DE3705512C2 - - Google Patents
Info
- Publication number
- DE3705512C2 DE3705512C2 DE19873705512 DE3705512A DE3705512C2 DE 3705512 C2 DE3705512 C2 DE 3705512C2 DE 19873705512 DE19873705512 DE 19873705512 DE 3705512 A DE3705512 A DE 3705512A DE 3705512 C2 DE3705512 C2 DE 3705512C2
- Authority
- DE
- Germany
- Prior art keywords
- dna
- hepatitis
- cesium chloride
- stool
- fraction
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 claims description 45
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 claims description 45
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 18
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 18
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 10
- 230000029087 digestion Effects 0.000 claims description 9
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 claims description 9
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 claims description 8
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 8
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 claims description 6
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 claims description 5
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 claims description 5
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 claims description 5
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 claims description 5
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 5
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 4
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 4
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims description 3
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 claims description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 claims description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 claims description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 claims description 3
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 3
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 claims description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 2
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 claims description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 2
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 claims 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 claims 2
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 claims 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 claims 2
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 claims 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 51
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 35
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 23
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 14
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 13
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 12
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 11
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 11
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 9
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 8
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 7
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 7
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 7
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 6
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 description 6
- 208000019423 liver disease Diseases 0.000 description 6
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 6
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 6
- 206010019786 Hepatitis non-A non-B Diseases 0.000 description 5
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 5
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 5
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 5
- 208000005252 hepatitis A Diseases 0.000 description 5
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 5
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 4
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 4
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 4
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 4
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 4
- INCIMLINXXICKS-UHFFFAOYSA-M pyronin Y Chemical compound [Cl-].C1=CC(=[N+](C)C)C=C2OC3=CC(N(C)C)=CC=C3C=C21 INCIMLINXXICKS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 4
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 4
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 3
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 3
- 102000016359 Fibronectins Human genes 0.000 description 3
- 108010067306 Fibronectins Proteins 0.000 description 3
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 3
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 3
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 3
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 3
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 3
- 229940094991 herring sperm dna Drugs 0.000 description 3
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 3
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 3
- ZCYVEMRRCGMTRW-YPZZEJLDSA-N iodine-125 Chemical compound [125I] ZCYVEMRRCGMTRW-YPZZEJLDSA-N 0.000 description 3
- 229940044173 iodine-125 Drugs 0.000 description 3
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 3
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 3
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 3
- FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M sodium iodide Chemical compound [Na+].[I-] FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 2
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 2
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 210000005228 liver tissue Anatomy 0.000 description 2
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- HKJKONMZMPUGHJ-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-hydroxy-3-[(4-nitrophenyl)diazenyl]-6-phenyldiazenylnaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=C(N=NC=3C=CC=CC=3)C(O)=C2C(N)=C1N=NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 HKJKONMZMPUGHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000002109 Argyria Diseases 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 208000000419 Chronic Hepatitis B Diseases 0.000 description 1
- 108090000317 Chymotrypsin Proteins 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 241000252203 Clupea harengus Species 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- 241001452028 Escherichia coli DH1 Species 0.000 description 1
- 229920001917 Ficoll Polymers 0.000 description 1
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 1
- 208000005176 Hepatitis C Diseases 0.000 description 1
- 206010019791 Hepatitis post transfusion Diseases 0.000 description 1
- 102000005348 Neuraminidase Human genes 0.000 description 1
- 108010006232 Neuraminidase Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 239000008118 PEG 6000 Substances 0.000 description 1
- 108010067372 Pancreatic elastase Proteins 0.000 description 1
- 102000016387 Pancreatic elastase Human genes 0.000 description 1
- 108090000526 Papain Proteins 0.000 description 1
- 229920002584 Polyethylene Glycol 6000 Polymers 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- GSEJCLTVZPLZKY-UHFFFAOYSA-N Triethanolamine Chemical compound OCCN(CCO)CCO GSEJCLTVZPLZKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- GFZPUGCMGGUPHH-UHFFFAOYSA-N [I].[Na] Chemical class [I].[Na] GFZPUGCMGGUPHH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000036770 blood supply Effects 0.000 description 1
- 238000009534 blood test Methods 0.000 description 1
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 1
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- VDQQXEISLMTGAB-UHFFFAOYSA-N chloramine T Chemical compound [Na+].CC1=CC=C(S(=O)(=O)[N-]Cl)C=C1 VDQQXEISLMTGAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002376 chymotrypsin Drugs 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N dATP Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J dCTP(4-) Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J 0.000 description 1
- HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N dGTP Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 1
- NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N dTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 230000004992 fission Effects 0.000 description 1
- 208000010710 hepatitis C virus infection Diseases 0.000 description 1
- 235000019514 herring Nutrition 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000009413 insulation Methods 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 229940055729 papain Drugs 0.000 description 1
- 235000019834 papain Nutrition 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 239000000700 radioactive tracer Substances 0.000 description 1
- 238000009419 refurbishment Methods 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 235000009518 sodium iodide Nutrition 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
- C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
- C12Q1/707—Specific hybridization probes for hepatitis non-A, non-B Hepatitis, excluding hepatitis D
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/576—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for hepatitis
- G01N33/5767—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for hepatitis non-A, non-B hepatitis
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2730/00—Reverse transcribing DNA viruses
- C12N2730/00011—Details
- C12N2730/10011—Hepadnaviridae
- C12N2730/10111—Orthohepadnavirus, e.g. hepatitis B virus
- C12N2730/10122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/24011—Flaviviridae
- C12N2770/24211—Hepacivirus, e.g. hepatitis C virus, hepatitis G virus
- C12N2770/24222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft die in den Ansprüchen 1, 2 und 5 angegebene Non-A-, Non-B-Hepatitis assoziierte DNA und Fragmente, nach den Ansprüchen 3 und 4 das Verfahren zu deren Herstellung und nach den Ansprüchen 6 bis 8 deren Verwendung.The present invention relates to that in claims 1, 2 and 5 indicated non-A, non-B hepatitis associated DNA and Fragments, according to claims 3 and 4, the method for their Production and their use according to claims 6 to 8.
Non-A, Non-B-Hepatitiserkrankungen sind in der Literatur ausführlich und zahlreich beschrieben. Ebenso bekannt sind aber die Schwierigkeiten der Erfassung des NANBH-Virus und Nachweis der Krankheit.Non-A, Non-B hepatitis diseases are in the literature described in great detail. Are also known but the difficulties of detecting the NANBH virus and Evidence of the disease.
Es wurden nun aus dem Stuhl von Non-A, Non-B-Hepatitis patienten Partikel isoliert und bezüglich ihres Molekular gewichts und ihrer Beschaffenheit charakterisiert sowie ein Nachweisverfahren auf das Vorhandensein solcher Partikel gefunden und der Nachweis dieser Partikel zur Diagnose des Vorliegens einer Non-A, Non-B-Hepatitis bei leberkranken Patienten angewandt.It was now out of the stool of Non-A, Non-B hepatitis patient particles isolated and their molecular weight and their characteristics characterized as well a verification procedure for the existence of such Particles found and the detection of these particles Diagnosing the presence of non-A, non-B hepatitis liver sick patients applied.
Aus den aus dem Stuhl isolierten Partikeln wurde DNA isoliert und nach herkömmlichen Methoden kloniert. Die so erhaltenen klonierten DNA-Stränge wurden zum Nachweis des Vorliegens homologer oder sehr ähnlicher DNA wiederum im Stuhl, Serum, Lebergewe be und Körperflüssigkeiten von leberkranken Patienten verwendet, bei denen auf diesem Wege eine Non-A, Non-B-Hepatitis mit hinreichender Wahrscheinlichkeit diagnostiziert werden kann.DNA was isolated from the particles isolated from the stool and cloned using conventional methods. The so obtained Cloned DNA strands were used to detect the presence homologous or very similar DNA in turn in stool, serum, liver tissue be and body fluids used by liver sick patients those who have a non-A, non-B hepatitis with sufficient Probability can be diagnosed.
Die Erfindung betrifft also zusammengefaßt die Isolierung Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierter Partikel sowie das Klonieren von DNA und die Verwendung sowohl dieser Partikel als auch der erhaltenen DNA-Klone zur Eingrenzung von Leber erkrankungen auf das Vorliegen einer Non-A, Non-B-Hepatitis. Weitere Aspekte der Erfindung liegen in der Entwicklung von erweiterten Nachweisverfahren und schließlich auch Impfstoffen auf Basis der zu erhaltenden Antikörper und durch Synthese synthetischer Peptide mit der Sequenz der Partikel, die diesen Virusproteinen ent spricht und die sich aus der Sequenz der klonierten DNA vorhersagen läßt.In summary, the invention relates to insulation Non-A, Non-B hepatitis-associated particles and that Cloning DNA and using both of these particles as well as the DNA clones obtained to narrow the liver diseases for the presence of non-A, non-B hepatitis. Further aspects of the invention lie in the development of advanced detection methods and finally also vaccines based on those to be obtained Antibodies and with synthesis of synthetic peptides the sequence of the particles that ent this virus proteins speaks and which results from the sequence of the cloned DNA lets predict.
