chain, may be missing or may be converted to some or all of these molecules. Substitutions can be in constant regions to reduce or increase effector function, such as complement-mediated cytotoxicity or ADCC [see, for example, Winter et al., US Pat. No. 5,624,821; Tso et al., US Pat. No. 5,834,597 and Lazar et al., Proc. Natl. Acad. sci. USA, 103:4005, 2006) or to extend the half-life in humans (see, for example, Hinton et al., J. Biol. Chem. 279:6213, 2004). Illustrative substitutions include Gln at position 250 and/or Leu at position 428 (Eu numbering) to increase the half-life of the antibody.
Некоторые антитела по изобретению конструируют путем введения мутации(мутаций) в константной области для получения пониженных эффекторных функций, таких как CDC и ADCC или ADCP, по сравнению с таким же антителом без мутации(мутаций). Предпочтительно каждая или все из этих эффекторных функций снижаются по меньшей мере на 50, 75, 90 или 95% по сравнению с антителами без мутации. Представленные примеры показывают, как можно измерить CDC. Другие анализы описаны в Shields et al, 2001 J. Biol. Chem., Vol. 276, p 6591-6604; Chappel et al, 1993 J. Biol. Chem., Vol 268, p 2512425131; Lazar et al, 2006 PNAS, 103; 4005-4010.Some antibodies of the invention are engineered by introducing mutation(s) in the constant region to produce reduced effector functions such as CDC and ADCC or ADCP compared to the same antibody without the mutation(s). Preferably, each or all of these effector functions are reduced by at least 50%, 75%, 90% or 95% compared to non-mutated antibodies. The examples presented show how CDC can be measured. Other assays are described in Shields et al, 2001 J. Biol. Chem., Vol. 276, p 6591-6604; Chappel et al, 1993 J. Biol. Chem., Vol 268, p 2512425131; Lazar et al, 2006 PNAS, 103; 4005-4010.
Замена любого или всех положений 234, 235, 236 и/или 237 снижает аффинность к Fcy рецепторам, в частности, к FcyRI рецептору (см., например, US 6624821). Аланин является предпочтительным остатком для замены, и L234A/L235A является предпочтительной двойной мутацией для снижения эффекторной функции. Другие комбинации мутаций с пониженными эффекторными функциями включают L234A/L235A/ G237A, E233P/L234V/L235A/G236, A327G/A330S/P331S, K322A, L234A и L235A, L234F/L235E/P331S. Необязательно, положения 234, 236 и/или 237 в человеческом IgG2 заменены аланином, а положение 235 глутамином (см., например, US 5624821). Две аминокислотные замены в сайте связывания комплемента C1q в положениях 330 и 331 (EU-индекс) уменьшают фиксацию комплемента (см. Tao et al., J. Exp. Med. 178:661 (1993) и Canfield and Morrison, J. Exp. Med. 173:1483 (1991)). Замена в человеческом IgG1 или IgG2 остатков в положениях 233-236 и в IgG4 остатков в положениях 327, 330 и 331 сильно снижает ADCC и CDC (см., например, Armour KL. et al., 1999 Eur J Immunol. 29(8):2613-24 и Shields RL. et al., 2001. J Biol Chem. 276(9):6591-604). N297A, N297Q или N297G (Eu нумерация) мутации снижают гликозилирование и, соответственно, эффекторные функции.Substitution of any or all positions 234, 235, 236 and/or 237 reduces the affinity for Fcy receptors, in particular the FcyRI receptor (see, for example, US 6624821). Alanine is the preferred replacement residue, and L234A/L235A is the preferred double mutation for reduced effector function. Other mutation combinations with reduced effector functions include L234A/L235A/G237A, E233P/L234V/L235A/G236, A327G/A330S/P331S, K322A, L234A and L235A, L234F/L235E/P331S. Optionally, positions 234, 236 and/or 237 in human IgG2 are replaced by alanine and position 235 by glutamine (see, for example, US 5624821). Two amino acid substitutions at the C1q complement binding site at positions 330 and 331 (EU index) decrease complement fixation (see Tao et al., J. Exp. Med. 178:661 (1993) and Canfield and Morrison, J. Exp. Med 173:1483 (1991)). The substitution in human IgG1 or IgG2 residues at positions 233-236 and in IgG4 residues at positions 327, 330 and 331 greatly reduces ADCC and CDC (see, for example, Armor KL. et al., 1999 Eur J Immunol. 29(8) :2613-24 and Shields RL et al 2001 J Biol Chem 276(9):6591-604). N297A, N297Q or N297G (Eu numbering) mutations reduce glycosylation and thus effector functions.
G. Экспрессия рекомбинантных антителG. Expression of recombinant antibodies
Химерные, гуманизированные (включая венированные) и человеческие антитела, как правило, получают путем рекомбинантной экспрессии. Рекомбинантные полинуклеотидные конструкции типично включают контролирующую экспрессию последовательность, функционально связанную с кодирующими последовательностями цепей антитела, включая природно-ассоциированные или гетерологичные промоторные области. Предпочтительно контролирующие экспрессию последовательности представляют собой эукариотические промоторные системы в векторах, способных трансформировать или трансфицировать эукариотические клетки-хозяева. После введения вектора подходящему хозяину этого хозяина поддерживают в условиях, подходящих для высокого уровня экспрессии нуклеотидных последоваChimeric, humanized (including veneered), and human antibodies are generally produced by recombinant expression. Recombinant polynucleotide constructs typically include an expression control sequence operably linked to the coding sequences of the antibody chains, including naturally associated or heterologous promoter regions. Preferably, the expression control sequences are eukaryotic promoter systems in vectors capable of transforming or transfecting eukaryotic host cells. Once the vector has been introduced into a suitable host, the host is maintained under conditions suitable for a high level of expression of the nucleotide sequences.
- 14 041301 тельностей, и осуществляют сбор и очистку рекомбинантных антител.- 14 041301 values, and collect and purify recombinant antibodies.
Клетки млекопитающего являются предпочтительным хозяином для экспрессии нуклеотидных сегментов, кодирующих иммуноглобулины или их фрагменты. См. Winnacker, From Genes to Clones, (VCH Publishers, NY, 1987). Различные подходящие клеточные линии-хозяева, способные секретировать интактные гетерологичные белки, были разработаны в данной области, и они включают CHO клеточные линии, различные COS клеточные линии, HeLa клетки, HEK293 клетки, L клетки и не продуцирующие антитела миеломы, включая Sp2/0 и NS0. Предпочтительно клетки являются нечеловеческими. Векторы экспрессии для этих клеток могут включать контролирующие экспрессию последовательности, такие как точка начала репликации, промотор, энхансер (Queen et al., Immunol. Rev. 89:49 (1986)), и необходимые сайты обработки информации, такие как сайты связывания рибосом, сайты сплайсинга РНК, сайты полиаденилирования и последовательности терминаторов транскрипции. Предпочтительными контролирующими экспрессию последовательностями являются промоторы, происходящие из эндогенных генов, цитомегаловируса, SV40, аденовируса, бычьего папилломавируса и т.п. См. Co et al., J. Immunol. 148:1149 (1992).Mammalian cells are the preferred host for the expression of nucleotide segments encoding immunoglobulins or fragments thereof. See Winnacker, From Genes to Clones, (VCH Publishers, NY, 1987). Various suitable host cell lines capable of secreting intact heterologous proteins have been developed in the art and include CHO cell lines, various COS cell lines, HeLa cells, HEK293 cells, L cells, and non-antibody producing myeloma including Sp2/0 and NS0. Preferably the cells are non-human. Expression vectors for these cells may include expression control sequences such as an origin of replication, a promoter, an enhancer (Queen et al., Immunol. Rev. 89:49 (1986)), and necessary information processing sites such as ribosome binding sites, RNA splicing sites, polyadenylation sites, and transcription terminator sequences. Preferred expression control sequences are promoters derived from endogenous genes, cytomegalovirus, SV40, adenovirus, bovine papillomavirus, and the like. See Co et al., J. Immunol. 148:1149 (1992).
После того, как антитела экспрессированы, они могут быть очищены в соответствии со стандартными процедурами, известными в данной области техники, включая ВЭЖХ очистку, колоночную хроматографию, гель-электрофорез и т.п. (см. в общем Scopes, Protein Purification (Springer-Verlag, NY, 1982)).Once the antibodies have been expressed, they can be purified according to standard procedures known in the art, including HPLC purification, column chromatography, gel electrophoresis, and the like. (See generally Scopes, Protein Purification (Springer-Verlag, NY, 1982)).
IV. Терапевтические примененияIV. Therapeutic Applications
Антитела могут использоваться для усиления иммунных реакций при лечении злокачественного новообразования и инфекционных заболеваний. Расстройства, поддающиеся лечению антителами по изобретению, включают, без ограничения, рак, включая гематологические злокачественные опухоли и солидные опухоли. Такие раковые опухоли могут экспрессировать или не экспрессировать TIGIT или CD155. Антитела к TIGIT эффективны против злокачественного новообразования, не экспрессирующего TIGIT, поскольку ингибирование взаимодействия TIGIT с CD155 стимулирует иммунный ответ против таких видов злокачественного новообразования. Примеры гематологических злокачественных новообразований включают лейкозы, лимфомы и миеломы, включая острый миелоидный лейкоз, T-клеточный лейкоз взрослых, T-клеточный крупногранулярный лимфоцитарный лейкоз, острый лимфобластный лейкоз, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, острый моноцитарный лейкоз, лимфому Ходжкина и не-ходжкинскую лимфому и множественную миелому. Примеры солидных опухолей включают, без ограничения, рак яичников, рак эндометрия, рак молочной железы, рак легких (мелкоклеточный или немелкоклеточный), рак толстой кишки, рак предстательной железы, рак шейки матки, рак поджелудочной железы, рак желудка, рак пищевода, гепатоцеллюлярную карциному (рак печени), почечноклеточную карциному (рак почки), опухоли головы и шеи, мезотелиому, меланому, саркомы и опухоли головного мозга (например, глиомы, такие как глиобластомы)Antibodies can be used to enhance immune responses in the treatment of cancer and infectious diseases. The disorders treatable with the antibodies of the invention include, without limitation, cancer, including hematologic malignancies and solid tumors. Such cancers may or may not express TIGIT or CD155. Anti-TIGIT antibodies are effective against non-TIGIT-expressing cancers because inhibition of TIGIT interaction with CD155 stimulates an immune response against such cancers. Examples of hematological malignancies include leukemias, lymphomas, and myelomas, including acute myeloid leukemia, adult T-cell leukemia, T-cell large granular lymphocytic leukemia, acute lymphoblastic leukemia, chronic lymphocytic leukemia, chronic myeloid leukemia, acute monocytic leukemia, Hodgkin's lymphoma, and non-Hodgkin's lymphoma. lymphoma and multiple myeloma. Examples of solid tumors include, without limitation, ovarian cancer, endometrial cancer, breast cancer, lung cancer (small cell or non-small cell), colon cancer, prostate cancer, cervical cancer, pancreatic cancer, gastric cancer, esophageal cancer, hepatocellular carcinoma (liver cancer), renal cell carcinoma (kidney cancer), head and neck tumors, mesothelioma, melanoma, sarcomas, and brain tumors (eg, gliomas such as glioblastomas)
Способы по изобретению можно осуществить на практике в условиях адъювантной терапии. Условия адъювантной терапии относится к клинической ситуации, когда индивид имеет историю пролиферативного заболевания, особенно злокачественного новообразования, и обычно (но не обязательно) отвечал на лечение, которое включает, но не ограничивается этим, хирургию, лучевую терапию и/или химиотерапию. Однако из-за истории пролиферативного заболевания эти индивиды считаются подверженными риску развития этого заболевания. Лечение или введение в условиях адъювантной терапии относится к последующему способу лечения. В некоторых вариантах осуществления в настоящей заявке представлен способ для лечения или осуществления профилактики злокачественного новообразования, включающий введение индивиду, имеющему рак или повышенный риск развития злокачественного новообразования, терапевтически эффективного количества любого из антител, раскрытых в настоящей заявке в условиях адъювантной терапии.The methods of the invention may be practiced under adjuvant therapy. Adjuvant therapy refers to a clinical situation where an individual has a history of a proliferative disease, especially malignancy, and has typically (but not necessarily) responded to treatment, which includes, but is not limited to, surgery, radiation therapy, and/or chemotherapy. However, due to a history of proliferative disease, these individuals are considered at risk for developing this disease. Treatment or administration under adjuvant therapy refers to the subsequent method of treatment. In some embodiments, provided herein is a method for treating or preventing cancer, comprising administering to an individual having cancer or an increased risk of developing cancer a therapeutically effective amount of any of the antibodies disclosed herein under adjuvant therapy.
Способы, представленные в настоящей заявке, также можно осуществлять в не-адъювантных условиях, то есть способ можно осуществить до первичной/радикальной терапии. В некоторых аспектах индивид ранее проходил лечение. В других аспектах индивид ранее не проходил лечение. В некоторых аспектах лечение представляет собой терапию первой линии. В некоторых вариантах осуществления в настоящей заявке представлен способ для лечения или осуществления профилактики злокачественного новообразования, включающий введение индивиду, имеющему рак или повышенный риск развития злокачественного новообразования, терапевтически эффективного количества любого из антител, раскрытых в настоящей заявке, в не-адъювантных условиях.The methods presented in this application can also be carried out in non-adjuvant conditions, that is, the method can be carried out before primary/radical therapy. In some aspects, the individual has previously received treatment. In other aspects, the individual has not previously received treatment. In some aspects, the treatment is a first line therapy. In some embodiments, provided herein is a method for treating or preventing cancer, comprising administering to an individual having cancer or an increased risk of developing cancer a therapeutically effective amount of any of the antibodies disclosed herein under non-adjuvant conditions.
Другие расстройства, которые можно лечить антителами по изобретению, включают инфекционные заболевания, вызванные вирусами, бактериями, грибами, простейшими и другими патогенами (например, вирус гепатита (A, B или C), вирус герпеса (например, VZV, HSV-1, HAV-6, HSV-II, и CMV, вирус Эпштейна-Барра), аденовирус, вирус гриппа, флавивирусы, эховирус, риновирус, вирус Коксаки, коронавирус, респираторный синцитиальный вирус, вирус эпидемического паротита, ротавирус, вирус кори, вирус краснухи, парвовирус, вирус коровьей оспы, HTLV вирус, вирус денге, папилломавирус, вирус моллюска, полиовирус, вирус бешенства, JC вирус, ВИЧ, ВСГ и вирус арбовирусного энцефалита, хламидии, бактерии риккетсии, микобактерии, стафилококки, стрептококки, пневмококки, менингококки и гонококки, клебсиелла, протеус, серрация, псевдомонас, легионелла, дифтерийная палочка, палочкаOther disorders that can be treated with the antibodies of the invention include infectious diseases caused by viruses, bacteria, fungi, protozoa, and other pathogens (e.g. hepatitis (A, B or C), herpes virus (e.g. VZV, HSV-1, HAV -6, HSV-II, and CMV, Epstein-Barr virus), adenovirus, influenza virus, flaviviruses, echovirus, rhinovirus, coxsackie virus, coronavirus, respiratory syncytial virus, mumps virus, rotavirus, measles virus, rubella virus, parvovirus, vaccinia virus, HTLV virus, dengue virus, papillomavirus, molluscum virus, poliovirus, rabies virus, JC virus, HIV, HCV and arbovirus encephalitis virus, chlamydia, rickettsia bacteria, mycobacteria, staphylococci, streptococci, pneumococci, meningococci and gonococci, klebsiella, proteus, serration, pseudomonas, legionella, diphtheria bacillus, bacillus
- 15 041301 сальмонеллы, бактерии, вызывающие холеру, столбняк, ботулизм, сибирскую язву, чуму, лептоспироз и болезнь Лайма.- 15 041301 salmonella, bacteria that cause cholera, tetanus, botulism, anthrax, plague, leptospirosis and Lyme disease.
A. Введение антителA. Administration of antibodies
Антитела, описанные в настоящей заявке, вводят в эффективном режиме, что означает дозировку, способ введения и частоту введения, которые задерживают начало развития, уменьшают тяжесть, ингибируют дальнейшее ухудшение и/или улучшают по меньшей мере один признак или симптом расстройства. Если индивид уже страдает от расстройства, режим можно назвать терапевтически эффективным режимом. Если у индивида повышенный риск заболевания по сравнению с общей популяцией, но он еще не испытывает симптомов, режим можно назвать профилактически эффективным режимом. В некоторых случаях терапевтическая или профилактическая эффективность может наблюдаться у отдельного индивида относительно исторических контролей или опыта прошлого у того же индивида. В других случаях терапевтическая или профилактическая эффективность может быть продемонстрирована в доклинических или клинических испытаниях в популяции получающих лечение индивидов по сравнению с контрольной популяцией не получающих лечение индивидов.The antibodies described herein are administered in an effective regimen, meaning a dosage, route of administration, and frequency of administration, that delays the onset of development, reduces the severity, inhibits further deterioration, and/or improves at least one sign or symptom of the disorder. If the individual is already suffering from the disorder, the regimen may be referred to as a therapeutically effective regimen. If an individual has an increased risk of disease compared to the general population, but is not yet experiencing symptoms, the regimen may be termed a prophylactically effective regimen. In some cases, therapeutic or prophylactic efficacy may be observed in an individual subject relative to historical controls or past experience in the same individual. In other cases, therapeutic or prophylactic efficacy may be demonstrated in preclinical or clinical trials in a population of treated individuals compared to a control population of untreated individuals.
В некоторых аспектах любой из описанных в настоящей заявке способов включает введение терапевтически эффективного количества одного или нескольких антител, описанных в настоящей заявке, индивидам, нуждающимся в этом. Используемый в настоящей заявке термин терапевтически эффективное количество или терапевтически эффективная доза противораковой терапии (такой как любое из антител против TIGIT, описанных в настоящей заявке) представляет собой количество, достаточное для получения полезных или желаемых результатов. Для терапевтического применения полезные или желаемые результаты включают клинические результаты, такие как уменьшение одного или нескольких симптомов, вызванных злокачественным новообразованием, повышение качества жизни индивидов, страдающих от злокачественного новообразования, уменьшение дозы других лекарственных средств, необходимых для лечения злокачественного новообразования, повышение эффекта другого лекарственного средства, например, путем нацеливания, задержки прогрессирования заболевания и/или продления выживания. Эффективную дозу можно вводить в виде одного или нескольких введений. Для целей настоящего изобретения эффективная дозировка противораковой терапии представляет собой количество, достаточное для осуществления терапевтического или профилактического лечения непосредственно или опосредованно. Как понимается в клиническом контексте, терапевтически эффективная доза противораковой терапии может достигаться или не достигаться в сочетании с другой противораковой терапией.In some aspects, any of the methods described in this application includes the introduction of a therapeutically effective amount of one or more antibodies described in this application, individuals in need of it. Used in this application, the term therapeutically effective amount or therapeutically effective dose of anticancer therapy (such as any of the antibodies against TIGIT described in this application) is an amount sufficient to obtain useful or desired results. For therapeutic use, useful or desirable results include clinical results such as a reduction in one or more of the symptoms caused by cancer, an improvement in the quality of life of individuals suffering from cancer, a reduction in the dose of other drugs needed to treat cancer, an increase in the effect of another drug eg by targeting, delaying disease progression and/or prolonging survival. An effective dose may be administered in one or more administrations. For the purposes of the present invention, an effective dosage of an anticancer therapy is an amount sufficient to effect a therapeutic or prophylactic treatment, either directly or indirectly. As understood in the clinical context, a therapeutically effective dose of an anticancer therapy may or may not be achieved in combination with another anticancer therapy.
Иллюстративные дозы для любого из антител, описанных в настоящей заявке, составляют около 0,1-20 мг/кг или 0,5-5 мг/кг массы тела (например, около 0,5, 1, 2, 3, 4, 5 г, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 мг/кг) или 10-1500 мг (например, любая доза из меньше чем 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 300, 350, 400, 450, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000, 1100, 1200, 1300, 1400 или 1500 мг или больше, включая значения между этими цифровыми значениями), в виде фиксированной дозы. Доза зависит от состояния индивида и ответа на предшествующее лечение, если оно имело место, независимо от того, является лечение профилактическим или терапевтическим, и от того, является расстройство острым или хроническим, помимо прочего.Illustrative doses for any of the antibodies described in this application are about 0.1-20 mg/kg or 0.5-5 mg/kg body weight (for example, about 0.5, 1, 2, 3, 4, 5 g, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 or 20 mg/kg) or 10-1500 mg (for example, any dose of less than 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 300, 350, 400, 450, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000, 1100, 1200, 1300, 1400 or 1500 mg or more, including values between these figures), as a fixed dose. The dose depends on the condition of the individual and the response to prior treatment, if any, whether the treatment is prophylactic or therapeutic, and whether the disorder is acute or chronic, among other things.
Введение может быть парентеральным, внутривенным, пероральным, подкожным, интраартериальным, интракраниальным, интратекальным, интраперитонеальным, интратуморальным, местным, интраназальным или внутримышечным. Предпочтительным является введение в системный кровоток путем внутривенного или подкожного введения. Внутривенное введение можно осуществить, например, путем инфузии в течение периода, такого как 30-90 мин.Administration may be parenteral, intravenous, oral, subcutaneous, intraarterial, intracranial, intrathecal, intraperitoneal, intratumoral, topical, intranasal, or intramuscular. Preferred is the introduction into the systemic circulation by intravenous or subcutaneous administration. Intravenous administration can be accomplished, for example, by infusion over a period such as 30-90 minutes.
Частота введения зависит от периода полужизни антитела в кровотоке, состояния индивида и способа введения, среди прочего. Частота может быть ежедневной, еженедельной, ежемесячной, ежеквартальной или с нерегулярными интервалами в ответ на изменения состояния индивида или прогрессирование расстройства, подвергаемого лечению. В качестве примера, частота для внутривенного введения представляет собой введение от одного раза в неделю до одного раза в квартал в ходе непрерывного периода лечения, хотя также возможно более или менее частое введение. Для подкожного введения в качестве примера можно указать частоту введения от одного раза в день до одного раза в месяц, хотя возможно более или менее частое введение.The frequency of administration depends on the circulating half-life of the antibody, the condition of the individual, and the route of administration, among other things. The frequency may be daily, weekly, monthly, quarterly, or at irregular intervals in response to changes in the individual's condition or progression of the disorder being treated. By way of example, the frequency for intravenous administration is from once a week to once a quarter during a continuous treatment period, although more or less frequent administration is also possible. For subcutaneous administration, an administration frequency of once a day to once a month can be exemplified, although more or less frequent administration is possible.
Количество вводимых доз зависит от того, является ли заболевание острым или хроническим, а также от ответа расстройства на лечение. Для острых расстройств или острых обострений хронических расстройств часто бывает достаточно от 1 до 10 доз. Иногда одна болюсная доза, необязательно в виде дробных доз, достаточна при остром расстройстве или остром обострении хронического расстройства. Лечение может повторяться при рецидиве острого расстройства или острого обострения. При хронических заболеваниях антитело можно вводить через регулярные промежутки времени, например, еженедельно, раз в две недели, раз в месяц, раз в квартал, раз в шесть месяцев в течение по меньшей мере 1, 5 или 10 лет или в течение жизни индивида.The number of doses administered depends on whether the disease is acute or chronic and the response of the disorder to treatment. For acute disorders or acute exacerbations of chronic disorders, 1 to 10 doses are often sufficient. Sometimes a single bolus dose, optionally in divided doses, is sufficient for an acute disorder or an acute exacerbation of a chronic disorder. Treatment may be repeated if the acute disorder or acute exacerbation recurs. In chronic diseases, the antibody can be administered at regular intervals, for example, weekly, biweekly, monthly, quarterly, every six months for at least 1, 5, or 10 years, or for the lifetime of the individual.
Лечение, включающее антитело против TIGIT, может облегчить заболевание, увеличивая среднюю выживаемость без прогрессирования или общее время выживания пациентов со злокачественным новообразованием по меньшей мере на около 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47,Anti-TIGIT antibody treatment can alleviate disease by increasing median progression-free survival or overall survival time in patients with cancer by at least about 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40 , 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47,
- 16 041301- 16 041301
48, 49%, но предпочтительно по меньшей мере на около 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или даже 100%, по сравнению с контрольными индивидами, или увеличить любое время из указанных на 2 недели, 1, 2 или 3 месяца, или предпочтительно на 4 или 6 месяцев, или даже на 9 месяцев или на год. Кроме того или альтернативно, лечение, включающее анти-TIGIT антитело, может повысить процент пациентов с полным ответом, частичным ответом или объективным ответом (полный + частичный) по меньшей мере на около 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49%, но предпочтительно по меньшей мере на около 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или даже 100%, по сравнению с контрольными индивидами. Контрольные индивиды принимают то же лечение, что и индивиды, принимающие анти-TIGIT антитело, за исключением антиTIGIT антитела. Таким образом, контрольные индивиды могут принимать только плацебо или комбинацию плацебо и некоторого химиотерапевтического средства отличного от анти-TIGIT антитела, если такое средство также принимают индивиды, принимающие анти-TIGIT антитело.48, 49%, but preferably at least about 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or even 100% compared to control individuals, or increase any of these times by 2 weeks, 1, 2 or 3 months, or preferably by 4 or 6 months, or even by 9 months or a year. Additionally or alternatively, treatment comprising an anti-TIGIT antibody can increase the percentage of patients with complete response, partial response, or objective response (complete + partial) by at least about 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49%, but preferably at least about 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 or even 100% compared to control individuals. Control individuals receive the same treatment as those receiving the anti-TIGIT antibody, with the exception of the anti-TIGIT antibody. Thus, control individuals may receive a placebo alone or a combination of a placebo and some chemotherapeutic agent other than an anti-TIGIT antibody, if such agent is also taken by individuals taking an anti-TIGIT antibody.
Анти-TIGIT антитела, раскрытые в настоящей заявке, могут усиливать NK-клеточноопосредованную цитотоксичность CD155-экспрессирующих клеток (таких как, но не ограничиваясь этим, K562 клетки), на любую величину из около 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35% или больше по сравнению с уровнем NK-клеточно-опосредованной цитотоксичности CD155-экспрессирующих клеток в отсутствие одного из анти-TIGIT антител, раскрытых в настоящей заявке.The anti-TIGIT antibodies disclosed herein can enhance the NK cell mediated cytotoxicity of CD155 expressing cells (such as, but not limited to, K562 cells) by any amount of about 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35% or more of the level of NK cell mediated cytotoxicity of CD155-expressing cells in the absence of one of the anti-TIGIT antibodies disclosed in this application.
Как правило, в клинических испытаниях (например, в фазе II, в фазе II/III или в фазе III) увеличение средней выживаемости без прогрессирования и/или частоты ответа индивидов, получавших антитело против TIGIT, по сравнению с контрольной группой индивидов статистически значимо, например, на уровне p=0,05 или 0,01 или даже 0,001. Проценты пациентов с полным и частичным ответом определяются объективными критериями, обычно используемыми в клинических испытаниях для лечения злокачественного новообразования, например, перечисленными или принятыми Национальным институтом рака и/или Управлением по контролю за продуктами и лекарствами, и могут включать, например, определение объема опухоли, количества опухолей, метастазов, время выживания и качества жизни, среди прочего.Generally, in clinical trials (e.g., phase II, phase II/III, or phase III), the increase in median progression-free survival and/or response rate of individuals treated with anti-TIGIT antibody compared to controls of individuals is statistically significant, e.g. , at p=0.05 or 0.01 or even 0.001. The percentages of complete and partial response patients are determined by objective criteria commonly used in clinical trials for the treatment of cancer, such as those listed or accepted by the National Cancer Institute and/or the Food and Drug Administration, and may include, for example, tumor sizing, number of tumors, metastases, survival time and quality of life, among others.
Фармацевтические композиции для парентерального введения предпочтительно являются стерильными и, по существу, изотоническими и изготавливаются в условиях GMP (правила правильного производства). Фармацевтические композиции могут быть представлены в стандартной дозированной форме (то есть доза для одного введения). Фармацевтические композиции могут быть сформулированы с использованием одного или нескольких физиологически приемлемых носителей, разбавителей, эксципиентов или вспомогательных веществ. Лекарственная форма зависит от выбранного пути введения. Для инъекций антитела могут быть сформулированы в водных растворах, предпочтительно в физиологически совместимых буферах, таких как раствор Хэнкса, раствор Рингера или физиологический раствор или ацетатный буфер (чтобы уменьшить дискомфорт в месте инъекции). Раствор может содержать агенты для формулирования, такие как суспендирующие, стабилизирующие и/или диспергирующие агенты. Альтернативно, антитела могут быть в лиофилизированной форме для восстановления подходящим носителем, например стерильной апирогенной водой, перед использованием. Концентрация антитела в жидких композициях может варьироваться примерно в пределах 10-150 мг/мл. В некоторых композициях концентрация составляет около 25-50 мг/мл.Pharmaceutical compositions for parenteral administration are preferably sterile and substantially isotonic and manufactured under GMP (Good Manufacturing Practices) conditions. Pharmaceutical compositions may be presented in unit dosage form (ie, single administration dose). Pharmaceutical compositions may be formulated using one or more physiologically acceptable carriers, diluents, excipients or excipients. The dosage form depends on the chosen route of administration. For injection, antibodies can be formulated in aqueous solutions, preferably in physiologically compatible buffers such as Hank's solution, Ringer's solution, or saline or acetate buffer (to reduce discomfort at the injection site). The solution may contain formulation agents such as suspending, stabilizing and/or dispersing agents. Alternatively, the antibodies may be in lyophilized form for reconstitution with a suitable vehicle, such as sterile, pyrogen-free water, prior to use. The concentration of the antibody in the liquid compositions can vary from about 10-150 mg/ml. In some compositions, the concentration is about 25-50 mg/ml.
B. Комбинированные терапииB. Combination therapies
Настоящее изобретение предусматривает применение антител против TIGIT в комбинации с одним или несколькими активными терапевтическими средствами (например, химиотерапевтическими средствами) или другими профилактическими или терапевтическими модальностями (например, облучением). В такой комбинированной терапии различные активные средства часто имеют разные взаимодополняющие механизмы действия. Такая комбинированная терапия может быть особенно предпочтительной, позволяя снизить дозу одного или нескольких средств, уменьшая или устраняя, таким образом, побочные эффекты, связанные с одним или несколькими средствами. Кроме того, такая комбинированная терапия может иметь синергический терапевтический или профилактический эффект на основное заболевание, расстройство или состояние.The present invention provides for the use of anti-TIGIT antibodies in combination with one or more active therapeutic agents (eg, chemotherapeutic agents) or other prophylactic or therapeutic modalities (eg, radiation). In such combination therapy, the different active agents often have different complementary mechanisms of action. Such a combination therapy may be particularly advantageous, allowing the dose of one or more agents to be reduced, thereby reducing or eliminating the side effects associated with one or more agents. In addition, such combination therapy may have a synergistic therapeutic or prophylactic effect on the underlying disease, disorder or condition.
Используемый в настоящей заявке термин комбинация означает терапевтические средства, которые можно вводить отдельно, например, сформулированными отдельно для отдельного введения (например, как может быть предусмотрено в наборе), и терапевтические средства, которые можно вводить вместе в одной композиции (т.е. совместная композиция).As used herein, the term combination means therapeutic agents that can be administered separately, for example, formulated separately for separate administration (for example, as may be provided in a kit), and therapeutic agents that can be administered together in one composition (i.e., joint composition).
