CN117916267A - Bcma定向细胞免疫疗法组合物和方法 - Google Patents
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Abstract
本文在若干个实施方案中提供了抗BCMA结合部分。这些抗BCMA结合部分可以用于BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)。本文还公开了基于免疫细胞的组合物,所述组合物包含抗BCMA结合部分和BCMA定向CAR。在若干个实施方案中,所述基于免疫细胞的组合物还靶向另外的肿瘤标记物和/或BCMA的另外的表位。在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR在自然杀伤细胞中表达。在若干个实施方案中,将表达BCMA‑CAR的NK细胞的组合与例如针对另外的癌症标记物和/或BCMA的另外的表位的表达CAR的NK细胞和/或表达CAR的T细胞联合施用。本文还提供了所述嵌合抗原受体在免疫疗法中的方法和用途。
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技术领域
本文提供的方法和组合物的一些实施方案涉及采用B细胞成熟抗原(BCMA)靶向嵌合抗原受体(CAR)的细胞疗法。一些实施方案涉及一种或多种由NK和/或T细胞表达的此类构建体。本文还公开了结合BCMA的抗原结合分子。
背景技术
随着对各种癌症以及可用于将癌细胞与健康细胞明确区分开来的癌性细胞的特征的进一步了解,正在开发利用癌性细胞的独特特征的治疗剂。采用工程化免疫细胞的免疫疗法是治疗癌症的一种方法。
发明内容
免疫疗法呈现出在疾病治疗中的新的技术进步,其中将免疫细胞工程化以表达特定的靶向分子和/或效应分子,所述靶向分子和/或效应分子特异性地识别患病或受损细胞并且与之反应。这代表了有希望的进展,其至少部分是由于特异性靶向患病或受损细胞的潜力,与更传统的方法(诸如化学疗法,其中所有细胞都受到影响,并且所希望的结局是足够的健康细胞存活以减轻患者的副作用)形成对照。一种免疫治疗方法是在免疫细胞中重组表达嵌合抗原受体(CAR),以实现目的异常细胞(诸如癌症)的靶向识别和破坏。
在某些癌症中,患者对免疫疗法的反应最初是稳健且积极的,但是短暂的。此类概况通过本文提供的细胞免疫疗法组合物的若干个实施方案解决。例如,在若干个实施方案中,将自然杀伤(NK)细胞工程化以表达一种或多种嵌合抗原受体(CAR)。由于工程化NK细胞展现出增强的细胞毒性,结合NK细胞的固有快速免疫应答,若干个实施方案允许可以基本上减少或甚至消除肿瘤负荷的增强的初始抗癌作用。在若干个实施方案中,此类工程化NK细胞是特别重要的,至少部分由于其与T细胞相比免疫原性潜力降低,因为侵袭性癌症可能不允许产生足够的时间用于自体T细胞疗法。
包含重链可变区(VH)的抗BCMA结合部分,所述重链可变区包含HCDR1、HCDR2和HCDR3,其中:所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114、105、107、129、104、106、108-113或115-128中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140、131、133、155、130、132、134-139或141-154中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166、157、159、181、156、158、160-165或167-180中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,抗BMCA结合部分进一步包含轻链可变区(VL),所述轻链可变区包含LCDR1、LCDR2和LCDR3,其中所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395、386、388、410、385、387、389-392或396-409中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ IDNO:421、412、414、436、411、413、415-420或422-435中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447、438、440、462、437、439、441-446或448-446中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,本文提供了包含抗BCMA结合部分的BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)。还提供了经工程化以表达抗BMCA结合部分(任选地以BCMA定向CAR的形式)的免疫细胞群体。在若干个实施方案中,本文提供了治疗癌症(诸如多发性骨髓瘤)的方法,所述方法包括向受试者施用经工程化以表达BMCA定向的免疫细胞(例如,自然杀伤(NK)细胞和/或T细胞)群体。在若干个实施方案中,本文还提供了BCMA定向CAR在制造药剂和/或用于治疗癌症中的用途。
在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的HCDR1包含与SEQ ID NO:114具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,HCDR2包含与SEQ ID NO:140具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且HCDR3包含与SEQ ID NO:166具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,抗BCMA结合部分的HCDR1包含与SEQ ID NO:105具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,HCDR2包含与SEQ ID NO:131具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且HCDR3包含与SEQ ID NO:157具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,抗BCMA结合部分的HCDR1包含与SEQ ID NO:107具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,HCDR2包含与SEQ ID NO:133具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且HCDR3包含与SEQ ID NO:159具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,抗BCMA结合部分的HCDR1包含与SEQ ID NO:129具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,HCDR2包含与SEQ ID NO:155具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且HCDR3包含与SEQ ID NO:181具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的LCDR1包含与SEQ ID NO:395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,LCDR2包含与SEQ ID NO:421具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且LCDR3包含与SEQ ID NO:447具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,抗BCMA结合部分的LCDR1包含与SEQ ID NO:386相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,LCDR2包含与SEQ ID NO:412相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且LCDR3包含与SEQ ID NO:438相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,抗BCMA结合部分的LCDR1包含与SEQ ID NO:388相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,LCDR2包含与SEQ ID NO:414相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且LCDR3包含与SEQ ID NO:440相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,抗BCMA结合部分的LCDR1包含与SEQ ID NO:410相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,LCDR2包含与SEQ ID NO:436相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且LCDR3包含与SEQ ID NO:462相比具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的VH包含与SEQ ID NO:270、261、263、285、260、262、263-269或271-284中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的VL包含与SEQ ID NO:551、542、544、566、541、543、545-550或552-565中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的HCDR1由核酸编码,所述核酸包含与SEQID NO:192、183、185、207、182、184、186-191或192-206中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,抗BCMA结合部分的HCDR2由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:218、209、211、233、208、210、212-217或219-232中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且抗BCMA结合部分的HCDR3由核酸编码,所述核酸包含与SEQID NO:244、235、237、259、234、236、238-243或245-258中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的LCDR1由核酸编码,所述核酸包含与SEQID NO:473、464、466、488、463、465、467-472或474-487中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,抗BCMA结合部分的LCDR2由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:499、490、492、514、489、491、493-498或500-513中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且抗BCMA结合部分的LCDR3由核酸编码,所述核酸包含与SEQ IDNO:525、516、518、540、515、517、519-524或526-539中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的VH由核酸编码,所述核酸包含与SEQ IDNO:296、287、289、311、286、288、290-295或297-310中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的VL由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:577、568、570、592、567、569、571-576或578-591中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,VH和VL(当存在时)通过接头分开。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的接头包含与SEQ ID NO:1388具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述VH在VL的N末端。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:603、594、596、618、593、595、597-602或604-617中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:629、620、622、644、619、621、623-628、630-643或645-670中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,所述VL(当存在时)在VH的N末端。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:681、672、674、696、671、673、675、680或682-695中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:707、698、700、722、697、699、701-706、708-721或723-748中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分的接头包含与SEQ ID NO:2260具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1483、1474、1476、1498、1473、1475、1477-1482或1484-1497中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1509、1500、1502、1524、1499、1501、1503-1508或1510-1523中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
本文还提供了包含本文所述抗BCMA结合部分的BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)。本文还提供了包含本文所述抗BCMA结合部分的免疫细胞。在若干个实施方案中,免疫细胞是自然杀伤(NK)细胞或T细胞。
在若干个实施方案中,所述CAR进一步包含铰链结构域;跨膜结构域;和包含CD3ζ亚结构域的胞内信号传导结构域。在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR的胞内信号传导结构域进一步包含OX40亚结构域。在若干个实施方案中,所述OX40亚结构域包含与SEQ IDNO:1394具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述CD3ζ亚结构域包含与SEQ ID NO:1395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述跨膜结构域是CD8跨膜结构域。在若干个实施方案中,CD8跨膜结构域包含与SEQ ID NO:1392具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述铰链结构域是CD8铰链结构域。在若干个实施方案中,所述CD8铰链结构域包含与SEQ ID NO:1389具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,可以使用CD28衍生的铰链、跨膜和/或胞内结构域代替一个或多个CD8结构域。
在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:3897、3888、3890、3912、3887、3889、3891-3896或3898-3911中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3923、3914、3916、3938、3913、3915、3917-3922、3924-3937或3939-3964中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述编码BCMA定向CAR的核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:4001、3992、3994、4016、3991、3993、3995-4000、4002-4015或4017-4042中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4053、4044、4046、4068、4043、4045、4047-4052或4054-4067中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4079、4070、4072、4094、4069、4071、4073-4078、4080-4093或4095-4120中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述编码BCMA定向CAR的核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:4157、4148、4150、4172、4147、4149、4151-4156、4158-4171或4173-4198中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:3869、3867、3868或3870中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQID NO:3885、3883、3884或3886中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干实施方案中,编码BCMA定向CAR的核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:3837、3835、3836或3839中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
本文还提供了VHH-BCMA定向嵌合抗原受体(CAR),所述CAR包含胞外抗BCMA结合部分,其中所述抗BCMA结合部分包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH),其中:所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104-129、1525-1543或3117-3139中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:130-155、1544-1562或3140-3162中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且所述HCDR3包含与SEQID NO:156-181、1563-1581或3163-3185中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;铰链结构域;跨膜结构域;和胞内信号传导结构域。
在若干实施方案中,所述抗BCMA结合部分进一步包含另外的VH,所述另外的VH包含另外的HCDR1、HCDR2和HCDR3,其中所述另外的HCDR1包含与SEQ ID NO:3117-3139中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述另外的HCDR2包含与SEQ ID NO:3140-3162中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且所述另外的HCDR3包含与SEQ ID NO:3163-3185中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,其他序列用于另外的HCDR1、HCDR2和/或HCDR3。
在若干个实施方案中,所述胞内信号传导结构域包含共刺激亚结构域和CD3ζ亚结构域。
本文还提供了经工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)的工程化免疫细胞群体,所述CAR包含胞外抗BCMA结合部分,所述胞外抗BCMA结合部分包含重链可变区(VH),所述重链可变区(VH)包含HCDR1、HCDR2和HCDR3,其中所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104-129、1525-1543或3117-3139中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述HCDR2包含与SEQ ID NO:130-155、1544-1562或3140-3162中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述HCDR3包含与SEQ ID NO:156-181、1563-1581或3163-3185中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;以及铰链结构域,跨膜结构域;和胞内信号传导结构域。在若干个实施方案中,由免疫细胞表达的CAR进一步包含含有另外的HCDR1、HCDR2和HCDR3的另外的VH,其中所述另外的HCDR1包含与SEQ ID NO:3117-3139中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述另外的HCDR2包含与SEQ ID NO:3140-3162中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且所述另外的HCDR3包含与SEQ ID NO:3163-3185中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。取决于实施方案,其他序列可以用于另外的HCDR1、HCDR2和/或HCDR3。在若干个实施方案中,所述HCDR1由与SEQ ID NO:182-207或3186-3208中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的核酸序列编码,所述HCDR2由与SEQ ID NO:208-233或3209-3231中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的核酸序列编码,并且所述HCDR3由与SEQ ID NO:234-259或3232-3254中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的核酸序列编码。
在若干个实施方案中,所述CAR进一步包含轻链可变区(VL),所述轻链可变区(VL)包含LCDR1、LCDR2和LCDR3,其中所述LCDR1包含与SEQ ID NO:3117-3139中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:3140-3162中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且所述LCDR3包含与SEQ IDNO:3163-3185中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
本文还提供了经工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)的免疫细胞群体,所述CAR包含抗BCMA结合部分,所述抗BCMA结合部分包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH),以及含有LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链可变区(VL),其中:所述HCDR1包含与SEQID NO:114、105、107、129、104、106、108-113或115-128中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQID NO:140、131、133、155、130、132、134-139或141-154中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3与SEQ IDNO:166、157、159、181、156、158、160-165或167-180中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQID NO:395、386、388、410、385、387、389-392或396-409中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQID NO:421、412、414、436、411、413、415-420或422-435中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR3包含与SEQID NO:447、438、440、462、437、439、441-446或448-446中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在若干个实施方案中,提供了治疗癌症的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用包含BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)的免疫细胞群体,所述CAR包含含有HCDR1、HCDR2、和HCDR3的重链可变区(VH),以及含有LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链可变区(VL),所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114、105、107、129、104、106、108-113或115-128中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140、131、133、155、130、132、134-139或141-154中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3与SEQ ID NO:166、157、159、181、156、158、160-165或167-180中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395、386、388、410、385、387、389-392或396-409中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:421、412、414、436、411、413、415-420或422-435中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447、438、440、462、437、439、441-446或448-446中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,以及铰链结构域、跨膜结构域和包含CD3ζ亚结构域的胞内信号传导结构域。在若干个实施方案中,所述VH包含与SEQ ID NO:270、261、263、285、260、262、263-269或271-284中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述VL包含与SEQ ID NO:551、542、544、566、541、543、545-550或552-565中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:3897、3888、3890、3912、3887、3889、3891-3896或3898-3911中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4053、4044、4046、4068、4043、4045、4047-4052或4054-4067中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:3869、3867、3868或3870中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在若干个实施方案中,所述方法(和免疫细胞群体的用途)用于治疗癌症,诸如多发性骨髓瘤。
本文公开了抗BCMA结合部分,所述抗BCMA结合部分包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH)和含有LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链可变区(VL)。在抗BCMA结合部分的一些实施方案中,所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104-129中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQID NO:130-155中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:156-181中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在抗BCMA结合部分的一些实施方案中,所述LCDR1包含与SEQ ID NO:385-410中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:411-436中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQID NO:437-462中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述VH包含与SEQ ID NO:260-285中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述VL包含与SEQ ID NO:541-566中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
本文还公开了BCMA定向嵌合抗原受体,所述嵌合抗原受体包含胞外抗BCMA结合部分、铰链结构域、跨膜结构域和包含OX40亚结构域和CD3ζ亚结构域的胞内信号传导结构域。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分是本文公开的抗BCMA结合部分中的任一种。在一些实施方案中,所述OX40亚结构域包含与SEQ ID NO:1394具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD3ζ亚结构域包含与SEQ ID NO:1395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述跨膜结构域是CD8跨膜结构域。在一些实施方案中,所述铰链结构域是CD8铰链结构域、IgG4铰链结构域或RQRCD8铰链结构域。
本文还公开了BCMA定向CAR构建体,所述CAR构建体包含BCMA定向CAR和膜结合IL15(mbIL15)。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR是本文公开的BCMA定向CAR中的任一种。在一些实施方案中,所述mbIL15包含与SEQ ID NO:1398具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
本文还公开了免疫细胞或免疫细胞群体,所述免疫细胞或免疫细胞群体包含本文公开的抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR或BCMA定向CAR构建体中的任一种。在一些实施方案中,所述免疫细胞是NK细胞和/或T细胞。
本文还公开了治疗有需要的受试者的癌症的方法。在一些实施方案中,所述方法包括向受试者施用本文公开的抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR、BCMA定向CAR构建体或工程化免疫细胞中的任一种。本文还公开了用于治疗癌症的本文公开的抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR、BCMA定向CAR构建体或工程化免疫细胞中的任一种。本文还公开了用于制造药剂的本文公开的抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR、BCMA定向CAR构建体或工程化免疫细胞中的任一种。
附图说明
图1A-图1D描绘了用于例如靶向BCMA的CAR构建体的非限制性实施方案的集合。所描绘的构建体包括通过自切割肽(例如,T2A)与CAR本身分离的膜结合IL15构建体。然而,本文还提供了不包括IL15构建体(和分离自切割肽)的CAR。“CD8 SP”:CD8信号肽;“GS接头”:包含甘氨酸和丝氨酸的接头;“VH”:重链可变区;“VL”:轻链可变区;“CD8 TM”:CD8跨膜结构域;“CD8 IC”:CD8胞内结构域;“OX40”:OX40胞内结构域;“CD3ζ”:CD3ζ结构域。图1A示出了VH-VL形式。图1B示出了VL-VH形式。图1C示出了具有较短铰链的VH-VL形式(IgG4)。图1D示出了具有较长铰链的VH-VL形式(RQRCD8)。应当理解,这些代表核苷酸序列,并且编码的CAR构建体将不包含T2A,并且mbIL15如果被编码,则将在细胞上单独表达。
