DE19928073B4 - Transconjugation plasmid for the mutagenesis of Pasteurellaceae - Google Patents

Transconjugation plasmid for the mutagenesis of Pasteurellaceae Download PDF

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Abstract

Transkonjugationsplasmid für die Einführung unmarkierter Deletionen in das Chromosom von Bakterien der Familie Pasteurellaceae, bestehend aus:
a) der Mobilisierungsregion mobRP4,
b) einem Polylinker,
c) einem Replikon des Col E1 Typs,
d) einer Resistenzdeterminante
e) einer transskriptionellen Fusion des Bacillus subtilis sacB-Gens mit dem Actinobacillus pleuropneumoniae omlA-Promotor.
Transconjugation plasmid for the introduction of unlabelled deletions into the chromosome of bacteria of the family Pasteurellaceae, consisting of:
a) mobilization region mobRP4,
b) a polylinker,
c) a replica of the Col E1 type,
d) a resistance determinant
e) a transcriptional fusion of the Bacillus subtilis sacB gene with the Actinobacillus pleuropneumoniae omlA promoter.

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Description

Die vorliegende Erfindung betrifft ein Transkonjugationsplasmid zur Mutagenese von Bakterien der Familie Pasteurellaceae. Genauer gesagt handelt es sich um ein Transkonjugationsplasmid für die Einführung unmarkierter Deletionen in diese Bakterien.The The present invention relates to a transconjugation plasmid for Mutagenesis of bacteria of the family Pasteurellaceae. More precisely it is a transconjugation plasmid for the introduction of unlabelled Deletions in these bacteria.

Actinobacillus (A.) pleuropneumoniae, ein Bakterium aus der Familie der Pasteurellaceae, ist ein hoch infektiöser Krankheitserreger im Respirationstrakt von Schweinen, der weltweit zu erheblichen ökonomischen Verlusten führt (Sebunya und Saunders 1983: Haemophilus pleuropneumoniae infection in swine: a review. J. Am. Vet. Med. Assoc. 182: 1331-1337; Fenwick und Henry 1994: Porcine pleuropneumonia. J. Am. Vet. Med. Assoc. 204: 1224-1340). Zum gegenwärtigen Zeitpunkt sind 12 Serotypen, (basierend auf Polysaccharidantigenen) identifiziert (Perry et al. 1990: Structural characteristics of the antigenic capsular polysaccharides and lipopolysaccharides involved in the serological classification of Actinobacillus pleuropneumoniae strains. Serodiag. Immunother. Infect. Dis. 4: 299-308). Die auf den Serotypen basierende Differenzierung korreliert mit Ergebnissen, die sowohl durch Untersuchungen zur elektrophoretischen Mobilität von Äußere-Membranproteinen und Enzymen (Multilokusenzymelektrophorese; Musser et al. 1987: Clonal diversity in Haemophilus pleuropneumoniae. Infect. Immun. 55: 1207-1215), als auch durch Toxintypisierung (Frey et al. 1995: Development of an efficient PCR method for toxin typing of Actinobacillus pleuropneumoniae strains. Mol. Cell. Probes 9: 277-282) und Analyse der Verwandschaftsbeziehungen aufgrund von Restriktionsenzympolymorphismen (Chevallier et al. 1998: Chromosome sizes and phylogenetic relationships between serotypes of Actinobacillus pleuropneumoniae. FEMS Microbiol. Lett. 160: 209-216) erzielt wurden.Actinobacillus (A.) pleuropneumoniae, a bacterium of the family Pasteurellaceae, is a highly infectious Pathogens in the respiratory tract of pigs, the world to significant economic losses leads (Sebunya and Saunders 1983: Haemophilus pleuropneumoniae infection in swine: a review. J. Am. Vet. Med. Assoc. 182: 1331-1337; Fenwick and Henry 1994: Porcine pleuropneumonia. J. Am. Vet. Med. Assoc. 204: 1224-1340). At the present time are 12 serotypes, identified (based on polysaccharide antigens) (Perry et al., 1990: Structural characteristics of the antigenic capsular polysaccharides and lipopolysaccharides involved in the serological classification of Actinobacillus pleuropneumoniae strains. Serodiag. Immunother. Infect. Dis. 4: 299-308). The on the serotypes based differentiation correlates with results that both by studies on the electrophoretic mobility of outer membrane proteins and enzymes (multi-nucleus enzyme electrophoresis; Musser et al., 1987: Clonal diversity in Haemophilus pleuropneumoniae. Infect. Immune. 55: 1207-1215) as well as by toxin typing (Frey et al., 1995: Development of an efficient PCR method for toxin typing of Actinobacillus pleuropneumoniae strains. Mol. Cell. Probes 9: 277-282) and analysis of relationship relationships due to restriction enzyme polymorphisms (Chevallier et al. 1998: Chromosome sizes and phylogenetic relationships between serotypes of Actinobacillus pleuropneumoniae. FEMS Microbiol. Lett. 160: 209-216).

Eine Impfung gegen A. pleuropneumoniae schützt erfolgreich gegen die klinische Erkrankung. Konventionelle Vakzinen sind jedoch in ihrer protektiven Wirkung auf den Serotyp, der für die Bakterin-Produktion eingesetzt wurde, beschränkt und verhindern darüber hinaus nicht eine Besiedlung durch den Erreger (Nielsen 1974: Pleuropneumonia of swine caused by Haemophilus pleuropneumoniae. Studies on the protection obtained by vaccination. Nord. Vet. Med. 28: 337-338; Rosendal et al. 1981: Vaccination against pleuropneumonia in pigs caused by Haemophilus pleuropneumoniae. Can. Vet. J. 22: 34-35; Higgins et al. 1985: Evaluation of a killed vaccine against porcine pleuropneumonia due to Haemophilus pleuropneumoniae. Can. Vet. J. 26: 86-89). Im Gegensatz dazu sind Tiere, die eine natürliche oder experimentelle Infektion mit einem A. pleuropneumoniae-Serotyp überstanden haben, unabhängig vom jeweiligen Serotyp vor klinischen Symptomen geschützt (Nielsen 1984: Haemophilus pleuropneumoniae serotypes – cross protection experiments. Nord. Vet. Med. 36: 221-234; Prideaux et al. 1999: Vaccination and protection of pigs against pleuropneumonia with a vaccine strain of Actinobacillus pleuropneumoniae produced by site-specific mutagenesis of the APXII operon. Infect. Immun. 67: 1962-1966), obwohl eine Besiedlung mit heterologen Serotypen noch durchaus möglich ist (Cruijsen et al. 1995: Convalescent pigs are protected completely against infection with a homologous Actinobacillus pleuropneumoniae strain but incompletely against a heterologous serotype strain. Infect. Immun. 63: 2341-2343). In neueren Arbeiten wurde gezeigt, daß eine Kreuzprotektion auch durch Impfung mit einer attenuierten Lebendvakzine zu erreichen ist (Prideaux et al. 1999: Vaccination and protection of pigs against pleuropneumonia with a vaccine strain of Actinobacillus pleuropneumoniae produced by site-specific mutagenesis of the APXII operon. Infect. Immun. 67: 1962-1966).A Vaccination against A. pleuropneumoniae successfully protects against the clinical Illness. However, conventional vaccines are protective in their Effect on the serotype that is responsible for The bacterin production was used, limited and prevent beyond not a colonization by the pathogen (Nielsen 1974: Pleuropneumonia of swine caused by Haemophilus pleuropneumoniae. Studies on the protection obtained by vaccination. Nord. Vet. Med. 28: 337-338; Rosendal et al. 1981: Vaccination against pleuropneumonia in pigs caused by Haemophilus pleuropneumoniae. Can. Vet. J. 22: 34-35; Higgins et al. 1985: Evaluation of a killed vaccine against porcine pleuropneumonia due to Haemophilus pleuropneumoniae. Can. Vet. J. 26: 86-89). In contrast, animals that are a natural or survived experimental infection with an A. pleuropneumoniae serotype have, independent protected from clinical symptoms by the respective serotype (Nielsen 1984: Haemophilus pleuropneumoniae serotypes - cross protection experiments. Nord. Vet. Med. 36: 221-234; Prideaux et al. 1999: Vaccination and Protection of pigs against pleuropneumonia with a vaccine strain of Actinobacillus pleuropneumoniae produced by site-specific mutagenesis of the APXII operon. Infect. Immune. 67: 1962-1966), although one Colonization with heterologous serotypes is still possible (Cruijsen et al. 1995: Convalescent pigs are protected completely against infection with a homologous Actinobacillus pleuropneumoniae strain but incompletely against a heterologous serotype strain. Infect. Immune. 63: 2341-2343). Recent work has shown that cross-protection also by vaccination with an attenuated live vaccine to achieve (Prideaux et al 1999: Vaccination and protection of pigs against pleuropneumonia with a vaccine strain of Actinobacillus pleuropneumoniae produced by site-specific mutagenesis of the APXII operon. Infect. Immune. 67: 1962-1966).

