EA040943B1 - ANTIBODIES TO CD154 AND METHODS FOR THEIR APPLICATION - Google Patents
ANTIBODIES TO CD154 AND METHODS FOR THEIR APPLICATION Download PDFInfo
- Publication number
- EA040943B1 EA040943B1 EA201890434 EA040943B1 EA 040943 B1 EA040943 B1 EA 040943B1 EA 201890434 EA201890434 EA 201890434 EA 040943 B1 EA040943 B1 EA 040943B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- seq
- antibody
- antibodies
- antigen
- human
- Prior art date
Links
Description
Перекрестные ссылки на смежные заявкиCross references to related applications
Заявка испрашивает преимущество по предварительной заявке на патент США сер. № 62/367,660, поданной 28 июля 2016 г., и предварительной заявке на патент США сер. № 62/201,150, поданной 5 августа 2015 г., все содержимое которых полностью включено в настоящий документ путем ссылки.The application claims benefit from U.S. Provisional Application Ser. No. 62/367,660, filed July 28, 2016, and U.S. Provisional Application Ser. No. 62/201,150, filed August 5, 2015, the entire contents of which are hereby incorporated by reference in their entirety.
Область применения изобретенияScope of the invention
Настоящее изобретение относится к антителам, специфически связывающим CD154, полинуклеотидам, кодирующим данные антитела или фрагменты, а также способам получения и применения указанных продуктов.The present invention relates to antibodies that specifically bind CD154, polynucleotides encoding these antibodies or fragments, as well as methods for obtaining and using these products.
Предпосылки создания изобретенияPrerequisites for the creation of the invention
CD154, также именуемый лигандом CD40 (CD40L), др39, родственный TNF активирующий белок (TRAP), антиген 5c8 или T-BAM, представляет собой тримерный трансмембранный белок из суперсемейства факторов некроза опухолей (TNF). CD154 экспрессируется зависимым от активации и ограниченным по времени образом на поверхности T-клеток CD4+. CD154 также экспрессируется после активации в субпопуляции T-клеток CD8+, базофилах, тучных клетках, эозинофилах, естественных киллерных клетках, B-клетках, макрофагах, дендритных клетках и тромбоцитах. CD154 также присутствует в крови в растворимой форме.CD154, also referred to as CD40 ligand (CD40L), dr39, TNF-related activating protein (TRAP), antigen 5c8 or T-BAM, is a trimeric transmembrane protein from the tumor necrosis factors (TNF) superfamily. CD154 is expressed in an activation-dependent and time-limited manner on the surface of CD4 + T cells. CD154 is also expressed after activation in a subset of CD8+ T cells, basophils, mast cells, eosinophils, natural killer cells, B cells, macrophages, dendritic cells, and platelets. CD154 is also present in the blood in a soluble form.
CD154 связывается с CD40 на антигенпрезентирующих клетках (APC), приводя к различным ответам, в зависимости от типа клетки-мишени. Взаимодействие CD40-CD154 необходимо для нормальных взаимодействий T- и B-клеток, в том числе, для повышения костимуляции, праймирования T-клеток, продукции цитокинов, переключения классов антител, созревания аффинности и продукции антител и аутоантител.CD154 binds to CD40 on antigen presenting cells (APCs), leading to different responses, depending on the type of target cell. The CD40-CD154 interaction is essential for normal T- and B-cell interactions, including increased costimulation, T-cell priming, cytokine production, antibody class switching, affinity maturation, and antibody and autoantibody production.
Показано, что нарушение работы пути CD40/CD154 при помощи блокады CD154 является полезным при аутоиммунных заболеваниях, таких как системная красная волчанка (СКВ), ревматоидный артрит (РА), рассеянный склероз (PC), воспалительное заболевание кишечника (ВЗК), диабет I типа (T1D) и отторжение аллотрансплантата. У человека мутации либо в CD40, либо в CD154 приводят к синдрому гипер-IgM, характеризующемуся недостаточностью изотипов IgG или IgA (Aruffo et al., Cell 72:291, 1993).Disruption of the CD40/CD154 pathway via CD154 blockade has been shown to be beneficial in autoimmune diseases such as systemic lupus erythematosus (SLE), rheumatoid arthritis (RA), multiple sclerosis (MS), inflammatory bowel disease (IBD), type I diabetes (T1D) and allograft rejection. In humans, mutations in either CD40 or CD154 result in a hyper-IgM syndrome characterized by a deficiency of IgG or IgA isotypes (Aruffo et al., Cell 72:291, 1993).
Антитела к CD154 были описаны, например, в международных патентных публикациях № WO1993/08207, WO1994/10308, WO1996/40918, WO1993/009812, WO1999/051258, WO1995/006480, WO1995/006481, WO1995/006666, WO2001/002057, W01997/017446, WO1999/012566, WO2001/068860, WO2005/003175, WO2006/033702, WO2006/030220, WO2008/118356, WO2012/052205, WO2012/138768, WO2012/138768, WO2013/055745 и WO2013/056068.Антитела к CD154 были описаны, например, в международных патентных публикациях № WO1993/08207, WO1994/10308, WO1996/40918, WO1993/009812, WO1999/051258, WO1995/006480, WO1995/006481, WO1995/006666, WO2001/002057, W01997 /017446, WO1999/012566, WO2001/068860, WO2005/003175, WO2006/033702, WO2006/030220, WO2008/118356, WO2012/052205, Wo2012/138768, Wo2013/055 and Wo20168.
Показано, что антитела к CD154 эффективны при лечении аутоиммунных заболеваний у человека. Однако наблюдаемая при лечении тромбоэмболия, из-за активации тромбоцитов, препятствует длительным клиническим исследованиям. Показано, что причиной активации тромбоцитов антителом 5c8 к CD154 является взаимодействие с FcyRIIa на тромбоцитах (Xie et al., J Immunol 192:4083-4092, 2014).It has been shown that antibodies to CD154 are effective in the treatment of autoimmune diseases in humans. However, thromboembolism observed during treatment, due to platelet activation, hinders long-term clinical studies. It has been shown that the cause of platelet activation by anti-CD154 antibody 5c8 is interaction with FcyRIIa on platelets (Xie et al., J Immunol 192:4083-4092, 2014).
Таким образом, существует потребность в дополнительных антителах к CD154 с улучшенными профилями безопасности и эффективности.Thus, there is a need for additional anti-CD154 antibodies with improved safety and efficacy profiles.
Изложение сущности изобретенияStatement of the Invention
В изобретении предлагается антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее человеческий CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее определяющую комплементарность область тяжелой цепи (HCDR) 1 с SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 с SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG) и HCDR3 с SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), причем необязательно остаток S1 HCDR1 мутирован в A, C, D, E, G, I, K, L, M, N, Q, R, T или V;The invention provides an antagonistic antibody or antigen-binding site thereof that specifically binds human CD154 with SEQ ID NO: 1, containing a heavy chain complementarity determining region (HCDR) 1 with SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 with SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG ) and HCDR3 of SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), optionally HCDR1 residue S1 mutated to A, C, D, E, G, I, K, L, M, N, Q, R, T, or V;
остаток I4 HCDR1 мутирован в M, L или V;residue I4 HCDR1 mutated to M, L, or V;
остаток S5 HCDR1 мутирован в A;residue S5 HCDR1 mutated in A;
остаток S3 HCDR2 мутирован в A, T или V;residue S3 HCDR2 mutated in A, T or V;
остаток P4 HCDR2 мутирован в V, T, L Q или E;the P4 HCDR2 residue is mutated to V, T, L Q, or E;
остаток N8 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;the N8 HCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
остаток T9 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;the T9 HCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
остаток N10 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;the N10 HCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
остаток S1 HCDR3 мутирован в A или M;residue S1 HCDR3 mutated to A or M;
остаток R2 HCDR3 мутирован в A, S, Q или K; и остаток L7 HCDR3 мутирован в M.the R2 residue of HCDR3 is mutated to A, S, Q, or K; and the L7 residue of HCDR3 is mutated in M.
В изобретении также предлагается выделенное антагонистическое антитело, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, причем антитело содержит определенные аминокислотные последовательности вариабельной области тяжелой цепи (VH) и вариабельной области легкой цепи (VL), описанные в настоящем документе.The invention also provides an isolated antagonist antibody specifically binding to CD154 of SEQ ID NO: 1, wherein the antibody comprises the defined heavy chain variable region (VH) and light chain variable region (VL) amino acid sequences described herein.
В изобретении также предлагается выделенное антагонистическое антитело, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, причем антитело содержит определенные аминокислотные последовательности HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3, описанные в настоящем документе.The invention also provides an isolated antagonist antibody specifically binding to CD154 of SEQ ID NO: 1, the antibody comprising the specific amino acid sequences HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 and LCDR3 described herein.
В изобретении также предлагается выделенное антагонистическое антитело, специфически связы- 1 040943 вающее CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащееThe invention also provides an isolated antagonist antibody specifically binding to CD154 of SEQ ID NO: 1, comprising
HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23, 30, 37, 44 и 52, соответственно;HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 and LCDR3 with SEQ ID NO: 17, 23, 30, 37, 44 and 52, respectively;
VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66; или тяжелую цепь с SEQ ID NO: 80 и легкую цепь с SEQ ID NO: 81.VH with SEQ ID NO: 59 and VL with SEQ ID NO: 66; or a heavy chain of SEQ ID NO: 80 and a light chain of SEQ ID NO: 81.
В изобретении также предлагается выделенное антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, причем CD154 представляет собой гомотример, а антитело связывает первый мономер CD154 в гомотримере в пределах аминокислотных остатков 182-207 CD154 и второй мономер CD154 в гомотримере в пределах аминокислотных остатков 176-253 CD154, при этом нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 1.The invention also provides an isolated antagonistic antibody or antigen-binding site thereof specifically binding CD154 with SEQ ID NO: 1, wherein CD154 is a homotrimer and the antibody binds the first CD154 monomer in the homotrimer within amino acid residues 182-207 of CD154 and the second CD154 monomer in the homotrimer within amino acid residues 176-253 of CD154, while the numbering of the residues corresponds to SEQ ID NO: 1.
В изобретении также предлагается иммуноконъюгат, содержащий антитело или антигенсвязывающий участок антитела изобретения, связанный с терапевтическим агентом или визуализирующим агентом.The invention also provides an immunoconjugate containing an antibody or antigen-binding site of an antibody of the invention associated with a therapeutic agent or imaging agent.
В изобретении также предложена фармацевтическая композиция, содержащая антитело изобретения и фармацевтически приемлемый носитель.The invention also provides a pharmaceutical composition comprising an antibody of the invention and a pharmaceutically acceptable carrier.
В изобретении также предлагается полинуклеотид, кодирующий VH антитела изобретения, VL антитела изобретения или VH и VL антитела изобретения.The invention also provides a polynucleotide encoding the VH of an antibody of the invention, the VL of an antibody of the invention, or the VH and VL of an antibody of the invention.
В изобретении также предлагается вектор, содержащий полинуклеотид изобретения.The invention also provides a vector containing the polynucleotide of the invention.
В изобретении также предлагается клетка-хозяин, содержащая вектор изобретения.The invention also provides a host cell containing the vector of the invention.
В изобретении также предлагается способ продуцирования антитела, включающий культивирование клетки-хозяина изобретения в условиях экспрессии антитела и выделение антитела, продуцированного клеткой-хозяином.The invention also provides a method for producing an antibody, comprising culturing a host cell of the invention under antibody expression conditions and isolating the antibody produced by the host cell.
В изобретении также предлагается способ лечения аутоиммунного заболевания или иммуноопосредованного воспалительного заболевания, включающий введение терапевтически эффективного количества выделенного антитела изобретения или фармацевтической композиции изобретения требующему лечения пациенту в течение времени, достаточного для лечения заболевания.The invention also provides a method of treating an autoimmune disease or an immune-mediated inflammatory disease, comprising administering a therapeutically effective amount of an isolated antibody of the invention or a pharmaceutical composition of the invention to a patient in need of treatment for a time period sufficient to treat the disease.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, связывающееся с антителом изобретения.The invention also provides an anti-idiotypic antibody that binds to an antibody of the invention.
В изобретении также предлагается набор, содержащий антитело изобретения.The invention also provides a kit containing an antibody of the invention.
Краткое описание чертежейBrief description of the drawings
На фиг. 1 показано влияние Fc антитела на активацию тромбоцитов иммунными комплексами (IC) CD154:антитело. IC растворимого человеческого CD154 (shCD154, обозначен на фигуре как SCD40L) и антитела 5c8 к CD154 (изотип IgG1) (IC 5c8IgG1) активировал тромбоциты, тогда как IC shCD154 и 5c8, клонированного на заглушенных IgG1-каркасах IgG1sigma, IgG1sigma-YTE, IgG2sigma или IgG2sigmaYTE (5c8IgG1z, 5c8IgG1z-YTE, 5c8IgG2z или 5c8IgG2z-YTE, соответственно) влияния не оказывал. Активацию тромбоцитов оценивали как % экспрессирующих PAC-1 (антитело PAC-1 специфически распознает конформационно активную форму интегрина αΠΒβ3) и CD62p (экспрессия P-селектина на поверхности) тромбоцитов от их общего числа. ADP (аденозинтрифосфат): положительный контроль. PBS (фосфатно-солевой буфер): отрицательный контроль. Активацию тромбоцитов оценивали у пяти доноров. Результаты представлены как среднее по каждому эксперименту ± CO.In FIG. 1 shows the effect of antibody Fc on platelet activation by immune complexes (IC) CD154:antibody. The IC of soluble human CD154 (shCD154, labeled SCD40L in the figure) and the 5c8 anti-CD154 (IgG1 isotype) antibody (IC 5c8IgG1) activated platelets, while the IC of shCD154 and 5c8 cloned on muted IgG1 scaffolds IgG1sigma, IgG1sigma-YTE, IgG2sigma or IgG2sigmaYTE (5c8IgG1z, 5c8IgG1z-YTE, 5c8IgG2z or 5c8IgG2z-YTE, respectively) had no effect. Platelet activation was assessed as the percentage of platelets expressing PAC-1 (PAC-1 antibody specifically recognizes the conformationally active form of αΠΒβ3 integrin) and CD62p (expression of P-selectin on the surface) of their total number. ADP (adenosine triphosphate): positive control. PBS (phosphate buffered saline): negative control. Platelet activation was assessed in five donors. Results are presented as the mean of each experiment ± CO.
На фиг. 2 показано, что иммунные комплексы (IC) shCD154 (sCD40L на фигуре) и имеющих заглушенную эффекторную функцию антител к CD154 IgG2sigma/K C4LB5, C4LB89, C4LB189, C4LB191, C4LB199 и C4LB150 не активируют тромбоциты. Активацию тромбоцитов оценивали как % экспрессирующих PAC-1 и CD62p тромбоцитов от их общего числа. IC shCD154 и 5c8IgG1 (5c8IgG1 IC) активировали тромбоциты. ADP: положительный контроль. Активацию тромбоцитов оценивали у пяти доноров. Результаты представлены как среднее по каждому эксперименту ± CO.In FIG. 2 shows that immune complexes (IC) of shCD154 (sCD40L in the figure) and anti-CD154 IgG2sigma/K antibodies C4LB5, C4LB89, C4LB189, C4LB191, C4LB199 and C4LB150, which have a muted effector function, do not activate platelets. Platelet activation was assessed as % of PAC-1 and CD62p expressing platelets of their total number. IC shCD154 and 5c8IgG1 (5c8IgG1 IC) activated platelets. ADP: positive control. Platelet activation was assessed in five donors. Results are presented as the mean of each experiment ± CO.
На фиг. 3 показано, что иммунные комплексы (IC) shCD154 (SCD40L) и антител к CD154 C4LB89 (IgG2sigma/K), C4LB231 (IgG1sigma/K) и C4LB232 (IgG1sigma/K) не активируют тромбоциты. Активацию тромбоцитов оценивали как % экспрессирующих PAC-1 и CD62p тромбоцитов от их общего числа. Активированные IC 5c8-IgG1 тромбоциты, активация которых блокировалась антителом к FcyIIa, показывают, что активация тромбоцитов IC CD154/5c8-IgG1 опосредуется FcyRIIa на тромбоцитах. ADP: положительный контроль. PBS: отрицательный контроль. Активацию тромбоцитов оценивали у пяти доноров. Результаты представлены как среднее по каждому эксперименту ± CO.In FIG. 3 shows that the immune complexes (IC) of shCD154 (SCD40L) and anti-CD154 antibodies C4LB89 (IgG2sigma/K), C4LB231 (IgG1sigma/K), and C4LB232 (IgG1sigma/K) do not activate platelets. Platelet activation was assessed as % of PAC-1 and CD62p expressing platelets of their total number. 5c8-IgG1 IC-activated platelets whose activation was blocked by anti-FcyIIa antibody indicate that CD154/5c8-IgG1 IC platelet activation is mediated by FcyRIIa on platelets. ADP: positive control. PBS: negative control. Platelet activation was assessed in five donors. Results are presented as the mean of each experiment ± CO.
На фиг. 4 показана поверхность взаимодействия между CD154 и C4LB89. Ароматические остатки F55, Y101 и Y102 в HCDR2 и HCDR3 участвуют в большинстве взаимодействий (нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 59). Легкая цепь C4LB89 не участвует в связывании.In FIG. 4 shows the interaction surface between CD154 and C4LB89. Aromatic residues F55, Y101 and Y102 in HCDR2 and HCDR3 are involved in most interactions (residue numbering corresponds to SEQ ID NO: 59). The light chain C4LB89 is not involved in binding.
На фиг. 5 представлено двухмерное изображение эпитопных и паратопных остатков, идентифицированных по кристаллической структуре CD154 игрунки в комплексе с C4LB89. Эпитопные остатки обведены эллипсом и показаны паратопные остатки в HCDR1, HCDR2 и HCDR3 тяжелой цепи (обозначены на фигуре как CDR1, CDR2 и CDR3). Антитело связывается одновременно с двумя мономерами CD154, A и B. Нумерация эпитопных остатков соответствует человеческому CD154 (SEQ ID NO: 1), аIn FIG. 5 is a 2D image of epitopic and paratopic residues identified by the crystal structure of marmoset CD154 complexed with C4LB89. Epitopic residues are circled in an ellipse and paratopic residues in HCDR1, HCDR2 and HCDR3 of the heavy chain are shown (indicated in the figure as CDR1, CDR2 and CDR3). The antibody binds simultaneously to two CD154 monomers, A and B. The numbering of epitope residues corresponds to human CD154 (SEQ ID NO: 1), and
- 2 040943 нумерация паратопных остатков соответствует вариабельной области тяжелой цепи C4LB89 (SEQ ID- 2 040943 numbering of paratopic residues corresponds to the variable region of the heavy chain C4LB89 (SEQ ID
NO: 59).NO: 59).
На фиг. 6A показано выравнивание остатков 1-180 CD154 человека (SEQ ID NO: 1, верхняя строка) и CD154 игрунки (SQ ID NO: 2, нижняя строка), демонстрирующее, что эпитопные остатки C4LB89 для CD1514 человека и игрунки являются консервативными. Эпитопные остатки на мономере 1 CD154 подчеркнуты, а эпитопные остатки на мономере 2 подчеркнуты двойной линией.In FIG. 6A shows an alignment of residues 1-180 of human CD154 (SEQ ID NO: 1, top row) and marmoset CD154 (SQ ID NO: 2, bottom row), demonstrating that the C4LB89 epitope residues of human and marmoset CD1514 are conserved. Epitopic residues on CD154 monomer 1 are underlined, and epitopic residues on monomer 2 are underlined with a double line.
На фиг. 6B показано выравнивание остатков 181-261 CD154 человека (SEQ ID NO: 1, верхняя строка) и CD154 игрунки (SQ ID NO: 2, нижняя строка), демонстрирующее, что эпитопные остатки C4LB89 для CD1514 человека и игрунки являются консервативными. Эпитопные остатки на мономере 1 CD154 подчеркнуты, а эпитопные остатки на мономере 2 подчеркнуты двойной линией.In FIG. 6B shows an alignment of residues 181-261 of human CD154 (SEQ ID NO: 1, top row) and marmoset CD154 (SQ ID NO: 2, bottom row), demonstrating that the C4LB89 epitope residues for human and marmoset CD1514 are conserved. Epitopic residues on CD154 monomer 1 are underlined, and epitopic residues on monomer 2 are underlined with a double line.
На фиг. 7 показано, что иммунные комплексы (IC) shCD154 (SCD40L на фигуре) и IgG1/κ-антитела C4LB237 к CD154 не активируют тромбоциты, тогда как IC shCD154 и другого IgG1-антитела 5c8 активируют тромбоциты. Сами по себе антитела не оказывали влияния на активацию тромбоцитов, измеряемую как % экспрессирующих PAC-1 и CD62p тромбоцитов от общего их числа. ADP: положительный контроль. PBS: отрицательный контроль. Активацию тромбоцитов оценивали у пяти доноров. Результаты представлены как среднее по каждому эксперименту ± CO. n=4 в каждой группе.In FIG. 7 shows that the immune complexes (IC) of shCD154 (SCD40L in the figure) and the anti-CD154 IgG1/κ antibody C4LB237 do not activate platelets, while the shCD154 IC and another IgG1 antibody 5c8 activate platelets. The antibodies themselves had no effect on platelet activation, measured as the percentage of PAC-1 and CD62p-expressing platelets of the total number. ADP: positive control. PBS: negative control. Platelet activation was assessed in five donors. Results are presented as the mean of each experiment ± CO. n=4 in each group.
На фиг. 8A показано, что иммунные комплексы (IC) shCD154 (sCD40L на фигуре) и C4LB119 с заглушенным Fc активируют тромбоциты независимым от FcyRIIa способом, тогда как IC shCD154 и антитела с доменами VH/VL C4LB119, экспрессированными на IgG1 (C4LB287), активировали тромбоциты FcγRIIa-зависимым способом. ADP: положительный контроль. PBS: отрицательный контроль.In FIG. 8A shows that shCD154 (sCD40L in figure) and Fc-mutated C4LB119 immune complexes (ICs) activate platelets in an FcyRIIa-independent manner, while shCD154 ICs and antibodies with VH/VL domains C4LB119 expressed on IgG1 (C4LB287) activated platelets FcγRIIa dependent way. ADP: positive control. PBS: negative control.
На фиг. 8B показано, что иммунные комплексы (IC) shCD154 (sCD40L на фигуре) и C4LB94 с заглушенным Fc активируют тромбоциты независимым от FcyRIIa способом, тогда как IC shCD154 и антитела с доменами VH/VL C4LB94, экспрессированными на IgG1 (C4LB289), активировали тромбоциты FcyRIIa-зависимым способом. ADP: положительный контроль. PBS: отрицательный контроль.In FIG. 8B shows that shCD154 (sCD40L in figure) and Fc-mutated C4LB94 immune complexes (ICs) activate platelets in an FcyRIIa-independent manner, while shCD154 ICs and antibodies with VH/VL domains C4LB94 expressed on IgG1 (C4LB289) activate FcyRIIa platelets. dependent way. ADP: positive control. PBS: negative control.
На фиг. 8C показано, что иммунные комплексы (IC) shCD154 (sCD40L на фигуре) и C4LB83 с заглушенным Fc умеренно активируют тромбоциты, тогда как IC shCD154 и антитела с доменами VH/VL C4LB83, экспрессированными на IgG1 (C4LB288), активировали тромбоциты зависимым от FcyRIIa способом. ADP: положительный контроль. PBS: отрицательный контроль.In FIG. 8C shows that the immune complexes (ICs) of shCD154 (sCD40L in figure) and Fc-muted C4LB83 moderately activate platelets, while shCD154 ICs and C4LB83 VH/VL domain antibodies expressed on IgG1 (C4LB288) activated platelets in an FcyRIIa dependent manner. . ADP: positive control. PBS: negative control.
Подробное описание изобретенияDetailed description of the invention
Все публикации, включенные в данное описание, включая, без ограничений, патенты и патентные заявки, включенные путем ссылок, являются частью настоящего документа, как если бы они были изложены непосредственно в настоящем документе.All publications included in this specification, including, without limitation, patents and patent applications incorporated by reference, are part of this document as if they were set forth directly in this document.
Следует понимать, что применяемые в настоящем документе термины используются только в целях описания конкретных вариантов осуществления и не являются ограничивающими. Все технические и научные термины, используемые в настоящем документе, если не указано иное, имеют общепринятое значение, понятное специалисту среднего уровня в области, к которой имеет отношение изобретение.It should be understood that the terms used in this document are used only for the purpose of describing specific embodiments and are not limiting. All technical and scientific terms used in this document, unless otherwise indicated, have the generally accepted meaning understood by a person of ordinary skill in the field to which the invention pertains.
Используемые в настоящем описании и в формуле изобретения формы единственного числа включают ссылки на множественные объекты, если иное не следует явно из контекста.As used in the present description and in the claims, the singular forms include references to plural objects, unless otherwise follows clearly from the context.
В настоящем документе описаны примеры способов и материалов, хотя при практическом осуществлении для проверки настоящего изобретения могут быть использованы любые способы и материалы, подобные или эквивалентные тем, которые описаны в настоящем документе. При описании и изложении формулы настоящего изобретения будут использованы следующие термины.Examples of methods and materials are described herein, although any methods and materials similar or equivalent to those described herein may be used to test the present invention in practice. In describing and presenting the claims of the present invention, the following terms will be used.
Термины специфическое связывание или специфически связывает, или связывает относятся к связыванию антитела с антигеном или эпитопом в пределах антигена с большей аффинностью, чем с другими антигенами. Как правило, антитело связывается с антигеном или эпитопом в пределах антигена с константой диссоциации (KD), составляющей около 1x10’8 М или менее, например около 1x10’9 M или менее, около 1x10’10 M или менее, около 1x10’11 M или менее или около 1x10’12 M или менее, как правило, с KD, которая по меньшей мере в сто раз менее значения KD связывания с неспецифическим антигеном (например, бычьим сывороточным альбумином (БСА), казеином). Константу диссоциации можно измерять стандартными процедурами. Однако антитела, которые специфически связываются с антигеном или эпитопом в пределах антигена, могут иметь перекрестную реактивность в отношении других родственных антигенов, например в отношении такого же антигена других биологических видов (гомологов), таких как человек или обезьяна, например Масаса fascicularis (яванский макак, макак), Pan troglodytes (шимпанзе) или Callithrix jacchus (обыкновенная игрунка, игрунка). Тогда как моноспецифическое антитело специфически связывает один антиген или один эпитоп, биспецифическое антитело специфически связывает два разных антигена или два разных эпитопа.The terms specific binding or specifically binds or binds refer to the binding of an antibody to an antigen or epitope within an antigen with greater affinity than to other antigens. Typically, an antibody binds to an antigen or epitope within the antigen with a dissociation constant (K D ) of about 1x10'8 M or less, such as about 1x10'9 M or less, about 1x10'10 M or less, about 1x10'11 M or less or about 1x10' 12 M or less, typically with a K D that is at least one hundred times less than the K D value of binding to a non-specific antigen (eg bovine serum albumin (BSA), casein). The dissociation constant can be measured by standard procedures. However, antibodies that specifically bind to an antigen or epitope within an antigen may be cross-reactive with other related antigens, for example with the same antigen of other species (homologues) such as humans or monkeys, such as Masaca fascicularis (cynomolgus macaque, macaques), Pan troglodytes (chimpanzee) or Callithrix jacchus (common marmoset, marmoset). Whereas a monospecific antibody specifically binds one antigen or one epitope, a bispecific antibody specifically binds two different antigens or two different epitopes.
Термины нейтрализация или нейтрализует, или нейтрализующее антитело, или антителоантагонист, или антагонист, или антагонистическое относятся к антителу или его антигенсвязывающему участку, которое частично или полностью ингибирует биологическую активность человеческого CD154. Антагонистические антитела можно выявлять с использованием анализов биологической активности CD154, описанных в настоящем документе. Антагонистическое антитело, специфически связы- 3 040943 вающее человеческий CD154, может ингибировать биологическую активность человеческого CD154 приблизительно на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% илиThe terms neutralizing or neutralizing or neutralizing antibody or antibody antagonist or antagonist or antagonist refer to an antibody or antigen-binding site thereof that partially or completely inhibits the biological activity of human CD154. Antagonist antibodies can be detected using the CD154 biological activity assays described herein. An antagonist antibody that specifically binds human CD154 can inhibit the biological activity of human CD154 by approximately 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or
100%.100%.
CD154 означает человеческий белок CD154 (hCD154) (например, человеческий CD40L). Аминокислотная последовательность человеческого полноразмерного белка CD154 показана в SEQ ID NO: 1. Человеческий CD154 обнаруживается на клеточной мембране в виде мембранного белка II типа, а также присутствует в растворимой форме в плазме. Связанная с мембраной форма CD154 содержит остатки 1261 последовательности SEQ ID NO: 1, причем трансмембранный домен расположен между остатками 23-46, а внеклеточный домен охватывает остатки 47-261. Растворимая форма человеческого CD154 (shCD154) образуется путем протеолитического процессинга связанной с мембраной формы и она содержит остатки 113-261 последовательности SEQ ID NO: 1) (аминокислотная последовательность shCD154 показана в SEQ ID NO: 4). Как связанный с мембраной, так и растворимый CD154 образует биологически активные тримеры. Обозначение CD154 охватывает различные формы CD154, включая мономерную, димерную, тримерную, связанную с мембраной и растворимую формы, а также варианты человеческого CD154 природного происхождения. Растворимый человеческий тример CD154 (тример shCD154) состоит из трех полипептидных цепей, каждая из которых имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4.CD154 means human CD154 protein (hCD154) (eg human CD40L). The amino acid sequence of the full-length human CD154 protein is shown in SEQ ID NO: 1. Human CD154 is found on the cell membrane as a type II membrane protein and is also present in soluble form in plasma. The membrane bound form of CD154 contains residues 1261 of SEQ ID NO: 1, with the transmembrane domain located between residues 23-46 and the extracellular domain spanning residues 47-261. The soluble form of human CD154 (shCD154) is formed by proteolytic processing of the membrane bound form and contains residues 113-261 of SEQ ID NO: 1) (the amino acid sequence of shCD154 is shown in SEQ ID NO: 4). Both membrane-bound and soluble CD154 form biologically active trimers. The designation CD154 encompasses various forms of CD154, including monomeric, dimeric, trimeric, membrane-bound, and soluble forms, as well as naturally occurring variants of human CD154. The soluble human CD154 trimer (shCD154 trimer) consists of three polypeptide chains, each having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4.
В контексте данного документа термин антитела подразумевается в широком значении и включает молекулы иммуноглобулинов, в том числе моноклональные антитела, включая мышиные, человеческие, гуманизированные и химерные моноклональные антитела, фрагменты антител, биспецифические или мультиспецифические антитела, димерные, тетрамерные или мультимерные антитела, одноцепочечные антитела, доменные антитела и любую другую модифицированную конфигурацию молекулы иммуноглобулина, которая содержит антигенсвязывающий участок требуемой специфичности. Молекулы целых антител состоят из двух тяжелых цепей (HC) и двух легких цепей (LC), соединенных между собой дисульфидными связями, а также из их мультимеров (например, IgM). Каждая тяжелая цепь состоит из вариабельной области тяжелой цепи (VH) и константной области тяжелой цепи (состоящей из доменов CH1, CH2 и CH3). Каждая легкая цепь состоит из вариабельной области легкой цепи (VL) и константной области легкой цепи (CL). Области VH и VL также можно подразделять на области гипервариабельности, именуемые областями определяющими комплементарность (CDR), между которыми располагаются каркасные области (FR). Каждая VH и VL состоит из трех сегментов CDR и четырех FR, расположенных в направлении от аминного конца к карбоксильному концу в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 и FR4.In the context of this document, the term antibodies is intended in a broad sense and includes immunoglobulin molecules, including monoclonal antibodies, including murine, human, humanized and chimeric monoclonal antibodies, antibody fragments, bispecific or multispecific antibodies, dimeric, tetrameric or multimeric antibodies, single chain antibodies, domain antibodies; and any other modified configuration of an immunoglobulin molecule that contains an antigen-binding site of the desired specificity. Whole antibody molecules consist of two heavy chains (HC) and two light chains (LC) linked by disulfide bonds, as well as their multimers (eg IgM). Each heavy chain is composed of a heavy chain variable region (VH) and a heavy chain constant region (consisting of the CH1, CH2 and CH3 domains). Each light chain is composed of a light chain variable region (VL) and a light chain constant region (CL). The VH and VL regions can also be subdivided into regions of hypervariability, referred to as complementarity determining regions (CDRs), between which are frame regions (FRs). Each VH and VL consists of three CDR segments and four FR segments, arranged in the direction from the amine end to the carboxyl end in the following order: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 and FR4.
Области, определяющие комплементарность (CDR) представляют в антителе антигенсвязывающие сайты. CDR можно определять, используя разные термины: (i) определяющие комплементарность области (CDR), три в VH (HCDR1, HCDR2, HCDR3) и три в VL (LCDR1, LCDR2, LCDR3), на основании вариабельности последовательностей (Wu and Kabat, J Exp Med 132:211-50, 1970; Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md., 1991). (ii) гипервариабельные области, HVR или HV, три в VH (H1, H2, H3) и три в VL (L1, L2, L3), относятся к областям вариабельных доменов антитела, являющихся по своей структуре гипервариабельными, согласно определению Чотиа и Леска (Chothia and Lesk, Mol. Biol 196:901-17, 1987). В международной базе данных ImMunoGeneTics (IMGT) (http://www_imgt_org) представлены стандартизированная нумерация и определение антигенсвязывающих участков. Соответствие между разграничениями CDR, HV и IMGT описано в Lefranc et al., Dev Comparat Immunol 27:55-77, 2003. Обозначения CDR, HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3 включают в себя CDR, определенные любым из способов, описанных выше, по Кабату, Чотиа или IMGT, если в данном описании явным образом не указано иное.Complementarity determining regions (CDRs) represent antigen-binding sites in an antibody. CDRs can be defined using different terms: (i) complementarity determining regions (CDRs), three in VH (HCDR1, HCDR2, HCDR3) and three in VL (LCDR1, LCDR2, LCDR3), based on sequence variability (Wu and Kabat, J Exp Med 132:211-50, 1970; Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md., 1991). (ii) hypervariable regions, HVR or HV, three in VH (H1, H2, H3) and three in VL (L1, L2, L3), refer to antibody variable domain regions that are structurally hypervariable, as defined by Chothia and Lesk (Chothia and Lesk, Mol. Biol 196:901-17, 1987). The international database ImMunoGeneTics (IMGT) (http://www_imgt_org) provides a standardized numbering and definition of antigen-binding sites. The correspondence between CDR, HV, and IMGT delimitations is described in Lefranc et al., Dev Comparat Immunol 27:55-77, 2003. The designations CDR, HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2, and LCDR3 include CDRs defined by any of the methods described above, according to Kabat, Chothia or IMGT, unless otherwise indicated in this description.
В зависимости от аминокислотной последовательности константного домена тяжелой цепи иммуноглобулины могут относиться к пяти основным классам, IgA, IgD, IgE, IgG и IgM. IgA и IgG дополнительно классифицируются на изотипы IgA1, IgA2, IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4. Легкие цепи антител любых видов позвоночных можно отнести, в зависимости от аминокислотных последовательностей их константных доменов, к одному из двух четко отличающихся типов, а именно каппа (к) и лямбда (λ).Depending on the amino acid sequence of the heavy chain constant domain, immunoglobulins can be classified into five major classes, IgA, IgD, IgE, IgG, and IgM. IgA and IgG are further classified into IgA1, IgA 2 , IgG1, IgG 2 , IgG 3 and IgG4 isotypes. The light chains of antibodies of any vertebrate species can be assigned, depending on the amino acid sequences of their constant domains, to one of two distinct types, namely kappa (k) and lambda (λ).
Термин фрагменты антитела или антигенсвязывающая часть антитела, относится к части молекулы иммуноглобулина, которая сохраняет антигенсвязывающий участок тяжелой цепи и/или легкой цепи, такой как определяющие комплементарность области тяжелой цепи (HCDR) 1, 2 и 3, определяющие комплементарность области легкой цепи (LCDR) 1, 2 и 3, вариабельная область тяжелой цепи (VH) или вариабельная область легкой цепи (VL). Фрагменты антител включают хорошо известные фрагменты Fab, F(ab')2, Fd и Fv, а также доменные антитела (dAb), содержащие один домен VH. Домены VH и VL могут быть связаны вместе посредством синтетического линкера с образованием различных типов конфигураций одноцепочечных антител, в которых домены VH/VL соединяются в пару внутримолекулярно или межмолекулярно в тех случаях, когда домены VH и VL экспрессируются отдельными одноцепочечными конструктами антител с образованием одновалентного антигенсвязывающего сайта, таких как одноцепочечный Fv (scFv) или диатело; они описаны, например, в международной патентной публикацииThe term antibody fragments, or antigen-binding portion of an antibody, refers to the portion of an immunoglobulin molecule that retains an antigen-binding region of the heavy chain and/or light chain, such as heavy chain complementarity determining regions (HCDRs) 1, 2 and 3, light chain complementarity determining regions (LCDRs) 1, 2 and 3, heavy chain variable region (VH) or light chain variable region (VL). Antibody fragments include the well-known Fab, F(ab') 2 , Fd and Fv fragments, as well as domain antibodies (dAbs) containing a single VH domain. The VH and VL domains can be linked together via a synthetic linker to form various types of single chain antibody configurations, in which the VH/VL domains are paired intramolecularly or intermolecularly in cases where the VH and VL domains are expressed by separate single chain antibody constructs to form a monovalent antigen binding site such as single chain Fv (scFv) or diabody; they are described, for example, in an international patent publication
- 4 040943 № WO1998/44001, международной патентной публикации № WO1988/01649; международной патентной публикации № WO1994/13804; международной патентной публикации № WO1992/01047.- 4 040943 No. WO1998/44001, International Patent Publication No. WO1988/01649; International Patent Publication No. WO1994/13804; International Patent Publication No. WO1992/01047.
Моноклональным антителом называется популяция антител с одинаковым аминокислотным составом в каждой тяжелой и каждой легкой цепи, за исключением возможных хорошо известных изменений, таких как удаление C-концевого лизина из тяжелой цепи антитела. Моноклональные антитела, как правило, связываются с одним антигенным эпитопом, за исключением биспецифических моноклональных антител, которые связываются с двумя отличными антигенными эпитопами. В пределах популяции антител моноклональные антитела могут иметь гетерогенное гликозилирование. Моноклональное антитело может быть моноспецифическим или мультиспецифическим, или моновалентным, бивалентным или мультивалентным. Биспецифическое антитело включено в термин моноклональное антитело.A monoclonal antibody refers to a population of antibodies with the same amino acid composition in each heavy and each light chain, except for possible well-known changes, such as the removal of the C-terminal lysine from the heavy chain of the antibody. Monoclonal antibodies generally bind to one antigenic epitope, with the exception of bispecific monoclonal antibodies, which bind to two different antigenic epitopes. Within an antibody population, monoclonal antibodies may have heterogeneous glycosylation. The monoclonal antibody may be monospecific or multispecific, or monovalent, bivalent or multivalent. A bispecific antibody is included in the term monoclonal antibody.
Термин выделенное антитело означает антитело или фрагмент антитела, которое, по существу, не содержит других антител, имеющих отличную антигенную специфичность (например, выделенное антитело, специфически связывающее CD154, по существу не содержит антител, специфически связывающих антигены, отличные от CD154. Термин выделенное антитело включает антитела, выделенные так, чтобы иметь более высокую степень чистоты, такие как антитела, являющиеся чистыми на 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100%.The term isolated antibody means an antibody or antibody fragment that is substantially free of other antibodies having distinct antigen specificity (e.g., an isolated antibody that specifically binds CD154 is substantially free of antibodies that specifically bind antigens other than CD154. The term isolated antibody includes antibodies isolated to be of higher purity, such as antibodies that are 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89% pure, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100%.
Термин остатки по Чотиа означает остатки VL и VH антител с нумерацией согласно Al-Lazikani (Al-Lazikani et al., J Mol Biol 273:927-48, 1997).The term Chothia residues means VL and VH residues of antibodies numbered according to Al-Lazikani (Al-Lazikani et al., J Mol Biol 273:927-48, 1997).
Термин гуманизированные антитела относится к антителам, у которых антигенсвязывающие сайты получены из видов, отличных от человека, а каркасы вариабельных областей получены из последовательностей человеческих иммуноглобулинов. Гуманизированные антитела могут включать замены в каркасных областях, в результате чего каркасная область может не являться точной копией экспрессированного человеческого иммуноглобулина или генных последовательностей зародышевой линии.The term humanized antibodies refers to antibodies in which the antigen-binding sites are derived from non-human species and the variable region frameworks are derived from human immunoglobulin sequences. Humanized antibodies may include substitutions in the framework regions, whereby the framework region may not be an exact copy of the expressed human immunoglobulin or germline gene sequences.
Термин человеческие антитела относится к антителам, имеющим вариабельные области тяжелой и легкой цепей, в которых как каркасные области, так и антигенсвязывающие сайты получены из последовательностей человеческого происхождения. Если антитело содержит константную область или часть контрастной области, константная область также получена из последовательностей человеческого происхождения.The term human antibodies refers to antibodies having heavy and light chain variable regions in which both the framework regions and the antigen binding sites are derived from sequences of human origin. If the antibody contains a constant region or part of a contrast region, the constant region is also derived from sequences of human origin.
Человеческое антитело содержит вариабельные области тяжелой или легкой цепи, которые получены из последовательностей человеческого происхождения, если вариабельные области антитела получены из системы, в которой используется человеческий иммуноглобулин зародышевого типа или перестроенные гены иммуноглобулина. Такими примерами систем являются библиотеки генов человеческих иммуноглобулинов, отображаемые на фаге, и трансгенные животные, отличные от человека, такие как мыши или крысы, несущие локусы человеческих иммуноглобулинов, как описано в настоящем документе. Антитело человека может содержать аминокислотные отличия по сравнению с зародышевой линией человека или перестроенные последовательности иммуноглобулинов, обусловленные, например, соматическими мутациями природного происхождения или намеренным введением замен в каркасный или антигенсвязывающий сайт, или обеими причинами. Как правило, антитело человека по меньшей мере на около 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентично аминокислотной последовательности, кодируемой геном человеческой зародышевой линии или перестроенным геном иммуноглобулина. В некоторых случаях антитело человека может содержать консенсусные каркасные последовательности, полученные в результате анализов каркасных последовательностей человека, например, как описано в Knappik et al., J Mol Biol 296:57-86, 2000, или синтетические HCDR3, включенные в библиотеки генов иммуноглобулинов человека, отображаемые на фаге, например, как описано в Shi et al., J Mol Biol 397:385-96, 2010 и международной патентной публикации № WO2009/085462.A human antibody contains heavy or light chain variable regions that are derived from sequences of human origin if the antibody variable regions are derived from a system that uses human germline immunoglobulin or rearranged immunoglobulin genes. Such systems are phage-displayed human immunoglobulin gene libraries and non-human transgenic animals such as mice or rats harboring human immunoglobulin loci as described herein. The human antibody may contain amino acid differences from the human germline, or rearranged immunoglobulin sequences due, for example, to naturally occurring somatic mutations or intentional substitutions at the framework or antigen binding site, or both. Typically, human antibody is at least about 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93 %, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence encoded by the human germline gene or rearranged immunoglobulin gene. In some cases, a human antibody may contain consensus framework sequences derived from human framework sequence assays, such as those described in Knappik et al., J Mol Biol 296:57-86, 2000, or synthetic HCDR3s included in human immunoglobulin gene libraries displayed on phage, for example, as described in Shi et al., J Mol Biol 397:385-96, 2010 and International Patent Publication No. WO2009/085462.
Выделенные гуманизированные антитела являются синтетическими. Антитела человека, хотя и полученные из последовательностей иммуноглобулинов человека, могут быть созданы с применением таких систем, как фаговый дисплей, включая синтетические CDR и/или синтетические каркасы, или могут быть подвергнуты мутагенезу in vitro для улучшения свойств антител, что приводит к получению антител, не экспрессирующихся зародышевой линией человека in vivo.The isolated humanized antibodies are synthetic. Human antibodies, although derived from human immunoglobulin sequences, may be generated using systems such as phage display, including synthetic CDRs and/or synthetic scaffolds, or may be subjected to in vitro mutagenesis to improve antibody properties, resulting in antibodies not expressed by the human germline in vivo.