图2描绘了重链可变区(VH)互补决定区(CDR)1、2和3(HCDR1、HCDR2和HCDR3)序列的非限制性组合。抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR和其表达细胞的实施方案可以使用本文所描绘的任何非限制性组合。
图3描绘了轻链可变区(VL)CDR1、2和3(LCDR1、LCDR2和LCDR3)序列的非限制性组合。抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR和其表达细胞的实施方案可以使用本文所描绘的任何非限制性组合。
图4描绘了VH和VL序列的非限制性组合。抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR和其表达细胞的实施方案可以使用本文所描绘的任何非限制性组合。
图5A-图5D示出了本文提供用于例如靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图5A示出了VH-GS接头-VL scFv及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、OX-40共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图5B示出了编码的氨基酸。图5C和图5D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图6A-图6D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图6A示出了VH-Whitlow接头-VL scFv、AAA间隔子及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、OX-40共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图6B示出了编码的氨基酸。图6C和图6D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图7A-图7D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图7A示出了VL-Whitlow接头-VH scFv、AAA间隔子及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、OX-40共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图7B示出了编码的氨基酸。图7C和图7D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图8A-图8D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图8A示出了骆驼科VHH结构域及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、OX-40共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图8B示出了编码的氨基酸。图8C和图8D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图9A-图9D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图9A示出了骆驼科VHH结构域-GS接头-VHH结构域及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、OX-40共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。所述VHH结构域可以是相同或不同的结构域。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图9B示出了编码的氨基酸。图9C和图9D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图10A-图10D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图10A示出了VL-Whitlow接头-VH scFv、AAA间隔子及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、OX-40共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图10B示出了编码的氨基酸。图10C和图10D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图11A-图11D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图11A示出了VL-Whitlow-VH、AAA间隔子及CD28铰链、CD28跨膜结构域、CD28胞内结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图11B示出了编码的氨基酸。图11C和图11D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图12A-图12D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图12A示出了VH-GS接头-VL scFv、AAA间隔子及CD28铰链、CD28跨膜结构域、CD28胞内结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图12B示出了编码的氨基酸。图12C和图12D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图13A-图13D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图13A示出了VH-GS接头-VL scFv、AAA间隔子及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、4-1BB共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图13B示出了编码的氨基酸。图13C和图13D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图14A-图14D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图14A示出了VL-Whitlow-VH scFv、AAA间隔子及CD28铰链、CD28跨膜结构域、CD28胞内结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图14B示出了编码的氨基酸。图14C和图14D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图15A-图15D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图15A示出了VL-Whitlow-VH scFv、AAA间隔子及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、4-1BB共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图15B示出了编码的氨基酸。图15C和图15D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图16A-图16D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图16A示出了VH-GS接头-VL scFv,AAA间隔子及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、4-1BB共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图16B示出了编码的氨基酸。图16C和图16D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图17A-图17D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图17A示出了VL-Whitlow接头-VH scFv、(AAA)2间隔子及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、4-1BB共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图17B示出了编码的氨基酸。图17C和图17D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图18A-图18D示出了本文提供例如用于靶向BCMA的CAR构建体的各种非限制性实施方案的示意图。图18A示出了具有VHH-GS接头-VHH结构的多结构域骆驼科BCMA结合剂、AAA间隔子及CD8α铰链、CD8α跨膜结构域、CD8α胞内结构域、4-1BB共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的非限制性示意图。尽管未在本文提供的所有实施方案中使用,但示意图中还包括T2A自切割肽,随后是编码mbIL15的另外的核苷酸。图18B示出了编码的氨基酸。图18C和图18D示出了没有FLAG标签-接头复合物的对应构建体的示意图。
图19示出了描绘了Jurkat细胞中CAR形式的各种非限制性例子的表达的点图。
图20描绘了与BMCA定向CAR的非限制性实施方案的功能相关的数据。该图示出了当将靶MM.1S细胞与经工程化以表达如本文提供的BCMA定向CAR的Jurkat细胞共培养时,与评估强直激活(Y轴)与BCMA结合诱导激活(X轴)的关系相关的数据。使用的效应子与靶标(E:T)细胞比率是1:1(Jurkat:MM.1S)。
图21示出了与如本文所提供的CAR的各种非限制性实施方案的BCMA诱导激活与强直激活的比率相关的数据。
图22示出了与CAR的各种克隆的表达(左图)相关的另外的数据,每个单独的克隆在序列上不同,但共享共同的CAR结构。图22的右图示出了每个克隆的BCMA结合。
图23A-图23B示出了活性与CAR表达的关系的散点图。图23A示出了BCMA结合诱导CAR激活与CAR表达的关系的散点图。图23B示出了强直信号传导与CAR表达的关系的散点图。
图24示出了BCMA结合与CAR表达的关系的散点图。
图25示出了本文提供的各种CAR构建体的激活/强直信号传导比率与CAR表达的关系的散点图。
图26A-图26F示出了与本文提供的CAR的功能(基于其结构的一个方面,接头)相关的数据。图26A示出了与使用Whitlow接头与GS接头的CAR的激活/强直信号传导比率相关的数据。图26B示出了使用Whitlow接头与GS接头的CAR的表达数据。图26C示出了与使用采用VH-VL形式与VL-VH形式的scFv的本文提供的CAR的激活/强直信号传导比率相关的数据。图26D示出了与使用采用VH-VL形式与VL-VH形式的scFv的本文提供的CAR的表达相关的数据。图26E示出了与本文提供的使用CD28结构域(铰链、跨膜和胞内)的CAR与使用具有OX-40共刺激结构域的CD8结构域的CAR的激活/强直信号传导比率相关的数据。
图27示出了与使用一个或多个骆驼科VHH结构域的单价或二价CAR的表达和BCMA结合功能相关的汇总数据。
图28A-图28B示出了使用一个或多个骆驼科VHH结构域的单价和二价CAR的表达和BCMA结合功能的数据。图28A示出了使用一个或多个骆驼科VHH结构域的二价(Y轴)与单价CAR的表达数据。图28B示出了二价(Y轴)与单价VHH-CAR的BCMA结合数据。
图29A-图29D示出了表达采用一个或多个VHH结构域的CAR的细胞的各种特征的评估。图29A示出了包含一个或多个VHH结构域的二价(Y轴)与单价(X轴)CAR的强直信号传导活性的散点图。图29B示出了二价(Y轴)与单价(X轴)VHH-CAR的激活/强直信号传导比率的散点图。图29C是示出了所选二价(实心条)和单价(空心条)VHH-CAR的激活/强直信号传导比率的直方图。图29D示出了与从所选二价(实心条)和单价(空心条)VHH-CAR检测到的强直信号传导相关的数据。
图30A-图30B示出了比较不同CAR构建体的数据。图30A示出了使用scFv(圆形)与VHH-CAR(三角形)和相应对照(scFv是正方形,VHH是X形)的CAR的强直信号传导与CAR表达的关系的散点图。
具体实施方式
本文提供的方法和组合物的一些实施方案涉及抗BCMA结合部分。本文还公开了BCMA定向嵌合抗原受体(CAR),其包含本文公开的任何抗BCMA结合部分。在一些实施方案中,所述CAR在如本文所述的细胞上表达。一些实施方案包括在免疫疗法中使用组合物或细胞的方法。一些实施方案涉及在自然杀伤(NK)细胞上表达的抗BCMA CAR的用途。
术语“抗癌作用”是指可以通过各种方式表现的生物学作用,包括但不限于肿瘤体积减少、癌细胞数量减少、转移瘤数量减少、预期寿命增加、癌细胞增殖减少、癌细胞存活降低、或与癌性病症相关的各种生理症状的改善。“抗癌作用”也可以通过CAR首先预防癌症发生的能力来表现。
细胞类型
本文提供的方法和组合物的一些实施方案涉及细胞,诸如免疫细胞。例如,可以将免疫细胞工程化以包含嵌合抗原受体(诸如BCMA定向CAR),或工程化以包含编码如本文所述的CAR的核酸。
传统的抗癌疗法依赖于手术方法、放射疗法、化学疗法或这些方法的组合。随着研究使人们对某些癌症的一些机制有了更深入的了解,这种知识被用来开发靶向癌症疗法。靶向疗法是一种癌症治疗方法,其使用靶向在癌细胞或支持癌症生长的细胞(如血管细胞)中发现的特定基因或蛋白质以减少或阻止癌细胞生长的某些药物。最近,基因工程化使得能够开发这样的方法,其利用免疫系统的某些方面来对抗癌症。在一些情况下,患者自身的免疫细胞被修饰以特异性地根除该患者的癌症类型。可以使用各种类型的免疫细胞,诸如T细胞和/或自然杀伤细胞(NK细胞),如本文更详细地描述。
为了促进癌症免疫疗法,本文提供了编码嵌合抗原受体(CAR)的多核苷酸、多肽和载体,所述嵌合抗原受体包含靶标结合部分(例如,由癌细胞表达的配体的胞外结合剂,诸如BCMA定向嵌合抗原受体)和细胞毒性信号传导复合物。一些实施方案包括编码BCMA定向嵌合抗原受体的多核苷酸、多肽或载体,以促进免疫细胞靶向癌症并且对癌细胞发挥细胞毒性作用。还提供了表达此类CAR的工程化免疫细胞(例如,T细胞和/或NK细胞)。在若干个实施方案中,本文还提供了编码构建体的多核苷酸、多肽和载体,所述构建体包含含有两个或更多个亚结构域的胞外结构域和细胞毒性信号传导复合物。还提供了表达此类双特异性构建体的工程化免疫细胞(例如,T细胞和/或NK细胞)。本文还提供了治疗癌症的方法和此类细胞用于癌症免疫疗法的其他用途。
用于免疫疗法的工程化细胞
在若干个实施方案中,将免疫系统的细胞工程化以对靶细胞(诸如肿瘤细胞)具有增强的细胞毒性作用。例如,可以将免疫系统的细胞工程化以包含如本文所述的BCMA定向嵌合抗原受体。在若干个实施方案中,使用白血细胞或白细胞,因为它们的天然功能是保护身体免受异常细胞的生长和感染性疾病的影响。存在多种类型的白血细胞,其在人免疫系统中起特定作用,因此是本文公开的细胞工程化的优选起点。白血细胞包括粒细胞和无粒白细胞(分别在细胞质中存在或不存在颗粒)。粒细胞包括嗜碱性粒细胞、嗜酸性粒细胞、中性粒细胞和肥大细胞。无粒白细胞包括淋巴细胞和单核细胞。可以将细胞(诸如下面或本文以其他方式描述的细胞)工程化以包含嵌合抗原受体,诸如BCMA定向嵌合抗原受体,或编码此类嵌合抗原受体的核酸,和/或工程化以共表达膜结合白介素15(mbIL15)共刺激结构域。
用于免疫疗法的单核细胞
单核细胞是白细胞的亚型。单核细胞可以分化为巨噬细胞和髓系树突状细胞。单核细胞与适应性免疫系统相关且发挥吞噬、抗原呈递和细胞因子产生的主要功能。吞噬是摄取细胞物质或整个细胞,之后是消化和破坏所吞没的细胞物质的过程。在若干个实施方案中,将单核细胞与如本文公开的一种或多种另外的工程化细胞结合使用。本文所述的方法和组合物的一些实施方案涉及包含BCMA定向嵌合抗原受体或编码BCMA定向嵌合抗原受体的核酸的单核细胞。本文公开的方法和组合物的若干个实施方案涉及工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体和膜结合白介素15(mbIL15)共刺激结构域的单核细胞。
用于免疫疗法的淋巴细胞
淋巴细胞(白细胞的另一种主要亚型)包括T细胞(细胞介导的细胞毒性适应性免疫)、自然杀伤细胞(细胞介导的细胞毒性先天免疫)和B细胞(体液、抗体驱动的适应性免疫)。虽然根据本文公开的若干个实施方案将B细胞工程化,但若干个实施方案还涉及工程化T细胞或工程化NK细胞(在一些实施方案中,使用T细胞和NK细胞的混合物)。本文所述的方法和组合物的一些实施方案涉及包括BCMA定向嵌合抗原受体或编码BCMA定向嵌合抗原受体的核酸的淋巴细胞。本文公开的方法和组合物的若干个实施方案涉及工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体和膜结合白介素15(mbIL15)共刺激结构域的淋巴细胞。
用于免疫疗法的T细胞
基于细胞表面上T细胞受体的存在,T细胞可与其他淋巴细胞亚型(例如,B细胞或NK细胞)区分开。T细胞可以分为各种不同的亚型,包括效应T细胞、辅助性T细胞、细胞毒性T细胞、记忆T细胞、调节性T细胞、自然杀伤T细胞、粘膜相关恒定T细胞和γδT细胞。在一些实施方案中,将T细胞的特定亚型工程化。在一些实施方案中,将T细胞亚型的混合池工程化。在一些实施方案中,不存在待工程化以表达本文公开的细胞毒性受体复合物的T细胞类型的特定选择。在若干个实施方案中,使用特定技术(诸如使用细胞因子刺激)来增强具有特定标记物特征的T细胞的扩增/收集。例如,在若干个实施方案中,通过使用CD3和/或CD28作为刺激分子来实现某些人T细胞(例如,CD4+T细胞、CD8+T细胞)的激活。在若干个实施方案中,提供了治疗或预防癌症或感染性疾病的方法,所述方法包括施用治疗有效量的表达如本文所述的细胞毒性受体复合物和/或归巢部分的T细胞。在若干个实施方案中,所述工程化T细胞是自体细胞,而在一些实施方案中,所述T细胞是同种异体细胞。本文所述的方法和组合物的一些实施方案涉及包含BCMA定向嵌合抗原受体或编码BCMA定向嵌合抗原受体的核酸的T细胞。本文公开的方法和组合物的若干个实施方案涉及工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体和膜结合白介素15(mbIL15)共刺激结构域的T细胞。
用于免疫疗法的NK细胞
在若干个实施方案中,提供了治疗或预防癌症或感染性疾病的方法,所述方法包括施用治疗有效量的表达如本文所述的细胞毒性受体复合物和/或归巢部分的自然杀伤(NK)细胞。在若干个实施方案中,所述工程化NK细胞是自体细胞,而在一些实施方案中,所述NK细胞是同种异体细胞。在若干个实施方案中,NK细胞是优选的,因为NK细胞的天然细胞毒性潜力相对高。在若干个实施方案中,出乎意料地有益的是,本文公开的工程化细胞可以进一步上调NK细胞的细胞毒性活性,从而导致甚至更有效的针对靶细胞(例如,肿瘤或其他患病细胞)的活性。在若干个实施方案中,利用NK细胞的高度急性细胞毒性(其通过本文公开的工程方法进一步增强)来提供特别有效的细胞疗法组合物。本文所述的方法和组合物的一些实施方案涉及包含BCMA定向嵌合抗原受体或编码BCMA定向嵌合抗原受体的核酸的NK细胞。本文公开的方法和组合物的若干个实施方案涉及工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体和膜结合白介素15(mbIL15)共刺激结构域的NK细胞。在一些实施方案中,所述NK细胞衍生自细胞系NK-92。NK-92细胞衍生自NK细胞,但缺乏由正常NK细胞展示的主要抑制性受体,同时保留了大部分的激活性受体。本文所述的NK-92细胞的一些实施方案涉及如下NK-92细胞,其经工程化以使某些另外的抑制性受体(例如,SMAD3)沉默,从而允许上调干扰素-γ(IFNγ)、颗粒酶B和/或穿孔素产生。与NK-92细胞系有关的另外的信息披露于WO 1998/49268和美国专利申请公开号2002-0068044中,并且通过引用以其整体并入本文。在若干个实施方案中,将NK-92细胞与本文公开的一种或多种其他细胞类型组合使用。例如,在一个实施方案中,将NK-92细胞与如本文所公开的NK细胞组合使用。在另外的实施方案中,将NK-92细胞与如本文所公开的T细胞组合使用。
用于癌症免疫疗法的造血干细胞
在一些实施方案中,造血干细胞(HSC)用于本文公开的免疫疗法的方法中。在若干个实施方案中,将细胞工程化以表达归巢部分和/或细胞毒性受体复合物。在若干实施方案中,使用HSC以利用其植入以便长期产生血细胞的能力,这可以导致靶向的抗癌效应细胞的持续来源,例如以对抗癌症缓解。在若干个实施方案中,这种持续进行的产生有助于抵消例如由于肿瘤微环境引起的其他细胞类型的无反应性或耗竭。在若干个实施方案中,使用同种异体HSC,而在一些实施方案中,使用自体HSC。在若干个实施方案中,将HSC与本文公开的一种或多种另外的工程化细胞类型组合使用。本文所述的方法和组合物的一些实施方案涉及包含BCMA定向嵌合抗原受体或编码BCMA定向嵌合抗原受体的核酸的干细胞,诸如造血干细胞)。本文公开的方法和组合物的若干个实施方案涉及经工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体和膜结合白介素15(mbIL15)共刺激结构域的干细胞,诸如造血干细胞。
用于癌症免疫疗法的诱导多能干细胞
在一些实施方案中,诱导多能干细胞(iPSC)用于本文公开的免疫疗法的方法中。在若干个实施方案中,使用iPSC以利用其分化和衍生为非多能细胞的能力,所述非多能细胞包括但不限于通过分化iPSC在选择的位点处包含一个或若干个基因修饰的CD34细胞、造血内皮细胞、HSC(造血干细胞和祖细胞)、造血多能祖细胞、T细胞祖细胞、NK细胞祖细胞、T细胞、NKT细胞、NK细胞和B细胞或者在相同的选择的位点处包含相同基因修饰的较少分化的细胞。在若干个实施方案中,使用iPSC以产生iPSC衍生的NK或T细胞。在若干个实施方案中,将细胞工程化以表达归巢部分和/或细胞毒性受体复合物。在若干个实施方案中,将iPSC与本文公开的一种或多种另外的工程化细胞类型组合使用。本文所述的方法和组合物的一些实施方案涉及干细胞,诸如经工程化以表达靶向肿瘤标记物(例如,CD19、CD123、CD70、Her2、间皮素、密封蛋白6、BCMA、EGFR以及本文公开的任何其他肿瘤标记物)的CAR以及任选的膜结合白介素15(mbIL15)共刺激结构域的诱导多能干细胞。本文公开的方法和组合物的若干个实施方案涉及经工程化以表达靶向肿瘤细胞上的配体(例如MICA、MICB、ULBP1、ULBP2、ULBP3、ULBP4、ULBP5和ULBP6(等))的激活性嵌合受体以及任选的膜结合白介素15(mbIL15)共刺激结构域的诱导多能干细胞。
免疫细胞的基因工程化
如上所讨论,多种细胞类型可以用于细胞免疫疗法。此外,如下面更详细地阐述以及在实施例中所示,可以对这些细胞进行基因修饰以增强它们的功效(例如,细胞毒性)和/或持久性(例如,活性寿命)的一个或多个方面。如本文所讨论的,在若干个实施方案中,NK细胞用于免疫疗法。在本文提供的若干个实施方案中,对NK细胞的基因编辑可以有利地赋予所编辑的NK细胞抵抗和/或克服在肿瘤微环境中产生的各种抑制信号的能力。已知肿瘤产生多种信号传导分子,其旨在降低免疫细胞的抗肿瘤作用。如下面更详细地讨论的,在若干个实施方案中,对NK细胞的基因编辑限制了肿瘤微环境对NK细胞、T细胞、NK和T细胞的组合或本文提供的任何编辑/工程化的免疫细胞的这种抑制作用。如下所讨论,在若干个实施方案中,使用基因编辑例如通过破坏编码所述蛋白质的潜在基因来降低或敲除靶蛋白的表达。在若干个实施方案中,基因编辑可以使靶蛋白的表达降低约30%、约40%、约50%、约60%、约70%、约75%、约80%、约85%、约90%、约95%、约97%、约98%、约99%或更多(包括所列那些值之间的任何量)。在若干个实施方案中,所述基因被完全敲除,使得靶蛋白的表达是不可检测的。在若干个实施方案中,基因编辑用于“敲入”或以其他方式增强靶蛋白的表达。在若干个实施方案中,靶蛋白的表达可以增强约30%、约40%、约50%、约60%、约70%、约75%、约80%、约85%、约90%、约95%、约97%、约98%、约99%或更多(包括所列那些值之间的任何量)。
作为非限制性例子,TGF-β是由肿瘤细胞释放的一种这样的细胞因子,其导致肿瘤微环境内的免疫抑制。这种免疫抑制降低了免疫细胞、甚至在一些情况下工程化CAR免疫细胞破坏肿瘤细胞的能力,从而允许肿瘤进展。在若干个实施方案中,如下面详细讨论的,通过基因编辑破坏免疫检查点抑制剂。在若干个实施方案中,使用肿瘤微环境中的免疫抑制细胞因子的阻断剂,包括其释放的阻断剂或降低信号传导分子结合和抑制免疫细胞的能力的竞争性抑制剂。这些信号传导分子包括但不限于TGF-β、IL10、精氨酸酶、诱导型NOS、反应性NOS、Arg1、吲哚胺2,3-双加氧酶(IDO)和PGE2。然而,在另外的实施方案中,提供了免疫细胞(诸如NK细胞),其中破坏和/或消除了NK细胞(或其他细胞)对给定的免疫抑制信号传导分子作出反应的能力。例如,在若干个实施方案中,对NK细胞或T细胞进行基因编辑以具有对TGF-β的降低的敏感性。TGF-β至少在增殖和细胞毒性水平上是NK细胞功能的抑制剂。因此,根据一些实施方案,通过基因编辑敲低或敲除TGF-β受体的表达,使得所编辑的NK对肿瘤微环境中的TGF-β的免疫抑制作用具有抗性。在若干个实施方案中,通过基因编辑,例如通过使用CRISPR-Cas编辑敲低或敲除TGFB2受体。在其他实施方案中使用小干扰RNA、反义RNA、TALEN或锌指。在一些实施方案中,编辑TGF-β受体的其他亚型(例如,TGF-β1和/或TGF-β3)。在一些实施方案中,通过基因编辑敲低T细胞中的TGF-β受体。
根据另外的实施方案,通过基因编辑调节NK细胞(或T细胞)功能的一个或多个方面的其他调节剂。多种细胞因子赋予免疫细胞阴性信号(如上述TGF-β)或阳性信号。作为非限制性例子,IL15是NK细胞的正调节剂,如本文所公开的,其可以增强NK细胞归巢、NK细胞迁移、NK细胞扩增/增殖、NK细胞毒性和/或NK细胞持久性中的一种或多种。为了在正常生理情况下保持NK细胞受控制,细胞因子诱导型含SH2的蛋白质(CIS,由CISH基因编码)充当NK细胞中IL-15信号传导的关键负调节剂。如本文所讨论的,因为IL15生物学影响NK细胞功能的多个方面,包括但不限于增殖/扩增、激活、细胞毒性、持久性、归巢、迁移等等。因此,根据若干个实施方案,编辑CISH增强了跨多个功能的NK细胞的功能,从而导致更有效和持久的NK细胞治疗剂。在若干个实施方案中,将CIS的抑制剂与工程化NK细胞施用结合使用。在若干个实施方案中,通过对CISH基因的基因编辑,例如通过使用CRISPR-Cas编辑,敲低或敲除CIS表达。在其他实施方案中使用小干扰RNA、反义RNA、TALEN或锌指。在一些实施方案中,通过基因编辑降低T细胞中的CIS表达。
在若干个实施方案中,CISH基因编辑赋予NK细胞增强的归巢至靶位点的能力。在若干个实施方案中,CISH基因编辑赋予NK细胞增强的迁移能力,例如响应于例如化学引诱剂而在组织内迁移或远离拒斥剂而迁移的能力。在若干个实施方案中,CISH基因编辑赋予NK细胞增强的激活能力,从而发挥例如抗肿瘤作用。在若干个实施方案中,CISH基因编辑赋予NK细胞增强的增殖能力,在若干个实施方案中,这允许从供体血液样品产生稳健的NK细胞数量。此外,在此类实施方案中,针对CISH编辑并经工程化以表达CAR的NK细胞在培养物中更容易、更稳健且更一致地扩增。在若干个实施方案中,CISH基因编辑赋予NK细胞增强的细胞毒性。在若干个实施方案中,CISH的编辑协同地增强表达CAR的工程化NK细胞和/或工程化T细胞的细胞毒性作用。
在若干个实施方案中,CISH基因编辑激活或抑制多种多样的途径。CIS蛋白是IL15信号传导的负调节剂,例如通过抑制JAK-STAT信号传导途径。这些途径典型地将导致IL15应答基因(包括CISH)的转录。在若干个实施方案中,CISH的敲低对JAK-STAT(例如,JAK1-STAT5)信号传导具有反抑制作用,并且IL15应答基因的转录增强。在若干个实施方案中,CISH的敲除产生增强的通过哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)的信号传导,以及与细胞代谢和呼吸相关的基因的表达的相应增加。在若干个实施方案中,CISH的敲除产生IL15诱导的增加的IL-2Rα(CD25)表达(而非增加的IL-15Rα或IL-2/15Rβ的表达)、增强的IL15和/或IL2的NK细胞膜结合、增加的STAT-3和/或STAT-5的磷酸化以及增加的抗凋亡蛋白(诸如Bcl-2)的表达。在若干个实施方案中,CISH的敲除导致与线粒体功能(例如,电子传递链和细胞呼吸)和细胞周期相关的所选择的基因的IL15诱导的上调。因此,在若干个实施方案中,通过基因编辑敲除CISH至少部分地经由代谢重编程增强NK细胞的细胞毒性和/或持久性。在若干个实施方案中,细胞代谢的负调节剂(诸如TXNIP)响应于CISH敲除而被下调。在若干个实施方案中,CISH敲除后,包括BIRC5(存活素)、TOP2A、CKS2和RACGAP1的细胞存活和增殖的启动子被上调,而抗增殖或促凋亡蛋白(诸如TGFB1、ATM和PTCH1)被下调。在若干个实施方案中,CISH敲除改变经由或通过CXCL-10、IL2、TNF、IFNg、IL13、IL4、Jnk、PRF1、STAT5、PRKCQ、IL2受体β、SOCS2、MYD88、STAT3、STAT1、TBX21、LCK、JAK3、IL&受体、ABL1、IL9、STAT5A、STAT5B、Tcf7、PRDM1和/或EOMES的信号传导状态(例如,激活或失活)。
在若干个实施方案中,对免疫细胞的基因编辑还可以提供所编辑的免疫细胞的扩增、持久性和/或细胞毒性的出乎意料的增强。如本文所公开的,也可以编辑工程化细胞(例如,表达CAR的那些),其组合提供用于免疫疗法的稳健细胞。在若干个实施方案中,所述编辑允许出乎意料地改善NK细胞扩增、持久性和/或细胞毒性。在若干个实施方案中,NK细胞中CISH表达的敲除去除了NK细胞中IL15介导的信号传导的有效负调节剂,对NK细胞具有反抑制作用并允许增强NK细胞归巢、NK细胞迁移、NK细胞的激活、扩增、细胞毒性和/或持久性中的一种或多种。另外,在若干个实施方案中,所述编辑可以增强在原本抑制性肿瘤微环境中的NK和/或T细胞功能。在若干个实施方案中,CISH基因编辑在无需外源性地提供Notch配体的情况下导致增强的NK细胞扩增、持久性和/或细胞毒性。另外的
在若干个实施方案中,基因编辑通过多种工程化核酸酶中的一种或多种来完成。在若干个实施方案中,使用限制酶,特别是当在多个区域希望双链断裂时。在若干个实施方案中,使用生物工程化核酸酶。取决于实施方案,使用锌指核酸酶(ZFN)、转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN)、兆核酸酶和/或规律间隔成簇短回文重复序列(CRISPR/Cas9)系统中的一种或多种特异性地编辑编码一种或多种TCR亚基的基因。
兆核酸酶的特征在于其识别和切割大DNA序列(14至40个碱基对)的能力。在若干个实施方案中,使用来自LAGLIDADG家族的兆核酸酶,并且使其经受诱变和筛选以产生识别一个或多个独特序列(诸如TCR或CISH或本文公开的任何其他靶基因中的特定位点)的兆核酸酶变体。可以容易地识别TCR中的靶位点。TCR区域内的靶位点的进一步信息可以在美国专利公开号2018/0325955和美国专利公开号2015/0017136中找到,将所述专利各自通过引用以其整体并入本文。在若干个实施方案中,融合两种或更多种兆核酸酶或其功能片段以产生杂交酶,所述杂交酶识别所述靶基因(例如,CISH)内的所希望的靶序列。
与兆核酸酶相反,ZFN和TALEN基于非特异性DNA切割催化结构域而起作用,所述非特异性DNA切割催化结构域与识别肽(诸如锌指或转录激活因子样效应物(TALE))的特异性DNA序列连接。有利地,ZFN和TALEN因此允许序列非依赖性DNA切割,并且在靶标识别中具有高度的序列特异性。锌指基序在转录因子中自然地起作用以识别用于转录的特异性DNA序列。每个指的C末端部分负责DNA序列的特异性识别。虽然由ZFN识别的序列相对较短(例如,约3个碱基对),但在若干个实施方案中,使用其识别位点已被表征的2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多个锌指的组合,从而允许靶向特定序列,诸如TCR(或免疫检查点抑制剂)的一部分。然后将组合的ZFN与内切核酸酶(诸如FokI(任选FokI异二聚体))的一个或多个催化结构域融合以诱导靶向的DNA断裂。关于使用ZFN编辑TCR和/或免疫检查点抑制剂的另外的信息可以在美国专利号9,597,357中找到,将所述专利通过引用并入本文。
转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN)是以33或34个氨基酸的重复序列的阵列为特征的特定DNA结合蛋白。像ZFN一样,TALEN是核酸酶的DNA切割结构域与TALE结构域的融合物,其允许使用高度精确的靶位点识别进行双链DNA断裂的序列非依赖性引入。TALEN可以在靶位点产生双链断裂,这可以通过容易出错的非同源末端连接(NHEJ)来修复,从而通过引入小的插入或缺失导致基因破坏。有利地,在若干个实施方案中使用TALEN,至少部分地由于其在DNA结合中的更高特异性、降低的脱靶效应以及易于构建DNA结合结构域。
