CN1920563A - 细胞凋亡敏感性蛋白cas的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白,找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白,免疫印迹实验进一步证实了细胞凋亡敏感性蛋白CAS的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于细胞凋亡敏感性蛋白CAS与肝细胞癌的这种相关性,该蛋白可以用作检测肝癌的蛋白质分子标记。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明涉及一种细胞凋亡敏感性蛋白CAS用作检测肝癌的蛋白质分子标记的应用。
背景技术
肝癌是一种严重危害人类的疾病。西方发达国家肝癌的发病率较低,国际上对肝癌的基础研究仍较为薄弱,而我国是肝癌高发国家,发病率和死亡率呈现上升趋势,且发病年龄构成年轻化,每年用于肝癌治疗的医疗支出大为增加,肝癌成了严重危害我国人民生命财产安全的头号敌人,并且是影响社会经济发展的一个重要因素,加大力度进行我国肝癌的基础研究具有战略意义,而分离和鉴定新的肝癌相关基因是目前肝癌基础研究中的前沿课题。
到目前为止,已有不下20种的基因异常表达被确定与肝癌的发生发展有关,但已确定的肝癌相关基因在肝癌中的异常表达率并不高,肝癌的发病机制至今仍未阐明,肝癌的早期诊断率仍有待提高。此外,传统的肝癌手术加化疗以及近年来配合使用的多种基因治疗方法仍没有明显提高肝癌患者的生存率,因而寻找新的肝癌相关基因尤其是肝癌高表达基因对于探讨肝癌的发病机制具有重要意义。
因此,为治疗和诊断目的研究和开发在肝癌中高表达的基因和/或蛋白具有重要意义。本领域迫切需要新的在肝癌中高表达的基因和/或蛋白。
细胞凋亡敏感性蛋白CAS(Cellular apoptosis susceptibility protein;Chromosomesegregation 1-like protein;Importin-alpha re-exporter;CAS;CSE1;XPO2;CSE1 chromosomesegregation 1 like(yeast);Cellular apoptosis susceptibility)的Genebank登录号为gi|29029559,NCBI的登录号为NP_001307,Swissprot登录号为P55060,IPI号为:IPI00022744.4。细胞凋亡敏感性蛋白CAS在酵母中存在着同源基因CSE-1,该蛋白的细胞定位是在核及胞质中。细胞凋亡敏感性蛋白CAS的功能正如其蛋白名,在细胞的凋亡过程中起着关键性的作用,在细胞中这一蛋白的表达可以提高细胞的抗凋亡能力。在哺乳类的细胞中,该蛋白对细胞周期的调节也起着一定的作用,介导着细胞的分裂增殖。同时,细胞凋亡敏感性蛋白CAS在一些蛋白的进核出核过程中起着关键性的作用。它是输入蛋白α的受体,在输入蛋白α的循环利用过程中负责把输入蛋白α从细胞核重新运回到细胞质中(Cell,Vol:90,1061-1071,Septemter 19,1997)。
细胞凋亡敏感性蛋白CAS是一种非受体的酪氨酸蛋白激酶(Src)的底物,在整合素介导的细胞粘连及细胞的运动位点被发现。它对Src介导的肿瘤发生机制影响很大。它的表达,大大地提高了细胞的侵袭能力(Oncogene.2004Sep.23;23(44):7406-15)。另有一篇文章指出,细胞凋亡敏感性蛋白CAS通常在卵巢癌的组织细胞中高表达,与细胞的凋亡及核的分裂能力相关;该篇文章还指出细胞凋亡敏感性蛋白CAS可以作为侵袭性肿瘤的标志物(Gynecol Oncol.2004 Jan.;92(1):268-76)。
最新一篇文献研究了细胞凋亡敏感性蛋白CAS在结肠癌(colon cancer)中的表达情况,提出了相反的观点。他们将细胞凋亡敏感性蛋白CAS转入了HT-29癌细胞中,研究指出,该蛋白抑制了HT-29癌细胞的迁移及生长。然后他们把转了细胞凋亡敏感性蛋白CAS的HT-29癌细胞注入裸鼠中,同样,他们发现该蛋白抑制了HT-29癌细胞在裸鼠中的生长(J.Exp.Clin.Cancer Res.2004 Jun;23(2):325-32)。