Антитела, в которых антигенсвязывающие сайты получены из видов, отличных от человека, не подходят под определение антитела человека.Antibodies in which the antigen-binding sites are derived from a species other than a human do not fit the definition of a human antibody.
Термин рекомбинантный относится к антителам и другим белкам, которые получены, экспрессированы, созданы или выделены рекомбинантными способами.The term recombinant refers to antibodies and other proteins that are produced, expressed, created or isolated by recombinant methods.
При использовании в настоящем документе термин эпитоп относится к части антигена, с которой специфически связывается антитело. Как правило, эпитопы состоят из химически активных (таких как полярные, неполярные или гидрофобные) поверхностных групп компонентов, таких как боковые цепи аминокислот или полисахаридов, и могут иметь конкретные характеристики трехмерной структуры, а также конкретные зарядовые характеристики. Эпитоп может быть образован из смежных и/или несмежных аминокислот, образующих конформационное пространственное звено. В случае несмежного эпитопа аминокислоты из разных участков линейной последовательности антигена подходят близко друг к другуAs used herein, the term epitope refers to the portion of an antigen to which an antibody specifically binds. Typically, epitopes are composed of reactive (such as polar, nonpolar, or hydrophobic) surface groupings of components such as amino acid or polysaccharide side chains, and may have specific three-dimensional structural characteristics as well as specific charge characteristics. An epitope may be formed from contiguous and/or non-contiguous amino acids forming a conformational spatial unit. In the case of a non-contiguous epitope, amino acids from different regions of the linear sequence of the antigen come close to each other
- 5 040943 в 3-мерном пространстве благодаря сворачиванию молекулы белка.- 5 040943 in 3-dimensional space due to the folding of the protein molecule.
Термин паратоп означает часть антитела, с которой специфически связывается антиген. Паратоп может быть линейным или дискретным, образованным за счет пространственных взаимоотношений между аминокислотами антитела, не находящимися в непрерывной последовательности, в отличие от взаимодействия линейных последовательностей аминокислот. Термины паратоп легкой цепи и паратоп тяжелой цепи, или аминокислотные остатки паратопа легкой цепи и аминокислотные остатки паратопа тяжелой цепи означают остатки легкой и тяжелой цепей антитела, контактирующие, соответственно, с антигеном или в целом остатки паратопа антитела означают те аминокислоты антитела, которые контактируют с антигеном.The term paratope refers to the part of an antibody to which an antigen specifically binds. The paratope may be linear or discrete, formed by spatial relationships between antibody amino acids that are not in a continuous sequence, as opposed to the interaction of linear amino acid sequences. The terms light chain paratope and heavy chain paratope, or amino acid residues of the light chain paratope and amino acid residues of the heavy chain paratope, refer to the residues of the light and heavy chains of an antibody in contact with the antigen, respectively, or in general, the residues of the paratope of an antibody refer to those amino acids of the antibody that come into contact with the antigen. .
Термин биспецифическое относится к антителу, которое специфически связывает два разных антигена или два разных эпитопа в пределах одного антигена. Биспецифическое антитело может иметь перекрестную реактивность с другими родственными антигенами или может связывать эпитоп, который является общим для двух или более различных антигенов.The term bispecific refers to an antibody that specifically binds two different antigens or two different epitopes within the same antigen. A bispecific antibody may be cross-reactive with other related antigens or may bind an epitope that is common to two or more different antigens.
Термин мультиспецифический относится к антителу, которое специфически связывает по меньшей мере два разных антигена или по меньшей мере два разных эпитопа в пределах одного антигена. Мультиспецифическое антитело может связываться, например, с двумя, тремя, четырьмя или пятью разными антигенами или разными эпитопами в пределах одного антигена.The term multispecific refers to an antibody that specifically binds at least two different antigens or at least two different epitopes within the same antigen. A multispecific antibody can bind, for example, to two, three, four or five different antigens or different epitopes within a single antigen.
Выражение в комбинации с означает, что лекарственные средства или терапевтические средства вводят субъекту, такому как человек, вместе в смеси, одновременно в виде отдельных агентов или последовательно в виде отдельных агентов в любом порядке.The expression in combination with means that drugs or therapeutic agents are administered to a subject, such as a human, together in admixture, simultaneously as separate agents or sequentially as separate agents in any order.
Термин биологическая активность CD154 относится к любой активности, возникающей в результате связывания CD154 с его рецептором CD40. Биологическая активность CD154 может представлять собой, например, опосредованную CD154 активацию B-клеток CD40+ или дендритных клеток (DC), или активацию нижележащих от CD40 сигнальных путей. Биологическую активность CD154 можно измерять с помощью хорошо известных методов или методов, описанных в настоящем документе, например путем измерения опосредованной CD154 пролиферации или активации B-клеток путем оценки повышения регуляции ICAM-1 или повышенной продукции цитокинов B-клетками, опосредованной CD154 активации DC путем оценки повышенной экспрессии CD80 и/или CD86 на поверхности или секреции цитокинов DC-клетками, или активации сигнального пути CD40 путем оценки с помощью анализов геноврепортеров, например измерения секреции секретируемой эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) клетками, экспрессирующими SEAP под контролем индуцируемого NF-kB промотора.The term biological activity of CD154 refers to any activity resulting from the binding of CD154 to its CD40 receptor. The biological activity of CD154 may be, for example, CD154-mediated activation of CD40+ B cells or dendritic cells (DC), or activation of signaling pathways downstream of CD40. The biological activity of CD154 can be measured using well known methods or the methods described herein, for example, by measuring CD154 mediated proliferation or B cell activation by assessing ICAM-1 upregulation or increased B cell cytokine production, CD154 mediated DC activation by assessing increased expression of CD80 and/or CD86 on the surface or secretion of cytokines by DC cells, or activation of the CD40 signaling pathway by assessing reporter gene assays, e.g. measuring secretion of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by cells expressing SEAP under the control of an inducible NF-kB promoter.
Термин вектор обозначает полинуклеотид, способный к удвоению внутри биологической системы или который можно перемещать между такими системами. Полинуклеотиды-векторы, как правило, содержат элементы, такие как точки начала репликации, сигнал полиаденилирования или маркеры отбора, функционирующие для облегчения удвоения или сохранения таких полинуклеотидов в биологической системе. Примеры таких биологических систем могут включать клетку, вирус, животное, растение и реконструированные биологические системы, использующие биологические компоненты, способные к удвоению вектора. Содержащий вектор полинуклеотид может представлять собой молекулы ДНК или РНК или их гибрид.The term vector refers to a polynucleotide capable of duplication within a biological system or which can be moved between such systems. Vector polynucleotides typically contain elements such as origins of replication, a polyadenylation signal, or selection markers that function to facilitate duplication or maintenance of such polynucleotides in a biological system. Examples of such biological systems may include cell, virus, animal, plant, and reengineered biological systems using biological components capable of vector doubling. The vector-containing polynucleotide may be a DNA or RNA molecule or a hybrid thereof.
Термин экспрессионный вектор означает вектор, который можно использовать в биологической системе или реконструированной биологической системе для управления трансляцией полипептида, кодированного полинуклеотидной последовательностью, присутствующей в экспрессионном векторе.The term expression vector means a vector that can be used in a biological system or a reshaped biological system to direct translation of a polypeptide encoded by a polynucleotide sequence present in an expression vector.
Термин полинуклеотид означает молекулу, содержащую цепь нуклеотидов, ковалентно связанных через сахарофосфатную основную цепь или другую эквивалентную ковалентную химическую структуру. Двухцепочечная и одноцепочечная ДНК и РНК представляют собой типичные примеры полинуклеотидов.The term polynucleotide means a molecule containing a chain of nucleotides covalently linked through a sugar phosphate backbone or other equivalent covalent chemical structure. Double-stranded and single-stranded DNA and RNA are typical examples of polynucleotides.
Термин полипептид или белок обозначает молекулу, которая содержит по меньшей мере два аминокислотных остатка, связанных пептидной связью с образованием полипептида. Малые полипептиды, содержащие менее 50 аминокислотных остатков, могут называться пептидами.The term polypeptide or protein refers to a molecule that contains at least two amino acid residues linked by a peptide bond to form a polypeptide. Small polypeptides containing less than 50 amino acid residues may be referred to as peptides.
В настоящем документе использованы общепринятые одно- и трехбуквенные коды обозначения аминокислот, как приведено в табл. 1.In this document, conventional one- and three-letter codes for the designation of amino acids are used, as shown in table. 1.
- 6 040943- 6 040943
Таблица 1Table 1
Композиции настоящего изобретенияCompositions of the present invention
В настоящем изобретении предлагаются антагонистические антитела, специфически связывающее CD154 с высокой аффинностью и эффективно нейтрализующие биологическую активность CD 154. Изобретение, по меньшей мере частично, основывается на том факте, что в отличие от текущего представления о том, что связывание антител, специфически связывающих CD154, с рецептором FcYRIIa на тромбоцитах приводит к активации и агрегации тромбоцитов и последующей тромбоэмболии, было обнаружено, что активация тромбоцитов также зависит от эпитопа на CD154, с которым связываются антитела. В настоящем изобретении было обнаружено, что антитела изобретения, связывающие определенный эпитоп на CD154 и способные задействовать FcyRIIa, не опосредуют активацию тромбоцитов. Кроме этого, антитела изобретения необязательно подвергаются изменению Fc в целях предотвращения запуска дополнительных нежелательных иммуностимулирующих функций. Следовательно, антитела изобретения могут иметь более благоприятные профили безопасности при клиническом применении по сравнению с существующими антителами, специфически связывающими CD154.The present invention provides an antagonist antibody that specifically binds CD154 with high affinity and effectively neutralizes CD154 biological activity. with the FcYRIIa receptor on platelets leads to platelet activation and aggregation and subsequent thromboembolism, it has been found that platelet activation also depends on the epitope on CD154 to which the antibody binds. In the present invention, it has been found that antibodies of the invention that bind a specific epitope on CD154 and are capable of recruiting FcyRIIa do not mediate platelet activation. In addition, the antibodies of the invention optionally undergo an Fc change to prevent triggering additional undesirable immunostimulatory functions. Therefore, the antibodies of the invention may have more favorable safety profiles in clinical use compared to existing antibodies that specifically bind CD154.
CD154 является мишенью при аутоиммунных реакциях, реакциях отторжения трансплантата и других связанных с иммунитетом заболеваниях у мышей, нечеловекообразных обезьян (NHP) и людей. В ряде клинических исследований фазы II было показано, что антитела, специфически связывающие CD154 эффективно блокируют активность CD154 in vivo и облегчают течение заболевания. Антагонисты CD154 отличаются от всех прочих терапевтических средств своим влиянием на иммунный ответ; они являются единственными терапевтическими средствами, способными вызвать функциональную иммунологическую толерантность, что продемонстрировано как на мышах, так и на обезьянах. На мышах течение практически всех аутоиммунных заболеваний можно эффективно облегчать антагонистами CD154 (Noelle et al., Ann N Y Acad Sci 815: 384-391, 1997; Mackey et al., J Leukoc Biol 63: 418-428, 1998; Noelle, Agents Actions Suppl 49: 17-22, 1998; Quezada et al., Annu Rev Immunol 22: 307-328, 2004), с наблюдением долговременной ремиссии.CD154 is a target in autoimmune reactions, transplant rejection reactions and other immune-related diseases in mice, non-human apes (NHP) and humans. In a number of phase II clinical trials, antibodies specifically binding to CD154 have been shown to effectively block CD154 activity in vivo and alleviate the course of the disease. CD154 antagonists differ from all other therapeutic agents in their effect on the immune response; they are the only therapeutic agents capable of inducing functional immunological tolerance, which has been demonstrated in both mice and monkeys. In mice, virtually all autoimmune diseases can be effectively ameliorated by CD154 antagonists (Noelle et al., Ann N Y Acad Sci 815: 384-391, 1997; Mackey et al., J Leukoc Biol 63: 418-428, 1998; Noelle, Agents Actions Suppl 49: 17-22, 1998; Quezada et al., Annu Rev Immunol 22: 307-328, 2004), with long-term remission observed.
В изобретении предлагается выделенное антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1.The invention provides an isolated antagonistic antibody, or antigen-binding site thereof, that specifically binds CD154 with SEQ ID NO: 1.
В изобретении также предлагается выделенное антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее CD154, причем CD154 представляет собой гомотример, а антитело связывает первый мономер CD154 в гомотримере в пределах аминокислотных остатков 182-207 CD154 и второй мономер CD154 в гомотримере в пределах аминокислотных остатков 176-253 CD154, при этом нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 1.The invention also provides an isolated antagonistic antibody or antigen-binding site thereof specifically binding CD154, wherein CD154 is a homotrimer and the antibody binds the first CD154 monomer in the homotrimer within amino acid residues 182-207 of CD154 and the second CD154 monomer in the homotrimer within amino acid residues 176- 253 CD154, with residue numbering corresponding to SEQ ID NO: 1.
Примером такого антитела является антитело C4LB89. Поскольку вариабельные области антител C4LB235 и C4LB236 отличаются при сравнении от таковых C4LB89 на один аминокислотный остаток в LCDR2, и поскольку C4LB231 и C4LB232 имеют идентичные C4LB89 последовательности VH/VL, ожидается, что эти антитела также будут связывать тот же эпитоп CD154, что и C4LB89. Антитела, связывающие CD154 в пределах остатков 182-207 и 176-253, не способны активировать тромбоциты, несмотря на то, что способны взаимодействовать с рецепторами FcyR, включая FcyRIIa. Следовательно, эти антитела могут иметь улучшенный профиль безопасности по сравнению с другими антагонистическими антителами, специфически связывающими CD154.An example of such an antibody is the C4LB89 antibody. Since the variable regions of antibodies C4LB235 and C4LB236 differ from those of C4LB89 by one amino acid residue in LCDR2 when compared, and since C4LB231 and C4LB232 have identical VH/VL sequences to C4LB89, these antibodies are also expected to bind the same CD154 epitope as C4LB89. Antibodies that bind CD154 within residues 182-207 and 176-253 are unable to activate platelets despite being able to interact with FcyR receptors, including FcyRIIa. Therefore, these antibodies may have an improved safety profile compared to other antagonistic antibodies that specifically bind CD154.
- 7 040943- 7 040943
В изобретении также предлагается антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее человеческий CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее определяющую комплементарность область тяжелой цепи (HCDR) 1 с SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 с SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG) и HCDR3 с SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), причем необязательно остаток S1 HCDR1 мутирован в A, C, D, E, G, I, K, L, M, N, Q, R, T или V;The invention also provides an antagonist antibody or antigen-binding site thereof specifically binding human CD154 of SEQ ID NO: 1, containing a heavy chain complementarity determining region (HCDR) 1 of SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 of SEQ ID NO: 23 ( WISPIFGNTNYAQKFQG) and HCDR3 of SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), optionally HCDR1 residue S1 mutated to A, C, D, E, G, I, K, L, M, N, Q, R, T, or V;
остаток I4 HCDR1 мутирован в M, L или V;residue I4 HCDR1 mutated to M, L, or V;
остаток S5 HCDR1 мутирован в A;residue S5 HCDR1 mutated in A;
остаток S3 HCDR2 мутирован в A, T или V;residue S3 HCDR2 mutated in A, T or V;
остаток P4 HCDR2 мутирован в V, T, L Q или E;the P4 HCDR2 residue is mutated to V, T, L Q, or E;
остаток N8 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;the N8 HCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
остаток T9 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;the T9 HCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
остаток N10 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;the N10 HCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
остаток S1 HCDR3 мутирован в A или M;residue S1 HCDR3 mutated to A or M;
остаток R2 HCDR3 мутирован в A, S, Q или K; и остаток L7 HCDR3 мутирован в M.the R2 residue of HCDR3 is mutated to A, S, Q, or K; and the L7 residue of HCDR3 is mutated in M.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит определяющую комплементарность область легкой цепи (LCDR) 1 с SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 с SEQ ID NO: 44 (YANSLQS) и LCDR3 с SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT), причем необязательно остаток Q4 LCDR1 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, R, S, T, V, W или Y;In some embodiments, an antibody of the present invention comprises a light chain complementarity determining region (LCDR) 1 of SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 of SEQ ID NO: 44 (YANSLQS), and LCDR3 of SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT), wherein optionally, the Q4 LCDR1 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, R, S, T, V, W, or Y;
остаток S5 LCDR1 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;the S5 LCDR1 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
остаток S7 LCDR1 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;the S7 LCDR1 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
остаток S8 LCDR1 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;residue S8 LCDR1 is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
остаток A2 LCDR2 мутирован в S;residue A2 LCDR2 mutated to S;
остаток N3 LCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;the N3 LCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
остаток S4 LCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;the S4 LCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
остаток L5 LCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, M, N, Q, R, S, T, V, W или Y;the L5 LCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, M, N, Q, R, S, T, V, W, or Y;
остаток Q6 LCDR2 мутирован в E, D или N;residue Q6 LCDR2 is mutated to E, D, or N;
остаток S7 LCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;the S7 LCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
остаток S3 LCDR3 мутирован в A;residue S3 LCDR3 mutated in A;
остаток D4 LCDR3 мутирован в N;residue D4 LCDR3 mutated to N;
остаток S5 LCDR3 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y; и остаток I6 LCDR3 мутирован в A, C, D, E, G, K, L, M, N, Q, R, S, T или V.the S5 LCDR3 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y; and LCDR3 residue I6 is mutated to A, C, D, E, G, K, L, M, N, Q, R, S, T, or V.
Кристаллическая структура комплекса антитела C4LB89 и CD154 показала, что антитело связывается с CD154 только по остаткам VH. Дополнительные анализы показали, что некоторые замены, показанные в табл. 19 и табл. 20, указанные выше в CDR антитела, не должны влиять на общую структуру комплекса и, следовательно, на характеристики антитела.The crystal structure of the complex of antibody C4LB89 and CD154 showed that the antibody binds to CD154 only at VH residues. Additional analyzes showed that some of the substitutions shown in table. 19 and tab. 20 above in the CDR of an antibody should not affect the overall structure of the complex and hence the characteristics of the antibody.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит определяющие комплементарность области легкой цепи (LCDR) 1, LCDR2 и LCDR3 сIn some embodiments, an antibody of the present invention comprises light chain complementarity determining regions (LCDRs) 1, LCDR2, and LCDR3 with
SEQ ID NO: 36, 43 и 51, соответственно;SEQ ID NOs: 36, 43 and 51, respectively;
SEQ ID NO: 37, 44 и 52, соответственно;SEQ ID NOs: 37, 44 and 52, respectively;
SEQ ID NO: 38, 45 и 53, соответственно;SEQ ID NOs: 38, 45 and 53, respectively;
SEQ ID NO: 39, 46 и 54, соответственно;SEQ ID NOs: 39, 46 and 54, respectively;
SEQ ID NO: 40, 47 и 55, соответственно;SEQ ID NOs: 40, 47 and 55, respectively;
SEQ ID NO: 41, 47 и 56, соответственно;SEQ ID NOs: 41, 47 and 56, respectively;
SEQ ID NO: 42, 48 и 57, соответственно;SEQ ID NOs: 42, 48 and 57, respectively;
SEQ ID NO: 37, 49 и 52, соответственно; илиSEQ ID NOs: 37, 49 and 52, respectively; or
SEQ ID NO: 37, 50 и 52, соответственно.SEQ ID NOs: 37, 50 and 52, respectively.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 37, 44 и 52, соответственно.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 37, 44, and 52, respectively.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23, 30, 37, 44 и 52, соответственно.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, 30, 37, 44, and 52, respectively.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23, 30, 37, 49 и 52, соответственно.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, 30, 37, 49, and 52, respectively.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23, 30, 37, 50 и 52, соответственно.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, 30, 37, 50, and 52, respectively.
В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс антитела изобретения и растворимого человеческого CD154 (shCD154) не активирует тромбоциты, причем активация тромбоцитов измеряется по экспрессии P-селектина на поверхности тромбоцитов.In some embodiments, the implementation of the immune complex of the antibody of the invention and soluble human CD154 (shCD154) does not activate platelets, and platelet activation is measured by the expression of P-selectin on the surface of platelets.
Активация тромбоцитов является хорошо известным процессом, превращающим гладкий неприкрепленный тромбоцит в липкую покрытую шипами частицу, которая высвобождает и экспрессирует биологически-активные вещества и приобретает способность связывать белок плазмы фибриноген. Активация также может происходить в результате физической стимуляции высоким сдвиговым напряжени- 8 040943 ем в жидкости, например, возникающим в месте критического сужения артерии (Quinn et al., 2005, Platelet Function: assessment, diagnosis, и treatment, Humana Press, pp. 3-20). Активация тромбоцитов приводит к активации внутриклеточных сигнальных путей, вызывающих усиление экспрессии на поверхности тромбоцитов P-селектина и увеличение аффинности связывания фибриногена с интегриновыми рецепторами αΠbβ3. Следовательно, активацию тромбоцитов можно измерять путем измерения повышения экспрессии P-селектина на поверхности или путем связывания зондирующего лиганда, например PAC-1, с интегрином αΠΕβ3 на тромбоцитах, например, при помощи проточной цитометрии. Антитела изобретения не активируют человеческие тромбоциты, если антитело в комплексе с shCD154 не повышает экспрессию P-селектина на поверхностности или не увеличивает связывание зондирующего лиганда (например, PAC-1) с интегрином αΠΕβ3 статистически достоверным образом в сравнении с индуцированной shCD154 экспрессией P-селектина на поверхности или связыванием зондирующего лиганда (например, PAC-1) с интегрином α^β3.Platelet activation is a well-known process that converts a smooth, unattached platelet into a sticky, spiked particle that releases and expresses bioactive substances and acquires the ability to bind the plasma protein fibrinogen. Activation can also occur as a result of physical stimulation by high fluid shear, such as that occurring at the site of critical arterial narrowing (Quinn et al., 2005, Platelet Function: assessment, diagnosis, and treatment, Humana Press, pp. 3 -20). Platelet activation leads to the activation of intracellular signaling pathways that cause an increase in the expression of P-selectin on the surface of platelets and an increase in the affinity of fibrinogen binding to αΠbβ3 integrin receptors. Therefore, platelet activation can be measured by measuring the increase in P-selectin expression on the surface, or by binding a probing ligand, eg PAC-1, to αΠΕβ3 integrin on platelets, eg by flow cytometry. Antibodies of the invention do not activate human platelets unless the antibody in combination with shCD154 increases surface P-selectin expression or increases the binding of a probing ligand (e.g., PAC-1) to αΠΕβ3 integrin in a statistically significant manner compared to shCD154-induced P-selectin expression on the surface. surface or by binding a probing ligand (eg, PAC-1) to the α^β3 integrin.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения имеет по меньшей мере одно из следующих свойств:In some embodiments, an antibody of the invention has at least one of the following properties:
связывается с CD154 с константой диссоциации(KD) около 5х10-9 М или менее, если KD измеряют с использованием системы ProteOn XPR36 при 25°C в фосфатно-солевом буферном растворе Дульбекко, содержащем 0,03% полисорбата P20 и 100 мкг/мл бычьего сывороточного альбумина;binds to CD154 with a dissociation constant (K D ) of about 5 x 10 -9 M or less when KD is measured using the ProteOn XPR36 system at 25° C. in Dulbecco's PBS containing 0.03% polysorbate P20 and 100 µg/mL bovine serum albumin;
ингибирует опосредованную CD154 пролиферацию B-клеток человека со значением IC50 около 2,7х10-9 М или менее; или ингибирует опосредованную CD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-kB минимального промотора интерферона-β (IFN-β) в клетках HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40, со значением IC50 около 2,1 х10-8 М или менее.inhibits CD154-mediated proliferation of human B cells with an IC 50 value of about 2.7 x 10 -9 M or less; or inhibits CD154-mediated expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by NF-kB inducible minimal interferon-β (IFN-β) promoter in HEK293 cells stably expressing SEAP and human CD40, with an IC 50 value of about 2.1 x 10 -8 M or less.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения связывает CD154 с константой диссоциации (KD) около 5х10-9 М или менее, около 1х10-9 М или менее, около 5х10-10 М или менее, около 1х10-10 М или менее, около 5х10’11 М или менее, или около 1х10’11 M или менее.In some embodiments, an antibody of the invention binds CD154 with a dissociation constant (KD) of about 5 x 10 -9 M or less, about 1 x 10 -9 M or less, about 5 x 10 -10 M or less, about 1 x 10 -10 M or less, about 5 x 10'11 M or less, or about 1x10'11 M or less.
В некоторых вариантах осуществления антитело, специфически связывающее CD154, перекрестно реагирует с CD154 Масаса fascicularis (яванский макак) или CD154 Callithrix jacchus (игрунка).In some embodiments, an antibody specifically binding to CD154 cross-reacts with CD154 Macaca fascicularis (cynomolgus monkey) or CD154 Callithrix jacchus (marmoset).
Аффинность антитела к CD154 человека, яванского макака или игрунки можно определять экспериментально с использованием любого приемлемого способа. Такие способы могут включать применение оборудования ProteOn XPR36, Biacore 3000 или KinExA, твердофазный иммуноферментный анализ (ИФА) или анализы конкурентного связывания, известные специалистам в данной области. Измеренное значение аффинности взаимодействия конкретного антитела с CD154 может изменяться при измерении в различных условиях (например, осмолярность, pH). Таким образом, измерения аффинности и других параметров связывания (например, KD, Kon, Koff), как правило, выполняются в стандартизированных условиях и с применением стандартизированного буферного раствора, такого как буферный раствор, описанный в настоящем документе. Специалистам в данной области будет понятно, что внутренняя ошибка измерений аффинности, например, с применением Biacore 3000 или ProteOn (измеряемая как стандартное отклонение, CO), как правило, для измерений может находиться в пределах 5-33%, оказываясь в границах типичных пределов обнаружения. Следовательно, термин около характеризует типичное стандартное отклонение при анализе. Например, типичное CO для значения KD, равного 1х10-9 M, составляет до ±0,33х10’9 M.The affinity of an antibody for human, cynomolgus or marmoset CD154 can be determined experimentally using any suitable method. Such methods may include the use of ProteOn XPR36, Biacore 3000 or KinExA equipment, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), or competitive binding assays known to those skilled in the art. The measured affinity value for the interaction of a particular antibody with CD154 may vary when measured under different conditions (eg, osmolarity, pH). Thus, measurements of affinity and other binding parameters (eg, KD, K on , K off ) are typically performed under standardized conditions and using a standardized buffer solution, such as the buffer solution described herein. Those skilled in the art will appreciate that the intrinsic error of affinity measurements, such as those using Biacore 3000 or ProteOn (measured as standard deviation, CO), can typically be in the range of 5-33% for measurements, falling within typical detection limits. . Therefore, the term about characterizes the typical standard deviation in the analysis. For example, a typical CO for a KD value of 1 x 10 -9 M is up to ±0.33 x 10' 9 M.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения ингибирует опосредованную CD154 пролиферацию В-клеток человека со значением IC50 около 2,7х10-9 М или менее.In some embodiments, an antibody of the invention inhibits CD154-mediated human B cell proliferation with an IC 50 value of about 2.7 x 10 -9 M or less.
При анализе пролиферации В-клеток 1х105 В-клеток из миндалин человека можно культивировать со 100 нг/мл рекомбинантного человеческого IL-21, 0,5 мкг/мл тримерного рекомбинантного растворимого человеческого CD154, экспрессированного в виде гибридного белка лейциновая застежка, и с антителами к CD154 в диапазоне 0,000064-25 мкг/мл в конечном объеме 200 мкл/лунку. После 2 дней инкубации к культурам можно добавлять метил (-ЗН)-тимидин (0,5 мкКи/лунку) и можно определять влияние антител на пролиферацию человеческих В-клеток после инкубации в течение ночи.In a B cell proliferation assay, 1 x 10 5 B cells from human tonsils can be cultured with 100 ng/ml recombinant human IL-21, 0.5 μg/ml trimeric recombinant soluble human CD154 expressed as a leucine zipper fusion protein, and antibodies to CD154 in the range of 0.000064-25 µg/ml in a final volume of 200 µl/well. After 2 days of incubation, methyl (-3H)-thymidine (0.5 μCi/well) can be added to cultures and the effect of antibodies on human B cell proliferation can be determined after overnight incubation.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения ингибирует индуцированную CD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-kB минимального промотора интерферона-β (IFN-β) в клетках HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40, со значением IC50 около 2,1х10-8 М или менее.In some embodiments, an antibody of the invention inhibits CD154-induced expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by an NF-kB inducible minimal interferon-β (IFN-β) promoter in HEK293 cells stably expressing SEAP and human CD40, with an IC 50 value of about 2 , 1x10 -8 M or less.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения ингибирует индуцированную CD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-kB минимального промотора интерферона-β в клетках HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40, со значением IC50 от около 2,1х10-8 М до 5,4х10-10 M.In some embodiments, an antibody of the invention inhibits CD154-induced expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by an NF-kB inducible minimal interferon-β promoter in HEK293 cells stably expressing SEAP and human CD40, with an IC 50 value of about 2.1 x 10 -8 M up to 5.4x10 -10 M.
Можно использовать, например, клетки HEK-Blue™ CD40L (InvivoGen, г. Сан-Диего, штат Калифорния, США). Человеческий CD154 можно предоставлять в виде гибридного белка тримерного раство- 9 040943 римого CD154-лейциновая застежка. С использованием хорошо известных методов можно обнаруживать сигнал от секретируемой щелочной фосфатазы и рассчитывать значение IC50 для ингибирования.For example, HEK-Blue™ CD40L cells (InvivoGen, San Diego, CA, USA) can be used. Human CD154 can be provided as a trimeric soluble CD154-leucine zipper fusion protein. Using well known methods, the secreted alkaline phosphatase signal can be detected and the IC 50 value for inhibition calculated.
В некоторых вариантах осуществления в гомотримере CD154 антитело изобретения связывает одновременно первый мономер CD154 и второй мономер CD154.In some embodiments, in a CD154 homotrimer, an antibody of the invention binds both a first CD154 monomer and a second CD154 monomer.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения связывает по меньшей мере один, два, три, четыре, пять, шесть, семь или восемь остатков CD154 в первом мономере CD154 в пределах аминокислотных остатков 182-207 CD154 с SEQ ID NO: 1.In some embodiments, an antibody of the invention binds at least one, two, three, four, five, six, seven, or eight CD154 residues in the first CD154 monomer within amino acid residues 182-207 of CD154 of SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения связывает по меньшей мере один, два, три, четыре, пять, шесть, семь или восемь остатков CD154 во втором мономере CD154 в пределах аминокислотных остатков 176-253 CD154 с SEQ ID NO: 1.In some embodiments, an antibody of the invention binds at least one, two, three, four, five, six, seven, or eight CD154 residues in the second CD154 monomer within amino acid residues 176-253 of CD154 of SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения связывает остатки E182, S185, Q186, A187, P188, S214, A215 и R207 в первом мономере CD154, причем нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 1.In some embodiments, an antibody of the invention binds residues E182, S185, Q186, A187, P188, S214, A215, and R207 on the first CD154 monomer, with residue numbering according to SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения связывает остатки T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250 и F253 во втором мономере CD154, причем нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 1.In some embodiments, an antibody of the invention binds residues T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250, and F253 on a second CD154 monomer, with residue numbering according to SEQ ID NO: 1.
В пределах означает, что антитело связывает только остатки в пределах диапазонов аминокислот 182-207, 176-354 или 182-207 и 176-354.Within means that the antibody only binds residues within the ranges of amino acids 182-207, 176-354, or 182-207 and 176-354.
Примером такого антитела является антитело C4LB89. Поскольку вариабельные области антител C4LB235 и C4LB236 отличаются при сравнении от таковых C4LB89 на один аминокислотный остаток в LCDR2, и поскольку C4LB231 и C4LB232 имеют идентичные C4LB89 последовательности VH/VL, ожидается, что эти антитела также будут связывать тот же эпитоп CD154, что и C4LB89.An example of such an antibody is the C4LB89 antibody. Since the variable regions of antibodies C4LB235 and C4LB236 differ from those of C4LB89 by one amino acid residue in LCDR2 when compared, and since C4LB231 and C4LB232 have identical VH/VL sequences to C4LB89, these antibodies are also expected to bind the same CD154 epitope as C4LB89.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения связывает человеческий CD154 при помощи паратопных остатков, находящихся в VH антитела.In some embodiments, an antibody of the invention binds human CD154 using paratopic residues found in the VH of the antibody.
Паратопный остаток представляет собой остаток в VH или VL антитела, находящийся на расстоянии в пределах 4 А от остатков CD154. Паратопные остатки можно идентифицировать по кристаллическим структурам комплекса антитела с CD154.A paratopic residue is a residue in the VH or VL of an antibody within 4 A of the CD154 residues. Paratopic residues can be identified by the crystal structures of the antibody-CD154 complex.
Примером антитела, которое связывает CD154 только при помощи паратопных остатков VH, без контакта VL с антигеном, является антитело, содержащее VH и VL антитела C4LB89. Поскольку вариабельные области C4LB235 и C4LB236 отличаются от таковых C4LB89 на один аминокислотный остаток в LCDR2, и поскольку C4LB231 и C4LB232 имеют последовательности VH/VL, идентичные с C4LB89, ожидается, что эти антитела также будут связывать CD154 при помощи только остатков VH. Антитела, которые связывают CD154 в пределах остатков 182-207 или 176-354 SEQ ID NO: 1 или остатков E182, S185, Q186, A187, P188, S214, A215 и R207 в первом мономере CD154 и остатков T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250 и F253 во втором мономере CD154 гомотримера CD154 не способны активировать тромбоциты, хотя и способны взаимодействовать с FcyR, включая FcyRIIa. Следовательно, эти антитела могут иметь улучшенный профиль безопасности по сравнению с другими антителами, специфически связывающими CD154.An example of an antibody that binds CD154 only with VH paratopic residues, without VL contact with antigen, is an antibody containing the VH and VL of the C4LB89 antibody. Since the variable regions of C4LB235 and C4LB236 differ from those of C4LB89 by one amino acid residue in LCDR2, and since C4LB231 and C4LB232 have identical VH/VL sequences to C4LB89, these antibodies are also expected to bind CD154 using only VH residues. Antibodies that bind CD154 within residues 182-207 or 176-354 of SEQ ID NO: 1 or residues E182, S185, Q186, A187, P188, S214, A215 and R207 in the first monomer of CD154 and residues T176, F177, C178, Q220 , S248, H249, G250, and F253 in the second CD154 monomer of the CD154 homotrimer are unable to activate platelets, although they are able to interact with FcyRs, including FcyRIIa. Therefore, these antibodies may have an improved safety profile compared to other antibodies that specifically bind CD154.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH) с SEQ ID NO: 59, причем необязательно VH содержит одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises a heavy chain variable region (VH) of SEQ ID NO: 59, optionally the VH comprises one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH) с SEQ ID NO: 59.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a heavy chain variable region (VH) of SEQ ID NO: 59.
Антитело, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, или содержащее HCDR VH с SEQ ID NO: 59 или VH с SEQ ID NO: 59, связывает CD154 при помощи только VH антитела. Следовательно, VH с SEQ ID NO: 59 или VH, содержащую HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, можно комбинировать с последовательностью вариабельной области легкой цепи (VL), а связывание полученного антитела с CD154 можно тестировать с использованием анализов, описанных в настоящем документе, с получением антитела, специфически связывающего CD154.An antibody containing HCDR1, HCDR2 and HCDR3 of SEQ ID NOs: 17, 23 and 30, respectively, or containing HCDR VH of SEQ ID NO: 59 or VH of SEQ ID NO: 59 binds CD154 with the VH antibody alone. Therefore, a VH of SEQ ID NO: 59 or a VH containing HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NO: 17, 23, and 30, respectively, can be combined with a light chain variable region (VL) sequence, and binding of the resulting antibody to CD154 can be tested using the assays described herein to produce an antibody that specifically binds CD154.
Например, VH, содержащую HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, или VH с SEQ ID NO: 59, можно использовать для скринингового поиска доменов VL, способных образовывать двухдоменный специфический антигенсвязывающий фрагмент, способный связываться с CD154. Такой скрининг может осуществляться с помощью методов скрининга с фаговым дисплеем, например с использованием иерархического двойного комбинаторного подхода, описанного в публикации PCT № WO1992/01047. При таком подходе индивидуальную колонию, содержащую либо клон цепи H, либо клон цепи L, например VH с SEQ ID NO: 59, используют для инфицирования всей библиотеки клонов, кодирующих другую цепь (L или H), а полученный двухцепочечный специфический антигенсвязывающий домен отбирают в соответствии с методиками фагового дисплея, описанными в настоящем документе, и тестируют на связывание и антагонистическую активность в отношении CD154.For example, a VH containing HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOs: 17, 23, and 30, respectively, or a VH of SEQ ID NO: 59 can be used to screen for VL domains capable of forming a dual-domain specific antigen-binding fragment capable of binding to CD154. Such screening can be performed using phage display screening methods, for example using the hierarchical dual combinatorial approach described in PCT Publication No. WO1992/01047. In this approach, an individual colony containing either an H chain clone or an L chain clone, such as VH with SEQ ID NO: 59, is used to infect the entire library of clones encoding the other chain (L or H), and the resulting double-stranded specific antigen-binding domain is selected in according to the phage display techniques described herein and tested for binding and antagonistic activity against CD154.
Альтернативно, VH с SEQ ID NO: 59 или VH, содержащую HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ IDAlternatively, a VH of SEQ ID NO: 59 or a VH containing HCDR1, HCDR2 and HCDR3 of SEQ ID
- 10 040943- 10 040943
NO: 17, 23 и 30, соответственно, можно комбинировать с доменами VL существующих антител к CD154 или описанных в настоящем документе антител к CD154, а полученное антитело тестируют на связывание и антагонистическую активность в отношении CD154.NO: 17, 23 and 30, respectively, can be combined with the VL domains of existing anti-CD154 antibodies or anti-CD154 antibodies described herein, and the resulting antibody is tested for binding and antagonistic activity against CD154.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит вариабельную область легкой цепи (VL) с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73, причем необязательно VL содержит одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a light chain variable region (VL) of SEQ ID NOs: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, or 73, with optional VL containing one, two, three, four, five , six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a VH of SEQ ID NO: 59 and a VL of SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, or 73.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит вариабельную область легкой цепи (VL) с SEQ ID NO: 66, 72 или 73, причем необязательно VL содержит одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a light chain variable region (VL) of SEQ ID NO: 66, 72, or 73, optionally the VL comprises one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven , twelve, thirteen, fourteen or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66.In some embodiments, an antibody of the invention comprises VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 72.In some embodiments, an antibody of the invention comprises VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 72.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 73.In some embodiments, an antibody of the invention comprises VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 73.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит по меньшей мере замену в области Fc, причем антитело не активирует человеческие тромбоциты.In some embodiments, an antibody of the invention contains at least a substitution in the Fc region, and the antibody does not activate human platelets.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения имеет сниженное связывание с FcyRI, FcyRIIa, FcyRIIb, FcyRIIIa или FcyRIIIb.In some embodiments, an antibody of the invention has reduced binding to FcyRI, FcyRIIa, FcyRIIb, FcyRIIIa, or FcyRIIIb.
Сниженное связывание означает уменьшенное связывание антител изобретения, имеющих по меньшей мере одну замену в области Fc, с рецептором FcyR по сравнению со связыванием родительского антитела, не имеющего этой замены, с тем же рецептором FcyR. Сниженное связывание может представлять собой по меньшей мере приблизительно 100-кратно, по меньшей мере приблизительно 500кратно, по меньшей мере приблизительно 1000-кратно, по меньшей мере приблизительно 5000-кратно, по меньшей мере приблизительно 10000-кратно, или по меньшей мере приблизительно 20000-кратно сниженное связывание. На практике, антитела, показывающие сниженное связывание с конкретным FcyR, представляют собой антитела, имеющие статистически незначимую эффекторную функцию, опосредованную конкретным FcyR.Reduced binding means reduced binding of the antibodies of the invention having at least one substitution in the Fc region to the FcyR receptor compared to the binding of the parent antibody lacking the substitution to the same FcyR receptor. The reduced binding may be at least about 100-fold, at least about 500-fold, at least about 1000-fold, at least about 5000-fold, at least about 10000-fold, or at least about 20000-fold. fold reduced binding. In practice, antibodies showing reduced binding to a particular FcyR are those having a statistically non-significant effector function mediated by a particular FcyR.
В некоторых вариантах осуществления, антитело изобретения содержит по меньшей мере одну замену в области Fc.In some embodiments, an antibody of the invention contains at least one substitution in the Fc region.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна замена в области Fc представляет собой замену L234A, L235A, G237A, P238S, M252Y, S254T, T256E, H268A, A330S или P331S, причем нумерация остатков соответствует индексу EU.In some embodiments, at least one substitution in the Fc region is an L234A, L235A, G237A, P238S, M252Y, S254T, T256E, H268A, A330S, or P331S substitution, with the residue numbering corresponding to the EU index.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит замены L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S или P331S в области Fc, причем нумерация остатков соответствует индексу EU.In some embodiments, an antibody of the invention contains substitutions L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S, or P331S in the Fc region, with residue numbering corresponding to the EU index.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна замена в области Fc представляет собой замену V234A, G237A, P238S, M252Y, S254T, T256E, H268A, V309L, A330S или P331S, причем нумерация остатков соответствует индексу EU.In some embodiments, at least one substitution in the Fc region is a V234A, G237A, P238S, M252Y, S254T, T256E, H268A, V309L, A330S, or P331S substitution, with the residue numbering corresponding to the EU index.
В некоторых вариантах осуществления, антитело изобретения содержит замены V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S и P331S в области Fc, причем нумерация остатков соответствует индексу EU.In some embodiments, an antibody of the invention contains substitutions V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S, and P331S in the Fc region, with residue numbering corresponding to the EU index.
В изобретении также предлагается антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее тяжелую цепь с SEQ ID NO: 80, и легкую цепь с SEQ ID NO: 81.The invention also provides an antagonistic antibody or antigen-binding site thereof specifically binding CD154 of SEQ ID NO: 1, comprising a heavy chain of SEQ ID NO: 80 and a light chain of SEQ ID NO: 81.
В изобретении также предлагается антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее тяжелую цепь с SEQ ID NO: 82, и легкую цепь с SEQ ID NO: 81.The invention also provides an antagonistic antibody or antigen-binding site thereof specifically binding CD154 of SEQ ID NO: 1, comprising a heavy chain of SEQ ID NO: 82 and a light chain of SEQ ID NO: 81.
В изобретении также предлагается антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее тяжелую цепь с SEQ ID NO: 83, и легкую цепь с SEQ ID NO: 81.The invention also provides an antagonistic antibody or antigen-binding site thereof specifically binding CD154 of SEQ ID NO: 1, comprising a heavy chain of SEQ ID NO: 83 and a light chain of SEQ ID NO: 81.
