CN1379099A - 耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因及其编码的多肽和制备方法 - Google Patents
耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因及其编码的多肽和制备方法 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因及其编码的多肽和制备方法。它涉及编码具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性或其功能等同变异体的分离的DNA及利用重组DNA技术以所述分离的DNA生产具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽或其功能等同变异体。以腾冲嗜热厌氧菌全基因组测序与分析为基础,克隆分离了耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因。利用该基因生产耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的转基因微生物或转基因动植物,并回收获得该基因编码的酶。另外,本发明还提供了具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽的氨基酸序列及功能等同体。同时,提供了制备、分离、纯化具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽的方法。
Description
技术领域
本发明涉及突变为或遗传工程领域,尤其涉及一种耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因及其编码的多肽和制备方法。
背景技术
6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6-phosphogluconate degydrogenase)是碳水化合物代谢过程中的一种酶。具体地说,该酶的作用是在磷酸戊糖途径的第一个阶段即氧化阶段中催化了6-磷酸葡萄糖酸脱氢脱羧产生了5-磷酸核酮糖,在这个反应中NADP+是作为氢的受体。而且6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶是葡萄糖代谢的磷酸戍糖途径的限速酶,它对于DNA合成原料——核糖的合成有关键作用。铁是6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的必需的活化因子。6-磷酸葡萄糖脱氢酶的编码基因为Gnd。该酶具有467个氨基酸,预测分子量为53392道尔顿。
磷酸戊糖途径的功能为产生NADP,为生物合成提供还原力,例如脂肪酸、固醇类物质的合成;产生磷酸戊糖参加核酸代谢;NADPH使红细胞中还原谷胱甘肽再生,对维持红细胞还原性有重要的作用;磷酸戊糖途径是植物光合作用中从CO2合成葡萄糖的部分途径。在动物的肝脏、骨髓、脂肪组织,泌乳期的乳腺、肾上腺皮质、红细胞等组织这个途径比较旺盛、有关的酶都在细胞质中。
因此,作为磷酸戊糖途径的重要酶之一,6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶具有很广阔的应用前景。它可以利用同工酶电泳在方法上比蛋白质电泳更为简便,酶带的显现更灵敏,应用于种子鉴定具有速度快、费用低、准确度高等优点应用于种子鉴定,目前可以鉴定的种子有水稻、玉米、小麦等二十多种的多个品种。
还有人对烟草品种的包括6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶等9种同工酶进行了聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,来运用同工酶遗传距离构建品种杂种优势群。经过有人研究,当肝细胞损伤(尤其肝炎)时,肝内糖代谢有关酶类发生了的特征性变化、6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的活性增高。表明肝细胞损伤时糖代谢变化的特点是磷酸戊糖途径及糖酵解途径相对增强。
综上所述,6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶在农业生产、工业生产及医药业方面具有广泛的应用前景。
本发明涉及的腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tangcongensis),是生活在我国云南省腾冲县的热泉中的一种微生物,是一种嗜热的真细菌(eubacteria),最适生长温度为75摄氏度,厌氧生长,革兰氏染色反应呈阳性。它是由中国科学院微生物所首先发现并进行了分类学上的分析。菌种保存在中国微生物保存中心MB4T(Chinese collection of microorganisms AS 1.2430T=JCM 11007T)。该嗜热厌氧菌是我国特有的一个物种,其体内所具有的耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶也具有自己特有的结构。
发明内容