CRISPR(规律间隔成簇短回文重复序列)是细菌用作抵御病毒的基因元件。重复序列是起源于病毒基因组并且已并入细菌基因组中的短序列。Cas(CRISPR相关蛋白)加工这些序列并且切割匹配的病毒DNA序列。通过将含有Cas基因和特异性构建的CRISPR的质粒引入真核细胞中,真核基因组可以在任何所希望的位置处被切割。关于CRISPR的另外信息可以在美国专利公开号2014/0068797中找到,将其通过引用并入本文。在若干个实施方案中,CRISPR用于操纵编码待敲除或敲入的靶基因的一个或多个基因,例如CISH、TGFBR2、TCR、B2M、CIITA、CD47、HLA-E等。在若干个实施方案中,CRISPR用于编辑T细胞的一个或多个TCR和/或编码一种或多种免疫检查点抑制剂的基因。在若干个实施方案中,所述免疫检查点抑制剂选自CTLA4和PD1中的一种或多种。在若干个实施方案中,CRISPR用于截短TCRα、TCRβ、TCRγ和TCRδ中的一种或多种。在若干个实施方案中,TCR被截短而不影响TCR的CD3z信号传导结构域的功能。取决于实施方案和待编辑的靶基因,使用1类或2类Cas。在若干个实施方案中,使用1类Cas,并且Cas类型选自以下类型:I、IA、IB、IC、ID、IE、IF、IU、III、IIIA、IIIB、IIIC、IIID、IV IVA、IVB及其组合。在若干个实施方案中,所述Cas选自Cas3、Cas8a、Cas5、Cas8b、Cas8c、Cas10d、Cse1、Cse2、Csy1、Csy2、Csy3、GSU0054、Cas10、Csm2、Cmr5、Cas10、Csx11、Csx10、Csf1及其组合。在若干个实施方案中,使用2类Cas并且Cas类型选自以下类型:II、IIA、IIB、IIC、V、VI及其组合。在若干个实施方案中,所述Cas选自Cas9、Csn2、Cas4、Cpf1、C2c1、C2c3、Cas13a(先前称为C2c2)、Cas13b、Cas13c、CasX、CasY及其组合。在一些实施方案中,使用2类CasX,其中CasX能够与指导核酸形成复合物,并且其中所述复合物可以与靶DNA结合,并且其中所述靶DNA包含非靶链和靶链。在一些实施方案中,使用2类CasY,其中CasY能够结合和修饰靶核酸和/或与靶核酸相关的多肽。
胞外结构域(结合部分)
本文所述的组合物和方法的一些实施方案涉及嵌合抗原受体,诸如包含胞外结构域的BCMA定向嵌合抗原受体。在一些实施方案中,胞外结构域包含可靶向肿瘤抗原的结合部分(也称为抗原结合蛋白或抗原结合结构域),如本文所述。在一些实施方案中,所述结合部分衍生自或包含抗体的野生型或非野生型序列、抗体片段、scFv、Fv、Fab、(Fab')2、单结构域抗体(sdAb)、VH或VL结构域、骆驼科VHH结构域或非免疫球蛋白支架(诸如DARPIN、亲和体(affibody)、affilin、艾得奈可汀(adnectin)、affitin、repebody、fynomer、alphabody、avimer、atrimer、centyrin、pronectin、抗运载蛋白(anticalin)、kunitz结构域、犰狳重复蛋白、自身抗原、受体或配体)。在一些实施方案中,所述结合部分含有多于一个抗原结合结构域。在实施方案中,所述结合部分直接或经由任选的接头可操作地连接至TCR结构域的NH2末端(例如TCR-α、TCR-β1、TCR-β2、前TCR-α、前-TCR-α-Del48、TCR-γ或TCR-δ的恒定链)。
在若干个实施方案中,提供了结合部分(也称为抗原结合蛋白)。如本文所用,术语“结合部分”应被赋予其普通含义,并且还应指如下蛋白质,其包含与抗原结合的抗原结合片段以及任选的允许抗原结合片段采用促进结合部分与抗原结合的构象的支架或框架部分。在一些实施方案中,所述抗原是癌症抗原(例如,BCMA)或其片段。在一些实施方案中,所述抗原结合片段包含来自与抗原结合的抗体的至少一个CDR。在一些实施方案中,所述抗原结合片段包含来自与抗原结合的抗体的重链或来自与抗原结合的抗体的轻链的所有三个CDR。在仍一些实施方案中,所述抗原结合片段包含来自与抗原结合的抗体的所有六个CDR(三个来自重链并且三个来自轻链)。在若干个实施方案中,所述抗原结合片段包含来自与抗原结合的抗体的一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR,并且在若干个实施方案中,所述CDR可以是重链和/或轻链CDR的任何组合。在一些实施方案中,所述抗原结合片段是抗体片段。
结合部分的非限制性例子包括抗体、抗体片段(例如,抗体的抗原结合片段)、抗体衍生物和抗体类似物。其他具体例子包括但不限于单链可变片段(scFv)、纳米抗体(例如,骆驼科重链抗体的VH结构域;VHH片段)、Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段、Fv片段、Fd片段和互补决定区(CDR)片段。这些分子可以来自任何哺乳动物来源,诸如人、小鼠、大鼠、兔子或猪、狗或骆驼科动物。抗体片段可以与完整(例如,天然)抗体竞争靶抗原的结合,并且所述片段可以通过对完整抗体的修饰(例如,酶或化学切割)或使用重组DNA技术或肽合成从头合成来产生。结合部分可以包含例如替代蛋白支架或具有移植的CDR或CDR衍生物的人工支架。此类支架包括但不限于抗体衍生的支架,其包含被引入以例如稳定结合部分的三维结构的突变;以及包含例如生物相容性聚合物的全合成支架。另外,可以使用肽抗体模拟物(“PAM”),以及基于利用纤连蛋白组件作为支架的抗体模拟物的支架。
在一些实施方案中,所述结合部分包含被引入单条多肽链或多条多肽链中的一个或多个抗体片段。例如,结合部分可以包括但不限于双抗体;胞内抗体;结构域抗体(单个VL或VH结构域或由肽接头连接的两个或更多个VH结构域);大抗体(2个与Fc区融合的scFv);三抗体;四抗体;微型体(与CH3结构域融合的scFv);肽抗体(一个或多个与Fc区附接的肽);线性抗体(一对串联Fd区段(VH-CH1-VH-CH1),其与互补轻链多肽一起形成一对抗原结合区);小型模块化免疫药物;以及免疫球蛋白融合蛋白(例如,IgG-scFv、IgG-Fab、2scFv-IgG、4scFv-IgG、VH-IgG、IgG-VH和Fab-scFv-Fc)。
在一些实施方案中,所述结合部分具有免疫球蛋白的结构。如本文所用,术语“免疫球蛋白”应被赋予其普通含义,并且还应指四聚体分子,其中每个四聚体包含两个相同的多肽链对,每对具有一条“轻”链(约25kDa)和一条“重”链(约50-70kDa)。每条链的氨基末端部分包括主要负责抗原识别的约100个至110个或更多个氨基酸的可变区。每条链的羧基末端部分限定主要负责效应子功能的恒定区。
在轻链和重链内,可变区(V)和恒定区(C)通过约12个或更多个氨基酸的“J”区连接,其中重链还包括约10个或更多个氨基酸的“D”区。每个轻/重链对的可变区形成抗体结合位点,使得完整的免疫球蛋白具有两个结合位点。
免疫球蛋白链展现出通过三个高变区(也称为互补决定区或CDR)接合的相对保守的框架区(FR)的相同总体结构。从N末端到C末端,轻链和重链均包含结构域FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4。
人轻链分类为κ和λ轻链。抗体“轻链”是指抗体分子中以其天然存在的构象存在于抗体分子中的两种类型的多肽链中的较小者。卡帕(K)轻链和拉姆达(λ)轻链是指两种主要的抗体轻链同种型。轻链可以包括多肽,其从氨基末端到羧基末端包含单个免疫球蛋白轻链可变区(VL)和单个免疫球蛋白轻链恒定结构域(CL)。
重链分类为谬(μ)、德尔塔(Δ)、伽马(γ)、阿尔法(α)和艾普西隆(ε),并且分别定义抗体的同种型为IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。抗体“重链”是指抗体分子中以其天然存在的构象存在的两种类型的多肽链中的较大者,并且通常决定了抗体所属的类别。重链可以包括多肽,其从氨基末端到羧基末端包含单个免疫球蛋白重链可变区(VH)、免疫球蛋白重链恒定结构域1(CH1)、免疫球蛋白铰链区、免疫球蛋白重链恒定结构域2(CH2)、免疫球蛋白重链恒定结构域3(CH3)和任选的免疫球蛋白重链恒定结构域4(CH4)。
IgG类进一步分为亚类,即IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。IgA类进一步分为亚类,即IgA1和IgA2。IgM具有多个亚类,包括但不限于IgM1和IgM2。IgG、IgA和IgD抗体中的重链具有三个结构域(CH1、CH2和CH3),而IgM和IgE抗体中的重链具有四个结构域(CH1、CH2、CH3和CH4)。免疫球蛋白重链恒定结构域可以来自任何免疫球蛋白同种型,包括亚型。抗体链经由CL结构域与CH1结构域之间(例如,在轻链与重链之间)以及抗体重链的铰链区之间的多肽间二硫键连接在一起。
在一些实施方案中,所述结合部分是抗体。如本文所用,术语“抗体”是指衍生自免疫球蛋白分子的蛋白质或多肽序列,其与抗原特异性地结合。抗体可以是单克隆或多克隆、多链或单链或完整的免疫球蛋白,并且可以来自天然来源或重组来源。抗体可以是免疫球蛋白分子的四聚体。抗体可以是“人源化”、“嵌合”或非人的。抗体可以包括任何同种型的完整免疫球蛋白,并且包括例如嵌合抗体、人源化抗体、人抗体和双特异性抗体。完整的抗体通常包含至少两条全长重链和两条全长轻链。抗体序列可以仅衍生自单个物种,或者可以是“嵌合的”,也就是说,抗体的不同部分可以衍生自两个不同的物种,如下文进一步描述。除非另有说明,否则术语“抗体”还包括包含两条基本上全长的重链和两条基本上全长的轻链的抗体,只要所述抗体保留与包含两条全长轻链和重链的抗体相同或相似的结合和/或功能即可。例如,在重链和/或轻链的N末端和/或C末端处具有1、2、3、4或5个氨基酸残基取代、插入或缺失的抗体被包括在定义中,只要所述抗体保留与包含两条全长重链和两条全长轻链的抗体相同或相似的结合和/或功能。抗体的例子包括单克隆抗体、多克隆抗体、嵌合抗体、人源化抗体、人抗体、双特异性抗体和合成抗体。在一些实施方案中,提供了单克隆抗体和多克隆抗体。如本文所用,术语“多克隆抗体”应被赋予其普通含义,并且还应指典型地在组成和结合特异性上广泛变化的抗体群体。如本文所用,术语“单克隆抗体”(“mAb”)应被赋予其普通含义,并且还应指具有相同序列的抗体群体中的一种或多种。单克隆抗体在抗原上的特定表位处与抗原结合。
在一些实施方案中,所述结合部分是抗体的片段或抗原结合片段。术语“抗体片段”是指抗体的至少一部分,其保持与抗原的表位特异性相互作用(例如,通过结合、位阻、稳定/去稳定、空间分布)的能力。抗体片段的例子包括但不限于Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、scFv抗体片段、二硫键连接的Fv(sdFv)、由VH和CHI结构域组成的Fd片段、线性抗体、单结构域抗体(诸如sdAb(VL或VH))、骆驼科VHH结构域、由抗体片段形成的多特异性抗体(诸如包含在铰链区通过二硫键连接的两个Fab片段的二价片段)以及分离的CDR或抗体的其他表位结合片段。还可以将抗原结合片段引入单结构域抗体、大抗体、微型抗体、纳米抗体、胞内抗体、双抗体、三抗体、四抗体、v-NAR和bis-scFv中(参见例如,Hollinger和Hudson,Nature Biotechnology 23:1126-1136,2005)。还可以将抗原结合片段移植到基于多肽(诸如纤连蛋白III型(Fn3))的支架中(参见美国专利号6,703,199,其描述了纤连蛋白多肽微型抗体)。抗体片段可以包括Fab、Fab’、F(ab’)2和/或Fv片段,其含有免疫球蛋白中足以赋予与癌症抗原的特异性抗原结合的至少一个CDR。抗体片段可以通过重组DNA技术或通过酶促或化学切割完整抗体来产生。
在一些实施方案中,提供了Fab片段。Fab片段是具有VL、VH、CL和CH1结构域的单价片段;F(ab’)2片段是具有通过铰链区处的二硫桥连接的两个Fab片段的二价片段;Fd片段具有VH和CH1结构域;Fv片段具有抗体单臂的VL和VH结构域;并且dAb片段具有VH结构域、VL结构域或VH或VL结构域的抗原结合片段。在一些实施方案中,这些抗体片段可以被引入单结构域抗体、单链抗体、大抗体、微型抗体、胞内抗体、双抗体、三抗体、四抗体、v-NAR和bis-scFv中。在一些实施方案中,所述抗体包含至少一种如本文所述的CDR。
在若干个实施方案中,本文还提供了单链可变片段。如本文所用,术语“单链可变片段”(“scFv”)应被赋予其普通含义,并且还应指其中VL和VH区通过接头(例如,氨基酸残基的合成序列)连接以形成连续蛋白质链的融合蛋白,其中接头足够长以允许蛋白质链在自身上折叠回并形成单价抗原结合位点)。为了清楚起见,除非另有说明,否则“单链可变片段”不是如本文所定义的抗体。双抗体是包含两条多肽链的二价抗体,其中每条多肽链包含通过接头连接的VH和VL结构域,所述接头被配置为降低或不允许同一链上的两个结构域之间的配对,从而允许每个结构域与另一条多肽链上的互补结构域配对。根据若干个实施方案,如果双抗体的两条多肽链相同,则由它们的配对产生的双抗体将具有两个相同的抗原结合位点。具有不同序列的多肽链可以用于制造具有两个不同抗原结合位点的双抗体。类似地,三抗体和四抗体是分别包含三条和四条多肽链并分别形成三个和四个可以相同或不同的抗原结合位点的抗体。
在若干个实施方案中,所述结合部分包含一个或多个CDR。如本文所用,术语“CDR”应被赋予其普通含义,并且还应指抗体可变序列内的互补决定区(也称为“最小识别单元”或“高变区”)。CDR允许结合部分与特定的目的抗原特异性地结合。有三个重链可变区CDR(HCDR1、HCDR2和HCDR3)和三个轻链可变区CDR(LCDR1、LCDR2和LCDR3)。两条链中的每一个中的CDR典型地通过框架区对齐以形成与靶蛋白上的特定表位或结构域特异性结合的结构。从N末端到C末端,天然存在的轻链和重链可变区典型地都符合这些元件的以下顺序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4。已经设计了编号系统以用于将编号分配给在这些结构域中的每一个中占据位置的氨基酸。该编号系统是Kabat Sequences of Proteins ofImmunological Interest(1987和1991,NIH,Bethesda,MD)或Chothia和Lesk,1987,J.Mol.Biol.196:901-917;Chothia等人,1989,Nature 342:878-883中定义的。使用该系统可以鉴定给定抗体的互补决定区(CDR)和框架区(FR)。免疫球蛋白链中氨基酸的其他编号系统包括(国际免疫遗传学信息系统;Lefranc等人,Dev.Comp.Immunol.29:185-203;2005)和AHo(Honegger和Pluckthun,J.Mol.Biol.309(3):657-670;2001)。一个或多个CDR可以共价或非共价地掺入分子中以使其成为结合部分。
抗BCMA结合部分
本文公开了包含含有重链互补决定区(CDR)1、2和3(HCDR1、HCDR2和HCDR3)的重链可变区(VH)以及含有轻链CDR1、2和3(LCDR1、LCDR2和LCDR3)的轻链可变区(VL)的抗BCMA结合部分。
在一些实施方案中,所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104-129中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:130-155中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:156-181中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104-129中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:130-155中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:156-181中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述VH包含如图2所描绘的HCDR1、HCDR2和HCDR3的组合。
在一些实施方案中,所述LCDR1包含与SEQ ID NO:385-410中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:411-436中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述LCDR3包含与SEQ ID NO:437-462中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述LCDR1包含与SEQ ID NO:385-410中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:411-436中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:437-462中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述VL包含如图3所描绘的LCDR1、LCDR2和LCDR3的组合。
在一些实施方案中,1)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,HCDR2包含与SEQ ID NO:130具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且HCDR3包含与SEQ ID NO:156具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
2)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:105具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:131具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:157具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
3)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:106具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:132具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:158具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
4)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:107具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:133具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:159具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
5)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:108具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:134具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:160具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
6)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:109具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:135具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:161具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
7)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:110具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:136具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:162具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
8)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:111具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:137具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:163具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
9)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:112具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:138具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:164具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
10)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:113具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:139具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:165具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
11)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
12)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:115具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:141具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:167具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
13)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:116具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:142具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:168具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
14)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:117具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:143具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:169具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
15)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:118具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:144具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:170具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
16)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:119具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:145具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:171具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
17)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:120具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:146具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:172具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
18)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:121具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:147具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:173具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
19)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:122具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:148具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:174具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
20)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:123具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:149具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:175具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
21)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:124具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:150具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:176具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
22)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:125具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:151具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:177具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
23)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:126具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:152具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:178具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
24)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:127具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:153具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:179具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
25)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:128具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:154具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:180具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;或
26)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:129具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:155具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:181具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,1)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:385具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,LCDR2包含与SEQ ID NO:411具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且LCDR3包含与SEQ ID NO:437具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
2)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:386具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:412具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:438具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
3)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:387具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:413具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:439具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
4)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:388具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:414具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:440具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
5)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:389具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:415具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:441具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
6)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:390具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:416具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:442具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
7)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:391具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:417具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:443具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
8)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:392具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:418具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:444具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
9)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:393具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:419具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:445具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