В некоторых вариантах осуществления любое из антител против TIGIT, раскрытых в настоящей заявке, вводят или применяют последовательно, например, когда одно средство вводят перед одним или несколькими другими средствами. В других вариантах осуществления антитела вводят одновременно, например, когда два или более средств вводят примерно в одно и то же время; два или более средств могут присутствовать в двух или более отдельных композициях или объединены в одну композицию (тоIn some embodiments, any of the anti-TIGIT antibodies disclosed herein is administered or used sequentially, such as when one agent is administered before one or more other agents. In other embodiments, the antibodies are administered simultaneously, for example, when two or more agents are administered at about the same time; two or more agents may be present in two or more separate compositions or combined into one composition (then
- 17 041301 есть совместную композицию). Независимо от того, вводят ли два или более средств последовательно или одновременно, они считаются вводимыми в комбинации для целей настоящего изобретения.- 17 041301 there is a joint composition). Whether two or more agents are administered sequentially or simultaneously, they are considered to be administered in combination for the purposes of the present invention.
Антитела по настоящему изобретению можно использовать в комбинации с по меньшей мере одним другим (активным) средством любым образом в соответствии с данными обстоятельствами. В одном варианте осуществления лечение по меньшей мере одним активным средством и по меньшей мере одним антителом против TIGIT по настоящему изобретению поддерживают в течение определенного периода времени. В другом варианте осуществления лечение по меньшей мере одним активным средством уменьшают или прекращают (например, когда индивид стабилен), в то время как лечение антителом против TIGIT по настоящему изобретению поддерживают при постоянном режиме введения. В еще одном варианте осуществления лечение по меньшей мере одним активным средством уменьшают или прекращают (например, когда индивид стабилен), тогда как лечение антителом против TIGIT по настоящему изобретению уменьшают (например, более низкая доза, менее частое введение или более короткий режим лечения). В еще одном варианте осуществления лечение по меньшей мере одним активным средством уменьшают или прекращают (например, когда индивид стабилен), и лечение антителом против TIGIT по настоящему изобретению увеличивают (например, более высокая доза, более частое введение или более длительный режим лечения). В еще одном варианте осуществления лечение по меньшей мере одним активным средством поддерживают, а лечение антителом против TIGIT по настоящему изобретению уменьшают или прекращают (например, более низкая доза, менее частое введение или более короткий режим лечения). В еще одном варианте осуществления лечение по меньшей мере одним активным средством и лечение антителами против TIGIT по настоящему изобретению уменьшают или прекращают (например, более низкая доза, менее частое введение или более короткий режим лечения).The antibodies of the present invention may be used in combination with at least one other (active) agent in any manner appropriate to the circumstances. In one embodiment, treatment with at least one active agent and at least one anti-TIGIT antibody of the present invention is maintained for a certain period of time. In another embodiment, treatment with at least one active agent is reduced or discontinued (eg, when the individual is stable) while treatment with an anti-TIGIT antibody of the present invention is maintained at a constant dosing regimen. In another embodiment, treatment with at least one active agent is reduced or discontinued (eg, when the individual is stable), while treatment with an anti-TIGIT antibody of the present invention is reduced (eg, lower dose, less frequent administration, or shorter treatment regimen). In yet another embodiment, treatment with at least one active agent is reduced or discontinued (eg, when the individual is stable) and treatment with an anti-TIGIT antibody of the present invention is increased (eg, higher dose, more frequent administration, or longer treatment regimen). In yet another embodiment, treatment with at least one active agent is maintained and treatment with the anti-TIGIT antibody of the present invention is reduced or discontinued (eg, lower dose, less frequent administration, or shorter treatment regimen). In yet another embodiment, treatment with at least one active agent and treatment with anti-TIGIT antibodies of the present invention is reduced or discontinued (eg, lower dose, less frequent administration, or shorter treatment regimen).
Лечение антителами по изобретению можно сочетать с другими лечениями, эффективными против рассматриваемого расстройства. При использовании в лечении пролиферативного состояния, злокачественного новообразования, опухоли или предраковых заболеваний, расстройств или состояний антитела по изобретению можно сочетать с химиотерапией, облучением (например, локализованной лучевой терапией или общей лучевой терапией тела), лечением стволовыми клетками, хирургией или лечением другими биологическими препаратами.Treatment with antibodies of the invention may be combined with other treatments effective against the disorder in question. When used in the treatment of a proliferative condition, malignancy, tumor or precancerous disease, disorder or condition, the antibodies of the invention may be combined with chemotherapy, radiation (e.g., localized radiation therapy or total body radiation therapy), stem cell therapy, surgery, or treatment with other biological agents. .
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к способам подавления опухоли или роста опухоли, включающим введение антител против TIGIT, описанных в настоящей заявке, в сочетании с ингибитором сигнальной трансдукции (STI) для достижения аддитивного или синергетического подавления роста опухоли. Используемый в настоящей заявке термин ингибитор сигнальной трансдукции относится к средству, которое селективно ингибирует одну или несколько стадий в сигнальном пути. Ингибиторы сигнальной трансдукции (STIs) по настоящему изобретению включают: (i) ингибиторы BCR-Abl-киназы (например, иматиниб мезилат (GLEEVEC)); (ii) ингибиторы рецепторов эпидермального фактора роста (EGF), в том числе ингибиторы киназы и антитела; (iii) ингибиторы HER2/пеи-рецепторов (например, HERCEPTIN); (iv) ингибиторы киназ семейства Akt или пути Akt (например, рапамицин); (v) ингибиторы киназы клеточного цикла (например, флавопиридол); и (vi) ингибиторы фосфатидилинозиткиназы. Средства, участвующие в иммуномодуляции, также можно использовать в комбинации с антителами против TIGIT, описанными в настоящей заявке, для подавления роста опухоли у раковых пациентов.In some embodiments, the present invention relates to methods for suppressing tumor or tumor growth, comprising administering anti-TIGIT antibodies described herein in combination with a signal transduction inhibitor (STI) to achieve additive or synergistic suppression of tumor growth. As used herein, the term signal transduction inhibitor refers to an agent that selectively inhibits one or more steps in a signaling pathway. The signal transduction inhibitors (STIs) of the present invention include: (i) BCR-Abl kinase inhibitors (eg, imatinib mesylate (GLEEVEC)); (ii) epidermal growth factor (EGF) receptor inhibitors, including kinase inhibitors and antibodies; (iii) HER2/nei receptor inhibitors (eg, HERCEPTIN); (iv) Akt family kinase or Akt pathway inhibitors (eg rapamycin); (v) cell cycle kinase inhibitors (eg, flavopiridol); and (vi) phosphatidylinositkinase inhibitors. Immunomodulatory agents can also be used in combination with the anti-TIGIT antibodies described herein to suppress tumor growth in cancer patients.
Примеры химиотерапевтических средств включают, но не ограничиваются этим, алкилирующие средства, такие как тиотепа и циклофосфамид; алкилсульфонаты, такие как бусульфан, имсульфан и пироссульфан; азиридины, такие как бензодопа, карбоквон, метуредопа и уредопа; этиленимины и метиламеламины, включая алтретамин, триэтиленмеламин, триэтиленфосфорамид, триэтилентиофосфаорамид и триметилоломелаламид; азотистые иприты, такие как хиорамбуцил, хлорнафазин, холофосфамид, эстрамустин, ифосфамид, мехлоретамин, гидрохлорид мехлоретамин оксид, мелфалан, новембихин, фенестерин, преднимустин, трофосфамид, урацилиприт; нитрозомочевины, такие как кармустин, хлорозотоцин, фотемустин, ломустин, нимустин, ранимустин; антибиотики, такие как аклациномизины, актиномицин, аутрамицин, азасерин, блеомицины, кактиномицин, калихеамицин, карбабицин, каминомицин, карцинофилин, хромомицины, дактиномицин, даунорубицин, деторубицин, 6-диазо-5-оксоЩ-норлейцин, доксорубицин, эпирубицин, эзорубицин, идарубицин, марцелломицин, митомицины, микофеноловая кислота, ногаламицин, оливомицины, пепломицин, потфиромицин, пуромицин, квеламицин, родорубицин, стрептонигрин, стрептозоцин, туберцидин, убенимекс, зиностатин, зорубицин; антиметаболиты, такие как метотрексат и 5-фторурацил (5-FU); аналоги фолиевой кислоты, такие как деноптерин, метотрексат, птероптерин, триметрексат; пуриновые аналоги, такие как флударабин, б-меркаптопурин, тиамиприн, тиогуанин; пиримидиновые аналоги, такие как анцитабин, азацитидин, 6-азауридин, кармофур, цитарабин, дидезоксиуридин, доксифлуридин, эноцитабин, флуксуридин, 5-FU; андрогены, такие как каластоун, дромоностанол пропионат, эпитиотонол, мепитиостан, тестолактон; средства, угнетающие функции надпочечников, такие как аминоглутетимид, митотан, трилостан; заменитель фолиевой кислоты, такой как фролиновая кислота; ацеглатон; альдофосфамидгликозид; аминолевулиновая кислота; амсакрин; бестрабуцил; бисантрен; эдатраксат; дефофамин; демеколцин; диазиквон; элформитин; эллиптиний ацетат; этоглуцид; нитрат галлия; гидроксимочевина; лентинан; лонидамин; митогуазон; митоксанExamples of chemotherapeutic agents include, but are not limited to, alkylating agents such as thiotepa and cyclophosphamide; alkylsulfonates such as busulfan, imsulfan and pyrosulfan; aziridines such as benzodopa, carbokwon, meturedopa and uredopa; ethyleneimines and methylamelamines, including altretamine, triethylenemelamine, triethylenephosphoramide, triethylenethiophosphoramide, and trimethylolomelalamide; nitrogen mustards such as chiorambucil, chlornaphasine, holofosfamide, estramustine, ifosfamide, mechlorethamine, mechlorethamine oxide hydrochloride, melphalan, novembihin, phenesterin, prednimustine, trofosfamide, uraciliprite; nitrosoureas such as carmustine, chlorozotocin, fotemustine, lomustine, nimustine, ranimustine; antibiotics such as aclacinomycins, actinomycin, autramycin, azaserine, bleomycins, cactinomycin, calicheamicin, carbabicin, kaminomycin, carcinophyllin, chromomycins, dactinomycin, daunorubicin, detorubicin, 6-diazo-5-oxo-Norleucine, doxorubicin, epirubicin, esorubicin, idarubicin, marcellomycin, mitomycin, mycophenolic acid, nogalamycin, olivomycin, peplomycin, potfiromycin, puromycin, quelamycin, rhodorubicin, streptonigrin, streptozocin, tubercidin, ubenimex, zinostatin, zorubicin; antimetabolites such as methotrexate and 5-fluorouracil (5-FU); folic acid analogs such as denopterin, methotrexate, pteropterin, trimetrexate; purine analogues such as fludarabine, β-mercaptopurine, thiamiprin, thioguanine; pyrimidine analogs such as ancitabine, azacitidine, 6-azauridine, carmofur, cytarabine, dideoxyuridine, doxyfluridine, enocytabine, fluxuridine, 5-FU; androgens such as calastone, dromonostanol propionate, epithiotonol, mepitiostane, testolactone; adrenal depressants such as aminoglutethimide, mitotane, trilostane; a folic acid substitute such as frolinic acid; aceglatone; aldophosphamide glycoside; aminolevulinic acid; amsacrine; bestrabucil; bisantrene; edatraksat; defofamine; demecolcin; diaziquon; elformitin; elliptinium acetate; etoglucid; gallium nitrate; hydroxyurea; lentinan; lonidamine; mitoguazone; mitoxan
- 18 041301 трон; мопидамол; нитракрин; пентостатин; фенамет; пирарубицин; подофиллиновая кислота; 2этилгидразид; прокарбазин; разоксан; сизофиран; спирогерманий; тенуазоновая кислота; триазиквон; 2,2',2''-трихлортриэтиламин; уретан; виндезин; дакарбазин; манномустин; митобронитол; митолактол; пипоброман; гацитозин; арабинозид (Apa-C); циклофосфамид; тиотепа; токсоиды (например, таксаны), например паклитаксел, таксол и доксетаксел; хлорамбуцил; гемцитабин; 6-тиогуанин; меркаптопурин; метотрексат; платина и платиновые координационные комплексы, такие как цисплатин и карбоплатин; винбластин; этопозид (VP-16); ифосфамид; митомицин C; митоксантрон; винкристин; винорелбин; навелбин; новантрон; тенипозид; дауномицин; аминоптерин; кселода; ибандронат; CPT11; ингибиторы топоизомеразы; камптотецины, дифторметилорнитин (DMFO); ретиноевая кислота; эсперамицины; капецитабин; антиметаболиты (например, азатиоприн); антрациклины; растительные алкалоиды (включая, например, алкалоиды барвинка); и фармацевтически приемлемые соли, кислоты или производные любого из вышеуказанных.- 18 041301 throne; mopidamol; nitracrine; pentostatin; phenamet; pyrarubicin; podophyllic acid; 2ethylhydrazide; procarbazine; razoxane; sisofiran; spirogermanium; tenuazonic acid; triaziquone; 2,2',2''-trichlorotriethylamine; urethane; vindesine; dacarbazine; mannomustine; mitobronitol; mitolactol; pipobroman; hacytosine; arabinoside (Apa-C); cyclophosphamide; thiotepa; toxoids (eg taxanes), eg paclitaxel, taxol and doxetaxel; chlorambucil; gemcitabine; 6-thioguanine; mercaptopurine; methotrexate; platinum and platinum coordination complexes such as cisplatin and carboplatin; vinblastine; etoposide (VP-16); ifosfamide; mitomycin C; mitoxantrone; vincristine; vinorelbine; navelbin; novantron; teniposide; daunomycin; aminopterin; xeloda; ibandronate; CPT11; topoisomerase inhibitors; camptothecins, difluoromethylornithine (DMFO); retinoic acid; esperamycins; capecitabine; antimetabolites (eg, azathioprine); anthracyclines; plant alkaloids (including, for example, vinca alkaloids); and pharmaceutically acceptable salts, acids or derivatives of any of the foregoing.
Химиотерапевтические средства также включают антигормональные средства, которые действуют как регулирующие или ингибирующие гормональное воздействие на опухоли, такие как антиэстрогены, включая, например, тамоксифен, ралоксифен, ингибирующие ароматазу 4(5)-имидазолы, 4гидрокситамоксифен, триоксифен, кеоксифен и торемифен; и антиандрогены, такие как флутамид, нилутамид, бикалютамид, лейпролид и гозерелин; и фармацевтически приемлемые соли, кислоты или производные любого из вышеуказанных. В некоторых вариантах осуществления комбинированная терапия включает введение гормона или соответствующего гормонального средства.Chemotherapeutic agents also include antihormonal agents that act to regulate or inhibit hormonal effects on tumors, such as antiestrogen including, for example, tamoxifen, raloxifene, aromatase-inhibiting 4(5)-imidazoles, 4hydroxytamoxifen, trioxifene, keoxifene, and toremifene; and antiandrogens such as flutamide, nilutamide, bicalutamide, leuprolide and goserelin; and pharmaceutically acceptable salts, acids or derivatives of any of the foregoing. In some embodiments, the combination therapy comprises the administration of a hormone or an appropriate hormonal agent.
Дополнительные способы лечения, которые можно использовать в сочетании с антителами против TIGIT, описанными в настоящей заявке, включают лучевую терапию, моноклональное антитело против опухолевого антигена, комплекс моноклонального антитела и токсина, T-клеточный адъювант, трансплантацию костного мозга или использование антиген-презентирующих клеток (например, терапия дендритными клетками) или клеточных терапий. Используемый в настоящей заявке термин клеточная терапия относится к любой терапии, которая включает введение клеток в целях достижения желаемого терапевтического эффекта, например, для восстановления поврежденных или пересыщенных клеточных популяций или тканей взрослых или для усиления иммунного ответа против патогена или пролиферативной клетки (такой как раковая клетка). В других вариантах осуществления клеточная терапия включает введение недифференцированной клетки (такой как стволовая клетка или другая мульти- или тотипотентная клетка), способной дифференцироваться в конкретный тип клеток, необходимый для достижения желаемого терапевтического эффекта, например, восстановления поврежденных или пересыщенных клеточных популяций или тканей взрослых или усиления иммунного ответа против патогена или пролиферативной клетки (такой как раковая клетка). В некоторых вариантах осуществления антитела по изобретению можно также вводить с инфильтрирующими опухоль T-клетками или природными киллерами, которые необязательно были размножены или выбраны для хоуминга к опухоли ex vivo. Антитело по изобретению способствует активации этих клеток.Additional therapies that can be used in combination with the anti-TIGIT antibodies described herein include radiation therapy, anti-tumor antigen monoclonal antibody, monoclonal antibody-toxin complex, T-cell adjuvant, bone marrow transplantation, or use of antigen-presenting cells ( e.g. dendritic cell therapy) or cell therapies. As used herein, the term cell therapy refers to any therapy that involves the administration of cells in order to achieve a desired therapeutic effect, for example, to restore damaged or supersaturated adult cell populations or tissues, or to enhance the immune response against a pathogen or proliferating cell (such as a cancer cell). ). In other embodiments, the cell therapy comprises administering an undifferentiated cell (such as a stem cell or other multi- or totipotent cell) capable of differentiating into the particular cell type required to achieve the desired therapeutic effect, such as repairing damaged or supersaturated cell populations or tissues in adults or enhancing the immune response against a pathogen or proliferative cell (such as a cancer cell). In some embodiments, antibodies of the invention can also be administered with tumor-infiltrating T cells or natural killer cells, which have optionally been expanded or selected for ex vivo homing to the tumor. The antibody of the invention promotes the activation of these cells.
Предпочтительная комбинация представляет собой антитело по изобретению с вторым антителом, направленным на поверхностный антиген, предпочтительно экспрессируемый на раковых клетках по сравнению с контрольной нормальной тканью. Некоторые примеры антител, которые можно вводить в комбинированной терапии при помощи антител по изобретению для лечения злокачественного новообразования, включают Герцептин® (трастузумаб) против антигена HER2, Авастин® (бевацизумаб) против VEGF или антитела к рецептору EGF, такие как (Erbitux®, цетуксимаб) и Vectibix® (панитумумаб). Другие средства, которые можно вводить, включают антитела или другие ингибиторы любых из PD-1, PDL1, CTLA-4, 4-1BB, BTLA, VISTA, TIM-3 и LAG-3; или другие ингибиторы пути передачи сигнала, например, ингибиторы mTOR и GSK3e; и цитокины, например, интерферон-γ, IL-2 и IL-15. Некоторые конкретные примеры дополнительных средств включают: ипилимумаб, пазопаниб, сунитиниб, дазатиниб, пембролизумаб, INCR024360, дабрафениб, траметиниб, атезолизумаб (MPDL3280A), рарцева, кобиметиниб и ниволумаб. Выбор второго антитела или другого средства для комбинированной терапии зависит от лечения злокачественного новообразования. Необязательно, рак тестируют на экспрессию или преимущественную экспрессию антигена для направления выбора подходящего антитела. Изотипом второго антитела предпочтительно является человеческий IgG1 для промотирования эффекторных функций, таких как ADCC, CDC и фагоцитоз.A preferred combination is an antibody of the invention with a second antibody directed to a surface antigen preferentially expressed on cancer cells compared to control normal tissue. Some examples of antibodies that can be administered in combination therapy with the antibodies of the invention for the treatment of cancer include Herceptin® (trastuzumab) against the HER2 antigen, Avastin® (bevacizumab) against VEGF, or antibodies to the EGF receptor such as (Erbitux®, cetuximab ) and Vectibix® (panitumumab). Other agents that may be administered include antibodies or other inhibitors of any of PD-1, PDL1, CTLA-4, 4-1BB, BTLA, VISTA, TIM-3, and LAG-3; or other signaling pathway inhibitors, eg mTOR and GSK3e inhibitors; and cytokines such as interferon-γ, IL-2 and IL-15. Some specific examples of additional agents include: ipilimumab, pazopanib, sunitinib, dasatinib, pembrolizumab, INCR024360, dabrafenib, trametinib, atezolizumab (MPDL3280A), rarceva, cobimetinib, and nivolumab. The choice of the second antibody or other agent for combination therapy depends on the treatment of the malignancy. Optionally, the cancer is tested for expression or preferential expression of the antigen to guide selection of the appropriate antibody. The isotype of the second antibody is preferably human IgG1 to promote effector functions such as ADCC, CDC and phagocytosis.
Антитела по изобретению также можно вводить с вакцинами, вызывающими иммунный ответ против злокачественного новообразования. Такой иммунный ответ усиливается антителом по изобретению. Вакцина может включать антиген, экспрессируемый на поверхности злокачественного новообразования, или его фрагмент, эффективный для индукции иммунного ответа, необязательно связанный с молекулойносителем.The antibodies of the invention can also be administered with vaccines that elicit an immune response against cancer. Such an immune response is enhanced by an antibody of the invention. The vaccine may include an antigen expressed on the surface of the cancer, or a fragment thereof effective to induce an immune response, optionally associated with a carrier molecule.
В настоящем изобретении рассматривается применение антител против TIGIT, описанных в настоящей заявке, в сочетании с ингибиторами иммунных контрольных точек.The present invention contemplates the use of the anti-TIGIT antibodies described herein in combination with immune checkpoint inhibitors.
Огромное количество генетических и эпигенетических изменений, характерных для всех видов злокачественного новообразования, обеспечивает разнообразный набор антигенов, которые иммунная сисA huge number of genetic and epigenetic changes, characteristic of all types of malignant neoplasm, provide a diverse set of antigens that the immune system
- 19 041301 тема может использовать для различения опухолевых клеток от их нормальных аналогов. В случае Tклеток, максимальная амплитуда (например, уровни продукции или пролиферации цитокинов) и качество (например, тип генерируемого иммунного ответа, такой как картина продукции цитокинов) ответа, который инициируется с помощью распознавания антигена T-клеточным рецептором (TCR), регулируется балансом между костимуляторными и ингибиторными сигналами (иммунными контрольными точками). В нормальных физиологических условиях иммунные контрольные точки имеют решающее значение для профилактики аутоиммунитета (то есть поддержания самоустойчивости), а также для защиты тканей от повреждений, когда иммунная система реагирует на патогенную инфекцию. Экспрессия белков иммунных контрольных точек может быть дисрегулирована опухолями как важный механизм иммуннорезистентности.- 19 041301 topic can be used to distinguish tumor cells from their normal counterparts. In the case of T cells, the maximum amplitude (eg, levels of cytokine production or proliferation) and quality (eg, type of immune response generated, such as a pattern of cytokine production) of the response that is initiated by antigen recognition by the T cell receptor (TCR) is governed by a balance between costimulatory and inhibitory signals (immune checkpoints). Under normal physiological conditions, immune checkpoints are critical for preventing autoimmunity (i.e., maintaining self-resistance) as well as protecting tissues from damage when the immune system responds to a pathogenic infection. Expression of immune checkpoint proteins may be dysregulated by tumors as an important mechanism of immune resistance.
Примеры иммунных контрольных точек (лигандов и рецепторов), некоторые из которых селективно повышающе регулируются в различных типах опухолевых клеток, которые являются кандидатами для блокады, включают PD-1 (белок запрограммированной клеточной гибели 1); PD-L1 (лиганд запрограммированной клеточной гибели-1); BTLA (B и T лимфоцитарный аттенюатор); CTLA-4 (цитотоксический T-лимфоцит-ассоциированный антиген 4); TIM-3 (T-клеточный мембранный белок 3); LAG-3 (ген активации лимфоцитов 3); V-доменный иммуноглобулиновый супрессор T-клеточной активации (VISTA); CD96; A2aR (аденозиновый A2a рецептор); A2bR (аденозиновый A2b рецептор); CD73 (экто-5'нуклеотидаза); CD39 (ENTPD1, NTPDase1); Аргиназу; индоламин-пиррол 2,3-диоксигеназу (IDO); триптофан 2,3-диоксигеназу (TDO); и ингибирующие рецепторы киллеров, которые можно подразделить на два класса на основании их структурных особенностей: i) киллерные иммуноглобулинподобные рецепторы (KIRs), и ii) лектиновые рецепторы C-типа (члены семейства трансмембранных рецепторов II типа). Другие иммунные контрольные точки, которые не были так хорошо определены, были описаны в литературе, включая как рецепторы (например, 2В4 (также известный как CD244) рецептор), так и лиганды (например, некоторые ингибиторные лиганды B7 семейства, такие B7-H3 (также известный как CD276) и B7-H4 (также известный как B7-S1, B7x и VCTN1)). См. Pardoll, (April 2012) Nature Rev. Cancer 12:25264.Examples of immune checkpoints (ligands and receptors), some of which are selectively upregulated in various tumor cell types that are candidates for blockade, include PD-1 (programmed cell death protein 1); PD-L1 (programmed cell death ligand-1); BTLA (B and T lymphocyte attenuator); CTLA-4 (cytotoxic T-lymphocyte-associated antigen 4); TIM-3 (T-cell membrane protein 3); LAG-3 (lymphocyte activation gene 3); V-domain immunoglobulin suppressor of T-cell activation (VISTA); CD96; A2aR (adenosine A2a receptor); A2bR (adenosine A2b receptor); CD73 (ecto-5'nucleotidase); CD39 (ENTPD1, NTPDase1); Arginase; indolamine-pyrrole 2,3-dioxygenase (IDO); tryptophan 2,3-dioxygenase (TDO); and inhibitory killer receptors, which can be divided into two classes based on their structural features: i) killer immunoglobulin-like receptors (KIRs), and ii) C-type lectin receptors (members of the type II transmembrane receptor family). Other immune checkpoints that have not been as well defined have been described in the literature, including both receptors (eg, the 2B4 (also known as CD244) receptor) and ligands (eg, some inhibitory ligands of the B7 family such as B7-H3 ( also known as CD276) and B7-H4 (also known as B7-S1, B7x and VCTN1)). See Pardoll, (April 2012) Nature Rev. Cancer 12:25264.
Настоящее изобретение предусматривает использование любого из антител против TIGIT, описанных в настоящей заявке, в сочетании с ингибиторами вышеуказанных рецепторов и лигандов иммунных контрольных точек, а также еще не описанных рецепторов и лигандов иммунных контрольных точек. В настоящее время доступны некоторые модуляторы иммунных контрольных точек, в то время как другие находятся в последней стадии разработки. Для иллюстрации, когда оно было одобрено для лечения меланомы в 2011 г., полностью гуманизированное моноклональное антитело CTLA-4 ипилимумаб (YERVOY, Bristol-Myers Squibb) стало первым ингибитором иммунной контрольной точки, получившим официальное одобрение в США. Слитые белки, содержащие CTLA-4 и антитело (CTLA-4-Ig, абатацепт (ORENCIA, Bristol-Myers Squibb)), использовали для лечения ревматоидного артрита, и было показано, что другие слитые белки эффективны у пациентов с трансплантацией почек, которые сенсибилизованы к вирусу Эпштейна Барра. Антитела против PD-1 находятся в стадии разработки (например, ниволумаб (Bristol-Myers Squibb) и пембролизумаб (ламбролизумаб) (Merck)), а также антитела против PD-L1 (например, MPDL3280A (Roche)). Ниволумаб и пембролизумаб показали потенциал у пациентов с меланомой, раком легких и почек.The present invention contemplates the use of any of the anti-TIGIT antibodies described herein in combination with inhibitors of the aforementioned immune checkpoint receptors and ligands, as well as as yet undescribed immune checkpoint receptors and ligands. Some immune checkpoint modulators are currently available, while others are in the last stages of development. To illustrate, when it was approved for the treatment of melanoma in 2011, the fully humanized CTLA-4 monoclonal antibody ipilimumab (YERVOY, Bristol-Myers Squibb) became the first immune checkpoint inhibitor to receive official approval in the US. Fusion proteins containing CTLA-4 and an antibody (CTLA-4-Ig, abatacept (ORENCIA, Bristol-Myers Squibb)) have been used to treat rheumatoid arthritis, and other fusion proteins have been shown to be effective in kidney transplant patients who are sensitized to the Epstein Barr virus. Anti-PD-1 antibodies are under development (eg, nivolumab (Bristol-Myers Squibb) and pembrolizumab (lambrolizumab) (Merck)), as well as anti-PD-L1 antibodies (eg, MPDL3280A (Roche)). Nivolumab and pembrolizumab have shown potential in patients with melanoma, lung and kidney cancer.
Подобную комбинированную терапию можно использовать для лечения или профилактики инфекционных заболеваний, таких как вирусные, бактериальные, грибковые и паразитарные заболевания, расстройства и состояния, а также связанных с ними расстройств. Например, антитело по изобретению можно комбинировать с антителом, направленным против патогена, или с вакциной против патогена, например, с паливизумабом против вируса саркомы Рауса. Вакцина может представлять собой белок патогена или его фрагмент, эффективный для индукции иммунного ответа. Антитело по изобретению усиливает иммунный ответ антитела или вакцины, направленной против патогена. Антитело по изобретению также можно вводить с T-клетками или природными киллерными клетками, размноженными ex vivo.Such combination therapy can be used to treat or prevent infectious diseases such as viral, bacterial, fungal and parasitic diseases, disorders and conditions, and related disorders. For example, an antibody of the invention can be combined with an antibody directed against a pathogen, or with a vaccine against the pathogen, such as palivizumab against Rous sarcoma virus. The vaccine may be a pathogen protein or fragment thereof effective to induce an immune response. An antibody of the invention enhances the immune response of an antibody or vaccine directed against a pathogen. The antibody of the invention can also be administered with ex vivo expanded T cells or natural killer cells.
Такая комбинированная терапия включает антивирусные средства, нацеленные на различные стадии жизненного цикла вируса и имеющие различные механизмы действия, включая, но не ограничиваясь этим, следующие: ингибиторы декапсидации вируса (например, амантадин и римантидин); ингибиторы обратной транскриптазы (например, ацикловир, зидовудин и ламивудин); средства, нацеленные на интегразу; средства, которые блокируют присоединение факторов транскрипции к вирусной ДНК; средства (например, антисмысловые молекулы), которые влияют на трансляцию (например, фомивирсен); средства, которые модулируют функцию трансляции/рибозимов; ингибиторы протеазы; модуляторы сборки вируса (например, рифампицин); антиретровирусные средства, такие как, например, нуклеозидные ингибиторы обратной транскриптазы (например, азидотимидин (AZT), ddl, ddC, 3TC, d4T); ненуклеозидные ингибиторы обратной транскриптазы (например, эфавиренц, невирапин); нуклеотидные ингибиторы обратной транскриптазы; и средства, которые предотвращают высвобождение вирусных частиц (например, занамивир и озелтамивир). Для лечения и/или профилактики некоторых вирусных инфекций (например, ВИЧ) часто необходима группа (коктейль) противовирусных средств.Such combination therapy includes antiviral agents that target different stages of the viral life cycle and have different mechanisms of action, including, but not limited to, the following: inhibitors of viral decapsidation (eg, amantadine and rimantidine); reverse transcriptase inhibitors (eg, acyclovir, zidovudine, and lamivudine); means aimed at integrase; agents that block the attachment of transcription factors to viral DNA; agents (eg, antisense molecules) that affect translation (eg, fomivirsen); agents that modulate the function of translation/ribozymes; protease inhibitors; virus assembly modulators (eg, rifampicin); antiretroviral agents such as, for example, nucleoside reverse transcriptase inhibitors (eg, azidothymidine (AZT), ddl, ddC, 3TC, d4T); non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (eg, efavirenz, nevirapine); nucleotide reverse transcriptase inhibitors; and agents that prevent the release of viral particles (eg zanamivir and oseltamivir). For the treatment and/or prevention of certain viral infections (eg HIV) often requires a group (cocktail) of antiviral agents.