- 11 040943- 11 040943
SEQ ID NO: 80 (C4LB89 VH на IgGlsigma: C4LB231 HC)SEQ ID NO: 80 (C4LB89 VH on IgGlsigma: C4LB231 HC)
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISPIFGNTN YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRYYGDLDYWGQGTLVTVSSASTKG PSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSW TVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGASSVFLFPPKPKDT LMISRTPEVTCVWDVSAEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWL NGKEYKCKVSNKALPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIA VEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLS LSPGKQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISPIFGNTN YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRYYGDLDYWGQGTLVTVSSASTKG PSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSW TVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGASSVFLFPPKPKDT LMISRTPEVTCVWDVSAEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWL NGKEYKCKVSNKALPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIA VEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLS LSPGK
SEQ ID NO: 81 (легкая цепь C4LB89 и C4LB231)SEQ ID NO: 81 (light chain C4LB89 and C4LB231)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYYANSLQSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSDSIPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDE QLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYE KHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYYANSLQSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSDSIPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDE QLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSKDSTYSLSSTLTLSKADYVTKSFACE KHQNSFACE
SEQ ID NO: 82 (C4LB89 VH на IgGlsigmaYTE)SEQ ID NO: 82 (C4LB89 VH on IgGlsigmaYTE)
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISPIFGNTN YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRYYGDLDYWGQGTLVTVSSASTKG PSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSW TVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGASSVFLFPPKPKDT LYITREPEVTCVWDVSAEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWL NGKEYKCKVSNKALPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIA VEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLS LSPGKQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISPIFGNTN YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRYYGDLDYWGQGTLVTVSSASTKG PSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSW TVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGASSVFLFPPKPKDT LYITREPEVTCVWDVSAEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWL NGKEYKCKVSNKALPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIA VEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLS LSPGK
SEQ ID NO: 83 (C4LB89 VH на IgG2sigma)SEQ ID NO: 83 (C4LB89 VH on IgG2sigma)
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISPIFGNTNQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISPIFGNTN
YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRYYGDLDYWGQGTLVTVSSASTKG PSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSW TVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTVERKCCVECPPCPAPPAAASSVFLFPPKPKDTLMISPKDTLMIS
RT PEVT CVWDVS AEDPEVQ FNWYVDGVEVHNAKTKPREE Q FNS T FRWS VL TVLHQDWLNGKERT PEVT CVWDVS AEDPEVQ FNWYVDGVEVHNAKTKPREE Q FNS T FRWS VL TVLHQDWLNGKE
YKCKVSNKGLPSSIEKTISKTKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKTKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE
SNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGSNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
КTO
Иммуноэффекторные свойства антител изобретения также могут быть усилены или ослаблены за счет модификаций Fc с использованием методик, хорошо известных специалистам в данной области. Например, эффекторные функции Fc, такие как связывание C1q, комплемент-зависимая цитотоксичность (CDC), антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность (ADCC), фагоцитоз, понижение регуляции рецепторов клеточной поверхности (например, рецептора B-клеток; BCR) и т. д., могут обеспечиваться и/или управляться модифицируемыми остатками в Fc, отвечающими за эти действия. Например, замены Fc V234A/G237A/P238S, V234A/G237A/H268Q, H268A/V309L/A330S/P331 или V2 34A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S (международная патентная публикация № WO11/066501), или L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S можно вводить в антитела изобретения.The immune effector properties of the antibodies of the invention can also be enhanced or attenuated by Fc modifications using techniques well known to those skilled in the art. For example, Fc effector functions such as C1q binding, complement dependent cytotoxicity (CDC), antibody dependent cell mediated cytotoxicity (ADCC), phagocytosis, downregulation of cell surface receptors (e.g., B cell receptor; BCR), etc. , may be provided and/or controlled by modifiable residues in Fc responsible for these actions. For example, Fc substitutions V234A/G237A/P238S, V234A/G237A/H268Q, H268A/V309L/A330S/P331 or V2 34A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S (International Patent Publication No. WO11/066501), or L2634A /L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S can be incorporated into the antibodies of the invention.
Связывание антител изобретения с FcyRI, FcYRIIa, FcYRIIb, FcyRIIIa и FcYRIIIb можно оценивать с использованием рекомбинантных растворимых форм или ассоциированных с клетками форм рецепторов Fcy. Например, можно применять прямые или непрямые измерения, например конкурентное связывание, для оценки относительных аффинностей и авидностей антител изобретения к различным FcyR. В одном примере анализа оценивают связывание тестируемого антитела с растворимым FcyR, захваченным на планшете, с использованием конкурентного связывания между 1 мкг/мл биотинилированного человеческого IgG1 и последовательных разведений тестируемого антитела в виде предкомплекса с антигеном.The binding of antibodies of the invention to FcyRI, FcYRIIa, FcYRIIb, FcyRIIIa and FcYRIIIb can be assessed using recombinant soluble forms or cell-associated forms of the Fcy receptors. For example, direct or indirect measurements, such as competitive binding, can be used to evaluate the relative affinities and avidities of the antibodies of the invention for various FcyRs. In one assay example, the binding of a test antibody to soluble FcyR captured on a plate is assessed using competitive binding between 1 μg/ml of biotinylated human IgG1 and serial dilutions of the test antibody as a precomplex with antigen.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения имеет сниженную антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC), антителозависимый клеточный фагоцитоз (ADCP) и/или комплемент-зависимую цитотоксичность (CDC).In some embodiments, an antibody of the invention has reduced antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC), antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP), and/or complement-dependent cytotoxicity (CDC).
- 12 040943- 12 040943
Термины антителозависимая клеточная цитотоксичность, антителозависимая клеточноопосредованная цитотоксичность или ADCC представляют собой механизм индукции гибели клеток, который зависит от взаимодействия покрытых антителами клеток-мишеней с эффекторными клетками, обладающими литической активностью, например естественными киллерными клетками, моноцитами, макрофагами и нейтрофилами, посредством гамма-рецепторов Fc (FcyR), экспрессирующихся на эффекторных клетках. Например, NK-клетки экспрессируют FcyRIIIa, тогда как моноциты экспрессируют FcyRI, FcyRII и FcyRIIIa. Для оценки активности ADCC антител изобретения данное антитело можно добавлять к клеткам-мишеням в комбинации с эффекторными клетками иммунной системы, которые могут быть активированы комплексами антиген-антитело, что приводит к цитолизу клетки-мишени. Цитолиз по существу обнаруживают по высвобождению из лизированных клеток метки (например, радиоактивных субстратов, флуоресцентных красителей или естественных внутриклеточных белков). Примеры эффекторных клеток для таких анализов включают мононуклеарные клетки периферической крови (PBMC) и NK-клетки. Примерами клеток-мишеней являются клетки D1.1 Jurkat (ATCC® CRL-10915™) или Tклетки, экспрессирующие CD154.The terms antibody-dependent cellular cytotoxicity, antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity, or ADCC is a mechanism for inducing cell death that depends on the interaction of antibody-coated target cells with effector cells with lytic activity, such as natural killer cells, monocytes, macrophages, and neutrophils, via Fc gamma receptors. (FcyR) expressed on effector cells. For example, NK cells express FcyRIIIa while monocytes express FcyRI, FcyRII and FcyRIIIa. To assess the ADCC activity of the antibodies of the invention, the antibody can be added to target cells in combination with effector cells of the immune system, which can be activated by antigen-antibody complexes, resulting in cytolysis of the target cell. Cytolysis is essentially detected by the release of labels (eg, radioactive substrates, fluorescent dyes, or natural intracellular proteins) from lysed cells. Examples of effector cells for such assays include peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and NK cells. Examples of target cells are D1.1 Jurkat cells (ATCC® CRL-10915™) or T cells expressing CD154.
Антителозависимый клеточный фагоцитоз (ADCP) относится к механизму уничтожения покрытых антителами клеток-мишеней путем интернализации фагоцитарными клетками, такими как макрофаги или дендритные клетки. ADCP можно оценивать с использованием образовавшихся из моноцитов макрофагов в качестве эффекторных клеток и клеток D1.1 Jurkat, экспрессирующих CD154, сконструированных с возможностью экспрессии GFP или другой маркирующей молекулы, в качестве клетокмишеней. Соотношение эффекторные клетки: клетки-мишени может составлять, например, 4: 1. Эффекторные клетки можно инкубировать с клетками-мишенями в течение 4 часов с тестовым антителом к CD154 или без него. После инкубации клетки можно отделять с помощью аккутазы. Идентификацию макрофагов можно проводить с помощью антител к CD11b и к CD14, связанных с флуоресцентной меткой, а процент фагоцитоза можно определять на основании % флуоресцентного GFP в макрофагах CD11+CD14+ с помощью стандартных методов.Antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP) refers to a mechanism for killing antibody-coated target cells by internalization by phagocytic cells such as macrophages or dendritic cells. ADCP can be assessed using monocyte-derived macrophages as effector cells and CD154-expressing D1.1 Jurkat cells engineered to express GFP or another labeling molecule as target cells. The ratio of effector cells:target cells can be, for example, 4:1. Effector cells can be incubated with target cells for 4 hours with or without test anti-CD154 antibody. After incubation, cells can be separated using accutase. Identification of macrophages can be done with anti-CD11b and anti-CD14 antibodies associated with a fluorescent label, and the percentage of phagocytosis can be determined based on the % fluorescent GFP in CD11+CD14+ macrophages using standard methods.
Комплемент-зависимая цитотоксичность или CDC, относится к механизму индукции гибели клеток, в рамках которого эффекторный домен Fc связанного с мишенью антитела связывает и активирует компонент комплемента C1q, который в свою очередь активирует каскад комплемента, приводящий к гибели клетки-мишени. Активация комплемента может также приводить к осаждению компонентов комплемента на поверхности клеток-мишеней, что облегчает ADCC посредством связывания на лейкоцитах рецепторов комплемента (например, CR3). CDC для клеток, экспрессирующих CD154, можно измерять, например, высевая клетки Jurkat в подходящую среду, добавляя в смесь антитела к CD154, с последующим добавлением объединенной человеческой сыворотки. После периода инкубации можно определять процентную долю (%) лизированных клеток как % клеток, окрашенных пропидия йодидом, в анализе цитометрии посредством сортировки клеток с активацией флуоресценции (FACS) с помощью стандартных методов.Complement-dependent cytotoxicity, or CDC, refers to a cell death induction mechanism in which the Fc effector domain of a target-bound antibody binds and activates the C1q complement component, which in turn activates the complement cascade leading to the death of the target cell. Complement activation can also lead to the deposition of complement components on the surface of target cells, which facilitates ADCC by binding complement receptors (eg, CR3) on leukocytes. The CDC for cells expressing CD154 can be measured, for example, by seeding Jurkat cells in a suitable medium, adding anti-CD154 antibodies to the mixture, followed by the addition of pooled human serum. After the incubation period, the percentage (%) of lysed cells can be determined as % cells stained with propidium iodide in a fluorescence activated cell sorting (FACS) cytometry analysis using standard methods.
Сниженная ADCC, сниженная CDC и сниженная ADCP представляет собой индуцированную антителами ADCC, CDC и/или ADCP, которая является статистически незначимой в стандартных анализах для измерения ADCC, CDC и/или ADCP, например в анализах, описанных в настоящем документе, или в анализах, описанных в патенте США № 8,871,204.Decreased ADCC, reduced CDC, and reduced ADCP is antibody-induced ADCC, CDC, and/or ADCP that is not statistically significant in standard assays for measuring ADCC, CDC, and/or ADCP, such as in the assays described herein or in assays described in US Pat. No. 8,871,204.
Антитела изобретения с желаемой аффинностью и профилем нейтрализации могут быть выбраны из библиотек вариантов или фрагментов при помощи отбора методом пэннинга с CD154 человека или CD154 игрунки и необязательно с применением дополнительного созревания аффинности антител. В примере проведения операции пэннинга фаговые библиотеки можно подвергать пэннингу с CD154 игрунки. Альтернативно, антитела изобретения можно получать путем иммунизации мышей CD154 человека и/или CD154 игрунки и скрининга гибридом на связывание с человеческим CD154, с последующим оцениванием антагонистических свойств антител с использованием описанных в настоящем документе способов.Antibodies of the invention with the desired affinity and neutralization profile can be selected from libraries of variants or fragments using panning selection from human CD154 or marmoset CD154, and optionally using additional antibody affinity maturation. In an example of a panning operation, phage libraries can be panned with marmoset CD154. Alternatively, antibodies of the invention can be generated by immunizing mice with human CD154 and/or marmoset CD154 and screening the hybridomas for binding to human CD154, followed by evaluation of antibody antagonist properties using the methods described herein.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения конкурирует за связывание с CD154 с антителом, содержащим VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66.In some embodiments, an antibody of the invention competes for binding to CD154 with an antibody containing VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66.
Конкуренцию за специфическое связывание с CD154 между антителами изобретения, содержащими определенные последовательности VH и VL, можно анализировать in vitro с использованием хорошо известных методов. Например, связывание меченых сложным эфиром NHS MSD Sulfo-Tag™ антител с CD154 в присутствии немеченого антитела можно анализировать твердофазным ИФА, или с помощью анализов Bioacore, или для демонстрации конкуренции с антителами настоящего изобретения можно использовать проточную цитометрию. Антитело конкурирует за связывание с CD154 с эталонным антителом (например, антителом, содержащим VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66), если антитело ингибирует связывание эталонного антитела с CD154 на 80% или более, например на 85% или более, на 90% или более, или 95% или более.Competition for specific binding to CD154 between antibodies of the invention containing certain VH and VL sequences can be analyzed in vitro using well known methods. For example, binding of NHS MSD Sulfo-Tag™ ester labeled antibodies to CD154 in the presence of unlabeled antibody can be analyzed by solid phase ELISA or Bioacore assays, or flow cytometry can be used to demonstrate competition with antibodies of the present invention. An antibody competes for binding to CD154 with a reference antibody (e.g., an antibody containing VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66) if the antibody inhibits binding of the reference antibody to CD154 by 80% or more, e.g., 85% or more, 90% or more, or 95% or more.
В некоторых вариантах осуществления VH с SEQ ID NO: 59 можно комбинировать с VL любых антител к CD154, описанных в международных патентных публикациях № WO1993/08207, WO1994/10308,In some embodiments, the VH of SEQ ID NO: 59 can be combined with the VL of any of the anti-CD154 antibodies described in International Patent Publication Nos. WO1993/08207, WO1994/10308,
- 13 040943- 13 040943
WO1996/40918, WO1993/009812, WO1999/051258, WO1995/006480, WO1995/006481, WO1995/006666,WO1996/40918, WO1993/009812, WO1999/051258, WO1995/006480, WO1995/006481, WO1995/006666,
WO2001/002057, WO1997/017446, WO1999/012566, WO2001/068860, WO2005/003175, WO2006/033702,WO2001/002057, WO1997/017446, WO1999/012566, WO2001/068860, WO2005/003175, WO2006/033702,
WO2006/030220, WO2008/118356, WO2012/052205, WO2012/138768, WO2012/138768, WO2013/055745 иWO2006/030220, WO2008/118356, WO2012/052205, WO2012/138768, WO2012/138768, WO2013/055745 and
WO2013/056068 с получением антагонистического антитела к CD154. Связывающую и антагонистическую активность полученных антител можно тестировать с использованием анализов и протоколов, опи санных в настоящем документе.WO2013/056068 to produce an anti-CD154 antagonist antibody. The binding and antagonistic activity of the resulting antibodies can be tested using the assays and protocols described herein.
В изобретении также предлагается антагонистическое антитело, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 сThe invention also provides an antagonist antibody that specifically binds CD154 with SEQ ID NO: 1, containing HCDR1, HCDR2 and HCDR3 with
SEQ ID NO: 16, 22 и 29, соответственно;SEQ ID NOs: 16, 22 and 29, respectively;
SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно;SEQ ID NOs: 17, 23 and 30, respectively;
SEQ ID NO: 16, 24 и 31, соответственно;SEQ ID NOs: 16, 24 and 31, respectively;
SEQ ID NO: 18, 25 и 32, соответственно;SEQ ID NOs: 18, 25 and 32, respectively;
SEQ ID NO: 19, 26 и 33, соответственно;SEQ ID NOs: 19, 26 and 33, respectively;
SEQ ID NO: 20, 27 и 34, соответственно; илиSEQ ID NOs: 20, 27 and 34, respectively; or
SEQ ID NO: 21, 28 и 35, соответственно.SEQ ID NOs: 21, 28 and 35, respectively.
В изобретении также предлагается антагонистическое антитело, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 сThe invention also provides an antagonist antibody that specifically binds CD154 with SEQ ID NO: 1, containing HCDR1, HCDR2 and HCDR3 with
SEQ ID NO: 16, 22 и 29, соответственно;SEQ ID NOs: 16, 22 and 29, respectively;
SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно;SEQ ID NOs: 17, 23 and 30, respectively;
SEQ ID NO: 16, 24 и 31, соответственно;SEQ ID NOs: 16, 24 and 31, respectively;
SEQ ID NO: 18, 25 и 32, соответственно;SEQ ID NOs: 18, 25 and 32, respectively;
SEQ ID NO: 19, 26 и 33, соответственно;SEQ ID NOs: 19, 26 and 33, respectively;
SEQ ID NO: 20, 27 и 34, соответственно; илиSEQ ID NOs: 20, 27 and 34, respectively; or
SEQ ID NO: 21, 28 и 35, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 сSEQ ID NOs: 21, 28, and 35, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 with
SEQ ID NO: 36, 43 и 51, соответственно;SEQ ID NOs: 36, 43 and 51, respectively;
SEQ ID NO: 37, 44 и 52, соответственно;SEQ ID NOs: 37, 44 and 52, respectively;
SEQ ID NO: 38, 45 и 53, соответственно;SEQ ID NOs: 38, 45 and 53, respectively;
SEQ ID NO: 39, 46 и 54, соответственно;SEQ ID NOs: 39, 46 and 54, respectively;
SEQ ID NO: 40, 47 и 55, соответственно;SEQ ID NOs: 40, 47 and 55, respectively;
SEQ ID NO: 41, 47 и 56, соответственно;SEQ ID NOs: 41, 47 and 56, respectively;
SEQ ID NO: 42, 48 и 57, соответственно;SEQ ID NOs: 42, 48 and 57, respectively;
SEQ ID NO: 37, 49 и 52, соответственно; илиSEQ ID NOs: 37, 49 and 52, respectively; or
SEQ ID NO: 37, 50 и 52, соответственно.SEQ ID NOs: 37, 50 and 52, respectively.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 16, 22 и 29, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 36, 43 и 51, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 58 и VL с SEQ ID NO: 65.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 16, 22, and 29, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 36, 43, and 51, respectively; or VH of SEQ ID NO: 58 and VL of SEQ ID NO: 65.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 37, 44 и 52, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, and 30, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 37, 44, and 52, respectively; or VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 16, 24 и 31, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 38, 45 и 53, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 60 и VL с SEQ ID NO: 67.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 16, 24, and 31, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 38, 45, and 53, respectively; or VH with SEQ ID NO: 60 and VL with SEQ ID NO: 67.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 18, 25 и 32, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 39, 46 и 54, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 61 и VL с SEQ ID NO: 68.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 18, 25, and 32, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 39, 46, and 54, respectively; or VH of SEQ ID NO: 61 and VL of SEQ ID NO: 68.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 19, 26 и 33, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 40, 47 и 55, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 62 и VL с SEQ ID NO: 69.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 19, 26, and 33, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 40, 47, and 55, respectively; or VH of SEQ ID NO: 62 and VL of SEQ ID NO: 69.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 20, 27 и 34, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 41, 47 и 56, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 63 и VL с SEQ ID NO: 70.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 20, 27, and 34, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 41, 47, and 56, respectively; or VH of SEQ ID NO: 63 and VL of SEQ ID NO: 70.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 21, 28 и 35, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 42, 48 и 57, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 64 и VL с SEQ ID NO: 71.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 21, 28, and 35, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 42, 48, and 57, respectively; or VH of SEQ ID NO: 64 and VL of SEQ ID NO: 71.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 37, 49 и 52, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 72.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, and 30, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 37, 49, and 52, respectively; or VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 72.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 37, 50 и 52, соответственно; или VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 73.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, and 30, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 37, 50, and 52, respectively; or VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 73.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH и VL, причем VH содержит аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63 или 64.In some embodiments, an antibody of the invention comprises VH and VL, wherein the VH comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63, or 64.
- 14 040943- 14 040943
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH и VL, причем VL содержит аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73.In some embodiments, an antibody of the invention comprises VH and VL, wherein VL comprises the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, or 73.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 58, 59, 60,In some embodiments, an antibody of the invention comprises a VH of SEQ ID NOs: 58, 59, 60,
61, 62, 63 или 64, и VL с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73.61, 62, 63 or 64, and VL with SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 or 73.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит аминокислотные последовательности HCDR1, HCDR2 и HCDR3 VH с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73, и аминокислотные последовательности LCDR1, LCDR2 и LCDR3 VL с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73, причем CDR определяются по Кабату, Чотиа и/или IMGT.In some embodiments, an antibody of the invention comprises the amino acid sequences HCDR1, HCDR2, and HCDR3 VH of SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, or 73, and the amino acid sequences of LCDR1, LCDR2, and LCDR3 VL of SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 or 73, with CDRs determined by Kabat, Chothia and/or IMGT.
Варианты антител изобретения, содержащие аминокислотные последовательности VH или VL, приведенные в табл. 8, табл. 9 и табл. 14, находятся в пределах объема изобретения. Например, варианты могут содержать одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен в VH и/или VL, которые не оказывают отрицательного влияния на свойства антитела. В некоторых вариантах осуществления идентичность последовательностей может составлять около 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% с аминокислотной последовательностью VH или VL изобретения.Variants of the antibodies of the invention containing the amino acid sequence VH or VL shown in table. 8, tab. 9 and tab. 14 are within the scope of the invention. For example, variants may contain one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions in VH and/or VL that do not adversely affect properties. antibodies. In some embodiments, the sequence identity may be about 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% with the VH or VL amino acid sequence of the invention.
Процентная идентичность между двумя последовательностями является функцией количества идентичных положений, общих для последовательностей (т. е. % идентичности=кол-во идентичных положений/общее кол-во положений χ 100), принимая во внимание количество гэпов и длину каждого гэпа, вводимого для оптимального выравнивания двух последовательностей.The percent identity between two sequences is a function of the number of identical positions shared by the sequences (i.e. % identity=number of identical positions/total number of positions χ 100), taking into account the number of gaps and the length of each gap entered for optimal alignment of two sequences.
Процентную идентичность между двумя аминокислотными последовательностями можно определять с помощью алгоритма, описанного в E. Meyers and W. Miller (Comput. Appl. Biosci., 4:11-17 (1988)), который встроен в программу ALIGN (версия 2.0), используя весовую таблицу остатков PAM120 со штрафом за длину гэпа 12 и штрафом за гэп 4. Кроме этого, процентную идентичность двух аминокислотных последовательностей можно определять, используя алгоритм, описанный в Needleman and Wunsch (J. Mol. Biol. 48:444-453 (1970)), встроенный в программу GAP из программного пакета GCG (доступен на сайте http://_www_gcg_com), используя либо матрицу Blossum 62, либо матрицу PAM250, с весом гэпов 16, 14, 12, 10, 8, 6 или 4 и весом длины гэпов 1, 2, 3, 4, 5 или 6.Percent identity between two amino acid sequences can be determined using the algorithm described in E. Meyers and W. Miller (Comput. Appl. Biosci., 4:11-17 (1988)), which is built into the ALIGN program (version 2.0) using weight table of PAM120 residues with a gap length penalty of 12 and a gap penalty of 4. In addition, the percent identity of two amino acid sequences can be determined using the algorithm described in Needleman and Wunsch (J. Mol. Biol. 48:444-453 (1970) ) embedded in the GAP program from the GCG software package (available at http://_www_gcg_com) using either a Blossum 62 matrix or a PAM250 matrix, with a gap weight of 16, 14, 12, 10, 8, 6, or 4 and a length weight gaps 1, 2, 3, 4, 5 or 6.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63 или 64, причем антитело проявляет одно или более из следующих свойств:In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63, or 64, wherein the antibody exhibits one or more of the following properties:
иммунный комплекс антитела и shCD154 не активирует тромбоциты, причем активация тромбоцитов измеряется по экспрессии P-селектина на поверхности тромбоцитов;the immune complex of the antibody and shCD154 does not activate platelets, and platelet activation is measured by the expression of P-selectin on the surface of platelets;
связывается с CD154 с константой диссоциации (KD) около 5χ10-9 М или менее, если KD измеряют с использованием системы ProteOn XPR36 с применением плана эксперимента, описанного в примере 1, для измерения аффинности;binds to CD154 with a dissociation constant (K D ) of about 5χ10 -9 M or less when K D is measured using the ProteOn XPR36 system using the experimental design described in Example 1 to measure affinity;
ингибирует опосредованную CD154 пролиферацию B-клеток человека со значением IC50 около 2,7χ10-9 М или менее; или ингибирует опосредованную CD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-kB минимального промотора интерферона-β (IFN-β) в клетках HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40, со значением IC50 около 2,1 χ10-8 М или менее.inhibits CD154-mediated proliferation of human B cells with an IC 50 value of about 2.7χ10 -9 M or less; or inhibits CD154-mediated expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by NF-kB inducible minimal interferon-β (IFN-β) promoter in HEK293 cells stably expressing SEAP and human CD40, with an IC 50 value of about 2.1 χ10 -8 M or less.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73, причем антитело проявляет одно или более из следующих свойств:In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, or 73, wherein the antibody exhibits one or more of the following properties:
иммунный комплекс антитела и shCD154 не активирует тромбоциты, причем активация тромбоцитов измеряется по экспрессии P-селектина на поверхности тромбоцитов;the immune complex of the antibody and shCD154 does not activate platelets, and platelet activation is measured by the expression of P-selectin on the surface of platelets;
связывается с CD154 с константой диссоциации (KD) около 5χ10-9 М или менее, если KD измеряют с использованием системы ProteOn XPR36 с применением плана эксперимента, описанного в примере 1, для измерения аффинности;binds to CD154 with a dissociation constant (K D ) of about 5χ10 -9 M or less when K D is measured using the ProteOn XPR36 system using the experimental design described in Example 1 to measure affinity;
ингибирует опосредованную CD154 пролиферацию В-клеток человека со значением IC50 около 2,7χ10 9 М или менее; или ингибирует опосредованную CD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-kB минимального промотора интерферона-β (IFN-β) в клетках HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40, со значением IC50 около 2,1 χ10-8 М или менее.inhibits CD154-mediated proliferation of human B cells with an IC 50 value of about 2.7χ10 9 M or less; or inhibits CD154-mediated expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by NF-kB inducible minimal interferon-β (IFN-β) promoter in HEK293 cells stably expressing SEAP and human CD40, with an IC 50 value of about 2.1 χ10 -8 M or less.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63 или 64, и VL, которая по меньшей мере на 90%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73, причем антитело проявляет одно или более из следующих свойств:In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63 or 64, and a VL that is at least 90%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98 %, 99% or 100% identical to VL with SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 or 73, and the antibody exhibits one or more of the following properties:
иммунный комплекс антитела и shCD154 не активирует тромбоциты, причем активация тромбоци- 15 040943 тов измеряется по экспрессии P-селектина на поверхности тромбоцитов;the immune complex of the antibody and shCD154 does not activate platelets, and platelet activation is measured by the expression of P-selectin on the surface of platelets;
связывается с CD154 с константой диссоциации (KD) около 5x10’9 М или менее, если KD измеряют с использованием системы ProteOn XPR36 с применением плана эксперимента, описанного в примере 1, для измерения аффинности;binds to CD154 with a dissociation constant (KD) of about 5x10' 9 M or less when KD is measured using the ProteOn XPR36 system using the experimental design described in Example 1 to measure affinity;
ингибирует опосредованную CD154 пролиферацию B-клеток человека со значением IC50 около 2,7x10’9 М или менее; или ингибирует опосредованную CD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-kB минимального промотора интерферона-β (IFN-β) в клетках HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40, со значением IC50 около 2,1x10’8 М или менее.inhibits CD154-mediated proliferation of human B cells with an IC 50 value of about 2.7x10' 9 M or less; or inhibits CD154-mediated expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by NF-kB inducible minimal interferon-β (IFN-β) promoter in HEK293 cells stably expressing SEAP and human CD40, with an IC 50 value of about 2.1x10'8 M or less.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 58.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 58.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 59.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 59.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 60.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 60.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 61.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 61.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 62.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 62.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 63.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 63.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 64.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VH that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VH from SEQ ID NO: 64.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 65.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 65.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 66.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 66.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 67.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 67.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 68.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 68.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 69.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 69.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 70.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 70.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 71.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 71.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 72.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 72.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 73.In some embodiments, an antibody of the invention contains a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the VL with SEQ ID NO: 73.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 58 и VL с SEQ ID NO: 65, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises a VH of SEQ ID NO: 58 and a VL of SEQ ID NO: 65, wherein the VH, VL, or both VH and VL optionally comprise one, two, three, four, five, six, seven , eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a VH of SEQ ID NO: 59 and a VL of SEQ ID NO: 66, wherein the VH, VL, or both VH and VL optionally comprise one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 60 и VL с SEQ ID NO: 67, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises VH of SEQ ID NO: 60 and VL of SEQ ID NO: 67, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally comprise one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 61 и VL с SEQ ID NO: 68, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a VH of SEQ ID NO: 61 and a VL of SEQ ID NO: 68, wherein the VH, VL, or both VH and VL optionally comprise one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 62 и VL с SEQ ID NO: 69, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пят- 16 040943 надцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises VH of SEQ ID NO: 62 and VL of SEQ ID NO: 69, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally comprise one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 63 и VL сIn some embodiments, an antibody of the invention comprises a VH of SEQ ID NO: 63 and a VL of
SEQ ID NO: 70, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.SEQ ID NO: 70, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally contain one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions .
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 64 и VL с SEQ ID NO: 71, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a VH of SEQ ID NO: 64 and a VL of SEQ ID NO: 71, wherein the VH, VL, or both VH and VL optionally comprise one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 72, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 72, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally comprise one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 73, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a VH of SEQ ID NO: 59 and a VL of SEQ ID NO: 73, wherein the VH, VL, or both VH and VL optionally comprise one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит аминокислотные последовательности HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3, показанные в табл. 8, табл. 9 и табл. 14, или их консервативные модификации, и причем антитела сохраняют желаемые функциональные свойства антагонистических антител, специфически связывающих CD 154.In some embodiments, an antibody of the invention comprises the amino acid sequences HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2, and LCDR3 shown in Table 1. 8, tab. 9 and tab. 14, or conservative modifications thereof, and wherein the antibodies retain the desired functional properties of antagonist antibodies that specifically bind CD 154.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 16, 22 и 29, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOs: 16, 22, and 29, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOs: 17, 23, and 30, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 16, 24 и 31, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOs: 16, 24, and 31, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 18, 25 и 32, соответственно, и их консервативные модификацииIn some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOs: 18, 25, and 32, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 19, 26 и 33, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOs: 19, 26, and 33, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 20, 27 и 34, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOs: 20, 27, and 34, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 21, 28 и 35, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the invention comprises HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOs: 21, 28, and 35, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 36, 43 и 51, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 36, 43, and 51, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 SEQ ID NO: 37, 44 и 52, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 37, 44, and 52, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 SEQ ID NO: 38, 45 и 53, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 38, 45, and 53, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 SEQ ID NO: 39, 4 6 и 54, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 39, 46, and 54, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 SEQ ID NO: 40, 47 и 55, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 40, 47, and 55, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 SEQ ID NO: 41, 47 и 56, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 41, 47, and 56, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 SEQ ID NO: 42, 4 8 и 57, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 42, 48, and 57, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 SEQ ID NO: 37, 49 и 52, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 37, 49, and 52, respectively, and conservative modifications thereof.
В некоторых вариантах осуществления антитело настоящего изобретения содержит LCDR1, LCDR2 и LCDR3 SEQ ID NO: 37, 50 и 52, соответственно, и их консервативные модификации.In some embodiments, an antibody of the present invention comprises LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOs: 37, 50, and 52, respectively, and conservative modifications thereof.
Антитела изобретения, содержащие определенные последовательности HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3 и их консервативные модификации, проявляют одно или более из следующих свойств:Antibodies of the invention containing certain sequences of HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2 and LCDR3 and conservative modifications thereof exhibit one or more of the following properties:
иммунный комплекс антитела и shCD154 не активирует тромбоциты, причем активация тромбоцитов измеряется по экспрессии P-селектина на поверхности тромбоцитов;the immune complex of the antibody and shCD154 does not activate platelets, and platelet activation is measured by the expression of P-selectin on the surface of platelets;
связываются с CD154 с константой диссоциации (KD) около 5x10’9 М или менее, если KD измеряют с использованием системы ProteOn XPR36 с применением плана эксперимента, описанного в примере 1, для измерения аффинности;bind to CD154 with a dissociation constant (K D ) of about 5x10'9 M or less when K D is measured using the ProteOn XPR36 system using the experimental design described in Example 1 to measure affinity;
ингибируют опосредованную CD154 пролиферацию B-клеток человека со значением IC50 околоinhibit CD154-mediated human B cell proliferation with an IC 50 value of about
- 17 040943- 17 040943
2,7χ10’9 М или менее; или ингибируют опосредованную CD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-kB минимального промотора интерферона-β (IFN-β) в клетках HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40 со значением IC50 около2.7χ10' 9 M or less; or inhibit CD154-mediated expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by an NF-kB inducible minimal interferon-β (IFN-β) promoter in HEK293 cells stably expressing SEAP and human CD40 with an IC 50 value of about
2,1 х10’8 М или менее.2.1 x 10' 8 M or less.
Термин консервативная модификация означает модификации аминокислот, которые незначительно изменяют или влияют на характеристики связывания антитела, содержащего такие аминокислотные последовательности. Консервативные модификации включают в себя замены, добавления и делеции аминокислот. Консервативными заменами являются такие, при которых аминокислота заменена остатком аминокислоты с аналогичной боковой цепью. Семейства аминокислотных остатков с аналогичными боковыми цепями четко определены и включают аминокислоты с кислотными боковыми цепями (например, аспарагиновую кислоту, глутаминовую кислоту), основными боковыми цепями (например, лизин, аргинин, гистидин), неполярными боковыми цепями (например, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин), незаряженными полярными боковыми цепями (например, глицин, аспарагин, глутамин, цистеин, серии, треонин, тирозин, триптофан), ароматическими боковыми цепями (например, фенилаланин, триптофан, гистидин, тирозин), алифатическими боковыми цепями (например, глицин, аланин, валин, лейцин, изолейцин, серии, треонин), амидами (например, аспарагин, глутамин), бета-разветвленными боковыми цепями (например, треонин, валин, изолейцин) и серосодержащими боковыми цепями (цистеин, метионин). Более того, любой природный остаток в полипептиде может быть замещен аланином, согласно способу, описанному раннее как аланин-сканирующий мутагенез (MacLennan et al., Acta Physiol. Scand. Suppl. 643:55-67, 1998; Sasaki et al., Adv. Biophys. 35:1-24, 1998). Аминокислотные замены в антителах изобретения можно выполнять хорошо известными способами, например путем мутагенеза ПЦР (патент США № 4,683,195). Альтернативно, библиотеки вариантов можно создавать известными способами, например путем применения случайных (NNK) или неслучайных кодонов, например кодонов DVK, кодирующих 11 аминокислот (Ala, Cys, Asp, Glu, Gly, Lys, Asn, Arg, Ser, Tyr, Trp). Характеристики полученных вариантов антител могут быть исследованы с применением анализов, описанных в настоящем документе.The term conservative modification means amino acid modifications that do not significantly alter or affect the binding characteristics of an antibody containing such amino acid sequences. Conservative modifications include substitutions, additions, and deletions of amino acids. Conservative substitutions are those in which an amino acid is replaced by an amino acid residue with a similar side chain. Families of amino acid residues with similar side chains are well defined and include amino acids with acidic side chains (eg, aspartic acid, glutamic acid), basic side chains (eg, lysine, arginine, histidine), non-polar side chains (eg, alanine, valine, leucine , isoleucine, proline, phenylalanine, methionine), uncharged polar side chains (e.g. glycine, asparagine, glutamine, cysteine, serine, threonine, tyrosine, tryptophan), aromatic side chains (e.g. phenylalanine, tryptophan, histidine, tyrosine), aliphatic side chains (eg, glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, serine, threonine), amides (eg, asparagine, glutamine), beta-branched side chains (eg, threonine, valine, isoleucine), and sulfur-containing side chains (cysteine, methionine). Moreover, any natural residue in the polypeptide can be replaced by alanine, according to the method previously described as alanine-scanning mutagenesis (MacLennan et al., Acta Physiol. Scand. Suppl. 643:55-67, 1998; Sasaki et al., Adv Biophys 35:1-24, 1998). Amino acid substitutions in the antibodies of the invention can be performed by well known methods, for example by PCR mutagenesis (US Patent No. 4,683,195). Alternatively, variant libraries can be generated by known methods, for example by using random (NNK) or non-random codons, such as DVK codons encoding 11 amino acids (Ala, Cys, Asp, Glu, Gly, Lys, Asn, Arg, Ser, Tyr, Trp) . The characteristics of the resulting antibody variants can be examined using the assays described herein.
Хотя варианты осуществления, приведенные в примерах, содержат пары вариабельных областей (одну для тяжелой цепи и одну для легкой цепи), специалист в данной области поймет, что альтернативные варианты осуществления могут содержать одиночные вариабельные области тяжелой или легкой цепи. Одиночный вариабельный участок может использоваться для скрининга вариабельных доменов, способных к формированию двухдоменного специфического антигенсвязывающего фрагмента, способного, например, специфически связываться с CD154. Такой скрининг может осуществляться с помощью методов фагового дисплея, например с применением иерархического дуального комбинаторного подхода, описанного в международной патентной публикации № WO1992/01047, как описано в настоящем документе.Although the embodiments given in the examples contain pairs of variable regions (one for the heavy chain and one for the light chain), one skilled in the art will appreciate that alternative embodiments may contain single heavy or light chain variable regions. A single variable region can be used to screen for variable domains capable of forming a dual-domain specific antigen-binding fragment capable of, for example, specifically binding to CD154. Such screening can be done using phage display techniques, for example using the hierarchical dual combinatorial approach described in International Patent Publication No. WO1992/01047 as described herein.
Антитела изобретения можно получать с использованием различных технологий. Например, для создания моноклональных антител можно использовать метод гибридом по Kohler and Milstein, Nature 256:495, 1975. В методе гибридом мышь или другое животное-хозяин, такое как хомяк, крыса или обезьяна, иммунизируют CD154 человека, игрунки или яванского макака, или фрагментами CD154, такими как растворимая форма CD154, с последующим слиянием клеток селезенки от иммунизированных животных с клетками миеломы с использованием стандартных способов с образованием клеток гибридомы (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp.59-103 (Academic Press, 1986)). Колонии, возникающие из одиночных клеток иммортализованной гибридомы, отбирают на основе продукции антител с желаемыми качествами, такими как специфичность связывания, перекрестная реактивность или ее отсутствие и аффинность к антигену.Antibodies of the invention can be obtained using various technologies. For example, the hybridoma method of Kohler and Milstein, Nature 256:495, 1975, can be used to generate monoclonal antibodies. In the hybridoma method, a mouse or other animal host such as a hamster, rat, or monkey is immunized with CD154 from a human, marmoset, or fragments of CD154, such as a soluble form of CD154, followed by fusion of spleen cells from immunized animals with myeloma cells using standard methods to form hybridoma cells (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp.59-103 (Academic Press, 1986)) . Colonies arising from single cells of the immortalized hybridoma are selected based on the production of antibodies with desired qualities such as binding specificity, cross-reactivity or lack of it, and affinity for the antigen.
Для продуцирования антител изобретения можно использовать различных животных-хозяев. Например, для создания антител можно использовать мышей Balb/c. Антитела, полученные от мышей Balb/c и от других животных, за исключением человека, можно гуманизировать с использованием различных технологий для создания последовательностей, имеющих большее сходство с человеческими. Примеры методик гуманизации, включающие выбор человеческих акцепторных каркасов, известны и включают пересадку CDR (патент США № 5,225,539), пересадку определяющей специфичность области (SDR) (патент США № 6,818,749), ремоделирование (Padlan, Mol Immunol 28:489-499, 1991), ремоделирование определяющих специфичность остатков (патентная публикация США № 20100261620), человеческую адаптацию (или адаптацию человеческих каркасов) (патентная публикация США № US2009/0118127), супер-гуманизацию (патент США № 7,709,226) и управляемую селекцию (Osbourn et al. (2005) Methods 36:61-68, 2005; патент США № 5,565,332). В этих способах CDR родительских антител переносят на человеческие каркасы, которые могут быть выбраны на основе их общей гомологии с родительскими каркасами, на основе информации о длине CDR каркаса, гомологии или канонической структуре, или их комбинации.Various animal hosts can be used to produce the antibodies of the invention. For example, Balb/c mice can be used to create antibodies. Antibodies derived from Balb/c mice and other non-human animals can be humanized using various techniques to generate sequences that are more human-like. Examples of humanization techniques involving selection of human acceptor scaffolds are known and include CDR grafting (US Patent No. 5,225,539), Specificity Determining Region (SDR) grafting (US Patent No. 6,818,749), Remodeling (Padlan, Mol Immunol 28:489-499, 1991) , remodeling of specificity-determining residues (US Patent Publication No. 20100261620), human adaptation (or adaptation of human scaffolds) (US Patent Publication No. US2009/0118127), superhumanization (US Patent No. 7,709,226) and guided selection (Osbourn et al. (2005 ) Methods 36:61-68, 2005; US patent No. 5,565,332). In these methods, parental antibody CDRs are transferred to human scaffolds, which can be selected based on their shared homology with parental scaffolds, based on scaffold CDR length information, homology or canonical structure, or a combination thereof.
Гуманизированные антитела можно дополнительно оптимизировать для улучшения их селективно- 18 040943 сти или аффинности к желаемому антигену путем включения остатков, поддерживающих измененный каркас, для сохранения аффинности связывания (обратных мутаций) с помощью таких методик, как описанные в международной патентной публикации № WO90/007861 и в международной патентной публикации №. WO92/22653, или путем введения вариации в любую из CDR, например для улучшения аффинности антитела.Humanized antibodies can be further optimized to improve their selectivity or affinity for the desired antigen by incorporating altered scaffold support residues to maintain binding affinity (backmutations) using techniques such as those described in International Patent Publication No. WO90/007861 and in international patent publication no. WO92/22653, or by introducing a variation in any of the CDRs, for example to improve the affinity of the antibody.
Для создания человеческих антител к белку-мишени можно использовать трансгенных мышей, несущих в своем геноме локусы человеческих иммуноглобулинов (Ig), и они описаны, например, в международной патентной публикации № WO90/04036; патенте США № 6,150,584; международной патентной публикации № WO99/45962, международной патентной публикации № WO02/066630, международной патентной публикации № WO02/43478, Lonberg et al. (1994) Nature 368:856-9; Green et al. (1994) Nature Genet. 7:13-21; Green & Jakobovits (1998) Exp. Med. 188:483-95; Lonberg and Huszar (1995) Int. Rev. Immunol. 13:65-93; Bruggemann et al. (1991) Eur. J. Immunol. 21:1323-1326; Fishwild et al. (1996) Nat. Biotechnol. 14:845-851; Mendez et al. (1997) Nat. Genet. 15:146-156; Green (1999) J. Immunol. Methods 231:11-23; Yang et al. (1999) Cancer Res. 59:1236-1243; Bruggemann and Taussig (1997) Curr. Opin. Biotechnol. 8:455-458; международной патентной публикации № WO02/043478). Эндогенные локусы иммуноглобулинов у таких мышей можно разрушать или удалять, а в мышиный геном можно вставлять по меньшей мере один полный или частичный локус человеческого иммуноглобулина с использованием гомологичной или негомологичной рекомбинации с использованием трансхромосом или с использованием минигенов. Для получения человеческих антител, направленных против выбранного антигена, с применением описанной выше технологии можно задействовать такие компании, как Regeneron (http://_www_regeneron_com), Harbour Antibodies (http://_www_harbourantibodies_com), Open Monoclonal Technology, Inc. (OMT) (http://_www_omtinc_net), KyMab (http://_www_kymab_com), Trianni (http://_www.trianni_com) и Ab lexis (http://_www_ablexis_com).Transgenic mice carrying human immunoglobulin (Ig) loci in their genome can be used to generate human antibodies to the target protein and are described, for example, in International Patent Publication No. WO90/04036; US Pat. No. 6,150,584; International Patent Publication No. WO99/45962, International Patent Publication No. WO02/066630, International Patent Publication No. WO02/43478, Lonberg et al. (1994) Nature 368:856-9; Green et al. (1994) Nature Genet. 7:13-21; Green & Jacobovits (1998) Exp. Med. 188:483-95; Lonberg and Huszar (1995) Int. Rev. Immunol. 13:65-93; Bruggemann et al. (1991) Euro. J. Immunol. 21:1323-1326; Fishwild et al. (1996) Nat. Biotechnol. 14:845-851; Mendez et al. (1997) Nat. Genet. 15:146-156; Green (1999) J. Immunol. Methods 231:11-23; Yang et al. (1999) Cancer Res. 59:1236-1243; Bruggemann and Taussig (1997) Curr. Opin. Biotechnol. 8:455-458; International Patent Publication No. WO02/043478). Endogenous immunoglobulin loci in such mice can be destroyed or removed, and at least one complete or partial human immunoglobulin locus can be inserted into the mouse genome using homologous or non-homologous recombination using transchromosomes or using minigenes. Companies such as Regeneron (http://_www_regeneron_com), Harbor Antibodies (http://_www_harbourantibodies_com), Open Monoclonal Technology, Inc. can be used to generate human antibodies directed against a selected antigen using the technology described above. (OMT) (http://_www_omtinc_net), KyMab (http://_www_kymab_com), Trianni (http://_www.trianni_com) and Ablexis (http://_www_ablexis_com).
