DE102006032637A1 - Device for the information of biological samples e.g. cells/tissues, comprises sound producing mechanism, which produces sound wave in the sample to be treated, a reception for a container, mixer with a retainer for mix element, and drive - Google Patents
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Abstract
Description
Die Erfindung betrifft eine Vorrichtung zum Aufschluss (Lyse) von biologischen Proben, die eine Schallerzeugungseinrichtung aufweist, die in der aufzuschließenden Probe, die vorzugsweise in Form einer wässrigen Suspension vorliegt, eine Schallwelle, vorzugsweise eine Ultraschallwelle erzeugen kann.The The invention relates to a device for digestion (lysis) of biological Samples, having a sound generating device, which in the aufzuschließenden Sample, which is preferably in the form of an aqueous suspension, a sound wave, preferably an ultrasonic wave can generate.
Aus
der
Gemäß
Vor diesem Hintergrund liegt der Erfindung die Aufgabe zugrunde, die bekannten Vorrichtungen zu verbessern.In front In this background, the invention is based on the object, the to improve known devices.
Diese
Aufgabe wird mit einer Vorrichtung zum Aufschluß von biologischen Proben mit
einer Schallerzeugungseinrichtung (
- – eine Aufnahme für einen Behälter, der die Probe aufnehmen kann,
- – einen Mixer mit einer Halterung für ein Mixelement, das in den Behälter eingebracht werden kann, wobei der Behälter in der Aufnahme oder in einer anderen Aufnahme angeordnet ist und
- – einen
Antrieb zur Bewegung der Aufnahme und/oder des Mixelements (
4 ) aufweist.
- A receptacle for a container capable of holding the sample,
- A mixer with a holder for a mixing element, which can be introduced into the container, wherein the container is arranged in the receptacle or in another receptacle, and
- A drive for moving the receptacle and / or the mixel element (
4 ) having.
Vorteilhafte Ausgestaltungen sind in den Unteransprüchen angegeben.advantageous Embodiments are specified in the subclaims.
Die Erfindung geht von dem Grundgedanken aus, in der Lysevorrichtung neben der Schallerzeugungseinrichtung ferner einen Mixer vorzusehen, mit dem die aufzubrechende biologische Probe behandelt werden kann. Insbesondere bevorzugt soll zusätzlich zu der Schallerzeugungseinrichtung ein Mixer nach der Art eines sog. Homogenisators hinzugefügt werden.The Invention is based on the idea in the lysis device furthermore to provide a mixer in addition to the sound generating device, with which the biological sample to be disrupted can be treated. Especially preferred is additionally intended to the sound generating device, a mixer of the type so-called Homogenisators added become.
Die Vorrichtung weist eine Aufnahme für einen Behälter, der das zu behandelnde biologische Material aufnehmen kann, auf. Als Behälter eignen sich insbesondere laborübliche Probengefäße wie bspw. 50 ml-Falcon-Röhrchen. Ferner ist ein Mixer vorgesehen, der eine Halterung für ein Mixelement aufweist, das in den Behälter eingebracht werden kann. Der Behälter wird durch eine Aufnahme in Position gehalten. Ein Antrieb ist vorgesehen, um die Aufnahme und/oder das Mixelement zu bewegen.The The device has a receptacle for a container that holds the treatment to be treated can absorb biological material. Suitable containers especially laboratory standard Sample containers such as. 50 ml Falcon tube. Furthermore, a mixer is provided, which has a holder for a mixing element, that in the container can be introduced. The container is held in place by a receptacle. A drive is provided to move the recording and / or the mixing element.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung ermöglicht es zum Aufschluß von biologischen Materialen wie bspw. Zellen und Geweben drei verschiedene Behandlungsmethoden mit nur einer Vorrichtung durchzuführen, nämlich die sog. „Sonication", die sog. Homogenisierung und in einer bevorzugten Ausführungsform die sog. „Bead Mill Disruption" (die Behandlung der Probe mit Hilfe von losen Teilchen, die der aufzuschließenden Probe beigefügt werden und zur Behandlung der Probe bewegt werden). Derartige Teilchen sind vorzugsweise kugelförmig und dienen dazu, den Aufschluß des Probenmaterials mechanisch zu unterstützen.The inventive device allows it for the digestion of biological materials such as cells and tissues three different treatment methods to perform with only one device, namely the so-called "Sonication", the so-called. Homogenization and in a preferred embodiment the so-called "Bead Mill Disruption "(the Treatment of the sample with the help of loose particles, the sample to be digested enclosed and moved to treat the sample). Such particles are preferably spherical and serve the digestion of the Mechanically support sample material.
