DE102015106731A1 - Peptides for cancer immunotherapy - Google Patents
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Abstract
Die vorliegende Erfindung betrifft immunogene Peptide bzw. für sie kodierende Nukleinsäuren, sowie deren Verwendung in der Krebsimmuntherapie, insbesondere im Zusammenhang mit B-Zell-Lymphomen, und insbesondere bei B-Zell-Lymphom-Patienten mit somatischer L265P MyD88 Driver-Mutation.The present invention relates to immunogenic peptides or nucleic acids encoding them, as well as their use in cancer immunotherapy, in particular in connection with B-cell lymphomas, and in particular in B-cell lymphoma patients with somatic L265P MyD88 Driver mutation.
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft immunogene Peptide für die Krebsimmuntherapie, insbesondere immunogene Peptide, die von Protein MyD88 abgeleitet sind und die somatische Mutation L265P tragen.The present invention relates to immunogenic peptides for cancer immunotherapy, in particular immunogenic peptides derived from protein MyD88 carrying the somatic L265P mutation.
Krebserkrankungen sind in Deutschland nach den Herz-Kreislauferkrankungen die zweithäufigste Todesursache. Dabei ist nicht jede Krebserkrankung tödlich, falls rechtzeitig eine Therapie begonnen wird oder eine niedrigmaligne (langsam wachsende) Krebserkrankung erst in so hohem Lebensalter auftritt, dass der Patient an einer anderen Todesursache verstirbt.Cancer is the second leading cause of death in Germany after cardiovascular disease. Not all cancers are fatal if timely therapy is started or low-grade (slow-growing) cancer first occurs at such high age that the patient dies of another cause of death.
Im gesunden Organismus stehen die Vermehrung von Zellen, aus denen sich die verschiedenen Gewebe der Organe aufbauen, und der Zelltod in einem artspezifischen ausgewogenen Gleichgewicht. Bei Krebserkrankungen ist dieses Gleichgewicht gestört: Krebszellen wachsen ungehindert, da hemmende Signale aufgrund von Mutationen oder Defekten in Genen nicht erkannt oder nicht ausgeführt werden oder Mutationen oder Defekte zu einer direkten Aktivierung des Zellwachstums führen. In the healthy organism, the proliferation of cells that make up the various tissues of the organs, and cell death in a species-specific balanced balance. In cancer, this balance is disturbed: cancer cells grow unhindered because inhibitory signals due to mutations or defects in genes are not recognized or performed, or mutations or defects lead to a direct activation of cell growth.
Tumore werden u.a. nach dem Typ des entarteten Gewebes klassifiziert. Neben den Karzinomen, die den größten Teil aller Krebserkrankungen ausmachen, bilden die hämatologischen Neoplasien des Blutes und der blutbildenden Organe, die sich in Leukämien und Lymphome, auch „Lymphdrüsenkrebs“ genannt, unterteilen lassen, eine große Gruppe. Diese lässt sich wiederum unterklassifizieren in Hodgkin-Lymphome und Non-Hodgkin-Lymphome (NHL), wobei letztere in eine B-(etwa 80 Prozent aller NHL) und eine T-Linie (20 Prozent) unterteilt werden, je nachdem, ob das NHL von B-lymphatischen oder T-lymphatischen Zellen ausgeht. Tumors are u.a. classified according to the type of degenerated tissue. In addition to the carcinomas, which make up the majority of all cancers, the hematological neoplasms of the blood and the blood-forming organs, which can be subdivided into leukemias and lymphomas, also called "lymphoid cancer", form a large group. In turn, this can be subclassified into Hodgkin's Lymphoma and Non-Hodgkin's Lymphoma (NHL), with the latter subdivided into a B (about 80 percent of all NHL) and a T-line (20 percent), depending on whether the NHL from B lymphatic or T lymphoid cells.
Die klassischen Behandlungsmethoden bei Krebserkrankungen sind die operative Tumorentfernung (Resektion), die Chemotherapie und die Strahlentherapie, wobei oftmals zwei oder gar alle drei Therapieformen gleichzeitig bei einem Krebspatienten angewendet werden. Nachteilig an den beiden letztgenannten Methoden sind insbesondere die zytotoxische Nebenwirkungen sowie die Tatsache, dass konventionelle Therapien nicht tumorspezifisch nur an Krebszellen wirken, sondern auch gesunde Körperzellen beeinträchtigen.The classic treatments for cancer include surgical resection, chemotherapy and radiotherapy, often using two or even all three forms of therapy simultaneously in a cancer patient. Disadvantages of the latter two methods are, in particular, the cytotoxic side effects and the fact that conventional therapies do not have a tumor-specific effect only on cancer cells, but also impair healthy body cells.
Seit Jahren wird daher an neuen Therapieverfahren geforscht, die eine möglichst hohe selektive Wirkung gegen Krebszellen aufweisen, wobei sich hier inzwischen die Krebsimmuntherapie als ein vielversprechender Ansatz erwiesen hat. Dabei unterscheidet man zwischen einer aktiven und einer passive Impfung. Bei der aktiven Immunisierung bekommt der Patient Krebsimpfstoffe verabreicht, die in seinem Immunsystem eine Immunantwort auslösen sollen. Die Immunantwort soll dabei idealerweise zum Tod der Tumorzellen oder zumindest zu einem verzögerten Tumorwachstum oder einer Seneszenz (einem Zustand des Wachstumsstillstands) führen. Im Unterschied dazu erhält der Patient bei der passiven Immunisierung Antikörper oder Antikörper-Fragmente. For years, therefore, research into new therapeutic methods that have the highest possible selective effect against cancer cells, with here now the cancer immunotherapy has proven to be a promising approach. A distinction is made between an active and a passive vaccination. In active immunization, the patient is given cancer vaccines that are supposed to trigger an immune response in his immune system. The immune response should ideally lead to the death of the tumor cells or at least to a delayed tumor growth or senescence (a state of growth arrest). In contrast, in passive immunization, the patient receives antibodies or antibody fragments.
Diese sollen selektiv an Tumorzellen binden und so zu ihrem Untergang führen. Schließlich werden bei der adoptiven Immuntherapie dem Patienten Leukozyten entnommen, ex vivo kultiviert und anschließend wieder dem Patienten injiziert.These should selectively bind to tumor cells and thus lead to their demise. Finally, in adoptive immunotherapy, leukocytes are removed from the patient, cultured ex vivo, and then injected back into the patient.
Beteiligt bei der Abwehr von Tumoren sind insbesondere CD8-positive zytotoxische T-Lymphozyten (CTL). Damit eine derartige Immunreaktion durch zytotoxische T-Zellen ausgelöst wird, müssen den T-Zellen fremde Peptide von Klasse I MHC-Rezeptoren ("major histocompatibility complex"), die auch als humane Leukozyten-Antigene (HLA) bezeichnet werden, an Zelloberflächen präsentiert werden. Daneben sind auch CD4-positive Helfer T-Lymphozyten an der Tumorabwehr beteiligt, indem sie nach Erkennung von Peptiden auf Klasse II MHC-Rezeptoren durch die Freisetzung von verschiedenen Zytokinen die Immunantwort unterstützen und die Seneszenz der Tumorzellen auslösen können.Particularly involved in the defense against tumors are CD8-positive cytotoxic T lymphocytes (CTL). For such an immune response to be elicited by cytotoxic T cells, foreign peptides of class I MHC (major histocompatibility complex) receptors, also referred to as human leukocyte antigens (HLA), must be presented to cell surfaces , In addition, CD4-positive helper T lymphocytes are also involved in tumor defense, since they can, after the recognition of peptides on class II MHC receptors by the release of different cytokines, support the immune response and trigger the senescence of the tumor cells.
Die Erkennung von MHC I- oder II-Peptid-Komplexen durch T-Zellen erfolgt durch die Bindung des multimeren T-Zellrezeptors (TCR), wobei die Erkennung der MHC-Peptid-Oberfläche durch ein Heterodimer der sog. α- und β-Kette erfolgt. Jede naive T-Zelle verfügt über einen, durch die Gensequenz der α- und β-Kette festgelegte Bindespezifizität. Im Menschen beträgt das Repertoire verschiedener Kombinationen von TCR > 1012. Während vor einer Impfung nur einige wenige naive(nicht aktivierte) T-Zellen die gewünschte MHC-Peptid-Spezifizität besitzen, löst die Bindung spezifischer TCRs an einen passenden MHC-Peptid-Komplex im Kontext ko-stimulatorischer Moleküle und Zytokine eine starke Proliferation der spezifischen T-Zellen aus, was letztlich zu einer schützenden CD4 und/oder CD8 T-Zell-Antwort führen kann.The recognition of MHC I or II peptide complexes by T cells is accomplished by the binding of the multimeric T cell receptor (TCR), whereby the recognition of the MHC peptide surface by a heterodimer of the so-called α- and β-chain he follows. Each naive T cell has a binding specificity determined by the gene sequence of the α and β chains. In humans, the repertoire of different combinations of TCR is> 10 12 . While only a few naive (unactivated) T cells have the desired MHC peptide specificity prior to vaccination, binding of specific TCRs to an appropriate MHC-peptide complex in the context of costimulatory molecules and cytokines triggers strong proliferation of the specific T cells, which can ultimately lead to a protective CD4 and / or CD8 T cell response.
Die Bindung eines Peptids an einen MHC-Proteinkomplex ist vom Allel des MHC-Proteinkomplexes und von der Aminosäuresequenz des Peptids abhängig. MHC-Klasse-I-bindende Peptide sind in der Regel 8–10 Aminosäuren lang und enthalten in ihrer Sequenz zwei konservierte Aminosäuren (sogenannte Ankeraminosäuren), die mit ihrer spezifischen Seitenkette mit der entsprechenden Bindungstasche des MHC-Proteinkomplexes interagieren. MHC-Klasse-II-bindenden Peptide sind in der Regel 15–25 Aminosäuren lang und die genauen Bindungsregeln sind bislang nicht vollständig aufgeklärt.The binding of a peptide to an MHC-protein complex is dependent on the allele of the MHC-protein complex and on the amino acid sequence of the peptide. MHC class I-binding peptides are usually 8-10 amino acids in length and contain in their sequence two conserved amino acids (so-called anchor amino acids) that interact with their specific side chain with the corresponding binding pocket of the MHC-protein complex. MHC class II binding peptides are usually 15-25 Amino acids long and the exact binding rules are not fully understood.