Человеческие антитела можно выбирать из библиотеки фагового дисплея, причем фаг конструируют с возможностью экспрессии человеческих иммуноглобулинов или их частей, таких как Fab, одноцепочечные антитела (scFv) или неспаренные либо спаренные вариабельные области антител (Knappik et al., J. Mol Biol 296:57-86, 2000; Krebs et al., J Immunol Meth 254:67-84, 2001; Vaughan et al., Nature Biotechnology 14:309-314, 1996; Sheets et al., PITAS (USA) 95:6157-6162, 1998; Hoogenboom and Winter, J Mol Biol 227:381, 1991; Marks et al., J Mol Biol 222:581, 1991). Антитела изобретения можно выделять, например, из библиотеки фагового дисплея, экспрессирующей вариабельные области легкой и тяжелой цепей антитела, в виде гибридных белков с белком оболочки бактериофага pIX, как описано в Shi et al., J Mol Biol 397:385-96, 2010 и международной патентной публикации № WO09/085462). В библиотеках можно проводить скрининг на связывание фагов с CD154 человека, игрунки и/или яванского макака и полученные позитивные клоны могут быть дополнительно охарактеризованы, из лизатов клонов могут быть выделены Fab, a затем может быть выполнена экспрессия полноразмерных IgG. Такое применение способов фагового дисплея для выделения антител человека, например, описано в: патентах США № 5,223,409; 5,403,484; и 5,571,698, выданных Ladner et al.; патентах СшА № 5,427,908 и 5,580,717, выданных Dower et al.; патентах США № 5,969,108 и 6,172,197, выданных McCafferty et al.; и патентах США № 5,885,793; 6,521,404; 6,544,731; 6,555,313; 6,582,915 и 6,593,081, выданных Griffiths et al.Human antibodies can be selected from a phage display library where the phage is engineered to express human immunoglobulins or portions thereof such as Fab, single chain antibodies (scFv), or unpaired or paired antibody variable regions (Knappik et al., J. Mol Biol 296:57 -86, 2000; Krebs et al., J Immunol Meth 254:67-84, 2001; Vaughan et al., Nature Biotechnology 14:309-314, 1996; Sheets et al., PITAS (USA) 95:6157-6162 , 1998; Hoogenboom and Winter, J Mol Biol 227:381, 1991; Marks et al., J Mol Biol 222:581, 1991). Antibodies of the invention can be isolated, for example, from a phage display library expressing antibody light and heavy chain variable regions as fusion proteins with bacteriophage coat protein pIX as described in Shi et al., J Mol Biol 397:385-96, 2010 and International Patent Publication No. WO09/085462). Libraries can be screened for phage binding to human, marmoset and/or cynomolgus CD154, and the resulting positive clones can be further characterized, Fab can be isolated from clone lysates, and full-length IgG can then be expressed. Such use of phage display techniques for the isolation of human antibodies is, for example, described in: US Pat. Nos. 5,223,409; 5,403,484; and 5,571,698 issued by Ladner et al.; U.S. Patent Nos. 5,427,908 and 5,580,717 issued to Dower et al.; US Pat. Nos. 5,969,108 and 6,172,197 issued to McCafferty et al.; and US Pat. Nos. 5,885,793; 6,521,404; 6,544,731; 6,555,313; 6,582,915 and 6,593,081 issued by Griffiths et al.
Получение иммуногенных антигенов и продукция моноклональных антител могут быть выполнены любой приемлемой методикой, например продукцией рекомбинантного белка. Иммуногенные антигены можно вводить животным в форме очищенного белка или белковых смесей, включающих целые клетки или клеточные либо тканевые экстракты, или антиген может быть образован de novo в теле животного из нуклеиновых кислот, кодирующих указанный антиген или его участок.The production of immunogenic antigens and the production of monoclonal antibodies can be accomplished by any suitable technique, such as production of a recombinant protein. Immunogenic antigens can be administered to animals in the form of purified protein or protein mixtures, including whole cells or cell or tissue extracts, or the antigen can be formed de novo in the body of the animal from nucleic acids encoding said antigen or portion thereof.
Антитела изобретения могут быть человеческими или гуманизированными.The antibodies of the invention may be human or humanized.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит каркас VH, полученный из человеческого гена зародышевой линии VH1_1-69, VH4_4-39, VH1_1-02 или VH4_4-59.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a VH framework derived from the human VH1_1-69, VH4_4-39, VH1_1-02, or VH4_4-59 germline germline gene.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения содержит каркас VL, полученный из человеческого гена зародышевой линии VKIV_B3, VKI_O12 или VL3_3R.In some embodiments, an antibody of the invention comprises a VL framework derived from the human VKIV_B3, VKI_O12, or VL3_3R germline gene.
Антитела изобретения могут относиться к типу IgA, IgD, IgE, IgG или IgM. Антитела изобретения могут относиться к типу IgG1, IgG2, IgG3, IgG4.The antibodies of the invention may be of the IgA, IgD, IgE, IgG or IgM type. The antibodies of the invention may be of the IgG1, IgG2, IgG3, IgG4 type.
Антитела изобретения дополнительно могут быть сконструированы с возможностью получения модифицированного антитела со сходными или измененными свойствами по сравнению с родительским антителом. В антителах изобретения могут быть сконструированными области VH, VL, VH и VL, константные области, каркас VH, каркас VL, или любая или все из шести CDR.Antibodies of the invention can additionally be engineered to produce a modified antibody with similar or altered properties compared to the parent antibody. Antibodies of the invention can be engineered VH, VL, VH and VL regions, constant regions, VH framework, VL framework, or any or all of the six CDRs.
Антитела изобретения могут быть сконструированы путем пересадки CDR. Одну или более последовательностей CDR антител изобретения можно пересаживать на другую каркасную последовательность. Пересадку CDR можно осуществлять с использованием способов, описанных в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления антитела изобретения содержат VH, содержащую HDCR1 с SEQ ID NO: 16, 17, 18, 19, 20 или 21, HCDR2 с SEQ ID NO: 22, 23, 24, 25, 26, 27 или 28, HCDR3 с SEQ ID NO: 29, 30, 31, 32, 33, 34 или 35 и VL, содержащую LCDR1 с SEQ ID NO: 36, 37, 38, 39, 40, 41 или 42, LCDR2 с SEQ ID NO: 43, 44, 45, 6, 47, 48, 49 или 50, и/или LCDR3 с SEQ ID NO: 51, 52, 53, 54, 55, 56 илиThe antibodies of the invention can be constructed by CDR transplantation. One or more CDR sequences of antibodies of the invention can be grafted onto another framework sequence. CDR grafting can be performed using the methods described herein. In some embodiments, the antibodies of the invention comprise a VH containing HDCR1 with SEQ ID NO: 16, 17, 18, 19, 20 or 21, HCDR2 with SEQ ID NO: 22, 23, 24, 25, 26, 27 or 28, HCDR3 with SEQ ID NO: 29, 30, 31, 32, 33, 34 or 35 and VL containing LCDR1 of SEQ ID NO: 36, 37, 38, 39, 40, 41 or 42, LCDR2 of SEQ ID NO: 43, 44 , 45, 6, 47, 48, 49 or 50, and/or LCDR3 with SEQ ID NO: 51, 52, 53, 54, 55, 56 or
- 19 040943- 19 040943
57, причем каркас VH не получен из VH1_1-69, VH4_4-39, VH1_1-02 или VH4_4-59, а каркас VL не получен из VKIV_B3, VKI _O12 или VL3_3R. Каркасные последовательности для использования можно получать из общедоступных баз данных по ДНК или опубликованной литературы, включающей зародышевые генные последовательности антител. Например, зародышевая ДНК и кодированные белковые последовательности для человеческих генов вариабельных областей легкой и тяжелой цепей можно найти в международной информационной системе IMGT®, international ImMunoGeneTics information system® http://_www-imgt_org.57, wherein the VH framework is not derived from VH1_1-69, VH4_4-39, VH1_1-02, or VH4_4-59, and the VL framework is not derived from VKIV_B3, VKI_O12, or VL3_3R. Framework sequences for use can be obtained from public DNA databases or published literature including germline antibody gene sequences. For example, germline DNA and protein encoded sequences for human light and heavy chain variable region genes can be found in the international information system IMGT®, international ImMunoGeneTics information system® http://_www-imgt_org.
Каркасные последовательности, которые можно использовать для замены существующих каркасных последовательностей в антителах изобретения, представляют собой такие последовательности, которые имеют наибольшую процентную идентичность с C4LB5, C4LB89, C4LB94, C4LB150, C4LB189, C4LB191, C4LB199, C4LB231, C4LB232, C4LB35 и C4LB256. Каркасные последовательности родительских и сконструированных антител можно подвергать дополнительной модификации, например путем обратных мутаций, для восстановления и/или улучшения связывания полученного антитела с антигеном, как описано, например, в патенте США № 6,180,370. Каркасные последовательности родительских и сконструированных антител можно дополнительно подвергать модификациям путем внесения мутаций в один или более остатков в пределах каркасной области или даже в пределах одной или более областей CDR, для удаления T-клеточных эпитопов и, следовательно, уменьшения потенциальной иммуногенности антитела. Такой подход также именуется деиммунизацией и описывается более подробно в патентной публикации США № 20030153043.Framework sequences that can be used to replace existing framework sequences in the antibodies of the invention are those that have the highest percentage identity with C4LB5, C4LB89, C4LB94, C4LB150, C4LB189, C4LB191, C4LB199, C4LB231, C4LB232, C4LB35 and C4LB256. The framework sequences of parental and engineered antibodies can be subjected to further modification, such as by backmutations, to restore and/or improve the binding of the resulting antibody to the antigen, as described, for example, in US patent No. 6,180,370. The framework sequences of parental and engineered antibodies can be further modified by mutating one or more residues within the framework region, or even within one or more CDR regions, to remove T-cell epitopes and therefore reduce the potential immunogenicity of the antibody. This approach is also referred to as deimmunization and is described in more detail in US Patent Publication No. 20030153043.
Остатки CDR антител изобретения можно подвергать мутации для улучшения одного или более свойств связывания интересующего антитела. Можно осуществлять сайт-направленный мутагенез или ПЦР-опосредованный мутагенез с целью внедрения мутации (-ий), а влияние на связывание антитела или на другое интересующее функциональное свойство можно оценивать в анализах in vitro или in vivo, как описано в настоящем документе и представлено в примерах. К примерам замен, которые можно внедрять, относятся консервативные модификации, описанные выше. Более того, в пределах CDR, как правило, изменяют не более одного, двух, трех, четырех или пяти остатков.CDR residues of antibodies of the invention can be mutated to improve one or more of the binding properties of the antibody of interest. Site-directed mutagenesis or PCR-mediated mutagenesis can be performed to introduce the mutation(s) and the effect on antibody binding or other functional property of interest can be assessed in in vitro or in vivo assays as described herein and provided in the examples . Examples of substitutions that can be implemented include the conservative modifications described above. Moreover, within a CDR, as a rule, no more than one, two, three, four, or five residues are changed.
Замены в Fc можно внедрять в антитело изобретения с целью модуляции периода полужизни антитела. Например, можно внедрять одну или более из замен M252Y, S254T и T256E с целью увеличения периода полужизни полученного антитела (Dall'Acqua et al., J Biol Chem 281:23514-240, 2006).Fc substitutions can be introduced into an antibody of the invention to modulate the half-life of the antibody. For example, one or more of the M252Y, S254T, and T256E substitutions can be introduced to increase the half-life of the resulting antibody (Dall'Acqua et al., J Biol Chem 281:23514-240, 2006).
Кроме того, антитела изобретения могут быть модифицированы посттрансляционно за счет таких процессов, как гликозилирование, изомеризация, дегликозилирование или искусственная ковалентная модификация, такая как присоединение фрагментов полиэтиленгликоля (пэгилирование) или липидизация. Такие модификации могут происходить in vivo или in vitro. Например, антитела изобретения могут быть конъюгированы с полиэтиленгликолем (ПЭГилированы) с целью улучшения их фармакокинетических профилей. Конъюгация может быть выполнена методиками, известными специалистам в данной области. Отмечено, что конъюгация терапевтических антител с ПЭГ улучшает фармакодинамику, в то же время не оказывая влияния на функционирование (Knigh et al., Platelets 15:409-18, 2004; Leong et al., Cytokine 16:106-19, 2001; Alfthan et al., Protein Eng. 16:761-70, 2003).In addition, the antibodies of the invention may be post-translationally modified by processes such as glycosylation, isomerization, deglycosylation, or artificial covalent modification such as the addition of polyethylene glycol moieties (pegylation) or lipidization. Such modifications may occur in vivo or in vitro. For example, the antibodies of the invention can be polyethylene glycol conjugated (PEGylated) to improve their pharmacokinetic profiles. Conjugation can be performed by techniques known to those skilled in the art. Conjugation of therapeutic antibodies to PEG has been shown to improve pharmacodynamics while not affecting function (Knigh et al., Platelets 15:409-18, 2004; Leong et al., Cytokine 16:106-19, 2001; Alfthan et al., Protein Eng. 16:761-70, 2003).
Антитела изобретения или их фрагменты, модифицированные с целью улучшения стабильности, селективности, перекрестной реактивности, аффинности, иммуногенности или достижения других желательных биологических или биофизических характеристик, охвачены рамками объема настоящего изобретения. Стабильность антитела определяется рядом факторов, включая: (1) пространственную укладку отдельных доменов, влияющую на их естественную стабильность; (2) поверхностные взаимодействия белков, влияющие на спаривание НС и LC; (3) глубину расположения полярных и заряженных остатков; (4) сеть H-мостиков между полярными и заряженными остатками; и (5) поверхностный заряд и распределение полярных остатков наряду с другими внутри- и межмолекулярными взаимодействиями (Worn et al., J Mol Biol 305:989-1010, 2001). Остатки, способные дестабилизировать структуру, можно идентифицировать на основе кристаллической структуры антитела или, в определенных случаях, путем молекулярного моделирования, а влияние остатков на стабильность антитела можно тестировать путем создания и оценки вариантов, содержащих мутации по идентифицированным остаткам. Один из способов увеличения стабильности антитела заключается в увеличении средней температуры перехода (Tm), измеряемой с помощью дифференциальной сканирующей калориметрии (DSC). Как правило, Tm белка имеет прямую корреляцию с его стабильностью и обратную корреляцию с его подверженностью к нарушению третичной структуры и денатурации в растворе, а также процессам деградации, которые зависят от склонности белка к нарушению третичной структуры (Remmele et al., Biopharm 13:36-46, 2000). Ряд исследований свидетельствует о корреляции между степенью физической стабильности структур, измеренной как термостабильность путем DSC, и измерениями физической стабильности, проведенными с помощью других методов (Gupta et al., AAPS PharmSci 5E8, 2003; Zhang et al., J Pharm Sci 93:3076-89, 2004; Maa et al., Int J Pharm 140:155-68, 1996; Bedu-Addo et al., Pharm Res 21:1353-61, 2004; Remmele et al., Pharm Res 15:200-8, 1997). Результаты исследований структур позволяют предположить, что Tm Fab влияет на долговременную физическую стабильность соответствующего моноклонального антитела (mAb).Antibodies of the invention, or fragments thereof, modified to improve stability, selectivity, cross-reactivity, affinity, immunogenicity, or other desirable biological or biophysical characteristics are within the scope of the present invention. The stability of an antibody is determined by a number of factors, including: (1) the spatial folding of individual domains, which affects their natural stability; (2) surface interactions of proteins that affect the pairing of HC and LC; (3) the depth of location of polar and charged residues; (4) a network of H-bridges between polar and charged residues; and (5) surface charge and distribution of polar residues along with other intra- and intermolecular interactions (Worn et al., J Mol Biol 305:989-1010, 2001). Residues capable of destabilizing the structure can be identified based on the crystal structure of the antibody or, in certain cases, by molecular modeling, and the effect of residues on antibody stability can be tested by creating and evaluating variants containing mutations at the identified residues. One way to increase the stability of an antibody is to increase the average transition temperature (T m ), measured using differential scanning calorimetry (DSC). In general, the T m of a protein is directly correlated with its stability and inversely correlated with its susceptibility to tertiary disruption and denaturation in solution, as well as degradation processes that depend on the protein's susceptibility to tertiary disruption (Remmele et al., Biopharm 13: 36-46, 2000). A number of studies indicate a correlation between the degree of physical stability of structures, measured as thermal stability by DSC, and physical stability measurements made using other methods (Gupta et al., AAPS PharmSci 5E8, 2003; Zhang et al., J Pharm Sci 93:3076 -89, 2004; Maa et al., Int J Pharm 140:155-68, 1996; Bedu-Addo et al., Pharm Res 21:1353-61, 2004; Remmele et al., Pharm Res 15:200-8 , 1997). The results of structural studies suggest that T m Fab affects the long-term physical stability of the respective monoclonal antibody (mAb).
- 20 040943- 20 040943
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения представляет собой биспецифическое антитело.In some embodiments, an antibody of the invention is a bispecific antibody.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения представляет собой мультиспецифическое антитело.In some embodiments, an antibody of the invention is a multispecific antibody.
Моноспецифические антитела изобретения, специфически связывающие CD154, можно конструировать в виде биспецифических антител, которые также входят в пределы объема настоящего изобретения. Из областей VL и/или VH антител изобретения с применением опубликованных способов можно конструировать одноцепочечные биспецифические антитела в виде структур, таких как конфигурации TandAb® (международная патентная публикация № WO1999/57150; патентная публикация США № 2011/0206672), или биспецифические scFV в виде структур, таких как описанные в патенте США № 5,869,620; международной патентной публикации № WO1995/15388, международной патентной публикации № WO1997/14719 или международной патентной публикации № WO2011/036460.Monospecific antibodies of the invention that specifically bind CD154 can be designed as bispecific antibodies, which are also within the scope of the present invention. From the VL and/or VH regions of antibodies of the invention using published methods, single chain bispecific antibodies can be constructed as structures such as TandAb® configurations (International Patent Publication No. WO1999/57150; US Patent Publication No. 2011/0206672), or bispecific scFVs as structures such as those described in US Pat. No. 5,869,620; International Patent Publication No. WO1995/15388, International Patent Publication No. WO1997/14719 or International Patent Publication No. WO2011/036460.
Из областей VL и/или VH антител изобретения можно конструировать биспецифические полноразмерные антитела, где каждое плечо антитела связывает отличный антиген или эпитоп. Такие биспецифические антитела могут быть получены путем модуляции взаимодействий CH3 между тяжелыми цепями двух антител с образованием биспецифических антител с помощью технологий, таких как описанные в патенте США № 7695936; международной патентной публикации № WO2004/111233; патентной публикации США № 2010/0015133; патентной публикации США № 2007/0287170; международной патентной публикации № WO2008/119353; патентной публикации США № 2009/0182127; патентной публикации США № 2010/0286374; патентной публикации США № 2011/0123532; международной патентной публикации № WO2011/131746; международной патентной публикации № WO2011/143545; или патентной публикации США № 2012/0149876.From the VL and/or VH regions of the antibodies of the invention, bispecific full length antibodies can be constructed wherein each antibody arm binds a different antigen or epitope. Such bispecific antibodies can be generated by modulating CH3 interactions between the heavy chains of two antibodies to form bispecific antibodies using techniques such as those described in US Pat. No. 7,695,936; International Patent Publication No. WO2004/111233; US Patent Publication No. 2010/0015133; US Patent Publication No. 2007/0287170; International Patent Publication No. WO2008/119353; US Patent Publication No. 2009/0182127; US Patent Publication No. 2010/0286374; US Patent Publication No. 2011/0123532; International Patent Publication No. WO2011/131746; International Patent Publication No. WO2011/143545; or US Patent Publication No. 2012/0149876.
Например, биспецифические антитела можно создавать in vitro в бесклеточной среде, вводя асимметричные мутации в области CH3 двух моноспецифических гомодимерных антител и образуя биспецифическое гетеродимерное антитело из двух родительских моноспецифических гомодимерных антител в восстановительных условиях для обеспечения изомеризации дисульфидной связи, в соответствии со способами, описанными в международной патентной публикации № WO2011/131746. В этих способах два моноспецифических бивалентных антитела конструируют так, чтобы они имели определенные замены в домене CH3, способствующие стабильности гетеродимера; антитела инкубируют вместе в восстановительных условиях, достаточных для обеспечения того, чтобы цистеины в шарнирной области подвергались изомеризации дисульфидной связи; таким образом, образуя биспецифическое антитело в результате обмена плечами Fab. Условия инкубирования можно оптимально возвращать к невосстанавливающим. К примерам пригодных для использования восстанавливающих агентов относятся 2-меркаптоэтиламин (2MEA), дитиотреитол (DTT), дитиоэритритол (DTE), глутатион, трис(2-карбоксиэтил)фосфин (TCEP), Lцистеин и бета-меркаптоэтанол, предпочтительно восстанавливающий агент выбирают из группы, состоящей из: 2-меркаптоэтиламина, дитиотреитола и трис(2-карбоксиэтил)фосфина. Например, можно использовать инкубирование в течение по меньшей мере 90 мин при температуре по меньшей мере 20°C в присутствии по меньшей мере 25 мМ 2-MEA или в присутствии по меньшей мере 0,5 мМ дитиотреитола при значении pH от 5 до 8, например при pH 7,0 или при pH 7,4.For example, bispecific antibodies can be generated in vitro in a cell-free environment by introducing asymmetric mutations in the CH3 region of two monospecific homodimeric antibodies and generating a bispecific heterodimeric antibody from the two parental monospecific homodimeric antibodies under reducing conditions to allow disulfide bond isomerization, according to the methods described in International Patent Publication No. WO2011/131746. In these methods, two monospecific bivalent antibodies are designed to have specific substitutions in the CH3 domain to promote heterodimer stability; the antibodies are incubated together under reducing conditions sufficient to ensure that the cysteines in the hinge region undergo disulfide bond isomerization; thus forming a bispecific antibody by exchanging Fab arms. The incubation conditions can be optimally reverted to non-reducing. Examples of suitable reducing agents include 2-mercaptoethylamine (2MEA), dithiothreitol (DTT), dithioerythritol (DTE), glutathione, tris(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), L-cysteine and beta-mercaptoethanol, preferably the reducing agent is selected from the group , consisting of: 2-mercaptoethylamine, dithiothreitol and tris(2-carboxyethyl)phosphine. For example, an incubation of at least 90 minutes at a temperature of at least 20° C. in the presence of at least 25 mM 2-MEA or in the presence of at least 0.5 mM dithiothreitol at a pH of 5 to 8 can be used, e.g. at pH 7.0 or at pH 7.4.
К примерам мутаций CH3, которые можно использовать в первой тяжелой цепи и во второй тяжелой цепи биспецифического антитела, относятся K409R и/или F405L.Examples of CH3 mutations that can be used in the first heavy chain and second heavy chain of the bispecific antibody include K409R and/or F405L.
Дополнительные биспецифические структуры, в которые могут быть встроены области VL и/или VH антител изобретения, могут представлять собой, например, иммуноглобулины с двойным вариабельным доменом (DVD) (международная патентная публикация № W02009/134776) или структуры, включающие в себя различные димеризационные домены для соединения двух плеч антител с разной специфичностью, например лейциновую застежку или коллагеновые димеризационные домены (международная патентная публикация № WO2012/022811, патент США № 5932448; патент США № 6833441). DVD представляют собой полноразмерные антитела, содержащие тяжелую цепь, имеющую структуру VH1-линкер-VH2-CH, и легкую цепь, имеющую структуру VL1-линкер-VL2-CL; причем линкер является необязательным.Additional bispecific structures into which the VL and/or VH regions of the antibodies of the invention can be inserted can be, for example, double variable domain (DVD) immunoglobulins (International Patent Publication No. W02009/134776) or structures comprising various dimerization domains for connecting two arms of antibodies with different specificities, such as a leucine zipper or collagen dimerization domains (International Patent Publication No. WO2012/022811, US Patent No. 5932448; US Patent No. 6833441). DVDs are full-length antibodies containing a heavy chain having the structure VH1-linker-VH2-CH and a light chain having the structure VL1-linker-VL2-CL; wherein the linker is optional.
В изобретении также предлагается антагонистическое антитело, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1, имеющее определенные последовательности VH и VL, причем VH антитела кодируется первым полинуклеотидом, a VL антитела кодируется вторым синтетическим полинуклеотидом. Полинуклеотид может быть комплементарной дезоксинуклеиновой кислотой (кДНК) и может иметь оптимизированные кодоны для экспрессии в приемлемом хозяине. Оптимизация кодоном является хорошо известной технологией.The invention also provides an antagonist antibody specifically binding to CD154 of SEQ ID NO: 1 having defined VH and VL sequences, the VH of the antibody being encoded by a first polynucleotide and the VL of the antibody being encoded by a second synthetic polynucleotide. The polynucleotide may be a complementary deoxynucleic acid (cDNA) and may have optimized codons for expression in a suitable host. Codon optimization is a well known technology.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотиды, кодирующие VH или VL антитела изобретения имеют последовательности с SEQ ID NO: 76, 77, 78 или 79.In some embodiments, the polynucleotides encoding the VH or VL antibodies of the invention have the sequences of SEQ ID NO: 76, 77, 78, or 79.
SEQ ID NO: 76 (кодирующая VH в C4LB231)SEQ ID NO: 76 (encoding VH in C4LB231)
GACATCCAGATGACCCAGAGCCCCAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTGGGCGACAGAGTGACGACATCCAGATGACCCAGAGCCCCAGCAGCCTGAGCGCCAGCGTGGGCGACAGAGTGAC
CATCACCTGTCGGGCCAGCCAGAGCATCAGCAGCTACCTGAACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCATCACCTGTCGGGCCAGCCAGAGCATCAGCAGCTACCTGAACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGC
- 21 040943- 21 040943
AAGGCCCCCAAGCTGCTGATCTACTACGCCAACAGCCTGCAGAGCGGCGTGCCCAGCAGATTCA GCGGCAGCGGCTCCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGC CACCTACTACTGCCAGCAGAGCGACAGCATCCCCTGGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGGTGGAA ATGAAGAAGGCCCCCCAAGCTGCTGATCTACTACGCCAACAGCCTGCAGAGCGGCGTGCCCAGCAGATTCA GCGGCAGCGGCTCCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAGCAGCCTGCAGCCCGAGACTTCGC CACCTACTACTGCCAGCAGAGCGACAGCATCCCCTGGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGGTGGAA ATGAAG
SEQ ID NO: 77 (кодирующая VL в C4LB231)SEQ ID NO: 77 (encoding VL in C4LB231)
CAGGTCCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCAGCAGCGTGAAGGT GTCCTGCAAGGCCAGCGGCGGCACCTTCAGCAGCTACGGCATCAGCTGGGTCCGACAGGCCCCA GGACAGGGCCTGGAATGGATGGGCTGGATCAGCCCCATCTTCGGCAACACCAACTACGCCCAGA AATTCCAGGGCAGAGTGACCATСАСCGCCGACGAGAGCACCAGCACCGCCTAGATGGAAGTGAG CAGCCTGCGGAGCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGAAGCCGGTACTACGGCGACCTG GACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTCACCGTGTCCTCTCAGGTCCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCAGCAGCGTGAAGGT GTCCTGCAAGGCCAGCGGCGGCACCTTCAGCAGCTACGGCATCAGCTGGGTCCGACAGGCCCCA GGACAGGGCCTGGAATGGATGGGCTGGATCAGCCCCATCTTCGGCAACACCAACTACGCCCAGA AATTCCAGGGCAGAGTGACCATСАСCGCCGACGAGAGCACCAGCACCGCCTAGATGGAAGTGAG CAGCCTGCGGAGCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGAAGCCGGTACTACGGCGACCTG GACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTCACCGTGTCCTCT
SEQ ID NO: 78 (кодирующая VH в C4LB191)SEQ ID NO: 78 (encoding VH in C4LB191)
CAGGTGCAGCTGGTGCAGAGCGGCGCTCAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCCGAAGT GAAGAAACCTGGCGCCAGCATGAAGGTGTCCTGCAAGGCCAGCGGCTACACCTTCACCGACTAC TACATCCACTGGGTGCGCCAGGCCCCAGGCCAGGGACTGGAATGGGTGGGACGGTTCAACCCCA ACAGCGGCGACACCAACGGCGCCCAGAAATTCCAGGGCAGAGTGACCATGACCCGGGACACCAG CATCAGCACCGCCTACATGGAACTGACCCGGCTGCGGAGCGACGACACCGCCGTGTACCACTGT GCCAGAGAGGGCGAGCTGGCCGGCATCTTCTTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAG TGTCCAGCCAGGTGCAGCTGGTGCAGAGCGGCGCTCAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCCGAAGT GAAGAAACCTGGCGCCAGCATGAAGGTGTCCTGCAAGGCCAGCGGCTACACCTTCACCGACTAC TACATCCACTGGGTGCGCCAGGCCCCAGGCCAGGGACTGGAATGGGTGGGACGGTTCAACCCCA ACAGCGGCGACACCAACGGCGCCCAGAAATTCCAGGGCAGAGTGACCATGACCCGGGACACCAG CATCAGCACCGCCTACATGGAACTGACCCGGCTGCGGAGCGACGACACCGCCGTGTACCACTGT GCCAGAGAGGGCGAGCTGGCCGGCATCTTCTTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAG TGTCCAGC
SEQ ID NO: 79 (кодирующая VL в C4LB191)SEQ ID NO: 79 (encoding VL in C4LB191)
AGCTACGAGCTGACCCAGCCCCCCAGCGTGTCCGTGTCTCCTGGCCAGACCGCCAGCAT CACCTGTAGCGGCGACAAGCTGGGCGACAAATACGTGTCCTGGAACCACCAGAAGCCCGGCCAG AGCCCCGTGCTGGTGATCTACCAGGACCGGAAGAGGCCCAGCGGCATCCCCGAGAGATTCAGCG GCAGCAACAGCGGCAACACCGCCACCCTGACCATCAGCGGCACCCAGGCCATGGACGAGGCCGA CTACTACTGCCAGGCCTGGGACAGCAGCACCGTGGTGTTCGGCGGAGGCACCAAGCTGACCGTG CTGAGCTACGAGCTGACCCAGCCCCCCAGCGTGTCCGTGTCTCCTGGCCAGACCGCCAGCAT CACCTGTAGCGGCGACAAGCTGGGCGACAAATACGTGTCCTGGAACCACCAGAAGCCCGGCCAG AGCCCCGTGCTGGTGATCTACCAGGACCGGAAGAGGCCCAGCGGCATCCCCGAGAGATTCAGCG GCAGCAACAGCGGCAACACCGCCACCCTGACCATCAGCGGCACCCAGGCCATGGACGAGGCCGA CTACTACTGCCAGGCCTGGGACAGCAGCACCGTGGTGTTCGGCGGAGGCACCAAGCTGACCGTG CTG
В изобретении также предлагается выделенный полинуклеотид, кодирующий любую из вариабельных областей тяжелой цепи антитела, вариабельных областей легкой цепи антитела, тяжелых цепей антитела и/или легких цепей антитела изобретения. Некоторые примеры полинуклеотидов описаны в настоящем документе, однако другие полинуклеотиды, которые, принимая во внимание вырожденность генетического кода или предпочтительность использования кодонов в данной экспрессирующей системе, кодируют антитела изобретения, также находятся в пределах объема настоящего изобретения. Примерами полинуклеотидов являются, например, полинуклеотиды, содержащие последовательности, приведенные в SEQ ID NO: 76, 77, 78 и 79. Полинуклеотидные последовательности, кодирующие VH или VL (или их фрагмент) антитела изобретения, могут быть функционально соединены с одним или более регуляторными элементами, такими как промотор или энхансер, которые позволяют экспрессировать нуклеотидную последовательность в предполагаемой клетке-хозяине. Полинуклеотид может представлять собой кДНК.The invention also provides an isolated polynucleotide encoding any of the antibody heavy chain variable regions, antibody light chain variable regions, antibody heavy chains, and/or antibody light chains of the invention. Some examples of polynucleotides are described herein, however, other polynucleotides which, given the degeneracy of the genetic code or the preference for codon usage in a given expression system, encode antibodies of the invention are also within the scope of the present invention. Examples of polynucleotides are, for example, those containing the sequences shown in SEQ ID NOs: 76, 77, 78 and 79. Polynucleotide sequences encoding the VH or VL (or fragment thereof) of an antibody of the invention may be operably linked to one or more regulatory elements. , such as a promoter or enhancer that allows the expression of the nucleotide sequence in the intended host cell. The polynucleotide may be cDNA.
В изобретении также предлагается вектор, содержащий полинуклеотид изобретения. Такие векторы могут представлять собой плазмидные векторы, вирусные векторы, векторы для экспрессии бакуловирусов, векторы на основе транспозонов или любые другие векторы, приемлемые для введения синтетического полинуклеотида изобретения в данный организм или в данное генетическое окружение любым способом. Например, полинуклеотиды, кодирующие вариабельные области легкой и/или тяжелой цепей антител изобретения, необязательно соединенные с константными областями, вставлены в экспрессионные векторы. Легкую и/или тяжелую цепи можно клонировать в одном или в разных экспрессионных векторах. ДНК-сегменты, кодирующие иммуноглобулиновые цепи, могут быть функционально соединены в экспрессионном(-ых) векторе(-ах) с управляющими последовательностями, обеспечивающими экспрессию иммуноглобулиновых полипептидов. К таким управляющим последовательностям относятся сигнальные последовательности, промоторы (например, естественно ассоциированные или гетерологичные промоторы), энхансерные элементы и последовательности терминации транскрипции, и их выбирают так, чтобы они были совместимы с клеткой-хозяином, выбранной для экспрессии антитела. После введения вектора в соответствующего хозяина проводят инкубацию хозяина в условиях, приемлемых дляThe invention also provides a vector containing the polynucleotide of the invention. Such vectors may be plasmid vectors, viral vectors, baculovirus expression vectors, transposon vectors, or any other vectors suitable for introducing the synthetic polynucleotide of the invention into a given organism or genetic environment by any means. For example, polynucleotides encoding the variable regions of the light and/or heavy chains of the antibodies of the invention, optionally linked to constant regions, are inserted into expression vectors. The light and/or heavy chains can be cloned in the same or different expression vectors. DNA segments encoding immunoglobulin chains may be operably linked in the expression vector(s) to control sequences for expression of immunoglobulin polypeptides. Such control sequences include signal sequences, promoters (eg, naturally associated or heterologous promoters), enhancer elements, and transcription termination sequences, and are selected to be compatible with the host cell selected for expression of the antibody. After introducing the vector into the appropriate host, the host is incubated under conditions acceptable for
- 22 040943 высокоуровневой экспрессии белков, кодируемых введенными полинуклеотидами.- 22 040943 high-level expression of proteins encoded by the introduced polynucleotides.
Как правило, приемлемые экспрессионные векторы могут подвергаться репликации в организмаххозяевах либо в виде эписом, либо в виде неотъемлемой части хромосомной ДНК хозяина. Обычно экспрессионные векторы содержат маркеры селекции, например вызывающие резистентность к ампициллину, резистентность к гигромицину, резистентность к тетрациклину, резистентность к канамицину или резистентность к неомицину, чтобы обеспечивать обнаружение таких клеток, трансформированных желаемыми последовательностями ДНК.In general, suitable expression vectors can replicate in host organisms either as episomes or as an integral part of the host's chromosomal DNA. Typically, expression vectors contain selection markers, eg, ampicillin resistance, hygromycin resistance, tetracycline resistance, kanamycin resistance, or neomycin resistance, to allow detection of such cells transformed with the desired DNA sequences.
Приемлемые промоторные и энхансерные элементы известны в данной области. Примеры промоторов для экспрессии в эукариотической клетке включают промоторные и энхансерные элементы генов легкой и/или тяжелой цепей иммуноглобулинов; немедленный ранний промотор цитомегаловируса; промотор тимидинкиназы вируса простого герпеса; ранние и поздние промоторы SV40; промотор, присутствующий в длинных терминальных повторах ретровируса; промотор мышиного металлотионеина-I и различные тканеспецифические промоторы, известные в данной области. Выбор подходящего вектора и промотора вполне по силам специалисту среднего уровня в данной области.Suitable promoter and enhancer elements are known in the art. Examples of promoters for expression in a eukaryotic cell include promoter and enhancer elements of immunoglobulin light and/or heavy chain genes; cytomegalovirus immediate early promoter; herpes simplex virus thymidine kinase promoter; SV40 early and late promoters; a promoter present in the long terminal repeats of the retrovirus; the mouse metallothionein-I promoter; and various tissue-specific promoters known in the art. The selection of an appropriate vector and promoter is well within the ability of one of ordinary skill in the art.
Специалистам в данной области известны большие количества приемлемых векторов и промоторов; многие доступны на рынке для создания заявленных рекомбинантных конструктов. Следующие векторы представлены в качестве примера. Бактериальные: pBs, phagescript, PsiX174, pBluescript SK, pBs KS, pNH8a, pNH16a, pNH18a, pNH46a (Stratagene, Ла-Холья, г. Сан-Диего, штат Калифорния, США); pTrc99A, pKK223-3, pKK233-3, pDR540 и pRIT5 (Pharmacia, г. Уппсала, Швеция). Эукариотические: pWLneo, pSV2cat, pOG44, PXR1, pSG (Stratagene), pSVK3, pBPV, pMSG и pSVL (Pharmacia).Large numbers of acceptable vectors and promoters are known to those skilled in the art; many are available on the market to generate the claimed recombinant constructs. The following vectors are provided as an example. Bacterial: pBs, phagescript, PsiX174, pBluescript SK, pBs KS, pNH8a, pNH16a, pNH18a, pNH46a (Stratagene, La Jolla, San Diego, CA, USA); pTrc99A, pKK223-3, pKK233-3, pDR540 and pRIT5 (Pharmacia, Uppsala, Sweden). Eukaryotic: pWLneo, pSV2cat, pOG44, PXR1, pSG (Stratagene), pSVK3, pBPV, pMSG and pSVL (Pharmacia).
В изобретении также предложена клетка-хозяин, содержащая один или более векторов изобретения. Термин клетка-хозяин относится к клетке, в которую вводят вектор. Следует понимать, что термин клетка-хозяин служит для обозначения не только конкретной заявленной клетки, но и потомства такой клетки, а также стабильной клеточной линии, созданной из конкретной заявленной клетки. Так как в последующих поколениях могут возникать некоторые модификации вследствие либо мутации, либо воздействий среды, такое потомство может не быть идентичным родительской клетке, но оно также может быть охвачено термином клетка-хозяин, используемым в данном документе. Такими клеткамихозяевами могут быть эукариотические, прокариотические, растительные клетки или клетки архей.The invention also provides a host cell containing one or more vectors of the invention. The term host cell refers to the cell into which the vector is introduced. It should be understood that the term host cell is used to refer not only to a specific claimed cell, but also to the progeny of such a cell, as well as a stable cell line created from a specific claimed cell. Since some modifications may occur in subsequent generations due to either mutation or environmental influences, such progeny may not be identical to the parent cell, but may also be encompassed by the term host cell as used herein. Such host cells can be eukaryotic, prokaryotic, plant or archaeal cells.
Кишечная палочка (Escherichia coli), такие бациллы, как сенная палочка (Bacillus subtilis), и другие энтеробактерии, такие как сальмонеллы, серрации и различные виды псевдомонад, являются примерами прокариотических клеток-хозяев. Также для экспрессии используют другие микроорганизмы, такие как дрожжи. Сахаромицеты (например, S. cerevisiae) и пихии являются примерами приемлемых дрожжевых клеток-хозяев. Примерами эукариотических клеток могут быть клетки млекопитающих, насекомых, птиц или другие клетки животного происхождения. Эукариотические клетки млекопитающих включают иммортализованные клеточные линии, такие как гибридомы или клеточные линии миеломы, например мышиные клеточные линии SP2/0 (Американская коллекция типовых культур (ATCC), г. Манассас, штат Вирджиния, США, CRL-1581), NS0 (Европейская коллекция клеточных культур (ECACC), г. Солсбери, Уилтшир, Великобритания, ECACC № 85110503), FO (ATCC CRL-1646) и Ag653 (ATCC CRL-1580). К примеру клеточной линии миеломы человека относится U266 (АТТС CRL-TIB-196). Другие используемые клеточные линии включают линии, полученные из клеток яичника китайского хомячка (CHO), например CHO-K1SV (Lonza Biologies, г. Уолкерсвилл, штат Мэриленд, США), CHO-K1 (ATCC CRL-61) или DG44.E. coli (Escherichia coli), bacilli such as hay bacillus (Bacillus subtilis), and other enterobacteria such as salmonella, serrations and various types of Pseudomonas are examples of prokaryotic host cells. Other microorganisms such as yeast are also used for expression. Saccharomycetes (eg S. cerevisiae) and pichias are examples of suitable yeast host cells. Examples of eukaryotic cells may be mammalian, insect, avian or other animal cells. Mammalian eukaryotic cells include immortalized cell lines such as hybridomas or myeloma cell lines, such as murine SP2/0 cell lines (ATCC, Manassas, VA, USA, CRL-1581), NS0 (European cell cultures (ECACC), Salisbury, Wiltshire, UK, ECACC No. 85110503), FO (ATCC CRL-1646) and Ag653 (ATCC CRL-1580). An example of a human myeloma cell line is U266 (ATTC CRL-TIB-196). Other useful cell lines include lines derived from Chinese hamster ovary (CHO) cells, such as CHO-K1SV (Lonza Biologies, Walkersville, MD, USA), CHO-K1 (ATCC CRL-61) or DG44.
В изобретении также предлагается способ продуцирования антитела изобретения, включающий культивирование клетки-хозяина изобретения в условиях экспрессии антитела и выделение антитела, продуцированного клеткой-хозяином. Способы получения антител и их очистки хорошо известны специалистам в данной области. После синтеза (химического либо рекомбинантного) полные антитела, их димеры, отдельные легкие и/или тяжелые цепи или другие фрагменты антител, такие как VH и/или VL, можно очищать в соответствии со стандартными процедурами, включая осаждение сульфатом аммония, применение аффинных колонок, колоночную хроматографию, высокоэффективную жидкостную хроматографию (ВЭЖХ), электрофорез в геле и т.п. (по существу см. Scopes, Protein Purification (SpringerVerlag, N.Y., 1982). Заявленное антитело может быть, по существу, чистым, например чистым по меньшей мере на от около 80 до 85%, чистым по меньшей мере на от около 85 до 90%, чистым по меньшей мере на от около 90 до 95%, чистым по меньшей мере на от около 98 до 99% или более, например не содержащим загрязнителей, таких как клеточный дебрис, макромолекулы и т.д., отличные от заявленного антитела.The invention also provides a method for producing an antibody of the invention, comprising culturing a host cell of the invention under antibody expression conditions and isolating the antibody produced by the host cell. Methods for producing antibodies and purifying them are well known to those skilled in the art. Once synthesized (chemically or recombinantly), whole antibodies, their dimers, individual light and/or heavy chains, or other antibody fragments such as VH and/or VL, can be purified according to standard procedures, including ammonium sulfate precipitation, the use of affinity columns, column chromatography, high performance liquid chromatography (HPLC), gel electrophoresis, and the like. (Essentially, see Scopes, Protein Purification (SpringerVerlag, N.Y., 1982). A claimed antibody may be substantially pure, e.g., at least about 80 to 85% pure, at least about 85 to 90% pure. %, pure at least from about 90 to 95%, pure at least from about 98 to 99% or more, for example, free of contaminants such as cellular debris, macromolecules, etc., other than the claimed antibody.
В изобретении также предлагается способ продуцирования антагонистического антитела, специфически связывающего CD154 с SEQ ID NO: 1, включающий объединение в экспрессионном векторе первого полинуклеотида, кодирующего VH антитела, и второго полинуклеотида, кодирующего VL антитела;The invention also provides a method for producing an antagonist antibody specifically binding CD154 with SEQ ID NO: 1, comprising combining in an expression vector a first polynucleotide encoding the VH antibody and a second polynucleotide encoding the VL antibody;
трансформацию этим экспрессионным вектором клетки-хозяина;transformation of the host cell with this expression vector;
культивирование клетки-хозяина в культуральной среде при условиях, в которых экспрессируются VL и VH, с образованием антитела; иculturing the host cell in a culture medium under conditions in which VL and VH are expressed to form an antibody; And
- 23 040943 выделение антитела из клетки-хозяина или культуральной среды.- 23 040943 isolation of the antibody from the host cell or culture medium.
