CN116895337B - 一种合成生物元件数据库系统 - Google Patents

Abstract

本发明涉及合成生物元件数据库技术领域，具体涉及一种合成生物元件数据库系统，包括元件数据库、处理端、客户端和眼动追踪模块。客户端用于向处理端发送检索请求，处理端用于根据检索请求在元件数据库中查找匹配的生物元件形成检索结果并发送至客户端。眼动追踪模块设于客户端以用于对使用者在查阅检索结果时的注视区域进行捕捉。客户端还用于根据实时显示内容和注视区域确定被忽略内容，并将被忽略内容与检索请求进行对比，若被忽略内容与检索请求的匹配度大于或等于临界阈值，则将被忽略内容插入到还未显示的内容当中。其能够有效地降低使用者的误读率，避免关键信息的遗漏，能够促进生物系统合成设计的高效开展。

Description

一种合成生物元件数据库系统

技术领域

本发明涉及合成生物元件数据库技术领域，具体而言，涉及一种合成生物元件数据库系统。

背景技术

合成生物学是通过人工设计和构建自然界中不存在的生物系统来解决能源、材料、健康、环保等问题的一门学科。生物元件（park）是设计合成生物系统的最基本单元。

在实际工作过程中，对生物元件的技术信息的检索和管理会耗费大量的时间，加上对技术信息的阅读，会耗费工作人员的大量精力。随着阅读量的增加，疲劳度直线上升，且误读率也会明显变高，这并不利于生物系统合成设计的高效开展。

有鉴于此，特提出本申请。

发明内容

本发明的目的在于提供一种合成生物元件数据库系统，其能够有效地降低使用者的误读率，避免关键信息的遗漏，能够促进生物系统合成设计的高效开展。

本发明的实施例是这样实现的：

一种合成生物元件数据库系统，其包括：元件数据库、处理端、客户端和眼动追踪模块。

元件数据库用于保存生物元件，每个生物元件均匹配有介绍文档，介绍文档用于记录对应的生物元件的技术信息。

客户端用于向处理端发送检索请求，处理端用于根据检索请求在元件数据库中查找匹配的生物元件形成检索结果并发送至客户端。客户端还用于将检索结果向使用者进行展示。

眼动追踪模块设于客户端以用于对使用者在查阅检索结果时的注视区域进行捕捉。

客户端还用于根据实时显示内容和注视区域确定被忽略内容，并将被忽略内容与检索请求进行对比，若被忽略内容与检索请求的匹配度大于或等于临界阈值，则将被忽略内容插入到还未显示的内容当中。

进一步的，在检索结果当中，对生物元件按相关度从高到低进行排序，并标注相关度值。

客户端在将被忽略内容与检索请求进行对比时，直接将被忽略内容的相关度值与临界阈值进行对比，若被忽略内容的相关度值大于或等于临界阈值，则将被忽略内容插入到还未显示的内容当中。

进一步的，当检测到被忽略内容的相关度值小于临界阈值时，对于在检索结果中位于该被忽略内容之后的生物元件，便不再插入到还未显示的内容当中。

进一步的，被忽略内容被插入到还未显示的内容当中并再次显示后，若该被忽略内容再次被忽略，则在该被忽略内容的介绍文档中查找与检索请求之间的匹配度最高的内容并进行截图，将该截图高亮显示并将该被忽略内容再次插入到还未显示的内容当中。

进一步的，在检索结果中，显示生物元件的标题和简介，点击标题后显示介绍文档。

处理端还用于对检索结果进行加工处理，包括：

在每个生物元件的介绍文档中确定出与检索请求相匹配的内容。

按介绍文档的显示排版构建网格图，每个网格块对应一个字符，网格块的分布与显示排版相适配。

在网格图中，将与检索请求相匹配的内容所对应的网格块高亮处理，以形成相关内容分布图。

在检索结果中，将相关内容分布图在对应的生物元件的标题旁显示。

进一步的，相关内容分布图为矢量图。

进一步的，客户端还用于向使用者提供选择工具。选择工具用于在相关内容分布图中对网格块进行选取，网格块之间支持连续选取，连续选取的方向与介绍文档中文字的排版顺序相同。