10)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:394具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:420具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:446具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
11)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:421具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
12)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:396具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:422具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:448具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
13)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:397具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:423具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:449具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
14)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:398具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:424具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:450具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
15)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:399具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:425具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:451具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
16)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:400具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:426具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:452具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
17)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:401具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:427具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:453具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
18)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:402具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:428具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:454具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
19)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:403具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:429具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:455具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
20)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:404具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:430具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:456具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
21)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:405具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:431具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:457具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
22)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:406具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:432具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:458具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
23)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:407具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:433具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:459具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
24)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:408具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:434具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:460具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
25)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:409具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:435具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:461具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;或
26)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:410具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:436具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:462具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,1)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:130具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:156具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ IDNO:385具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:411具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:437具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
2)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:105具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:131具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:157具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:386具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:412具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:438具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
3)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:106具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:132具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:158具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:387具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:413具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:439具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
4)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:107具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:133具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:159具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:388具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:414具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:440具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
5)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:108具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:134具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:160具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:389具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:415具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:441具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
6)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:109具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:135具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:161具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:390具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:416具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:442具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
7)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:110具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:136具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:162具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:391具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:417具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:443具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
8)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:111具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:137具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:163具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:392具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:418具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:444具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
9)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:112具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:138具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:164具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:393具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:419具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:445具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
10)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:113具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:139具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:165具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:394具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:420具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:446具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
11)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:421具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
12)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:115具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:141具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:167具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:396具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:422具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:448具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
13)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:116具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:142具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:168具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:397具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:423具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:449具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
14)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:117具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:143具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:169具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:398具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:424具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:450具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
15)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:118具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:144具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:170具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:399具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:425具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:451具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
16)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:119具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:145具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:171具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:400具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:426具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:452具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
17)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:120具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:146具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:172具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:401具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:427具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:453具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
18)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:121具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:147具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:173具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:402具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:428具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:454具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
19)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:122具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:148具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:174具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:403具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:429具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:455具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
20)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:123具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:149具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:175具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:404具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:430具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:456具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
21)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:124具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:150具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:176具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:405具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:431具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:457具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
22)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:125具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:151具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:177具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:406具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:432具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:458具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
23)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:126具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:152具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:178具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:407具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:433具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:459具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
24)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:127具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:153具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:179具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:408具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:434具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:460具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
25)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:128具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:154具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:180具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:409具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:435具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:461具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;或
26)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:129具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:155具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR3包含与SEQ ID NO:181具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;所述LCDR1包含与SEQ ID NO:410具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:436具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:462具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述VH包含与SEQ ID NO:260-285中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述VL包含与SEQ ID NO:541-566中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含如图4所描绘的VH和VL的组合。
在一些实施方案中,所述HCDR1由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:182-207中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述HCDR2由核酸编码,所述核酸包含与SEQ IDNO:208-233中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述HCDR3由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:234-259中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述LCDR1由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:463-488中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述LCDR2由核酸编码,所述核酸包含与SEQ IDNO:489-514中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述LCDR3由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:515-540中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述VH包含与SEQ ID NO:286-311中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述VH由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:286-311中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述VL包含与SEQ ID NO:567-592中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述VL由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:567-592中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述VH进一步包含重链信号肽(H-SP)。在一些实施方案中,所述重链信号肽包含SEQ ID NO:1-9中任一个的序列。在一些实施方案中,所述重链信号肽由具有SEQ ID NO:10-19中任一个的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述VH进一步包含框架区。在一些实施方案中,所述VH包含框架区1、2、3和4(H-FR1、H-FR2、H-FR3和H-FR4)。在一些实施方案中,所述H-FR1包含SEQ ID NO:20-32中任一个的序列。在一些实施方案中,所述H-FR2包含SEQ ID NO:33-38中任一个的序列。在一些实施方案中,所述H-FR3包含SEQ IDNO:39-53中任一个的序列。在一些实施方案中,所述H-FR4包含SEQ ID NO:54的序列。在一些实施方案中,所述H-FR1由具有SEQ ID NO:55-73中任一个的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述H-FR2由具有SEQ ID NO:74-84中任一个的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述H-FR3由具有SEQ ID NO:85-102中任一个的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述H-FR4由具有SEQ ID NO:103的序列的核酸编码。