本发明的目的之一是提供一种分离的,编码具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽的核苷酸序列。
本发明的另一目的是提供一种分离的,具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性多肽。
本发明还提供了含有编码耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的DNA的重组载体、含有前述重组载体的宿主细胞,以及生产该蛋白的方法。
本发明的第一方面提供了一种编码具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽的核苷酸序列。该核苷酸序列能编码具有序列表SEQ ID NO.2中的氨基酸序列的多肽或所述多肽的修饰形式,该修饰形式功能上相当或与6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶相关。核苷酸序列具有序列表SEQ ID NO.1的多核苷酸序列以及它的突变形式,突变类型包括:缺失、无义、插入、错义。
本发明的第二方面提供了一种耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽。该多肽具有序列表SEQ ID No.2中的氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
本发明的第三方面提供了生产耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的方法:
1)分离出编码耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的基因核苷酸序列SEQ IDNO.1;
2)构建含SEQ ID NO.1核苷酸序列的表达载体;
3)将步骤2)中表达载体转入宿主细胞,形成能生产耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的重组细胞;
4)培养步骤3)中的重组细胞;
5)分离、纯化得到耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶。
本发明涉及嗜热厌氧菌的6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因的分离及表达。以腾冲嗜热厌氧菌全基因组测序与分析为基础,克隆分离了耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因。运用该基因生产耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的转基因微生物或动植物,并回收获得该基因编码的酶。另外,本发明还提供了具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽的氨基酸序列及功能等同体。同时,本发明还提供了制备,分离,纯化具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽的方法。
附图说明
图1是测序文库构建步骤流程图;
图2是测序与数据分析流程图。
具体实施方式
首先,本发明提供了分离的,编码耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽的核苷酸分子,该核苷酸分子是通过对腾冲嗜热厌氧菌全基因组测序与分析而获得的,具有序列表SEQ.ID NO.1所示的核苷酸序列。它编码了具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的有467个氨基酸的多肽,该多肽的推测分子量为53392道尔顿。
本发明还涉及一种重组载体,该载体包含本发明的分离的核苷酸分子,以及包含有重组载体的宿主细胞。同时,本发明包括构建该重组载体和宿主细胞的方法,以及利用重组工程技术生产6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的方法。
本发明进一步地提供了一种分离的耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶或多肽,其特征在于具有序列表SEQ.ID NO.2所示的氨基酸序列,或至少70%相似,更佳地,至少具有90%,95%,99%的相同。
在本发明中,“分离的”DNA是指该DNA或片段已从天然状态下位于其两侧的序列中分离出来,还指该DNA或片段已经与天然状态下伴随核酸的组份分开,而且已经与在细胞中伴随其的蛋白质分开。
在本发明中,“耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因”指编码具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的多肽的核苷酸序列,如序列表SEQ.ID NO.1的核苷酸序列及其简并序列。该简并序列是指该序列中有一个或多个密码子被编码相同氨基酸的简并密码子所取代后而产生的序列。由于公知的密码子的简并性,所以与SEQ ID NO.1核苷酸序列同源性低至约70%的简并序列也能编码出序列表SEQ ID NO.2所述的氨基酸序列。该术语还包括能在中度严谨条件下,更佳地在高度严谨条件下与序列表SEQ ID NO.1的核苷酸序列杂交的核苷酸序列。该术语还包括与序列表SEQ ID NO.1核苷酸序列同源性至少70%,较佳地至少80%,更佳地至少90%,最佳地至少95%的核苷酸序列。
