CZ33391U1 - Equipment for determining the specific effect of adenylate cyclase isoforms using HEK293 cell membrane fractions - Google Patents
Equipment for determining the specific effect of adenylate cyclase isoforms using HEK293 cell membrane fractions Download PDFInfo
- Publication number
- CZ33391U1 CZ33391U1 CZ201936197U CZ201936197U CZ33391U1 CZ 33391 U1 CZ33391 U1 CZ 33391U1 CZ 201936197 U CZ201936197 U CZ 201936197U CZ 201936197 U CZ201936197 U CZ 201936197U CZ 33391 U1 CZ33391 U1 CZ 33391U1
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- range
- mmol
- plasmid
- seq
- camp
- Prior art date
Links
- 102000030621 adenylate cyclase Human genes 0.000 title claims description 27
- 108060000200 adenylate cyclase Proteins 0.000 title claims description 27
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 title claims description 23
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 title claims description 23
- 230000000694 effects Effects 0.000 title claims description 18
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 title 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 43
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 229940089468 hydroxyethylpiperazine ethane sulfonic acid Drugs 0.000 claims description 16
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 claims description 15
- 108010039627 Aprotinin Proteins 0.000 claims description 14
- 239000000872 buffer Substances 0.000 claims description 14
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 13
- 239000012981 Hank's balanced salt solution Substances 0.000 claims description 12
- GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N Leupeptin Natural products CC(C)CC(NC(C)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N leupeptin Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(C)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N 0.000 claims description 12
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 claims description 12
- APIXJSLKIYYUKG-UHFFFAOYSA-N 3 Isobutyl 1 methylxanthine Chemical compound O=C1N(C)C(=O)N(CC(C)C)C2=C1N=CN2 APIXJSLKIYYUKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 229910052693 Europium Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 229960004405 aprotinin Drugs 0.000 claims description 10
- ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N iniprol Chemical compound C([C@H]1C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@H]2CSSC[C@H]3C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC=4C=CC=CC=4)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC2=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC=2C=CC=CC=2)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H]2N(CCC2)C(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N3)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@H](C(=O)N1)C(C)C)[C@@H](C)O)[C@@H](C)CC)=O)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N 0.000 claims description 10
- VHJLVAABSRFDPM-UHFFFAOYSA-N 1,4-dithiothreitol Chemical compound SCC(O)C(O)CS VHJLVAABSRFDPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 claims description 9
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 claims description 9
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 claims description 9
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 claims description 9
- OGPBJKLSAFTDLK-UHFFFAOYSA-N europium atom Chemical compound [Eu] OGPBJKLSAFTDLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 claims description 9
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims description 8
- MGSKVZWGBWPBTF-UHFFFAOYSA-N aebsf Chemical compound NCCC1=CC=C(S(F)(=O)=O)C=C1 MGSKVZWGBWPBTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 7
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 claims description 6
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 claims description 4
- -1 MgCF 6 H 10 Chemical compound 0.000 claims description 3
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 claims description 3
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 claims description 3
- WRDABNWSWOHGMS-UHFFFAOYSA-N AEBSF hydrochloride Chemical compound Cl.NCCC1=CC=C(S(F)(=O)=O)C=C1 WRDABNWSWOHGMS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims 1
- OHCQJHSOBUTRHG-KGGHGJDLSA-N FORSKOLIN Chemical compound O=C([C@@]12O)C[C@](C)(C=C)O[C@]1(C)[C@@H](OC(=O)C)[C@@H](O)[C@@H]1[C@]2(C)[C@@H](O)CCC1(C)C OHCQJHSOBUTRHG-KGGHGJDLSA-N 0.000 description 26
- IVOMOUWHDPKRLL-KQYNXXCUSA-N Cyclic adenosine monophosphate Chemical compound C([C@H]1O2)OP(O)(=O)O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H]2N1C(N=CN=C2N)=C2N=C1 IVOMOUWHDPKRLL-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 24
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 23
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 20
- OHCQJHSOBUTRHG-UHFFFAOYSA-N colforsin Natural products OC12C(=O)CC(C)(C=C)OC1(C)C(OC(=O)C)C(O)C1C2(C)C(O)CCC1(C)C OHCQJHSOBUTRHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 14
- SUZLHDUTVMZSEV-UHFFFAOYSA-N Deoxycoleonol Natural products C12C(=O)CC(C)(C=C)OC2(C)C(OC(=O)C)C(O)C2C1(C)C(O)CCC2(C)C SUZLHDUTVMZSEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-J ATP(4-) Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)[C@H]1O ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-J 0.000 description 8
- ZKHQWZAMYRWXGA-UHFFFAOYSA-N Adenosine triphosphate Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1OC(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)C(O)C1O ZKHQWZAMYRWXGA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 8
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 6
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 6
- 238000000034 method Methods 0.000 description 6
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 6
- PZTWBYCZTVLVPV-UHFFFAOYSA-N 2-[2-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCCC1CNCCN1CCS(O)(=O)=O PZTWBYCZTVLVPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102100031590 Uncharacterized protein encoded by LINC01587 Human genes 0.000 description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 4
- 230000003491 cAMP production Effects 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N pepstatin A Chemical compound OC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CC(C)C FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N 0.000 description 4
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 3
- 102000003688 G-Protein-Coupled Receptors Human genes 0.000 description 3
- 108090000045 G-Protein-Coupled Receptors Proteins 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 3
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 238000002877 time resolved fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 3
- BRZYSWJRSDMWLG-DJWUNRQOSA-N (2r,3r,4r,5r)-2-[(1s,2s,3r,4s,6r)-4,6-diamino-3-[(2s,3r,4r,5s,6r)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-[(1r)-1-hydroxyethyl]oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-5-methyl-4-(methylamino)oxane-3,5-diol Chemical compound O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]([C@@H](C)O)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N BRZYSWJRSDMWLG-DJWUNRQOSA-N 0.000 description 2
- VGGGPCQERPFHOB-MCIONIFRSA-N Bestatin Chemical compound CC(C)C[C@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](O)[C@H](N)CC1=CC=CC=C1 VGGGPCQERPFHOB-MCIONIFRSA-N 0.000 description 2
- 238000009010 Bradford assay Methods 0.000 description 2
- 239000006391 Luria-Bertani Medium Substances 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 2
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 2
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 2
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 2
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 2
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 2
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 2
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 2
- 108010052968 leupeptin Proteins 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 2
- 108010091212 pepstatin Proteins 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 2
- 229950009811 ubenimex Drugs 0.000 description 2
- AABPQXARUSDVOR-USNXXZSXSA-N (3S,4S)-4-amino-3-hydroxy-6-methylheptanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)[C@@H](O)CC(O)=O.CC(C)C[C@H](N)[C@@H](O)CC(O)=O AABPQXARUSDVOR-USNXXZSXSA-N 0.000 description 1
- ATHMIPPILZWLSL-UHFFFAOYSA-N 2-(2-ethyl-2-hydroxypiperazin-1-yl)ethanesulfonic acid Chemical compound CCC1(O)CNCCN1CCS(O)(=O)=O ATHMIPPILZWLSL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DFVFTMTWCUHJBL-UHFFFAOYSA-N 4-Amino-3-hydroxy-6-methylheptanoic acid Natural products CC(C)CC(N)C(O)CC(O)=O DFVFTMTWCUHJBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 102000004580 Aspartic Acid Proteases Human genes 0.000 description 1
- 108010017640 Aspartic Acid Proteases Proteins 0.000 description 1
- VGGGPCQERPFHOB-UHFFFAOYSA-N Bestatin Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(O)C(N)CC1=CC=CC=C1 VGGGPCQERPFHOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 1
- 235000005320 Coleus barbatus Nutrition 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 229940121710 HMGCoA reductase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101000975753 Homo sapiens Acid ceramidase Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 239000004395 L-leucine Substances 0.000 description 1
- 239000006142 Luria-Bertani Agar Substances 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 241000131459 Plectranthus barbatus Species 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 1
- TTWYZDPBDWHJOR-IDIVVRGQSA-L adenosine triphosphate disodium Chemical compound [Na+].[Na+].C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)[C@H]1O TTWYZDPBDWHJOR-IDIVVRGQSA-L 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 230000001088 anti-asthma Effects 0.000 description 1
- 239000000924 antiasthmatic agent Substances 0.000 description 1
- 229940125715 antihistaminic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000000739 antihistaminic agent Substances 0.000 description 1
- 239000002876 beta blocker Substances 0.000 description 1
- 229940097320 beta blocking agent Drugs 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 229930004069 diterpene Natural products 0.000 description 1
- 150000004141 diterpene derivatives Chemical class 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 1
- 238000001952 enzyme assay Methods 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 1
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 150000004682 monohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 239000002547 new drug Substances 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 229940024999 proteolytic enzymes for treatment of wounds and ulcers Drugs 0.000 description 1
- 238000012827 research and development Methods 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000027 toxicology Toxicity 0.000 description 1
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/527—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving lyase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y406/00—Phosphorus-oxygen lyases (4.6)
- C12Y406/01—Phosphorus-oxygen lyases (4.6.1)
- C12Y406/01001—Aodenylate cyclase (4.6.1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/10—Plasmid DNA
- C12N2800/106—Plasmid DNA for vertebrates
- C12N2800/107—Plasmid DNA for vertebrates for mammalian
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/91—Cell lines ; Processes using cell lines
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
Oblast technikyTechnical field
Technické řešení se týká kitu pro stanovení specifického ovlivnění aktivity různých izoforem adenylátcykláz citlivých na forskolin (FSK) nebo jiné chemické sloučeniny, exprimovaných buňkami HEK293 s využitím jejich membránových frakcí.The present invention relates to a kit for determining a specific effect on the activity of various forskolin-sensitive adenylate cyclase (FSK) isoforms or other chemical compounds expressed by HEK293 cells using their membrane fractions.