Aus den Stuhlproben Non-A, Non-B-Hepatitis erkrankter Patienten wurde eine Substanz isoliert, die sich signifikant gehäuft im Stuhl solcher Non-A- Non-B-Hepatitis-Patienten findet, dagegen bei gesunden sowie bei Patienten mit Lebererkrankungen anderer Genese in signifikant geringerem Ausmaß findet. Ein Verfahren zum Nachweis dieser Substanz wurde entwickelt, worin Polystyrolbeads mit verdünntem Serum von Non-A, Non-B-Hepatitis-Rekonvaleszenten beschichtet werden. Die gewaschenen beads werden dann mit einer 10%igen Stuhlsuspension eines zu untersuchenden Probanden inkubiert, wobei eventuell vorhandene Non-A- Non-B-Hepatitis assoziierte Substanz an die in dem Rekonvaleszentenserum enthaltenen, an die Polystyrolkugeln gebundenen Antikörper gegen diese Substanz bindet und so immobilisiert wird. Die Bindung der Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierten Teilchen kann nachgewiesen werden durch Bindung von menschlichem IgG wiederum aus Rekonvaleszentenserum von Non-A- Non-B-Hepatitis-Patienten, das mit Jod 125 radioaktiv markiert ist. Bei Vorliegen der Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierten Substanz im Stuhl des Probanden wird radioaktives Immunglobulin an diese gebunden und das entprechende Signal zum Nachweis verwendet.From the stool samples of non-A, non-B hepatitis of sick patients a substance was isolated that accumulated significantly in the stool of such non-a-non-b hepatitis patients finds, however, in healthy as well as in patients with liver diseases other genesis to a significantly lesser extent finds. A method for the detection of this substance was developed developed in which polystyrene beads with diluted serum coated by non-A, non-B hepatitis convalescent. The washed beads are then washed with a 10% Incubated stool suspension from a subject to be examined, possibly associated non-A-non-B hepatitis Substance to those contained in the convalescent serum antibodies bound to the polystyrene balls against them Substance binds and is immobilized. Binding the Non-A, Non-B hepatitis-associated particles can be detected are in turn made by binding human IgG Convalescent serum from non-a-non-b hepatitis patients, which is radioactively labeled with iodine 125. If the Non-A, Non-B hepatitis-associated substance in the stool of the Subjects are bound to radioactive immunoglobulin and the corresponding signal is used for detection.
Bei Verwendung dieses Nachweisverfahrens für die Hepatitis- Non-A- Non-B-assoziierte Substanz in großen Kollektiven von Patienten mit Lebererkrankungen unterschiedlicher Genese zeigte es sich, daß diese Substanz hochsignifikant gehäuft bei Patienten mit gesicherter Hepatitis Non-A, Non-B im Stuhl nachweisbar ist (s. Tabelle 1). Bei Patienten mit anderen Lebererkrankungen, bei denen eine Non-A, Non-B-Hepatitis eher unwahrscheinlich ist, die teilweise in ihrem klinischen Bild jedoch einer akuten oder abgelaufenen Non-A, Non-B-Hepatitis ähneln können, insbesondere auch bei Patienten mit einer akuten unabgelaufenden Hepatitis A oder B fand sich dagegen nur in äußerst wenigen Fällen die Non-A, Non-B- Hepatitis-assoziierte Substanz (s. Tabellen 2 und 3). Hieraus ergibt sich, daß das Vorliegen dieser Substanz einen deutlichen Hinweis auf die Ätiologie einer zunächst unbekannten, entzündlichen Lebererkrankung liefern kann, und daß der Nachweis dieser Substanz daher eine Untersuchung von ho hen diagnostischem Wert zum Nachweis oder Ausschluß des Vor liegens einer Non-A, Non-B-Hepatitis liefern kann.When using this detection method for hepatitis Non-A- Non-B-associated substance in large groups of Patients with liver disease of different origins it turned out that this substance was highly significant in patients with confirmed hepatitis Non-A, Non-B im Stool is detectable (see Table 1). In patients with others Liver disease in which non-A, non-B hepatitis is rather unlikely, partly in their clinical Image of an acute or expired non-A, Non-B hepatitis can resemble, especially in patients with an acute, ongoing hepatitis A or B. In contrast, the non-A, non-B Hepatitis-associated substance (see Tables 2 and 3). Out of this it follows that the presence of this substance clear indication of the etiology of an initially unknown, inflammatory liver disease can deliver, and that the detection of this substance therefore an investigation by ho hen diagnostic value to prove or exclude the project a non-A, non-B hepatitis.
Die mit der Non-A, Non-B assoziierte Substanz weist somit eine hohe Affinität gegenüber menschlichen Immunglobulinen und Fibronectin sowie dessen nicht kollagenbindenden Spalt produkten auf. Die Bindung an Fab-2- Bruchstücke aus dem IgG gesunder und Hepatitis Non-A, Non-B- rekonvaleszenter Personen spricht gegen eine unspezifische Bindung der assoziierten Substanz an dem Fc-Teil der Immun globuline. Die hohe Affinität gegenüber Fibronectin und dessen nicht kollagenbindenden Spaltprodukten ist eine Eigenschaft, die diese Substanz mit antigenen Proteinen anderer Viren ge meinsam hat. Behandlung mit organischen Lösungsmitteln (Chloroform, Äther) und mit Hitze (70°C, 10 min) zerstört die Bindungsaffinität der Non-A, Non-B assoziierten Substanz nicht. Während die Verdauung mit Chymotrypsin, Trypsin, Elastase und Neuraminidase keinen Einfluß auf die Bindungseigenschaften der Substanz zeigt, führt die Verdauung mit Papain zu einem vollständigen und schnellen Verlust der Bindungsaffinität.The substance associated with the non-A, non-B thus points a high affinity for human immunoglobulins and fibronectin and its non-collagen-binding gap products on. Binding to Fab-2- Fragments from the IgG of healthy and hepatitis Non-A, Non-B convalescent people speak against an unspecific Binding of the associated substance to the Fc part of the immune globuline. The high affinity for fibronectin and its non-collagen binding fission products is a property which this substance with antigenic proteins of other viruses ge together. Treatment with organic solvents (chloroform, ether) and with heat (70 ° C, 10 min) destroys the binding affinity the non-A, non-B associated substance. While the Digestion with chymotrypsin, trypsin, elastase and neuraminidase no influence on the binding properties of the substance shows, digestion with papain leads to complete and rapid loss of binding affinity.
Nach Zentrifugation bei 150 000 g, 2 Std., läßt sie sich im Sediment nachweisen und stellt sich nach 72stündiger Laufzeit bei einer Dichte von 1,3 (1,29-1,32) g/ml Cäsiumchlorid ein. Nach Auftrennung der bei 1,30 g/ml Cäsiumchloridbandenden Fraktion über eine Gradienten-Poly acrylamidgel-Elektrophorese werden in der Silberfärbung mehrere Bande unterschiedlichen Molekulargewichts dargestellt. Nach Transfer auf Nitrocellulose lassen sich im Western-Blot mit radioaktiv markierten IgG und Fab-2-Fragmenten von Non-A, Non-B Hepatitis-Patienten und gesunden Probanden Bande dar stellen, die bei Extraktion gesunder Kontrollstühle nicht auftreten. Insgesamt werden 4 Banden dargestellt, zwei gut sichtbare Hauptbanden mit einem Molekulargewicht von ca. 64 000 und 56 000 sowie zwei schwächere Bande mit einem Molekulargewicht von 51 000 und 43 000. Die Banden mit Fab-2- Bruchstücken sind schwächer und zeigen eine höheren Background. Die Auftrennung von Rohstuhlkonzentraten ohne Cäsiumchlorid-Reinigung nach SDS-Page und Blotting zeigten in positiven Stühlen die beiden Hauptbanden mit einem ungefähren Molekulargewicht um 60 000.After centrifugation at 150,000 g, 2 hours, it can be detected in the sediment and adjusts itself 72-hour runtime at a density of 1.3 (1.29-1.32) g / ml cesium chloride. After separation of the 1.30 g / ml Cesium chloride banding fraction over a gradient poly Acrylamide gel electrophoresis are used in silver staining several bands of different molecular weights are shown. After transfer to nitrocellulose, it is possible to use a Western blot with radioactively labeled IgG and Fab-2 fragments from Non-A, Non-B hepatitis patients and healthy volunteers are gang places that do not when extracting healthy control chairs occur. A total of 4 bands are shown, two good visible main bands with a molecular weight of approx. 64,000 and 56,000 and two weaker bonds with one Molecular weight of 51,000 and 43,000. The bands with Fab-2 Fragments are weaker and show a higher background. The separation of raw chair concentrates without Cesium chloride purification after SDS-Page and blotting showed in positive stools the two main bands with an approximate one Molecular weight around 60,000.
