DE10343690A1 - Verfahren zur Bestimmung optimierter Oligomere - Google Patents
Verfahren zur Bestimmung optimierter Oligomere Download PDFInfo
- Publication number
- DE10343690A1 DE10343690A1 DE10343690A DE10343690A DE10343690A1 DE 10343690 A1 DE10343690 A1 DE 10343690A1 DE 10343690 A DE10343690 A DE 10343690A DE 10343690 A DE10343690 A DE 10343690A DE 10343690 A1 DE10343690 A1 DE 10343690A1
- Authority
- DE
- Germany
- Prior art keywords
- oligomers
- optimized
- determination
- sequences
- library
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Ceased
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
- G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
- G16C20/60—In silico combinatorial chemistry
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B35/00—ICT specially adapted for in silico combinatorial libraries of nucleic acids, proteins or peptides
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B35/00—ICT specially adapted for in silico combinatorial libraries of nucleic acids, proteins or peptides
- G16B35/20—Screening of libraries
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Library & Information Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Computing Systems (AREA)
- Management, Administration, Business Operations System, And Electronic Commerce (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Bestimmung optimierter Oligomere, bei dem oligomere Sequenzen rechnerisch erzeugt und in einer Start-Bibliothek abgelegt werden. Aufgabe der Erfindung ist es, ein solches Verfahren derart weiterzuentwickeln, dass die Bestimmung optimierter Oligomere ohne einen experimentellen Verstärkungsschritt mit verbesserten Erfolgsaussichten möglich ist. Erfindungsgemäß wird die Aufgabe dadurch gelöst, dass jeder oligomeren Sequenz der Start-Bibliothek jeweils eine Wartezahl zugeordnet wird, die aufgrund mindestens einer mit der zu optimierenden Eigenschaft korrelierten Bedingung ermittelt wird, und dass eine bestimmte Anzahl von Sequenzen mit den besten Wertzahlen als Ausgangssequenzen für die Optimierung ausgewählt wird. Die Erfindung betrifft ferner nach diesem Verfahren herstellbare Oligomere.
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE10343690A DE10343690A1 (de) | 2003-09-18 | 2003-09-18 | Verfahren zur Bestimmung optimierter Oligomere |
PCT/EP2004/010190 WO2005029384A2 (de) | 2003-09-18 | 2004-09-13 | Verfahren zur bestimmung optimierter oligomere und nach diesem verfahren herstellbare oligomere |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE10343690A DE10343690A1 (de) | 2003-09-18 | 2003-09-18 | Verfahren zur Bestimmung optimierter Oligomere |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DE10343690A1 true DE10343690A1 (de) | 2005-04-21 |
Family
ID=34352972
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE10343690A Ceased DE10343690A1 (de) | 2003-09-18 | 2003-09-18 | Verfahren zur Bestimmung optimierter Oligomere |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
DE (1) | DE10343690A1 (de) |
WO (1) | WO2005029384A2 (de) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE102007011912A1 (de) * | 2007-03-13 | 2008-09-18 | Sanofi-Aventis | Verfahren für das Erzeugen von Peptidbibliotheken und deren Verwendung |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2002020564A2 (en) * | 2000-09-05 | 2002-03-14 | Callistogen Ag | A method for identifying peptide sequences having a specific functionality |
WO2003075129A2 (en) * | 2002-03-01 | 2003-09-12 | Maxygen, Inc. | Methods, systems, and software for identifying functional bio-molecules |
-
2003
- 2003-09-18 DE DE10343690A patent/DE10343690A1/de not_active Ceased
-
2004
- 2004-09-13 WO PCT/EP2004/010190 patent/WO2005029384A2/de active Application Filing