在本发明中,“分离的”蛋白的多肽是指其至少占样品总物质的至少20%,较佳地至少50%,更佳地至少80%,最佳地至少90%(按干重或湿重计)。纯度可以用任何合适的方法进行测量,如用柱层析,PAGE或HPLC法测量多肽的纯度。分离的多肽基本上不含天然状态下的伴随其的组份。
在本发明中,“耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶”指具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性的序列表SEQ ID NO.2序列的多肽。该术语还包括序列表SEQID NO.2序列的变异体,这些变异体具有与天然耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶相同的功能。这些变异体包括(但不限于)若干个氨基酸的缺失,插入和/或取代,以及在C末段和/或N末端添加一个或数个氨基酸,也可以是不影响序列的修饰形式上的差异。例如,为本领域所公知的,用性能相近或相似的氨基酸进行取代时,通常不会改变蛋白质的功能。又比如,在C末段和/或N末端添加一个或数个氨基酸通常也不会改变蛋白质的功能。该术语还包括耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的活性片段和活性衍生物。
在本发明中,可选用本领域已知的各种载体,如市场上销售的各种质粒、粘粒、噬菌体及反转录病毒等。在生产本发明的耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶时,可以将耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因序列可操作地连于表达调控序列,从而形成耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶表达载体。该表达载体含有复制起始点和表达调控序列,启动子,增强子和必要的加工信息位点。表达载体还必须含有可供选择的标记基因,如a)提供对抗生素或其它毒性物质(氨苄青霉素,卡那霉素,氨甲蝶呤等)的抗性的蛋白质或b)互补营养缺陷型蛋白质或c)提供复合培养基中没有的必需营养成分的蛋白质。各种不同宿主的合适标记基因是本领域中所熟知或生产厂商说明书注明的。这些表达载体可以用本领域技术人员所公知的重组DNA技术制备,如可参考Sambrook等人的做法(1989),或Ausubel等人的做法(1992)。
重组表达载体可以用本领域熟知的方法引入宿主细胞,这些方法包括:电转化法,氯化钙法,基因枪法等。将外源重组载体导入宿主细胞的过程称为“转化”。通过培养宿主细胞,诱导所需蛋白的表达,并通过本领域所熟知的蛋白分离技术,如柱层析等得到所需的蛋白质。也可采用固相技术等人工合成该蛋白质。
在本发明中,术语“宿主细胞”包括原核细胞和真核细胞。常用的原核细胞如大肠杆菌,枯草杆菌等。常用的真核细胞如酵母细胞,或各种动植物细胞。本发明的耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因全长序列或其片段通常可以用PCR(聚合酶链式反应)扩增法,重组法,或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据本发明所公开的有关核苷酸序列来设计引物,用本领域技术人员已知的常规方法制备的嗜热厌氧菌全基因组DNA为模板,扩增而得到有关序列。一旦获得了有关序列,就可以将其克隆入有关载体,再转入宿主细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到大批量的有关序列。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。实施例1:构建测序文库
测序文库的构建采用全基因组霰弹法(shotgun)进行。首先培养腾冲嗜热厌氧菌,培养方法按(Yanfen Xue,2000)改进的MB培养基(Balch et al.,1979),按Marmur(1961)方法收集细菌,提取总DNA。为了保证测序文库构建的随机性,最大程度地避免产生断裂热点的问题,采用多种方法、不同条件的建库原则。先采用物理剪切方法(包括超声波法及用Hydroshear Machine进行剪切),其次根据该菌基因组特征选用AluI进行随机部分酶切。物理剪切时采用不同强度处理样品,酶切时通过设置酶量梯度处理样品。处理后的样品经平末端处理后,采用电泳分部收集1.5-4kbDNA片段,与去磷酸化的经SmaI酶切的pUC18进行连接,连接产物通过电转化E.coli DH5α构建了随机测序的文库。同时,为了便于以后重叠群(contig)的搭接还构建了长插入片段(10kb左右)的测序文库(将基因组DNA以Sau3AI随机部分酶切,电泳收集10kb左右的片段,与去磷酸化的经BamHI酶切的pUC18进行连接、构建文库)。该文库经两个末端的测序在构建完成图(finishing)的过程中可以得到重叠群(contig)之间的关系,并可以解决较大的洞(gap)对补洞造成的困难。建库流程如(见图1)。