当使用者选取完毕后，客户端在介绍文档中将被选取的网格块所对应的内容进行提取，并向使用者展示。

进一步的，客户端还用于设置字符数阈值。在检索结果中，若介绍文档的字符数大于或等于字符数阈值，则对相关内容分布图进行缩略处理，包括：

根据预设的聚类规则对高亮的网格块进行聚类处理，得到集中区域。

对属于同一个集中区域的全部网格块用同一种颜色进行填充，不同的集中区域之间用不同的颜色进行区分，以形成若干区域色块。

将相邻的区域色块之间的网格块删除，从而将全部区域色块相互靠拢，靠拢之后各个区域色块之间的方向关系与靠拢前相适配，以得到相关内容缩略图。

在检索结果中，将相关内容缩略图在对应的生物元件的标题旁显示。

进一步的，在相关内容缩略图中，相邻的区域色块之间标注分界线。

点击区域色块时，显示该区域色块对应的相关内容缩略图。点击分界线时，显示该分界线对应的两个区域色块之间的区域所对应的介绍文档内容。

进一步的，选择工具还用于在区域色块对应的相关内容缩略图中对网格块进行选取，且网格块之间支持连续选取，连续选取的方向与介绍文档中文字的排版顺序相同。

当使用者选取完毕后，客户端在介绍文档中将被选取的网格块所对应的内容进行提取，并向使用者展示。

本发明实施例的技术方案的有益效果包括：

本发明实施例提供的合成生物元件数据库系统有效地避免了使用者在阅读检索结果的过程中因为个人疏忽而漏掉一些内容，同时也不会打乱使用者的正常阅读顺序和阅读习惯，可以针对性地对已经遗漏的内容进行补充阅读。

总体而言，本发明实施例提供的合成生物元件数据库系统能够有效地降低使用者的误读率，避免关键信息的遗漏，能够促进生物系统合成设计的高效开展。

附图说明

为了更清楚地说明本发明实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，应当理解，以下附图仅示出了本发明的某些实施例，因此不应被看作是对范围的限定，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他相关的附图。

图1为本发明实施例提供的合成生物元件数据库系统的构成示意图；

图2为介绍文档中字符排布的示例图；

图3为与图2中字符排布相对应的网格图；

图4为与图2相对应的相关内容分布图；

图5为长篇幅介绍文档中匹配内容的分布示例；

图6为对匹配内容进行聚类分析后得到的集中区域的示意图；

图7为基于图6得到的区域色块的示意图；

图8为基于图6得到的相关内容缩略图；

图9为各个区域色块与介绍文档各个部分的对应关系示意图。

附图标记说明：

合成生物元件数据库系统1000；元件数据库100；处理端200；客户端300；眼动追踪模块400。

具体实施方式

为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例。通常在此处附图中描述和示出的本发明实施例的组件可以以各种不同的配置来布置和设计。

因此，以下对在附图中提供的本发明的实施例的详细描述并非旨在限制要求保护的本发明的范围，而是仅仅表示本发明的选定实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本发明保护的范围。

应注意到：相似的标号和字母在下面的附图中表示类似项，因此，一旦某一项在一个附图中被定义，则在随后的附图中不需要对其进行进一步定义和解释。

如本说明书和权利要求书中所示，除非上下文明确提出示例外情形，“一”、“该”等词并非特指单数，也可包括复数。一般说来，术语“包括”与“包含”仅提示包括已明确标识的步骤和元素，而这些步骤和元素不构成一个排它性的罗列，方法或者设备也可能包含其它的步骤或元素。

本说明书中使用的流程图用来说明根据本说明书的实施例的系统所执行的操作。可以理解，各步骤的操作不一定按照顺序来精确地执行。相反，可以按照倒序或同时处理各个步骤。同时，也可以将其他操作添加到这些过程中，或从这些过程移除某一步或数步操作。

请参照图1，本实施例提供一种合成生物元件数据库100系统1000，用于辅助研究人员快速检索所需的生物元件信息。

合成生物元件数据库100系统1000包括：元件数据库100、处理端200、客户端300和眼动追踪模块400。

元件数据库100用于保存生物元件的信息，每个生物元件均匹配有介绍文档，介绍文档用于记录对应的生物元件的技术信息，技术信息包括但不限于：理化性质、应用、相关研究等。