US 5,801,018 offenbart Vakzinen gegen Actinobacillus pleuropneumoniae. Die Vakzinen enthalten zumindest ein Transferrin-bindendes Protein und/oder ein Zytolysin von Actinobacillus pleuropneumoniae und/oder einen Actinobacillus pleuropneumoniae APP4. Darüberhinaus werden die für diese Proteine kodierende DNA-Sequenzen, die Vektoren, die diese Sequenzen beinhalten, sowie die Wirtszellen, die mit diesen Vektoren transformiert sind, offenbart. Die Vakzinen können zur Behandlung oder zur Vorbeugung von respiratorischen Infektionen bei Schweinen eingesetzt werden. US 5,801,018 discloses vaccines against Actinobacillus pleuropneumoniae. The vaccines contain at least one transferrin-binding protein and / or a cytolysin of Actinobacillus pleuropneumoniae and / or an Actinobacillus pleuropneumoniae APP4. In addition, the DNA sequences encoding these proteins, the vectors containing these sequences, and the host cells transformed with these vectors are disclosed. The vaccines can be used to treat or prevent respiratory infections in pigs.

US 5, 429, 818 beschreibt unbekapselte Mutanten von normal bekapselten Actinobacillus pleuropneumoniae Stämmen im Einsatz als Impfstoff. Im Be sonderen ist eine unbekapselte Mutante von Actinobacillus (Haemophilus) pleuropneumoniae beschrieben, die vor der Pleuropneumonie beim Schwein schützt. US 5, 429, 818 describes unencapsulated mutants of normally encapsulated Actinobacillus pleuropneumoniae strains in use as a vaccine. In particular, an unencapsulated mutant of Actinobacillus (Haemophilus) pleuropneumoniae is described, which protects against pleuropneumonia in pigs.

Bereits beschriebene Methoden für die Actinobacillus pleuropneumoniae-Mutagenese beschränkten sich auf die Insertions-Knockout-Mutagenese (Jansen et al. 1995: Knockout mutants of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 1 that are devoid of RTX toxins do not activate or kill porcine neutrophils. Infect. Immun. 63: 27-37; Fuller et al. 1996: A riboflavin auxotroph of Actinobacillus pleuropneumoniae is attenuated in swine. Infect. Immun. 64: 4659-4664; Prideaux et al. 1999: Vaccination and protection of pigs against pleuropneumonia with a vaccine strain of Actinobacillus pleuropneumoniae produced by site-specific mutagenesis of the APXII operon. Infect. Immun. 67: 1962-1966) oder Transposon-Shuttle-Mutagenese-Techniken (Tascon et al. 1993: Transposon mutagenesis in Actinobacillus pleuropneumoniae with a Tn10 derivative. J. Bact. 175: 5717-5722; Tascon-Cabrero et al. 1997: Actinobacillus pleuropneumoniae does not require urease activity to produce acute swine pleuropneumonia. FEMS Microbiol. Lett. 148: 53-57). Darüber hinaus stehen keine selektierbaren Marker für den Gebrauch dieses Bakteriums zur Verfügung. Es ist daher wünschenswert, attenuierte und phänotypisch unterscheidbare Mutanten ohne Antibiotika-Marker als Kandidatenimpfstoffe zu entwickeln. Die Gegenselektion mit Hilfe des sacB-Gens von Bacillus subtilis ist bei einer Reihe von gramnegativen Bakterien erfolgreich etabliert (Reyrat et al. 1998: Counterselectable markers: Untapped tools for bacterial genetics and pathogenesis. Infect. Immun. 66: 4011-4017).Methods already described for Actinobacillus pleuropneumoniae mutagenesis have been limited to insertion knockout mutagenesis (Jansen et al., 1995): Knockout mutants of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 1 that are devoid of RTX toxins do not activate or kill porcine neutrophils. 63: 27-37; Fuller et al 1996: A riboflavin auxotroph of Actinobacillus pleuropneumoniae attenuated in swine Infect Immun 64: 4659-4664; Prideaux et al 1999: Vaccination and protection of pigs against pleuropneumo Actinobacillus pleuropneumoniae produced by site-specific mutagenesis of the APXII operon. Infect. Immune. 67: 1962-1966) or transposon shuttle mutagenesis techniques (Tascon et al 1993: Transposon mutagenesis in Actinobacillus pleuropneumoniae with a Tn10 derivative J. Bact 175: 5717-5722 Tascon-Cabrero et al 1997 Actinobacillus pleuropneumoniae does not require urease activity to produce acute swine pleuropneumonia, FEMS Microbiol., Lett., 148: 53-57). In addition, there are no selectable markers for the use of this bacterium. It is therefore desirable to develop attenuated and phenotypically distinguishable mutants without antibiotic markers as candidate vaccines. Counterselection using the Bacillus subtilis sacB gene has been successfully established in a number of Gram-negative bacteria (Reyrat et al 1998: Counterselectable markers: Untapped tools for bacterial genetics and pathogenesis, Infect. Immun. 66: 4011-4017).

Eine Methode zur Erzeugung unmarkierter Deletionen im Genom von Helicobacter pylori ist aus Copass et al. (1997: Introduction of unmarked mutations in the Helicobacter pylori vacA gene with a sucrose sensitivity marker. Infect Immun. 65: 1949-1952) bekannt. Darin wird ein zweistufiges Transkonjugationssystem beschrieben, das auf einem Plasmid mit einer kan-sacB-Kasette unter Kontrolle des H. pylori-spezifischen Flagellin-Promotors basiert.A Method for generating unlabelled deletions in the genome of Helicobacter pylori is from Copass et al. (1997: Introduction of unmarked mutations in the Helicobacter pylori vacA gene with a sucrose sensitivity marker. Infect immune. 65: 1949-1952). This is a two-stage Transkonjugationssystem described on a plasmid with a kan-sacB cassette under the control of the H. pylori-specific flagellin promoter based.

Die Selektion allelischer Austauschmutanten in Mykobakterien wird in der US-Patentschrift 5,843,664 beschrieben. Das dabei verwendete Verfahren basiert auf einem Plasmid, das als Fusion das sacB-Gen und die mutierte Sequenz des zu inaktivierenden Gens enthält.The Selection of allelic mutant replacements in mycobacteria is reported in U.S. Patent 5,843,664. The used Method is based on a plasmid that as fusion the sacB gene and contains the mutated sequence of the gene to be inactivated.

Von Jost et al. (1997: The sacB gene cannot be used as a counter-selectable marker in Pasteurella multocida. Mol. Biotechnol. 8: 189-191) ist gezeigt worden, dass die Verwendung des sacB-Gens als Marker zur Gegenselektion in Stämmen von Pasteurella multocida dabei nicht geeignet ist.From Jost et al. (1997: The sacB gene can not be used as a counter-selectable marker in Pasteurella multocida. Mol. Biotechnol. 8: 189-191) It has been shown that the use of the sacB gene as a marker for Counterselection in trunks Pasteurella multocida is not suitable.

Aufgabe der vorgelegten Erfindung ist es daher, ein einfaches und effektives genetisches Werkzeug zur Einführung unmarkierter Deletionen in das Chromosom von Bakterien der Familie Pasteurellaceae und hierbei im Besonderen der Gattung Actinobacillus zur Verfügung zu stellen.task The present invention is therefore a simple and effective genetic tool for introduction unlabelled deletions into the chromosome of family bacteria Pasteurellaceae and here in particular the genus Actinobacillus to disposal to deliver.