在一些实施方案中,所述VL进一步包含轻链信号肽(L-SP)。在一些实施方案中,所述轻链信号肽包含SEQ ID NO:312-317中任一个的序列。在一些实施方案中,所述轻链信号肽由具有SEQ ID NO:318-324中任一个的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述VL进一步包含框架区。在一些实施方案中,所述VL包含框架区1、2、3和4(L-FR1、L-FR2、L-FR3和L-FR4)。在一些实施方案中,所述L-FR1包含SEQ ID NO:325-331中任一个的序列。在一些实施方案中,所述L-FR2包含SEQ ID NO:332-337中任一个的序列。在一些实施方案中,所述L-FR3包含SEQ ID NO:338-347中任一个的序列。在一些实施方案中,所述L-FR4包含SEQ IDNO:348-353中任一个的序列。在一些实施方案中,所述L-FR1由具有SEQ ID NO:354-357或1416-1420中任一个的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述L-FR2由具有SEQ ID NO:358-366中任一个的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述L-FR3由具有SEQ ID NO:367-377中任一个的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述L-FR4由具有SEQ ID NO:378-384中任一个的序列的核酸编码。
抗BCMA结合部分的实施方案包含本文公开的VH和VL的各种排列。在一些实施方案中,所述VH和VL通过接头分开。在一些实施方案中,所述接头包含SEQ ID NO:1388的序列。
在抗BCMA结合部分的一些实施方案中,所述VH在VL的N末端。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:593-618中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:619-670中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在抗BCMA结合部分的一些实施方案中,所述VL在VH的N末端。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:671-696中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:697-748中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1421-1426中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1447-1472中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1473-1498中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1499-1524中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1582-1600中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1601-1619中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1677-1695中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1696-1714中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1715-1733中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1734-1771中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1772-1790中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1791-1828中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1829-1847中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1848-1866中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1867-1885中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1886-1923中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:3255-3277中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3278-3323中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:3324-3346中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3347-3392中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:5457-5479中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:5480-5502中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:3859-3862中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3875-3878中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含VHH结构域,所述VHH结构域具有与SEQ ID NO:5457-5479中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述VHH结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:5480-5502中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,本文提供的结合部分包含作为较大多肽链的一部分的一个或多个CDR。在一些实施方案中,所述抗原结合蛋白将所述一个或多个CDR共价连接至另一条多肽链。在一些实施方案中,所述抗原结合蛋白非共价地掺入所述一个或多个CDR。在一些实施方案中,所述抗原结合蛋白可以包含掺入生物相容性框架结构中的至少一个本文所述CDR。在一些实施方案中,所述生物相容性框架结构包含足以形成构象稳定的结构支持物或框架或支架的多肽或其部分,所述结构支持物或框架或支架能够在局部表面区域中展示与抗原结合的一个或多个氨基酸序列(例如,CDR、可变区等)。此类结构可以是天然存在的多肽或多肽“折叠”(结构基序),或者相对于天然存在的多肽或折叠可以具有一个或多个修饰,诸如氨基酸的添加、缺失和/或取代。取决于实施方案,所述支架可以衍生自多种不同物种(或多于一种物种)的多肽,多种不同物种诸如人、非人灵长类动物或其他哺乳动物、其他脊椎动物、无脊椎动物、植物、细菌或病毒。
取决于实施方案,所述生物相容性框架结构基于除免疫球蛋白结构域之外的蛋白质支架或骨架。在一些此类实施方案中,那些框架结构是基于纤连蛋白、锚蛋白、脂质运载蛋白、新制癌菌素(neocarzinostain)、细胞色素b、CP1锌指、PST1、卷曲螺旋、LACI-D1、Z结构域和/或淀粉酶抑肽(tendamistat)结构域。
在一些实施方案中,还提供了具有多于一个结合位点的结合部分。在若干个实施方案中,所述结合位点彼此相同,而在一些实施方案中,所述结合位点彼此不同。例如,抗体典型地具有两个相同的结合位点,而“双特异性”或“双功能性”抗体具有两个不同的结合位点。双特异性抗原结合蛋白或抗体的两个结合位点将与两个不同的表位结合,这两个不同的表位可以位于相同或不同的蛋白质靶标上。在若干个实施方案中,这是特别有利的,因为双特异性嵌合抗原受体可以赋予工程化细胞靶向多种肿瘤标记物(例如,BCMA和另外的肿瘤标记物,诸如CD19、CD38、CS1、FCRL5、GPR5CD、CD229、NKG2D或本文公开的或本领域理解作为肿瘤特异性抗原或肿瘤相关抗原的任何其他标记物)的能力。
另外的抗BCMA结合部分是本领域已知的,诸如美国专利号9,765,342、10,294,304、10,174,095、欧洲专利号EP 3230321、美国专利公开号2018/0118842、美国专利公开号2019/0153061和PCT专利公开号WO 2019/149269中披露的那些,将其各自全部内容通过引用并入本文。
如本文所用,术语“嵌合抗体”应被赋予其普通含义,并且还应指含有来自一种抗体的一个或多个区域以及来自一种或多种其他抗体的一个或多个区域的抗体。在一些实施方案中,一个或多个CDR源自抗癌抗原(例如,BCMA)抗体。在若干个实施方案中,所有CDR均源自抗癌抗原抗体(诸如抗BCMA)。在一些实施方案中,将来自多于一种抗癌症抗原抗体的CDR在嵌合抗体中混合和匹配。例如,嵌合抗体可以包含来自第一抗癌症抗原抗体的轻链的CDR1、来自第二抗癌症抗原抗体的轻链的CDR2和CDR3以及来自第三抗癌症抗原抗体的重链的CDR。此外,本文公开的抗原结合蛋白的框架区可以衍生自相同的抗癌抗原(例如,BCMA)抗体之一,源自一种或多种不同的抗体,诸如人抗体,或衍生自人源化抗体。在嵌合抗体的一个例子中,重链和/或轻链的一部分与来自特定物种或属于特定抗体类别或亚类的抗体相同、同源或衍生自所述抗体,而所述链的其余部分与来自另一物种或属于另一种抗体类别或亚类的一种或多种抗体相同、同源或衍生自所述一种或多种抗体。本文还提供了展现出所希望的生物活性的此类抗体的片段。
细胞毒性信号传导复合物
本文所述的组合物和方法的一些实施方案涉及嵌合抗原受体(诸如BCMA定向CAR),所述嵌合抗原受体包含细胞毒性信号传导复合物。如本文所公开的,根据若干个实施方案,所提供的细胞毒性受体复合物包含一个或多个跨膜结构域和/或胞内结构域,所述一个或多个跨膜结构域和/或胞内结构域在一个或多个胞外结构域与靶细胞的表面上的配体结合时引发细胞毒性信号传导级联。本文公开的某些实施方案涉及嵌合抗原受体构建体,其中肿瘤靶向结构域(例如,抗BCMA结合部分)与细胞毒性信号传导复合物偶联。
在若干个实施方案中,所述细胞毒性信号传导复合物包含至少一个跨膜结构域、至少一个共刺激结构域和/或至少一个信号传导结构域。在一些实施方案中,多于一个组件部分构成给定结构域,例如,共刺激结构域可以包含两个亚结构域。此外,在一些实施方案中,结构域可以起到多种功能,例如,跨膜结构域也可以起到提供信号传导功能的作用。
铰链结构域
本文公开的CAR(诸如BCMA定向CAR)的一些实施方案包含铰链结构域。铰链结构域典型地用于将胞外结合部分与CAR组件的其余部分(包括通过跨膜结构域桥接至胞外结合部分的胞内组件)分开。本文公开的或本领域通常已知的任何铰链结构域可以用于本文公开的BCMA定向CAR中。
在一些实施方案中,所述铰链结构域是CD8铰链结构域。在一些实施方案中,所述CD8铰链结构域包含与SEQ ID NO:1389具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8铰链结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1400具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8铰链结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1389的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
在一些实施方案中,所述铰链结构域是IgG4铰链结构域。在一些实施方案中,所述IgG4铰链结构域包含与SEQ ID NO:1390具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述IgG4铰链结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1401具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述IgG4铰链结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1390的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
在一些实施方案中,所述铰链结构域是RQRCD8铰链结构域。如本领域所理解的,“RQRCD8铰链结构域”是具有另外的CD20和CD34表位的CD8铰链结构域。这些另外的表位的存在允许用这些表位检测的替代方法,以及使得能够选择性地耗尽用具有这些表位的CAR工程化的免疫细胞(例如,使用对CD20或CD34特异性的抗体)。在一些实施方案中,所述RQRCD8铰链结构域包含与SEQ ID NO:1391具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述RQRCD8铰链结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1402具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述RQRCD8铰链结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1391的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。RQRCD8铰链结构域(也称为“RQR8”)在Philip等人“A highly compact epitope-based marker/suicide gene for easier and saferT-cell therapy”Blood 124(8):1277-1287和PCT publication WO 2013/153391中进行了探讨,将其各自通过引用以其整体明确地并入本文。
跨膜结构域
本文公开的CAR(诸如BCMA定向CAR)的一些实施方案包含跨膜结构域。如常规理解的,跨膜结构域用于充当跨越细胞质膜的区域以连接CAR的胞外和胞内结构域。本文公开的或本领域通常已知的任何跨膜结构域可以用于本文公开的BCMA定向CAR中。
在一些实施方案中,所述跨膜结构域是CD8跨膜结构域(CD8TM)。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域包含与SEQ ID NO:1392具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1403具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1392的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域还可以包含CD8胞内结构域(CD8IC)。在一些实施方案中,所述CD8胞内结构域包含SEQ ID NO:1393的序列。在一些实施方案中,所述CD8胞内结构域由包含SEQ ID NO:1404的序列的核酸编码。在一些实施方案中,出于本公开文本的目的,所述CD8跨膜结构域可以被认为包括CD8胞内结构域,使得CD8跨膜结构域从N末端到C末端方向包含SEQ ID NO:1392和SEQ ID NO:1393的序列。
在一些实施方案中,所述跨膜结构域是CD28跨膜结构域(CD28TM)。在一些实施方案中,所述CD28跨膜结构域包含与SEQ ID NO:1414具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1415具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1414的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
信号传导结构域
本文公开的CAR(诸如BCMA定向CAR)的一些实施方案包含胞内信号传导结构域。如本领域通常理解的,通过使用其活性协同作用的多个信号传导结构域可以实现出乎意料地增强的信号传导。本文公开的或本领域通常已知的任何胞内信号传导结构域可以用于本文公开的BCMA定向CAR中。
在一些实施方案中,所述胞内信号传导结构域包含OX40亚结构域和CD3ζ亚结构域。在一些实施方案中,所述OX40亚结构域包含与SEQ ID NO:1394具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述OX40亚结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1405具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述OX40亚结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1394的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。在一些实施方案中,所述CD3ζ亚结构域包含与SEQ ID NO:1395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD3ζ亚结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1406具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD3ζ亚结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1395的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。在一些实施方案中,OX40亚结构域在CD3ζ亚结构域的N末端。在一些实施方案中,CD3ζ亚结构域在OX40亚结构域的N末端。
共刺激结构域
在一些实施方案中,本文公开的CAR与共刺激结构域一起表达,其中另外的共激活分子改善CAR活性的方面,包括但不限于细胞毒性活性、CAR稳定性和细胞寿命。在一些实施方案中,另外的共激活分子可以是细胞因子,包括但不限于某些白介素,诸如白介素2(IL2)和/或白介素15(IL15)。在一些实施方案中,表达CAR的免疫细胞还经工程化以表达作为分泌形式的此类另外的共激活分子。在一些实施方案中,表达CAR的免疫细胞还经工程化以表达作为膜结合形式的此类另外的共激活分子,充当自分泌刺激分子(或甚至充当邻近细胞的旁分泌刺激剂)。膜结合IL15在WO 2015/174928中进行了探讨,将其通过引用以其整体明确地特此并入。
在一些实施方案中,所述免疫细胞经工程化以表达IL15,任选地作为膜结合IL15(mbIL15)。在此类实施方案中,免疫细胞上的mbIL15表达通过增强免疫细胞的增殖和/或寿命来增强工程化免疫细胞的细胞毒性作用。在一些实施方案中,所述IL15是人IL15。在一些实施方案中,所述IL15包含SEQ ID NO:1397的序列。在一些实施方案中,所述IL15由包含SEQ ID NO:1408的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述mbIL15通过将IL15与CD8信号肽(CD8SP)、CD8铰链(CD8h)、CD8跨膜结构域(CD8TM)和CD8胞内结构域(CD8IC)中的一种或多种融合来组装。在一些实施方案中,根据以下顺序组装mbIL15:CD8SP-IL15-CD8h-CD8TM-CD8IC,从N末端至C末端。然而,还设想了产生膜结合IL15的其他方法。
在一些实施方案中,mbIL15的CD8SP包含SEQ ID NO:1396的序列。在一些实施方案中,mbIL15的CD8h包含SEQ ID NO:1400的序列。在一些实施方案中,mbIL15的CD8TM包含SEQID NO:1392的序列。在一些实施方案中,mbIL15的CD8IC包含SEQ ID NO:1393的序列。在一些实施方案中,mbIL15的CD8SP由包含SEQ ID NO:1407的序列的核酸编码。在一些实施方案中,mbIL15的CD8h由包含SEQ ID NO:1409的序列的核酸编码。在一些实施方案中,mbIL15的CD8TM由包含SEQ ID NO:1410的序列的核酸编码。在一些实施方案中,mbIL15的CD8IC由包含SEQ ID NO:1411的序列的核酸编码。在一些实施方案中,所述mbIL15包含与SEQ ID NO:1398的序列具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述mbIL15由核酸编码,所述核酸包含与SEQ IDNO:1412的序列具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述mbIL15可以被截短或修饰,使得其与SEQ IDNO:1398的序列具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%序列同一性。
在一些实施方案中,所述CAR和mbIL15以包含自切割肽的多肽的双顺反子构型同时表达。在一些实施方案中,所述CAR和mbIL15从包含编码自切割肽的序列的多核苷酸以双顺反子构型同时表达。在一些实施方案中,所述自切割肽是T2A自切割肽、P2A自切割肽、E2A自切割肽或F2A自切割肽。以这种方式,如果需要,所述CAR和mbIL15可以作为单一载体递送至免疫细胞。在一些实施方案中,使用T2A自切割肽。在一些实施方案中,所述T2A自切割肽包含SEQ ID NO:1399的序列。在一些实施方案中,所述T2A自切割肽由包含SEQ ID NO:1413的序列的核酸编码。
BCMA定向嵌合抗原受体
本文公开了BCMA定向CAR。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含胞外抗BCMA结合部分、铰链结构域、跨膜结构域和包含OX40亚结构域和CD3ζ亚结构域的胞内信号传导结构域。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分可以是本文公开的抗BCMA结合部分中的任一种。在一些实施方案中,所述铰链结构域可以是本文公开的铰链结构域中的任一种。在一些实施方案中,所述跨膜结构域可以是本文公开的跨膜结构域种的任一种。在一些实施方案中,所述胞内信号传导结构域可以是本文公开的胞内信号传导结构域中的任一种。
在一些实施方案中,所述OX40亚结构域(OX40)包含与SEQ ID NO:1394具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述OX40亚结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1405具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述OX40亚结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1394的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。在一些实施方案中,所述CD3ζ亚结构域包含与SEQ ID NO:1395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD3ζ亚结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1406具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD3ζ亚结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1395的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。在一些实施方案中,OX40亚结构域在CD3ζ亚结构域的N末端。在一些实施方案中,CD3ζ亚结构域在OX40亚结构域的N末端。
在一些实施方案中,所述跨膜结构域是CD8跨膜结构域(CD8TM)。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域包含与SEQ ID NO:1392具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1403具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1392的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
在一些实施方案中,所述跨膜结构域是CD28跨膜结构域(CD28TM)。在一些实施方案中,所述CD28跨膜结构域包含与SEQ ID NO:1414具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1415具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1414的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
在一些实施方案中,铰链结构域是CD8铰链结构域(CD8h)。在一些实施方案中,所述CD8铰链结构域包含与SEQ ID NO:1389具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8铰链结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1400具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述CD8铰链结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1389的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
在一些实施方案中,CD8铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域构成BCMA定向CAR的除抗BCMA结合部分之外的部分。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含CD8铰链结构域(CD8h)、CD8跨膜结构域(CD8TM)、CD8胞内结构域(CD8IC)、OX40亚结构域(OX40)和CD3ζ亚结构域(CD3ζ)。在一些实施方案中,CD8h、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ从N末端到C末端的顺序为CD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ。在一些实施方案中,CD8铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域由与SEQ ID NO:1375具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列表示。在一些实施方案中,CD8铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1376具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在其中BCMA定向CAR包含具有抗BCMA结合部分的CD8h、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ的一些实施方案中,所述BCMA定向CAR可以包含与SEQ ID NO:749-774中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:775-800中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸针对人进行密码子优化并且具有与SEQ ID NO:801-826中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:905-930中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:931-956中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸针对人进行密码子优化并且具有与SEQ ID NO:957-982中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述铰链结构域是IgG4铰链结构域。在一些实施方案中,所述IgG4铰链结构域包含与SEQ ID NO:1390具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述IgG4铰链结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1401具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述IgG4铰链结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1390的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
在一些实施方案中,IgG4铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域构成BCMA定向CAR的除抗BCMA结合部分之外的部分。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含IgG4铰链结构域(IgG4h)、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ。在一些实施方案中,IgG4h、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ从N末端到C末端的顺序为IgG4h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ。在一些实施方案中,IgG4铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域由与SEQ ID NO:1377具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列表示。在一些实施方案中,IgG4铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1378具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在其中BCMA定向CAR包含具有抗BCMA结合部分的IgG4、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ的一些实施方案中,所述BCMA定向CAR可以包含与SEQ ID NO:1061-1086中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1087-1112中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸针对人进行密码子优化并且具有与SEQ ID NO:1113-1138中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述铰链结构域是RQRCD8铰链结构域。在一些实施方案中,所述RQRCD8铰链结构域包含与SEQ ID NO:1391具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述RQRCD8铰链结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1402具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述RQRCD8铰链结构域被截短或修饰,并且与具有SEQ ID NO:1391的序列的肽至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%同源。