Dosavadní stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION
Adenylátcyklázy (AC) jsou enzymy, které katalyzují přeměnu adenosintrifosfátu (ATP) na signální molekulu cyklického adenosinmonofosfátu (cAMP). cAMP hraje klíčovou roli v regulaci funkcí buněk a zprostředkovává přenos signálu po aktivaci významné skupiny receptorů nazývaných receptory spřažené s G-proteiny. Velké množství dostupných léčiv, které se v současnosti užívají v klinické praxi (např. betablokátory, antihistaminika, antiastmatika) působí jako ligandy receptorů spřažených s G-proteiny a modulují aktivitu AC. V současnosti je popsáno přes 750 subtypů receptorů spřažených s G-proteiny. Tudíž se jedná o velmi komplexní rodinu receptorů a jejich specifická modulace je problematická. Navíc modulací těchto receptorů dochází nejen k ovlivnění jejich aktivace, ale také nepřímo i k modulaci aktivity AC. Avšak nepřímý vliv těchto léčiv na AC není v dnešní době dostatečně prostudován.Adenylate cyclase (AC) is an enzyme that catalyzes the conversion of adenosine triphosphate (ATP) to the cyclic adenosine monophosphate (cAMP) signaling molecule. cAMP plays a key role in regulating cell functions and mediates signal transduction upon activation of a significant group of receptors called G-protein coupled receptors. A large number of available drugs currently used in clinical practice (eg beta-blockers, antihistamines, antiasthmatics) act as ligands for G-protein coupled receptors and modulate AC activity. Over 750 G-protein coupled receptor subtypes are currently described. Thus, it is a very complex family of receptors and their specific modulation is problematic. In addition, modulation of these receptors not only affects their activation, but also indirectly modulates AC activity. However, the indirect effect of these drugs on AC is not well studied today.
Do dnešní doby bylo identifikováno 10 různých izoforem AC, které jsou distribuovány napříč tkáněmi a mohou být různě regulovány. Výzkum nových izoformově-specifických modulátorů naznačuje, že se AC mohou stát zajímavým přímým terapeutickým cílem léčiv nové generace. Cílené testování látek napříč jednotlivými izoformami tak umožní selekci a řízenou syntézu látek, které budou vysoce specifické vůči jednotlivým izoformám AC.To date, 10 different AC isoforms have been identified that are distributed across tissues and can be regulated differently. Research into new isoform-specific modulators suggests that ACs can become an interesting direct therapeutic target for next-generation drugs. Targeted testing of substances across individual isoforms will thus allow the selection and directed synthesis of substances that will be highly specific to individual AC isoforms.
Pro výzkum aktivity různých izoforem AC se používá známý neselektivní aktivátor forskolin, diterpen izolovaný z kořenů rostliny Coleus forskohlii. Forskolin je schopen stimulovat aktivitu 8 membránově vázaných AC (AC1-8).The known non-selective activator forskolin, diterpene isolated from the roots of Coleus forskohlii, is used to investigate the activity of various AC isoforms. Forskolin is able to stimulate the activity of 8 membrane-bound ACs (AC1-8).
V současnosti neexistují komerčně dostupné technologie umožňující testování selektivní modulace aktivity těchto membránově vázaných AC citlivých na forskolin.Currently, there are no commercially available technologies allowing testing of selective modulation of the activity of these forskolin-sensitive membrane-bound ACs.
Podstata technického řešeníThe essence of the technical solution
Úkolem technického řešení je vyvinout kit, pomocí kterého by bylo možné stanovit vliv různých sloučenin, například farmak, na aktivitu izoforem adenylátcykláz. Mezi takováto farmaka mohou patřit sloučeniny ovlivňující aktivitu izoforem adenylátcykláz, například forskolin nebo jeho deriváty.SUMMARY OF THE INVENTION The object of the present invention is to provide a kit by which the influence of various compounds, for example pharmaceuticals, on the activity of adenylate cyclase isoforms can be determined. Such pharmaceuticals may include compounds affecting the activity of adenylate cyclase isoforms, for example forskolin or derivatives thereof.