Diese Aufgabe wird durch ein Transkonjugationsplasmid gelöst, welches aus einer mobilisierenden Region mobRP4, einem Polylinker, einem Replikon des Col E1 Typs, einem resistenzvermittelnden Gen und einer transkriptionellen Fusion zwischen dem Bacillus subtilis-sacB-Gen und dem omlA-Promotor von Actinobacillus pleuropneumoniae besteht. Zur einfacheren Be schreibung der vorgelegten Erfindung wird das genannte Plasmid als pBMK1 bezeichnet.These Task is solved by a Transkonjugationsplasmid, which from a mobilizing region mobRP4, a polylinker, one Replicon of the Col E1 type, a resistance-mediating gene and a transcriptional fusion between the Bacillus subtilis sacB gene and the omlA promoter of Actinobacillus pleuropneumoniae. For ease of description of the present invention Be the called plasmid referred to as pBMK1.

Eine weitere bevorzugte Ausführungsform der Erfindung ist dadurch gekennzeichnet, daß ein Segment exogener DNA in den Polylinker des Plasmids eingesetzt wurde. Dieses Segment exogener DNA beinhaltet z.B. ein modifiziertes Actinobacillus pleuropneumoniae-ureC-Gen in dem beschriebenen Polylinker.A further preferred embodiment The invention is characterized in that a segment of exogenous DNA was used in the polylinker of the plasmid. This segment exogenous DNA includes e.g. a modified Actinobacillus pleuropneumoniae acidC gene in the described polylinker.

Eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es, ein einfaches und effektives Verfahren zur Einfügung unmarkierter Deletionen in das Chromosom von Bakterien der Familie Pasteurellaceae und hierbei im besonderen der Gattung Actinobacillus zur Verfügung zu stellen.A Another object of the present invention is to provide a simple and effective method for the insertion of unlabelled deletions into the chromosome of bacteria of the family Pasteurellaceae and here in the particular of the genus Actinobacillus.

Diese Aufgabe der vorliegenden Erfindung wird durch ein Verfahren zur Mutagenese von Bakterien der Familie Pasteurellaceae gelöst, welches erfindungsgemäß die Schritte der Transkonjugation des Plasmids von einem Escherichia coli-Mobilisierungsstamm in den zu mutagenisierenden Bakterienstamm aus der Familie Pasteurellaceae umfaßt sowie die positive Selektion oder das Screening auf Auxotrophie des Pasteurellaceae-Stamms, welcher das transkonjugierte Plasmid stabil im Chromosom integriert hat, als auch eine Gegenselektion mit Saccharose und ein Screening des Saccharose-resistenten Stamms auf einen Stamm, welcher eine unmarkierte Deletion an der entsprechenden Stelle des Chromosoms besitzt.These Object of the present invention is achieved by a method for Mutagenesis of bacteria of the family Pasteurellaceae solved, which According to the invention, the steps transconjugation of the plasmid from an Escherichia coli mobilization strain in the mutagenized bacterial strain of the family Pasteurellaceae comprises and positive selection or screening for auxotrophy of the Pasteurellaceae strain containing the transconjugated plasmid stably integrated into the chromosome, as well as a counterselection with sucrose and a screening of the sucrose-resistant strain to a strain which has an unlabelled deletion at the corresponding Owns the site of the chromosome.

Ein erfindungsgemäß verwendbares Plasmid ist pBMKΔ1. Dieser Vektor kann z.B. als ein positives Testsystem für das erfinderische Verfahren verwendet werden. In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform der vorliegenden Erfindung gehören die zu mutierenden Bakterien zu der Gattung Actinobacillus. Am meisten bevorzugt ist ein Stamm von Actinobacillus pleuropneumoniae.One usable according to the invention Plasmid is pBMKΔ1. This vector may e.g. as a positive test system for the inventive Procedure can be used. In a further preferred embodiment of the present invention the bacteria to be mutated into the genus Actinobacillus. Most preferred is a strain of Actinobacillus pleuropneumoniae.

Weitere bevorzugte Ausführungsformen sind in den abhängigen Ansprüchen gekennzeichnet.Further preferred embodiments are in the dependent claims characterized.

Um ein universelles System zur Einführung unmarkierter Mutationen in Actinobacillus pleuropneumoniae zur Verfügung zu stellen, wurde der Vektor pBMK1 konstruiert. Für den Einsatz dieses Vektors sind Transkonjuganten notwendig, die stabile Plasmidkointegrate enthalten und basierend auf ihrer Antibiotikaresistenz selektiert sind. Die folgende Gegenselektion benötigt nur ein einziges Crossover-Ereignis um eine unmarkierte Deletionsmutante hervorzubringen. Dieses erfindungsgemäße System erleichtert die effektive Einführung einer unmarkierten ureC-Deletion in das Genom von Actinobacillus pleuropneumoniae. Im Prinzip ermöglicht es auch die konsekutive Einführung von verschiedenen unmarkierten Mutationen. Dieses System erleichtert die Konstruktion einer nicht attenuierten Actinobacilluspleuropneumoniae-Lebendvakzine, die, um zusätzlich einen bestimmbaren und leicht detektierbaren Phänotyp zu besitzen, eine Differenzierung zwischen geimpften und infizierten Tieren möglich macht.Around a universal system for introduction unlabeled mutations in Actinobacillus pleuropneumoniae For example, the vector pBMK1 was constructed. For the use of this vector Transconjugants are necessary, the stable plasmid cointegrate contained and selected based on their antibiotic resistance are. The following counterselection requires only a single crossover event to produce an unlabelled deletion mutant. This inventive system facilitates the effective introduction an unlabelled ureC deletion into the genome of Actinobacillus pleuropneumoniae. In principle allows it is also the consecutive introduction of various unlabelled mutations. This system facilitates the construction of an unimpregnated Actinobacilluspleuropneumoniae live vaccine, the, in addition to have a determinable and easily detectable phenotype, a differentiation between vaccinated and infected animals.

Um ein erfindungsgemäßes Transkonjugationsplasmid zur Verfügung zu stellen, wurde eine transkriptionelle Fusion zwischen dem Actinobacillus pleuropneumoniae omlA-Promotor und dem Bacillus subtilis sacB-Gen durchgeführt. Überraschenderweise konnte gezeigt werden, daß ein Escherichia coli-Actinobacillus pleuropneumoniae-Shuttlevektor, der dieses Konstrukt beinhaltet, in Anwesenheit von 10 % Saccharose effektiv aus den Actinobacillus pleuropneumoniae-Transformanten kuriert werden konnte. Dieses bedeutet, daß sacB als gegenselektiver Marker in Actinobacillus pleuropneumoniae benutzt werden kann, während in der Literatur beschrieben ist, daß dieses bei Pasteurella (P.) multocida, ebenfalls ein Angehöriger der Familie Pasteurellaceae, nicht der Fall ist (Jost et al. 1997: The sacB gene cannot be used as a counter-selective marker in Pasteurella multocida. Mol. Biotechnol. 8: 189-191).Around a transconjugation plasmid according to the invention to disposal To put, was a transcriptional fusion between the Actinobacillus pleuropneumoniae omlA promoter and the Bacillus subtilis sacB gene carried out. Surprisingly could be shown that a Escherichia coli Actinobacillus pleuropneumoniae shuttle vector, containing this construct, in the presence of 10% sucrose effectively from the Actinobacillus pleuropneumoniae transformants could be cured. This means that sacB is counterselective Marker in Actinobacillus pleuropneumoniae can be used while in the literature is described that this in Pasteurella (P.) multocida, also a relative the family Pasteurellaceae, is not the case (Jost et al 1997: The sacB gene can not be used as a counter-selective marker in Pasteurella multocida. Mol. Biotechnol. 8: 189-191).

Überraschenderweise konnte gezeigt werden, daß die Methode, basierend auf einer transkriptionellen Fusion zwischen dem sacB-Gen und dem Actinobacillus pleuropneumonia-omlA-Promotor einschließlich einer nachfolgenden positiven und negativen Selektion, dazu benutzt werden kann, unmarkierte Knockout-Mutanten in Actinobacillus pleuropneumoniae, einem Angehörigen der Familie Pasteurellaceae, zu konstruieren.Surprisingly could be shown that the Method based on a transcriptional fusion between the sacB gene and the Actinobacillus pleuropneumonia omlA promoter including a subsequent positive and negative selection, used unmarked knockout mutants in Actinobacillus pleuropneumoniae, a relative of the family Pasteurellaceae, to construct.