客户端300用于向处理端200发送检索请求，处理端200用于根据检索请求在元件数据库100中查找匹配的生物元件形成检索结果并发送至客户端300。客户端300还用于将检索结果向使用者进行展示。

眼动追踪模块400设于客户端300，眼动追踪模块400用于对使用者在查阅检索结果时在屏幕上的注视区域进行捕捉。

客户端300还用于根据对检索结果的实时显示内容和注视区域确定被忽略内容。其中，屏幕上的显示内容和使用者的注视区域都是实时确认的，进入注视区域的内容则被认为是使用者关注到了的，而从始至终均为进入过实时注视区域的内容则被认定为没有被使用者注意到的，即为被忽略内容。

并将被忽略内容与检索请求进行对比，若被忽略内容与检索请求的匹配度大于或等于临界阈值，则将被忽略内容插入到还未显示的内容当中。随着检索内容内依次显示，之前被插入到还未显示的内容当中的被忽略内容就能够再次在屏幕上显示一遍，以供使用者补充查阅。

这样的话，有效地避免了使用者在阅读检索结果的过程中因为个人疏忽而漏掉一些内容，同时也不会打乱使用者的正常阅读顺序和阅读习惯，可以针对性地对已经遗漏的内容进行补充阅读。

其中，临界阈值可以根据实际需要灵活设置。

总体而言，合成生物元件数据库100系统1000能够有效地降低使用者的误读率，避免关键信息的遗漏，能够促进生物系统合成设计的高效开展。

在本实施例中，在检索结果当中，对生物元件按相关度从高到低进行排序，并标注相关度值。

客户端300在将被忽略内容与检索请求进行对比时，直接将被忽略内容的相关度值与临界阈值进行对比，若被忽略内容的相关度值大于或等于临界阈值，则将被忽略内容插入到还未显示的内容当中。

相应的，当检测到被忽略内容的相关度值小于临界阈值时，对于在检索结果中位于该被忽略内容之后的生物元件，便不再插入到还未显示的内容当中。这样的话，一旦检测到某个被忽略内容的相关度值小于临界阈值，在检索结果中位于该被忽略内容之后的生物元件便统一均不再二次显示，有效地降低了系统后台荷载。

可选的，被忽略内容被插入到还未显示的内容当中并再次显示后，若该被忽略内容再次被忽略，则在该被忽略内容的介绍文档中查找与检索请求之间的匹配度最高的内容并进行截图，将该截图高亮显示并将该被忽略内容再次插入到还未显示的内容当中。通过该设计，可以进一步避免因为使用者未第一时间捕捉到关键信息而产生信息遗漏。作为一种数据获取的补充，可以降低使用者的阅读负担。

进一步的，在检索结果中，显示生物元件的标题和简介，点击标题后显示介绍文档。

处理端200还用于对检索结果进行加工处理，包括：

在每个生物元件的介绍文档中确定出与检索请求相匹配的内容。如图2所示，图2中每个方格表示介绍文档中的一个字符，虚线框出的内容为确定出的与检索请求相匹配的内容。

按介绍文档的显示排版构建网格图，每个网格块对应一个字符，网格块的分布与显示排版相适配。如图3所示，图3为与图2中的文档相适配的网格图，每个网格对应图2中的一个字符，网格的排布方式与介绍文档中的字符的排布方式相同。

在网格图中，将与检索请求相匹配的内容所对应的网格块高亮处理，如图4中的实心点，以形成相关内容分布图。

在检索结果中，将相关内容分布图在对应的生物元件的标题旁显示。

这样的话，使用者通过标题旁的相关内容分布图，即可快速了解该生物元件的介绍文档中的相关内容量和分布情况，以提高检索和信息收集效率。以图4为例，实心点在该图中的分布就对应了匹配内容在介绍文档中的分布，可以在使用者阅读介绍文档时提供指引，以快速确定关键内容。