Damit das Immunsystem eine effektive CTL- oder T-Helfer-Antwort gegen ein Peptid entwickeln kann, muss dieses Peptid nicht nur in der Lage sein, an die bestimmten MHC-Klasse-I oder II-Moleküle zu binden, die von den Tumorzellen exprimiert werden, sondern es muss auch von den verfügbaren T-Zell-Spezifitäten mittels TCR erkannt werden.For the immune system to develop an effective CTL or T helper response against a peptide, this peptide must not only be able to bind to the particular MHC class I or II molecules expressed by the tumor cells but it also needs to be recognized by the available T-cell specificities via TCR.
Durch die Identifikation von tumorassoziierten oder tumorspezifischen MHC-Peptid-Komplexen (Antigenen) eröffnet sich die Möglichkeit, das Immunsystem von Krebspatienten spezifisch gegen die Tumorzellen zu aktivieren. Das Auffinden von Genen, die in Tumorgeweben überexprimiert sind, oder die in derartigen Geweben selektiv exprimiert werden, liefert jedoch keine präzise Information für einen Einsatz der von diesen Genen transkribierten Antigene in der Immuntherapie. Dies hat die Ursache darin, dass jeweils nur einzelne Epitope dieser Antigene für einen derartigen Einsatz geeignet sind, da nur die Epitope der Antigene – nicht das gesamte Antigen – durch MHC-restringierte Präsentation eine T-Zell-Antwort hervorrufen. Daher ist es wichtig, diejenigen Peptide von überexprimierten, selektiv oder in mutierter Form exprimierten Proteinen zu selektieren, die mit MHC-Molekülen präsentiert werden, wodurch Angriffspunkte für die spezifische Tumorerkennung durch zytotoxische oder Helfer-T-Lymphozyten gewonnen werden könnten.The identification of tumor-associated or tumor-specific MHC-peptide complexes (antigens) opens up the possibility of specifically activating the immune system of cancer patients against the tumor cells. However, finding genes that are overexpressed in tumor tissues or that are selectively expressed in such tissues does not provide accurate information for use of the antigens transcribed from these genes in immunotherapy. This is due to the fact that only individual epitopes of these antigens are suitable for such use, since only the epitopes of the antigens - not the entire antigen - by MHC-restricted presentation cause a T cell response. Therefore, it is important to select those peptides from overexpressed, selectively or mutated-expressed proteins presented with MHC molecules, which could provide targets for specific tumor recognition by cytotoxic or helper T lymphocytes.
Bei den gegenwärtig bekannten peptidbasierten Immuntherapien werden vorwiegend standardisierte „off-the-shelf“ Peptidvakzine oder Patienten-individuelle, personalisierte Peptidvakzine eingesetzt. Der erstgenannte Ansatz beruht auf im Tumor überexprimierten Peptidantigenen, welche patientenübergreifend vor allem auf malignen Zellen präsentiert werden. Diese tumorassoziierten Antigene zeichnen sich durch breitere Anwendbarkeit, allerdings potentiell eingeschränkte Tumorspezifität aus. Der Ansatz personalisierter Peptidvakzine, basierend auf Patienten-individuellen tumorassoziierten- und tumorspezifischen Antigenen, ermöglicht einerseits potentiell eine höhere Tumorspezifität und Immunogenität des Vakzins, verhindert aber andererseits meist die patientenübergreifende Anwendung. Diese Umstände liegen darin begründet, dass solcherlei personalisierte Vakzine patienten-/tumor-individuelle, d.h. für jeden Patienten unterschiedliche, Mutationen und Expressionsmuster von Antigenen berücksichtigen. The currently known peptide-based immunotherapies mainly use standardized "off-the-shelf" peptide vaccines or patient-individual, personalized peptide vaccines. The former approach is based on overexpressed in the tumor peptide antigens, which are presented cross-patient especially on malignant cells. These tumor-associated antigens are characterized by broader applicability, but potentially limited tumor specificity. The approach of personalized peptide vaccines, based on patient-specific tumor-associated and tumor-specific antigens, on the one hand potentially enables a higher tumor specificity and immunogenicity of the vaccine, but on the other hand usually prevents cross-patient application. These circumstances are due to the fact that such personalized vaccines are patient / tumor individual, i. consider different mutations and expression patterns of antigens for each patient.
Vor diesem Hintergrund ist es Aufgabe der vorliegenden Erfindung, immunogene Peptide bereit zu stellen, die sich direkt oder indirekt (z.B. über die Herstellung zellulärer Agenzien für die Immuntherapie) sowohl für eine tumorspezifische Immuntherapie als auch für die Anwendung in einer Mehrzahl verschiedener Patienten und für verschiedene Krebsarten eignen. Against this background, it is an object of the present invention to provide immunogenic peptides which are directly or indirectly (eg via the production of cellular agents for immunotherapy) both for a tumor-specific immunotherapy and for use in a plurality of different patients and for various Cancers are suitable.
Erfindungsgemäß wird diese Aufgabe gelöst durch die Bereitstellung eines oder mehrerer immunogenen Peptids/Peptide mit einer Länge von 8 bis 25 Aminosäuren, welche mindestens 8 aufeinanderfolgende Aminosäuren aus der Aminosäuresequenz mit der SEQ ID Nr. 1 des beigefügten Sequenzprotokolls umfassen, sowie die nur in Krebszellen vorkommende Aminosäure Nr. 25 der SEQ ID Nr. 1, wobei das immunogene Peptid die Fähigkeit aufweist, an ein Molekül des menschlichen Haupt-Histokompatibilitäts-Komplexes (MHC) der Klasse I oder Klasse II zu binden.According to the invention, this object is achieved by providing one or more immunogenic peptide / peptides having a length of 8 to 25 amino acids, which comprise at least 8 consecutive amino acids from the amino acid sequence with SEQ ID NO: 1 of the attached sequence listing, as well as those occurring only in cancer cells Amino acid No. 25 of SEQ ID NO: 1, wherein the immunogenic peptide has the ability to bind to a molecule of the human major histocompatibility complex (MHC) of class I or class II.
Die Aminosäuresequenz mit der SEQ ID Nr. 1 stellt einen Abschnitt des die L256P Mutation tragenden MyD88 Proteins dar. Die Erfinder der vorliegenden Anmeldung konnten in eigenen Versuchen die Immunogenität für von dieser Sequenz abgeleitete und die Mutation aufweisende Peptide gegenüber den entsprechenden Wildtyp-Peptidsequenzen zeigen. The amino acid sequence having SEQ ID NO: 1 represents a portion of the MyD88 protein carrying the L256P mutation. The inventors of the present application have been able to demonstrate in their own experiments the immunogenicity for peptides derived from this sequence and the mutation against the corresponding wild-type peptide sequences.
Das MyD88 Protein ist ein Adapter für viele „Toll-like receptors“ (TLRs) und Interleukin-1-Rezeptoren (IL1Rs). The MyD88 protein is an adapter for many toll-like receptors (TLRs) and interleukin-1 receptors (IL1Rs).
Sogenannte “Driver Mutationen“ sind krebsassoziierte Mutationen, die essentiell für die maligne Transformation von Zellen sind, wohingegen “Passenger Mutationen“ funktionell weniger relevant sind. Die Driver Mutationen, die viel seltener sind, verleihen dem Tumorklon einen Wachstumsvorteil gegenüber normalen Zellen, und sorgen auch für die Ausbreitung des Klons in andere Gewebe. So-called "driver mutations" are cancer-associated mutations that are essential for the malignant transformation of cells, whereas "passenger mutations" are functionally less relevant. The driver mutations, which are much rarer, give the tumor clone a growth advantage over normal cells, as well as spreading the clone into other tissues.
Die somatische L265P Driver Mutation in MyD88 ist eine verhältnismäßig weit verbreitete Mutation, deren Auftreten in einer Vielzahl von Neoplasien beschrieben wurde, die von B-Lymphozyten herrühren, z.B. aber nicht ausschließlich bei Chronisch Lymphatischer Leukämie (CLL), Diffus-großzelligem B-Zell-Lymphom, Waldenström Makroglobulinämie. The somatic L265P driver mutation in MyD88 is a relatively widespread mutation, the occurrence of which has been described in a variety of neoplasms derived from B lymphocytes, e.g. but not exclusively in chronic lymphocytic leukemia (CLL), diffuse large cell B-cell lymphoma, Waldenström macroglobulinemia.
Die Aminosäure-Position "Leucin 265" bezieht sich auf die
Durch das breite Auftreten der genau definierten L265P Mutation in verschiedenen Neoplasien und verschiedenen Patienten ergibt sich ein breiter Anwendungsbereich der neu identifizierten immunogenen Peptide: Da die Immunreaktion mutations- und damit tumorspezifisch ist, sind diese Peptide, die an ein Molekül des menschlichen Haupt-Histokompatibilitäts-Komplexes (MHC) Klasse-I oder Klasse II binden, bei allen Krebs-Patienten mit somatischer L265P MyD88 Driver Mutation therapeutisch anwendbar, und insbesondere bei Positivität für das Klasse I HLA B*07, das HLA B*15 oder das B*35 Allel, und weiter insbesondere bei mutiertem B-Zell-Lymphom, und weiter insbesondere bei B*07, B*35 oder B*15 Patienten mit MyD88 mutiertem B-Zell-Lymphom. The broad occurrence of the well-defined L265P mutation in various neoplasms and different patients results in a broad scope of the newly identified immunogenic peptides: Since the immune response is mutagenic and thus tumor-specific, these are peptides that bind to a molecule of the human major histocompatibility Compound (MHC) Class I or Class II binding, therapeutically applicable in all cancer patients with somatic L265P MyD88 Driver mutation, and particularly in positivity for the class I HLA B * 07, the HLA B * 15 or the B * 35 allele , and more particularly in mutated B-cell lymphoma, and more particularly B * 07, B * 35 or B * 15 patients with MyD88 mutant B-cell lymphoma.