Indem mit der Erfindung eine Vorrichtung geschaffen wird, die die Durchführung aller dieser drei Behandlungsmethoden erlaubt, wird die Tätigkeit des solche Vorrichtungen einsetzenden Benutzers deutlich vereinfacht. Er kann sich spontan für die beste Behandlungsmethode des aufzuschließenden Materials entscheiden. Ferner entfällt die Notwendigkeit, für jede Behandlungsmethode im Labor eine eigene Vorrichtung vorzuhalten und zu warten. Damit einher geht der weitere Vorteil der Platzersparnis. Darüber hinaus können sämtliche Behandlungsmethoden kumulativ, d.h. gleichzeitig oder nacheinander durchgeführt werden. Beispielsweise könnte die Ultraschallbehandlung und die Rotor/Stator Homogenisierung gleichzeitig durchgeführt werden. Durch die sequentielle Behandlungsabfolge aller drei Methoden könnte beispielsweise ein Aufschluss von sehr schwierigen Probematerialien verbessert werden.By doing with the invention, a device is provided, which is the implementation of all These three treatment methods will allow the activity of such devices using user significantly simplified. He can spontaneously for decide the best treatment method of the material to be broken up. Further deleted the need for Each treatment method in the laboratory a separate device vorzuhalten and wait. This is accompanied by the further advantage of saving space. Furthermore can all Treatment methods cumulative, i. simultaneously or in succession carried out become. For example, could the ultrasonic treatment and the rotor / stator homogenization simultaneously carried out become. Through the sequential treatment sequence of all three methods could for example improved digestion of very difficult sample materials become.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung ermöglicht in vorteilhafter Weise den Aufschluß (Lyse) von biologischen Materialien, wie bspw. Zellen oder Geweben. Durch die Zerstörung der Membran der Zellen werden intrazelluläre biologische Bestandteile freigesetzt (bspw. Nukleinsäuren und Proteine), die im Anschluß an den Zellaufschluß weiterverarbeitet, bzw. aufgereinigt oder analysiert werden können.The inventive device allows Advantageously, the digestion (lysis) of biological materials, such as cells or tissues. By destroying the membrane of the cells become intracellular released biological components (for example, nucleic acids and Proteins) following the cell digestion further processed, or can be purified or analyzed.