Uvedený úkol splňuje a uvedené nevýhody a nedostatky odstraňuje kit podle technického řešení, jehož podstatou je, že obsahuje alespoň jeden klon buněk HEK293 (human embryonic kidney 293), který selektivně exprimuje alespoň jednu izoformu adenylátcyklázy a obsahuje plazmid vybraný ze skupiny obsahující plazmid č.l o sekvenci SEQ No.l, plazmid č.2 o sekvenci SEQ No.2, plazmid č.3 o sekvenci SEQ No.3, plazmid č.4 o sekvenci SEQ No.4, plazmid č.5 o sekvenci SEQ No.5, plazmid č.6 o sekvenci SEQ No.6, plazmid č.7 o sekvenci SEQ No.7 nebo plazmid č.8 o sekvenci SEQ No.8, přičemž dále odděleně obsahuje lyzační pufir obsahující hydroxyethyl piperazinethansulfonovou kyselinu (HEPES), ethylendiamintertraoctovou kyselinu (EDTA), MgCkóPFO, dithiotreitol (DTT), sacharózu a směs ihibitorů proteáz obsahujícíThe present invention fulfills the above-mentioned disadvantages and drawbacks, which comprises at least one human embryonic kidney 293 cell clone which selectively expresses at least one adenylate cyclase isoform and contains a plasmid selected from the group consisting of plasmid no. SEQ. ID. NO. 1, plasmid No. 2 with SEQ ID NO.2, plasmid No. 3 with SEQ ID NO.3, plasmid No. 4 with SEQ ID NO.4, plasmid No. 5 with SEQ ID NO.5, plasmid # 6 of SEQ ID NO: 6, plasmid # 7 of SEQ ID NO, or plasmid # 8 of SEQ ID NO, further separately comprising a lysis buffer containing hydroxyethyl piperazineethanesulfonic acid (HEPES), ethylenediaminetraacetic acid ( EDTA), MgCl2PFO, dithiotreitol (DTT), sucrose and a protease inhibitor mixture containing
- 1 CZ 33391 U1 (4-(2-aminoethyl)benzensulfonyl fluorid hydrochlorid) (AEBSF), aprotinin (bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI)), ,V-[(25’,3/?)-3-amino-2-liydiOxy-4-fcnylbutyryl]-L-lcucin (Bestatin), (trans-epoxysukcinyl-l-leucylamido-(4-guanidino)butan) (E-64), N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal (Leupeptin), hexapaptid isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta (Iva-Val-Val-Sta-Ala-Sta) (Pepstatin A), dále odděleně obsahuje stimulační pufr obsahující Hanksův vyvážený solný roztok (HBSS), 3-isobutyl-l-methylxanthin, hovězí sérový albumin (BSA stabilizátor), hydroxyethyl piperazinethansulfonovou kyselinu, 3-isobutyl-l-methylxanthin, MgCF.óEFO, ATP (adenosintrifosfát) a dále odděleně obsahuje detekční sadu, která zahrnuje vodný roztok obsahující europiem značené cAMP, cAMP-specifickou monoklonální protilátku značenou fluorescenčním barvivém mající emisi v rozsahu od 600 do 635 nm.- 1 (4- (2-aminoethyl) benzenesulfonyl fluoride hydrochloride) (AEBSF), aprotinin (bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI)), V - [(2 S, 3 R) - 3-amino-2] -liydixy-4-phenylbutyryl] -L-lucine (Bestatin), (trans-epoxysuccinyl-1-leucylamido- (4-guanidino) butane) (E-64), N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L -argininal (Leupeptin), isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta hexapaptide (Iva-Val-Val-Sta-Ala-Sta) (Pepstatin A), separately containing a stimulation buffer containing Hanks Balanced Salt Solution (HBSS), 3-isobutyl-1-methylxanthine, bovine serum albumin (BSA stabilizer), hydroxyethyl piperazinethanesulfonic acid, 3-isobutyl-1-methylxanthine, MgCF.EFO, ATP (adenosine triphosphate) and further separately contain a detection kit that includes an aqueous solution containing europium labeled cAMP, a cAMP-specific monoclonal antibody labeled with a fluorescent dye having an emission in the range of 600 to 635 nm.
Podle výhodného provedení technického řešení jsou buňky HEK293 ve formě buněčné suspenze.According to a preferred embodiment of the invention, the HEK293 cells are in the form of a cell suspension.
S výhodou je v lyzačním pufiru koncentrace hydroxyethyl piperazinethansulfonové kyseliny v rozsahu 1 až 10mmol/l, EDTA v rozsahu 0,5 až 5 mmol/1, MgCF.óFFO v rozsahu 0,5 až 5 mmoFl, dithiotreitolu v rozsahu 0,5 až 5 mmol/1, sacharózy v rozsahu 100 až 400 mmol/1, hydrochlorid (4-(2-aminoethyl)benzensulfonyl fluoridu) v rozsahu 50 až 100 mmol/1, aprotininu v rozsahu 40 až 80 pmol/l, /V-[(25’,3/?)-3-amino-2-liydroxy-4-fcnylbutyryl]-L-lcucinu v rozsahu 1 až 4 mmol/1, (trans-epoxysukcinyl-l-leucylamido-(4-guanidino)butanu) v rozsahu 0,5 až 1,5 mmol/1, N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal v rozsahu 0,5 až 2 mmoFl, isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta v rozsahu 0,5 až 1,5 mmol/1.Preferably, in the lysis buffer, the concentration of hydroxyethyl piperazineethanesulfonic acid is in the range of 1 to 10 mmol / l, the EDTA is in the range of 0.5 to 5 mmol / l, the MgCl 2 · FFO is in the range of 0.5 to 5 mmoFl. mmol / l, sucrose in the range 100 to 400 mmol / l, hydrochloride (4- (2-aminoethyl) benzenesulfonyl fluoride) in the range 50 to 100 mmol / l, aprotinin in the range 40 to 80 pmol / l, N - [( 25 ', 3R-3-amino-2-liydroxy-4-phenylbutyryl] -L-1-succin in the range of 1 to 4 mmol / l, (trans-epoxysuccinyl-1-leucylamido- (4-guanidino) butane) in range 0.5 to 1.5 mmol / l, N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal in the range 0.5 to 2 mmoFl, isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta in the range 0 5 to 1.5 mmol / l.
S výhodou je ve stimulačním pufiru koncentrace hydroxyethyl piperazinethansulfonové kyseliny v rozsahu 1 až 10 mmol/1, 3-isobutyl-l-methylxanthinu je v rozsahu 0,1 až 1 mmol/1, hovězího sérového albuminu v rozsahu 0,05 až 0,5 mmoFl, MgCkóíFO v rozsahu 5 až 20 mmoFl, ATP v rozsahu 0,05 až 0,5 mmol/1.Preferably, in the stimulation buffer, the concentration of hydroxyethyl piperazineethanesulfonic acid is in the range of 1 to 10 mmol / l, 3-isobutyl-1-methylxanthine is in the range of 0.1 to 1 mmol / l, bovine serum albumin is in the range of 0.05 to 0.5 mmoFl, MgCl 2 -FO in the range of 5 to 20 mmoFl, ATP in the range of 0.05 to 0.5 mmol / L.
A s výhodou je koncentrace europiem značené cAMP ve vodném roztoku v rozmezí 1 až 5 nmol/1 a cAMP-specifické monoklonální protilátky značené fluorescenčním barvivém je v rozmezí 0,1 až 1 pg/ml.Preferably, the concentration of europium-labeled cAMP in the aqueous solution is in the range of 1 to 5 nmol / L and the cAMP-specific monoclonal antibody labeled with the fluorescent dye is in the range of 0.1 to 1 µg / ml.
S výhodou detekční sada obsahuje cAMP kalibrační standard.Preferably, the detection kit comprises a cAMP calibration standard.
Bylo vyvinuto osm klonů buněk HEK293, z nichž každý klon obsahuje odlišný specifický plazmid 1 až 8. Buňky HEK293 obsahující plazmid č. 1 jsou schopny exprimovat izoformu AC1. Stejný princip platí i pro buňky HEK293 obsahující jednotlivě plazmidy č. 2 až 8, exprimují tedy jednotlivě odpovídající izoformy AC2 až AC8.Eight HEK293 cell clones were developed, each clone containing a different specific plasmid 1-8. HEK293 cells containing plasmid # 1 are capable of expressing the AC1 isoform. The same principle applies to HEK293 cells containing plasmids Nos. 2 to 8 individually, thus expressing the corresponding isoforms AC2 to AC8 individually.
Každý z výše uvedených plazmidů obsahuje stejnou část - vektor pCMV6-Entry viz SEQ No. 9 a liší se sekvencí dané izoformy vložené do multiklonovacího místa vektoru. Konkrétně byly použity níže uvedené plazmidy mající sekvence plazmidů SEQ NO.l až 8, jak jsou uvedeny v Seznamu sekvencí.Each of the above plasmids contains the same portion - the vector pCMV6-Entry see SEQ. 9 and differ in the sequence of a given isoform inserted into the multi-cloning site of the vector. In particular, the plasmids below having the sequences of plasmids SEQ NO.1 to 8, as listed in the Sequence Listing, were used.
Klony buněk HEK293 obsahující alespoň jeden plazmid mající SEQ No. 1 až 8 nejsou schopny reprodukce, tudíž je nelze považovat za biologicky reproduktivní materiál.HEK293 cell clones comprising at least one plasmid having SEQ. 1 to 8 are not reproducible and therefore cannot be considered as a biologically reproducible material.