Mit den vorliegend erstmals präsentierten immunogenen Peptiden werden praktisch ideale Tumorantigene (Fragmente von in Tumoren produzierten Proteinen) bereitgestellt, da diese: (i) nur von Krebszellen auf der Zellmembran exprimiert werden, und in gesunden Zellen nicht vorhanden sind (tumorspezifische Antigene (TSA)). Die bisher bei B-Zell-Lymphomen und -Leukämien bekannten Tumorantigene sind hingegen lediglich tumorassoziiert und werden dementsprechend auch von gesunden Zellen exprimiert. Deshalb sind tumorassoziierte Antigene nur bedingt bei einer Überexprimierung für die Immuntherapie einsetzbar; (ii) von einer klonalen Driver Mutation abstammen und somit die überwiegende Mehrheit der Tumorzellen diese Mutation trägt, die mutationsabgeleiteten Peptide auf MHC-Molekülen an der Zelloberfläche präsentieren und von einer induzierten Immunantwort erkannt und bekämpft werden; (iii) durch die begrenzte Anzahl von Peptiden, die die L265P Mutation enthalten, prinzipiell in einer Mehrzahl verschiedener Patienten des gleichen Klasse I oder Klasse II HLA-Typs anwendbar sind.The immunogenic peptides presented here for the first time provide virtually ideal tumor antigens (fragments of proteins produced in tumors) since they: (i) are expressed only by cancer cells on the cell membrane and are absent in healthy cells (tumor specific antigens (TSA)) , By contrast, the tumor antigens hitherto known for B-cell lymphomas and leukemias are only tumor-associated and accordingly are also expressed by healthy cells. Therefore, tumor-associated antigens are only conditionally applicable in overexpression for immunotherapy; (ii) derived from a clonal driver mutation, and thus the vast majority of tumor cells carry this mutation that present mutation-derived peptides on MHC molecules on the cell surface and are recognized and controlled by an induced immune response; (iii) by the limited number of peptides containing the L265P mutation are principally applicable in a plurality of different patients of the same class I or class II HLA type.
Die vorliegend bereitgestellten Tumorantigene besitzen eine hohe Immunogenität, und bieten damit ein herausragendes Mittel für die Immunisierung. So können bspw. durch gezieltes Primen (in vivo, in vitro oder ex vivo) mit den erfindungsgemäßen immunogenen Peptiden naive CD8+ T-Zellen zu Effektorzellen (CTL) aktiviert werden. Unter Primen versteht man die peptidspezifische Stimulation naiver (bisher nicht aktivierter) T-Zellen, was peptidspezifische T-Zellen zur Differenzierung in Effektorzellen und zur Proliferation anregt.The tumor antigens provided herein have high immunogenicity and thus provide an outstanding means of immunization. For example, naive CD8 + T cells can be activated into effector cells (CTL) by targeted priming (in vivo, in vitro or ex vivo) with the immunogenic peptides according to the invention. Priming refers to the peptide-specific stimulation of naive (previously unactivated) T cells, which stimulates peptide-specific T cells to differentiate into effector cells and to proliferate.
Nach einer Aktivierung schütten die CTLs Perforine und Granzyme aus, welche die MHC-I-tragende, antigenpräsentierende Zelle in den programmierten Zelltod treiben. Zudem produzieren und sezernieren aktivierte CTL auch Proteine wie das Interferon-γ, welches in benachbarten Zellen die Produktion von MHC-I-Proteinen fördert. Dies führt wiederum zu einer stärkeren Präsentation der Peptide.Upon activation, the CTLs release perforins and granzymes which drive the MHC-I-bearing antigen-presenting cell into programmed cell death. In addition, activated CTL also produce and secrete proteins such as interferon-γ, which promotes the production of MHC-I proteins in neighboring cells. This in turn leads to a stronger presentation of the peptides.
Helfer-T-Lymphozyten können nach peptidspezifischer Aktivierung Tumor-Nekrose-Faktor (TNF) und Interferon-gamma (IFNγ) ausschütten, was zur Induktion der Seneszenz von Tumorzellen führen kann.Helper T lymphocytes may release tumor necrosis factor (TNF) and interferon-gamma (IFNγ) after peptide-specific activation, which may induce senescence of tumor cells.
Vorliegend wird unter einem “Peptid" eine Kette von Aminosäuren verstanden, die durch Peptidbindungen miteinander verknüpft sind. Im Allgemeinen wird ein längeres Peptid als „Polypeptid“ bezeichnet. Ein “Protein" ist dann aus einem oder mehreren Polypeptiden aufgebaut. As used herein, a "peptide" refers to a chain of amino acids linked together by peptide bonds, Generally, a longer peptide is termed a "polypeptide." A "protein" is then composed of one or more polypeptides.
Unter einem tumorassoziierten Antigen-Polypeptid oder einem „TAA-Polypeptid" ist vorliegend, wie auch allgemein nach Stand der Technik, ein nicht fragmentiertes Polypeptid in voller Länge eines tumorassoziierten Antigens zu verstehen, während ein tumorassoziiertes Antigen-Peptid oder ein TAA-Peptid ein Fragment eines solchen TAA-Polypeptids ist (oder dieses einschließt). TAA-Peptide sind, wie weiter oben erwähnt, nicht tumorspezifische Peptide, sondern stellen Peptide dar, die in einem Tumor bspw. höher exprimiert werden als in anderen Geweben. As used herein, as well as generally known in the art, a tumor-associated antigen polypeptide or "TAA polypeptide" is understood to be a full-length non-fragmented polypeptide of a tumor-associated antigen, while a tumor-associated antigen peptide or a TAA peptide is a fragment As mentioned above, TAA peptides are not tumor-specific peptides, but are peptides that are more highly expressed in a tumor than in other tissues, for example.
Im Gegensatz dazu sind tumorspezifische Polypeptide oder tumorspezifische Antigene (TSA) Proteine, die ganz spezifisch für Tumorzellen sind. Entsprechend ist ein tumorspezifisches Antigen-Peptid ein Fragment eines solchen TSA-Polypeptids. Die vorliegend beschriebenen immunogenen Peptide stellen tumorspezifische Peptide dar. In contrast, tumor-specific polypeptides or tumor-specific antigens (TSA) are proteins that are quite specific for tumor cells. Similarly, a tumor-specific antigenic peptide is a fragment of such a TSA polypeptide. The immunogenic peptides described herein are tumor-specific peptides.
Diese Peptide können eine beliebige Länge, bis zu gerade unter der vollen Länge eines TSA-Polypeptids, aufweisen, jedoch haben die immunogenen Peptide zur Verwendung in der Erfindung eine relativ kurze Länge wie beispielsweise acht, neun, zehn, elf, zwölf, dreizehn, vierzehn oder fünfzehn Aminosäuren. These peptides may be of any length up to just below the full length of a TSA polypeptide, however, the immunogenic peptides for use in the invention have a relatively short length, such as eight, nine, ten, eleven, twelve, thirteen, fourteen or fifteen amino acids.
Auch Peptide, die Aminosäuresubstitutionen beinhalten, können als immunogene Peptide im Rahmen der vorliegenden Erfindung eingesetzt werden. So kann beispielsweise ein immunogenes Peptid einen Bereich von wenigstens neun Aminosäuren beinhalten, von denen jeweils sechs oder mehr zu den Aminosäuren innerhalb eines Neunaminosäurestrangs in dem vorgegebenen TSA, hier die SEQ ID Nr. 1, identisch sind. Vorzugsweise sind wenigstens sieben, insbesondere wenigstens acht und am meisten bevorzugt alle neun der Aminosäuren in einem immunogenen Peptid-Neunaminosäurebereich identisch zu einem Neunaminosäurebereich in dem TSA.Peptides containing amino acid substitutions can also be used as immunogenic peptides in the context of the present invention. For example, an immunogenic peptide may include a region of at least nine amino acids, six or more of which are identical to the amino acids within a nine amino acid strand in the given TSA, here SEQ ID NO: 1. Preferably, at least seven, more preferably at least eight, and most preferably all nine of the amino acids in an immunogenic peptide-nine amino acid region are identical to a nine amino acid region in the TSA.
Auch sind Peptide mit umfasst, die post-translationale Modifikationen wie bspw. Phosphorylierungen insbesondere der Aminosäuren Serin, Threonin oder Tyrosin aufweisen, sowie bspw. Hydroxylierungen, insbesondere von Lysin-Resten, Glykosylierungen, Acetylierungen und Methylierungen, insbesondere an Lysinen, Succinierungen an Cysteinen, Sulfatierungen, etc.Also included are peptides which have post-translational modifications, such as, for example, phosphorylations, in particular of the amino acids serine, threonine or tyrosine, and, for example, Hydroxylations, in particular of lysine residues, glycosylations, acetylations and methylations, in particular on lysines, succinations on cysteines, sulfations, etc.
Wie weiter unten diskutiert wird, ist es bevorzugt, dass die immunogenen Peptide der Erfindung Bereiche beinhalten, die an Haupthistokompatibilitätskomplex(MHC)-Antigene der Klasse I oder Klasse II binden. As discussed further below, it is preferred that the immunogenic peptides of the invention include regions that bind to major histocompatibility complex (MHC) class I or class II antigens.