具体的，相关内容分布图为矢量图。这样的话，对于不同篇幅的介绍文档，都能够保证相关内容分布图的清晰度。

在此基础上，为了进一步提高阅读效率，客户端300还用于向使用者提供选择工具。

选择工具用于在相关内容分布图中对网格块进行选取，网格块之间支持连续选取，连续选取的方向与介绍文档中文字的排版顺序相同。例如：文档是按照从左到右、由上至下进行排版的，那么网格块也是按照从左到右、由上至下进行连续选取的，左右不相邻的两个网格块无法连续选取（上一行最后一个网格块和下一行第一个网格块可以连续选取），也无法隔行连续选取。

当使用者选取完毕后，客户端300在介绍文档中将被选取的网格块所对应的内容进行提取，并向使用者展示。可选的，对于这部分内容，可以通过悬浮窗口进行显示。

这样的话，便于使用者快速地对检索结果进行浏览和核验，以确定是否为所需数据，大大提高了检索效率，同时也加强了检索过程中的引导效果，帮助使用者对关键内容快速定位。

进一步的，客户端300还用于设置字符数阈值。符数阈值可以根据实际情况灵活设置。

在检索结果中，若介绍文档的字符数大于或等于字符数阈值，则表明该介绍文档篇幅过长，如果仍然采用相关内容分布图进行显示，如果要保持图形清晰度并便于使用者对网格块进行选取，图形的尺寸会偏大，影响正产显示。如果按统一尺寸进行显示，又会导致在图像中网格块过小无法准确选取和识别。

对于此种情况，则对相关内容分布图进行缩略处理，包括：

根据预设的聚类规则对高亮的网格块进行聚类处理，得到集中区域；如图5所示，实心点为高亮的网格块，聚类处理后，得到五个集中区域，如图6所示。

对属于同一个集中区域的全部网格块用同一种颜色进行填充，不同的集中区域之间用不同的颜色进行区分，以形成若干区域色块；如图7所示，五个集中区域分别对应区域色块A、区域色块B、区域色块C、区域色块D、和区域色块E。

将相邻的区域色块之间的网格块删除，从而将全部区域色块相互靠拢，靠拢之后各个区域色块之间的方向关系与靠拢前相适配，以得到相关内容缩略图，如图8所示。

需要注意的是，方向关系仅保持相对方向相匹配，不强调相互距离；且相对方向可以只保留左右关系和上下关系中的一者。如图8中所示，区域色块C和区域色块D之间只保留了左右位置关系。

在检索结果中，将相关内容缩略图在对应的生物元件的标题旁显示。

通过以上设计，能够顺利地将长篇幅的介绍文档的内容中与检索需求相匹配的内容分布情况展现出来，且不会因为介绍文档篇幅过长而影响结果的展现，同时还保留了相关内容的分布关系。

具体的，在相关内容缩略图中，相邻的区域色块之间标注分界线。

其中，点击区域色块时，显示该区域色块对应的相关内容缩略图，如图9所示。也就是说，点击某一个区域色块后，就将该区域色块在整个介绍文档中所对应的内容的相关内容缩略图进行显示，可以看做是将长篇幅的介绍文档的不同部分分别做成一个单独的相关内容缩略图。

而在点击分界线时，则显示该分界线对应的两个区域色块之间的区域所对应的介绍文档内容。

相对应的，选择工具还用于在区域色块对应的相关内容缩略图中对网格块进行选取，且网格块之间支持连续选取，连续选取的方向与介绍文档中文字的排版顺序相同。

当使用者选取完毕后，客户端300在介绍文档中将被选取的网格块所对应的内容进行提取，并向使用者展示。

通过以上设计，实现了对长篇幅介绍文档中的关键信息的快速定位和快速阅读。特别适合对篇幅长、匹配内容相对分散的介绍文档进行检索定位。

通过上述举措，有效地提高了对生物元件的检索效率，降低了技术信息收集过程中的阅读负担。

综上所述，本发明实施例提供的合成生物元件数据库100系统1000能够有效地降低使用者的误读率，避免关键信息的遗漏，能够促进生物系统合成设计的高效开展。

以上所述仅为本发明的优选实施例而已，并不用于限制本发明，对于本领域的技术人员来说，本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的精神和原则之内，所作的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (10)