Полинуклеотиды, кодирующие определенные последовательности VH или VL изобретения, могут быть включены в векторы с применением стандартных способов молекулярной биологии. Трансформацию клетки-хозяина, культивирование, экспрессию и очистку антитела выполняют с применением хорошо известных способов.Polynucleotides encoding certain VH or VL sequences of the invention can be incorporated into vectors using standard molecular biology techniques. Transformation of the host cell, culture, expression and purification of the antibody are performed using well known methods.
Способы леченияMethods of treatment
Антагонистические антитела изобретения, специфически связывающие CD154, например антитела C4LB5, C4LB89, C4LB94, C4LB150, C4LB189, C4LB191, C4LB199, C4LB231, C4LB232, C4LB35 и C4LB236, можно использовать для лечения и/или предотвращения любого состояния или заболевания, при котором антагонистические эффекты в отношении CD154 могут быть терапевтически эффективными и могут снижать симптомы заболевания. К примерам относится лечение аллергических, аутоиммунных, раковых, трансплантационных состояний, реакции трансплантат против хозяина (РТПХ), воспалительных и иных состояний, в особенности состояний, при которых индукция толерантности и/или подавление гуморального иммунитета является желательным с терапевтической точки зрения. К заболеваниям, которые можно лечить антителами изобретения, относятся иммуноопосредованные воспалительные заболевания или аутоиммунные заболевания, такие как артрит, системная красная волчанка (СКВ), воспалительное заболевание кишечника, трансплантация, трансплантация почки, трансплантация кожи, трансплантация костного мозга, реакция трансплантат против хозяина (РТПХ), иммунная тромбоцитопения (ITP), рассеянный склероз, тиреоидит, диабет I типа или атеросклероз.Antagonist antibodies of the invention that specifically bind CD154, such as antibodies C4LB5, C4LB89, C4LB94, C4LB150, C4LB189, C4LB191, C4LB199, C4LB231, C4LB232, C4LB35 and C4LB236, can be used to treat and/or prevent any condition or disease in which antagonistic effects in against CD154 may be therapeutically effective and may reduce the symptoms of the disease. Examples include the treatment of allergic, autoimmune, cancerous, transplantation conditions, graft-versus-host disease (GVHD), inflammatory and other conditions, especially conditions in which tolerance induction and/or suppression of humoral immunity is therapeutically desirable. Diseases that can be treated with antibodies of the invention include immune-mediated inflammatory diseases or autoimmune diseases such as arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), inflammatory bowel disease, transplantation, kidney transplantation, skin transplantation, bone marrow transplantation, graft-versus-host disease (GVHD). ), immune thrombocytopenia (ITP), multiple sclerosis, thyroiditis, type I diabetes, or atherosclerosis.
Помимо простого блокирования взаимодействий CD154-CD40, анти-CD154-терапия приводит к индукции иммунологической толерантности (Gordon et al., Diabetes 47: 1199-1206, 1988); Markees et al., Transplantation 64: 329-335, 1997; Jarvinen et al., Transplantation 76: 1375-1379, 2003; Quezada et al., Blood 102: 1920-1926, 2003; Frleta et al., J Immunother 26: 72-84, 2003; Elster et al., Transplantation 72: 1473-1478, 2001; Benda et al., Cell Transplantation 11: 715-720, 2002; Wekerle and Sykes, Annual review of medicine 2001. 52: 353-37019; Camirand et al., Transplantation 73: 453-461, 2002).In addition to simply blocking CD154-CD40 interactions, anti-CD154 therapy leads to the induction of immunological tolerance (Gordon et al., Diabetes 47: 1199-1206, 1988); Markees et al., Transplantation 64: 329-335, 1997; Jarvinen et al., Transplantation 76: 1375-1379, 2003; Quezada et al., Blood 102: 1920-1926, 2003; Frleta et al., J Immunother 26: 72-84, 2003; Elster et al., Transplantation 72: 1473-1478, 2001; Benda et al., Cell Transplantation 11: 715-720, 2002; Wekerle and Sykes, Annual review of medicine 2001. 52: 353-370 19 ; Camirand et al., Transplantation 73: 453-461, 2002).
В изобретении также предлагается способ лечения иммуноопосредованного воспалительного заболевания или аутоиммунного заболевания, включающий введение терапевтически эффективного количества антитела изобретения требующему этого субъекту в течение времени, достаточного для лечения иммуноопосредованного воспалительного заболевания или аутоиммунного заболевания.The invention also provides a method for treating an immune-mediated inflammatory disease or an autoimmune disease, comprising administering a therapeutically effective amount of an antibody of the invention to a subject in need thereof for a time period sufficient to treat the immune-mediated inflammatory disease or autoimmune disease.
В изобретении также предлагается способ лечения артрита, включающий введение терапевтически эффективного количества антитела изобретения требующему этого субъекту в течение времени, достаточного для лечения артрита.The invention also provides a method for treating arthritis comprising administering a therapeutically effective amount of an antibody of the invention to a subject in need thereof for a time period sufficient to treat the arthritis.
В некоторых вариантах осуществления артрит представляет собой ювенильный артрит, ревматоидный артрит, псориатический артрит, синдром Рейтера, анкилозирующий спондилит или подагрический артрит.In some embodiments, the arthritis is juvenile arthritis, rheumatoid arthritis, psoriatic arthritis, Reiter's syndrome, ankylosing spondylitis, or gouty arthritis.
В изобретении также предлагается способ лечения волчанки, включающий введение терапевтически эффективного количества антитела изобретения требующему этого субъекту в течение времени, достаточного для лечения волчанки.The invention also provides a method for treating lupus, comprising administering a therapeutically effective amount of an antibody of the invention to a subject in need thereof for a time period sufficient to treat lupus.
В некоторых вариантах осуществления волчанка представляет собой системную красную волчанку (СКВ) или кожную красную волчанку (ККВ).In some embodiments, the lupus is systemic lupus erythematosus (SLE) or cutaneous lupus erythematosus (CLE).
В некоторых вариантах осуществления субъект болен волчаночным нефритом.In some embodiments, the subject has lupus nephritis.
В изобретении также предлагается способ лечения воспалительного заболевания кишечника, включающий введение терапевтически эффективного количества антитела изобретения требующему этого субъекту в течение времени, достаточного для лечения воспалительного заболевания кишечника.The invention also provides a method for treating inflammatory bowel disease, comprising administering a therapeutically effective amount of an antibody of the invention to a subject in need thereof for a time period sufficient to treat the inflammatory bowel disease.
В некоторых вариантах осуществления воспалительное заболевание кишечника представляет собой болезнь Крона.In some embodiments, the inflammatory bowel disease is Crohn's disease.
В некоторых вариантах осуществления воспалительное заболевание кишечника представляет собой язвенный колит.In some embodiments, the inflammatory bowel disease is ulcerative colitis.
Термины лечение или лечить означают терапевтическое лечение. Субъекты, требующие лечения, включают тех субъектов, у кого диагностировано расстройство или симптом расстройства. Субъекты, которых можно лечить, также включают тех, кто подвержен или восприимчив к расстройству, или тех, кому требуется профилактика расстройства. Преимущественные или желательные клинические результаты включают в себя ослабление симптомов, уменьшение степени заболевания, стабилизацию (т. е. отсутствие ухудшения) течения заболевания, задержку или замедление прогрессирования заболевания, облегчение или временное улучшение болезненного состояния и ремиссию (частичную или полную), как обнаруживаемые, так и не обнаруживаемые. Благоприятный клинический результат у субъекта, получившего лечение, включает в себя, например, сниженную пролиферацию B-клеток или дендритных клеток, снижение уровня провоспалительных цитокинов, молекул адгезии, протеаз, иммуноглобулинов (в случаях, если несущая CD40 клетка представляет собой B-клетку), их комбинации, увеличенную продукцию противовоспалительных белков, уменьшение числа аутореактивных клеток, увеличение иммунной толерантности, ингибирование выживания аутореактивных клеток и/или уменьшение одного или более симптомов, опосредованных стимуляцией CD40-экспрессирующих клеток посредством CD154.The terms treatment or treat mean therapeutic treatment. Subjects in need of treatment include those subjects diagnosed with a disorder or a symptom of a disorder. Subjects that can be treated also include those who are susceptible to or susceptible to the disorder, or those in need of prophylaxis for the disorder. Beneficial or desirable clinical outcomes include relief of symptoms, reduction in disease severity, stabilization (i.e., no worsening) of the course of the disease, delay or retardation of disease progression, alleviation or temporary amelioration of the disease state, and remission (partial or complete) as detectable, so undetectable. Beneficial clinical outcome in a treated subject includes, for example, reduced B cell or dendritic cell proliferation, decreased levels of pro-inflammatory cytokines, adhesion molecules, proteases, immunoglobulins (in cases where the CD40-bearing cell is a B cell), combinations thereof, increased production of anti-inflammatory proteins, decreased number of autoreactive cells, increased immune tolerance, inhibition of survival of autoreactive cells, and/or reduction of one or more symptoms mediated by stimulation of CD40-expressing cells by CD154.
- 24 040943- 24 040943
Клинический ответ можно оценивать при помощи скрининговых методик, таких как магнитнорезонансная томография (МРТ), рентгенография, компьютерная томография (КТ), проточная цитометрия или цитометрия посредством сортировки клеток с активацией флуоресценции (FACS), гистология, макропатология и биохимия крови, включая, без ограничений, изменения, определяемые методом твердофазного ИФА, радиоиммуноанализом (РИА), хроматографией и т.п.Clinical response can be assessed using screening techniques such as magnetic resonance imaging (MRI), radiography, computed tomography (CT), flow cytometry or fluorescence activated cell sorting (FACS), histology, macropathology, and blood chemistry, including but not limited to , changes determined by the method of solid-phase ELISA, radioimmunoassay (RIA), chromatography, etc.
Примеры антител, которые можно применять в способах изобретения, включают в себя области VH, VL, HCDR и/или LCDR, показанные в табл. 2, табл. 3, табл. 4, табл. 5, табл. 6, табл. 7, табл. 8, табл. 9, табл. 13 и табл. 14, и антитела C4LB5, C4LB89, C4LB94, C4LB150, C4LB189, C4LB191, C4LB199, C4LB231, C4LB232, C4LB35 и C4LB236.Examples of antibodies that can be used in the methods of the invention include the VH, VL, HCDR and/or LCDR regions shown in Table 1. 2, tab. 3, tab. 4, tab. 5, tab. 6, tab. 7, tab. 8, tab. 9, tab. 13 and tab. 14, and antibodies C4LB5, C4LB89, C4LB94, C4LB150, C4LB189, C4LB191, C4LB199, C4LB231, C4LB232, C4LB35 and C4LB236.
Способы изобретения можно применять для лечения субъекта в рамках любой классификации животных. Примеры субъектов, которых можно лечить, включают млекопитающих, таких как люди, грызуны, собаки, кошки и сельскохозяйственные животные.The methods of the invention can be used to treat a subject within any classification of animals. Examples of subjects that can be treated include mammals such as humans, rodents, dogs, cats, and farm animals.
Антитела изобретения также могут использоваться для получения лекарственного средства для проведения такого лечения, причем лекарственное средство получают для введения в дозировках, определенных в настоящем документе.Antibodies of the invention can also be used to obtain a drug for such treatment, and the drug is obtained for administration in dosages defined herein.
Антитела изобретения можно вводить в комбинации со вторым терапевтическим агентом.The antibodies of the invention may be administered in combination with a second therapeutic agent.
Второй терапевтический агент может представлять собой любое известное средство терапии аутоиммунных и воспалительных заболеваний, включая любой агент или комбинацию агентов, польза которых известна, или которые использовались или в настоящее время используются для лечения аутоиммунных и воспалительных заболеваний. К таким средствам терапии и терапевтическим агентам относятся хирургия или хирургические процедуры (например, спленэктомия, лимфаденоэктомия, тироидэктомия, плазмаферез, лейкофорез, трансплантация клеток, тканей или органов, процедуры на кишечнике, перфузия органов и т. п.), радиационная терапия, такая терапия, как стероидная и нестероидная терапия, гормональная терапия, цитокиновая терапия, терапия дерматологическими агентами (например, агентами для местного применения, используемыми для лечения кожных патологий, таких как аллергии, контактный дерматит и псориаз), иммуносупрессорная терапия и терапия другими противовоспалительными моноклональными антителами.The second therapeutic agent may be any known therapeutic agent for autoimmune and inflammatory diseases, including any agent or combination of agents known to be useful or that has been or is being used to treat autoimmune and inflammatory diseases. Such therapies and therapeutic agents include surgery or surgical procedures (eg, splenectomy, lymphadenectomy, thyroidectomy, plasmapheresis, leukophoresis, cell, tissue, or organ transplantation, bowel procedures, organ perfusion, etc.), radiation therapy, such therapy such as steroid and non-steroid therapy, hormonal therapy, cytokine therapy, therapy with dermatological agents (eg, topical agents used to treat skin conditions such as allergies, contact dermatitis, and psoriasis), immunosuppressive therapy, and therapy with other anti-inflammatory monoclonal antibodies.
Второй терапевтический агент может представлять собой кортикостероид, противомалярийное лекарственное средство, иммунодепрессант, цитотоксическое лекарственное средство или модулятор Bклеток.The second therapeutic agent may be a corticosteroid, an antimalarial drug, an immunosuppressant, a cytotoxic drug, or a B cell modulator.
В некоторых вариантах осуществления второй терапевтический агент представляет собой преднизон, преднизолон, метилпреднизолон, дефлазкорт, гидроксихлорохин, азатиоприн, метотрексат, циклофосфамид, микофенолата мофетил (ММФ), микофенолат натрия, циклоспорин, лефлуномид, такролимус, RITUXAN® (ритуксимаб) или BENLYSTA® (белимумаб).In some embodiments, the second therapeutic agent is prednisone, prednisolone, methylprednisolone, deflascort, hydroxychloroquine, azathioprine, methotrexate, cyclophosphamide, mycophenolate mofetil (MMF), sodium mycophenolate, cyclosporine, leflunomide, tacrolimus, RITUXAN® (rituximab), or BENLYSTA® (belimumab). ).
В некоторых вариантах осуществления антитела изобретения вводят в комбинации со вторым терапевтическим агентом. К примерам вторых терапевтических агентов относятся кортикостероиды, нестероидные противовоспалительные препараты (НПВП), салицилаты, гидроксихлорохин, сульфасалазин, цитотоксические препараты, иммуносупрессорные лекарственные средства, иммуномодулирующие антитела, метотрексат, циклофосфамид, мизорибин, хлорамбуцил, циклоспорин, такролимус (FK506; ProGrafrM), микофенолата мофетил и азатиоприн (6-меркаптопурин), сиролимус (рапамицин), дезоксиспергуалин, лефлуномид и его малононитрилоамидные аналоги; антитела к CTLA4 и гибридные Ig, антитела к стимуляторам B-лимфоцитов (например, LYMPHOSTAT-BTM) и гибридные белки CTLA4-Ig (BLySlg), антитела к CD80, анти-Т-клеточные антитела, такие как антитела к CD3 (ОКТЗ), антитела к CD4, кортикостероиды, такие как, например, клобетазол, галобетазол, гидрокортизон, триамцинолон, бетаметазон, флуоцинол, флуоцинонид, преднизон, преднизолон, метилпреднизолон; нестероидные противовоспалительные препараты (НПВП), такие как, например, сульфасалазин, содержащие мезаламин лекарственные средства (известные как агенты 5-ASA), целекоксиб, диклофенак, этодолак, фенпрофен, флурбипрофен, ибупрофен, кетопрофен, меклофамат, мелоксикам, набуметон, напроксен, оксапрозин, пироксикам, рофекоксиб, салицилаты, сулиндак и толметин; ингибиторы фосфодиэстеразы-4, антитела к TNFa REMICADE® (инфликсимаб), SIMPONI® (голимумаб) и HUMIRA® (адалимумаб), талидомид или его аналоги, такие как леналидомид.In some embodiments, the antibodies of the invention are administered in combination with a second therapeutic agent. Examples of second therapeutic agents include corticosteroids, non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs), salicylates, hydroxychloroquine, sulfasalazine, cytotoxic drugs, immunosuppressive drugs, immunomodulating antibodies, methotrexate, cyclophosphamide, mizoribine, chlorambucil, cyclosporine, tacrolimus (FK506; ProGrafrM), mycophenolate mofetil and azathioprine (6-mercaptopurine), sirolimus (rapamycin), deoxyspergualine, leflunomide and its malononitriloamide analogues; antibodies to CTLA4 and fusion Igs, antibodies to B-lymphocyte stimulators (e.g. LYMPHOSTAT-BTM) and CTLA4-Ig fusion proteins (BLySlg), antibodies to CD80, anti-T cell antibodies such as anti-CD3 antibodies (OCTZ), anti-CD4 antibodies, corticosteroids such as, for example, clobetasol, halobetasol, hydrocortisone, triamcinolone, betamethasone, fluocinol, fluocinonide, prednisone, prednisolone, methylprednisolone; non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs), such as, for example, sulfasalazine, medicines containing mesalamine (known as 5-ASA agents), celecoxib, diclofenac, etodolac, fenprofen, flurbiprofen, ibuprofen, ketoprofen, meclofamate, meloxicam, nabumetone, naproxen, oxaprozin , piroxicam, rofecoxib, salicylates, sulindac and tolmetin; phosphodiesterase-4 inhibitors, anti-TNFa antibodies REMICADE® (infliximab), SIMPONI® (golimumab) and HUMIRA® (adalimumab), thalidomide or analogues such as lenalidomide.
Антитела изобретения можно вводить в комбинации со вторым терапевтическим агентом одновременно, последовательно или отдельно.The antibodies of the invention may be administered in combination with a second therapeutic agent simultaneously, sequentially or separately.
Эффективность лечения или РА можно оценивать, используя эффективность, измеренную по клиническим ответам, определяемым критериями Американского колледжа ревматологии (American College of Rheumatology), критериями Европейской лиги против ревматизма или любыми другими критериями. См., например, Felson et al. (1995) Arthritis Rheum. 38: 727-35 и van Gestel et al. (1996) Arthritis Rheum. 39: 34-40.Treatment efficacy or RA may be assessed using efficacy as measured by clinical responses as defined by the American College of Rheumatology criteria, the European League Against Rheumatism criteria, or any other criteria. See, for example, Felson et al. (1995) Arthritis Rheum. 38:727-35 and van Gestel et al. (1996) Arthritis Rheum. 39:34-40.
Введение. Фармацевтические композицииIntroduction. Pharmaceutical compositions
В изобретении предложены фармацевтические композиции антагонистических антител, специфически связывающих CD154, и фармацевтически приемлемый носитель. Для терапевтического примененияThe invention provides pharmaceutical compositions of antagonistic antibodies specifically binding to CD154 and a pharmaceutically acceptable carrier. For therapeutic use
- 25 040943 возможно получение антител изобретения в виде фармацевтических композиций, содержащих эффективное количество антитела в качестве активного ингредиента в фармацевтически приемлемом носителе. Термин носитель относится к разбавителю, адъюванту, эксципиенту или несущей среде, вместе с которыми вводят активное соединение. Такие носители могут представлять собой жидкости, такие как вода и масла, включая масла, получаемые из нефти, масла животного, растительного или синтетического происхождения, такие как арахисовое масло, соевое масло, минеральное масло, кунжутное масло и т. п. Например, можно применять 0,4% солевой раствор и 0,3% раствор глицина. Эти растворы стерильны и по существу не содержат твердых частиц. Их можно стерилизовать с применением хорошо известных стандартных методик стерилизации (например, фильтрации). Композиции могут содержать фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества, необходимые для приближения к физиологическим условиям, такие как регулирующие pH агенты и буферные агенты, стабилизирующие, загущающие, смазывающие и окрашивающие агенты и т. д. Концентрация молекул или антител изобретения в таком фармацевтическом составе может значительно варьироваться, т.е. от менее около 0,5 мас.%, обычно по меньшей мере от около 1 и до 5 мас.%, 10 мас.%, 15 мас.%, 20 мас.%, 25 мас.%, 30 мас.%, 35 мас.%, 40 мас.%, 45 мас.% или 50 мас.%, и будет преимущественно выбираться на основании необходимой дозы, объемов текучей среды, значений вязкости и т.д. в соответствии с конкретным выбранным способом введения. Приемлемые несущие среды и составы, включающие другие человеческие белки, например сывороточный альбумин человека, описаны, например, в Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21st Edition, Troy, D.B. ed., Lipincott Williams and Wilkins, Philadelphia, PA 2006, Part 5, Pharmaceutical Manufacturing pp 6911092, см., в особенности pp. 958-989.- 25 040943 it is possible to obtain antibodies of the invention in the form of pharmaceutical compositions containing an effective amount of the antibody as an active ingredient in a pharmaceutically acceptable carrier. The term carrier refers to the diluent, adjuvant, excipient or carrier vehicle with which the active compound is administered. Such carriers may be liquids such as water and oils, including oils derived from petroleum, animal, vegetable or synthetic oils such as peanut oil, soybean oil, mineral oil, sesame oil, and the like. For example, 0.4% saline and 0.3% glycine solution. These solutions are sterile and essentially free of particulate matter. They can be sterilized using well known standard sterilization techniques (eg filtration). The compositions may contain pharmaceutically acceptable adjuvants necessary to approximate physiological conditions, such as pH adjusting and buffering agents, stabilizing, thickening, lubricating and coloring agents, etc. The concentration of the molecules or antibodies of the invention in such a pharmaceutical formulation can vary greatly, those. from less than about 0.5 wt.%, usually at least from about 1 to 5 wt.%, 10 wt.%, 15 wt.%, 20 wt.%, 25 wt.%, 30 wt.%, 35 wt.%, 40 wt.%, 45 wt.% or 50 wt.%, and will be mainly selected based on the required dose, fluid volumes, viscosity values, etc. according to the specific route of administration chosen. Suitable carrier media and formulations including other human proteins, such as human serum albumin, are described, for example, in Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21st Edition, Troy, DB ed., Lipincott Williams and Wilkins, Philadelphia, PA 2006, Part 5, Pharmaceutical Manufacturing pp 6911092, see especially pp. 958-989.
Способом введения антител изобретения в способах изобретения может быть любой приемлемый путь, такой как парентеральное введение, например внутрикожное, внутримышечное, внутрибрюшинное, внутривенное или подкожное, трансмукозальное (пероральное, интраназальное, интравагинальное, ректальное) или другие способы, известные специалисту, как хорошо известно в данной области.The route of administration of the antibodies of the invention in the methods of the invention may be any suitable route, such as parenteral administration, for example, intradermal, intramuscular, intraperitoneal, intravenous or subcutaneous, transmucosal (oral, intranasal, intravaginal, rectal), or other methods known to the skilled person, as is well known in this area.
Антитела изобретения можно вводить субъекту любым приемлемым способом, например парентерально путем внутривенной (в/в) инфузии или болюсной инъекции, внутримышечно, подкожно или внутрибрюшинно. В/в инфузию можно осуществлять, например, в течение 15, 30, 60, 90, 120, 180 или 240 мин, или 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 ч.The antibodies of the invention can be administered to a subject by any suitable route, such as parenterally by intravenous (IV) infusion or bolus injection, intramuscularly, subcutaneously, or intraperitoneally. IV infusion can be carried out, for example, for 15, 30, 60, 90, 120, 180 or 240 minutes, or 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 or 12 h.
Доза, которую вводят субъекту с иммуноопосредованным воспалительным заболеванием или аутоиммунным заболеванием, таким как ревматоидный артрит, достаточна для того, чтобы ослабить или по меньшей мере частично купировать заболевание, подлежащее лечению (терапевтически эффективное количество), и может иногда составлять от 0,005 мг/кг до около 100 мг/кг, например от около 0,05 мг/кг до около 20 мг/кг, или от около 0,1 мг/кг до около 20 мг/кг, или от около 1 мг/кг до около 20 мг/кг, или около 4 мг/кг, около 8 мг/кг, около 16 мг/кг или около 24 мг/кг, или, например, около 1, 2, 3, 4, 5, б, 7, 8, 9 или 10 мг/кг, но может быть даже выше, например около 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 мг/кг.The dose administered to a subject with an immune-mediated inflammatory disease or an autoimmune disease such as rheumatoid arthritis is sufficient to attenuate or at least partially reverse the disease being treated (therapeutically effective amount) and may sometimes range from 0.005 mg/kg to about 100 mg/kg, for example, from about 0.05 mg/kg to about 20 mg/kg, or from about 0.1 mg/kg to about 20 mg/kg, or from about 1 mg/kg to about 20 mg/kg kg, or about 4 mg/kg, about 8 mg/kg, about 16 mg/kg or about 24 mg/kg, or, for example, about 1, 2, 3, 4, 5, b, 7, 8, 9 or 10 mg/kg, but may be even higher, such as about 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 or 100 mg/kg.
Также можно вводить фиксированную стандартную дозу, например 50, 100, 200, 500 или 1000 мг, или доза может быть основана на учете площади поверхности тела пациента, например 500, 400, 300, 250, 200 или 100 мг/м2. Для лечения иммуноопосредованного воспалительного заболевания, такого как ревматоидный артрит, обычно можно вводить от 1 до 8 доз (например, 1, 2, 3, 4, 5, б, 7 или 8), но можно вводить и 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более доз.A fixed unit dose may also be administered, such as 50, 100, 200, 500, or 1000 mg, or the dose may be based on the patient's body surface area, such as 500, 400, 300, 250, 200, or 100 mg/m 2 . For the treatment of an immune-mediated inflammatory disease such as rheumatoid arthritis, 1 to 8 doses (eg, 1, 2, 3, 4, 5, b, 7, or 8) can usually be administered, but 9, 10, 11, 12 can also be administered. , 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 or more doses.
Введение антител изобретения можно повторять через одни сутки, двое суток, трое суток, четверо суток, пять суток, шесть суток, одну неделю, две недели, три недели, один месяц, пять недель, шесть недель, семь недель, два месяца, три месяца, четыре месяца, пять месяцев, шесть месяцев или более. Также возможны повторные курсы лечения в виде длительного введения. Повторное введение можно проводить в той же дозе или в другой дозе. Например, антитела изобретения можно вводить путем инфузии в дозе 0,1 мг/кг, 1 мг/кг, 5 мг/кг, 8 мг/кг или 16 мг/кг с интервалом в одну неделю в течение 8 недель, с последующим введением в дозе 8 мг/кг или 16 мг/кг каждые две недели в течение дополнительных 16 недель, с последующим введением в дозе 8 или 16 мг/кг каждые четыре недели.Administration of antibodies of the invention can be repeated after one day, two days, three days, four days, five days, six days, one week, two weeks, three weeks, one month, five weeks, six weeks, seven weeks, two months, three months , four months, five months, six months or more. Repeated courses of treatment in the form of long-term administration are also possible. Repeated administration can be carried out at the same dose or at a different dose. For example, the antibodies of the invention may be administered by infusion at 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, 5 mg/kg, 8 mg/kg, or 16 mg/kg one week apart for 8 weeks, followed by infusion into 8 mg/kg or 16 mg/kg every two weeks for an additional 16 weeks, followed by 8 or 16 mg/kg every four weeks.
Антитела изобретения можно вводить в виде поддерживающей терапии, например один раз в неделю в течение периода 6 или более месяцев.The antibodies of the invention may be administered as maintenance therapy, eg once a week for a period of 6 months or more.
Например, антитела изобретения можно вводить в виде суточной дозы в количестве около 0,1-100 мг/кг, например 0,5, 0,9, 1,0, 1,1, 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 мг/кг в сутки, по меньшей мере в одни из суток 1, 2, 3, 4, 5, б, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39 или 40, или, альтернативно, по меньшей мере в одну из недель 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 после начала лечения, или в любой их комбинации с применением одной или разделенных доз каждые 24, 12, 8, 6, 4 или 2 ч, или в любой их комбинации.For example, the antibodies of the invention can be administered as a daily dose of about 0.1-100 mg/kg, such as 0.5, 0.9, 1.0, 1.1, 1.5, 2, 3, 4, 5 , 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 , 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, or 100 mg/kg per day on at least one of days 1, 2, 3, 4, 5, b, 7, 8, 9, 10, 11 , 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36 , 37, 38, 39 or 40, or alternatively at least one of weeks 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 or 20 after the start of treatment, or any combination thereof, using single or divided doses every 24, 12, 8, 6, 4 or 2 hours, or any combination thereof.
Антитела изобретения также можно вводить с профилактической целью, чтобы уменьшать риск развития иммуноопосредованного воспалительного заболевания или аутоиммунного заболевания, такого как артрит или ревматоидный артрит, и/или для задержки проявления иммуноопосредованного воспалительного заболевания аутоиммунного заболевания.The antibodies of the invention can also be administered prophylactically to reduce the risk of developing an immune-mediated inflammatory disease or an autoimmune disease such as arthritis or rheumatoid arthritis and/or to delay the onset of an immune-mediated inflammatory disease of an autoimmune disease.
- 26 040943- 26 040943
Таким образом, фармацевтическую композицию изобретения для внутримышечной инъекции можно получать с содержанием 1 мл стерильной забуференной водой и от около 1 нг до около 100 мг/кг, например от около 50 нг до около 30 мг/кг или, предпочтительнее, от около 5 мг до около 25 мг/кг антитела изобретения.Thus, a pharmaceutical composition of the invention for intramuscular injection can be prepared at a content of 1 ml of sterile buffered water and from about 1 ng to about 100 mg/kg, for example from about 50 ng to about 30 mg/kg, or more preferably from about 5 mg to about 25 mg/kg of an antibody of the invention.
Например, фармацевтическую композицию, содержащую антитела изобретения, для введения пациенту с массой тела 80 кг путем внутривенной инфузии, можно готовить таким образом, чтобы она содержала около 200 мл стерильного раствора Рингера и от около 8 мг до около 2400 мг, от около 400 мг до около 1600 мг или от около 400 мг до около 800 мг антител изобретения. Способы получения композиций для парентерального введения хорошо известны и описаны более подробно, например, в Remington's Pharmaceutical Science, 15th ed., Mack Publishing Company, Easton, PA. Терапевтически эффективное количество антител изобретения, эффективное для лечения иммуноопосредованного воспалительного заболевания или аутоиммунного заболевания, можно определять стандартными методами исследования. К примеру, для помощи в определении оптимального диапазона доз можно использовать анализы in vitro. Дозу антител изобретения, которая может быть эффективной при лечении иммуноопосредованных воспалительных заболеваний или аутоиммунных заболеваний, таких как артрит или ревматоидный артрит, необязательно можно определять путем введения антител на соответствующих животных моделях, хорошо известных в данной области. Выбор конкретной эффективной дозы (например, посредством клинических испытаний) могут осуществлять специалисты в данной области на основании нескольких факторов. Такие факторы включают: подлежащее лечению или профилактике заболевание, отмеченные симптомы, массу тела пациента, иммунологический статус пациента и другие известные специалисту факторы. Точная доза, предназначенная для применения в составе, также будет зависеть от пути введения и тяжести заболевания и должна определяться на основании решения медработника и состояния каждого пациента. Эффективные дозы можно экстраполировать на основе кривых доза-ответ, полученных в тестовых системах in vitro или животных моделей. Антитела изобретения можно тестировать на предмет их эффективности и эффективной дозы с применением любой из моделей, описанных в данном документе.For example, a pharmaceutical composition containing antibodies of the invention for administration to an 80 kg patient by intravenous infusion may be formulated to contain about 200 ml of sterile Ringer's solution and about 8 mg to about 2400 mg, from about 400 mg to about 1600 mg or about 400 mg to about 800 mg of the antibodies of the invention. Methods for preparing compositions for parenteral administration are well known and described in more detail, for example, in Remington's Pharmaceutical Science, 15th ed., Mack Publishing Company, Easton, PA. A therapeutically effective amount of an antibody of the invention effective for treating an immune-mediated inflammatory disease or an autoimmune disease can be determined by standard assay methods. For example, in vitro assays can be used to help determine the optimal dosage range. The dose of antibodies of the invention that may be effective in the treatment of immune-mediated inflammatory diseases or autoimmune diseases such as arthritis or rheumatoid arthritis can optionally be determined by administration of the antibodies in appropriate animal models well known in the art. The choice of a specific effective dose (eg, through clinical trials) can be performed by those skilled in the art based on several factors. Such factors include: the disease to be treated or prevented, the symptoms noted, the body weight of the patient, the immunological status of the patient, and other factors known to the person skilled in the art. The exact dose to be used in the formulation will also depend on the route of administration and the severity of the disease and should be determined based on the judgment of the healthcare professional and the condition of each patient. Effective doses can be extrapolated from dose-response curves obtained in in vitro test systems or animal models. Antibodies of the invention can be tested for their efficacy and effective dosage using any of the models described herein.
Антитела изобретения могут быть лиофилизированы для хранения и восстановлены в приемлемом носителе перед использованием. Было показано, что эта методика эффективна для стандартных белковых препаратов и можно использовать хорошо известные методики лиофилизации и восстановления.Antibodies of the invention may be lyophilized for storage and reconstituted in an acceptable vehicle prior to use. This technique has been shown to be effective for standard protein preparations and well known lyophilization and reconstitution techniques can be used.
Антиидиотипические антителаAnti-idiotypic antibodies
В настоящем изобретении предлагается антиидиотипическое антитело, связывающееся с антителом изобретения.The present invention provides an anti-idiotypic antibody that binds to an antibody of the invention.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 58 и VL с SEQ ID NO: 65.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 58 and VL of SEQ ID NO: 65.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 60 и VL с SEQ ID NO: 67.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 60 and VL of SEQ ID NO: 67.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 61 и VL с SEQ ID NO: 68.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 61 and VL of SEQ ID NO: 68.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 62 и VL с SEQ ID NO: 69.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 62 and VL of SEQ ID NO: 69.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 63 и VL с SEQ ID NO: 70.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 63 and VL of SEQ ID NO: 70.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 64 и VL с SEQ ID NO: 71.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 64 and VL of SEQ ID NO: 71.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 72.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 72.
В изобретении также предлагается антиидиотипическое антитело, специфически связывающее антитело, содержащее VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 73.The invention also provides an anti-idiotypic antibody specifically binding an antibody comprising VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 73.
Антиидиотипическое (Id) антитело является антителом, распознающим антигенные детерминанты (например, паратоп или CDR) антитела. Id-антитело может быть блокирующим или неблокирующим антиген. Блокирующее антиген Id-антитело можно использовать для обнаружения свободного антитела в образце (например, описанного в настоящем документе антитела к CD154 изобретения). Неблокирующее Id-антитело можно использовать для обнаружения всех антител (свободных, частично связанных с антигеном или полностью связанных с антигеном) в образце. Id-антитело можно получать путем иммунизации животного антителом, для которого получают анти-Id-антитело.An anti-idiotypic (Id) antibody is an antibody that recognizes the antigenic determinants (eg, paratope or CDR) of an antibody. The Id antibody may be blocking or non-blocking antigen. An antigen-blocking Id antibody can be used to detect a free antibody in a sample (eg, the anti-CD154 antibody of the invention described herein). A non-blocking Id antibody can be used to detect all antibodies (free, partially bound to an antigen, or fully bound to an antigen) in a sample. An Id antibody can be obtained by immunizing an animal with an antibody for which an anti-Id antibody is obtained.
Анти-Id-антитело также может использоваться как иммуноген для индуцирования иммунного ответа у еще одного животного, получая так называемое анти-анти-Id-антитело. Анти-анти-Id-антитело может быть эпитопно идентично первичному mAb, которое индуцировало анти-Id. Таким образом, используя антитела к идиотипическим детерминантам mAb, можно идентифицировать другие клоны, экспрессирующие антитела идентичной специфичности. Анти-Id-антитела можно подвергать вариациям (полу- 27 040943 чая, тем самым, варианты анти-И-антител) и/или получению производных при помощи любой приемлемой методики, например описанных в других частях настоящего документа применительно к антителам, специфически связывающим антитела к HLA-DR.An anti-Id antibody can also be used as an immunogen to induce an immune response in another animal, producing a so-called anti-anti-Id antibody. The anti-anti-Id antibody may be epitopically identical to the primary mAb that induced the anti-Id. Thus, by using antibodies to the idiotypic determinants of the mAb, other clones expressing antibodies of identical specificity can be identified. Anti-Id antibodies can be subjected to variations (thereby variants of anti-I antibodies) and/or derivatization using any suitable technique, for example, described in other parts of this document in relation to antibodies that specifically bind antibodies to HLA-DR.
ИммуноконгьюгатыImmunoconjugates
Термин иммуноконъюгат означает антитело изобретения, конъюгированное с одной или более гетерологичными молекулами. В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения конъюгировано с одним или более цитотоксическими агентами. К примерам таких цитотоксических агентов относятся химиотерапевтические агенты или лекарственные средства, ингибирующие рост агенты, токсины (например, белковые токсины, ферментативно активные токсины бактериального, грибкового, растительного или животного происхождения, или их фрагменты) и радиоактивные изотопы.The term immunoconjugate means an antibody of the invention conjugated to one or more heterologous molecules. In some embodiments, an antibody of the invention is conjugated to one or more cytotoxic agents. Examples of such cytotoxic agents include chemotherapeutic agents or drugs, growth inhibitory agents, toxins (eg, protein toxins, enzymatically active toxins of bacterial, fungal, plant or animal origin, or fragments thereof), and radioactive isotopes.
В некоторых вариантах осуществления иммуноконъюгат представляет собой конъюгат антителолекарственное средство (ADC), в котором антитело изобретения конъюгировано с одним или более лекарственных средств, например с майтанзиноидом (см., например, патенты США № 5,208,020, 5,416,06)); ауристатином, например монометилауристатиновыми лекарственными группами DE и DF (MMAE и MMAF) (см., например, патенты США № 5,635,483, 5,780,588, и 7,498,298), доластатином, калихеамицином или их производными (см., например, патенты США № 5,712,374, 5,714,586, 5,739, 116, 5,767,285, 5,770,701, 5,770,710, 5,773,001 и 5,877,296; Hinman et al., (1993) Cancer Res 53:3336-3342 и Lode et al., (1998) Cancer Res 58:2925-2928); антрациклином, например дауномицином или доксорубицином (см., например, Kratz et al., (2006) Current Med. Chem 13:477-523; Jeffrey et al., (2006) Bioorganic & Med Chem Letters 16:358-362; Torgov et al., (2005) Bioconj Chem 16:717-721; Nagy et al., (2000) Proc Natl Acad Sci USA 97:829-834; Dubowchik et al., Bioorg. & Med. Chem. Letters 12: 1529-1532 (2002); King et al., (2002) J Med Chem 45:4336-4343 и патент США № 6,630,579), метотрексатом, виндезином, таксаном, таким как доцетаксел, паклитаксел, ларотаксел, тезетаксел и ортатаксел.In some embodiments, the immunoconjugate is an antibody drug conjugate (ADC) wherein an antibody of the invention is conjugated to one or more drugs, such as maytansinoid (see, for example, US Pat. Nos. 5,208,020, 5,416,06)); auristatin, such as the monomethylauristatin drug groups DE and DF (MMAE and MMAF) (see, for example, US Pat. 5.739, 116, 5.767.285, 5.770.701, 5.770.710, 5.773.001 and 5.877.296 Hinman et al. (1993) Cancer Res 53:3336-3342 and Lode et al. (1998) Cancer Res 58:2925); an anthracycline such as daunomycin or doxorubicin (see e.g. Kratz et al., (2006) Current Med. Chem 13:477-523; Jeffrey et al., (2006) Bioorganic & Med Chem Letters 16:358-362; Torgov et al., (2005) Bioconj Chem 16:717-721; Nagy et al., (2000) Proc Natl Acad Sci USA 97:829-834; Dubowchik et al., Bioorg. & Med. Chem. Letters 12: 1529 -1532 (2002); King et al., (2002) J Med Chem 45:4336-4343 and US Pat. No. 6,630,579), methotrexate, vindesine, taxane such as docetaxel, paclitaxel, larotaxel, tezetaxel and orthotaxel.
В некоторых вариантах осуществления иммуноконъюгат содержит антитело изобретения, конъюгированное ферментативно активным токсином или его фрагментом, таким как A-цепь дифтерийного токсина, несвязывающие активные фрагменты дифтерийного токсина, A-цепь экзотоксина (из Pseudomonas aeruginosa), A-цепь рицина, A-цепь абрина, A-цепь модексина, альфа-сарцин, белки Aleurites fordii, диантиновые белки, белки Phytolaca americana (PAPI, PAPII и PAP-S), ингибитор omordica charantia, курцин, кротин, ингибитор sapaonaria officinalis, гелонин, митогеллин, рестриктоцин, феномицин, эномицин и трикотецены.In some embodiments, the immunoconjugate comprises an antibody of the invention conjugated with an enzymatically active toxin or fragment thereof, such as diphtheria toxin A chain, non-binding diphtheria toxin active moieties, exotoxin A chain (from Pseudomonas aeruginosa), ricin A chain, abrin A chain , Modexin A-chain, alpha-sarcin, Aleurites fordii proteins, diantin proteins, Phytolaca americana proteins (PAPI, PAPII and PAP-S), omordica charantia inhibitor, curcin, crotin, sapaonaria officinalis inhibitor, gelonin, mitogellin, restrictocin, fenomycin, enomycin and tricothecenes.
В некоторых вариантах осуществления антитело изобретения конъюгировано с радиоактивным атомом с образованием радиоконъюгата. Для получения радиоконъюгатов существуют разнообразные радиоактивные изотопы. К примерам относятся At211, 1131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 и радиоактивные изотопы Lu. При использовании для детекции радиоконъюгата, он может содержать радиоактивный атом для сцинтиграфических исследований, например tc99m или 1123, или спиновую метку для визуализации с использованием ядерного магнитного резонанса (ЯМР) (также именуемой магнитно-резонансной томографией, МРТ), например снова йод-123, йод-131, индий-11, фтор-19, углерод-13, азот-15, кислород-17, гадолиний, марганец или железо.In some embodiments, an antibody of the invention is conjugated to a radioactive atom to form a radioconjugate. To obtain radioconjugates, there are various radioactive isotopes. Examples include At211, 1131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 and Lu radioactive isotopes. When used to detect a radioconjugate, it may contain a radioactive atom for scintigraphy, such as tc99m or 1123, or a spin label for nuclear magnetic resonance (NMR) imaging (also referred to as magnetic resonance imaging, MRI), such as iodine-123 again, iodine-131, indium-11, fluorine-19, carbon-13, nitrogen-15, oxygen-17, gadolinium, manganese or iron.
Конъюгаты антитела изобретения и цитотоксического агента могут быть получены с использованием различных бифункциональных агентов для соединения белков, таких как N-суkцинимидил-3-(2пиридилдитиол)пропионат (SPDP), сукцинимидил-4-(N-мαлеимидометил)циклогексан-1 -карбоксилат (SMCC), иминотиолан (IT), бифункциональные производные сложных имидоэфиров (таких как диметиладипимидат HQ), активных сложных эфиров (таких как дисукцинимидилсуберат), альдегиды (такие как глутаральдегид), бис-азидные соединения (такие как бис-(п-азидобензоил)гександиамин), производные бис-диазония (такие как бис-(п-диазонийбензоил)-этилендиамин), диизоцианаты (такие как толуол-2,6диизоцианат) и соединения с двумя активными фторными группами (такие как 1,5-дифтор-2,4динитробензол). Например, иммунотоксин рицин можно получать, как описано в Vitetta et al., (1987) Science 238: 1098. Меченный углеродом-14 l-изотиоцианатобензил-3-метилдиэтилентриаминпентауксусная кислота (MX-DTPA) является примером хелатирующего агента для конъюгации радионуклида с антителом. См., например, WO94/11026. Линкер может представлять собой отщепляемый линкер, упрощающий высвобождение цитотоксического лекарственного средства в клетке. Например, можно использовать кислотно-лабильный линкер, чувствительный к пептидазам линкер, фотолабильный линкер, диметиловый линкер или дисульфид-содержащий линкер (Chari et al., (1992) Cancer Res 52: 127-131; патент США № 5,208,020).Conjugates of the antibody of the invention and a cytotoxic agent can be prepared using various bifunctional protein coupling agents such as N-succinimidyl-3-(2pyridyldithiol)propionate (SPDP), succinimidyl-4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate (SMCC ), iminothiolane (IT), bifunctional derivatives of imidoesters (such as dimethyl adipimidate HQ), active esters (such as disuccinimidyl suberate), aldehydes (such as glutaraldehyde), bis-azide compounds (such as bis-(p-azidobenzoyl)hexanediamine) , bis-diazonium derivatives (such as bis-(p-diazoniumbenzoyl)-ethylenediamine), diisocyanates (such as toluene-2,6 diisocyanate) and compounds with two active fluorine groups (such as 1,5-difluoro-2,4 dinitrobenzene). For example, the ricin immunotoxin can be prepared as described in Vitetta et al., (1987) Science 238:1098. Carbon-14 labeled l-isothiocyanatobenzyl-3-methyldiethylenetriaminepentaacetic acid (MX-DTPA) is an example of a chelating agent for conjugating a radionuclide to an antibody. See, for example, WO94/11026. The linker may be a cleavable linker that facilitates the release of the cytotoxic drug into the cell. For example, an acid labile linker, a peptidase sensitive linker, a photolabile linker, a dimethyl linker, or a disulfide containing linker can be used (Chari et al., (1992) Cancer Res 52: 127-131; US Pat. No. 5,208,020).