Die biologische Probe, die die zu lysierenden Bestandteile wie bspw. die Zellen enthält, wird vorzugsweise in einem flüssigen Medium, in der Art einer Suspension, verarbeitet. Das Bead-Mill Verfahren erlaubt jedoch auch einen Aufschluss einer Probe mit oder ohne umgebendem Medium. Die Probe kann hierbei als „frisches" oder gefrorenes oder gefriergetrocknetes Material vorliegenThe biological sample containing the components to be lysed, such as the cells, is preferably processed in a liquid medium, in the manner of a suspension. The bead-mill procedure However, ren also allows a digestion of a sample with or without surrounding medium. The sample may be present as a "fresh" or frozen or freeze-dried material
In der allgemeinsten Ausführungen der erfindungsgemäßen Vorrichtung hält die Aufnahme den Probenbehälter. Dabei ist die Aufnahme vorzugsweise so ausgebildet, daß der Behälter aus der Aufnahme herausgenommen werden kann. In einer bevorzugten Ausführungsform ist die Aufnahme derart ausgebildet, daß sie einen Behälter, wenn er in die Vorrichtung eingesetzt wird, backenartig umgreift. Es hat sich gezeigt, daß der derart in der Aufnahme gehaltene Behälter besonders gut fixiert ist und, soweit ein Antrieb zur Bewegung der Aufnahme vorgesehen ist, zu einer guten Übertragung der Bewegung auf den Behälter geeignet ist. Ferner lässt sich ein Behälter besonders einfach in eine backenartig ausgeführte Aufnahme einsetzen. Unter einer backenartigen Aufnahme wird insbesondere eine u-förmige oder vergleichbar ausgebildete Aufnahme verstanden. Eine Schwingbacke ist ein zu nennendes Beispiel. Die Aufnahme kann beispielsweise so ausgebildet sein, daß sie ein vertikales 50ml Falcon-Röhrchen sicher halten kann und mittels eines Adapters die üblicherweise für das "Bead Mill Disruption"-Verfahren eingesetzten Behälter aufnehmen kann. Beispielsweise kann der von der Aufnahme gehaltene Adapter so ausgebildet sein, daß er im Einbauzustand einen oder mehrere der bei dem "Bead Mill Disruption"-Verfahren verwendeten Behälter horizontal liegend hält. Beim "Bead Mill Disruption"-Verfahren können beispielsweise 2,0 ml Eppendorf Reaktionsgefäße benutzt werden. Zum Aufschluss werden beispielsweise 6 mm Kugeln aus Glas, Edelstahl oder Wolfram-Carbid benutzt. Beim Aufschluss von Bakterien und Pilzen werden teilweise auch sehr kleine Glaspartikel eingesetzt. Für größere Mengen Material (<< 1 g) kommen auch Edelstahlschraubbehälter mit einer 2 cm Kugel zum Einsatz.In the most general versions the device according to the invention Hold the Take the sample container. The receptacle is preferably designed so that the container the recording can be taken out. In a preferred embodiment the receptacle is designed such that it has a container when he is inserted into the device, surrounds like a jaw. It has it turned out that the so held in the receptacle container very well fixed and, as far as a drive is provided for the movement of the recording, to a good transfer the movement on the container suitable is. Further leaves a container very easy to insert in a jaw-like recording. Under a jaw-like receptacle is in particular a U-shaped or comparable trained recording understood. A jaw is a name to be named Example. The receptacle can be designed, for example, that she a vertical 50ml Falcon tube can hold safely and by means of an adapter usually used for the "Bead Mill Disruption" method container can record. For example, the held by the recording Adapter be designed so that he when installed, one or more of the containers used in the "Bead Mill Disruption" method horizontal lying down. For example, in the "Bead Mill Disruption" method 2.0 ml Eppendorf reaction tubes used become. For example, 6 mm balls of glass, Stainless steel or tungsten carbide used. In the digestion of bacteria and Mushrooms are sometimes used even very small glass particles. For larger quantities Material (<< 1 g) come too Edelstahlschraubbehälter with a 2 cm ball for use.
In einer bevorzugen Ausführungsform ist der Antrieb zur oszillierenden Bewegung der Aufnahme ausgestaltet. Es hat sich gezeigt, daß die Behandlung der aufzuschließenden Probe besonders gut erfolgt, wenn der Behälter mittels des Antriebs oszillierend bewegt wird. Dies gilt insbesondere für eine Bewegung der in der Suspension befindlichen Teilchen bei der Durchführung der sog. "Bead Mill Disruption"-Methode.In a preferred embodiment the drive is configured for the oscillating movement of the receptacle. It has been shown that the Treatment of the aufzuschließenden Sample is done particularly well when the container is oscillating by means of the drive is moved. This is especially true of a movement in the Suspension particles in the implementation of the so-called "Bead Mill Disruption" method.