- 20 041301- 20 041301
Другие противовирусные средства, предназначенные для использования в сочетании с любым из антител против TIGIT, описанных в настоящей заявке, включают, но не ограничиваются этим, следующие: абакавир, адефовир, амантадин, ампренавир, амплиген, арбидол, атазанавир, атрипла, боцепревирертет, цидофовир, комбривир, дарунавир, делавирдин, диданозин, докозанол, эдоксидин, эмтрицитабин, энфувиртид, энтекавир, фамцикловир, фосампренавир, фоскарнет, фосфонет, ганцикловир, ибацитабин, иминовир, идоксуридин, имиквимод, индинавир, инозин, различные интерфероны (например, пегинтерферон альфа-2a), лопинавир, лоризид, маравирок, мороксидин, метизазон, нелфинавир, нексавир, пенцикловир, перимивир, плеконарил, подофиллотоксин, ралтегравир, рибавирин, ритонавир, пирамидин, саквинавир, ставудин, телоправир, тенофовир, типранавир, трифлуридин, тризивир, тромантадин, трувада, валацикловир, валганцикловир, викривирок, видарабин, вирамидин и залцитабин.Other antiviral agents for use in combination with any of the anti-TIGIT antibodies described herein include, but are not limited to, the following: abacavir, adefovir, amantadine, amprenavir, ampligen, arbidol, atazanavir, atripla, boceprevirertet, cidofovir, combrivir, darunavir, delavirdine, didanosine, docosanol, edoxydin, emtricitabine, enfuvirtide, entecavir, famciclovir, fosamprenavir, foscarnet, phosphonet, ganciclovir, ibacitabine, iminovir, idoxuridine, imiquimod, indinavir, inosine, various interferons (eg, peginterferon alfa-2a) , lopinavir, lorizide, maraviroc, moroxidine, metizazon, nelfinavir, nexavir, penciclovir, perimivir, pleconaril, podophyllotoxin, raltegravir, ribavirin, ritonavir, pyramidin, saquinavir, stavudine, telopravir, tenofovir, tipranavir, trifluridine, trizivir, tromantadine, truvada, valaciclovir , valganciclovir, vicriviroc, vidarabine, viramidine, and zalcitabine.
Настоящее изобретение рассматривает использование любого из антител против TIGIT, раскрытых в настоящей заявке, в сочетании с противопаразитарными средствами. Такие средства включают, но не ограничиваются этим, тиабендазол, пирантел памоат, мебендазол, празиквантел, никлозамид, битионол, оксамникин, метриконат, ивермектин, албендазол, эфлорнитин, меларсопрол, пентамидин, беннидазол, нифуртимокс и нитроимидазол. Специалистам в данной области известны другие средства, которые могут оказаться полезными для лечения паразитарных расстройств.The present invention contemplates the use of any of the anti-TIGIT antibodies disclosed herein in combination with antiparasitic agents. Such agents include, but are not limited to, thiabendazole, pyrantel pamoate, mebendazole, praziquantel, niclosamide, bithionol, oxamnikin, metriconate, ivermectin, albendazole, eflornithine, melarsoprol, pentamidine, bennidazole, nifurtimox, and nitroimidazole. Those skilled in the art are aware of other agents that may be useful in the treatment of parasitic disorders.
Варианты осуществления настоящего изобретения предполагают использование любого из антител против TIGIT, раскрытых в настоящей заявке, в сочетании со средствами, полезными для лечения или профилактики бактериальных расстройств. Антибактериальные средства можно классифицировать различным образом, в том числе на основе механизма действия, на основе химической структуры и на основе спектра активности. Примеры антибактериальных средств включают средства, которые нацелены на клеточную стенку бактерий (например, цефалоспорины и пенициллины) или клеточную мембрану (например, полимиксины), или вмешиваются в действие основных бактериальных ферментов (например, сульфонамиды, рифамицины и хинолины). Большинство антибактериальных средств, которые направленно действуют на синтез белка (например, тетрациклины и макролиды), являются бактериостатическими, тогда как средства, такие как аминогликозид, являются бактерицидными. Другой способ классификации антибактериальных средств основан на их целевой специфичности; средства узкого спектра нацелены на конкретные типы бактерий (например, грамположительные бактерии, такие как стрептококк), тогда как средства широкого спектра обладают активностью в отношении более широкого круга бактерий. Специалистам в данной области известны типы антибактериальных средств, подходящих для применения при конкретных бактериальных инфекциях.Embodiments of the present invention contemplate the use of any of the anti-TIGIT antibodies disclosed herein in combination with agents useful in the treatment or prevention of bacterial disorders. Antibacterial agents can be classified in various ways, including based on mechanism of action, based on chemical structure, and based on spectrum of activity. Examples of antibacterial agents include agents that target the bacterial cell wall (eg, cephalosporins and penicillins) or cell membrane (eg, polymyxins), or interfere with the action of essential bacterial enzymes (eg, sulfonamides, rifamycins, and quinolines). Most antibacterial agents that target protein synthesis (eg, tetracyclines and macrolides) are bacteriostatic, while agents such as aminoglycoside are bactericidal. Another way to classify antibacterial agents is based on their target specificity; narrow spectrum agents target specific types of bacteria (eg, gram-positive bacteria such as streptococcus), while broad spectrum agents have activity against a broader range of bacteria. Those skilled in the art are aware of the types of antibacterial agents suitable for use in specific bacterial infections.
Варианты осуществления настоящего изобретения предусматривают использование любого из антител против TIGIT, описанных в настоящей заявке, в сочетании со средствами, полезными для лечения или профилактики грибковых расстройств. Противогрибковые средства включают полиены (например, амфотерицин, нистатин и пимарицин); азолы (например, флуконазол, итраконазол и кетоконазол); аллиламины (например, нафтифин и тербинафин) и морфолины (например, аморолфин); и антиметаболиты (например, 5-фторцитозин).Embodiments of the present invention provide for the use of any of the anti-TIGIT antibodies described herein in combination with agents useful in the treatment or prevention of fungal disorders. Antifungals include polyenes (eg, amphotericin, nystatin, and pimaricin); azoles (eg fluconazole, itraconazole and ketoconazole); allylamines (eg naftifine and terbinafine) and morpholines (eg amorolfine); and antimetabolites (eg, 5-fluorocytosine).
Настоящее изобретение охватывает фармацевтически приемлемые соли, кислоты или производные средств (и представителей классов средств), перечисленных выше.The present invention encompasses pharmaceutically acceptable salts, acids or derivatives of the agents (and representatives of the classes of agents) listed above.
Антитела против TIGIT можно использовать в сочетании с любым из вторых антител или средств, описанных для использования в совместном лечении в качестве компонентов фармацевтической композиции. В фармацевтической композиции средства могут быть объединены с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми носителями, как описано.Anti-TIGIT antibodies can be used in combination with any of the second antibodies or agents described for use in co-treatment as components of a pharmaceutical composition. In a pharmaceutical composition, the agents may be combined with one or more pharmaceutically acceptable carriers as described.
V. Другие варианты примененияV. Other applications
Антитела против TIGIT можно использовать для детекции TIGIT в контексте клинической диагностики или лечения или в исследованиях. Например, антитела можно использовать для детекции присутствия TIGIT на T-клетках, природных киллерных клетках и раковых клетках в качестве признака того, что индивид страдает от злокачественного новообразования или инфекционного заболевания, поддающегося лечению. Экспрессия TIGIT на T-клетках, природных киллерных клетках и/или раковых клетках индивида, страдающего злокачественным новообразованием или инфекционным заболеванием, также свидетельствует о том, что рак или инфекционное заболевание поддаются лечению антителами по настоящему изобретению. Антитела также могут продаваться в качестве исследовательских реагентов для лабораторных исследований для детекции T-клеток, природных киллерных клеток и злокачественных клеток и их реакции на различные стимулы. В таких применениях моноклональные антитела могут быть мечены флуоресцентными молекулами, спин-мечеными молекулами, ферментами или радиоизотопами и могут быть представлены в виде набора со всеми необходимыми реагентами для осуществления анализа на TIGIT. Антитела также можно использовать для очистки TIGIT, например, при помощи аффинной хроматографии.Anti-TIGIT antibodies can be used to detect TIGIT in the context of clinical diagnosis or treatment, or in research. For example, antibodies can be used to detect the presence of TIGIT on T cells, natural killer cells, and cancer cells as an indication that an individual is suffering from a treatable cancer or infectious disease. Expression of TIGIT on T cells, natural killer cells and/or cancer cells of an individual suffering from a malignant neoplasm or infectious disease also indicates that the cancer or infectious disease is amenable to treatment with the antibodies of the present invention. Antibodies can also be sold as research reagents for laboratory testing to detect T-cells, natural killer cells and malignant cells and their response to various stimuli. In such applications, monoclonal antibodies can be labeled with fluorescent molecules, spin-labeled molecules, enzymes, or radioisotopes, and can be provided as a kit with all necessary reagents to perform a TIGIT assay. Antibodies can also be used to purify TIGIT, for example using affinity chromatography.
VI. НаборыVI. Sets
Антитела против TIGIT можно объединить с любым из вторых антител или средств, описанных для использования в совместном лечении в качестве компонентов набора. Изобретение, раскрытое в настоящей заявке, предусматривает один или несколько наборов, содержащих одно или несколько из описанAnti-TIGIT antibodies can be combined with any of the second antibodies or agents described for use in co-treatment as kit components. The invention disclosed in this application provides one or more kits containing one or more of the described
- 21 041301 ных в настоящей заявке антител, а также один или несколько фармацевтически приемлемых эксципиентов или носителей (таких как, без ограничения, фосфатно-солевые буферные растворы, вода, стерильная вода, полиэтиленгликоль, поливинилпирролидон, лецитин, арахисовое масло, кунжутное масло, эмульсии, такие как эмульсии масло/вода или эмульсии вода/масло, микроэмульсии, наноносители и различные типы смачивающих веществ). Добавки, такие как спирты, масла, гликоли, консерванты, ароматизаторы, красители, суспендирующие агенты и т.п., также могут быть включены в наборы по настоящему изобретению вместе с носителем, разбавителем или эксципиентом. В одном варианте осуществления фармацевтически приемлемый носитель, подходящий для использования в композициях антител, описанных в настоящей заявке, является стерильным, свободным от патогенов и/или иным образом безопасным для введения индивиду без риска соответствующей инфекции и других нежелательных побочных эффектов. В наборе соответствующие вещества могут быть представлены в отдельных флаконах с инструкциями для комбинирования и последующего введения или с инструкциями для отдельного введения. Набор может также включать письменные инструкции для правильной манипуляции и хранения любых антител против TIGIT, описанных в настоящей заявке.- 21 041301 antibodies, as well as one or more pharmaceutically acceptable excipients or carriers (such as, without limitation, phosphate-buffered saline solutions, water, sterile water, polyethylene glycol, polyvinylpyrrolidone, lecithin, peanut oil, sesame oil, emulsions such as oil/water or water/oil emulsions, microemulsions, nanocarriers and various types of wetting agents). Additives such as alcohols, oils, glycols, preservatives, flavors, colorants, suspending agents, and the like may also be included in the kits of the present invention along with a carrier, diluent, or excipient. In one embodiment, a pharmaceutically acceptable carrier suitable for use in the antibody compositions described herein is sterile, pathogen-free and/or otherwise safe for administration to an individual without the risk of associated infection and other undesirable side effects. In a kit, the respective substances may be presented in separate vials with instructions for combination and subsequent administration, or with instructions for single administration. The kit may also include written instructions for the correct handling and storage of any anti-TIGIT antibodies described herein.
Предполагается, что каждое максимальное числовое ограничение, приведенное в настоящем описании, включает каждое более низкое числовое ограничение, как если бы такие более низкие числовые ограничения были явно указаны в настоящей заявке. Каждое минимальное числовое ограничение, приведенное в настоящем описании, будет включать все более высокие числовые ограничения, как если бы такие более высокие числовые ограничения были явно указаны в настоящей заявке. Каждый численный диапазон, указанный в настоящем описании, будет включать в себя все более узкие числовые диапазоны, которые попадают в такой более широкий численный диапазон, как если бы такие более узкие числовые диапазоны были явно указаны в настоящей заявке.It is intended that each maximum numerical limit given in the present description, includes each lower numerical limit, as if such lower numerical limits were explicitly stated in this application. Each minimum numeric limit provided herein will include all higher numeric limits as if such higher numeric limits were explicitly stated herein. Each numerical range specified in the present description will include all narrower numerical ranges that fall within such a broader numerical range, as if such narrower numerical ranges were explicitly stated in this application.
Все патентные заявки, веб-сайты, другие публикации, номера доступа и т.п., на которые ссылаются выше или ниже, включены в качестве ссылки во всей их полноте для всех целей в той же степени, как если бы каждая отдельная публикация была специально и индивидуально указана для ее включения посредством ссылки. Если разные версии последовательности связывают с номером доступа в разное время, имеется в виду версия, связанная с номером доступа на действующую дату подачи настоящей заявки. Действующая дата подачи означает более раннюю, чем фактическая дата подачи, или дату подачи приоритетной заявки, ссылающейся на номер доступа, если это применимо. Подобным образом, если разные версии публикации, веб-сайта или т.п. опубликованы в разное время, имеется в виду версия, которая была недавно опубликована на действующую дату подачи заявки, если не указано иное. Любой признак, стадия, элемент, вариант осуществления или аспект изобретения можно использовать в сочетании с любым другим, если специально не указано иное.All patent applications, websites, other publications, access numbers, etc. referenced above or below are incorporated by reference in their entirety for all purposes to the same extent as if each individual publication were specifically and is individually identified for inclusion by reference. When different sequence versions are associated with an access number at different times, the version associated with the access number at the current filing date of this application is meant. Valid filing date means earlier than the actual filing date or the filing date of the priority application referring to the access number, if applicable. Similarly, if different versions of a publication, website, or the like are published at different times, meaning the version that was most recently published on the current filing date, unless otherwise indicated. Any feature, step, element, embodiment, or aspect of the invention may be used in conjunction with any other, unless specifically noted otherwise.
Хотя настоящее изобретение было описано достаточно подробно при помощи иллюстрации и примера для ясности и понимания, будет очевидно, что определенные изменения и модификации могут быть реализованы в рамках прилагаемой формулы изобретения.While the present invention has been described in sufficient detail by way of illustration and example for clarity and understanding, it will be apparent that certain changes and modifications may be made within the scope of the appended claims.
ПримерыExamples
В следующих примерах обсуждается получение, описание и гуманизирование моноклональных антител против человеческого TIGIT, а также представлены иллюстративные способы, при помощи которых можно определить характеристики связывания антител, описанных в настоящей заявке.The following examples discuss the production, description, and humanization of anti-human TIGIT monoclonal antibodies, and provide illustrative methods by which the binding characteristics of the antibodies described in this application can be determined.
Пример 1. Экспрессия рекомбинантных человеческих белков TIGITExample 1 Expression of Recombinant Human TIGIT Proteins
Клонирование генов, мутагенез и конструирование плазмиды в этой работе осуществляли с использованием стандартных методов молекулярной биологии, таких, которые описаны в Sambrook and Russel (Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 3rd ed., 2001, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY), Kostelny et al. (Int. J. Cancer 93:556-565, 2001) и Cole et al. (J. Immunol. 159:3613-3621, 1997).Gene cloning, mutagenesis, and plasmid construction in this work were performed using standard molecular biology techniques such as those described in Sambrook and Russel (Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 3rd ed., 2001, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY), Kostelny et al. (Int. J. Cancer 93:556-565, 2001) and Cole et al. (J. Immunol. 159:3613-3621, 1997).
Вектор экспрессии млекопитающего pFCm404 (фиг. 1) для продукции внеклеточной области человеческого TIGIT, слитой с Fc областью γ1 цепи человеческого иммуноглобулина (hTIGIT-Fc; SEQ ID NO: 59), содержит следующие генетические компоненты. По направлению часовой стрелки от SalI сайта pFCm404 на фиг. 1, плазмида содержит транскрипционную единицу для hTIGIT-Fc, начиная с главного предраннего промотора и энхансера (CMV-P на фиг. 1) из цитомегаловируса человека (CMV). После CMV промотора следуют кодирующие области сигнального пептида (sp; SEQ ID NO: 2), внеклеточная область человеческого TIGIT (hTIGIT; SEQ ID NO: 3), полипептидный линкер (SEQ ID NO: 4) и человеческая γ1 Fc область (SEQ ID NO: 5), а затем следует сайт полиаденилирования гена γ1 тяжелой цепи человека. После hTIGIT-Fc гена следуют SV40 ранний промотор (SV40-P), ген пуромицин N-ацетилтрансферазы (puro) для резистентности к пуромицину и сегмент, содержащий SV40 сайт полиаденилирования (SV40-A). И наконец, pFCm404 содержит часть плазмиды pUC19, включающую бактериальную точку начала репликации (pUC ori) и ген β лактамазы (β лактамаза). Стрелки на фигуре показывают ориентацию транскрипции. Соответствующие сайты для рестрикционных ферментов показаны на чертежах.The mammalian expression vector pFCm404 (FIG. 1) for the production of the human TIGIT extracellular region fused to the Fc region of the human immunoglobulin γ1 chain (hTIGIT-Fc; SEQ ID NO: 59) contains the following genetic components. Clockwise from the SalI site of pFCm404 in FIG. 1, the plasmid contains a transcription unit for hTIGIT-Fc, starting with a major immediate early promoter and enhancer (CMV-P in FIG. 1) from human cytomegalovirus (CMV). The CMV promoter is followed by the signal peptide coding regions (sp; SEQ ID NO: 2), human TIGIT extracellular region (hTIGIT; SEQ ID NO: 3), polypeptide linker (SEQ ID NO: 4), and human γ1 Fc region (SEQ ID NO: : 5), followed by the polyadenylation site of the human heavy chain γ1 gene. The hTIGIT-Fc gene is followed by the SV40 early promoter (SV40-P), the puromycin N-acetyltransferase (puro) gene for puromycin resistance, and the segment containing the SV40 polyadenylation site (SV40-A). Finally, pFCm404 contains a portion of the pUC19 plasmid including the bacterial origin of replication (pUC ori) and the β-lactamase (β-lactamase) gene. The arrows in the figure show the orientation of the transcription. The corresponding sites for restriction enzymes are shown in the drawings.
Кодирующую область внеклеточной области человеческого TIGIT в pFCm404 заменяли ДНК фрагментом, кодирующим внеклеточную область человеческого CD155 (hCD155; SEQ ID NO: 6), что приводило к образованию нового вектора экспрессии pFCm406 (фиг. 1). Внеклеточную область человеческогоThe human TIGIT extracellular coding region in pFCm404 was replaced with a DNA fragment encoding the human CD155 extracellular region (hCD155; SEQ ID NO: 6), resulting in a new expression vector pFCm406 (FIG. 1). The extracellular region of the human
- 22 041301- 22 041301
CD155, слитую с человеческой γ1 Fc областью (hCD155-Fc; SEQ ID NO: 7), экспрессировали из pFCm406.CD155 fused to the human γ1 Fc region (hCD155-Fc; SEQ ID NO: 7) was expressed from pFCm406.
Кодирующую область γ1 Fc области между AgeI и EagI сайтами в pFCm404 заменяли ДНК фрагментом, кодирующим FLAG пептид (FLAG; SEQ ID: 8), с последующим сигналом связывания гликозилфосфатидилинозита человеческого CD55 (GPI; SEQ ID: 9), что приводило к образованию нового вектора экспрессии pFCm407 (фиг. 1). Внеклеточную область человеческого TIGIT, слитую с FLAG и GPI (hTIGIT-GPI)-кодируемым pFCm406, экспрессировали на клеточной поверхности.The coding region of the γ1 Fc region between the AgeI and EagI sites in pFCm404 was replaced with a DNA fragment encoding the FLAG peptide (FLAG; SEQ ID: 8) followed by the human CD55 glycosylphosphatidylinositol binding signal (GPI; SEQ ID: 9), resulting in a new vector expression of pFCm407 (Fig. 1). The extracellular region of human TIGIT fused to FLAG and GPI (hTIGIT-GPI)-encoded pFCm406 was expressed on the cell surface.
Для получения клеточных линий, стабильно продуцирующих hTIGIT-Fc и hCD155-Fc в культуральных супернатантах, векторы экспрессии pFCm404 и pFCm406, соответственно, вводили в хромосому мышиной миеломной клеточной линии NS0 (European Collection of Animal Cell Cultures, Salisbury, Wiltshire, UK). NS0 клетки выращивали в DME среде, содержащей 10% фетальную бычью сыворотку (FBS), при 37°C в 7,5% CO2 инкубаторе. Стабильную трансфекцию в NS0 осуществляли путем электропорации, как описано в Bebbington et al. (Bio/Technology 10: 169-175, 1992). Перед трансфекцией векторы экспрессии линеализировали с использованием FspI. Примерно 107 клеток трансфицировали при помощи 10 мкг линеализированной плазмиды, суспендировали в DME среде, содержащей 10% FBS, и высевали в несколько 96-луночных планшетов. Через 24 ч наносили селективную среду (DME среда, содержащая 10% FBS и 3 мкг/мл пуромицина). Примерно через 10 дней после начала селекции культуральные супернатанты анализировали на продукцию Fc слитых белков методом ELISA с использованием козлиного антитела против человеческой гамма цепи для покрытия и HRP-конъюгированного козлиного антитела против человеческой гамма цепи для детекци Fc слитых белков.To obtain cell lines stably producing hTIGIT-Fc and hCD155-Fc in culture supernatants, expression vectors pFCm404 and pFCm406, respectively, were introduced into the chromosome of the mouse myeloma cell line NS0 (European Collection of Animal Cell Cultures, Salisbury, Wiltshire, UK). NS0 cells were grown in DME medium containing 10% fetal bovine serum (FBS) at 37°C in a 7.5% CO2 incubator. Stable transfection into NS0 was performed by electroporation as described in Bebbington et al. (Bio/Technology 10: 169-175, 1992). Prior to transfection, the expression vectors were linearized with FspI. Approximately 10 7 cells were transfected with 10 μg of the linearized plasmid, suspended in DME medium containing 10% FBS, and plated in several 96-well plates. After 24 hours, selective medium (DME medium containing 10% FBS and 3 μg/ml puromycin) was applied. Approximately 10 days after the start of selection, culture supernatants were analyzed for production of Fc fusion proteins by ELISA using goat anti-human gamma chain antibody for coating and HRP-conjugated goat anti-human gamma chain antibody for detection of Fc fusion proteins.
NS0 стабильные трансфектанты, продуцирующие высокие уровни Fc слитых белков, адаптировали к Гибридома-SFM среде и размножали в ней (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA) и выращивали до истощения в роллерных флаконах. После центрифугирования и фильтрации культуральный супернатант загружали на колонку с белком-A-сефарозой (GE Healthcare, Piscataway, NJ). Колонку промывали фосфатно-солевым буферным раствором (PBS), затем Fc слитые белки элюировали с использованием 0,1 М глицина-HCl (pH 3,0). После нейтрализации при помощи 1 М Tris-HCl (pH 8) буфер элюируемых Fc слитых белков обменивали на PBS путем диализа.NS0 stable transfectants producing high levels of Fc fusion proteins were adapted to and expanded in Hybridoma-SFM medium (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA) and grown to exhaustion in roller flasks. After centrifugation and filtration, the culture supernatant was loaded onto a protein-A-sepharose column (GE Healthcare, Piscataway, NJ). The column was washed with phosphate buffered saline (PBS), then the Fc fusion proteins were eluted using 0.1 M glycine-HCl (pH 3.0). After neutralization with 1 M Tris-HCl (pH 8), the Fc-eluting fusion protein buffer was exchanged for PBS by dialysis.
Для получения клеточных линий, экспрессирующих hTIGIT-GPI на поверхности, вектор экспрессии pFCm407 стабильно трансфицировали в NS0 клетки. Экспрессию hTIGIT-GPI на клеточной поверхности контролировали методом проточной цитометрии с использованием крысиного анти-FLAG моноклонального антитела и PE-меченного козлиного анти-крысиного IgG, Fc-специфического антитела. NS0 клеточные линии, экспрессирующие высокие уровни hTIGIT-GPI на клеточной поверхности (NS0-hTIGIT), использовали для скрининга анти-TIGIT антител.To obtain cell lines expressing hTIGIT-GPI on the surface, the pFCm407 expression vector was stably transfected into NS0 cells. Expression of hTIGIT-GPI on the cell surface was monitored by flow cytometry using a rat anti-FLAG monoclonal antibody and a PE-labeled goat anti-rat IgG, Fc-specific antibody. NS0 cell lines expressing high levels of hTIGIT-GPI on the cell surface (NS0-hTIGIT) were used to screen for anti-TIGIT antibodies.
Пример 2. Генерирование и характеризация анти-TIGIT моноклональных антителExample 2 Generation and Characterization of Anti-TIGIT Monoclonal Antibodies
Мышиные гибридомы, продуцирующие античеловеческие TIGIT моноклональные антитела, получали на JN Biosciences (Mountain View, CA) с использованием стандартной гибридомной технологии, такой как GenomONE CF EX Cell Fusion Reagent (Cosmo Bio, Carlsbad, CA). В качестве иммуногенов использовали человеческие TIGIT-Fc слитые белки и NS0-hTIGIT клетки.Mouse hybridomas producing anti-human TIGIT monoclonal antibodies were generated at JN Biosciences (Mountain View, CA) using standard hybridoma technology such as GenomONE CF EX Cell Fusion Reagent (Cosmo Bio, Carlsbad, CA). Human TIGIT-Fc fusion proteins and NS0-hTIGIT cells were used as immunogens.
Мышиные антитела, секретированные в культуральных супернатантах гибридомных клеток, подвергали серии скринингов для идентификации антител со следующими свойствами: (1) связывание с очищенным hTIGIT-Fc слитым белком, (2) связывание с NS0-hTIGIT клетками, (3) не связывание с NS0 клетками, (4) связывание с CD3+ T-клетками, происходящими из фитогемаглютинин-обработанных мононуклеарных клеток периферической крови человека, и (5) блокирование связывания hCD155-Fc слитого белка с NS0-hTIGIT клетками. Первое свойство связывания с hTIGIT-Fc испытывали методом ELISA с использованием HRP-конъюгированных козлиных антител против мышиных каппа и лямбда легких цепей (SouthernBiotech, Birmingham, AL) для идентификации мышиных анти-TIGIT антител. Второе, третье и четвертое свойства исследовали методом проточной цитометрии с использованием PE-меченного козлиного анти-мышиная гамма цепь антитела (SouthernBiotech) для детекции связанных с клетками мышиных антител. Пятое свойство анализировали методом проточной цитометрии, как описано ниже. Было обнаружено, что три мышиных моноклональных антитела (TIG1, TIG2 и TIG3) обладают всеми из этих пяти свойств. TIG1, TIG2 и TIG3 моноклональные антитела очищали из культурального супернатанта гибридомных клеток колоночной хроматографией с белком A, как описано выше. Изотипы TIG1, TIG2 и TIG3 представляют собой мышиные IgG2b/каппа, IgG2a/каппа и IgG2a/каппа, соответственно.Mouse antibodies secreted in hybridoma cell culture supernatants were subjected to a series of screens to identify antibodies with the following properties: (1) binding to purified hTIGIT-Fc fusion protein, (2) binding to NS0-hTIGIT cells, (3) not binding to NS0 cells , (4) binding to CD3+ T cells derived from phytohemagglutinin-treated human peripheral blood mononuclear cells, and (5) blocking the binding of the hCD155-Fc fusion protein to NS0-hTIGIT cells. The first binding property to hTIGIT-Fc was tested by ELISA using HRP-conjugated goat anti-mouse kappa and lambda light chain antibodies (SouthernBiotech, Birmingham, AL) to identify mouse anti-TIGIT antibodies. The second, third and fourth properties were examined by flow cytometry using a PE-labeled goat anti-mouse gamma chain antibody (SouthernBiotech) to detect cell-bound mouse antibodies. The fifth property was analyzed by flow cytometry as described below. Three mouse monoclonal antibodies (TIG1, TIG2 and TIG3) were found to have all of these five properties. TIG1, TIG2 and TIG3 monoclonal antibodies were purified from the hybridoma cell culture supernatant by protein A column chromatography as described above. The isotypes TIG1, TIG2 and TIG3 are mouse IgG2b/kappa, IgG2a/kappa and IgG2a/kappa, respectively.
Активность TIG1, TIG2 и TIG3 для блокирования взаимодействия между TIGIT и CD155 анализировали методом проточной цитометрии. NS0-hTIGIT клетки инкубировали с субнасыщающей концентрацией hCD155-Fc в присутствии (или в отсутствие) различных концентраций анти-TIGIT моноклонального антитела в качестве конкурента. Детекцию hCD155-Fc, связанных с NS0-hTIGIT клетками, осуществляли с использованием DyLight488-меченного козлиного античеловекого IgG, Fcспецифического антитела (Jackson ImmunoResearch, West Grove, PA). Как показано на фиг. 2, TIG1, TIG2 и TIG3 ингибировали связывание hCD155-Fc с NS0-hTIGIT клетками дозо-зависимым образом. Полумаксимальная ингибирующая концентрация (IC50) для блокирования взаимодействия между hCD155-Fc иThe activity of TIG1, TIG2 and TIG3 to block the interaction between TIGIT and CD155 was analyzed by flow cytometry. NS0-hTIGIT cells were incubated with a subsaturating concentration of hCD155-Fc in the presence (or absence) of various concentrations of anti-TIGIT monoclonal antibody as a competitor. Detection of hCD155-Fc associated with NS0-hTIGIT cells was performed using a DyLight488-labeled goat anti-human IgG, Fc-specific antibody (Jackson ImmunoResearch, West Grove, PA). As shown in FIG. 2, TIG1, TIG2, and TIG3 inhibited hCD155-Fc binding to NS0-hTIGIT cells in a dose-dependent manner. Half-maximal inhibitory concentration (IC 50 ) to block the interaction between hCD155-Fc and
- 23 041301- 23 041301
NSO-hTIGIT клетками составляла 49 нг/мл для TIG1, 197 нг/мл для TIG2 и 460 нг/мл для TIG3. Концентрация антител, необходимая для блокирования более чем 95% связывания CD155 с TIGIT, составляла 0,63 мкг/мл для TIG1, 1,25 мкг/мл для TIG2 и 2,5 мкг/мл для TIG3.NSO-hTIGIT cells was 49 ng/ml for TIG1, 197 ng/ml for TIG2 and 460 ng/ml for TIG3. The antibody concentration required to block more than 95% of CD155 binding to TIGIT was 0.63 μg/ml for TIG1, 1.25 μg/ml for TIG2, and 2.5 μg/ml for TIG3.