Bei weiterer Analyse der Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierten Partikel ließ sich DNA isolieren und mit herkömmlichen Methoden in Fragmenten klonieren. Diese klonierten DNA-Fragmente aus dem Stuhl von Non-A, Non-B-Hepatitis-Patienten konnten als DNA-Sonden für die Untersuchung des Stuhls, Serums, Lebergewebe und Körperflüssigkeiten sowie Blutkonserven und Plasmaderivaten anderer Patienten mit Verdacht auf das Vorliegen einer Non-A, Non-B-Hepatitis verwendet werden. Mit den klassischen Hybridisierungsverfahren läßt sich so zeigen, ob in den unbekannten Stühlen DNA vorliegt, deren Sequenz der Non-A, Non-B-Hepatitis- assoziierten DNA der erhaltenen Klone so ähnlich ist, daß sich ein Hybridisierungssignal zeigt. Mit diesem weiteren Nachweisverfahren für Hepatitis Non-A, Non-B-assoziierten DNA-Sequenzen konnten dann Proben von Probanden untersucht werden auf das Vorliegen von Non-A, Non-B-Hepatitis- assoziierter DNA. Die bisherigen Ergebnisse legen nahe, daß es sich bei der Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierten Substanz um ein Viruspartikel handelt und daß es sich bei der isolierten DNA-Sequenz um eine Sequenz einer Virus-DNA handelt, wie das Aufschlußverfahren einerseits und andererseits die Sequenz selbst zeigen.Upon further analysis of non-A, non-B hepatitis-associated Particles were isolated using DNA and using conventional methods clone in fragments. These cloned DNA fragments from the stool of non-a, non-b hepatitis patients could as DNA probes for the examination of stool, serum, liver tissue and body fluids, as well as blood supplies and plasma derivatives other patients suspected of having one Non-A, Non-B hepatitis can be used. With the classic hybridization processes can be shown whether in the unknown DNA is stool, the sequence of which is non-A, non-B hepatitis associated DNA of the clones obtained is so similar that a hybridization signal appears. With this further Detection method for hepatitis non-A, non-B-associated DNA sequences could then be used to examine samples from test subjects are on the presence of non-A, non-B hepatitis associated DNA. The results so far suggest that it is the non-A, non-B hepatitis-associated substance is a virus particle and that it is the isolated DNA sequence is a sequence of virus DNA, such as the digestion process on the one hand and the sequence on the other show yourself.
Die folgenden Beispiele erläutern die Erfindung.The following examples illustrate the invention.
0,5 g Stuhl werden in 10 ml Puffer suspendiert, bei 8000 g zentrifugiert und der Überstand gesammelt. Der Rückstand wird noch einmal mit 10 ml und anschließend mit 5 ml Puffer ausgewaschen. Die gesammelten Überstände werden zentrifugiert (30 min, 10 000 rpm) und durch ein bakteriendichtes Filter filtriert (Millipore 0,22 µm). Der Überstand wird mit PEG 6000 (Endkonzentration 10% bzw. 0,4 mol) präzipitiert. Nach mindestens 2 und höchstens 12 Stunden wird das Präzipitat abzentrifugiert und in 10 ml Puffer gelöst. Diese Lösung wird mit 10 ml Freon ausgeschüttelt, die Phasen durch Zentrifugation getrennt, die Freonphase noch einmal mit 5 ml Puffer gewaschen. Die Fällung mit PEG und NaCl (Endkonzentration 10% bzw. 0,4 mol) wird wiederholt, das Präzipitat in ca. 800 µl Puffer aufgenommen.0.5 g of stool are suspended in 10 ml of buffer at 8000 g centrifuged and the supernatant collected. The backlog will still be Washed out once with 10 ml and then with 5 ml of buffer. The The supernatants collected are centrifuged (30 min, 10,000 rpm) and filtered through a bacteria-proof filter (Millipore 0.22 µm). The supernatant is precipitated with PEG 6000 (final concentration 10% or 0.4 mol). After at least 2 and at most 12 hours, the precipitate centrifuged and dissolved in 10 ml of buffer. This solution comes with 10 ml Freon shaken out, the phases separated by centrifugation, the Freon phase washed again with 5 ml buffer. Precipitation with PEG and NaCl (final concentration 10% or 0.4 mol) is repeated Precipitate taken up in approx. 800 µl buffer.
Die so erhaltene Lösung wird mit RNase und DNase 1 Std. bei 37°C verdaut (800 µl PEG-Präzipitat in Tris-HCl-Puffer, pH 7,4; 0,05 M; 2800 U RNase und 1500 U DNase, proteasenfreie Präparationen). Isolierungen, die nicht zur Extraktion von DNA dienen, können ohne diesen Schritt durchgeführt werden.The solution thus obtained is treated with RNase and DNase for 1 hour at 37 ° C digested (800 µl PEG precipitate in Tris-HCl buffer, pH 7.4; 0.05 M; 2800 U RNase and 1500 U DNase, protease-free preparations). Isolations that are not used to extract DNA can be used without it Step.
Nach Verdauung mit DNase und RNase wird das Inkubat auf einen Cäsiumchlorid-Gradienten gebracht.After digestion with DNase and RNase, the incubate is put on one Brought cesium chloride gradient.
Die Zentrifugenröhrchen werden mit 1 ml Cäsiumchlorid-Lösung mit einer Dichte von 1,4 g/ml gegeben und mit je 3 ml Cäsiumchlorid von einer Dichte von 1,3 g, 1,25 g und 1,2 g/ml überschichtet. Alle Cäsiumchlorid- Lösungen werden mit dem obengenannten Puffer hergestellt, der Gradient wird mit 800 µl Stuhlextrakt überschichtet, die Zentrifugationsdauer beträgt 65-72 Stunden. Temperatur +10°C, rpm 31 000. Nach Beendigung der Laufzeit wird der Gradient im unteren Bereich (Dichte 1,2-1,4) in Fraktionen von ca. 200 µl gesammelt, im oberen Bereich Dichte 1,1- 1,2 können größere Fraktionen entnommen werden. Die Dichte jeder Fraktion wird durch Messung des Brechungsindex bestimmt. Alle Fraktionen werden ausgiebig gegen Puffer dialysiert und 50 µl jeder Fraktion in NANB-Assay auf Non-A, Non-B assoziierende Substanz untersucht. Von den positiven Fraktionen wird die Eiweißkonzentration nach Lowry be stimmt.The centrifuge tubes are filled with 1 ml of cesium chloride solution Given density of 1.4 g / ml and with 3 ml of cesium chloride of one Densities of 1.3 g, 1.25 g and 1.2 g / ml were overlaid. All cesium chloride Solutions are made with the above buffer, the gradient is overlaid with 800 µl stool extract, the centrifugation time is 65-72 hours. Temperature + 10 ° C, rpm 31 000. After completion the gradient is in the lower range (density 1.2-1.4) collected in fractions of approx. 200 µl, density 1.1- in the upper area 1,2 larger fractions can be removed. The density of everyone Fraction is determined by measuring the refractive index. All factions are dialyzed extensively against buffer and 50 ul of each fraction in NANB assay examined for non-A, non-B associating substance. From the positive fractions will be the Lowry protein concentration Right.
Zwei Lösungen mit verschiedenen Acrylamidkonzentrationen werden durch einen Gradientenmischer zu einem linearen Gradienten aufgeschichtet. Die Lösung mit der höheren AA-Konzentration enthält außerdem 15% Saccharose, um Turbulenzen zu verhindern. Ansonsten sind die Lösungen zusammengesetzt wie bei LAEMMLI (1970) berschrieben. Dies gilt auch für das Kammgel.Two solutions with different acrylamide concentrations will be layered by a gradient mixer to form a linear gradient. The solution with the higher AA concentration also contains 15% Sucrose to prevent turbulence. Otherwise there are the solutions composed as described in LAEMMLI (1970). this applies also for the comb gel.