实施例2:基因组测序
在完成腾冲嗜热厌氧菌基因组的测序时,主要使用了两种全自动测序仪:ABI377和MegaBACE 1000。这两种测序仪都是利用电泳原理进行测序(见图2),每次可完成96个样品。ABI377是ABI公司的产品,是ABI系列的一种。它属于平板凝胶电泳测序仪。MegaBACE 1000是法玛西亚公司的产品,属于毛细管凝胶电泳测序仪。
实施例3:数据分析
1)Basecalling和测序质量监控
所谓Basecalling是指从测序仪上得到的原始数据文件中得到正确的碱基序列的过程。由于测序仪上得到的是A,T,G,C四种碱基对应的不同波长的光的强度变化轨迹(trace),需要用计算机采取一定的算法从中正确识别出不同的轨迹对应的碱基。我们使用的是Phred软件(Ewing B,Hillier L,1998),原因是其结果更可靠,并且其结果输出更便于同一软件包中的其他程序进行进一步的分析。Phred进行Basecalling的算法原理,是根据轨迹中各个峰的形状,间距,以及信噪比等因素,判断碱基类型,同时对这个碱基给出可信度信息,即碱基的测序质量。
在大规模测序中,测序质量的监控是十分重要的,它直接影响对测序的决策,包括文库的构建,覆盖率的大小。同时对测序实验中可能出现的失误能及时反馈。
2)序列拼接
所谓序列拼接,就是把全基因组霰弹法(又称鸟枪法)随机测序得到的样品序列组装成连续的重叠群(contig),主要利用它们之间的重叠序列作参考。考虑到测序中存在载体的影响,需要先对样品序列进行去载体处理。这里所用的软件cross match和后面拼接所用的软件Phrap都是美国Washington大学的软件(Gordon D,Abajian C,1998),其基本原理为Swith-Waterman算法(WatermanMS,1990)。这是一种动态算法,在考虑了两两序列之间的比较之后,可以得到一组序列的公有序列(consensus sequence)。去除载体后的样品序列再用Phrap进行拼接。在拼接时,碱基的测序质量也被考虑了,所得到的公有序列各碱基的可信度,由组成该公有序列的样品的测序质量计算得到。
3)基因注释
在大体得到基因组的大部分序列(完成工作框架图)后,就需要对基因组进行注释,包括进行开放阅读框架(Open Reading Frame,ORF)的预测,基因功能的预测,以及特殊RNA片段的分析等。
第一步采用缺省参数的GLIMMER2.0(Delcher,A.L.,Harmon,D.1999)和ORPHEUS(Frishman,D.1998)软件预测基因编码序列,然后所有预测的开读框和非编码区(intergenic region)都用BLAST软件(Altschul,S.F.et al.1997)与NCBI(美国国家生物技术信息中心)的无冗余蛋白数据库(non-redundant proteindatabase)比较来发现可能漏掉的基因。在判断一个基因的起始点时,将参考各种相关信息,如序列同源性,核糖体结合位点,可能的信号肽序列和启动子序列等。如果在一个开放阅读框内出现多个启动子时,一般采用第一个启动子作为基因的起始点。采用TransTerm软件(Ermolaeva,M.D.2000)在非编码区预测不依赖于Rho(ρ)因子的转录终止子。如果该终止子位于一个基因的下游区的太远处,则可能暗示一个小基因的丢失或测序错误人为地缩短了该基因,可作为进一步分析的参考。在确定移框突变和点突变时,主要根据与数据库中的蛋白质的相似性来判断。如果出现一个蛋白质对应于两个彼此相邻的编码序列的情况,则被认为是一个无活性基因(假基因seudogenes),因为这说明这两个编码序列之间由于突变而产生异常中止现象,进而使基因失去活性。所有分析结果再用Artemis sequence viewer软件(Rutherford,K.et al.2000)进行手工分析。一些明显与其它编码序列有重叠的开读框,长度小于150碱基对并且在已有数据库中没有同源性和其中没有明显的启动子或终止区域的开放阅读框将被去除。
蛋白质的功能片段(motif)和功能区域(domain)分别采用与Pfam、PRINTS、PROSITE、ProDom和SMART数据库进行比对分析,结果再用InterPro数据库(Apweiler,R.et al.2001)进行汇总分析。根据NCBI的COGs数据库(Tatusov,R.L.et al.2001)并且参照其他数据库的查询结果来确定蛋白质在COGs分类中的功能分类和可能的代谢途径。用TMHMM软件(Krogh,A.et al.2001)来确认膜蛋白、ABC转运蛋白和跨膜功能域。采用革兰氏阴性菌为参数,用SIGNALP2.0软件(Nielsen,H.et al.1999)分析信号肽区域。
4)补洞
在完成基因组的工作框架图之后,就要进行更加困难的补洞工作,即完成整个基因组100%的测序,得到一个环形基因组。主要工作就是把前面得到的contig连接起来。这是一项十分具体而又繁杂的工作。主要方法包括:
A.利用测序中的正反向测序样品信息
在测序过程中,我们有意对某些样品进行了双向测序,即同时测序某个插入片段的两端,再将所得序列与其他序列一起进行拼接。由于这一对序列在基因组上的关系一定,它们之间的距离大致已知,根据这一信息,一可以确认某段contig是否可靠,二是当这一对序列分别位于不同的contig上时,可以确定这两个contig的方向关系和位置关系,为进一步设计实验提供参考。