Иммуноконъюгаты или ADC можно получать с кросс-линкерными реагентами, такими как BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, сульфо-EMCS, сульфо-GMBS, сульфо-KMUS, сульфо-MBS, сульфо-SIAB, сульфо-SMCC, сульфо-SMPB и SVSB (сукцинимидил-(4-винилсульфон)бензоат), которые имеются в продаже (например, от Pierce Biotechnology, Inc., г. Рокфорд, штат Иллинойс, США).Immunoconjugates or ADCs can be prepared with cross-linker reagents such as BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, sulfo-EMCS, sulfo-GMBS, sulfo -KMUS, sulfo-MBS, sulfo-SIAB, sulfo-SMCC, sulfo-SMPB and SVSB (succinimidyl-(4-vinyl sulfone) benzoate), which are commercially available (for example, from Pierce Biotechnology, Inc., Rockford, State Illinois, USA).
В изобретении также предлагается иммуноконъюгат, содержащий антитело, специфически связывающее CD154 с SEQ ID NO: 1 изобретения, связанное с терапевтическим агентом или визуализирующим агентом.The invention also provides an immunoconjugate containing an antibody that specifically binds CD154 with SEQ ID NO: 1 of the invention, associated with a therapeutic agent or imaging agent.
- 28 040943- 28 040943
Дополнительные варианты осуществления изобретенияAdditional embodiments of the invention
Ниже изложены некоторые дополнительные варианты осуществления изобретения в соответствии с описаниями, представленными в других частях настоящего документа. Элементы из вариантов осуществления изобретения, изложенных выше, описанные как связанные с изобретением, раскрытым в настоящем документе, также относятся ко всем и каждому без исключения из этих дополнительно пронумерованных вариантов осуществления.Below are some additional embodiments of the invention in accordance with the descriptions provided in other parts of this document. The elements from the embodiments of the invention set forth above, described as being related to the invention disclosed herein, also apply to each and every one of these additionally numbered embodiments.
1) Выделенное антагонистическое антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее человеческий CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее определяющую комплементарность область тяжелой цепи (HCDR) 1 с SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 с SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG) и HCDR3 с SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), причем необязательно1) An isolated antagonist antibody or antigen-binding site thereof specifically binding human CD154 with SEQ ID NO: 1, containing a heavy chain complementarity determining region (HCDR) 1 with SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 with SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG ) and HCDR3 of SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), optionally
a) остаток S1 HCDR1 мутирован в A, C, D, E, G, I, K, L, M, N, Q, R, T или V;a) HCDR1 residue S1 is mutated to A, C, D, E, G, I, K, L, M, N, Q, R, T, or V;
b) остаток I4 HCDR1 мутирован в M, L или V;b) HCDR1 residue I4 is mutated to M, L or V;
c) остаток S5 HCDR1 мутирован в A;c) the S5 HCDR1 residue is mutated in A;
d) остаток S3 HCDR2 мутирован в A, T или V;d) the S3 residue of HCDR2 is mutated to A, T, or V;
e) остаток P4 HCDR2 мутирован в V, T, L Q или E;e) the P4 HCDR2 residue is mutated to V, T, L Q or E;
f) остаток N8 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;f) the N8 residue of HCDR2 is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
g) остаток T9 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;g) the T9 HCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
h) остаток N10 HCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;h) the N10 HCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
l) остаток S1 HCDR3 мутирован в A или M;l) HCDR3 residue S1 is mutated to A or M;
j) остаток R2 HCDR3 мутирован в A, S, Q или K; и k) остаток L7 HCDR3 мутирован в M.j) the R2 residue of HCDR3 is mutated to A, S, Q, or K; and k) the L7 residue of HCDR3 is mutated into M.
2) Антитело по п. 1, содержащее определяющую комплементарность область легкой цепи (LCDR) 1 с SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 с SEQ ID NO: 44 (YANSLQS) и LCDR3 с SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT), причем необязательно2) An antibody according to claim 1 containing a light chain complementarity determining region (LCDR) 1 with SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 with SEQ ID NO: 44 (YANSLQS) and LCDR3 with SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT), and optionally
a) остаток Q4 LCDR1 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, R, S, T, V, W или Y;a) the Q4 LCDR1 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, R, S, T, V, W, or Y;
b) остаток S5 LCDR1 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;b) the S5 LCDR1 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
c) остаток S7 LCDR1 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;c) the S7 LCDR1 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
d) остаток S8 LCDR1 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;d) the S8 LCDR1 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
e) остаток A2 LCDR2 мутирован в S;e) LCDR2 residue A2 is mutated to S;
f) остаток N3 LCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W или Y;f) the LCDR2 N3 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, R, S, T, V, W, or Y;
g) остаток S4 LCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;g) the S4 LCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
h) остаток L5 LCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, M, N, Q, R, S, T, V, W или Y;h) LCDR2 L5 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, M, N, Q, R, S, T, V, W, or Y;
i) остаток Q6 LCDR2 мутирован в E, D или N;i) the Q6 LCDR2 residue is mutated to E, D or N;
j) остаток S7 LCDR2 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y;j) the S7 LCDR2 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y;
k) остаток S3 LCDR3 мутирован в A;k) the S3 LCDR3 residue is mutated in A;
l) остаток D4 LCDR3 мутирован в N;l) the D4 LCDR3 residue is mutated to N;
m) остаток S5 LCDR3 мутирован в A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W или Y; иm) the S5 LCDR3 residue is mutated to A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, R, T, V, W, or Y; And
n) остаток 16 LCDR3 мутирован в A, C, D, E, G, K, L, M, N, Q, R, S, T, V.n) LCDR3 residue 16 is mutated to A, C, D, E, G, K, L, M, N, Q, R, S, T, V.
3) Антитело по варианту осуществления 1 или 2, содержащее HCDR1 с SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 с SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG), HCDR3 с SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), LCDR1 с SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 с SEQ ID NO: 44 (YANSLQS) и LCDR3 с SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT).3) Antibody according to embodiment 1 or 2, containing HCDR1 with SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 with SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG), HCDR3 with SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), LCDR1 with SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 of SEQ ID NO: 44 (YANSLQS), and LCDR3 of SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT).
4) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-3, содержащее4) An antibody according to any one of embodiments 1-3, comprising
a) VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66; илиa) VH with SEQ ID NO: 59 and VL with SEQ ID NO: 66; or
b) тяжелую цепь с SEQ ID NO: 80 и легкую цепь с SEQ ID NO: 81.b) a heavy chain of SEQ ID NO: 80 and a light chain of SEQ ID NO: 81.
5) Выделенное антагонистическое антитело, специфически связывающее растворимый человеческий CD154 (shCD154) с SEQ ID NO: 4.5) An isolated antagonist antibody specifically binding soluble human CD154 (shCD154) of SEQ ID NO: 4.
6) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-5, содержащее по меньшей мере одну замену в области Fc.6) An antibody according to any one of embodiments 1-5, containing at least one substitution in the Fc region.
7) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-6, которое не активирует человеческие тромбоциты.7) An antibody according to any one of embodiments 1-6 that does not activate human platelets.
8) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-7, в котором антитело связывается с shCD154 с константой диссоциации KD около 5x10’9 М или менее, около 1x10’9 М или менее, около 5x10’ 10 М или менее, около 1x10’10 М или менее, около 5x10’11 М или менее, или около 1x10’11 M или менее, причем KD измерена с использованием системы ProteOn XPR36 с применением плана эксперимента, описанного в примере 1, для измерения аффинностей.8) An antibody according to any one of embodiments 1-7, wherein the antibody binds to shCD154 with a KD dissociation constant of about 5x10'9M or less, about 1x10'9M or less, about 5x10'10M or less, about 1x10' 10 M or less, about 5x10'11 M or less, or about 1x10'11 M or less, wherein K D is measured using a ProteOn XPR36 system using the experimental design described in Example 1 to measure affinities.
9) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-8, в котором антитело ингибирует опосредованную shCD154 пролиферацию человеческих B-клеток со значением IC50 от около 7,0x10’11 М до около 6x10’10 M.9) An antibody according to any one of embodiments 1-8, wherein the antibody inhibits shCD154 mediated proliferation of human B cells with an IC 50 value of about 7.0 x 10'11 M to about 6 x 10' 10 M.
10) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-9, в котором антитело ингибирует опосредованную shCD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-κΒ минимального промотора интерферона-β (IFN-β) в клетках10) An antibody according to any one of embodiments 1-9, wherein the antibody inhibits shCD154 mediated expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by an NF-κΒ inducible interferon-β (IFN-β) minimal promoter in cells
- 29 040943- 29 040943
HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40 со значением IC50 около 2,1х10’8 М или менее.HEK293 stably expressing SEAP and human CD40 with an IC 50 value of about 2.1 x 10' 8 M or less.
11) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-10, в котором антитело конкурирует за связывание с shCD154 с антителом, содержащим вариабельную область тяжелой цепи (VH) и вариабельную область легкой цепи (VL), причем VH содержит последовательность SEQ ID NO: 59, a VL содержит последовательность SEQ ID NO: 66.11) An antibody according to any one of embodiments 1-10, wherein the antibody competes for binding to shCD154 with an antibody comprising a heavy chain variable region (VH) and a light chain variable region (VL), wherein the VH comprises the sequence of SEQ ID NO: 59 , and VL contains the sequence SEQ ID NO: 66.
12) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-11, в котором антитело содержит аминокислотные последовательности определяющих комплементарность областей тяжелой цепи (HCDR) 1 (HCDR1), 2 (HCDR2) и 3 (HCDR3) VH с SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63 или 64, необязательно имеющее одну, две или три консервативные аминокислотные замены в HCDR1, HCDR2 и/или HCDR3, причем HCDR определяются по системе Кабата, Чотиа или IMGT.12) An antibody according to any one of embodiments 1-11, wherein the antibody comprises the amino acid sequences of heavy chain complementarity determining regions (HCDR) 1 (HCDR1), 2 (HCDR2), and 3 (HCDR3) VH of SEQ ID NOs: 58, 59 , 60, 61, 62, 63, or 64, optionally having one, two, or three conservative amino acid substitutions in HCDR1, HCDR2, and/or HCDR3, with HCDR defined by the Kabat, Chothia, or IMGT system.
13) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-12, в котором антитело содержит аминокислотные последовательности определяющих комплементарность областей легкой цепи (LCDR) 1 (LCDR1), 2 (LCDR2) и 3 (LCDR3) VL с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73, необязательно имеющее одну, две или три консервативные аминокислотные замены в LCDR1, LCDR2 и/или LCDR3, причем LCDR определяются по системе Кабата, Чотиа или IMGT.13) An antibody according to any one of embodiments 1-12, wherein the antibody comprises the amino acid sequences of light chain complementarity determining regions (LCDR) 1 (LCDR1), 2 (LCDR2), and 3 (LCDR3) VL of SEQ ID NOs: 65, 66 , 67, 68, 69, 70, 71, 72, or 73, optionally having one, two, or three conservative amino acid substitutions in LCDR1, LCDR2, and/or LCDR3, where LCDRs are defined by the Kabat, Chothia, or IMGT system.
14) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-13, содержащее аминокислотные последовательности HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с14) An antibody according to any one of embodiments 1-13 containing the amino acid sequences HCDR1, HCDR2 and HCDR3 with
a) SEQ ID NO b) SEQ ID NO c) SEQ ID NO d) SEQ ID NO e) SEQ ID NOa) SEQ ID NO b) SEQ ID NO c) SEQ ID NO d) SEQ ID NO e) SEQ ID NO
16, 2216, 22
17, 2317, 23
16, 2416, 24
18, 2518, 25
19, 26 и 29, соответственно, и 30, соответственно, и 31, соответственно, и 32, соответственно, и 33, соответственно, и и и и и их консервативные модификации; их консервативные модификации; их консервативные модификации; их консервативные модификации; их консервативные модификации;19, 26 and 29, respectively, and 30, respectively, and 31, respectively, and 32, respectively, and 33, respectively, and and and and and their conservative modifications; their conservative modifications; their conservative modifications; their conservative modifications; their conservative modifications;
f) SEQ ID NO: 20, 27 и 34, соответственно, и их консервативные модификации илиf) SEQ ID NOs: 20, 27 and 34, respectively, and conservative modifications thereof, or
g) SEQ ID NO: 21, 28 и 35, соответственно, и их консервативные модификации.g) SEQ ID NOs: 21, 28 and 35, respectively, and their conservative modifications.
15) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-10, содержащее аминокислотные последовательности LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с15) An antibody according to any one of embodiments 1-10, comprising the amino acid sequences LCDR1, LCDR2, and LCDR3 with
a) SEQ ID NO b) SEQ ID NO c) SEQ ID NO d) SEQ ID NO e) SEQ ID NOa) SEQ ID NO b) SEQ ID NO c) SEQ ID NO d) SEQ ID NO e) SEQ ID NO
36, 4336, 43
37, 4437, 44
38, 4538, 45
39, 4639, 46
40, 47 и и и и и40, 47 and and and and and
51, соответственно,51, respectively,
52, соответственно,52, respectively,
53, соответственно,53, respectively,
54, соответственно,54, respectively,
55, соответственно, и и и и и их консервативные модификации; их консервативные модификации; их консервативные модификации; их консервативные модификации; их консервативные модификации;55, respectively, and and and and and their conservative modifications; their conservative modifications; their conservative modifications; their conservative modifications; their conservative modifications;
f) SEQ ID NO: 41, 47 и 56, соответственно, и их консервативные модификации;f) SEQ ID NOs: 41, 47 and 56, respectively, and conservative modifications thereof;
g) SEQ ID NO: 42, 48 и 57, соответственно, и их консервативные модификации;g) SEQ ID NOs: 42, 48 and 57, respectively, and conservative modifications thereof;
h) SEQ ID NO: 37, 49 и 52, соответственно, и их консервативные модификации илиh) SEQ ID NOs: 37, 49 and 52, respectively, and conservative modifications thereof, or
i) SEQ ID NO: 37, 50 и 52, соответственно, и их консервативные модификации.i) SEQ ID NOs: 37, 50 and 52, respectively, and conservative modifications thereof.
16) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-15, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с16) An antibody according to any one of embodiments 1-15 containing HCDR1, HCDR2 and HCDR3 with
a) SEQ ID NO: 16, 22 и 29, соответственно;a) SEQ ID NOs: 16, 22 and 29, respectively;
b) SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно;b) SEQ ID NOs: 17, 23 and 30, respectively;
c) SEQ ID NO: 16, 24 и 31, соответственно;c) SEQ ID NOs: 16, 24 and 31, respectively;
d) SEQ ID NO: 18, 25 и 32, соответственно;d) SEQ ID NOs: 18, 25 and 32, respectively;
e) SEQ ID NO: 19, 26 и 33, соответственно;e) SEQ ID NOs: 19, 26 and 33, respectively;
f) SEQ ID NO: 20, 27 и 34, соответственно илиf) SEQ ID NOs: 20, 27 and 34, respectively, or
g) SEQ ID NO: 21, 28 и 35, соответственно.g) SEQ ID NOs: 21, 28 and 35, respectively.
17) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-16, содержащее аминокислотные последовательности LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с17) An antibody according to any one of embodiments 1-16, comprising the amino acid sequences LCDR1, LCDR2, and LCDR3 with
a) SEQ ID NO: 36, 43 и 51, соответственно;a) SEQ ID NOs: 36, 43 and 51, respectively;
b) SEQ ID NO: 37, 44 и 52, соответственно;b) SEQ ID NOs: 37, 44 and 52, respectively;
c) SEQ ID NO: 38, 45 и 53, соответственно;c) SEQ ID NOs: 38, 45 and 53, respectively;
d) SEQ ID NO: 39, 46 и 54, соответственно;d) SEQ ID NOs: 39, 46 and 54, respectively;
e) SEQ ID NO: 40, 47 и 55, соответственно;e) SEQ ID NOs: 40, 47 and 55, respectively;
f) SEQ ID NO: 41, 47 и 56, соответственно;f) SEQ ID NOs: 41, 47 and 56, respectively;
g) SEQ ID NO: 42, 48 и 57, соответственно;g) SEQ ID NOs: 42, 48 and 57, respectively;
h) SEQ ID NO: 37, 49 и 52, соответственно илиh) SEQ ID NOs: 37, 49 and 52, respectively, or
i) SEQ ID NO: 37, 50 и 52, соответственно.i) SEQ ID NOs: 37, 50 and 52, respectively.
18) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 16, 22 и 29, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 36, 43 и 51, соответственно.18) An antibody according to any one of embodiments 1-17, comprising HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 16, 22, and 29, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 36, 43, and 51, respectively .
19) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 37, 44 и 52, соответственно.19) An antibody according to any one of embodiments 1-17, comprising HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, and 30, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 37, 44, and 52, respectively .
- 30 040943- 30 040943
20) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и20) Antibody according to any one of embodiments 1-17, containing HCDR1, HCDR2 and
HCDR3 с SEQ ID NO: 16, 24 и 31, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 38, 45 и 53, соответственно.HCDR3 with SEQ ID NOs: 16, 24 and 31, respectively, and LCDR1, LCDR2 and LCDR3 with SEQ ID NOs: 38, 45 and 53, respectively.
21) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 18, 25 и 32, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 39, 46 и 54, соответственно.21) An antibody according to any one of embodiments 1-17, comprising HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 18, 25, and 32, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 39, 46, and 54, respectively .
22) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 19, 26 и 33, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 40, 47 и 55, соответственно.22) An antibody according to any one of embodiments 1-17, comprising HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 19, 26, and 33, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 40, 47, and 55, respectively .
23) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 20, 27 и 34, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 41, 47 и 56, соответственно.23) An antibody according to any one of embodiments 1-17, comprising HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 20, 27, and 34, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 41, 47, and 56, respectively .
24) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 21, 28 и 35, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 42, 48 и 57, соответственно.24) An antibody according to any one of embodiments 1-17, comprising HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 21, 28, and 35, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 42, 48, and 57, respectively .
25) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 37, 49 и 52, соответственно.25) An antibody according to any one of embodiments 1-17, comprising HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, and 30, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 37, 49, and 52, respectively .
26) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-17, содержащее HCDR1, HCDR2 и HCDR3 с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, соответственно, и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 с SEQ ID NO: 37, 50 и 52, соответственно.26) An antibody according to any one of embodiments 1-17, comprising HCDR1, HCDR2, and HCDR3 of SEQ ID NOS: 17, 23, and 30, respectively, and LCDR1, LCDR2, and LCDR3 of SEQ ID NOS: 37, 50, and 52, respectively .
27) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-26, содержащее VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VH с SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63 или 64.27) An antibody according to any one of embodiments 1-26, containing a VH that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to VH with SEQ ID NO: 58, 59, 60, 61, 62, 63 or 64.
28) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-27, содержащее VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична VL с SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 или 73.28) An antibody according to any one of embodiments 1-27, comprising a VL that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to VL with SEQ ID NO: 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72 or 73.
29) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 58 и VL с SEQ ID NO: 65, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.29) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 58 and VL of SEQ ID NO: 65, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
30) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.30) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
31) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 60 и VL с SEQ ID NO: 67, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.31) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 60 and VL of SEQ ID NO: 67, wherein VH, VL or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
32) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 61 и VL с SEQ ID NO: 68, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.32) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 61 and VL of SEQ ID NO: 68, wherein VH, VL or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
33) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 62 и VL с SEQ ID NO: 69, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.33) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 62 and VL of SEQ ID NO: 69, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
34) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 63 и VL с SEQ ID NO: 70, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.34) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 63 and VL of SEQ ID NO: 70, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
35) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 64 и VL с SEQ ID NO: 71, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.35) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 64 and VL of SEQ ID NO: 71, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
36) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 72, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать или пятнадцать аминокислотных замен.36) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 72, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen, or fifteen amino acid substitutions.
37) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-28, содержащее VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 73, причем VH, VL или как VH, так и VL необязательно содержат одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать37) An antibody according to any one of embodiments 1-28, comprising VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 73, wherein VH, VL, or both VH and VL optionally contain one, two, three, four , five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen
- 31 040943 или пятнадцать аминокислотных замен.- 31 040943 or fifteen amino acid substitutions.
38) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-37, которое содержит по меньшей мере одну замену в области Fc.38) An antibody according to any one of embodiments 1-37, which contains at least one substitution in the Fc region.
39) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-38, в котором по меньшей мере одна замена в области Fc представляет собой замены L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S и P331S, причем нумерация остатков соответствует индексу EU.39) An antibody according to any one of embodiments 1-38, wherein at least one Fc region substitution is L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S, and P331S, with residue numbering corresponding to the EU index.
40) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-38, в котором по меньшей мере одна замена в области Fc представляет собой замены V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S и P331S, причем нумерация остатков соответствует индексу EU.40) An antibody according to any one of embodiments 1-38, wherein at least one substitution in the Fc region is V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S, and P331S, with residue numbering corresponding to the EU index.
41) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-40, в котором антитело представляет собой изотип IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4.41) An antibody according to any one of embodiments 1-40, wherein the antibody is an IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 isotype.
42) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-41, в котором все паратопные остатки антитела находятся в VH.42) An antibody according to any one of embodiments 1-41, wherein all paratopic residues of the antibody are in the VH.
43) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-42, в котором антитело одновременно связывает первый мономер CD154 и второй мономер CD154 растворимого тримера человеческого CD154.43) An antibody according to any one of embodiments 1-42, wherein the antibody simultaneously binds the first CD154 monomer and the second CD154 monomer of the soluble human CD154 trimer.
44) Антитело по варианту осуществления 43, в котором антитело связывает по меньшей мере один, два, три, четыре, пять, шесть, семь или восемь остатков CD154 в первом мономере CD154 в пределах аминокислот 182-207 CD154 в SEQ ID NO: 1, где нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 1.44) The antibody of embodiment 43, wherein the antibody binds at least one, two, three, four, five, six, seven, or eight CD154 residues in the first CD154 monomer within amino acids 182-207 of CD154 in SEQ ID NO: 1, where the numbering of residues corresponds to SEQ ID NO: 1.
45) Антитело по варианту осуществления 43 или 44, в котором антитело связывает по меньшей мере один, два, три, четыре, пять, шесть, семь или восемь остатков CD154 во втором мономере CD154 в пределах аминокислот 176-253 CD154 в SEQ ID NO: 1, где нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 1.45) The antibody of embodiment 43 or 44, wherein the antibody binds at least one, two, three, four, five, six, seven, or eight CD154 residues in the second CD154 monomer within amino acids 176-253 of CD154 in SEQ ID NO: 1, where the numbering of residues corresponds to SEQ ID NO: 1.
46) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 43-45, в котором антитело связывает остатки E182, S185, Q186, A187, P188, S214, A215 и R207 в первом мономере CD154, причем нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 1.46) An antibody according to any one of embodiments 43-45, wherein the antibody binds residues E182, S185, Q186, A187, P188, S214, A215, and R207 in the first CD154 monomer, with residue numbering according to SEQ ID NO: 1.
47) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 43-46, в котором антитело связывает остатки T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250 и F353 во втором мономере CD154, причем нумерация остатков соответствует SEQ ID NO: 1.47) An antibody according to any one of embodiments 43-46, wherein the antibody binds residues T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250, and F353 in the second CD154 monomer, with residue numbering according to SEQ ID NO: 1.
48) Биспецифическая молекула, содержащая антитело или его антигенсвязывающий участок, по любому из вариантов осуществления 1-47, связанная со второй антигенсвязывающей молекулой, имеющий другую специфичность связывания.48) A bispecific molecule comprising an antibody or antigen-binding site thereof, according to any one of embodiments 1-47, associated with a second antigen-binding molecule having a different binding specificity.
49) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-47 или биспецифическая молекула по 48, которая49) An antibody according to any one of embodiments 1-47, or a bispecific molecule according to 48, which
a) в иммунном комплексе с shCD154 не активирует человеческие тромбоциты;a) in the immune complex with shCD154 does not activate human platelets;
b) связывается с shCD154 с константой диссоциации KD около 5x10’9 М или менее;b) binds to shCD154 with a dissociation constant K D of about 5x10'9 M or less;
c) ингибирует опосредованную shCD154 пролиферацию B-клеток человека; илиc) inhibits shCD154 mediated human B cell proliferation; or
d) ингибирует биологическую активность CD154 в анализе гена-репортера NF-kB-SEAP.d) inhibits the biological activity of CD154 in the NF-kB-SEAP reporter gene assay.
50) Иммуноконъюгат, содержащий антитело или его антигенсвязывающий участок по любому одному из вариантов осуществления 1-47, связанный с терапевтическим агентом или визуализирующим агентом.50) An immunoconjugate comprising an antibody or antigen-binding site thereof according to any one of embodiments 1-47 associated with a therapeutic agent or an imaging agent.
51) Фармацевтическая композиция, содержащая антитело по варианту осуществления 1-47 и фармацевтически приемлемый носитель.51) A pharmaceutical composition comprising the antibody of Embodiment 1-47 and a pharmaceutically acceptable carrier.
52) Полинуклеотид, кодирующий VH антитела, VL антитела или VH антитела и VL антитела по любому одному из вариантов осуществления 1-47.52) A polynucleotide encoding an antibody VH, an antibody VL, or an antibody VH and an antibody VL according to any one of embodiments 1-47.
53) Вектор, содержащий полинуклеотид по варианту осуществления 52.53) A vector containing the polynucleotide of embodiment 52.
54) Клетка-хозяин, содержащая вектор по варианту осуществления 53.54) Host cell containing the vector of embodiment 53.
55) Способ продуцирования антитела, включающий культивирование клетки-хозяина по варианту осуществления 54 в условиях экспрессии антитела и выделение антитела, продуцированного клеткойхозяином.55) A method for producing an antibody, comprising culturing the host cell of embodiment 54 under antibody expression conditions, and isolating the antibody produced by the host cell.
56) Антитело по любому из вариантов осуществления 1-47 или фармацевтическая композиция по варианту осуществления 51 для применения в лечении аутоиммунного заболевания или иммуноопосредованного воспалительного заболевания.56) An antibody according to any one of embodiments 1-47 or a pharmaceutical composition according to embodiment 51 for use in the treatment of an autoimmune disease or an immune-mediated inflammatory disease.
57) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-47 для применения в лечении таких заболеваний как артрит, системная красная волчанка (СКВ), воспалительное заболевание кишечника, трансплантация, трансплантация почки, трансплантация кожи, трансплантация костного мозга, реакция трансплантат против хозяина (РТПХ), иммунная тромбоцитопения (ITP), рассеянный склероз, тиреоидит, диабет I типа или атеросклероз.57) An antibody according to any one of embodiments 1-47 for use in the treatment of diseases such as arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), inflammatory bowel disease, transplantation, kidney transplantation, skin transplantation, bone marrow transplantation, graft versus host disease (GVHD ), immune thrombocytopenia (ITP), multiple sclerosis, thyroiditis, type I diabetes, or atherosclerosis.
58) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-47 для применения в лечении ревматоидного артрита.58) An antibody according to any one of embodiments 1-47 for use in the treatment of rheumatoid arthritis.
59) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-47 для применения в лечении вол-59) An antibody according to any one of embodiments 1-47 for use in the treatment of
- 32 040943 чанки.- 32 040943 chunks.
60) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-47 для применения в лечении при трансплантации.60) An antibody according to any one of embodiments 1-47 for use in transplantation treatment.
61) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-47 для применения в лечении воспалительного заболевания кишечника.61) An antibody according to any one of embodiments 1-47 for use in the treatment of inflammatory bowel disease.
62) Антитело по любому одному из вариантов осуществления 1-47 для применения в лечении по любому из вариантов осуществления 56-61 в комбинации со вторым терапевтическим агентом.62) An antibody according to any one of embodiments 1-47 for use in the treatment of any one of embodiments 56-61 in combination with a second therapeutic agent.
63) Антитело по варианту осуществления 62, в котором второй терапевтический агент представляет собой нестероидные противовоспалительные препараты (НПВП), салицилаты, гидроксихлорохин, сульфасалазин, кортикостероиды, цитотоксические лекарственные средства, иммуносупрессорные лекарственные средства и/или антитела.63) The antibody of embodiment 62, wherein the second therapeutic agent is non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs), salicylates, hydroxychloroquine, sulfasalazine, corticosteroids, cytotoxic drugs, immunosuppressive drugs, and/or antibodies.
В изобретении также предлагается выделенное антитело или его антигенсвязывающий участок, специфически связывающее человеческий CD154 с SEQ ID NO: 1, содержащее определяющую комплементарность область тяжелой цепи (HCDR) 1 с SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 с SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG), HCDR3 с SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), определяющую комплементарность область легкой цепи (LCDR) 1 с SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 с SEQ ID NO: 44 (YANSLQS) и LCDR3 с SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT).The invention also provides an isolated antibody or antigen-binding site thereof specifically binding human CD154 with SEQ ID NO: 1, containing a heavy chain complementarity determining region (HCDR) 1 with SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 with SEQ ID NO: 23 ( WISPIFGNTNYAQKFQG), HCDR3 of SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), Light Chain Complementarity Determining Region (LCDR) 1 of SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 of SEQ ID NO: 44 (YANSLQS), and LCDR3 of SEQ ID NO: 52(QQSDSIPWT).
В изобретении также предлагается выделенное антагонистическое антитело, специфически связывающее растворимый человеческий CD154 (shCD154) с SEQ ID NO: 4, содержащее HCDR1 с SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 с SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG), HCDR3 с SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), LCDR1 с SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 с SEQ ID NO: 44 (YANSLQS) и LCDR3 с SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT).The invention also provides an isolated antagonist antibody specifically binding soluble human CD154 (shCD154) with SEQ ID NO: 4, containing HCDR1 with SEQ ID NO: 17 (SYGIS), HCDR2 with SEQ ID NO: 23 (WISPIFGNTNYAQKFQG), HCDR3 with SEQ ID NO: 30 (SRYYGDLDY), LCDR1 with SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN), LCDR2 with SEQ ID NO: 44 (YANSLQS), and LCDR3 with SEQ ID NO: 52 (QQSDSIPWT).
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66.In some embodiments, the antibody comprises VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66.
В некоторых вариантах осуществления антитело связывается с shCD154 с константой диссоциации KD около 5x10’9 М или менее, около 1x10’9 М или менее, около 5x10’1° М или менее, около 1х10’10 М или менее, около 5x10’11 М или менее, или около 1x10’11 M или менее, причем KD измерена с использованием системы ProteOn XPR36 с применением плана эксперимента, описанного в примере 1, для измерения аффинности.In some embodiments, the antibody binds to shCD154 with a KD dissociation constant of about 5x10'9 M or less, about 1x10'9 M or less, about 5x10'1° M or less, about 1x10'10 M or less, about 5x10'11 M or less, or about 1x10'11 M or less, with KD measured using a ProteOn XPR36 system using the experimental design described in Example 1 to measure affinity.
В некоторых вариантах осуществления антитело ингибирует опосредованную shCD154 пролиферацию B-клеток человека со значением IC50 от около 7,0x10’11 М до около 6x10’10 M.In some embodiments, the antibody inhibits shCD154 mediated human B cell proliferation with an IC 50 value of about 7.0 x 10' 11 M to about 6 x 10' 10 M.
В некоторых вариантах осуществления антитело ингибирует опосредованную shCD154 экспрессию секретированной эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP) под действием индуцируемого NF-kB минимального промотора интерферона-р (IFN-β) в клетках HEK293, стабильно экспрессирующих SEAP и человеческий CD40 со значением IC50 около 2,1x10’8 М или менее.In some embodiments, the antibody inhibits shCD154-mediated expression of secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) by an NF-kB inducible minimal interferon-β (IFN-β) promoter in HEK293 cells stably expressing SEAP and human CD40 with an IC 50 value of about 2.1x10 '8 M or less.
В некоторых вариантах осуществления антитело относится к изотипу IgG1, необязательно содержащему замены в тяжелой цепи L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S и P331S по сравнению с IgG1 дикого типа.In some embodiments, the antibody is of the IgG1 isotype, optionally containing heavy chain substitutions L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S, and P331S compared to wild-type IgG1.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO:66, и относится к изотипу IgG1, необязательно содержащему замены в тяжелой цепи L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S и P331S по сравнению с IgG1 дикого типа.In some embodiments, the antibody comprises VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66, and is of the IgG1 isotype, optionally containing heavy chain substitutions L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S, and P331S compared to IgG1 wild type.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66 и относится к изотипу IgG1/K, содержащему замены в тяжелой цепи L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S и P331S по сравнению с IgG1 дикого типа.In some embodiments, the antibody comprises VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66 and is an IgG1/K isotype containing heavy chain substitutions L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S, and P331S compared to IgG1 wild type.
В некоторых вариантах осуществления антитело относится к изотипу IgG2, необязательно содержащему замены в тяжелой цепи V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S и P331S по сравнению с IgG2 дикого типа.In some embodiments, the antibody is of the IgG2 isotype, optionally containing heavy chain substitutions V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S, and P331S compared to wild-type IgG2.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66 и относится к изотипу IgG2/K, содержащему замены в тяжелой цепи V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S и P331S по сравнению с IgG2 дикого типа.In some embodiments, the antibody comprises VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66 and is an IgG2/K isotype containing heavy chain substitutions V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S, and P331S compared to IgG2 wild type.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит тяжелую цепь (HC) с SEQ ID NO: 80 и легкую цепь (LC) с SEQ ID NO: 81.In some embodiments, the antibody comprises a heavy chain (HC) of SEQ ID NO: 80 and a light chain (LC) of SEQ ID NO: 81.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит тяжелую цепь (HC) с SEQ ID NO: 80 и легкую цепь (LC) с SEQ ID NO: 81.In some embodiments, the antibody comprises a heavy chain (HC) of SEQ ID NO: 80 and a light chain (LC) of SEQ ID NO: 81.
В некоторых вариантах осуществления антитело представляет собой биспецифическое антитело.In some embodiments, the antibody is a bispecific antibody.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении аутоиммунного заболевания.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of an autoimmune disease.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении иммуноопосредованного воспалительного заболевания.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of an immune-mediated inflammatory disease.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении артрита.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of arthritis.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении системной красной волчанThe antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of systemic lupus erythematosus
- 33 040943 ки.- 33 040943 ki.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении воспалительного заболевания кишечника.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of inflammatory bowel disease.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при терапии при трансплантации.The antibody is suitable for use in therapy, such as transplant therapy.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например, при терапии при трансплантации почки. Антитело приемлемо для применения в терапии, например при терапии при трансплантации кожи. Антитело приемлемо для применения в терапии, например при терапии при трансплантации костного мозга.The antibody is suitable for use in therapy, for example in kidney transplant therapy. The antibody is suitable for use in therapy, for example in skin graft therapy. The antibody is suitable for use in therapy, for example in bone marrow transplantation therapy.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении реакции трансплантат против хозяина.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of graft versus host disease.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении иммунной тромбоцитопении.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of immune thrombocytopenia.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении рассеянного склероза.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of multiple sclerosis.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении тиреоидита.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of thyroiditis.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении диабета I типа.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of type I diabetes.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении атеросклероза.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of atherosclerosis.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении ревматоидного артрита.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of rheumatoid arthritis.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении болезни Крона.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of Crohn's disease.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении язвенного колита.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of ulcerative colitis.
Антитело приемлемо для применения в терапии, например при лечении воспалительного заболевания кишечника в комбинации со вторым терапевтическим агентом.The antibody is suitable for use in therapy, for example in the treatment of inflammatory bowel disease in combination with a second therapeutic agent.
Настоящее изобретение далее будет описано со ссылкой на нижеприведенные конкретные примеры, не имеющие ограничительного характера.The present invention will now be described with reference to the following non-limiting specific examples.
Пример 1. Материалы и способы.Example 1. Materials and methods.
Получение используемых белков.Getting used proteins.
Поскольку эндогенный CD154 участвует в передаче сигнала в качестве тримера, рекомбинантный CD154 экспрессировали разными способами для получения функционального рекомбинантного тримера. Растворимый человеческий CD154 (shCD154; SEQ ID NO: 4), растворимый CD154 Callithrix jacchus (обыкновенная игрунка; в настоящем документе именуемая игрункой) (smCD154; SEQ ID NO: 5) или растворимый CD154 Масаса fascicularis (макак-крабоед, в настоящем документе именуемый яванским макаком) (scCD154; SEQ ID NO: 6) клонировали и экспрессировали в качестве слияний с His6 (SEQ ID NO: 10) (shCD154-his, SEQ ID NO: 7; smCD154-his, SEQ ID NO: 8; scCD154-his, SEQ ID NO: 9) или в качестве гибридного белка с лейциновой застежкой (ILZ) (SEQ ID NO: 11) (shCD154-ILZ, SEQ ID NO: 12; smCD154-ILZ, SEQ ID NO: 13; scCD154-ILZ, SEQ ID NO: 14). Клонирование, экспрессию и очистку белков выполняли с использованием стандартных способов. Слияния с His и ILZ представляли собой преимущественно тримеры. Белки smCD154 и smCD154-ILZ были биотинилированы с использованием EZLink™ сульфо-NHS-LC-биотин и набора для включения меток (Thermo, кат. № 21327), успешность биотинилирования анализировали при помощи HABA-авидинового анализа (Thermo, кат. № 46610) и Octet. Клетки, экспрессирующие человеческий CD40 (SEQ ID NO: 15), использовали в некоторых анализах. В некоторых анализах использовали клетки D1.1 Jurkat (ATCC® CRL-10915™), эндогенно экспрессирующие человеческий CD154.Because endogenous CD154 is involved in signal transduction as a trimer, recombinant CD154 has been expressed in various ways to produce a functional recombinant trimer. Soluble human CD154 (shCD154; SEQ ID NO: 4), soluble CD154 Callithrix jacchus (common marmoset; herein referred to as marmoset) (smCD154; SEQ ID NO: 5), or soluble CD154 Macaca fascicularis (cynomolgus monkey, herein referred to as cynomolgus monkey) (scCD154; SEQ ID NO: 6) were cloned and expressed as fusions to His6 (SEQ ID NO: 10) (shCD154-his, SEQ ID NO: 7; smCD154-his, SEQ ID NO: 8; scCD154- his, SEQ ID NO: 9) or as a leucine zipper (ILZ) fusion protein (SEQ ID NO: 11) (shCD154-ILZ, SEQ ID NO: 12; smCD154-ILZ, SEQ ID NO: 13; scCD154-ILZ , SEQ ID NO: 14). Cloning, expression and purification of proteins were performed using standard methods. Fusions to His and ILZ were predominantly trimers. The smCD154 and smCD154-ILZ proteins were biotinylated using EZLink™ sulfo-NHS-LC-Biotin and labeling kit (Thermo, cat. no. 21327), biotinylation success was analyzed using the HABA-avidin assay (Thermo, cat. no. 46610) and Octet. Cells expressing human CD40 (SEQ ID NO: 15) were used in some of the assays. Some assays used D1.1 Jurkat cells (ATCC® CRL-10915™) endogenously expressing human CD154.
Человеческий CD154; SEQ ID NO: 1Human CD154; SEQ ID NO: 1
MIETYNQTSPRSAATGLPISMKIFMYLLTVFLITQMIGSALFAVYLHRRLDKIEDERNL HEDFVFMKTIQRCNTGERSLSLLNCEEIKSQFEGFVKDIMLNKEETKKENSFEMQKGDQNPQIA AHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQA PFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGT GFTSFGLLKLMIETYNQTSPRSAATGLPISMKIFMYLLTVFLITQMIGSALFAVYLHRRLDKIEDERNL HEDFVFMKTIQRCNTGERSLSLLNCEEIKSQFEGFVKDIMLNKEETKKENSFEMQKGDQNPQIA AHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQA PFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGT GFTSFGLLKL
- 34 040943- 34 040943
CD154 игрунки; SEQ ID NO: 2CD154 marmosets; SEQ ID NO: 2
MIETYNQPVPRSAATGPPVSMKIFMYLLTVFLITQMIGSALFAVYLHRRLDKIEDERNL HEDFVFMKTIQRCNTGERSLSLLNCEEIKSQFEGFVKDIMLNKEEKKKENSFEMQKGDQNPQIA AHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQA PFIASLCLKPPNRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGIFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGT GFTSFGLLKLMIETYNQPVPRSAATGPPVSMKIFMYLLTVFLITQMIGSALFAVYLHRRLDKIEDERNL HEDFVFMKTIQRCNTGERSLSLLNCEEIKSQFEGFVKDIMLNKEEKKKENSFEMQKGDQNPQIA AHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQA PFIASLCLKPPNRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGIFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGT GFTSFGLLKL
CD154 яванского макака; SEQ ID NO: 3CD154 cynomolgus monkey; SEQ ID NO: 3
MIETYNQPSPRSAATGLPVRMKIFMYLLTIFLITQMIGSALFAVYLHRRLDKIEDERNL HEDFVFMKTIQRCNTGERSLSLLNCEEIKSQFEGFVKDIMLNKEEKKKENSFEMQKGDQNPQIA AHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQA PFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGT GFTSFGLLKL shCD154; SEQ ID NO: 4MIETYNQPSPRSAATGLPVRMKIFMYLLTIFLITQMIGSALFAVYLHRRLDKIEDERNL HEDFVFMKTIQRCNTGERSLSLLNCEEIKSQFEGFVKDIMLNKEEKKKENSFEMQKGDQNPQIA AHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQA PFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGT GFTSFGLLKL shCD154; SEQ ID NO: 4
MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYI YAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGA SVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL smCD154; SEQ ID NO: 5SVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL smCD154; SEQ ID NO: 5
MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYI YAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKPPNRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGIFELQPGA SVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKLMQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYI YAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKPPNRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGIFELQPGA SVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL
SCGD154; SEQ ID NO: 6SCGD154; SEQ ID NO: 6
MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYI YAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGA SVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL shCD154-his; SEQ ID NO: 7shCD154-his; SEQ ID NO: 7
GSHHHHHHGGGSMQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGK QLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSI HLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL smCD154-his; SEQ ID NO: 8HLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL smCD154-his; SEQ ID NO: 8
GSHHHHHHGGGSMQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGK QLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKPPNRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSI HLGGIFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL scCD154-his; SEQ ID NO: 9GSHHHHHHGGGSMQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGK QLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKPPNRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSI HLGGIFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL scCD154-his; SEQ ID NO: 9
GSHHHHHHGGGSMQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGK QLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSI HLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKLGSHHHHHHGGGSMQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGK QLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSI
- 35 040943- 35 040943
His6; SEQ ID NO: 10His6; SEQ ID NO: 10
HHHHHHHHHHH
ILZ; SEQ ID NO: 11ILZ; SEQ ID NO: 11
RMKQIEDKIEEILSKIYHIENEIARIKKLIGER shCD154-ILZ; SEQ ID NO: 12RMKQIEDKIEEILSKIYHIENEIARIKKLIGER shCD154-ILZ; SEQ ID NO: 12
GSHHHHHHGGGSRMKQIEDKIEEILSKIYHIENEIARIKKLIGERGGGSMQKGDQNPQI AAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQ APFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHG TGFTSFGLLKL smCD154-ILZ; SEQ ID NO: 13GSHHHHHHGGGSRMKQIEDKIEEILSKIYHIENEIARIKKLIGERGGGSMQKGDQNPQI AAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQ APFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDSFQVGLSHL TGFTCDPSQVGLSHL TGFTCDSFQVGLSHL TGFTCDPSQVGLSHL SEQ ID NO: 13
GSHHHHHHGGGSRMKQIEDKIEEILSKIYHIENEIARIKKLIGERGGGSMQKGDQNPQI AAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQ APFIASLCLKPPNRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGIFELQPGASVFVNVTDPSQVSHG TGFTSFGLLKL scCD154-ILZ; SEQ ID NO: 14GSHHHHHHGGGSRMKQIEDKIEEILSKIYHIENEIARIKKLIGERGGGSMQKGDQNPQI AAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQ APFIASLCLKPPNRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGGIFELQPGASVFVNVTDSFQVGLSHL TGFTCDSFQVLSHL TGFTCDSFQVLSHL TGFTCDSFQVLSHL SEQ ID NO: 14
GSHHHHHHGGGSRMKQIEDKIEEILSKIYHIENEIARIKKLIGERGGGSMQKGDQNPQI AAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQ APFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHG TGFTSFGLLKL человеческий CD40; SEQ ID NO: 15human SEQ ID NO: 15
MVRLPLQCVLWGCLLTAVHPEPPTACREKQYLINSQCCSLCQPGQKLVSDCTEFTETEC LPCGESEFLDTWNRETHCHQHKYCDPNLGLRVQQKGTSETDTICTCEEGWHCTSEACESCVLHR SCSPGFGVKQIATGVSDTICEPCPVGFFSNVSSAFEKCHPWTSCETKDLWQQAGTNKTDWCG PQDRLRALWIPIIFGILFAILLVLVFIKKVAKKPTNKAPHPKQEPQEINFPDDLPGSNTAAPV QETLHGCQPVTQEDGKESRISVQERQMVRLPLQCVLWGCLLTAVHPEPPTACREKQYLINSQCCSLCQPGQKLVSDCTEFTETEC LPCGESEFLDTWNRETHCHQHKYCDPNLGLRVQQKGTSETDTICTCEEGWHCTSEACESCVLHR SCSPGFGVKQIATGVSDTICEPCPVGFFSNVSSAFEKCHPWTSCETKDLWQQAGTNKTDWCG PQDRLRALWIPIIFGILFAILLVLVFIKKVAKKPTNKAPHPKQEPQEINFPDDLPGSNTAAPV QETLHGCQPVTQEDGKESRISVQERQ
Измерения аффинности.Affinity measurements.