Die Erfindung wird durch die folgende detaillierte Beschreibung der vorliegenden Erfindung, im Zusammenhang mit den angefügten Ansprüchen, der Beschreibung und den beiliegenden Figuren, besser verständlich, worin:The The invention will be better understood by the following detailed description of present invention, in conjunction with the appended claims, the Description and the attached figures, better understood, wherein:

1 die physikalische Karte des im Rahmen der Erfindung konstruierten Plasmids zeigt. Die Konstruktion der Plasmide pJUK04, pJUOK14 und pJUOK27 erforderte einige zwischengeschaltete Klonierungsschritte. Kurz gesagt, ein BamHI-PstI-Fragment (welches das sacB-Gen enthält) wurde in die BamHI-PstI-Schnittstelle des pBluescript-SK-Vektor ligiert; dann wurde das PstI-Fragment aus pUC4K (welches die Kanamycin-Resistenz (kmr) trägt) in die PstI-Schnittstelle ligiert und ergab damit das Plasmid pSB5. Schließlich wurde der omlA-Promotor mittels PCR unter Einsatz der Primer olp1B und olp2 amplifiziert, das PCR-Produkt mit BamHI und BglII geschnitten und in die einzige BamHI-Schnittstelle in beiden Orientierungen ligiert, was im Plasmid pSOP12 (Gegenrichtung) und pSOP15 (transkriptionelle Fusion) resultierte. Danach wurde die ureC-sacB-kmr-Kassette konstruiert. Kurz gesagt, das ureC-Gen wurde mittels PCR unter Einsatz der Primer ureC2 und ureX amplifiziert, das PCR-Produkt mit BamHI und SalI geschnitten und in einen mit BamHI und SalI geschnittenen pBluescript-SK-Vektor ligiert. Danach wurde das SphI-BstEII-Fragment aus dem ligierten ureC-Gen entfernt, die Enzymschnittstellen wurden stumpfendig gemacht und ein stumpfendig gemachtes XbaI-SalI-Fragment, das die sacB-kmr-Kassette aus pSB5, pSOP12 oder pSOP15 enthielt, wurde eingefügt. Aus diesen pBluescript-Derivaten wurde die ureC-sacB-kmr-Kassette auf einem stumpfendig gemachten ApaI-SacI-Fragment liegend und in die stumpfendig gemachte ClaI-Schnittstellen von pJFF244 ligiert, was zu den Plasmiden pJUK04, pJUOK14 und pJUOK27 führte. Die Plasmide pRUOK23 und pRUOK29 enthalten dasselbe ApaI-SacI-Fragments, wie es in pJUOK 27 vorhanden ist; es wurde in beiden Orientierungen in die stumpfendig gemachte EcoRI-Schnittstelle von pBOR8 ligiert. Die Konstruktion des Plasmids pBMK1 benötigte ebenfalls einige zwischengeschaltete Klonierungsschritte. Die sacB-kmr-Kassette wurde von pSOP15 auf einem SacI-SalI-Fragment liegend entfernt, stumpfendig gemacht, und in die stumpfendig gemachte EcoRI-Schnittstelle von pBOR8 kloniert, was zu dem Plasmid pROKB1 führte. Ein BamHI-Fragment aus pBOR, (welches mobRP4 enthält) wurde stumpfendig gemacht und in den SacI-geschnittenen und stumpfendig gemachten pBluescript-SK ligiert, wodurch der Vektor pBluescript-RP4 entstand. Danach wurde ein stumpfendig gemachtes BamHI-SacI-Fragment aus pROKB1 (welches die sacB-kmr-Kassette enthält) in eine stumpfendig gemachte KpnI-Schnittstelle von pBluescript-RP4 ligiert und somit das pBMK1 konstruiert. Die mit „C" markierten offenen Kästen und die Pfeile bezeichnen die Position und Orientierung der ureC-Sequenz. Der mit sacB und kmr bezeichnete offene Pfeil bezeichnet den Ort und die Orientierung des sacB-Gens und der Kanamycin-Resistenz vermittelten Determinanten. Die gefüllten Pfeilspitze an dem einen Ende des sacB-Gens markiert den Ort und die Orientierung des omlA-Promotors (omlA-P). Die nur einmal vorkommenden Restriktionsenzym-Schnittstellen in pBMK1 sind mit einem Stern markiert. 1 shows the physical map of the plasmid constructed within the scope of the invention. The construction of plasmids pJUK04, pJUOK14 and pJUOK27 required some intermediate cloning steps. Briefly, a BamHI-PstI fragment (containing the sacB gene) was ligated into the BamHI-PstI site of the pBluescript SK vector; then the PstI fragment from pUC4K (carrying kanamycin resistance (km r )) was ligated into the PstI site to give plasmid pSB5. Finally, the omlA promoter was amplified by PCR using primers olp1B and olp2, the PCR product was digested with BamHI and BglII and ligated into the unique BamHI site in both orientations, resulting in plasmid pSOP12 (opposite direction) and pSOP15 (transcriptional fusion ) resulted. Thereafter, the ureC-sacB-km r cassette was constructed. Briefly, the ureC gene was amplified by PCR using primers ureC2 and ureX, the PCR product was cut with BamHI and SalI and ligated into a BamHI and SalI cut pBluescript SK vector. Thereafter, the SphI-BstEII fragment was removed from the ligated ureC gene, the enzyme cleavage sites were blunt-ended, and a blunt-ended XbaI-SalI fragment containing the sacB-km r cassette from pSB5, pSOP12 or pSOP15 was inserted. From these pBluescript derivatives, the ureC-sacB-km r cassette was located on a blunt-ended ApaI-SacI fragment and ligated into the blunt-ended ClaI sites of pJFF244 resulting in plasmids pJUK04, pJUOK14 and pJUOK27. The plasmids pRUOK23 and pRUOK29 contain the same ApaI-SacI fragment as present in pJUOK 27; it was ligated in both orientations into the blunt-ended EcoRI site of pBOR8. The construction of plasmid pBMK1 also required some intermediate cloning steps. The sacB-km r cassette was removed from pSOP15 on a SacI-SalI fragment, blunt-ended, and cloned into the blunt-ended EcoRI site of pBOR8, resulting in the plasmid pROKB1. A BamHI fragment from pBOR (containing mobRP4) was blunt-ended and ligated into the SacI-cut and blunt-ended pBluescript-SK resulting in the vector pBluescript-RP4. Thereafter, a blunt-ended BamHI-SacI fragment from pROKB1 (containing the sacB-km r cassette) was ligated into a blunt-ended KpnI site of pBluescript-RP4, thus constructing the pBMK1. The open boxes marked with "C" and the arrows indicate the position and orientation of the ureC sequence The open arrow labeled sacB and km r indicates the location and orientation of the sacB gene and kanamycin resistance mediated determinants Arrowhead at one end of the sacB gene marks the location and orientation of the omlA promoter (omlA-P). The unique restriction enzyme sites in pBMK1 are marked with an asterisk.

2 zeigt die Resultate des Plasmid-'curing'-Experiments mit Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 Transformanten, die in PPLO-Bouillon ohne (a, b) und mit (c, d) Saccharose angezüchtet wurden. Die Transformanten wurden auf PPLO-Agarplatten ohne (a, c) und mit (b, d) Kanamycinselektion ausplattiert. Die gefüllten Symbole zeigen die arithmetischen Mittel aus vier unabhängigen Experimenten, die Balken dokumentieren die Standardabweichung. 2 shows the results of the Plasmid'curing 'experiment with Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 transformants grown in PPLO broth without (a, b) and with (c, d) sucrose. The transformants were plated on PPLO agar plates without (a, c) and with (b, d) kanamycin selection. The filled symbols show the arithmetic mean of four independent experiments, the bars document the standard deviation.

3 zeigt eine schematische Darstellung der einzelnen Crossover-Ereignisse, die zu Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 41 (unmarkiert ureasenegativ) führten. Die gefüllten Kästen am intakten ureC-Gen weisen auf die vorhandene Sequenz; die offenen Kästen weisen auf das Teilstück, welches in ureC deletiert wurde. Die unterbrochene Linie markiert die homologen Rekombinationsereignisse. 3 Figure 4 shows a schematic representation of the individual crossover events that led to Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 41 (unlabeled urease negative). The filled boxes on the intact ureC gene indicate the presence of the sequence; the open boxes indicate the section which was deleted in ureC. The broken line marks the homologous recombination events.