Ein immunogenes Peptid gemäß der vorliegenden Erfindung kann mit Aminosäuresequenzen verbunden werden, die nicht natürlich in dem TSA, des mit der SEQ ID Nr. 1 beschrieben ist, vorkommen. Darüber hinaus kann ein immunogenes Peptid an der Oberfläche einer Zelle oder an einem Molekül oder einem Makromolekül (z.B. einem Histokompatibilitätsantigen) befestigt werden, oder ein immunogenes Peptid kann mit Immunogenen oder Hilfsmitteln, die den Fachleuten auf diesem Gebiet bekannt sind, beispielsweise Napfschnecken-Hämocyanin (KLH), zu dem Zweck, eine TSA-spezifische Immunantwort hervorzurufen, konjugiert werden. An immunogenic peptide according to the present invention may be linked to amino acid sequences that are not naturally occurring in the TSA described with SEQ ID NO: 1. In addition, an immunogenic peptide may be attached to the surface of a cell or to a molecule or macromolecule (eg, a histocompatibility antigen), or an immunogenic peptide may be immunohistochemically or adjuvanted to those skilled in the art, for example, limpet hemocyanin ( KLH) are conjugated for the purpose of eliciting a TSA-specific immune response.
Mit "Nukleinsäuremolekül" oder "Nukleinsäure" ist vorliegend ein DNA-oder RNA(z.B. mRNA)-Molekül gemeint. Dieses kann bspw. für ein immunogenes Peptid oder Protein wie oben definiert kodieren, wobei in diesem Falle der Impfstoff nicht an einen bestimmten HLA-Typ gebunden ist, da das von der Nukleinsäure kodierte Molekül in vivo HLA-gerecht prozessiert und präsentiert werden kann und somit für einen breiteren Patientenkreis einsetzbar ist. Eine erfindungsgemäße Nukleinsäure bzw. Nukleinsäuresequenzen können ferner für α- und/oder β-Ketten von T-Zellrezeptoren kodieren, die zur Transduktion oder Transfektion von T-Zellen zur Übertragung einer neuen Spezifität eingesetzt werden können (siehe auch weiter unten).By "nucleic acid molecule" or "nucleic acid" herein is meant a DNA or RNA (e.g., mRNA) molecule. This can, for example, code for an immunogenic peptide or protein as defined above, in which case the vaccine is not bound to a specific HLA type, since the molecule encoded by the nucleic acid can be processed and presented in vivo in accordance with HLA, and thus can be used for a wider range of patients. A nucleic acid or nucleic acid sequences according to the invention can furthermore code for α and / or β chains of T cell receptors which can be used for the transduction or transfection of T cells for the purpose of transmitting a new specificity (see also below).
"Isoliert“ meint vorliegend ex vivo aus einer Probe mittels gängiger Verfahren isoliert, oder rekombinant oder synthetisch hergestellt und in isolierter Form vorliegend. "Isolated" in this case means ex vivo isolated from a sample by conventional methods, or produced recombinantly or synthetically and present in isolated form.
Unter "Impfung" oder Vakzine ist vorliegend die Verabreichung eines immunogenen Präparats gemeint, das eines oder mehrere immunogenen Peptide gemäß der vorliegenden Erfindung, Nukleinsäuremoleküle, oder eine das immunogene Peptidpräsentierende Zelle oder Mischungen von diesen einschließt. Die Impfung wird an einer Person, die einen Tumor hat, eine Vorgeschichte mit einem Tumor oder Tumoren hat oder bei der es wahrscheinlich ist, dass sie einen Tumor entwickelt, oder an einer Person, in welcher peptidspezifische Immunzellen (wie z.B. CTLs) zur Übertragung auf einen Patienten erzeugt werden sollen, durchgeführt. Die Impfung stimuliert eine spezifische Immunantwort in der Person. Zusätzlich kann die Impfung eine Prophylaxe gegenüber der Entwicklung neuer Tumore bieten. By "vaccine" or vaccine is meant herein the administration of an immunogenic preparation which includes one or more immunogenic peptides according to the present invention, nucleic acid molecules, or a cell presenting the immunogenic peptide, or mixtures of these. The vaccine is administered to a person having a tumor, a history of a tumor or tumors, or likely to develop a tumor, or to a subject in which peptide-specific immune cells (such as CTLs) are transmitted a patient to be generated performed. The vaccine stimulates a specific immune response in the person. In addition, the vaccine may provide prophylaxis against the development of new tumors.
Entsprechend ist ein “Impfstoff" wie hierin verwendet eine immunogene Zusammensetzung, die bei dem oben beschriebenen Impfverfahren verabreicht werden kann. Somit beinhaltet ein Impfstoff beispielsweise ein oder mehrere immunogene Peptide gemäß der vorliegenden Erfindung, Nukleinsäuren, oder die immunogenen Peptide präsentierenden oder auf sie reagierende Zellen, oder Mischungen davon. Wahlweise kann eine Impfstoffzusammensetzung noch Hilfsmittel beinhalten, die eine Immunantwort auf das zusammen damit verabreichte Impfstoffantigen oder -agens stimulieren, wie beispielsweise, jedoch nicht ausschließlich, immunstimulierende Adjuvantien wie Imiquimod oder GM-CSF; oder Hilfsmittel welche Einflüsse, die die Immunantwort als Ganzes zellulär oder molekular bremsen, ausschalten, wie beispielsweise, jedoch nicht ausschließlich, gegen regulatorische T-Zellen gerichtetes Cyclophosphamid oder Immuncheckpoint-Inhibitoren wie bspw. jedoch nicht ausschließlich Ipilimumab.Accordingly, a "vaccine" as used herein is an immunogenic composition that can be administered in the vaccination method described above Thus, for example, a vaccine will include one or more immunogenic peptides according to the present invention, nucleic acids, or cells presenting or responding to the immunogenic peptides Alternatively, a vaccine composition may include adjuvants that stimulate an immune response to the vaccine antigen or agent co-administered therewith, such as, but not limited to, immunostimulatory adjuvants such as imiquimod or GM-CSF; Inhibiting the immune response as a whole cellularly or molecularly, such as, but not limited to, anti-regulatory T cell directed cyclophosphamide or immunocheckpoint inhibitors such as but not limited to ipilimumab.
Unter einer „Probe" wird vorliegend eine Tumor- oder Gewebebiopsie, eine Lymphknotenbiopsie, Knochenmark, Zellen, Blut, Serum, Urin, Stuhl, Sputum, Speichel, Liquor oder eine andere Probe, die von einem Patienten erhalten wird, verstanden. Eine Probe kann analysiert werden, um das Vorliegen von CTLs oder Helfer-T-Lymphozyten, die für die immunogenen Peptide spezifisch sind, das Niveau von Antikörpern, die für die immunogenen Peptide spezifische sind, oder das Niveau von irgendeinem anderen Indikator für die Immunantwort (z.B. das Zytokinniveau) in dem Patienten, aus dem die Probe entnommen wurde, durch Verfahren, die im Stand der Technik bekannt sind, zu bestimmen.A "sample" herein means a tumor or tissue biopsy, lymph node biopsy, bone marrow, cells, blood, serum, urine, stool, sputum, saliva, cerebrospinal fluid, or another sample obtained from a patient to analyze the presence of CTLs or helper T lymphocytes specific for the immunogenic peptides, the level of antibodies specific to the immunogenic peptides, or the level of any other indicator of immune response (eg, cytokine level ) in the patient from whom the sample was taken by methods known in the art.
Beispielsweise kann ein ELISA verwendet werden, um die Niveaus von spezifischen Antikörpern zu messen, und ein ELISPOT oder intrazelluläre Zytokinfärbung können verwendet werden, um Zytokinniveaus zu messen. Ebenso können Cr51-Freisetzungs(T-Zell-Zytotoxizitäts)-Tests und Tests, die die Bindung von CTLs oder T-Helfer-Lymphozyten an tetramere Peptid/MHC-Komplexe testen, wie sie hierin beschrieben sind, verwendet werden, um Niveaus von spezifischen CTLs oder T-Helfer-Lymphozyten zu messen. For example, an ELISA can be used to measure the levels of specific antibodies, and ELISPOT or intracellular cytokine staining can be used to measure cytokine levels. Similarly, Cr 51 release (T cell cytotoxicity) assays and assays that test the binding of CTLs or T helper lymphocytes to tetrameric peptide / MHC complexes as described herein can be used to assess levels of to measure specific CTLs or T helper lymphocytes.
Gemäß einem Aspekt der vorliegenden Erfindung besitzt das immunogene Peptid eine Aminosäuresequenz mit einer der SEQ ID Nrn. 2 bis 93 besitzt, und gemäß einer weiteren Ausführungsform die SEQ ID Nrn. 17, 20, 23 oder 27. According to one aspect of the present invention, the immunogenic peptide has an amino acid sequence having one of SEQ ID Nos. 2 to 93, and according to another embodiment, SEQ ID Nos. 17, 20, 23 or 27.
In einer bevorzugten Ausführungsform ist das Peptid geeignet, eine T-Helfer-Zell-Antwort zu stimulieren oder eine zytotoxische T-Lymphozyten(CTL)-Antwort zu produzieren.In a preferred embodiment, the peptide is capable of a T helper cell response stimulate or produce a cytotoxic T-lymphocyte (CTL) response.
Gemäß einem Aspekt der vorliegenden Erfindung ist das immunogene Peptid 8, 9, 10, 11 oder 12, oder 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 oder 25 Aminosäuren lang, vorzugsweise, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, oder 15 Aminosäuren lang, und noch bevorzugter 8, 9, 10, 11 oder 12 Aminosäuren lang.According to one aspect of the present invention, the immunogenic peptide is 8, 9, 10, 11 or 12, or 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 or 25 amino acids, preferably, 8 , 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15 amino acids in length, and more preferably 8, 9, 10, 11 or 12 amino acids in length.