Die dialysierten und evtl. eingeengten Fraktionen des Cäsiumchlorid- Gradienten werden mit 10 µl SDS, 10 µl Glycerin und 5 µl beta- Mercaptoäthanol, 5 µl Bromophenolblau pro 100 µl Probe versetzt und 3 Min. im Wasserbad gekocht. Danach werden sie mit 5 µl 0,1%igem Pyronin versetzt und auf das Gel aufgetragen. Laufzeit 3½ Stunden, Spannung 160-300 V, Stromstärke 40-25 A, Leistung 20 W.The dialyzed and possibly narrowed fractions of the cesium chloride Gradients are beta-coated with 10 µl SDS, 10 µl glycerol and 5 µl Mercaptoethanol, 5 µl bromophenol blue per 100 µl sample and 3 Min. Boiled in a water bath. Then they are mixed with 5 µl of 0.1% pyronine added and applied to the gel. Running time 3½ hours, excitement 160-300 V, current 40-25 A, power 20 W.
Ca. 5 Min. vor Ende des Laufes wird noch einmal 5 µl Pyronin aufgetragen und der Lauf beendet, sobald sie Pyronin und Kammgel durchlaufen hat. Das Gel wird entweder mit Silber gefärbt (WRAY und Mitarbeiter 1981) oder ein Western-Blotting durchgeführt (TOWBIN und Mitarbeiter 1979). Das Blotting wird über Nacht bei 0,5 A, anschließend 1 Std. bei 1 A durchgeführt.Approx. 5 µl of pyronine is applied again 5 minutes before the end of the run and the run ends as soon as it goes through pyronine and comb gel. The gel is either stained with silver (WRAY and co-workers 1981) or Western blotting was carried out (TOWBIN et al. 1979). Blotting is carried out overnight at 0.5 A, then 1 hour at 1 A carried out.
Nach Beendigung des Blotting werden die verschiedenen Streifen (an den Pyroninmarkierungen kenntlich) ausgeschnitten und mitgeführte Molekulargewichtstandards mit Amidoschwarz gefärbt. Probenstreifen werden 24-72 Stunden in 1%iger Gelatine PBS-Lösung geschüttelt. Die IgG- Fraktion eines Patienten bzw. die Fab-2-Fragmente dieser IgG-Fraktion werden mit Jod 125 (Chloramin T) markiert: 0,5 mCi auf 100 µg Protein. After the blotting is complete, the different strips (on the Pyronine markings) and cut out molecular weight standards dyed with amido black. Sample strips will be Shaken for 24-72 hours in 1% gelatin PBS solution. The IgG Fraction of a patient or the Fab-2 fragments of this IgG fraction are labeled with iodine 125 (chloramine T): 0.5 mCi per 100 µg protein.
Dabei werden etwa 70% der Aktivität inkorporiert. Der Tracer, dessen Volumen ca. 2 µg Protein entsprechen sollte, wird in 20 ml Gelatine/PBS verdünnt und damit die Streifen 12 Stunden unter Schütteln inkubiert. Danach werden die Streifen je 1 Stunde 3× mit Gelatine-PBS, 2× mit PBS-Tween 0,5% und 1× mit Wasser gewaschen. Nach Trocknen der Streifen werden diese auf einen empfindlichen Röntgenfilm aufgelegt und bei -70°C 2-7 Tage exponiert.About 70% of the activity is incorporated. The tracer, whose Volume should correspond to about 2 µg protein, is in 20 ml gelatin / PBS diluted and the strips incubated for 12 hours with shaking. Then the strips are 3 times with gelatin PBS, 2 times with 1 hour PBS-Tween 0.5% and washed 1 × with water. After drying the These are placed on a sensitive X-ray film and strips Exposed at -70 ° C for 2-7 days.
Polystyrol Beads wurden mit Serum von rekonvaleszenten Patienten mit Non-A, Non-B-Hepatitis in einer Verdünnung von 1 : 200 in Carbonatpuffer, pH 9,2, 0,01 Mol/l, 12 Stunden bei Raumtemperatur inkubiert. Die so beschichteten Röhrchen wurden mit phosphatgepufferter physiologischer Kochsalzlösung (PBS) ausgiebig gewaschen. Die Stuhlproben wurden in Form einer 10%igen Stuhlsuspension (g/V) 2 Stunden bei 37°C mit den wie oben geschichteten Polystyrol Beads inkubiert, danach ausgiebig mit PBS, die 0,5% Tween 20 enthielt, gewaschen und danach 1 Stunde mit humanem IgG aus dem Serum von Rekonvaleszenten von einer Non-A, Non-B-Hepatitis, das mit Jod 125 markiert war, bei 37°C inkubiert. Nach neuerlichem, ausführlichem Waschen mit destilliertem Wasser wurden die an die Beads gebundene Radioaktivität in einem Gamma-Counter ausgezählt. Stuhlproben, bei denen die gebundene Radioaktivität den dreifachen Wert der Negativkontrolle erreichte, wurden als positiv für das Vorliegen der Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierten Substanz befunden.Polystyrene beads were made with Serum from convalescent patients with non-A, non-B hepatitis in a dilution of 1: 200 in carbonate buffer, pH 9.2, 0.01 mol / l, 12 hours at room temperature incubated. The tubes coated in this way were also used phosphate buffered saline (PBS) washed extensively. The stool samples were in the form of a 10% stool suspension (w / v) for 2 hours at 37 ° C with the incubated as layered polystyrene beads, then extensively with PBS containing 0.5% Tween 20 washed and then washed out with human IgG for 1 hour the serum of convalescents from non-A, non-B hepatitis, which was labeled with iodine 125, incubated at 37 ° C. After renewed, thorough washing with distilled The radioactivity bound to the beads was in water counted a gamma counter. Stool samples in which the bound radioactivity three times the value of the negative control were considered positive for the presence of the non-A, non-B hepatitis-associated substance.
Jede der Tabellen 1 bis 4 wurde wie oben beschrieben erstellt und nach den angegebenen Kriterien ausgewertet. Es wurde festgestellt, daß gemäß Tabelle 1 bei Patienten einer gesicherten Non-A, Non-B-Hepatitis diese Substanz in einem großen Prozentsatz der Fälle gefunden wurde, daß gemäß Tabelle 2 bei Verwendung dieses Essays für diese Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierte Substanz bei einem Patientenkollektiv mit einer Vielzahl von ganz unterschiedlichen Lebererkrankungen, die aber nichts mit einer Non-A, Non-B-Hepatitis zu tun haben, die Substanz, wenn überhaupt, nur in sehr niedrigen Prozentsätzen gefunden wird.Each of Tables 1 through 4 was described as above created and evaluated according to the specified criteria. It was found that according to Table 1 in patients with confirmed non-A, non-B hepatitis found this substance in a large percentage of cases has been, that according to Table 2 when using this essay for this Non-A, Non-B hepatitis-associated substance in one Patient group with a variety of very different Liver disease but nothing to do with a Non-A, Non-B hepatitis have to do with the substance, though at all, only found in very low percentages.
Tabelle 3 zeigt, daß man während der Untersuchung von Patientenkollektiven mit Hepatitis anderer Genese, also entweder Hepatitis A oder Hepatitis B zu einem sehr niedrigen Prozentsatz die Non-A, Non-B-assoziierte Substanz findet.Table 3 shows that during the investigation of Patient groups with hepatitis of a different genesis, that is either hepatitis A or hepatitis B to a very low Percentage that finds Non-A, Non-B-associated substance.
Es ist festzustellen, daß man bei den Non-A, Non-B-Hepatitis- Fällen praktisch immer, also fast 30% positive Befunde hat, wohingegen bei den Hepatitis A, Hepatitis A-Verdacht, Hepatitis B und Posthepatitis B Patienten die Zahlen erheblich niedriger liegen.It should be noted that the non-A, non-B hepatitis Cases almost always, i.e. almost 30% positive results, whereas with the suspected hepatitis A, suspected hepatitis A, Hepatitis B and posthepatitis B patients' numbers increased significantly lie lower.
Die relative hohe positive Anzahl für die Substanz bei chronischen Hepatitis B-Patienten läßt vermuten, daß es sich um eine Doppelinfektion mit Non-A, Non-B und Hepatitis B handelt.The relatively high positive number for the substance chronic hepatitis B patients suggest that it is a double infection with Non-A, Non-B and hepatitis B acts.