在一些实施方案中,RQRCD8铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域构成BCMA定向CAR的除抗BCMA结合部分之外的部分。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含RQRCD8铰链结构域(RQRCD8h)、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ。在一些实施方案中,RQRCD8h、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ从N末端到C末端的顺序为RQRCD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ。在一些实施方案中,RQRCD8铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域由与SEQ ID NO:1379具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列表示。在一些实施方案中,RQRCD8铰链结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1380具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在其中BCMA定向CAR包含具有抗BCMA结合部分的RQRCD8、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ的一些实施方案中,所述BCMA定向CAR可以包含与SEQ ID NO:1217-1242中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1243-1268中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸针对人进行密码子优化并且具有与SEQ ID NO:1269-1294中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
BCMA定向嵌合抗原受体构建体
在一些实施方案中,提供了包含BCMA定向CAR的BCMA定向CAR构建体。图1描绘了如本公开文本中体现的示例性BCMA定向CAR构建体。如图1所示,BCMA定向CAR构建体的实施方案包含抗BCMA结合部分、铰链结构域、CD8跨膜结构域、CD8胞内结构域、OX40亚结构域、CD3ζ亚结构域、T2A自切割肽和膜结合IL15。在一些实施方案中,所述CD8跨膜结构域可以取代CD28跨膜结构域。这些组件中的任何一个或多个可以是本文公开的相应组件的任何实施方案。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR是本文公开的BCMA定向CAR中的任一种,并且所述BCMA定向CAR构建体包含所述BCMA定向CAR和双顺反子构型的膜结合IL15。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体包含BCMA定向CAR和膜结合IL15(mbIL15),所述BCMA定向CAR包含抗BCMA结合部分、CD8h、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ,其中所述BCMA定向CAR和mbIL15被自切割肽(例如,T2A自切割肽)分开。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体从N末端到C末端以抗BCMA结合部分-CD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15的顺序排列。在一些实施方案中,CD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15包含与SEQ ID NO:1381具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,CD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1382具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含VH和VL,其排列使得VH在VL的N末端。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体包含与SEQ ID NO:827-852中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:853-878中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体由核酸编码,所述核酸针对人进行密码子优化并且包含与SEQ ID NO:879-904中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体包含BCMA定向CAR和mbIL15,所述BCMA定向CAR包含抗BCMA结合部分、CD8h、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ,其中所述BCMA定向CAR和mbIL15被自切割肽(例如,T2A自切割肽)分开。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体从N末端到C末端以抗BCMA结合部分-CD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15的顺序排列。在一些实施方案中,CD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15包含与SEQ ID NO:1381具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,CD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1382具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述抗BCMA结合部分包含VH和VL,其排列使得VL在VH的N末端。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体包含与SEQ IDNO:983-1008中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1009-1034中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体由核酸编码,所述核酸针对人进行密码子优化并且包含与SEQ ID NO:1035-1060中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体包含BCMA定向CAR和mbIL15,所述BCMA定向CAR包含抗BCMA结合部分、IgG4h、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ,其中所述BCMA定向CAR和mbIL15被自切割肽(例如,T2A自切割肽)分开。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体从N末端到C末端以抗BCMA结合部分-IgG4h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15的顺序排列。在一些实施方案中,IgG4h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15包含与SEQ IDNO:1383具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,IgG4h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1384具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体包含与SEQ ID NO:1139-1164中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1165-1190中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体由核酸编码,所述核酸针对人进行密码子优化并且包含与SEQ IDNO:1191-1216中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体包含BCMA定向CAR和mbIL15,所述BCMA定向CAR包含抗BCMA结合部分、RQR8CDh、CD8TM、CD8IC、OX40和CD3ζ,其中所述BCMA定向CAR和mbIL15被自切割肽(例如,T2A自切割肽)分开。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体从N末端到C末端以抗BCMA结合部分-RQR8CDh-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15的顺序排列。在一些实施方案中,RQRCD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15包含与SEQID NO:1385具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,RQRCD8h-CD8TM-CD8IC-OX40-CD3ζ-T2A-mbIL15由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1386具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体包含与SEQ ID NO:1295-1320中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1321-1346中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR构建体由核酸编码,所述核酸针对人进行密码子优化并且包含与SEQ ID NO:1347-1372中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:3851-3854中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:3867-3870中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3883-3886中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:3887-3912中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3913-3964中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:3991-4042中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4043-4068中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4069-4120中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:4147-4198中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4199-4224中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4225-4276中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:4303-4354中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4355-4380中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4381-4432中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:4459-4510中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4513-4531中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4531-4569中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:4589-4626中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4627-4645中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4646-4683中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:4703-4740中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4741-4759中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4760-4797中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:4817-4854中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4855-4873中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4874-4911中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:4931-4968中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:4969-4994中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4995-5046中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:5073-5124中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:5125-5150中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:5151-5176中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:5203-5228中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:5229-5247中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:5248-5285中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:5305-5342中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:5343-5361中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:5362-5399中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:5419-5456中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:5503-5525中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:5526-5571中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:5595-5640中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含与SEQ ID NO:5641-5663中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:5664-5709中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且具有与SEQ ID NO:5733-5778中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,所述BCMA定向CAR包含VHH结构域并且包含与SEQ ID NO:5779-5801中任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向VHH-CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:5802-5847中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,所述BCMA定向VHH-CAR由核酸编码,所述核酸也编码mbIL15并且与SEQ ID NO:5871-5916中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
应当理解,对于本文所述的任何受体构建体,当组合序列(例如,用于建立限制位点)时,由于例如克隆的便捷性或效率,可能导致所公开的序列的某些序列变异性、延伸和/或截短。
治疗方法以及施用和给药
本文公开了免疫细胞群体,所述免疫细胞群体包含本文公开的抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR或BCMA定向CAR构建体中的任一种。在一些实施方案中,所述免疫细胞是NK细胞和/或T细胞。在一些实施方案中,所述免疫细胞群体进一步包含结合非BCMA癌症标记物的另外的胞外部分或CAR。在一些实施方案中,非BCMA癌症标记物包括CD138、SLAMF7、CD38、GPRC5D或CD19中的一种或多种。
本文还提供了涉及用包含本文公开的抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR或BCMA定向CAR构建体中的任一种的免疫细胞或免疫细胞群体治疗、改善、抑制或预防癌症的方法的实施方案。在一些实施方案中,所述方法包括施用治疗有效量的免疫细胞或免疫细胞群体,所述免疫细胞或免疫细胞群体包含本文公开的抗BCMA结合部分、BCMA定向CAR或BCMA定向CAR构建体中的任一种。
在某些实施方案中,用本文所述的一种或多种基因工程化细胞治疗受试者实现以下效果中的一种、两种、三种、四种或更多种,包括例如:(i)降低或改善与之相关的疾病或症状的严重程度;(ii)减少与疾病相关的症状的持续时间;(iii)防止疾病或与之相关的症状的进展;(iv)疾病或与之相关的症状的消退;(v)防止与疾病相关的症状的发展或发作;(vi)防止与疾病相关的症状的复发;(vii)减少受试者的住院治疗;(viii)减少住院治疗时间长度;(ix)增加患有疾病的受试者的存活期;(x)降低与疾病相关的症状的数量;(xi)增强、改善、补充、补充或加强另一种疗法的一种或多种预防性或治疗性作用。这些比较中的每一个是相对于例如用于疾病的不同疗法而言的,所述用于疾病的不同疗法包括使用不表达本文公开的构建体的细胞的用于疾病的基于细胞的免疫疗法。
施用可以通过多种途径进行,包括而不限于静脉内、动脉内、皮下、肌内、肝内、腹膜内和/或局部递送至受影响的组织。对于给定的受试者,可以基于其体重、疾病类型和状态以及所希望的治疗侵袭性来容易地确定免疫细胞(诸如NK和/或T细胞)的剂量,但是取决于实施方案,其范围是约105个细胞/kg至约1012个细胞/kg(例如,105-107、107-1010、1010-1012个细胞/kg以及其中的重叠范围)。在一个实施方案中,使用剂量递增方案。在若干个实施方案中,施用一定范围的免疫细胞(诸如NK和/或T细胞),例如约1x106个细胞/kg与约1x108个细胞/kg之间。取决于实施方案,可以治疗各种类型的癌症。在若干个实施方案中,治疗肝细胞癌。本文提供的其他实施方案包括治疗或预防以下非限制性的癌症例子,包括但不限于急性成淋巴细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、肾上腺皮质癌、卡波西肉瘤、淋巴瘤、胃肠道癌、阑尾癌、中枢神经系统癌、基底细胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨癌、脑肿瘤(包括但不限于星形细胞瘤、脊髓肿瘤、脑干胶质瘤、胶质母细胞瘤、颅咽管瘤、室管膜母细胞瘤、室管膜细胞瘤、成神经管细胞瘤、髓上皮瘤)、乳腺癌、支气管肿瘤、伯基特淋巴瘤、宫颈癌、结肠癌、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性骨髓增殖性障碍、导管癌、子宫内膜癌、食道癌、胃癌、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、毛细胞白血病、肾细胞癌、白血病、口腔癌、鼻咽癌、肝癌、肺癌(包括但不限于非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌)、胰腺癌、肠癌、淋巴瘤、黑色素瘤、眼癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、垂体癌、子宫癌和阴道癌。
还提供了如本文公开的工程化NK细胞用于治疗癌症和/或用于制备用于治疗癌症的药剂的用途。在若干个实施方案中,所述癌症是多发性骨髓瘤。
在若干个实施方案中,编码所公开的嵌合抗原受体(包括但不限于BCMA定向嵌合抗原受体)的多核苷酸是mRNA。在一些实施方案中,所述多核苷酸是DNA。在一些实施方案中,将多核苷酸与用于表达细胞毒性受体复合物的至少一个调节元件可操作地连接。
根据若干个实施方案,另外提供了一种载体,其包含编码本文提供的任何多核苷酸的多核苷酸,其中所述多核苷酸任选地与用于表达细胞毒性受体复合物的至少一个调节元件操作性地连接。在若干个实施方案中,所述载体是逆转录病毒。
本文进一步提供了工程化免疫细胞(诸如NK和/或T细胞),其包含如本文所公开的多核苷酸、载体或细胞毒性受体复合物。本文进一步提供了包含工程化免疫细胞(诸如NK细胞和/或工程化T细胞)的混合物的组合物,每个群体包含如本文所公开的多核苷酸、载体或细胞毒性受体复合物。
癌症类型
本文所述的组合物和方法的一些实施方案涉及向患有癌症的受试者施用包含嵌合抗原受体(诸如BCMA定向嵌合抗原受体)的免疫细胞。本文提供的各种实施方案包括治疗或预防以下非限制性的癌症例子。癌症的例子包括但不限于多发性骨髓瘤、急性成淋巴细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、肾上腺皮质癌、卡波西肉瘤、淋巴瘤、胃肠道癌、阑尾癌、中枢神经系统癌、基底细胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨癌、脑肿瘤(包括但不限于星形细胞瘤、脊髓肿瘤、脑干胶质瘤、颅咽管瘤、室管膜母细胞瘤、室管膜细胞瘤、成神经管细胞瘤、髓上皮瘤)、乳腺癌、支气管肿瘤、伯基特淋巴瘤、宫颈癌、结肠癌、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性骨髓增殖性障碍、导管癌、子宫内膜癌、食道癌、胃癌、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、毛细胞白血病、肾细胞癌、白血病、口腔癌、鼻咽癌、肝癌、肺癌(包括但不限于非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌)、胰腺癌、肠癌、淋巴瘤、黑色素瘤、眼癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、垂体癌、子宫癌和阴道癌。
癌症靶标
本文所述的组合物和方法的一些实施方案涉及包含一种或多种靶向癌症抗原的嵌合抗原受体的免疫细胞。靶抗原的非限制性例子包括:BCMA、CD19、CD38、CD138(也称为黏结蛋白聚糖1)、G蛋白偶联受体C类第5组成员D(GPRC5D)、SLAMF7、CD229(SLAMF3)、CD123、DLL3、表皮生长因子受体(EGFR)、前列腺特异性膜抗原(PSMA)、Fms样酪氨酸激酶3(FLT3);KREMEN2(含Kringle的跨膜蛋白2)、碱性磷酸酶、胎盘样2(ALPPL2)、密封蛋白4、密封蛋白6、CD5、CD22;CD30;CD171;CS1(也称为CD2子集1、CRACC、SLAMF7、CD319和19A24);C型凝集素样分子-1(CLL-1或CLECL1);CD33;表皮生长因子受体变体III(EGFRviii);神经节苷脂G2(GD2);神经节苷脂GD3(aNeu5Ac(2-8)aNeu5Ac(2-3)bDGalp(l-4)bDGlcp(l-l)Cer);Tn抗原((Tn Ag)或(GalNAca-Ser/Thr));前列腺特异性膜抗原(PSMA);受体酪氨酸激酶样孤儿受体1(ROR1);Fms样酪氨酸激酶3(FLT3);肿瘤相关糖蛋白72(TAG72);CD38;CD44v6;在急性白血病或淋巴瘤上表达但在造血祖细胞上不表达的糖基化CD43表位、在非造血系统癌症上表达的糖基化CD43表位、癌胚抗原(CEA);上皮细胞粘附分子(EPCAM);B7H3(CD276);KIT(CD117);白介素13受体亚基α-2(IL-13Ra2或CD213A2);间皮素;白介素11受体α(IL-llRa);前列腺干细胞抗原(PSCA);丝氨酸蛋白酶21(Testisin或PRSS21);血管内皮生长因子受体2(VEGFR2);路易斯(Y)抗原;CD24;血小板源性生长因子受体β(PDGFR-β);阶段特异性胚胎抗原4(SSEA-4);CD20;叶酸受体α(FRa或FR1);叶酸受体β(FRb);受体酪氨酸蛋白激酶ERBB2(Her2/neu);细胞表面相关粘蛋白1(MUC1);表皮生长因子受体(EGF R);神经细胞粘附分子(NCAM);前列腺酶;前列腺酸磷酸酶(PAP);突变的延伸因子2(ELF2M);肝配蛋白B2;成纤维细胞激活蛋白α(FAP);胰岛素样生长因子1受体(IGF-I受体)、碳酸酐酶IX(CAIX);蛋白酶体(Prosome,Macropain)亚基,β型,9(LMP2);糖蛋白100(gp100);由断点簇区域(BCR)和Abelson鼠白血病病毒癌基因同源物1组成的癌基因融合蛋白(Abl)(bcr-abl);酪氨酸酶;肝配蛋白A型受体2(EphA2);唾液酸路易斯粘附分子(sLe);神经节苷脂GM3(aNeu5Ac(2-3)bDClalp(l-4)bDGlcp(l-l)Cer);转谷氨酰胺酶5(TGS5);高分子量黑色素瘤相关抗原(HMWMA A);o-乙酰基-GD2神经节苷脂(OAcGD2);肿瘤内皮标记物1(TEM1/CD248);肿瘤内皮标记物7相关蛋白(TEM7R);密封蛋白6(CLDN6);促甲状腺激素受体(TSH R);G蛋白偶联受体C类第5组成员D(GPRC5D);X染色体开放阅读框61(CXORF61);CD97;CD179a;间变性淋巴瘤激酶(ALK);聚唾液酸;胎盘特异性蛋白1(PLAC1);globoH甘油酰胺的六糖部分(GloboH);乳腺分化抗原(NY-BR-1);尿斑蛋白2(UP K2);甲型肝炎病毒细胞受体1(HAVCR1);肾上腺素受体β3(ADRB3);泛连接蛋白3(PANX3);G蛋白偶联受体20(GPR20);淋巴细胞抗原6复合体,K9位点(LY6K);嗅觉受体51E2(OR51E2);TCRγ备用读码框蛋白(TARP);肾母细胞瘤蛋白(WT1);癌症/睾丸抗原1(NY-ES0-1);癌症/睾丸抗原2(LAGE-la);黑色素瘤相关抗原1(MAGE-A1);位于染色体12p上的ETS易位变异基因6(ETV6-AML);精子蛋白17(SPA17);X抗原家族成员1A(XAGE1);血管生成素结合细胞表面受体2(Tie2);黑色素瘤癌睾丸抗原1(MAD-CT-1);黑色素瘤癌睾丸抗原2(MAD-CT-2);Fos相关抗原1;肿瘤蛋白p53(p53);p53突变体;前列腺素;生存素;端粒酶;前列腺癌肿瘤抗原1(PCT A-l或半乳凝素8),T细胞识别的黑色素瘤抗原1(MelanA或MARTI);大鼠肉瘤(Ras)突变体;人类端粒酶;逆转录酶(hTERT);肉瘤易位断点;黑色素瘤细胞凋亡抑制剂(ML-IAP);ERG(跨膜蛋白酶,丝氨酸2(TMPRSS2)ETS融合基因);N-乙酰葡糖胺基转移酶V(NA17);配对盒蛋白Pax-3(PAX3);雄激素受体;细胞周期素B1;v-myc禽骨髓细胞瘤病毒癌基因神经母细胞瘤衍生同源物(MYCN);Ras同源物家族成员C(RhoC);酪氨酸酶相关蛋白2(TRP-2);细胞色素P450 IB 1(CYPIB 1);CCCTC结合因子(锌指蛋白)样(BORIS或印记位点调节因子兄弟蛋白(Brother of the Regulator oflmprintedSites))、T细胞识别的鳞状细胞癌抗原3(SART3);配对盒蛋白Pax-5(PAX5);前顶体蛋白结合蛋白sp32(OY-TES1);淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK);激酶锚定蛋白4(AKAP-4);滑膜肉瘤,X断点2(SSX2);高级糖基化终产物的受体(RAGE-1);肾泛蛋白1(RU1);肾泛蛋白2(RU2);天冬酰胺内肽酶(legumain);人乳头瘤病毒E6(HPV E6);人乳头瘤病毒E7(HPV E7);肠羧酯酶;热休克蛋白70-2突变(mut hsp70-2);CD79a;CD79b;CD72;白细胞相关免疫球蛋白样受体1(LAIR1);IgA受体的Fc片段(FCAR或CD89);白细胞免疫球蛋白样受体亚家族A成员2(LILRA2);CD300类分子家族成员f(CD300LF);C型凝集素结构域家族12成员A(CLEC12A);骨髓基质细胞抗原2(BST2);含EGF样模块的粘蛋白样激素受体样2(EMR2);淋巴细胞抗原75(LY75);磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3(GPC 3);Fc受体样5(FCRL5);和免疫球蛋白λ样多肽1(IGLLl)、MPL、生物素、c-MY C表位标签、CD34、LAMP1 TROP2、GFRα4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD 200R、Slea(CA19.9;唾液酸路易斯抗原);岩藻糖基-GMl、PTK7、gpNMB、CDH1-CD324、DLL3、CD276/B7H3、ILl lRa、IL13Ra2、CD179b-IGLll、TCRγ-δ、NKG2D、CD32(FCGR2A)、Tn ag、Timl-/HVCR1、CSF2RA(GM-CSFR-α)、TGFβR2、LewsAg、TCR-βl链、TCR-β2链、TCR-γ链、TCR-δ链、FITC、黄体生成激素受体(LHR)、卵泡刺激素受体(FSHR)、促性腺激素受体(CGHR或GR)、CCR4、GD3、SLAMF6、SLAMF4、HIV1包膜糖蛋白、HTLVl-Tax、CMV pp65、EBV-EBNA3c、KSHV K8.1、KSHV-gH、甲型流感血凝素(HA)、GAD、PDL1、鸟苷酸环化酶C(GCC)、桥粒芯糖蛋白3的自身抗体(Dsg3)、桥粒芯糖蛋白1的自身抗体(Dsgl)、HLA、HLA-A、HLA-A2、HLA-B、HLA-C、HLA-DP、HLA-DM、HLA-DOA、HLA-DOB、HLA-DQ、HLA-DR、HLA-G、IgE、CD99、Ras G12V、组织因子1(TF1)、AFP、GPRC5D、密封蛋白l 8.2(CLD18A2或CLDN18A.2))、P-糖蛋白、STEAP1、Livl、连接蛋白-4、Cripto、gpA33、BST1/CD157、低电导氯离子通道、以及由TNT抗体识别的抗原。
实施例
本文公开的材料和方法是根据本文公开的某些实施方案所采用的非限制性例子。
实施例1-在NK细胞中的抗BCMA CAR表达
根据若干个实施方案,NK细胞将从外周血单个核细胞中分离并且通过使用饲养细胞系进行扩增。在若干个实施方案中,所述饲养细胞经工程化以表达某些刺激分子(例如,白介素、CD3、4-1BBL等)从而促进免疫细胞扩增和激活。例如,美国专利号:7,435,596或8,026,097、国际专利申请PCT/SG 2018/050138、国际专利申请PCT/US 2020/044033和美国临时专利申请号:63/073,671中披露了用于扩增NK细胞的工程化饲养细胞和相关方法,将其各自通过引用以其整体明确地并入本文。
从PBMC分离的NK细胞将与表达膜结合IL15和4-1BBL的K562细胞共培养,其中培养基中补充IL2。将在大约第7天用编码抗BCMA定向嵌合抗原受体构建体(诸如本文公开的那些中的任一种)的载体进行病毒转导。各种抗BCMA CAR构建体将被转导到不同的NK细胞群体中。可以使用本文公开的一种或多种跨膜结构域、一种或多种铰链结构域、一种或多种共刺激结构域和一种或多种信号传导结构域的任何组合。在若干个实施方案中,所述抗BCMACAR将包含OX40结构域和CD3ζ信号传导结构域。在若干个实施方案中,病毒载体还将编码白介素15,任选地以膜结合形式由NK细胞与抗BCMA CAR一起表达。所得的工程化NK细胞将在总培养时间的第14天或更多天时进行评价。
将通过检测CAR构建体来评价抗BCMA CAR构建体的表达,例如通过评估表达整合到CAR中的标签序列(例如,FLAG表位标签或RQRCD8铰链的CD34和CD20表位)的测试群体中NK细胞的百分比,但本文公开的实施方案还提供了无表位标签的CAR构建体。认为,至少约75%或更多的NK细胞将以稳定的方式(例如,在培养物中至少2-3周或更长时间)表达CAR。
这是一个预言性实施例。
实施例2-在T细胞中的抗BCMA CAR表达