Wie zuvor erwähnt, können also die erfindungsgemäßen immunogenen Peptide in der Krebstherapie eingesetzt werden, z.B. um eine Immunantwort gegen Tumorzellen, insbesondere B-Zell-Lymphome, zu induzieren, die die entsprechenden Antigene exprimieren, von denen die Peptide abstammen. As mentioned above, therefore, the immunogenic peptides of the invention can be used in cancer therapy, e.g. to induce an immune response against tumor cells, particularly B cell lymphomas, expressing the corresponding antigens from which the peptides are derived.
Eine solche Immunantwort z.B. in Form einer Induktion von CTL kann zum einen in vivo erreicht werden. Dazu wird einem Patienten, der an einer mit dem tumorspezifischen Antigen assoziierten Tumorerkrankung leidet, das Peptid, bspw. auch in Form einer pharmazeutischen Zusammensetzung, verabreicht. Such an immune response e.g. in the form of induction of CTL, on the one hand, can be achieved in vivo. For this purpose, a patient who suffers from a tumor disease associated with the tumor-specific antigen, the peptide, eg. Also in the form of a pharmaceutical composition administered.
Andererseits kann eine T-Zell-Antwort auf einen Tumor, der die Antigene, von denen die Peptide abstammen, exprimiert, auch ex vivo ausgelöst werden. Dazu inkubiert man naive T-Vorläuferzellen zusammen mit Antigen-präsentierenden Zellen und den Peptiden, oder verwendet sogenannte „artifizielle Antigen-präsentierenden Zellen“ (Streptavidin-Kügelchen, auf denen rekombinantes MHC Protein, beladen mit einem erfindungsgemäßen Peptid, sowie anti-CD28 Antikörper zum „primen“ von T Zellen in vitro verankert sind). Anschließend kultiviert und expandiert man die dadurch stimulierten peptidspezifischen CTL oder T-Helfer-Lymphozyten und verabreicht diese aktivierten CTL oder T-Helfer-Lymphozyten dem Patienten. On the other hand, a T cell response to a tumor that expresses the antigens from which the peptides are derived may also be triggered ex vivo. For this, naive T-progenitor cells are incubated together with antigen-presenting cells and the peptides, or uses so-called "artificial antigen-presenting cells" (streptavidin beads, on which recombinant MHC protein loaded with a peptide according to the invention, as well as anti-CD28 antibodies to "Prime" of T cells are anchored in vitro). Subsequently, the peptide-specific CTL or T helper lymphocytes stimulated thereby are cultivated and expanded, and the activated CTL or T helper lymphocytes are administered to the patient.
Weiterhin besteht die Möglichkeit, APCs (antigenpräsentierende Zellen) ex vivo mit den Peptiden zu beladen und diese beladenen APCs dem Patienten zu verabreichen, der im Tumorgewebe das Antigen exprimiert, von dem das Peptid abstammt. Die APCs können dann wiederum in vivo den T-Lymphozyten das Peptid präsentieren und sie aktivieren. Furthermore, it is possible to load APCs (antigen-presenting cells) with the peptides ex vivo and to administer these loaded APCs to the patient, who in the tumor tissue expresses the antigen from which the peptide is derived. The APCs may then in turn present the peptide to the T lymphocytes in vivo and activate them.
Die erfindungsgemäßen immunogenen Peptide können aber auch als diagnostische Reagenzien eingesetzt werden.However, the immunogenic peptides according to the invention can also be used as diagnostic reagents.
So kann mit den immunogenen Peptiden herausgefunden werden, ob in einer T-Zell-Population spezifisch gegen ein Peptid gerichtete CTLs oder T-Helfer-Lymphozyten vorliegen oder durch eine Therapie induziert werden.Thus it can be found with the immunogenic peptides whether in a T-cell population specifically against a peptide directed CTLs or T helper lymphocytes are present or induced by a therapy.
Außerdem kann mit den immunogenen Peptiden die Zunahme von Vorläufer T-Zellen getestet werden, die eine Reaktivität gegen das definierte Peptid aufweisen.In addition, with the immunogenic peptides, the increase of precursor T cells can be tested, which have a reactivity against the defined peptide.
Ferner kann das immunogene Peptid als Marker dazu verwendet werden, um den Krankheitsverlauf eines Tumors zu verfolgen, der das Antigen exprimiert, von dem das immunogene Peptid abstammt.Further, the immunogenic peptide can be used as a marker to track the disease process of a tumor expressing the antigen from which the immunogenic peptide is derived.
Für einen Einsatz von tumorspezifischen Antigenen in einem Tumorvakzin sind grundsätzlich mehrere Applikationsformen möglich. So beschrieben
Das Peptid kann dabei in einer bevorzugten Ausführungsform mit Zugabe von Adjuvantien verwendet werden, oder aber auch in Alleinstellung.The peptide can be used in a preferred embodiment with the addition of adjuvants, or even in isolation.
Verschiedene Adjuvantien sind zwischenzeitlich im Stand der Technik bekannt, auch diesbezüglich wird auf die oben erwähnten Veröffentlichungen Bezug genommen. Als Adjuvans kann bspw. der Granulocyte-macrophage-colony-stimulating-factor (GM-CSF) eingesetzt werden. Weitere Beispiele für solche Adjuvantien sind Aluminiumhydroxid, Emulsionen von Mineralölen, wie bspw. das Freundsche Adjuvans, Saponine oder Siliciumverbindungen, Imiquimod oder Monophosphoryl-Lipid A. Die Verwendung mit Adjuvantien bietet den Vorteil, dass die durch das Peptid ausgelöste Immunantwort verstärkt werden kann und/oder dass das Peptid stabilisiert wird.Various adjuvants are known in the art in the meantime, and reference is made to the publications mentioned above in this respect. As an adjuvant, for example, the granulocyte-macrophage-colony stimulating factor (GM-CSF) can be used. Other examples of such adjuvants are aluminum hydroxide, emulsions of mineral oils such as Freund's adjuvant, saponins or silicon compounds, imiquimod or monophosphoryl lipid A. Use with adjuvants has the advantage that the immune response elicited by the peptide can be enhanced and / or that the peptide is stabilized.
In einer anderen bevorzugten Ausführungsform wird das immunogene Peptid gebunden auf einer Antigen-präsentierenden Zelle oder den sogenannten „artifiziellen Antigen-präsentierenden Zellen“ eingesetzt. In another preferred embodiment, the immunogenic peptide is bound to an antigen presenting cell or the so-called "artificial antigen presenting cells".
Diese Maßnahme hat den Vorteil, dass die immunogenen Peptide dem Immunsystem, insbesondere den zytotoxischen T-Lymphozyten (CTL), präsentiert werden können. Dadurch können die CTL die Tumorzellen erkennen und spezifisch abtöten. Als Antigen-präsentierende Zellen sind bspw. dendritische Zellen, Monozyten oder B-Lymphozyten für einen solchen Einsatz geeignet.This measure has the advantage that the immunogenic peptides can be presented to the immune system, in particular the cytotoxic T lymphocytes (CTL). This allows the CTL to recognize and specifically kill the tumor cells. As antigen-presenting cells, for example, dendritic cells, monocytes or B-lymphocytes are suitable for such use.
So sind bspw. dendritische Zellen (englisch: Dendritic Cells, DC) in der Lage, Antigene aufzunehmen, zu prozessieren und sie auf ihrer Zelloberfläche zu präsentieren, was antigen-spezifische T-Zellen aktiviert und dadurch zur Reifung/Differenzierung und Teilung angeregt werden. Die T-Zellen werden dadurch in die Lage versetzt, die Antigen-tragenden Tumorzellen zu erkennen und zu eliminieren. Ebenso können dendritische Zellen natürliche Killerzellen (= NK-Zellen) dazu aktivieren, Tumorzellen anzugreifen. Entsprechend können die dendritischen Zellen mit unterschiedlichen Tumorantigenen versehen werden, um verschiedene Tumorarten zu behandeln ("DC Vakzinierung").For example, dendritic cells (DCs) are capable of accepting and processing antigens and presenting them on their cell surface, activating antigen-specific T cells and thereby stimulating maturation / differentiation and division. The T cells are thereby enabled to recognize and eliminate the antigen-bearing tumor cells. Likewise, dendritic cells can activate natural killer cells (= NK cells) to attack tumor cells. Accordingly, the dendritic cells can be provided with different tumor antigens to treat different types of tumors ("DC vaccination").
Die das Peptid tragenden Antigen-präsentierenden Zellen können dabei entweder direkt verwendet werden oder aber vor einem Einsatz bspw. mit dem Hitzeschock-Protein gp96 aktiviert werden. The antigen-presenting cells carrying the peptide can either be used directly or activated with the heat-shock protein gp96 prior to use, for example.
In einer anderen bevorzugten Ausführungsform werden die Peptide zur Markierung von Leukozyten, insbesondere von T-Lymphozyten verwendet.In another preferred embodiment, the peptides are used to label leukocytes, especially T lymphocytes.
Diese Verwendung ist von Vorteil, wenn mit den Peptiden herausgefunden werden soll, ob in einer T-Zell-Population spezifisch gegen ein immunogenes Peptid gerichtete CTLs oder Helfer-T-Zellen vorliegen. This use is advantageous when the peptides are to be used to find out whether CTLs or helper T cells directed against an immunogenic peptide are present in a T cell population.
Ferner kann das immunogene Peptid als Marker zur Beurteilung eines Therapieverlaufes bei einer Krebserkrankung, insbesondere einem B-Zell-Lymphom, verwendet werden. Furthermore, the immunogenic peptide can be used as a marker for evaluating a course of therapy in a cancer, in particular a B-cell lymphoma.
Auch bei anderen Immunisierungen oder Therapien kann das erfindungsgemäße immunogene Peptid für das Monitoring der Therapie eingesetzt werden. Somit ist das Peptid nicht nur therapeutisch, sondern auch diagnostisch einsetzbar.The immunogenic peptide according to the invention can also be used for monitoring the therapy in other immunizations or therapies. Thus, the peptide is not only therapeutically but also diagnostically useful.