In einer bevorzugten Ausführungsform erfolgt die durch den Antrieb verursachte Bewegung der Aufnahme in horizontaler Richtung. Auch dies dient einer besonders guten Behandlung der Probe, insbesondere beim Einsatz der "Bead Mill Disruption"-Methode.In a preferred embodiment the movement of the recording caused by the drive takes place in a horizontal direction. This also serves a particularly good Treatment of the sample, especially when using the "Bead Mill Disruption" method.
Die Homogenisierung der Probe kann durch das in der Halterung gehaltene Mixelement erfolgen. Das Mixelement ist dabei insbesondere nach der sog.The Homogenization of the sample can be achieved by holding it in the holder Mix element done. The mixing element is in particular after the so-called
Rotor/Stator-Bauweise ausgebildet und weist einen (stationär gehaltenen) Mixstab (Stator) und ein relativ zum Stator rotierendes Rotationselement auf, das beispielsweise am Ende des Mixstabs angeordnet ist. Das Rotationselement weist vorzugsweise Schneiden auf. Beispielsweise kann das Mixelement nach der Bauweise des von der Qiagen GmbH, Hilden, Deutschland vertriebenen "Tissueruptor" ausgebildet sein.Rotor / stator design formed and has a (stationary held) mixing rod (stator) and a rotating relative to the stator rotation element, for example is located at the end of the blender bar. The rotating element has preferably cutting up. For example, the Mixelement after the design of the "Tissueruptor" distributed by Qiagen GmbH, Hilden, Germany.
In der besonders bevorzugten Bauform wird demnach durch Rotation eines am Ende des Stators angeordneten Rotors die gewünschte Lyse bewirkt. Die erfindungsgemäße Vorrichtung erlaubt aber auch andere, ggf. zu dieser Rotation ergänzende Vorgehensweisen, um eine Homogenisierung zu erreichen. Beispielsweise kann das vollständige Mixelement rotiert und/oder vertikal bewegt und/oder horizontal bewegt werden. Anstelle einer horizontalen und/oder vertikalen Bewegung des Mixelements kann beispielsweise auch der Behälter durch die Aufnahme horizontal und/oder vertikal bewegt werden, um so die gleiche Relativbewegung zwischen Mixelement und Behälter zu erzeugen. Die Bewegung der Aufnahme kann also neben der Verwendung bei der "Bead Mill Disruption"-Methode auch bei Durchführung einer Homogenisierungsmethode eingesetzt werden.In The particularly preferred design is therefore by rotation of a arranged at the end of the stator rotor causes the desired lysis. The device according to the invention but also allows other, possibly complementary to this rotation procedures, to achieve a homogenization. For example, the complete Mixelement rotated and / or moved vertically and / or moved horizontally. Instead of a horizontal and / or vertical movement of the Mixelements For example, the container be moved horizontally and / or vertically by the recording so the same relative movement between mixing element and container too produce. The movement of the recording can therefore be in addition to the use at the "Bead Mill Disruption "method also when carrying out a Homogenization method can be used.