4 zeigt die PCR-Analyse von Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 (1), AP76 41 (2) und der Negativkontrolle (3). (A) PCR mit den Primern ureC2 und ureX; (B) Southern Blot-Analyse mit BstEII- und SphI-verdauter DNA unter Benutzung des ureC-Gens als Sonde; (C) Pulsfeldgelelektrophorese von ApaI, AscI und NotI-verdauter DNA; die weiße Pfeilspitze markiert das ApaI-Fragment, auf dem ureC-Gen kartiert werden konnte. 4 shows the PCR analysis of Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 (1), AP76 41 (2) and the negative control (3). (A) PCR with the primers ureC2 and ureX; (B) Southern blot analysis with BstEII and SphI digested DNA using the ureC gene as a probe; (C) pulsed-field gel electrophoresis of ApaI, AscI and NotI-digested DNA; the white arrowhead marks the ApaI fragment on which the ureC gene could be mapped.

Basierend auf den Ergebnissen des Plasmid-'curing'-Experiments wurde der Konstruktion einer unmarkierten, ureasenegativen Mutante nachgegangen.Based on the results of the plasmid'curing' experiment followed up the construction of an unlabeled, mutagenic mutant.

Das ureC-Gen wurde als geeignetes Ziel ausgewählt, da ureasenegative Mutanten sehr schnell aufgrund ihres Phänotyps identifiziert werden können. Dieses erschien nicht nur vorteilhaft, um die Mutageneseprozedur zu etablieren, sondern auch der Verlust der Ureaseaktivität ist ein exzellenter phänotypischer Marker für bekannte attenuierte Actinobacillus pleuropneumoniae-Lebendimpfstoffe, die durch chemische Mutagenese gewonnen wurden (Inzana et al. 1993: Safety, stability and efficacy of noncapsulated mutants of Actinobacillus pleuropneumoniae for use in live vaccines. Infect. Immun. 61: 1682-1686; Byrd und Hooke 1997: Temperature-sensitive mutants of Actinobacillus pleuropneumoniae induce protection in mice. Infect. Immun. 65: 2206-2210); so ist die überwiegende Mehrheit der klinischen Actinobacillus pleuropneumoniae-Isolate ureasepositiv und das Fehlen der Ureaseaktivität beeinflußt die Virulenz von Actinobacillus pleuropneumoniae nicht (Tascon-Cabrero et al. 1997: Actinobacillus pleuropneumoniae does not require urease activity to produce acute swine pleuropneumonia. FEMS Microbiol. Lett. 148: 53-57).The ureC gene was selected as a suitable target because urease-negative mutants very fast due to their phenotype can be identified. This not only appeared beneficial to the mutagenesis procedure but also the loss of urease activity is a excellent phenotypic Markers for known attenuated Actinobacillus pleuropneumoniae live vaccines, obtained by chemical mutagenesis (Inzana et al., 1993: Safety, stability and efficacy of noncapsulated mutants of Actinobacillus pleuropneumoniae for use in live vaccines. Infect. Immune. 61: 1682-1686; Byrd and Hooke 1997: Temperature-sensitive mutants of Actinobacillus pleuropneumoniae induce protection in mice. Infect. Immune. 65: 2206-2210); so is the vast one Majority of clinical Actinobacillus pleuropneumoniae isolates urease positive and the absence of urease activity affects the virulence of Actinobacillus pleuropneumoniae not (Tascon-Cabrero et al. 1997: Actinobacillus pleuropneumoniae does not require urease activity to produce acute swine pleuropneumonia. FEMS Microbiol. Lett. 148: 53-57).

Der ursprüngliche Ansatz, eine unmarkierte ureC-Mutante zu konstruieren, basierte auf dem für Actinobacillus pleuropneumoniae beschriebenen gerichteten Mutagenesesystem (Mulks und Buysse 1995: A targeted mutagenesis system for Actinobacillus pleuropneumoniae. Gene 165: 61-66). Die Transkonjugationsvektoren pRUOK23 und pRUOK29 trugen die sacB-kmr-Kassette im ureC-Gen und spiegelten so die allgemeinen Eigenschaften der Plasmide wider, die zuvor für die Einführung unmarkierter Mutationen in andere Bakterien genutzt worden sind (Blomfield et al. 1991: Allelic exchange in Escherichia coli using the Bacillus subtilis sacB gene and a temperaturesensitive pSC101 replicon. Mol. Microbiol. 5: 1447-1457; Copass et al. 1997: Introduction of unmarked mutations in the Helicobacter pylori vacA gene with a sucrose sensitivity marker. Infect. Immun. 65: 1949-1952). Dieser Ansatz setzt eine initiale doppelte Crossover-Rekombination voraus, wie auch einen zweiten Transkonjugationsschritt vor der Gegenselektion. Unser vergebliches Bemühen eine einzige ureasenegative, kanamycinresistente und saccharosesensitive Actinobacillus pleuropneumoniae-Serotyp 7-Mutante zu erhalten, weist auf eine niedrige Rekombinationsaktivität hin.The original approach to construct an unlabelled ureC mutant was based on the directed mutagenesis system described for Actinobacillus pleuropneumoniae (Mulks and Buysse 1995: A targeted mutagenesis system for Actinobacillus pleuropneumoniae, Gene 165: 61-66). The transconjugation vectors pRUOK23 and pRUOK29 carried the sacB-km r cassette in the ureC gene and thus reflected the general characteristics of the plasmids previously used for the introduction of unlabelled mutations into other bacteria (Blomfield et al 1991: Allelic exchange in Microbiol 5: 1447-1457; Copass et al 1997: Introduction of unmarked mutations in the Helicobacter pylori vacA gene with a sucrose sensitivity marker. 65: 1949-1952). This approach requires an initial double crossover recombination as well as a second transconjugation step before counterselection. Our futile effort to obtain a single urease-negative, kanamycin-resistant and sucrose-sensitive Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 7 mutant indicates low recombination activity.

Beispiel 1: 8. subtilis sacB-Genvermitteltes Plasmid-'curing' in Actinobacillus pleuropneumoniaeExample 1: 8. subtilis sacB Gene Mediated Plasmid'curing 'in Actinobacillus pleuropneumoniae