In einer weiteren Ausführungsform werden die Peptide zur Herstellung eines Antikörpers eingesetzt, die mittels im Stand der Technik hinreichend bekannter Verfahren hergestellt werden können. „Antikörper“ schließt im Folgenden auch alle nach aktuellem Stand der Technik auf „Antikörper“-Prinzip im weitesten Sinne beruhenden Anwendungen wie bspw. Fab-Fragmente, single-chain variable fragments, scFv, Einzeldomänenantikörper, VHH, VNAR oder Nanobodies, ein. So können polyklonale Antikörper in herkömmlicher Weise durch Immunisierung von Tieren mittels Injektion der Peptide und anschließender Reinigung des Immunglobulins gewonnen werden. Monoklonale Antikörper können nach Standardprotokollen hergestellt werden, wie bspw. in
In einer weiteren Ausführungsform werden die Peptide zur Herstellung von T-Zellen eingesetzt, die spezifisch für die erfindungsgemäßen Peptide im Kontext von MHC I oder II Molekülen sind, welche mittels im Stand der Technik hinreichend bekannter Verfahren hergestellt werden können. Diese T-Zellen können nach Vakzinierung des Patienten isoliert und nach Vervielfältigung dem Patienten wieder verabreicht werden, oder in vitro mittels Stimulation naiver T-Zellen des Patienten generiert und zur Krebstherapie verabreicht werden. In a further embodiment, the peptides are used to produce T cells which are specific for the peptides of the invention in the context of MHC I or II molecules which can be prepared by methods well known in the art. These T cells can be isolated after vaccination of the patient and re-administered to the patient after amplification, or generated in vitro by stimulation of naive T cells of the patient and administered for cancer therapy.
In noch einer weiteren Ausführungsform werden die Peptide zur Herstellung von T-Zellen eingesetzt, deren Peptid-MHC-spezifischer T-Zellrezeptor (TCR) α- und/oder β-Ketten kloniert und sequenziert werden, um Nukleinsäuren generieren zu können, die wiederum dazu eingesetzt werden können, aus T-Zellen anderer Spezifizität mittels Übertragung dieser Nukleinsäuren MHC-Peptid-spezifische T-Zellen zu generieren. Dies kann durch bspw. durch Transduktion oder Transfektion autologer PBMC (mononukleäre Zellen des peripheren Bluts) oder isolierter T-Zellen des Patienten bewerkstelligt werden. Diese autologen T-Zellen können dem Patienten zur Krebstherapie wieder verabreicht werden. In yet another embodiment, the peptides are used to produce T cells whose peptide-MHC-specific T cell receptor (TCR) clones and sequences α and / or β chains to generate nucleic acids, which in turn can be used to generate MHC-peptide-specific T cells from T cells of other specificity by transfer of these nucleic acids. This can be accomplished, for example, by transduction or transfection of autologous PBMC (peripheral blood mononuclear cells) or isolated T cells of the patient. These autologous T cells can be re-administered to the patient for cancer therapy.
Diese Ausführungsform hat gegenüber dem Einsatz von peptidspezifischen T-Zellpopulationen den Vorteil, dass hier die oftmals problematische Verschiedenheit der MHC-Moleküle zwischen Spender-T-Zellen und Patient überwunden werden kann. Vorteilhafterweise kann bei dieser Ausführungsform statt der ganzen T-Zellen leidglich die Spezifität eines charakterisierten tumorantigenspezifischen T-Zellkolons, mithin der spezifische T-Zellrezeptor, in den zu behandelnden Patienten bzw. in autologe T-Zellen des Patienten oder in passende Spenderzellen eingebracht werden. Damit kann auch die Schwierigkeit bei Übertragung von frischen T-Zellen überwunden werden, dass diese in der Regel nur zeitlich eingeschränkt aktiv sind. This embodiment has the advantage over the use of peptide-specific T-cell populations that the often problematic diversity of MHC molecules between donor T-cells and the patient can be overcome. Advantageously, in this embodiment, instead of the whole T cells, the specificity of a characterized tumor antigen-specific T cell colon, thus the specific T cell receptor, can be introduced into the patient to be treated or into autologous T cells of the patient or into suitable donor cells. Thus, the difficulty in transferring fresh T cells can be overcome that they are usually active only limited in time.
Dass durch die Übertragung der Sequenzen der α- und β-Ketten eines T-Zellrezeptors die Reaktivität und Spezifität eines T-Zellklons auf sekundäre Zellen übertragen werden kann, wurde bereits im Stand der Technik generell gezeigt. Diesbezüglich wird bspw. auf
Für diese sogenannte T-Zellrezeptor-Therapie wird zunächst ein T-Zellklon identifiziert und isoliert, welcher eine hohe Affinität für das immunogene Peptid aufweist, was bspw. durch Isolierung von tumorspezifischen T-Zellen aus Patienten erfolgen kann, gefolgt von einer anschließenden in vitro Vermehrung und Klonierung. Anschließend werden die α- und/oder β-Kette des T-Zellrezeptors identifiziert und die Gene, die für diese kodieren, durch molekulare Klonierung isoliert. For this so-called T cell receptor therapy, a T cell clone is first identified and isolated which has a high affinity for the immunogenic peptide, which can be done, for example, by isolating tumor-specific T cells from patients, followed by a subsequent in vitro multiplication and cloning. Subsequently, the α and / or β chain of the T cell receptor are identified and the genes coding for them are isolated by molecular cloning.
Die Nukleinsäuren, die für die α- und/oder β-Kette des T-Zellrezeptors, der für das immunogene Peptid spezifisch ist, kodieren, werden dann bspw. mittels eines retroviralen oder lentiviralen Vektors in periphere T-Zellen transduziert (siehe bspw.
Die Erfindung betrifft außerdem in einem weiteren Aspekt eine pharmazeutische Zusammensetzung, die eines oder mehrere der Peptide enthält. The invention also relates in a further aspect to a pharmaceutical composition containing one or more of the peptides.
Diese Zusammensetzung dient bspw. der parenteralen Verabreichung, bspw. subkutan, intradermal oder intramuskulär, oder der oralen Verabreichung. Dabei sind die Peptide in einem pharmazeutisch annehmbaren, vorzugsweise wässrigen, Träger gelöst oder suspendiert. Darüber hinaus kann die Zusammensetzung Hilfsstoffe, wie bspw. Puffer, Bindemittel, Verdünnungsmittel, etc. enthalten. Die Peptide können auch zusammen mit immunstimulierenden Substanzen, z.B. Zytokinen, verabreicht werden. Daneben können die Peptide auch gemeinsam mit Substanzen verabreicht werden, die einen negativen Effekt auf die Immunreaktion aufheben (z.B. Depletion von regulatorischen T Zellen oder Immuncheckpoint-Blockade). Eine umfassende Darstellung von Hilfsstoffen, wie sie bei einer derartigen Zusammensetzung verwendet werden können, ist bspw. in
Das Mittel kann dabei zur Prävention, Prophylaxe und/oder Therapie von Tumorerkrankungen eingesetzt werden.The agent can be used for the prevention, prophylaxis and / or therapy of tumor diseases.
Die in der pharmazeutischen Zusammensetzung vorliegende Menge des Peptids liegt dabei in einer therapeutisch effektiven Menge vor.The amount of the peptide present in the pharmaceutical composition is present in a therapeutically effective amount.
Die immunogenen Peptide binden dabei gemäß einer bevorzugten Ausführungsform an den HLA-Typ B*07, B*35, B*15. Es versteht sich dabei, dass die konkret aufgeführten HLA-Typen lediglich beispielhaft genannt sind, und auch alle anderen HLA-Typen in Frage kommen.The immunogenic peptides bind according to a preferred embodiment of the HLA type B * 07, B * 35, B * 15. It goes without saying that the specifically listed HLA types are given by way of example only, and all other HLA types are also suitable.
Die vorliegende Erfindung betrifft in einem weiteren Aspekt Nukleinsäuremoleküle, die die Sequenz beinhalten oder aus diesen bestehen, die für die erfindungsgemäßen immunogenen Peptide mit der Sequenz ID-Nr. 2 bis 93 kodieren. In a further aspect, the present invention relates to nucleic acid molecules which comprise or consist of the sequence which is suitable for the immunogenic peptides according to the invention having the sequence ID no. 2 to 93 encode.
Die Nukleinsäuremoleküle können dabei DNA- oder RNA-Moleküle sein und ebenfalls für die Immuntherapie von Krebserkrankungen eingesetzt werden. Dabei induziert das von dem Nukleinsäuremolekül exprimierte immunogene Peptid eine Immunantwort gegen Tumorzellen, die das Peptid exprimieren.The nucleic acid molecules may be DNA or RNA molecules and also be used for the immunotherapy of cancers. In this case, the immunogenic peptide expressed by the nucleic acid molecule induces an immune response against tumor cells expressing the peptide.
Erfindungsgemäß können die Nukleinsäuremoleküle auch in einem Vektor vorliegen.According to the invention, the nucleic acid molecules can also be present in a vector.
Entsprechend betrifft die vorliegende Erfindung auch einen Impfstoff, der ein erfindungsgemäßes immunogenes Peptid oder eine erfindungsgemäße Nukleinsäure umfasst. Dieser Impfstoff kann Patienten verabreicht werden, bei welchen das Vorliegen der somatischen L265P MyD88 Driver-Mutation zuvor nachgewiesen wurde. Dadurch wird in diesen Patienten die Bildung einer Immunantwort ausgelöst, welches sich gezielt auf den Tumor richten kann. Accordingly, the present invention also relates to a vaccine comprising an immunogenic peptide or a nucleic acid according to the invention. This vaccine can be administered to patients previously detected for the somatic L265P MyD88 Driver mutation. This triggers the formation of an immune response in these patients, which can specifically target the tumor.