Dále kit podle technického řešení obsahuje komponenty pro detekci enzymatické aktivity AC, který zahrnuje europiem značené cAMP ve vodném roztoku o koncentraci v rozmezí 1 až 5 nmol/1 a cAMP-specifickou monoklonální protilátku značenou fluorescenčním barvivém s rozsahem emise 600-635 nm, který je vhodný jako FRET akceptor. Jedná se například o Seta640-di-NHS nebo sulfo-Cyanine7, ve vodném roztoku o koncentraci v rozmezí 0,1 až 1 pg/ml, cAMP kalibrační standard a stimulační pufr (složení viz Tabulka I).Further, the kit according to the invention comprises components for detecting the enzymatic activity of AC, which comprises europium-labeled cAMP in an aqueous solution at a concentration ranging from 1 to 5 nmol / L and a cAMP-specific monoclonal antibody labeled with a fluorescent dye having an emission range of 600-635 nm. suitable as FRET acceptor. Examples include Seta640-di-NHS or sulfo-Cyanine7, in an aqueous solution at a concentration ranging from 0.1 to 1 µg / ml, cAMP calibration standard, and stimulation buffer (see Table I for composition).
-2cz 33391 U1-2cz 33391 U1
Tabulka I - Složení stimulačního pufru použitý pro suspenzi buněk HEK293Table I - Stimulation buffer composition used for HEK293 cell suspension
Hanksův vyvážený solný roztok (HBSS) má složení 1,26 mM CaCl2, 0,4 mM MgSO4-7H2O, 0,49 mM MgCl2.6H2O, 5,33 mM KC1, 137,99 mM NaCl, 4,16 mM NaHCO3, 0,44 mM KH2PO4, 0,34 mM Na2HPO4, 5,56 mM glukosa, pH 7,4, MilliQ voda.Hanks Balanced Salt Solution (HBSS) has a composition of 1.26 mM CaCl 2 , 0.4 mM MgSO 4 -7H 2 O, 0.49 mM MgCl 2 .6H 2 O, 5.33 mM KCl, 137.99 mM NaCl, 4.16 mM NaHCO 3 , 0.44 mM KH 2 PO 4 , 0.34 mM Na 2 HPO 4 , 5.56 mM glucose, pH 7.4, MilliQ water.
Kalibrační standard je vodný roztok cAMP (monohydrát, sodná sůl adenosin 3',5'-cyklického monofosfátu) o přesné koncentraci, který slouží k vypracování kalibrační křivky.The calibration standard is an aqueous solution of cAMP (monohydrate, adenosine sodium 3 ', 5'-cyclic monophosphate) at a precise concentration, which is used to generate a calibration curve.
Strukturní vzorec fluorescenčního barviva sulfo-Cyanine7 je:The structural formula of the fluorescent dye sulfo-Cyanine7 is:
Tabulka II - Složení lyzačního pufru použitý pro suspenzi buněk HEK293Table II - Lysis buffer composition used for HEK293 cell suspension
Aprotinin je malý protein - hovězí pankreatický inhibitor trypsinu (BPTI), neboli základní inhibitor trypsinu hovězí slinivky břišní, což je antiiybrinolická molekula, která inhibuje trypsin a s ním související proteolitické enzymy. Leupeptin je N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal.Aprotinin is a small protein - bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI), or the basic inhibitor of bovine pancreatic trypsin, which is an anti-cybrinol molecule that inhibits trypsin and its related proteolytic enzymes. Leupeptin is N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal.
Jde o přirozeně se vyskytující inhibitor proteáz. Pepstatin A je účinným inhibitorem aspartyl proteáz. Jedná se o hexapeptid obsahující neobvyklou aminokyselinu statin (Sta, kyselina (3S,4S)-4-amino -3-hydroxy-6-methylheptanová), který má sekvenci isovaleryl-Val-Val- Sta-Ala- Sta (Iva-Val-Val- Sta-Ala- Sta).It is a naturally occurring protease inhibitor. Pepstatin A is a potent inhibitor of aspartyl proteases. It is a hexapeptide containing the unusual amino acid statin (Sta, (3S, 4S) -4-amino-3-hydroxy-6-methylheptanoic acid) having the sequence isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta (Iva-Val- Val-Sta-Ala-Sta).
Takovýto typ křtu podle technického řešení, kdy se využívá membránových frakcí buněk HEK293 permanentně zvýšeně exprimujících vybrané izoformy lidských AC pro stanovení stupně modulace a vzájemné porovnání regulace jednotlivých izoforem AC, není komerčně dostupný. Uplatnění křtu je nejen ve vývoji nových farmak cílených na modulaci produkce cAMP, ale také ve farmakologii a toxikologii při testování účinků látek na produkci cAMP.Such a type of baptism according to the present invention, using membrane fractions of HEK293 cells stably overexpressing selected human AC isoforms to determine the degree of modulation and cross-compare between individual AC isoforms, is not commercially available. Baptism is involved not only in the development of new drugs targeted to modulate cAMP production, but also in pharmacology and toxicology in testing the effects of substances on cAMP production.
Užitný vzor byl vytvořen v rámci projektu TG020I0048 „Podpora ověřování a komercializace výsledků výzkumu a vývoje ve Fakultní nemocnici u sv. Anny v Brně“, Technologická agentura České republiky, Název programu: Program aplikovaného výzkumu, experimentálního vývoje a inovací GAMA.The utility model was created within the project TG020I0048 “Support of verification and commercialization of the results of research and development in the University Hospital of St. George. Anny v Brně “, Technology Agency of the Czech Republic, Program title: GAMA Applied Research, Experimental Development and Innovation Program.
Objasnění výkresůClarification of drawings
Obrázek 1: Schéma plasmidu č. 1Figure 1: Scheme of plasmid # 1
Obrázek 2: Schéma plasmidu č. 2Figure 2: Scheme of plasmid # 2
Obrázek 3: Schéma plasmidu č. 3Figure 3: Scheme of plasmid # 3
Obrázek 4: Schéma plasmidu č. 4Figure 4: Scheme of plasmid # 4
Obrázek 5: Schéma plasmidu č. 5Figure 5: Scheme of plasmid # 5
Obrázek 6: Schéma plasmidu č. 6Figure 6: Scheme of plasmid # 6
Obrázek 7: Schéma plasmidu č. 7Figure 7: Scheme of plasmid # 7
Obrázek 8: Schéma plasmidu č. 8Figure 8: Scheme of plasmid # 8
Příklady uskutečnění technického řešeníExamples of technical solutions
Kit pro analýzu ovlivnění aktivity specifických lidských membránově vázaných izoforem AC 1 8. Využívá se membránové frakce izolované z unikátních klonů buněk HEK293. Analýza ovlivnění aktivity jednotlivých membránově vázaných izoforem AC je detekována pomocí měření produkce cAMP metodou homogenní fluorescence s časovým rozlišením (TR-FRET).A kit for analyzing the activity of specific human membrane-bound isoforms AC18. Membrane fractions isolated from unique HEK293 cell clones are utilized. Analysis of affecting the activity of individual membrane-bound AC isoforms is detected by measuring cAMP production by the homogeneous fluorescence time-resolution (TR-FRET) method.
Příklad 1Example 1
Metodika přípravy unikátních klonů buněk HEK293 s vysokou expresí jednotlivých izoforem AC (1-8)Methodology of preparation of unique HEK293 cell clones with high expression of individual AC isoforms (1-8)
Amplifikace a izolace plazmidové DNAPlasmid DNA amplification and isolation
Při tvorbě unikátních klonů bylo použito osm plazmidů tvořených stejným vektorem (pCMVóEntry, Origené) obsahujícím sekvenci genu pro jednotlivou izoformu AC (acl-8). Plazmid obsahuje sekvenci kódující geny pro kanamycinovou rezistenci, která slouží jako selekční markerIn order to create unique clones, eight plasmids made of the same vector (pCMV6Entry, Origene) containing the gene sequence for a single AC isoform (acl-8) were used. The plasmid contains a sequence encoding kanamycin resistance genes that serve as a selectable marker
-4CZ 33391 U1 při transformaci prokaryotických buněk a neomycinovou rezistenci pro selekci transfekce eukaryotických buněk (použití antibiotika G418 v případě savčích buněk, viz níže).In the transformation of prokaryotic cells and neomycin resistance for selection of eukaryotic cell transfection (use of the antibiotic G418 in mammalian cells, see below).