Tabelle 4 zeigt folgendes: Eine Untersuchung an Empfängern mit einer Bluttransfusion, die prinzipiell als Risikopatienten zu gelten haben, weil bei Bluttransfusionen häufig eine Non-A, Non-B-Hepatitis Infektion eintritt. Es handelt sich um eine prospektive Studie.Table 4 shows the following: An investigation on recipients with a blood transfusion that is principally considered a risk patient have to apply because common in blood transfusions a non-A, non-B hepatitis infection occurs. It deals is a prospective study.
Hieraus ergibt sich sehr deutlich, daß abhängig vom Schweregrad der Folgen der Transfusion einerseits Patienten gar nichts geschehen ist, wo also diese Substanzen nur in sehr geringem Maße ausgeschieden worden ist, andererseits bei Patienten, bei denen die Krankheit erkennbar ist und bei denen, die eine ganz manifeste Hepatitis haben, in über 70% der Fälle diese Substanz nachweisbar ist.This clearly shows that depending on the severity the consequences of transfusion, on the one hand, patients nothing has happened, so where these substances are only in very has been eliminated to a small extent, on the other hand at Patients in whom the disease is recognizable and in to those who have overt hepatitis in over 70% of the time this substance is detectable.
Aus dem Stuhl von Patienten mit Non-A, Non-B-Hepatitis wurden, wie in Beispiel 1 beschrieben, Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierte Partikel isoliert und, wie dort beschrieben, mit RNAs und DNAs behandelt und über einen Cäsiumchlorid-Gradienten gereinigt und ausgiebig dialysiert. Die dialysierten Fraktionen wurden auf die oben beschriebene Art auf die Anwesenheit von NANB-assoziierter Substanz untersucht. Die Fraktion der Dichte von 1,3 g/ml im Cäsiumchloridgradienten wurde mit 50 Mikrogramm Proteinase K, 1% SDS und EDTA in einer Endkonzentration von 10 mM/l 6 Stunden bei 37°C verdaut. Proteine wurden durch Extraktion mit 80%igem Phenol (Gewicht/Volumen) und Chloroform entfernt, und daraufhin die in der wäßrigen Phase gelöste DNA in Gegenwart von 0,3 Mol/l Natriumacetat mit einem zweieinhalb-fachen Volumen an Äthanol für 60 Stunden bei -70°C gefällt. Danach wurde zentrifugiert und das Sediment einmal mit 70%igem Äthanol gewaschen und daraufhin in TE-Puffer, bestehend aus 10 mmol/l Tris, pH 8,0, und 1 mmol/l EDTA, in einem Volumenverhältnis von einem Mikroliter/5 mg aufgearbeitetem Stuhl, aufgenommen.From the stool of patients with non-A, non-B hepatitis were, as in example 1, non-A, non-B hepatitis-associated particles isolated and, as described there, treated with RNAs and DNAs and via a Cesium chloride gradient cleaned and dialyzed extensively. The dialyzed Fractions were presence in the manner described above of NANB-associated substance examined. The faction the density of 1.3 g / ml in the cesium chloride gradient was determined with 50 micrograms proteinase K, 1% SDS and EDTA at a final concentration of 10 mM / l digested for 6 hours at 37 ° C. Proteins were extracted by extraction with 80% phenol (Weight / volume) and chloroform removed, and then the DNA dissolved in the aqueous phase in the presence of 0.3 mol / l sodium acetate with a volume two and a half times of ethanol precipitated for 60 hours at -70 ° C. After that was centrifuged and the sediment once with 70% ethanol washed and then in TE buffer consisting of 10 mmol / l Tris, pH 8.0, and 1 mmol / l EDTA, in a volume ratio from a microliter / 5 mg of processed stool, added.
15 Mikroliter dieser DNA-Stammlösung wurden in einem Gesamtreaktionsvolumen von 50 Mikroliter mit 6 Einheiten Klenow- Polymerase (DNA-Polymerase I, großes Fragment), 1 Mikroliter einer Lösung von dATP, dTTP und dGTP, jeweils in einer Konzentration von 1 mM/l, sowie 5 Mikroliter alpha- 32P-dCTP (3000 Ci/mmol, 10 mCi/ml) im Inkubationspuffer für Klenow-Polymerase nach den Angaben des Herstellers 1 Stunde bei Raumtemperatur inkubiert. 15 microliters of this DNA stock solution were in a total reaction volume of 50 microliters with 6 units of Klenow Polymerase (DNA polymerase I, large fragment), 1 microliter a solution of dATP, dTTP and dGTP, each in a concentration of 1 mM / l and 5 microliters of alpha 32P-dCTP (3000 Ci / mmol, 10 mCi / ml) in the incubation buffer for Klenow polymerase according to the manufacturer's instructions Incubated for 1 hour at room temperature.
Danach wurden 2,5 Mikroliter einer 1 mMol/l dCTP-Lösung zugegeben und die Probe eine weitere Stunde bei Zimmertemperatur inkubiert. Nach Inaktivierung des Enzyms durch Erhitzen auf 68°C für 10 Minuten wurde die Reaktionslösung auf 0°C abgekühlt. Danach wurde das Reaktionsgemisch zusammen mit 2 Einheiten T4-DNA-Ligase, 1 Mikrogramm phosphorylierter EcoR-I-Linker und 6 Mikroliter 10 mM ATP-Lösung für 16 Stunden bei 16°C inkubiert. Das Reaktionsgemisch wurde danach auf eine Endkonzentration von 150 mMol/l NaCl eingestellt und mit 240 Einheiten EcoR-I Restriktionsendonuclease (80 Einheiten/Mikroliter) 3 Stunden bei 37°C verdaut. Die Reaktion wurde durch Zugabe von 5 Mikroliter 80%igem Phenol und 1 Mikroliter 20%igem SDS gestoppt. Die radioaktiv markierte und mit Linkern versehene DNA wurde von Salz und nicht legierten Linkern über eine Sepharose 4B-CL-Säule (3 ml Säulenvolumen, 25 cm Länge) abgetrennt und mit 2,5 Volumina Äthanol 16 Stunden bei -70°C gefällt. Die präzipitierte DNA wurde 10 Min. bei 14 000 g zentrifugiert und das Sediment bei 150 Mikroliter 70%igem Alkohol gewaschen, getrocknet und in 10 Mikroliter TE-Puffer aufgenommen.Then 2.5 microliters of a 1 mmol / l dCTP solution were added and the sample for another hour at room temperature incubated. After inactivating the enzyme by heating at 68 ° C for 10 minutes the reaction solution was on Cooled to 0 ° C. After that, the reaction mixture became together with 2 units of T4 DNA ligase, 1 microgram phosphorylated EcoR-I linker and 6 microliters of 10 mM ATP solution for 16 hours incubated at 16 ° C. The reaction mixture was then adjusted to a final concentration of 150 mmol / l NaCl and with 240 units of EcoR-I restriction endonuclease (80th Units / microliter) digested for 3 hours at 37 ° C. The reaction was by adding 5 microliters of 80% phenol and 1 microliter of 20% SDS stopped. The radioactively marked and linked DNA was from salt and unalloyed linkers on a Sepharose 4B-CL column (3 ml column volume, 25 cm length) separated and with 2.5 Volumes of ethanol precipitated at -70 ° C for 16 hours. The precipitated DNA was centrifuged at 14,000 g for 10 min and the Sediment washed at 150 microliters of 70% alcohol, dried and taken up in 10 microliters of TE buffer.