Ferner betrifft die vorliegende Erfindung auch eine isolierte T-Zelle, spezifisch für ein erfindungsgemäßes immunogenes Peptid, oder produziert durch Stimulierung von peripheren mononukleären Blutzellen (PBMCs) mit einem erfindungsgemäßen immunogenen Peptid oder einer erfindungsgemäßen Nukleinsäure.Further, the present invention also relates to an isolated T cell specific for an immunogenic peptide of the invention, or produced by stimulating peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) with an immunogenic peptide of the invention or a nucleic acid of the invention.
Ferner betrifft die vorliegende Erfindung die Nukleinsäuresequenz eines der α- und/oder β-Kette eines T-Zellrezeptors (TCR), der spezifisch für ein erfindungsgemäßes immunogenes Peptid ist, welches z.B., aber nicht ausschließlich, zur Herstellung peptidspezifischer T-Zellen durch Transduktion oder Transfektion aus PBMCs oder isolierten T-Zellen eines Spenders eingesetzt werden kann. Die Nukleinsäuresequenz eines solchen TCR, der spezifische für ein erfindungsgemäßes immunogenes Peptid ist, kann mittels im Stand der Technik bekannter Verfahren und Methoden identifiziert und generiert werden. Diesbezüglich wird auf die Ausführungen weiter oben zu der Verwendung der erfindungsgemäßen Peptide zur Herstellung von T-Zellen Bezug genommen, deren Peptid-MHC-spezifischer TCR α- und/oder β-Ketten kloniert und sequenziert werden, um Nukleinsäuren herzustellen, die dazu dienen können, aus T-Zellen anderer Spezifizität mittels Übertragung dieser Nukleinsäuren MHC-Peptid-spezifische T-Zellen zu generieren.Furthermore, the present invention relates to the nucleic acid sequence of one of the α and / or β chain of a T cell receptor (TCR), which is specific for an immunogenic peptide according to the invention, for example, but not exclusively, for the production of peptide-specific T cells by transduction or Transfection can be used from PBMCs or isolated T cells of a donor. The nucleic acid sequence of such a TCR which is specific for an immunogenic peptide according to the invention, can be identified and generated by methods and methods known in the art. In this regard, reference is made to the comments above on the use of the peptides of the invention for the production of T cells whose peptide-MHC-specific TCR clones α and / or β chains and are sequenced to produce nucleic acids that can serve this purpose to generate MHC-peptide-specific T cells from T cells of a different specificity by transferring these nucleic acids.
Ferner betrifft die vorliegende Erfindung auch isolierte APCs (z.B. dendritische Zellen), die spezifisch das erfindungsgemäße immunogene Peptid nach Behandlung mit erfindungsgemäßem immunogenen Peptid oder einer erfindungsgemäßen Nukleinsäure auf MHC I oder MHC II präsentieren, z.B. in der Form eines sogenannten „DC-Vakzins“.Furthermore, the present invention also relates to isolated APCs (for example dendritic cells) which specifically present the immunogenic peptide of the invention after treatment with immunogenic peptide or a nucleic acid according to the invention on MHC I or MHC II, e.g. in the form of a so-called "DC vaccine".
Die vorliegende Erfindung betrifft entsprechend auch eine pharmazeutische Zusammensetzung, umfassend:
- (a) ein erfindungsgemäßes immunogenes Peptid und einen pharmazeutisch akzeptablen Träger oder Hilfsstoff;
- (b) eine erfindungsgemäße Nukleinsäure und einen pharmazeutisch akzeptablen Träger oder Hilfsstoff; oder
- (c) zwei oder mehrere eines erfindungsgemäßen immunogenen Peptids, oder einer erfindungsgemäßen Nukleinsäure, zur gleichzeitigen, sequenziellen oder getrennten Verabreichung.
- (a) an immunogenic peptide of the invention and a pharmaceutically acceptable carrier or excipient;
- (b) a nucleic acid of the invention and a pharmaceutically acceptable carrier or excipient; or
- (c) two or more of an immunogenic peptide of the invention, or a nucleic acid of the invention, for simultaneous, sequential or separate administration.
Ferner betrifft die vorliegende Erfindung ein erfindungsgemäßes immunogenes Peptid, eine erfindungsgemäße Nukleinsäure, einen erfindungsgemäßen Impfstoff, eine erfindungsgemäße isolierte T-Zelle, eine erfindungsgemäße peptidspezifische T-Zell-Rezeptor Sequenz-kodierende Nukleinsäure, eine erfindungsgemäße APC oder eine erfindungsgemäße pharmazeutische Zusammensetzung zur Verwendung in der Prophylaxe, Therapie oder Behandlung von B-Zell-Lymphomen und -leukämien.The present invention furthermore relates to an immunogenic peptide according to the invention, a nucleic acid according to the invention, a vaccine according to the invention, an isolated T cell according to the invention, a peptide-specific T cell receptor sequence-encoding nucleic acid according to the invention, an APC according to the invention or a pharmaceutical composition according to the invention for use in the Prophylaxis, therapy or treatment of B-cell lymphomas and leukemias.
Insbesondere betrifft die vorliegende Erfindung ein erfindungsgemäßes immunogenes Peptid, eine erfindungsgemäße Nukleinsäure, einen erfindungsgemäßen Impfstoff, eine erfindungsgemäße isolierte T-Zelle, eine erfindungsgemäße APC oder eine erfindungsgemäße pharmazeutische Zusammensetzung zur Verwendung für die in vitro Stimulation von T-Zellen in der adoptiven Immuntherapie von Menschen.In particular, the present invention relates to an immunogenic peptide according to the invention, a nucleic acid according to the invention, a vaccine according to the invention, an isolated T cell according to the invention, an APC according to the invention or a pharmaceutical composition according to the invention for use for the in vitro stimulation of T cells in adoptive immunotherapy of humans ,
Die vorliegende Erfindung betrifft daher auch Verwendung des erfindungsgemäßen immunogenen Peptids zur Herstellung eines therapeutischen oder diagnostischen Antikörpers. The present invention therefore also relates to the use of the immunogenic peptide according to the invention for the production of a therapeutic or diagnostic antibody.
Wie weiter oben dargelegt, betrifft die vorliegende Erfindung auch ein erfindungsgemäßes immunogenes Peptid, eine erfindungsgemäße Nukleinsäure, einen erfindungsgemäßen Impfstoff, eine erfindungsgemäße isolierte T-Zelle, eine erfindungsgemäße APC oder eine erfindungsgemäße pharmazeutische Zusammensetzung zur Verwendung in der Prophylaxe, Therapie oder Behandlung von B-Zell-Lymphomen und -leukämien, und insbesondere bei Patienten mit somatischer L265P MyD88 Driver-Mutation, und gemäß einer Ausführungsform bei Patienten mit B*07, B*35 oder B*15 HLA-Typ.As stated above, the present invention also relates to an immunogenic peptide according to the invention, a nucleic acid according to the invention, a vaccine according to the invention, an isolated T cell according to the invention, an APC according to the invention or a pharmaceutical composition according to the invention for use in the prophylaxis, therapy or treatment of B cells. Cell lymphomas and leukemias, and particularly in patients with somatic L265P MyD88 Driver mutation, and in one embodiment in patients with B * 07, B * 35 or B * 15 HLA type.
Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform sind die B-Zell-Lymphome und -leukämien ausgewählt aus der Gruppe umfassend: Diffuses großzelliges B-Zell-Lymphom (DLBCL), Schleimhaut-assoziiertes lymphoides Gewebe Lymphom (MALT), chronische lymphatische Leukämie (CLL), Waldenströms Makroglobulinämie (WM), primäre kutane großzellige B-Zell-Lymphome (PCLBCL), primäres zentrales Nerven-B-Zell-Lymphom (PCNBL), extranodale Randzonenlymphome im okulären Adnex (OAEMZL), und splenisches Marginalzonenlymphom (SMZL), Burkitt Lymphom (BL), Monoklonale Gammopathie unklarer Signifikanz (MGUS), Intra-okuläres B-Zell-Lymphom (IOL). In a preferred embodiment, the B-cell lymphomas and leukemias are selected from the group comprising: diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma (MALT), chronic lymphocytic leukemia (CLL), Waldenstrom's macroglobulinemia (WM), primary cutaneous large cell B-cell lymphoma (PCLBCL), primary central nervous B-cell lymphoma (PCNBL), extranodal marginal zone lymphoma in ocular adnex (OAEMZL), and splenic marginal zone lymphoma (SMZL), Burkitt's lymphoma (BL) , Monoclonal gammopathy of unclear significance (MGUS), intra-ocular B-cell lymphoma (IOL).
Die Patienten, die im Rahmen der vorliegenden Erfindung für die Therapie mit den erfindungsgemäßen Peptiden, den hierein beschriebenen Impfstoff oder einer anderen erfindungsgemäßen Verwendung geeignet sind, können mittels einfachen PCR-basierten Methoden auf das Vorliegen der L265P MyD88-Mutation und durch HLA-Typisierung identifiziert werden, siehe hierzu beispielsweise
Entsprechend betrifft die vorliegende Erfindung auch ein Behandlungsverfahren, bei dem zunächst Patienten mit L265P MyD88-Mutation identifiziert werden, und die anschließend mit den immunogenen Peptiden/dem Impfstoff/den T-Zellen/der pharmazeutischen Zusammensetzung/den Antikörpern oder überhaupt gemäß der vorliegenden Erfindung behandelt werden. Gemäß einer Ausführungsform werden insbesondere Patienten mit L265P MyD88 Mutation und mit B*07, B*35, B*15 HLA-Typ identifiziert. Accordingly, the present invention also relates to a method of treatment in which patients with L265P MyD88 mutation are first identified and subsequently treated with the immunogenic peptides / vaccine / T cells / pharmaceutical composition (s) or in general according to the present invention become. According to one embodiment, in particular patients with L265P MyD88 mutation and with B * 07, B * 35, B * 15 HLA type are identified.