Transformace chemokompetentních buněk Escherichia coli (E. coli, kmen DH5-a, NEB) byla provedena metodou teplotního šoku. Roztok plazmidové DNA (40 ng) se smíchal se 100 μΐ kompetentních buněk. Směs byla ponechána 10 min na ledu, poté inkubována 2 min při 42 °C. Směs byla následně ponechána 2 min na ledu a inkubována stálým třepáním v 0,9 ml LuriaBertani médiu (LB-médiu, Duchefa Biochemie) 1 hod při 37 °C. Pelet byl po zcentrifugování (3500 rpm, 1 min při pokojové teplotě) resuspendován v 0,1 ml LB-média (Duchefa Biochemie). Buňky byly vysety na selekční LB-agarové plotny (1% agar v Luria-Bertani médiu, Oxoid) obsahující selekční antibiotikum kanamycin (25 μΙ/ml, Serva) a ponechány přes noc v inkubátoru při 37 °C.Transformation of Escherichia coli chemocompetent cells (E. coli, strain DH5-a, NEB) was performed by the heat shock method. The plasmid DNA solution (40 ng) was mixed with 100 μΐ of competent cells. The mixture was left on ice for 10 min, then incubated for 2 min at 42 ° C. The mixture was then left on ice for 2 min and incubated by shaking in 0.9 ml LuriaBertani medium (LB-medium, Duchefa Biochemie) for 1 hour at 37 ° C. After centrifugation (3500 rpm, 1 min at room temperature), the pellet was resuspended in 0.1 ml LB-medium (Duchefa Biochemistry). Cells were plated on selective LB-agar plates (1% agar in Luria-Bertani medium, Oxoid) containing the selective antibiotic kanamycin (25 μΙ / ml, Serva) and left overnight in an incubator at 37 ° C.
Z transformovaných buněk E. coli byl izolován amplifikovaný plazmid pomocí Plazmid MaxiPrep Kit (JetStar) dle přiloženého návodu. Čistota a koncentrace DNA byla změřena na spektrofotometru NanoDrop® ND-1000 (Thermo Scientific) dle poměru hodnot absorbancí při vlnových délkách 260 a 280 nm.The amplified plasmid was isolated from transformed E. coli cells using the Plasmid MaxiPrep Kit (JetStar) according to the attached instructions. DNA purity and concentration was measured on a NanoDrop® ND-1000 (Thermo Scientific) spectrophotometer according to the ratio of absorbance values at 260 and 280 nm.
Transfekce tkáňové kultury HEK293Transfection of HEK293 tissue culture
Napěstované buňky HEK293 (Human Embryonic Kidney 293 cells) do 70 až 80% konfluence byly transfekovány postupně jednotlivými 8 plazmidy pCMV6-Entry (15 pg, Origene) nesoucími geny pro jednotlivé AC (1-8) využitím metody elektroporace. Elektroporátor Gene Pulser® II (Bio-Rad) byl nastaven na parametry 1050 pF, 270 V a byl 2x aplikován impuls (25 až 40 ms) s pauzou 10 s. Vzniklé transfekované klony byly 3 až 4 týdny selektovány s využitím antibiotika G418 (2,2 mg/ml, Biotech).Cultured HEK293 cells (Human Embryonic Kidney 293 cells) to 70-80% confluency were transfected sequentially with individual 8 plasmids pCMV6-Entry (15 pg, Origene) carrying individual AC (1-8) genes using an electroporation method. The Gene Pulser® II electroporator (Bio-Rad) was set at 1050 pF, 270 V and pulsed twice (25-40 ms) with a 10-second pause. The resulting transfected clones were selected for 3-4 weeks using the antibiotic G418 (2 , 2 mg / ml, Biotech).
Izolace membránových frakcíIsolation of membrane fractions
Pro izolaci membránových frakcí byly použity unikátně vytvořené klony buněk HEK293 s vysokou expresí jednotlivých izoforem AC, jejichž výroba je popsána výše. Tři 150 mm Petriho misky s 90 % konfluentní HEK293 buněčnou linií byly zlyzovány (lyzačního pufr, Tab. Ill) a homogenizovány s využitím Dounce-homogenizátoru. Takto připravený homogenizovaný buněčný lyzát byl stočen (1800 g, 5 min, 4 °C) pro odstranění jader a supernatant byl následně cetrifůgován v ultracentrifůze XL-80 Ultracentrifuge (Beckman) za podmínek 23 000 rpm, 20 min, 4 °C. Vzniklý membránový pelet byl resuspendován ve 100 pl lyzačního pufru. Koncentrace membránových frakcí byla stanovena na základě určení celkových proteinů Bradfordovou metodou (Pierce Detergent Compatible Bradford Assay Kit, Thermo Scientific).For the isolation of membrane fractions, uniquely engineered HEK293 cell clones with high expression of individual AC isoforms, as described above, were used. Three 150 mm Petri dishes with a 90% confluent HEK293 cell line were lysed (lysis buffer, Tab. Ill) and homogenized using a Dounce homogenizer. The homogenized cell lysate thus prepared was centrifuged (1800 g, 5 min, 4 ° C) to remove the nuclei, and the supernatant was subsequently cetrifuged in an XL-80 Ultracentrifuge (Beckman) at 23,000 rpm, 20 min, 4 ° C. The resulting membrane pellet was resuspended in 100 µl lysis buffer. The membrane fraction concentration was determined by total protein determination by the Bradford method (Pierce Detergent Compatible Bradford Assay Kit, Thermo Scientific).
Tabulka III - Složení lyzačního pufiru pro izolaci membránových frakcí z buněk HEK293.Table III - Lysis Buffer Composition for Isolation of Membrane Fractions from HEK293 Cells.
-5 CZ 33391 U1-5 GB 33391 U1
Analýza ovlivnění aktivity jednotlivých izoforem ACAnalysis of influence of AC isoforms activity
V této technologii je využita metoda homogenní fluorescence s časovým rozlišením (TR-FRET) k měření produkce cAMP po regulaci aktivity AC. V rámci postupu se kombinují dvě komponenty - europiem značený cAMP (3 nmoFl) a cAMP-specifická monoklonální protilátka značená fluorescenčním barvivém Seta-640-di-NHS (0,5 pg/ml) a cAMP kalibrační standard (50 μΜ). Stimulační pufr (Tabulka IV) byl použit na ředění kalibračního standardu cAMP a aktivátoru forskolinu nebo testovaných látek. Membrány byly naředěny na zásobní koncentraci 1 mg/ml v lyzačním pufru (Tabulka III). Stanovení optimálního množství membrán na jamku bylo určeno na základě dynamického rozsahu kalibrační křivky.In this technology, the time-resolved homogeneous fluorescence (TR-FRET) method is used to measure cAMP production after regulation of AC activity. The procedure combines two components - europium-labeled cAMP (3 nmoFl) and cAMP-specific monoclonal antibody labeled with fluorescent dye Seta-640-di-NHS (0.5 µg / ml) and cAMP calibration standard (50 µ (). Stimulation buffer (Table IV) was used to dilute the cAMP calibration standard and forskolin activator or test substances. The membranes were diluted to a stock concentration of 1 mg / ml in lysis buffer (Table III). Determination of the optimal amount of membranes per well was determined based on the dynamic range of the calibration curve.