Zur Ligation mit der Vektor-DNA wurden 2 Mikrogramm DNA des Phagen-lambda 1149 mit 2 Einheiten EcoR-I (4 E/Mikroliter) in einem Gesamtreaktionsvolumen von 6 Mikroliter (Inkubationspuffer nach Angabe des Enzymherstellers (Boehringer, Mannheim) 1 Stunde bei 37°C inkubiert. Dann wurde das Enzym durch 10minütiges Erhitzen auf 68°C inaktiviert. Diese Lösung wurde mit 3 Mikroliter markierter DNA, die wie im vorigen Beispiel beschrieben, isoliert wurde, 1 Mikroliter 5 mM ATP und 1 unit T4-DNA-Ligase bei Raumtemperatur ligiert. 4 Mikroliter dieses Reaktionsansatzes wurden in lambda-Phagenhüllen verpackt (unter Verwendung eines fertigen Verpackungs extrakts, Vector-cloning systems). Mit diesen verpackten Phagen wurde der Escherichia Coli Stamm NM 514 infiziert. Zum screening auf das Vorhandensein eingebauter DNA wurden ca. 10⁵ "plaque forming units" auf 22×22 cm screening plates ausplattiert und über Nacht bei 37°C inkubiert. Phagen-DNA wurde auf Nitrozellulosefilter durch Abklatsch übertragen, und die so erhaltenen Abklatschfilter wurden mit 1 Mikroliter der oben beschriebenen radioaktiven DNA Stammlösung gemäß Maniatis et al. (1982) hybridisiert, gewaschen und 6 Std. bei 70°C autoradiographiert.For the ligation with the vector DNA, 2 micrograms of DNA from the Phage lambda 1149 with 2 units of EcoR-I (4 U / microliter) in a total reaction volume of 6 microliters (incubation buffer according to the enzyme manufacturer (Boehringer, Mannheim) incubated for 1 hour at 37 ° C. Then the enzyme inactivated by heating to 68 ° C for 10 minutes. This solution was labeled with 3 microliters of DNA, as in the previous Example described, was isolated, 1 microliter 5 mM ATP and 1 unit T4 DNA ligase ligated at room temperature. 4 microliters of this reaction mixture were in lambda phage casings packed (using a finished packaging extracts, vector-cloning systems). With these packaged phages, the Escherichia Coli strain became NM 514 infected. For screening for the presence of built-in DNA was about 10⁵ "plaque forming units" on 22 × 22 cm screening plates plated and over Incubated at 37 ° C overnight. Phage DNA was on nitrocellulose filter transferred by imitation, and the so obtained Contact filters were used with 1 microliter of that described above radioactive DNA stock solution according to Maniatis et al. (1982) hybridized, washed and autoradiographed for 6 hours at 70 ° C.
Von mehreren positiven Hybridisierungssignalen wurden 17 zugeordnete Phagenkolonien in einer Dichte von ca. 5 Plaques pro cm² ausplaziert. Von 70 Signalen, die auf diesen Musterplatten einem Plaque zugeordnet werden konnten, wurden 17 weiterverfolgt durch plaques purification nach BENTON und DAVIS (1978) und von den schließlich erhaltenen 16 positiven erhaltenen Plaques wurden Lysate hergestellt. Mehrere dieser Phagen enthielten DNA-Inserte in einer Länge zwischen 0,3 und etwa 1,6 KB, die mit einer Probe der ursprünglichen DNA-Stammlösung hybridisierten.Of several positive ones Hybridization signals were assigned to 17 phage colonies placed in a density of approx. 5 plaques per cm². Out of 70 signals on these sample plates Plaque could be assigned, 17 were followed up through plaques purification according to BENTON and DAVIS (1978) and out of the 16 positive ones finally received Lysates were prepared for plaques. Several of these phages contained DNA inserts between 0.3 and about a length 1.6 KB with a sample of the original DNA stock solution hybridized.
Das DNA-Fragment wurde durch Verdauung mit entsprechenden Restriktionsendonucleasen (EcoR-I) unter den oben bereits beschriebenen Bedingungen aus dem der Phagen DNA entfernt, das Fragment dann auf Agarose Gel von der lambda-Phagen DNA getrennt und die dem Insert entsprechende DNA-Bande aus dem Gel eluiert. Die solchermaßen isolierte Insert-DNA wird dann genau wie oben beschrieben, in Vektor-DNA PUC 19 hineinligiert und dann auf Escherichia coli Stamm DH 1 transfiziert. Nach Selektion von Bakterienstämmen, die dieses Plasmid mit dem eingebauten Hepatitis Non-A, Non-B-DNA-Insert aufgenommen haben und vermehren, wurde die Züchtung dann durchgeführt und wie bei T. Maniatis et al. 1982, in "Molecular Cloning, a laboratory manual", beschrieben, aufgearbeitet.The DNA fragment was digested with appropriate Restriction endonucleases (EcoR-I) among those already above described conditions removed from that of the phage DNA, the fragment then on agarose gel from the lambda phage DNA separated and the DNA band corresponding to the insert from the Gel eluted. The insert DNA thus isolated is then exactly as described above, ligated into vector DNA PUC 19 and then transfected to Escherichia coli strain DH 1. To Selection of bacterial strains that this plasmid with the built-in hepatitis Non-A, Non-B DNA insert added have and multiply, the breeding was then carried out and as in T. Maniatis et al. 1982, in "Molecular Cloning, a laboratory manual ", described, processed.
Das gleiche Insert wurde radioaktiv markiert und mit Southern-Analyse auf Hybridisierung mit dem DNS-Ausgangsmaterial, DNS-Extraktionen aus Stühlen von Kontrollpersonen, Hepatitis B-Virus-DNS und Escherichia coli Plasmid PBR 322 geprüft.The same insert was labeled radioactively and with Southern analysis for hybridization with the DNA starting material, DNA extractions from stools of control subjects, hepatitis B virus DNA and Escherichia coli plasmid PBR 322 tested.
2-5 ml Serum werden bei 150 000 g 2 Stunden zentrifugiert. Das Sediment wird in 200 µl Proteinase K-Lösung (0,5 mg/ml + 10 mmol EDTA) bei 37°C 1 Stunde verdaut. Danach werden zu dieser Lösung 165 µl einer heiß gesättigten Natriumjod Lösung (2,5 g Natriumjodid/ml H₂O, 75°C) gegeben (Endkonzentration 12,5 M). Diese Lösung wird 10 Minuten auf 90°C erhitzt und unmittelbar durch Nitrozellulosefilter mittels Vakuum filtriert (Dot-Blot-Apparatur) Nach der Filtration wird die Nitrozellulosefolie 3× mit 70%igem Äthanol gewaschen und darauf 10 Min. bei Raumtemperatur in 100 ml Essigsäureanhydrid (100 ml 0,1 M Triäthanolamin + 250 µl Essigsäureanhydrid) inkubiert. Nach der Inkubation wird die Folie im Vakuum bei 80°C 1-2 Stunden gebacken. Die trockene Folie wird in Vorhybridisierungslösung gebracht und 3 Stunden bei 65°C inkubiert (6× SSC, 1× Denhardt, 0,5% SDS, 20 µg/ml Hitze denaturierte Heringssperma- DNS entsprechend den Angaben in: Maniatis, Molecular Cloning, 1982). Mittels Nick-Translation (siehe Maniatis, Molecular Cloning, 1982) mit 32P-markierte Probe über Nacht unter Prähybridisierungsbedingungen inkubiert. Danach wird die Nitrozellulosefolie 3× gewaschen (1). 6× SSC, 1× Denhardt, 0,5% SDS, 20 µg/ml Heringssperma-DNA, 2). 1× SSC, 0,5% SDS, 1× Denhardt, 3). 0,1× SSC + 0,05% SDS). Nach Trocknen der Folie wird diese auf einen Röntgenfilm aufgelegt (Autoradiographiezeit 6 Stunden bis 2 Tage bei -70°C). 2-5 ml of serum are centrifuged at 150,000 g for 2 hours. The sediment is dissolved in 200 µl Proteinase K solution (0.5 mg / ml + 10 mmol EDTA) digested at 37 ° C for 1 hour. After that, too this solution 165 µl of a hot saturated sodium iodine solution (2.5 g sodium iodide / ml H₂O, 75 ° C) added (final concentration 12.5 M). This solution is heated to 90 ° C for 10 minutes and directly through nitrocellulose filter using vacuum filtered (dot blot apparatus) After filtration, the nitrocellulose sheet Washed 3 × with 70% ethanol and then at 10 min Room temperature in 100 ml acetic anhydride (100 ml 0.1 M Triethanolamine + 250 ul acetic anhydride) incubated. To The incubation is done in vacuum at 80 ° C for 1-2 hours baked. The dry film is in pre-hybridization solution brought and incubated for 3 hours at 65 ° C (6 × SSC, 1 × Denhardt, 0.5% SDS, 20 µg / ml heat denatured herring sperm DNS according to the information in: Maniatis, Molecular Cloning, 1982). Using nick translation (see Maniatis, Molecular Cloning, 1982) with 32P-labeled sample overnight under pre-hybridization conditions incubated. Then the nitrocellulose film Washed 3 × (1). 6 × SSC, 1 × Denhardt, 0.5% SDS, 20 µg / ml herring sperm DNA, 2). 1 × SSC, 0.5% SDS, 1 × Denhardt, 3). 0.1 × SSC + 0.05% SDS). After drying the film is placed on an X-ray film hung up (autoradiography time 6 hours to 2 days at -70 ° C).