Das klinische Actinobacillus pleuropneumoniae Serotyp 7 Isolat AP76 wurde mit den als pJUK04, pJUOK14 und pJUOK27 bezeichneten Plasmiden elektrotransformiert (1). Alle drei Plasmide basieren auf dem Shuttlevektor pJFF224, einem Plasmid mit einer niedrigen Kopieanzahl („Low copy plasmid"), das sich in Actinobacillus pleuropneumoniae repliziert (Frey 1992: Consturction of a broad range shuttle vector for gene cloning and expression in Actionobacillus pleuropneumoniae and other Pasteurellaceae. Res. Microbiol. 143: 263-269). Alle Plasmide trugen eine Kassette, die das sacB-Gen von 8. subtilis (Gay et al. 1983: Cloning structural gene sacB, which codes for exoenzyme levansucrase of Bacillus subtilis: expression of the gene in Escherichia coli. J. Bacteriol. 153: 1424-1431), sowie die im ureC-Gen von Actinobacillus pleuropneumoniae lokalisierte, von Tn903 stammende Kanamycinresistenz-Determinante (kmr) enthält (Bosse und McInnes 1997). Der einzige Unterschied zwischen den Plasmiden war die Anwesenheit und Orientierung des von Actinobacillus pleuropneumoniae stammenden omlA-Promotors (Gerlach et al. 1993: Molecular characterization of a protective outer membrane protein (OmlA) from Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 1. Infect. Immun. 61: 565-572; 1; Tabelle 1). Um die Effizienz des Plasmid-'curing' bei der transkriptionellen Fusion zwischen dem sacB-Genprodukt und dem omlA-Promotor zu überprüfen, wurden die Actinobacillus pleuropneumoniae-Transformanten in Flüssigkultur mit und ohne Zusatz von 10% Saccharose angezüchtet und anschließend auf Platten mit und ohne Kanamycin ausplattiert (2). Die Gesamtzahl koloniebildender Einheiten (KbE) blieb über einen Inkubationszeitraum von 4 Stunden konstant bei ca. 5 × 107 KbE/ml, unabhängig von der Anwesenheit von 10% Saccharose (2a, 2c). Während dieser Inkubationszeit konnte eine Abnahme der plasmidenthaltenen Zellen sogar in Abwesenheit von Saccharose beobachtet werden, da die Anzahl der kanamycinresistenten (kmr) koloniebildenden Einheiten von 1 × 107 KbE/ml auf 1 × 105 KbE/ml absank (2b). In Anwesenheit von Saccharose nahm die Anzahl plasmidtragenden Bakterienzellen signifikant von 1 × 107 KbE/ml auf unter 40 KbE/ml innerhalb von 60 Minuten bei den Transformanten ab, die die transkriptionelle sacB-omlA- Promotorfusion beinhalteten. Im Gegensatz dazu wurde kein erhöhter Plasmidverlust während dieser Zeit bei Bakterien beobachtet, die sacB ohne transkriptionelle Fusion mit dem Actinobacillus pleuropneumoniae-omlA-Promotor enthielten (2d).The clinical Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 7 isolate AP76 was electrotransformed with the plasmids designated pJUK04, pJUOK14 and pJUOK27 ( 1 ). All three plasmids are based on the shuttle vector pJFF224, a low copy plasmid, that replicates in Actinobacillus pleuropneumoniae (Frey 1992: Consturction of a broad-spectrum shuttle vector for gene cloning and expression in Actionobacillus pleuropneumoniae and other Microbiol 143: 263-269) All plasmids carried a cassette containing the sacB gene from 8. subtilis (Gay et al 1983: Cloning structural gene sacB, which codes for exoenzyme levansucrase of Bacillus subtilis: expression of the genes in Escherichia coli J. Bacteriol 153: 1424-1431) and the Tn903-derived kanamycin resistance determinant (km r ) located in Actinobacillus pleuropneumoniae ureC gene (Bosse and McInnes 1997) between the plasmids was the presence and orientation of the omlA promoter derived from Actinobacillus pleuropneumoniae (Gerlach et al., 1993: Molecular characterization of a protec tive outer membrane protein (OmlA) from Actinobacillus pleuropneumonia serotype 1. Infect. Immune. 61: 565-572; 1 ; Table 1). To check the efficiency of plasmid'curing 'in the transcriptional fusion between the sacB gene product and the omlA promoter, the Actinobacillus pleuropneumoniae transformants were grown in liquid culture with and without the addition of 10% sucrose and then on plates with and without Kanamycin plated ( 2 ). The total number of colony-forming units (KbE) remained constant at approximately 5 × 10 7 CFU / ml over an incubation period of 4 hours, irrespective of the presence of 10% sucrose ( 2a . 2c ). During this incubation period, a decrease in plasmid-containing cells could be observed even in the absence of sucrose since the number of kanamycin-resistant (km r ) colony forming units decreased from 1 x 10 7 CFU / ml to 1 x 10 5 CFU / ml ( 2 B ). In the presence of sucrose, the number of plasmid-bearing bacterial cells decreased significantly from 1 × 10 7 CFU / ml to less than 40 CFU / ml within 60 minutes for the transformants that contained sacB-omlA transcriptional promoter fusion. In contrast, no increased plasmid loss during this time was observed in bacteria containing sacB without transcriptional fusion with the Actinobacillus pleuropneumoniae omlA promoter ( 2d ).

Diese Resultate zeigen, daß Plasmide, die eine transkriptionelle Fusion zwischen dem sacB-Gen und dem omlA-Promotor tragen, als Suizid-Vektor in Actinobacillus pleuropneumoniae verwendet werden können.These Results show that plasmids, the one transcriptional fusion between the sacB gene and the omlA promoter, as a suicide vector in Actinobacillus pleuropneumoniae can be used.

Beispiel 2: Konstruktion einer unmarkierten ureasenegativen Actinobacillus pleuropneumoniae „Knockout"-MutanteExample 2: Construction an unlabelled urease-negative Actinobacillus pleuropneumoniae knockout mutant

Die ureC-kmr-sacB-Kassette von pJUOK27 wurde in beiden Orientierungen in pBOR8 (Herrero et al. 1990: Transposon vectors containing non-antibiotic resistance selection markers for cloning and stable chromosomal insertion of foreign genes in gram-negative bacteria. J. Bacteriol. 172: 6557-6567) kloniert und ergab pRUOK23 und pRUOK29 (1). Beide Plasmide wurden in Actinobacillus pleuropneumoniae AP 76 mittels E. coli ß2155 als Spenderstamm (Dehio und Meyer 1997: Maintenance of broad-host-range incompatibility group P and group Q plasmids and transposition of Tn5 in Bartonella hensalae following conjugal plasmid transfer from Escherichia coli. J. Bacteriol. 179: 538-540) transkonjugiert. Obwohl insgesamt mehr als 500 kmr Actinobacillus pleuropneumoniae Transkonjuganten untersucht wurden, wurden keine ureasenegativen Transkonjuganten erhalten. Da aber Doppel-Crossover-Mutanten für die nachfolgende Gegenselektion erforderlich sind (Blomfield et al. 1991: Allelic exchange in Escherichia coli using the Bacillus subtilis sacB gene and a temperature-sensitive pSC101 replicon, Mol. Microbiol. 5: 1447-1457; Copass et al. 1997: Introduction of unmarked mutations in the Helicobacter pylori vacA gene with a sucrose sensitivity marker. Infect. Immun. 65: 1949-1952), wurde diese Methode als ungeeignet bewertet.The ureC-km r -sacB cassette of pJUOK27 was isolated in both orientations in pBOR8 (Herrero et al., 1990: Transposon vectors containing non-antibiotic resistance selection markers for cloning and stable chromosomal insertion of foreign genes into gram-negative bacteria. Bacteriol 172: 6557-6567) and gave pRUOK23 and pRUOK29 ( 1 ). Both plasmids were transfected into Actinobacillus pleuropneumoniae AP 76 using E. coli β2155 as a donor strain (Dehio and Meyer 1997: Maintenance of broad-host-range incompatibility group P and group Q plasmids and transposition of Tn5 in Bartonella hensalae following conjugal plasmid transfer from Escherichia coli. J. Bacteriol 179: 538-540). Although total pleuropneumoniae transconjugants were examined more than 500 km of r Actinobacillus, no ureasenegativen transconjugants were obtained. However, since double crossover mutants are required for subsequent counterselection (Blomfield et al 1991: Allelic exchange in Escherichia coli using the Bacillus subtilis sacB gene and a temperature-sensitive pSC101 replicon, Mol. Microbiol. 5: 1447-1457, Copass et al., 1997: Introduction of unmarked mutations in the Helicobacter pylori vacA gene with a sucrose sensitivity marker, Inf. Immun., 65: 1949-1952), this method was evaluated as inappropriate.