Tabulka IV - Složení stimulačního pufru použitého pro membránové frakce buněk HEK293Table IV - Composition of stimulation buffer used for membrane fractions of HEK293 cells
Do černé 384jamkové desky (ThermoFisher Scientific) bylo napipetováno v duplikátu 5 μΐ jednotlivého ředění kalibračního standardu, resp. testované látky a do každé jamky bylo přidáno 5 μΐ stimulačního pufru, resp. membránové suspenze. Směs byla inkubována 30 min při pokojové teplotě, deska byla zakryta folií (SealPlate film, Sigma-Aldrich). Do každé jamky byly připipetovány komponenty, nejdříve Europiem značené cAMP (3 nmol/1) a poté cAMP-specifická monoklonální protilátka značená fluorescenčním barvivém Seta-640-di-NHS (0,5 pg/ml). Deska byla inkubována 1 hod při pokojové teplotě, bez vystavení světla. Po inkubaci byly vzorky měřeny v multifunkčním modulárním fluorescenčním spektrofotometru Spark 10M (Tecan), při optimalizovaném nastavení parametrů (viz Tabulka V).In a black 384-well plate (ThermoFisher Scientific), 5 μΐ of the single dilution of the calibration standard, respectively, was pipetted in duplicate. of test substance and 5 µl of stimulation buffer and 5 µl of each well was added to each well. membrane suspensions. The mixture was incubated for 30 min at room temperature, the plate was covered with foil (SealPlate film, Sigma-Aldrich). Components were pipetted into each well, first with Europium-labeled cAMP (3 nmol / L) and then with cAMP-specific monoclonal antibody labeled with fluorescent dye Seta-640-di-NHS (0.5 µg / ml). The plate was incubated for 1 hour at room temperature, without exposure to light. After incubation, samples were measured in a Spark 10M multifunctional fluorescence spectrophotometer (Tecan), with optimized parameter settings (see Table V).
Tabulka V - Parametry pro měření TR-FRETTable V - Parameters for TR-FRET measurement
-6CZ 33391 U1-6GB 33391 U1
Výsledná hodnota fluorescence byla normalizována jako podíl experimentální (při 665 nm) a referenční (při 620 nm) naměřené hodnoty. Od takto vypočtené fluorescence byla odečtena normalizovaná fluorescence při nejvyšší koncentraci forskolinu (Y). 100% aktivace je tak vyjádřena rozdílem mezi spontánní fluorescencí a fluorescencí nejvyšší koncentrace forskolinu (zbc). Procenta aktivace vztažená k maximální možné stimulaci forskolinem byla vypočtena dle vzorce:The resulting fluorescence value was normalized as the ratio of the experimental (at 665 nm) and the reference (at 620 nm) measured values. Normalized fluorescence at the highest concentration of forskolin (Y) was subtracted from the fluorescence so calculated. Thus, 100% activation is expressed as the difference between spontaneous fluorescence and fluorescence of the highest concentration of forskolin (zbc). The percentage of activation relative to the maximum possible forskolin stimulation was calculated according to the formula:
Δχ r % afeřiwce - —----x 100Rχ r% affinity - —---- x 100
Validace membránového enzymatického testuValidation of membrane enzyme assay
a) Opakovatelnost (intra-assay variability):(a) Intra-assay variability:
Tento test byl proveden měřením dvou negativních (NI a N2 - ΟμΜ FSK) a dvou pozitivních (PÍ aP2 - 10μΜ FSK) vzorků v 20 replikacích od každého vzorku dle standardního pracovního postupu uvedeného výše. Pro každý vzorek byla vypočítána průměrná hodnota normalizované fluorescence (relative fluorescence unit - RFU, 665/620 nm), směrodatná odchylka výběrová (SD) a variační koeficient (CV) (Tabulka VI a-h). Výsledkem testuje variační koeficient pro celý rozsah měření. Do testu bylo zahrnuto všech 8 klonů membránově vázaných AC citlivých na stimulaci forskolinem (AC1-8).This test was performed by measuring two negative (N1 and N2 - ΟμΜ FSK) and two positive (PI and P2 - 10μΜ FSK) samples in 20 replicates of each sample according to the standard procedure above. The average relative fluorescence unit (RFU, 665/620 nm), sample standard deviation (SD) and variation coefficient (CV) were calculated for each sample (Table VI a-h). As a result, it tests the coefficient of variation for the entire measurement range. All 8 membrane-bound AC clones sensitive to forskolin stimulation (AC1-8) were included in the assay.
Tabulka VI - Výsledky měření intra-assay variability, a) AC1, b) AC2, c) AC3, d) AC4, e) AC5, f) AC6, g) AC7, h) AC8Table VI - Results of intra-assay variability measurements, a) AC1, b) AC2, c) AC3, d) AC4, e) AC5, f) AC6, g) AC7, h) AC8
-7 CZ 33391 U1-7 GB 33391 U1
-8CZ 33391 U1-8GB 33391 U1
d) AC4d) AC4
-9cz 33391 U1-9cz 33391 U1
- 10CZ 33391 U1- 10GB 33391 U1
b) Opakovatelnost (inter-assay variability):(b) Inter-assay variability:
Testování bylo provedeno jako deset nezávislých analýz. Byly testovány dva negativní (NI a N2 - ΟμΜ FSK) a dva pozitivní (Pl a P2 - ΙΟμΜ FSK) vzorky membrán, každý vzorek v kvadruplikátu dle standardního pracovního postupu uvedeného výše. Pro každý vzorek byla vypočítána průměrná hodnota fluorescence (RFU, 665/620 nm), ze všech testů byl vypočítán průměr, průměr pro celý rozsah, směrodatná odchylka výběrová a variační koeficient pro celý ίο rozsah měření (Tabulka VII a-h). Do testu bylo zahrnuto všech 8 klonů membránově vázaných AC citlivých na stimulaci forskolinem (AC1-8).Testing was performed as ten independent analyzes. Two negative (N1 and N2 - ΟμΜ FSK) and two positive (P1 and P2 - ΙΟμΜ FSK) membrane samples were tested, each in quadruplicate according to the standard procedure above. The average fluorescence value (RFU, 665/620 nm) was calculated for each sample, the mean, the mean for the whole range, the standard deviation, the selection and the coefficient of variation for the whole measurement range were calculated (Table VII a-h). All 8 membrane-bound AC clones sensitive to forskolin stimulation (AC1-8) were included in the assay.
Tabulka VII- Výsledky měření inter-assay variability, a) AC1, b) AC2, c) AC3, d) AC4, e) AC5, f) AC6, g) AC7, h) AC8Table VII - Inter-assay variability measurement results, a) AC1, b) AC2, c) AC3, d) AC4, e) AC5, f) AC6, g) AC7, h) AC8
- 11 CZ 33391 U1- 11 GB 33391 U1
- 12CZ 33391 U1- 12GB 33391 U1
- 13CZ 33391 U1- 13GB 33391 U1
- 14CZ 33391 U1- 14GB 33391 U1
- 15CZ 33391 U1- 15GB 33391 U1
- 16cz 33391 U1- 16cz 33391 U1
Příklad 3Example 3
Příklady složení jednotlivých kitů jsou uvedeny níže.Examples of the composition of each kit are given below.