Измерения аффинности с использованием поверхностного плазмонного резонанса (SPR) выполняли с помощью системы ProteOn XPR36 (BioRad). Биосенсорную поверхность готовили путем связывания антитела к Fc человеческого IgG (Jackson кат. № 109-005-098) с модифицированной слоем альгинатного полимера поверхностью чипа GLC (BioRad, кат. № 176-5011) с использование инструкций производителя по проведению аминного связывания. Иммобилизировали приблизительно 4700 RU (отвечающих единиц) исследуемых антител. Кинетические эксперименты выполняли при 25°C в подвижном буферном растворе (DPBS+0,03% полисорбат P20+100 мкг/мл BSA). Для выполнения кинетических экспериментов захватывали 100 RU антител, с последующим выполнением инъекций аналитов (shCD154-his и smCD154-his) с концентрациями в диапазоне от 0,391 нМ до 100 нМ (в 4-кратном последовательном разведении). Фазу ассоциации отслеживали в течение 3 мин при 50 мкл/мин, с последующим 15-минутным прогоном буферного раствора (фаза диссоциации). Поверхность чипа регенерировали двумя 18секундными импульсами 100 мМ H3PO4 (Sigma, кат. № 7961) при 100 мкл/мин.Affinity measurements using surface plasmon resonance (SPR) were performed using a ProteOn XPR36 system (BioRad). A biosensor surface was prepared by binding an anti-human IgG Fc antibody (Jackson cat. no. 109-005-098) to an alginate polymer layer-modified GLC chip surface (BioRad, cat. no. 176-5011) using the manufacturer's instructions for amine coupling. Approximately 4700 RU (response units) of the test antibodies were immobilized. Kinetic experiments were performed at 25° C. in running buffer solution (DPBS+0.03% polysorbate P20+100 μg/ml BSA). To perform kinetic experiments, 100 RU of antibodies were captured, followed by injections of analytes (shCD154-his and smCD154-his) at concentrations ranging from 0.391 nM to 100 nM (in 4-fold serial dilution). The association phase was monitored for 3 min at 50 μl/min, followed by a 15 min buffer run (dissociation phase). The chip surface was regenerated with two 18 second pulses of 100 mM H 3 PO 4 (Sigma, cat. no. 7961) at 100 μl/min.
Полученные данные обрабатывали с использованием программного обеспечения ProteOn Manager. Сначала корректировали данные по отношению к фону, используя промежуточные участки. Впоследствии для данных выполняли двойное вычитание эталона, используя инъекцию буферного раствора вместо инъекций аналитов. Кинетический анализ данных выполняли, используя модель связывания Ленгмюра 1: 1.The obtained data were processed using the ProteOn Manager software. First, the data was corrected against the background using intermediate plots. Subsequently, a double standard subtraction was performed on the data using buffer injection instead of analyte injections. Kinetic data analysis was performed using a 1:1 Langmuir binding model.
Индуцированная CD154 активация клеток Ramos.CD154-induced activation of Ramos cells.
Способность антител к CD154 ингибировать активацию клеток Ramos оценивали, используя CD54 в качестве маркера активации клеток. Клетки Ramos (клетки лимфомы Беркитта, ATCC® CRL-1596™), культивированные согласно протоколу поставщика, высевали в 96-луночный планшет с V-образным дном лунок при плотности 2,0х105 клеток/лунку в полную ростовую среду по 100 мкл/лунку. Тестируемые антитела в концентрациях 0,2, 2 или 20 мкг/мл предварительно инкубировали с 40 нг/мл smCD154his в течение 1 ч при комнатной температуре (КТ) и впоследствии добавляли их к клеткам. Планшет накрывали и инкубировали в течение ночи (37°C, 5% CO2). На следующий день центрифугировали анализируемый планшет и удаляли истощенную ростовую среду. Полученный осадок клеток промывали холодным PBS/2% FBS и впоследствии клетки окрашивали меченным PE антителом к CD54 (ICAM-1) или подходящим изотипическим контролем в течение 1 ч при 4°C. Клетки промывали холодным PBS/2% FBS, ресуспендировали в 100 мкл/лунку холодного PBS/2% FBS и измеряли флуоресцентный сигнал (желтый канал) на проточном цитометре. Антитела считали антагонистами при выполнении следующих критериев: % активности относительно антитела 5C8 > 5% активности 5C8, где % активности представляет собой нормализованное процентное значение ингибирования относительно 5C8 при наибольшейThe ability of anti-CD154 antibodies to inhibit Ramos cell activation was assessed using CD54 as a cell activation marker. Ramos cells (Burkitt's lymphoma cells, ATCC® CRL-1596™), cultured according to the supplier's protocol, were plated in a 96-well V-bottom plate at a density of 2.0 x 10 5 cells/well in complete growth medium at 100 μl/well . Test antibodies at concentrations of 0.2, 2 or 20 μg/ml were pre-incubated with 40 ng/ml smCD154his for 1 hour at room temperature (RT) and subsequently added to the cells. The tablet was covered and incubated overnight (37°C, 5% CO 2 ). The next day, the assay plate was centrifuged and the depleted growth medium was removed. The resulting cell pellet was washed with cold PBS/2% FBS and subsequently the cells were stained with PE labeled anti-CD54 antibody (ICAM-1) or an appropriate isotype control for 1 h at 4°C. Cells were washed with cold PBS/2% FBS, resuspended in 100 μl/well of cold PBS/2% FBS and the fluorescent signal (yellow channel) measured on a flow cytometer. Antibodies were considered antagonists when the following criteria were met: % activity against antibody 5C8 > 5% activity against 5C8, where % activity is the normalized percentage of inhibition against 5C8 at the highest
- 36 040943 протестированной концентрации.- 36 040943 tested concentration.
Анализ гена-репортера NF-kB-SEAP.Analysis of the NF-kB-SEAP reporter gene.
Способность антител к CD154 ингибировать индуцированные CD154 сигнальные пути нижележащие от CD40 оценивали с использованием клеток HEK-Blue™ CD40L (Invivogen), сконструированных с возможностью экспрессии человеческого CD40 и трансфицированных геном-репортером секретируемой эмбриональной щелочной фосфатазы (SEAP), находящимся под контролем индуцируемого NF-kB промотора (минимального промотора IFN-β). Клетки стимулировали CD154 человека или яванского макака, либо клетками Jurkat. Клетки HEK-Blue™ CD40L культивировали в соответствии с протоколом поставщика и все анализы активности выполняли в DMEM с добавлением 10% инактивированной нагревом эмбриональной бычьей сыворотки и 1X Glutamax. Клетки высевали в 96-луночные планшеты для культивирования ткани с плотностью клеток 2,5 или 5х104 клеток на лунку в объеме 100 мкл и инкубировали в течение ночи (37°C, 5% CO2). На следующий день 4X растворы shCD154-His или shCD154-ILZ, либо клеток D1.1 Jurkat предварительно инкубировали с 4X растворами антител к CD154 (в подходящих концентрациях) в соотношении 1: 1 с получением 2X растворов смесей предкомплексов CD154:антитело. Смеси CD154:антитело инкубировали при КТ в течение 1 ч, а смесь D1.1 Jurkat:mAb инкубировали при 37°C и 5% CO2 в течение 1 ч. В конце периода инкубации предкомплексов в 96-луночный аналитический планшет, содержащий клетки HEK-Blue™ CD40L, добавляли по 100 мкл/лунку 2X растворов предкомплексов; конечный объем при анализе составлял 200 мкл/лунку с конечными концентрациями CD154 80 нг/мл shCD154-His или 40 нг/мл shCD154-ILZ, или 2,5-6,0x104 клеток D1.1 Jurkat. После 16-24 ч периода обработки (37°C, 5% CO2) супернатанты анализировали на активность фосфатазы (SEAP) путем измерения поглощения (650 нм) для супернатантов, введенных в концентрации 40 мкл/лунку и инкубированных с 160 мкл/лунку QUANTI-Blue™ (Invivogen) при 37°C в течение 30-60.The ability of anti-CD154 antibodies to inhibit CD154-induced signaling pathways downstream of CD40 was assessed using HEK-Blue™ CD40L cells (Invivogen) engineered to express human CD40 and transfected with a secreted embryonic alkaline phosphatase (SEAP) reporter gene under the control of inducible NF- kB promoter (minimal IFN-β promoter). Cells were stimulated with human or cynomolgus monkey CD154 or Jurkat cells. HEK-Blue™ CD40L cells were cultured according to the supplier's protocol and all activity assays were performed in DMEM supplemented with 10% heat-inactivated fetal bovine serum and 1X Glutamax. Cells were seeded in 96-well tissue culture plates at a cell density of 2.5 or 5x10 4 cells per well in a volume of 100 μl and incubated overnight (37° C., 5% CO 2 ). The next day, 4X solutions of shCD154-His or shCD154-ILZ or D1.1 Jurkat cells were pre-incubated with 4X solutions of anti-CD154 antibodies (at appropriate concentrations) in a 1:1 ratio to obtain 2X solutions of mixtures of CD154:antibody precomplexes. The CD154:antibody mixtures were incubated at RT for 1 h and the D1.1 Jurkat:mAb mixture was incubated at 37°C and 5% CO2 for 1 h. Blue™ CD40L, added 100 µl/well of 2X precomplex solutions; the final assay volume was 200 µl/well with final CD154 concentrations of 80 ng/ml shCD154-His or 40 ng/ml shCD154-ILZ, or 2.5-6.0x104 D1.1 Jurkat cells. After a 16-24 h treatment period (37° C., 5% CO2), supernatants were analyzed for phosphatase activity (SEAP) by measuring absorbance (650 nm) for supernatants injected at 40 µl/well and incubated with 160 µl/well QUANTI- Blue™ (Invivogen) at 37°C for 30-60.
Анализ опосредованной клетками Jurkat активации дендритных клеток.Analysis of Jurkat cell-mediated activation of dendritic cells.
Способность антител к CD154 ингибировать опосредованную клетками Jurkat активацию дендритных клеток (DC) оценивали путем измерения снижения продукции различных цитокинов DC. Человеческие моноциты (Biologic Specialties) культивировали с 50 нг/мл IL-4 и GM-CSF в течение шести дней. На 3 день клеткам заменяли среду на свежую (с IL-4 и GM-CSF). Незрелые клетки DC (iDC) (CD1a+ CD14low CD83-) использовали в анализах с применением клеток на 6 день. Инкубировали 2,5x105 клеток D1.1 Jurkat (облученных дозой 1000 рад) с 0,000064-25 мкг/мл мкг/мл антител к CD154 в течение 15-20 мин и впоследствии сокультивировали с 2,5x104 iDC в конечном объеме 200 мкл/лунку в 96-луночном круглодонном планшете. После 48 часов инкубации собирали супернатанты для анализа на цитокины.The ability of anti-CD154 antibodies to inhibit Jurkat-mediated dendritic cell (DC) activation was assessed by measuring the reduction in the production of various DC cytokines. Human monocytes (Biologic Specialties) were cultured with 50 ng/ml IL-4 and GM-CSF for six days. On day 3, the cells were replaced with fresh medium (with IL-4 and GM-CSF). Immature DC cells (iDC) (CD1a + CD14 low CD83 - ) were used in cell assays on day 6. 2.5x105 D1.1 Jurkat cells (irradiated at 1000 rad) were incubated with 0.000064-25 µg/ml µg/ml anti-CD154 antibody for 15-20 min and subsequently co-cultured with 2.5x10 4 iDC in a final volume of 200 µl /well in a 96-well round bottom plate. After 48 hours of incubation, supernatants were collected for cytokine analysis.
Анализ опосредованной клетками Jurkat активации В-клеток.Analysis of Jurkat Cell-Mediated B-Cell Activation.
Способность антител к CD154 ингибировать опосредованную клетками Jurkat активацию В-клеток оценивали путем анализа влияния антител на пролиферацию В-клеток. Сокультивировали 1x105 клеток D1.1 Jurkat (облученных дозой 5000 рад) с 1x105 В-клеток из человеческих миндалин в присутствии IL21 (100 нг/мл) и 0,0077 нг/мл - 15 мкг/мл антител к CD154 в конечном объеме 200 мкл/лунку в 96луночном круглодонном планшете. После 2 дней инкубации к культурам добавляли метил (-3H)тимидин (0,5 мкКюри/лунку) и определяли пролиферацию человеческих В-клеток после инкубации в течение ночи.The ability of anti-CD154 antibodies to inhibit Jurkat-mediated B cell activation was assessed by analyzing the effect of antibodies on B cell proliferation. 1x105 D1.1 Jurkat cells (irradiated at 5000 rad) were co-cultured with 1x105 B cells from human tonsils in the presence of IL21 (100 ng/ml) and 0.0077 ng/ml - 15 μg/ml anti-CD154 antibody in a final volume of 200 μl /well in a 96-well round bottom plate. After 2 days of incubation, methyl (-3H)thymidine (0.5 μCi/well) was added to the cultures and the proliferation of human B cells was determined after overnight incubation.
Анализ опосредованной CD154 активации В-клеток.Analysis of CD154 mediated B cell activation.
Способность антител к CD154 ингибировать опосредованную рекомбинантным CD154 активацию В-клеток оценивали на В-клетках человека или яванского макака. Культивировали 1x105 В-клеток из человеческих миндалин или клеток селезенки яванского макака с 100 нг/мл rhIL-21, 0,5 мкг/мл shCD154ILZ и 0,0077 нг/мл - 15 мкг/мл антител к CD154 в конечном объеме 200 мкл/лунку в 96-луночном круглодонном планшете. После 2 дней инкубации к культурам добавляли метил (-ЗН)-тимидин (0,5 мкКюри/лунку) и определяли пролиферацию человеческих В-клеток после инкубации в течение ночи.The ability of anti-CD154 antibodies to inhibit recombinant CD154-mediated B cell activation was evaluated in human or cynomolgus monkey B cells. 1x105 B cells from human tonsils or cynomolgus spleen cells were cultured with 100 ng/ml rhIL-21, 0.5 µg/ml shCD154ILZ and 0.0077 ng/ml - 15 µg/ml anti-CD154 antibodies in a final volume of 200 µl/ well in a 96-well round bottom plate. After 2 days of incubation, methyl (-3H)-thymidine (0.5 μCi/well) was added to the cultures and the proliferation of human B cells was determined after overnight incubation.
Пример 2. Выделение антител к CD154 из библиотек фаговых дисплеев.Example 2 Isolation of Anti-CD154 Antibodies from Phage Display Libraries.
Связывающие CD154 Fab выбирали из получаемых de novo библиотек pIX-фаговых дисплеев, как описано в Shi et al., J Mol Biol 397:385-96, 2010; международной патентной публикации № WO2009/ 085462; патентной публикации США № US2010/0021477). Вкратце, библиотеки создавали путем диверсификации человеческих каркасов, в которых гены VH зародышевой линии IGHV1-69*01, IGHV3-23*01 и IGHV5-51*01 рекомбинировали с человеческим минигеном IGHJ-4 посредством петли H3, а человеческие гены VL-каппа зародышевой линии O12 (IGKV1-39*01), L6 (IGKV3-11*01), А27 (IGKV3-20*01) и В3 (IGKV4-1*01) рекомбинировали с минигеном IGKJ-1 для сборки полных доменов VH и VL. Для диверсификации выбирали положения вариабельных областей легкой и тяжелой цепи возле петель H1, H2, L1, L2 и L3, соответствующие положениям, для которых был выявлен частый контакт с белковыми и пептидными антигенами. Диверсификация последовательности в выбранных положениях ограничивалась остатками, появляющимися в каждом из положений в семействах генов зародышевой линии IGHV или IGLV для соответствующих генов IGHV или IGLV. Диверсификацию петли H3 создавали, используя синтетические короткие или средние петли длиной 7-14 аминокислот. Распределение аминокислот в H3 выполняли аналогично наблюдаемой вариации аминокислот в человеческих антителах. КонфигурацияCD154 binding Fabs were selected from de novo generated pIX phage display libraries as described in Shi et al., J Mol Biol 397:385-96, 2010; International Patent Publication No. WO2009/085462; US Patent Publication No. US2010/0021477). Briefly, libraries were generated by diversifying human scaffolds in which the IGHV1-69*01, IGHV3-23*01, and IGHV5-51*01 germline VH genes were recombined with the human IGHJ-4 minigene via the H3 loop, and the human VL germline kappa genes were recombined. lines O12 (IGKV1-39*01), L6 (IGKV3-11*01), A27 (IGKV3-20*01), and B3 (IGKV4-1*01) were recombined with the IGKJ-1 minigene to assemble the complete VH and VL domains. For diversification, the positions of the variable regions of the light and heavy chains near the H1, H2, L1, L2, and L3 loops were chosen, corresponding to the positions for which frequent contact with protein and peptide antigens was detected. Sequence diversification at selected positions was limited to residues appearing at each of the positions in the IGHV or IGLV germline gene families for the respective IGHV or IGLV genes. Diversification of the H3 loop was created using synthetic short or medium loops of 7-14 amino acids in length. The distribution of amino acids in H3 was performed similarly to the observed amino acid variation in human antibodies. Configuration
- 37 040943 библиотеки подробно описана в Shi et al., J Mol Biol 397:385-96, 2010. Каркасы, использованные для создания библиотек, получали наименования в соответствии с их происхождением от человеческого гена зародышевой линии VH и VL. Три библиотеки тяжелых цепей объединяли с четырьмя легкими цепями зародышевой линии или библиотеками легких цепей зародышевых линий для создания 12 уникальных комбинаций VH:VL для экспериментов по пэннингу на smCD154 или клеток, экспрессирующих полноразмерный CD154 яванского макака.- 37 040943 libraries are described in detail in Shi et al., J Mol Biol 397:385-96, 2010. The scaffolds used to create the libraries were named according to their origin from the human VH and VL germline gene. Three heavy chain libraries were combined with four germline light chains or germline light chain libraries to create 12 unique VH:VL combinations for panning experiments on smCD154 or cells expressing full-length cynomolgus CD154.
Библиотеки подвергали пэннингу относительно либо полноразмерного CD154 яванского макака (SEQ ID NO: 3), стабильно экспрессирующегося в клетках CHO, либо биотинилированного и небиотинилированного smCD154 (SEQ ID NO: 5). После нескольких циклов пэннинга выполняли твердофазный ИФА с поликлональными фагами с использованием smCD154 в качестве антигенов для обнаружения специфического обогащения в отдельных экспериментах по пэннингу. Фаги, собранные в результате таких экспериментов по пэннингу, которые показали обогащение на связующие smCD154 вещества, подвергали дополнительному скринингу твердофазным ИФА с моноклональными Fab, при котором белки Fab, экспрессированные из отдельных клонов Fab, применяли как связующие небиотинилированный smCD154 вещества, нанесенные непосредственно на планшет. Клоны Fab, для которых сигнал связывания в четыре раза превышал сигнал от Fab отрицательного контроля, отбирали для скрининга в формате полных IgG. Выбранные Fab клонировали в каркас IgG2sigma/κаппа и дополнительно определяли характеристики связывания с клетками D1.1 Jurkat. IgG2sigma представляет собой заглушенный Fc и имеет замены V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S и P331S по сравнению с IgG2 дикого типа. Описание IgG2sigma представлено в патенте США № 8,961,967.Libraries were panned against either full-length cynomolgus CD154 (SEQ ID NO: 3) stably expressed in CHO cells or biotinylated and non-biotinylated smCD154 (SEQ ID NO: 5). After several cycles of panning, ELISA was performed with polyclonal phages using smCD154 as antigens to detect specific enrichment in separate panning experiments. Phages harvested from these panning experiments, which showed enrichment for smCD154 binders, were further screened with monoclonal Fab ELISA, in which Fab proteins expressed from individual Fab clones were used as binders of non-biotinylated smCD154 binders applied directly to the plate. Fab clones for which the binding signal was four times that of the negative control Fab were selected for screening in full IgG format. Selected Fabs were cloned into the IgG2sigma/κappa framework and further characterized for binding to D1.1 Jurkat cells. IgG2sigma is a muted Fc and has substitutions V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S and P331S compared to wild-type IgG2. A description of IgG2sigma is provided in US Pat. No. 8,961,967.
Пример 3. Получение антител к CD154 на крысах.Example 3 Obtaining antibodies to CD154 in rats.
Антитела к CD154 получали, используя трансгенных крыс, экспрессирующих локусы человеческих иммуноглобулинов, OmniRat®; OMT, Inc. Эндогенные локусы иммуноглобулинов в OmniRat® заменены человеческими локусами IgK и Igλ, а химерный локус IgH человека/крысы с сегментами V, D и J человеческого происхождения связан с крысиным локусом CH. Локус IgH содержит 22 человеческих VH, все человеческие сегменты D и JH в природной конфигурации связаны с крысиным локусом CH. Получение и определение характеристик крыс OmniRat® описано в Osborn, et al. J Immunol 190: 1481-1490, 2013; и международной патентной публикации № WO2014/093908.Anti-CD154 antibodies were generated using transgenic rats expressing human immunoglobulin loci, OmniRat®; OMT Inc. The endogenous immunoglobulin loci in OmniRat® are replaced by human IgK and Igλ loci, and the chimeric human/rat IgH locus with V, D and J segments of human origin is linked to the rat CH locus. The IgH locus contains 22 human VHs, all of the human D and J H segments in natural configuration are linked to the rat CH locus. The preparation and characterization of OmniRat® rats is described in Osborn, et al. J Immunol 190: 1481-1490, 2013; and International Patent Publication No. WO2014/093908.
Крыс OmniRat® иммунизировали smCD154 с использованием протокола повторяющейся иммунизации во множестве участков (RIMMS). После 45-дневной схемы иммунизации у всех четырех крыс забирали лимфоузлы и использовали их для получения гибридом. Супернатанты гибридом в 96-луночных планшетах подвергали скринингу путем связывания в твердофазном ИФА для выявления mAb, проявляющих связывание с smCD154, из числа которых отбирали супернатанты гибридом, показывающие при анализе сигнал, более чем в 3 раза превышающий средний сигнал отрицательного контроля.OmniRat® rats were immunized with smCD154 using a repeat immunization at multiple sites (RIMMS) protocol. After a 45 day immunization schedule, lymph nodes were harvested from all four rats and used to generate hybridomas. Hybridoma supernatants in 96-well plates were screened by binding in solid phase ELISA to detect mAbs exhibiting binding to smCD154, from which hybridoma supernatants showing a signal greater than 3 times the mean signal of the negative control were selected.
Выбранные антитела клонировали в виде полноразмерных IgG2sigma/λ. Антитела, демонстрирующие антагонистическую активность в отношении индуцированной CD154 активации клеток Ramos, отбирали для дальнейшего определения характеристик.The selected antibodies were cloned as full length IgG2sigma/λ. Antibodies showing antagonistic activity against CD154-induced activation of Ramos cells were selected for further characterization.
Пример 4. Определение характеристик антител.Example 4 Characterization of antibodies.
Несколько антител к CD154, полученных из фагового дисплея или трансгенных животных, экспрессирующих локусы человеческих иммуноглобулинов, продемонстрировавших антагонистическую активность, как описано в примерах 2 и 3, секвенировали и дополнительно определяли их характеристики по связыванию с дендритными клетками человека и яванского макака, по способности ингибировать функции дендритных клеток и B-клеток человека и яванского макака, и по эффекторным функциям антител. Области VH и VL антител секвенировали с использованием стандартных способов.Several anti-CD154 antibodies derived from phage display or transgenic animals expressing human immunoglobulin loci exhibiting antagonistic activity as described in Examples 2 and 3 were sequenced and further characterized for binding to human and cynomolgus dendritic cells, for their ability to inhibit functions human and cynomolgus monkey dendritic cells and B cells, and on the effector functions of antibodies. The VH and VL regions of the antibodies were sequenced using standard methods.
В табл. 2 показаны аминокислотные последовательности HCDR1 выбранных антител.In table. 2 shows the HCDR1 amino acid sequences of selected antibodies.
В табл. 3 показаны аминокислотные последовательности HCDR2 выбранных антител.In table. 3 shows the HCDR2 amino acid sequences of selected antibodies.
В табл. 4 показаны аминокислотные последовательности HCDR3 выбранных антител.In table. 4 shows the HCDR3 amino acid sequences of selected antibodies.
В табл. 5 показаны аминокислотные последовательности LCDR1 выбранных антител.In table. 5 shows the LCDR1 amino acid sequences of selected antibodies.
В табл. 6 показаны аминокислотные последовательности LCDR2 выбранных антител.In table. 6 shows the LCDR2 amino acid sequences of selected antibodies.
В табл. 7 показаны аминокислотные последовательности LCDR3 выбранных антител.In table. 7 shows the LCDR3 amino acid sequences of selected antibodies.
В табл. 8 показаны аминокислотные последовательности VH выбранных антител.In table. 8 shows the VH amino acid sequences of selected antibodies.
В табл. 9 показаны аминокислотные последовательности VL выбранных антител.In table. 9 shows the VL amino acid sequences of selected antibodies.
- 38 040943- 38 040943
Таблица 3Table 3
Таблица 4Table 4
Таблица 5Table 5
Таблица 6Table 6
-39040943-39040943
Таблица 7Table 7
Таблица 9Table 9
- 40 040943- 40 040943
Антитела ингибировали как функцию эндогенного CD 154 на клетках Jurkat (клетки Dl.l Jurkat в табл. 10), так и рекомбинантно экспрессированного тримера человеческого CD 154 (экспрессированного в виде shCD154-ILZ или shCD154-his) по данным измерения в анализе гена-репортера NF-кВ SEAP. Антитела ингибировали сигнализацию со значениями 1С50 в диапазоне 0,08-21,15 нМ. Значения 1С50 для выбранных антител в данном анализе показаны в табл. 10. Значения 1С50 в таблице для каждого антитела представляют собой наибольшие и наименьшие значения 1С50, полученные в отдельных экспериментах, а единственное значение указывает, что антитело тестировалось в одном эксперименте, или имеется только одно достоверное значение 1С50.Antibodies inhibited both the function of endogenous CD 154 on Jurkat cells (Dl.l Jurkat cells in Table 10) and the recombinantly expressed human CD 154 trimer (expressed as shCD154-ILZ or shCD154-his) as measured in the reporter gene assay NF-kV SEAP. The antibodies inhibited signaling with IC 50 values in the range of 0.08-21.15 nM. Values IC 50 for selected antibodies in this analysis are shown in table. 10. The IC 50 values in the table for each antibody represent the highest and lowest IC 50 values obtained in separate experiments, with a single value indicating that the antibody was tested in a single experiment or there is only one valid IC 50 value.
Таблица 10Table 10
*Формат CD154, использованный для индукции сигнализации*CD154 format used for alarm induction
Способность антител ингибировать активацию дендритных клеток оценивали с использованием секреции IL-12p40 в качестве маркера активации DC. Антитела ингибировали активацию DC, вызванную эндогенным CD 154 на клетках Jurkat, со значениями 1С50в диапазоне от 0,02 до 0,49 нМ. В табл. 11 показаны значения 1С50, полученные при анализе выбранных антител. Диапазон 1С50 в таблице представляет собой наименьшее и наибольшее значение 1С50, полученные в отдельных экспериментах по 2-4 донорам в 1 -6 повторах.The ability of antibodies to inhibit dendritic cell activation was assessed using IL-12p40 secretion as a marker of DC activation. The antibodies inhibited DC activation induced by endogenous CD 154 on Jurkat cells with IC 50 values ranging from 0.02 to 0.49 nM. In table. 11 shows the IC 50 values obtained from the analysis of selected antibodies. The 1C 50 range in the table represents the smallest and largest 1C 50 values obtained in separate experiments on 2-4 donors in 1-6 replicates.
Таблица 11Table 11
Способность антител ингибировать активацию В-клеток человека или яванского макака измеряли с использованием в качестве показателя пролиферации В-клеток. Антитела ингибировали пролиферацию, вызванную как эндогенным CD 154 (клетки Dl.l Jurkat), так и рекомбинантным тримером человеческого CD 154 (shCD154-ILZ) со значениями 1С50 в диапазоне 0,01-5,35 нМ. В табл. 12 показаны значения 1С50 для разных антител, полученные при анализе активации В-клеток человека или яванского макака. Диапазон 1С50 в таблице представляет собой наименьшее и наибольшее значение 1С50, полученные в отдельных экспериментах по 2-4 донорам в 1-6 повторах. Единственное значение 1С50 в таблице указывает на наличие одного достоверного значения 1С50.The ability of antibodies to inhibit human or cynomolgus B cell activation was measured using B cell proliferation as an indicator. The antibodies inhibited proliferation induced by both endogenous CD 154 (Dl.l Jurkat cells) and recombinant human CD 154 trimer (shCD154-ILZ) with IC 50 values ranging from 0.01-5.35 nM. In table. 12 shows IC 50 values for various antibodies obtained from human or cynomolgus B cell activation assays. The 1C 50 range in the table represents the smallest and largest 1C 50 values obtained in separate experiments on 2-4 donors in 1-6 repetitions. The only 1C 50 value in the table indicates the presence of one valid 1C 50 value.
Таблица 12Table 12
НВ: не выполняли *Формат CD154, использованный для индукции сигнализации/источника В-клетокHB: not performed *CD154 format used for signaling induction/source of B cells
Пример 5. Конструирование антител для сведения к минимуму риска посттрансляционной модификации.Example 5 Design of antibodies to minimize the risk of post-translational modification.
VL антитела C4LB89 содержала предполагаемый участок дезаминирования в LCDR2 (N52-S53 в легкой цепи C4LL49, SEQ ID NO: 66). Были сделаны отдельные замены в каждом положении (N52S иThe VL of the C4LB89 antibody contained a putative deamination site in LCDR2 (N52-S53 in the C4LL49 light chain, SEQ ID NO: 66). Individual substitutions were made in each position (N52S and
-41 040943-41 040943
S53T) в VL. Мутированные легкие цепи совместно экспрессировали с родительской тяжелой цепью C4LH165 (SEQ ID NO: 59) с образованием антител C4LB235 и C4LB236 в форме IgG2sigma/K. Аминокислотные последовательности LCDR2 и VL из C4LB235 и C4LB236 показаны в табл. 13 и табл. 14, соответственно. C4LB235 содержит HCDR с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, LCDR с SEQ ID NO: 37, 49 или 52, VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 72. C4LB236 содержит HCDR с SEQ ID NO: 17, 23 и 30, LCDR с SEQ ID NO: 37, 50 или 52, VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 73.S53T) to VL. The mutated light chains were co-expressed with the parent C4LH165 heavy chain (SEQ ID NO: 59) to generate C4LB235 and C4LB236 antibodies as IgG2sigma/K. The amino acid sequences of LCDR2 and VL from C4LB235 and C4LB236 are shown in Table 1. 13 and tab. 14, respectively. C4LB235 contains HCDRs of SEQ ID NOs: 17, 23, and 30, LCDRs of SEQ ID NOs: 37, 49, or 52, VHs of SEQ ID NOs: 59, and VLs of SEQ ID NOs: 72. C4LB236 contains HCDRs of SEQ ID NOs: 17, 23 and 30, LCDR with SEQ ID NO: 37, 50 or 52, VH with SEQ ID NO: 59 and VL with SEQ ID NO: 73.
Оба антитела тестировали на способность ингибировать пролиферацию B-клеток яванского макака. C4LB235 проявило эффективность, сходную с C4LB89, a C4LB236 проявило сниженную активность по сравнению с C4LB89.Both antibodies were tested for their ability to inhibit the proliferation of cynomolgus monkey B cells. C4LB235 showed similar potency to C4LB89 and C4LB236 showed reduced activity compared to C4LB89.
Пример 6. Антитела к CD154 с заглушенной эффекторной функцией не индуцируют активацию тромбоцитов.Example 6 Anti-CD154 antibodies with muted effector function do not induce platelet activation.
В клинике исследованы антитела к CD154, дающие положительные результаты у пациентов с аутоиммунными заболеваниями, однако из-за случаев тромбоэмболии (TE) дальнейшая клиническая разра ботка этих антител остановлена. Гуманизированное антитело 5c8 (IgG1/K) представляет собой антитело к CD154, которое в клинике приводило к TE (Yazdany et al., Lupus 13:377-380, 2004). Была выдвинута гипотеза, что тромбоэмболия (TE), опосредованная гуманизированным 5c8, является результатом активации и агрегации тромбоцитов из-за формирования иммунных комплексов (IC) антитело к CD154/CD154 высшего порядка, которые перекрестно связывают тромбоциты путем связывания Fc с рецептором FcYRIIa тромбоцитов. В условиях in vitro сконструированное антитело 5c8 с заглушенным Fc (замена D265A в IgG1), не связывающее рецептор FcYRIIa, не активирует тромбоциты (Xie et al., J Immunol 192:4083-4092, 2014).Anti-CD154 antibodies have been clinically investigated with positive results in patients with autoimmune diseases, but due to cases of thromboembolism (TE), further clinical development of these antibodies has been halted. The humanized antibody 5c8 (IgG1/K) is an anti-CD154 antibody that has resulted in TE in the clinic (Yazdany et al., Lupus 13:377-380, 2004). It has been hypothesized that thromboembolism (TE) mediated by humanized 5c8 is the result of platelet activation and aggregation due to the formation of higher order anti-CD154/CD154 antibody immune complexes (IC) that cross-link platelets by binding Fc to the platelet FcYRIIa receptor. In vitro, the Fc-mutated engineered 5c8 antibody (D265A substitution in IgG1) that does not bind the FcYRIIa receptor does not activate platelets (Xie et al., J Immunol 192:4083-4092, 2014).
Антитела к CD154, имеющие нарушенное связывание по меньшей мере с FcYRIIa и имеющие сниженные эффекторные функции, таким образом, могут быть более приемлемым терапевтическим средством со сниженным риском развития TE.Anti-CD154 antibodies having impaired binding to at least FcYRIIa and having reduced effector functions may thus be a more acceptable therapeutic agent with a reduced risk of developing TE.
С этой целью были получены антитела к CD154 с заглушенной эффекторной функцией, имеющие различные замены в Fc, и протестированы в плане влияния на активацию тромбоцитов.To this end, anti-CD154 antibodies with silted effector function were obtained, having various substitutions in Fc, and tested in terms of their effect on platelet activation.
VH и VL гуманизированного антитела 5c8 (Karpusas et al., Structure 9: 321-329, 2001) клонировали в форме IgG1sigma/K, IgG1sigmaYTE/K, IgG2sigma/K или IgG2sigmaYTE/K с целью оценки влияния Fc на активацию тромбоцитов; полученные антитела были названы 5c8IgG1sigma, 5c8IgG1sigmaYTE, 5c8IgG2sigma и 5c8IgG2sigmaYTE). IgG1sigma содержит замены L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S и P331S по сравнению с IgG1 дикого типа. IgG1sigmaYTE содержит замены L234A, L235A, G237A, P238S, M252Y, S254T, Т256Е H268A, A330S и P331S. IgG2sigma содержит замены V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S и P331S. IgG2sigmaYTE содержит замены V234A, G237A, P238S, M252Y, S254T, T256E, H268A, V309L, A330S и P331S. Нумерация остатков соответствует индексу EU. У антител с каркасом IgG2sigma отсутствуют эффекторные функции и связывание с FcYR, что описано в патенте США № 8,961,967. Замена YTE (M252Y, S254T, T256E) описана в Dall'Acqua et al., J Biol Chem 281:23514-24, 2006.The VH and VL of the humanized 5c8 antibody (Karpusas et al., Structure 9: 321-329, 2001) were cloned as IgG1sigma/K, IgG1sigmaYTE/K, IgG2sigma/K, or IgG2sigmaYTE/K to evaluate the effect of Fc on platelet activation; the resulting antibodies were named 5c8IgG1sigma, 5c8IgG1sigmaYTE, 5c8IgG2sigma and 5c8IgG2sigmaYTE). IgG1sigma contains substitutions L234A, L235A, G237A, P238S, H268A, A330S and P331S compared to wild-type IgG1. IgG1sigmaYTE contains substitutions L234A, L235A, G237A, P238S, M252Y, S254T, T256E H268A, A330S and P331S. IgG2sigma contains substitutions V234A, G237A, P238S, H268A, V309L, A330S and P331S. IgG2sigmaYTE contains substitutions V234A, G237A, P238S, M252Y, S254T, T256E, H268A, V309L, A330S and P331S. The numbering of residues corresponds to the EU index. IgG2sigma backbone antibodies lack effector functions and FcYR binding as described in US Pat. No. 8,961,967. The YTE substitution (M252Y, S254T, T256E) is described in Dall'Acqua et al., J Biol Chem 281:23514-24, 2006.
Домены VH и VL гуманизированного 5c8 описаны в SEQ ID NO: 74 и 75, соответственно.The VH and VL domains of humanized 5c8 are described in SEQ ID NOs: 74 and 75, respectively.
SEQ ID NO: 74SEQ ID NO: 74
QVQLVQSGAEWKPGASVKLSCKASGYIFTSYYMYWVKQAPGQGLEWIGEINPSNGDTNQVQLVQSGAEWKPGASVKLSCKASGYIFTSYYMYWVKQAPGQGLEWIGEINPSNGDTN
FNEKFKSKATLTVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCTRSDGRNDMDSWGQGTLVTVSSFNEKFKSKATLTVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCTRSDGRNDMDSWGQGTLVTVSS
SEQ ID NO: 75SEQ ID NO: 75
DIVLTQSPATLSVSPGERATISCRASQRVSSSTYSYMHWYQQKPGQPPKLLIKYASNLEDIVLTQSPATLSVSPGERATISCRASQRVSSSTYSYMHWYQQKPGQPPKLLIKYASNLE
SGVPARFSGSGSGTDFTLTISSVEPEDFATYYCQHSWEIPPTFGGGTKLEIKSGVPARFSGSGSGTDFTLTISSVEPEDFATYYCQHSWEIPPTFGGGTKLEIK
- 42 040943- 42 040943
5c8IgG1sigma, 5c8IgG1sigmaYTE, 5c8IgG2sigma и 5c8IgG2sigmaYTE исследовали на предмет влияния на активацию тромбоцитов.5c8IgG1sigma, 5c8IgG1sigmaYTE, 5c8IgG2sigma and 5c8IgG2sigmaYTE were studied for effects on platelet activation.
Использовали кровь здоровых людей-доноров, прошедших предварительный скрининг по низкому ответу только на shCD154. Активацию тромбоцитов исследовали методом проточной цитометрии с использованием валидированных маркеров активации тромбоцитов PAC-1 (активированный GPIIb/IIIa) и CD62p (P-селектин). Вкратце, цельную кровь (WB) добавляли в модифицированный буферный раствор Tyrodes-HEPES, содержащий 1 мМ CaCl2, и к смеси добавляли антитела к PAC1 и к CD62p с блокирующим FcYRIIa антителом или без такового (клон IV.3, StemCell Technologies, № 60012), после чего инкубировали ее в течение 25 минут. К смеси добавляли предварительно сформированные иммунные комплексы растворимого CD154 (PeproTech, кат. № 310-02; SEQ ID NO: 4 или Tonbo Biosciences, кат. № 217088) /антитела с молярным соотношением CD154 и антитела к CD154 3: 1 и инкубировали еще 20 минут; тромбоциты фиксировали в 1% формалине, после чего проводили анализ FACS. Активацию тромбоцитов для каждого условия оценивали как % долю отобранных тромбоцитов (CD61-положительных событий), экспрессирующих PAC-1 и CD62p; для каждого условия обработки фиксировали и анализировали 5000 событий экспрессии CD61 (тромбоцитов). Результаты эксперимента показаны на фиг. 1. IC CD154/5c8IgG1 (IgG1 дикого типа) активировали тромбоциты, тогда как IC CD154 с 5c8-IgG1sigma, 5c8IgG1sigmaYTE, 5c8IgG2sigma и 5c8IgG2sigma-YTE не активировали тромбоциты. Активация тромбоцитов при помощи ADP не ингибировалась иммунными комплексами (данные не показаны). Ни одно из антител само по себе не активировало тромбоциты (данные не показаны).Blood from healthy human donors pre-screened for low response to shCD154 only was used. Platelet activation was studied by flow cytometry using validated platelet activation markers PAC-1 (activated GPIIb/IIIa) and CD62p (P-selectin). Briefly, whole blood (WB) was added to a modified Tyrodes-HEPES buffer solution containing 1 mM CaCl 2 , and anti-PAC1 and anti-CD62p antibodies with or without FcYRIIa blocking antibody (clone IV.3, StemCell Technologies, no. 60012) were added to the mixture. ), after which it was incubated for 25 minutes. Preformed immune complexes of soluble CD154 (PeproTech cat. no. 310-02; SEQ ID NO: 4 or Tonbo Biosciences cat. no. 217088)/antibody with a 3:1 molar ratio of CD154 and anti-CD154 antibody were added to the mixture and incubated for an additional 20 minutes; platelets were fixed in 1% formalin followed by FACS analysis. Platelet activation for each condition was assessed as the % proportion of selected platelets (CD61-positive events) expressing PAC-1 and CD62p; for each treatment condition, 5000 CD61 (platelet) expression events were recorded and analyzed. The results of the experiment are shown in Fig. 1. CD154/5c8IgG1 IC (wild-type IgG1) activated platelets, while CD154 IC with 5c8-IgG1sigma, 5c8IgG1sigmaYTE, 5c8IgG2sigma and 5c8IgG2sigma-YTE did not activate platelets. Platelet activation by ADP was not inhibited by immune complexes (data not shown). None of the antibodies alone activated platelets (data not shown).
Антитела к CD154 C4LB5, C4LB89, C4LB94, C4LB150, C4LB189, C4LB191, C4LB199 (все mAb IgG2sigma с заглушенной эффекторной функцией) также были протестированы в анализе активации тромбоцитов, чтобы подтвердить, что антитела утратили связывание с FcYRIIa и не активируют тромбоциты. На фиг. 2 показаны результаты эксперимента, демонстрирующие, что иммунные комплексы CD154 в комплексе с C4LB5, C4LB89, C4LB150, C4LB189, C4LB191 или C4LB199 не активировали тромбоциты. IC CD154/ C4LB94 индуцировали PAC-1 на тромбоцитах. Результаты демонстрируют, что антитела к CD154 с изотипами IgG1sigma, IgG1sigmaYTE, IgG2sigma или IgG2sigmaYTE в целом не могут активировать тромбоциты и, следовательно, могут иметь улучшенный профиль безопасности относительно антител на основе IgG1 дикого типа.Anti-CD154 antibodies C4LB5, C4LB89, C4LB94, C4LB150, C4LB189, C4LB191, C4LB199 (all IgG2sigma mAbs with silenced effector function) were also tested in a platelet activation assay to confirm that the antibodies had lost FcYRIIa binding and did not activate platelets. In FIG. 2 shows experimental results demonstrating that CD154 immune complexes complexed with C4LB5, C4LB89, C4LB150, C4LB189, C4LB191, or C4LB199 did not activate platelets. IC CD154/C4LB94 induced PAC-1 on platelets. The results demonstrate that anti-CD154 antibodies with IgG1sigma, IgG1sigmaYTE, IgG2sigma or IgG2sigmaYTE isotypes generally cannot activate platelets and therefore may have an improved safety profile relative to wild-type IgG1 antibodies.