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2002020564A2 (en) * | 2000-09-05 | 2002-03-14 | Callistogen Ag | A method for identifying peptide sequences having a specific functionality |
WO2003075129A2 (en) * | 2002-03-01 | 2003-09-12 | Maxygen, Inc. | Methods, systems, and software for identifying functional bio-molecules |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
BOLON,Daniel,N.,et.al.:De novo design of biocatalysts.In: Curr. Opin. Chem. Biol., (2002),6,(2),S.125-9 * |
HAYES,Robert,J.,et.al.:Combining computational and experimental screening for rapid optimization of protein properties.In:Proc. Natl. Acad. Sci., (2002),99,(25),S.15926-31 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE102007011912A1 (de) * | 2007-03-13 | 2008-09-18 | Sanofi-Aventis | Verfahren für das Erzeugen von Peptidbibliotheken und deren Verwendung |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2005029384A2 (de) | 2005-03-31 |
WO2005029384A3 (de) | 2005-11-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
DE602004036672C5 (de) | Nukleinsäureamplifikation auf Basis von Kügelchenemulsion | |
ATE321088T1 (de) | Polysiloxanpolymere, verfahren zu ihrer herstellung und ihre verwendung | |
ATE364866T1 (de) | Verfahren und schaltungen zum schnellen auffinden des minimalen / maximalen wertes in einer menge von zahlen | |
EP1504965A3 (de) | Verfahren zur Ermittlung eines kritischen Fahrverhaltens | |
EP1120633A3 (de) | Verfahren zur Informationseingabe in ein elektrisches Gerät | |
ATE493513T1 (de) | Verfahren zur sequenzierung einer polynukleotidmatrize | |
EP1589416A3 (de) | Verfahren und System zum Erzeugen eines Quellcodes für ein Computerprogramm | |
DE602004030141D1 (de) | Imprägnierbare, fadenkrümmungsfreie verstärkungsgewebe und verfahren zu deren herstellung | |
DE60129463D1 (de) | Walzdraht für hartgezogene feder, gezogener draht für hartgezogene feder und hartgezogene feder und verfahren zur herstellung von hartgezogenen federn | |
DE10343690A1 (de) | Verfahren zur Bestimmung optimierter Oligomere | |
DE50115074D1 (de) | Verfahren zur herstellung einer nocke für eine nockenwelle | |
EP3412875A3 (de) | Einlaufstruktur für eine strömungsmaschine und verfahren zum herstellen einer einlaufstruktur | |
DE50213541D1 (de) | Verfahren zur Herstellung von DNA | |
ATE270163T1 (de) | Verfahren zur herstellung von dünnwandigen bauteilen aus stahl und danach hergestellte bauteile | |
JP4607123B2 (ja) | 2系列マルチレベルマーケティング組織構築システム | |
EP0845473A3 (de) | Verfahren zur Entfernung von Restmengen an acidem Chlor in Carbonoyloxysilanen | |
EP2124335A3 (de) | Verfahren zum Optimieren einer mehrstufigen Filterbank sowie entsprechende Filterbank und Hörvorrichtung | |
AT16763U3 (de) | Verfahren zur Herstellung von Wendeln für ein Maschendrahtnetz | |
WO2002048351A3 (en) | A method for in vitro molecular evolution of protein function | |
EP1205544A3 (de) | Verfahren zur Herstellung von Linalooxid oder von Linalooloxid enthaltenden Gemischen | |
EP2177366A3 (de) | Binden von aufeinander gestapelten Flachteilen | |
EP1170785A3 (de) | Vefahren zum Erzeugen von Mikro-Rauhigkeiten auf einer Oberfläche | |
EP2112058A3 (de) | Verfahren zur Fertigung von Kraftfahrzeugen | |
EP1538688A3 (de) | System und Verfahren zum Umsetzen von Brennstoff und Oxidationsmittel zu Reformat | |
DE602005018224D1 (de) | Verfahren und Telekommunikationsvorrichtung zur Auswahl einer Anzahl von Kodekanälen und eines zugehörigen Spreizfaktors für CDMA-Übertragung |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
OM8 | Search report available as to paragraph 43 lit. 1 sentence 1 patent law | ||
8110 | Request for examination paragraph 44 | ||
8131 | Rejection |