Kit č. 1 obsahuje suspenzi klonu buněk HEK293 mající plazmid o sekvenci SEQ No.l. Dále odděleně obsahuje lyzační pufr obsahující hydroxyethyl piperazinethansulfonovou kyselinu o koncentraci 1 mmol/1, EDTA o koncentraci 0,5 mmol/1, MgCh.óEhO o koncentraci 0,5 mmol/1, dithiotreitol o koncentraci 0,5 mmol/1, sacharózu o koncentraci 100 mmol/1, hydrochlorid (4-(2-aminoethyl)benzensulfonyl fluoridu) 50 mmol/1, aprotininu 40 pmol/l, ,V-[(2ó’,3/?)-3-amino-2-liydiOxy-4-fcnylbutyryl]-L-lcucin 1 mmol/1, (trans-epoxysukcinyl-l-leucylamido-(4-guanidino)butanu) 0,5 mmol/1, N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal 0,5 mmol/1, isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta 0,5 mmol/1. Dále odděleně obsahuje stimulační pufr obsahující Hanksův vyvážený solný roztok o složení, jak je uvedeno výše, hydroxyethyl piperazinethansulfonovou kyselinu o koncentraci 1 mmol/1, 3-isobutyl-l-methylxanthin o koncentraci 0,1 mmol/1, hovězí sérový albumin o koncentraci 0,05 mmol/1, MgCh.óHjO o koncentraci 5 mmol/1, ATP o koncentraci 0,05 mmol/1. Také odděleně obsahuje detekční sadu, která zahrnuje europiem značené cAMP 1 nmol/1, cAMPspecifickou monoklonální protilátku značenou Seta-640-di-NHS 0,1 pg/ml acAMP kalibrační standard.Kit No. 1 contains a suspension of a HEK293 cell clone having the plasmid of SEQ. Separately, it contains a lysis buffer containing 1 mmol / l hydroxyethyl piperazineethanesulfonic acid, 0.5 mmol / l EDTA, 0.5 mmol / l MgCl2 / h, 0.5 mmol / l dithiotreitol, sucrose. 100 mmol / l, (4- (2-aminoethyl) benzenesulfonyl fluoride) hydrochloride 50 mmol / l, aprotinin 40 pmol / l, N - [(2 ', 3 R) -3-amino-2-liyldoxy] - 4-phenylbutyryl] -L-lucucine 1 mmol / l, (trans-epoxysuccinyl-1-leucylamido- (4-guanidino) butane) 0.5 mmol / l, N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L- argininal 0.5 mmol / l, isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta 0.5 mmol / l. Separately, the stimulation buffer containing Hanks Balanced Salt Solution, as described above, contains 1 mmol / 1, 3-isobutyl-1-methylxanthine hydroxyethyl piperazineethanesulfonic acid, 0.1 mmol / l, bovine serum albumin at 0 0.05 mmol / l, 5 mmol / l MgCl2H2O, 0.05 mmol / l ATP. It also separately contains a detection kit that includes a europium-labeled cAMP 1 nmol / L, a cAMPspecific monoclonal antibody labeled with Seta-640-di-NHS 0.1 pg / ml acAMP calibration standard.
Kit č. 2 obsahuje suspenzi klonu buněk HEK293 mající plazmid o sekvenci SEQ No.4. Dále odděleně obsahuje lyzační pufr obsahující hydroxyethyl piperazinethansulfonovou kyselinu o koncentraci 5 mmol/1, EDTA o koncentraci 1 mmol/1, MgCh.óHjO o koncentraci 1 mmol/1, dithiotreitol o koncentraci 1 mmol/1, sacharózu o koncentraci 250 mmol/1, hydrochlorid (4-(2-aminoethyl)benzensulfonyl fluoridu) 80 mmol/1, aprotininu 60 pmol/l, ,V-[(2ó’,3/?)-3-amino-2-liydroxy-4-fcnylbutyryl]-L-lcucinu 2 mmol/1, (trans-epoxysukcinyl-l-leucylamido-(4-guanidino)butanu) 1 mmol/1, N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal 1 mmol/1, isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta 1 mmol/1.Kit No. 2 contains a suspension of a HEK293 cell clone having a plasmid of SEQ ID NO.4. Separately, it contains a lysis buffer containing 5 mmol / l hydroxyethyl piperazineethanesulfonic acid, 1 mmol / l EDTA, 1 mmol / l MgCl 2, 10 mmol / l dithiotreitol, 250 mmol / l sucrose, (4- (2-aminoethyl) benzenesulfonyl fluoride) 80 mmol / l, aprotinin 60 pmol / l, N - [(2 ', 3 R) -3-amino-2-liydroxy-4-phenylbutyryl] -L -lucucine 2 mmol / l, (trans-epoxysuccinyl-1-leucylamido- (4-guanidino) butane) 1 mmol / l, N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal 1 mmol / l, isovaleryl- Val-Val-Sta-Ala-Sta 1 mmol / L.
Dále odděleně obsahuje stimulační pufr obsahující Hanksův vyvážený solný roztok o složení, jak je uvedeno výše, hydroxyethyl piperazinethansulfonovou kyselinu o koncentraci 5 mmol/1 a 3-isobutyl-l-methylxanthin o koncentraci 0,5 mmol/1, hovězí sérový albumin o koncentraci 0,1 mmol/1, MgCh.óHjO o koncentraci 10 mmol/1, ATP o koncentraci 0,1 mmol/1. Také odděleně obsahuje detekční sadu, která zahrnuje europiem značené cAMP 3 nmol/1, cAMP-specifickou monoklonální protilátku značenou Seta-640-di-NHS 0,5 pg/ml a cAMP kalibrační standard.Separately, the stimulation buffer containing Hanks Balanced Salt Solution, as described above, contains 5 mmol / l hydroxyethyl piperazineethanesulfonic acid and 0.5 mmol / l 3-isobutyl-1-methylxanthine, bovine serum albumin at 0 1 mmol / l, 10 mmol / l MgCl2 · H2O, 0.1 mmol / l ATP. It also separately contains a detection kit that includes a europium-labeled cAMP of 3 nmol / L, a cAMP-specific monoclonal antibody labeled with Seta-640-di-NHS 0.5 µg / ml, and a cAMP calibration standard.
Kit č. 3 obsahuje suspenzi klonu buněk HEK293 mající plazmid o sekvenci SEQ No.8. Dále odděleně obsahuje lyzační pufr obsahující hydroxyethyl piperazinethansulfonovou kyselinu o koncentraci 10 mmol/1, EDTA o koncentraci 5 mmol/1, MgC12.6H2O o koncentraci 5 mmol/1, dithiotreitol o koncentraci 5 mmol/1, sacharózu o koncentraci 400 mmol/1, hydrochlorid (4-(2-aminoethyl)benzensulfonyl fluoridu) 100 mmol/1, aprotininu 80 pmol/l, ,V-[(2ó’,3/?)-3-amino-2-liydiOxy-4-fcnylbutyryl]-L-lcucinu 4 mmol/1, (trans-epoxysukcinyl-l-leucylamido-(4-guanidino)butanu) 1,5 mmol/1, N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal v rozsahu 2 mmol/1,Kit No. 3 contains a suspension of a HEK293 cell clone having the plasmid of SEQ. Further, separately includes a lysis buffer containing hydroxyethyl piperazineethanesulphonic acid at a concentration of 10 mmol / 1 EDTA at a concentration of 5 mM / 1 MgC12.6H 2 O at a concentration of 5 mmol / 1 dithiothreitol at a concentration of 5 mmol / 1, sucrose at a concentration of 400 mmol / 1, (4- (2-Aminoethyl) benzenesulfonyl fluoride) hydrochloride 100 mmol / l, aprotinin 80 pmol / 1, N - [(2 ', 3 R) -3-amino-2-liidiidoxy-4-phenylbutyryl] -L-lucucine 4 mmol / l, (trans-epoxysuccinyl-1-leucylamido- (4-guanidino) butane) 1.5 mmol / l, N-acetyl-L-leucyl-L-leucyl-L-argininal in range 2 mmol / l,
- 17CZ 33391 U1 isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta 1,5 mmoFl. Dále odděleně obsahuje stimulační pufr obsahující Hanksův vyvážený solný roztok o složení, jak je uvedeno výše, hydroxyethyl piperazinethansulfonovou kyselinu o koncentraci 10 mmoFl a 3-isobutyl-l-methylxanthin o koncentraci 1 mmol/1, hovězí sérový albumin o koncentraci 0,5 mmol/1, MgCF.óHjO o koncentraci 20 mmol/1, ATP o koncentraci 0,5 mmoFl. Také odděleně obsahuje detekční sadu, která zahrnuje europiem značené cAMP 5 nmoFl, cAMP-specifickou monoklonální protilátku značenou sulfo-Cyanine7 1 pg/ml.- 17GB 33391 U1 isovaleryl-Val-Val-Sta-Ala-Sta 1.5 mmoFl. Separately, the stimulation buffer containing Hanks balanced salt solution of the composition as described above contains 10mmoFl hydroxyethyl piperazineethanesulfonic acid and 1 mmol / l 3-isobutyl-1-methylxanthine, 0.5 mmol bovine serum albumin. 1, 20 mmol / l MgCl2 · H2O, 0.5 mmoFl ATP. It also separately contains a detection kit that includes europium-labeled cAMP 5 nmoF1, a cAMP-specific monoclonal antibody labeled with sulfo-Cyanine7 1 µg / ml.