Пример 3. V генное секвенирование анти-TIGIT моноклональных антителExample 3 V Gene Sequencing of Anti-TIGIT Monoclonal Antibodies
Определение последовательностей вариабельных областей тяжелой и легкой цепей (VH и VL, соответственно) мышиных анти-TIGIT антител осуществляли, следуя процедурам, описанным в Tsurushita et al (Methods 36:69-83, 2005). Тотальную РНК экстрагировали из примерно 107 клеток с использованием TRIzol реагента (Invitrogen, Carlsbad, CA) в соответствии с протоколом поставщика. Олиго dTпримированную кДНК для 5'-RACE синтезировали с использованием набора для кДНК амплификации SMARTer RACE (Clontech, Mountain View, CA), следуя протоколу поставщика. кДНК VH и VL амплифицировали при помощи полимеразной цепной реакции (ПЦР), используя Phusion ДНК полимеразу (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA), с использованием 3' праймеров, которые специфически гибридизуются с мышиными константными областями тяжелой или легкой цепи (Tsurushita et al., supra) соответственно, и 5' праймера, обеспечиваемого в наболе SMARTer RACE для кДНК амплификации. Амплифицированные VH и VL гены клонировали с использованием набора для клонирования CloneJet PCR (Thermo Fisher Scientific) и подвергали секвенированию с праймерами, представленными в наборе для клонирования CloneJet PCR. Несколько VH и VL клонов секвенировали и идентифицировали уникальные последовательности, гомологичные типичным мышиным вариабельным областям тяжелой и легкой цепи.Sequencing of the heavy and light chain variable regions (VH and VL, respectively) of mouse anti-TIGIT antibodies was performed following the procedures described in Tsurushita et al (Methods 36:69-83, 2005). Total RNA was extracted from about 10 7 cells using the TRIzol reagent (Invitrogen, Carlsbad, CA) according to the supplier's protocol. Oligo-dT-primed 5'-RACE cDNA was synthesized using the SMARTer RACE cDNA amplification kit (Clontech, Mountain View, CA) following the vendor's protocol. VH and VL cDNA were amplified by polymerase chain reaction (PCR) using Phusion DNA polymerase (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA) using 3' primers that hybridize specifically to mouse heavy or light chain constant regions (Tsurushita et al. , supra) respectively, and the 5' primer provided in the SMARTer RACE set for cDNA amplification. The amplified VH and VL genes were cloned using the CloneJet PCR cloning kit (Thermo Fisher Scientific) and sequenced with the primers provided in the CloneJet PCR cloning kit. Several VH and VL clones were sequenced and identified unique sequences homologous to typical murine heavy and light chain variable regions.
Аминокислотная последовательность зрелой VH TIG1 (SEQ ID NO: 10) показана на фиг. 3. Аминокислотные последовательности CDR1, 2 и 3 областей TIG1 VH представляют собой NFGMH (SEQ ID NO: 11), FISSGSSSIYYADTVKG (SEQ ID NO: 12) и MRLDYYAMDY (SEQ ID NO: 13) соответственно.The amino acid sequence of mature VH TIG1 (SEQ ID NO: 10) is shown in FIG. 3. The amino acid sequences of CDR1, 2 and 3 of the TIG1 VH regions are NFGMH (SEQ ID NO: 11), FISSGSSSIYYADTVKG (SEQ ID NO: 12) and MRLDYYAMDY (SEQ ID NO: 13), respectively.
Аминокислотная последовательность зрелой VL TIG1 (SEQ ID NO: 14) показана на фиг. 4. Аминокислотные последовательности CDR1, 2 и 3 областей TIG1 VL представляют собой RASKSISKYLA (SEQ ID NO: 15), SGSTLQS (SEQ ID NO: 16) и QQHNEYPWT (SEQ ID NO: 17) соответственно.The amino acid sequence of mature VL TIG1 (SEQ ID NO: 14) is shown in FIG. 4. The amino acid sequences of CDR1, 2 and 3 of the TIG1 VL regions are RASKSISKYLA (SEQ ID NO: 15), SGSTLQS (SEQ ID NO: 16) and QQHNEYPWT (SEQ ID NO: 17), respectively.
Аминокислотная последовательность зрелой VH TIG2 (SEQ ID NO: 18) показана на фиг. 5. Аминокислотные последовательности CDR1, 2 и 3 областей TIG2 VH представляют собой EYTMH (SEQ ID NO: 19), GINPNNGGTSYNQKFKG (SEQ ID NO: 20) и PGWYNYAMDY (SEQ ID NO: 21) соответственно.The amino acid sequence of mature VH TIG2 (SEQ ID NO: 18) is shown in FIG. 5. The amino acid sequences of CDR1, 2 and 3 of the TIG2 VH regions are EYTMH (SEQ ID NO: 19), GINPNNGGTSYNQKFKG (SEQ ID NO: 20) and PGWYNYAMDY (SEQ ID NO: 21), respectively.
Аминокислотная последовательность зрелой VL TIG2 (SEQ ID NO: 22) показана на фиг. 6. Аминокислотные последовательности CDR1, 2 и 3 областей TIG2 VL представляют собой KASQGVSTAVA (SEQ ID NO: 23), SASYRYT (SEQ ID NO: 24) и QQHYITPWT (SEQ ID NO: 25) соответственно.The amino acid sequence of mature VL TIG2 (SEQ ID NO: 22) is shown in FIG. 6. The amino acid sequences of CDR1, 2 and 3 of the TIG2 VL regions are KASQGVSTAVA (SEQ ID NO: 23), SASYRYT (SEQ ID NO: 24) and QQHYITPWT (SEQ ID NO: 25), respectively.
Аминокислотная последовательность зрелой VH TIG3 (SEQ ID NO: 26) показана на фиг. 7. Аминокислотные последовательности CDR1, 2 и 3 областей TIG3 VH представляют собой DYDMS (SEQ ID NO: 27), YISDGGYNTYYPDTVKG (SEQ ID NO: 28) и QILLRYYFDY (SEQ ID NO: 29) соответственно.The amino acid sequence of mature VH TIG3 (SEQ ID NO: 26) is shown in FIG. 7. The amino acid sequences of CDR1, 2 and 3 of the TIG3 VH regions are DYDMS (SEQ ID NO: 27), YISDGGYNTYYPDTVKG (SEQ ID NO: 28) and QILLRYYFDY (SEQ ID NO: 29), respectively.
Аминокислотная последовательность зрелой VL TIG3 (SEQ ID NO: 30) показана на фиг. 8. Аминокислотные последовательности CDR1, 2 и 3 областей TIG3 VL представляют собой KSSQSLLYSSNQKNYLA (SEQ ID NO: 31), WASTRES (SEQ ID NO: 32) и QQYHSYPWT (SEQ ID NO: 33), соответственно.The amino acid sequence of mature VL TIG3 (SEQ ID NO: 30) is shown in FIG. 8. The amino acid sequences of CDR1, 2 and 3 of the TIG3 VL regions are KSSQSLLYSSNQKNYLA (SEQ ID NO: 31), WASTRES (SEQ ID NO: 32) and QQYHSYPWT (SEQ ID NO: 33), respectively.
Присвоение CDR последовательностей и нумерация положений аминокислот на фиг. 3-8 представлены в соответствии с Кэбат et al. (1991). Последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 подчеркнуты на чертежах.Assignment of CDR sequences and numbering of amino acid positions in FIG. 3-8 are presented according to Kabat et al. (1991). The sequences CDR1, CDR2 and CDR3 are underlined in the drawings.
Пример 4. Конструирование и экспрессия гуманизированного TIG1 антителаExample 4 Construction and expression of a humanized TIG1 antibody
Гуманизацию VH и VL TIG1 осуществляли, как описанно в Queen et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86:10029-10033, 1989), следуя процедурам Tsurushita et al. (Methods 36:69-83, 2005). Вкратце, трехмерную молекулярную модель вариабельных областей TIG1 сначала конструировали с использованием алгоритма, разработанного JN Biosciences. Затем идентифицировали каркасные аминокислотные остатки, важные для образования структуры определяющих комплементарность областей (CDR) TIG1 с использованием молекулярной модели. Параллельно этому, выбирали кДНК-происходящие аминокислотные последовательности человеческих VH и VL с высокой гомологией с TIG1 VH и VL соответственно. И наконец, осуществляли прививку последовательностей CDR вместе с каркасными аминокислотными остатками, важными для поддержания CDR структуры, из TIG1 VH и VL в соответствующие выбранные человеческие каркасные последовательности.Humanization of VH and VL TIG1 was performed as described in Queen et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86:10029-10033, 1989) following the procedures of Tsurushita et al. (Methods 36:69-83, 2005). Briefly, a three-dimensional molecular model of TIG1 variable regions was first constructed using an algorithm developed by JN Biosciences. Then identified framework amino acid residues important for the formation of the structure of complementarity determining regions (CDR) TIG1 using a molecular model. In parallel, cDNA-derived human VH and VL amino acid sequences with high homology to TIG1 VH and VL, respectively, were selected. Finally, CDR sequences were grafted along with framework amino acid residues important for maintaining the CDR structure from TIG1 VH and VL into the appropriate selected human framework sequences.
Аминокислотная последовательность сконструированной гуманизированной TIG1 VH (HuTIG1 VH) представляет собойThe amino acid sequence of the engineered humanized TIG1 VH (HuTIG1 VH) is
MDSRLNLVFLVLILKGVQCEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLMDSRLNLVFLVLILKGVQCEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGL
EWVAFISSGSSSIYYADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYW GQGTMVTVSS (SEQ ID NO:34).EWVAFISSGSSSIYYADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYW GQGTMVTVSS (SEQ ID NO:34).
Аминокислотная последовательность зрелой HuTIG1 VHAmino acid sequence of mature HuTIG1 VH
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIYEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIY
YADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO:35)YADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO:35)
- 24 041301 начинается в положении 20 в SEQ ID NO: 34.- 24 041301 starts at position 20 in SEQ ID NO: 34.
Аминокислотная последовательность сконструированной гуманизированной TIG1 VL (HuTIG1 VL) представляет собойThe amino acid sequence of the engineered humanized TIG1 VL (HuTIG1 VL) is
MRFQVQVLGLLLLWISGAQCDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPMRFQVQVLGLLLLWISGAQCDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAP
KLLIYSGSTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIK (SEQ ID NO: 36) .KLLIYSGSTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIK (SEQ ID NO: 36) .
Аминокислотная последовательность зрелой HuTIG1 VLAmino acid sequence of mature HuTIG1 VL
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVPSRFSGDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVPSRFSG
SGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIK (SEQ ID NO:37), начинается в положении 21 в SEQ ID NO: 36.SGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIK (SEQ ID NO:37), starts at position 21 in SEQ ID NO:36.
Ген, кодирующий HuTIG1 VH, синтезировали в виде экзона, включающего сигнал донора сплайсинга на 3' конце кодирующей области, SpeI сайт на 5' конце фрагмента и HindIII сайт на 3' конце фрагмента. Нуклеотидная последовательность синтетического HuTIG1 VH гена, фланкированная SpeI и HindIII сайтами (SEQ ID NO: 38), показана вместе с предсказанной аминокислотной последовательностью (SEQ ID NO: 34) на фиг. 9A.The gene encoding HuTIG1 VH was synthesized as an exon including a splicing donor signal at the 3' end of the coding region, a SpeI site at the 5' end of the fragment, and a HindIII site at the 3' end of the fragment. The nucleotide sequence of the synthetic HuTIG1 VH gene flanked by SpeI and HindIII sites (SEQ ID NO: 38) is shown along with the predicted amino acid sequence (SEQ ID NO: 34) in FIG. 9A.
Ген, кодирующий HuTIG1 VL, синтезировали в виде экзона, включающего сигнал донора сплайсинга на 3' конце кодирующей области, NheI сайт на 5' конце фрагмента и EcoRI сайт на 3' конце фрагмента. Нуклеотидная последовательность синтетического HuTIG1 VL гена, фланкированная NheI и EcoRI сайтами (SEQ ID NO: 39), показана вместе с предсказанной аминокислотной последовательностью (SEQ ID NO: 36) на фиг. 9B.The gene encoding HuTIG1 VL was synthesized as an exon including a splicing donor signal at the 3' end of the coding region, a NheI site at the 5' end of the fragment, and an EcoRI site at the 3' end of the fragment. The nucleotide sequence of the synthetic HuTIG1 VL gene flanked by NheI and EcoRI sites (SEQ ID NO: 39) is shown along with the predicted amino acid sequence (SEQ ID NO: 36) in FIG. 9b.
Вектор экспрессии млекопитающего pHuTIG1.AA (фиг. 10) для продукции гуманизированной IgG1/каппα формы мышиного моноклонального античеловеческого антитела к TIGIT, TIG1 (HuTIG1IgG1.AA) был сконструирован как содержащий следующие генетические компоненты. По направлению часовой стрелки от SalI сайта на фиг. 10 вектор содержит транскрипционную единицу тяжелой цепи, начиная с главного предраннего промотора и энхансера из цитомегаловируса человека (CMV) (CMV-P на фиг. ) для инициации транскрипции гена тяжелой цепи антитела. После CMV промотора следует экзон, кодирующий вариабельную область тяжелой цепи гуманизированной формы TIG1, фланкированный SpeI и HindIII сайтами (HuTIG1 VH), геномная последовательность, содержащая человеческие константные области γ1 тяжелой цепи, включая экзоны CH1, шарнирной области, CH2 и CH3 с промежуточными интронами, и сайт полиаденилирования человеческого гена тяжелой γ1 цепи. CH2 область, кодируемая в pHuTIG1.AA, содержит замены аминокислот на аланиновые остатки в положениях 234 и 235 (Eu нумерация) (L234A/L235A) для элиминации эффекторных функций (Hezareh et al., J. Virol. 75:12161-12168, 2001). После последовательности гена тяжелой цепи транскрипционная единица легкой цепи начинается с CMV промотора и энхансера (CMV-P), с последующим экзоном, кодирующим вариабельную область легкой цепи гуманизированной формы TIG1, фланкированным NheI и EcoRI сайтами (HuTIG1 VL), геномной последовательностью, содержащей человеческий экзон константной области каппа цепи (Ск) с предшествующей ему частью интрона, и сайтом полиаденилирования человеческого гена каппа цепи после Ск экзона. Затем после гена легкой цепи следует ранний промотор SV40 (SV40-P), ген пуромицин N-ацетил-трансферазы (puro) для резистентности к пуромицину, и сегмент, содержащий сайт полиаденилирования SV40 (SV40-A). И наконец, pHuTIG1.AA содержит часть плазмиды pUC19, включающую бактериальную точку начала репликации (pUC ori) и ген β лактамазы (β лактамаза). Стрелки на фиг. показывают ориентацию транскрипции.The mammalian expression vector pHuTIG1.AA (FIG. 10) for the production of a humanized IgG1/kappα form of the mouse monoclonal anti-human anti-TIGIT antibody, TIG1 (HuTIG1IgG1.AA) was constructed to contain the following genetic components. Clockwise from the SalI site in FIG. 10, the vector contains a heavy chain transcription unit, starting with a major immediate early promoter and enhancer from human cytomegalovirus (CMV) (CMV-P in FIG. ) to initiate transcription of the antibody heavy chain gene. The CMV promoter is followed by an exon encoding the heavy chain variable region of a humanized form of TIG1 flanked by SpeI and HindIII sites (HuTIG1 VH), a genomic sequence containing the human heavy chain γ1 constant regions, including exons CH1, hinge, CH2 and CH3 with intervening introns, and a polyadenylation site for the human γ1 heavy chain gene. The CH2 region encoded in pHuTIG1.AA contains amino acid substitutions for alanine residues at positions 234 and 235 (Eu numbering) (L234A/L235A) to eliminate effector functions (Hezareh et al., J. Virol. 75:12161-12168, 2001 ). After the heavy chain gene sequence, the light chain transcriptional unit begins with a CMV promoter and enhancer (CMV-P), followed by an exon encoding the light chain variable region of a humanized form of TIG1 flanked by NheI and EcoRI sites (HuTIG1 VL), a genomic sequence containing the human exon constant region of the kappa chain (CK) with the part of the intron preceding it, and the polyadenylation site of the human kappa chain gene after the CK exon. The light chain gene is then followed by the SV40 early promoter (SV40-P), the puromycin N-acetyl transferase (puro) gene for puromycin resistance, and the segment containing the SV40 polyadenylation site (SV40-A). Finally, pHuTIG1.AA contains a portion of the pUC19 plasmid including the bacterial origin of replication (pUC ori) and the β-lactamase (β-lactamase) gene. The arrows in Fig. show the orientation of transcription.
Аминокислотная последовательность зрелой тяжелой гамма цепи HuTIG1-IgG1.AA, кодируемой в pHuTIG1.AA, представляет собойThe amino acid sequence of the mature gamma heavy chain HuTIG1-IgG1.AA encoded in pHuTIG1.AA is
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIYYADTV KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSSASTKGPSVF PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSWTVPS SSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMIS RTPEVTCVWDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKE YKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG К (SEQ ID NO:40).EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIYYADTV KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSSASTKGPSVF PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSWTVPS SSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMIS RTPEVTCVWDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKE YKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG К (SEQ ID NO:40).
C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать.The C-terminal lysine may or may not be present.
Аминокислотная последовательность зрелой легкой каппа цепи HuTIG1-IgG1.AA, кодируемой в pHuTIG1.AA, представляет собойThe amino acid sequence of the mature HuTIG1-IgG1.AA kappa light chain encoded in pHuTIG1.AA is
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVPSRFSGDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVPSRFSG
SGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSG TASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVY ACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:41).SGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSG TASVVCLLNNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVY ACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:41).
Вектор экспрессии pHuTIG1.AA вводили в хромосомы в клеточной линии CHO-K1 яичников киThe expression vector pHuTIG1.AA was introduced into the chromosomes in the CHO-K1 cell line of the ovaries.
- 25 041301 тайского хомячка (ATCC, Manassas, VA) для получения клеточных линий, стабильно продуцирующих HuTIG1-IgG1.AA. CHO-K1 клетки выращивали в SFM4CHO среде (GE Healthcare Life Sciences, Logan, UT) при 37°C в 7,5% CO2 инкубаторе. Стабильную трансфекцию в CHO-K1 осуществляли путем электропорации. Перед трансфекцией pHuTIG1.AA линеализировали с использованием FspI. В типичном эксперименте примерно 107 клеток трансфицировали при помощи 20 мкг линеализированной плазмиды, суспендировали в SFM4CHO среде и высевали при 100 мкл/лунка в несколько 96-луночных планшетов после соответствующих разведений клеток. Через 48 ч добавляли SFM4CHO среду, содержащую 20 мкг/мл пуромицина, при 100 мкл/лунка для выделения стабильных трансфектантов. Примерно через десять дней после начала селекции культуральные супернатанты трансфектантов анализировали на продукцию антител.- 25 041301 Thai hamster (ATCC, Manassas, VA) to obtain cell lines that stably produce HuTIG1-IgG1.AA. CHO-K1 cells were grown in SFM4CHO medium (GE Healthcare Life Sciences, Logan, UT) at 37° C. in a 7.5% CO2 incubator. Stable transfection into CHO-K1 was performed by electroporation. Prior to transfection, pHuTIG1.AA was linearized with FspI. In a typical experiment, approximately 10 7 cells were transfected with 20 μg of the linearized plasmid, suspended in SFM4CHO medium, and plated at 100 μl/well in several 96-well plates after appropriate cell dilutions. After 48 hours, SFM4CHO medium containing 20 μg/ml puromycin was added at 100 μl/well to isolate stable transfectants. Approximately ten days after the start of selection, the culture supernatants of the transfectants were analyzed for antibody production.
Экспрессию HuTIG1-IgG1.AA измеряли сэндвич-методом ELISA. В типичном эксперименте ELISA планшет покрывали козлиным анти-человеким IgG Fc-специфическим поликлональным антителом, промывали промывочным буфером (PBS, содержащий 0,05% Tween 20) и блокировали ELISA буфером (PBS, содержащий 2% снятого молока и 0,05% Tween 20). После промывки промывочным буфером испытываемые образцы, соответствующим образом разведенные в ELISA буфере, наносили на ELISA планшет. Соответствующее гуманизированное IgG1/к антитело использовали в качестве стандарта. После инкубации ELISA планшета в течение 1 ч при комнатной температуре и промывки промывочным буфером, связанные антитела определяли с использованием HRP-конъюгированного козлиного поликлонального антитела к каппа цепи человека. После инкубации планшета в течение 0,5 ч при комнатной температуре и промывки промывочным буфером инициировали проявление цвета путем добавления 100 мкл/лунка ABTS субстрата (Sigma-Aldrich) и останавливали при помощи 100 мкл/лунка 2% щавелевой кислоты. Поглощение считывали при 405 нм. CHO-K1 стабильные трансфектанты, продуцирующие высокие уровни HuTIG1-IgG1.AA, увеличивали в объеме в SFM4CHO до тех пор, пока клеточная жизнеспособность не становилась меньше чем 50%. После центрифугирования и фильтрации культуральные супернатанты загружали на колонку с Белком A (HiTrap MABSelect SuRe, GE Healthcare, Piscataway, NJ). Колонку промывали при помощи PBS, затем антитело элюировали с использованием 0,1 М глицин-HCl (pH 3,0). Буфер элюируемых антител нейтрализовали при помощи 1 М Tris-HCl (pH 8) и затем обменивали с PBS путем диализа. Концентрацию антител определяли путем измерения поглощения при 280 нм (1 мг/мл=1,4 OD).Expression of HuTIG1-IgG1.AA was measured by sandwich ELISA. In a typical ELISA experiment, the plate was coated with a goat anti-human IgG Fc-specific polyclonal antibody, washed with wash buffer (PBS containing 0.05% Tween 20) and blocked with ELISA buffer (PBS containing 2% skimmed milk and 0.05% Tween 20). ). After washing with wash buffer, the test samples, appropriately diluted in ELISA buffer, were applied to the ELISA plate. The corresponding humanized IgG1/k antibody was used as a standard. After incubating the ELISA plate for 1 hour at room temperature and washing with wash buffer, bound antibodies were detected using an HRP-conjugated goat polyclonal anti-human kappa chain antibody. After incubating the plate for 0.5 h at room temperature and washing with wash buffer, color development was initiated by adding 100 µl/well of ABTS substrate (Sigma-Aldrich) and stopped with 100 µl/well of 2% oxalic acid. Absorbance was read at 405 nm. CHO-K1 stable transfectants producing high levels of HuTIG1-IgG1.AA were expanded in SFM4CHO until cell viability was less than 50%. After centrifugation and filtration, culture supernatants were loaded onto a Protein A column (HiTrap MABSelect SuRe, GE Healthcare, Piscataway, NJ). The column was washed with PBS, then the antibody was eluted using 0.1 M glycine-HCl (pH 3.0). The eluting antibody buffer was neutralized with 1 M Tris-HCl (pH 8) and then exchanged with PBS by dialysis. The antibody concentration was determined by measuring the absorbance at 280 nm (1 mg/ml=1.4 OD).
Пример 5. Характеристика HuTIG1-IgG1.AAExample 5 Characterization of HuTIG1-IgG1.AA
Связывание HuTIG1-IgG1.AA с человеческим TIGIT исследовали методом ELISA. ELISA планшет покрывали 5 мкг/мл hTIGIT-Fc в PBS (100 мкл/лунка) при 4°C в течение ночи, промывали промывочным буфером (PBS, содержащий 0,05% Tween 20) и блокировали при помощи 200 мкл/лунка SuperBlock блокирующего буфера (Thermo Fisher Scientific). После промывки лунок промывочным буфером добавляли HuTIG1-IgG1.AA, начиная с 2,5 мкг/мл и серийных 2-кратных разведений в SuperBlock блокирующем буфере, для связывания со связанным на планшете человеческим TIGIT. После инкубации ELISA планшета в течение 1 часа при комнатной температуре и промывки промывочным буфером связанные антитела определяли с использованием 100 мкл/лунка HRP-конъюгированного козлиного поликлонального антитела против человекой каппа цепи (Southern Biotech), 1/2000-разбавленного в ELISA Буфере. После инкубации в течение 30 минут при комнатной температуре и промывки промывочным буфером инициировали проявление цвета с использованием 100 мкл/лунка ABTS субстрата и останавливали при помощи 100 мкл/лунка 2% щавелевой кислоты. Поглощение считывали при 405 нм. Как показано на фиг. 11, HuTIG1-IgG1.AA связывались с человеческий TIGIT дозо-зависимым образом. Полумаксимальная эффективная концентрация (EC50) HuTIG1-IgG1.AA для связывания с TIGIT составила 65 нг/мл. Это показывает, что HuTIG1-IgG1.AA представляет собой хорошее связующее для человеческого TIGIT.The binding of HuTIG1-IgG1.AA to human TIGIT was examined by ELISA. ELISA plate was coated with 5 μg/ml hTIGIT-Fc in PBS (100 μl/well) at 4°C overnight, washed with wash buffer (PBS containing 0.05% Tween 20) and blocked with 200 μl/well SuperBlock blocking buffer (Thermo Fisher Scientific). After washing the wells with wash buffer, HuTIG1-IgG1.AA was added starting at 2.5 μg/ml and serial 2-fold dilutions in SuperBlock blocking buffer to bind to plate-bound human TIGIT. After incubating the ELISA plate for 1 hour at room temperature and washing with wash buffer, bound antibodies were detected using 100 μl/well HRP-conjugated goat anti-human kappa chain polyclonal antibody (Southern Biotech), 1/2000-diluted in ELISA Buffer. After incubation for 30 minutes at room temperature and washing with wash buffer, color development was initiated using 100 μl/well of ABTS substrate and stopped with 100 μl/well of 2% oxalic acid. Absorbance was read at 405 nm. As shown in FIG. 11, HuTIG1-IgG1.AA associated with human TIGIT in a dose-dependent manner. The half maximum effective concentration (EC 50 ) of HuTIG1-IgG1.AA for TIGIT binding was 65 ng/ml. This shows that HuTIG1-IgG1.AA is a good binder for human TIGIT.
Связывание HuTIG1-IgG1.AA с человеческим TIGIT также исследовали методом проточной цитометрии. NS0-hTIGIT клетки (8x105 клеток) инкубировали в 160 мкл FACS Буфера (PBS, содержащий 0,5% бычьего сывороточного альбумина и 0,05% азида натрия) в присутствии (или в отсутствие) различных концентраций HuTIG1-IgG1.AA, начиная с 10 мкг/мл и серийных 2-кратных разведений, в течение 20 мин при 4°C. После промывки FACS Буфером связывание HuTIG1-IgG1.AA на NS0-hTIGIT клетках определяли с использованием PE-меченного козлиного античеловеческого IgG антитела в FACS буфере. После инкубации в течение 20 минут и промывки FACS Буфером клетки подвергали проточной цитометрии с использованием FACScan проточного цитометра (BD Biosciences, San Jose, CA) для получения среднеканальной флуоресценции (MCF) при каждой концентрации антител. Фиг. 12 показывает график MCF (вертикальная ось) при каждой концентрации антител (горизонтальная ось). EC50 значение составляло 60 нг/мл. Это показывает, что HuTIG1-IgG1.AA представляет собой хорошее связующее для человеческого TIGIT, экспрессируемого на клеточной поверхности.Binding of HuTIG1-IgG1.AA to human TIGIT was also examined by flow cytometry. NS0-hTIGIT cells (8x105 cells) were incubated in 160 µl FACS Buffer (PBS containing 0.5% bovine serum albumin and 0.05% sodium azide) in the presence (or absence) of various concentrations of HuTIG1-IgG1.AA starting from 10 μg/ml and serial 2-fold dilutions, for 20 min at 4°C. After washing with FACS Buffer, HuTIG1-IgG1.AA binding on NS0-hTIGIT cells was determined using PE-labeled goat anti-human IgG antibody in FACS buffer. After incubation for 20 minutes and washing with FACS Buffer, cells were subjected to flow cytometry using a FACScan flow cytometer (BD Biosciences, San Jose, CA) to obtain mid-channel fluorescence (MCF) at each antibody concentration. Fig. 12 shows a plot of MCF (vertical axis) at each antibody concentration (horizontal axis). The EC 50 value was 60 ng/ml. This shows that HuTIG1-IgG1.AA is a good binder for human TIGIT expressed on the cell surface.
Активность HuTIG1-IgG1.AA для блокирования взаимодействия между человеческим TIGIT и человеческим CD155 анализировали методом проточной цитометрии с использованием NS0-hTIGIT клеток. NS0-hTIGIT клетки (106 клеток) инкубировали с суб-насыщающей концентрацией (125 нг/мл) FITCмеченных hCD155-Fc слитых белкой (hCD155-Fc-FITC) в 200 мкл FACS Буфера в присутствии (или в отсутствие) различных концентраций HuTIG1-IgG1.AA, начиная с 10 мкг/мл и серийных 2-кратных разThe activity of HuTIG1-IgG1.AA to block the interaction between human TIGIT and human CD155 was analyzed by flow cytometry using NS0-hTIGIT cells. NS0-hTIGIT cells (106 cells) were incubated with a sub-saturating concentration (125 ng/ml) of FITC-labeled hCD155-Fc fusion protein (hCD155-Fc-FITC) in 200 µl of FACS Buffer in the presence (or absence) of various concentrations of HuTIG1-IgG1 .AA starting at 10 µg/mL and serial 2x times
- 26 041301 ведений, в течение 20 мин при 4°C. После промывки FACS Буфером NS0-hTIGIT клетки подвергали проточной цитометрии с использованием FACScan проточного цитометра (BD Biosciences, San Jose, CA). Для исследования связывания hCD155-Fc-FITC на клетках получали MCF при каждой концентрации антител. Как показано на фиг. 13, HuTIG1-IgG1.AA блокировали взаимодействи между hCD155-Fc-FITC и TIGIT на клеточной поверхности дозозависимым образом. Полумаксимальная ингибирующая концентрация (IC50) HuTIG1-IgG1.AA для блокирования TIGIT-CD155 взаимодействи составляла 67 нг/мл. Это показывает, что HuTIG1-IgG1.AA является эффективным блокатором взаимодействия между CD155 и TIGIT.- 26 041301 trials, for 20 min at 4°C. After washing with FACS Buffer NS0-hTIGIT, cells were subjected to flow cytometry using a FACScan flow cytometer (BD Biosciences, San Jose, CA). To study the binding of hCD155-Fc-FITC on cells received MCF at each concentration of antibodies. As shown in FIG. 13, HuTIG1-IgG1.AA blocked interactions between hCD155-Fc-FITC and TIGIT on the cell surface in a dose-dependent manner. The half-maximal inhibitory concentration (IC 50 ) of HuTIG1-IgG1.AA to block the TIGIT-CD155 interaction was 67 ng/ml. This shows that HuTIG1-IgG1.AA is an effective blocker of the interaction between CD155 and TIGIT.
Пример 6. Конструирование и экспрессия гуманизированного TIG3 антителаExample 6 Construction and Expression of a Humanized TIG3 Antibody
Гуманизацию VH и VL TIG3 осуществляли, следуя общей процедуре, описанной в примере 4. Аминокислотная последовательность сконструированной гуманизированной VH TIG3 (HuTIG3 VH) представляет собойHumanization of VH and VL TIG3 was performed following the general procedure described in Example 4. The amino acid sequence of the engineered humanized VH TIG3 (HuTIG3 VH) is
MNFGLRLIFLVLTLKGVNCEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLMNFGLRLIFLVLTLKGVNCEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGL
EWVAYISDGGYNTYYPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYW GQGTTVTVSS (SEQ ID NO:42).EWVAYISDGGYNTYYPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYW GQGTTVTVSS (SEQ ID NO:42).