Bei Seren mit hohem Gehalt an HNANB-Viren kann die Ankonzentrierung von 2-5 ml Serum durch Zentrifugation entfallen und die Seren nach Proteinase-K-Verdauung entsprechend der Methode (Seelig et al., klinikarzt 2/1985, Seite 86 ff.) direkt auf Nitrozellulose aufgetragen werden (s. Bsp. 7).In the case of sera with a high content of HNANB viruses, the concentration can be reduced of 2-5 ml of serum by centrifugation are omitted and the sera after Proteinase K digestion according to the method (Seelig et al., clinician 2/1985, page 86 ff.) directly on nitrocellulose be applied (see Example 7).
200 µl Serum werden mit 75 µl Proteinase K-Lösung (4 mg/ml) und 25 µl 0,5 M EDTA bei 37°C 1 Stunde inkubiert. Das Inkubat wird mit 100 µl 1 N NaOH 10 Minuten bei Raumtemperatur inkubiert und mit 250 µl 2 M NH₄OAc neutralisiert. 500 µl des Ansatzes (entsprechend 181 µl Serum) werden auf Nitrozellulose aufgetragen (Dott-Blott-Apparatur). Nach nochmaliger Neutralisierung mit 250 µl 2 M NaH₄OAc werden die Filter in Vakuum bei 80°C 45 Minuten getrocknet. Die Filter werden in 6× SSC (20× SSC (Standard Saline Citrat) entspricht 3 M NaCl, 1,5 M Natriumcitrat), 0,5% SDS (SDS Natriumdodecylsulfat), 1× Denhardt-Lösung (100× Denhardt-Lösung entspricht 2% Ficoll; 2% Polyvinylpyrolidon, 2% Bovin Serumalbumin) und 20 µl/ml Hitze denaturierter (5 Minuten, 100°C) Heringsperma-DNA bei 65°C 3 Stunden prähybridisiert. Zur Hybridisierung, die über Nacht unter Prähybridisierungsbedingungen erfolgt, wird das durch Nick-Translation mit 32P-markierten Inserts der Phagenclone verwendet (spezifische Aktivität ca. 1-2×10⁹ cpm/µg DNA). Die Filter werden danach jeweils einmal 20 Minuten bei 65°C mit 6× SSC, 1× Denhardt- Lösung, 0,5% SDS, 20 µg/ml denaturierter Heringssperma-DNA, danach mit 1× SSC, 0,5% SDS, 1× Denhardt-Lösung und 0,1× SSC, 0,05% SDS gewaschen und bei 80°C getrocknet. Die Autoradiographie erfolgt mittels Röntgenfilm und Verstärkerfolie mit einer Autoradiographiezeit von 6-48 Stunden bei -70°C. 200 ul serum with 75 ul proteinase K solution (4 mg / ml) and 25 µl 0.5 M EDTA incubated at 37 ° C for 1 hour. The incubate is mixed with 100 µl 1 N Incubate NaOH for 10 minutes at room temperature and with 250 µl 2 M NH₄OAc neutralized. 500 µl of the mixture (corresponding to 181 µl serum) are applied Nitrocellulose applied (Dott-Blott apparatus). To neutralization again with 250 µl 2 M NaH₄OAc Vacuum dried at 80 ° C for 45 minutes. The filters are in 6 × SSC (20 × SSC (standard saline citrate) corresponds to 3 M NaCl, 1.5 M sodium citrate), 0.5% SDS (SDS sodium dodecyl sulfate), 1 × Denhardt's solution (100 × Denhardt's solution corresponds to 2% Ficoll; 2% polyvinylpyrolidone, 2% Bovin serum albumin) and 20 µl / ml heat denatured (5 minutes, 100 ° C) Pre-hybridized herring sperm DNA at 65 ° C for 3 hours. For hybridization, that takes place overnight under prehybridization conditions will by nick translation with 32P-labeled phage clone inserts used (specific activity approx. 1-2 × 10⁹ cpm / µg DNA). The filters are then once each 20 minutes at 65 ° C with 6 × SSC, 1 × Denhardt Solution, 0.5% SDS, 20 µg / ml denatured herring sperm DNA, then with 1 × SSC, 0.5% SDS, 1 x Denhardt's solution and 0.1 x SSC, 0.05% SDS and dried at 80 ° C. The autoradiography is carried out using an X-ray film and intensifying screen with an autoradiography time from 6-48 hours at -70 ° C.
Die Sequenzierung der beigefügten Sequenz erfolgte nach der Sanger-Methode nach Umklonieren von PUC 8 in M 13.The sequencing of the attached sequence was carried out after the Sanger method after cloning PUC 8 into M 13.
In den Fig. 1 bis 3 ist die gefundene DNA- Sequenz gezeigt.The DNA sequence found is shown in FIGS. 1 to 3.
Fig. 1 zeigt den Minus Strang, Fig. 1 shows the minus strand,
Fig. 2 den Plus Strang und Fig. 2 the plus strand and
Fig. 3 die Schnittstellen mit den ebenfalls angegebenen Enzymen. Fig. 3 shows the interfaces with the enzymes also specified.
Zusammnenfassend läßt sich somit folgendes sagen: Die Non-A, Non-B-assoziierte Substanz ist gekennzeichnet durch die signifikante Bindung an Immunglobuline und die Bindung an Fab2-Bruchstücke gereinigten IgGs, durch Bindung an nicht kollagenbindende Fibronectinspaltprodukte sowie durch die Infektiösität gegenüber menschlichen Zellkulturlinien, die morphologisch darstellbar sind durch virustypische Veränderungen derselben (Flaschen) und molekulargenetisch durch den Nachweis einer spezifisch hybridisierenden, ca. 3,2 KB großen DNA innerhalb dieser Zellkulturen. Die in den infizierten Zellen sowie im Serum vom Non-A, Non-B-Hepatitis-Patienten nachweisbare DNA hybridisiert mit der aus Non-A, Non-B-Substanz isolierten, ca. 3,2 KB großen DNA bzw. der aus diesem Material hergestellten klonierten DNA.In summary, the following can be said: The non-A, non-B-associated substance is characterized by significant binding to immunoglobulins and binding IgGs purified on Fab2 fragments by binding to not collagen-binding fibronectin cleavage products and by Infectiousness to human cell culture lines that are morphologically representable through virus-typical changes the same (bottles) and molecular genetically by the Evidence of a specifically hybridizing, approximately 3.2 KB in size DNA within these cell cultures. Those in the infected Cells as well as in the serum of non-A, non-B hepatitis patients Detectable DNA hybridizes with that from non-A, non-B substance isolated, approx. 3.2 KB large DNA or the DNA from it Material produced cloned DNA.
Die Non-A, Non-B-Hepatitis-assoziierte DNA mit ca. 3,2 KB ist circulär, partiell doppelsträngig und läßt sich mit Klenow- Polymerase 1 auffüllen.The Non-A, Non-B hepatitis-associated DNA is approximately 3.2 KB circular, partially double-stranded and can be Fill in polymerase 1.
Mit der DNA ist die Expression von Virusanlagen in geeigneten Vektoren in E.coli und Hefen (Saccharomyces cereviciae) sowie Zellkulturen für die Diagnostik und die Herstellung von Immunreagentien und Vaccinen möglich. Bei der Diagnostik sind insbesondere die Untersuchung auf Infektiösität (Blutkonservenuntersuchung) und die Ausschlußdiagnostik zu nennen. With the DNA, the expression of virus systems is suitable Vectors in E.coli and yeast (Saccharomyces cereviciae) as well as cell cultures for diagnostics and the production of immune reagents and vaccines possible. When diagnosing are particular the examination for infectiousness (blood test) and to mention the exclusion diagnosis.
Eine Teilsequenz von ca. 300 Basenpaaren der klonierten DNA wurde bestimmt und mit bekannten menschlichen DNA-Sequenzen, Phagen-DNA-Sequenzen, Plasmid-DNA-Sequenzen und bekannten publizierten Virus-DNA-Sequenzen verglichen. Sie entspricht nach diesen Daten keiner bisher beschriebenen Sequenz. Nach dem offenen Leserahmen der Sequenz kann man Rückschlüsse auf die kodierten und exprimierten virusspezifischen Proteine ziehen. Damit kann man die hydrophilen und hydrophoben Regionen innerhalb der Peptide identifizieren, und somit ist die Herstellung synthetischer Peptide aus den möglichen antigenen Epitopen in den hydrophilen Regionen möglich. Dies gestattet den Antikörpernachweis in vivo und die Antikörpersynthese. A partial sequence of approximately 300 base pairs of the cloned DNA was determined and with known human DNA sequences, Phage DNA sequences, plasmid DNA sequences and known published Virus DNA sequences compared. It corresponds after this data no sequence described so far. To conclusions can be drawn from the open reading frame of the sequence the encoded and expressed virus-specific proteins pull. This allows you to see the hydrophilic and hydrophobic regions identify within the peptides, and thus the Production of synthetic peptides from the possible antigens Epitopes possible in the hydrophilic regions. This allows antibody detection in vivo and antibody synthesis.