Dahingegen wurde ein weiterer Ansatz verfolgt, der nicht zwei aufeinanderfolgende, Doppel-Crossover-Mutationsereignisse erfordert, sondern basierend auf zwei aufeinanderfolgenden Einzel-Crossover-Mutationen funktioniert (3). Der Vektor pBMK1 (Tabelle 1; 1) wurde konstruiert und das ureC-Gen mit einer internen 870 bp-Deletion (ure C) neben die kmr-sacB-Kassette ligiert. Das entstehende Plasmid wurde als pBMKU 1 be zeichnet (Tabelle 1, 1) und in Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 transkonjugiert. Zwischen zehn und zwanzig Transkonjuganten konnten pro Versuchsansatz erreicht werden und alle Kmr-Transkonjuganten waren ureasepositiv; 20% waren saccharosesensitiv und enthielten Plasmidkointegrate. Bei der Gegenselektion mit Saccharose waren 5 % der saccharoseresistenten Kolonien auch ureasenegativ. Fünf dieser Kolonien aus unabhängigen Experimenten enthielten alle identische Doppel-Crossover-Mutationen ohne Fremd-DNA, was durch Polymerasekettenreaktion (PCR) und Southern Blot bestätigt werden konnte (4a, 4b). Für eine dieser als Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 41 bezeichneten Mutanten konnte in der Pulsfeldgelelektrophorese nachgewiesen werden, daß keine größeren Deletionen oder chromosomale Rearrangements stattgefunden haben (4c). Zusätzlich ergab die Nukleotidsequenzanalyse eine identische ureC-Sequenz in pBMKU 1 und in Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 41, was beweist, daß wie erwartet eine doppelte Crossover-Mutation erfolgt ist (3). Eine Elektrotransformation von Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 41 mit den Plasmiden pFOKU1 und pFOKU4 (Tabelle 1) stellt die Ureaseaktivität wieder her, wenn der intakte offene Leserahmen des ureC eine transskriptionelle Fusionseinheit mit dem Vektor abgeleiteten T4-Promotor bildet. Diese Ergebnisse zeigen, daß das Plasmid pBMK1, welches mobRP4, einen Polylinker, die Tn903-abgeleitete Kanamycin-Determinante und eine transkriptionelle Fusion vom B. subtilis-sacB-Gen und dem Actinobacillus pleuropneumoniae-omlA-Promotor enthält, dazu verwendet werden kann, um effizient unmarkierte Mutationen in Actinobacillus pleuropneumoniae zu konstruieren.On the other hand, another approach has been followed that does not require two consecutive, double crossover mutational events, but works based on two consecutive single crossover mutations ( 3 ). The vector pBMK1 (Table 1; 1 ) was constructed and the ureC gene ligated with an internal 870 bp deletion (ure C) adjacent to the km r -sacB cassette. The resulting plasmid was designated pBMKU 1 (Table 1, 1 ) and transconjugated into Actinobacillus pleuropneumoniae AP76. Between ten and twenty transconjugants could be obtained per trial and all Km r transconjugants were urease positive; 20% were sucrose-sensitive and contained plasmid cointegrates. In the counter-selection with sucrose, 5% of the sucrose-resistant colonies were also urease-negative. Five of these independent experiments colonies all contained identical double crossover mutations without foreign DNA, which could be confirmed by polymerase chain reaction (PCR) and Southern blot ( 4a . 4b ). For one of these mutants designated as Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 41, it was possible to demonstrate in pulsed-field gel electrophoresis that no major deletions or chromosomal rearrangements took place ( 4c ). In addition, nucleotide sequence analysis revealed an identical ureC sequence in pBMKU 1 and in Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 41, demonstrating that, as expected, a double crossover mutation has occurred ( 3 ). Electro-transformation of Actinobacillus pleuropneumoniae AP7641 with plasmids pFOKU1 and pFOKU4 (Table 1) restores urease activity when the intact open reading frame of ureC forms a transcriptional fusion unit with the vector-derived T4 promoter. These results show that the plasmid pBMK1, which contains mobRP4, a polylinker containing the Tn903-derived kanamycin determinant and a transcriptional fusion of the B.subtilis sacB gene and the Actinobacillus pleuropneumoniae omlA promoter, can be used to efficiently construct unlabeled mutations in Actinobacillus pleuropneumoniae.

Die Bakterienstämme, Plasmide und Primer, die in der vorliegenden Erfindung vergwendet wurden, sind in Tabelle 1 aufgelistet. Die E. coli-Stämme wurden in Luria-Bertani-Medium (Sambrook et al. 1989: Molecular Cloning: A Laboratory manual, 2nd ed. Cold Spring Harbour, NY) unter Zusatz der entsprechenden Chemotherapeutika (Ampicillin 100 μg/ml; Kanamycin 50 μg/ml; Chloramphenicol 25 μg/ml) angezüchtet. Zur Kultivierung von E. coli ß2155 (dap) wurde Diaminopimelinsäure (1 mM, Sigma Chemical Company, Deisenhofen) hinzugefügt. Actinobacillus-pleuropneumoniae-Stämme wurden in PPLO-Medium (Difco GmbH, Augsburg) kultiviert, das mit Nikotinamiddinukleotid (NAD 10 μg/ml, Merck, Darmstadt), L-Glutamin (100 μg/ml, Serva, Heidelberg), L-Cysteinhydrochlorid (260 μg/ml, Sigma), L- Cysteindihydrochlorid (10 μg/ml, Sigma) und Dextrose (1 mg/ml) supplementiert wurde. Für die Selektion von Actinobacillus-pleuropneumoniae-Transkonjuganten wurde Kanamycin (25 μg/ml) zugesetzt. Für die Saccharose-Gegenselektion wurde eine salzfreie Stocklösung (2x) zum Einsatz in Flüssig- und Plattenkultur hergestellt. In Kurzform beschrieben wurde Bacto Beef Heart For Infusion® (37 g/l, Difco) 1 h bei 50°C inkubiert, für 3 Minuten gekocht und filtriert, um feste Bestandteile zu entfernen. Es wurde Bacto Pepton® (7,5 g/l, Difco) hinzugegeben; die Lösung wurde auf einen pH von 7.4 eingestellt und sterilfiltriert. Vor Gebrauch wurde diese Stocklösung wie oben beschrieben angereichert, das entsprechende Antibiotikum hinzugegeben und dann mit einem gleichen Volumen 20%iger Saccharose oder zur Bereitung fester Nährböden mit 20%iger Saccharose und 3% Bacto Agar (Difco) vermischt.The bacterial strains, plasmids and primers used in the present invention are listed in Table 1. E. coli strains were amplified in Luria-Bertani medium (Sambrook et al., 1989: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor, NY) with addition of the appropriate Chemotherapeutic agents (ampicillin 100 μg / ml, kanamycin 50 μg / ml, chloramphenicol 25 μg / ml). For the cultivation of E. coli β2155 (dap), diaminopimelic acid (1 mM, Sigma Chemical Company, Deisenhofen) was added. Actinobacillus pleuropneumoniae strains were cultured in PPLO medium (Difco GmbH, Augsburg) supplemented with nicotinamide dinucleotide (NAD 10 μg / ml, Merck, Darmstadt), L-glutamine (100 μg / ml, Serva, Heidelberg), L-cysteine hydrochloride (260 μg / ml, Sigma), L-cysteine dihydrochloride (10 μg / ml, Sigma) and dextrose (1 mg / ml). Kanamycin (25 μg / ml) was added for the selection of Actinobacillus pleuropneumoniae transconjugants. For the sucrose counterselection, a salt-free stock solution (2x) was prepared for use in liquid and plate culture. Has been described in brief Bacto Beef Heart Infusion For ® (37 g / l, Difco) for 1 h at 50 ° C, boiled for 3 minutes and filtered to remove solid components to. It was Bacto peptone ® (7.5 g / l, Difco) was added; The solution was adjusted to pH 7.4 and sterile filtered. Prior to use, this stock solution was enriched as described above, the appropriate antibiotic added and then mixed with an equal volume of 20% sucrose or to prepare solid nutrient media with 20% sucrose and 3% Bacto agar (Difco).

Die Ureaseaktivität wurde folgendermaßen bestimmt: Bakterienkolonien wurden auf Nitrozelluloseplättchen transferriert; diese wurden dann in leere Petrischalen überführt und mit Indikatoragarose (0.5 % Agarose abgekühlt auf 50°C und angereichert mit Harnstoff (20 mg/ml) und Phenolrot (100 μg/ml)) überschichtet. Die Ureaseaktivität kennzeichnende rote Färbung entwickelte sich nach 2 bis 10 Minuten.The urease became like this determined: bacterial colonies were transferred to nitrocellulose platelets; these were then transferred to empty petri dishes and with indicator agarose (0.5% agarose cooled to 50 ° C and enriched with urea (20 mg / ml) and phenol red (100 μg / ml)). The urease distinctive red coloring developed after 2 to 10 minutes.

Zur Modifizierung der DNA wurden DNA-modifizierenden Enzyme von New England Biolabs (Bad Schwalbach) bezogen und gemäß den Herstellerinstruktionen verwendet. Die DNA bzw. Plasmid-DNA wurde für den Einsatz in der PCR und im Southern Blot nach Standardprotokollen präpariert (Sambrook et al. 1989). Transformationen, Gelelektrophorese, PCR und Southern Blots wurden gemäß entsprechender Standardprozeduren durchgeführt (Sambrook et al. 1989).to Modification of the DNA were DNA-modifying enzymes of New England Biolabs (Bad Schwalbach) and according to the manufacturer's instructions used. The DNA or plasmid DNA was for use in PCR and prepared by standard protocols in the Southern blot (Sambrook et al., 1989). transformations Gel electrophoresis, PCR and Southern blots were performed according to appropriate Standard procedures performed (Sambrook et al., 1989).