Аминокислотная последовательность зрелой VH HuTIG3Amino acid sequence of mature VH HuTIG3
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTYYPDTVEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTYYPDTV
KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO:43) начинается в положении 20 в SEQ ID NO: 42.KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO:43) starts at position 20 in SEQ ID NO:42.
Аминокислотная последовательность сконструированной гуманизированной VL TIG3 (HuTIG3 VL) представляет собойThe amino acid sequence of the engineered humanized TIG3 VL (HuTIG3 VL) is
MDSQAQVLMLLLLWVSGTCGDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQMDSQAQVLMLLLLWVSGTCGDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQ
KPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGT KVEIK (SEQ ID NO: 44).KPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGT KVEIK (SEQ ID NO: 44).
Аминокислотная последовательность зрелой VL HuTIG3Amino acid sequence of mature VL HuTIG3
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGVDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGV
PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIK (SEQ IDPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIK (SEQ ID
NO :4 5) , начинается в положении 21 в SEQ ID NO: 44.NO :4 5) starts at position 21 in SEQ ID NO: 44.
Ген, кодирующий HuTIG3 VH, синтезировали в виде экзона, включающего сигнал донора сплайсинга на 3' конце кодирующей области, SpeI сайт на 5' конце фрагмента и HindIII сайт на 3' конце фрагмента. Нуклеотидная последовательность синтетического гена HuTIG3 VH (SEQ ID NO: 46) показана вместе с предсказанной аминокислотной последовательностью (SEQ ID NO: 42) на фиг. 14A.The gene encoding HuTIG3 VH was synthesized as an exon including a splicing donor signal at the 3' end of the coding region, a SpeI site at the 5' end of the fragment, and a HindIII site at the 3' end of the fragment. The nucleotide sequence of the synthetic HuTIG3 VH gene (SEQ ID NO: 46) is shown along with the predicted amino acid sequence (SEQ ID NO: 42) in FIG. 14A.
Ген, кодирующий гуманизированную VL TIG3 (HuTIG3 VL), синтезировали в виде экзона, включающего сигнал донора сплайсинга на 3' конце кодирующей области, NheI сайт на 5' конце фрагмента и EcoRI сайт на 3' конце фрагмента. Нуклеотидная последовательность синтетического HuTIG3 VL гена (SEQ ID NO: 47) показана вместе с предсказанной аминокислотной последовательностью (SEQ ID NO: 44) на фиг. 14B.The gene encoding humanized TIG3 VL (HuTIG3 VL) was synthesized as an exon including a splicing donor signal at the 3' end of the coding region, a NheI site at the 5' end of the fragment, and an EcoRI site at the 3' end of the fragment. The nucleotide sequence of the synthetic HuTIG3 VL gene (SEQ ID NO: 47) is shown along with the predicted amino acid sequence (SEQ ID NO: 44) in FIG. 14b.
Вектор экспрессии млекопитающего pHuTIG3.AA для продукции гуманизированной IgG1/каппа формы моноклонального антитела TIG3 против человеческого TIGIT (HuTIG3-IgG1.AA) конструировали путем модификации pHuTIG1.AA следующим образом: (1) HuTIG1 VH ген заменяли HuTIG3 VH геном между SpeI и HindIII сайтами, и (2) HuTIG1 VL ген заменяли HuTIG3 VL геном между NheI и EcoRI сайтами. CH2 область, кодируемая в pHuTIG3.AA, содержит замены аминокислот на аланиновые остатки в положениях 234 и 235 (Eu нумерация) (L234A/L235A) для элиминирования эффекторных функций.The pHuTIG3.AA mammalian expression vector for the production of a humanized IgG1/kappa form of the TIG3 anti-human TIGIT monoclonal antibody (HuTIG3-IgG1.AA) was constructed by modifying pHuTIG1.AA as follows: (1) The HuTIG1 VH gene was replaced with the HuTIG3 VH gene between the SpeI and HindIII sites , and (2) the HuTIG1 VL gene was replaced with the HuTIG3 VL gene between the NheI and EcoRI sites. The CH2 region encoded in pHuTIG3.AA contains amino acid substitutions for alanine residues at positions 234 and 235 (Eu numbering) (L234A/L235A) to eliminate effector functions.
Аминокислотная последовательность зрелой тяжелой гамма цепи HuTIG3-IgG1.AA, кодируемой в pHuTIG3.AA, представляет собойThe amino acid sequence of the mature gamma heavy chain HuTIG3-IgG1.AA encoded in pHuTIG3.AA is
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTYYPDTVEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTYYPDTV
KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVF
PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPS
SSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMIS
RTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKERTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKE
YKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE
SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG К (SEQ ID NO:48)SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG K (SEQ ID NO:48)
C-концевой лизин может присутствовать или не присутствовать.The C-terminal lysine may or may not be present.
Аминокислотная последовательность зрелой легкой каппа цепи HuTIG3-IgG1.AA, кодируемой в pHuTIG3.AA, представляет собойThe amino acid sequence of the mature HuTIG3-IgG1.AA kappa light chain encoded in pHuTIG3.AA is
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGVDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGV
PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSD
EQLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADY EKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:49).EQLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADY EKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:49).
Транзиентную трансфекцию pHuTIG3.AA в 100 мл экспоненциально растущих Expi293 клетокTransient transfection of pHuTIG3.AA into 100 ml exponentially growing Expi293 cells
- 27 041301 (Thermo Fisher Scientific) осуществляли в соответствии с протоколом поставщика. CHO-K1 стабильные трансфектанты, продуцирующие высокие уровни HuTIG3-IgG1.AA, также получали путем электропорации pHuTIG3.AA, как описано выше, и увеличивали в объеме в SFM4CHO до тех пор, пока клеточная жизнеспособность не становилась меньше чем 50%. HuTIG3-IgG1.AA очищали из культуральных супернатантов каждых транзиентно трансфицированных Expi293 клеток и стабильно трансфицированных CHO-K1 клеток на аффинной колонке с белком A, как описано выше.- 27 041301 (Thermo Fisher Scientific) was performed according to the supplier's protocol. CHO-K1 stable transfectants producing high levels of HuTIG3-IgG1.AA were also prepared by pHuTIG3.AA electroporation as described above and expanded in SFM4CHO until cell viability was less than 50%. HuTIG3-IgG1.AA was purified from culture supernatants of each transiently transfected Expi293 cells and stably transfected CHO-K1 cells on a protein A affinity column as described above.
Пример 7. Характеристика HuTIG3-IgG1.AAExample 7 Characterization of HuTIG3-IgG1.AA
Связывание HuTIG3-IgG1.AA с человеческим TIGIT исследовали методом ELISA, как описано в примере 5. Как показано на фиг. 15, HuTIG3-IgG1.AA связывается с человеческим TIGIT дозозависимым образом. Полумаксимальная эффективная концентрация (EC50) HuTIG3-IgG1.AA для связывания с TIGIT составила 85 нг/мл. Это показывает, что HuTIG3-IgG1.AA представляет собой хорошее связующее для человеческого TIGIT.Binding of HuTIG3-IgG1.AA to human TIGIT was examined by ELISA as described in Example 5. As shown in FIG. 15, HuTIG3-IgG1.AA binds to human TIGIT in a dose dependent manner. The half maximum effective concentration (EC 50 ) of HuTIG3-IgG1.AA for TIGIT binding was 85 ng/ml. This shows that HuTIG3-IgG1.AA is a good binder for human TIGIT.
Связывание HuTIG3-IgG1.AA с человеческим TIGIT также исследовали методом проточной цитометрии, как описано в примере 5. Как показано на фиг. 12, HuTIG3-IgG1.AA связывается с человеческим TIGIT дозозависимым образом. Полумаксимальная эффективная концентрация (EC50) HuTIG3-IgG1.AA для связывания с TIGIT составила 370 нг/мл. Это показывает, что HuTIG3-IgG1.AA представляет собой хорошее связующее для человеческого TIGIT.Binding of HuTIG3-IgG1.AA to human TIGIT was also examined by flow cytometry as described in Example 5. As shown in FIG. 12, HuTIG3-IgG1.AA binds to human TIGIT in a dose dependent manner. The half maximum effective concentration (EC 50 ) of HuTIG3-IgG1.AA for binding to TIGIT was 370 ng/ml. This shows that HuTIG3-IgG1.AA is a good binder for human TIGIT.
Активность HuTIG3-IgG1.AA для блокирования взаимодействия TIGIT с CD155 анализировали методом проточной цитометрии с использованием NS0-hTIGIT клеток и FITC-меченного hCD155-Fc, как описано в примере 5. Как показано на фиг. 13, HuTIG3-IgG1.AA блокирует взаимодействие между TIGIT и CD155 дозозависимым образом. Полумаксимальная ингибирующая концентрация (IC50) HuTIG3IgG1.AA для блокирования TIGIT-CD155 взаимодействия составляла 279 нг/мл. Это показывает, что HuTIG3-IgG1.AA является эффективным блокатором взаимодействия между CD155 и TIGIT.The activity of HuTIG3-IgG1.AA to block TIGIT interaction with CD155 was analyzed by flow cytometry using NS0-hTIGIT cells and FITC-labeled hCD155-Fc as described in Example 5. As shown in FIG. 13, HuTIG3-IgG1.AA blocks the interaction between TIGIT and CD155 in a dose-dependent manner. The half-maximal inhibitory concentration (IC 50 ) of HuTIG3IgG1.AA to block the TIGIT-CD155 interaction was 279 ng/mL. This shows that HuTIG3-IgG1.AA is an effective blocker of the interaction between CD155 and TIGIT.
Пример 8. Ответ IL-2 цитокинов на столбнячный анатоксин в человеческих T-клетках усиливается посредством блокады TIGITExample 8 IL-2 Cytokine Response to Tetanus Toxoid in Human T Cells Enhanced by Blockade of TIGIT
Способность мышиных анти-TIGIT антител усиливать антигенспецифические T-клеточные ответы исследовали с использованием in vitro анализа антигенспецифического ответа на столбнячный анатоксин (см., например, Piersma et al., Vaccine. 2006 Apr 12;24(16):3076-83; Zaunders et al., J Immunol. 2009 Aug 15;183(4):2827-36). Достаточная вакцинная защита для столбнячного анатоксина достигается при помощи бустер-инъекций, которые позволяют иммунной системе индуцировать ответы CD4+ и CD8+ Tклеток памяти. В качестве суррогатного показателя эффективности (см., например, Plotkin et al., Clin Vaccine Immunol. 2010 Jul; 17(7):1055-1065; Goulon et al. Nov. 1972 Presse Med. 1:3049-3050.), уровни в сыворотке 0,1 МЕ/мл анатоксина против столбняка указывают на поддержание иммунного ответа.The ability of mouse anti-TIGIT antibodies to enhance antigen-specific T-cell responses was investigated using an in vitro antigen-specific response to tetanus toxoid assay (see, e.g., Piersma et al., Vaccine. 2006 Apr 12;24(16):3076-83; Zaunders et al., J Immunol 2009 Aug 15;183(4):2827-36). Sufficient vaccine protection for tetanus toxoid is achieved with booster injections that allow the immune system to induce CD4+ and CD8+ memory T cell responses. As a surrogate measure of efficacy (see, e.g., Plotkin et al., Clin Vaccine Immunol. 2010 Jul; 17(7):1055-1065; Goulon et al. Nov. 1972 Presse Med. 1:3049-3050.), Serum levels of 0.1 IU/mL of tetanus toxoid indicate maintenance of the immune response.
Мононуклеарные клетки периферической крови (PBMCs) от людей-добровольцев, вакцинированных столбнячным анатоксином, получали (iQ Biosciences) с подтверждением титра столбняка в крови добровольцев выше чем 1,0 МЕ/мл методом ELISA (Genway). 800000 PBMCs культивировали в RPMI 1640 среде (Invitrogen), содержащей 10% фетальную бычью сыворотку (FBS), в 96-луночных круглодонных планшетах (Nunc). 2 мкг/мл столбнячного анатоксина (List Biological Laboratories) добавляли в лунки, содержащие PBMCs, в присутствии мышиного анти-PD-1 антитела (Biolegend, клон EH12.2H7) или анти-TIGIT антитела (TIG1) при 3,3 или 10 мкг/мл в течение 4 дней при 37°C в 5% CO2 инкубаторе. В качестве контроля 2 мкг/мл столбнячного анатоксина добавляли к PBMC без каких-либо антител. Супернатанты из культивированных лунок собирали и измеряли содержание цитокинов, указывающих на Tклеточную активацию, IL-2, путем мультиплексного анализа на микросферах (BD Pharmingen, CBA Th1/Th2 Cytokine Kit) методом проточной цитометрии (BD FACSCalibur). Как показано на фиг. 16, продукция IL-2 при стимуляции только столбнячным анатоксином составила 31 пг/мл. Продукция IL-2 еще больше повышалась до 70 и 86 пг/мл в присутствии мышиного анти-TIGIT антитела TIG1 при 3,3 мкг/мл и 10 мкг/мл соответственно. Продукция IL-2 при стимуляции столбнячным анатоксином также повышалась до 39 пг/мл и 57 пг/мл в присутствии мышиного анти-PD-1 антитела EH12.2H7 при 3,3 и 10 мкг/мл соответственно. Эти данные показывают, что TIG1 обладает функциональной способностью усиливать антигенспецифические ответы T-клеточных цитокинов.Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from human volunteers vaccinated with tetanus toxoid were obtained (iQ Biosciences) with confirmation of a tetanus titer in the blood of volunteers higher than 1.0 IU/ml by ELISA method (Genway). 800,000 PBMCs were cultured in RPMI 1640 medium (Invitrogen) containing 10% fetal bovine serum (FBS) in 96-well round bottom plates (Nunc). 2 μg/ml tetanus toxoid (List Biological Laboratories) was added to wells containing PBMCs in the presence of mouse anti-PD-1 antibody (Biolegend, clone EH12.2H7) or anti-TIGIT antibody (TIG1) at 3.3 or 10 μg /ml for 4 days at 37°C in a 5% CO 2 incubator. As a control, 2 μg/ml tetanus toxoid was added to PBMC without any antibodies. Supernatants from cultured wells were harvested and cytokines indicative of T cell activation, IL-2, were measured by multiplex microsphere analysis (BD Pharmingen, CBA Th1/Th2 Cytokine Kit) by flow cytometry (BD FACSCalibur). As shown in FIG. 16, IL-2 production upon stimulation with tetanus toxoid alone was 31 pg/mL. IL-2 production was further increased to 70 and 86 pg/ml in the presence of mouse anti-TIGIT antibody TIG1 at 3.3 μg/ml and 10 μg/ml, respectively. IL-2 production upon stimulation with tetanus toxoid was also increased to 39 pg/ml and 57 pg/ml in the presence of mouse anti-PD-1 antibody EH12.2H7 at 3.3 and 10 μg/ml, respectively. These data indicate that TIG1 has the functional ability to enhance antigen-specific responses of T-cell cytokines.
Пример 9. Пролиферативный ответ T-клеток человека на столбнячный анатоксин усиливается посредством блокады TIGITExample 9 Human T cell proliferative response to tetanus toxoid is enhanced by blockade of TIGIT
Способность мышиных анти-TIGIT антител усиливать антигенспецифические T-клеточные ответы исследовали с использованием in vitro анализа антигенспецифического ответа на столбнячный анатоксин (см., например, Piersma et al., Vaccine. 2006 Apr 12;24(16):3076-83; Zaunders et al., J Immunol. 2009 Aug 15;183(4):2827-36). PBMC от людей-добровольцев, вакцинированных столбнячным анатоксином, получали (iQ Biosciences) как описано в примере 8. PBMC метили карбоксифлуоресцеинсукцинимидиловым эфиром (CFSE) (ThermoFisher), представляющим собой реагент, используемый для in vitro и in vivo мечения клеток для отслеживания нескольких поколений с использованием разведения красителя методом проточной цитометрии. 250000 CFSE-меченные PBMCs культивировали в AIM-V среде (Invitrogen) в 96луночных круглодонных планшетах (Nunc). 2 мкг/мл столбнячного анатоксина (Astarte Biologies, LLC) добавляли в каждую лунку в присутствии мышиного анти-PD-1 антитела (Biolegend клон EH12.2H7) илиThe ability of mouse anti-TIGIT antibodies to enhance antigen-specific T-cell responses was investigated using an in vitro antigen-specific response to tetanus toxoid assay (see, e.g., Piersma et al., Vaccine. 2006 Apr 12;24(16):3076-83; Zaunders et al., J Immunol 2009 Aug 15;183(4):2827-36). PBMCs from human volunteers vaccinated with tetanus toxoid were prepared (iQ Biosciences) as described in Example 8. PBMCs were labeled with carboxyfluorescein succinimidyl ether (CFSE) (ThermoFisher), which is a reagent used for in vitro and in vivo labeling of cells to track multiple generations with using dye dilution by flow cytometry. 250,000 CFSE-labeled PBMCs were cultured in AIM-V medium (Invitrogen) in 96 well round bottom plates (Nunc). 2 μg/ml tetanus toxoid (Astarte Biologies, LLC) was added to each well in the presence of mouse anti-PD-1 antibody (Biolegend clone EH12.2H7) or
- 28 041301- 28 041301
TIG1 при 2,5, 5 или 10 мкг/мл в каждой лунке. Клетки инкубировали в течение 4 дней при 37°C в 5% CO2 инкубаторе. В День 4 IL-2 [50 единиц/мл] (Peprotech) добавляли к культурам, а в День 6 PBMCs собирали для измерений пролиферации методом проточной цитометрии (BD FACSCalibur) для определения разбавления CFSE на CD4+ T-клетках или CD8+ T-клетках.TIG1 at 2.5, 5, or 10 µg/mL in each well. Cells were incubated for 4 days at 37°C in a 5% CO 2 incubator. On Day 4, IL-2 [50 units/mL] (Peprotech) was added to cultures, and on Day 6, PBMCs were harvested for proliferation measurements by flow cytometry (BD FACSCalibur) to determine CFSE dilution on CD4+ T cells or CD8+ T cells.
Как показано на фиг. 17 (верхние панели), столбнячный анатоксин индуцировал пролиферацию 4,5 и 6,5% человеческих CD4+ T-клеток, полученных от доноров 1 и 2 соответственно. Добавление TIG1 еще больше повышало CD4+ T-клеточную пролиферацию при всех испытываемых концентрациях антител (2,5, 5 и 10 мкг/мл), при этом подобные пролиферативные эффекты наблюдали с анти-PD-1 антителом при этих диапазонах доз.As shown in FIG. 17 (upper panels), tetanus toxoid induced proliferation of 4.5 and 6.5% of human CD4+ T cells derived from donors 1 and 2, respectively. The addition of TIG1 further increased CD4+ T cell proliferation at all antibody concentrations tested (2.5, 5 and 10 μg/ml), with similar proliferative effects observed with anti-PD-1 antibody at these dose ranges.
Как показано на фиг. 17 (нижние панели), столбнячный анатоксин индуцировал пролиферацию 15 и 15,5% человеческих CD8+ T-клеток, полученных от доноров 1 и 2 соответственно. Добавление TIG1 еще больше повышало CD8+ T-клеточную пролиферацию при всех испытываемых концентрациях антител (2,5, 5 и 10 мкг/мл), при этом подобные пролиферативные эффекты наблюдали с анти-PD-1 антителом EH12.2H7 при этих диапазонах доз. Эти результаты показывают, что TIG1 обладает способностью усиливать антигенспецифеские T-клеточные пролиферативные ответы.As shown in FIG. 17 (lower panels), tetanus toxoid induced proliferation of 15 and 15.5% of human CD8+ T cells derived from donors 1 and 2, respectively. The addition of TIG1 further increased CD8+ T cell proliferation at all antibody concentrations tested (2.5, 5 and 10 μg/mL), with similar proliferative effects observed with anti-PD-1 antibody EH12.2H7 at these dose ranges. These results indicate that TIG1 has the ability to enhance antigen-specific T-cell proliferative responses.
Пример 10. Повышение NK-клеточно-опосредованной цитотоксичности с использованием человеческих первичных эффекторных клеток и K562 клеток-мишеней посредством блокады TIGITExample 10 Enhancement of NK Cell Mediated Cytotoxicity Using Human Primary Effector Cells and K562 Target Cells via TIGIT Blockade
Человеческие NK-клетки способны индуцировать природную цитотоксичность для клетокмишеней, которые не содержат MHC I, таких как K562, клеточная линия хронического миелогенного лейкоза (CML) (см., например, Nagel et al., Cancer Res 1981;41:2284-2288; Andersson et al., Int J Cancer. 1979 Feb;23(2):143-7.; Lozzio et al., Leuk Res. 1979;3(6):363-70). Экспрессию CD155 (PVR) на K562 клетках (ATCC) подтверждали с использованием коммерческого антитела (Biolegend анти-CD 155 клон SKII.4). Как показано на фиг. 18 (верхняя панель), 98% K562 клеток, как было обнаружено, экспрессируют высокие уровни CD155 (черная гистограмма). Экспрессию TIGIT на человеческих CD56положительных NK-клетках в PBMC (iQ Biosciences) с использованием коммерческого антитела (eBiosciences анти-TIGIT клон MBSA43 и Biolegend анти-CD56 клон HCD56) также подтверждали на 3 репрезентативных человеческих донорах (фиг. 18, нижние панели).Human NK cells are capable of inducing native cytotoxicity to target cells that do not contain MHC I, such as K562, a chronic myelogenous leukemia (CML) cell line (see, for example, Nagel et al., Cancer Res 1981;41:2284-2288; Andersson et al., Int J Cancer 1979 Feb;23(2):143-7.; Lozzio et al., Leuk Res. 1979;3(6):363-70). Expression of CD155 (PVR) on K562 cells (ATCC) was confirmed using a commercial antibody (Biolegend anti-CD 155 clone SKII.4). As shown in FIG. 18 (upper panel), 98% of K562 cells were found to express high levels of CD155 (black bar graph). Expression of TIGIT on human CD56 positive NK cells in PBMC (iQ Biosciences) using a commercial antibody (eBiosciences anti-TIGIT clone MBSA43 and Biolegend anti-CD56 clone HCD56) was also confirmed in 3 representative human donors (FIG. 18, bottom panels).
Лизис K562 клеток, опосредованный NK-клетками, измеряли с и без TIG1. PBMC культивировали в течение ночи в AIM-V среде (Invitrogen) в присутствии интерлейкина-2 (IL-2) [200 единиц/мл] (Peprotech) при 37°C в 5% CO2 инкубаторе. На следующий день K562 клетки метили CFSE и совместно культивировали 1:100 с PBMCs (Мишень:PBMCs; одна K562 клетка на сто PBMC, которые содержали примерно 5% NK-клеток) в течение 4 ч при 37°C в 5% CO2 инкубаторе в присутствии 10 мкг/мл TIG1. После инкубации клетки собирали и окрашивали при помощи 5 нМ Sytox Red (ThermoFisher) для различения мертвых клеток-мишеней при помощи (CFSE+ Sytox Red+). Проценты K562 клеток-мишеней, лизированных NK-клетками, определяли методом проточной цитометрии (FACSCalibur; FlowJo Анализ). Как показано на фиг. 19, 2% K562 клеток было лизировано без TIG1. Когда добавляли TIG1, было лизировано 4,4% K562 клеток. Добавление TIG1 повышало NK-клеточно-опосредованную природную цитотоксичность K562 клеток двукратно, демонстрируя, что TIG1 обладает способностью повышать уровень киллинга клеток-мишеней субпопуляцией человеческих эффекторных клеток.Lysis of K562 cells mediated by NK cells was measured with and without TIG1. PBMC were cultured overnight in AIM-V medium (Invitrogen) in the presence of interleukin-2 (IL-2) [200 units/ml] (Peprotech) at 37°C in a 5% CO2 incubator. The next day, K562 cells were labeled with CFSE and co-cultured 1:100 with PBMCs (Target: PBMCs; one K562 cell per hundred PBMCs that contained approximately 5% NK cells) for 4 h at 37°C in a 5% CO2 incubator in presence of 10 μg/ml TIG1. After incubation, cells were harvested and stained with 5 nM Sytox Red (ThermoFisher) to distinguish between dead target cells with (CFSE+ Sytox Red+). The percentages of K562 target cells lysed by NK cells were determined by flow cytometry (FACSCalibur; FlowJo Analysis). As shown in FIG. 19.2% of K562 cells were lysed without TIG1. When TIG1 was added, 4.4% of K562 cells were lysed. The addition of TIG1 increased the NK cell-mediated intrinsic cytotoxicity of K562 cells by a factor of two, demonstrating that TIG1 has the ability to increase the level of killing of target cells by a subpopulation of human effector cells.
Пример 11. SEB-индуцированная продукция цитокинов человеческими T-клетками усиливается посредством блокады TIGITExample 11 SEB-Induced Cytokine Production by Human T Cells Enhanced by Blockade of TIGIT
Суперантигены, такие как SEB (Staphylococcus Enterotoxin B), активируют T-клетки путем связывания молекул MHC класса II на антигенпрезентирующих клетках с ve элементом TCR, приводя к продукции цитокинов, включая интерлейкин-2 (IL-2), интерлейкин-6 (IL-6), фактор некроза опухоли альфа (TNFa) и интерферон гамма (IFNy) (см., например, Krakauer et al., Toxins (Basel). 2010 Aug; 2(8):19631983). По сравнению с типичным антигениндуцированным T-клеточным ответом, где 0,1-0,001% Tклеток могут активироваться, SEB способен активировать до 10-20% T-клеток в человеческой крови в зависимости от фракции T-клеток, содержащих ve3, ve12, ve14 и ve17, обнаруженной в крови каждого конкретного донора. Поэтому SEB можно использовать для T-клеточного анализа секреции цитокинов для определения уровня модуляции мишени посредством блокады TIGIT с использованием клеток цельной крови человека (WBC).Superantigens such as SEB (Staphylococcus Enterotoxin B) activate T cells by binding class II MHC molecules on antigen presenting cells to the ve element of the TCR, resulting in the production of cytokines including interleukin-2 (IL-2), interleukin-6 (IL- 6), tumor necrosis factor alpha (TNFa) and interferon gamma (IFNy) (see, for example, Krakauer et al., Toxins (Basel). 2010 Aug; 2(8):19631983). Compared to a typical antigen-induced T cell response, where 0.1-0.001% of T cells can be activated, SEB is able to activate up to 10-20% of T cells in human blood, depending on the fraction of T cells containing ve3, ve12, ve14 and ve17 found in the blood of each specific donor. Therefore, SEB can be used for T-cell cytokine secretion assay to determine the level of target modulation through TIGIT blockade using human whole blood cells (WBC).
Свежевыделенные образцы WBC (Stanford Blood Center) получали с использованием натрий гепарина не позднее чем через 4 ч после взятия крови с отсутствием визуальных признаков гемолизиса. 250 мкл распределяли аликвотами по лункам в 96-луночные круглодонные планшеты (Nunc) и стимулировали при помощи SEB (Toxin Technology) при 1 мкг/мл конечной концентрации в присутствии 10 мкг/мл гуманизированного анти-PD-1 моноклонального антитела или 10 мкг/мл HuTIG1-IgG1.AA в течение 24 часов при 37°C в 5% CO2 инкубаторе. Через 24 ч 96-луночные планшеты быстро центрифугировали для отделения слоя плазмы для сбора. После сбора образцов плазмы уровни экспрессии IL-2, IL-6, TNFa и IFNy измеряли путем мультиплексного анализа на микросферах для определения содержания цитокинов (Biolegend, LEGENDplex™ Панель человеческих CD8/NK) методом проточной цитометрии (BD FACSCalibur) и анализировали с использованием Biolegend программы для количественного определения.Freshly isolated WBC samples (Stanford Blood Center) were obtained using sodium heparin no later than 4 hours after blood sampling with no visual signs of hemolysis. 250 µl were aliquoted into wells in 96-well round bottom plates (Nunc) and stimulated with SEB (Toxin Technology) at 1 µg/ml final concentration in the presence of 10 µg/ml humanized anti-PD-1 monoclonal antibody or 10 µg/ml HuTIG1-IgG1.AA for 24 hours at 37°C in a 5% CO2 incubator. After 24 hours, the 96-well plates were rapidly centrifuged to separate the plasma layer for collection. After plasma sampling, expression levels of IL-2, IL-6, TNFa and IFNy were measured by cytokine microsphere multiplex assay (Biolegend, LEGENDplex™ Human CD8/NK Panel) by flow cytometry (BD FACSCalibur) and analyzed using Biolegend programs for quantitative determination.
- 29 041301- 29 041301
Для определения изменения уровня экспрессии каждого из IL-2, IL-6, TNFa и IFNy, уровень цитокинов в присутствии испытываемого антитела (плюс SEB) делили на уровень цитокинов в отсутствие антитела для каждого донора. 2-кратное изменение (например, определенное в присутствии анти-TIGIT), таким образом, означает, что абсолютная концентрация цитокинов, измеренная в эксперименте, в два раза больше обнаруженной в SEB-стимулированных контрольных условиях. Как показано на фиг. 20, SEB-стимулированная продукция IL-2, IL-6, TNFa или IFNy клетками крови здорового донора повышалась в присутствии 10 мкг/мл гуманизированного анти-PD-1 или 10 мкг/мл HuTIG1-IgG1.AA. В этих условиях, SEB-индуцированная продукция цитокинов клетками WBC и ее модуляция при помощи HuTIG1IgG1.AA является регистрируемым показателем потенцирования эффекторных ответов цитокинов. HuTIG1-IgG1.AA способен потенцировать иммунные ответы, как продемонстрировано стимуляцией продукции IL-2, IL-6, TNFa и IFNy в показанном анализе.To determine the change in expression level of each of IL-2, IL-6, TNFa, and IFNy, the cytokine level in the presence of test antibody (plus SEB) was divided by the cytokine level in the absence of antibody for each donor. A 2-fold change (eg, determined in the presence of anti-TIGIT) thus means that the absolute concentration of cytokines measured in the experiment is twice that found in SEB-stimulated control conditions. As shown in FIG. 20, SEB-stimulated production of IL-2, IL-6, TNFa, or IFNy by healthy donor blood cells was increased in the presence of 10 μg/ml humanized anti-PD-1 or 10 μg/ml HuTIG1-IgG1.AA. Under these conditions, SEB-induced cytokine production by WBC cells and its modulation by HuTIG1IgG1.AA is a recordable indicator of potentiation of cytokine effector responses. HuTIG1-IgG1.AA is able to potentiate immune responses as demonstrated by stimulating the production of IL-2, IL-6, TNFa and IFNy in the assay shown.