根据若干个实施方案,T细胞将从外周血单个核细胞中分离并且通过使用可商购T细胞扩增产物(例如,与抗CD3和抗CD28抗体偶联的珠)进行扩增。
将在大约第7天用编码抗BCMA定向嵌合抗原受体构建体(诸如本文公开的那些中的任一种)的各种载体进行T细胞的病毒转导。各种抗BCMA CAR构建体将被转导到不同的T细胞群体中。可以使用本文公开的一种或多种跨膜结构域、一种或多种铰链结构域、一种或多种共刺激结构域和一种或多种信号传导结构域的任何组合。在若干个实施方案中,所述抗BCMA CAR将包含OX40结构域和CD3ζ信号传导结构域。在若干个实施方案中,病毒载体还将编码白介素15,任选地以膜结合形式由T细胞与抗BCMA CAR一起表达。所得的工程化T细胞将在总培养时间的第14天或更多天时进行评价。
将通过检测CAR构建体来评价抗BCMA CAR构建体的表达,例如通过评估表达整合到CAR中的标签序列(例如,FLAG表位标签或RQRCD8铰链的CD34和CD20表位)的测试群体中T细胞的百分比,但本文公开的实施方案还提供了无表位标签的CAR构建体。认为,至少约75%或更多的T细胞将以稳定的方式(例如,在培养物中至少2-3周或更长时间)表达CAR。
这是一个预言性实施例。
实施例3-表达抗BCMA CAR的NK和T细胞的细胞毒性的体外评估
表达各种抗BCMA CAR(诸如本文公开的那些)的NK细胞和/或T细胞将与表达BCMA的肿瘤细胞以及表达很少或不表达BCMA的细胞共培养作为对照。非转导NK和/或T细胞也可以用作阴性对照。肿瘤细胞将任选地用荧光检测标签(例如,GFP)进行加标签,以通过流式细胞术进行检测/定量。将评估各种效应子:靶标(E:T)比率,例如8:1、4:1、2:1、1:1、1:2、1:4和/或1:8。共培养之后,将收集培养基并且测定各种细胞毒性或促炎性细胞因子的水平。将对肿瘤细胞存活率进行定量。
认为,表达抗BCMA CAR并且与表达BCMA的肿瘤细胞共培养的NK和/或T细胞将导致细胞毒性效应子分子(诸如颗粒酶B、穿孔素和/或干扰素γ)的释放与非转导NK和/或T细胞以及用表达降低的BCMA水平的肿瘤细胞培养的表达BCMA-CAR的NK和/或T细胞的那些效应子的释放相比更高。
认为,表达抗BCMA CAR并且与表达BCMA的肿瘤细胞共培养的NK和/或T细胞将以取决于给定实验的E:T比率的方式展现出对肿瘤细胞的细胞毒性作用。认为,工程化NK和/或T细胞将展现出在自然界中持久的抗肿瘤细胞作用(例如,能够展现出在用抗BCMA CAR转导后至少2-3周的细胞毒性)。
这是一个预言性实施例。
实施例4-表达抗BCMA CAR的NK和T细胞的细胞毒性的体内评估
NK和T细胞将从PBMC中分离并且如本文所述扩增。将NK细胞和T细胞工程化以通过NK或T细胞的病毒转导来表达抗BCMA CAR,诸如本文公开的那些中的任一种。病毒转导将在分离后大约第7天进行。各种抗BCMA CAR构建体将被转导到不同的NK细胞和T细胞群体中。可以使用本文公开的一种或多种跨膜结构域、一种或多种铰链结构域、一种或多种共刺激结构域和一种或多种信号传导结构域的任何组合。在若干个实施方案中,所述抗BCMA CAR将包含OX40结构域和CD3ζ信号传导结构域。在若干个实施方案中,病毒载体还将编码白介素15,任选地以膜结合形式由NK细胞与抗BCMA CAR一起表达。由此产生的工程化NK细胞和工程化T细胞将在总培养时间的第14天或更多天时进行评价。
在第0天,对免疫缺陷NSG小鼠静脉注射适当剂量(例如,1x105个细胞)并且表达发光标记物的BCMA阳性肿瘤细胞(例如,多发性骨髓瘤细胞,诸如NCI-H929、U266-B1或RPMI-8226)。在第1天,小鼠将接受PBS对照注射、非转导NK和/或T细胞、或表达本文公开的各种抗BCMA CAR之一的NK和/或T细胞。将在多个时间点收集生物发光成像数据,诸如第0天、第8天、第11天、第16天、第20天、第28天、第32天和第40天。将在多个时间点收集血液样品,诸如第5天、第15天和第20天、第25天、第30天、第35天和第40天。
将使用流式细胞术分析血液样品中肿瘤细胞的存在和数量,以检测BCMA或另一种识别细胞表面蛋白。将检查生物发光图像以了解不同时间点的信号强度。预期PBS对照组和非转导NK和/或T细胞的生物发光信号将随着时间的推移而增加,这表明肿瘤细胞的扩增。预计表达抗BCMA CAR的NK细胞的注射将导致肿瘤细胞生长的进展减缓。预计表达抗BCMACAR的T细胞的注射将导致肿瘤细胞生长的进展减缓。预计表达抗BCMA CAR的NK细胞和表达抗BCMA CAR的T细胞的组合的注射将产生肿瘤细胞生长的进展的显著或甚至协同的减缓。在其中BCMA的另外的表位被靶向(例如,被由NK和/或T细胞表达的双特异性CAR或第二CAR靶向)的实施方案中,预期细胞毒性进一步增强。
预期接受表达抗BCMA CAR(或CAR)的NK细胞和/或T细胞的小鼠将展现出与对照组相比增强的存活率。
这是一个预言性实施例。
实施例5-其他癌症靶标与表达抗BCMA CAR的NK和/或T细胞的组合
NK和T细胞将从PBMC中分离并且如本文所述扩增。将NK细胞和T细胞工程化以通过NK或T细胞的病毒转导来表达抗BCMA CAR,诸如本文公开的那些中的任一种。病毒转导将在分离后大约第7天进行。各种抗BCMA CAR构建体将被转导到不同的NK细胞和T细胞群体中。可以使用本文公开的一种或多种跨膜结构域、一种或多种铰链结构域、一种或多种共刺激结构域和一种或多种信号传导结构域的任何组合。在若干个实施方案中,所述抗BCMA CAR将包含OX40结构域和CD3ζ信号传导结构域。在若干个实施方案中,病毒载体还将编码白介素15,任选地以膜结合形式由NK细胞与抗BCMA CAR一起表达。
将NK细胞和/或T细胞工程化以表达针对另外的(例如,非BCMA)肿瘤标记物的CAR。另外的肿瘤标记物将是CD19、CD38、CD138、SLAM-F7或GPRC5D中的一种或多种,或本领域通常已知的其他肿瘤标记物。在若干个实施方案中,将单一CAR工程化以既靶向BCMA也靶向CD19、CD38、CD138、SLAM-F7或GPRC5D中的一种或多种,或本领域通常已知的其他肿瘤标记物。与BCMA靶向CAR一样,可以使用本文公开的一种或多种跨膜结构域、一种或多种铰链结构域、一种或多种共刺激结构域和一种或多种信号传导结构域的任何组合。在若干个实施方案中,针对非BCMA标记物的CAR将包含OX40结构域和CD3ζ信号传导结构域。在若干个实施方案中,用于用非BCMA CAR转导NK和/或T细胞的病毒载体还将编码白介素15,任选地以膜结合形式由NK细胞与非BCMA CAR(或双特异性CAR)一起表达。由此产生的工程化NK细胞和工程化T细胞将在总培养时间的第14天或更多天时进行评价。
在第0天,对免疫缺陷NSG小鼠静脉注射呈BCMA阳性、对一种或多种非BCMA肿瘤标记物(例如,CD19、CD38、CD138、SLAM-F7或GPRC5D)呈阳性并且表达发光标记物的肿瘤细胞(以适当剂量,诸如1x105个细胞)。在第1天,小鼠将接受PBS对照注射、非转导NK和/或T细胞、或表达本文公开的各种抗BCMA CAR之一、表达本文公开的各种非BCMA CAR之一的NK和/或T细胞、或表达双特异性BCMA/非BCMA CAR的NK和/或T细胞。将在多个时间点收集生物发光成像数据,诸如第0天、第8天、第11天、第16天、第20天、第28天、第32天和第40天。将在多个时间点收集血液样品,诸如第5天、第15天和第20天、第25天、第30天、第35天和第40天。
将使用流式细胞术分析血液样品中肿瘤细胞的存在和数量,以检测BCMA和非BCMA细胞表面蛋白。将检查生物发光图像以了解不同时间点的信号强度。预期PBS对照组和非转导NK和/或T细胞的生物发光信号将随着时间的推移而增加,这表明肿瘤细胞的扩增。预计注射表达抗BCMA CAR和针对非BCMA靶标的CAR的NK细胞、T细胞、和/或NK细胞与T细胞的组合将导致肿瘤细胞生长的进展减缓。预计这种减缓产生的肿瘤生长减缓将大于由表达抗BCMA或非BCMA CAR的细胞实现的那些单独产生的肿瘤生长减缓。在若干个实施方案中,使用靶向BCMA和非BCMA靶标的双特异性CAR(无论是在NK细胞、T细胞上还是在NK细胞和T细胞两者的组合上表达)都将预期肿瘤细胞生长的类似减缓。
预期接受表达抗BCMA CAR和非BCMA靶向CAR(或单一双特异性CAR)的NK细胞和/或T细胞的小鼠将与对照组相比以及与用仅表达一种CAR(BCMA或非BCMA定向的)的细胞处理的组相比展现出增强的存活率。
这是一个预言性实施例。
实施例6-强直与靶标结合诱导的信号传导的筛选
如上所述,本文提供的CAR采用各种结构组件和/或以不同的结构配置使用相同的组件。为了选择用于免疫疗法的CAR,进行一系列实验来评价本文公开的各种CAR组件和CAR形式与强直信号传导(例如,在没有靶标的情况下来自CAR的信号传导)相比如何影响表达、靶标结合、和靶标结合诱导的激活。如图所描绘(作为非限制性实施方案)并且如本文所述,CAR根据实施方案采用各种结构。例如,在若干个实施方案中,不同的铰链结构域用于将CAR的肿瘤结合部分可操作地连接到CAR的其余部分(例如,跨膜和信号传导区域)。在若干个实施方案中,使用CD8α衍生的结构域。例如,在若干个实施方案中,CD8铰链、跨膜和胞内结构域用于CAR。在若干个实施方案中,使用CD28。在若干个实施方案中,使用更长或更短的铰链结构域。同样,对于含有scFv的CAR,可以使用VH-接头-VL或VL-接头-VH形式,注意接头在构建体之间可以是不同的。图19示出了产生四种非限制性CAR结构(VH-接头-VL-CD8α铰链、VL-接头-VH-CD8α铰链、VH-接头-VL-IgG4铰链(短)和VH-接头-VL-RQRCD8铰链(长))的结果。通过检测嵌入编码构建体的核苷酸序列中的FLAG标签来测量表达。应当理解,本文提出的采用FLAG(或其他检测标签)的任何构建体也可以设想为没有标签(以及任何对应的另外的序列,诸如相关接头)。图19的表达数据显示为平均荧光强度(MFI)。
如图19所示,无论采用何种接头,这些形式中的每一种都由Jurkat细胞表达。虽然在这个实验中,表达看起来没有受到接头选择的显著影响,但VH-接头-VL scFv形式看起来导致更高的表达水平。然而,在若干个实施方案中,VL-接头-VH scFv形式仍然能够足够好地表达以使用此类scFv的CAR能够结合相应的靶标(例如,BCMA)并且诱导针对这种表达靶标的肿瘤细胞的细胞毒性。
癌症免疫疗法要求工程化细胞能够结合肿瘤细胞并且在很大程度上或完全避免靶向和作用于非肿瘤细胞。某些CAR主要或仅在它们结合其被工程化所识别的肿瘤标记物时才有反应。这在本文中称为激活。对于在免疫疗法中的使用标记物而言不太理想的其他CAR即使在它们相应的肿瘤不存在时也展现出信号传导。这在本文中称为强直信号传导。本文讨论的某些实验涉及激活与强直信号传导的比率,其中较大的比率值表示给定CAR的较大信号传导和/或较小的强直信号传导。
在用于评估信号传导的模型系统中评价激活和强直信号传导,其中使用Jurkat细胞(作为细胞疗法中使用的其他细胞的替代物)。Jurkat细胞是一种永生人类白血病T细胞系,其已广泛用于评估T细胞激活和信号传导机制。尽管Jurkat细胞不分泌原代T细胞所分泌的完整细胞因子,并且Jurkat细胞缺乏显著的细胞溶解活性,但Jurkat细胞在激活时确实产生IL-2并且上调CD69。由于使用荧光抗体可以容易地检测(例如,通过流式细胞术)细胞表面CD69表达,因此使用诱导的CD69染色表达的评价来确定在存在和不存在表达BCMA的靶细胞(此处为MM.S1细胞)的情况下表达本文提供的CAR的Jurkat细胞的激活。
图20示出了来自E:T比率为1:1(Jurkat:MM.1S)的所得数据,所得数据基于不存在靶细胞的情况下工程化Jurkat细胞的信号传导而绘制。与存在较少数量的肿瘤细胞的类似实验相比(例如,E:T为10:1,数据未示出),靶肿瘤细胞数量的增加导致CD69表达的增加。如散点图所示,若干个克隆展现出高激活以及升高的强直信号传导(右上)。同样,一些克隆显示出低激活和升高的强直信号传导或低激活和低信号传导(散点图的左侧部分)。然而,选定的克隆显示出高激活和低强直信号传导,使其对于在癌症免疫疗法中的潜在用途而言具有吸引力。
所述数据诸如与强直信号传导和BCMA结合相关的数据可以用于产生BCMA结合诱导的信号传导与强直信号传导的比率,所述比率可以用作数据点来在靶性能(on-targetperformance)方面比较给定CAR与其他CAR。图21示出了在其激活/强直信号传导比率方面进行比较的所选的非限制性CAR构建体。构建体A、构建体B和构建体C中的每一个具有不同的架构(例如,VH/VL结构域的顺序、接头等)。在给定的架构中,克隆1、2、3和4中的每一个在其结合剂序列方面有所不同。对照使用两种不同的对照CAR架构。给定CAR架构中的肿瘤标记物结合剂序列确实在激活/强直信号传导比率方面存在一些差异。例如,与克隆A4相比,克隆A1看起来具有升高的比率。可以看到类似的结果,例如克隆C1与C4相比。与克隆A3或C3相比,在比较克隆A1或C1时显示出显著差异。虽然整个克隆1和克隆3组共享相似的模式,但克隆A3和C3显示出明显更高的激活/强直信号传导比率。这些数据表明,CAR的架构可以显著影响激活/强直信号传导比率。因此,根据若干个实施方案,可以优化CAR架构(例如,VH-接头A-VL、VL-接头A-VH、VH-接头B-VL或VL-接头B-VH)以增强由于CAR与肿瘤标记物(诸如BCMA)的结合而引起的活性程度,同时减少/消除即使当肿瘤标记物最小表达或根本不表达时也发生的强直信号传导。
实施例7-CAR组件的表达和功能评估
基于先前实施例的结果,进行进一步的实验来评价BCMA定向CAR表达和功能。如本文所提供的,设计和构建了两个系列的CAR,其架构各不相同,如下所概述。
表1-CAR架构
基于上述各种结构,进行测定以确定特定CAR架构和给定架构内的特定序列是否导致增强的表达和/或活性(例如,升高的激活与降低的强直信号传导)。
图22示出了与给定CAR架构中每个克隆的表达相关的一系列直方图(架构F在本图中显示为非限制性数据)。图22的左图示出了Jurkat细胞的CAR表达,如通过检测整合到编码CAR的核酸中的FLAG标签所测量的。数据显示为MFI,其表示特定细胞表达CAR的程度(例如,每个细胞的CAR“拷贝数”)。如可以看出,即使在给定的架构中,某些克隆序列的表达也比其他序列更稳健。图22的右图涉及给定架构中每个克隆结合BCMA(预期靶标)的能力。有趣的是,虽然一些稳健表达的细胞实现了升高的BCMA结合,但即使是那些低表达的细胞中的一些仍然展现出与具有更高平均表达的其他CAR相当的BCMA结合。这些数据表明,序列不仅对表达很重要,而且结合可以独立于表达。因此,在若干个实施方案中,对CAR的两个方面的分析是重要的,因为表达较低的CAR可以克服较低的表达水平与升高的结合活性。
如上所讨论,可以评价的另一个特征是激活(基于靶标结合)与强直信号传导比率。该比率有助于评价特定CAR的潜在“在靶”和“脱靶”潜力。图23A-图23B示出了与BCMA结合诱导的激活(23A)和不希望的强直信号传导(23B)相关的散点图。如图23A中可以看出,若干个构建体(来自不同的架构并且也在架构内)基于与BCMA的结合来实现CAR的激活。这些被描绘为高于10,000值阈值水平线的圆圈。低于阈值线的那些被认为通过筛选(至少仅基于激活)的激活不足。图23B示出了强直信号传导的相应数据。同样,被激活的那些表达CAR的细胞,即使在没有全部或基本上全部靶标肿瘤标记物的情况下,也被认为展现出一定程度的强直信号传导。那些高于10,000单位阈值的圆圈被认为显示出一定程度的强直信号传导。低于阈值的那些不会。然而,单独评估强直信号传导或激活是部分分析。在观察显示激活高于阈值但没有展现出强直信号传导的克隆时,在这个特定的筛选中,有五种CAR满足这些标准。它们由图23A中的箭头标识。
在此分析的基础上,图24示出了BCMA结合随CAR表达的变化的散点图,其中标记指示CAR的各种分组。图的左下方示出了既没有充分表达也没有显示出足够BCMA结合的那些CAR。右下方示出了表达良好但显示BCMA结合不足的CAR亚群。图的中央部分中的两个克隆是展现出良好表达和良好BCMA结合的克隆。然而,如上所讨论,为了更稳固地了解给定的CAR,可以将表达和激活与强直信号传导(或缺乏强直信号传导)的评估一起考虑。
图25示出了本文提供的CAR的一部分的筛选中的激活/强直信号传导比率的散点图。激活/强直信号传导比率显示在Y轴上,并且表达显示在X轴上。与前面的图一样,左下方部分中的那些显示出低表达或低激活/强直信号传导比率(指示强直信号传导大于希望的程度,这降低了比率)。右下图显示出这些克隆具有合理的表达,但不希望的激活/强直信号传导比率。图的中央部分中的大量克隆展现出不同量的可接受表达水平和更高的激活/强直信号传导比率。
对CAR架构的影响进行进一步评估,以确定CAR架构的特定特征是否对表达、靶标结合或激活/强直信号传导显示出主导影响。图26A和图26B示出了当使用Whitlow与GS接头时与激活/强直信号传导比率(26A)和表达(26B)相关的数据。虽然某些单独克隆的行为看起来是表现独特的,但大多数克隆在激活/强直信号传导或表达方面看起来并没有偏离标准。当比较scFv中重链和轻链的取向时,鉴定出表达和激活/强直信号传导比率有一些更大的分布。图26C示出了当比较VH-连接子-VL scFv结构(Y轴)相对于VL-接头-VH scFv结构(X轴)时的激活/强直信号传导比率。虽然某些克隆通过VH-VL排序显示出改善的激活,但其他克隆通过VL-VH排序显示出更好的活性。关于表达,图26D中示出了类似的克隆特异性结果。
由于此筛选中的某些CAR在跨膜和信号传导结构域的亚组件方面不同,因此进行额外的比较,以比较CD28衍生序列的铰链、跨膜和胞内结构域的这些CAR与使用来自CD8α(带有OX40共刺激结构域)的相应结构域CAR中的激活/强直信号传导比率。这里,如图26E所示的数据看起来表明,与CD28结构域相反,当使用CD8-OX40结构域时,激活/强直信号传导比率总体呈改善趋势。或许甚至更清楚地,对于CAR构建体的表达,情况看起来也是如此,如图26F所示。这些数据表明,结构和基于序列的变化都可能影响CAR表达、结合和激活。根据本文公开的若干个实施方案,BCMA定向CAR可以在免疫细胞(诸如NK细胞)中实现合适的表达,以及所希望水平的激活和强直信号传导,使其成为BCMA定向癌症免疫疗法的适当候选者。
实施例8-含VHH的CAR的评价
本文还提供了使用基于骆驼科的肿瘤结合剂而不是scFv肿瘤结合剂形式的CAR。在若干个实施方案中,使用单价(单一VHH)CAR,而在其他实施方案中,使用二价(VHH-接头-VHH)CAR形式。与上面讨论的实施例类似,进行实验以确定对VHH-CAR架构的结构或基于序列的改变是否影响表达VHH-CAR的细胞的表达、靶标结合和/或激活。将单价或二价VHH-CAR在Jurkat中表达,并且评估表达、BCMA结合和激活/强直信号传导比率。
图27示出了绘制单价和二价VHH-CAR的表达程度相对于BCMA结合的变化的数据。这些数据表明,单价(圆形)和二价(三角形)VHH-CAR的表达程度相对类似,尽管各个克隆之间存在差异。这些数据看起来也表明二价VHH-CAR显示出BMCA结合增加的趋势。鉴于二价VHH-CAR的双结合结构域形式,这并非完全出乎意料。
图28A-图28B进一步支持这个初始意见。图28A示出了二价VHH-CAR相对于单价VHH-CAR的表达的数据。如散点图所示,大多数数据点位于等效阈值线之上,表明二价VHH-CAR的表达更大。类似地,如果不是更深刻,结果示出在图28B中,其中与单价VHH-CAR相比,当使用二价VHH-CAR时,BCMA结合看起来更加稳健。
然而,如上所讨论的,需要了解靶肿瘤标记物的结合和在不存在靶肿瘤标记物的情况下表达CAR的细胞的激活(例如,强直激活)之间的潜在相互作用。图29A示出了与检测二价和单价VHH-CAR的强直信号传导相关的数据。这些数据表明,强直信号传导在二价VHH-CAR形式下更为普遍。图29B评估了激活/强直信号传导比率,其显示出单价与二价形式之间所述比率相当均匀的分布。这可以部分地通过由二价构建体显示的BMCA结合的明显增加来解释。因此,分子(结合/激活)和分母(强直信号传导)都以二价形式增加,从而使基于所述比率的评价看起来更类似于单价的评价。
图29C-图29D使用六种VHH-CAR列出了数据的子集,显示了单价和二价形式的最优选特征。图29C是比较激活/强直信号传导比率的直方图。这些数据表明,单价形式显示出通常高于二价形式的比率。基础机制看起来在图29B中得到证实,这表明二价形式的强直信号传导远大于单价构建体。
将这些实施例中的每一个考虑在内,进行分析以比较scFv-CAR与VHH-CAR。这些数据示出于图30A和图30B中。图30A示出了强直信号传导程度随表达的变化。候选VHH-CAR比候选scFv(以及对照VHH-CAR)显示出显著更大的强直信号传导。图30B示出了与细胞激活相关的数据,并且揭示了虽然VHH-CAR总体上具有比scFv更高的激活,但当scFv CAR结合BCMA时名义上较低的激活,连同显著较低的强直信号传导,scFv CAR形式看起来以优选的方式执行,因此使其可能成为候选而用于细胞免疫疗法。虽然该特定数据表明scFv-CAR是优选的,但在一些实施方案/形式中,也可以使用VHH-CAR。尽管如此,这些数据表明,可能有必要对这些参数中的每一个进行独立评价,以充分了解给定CAR的特征。
可以设想,可以制备以上公开的实施方案的特定特征和方面的各种组合或子组合,并且其仍然落入本发明的一个或多个之内。此外,本文中关于与实施方案相关的任何特定特征、方面、方法、特征、质量、属性、要素等的公开内容可以用于本文阐述的所有其他实施方案中。因此,应当理解,所公开的实施方案的各种特征和方面可以彼此组合或相互替代,以形成所公开的发明的不同模式。因此,本文公开的本发明的范围不应受上述具体公开的实施方案的限制。此外,尽管本发明易受各种修改和替代形式的影响,但其具体例子已经在附图中示出并在本文中详细描述。然而,应当理解的是,本发明不限于所公开的特定形式或方法,相反,本发明涵盖落入所描述的各种实施方案和所附权利要求的精神和范围内的所有修改、等同物和替代方案。本文公开的任何方法不必按照所列举的顺序执行。本文公开的方法包括由从业者采取的某些动作;然而,它们也可以明示地或暗示地包括那些动作的任何第三方指示。另外,在本公开文本的特征或方面按马库什群组(Markush group)来描述的情况下,本领域技术人员应认识到,本公开文本因此也按马库什群组的任何单独成员或成员亚组来描述。
本文公开的范围还包括任何和所有重叠、子范围及其组合。诸如“多达”、“至少”、“大于”、“小于”、“在……之间”等语言包括所列举的数字。数字前面的术语诸如“约”或“大约”包括所列举的数字。例如,“约90%”包括“90%”。在一些实施方案中,具有至少95%序列同一性的序列包括与参考序列具有96%、97%、98%、99%和100%序列同一性的序列。另外,当序列被公开为“包含”核苷酸或氨基酸序列时,除非另有说明,否则这种引用还应包括序列“包含”所列举的序列、“由所列举的序列组成”或“基本上由所列举的序列组成”。
在若干个实施方案中,提供了与本文公开的任何核酸相对应的氨基酸序列,同时解释了核酸密码的简并性。此外,设想与本文明确公开的那些不同但具有功能相似性或等效性的那些序列(无论是核酸还是氨基酸)也在本公开文本的范围内。前述内容包括突变体、截短、取代或其他类型的修饰。
本文使用的任何标题或子标题是出于组织目的,并且不应用于限制本文公开的实施方案的范围。
将包括但不限于已发表和未发表的申请、专利和文献参考文献的在本文中引用的所有参考文献通过引用以其整体并入本文,并由此构成本说明书的一部分。就通过引用并入的出版物和专利或专利申请与本说明书中包含的公开内容相矛盾而言,本说明书旨在取代和/或优先于任何这种矛盾的材料。
Claims (87)
1.一种抗BCMA结合部分,所述抗BCMA结合部分包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH)和含有LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链可变区(VL),其中:
所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114、105、107、129、104、106、108-113或115-128中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140、131、133、155、130、132、134-139或141-154中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166、157、159、181、156、158、160-165或167-180中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395、386、388、410、385、387、389-392或396-409中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR2包含与SEQ ID NO:421、412、414、436、411、413、415-420或422-435中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447、438、440、462、437、439、441-446或448-446中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
2.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中:
1)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:
140具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
2)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:105具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:
131具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:157具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
3)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:107具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:
133具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:159具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
或
4)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:129具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:
155具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:181具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
3.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中:
1)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:
421具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
2)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:386具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:
412具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:438具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
3)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:388具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:
414具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:440具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;或
4)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:410具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:
436具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:462具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
4.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中所述VH包含与SEQ ID NO:270、261、263、285、260、262、263-269或271-284中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
5.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中所述VL包含与SEQ ID NO:551、542、544、566、541、543、545-550或552-565中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
6.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中:
所述HCDR1由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:192、183、185、207、182、184、186-191或192-206中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR2由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:218、209、211、233、208、210、212-217或219-232中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述HCDR3由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:244、235、237、259、234、236、238-243或245-258中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
7.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中:
所述LCDR1由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:473、464、466、488、463、465、467-472或474-487中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR2由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:499、490、492、514、489、491、493-498或500-513中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述LCDR3由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:525、516、518、540、515、517、519-524或526-539中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
8.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中所述VH由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:296、287、289、311、286、288、290-295或297-310中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
9.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中所述VL由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:577、568、570、592、567、569、571-576或578-591中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
10.根据权利要求1所述的抗BCMA结合部分,其中所述VH和VL通过接头分开。
11.根据权利要求10所述的抗BCMA结合部分,其中所述接头包含SEQ ID NO:1388的序列。
12.根据权利要求11所述的抗BCMA结合部分,其中所述VH在所述VL的N末端。
13.根据权利要求12所述的抗BCMA结合部分,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:603、594、596、618、593、595、597-602或604-617中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
14.根据权利要求12所述的抗BCMA结合部分,其中所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:629、620、622、644、619、621、623-628、630-643或645-670中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
15.根据权利要求11所述的抗BCMA结合部分,其中所述VL在所述VH的N末端。