Claims (8)
Priority Applications (13)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19873705512 DE3705512A1 (en) | 1987-02-20 | 1987-02-20 | Virus antigen, process for obtaining it and use in diagnosis and therapy (vaccine) |
DE19873744242 DE3744242A1 (en) | 1987-02-20 | 1987-12-24 | VIRUSANT, METHOD FOR ITS OBTAINMENT AND USE IN DIAGNOSIS AND THERAPY (VACCINE) |
ZA881081A ZA881081B (en) | 1987-02-20 | 1988-02-16 | Virus antigen,method for its preparation and its use for diagnostic and therapeutic purposes(vaccines) |
AU13476/88A AU620801B2 (en) | 1987-02-20 | 1988-02-19 | Viral antigen, process for its production, and application in diagnosis and therapy (vaccine) |
EP88102469A EP0279460A1 (en) | 1987-02-20 | 1988-02-19 | Virus antigen, method for its preparation and its use in diagnosis and therapy (as a vaccine) |
JP63501989A JPH01502956A (en) | 1987-02-20 | 1988-02-19 | Viral antigens, their production methods and their use for diagnosis and treatment (vaccines) |
PCT/EP1988/000123 WO1988006184A1 (en) | 1987-02-20 | 1988-02-19 | Viral antigen, process for its production, and application in diagnosis and therapy (vaccine) |
CN198888101839A CN88101839A (en) | 1987-02-20 | 1988-02-20 | Virus antigen, its preparation method and the application (vaccine) in diagnosis and treatment |
NO884654A NO884654L (en) | 1987-02-20 | 1988-10-19 | THE VIRUS ANTI, THE PROCEDURE FOR ITS MANUFACTURING AND USE IN DIAGNOSIS AND THERAPY (VACCINE). |
DK582088A DK582088A (en) | 1987-02-20 | 1988-10-19 | ANTI-VIRUS ANTI-METHOD OF ITS MANUFACTURING AND USE IN DIAGNOSIS AND THERAPY (VACCINE) |
FI884823A FI884823A0 (en) | 1987-02-20 | 1988-10-19 | VIRUSANTIGEN, FOERFARANDE FOER DESS FRAMSTAELLNING OCH ANVAENDNING VID DIAGNOS OCH TERAPI. |
KR1019880701307A KR890700662A (en) | 1987-02-20 | 1988-10-19 | Viral antigens and methods for their preparation and methods of use for diagnostic and therapeutic purposes |
SU894356796A SU1711676A3 (en) | 1987-02-20 | 1989-10-19 | Method of dna isolation for diagnosis of non-a,non-b- hepatitis |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19873705512 DE3705512A1 (en) | 1987-02-20 | 1987-02-20 | Virus antigen, process for obtaining it and use in diagnosis and therapy (vaccine) |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DE3705512A1 DE3705512A1 (en) | 1988-09-01 |
DE3705512C2 true DE3705512C2 (en) | 1991-10-02 |
Family
ID=6321438
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE19873705512 Granted DE3705512A1 (en) | 1987-02-20 | 1987-02-20 | Virus antigen, process for obtaining it and use in diagnosis and therapy (vaccine) |
Country Status (3)
Country | Link |
---|---|
DE (1) | DE3705512A1 (en) |
SU (1) | SU1711676A3 (en) |
ZA (1) | ZA881081B (en) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
MD34Z5 (en) * | 2008-05-20 | 2010-01-31 | Национальный Центр Общественного Здоровья Министерства Здравоохранения Республики Молдова | Method for diagnosing the viral hepatitis B to babies of up to one year |
MD1166Z (en) * | 2017-01-19 | 2018-02-28 | Национальный Центр Общественного Здоровья Министерства Здравоохранения Республики Молдова | Method for testing donor blood for viral hepatitis B markers |
-
1987
- 1987-02-20 DE DE19873705512 patent/DE3705512A1/en active Granted
-
1988
- 1988-02-16 ZA ZA881081A patent/ZA881081B/en unknown
-
1989
- 1989-10-19 SU SU894356796A patent/SU1711676A3/en active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
DE3705512A1 (en) | 1988-09-01 |
ZA881081B (en) | 1988-08-11 |
SU1711676A3 (en) | 1992-02-07 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Libbey et al. | Use of abdominal fat tissue aspirate in the diagnosis of systemic amyloidosis | |
EP0279460A1 (en) | Virus antigen, method for its preparation and its use in diagnosis and therapy (as a vaccine) | |
DE4040339C2 (en) | Viral agent | |
DE68929467T2 (en) | HIV-2 variants | |
Babudieri | Laboratory diagnosis of leptospirosis | |
Sheldrake et al. | Intestinal uptake of intact maternal lymphocytes by neonatal rats and lambs | |
Formal et al. | Failure of parenteral vaccines to protect monkeys against experimental shigellosis | |
DE69432658T2 (en) | RIB PROTEIN, A SURFACE PROTEIN WHICH IMMUNITY PROVIDES AGAINST MANY STREPTOCOCCUS STRAINS OF GROUP B, CLEANING PROCEDURE FOR THE RIB PROTEIN, TEST SET AND PHARMACEUTICAL COMPILATION (MEDICINE) | |
DE69329642T3 (en) | BREITREAKTIVE OPSONIC ANTIBODIES THAT RESPOND WITH COMMON ANTIGENES OF STAPHYLOCOCCUS | |
DE3619902A1 (en) | CMV DNA STRUCTURES, EXPRESSION VECTOR DAFUER, CMV PROTEIN STRUCTURES AND THEIR USE | |
Andrea da Rocha et al. | Detection of mycoplasmalike organisms in situ by indirect immunofluorescence microscopy | |
EP0124896B1 (en) | Process for obtaining viruses or virusantigens and use thereof in diagnosis and therapy (vaccine) | |
Oda et al. | Isolation of a Coxiella burnetii strain that has low virulence for mice from a patient with acute Q fever | |
DE69633233T2 (en) | MULTIVALENCE AGAINST BOVINE CORONAVIRUS AND METHOD FOR THE TREATMENT OF INFECTION WITH BOVINE CORONAVIRUS | |
DE3705512C2 (en) | ||
DE2610717B2 (en) | Hepatitis B vaccine and process for its preparation | |
CH652032A5 (en) | METHOD FOR PRODUCING IMMUNIOLOGICAL PREPARATIONS SUITABLE FOR DETECTING, PREVENTING AND / OR TREATING CANDIDA GUILLIERMONDII INFECTION. | |
Murphy et al. | Cryptococcal culture filtrate antigen for detection of delayed-type hypersensitivity in cryptococcosis | |
DE3410694C2 (en) | ||
Whittington et al. | Effects of the severity and duration of lesions on the primary and anamnestic humoral responses of sheep to Dichelobacter nodosus and observations of natural resistance to footrot | |
EP0061740A2 (en) | Process for the production of hybridisation probes | |
EP1238280A2 (en) | Agents and method for diagnosing lyme disease and borreliosis vaccine | |
DE60128569T2 (en) | NEOSPORA CANINUM ISOLATE | |
DE2810506A1 (en) | PROCEDURE FOR DETECTION OF ANTIBODIES AGAINST DANE CORE ANTIGENTS AND REAGENTS FOR CARRYING OUT THE PROCEDURE | |
Havlíček | M Protein of Type 12 Streptococcus pyogenes: Isolation by Electrofocusing and some Molecular Weight-Dependent Properties |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
OP8 | Request for examination as to paragraph 44 patent law | ||
AG | Has addition no. |
Ref country code: DE Ref document number: 3744242 Format of ref document f/p: P |
|
AG | Has addition no. |
Ref country code: DE Ref document number: 3744242 Format of ref document f/p: P |
|
D2 | Grant after examination | ||
8364 | No opposition during term of opposition | ||
8327 | Change in the person/name/address of the patent owner |
Owner name: SEELIG, HANS PETER, PROF. DR.MED., 76133 KARLSRUHE |
|
8381 | Inventor (new situation) |
Free format text: SEELIG, RENATE DR., 76133 KARLSRUHE, DE SEELIG, PROF.DR.MED., HANS PETER, 76133 KARLSRUHE, DE BUCKHARDT, JEAN DR., 76133 KARLSRUHE, DE |
|
8339 | Ceased/non-payment of the annual fee |