B.长插入片段及装备型载体粘粒(Cosmid)末端测序
基于同样的原理,我们可以构建不同长度的插入片段文库,只对其两端测序,然后拼接,分析其具体位置。这些文库包括长度为9-12Kb的长插入片段库和20-40Kb左右的Cosmid文库。具体分析方法同上所述。
C.PCR和末端延伸(Walking)实验
根据上述步骤A和B所提供的contig的方向和位置关系,进一步的生物化学实验就可以进行了。如设计一对引物进行PCR扩增,或以某一contig末端序列合成引物进行末端延伸(Walking)来补洞等。实施例4:6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的制备和提纯
根据实施例中基因注释得到的6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因全长编码序列(SEQ ID NO.1),设计出能扩增出完整编码阅读框的引物,并在正反引物上分别引入限制性内切酶位点,以便构建表达载体。以实施例1中获得的测序文库的质粒DNA为模板,经PCR扩增后,在保证阅读框正确的前提下重组至pGEX-2T载体(Pharmacia,Piscataway,NJ)。再将重组载体转化入大肠杆菌DH5α中(转化方法为CaCL2法或电转化法)。筛选鉴定的到含有表达载体的工程菌DH5α-pGEX-2T-Gnd。
挑取单菌落的工程菌DH5α-pGEX-2T-Gnd于3ml含100μg/ml氨苄青霉素的LB培养基中振摇培养37℃过夜,按1∶100的浓度吸取培养液于新的LB培养基(含100μg/ml氨苄青霉素)中培养约3小时,至OD600达0.5后,加入IPTG至终浓度1mmol/L,继续于37℃分别培养0,1,2,3小时。取培养时间不同的1ml菌液离心,在细菌沉淀物中加入裂解液(2×SDS上样缓冲液50μl,蒸馏水45μl,二巯基乙醇5μl),混悬细菌沉淀,沸水浴中煮5分钟,10000rpm离心1分钟,上清加入12%SDS-PAGE胶中电泳。染色后观察预期分子量大小的蛋白量随IPTG诱导时间增加而增加的菌株即为表达所需蛋白的工程菌。
按上述方法诱导表达所需蛋白的工程菌后,将细菌离心沉淀,按每400ml菌加入20ml PBS饱和的50%谷胱苷肽Sepharose 4B,37℃振摇结合30分钟,10000rpm离心10分钟沉淀结合了所需蛋白的谷胱苷肽Sepharose 4B,弃上清。按每毫升超声液所得沉淀加入100μl还原型谷胱苷肽洗脱液,室温置10分钟,上清即为洗脱的蛋白。重复洗脱两次。洗脱的上清保存于-80℃,并进行SDS-PAGE SEQ ID NO.1电泳,检测纯化效果。在53392道尔顿处的蛋白质条带即为6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶。
序列表<110>杭州华大基因研发中心<120>耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因及其编码的多肽和制备方法<140><141><160>2<170>PatentIn Version 3.1<210>1<211>1404<212>DNA<213>腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tangcongensis)<220><221>gene<222>(1)…(1404)<223>n=a或g或c或t<400>1atgaatgatg tgggtttaat aggattggcg gtaatgggac aaaattttgc cttgaacatg 60gcaaggaaag gttatagagt ttcggtttat aataggaccc ctgagagaac aaagaagttt 120gttgaggaaa aagttagaga cgaatcaatt tttccgtttt atactataga agagtttgtg 180aaaagtttaa aaaaacctag aaaaataatt ctgatgataa aggctggaaa ggctgtagat 240gacatgattg ctgaaattct tccatatctg gagctagggg accttatagt agacagtggg 300aattcgcatt ttgctgatac tgctagaagg ctagaatatt tatcgcaaaa aaacattttg 360tttctcggaa tgggtatttc tggaggagag tacggggctt tacatggacc ctcattaatg 420ccaggtggta caaaagaggc ttatgactta ataaaagata ttcttttaaa ggctgcagca 480aagacggaag atggaccttg ctgtacatat gtgggaaagg gttcagcagg tcattttgtg 540aaaatggttc ataatggtat tgaatatgct attatgcagt taattgctga agtatatgat 600tttatgaaaa aagtattgaa tatgactaat gaacaaatag