Пример 12. Характеристика HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA-опосредованной комплементзависимой цитотоксичностиExample 12 Characterization of HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA-Mediated Complement-Dependent Cytotoxicity
Комплементзависимая цитотоксичность (CDC) относится к лизису клетки, которая экспрессирует молекулы-мишени в присутствии комплемента (см., например, Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods, 202:163). Активация классического пути комплемента инициируется связыванием первого компонента системы комплемента (C1q) с антителами (подходящего подкласса), которые связаны с их распознанным антигеном на клеточной поверхности. Для оценки активации комплемента, человеческую Tклеточную двойную репортерную родительскую клеточную линию Jurkat (Dual Jurkat; Invivogen) сконструировали для стабильной экспрессии человеческого TIGIT (Jurkat-TIGIT) на поверхности. Как показано на фиг. 21, экспрессию TIGIT на поверхности Jurkat-TIGIT клеток подтверждали методом проточной цитометрии с использованием коммерческого PE-меченного анти-TIGIT антитела (eBiosciences клон MSBA43). Jurkat-TIGIT поэтому использовали в качестве клеток-мишеней, которые конститутивно экспрессируют мембрана-связанный TIGIT и, таким образом, могут подвергаться активности антителосвязанного CDC в присутствии комплемента.Complement dependent cytotoxicity (CDC) refers to the lysis of a cell that expresses target molecules in the presence of complement (see, for example, Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods, 202:163). Activation of the classical complement pathway is initiated by the binding of the first component of the complement system (C1q) to antibodies (of the appropriate subclass) that are bound to their recognized antigen on the cell surface. To assess complement activation, a Jurkat human T cell double reporter parental cell line (Dual Jurkat; Invivogen) was engineered to stably express human TIGIT (Jurkat-TIGIT) on the surface. As shown in FIG. 21, TIGIT expression on the surface of Jurkat-TIGIT cells was confirmed by flow cytometry using a commercial PE-labeled anti-TIGIT antibody (eBiosciences clone MSBA43). Jurkat-TIGIT has therefore been used as target cells that constitutively express membrane-bound TIGIT and thus can undergo antibody-bound CDC activity in the presence of complement.
Анализ CDC осуществляли с использованием Jurkat-TIGIT клеток и человеческого комплемента в присутствии HuTIG1-IgG1.AA, HuTIG3-IgG1.AA или кроличьего антитимоцитарного глобулина (ATG) (Fresenius Biotech GmbH) с увеличивающимися концентрациями до 50 мкг/мл. ATG использовали в качестве положительного контроля из-за его реактивности с Jurkat клетками и документально подтвержденной комплементзависимой цитотоксической активности с Jurkat клетками (см., например, Eiermann et al., J Hematother Stem Cell Res. 2001 Jun; 10 (3):385-90.; Ayuk et al., AntiCancer Research 29: 1355-1360 (2009). 50000 Jurkat-TIGIT клеток в RPMI 1640 среде (Invitrogen), содержащей 10% фетальную бычью сыворотку (FBS), высевали в 96-луночные круглодонные планшеты (Nunc). Используемые для обработки антитела добавляли, начиная с наивысшей концентрации 50 мкг/мл, с последующим трехкратным серийным разведением, и оставляли для инкубации с клетками в течение 1 ч при 37°C в 5% CO2 инкубаторе. После этой 1-часовой инкубации добавляли человеческий комплемент и оставляли для инкубации еще в течение 3 ч при 37°C в 5% CO2 инкубаторе. После завершения этой 3-часовой инкубации добавляли 5 мкг/мл пропидий иодида (ThermoFisher) и образцы анализировали методом проточной цитометрии (BD FACSCalibur) для определения процентов пропидий иодид-положительных в качестве показателя клеточной гибели.CDC analysis was performed using Jurkat-TIGIT cells and human complement in the presence of HuTIG1-IgG1.AA, HuTIG3-IgG1.AA or rabbit antithymocyte globulin (ATG) (Fresenius Biotech GmbH) at increasing concentrations up to 50 μg/ml. ATG was used as a positive control because of its reactivity with Jurkat cells and documented complement-dependent cytotoxic activity with Jurkat cells (see, e.g., Eiermann et al., J Hematother Stem Cell Res. 2001 Jun; 10(3):385- 90.; Ayuk et al., AntiCancer Research 29: 1355-1360 (2009) 50,000 Jurkat-TIGIT cells in RPMI 1640 medium (Invitrogen) containing 10% fetal bovine serum (FBS) were plated in 96-well round bottom plates ( Nunc) . incubation, human complement was added and left to incubate for an additional 3 h at 37° C. in a 5% CO2 incubator After completion of this 3 h incubation, 5 μg/ml propidium iodide (ThermoFisher) was added and samples were analyzed by flow cytometry (BD F ACSCalibur) to determine the percentage of propidium iodide positive as an indicator of cell death.
Для определения нормализованных изменений проценты жизнеспособных клеток измеряли методом проточной цитометрии и процент пропидий иодид-положительных клеток оценивали как мертвые клетки. Значения для необработанных образцов нормализовали к 100%. Проценты жизнеспособности образцов в присутствии антитела делили на нормализованные необработанные с получением кратного изменения жизнеспособности. Как показано на фиг. 22, ни HuTIG1-IgG1.AA ни HuTIG3-IgG1.AA вплоть до 50 мкг/мл не индуцировали CDC активность. Эти данные показывают, что связывание как HuTIG1IgG1.AA, так и HuTIG3-IgG1.AA с TIGIT не приводит к комплемент-опосредованной клеточной гибели T-клеток.To determine normalized changes, the percentage of viable cells was measured by flow cytometry and the percentage of propidium iodide-positive cells was evaluated as dead cells. Values for untreated samples were normalized to 100%. Percent viability of samples in the presence of antibody was divided by normalized untreated to obtain a fold change in viability. As shown in FIG. 22, neither HuTIG1-IgG1.AA nor HuTIG3-IgG1.AA up to 50 μg/ml induced CDC activity. These data show that binding of both HuTIG1IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA to TIGIT does not lead to complement-mediated cell death of T cells.
Пример 13. Характеристика HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA с использованием Jurkat двойной репортерной клеточной линииExample 13 Characterization of HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA Using the Jurkat Dual Reporter Cell Line
Функциональное следствие блокирования человеческого TIGIT рецептора анализировали с использованием Jurkat-TIGIT репортерной клеточной линии, которая несет в хромосоме секретированный люциферазный репортерный ген, который управляется IFNe минимальным промотором, слитым с пятью копиями NF-кВ консенсусного элемента транскрипционного ответа и тремя копиями c-Rel сайта связывания. Jurkat-TIGIT клетки также экспрессируют секретированный эмбриональный репортерный ген щелочной фосфатазы (SEAP) под контролем ISG54 минимального промотора вместе с пятью элементами IFN-стимулируемого ответа.The functional consequence of blocking the human TIGIT receptor was analyzed using a Jurkat-TIGIT reporter cell line that carries a secreted luciferase reporter gene in the chromosome, which is driven by an IFNe minimal promoter fused to five copies of the NF-κB transcriptional response consensus element and three copies of the c-Rel binding site. . Jurkat-TIGIT cells also express a secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) reporter gene under the control of the ISG54 minimal promoter along with five IFN-stimulated response elements.
Анализы включают две клеточные линии, представляющие T-эффекторные клетки (Jurkat-TIGIT) и антигенпрезентирующие клетки. Т-эффекторные клетки стабильно экспрессируют люциферазный репортер, который активируется ниже от T-клеточного рецептора (TCR). Антигенпрезентирующие клетки (искусственные антигенпрезентирующие клетки или aAPC) стабильно экспрессируют активаторный белокThe assays include two cell lines representing T effector cells (Jurkat-TIGIT) and antigen presenting cells. T effector cells stably express the luciferase reporter, which is activated downstream of the T cell receptor (TCR). Antigen-presenting cells (artificial antigen-presenting cells or aAPCs) stably express the activator protein
- 30 041301- 30 041301
T-клеток, который связывается и активирует T-эффекторную клетку, такую как Jurkat-TIGIT, антигеннезависимым образом (Promega). aAPC клетки также сконструированы для экспрессии CD155. Когда Tэффекторную клетку совместно культивируют с ее соответствующей aAPC клеткой, взаимодействие TIGIT с CD155 ингибирует активацию T-эффекторных клеток и уменьшает экспрессию люциферазы. Добавление анти-TIGIT блокирующего антитела высвобождает ингибиторный сигнал, делающий возможной экспрессию люциферазной активности.T cell that binds to and activates a T effector cell such as Jurkat-TIGIT in an antigen-independent manner (Promega). aAPC cells are also engineered to express CD155. When a T effector cell is co-cultured with its corresponding aAPC cell, the interaction of TIGIT with CD155 inhibits T effector cell activation and reduces luciferase expression. The addition of an anti-TIGIT blocking antibody releases an inhibitory signal allowing the expression of luciferase activity.
В этом анализе 16000 aAPC, которые экспрессируют человеческий CD155 и активаторный белок Tклеток (TCR Активатор CD155 CHO-K1) (Promega) высевали на 96-луночный планшет с половинным объемом лунок и инкубировали при 37°C в 5% CO2 инкубаторе в течение 24 ч. На следующий день 50000 человеческих Jurkat-TIGIT клеток совместно культивировали с TCR Активатор CD155 CHO-K1 в отсутствие или в присутствии HuTIG1-IgG1.AA или HuTIG3-IgG1.AA, начиная при 10 мкг/мл с двукратным серийным разведением, еще в течение 24 ч. Супернатанты собирали и секретированную люциферазу измеряли с использованием QUANTI-Luc (Invivogen) и многорежимного планшет-ридера (Perkin Elmer EnSpire) в виде относительных световых единиц. Для определения кратного изменения относительных световых единиц относительные световые единицы Jurkat-TIGIT, совместно культивированных с TCR Активатор CD155 CHO-K1 в присутствии различных концентраций анти-TIGIT антител, делили на относительные световые единицы в отсутствие антител. Поэтому в качестве примера 2-кратное увеличение (например, определенное в присутствии анти-TIGIT), таким образом, означает, что относительные световые единицы, измеренные в эксперименте, в два раза больше, чем количество, определенное в контрольных условиях, стимулированных только TCR-активатором.In this assay, 16,000 aAPCs that express human CD155 and T cell activator protein (TCR CD155 Activator CHO-K1) (Promega) were plated in a 96-well half-well plate and incubated at 37°C in a 5% CO2 incubator for 24 h. The next day, 50,000 human Jurkat-TIGIT cells were co-cultured with TCR CD155 Activator CHO-K1 in the absence or presence of HuTIG1-IgG1.AA or HuTIG3-IgG1.AA, starting at 10 μg/mL with 2-fold serial dilution, for another 24 hours Supernatants were harvested and secreted luciferase was measured using QUANTI-Luc (Invivogen) and a multi-mode plate reader (Perkin Elmer EnSpire) as relative light units. To determine the fold change in relative light units, the relative light units of Jurkat-TIGIT co-cultured with TCR Activator CD155 CHO-K1 in the presence of various concentrations of anti-TIGIT antibodies were divided by relative light units in the absence of antibodies. Therefore, by way of example, a 2-fold increase (e.g., determined in the presence of anti-TIGIT) thus means that the relative light units measured in the experiment are two times greater than the amount determined in control conditions stimulated with TCR alone. activator.
Как показано на фиг. 23, и HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA могли повышать естественную Tклеточную активирующую сигнализацию, как определено по увеличению относительных световых единиц, индуцированных в присутствии каждого блокирующего TIGIT антитела, от 0,6 мкг/мл до 10 мкг/мл, примерно с 1,5-2,5-кратным увеличением. Эти данные показывают, что анти-TIGIT антитела обладают антагонистической активностью, блокируя функцию TIGIT, и повышают естественную T-клеточную активность.As shown in FIG. 23, and HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA could increase natural T cell activating signaling, as determined by the increase in relative light units induced in the presence of each TIGIT blocking antibody, from 0.6 μg/mL to 10 μg/mL. approximately 1.5-2.5x magnification. These data show that anti-TIGIT antibodies have antagonistic activity, blocking TIGIT function, and increase natural T-cell activity.
Пример 14. Конкурентное связывание с TIGITExample 14 Competitive Binding with TIGIT
Проточную цитометрию используют для идентификации антитела, которое конкурирует с TIG1 за связывание с человеческим TIGIT. TIG1 метят флуоресцентным красителем FITC с использованием набора для FITC-мечения антител Pierce (Thermo Fisher Scientific) в соответствии с протоколом изготовителя. Связывание полученного FITC-меченного TIG1 с человеческим TIGIT исследуют методом проточной цитометрии с использованием NS0-hTIGIT клеток. Сто тысяч NS0-hTIGIT клеток инкубируют с различными концентрациями FITC-меченного TIG1, начиная с 10 мкг/мл и двукратных серийных разведений, в 200 мкл FACS Буфера (PBS, содержащий 0,5% бычьего сывороточного альбумина и 0,05% азида натрия) при 4°C в течение 30 мин. После промывки при помощи 2 мл FACS Буфера NS0-hTIGIT клетки суспендируют 0,2 мл FACS Буфера и подвергают анализу методом проточной цитометрии с использованием проточного цитометра FACScan (BD Biosciences, San Jose, CA) и получают среднеканальную флуоресценцию (MCF) при каждой концентрации антител. Субнасыщающую концентрацию, где достигается 90% от максимального уровня флуоресценции, определяют для FITC-меченного TIG1.Flow cytometry is used to identify an antibody that competes with TIG1 for binding to human TIGIT. TIG1 is labeled with a FITC fluorescent dye using a Pierce FITC antibody labeling kit (Thermo Fisher Scientific) according to the manufacturer's protocol. Binding of the resulting FITC-labeled TIG1 to human TIGIT was examined by flow cytometry using NS0-hTIGIT cells. One hundred thousand NS0-hTIGIT cells are incubated with various concentrations of FITC-labeled TIG1, starting at 10 µg/ml and 2-fold serial dilutions, in 200 µl FACS Buffer (PBS containing 0.5% bovine serum albumin and 0.05% sodium azide) at 4°C for 30 min. After washing with 2 ml of FACS Buffer NS0-hTIGIT, cells were suspended in 0.2 ml of FACS Buffer and subjected to flow cytometry analysis using a FACScan flow cytometer (BD Biosciences, San Jose, CA) and mean channel fluorescence (MCF) was obtained at each antibody concentration . The subsaturating concentration where 90% of the maximum fluorescence level is reached is determined for FITC-labeled TIG1.
Субнасыщающую концентрацию FITC-меченного TIG1 инкубируют со ста тысячами NS0-hTIGIT клеток в присутствии (или в отсутствие) 200-кратно более высокой концентрации испытываемого антитела в 200 мкл FACS Буфера при 4°C в течение 30 мин. Например, когда 0,1 мкг/мл FITC-меченного TIG1 используют для связывания с NS0-hTIGIT клетками, 20 мкг/мл испытываемого антитела добавляют к клеточной суспензии. В качестве фонового контроля сто тысяч NS0-hTIGIT клеток инкубируют без каких-либо антител. После промывки при помощи 2 мл FACS Буфера NS0-hTIGIT клетки суспендируют в 0,2 мл FACS Буфера и подвергают анализу методом проточной цитометрии.A subsaturating concentration of FITC-labeled TIG1 is incubated with one hundred thousand NS0-hTIGIT cells in the presence (or absence) of 200-fold higher concentration of test antibody in 200 µl of FACS Buffer at 4° C. for 30 minutes. For example, when 0.1 μg/ml of FITC-labeled TIG1 is used to bind to NS0-hTIGIT cells, 20 μg/ml of test antibody is added to the cell suspension. As a background control, one hundred thousand NS0-hTIGIT cells are incubated without any antibodies. After washing with 2 ml FACS Buffer, NS0-hTIGIT cells are suspended in 0.2 ml FACS Buffer and analyzed by flow cytometry.
MCF значение для клеток NS0-hTIGIT, инкубированных с FITC-меченным TIG1 [MCF A], нормализуют к 100%, и MCF значение для клеток NS0-hTIGIT, инкубированных без каких-либо антител [MCF B], нормализуют к 0%. MCF значение для клеток NS0-hTIGIT, инкубированных с FITC-меченным TIG1 и испытываемым антителом [MCF C], нормализуют с использованием следующей формулы: 100 х ([MCF C] - [MCF B])/([MCF A] - [MCF B]). Когда нормализованное значение MCF для NS0-hTIGIT, инкубированных с FITC-меченным TIG1 и испытываемым антителом, меньше чем 20%, испытываемое антитело определяется как конкурирующее с TIG1 за связывание с человеческим TIGIT.The MCF value for NS0-hTIGIT cells incubated with FITC-labeled TIG1 [MCF A] is normalized to 100%, and the MCF value for NS0-hTIGIT cells incubated without any antibodies [MCF B] is normalized to 0%. The MCF value for NS0-hTIGIT cells incubated with FITC-labeled TIG1 and test antibody [MCF C] is normalized using the following formula: 100 x ([MCF C] - [MCF B])/([MCF A] - [MCF B]). When the normalized MCF value for NS0-hTIGIT incubated with FITC-labeled TIG1 and test antibody is less than 20%, the test antibody is determined to compete with TIG1 for binding to human TIGIT.
Такой же анализ можно использовать для идентификации антител, которые конкурируют с TIG2 или TIG3.The same assay can be used to identify antibodies that compete with TIG2 or TIG3.
Пример 15. Измерение аффинностиExample 15 Affinity Measurement
Антигенсвязывающую аффинность моноклональных антител можно измерить при помощи безмаркерных оптических биосенсоров на эффекте поверхностного плазмонного резонанса (SPR), таких как Biacore T100 (GE Healthcare Life Sciences, Marlborough, MA), ProteOn XPR36 (BioRad, Hercules, CA), Octet RED384 (ForteBio, Menlo Park, CA) и IBIS MX96 (Wasatch Microfluidics, Salt Lake City, UT) (Yang et al., Anal. Biochem. 508:78-96, 2016). Аффинность связывания антигена для каждого из TIG1, TIG2 и TIG3 измеряли с использованием Biacore T100, как описано Yang et al. (supra). Белок A/G (Thermo Fisher ScienThe antigen-binding affinity of monoclonal antibodies can be measured using markerless surface plasmon resonance (SPR) optical biosensors such as Biacore T100 (GE Healthcare Life Sciences, Marlborough, MA), ProteOn XPR36 (BioRad, Hercules, CA), Octet RED384 (ForteBio, Menlo Park, CA) and IBIS MX96 (Wasatch Microfluidics, Salt Lake City, UT) (Yang et al., Anal. Biochem. 508:78-96, 2016). Antigen binding affinity for each of TIG1, TIG2 and TIG3 was measured using Biacore T100 as described by Yang et al. (supra). Protein A/G (Thermo Fisher Scien
- 31 041301 tific) иммобилизовали на проточных ячейках в CM5 сенсорном чипе (GE Healthcare Life Sciences) с использованием стандартного протокола связывания. Испытываемое антитело (TIG1, TIG2 или TIG3) захватывалось белком A/G на CM5 сенсорном чипе. Различные концентрации рекомбинантных человеческих TIGIT белков, таких как Рекомбинантный Человеческий TIGIT, His-меченный (Creative BioMart, Shirley, NY), использовали в потоке для связывания с испытываемым антителом на сенсорном чипе. Значения скорости ассоциации (ka) и скорости диссоциации (kd) взаимодействия между испытываемым антителом и человеческим TIGIT получали с использованием программы BIAevaluation (GE Healthcare Life Sciences). Константу ассоциации (Ka) рассчитывали путем деления скорости ассоциации (ka) на скорость диссоциации (kd) для каждого из TIG1, TIG2 и TIG3. Константу диссоциации (Kd) рассчитывали путем деления скорости диссоциации (kd) на скорость ассоциации (ka).- 31 041301 tific) were immobilized on flow cells in a CM5 sensor chip (GE Healthcare Life Sciences) using a standard binding protocol. The test antibody (TIG1, TIG2, or TIG3) was captured by the A/G protein on the CM5 sensor chip. Various concentrations of recombinant human TIGIT proteins, such as Recombinant Human TIGIT, His-tagged (Creative BioMart, Shirley, NY), were used on-line to bind to the sensor chip test antibody. Association rate (ka) and dissociation rate (kd) values for the interaction between test antibody and human TIGIT were obtained using the BIAevaluation program (GE Healthcare Life Sciences). The association constant (Ka) was calculated by dividing the association rate (ka) by the dissociation rate (kd) for each of TIG1, TIG2 and TIG3. The dissociation constant (Kd) was calculated by dividing the dissociation rate (kd) by the association rate (ka).
Исследования с использованием биосенсоров для HuTIG1-IgG1.AA осуществляли на BioRad ProteOn XPR36 системе в 10 мМ HEPES, 150 мМ NaCl, pH 7,4, 0,005% Tween-20 и 0,2 мг/мл BSA при 25°C. HuTIG1-IgG1.AA разбавляли до 3,7, 1,2 и 0,4 нМ и захватывали в течение 5 мин на GLM сенсорном чипе, покрытом ~10000 RU античеловеческого IgG антитела от GE. His-меченный растворимый рекомбинантный человеческий TIGIT (Cat # TIT-H52H3; Acro Biosystems, Newark, DE) испытывали при 100 нМ в виде наивысшей концентрации в 3-кратных серийных разведениях до 1,2 нМ. Данные от трех разных поверхностных плотностей антител глобально подгоняли к 1:1 модели взаимодействия с использованием локально установленного Rmax. Полученные скорость ассоциации (ka) и скорость диссоциации (kd) представляли собой (4,42 ± 0,02) х 105 М’с’1 и (4,09 ± 0,02) х 10-4 с-1 соответственно. Рассчитанная константа диссоциации (Kd) имела значение 925 ± 7 пМ.Biosensor studies for HuTIG1-IgG1.AA were performed on a BioRad ProteOn XPR36 system in 10 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7.4, 0.005% Tween-20, and 0.2 mg/mL BSA at 25°C. HuTIG1-IgG1.AA was diluted to 3.7, 1.2 and 0.4 nM and captured for 5 min on a GLM sensor chip coated with ˜10,000 RU of anti-human IgG antibody from GE. His-labeled soluble recombinant human TIGIT (Cat # TIT-H52H3; Acro Biosystems, Newark, DE) was tested at 100 nM at the highest concentration in 3-fold serial dilutions up to 1.2 nM. Data from three different antibody surface densities were globally fitted to a 1:1 interaction model using a locally set Rmax. The resulting association rate (ka) and dissociation rate (kd) were (4.42 ± 0.02) x 105 M's' 1 and (4.09 ± 0.02) x 10 -4 s -1 , respectively. The calculated dissociation constant (Kd) was 925 ± 7 pM.
Пример 16. Картирование эпитоповExample 16 Epitope Mapping
Для локализации эпитопа, распознаваемого каждым из TIG1, TIG2 и TIG3 в TIGIT молекуле, мутанты с одной аминокислотной заменой были образованы во внеклеточной области TIGIT (SEQ ID NO: 3) методом сайт-направленного мутагенеза с использованием ПЦР с перекрывающимися расширениями (Higuchi, R., 1989, в PCR Technology: Principles and Applications for DNA Amplification, Erlich H. A., ed., Stockton Press, New York, NY, pp 61-70). Для анализа использовали следующие шесть мутантов во внеклеточной области TIGIT: Q35A (SEQ ID NO: 50), N37A (SEQ ID NO: 51), Q39A (SEQ ID NO: 52), N49A (SEQ ID NO: 53), D51A (SEQ ID NO: 54) и F86A (SEQ ID NO: 55). Буква слева, цифра в середине и буква справа в названии каждого мутанта означают аминокислотный остаток в TIGIT дикого типа, расположение считая от N-концевого метионинового остатка во внеклеточной области TIGIT (SEQ ID NO: 3), и аминокислоту в мутанте, соответственно. Аминокислотные остатки обозначены однобуквенным кодом. Каждый из этих шести мутантов содержит аминокислотную замену вблизи области контакта TIGITCD155 комплекса (Stengel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109:5399-5404, 2012).To localize the epitope recognized by each of TIG1, TIG2, and TIG3 in the TIGIT molecule, single amino acid substitution mutants were generated in the extracellular region of TIGIT (SEQ ID NO: 3) by site-directed mutagenesis using overlap-extension PCR (Higuchi, R. , 1989, in PCR Technology: Principles and Applications for DNA Amplification, Erlich H. A., ed., Stockton Press, New York, NY, pp 61-70). The following six mutants in the TIGIT extracellular region were used for analysis: Q35A (SEQ ID NO: 50), N37A (SEQ ID NO: 51), Q39A (SEQ ID NO: 52), N49A (SEQ ID NO: 53), D51A (SEQ ID NO: 54) and F86A (SEQ ID NO: 55). The letter on the left, the number in the middle, and the letter on the right in the name of each mutant denote the amino acid residue in wild-type TIGIT, the location counting from the N-terminal methionine residue in the extracellular region of TIGIT (SEQ ID NO: 3), and the amino acid in the mutant, respectively. Amino acid residues are indicated by a one-letter code. Each of these six mutants contains an amino acid substitution near the junction of the TIGITCD155 complex (Stengel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109:5399-5404, 2012).
Вектор экспрессии млекопитающего pFCm179 имел такую же структуру, как pFCm404 (фиг. 1), за исключением того, что (i) ген пуромицин N-ацетилтрансферазы заменен геном ксантингуанинфосфорибозилтрансферазы E. coli, и (ii) внеклеточная область человеческого TIGIT заменена человеческим IL-15. ДНК фрагменты, кодирующие шесть включающих замену аланином мутантов внеклеточной области человеческого TIGIT, индивидуально встраивали в pFCm179 для замены IL-15-кодирующей области. Полученные векторы экспрессии, pFCm179-Q35A, pFCm179-N37A, pFCm179-Q39A, pFCm179-N49A, pFCm179-D51A и pFCm179-F86A, содержали Q35A, N37A, Q39A, N49A, D51A и F86A мутанты в TIGITкодирующей области, соответственно, и экспрессировали такую же последовательность TIGIT-Fc слитых белков, как кодируемая в pFCm4 04, за исключением одной аминокислотной замены, специфической для каждого мутанта.The mammalian expression vector pFCm179 had the same structure as pFCm404 (FIG. 1), except that (i) the puromycin N-acetyltransferase gene was replaced by the E. coli xanthineguanine phosphoribosyltransferase gene, and (ii) the extracellular region of human TIGIT was replaced with human IL-15 . DNA fragments encoding six human TIGIT extracellular region alanine substitution mutants were individually inserted into pFCm179 to replace the IL-15 coding region. The resulting expression vectors, pFCm179-Q35A, pFCm179-N37A, pFCm179-Q39A, pFCm179-N49A, pFCm179-D51A, and pFCm179-F86A, contained Q35A, N37A, Q39A, N49A, D51A, and F86A mutants in the TIGIT coding region, respectively, and expressed the following the same sequence of TIGIT-Fc fusion proteins as encoded in pFCm4 04, except for one amino acid substitution specific to each mutant.
Дикого типа и мутантные TIGIT-Fc слитые белки транзиентно экспрессировали в клеточной линии эмбриональных почек человека HEK293. HEK293 клетки выращивали в DMEM, содержащей 10% FCS, при 37°C в 7,5% CO2 инкубаторе. Векторы экспрессии дикого типа и мутантных TIGIT-Fc слитых белков (pFCm404, pFCm179-Q35A, pFCm179-N37A, pFCm179-Q39A, pFCm179-N49A, pFCm179-D51A и pFCm179-F86A) индивидуально трансфицировали в HEK293 клетки способом с использованием полиэтиленимина (Durocher et al. Nucl. Acids Res. 30: e9, 2002). Уровни продукции TIGIT-Fc слитых белков в культуральных супернатантах измеряли методом ELISA. Вкратце, ELISA планшет покрывали 100 мкл/лунка козлиным анти-человеким IgG Fc-специфическим поликлональным антителом (SigmaAldrich), 1/2000-разведенным в PBS, при 4°C в течение ночи, промывали промывочным буфером и блокировали ELISA Буфером 200 мкл/лунка в течение 20 мин при комнатной температуре. После промывки промывочным буфером культуральные супернатанты транзиентно трансфицированных HEK293 клеток, соответствующим образом разведенные в ELISA Буфере (100 мкл/лунка), наносили на ELISA планшет. Очищенный hTIGIT-Fc использовали в качестве стандарта. После инкубации ELISA планшета в течение 30 минпри комнатной температуре и промывки промывочным буфером определяли связанные Fc слитые белки с использованием 100 мкл/лунка HRP-конъюгированного козлиного анти-человекого IgG поликлонального антитела (SouthernBiotech), 12000-разведенного в ELISA Буфере. После инкубации планшета в течение 30 минут при комнатной температуре и промывки промывочным буфером инициировали проявление цвета путем добавления 100 мкл/лунка ABTS субстрата (Sigma-Aldrich) и останавливали приWild-type and mutant TIGIT-Fc fusion proteins were transiently expressed in the human embryonic kidney cell line HEK293. HEK293 cells were grown in DMEM containing 10% FCS at 37° C. in a 7.5% CO 2 incubator. Expression vectors for wild-type and mutant TIGIT-Fc fusion proteins (pFCm404, pFCm179-Q35A, pFCm179-N37A, pFCm179-Q39A, pFCm179-N49A, pFCm179-D51A and pFCm179-F86A) were individually transfected into HEK293 cells by the polyethyleneimine method (Durocher et al Nucl Acids Res 30: e9, 2002). Production levels of TIGIT-Fc fusion proteins in culture supernatants were measured by ELISA. Briefly, an ELISA plate was coated with 100 µl/well goat anti-human IgG Fc-specific polyclonal antibody (SigmaAldrich), 1/2000-diluted in PBS, at 4° C. overnight, washed with wash buffer and blocked with ELISA Buffer 200 µl/well for 20 min at room temperature. After washing with wash buffer, culture supernatants of transiently transfected HEK293 cells, appropriately diluted in ELISA Buffer (100 μl/well), were loaded onto an ELISA plate. Purified hTIGIT-Fc was used as a standard. After incubating the ELISA plate for 30 min at room temperature and washing with wash buffer, bound Fc fusion proteins were detected using 100 μl/well HRP-conjugated goat anti-human IgG polyclonal antibody (SouthernBiotech), 12,000-diluted in ELISA Buffer. After incubating the plate for 30 minutes at room temperature and washing with wash buffer, color development was initiated by adding 100 µl/well of ABTS substrate (Sigma-Aldrich) and stopped at
- 32 041301 помощи 100 мкл/лунка 2% щавелевой кислоты. Поглощение считывали при 405 нм.- 32 041301 Aid 100 µl/well 2% oxalic acid. Absorbance was read at 405 nm.