Пример 7. Влияние переключения изотипа на свойства антител.Example 7 Effect of Isotype Switching on Antibody Properties.
Вариабельные области антитела C4LB89 клонировали в форме изотипов IgG1sigma/K и IgG1sigmaYTE для оценки возможных отличий по функциональности и возможностей для разработки. Новые антитела были названы C4LB231 (IgG1sigma) и C4LB232 (IgG1sigmaYTE).The variable regions of the C4LB89 antibody were cloned as IgG1sigma/K and IgG1sigmaYTE isotypes to evaluate potential differences in functionality and opportunities for development. The new antibodies were named C4LB231 (IgG1sigma) and C4LB232 (IgG1sigmaYTE).
Полученные антитела IgG1sigma и IgG1sigmaYTE сравнивали с родительским антителом по функциональности. Антитела C4LB231 и C4LB232 были сопоставимы по функциям с родительским C4LB89. В табл. 15 показаны значения IC50 или диапазон значений IC50 для каждого антитела в функциональных анализах, показанных в таблице. Диапазон IC50 в таблице представляет собой наименьшее и наибольшее значение IC50, полученное в экспериментах по 2-4 донорам в 1-6 повторах. Единственное значение IC50 в таблице указывает на наличие одного достоверного значения IC50.The resulting IgG1sigma and IgG1sigmaYTE antibodies were compared with the parent antibody in terms of functionality. Antibodies C4LB231 and C4LB232 were comparable in function to the parental C4LB89. In table. 15 shows the IC50 values or range of IC50 values for each antibody in the functional assays shown in the table. The IC 50 range in the table represents the smallest and largest IC 50 values obtained from experiments with 2-4 donors in 1-6 replicates. A single IC 50 value in the table indicates the presence of one valid IC 50 value.
Таблица 15Table 15
C4LB231 и C4LB232 также были протестированы в плане их влияния на тромбоциты. Ни IC shCD154:C4LB231, ни IC shCD154:C4LB232 не активировали тромбоциты в сравнении с исходным уровнем. IC CD154/5c8IgG1 активировал тромбоциты и активация блокировалась в присутствии IV.3, иC4LB231 and C4LB232 have also been tested for their effects on platelets. Neither IC shCD154:C4LB231 nor IC shCD154:C4LB232 activated platelets from baseline. IC CD154/5c8IgG1 activated platelets and activation was blocked in the presence of IV.3, and
- 43 040943 это показывает, что активация тромбоцитов опосредована связыванием IC с FcyRIIa. На фиг. 3 показаны результаты эксперимента.- 43 040943 this shows that platelet activation is mediated by IC binding to FcyRIIa. In FIG. 3 shows the results of the experiment.
Пример 8. Антитела к CD154 связывают человеческий CD154 с высокой аффинностью.Example 8 Anti-CD154 antibodies bind human CD154 with high affinity.
Измерения аффинности проводили с использованием ProteOn, как описано в примере 1. Значения скорости ассоциации, скорости диссоциации и аффинности показаны в табл. 16. Параметры, приведенные в данной таблице, получены на модели связывания Ленгмюра 1: 1 для всех образцов, за исключением C4LB94 и C4LB150, которые аппроксимировали моделью связывания с двумя состояниями.Affinity measurements were performed using ProteOn as described in Example 1. Association rate, dissociation rate, and affinity values are shown in Table 1. 16. The parameters shown in this table are derived from a 1:1 Langmuir binding model for all samples except C4LB94 and C4LB150, which are approximated by a two-state binding model.
Таблица 16Table 16
Пример 9. Кристаллическая структура CD154 игрунки в комплексе с C4LB89.Example 9 Crystal structure of marmoset CD154 complexed with C4LB89.
Эпитоп антитела C4LB89 определяли с помощью рентгенокристаллографии. Имеющий His-метку Fab-фрагмент C4LB89 и имеющую His-метку растворимую форму CD40L игрунки (smCD154-his) экспрессировали в клетках HEK293 GnTI и очищали с использованием аффинной хроматографии и гельфильтрационной хроматографии. Комплекс smCD154:C4LB89 инкубировали в течение ночи при 4°C, концентрировали и отделяли с помощью гель-фильтрационной хроматографии. Комплекс кристаллизовали из раствора, содержащего 16% PEG 3350, 0,2 М цитрата аммония, 0,1 М MES, pH 6,5, методом диффузии паров. Кристаллы принадлежали к кубической пространственной группе P2i3 с размером элементарной ячейки 162,1 А. Структуру комплекса определяли методом молекулярного замещения с использованием в качестве поисковых моделей кристаллических структур C4LB89 Fab и CD40L (идентификатор входа в PDB - 1ALY).The epitope of the C4LB89 antibody was determined by X-ray crystallography. His-tagged C4LB89 Fab fragment and His-tagged soluble marmoset CD40L form (smCD154-his) were expressed in HEK293 GnTI cells and purified using affinity chromatography and size exclusion chromatography. The smCD154:C4LB89 complex was incubated overnight at 4°C, concentrated and separated by size exclusion chromatography. The complex was crystallized from a solution containing 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate, 0.1 M MES, pH 6.5 by vapor diffusion. The crystals belonged to the cubic space group P2i3 with a unit cell size of 162.1 A. The structure of the complex was determined by the molecular substitution method using C4LB89 Fab and CD40L crystal structures as search models (PDB entry identifier 1ALY).
Комплекс smCD154:C4LB89 представляет собой симметричный тример, расположенный на кристаллографической оси симметрии 3-го порядка. C4LB89 связывает mCD154 на границе между двумя субъединицами в эпитопе, дистальном от клеточной поверхности. Эпитоп содержит 16 остатков, по 8 от каждой из двух субъединиц CD154. Эпитопными остатками являются E182, S185, Q186, A187, P188, S214, A215 и R207 в первой субъединице CD154 и T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250 и F253 во второй субъединице CD154. Нумерация остатков эпитопа соответствует полноразмерному человеческому CD154 с SEQ ID NO: 1. Паратоп определяется как остатки антитела, находящиеся в пределах 4 А от остатков CD154. Паратоп C4LB89 включает в себя 9 остатков из тяжелой цепи C4LB89: S31 и Y32 из HCDR1, S52, I54, F55 и N57 из HCDR2 и R100, Y101 и Y102 из HCDR3. Нумерация остатков паратопа соответствует VH C4LB89 с SEQ ID NO: 59. Легкая цепь не участвует в контактах с mCD154. Учитывая количество контактов, F55 в HCDR2 является ключевым элементом для распознавания антигена. F55 образует контакт с остатками CD154 T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250 и F253. Остатки HCDR3 Y101 и Y102 также участвуют в связывании. На фиг. 4 показаны контактные остатки HCDR2 и HCDR3 и отсутствие связывания LC с CD154. На фиг. 5 показаны в виде рисунка остатки эпитопа и паратопа.The smCD154:C4LB89 complex is a symmetrical trimer located on the 3rd order crystallographic symmetry axis. C4LB89 binds mCD154 at the interface between the two subunits at an epitope distal to the cell surface. The epitope contains 16 residues, 8 from each of the two CD154 subunits. The epitopic residues are E182, S185, Q186, A187, P188, S214, A215 and R207 in the first subunit of CD154 and T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250 and F253 in the second subunit of CD154. Epitope residue numbering corresponds to full-length human CD154 of SEQ ID NO: 1. A paratope is defined as antibody residues within 4 A of CD154 residues. The C4LB89 paratope includes 9 residues from the C4LB89 heavy chain: S31 and Y32 from HCDR1, S52, I54, F55 and N57 from HCDR2 and R100, Y101 and Y102 from HCDR3. The numbering of the paratope residues corresponds to VH C4LB89 with SEQ ID NO: 59. The light chain is not involved in contacts with mCD154. Given the number of contacts, F55 in HCDR2 is a key element for antigen recognition. F55 makes contact with CD154 residues T176, F177, C178, Q220, S248, H249, G250 and F253. HCDR3 residues Y101 and Y102 are also involved in binding. In FIG. 4 shows contact residues of HCDR2 and HCDR3 and no LC binding to CD154. In FIG. 5 shows in drawing the remains of an epitope and a paratope.
Растворимые белки CD154 человека и игрунки отличаются всего на 8 аминокислотных остатков. Все эпитопные остатки mCD154 C4LB89 у человека являются консервативными. Следовательно, ожидается, что эпитоп будет консервативным при сравнении CD154 человека и игрунки. Выравнивание полноразмерных белков CD154 человека и игрунки показано на фиг. 6.The soluble CD154 proteins of humans and marmosets differ by only 8 amino acid residues. All human mCD154 C4LB89 epitope residues are conserved. Therefore, the epitope is expected to be conservative when comparing human and marmoset CD154. The alignment of full-length human and marmoset CD154 proteins is shown in FIG. 6.
Пример 10. Активация тромбоцитов антителами к CD154 зависит от эпитопа.Example 10 Platelet activation by anti-CD154 antibodies is epitope dependent.
Вариабельные области C4LB89 (VH с SEQ ID NO: 59 и VL с SEQ ID NO: 66) клонировали в форме IgG1/K, получив антитело C4LB237. Было подтверждено, что C4LB237 сохраняет связывание человеческого CD154 (табл. 17) по данным измерений с использованием ProteOn, как описано в примере 1. Аффинность C4LB237 к человеческому CD154 составляла 23,6 ± 5,4 пМ. Оказалось, что переключение изотипа VH/VL, полученных от C4LB89, с IgG2sigma на IgG1 изменяло аффинность связывания полученных антител.The C4LB89 variable regions (VH of SEQ ID NO: 59 and VL of SEQ ID NO: 66) were cloned as IgG1/K to give the C4LB237 antibody. C4LB237 was confirmed to retain binding to human CD154 (Table 17) as measured using ProteOn as described in Example 1. The affinity of C4LB237 for human CD154 was 23.6 ± 5.4 pM. It turned out that switching the isotype of VH/VL derived from C4LB89 from IgG2sigma to IgG1 changed the binding affinity of the resulting antibodies.
Как и ожидалось, C4LB237 связывало человеческий FcyRIIa и FcyRIIIa с KD 0,994 мкМ и 0,146 мкМ, соответственно. C4LB237 показало активность, сходную с C4LB231, и более высокую, чем C4LB89 в анализах гена-репортера NF-KB SEAP, если для индукции сигнализации использовали shCD154-his (табл. 18).As expected, C4LB237 bound human FcyRIIa and FcyRIIIa with KDs of 0.994 μM and 0.146 μM, respectively. C4LB237 showed activity similar to C4LB231 and higher than C4LB89 in NF-KB SEAP reporter gene assays when shCD154-his was used to induce signaling (Table 18).
C4LB237 тестировали на предмет влияния на активацию тромбоцитов. IC shCD154:C4LB237 не активировали тромбоциты выше исходного уровня, что показано на фиг. 7. Этот результат свидетельствует, что помимо Fc, на способность антитела или ее отсутствие в отношении активации тромбоцитов влияет эпитоп антитела.C4LB237 was tested for an effect on platelet activation. IC shCD154:C4LB237 did not activate platelets above baseline as shown in FIG. 7. This result indicates that in addition to Fc, the ability of the antibody, or lack of it, to activate platelets is affected by the epitope of the antibody.
- 44 040943- 44 040943
Таблица 17Table 17
Таблица 18Table 18
Пример 11. Введение нейтральных мутаций в C4LB89.Example 11 Introduction of neutral mutations in C4LB89.
Анализы кристаллической структуры C4LB89 в комплексе с CD 154 выявили положения в CDR C4LB89, которые можно подвергать мутации без влияния на общую структуру комплекса и от которых, следовательно, можно ожидать отсутствия влияния на свойства антитела C4LB89. Эти нейтральные мутации в CDR легкой цепи перечислены в табл. 19, а нейтральные мутации в CDR тяжелой цепи - в табл. 20. Нумерация остатков, которые можно подвергать мутации, показана как на отдельных CDR, так и на VL или VH. Например, остаток Q4 в LCDR1 с SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN) можно мутировать в А, С, D, Е, F, G, Η, I, К, L, Μ, N, R, S, Τ, V, W или Y, и ожидать, что характеристики антитела по существу не изменятся. Соответствующий остаток в VL с SEQ ID NO: 66 представляет собой Q27.Crystal structure analyzes of C4LB89 complexed with CD 154 revealed positions in the CDR of C4LB89 that could be mutated without affecting the overall structure of the complex and would therefore not be expected to affect the properties of the C4LB89 antibody. These neutral mutations in the light chain CDRs are listed in Table 1. 19, and neutral mutations in the CDR of the heavy chain - in table. 20. The numbering of residues that can be mutated is shown both on individual CDRs and on VL or VH. For example, the Q4 residue in LCDR1 with SEQ ID NO: 37 (RASQSISSYLN) can be mutated into A, C, D, E, F, G, Η, I, K, L, Μ, N, R, S, Τ, V, W or Y, and expect that the characteristics of the antibody will not change substantially. The corresponding residue in VL of SEQ ID NO: 66 is Q27.
Мутации, показанные в табл. 19 или табл. 20, выполнены в C4LB89 по одиночке или в комбинации с использованием стандартных способов. Экспрессировали полученные пары VH/VL, а мутировшие антитела выделяли и определяли их характеристики с использованием способов, описанных в настоящем документе.Mutations shown in Table. 19 or tab. 20 are made in C4LB89 singly or in combination using standard methods. The resulting VH/VL pairs were expressed, and mutated antibodies were isolated and characterized using the methods described herein.
Таблица 19Table 19
-45040943-45040943
Таблица 20Table 20
Пример 12. Оценка активации тромбоцитов и формирование иммунного комплекса высшего порядка.Example 12 Evaluation of Platelet Activation and Higher Order Immune Complex Formation.
При оценке данных по кристаллической структуре комплекса области Fab и shCD154 для более ранних экспериментов с C4LB231 и 5C8IgG1 при помощи гель-фильтрационной высокоэффективной жидкостной хроматографии (ГФ-ВЭЖХ) и динамического светорассеяния (DLS), а также изучения данных об активации тромбоцитов, была выдвинута гипотеза, что небольшие отличия в связывании антител к CD154 с тримером shCD154 могут облегчать формирование иммунного комплекса высшего порядка: 1) Fab C4LB231 связывается между 2 субъединицами тримера sCD154, a Fab 5C8 связывает 1 субъединицу SCD154, 2) Fab C4LB231 оказывается более жестким в такой конформации, чем Fab 5c8 3) и угол связывания антитела к CD154 с SCD154.When evaluating the crystal structure data of the Fab region and shCD154 region complex for earlier experiments with C4LB231 and 5C8IgG1 using gel filtration high performance liquid chromatography (GP-HPLC) and dynamic light scattering (DLS), as well as studying data on platelet activation, a hypothesis was put forward that small differences in the binding of anti-CD154 antibodies to the shCD154 trimer may facilitate the formation of a higher order immune complex: 1) Fab C4LB231 binds between 2 subunits of the sCD154 trimer, and Fab 5C8 binds 1 subunit of SCD154, 2) Fab C4LB231 is more rigid in this conformation, than Fab 5c8 3) and the binding angle of anti-CD154 antibody to SCD154.
Чтобы дополнительно оценить роль эпитопа антитела, опосредующего активацию тромбоцитов и образование иммунного комплекса высшего порядка с shCD154, VH и VL различных антител к CD154 клонировали и экспрессировали в виде изотипов IgG2sigma и IgG1sigma с заглушенным Fc, или в виде IgG1. Созданные антитела представлены в табл. 21. Анализы активации тромбоцитов проводили, как описано в примере 6. Для проведения оценок при формировании иммунного комплекса высшего порядка методом гель-фильтрационной высокоэффективной жидкостной хроматографии (ГФ-ВЭЖХ) и динамического светорассеяния (DLS) получали комплексы антител с shCD154 в молярных соотношениях 1: 1 (также именуемом 10: 10) и 10: 1 с целью выявления наличия зависимых от концентрации различий при образовании иммунных комплексов.To further evaluate the role of the antibody epitope mediating platelet activation and higher order immune complex formation with shCD154, VH and VL of various anti-CD154 antibodies were cloned and expressed as Fc-muted IgG2sigma and IgG1sigma isotypes or as IgG1. Created antibodies are presented in table. 21. Platelet activation assays were performed as described in Example 6. For evaluations in higher order immune complex formation, gel filtration high performance liquid chromatography (GP-HPLC) and dynamic light scattering (DLS) methods were used to obtain complexes of antibodies with shCD154 in molar ratios of 1: 1 (also referred to as 10:10) and 10:1 in order to detect the presence of concentration-dependent differences in the formation of immune complexes.
Таблица 21Table 21
- 46 040943- 46 040943
SEQ ID NO: 84 VH C4LB119SEQ ID NO: 84 VH C4LB119
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYYISWVRQAPGQGLEWMGAIDPYFGYANQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYYISWVRQAPGQGLEWMGAIDPYFGYAN
YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARTGLNYGGFDYWGQGTLVTVSSYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARTGLNYGGFDYWGQGTLVTVSS
SEQ ID NO: 85 VL C4LB119SEQ ID NO: 85 VL C4LB119
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPEIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIP
ARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPLTFGQGTKVEIKARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPLTFGQGTKVEIK
SEQ ID NO: 86 VH C4LB83SEQ ID NO: 86 VH C4LB83
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMGWIIPIFGNTNQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMGWIIPIFGNTN
YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAREKDFRGYTKLDYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO: 87 VL C4LB83YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAREKDFRGYTKLDYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO: 87 VL C4LB83
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSINNWLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSINNWLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVP
SRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSFSFPYTFGQGTKVEIKSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSFSFPYTFGQGTKVEIK
Для C4LB83 и C4LB119 характеристики связывания и функциональность оценивали с использованием протоколов, описанных в примере 1, а данные показаны в табл. 22.For C4LB83 and C4LB119 binding characteristics and functionality were evaluated using the protocols described in example 1, and the data are shown in table. 22.
Таблица 22Table 22
Способы ГФ-ВЭЖХ.Methods GF-HPLC.
Иммунные комплексы антител, указанных в табл. 21, и меченного Alexafluo-448 shCD154 готовили в молярном соотношении антитела и shCD154 1: 1 и 10: 1 в 110 мкл 1x PBS и инкубировали при 37°C в течение 30 мин. Для каждого прогона в колонку (Agilent, система 1100/1200) вводили по 100 мкл каждого образца, содержащего 5 мкг меченного AF488 shCD154 и 15 мкг (соотношение 1: 1) или 150 мкг (соотношение 10: 1) mAb к CD154. Молекулярную массу определяли на основе времени удерживания стандартов (Bio-Rad). Взаимоотношение между молекулярной массой и временем удерживания белка удовлетворяет следующему уравнению:Immune complexes of the antibodies indicated in table. 21 and Alexafluo-448 labeled shCD154 were prepared in 1:1 and 10:1 molar ratios of antibody and shCD154 in 110 µl of 1x PBS and incubated at 37°C for 30 min. For each run, 100 μl of each sample containing 5 μg of AF488 labeled shCD154 and 15 μg (1:1 ratio) or 150 μg (10:1 ratio) of anti-CD154 mAb was injected into the column (Agilent, 1100/1200 system). Molecular weight was determined based on the retention time of the standards (Bio-Rad). The relationship between molecular weight and protein retention time satisfies the following equation:
log (М) —Ь - с Т, где M - молекулярная масса, T - время удерживания, а b и c - константы. Линейную кривую зависимости log(M) от T получали по ГФ-ВЭЖХ хроматограмме стандартов с аппроксимацией методом наименьших квадратов с R2=0,9928.log (M) - b - c T, where M is the molecular weight, T is the retention time, and b and c are constants. A linear curve of log(M) versus T was obtained from the GP-HPLC chromatogram of the standards with a least squares fit with R 2 =0.9928.
DLS.DLS.
Измерение методом DLS основано на принципах светорассеяния и молекулярного или броуновского движения. Броуновское движение, характерное движение молекул в растворе, вызывает рассеивание света как по фазе, так и вне фазы, что приводит к усиливающей и ослабляющей интерференции. Результатом является то, что интенсивность рассеянного света колеблется со временем. При анализе DLS или QELS (квазиэлектрическое светорассеяние) эта зависящая от времени флуктуация интенсивности рассеянного света захватывается быстрым счетчиком фотонов. Флуктуации прямо пропорциональны скорости диффузии. Решение для корреляционных данных с использованием уравнения Стокса - Эйнштейна дает гидродинамический радиус. В отличие от методов гель-фильрационной хроматографии-многоуглового светорассеяния (SEC-MALS) или SEC, где степень различения образца позволяет различать мономер и димер, DLS позволяет различать только вещества, отличающиеся размерным коэффициентом ~ 4, и, следовательно, различение начнется с мономера и тетрамера; хотя мономер и димер неразличимы, будет определено средневзвешенное значение для смеси.DLS measurement is based on the principles of light scattering and molecular or Brownian motion. Brownian motion, the characteristic motion of molecules in solution, causes light to scatter both in and out of phase, resulting in amplifying and attenuating interference. The result is that the scattered light intensity fluctuates with time. In DLS or QELS (Quasi-Electric Light Scattering) analysis, this time-dependent fluctuation in scattered light intensity is captured by a fast photon counter. The fluctuations are directly proportional to the diffusion rate. Solving the correlation data using the Stokes-Einstein equation gives the hydrodynamic radius. Unlike SEC-MALS or SEC methods, where the degree of sample discrimination allows distinguishing between monomer and dimer, DLS only distinguishes substances that differ by a size factor of ~4, and therefore discrimination will start from the monomer and tetramer; although monomer and dimer are indistinguishable, a weighted average of the mixture will be determined.
Уравнение Стокса - Эйнштейна: Rh=kT/ 6πηϋ;Stokes - Einstein equation: R h=kT/ 6πηϋ;
где D=коэффициент диффузии, k=константа Больцмана,where D=diffusion coefficient, k=Boltzmann constant,
T=температура,T=temperature,
П=вязкость.P=viscosity.
Отдельные антитела в концентрации 10 мкМ или иммунные комплексы антител, показанных в табл. 21, и shCD154 готовили в молярных концентрациях антитела и shCD154 10: 1 или 10: 10 (10 мкМ антитела либо на 1 мкМ, либо на 10 мкМ shCD154) в PBS. Все образцы готовили в стеклянных флаконах со вставками во флакон (250 мкл дезактивированное стекло с полимерной лапкой, Agilent кат. № 5181-8872) и образцы добавляли в следующем порядке: PBS, mAb, shCD154. Образцы перемешивали путем осторожного встряхивания при КТ, с качанием (Nutating Mixer (VWR) ~ 30 об/мин в течение приблизительно 23 ч. При необходимости антитела сначала концентрировали стандартными способами.Individual antibodies at a concentration of 10 μm or immune complexes of the antibodies shown in table. 21 and shCD154 was prepared at 10:1 or 10:10 molar concentrations of antibody and shCD154 (10 μM antibody per 1 μM or 10 μM shCD154) in PBS. All samples were prepared in glass vials with vial inserts (250 μl deactivated glass with polymer foot, Agilent cat. no. 5181-8872) and the samples were added in the following order: PBS, mAb, shCD154. Samples were mixed by gentle shaking at RT, shaking (Nutating Mixer (VWR) ~ 30 rpm for approximately 23 hours. If necessary, antibodies were first concentrated by standard methods.
- 47 040943- 47 040943
Размер частиц и распределение вещества во всех образцах определяли на планшетном сканере DynaPro Plate Reader DLS (Wyatt Technologies Corporation) при 23°C. Достоверность DLS сначала валидировали при помощи BSA (данные не показаны). Измерения выполняли, вводя 30 мкл образца в каждую из 3 лунок (измерения в трех повторах). Измерения DLS проводили на планшетном сканере DynaPro. Выполняли двадцать 5-секундных считываний для каждого образца и прибор выполнял автоматическую корректировку мощности лазера. К параметрам, использованным при анализе данных, относились вязкость при 23°C для PBS, составившая 1,019 сП, и значение показателя преломления при 589 нм и 23°C для PBS, составившее 1,333. Программа использовала модель глобулярного белка. Сигналы объединялись в пики, где пик 1 составлял 0,1-10 нм, пик 2 составлял 10-100 нм, пик 3 составлял 100-1000 нм и пик 4 составлял 1000-5000 нм. Регистрировали видимые осадки в образце (если они образовывались). Анализ данных выполняли с использованием программного обеспечения Dynamics (Wyatt Technology Inc.). Строили графики зависимости процентного значения массы относительно радиуса частиц (Rh). Вычисляли и регистрировали пиковый радиус, полидисперсность, процентное значение массы и процентную интенсивность.The particle size and distribution of the substance in all samples was determined on a flatbed scanner DynaPro Plate Reader DLS (Wyatt Technologies Corporation) at 23°C. DLS validity was first validated with BSA (data not shown). Measurements were performed by injecting 30 μl of sample into each of 3 wells (triple measurements). DLS measurements were carried out on a DynaPro flatbed scanner. Twenty 5 second readings were taken for each sample and the instrument performed automatic laser power adjustments. The parameters used in data analysis were the viscosity at 23°C for PBS, which was 1.019 cP, and the value of the refractive index at 589 nm and 23°C for PBS, which was 1.333. The program used the globular protein model. The signals were combined into peaks where peak 1 was 0.1-10 nm, peak 2 was 10-100 nm, peak 3 was 100-1000 nm and peak 4 was 1000-5000 nm. Recorded visible precipitation in the sample (if any). Data analysis was performed using Dynamics software (Wyatt Technology Inc.). Build graphs of the percentage of the mass relative to the radius of the particles (Rh). Peak radius, polydispersity, weight percentage and intensity percentage were calculated and recorded.
Результаты. Активация тромбоцитов.Results. platelet activation.
Оценивали способность иммунных комплексов shCD154 и антител, экспрессированных в форме IgG2sigma или IgG1sigma с заглушенным Fc, или в форме IgG1 дикого типа, активировать тромбоциты. В качестве контроля использовали антитело 5c8, клонированное на разных каркасах IgG. На фиг. 3 показано, что иммунные комплексы 5c8IgG1:shCD154 активировали тромбоциты зависимым от FcyRIIa образом, поскольку антитело к FcyRIIa ингибировало опосредованную 5c8IgG1 активацию тромбоцитов. Области VH/VL 5c8, клонированные на в форме с заглушенным эффекторным Fc IgG1sigma или IgG2sigma, теряли способность активировать тромбоциты (фиг. 1). Такие результаты соответствуют описанным ранее. Однако неожиданно эксперименты, проведенные в примере 10, показали, что иммунные комплексы с антителом IgG1 дикого типа (C4LBB237:shCD154) не активировали тромбоциты (фиг. 7), что указывает на необходимость дальнейших исследований возможной зависимости активации тромбоцитов от эпитопа.The ability of shCD154 immune complexes and antibodies expressed as Fc-muted IgG2sigma or IgG1sigma or wild-type IgG1 to activate platelets was assessed. The 5c8 antibody cloned on different IgG scaffolds was used as a control. In FIG. 3 shows that the 5c8IgG1:shCD154 immune complexes activated platelets in an FcyRIIa-dependent manner, since the anti-FcyRIIa antibody inhibited 5c8IgG1-mediated platelet activation. The 5c8 VH/VL regions cloned in IgG1sigma or IgG2sigma effector Fc muted form lost their ability to activate platelets (FIG. 1). These results are consistent with those described earlier. Surprisingly, however, the experiments performed in Example 10 showed that immune complexes with the wild-type IgG1 antibody (C4LBB237:shCD154) did not activate platelets (FIG. 7), indicating the need for further research on the possible dependence of platelet activation on the epitope.
Области VH/VL 4 отдельных антител клонировали в форме IgG2sigma, IgG1sigma или IgG1 дикого типа, чтобы оценить влияние эпитопа и/или Fc на активацию тромбоцитов, а также на формирование иммунных комплексов высшего порядка. В противоположность данным, описанным ранее в литературе, было обнаружено, что активация тромбоцитов в некоторых случаях опосредовалась эпитопом антитела независимо от опосредованного FcyRIIa перекрестного связывания.The VH/VL regions of 4 individual antibodies were cloned as wild-type IgG2sigma, IgG1sigma or IgG1 to evaluate the effect of the epitope and/or Fc on platelet activation as well as higher order immune complex formation. In contrast to data previously described in the literature, it was found that platelet activation was in some cases mediated by the antibody epitope independently of FcyRIIa-mediated cross-linking.
На фиг. 8A, фиг. 8B и фиг. 8C представлены сводные данные анализов. Иммунные комплексы антител C4LB119 (фиг. 8A) и C4LB94 (фиг. 8B) с заглушенными Fc, активировали тромбоциты независимым от FcyRIIa способом, поскольку предварительное блокирование антителом к FcyRIIa не обеспечивало ингибирования активации тромбоцитов. IC C4LB83, также антителом с заглушенным Fc, умеренно активировал тромбоциты (фиг. 8C). IC антител с идентичными доменами VH/VL, клонированными на IgG1 дикого типа, в каждом случае активировал тромбоциты опосредованным FcyRIIa образом (C4LB278 на фиг. 8A, C4LB289 на фиг. 8B и C4LB288 на фиг. 8C). Таким образом, было выявлено несколько антител, опосредующих активацию тромбоцитов, несмотря на наличие заглушенного Fc. Было выявлено, что одна пара доменов VH/VL не опосредовала активацию тромбоцитов ни на заглушенном (C4LB231), ни на относящемся к IgG1 дикого типа (C4LB237). Эти данные демонстрируют, что эпитоп антитела играет определенную роль в опосредовании агрегации тромбоцитов.In FIG. 8A, FIG. 8B and FIG. 8C is a summary of the assays. Fc-mutated immune complexes of antibodies C4LB119 (FIG. 8A) and C4LB94 (FIG. 8B) activated platelets in an FcyRIIa-independent manner, since pre-blocking with anti-FcyRIIa did not inhibit platelet activation. IC C4LB83, also an Fc-muted antibody, moderately activated platelets (Fig. 8C). IC antibodies with identical VH/VL domains cloned on wild-type IgG1 activated platelets in an FcyRIIa-mediated manner in each case (C4LB278 in Fig. 8A, C4LB289 in Fig. 8B and C4LB288 in Fig. 8C). Thus, several antibodies have been identified that mediate platelet activation despite the presence of muted Fc. One VH/VL domain pair was found not to mediate platelet activation on either muted (C4LB231) or wild-type IgG1 (C4LB237). These data demonstrate that the antibody epitope plays a role in mediating platelet aggregation.
Формирование иммунного комплекса высшего порядка.Formation of the immune complex of a higher order.
Методы ГФ-ВЭЖХ и DLS использовали для дополнительной оценки наличия иммунных комплексов высшего порядка, и приблизительного размера этих иммунных комплексов для разных антител к CD154, представленных в табл. 21, и shCD154. Поскольку shCD154 в растворе представляет собой тример, ожидаемое стехиометрическое соотношение антитела и тримера shCD154 в растворе составляет 3: 1. В случае ГФ-ВЭЖХ более тяжелые и, следовательно, более большие иммунные комплексы должны иметь более короткое время удерживания, а более легкие и, следовательно, более мелкие иммунные комплексы должны иметь более длительные времена удерживания, за исключением очень больших иммунных комплексов, которые неспособны элюироваться из колонки и проявляются низким % извлечения. В случае DLS, чем больше значение радиуса (Rh), тем больше иммунный комплекс. Планшетные методики DLS не позволяют различать мономеры, димеры, тримеры и тетрамеры IgG. Таким образом, полученные значения Rh будут представлять собой средневзвешенное значение для мономера-тетрамера, следовательно, значения Rh, более близкие к 6,5 могут представлять собой растворы mAb, содержащие частицы высшего порядка, как правило, димер. Если связывание mAb с shCD154 является стехиометрическим, могут присутствовать два вида частиц - комплекс 3:1 (~ 500 кДа) и несвязанное антитело (~ 150 кДа), которые соответствуют значениям Rh ~ 8,8 нм и 5-6,5 нм для комплекса 3: 1 и свободного mAb, соответственно. Ни одна методика не может точно определять молекулярную массу иммунных комплексов, но возможно получение сравнительных размеров. В табл. 23 показана взаимосвязь времени удерживания и гидродинамических радиусов с приблизительными молекулярными массами.GP-HPLC and DLS methods were used to further evaluate the presence of higher order immune complexes and the approximate size of these immune complexes for various anti-CD154 antibodies shown in Table 1. 21, and shCD154. Since shCD154 in solution is a trimer, the expected stoichiometric ratio of antibody to shCD154 trimer in solution is 3:1. , smaller immune complexes should have longer retention times, except for very large immune complexes that are unable to elute from the column and show low % recovery. In the case of DLS, the larger the radius (Rh) value, the larger the immune complex. DLS plate techniques do not distinguish between IgG monomers, dimers, trimers, and tetramers. Thus, the resulting Rh values will be a weighted average of the monomer-tetramer, therefore Rh values closer to 6.5 may represent mAb solutions containing higher order particles, typically a dimer. If mAb binding to shCD154 is stoichiometric, two species of particles may be present - 3:1 complex (~500 kDa) and unbound antibody (~150 kDa), which correspond to Rh values of ~8.8 nm and 5-6.5 nm for the complex 3:1 and free mAb, respectively. No technique can accurately determine the molecular weight of immune complexes, but it is possible to obtain comparative sizes. In table. 23 shows the relationship between retention times and hydrodynamic radii with approximate molecular weights.
- 48 040943- 48 040943
Таблица 23Table 23
DLS.DLS.
Размеры mAb в отсутствие CD154 и иммунного комплекса антитело: shCD154 оценивали в условиях, в которых комплексы антитело: shCD154 формировались в избытке антитела (молярное соотношение 10: 1) и при эквивалентной концентрации (молярное соотношение 1: 1). В условиях избытка антитела, антитело обычно насыщает участки CD154 с образованием иммунного комплекса и присутствует избыток несвязавшегося антитела. При эквивалентной концентрации свободное антитело или свободный shCD154 отсутствует. Значения Rh, полученные для каждого mAb в отсутствие shCD154 и при наличии shCD154 при молярных соотношениях 10: 1 и 10: 10, представлены в табл. 24.mAb sizes in the absence of CD154 and antibody:shCD154 immune complex were evaluated under conditions where antibody:shCD154 complexes were formed in excess antibody (10:1 molar ratio) and at an equivalent concentration (1:1 molar ratio). Under conditions of excess antibody, the antibody typically saturates regions of CD154 to form an immune complex, and there is an excess of unbound antibody. At an equivalent concentration, there is no free antibody or free shCD154. The Rh values obtained for each mAb in the absence of shCD154 and in the presence of shCD154 at molar ratios of 10:1 and 10:10 are shown in Table 1. 24.
Типичное mAb с номинальной ММ 150 кДа дает значение Rh 5,0-6,5 нм. Димеры IgG, часто наблюдаемые при гель-фильтрационной хроматографии, нельзя различать методиками планшетного DLS. Полученные значения Rh будут представлять собой средневзвешенное значение мономера-тетрамера, следовательно, значения Rh, более близкие к 6,5, могут представлять собой растворы mAb, содержащие частицу высшего порядка, как правило, димер.A typical mAb with a nominal MM of 150 kDa gives an Rh value of 5.0-6.5 nm. IgG dimers, often seen in size exclusion chromatography, cannot be distinguished by plate DLS techniques. The resulting Rh values will be a weighted average of the monomer-tetramer, therefore Rh values closer to 6.5 may represent mAb solutions containing a higher order particle, typically a dimer.
Для mAb в отсутствие CD154 наблюдали ожидаемые значения Rh 5,5-6,3 нм для всех mAb, за исключением C4LB287 и C4LB234, для которых значения Rh составили 6,9, и 7,1 нм, соответственно, и это предполагает, что эти антитела имеют внутренне присущие тенденции к агрегации.For mAbs in the absence of CD154, expected R h values of 5.5-6.3 nm were observed for all mAbs except for C4LB287 and C4LB234, for which R h values were 6.9 and 7.1 nm, respectively, suggesting that these antibodies have intrinsic tendencies to aggregate.
Значения Rh для комплексов антитело:shCDl54, образованных при соотношении 10: 1, были по существу менее около 8,8 нм, что указывает на образование стехиометрического комплекса 3: 1 без образования иммунных комплексов высшего порядка, за исключением 5c8IgG2sigma (C4LB71) и C4LB234 (значения Rh составили 8,9 и 9,3 нм, соответственно), что указывает на образование иммунных комплексов высшего порядка.Rh values for antibody:shCDl54 complexes formed at a ratio of 10:1 were substantially less than about 8.8 nm, indicating formation of a 3:1 stoichiometric complex with no higher order immune complex formation except for 5c8IgG2sigma (C4LB71) and C4LB234 ( the R h values were 8.9 and 9.3 nm, respectively), indicating the formation of higher order immune complexes.
Увеличение концентрации shCD154 до 10 мкМ приводило к появлению иммунных комплексов антитело: shCD154 с увеличенными Rh по сравнению с комплексами с 1 мкМ CD154 (соотношение антитела и CD154 составляло 10: 1). Некоторые комплексы антитело: shCD154 демонстрировали гетерогенность с присутствием вторичных частиц высокой молекулярной массы, в диапазоне от 7-25% от общей массы. Для IC C4LB71, 5C8IgG1, C4LB89, C4LB119, C4LB94, C4LB234 и C4LB289 значения Rh составляли 22,1, 615, 56,3, 45,0, 18,3, 18,7 и 19,6 нм, соответственно. Кроме этого, C4LB89, C4LB119, C4LB83, C4LB228 также формировали частицы 900-4000 нм, a C4LB89 и C4LB119 формировали преципитаты, указывающие на образование очень больших иммунных комплексов. Частицы с Rh около 12 нм обычно соответствуют массе ~ 1000 кДа, следовательно, эти mAb при этих условиях формируют очень большие иммунные комплексы с CD154.Increasing the concentration of shCD154 to 10 μM led to the appearance of antibody:shCD154 immune complexes with increased Rh compared to complexes with 1 μM CD154 (antibody to CD154 ratio was 10:1). Some antibody:shCD154 complexes showed heterogeneity with the presence of high molecular weight secondary particles ranging from 7-25% of the total weight. For C4LB71, 5C8IgG1, C4LB89, C4LB119, C4LB94, C4LB234, and C4LB289 ICs, the Rh values were 22.1, 615, 56.3, 45.0, 18.3, 18.7, and 19.6 nm, respectively. In addition, C4LB89, C4LB119, C4LB83, C4LB228 also formed 900-4000 nm particles, and C4LB89 and C4LB119 formed precipitates indicating the formation of very large immune complexes. Particles with Rh around 12 nm typically correspond to a mass of ~1000 kDa, hence these mAbs form very large immune complexes with CD154 under these conditions.
Таблица 24Table 24
- 49 040943- 49 040943
ГФ-ВЭЖХ.GF-HPLC.
В табл. 25 представлено время удерживания, доля извлечения и оценочная молекулярная масса (ММ) антител к CD 154 отдельно или в иммунном комплексе с shCD154 по данным анализа ГФ-ВЭЖХ. Типичное антитело имело ММ около 150 кДа, а тример shCD154 имел ММ около 50 кДа. Следовательно, комплекс mAb: тример shCD154 со стехиометрическим отношением 3: 1 имеет ожидаемую ММ около 500 кДа.In table. 25 shows the retention time, recovery rate, and estimated molecular weight (MW) of anti-CD154 antibodies alone or in immune complex with shCD154 as determined by GP-HPLC analysis. A typical antibody had an MM of about 150 kDa, and the shCD154 trimer had an MM of about 50 kDa. Therefore, the mAb:shCD154 trimer complex with a 3:1 stoichiometric ratio has an expected MW of about 500 kDa.
Таблица 25Table 25
*(гпАЬ: CD154) “Степень извлечения < 50%*(rnAb: CD154) “Recovery < 50%
Антитела с идентичными VH/VL разбиты на группы, разделенные пустыми строкамиAntibodies with identical VH/VL are divided into groups separated by blank lines
IgG2a: IgG2sigmaIgG2a: IgG2sigma
IgGla: IgGlsigmaIgGla: IgGlsigma
Все антитела формировали иммунный комплекс с shCD154. C4LB231, C4LB237, C4LB290, C4LB287 (все IgGlsigma) формировали иммунный комплекс с SCD154 и элюировались на 7,0 мин. Однако C4LB290 и C4LB287 имели более низкий % извлечения в условиях 1: 1 по сравнению с условиями 10: 1, тогда как C4LB231 и C4LB237 имели более высокий % извлечения (> 80%). C4LB289 (IgGl), C4LB234 (IgGlsigma), 5c8IgGlsigma (C4LB71) и C4LBB94 (IgG2sigma) элюировались раньше, на 6,2-6,5 мин, что указывает на образование вышеупомянутыми mAb более больших комплексов. 5c8IgGl имело более широкий пик на ожидаемом времени удерживания для иммунного комплекса mAb: тример shCD154 3: 1, однако широкий пик и меньшая степень извлечения (56% в условиях 1: 1) указывает на возможное образование иммунных комплексов высшего порядка, которые не могли ни вступить во взаимодействие с колонкой или ни войти в нее. C4LB89 и C4LB119 (оба IgG2sigma) формировали иммунный комплекс с shCD154 и элюировались с широким пиком и очень низким извлечением (6-17% в условиях 1: 1), вероятно, вследствие образования больших комплексов, не входящих в колонку. Как правило, антитела на изотипах IgG2sigma формировали более большие иммунные комплексы по сравнению с антителами на IgGlsigma или IgGl.All antibodies formed an immune complex with shCD154. C4LB231, C4LB237, C4LB290, C4LB287 (all IgGlsigma) formed an immune complex with SCD154 and eluted at 7.0 min. However, C4LB290 and C4LB287 had a lower % recovery under 1:1 conditions compared to 10:1 conditions, while C4LB231 and C4LB237 had a higher % recovery (>80%). C4LB289 (IgGl), C4LB234 (IgGlsigma), 5c8IgGlsigma (C4LB71) and C4LBB94 (IgG2sigma) eluted earlier, at 6.2-6.5 min, indicating that the aforementioned mAbs were forming larger complexes. 5c8IgGl had a broader peak at the expected retention time for the mAb: shCD154 3:1 trimer, however, the broad peak and lower recovery (56% under 1:1 conditions) indicates the possible formation of higher order immune complexes that could not enter to interact with the column or not to enter it. C4LB89 and C4LB119 (both IgG2sigma) formed an immune complex with shCD154 and eluted with a broad peak and very low recovery (6-17% under 1:1 conditions), probably due to the formation of large off-column complexes. As a rule, antibodies against IgG2sigma isotypes formed larger immune complexes compared to antibodies against IgGlsigma or IgGl.
В табл. 26 показаны сводные данные по характеристикам антител. В общем, данные по активации тромбоцитов, данные ГФ-ВЭЖХ и DLS, в совокупности, указывают, что активация тромбоцитов не полIn table. 26 shows a summary of antibody characterization data. In general, platelet activation data, GP-HPLC and DLS data, taken together, indicate that platelet activation is not
Claims (22)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62/201,150 | 2015-08-05 | ||
US62/367,660 | 2016-07-28 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA040943B1 true EA040943B1 (en) | 2022-08-22 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11421037B2 (en) | Nucleic acids encoding anti-CD154 antibodies | |
JP7235733B2 (en) | Antibodies that specifically bind to PD-1 and methods of use | |
US20190048089A1 (en) | Antagonistic Antibodies Specifically Binding Human CD40 and Methods of Use | |
US20180355043A1 (en) | Antibodies Specifically Binding HLA-DR and Their Uses | |
KR20150117259A (en) | Antibodies that bind to tl1a and their uses | |
KR20230017841A (en) | Proteins Comprising CD3 Antigen Binding Domains and Uses Thereof | |
US11802154B2 (en) | Humanized anti-CD200 antibodies and uses thereof | |
EA040943B1 (en) | ANTIBODIES TO CD154 AND METHODS FOR THEIR APPLICATION | |
NZ739597B2 (en) | Anti-cd154 antibodies and methods of using them |