Es versteht sich, dass die vorstehend genannten und die nachstehend noch zu erläuternden Merkmale nicht nur in der jeweils angegebenen Kombination, sondern auch in Alleinstellung verwendbar sind, ohne den Rahmen der vorliegenden Erfindung zu verlassen.It is understood that the features mentioned above and those yet to be explained below can be used not only in the respectively specified combination but also alone, without departing from the scope of the present invention.
Weitere Merkmale ergeben sich aus der nachstehenden Figuren und der Beschreibung. Es zeigen: Further features will become apparent from the following figures and the description. Show it:
Material und Methodenmaterial and methods
Vom Institut für Klinische und Experimentelle Transfusionsmedizin des Universitätsklinikums Tübingen werden Vollblutkonserven HLA-typisierter gesunder Blutspender nach Aufklärung und schriftlicher Einwilligung der Spender anonymisiert zur Abteilung Immunologie transferiert. Hier erfolgte ein in vitro Priming mit artifiziellen antigenpräsentierenden Zellen (aAPCs, s.o.) der enthaltenen CD8+ T-Zellen. Die Aufarbeitung und Isolierung der enthaltenen peripheren mononukleären Zellen (PBMCs) erfolgt über Ficoll-Dichtegradientenzentrifugation. Die Isolation der zytotoxischen CD8+ T-Zellen erfolgt über MACS-Anreicherung (magnetisch aktivierte Zellsortierung) mittels positiver Selektion durch CD8 Microbeads. Die verwendeten aAPCs bestehen aus Streptavidinbeschichteten Polystyrolpartikeln, die mit biotinyliertem anti-CD28-Antikörper und den gewünschten biotinylierten HLA-Peptidkomplexen beladen werden. Letztere werden in Eigenproduktion nach rekombinanter Expression in Bakterien durch Rückfaltung mit dem gewünschten Peptid hergestellt. Pro Ansatz werden eine Million CD8+ T-Zellen mit der gleichen Menge aAPCs im Abstand von 7 Tagen über einen Gesamtzeitraum von 3–4 Wochen stimuliert. Die Expansion aktivierter T-Zellen wird außerdem durch Zugabe von rekombinantem IL-2 jeweils 2 Tage nach aAPC-Stimulation gefördert. Anschließend wird die erfolgreiche Expansion spezifischer T-Zellen durch HLA-Multimerfärbung nachgewiesen. Dabei kommen die gleichen biotinylierten HLA-Peptidkomplexe zum Einsatz, die auch für die Herstellung der aAPCs verwendet wurden. Diese werden allerdings mit Phycoerythrin-gekoppeltem Streptavidin zu HLA-Multimeren tetramerisiert. Letztere lassen sich dann zusammen mit anderen Antikörpern für die Identifizierung Tetramer-positiver T-Zellen in der Durchflusszytometrie verwenden.The Institute for Clinical and Experimental Transfusion Medicine at the University Hospital Tübingen transfers whole blood preserves of HLA-typed healthy blood donors anonymously to the Department of Immunology after informed consent and written consent of the donors. Here an in vitro priming with artificial antigen-presenting cells (aAPCs, see above) of the contained CD8 + T-cells took place. The processing and isolation of the contained peripheral mononuclear cells (PBMCs) is carried out by Ficoll density gradient centrifugation. The isolation of the cytotoxic CD8 + T cells takes place via MACS enrichment (magnetically activated cell sorting) by means of positive selection by CD8 microbeads. The aAPCs used consist of streptavidin-coated polystyrene particles loaded with biotinylated anti-CD28 antibody and the desired biotinylated HLA-peptide complexes. The latter are produced in-house after recombinant expression in bacteria by refolding with the desired peptide. Per each approach, one million CD8 + T cells are stimulated with the same amount of aAPCs every 7 days for a total period of 3-4 weeks. The expansion of activated T cells is also promoted by the addition of recombinant IL-2 every 2 days after aAPC stimulation. Subsequently, the successful expansion of specific T cells by HLA multimer staining is detected. Here, the same biotinylated HLA-peptide complexes are used, which were also used for the production of aAPCs. However, these are tetramerized with phycoerythrin-coupled streptavidin to HLA multimers. The latter can then be used together with other antibodies to identify tetramer-positive T cells in flow cytometry.
Für den Nachweis der Funktionalität und spezifischen Interferon-gamma (IFN-γ) Produktion peptidspezifischer T-Zellen nach Stimulation mit dem mutationsabgeleitetem Peptid wird ein ELISPOT (Enzyme Linked Immuno Spot Assay) durchgeführt. Dazu werden die in vitro geprimten Zellen, welche als Tetramer-positive identifiziert wurden, in einer zuvor mit IFN-γ-Antikörpern beschichteten Platte ausgesät und erneut mit dem jeweiligen Peptid stimuliert. Nach 24 h kann dann die sekundäre Färbung des sezernierten IFN-γ erfolgen. Hierbei wird jede IFN-γ-produzierende T-Zelle als Spot dargestellt. Um die Mutations-Spezifität zu bestätigen werden dieselben Analysen ebenfalls mit dem passenden wildtypischen Peptid durchgeführt.For the detection of the functionality and specific interferon-gamma (IFN-γ) production of peptide-specific T cells after stimulation with the Mutation-derived peptide is an ELISPOT (Enzyme Linked Immuno Spot Assay) performed. For this, the in vitro primed cells, which were identified as tetramer-positive, are seeded in a previously coated with IFN-γ antibodies plate and stimulated again with the respective peptide. After 24 h, the secondary staining of the secreted IFN-γ can then take place. Here, each IFN-γ-producing T cell is displayed as a spot. To confirm the mutation specificity, the same analyzes are also performed with the appropriate wild-type peptide.
ErgebnisseResults
Für die Identifizierung von potentiellen mutations-abgeleiteten Peptiden der MyD88 L265P Mutation wurden 8 bis 12mer Peptide, die die Mutation an jeder möglichen Position innerhalb des Peptides umfassen, erstellt. Die Peptide wurden dann mit den Datenbanken SYFPEITHI und NetMHC als mögliche Liganden für verschiedene MHC-Klasse I Allele vorhergesagt. Solche Peptide, die als gute Liganden vorhergesagt wurden, wurden synthetisch hergestellt, um eine experimentellen Überprüfung der Bindung sowie der Immunogenität durchzuführen. For the identification of potential mutation-derived peptides of the MyD88 L265P mutation, 8 to 12mer peptides comprising the mutation at every possible position within the peptide were generated. The peptides were then predicted with the SYFPEITHI and NetMHC databases as potential ligands for various MHC class I alleles. Such peptides, which were predicted to be good ligands, were synthesized to perform experimental binding and immunogenicity testing.
Folgende Gating Strategie wurde bei der durchflusszytometrischen Analyse von tetramerpositiven CD8+ T-Zellen nach in vitro Priming angewandt: Geprimte CD8+ T-Zellen wurden mit dem Farbstoff aqua fluorescent reactive dye, einem monoklonalen Antikörper gegen das humane CD8 sowie einem spezifischen Tetramer gefärbt. Hierzu wurden zuerst die Lymphozyten mit Hilfe des forward light scatter (FSC) und des side light scatter (SSC) gegated. Um Doubletten zu eliminieren wurde der forward light scatter area (FSC-A) gegen den forward light scatter height (FSC-H) verwendet. Tote Zellen wurden mit Hilfe des aqua fluorescent reactive Farbstoffs ausgeschlossen. Die CD8+ T-Zellen mit einem spezifischen T-Zell-Rezeptor für das Antigen wurden mit einer Färbung gegen CD8 sowie dem spezifischen Tetramer identifiziert (Daten nicht gezeigt). The following gating strategy was used in the flow cytometric analysis of tetramerpositiven CD8 + T cells after in vitro priming: Primed CD8 + T-cells were stained with the dye reactive aqua fluorescent dye, a monoclonal antibody against the human CD8 as well as a specific tetramer. For this purpose, the lymphocytes were first gated using the forward light scatter (FSC) and the side light scatter (SSC). Around To eliminate doublets, the forward light scatter area (FSC-A) was used against the forward light scatter height (FSC-H). Dead cells were excluded using the aqua fluorescent reactive dye. The CD8 + T cells with a specific T cell receptor for the antigen were identified with staining for CD8 and the specific tetramer (data not shown).
In
In weiteren Experimenten wurde die Interferon-gamma- und die Tumornekrosefaktor-alpha-Produktion durch CD8+ T-Zellen nach Stimulation mit einem erfindungsgemäßen Peptid zum Nachweis der Funktionalität der geprimten T-Zellen untersucht (siehe die in
Hierzu wurden neben dem ELISPOT ebenfalls eine intrazelluläre Zytokinfärbung (ICS) sowie eine Färbung des Degranulationsmarkers CD107a durchgeführt. Hierfür wurden die geprimten Zellen nach Hemmung der Zytokinfreisetzung durch Blockieren des Golgi-Apparats mit Fluoreszenz-gekoppelten Antikörpern gegen CD8, CD107a und nach Permeabilisation mit Antikörpern gegen Interferon-gamma und Tumornekrosefaktor-alpha gefärbt und mittels Durchflusszytometrie analysiert. In addition to the ELISPOT, intracellular cytokine staining (ICS) and staining of the degranulation marker CD107a were also performed. For this, the primed cells were stained for inhibition of cytokine release by blocking the Golgi apparatus with fluorescence-coupled antibodies to CD8, CD107a and after permeabilization with antibodies to interferon-gamma and tumor necrosis factor-alpha and analyzed by flow cytometry.
In
Damit konnte die peptidspezifische Funktionalität der geprimten T-Zellen nachgewiesen werden. Thus, the peptide-specific functionality of the primed T cells could be detected.
Die oben dargestellten Daten zeigen beeindruckend, dass bei gesunden Spendern ein in vitro Priming von naiven CD8+ T-Zellen möglich ist. The above data shows impressively that in healthy donors in vitro priming of naïve CD8 + T cells is possible.
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Zitierte Nicht-PatentliteraturCited non-patent literature
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