Связывание каждого из мышиных TIG1, TIG2 и TIG3 антител с TIGIT мутантами исследовали методом ELISA. ELISA планшет покрывали при помощи 100 мкл/лунка козлиным античеловеческим IgG Fc-специфическим поликлональным антителом (Sigma-Aldrich), 1/2000 разведенным в PBS, при 4°C в течение ночи, промывали промывочным буфером и блокировали 200 мкл/лунка ELISA Буфером в течение 20 мин при комнатной температуре. После промывки промывочным буфером 0,5 мкг/мл транзиентно экспрессируемых TIGIT-Fc слитых белков, содержащих либо TIGIT дикого типа, либо один из шести TIGIT мутантов, в ELISA Буфере (100 мкл/лунка) наносили на ELISA планшет в двух параллельных экспериментах для инкубации при комнатной температуре в течение 30 мин. В качестве отрицательного контроля использовали культуральные супернатанты нетрансфицированных HEK293 клеток. После промывки промывочным буфером наносили 100 мкл/лунка 200 нг/мл испытываемого антитела (TIG1, TIG2 или TIG3) в ELISA Буфере (100 мкл/лунка). После инкубации ELISA планшета в течение 30 минут при комнатной температуре и промывки промывочным буфером определяли связанные антитела с использованием 100 мкл/лунка HRP-конъюгированного козлиного поликлонального антитела к мышиной каппа цепи (Bethyl Laboratories, Montgomery, TX), 1/2000 разбавленного в ELISA Буфере. После инкубации планшета в течение 0,5 ч при комнатной температуре и промывки промывочным буфером инициировали проявление цвета путем добавления 100 мкл/лунка ABTS субстрата (Sigma-Aldrich) и останавливали при помощи 100 мкл/лунка 2% щавелевой кислоты. Поглощение считывали при 405 нм.The binding of each of the mouse TIG1, TIG2 and TIG3 antibodies to the TIGIT mutants was examined by ELISA. The ELISA plate was coated with 100 µl/well goat anti-human IgG Fc-specific polyclonal antibody (Sigma-Aldrich) 1/2000 diluted in PBS at 4° C. overnight, washed with wash buffer and blocked with 200 µl/well ELISA Buffer in for 20 min at room temperature. After washing with wash buffer 0.5 μg/ml transiently expressed TIGIT-Fc fusion proteins containing either wild-type TIGIT or one of the six TIGIT mutants in ELISA Buffer (100 μl/well) were applied to the ELISA plate in two parallel experiments for incubation at room temperature for 30 min. Culture supernatants of untransfected HEK293 cells were used as a negative control. After washing with wash buffer, 100 μl/well of 200 ng/ml of test antibody (TIG1, TIG2 or TIG3) was applied in ELISA Buffer (100 μl/well). After incubating the ELISA plate for 30 minutes at room temperature and washing with wash buffer, bound antibodies were determined using 100 μl/well HRP-conjugated goat anti-mouse kappa chain polyclonal antibody (Bethyl Laboratories, Montgomery, TX), 1/2000 diluted in ELISA Buffer . After incubating the plate for 0.5 h at room temperature and washing with wash buffer, color development was initiated by adding 100 µl/well of ABTS substrate (Sigma-Aldrich) and stopped with 100 µl/well of 2% oxalic acid. Absorbance was read at 405 nm.
Таблица 1. Связывание TIG1, TIG2 и TIG3 с TIGIT мутантамиTable 1 Binding of TIG1, TIG2 and TIG3 to TIGIT mutants
Относительное связывание с TIGIT (%)Relative binding to TIGIT (%)
Для каждого из TIG1, TIG2 и TIG3 относительное связывание с каждым TIGIT мутантом рассчитывали по следующей формуле. Среднее поглощение с дикого типа TIGIT-Fc слитыми белками [Abs A] нормализовали к 100%, и среднее поглощение с культуральными супернатантами нетрансфицированных HEK293 клеток [Abs B] нормализовали к 0%. Среднее поглощение с мутантным TIGIT-Fc слитым белком [Abs C] нормализовали с использованием следующей формулы: 100 х ([Abs C] - [Abs B])/([Abs A] [Abs B]). Результат представлен в табл. 1. Относительное связывание TIG1 было меньше чем 5%, когда аминокислотный остаток был заменен аланином в положении 35, 37, 49 или 51, указывая на то, что аминокислотные остатки в этих четырех положениях являются критичными для связывания TIG1 с TIGIT. Ни один из TIGIT мутантов, используемых в этом анализе, не устранял связывание TIG2 и TIG3 с TIGIT.For each of TIG1, TIG2 and TIG3, the relative binding to each TIGIT mutant was calculated using the following formula. The mean uptake from the wild-type TIGIT-Fc fusion proteins [Abs A] was normalized to 100%, and the average uptake from culture supernatants of untransfected HEK293 cells [Abs B] was normalized to 0%. Mean absorbance with the mutant TIGIT-Fc fusion protein [Abs C] was normalized using the following formula: 100 x ([Abs C] - [Abs B])/([Abs A] [Abs B]). The result is presented in table. 1. The relative binding of TIG1 was less than 5% when the amino acid residue was replaced with alanine at position 35, 37, 49, or 51, indicating that the amino acid residues at these four positions are critical for binding TIG1 to TIGIT. None of the TIGIT mutants used in this assay abolished TIG2 and TIG3 binding to TIGIT.
Пример 17. Повышенная секреция IFNy при добавлении HuTIG1-IgG1.AA, анти-PD-L1 антитела и HuTIG1-IgG1.AA в комбинации с анти-PD-L1 антителомExample 17 Increased IFNy secretion by the addition of HuTIG1-IgG1.AA, anti-PD-L1 antibody and HuTIG1-IgG1.AA in combination with anti-PD-L1 antibody
Человеческие PBMCs сначала выделяли из лейкоцитарной пленки путем наслаивания крови на градиентную среду (Lymphoprep; STEMCELL; 07801) и сбора PBMCs после центрифугирования из интерфазы. На следующей стадии человеческие моноциты выделяли из PBMCs путем CD14 положительной селекции (набор EasySep для положительной селекции человеческих CD14; STEMCELL; Cat# 18058) в соответствии с протоколом изготовителя и культивировали в течение шести дней в RPMI среде, дополненной 5% FBS и 0,1 мкг/мл GM-CSF (R&D; Cat# 215-GM-050/CF) и 0,1 мкг/мл IL-4 (R&D; Cat# 204-IL050/CF). Дифференцированные моноцитарные дендритные клетки (moDCs) собирали и проверяли на экспрессию CD155, CD112 и PD-L1 методом проточной цитометрии (фиг. 24).Human PBMCs were first isolated from the buffy coat by layering blood on gradient media (Lymphoprep; STEMCELL; 07801) and harvesting the PBMCs after centrifugation from interphase. In the next step, human monocytes were isolated from PBMCs by CD14 positive selection (EasySep human CD14 positive selection kit; STEMCELL; Cat# 18058) according to the manufacturer's protocol and cultured for six days in RPMI medium supplemented with 5% FBS and 0.1 µg/ml GM-CSF (R&D;Cat# 215-GM-050/CF) and 0.1 µg/ml IL-4 (R&D;Cat# 204-IL050/CF). Differentiated monocytic dendritic cells (moDCs) were harvested and checked for CD155, CD112 and PD-L1 expression by flow cytometry (FIG. 24).
Человеческие CD4+ клетки от 4 разных доноров выделяли из лейкоцитарных пленок путем отрицательного истощения (RosetteSep коктейль, обогащенный человеческими CD4 T-клетками; STEMCELL; #15062) и определяли чистоту методом проточной цитометрии.Human CD4+ cells from 4 different donors were isolated from buffy coats by negative depletion (RosetteSep cocktail enriched in human CD4 T cells; STEMCELL; #15062) and determined for purity by flow cytometry.
moDCs и CD4+ клетки объединяли в соотношени 1:4 (25000 moDCs; 100000 CD4+ клеток) и культивировали в течение четырех дней в бессывороточной среде (X-Vivo-20; LONZA; Cat# 04-448Q) в присутствии HuTIG1-IgG1.AA (5 мкг/мл или 15 мкг/мл) или анти-PD-L1 антитела (10 мкг/мл; клон 243,55.S1; SEQ ID NO: 56 & 57) или обоих HuTIG1-IgG1.AA (15 мкг/мл) и анти-PD-L1 антитела (10 мкг/мл) в течение 4 дней перед количественным анализом IFNy с использованием Цитометрического Анализа на Микросферах (CBA; Human IFNy Flex Set; BD; Cat# 560111). Человеческий IgG1 Fc (25 мкг/мл; BioXcell; Cat# BE0096) использовали в качестве контроля.moDCs and CD4+ cells were pooled in a 1:4 ratio (25,000 moDCs; 100,000 CD4+ cells) and cultured for four days in serum-free medium (X-Vivo-20; LONZA; Cat# 04-448Q) in the presence of HuTIG1-IgG1.AA ( 5 µg/mL or 15 µg/mL) or anti-PD-L1 antibody (10 µg/mL; clone 243.55.S1; SEQ ID NOs: 56 & 57) or both HuTIG1-IgG1.AA (15 µg/mL ) and anti-PD-L1 antibody (10 μg/mL) for 4 days prior to quantification of IFNy using a Cytometric Microsphere Assay (CBA; Human IFNy Flex Set; BD; Cat# 560111). Human IgG1 Fc (25 μg/ml; BioXcell; Cat# BE0096) was used as a control.
Как показано на фиг. 25, блокада HuTIG1-IgG1.AA и анти-PD-L1 антителом независимо повышала продукцию IFNy по сравнению с соответствующим изотипическим контрольным антителом. Комбинация HuTIG1-IgG1.AA с анти-PD-L1 антителом существенно и синергически повышала продукцию IFNy по сравнению с любой монотерапией, используемой отдельно.As shown in FIG. 25, blockade of HuTIG1-IgG1.AA and anti-PD-L1 antibody independently increased IFNy production compared to the corresponding isotype control antibody. The combination of HuTIG1-IgG1.AA with an anti-PD-L1 antibody significantly and synergistically increased IFNy production compared to any monotherapy used alone.
Пример 18. HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA распознают TIGIT, экспрессируемый на человеческих лимфоидных и миелоидных клеткахExample 18 HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA recognize TIGIT expressed on human lymphoid and myeloid cells
Суммарные человеческие PBMCs, выделенные у десяти доноров, совместно окрашивали непосредTotal human PBMCs isolated from ten donors were costained directly
- 33 041301 ственно конъюгированными антителами, разграничивая Т-клетки, B-клетки, NK-клетки и субпопуляции миелоидной линии. Мертвые клетки исключали с использованием набора для окрашивания Live/dead Fixable Aqua Dead Cell Stain kit. Экспрессию TIGIT определяли с использованием HuTIG1-IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA антител, конъюгированных с Alexa47 красителем. Экспрессию CD96 определяли с использованием коммерчески доступного анти-CD96 антитела (клон NK92,39). На фиг. 26A, знак плюс (+) означает экспрессию выше фоновой, а (+++) означает наивысшую наблюдаемую экспрессию. Знак плюс/минус (+/-)показывает, что только субпопуляция клеток в обозначенной популяции экспрессирует TIGIT или CD96 выше фонового значения, а знак минус (-) указывает на отсутствие экспрессии выше фоновой. Во всех случаях фоновое значение определяли с использованием модифицированного способа Fluorescence Minus One (FMO), в котором были добавлены все флуорохромы, используемые в окрашивающей панели, за исключением целевого антитела (т.е. HuTIG1-IgG1.AA, HuTIG3-IgG1.AA, анти-CD96 антитело). Наоборот, целевое антитело заменяли IgG специфическим изотипическим контрольным антителом такой же конфигурации. Фиг. 26B показывает репрезентативные гистограммы окрашивания антиTIGIT антителами в PBMCs при разных уровнях экспрессии, которые использовали для определения уровней экспрессии CD96 на фиг. 26A. Светлые гистограммы представляют модифицированный FMO. Темные гистограммы представляют HuTIG1-IgG1.AA или HuTIG3-IgG1.AA окрашивание.- 33 041301 directly conjugated antibodies, distinguishing between T-cells, B-cells, NK-cells and subpopulations of the myeloid lineage. Dead cells were excluded using the Live/dead Fixable Aqua Dead Cell Stain kit. TIGIT expression was determined using HuTIG1-IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA antibodies conjugated to Alexa47 dye. CD96 expression was determined using a commercially available anti-CD96 antibody (clone NK92.39). In FIG. 26A, a plus sign (+) means expression above background, and (+++) means the highest observed expression. A plus/minus sign (+/-) indicates that only a subpopulation of cells in the designated population expresses TIGIT or CD96 above background, and a minus sign (-) indicates no expression above background. In all cases, the background value was determined using a modified Fluorescence Minus One (FMO) method in which all fluorochromes used in the staining panel were added except for the target antibody (i.e. HuTIG1-IgG1.AA, HuTIG3-IgG1.AA, anti-CD96 antibody). Conversely, the target antibody was substituted for IgG with a specific isotype control antibody of the same configuration. Fig. 26B shows representative histograms of antiTIGIT antibody staining in PBMCs at different expression levels, which were used to determine CD96 expression levels in FIG. 26A. Light histograms represent modified FMO. Dark histograms represent HuTIG1-IgG1.AA or HuTIG3-IgG1.AA staining.
Диссоциированные опухолевые клетки из меланомы, колоректального злокачественного новообразования, немелкоклеточной карциномы легкого и светлоклеточной почечно-клеточной карциномы получали из коммерческого источника и окрашивали непосредственно конъюгированными антителами, разграничивая T-клетки и антигенпрезентирующие клеточные субпопуляции. Лейкоциты идентифицировали с использованием пан-изоформы анти-CD45 антитела (клон HI30). Мертвые клетки исключали с использованием набора для окрашивания Live/dead Fixable Aqua Dead Cell Stain kit. Экспрессию TIGIT определяли с использованием HuTIG1-IgG1.AA антитела, конъюгированного с Alexa47 красителем. Во всех случаях фоновое значение определяли с использованием модифицированного способа Fluorescence Minus One (FMO), в котором были добавлены все флуорохромы, используемые в окрашивающей панели, за исключением целевого антитела (т.е. HuTIG1-IgG1.AA). Наоборот, целевое антитело заменяли IgG специфическим изотипическим контрольным антителом такой же конфигурации. Фиг. 32B показывает репрезентативные гистограммы анти-TIGIT окрашивания на опухоль-инфильтрирующих лимфоцитах (TILs) при разных уровнях экспрессии, показанных на фиг. 32A. Светлые гистограммы представляют модифицированный FMO. Темные гистограммы представляют HuTIG1-IgG1.AA окрашивание.Dissociated tumor cells from melanoma, colorectal cancer, non-small cell lung carcinoma, and clear cell renal cell carcinoma were obtained from a commercial source and stained with directly conjugated antibodies, distinguishing between T cells and antigen presenting cell subpopulations. Leukocytes were identified using the pan isoform of the anti-CD45 antibody (clone HI30). Dead cells were excluded using the Live/dead Fixable Aqua Dead Cell Stain kit. TIGIT expression was determined using the HuTIG1-IgG1.AA antibody conjugated to the Alexa47 dye. In all cases, the background value was determined using a modified Fluorescence Minus One (FMO) method in which all fluorochromes used in the staining panel were added except for the target antibody (ie HuTIG1-IgG1.AA). Conversely, the target antibody was substituted for IgG with a specific isotype control antibody of the same configuration. Fig. 32B shows representative histograms of anti-TIGIT staining on tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) at various expression levels shown in FIG. 32A. Light histograms represent modified FMO. Dark histograms represent HuTIG1-IgG1.AA staining.
Пример 19. Картирование эпитопов античеловеческого TIGIT антитела HuTIG1-IgG1.AA методом проточной цитометрииExample 19 Epitope Mapping of the Anti-Human TIGIT Antibody HuTIG1-IgG1.AA by Flow Cytometry
Человеческую кДНК TIGIT клонировали в pcDNA 3.1 (+) с включающей 9 остатков гемагглютининовой (HA) пептидной меткой, с последующим состоящим из 10 остатков пептидным линкером, встроенным после состоящего из 21 остатка природного сигнального пептида и перед N-концом зрелого TIGIT белка (SEQ ID NO: 58). Аминокислотные остатки, представляющие интерес (T34, Q35, N37, E39, L44, I47, N49, D51, L52, H55, F86, I88, H90, Y92 и T96), во внеклеточной области человеческого TIGIT были мутированы в аланин, по одной аминокислоте за один раз. Плазмиды очищали и транзиентно трансфицировали в CHO-K1 клетки с использованием реагента Fugene 6 (Promega) для трансфекции в соответствии с рекомендациями изготовителя. Экспрессию HA-меченного человеческого TIGIT мутанта подтверждали путем детекции при помощи анти-HA антитела.Human TIGIT cDNA was cloned into pcDNA 3.1 (+) with a 9 residue hemagglutinin (HA) peptide tag followed by a 10 residue peptide linker inserted after the 21 residue natural signal peptide and before the N-terminus of the mature TIGIT protein (SEQ ID NO: 58). Amino acid residues of interest (T34, Q35, N37, E39, L44, I47, N49, D51, L52, H55, F86, I88, H90, Y92, and T96) in the extracellular region of human TIGIT were mutated to alanine, one amino acid each at once. Plasmids were purified and transiently transfected into CHO-K1 cells using Fugene 6 transfection reagent (Promega) according to the manufacturer's recommendations. Expression of the HA-labeled human TIGIT mutant was confirmed by detection with an anti-HA antibody.
Для анализа проточной цитометрии связывания анти-hTIGIT антитела с эпитопом, НА-меченные человеческие TIGIT белки с или без одиночной аминокислотной мутации транзиентно трансфицировали в CHO-K1 клетки. Через 24 часа трансфицированные клетки суспендировали в HBSS буфере (Thermo Fisher Scientific, Cat# 14175095) и инкубировали с HuTIG1-IgG1.AA антителом при меняющихся концентрациях в объеме 50 мкл. После инкубации в течение 1 часа при 4°C клетки промывали и осуществляли вторую инкубацию с 50 мкл Alexa488-конъюгированного античеловеческого IgG(H+L) вторичного антитела (Thermo Fisher Scientific, Cat#A-11013) для детекции клеток, связанных антителом. Клетки инкубировали с анти-HA антителом (Sigma, Cat# H7411) в качестве положительного контроля, а нетрансфицированные CHO-K1 клетки использовали в качестве отрицательного контроля. Клетки анализировали на Attune NxT цитометре (Thermo Fisher Scientific) и данные обрабатывали с использованием программы FlowJo. Для каждого мутанта MFI (средняя интенсивность флуоресценции) при связывании насыщающего антитела нормализовали к 100% POC (процент от контроля), и MFI для контроля с отсутствием связывания первичного антитела нормализовали к 0% POC. Данные затем использовали для получения нелинейной сигмоидальной кривой с 4 параметрами при помощи программы для подборки кривой GraphPad Prism 7 с использованием следующей формулы: Y=Нижняя точка+(Верхняя точка-Нижняя точка)/( 1 + 10((LogEC50x)*Угловой коэффициент Хилла))For flow cytometry analysis of anti-hTIGIT antibody epitope binding, HA-labeled human TIGIT proteins with or without single amino acid mutation were transiently transfected into CHO-K1 cells. After 24 hours, transfected cells were suspended in HBSS buffer (Thermo Fisher Scientific, Cat# 14175095) and incubated with HuTIG1-IgG1.AA antibody at varying concentrations in a 50 μl volume. After incubation for 1 hour at 4° C., cells were washed and a second incubation was performed with 50 μl of Alexa488-conjugated anti-human IgG(H+L) secondary antibody (Thermo Fisher Scientific, Cat#A-11013) to detect cells bound by the antibody. Cells were incubated with anti-HA antibody (Sigma, Cat# H7411) as a positive control and untransfected CHO-K1 cells were used as a negative control. Cells were analyzed on an Attune NxT cytometer (Thermo Fisher Scientific) and data was processed using FlowJo software. For each mutant, the MFI (mean fluorescence intensity) for saturation antibody binding was normalized to 100% POC (percentage of control), and the MFI for the control with no primary antibody binding was normalized to 0% POC. The data was then used to generate a non-linear 4-parameter sigmoid curve using GraphPad Prism 7 curve fitting software using the following formula: Y=Lowpoint+(Highpoint-Lowpoint)/( 1 + 10((LogEC50x)*Hill Slope ))
В этом анализе HuTIG1-IgG1.AA связывался с человеческим TIGIT дикого типа с EC50=1,28 нМ. Пять из пятнадцати одноточечных аланиновых TIGIT мутантов связывались с HuTIG1-IgG1.AA с более чем 10-кратным снижением аффинности связывания. Человеческий TIGIT (SEQ ID NO: 3) с мутациями N49A, D51A, Н9ОА, N37A или Q35A связывался с HuTIG1-IgG1.AA с активностью, уменьшающейся в следующем диапазоне EC50=17,7 до 176 нМ, соответственно (фиг. 27). Все из этих остатков коIn this assay, HuTIG1-IgG1.AA bound human wild-type TIGIT with an EC 50 =1.28 nM. Five of the fifteen single point alanine TIGIT mutants bound to HuTIG1-IgG1.AA with over a 10-fold reduction in binding affinity. Human TIGIT (SEQ ID NO: 3) with N49A, D51A, H9OA, N37A, or Q35A mutations bound HuTIG1-IgG1.AA with activity decreasing in the following range of EC 50 =17.7 to 176 nM, respectively (FIG. 27) . All of these remnants
- 34 041301 локализуются к одной дискретной области на передней β-листовой структуре IgV внеклеточного домена TIGIT (фиг. 28).- 34 041301 are localized to one discrete region on the anterior β-sheet structure of the IgV extracellular domain of TIGIT (Fig. 28).
Пример 20. Ex vivo Иммунофенотипирование T-клеточных субпопуляций из цельной крови отличных от человека приматов, которым вводили HuTIG1-IgG1.AAExample 20 Ex vivo Immunophenotyping of T cell subpopulations from whole blood of non-human primates injected with HuTIG1-IgG1.AA
Фармакокинетическое исследование осуществляли в Charles River Laboratories (Reno, NV). Целью этого исследования было исследование ex vivo образцов цельной крови от обезьян cynomolgus, которым вводили одну дозу 10 мг/кг анти-TIGIT (HuTIG1-IgG1.AA) антитела для опосредованной оценки занятости рецепторов для TIGIT.The pharmacokinetic study was carried out at Charles River Laboratories (Reno, NV). The aim of this study was to examine ex vivo whole blood samples from cynomolgus monkeys treated with a single dose of 10 mg/kg anti-TIGIT (HuTIG1-IgG1.AA) antibody to indirectly evaluate TIGIT receptor occupancy.
Трем ранее не подверженным экспериментам самкам обезьян cynomolgus (#67, #68 & #69) вводили разовую внутривенную дозу 10 мг/кг HuTIG1-IgG1.AA антитела. Образцы цельной крови в натрий гепарине получали в течение 24 ч после последнего сбора образцов в точках времени, которые соответствовали следующим: пред-дозовая, Дни 1, 2, 7, 14, 21 и 28 после введения дозы. Для исследования цельной крови методом проточной цитометрии флуоресцентно меченное анти-человеческое TIGIT от BioLegend (клон MBSA43) использовали для определения уровней экспрессии TIGIT на клеточных субпопуляциях лимфоцитов крови обезьян cynomolgus, поскольку, как было показано, они перекрестно реагируют с нечеловеческими приматами (PLoS Pathog. 2016 Jan; 12(1); BioLegend). Живые клетки получали при помощи FACSCalibur и анализировали с использованием программы FlowJo.Three previously unexperimented female cynomolgus monkeys (#67, #68 E) were given a single intravenous dose of 10 mg/kg HuTIG1-IgG1.AA antibody. Whole blood samples in sodium heparin were obtained within 24 hours of the last sample collection at time points that corresponded to the following: pre-dose, Days 1, 2, 7, 14, 21 and 28 post-dose. For whole blood flow cytometric testing, BioLegend's fluorescently labeled anti-human TIGIT (clone MBSA43) was used to determine levels of TIGIT expression on cell subpopulations of cynomolgus monkey blood lymphocytes, as they have been shown to cross-react with non-human primates (PLoS Pathog. 2016 Jan; 12(1); BioLegend). Live cells were obtained using FACSCalibur and analyzed using the program FlowJo.
Анти-TIGIT (MBSA43) было способно связываться как с CD4+, так и с CD8+ T-клеточными субпопуляциями при окрашивании пред-дозовых образцов цельной крови. После введения дозы анти-TIGIT (MBSA43) было неспособно обнаруживать экспрессию TIGIT на этих T-клеточных субпопуляциях вплоть до Дня 14 или 21, в зависимости от разных исследуемых обезьян, при этом уровни возвращались к пред-дозовым уровням обнаружения к Дню 21 или 28, в зависимости от разных исследуемых животных (фиг. 29B & 30B). Причиной этой неспособности обнаруживать экспрессию TIGIT не были существенные изменения частоты CD4+ или CD8+ T-клеток (фиг. 29A & 30A соответственно), из чего можно заключить, что это было из-за занятости поверхности TIGIT обрабатываемым антителом (HuTIG1IgG1.AA), а не из-за истощения T-клеточной субпопуляции.Anti-TIGIT (MBSA43) was able to bind to both CD4+ and CD8+ T cell subpopulations when staining pre-dose whole blood samples. Following a dose of anti-TIGIT (MBSA43), it was unable to detect TIGIT expression on these T-cell subpopulations until Day 14 or 21, depending on the different monkeys studied, with levels returning to pre-dose detection levels by Day 21 or 28, depending on the different animals studied (FIGS. 29B & 30B). This failure to detect TIGIT expression was not due to significant changes in the frequency of CD4+ or CD8+ T cells (FIGS. 29A & 30A, respectively), suggesting that this was due to occupancy of the TIGIT surface by the treated antibody (HuTIG1IgG1.AA) rather than due to the depletion of the T-cell subpopulation.
Эти данные подтверждают, что анти-TIGIT антитело HuTIG1-IgG1.AA является перекрестнореактивным у обезьян cynomolgus, и использование античеловеческого TIGIT от BioLegend (клон MBSA43) обеспечивает оценку занятости TIGIT рецептора.These data confirm that the anti-TIGIT antibody HuTIG1-IgG1.AA is cross-reactive in cynomolgus monkeys, and the use of BioLegend's anti-human TIGIT (clone MBSA43) provides an estimate of TIGIT receptor occupancy.
Пример 21. Повышенная NK-клеточноопосредованная цитотоксичность, вызванная HuTIG1IgG1.AA и HuTIG3-IgG1.AA на K562 клетках-мишеняхExample 21 Increased NK cell-mediated cytotoxicity induced by HuTIG1IgG1.AA and HuTIG3-IgG1.AA on K562 target cells
Анализ NK-клеточноопосредованной цитотоксичности, описанный в Примере 10, повторяли с использованием очищенных NK клеток вместо PBMCs. Для получения достаточных и подходящих очищенных NK клеток для этих экспериментов важно осуществить скрининг на донорные PBMCs с высокой NK-клеточной частотой, достаточной экспрессией TIGIT на поверхности и достаточной экспрессией CD226. Получали LeukoPak периферической крови (состоящие из 10 миллиардов клеток или больше) и осуществляли выделение NK клеток с использованием Miltenyi autoMACS Pro Separator в соответствии с инструкциями изготовителя (Miltenyi Biotec, catalog#130-092-657). Очищенные NK клетки peсуспендировали в среде, содержащей интерлейкин-2 (IL-2) [200 единиц/мл], в 6-луночных планшетах. 6луночные планшеты помещали в 5% CO2 инкубатор при 37°C на 24 ч перед осуществлением исследований естественной цитотоксичности с клетками, собранными из лунок.The NK cell mediated cytotoxicity assay described in Example 10 was repeated using purified NK cells instead of PBMCs. To obtain sufficient and suitable purified NK cells for these experiments, it is important to screen for donor PBMCs with high NK cell frequency, sufficient surface TIGIT expression, and sufficient CD226 expression. LeukoPak peripheral blood (consisting of 10 billion cells or more) was prepared and NK cell isolation was performed using the Miltenyi autoMACS Pro Separator according to the manufacturer's instructions (Miltenyi Biotec, catalog#130-092-657). Purified NK cells were resuspended in medium containing interleukin-2 (IL-2) [200 units/ml] in 6-well plates. The 6-well plates were placed in a 5% CO 2 incubator at 37° C. for 24 hours before carrying out natural cytotoxicity studies with cells harvested from the wells.
Лизис K562 клеток, опосредованный очищенными NK клетками, измеряли с и без анти-TIGIT антитела (TIG1). NK клетки культивировали в RPMI 1640 среде (Invitrogen) в присутствии интерлейкина-2 (IL-2) [200 единиц/мл] (Peprotech) в течение ночи при 37°C в 5% CO2 инкубаторе. На следующий день K562 клетки метили CFSE и совместно культивировали 1:20 с NK клетками (Мишень^^ одна K562 клетка на двадцать NK клеток) в течение 4 ч при 37°C в 5% CO2 инкубаторе в присутствии 10 мкг/мл Ритуксана или гуманизированных анти-TIGIT антител (HuTIG1-IgG1.AA или HuTIG3-IgG1.AA). Ритуксан использовали в качестве отрицательного контроля, поскольку K562 клетки не экспрессируют CD20. После инкубации клетки собирали и окрашивали при помощи 5 нМ Sytox Красного (ThermoFisher) для различения мертвых клеток-мишеней при помощи (CFSE+ Sytox Красный+). Проценты K562 клетокмишеней, лизированных NK-клетками, определяли методом проточной цитометрии (FACSCalibur; Анализ FlowJo).K562 cell lysis mediated by purified NK cells was measured with and without anti-TIGIT antibody (TIG1). NK cells were cultured in RPMI 1640 medium (Invitrogen) in the presence of interleukin-2 (IL-2) [200 units/ml] (Peprotech) overnight at 37°C in a 5% CO2 incubator. The next day, K562 cells were labeled with CFSE and co-cultured 1:20 with NK cells (Target^^ one K562 cell per twenty NK cells) for 4 h at 37°C in a 5% CO2 incubator in the presence of 10 μg/ml Rituxan or humanized anti-TIGIT antibodies (HuTIG1-IgG1.AA or HuTIG3-IgG1.AA). Rituxan was used as a negative control because K562 cells do not express CD20. After incubation, cells were harvested and stained with 5 nM Sytox Red (ThermoFisher) to distinguish between dead target cells with (CFSE+ Sytox Red+). The percentages of K562 target cells lysed with NK cells were determined by flow cytometry (FACSCalibur; FlowJo Analysis).
Как показано на фиг. 31, при использовании очищенных NK клеток добавление анти-TIGIT антител повышало NK-клеточно-опосредованную природную цитотоксичность K562 клеток, демонстрируя, что анти-TIGIT антитела (HuTIG1-IgG1.AA или HuTIG3-IgG1.AA) обладают способностью повышать уровень киллинга клеток-мишеней (на 28 или 19%, соответственно, по сравнению с нормализованными процентами Без Антителаили с Ритуксаном) субпопуляцией человеческих эффекторных клеток.As shown in FIG. 31, when using purified NK cells, the addition of anti-TIGIT antibodies increased the NK cell-mediated intrinsic cytotoxicity of K562 cells, demonstrating that anti-TIGIT antibodies (HuTIG1-IgG1.AA or HuTIG3-IgG1.AA) have the ability to increase cell killing- targets (by 28% or 19%, respectively, compared to normalized percentages Without Antibody or with Rituxan) by a subpopulation of human effector cells.