1.一种合成生物元件数据库系统，其特征在于，包括：元件数据库、处理端、客户端和眼动追踪模块；

所述元件数据库用于保存生物元件，每个所述生物元件均匹配有介绍文档，所述介绍文档用于记录对应的生物元件的技术信息；

所述客户端用于向所述处理端发送检索请求，所述处理端用于根据所述检索请求在所述元件数据库中查找匹配的生物元件形成检索结果并发送至所述客户端；所述客户端还用于将所述检索结果向使用者进行展示；

所述眼动追踪模块设于所述客户端以用于对使用者在查阅所述检索结果时的注视区域进行捕捉；

所述客户端还用于根据实时显示内容和所述注视区域确定被忽略内容，并将所述被忽略内容与所述检索请求进行对比，若所述被忽略内容与所述检索请求的匹配度大于或等于临界阈值，则将所述被忽略内容插入到还未显示的内容当中。

2.根据权利要求1所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，在所述检索结果当中，对生物元件按相关度从高到低进行排序，并标注相关度值；

所述客户端在将所述被忽略内容与所述检索请求进行对比时，直接将所述被忽略内容的相关度值与所述临界阈值进行对比，若所述被忽略内容的相关度值大于或等于所述临界阈值，则将所述被忽略内容插入到还未显示的内容当中。

3.根据权利要求2所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，当检测到所述被忽略内容的相关度值小于所述临界阈值时，对于在所述检索结果中位于该被忽略内容之后的生物元件，便不再插入到还未显示的内容当中。

4.根据权利要求2所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，所述被忽略内容被插入到还未显示的内容当中并再次显示后，若该被忽略内容再次被忽略，则在该被忽略内容的介绍文档中查找与所述检索请求之间的匹配度最高的内容并进行截图，将该截图高亮显示并将该被忽略内容再次插入到还未显示的内容当中。

5.根据权利要求1所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，在所述检索结果中，显示生物元件的标题和简介，点击所述标题后显示所述介绍文档；

所述处理端还用于对所述检索结果进行加工处理，包括：

在每个生物元件的介绍文档中确定出与所述检索请求相匹配的内容；

按介绍文档的显示排版构建网格图，每个网格块对应一个字符，网格块的分布与所述显示排版相适配；

在所述网格图中，将与所述检索请求相匹配的内容所对应的网格块高亮处理，以形成相关内容分布图；

在所述检索结果中，将所述相关内容分布图在对应的生物元件的标题旁显示。

6.根据权利要求5所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，所述相关内容分布图为矢量图。

7.根据权利要求5所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，所述客户端还用于向使用者提供选择工具；所述选择工具用于在所述相关内容分布图中对网格块进行选取，网格块之间支持连续选取，连续选取的方向与介绍文档中文字的排版顺序相同；

当使用者选取完毕后，所述客户端在介绍文档中将被选取的网格块所对应的内容进行提取，并向使用者展示。

8.根据权利要求7所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，所述客户端还用于设置字符数阈值；在所述检索结果中，若介绍文档的字符数大于或等于所述字符数阈值，则对所述相关内容分布图进行缩略处理，包括：

根据预设的聚类规则对高亮的网格块进行聚类处理，得到集中区域；

对属于同一个集中区域的全部网格块用同一种颜色进行填充，不同的集中区域之间用不同的颜色进行区分，以形成若干区域色块；

将相邻的区域色块之间的网格块删除，从而将全部区域色块相互靠拢，靠拢之后各个区域色块之间的方向关系与靠拢前相适配，以得到相关内容缩略图；

在所述检索结果中，将所述相关内容缩略图在对应的生物元件的标题旁显示。

9.根据权利要求8所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，在所述相关内容缩略图中，相邻的区域色块之间标注分界线；

点击所述区域色块时，显示该区域色块对应的相关内容缩略图；点击所述分界线时，显示该分界线对应的两个区域色块之间的区域所对应的介绍文档内容。

10.根据权利要求9所述的合成生物元件数据库系统，其特征在于，所述选择工具还用于在所述区域色块对应的相关内容缩略图中对网格块进行选取，且网格块之间支持连续选取，连续选取的方向与介绍文档中文字的排版顺序相同；

当使用者选取完毕后，所述客户端在介绍文档中将被选取的网格块所对应的内容进行提取，并向使用者展示。