Seznam použité a související literatury https://www.salimetrics.com/calculating-inter-and-intra-assay-coefficients-of-variability/List of used and related literature https://www.salimetrics.com/calculating-inter-and-intra-assay-coefficients-of-variability/
Agarwal, S. R., P.-C. Yang, et al. (2014). Role of Membrane Microdomains in Compartmentation of cAMP Signaling. Pios One 9(4).Agarwal, S.R., P.-C. Yang, et al. (2014). Role of Membrane Microdomains in Compartmentation of cAMP Signaling. Pios One 9 (3).
Alasbahi, R. H. and M. F. Melzig (2012). Forskolin and derivatives as tools for studying the role of cAMP. Pharmazie 67(1): 5-13.Alasbahi, R.H. and M.F. Melzig (2012). Forskolin and derivatives as tools for studying the role of cAMP. Pharmazie 67 (1): 5-13.
Dessauer, C. W., V. J. Watts, et al. (2017). International Union of Basic and Clinical Pharmacology. CI. Structures and Small Molecule Modulators of Mammalian Adenylyl Cyclases. Pharmacol Rev 69(2): 93-139.Dessauer, C.W., V.J. Watts, et al. (2017). International Union of Basic and Clinical Pharmacology. WHOSE. Structures and Small Molecule Modulators of Mammalian Adenylyl Cyclases. Pharmacol Rev 69 (2): 93-139.
Hylse, O., L. Maier, et al. (2017). A Concise Synthesis of Forskolin. Angew Chem Int Ed Engl 56(41): 12586-12589.Hylse, O., L. Maier, et al. (2017). A Concise Synthesis of Forskolin. Angew Chem Int. Ed Engl 56 (41): 12586-12589.
Pavan, B., C. Biondi, et al. (2009). Adenylyl cyclases as innovative therapeutic goals. Drug Discov Today 14(19-20): 982-991.Pavan, B., C. Biondi, et al. (2009). Adenylyl cyclases as innovative therapeutic goals. Drug Discov Today 14 (19-20): 982–991.
Pierre, S., T. Eschenhagen, et al. (2009). Capturing adenylyl cyclases as potential drug targets. Nat Rev Drug Discov 8(4): 321-335.Pierre, S., T. Eschenhagen, et al. (2009). Capturing adenylyl cyclases as potential drug targets. Nat Rev Drug Discov 8 (4): 321–335.
Hylse, O., L. Maier, et al. (2017). A Concise Synthesis of Forskolin. Angew Chem Int Ed Engl 56(41): 12586-12589.Hylse, O., L. Maier, et al. (2017). A Concise Synthesis of Forskolin. Angew Chem Int. Ed Engl 56 (41): 12586-12589.
NÁROKY NA OCHRANUPROTECTION REQUIREMENTS
Claims (6)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CZ201936197U CZ33391U1 (en) | 2019-05-13 | 2019-05-13 | Equipment for determining the specific effect of adenylate cyclase isoforms using HEK293 cell membrane fractions |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CZ201936197U CZ33391U1 (en) | 2019-05-13 | 2019-05-13 | Equipment for determining the specific effect of adenylate cyclase isoforms using HEK293 cell membrane fractions |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ33391U1 true CZ33391U1 (en) | 2019-11-19 |
Family
ID=68617416
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ201936197U CZ33391U1 (en) | 2019-05-13 | 2019-05-13 | Equipment for determining the specific effect of adenylate cyclase isoforms using HEK293 cell membrane fractions |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CZ (1) | CZ33391U1 (en) |
-
2019
- 2019-05-13 CZ CZ201936197U patent/CZ33391U1/en not_active IP Right Cessation
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Tansey et al. | Ca (2+)-dependent phosphorylation of myosin light chain kinase decreases the Ca2+ sensitivity of light chain phosphorylation within smooth muscle cells | |
Tai et al. | A homogeneous and nonisotopic assay for phosphatidylinositol 4-kinases | |
Högberg et al. | Succinate independently stimulates full platelet activation via cAMP and phosphoinositide 3‐kinase‐β signaling | |
Surviladze et al. | Identification of a small GTPase inhibitor using a high-throughput flow cytometry bead-based multiplex assay | |
Mucha et al. | RIP3 and AtKinesin-13A–a novel interaction linking Rho proteins of plants to microtubules | |
US20090035796A1 (en) | Enzyme sensors including environmentally sensitive or fluorescent labels and uses thereof | |
Doyle et al. | Functional characterization of AC5 gain-of-function variants: Impact on the molecular basis of ADCY5-related dyskinesia | |
US10781472B2 (en) | Systems and methods for determining cyclic nucleotide concentration and related pathway activation | |
ES2832331T3 (en) | Protein-based biosensor that interacts with gbetagamma to monitor G protein activation | |
Fiene et al. | Fluorescence polarization immunoassays for monitoring nucleoside triphosphate diphosphohydrolase (NTPDase) activity | |
Rampelt et al. | Nucleotide exchange factors for Hsp70 chaperones | |
Vivoli et al. | A miniaturized peptidyl-prolyl isomerase enzyme assay | |
Nehmé et al. | New in-capillary electrophoretic kinase assays to evaluate inhibitors of the PI3k/Akt/mTOR signaling pathway | |
JP2009512460A (en) | Method for detecting intracellular enzyme complex | |
CZ33391U1 (en) | Equipment for determining the specific effect of adenylate cyclase isoforms using HEK293 cell membrane fractions | |
van Haastert et al. | Forty-five years of cGMP research in Dictyostelium: understanding the regulation and function of the cGMP pathway for cell movement and chemotaxis | |
Zhao et al. | Vulnerability of the cysteine-less proton-coupled folate transporter (PCFT-SLC46A1) to mutational stress associated with the substituted cysteine accessibility method | |
Klink et al. | Evaluating PI3 kinase isoforms using Transcreener™ ADP assays | |
US7575866B2 (en) | Ligand/binding partner bio-labeling systems | |
Starkey et al. | Determination of endogenous extracellular signal-regulated protein kinase by microchip capillary electrophoresis | |
Newton et al. | A real-time fluorescent assay of the purified nitric oxide receptor, guanylyl cyclase | |
ES2459218T3 (en) | Test system for transport proteins | |
ES2325739T3 (en) | ENZYMATIC MEASUREMENT OF IMATINIB MESILATE. | |
Vadakkadathmeethal et al. | Fluorescence-based adenylyl cyclase assay adaptable to high throughput screening | |
van Haastert et al. | A Highlights from MBoC Selection: Forty-five years of cGMP research in Dictyostelium: understanding the regulation and function of the cGMP pathway for cell movement and chemotaxis |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FG1K | Utility model registered |
Effective date: 20191119 |
|
MK1K | Utility model expired |
Effective date: 20230513 |