16.根据权利要求15所述的抗BCMA结合部分,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:681、672、674、696、671、673、675、-680或682-695中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
17.根据权利要求15所述的抗BCMA结合部分,其中所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:707、698、700、722、697、699、701-706、708-721或723-748中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
18.根据权利要求10所述的抗BCMA结合部分,其中所述接头包含SEQ ID NO:2260的序列。
19.根据权利要求18所述的抗BCMA结合部分,所述抗BCMA结合部分包含与SEQ ID NO:1483、1474、1476、1498、1473、1475、1477-1482或1484-1497中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
20.根据权利要求18所述的抗BCMA结合部分,其中所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1509、1500、1502、1524、1499、1501、1503-1508或1510-1523中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
21.一种包含根据权利要求1-20中任一项所述的抗BCMA结合部分的BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)。
22.一种免疫细胞,所述免疫细胞包含根据权利要求1-20中任一项所述的抗BCMA结合部分或根据权利要求21所述的CAR。
23.根据权利要求22所述的免疫细胞,其中所述免疫细胞是自然杀伤(NK)细胞或T细胞。
24.根据权利要求21所述的BCMA定向CAR,其中所述CAR进一步包含铰链结构域;跨膜结构域;和包含CD3ζ亚结构域的胞内信号传导结构域。
25.根据权利要求24所述的BCMA定向CAR,其中所述胞内信号传导结构域进一步包含OX40亚结构域。
26.根据权利要求25所述的BCMA定向CAR,其中所述OX40亚结构域包含与SEQ IDNO:1394具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
27.根据权利要求24-26中任一项所述的BCMA定向CAR,其中所述CD3ζ亚结构域包含与SEQ ID NO:1395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
28.根据权利要求24-27中任一项所述的BCMA定向CAR,其中所述跨膜结构域是CD8跨膜结构域。
29.根据权利要求28所述的BCMA定向CAR,其中所述CD8跨膜结构域包含与SEQ ID NO:1392具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
30.根据权利要求24-29中任一项所述的BCMA定向CAR,其中所述铰链结构域是CD8铰链结构域。
31.根据权利要求30所述的BCMA定向CAR,其中所述CD8铰链结构域包含与SEQ ID NO:1389具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
32.根据权利要求24-31中任一项所述的BCMA定向CAR,所述BCMA定向CAR包含与SEQ IDNO:3897、3888、3890、3912、3887、3889、3891-3896或3898-3911中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
33.根据权利要求32所述的BCMA定向CAR,其中所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3923、3914、3916、3938、3913、3915、3917-3922、3924-3937或3939-3964中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
34.根据权利要求33所述的BCMA定向CAR,其中编码所述BCMA定向CAR的所述核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:4001、3992、3994、4016、3991、3993、3995-4000、4002-4015或4017-4042中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
35.根据权利要求24-31中任一项所述的BCMA定向CAR,所述BCMA定向CAR包含与SEQ IDNO:4053、4044、4046、4068、4043、4045、4047-4052或4054-4067中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
36.根据权利要求35所述的BCMA定向CAR,其中所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4079、4070、4072、4094、4069、4071、4073-4078、4080-4093或4095-4120中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
37.根据权利要求36所述的BCMA定向CAR,其中编码所述BCMA定向CAR的所述核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:4157、4148、4150、4172、4147、4149、4151-4156、4158-4171或4173-4198中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
38.根据权利要求24-31中任一项所述的BCMA定向CAR,所述BCMA定向CAR包含与SEQ IDNO:3869、3867、3868或3870中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
39.根据权利要求38所述的BCMA定向CAR,其中所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3885、3883、3884或3886中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
40.根据权利要求36所述的BCMA定向CAR,其中编码所述BCMA定向CAR的所述核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:3837、3835、3836或3839中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
41.一种免疫细胞,所述免疫细胞包含根据权利要求24-40中任一项所述的CAR。
42.根据权利要求41所述的免疫细胞,其中所述免疫细胞是自然杀伤(NK)细胞或T细胞。
43.一种BCMA定向嵌合抗原受体(CAR),所述CAR包含:
胞外抗BCMA结合部分;
其中所述抗BCMA结合部分包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH),其中:
所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104-129、1525-1543或3117-3139中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR2包含与SEQ ID NO:130-155、1544-1562或3140-3162中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR3包含与SEQ ID NO:156-181、1563-1581或3163-3185中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
铰链结构域;
跨膜结构域;以及
胞内信号传导结构域。
44.根据权利要求43所述的抗BCMA结合部分,所述抗BCMA结合部分进一步包含含有另外的HCDR1、HCDR2和HCDR3的另外的VH,其中:
所述另外的HCDR1包含与SEQ ID NO:3117-3139中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述另外的HCDR2包含与SEQ ID NO:3140-3162中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述另外的HCDR3包含与SEQ ID NO:3163-3185中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
45.根据权利要求43或44所述的抗BCMA结合部分,其中所述胞内信号传导结构域包含共刺激亚结构域和CD3ζ亚结构域。
46.一种工程化免疫细胞群体,所述工程化免疫细胞群体包含:
经工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)的免疫细胞群体,所述CAR包含:
胞外抗BCMA结合部分;
其中所述抗BCMA结合部分包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH),其中:
所述HCDR1包含与SEQ ID NO:104-129、1525-1543或3117-3139中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR2包含与SEQ ID NO:130-155、1544-1562或3140-3162中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR3包含与SEQ ID NO:156-181、1563-1581或3163-3185中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
铰链结构域;
跨膜结构域;以及
胞内信号传导结构域。
47.根据权利要求46所述的免疫细胞群体,其中所述CAR进一步包含含有另外的HCDR1、HCDR2和HCDR3的另外的VH,其中:
所述另外的HCDR1包含与SEQ ID NO:3117-3139中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述另外的HCDR2包含与SEQ ID NO:3140-3162中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述另外的HCDR3包含与SEQ ID NO:3163-3185中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
48.根据权利要求46或47所述的免疫细胞群体,其中:
所述HCDR1由核酸序列编码,所述核酸序列与SEQ ID NO:182-207或3186-3208中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性;
所述HCDR2由核酸序列编码,所述核酸序列与SEQ ID NO:208-233或3209-3231中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性;并且
所述HCDR3由核酸序列编码,所述核酸序列与SEQ ID NO:234-259或3232-3254中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。
49.根据权利要求46所述的免疫细胞群体,其中所述CAR进一步包含含有LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链可变区(VL),其中:
所述LCDR1包含与SEQ ID NO:3117-3139中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR2包含与SEQ ID NO:3140-3162中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述LCDR3包含与SEQ ID NO:3163-3185中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
50.一种经工程化以表达BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)的免疫细胞群体,所述CAR包含:
抗BCMA结合部分,所述抗BCMA结合部分包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH)和含有LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链可变区(VL),其中:
所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114、105、107、129、104、106、108-113或115-128中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140、131、133、155、130、132、134-139或141-154中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166、157、159、181、156、158、160-165或167-180中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395、386、388、410、385、387、389-392或396-409中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR2包含与SEQ ID NO:421、412、414、436、411、413、415-420或422-435中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447、438、440、462、437、439、441-446或448-446中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
51.根据权利要求50所述的免疫细胞群体,其中:
1)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
2)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:105具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:131具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:157具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
3)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:107具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:133具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:159具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
或
4)所述HCDR1包含与SEQ ID NO:129具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述HCDR2包含与SEQ ID NO:155具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述HCDR3包含与SEQ ID NO:181具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
52.根据权利要求50或51所述的免疫细胞群体:
1)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:421具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
2)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:386具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:412具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:438具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
3)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:388具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:414具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:440具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;或
4)所述LCDR1包含与SEQ ID NO:410具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,所述LCDR2包含与SEQ ID NO:436具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且所述LCDR3包含与SEQ ID NO:462具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
53.根据权利要求50-52中任一项所述的免疫细胞群体,其中所述VH包含与SEQ IDNO:270、261、263、285、260、262、263-269或271-284中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
54.根据权利要求50-53中任一项所述的免疫细胞群体,其中所述VL包含与SEQ IDNO:551、542、544、566、541、543、545-550或552-565中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
55.根据权利要求50-54中任一项所述的免疫细胞群体,其中:
所述HCDR1由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:192、183、185、207、182、184、186-191或192-206中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR2由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:218、209、211、233、208、210、212-217或219-232中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述HCDR3由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:244、235、237、259、234、236、238-243或245-258中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
56.根据权利要求50-55中任一项所述的免疫细胞群体,其中:
所述LCDR1由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:473、464、466、488、463、465、467-472或474-487中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR2由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:499、490、492、514、489、491、493-498或500-513中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述LCDR3由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:525、516、518、540、515、517、519-524或526-539中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
57.根据权利要求50-56中任一项所述的免疫细胞群体,其中所述VH由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:296、287、289、311、286、288、290-295或297-310中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
58.根据权利要求50-57中任一项所述的免疫细胞群体,其中所述VL由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:577、568、570、592、567、569、571-576或578-591中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
59.根据权利要求50-58中任一项所述的免疫细胞群体,其中所述VH和VL通过接头分开。
60.根据权利要求59所述的免疫细胞群体,其中所述接头包含SEQ ID NO:1388的序列。
61.根据权利要求60所述的免疫细胞群体,其中所述VH在所述VL的N末端。
62.根据权利要求61所述的免疫细胞群体,其中所述抗BCMA结合部分包含与SEQ IDNO:603、594、596、618、593、595、597-602或604-617中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
63.根据权利要求61或62所述的免疫细胞群体,其中所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:629、620、622、644、619、621、623-628、630-643或645-670中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
64.根据权利要求60所述的免疫细胞群体,其中所述VL在所述VH的N末端。
65.根据权利要求64所述的免疫细胞群体,其中所述抗BCMA结合部分包含与SEQ IDNO:681、672、674、696、671、673、675-680或682-695中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
66.根据权利要求64或65所述的免疫细胞群体,其中所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:707、698、700、722、697、699、701-706、708-721或723-748中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
67.根据权利要求59所述的免疫细胞群体,其中所述接头包含SEQ ID NO:2260的序列。
根据权利要求67所述的免疫细胞群体,所述免疫细胞群体包含与SEQ ID NO:1483、1474、1476、1498、1473、1475、1477-1482或1484-1497中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
68.根据权利要求67或68所述的免疫细胞群体,其中所述抗BCMA结合部分由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:1509、1500、1502、1524、1499、1501、1503-1508或1510-1523中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
69.根据权利要求46至69中任一项所述的免疫细胞群体,其中所述免疫细胞是自然杀伤(NK)细胞或T细胞。
70.一种治疗癌症的方法,所述方法包括:
向有需要的受试者施用包含BCMA定向嵌合抗原受体(CAR)的免疫细胞群体,所述CAR包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH)和含有LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链可变区(VL),其中:
所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114、105、107、129、104、106、108-113或115-128中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140、131、133、155、130、132、134-139或141-154中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166、157、159、181、156、158、160-165或167-180中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395、386、388、410、385、387、389-392或396-409中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR2包含与SEQ ID NO:421、412、414、436、411、413、415-420或422-435中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447、438、440、462、437、439、441-446或448-446中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
铰链结构域;
跨膜结构域;以及
胞内信号传导结构域,所述胞内信号传导结构域包含CD3ζ亚结构域。
71.根据权利要求71所述的方法,其中所述VH包含与SEQ ID NO:270、261、263、285、260、262、263-269或271-284中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
72.根据权利要求71或72所述的方法,其中所述VL包含与SEQ ID NO:551、542、544、566、541、543、545-550或552-565中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
73.根据权利要求72-73中任一项所述的方法,其中所述BCMA定向CAR包含与SEQ IDNO:3897、3888、3890、3912、3887、3889、3891-3896或3898-3911中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
74.根据权利要求74所述的方法,其中所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3923、3914、3916、3938、3913、3915、3917-3922、3924-3937或3939-3964中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
75.根据权利要求75所述的方法,其中编码所述BCMA定向CAR的所述核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:4001、3992、3994、4016、3991、3993、3995-4000、4002-4015或4017-4042中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
76.根据权利要求72-73中任一项所述的方法,所述方法包括与SEQ ID NO:4053、4044、4046、4068、4043、4045、4047-4052或4054-4067中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
77.根据权利要求77所述的方法,其中所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:4079、4070、4072、4094、4069、4071、4073-4078、4080-4093或4095-4120中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
78.根据权利要求78所述的方法,其中编码所述BCMA定向CAR的所述核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:4157、4148、4150、4172、4147、4149、4151-4156、4158-4171或4173-4198中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
79.根据权利要求72-73中任一项所述的方法,其中所述BCMA定向CAR包含与SEQ IDNO:3869、3867、3868或3870中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
80.根据权利要求80所述的方法,其中所述BCMA定向CAR由核酸编码,所述核酸包含与SEQ ID NO:3885、3883、3884或3886中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
81.根据权利要求81所述的方法,其中编码所述BCMA定向CAR的所述核酸进一步编码膜结合白介素15(mbIL15)并且包含与SEQ ID NO:3837、3835、3836或3839中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
82.根据权利要求71-82中任一项所述的方法,其中所述免疫细胞是NK细胞。
83.根据权利要求71-83中任一项所述的方法,其中所述癌症是多发性骨髓瘤。
84.工程化免疫细胞群体用于治疗癌症的用途,所述免疫细胞包含BCMA定向嵌合抗原受体(CAR),所述CAR包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH)和含有LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链可变区(VL),其中:
所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114、105、107、129、104、106、108-113或115-128中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140、131、133、155、130、132、134-139或141-154中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166、157、159、181、156、158、160-165或167-180中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR1包含与SEQ ID NO:395、386、388、410、385、387、389-392或396-409中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
所述LCDR2包含与SEQ ID NO:421、412、414、436、411、413、415-420或422-435中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;并且
所述LCDR3包含与SEQ ID NO:447、438、440、462、437、439、441-446或448-446中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列;
铰链结构域;
跨膜结构域;以及
胞内信号传导结构域,所述胞内信号传导结构域包含CD3ζ亚结构域。
85.工程化免疫细胞群体用于治疗癌症的用途,所述免疫细胞包含BCMA定向嵌合抗原受体(CAR),所述CAR包含含有HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链可变区(VH),其中:
所述HCDR1包含与SEQ ID NO:114、105、107、129、104、106、108-113或115-128中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,
所述HCDR2包含与SEQ ID NO:140、131、133、155、130、132、134-139或141-154中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,并且
所述HCDR3包含与SEQ ID NO:166、157、159、181、156、158、160-165或167-180中的任一个具有至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,
铰链结构域;
跨膜结构域;以及
胞内信号传导结构域,所述胞内信号传导结构域包含CD3ζ亚结构域。
86.权利要求86或87在制造用于治疗癌症的药剂中的用途。
87.根据权利要求86、87或88所述的用途,其中所述癌症是多发性骨髓瘤。
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