但是截止目前,现有技术中未见有关于细胞凋亡敏感性蛋白CAS与肝细胞癌的相关性的报道。
发明内容
通过筛选在肝细胞癌癌组织以及肝细胞癌癌旁组织中差异表达的蛋白质,本申请的发明人找到了一种在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白质(在癌组织中上调表达),经质谱鉴定为细胞凋亡敏感性蛋白CAS。进一步的免疫印迹实验证实,细胞凋亡敏感性蛋白CAS的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达(在癌组织中上调表达)。
基于细胞凋亡敏感性蛋白CAS与肝细胞癌的这种相关性,以该蛋白作为一个蛋白质分子标记检测其表达量可以用于检测肝癌。
因此,本发明的首要目的即在于提供一种细胞凋亡敏感性蛋白CAS用作检测肝癌的蛋白质分子标记的应用。
本发明的另一个目的在于提供一种抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体,包括单克隆抗体和多克隆抗体,用于制备检测肝癌的制剂的应用。
本发明的再一个目的还在于提供一种抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体,包括单克隆抗体和多克隆抗体,用于制备检测肝癌的试剂盒的应用。
本发明的又一个目的在于提供一种体外检测肝细胞组织中细胞凋亡敏感性蛋白CAS的表达是否异常的方法,该方法包括以下步骤:
A、用特异性抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体检测待测肝细胞中细胞凋亡敏感性蛋白CAS的数量;
B、将步骤A测得的细胞凋亡敏感性蛋白CAS的数量与正常肝组织中的细胞凋亡敏感性蛋白CAS的数量进行比较,如测得的蛋白数量高于正常值,则表示被检测肝组织中细胞凋亡敏感性蛋白CAS的表达异常。
虽然在现有技术中有关于细胞凋亡敏感性蛋白CAS在侵袭性癌症中高表达的报道,但是到目前为止,还没有细胞凋亡敏感性蛋白CAS与肝细胞癌的相关性的报道,因此,本发明的这一发现将为肝细胞癌的诊断和/或治疗提供一条全新的途径。
附图说明
图1显示了对细胞凋亡敏感性蛋白CAS的免疫印迹分析结果。
具体实施方式
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。
下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
本申请的发明人用非酶解样品制备法(nonenzymatic sample preparation,NESP)制备了肝细胞癌的癌组织与癌旁组织蛋白质样品,以同位素亲和标签与凝胶增强的液质联用技术(gel-enhanced liquid chromatography-mass spectrometry coupled with isotope-coded affinitytag,GeLC-MS-ICAT)对其中的蛋白进行鉴定并比较其表达量,结果发现细胞凋亡敏感性蛋白CAS在肝细胞癌癌组织中高表达。免疫印迹实验进一步证实细胞凋亡敏感性蛋白CAS的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。
因此,以细胞凋亡敏感性蛋白CAS作为一个蛋白质分子标记对其表达量进行检测可以用于检测肝癌,即细胞凋亡敏感性蛋白CAS可以用作检测肝癌的蛋白质分子标记。
实施例1、肝细胞癌癌组织及癌旁组织蛋白质样品的制备
本实施例中所使用的尿素、3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙铵]-1-丙磺酸(CHAPS)、苯甲基磺酰氟(PMSF)、二硫苏糖醇(DTT)均购自Sigma公司。
本实施例以非酶解样品制备法(nonenzymatic sample preparation,NESP)制备肝细胞癌的癌组织及癌旁组织蛋白质样品,具体如下:
手术切除的新鲜组织块迅速置于冰上,快速切成几个肉眼可见、无坏死区域的小块。用预冷的不含谷氨酰胺的RPMI1640培养基(5%胎牛血清,0.2mM PMSF,1mM EDTA,苯甲异噁唑青霉素25mg/mL,庆大霉素50mg/mL,青霉素100U/mL,链霉素100mg/mL,两性霉素B 0.25mg/mL,制霉菌素50U/mL)洗涤组织小块数次后,在液氮中快速研磨成细胞沉淀,细胞沉淀分别溶于适量裂解液(8mol/L尿素、4%CHAPS、40mmol/L Tris和65mmmol/L DTT)中,超声细胞破碎仪(Soniprep 150,英国,MSE)冰浴间歇超声2min,15000r/min、4℃离心1h。取上清,以改良的Bradford法(见Bio-Rad公司产品说明书)进行总蛋白质定量,制备好的肝细胞癌癌组织及相应癌旁组织的蛋白质样品分装,-80℃保存备用。
以上述方法制备11对肝细胞癌癌组织及癌旁组织蛋白质样品。11例肝细胞癌标本均来自东方肝胆外科医院,由2个病理科医生明确为肝细胞癌。均为男性,平均年龄48.5岁(31~65岁),血清检测hepatitis B病毒感染阳性,11例(100%)属临床分级(TNM分级)III级。其中,甲胎蛋白(AFP)高于25μg/L的10例(90.9%);9例肿瘤大于5cm。11例肝细胞癌标本的病理资料详见表1。
表1、11例肝细胞癌标本的病理资料
No. | 性别 | 年龄 | HBV | HCV | 等级 | AFP | 尺寸 |
3 27 | 男性 | 44 | + | - | III | >1000 | 8×8×7 |
4 15 | 男性 | 40 | + | - | III | >1000 | 10×8×6 |
4 18 | 男性 | 31 | + | - | III | 3.7 | 8×5×8 |
4 22 | 男性 | 57 | + | - | III | >1000 | 3.5×4 |
4 29 | 男性 | 44 | + | - | III | >1000 | 7.2×6 |
3 17 | 男性 | 58 | + | - | III | >1000 | 5.2×6.4 |
4 2 | 男性 | 45 | + | - | III | >1000 | 7.7×5.4 |
4 5 | 男性 | 51 | + | - | III | >1000 | 5.5×4.0 |
4 8 | 男性 | 55 | + | - | III | >1000 | 4×3 |
4 9 | 男性 | 43 | + | - | III | >1000 | 12×12 |
4 24 | 男性 | 65 | + | - | III | >1000 | 11.5×6.5 |
本实施例所用癌组织及癌旁组织样品均为取自同一肝细胞癌患者的成对样品,所有11例肝细胞癌病例有极相似的病例诊断指标:均为男性,平均年龄48.5岁(31~65岁),血清检测hepatitis B病毒感染阳性,11例(100%)属TNM分级III级。其中,AFP高于25μg/L的10例(93.75%);9例肿瘤大于5cm。这种取样方法有利于降低个体间差别对实验分析工作的影响。
实施例2、差异表达蛋白的筛选
本实施例中使用的尿素、3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙铵]-1-丙磺酸(CHAPS)、十二烷基磺酸钠(SDS)、二硫苏糖醇(DTT)购自Sigma公司;碘乙酰胺(IAA)、丙烯酰胺、N,N-甲叉双丙烯酰胺等购自Fluka公司;cleavable ICAT试剂购自Applied BiosystemsFramingham,MA公司。
过硫酸胺(AP)、TEMED、Tri-n-butylphosphat(TBP)、PDQuest软件等为Bio-Rad产品。
Avidin亲和柱购自Applied Biosystems,Framingham,MA公司。
LCQTM Deca XP system和ProteomeXTM Workstation购自Thermo Finnigan公司。
所使用的上样缓冲液的组成为:1mol/L Tris-HCl(pH6.8)0.6ml,50%甘油5ml,10%SDS 2ml,巯基乙醇0.5ml,蒸馏水1.9ml,少量六溴酚蓝。