- 35 041301- 35 041301
ПоследовательностиSequences
SEQ ID NO:1: Аминокислотная последовательность зрелого человеческого TIGIT:SEQ ID NO:1: Amino acid sequence of mature human TIGIT:
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPLLG AMAATLWICTAVIVWALTRKKKALRIHSVEGDLRRKSAGQEEWSPSAPSPPGSCVQAEAAPA GLCGEQRGEDCAELHDYFNVLSYRSLGNCSFFTETGMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPLLG AMAATLWICTAVIVWALTRKKKALRIHSVEGDLRRKSAGQEEWSPSAPSPPGTGSCVQAEAAPA GLCGEQRGEDCAELHDLCFNVLSYRS
SEQ ID NO:2: Аминокислотная последовательность сигнального пептида выше внеклеточной области человеческого TIGIT:SEQ ID NO:2: Amino acid sequence of the signal peptide upstream of the extracellular region of human TIGIT:
MGWSWIFFFLLSGTASVLSMGWSWIFFFLLSGTASVLS
SEQ ID NO:3: Аминокислотная последовательность внеклеточной области человеческого TIGIT (hTIGIT):SEQ ID NO:3: Amino acid sequence of human TIGIT extracellular region (hTIGIT):
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPSFKDRV APGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPSFKDRV APGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTG
SEQ ID NO:4: Аминокислотная последовательность полипептидного линкера непосредственно ниже от hTIGIT: TGGGSEQ ID NO:4: Amino acid sequence of polypeptide linker immediately downstream from hTIGIT: TGGG
SEQ ID NO:5: Аминокислотная последовательность человеческой γΐ Fc области:SEQ ID NO:5: Amino acid sequence of the human γΐ Fc region:
EPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEVK FNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISK AKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDG SFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEVK FNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISK AKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYVMKTTFSVLDCSPGQHLSK
SEQ ID NO:6: Аминокислотная последовательность внеклеточной области человеческого CD155:SEQ ID NO:6: Amino acid sequence of human CD155 extracellular region:
DWVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSY SESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAE VQKVQL Т GE PVPMARCVS Т GGRPPAQITWHS DLGGMPNT S QVPGFL S GTVTVT S LWILVP S S QV DGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYN WSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGMSR NADWVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSY SESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAE VQKVQL Т GE PVPMARCVS Т GGRPPAQITWHS DLGGMPNT S QVPGFL S GTVTVT S LWILVP S S QV DGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYN WSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGMSR NA
SEQ ID NO:7: Аминокислотная последовательность внеклеточной области человеческого CD155, слитой с Fc областью человеческой γΐ цепи (hCD155-Fc):SEQ ID NO:7: Amino acid sequence of human CD155 extracellular region fused to human γΐ chain Fc region (hCD155-Fc):
DWVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSY SESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAE VQKVQL Т GE PVPMARCVS Т GGRPPAQITWHS DLGGMPNT S QVPGFL S GTVTVT S LWILVP S S QV DGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYN WSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGMSR NATGGGEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEV KFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTIS KAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSD GSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKDWVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSY SESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAE VQKVQL Т GE PVPMARCVS Т GGRPPAQITWHS DLGGMPNT S QVPGFL S GTVTVT S LWILVP S S QV DGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYN WSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGMSR NATGGGEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEV KFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTIS KAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSD GSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO:8: Аминокислотная последовательность FLAG пептидаSEQ ID NO:8: Amino acid sequence of FLAG peptide
- 36 041301 (FLAG): DYKDDDDK- 36 041301 (FLAG): DYKDDDDK
SEQ ID NO:9: Аминокислотная последовательность сигнала связывания гликозилфосфатидилинозита человеческого CD55 (GPI): PNKGSGTTSGTTRLLSGHTCFTLTGLLGTLVTMGLLTSEQ ID NO:9: Amino acid sequence of human CD55 glycosylphosphatidylinositol (GPI) binding signal: PNKGSGTTSGTTRLLSGHTCFTLTGLLGTLVTMGLLT
SEQ ID NO:10: Аминокислотная последовательность TIG1 VH: DVQLVESGGGLVQPGGSRKLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPEKGLEWVAFISSGSSSIYYADTV KGRFTISRDNPKNTLFLQMTSLRSEDTAMYYCARMRLDYYAMDYWGQGTSVTVSSSEQ ID NO:10: TIG1 VH amino acid sequence: DVQLVESGGGLVQPGGSRKLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPEKGLEWVAFISSGSSSIYYADTV KGRFTISRDNPKNTLFLQMTSLRSEDTAMYYCARMRLDYYAMDYWGQGTSVTVSS
SEQ ID NO:11: Аминокислотная последовательность TIG1 VH CDR1: NFGMHSEQ ID NO:11: TIG1 VH CDR1 amino acid sequence: NFGMH
SEQ ID NO :12: Аминокислотная последовательность TIG1 VHSEQ ID NO:12: Amino acid sequence of TIG1 VH
CDR2: FISSGSSSIYYADTVKGCDR2: FISSGSSSIYYADTVKG
SEQ ID NO:13: Аминокислотная последовательность TIG1 VHSEQ ID NO:13: TIG1 VH amino acid sequence
CDR3: MRLDYYAMDYCDR3: MRLDYYAMDY
SEQ ID NO:14: Аминокислотная последовательность TIG1 VL: DVQITQSPSYLAASPGETITINCRASKSISKYLAWYQEKPGKTNKLLIYSGSTLQSGIPSRFSG SGSGTDFTLTISSLEPEDFAMYYCQQHNEYPWTFGGGTKLEIKSEQ ID NO:14: TIG1 VL amino acid sequence: DVQITQSPSYLAASPGETITINCRASKSISKYLAWYQEKPGKTNKLLIYSGSTLQSGIPSRFSG SGSGTDFTLTISSLEPEDFAMYYCQQHNEYPWTFGGGTKLEIK
SEQ ID NO :15: Аминокислотная последовательность TIG1 VL CDR1: RASKSISKYLASEQ ID NO:15: TIG1 VL CDR1 amino acid sequence: RASKSISKYLA
SEQ ID NO :16: Аминокислотная последовательность TIG1 VLSEQ ID NO:16: Amino acid sequence of TIG1 VL
CDR2: SGSTLQSCDR2: SGSTLQS
SEQ ID NO :17: Аминокислотная последовательность TIG1 VLSEQ ID NO:17: Amino acid sequence of TIG1 VL
CDR3: QQHNEYPWTCDR3: QQHNEYPWT
SEQ ID NO:18: Аминокислотная последовательность TIG2 VH: EVQLQQSGPELVKPGASVKISCKTSGYTFTEYTMHWVKQSHGKNLEWIGGINPNNGGTSYNQKF KGRATLTVDKS S S TAYMELRSLTSDDSAVYYCARPGWYNYAMDYWGQGT SVTVSSSEQ ID NO:18: TIG2 VH amino acid sequence: EVQLQQSGPELVKPGASVKISCKTSGYTFTEYTMHWVKQSHGKNLEWIGGINPNNGGTSYNQKF KGRATLTVDKS S S TAYMELRSLTSDDSAVYYCARPGWYNYAMDYWGQGT SVTVSS
SEQ ID NO :19: Аминокислотная последовательность TIG2 VH CDR1: EYTMHSEQ ID NO:19: TIG2 VH CDR1 amino acid sequence: EYTMH
SEQ ID NO :20: Аминокислотная последовательность TIG2 VHSEQ ID NO:20: Amino acid sequence of TIG2 VH
CDR2: GINPNNGGTSYNQKFKGCDR2: GINPNNGGTSYNQKFKG
SEQ ID NO :21: Аминокислотная последовательность TIG2 VHSEQ ID NO:21: Amino acid sequence of TIG2 VH
CDR3: PGWYNYAMDYCDR3: PGWYNYAMDY
SEQ ID NO:22: Аминокислотная последовательность TIG2 VL: DIVMTQSHKFMSTSVGDRVNITCKASQGVSTAVAWYQQKPGQSPKLLIYSASYRYTGVPDRFTG SGSGTDFTFTISSVQAEDLAVYHCQQHYITPWTFGGGTKLEIKSEQ ID NO:22: TIG2 VL Amino Acid Sequence: DIVMTQSHKFMSTSVGDRVNITCKASQGVSTAVAWYQQKPGQSPKLLIYSASYRYTGVPDRFTG SGSGTDFTFTISSVQAEDLAVYHCQQHYITPWTFGGGTKLEIK
SEQ ID NO :23: Аминокислотная последовательность TIG2 VL CDR1: KASQGVSTAVASEQ ID NO:23: TIG2 VL CDR1 amino acid sequence: KASQGVSTAVA
- 37 041301- 37 041301
SEQ ID NO:24: Аминокислотная последовательность TIG2 VLSEQ ID NO:24: Amino acid sequence of TIG2 VL
CDR2: SASYRYTCDR2: SASYRYT
SEQ ID NO:25: Аминокислотная последовательность TIG2 VLSEQ ID NO:25: Amino acid sequence of TIG2 VL
CDR3: QQHYITPWTCDR3: QQHYITPWT
SEQ ID NO:26: Аминокислотная последовательность TIG3 VH: EVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFAFSDYDMSWVRQTPEKRLEWVAYISDGGYNTYYPDTV KGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKSEDTAIYYCARQILLRYYFDYWGQGTTLTVSSSEQ ID NO:26: TIG3 VH amino acid sequence: EVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFAFSDYDMSWVRQTPEKRLEWVAYISDGGYNTYYPDTV KGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKSEDTAIYYCARQILLRYYFDYWGQGTTLTVSS
SEQ ID NO:27: Аминокислотная последовательность TIG3 VH CDR1: DYDMSSEQ ID NO:27: TIG3 VH CDR1 amino acid sequence: DYDMS
SEQ ID NO:28: Аминокислотная последовательность TIG3 VHSEQ ID NO:28: TIG3 VH amino acid sequence
CDR2: YISDGGYNTYYPDTVKGCDR2: YISDGGYNTYYPDTVKG
SEQ ID NO:29: Аминокислотная последовательность TIG3 VHSEQ ID NO:29: TIG3 VH amino acid sequence
CDR3: QILLRYYFDYCDR3: QILLRYYFDY
SEQ ID NO:30: Аминокислотная последовательность TIG3 VL: DIVMSQSPSSLAVSVGEKVTMTCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASTRESGV PDRFTGSGSGTDFTLTISSVKAEDLAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKLEIKSEQ ID NO:30: TIG3 VL amino acid sequence: DIVMSQSPSSLAVSVGEKVTMTCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASTRESGV PDRFTGSGSGTDFTLTISSVKAEDLAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKLEIK
SEQ ID NO:31: Аминокислотная последовательность TIG3 VL CDR1: KSSQSLLYSSNQKNYLASEQ ID NO:31: TIG3 VL CDR1 amino acid sequence: KSSQSLLYSSNQKNYLA
SEQ ID NO:32: Аминокислотная последовательность TIG3 VLSEQ ID NO:32: Amino acid sequence of TIG3 VL
CDR2: WASTRESCDR2: WASTERS
SEQ ID NO:33: Аминокислотная последовательность TIG3 VLSEQ ID NO:33: Amino acid sequence of TIG3 VL
CDR3: QQYHSYPWTCDR3: QQYHSYPWT
SEQ ID NO :34: Аминокислотная последовательность сконструированной гуманизированной TIG1 VH (HuTIGl VH): MDSRLNLVFLVLILKGVQCEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGL EWVAFISSGSSSIYYADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYW GQGTMVTVSSSEQ ID NO:34: Humanized engineered TIG1 VH (HuTIGl VH) amino acid sequence: MDSRLNLVFLVLILKGVQCEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGL EWVAFISSGSSSIYYADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYW GQGTMVTVSS
SEQ ID NO :35: Аминокислотная последовательность зрелой HuTIGl VH:SEQ ID NO:35: Amino acid sequence of mature HuTIGl VH:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIY YADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIY YADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSS
SEQ ID NO:36: Аминокислотная последовательность сконструированной гуманизированной TIG1 VL (HuTIGl VL): MRFQVQVLGLLLLWISGAQCDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAP KLLIYSGSTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIKSEQ ID NO:36: Humanized engineered TIG1 VL (HuTIGl VL) amino acid sequence: MRFQVQVLGLLLLWISGAQCDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAP KLLIYSGSTLQSGVPSRFSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIK
SEQ ID NO :37: Аминокислотная последовательность зрелойSEQ ID NO:37: Amino acid sequence of mature
- 38 041301- 38 041301
HuTIGl VL:HuTIGl VL:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIKDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIK
SEQ ID NO :38: Нуклеотидная последовательность синтетического HuTIGl VH гена в pHuTIGl.AA:SEQ ID NO:38: Nucleotide sequence of the synthetic HuTIGl VH gene in pHuTIGl.AA:
ACTAGTACCACCATGGACTCCAGGCTCAATCTGGTTTTCCTTGTCCTTATTCTGAAAGG CGTCCAGTGTGAAGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCCTGGTGCAGCCTGGAGGGTCCCTG AGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAACTTTGGAATGCACTGGGTTCGACAGG CTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGGTCGCATTCATTAGTAGTGGCAGTAGTTCCATCTACTATGC AGACACAGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACAGCCTGTACCTGCAA ATGAACAGTCTGAGGGCTGAGGACACTGCCGTGTATTACTGTGCAAGAATGAGACTGGATTACT ATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCATGGTCACCGTCTCCTCAGGTAAGTATGGCCTCTA AGCTTACTAGTACCACCATGGACTCCAGGCTCAATCTGGTTTTCCTTGTCCTTATTCTGAAAGG CGTCCAGTGTGAAGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCCTGGTGCAGCCTGGAGGGTCCCTG AGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAACTTTGGAATGCACTGGGTTCGACAGG CTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGGTCGCATTCATTAGTAGTGGCAGTAGTTCCATCTACTATGC AGACACAGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACAGCCTGTACCTGCAA ATGAACAGTCTGAGGGCTGAGGACACTGCCGTGTATTACTGTGCAAGAATGAGACTGGATTACT ATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCATGGTCACCGTCTCCTCAGGTAAGTATGGCCTCTA AGCTT
SEQ ID NO :39: Нуклеотидная последовательность синтетического HuTIGl VL гена в pHuTIGl.AA:SEQ ID NO:39: Nucleotide sequence of the synthetic HuTIGl VL gene in pHuTIGl.AA:
GCTAGCACCACCATGAGGTTCCAGGTTCAGGTTCTGGGGCTCCTTCTGCTCTGGATCTC AGGAGCCCAGTGTGATATCCAGATGACCCAGTCTCCATCTTCTCTTTCTGCATCTGTTGGAGAT AGAGTCACTATTACTTGCAGGGCAAGTAAGAGCATTAGCAAATATCTGGCCTGGTATCAACAGA AACCTGGGAAAGCTCCTAAGCTGCTTATCTACTCTGGGTCCACTTTGCAATCTGGAGTTCCATC AAGATTCAGTGGCAGTGGATCTGGTACAGATTTCACTCTCACCATCAGTAGCCTGCAGCCTGAA GATTTTGCAACCTATTACTGTCAACAGCATAATGAATACCCCTGGACCTTCGGCGGAGGCACCA AAG T C GAAAT СAAAC G TAAG TAGAAT С CAAAGAATT CGCTAGCACCACCATGAGGTTCCAGGTTCAGGTTCTGGGGCTCCTTCTGCTCTGGATCTC AGGAGCCCAGTGTGATATCCAGATGACCCAGTCTCCATCTTCTCTTTCTGCATCTGTTGGAGAT AGAGTCACTATTACTTGCAGGGCAAGTAAGAGCATTAGCAAATATCTGGCCTGGTATCAACAGA AACCTGGGAAAGCTCCTAAGCTGCTTATCTACTCTGGGTCCACTTTGCAATCTGGAGTTCCATC AAGATTCAGTGGCAGTGGATCTGGTACAGATTTCACTCTCACCATCAGTAGCCTGCAGCCTGAA GATTTTGCAACCTATTACTGTCAACAGCATAATGAATACCCCTGGACCTTCGGCGGAGGCACCA AAG T C GAAAT СAAAC G TAAG TAGAAT С CAAAGAATT C
SEQ ID NO:40: Аминокислотная последовательность зрелой гамма тяжелой цепи HuTIGl-IgGl.АА, кодируемой в pHuTIGl.AA: EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIYYADTV KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSSASTKGPSVF PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSWTVPS SSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMIS RTPEVTCVWDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKE YKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG КSEQ ID NO:40: Аминокислотная последовательность зрелой гамма тяжелой цепи HuTIGl-IgGl.АА, кодируемой в pHuTIGl.AA: EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIYYADTV KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSSASTKGPSVF PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSWTVPS SSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMIS RTPEVTCVWDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKE YKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG К
SEQ ID NO:41: Аминокислотная последовательность зрелой каппа легкой цепи HuTIGl-IgGl.АА, кодируемой в pHuTIGl.AA: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVPSRFSG SGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGSEQ ID NO:41: Amino acid sequence of the mature HuTIGl-IgGl.AA light chain kappa encoded in pHuTIGl.AA:
- 39 041301- 39 041301
TASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVY ACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVY ACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO:42: Аминокислотная последовательность сконструированной гуманизированной TIG3 VH (HuTIG3 VH): MNFGLRLIFLVLTLKGVNCEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGL EWVAYISDGGYNTYYPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYW GQGTTVTVSSSEQ ID NO:42: Humanized engineered TIG3 VH (HuTIG3 VH) amino acid sequence: MNFGLRLIFLVLTLKGVNCEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGL EWVAYISDGGYNTYYPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDVSS
SEQ ID NO :43: Аминокислотная последовательность зрелой HuTIG3 VH:SEQ ID NO:43: Amino acid sequence of mature HuTIG3 VH:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTY YPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTY YPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO:44: Аминокислотная последовательность сконструированной гуманизированной TIG3 VL (HuTIG3 VL): MDSQAQVLMLLLLWVSGTCGDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQ KPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGT KVEIKSEQ ID NO:44: Humanized engineered TIG3 VL (HuTIG3 VL) amino acid sequence: MDSQAQVLMLLLLWVSGTCGDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQ KPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGT KVEIK
SEQ ID NO :45: Аминокислотная последовательность зрелой HuTIG3 VL:SEQ ID NO:45: Amino acid sequence of mature HuTIG3 VL:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWAST RESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIKDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWAST RESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIK
SEQ ID NO:46: Нуклеотидная последовательность синтетического HuTIG3 VH гена в pHuTIG3.AA:SEQ ID NO:46: Nucleotide sequence of the synthetic HuTIG3 VH gene in pHuTIG3.AA:
ACTAGTACCACCATGAACTTTGGGCTCAGATTGATTTTCCTTGTCCTTACTCTGAAAGG CGTGAACTGTGAAGTCCAGCTCGTGGAGTCTGGGGGAGGCCTTGTGCAGCCTGGAGGGTCCCTG AGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCGCTTTCAGTGACTATGACATGTCTTGGGTTCGCCAGG CTCCTGGCAAGGGGCTGGAGTGGGTCGCATACATTAGTGATGGCGGTTATAACACCTACTATCC AGACACTGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAA ATGAACAGTCTGAGGGCTGAGGACACAGCCGTCTATTACTGTGCAAGACAAATTCTGCTGCGGT ACTACTTTGACTACTGGGGCCAAGGCACCACTGTCACAGTCTCCTCAGGTGAGTCCTTAAAACA AGCTTACTAGTACCACCATGAACTTTGGGCTCAGATTGATTTTCCTTGTCCTTACTCTGAAAGG CGTGAACTGTGAAGTCCAGCTCGTGGAGTCTGGGGGAGGCCTTGTGCAGCCTGGAGGGTCCCTG AGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCGCTTTCAGTGACTATGACATGTCTTGGGTTCGCCAGG CTCCTGGCAAGGGGCTGGAGTGGGTCGCATACATTAGTGATGGCGGTTATAACACCTACTATCC AGACACTGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAA ATGAACAGTCTGAGGGCTGAGGACACAGCCGTCTATTACTGTGCAAGACAAATTCTGCTGCGGT ACTACTTTGACTACTGGGGCCAAGGCACCACTGTCACAGTCTCCTCAGGTGAGTCCTTAAAACA AGCTT
SEQ ID NO :47: Нуклеотидная последовательность синтетического HuTIG3 VL гена в pHuTIG3.AA:SEQ ID NO:47: Nucleotide sequence of the synthetic HuTIG3 VL gene in pHuTIG3.AA:
GCTAGCACCACCATGGATTCACAGGCCCAGGTTCTTATGCTGCTGCTGCTCTGGGTTTC TGGAACCTGTGGGGACATTCAGATGACACAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCCTCAGTTGGAGAC AGGGTTACTAT СAC С T G CAAG T С CAG T CAGAG TCTTCTGTATAGTAG СAAT CAAAAGAAC TACT TGGCCTGGTACCAGCAGAAACCAGGGAAGGCTCCTAAACTGCTGATTTACTGGGCATCCACTAGGCTAGCACCACCATGGATTCACAGGCCCAGGTTCTTATGCTGCTGCTGCTCTGGGTTTC TGGAACCTGTGGGGACATTCAGATGACAACAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCCTCAGTTGGAGAC AGGGTTACTAT CAC C T G CAAG T C CAG T CAGAG TCTTCTGTATAGTAG CAAAT CAAAAGAAC TACT TGGCCTTGGCGTACCAGCAGAAACCACTACTGGAAGGATTCACT
- 40 041301- 40 041301
GGAATCTGGGGTCCCTAGTCGCTTCTCAGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATC AGCAGTCTGCAGCCTGAAGACTTCGCAGTTTATTACTGTCAGCAATATCATAGCTATCCCTGGA CCTTCGGCGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAACGTAAGTAGAATCCAAAGAATTCGGAATCTGGGGTCCCTAGTCGCTTCTCAGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATC AGCAGTCTGCAGCCTGAAGACTTCGCAGTTTATTACTGTCAGCAATATCATAGCTATCCCTGGA CCTTCGGCGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAACGTAAGTAGAATCCAAAGAATTC
SEQ ID NO:48: Аминокислотная последовательность зрелой гамма тяжелой цепи HuTIG3-IgGl.АА, кодируемод в pHuTIG3.AA: EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTYYPDTV KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVF PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSWTVPS SSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMIS RTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKE YKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG КSEQ ID NO:48: Аминокислотная последовательность зрелой гамма тяжелой цепи HuTIG3-IgGl.АА, кодируемод в pHuTIG3.AA: EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTYYPDTV KGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVF PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSWTVPS SSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMIS RTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKE YKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG К
SEQ ID NO:49: Аминокислотная последовательность зрелой каппа легкой цепи HuTIG3-IgGl.АА, кодируемод в pHuTIG3.AA: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGV PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSD EQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADY EKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECSEQ ID NO:49: Аминокислотная последовательность зрелой каппа легкой цепи HuTIG3-IgGl.АА, кодируемод в pHuTIG3.AA: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGV PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSD EQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADY EKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO :50: Аминокислотные последовательности внеклеточной области человеческого TIGIT с Q35A мутацией:SEQ ID NO:50: Amino acid sequences of the extracellular region of human TIGIT with Q35A mutation:
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTAVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTAVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTG
SEQ ID NO :51: Аминокислотные последовательности внеклеточной области человеческого TIGIT с N37A мутацией:SEQ ID NO:51: Amino acid sequences of the extracellular region of human TIGIT with N37A mutation:
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVAWEQQDQLLAICNADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVAWEQQDQLLAICNADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTG
SEQ ID NO :52: Аминокислотные последовательности внеклеточной области человеческого TIGIT с Q39A мутацией:SEQ ID NO:52: Amino acid sequences of the extracellular region of human TIGIT with Q39A mutation:
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWAQQDQLLAICNADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWAQQDQLLAICNADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTG
SEQ ID NO :53: Аминокислотные последовательности внеклеточной области человеческого TIGIT с N49A мутацией:SEQ ID NO:53: Amino acid sequences of the extracellular region of human TIGIT with N49A mutation:
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICAADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICAADLGWHISPS FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTG
SEQ ID NO :54: Аминокислотные последовательностиSEQ ID NO:54: Amino acid sequences
- 41 041301 внеклеточной области человеческого TIGIT с D51A мутацией:- 41 041301 extracellular region of human TIGIT with D51A mutation:
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNAALGWHISPSMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNAALGWHISPS
FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGFKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTG
SEQ ID NO:55: Аминокислотные последовательности внеклеточной области человеческого TIGIT с F86A мутацией:SEQ ID NO:55: Amino acid sequences of the extracellular region of human TIGIT with F86A mutation:
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPSMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPS
FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYACIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGFKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYACIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTG
SEQ ID NO:56: Аминокислотная последовательность зрелой тяжелой цепи анти-человеческого PD-L1 антителаSEQ ID NO:56: Amino acid sequence of mature heavy chain of anti-human PD-L1 antibody
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTY YADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSAASTKG PSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSW TVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDT LMISRTPEVTCVWDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRWSVLTVLHQDWL NGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIA VEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLS LSPGEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTY YADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSAASTKG PSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSW TVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDT LMISRTPEVTCVWDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRWSVLTVLHQDWL NGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIA VEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLS LSPG
SEQ ID NO:57: Аминокислотная последовательность зрелой легкой цепи анти-человеческого PD-L1 антителаSEQ ID NO:57: Amino acid sequence of mature light chain of anti-human PD-L1 antibody
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLFTPPTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDE QLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYE KHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLFTPPTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDE QLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYVTHNKSSFQACE
SEQ ID NO:58: Аминокислотная последовательность сигнального, НА tag и линкерного пептидов, слитых со зрелым человеческим TIGIT:SEQ ID NO:58: Amino acid sequence of signal, HA tag and linker peptides fused to mature human TIGIT:
MRWCLLLIWAQGLRQAPLASGYPYDVPDYAGGGGSGGGGSMMTGTIETTGNISAEKGGSMRWCLLLIWAQGLRQAPLASGYPYDVPDYAGGGGSGGGGSMMTGTIETTGNISAEKGGS
IILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPSFKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTG EYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPLLGAMAATLWICTAVIVWALTRKKK ALRIHSVEGDLRRKSAGQEEWSPSAPSPPGSCVQAEAAPAGLCGEQRGEDCAELHDYFNVLSYR SLGNCSFFTETGIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPSFKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTG EYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPLLGAMAATLWICTAVIVWALTRKKK ALRIHSVEGDLRRKSAGQEEWSPSAPSPPGSCVQAEAAPAGLCGEQRGEDCAELHDYFNVLSYR SLGNCSFFTETG
SEQ ID NO:59: Аминокислотная последовательность внеклеточной области человеческого TIGIT, слитой с Fc областью γΐ цепи человеческого иммуноглобулина (hTIGIT-Fc):SEQ ID NO:59: Amino acid sequence of human TIGIT extracellular region fused to human immunoglobulin γΐ chain Fc region (hTIGIT-Fc):
MMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPSMMTGTIETTGNISAEKGGSIILQCHLSSTTAQVTQVNWEQQDQLLAICNADLGWHISPS
- 42 041301- 42 041301
FKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGT GGGEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEVKFN WYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAK GQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSF FLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKFKDRVAPGPGLGLTLQSLTVNDTGEYFCIYHTYPDGTYTGRIFLEVLESSVAEHGARFQIPTGT GGGEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEVKFN WYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAK GQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSF FLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO :60: Аминокислотная последовательность зрелой гамма тяжелой цепи HuTIGl-IgGl.Q:SEQ ID NO:60: HuTIGl-IgGl.Q mature gamma heavy chain amino acid sequence:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIY YADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSSASTK GPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSV VTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKD TLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYQSTYRVVSVLTVLHQDW LNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDI AVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSL SLSPGKEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIY YADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVSSASTK GPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSV VTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKD TLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYQSTYRVVSVLTVLHQDW LNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDI AVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSL SLSPGK
SEQ ID NO:61: Аминокислотная последовательность зрелой гамма тяжелой цепи HuTIGl-IgG4.Р:SEQ ID NO:61: HuTIGl-IgG4.P mature gamma heavy chain amino acid sequence:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIYEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFGMHWVRQAPGKGLEWVAFISSGSSSIY
YADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVS SASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLY SLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKP KDTLMISRTPEVTCVWDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRWSVLTVLHQ DWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPS DIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQK SLSLSLGKYADTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARMRLDYYAMDYWGQGTMVTVS SASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLY SLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKP KDTLMISRTPEVTCVWDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRWSVLTVLHQ DWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPS DIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQK SLSLSLGK
SEQ ID NO :62: Аминокислотная последовательность зрелой гамма тяжелой цепи HuTIG3-IgGl.Q:SEQ ID NO:62: HuTIG3-IgGl.Q mature gamma heavy chain amino acid sequence:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTY YPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSASTK GPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSV VTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKD TLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYQSTYRVVSVLTVLHQDW LNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDI AVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSL SLSPGKEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTY YPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSASTK GPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSV VTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKD TLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYQSTYRVVSVLTVLHQDW LNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDI AVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSL SLSPGK
SEQ ID NO :63: Аминокислотная последовательность зрелой гамма тяжелой цепи HuTIG3-IgG4.Р:SEQ ID NO:63: HuTIG3-IgG4.P mature gamma heavy chain amino acid sequence:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTY YPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSASTK GPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSV VTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLM ISRTPEVTCVWDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRWSVLTVLHQDWLNG KEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVE WESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLS LGKEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYDMSWVRQAPGKGLEWVAYISDGGYNTY YPDTVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARQILLRYYFDYWGQGTTVTVSSASTK GPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSV VTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLM ISRTPEVTCVWDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRWSVLTVLHQDWLNG KEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVE WESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLS LGK
SEQ ID NO :64: Аминокислотная последовательность зрелой каппа легкой цепи HuTIGl-IgGl.Q и HuTIGl-IgG4.Р:SEQ ID NO:64: Amino acid sequence of mature HuTIGl-IgGl.Q and HuTIGl-IgG4.P light chain kappa light chain:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDE QLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYE KHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASKSISKYLAWYQQKPGKAPKLLIYSGSTLQSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHNEYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDE QLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYVTHGLNSPVACE
SEQ ID NO :65: Аминокислотная последовательность зрелой каппа легкой цепи HuTIG3-IgGl.Q и HuTIG3-IgG4.Р:SEQ ID NO:65: Amino acid sequence of mature kappa light chain HuTIG3-IgGl.Q and HuTIG3-IgG4.P:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGV PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSD EQLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADY EKHKVYACEVTHQGLS S PVTKS FNRGE СDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGV PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQYHSYPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSD EQLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSGETYSLTLVGLSKADY PACEVK
Claims (33)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62/304,045 | 2016-03-04 | ||
US62/413,025 | 2016-10-26 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA041301B1 true EA041301B1 (en) | 2022-10-05 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11723971B2 (en) | Antibodies to TIGIT | |
ES2774320T3 (en) | Anti-TIGIT antibodies, anti-PVRIG antibodies and combinations thereof | |
TWI814525B (en) | Cd70 binding molecules and methods of use thereof | |
KR20170128234A (en) | Antibodies specific for ROR1 and chimeric antigen receptors | |
US11820824B2 (en) | Antibodies to TIGIT | |
CN113286819A (en) | anti-BTN 3A antibodies and their use in treating cancer or infectious disorders | |
KR20200083598A (en) | Antibodies specific for immunoglobulin-like transcript 3 (ILT3) and uses thereof | |
US20220306752A1 (en) | Epha2 antibodies | |
EA041301B1 (en) | ANTIBODIES TO TIGIT | |
NZ785761A (en) | Antibodies to TIGIT | |
BR122024004584A2 (en) | ANTI-TIGIT ANTIBODY AND ITS USE, MONOCLONAL ANTIBODY THAT COMPETES WITH ANY ONE OF TIG1, TIG2 OR TIG3 FOR BINDING TO HUMAN TIGIT AND ITS USE AND PHARMACEUTICAL COMPOSITION | |
WO2024035341A1 (en) | Cd30 antigen-binding molecules |