In einer bevorzugten Ausführungsform weist die Vorrichtung die Möglichkeit auf, zwischen verschiedenen Arten der Homogenisierung zu wählen. So kann in einem ersten Programm lediglich eine Bewegung der Aufnahme vorgesehen sein, während in einem weiteren, wählbaren Programm eine ausschließliche Bewegung des Rotor/Stator Elements vorgesehen sein kann und beispielsweise in einem dritten Programm eine gleichzeitige Bewegung der Aufnahme und des Mixelements vorgesehen sein. Auf diese Weise werden die Einsatzmöglichkeiten der erfindungsgemäßen Vorrichtung erhöht, da der Benutzer nun nicht nur zwischen der Behandlungsart (Sonication, Homogenisierung, Bead Mill Disruption) wählen kann, sondern auch innerhalb der Behandlungsmethode der Homogenisierung verschiedene Vorgehensweisen wählen kann.In a preferred embodiment the device has the option to choose between different types of homogenization. So can in a first program only a movement of recording be provided while in another, selectable Program an exclusive Movement of the rotor / stator element may be provided and, for example in a third program a simultaneous movement of the recording and the Mixelements be provided. In this way, the Possible uses of Device according to the invention elevated, since the user now not only between the type of treatment (Sonication, Homogenization, Bead Mill Disruption), but also within the method of homogenization different approaches choose can.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform kann der für die Bewegung der Aufnahme vorgesehene Antrieb auch die Halterung des Mixelements translatorisch und/oder rotatorisch bewegen, bzw. eine Rotationsbewegung derart übertragen, daß ein am Ende eines in der Halterung gehaltenen Mixstabs angeordnetes Rotationselement im Verhältnis zum Mixstab rotierend angetrieben werden kann. Hierfür kann der Antrieb mehrere Motoren und/oder mehrere Getriebe aufweisen. Diese bevorzugte Ausführungsform nutzt die Synergieeffekte, die sich daraus ergeben, daß die Vorrichtung zur Durchführung der drei genannten Behandlungsmethoden ausgelegt ist, besonders gut fort, indem sie das Einsparen von Bauteilen erlaubt.In a particularly preferred embodiment, the drive provided for the movement of the receptacle may also translate and / or rotationally move the holder of the mixel element, or transmit a rotational movement in such a way that a rotating element arranged at the end of a mixer bar held in the holder rotates in relation to the mixing bar can be driven. For this purpose, the drive may have a plurality of motors and / or a plurality of transmissions. This preferred off The design makes use of the synergy effects that result from the fact that the device is designed to carry out the three mentioned treatment methods, particularly well by allowing the saving of components.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform ist zwischen dem Antrieb und dem Mixer eine flexible Welle vorgesehen. Eine derartige flexible Welle erlaubt es besonders gut, eine Rotationsbewegung des Antriebs auf die Halterung des Mixelements zu übertragen. Außerdem kann eine flexible Antriebswelle Zustellbewegungen erlauben, die mit einem Mixelement durchgeführt werden müssen, um das Mixelement von oben in ein in der Aufnahme vertikal gehaltenes Röhrchen einzutauchen.In a particularly preferred embodiment is provided between the drive and the mixer a flexible shaft. Such a flexible shaft allows particularly good, a rotational movement of the drive to the holder of Mixelements to transfer. Furthermore can allow a flexible drive shaft feed movements, the performed with a mixing element Need to become, around the mixing element from the top into a vertically held in the receptacle tube immerse.
In einer bevorzugten Ausführungsform weist die Vorrichtung ein Schallhorn auf, dessen Schallausgangsöffnung derart angeordnet ist, daß sie an der Behälterwand des in der (soweit vorgesehen) angetriebenen oder einer anderen Aufnahmen gehaltenen Behälters anliegt, wenn ein Behälter in die Aufnahme eingesetzt wird. Es hat sich gezeigt, daß auf diese Weise besonders gut eine Schallwelle in der aufzuschließenden Probe erzeugt werden kann.In a preferred embodiment the device has a sound horn whose sound output opening is such it is arranged that they on the container wall in the (if provided) driven or another Recordings held container is present when a container is inserted into the receptacle. It has been shown that on these Especially good is a sound wave in the sample to be split up can be generated.