gcgatgtctt tgaaaaatgg 660aataagggag aacttaattc ctatttaatg gaaatttctt ataagattat gagatataaa 720gacaaggaga caggaggatt tttgatagac tacattttgg ataaagcaga acaaaagggt 780actgggaaat ggactgctca aacttctttg gatttagggg ttcctacgcc aacattgaat 840ttggcggtag aagccagaat tatttctcac tataaagaag agagaaagat tttatcgaaa 900ttatattcga aagaaaagaa tataatctct gtgaataaag aagaaatgat agagcattta 960aagaaagcac tgctttttgg agtatttatg tctttctctc aaggcttatg gctaattgac 1020gaagcatcca agcaatataa ttatggaata gaccttagcg aaatattaag aatttggaaa 1080ggaggctgta ttataagggc cgaaattcta gactttttga gggatatcat tagagaaaat 1140gaggaagatg caaatctttt gcatagtgat aaggctatag actttattaa agataaatta 1200aattccatct accaagttac agaaattggg aaaaattaca gaatacctct tatgacaatg 1260aattctgcac ttgattatta ttttgcttta acagaagaga atctcccagc aaacattatt 1320caagctcaac gggacttttt tggagctcat acttacgaaa gaattgacag agaagggata 1380tttcatacag agtgggaaag ataa 1404<210>2<211>467<212>PRT<213>腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tangcongensis)<400>2Met Asn Asp Val Gly Leu Ile Gly Leu Ala Val Met Gly Gln Asn Phe1 5 10 15Ala Leu Asn Met Ala Arg Lys Gly Tyr Arg Val Ser Val Tyr Asn Arg
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180 185 190Gln Leu Ile Ala Glu Val Tyr Asp Phe Met Lys Lys Val Leu Asn Met
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450 455 460Trp Glu Arg465
Claims (8)
1.一种分离的DNA分子,其特征在于:它是编码具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶蛋白活性的多肽的核苷酸序列。
2.如权利要求1所述的DNA分子,其特征在于:所说的核苷酸序列编码具有SEQ.ID NO.2中的氨基酸序列的多肽或该多肽的修饰形式,该修饰形式功能上相当或与耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶相关。
3.如权利要求1所述的DNA分子,其特征在于:所说的核苷酸序列具有SEQ ID NO.1的多核苷酸序列以及它的突变形式,突变类型包括:缺失、无义、插入、错义。
4.一种分离出的多肽,其特征在于:它具有耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶活性。
5.如权利要求4所述的多肽,其特征在于:它具有SEQ ID No.2中的氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
6.一种载体,其特征在于:它含有权利要求1中之DNA。
7.一种宿主细胞,其特征在于:它是用权利要求6所述载体转化的原核细胞或真核细胞。
8.一种制备耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的方法,其特征在于该方法包括如下步骤:
1)分离出编码耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的基因核苷酸序列SEQ IDNO.1;
2)构建含SEQ ID NO.1核苷酸序列的表达载体;
3)将步骤2)中表达载体转入宿主细胞,形成能生产耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的重组细胞;
4)培养步骤3)中的重组细胞;
5)分离、纯化得到耐高温6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶。
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