Die Elektrotransformation wurde mit einem Gene Pulser (BioRad, München) gemäß den Anweisungen des Herstellers, allerdings unter Zusatz von Tween 80 (0.02 %, Roth, Karlsruhe), Trypton und Hefeextrakt in das Elektrotransformationsmedium (Tung und Chow 1995), durchgeführt. DNA von E. coli ß2155 wurde auf Actinobacillus pleuropneumoniae per Filtermating-Technik nach Dehio und Meyer (1997) übertragen.The Electro transformation was performed with a Gene Pulser (BioRad, Munich) according to the instructions of the Manufacturer, but with the addition of Tween 80 (0.02%, Roth, Karlsruhe), tryptone and yeast extract into the electrotransformation medium (Tung and Chow 1995). DNA from E. coli β2155 was on Actinobacillus pleuropneumoniae via filter-mating technique transferred to Dehio and Meyer (1997).

Nach der Transkonjugation wurden Kmr Actinobacillus pleuropneumoniae Kolonien auf das Vorhandensein von Crossoverereignissen in der PCR mit den Primerpaaren ureC2 und ureX (Reaktion 1) und den Primern ureC2 und kan2 (Reaktion 2, Tabelle 1) untersucht. Kolonien mit dem korrekten PCR-Profil wurden mittels Southern Blot Analyse unter Verwendung der Kanamycin-Determinante und des ureC-Gens als Sonden bestätigt.After transconjugation, Km r Actinobacillus pleuropneumoniae colonies were assayed for the presence of crossover events in the PCR with the primer pairs ureC2 and ureX (Reaction 1) and the primers ureC2 and kan2 (Reaction 2, Table 1). Colonies with the correct PCR profile were confirmed by Southern blot analysis using the kanamycin determinant and the ureC gene as probes.

Für die Gegenselektion wurde das supplementierte PPLO-Medium mit 1/10 Volumen einer Übernachtkultur einer bestätigten, einzelnen Crossover-Mutante beimpft und für 2 h unter Schütteln inkubiert. Die Bakterien wurden pelletiert, auf einen saccharosehaltige Nährboden ausplattiert und über Nacht bebrütet. Saccharoseresistente Kolonien wurden auf Nitrozelluloseplättchen transferriert und auf Ureaseaktivität getestet.For the counterselection The supplemented PPLO medium was 1/10 volume overnight a confirmed, single crossover mutant inoculated and for Shaking for 2 h incubated. The bacteria were pelleted to a sucrose-containing fertile soil plated and over Incubated night. Sucrose resistant colonies were transferred to nitrocellulose platelets and urease activity tested.

Ureasenegative Mutanten wurden in der PCR und im Southern Blot wie oben beschrieben analysiert. Eine zusätzliche Bestätigung wurde durch Pulsfeldgelelektrophorese (Chevailler et al. 1998: Chromosome sizes and phylogenetic relationships between serotypes of Actinobacillus pleuropneumoniae. FEMS Microbiol. Lett. 160: 209-216) unter Einsatz der Restriktionsendonukleasen ApaI, AscI und NotI, sowie durch Nukleotidsequenzanalyse des ureC -Gens erhalten.

Figure 00150001
Ureasenegative mutants were analyzed by PCR and Southern blotting as described above. Additional confirmation was obtained by pulsed field gel electrophoresis (Chevailler et al 1998: Chromosome sizes and phylogenetic relationships between serotypes of Actinobacillus pleuropneumoniae, FEMS Microbiol., Lett: 160: 209-216) using restriction endonucleases ApaI, AscI and NotI, as well as by nucleotide sequence analysis of ureC Gene.
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Claims (13)

Transkonjugationsplasmid für die Einführung unmarkierter Deletionen in das Chromosom von Bakterien der Familie Pasteurellaceae, bestehend aus: a) der Mobilisierungsregion mobRP4, b) einem Polylinker, c) einem Replikon des Col E1 Typs, d) einer Resistenzdeterminante e) einer transskriptionellen Fusion des Bacillus subtilis sacB-Gens mit dem Actinobacillus pleuropneumoniae omlA-Promotor.Transconjugation plasmid for the introduction of unlabelled deletions in the chromosome of bacteria of the family Pasteurellaceae, consisting out: a) mobilization region mobRP4, b) a polylinker, c) a replica of the Col E1 type, d) a resistance determinant e) a transcriptional fusion of the Bacillus subtilis sacB gene with the Actinobacillus pleuropneumoniae omlA promoter. Plasmid gemäß Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß die Resistenzdeterminante die von Tn903 stammende Kanamycin-Resistenzdeterminante ist.Plasmid according to claim 1, characterized in that the Resistance determinant of Tn903-derived kanamycin resistance determinant is. Plasmid gemäß einem der voranstehenden Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, daß ein Segment exogener DNA in den Polylinker inseriert ist.Plasmid according to one of the preceding claims, characterized in that a Segment of exogenous DNA is inserted into the polylinker. Plasmid gemäß Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet, daß das in den Polylinker inserierte exogene DNA-Segment mutiert ist.Plasmid according to claim 3, characterized in that the inserted into the polylinker exogenous DNA segment is mutated. Plasmid gemäß Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet, daß das Segment exogener DNA ein modifiziertes Actinobacillus pleuropneumoniae – ureC-Gen enthält, das in den Polylinker inseriert ist.Plasmid according to claim 3, characterized in that the Segment of exogenous DNA is a modified Actinobacillus pleuropneumoniae acidC gene contains which is inserted in the polylinker. Verfahren zur Mutagenese eines Bakteriums der Familie Pasteurellaceae, umfassend die Schritte a) einer Transkonjugation des Plasmids gemäß Anspruch 3 aus einem Escherichia coli Mobilisierungsstamm in einen zu mutagenisierenden Stamm eines Bakteriums der Familie Pasteurellaceae, b) einer positiven Selektion oder Screening auf Auxotrophie des Pasteurellaceae Stamms, der das transkonjugierte Plasmid stabil im Chromosom integriert trägt, c) einer Gegenselektion mit Saccharose und d) eines Screenings der saccharoseresistenten Stämme auf einen Stamm, der eine unmarkierte Deletion an der interessierenden Stelle des Chromosoms trägt.Method for mutagenesis of a bacterium of the family Pasteurellaceae, comprising the steps a) a transconjugation the plasmid according to claim 3 from an Escherichia coli mobilization strain into one to be mutagenized Strain of a bacterium of the family Pasteurellaceae, b) one positive selection or screening for auxotrophy of Pasteurellaceae Strain that stably integrates the transconjugated plasmid into the chromosome wearing, c) a counterselection with sucrose and d) a screening of sucrose-resistant strains on a strain containing an unlabelled deletion at the point of interest Body of the chromosome carries. Verfahren gemäß Anspruch 6, dadurch gekennzeichnet, daß der zu mutagenisierende Bakterienstamm ein Actinobacillus pleuropneumoniae Stamm ist.Method according to claim 6, characterized in that the Actinobacillus pleuropneumoniae to be mutagenized Trunk is. Bakterium der Familie Pasteurellaceae, dadurch gekennzeichnet, daß das Bakterium mit dem Plasmid gemäß Anspruch 3 transformiert ist.Bacterium of the family Pasteurellaceae, characterized that this A bacterium containing the plasmid according to claim 3 is transformed. Bakterium gemäß Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet, daß das Bakterium eine durch die Transformation hervorgerufene Auxotrophie enthält.Bacterium according to claim 8, characterized in that the Bacterium is an auxotrophy caused by the transformation contains. Bakterium gemäß Anspruch 8, gekennzeichnet dadurch, daß das Bakterium ein Stamm der Gattung Actinobacillus ist.Bacterium according to claim 8, characterized in that the Bacterium is a strain of the genus Actinobacillus. Wirtszellen, stabil transformiert mit einem Plasmid gemäß Anspruch 1.Host cells stably transformed with a plasmid according to claim 1. Wirtszellen, stabil transformiert mit einem Plasmid gemäß Anspruch 3.Host cells stably transformed with a plasmid according to claim Third Kit zur Einführung unmarkierter Deletionen in das Chromosom eines Bakteriums der Familie Pasteurellaceae, welches das Plasmid gemäß Anspruch 3 enthält.Kit for introduction unlabelled deletions into the chromosome of a bacterium of the family Pasteurellaceae containing the plasmid according to claim 3.
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