In einer bevorzugten Ausführungsform weist die Schallerzeugungseinrichtung ein elastisches Element auf, mit dem eine/die Schallausgangsöffnung gegen eine/die Behälterwand gedrückt werden kann. Insbesondere bei der Verwendung eines Schallhorns, dessen Schallausgangsöffnung derart angeordnet ist, daß sie an der Behälterwand des in der oder einer anderen Aufnahme gehaltenen Behälters anliegt, ist es vorteilhaft, dieses Schallhorn mittels eines elastischen Elements, beispielsweise einer Feder, gegen die Behälterwand zu drücken. Auf diese Weise hat die Schallerzeugungseinrichtung einen besonders hohen Wirkungsgrad.In a preferred embodiment the sound generating device has an elastic element, with the one / the sound outlet opening against one / the container wall depressed can be. Especially when using a sonic horn, its sound output opening is arranged so that they on the container wall of the container held in the or another receptacle, it is advantageous to use this sound horn by means of an elastic Elements, such as a spring, against the container wall to press. In this way, the sound generating device has a special high efficiency.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung weist vorzugsweise einen Behälter zur Aufnahme der biologischen Probe auf. Dieser Behälter kann insbesondere ein röhrenförmiger Probenbehälter wie bspw. ein 50 ml-Falcon-Röhrchen sein. Der Behälter ist vorzugsweise aus Kunststoff.The inventive device preferably has a container for receiving the biological sample. This container can in particular a tubular sample container such as for example, a 50 ml Falcon tube be. The container is preferably made of plastic.
In einer bevorzugten Ausführungsform befinden sich in dem Behälter lose Teilchen, die die Zerkleinerung der Probe und damit den Aufschluß des Materials, erleichtern. Diese Teilchen („Mahlkugeln") dienen dazu, mit der Vorrichtung eine Behandlung der Suspension nach dem „Bead Mill Disruption"-Verfahren durchzuführen.In a preferred embodiment are in the container loose particles, the comminution of the sample and thus the digestion of the material, facilitate. These particles ("grinding balls") serve with the device a treatment of the suspension after the "Bead Mill Disruption 'procedure perform.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung wird insbesondere bevorzugt beim Aufschluß biologischer Proben eingesetzt und zwar insbesondere bevorzugt zum:
- – Aufschluß von Zellen und Gewebe für DNA und RNA Präparationen;
- – Aufschluß von forensischen Materialien (bspw Knochen) für DNA und RNA Präparationen;
- – Aufschluß von Zellen oder zum Aufschluß von anderen biologischen Materialien für Protein- und NA-Extraktionen.
- - disruption of cells and tissue for DNA and RNA preparations;
- - digestion of forensic materials (eg bones) for DNA and RNA preparations;
- - Digestion of cells or digestion of other biological materials for protein and NA extractions.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung hat ferner den Vorteil, daß sie eine flexible Größe der Probe hinsichtlich der Menge und des Volumens der Probe ermöglicht. Mit der erfindungsgemäßen Vorrichtung lassen sich sowohl gefrorene, als auch „frische" Proben verarbeiten.The inventive device has the further advantage that it a flexible size of the sample in terms the amount and volume of the sample. Leave with the device according to the invention processing both frozen and fresh samples.
Nachfolgend wird die Erfindung anhand einer, lediglich ein Ausführungsbeispiel darstellenden, Zeichnung näher erläutert. Darin zeigenfollowing The invention is based on one, only one embodiment performing, drawing closer explained. Show in it
Bei
der in
Die
Vorrichtung erlaubt es, die Aufnahme
- 11
- Behältercontainer
- 22
- Aufnahmeadmission
- 33
- Halterungbracket
- 44
- Mixelementmixing element
- 55
- Antriebdrive
- 66
- Motorengine
- 77
- flexible Welleflexible wave
- 88th
- SchallerzeugungseinrichtungSound generator
- 99
- Schallhornsound Horn
- 2020
- Reaktionsgefäßreaction vessel
- 2121
- Adapteradapter
- 2222
- Unterteillower part
- 2323
- Bohrungdrilling
- 2424
- Deckelcover
- 2525
- Probenmaterialsample material
- 2626
- KugelBullet
- Pfeil Aarrow A
- horizontale Bewegung der Aufnahmehorizontal Movement of the recording
- Pfeil Barrow B
- translatorische Bewegung der Halterungtranslational Movement of the bracket
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DE102006032637A1 true DE102006032637A1 (en) | 2008-01-17 |
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ID=38825284
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