首先采用同位素亲和标签与凝胶增强的液质联用技术(gel-enhanced liquidchromatography-mass spectrometry coupled with isotope-coded affinity tag,GeLC-MS-ICAT)对实施例1得到的11对蛋白质样品中的其中一对(病例编号为4 29)肝细胞癌的癌组织及癌旁组织中的差异表达蛋白进行筛选鉴定,方法参照2003年Steven P.Gygi发表在MCP上的文献(Jiaxu Li et al.Mol Cell Proteomics.2003 Nov;2(11):1198-204.Epub.2003 Sep.23),具体过程如下:
NESP法制备的一对肝细胞癌癌组织与相应癌旁组织蛋白质样品(病例编号为4 29),分别取100μg,先用TBP还原蛋白质,而后分别用cleavable ICAT试剂(C12和C13)标记(其中C12与C13分别对应癌组织与相应癌旁组织,标记方法参照产品说明书)。混合后加入适量上样缓冲液,跑5%浓缩胶(上层胶)和7.5%~17.5%分离胶(下层胶),电泳条件为15mA/胶30min,然后30mA/胶,保持至溴酚蓝前沿入浓缩胶8cm左右。
考染染出条带后,将整个上样条带平均切为8份,每份再分别切成1mm3的小块,在100mM NH4HCO3、30%ACN中脱色,真空冷冻干燥,100μl 50mmol/L NH4HCO3(pH8.3,蛋白质∶胰蛋白酶=1∶5,w/w)中4℃放置2hr,加入50μl 50mmol/L NH4HCO3(pH8.3),37℃酶解过夜。
抽提蛋白(60%ACN、0.1%TFA),真空冷冻干燥。酶解后的每份肽段混合物经Avidin亲和柱纯化出已标记肽段后,再用LCQTM ProteomeXTM Workstation进行液相串联(LC-MS/MS)质谱鉴定,Bioworks软件(Thermo finnigan公司)进行数据库搜索并用relex软件(Scripps Research Institute,USA)进行数值计算。
运用NESP法和GeLC-MS-ICAT技术,我们共鉴定到426种有定量关系的蛋白质。其中两倍以上量变的蛋白质共201种,肝细胞癌癌组织高表达的有155种蛋白质;肝细胞癌癌旁组织高表达的有46种蛋白质。
用LC-MS/MS质谱鉴定、数据库搜索及比值计算得3个含Cys的肽段被总共鉴定到4次,与细胞凋亡敏感性蛋白CAS(Cellular apoptosis susceptibility protein;Chromosomesegregation 1-like protein;Importin-alpha re-exporter;CAS;CSE1;XPO2;CSE1 chromosomesegregation 1 like(yeast);Cellular apoptosis susceptibility)相符,氨基酸覆盖率为5.46%。relex软件计算结果显示细胞凋亡敏感性蛋白CAS在肝细胞癌癌组织中高表达,癌组织/癌旁组织的比值为7.344(SD=9.551),详细的鉴定情况及肽段打分结果见表格2。
表2、GeLC-MS-ICAT中3个含Cys的肽段的详细鉴定结果
鉴定到的肽段(4段共9次) | 质量数(MH+) | 电荷数 | X corr值 | Delta Cn值 |
K.HGITQANELVNLTEFFVNHILPDLK.S | 2864.25 | 3 | 5.1468 | 0.5784 |
K.NLFEDQNTLTSICEK.V | 1983.19 | 2 | 3.0026 | 0.3529 |
K.NLFEDQNTLTSICEK.V | 1983.19 | 2 | 3.071 | 0.3511 |
K.SQICDNAALYAQK.Y | 1652.85 | 2 | 2.5864 | 0.3179 |
实施例3、细胞凋亡敏感性蛋白CAS差异表达的免疫印迹验证
为确认细胞凋亡敏感性蛋白CAS的差异表达,取10位肝细胞癌患者的癌组织及相应癌旁组织蛋白质样品(NESP法制备,表1中除429例以外的其它10例),用购买的抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS抗体进行免疫印迹分析,具体过程简述如下:
每个样品取60μg蛋白质样品用12%SDS-PAGE分离,转移至PVDF膜(购自Amersham Biosciences公司)上,一抗使用鼠抗人细胞凋亡敏感性蛋白CAS单抗(购自NeoMarkers,Inc公司,1∶100),室温孵育2小时,用TBST(每升含Tris 2.42g,氯化钠8g,Tween 20ml,用HCl调节pH到7.6)洗涤三次,每次5分钟,二抗为抗鼠抗体(购自Santa Cruz公司,1∶10000)室温孵育1小时,再用TBST洗涤三次,每次10分钟,最后用ECL plus试剂(Amersham Biosciences)反应5分钟后,以X-光片曝光检测,检测结果如图1所示。
从图1的免疫印迹结果可见,10对癌组织与癌旁组织中除一对(4 9)不甚明显外,其余各对均呈现癌组织中细胞凋亡敏感性蛋白CAS的杂交条带的浓度明显高于相应的癌旁组织的现象;可见细胞凋亡敏感性蛋白CAS在肝细胞癌的癌组织中存在高表达,该结果与质谱检测结果一致。
综上所述,细胞凋亡敏感性蛋白CAS在肝细胞癌的癌组织及癌旁组织中存在差异表达,显然与肝细胞癌的发生发展有着密切的相关性,因此以该蛋白作为一个蛋白质分子标记对其表达量进行检测可以用于检测肝细胞癌。相应的,特异性抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体,包括各种抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的单克隆抗体和多克隆抗体,由于其能够用于检测细胞凋亡敏感性蛋白CAS的表达量,因而可以用于检测肝癌,或者用于制备检测肝癌的制剂或试剂盒等,这对于本领域的技术人员来说是显而易见的。
虽然有关细胞凋亡敏感性蛋白CAS动态的生物学功能及肿瘤相关机制还有待进一步研究,但是将其作为检测肝癌的标记物却是肯定的。细胞凋亡敏感性蛋白CAS可作为肝细胞癌的潜在标志,而其在胞内的生物学功能提示细胞凋亡敏感性蛋白CAS可能作为肝癌的预后分子标记和临床治疗的靶分子。
Claims (9)
1、一种细胞凋亡敏感性蛋白CAS的应用,其特征在于,用作检测肝癌的蛋白质分子标记。
2、如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述用作检测肝癌的蛋白质分子标记是检测该蛋白在肝细胞组织中的表达量。
3、如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测该蛋白在肝细胞组织中的表达量是检测该蛋白在肝细胞组织中是否存在上调表达。
4、一种抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体的应用,其特征在于,用于制备检测肝癌的制剂。
5、如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体包括单克隆抗体和多克隆抗体。
6、一种抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体的应用,其特征在于,用于制备检测肝癌的试剂盒。
7、如权利要求6所述的应用,其特征在于,所述抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体包括单克隆抗体和多克隆抗体。
8、一种体外检测肝细胞组织中细胞凋亡敏感性蛋白CAS的表达是否异常的方法,其特征在于包括以下步骤:
A、用特异性抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体检测待测肝细胞中细胞凋亡敏感性蛋白CAS的数量;
B、将步骤A测得的细胞凋亡敏感性蛋白CAS的数量与正常肝组织中的细胞凋亡敏感性蛋白CAS的数量进行比较,如测得的蛋白数量高于正常值,则表示被检测肝组织中细胞凋亡敏感性蛋白CAS的表达异常。
9、如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述所述抗细胞凋亡敏感性蛋白CAS的抗体包括单克隆抗体和多克隆抗体。
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